Egidio Vagnozzi gikk på Collegio Romano og studerte katolsk teologi og filosofi ved lateranuniversitetet i Roma. Han ble presteviet den 22. desember 1928 og gikk etter videre studier inn i tjeneste ved Statssekretariatet i 1930. Fra 1932 til 1942 var han medlem av staben til den apostoliske delegasjon til USA, fra 1942 til 1945 var han postert til det apostoliske nuntiatur i Portugal, og fra 1945 til 1947 var han postert til Frankrike.