Kuppet ble bredt fordømt av det internasjonale samfunnet. Landene i ECOWAS, det vestafrikanske mellomstatlige samveldet, forbød umiddelbart grensehandel med Mali og frøs maliske innskudd ved sentralbanken i de vestafrikanske CFA-franc-statene. Militærjuntaen befant seg i fullstendig internasjonal isolasjon, uten penger og med tuareg-islamistiske opprørere som rykket frem fra nord. Landet begynte raskt å gå tom for drivstoff, som ble fullstendig importert, og det begynte å oppstå problemer med strømforsyningen.