Eléonore er det trettende barnebarnet til kong Albert II av Belgia. Hun ble døpt av kardinal Godfried Danneels, erkebiskop av Mechelen-Brussel den 14. juni 2008 i kapellet ved slottet Château Royal de Ciergnon i de belgiske Ardennene. Kronprinsesse Victoria av Sverige og Claire av Belgia var gudmødre og grev Sébastien von Westphalen zu Fürstenberg.