Stavropol kraj ligger i det kuperte forland til Kaukasus. Den nordlige del af regionen utgjør Manytsj-lavlandet. Regionen grenser opp til flere av de mindre, men og til tider urolige, kaukasusrepublikker, noe som har medført periodevis væpnet inntrengen og adskillige terrorangrep, bemerkelsesværdigt var blant annet terrorangrepet i Budyonnovsk i 1995 (140+ døde) og selvmordsangrepet mot et tog i 2003 (46+ døde).