Alta Museum ble stiftet av Alta Historielag i 1978 og var et kommunalt museum fram til 2007. Museet flyttet i 1991 inn i nytt bygg i Hjemmeluft, og ble i 1993 kåret til Årets museum i Europa. Som ledd i den nasjonale museumsreformen på 2000-tallet ble museet i 2007 et interkommunalt selskap (IKS) eid av Alta kommune og Finnmark fylkeskommune med 50 % ansvarsandel hver. I 2015 ble Verdensarvsenter for bergkunst – Alta Museum i tillegg et autorisert verdensarvsenter gjennom Klima- og miljødepartementet.