Klubben hadde i utgangspunktet hvite drakter med svarte vertikale striper på begynnelsen av 1900-tallet. Ifølge legenden fikk klubben sine nåværende farger etter en kamp mot en klubb med samme farger som Boca ved navn Nottingham de Almagro. Vinneren av kampen fikk beholde fargene sine. Boca tapte. Klubben bestemte seg dermed for å adoptere fargene til det første skipet som seilet inn i den lokale havnen, et skip fra Sverige som bar det blå og gule svenske flagget.