Etter at Arnold Rüütel ble valgt til Estlands president i 2001, var partiet ledet av utenriksminister Villu Reiljan. Velgeroppslutningen sviktet utover 2000-tallet. Rüütel tapte presidentvalget i 2005, og partiet falt for sperregrensen ved parlamentsvalget i 2011. Fallende oppslutning gjorde at man ønsket å slå sammen partiet med Det sosialdemokratiske partiet i 2010, men bare et mindretall støttet forslaget. Mange partimedlemmer meldte selv overgang til Det sosialdemokratiske partiet eller Det estiske senterpartiet. Estlands folkeunions representanter i Riigikogu meldte også overgang til andre partier.