Francis Chatard, som studerte i Roma ved Pontificio Collegio Urbano, ble presteviet av kardinal Costantino Patrizi Naro den 14. juni 1862. Han ble deretter viserektor på det nordamerikanske kolleg i Roma. I 1868 ble han utnevnt til rektor for dette Pontifical North American College. Dette embedet innehadde han til sin bispeutnevnelse.