Ferid Murads foreldre var Henrietta Josephine Bowman fra Alton i Illinois, og Xhabir Murat Ejupi, en albansk immigrant fra Gostivar i en del av Det osmanske rike som senere er blitt del av Nord-Makedonia. Faren endret sitt navn til John Murad etter å ha blitt sluset gjennom Ellis Island i 1913. Hans mor var baptist og rømte hjemmefra i 1935, da hun var 17 år, for å gifte seg med hans far, som var 39 og muslim. Murad var den eldste av tre sønner. Murad og brødrene ble oppdratt som katolikker. Han ble senere episkopalianer (anglikaner) da han gikk på college. Familien eide en liten restaurant da Murad vokste opp, og han hjalp i ungdomsårene til i familiebedriften.