Eugen Seiterich ble født som den eldste sønn til den storhertuglige hoffvognmannen Franz Seitenich og hans hustru Adelheid née Müller. Hans bror Ludwig Seitenich (1904–1979) var senere distriktsadministrator i Waldshut og Konstanz. Eugen Seiterich tilbrakte sin barndom og ungdom i Karlsruhe og ble uteksaminert fra der i mars 1921.