Naxos' sentrale posisjon i krysningen av flere sjøruter var en viktig faktor i den kulturelle og økonomiske utviklingen på øya på denne tiden. I den mykenske perioden (1600-1100 f.Kr.) opprettholdt Naxos sin sentrale posisjon, og mykensk kultur ble spredt videre til de øvrige øyene i Kykladene.