I 1939 konsoliderte Franz Six de jødiske boksamlingene i en enhet og med det ble det etablert et sentralt bibliotek for opposisjonslitteratur. Bakgrunnen var at Six ville ha et sentralisert jødisk bibliotek for å forske på jødedommen. Etter okkupasjonen av Polen i 1939 økte tilgangen på jødiske bøker og seks godsvogner med bøker til Berlin ble sendt fra synagoger og jødiske bibliotekt i Polen. Da RSHA ble etablert i 1939 ble det etter forslag fra Six etablert en forskningsavdeling med fokus på regimets motstandere. Six ble leder for avdelingen «ideologier – forskning og evaluering» med ansvar for bibliotek, museum og forskning.