I sin periode som leder av TULF var Amirthalingam under sterkt press fra unge militante tamiler som anså parlamentarisk arbeid som nyttesløst og var av den mening at kun væpnet kamp kunne vinne det nødvendige selvstyre. Amirthalingam ble samtidig av den singalesiske majoriteten beskyldt for å støtte terrorangrep de samme militante unge utførte.