Rapinoe debuterte for det amerikanske landslaget i 2006, men grunnet korsbåndsskade mistet hun både VM i 2007 og Sommer-OL i Beijing 2008. Hun spilte sitt første mesterskap i VM 2011, hvor USA tok sølv etter å ha tapt finalen mot Japan. Hun ble verdensmester med USA i 2015 og 2019.