JonBenét hadde blitt torturert, seksuelt misbrukt og deretter blitt kvalt til døde. Det var faren som først oppdaget liket og forsøkte å gi henne førstehjelp. Mordet forblir uløst. Morderen hadde etterlatt et brev som sier at han hadde kidnappet henne, med krav om løsepenger. Da foreldrene begynte å lete etter henne fant de henne død i kjelleren.