Han ble utnevnt til spesiell chargé d'affaires til alle de sentralamerikanske statene i 1849, og forhandlet frem avtaler med Nicaragua, Honduras og El Salvador. I 1853 gjorde han sitt andre besøk til Sentral-Amerika for å foreta undersøkelser for en trasé for en mulig jernbane mellom Atlanterhavet og Stillehavet før han gjorde videre studier i arkeologi i landet. I 1856 fikk han medalje fra det franske geografiske selskap for sin forskning.