Ved krigsutbruddet i juni 1940 hadde det italienske flyvåpenet 69 Ca.309 fly, av disse 42 fly var fordelt til 1° og 2° Aviazione Presidi Coloniale på Mellaha og El Adem, og 26a og 99a Squadriglie Aviazione Sahariana på Cufra og Hon. I de første ni måneder av krigen gikk 3 fly tapt og andre 5 fly var blitt skadet etter de første krigspatruljer langs grensen mot Fransk Tunisia fra juni 1940.