Senere slo Raphaëlis seg ned i Sachsen, hvor han blant annet bygget slottskapellorgler til kurfyrst August av Sachsen, som var svigersønn til den dansk-norske dronning Dorothea. Mye tyder på at orglet i dronning Dorotheas kapell på Sønderborg slott kan være et Raphaëlisarbeide.