Selv om han ble født inn i en hengiven ortodoks jødisk familie, er Sapolsky personlig ateist. Sapolsky har mottatt en rekke æresbevisninger og priser for sitt arbeid, inkludert den prestisjetunge MacArthur Fellowship i 1987, en Alfred P. Sloan Fellowship og Klingenstein Fellowship innenfor nevrovitenskap. Han ble også tildelt prisene National Science Foundation Presidential Young Investigator Award og Young Investigator of the Year Awards fra Society for Neuroscience.