Han var sønn av Mogens Gøye (d. 1615) og Hilleborg Eilersdatter Krafse. I årene 1641–19 var han lensherre på Tryggevælde, Sjælland, men ble deretter knyttet til Norge som lensherre over Nedenæs ved Arendal. Her ble han boende, også etter at han mistet lenet i 1630. I 1624 hadde han solgt sin fedrenegård Gunderslevholm, også på Sjælland.