I 1893, etter kontroverser over deler av hans arbeid som prest, forlot han posten som almissekapellan i palasset til markien av Comillas. Publiseringen av trilogien ble fullført, og han ble overført til tempelet . I en periode var han fratatt rettighetene som prest, selv om disse etterhvert ble gitt tilbake. I 1894 ble bøkene og utgitt. 31. mars forlot han tempelet .