I de følgende år var han ansvarlig for organisasjon og gjennomføring av en rekke bispesynoder. Foruten dette var Tomko fra tidlig i 1970-årene med på den økumeniske dialog med lutheranerne og med undervisning ved Gregoriana. Derutover var han sjelesørger i forskjellige menigheter i Roma og engasjerte seg for slovakiske utenlandsmenigheter, fremfor alt i USA.