Historien til kirken strekker seg tilbake til andre halvdel av det 17. århundre, da St. Benon broderskap bestemte seg for å bygge en ny kirke. Bygningsarbeidene ble avsluttet i 1669. Mot slutten av det 18. århundre ble kirken overtatt av redemptoristene, på samme tid som St. Klemens kom til Warszawa i 1778.