Etter at han var løslatt, og nok en gang ble tiltalt i Irland for medlemskap i IRA, ble han stadig mer fremtredende i Sinn Féin, IRAs politiske gren. Han hadde kontakt med britisk etterretningstjeneste og regjeringen i 1980. Sinn Féin fremholder at britiske statsministre hadde hatt forhandlinger med dem på høyt nivå siden 1970-årene. Sinn Féin sier at dette er bakgrunnen for ryktene om at Martin McGuinness skulle ha arbeidet for etterretningstjenesten og at dette ikke er sant.