Professor Cappelørn er medlem av Etisk Råd, et rådgivende organ for Alltinget om spørsmål og etiske problemer knyttet til biomedisin, og medlem av Det Norske Videnskaps-Akademi. Han ble ridder av Dannebrog i 1992. Et festskrift til hans ære, , ble utgitt i 2010 i anledning av professor Cappelørns 65-årsdag.