Under den tyske okkupasjonen av Norge deltok Røtjer i motstanden som medlem av Milorgs Gruppe 131134. Etter krigen studerte han ved Norges tekniske høgskole, hvor han ble uteksaminert som maskiningeniør i 1949. Han ble ansatt ved sin fars arbeidsplass Kværner Brug i 1950, og i 1958 ble han forfremmet til å etterfølge sin far som leder for blikkenslageravdelingen.