Ved opprettelsen omfattet etaten 44 kommunale skattekontor (tidligere ), inkludert etatens hovedkontor. I 2011 og 2012 har Skatteetaten gjennomført en større sentralisering på landsbasis. I Skatt nord ble 19 kommunale skattekontorer lagt ned, og det er idag 25 kontorer igjen (26 med Svalbard). I 2016 har Skatteetaten varslet en ny sentralisering.