Metsola ble fungerende president i Europaparlamentet 11. januar 2022 da den valgte presidenten David Sassoli døde. Sassolis valgperiode var da i ferd med å løpe ut, og Metsola var da etter rangordningen favoritt i valget. Hun var på dette tidspunktet den fremste av parlamentets 14 visepresidenter. Den 18. januar 2022, på sin 43-årsdag, ble hun valgt til president i Europaparlamentet, som den yngste noensinne.