Forholdet mellom Ján Sokol og hans etterfølger var ikke særlig godt, noe som fremgår av et svært skarpt brev fra Róbert Bezák til Ján Sokol datert 13. september 2009, publisert i februar 2010 av Markíza TV og senere av andre pressemedier. I brevet advarer Bezák erkebiskopen emeritus om ikke å betrede i lokalene til erkebiskopens administrasjon vilkårlig, for ikke å «representere» ham i Bezáks fravær, og beordrer at han ikke skulle feire offentlige masser i Trnava erkebispedømme uten hans samtykke.