Selskapet ble stiftet i 1886 av Alfred Kern (1850–1893) og Edouard Sandoz (1853–1928) under navnet . Til å begynne med produserte de fargestoffer. Da Kern døde skiftet selskapet navn til i 1895 og begynte samme år å produsere legemidler for første gang. I 1899 begynte de å produsere sakkarin.