Edmund Spenser antas å ha blitt født en gang rundt 1552 i London. Det er ikke funnet dokumentasjon for hans fødsel, men i en passasje i diktet «Amoretti» sies at han har levd i 41 år. «Amoretti» ble utgitt i 1595, og på tittelsiden nevnes at diktet er «skrevet for ikke lenge siden», noe som setter fødselsåret til 1552 eller 1553. Også fødestedet London er rekonstruert fra en velvillig tolkning av ett av hans dikt: («Lykkelige London, min vennligste amme, som ga meg denne livets førstefødte kilde».) I det samme diktet nevner han at hans navn kommer fra , «et hus av eldgammelt ry». Antagelig kom hans familie fra dem beskjedne Spencer-slekten i det nordøstlige Lancashire.