I Iemitsus tid ved makten fikk europeerne innreiseforbud i Japan, landets grenser ble stengt og kristne forfulgt, blant annet korsfestet. Fra Iemitsus tid var shogunatets kontroll over Japan total, med en sentralregjering som grep inn i de fleste av samfunnslivets aspekter. Shogunatet skulle nå ikke på alvor utfordres på nærmere 200 år og de stengte grensene forble det like lenge.