Kort tid etter at det ble annonsert at Harder ga seg i West Ham, ble det klart at han var ansatt som ny sportssjef i SK Brann Kvinner. I juli 2022 overtok han som hovedtrener i Brann for resten av sesongen, etter at Alexander Straus ble hentet til Bayern München. 7. desember 2022 ble det kjent at Harder ble permanent hovedtrener for Brann.