Takeshita ble tvunget til å gå av som statsminister i 1989 etter gjentatte anklager angående innsidehandel og korrupsjon innen regjeringen hans, men han ble aldri personlig anklaget for noe. Han klarte å beholde hans sete i riksdagen inntil kort tid før hans død i 2000. Han ble etterfulgt av Tomosaburo Kato i statsminister-kontoret. Den kjente artisten Eiki Eiki er hans barnebarn.