I Cincinnati skrev Burnet en rekke artikler for om sin tid blant indianerne. Burnet virket som jurist i en årrekke før han førte om Stephen F. Austins vellykkede koloni for , og da dro han tilbake til Texas. Burnet bosatte seg i San Felipe, hovedkvarteret for Austins koloni, i 1826. De neste 18 måneder gav han juridisk hjelp til de 200 nybyggerne der og organiserte den første presbyteriandle søndagsskole i Texas. Han var dypt kristen, og verken drakk eller bannet, og hadde alltid med seg en Bibel i lommen i all sin ferd.