Nautilus har støtte for å utforske lokale filsystemer samt nettverkstjenere (gjennom FTP, SSH og Samba, men også flere filoverføringsprotokoller). Nautilus støtter å forhåndsvise filer i ikonene deres (tekstfiler, bilder, lyder og video) ved hjelp av Totem. Nautilus inkluderer originale vektoriserte ikoner laget av Susan Kare. Nautilus har støtte for bokmerker, vindusbakgrunner, emblemer, notater og utvidelses-skript, og har forskjellige visningsmoduser å velge i, inkludert ikon- og liste-visning. Det fører en logg over besøkte kataloger som gir brukeren enkel tilgang til tidligere besøkte kataloger. Ved hjelp av Gamin-biblioteket, sporer Nautilus endringer i lokale filer i sanntid, noe som fjerner behovet for å oppdatere visningen manuelt.