Alonso deltok ved Liverpools sterke høstsesong. I løpet av høsten 2008 fikk fire motspillere røde kort etter taklinger av spanjolen. Alonso bidro blant annet med en scoring i borteoppgjøret mot Chelsea som Liverpool vant 1-0. I løpet av høsten kåret også Setanta til å være den første spilleren i Premier League som passerte 1000 vellykkede pasninger. Sommeren 2009 gikk han til Real Madrid.