Unionens høye representant (HR/VP), er ansvarlig for å foreslå og gjennomføre CSDP-beslutninger. Slike vedtak blir vedtatt av Utenriksrådet (FAC), som generelt krever enstemmighet. CSDP-organisasjonen, som ledes av HR/VP, omfatter de relevante deler av Den europeiske utenrikstjeneste (EEAS) - inkludert Militærstaben (EUMS) med sitt operasjonelle hovedkvarter (MPCC) - en rekke forberedelsesorganer for FAC - som Militærkomitéen (EUMC) - samt fire byråer, inkludert forsvarsbyrået (EDA).