I 1851 ble han professor ved Philipps-Universität Marburg og i 1865 ved Universitetet i Leipzig. Kobles arbeider faller hovedsakelig inn under organisk kjemi. Blant de tidligere kan nevnes hans studier av klors virkning på karbondisulfid, av nitrilene (et arbeid påbegynt sammen med Edward Frankland under et besøk i London 1845-47) og av splitting av organiske syrer med elektrisk strøm, samt metoden for å fremstille syrer med høyere karboninnhold fra alkoholradikalenes cyanforbindelser (dvs. nitriler).