Han overtok gården Støvra etter faren Peter i 1873 og gav den videre til sønnen Peter i 1907. Nils Muus tilhørte slekten Muus, med flere kjente slektninger. Nils' far Peter Muus var også herredskasserer og ordfører, og Nils' søster Karen var gift med lærer og ordfører Lorentz Nicolai Bøgset.