Shibuya er født i 1965. I løpet av grunnskolegangen begynte hun å tegne illustrasjoner og animasjoner inspirert av anime-serier som og . Senere valgte hun å studere animasjon, samtidig som hun jobbet deltid ved studioer som animerte populære anime-serier som , og . Hun begynte å miste interessen for animasjonsarbeid i 1986, men ble rekruttert av videospillselskapet Square.