Unitas fortsatte å imponere i 1965, med 2 530 pasningsyards og 23 touchdowns, og ledet ligaen med en passer rating på 97,1, som også var en personlig rekord, til tross for at han pådro seg en kneskade i uke 12 mot Bears. Reservequarterbacken Gary Cuozzo pådro seg også en skade uken etter, og running back Tom Matte måtte ta over som quarterback ut i sesongfinalen og i sluttspillkampen mot Packers. Colts og Packers avsluttet sesongen på delt førsteplass i Western Conference, og Colts endte opp med å tape på overtid i en tiebreaker-kamp mellom lagene, 13–10, etter et kontroversielt field goal fra Don Chandler.