Jones var en av de beste quarterbackene i NFLs draft i 2021 og var forventet å bli valgt i første runde, og mange eksperter forventet at San Francisco 49ers skulle velge ham som nummer 3. 49ers valgte istedenfor quarterback Trey Lance fra North Dakota State og Jones ble valgt som #25 av New England Patriots. Han var en av fem quarterbacks og seks spillere for Alabama som ble valgt i første runde, og det var første gang Patriots hadde valgt en quarterback i første runde av draftet siden Drew Bledsoe i 1993. Jones signerte sin 4-årige nykommerkontrakt, verdt $15,6 millioner som var fullt garantert, den 6. juli 2021.