Jean-Marie Lustiger studerte ved Lyceum Montaigne i Paris, deretter i Orléans og så ved Sorbonne. I sine studienår var han aktiv i studentmenighetene. Etter at han hadde arbeidet i ett år som mekaniker i Decazenville i det sørvestlige Frankrike, sluttet han seg til karmelittenes seminar i Paris. Han studerte også katolsk teologi ved og tok lisensiatsgraden i eksegese og filosofi ved Sorbonne.