Den første kjente av alkmaionidene var Megakles, da familiens overhode og arkont («hersker») i Athen på 600-tallet f.Kr. Han var ansvarlig for drapet på tilhengerne av Kylon av Athen under forsøket på statskupp i 632 f.Kr. da Kylon hadde søkt tilflukt i tempelet til Athene. Megakles og hans alkmaionidene (familie og tilhengere) arvet en forbannelse og ble forvist fra Athen. Selv legemene av døde alkmaionider ble grav opp og fjernet fra byens omkrets.