Da regjeringen inntok en mer forsonlig tone og tillot kardinal Silva å besøke politiske fanger, samlet han inn informasjon om menneskerettighetskrenkelser og regjeringsdirigert tortur; dette ble informasjon som senere inngikk i en rapport som etter Pinochets fall fra makten oppførte mer en 3.000 chilenere som var blitt drept i fengsel eller som var forsvunnet. Regimetilhengere truet kardinalen ved å skjende hans foreldres grav, og ved å skyte mot hans hus.