Den 22. mars 1947 ble Begin utnevnt til hjelpebiskop i Cleveland og titulærbiskop av Sala av pave Pius XII. Han mottok sin bispeinnvielse den følgende 1. mai fra biskop Edward Francis Hoban av Cleveland, med biskopene James A. McFadden av Youngstown og Joseph Thomas McGucken, hjelpebiskop i Los Angeles, som medkonsekratorer. Han ble utnevnt til generalvikar for bispedømmet i mars 1948 og pastor for St. Agnes Church i Cleveland i januar 1949.