Seyffarth ble midlertidig professor i filosofi ved universitetet i Leipzig. Han reiste 1826–1829 i Italia, Sør-Tyskland, Nederland, Frankrike og England, hvor han overalt studerte flittig det han kunne finne av egyptiske fornsaker. I 1829 ble han professor i arkeologi i Leipzig, en post, som han i 1854 plutselig forlot for å utvandre til Amerika.