Etterkommerne etter de første kolonistene, , utøvet særlig status og holdt makten inntil de ble forvist av de lavere klassene, . De førstnevnte kom tilbake til makten i 485 f.Kr. ved hjelp av Gelon, herskeren av byen Gela. Gelon selv gjorde seg til byens tyrann, og flyttet mange av innbyggerne i Gela, Kamarina og Megera til byen, bygde nye kvartaler av Tyke og Neapolis utenfor bymurene. Hans program med nye konstruksjoner omfattet også et nytt teater, formgitt av arkitekten Damokopos, og det ga byen et blomstrende kulturliv: det tiltrakk seg personligheter som Aiskhylos, Ario av Metimma, Eumelos av Korint, og den kvinnelige poeten Sapfo som hadde blitt forvist hit fra Mytilene. Siracusas økende makt førte uunngåelig til at byen kom i konflikt med Kartago, som hersket over den vestlige delen av Sicilia. I slaget ved Himera i 480 f.Kr. beseiret Gelon, som hadde allierte seg med Teron av Akragas, den langt større kartagiske hæren ledet av Hamilkar. Et tempel dedisert til Athene (på samme sted som dagens katedral) ble reist i byen for å minnes denne hendelsen.