Han kom til makten i Komorene etter å ha ledet et statskupp og avsatt president Tadjidine Ben Said Massounde. Han vant presidentvalget i mai 2002 etter at han i henhold til forfatningen gikk av i januar for å kunne stille til valg. Hamada Madi var fungerende president i perioden fram til Assoumani overtok. Den 15. mai 2016 vant han valget på nytt og overtok som president etter Ikililou Dhoinine.