Han ble så, i 1994, utnevnt til erke-epark av Homs, Naba og Nabk, noe som ble godkjent av pave Johannes Paul II. I 1998 ble han valgt til patriark. Etter dette førte han tiltaleformen . I 2000 ble han prefekt for Kongegrasjonen for Østkirkene, og i 2001 ble han utnevnt til kardinal av Johannes Paul II. Han gikk av som patriark 8. januar 2001, men beholdt etter tradisjonen tittelen . Han fratrådte 9. juni 2007.