Én teori går ut på at den opprinnelige, abstrakte (ikke antropomorfiske) guddommen ved Eridu ikke var Enki, men Apsu ( = «vann», = «dybt»). Med tiden begynte det å bli fortalt mytologiske fortellinger om Enki som den guddommelige elskeren til Ninhursag, samt fortellinger om den guddommelige kampen mellom de yngre Igigi-guddommene og Apsu, og dette førte til at man bygget tempelet ved de underjordiske kildene ved akviferen ved Eridu.