I 1747 ble Agnesi Pinottinis første verk, hyrdekantaten , oppført ved i Milano. Etter farens død i 1752 giftet Maria Teresa seg med Pietro Antonio Pinottini, en beiler faren tidligere hadde avvist. Fra og med nå egnet hun nesten all sin tid til musikk, og ved siden av konserter, sonater, fantasier og kammerarier, skrev hun flere operaer, til noen av dem også librettoen.