Eggen var utdannet arkitekt fra Norges tekniske høyskole der han avla avgangseksamen i 1957. Han arbeidet deretter noen år som arkitekt i Danmark, før han vendte tilbake til Norge og etablerte eget arkitektkontor i 1963. I Norge var han særlig virksom i Trondheim. Hans arkitektkontor, Eggen Arkitekter, har tegnet besøkssenteret ved Nidarosdomen og sto bak gjenoppbyggingen av Erkebispegården. Innen kirkearkitektur sto Eggen også bak Kolstad kirke i Trondheim, Lahpoluoppal kapell i Kautokeino og Rognsund kirke i Alta. Han tegnet en rekke skole- og undervisningsbygninger, blant annet Olavsgården kurs- og konferansesenter, undervisningsfløyen ved Dronning Mauds Minne, Steindal barneskole og Sjetne barneskole, samt Bygningsingeniøravdelingen ved NTH (nå integrert i NTNU) og Ørland ungdomsskole. Han sto videre bak Kautokeino fjellstue, Havstein bo- og servicesenter og Teglverkstunet boligområde.