I 1681 gikk han av fra begge disse stillingene og ble etterfulgt som postmester av Christian Stockfleth. I stedet ble han utnevnt til mønster- og kommisjonskommissær i Christiania stift. Fra 1684 til 1687 var han igjen postmester, idet stattholderen bortforpaktet postverket til Boyesen for tre år for 3000 riksdaler i året. Forpaktningen ble ikke fornyet i 1687, da hans nevø Peter Grüner overtok stillingen. Boyesen ble i stedet utnevnt til generalveimester i det sønnenfjelske Norge. Som veimester lot han blant annet bygge en ny vei mellom Brevik og Kristiansand, og fikk satt opp uthuggede milesteiner langs veiene. Han fikk tittelen justisråd i 1702 og overlot veimesterstillingen til sin sønn Ulrik Frederik Bøyesen Schøyendal samme år.