Innen biopati hevdes det at en av de viktigste årsakene til sykdom finnes i forholdet mellom menneskekroppen og dens mikroorganismer. Mennesker har flere bakterier i kroppen enn man har celler. Mesteparten av disse er viktige for vår overlevelse, som for eksempel den vennligsinnede bakteriefloraen i tarmsystemet. Kunnskapen om hvordan og hvorfor mikroorganismer kan forårsake kroniske degenerative sykdommer kalles «immunterapi» eller «symbioseterapi» innen biopati. Det kan omfatte kroniske infeksjonsfokus (tenner, mandler, bronkier, mellomøre, bihuler, underliv, urinveier osv.), dysbiose i fordøyelsen, generelt svekket immunforsvar og svekket evne til avgiftning.