I april 1990 innebar innstilling av etterforskningen mot de tre militæranklagede for drapet (José Carlos González, Luis Manzanelli og Ricardo Román Oscar Otero). Denne loven, og loven om tilbørlig lydighet ble opphevet i 2005, og i august samme år ble saken gjenåpnet. Høyesterett delte saken i to: Anklagen mot militæret ble sendt til tribunalene i Córdoba, og mulig deltagelse av sivile i drapet ble sendt til La Rioja. Tidligere kommandør Menéndez ble innstevnet av La Rioja-domstolen 16. mai 2006, men kom ikke med noen uttalelse. Den 5. juli 2014 ble Menéndez og Luis Estrella, som hadde ledet flyvåpenbasen og tortursenteret i El Chamical, dømt til livstid for drap på Angelelli.