Anne Margrethe Rynning var datter av skipsmegler Peder Lorentzen Holtermann (1802-1860) av slekten Holtermann og Fredrikke Amalie Olsen (1803-1885). Hun ble 12. juni 1856 gift i Bergen med gårdbruker og sorenskriverfullmektig, senere protokollfører i Kristiania byrett Paul Emil Rynning (1818-1906), og var mor til fiolinist, dirigent, komponist, musikkpedagog, genealog og kvinnesaksforkjemper Fredrikke Waaler (1865-1952) og advokat og rettshistoriker Lorents Rynning (1870-1962).