Pedro Nunes fikk publisert flere avhandlinger: «Tratado em defensam da carta de marear» (), «Tratado sobre certas dúvidas da navegação» (med en diskusjon om loksodromens betydning) og «Tratado da sphera com a Theorica do Sol e da Lua» bygd på «De sphaera mundi» av Johannes de Sacrobosco, «Theoricae novae planetarum» av Georg Peurbach og «Geographia» av Klaudios Ptolemaios. Coimbra.