Utover i sesongen blir det stadig flere intriger og mysterier, og Veronica kommer enda nærmere å finne ut hvor det ble av moren hennes, hva som skjedde på bussen og hvem det var som dopet og voldtok henne i sesong 1. I sesongens siste episode nøstes alle tråder opp, og handlingen får en overraskende vending.