Eimsbüttel var opprinnelig en liten landsby i Hamburgs utkant. Den ble i 1275 kjent som Eyersbuttele. I 1870 var folketallet vokst til 4 000 men allerede i 1885 til 52 189 og i 1925 nesten 125 000 innbyggere. Under luftangrepene under andre verdenskrig, kalt operasjon Gomorrah ble nesten 40 % av bygningene i bydelen ødelagt. Mange av de vakre gründerzeit-bygningene ble likevel bevart.