Ved Hyrule Castle møter Link Prinsesse Zelda som forklarer ham at hun har drømt om Hyrules fremtid og at hun forutså Links ankomst. Hun tror at en konge fra ørkenen ved navn Ganondorf er ute etter Triforcen, en hellig relikvie i Sacred Realm som gir bæreren guddommelige krefter. Zeldas beskrivelse av Ganondorf er lik trollmannen som drepte Great Deku Tree. Hun spør Link om å finne de to gjenværende Spiritual Stones slik at han kan entre Sacred Realm og ta Triforcen før Ganondorf når den.