Pave Gregor XIII lot ham etter noen år vende tilbake til Roma. Ciocchis slette rykte og mange forehavender gjorde at han imidlertid aldri fikk igjen noe av sin tidligere handlefrihet og innflytelse. Pave Gregor XIII skulle også overleve Innocenzo del Ciocchi del Monte, så dilemmaet om hans rett til å delta på pavevalg ble ikke satt på spissen. Kardinalen var på dette tidspunkt alment foraktet.