Rupert av Pfalz ledet 11. januar 1649 åtte underbemannede skip til Kinsale i Irland i et forsøk på å forhindre at parlamentet skulle ta Irland fra rojalistene. Blake la Ruperts flåte under blokade i Kinsale fra 22. mai, noe som gjorde at Oliver Cromwell kunne gå i land ved Dublin den 15. august. Blake ble fordrevet av en storm i oktober og Rupert flyktet via Spania til Lisboa hvor Rupert utvidet sin flåte til tretten skip. Blake gikk ut til sjøs med tolv skip i februar 1650 og ankret opp utenfor Lisboa i et forsøk på å overtale den portugisiske kongen til å utvise Rupert. Etter to måneder bestemte kongen seg for støtte Rupert. Ytterligere fire krigsskip under Edward Popham sluttet seg til Blake, og Popham førte med seg autoritet til å gå til krig mot Portugal.