I 1997 ble han apostolisk nuntius til de baltiske statene Litauen, Latvia og Estland og en måned etter dessuten til apostolisk administrator av Estland; den katolske kirke i Estland var blitt svekket i Sovjetunionen og under andre verdenskrig og da det ble mulig etter Sovjetunionens sammenbrudd var det pavelige diplomater som fikk ledelsesansvaret.