Funn tyder på at det har levd mennesker langs Notwane-elva siden den afrikanske steinalderen. Arkeologer har funnet gjenstander i og rundt dagens Gaborone fra rundt år 400 f.Kr.. Områdene i dagens Botswana var utelukkende bebodd av tamdyrnomader, hovedsakelig februkere, fra khoi-khoi fram til det 8. århundret e.Kr., da toutswe-folket også bosatte seg her. Toutswe-folket (også kalt -samfunnet etter hovedtilholdsstedet, Toutswemogala-åsen) slo seg ned ved Palapye og Serowe, og lærte seg å dyrke durra og hirse. Ved inngangen av det 9. århundret hadde toutswe-kulturen fått fotfeste i Botswana. Liksom khoi-khoi, var toutswe-kulturen sentrert om februk: det er blitt funnet flere kraaler, innhenginger for kveg, rundtom i østre Botswana. I denne kulturen var velstanden og hierarkiet bestemt av antall kveg i stedet for mengden gull, slik tilfellet var for det nærliggende mapungubwe-samfunnet. Toutswe-folket drev langvegs handel, og kjøpte blant annet perler og porselen. Overbeiting og tørke førte til at toutswe-kulturen begynte å kollapse i det 13. århundret. Kvegene forble likevel høyt verdsatt i det botswanske samfunnet.