Krigføringen varte til 10. februar 1943, da de siste australske troppene ble evakuert. De hadde lykkes å oppholde en hel japansk divisjon på Timor i mer enn seks måneder. Dette hadde forhindret japanerne i å bruke divisjonen ved andre frontavsnitt. På tross av at Portugal ikke var med i krigen var mange østtimoresiske sivile og portugisiske kolonister aktive i den allierte motstandskampen. Noen av de sivile fortsatte motstandskampen etter at de allierte styrkene hadde blitt evakuert.