De resterende 151 kilometerne flyter Nišava hovedsakelig i en vestlig retning og passerer Dimitrovgrad, Pirot, Bela Palanka, Niška Banja og Niš; en av de største byene i Serbia. 10 kilometer etter Niš løper Nišava sammen med Južna Morava. Etter Niš' raske vekst de siste tiårene er nå elvens bredder urbanisert nesten helt til munningen.