Han var i sitt første ekteskap gift med Marie Sæter, datter av Oppdals ordfører og stortingsmann Ingebrigt Haldorsen Sæter. Mikkel og Marie fikk fem barn før hun døde i 1880. Som enkemann giftet han seg på nytt med Helene Neergaard, datter av tidligere stortingsmann John Neergaard. Han fikk også tre barn i sitt andre ekteskap.