Giacomo Morandi studerte filosofi og katolsk teologi ved det interdiocesane seminar Reggio-Modena-Parma-Carpi i Reggio nell'Emilia. Han ble presteviet den 11. april 1990 av erkebiskopen av Modena-Nonantola, Santo Bartolomeo Quadri. I 1992 ble Morandi uteksaminert fra Det pavelige bibelinstitutt i Roma med en grad i bibelske studier og fra Det pavelige gregorianske universitet med en grad i missiologi. I 2008 tok han doktorgraden i missiologi med en avhandling om teologi i evangeliseringen.