Rattsøs viktigste forskningsfelt er offentlig økonomi og økonomisk vekst og utvikling. Rattsø har ledet og deltatt i en rekke offentlige utredninger, blant annet fire utvalg som har blitt kjent som «Rattsø-utvalget». Fra 2014 til 2016 ledet han Produktivitetskommisjonen.