Maguire er barndomsvenn med Leonardo DiCaprio. De to er fremdeles gode venner. Han har også blitt gode venner med flere av sine medskuespillere i filmer han har medvirket i, som for eksempel James Franco, Kirsten Dunst og Reese Witherspoon. Han var i bryllupet til sistnevnte da hun giftet seg med skuespilleragenten Jim Toth i 2011.