Rotaen har sitt opphav i , som ble opprettet i det 14. århundre. Den har siden blitt reorganisert en rekke ganger. Den siste store endringen kom i 1908 under Pius X. Rotaen hadde da vært ute av funksjon siden 1870, men ble gjenopprettet i konstitusjonen . De nåværende normene for domstolen ble fastsatt av Johannes Paul II i 1994.