Sent i 1948 brøt Scruggs med Monroe. Et par uker senere fikk han følge av Lester Flatt. De to slo seg sammen, og med tre medspillere dannet de kvintetten Flatt & Scruggs & The Foggy Mountain Boys, for korthets skyld ofte kalt "Flatt & Scruggs". De fikk med seg Watts fra Monroes gruppe, noe senere også Chubby Wise. Som felespiller vekslet han med Art Wooten – også han med en fortid hos Bill Monroe. Curly Seckler (1919–2017) spilte, med et avbrekk i 1950–52, mandolin med Flatt & Scruggs i 1949–1962. Han var en allsidig musiker. Som Flatt hadde han en fortid bl.a. i gruppen til Charlie Monroe (og en fremtid hos Bill – han spilte inn noen sanger med ham i 1972). Som Scruggs og Monroe vokste Seckler opp i en stor søskenflokk med sang og musikk. Som Scruggs måtte han tidlig ut i arbeid i bomullsindustrien etter å ha mistet faren i tidlig barndom. En kort stund spilte Chet Atkins i gruppen.        Gjennomtrekk blant medspillerne var typisk for datidens country og bluegrass – og var faktisk mer utpreget hos Monroe enn hos Flatt & Scruggs. Musikerne omgikkes likevel ofte som venner, og de kunne finne tilbake til hverandre. De kunne iallfall møtes i gemyttelighet både på scenen og bak den. Monroe-brødrene spilte f.eks. sammen en rekke ganger etter bruddet i 1938. Derimot ble Monroe og Flatt og Scruggs uvenner etter bruddet i 1948. Monroe trodde de to hadde konspirert mot ham.