I mellomtiden har Don begynt et forhold med en annen FBI-agent, Liz Warner. Til tross for Dons bekymringer, blir Alan engasjert i en del FBI-konsultasjoner med sine ingeniør-kunnskaper. Larry kommer tilbake fra Den internasjonale romstasjonen, men har også blitt mer desillusjonert. Sesong-finalen avsluttes med en avsløring om at FBI-agent Colby Granger har fungert som dobbeltagent for kineserne.