I NES-versjonen av og fantes det ikke en spesiell bonus der man fikk 50 poeng for hver tidsenhet som sto igjen på klokka når en nådde slutten av et x-4 brett. Dette fantes derimot i Super NES versjonen. Spillere trenger ikke lenger å holde inne A-knappen mens man trykket Start for å fortsette i den verdenen man eventuelt døde, siden man nå kan fortsette fra et lagret spill. Bowser, Prinsesse Toadstool og Toadene har fått nye animasjoner, og man kan høre ny bakgrunnsmusikk når man treffer på Bowser. Labyrintbaner som brett 4-4 og 7-4 i har nå lydeffekter som indikerer den riktige veien.