Den doble, forgylte kuppelen på moskéen ble delvis ødelagt av krigshandlinger 29. mars 1912 da Mashhad ble utsatt for russisk artilleriangrep. I 1960 ble det fastslått at kuppelen sto i fare for å falle sammen etter ytterligere skader under et opprør i 1935 og flere jordskjelv. Etter ordre fra shah Muhammed Reza Pahlavi ble mosaikken tatt ned og den ytre kuppelen revet og erstattet av en ny i armert betong. Mosaikken ble deretter satt tilbake. I 1960-årene ble også den østre iwanen revet og gjenoppbygd med det opprinnelige utseende.