Fourier-transform ion syklotron resonans massespektrometri er en type massespektrometri som brukes for å bestemme masse-til-ladningsforholdet (m/z) av ioner basert på ionens syklotronfrekvens i et fast magnetfelt. Ionene er fanget i en Penning-felle der de blir begeistret for en større syklotronradius av et oscillerende elektrisk felt som er vinkelrett på magnetfeltet. Eksitasjonen resulterer også i at ionene beveger seg i fase (i en pakke). Signalet oppdages som en bildestrøm på et par plater som pakken med ioner passerer nær mens de syklotroner. Det resulterende signalet kalles et fritt induksjonsforfall (fid), transient eller interferogram som består av en overstilling av sinusbølger. Det nyttige signalet ekstraheres fra disse dataene ved å utføre en Fourier-transformasjon for å gi et massespektrum.