Azuela flyttet til Mexico by i 1917, og bodde der resten av sitt liv. Der fortsatte han å skrive samtidig som han arbeidet som lege blant fattige. I 1942 mottok han en meksikansk nasjonal litteraturpris. Den 8. april 1943 var han med på å grunnlegge Colegio Nacional de México. I 1949 mottok Azuela den meksikanske nasjonale prisen for kunst og forskning. Han døde i Mexico by 1. mars 1952, i en alder av 79 år. Han ble gravlagt ved Rotonda de los Hombres Ilustres.