Etter sekulariseringen og den dermed forbundne oppløsning av Ettal-klosteret i 1803 arbeidet pater Othmar Weis videre som lærer, blant annet i Oberau, hvor den senere sogneprest i Oberammergau, Joseph Alois Daisenberger, var blant hans elever. Senere ble pater Othmar Weis sogneprest i Jesenwang, der han døde den 26. januar 1843.