Målet for HUGO er: Å koordinere forskningen om det menneskelige genom for å unngå unødvendig konkurranse og dobbeltarbeid. Å koordinere kartleggingen av menneskets DNA i forhold til kartleggingen av andre organismer. Å forbedre og forenkle utbytte av data. Å gi informasjon til og stimulere den offentlige debatten om de vitenskapelige resultatene og de etiske, sosiale, juridiske og kommersielle følgene av HGP.