Erzberger ble 3. oktober 1918 statssekretær uten portefølje i Maximilian von Badens regjering. I november 1918 undertegnet han avtalen om våpenstillstanden i Compiègneskogen, som påla Det tyske keiserriket tyngende betingelser. Senere uttalte den samtidige politikeren Joseph Wirth at Erzberger med dette også i praksis underskrev sin egen dødsdom.