Den 18. juli 1987 ble han ordinert til prest i Ko (bispedømmet Wa) i Ghana. Etter å ha virket som misjonær i Livulu i erkebispedømmet Kinshasa i Kongo studerte han bibeleksegese i Roma fra 1991 og fullførte utdannelse i ignatiansk spiritualitet i Le Châtelard nær Lyon, et senter drevet av jesuittene. Fra 1996 til 1999 var Richard Baawobr leder av novisiatet i Kahangala i Tanzania. I 1999 ble han direktør for utdannelse ved ordenens seminar i Toulouse. I 2004 tok han doktorgraden i bibelvitenskap. Han var delegat for den franske ordensprovinsen i generalkapittelet i 2004 og ble valgt til ordenens generalassistent.