Yaqoob er etnisk pasjtuner av hotak-stammen, som er en del gren av den større Ghilzai-grenen. Da hans far døde i april 2013, og det oppstod rykter om at det var hans konkurrent Akhtar Mansour som hadde myrdet ham, bestred Yaqoob at faren var blitt drept, og sa at dødsfallet hadde vært av naturlige grunner. Yaqoob vergret seg ikke desto mindre mot støtte taliban-sjefen Akhtar Mansurs lederskap, da han den 29. juli 2015 ble valgt til leder av Taliban-orrganisasjonen. Han var ikke beredt til å innta noen ledelsesroller i gruppen.