Fra 500- til begynnelsen av 100-tallet f.Kr. er det tynt med bevis på beboelse. Under den romerske perioden var det igjen betydelig bygging, blant annet et , et bad med trappetrinn som ble benyttet for jødisk rituelt bad, og vannkanaler. Gibeon var muligens under beskyttelse av Jerusalem, og var således ikke befestet på denne tiden.