Bukharaskruegeit hører naturlig hjemme i Afghanistan, Tadsjikistan og Usbekistan. I dag finnes den kun i to eller tre spredte populasjoner i Kugitangfjellene, i grensestrøkene mellom Turkmenistan og Usbekistan, i et område mellom elvene Pyandsj og Vakhsj i Tadsjikistan, og i den nordvestre delen av Darwashalvøya i Afghanistan, nær grensen mot Tadsjikistan.