I juli 2020, som et tiltak for å begrense spredningen av covid-19-viruset, innførte han en regel om at nattverden skal mottas i hånden i stedet for på tungen. Da prestene og legfolket i bispedømmet protesterte mot dette, identifiserte Taussig sitt presteseminar, det største i Argentina, som sentrum for motstanden mot hans myndighet, og stengte det. I oktober ba han folk om ikke å delta i marsjer som protesterte mot nedleggelsen av seminaret. I november møtte Taussig protester under et pastoralbesøk der han forsøkte å forklare sin beslutning om å stenge seminaret. Det var også et fysisk angrep på biskopen høsten 2020; presten som slo, ble suspendert fra sin tjeneste.