Den 20. september 1977 ble han utnevnt av pave Paul VI til hjelpebiskop i erkebispedømmet Wien og titulærbiskop av . Den 20. november 1977 ble Krätzl sammen med Florian Kuntner ordinert til biskop av kardinal Franz König i Stefansdomen i Wien. Medkonsekratorer var koajutorerkebiskop Franz Jachym fra Wien og hjelpebiskop Reinhard Lettmann fra Münster.