Den 8. desember 2019 ble Fernando Filoni utnevnt til stormester for Ridderordenen av Den Hellige Grav i Jerusalem av pave Frans. Han etterfulgte dermed Edwin Frederick O'Brien, hvis aldersrelaterte pensjoneringsforespørsel ble innvilget av pave Frans. Den 4. mars 2022 ble O'Brien utnevnt til kardinalprest av pave Frans.