Möller forsøkte å ta sitt eget liv i Stammheim-fengselet den 18. oktober 1977, under «den tyske høsten», men selvmordsforsøket mislyktes. I det som ble kjent som «Stammheim-natten» tok Andreas Baader, Gudrun Ensslin og Jan-Carl Raspe sine egne liv. Möller har alltid benektet at det var tale om et kollektivt selvmord, og påstår at det dreide seg om drap og drapsforsøk utført av myndighetene.