Etter en profilert rettssak ble Green dømt av delstaten Utah den 18. mai 2001 for fire tilfeller av bigami og én for manglende betaling av barnebidrag. Denne avgjørelsen ble opprettholdt av Utah State Supreme Court i 2004. Han ble også dømt for barnevoldtekt, på bakgrunn av at han hadde impregnert hustruen Linda da hun var 13 år. Den aktuelle hustruen var hans stedatter før de ble gift; hun var datter av hans første polygamihustru. Totalt sonet han seks år i fengsel og ble løslatt i 2007.