Da han ble utnevnt til kardinal i 2003 var han ennå ikke biskop; han fikk som titteldiakonia. Vanligvis er det nå bare biskoper som utnevnes til kardinaler, men under pave Johannes Paul II var det ikke uvanlig at det ved hvert konsistorium var med minst én ikke-biskop. I Cottiers tilfelle fulgte imidlertid en ordinasjon til biskop noen uker etter utnevnelsen, og én dag før selve kreeringen. Hovedkonsekrerende var kardinal Christoph Schönborn O.P., medkonsekreende var biskop Bernard Genoud av Lausanne, Genève et Fribourg, og erkebiskop Paolo Sardi.