På vei inn i sesongfinalen fikk hovedtrener Chip Kelly sparken, og offensive coordinator Pat Shurmur ble hans midlertidige erstatning. Murray løp for en 54-yard touchdown på sitt første løp og avsluttet kampen med 5,8 yards per løp, hans beste resultat i sesongen. Murray avsluttet sesongen med 702 yards på løp og hadde kun to kamper med 20+ løp, hans laveste siden 2012.