I 1991 ble han utnevnt til formann for statskomiteen i republikken Usbekistan for utenrikshandel og utenriksrelasjoner. Etter forbudet mot, og avviklingen av Sovjetunionens Kommunistiske Parti (SUKP) og den republikanske gren - Usbekistans kommunistparti, ble han en av medstifterne av People's Democratic Party of Uzbekistan (PDPU), et konservativt, nasjonalistisk parti som i noen grad erstattet kommunistpartiet. og ble med i organisasjonskomiteen til partiet og ble valgt inn i sentralstyret. Den første formannen for sentralrådet (lederen) for partiet var republikkens president, Islom Karimov. I februar 1992 ble Oʻtkir Sultonov utnevnt til minister for utenriksøkonomiske forbindelser i republikken Usbekistan, og senere samme år ble han samtidig visestatsminister i regjeringen til Abdulhashim Mutalov.