Han var sønn av den tyskfødte kirurg Christian Frauen (d. 1717), morens navn var Elisabeth Marie Dalhuus (d. 1731). Frauen ble student i Trondhjem fra 1705, men reiste siden til Halle, hvor han formentlig ble påvirket av pietismen. Etter hjemkomsten, ble han med støtte av prins Carl og prinsesse Sophie Hedevig sogneprest i Gerlev og Dråby i Hornsherred på Sjælland. Her giftet han seg med den avdøde sogneprest Bendix Lysters (d.1721) enke, Anna Juel (d. 1744). Bryllupet foregikk den 21. juli 1722 på Jægerspris slott, som på det tidspunkt tilhørte prins Carl.