Også Nintendo DS-spell er det til en viss grad mulig å kommunisere med. I er det mulig å spelle på baner forma som pokémon en har på Game Boy Advance-pokémonspella dersom en har eller i Game Boy Advance-porten på Nintendo DS. En kan overføre pokémon til , og , også her ved å ha spella i Game Boy Advance-porten. I tillegg kan en få låst opp enkelte ting i DS-spella ved å ha i eller .