Reynolds ble rektor ved i 1824. I 1830 ble han professor i katolsk teologi ved, etter Francis Patrick Kenrick. Deretter ble fader Reynolds prest for Sisters of Charity of Nazareth og pastor i Louisville, og ble generalvikar. Bispesetet for bispedømmet Bardstown ble i 1841 fluttet til den nærliggende og viktigere yen Louisville, og ble fra da av til bispedømmet Louisville.