Elisabeth var datter av Hans den yngre av Sønderborg og hans hustru fra første ekteskap Elisabeth av Braunschweig-Grubenhagen (1550–1586). I 1615 giftet hun seg med den pommerske hertug Bogislav XIV. I ekteskapskontrakten foreskrev han henne slottet og området Rügenwalde (Darłowo) på livstid. Paret fikk ingen barn.