Under nasjonalforsamlingens 2013–2014-sesjon arbeidet Villavicencio som assistent for parlamentarikeren Cléver Jiménez, som var representant for Pachakutik-partiet. I denne perioden rettet Jiménez og Villavicencio beskyldninger om at president Rafael Correa i forbindelse med et politiopprør i september 2010 hadde gitt ordre om at en bevæpnet styrke skulle rykke inn i et sykehus. Correa reiste søksmål, og Villavicencio ble dømt til 18 måneders fengsel for æreskrenkelser. Han fløy til Washington, D.C. for å be om hjelp fra Inter-American Commission on Human Rights, men da han returnerte til Ecuador forelå det en arrestordre mot ham. I stedet for å melde seg til myndighetene, gikk han i dekning i Amazonasregionen til dommen var blitt foreldet.