Fra 1983 til 1990 var Kitarō gift med Yuki Taoka, datter av Kazuo Taoka som var en av de mest fremtredende innen japansk organisert kriminalitet, "The Japanese Godfather". De har en sønn. Tidlig på 1990-tallet flyttet han fra Japan til USA. På midten av 1990-tallet giftet han seg med Keiko Matsubara, en musiker som spilte på flere av albumene hans. Sammen med Keikos sønn bodde paret i Ward, Colorado, på en 72 hektar stor eiendom, hvor han komponerte i sitt 230 m² store hjemmestudio "Mochi House" (det er stort nok til å romme et orkester med 70 medlemer). Rundt 2005 flyttet de til Sebastopol, California.