Han er lederen av partiet Pakistan Tehreek-e-Insaf (PTI). I valget til Pakistans nasjonalforsamling i 2018 stilte Khan som partiets statsministerkandidat. PTI fikk flest stemmer og flest seter i nasjonalforsamlingen. Ifølge landets valgkommisjon vil det innta 109 av 269 seter i nasjonalforsamlingen, slik at det blir nødt til å danne en koalisjonsregjering.