Artsdatabanken oppgir 4 underarter av blåklokke. Plantene i fjellet skiller seg fra lavlandplantene og oppfattes derfor som en egen underart som er gitt navnet fjellblåklokke. I tillegg føres plantene i Nord-Troms, Finnmark og Svalbard, som ligner fjellblåklokke til en tredje underart med navnet polarblåklokke. Denne skiller seg ut ved at den har 34 kromosomer mot det vanlige for arten som er 68. Polarblåklokke ( subsp. ) Fjellblåklokke ( subsp. ) Bakkeblåklokke ( subsp. ) subsp.