Snake blir tildelt tittelen «Big Boss» og mottar Distinguished Service Cross for hans innsats av president Johnson foran hans FOX Unit og andre tjenestemenn; men Snake har blitt så forvirret og demoralisert etter EVAs avsløringer at han reiser omtrent like etter at han mottar medaljen, og erkjenner knapt Major Zeros, Para-Medics og Sigints rolle under oppdraget. Senere ankommer han en anonym grav, graven til The Boss, bare én av tusen graver ved Æresgravlunden i Arlington. Etter å ha lagt ned The Boss' våpen og en bukett med liljer på den navnløse graven hennes, ser han utover de endeløse rekkene med graver, gjør en salutt og feller en enslig tåre.