Han ble ordinert til diakon av biskopen av Brentwood, Thomas McMahon, den 14. mai 2011 i i Wanstead, og ble ordinert til prest for den 11. juni samme år i . Fra 2011 til 2015 fungerte Waller som menighetsadministrator ved i Ilford. Fra 2015 var han sokneprest for i Chingford. Han var også president for styringsrådet for det personlige ordinariat til og som dekan for Sørøst-England og, fra 2020, som generalvikar for ordinariatet.