Hanssen fortsate sin informantvirksomhet i 1985 da han formidlet navn på KGB-folk som var blitt dobbeltarbeidere for FBI. I sin mest aktive periode (1985–1991) var han først tilknyttet FBI i New York og deretter FBI-hovedkvarteret i Washington, og skal ha solgt flere og mer sensitive hemmeligheter til Sovjetunionen enn i noen annen amerikansk-sovjetisk spionasjeaffære noensinne.