De to første ukene i august 1941 ledet Bach-Zelewski «opprenskingsaksjonen» i Pripjat-sumpene og omegn. Aksjonen ble gjennomført av SS-kavaleriet, og Himmler ga ordre om å skyte mennene og drive kvinnene ut i sumpen for å la dem dø der. Bach-Zelewski rapporterte 7. august at antallet henrettede jøder i hans område var passert . Dagene etter ble flere tusen jøder i byen Pinsk henrettet. Himmler og SS-general Karl Wolff møtte Bach-Zelewski og Arthur Nebe (sjef for Einsatzgreppe B) i Minsk senere i august 1941. På dette tidspunktet hadde den tyske okkupanten i begrenset omfang begynt å henrette jøder fra ghettoen i Minsk (det var ventet transporter av tyske jøder til ghettoen). Jøder fra omliggende mindre byer hadde i juli-august 1941 blitt samlet i Minsk-ghettoen som var kommet opp i mennesker. I Minsk var Bach-Zelewski sammen med Himmler og Wolff tilstede da flere hundre internerte (mange jøder og kvinner) ble henrettet ved skyting, anklaget for partisanvirksomhet. Synet av massakren skal ha gjort Himmler ubekvem og han holdt etterpå en tale til mannskapene der han understreket at jøder og slavere måtte behandles nådeløst og i samsvar med ordre. Ifølge Himmler kom ordren direkte fra Hitler og at Føreren alene hadde ansvaret (noen vitner fortalte at Himmler alene tok på seg ansvaret). Bach-Zelewski forsøkte å bruke Himmlers øyeblikk av svakhet til å skåne politimennene (ikke ofrene).