Sigurd Halling var sønn av daværende sogneprest i Lom Honoratus Halling (1819–86) og Marie Henrikke Bomhoff (1837–1907). Fra 1847 var faren kapellan ved Gamle Aker kirke, hvor han ble kjent med arbeiderklassens vanskelige kår i fabrikkstrøkene langs Akerselva. Han forfektet en arbeidersak på kristen-konservativt grunnlag og grunnla i 1850 som et mottrekk mot Marcus Thranes sosialistiske arbeiderforeninger. Marie Halling var søster til sentralbanksjef Karl Gether Bomhoff (1842–1925), hvis datter Haldis Bomhoff (1885–1963), se Eckhoff) var Kong Olav Vs første lærerinne og også tilsatt på Halling skole. I 1896 giftet Sigurd Halling seg med Lagertha Grøntvedt (1865–1937), datter av Lars Grøntvedt (1827–81) og Anna Marie Ottilie Mellbye (1839–1923). Sigurd var bror til Marie Halling (1877–1965), som var mor til veversken Else Halling (1899–1987).