Lagesen var rektor ved Journalisthøgskolen fra 1990 til 1994. I 1992–94 var han leder i rektorkollegiet for Høgskolen i Oslo og Akershus. I den nye Høgskolen i Oslo var han prodekan, seniorrådgiver og tilslutt prorektor før nådd pensjonsalder i 2006.