I 1355 ble den syv år gamle Margarete gift med Filip av Rouvres, barnebarn og arving av Eudes IV av Burgund. Filip var elleve år gammel og hennes tremenning. Han var greve av Burgund og Artois (1347–1361), hertug av Burgund (1350–1361) og ble greve av Auvergne og Boulogne (1360–1361).