Han ble presteviet i Trier i 1739. Før han ble sendt til Kina som misjonær, fullførte han studier i Paris i matematikk, astronomi og hydraulikk under Nicolas-Louis de Lacaille og Louis Guillaume Le Monnier, som begge var medlemmer av det franske vitenskapsakademi. Det var under deres ledelse at pater Benoist studerte arkitektur, som forberedelse på hans virke ved Qing-keiserens hoff.