I 1529 ledsaget Rörer Luther ved samtalene med Ulrich Zwingli i Marburg (). Ved siden av å være Luthers ledsager ved denne og andre reiser, gjorde han seg fortjent gjennom nedskrivningen av Luthers prekener, forelesninger, taler og brev, samt forelesninger av Melanchthon og prekener av Bugenhagen. Særlig viktig var hans bidrag til , en samling nedtegnelser av hva Luther sa (talte) «ved bordet». I 1537 fritok kurfyrst Johann Fredrik I av Sachsen ham fra hans kirkelige plikter, og gav ham offisielt i oppdrag å arbeide med dokumentasjonen av Luthers verk.