Klimaet i Mouxy er som i Savoie forøvrig preget av nærheten til fjellene. Vintrene er gjennomgående kalde, og dstore mengder med snø er ikke et ukjent fenomen. Vinteren 2007-2008 karakteriserte seg imidlertid ved at det ikke falt noe snø i det hele tatt. Gjennomsnittstemperaturen i januar er om lag 3 grader. Somrene er derimot varme, med en gjennomsnittlig maksimaltemperatur på cirka 25 grader.