Vi finner bunndyr både i innsjøer og elver, og typiske eksempler på bentiske organismer i ferskvann er vårfluer, fjærmygg, igler og muslinger. Type bunndyr man finner avhenger av bunnsedimentene, og hva de lever av. Bunndyr kan deles inn etter hvordan de konsumerer organisk materiale, noen filtrerer vannmassene, mens andre spiser f. eks alger på steiner.