Som tingmann hørte Holmboe først til opposisjonen, men litt etter litt inntok han et mer moderat standpunkt og ble i sin siste tid regnet som en av regjeringens mest trofaste støtter. Som medlem og formann i Stortingets kirkekommisjon hadde han stor innflytelse på det norske skolevesenet. Han utga flere småskrifter og en mengde avisartikler om pedagogiske spørsmål.