Etter å ha avsluttet fjoråret 6–10 etter å ha startet sesongen 0–9 var 49ers ute etter å en sterkere sesongavslutning og å nå sluttspillet for første gang siden 2013. 49ers avslutt derimot sesongen 4–12 og slet med flere seriøse sesongavsluttende skader, inkludert at running back Jerick McKinnon revnet et korsbånd under treningsleir, og quarterback Jimmy Garoppolo revnet et korsbånd i kampen mot Kansas City Chiefs i uke 3. Etter et tap mot Seattle Seahawks i uke 13 kunne laget ikke lenger nå sluttspillet. Det var første gang siden 1979 at San Francisco gikk 0–8 på bortebane.