I 1985 ble han direktør i sentralbanken, og visesentralbanksjef i 1988. Da Jean Godeaux gikk av som sentralbanksjef i 1989 overtok Verplaetse som sentralbanksjef. I 1990 fikk han knyttet den belgiske francen til den tyske marken, for å stabilisere Belgias økonomi. Sammen med blant andre Guy Quaden, som da var direktør i sentralbanken, ble Belgias pengepolitikk også reformert, for å forberede innføringen av euroen.