Å klassifisere denne farao i egyptisk kronologi er preget av stor usikkerhet. Mens Kim Ryholt og Darrell D. Baker har fremmet Rahotep som første farao av 17. dynasti, har Jürgen von Beckerath forstått ham som andre farao av samme dynasti. Alternativt har Claude Vandersleyen ønsket å plassere ham i 13. dynasti, på det grunnlag at han mener Rahotep kan være beslektet med Sobekemsaf I, som Vandersleyen også daterer til 13. dynasti grunnet kvaliteten og antallet av statuer som tilskrevet ham. Begge tolkninger trenger å bli revidert i henhold til senere oppdagelser. Baker har bedømt begge disse argumenter som «tynne og avvist av de fleste forskere».