Etter Köppens klimaklassifisering har Ernakulam tropisk monsunklima. Siden regionen ligger sydvest i Kerala har den tropisk klima, med minimale temperatursvingninger i løpet av døgnet, året igjennom. Sommeren varer til mai og blir etterfulgt av øst-vest-monsunen fra juni til september. I oktober og november kommer ettermonsunen («retreating monsoon»). Vinteren varer fra desember til februar, og er noe kjøligere på grunn av vinden fra Nilgiris-fjellene (Vest Ghat).