Den 4. februar 1913 ble Araujo angrepet av tre menn med macheter og en pistol. Han overlevde selve angrepet, men døde av skadene fem dager senere. Motivet for angrepet ble aldri slått fast, men regjeringen mente at den tidligere visepresidenten Prudencio Alfaro sto bak. Araujo ble etterfulgt av Carlos Meléndez som president.