Hwang ble funnet død i sitt hjem om morgenen 10. oktober 2010. Han hadde dødd av et hjerteinfarkt mens han badet. Obduksjonen og kameraovervåkningen av boligen viste ingen mistenkeligheter rundt dødsfallet, og politiet avsluttet derfor sin etterforskning. Politiet arresterte kort tid senere en nordkoreaner som planla å myrde Hwang, også under dekke av å være en nordkoreansk avhopper, men han ble ikke knyttet til Hwangs død.