Det er antatt at Al-Qaeda sammen med den sunnimuslimske militante ekstremistgruppen Lashkar-e-Jhangvi (LeJ), skal ha stå bak angrepene. Imidlertid er det noen hazaraere som ikke tror det er mulig at Al Quaeda og LeJ kan gjøre dette uavhengig av noen andre grupper. Asian Human Rights Commission rapporterte i januar 2012 at Pakistans militære i samarbeid med [[Inter-Services Intelligence |ISI]] hadde opprettet en militant organisasjon som hadde som mål å angripe å drepe intellektuelle, aktivister og hazaraere i Balutsjistan. Det Pakistanske militæret og dens beryktet etterretningsving, [[Inter-Services Intelligence |ISI]] har anklaget utenlandsk innblandelse i Balutsjistans saker, uten at de selv har kommentert på anklagene om at de selv er innblandet i attentatene i provinsen. Så langt at det ikke blitt lagt press på militæret eller ISI til å gjøre noe med problemene med militante grupperinger i Quetta og rundt om i dens provins.