Lyngebreen ligger oppå, og graver seg ned i, fjellmassivet Kistefjellet som er Svalbards sørligste fjell. Breen er en innlandsbre og har ingen utløper til hav, men skyver foran seg en 1 km stor dalmorene nedover mot Sommerfeldtbukta, sør for fjellveggen av St. Nikolausfjellet. Smeltevannet ledes ut i Sommerfeldtbukta via elva Øyra, over sletteområdet Øyrlandsleira.