Tidlige varianter ble brukt i rekognoseringsoppdrag under felttoget i Norge. De første standardmodellene, BV 138C-1, kom imidlertid ikke i tjeneste før i mars 1941. BV 138 ble laget i en rekke varianter, deriblant som maritimt bombefly og minesveiper. Enkelte varianter var utstyrt med FuG 200 Hohentwiel radar.