Sesong 2 hadde premiere i USA 7. januar 2003, og består av 13 episoder. Den første halvdelen av sesongen tar for seg en ny narkotika-salg fra Armadillo, en innvandrer som har tvunget mørk-hudede og latinamerikanske gjengene til å arbeide sammen, noe som gjør det vanskelig for Strike Team å anklage Armadillo. Andre halvdel av sesongen omhandler Strike Teams oppdagelse av armenske kriminelle som hvitvaske kriminelle penger. Mackey og Strike Team kaprer en av forsendelsene deres, og ender opp med millioner av dollar.