Caroline er et viktig fugleområde, særlig på grunn av det store antallet hekkende sotterne (), i 1988–1990 beregnet til hekkende par. Andre hekkende arter av betydning er svartnoddy (), silketerne (), rødfotsule og storfregattfugl (). Alaskaspove flyr sørover for å overvintre på Caroline. For å beskytte fuglelivet, er atollen vernet.