Skyer klassifisieres etter høyden de oppstår i, og utseende og egenskaper. De fleste skyene er enten (lagdelte) eller (vertikalt utviklet). Så vi har stratus- og cumulusskyer som oppstår i lavee høyder (opp til 2 km). Skyer som oppstår i de høyeste områdene av troposfæren har forstavelsen i navnet, og her finner vi cirrostratus og cirrocumulus. Skyer i midlere høyder har forstavelsen i navnet. I tillegg har en cumulonimbus som strekker seg gjennom hele troposfæren, fra et par hundre meter over bakken og helt opp til tropopausen. Cumulonimbusskyer kalles også tordenskyer, og er skyene som skaper tordenvær.