Den 24. oktober 2002 ble han valgt til erkebiskop av erkebispedømmet Kirkuk, men den pavelige bekreftelsen fra pave Johannes Paul II kom før ett år senere, den 27. september 2003, på grunn av Irak-krigen. Den 14. november 2003 ble Sako ordinert til biskop av sin forgjenger, erkebiskop André Sana; Medkonsekratorer var Shlemon Warduni, hjelpebiskop i patriarkatet Babylon, og Paulos Faraj Rahho, erkebiskop av Mosul.