Hobson reiste til Wellington i august 1841 hvor han hørte klager av bosettere og utvalgte dommere. Han besøkte Akaroa å gjøre opp de franske kravene. Tilbake i Auckland, hadde han litt problemer med maoriene og hans regjering ble latterliggjort av journalister i Wellington og Auckland. Han svarte med å stenge Da hans regjering hadde lite med midler, tydde han til å utstede uautorisert sedler på det britiske finansdepartementet i 1842. Hobson møtte motstand fra den «senatsklikken»-radikalere som sendte en anmodning til utenriksministeren for å ha Hobson tilbakekalt. En av Hobsons siste handlinger var å erklære en Auckland Anniversary Day, for å markere årsdagen for hans ankomst i Bay of Islands.