Jordbruk er en liten, men voksende næring i Yukon, og vanskeliggjøres på grunn av dårlig jordsmonn, topografi og klima. Territoriet har omtrent hektar jordbruksland, og jordbruket i regionen er i hovedsak sentrert rundt Whitehorse, hvor det største jordbruksområder er Takhini Valley vest for byen. Viktige jordbruksområder finnes imidlertid også i andre områder i Yukon, hovedsakelig rundt Dawson City, Watson Lake og Mayo. Yukon har lite skogbruk, men det produseres diverse trevarer til lokal bruk, hovedsakelig i territoriets sørlige deler hvor ressursene er tilgjengelig.