Johanna ble født og bodde hele sitt liv i landsbyen Spital i Waldviertel, Niederösterreich. 5. september 1848 giftet hun seg med gårdbrukeren Johann Baptist Pölzl (1825–1901), sønn av Johann og Juliana Pölzl. Paret skulle få fem sønner og seks døtre, men av disse vokste bare to sønner og tre døtre opp. Datteren Klara ble født på gården i Spital 12. august 1860.