Pipilene stammer fra flere ulike grupper som på 1100-tallet dro ut fra nåværende Mexicos sentrale høyland og den mexikanske kysten via Tehuantepeneset. De migrerte for å unngå tørke som rammet de sentrale delene av nåværende Mexico. Men de ville også vekk fra sosiale og politiske forhold, ikke minst toltekernes makt.