Mariager kloster var sammen med klostret i Maribo de eneste klostrene i Danmark som tilhørte birgittinerordenen. Klostret var innviet til Vår Frue og Sankt Birgitta. Klostret ble opprettet i kong Erik av Pommerns regjeringstid, en gang i perioden 1425-1432. Det egentlige stiftelsesår regnes dog å være 1446, året pave Eugenius IV stadfestet en overdragelse av de to tidligere benediktinerklostrene i Glenstrup og Randers til birgittinerne i Maribo, for at det kunne gi grunnlaget for opprettelsen av datterklosteret i Mariager. Blant grunnleggerne var en krets av adelige, blant annet rikshoffmesteren Otte Nielsen Rosenkrantz. I de følgende årene vokste stiftelsen, og ved slutten av middelalderen var Mariager kloster det største og helt dominerende klosteret i Østjylland. Birgittinerordenen tiltrakk seg i særlig grad medlemmer av adelige slekter. Ved inntredenen i klosteret skulle man ha med seg en «medgift» tilsvarende «mat og drikke» på livstid. Dette medførte at Mariager ved reformasjonen hadde over 600 gårder i Nordøstjylland.