Inndelingen av bladmosene er fremdeles svært usikker. Man vet at lever- og nålkapselmoser ikke hører til bladmosene; at bladmosene er søstergruppen til karplantene; og at de fleste bladmoser (over 90 %) hører til de egentlige bladmosene (Bryidae), som utgjør en naturlig gruppe. Plasseringen av diverse mindre mosegrupper er derimot ikke avklart ennå.