Naturlig forekommende hafnium består av 6 isotoper hvorav 5 er stabile: (5,26 %), (18,6 %), (27,28 %), (13,62 %) og (35,08 %), og 1 er ustabil: (0,16 %) med halveringstid 2 · 10 år. I tillegg er 30 kunstig fremstilte ustabile isotoper kjent, hvorav de mest stabile er: med halveringstid 8,88 · 10 år, med halveringstid 42,384 dager og med halveringstid 23,6 dager. De resterende isotopene har alle halveringstider på mindre enn 1 døgn, og de fleste mindre enn 1 time.