Arten består som fem underarter. De tre nordligste underartene (, og ) blir av og til betraktet som en selvstendig art, under det vitenskapelige navnet (nordlig båtnebbhegre). Dette skyldes i hovedsak forskjeller i utfargingen. Spp. er en mellomform mellom nordlig båtnebbhegre og sørlig båtnebbhegre (nominatformen). Her betraktes alle som underarter av samme art.