Yahya Sinwar sa senere at han tilbrakte tiden i fengsel med å studere fienden. Sinwar fortsatte med å røke ut informanter mens han var i fengsel. Israelske myndigheter mistenkte ham for å ha beordret halshugging av to mistenkte informanter. De skal ha kastet ofrenes avkuttede kroppsdeler ut av celledører og bedt vaktene «ta hodet til hundene».