Pierre Nguyên Soan studerte filosofi og teologi ved presteseminarene i Song Lang og Nha Trang og ved i Da Lat. Den 21. desember 1968 ble han presteviet for bispedømmet Quy Nhơn. Han fortsatte studiene ved Det pavelige universitet Urbaniana i Roma og tok doktorgrad i kanonisk rett i 1973.