Haushofer forble en stor beundrer av japansk kultur. Etter at Adolf Hitler kom til makten i 1933 var professor Haushofer medvirkende i utviklingen av Tysklands allianse med Japan. Flesteparten av møtene mellom høytstående japanske funksjonærer og naziledere fant sted i Haushofers hjem ved München. Han så på Japan som en brodernasjon for Tyskland.