Vann tilsiger IJsselmeer fra elvene Rhinen (via armene Utrechtse Vecht (gjennom IJmeer og Markermeer, og via elven IJssel (via Ketelmeer) Overijsselse Vecht (via Zwarte Water, Zwarte Meer og Ketelmeer) Eem (via Eemmeer, Gooimeer, IJmeer og Markermeer) Hierdense Beek (via Veluwemeer, Drontermeer og Ketelmeer) Amstel (via IJ, IJmeer og Markermeer).