Den 6. januar 2006 oppnådde han sitt andre stormesternapp under Hastings Ches Congress der han scoret 6/10 og en prestasjon på 2568. Negi avsluttet på 16.-plass. Sitt tredje og siste stormesternapp fikk han under Chelyabinsk Region Superfinal Championship i Satka, Russland, den 1. juli 2006 da han fikk remis mot den russiske stormesteren Ruslan Sherbakov. Han ble dermed den nest yngste stormester noensinne i en alder av 13 år og 142 dager (13 år, 4 måneder og 20 dager) kun slått av Sergej Karjakin. Negi ble stormester 5 dager yngre enn norske Magnus Carlsen. Han er den yngste stormesteren på rankinglisten til FIDE per juli 2008.