Etter å ha lagt opp som spiller, ble han assisterende trener i en av klubbene han hadde spilt for, TPS. Han tok over ledelsen av klubben i 2008, da Martti Kuusela forlot klubben. Etter ansettelsen av Pasi Rautiainen i 2009, tok Allen over TPS' farmerlag Åbo IFK, samt TPS' juniorlag.