Flere paralelle historer løper utover sesongen. Én historie handler om Darth Sidious som hyrer Cad Bane, for å stjele en «holocron» fra Jedi-tempelet på Coruscant. Dette håper Sidious skal hjelpe ham med å finne barn som er sensitive for kraften. Samtidig ønsker Boba Fett å begynne sin karriere som dusørjeger. Sammen med en gruppe mer erfarne leiesoldater, søker Boba Fett hevn mot Mace Windu for å ha drept faren hans.