Londonkonvensjonen forble grunnlaget for relasjonene mellom Storbritannia og SAR frem til 1899 da andre boerkrig brøt ut. Ved krigens slutt i 1902, sluttet SAR å eksistere som uavhengig stat og ble i stedet den britiske kronkolonien Transvaal. I 1907 fikk Transvaal selvstyre under kronen, og i 1910 sluttet den seg til Kappkolonien, Orange River Colony og Natalkolonien og dannet Unionen Sør-Afrika.