Etter den 9. thermidor støttet Amar videreførelsen av . Han var blant de «venstre» thermidorianerne rundt Bertrand Barère, Jacques Nicolas Billaud-Varenne og Jean-Marie Collot d'Herbois, som ville videreføre jakobinerstyret uten Robespierre. Etter den feilslåtte Germinaloppstanden (1. april 1795) ble Amar fengslet frem til amnestiet av 26. oktober 1795.