Fords status som ledende skuespiller ble ytterligere forsterket med filmen (1981), et samarbeid mellom George Lucas og Steven Spielberg, som ga Ford sin andre franchise-rolle som den heroiske globetrotteren og arkeologen Indiana Jones. Til tross for innledende motstand fra Lucas, som allerede hadde jobbet med Ford i og , ble han til slutt tildelt rollen etter at Tom Selleck ikke kunne påta seg oppdraget. Filmen ble en enorm suksess, og ble årets mest innbringende. Ford fortsatte å spille rollen gjennom resten av tiåret, med hovedroller i (1984) og oppfølgeren (1989), hvor Sean Connery spilte rollen som Indiana Jones' far. Under filmingen av i London i juni 1983, fikk Ford en skiveprolaps. Den da 40 år gamle skuespilleren måtte derfor avbryte innspillingen i seks uker, mens han var i Los Angeles for å operere.