Padmé og Obi-Wans Padawan Anakin Skywalker reiser deretter til Geonosis, i forsøk på å redde Obi-Wan Kenobi. Men de blir også tatt til fange, og alle tre Jediene blir umiddelbart dømt til døden. Når en stor gruppe Jedier ankommer planeten for å redde trioen, får de snart selskap av republikkens nye klone-hær. Dette resulterer i en storstilt konflikt mellom republikken og separatist-styrkene. Grev Dooku planlegger å flykte fra området når motstanden blir alt for stor, men Obi-Wan og Anakin Skywalker følger etter ham - og de havner i en lyssabel-duell.