Hun er gravlagt i «Katherine Drexel Shrine» i forstaden Bensalem til Philadelphia. Hennes kiste ble båret av seks menn; to indianere, to svarte og to hvite. Det er beregnet at hun i løpet av sin levetid brukte 12 millioner dollars på arbeidet for indianere og fargede. Til slutt hadde hun ikke igjen noen penger å testamentere bort, og Drexel-fondet gikk til de veldedige formålene som var spesifisert i farens testamente. Disse inkluderte ikke noen av hennes mange prosjekter, som alle var påbegynt etter den tid.