Den 4. mars 1834 ble Eccleston utnevnt av pave Gregor XVI til koadjutorerkebiskop av Baltimore og titulærerkebiskop av . Han mottok sin bispeordinasjon den 14. september av erkebiskop James Whitfield i katedralen i Baltimore. Medkonsekratorer var biskop av Bardstown Benedict Joseph Flaget P.S.S. og koadjutorbiskop Philadelphia Francis Patrick Kenrick.