Programmet ble startet i 1939. I 1941 hadde T4 blitt allment kjent og det kom protester fra byråkratiet, privatpersoner og representanter for forskjellige kirkesamfunn. Etter hvert fikk spesielt protester fra katolsk hold betydning. Det er antatt at spesielt biskop Clemens August Graf von Galen av Münsters aktiviteter og evne til å påvirke opinionen med en rekke markante prekener, fikk Adolf Hitler til å gi ordre om opphør av Aktion T4 den 24. august 1941. Da programmet ble offisielt avsluttet var mer enn 70.000 personer avlivet. Trolig ble et like stort antall drept uoffisielt etter denne datoen.