Mange leger mener at Blastocystis er ikke patogen på tross av den store mengde med publiseringer som kraftig antyder at Blastocystis trolig er patogen. Det er dokumentert minst 9 ulike sub-typer av Blastocystis hominis, noen av disse er muligens mer patogene enn andre, noe som muligens kan forklare at noen har betydelige symptomer mens andre som er kroniske bærere av Blastocystis hominis ikke har symptomer. Lengden på infeksjonen kan muligens også spille en rolle. Personer i relativ ung alder (under 40) som har Blastocystis hominis har ofter mindre symptomer enn de over 40.