Antall tvillingfødsler er høyt ved bruk av IVF. Stimuleringen av eggstokkene kan føre til ovarialt hyperstimuleringssyndrom, og ca 1% av alle som forsøker IVF trenger behandling for dette. Barn som fødes etter IVF har en økt fare for bl.a. lav fødselsvekt, medfødt hjertefeil og leppe-kjeve-ganespalte.