Huxley var sønn av forfatteren Leonard Huxley og hans hustru Julia Arnold. Moren døde i 1908, da Aldous akkurat var fylt 14 år. Tre år senere fikk han en øyelidelse som sterkt reduserte hans syn. Dette problemet gjorde at han ikke ble aktuell som tjenestegjørende under første verdenskrig. Huxley var sønnesønn av biologen Thomas Huxley og bror av UNESCO-lederen Julian Huxley.