Fra denne post var han et priviligert vitne til de turbulente år under Primo de Riveras diktatur, Den andre republikk, borgerkrigen og konsolideringen av Franco-regimet ved makten. Sammen med kardinalprimasen av Toledo, Isidro Gomá y Tomás og biskopen av Salamanca, Enrique Plá y Deniel, utarbeidet han ( De spanske biskopers kollektive brev i anledning krigen i Spania) i 1937. Sammen med 19 andre spanske biskoper organiserte han den 20. mai 1939 en religiøs seremoni presedert over av Franco i kirken i Madrid for å oppofre for Gud seieren i borgerkrigen.