Hanssen ble med tiden mildt refsende overfor russerne, og uttrykte frustrasjon over at han ikke hadde muligheter til å forpurre amerikanernes avsløring av agenten Stanislav Borisovitsj Gusev i 1999. Amerikanerne hadde oppdaget avlyttingsutstyr inne i sitt utenriksdepartement, men hadde ennå ikke avslørt hvem som stod bak, og Hanssen klarte ikke å advare russerne.