Djourou spilte i den sveitsiske fotballklubben Etoile Carouge FC før han ble Arsenal-spiller den 1. august 2003. Han spiller midtforsvar, men kan også brukes som defensiv midtbane. Djourou debuterte for Arsenal i 2004 mot Manchester City FC i 3. runde i Ligacupen. Denne kampen vant Arsenal 2–1. Han er også .