Han ble tildelt Nobels fredspris i 2016 for sin innsats for å prøve å skape fred i den colombianske konflikten. Santos og FARCs leder Timoleón Jiménez ble enige om en fredsavtale som skulle ende konflikten, men Colombias innbyggere stemte nei til forslaget i folkeavstemningen om Colombias fredsavtale 2016.