Homer lider også av flere arvelige sykdommer som for eksempel at han er skallet, men også det mannlige «Simpson-dumhetsgenet», tykke fingre (unormalt korte og tykke fingre) og «Simpson-rumpa» (en stor rumpe som gjør at han må bruke ballongbukser), disse sykdommene har han gitt videre til barna sine. Homer er også langsynt (av og til), derfor bruker han lesebriller når han leser en bok eller en avis.