Etter at han kom hjem til USA, arbeidet June som testpilot for den amerikanske marinen, og fortsatte gjennom andre verdenskrig. I 1941 ble han stasjonert ved Naval Air Station i Pensacola, Florida. Han ble utnevnt til warrant officer 21. mars 1942, og forfremmet til løytnant 4. mai 1943. Etter krigen var han sjef-testpilot ved marinens base i Alameda.