Kaptein Berg ble arrestert på Trønderheimen i Trondheim, der han midlertidig bodde, kvelden den 6. oktober. Tidligere på dagen hadde han blitt advart om fare, men valgte ikke å gå i dekning. Etter å ha blitt ført til Gestapo-hovedkvarteret på Misjonshotellet, ble han senere overført til Falstad fangeleir. Han ble henrettet sammen med de ni andre sonofrene ved daggry den 7. oktober 1942.