Vi kjenner ikke til hvem hans foreldre var. Da keiser Basileios Megas Komnenos døde 6. april 1340 dukket det opp en milits som fikk navnet «Scholarioi». Navnet var tilsynelatende tatt fra den tidligere bysantinske militærenheten og keiserlige livgarden «Scholae Palatinae» og man har trodd at Niketas Scholares’ familie Det kan være sannsynlig at høytstående flyktninger fra Konstantinopel dro til Trapezunt etter korsfarerne hadde erobret byen, men det er mer sannsynlig at navnelikheten er tilfeldig.