I 1989 kom han tilbake til Tsjekkoslovakias Statsbank, da han ble utnevnt til (sentralbanksjef). Da Tsjekkoslovakia ble splittet i Tsjekkia og Slovakia i 1993 ble han også sentralbanksjef i Tsjekkias nye sentralbank, Tsjekkias nasjonalbank, fra 20. januar 1993. Han ble da også Tsjekkias representant i IMF og EBRD. Den 17. desember 1997 ble han imidlertid utnevnt til statsminister i Tsjekkias forretningsministerium som ble utpekt av president Václav Havel, i etterkant av at Vaclav Klaus' mindretallsregjering kollapset i november 1997.