I Los Angeles oppdager Kyle et stumt barn som heter Star under en trefning mot Skynets maskiner. Men Kyle og Star blir bortført, og tatt i fange av Skynet. Samtidig lokaliserer Marcus Wright den ned-skutte piloten Blair Williams. De finner veien til Johns base. Motstandskjemperne som slåss mot Skynet oppdager at Marcus faktisk er en cyborg, med et mekanisk skjelett og en delvis kunstig hjernebark. Selv om Marcus mener at han er ett vanlig menneske, tror John og hans kone Kate at Marcus har blitt sendt for å henrette John. De ønsker å ødelegge Marcus, men Blair hjelper Marcus å komme seg unna. John ber general Ashdown om å utsette deres offensiv slik at de kan legge en plan for å hjelpe ut alle menneskene som Skynet holder fanget. Men Ashdown nekter, og fjerner John fra hans tidligere kommando.