Vedtak om å opprette en biologisk stasjon i Trondheim kom under et fiskerimøte i Kristiansund i februar 1891. Formålet med en slik stasjon var at det skulle tilknyttes arbeider i praktisk-vitenskapelig retning for å fremme fiskeri i Trøndelag- og Romsdaldistriktet. Flere prominente borgere i Trondheim støttet forslaget og det ble sendt inn en søknad til Trondhjems Brændevinssamlag om et økonomisk bidrag. Etter å ha fått tilsagn på søknaden ble det i september 1891 nedsatt en plankomité for å gjennomføre prosjektet, hvor blant annet Vilhelm Storm var en av medlemmene. Flere lokaliteter langs havnen i byen ble vurdert, hvor tollvakthusene ved Skansevollene var komiteens førstevalg frem til Forsvarsdepartementet avslo dette alternativet.