I 1894 ble riggen tatt ned, maskinen fjernet og hun ble brukt som losjiskip på Hortens indre havn. 13. september 1932 ble det besluttet å hugge opp fregatten, etter et forgjeves forsøk på å skaffe til veie 30 000 kroner som skulle brukes til å bevare skipet for ettertiden. Dette ble ikke oppnådd, og «Kong Sverre» ble 28. juli 1932 solgt til Stavanger Skibs-Ophugnings Co. AS i Stavanger for opphugging.