Saken var svært lenge til behandling i USADA, det amerikanske antidoping-forbundet, hvor det til slutt ble erkjent at han hadde brukt ulovlige midler. Reglene til UCI, det internasjonale sykkelforbundet, krever at kjennelsen om diskvalifisering er gjort i syklistens hjemland. Landis ble utestengt fra proffsykling i to år. Han vant ikke frem med sin anke, og i september 2007 ble Óscar Pereiro Sio utropt til vinner av Tour de France 2006.