Müller virket primært som orgelbygger, men leverte i 1750-årene også billedskjærerarbeider til kirkeinteriør i Danmark. Til Frederiksberg kirke ved København bygget han både selve orgelet og fasaden med rokokkoutsmykninger. Til Larvik kirke leverte han figurene Troen, Håpet, Kjærligheten og Tålmodigheten, skåret i København av snekkermester Hendrich Rohde.