Etter hjemkomsten ble Howell personlig sekretær for erkebiskopen av Brisbane, John Alexius Bathersby. Deretter var han stedfortredende administrator for og ble sogneprest i en menighet i Brisbane (2002-2003) og viserektor ved (2002-2005). Fra 2005 til 2013 var han menighetsadministrator for katedralen. I tillegg fungerte han som dekan for fra 2006 til 2013 og menighetsadministrator for i Sør-Brisbane fra 2009 til 2012. Fra 2013 var Howell sokneprest i Burleigh Heads. Han ledet også bispedømmets liturgikommisjon og et hus for pensjonerte prester i erkebispedømmet Brisbane. Han var også medlem av Nasjonalt råd for liturgisk musikk.