Det går tilbake den såkalte «tegneskolen», som allerede ble kalt akademi (), og som ble grunnlagt av kurfyrst Maximilian III i 1770. I 1808 ble akademiet grunnlagt i dagens form av kong Maximilian I under navnet . Akademiets første direktør var Johann Peter von Langer, som tidligere hadde vært leder for Kunstakademie Düsseldorf. I 1824 ble han etterfulgt av Peter von Cornelius. I 1886 flyttet akademiet inn i dagens bygning, et palassaktig nybygg i tre fløyer oppført av Gottfried von Neureuther mellom 1876 og 1885 ved Seiersporten.