Thomas Kyd var sønn av Francis og Anna Kyd og ble døpt i St Mary Woolnoth-kirken i Ward of Langborn, Lombard Street i London den 6. november 1558. Ettersom dåpen på denne tiden ble vanligvis utført tre dager etter fødselen er det antatt at hans fødsel var 3. november. Dåpsopptegnelsen har følgende innskrift: «Thomas, sønn av Francis Kydd, borger og skriver av hoffbrev av London». Francis Kydd var en skriver og i 1580 ble han bestyrer av skrivernes selskap, .