Den 25. juli 1967 ble han av pave Paul VI utnevnt til hjelpebiskop i Münster og titulærbiskop av . Bispevielsen ved biskop Joseph Höffner fant sted den 24. september 1967. Medkonsekratorene var hjelpebiskopene Heinrich Baaken og Heinrich Tenhumberg. Ved siden av sine oppgaver som hjelpebiskop ledet Böggering blant annet verdenskirkeavdelingen i generalvikariatet.