I 1939 reiste han til USA og ankom New York i august få dager før utbruddet av andre verdenskrig. Reich forlot Oslo 19. august 1939 med siste skipsavgang før krigsutbruddet. Der fikk han en stilling ved The New School of Social Research i New York der han forsatte forskning på kreft. Han fortsatte samtidig forskningen på orgon, og var særlig interessert i kreftproblemet. Dette førte til at praksisen hans i 1947 ble etterforsket. Fordi han ikke kunne påvise at orgon metodene kunne hjelpe kreftpasienter, fikk han forbud mot å fortsette med denne formen for terapi. Den gang identifiserte han seg som førsteamanuensis i medisinsk psykologi, direktør for Orgone-instituttet.