Da han kom i faresonen for en mulig arrestasjon dro biskop Hlad til České Budějovice. Der ble han oppsporet i juli 1950, arrestert og satt i internering for prester i det tidligere klosteret Želiv. Den 30. september ble han av domstolen dømt tiil tre års fengsel og pengebot på 20.000 tsjekkoslovakiske kroner.