I en hemmelig tilleggsprotokoll til Molotov–Ribbentrop-pakten, en ikke-angrepsavtale mellom det nazistiske Tyskland og Sovjetunionen undertegnet i 1939, var det egentlig avtalt at Latvia og Estland lå i Sovjetunionens interessesfære, mens Litauen lå i Tysklands. Likevel kom det meste av Latvia under tysk okkupasjon den 10. juli 1941. Holocaust i Latvia fikk ingen offentlig oppmerksomhet før etter uavhengigheten i 1990. Høsten 1944 var hele Latvia igjen okkupert av Sovjetunionen. Etter krigen ble latvierne igjen ofre for Stalins terror; kollektiviseringen i jordbruket og russifiseringen på flere samfunnsområder medførte forfølgelser og massedeportasjoner. Utrenskningene kom også til å ramme latvisknasjonale kommunister.