Navnet kom av V8-motorens sylindervolum som var 3.6 liter. Hver sylinder hadde fem ventiler og fikk bensin fra et innsprøytningssystem levert av tyske Bosch. Den ble den første Ferrari som i sin helhet var laget av aluminium,<ref>Kjell Magne Aalbergsjø, Ferrari Challenge''. Den hadde samme motor, men var ellers endret for å kjøre ekstra fort. fra 2002 var laget i 30 eksemplarer for bruk i FIE og A.C.O. sine raserløp. var en 110 kg lettere 360 Modena med 425 hk. Det ble ellers laget diverse spesialutgaver. fra 2000 med lav frontrute var Gianni Agnelli (1924–2003) sin bryllupsgave da fabrikkens president Luca Cordero di Montezemolo (født 1947) giftet seg for tredje gang, med den 29-årige gullsmeden Ludovica Andreoni.