Fremdeles holdt polakkene hans far som gissel, og da Filaret hørte at sønnen var valgt som tsar, var han opprørt over at han ikke var rådspurt i saken. Høsten 1617 gikk den polske hær inn i Russland, og Władysław IV Vasa angrep 1. oktober 1617 Moskva. Men den russiske vinteren førte til den polske hærs fullstendige sammenbrudd, og 2. februar 1619 ble det inngått våpenhvile. Smolensk ble riktignok polsk, men Mikhails far ble løslatt. I juni 1619 møttes far og sønn igjen etter ni års atskillelse. Filaret ble utnevnt til med-tsar av sin sønn, og de satt side om side på identiske troner. Men Filaret var «oppfarende, mistenksom og så diktatorisk at selv tsaren var redd ham», og hans fokus var å forberede en gjengjeldelse mot Polen. Kirkens eiendommer ble overført til Romanovene og dannet grunnlag for dynastiets rikdom. Jordeierne fikk større kontroll over sine livegne i bytte mot militær støtte. Trettiårskrigen gjorde det enklere å få tak i erfarne leiesoldater, og britiske offiserer moderniserte Russlands egen hær.