Tirsdag formiddag 20. april 1999 plasserte Harris og Klebold to tøybager i skolekantina. Hver bag inneholdt propanbomber, som var innstilt til å gå av klokka 11.17, under «A»-lunsjpausen. Ingen vitner kunne huske å ha sett tøybagene bli satt blant de omtrent 400 andre ryggsekkene som allerede var i kantina. Sikkerhetspersonalet på Columbine observerte ikke at bagene ble plassert i kantina. En vaktmester byttet ut overvåknings-tapen rundt klokka 11.14, som kan ha vært tidspunktet da bagene ble plantet. Noen hobbydetektiver på Internett hevdet at bagene med bombene kan sees på videoen fra overvåkningskameraet rundt klokka 10.58. Kort tid etter massakren etterforsket politet hvorvidt bombene kunne ha blitt plassert under «etter-skoleball»-festen som var holdt der helgen før.