Sophia Hapgood, en tidligere kollega av Indy, jobber nå som en synsk person og holder seminarer hvor hun prater om Atlantis og at hun kommuniserer med en atlantisk konge, Nur-ab-sal. Kerner er ute etter medaljongen hennes, som hun og Indy fant på Island. Den hjelper henne med å kommunisere med Nur-ab-sal. Et kappløp mellom Indy og nazistene for å finne Atlantis begynner. Kerner har funnet ut at kula i statuen er orikalkum, det legendariske metallet som kan gi ekstrem kraft til maskiner og som kan benyttes til å lage bomber. Kerner finner ut dette etter at han gir statuen og kula til den gale vitenskapsmannen Dr. Hans Ubermann.