Etter uavhengighetskrigen arbeidet Brant også med en føderasjon av seks nasjoner med stammer i det vestlige USA for å motstå amerikansk ekspansjon inn i Nortwest Territory. Hans forsøk på å skape enhet på tvers av stammene mislyktes, men hans forsøk ble gjenopptatt en generasjon senere av shawneenes leder Tecumseh. Da motstanden i nordvest ble krig i full skala (den nordvestlige indianerkrigen), ble Brant bedt om å mekle frem en avtale av administrasjonen til president Washington. Brant var ute av stand til å fremforhandle en våpenstillstand, og krigen fortsatte. Den tok slutt med slaget ved Fallen Timbers i 1794.