I 1990 var han med på å kjøpe et oppdrettsselskap, som i 1999 ble solgt til et konsortium av norske og færøyske interesser. I 2003 kjøpte de det tilbake under navnet Faroe Farming, der Joensen ble administrerende direktør. Bakkafrost fikk i 2011 en kontrollerende eierpost i virksomheten.