Szeged har 62 barnehager, 32 barne- og ungdomsskoler, 18 videregående skoler og ett universitet, sistnevnte ble etablert ved sammenslåing av flere høyere utdanningsinstitusjoner. De to mest framstående gymnasene ( og ) er blant de femten beste i landet. Szeged er senteret for høyere utdanning i det sørlige Ungarn, og har skaffet seg et godt rykte på dette området. Tusener av studenter studerer her, og av dem er mange utenlandske studenter fra hele verden. ved det ungarske forskningsakademiet, som ble bygd mha. UNESCO-fond, har vært en viktig kilde for avansert forskning. Forskere ved dette laboratoriet var de første i verden til å produsere i år 2000. Bygningen har vært vert for mange velkjente konferanser og vil fortsette å gjøre bidrag til forskningens verden. Universitetet i Szeged ble rangert som det beste universitetet i landet på Academic Ranking of World Universities – 2005.