Den andre store bedriften i Beckton, kloakkrenseverket, er fortsatt i drift. Det ble grunnlagt i 1864 som en del av Joseph Bazalgettes plan for å fjerne kloakk fra Londons elver, og dermed minske antall sykdomstilfeller. Det drives nå av Thames Water, og er det største kloakkrenseverket i Storbritannia.