Kjell Gunnar Larsen var sentral da en gruppe AKP-medlemmer overtok sentrale verv i SOS Rasisme tidlig på 1990-tallet, i det som den tidligere ledelsen kalte et «kupp». Fra 1993 var han hovedkasserer, landsstyremedlem, medlem av arbeidsutvalget og daglig leder i SOS Rasisme. Han hadde også en lang rekke andre verv i organisasjonen. Bl.a. var han styreleder i det heleide eiendomsselskapet Aktivisteiendom AS.