En del foreldre var kritiske til undervisning i tungetale, og Fylkesmannen ga pålegg om å skille tydeligere mellom meninghetsarbeid og undervisning. I forbindelse med kritikken for at skolen underviste i tungetale uttalte pastor i Skjærgårdskirken og styreleder i Skjærgårdsskolen, Glenn Rasmussen, til VG. «» Skolen skrev også til foreldrene at tungetalen ville fortsette ved Skjærgårdsskolen helt ned i 2. og 3. klasse.