Skipet "Axel Thordsen" ble bygd i 1810 og var 60 fot lang. Skipet var laget av eik for å tåle de harde værforholdene i det nordatlantiske hav. Skipet hadde også med seg fire robåter som ble brukt ved landinntakelse og i områder der «Axel Thordsen» ikke kunne navigeres. Før skipet ble brukt som ekspedisjonsskip var det tidligere brukt av marinen. Da var det også utstyrt med 12 PDS-kanoner av modell 1683. Skipet var konstruert av Herman Brunchorst, og antagelig har navnet kommet fra dikter og diplomat Peter Harboe Frimann, som skrev en ballade med navnet «Axel Thordsen og skjønn Walborg». Skipet ble utrangert i 1863 og bygd om.