Trapezunt-riket var også i konflikt med handelsmenn fra Genova. I 1348 okkuperte genoveserne byen Kerasous (nåværende Giresun) som var rikets nest største by, som hevn for en massakre på genovesere som trapezuntere hadde gjennomført noen år tidligere. I mai 1349 kom genovesere fra Caffa (nå Feodosija) på Krim og angrep den lille flåtestyrken som Trapezunt hadde. Skipene ble ødelagt, men innbyggerne i Trapezunt hevnet seg ved å drepe vestlige handelsmenn i hovedstaden. Det ble etter hvert oppnådd fred med genoveserne, og i bytte for Kerasous fikk de kontrollen over festningen Leonkastron. Trapezunts handelsinntekter ble svekket etter dette fordi genoveserne fikk langt bedre adgang til handelsrutene over Svartehavet.