Fra 2000 til 2006 var den språkmektige biskopen visepresident og fra 2006 til 2012 president for EUs bispekommisjon COMECE, som var blitt opprettet i 1980. I denne rolle hilste han med tilfredshet den irske ratifisering av Lisboatraktaten. Han sa at traktaten vil forbedre kommunikasjonen mellom institusjonene i Det europeiske fellesskap (EF) og at de spesifikke forsikringer gitt til Irland vil bidra til å beskytte «retten til liv, beskyttelsen av familien og foreldrenes rett til å utdanne sine barn» i hele EU.