Da NSB ble delt inn i gods- og persontog samtidig som man fikk nye motorvognsett, begynte El 16 å forsvinne fra passasjertogene. I 2002 ble seks lokomotiver solgt til Svenska Tågkompaniet, hvor fire av dem siden ble solgt videre til Trafikaktiebolaget Grängesberg-Oxelösunds Järnvägar (TGOJ). I 2007 ble disse seks lokomotivene solgt tilbake til Norge og CargoNet. Den 22. juni 2006 ble nr. 2216 ødelagt i en brann i Sverige, og den 14. juli samme år gikk nr. 2207 tapt i en brann, også det i Sverige. Den 2. oktober 2021 brant nr. 2206 ved Sarpsborg stasjon.