Delstaten fikk nye flagg i tiden omkring borgerkrigstiden. Et av de første flagg som da ble heist hadde rød flaggduk med en hvit stjerne i midten og en hvit halvmåne i kantonen. Flagget var uoffisielt, men ble benyttet fra desember 1860 til 1865. Et annet flagg fra samme tid, som også var uoffisielt, benyttet fargekombinasjonen rødt, hvitt og blått, fargene til både USA og sørstatene. Flagget hadde et blått kors besatt med femten hvite stjerner i rød flaggduk, med en kanton der en hvit palme og halvmåne var plassert. Antallet stjerner tilsvarte tallet på stater som tillot slaveri. Dette flagget var i bruk omkring årsskiftet 1860-1861. Et tredje flagg, benyttet i januar 1861, hadde blå flaggduk med en oval hvit skive der det var plassert en gul palme. Også dette flagget hadde en hvit halvmåne i øvre hjørne ved stangen.