Fra 1919 til 1922 studerte han landbruk ved Technische Hochschule i München, og arbeidet et år ved en gjødselfabrikk i Schleissheim. Han tok kurs i russisk og forhørte seg i den sovjetiske ambassaden om mulighetene for å forvalte gods i Ukraina. I løpet av studietiden beveget han seg bort fra sitt katolske ståsted, og ble tiltrukket av paganistiske miljøer og ble etterhvert medlem av et slikt broderskap. Gjennom kontakter i Freikorps ble han involvert i de radikale og antisemittiske foreningene Artamanene og Thuleselskapet. Himmlers tenkning skal ha vært innenfor ariosofi og en overbevisning om den ariske rasens overlegenhet og germanisme, delvis utviklet fra hans egen tolkning av de gamle teutoniske stammenes folklore og mytologi.