Ordenstegnet for Mapungubwe-ordenen består av en oval over en trapesform som øverst er buet utover. Ovalens ytterkant er utformet med fire spisser som skal symbolisere de fire himmelretninger og sørafrikaneres innsats verden over. I ovalen er det plasser et neshorn i gull og en sol over en profil som representerer Mapungubweberget. Neshornet viser til en gullbelagt figur som ble funnet under arkeologiske utgravninger ved Mapungubwe. Solen skal symbolisere at Afrika står overfor en ny dag. Nederst i trapesformen er det plassert et ildsted og smeltedigler for gull ved siden av denne. I trapesformens midtre del er det plassert et septer, med en utforming likt det som ble funnet ved utgravingene av Mapungubwe. Reversen viser Sør-Afrikas riksvåpen.