I 1506 døde Husayn og Badi' overtok makten etter sin far. Han ble imidlertid raskt utfordret av sin bror Muzaffar Husayn samtidig som de fremvoksende usbekerne under ledelse av Muhammad Shaybani truet riket. Timuriden Babur var på vei fra Kabul mot Herat med sine tropper for å understøtte Husayn, men han så at Husayns sønner sto svakt og han dro seg tilbake uten å gå til kamp mot usbekerne. Året etter inntok usbekerne Herat og gjorde for alltid ende på timuridenes herredømme der. Badi' og Muzaffar flyktet, men kort tid etter døde Muzaffar. Badi' dro til Kandahar og skaffet seg en militær styrke der som han gikk mot usbekerne med, men han ble slått tilbake. Han dro så til Ismail I, sjah av Iran hvor han fikk tildelt et landområde ved Tabriz og også en betydelig årlig lønn. Han oppfordret Ismail til å angripe usbekerne og i 1510 ble Khorasan-provinsen gjenerobret fra usbekerne og innlemmet i safavidenes iranske rike. Badi' oppholdt seg i Tabriz inntil de osmanske styrkene vant over Ismail i slaget ved Chaldiran i august 1514. Badi' måtte flykte på nytt, denne gang til Konstantinopel hvor han døde under en pestepidemi samme år.