Bens eksponering polariserer hva verdenssamfunnet mener om ham. Yngre tilhengere idoliserer ham, og voksne (blant dem nyhetsanker Will Harangue) håner Ben som en trussel mot verdensfreden. Ben blir deretter tvunget til å tilpasse seg et nytt liv, som ikke bare innebærer å kjempe mot ondskapens krefter sammen med sin kusine Gwen Tennyson og vennen Kevin Levin. Men også problemer som oppstår på grunn av hans nyvunne berømmelse. Den første sesongen av Ultimate Alien dreier seg om en skurk ved navn Aggregor, som kidnapper fem mektige romvesener fra Andromeda-galaksen for å tilrane seg alle kreftene deres. Selv om Ben og teamet hans forsøker å stoppe Aggregor, lykkes han med å absorbere romvesenene i seg selv - og blir praktisk talt ustoppelig.