Grntsjarov startet sin fotballkarriere med ungdomsfotball hos FK Vardar på siste halvdel av 1990-tallet, hvor han fikk sin debut på førstelaget under 1999/2000-sesongen av Prva Liga. I 2000 meldte han overgang til den serbiske klubben OFK Beograd, hvor han etablerte seg fast på førstelaget og hvor han omsider ble tatt ut for spill på det makedonske herrelandslaget i en alder av 20 år. Som følge av hans spill begynte klubben å se nærmere etter talenter i makedonsk fotball, og i løpet av 2002/2003-sesongen signerte klubben kontrakter med fem andre makedonske spillere.