Han vant Tour de ski sammenlagt også i 2009/2010 og var den første på herresiden som vant touren to ganger. I løpet av sesongen tok han ytterligere én verdenscupseier, men nådde ikke opp i verdenscupen sammenlagt. I OL 2010 i Vancouver ble han nummer tre på 15 km fristil, og han gikk han på det tsjekkiske laget som ble nummer tre på 4 x 10 km stafett.