Jonah Hex var soldat for Sørstatene under den amerikanske borgerkrigen. Han nekter å følge ordre fra sin kommanderende offiser, Quentin Turnbull, om å tenne på et sykehus. Han ender med å skyte sin beste venn, Jeb Turnbull, som er Quentins sønn. Etter borgerkrigen blir Hex oppsøkt og overmannet av Turnbull og hans menn, og han blir tvunget til å se huset sitt brenne ned, med hans kone og sønn inne i huset. Turnbull brennmerker ham så i ansiktet med bokstavene QT, og etterlater ham fastbundet for å dø. Men Hex blir funnet i tide av en stamme med crow-indianere. De redder ham, men Hex har vært så nærme døden at han nå kan kommunisere med de døde. Hex bruker en øks som han gjør rødglødende, og svir bort brennmerket han har i ansiktet. Men hele hans høyre side av ansiktet blir misformet. Han setter etter Turnbull for å ta hevn, men Turnbull dør angivelig i en hotellbrann før Hex finner ham. Etter dette begynner Hex som dusørjeger.