Den autonome regionen Sør-Sudan ble avskaffet i 1983. eksisterte i Sør-Sudan 1987–1989. Etter at fredsavtalen ble undertegnet i Khartoum i 1997, ble etablert. Dette organet ble avskaffet i 2005, da Sør-Sudans autonome regjering ble opprettet.