Hernández var president i nasjonalforsamlingen i Honduras fra januar 2010 til juni 2013, da han ble innviget permisjon fra embedet for å stille som presidentkandidat. I 2015 tillot honduransk høyesterett at presidenten kan gjenvelges, og Hernández kunngjorde da at han stilte til gjenvalg i 2017. I mars 2017 vedtok (Honduras’ Nasjonale Parti, PNH) å fremme Hernández som partiets presidentkandidat i 2017.