Byen synker, fordi mye vann blir pumpet opp fra grunnen til bruk blant annet som drikkevann. I tillegg kommer havnivåstigning på grunn av global oppvarming; stigningen er pr 2024 på noe over 4 millimeter per år og går stadig raskere. Deler av byen ligger allerede under havoverflaten, omgitt av demninger. Store deler av byen vil bli oppgitt. Nusantara vil bli landets nye hovedstad.