Håndlykken var fra 1997 til 2012 ansatt i ulike organisasjoner innenfor miljøbevegelsen. Han var i en årrekke aktiv i Natur og Ungdoms lokallag i Grenland før han i 1997 ble nestleder i organisasjonen på landsplan. Han ble leder i 1999, et verv han hadde til 2001 da han ble ansatt i miljøstiftelsen Bellona. Sammen med fire andre Bellona-ansatte startet han i 2002 ZERO, der han var daglig leder i ti år.