Hun vant skranke under Winter Cup 2021, og hun fikk bronse i bom. Under American Classic 2021 vant hun skranke og bom. Hun deltok bare i skranke og bom under U.S. Classic 2021, men falt i begge apparatene, og endte på hhv. tiendeplass og åttendeplass. Hun deltok i USA-mesterskapet i turn 2021, og vant der skranke, med 6,8 i vanskeverdi (D) og 15,3 i score, og hun fikk sølv i bom og i mangekampen, som ble vunnet av Simone Biles. Lee ble etter dette tatt ut til å delta i U.S Olympic Team Trials, USAs OL-uttakskonkurranse. Der kom hun på andreplass i mangekampen, og hun vant skranke og bom i apparatfinalene, og ble dermed tatt ut til å representere USA under Sommer-OL 2020 i Tokyo.