Elven Luni, med sideelver, er det største systemet av elver i regionene Godwar og Marwar. De renner fra de vestlige fjellsidene av Aravallifjellene ned til de våtmarkene Rann of Kutch i Gujarat. Elven Ghaggar som stammer fra Haryana renner ut i ørkenen. Den er tidvis uttørret.