Google Apps har sikkerhet og overholdelse av regler og standarder på Enterprise-nivå, inkludert SSAE 16 / ISAE 3402 Type II, SOC 2-revisjon, ISO 27001-sertifisering, overholdelse av Safe Harbor-personvernprinsippene, og kan støtte bransjespesifikke krav, som for eksempel Health Insurance Portability and Accountability Act (HIPAA). Google forklarer at filtre for søppelpost er integrert i Google Apps, og at meldinger og dokumenter sjekkes for datavirus før brukeren kan laste dem ned.