Før Quezon City ble opprettet hadde området den dekker en rekke små byer, som San Francisco del Monte, Novaliches og Balintawak. Den 23. august 1896 initierte selvstendighetsgruppen Katipunan, under ledelse av sin , den filippinske revolusjon mot det spanske rike i Melchora Aquinos i Pugad Lawin (nå kjent som Balintawak).