Francesco Sgalambro gikk inn i erkebiskopens seminar «San Pio X» i Messina i 1949. Mellom 1954 og 1957 fullførte han sine teologiske studier ved det teologiske fakultetet «San Luigi» i Napoli og ble ordinert til prest den 22. september 1957. Deretter mottok han sin doktorgrad fra Det pavelige universitet Gregoriana. Fra 1958 arbeidet han som professor i filosofi ved erkebiskopens seminar i Messina og fra 1977 ved i Messina.