I Sesong 12 kunngjør Penny at hun ikke ønsker å få barn, og Leonard støtter motvillig avgjørelsen hennes. Senere vil hennes tidligere kjæreste Zack og hans nye kone at Leonard skal være surrogat-far for barnet deres, ettersom Zack ikke er fruktbar. Penny går motvillig med på å la Leonard donere sæden hans. Men hun prøver likevel å forføre Leonard, til tross for at hun vet at han ikke kan ha sex i noen dager før han skal donere sæd. Leonard ombestemmer seg, og ønsker ikke å sette barn til verden som han ikke kan oppdra selv. Mot slutten av TV-serien er Penny gravid med Leonards baby, og hun har forandret mening om å aldri ønske seg egne barn.