Den 1. januar 1990 inngikk departementet inn i det nye Utdannings- og forskningsdepartementet (UFD) bortsett fra kirkeavdelingen fra det tidligere Kirke- og utdanningsdepartementet som ble flyttet til det tidligere Kulturdepartementet. Det nye departementet fikk navnet Kirke- og kulturdepartementet (KD).