Gruppen er delt inn i to underordner, det er antennes oppbygning som ligger til grunn for inndelingen. (Nematocera) har mer enn 3 ledd i antennen som er lang og leddene er tydelig adskilte, litt flate (skiveformede), men runde. Antall ledd varierer, men de er lett synlige som perler på en snor. (Brachycera) har antenner med bare (tilsynelatende) 3 ledd, der det siste leddet har et langt, tynt hår som står ut fra siden eller det kan være spist utdratt (ténformet). Fluer har bredere, kraftigere kropp enn mygg.