Karl Otto Meyer vokste opp i Adelbylund ved Flensborg, hvor han gikk i mindretallets danske skole i Tarup (i Adelby sogn litt øst for Flensborg) 1934–1938. Han kom deretter på Duborg-Skolen i Flensborg 1938–1944 og gikk ut med præliminæreksamen. I noen få måneder (august–oktober 1944) gikk han på Sønderborg Statsskole, inntil han fik sin innkalling til det tyske militære.