Haaland Matlary var forsker ved Norsk utenrikspolitisk institutt (NUPI) 1987–1992 og forskningsdirektør ved ARENA – Senter for europaforskning 1995–1997, og er professor i internasjonal politikk ved Universitetet i Oslo fra 2001. Hennes forskningsfelt er primært sikkerhetshetspolitikk og strategi, herunder NATO og EU, men også politiske ideologi og verdispørsmål.