Pasientreiser HF administrerer ikke rekvirerte reiser, som er reiser med drosje, fly og Helseekspress, for eksempel. Dette er reiser som helseforetakene har ansvar for. De har egne enheter for Pasientreiser som inngår avtaler og administrerer ordningen for reiser med rekvisisjon. Det er 17 ulike helseforetak som deler dette ansvaret.