Hennes fratreden ble bekjentgjort 2. april 2007. Professor Larry Diamond ved Stanford University, som tidligere hadde arbeidet i den amerikanskledede koalisjonens midlertidige styre i Irak, mente at Bush-administrasjonens politikk hadde slått feil, men at selv om O'Sullivan hadde spilt sin rolle i beslutningsprosessen så måtte mesteparten av ansvaret tas av personer høyere opp i systemet. Diamond hadde tidligere anbefalt henne om ikke å bli involvert med Irak fordi han mente at strategien den gang var helt feil og han ønsket ast hun skulle slippe å bli knyttet til en feilstått krig. – Senere (høsten 2008) har det imidlertid vist seg at «surge»-strategien som O'Sullivan gikk inn for, faktisk kan ha hatt den tilsiktede effekt. Den 15. september sluttet Meghan O'Sullivan i Det hvite hus og begynte i en undervisningsstilling ved Harvard University tre dager etter.