Flynn innrømmet først å ha løyet til FBI, men trakk senere tilståelsen. Saken ble henlagt av justisdepartementet i mai 2020. Dommeren i saken, Emmet Sullivan, valgte da å utnevne en annen dommer til å argumentere mot justisdepartementets begrunnelse for henleggelsen, samt gi en vurdering på hvorvidt Flynn ved å ha trukket tilståelsen sin gjorde seg skyldig i å ha løyet for retten. Flynn sendte da en begjæring til en ankedomstol for å få Sullivan til å henlegge saken. Ankedomstolen konkluderte med at Sullivans forlengelse av saken var grunnlovsstridig og beordret saken henlagt.