Med endringene i ligningsloven av 1980 foretok ligningskontoret nær all den ordinære saksbehandlingen under de årlige skatteoppgjørene. Ligningsnemnda ble dermed i praksis første klageinstans over ligningskontorets avgjørelser, og kunne overprøve ligningskontoret. Overligningsnemnda var ordinær klageinstans, både for skattyter og ligningsmyndighet. Ligningsnemnda skulle i tillegg være førsteinstans for visse typer avgjørelser, som alle avgjørelser om tilleggsskatt eller der det var snakk om å skattlegge tjenestemenn og ombudsmenn i ligningsvesenet.