Strangford Lough og dens øyer er et viktig fugleområde. Strangford Lough er et viktig vintertrekkmål for mange vade- og sjøfugler. Dyr som ofte finnes i «innsjøen» omfatter steinkobbe, brugde og ringgås. Tre fjerdedeler av verdensbefolkningen av ringgås tilbringer vinteren i «innsjøen». Ofte utgjør de opp til 15 000. Våtmarksreservatet Castle Espie ligger ved bredden av vannet nær Comber. Havnespy (), også kalt for japansk sjøpung, er en art sjøpung eller sekkdyr som naturlig hører hjemme i Japan, men har beklageligvis også som fremmed art blitt funnet i Strangford Lough i 2012.