På begynnelsen av 1940-tallet redigerte Amado et litterært supplement for nazistenes politiske avis Meio-Dia. Han var en kommunistisk militant i 1941 og 1942. Amado ble tvunget til å reise i eksil til Argentina og Uruguay. Da han returnerte til Brasil etter sitt eksil, ble han skilt fra Matilde Garcia Rosa. I 1945 ble han valgt inn i den konstituerende politiske forsamlingen, som representant for det brasilianske kommunistpartiet (PCB). Som medlem av dette partiet fikk han flere stemmer enn noen annen kandidat fra delstaten São Paulo. Det samme året giftet Amado seg for andre gang, denne gangen med Zélia Gattai, som også var forfatter.