Han kom tilbake til hæren i 1939 og ledet New Zealand Divisions sjette brigade og ble blant annet sendt til Hellas og senere var han stasjonert i Nord-Afrika. Barrowclough returnerte til New Zealand tidlig i 1942 for å lede den tredje divisjon som senere ble en del de allierte styrkene i Stillehavskrigen. Under hans kommando spilte denne divisjonen en viktig rolle under den allierte landsgangen på Salomonøyene, og divisjonen var en del av flere amfibiske landganger i Stillehavet etter det.