Radioen ble grunnlagt 1. september 1987 av Odd Tangen og Erling Zappfe. Ole Jon Tveito har vært ansvarlig redaktør fra 1989, og daglig leder fra 1992, med unntak av to år fra 1999-2001, da Ragnar Øhrn hadde vervet. Odd Tangen var første redaktør i 1987, før Øystein Haugan overtok i 1988, Året etter overtok Lisbeth Østmo Bjervøy, som da ble gift og tok navnet Bula, før Tveito overtok 1. desember 1989. Lokalradioen ble omorganisert fra andelslag (A/L) til AS i 2001, da Radio Vest-Telemark gikk inn som hovedaksjeeier. Radioen holdt fra 1987-1992 til i Sam Eydesgate 110, og flyttet 1. juni 1992 til Rjukan stasjon i Såheimsveien 26, der radiostasjonen fortsatt holder til. Radio Rjukan var første lokale nyhetstjeneste som gikk på internett med nyhetside seinhøsten i 1995. Radio Rjukan inngikk i 2019 et nyhetssamarbeid med Amedia-avisen Rjukan Arbeiderblad (RA) for bidra til at RA skulle etableres med nettutgave.