Den 29. juni 1963 mottok Lorenzo Baldisseri prestevielsens sakrament fra erkebiskopen av Pisa, Ugo Camozzo. Han var student ved Det pavelige institutt i kirkemusikk (Pontificium Institutum Musicae Sacrae). Han skiftet senere studieretning, og tok sin doktorgrad i kanonisk rett fra Det pavelige Lateranuniversitet i Roma. Dissertasjonen var om .