Ved å gi sitt bifall til den siste merovingiske kongens, Childerik IIIs, avsettelse og Pipin den lilles tronbestigelse la han et bærekraftig grunnlag for Frankerrikets og den frankiske kirkes nære forbindelse med Roma, en forbindelse som senere ble av stor betydning for den katolske kirke. Med klokhet forstod Zacharias å beskytte Pavestolens interesser overfor langobardene.