Annos bruk av freudiansk ordbruk og psykoanalytisk teori i tillegg til hans hentydninger til religion og biologi er ofte idiosynkratisk brukt og omtolket til å bære hans budskap. Denne tendensen til Anno har blitt kritisert som «totalt plagiat» og «bare mer hjernespill fra animasjonsteamet». Anno forsvarte seg med at det ikke er mulig å skape et originalt verk uten å låne litt fra en annen anime: «Det er ikke lenger plass for absolutt originalitet i animefeltet, spesielt når man tar for seg at vår generasjon har blitt oppdratt på masseproduserte animer. Alle historier og teknikker unngår ikke å bære en viss følelse av déjà vu. Den eneste veien igjen som vi kan uttrykke oss på er å produsere en collagelignende effekt basert på å sette sammen eksisterende verk».