Han ble plukket opp av Seattle Seahawks med 12. pick i tredje runde (#75) i NFLs draft i 2012. Etter å ha slått Matt Flynn for stillingen som kampstarter under treningsleiren hadde Wilson en vellykket første sesong, hvor han tangerte Peyton Mannings rekord for flest touchdownpasninger av en nykommer (26) og ble utpekt til Pepsi NFL Rookie of the Year.