Caffarra vakte deretter oppsikt som kritiker av pave Frans’ postsynodale skriv . Han var ved siden av kardinalene Joachim Meisner, Raymond Leo Burke og Walter Brandmüller en av underskriverne av det åpne brevet til pave Frans som uttrykte tvil ved moralteologiske punkter som ble aktualisert ved pavens skriv ved mulige tvetydigheter i spørsmål om behandlingen av gjengifte skilte.