Hun ble ferdig utdannet lege i 1995 og praktiserte som allmennmedisiner 1997-2008. Hun ble spesialist i allmennmedisin 2006, spesialist samfunnsmedisin 2016 og tok master i helseadministrasjon og ledelse 2011. Lønning var fagsjef i Legeforeningen 2008 - 2013, og direktør for helsetjenesten i SiO fra 2013.