Mette Halskov Hansen har vært gjesteforsker ved Zhejiang Universitet, Chinese University of Hong Kong, Academia Sinica (Taiwan), og Stanford Universitet. Hun har ledet flere større forskningsprosjekter, blant andre prosjekter støttet av Norges Forskningsråd som for eksempel de tverrfaglige "The Chinese Individual" om individualisering i Kina; "Airborne" om de menneskelige og politiske dimensjonene av luftforurensing i Kina, og "Transsustain" om det globale potensialet i spirituelle miljøbevegelser i Asia. Hun har gitt ut en rekke bøker og artikler internasjonalt, men også en norsk populærvitenskapelig bok sammen med Stig Thøgersen fra Aarhus Universitet, og Koen Wellens fra Universitetet i Oslo.