Dens viktigste oppgaver var tidligere å opprettholde et landbasert luftforsvar med Nike-raketter og HAWK-batterier. Disse ble nedlagt i forbindelse med forsvarsforliket i 2000. I samme omgang ble det dog tilført en lang rekke nye oppgaver til stedet, blant annet som følge av at Flystasjon Værløse ble nedlagt. Således ivaretar man i dag «VIP»-flyvninger for Kongehuset, regjeringen og Folketinget. Dessuten er flystasjonen østlig base for Skvadron 722 og hjemsted for Forsvarets Sundhedstjeneste.