I 1586 ble mer enn to tredjedeler av byen ødelagt av brann, og flere kriger i regjeringstiden til Ludvig XIV av Frankrike førte til dårlige økonomiske kår for Neuss. Byen ble gradvis en mindre viktig handelsby og fra midten av 1600-tallet var Neuss stort sett bare viktig på grunn av jordbruket sitt.