Lower studerte ved Exeter College (Oxford), hvoretter han giftet seg og bosatte seg i det sørvestlige Wales. I 1670 observerte han Halleys komet, og foretok en rekke grundige målinger av dens bevegelser. Sammen med astronomen og matematikeren Thomas Harriot, fant han at kometen fulgte en kurveformet bane. Han foreslo at den fulgte Keplers lover for planetenes bevegelser, og ikke var et atmosfærisk fenomen som fulgte en rettlinjet bane, noe som var alment antatt på denne tiden.