Etter Tysklands gjenforening fikk Kreis Hoyerswerda tilbake sin status som Landkreis i henhold til tysk kommunalrett. Fra og med 1990 ble største delen av kretsen overført fra Brandenburg, i den tidligere Bezirk Cottbus, til Sachsen. Under kretsreformen i Sachsen i 1994 og 1996 ble den sammen med Kreis Kamenz slått sammen til Landkreis Kamenz, mens byen Hoyerswerda fortsatte som en kretsfri by og kommunen Uhyst ble overført til Niederschlesischer Oberlausitzkreis. Under kretsreformen i Sachsen i 2008 ble Landkreis Kamenz, Landkreis Bautzen (1994–2008) og den kretsfrie byen Hoyerswerda slått sammen til den nye Landkreis Bautzen.