Etter reformasjonen overtok kong Christian III (1536-59) i 1541 Æbelholt kloster og forlenet det i årene 1544-60 til Christoffer Throndsen Rustung, mot at Rustung til gjengjeld sørget skikkelig for abbed Anders Ibsen.<ref>[https://www.roskildehistorie.dk/gods/klostergods/landklostre/Ebelholt/Ebelholtbygning.htm «Æbelholt kloster», morbus Æbelholt''. Museet har også gjenskapt en klosterhage med mange legeurter.