Flikmelde vurderes i utgangspunktet som nær truet (NT). Ut fra B-kriteriet vurderes den slik på grunn av et noe begrenset forekomstareal og store fluktuasjoner i antall lokaliteter og individer mellom år. Vurderingen nedgraderes til livskraftig (LC°) på grunn av stor sannsynlighet for hyppig nyrekruttering fra større og mer vitale forekomster på strendene i Vest-Sverige og Danmark. Dette er en endring fra sterk truet (EN) i forrige rødlistevurdering på grunn av at arten har hyppig rekrutteringen til landet.