Perioden med oppsplitting sluttet i mai 1447 da Ala al-Dawlas onkel Ulugh Beg som styrte Transoxiana fra Samarkand tok Abu Bakr, sønn av Muhammad Juki til fange og inntok Balkh med sine tropper. Ala al-Dawla hadde en utfordring med sin bror Abul-Qasim Babur Mirza som raidet området utenfor Herat med sine tropper, og han inngikk en fredsavtale med Ulugh Beg som tillot Ulugh å beholde store deler av Abu Bakrs tidligere territorium. Ala al-Dawla marsjerte nå mot sin bror, men emirene hos begge brødrene overtalte dem til å inngå fredsavtale og akseptere Ulugh Begs overhøyhet i Timuridriket. Ala al-Dawla og Abul-Qasim ble enige om en grense mellom deres territorier og de dro seg tilbake til sine respektive hovedkvarter.