Under krigen fulgte elevene ved Gyldenpris skole undervisning ved Ny Krohnborg skole. I 1944 ble skolebygningen revet på grunn av gjennomføringen av Michael Krohns gate. Fra og med 1945 ble Gyldenpris skoledistrikt lagt til Ny Krohnborg skole. Arkivet etter Gyldenpris skole er oppbevart ved Bergen Byarkiv.