Den 9. januar 1431 åpnet biskop Cauchon det som skulle bli en av de viktigste rettssaker i Frankrikes historie, i slottskapellet i Rouen: Inkvisisjonsprosessen mot Jeanne d’Arc. Anklagen var at hun var kjetter, heks og trollkvinne, spåkvinne og falsk profet. Biskop Cauchon gjennomførte prosessen i tett koordinering med Englands stattholder Richard Beauchamp, 13. Earl of Warwick, som fra første stund forlanget intet mindre enn dødsstraff.