Brann fikk liten nytte på banen av Giske på grunn av ryggskaden. Han overtok et lederverv i Brann like etter og fortsatte å arbeide med spillerutvikling i klubben frem til 1998. I 1999 overtok han som assistenttrener og var i perioder trener ved Bergen Fotball Akademi. Etter noen år gikk han over til Sogndal IL som spillerutvikling. Anders Giske har siden høsten 2005 vært ansatt som sportslig leder for Sogndal IL. Han har tatt fotballforbundets Trener III og Leder III-utdannelse. Han er også medeier og gründer i firmaet 2feet, som antas å ha oppfunnet den nye ballgolfsporten og ferdighetsspillet Putball.