Etter at Silverius var blitt pave forsøkte keiserinne Theodora å vinne over ham til monofysittismen. I særdeleshet la hun vinn på å formå ham til å forsone eig med den monofysittiske patriarken av Konstantinopel, Anthimos, som var blitt avsatt og ekskommunisert av pave Agapetus, og med Severus av Antiochia. Paven gav imidlertid ikke noen løfter om noe slikt, hvorpå keiserinnen truet med å avsette ham til fordel for Vigilius.