Spilleren kan gjennomføre oppdragene på ulike måter. Man kan utnytte spillets snikemekanismer ved å skru av lyset for å ikke bli sett eller å kaste noe for å distrahere fiender. Spilleren kan også liste seg innpå fienden for å snikdrepe dem. Spillerne oppfordres til å legge en plan før de går ut på oppdraget. Fiendenes atferd, som styres av kunstig intelligens, kan endre seg avhengig av hvilken tid på dagen det er. For eksempel kan fiender som patruljerer en leir på dagen gå for å legge seg om kvelden, noe som vil gjøre infiltrasjon av leiren enklere. Spillet har et dynamisk værsystem, som gjør det mulig for spillerne å utnytte stormer og regn for å overdøve Artyoms fottrinn. Tiden på dagen kan endres ved "safehouses" rundt om i spillverdenen.