Douste-Blazy ble i 2008 utnevnt til FNs spesialrådgiver for innovativ finansiering av utvikling og formann i Unitaid. Han har rang av visegeneralsekretær. I denne posten har han vært forkjemper for solidaritetsskatter, som kan innbringe midler til kjøp av medisiner mot hiv/aids, malaria og tuberkulose.