Senteret ble grunnlagt som i 2007, og var dengang underlagt Forsvarsakademiet. I forbindelse med forsvarsforliket 2010–2014, ble CMS opprettet som følge av en avtale mellom Forsvarsministeriet og Københavns Universitet. I 2016 plasserte University of Pennsylvania senteret som nummer 19 av 85 på deres globale liste over forsvars- og sikkerhetspolitiske tankesmier.