Folkman var blant annet medlem av National Academy of Sciences, Institutt for indremedisin, National Academy of Arts and Sciences og amerikanske Philosophical Society. Han var forfatter av rundt 400 artikler og mer enn 100 monografier og kapitler til flere bøker. Folkman mottok flere internasjonale priser, blant annet Canadas Gairdner Foundation International Award, Israels Wolf Foundation-pris i medisin og Tysklands Ernst Schering-pris. I 2006 ble Folkman en av syv personer oppnevnt av president George W. Bush til National Cancer Advisory Board av National Institutes of Health.