Han var fjerde og yngste sønn av den tyrkisk-mongolske erobreren Timur Lenk som grunnla Timurid-dynastiet i 1370 da han etablerte sitt rike i Transoxiana. Riket omfattet store deler av dagens Usbekistan og nabolandene. Etter Timurs død i 1405 ble riket delt på grunn av stridigheter mellom flere av hans etterkommere og det ble redusert i utstrekning på grunn av invasjoner vestfra. Shah Rukh hersket over de sørøstlige delene av riket – Transoxiana og deler av Persia. Han opprettholdt imidlertid rikets betydelige maktposisjon i regionen.