Mester Mace Windu møter en droide-hær ubevæpnet på planeten Dantooine. Mester Yoda reiser til is-verdenen Ilum for å redde to Jedi i problemer. En gruppe Jedier møter også den fryktede general Grievous på Hypori. Republikken er desperat, og etter mye overveielse bestemmer Jedi-rådet seg for å forfremme Anakin til Jedi-ridder. Mot slutten av krigen har Anakin blitt en mye kraftigere Jedi. Serien tar slutt rett før Star Wars Episode III: Sithene tar hevn begynner.