Handlingen finner sted to år etter Final Fantasy X, og er satt til en fiktiv verden kalt Spira, som består av en stor landmasse delt inn i tre subkontinent, omgitt av små tropiske øyer. Områdene har forskjellig klima, og var i stor grad modellert etter Sørøst-Asia med hensyn til vegetasjon, topografi og arkitektur. Selv om Spira hovedsakelig befolkes av mennesker, bor det også en rekke andre raser der. Blant dem er Al Bhed, en teknologisk avansert under-gruppe av mennesker med særegne grønne øyne og unikt språk.