Dronning Heonae ble født innen Hwangjugrenen av kongeriket Goryeo herskerhus. Hennes far, Wang Uk (hangul: 왕욱, hanja: 王旭), var åttende sønn av kong Taejo av Goryeo med sin fjerde hustru, dronning Sinjeong (hangul: 신정왕후, hanja: 神靜王后). Hun hadde én eldre bror, Wang Chi, den fremtidige kong Seongjong av Goryeo, og en yngre søster som skulle bli mor til kong Hyeonjong av Goryeo.