Kjempetuja har også et disjunkt utbredelsesområde i innlandet på vestsiden av det nordamerikanske vannskillet. Det strekker seg fra 54° 30' nord i Britisk Columbia langs Selkirk Mountains inn i vestlige Montana og nordlige Idaho. Sørgrensa er i Ravalli County i Montana (45° 50' nord). De østligste bestandene er ved Lake McDonald i Glacier nasjonalpark i Montana.