Lundgren var mellom 1994 og 2011 gift med Anette Qviberg, svensk smykkedesigner og motestylist. Paret har to døtre, Ida Sigrid Lundgren (født i april 1996) og Greta Eveline Lundgren (født i januar 2002). I juli 2023 giftet han seg med norske Emma Krokdal.