Det er anbefalt å tilpasse parametre som mutasjonssannsynlighet, rekombinasjonssannsynlighet og populasjonsstørrelse for å finne fornuftige innstillinger for det bestemte problemet som skal løses. En for liten mutasjonsrate kan føre til genetisk drift. En rekombinasjonsrate som er for høy kan føre til at den genetiske algoritmen når konvergens for tidlig. En høy mutasjonsrate kan føre til tap av potensielt gode løsninger, med mindre man bruke elitisme, en prosess hvor man lar de beste individene fra forrige generasjon krysse over til neste generasjon.