Væskevarmevekslere krever også regelmessig vedlikehold for å opprettholde optimal ytelse. Rør og varmevekslere bør inspiseres og rengjøres for å hindre sedimentdannelse som kan hemme varmeoverføringen. Dersom vedlikeholdet neglisjeres, kan systemet miste effektgrad over tid og i verste fall bli mindre kostnadseffektivt enn forutsatt.