Hellqvist underviste ved og ble utnevnt til professor samme sted i 1885. Han led av kraftige hodesmerter etter en hjernerystelse noe som tvang han til å avslutte sin undervisning i 1886. Han sluttet å male rundt samme tid. I 1890 ble det gitt til kjenne at Hellqvists ateljéutstyr skulle selges.