Tidligere fungerte Kolonia som landets hovedstad. Et landområde i Palikir ble i 1985 utpekt som føderasjonens nye hovedstad og stedet for landets føderale institusjoner. Et kompleks med ni regjeringsbygninger ble reist på stedet. Forbundsregjeringen tok offisielt de nye lokalene i Palikir i bruk i november 1989. Mikronesiaføderasjonens president, kongressen og høyesterett holder til her.