Han arbeidet noen år etter gymnaset som journalist i Sosialurin og Kringvarp Føroya. Han studerte så jus ved Københavns Universitet og arbeidet som assistent for Sjúrður Skaale og senere Magni Arge i Folketinget. Eirikur í Jákupsstovu har senere arbeidet med blant annet sjøforsikring i Tryggingarfelagið Føroyar/Betri Trygging og som nærings- og kultursjef i Klaksvíkar kommuna.