Utgravninger ble foretatt av Dorothy Garrod sommeren 1928 og avdekket bevis på en sen epipaleolitisk natufisk kultur, karakterisert av nærværet av tallrike steinredskaper (mikrolitter), menneskelige begravelser og verktøy for grunnstein. Skhul representer også et område hvor neanderthalere kan ha levd for mellom 200,000 og 45,000 år siden ago, parallelt med mennesker for 100,000 år siden. Grotten har også lag fra midten av paleolitikum.