Marcelino Antonio Maralit studerte filosofi ved -seminaret og teologi ved Universitetet i Navarra i Pamplona, hvor han også skaffet seg lisensiat. Den 13. mars 1995 ble han presteviet for erkebispedømmet Lipa. Etter videre studier ved Det pavelige universitet Santa Croce, oppnådde han lisensiat i kirkehistorie.