Harley Quinn er dyktig i å bruke en rekke ulike våpen, og bruker ofte bevæpnede klovnemekanismer og andre komiske gjenstander, heriblant gummikyllinger og en pistol som skyter en boksehanske. Andre våpen hun bruker inkluderer: ukonvensjonelle våpen som et balltre; eksplosive våpen, herunder bazooka, bomber og dynamitt; og skytevåpen som pistol, automatgevær, og maskingevær. Harley Quinn har også et par med hyener, Bud og Lou, som hun kan tilkalle for å angripe motstanderne sine. Til tross for å være mentalt ustabil og lett distrahert, er Harley svært intelligent. Hennes intellekt strekker seg til hennes psykologiske, taktiske og bedragsevner, men hun skiller seg ikke særlig ut for å ha spesielle strategiske eller vitenskapelige ferdigheter, og forblir ofte en underordnet til Joker, som mellom de to er geniet og oppfinneren. Selv om Hun ikke er på nivå med Joker, er hun fortsatt en eksperttaktiker, en dyktig bedrager og en profesjonell rømningsartist. Harley Quinn er den eneste personen unntatt Joker som får til å lage Joker-venom, Jokers hemmelige våpen, og det er kjent at hun skal ha klart å utvikle en antitoksin.