Vassdraget er lakse-, sjøaure- og sjørøyeførende, men bestandsstatusen for laks er usikker. Gjerdalselva har i tillegg bestander av innlandsrøye og innlandsaure. Kobbvatnet har stor populasjon av innlandsrøye. Gjerdalselva har gode gyteforhold for både laks og sjøaure.