I 1957 dro hun til Paris og trådte der inn i Filles du Cœur de Marie (Maria Hjerte-døtrenes kongregasjon). Etter videreførende medisinske studier – i 1958 internmedisin i Köln ved Hildegardis-sykehuset, i 1959 gynekologi i Bonn ved Elisabeth-sykehuset Bonn – ble hun i 1960 sendt av sin orden til India for der å virke som gynekolog. På grunn av et visumproblem måtte hun imislertid stanse i Karachi (Vest-Pakistan) på veien. Der forble så Pfau, for hennes møte med de leprasyke i slumområdene i storbyen ble bestemmende for hennes videre livsløp. Hun bestemte seg for å etablere et sykehus der for leprabekjempelse. Marie Adelaide Leprosy Centre (MALC) ble en nasjonalt anerkjent institusjon. Hun ledet den til 2013.