Lokaltrafikken i Trondheimsregionen ble reorganisert og gjenopprettet under navnet Trønderbanen, men togstopp på Vikhamar inngikk ikke i stoppmønsteret for Trønderbanen. Den tidligere lokaltogene mellom Trondheim og Stjørdal/Steinkjer hadde mange togstopp, og for å få ned reisetiden samtidig med at nye motorvogner (type 92) ble satt i drift i 1985, nedla NSB en rekke stoppesteder. Vikhamar var altså en av disse. Det ble protestert fra lokalt hold mot dette, og et av argumentene for å få gjenopprettet togstopp på Vikhamar stasjon, var at Hommelvik hadde beholdt hele tre togstopp over en 3 km lang strekning. Etter lokale protester mot av Vikhamar hadde mistet persontogstopp, mens Hommelvik med omtrent like stor befolkning hadde beholdt tre stopp (Hallstad, Hommelvik og Solbakken). Fra 22. august 1999 ble Hallstad holdeplass nedlagt og Vikhamar stasjon fikk tilbake persontogstopp. Oppføring av et større boligkompleks rett ved stasjonen bidrog også til å begrunne behovet for togstopp på Vikhammer. På 2000-tallet ble fasilitetene for reisende utbedret gjennom først et venteskur (se bilde), senere ny plattform og forbedret atkomst med bil til parkeringsplassene.