Philip Pullman har vært en aktiv debattant i flere hete diskusjonstemaer den siste tiden, noen hvor hans egne bøker av og til har vært selve utgangspunktet. har, som -bøkene, fått hard kritikk fra kristne fundamentalistiske grupper. Noen omtaler trilogien som «blasfemisk» og som et «angrep på kristendommen». Pullman selv avviser dette, og sier at det ikke er kristendommen i seg selv som får gjennomgå i bøkene hans, men snarere teokrati og undertrykkende religion. Folk har tanker om at Pullman er i mot organisert religion, men noen tror annerledes. Her har forfatteren fått støtte fra erkebiskopen av Canterbury, som har gått så langt som å foreslå at blir en del av religionsundervisningen i skolen.