Fra 2001 til 2007 var han president for Den pavelige komite for eukaristiske verdenskongresser. Den 1. oktober 2007 utnevnte pave Benedikt XVI erkebiskop Piero Marini til hans etterfølger i dette embede. I 2008 deltok kardinal Tomko som pavelig legat ved den 49. eukaristiske verdenskongress.