Ntare V hadde sin utdannelse fra Institut Le Rosey i Sveits. Moren hans var dronning Baramparaye (1929—2007). Han hadde en bror, prins Louis Rwagasore, som ble drept i 1961 da han var statsminister, og to søstre; prinsesse Rose Paula Iribagiza (født 1934) og prinsesse Regina Kanyange (død 1987).