Til slutt, 26. juli 1989, utnevnte pave Johannes Paul II ham til apostolisk administrator og til hjelpebiskop i Olomouc og samtidig titulærbiskop av . Han ble bispeviet 26. august 1989 av den daværende hjelpebiskop i Praha og senere biskop av Budweis, Antonín Liška. Medkonsekratorer var den apostoliske nuntius i Polen, Francesco Colasuonno, og erkebiskop Ján Sokol av Trnava.