I USA-mesterskapet i friidrett innendørs 2016 kom Nageotte på femteplass, med 4,50 meter. Utendørs kom hun på tredjeplass i Texas Invitational og Drake Relays, og hun kom på sjetteplass i Diamond League-stevnet i Doha. Hun vant Great City Games i Manchester i mai, og kom på sjetteplass i British Grand Prix. USA-mesterskapet i friidrett 2016 fungerte også som OL-uttak, og Nageotte kom der på femteplass med ny personlig rekord på 4,60 meter, og ble dermed ikke kvalifisert til Sommer-OL 2016.