Kongen ble oppmuntret av Diogo de Gouveia, rektor ved , om må rekruttere nesten de ferdigutdannede studenter som var i ferd med å bli approberte som Jesu Selskap. Ignatius utpekte straks Nicolas Bobadilla og Simão Rodrigues. Men i siste øyeblikk ble Bobadilla alvorlig syk. Etter noe nølen og uro spurte da Ignatius Frans Xavier og å ta Bobadillas sted. Slik var det at Frans Xavier ble jesuittenes første misjonær så å si ved en tilfeldighet.