Han ble senere arrestert og tiltalt for å ha forårsaket omfattende uro, oppfordret til etnisk hat og for å ha vært delaktig i drap. Flere internasjonale menneskerettighetsgrupper protesterte mot rettssaken, blant annet på grunn av påstått tortur og politiets trusler mot vitner i rettssalen. Asqarov fikk livstidsdom. I november 2010 ble det rapportert at Asqarovs helse var svekket.