Men, Downes fant en ny vei for ved å kontakte vokalisten og bassisten John Payne. Ved å skaffe nye musikere, ledet han gjennom 1990-tallet med en rekke velproduserte, men dårlig solgte album. Comeback-albumet fra 1992 hadde deler fra Steve Howe og Carl Palmer. Downes' miljøforkjempede single «Who Will Stop The Rain?» fikk mye spilletid på radio, men den tungt promoterte Aqua-turneen med Howe ble dårlig mottatt av bandets fans, spesielt fordi Howe først kom på scenen etter at halve konserten ble spilt. Likevel ble turneen suksessfull nok til å garantere bandets langlivhet.