Ekeberghallene ligger ved Oslo havn nedenfor Ekebergskråninga mot Oslofjorden, det vil si ved Sydhavna mellom Sjursøya og Bekkelaget lengst øst i fjordbassenget utenfor byen. «Inngang nord» har gateadresse Kongshavnveien 26 og ligger rett innafor kai- og industrianlegga på Sjursøya. Atkomsten går via Mosseveien (E18).