På grunn av uregelmessigheter i forkant av nytt presidentvalg på øya, bestemte Den afrikanske union og den føderale regjeringen å utsette valget på Anjouan, men en trassig president Mohamed Bacar trykte opp sine egne valgsedler, avholdt valg allikevel, og hevdet å ha vunnet valget med et valgskred med 90% av stemmene 11. mai 2007. Regjeringsstyrker prøvde uten hell å gjenta kontrollen over offentlige bygninger på Anjouan og innsette en erstatnings-president som en domstol ga ordre om i mai 2007. Flere soldater ble drept i sammenstøtene da.