Montenegro − 29. august 2016 informerte den montenegrinske kringkasteren RTCG at Montenegro ikke vil delta i Junior Eurovision Song Contest 2016. San Marino − 14. juli 2016 informerte den sanmarinske kringkasteren San Marino RTV at San Marino ikke vil delta i Junior Eurovision Song Contest 2016. Slovenia − 24. mai 2016 informerte den slovenske kringkasteren RTVSLO at Slovenia ikke vil delta i Junior Eurovision Song Contest 2016. Årsaken til at de trekker seg, er de nye regelendringene i Junior Eurovision Song Contest laget av EBU.