Kargat begynner i de sørlige delene av Vasiugansumpene, på 143 moh, og renner i sørvestlig retning over Barabasteppene, og munner ut i Tsjulym-elva på rundt 110 moh. En stor del av vannføringen fordamper og infiltreres i bakken, og middelvannføringen (ved landsbyen Nizjnij Kargat, 36 km fra munningen) er på kun . I sitt nedre løp er elva rundt 30 meter bred og 2 meter dyp, med en strømhastighet på . Kargat har ingen større sideelver.