Fra Romerriket fall i 476 e.Kr. til tidlig på middelalderen i tiden rundt 1000, var Capri underlagt Napoli, dog uten å bli påvirket av de politiske forandringer som skjedde under forskjellige dynastier som regjerte byen. Capri hadde nok med sine egne problemer, særlig lå den utsatt til fra angrep fra pirater.