I 1942 skrev Metzger et brev til Hitler, hvori han oppfordret Hitler til å fratre, men han sendt det ikke - en venn av ham fikk ham fra det. I 1943 skrev Metzger et memorandum om reoganiseringen av Tysklands statsskikk og landets integrering i et fremtidig internasjonalt verdensfredssystem. Dette memorandum forsøkte han å formidle til den lutherske erkebiskopen av Uppsala; han hadde en kurer, Dagmar Imgart, som skulle overbringe det. Men han ble forrådt av henne - den svenskfødte kvinnen var en Gestapo-agent infiltrert i -brorskapet. Så ble han arrestert, den 29. juni 1943. Han ble brakt inn for Volksgerichtshof ledet av Roland Freisler. I en skueprosessk som varte i bare 70 minutter nektet rettens president, Freisler, som allerede hadde fullført tre rettssaker den dagen, å høre tiltalte. Han erklærte at «en slik pest må utryddes». Metzger ble dømt til døden for «høyforræderi og fiendefavorisering».