Alger vant guvernørsvalget i Michigan i 1884. Han bestemte seg for å ikke stå som kandidat til omvalg i guvernørsvalget i 1886. Han var en av de nominerte kandidatene på republikanernes partikonvent i Chicago forut for presidentvalget i USA i 1888. Han kom på tredje plass etter Benjamin Harrison og John Sherman. Harrison beseiret deretter den sittende presidenten, Grover Cleveland, i selve presidentvalget.