Gallikanismens eldste røtter hevdes å kunne spores til Karl den stores (742-814) tid. Et eksempel på kampen mellom konge- og pavemakt er striden mellom kong Filip IV av Frankrike (1268-1314) og pave Bonifatius VIII (1235-1303), der kongen blant ville ha rett til å ta inn penger fra vakante bispedømmer, det vil slike som for en tid var uten biskop. I løpet av de kommende 150 år ble konsiliarismen utviklet, det syn at konsilet som det allmene kirkemøte er overordnet paven.