Det gikk ikke lang tid før man begynte ombyggingen til det som skulle bli dagens gotiske katedral. Rundt 1420 føyde man til vestkapeller og fundamentet til et tårn. Byggingen ble avsluttet i siste halvdel av 1400-tallet og da hadde man bygget om koret til et gotisk høykor i fire fag i hele skipets bredde. Høye gotiske vinduer var plassert i hvert fag. Innvendige hvelvinger og ferdigstillelsen av det høye gotiske tårnet skjedde ca. 1470. Domkirken man ser i dag, sto ferdigstilt rundt 1480 og fremsto da som en treskipet gotisk kirke med en lengde på 93 meter, som skal være Danmarks lengste. Kirken har senere blitt bygget noe om og restaurert flere ganger.