Spillet foregår i en verden hvor parapsykologi eksisterer, og hemmelige forskningsprosjekter avdekket bevis på at kraftige psykiske evner kunne overføres genetisk til andre områder. Spillets viktigste antagonist er et fiktivt amerikansk byrå kalt National Security Executive (NSE) som ønsker å bruke denne parapsykologiske forskningen til deres egne formål. Den amerikanske parapsykologi-forskeren John Vattic våkner inne i en celle ved et medisinsk anlegg i Virginia, uten noen minner om hans fortid eller identitet. Spilleren oppdager at han besitter kraftige psykiske evner av ukjent opprinnelse, som han bruker for å komme seg løs og utforske anlegget han blir holdt fanget ved.