I motsetning til den skotske ligacupen, er Scottish Cup også åpen for klubber utenfor ligasystemet. Tidligere var alle ligaklubber automatisk kvalifisert, og hvor lagene fra Scottish Premier League og First Division gikk inn i tredje runde, og de andre lagene måtte først gjennom en egen kvalifiseringscup. Fra sesongen 2007-2008 ble dette endret slik at alle klubber, inkludert lagene fra Scottish Premier League og Scottish Football League går inn i første runde.