Stedet lå til Bjarkøygodset i senmiddelalderen, i likhet med resten av øya Vanna. Stedet hadde tidligere kirke. Den eldste omtalen av en kirke på Vannvåg er fra 1589. Kirken var da et anneks under Tromsø kirke og ble betjent av en residerende kapellan på Karlsøy. Kirken nevnes siste gang i 1625.