Han vant Honda Classic tidlig på sesongen, og to av turneringene i FedEx Cup-sluttspillet senere på året. Han måtte imidlertid gi tapt om seieren i selve FedEx-cupen. McIlroy avsluttet 2012 med å vinne finaleturneringen på Europatouren, DP World Tour Championship, en turnering der han befestet stillingen som vinner av Race to Dubai.