Hun klarte etter sammenbruddet i 1945 å komme seg igjennom de russiske linjene forkledd som mann og over til amerikansk-kontrollert område hvor hun ble arrestert i juni 1946 i München. I forhørene bekreftet hun Martin Bormanns døde som privatsjåføren Erich Kempka var vitne til og fortalte om straks etterpå. Junge kunne ikke bekrefte Gestapo-sjef Heinrich Müllers død og hun uttalte at kjente ham ikke før han kom til bunkeren 22. april 1945- Etter forhør ble hun løslatt etter 6 måneder. Hun ble senere løslatt med begrunnelsen at hun var for ung til å skjønne rekkevidden av sine handlinger.