I den såkalte Cappelen–Jensen-saken ble Jensen i 2014 arrestert og suspendert fra politiet og deretter tiltalt for grov korrupsjon og narkotikasmugling i samarbeid med den selverklærte «narkobaronen» Gjermund Cappelen. Jensen ble 18. september 2017 dømt i Oslo tingrett til 21 års ubetinget fengsel for grov korrupsjon, medvirkning til narkotikasmugling og ulovlig våpenbesittelse. Han anket til Borgarting lagmannsrett; 28. januar 2019 endte behandlingen i lagmannsretten med at lagretten fant Jensen skyldig i grov korrupsjon, men frifant ham for tiltalepunktet om narkotikasmugling med knappest mulig flertall, men fagdommerne tilsidesatte lagrettens kjennelse fordi de enstemmig mente at Jensen utvilsomt var skyldig etter hele tiltalen og at lagrettens kjennelse var feil. Lagmannsretten bestemte at saken skulle behandles på nytt som meddomsrett i Borgarting lagmannsrett. Jensen anket denne beslutningen til Høyesterett, som avviste Jensens anke 22. februar 2019. Den 19. juni 2020 ble Jensen dømt på alle tiltalepunktene for grov korrupsjon og narkotikasmugling med en straff på 21 år i fengsel. Han ble derfor umiddelbart pågrepet i retten og innsatt som fange i Kongsvinger fengsel. Jensen anket straffeutmålingen til Høyesterett, men Høyesteretts ankeutvalg avviste anken 10. november 2020 og dommen er dermed rettskraftig og endelig avgjort. Jensen er fra november 2020 soningsfange og var innsatt i Kongsvinger fengsel frem til han fikk innvilget midlertidig hjemmesoning i 2023.