Mauro Morelli var sønn av Eduardo Morelli og Rosa Gomes, og han vokste opp i Penápolis i delstaten São Paulo. Hans videregående skolegang og klassiske studier ble ved i Piracicaba. Filosofistudiene tok han ved i Viamão i delstaten Rio Grande do Sul, og teologi studerte han ved Saint Mary's Seminary and University i Baltimore i USA.