Etter sin habilisasjon i 1925 ved universitetet i Giessen ble Westhues professor i veterinærmedisin samme sted. Året etter ble han kalt til München, hvor han ble professor i alminnelig og spesiell kirurgi inkludert øyensykdommer ved den kirurgiske dyreklinikk i 1931. Han innehadde dette professoratet frem til han ble pensjonert i 1965. Fra 1955 til 1956 var Westhues rektor ved Ludwig-Maximilian-universitetet. Han var dessuten i en årrekke bayersk senator.