Etter at han var blitt frikjent bidro Sheppard i å skrive boken som presenterte hans side av saken og ga innsikt i hans år i fengsel. Han vendte også kortvarig tilbake som lege, men ble sakssøkt to ganger for medisinsk uaktsomhet. Senere var han kortvarig også en fribryter under navnet «The Killer» med oppvisninger over hele USA.