På øyene er det opprettet tre parker; den 69 166 km² store Naikoon Provincial Park og Gwaii Haanas nasjonalpark som ligger sør på Moresby Island. Sistnevnte består av 138 øyer og dekker et område på rundt 1 500 km². Den tredje parken er Pure Lake Provincial Park 15 kilometer nord for Masset på Graham Island, samt , et verneområde for mer enn 140 fuglearter.