Schøyen arbeidet aktivt for dyrs beskyttelse, og var en stor bidragsyter til Foreningen til dyrenes beskyttelse i Christiania. Han testamenterte 40 000 kroner til foreningen ved sin død i 1913, da et svært stort beløp. I for august 1913 ble det trykket et minneord om Schøyen som beskrev både testamentets ordlyd og Schøyens innsats for dyrevelferd.