Kommunen har en sterk tilknytning til luftfart ved at 333 skvadron i Luftforsvaret er stasjonert på Andøya flystasjon, og til romfart ved at Andøya Space i Oksebåsen ved Andenes er involvert i internasjonalt samarbeid om utforskning av den polare atmosfæren og fenomenet nordlys. Andøya flystasjon er foreslått nedlagt innen 2025, hvor virksomheten skal flyttes til Evenes flystasjon. Forsvarsdepartementet har besluttet å legge et alliert treningssenter (ATS) til den nedlagte flystasjonen, slik at det blir videre drift der. Det satses også på droner. Fiske og fiskeindustri er likevel av sentral betydning for kommunen. Kommunesenteret Andenes er et av landets største fiskevær og havnen utgjør en av Nord-Europas største havneanlegg med nærmere med moloanlegg. Andenes er også liggehavn for en av Redningsselskapets redningsskøyter.