I 1477 giftet Leonardo seg for andre gang med Francesca Marzano, et (uekte) barnebarn av kong Alfonso V av Aragon. Hans sønn Ferdinand I regjerte nå i Napoli. Ifølge historikeren William Miller trodde Leonardo at venetianerne ikke ville søke kontroll over De joniske øyer hvis han hadde familiebånd til Napoli. Da osmanene fant en unnskyldning for å invadere også øyene, var det imidlertid ingen fra det italienske fastlandet som ønsket å yte motstand. Leonardo flyktet med sin kone, sine tre barn og sine verdisaker, først til Taranto og deretter til Napoli. Osmanene underla seg Keffalonia, Lefkada og Zante, og også Vonitsa, i 1479.