Personer med mikrokefali har nedsatt hjernefunksjon, og gjerne nedsatt allmenn helsetilstand og lav forventet levealder. Levealderen vil i stor grad være avhengig av andre medfødte helseproblemer knyttet til mikrokefalien. I de tilfeller der det ikke er tilstøtende komplikasjoner, kan mikrokefaler leve like lenge som andre mennesker. William Henry Johnson, best kjent som «Zip the pinhead» ble over 80 år gammel.