Etter ordinasjonen var Szarek kapellan ved menigheten i Nawiady fra 1960 til 1962. Fra 1962 til 1970 ledet han den lutherske menighet i Giżycko, og senere var han fra 1970 til 1975 biskoppelig vikar i Bielsko-Biała, der han i 1975 ble valgt til den andre sogneprest. I 1979 fikk han vervet som av bispedømmet Cieszyn.