Mwerusjøen har et areal på 5 120 km². Den er ganske grunn, med en største dybde på 27 meter. Breddene er stort sett slake med unntak av klippeformasjoner på den vestlige kysten. Sjøen har ei stor øy, Kilwa i sør. Det er registrert 88 ulike fiskearter i sjøen, derav 12 ciklider.