Packers nådde knapt sluttspillet som femte seed i NFC med et sesongresultat på 10–6. I Wild Card-runden slo de Washington Redskins 35–18 på bortebane. Rodgers avsluttet kampen med 210 yards og to touchdownpasninger. I divisjonsrunden mot Arizona Cardinals kastet Rodgers igjen en Hail Mary-pasning, denne gangen på 41 yards til Jeff Janis, som sendte kampen til overtid, hvor Packers tapte 26–20. Rodgers fullførte 24 av 44 pasninger for 261 yards, med to touchdowns og én interception. Han ble utvalgt til sitt femte Pro Bowl og ble rangert som ligaens sjette beste spiller på NFL Top 100 Players of 2016.