Flere fergeforbindelser krysser fjorden. Fra Bodø går det ferge til Røst, Værøy og Moskenes. Fra Bodø til Moskenes er det ca. 95 km, en tur som tar rundt fire timer. Fra Skutvik i Hamarøy går det ferge til Svolvær i Vågan. Innerst i fjorden går det ferge fra Bognes til Lødingen.