I motsetning til USAs store hangarskip er ikke «Queen Elizabeth» utstyrt med fly-katapult og ståltau-system for å stoppe fly som lander. I stedet skal skipet brukes av V/STOL-fly; skipets flyavdeling vil typisk bestå av F-35B Lightning II jagerfly og Merlin-helikoptre med AWACS-radar og antiubåt-systemer.