Anandarayar ble etter sin teologiske utdannelse presteviet den 21. desember 1971. Han fullførte så doktorgradsstudier i misjonsvitenskap og kirkerett. Fra 1981 underviste han ved det pavelige seminar St. Peter i Bengaluru og var dets viserektor (1982–1990) og rektor (1990–1996).