Fra Senja sorenskriveri kom første avlevering av arkiv i 1896 og neste i 1919. En avlevering i 1931 inneholdt blant annet arkivsaker fra 1850-tallet, og dette var den siste avleveringen som inneholdt materiale som proveniensmessig tilhører Senja og Tromsø sorenskriveri. De mest sentrale protokollseriene ble overført fra Statsarkivet i Trondheim til Statsarkivkontoret i Tromsø da dette ble opprettet i 1952. I 1983 ble pakkesakene og noen protokoller overført. Arkivet etter Senja og Tromsø sorenskriveri er på 48,5 hyllemeter.