Da sovjetisk styrker nærmet seg Auschwitz i januar 1945 ble Moll overført til Dachau konsentrasjonsleir og han ledet da en dødsmarsj fra Gleiwitz (underleir til Auschwitz) til Dachau. I slutten av april 1945 ble Dachau evakuert og flere tusen fanger sendt i retning Alpene. Moll, 43 SS-soldater og en gruppe fanger ankom Buchberg leir ved Wolfratshausen (helt sør i Bayern) 29. april. Moll forlangte å få overta jødene i Buchberg leir og hevdet at de var utpekt til utryddelse. Buchberg-kommandanten nektet og Moll tok da med seg 120 til 150 kvinnelige, russiske fanger fra leiren og drepte dem i skogen. Buchberg ble frigjort av amerikanske styrker 30. april.