Hun har deltatt i en mengde antikrigsmarsjer og samlinger, som protester i New York organisert av Fifth Avenue Vietnam Peace Parade Committee, den første i 1966. Baez ble fengslet etter å ha støttet motstand mot vernepliktstjeneste i Vietnam. En gratis konsert i 1967 ved Washingtonmonumentet i Washington DC, tiltrakk seg 30 000 mennesker for å høre hennes antikrigsbudskap.