Fra 1. januar 2006 ble Nedre Telemark prosti delt mellom Aust-Telemark prosti og Vest-Telemark prosti. Seljord ble overført til Vest-Telemark prosti mens resten gikk til Aust-Telemark prosti. Fra 2004 ble prestegjeldet som administrativ enhet faset ut, og fra 2012 gikk det også ut av lovverket. Kirken ble nå organisert med soknene som grunnenheter, og prestene ble ansatt i et prosti. I 2010 lå følgende sokn under prostiet; Kviteseid (med Fjågsund, Kilen, Brunkeberg og Vrådal) Tokke (med Lårdal, Eidsborg, Høydalsmo, Mo og Skafså) Rauland (med Øyfjell og Mosstrond) Vinje (med Nesland og Grungedal), Fyresdal, Nissedal (med Treungen) Seljord (Flatdal og Åmotsdal)1.1.2015 ble Aust-Telemark og Vest-Telemark prostier slått sammen til Øvre Telemark prosti.