Dette var det første parlamentsvalget i Estland etter uavhengigheten fra Sovjetunionen. Parlamentsvalget ble holdt på samme dag som den første valgomgangen i presidentvalget. Den andre valgomgangen i presidentvalget ble holdt blant det nyvalgte parlamentets medlemmer den 5. oktober. Spørsmålet om hvem som hadde rett til estisk statsborgerskap var fortsatt betent. Mange velgere kunne ikke dokumentere rett til statsborgerskap, og de fleste etniske russere oppnådde ikke stemmerett ved valget.