Rasmussen er medforfatter av to av bindene i (2002) og har stått for utvalget og skrevet innledningsessayet til boken i serien utgitt av Bokklubbene (2005). Han har skrevet en rekke artikler i norske og internasjonale fagtidsskrifter. Som kirkehistoriker er Rasmussen opptatt av at teologien ikke isolerer seg, men går i dialog med kulturfagene. Gjennom årene har han vært veileder for en rekke fordypningsoppgaver i teologi, hovedfag- og masteroppgaver, samt doktoravhandlinger.