Det var i tiden ved Gregoriana at Galea møtte Hugh O'Flaherty, en irsk prest tilknyttet det pavelige diplomati og som virket ved statssekreteriatet i Vatikanet. O'Flaherty organiserte arbeid med å berge, skjule eller få smuglet ut tusener av jøder og allierte soldater fra det tysk-okkuperte Italia. O'Flaherty trengte medhjelpere, og pater Galea ble en av hans nærmeste medarbeidere. I løpet av krigsårene klarte O'Flaherty og hans hjelpere å berge mer enn 6.500 allierte soldater og jøder. Etter frigjøringen av Italia ble pater Galea hedret med Order of the British Empire.