Fra Stor-Arnøya er det veiforbindelse via moloer og broer til Kongensøya, Kjeøya, Severinholmen, Hestøya og Sandøya. Sammen utgjør disse øyene Arnøy grunnkrets. Arnøy grenser til Fikkan og Varøya i nord, og til Arnøyfjorden i sør.