I 1961 krasjer en Arken, et romfartøy med en spesiell oppfinnelse som kan avslutte konflikten mellom autobotene og de ondsinnede Decepticons, på den mørke siden av jordens måne. Krasjet blir snart oppdaget av NASA, og USAs president John F. Kennedy autoriserer et oppdrag for å sende mannskap til månen for å undersøke romfartøyet ytterligere. I 1969 lander mannskapet fra Apollo 11 på Månen, og de inspiserer i all hemmelighet Arken før de reiser tilbake mot jordkloden. President Richard Nixon gir astronautene ordre om å holde alle detaljene fra dette måne-oppdraget strengt hemmelig.