I 1957 mottok Israels myndigheter informasjon som indikerte at Adolf Eichmann hadde bosatt seg i Argentina. I 1959 fikk Harel det øverste ansvaret for en operasjon som gikk ut på å finne, arrestere og i all hemmelighet få Eichmann ut av Argentina, med den hensikt å få ham til Israel slik at han kunne stilles for retten.