Sderot ble grunnlagt i 1951 som en transittleir for kurdiske og persiske jødiske immigranter, som bodde i telt og skur under den jødiske utflyttingen fra muslimske land. I 1954 stod permanente boligdhus ferdige. Byen ble bygd på landområder som tilhørte den palestinsk-arabiske landsbyen Najd og ligger noen få kilometer sør for ruinene av denne landsbyen. Den 13. mai 1948 ble Najd okkupert av Negev-brigaden som en del av Operasjon Barak, og landsbyboere ble fordrevet derfra til Gaza.