I 2010 avslørte Ekroll hvordan sensitiv og detaljert informasjon om de hemmelige tjenestene og Regjeringens krigshovedkvarter var kompromittert på grunn av sikkerhetssvikt og manglende rutiner i statsforvaltningen. I 2013 kom det fram at Ekroll var én av ni journalister Etterretningsbataljonen i Forsvaret hadde kartlagt ulovlig. Kartleggingen ble satt i sammenheng med journalistenes arbeid med etterretningstematikk. Datatilsynet konkluderte i september 2014 med at bataljonens registreringer var i strid med Personopplysningsloven, og ila derfor Forsvaret et gebyr på 75 000 kroner for å ha krenket journalistenes rett til privatliv. Samme måned fikk Forsvaret kritikk av OSSEs høykommissær for mediefrihet, som uttalte at kartlegging av uavhengige journalister «aldri kan rettferdiggjøres».