Den 17. mai 1940 ble han utsett til fransk øverstkommanderende og erstattet Maurice Gamelin påfølgende dag. Den 20. mai samme år nådde tyskerne frem til den engelske kanal. Weygands planlagte motangrep, som skulle bryte ut av omringelsen, mislyktes, hvoretter de allierte styrkene i Belgia ble innsirklet i en stadig mindre lomme rundt Dunkerque.