I mars 1932 ble han kontaktet av Hitler som ønsket å leie et Lufthansa-fly til valgkampen, med Baur som pilot. Baur hadde da fløyet rundt en million kilometer og krysset Alpene 150 ganger. I løpet av to uker skulle de besøke 60 byer som del av valgkampen. 1. februar 1933 forlot Baur Lufthansa for å gå i tjeneste hos Hitler. På Tempelhof fikk han sin egen hall og bestilte først seks Junkers Ju 52-fly, senere seks Condor-fly. Snart hørte Baur til den kretsen Hitler samlet rundt seg i rikskanselliet utpå kveldene, på Berghof eller stamstedet Osteria i München. At Hitler ble fløyet til München, var høydepunktet på Röhm-affæren. Ifølge Baur lyktes det å overrumple Röhm fordi Hitler ikke brukte privatflyet som ville blitt gjenkjent overalt, men et annet fly, slik at flyledelsen i München ikke fikk varslet Röhm om at Hitler var landet; Röhm gikk da med planer om å arrestere Hitler, men nå skjedde det motsatte.