I 1986 signerte platekontrakt med Warner Bros. som en av de første bandene fra den amerikanske indie-scenen. Spenningene mellom Mould og Hart ble imidlertid større etter at de signerte med Warner Bros. Hart ble heroinavhengig på deres turnéen som fulgte med debutplaten deres, fra 1986, og senere det året ble Hart diagnostisert som hiv-positiv. Mould og Hart hadde åpne krangler om hans dop-misbruk og de kreative forskjellene mellom de to. Hart beskyldte Mould for å hindre at han ikke fikk flere enn 45 prosent av sangene på hvert album. Bandet ble oppløst etter en konsert i Columbia, Missouri på turné for bandets siste album, . Hart prøvde å få bukt med heroinavhengigheten med å forsyne seg med metadon, men flasken han oppbevarte dopet hadde lekket. Han spilte den påfølgende konserten, men Mould og Norton bekymret seg for Harts tilbakeholdne holdning, og trodde han ikke var i stand til å spille de neste konsertene. Hart insisterte at han kunne spille, men Mould hadde allerede avlyst bandets neste konserter. Han sluttet i bandet fire dager senere. Hart sa senere at hans dopmisbruk ikke var grunnen til bandets oppløsning, men snarere uenighetene mellom bandmedlemmene. Hart uttalte at det «var enklere å forholde seg til Mould om du fulgte hans regler», og sa at Moulds låter hadde utviklet seg til å bli «firkantede».