Eli Silseth hadde en bred og lang utdannelse. I 1944 var hun elev på Harald Krohg Stabells malerskole i Trondheim, der hun gikk sammen med blant andre Oskar Bodøgaard og Eilif Helland. Deretter studerte hun ved Kunstskolen i Trondheim i perioden 1945–1947. På Kunstskolen i Trondheim hadde hun blant andre Roar Wold, Tone Thiis Schjetne og Skule Waksvik som kullkamerater.