STS-51-C var den første romferden som ble dedikert til det amerikanske Forsvarsdepartementet, som har gjort at mange detaljer fra romferden har forblitt hemmelige. Det kom ut lite informasjon til vanlige folk før oppskytningen. Eksperter tror en satellitt ble sendt ut i en geosynkron bane. Det sies at STS-33 og STS-38 sendte ut de gjenværende delene. STS-51-C ble siden brukt som en viktig del av etterforskningen av Challengerulykken (STS-51-L), der en av mannskapet, Ellison Onizuka, omkom.