Kibbutz Dan ble grunnlagt i 1939 av jødiske bønder fra Transilvania. De hørte til Hashjomer Hatzair-bevegelsen. I 1947 var folketallet 340. Dan var en av to landsbyer som ble grunnlagt til ære for Menachem Ussishkin. Den ble kalt opp etter den israelittiske byen Dan, som er nevnt i 1. Kongebok 12:29, 1. Samuelsbok 3:20 og 1. Mosebok 14:14, og som er identifisert som den nærliggende Tel Dan. Kibbutz Dan ligger i området til den israelittiske Dan-stammet (Josva 19:47). Han led store tap under den arabisk-israelske krigen 1948 under den syriske invasjonen.