Gortyn hadde et meget godt forhold til den hellenistiske farao Ptolemaios IV Filopator i Egypt, og fikk ytterligere en vekst i den romerske perioden. Da den var i allianse med Romerriket unngikk byen de katastrofer som skjedde med andre byer på Kreta under romernes invasjon og krigføring i 68 f.Kr.