Selv om den bolivianske hæren slo ned det kommunistiske opprøret i oktober 1967, førte det til en politisk skandale i Bolivia i 1968. Det året forsvant president Barrientos nære venn og innenriksminister Antonio Arguedas med Guevaras dagbok, som litt senere dukket opp igjen i Havanna. Fra utlandet erklærte Arguedas at han alltid hadde vært en hemmelig tilhenger av marxismen, og han anklaget Barrientos og mange av hans støttespillere for å være betalt av CIA. Dette ble pinlig for Barrientos, siden anklagen viste til hans lite gjennomtenkte valg, og den førte til at Ovando Candía distanserte seg fra presidenten med tanke på det neste presidentvalget i 1970. Etter Barrientos døde i et helikopterstyrt 27. april 1969, ble Ovando Candía 26. september igjen president etter å ha styret Barrientos visepresident, Luis Adolfo Siles Salinas, i et statskupp.