Kirken var sentrum for reformasjonen og husittbevegelsen i Böhmen frem til Slaget på Det hvite berg 8. november 1620 mellom protestantene og Ferdinand IIs hær. Etter slaget ble 27 tsjekkiske protestantiske adelsmenn og borgere henrettet foran kirken i 1621 for deres deltagelse i opprøret mot habsburgerne.