Etter 1887 ble territoriet administrert i fellesskap av Frankrike og Storbritannia. Området ble i 1906 formalisert som et anglo-fransk kondominium. Under andre verdenskrig, var Port Vila en amerikansk og australsk flybase. I 1987, ødela en syklon deler av byen og i januar 2002 førte et kraftig jordskjelv til omfattende ødeleggelser i byen og omkringliggende områder.