Lobsang Chökyi Gyaltsen var den femte Dalai Lamas lærer og allierte. Dalai Lama skjenket klosteret Trashilhünpo i Shigatse til Lobsang Chökyi Gyaltsen og forkynte at han var en inkarnasjon Amitabha Buddha. Da han døde i en alder av 93 år innledet Dalai Lama et søken etter hans inkarnasjon og etablerte med dette Panchen Lama-tradisjonen.