Mens hun bodde i Irvington i New Jersey, ble Noyes medlem av Women's Advisory Committee for Aeronautics. I august 1936 var hun blant en håndfull av ledende kvinnelige flygere til å delta i Air Marking Group, grunnlagt av Bureau of Air Commerce, finansiert av Works Progress Administration. Gruppens mål var å bidra til flynavigasjon ved å skrive navnet til den nærmeste byen i hvit maling på takene av større bygninger hvis det var mulig, ellers på bakken, med 25 kilometers intervaller. Da USA kom med i andre verdenskrig i desember 1941, måtte Noyes' team av sikkerhetsmessige årsaker stryke ut omtrent 13 000 områder som de hadde merket. Etter krigen ble ytterligere navigasjonshjelpemidler lagt til. I henhold til National Air and Space Museum var hun i mange år den eneste kvinnelige piloten med tillatelse til å fly regjeringens fly.