Andrej Karlin ble utnevnt den 6. februar 1911 til biskop av bispedømmet Triest-Koper, og bispeviet den 19. mars samme år. Han ble bispeviet av erkebiskop Franz Xaver Nagl; medkonsekrerende var erkebiskop Franz Borgia Sedej av Gorizia og Gradisca, biskop Anton Bonaventura Jeglič av Ljubljana, biskop Giovanni Battista Flapp av Poreč og Pula, og Anton Mahnič av Krk.