Museet åpnet i 1947 i Palais de Tokyo. Starten besto av donasjoner fra kunstnere og private samlere. Samlingen har vokst jevnt siden, både ved gaver og egne innkjøp. Innflytting i Pompidousenteret skjedde i 1977. Starck, Nouvel, Perrault er ansvarlig for arkitektur og design.