Ekeberg var lovende som juniorløper, og representerte Norge ved to anledninger i Junior-VM i orientering. Sammen med Ulf Forseth Indgaard og Erik Sagvolden tok han bronse på stafetten under juniorverdensmesterskapet i Göteborg i 2008. Som 23-åringtok han sin første NM-medalje da han ble nummer tre på langdistansen under NM-uka på Romerike i 2011. Tre år på rad avgjorde han NM-stafetten til Tyrvings fordel. Fra 2012 til 2014 ble det dermed tre strake stafettnorgesmesterskap etter å ha gått seirende ut av tette dueller mot henholdsvis Hans Gunnar Omdal, Magne Dæhli og Olav Lundanes. Ekeberg tok sitt første individuelle NM-gull da han gikk til topps på mellomdistansen under NM-uka i Levanger i 2015.