Etter at Mooney returerte til USA som biskop av Rochester i 1933, ble Hurley værende i Japan for å tjene som for den apostoliske delegasjonen fra 1933 til 1934. I løpet av denne perioden bidro han til å løse en konflikt som oppsto mellom Japan og Canada etter at avisene i Kagoshima anklaget kanadiske katolske misjonærer for å gjennomføre spionasjeoperasjoner på de befestede øyene utenfor Kagoshimabukten.