Thor Hiorth Schøyen overtok i 1913, etter sin far stillingen som statsentomolog. De første årene var mykologi inkludert i stillingen, men 1919 ble det opprettet en annen (egen) stilling som stasmykolog. Han var uten kontorhjelp og besvarte årlig hundrevis av forespørsler om skadedyr og soppsykdommer. Han hadde også mange tjenestereiser i Norge. Først i 1939 fikk han en vitenskapelig assistent. Han ble leder for zoologisk avdeling ved Statens plantevern i 1942 og administrativ leder for hele instituttet i 1955. Tilsammen var han statsentomolog i 42 år.