Han avviste i 2004 å utskrive nyvalg etter at statsminister José Manuel Barroso gikk av. Avvisningen møtte voldsomme protester fra alle venstreorienterte politiske partier, og betød at Eduardo Ferro Rodrigues trådte tilbake som formann for Partido Socialista. Sampio begrunnet sin beslutning med at det var nødvendig å sikre politisk stabilitet i landet på et tidspunkt da det stod overfor økonomisk resesjon. Han utpekte Pedro Santana Lopes som ny statsminister. Etter fire måneder konkluderte Sampio med at den nye regjeringen ikke sikret stabilitet, men snarere det motsatte. Han utskrev derfor nyvalg til avholdelse i februar 2005. Den 24. februar 2005 utpekte han José Sócrates som ny statsminister.