For å motvirke dette har man siden 2002 gjenåpnet dammene til sidearmene slik at de i det minste kan gjennomstrømmes ved høyere vannstand. I et pilotprosjekt som ble avsluttet i 2006 ble hele flomvernet langs elvebredden fjernet over en strekning på 3 kilometer ved Hainburg. Prosjektet var støttet av LIFE+-programmet til EU og det østerrikske vannveiselskapet via donau. Slik har elven igjen fått muligheten til å bre seg utover landskapet ved høy vannføring. Etter pilotprosjektet ved Hainburg og Witzelsdorf skal det videre nedbygges 50 % av Donaus elvebredd mellom Wien og den østlige statsgrensen. I tillegg til oppblomstringen av livet i våtmarken langs elven forventes at dette vil redusere virkningen av flom og stabilisere elveleiet til fordel for skipstrafikken.