I en alder av 22 år ble Mollison instruktør ved (CFS), og igjen satte han rekord ved å være den yngste i denne rolle. Kort tid etter ble han overført til RAFs reservestyrke, nå kunne han bruke all sin tid på sivil luftart. I 1928–29 arbeidet han som instruktør for i Adelaide, men forlot jobben for å bli pilot i og Australian National Airways.