I 2006/07-sesongen kjempet Moore i starten på sesongen sammen med Dean Leacock og Michael Johnson om midtstopperplassene til Derby, men utover i sesongen ble han sammen med Dean Leacock fast førstevalg i midtforsvaret. Totalt spilte Moore 35 ligakamper for Derby, og han fikk også med seg 7 andre obligatoriske kamper for Derby denne sesongen. Han fikk også bokført 4 mål for , og ett av disse målene kom i den siste playoff-semifinalen mot den 15. mai 2007. Han spilte også hele playoff-finalen den 28. mai 2007 da Derby slo hans gamle klubb West Bromwich 1-0, og dermed kvalifiserte seg til spill i Premier League.