MARSOC ble opprettet i 2006, etter langvarig motstand mot å flytte elitestyrker ut av marinekorpsets konvensjonelle styrke­struktur. En reevaluering som følge av terrorangrepet 11. september 2001 og den påfølgende krigen mot terror, påskyndet av forsvars­minister Donald Rumsfeld og general James L. Jones, medførte imidlertid at holdningen endret seg.