I 848 ble byen omdøpt til , etter borgen Clarus Mons. I denne perioden var det en episkopal by styrt av biskopen, og ble utgangspunkt for første korstog av de kristne for å frigi Jerusalem fra muslimene. Pave Urban II talte til korstoget der i 1095 under Konsilet i Clermont. I 1120, for å stå i mot makten til prestsstanden, grunnla hertugene av Auvergne-Rhône-Alpes byen Montferrand etter modell av de nye byene i Sør-Frankrike (Midi). I 1551 ble Clermont en kongelig by, og i 1610 ble byen en uatskillelig eiendom for kongemakten.