Gérson Caçapa startet karrieren hos den brasilianske toppklubben . I 1989 signerte han for italienske , som da var nyopprykket til italiensk Serie A. Med seg til Bari var landsmannen João Paulo og argentineren Néstor Lorenzo. Gérson Caçapas første sesong for Bari var vellykket. I spann med Angelo Carbone sentralt på midtbanen, hjalp han laget til en plass midt på tabellen i seriespillet, og seier i Mitropa Cup. I hans andre sesong for Bari, hjalp han laget sikre plassen i Serie A, med tabellplassering et par plasser over nedrykksstreken. Da Bari på sommeren i 1991 hentet inn kroatene Robert Jarni og Zvonimir Boban, og engelskmannen David Platt, var det ikke lenger plass til Gérson Caçapa i utenlandskvoten på tre spillere. Gérson Caçapa ble så sendt på utlån til den tyrkiske toppklubben .