I 1652 og 1654 ble han nødt til å selge sin samling av malerier og grafisk kunst, og han måtte flytte til et mindre hus. Han døde i 1656 i Den Haag, og hadde da en gjeld på 18000 Gylden. Hans enke ble tvunget til å selge gjenværende møbler og malerier. van Goyens økonomiske problemer hadde trolig også betydning for utsiktene til hans elev og svigersønn Jan Steen, som forlot Den Haag i 1654.