Corrigan ble klandret av Vatikanet i 1887 for å neglisjere de åndelige behov hos den sterkt økende strøm av italirnske innvandrere som slo seg ned i New York, and for å behandle dem ydmykende. Italienere ble verken tillatt å delta i messer i irske menigheter, eller bygge sine egne kirker, og var henvist til messer i kjelleren i irske menigheter. Erkebiskop Corrigan begrunnet denne utelukkelsen med at italienerne ikke var renslige, og at det ville føre til inntektstap med mindre man segregerte dem fra irlenderne.