I slutten av 1946 var han igjen lærer ved Sjøfartsskolen i Bremen, som han ledet som overdirektør fra 1951 til 1963. I løpet av hans periode ble Sjøfartsskolen i Bremen, sammen med avdelingen i Bremerhaven, gjenoppbygd. Skolene ble bygd etter de nyeste nautiske, tekniske og pedagogiske prinsippene og ble retningsgivende for nybygg av nautiske utdanningsinstitusjoner både i Tyskland og utlandet. Bremen hadde den første radarsimulatoren på det europeiske kontinentet. Berger introduserte også nye fag for fremtidige kapteiner, som omhandlet livet om bord og økonomiske aspekter ved sjøfart. Han var en av medgrunnleggerne av Deutsche Gesellschaft für Ortung und Navigation. Hans etterfølger i Bremen var Karl Terheyden. Berger døde i sitt 80. år og ble gravlagt i en nisje i Osterholz. Graven eksisterer ikke lenger.