Sestra ligger på Det karelske neset. Til først på 1700-tallet munnet elva direkte ut i Finskebukta. Etter byggingen av en demning for å forsyne våpenfabrikken i Sestroretsk ble en del av elva omgjort til et to meter dypt og 10,6 km² stort vannreservoar kalt . Sestra har siden da munnet ut i dette reservoaret, som er skilt fra Finskebukta med en rygg av kunstige sanddyner. Fra reservoaret renner elva videre til Finskebukta gjennom en 4,8 km lang kanal.