Den 6. august 2014 gikk Manquillo til på et to års langt lån, der Liverpool har en opsjon på kjøp. Javier ble med dette den 19.spanjolen til å spille for Liverpool, og den første spilleren som kommer fra Atletico til Anfield siden Maxi Rodriguez kom i 2010. Manquillo fikk sin første kamp for «the Reds» i en treningskamp mot Borussia Dortmund på Anfield, som laget vant 4-0. Hans første seriekamp kom i den første seriekampen av 2014/2015-sesongen i 2-1 seieren hjemme over Southampton.