Politiets sjøtjeneste er lagt opp som en allsidig tjeneste hvor man patruljerer over store strekninger for å få størst mulig forebyggende effekt av politiets nærvær. Videre prioriteres kontrollvirksomhet mot problemområder som uvettig kjøring, høyhastighetskjøring og promillekjøring. Det er også etablert et utstrakt samarbeid med andre offentlig etater og private organisasjoner på sjøen, som Kystvakten, Tolletaten, Fiskeridirektoratet, Statens naturoppsyn, kommunenes skjærgårdstjeneste og frivillige organisasjoner som Redningsselskapet.