Den 17. september 1656 døde han i Zhaoqing i provinsen Guangdong. (De gamle kilder transkriberer byens navn som Tszan-King, Zhaojing, Zhaoging Fou). Nokså mange av de europeiske misjonærer slet med å tilpasse seg Kina helsemessig. Særlig på landet og i utkantstrøkene var de sanitære forhold dårlige; utilstrekkelige midler og dermed mangel på medisiner og feilernæring skapte problemer. Mange vestlige misjonærer ble syke; hele 51 døde før de var fylt femti år, som pater Smogulecki som bare ble 40 år.