Miera hadde deretter mange oppdrag som trener. Klubben han trente mest va Racing Santander, men i 1982 ble han assistenttrener for under Miguel Muñoz fram til 1986. I 1991 fikk han ta over som seniorsjef etter at Luis Suárez Miramontes fikk sparken. Han selv ble sittende i kort tid ettersom landslaget ikke kvalifiserte seg til EM i fotball 1992. I stedet tok han over OL-landslaget, og ledet det til gull på hjemmebane i 1992.