Oxenstierna tilhørte en svært fremstående adelsfamilie. Hans mor Märta Finvidsdotter (Frössviksätten) var arving i Frössvikfamilien og hans far Jöns Bengtsson Oxenstierna (død 1396–99) var sønn av og en av arvingene til Ingeborg Nilsdotter i familien som senere tok navnet Sparre. Hun var arving til Ängsö og Salsta. Jöns Bengtsson arvet Frössvik (i Uppland) fra sin mor og Ängsö (i Västmanland) fra sin far. Hans bror, Bengt Jönsson Oxenstierna, ble far til Jöns Bengtsson (Oxenstierna), erkebiskop i Uppsala 1417–1467.