Den 9. mars 2018 signerte Fitzpatrick en 1-årig kontraktforlengelse med Buccaneers. Kampstarteren Jameis Winston ble suspendert i tre kamper, som gjorde Fitzpatrick til Buccaneers' startende quarterback i begynnelsen av -sesongen. I uke 1 mot New Orleans Saints fullførte Fitzpatrick 21 av 28 pasninger for et personlig beste 417 yards, og hadde fire touchdownpasninger samt 36 yards og en touchdown på løp. Fitzpatrick fikk en quarterback rating på 156,2 i kampen, som Buccaneers vant 48–40. Han ble utpekt til NFC Offensive Player of the Week for sine prestasjoner i sesongåpningen. Fitzpatrick fortsatte å imponere i uke 2 mot Philadelphia Eagles, hvor han fullførte 27 av 33 pasninger for 402 yards og fire touchdowns, for en QB rating på 144,4 til tross for å ha kastet en interception. Buccaneers vant kampen 27–21. Fitzpatrick ble utpekt til NFC Offensive Player of the Week for andre uke på rad. Hans uventede prestasjonsnivå i sesongens to første kamper førte til at folk igjen begynte å ta i bruk kallenavnet han fikk i sin tid med Bills, "Fitzmagic". Under mot Pittsburgh Steelers i uke 3 hadde Fitzpatrick 411 pasningsyards, tre touchdowns og tre interceptions da Buccaneers tapte 27–30. Han var dermed den første spilleren i NFL til å ha 400+ pasningsyards i tre kamper på rad. Fitzpatrick stilte igjen til start i uke 4 mot Chicago Bears, men imponerte ikke; han hadde kun 126 pasningsyards og en interception. Han ble erstattet av Winston, og Buccaneers tapte kampen 10–48.