Rudolf Steiner betraktet barnesykdommer som en nyttig bestanddel av et barns personlige utvikling, og selv om vaksiner mot slike sykdommer først ble utviklet etter hans død bekymret han seg for at vaksiner i fremtiden ville fordrive åndelighet til fordel for materialisme. Det har fått oppmerksomhet at det ved noen steinerskoler har vært utbrudd av meslinger. Norske legers forening for antroposofisk medisin (NLFAM) har uttalt at antroposofien eller de antroposofiske institusjonene ikke er motstandere av vaksiner, og hevder at vaksinedekningen ved norske steinerskoler er omtrent på nivå med offentlig skole.. European Council for Steiner Waldorf Education har også uttalt at de ikke er mot vaksiner, men at foreldrene selv må velge.Det står imidlertid sentralt i den antroposofiske medisin at det er positivt for et barn å gjennomleve barnesykdommer, og mange antroposofer sår tvil om effektivitet og trygghet ved vaksiner. Antroposofiske leger er derfor tilbakeholdne med å anbefale vaksiner.