Den anglikanske katedralen til sankt Mikael og sankt Georg er et bispesete i den anglikanske kirke i det sørlige Afrika. Grahamstown har også blant andre katolikker, presbytere, metodister, baptister, Nederduits Gereformeerde Kerk og karismatiske kirker. Der er også møtesteder for hinduer, scientologer, kvekere, Jesu Kristi kirke av siste dagers hellige og muslimer.