I 1999 ønsket Norsk filminstitutt å knytte Amandus til film- og fjernsynsutdanningsmiljøet på Lillehammer. Fra dette året var festivalen et samarbeid mellom Norsk filminstitutt, Høgskolen på Lillehammer ved Filmskolen og fjernsynsutdanningen og Lillehammer kino. Lillehammer kommune og Oppland fylkeskommune bidro praktisk og økonomisk. I de senere årene har Amandus også fått verdifull støtte fra Film og Kino. En rekke private selskap har også bidratt med tjenester og verdier i form av reiser, kurs og lignende.