Frederick W. Lander ledet et vellykket angrep mot en konføderasjonsleir ved Bloomery Gap den 14. februar 1862, noen uker før han ble syk. Han døde i felten av lungebetennelse i Camp Chase ved Paw Paw 2. mars 1862 og ble begravd på Broad Street Cemetery i Salem i Massachusetts, nær hans foreldrehjem.