Den endelige rapporten ble utgitt av den franske flyhavarikommisjonen på en pressekonferanse 5. juli 2012, og den forteller at ulykken skyldtes en rekke hendelser: Uoverensstemmelser mellom fartsmålerne (ingen måling), sannsynligvis etter at iskrystaller utviklet seg i pitot-rørene (som blant annet måler hastighet og høyde), som deretter forårsaket at autopiloten koblet ut, og deretter en lang liste med feilmeldinger. Det var tre piloter om bord, men kapteinen oppholdt seg i sovelugaren i cockpiten, og ble først involvert etter at flyet mistet instrumentmålingene. Han ropte ut noen ordre og prøvde å få oversikt over situasjonen. Styrmannen begikk flere feil i forsøket på å berge flyet, og styrte flyet i havet. De siste minuttene av ferden forsøkte pilotene desperat å gjenvinne kontroll over flyet, og i det siste minuttet oppdaget kapteinen at styrmannen hadde begått en feil, men rakk ikke å berge flyet.