Den sivile versjonens prototype fikk modellnummeret , og gjennomførte sin første flyvning 16. september 1958. Det var drevet av to General Electric YJ85 turbojet-motorer. Typen fikk sin FAA sertifisering i april 1963. UTX-kandidaten, benevnt , var en identisk konfigurasjon til NA-265, men da kontrakten ble tildelt, og T-39A ble satt i produksjon, var den drevet av to Pratt & Whitney JT12A-8 turbojet-motorer.