Bindel har fått mye oppmerksomhet for sine kritiske uttalelser om transpersoner, og har blitt beskrevet som en transekskluderende radikalfeminist. LHBT-bevegelsen har anklaget henne for hatefulle ytringer mot transpersoner og omtalt henne som transfob, og hun har blitt boikottet og avinvitert en rekke ganger i hjemlandet. I 2015 skulle hun tale på et arrangement ved Universitetet i Manchester sammen med -skribenten Milo Yiannopoulos, men begge ble erklært uønsket på grunn av hatefulle ytringer etter en protestkampanje mot dem fra studentene ved universitetet. I Norge ble Bindel mye omtalt da SVs kvinnekonferanse i 2017 trakk invitasjonen de hadde gitt henne, etter at Fri – foreningen for kjønns- og seksualitetsmangfold (tidligere LLH) protesterte mot invitasjonen. Hun ble også omtalt i norske medier i 2015 da hun ble invitert av Kvinnefronten, noe som ble kritisert av bl.a. Skeiv Ungdom.