Inzaghi debuterte som profesjonell spiller i den hjemlige Serie B for den lokale klubben Piacenza Calcio. Den første sesongen (1991/1992) spilte han to kamper. Året etter fikk han vist talentet som måltyv med tretten fulltreffere på 21 kamper for Serie C-klubben UC Albinoleffe. Etter korte opphold i Verona og deretter Piacenza debuterte han i sesongen 1995/1996 for daværende AC Parma, i dag FC Parma, i Serie A, og scoret to mål på 15 kamper.