I./KG 26 ble sendt tilbake til Norge etter ombygging i Danmark. Den angrep flere allierte konvoier uten resultat. Den 10. januar 1945 ble den beordret oppløst. Noen piloter ble sendt til jagerenheter for å omskoleres til forsvar av Riket-plikter. Andre personell ble omgjort til feltdivisjoner i Danmark i februar – mars 1945. II./KG 26 flyttet til Banak, Norge den 25. oktober 1944. Den gjennomførte anti-skip-oppdrag mot konvoi JW/RA 64 sør for Bjørnøya 7.–10. februar 1945. Den hevdet 8 treff. Dagen etter hevdet den treff på 11 frakteskip, to kryssere og to destroyere. Britene hevdet imidlertid at det ikke ble gjort noen treff. Den 23. februar 1945 gjennomførte den sitt siste kampoppdrag ved å senke Liberty-skipet SS Henry Bacon. I mai 1945 begynte den å redde innringede tyske soldater fra Courland-lommen mens Den røde armé nærmet seg. Gruppens siste operasjon, den 9. mai 1945, ble godkjent av de vestlige allierte. III./KG 26 bistod også i disse operasjonene. De to gruppene overga seg til allierte styrker på Gardermoen og Trondheim, Norge, den 9. mai 1945.