Trondheim Symfoniorkester og Opera er organisert som en stiftelse og mottar offentlig støtte fra stat, fylke og kommune. Styret har til sammen sju medlemmer; Kulturdepartementet har delegert oppnevning av fire representanter til Sør-Trøndelag fylke og Trondheim kommune oppnevner en representant med en vararepresentant. Det er to ansatterepresentanter.