Etter at Lerkendal hagekoloni ble nedlagt i 1959 ble det gitt lovnader fra Trondheim kommune om å opprette en ny hagekoloni som erstatning. Først i april 1988 ble Klemetsaune kolonihage etablert ved at man fikk leie en del av arvefesteplassen Klemetsaunet fra kommunen gjennom en festeavtale. Kolonihagen ble opparbeidet rundt hovedbygningen til Klemetsaunet, hvor kolonihageforeningen overtok rundt 45 dekar med dyrket mark og bygde ut området på dugnadsarbeid.