Wegner mente at ekteparet Fagereng var uskyldige og forsøkte å overbevise underordnede tjenestemenn om å stanse straffeforfølgelsen av ekteparet. Dette førte til at Wegner ble kritisert for å blande seg inn i og forsinke etterforskningen av Ragnar Fagereng. En anmeldelse av Wegner til SEFO fra seks underordnede tjenestemenn ble henlagt av Riksadvokaten etter bevisets stilling. Wegner var parallelt svært populær blant innbyggerne i Bergen. Da det ble kjent at hans etterfølger skulle gå av i 2004, viste en undersøkelse i BA-parlamentet at mer enn 60 % av bergenserne ønsket Wegner tilbake som politimester.