Den 11. juni 1983 mottok Gabriele Caccia prestevielsen fra kardinal Carlo Maria Martini S.J. for erkebispedømmet Milano. Deretter virket han der som sjelesørger til 1986. Han ble deretter fristilt for studier ved Det pavelige diplomatakademi, og tok lisensiat i kanonisk rett. I 1991 tok han doktorgraden fra Det pavelige gregorianske universitet med en avhandling med tittelen .