Micas var først kapellan i Saint-Gaudens (1991–1995) og senere sjelesørger i Labège og Escalquens (1995–1998). Han var også kapellan for den euckristiske ungdomsbevegelset i erkebispedømmet Toulouse fra 1993 til 1998 og var ansvarlig for kallsapostolatet fra 1997 til 2000. Jean-Marc Micas sluttet seg senere til sulpicianerne og avla sine løfter den 6. juni 1999.