Johansen startet sin militære karriere i 1989 som seksjonssjef i Sambandskompaniet (ble Sambandsbataljonen i 1996) og hadde forskjellige stillinger i avdelingen frem til han ble troppssjef 1995. Fra 1996 til 1999 var Johansen S-6 i Forsvarets Spesialkommando (FSK) før han i 1999 dro til Kosovo for å tjenestegjøre som S-6 for FSK.