Bukta er oppkalt etter den nærliggende tyrkiske byen İskenderun, som i antikken het Alexandretta (gresk: Αλεξανδρέττα, bokstavelig «Lille Alexandria»). Bukta var også tidligere kjent som Issusbukten eller -havet (latin: eller ) (gammelgresk: Ἰσσικὸς κόλπος). Herodot og Stefan fra Bysants registrerer den også som Marandynianske bukt (gammelgresk: Μυριανδικὸς κόλπος), etter den nærliggende byen Myriandros. På 800- til 1100-tallet ble bukten kjent som den armenske bukten (armensk: Հայկական ծոց). grunnet opprettelsen av det armenske kongedømmet Kilikia ved İskenderunbukta.