Store deler av øya er består av skog. Området rundt landsbyene og Skiathos by er derimot jordbruksområde. Skogene på øya består for det meste av aleppofuru, men furutrærne på den kjente Koukounaries-stranda er den innførte arten pinje. Man kan se øya Skopelos fra Skiathos og i klart vær kan man også se øyene Euboea og Skyros. Ved klart vær er det også muligheter for å se Pilionhalvøyen, som er knyttet til fastlandet. Det høyeste punktet på øya ligger i vest og her står det ei kommunikasjonsmast.