Bakgrunnen for arrestasjonen er ikke klar, men det er ikke usannsynlig at ordren kom fra kong Karl II. Gjennom den omfattende korrespondansen med utlandet samlet Oldenburg også informasjon som ikke var knyttet til vitenskap, for eksempel om politiske forhold. Slik informasjon var han villig til å selge til enhver som kunne betale. En av mottakerne av denne typen informasjon var sir Joseph Williamson, som var undersekretær for lord Arlington. For Williamson og lord Arlington var det dermed egentlig uheldig at Oldenburg ble arrestert, de mistet da en kilde til informasjon. Antagelig har Oldenburg i korrespondansen med utlandet skrevet noe som har fanget kongens oppmerksomhet.