Thomson ble doctor of science ved Harvard University 1909, var president ved den internasjonale elektrikkerkongressen i St. Louis i1904 og medlem av den internasjonale elektriske komittén 1908-11. Av utmerkelser dom han fikk, kan nevnes Grand Prix i Paris 1889 og 1900, Grand Prize i Saint Louis, 1904, American Institute of Electrical Engineers første Edisonmedalje i 1909, Hughes-medaljen I1916 og Kelvin-medaljen i 1924.