Skullerud ble medlem i Frikirken i 2004. Han begynte i stillingen som daglig leder for FriBU (Frikirkens Barn og Unge) samme år. Han sluttet i FriBU i 2010 og fortsatt i Den Evangelisk Lutherske Frikirke som pastor i Bamle menighet fra 2011. Da vervet som synodeformann innebærer full stilling, avsluttet han sin tjeneste som pastor i Bamle i mars 2015.