I en kamp i april 2009 mot Juventus der han skåret Inters eneste mål i 1–1 kampen, ble Balotelli utsatt for rasistiske tilrop fra Juventus fansen gjennom hele kampen. Dette førte til at Inters eier Massimo Moratti raste og sa at han ville tatt laget av banen, dersom han hadde vært tilsted. De rasistiske tilropene ble også fordømt av Juventus sin formann Giovanni Cobolli Gigli og Juventus ble dømt til en hjemmekamp uten tilskuere på grunn av hendelsen.