I 1580 ble han oppsagt fra embedet sitt, men fra 1592 og fram til han døde i 1602 fikk han en statsstøtte på 10 daler i året. Han skrev oppbyggelige skrifter som han solgte på markeder eller på dørene hos folk. Disse tekstene gav han ut under navnet Jakob Matzøn Kiøbenhavn, ettersom det var i danske hovedstaden at han oppholdt seg.