I 2011 trente han med G12-laget til . Erik Botheim startet sin karriere på Lyn og fikk sin seniordebut som 15-åring i juni 2015, da han kom inn fra benken mot Ullern i en kamp som endte 2–2. Han scoret sitt første seniormål i oktober 2015, da han scoret i Lyns 9–2-seier over Holmen.