August 2013, signerte Mannion for Birmingham City. Hun fikk debuten sin 16. oktober 2013, i den første kampen mot det finske laget PK-35 Vantaa, i Champions League 2013-14. Birmingham slo PK-35 Vantaa 1-0, og gikk videre til åttedelsfinalen. Mannion spilte hvert eneste minutt i seriekampene, og ble nominert til PFA Women's Young Player of the Year i 2015, men ble slått av Leah Williamson. Hun signerte en ny kontrakt i forkant 2016-sesongen. I 2016 fortsatte Mannion der hun slapp av i sesongen før, og startet alle kamper bortsett fra siste seriekampen. Da hadde hun startet i 44 seriekamper på rad. Birmingham kom seg til FA Cup finalen for andre gang i historien. Mannion startet også denne kampen, men Birmingham måtte se seg slått 4-1 av Manchester City. Under Marc Skinner, ble Mannion valgt ut til PFA Team of The Year, i 2017-18 og 2018-19. Etter at hun avslo tilbudet om ny kontrakt, forlot hun klubben 30. juni 2019.