Mørsvikfjorden er omgitt av fjell som når rundt tusen meters høyde; Hopfjellet, Ånderbakkstindan og Mørsviktinden langs nordkysten og tindene på halvøya Stábánjárgga langs sørkysten. De 2,3 kilometrene av fjorden som ligger innenfor Mørsvikneset, omtales som Mørsvikbotn.