Issoufou er gruveingeniør og har sin utdannelse fra Université de Niamey, Université des Sciences et Techniques du Languedoc i Montpellier, Université de Paris VI og École nationale supérieure des mines de Saint-Étienne i Frankrike. Han arbeidet med gruvespørsmål i Nigers statsforvaltning og senere i gruveselskapet Société des Mines de l'Aïr.