Tukydid identifiserer seg selv som en athener, og forteller at farens navn var Oloroso og at han var fra den athenske Halimous. En omstridt anekdote fra hans tidlige liv forteller at da Tukydid var 10–12 år gammel, skulle han og faren ha dratt til Athens agora hvor den unge Tukydid hørte et foredrag av historikeren Herodot. Ifølge noen beretninger gråt den unge Tukydid av glede etter å ha hørt forelesningen, og bestemte seg for at det å skrive historie ville være hans livs kall. Den samme beretningen hevder også at Herodot etter forelesningen snakket med ungdommen og faren hans og sa: «Oloroso, din sønn lengter etter kunnskap.» I alt vesentlig er episoden mest sannsynlig fra en senere gresk eller romersk popularisert beretning om livet hans. Han overlevde utbruddet av pesten i Athen som drepte Perikles og mange andre athenere. Det er en første observasjon av ervervet immunitet. Han registrerte også at han eide gullgruver ved Skaptē Hulē (Σκαπτὴ ὕλη, bokstavelig talt «Gravd skogland»), et kystområde i greske Trakia, overfor øya Thasos.