Carter var i mange år romantisk lenket til bassisten Howie Epstein, mest kjent for å spille sammen med Tom Petty and the Heartbreakers. Hun bodde sammen med Epstein i Tesuque, New Mexico, fra 1996 til 2002. 26 juni 2001 stoppet en New Mexico politimann bilen til Carter og Epstein. Han undersøkte bilen og fant narkotika og oppdaget også at bilen var stjålet. Epstein døde i 2003 antagelig av en overdose narkotika.