Siden Rituximab virker målrettet mot celler med CD20-proteinet, er det mye mer spesifikt enn tradisjonell cellegift (cytostatika). Det har derfor betydelig mindre alvorlige bivirkninger enn disse. Likevel er det knyttet en risiko for anafylaktiske reaksjoner til infusjonen av antistoffer som Rituximab. I tillegg svekker medikamentet immunsystemet, noe som kan føre til at man lettere får infeksjoner og kreft, samt oppblussing av latente virus i kroppen (f.eks. hepatitt B og cytomegalovirus).