Haugan arbeidet i entreprenørfirmaene Ingeniør F. Selmer (som nå er en del av Skanska) og det tekniske konsulentselskapet Terramar før han i 1991 ble sjefingeniør i Norsk Hydro. Haugan hadde forskjellige lederstillinger i Hydros olje- og gassvirksomhet, og senere i aluminiumsvirksomheten. Mellom 2009 og 2011 var han administrerende direktør for Qatar Aluminium (Qatalum) i Mesaieed utenfor Doha i Qatar. Qatalum er et selskap som er eid av Hydro Aluminium og Qatar Petroleum.