Yale har det nest største pengefondet av alle verdens utdanningsinstitusjoner. Det var i 2019 verdt 30,3 milliarder dollar. Justert for skolens størrelse gir dette vel over 2 millioner dollar per student, mer enn Harvard og kun mindre enn Princeton University. Modellen brukt av Yale Investment Office for å forvalte skolens pengefond regnes som det ledende i USA. Yale er det amerikanske eliteuniversitetet som bruker klart mest ressurser per student, i 2019 på over $120 000, sammenlignet med $50 800 ved Harvard og $62 600 ved Princeton. Dette er på tross av en relativt lik gjennomsnittlig nettopris på $16 000-$18 000 ved alle tre.