På et mystisk romskip i verdensrommet blir en blekksprut-lignende utenomjordisk skurk ved navn Gallaxhar varslet om tilstedeværelsen av «kvantium», en kraftig energikilde på jordkloden. Han sender en robot-sonde for å få tak i energien. Sonden lander senere på jorden, hvor USAs president forsøker å oppnå kontakt med den. Men sonden beveger seg mot San Francisco og begynner å rasere området, til tross for mislykkede forsøk fra USAs væpnede styrker. W.R. Monger overbeviser presidenten om å gi monstrene større frihet hvis de klarer å stanse sonden og bli helter. I San Francisco oppdager roboten kvantium-stråling gjennom Ginormicas kropp. Den forsøker å ta stoffet fra henne, og setter mange liv i fare. Ved Golden Gate Bridge klarer Insectosaurus, The Missing Link, dr. Cockroach, B.O.B og Ginormica å ødelegge den gigantiske roboten, ved å bruke deler av selve broen.