I Den spanske bispekonferanse var Luis Javier Argüello García også medlem av pastoralkommisjonen og kommisjonen for seminarer og universiteter fra 2017 til 2018. Den 21. november 2018 ble Argüello García generalsekretær og presseansvarlig for Den spanske bispekonferanse. Han er også medlem av eksekutivkomiteen og det faste råd.