I 1999 åpnet Spania en straffesak mot Garcia på bakgrunn av gjentatte beskyldninger om tortur og folkemord mot sivile. Imidlertid nektet den venezuelanske øverste domstolen utlevering og de hevdet at de nødvendige bevisene ikke var presentert løftet, de godtok en forespørsel om å sette Garcia i husarrest. Han døde i eksil i Puerto La Cruz, Venezuela i en alder av 82 år. Da hadde han bodd i 12 år sammen med sin kone Elsa Cirigliano. På tidspunktet for hans død led han av Alzheimers og diverse andre plager.