I 1885 ble han utnevnt til assisterende finansminister, hvor han ofte fikk muligheten til å representere til fordel for daværende minister Daniel Manning, mye på grunn av hans dårlige helse. I april 1887 gikk Manning som finansminister, og stillingen gikk til Fairchild, som satt i embetet til slutten av Grover Clevelands første mandatperiode som landets president. Etter denne perioden var han administrerende direktør for New York Security and Trust Company mellom 1889 til 1904. Fairchild døde den 24. november 1924 i sin hjemby Cazenovia.