I 806 døde keiser Kanmu, og dermed forsvant Saichos største støtte for etableringen av tendai i Japan. Den nye keiser, Heizei, hadde før visselig støttet Saicho, men etter maktovertakelsen gjennomførte han konservative økonomiske reformer, som førte til at manga tempelbygg måtte avbrytes. Dette gjorde at spredningen av tendai stanset. Før Kanmus død var Saicho ofte ved hoffet, og nevnes i mange dokumenter fra hoffet. Det finnes derimot ingen sikre kilder som nevner Saicho i de år som fulgte rett etter Kanmus død. Ifølge de fleste kilder befant han seg ved fjellet Hiei årene etter Kanmus død, men alle disse kilder er fra lenge etter Saichos død.