Gjerpe ble uteksaminert cand.med. fra embedstudiet i medisin ved Universitetet i Oslo i 2005. Hun fullførte et masterprogram i ledelse; nyskaping og kommersialisering fra Handelshøyskolen BI i 2015. I tillegg studerte hun mediafag med hovedvekt på fotografi ved Fana Folkehøgskule i 1988. Maria Gjerpe har også gått i lære hos den norske kunstmaleren Markus Brendmoe og hun er innkjøpt av blant annet Kavlifondet.