Nå, i 1995, er hun tvangsinnlagt på et mentalsykehus i Los Angeles. Mens hun er der sendes en ny og mer avansert robot, en T-1000, med samme mål. Samtidig har en eldre modell, en T-800, blitt omprogrammert og sendt etter for å beskytte henne og sønnen. Sarah hadde fått en sønn, John, med sin tidligere beskytter. John har bodd i et fosterhjem i flere år. Han befinner seg i en spillehall sammen med noen kamerater når T-1000, forkledd som politimann, går til aksjon. I siste liten kommer T-800 ham til unnsetning og sammen klarer de å rømme fra den ekstremt standhaftige drapsmaskinen. T-800 forsøker å forklare ham situasjonen og omsider begynner John å akseptere den vanvittige historien som inkluderer hans mor. Sammen med den omprogrammerte terminatoren iverksetter han en redningsaksjon for å hente Sarah ut av sykehuset. Det overordnede målet deres blir deretter å stanse etableringen av Skynet og dermed forhindre en altomfattende atomkrig. Men dette prøver T-1000 for alt i verden å forhindre. Maskinenes fremtidige hegemoni er avhengig av Skynets tilblivelse.