PWS er en skade i sentralnervesystemet, og som skyldes en kromosomfeil på kromosom 15. Dette vil gi særlig forstyrrelse av den del av hjernen som heter hypothalamus, som er viktig for i kroppens ulike hormoner som utskilles fra hypofysen. En av konsekvensene ved redusert funksjon i hypothalamus funksjon vil være nedsatt utskillelse av kjønnshormoner, som i seg vil føre til forsinket pubertet, manglende utvikling av kjønnsorgan, redusert seksuell lust og hjemmet modning av reproduksjonsorgan til både jenter og gutter.