Den kjemiske naturen til "A" avhenger av hvilken type organisme. I lilla svovelbakterier oksideres hydrogensulfid (HS) til svovel (S). I oksigenisk fotosyntese fungerer vann (HO) som et substrat for fotolyse, noe som resulterer i generering av oksygengass (O). Dette er prosessen som returnerer oksygen til jordens atmosfære. Fotolyse av vann forekommer i tylakoider av cyanobakterier og kloroplaster av grønne alger og planter.