Bong ble deretter testpilot ved Lockheeds fabrikk i Burbank, California, der han fløy P-80 Shooting Star jetjagerfly. Den 6. august 1945 fungerte ikke flyets primære drivstoffpumpe under takeoff på en leveringsflygning av P-80A 44-85048. Bong hadde enten glemt å skifte til den ekstra drivstoffpumpen eller var av en annen grunn ikke i stand til å gjøre det. Bong hoppet ut av flyet, men var for lavt til at fallskjermen foldet seg ut. Flyet havarerte inn i et smalt område i Oxnard St & Satsuma Avenue i North Hollywood. Hans ulykke og død kom på forsiden på alle landets aviser, men måtte dele plass med den store nyheten om bombingen av Hiroshima.