Prajñāpāramitā står sentralt i en ontologisk lære om «tomheten» som har funnet sin utforming innenfor skolene madhyamaka, zen og dzogchen. Prajña er å innse at alle fenomener er flyktige og forgjengelige fordi de er tomme for egen eksistens . Som hjelp i meditasjon bruker prajñāpāramitātekstene numeriske lister fra de skolastiske -tekstene.