Combine ledes av Advisors, en underrase av Combine som har sterke telepatiske krefter. Combine har sørget for at det bare finnes noen få steder igjen på jorden hvor man kan overleve, deriblant City 17, hvor mye av handlingen i Half-Life 2 foregår. I store deler av spillet hersker Combine totalt over verdens gjenværende steder, med Dr. Wallace Breen som en administrator for Combine-styrker på jorda (Overwatch), kontrollert av Advisors.