Senere i 2009 bekreftet FC Seoul Lees overgang til Bolton Wanderers og Premier League. 29. juli ble det bekreftet at han hadde fått arbeidstillatelse, og dermed var en overgang verd 2,2 millioner pund klar. Debutkampen gikk 15. august 2009 da han erstattet Gavin McCann mot Sunderland på Reebok Stadium. Lees første mål kom i en 2–1 kamp mot Birmingham City 26. september.