Under andre verdenskrig ble kolonien administrert av Vichy-regjeringen og okkupert av Japan. Da Japan kapitulerte ved krigens avslutning, abdiserte den vietnamesiske keiseren av Nguyen-dynastiet Bảo Đại, og Việt Minh, ledet av Hồ Chí Minh, erklærte uavhengighet i Hanoi. Som et svar på uavhengighetserklæringen i Hanoi, ble den franske koloniadministrasjonen gjenopprettet i september 1945, og året etter ble Cochinkina erklært for å være en selvstendig republikk innen Fransk Indokina og Første indokinesiske krig brøt ut da forhandlinger mellom vietnamesiske politikere og Frankrike brøt sammen.