I 1815 begynte Nagler på Wilhelmsgymnasium München. Åtte år senere begynte han å studere filologi og naturvitenskap. I 1829 tok han en filosofisk doktorgrad ved Universitetet i Erlangen. Siden 1827 hadde han eid et antikvariat sammen med sin kone Johanna Ehrentreich. Senere arbeidet han i , som på det tidspunktet var redigert av Joseph Heinrich Wolf.