Poupard var interessert i forholdet mellom tro og viten, kirke og stat, og religion og vitenskap fra tidslig av, og dette engasjerte ham det meste av hans liv. Han forsket og skrev om disse emner, og noen av hans skrifter er blitt oversatt fra fransk til mange språk; til arabisk, bulgarsk, kinesisk, kroatisk, engelsk, tysk, ungarsk, italiensk, japansk, koreansk, portugisisk, russisk og spansk.