I tillegg til enspillerversjonen har også Watch Dogs flerspillerfunksjonalitet. En av disse er én-mot-én-spill, der en spiller i hemmelighet infiltrerer enkeltspilleropplevelsen til en annen spiller for å installere et «bakdørvirus» på telefonen hans. Det er også en free roam-modus for opptil åtte spillere, dekrypteringskonkurranse, bilres, og en ctOS-mobilutfordring (free roam og dekryptering er imidlertid ikke tilgjengelig på PlayStation 3 og Xbox 360). En mobilapplikasjon for Android og iOS lar spillere utfordre andre spillere og bruke hacking for å utløse feller for å hindre dem i å lykkes.