I 1956 ble Huppenkothen dømt av Bundesgerichtshof til seks års fengsel, men ble løslatt i 1959. Under tiden som alliert krigsfange arbeidet han tett med amerikanske myndigheter og gav dem informasjon om kommunistene på Østfronten. Dette kan ha vært en årsak til den lave straffen han fikk.