Fra 1864 utmerket han seg som pedagog, og foreleste i harmonilære, kontrapunkt og komposisjon ved musikkinstituttet i Warszawa. Hans musikk har nytt stor anerkjennelse i det polske samfunnet, og betraktes allment som eksemplarisk slavisk. Moniuszko døde plutselig i 1872 av et hjerteinfarkt, og ble gravlagt på Powązki-kirkegården i Warszawa.