Overgangen ble gjort permanent den 30. november 2011, da Leno fikk en avtale som bandt ham til Bayer Leverkusen til 2017. Leno ble en fast spiller på førstelaget, og etter en rekke imponerende prestasjoner signerte han den 8. november 2013 en forbedret kontrakt som holdt ham i klubben til 2018.