Pagnini ble medlem av dominikanerordenen og fikk på grunn av sine kunnskaper innen orientalske språk en så høy anseelse at pave Leo X innbudte ham til å undervise i Roma. I eller rundt 1518 gjorde han ferdig en oversettelse til latin av Bibelen, oversatt fra hebraisk og gresk. Den ble publisert i 1527 i Lyon og senere (1541) i Köln. Dette var den første Bibel som inndelte Bibelen i verss (etter et annet system enn det som skulle «seire» noen år senere). Pagnini utarbeidet dessuten en hebraisk grammatikk og en ordbok, som kom i mange opplag.