Hans fremste verk var fresker i i basilikaen , bestilt av pave For i Trastevere malte han fresker med scener fra jomfru Marias liv. I denne kirken man man også beskue maleriet av den hellige Sebastian. Et utmerket eksempel på Bagliones virtuositet er «Nattverden» i kirken i nærheten av Marcellusteateret.