Han har dømt flere landskamper på U-17, U-19 og U-21-nivå, blant annet flere kamper under kvalifisering til aldersbestemte europamesterskap. Han var også hoveddommer i tre kamper under U19-EM i fotball for menn 2016 i Tyskland. Hernández debuterte internasjonalt som hoveddommer på øverste nivå den 24. mai 2014, da han dømte vennskapskampen mellom og (0–4). Han har siden dømt flere EM- og VM-kvalifiseringskamper samt gruppespillkamper under UEFA Nations League.