APCI ble påført GC/MS og LC/MS også av Hornings gruppe i 1975. Analytt i LC-eluat ble fordampet og ionisert i en oppvarmet blokk. Høy følsomhet og enkle massespektre ble oppnådd gjennom denne applikasjonen. I de senere tiårene ble koblingen av APCI med LC/MS berømt og fanget mye oppmerksomhet. Innføringen av APCI og LC-MS hadde utvidet rollen som massespektrometri dramatisk i legemiddelindustrien innen medisinutvikling. Følsomheten til APCI kombinert med sensitiviteten og spesifisiteten til LC/MS og væskekromatografi-tandem massespektrometri (LC-MS/MS) gjør den til den valgte metoden for kvantifisering av legemidler og medikamentmetabolitter.