Navnet på fylket er gitt for å ære den syvende guvernør av staten New York, DeWitt Clinton. En del statlige organisasjoner lister navnet som , men fylket selv skriver uten mellomrom. Fylkets sete er byen Clinton som ligger geografisk sentralt i fylket. Fylket ble grunnlagt i 1839 fra fylkene Macon og McLean. I 2000 var befolkningen på mennesker.