Trafikken på strekningen mellom Jaffa og Jerusalem, som åpnet i 1892, ble stanset i 1998 på grunn av at sporet var i dårlig forfatning. Linjen er nå gjenoppbygd og oppgradert. Delstrekningen frem til Beit Shemesh ble gjenåpnet i september 2003 og resten av den oppgraderte banestrekningen helt frem til Jerusalem ble åpnet i april 2005. Samtidig ble den nye Jerusalem Malha Station i Sør-Jerusalem åpnet til erstatning for den gamle.