Omuras dvergbrydehval er oppkalt etter den japanske cetologen Hideo Omura. Den ble først beskrevet av de tre japanske forskerne , og i en artikkel i det vitenskapelige magasinet Nature (426, 278-281) den 20. november 2003. Wada, Oishi og Yamada fastslo arten eksistens gjennom analyser av morfologi og mtDNA for ni individer. Åtte av disse ble opprinnelig fanget av et japansk forskningsfartøy på slutten av 1970-tallet og befant seg på et museum, mens det niende eksemplaret ble fanget i 1998 utenfor ei av de japanske øyene.