Etter at det ble avdekket at store summer som var bevilget av offentlige myndigheter til arbeidet med å etablere et barnehospice og palliativ omsorg for døende barn, var blitt brukt til andre formål, ble det innledet en granskingsprosess som førte til at Pedersen i januar 2023 ble sagt opp med umiddelbar virkning fra stillingen som generalsekretær. I Helsedirektoratets oppsummering av den eksterne granskingsrapporten ble det presisert at det ikke forelå indikasjoner på at noen hadde brukt midlene til personlig berikelse.