Balkanmeis finnes i sørøstlige Europa nordover til Slovenia og de sørlige Karpatene i Romania, samt i Anatolia, Levanten og Det armenske høylandet. I Iran finnes den i Zagrosfjellene og sørøst i landet. I Elburzfjellene i Nord-Iran finnes det en meis som tidligere ble regnet til balkanmeis, men som nå har status som egen art, elbursmeis ().