Etter å ha blitt sparket av Saskatchewan returnerte Tripucka til spillerkarrieren med American Football League (AFL) som startende quarterback for Denver Broncos. Broncos hadde ansatt Filchock som hovedtrener, som først hadde ansatt Tripucka som en assistenttrener. Han stilte til start i alle Denvers 14 kamper i lagets første sesong, og selv om han ledet ligaen i interceptions i 1960 med 34 (som fremdeles er en lagrekord) ledet han også ligaen med 248 fullførte pasninger fra 478 forsøk for 3 038 yards (den første sesongen med 3 000 pasningsyards av en quarterback i AFL eller NFL) og 24 touchdowns, inkludert den første touchdownpasningen i ligaens historie. Han stilte til start i 11 kamper i 1961, hvor han kastet for 1 690 yards, 10 touchdowns og 21 interceptions. I 1962 ledet han igjen ligaen med 240 fullførte pasninger, 440 forsøk og 2 917 yards. I en seier over Buffalo Bills i uke 2 kastet Tripucka for 447 yards, en lagrekord som ble stående i 38 år. I løpet av sesongen hadde han 17 touchdowns og 25 interceptions, og ble utvalg til AFLs All Star-kamp. I hans siste sesong med laget i 1963 fullførte Tripucka kun syv pasninger for 31 yards i løpet av to kamper. Han flyttet tilbake til Saskatchewan og endte spillerkarrieren sin som reserve for Ron Lancaster, og endte sesongen der med 38 fullførte pasninger for 435 yards.