Den 2. desember 1913 opprettet pave Pius X erkebispedømmet Managua, idet han oppdelte det tidligere bispedømme Nicaragua i flere kirkelige jurisdiksjoner. Lezcano y Ortega ble ordinert til biskop i det som ble katedralen i Managua den 3. mai 1914, av biskop Simeón Pereira y Castellón, den første biskopen av León og den siste av Nicaragua, og av José Cándido Piñol y Batres, den første biskopen av Granada.