Han dukket opp igjen i , og tok over et nytt sted som het Dinosaur Land. Mario-brødrene og Peach var på ferie på den nærliggende Yoshi Øya, og Bowser grep muligheten og kidnappet henne igjen. Denne gangen tok han opp kampen i sin nye inntrettning, "klovnebilen", et helikopterlignende kjøretøy med et svært klovneansikt utpå. Etter nok en kamp måtte han gi slipp på Peach og forsvant igjen.