Jennings var født 6. oktober 2000 i Sør Florida i en jødisk familie. Jennings har en eldre søster, Ari, og to eldre brødre, tvillingene Sander og Griffen. Jazz Jennings var tildelt mannlig anatomi ved fødselen av, men identifiserer seg selv med det kvinnelige kjønn. I 2004 fikk hun diagnosen kjønnsidentitetsforstyrrelse som barn. Jennings ønsket å leve som jente allerede i ung alder og ga klar beskjed at hun er jente helt siden hun hadde lært seg å snakke. Hun ble kledd opp i kjønnsnøytrale klær i mange anledninger, selv om hun foretrakk tradisjonelle feminine klær. Men hjemme gikk hun i kjoler.