Rett etter hendelsene i Jurassic World ankommer en gruppe leiesoldater frem til den forlatte Isla Nublar for å samle inn DNA fra et kadaver av Indominus rex i bunnen av parkens lagune. Laget unnslipper så vidt fra øya, etter angrep fra en Mosasaurus og en Tyrannosaurus Rex. Tre år senere diskuterer en høring i det amerikanske senatet i Washington, D.C. en sak om dinosaurer skal reddes før et nært forestående vulkan-utbrudd ved Isla Nublar. I mellomtiden har Jurassic Worlds tidligere operasjonsleder, Claire Dearing, etablert organisasjonen "Dinosaur Protection Group" i forsøk på å redde alle dyrene.