Han var sønn av bonde Johannes Frederik Joensen (død 1934) og hustru Anna Katrine Abrahamsen (død 1954) på Mykines. Han ble døpt Samuel Elias Frederik Joensen. I 1943 gjorde han en formell navneendring til Sámal Joensen-Mikines, som tok opp i seg øynavnet og svarte til den færøyske skrivemåten.