Manning vant flere priser som senior; han ble enstemmig valgt til All-American og vant blant annet Maxwell Award, Davey O'Brien Award, Johnny Unitas Award og ESPY for Best College Player. Han endte på andreplass i avstemningen for Heisman-troféet, bak Charles Woodson. I 2005 pensjonerte Tennessee Mannings trøyenummer (Nr. 16). En av gatene som leder opp mot Neyland Stadium har blitt omdøpt "Peyton Manning Pass". Manning avsluttet sin siste sesong ved Tennessee med 3 819 pasningsyards, 36 touchdowns og 11 interceptions. Manning utmerket seg også akademisk ved University of Tennesse og ble valgt inn i Phi Beta Kappa Society i 1997 og ble tildelt National Football Foundation National Scholar-Athlete Award.