Hunskår har til 2013 publisert over 350 vitenskapelige publikasjoner innen smerteforskning, urologiske emner (spesielt urininkontinens), legevaktmedisin og generelle allmennmedisinske emner. Han har veiledet om lag 20 kandidater til medisinsk doktorgrad. Hunskår er mye benyttet som foredragsholder i inn- og utland, og har holdt en rekke inviterte foredrag ved internasjonale forskningskongresser. Han har skrevet mange bokkapittler og vært medredaktør i flere bøker. Hans mest kjente verk er læreboken «Allmennmedisin» som blir brukt i legeutdanningen i hele Norden (3. utgave i 2013).