Marwan Issa ble drept den 10. mars 2024 i et israelsk luftangrep mot en tunnel i Nuseiratleiren på den sentrale Gazastripen. Israel meldte at Marwan Issa kunne ha mistet livet da, men sa at saken var fremdels til analyse. Den 17. mars 2024 ble det meldt at Hamas hadde bekreftet privat at Issa var blitt drept i angerpet. Han var så langt i krigen den høystrangferend Hamas-kommandant som var blitt drept i krigen. Den 18. mars 2024 bekreftet Det Hvite Hus' masjonaler sikkerhetsrådgiver Jake Sullivan Issas død. Den 26. mars 2024 bekreftet Israel Defense Forces offisielt Issas død.