Calvin var en utrettelig polemiker og apologetisk forfatter som skapte mye kontrovers. Han prekte den dystre læren om Gud som den allmektige vilje som har utvalgt noen mennesker til salighet og andre til fordømmelse. I bibeltolkningen var han strengere enn Luther, og satte Det gamle testamentet høyere enn Det nye testamentet da de gamletestamentlige stridsmenn var hans forbilder. Han utvekslet også hjertelige og støttende brev med mange reformatorer, inkludert Philipp Melanchthon og Heinrich Bullinger. I tillegg til den nevnte boken fra 1536, skrev Calvin kommentarer til de fleste bibelbøker, bekjennelseskrifter (skriftemål) og ulike andre teologiske avhandlinger.