Men et mannskap med sjørøvere ankommer Lincoln Island for å bruke ormådet som gjemmested. Men sjørøver-skipet blir på mystisk vis ødelagt i en eksplosjon, og sjørøverne selv blir funnet døde - men uten synlige sår. Hemmeligheten til øya avsløres når det viser seg å være kaptein Nemos gjemmested, og hjemme-havnen til Nautilus.