Verdens helseorganisasjon (WHO) og Nasjonalt kunnskapssenter for helsetjenesten anser kiropraktorbehandling for å være en forholdsvis trygg behandlingsform uten nevneverdige varige bivirkninger hvis utført av autorisert kiropraktor.. Mildere forbigående bivirkninger som lokal ømhet, hodepine og slitenhet forekommer ofte etter ulike typer manuell behandling .. Alvorlige bivirkninger som kardiovaskulære slag, lammelse og dødsfall har vært rapportert, men anslås som svært sjeldent.. Det er derimot vanskelig å fastslå eksakt risiko da disse bivirkningene er meget sjeldene. Kasus-kontrollstudier viser at plutselig kardiovaskulære slag skjer like ofte hos andre behandlere i primærhelsetjenesten, hvor aktiviteter og hendelser som fører til kraftige nakkebevegelser blir trukket fram som mulige årsaker . Det er innført generell rapportering av bivirkninger hos kiropraktorer på rutinebasis i mange land, men det er fremdeles en uakseptabel underraportering av bivirkninger og interessekonflikter i randomiserte kontrollerte studier.