Etter hvert kommer Link seg ned til Hyrule og finner Mestersverdet. Han invaderer Forsaken Fortress nok en gang og beseirer Helmaroc King. Link og Ganondorf møtes igjen i huset hans på toppen av tårnet. Der avslører Ganondorf at mesteparten av hans krefter var låst vekk av Mestersverdet, og i det samme Link trakk det opp ifra pidestallen slapp han fri alle hans krefter. Dessuten hadde han sørget for å uskadeligjøre det hellige sverdet ved å drepe vismennene som gav det sin kraft for lenge siden. Ganondorf tar fram sitt eget sverd og skal til å drepe Link, men han blir distrahert av Tetra som hopper oppå ham og begynner å angripe fjeset hans. Ganondorf overmanner henne raskt, men når hans Triforce of Power resonerer med hennes Triforce of Wisdom skjønner han at endelig har funnet Zelda. Før han får gjort noe mer blir begge to reddet av Quill og Komali, og før han får sukk for seg kommer Valoo og flamberer hele toppen av tårnet.