Av Böhms musikk er en god del gått tapt, blant annet et pasjonsverk basert på Lukasevangeliet, men også flere begravelseskantater. Andre kantater har overlevd. I tillegg er en del av hans verk for orgel blitt tatt vare på. De viser at han er preget av det som man i dag kaller den nordtyske stilen i sin musikk. Han varierer frie fantasier med konservative fuger og dansesatser.