Lee Hamilton vokste opp i og gikk på offentlige skoler i Evansville. Deretter studerte han ved DePauw University i Greencastle til 1952. I 1952 og 1953 fortsatte han studiene ved Goethe-universitetet i Frankfurt am Main. Etter å ha studert jus ved Indiana University og blitt tatt opp i advokatstanden i 1956, begynte han å arbeide i dette yrket.