Knot jobbet i sentralbanken første gang fra 1995 til 1998, som økonomirådgiver. I 1999 jobbet han en liten periode for Det internasjonale pengefondet (IMF) i august, men returnerte til sentralbanken i september. Fra 1999 til 2002 var han direktør for avdelingen for tilsyn med finansnæringen. Fra 2002 til 2004 var han direktør i tilsynet for pensjon og forsikring (Pensioen- en Verzekeringskamer), som fra 2004 av ble en del av Nederlands bank. Etter denne fusjonen, og fram til 2009, jobbet han som divisjonsdirektør for divisjonen for personvern (Toezicht Beleid) i Nederlands bank.