Arbeidet med NixOS startet i 2003. Første stabile versjon, NixOS 13.10 , ble lansert 31. oktober 2013. Siden den gang har det blitt lansert nye versjoner to ganger i året, med unntak av 2015 som kun hadde én utgivelse. Nyeste versjon er NixOS 24.11 lansert 30. november 2024.