Ndong Sima ble født 23. januar 0955 i provinshovedstaden Oyem i Woleu-Ntem i det nordlige Gabon og fikk sin utdannelse i Frankrike. Han ble ansatt i planleggings- og økonomidepartementet i 1986 hvor han fikk ansvar for strukturell tilpasning og forholdet til Det internasjonale pengefondet og Verdensbanken. I 1992 ble han leder for hele økonomiavdelingen og beholdt samtidig ansvaret for strukturell tilpasning fra til 1994. Deretter var han generaldirektør for , en statlig gummiprodusent fra 1994 til 1998. Ndong Sima ble utnevnt til landbruksminister 17. oktober 2009.