Han sitter i styret i Islands sentralbank, som en av tre personer. Der ble han utnevnt for en syvårsperiode fra 1. mai 2005. Han har sittet i styret siden 1994, og har jobbet i sentralbanken siden 1969. Styremedlemmer i sentralbanken sitter i 7 år, så Guðnasons periode utløper i april 2012.