I Townsville, en by plaget av kriminalitet, blander Professor Utonium sukker, krydder og andre ingredienser i håp om å skape «perfekte små jenter» som kan gjøre byen til et bedre sted. Resultatet blir «kjemikalie X», som eksploderer og gir liv til de tre Powerpuffjentene Blomst, Boble og Belle.