Aarli ble i 2005 valgt til president for World Federation of Neurology (WFN). Han var president i en fireårsperiode til 2009. Tidligere var han visepresident fra 2001 til 2005. Aarli var initiativtaker og jobbet for å få Kina med i WFNs organisasjon og lyktes med det, han jobbet også for å kartlegge fordelingen av nevrologisk kompetanse på verdensbasis og spesielt i Afrika. I Afrika var det enkelte land der det ikke var en eneste nevrolog.