I den tredje Millennium-romanen fra 2007, blir Salander arrestert for overfallet på Zalachenko, samtidig som hun kommer seg på sykehuset. Zalachenko, en pasient ved det samme sykehuset, blir myrdet av noen fra Seksjonen. Mannen forsøker også å drepe Salander, men advokaten hennes Annika Giannini - søsteren til Mikael Blomkvist - sperrer døren og redder Salander. Denne leiemorderen begår deretter selvmord. På grunn av hennes dype mistillit til autoriteter, nekter Salander først å samarbeide på noen måte med hennes egen forsvarer. Hun stoler i stedet på vennene hennes i hacker-miljøet. De hjelper til slutt Blomkvist med å oppdage hele omfanget av seksjonens konspirasjoner, som han forsøker å publisere med risiko for sitt eget liv.