I 348 f.Kr. ble Stageira angrepet av Filip II av Makedonia som deretter ødela byen. Til gjengjeld for at Aristoteles ga undervisning til hans sønn Aleksander i Pella, lot Filip byen bli gjenoppbygd og la beboerne bosette seg der på nytt. De hadde da vært gjort til slaver. Mange nye strukturer ble bygd på denne tiden, blant annet en akvedukt, to helligdommer for Demeter og mange hus. Innbyggerne startet senere en festival til ære for Aleksander i takknemlighet.