Etter at forholdet ble kjent, flyttet John og Michelle Phillips ut fra leiligheten de delte med Doherty, men bandet holdt fremdeles sammen. I juni 1966 avga bandet, støttet av plateselskapet, en uttalelse der det ble offentliggjort at Michelle Phillips ikke lengre skulle være en del av bandet. Hun ble raskt erstattet av Jill Gibson, produsenten Lou Adlers kjæreste. Hennes deltagelse i bandet varte i to og en halv måned, og i denne perioden begynte Doherty å drikke mye.