Pontianak er en viktig havneby og handelsby på Borneo, og derfra utskipes blant annet kopra, gummi, tømmer, palmeolje, pepper, ris, tobakk og gull (det er gullforekomster ikke langt unna). Byen har også verftsindustri. Pontianak ble i 1959 universitetsby med , som er et statlig universitet. Byen har senere også fått et privat universitet.