Chen forsøkte sammen med andre i Kuomintangs konservative fløy forgjeves å forhindre at reformisten Lee Teng-hui overtok etter Chiang Ching-kuo som statspresident og som leder for partiet. Han fikk ikke desto mindre fortsette som en av presidentens rådgivere til 1996. Samme år utfgav han sine memoarer, hvori han beskrev en lang rekke episoder fra sin glanstid ved Chiang Kai-sheks side.