Gårdens historie skal gå tilbake til før vikingtiden. Det er ikke kjent akkurat når gården ble prestegård, men prestegårdsstatusen er i alle fall bekreftet i 1527. En rekke gårder og gårdparter ble etterhvert underlagt prestegården, og Bø tettsted ligger på det som var prestegårdens grunn. Prestegårdsjorden ble etterhvert fradelt og solgt, og selve prestegårdstunet med hovedbygning, stabbur og hage ble i 2006 solgt til Stiftinga Bø Prestegard. Stiftelsen har som mål å ta vare på den lokale kulturarven, og gården brukes til diverse kulturformål.