Lopukhin ble utdannet ved fakultetet for økonomi ved Moskvas statsuniversitet i 1975. Etter Sovjetunionens oppløsning var han fra november 1991 til juli 1992 den russiske føderasjons første minister for drivstoff og energi. Han ble høsten 1992 utnevnt til rådgiver for den russiske statsminister Jegor Gajdar, og var også partner i Lazard fra 1992 til 1996.