Samherji imøtegikk anklagene ved å publisere en uttalelse der de hevdet at det var Jóhannes Stefánsson som hadde stått bak bestikkelsene og at ingen andre i ledelsen hadde vært klar over det som foregikk. Selskapet viste også til at de hadde engasjert det norske advokatfirmaet Wikborg Rein til å foreta en selvstendig gransking av saken. Selv om Jóhannes innrømmet å ha vært medansvarlig for korrupsjonen, viste ytterligere undersøkelser at han aldri hadde disponert bankkontiene på Kypros som var blitt benyttet til transaksjonene, og at pengeoverføringene hadde fortsatt i tre år etter at han forlot selskapet.