Brahe samlet en stor del gods til Næsbyholm på Sjælland og ble i 1622 eier av Ravnholdt på Fyn. Til tross for sin gunstige økonomiske posisjon samt tilhørigheten til en av landets mægtigste og mest ansete adelsslekter, fikk han aldri len og ble heller aldri riksråd. I 1632 utga han en samling hus- og kirkebønner.