I 1960 var Barron Hilton, sønn av hotellmogulen Conrad Hilton, den originale eieren av Los Angeles Chargers i den nye ligaen American Football League. Chargers’ general manager Frank Leahy spurte Lowe om å besøke lagets treningsleir på bakgrunn av Lowes tid med Orgeon State Beavers. Lowe endte opp med å bli signert som en free agent. Hans første berøring i AFL var en 105-yard touchdown i Chargers’ første treningskamp. I 1960 endte Chargers sesongen 10–4 og som divisjonsmestere i AFL Western Division. Han ledet laget med 855 yards på 136 løp og satte en personlig rekord med 6,3 yards per løp, og hadde også 23 mottakelser for 377 yards. Lowe var nummer to i ligaen på løp, 20 yards bak Dallas Texans’ Abner Haynes, og ble utnevnt til All-AFL førstelag som halfback. I American Football League Championship Game 1960 hadde Lowe 165 yards på løp.