I 1965 ble Wcela foreleser ved Immaculate Conception Seminary i Huntington, hvor han også fungerte som rektor fra 1973 til 1979. Fra 1969 til 1975 var han også direktør for prestenes videreutdannelse. Fra 1979 til 1987 var han også pastor i St. Josephs kirke i Garden City. I 1988 ble han utnevnt til grunnleggende prest for Church of the Resurrection i Farmingville. Samtidig hadde han utført en rekke oppgaver på bispedømmeplan.