Etter nesten tyve år med borgerkrig underskrev al-Bashir fredsavtale med opprørerne i Sør-Sudan i 2005. Al-Bashir er en kontroversiell figur både i Sudan og hele verden. Omar al-Bashir fikk den tvilsomme æren å toppe listen over «verdens 10 verste diktatorer» i Parade Magazine i 2006.