Selv om konflikten over Abyei ikke førte til krigsutbrudd, var de-eskaleringen bare midlertidig. Tidlig i desember 2011 gikk sudanesiske styrker til angrep på den sørsudanesiske byen Jau i staten Unity, og besatte den militært. I mars 2012 ble Panyikang bombet av det sudanesiske flyvåpenet. Begge landene anklaget også hverandre for å støtte opprørsgrupper mot de respektive regjeringene.