I mars 2019 ytret kardinal Ezzati offentlig for første gang på chilensk fjernsyn om anklagene mot ham. De er knyttet til behandlingen av Fernando Karadima-saken, som var katastrofal for den chilenske kirke, og som sies å ha blitt tildekket blant annet av Ezzatis forgjenger Errázuriz, samt kirkens behandling av andre overgrep som var blitt rapportert etter at Ezzati tiltrådte i 2011. I tillegg til Muñoz-saken omfatter dette saken om en kjent prest og menneskerettighetsaktivist under militærdiktaturet under Augusto Pinochet, Cristián Precht, som ble offentlig kjent i 2012. Precht ble tvangslaisert i september 2018. Man mente at Ezzati her hadde anvendt de kirkelige prosedyrer inkonsekvent. Ezzati ble også personlig anklaget for nedverdigende behandling av et voldtektsoffer som skulle ha blitt dopet og misbrukt av den tradisjonalistiske presten Héctor «Tito» Rivera Arroyo i et siderom i katedralen i Santiago de Chile i 2015. Mens erkebispedømmet ikke benektet anklagene mot Rivera og suspenderte 61-åringen fra presteskapet for 14 år som en straff høsten 2018, uttalte Tito Rivera i en TV-sending i mars 2019 at den aktuelle mann, en nødlidende tigger, hadde fremsatt falsk anklage ut av pengebegjær. Rivera krevde likevel at han ble løst fra prestestanden. Erkebiskop Ezzati skulle angivelig ha gitt det økonomisk trengende mannen et lite beløp for å holde stille om det, da han avslørte hendelsen for kardinalen i katedralens skriftestol. Kardinalen benektet dette.