I 2003 flyttet hun tilbake til Irak med økonomisk støtte fra feminist- og kvinnesaksgrupper i USA og Nederland. Da startet hun Organization for Women's Freedom in Iraq (OWFI). Organisasjonen har flere grupper i landet og driver kvinnehus for å gi beskyttelse til kvinner utsatt for familievold og æresdrap. Den arbeider mot trafficing og for å redde kvinner for seksuelt slaveri og prostitusjon. Yanar Mohammed er redaktør for det feministiske bladet (Likhet) som drives av organisasjonen.