Flere typer HPV kan føre til kreft (inkludert 16, 18, 31, og 45) og er kjent som høyrisikotyper. Kreften kan oppstå i strupehode, svelg, vulva, vagina, livmorhals, penis og anus. Alle disse HPV-typene påvirker flerlaget epitel. Personer med HIV er mer utsatt for å utvikle kreft fra en HPV-infeksjon.