Et kontroversielt innslag i byggingen av tunnelbanen, som ble godkjent den 4. februar 1965 av Mao Zedong, var forslaget å rive ned Beijings bymur, for å muliggjøre byggingen av Linje 2, hvilket dog ble godkjent av Mao som foretrakk å heller rive ned bymuren enn å rive ned bolighus. Tunnelbanen var dog stengt 11. november 1969 till 15. januar 1971 på grunn av en elbrann som utbrøt bare 41 dager etter innvielsen og skadet mer enn hundre personer, av hvilka tre døde, og to tunnelbanevognar, og senere av politiske årsaker under 398 dager 1971–75 (under slutten av Kulturrevolusjonen). Tunnelbanen overgikk fra testvirksomhet til offisiell virksomhet 15. september 1981.