Mens Sidotti arbeidet som prest, fikk han høre historier om misjonærer som var lidd martyrdøden i Japan, og bestemte seg for selv å reise til Japan. Den da herskende landsstengingspolitikken gjorde slik innreise illegal og underlagt dødsstraff. Etter at han hadde innhentet tillatelse fra pave Klemens XI, kom han seg til Manila, men fant deder ingen skippsleilighet som kunne bringe ham til Japan.