Den 20. mai 1990 ble han ordinert til prest. Burger tilbrakte sine første år som prest i Tauberbischofsheim og Pforzheim. I 1995 var han først sogneadministrator og senere sogneprest i i Sankt Leon-Rot. Mellom 2004 og 2006, mens han fortsatt var sogneprest, studerte han for lisensiatagraden i kanonisk rett ved Universitetet i Münster.