Colts' første tur til Super Bowl på 36 år satte en ny rekord for lengste periode mellom to Super Bowls for et lag (siden slått av Kansas City Chiefs). Det var resultatet av en ni år lang gjenoppbyggingsprosess for laget. I 1998 draftet de quarterback Peyton Manning til å lede laget. Over de neste fire sesonger transformerte Manning, sammen med andre stjerner som receiver Marvin Harrison og running back Edgerrin James, laget til et av de beste angrepslagene i NFL, men laget slet med å finne et forsvar som kunne prestere konsekvent og endte alltid opp med enten tapende sesonger eller å bli eliminert fra sluttspillet i første runde. I 2002 sparket Indianapolis hovedtrener Jim Mora og erstattet ham med Tony Dungy. Dungy hadde utviklet et av ligaens beste forsvar som trener for Tampa Bay Buccaneers, og håpet var at han kunne gjøre det samme med Colts.