Som førstevoterende under høyesterettssaken mot Vidkun Quisling leste han opp dødsdommen. Som høyesterettsdommer i rettsoppgjøret etter krigen ble Fougner kjent for et nyansert syn, og ytret i saken mot Øystein Ravner (siktet for sin bistand som «kommissarisk» statsråd ved forsyningsdepartementet 1940-42) tvil om Nasjonal Samlings tiltak hadde vært til skade for Norge. Fougner sa under rettssaken i oktober 1947 også at Ravner som sjef for forsyningsdepartementet «». Ravner ble frikjent.