I 1579 utsendte han nok en ekspedisjon mot sør, under ledelse av kaptein Gabriel de Ribera, til Mindanao og Jolo, for å sikre seg at morogolket virkelig underkastet seg spansk overhøyhet. Han dro til Rio Grande, men fant der bare restene av forlatte landsbyer. Han etablerte så en befestning for befolkningen og dro nordover for å nedkjempe de opprørske butuanoner. På vei tilbake mot Luzon møtte Ribera noen innfødte fra Jolo som bare kunne yte en liten tributt; de sa at de hadde lite å gi til spanjolene ettersom portugiseren Estevan Rodriguez de Figueroa nylig hadde angrepet deres bosettinger.