Ved kongressvalget i 1898 ble Garner første gang valgt inn i Representantenes hus fra et landdistrikt i det sørlige Texas, og ble sittende som kongressmedlem frem til han ble visepresident i 1933. Garners kone jobbet som hans privatsekretær. Garner var representanthusets speaker (ordstyrer) i perioden 1931–1933. Med unntak av Garner er det bare Schuyler Colfax som har vært speaker i representanthuset før han ble USAs visepresident.