I andre kvarter av en kamp mot Indianapolis Colts 14. desember løp Fitzpatrick ballen to yards før han ble taklet. Taklingen endte opp med et brudd i venstre skinnben, som betydde slutten på sesongen for ham. Han ble erstattet av nykommeren Tom Savage som også pådro seg en mindre skade, og Texans tapte kampen 10–17. Til tross for skaden hadde Fitzpatrick en solid sesong. Han kastet for 2 483 yards med 17 touchdowns og åtte interceptions, og satte en personlig rekord med en passer rating på 95,3. Han avsluttet sesongen 6–6 som Texans' startende quarterback.