Som Robespierres nærmeste fortrolige satt han sammen med ham i den mektige Comité de salut public (). Han ble sendt som kommissær til fronten under Revolusjonskrigene mens krigen gikk dårlig for Frankrike. Her innførte han streng disiplin og er blitt betegnet som en av årsakene til at krigslykken snudde. Da han kom tilbake til Paris hjalp han Robespierre med å konsolidere sin makt. Dette skjedde på en nådeløs og blodig måte. I løpet av hans relativt kort tid på historiens scene ble Saint-Just skrekkveldets ansikt utad, kalt for «dødens engel», og fylt av mørk energi og nidkjærhet. Han organiserte arrestasjonene og henrettet mange av de mest kjente figurene i revolusjonen.