Modellen var nyttig for å forklare arveforhold i enkle tilfeller, men den tar ikke høyde for de komplekse mekanismene vi kjenner til i dag. Moderne genetikk viser at fenotyper avhenger av proteinproduksjon, genregulering og ofte samspill mellom flere gener. Likevel er Mendels arbeid grunnleggende for vår forståelse av genetikk.