Owo kom under britisk herredømme i 1893. Etter at Nigeria erklærte seg uavhengig i 1960, og ble så del av landets Western Region til 1967 da den ble del av Western State. Owo og dets innvånere spilte viktige roller i Nigerias første republikk. I 1976 ble byen del av den da opprettede Ondo State.