Da Packers slo San Francisco 49ers 34–16 i uke 13 hadde Rodgers 298 pasningsyards og tre touchdowns, og fikk sin første NFC Offensive Player of the Week-tittel. I uke 14 pådro han seg sesongens andre hoderystelse. Reserven Matt Flynn tok over. Packers tapte kampen 7–3 mot Detroit Lions. Rodgers var ikke startende quarterback mot New England Patriots, som avsluttet hans rekke på 45 på rad, tangert for nest lengste i lagets historie.