Klubben har spilt åtte sesonger i Europaligaen, med kvartfinale i 1981 som beste resultat. I 1981 ble Lokeren også nummer to i det belgiske seriemesterskapet, deres beste resultat gjennom tidene, og nådde finalen i cupen. I 2003 tok klubben bronse i serien, og i 2012 og 2014 vant Lokeren cupmesterskapet i Belgia.