Kl 1:35 fikk admiralen beskjed fra vaktbåten «Manger»: «». Han videresendte dette til overkommandoen i Oslo, som derved ble klar over at inntrengerne var tyske, ikke britiske. Uten å avvente ordre fra admiralstaben, ga Tank-Nielsen beskjed til mineleggeren «Tyr» om å legge ut sine 50 miner. Lerøy fort fikk ordre om å åpne ild mot fremmede skip. Admiral Tank-Nielsen beordret også byen mørklagt. Gasslyktene som stod for gatebelysningen, ble slukket. Kl 1:45 ble strømmen tatt, med katastrofale følger for Kvarven fort der lyskasterne og heisene i prosjektilmagasinet ikke lenger virket. Nødlys ble rigget opp på Bergenhus og Marineholmen, og Kvarven fikk hjelp fra et nødaggregat.