Etter at han avsluttet karrieren som utøver, var han hopptrener, blant annet assistenttrener for USAs hopplandslag og hovedtrener for Canadas hopplandslag. Han bosatte seg i Calgary og ble leder for hopp- og bobsleighanlegget Canadian Olympic Park. Bill Bakke ble tatt opp i The American Ski Jumping Hall of Fame i 2008.