Hinlopenstretet har en rekke fjorder, og Wahlenbergfjorden i Nordaustlandet er blant Svalbards største. Regnet fra nord med klokken er de største fjordene Murchisonfjorden, Wahlenbergfjorden og Palanderbukta på Nordaustlandet, og Lomfjorden på Spitsbergen. På begge sider munner isbreer mange steder helt ned i havet, ikke minst i sørvest og sørøst. Men store kyststrekninger er også isfrie.