Føroya Fiskasøla fikk store økonomiske problemer under bankkrisen på Færøyene i 1990-årene. I 1994 ble samvirket omdannet til et aksjeselskap. Føroya Fiskasøla og fiskeindustribedriften United Seafood ble etter hvert nasjonalisert av danske og færøyske myndigheter. Den danske stat trakk seg ut i 1998. I 2005 ble Føroya Fiskasøla og United Seafood ble fusjonert til Faroe Seafood. Selskapet ble deretter privatisert.