Ettersom ligaen omfatter klubber fra hele Tyskland (på tysk: vom ganzen Bundesgebiet Deutschland) ville det språklig, i likehet med de to høyere ligaene i systemet, vært naturlig å bruke betegnelsen Bundesliga som en del av navnet. Grunnen til at dette ikke er tilfellet, beror på markedsføringsrettigheter. I motsetning til de to øverste ligaene, som administreres av Deutsche Fußball Liga (DFL), administreres 3. Liga av Det Tyske Fotballforbundet (DFB). Bare DFL har retten til å markedsføre navnet .