Friarfjordelva utgjør den nederste delen av et vassdrag som starter som flere små bekker på Váđasbákseaibbuš, helt nordvest på Laksefjordvidda. Bekkene samles i Gahpatjávri, og vassdraget fortsetter gjennom Sieidejávri, Store Måsvannet og Loavddajávri, med bare korte elvestubber mellom. Elva fra Loavddajávri kalles , som renner ned til Tredjevannet og Fossevannet. Fra Fossevannet renner Friarfjordelva mot nordvest, passerer gjennom Friarfjordvannet og fortsetter videre til utløpet ved Heimdal i Friarfjorden. Vassdraget er 36,8 kilometer langt, hvorav strekningen fra Fossevannet til fjorden utgjør 5,0 kilometer.