Biblioteket, med arkiv og bibliografisk avdeling. Estisk folkeminnesamling, etablert i 1927. Avdelingen forsker på skikker, folkedans mm, både blant den estiske, finsk-ugriske befolkdningen, og blant Estlands minoriteter: tyskbaltere, russere, jøder mfl Estisk kulturhistorisk arkiv, etablert i 1929. Samlingene omfatter manuskript, fotografi, film, lyd og kunst. Tidligere samlinger etablert Det estiske litteraturselskapet og Akademimuseet er innlemmet i arkivet. Folkloristisk avdeling, etablert i 1947. Avdelingen utgir to tidsskrift, seks monografiserier og har ansvaret for utgivelsen av det omfattende folkemusikkverket Monumenta Estoniae Antiquae.