Jostedølas materialtransport (i form av slam) innebærer en sedimentasjon i Gaupnefjorden på 10 til 20 cm/år nær elveosen, og 1 cm/år 2 km fra elveosen. Elven transporterer 50 000 til 100 000 tonn slam årlig. Slamkonsentrasjonen fra Jostedøla er på det meste 1 g/liter. Det er særlig ved Gaupne at smeltevannet fra breene merkes på vannfargen.