Isabella MacDuff satt fengslet i dette buret i fire år, og ble deretter flyttet til karmelittklosteret i Berwick. Dette var ikke nødvendigvis av humanitære hensyn. Det antydes at Robert Bruce på dette stadiet fikk gjennomslagskraft og hans kvinnelige slektninger var potensielt verdifulle gisler, og engelskmennene ønsket ikke at de skulle dø av mishandling. Den siste direkte omtalen av Isabella MacDuff er at hun ble overført igjen i 1313, hennes endelige skjebne var usikker. Det ble gjort forsøk av Robert Keith og John Mowbray på å få henne løslatt ved å appellere til hennes bror, Duncan, jarl av Fife, men det kom ingenting ut avankene. I 1313 ble plassert under varetekten til Henry de Beaumont, som var gift med Alice Comyn, grevinne av Buchan, niese og medarving av Isabellas ektemann John Comyn. Det er det siste som blir hørt av Isabella. De fleste av Bruces kvinnelige slektninger var blitt sendt tilbake til Skottland tidlig i 1315 i utvekling mot engelske adelsmenn som ble tatt til fange etter slaget ved Bannockburn. Isabella hadde sannsynligvis dødd innen denne tiden, muligens av ødelagt helse i fangenskapet.