I 1820 hadde Baily allerede fått en ledende rolle i stiftelsen av Royal Astronomical Society, og han mottok gullmedaljen i 1827 for sin utarbeidelse av RAS' katalog over 2881 stjerner. Han vant gullmedaljen på nytt i 1843. Han ble valgt som president for Royal Astronomical Society fire ganger, med to års valgperiode hver (1825–27, 1833–35, 1837–39 og 1843–45). Ingen andre har tjent i stillingen mer enn Bailys fire ganger (en rekord han deler med George Airy), mens hans åtte år i stillingen er en rekord.