Over Jamesons femti-års periode, bygget han opp en stor samling av mineralogiske og geologiske prøver for Edinburgh Universitys museum,inkludert fossiler, fugler og insekter. I 1852 det var over 74 000 zoologiske og geologiske prøver i museet, og i Storbritannias naturhistorisk samlinger var andre bare til at av British Museum. Kort tid etter hans død ble University Museum overført til den Britiske Kronen, og ble en del av den Kongelige Skotske Museum, nå Skottlands nasjonalmuseum, Edinburgh Chambers Street. Han var også en produktiv forfatter av vitenskapelige artikler og bøker, blant annet (1800), hans (1808), som kom ut tre utgaver. I 1819, sammen med sir David Brewster (1781-1868) startet Jameson og ble redaktør i 1824.