Tørke og overutnyttelse av grunnvannet, og problemer knyttet til skittent vann fra industrien siden 1990-årene, har påført Beijangsjøen økologiske utfordringer (som kvikksølv og arsen), som de lokale styresmakter sliter med å motvirke. Vannstanden er det også vanskelig med; på grunn av vannmangel i Beijing tar en vannkanal fra en elv i byprefekturet Liaocheng i Shandong unna i overkant store mengder av vann som ellers ville ha rent inn i Baiyangsjøen.