Tre år senere venter «Butterfly» fremdeles på at Pinkerton skal komme tilbake, fordi han hadde reist sin vei kort tid etter bryllupet deres. Hushjelpen hennes Suzuki forsøker å overbevise Butterfly om at Pinkerton aldri kommer tilbake. Men Butterfly ønsker ikke å høre på henne. Goro, som arrangerte ekteskapet hennes, fortsetter å prøve å gifte henne bort igjen til noen andre - men hun hører ikke på ham heller. Den amerikanske konsulen, Sharpless, kommer til huset med et brev han har mottatt fra Pinkerton, som ber ham levere noen nyheter til Butterfly: at Pinkerton endelig er på vei tilbake til Japan. Men Sharpless klarer ikke å fullføre resten av brevet, fordi Butterfly blir alt for spent over å høre at Pinkerton kommer tilbake.