Mot protester fra Flora kommune og Sogn og Fjordane fylkeskommune avgjorde Samferdselsdepartementet at flyrutene til Bergen og Oslo skulle tas ut av anbudet fra 1. april 2016, og hvilket som helst flyselskap kunne dermed begynne å trafikkere disse rutene. Fra 1. oktober 2021 ble ruten til Oslo tatt inn igjen som anbudsrute, som følge av Koronaviruspandemien.