Boshinkrigen bevitnet at Japan hadde allerede oppnådd en hurtig modernisering og var på vei mot et utviklingsnivå tilsvarende de industrialiserte nasjonene i Vesten, men samtidig avviste frihandelen som ble påtvunget av Vesten, noe som underminerte Japans økonomi. Krigen viste den store innflytelse som vestlige nasjoner, særlig Storbritannia og Frankrike, hadde på landets indre politikk og den ganske turbulente opprettelsen av keisermakten. Over tid ble krigen romantisert av japanere og andre som vurderte Meiji-restaurasjonen som en form for «blodløs revolusjon», til tross for det store antall døde. Krigen er blitt filmatisert mange ganger i Japan, og deler av konflikten ble framstilt i den amerikanske filmen (2005), med Tom Cruise i hovedrollen.