I 1780 ble Danzis første opera, , uroppført i Mannheim. Året etter flyttet han til München, der han i januar 1784 ble farens etterfølger som solocellist. I 1790 giftet han seg med sopranen og komponisten Maria Margarethe Marchand. Fra 1790 til 1796 var de på en lengre turne i Leipzig, Praha, Venezia og Firenze og feiret store triumfer. De vendte tilbake til München i 1796, der Margarethe Danzi var primadonna ved og der Franz Danzi i 1798 ble visekapellmester. Da hun døde i 1800, bare 32 år gammel, trakk Danzi seg tilbake fra offentligheten i flere år. Fra 1807 til 1812 var han hoffkapellmester ved det kongelige hoffteater i Stuttgart og fra 1812 og fram til sin død hoffkapellmester ved .