Dzogchen, som det ble undervist i nyingma-skolen, påberoper seg å stamme fra mesteren Garab Dorje som levde i det 6.århundre. Han var etter nyingma-overlevering den første menneskelige lærer som underviste dzogchen. Før ble det undervist av adi-buddhaen Samantabhadra til buddhaen Vajrasattva. Vajrasattva overførte læren direkte til Garab Dorje i en ren vision. Garab Dorje underviste munkene Manjushrimitra og Sri Singha. Den siste overførte læren foruten Jnanasutra også til Padmasambhāva og Vimalamitra som overførte læren til mange elever sammen med læreren Vairocana under innførselen av buddhismen i Tibet i det 8. århundre. Det finnes idag mange dzogchen-tradisjoner innen nyingma-skolen som kan påberoper seg på Padmasambhāva eller Vairocana som utgangspunkt av overdragelsen. Selv om man kan tilknytte dzogchen historisk til disse to religiøse tradisjonene, er dzogchen i seg selv ikke en religiøs lære, fordi i sin direktehet skjærer dzogchen gjennom alle religiøse konsept og inneholder adgangen til den umiddelbare erfaring av ikke-dualitet.