Cowboys møtte Seattle Seahawks i wildcard-runden av sluttspillet 6. januar 2007. Cowboys lå under 21–20 på en 4th-and-1 med 1:19 igjen av kampen, da Cowboys forsøkte et 19-yard field goal. Romo, som var holder for sparket, hadde en fumble på snappet. Han klarte å plukke opp ballen og forsøkte å løpe den inn, men ble taklet på Seattles 2-yard linje, og Cowboys mistet ballen på downs. De tapte kampen. Romo avsluttet 2006-sesongen som #7 i NFC i pasningsyards (2 903) og touchdownpasninger (19).