Jernbanestrekningen forbi Værnes åpnet 27. oktober 1902, som en del av Hell–Sunnanbanen – idag en del av Nordlandsbanen. Planene for en jernbanestasjon i forbindelse med terminalen på Værnes ble lansert i 1990, sammen med planer om å bygge en ny terminal. Byggingen av den nye terminalen startet 1. oktober 1992. 15. mars 1993 kunngjorde NSB at de ville starte en pendlertogrute mellom Steinkjer og Melhus, sør for Trondheim. Den nye ruta vil gi en halvtime kortere reisetid i rushtiden mellom Stjørdal og Melhus, og en times kortere reisetid videre til Steinkjer. NSB opplyste at konseptet var basert på suksessen til Jærbanen og at de håpet å ha en 70% økning i antallet passasjerer, delvis på grunn av åpningen en holdeplass på av flyplassen. Det nye konseptet vil også dra nytte av utvidelse av Trondheim sentralstasjon, som samlokaliserte de viktigste buss- og togstasjonen i Trondheim sentrum. Ruta ville gjøre det lettere å reise videre langs Dovrebanen til Oppdal og Rørosbanen til Tynset. Det ble anslått at toget ville få en 10% markedsandel på strekningen. Den nye pendlertogruta startet 1. september 1993.