Protonet ble oppdaget av flere fysikere, det er fordi man ofte ikke klarer å definere hva man har oppdaget, eller oppdaget det indirekte. Navn som bør nevnes er blant annet Eugen Goldstein i 1886 og Wilhelm Wien i 1891, men det var Ernest Rutherford som i 1919 først publiserte forskning som påviste eksistensen av protonet.