På grunn av sine geografiske nærhet, er det pågående mindre rivalitet mellom Malmö FF og klubbene Trelleborgs FF og Landskrona BoIS, som også ligger i Skåne. Malmö FFs fremste rivaler er Helsingborgs IF, IFK Göteborg og IFK Malmö. Rivaliseringen med IFK Göteborg har pågått siden Malmö FF rykket opp i Allsvenskan på 1930-tallet. Rivaliseringen med IFK Göteborg er i større grad relatert til tittelfightingen klubbene imellom, da de er de to mest framgangsrike klubbene i svensk fotballhistorie, og de to eneste som har spilt i europeiske cupfinaler, IFK Göteborg i UEFA-cupen i 1982 og 1987, og Malmö FF i Serievinnercupen i 1979.