I en alder av 35 år ble Quinn tatt ut i den irske troppen til VM i fotball 2002 av landslagstrener Mick McCarthy, hvor han kom inn som innbytter i to gruppespillkamper mot henholdsvis og og 16-delsfinalen mot . Etter dette la han opp som landslagsspiller etter å ha spilt 92 landskamper og scoret 21 mål for Irland, noe som var målrekord for Irland frem til den ble slått av Robbie Keane i oktober 2004.