Før 1997-sesongen signerte Fisichella for Jordan-laget, der han kjørte sammen med Ralf Schumacher, den yngre broren til verdensmesteren Michael Schumacher. Giancharlo Fisichella fikk sin første pallplasering da han kom på tredjeplass i Canada Grand Prix; på den tyske racerbanen Hockenheimring var Fisichella nær sin første seier, men måtte bryte etter en punktering. På Spa-banen i Belgia Grand Prix samme år kom han på andreplass, etter Michael Schumacher. Etter dette løpet signerte han for Benetton-laget.