Den 24. juni 2019 utnevnte pave Frans Dubost til apostolisk administrator av erkebispedømmet Lyon, og suspenderte dermed kardinal Philippe Barbarins jurisdiksjon der med umiddelbar virkning. Etter at pave Frans godtok kardinal Barbarins avgang den 6. mars 2020, fungerte Dubost som apostolisk administrator frem til innsettelsen av den nye erkebiskopen, Olivier de Germay, den 20. desember 2020.