Winfried Aymans studerte katolsk teologi fra 1956 ved universitetene i Bonn, München og Köln og ble presteviet 22. februar 1962 for erkebispedømmet Köln. Fra 1964 studerte han kirkerett i München og ble promovert til dokrorgrad i faget i 1968. Han habiliterete seg i 1970 i München med skriftet «Das synodale Element in der Kirchenverfassung». I 1971 ble han kalt til Universitetet i Trier, i 1975 til Universitetet i Bonn.