Siden cupvinner Hearts var kvalifisert for Mesterligaen gjennom sin 2.-plass i serien, var Gretna som første lag fra nivå 3 i Skottland høsten 2006 kvalifisert for UEFA-cupen. Gretnas hjemmebane Raydale Park tilfredsstilte imidlertid ikke UEFAs krav til stadionanlegg, og klubben måtte derfor spille hjemmekampen(e) på Motherwells bane Fir Park, 120 km hjemmefra. Gretnas debut i UEFA-cupen ble imidlertid en skuffelse. Laget ble slått ut av Derry City fra Nord-Irland/Irland etter 1-5 «hjemme» i Motherwell og 2-2 borte.