Kyndby Huse ble grunnlagt i forbindelse med etableringen av Kyndbyverket, som ble satt i drift i 1940. I 2002 solgte energiselskapet Energi E2 de ca. 150 eiendommene og beboerne stiftet den 9. april 2002 en andelsboligforening som endelig overtok byen og området den 1. juli 2002.