Peter J. Jugis studerte ved University of North Carolina i Charlotte, hvor han oppnådde en -grad i 1979. Etter å ha bestemt seg for å gå inn i presteskapet, ble Jugis sendt til Roma i 1979 for å bo ved Pontifical North American College. Han ble tildelt en Bachelor of Sacred Theology-grad fra Det pavelige gregorianske universitet i Roma i 1982.