Deres status som en virkelig villhest ble satt i tvil da tamhester fra den 5000 år gamle botaikulturen (en arkeologisk kultur datert til 3000-tallet f.Kr.) i området til dagens Kasakhstan ble funnet nærmere knyttet til przewalskihesten enn til (dagens hest). Studien reiste muligheten for at moderne przewalskihester kunne være de ville etterkommerne av de tamme botaihestene. Det er imidlertid fortsatt mulig at både botaihestene og de moderne przewalskihestene stammer adskilt fra den samme ville populasjon av przewalskihester fra oldtiden.