Han var sønn av grossist Bartholomæus Jørgensen og Johanne Margaretha Lind. Han giftet seg i 1831 med Charlotte Christine Emilie Tøxen, datter av overlærer og senere literatus Jørgen Carsten Bloch Tøxen. Deres datter Charlotte Louise Johanne Jørgensen giftet seg med kommandant og folketingsmann Philip Dam.