Hans utnevnelse som Australia første generalguvernør ble godkjent av dronning Victoria i juli 1900 og deretter ble den kunngjort av den politiske administrasjonen i Australia, den 13. juli 1900. Hopetoun ankom Sydney den 15. desember. Han hadde reist via India, hvor han hadde blitt smittet med tyfoidfeber og hans kone hadde blitt smittet med malaria. Hopetoun umiddelbare oppgave var å utnevne en statsminister som skulle danne en midlertidig australsk regjering. Han valgte Sir William Lyne til denne jobben.