Etter krigen ble flyplassen benyttet av Royal Aeronautical Establishment (RAE) for forskning og utvikling i tiden mellom 1946 og 1994. Flyplassen ble i denne tiden kalt for RAE Bedford. Rullebanen ble utvidet, noe som gjorde det nødvendig å stenge veien mellom Thurleigh og landsbyen Keysoe. I tillegg ble grenden Backnoe End revet.