Thiago Alcântara ble født i den italienske byen Bari i 1991. Familien flyttet imidlertid tidlig, da henholdsvis til Spania og Brasil fordelt på ulike år. Dermed ble Thiago født i ett land, mens oppveksten foregikk i to andre land. Han viste tidlig talent og startet sin karriere i Flamengo. I en alder av 5 år flyttet han til Spania med faren, for å spille for Ureca.