Den første halvdelen av utdanningen på det femårige masterstudiet foregår hovedsakelig på Gløshaugen (hovedcampus), mens siste halvdel foregår på Marinteknisk senter (MTS), lokalisert på Tyholt. For øyeblikket er campus lokalisert på Moholt fordi MTS bygges om til Norsk havteknologisenter med nytt undervisnings- og kontorbygg, samt nye laboratorier.