I 1892 ble Isaacs valgt inn til den lovgivende forsamlingen i Victoria som liberal politiker. Han hadde flere ulike politiske verv på 1890-tallet, og i 1897 ble han valgt til konvensjonen, som utarbeidet den australske grunnloven, hvor han støttet dem som argumenterte for et mer demokratisk utkast til grunnlov. Han ble medlem av Queen's Counsell i 1899.