Det ble den 20. november 2008 meldte CNN at hun var Obamas utvalgte til fremtidig handelsminister i regjeringen hans, som skulle tiltre den 20. januar 2009; kort etter ble det sagt at hun hadde avbøyd fordi hun trodde bekreftelsesprosessen i senatet ville bli vanskelig. I 2013 ble hun nominert til stillingen, og hun overtok stillingen i juni samme år. Hun gikk av samme dag som president Obama.