Alsace ligger lengst øst i Frankrike, og grenser i øst mot Tyskland, i sør mot Sveits og i vest mot Franche-Comté og Lorraine. Regionen omfatter slettelandet mellom Rhinen i øst som er grensa mot Tyskland og fjellkjeden Vogesene i vest. Høyeste punkt er Grand Ballon på 1424 moh.