Etter å ha gått til halftime uavgjort 10–10 tok San Francisco avspark i andre halvdel og flyttet ballen 60 yards på ni plays, hvor Emmanuel Sanders tok imot to pasninger for 20 yards, Samuel løp for 14 yards og Juszczyk tok imot en pasning på 14 yard. Gould avsluttet drivet med et 42-yard field goal som gav 49ers en 13–10 ledelse. Linebacker Fred Warner hadde så en interception på Mahomes på neste drive, som han returnerte tre yards til San Franciscos 45-yard linje. 49ers' quarterback Jimmy Garoppolo startet neste drive med en 16-yard pasning til Samuel. Tre plays senere, på tredje down med åtte yard igjen, kastet han en 26-yard pasning til receiver Kendrick Bourne og fulgte det opp med en 10-yard pasning til Juszczyk til Chiefs' 1-yard linje. Raheem Mostert løp ballen inn i målsonen på neste play, og økte 49ers' ledelse til 20–10 med 2:35 igjen av tredje kvarter.