Parkrun ble grunnlagt av Paul Sinton-Hewitt den 2. oktober 2004 i Bushy Park i London, England. Løpet ble opprinnelig kalt Bushy Park Time Trial, og etter hvert som det vokste i popularitet så ble det til et nettverk av lignende løp som ble kalt UK Time Trials. I 2008 spredte konseptet seg til andre land og navnet ble endret til Parkrun. Det første løpet utenfor Storbritannia var i Zimbabwe i 2007, fulgt av Danmark i 2009, Sør-Afrika og Australia i 2011 og USA i 2012. Sinton-Hewitt ble tildelt en CBE i 2014 for hans innsats innen lavterskel-idrett.