Personer som tilbyr behandling som betegnes som funksjonell medisin, mener at ernæring og miljø er selve grunnlaget for alt levende liv og daglig utvikling og kroppen, og at ethvert vitamin, mineral og elementer fra mat og drikke brukes i kroppen for å opprettholde cellenes reproduksjon og normal kroppsfunksjon; derav navnet «funksjonell medisin». Det finnes også kritikere av funksjonell medisin, som avviser denne forståelsen, også fordi den bygger på et premiss som de i utgangspunktet mener er feil, nemlig at konvensjonell vitenskap går ut på å behandle symptomene, og ikke leter etter underliggende årsaker til lidelsen. Et nordisk forskningsprosjekt i regi av The Joint Committee of The Nordic Medical Research Councils (NOS-M) publiserte en rapport om dette i 2019 kalt .