Flagget minner om flagget til Røde Kors. Opprinnelig var flagget identisk med Røde Kors' flagg, men for å unngå forvirring ble det endret til dagens flagg. Flagget har vært i bruk siden 1864, men ble offisielt tatt i bruk i 1875. I Tongas grunnlov står det at flagget aldri skal endres.