Etter dødsfallet ble det holdt minnemarkeringer i rundt 30 byer i Russland og politiet anholdt flere hundre personer i forbindelse med disse. Markeringene skjedde blant annet ved at blomster ble lagt ved minnesmerker for ofre for undertrykkelsen i sovjettiden. Blomstene ble fjernet av myndighetene. I flere byer og land i Europa samlet demonstranter seg, blant annet utenfor russiske amassader, etter nyheten om dødsfallet. I Russland har Navalnyjs dødsfall vært lite omtalt og media har begrenset det til notiser.