Fowler ble draftet av Philadelphia Eagles i NFLs draft i 1959, men endte heller opp med å signere med American Football Leagues Buffalo Bills. Han var en del av lagets første spillerstall i 1960-sesongen, og som startende halfback ble han den første Bills-spilleren med 100 yards på løp i en kamp. En revnet akillessene i 1961 endte spillerkarrieren hans.