Selv om Zülle har en imponerende merittliste, klarte han aldri å vinne Tour de France. I hans aktive karriere ble rittet dominert først av Miguel Indurain (5 seire) og siden Lance Armstrong (7 seire), men Zülle tok med seg to andreplasser hjem til Sveits (i 1995 og 1999). Zülle hadde mer suksess i Vuelta a España, som han vant i 1996 og 1997. I 1996 ble han også verdensmester på tempo.