Museet ble etablert i 1959 av den samiske foreningen Sámii Litto som (Enare samemuseum). Dette friluftsmuseet fikk sitt første hus i 1960 og åpnet for publikum i 1963. Stiftelsen ble etablert i 1986. Det nye museumsbygget, tegnet av Juhani Pallasmaa, åpnet i 1998.