Havforskningsinstituttet (HI) bemanner og drifter forskningsfartøyene «Johan Hjort», «G.M. Dannevig», «G.O. Sars» og «Kristine Bonnevie». I tillegg bemanner og drifter HI det NORAD-eide fartøyet «Dr. Fridtjof Nansen», som opererer langs kysten av Afrika og i Det indiske hav, det isgående fartøyet FF «Kronprins Haakon», som eies av Norsk polarinstitutt, «Hans Brattström», som eies av Universitetet i Bergen og sjømålingsfartøyet MS «Hydrograf», som er eid av Statens kartverk.