Fra 1952 til 1974 var Alfrink president for den nederlandske avdeling av Pax Christi; fra 1965 til 1975 også for hele denne internasjonale forening Han engasjerte seg også for opprettelsen av et interkirkelig fredsråd i Nederland i 1966. Alfrink støttet Edward Schillebeeckx og betraktet den kirkelige vstandtagen fra noen av habns teologiske synspunkter som en krenkelse av den nederlandske kirke.