Den 14. oktober, før byttevinduet ble lukket i uke 6, ble Roy Williams byttet til Dallas Cowboys mot picks i første, tredje og syvende runde i NFLs draft i 2009, som flyttet Johnson til toppen på Lions' dybdekart, som den siste store trusselen i lagets angrepsrekke. I sin første kamp uten Roy Williams som lagkamerat, mot Houston Texans i uke 7, tok Johnson kun imot to pasninger for 154 yards. Med Williams borte og startende quarterback Jon Kitna ute med skade ut sesongen trengte Texans' forsvar kun å fokusere på Johnson for å slå Lions' angrep, og vant kampen 28–21.