Komagelva er kjent som ei meget god lakseelv. Laksen går helt inn til Bjørnskaret, 25 kilometer fra munningen. I tillegg er det også en stor bestand av sjørøye i vassdraget. Vassdraget er et viktig område for friluftsliv, som foruten sportsfiske omfatter jakt, bærsanking og fotturisme. Mesteparten av nedbørfeltet er upåvirket av tekniske inngrep, bortsett fra veien til Vadsø som krysser elva ved munningen, samt en del hytter og kjørespor i de nedre deler.