Kort tid etter sin fars død i 1375 ga Margrethe den unge kanniken sitt gods i Ubby øst for Kalundborg i gave. Både dronningen og Lodehatt hadde nære bånd til birgittinerordenen, som i høy grad banet vei for Margrethes maktovertakelse i Sverige. Under kanoniseringsprosessen for Birgitta stod han i 1379-80 for vitneavhøringene i Roma, der han avløste den offisielle forhørslederen. I 1382 ble bispestolen ledig i Växjö i Småland, og Margrethe utnevnte Lodehatt til å overta den, i strid med domkapitlets ønske, og flere år før Sverige var blitt en del av Kalmarunionen. Trolig stod birgittinerne bak, men alt fire år senere ble Lodehatt overflyttet, da han i 1386 ble biskop i Århus. I 1395 overtok han bispestolen i Roskilde. Som Margrethes kansler og rådgiver deltok han i adskillige statsforhandlinger, og han var en av hovedmennene bak Kalmarunionen.