Brady startet i begge kampene i sluttspillet. Patriots vant 41–28 mot Houston Texans i divisjonsrunden. Brady hadde 344 pasningsyards og tre touchdowns, og ledet laget til AFC Championship Game i hans 12. år som startende quarterback. Med seieren forbigikk Brady Joe Montana i antall sluttspillseiere med 17. Patriots tapte så mot Baltimore Ravens, som gikk videre til å vinne Super Bowl XLVII, 28–13 i AFC Championship. Han kastet for 320 yards med én touchdown og to interceptions. Det var Bradys første nederlag noensinne på hjemmebane etter å ha ledet til halftime, etter 67 slike kamper.