Integrert i dobbeltmembranen kan det finnes mange slag proteiner, avhengig av hvilken celle eller organell det er snakk om. De kan være , proteiner. De transmembrane proteinene er integrert i selve membranen, mens de perifere kan være knyttet til membranens innside eller utside. De perifere proteinene kan også være frie fra membranen på innsiden eller utsiden av organeller, eller på innsiden av cellemembranen.