Hun var leder av NAV under Trygdeskandalen 2019–2020, da Trygderetten påpekte at folketrygdlovens krav om å oppholde seg i Norge dersom en var mottaker av enkelte ytelser fra NAV var i strid med EØS-avtalen. Som følge av dette kom hun under sterk kritikk og det kom sterke krav blant annet fra stortingspolitikere om at hun måtte gå av. Det kom frem at NAV hadde hatt kunnskap om Trygdeskandalen siden februar 2019, uten å informere departementet før i august samme år. Robert Erikssons etterfølger som arbeids- og sosialminister, Anniken Hauglie (H), ville som følge av dette ikke svare på om hun hadde tillit til Vågeng.