Ved sin tilbakekomst til Filippinene arbeidet han ved presteseminaret i Vigan og ved regionalseminaret i Jaro i Iloilo City. I 1995 ble han rektor for St. Pius X Seminary i Capiz; han arbeidet også i erkebispedømmetd kirkelige domstol. I 1999 ble han sogneprest for menigheten i Dao.