Gellert led av dårlig helse, og en utpreget hypokondri hjalp heller ikke. Under syvårskrigen prøvde han å bearbeide sin traumatiske opplevelser i (1757), men verken kurer eller reiser til Berlin, Karlsbad eller Dresden kunne bedre humøret hans. Mens han arbeidet på , forverret helsen seg betydelig, og han døde i en alder av 54 år. Han ble bisatt ved i Leipzig, og etter en del omflytting hviler nå levningen hans på gravplassen i Leipzig (1. avdeling).