Det var under Filip sin tid at det første korstoget ble sendt ut 1095, han støttet ikke dette personlig på grunn av sin konflikt med pave Urban II (1088–99). Paven hadde ikke kunnet la Filip delta ettersom han hadde gjentatt bannlysingen før korstoget. Men Filips bror, Hugh I av Vermandois, var en av hoveddeltakerne. I investiturstriden fant paven og Filip i 1097 frem til et kompromiss og i tiden som fulgte kunne kongen støtte seg til kirken i striden mot vasallene.