Hun var datter av riksråd Jens Holgersen Ulfstand og Margrethe Trolle (1475–1522). Sidsel Ulfstand giftet seg senest i 1532 med riksråd Knud Pedersen Gyldenstierne (1480–1552), paret fikk syv barn. Etter at han døde, arvet hun godsene Ljungby (senere Trolle Ljungby) i Skåne, Tim i Nørrejylland og Bønnet på Falster (sistnevnte etter sine brødre). Hun arvet også mannens embete som lensmann i Villand herred i Skåne.