Siden 1930-årene er det gjort mange arkeologiske utgravninger og undersøkelser i Khaburdalen, og de indikerer at det har bodd folk her siden eldre steinalder. Viktige steder som er utgravde er blant andre Tell Halaf, Tell Brak, Tell Leilan, Tell Mashnaqa, Tell Mozan og Tell Barri. Regionen har gitt navn til et særskilt malt steintøy funnet i Nord-Mesopotamia og Syria, og som stammer fra tidlig på 1000-tallet f.Kr. Regionen omkring Khabur-elva er også tilknyttet starten på kongedømmet Mitanni som blomstret ca. 1500-1300 f.Kr.