Ved siden av forskning har hun utgitt to romaner og en populærvitenskapelig bok. Debutromanen kom på Gyldendal Norsk Forlag i 2008. Romanen som kom i 2019 under pseudonymet Helene Flood er solgt til 28 land og skal filmatiseres. Hun har brukt det fulle navnet Helene Flood Aakvaag i alle vitenskapelige arbeider og i sine to første bøker, men kom under navnet Helene Flood.