Agnon tolket brannen i Bad Homburg som en straff for hans lange opphold i «eksil» utenfor og et tegn om at familien måtte flytte tilbake til Palestina og det jødiske samfunnet der. De ble enige om at han skulle reise først, mens Esther og barna skulle følge etter når han hadde etablert seg. 37 år gammel emigrerte Agnon til Palestina for andre gang og bosatte seg i Jerusalem. Han begynte å gå med kippah og leve etter den jødiske religionens bud (), en livsstil han opprettholdt resten av livet.