Deretter angriper Mothra, og Yuri intervjuer Hirotoshi Isayama - en eldre mann som forklarer legenden om de tre monstrene Baragon, Mothra og Ghidorah. Godzilla går senere i land og angriper Bonin-øyene, og etterlater seg få overlevende. Godzilla dukker opp igjen, og Yuri blir skadd. Det japanske militæret sender flere jagerfly for å angripe Godzilla, men alle blir raskt utslettet. Tachibana setter opp en ny forsvarslinje ved Yokohama i ett forsøk på å hindre videre ødeleggelser. Mothra og Ghidorah våkner også, for å slåss mot Godzilla.