IKOS består av fem faggrupper som forvalter fem undervisningsfag. Disse er: kulturhistorie/museologi, religionsvitenskap, Kina-/Korea-studier, Japan-studier og Midtøsten-studier. I tillegg er det flere av de ansatte ved disse fagene som arbeider på feltet miljøhumaniora. Dette fagfeltet strekker seg på tvers av fagene ved IKOS og omfatter også samarbeid med andre fagfelt innad ved universitetet og ut over dette.