Sagene menighet ble opprettet i 1880 ved utskilling fra Vestre Aker. Et mindre område av Gamle Aker menighet ble også lagt til Sagene menighet. Menighetspleien ble stiftet samme år og hadde fra begynnelsen et stort sosialt og diakonalt arbeid. Sagene menighetsråd, opprettet som frivillig ordning 1899, var trolig landets første menighetsråd. I 1916 ble Lilleborg menighet skilt ut fra Sagene. Torshov menighet ble skilt ut som egen menighet i 1930, etter at befolkningen i menigheten hadde øket til 29 000. Iladalen småkirkemenighet ble utskilt i 1938 i forbindelse med utbyggingen i Iladalen. Sagene menighet tilhører Nordre Aker prosti i Oslo bispedømme. I menighetens geografiske område bodde det 11 305 mennesker per 1. januar 2006. Kirkens første sogneprest, fra 1880 til 1905, var Johan Nordahl Brun, oldebarn til biskop Johan Nordahl Brun. Kirkens første organist, fra 1880 til 1884, var Johannes Haarklou.