De høyenergiske molekylionene som produseres av bombingen med elektroner, overfører energien til nøytrale molekyler via kollisjon. Dette gjør at analyttene kan være mindre fragmenterte, og derfor kan molekylvekten til en ukjent analyt bestemmes. Omfanget av fragmentering styres av riktig valg av reagensgass. Spektrene gitt av CI er enklere og mer følsomme sammenlignet med andre ioniseringsmetoder. Videre kan noen variasjoner av CI kobles til kromatografiske separasjonsteknikker, og forbedrer derved dets nytte ved identifisering av forbindelser. Imidlertid er denne metoden begrenset til flyktige forbindelser, og på grunn av mindre fragmentering kan mindre mengde informasjon oppnås.