I mars 1944 ble det tidligere SS-depotet gjort om til en ny underleir, . Depotet var en improvisert konsentrasjonsleir helt fram til Tysklands kapitulasjon. Gusen II hadde mellom 12 000 og 17 000 fanger, som var fratatt selv de mest grunnleggende fasiliteter. I desember 1944 ble ytterligere en underleir åpnet i nærheten av Lungitz, . Deler av infrastrukturen til en fabrikk ble tilpasset etableringen av leiren. Etableringen av nye underleirer kunne likevel ikke holde tritt med det stadig økende antallet fanger, og kapasiteten var sprengt i brakker i alle leirene tilhørende Mauthausen-Gusen. Fra slutten av 1940 og fram til 1944 økte antallet fanger per seng fra to til fire.