Som med alle planteplankton er den primærproduksjonen som står for gjennom fotosyntesen et sluk for karbondioksid (CO). Imidlertid er produksjon av kokkolitt gjennom forkalkning, en kilde til CO. Dette betyr at kalkflagellater som har potensial til å fungere som en netto kilde til utslipp av CO fra havet. Om de er en netto kilde eller sluk, og hvordan de vil reagere på den pågående forsuringen av havet er ennå ikke godt forstått. og kiselalgen er blant to planteplanktoner spesielt viktige for den såkalte biologiske karbonpumpen i havet. En studie på deres utbredelse i år 2100, forutsatt store utslipp av klimagasser, antyder at totalt havareal dekket av og vil bli redusert med 16 % og 8 %.