Ved kongelig resolusjon 28. august 1854 ble det bestemt at Senja og Tromsø sorenskriveri igjen skulle deles i to sorenskriverier: Senja sorenskriveri og Tromsø sorenskriveri. De delene av det gamle embetsarkivet som ikke "bequemmelig" kunne deles skulle "overgaae" til Tromsø sorenskriveri. Det hadde delvis vært ført separate arkivserier for de to distriktene. Dette gjelder for eksempel pantebøkene for hele perioden og skifteprotokollene etter ca. 1806. Også en del pakkesaker ble arkivert distriktsvis, f.eks. auksjoner fra 1803 og skiftedokumenter fra ca. 1806.