Han tok eksamen artium i 1965 og studerte medisin ved Universitetet i Münster (Westfalen, Tyskland) og Universitetet i Oslo. Han var deretter militærlege (forskningsoppgaver) knyttet til Kontoret for katastrofepsykiatri, fulgt av klinisk tjeneste ved universitetets psykiatriske klinikk, Vinderen og Gaustad sykehus, der han utdannet seg til spesialist i psykiatri. Han har spesielt arbeidet med psykiske aspekter ved legemlige sykdommer og skader (psykosomatisk medisin, konsultasjon-liaison psykiatri, post-traumatisk stress) og stemningslidelser (bipolare spektrum lidelser). Han har vært hovedredaktør for flere lærebøker i psykiatri, sist Lærebok i psykiatri. Oslo: Gyldendal akademiske 2020 og medredaktør i studentutgaven fra 2021. Han har også vært hovedansvarlig for innføringen av diagnostiske intervjuer med tanke på psykiatriske diagnoser i psykiatri i Norge og var den eneste nordmannen som var involvert i utarbeidelse av diagnostiske kriterier for den 10de utgaven av det internasjonale klassifikasjonssystemet for psykiske lidelser. Malt har vært faglig ad hoc rådgiver om depresjoner for WHO og EU (under det Belgiske presidentskap) og vise-president i Verdens Psykiaterforenings utvalg for farmakoterapi. Han er æresmedlem i Scandinavian College of Neuropsychopharmakology (hvor han var president fra 1995–2000) og i European Association of Psychosomatic Medicine.