Han kjøpte Apotekergården (Hvedinggården) i Levanger av Rascanus Tonning i 1886, og åpnet dessuten et filialapotek på Verdalsøra i 1903. I løpet av sin tid i Levanger var han blant annet byens ordfører i 1893, valgt som høyremann. I 1906 solgte han sitt apotekerprivilegium til staten, mot å få overta Apoteket St. Olav i Trondhjem. Han besørget flyttingen av apoteket fra Olav Tryggvasons gate til Søndre gate. Aagaard var en tid formann i Trondhjem krets av Den norske apotekerforening. Han døde av spanskesyken i 1918.