Den 1. juni 1925 avla Vilatte sin skyldsbekjennelse overfor den apostoliske nuntius erkebiskop Bonaventura Cerretti (1872-1933) i Paris og underkastet seg paven i Roma. Han ble deretter tildelt en pavelig pensjon og tilvist plass i cistercienserklosteret i Versailles som sitt bosted. Der bodde han fritt, korresponderte og tok imot besøkende, blant andre den gnostisk-katolske biskop Jean Bricaud («Tau Jean II»; 1881–1934). Der tilbrakte han de siste årene av sitt liv.