Den bulgarsk-katolske kirken ble opprettet gjennom en union av tidligere ortodokse kristne med paven i 1861. Allerede 1870 ble imidlertid den den bulgarsk-ortodokse kirke opprettet, noe som førte til at de fleste «nyvunne» bulgarske gresk-katolikkene vendte tilbake til den ortodokse kirken. Ved omorganiseringen av de katolske strukturene i 1926 ble opprettet fra de bulgarske delene av de tidligere eksarkatene med sete i Adrianopolis og Thessaloniki.