I et og et halvt århundre var så villaen benyttet av storhertugen av Toscanas ambassadør ved pavestolen, innen familien Medicis mannlige linje døde ut i år 1737. Etter det havnet villaen i hendene på huset Lothringen, men i Napoleon Bonapartes tid ble det oversatt av franskmennene. Det var Napoleon som skjenkte villaen til Det franske akademi i Roma, som har husert der siden da.