Vatnar har vært medlem av flere offentlige utvalg. Hun var medlem av det regjeringsoppnevnte Kvinnevoldsutvalget som avga NOU 2003: 31: Retten til et liv uten vold. Fra 2010 var hun medlem av Våpenlovutvalget. I 2018 ble hun medlem av det regjeringsoppnevnte Partnerdrapsutvalget som la frem NOU 2020: 17.