Sammen med tilbakevendende elementer som Ice Flowers og Yoshi, er et flygende ekorn en ny karakter som lar spilleren gli over lange avstander eller skli sakte nedover vertikale stier og klamre seg til siden av veggene. I tillegg er baby-yoshi et element som kan bæres av en spiller, og hver baby Yoshi har en spesiell evne avhengig av hva slags farge de får. Enkelte eldre "power-ups" har også fått nye evner, for eksempel Mini-Mushroom som blant annet tillater spilleren å løpe oppover vegger. Enkelte nivåer har også flere utganger som kan føre til alle de forskjellige områdene på kartet.