Nieuport 16 egentlig var ikke annet enn et Nieuport 11 fly ombygd med en ny og kraftigere rotasjonsmotor av type Le Rhōne 9J med ytelse på 110 hestekrefter. Mekanikerne i flere skvadroner utover månedene i året 1916 besluttet seg om å skifte ut de eldre og svakere motorene på Nieuport 11 flyene med de nyere. Dette oppmuntret flyprodusenten Nieuport til å bygge en ny modell basert på etterspørslene fra feltet. Det nye flyet skilte seg fra de modifiserte Nieuport 11 flyene med et par viktige detaljer; Motordekselet fikk en større åpning forut for mer effektiv luftkjøling og en nakkestøtte ble montert bak pilotseteren i førerkabinen.