I junior-NM i friidrett 2013 vant han 110 meter hekk, høydehopp og lengdehopp, og fikk sølv i tresteg, bak Marius Bull Hjeltnes. Han deltok i Nordisk juniormesterskap i friidrett 2013 (U20) i Esbo kom han på fjerdeplass i lengdehopp, med 7,06 meter. I tillegg kom han på sjetteplass på 110 meter hekk, og han deltok på Norges lag som kom på andreplass på 4 x 400 meter stafett. Warholm løp her sammen med Håkon Høye, Joachim Sandberg og Markus Loftås.