Vinteren 2012/2013 var Marsteintredet involvert i en kontroversiell ansettelsessak ved Universitetet i Bergen. Marsteintredet hevdet at han ikke fikk en jobb på Institutt for sammenliknende politikk grunn av ulovlig radikal kjønnskvotering. Likestillings- og diskrimineringsombudet felte UiB for kjønnsdiskriminerte og konkluderte med at UiB hadde brutt likestillingsloven. UiB tilbød deretter Marsteintredet stilling som førsteamanuensis.