Billborn var involvert i IF Brommapojkarna i flere forskjellige roller fra 1997. Han gikk gradene fra å trene knøttelag, via juniorlag til å bli assistenttrener for A-laget i 2012. Før 2014-sesongen tok han over som hovedtrener for BP i Allsvenskan. I 2015 ble han ansatt som akademisjef i Hammarby IF. I 2017 ble han Jacob Michelsens assistenttrener i Hammarby, før han i 2018 ble klubbens hovedtrener. Den 11. juni 2021 valgte Hammarby å avslutte samarbeidet med Billborn.