Aller er blant de få nordtyske elver med store, uberørte strekninger og maleriske løp gjennom landsbyer, jordbruksmark og skoger. Ved Wolfsburg løper et stykke av kanalen Allerkanal, bygd 1860-63, ett par kilometer parallelt med Aller sør for elven. Ved Wolfsburg krysses elven også av den store kanalen Mittellandkanal, og ved byen Gifhorn krysses elven av Elbe-Seitenkanal.