Miljødirektoratet har i oppdrag å lede arbeidet. På nettsiden til naturindeks kan du følge tilstand og utvikling til enkeltarter, økosystemer for hele Norge og for 5 ulike regioner. Økosystemene hav, ferskvann, åpent lavland, skog, våtmark og fjell blir presentert. I tillegg presenteres ulike temaindekser, blant annet hvilke påvirkninger som reduserer det biologiske mangfoldet. Naturindeksen presenterer utviklingen fra 1990 og fram til 2015. Naturindeksen vil bli oppdatert i 2020. Forskningsinstitusjonene NIBIO, NIVA, NINA, NTNU-Vitenskapsmuseet, Havforskningsinstituttet og SSB bidrar med data og kunnskap inn i prosjektet. NINA har ansvar for den vitenskapelige tilnærmingen i arbeidet.