Registrering for selskaper i IOSS-portalen har vært mulig siden 2021 april 1 i alle EU-land, og det er tilstrekkelig å registrere seg i én enkelt EU-medlemsstat. Selskapet mottar da et IOSS-identifikasjonsnummer (også bare kalt et IOSS-nummer). Dersom selskapet ikke er EU-basert må det bruke et EU-basert mellomledd (en skattemessig representant) for å kunne oppfylle og garantere sine mva-forpliktelser i henhold til IOSS. IOSS mva-nummeret utstedes av skattemyndighetene i et EU-medlemsland, og gjøres tilgjengelig elektronisk for alle andre tollmyndigheter i EU. Databasen med IOSS-numre er imidlertid ikke offentlig for å hindre misbruk. Ved tolldeklarasjon vil tollmyndighetene sjekke IOSS-nummeret på pakken mot databasen med IOSS-numre. Dersom IOSS-nummeret er gyldig og den virkelige verdien av forsendelsen ikke overstiger 150 euro vil ikke tollmyndighetene kreve umiddelbar betaling av mva på lavverdige varer som er registrert gjennom IOSS.