Tana og Varanger museumssiida er en stiftelse som ble etablert 2010 med Sametinget, Sør-Varanger kommune, Nesseby kommune og Tana kommune som stiftere. Den har ansvar for den daglige driften, mens museenes bygninger og samlinger eies av respektive kommune. Organisasjonen har elleve ansatte og har hovedkvarter ved Varanger Samiske Museum i Varangerbotn.