Doherty døde 25 år gammel under sultestreiken i Maze fengsel, også kjent som Long Kesh. Han hadde da ikke tatt til seg næring på 73 døgn, hvilket var den lengste tiden noen av de sultestreikende holdt ut, og bare ett døgn mindre enn Terence MacSwiney. Under sultestreiken ble han valt inn i Dáil Éireann for Cavan-Monaghan på den uavhengige listen Anti H-Block.