Moskushjort er klassifisert som en truet art av Verdens naturvernunion, som lister den som sårbar. Den jaktes hovedsakelig for sine moskuskjertler, som er kjent for duftsubstansen musk som inngår i noen svært kostbare parfymer. Musk selges for opp mot 45 000 amerikanske dollar kiloet. Bare noen få tidels gram kan utvinnes fra kjertlene til en voksen hann. Det er også mulig å fjerne kjertelen uten å avlive dyret, men dette gjøres sjelden.