Den 18. april 1906 ble Morris utnevnt til koadjutorbiskop av bispedømmet Little Rock, og titulærbiskop av , av pave Pius X. Han mottok sin bispeinnvielse den 11. juni 1906 av biskop Thomas Sebastian Byrne, med biskopene Edward Allen og Nicholas Gallagher som medkonsekratorer ved . Han var den første innfødte tennesseaner som ble opphøyet til den katolske bispestand. Etter biskop Edward Fitzgeralds død 21. februar 1907, etterfulgte Morris ham automatisk som den tredje biskopen av Little Rock.