Ved det all-ortodokse konsil i Sofia den 1. oktober 1998 gikk Ambrosius tilbake til den bulgardk-ortodokse hovedkirke, og hans ordinasjon til metropolitt under den alternative synod ble anerkjent «som en ekstrem nådesakt» og han ble mottatt inn i den-bulgarsk-ortodokse kirkes enhet med rang av biskop og tittel som metropolitt av Branicki. Han virket også som vikar for metropolitten av Vidin. Samtidig var han fra 1999 til 2004 abbed av Klisura-klosteret, og evnet å reparere og stabilisere det finansielt.