Jens Hagerup Krog var sønn av Eilert Hagerup Krog (fogd i Lofoten og Vesterålen fra 1787 til 1806 og sønn av Jens Krog og Christine Marie Hegelund) og Gjertrud Magdalena Bruun Irgens (datter av Johannes Irgens og Anne Margrethe Borchgrevink).