Propionatderivatet, propionyl-CoA, omdannes til D-metylmalonyl-CoA ved hjelp av propionyl-CoA karboksylase og deretter til L-metylmalonyl-CoA ved hjelp av metylmalonyl-CoA epimerase. Inntreden i sitronsyresyklusen skjer ved at L-metylmalonyl-CoA omdannes til succinyl-CoA ved hjelp av L-metylmalonyl-CoA mutase, der vitamin B i form av adenosylkobalamin er nødvendig som kofaktor. Denne nedbrytningsveien fra propionyl-CoA til succinyl-CoA representerer en av de viktigste anaplerotiske veiene i sitronsyresyklusen. Metylmalonsyre dannes som et biprodukt av denne metabolske veien når D-metylmalonyl-CoA spaltes til metylmalonsyre og CoA av D-metylmalonyl-CoA hydrolase. Enzymet acyl-CoA-syntetase familiemedlem 3 (ACSF3) er i sin tur ansvarlig for omdannelsen av metylmalonsyre og CoA til metylmalonyl-CoA.