Christophe følte seg fornærmet, og han dro sammen med sine tilhengere til Plaine-du-Nord, og opprettet der en separat regjering. Christophe hadde mistanker om at han ville bli den neste som ble myrdet. I 1807 utnevnte han seg selv til «president og generalissimo for Staten Haitis land- og sjøstyrker» (). I Sør-Haiti ble Pétion president, støttet av general Jean Pierre Boyer, som kontrollerte de sørhaitiske arméene.