Baughs storhetstid kom under andre verdenskrig. I vant Baugh og Redskins East Conference med et sesongresultat på 10–1. Samme sesong gikk Bears 11–0 med en poengforskjell på 376–84. I tittelkampen i 1942 kastet Baugh en touchdownpasning og holdt Bears på egen banehalvdel med noen solide punts, inkludert en på 85 yards, og Washington vant kampen 14–6.