Eleanores ekteskap i 1254 til den framtidige Edvard I av England var ikke det første ekteskap hennes familie planla for henne. Kongene av Castilla hadde lenge et tynt krav på å være overordnete herrer av kongedømmet Navarra i Pyreneene, og fra 1252 ønsket hennes fars etterkommer, Eleanoras halvbror Alfonso X, at hun skulle gifte seg med Theobald II av Navarra. For å unngå kastiljansk kontroll over Navarra, sørget Margaret av Bourbon, som var mor og regent for Theobald II, for å alliere seg med Jakob I av Aragón isteden, og som en del av denne avtalen var løftet om at Theobald aldri skulle gifte seg med Eleanore.