Den 18. juli 1946 ble han utnevnt av pave Pius XII til biskop av Jixian (Weihwei) og ble innført i dette embede den 28. juli 1946. Etter Mao Zedongs seier i den kinesiske borgerkrig ble alle utenlandske misjonærer enten utvist, eller arrestert og senere utvist, og også biskop Civelli ble slik reelt avskåret fra å ivareta sitt embede, som han formelt likevel innehadde frem til sin død.