Han ble ordinert til prest deb 18. desember 1988. Han jobbet i sjelesorgen i Khartoum, og i Bahati i bispedømmet Nakuru i Kenya (1989-90) og i Torit, hovedstaden i Eastern Equatoria State i Sør-Sudan. På grunn av at Torit ble erobret av regjeringstropper, ble han tvunget til å flykte til Kampala, hovedstaden i Uganda.