Schnitgers orgler har vært inspirasjonkilde for moderne orgelbyggere. Danske instrumentmakere begynte å interessere seg for Schnitgers orgelstil rundt 1940, og innflytelsen har vært avgjørende for utviklingen av det moderne danske orgel. Den svenske organisasjonen har for forskningsformål bygd en eksakt replika av et Schnitgerorgel som står i .