Brandtzæg var i 2011 medlem i det offentlige utvalget "Ungdommens maktutredning", ledet av Trond Viggo Torgersen. Han var også medlem i utvalget for nasjonale retningslinjer for åpen tilgang til forskningsresultater, som leverte sin innstilling til Kunnskapsdepartementet 1. juni 2016. Brandtzæg er i perioden 1. januar 2017 til 31. desember 2024 varamedlem i den regjeringsoppnevnte Personvernsnemda ledet av Mari Bø Haugstad.