Før dette var Wisløff ekspedisjonssjef i Helse- og omsorgsdepartementet, hvor han ledet samhandlingsavdelingen. Han var tidligere rådmann i Drammen i ni år, fylkesrådmann i Vestfold, rådmann i Lier kommune og viseadministrerende direktør i Kommunenes Sentralforbund. I perioden 2003–2005 ledet han et regjeringsoppnevnt utvalg for samhandling i helsesektoren («Wisløff-utvalget»). Nils Fredrik Wisløff deltok i en rekke offentlig oppnevnte råd og utvalg, blant dem nasjonalt råd for kvalitet og prioritering i helsesektoren og helseministerens ekspertutvalg. Han var også styreleder for det tidligere Helse Sør.