Ulrich har vært gift to ganger. Hans første ekteskap var i 1988 med Debbie Jones, en britisk kvinne han møtte på turné. Paret skiltes i 1990 på grunn av Ulrichs konstante fravær i forbindelse med turneer og under innspillingen av . Hans andre ekteskap var med overlegen Skylar Satenstein, fra 1997 til 2004. De har to sønner, Myles (f. 1998) og Layne (f. 2001). Myles følger i sin fars fotspor og spiller trommer for bandet My Missing Half.