I eksil skrev El-Shazly sin beretning om hans militære karrier som han ble stilt for retten av en militær egyptisk domstol in absentia og uten noen form for juridisk representasjon. el-Shazly ble dømt til tre års fengsel. Tiltalen var å publisere boken uten å få tillatelse fra det egyptiske Forsvarsdepartementet, noe han innrømmet i pressen. Et annet tiltalepunkt var et angivelig forsøk på å avsløre militære hemmeligheter i hans bok, noe han benektet på det kraftigste. I 1992 vendte El-Shazly tilbake til Egypt hvor han ble arrestert og satt til å sone sin fengselsstraff. El Shazly døde den 10. februar 2011, da han var 88 år gammel.