Kommisjonen leverte sin rapport 11. april 2003, der den foreslo en ”Partnerskapstraktat mellom Grønland og Danmark om Grønlands selvbestemmelsesrett”. Dette skulle signalisere at det også i fremtiden var ønskelig med et godt og tett forhold mellom riksfellesskapets parter, og at forholdet skulle baseres på oppfattelsen av likeverdige parter, som gjensidig respekterer hverandre. Det er Selvstyrekommissionen oppfattelse at selvstyre så langt det er mulig bør være basert på en selvbærende økonomi, der Danmarks tilskudd til Grønland på sikt reduseres vesentlig. Derfor var det viktig i fremtiden å fokusere på den samlede økonomi i samfunnet, ikke minst Grønlands handel med utlandet.