Savisaar pådrog seg våren 2015 en streptokokkinfeksjon, som endte med at han måtte amputere en fot. Han ble stilt for retten i 2018, men rettsforhandlingene ble avsluttet før det kom til noen dom, ettersom Savisaar fortsatt var alvorlig syk. Høyesterett avgjorde samme år at rettsforhandlingene ikke ville bli gjenopptatt. Saken ble endelig formelt avsluttet i 2020.