På Malta ble han utnevnt til professor i fysiologi og bakteriologi ved Maltas universitet. Han ble også nominert som spesialist i patologi ved Central Civil Hospital i Floriana. Som følge av at hans bror, professor Carmelo Samut, døde i 1915, ble han utnevnt til professor i anatomi og patologi ved Maltas universitet i tillegg til de to posisjonene han allerede hadde. I tillegg til sine posisjoner, tok han seg tid til hjemmebesøk og da mange av beboerne i Floriana var fattige, behandlet han dem uten kostnader.