Gäfgen tok juridisk eksamen i fengselet og har i årene etter dommen ført flere rettssaker mot tyske myndigheter med påstander om at han led overlast i politiets varetekt og ikke fikk ivaretatt rettighetene sine, herunder en sak han anla mot Tyskland ved Den europeiske menneskerettighetsdomstolen som har vært mye diskutert i faglige debatter knyttet til tortur og nødrett. Han utga en bok om sin egen sak i 2005 og saken hans har også blitt filmatisert flere ganger. Det er også laget flere dokumentarer om saken, bl.a. i serien , og en episode i TV-serien Tatort bygde på saken. I 2015 ble det kjent at Magnus Gäfgen hadde endret navn til Thomas David Lukas Olsen, inspirert av filmene om Olsenbanden.