Guettée utgav (12 bind, Paris 1847—56), og ble da beskyldt for å helle mot jansenismen, og måtte i 1856 forlate sin stilling. I 1862 gikk han over til den russisk-ortodokse kirke, hvis lære han fremsatte og forsvarte i sitt tidsskrift . Hans skrifter etter konversjonen var ofte svært polemiske mot den katolske kirke i Frankrike.