Hans liberale synspunkter innen den gammeltestamentlige eksegese førte til at han ble kirkerettslig suspendert. Han ble så i 1893 tilvist oppgave som huskapellan for en søsterkonvent i Rennes; dette embede innehadde han til 1930. Under disse årene levde han tilbaketrukket, preget av vitenskapelig arbeide som dogmatikkhistoriker ogutviklet seg til fagmann innen patristikk.