Fra 28. mai 2014 var Ndaw forsvarsminister under president Soumeylou Boubèye Maïga. I sin tid som forsvarsminister signerte han en forsvarsavtale med Frankrike, og han gjennomførte en reorganisering av de væpnede styrkene i landet. Da Moussa Mara tok over for Modibo Keita som statsminister i januar 2015 gikk Ndaw av.