Spanierne forsøkte ikke å kolonisere området før i 1770, da Gaspar de Portola, sammen med fransiskanerne Junipero Serra og Juan Crespi. De etablerte misjonsstasjonen Mission San Carlos Borromeo de Carmelo 3. juni 1770 i Monterey, samtidig som det ble etablert en annen i Alta California. Men misjonsstasjonen i Monterey ble snart en hovedstad for California, og hadde denne posisjonen fram til 1849. Da Ny-Spania gikk i oppløsing som følge av Mexicos uavhengighetskrig i 1821, ble Carmel en del av den nye staten Mexico. mini|left|Mission San Carlos Borromeo de Carmelo er i dag listeført i National Register of Historic Places og er et National Historic Landmark mini|290px|Stranden ved Carmel mini|290px|Bykart over Carmel, misjonsstasjonen er det grå området i overkant av det grønne mot sjøen nederst på kartet John Martin Welder kjøpte opp områdene rundt misjonsstasjonen i 1833, og ga dette navnet . Carmel ble en del av USA i 1848, da Mexico måtte overføre California som følge av den meksikansk-amerikanske krigen.