I 2018 ble det avisoverskrifter da Filippinenes president Rodrigo Duterte beskyldte ham for å være narkotikabruker. David var sterkt kritisk til president Dutertes «krig mot narkotika». Den 19. juli 2019 siktet Philippine National Police–Criminal Investigation and Detection Group (CIDG) siktelser mot biskop David og mot biskopene Honesto Ongtioco and Socrates Villegas, og mot medlemmer opposisjonen for «sedition, cyber libel, libel, , harboring a criminal, and obstruction of justice».