Direktør for Justismuseet fra stiftelsen i 2001 har vært Johan Sigfred Helberg. Han gikk av med pensjon i 2017. Brynja Björk Birgisdottir. var direktør fra januar 2018, til hun ble direktør for Sverresborg mars 2019. Åshild Karevold overtok direktørstillingen i mars 2019.