I september 2016, i sin aller første ATP Challenger-turnering, vant han turneringen i Copa Sevilla i Spania ved å slå japanske Taro Daniel (nr. 102 på ATPs verdensranking) i finalen. På veien til finalen slo han sin første spiller rangert blant topp 250, topp 150 og topp 100 på ATP-rankingen. Han slo ut den høyeste rangerte spilleren Iñigo Cervantes, som på det tidspunktet lå som nummer 75 i verden, i kvartfinalen.. Han er den fjerde yngste tennisspilleren som har vunnet en ATP Challenger-turnering i sin debutsesong. På grunn av seieren i Sevilla fikk Ruud et wildcard til Chengdu Open, hvor han tapte i første runde mot Viktor Troicki.