Byen spilte en stor rolle i det siste 1200-tallet, da den var hovedstaden til de uavhengige greske herskerne i Thessalia, Johannes I Doukas, Konstantinos Doukas og Johannes II Doukas. Leiesoldatene til det katalanske kompaniet grep Neopatras (= Ypati) og store deler av Fthiotis og det sørlige Thessalia i 1319, og dannet det nye hertugdømmet Neopatras, en vasall av hertugdømmet Athen. Det var en av de siste gjenværende katalanske besittelsene i Hellas, og falt til de osmanske tyrkerne i 1394. På 1200- og 1300-tallet lå festningsbyen Siderokastron også i de østlige skråningene av Itifjellet. Agathonos-klosteret, som dateres minst til 1400-tallet, ligger i de nordlige skråningene av fjellet nær Ypati.