Yli Lompolo har tilførsel fra Luossajärvi via Luossajoki i nord, og dreneres via Luossajoki til myrsjøen Ala Lompolo i sør. Siden innsjøen er så grunn (gjennomsnittsdybden er ca en meter) er sjøbunnen først og fremst en såkalt erosjon- og transportbunn, og dette innebærer at partikler ikke sedimenterer og blir på bunnen særlig lenge, men drives videre nedstrøms.