Kutschker ble valgt til titulærbiskop av og til hjelpebiskop i erkebispedømmet Wien 7. april 1862. Den 11. mai 1862 ble han ordinert til biskop av Wiens fyrsterkebiskop Joseph Othmar von Rauscher; medkonsekratorer var Anton Ernst von Schaffgotsch, biskop av Brünn og Ignaz Feigerle, biskop av Sankt Pölten.