Lakseparasitten ble påvist i Skibotnvassdraget første gang i 1979, som følge av utsetting av infisert settefisk fra Sverige. Elva har to ganger vært behandlet med rotenon for å bekjempe parasitten, men forsøkene var mislykket og elva er fortsatt (per 2013) infisert av parasitten.