Etter eksamen ved konservatoriet reiste han tilbake til Trondheim, og fortsatte som organist og musikklærer. Han hadde nå et sterkt ønske om å gi andre samme muligheter som han selv hadde fått, og ville opprette en musikkskole i byen, drevet etter samme retningslinjer som konservatoriet i Oslo. Han mottok noe økonomisk støtte, blant annet fra et legat etter Toldkasserer A.C. Schults, og i september 1911 åpnet han Trondhjems Musikskole i leide lokaler. Skolen hadde trange økonomiske kår, og i 1913 aksepterte Skaug et tilbud om en organiststilling i Tromsø, men han ble ikke lenge der. Allerede i 1914 var han tilbake i Trondheim, arbeidet videre med musikkskolen og giftet seg med sin forlovede, Sigrid Hagen fra Rissa. Hun hadde utdannelse som lærer fra Industriskolen i Oslo, og hadde fått undervisning i sang ved Statens Sangkurs. Hun tok også organisteksamen og drev musikkskolen sammen med sin mann. De to ga flere konserter sammen, både i Norge og Sverige. Hun sang, og han akkompagnerte henne på orgel.