I 1598 ble han sendt til Irland, men ble arrestert på veien dit. Han sett innesperret i Gatehouse Prison i Westminster, Tower of London og Wisbech Castle, og ble til slutt bragt over til kontinentet etter dronning Elizabeths død. Deretter gjenopptok han sin avbrutte reise og nådde Irland på i 1604. Samme år publiserte han to latinske verk som angrep Church of England.