Nordnorsk Kunstmuseum viser utstillinger med både historisk og samtidig kunst og kunsthåndverk, basert på museets egen kunstsamling, utstillingsspesifikke innlån, langsiktige deposita og donasjoner. Langsiktige deposita omfatter verk fra Nasjonalmuseet, KODE, SpareBank 1 Nord-Norges kunststiftelse, Sparebankstiftelsen DNB NOR, Tromsø Kunstforening, UiT - Norges Arktiske Universitet, Tromsø Museum og flere private samlinger.