Clarke fant seg raskt til rette i Leeds og scoret 26 mål i sin første sesong da klubben jaktet på FA-cupseier, seriegull og Europacupseier. De vant ingen av troféene. Senere skulle han hjelpe Leeds til seier i Messebycupen og i FA-cupen og til et ligamesterskap. Han avsluttet sin aktive karriere med to sesonger som spillende manager for Barnsley.