På grunn av ideologiske uoverensstemmelser med PDA grunnla han for å stille som ordførerkandidat i hovedstaden Bogotá. Han ble valgt 30. oktober 2011 og ble innsatt 1. januar 2012. Han stilte som presidentkandidat ved valget i 2018 og fikk over 25% av stemmene, men tapte i andre valgomgang. I 2022 stilte han til valg for partiet Unión Patriótica (UP) og vant med over 80% av stemmene.