Smith begynte som en Agent, et AI-program i Matrix programmert til å holde orden i systemet ved å avslutte menneskelige simulasjoner som ville bringe ustabilitet til den simulerte virkeligheten. Han får også i oppdrag å bli kvitt eventuelle useriøse programmer, som ikke lenger tjener noen hensikt for Machine-kollektivet. For dette formål besitter Smith og hans med-agenter en rekke over-menneskelige egenskaper. Smith kan manifestere sin fysiske form ved å overskrive den simulerte kroppen til et menneske som er koblet inn i Matrixen. Han kan bevege seg fra kropp til kropp, og kan reformere seg selv hvis han blir "drept" (som bare dreper vertskroppen) og kan dukke opp praktisk talt hvor som helst.