Hjernemargsår er en sentralnervøs form av pulpanyresyke. Det skyldes epsilon-toksin produsert av C. perfringens type D. Affiserte dyr får unormal atferd, ulike sentralnervøse symptomer og kan bli blinde. Ved obduksjon finner man mikroskopiske blødninger i basalhjernen og nyreforandringer som minner om pulpanyre.