Stilmessig er Lupis musikk beslektet med Nicolas Gomberts og utviser typiske tendenser for generasjonen etter Josquin: en tett polyfon sats og en forkjærlighet for polyfone imitasjoner. Lupi var imidlertid særlig opptatt av teksten og var i stand til å lage forståelig musikk i åttestemmig kontrapunkt. Hans chansons kjennetegnes av en vid tematisk spennvidde fra det seriøse til det slibrige.