Sammen med Francis Pratt grunnla han motor- og industriverktøyprodusenten Pratt & Whitney i 1860 for å produsere verktøymaskiner for konstruksjon av symaskiner og våpen samt våpenproduksjonsutstyr til bruk av Unionshæren under den amerikanske borgerkrigen. Han etablerte framgangsmåter som førte til en vellykket opptrening av lærlinger i selskapet og ble administrerende direktør før han tilslutt gikk av med pensjon i en alder av 69 år i 1901, da Pratt & Whitney ble tatt over av Niles-Bement-Pond Company.