Årsak til dissosiativ identitetsforstyrrelse er ukjent og mye omdiskutert, men det er mange hypoteser som viser til at det kan være en reaksjon på traumer ved at lidelsen får et individ til å tre i rollen som en annen identitet enn seg selv. Forstyrret og endret søvn og endringer i miljø har og vært antydet som en årsak til dissosiativ identitetsforstyrrelse.