Wizz Air har sitt hovedkvarter i bygg 221 på Budapest Liszt Ferenc internasjonale lufthavn i Budapest. Wizz Air undertegnet leieavtale i oktober 2010 og flyttet dit i juni 2011. Flyselskapet har mer enn 2000 kvadratmeter med plass i et kontorbygg pusset opp etter flyselskapets ankomst. Anlegget, med åpne kontorlandskap, huser ca. 150 ansatte. Tidligere var hovedkontoret i Airport Business Park C2 i Vecsés, nær flyplassen.