Forgjengeren til universitetet var Shiritsu Tetsugakukan (私立哲学館) som ble grunnlagt i Rinsho-in templelet i 1887 av Enryo Inoue. Inoue følte at filosofi ble neglisjert på høyere japanske skoler på denne tiden. I 1906 flyttet skolen til sitt nåværende sted (Hakusan Campus) og endret navn til Universitetet i Tōyō. Universitetets motto er «Grunnlaget for all læring ligger i filosofi». Universitetet har 30,556 studenter.