Eksisterende GMOer har vist seg ikke å ha vesentlige direkte miljøeffekter . Genmodifiserte bakterier og sopp kan benyttes for bedre å sanere utslipp av skadelige stoffer. Grønne GMOer har positive miljøeffekter sammenlignet med konvensjonelt avlede planter, og har bidratt til å redusere utslipp av plantevernmidler og drivhusgasser.