Han bidro også i utrustningen av den argentinske korvetten «Uruguay», som ble utstyrt for bergningsoperasjonen av den strandete svenske antarktiseskspedisjonen under Nordenskjöld. På utkikk etter en mer permanent ansettelse søkte Shackleton om vanlig tjeneste i marien, via bakveien med suppleringsliten, men til tross for støtte fra Markham og presidenten i Royal Society lyktes han ikke. I stedet ble han journalist for , men fant dette lite tilfredsstillende. Han ble så tilbudt og aksepterte en sekretærfunksjon i Royal Geographical Society (RSGS), en stilling han begynte i 11. januar 1904.