I kontrollerte kliniske prøver har emtricitabin viset effektiv kontroll av HIV-replikasjon når det kombineres med andre antiretrovirale legemidler. Emtricitabin minsker HIV-nivåt i blodet i opptil 48 uker hos pasienter som påbegynner antiretroviral behandling for første gang, samt hos tidligere behandlede pasienter med stabil virologisk kontroll.