I 1943 var han blant studentene som ble arrestert og satt i arrest i Universitetets aula i noen dager for de ble ført til en leir i Stavern. Der satt de til over jul. Abrahamsen ble sendt til Tyskland med skipet DS «Donau», og nådde Buchenwald midt i januar 1944. Det var en hard vinter i konsentrasjonsleiren. Sommeren 1944 ble Abrahamsen og de andre studentene fra Buchenwaldleiren overført til Sennheim i Alsace. Der ble de internert med andre norske studenter. Studentene ble der presset hardt for å bli SS-soldater. Studentene ble etter hvert returnert til Buchenwald og hentet hjem til Norge med de hvite bussene via Sverige.