Den 12. oktober 1798 forsøkte en større fransk styrke bestående av mann, og også Wolfe Tone selv, å gjøre landgang i grevskapet Donegal nær havinnløpet Lough Swilly nord på øya Irland. Den ble fanget opp av en større skvadron fra den britiske marinen, og overga seg til slutt etter en tre timer lang kamp uten å komme i land på irsk jord. Wolfe Tone ble stilt for krigsrett i Dublin og funnet skyldig. Han ba om døden ved skyting, men da dette ble avslått, snytt Tone bøddelen ved å skjære over sin egen strupe i fengselet 12. november, og døde en uke senere. I ettertid er det også hevdet at det ikke var et selvmord, men at han ble myrdet.