Etter flere års drøftinger besluttet Lübecks borgerskap å opprette et hansamuseum. Arbeidet på tomten ‘An der Untertrave 1’ begynte i januar 2012. På stedet var tidligere et tilfluktsrom fra andre verdenskrig og et sjømannshjem. Arkeologiske utgravinger måtte gjøres før byggingen kunne begynne og det ble gjort interessante funn. Bygningen ble oppført etter tegninger av arkitekt Andreas Heller som også sto bak utstillingskonseptet. Vitenskapelig rådgiver var hansaforskeren Rolf Hammel-Kiesow. Utstillingsarealene omfatter cirka 7 000 m², da inngår 2 400 m² i nabohuset, klosterborgen (Burgkloster). Byggearbeidene kostet 45 millioner euro og ble åpnet 27. mai 2015 av Tysklands forbundskansler Angela Merkel.