Den 14. august 1918, rett før bolsjevikene invaderte, forlot Kessler byen Saratov til fots, og dro til Odessa. Da en kommunistisk maktovertakelse avtegnet seg også for Odessa, skrev biskopen et brev som advarte nasjonen, der han kalte den bolsjevikske regjering en overtakelse av en antikrist, og han forordnet at den som sluttet seg til denne makt skulle ekskluderes fra kirken. Den nye sovjetregjeringens etterretning, Tsjekaen, ble av dette ansporet i sitt forehavende å finne biskop Kessler så raskt som mulig. Men i hemmelighet ville han å forlate Russland og dra til Bessarabia, der han for lenge siden hadde vært prest i landsbyen Krasna.