Halikarnassos er nevnt i som blant de byene som konsul Lucius sendte brev til angående et forbund mellom Roma og den jødiske ypperstepresten Simon. Romerne ga senere den jødiske kolonien tillatelse til å bygge en synagoge ved kysten. I kristen tid fortelles det om tre biskoper fra byen: en som ble sendt til konsilet i Kalkedon i 451 e.Kr., en som i 536 ble fordømt for aftartodoketisme, og en som i 553 ble sendt til andre konsil i Konstantinopel. Ved andre konsil i Nikea i 787 var bispesetet også representert, men med diakon.