Denne holdningen ble kritisert av noen forskere for sin oppfattede essensialistiske og arabisk-sentriske tilnærming. Kritikere, inkludert ikke-arabiske muslimske intellektuelle, utfordret hans påstand om at arabisk var den eneste språklige strukturen som var egnet for islamsk tanke. Al-Faruqis tid i Pakistan, hvor han ble utsatt for ulike muslimske kulturer, gjorde lite for å endre hans arabisk-sentriske synspunkter i utgangspunktet.