Klubbfargene har imidlertid ikke alltid vært himmelblå. Klubbens forgjenger, BK Idrott, brukte blå- og hvitstripede trøyer og hvite shorts, og dette draktsettet ble fortsatt brukt første halvår av 1910, da Malmö FF ble stiftet. Dette ble senere endret til rød- og hvitstripede trøyer og sorte shorts for å symbolisere at Malmö FF var en ny klubb, et draktsett som minner mye om dagens draktsett for bortekamper. Det nåværende himmelblå draktsettet ble innført 1920. Siden 2010 har det vært benyttet et lite skånsk flagg bak på trøyen, like under halsen.