Skaftnesmo har også uttrykt seg kritisk om håndteringen av den franske forskeren Gilles-Éric Séralini som har publisert forskning som angivelig har vist at rotter foret med genmodifisert mais utviklet kreft, men som senere er blitt trukket tilbake etter kritikk mot metodologi og analyse. Han har også oversatt boken av John Fagan til norsk. Skaftnesmo er generelt kritisk til GMO og sprøytemiddelet Roundup som selges av selskapet Monsanto, og er tilhenger av biodynamisk jordbruk.