Pave Frans utnevnte ham til erkebiskop av Kraków den 8. desember 2016, etterfulgt av kardinal Stanisław Dziwisz. Innvielsen fant sted den 28. januar året etter. Han var kjent for tydelige avvisninger av abort, regnbueideologi, og annet der de katolske standpunkter møter motstand ikke minst i Vest-Europa, og hans utnevnelse ble evaluert av den tyske politikeren Heiner Geißler som en feil av pave Frans. Noen polske medier mente Jędraszewski for å være politisk aktiv i partiet (PiS) ledet av Jarosław Kaczyński.