Air Algérie ble grunnlagt 15. mars 1947 som Société Algérienne de Construction Aéronautique (SACA)-Air Algérie. I 1953 slo flyselskapet seg i sammen med Compagnie Air Transport som dannet Compagnie Générale de Transports Aériens Air Algérie, med en kombinert flyflåte som inkluderte: en Breguet 761, Seks Bretagnes, fem DC-3'ere og tre DC-4'ere. Société de Travail Aérien, var et flyselskap som ble grunnlagt i 1998, og ble tatt over av Air Algérie i mai 1972. Air Algérie ble et aksjeselskap i 1997 og 2006, kapitalen utgjorde 57 millioner dinarer (ca 42,5 millioner norske kroner). I september 2021, etter arrestasjonen av en av dets forvaltere som transporterte narkotika mellom Frankrike og Algerie, strammet det nasjonale selskapet opp reglene.