Sommeren 2008 begynte det å gå rykter som koblet Kuyt til en overgang til tyske Hamburger SV, men Rafa Benitez gikk ut og avkreftet en overgang, og sa at nederlenderen ville bli i klubben, da «Han er en spiller jeg er svært fornøyd med og han blir værende her på Anfield». Den 3. april 2009 ble det klart at Kuyt var blitt enig med Liverpool FC om en kontraktsforlengelse på to år helt frem til sommeren 2012, noe som skjedde samme dag som kaptein Gerrard også forlenget sin kontrakt. Litt senere i måneden, i sin seriekamp nr. 100 for Liverpool, skåret han sine 24. og 25. mål, da Liverpool slo Hull City 3-1 borte den 25. april. Den 6. mars 2011 scoret Kuyt sitt første hat-trick for Liverpool i 3-1 seieren mot Manchester United.