Zonda GR er basert på Zonda C12 S. Den ble bygget på det samme karbonfiberchassiset, med en rørramme foran og bak. Karosseriet ble modifisert med diffusere foran og bak og luftkanaler for økt aerodynamikk. Bilen var 2 meter bred, og oppfyller dermed FIA og ACO-regler. Bilens vekt ble redusert til 1 100 kg, og et nytt understell ble utviklet. Nye felger og bremser ble også utviklet. Motoren ble utstyrt med en større radiator, og både motor og girkasse fikk nye oljekjølere.