I en annen valgrunde 21. juli 2008 ble Yādav valgt til Nepals første president med 380 av de 590 avgitte stemmene i den konstituerende forsamlingen. Han beseiret Ram Raja Prasad Singh, som stilte for Nepals kommunistiske parti (maoistisk). To dager senere ble han tatt i ed som president i presidentpalasset av høyesterettsdommeren Kedar Prasad Giri. Selv tok han sin visepresident Parmanand Jha i ed.