I Kina ble han professor på Nanking Theological Seminary, en stilling han hadde fram til 1952. Da krigen mellom Kina og Japan brøt ut i 1937, flyktet han og konen til vest i Kina. I årene andre verdenskrig pågikk jobbet Prince for å øke forståelsen for, og sympatien med Kina i USA. Han holdt en serie med forelesninger, skrev artikler og brukte radio aktivt i arbeid.