Oppløst karbondioksid i sjøvann øker konsentrasjonen av hydrogenioner i havet, og senker derfor havets pH. CO løses opp i sjøvann og det skjer en kjemisk reaksjon der det dannes karbonsyre (HCO). HCO reagerer videre og danner hydrogenioner, som reagerer med karbonat (CO) oppløst fra havets kalkstein og andre mineraler, som igjen reagerer og danner hydrogenkarbonat (HCO). Dette uorganiske karbonet, som ikke innlemmes i organisk karbon via fotosyntese, blir til uoppløselige ioniske salter, hvorav størstedelen er kalsiumkarbonat (CaCO). CaCO er uoppløselig, og blir til bunnfall. Imidlertid er det mange organismer i havet som bruker CaCO som byggesteiner, for eksempel koraller, skalldyr og plankton.