Et kart over planeten Arrakis vises før de aller fleste oppdrag, hvor spilleren kan velge neste territorium å spille på. Ni territorier må bekjempes, uavhengig av hus, for å komme helt til sluttspillet. Å gjennomføre oppdrag gir mulighet til forbedret teknologi og andre våpen som er unike for hvert hus. En spiller kan få tilgang til andre hus sine spesielle enheter ved å fange en fiendtlig fabrikk som produserer de ønskede enhetene ved den fangede fabrikken.