Ferdinand Julian Egeberg var far til premierløytnant Westye Parr Egeberg (1877–1959), gift med Nini Wedel-Jarlsberg, som overtok Bogstad gård etter sine foreldre og var gårdens siste private eier sammem med sin mann. De var foreldre til Lucy Egeberg (f. 1907), gift med skipsreder Leif Høegh (1896–1974), og Karen Egeberg (1911–2007), gift med godseier Nils Fredrik Nicolai Aall (1911–1981). Ferdinand Julian Egeberg var dessuten morfar til maleren Ferdinand Finne.