Han studerte ved Universitetet i Padova og promoverte til doktor i sivilrett og i kirkerett. Deretter ble han ved der Markuskirken i Venezia og i 1462 kannik ved Peterskirken i Roma. Han bodde med sin onkel, pave Paul II, i Vatikanpalasset. Den 23. desember 1467 mottok han som kommender benediktinerklosteret Abbazia Santo Stefano i Carrara i bispedømmet Padova og likeså klosteret Mozza ved Aquileia, etter at paven gav avkall på disse. I 1467 ble Giovanni Battista Zeno apostolisk protonotar.