Furlong har kjempet med narkotika- og alkoholmisbruk gjennom hele karrièren. Han gjennomgikk rehabilitering første gang i 2000. Han hevdet da at han ikke likte kokain og at han aldri har brukt heroin. Han har senere sagt at han var avhengig av både heroin og kokain. Han har siden blitt arrestert flere ganger for bruk av narkotika, familievold og brudd på besøksforbud.