Sophie Apenes var først elev av Ida Basilier-Magelssen, før hun studerte hos professor Günther ved Kungliga Musikaliska Akademien i Stockholm. Deretter studerte hun i likhet med sin venninne Ellen Gulbranson sang hos den berømte sangpedagogen Mathilde Marchesi i Paris, i tillegg til at hun var elev av Enrico Delle Sedie samme sted i 1888.