Hun forlot også stillingen som styreleder i det svenske bankforbundet da hun fikk sparken som administrerende direktør i Swedbank. 23. mars 2020 kunngjorde Swedbank at styret ensidig hadde sagt opp avtalen om sluttvederlag til Bonnesen. Totalt ville Bonnesen fått sluttvederlag på 18 månedslønninger, cirka 21,5 millioner svenske kroner, ifølge bankens årsrapport.