Den 7. april 2003, på sin 38. fødselsdag giftet Crowe seg med den australske sangeren og skuespilleren Danielle Spencer. Deres sønn, Charles Spencer Crowe ble født den 21. desember det samme året. Crowe møtte Spencer mens han filmet i 1990. I januar 2005 annonserte Crowe at de ville få sitt andre barn i juli. Crowe har tidligere vært sammen med den amerikanske skuespilleren Meg Ryan etter at de to møttes mens de filmet i 2000.