I perioden 2013–2015 jobbet hun som seniorrådgiver ved daværende Universitetet i Nordland. I 2015 ble hun ansatt som markeds- og kommunikasjonssjef ved Nord universitet, før hun i perioden 2016–2018 jobbet som kommunikasjonssjef. I 2018 ble hun ansatt som seniorrådgiver i kommunikasjonsbyrået Apeland. I 2019 gikk Lotte Grepp Knutsen videre til Equinor, der hun jobber som rådgiver innen samfunns- og myndighetskontakt.