I 1788 ble Federal Hall bygget om og utvidet under ledelse av Pierre Charles L'Enfant, som senere fikk i oppdrag av president George Washington å planlegge den nye hovedstaden ved Potomac-elven. Resultatet av L'Enfants ombygging var USAs første eksempel på arkitektur i såkalt «føderal stil». Bygget ble omdøpt til Federal Hall i 1789. USAs første kongress møttes der den 4. mars 1789 for å etablere den nye føderale regjeringen, og kongressens første tiltak var å telle stemmene som valgte George Washington til USAs første president. Presidentinnsettelsen fant sted på bygningens balkong den 30. april 1789.