Det har gjennom årene vært mange endringer og omstruktureringer ved de to høyskolene som fra 1996 inngikk i NTNU: Den allmennvitenskapelige høgskole (AVH, tidligere NLHT) og NTH. Waadeland hadde helt fra 1965 en sentral rolle under etableringen av et studieprogram i «universitetsmatematikk» ved NLHT. Hans professorstilling var formelt tillagt NTH, men «med plikt til å forestå undervisningen i matematikk ved NLHT». Denne ordningen varte frem til 1984, da Waadeland ble utnevnt til professor i matematikk ved det som da var blitt Universitetet i Trondheim, Den allmennvitenskapelige høgskolen.