Han og hans kone unnslapp så vidt Gestapo, og etter et kort opphold i Sveits dro han til Amerika. Han underviste ved forskjellige universiteter før han slo seg ned ved Louisiana State-universitetets Department of Government i 1942. De ble amerikanske borgere i 1944. Han tilbrakte mesteparten av sin akademiske karriere ved University of Notre Dame, Louisiana State University, Universitetet i München og Stanford universitetets Hoover Institution. Louisiana-universitetet opprettet i 1987 et Vogelin-institutt til minne om hans virke ved universitetet.