I 1998 etablerte han risikokapitalfondet Cognition Ventures i London, som begynte, ved hjelp av et svensk statlig pensjonsfond, med oppkjøpet av IT-selskapet NetSys fra Kinnevik. Ager-Hanssen bygde opp en større portefølje innen IT-sektoren under «dot com-boblen», ofte ved bytte til seg aksjer i mindre, unoterte selskaper. Han tapte store verdier da boblen sprakk.