Han døde 9. april 1999 i Santiago de Chile og ble bisatt i katedralen i Santiago. Regjeringen i Chile erklærte en fem dagers lang sørgeperiode etter hans død, og president Eduardo Frei sa at Silvas død smertet hele nasjonen. Under begravelsen kom det fra mengden taktfaste tilrop: «» (Raul, venn, folket er med deg).