Freylinghausen studerte teologi i Jena og ble der kjent med Joachim Justus Breithaupt. Han ble omvendt til pietismen av August Hermann Francke i Halle, og ble i 1695 hans assistent som predikant i St. Ulrich kirke i Halle. Han døde i 1739 i Halle, og var da sogneprest i St. Ulrich, og direktør for Vaisenhuset i byen.