I juli 1942 ble skvadronen utplassert til Malta, hvor den fløy langdistanse jagerstøtte for Malta-konvoien Operasjon Pedestal, angrep flyplasser på Sardinia og en konvoi utenfor Korfu før den returnerte til Storbritannia, etter å ha forlatt sine fly. Når den var tilbake i Storbritannia med et nytt sett Beaufighter, ble skvadronen tildelt oppgaven med å utføre jagerpatruljer over Western Approaches og Biscayabukten som en del av No. 19 Group RAF fra RAF Talbenny i Pembrokeshire. Sammen med den tilsvarende Beaufighter-skvadronen No. 235, hadde No. 248 en spesifikk rolle i å motarbeide tyske Junkers Ju 88-jagere som angrep allierte anti-ubåt-fly over Biscayabukten. Gjentatte kamper fant sted gjennom våren og sommeren av 1943, med skvadronen som mottok Beaufighter Xs i juni 1943, noe som la til anti-skip-angrep på oppdragene og opererte en avdeling fra Gibraltar.