Den viktigste kritikken mot generalløytnant Short var at han hadde beordret flyene tett parkert (på denne tiden var flyvåpenet en del av hæren, US Airforce ble ikke opprettet før i 1947), og slik gjort det lett for japanerne å ødelegge de ved bombing. Grunnlaget for avgjørelsen var imidlertid at man var redd for sabotasje, og det var lettere å holde vakt over flyene når de var tett parkert. En annen anklage var at de to ikke tok tidligere advarsler alvorlig og ikke trodde et flyangrep på Pearl Harbor var mulig.