Sąjūdis var den senest stiftede av folkebevegelsene i de tre baltiske landene. Stiftelsesmøtet valgte ingen leder, men etter en måned ble pianisten og musikkprofessoren Vytautas Landsbergis valgt som president. Ved valget til folkekongressen i Moskva i 1989 lå Sąjūdis an til å vinne samtlige av mandatene. I valgkretsen til den respekterte kommunistlederen Algirdas Brazauskas unnlot Sąjūdis å stille lister, slik at også kommunispartiet ble representert i Moskva. Ved valget i mars 1990, vant Sąjūdis to tredeler av plassene i Litauens øverste sovjet. Ved valget i 1992 var partiet nest størst i parlamentet, men allerede i 1996 var Sajudis ute av nasjonalforsamlingen. Landsbergis hadde i 1996 brutt ut av partiet og ledet det konservative Tevynes sajunga - Lietuvos konservatoriai.