Da han ble fanget, var Bjørn Pedersen utstyrt med britisk uniform og papirer som viste at han var sub-løytnant (fenrik) i den britiske marinen (Royal Navy). Han virkelige grad var da sersjant i Kompani Linge. Overfor tyskerne holdt han hele tiden fast på at han var britisk offiser; hadde de blitt klar over at han var norsk motstandsmann, ville han ha blitt regnet som sabotør og drept. Etter flere forhør i Norge ble han sendt til Århus Danmark og derifra til Bremen. Helt i slutten av november 1943 ble han sendt til krigsfangeleiren Marlag und Milag Nord, der han satt som fange nr 1181 resten av krigen, i omtrent ett og et halvt år.