La Salle kom til St. Ignace 27. august 1679 under utforskningen av regionen med Louis Hennepin på båten Le Griffon. Jesuittene forlot misjonsstasjonen i 1705. I 1882 ble St. Ignace revitalisert med byggingen av Detroit, Mackinac and Marquette Railroad. Den ble innlemmet som landsby 23. februar 1882, og fikk bystatus i 1883.