I 1998-sesongen gjentok Broncos fjorårets suksess med en 34–19 seier over Atlanta Falcons i Super Bowl XXXIII. Elway ble utpekt til Super Bowl MVP etter å ha kastet 336 yards og én touchdown med én interception, og scoret også en touchdown på løp. Det var Elways siste kamp, sett bort fra Pro Bowl 1999.