Han hadde ry som en fryktløs og hensynsløs kriger med strategisk kløkt. Hans tilhengere betraktet ham som tamilsk frihetshelt, mens hans motstandere så ham som en despot med ansvar for likvidasjon av flere av Sri Lankas toppledere samt Indias statminister Rajiv Gandhi. Prabhakaran, som hadde sagt at «Jeg foretrekker å dø på slagmarken under kamp med ære i stedet for bli tatt i live av fienden», ble drept under kamper med den srilankiske hæren i mai 2009.