Ekker var medlem av Fosnes herredsstyre fra 1908 til herredsdelingen i 1913, da Statland gikk til Otterøy herred. Ekker var valgt til herredsstyret på bygdelister, men kom tidlig med i Bondepartiet etter partidannelsen i 1920 og tilsluttet seg dette partiet i fylkestinget som Otterøys ordfører 1920–1934. Både før og etter dette var han varaordfører.