På begynnelsen av 2000-tallet vedtok fylkestinget i Hedmark å bygge ny storskole for Hamar. Den nye skolen fikk navnet Hamar katedralskole. Samtidig vedtok fylkestinget å beholde Storhamar videregående skole og å legge ned Ankerskogen. Høsten 2006 ble Ankerskogen og Ajer videregående skole fusjonert inn i Hamar katedralskole. Høsten 2008 ble de tre skolene samla under ett tak. Dermed var det slutt på Ankerskogen som en selvstendig skole. Åshild Skomedal var skolens siste rektor.