Programvare som er fri og åpen kildekode kan bli optimalisert og kompilert til å fungere på Loongson. De mest populære programvarene som er fullstendig fri, som LibreOffice, Mozilla Firefox, Pidgin, VLC og Amarok har allerede blitt portert til Loongson. For .NET-utvikling finnes det en uoffisiell port av programmeringsspråket Mono.