Schjønning-Larsen er født og oppvokst i Danmark, med dansk far og estisk mor. Som tenåring spilte han i de aldersbestemte klassene for AB Youth og . Frem til sommeren 2018 bodde han i Danmark og spilte for de to overnevnte aldersbestemte danske lagene, samtidig som han spilte og trente med Estlands aldersbestemte landslag. Han flyttet så til sine besteforeldre i Estland sommeren 2018, og gikk den 1 juli. 2018 inn i sitt U21 lag.