Dermed var Ukraina med i kvalifiseringen til VM i 1999, der laget endte på andreplass bak Sverige. Ukraina gikk videre til kvalifiseringskamp mot Tyskland. Tyskland vant komfortabelt 5–0 hjemme, og gikk videre etter 1–1 i Kyiv. Også i kvalifiseringen til EM ble det omspill. Denne gangen ble England for sterke. I kvalifiseringen til VM i 2003 ble Ukraina nummer tre bak Frankrike og Norge. En rekke dårlige borteresultater ødela for laget i neste kvalifisering, til EM i 2005. Innsatsen i kvalifiseringen til VM i 2007 var mer imponerende, Ukraina endte på andreplass foran vanligvis sterkere Italia, men bak Norge, og var dermed ikke kvalifisert.