Pave Julius II grunnla museene tidlig på 1500-tallet. Det sixtinske kapell med dets tak dekorert av Michelangelo og Stanze della Segnatura («Rafaels rom») dekorert av Rafael er på den faste besøkruten gjennom Vatikanmuseene. I 2013 ble de besøkt av 5,5 millioner mennesker som til sammen gjør det til den femte mest besøkte kunstmuseum i verden.