Foreldrene ble skilt, og etter oppvekst i Angola bodde dos Santos sammen med moren i London. Der studerte dos Santos ingeniørvitenskap ved King's College. Det var der hun møtte sin senere ektemann fra Zaire, Sindika Dokolo, sønn av millionæren Augustin Dokolo Sanu fra Kinshasa og hans danske kone Hanne. Isabel giftet seg med Sindika Dokolo i 2002.