Ved endring av komitestrukturen i Stortinget i 2005, ble prinsippet om at komiteene skulle svare til hvert sitt departement oppløst. Dermed ble Kirke-, utdannings- og forskningskomiteen opprettholdt, og kirkesakene liggende her, selv om de ikke lenger lå i Kunnskapsdepartementet. Midlertid, så ble kirkesaker flyttet til Familie- og kulturkomiteen i 2017, og Kirke-, utdannings- og forskningskomiteen endre navn til dagens navn - Utdannings- og forskningskomiteen.