Vitnebeskyttelsen anses iblant ikke komplett og fullstendig. Vitnebeskyttelse kan gi store personlige problemer, såsom å tvinges til å forlate sitt arbeid eller skilles fra sine barn. Det kan oppstå problemer med kommunale rettigheter såsom skole for barna ettersom familien ikke er folkeregistrert i rett kommune og på rett adresse.