Kardinal Egan mente at katolske politikere som gikk inn for fri abort burde forbys nattverd for å avverge offentlig skandale. I april 2008, etter at aviser publiserte fotografier av tidligere New York-borgermester Rudolph Giuliani som mottok nattverden i en messe i St. Patrick's Cathedral der pave Johannes Paul II presiderte, sa han i en uttalelse at han hadde gjort det klart for Giuliani at den katolske kirke lærer at abort er et alvorlig anstøt mot Guds vilje, og at Giuliani visste at han ikke kunne gå til nattverd. Videre at han ville søke å besøke ham for å instistere at han forholdt seg deretter.