Vergil drar tilbake til Qliphoth treet, og forteller Dante om å få tilbake hans fulle styrke før de slåss igjen. Nero insisterer på å bli med, men Dante stopper han ved å si at Vergil er hans far, bevist ved hvordan sverdet Yamato reagerte i Fortuna eventet i DMC4 hvor de først møttes, og nekter Nero ifra å drepe hans egen far. Dante blir da møtt med Vs familiærer, avslørt som minner fra Vergils tid som Nelo Angelo, og de velger å dø av Dantes egne hender for å minske Vergils traumer. Dante og Vergil blir nok en gang møtt i en kamp, hvor Vergil lærer at Nero er hans sønn. Nero roer seg ned ved å tilkalle Kyrie, bestemmer seg for å ikke la hverken hans onkel eller far dø, noe som fullt utløser hans demoniske krefter og gror ut hans manglende arm i prosessen. Nero stanser brødrenes dødelige krangel og slår ut Vergil, som gir Vs bok til han som et minne. Vergil og Dante tar en enveistur ned til Underverdenen for å drepe Qliphoth før den ødelegger Red Garve City totalt. Flere uker senere så blir Trish og Lady satt i arbeid av Morrison, som Dante ga makt over hans kontor. I Underverdenen forsetter Dante og Vergil å slåss mot hverandre mens demoner angriper dem, nå som vennlige rivaler istedenfor fiender.