Makienok Christoffersen fikk sin offisielle landslagsdebut for i en VM-kvalifiseringskamp mot den 22. mars 2013, hvor han kom inn som innbytter for Andreas Cornelius. Han scoret ett mål mot (1–1) under firenasjonerscupen King's Cup i Thailand i januar 2012, men det danske fotballforbundet regner ikke denne kampen som offisiell.