Den 9. februar 2021 stemte Cassidy for at riksrettssaken mot Trump var konstitusjonell, det motsatte av hans forrige avlagte stemme om saken. Den 13. februar var han en av syv republikanere som stemte for å dømme Trump for oppfordring til oppvigleri. Bare timer etter avstemningen ble Cassidy kraftig kritisert av Republican Party of Louisiana. Cassidy fikk også støtte fra flere demokrater, inkludert sin egen forgjenger Mary Landrieu som Cassidy slo i valget i 2014. Sammen med fem andre republikanere og alle demokratene som var tilstede stemte han den 27. mai 2021 for å etablere en uavhengig kommisjon som skulle etterforske stormingen av USAs kongress den 6. januar. Stemmen oppnådde ikke de 60 stemmene som var nødvendig.