I april 1940 ble Wintzer sjef for Wehrwirtschaftsstaben i Norge, fra 1. oktober 1940 med karakter som generalløytnant, fulgt av formell forfremmelse 1. oktober 1941. Den 1. desember 1942 ble han inspektør for Wehrwirtschafts- og Rüstungs-Inspektion I. Etter noen måneder i Führerreserven ved Oberkommando des Heeres, tjenestegjorde han i september og oktober 1944 som Rhein-kommandant II (Düsseldorf) og fra november 1944 til krigens slutt som inspektør for Wehrersatz-Inspektion Münster.