Museets første direktør var José de Figueiredo, som straks startet arbeidet med å reformere museet; basert på de nyeste ideer og utstillingprinsipper. Maleri ble en hovedsatsning. Figueiredo var den første som studerte Saint Vincent-panelene, som ble utstilt i museet i 1916. I 1940 utvidet museet samlingene ved å erverve det gamle klosteret (som lå vegg i vegg) og gjorde det til en del av museet. Klosterets kapell er et fint eksempel på 17-hundretallets portugisiske kunst og arkitektur i barokk stil, og dette ble nå innlemmet i utstillingene.