I 2020 rykket klubben opp til Elitedivisionen, det øverste nivået i dansk fotball for kvinner. I sin første sesong på toppnivå i 2020/21-sesongen, ble HB Køge seriemester og brøt en rekke hvor Brøndby eller Fortuna Hjørring hadde vunnet serien hvert år siden 2002.