Oppert, som hadde jødiske foreldre, studert først jus i Heidelberg, siden orientalske språk i Bonn, Berlin og Paris. I Kiel tok han doktorgraden i 1847 med arbeidet . Samme år forlot han Tyskland og dro til Frankrike. Han ble tatt i mot med åpne armer av forskningspersonligheter som Jean Antoine Letronne, Eugène Burnouf, Silvestre de Sacy og Adrien Prévost de Longpérier, som alle innså at hans verk «Lautsystem des Altpersischen» (1847) var ett av de viktigste bidrag til forståelsen av gammelpersisk. Han ble lærer i tysk ved Lavals lyceum, og senere i Reims.