Cecilie Leganger gikk til slovenske Krim Ljubljana sesongen 2003/2004 og debuterte for klubben i september. Hun spilte ikke hele kamper av hensyn til det korsbåndopererte kneet foran VM i Kroatia. I februar 2004 var hun fullt restituert etter sin korsbåndskade. Hun fant seg ikke helt til rette i Krim og spilte kun en sesong der. Leganger og Krim til finalen i Mesterligaen i håndball for kvinner i 2004, men tapte for Slagelse DT.