Johann Sebastian Bachs musikk var stort sett glemt i Zelters tid, men han selv var full av beundring for Bach og viderformidlet sin entusiasme til eleven Mendelssohn. Zelter har derfor sin del av æren for den revurderingen og fornyede interessen for Bachs musikk som startet opp etter Mendelssohns oppføring av Matteuspasjonen med i 1829.