Margarin har i mange år vært pekt på som en matvare som inneholder mye transfett, spesielt sammenlignet med meierismør. Dette stemte tidligere, hvor den industrielle herdingen av vegetabilske oljer førte til at at de gode fettsyrene ble omdannet til transfett. Nå finnes det nyere metoder å fremstille margarin på, og margarin inneholder ikke transfett i Norge i dag.