Bukten består også av didere delomrtåder, som Santa Anna-bukten mellom Panay og Guimaras, og av Guimarasstredet mellom Guimaras og Negros. I sørøst er elven Ilogs delta, som er på ca. 50 km². Gjemmom Guimarasstredet har Panaybukten forbindelse til Visayassjøen. I farvannene ved Guimaras ligger Taklong Island National Marine Reserve; den ble etablert i 1990 gegründet på kysten utenfor kommunen Nueva Valencia.