I 2003 ble Savi ble valgt av Riigikogu til å være en av landets observatører i Europaparlamentet, i påvente av Estlands EU-medlemskap. Ved de første valgene til Europaparlamentet i Estland i 2004 ble Savi valgt inn som ordinært medlem. Han sluttet seg til den liberale parlamentsgruppen, Alliansen av liberale og demokrater for Europa. Han gikk ut av parlamentet i 2009.