Etter at en by i nærheten ble inntatt av SPLA – Sudanese People's Liberation Army i 1991 begynte sudanesiske flyktninger å bosette seg i områder rundt parken. I 1993 var det 50 000 flyktninger i området. SPLAs nærvær førte flere skytevåpen inn i området, og førte til tung beskatning av faunaen i parken. Viltoppsynstjenesten var ikke i stand til å kontrollere dette, og 121 dyr ble drept mellom 1993 og 1995. Etter at 2 hvite neshorn ble skutt i 1996 ble parken igjen oppført på listen over truede verdensarvsteder.