Organisasjonen har sin opprinnelse tilbake til en super tungvektskamp mellom Mitch Green og Danny Wofford 9. mars 2002, via forgjengerne World Boxing Syndicate (WBS) og World Boxing Empire (WBE). I 2005 ble WBE slått sammen med United States Boxing Council (USBC), og fikk det nye navnet World Professional Boxing Federation 6. juli 2006.