Mangersnes er opprinnelig fra Fyllingen Fotball. Her startet han også sin trenerkarriere i ung alder. Men det var i Åsane Fotball han fikk sine første jobber på høyere nivå. Han var spillerutvikler, juniortrener, assistenttrener og senere hovedtrener A-lag i perioden 2002–2007. Fra 2006 ble også analyse en anerkjent kompetanse for Mangersnes, og som gjorde at han i 2007 fikk et kort opphold i Sportsklubben Brann for å kartlegge klubbens motstandere i UEFA-Cupen. Fra 2008 ble han assistenttrener i Løv-Ham Fotball, en jobb han hadde til mai 2011. I denne perioden etablerte Løv-Ham seg på nivå 2 i norsk fotball, og holdt på å rykke opp til Eliteserien høsten 2010 under Arne Sandstø og Tom Mangersnes ledelse. Da Sandstø overtok Sandefjord i mai 2011, overtok Mangersnes som hovedtrener. Han fikk med seg David Nielsen som assistent en kort periode. I stedet for at Løv-Ham fikk utvikle seg videre, var klubben dessverre nærmest konkurs, og styrte høsten 2011 for å fullføre og la den nye sammenslåingsklubben FK Fyllingsdalen få starte på ny i 2.divisjon.