Det er også mye vanskeligere å utføre et Speedrun en det var i Fallout 1. I Fallout 1 kunne spilleren gå rett til Millitærbasen og ødelegge den, for så å reise til the Cathedral og gjøre det samme der. I Fallout 2 kan man ikke nå den siste basen før en databit fra Vault 13 er funnet, og Vault 13 kan ikke bli funnet før man har gjort ett av to oppdrag, noe som gjør at man trenger å slåss mye, som gjør disse oppgavene vanskelige for nye figurer. (Merk: Det er mulig å unngå Vault 13 og databiten med en dum figur, du kan for eksempel bruke Psycho for å sette ned intelligensen midlertidig). Man kan rekruttere allierte for kampen, men man kan ikke unngå å konfrontere Frank Horrigan, spillets siste utfordring, i Fallout 2. Til tross for disse faktorene, ble spillet slått i løpet av 17:51 på en video publisert hos Speed Demos Archive.