I 1875 giftet Alois seg med den 14 år eldre, helsesvake Anna Glasl-Hörer, adoptivdatter av en høyere tollfunksjonær og utstyrt med en liten medgift. Ekteskapet var ikke lykkelig og forble barnløst. I stedet tok de inn en pleiedatter, Klara Pölzl, datterdatter av Johann Nepomuk Hüttler. Da Anna ble syk, ser det ut til at han vurderte å gifte seg med Klara. Da Hiedler omsider anerkjente ham som sin sønn, og han fikk sin del av arven etter fosterfaren Hüttler som var Klaras morfar, var Klara 16 år og akkurat gammel nok til å inngå ekteskap.