Fra 1993 til 1994 var Issoufou statsminister. Han vant presidentvalget i Niger i mars 2011, og overtok makten etter en militærregjering som holdt makten etter å ha styrtet den forrige valgte presidenten i februar 2010. Issoufou vant presidentvalget i 2016 med mer enn 90 % av stemmene. Opposisjonen boikottet valget.