Puntland grenser til Somaliland i vest, Adenbukten i nord, Guardafui-kanalen i nordøst, det somaliske havet i sørøst, den sentrale Galmudug-regionen i sør og Etiopia i sørvest. Det er flere store geografiske severdigheter i Puntland, inkludert Cape Guardafui som danner spissen av Afrikas Horn, Ras Hafun det østligste stedet på hele det afrikanske kontinentet, og begynnelsen av Karkaar-fjellkjeden. Puntland har også den nordligste storbyen i Somalia, Bosaso.