I oktober 2010 ble det kjent at Klæboe var ansatt som assistenttrener i Sarpsborg 08. Før 2014-sesongen gikk han fra å være assistenttrener til å bli utviklingssjef i Sarpsborg 08. Klæboe ledet også klubbens andrelag i kamper under sin tid i Sarpsborg. Etter 2016-sesongen ga han seg i klubben for å søke nye utfordringer.