Scott annonserte at han hadde valgt Louisiana State University i 2006. Han fikk sin første start i college mot Mississippi State hvor han scoret to touchdowns. Scott hadde sin første kamp med minst 100 yards på løp mot Tulane Green Wave, da han hadde 101 yards og to touchdowns på 15 løp. Hans prestasjon mot Tulane gjorde ham til den kjappeste freshmanen til å nå 100 yards siden Kevin Faulk gjorde det i sin andre kamp i 1995.