Sinuhe arbeider som doktor i oldtidens Egypt. På løvejakt sammen med sin robuste venn Horemheb, oppdager Sinuhe Egypt sin nye farao Akhnaton, som er alene i ørkenen midt i en religiøs åpenbaring. Mens han ber, blir herskeren plutselig rammet av et epileptisk anfall - som Sinuhe er i stand til å hjelpe ham med. Den takknemlige Akhnaton gjør ham til sin personlige lege, og han gir Horemheb en stilling blant de kongelige vaktene. Hans nye fremtredende stilling gir Sinuhe et innblikk i Akhnatons regjering, og herskerens hengivenhet til en ny religion som faraoen føler har blitt guddommelig åpenbart for ham. Denne troen avviser egypternes tradisjonelle guder til fordel for tilbedelse av solen, referert til som Aten. Akhnaton blir derfor upopulær blant landets korrupte og politisk aktive prestedømme.