Haukedalen kirke er nå sammen med Holsen kirke sognekirker i Holsen og Haukedalen sogn i Sunnfjord prosti. Tidligere hadde gudshuset i Haukedalen status som kapell under Holsen, og før Haukedalen fikk eget kapell på slutten av 1600-tallet sognet folket i området til Holsen kirke. Kapellet fra 1600-tallet ble revet i forbindelse med byggingen av dagens kirke. En altertavle fra 1673 som hang i gamlekirken er nå i samlingen til Sunnfjord Museum.