Motrøen spilte for Tynset ut 1992-sesongen hvorpå han forlot den daværende 3. divisjonsklubben til fordel for Eliteserie-klubben . Han spilte nesten to år på hovedstadsklubbens rekruttlag Lyn 2 før han på høsten i 1994 ble tatt opp i A-stallen.