Han samarbeidet med og var generalvikar for erkebispedømmet fra 1924 til kardinal Maurilio Fossati fjernet ham fra stillingen i 1931 etter råd fra pave Pius XI. Dette gjorde det mulig for ham å vie mer tid til pastorale oppgaver i sognekirke hvor han tjenestegjorde fra 1912 til sin død. Biskop Pinardi var kjent for sine antifascistiske synspunkter, noe som bidro til hans degradering fra generalvikarstillingen. Paven fryktet at å gi Pinardi mer kuriøst ansvar ville motvirke det fascistiske regimet og ville forsøke å tenne opp spenninger.