Den ble startet i 1988 som Club Femení Barcelona, og en av klubbene som samme året startet den spanske kvinneligaen. I 1994 vant de sin første cupseier og var nest best i ligaen. Fra 2001 har de vært en offisiell del av storlaget FC Barcelona som hadde stått som viktig sponsor frem til da. Norske Caroline Graham Hansen gikk hit i 2019 som angriper. I juli 2021 signerte norske Ingrid Syrstad Engen med klubben.