Lagos ligger ved bredden av Bensafrim hvor elven munnen ut i Atlanterhavet. Den er en havneby med en godt vernet havn. På 1400- og 1500-tallet var byen utgangspunkt for en rekke oppdagingsreiser. Lagos har også vært kjent for sitt sardinfiske. Byen ble delvis ødelagt under Lisboa-jordskjelvet i 1755. I dag er Lagos også en turistby med kraftig økning i innbyggertallet i høysesongen.