I 1966 ble SCSA (Supreme Council of Sport in Africa) dannet i Bamako og denne organisasjonen sto som ansvarlig for panafrikanske leker frem til 2013. De andre lekene ble tildelt Mali i 1969, men et militærkupp gjorde at lekene måtte kanselleres. Lagos i Nigeria overtok som arrangør i 1971, og de ble endelig arrangert i 1973 etter Biafrakrigen. I 1977 ble de tredje lekene planlagt å arrangeres i Algerie, men av tekniske årsaker ble de utsatt et år, og ble arrangert i 1978. Også senere leker ble utsatt; de fjerde lekene skulle arrangeres i Kenya i 1983, men ble først utsatt til 1985, og ble til slutt arrangert i Nairobi i 1987. I januar 2012 ble det besluttet at lekene skulle hete .