Innenfor alternativ medisin har håranalyse som metode vært benyttet i flere tiår, og metoden kalles da ofte for . Det er da vanlig at det påståtte spekteret for diagnostisering utvides betydelig, deriblant å kunne påvise en pasients behov for vitaminer og mineraler og determinere pasientens generelle helsetilstand. Normalt brukes da analysene til å anbefale kjøpt av unødvendige kosttilskudd. I 1985 viste en omfattende test fra USA at friske personer ble tildelt alvorlige diagnoser gjennom alternativt anvendt håranalyse, og senere kontroller av slike håranalyser har medført at American Medical Association har frarådet all bruk metoden fordi den mangler vitenskapelig forankring og antas å være ulovlig. Til tross for at metoden er klassifisert som uegnet for diagnostisering, er den fortsatt meget utbredt, og også i Norge finnes det mange alternative terapeuter som tilbyr håranalyse. I 2014 ga Statens helsetilsyn en advarsel til en helsefagarbeider som hadde brukt håranalyse som diagnostikk og grunnlag for anbefaling av kosttilskudd. I 2016 sendte journalister fra VG inn hår fra samme person til tre separate tester, og fikk tre svært forskjellige resultater.