Problemene med vannstanden i Red Mountain-gruvene hindret lønnsom drift. I 1905 begynte selskapet å bore – en tunnel fra dalbunnen og inn til gruvesjaktene til Genesse-Vanderbilt med forgreininger til Yankee Girl, Guston og Robinson. Hensikten var å drenere vannet fra gruvene og starte utvinning igjen. Selskapet leaset strekningen Red Mountain–Ironton i forbindelse med prosjektet. var ferdig i 1907, og var en suksess. Ikke bare kom produksjonen raskt i gang igjen, men tunnelen forenklet også uttransporteringen av malmen. I 1909 tok Mears kontroll over jernbanen igjen. Han kjøpte en brukt passasjervogn fra D&RG og fortsatte med oppgraderinger av linjen da store nedbørsmengder i august 1909 stengte D&RGs linje mellom Silverton og Durango. Linjen ble gjenåpnet i begynnelsen av september, bare for å bli stengt igjen av et nytt uvær like etter. Først i slutten av september gikk togtrafikken som normalt. Høsten 1910 kom det på nytt store nedbørsmengder, og denne gangen ble også Mears' jernbaner ut fra Silverton rammet. Flom, jordras og utvaskinger gjorde skader for dollar, men Mears bestemte seg for å reparere linjene. I 1911 tok Mears' svigersønn James Pitcher over den daglige driften av Silverton-banene som nå talte tre etter at Silverton, Gladstone & Northerly (SG&N) ble leaset av Mears i 1910.