Rundt 09.15 den 3. juli 2012 var de Villota involvert i en ulykke under rettlinje-testing av Marussias MR-01 på Duxford Aerodrome, sør for Cambridge i England. Bilen hennes hadde akkurat returnert til depotområdet etter en testrunde da den kolliderte med en stillestående lastebil. Øyenvitner anslo at bilen hadde en fart på mellom 50 og 65 km/t da den krasjet. Det tok en time å få henne ut av bilen, hvorpå hun ble fraktet til Addenbrooke sykehus i Cambridgeshire med livstruende hode- og ansiktsskader. Det ble senere rapportert at hun var ved bevissthet. Dagen etter uttalte Marussias teamsjef John Booth at de Villota fortsatt var i en «kritisk, men stabil» tilstand på sykehuset, og at hun hadde mistet det høyre øyet.