Plottet i Cyberpunkt 2077 starter ved at hovedpersonen, V, sammen med sin gode venn Jackie, får i oppgave å «hente» en spesiell bio-chip fra Yorinobu Arasaka, som har stjålet den fra sin fars selskap. Mens V og Jackie er der kommer faren, Saburo Arasaka, med tilnavnet «Keiseren». V og Jackie blir vitne til et mord, som de forstår de vil bli anklagd for, og de to må flykte med bio-chipen som er blitt skadet. Når V på et tidspunkt må koble bio-chipen til sin egen hjerne blir det snart klart at chipen inneholder bevisstheten til terrorist eller frigjøringshelt Johnny Silverhand. V kan ikke koble ut chipen uten å dø, og ender opp i en rekke konflikter med Johnny Silverhand, med de som er interessert i mordet og de som vil ha tak i biochipen.