Buonamente var katolsk prest og medlem av Fransiskanerordenens . Fra omtrent 1622 sto han i tjeneste hos fyrstefamilien Gonzaga i Mantova. Tidlige påvirkningskilder var sannsynligvis Salamone Rossi og Claudio Monteverdi. Mellom 1626 og 1630 var han ved som keiserlig kammermusiker og komponist. I 1627 medvirket han ved kroningsseremonien til keiser Ferdinand III av Det tysk-romerske rike i Praha. Buonamente var fiolinist ved kirken i Parma i året 1632, året etter ble han i Assisi, der han ble til sin død.