I London lot kongen ham arrestere og forvares i Tower of London. Geralds stilling ble ytterligere forverret da ryktene om at han var blitt henrettet kom til Irland. Hans unge sønn Thomas fraskrev seg derfor i juni 1534 sin troskap til den engelske tronen og gjorde seg til leder for et irsk opprør, men som ikke fikk den oppslutning han hadde håpet på. Den 2. september dør Gerald, ikke ved kongens dom, men av naturlige årsaker og antagelig av de generelle dårlige forholdene i fengselet.