Willerslev er idag professor II på Kulturhistorisk Museum. Fra 2013 til nå har han ledet ARTS arktisk forskning fokus og koordinert tverrfaglig arktisk forskning ved Aarhus Universitet Arctic Research Centre. I 2013 ble han tildelt en Jens Christian Skou Fellowship ved det nyetablerte Aarhus Institute for Advanced Studies. To ganger (2006 og 2010), har han blitt tildelt eliteforskningspriser af Danmarks Frie Forskningsråd, og han har gitt den prestisjetunge Malinowski Memorial Lecture på LSE i 2010. Han er forfatter og medforfatter av en rekke artikler og bokkapitler, vitenskapelige monografier, og har redigert flere antologier og spesielle utgaver av magasiner. Siden 2007 har han vært medredaktør av Acta Borealia: Nordic Journal of Circumpolar Societies. Han er også redaktør og medredaktør av tre bokserien: Etnografi, teori, Experiment (Berghahn Books) og Studies in Death, Materiality and Time og Culture, Environment and Adaptation in the North (begge Ashgate Publishing). I 2007 blev boken Soul Hunters: Hunting, Animism, and Personhood among the Siberian Yukaghirs (University of California Press) publisert, som har blitt brukt mye for sin innovative teoretiske nytenkning av animisme.