Masur studerte piano, komposisjon og dirigering i Leipzig. Han dirigerte i tre år frem til 1955–1958 og 1967–1972. Han arbeidet også med Komische Oper Berlin. I 1970 ble han kapellmester for Gewandhausorkester Leipzig, en befatning han innehadde til 1996 da han ble utnevnt til æresdirigent.