Agders vassdragsnatur domineres av de seks store sørlandselvene: Sira, Kvina, Mandalselva, Otra, Tovdalselva og Nidelva. Nidelva har mesteparten av sine kildeområder i Telemark. Langs kysten av Agder ligger en rekke mindre vassdrag, hvorav Lygna og Audna, Vegårvassdraget og Gjerstadvassdraget er de største. Langs fylkesgrensa i vest ligger også de øverste delene av flere elver som renner vestover og inn i Rogaland.