Jensen startet karrieren i FC København, hvor han gikk gradene til han i forkant av 2012/2013-sesongen ble hentet til førstelaget. Jensen spilte sin første kamp i Superligaen 16. mai 2013, da laget møtte Randers FC. Jensen var høsten 2014 på utlån til AC Horsens. Fra 2015-sesongen har han vært på utlån i Sandefjord.