GNU Emacs støtter muligheten for å bruke Emacs Lisp som en kommandotolk uten å vise teksteditoren i brukergrensesnittet. I batchmodus blir brukerkonfigurasjonen ikke lastet, og teksten som redigeres blir ikke vist til gjennom kommandoene , eller (eller ved feil). Interrupt-tegnene og vil ha deres vanlige effekt å avslutte et program eller suspendere utførelsen istedet for å påkalle Emacs-tastebindinger. GNU Emacs har kommandolinje-opsjoner som spesifiserer enten en fil som skal lastes og utføres, eller en Emacs Lisp-funksjon som kan sendes inn fra kommandolinjen. GNU Emacs vil starte opp, utføre den innsendte datafil eller funksjon, skrive ut resultatet, og så avslutte. Shebang-linjen kan skape frittstående skript i Emacs Lisp. Batchmodus er ikke en Emacs-modus , men beskriver en alternativ utførelse for Emacs-programmet.