Sindre Eid startet sin karriere for Langevåg Idrettslag og var blant annet på U15 (guttelandslaget) og scoret vinnermålet mot Tsjekkoslovakia i 1990, da de fikk bronse i en turnering avholdt i Polen. Etter å ha vært på U16 i 1991 og U17 i 1992 gikk han over til Molde FK som også hadde kjøpt André Nevstad fra Hødd, og lånt Roar Strand fra Rosenborg. Eid gikk på Molde videregående skole (toppidrettsgymnas) og var også blitt kaptein på U18 (juniorlandslaget) og med i Even Pellerud sitt såkalte «Prosjekt VM/98». I 1994 spilte Eid for OL-Laget, men foran 1995-sesongen gikk han til Hødd for kroner 150 000 sammen med Andre Nevstad, og fikk mange kamper i Tippeligaen 1995 som rykket ned, men han var i U21-troppen (kaptein), da og tapte 0-5 for RBK i semifinalen av Norgesmesterskapet i fotball for herrer 1995.