Goldblum ble født i West Homestead nær Pittsburgh i Pennsylvania. Han var sønnen til Shirley, som var programleder for et radioprogram, og Harold Goldblum, som var lege. Han har en søster, Pamela, og en eldre bror, Lee. En annen bror, Rick, levde bare til han ble 23. Familien var jødisk og tilhørte en ortodoks synagoge. Goldblum flyttet til New York City i en alder av sytten år for å bli skuespiller.