I 1993 kidnappet Abu Sayyaf en amerikansk bibeloversetter i den sørlige delen av Filippinene. I 2000 kidnappet Abu Sayyaf en amerikansk muslim som besøkte øya Jolo og de krevde at USA skulle slippe Sjeik Omar Abdel Rahman og Ramzi Yousef ut fra fengslet der de satt på grunn av sitt engasjement i bombingen av World Trade Center i 1993.