Temperaturen rundt Natronsjøen er ofte over 40 °C, men den kan av og til nå opp i 60 °C, noe svært få arter tåler. Natronsjøen får i hovedsak tilsig fra den sørlige Ewaso Ng'iroelva. Innsjøen varierer mye i størrelse på grunn av tørketiden. Etter hvert som vannstanden synker med tørken, øker saliniteten i vannet, og med dét øker også produksjonen av halofile mikroorganismer, som blågrønnbakterier. Dette er primærnæring for de høyt spesialiserte filteretende flamingoene. Dvergflamingoen har denne innsjøen som et av sine primære hekkeområder, og kan opptre her i horder på én million individer. Det skjedde blant annet i 1957.