Fra februar 2002 til desember 2004 var Rønningen avdelingsdirektør og leder for juridisk avdeling ved Fylkesmannen i Østfold. Fra januar 2005 til august 2006 var han direktør og fylkesberedskapssjef og leder for områdene kommunal-, justis og samfunnssikkerhet ved Fylkesmannen i Østfold.