Lodge giftet seg i 1877 med Mary Marshall som han hadde kjent fra de var barn. De fikk tilsammen tolv barn, seks døtre og seks sønner. Etter at han hadde trukket seg tilbake fra stillingen i Birmingham, flyttet han til Wiltshire hvor han ble til sin død i 1940. Der er også han og hans kone begravet, ikke langt fra Stonehenge.