Støp-Bowitz arbeidet som konservator ved Zoologisk museum i Oslo og som førstelektor ved Universitetet i Oslo der han ble dr.philos. i 1970. Hans zoologiske forskning dreide seg om flerbørstemarker og meitemark. Støp-Bowitz var også president i Norvega Esperantista Ligo og medlem av det Internasjonale Esperantoakademiet (Akademio de Esperanto). Han publiserte mange arbeider innen zoologi og om språket esperanto, blant annet som hovedredaktør av utgitt i perioden fra 1965 til 1971. Carl Støp-Bowitz ble dessuten utnevnt til professor ved Det internasjonale universitetet i San Marino (Akademio Internacia de la Sciencoj San Marino).