Jørgensen ble utdannet som klinikkassistent hos en tannlege, før hun søkte seg inn på Statens Teaterskole i København i 1989 og ble uteksaminert i 1993. I 1992 ble hun kjent med Thomas Vinterberg. Han brukte henne i sin avgangsfilm fra Filmskolen, , i 1992. Samme år medvirket hun i hans TV-film . Blant dansker flest er hun allikevel best kjent for sitt TV-arbeide ( (1997–99) og sine filmroller i og . I 2005 medvirket hun i som Tove og fortsettelsen , og i .