Den har innløp vest for Osparøya mellom Justenakken og Rubbestadneset og går først litt sørvestover. Den ytterste delen av fjorden er cirka like lang som den er bred og på sørsiden ligger Klenesvågen og grenda Ekornsætre. Lengst vest i fjorden ligger Innvær, som fjorden er oppkalt etter. Mellom Innvær og Rubbestadneset strekker en smal del av fjorden seg cirka 1,5 kilometer nordover til Stangarvågen. Ved innløpet til denne smale delen av fjorden går en cirka 15 meter lang bro langs riksvei 541 over fjorden til Rubbestadneset.