De første bosetninger i Guatemala går minst tilbake til  f.Kr. Det finnes noen bevis som tilsier at bosetninger kan ha eksistert så langt tilbake som , blant annet rester av spydspisser. Det finnes arkeologiske bevis for at den første befolkningen var jegere og sankere, men ved stillehavskysten finnes det også bevis for at dyrking av mais utviklet seg rundt 3500 f.Kr. Steder for mer permanente bosetninger har blitt datert tilbake til 6500 f.Kr.