Etter krigen gikk biskop Stohr kraftig mot -anklager mot alle tyskere, og advarte også om at overdrevne denazifiseringstiltak mot dem som var mindre inkriminerte og tilhengere, kunne bremse gjenoppbyggingen av landet. Han fryktet at tyskerne på denne måten ville bli presset fra ytre høyre til ytre venstre. I tillegg satte Stohr seg ned med okkupasjonsmaktene for en rask løslatelse av krigsfanger og for forbedret omsorg for dem.