Et bibliotek ble etablert sammen med instituttet og regnes som en integrert del av instituttet. Den første samlingen ble opprettet fra dubletter og duplikater av Vatikanbiblioteket. Så ble det systematisk utviklet. I dag er det verdsatt av forskere fra hele verden. Biblioteket spesialiserer seg på bibelske og orientalske studier: bibelsk eksegese og relaterte vitenskaper (semittisk og gresk filologi), historie om kristen og jødisk eksegese, arkeologi i det gamle nære østen.