På bakgrunn av varsler fra elever som mottok koranundervisning hos Minhaj-ul-Quran, ble moskeen i 1996 anklaget av ledelsen ved Lakkegata skole og skolesjefen i Oslo for vold mot barn. De hevdet barn ble utsatt for daglig straff med stokkeslag over fingrene og baken mens de måtte sitte i sammenkrøpet stilling. Anklagene skapte en diskusjon i media om fysisk avstraffelse ved norske moskeer.