I 1986 spilte Noonan Francis Dolarhyde som var en seriemorder som dreper hele familier i filmen . Hovedpersonen i denne filmen ble sammenlignet med Hannibal Lecter. Til dags dato er det denne filmen som er Noonans mest gjenkjennelige ledende rolle. Han spilte også Frankenstein i filmen . I løpet av 1990-tallet skrev han flere skuespill, inkludert to som han lagde til filmer. I 2009 var han med i filmen The House of the Devil.