I 2002 ble ŽSR delt opp. ŽSR ble forvalter av infrastrukturen mens passasjer- og godstransport ble overført til det nye selskapet Železničná spoločnosť Slovensko, a. s. (ŽSSK) bestått. I 2005 ble dette selskapet igjen delt i to selskaper: ŽSSK for persontransport og ŽSSK Cargo for godstransport. Aksjene i selskapene eies av staten.