Målet til IMF-teamet er å løse en kidnappingssak, ettersom en terrorgruppe ved navn «Sinister 7» har kidnappet både en kjent vitenskapsmann og Shannon Reed, en annen IMF-agent. Jakten foregår sted fra kanalene i Venezia til de sveitsiske alpene, og teamet skal infiltrere en rekke fiendtlige fleretasjes installasjoner i jakten på gislene.