Under andre verdenskrig ble flyplassen kraftig utbygget av den tyske okkupasjonsmakten, med blant annet hangarer, verksted og sykehus i tillegg til stillinger for forsvar. Bygninger og installasjoner ble ødelagt av okkupantene da de trakk seg tilbake i 1944. Til forsvar av flyplassen ble Banak fort anlagt.