I uke 1 mot Buffalo Bills pådro Rodgers seg en ankelskade på sitt fjerde snap etter en sack av Bills’ defensive end Leonard Floyd. Rodgers ble hjulpet av banen og tatt inn i garderoben for videre undersøkelser. Rodgers’ reserve Zach Wilson ledet laget til en 22–16 seier på overtid. Dagen derpå ble det klart at Rodgers hadde revnet akillessenen, og at han derfor var ute for sesongen. Han ble offisielt plassert på injured reserve senere samme dag. Rodgers ble operert 13. september, og kan tidligst være tilbake på banen i midten av januar 2024. Den 29. november åpnet Jets Rodgers’ 21-dagers treningsvindu. Rodgers var begrenset under trening, og klarert for aktivitet, men ikke kontakt. Han ble flyttet til aktiv spillerstall 20. desember, men Jets annonserte at han ikke kom til å spille i løpet av sesongen ettersom laget ikke lenger kunne nå sluttspillet etter et nederlag mot Miami Dolphins i uke 15.