Man antar at innsjøen har hatt stor betydning gjennom flere tusen år av Jämtlands historie. Langs Idsjön finnes flere fortidsminner, blant annet to gravfelt, et titalls fanstboplasser, fangstgroper og innsjøgraver. Fangstordninger for sikfiske, såkalt vaktfiske, har ved Gimåns innløp til innsjøen blitt praktisert kontinuerlig fra middelalderen fram til i dag. Området er derfor utmerket som av «nasjonal interesse i kulturspørsmål».