Zizioulas ble i 1964 assisterende professor for kirkehistorie ved Universitetet i Athen, og seks år etter professor i patristikk ved New College i Edinburgh fra 1970 til 1973. Han flyttet over til University of Glasgow der det ble opprettet lærestol for ham i systematisk teologi; han var der i fjorten år. Han var også gjesteprofessor ved på King's College London.