Klimaet i Klonike er svært hardt, svært varmt og tørt i den korte sommeren, og ekstremt kaldt gjennom den lange vinteren. Den kalde årstiden varer i syv måneder, fra september til mai, med mange forrykende snøstormer i mellom. Alle elvene er frosset over innen 20. oktober. Telen går ned til en dybde på 1 til 3 meter store deler av året.