Fløyten utviklet seg fra kinesiske bambusfløyter og til å begynne med var tverrfløyten uten klaffer, den hadde bare hull man dekket med fingrene. Etter hvert som fløyten utviklet seg kom det flere klaffer til. I 1847 tok Theobald Boehm patent på et revolusjonerende nytt fløytedesign som den dag i dag danner utgangspunktet for utformingen av enhver tverrfløyte. Før var fløytene laget av tre og i et stykke. I dag er fløytene oftest laget av sølv og nikkel, mens noen profesjonelle modeller er laget av gull. Den kan også være laget av tre, bein, eller glass, og materialet påvirker lydkvaliteten.