Merritt gikk ved University of Tennessee, og vant NCCA-mesterskapet i 2006, på 110 meter hekk. Da løp han på 13,21, og slo med det Greg Fosters forrige stevnerekord fra 1978. Han ble utnevnt til «NCAA All-American» syv ganger, og satte til sammen 14 skolerekorder, mesterskapsrekorder og banerekorder. I 2005, mens han gikk på University of Tennessee ble han tildelt både «Ed Murphey Award» og «Most Valuable Track Athlete Award».