De fleste av Hutchinsons bidrag til amerikansk limnologi kom fra forskning på Linsley Pond i Connecticut. Studiene ble gjort i små innsjøer, og en studerte slike forhold som kjemiske lagdeling, oksygenunderskudd, produktivitet og den økologiske betydningen av oksidasjons-reduksjonspotensialet i vann. Hans bokverk ble et standardverk for studenter i limnologi. Hutchinson utvidet fagfeltet, spesielt for aspekter relatert til økologi og biogeokjemi. Han fremmet bruk av statistiske og matematiske metoder i limnologi. Hans doktorstudent Raymond Lindeman (1915–1942) benyttet Hutchinson modell for trofisk dynamikk. Sammen så de på energienflyten gjennom sjøer og trofiske nivåer i økosystemer. De fulgte energiflyten ved hjelp av sitt egenutviklede system, kjent som , der hver organisme ble gitt et heltall for å markere hvor mange ledd energien måtte passere gjennom, altså trofiske nivåer. Det ble da mulig å måle effektiviteten av et gitt system, eller energitap mellom de forskjellige trofiske nivåene.