En infrarød laser ledes gjennom et vindu inn i vakuumet til massespektrometeret hvor ionene er. Fragmenteringsmekanismen innebærer absorpsjon av et gitt ion av flere infrarøde fotoner. Forelderionet blir begeistret i mer energiske vibrasjonstilstander til en binding(er) brytes, noe som resulterer i gassfasefragmenter av foreldreionet. Når det gjelder kraftige laserpulser, fortsetter dissosiasjonen via ionisering av indre valenser av elektroner.