Man fortsatte å sette opp kongepokalen for menn i en forhåndsbestemt NM-øvelse, før man en gang på 1990-tallet endret kriteriene til å se alle NM-vinnere i sammenheng før man delte ut kongepokalen. I 1996 ble kongepokalen tildelt Martin Engelsviken fordi han hadde best tid på 10 km og 20 km sammenlagt. Kristian Lunde Lyssand vant kongepokalen i 1998 fordi han var den eneste NM-vinner som hadde deltatt i både NM på 10000 meter bane og NM på 20000 meter bane.