Året etter (2011) vant hun sølv på 100 meter hekk i junior-EM i friidrett 2011 i Tallinn. Hun løp på 13,37, og ble slått av Nooralotta Neziri fra Finland med tre hundredels sekund. Isabelle Pedersen vant sitt første NM-gull i 2011 i NM i Byrkjelo, og forbedret sin egen norske juniorrekord til 13,21. I 2011 ble hun også rangert som verdens beste junior (U20) på 100 m hekk av All-Athletics.com.