I 1913 ble Johannes Poggenburg valgt til biskop av Münster etter at hans forgjenger ble utnevnt til erkebiskop av Köln. Han ble ordinert til den biskop 16. oktober 1913 av den nye erkebiskopen av Köln Felix von Hartmann; medkonsekratorer var Paderborn-biskop Karl Joseph Schulte og Osnabrück-biskop Hubertus Voß.