Kanalens administrasjon har investert nærmere én milliard dollar for å modernisere og utvide kanalen, med mål om å øke kapasiteten med 20 prosent. Større forbedringsprosjekter er: Å utvide og rette ut Gaillard Cut for å minske problemet med møtende trafikk. Å gjøre passasjen gjennom Gatunsjøen dypere for å minske trafikkens restriksjoner og forbedre vannflyten. Å gjøre begge munningene inn til kanalen dypere. En økning av bukserbåtflåtens størrelse med 20 prosent. Forbedringer av kanalens maskineri inklusive flere, større og kraftigere dralok. Anlegging av mer enn 16 kilometer jernbaneskinner, samt nye maskinkontroller. Forbedringer har blitt utført trafikkledningssystemet for å mer effektivt kontrollere trafikkflyten gjennom kanalen. Etter USAs tilbaketrekning har Panama tatt over salget av vannkraft/elektrisitet generert i kanaldammene, som USAs regjering hadde ansvar for tidligere. Bare 25 prosent av den produserte elektrisiteten går til driften av kanalen.