Det nedre tempelet, bygget i tidlig Tarxien-fase, er det mest imponerende og muligens det beste eksempelet på megalittisk arkitektur på Malta. Det hadde en stor forgård med steinbenker, en inngang dekket av horisontale steinplater, en som har overlevd, og levninger av et muligens kuppelformet tak. Tempelet er dekorert med innhogd mønster av spiraler, og gjennomhullet av glugger, en del til mindre rom og en inn til et arrangement av steiner.