Kommisjonens arbeid endte med oppreisning for Henning Irgens. Han ble frikjent for anklagene om ulovlig handel med svenskene, samt de andre punktene som handlet om økonomisk svindel og fornærmelser. Han ble gjeninnsatt som direktør for verket i 1685. Denne gangen gikk det imidlertid ikke lang tid før han igjen ble fratatt vervet som direktør. Den nye overberghauptmannen i Kongsberg, Henrich von Schlanbusck, ønsket å gå bergledelsen etter i sømmene og gjerne erstatte de sittende lederne med tyske bergkyndige (perioden under Schlanbuscks ledelse er i ettertiden blitt referert til som ”Tysketiden” ved verket). Irgens ble av Schlanbusck referert til som ”den største idiot i gruve- og hyttedrift jeg noen gang har sett”. 15. juli 1687 ble dermed Henning Irgens oppsagt som direktør ved verket for annen gang. Han ble imidlertid nok en gang gjeninnsatt, og denne gang for en lenger periode. Nok en gang var det arbeidet til Bragerneskommisjonen som ble hans redning.