I 1797 utvidet han påstanden om ikke-ledende egenskaper til å gjelde væsker. Ideen førte til massive protester fra etablert vitenskap, med John Dalton og John Leslie i spissen. Mer nøyaktige måleinstrumenter måtte til for å bevise Thompsons teori. Igjen ser det ut til at han hadde latt seg påvirke av sin tro, og det virker som han ville gi vann en helt spesiell privilegert status i styringen av menneskelig liv.