Kampen mot Aalesund på Color Line Stadion skulle vere hans siste kamp i sogndaldrakten. Han la opp som fotballspiller med en scoring på samvittigheten mot Aalesund. Den 2. april 2010 annonserte Håvard Flo at han ville gjøre comeback for Sogndal, og han gjorde flere viktige opptredener for klubben den sesongen, som endte med seier i Adeccoligaen og nytt opprykk til Tippeligaen.