Fenne slet med forkjølelse før sesongstart i 2016, og stod over sesongåpningen. Hun fikk to pallplasseringer i stafett i Verdenscupen i skiskyting 2016/17, og endte på 78.-plass i verdenscupen totalt. Norge endte på 4.-plass i stafett og 6.-plass i nasjonscupen i verdenscupen denne sesongen.