Etter bruddet ga Morrissey ut en del suksessfulle soloalbum. Han ble i 1990-årene anklaget for rasisme, på bakgrunn av sanger som «Bengali In Platforms» og «National Front Disco». Dessuten var han ubetenksom med bruken av det britiske flagget under den første gjenforeningskonserten til Madness i Finsbury Park. Et førstesideoppslag i musikkavisa NME førte til at han nektet å snakke med bladet på mange år.