Tsuwano har to katolske kirker, noe som er nokså uvanlig for japanske småbyer. Den katolske kirke i selve Tsuwano er dedisert til St. Frans Xavier, som misjonerte i landet i 1549–50, og den ligger ved hovedgaten. Santa Maria-kirken ved Otome-passet ble dedisert i 1951 og er del av et minnested for japanske kristne som ble forfulgt og torturert i Tsuwano av regjeringen i Edo- og Meiji-periodene. Her hedres minnet av de 36 japanske kristne som ble myrdet her i 1886.