I 1623 opprettet Christian IV Sorø Akademi som et akademi for unge adelsmenn. Akademiet fungerte som en slags overbygning til skolen og var ment som en høyere utdanningsanstalt slik at adelen ikke trengte å reise til utlandet. Dette akademiet stengte i 1665 og i 1737 ble også skolen nedlagt.