Kedrovyj ble grunnlagt i 1982 som en bosetning for oljearbeidere. I 1987 fikk den bystatus. Forventningene til utviklingen av oljeforekomstene i området har så langt ikke slått til, hovedsakelig på grunn av områdets ugunstige infrastruktur. På grunn av dette har befolkningsutviklingen i byen stagnert, i motsetning til mange andre byer på det vestsibirske slettelandet.