I slike kjemiske sammenhenger spiller også det magnetiske kvantetallet en viktig rolle. I et underskall med en gitt verdi av det asimutale kvantetallet , tar dette tredje kvantetallet 2 + 1 heltallige verdier fra - til +. Hvert underskall blir på den måten oppdelt i et tilsvarende antall orbitaler med elektroner som har sterkt retningsavhengige, romlige sannsynlighetsfordelinger i rommet. Disse gir molekylene deres kompliserte strukturer.