Ved siden av sin spareiver var Jaabæk en uhyre dyktig organisator. I 1865 grunnla han organisasjonen «Selskabet Bondevennerne» etter dansk mønster. Bondevennerne ble raskt en landsomfattende organisasjon og ble en betydelig maktfaktor. Bondevennerne la grunnlaget for blant annet sparebankene og samvirketjenestene, og foreningene kan på mange måter sees som en forløper for det kommende Venstre-partiet. I sin siste stortingsperiode representerte han Moderate Venstre.