Ifølge biografene fr. Vincent A. Yzermans og Franz Xaver Wetzel opphørte erkebiskop Zardettis teologiske sammenstøt med erkebiskop John Ireland og hans tilhengere i det amerikanske hierarki aldri helt. Zardetti spilte en sentral rolle som medlem av den romerske kurie i utarbeidelsen av pave Leo XIIIs apostoliske brev , som fordømte amerikanismen som en heresi. Encyklikaen ble undertegnet av paven den 22. januar 1899. Som påskjønnelse ble Zardetti elevert til assistent til den pavelige trone den14. februar 1899.