Pors spilte i den første utgaven av Hovedserien i 1948/49, endte som nr. 7 i sin avdeling og rykket ned. Neste, og foreløpig siste, opptreden i øverste divisjon var i 1970. Pors spilte etter dette kvalifisering til toppdivisjonen fire ganger; 1972, 1979, 1981 og 1983, men lyktes aldri å ta steget opp. Klubben rykket ned fra 2. divisjon i 1974, men kom tilbake etter 4 år med en stamme fra laget som vant junior-NM 1973, etter en finale mot Brann over 4 omkamper. Etter 6 sterke sesonger i 2. divisjon rykket Pors ned i 1985. Imidlertid rykket Pors opp i daværende 2. divisjon i 1988, etter å ha gått ubeseiret gjennom sesongen. Pors ble værende i 2. divisjon i 4 sesonger, og både i 1989, 1990 og 1991 ble plassen reddet i siste serierunde; I 1989 ved å slå Eik-Tønsberg 2-0 på Pors Stadion, i 1990 ved tap 1-3 borte mot Skarp, i 1991 ved å slå Mjølner 3-1 på Pors Stadion. I 1992 var imidlertid tiden i 2. divisjon over, og Pors rykket ned sammen med Fredrikstad FK og Odd.