I 1731 ble Hillesøy eget prestegjeld med Øyfjord og Baltestad under seg, før Hillesøy ble lagt under Lenvik i 1759. Baltestad kirke ble da nedlagt. Da Lenvik kirke ble revet i 1855, fikk Hillesøy kirke det gamle alterskapet fra Baltestad i gave.