Selv på introduksjonstidspunktet var det bekymring for sikkerheten til Thorotrast. Etter injeksjon distribueres legemidlet til leveren, milten, lymfeknuter og bein, der det absorberes. Etter denne første absorpsjonen skjer omfordeling i et veldig sakte tempo. Spesielt anslås den biologiske halveringstiden til å være 22 år. Dette betyr at organene til pasienter som har fått Thorotrast vil bli utsatt for intern alfastråling resten av livet. Betydningen av denne langsiktige eksponeringen ble ikke fullstendig forstått da Thorotrast ble introdusert i 1931.