Modula-2 var det eneste programmeringsspråket og applikasjonsprogramvare for Medos-2, operativsystemet til den personlige arbeidsstasjonen Lilith. De første ti Lilith-maskinene ble innstallert i 1980. Lilith var bygd opp rundt mikrobrikken AMD 2901 fra Advanced Micro Devices som kjørte i 7 MHz, og var implementert som en stakkmaskin. Operativsystemet , for arbeidsstasjonen Kronos, ble bygd opp av moduler fra Modula-2. Kronos ble lansert i 1988, og var bygd omkring en 32-biter proprietær datamaskinarkitektur. Operativsystemet ble utviklet av Kronos Research Group (KRG) i Novosibirsk, som var tilknyttet Sovjetunionens vitenskapsakademi. IBM Modula-2 ble 26. august 1988 delvis brukt i OS/400 (kjernen til OS/400). Denne koden ble for det meste erstattet med C++ da OS/400 ble portert til mikroprosessorfamilien IBM RS64 fra 1992 til 1995. Operativsystemet ble omdøpt til den 26. august 2004 (fordi den kjørte på POWER5) og til den 2. april 2008; det hadde da fortsatt litt Modula-2 kode i kjernen.