Fra Shannon Pot innbefatter elven en rekke bielver før den fyller opp innsjøen Lough Allen i spissen. Elven renner gjennom eller mellom 11 av Irlands grevskaper, og innbefatter blant andre bielvene Boyle, Inny, Suck, Mulkear og Brosna, før den når Shannons elvemunningen ved Limerick.