I 1998 grunnla Homme Queens of the Stone Age, sammen med sin tidligere Kyuss-kollega Nick Oliveri. Bandet fortsatte i samme spor som Kyuss, men utviklet seg også videre med en mer variert og eksperimentell musikkstil. De fikk sitt gjennombrudd med albumet som ble utgitt i 2002. Screaming Trees' tidligere vokalist Mark Lanegan og Dave Grohl (Nirvana, Foofighters) deltok også på denne platen.