Jacobsen støttet kunsten i et omfang som var uvanlig i hans samtid. Bl.a. sto han bak Frederiksborgmuseet som Carlsbergfondet i dag driver videre. Han var også med på å finansiere Palmehuset i Botanisk have og pådriver for å få reist det. Han hadde tegnet det selv i samarbeid med arkitekt F.E. Kerrn etter inspirasjon fra drivhuset i Royal Botanic Gardens i Kew og Krystallpalasset i London.