Innen dette hadde Guillaume lært Bernhard av Clairvaux å kjenne og blitt hans nære betrodde, et vennskap som skulle vare livet ut. Hans høyeste ønske var å få bo med ham i Clairvaux, men Bernhard av Clairvaux motsatte seg dette og oppfordret ham i stedet til å utføre sin plikt å lede den forsamling som forsynet hadde utsett til ham. Etter at Guillaume hadde tjenestegjort ved benediktinernes første generalkapittel, i St-Medard nær Soissons i 1140, og avgått fem år tidligere som abbed, fikk han etter langvarig overtalelse trekke seg tilbake i cistercienserklosteret i Signy. Han våget ikke å vende seg til klosteret i Clairvaux i tilfelle Bernhard skulle nekte å godkjenne hans avgang som abbed. I Signy utsatte han seg for stor fysisk lidelse med strenge botsøvelser, og viet all ledig stund til bønn og studier.