Det hele begynner 24. juli 1998. Mange groteske mord har foregått i fjellene. Mennesker blir angrepet av folk i grupper inni deres egne hus og bevis tyder på at ofrene trolig ble spist. Bravo Team blir sendt for å undersøke mordene, når kontakten til laget forsvinner så blir Alpha Team sendt ut for å finne Bravo Team og for å undersøke mordene i fjellene. De finner helikopteret til Bravo Team nede. De finner ingen overlevende, men de finner en avsagd hånd. Helt uventet blir Alpha Team angrepet av aggressive hunder (kalt «Cerberus» i spillet, oppkalt etter navnebroren fra Romersk Mytologi) og hundene dreper Joseph Frost. Laget som nå består av Chris, Jill, Barry og Wesker flykter inn i et stort hus de tror er forlatt. Inne i huset hører de et skudd bli avfyrt. Her velger spilleren om en vil velge å spillet som Chris Redfield eller Jill Valentine. Laget blir enige om å splitte opp og undersøke hver sin del av huset. Det tar ikke lang tid før de skjønner at huset er fullt av zombier og andre demoniske skapninger.