De første fakultetene ble grunnlagt i 1960-årene, men var underlagt Universitetet i Beograd. Antall studenter vokste enormt og i begynnelsen av 1980-årene hadde universitetet studenter, som er det høyeste antall studenter noensinne. I dag har universitetet i underkant av studenter, omtrent like mange kvinner som menn. 99 % av studentene er albanere. Universitetet er inndelt i 17 fakulteter hvorav 14 holder til i Priština og 3 i byene Peja/Pec, Mitrovica og Ferizaj/Urosevac.