Etter å ha lagt opp som spiller hadde Quinn en kortere periode som trener for Sunderland før han deretter arbeidet som ekspertkommentator for Sky Sports. I juni 2006 kjøpte han seg opp i Sunderland og ble dermed klubbens direktør og manager, før han etter etter en måned med dårlige resultater overlot managerjobben til sin tidligere landslagskollega Roy Keane i august 2006.