Friederike Brun, født Münter, var bare noen måneder gammel da hun kom til Danmark med sine foreldre. Faren, Balthasar Münther, hadde fått stilling som prest i den tyske menigheten Sankt Petri kirke (København). I barndommen fikk hun og broren Friedrich (senere biskop) undervisning hjemme og på «St. Petri Pigeskole», som var startet av faren.