Kontorsted for avdelingene på Senja ligger på Øverbotn i "SAZZA", Senja natur- og kultursenter. På Senja finner man en rekke museumsavdelinger: Kveitmuseet og Gammelbutikken i Skrolsvik Hofsøya Bygdemuseum på Stonglandet Kaperdalen Samemuseum Tranøya (permanent utstilling i den gamle prestegården).