Etter krigen valgte Dagan å forlate landet etter kommunistenes maktovertagelse i 1948. I den forbindelse byttet han ut sitt tsjekkiske navn med et hebraisk. Han gikk så inn i den israelske utenrikstjenesten, og ble ambassadør i Wien i 1956. Han var også senere Israels ambassadør i Norge (1969–1972) og i Polen.