Benins erfaring i Afrikamesterskapet begrenser seg til en kvalifisering, i 2006. Benin slo Malawi hjemme og spilte uavgjort borte i innledende runde, og kom dermed videre til første kvalifiseringsrunde. Der spilte de 1-1 mot Elfenbenskysten, og kom videre etter straffesparkkonkurranse. I nivå to av konkurransen møtte Benin Mali, og tapte begge kampene.