Før han begynte ved fakultetet på Harvard Business School (HBS) i 1992, jobbet Christensen for Boston Consulting Group. Senere fungerte han som formann og president i Ceramics Process Systems Corporation (nå CPS Holdings), et selskap han var med på å starte med flere MIT-professorer i 1984. I 2000 grunnla han Innosight LLC, et konsulentfirma og opplæringsfirma som beskriver seg som «fokus på idéskaping, strategi utvikling, kommersialisering og nyskapende prosessutvikling». Sammen med sine kolleger ved Innosight lanserte han i 2005 Innosight Ventures, et ventureselskap fokusert på å investere i India. I 2007, etter ha fulgt prosessene tett i seks år, var han med på å grunnlegge Rose Park Advisors LLC (oppkalt etter området i Salt Lake City der han vokste opp), et investeringsselskap som anvender hans forskning som en investeringsstrategi.