I løpet av den tredje sesongen utvikler det seg et blomstrende romanse mellom Joey og Pacey. Men Dawson oppdager at de to vennene hans har blitt kjærester bak ryggen hans, og han blir oppgitt og irritert. Dawson og Pacey begynner etter hvert å konkurrere om Joeys kjærlighet. Jen vekker imidlertid interessen til fotballspilleren Henry Parker, selv om Jen til å begynne med mener at Henry er alt for umoden.