Gjennom den andre sesongen strever Marissa med alkohol problemer og depresjoner, mye på grunn av at Ryan er ute han hennes liv. Når Ryan kommer tilbake, kan det se ut som om de finner tilbake til det gamle forholdet, men etter at Ryan finner ut av er forhold Marissa har med en som heter D.J, vil Ryan at de skal fortsette som venner, noe de fortsetter med i mesteparten av sesongen. Forholdene hun har i mellomtiden er nok mest for å irritere moren – først D.J og så et lesbisk sex-forhold til Alex Kelly, Seths eks-kjæreste.