Sonja Jógvansdóttir har særlig vært opptatt av emner som likestilling mellom kjønnene, homofiles rettigheter og fattigdom. I 2015 ble hun innvalgt på Lagtinget for det sosialdemokratiske partiet Javnaðarflokkurin med 1 021 personstemmer, nest flest etter partiets leder Aksel V. Johannesen. Hun meldte seg ut av Javnaðarflokkurin kort tid etter valget, fordi Aksel V. Johannesens regjering ikke nevnte borgerlig vielse av homofile i sitt regjeringsgrunnlag. Hun tok sete i Lagtingets justiskomité. Hun støttet regjeringen som partiløs. I februar 2019 meldte hun seg inn i Tjóðveldi, men ble ikke tatt opp i Tjóðveldis lagtingsgruppe, ettersom hun opprinnelig var valgt for et annet parti. Hun stilte ikke til gjenvalg til Lagtinget i 2019.