Terapeuten jobber sammen med familien i hjemmet, på tidspunkter som passer for familien. MST-terapeuten skal hjelpe og veilede foreldrene uten å overta deres oppgaver eller ansvar og behandlingen skal tilpasses hver enkelt familie. Foreldrene, ungdommen og terapeuten setter ukentlige mål for arbeidet og det settes opp skjematiske og konkrete planer for hvordan målene skal nås. Behandlingen er intensiv, og det kan i enkelte perioder dreie seg om flere møter per uke, både hjemme, med skole og med andre støttepersoner. Terapeuten skal uansett tid på døgnet være tilgjengelig for foreldrene i behandlingsperioden. Behandlingsperioden varer vanligvis fra tre til fem måneder, men dersom ungdommen når målene kan den avsluttes tidligere.