Fabrizio Spadas viktigste støtte, kardinal Bernardino Spada, døde i 1661, innen Fabrizio Spada var kommet inn på det karrierespor i Vatikanet hvorpå resten så å si ville gå på skinner. Dermed ble den stående i ro i en fireårsperiode, som protonotar og rettsreferendar. Først i april 1668 ble han utnevnt til sekretær for en avdeling som tok seg av forvaltningen av Kirkestatens provinser.