Napoleon Dynamite er en ny type helt, med rødt, krusete hår, månestøvler og uslåelige evner. Napoleon Dynamite er en sosialt introvert 16 år gammel gutt fra Preston, Idaho, som bor sammen med sin bestemor, Carlinda Dynamite, og hans eldre bror, Kipling Ronald "Kip" Dynamite. Napoleon bruker dagene på å dagdrømme seg gjennom skole-timene, tegne forskjellige fantasimonstre, gå i tottene på broren Kip og unngå sin sleipe onkel Rico. Napoleons bestemor skader ett halebein i en ulykke på en firhjuling, og ber sin onkel Rico om å passe på guttene hennes når hun er skadet. Rico, en middelaldrende tidligere idrettsutøver som bor i en bobil, behandler Napoleon som et lite barn.