Karl Meyer hadde en urolig oppvekst i Kristiania. På slutten av 1890-årene ble hans foreldre skilt, og faren mistet store deler av sin formue i Kristianiakrakket i 1899. Etter at Ludvig Meyer forlot Arbeiderpartiet i 1903, tok han med seg sønnen og flyttet til England. Dette førte til at Karl Meyer gikk på flere skoler, inkludert en kostskole i England, før han fullførte skolegangen på Katedralskolen i Hamar. Han ble immatrikulert ved Det Kongelige Frederiks Universitet (Universitetet i Oslo) i 1906, men fullførte aldri noen universitetsutdannelse. Han fullførte derimot Krigsskolen i 1907.