Den største trusselen mot zairegorillaen og generelt alle arter i familien er svedjebruk og krypskytteri. Den jages for kjøttet og til trofeer og suvenirer. Nesten alle gorillaer i dyrehager er zairegorillaer. Det blir sjeldent gjort forsøk på å gjeninnføre individer som er oppfostret i fangenskap til naturen. Delvis på grunn av gorillaens komplekse, fast sammenknyttede liv. I stedet prioteres vern av biotoper.