I 1986 sang Thompson vokal på et soloalbum av den tidligere gitaristen i Genesis, Steve Hackett. Albumet inneholdt gjesteopptredener av artister som Brian May (Queen), Pete Trewavas (Marillion), Ian Mosley (også fra Marillion) og Bonnie Tyler. Imidlertid ble albumet, med tittelen , ikke gitt ut før 2002. Til tross for den allerede travle timeplanen i 1986, fant Thompson fremdeles tid til å returnere til Manfred Mann for deres nye album, , i tillegg til å lage litt solo-materiale. Han spilte inn sangen «It's Not Over» for lydsporet til filmen , og dette sporet ble også med (med litt lengre fade-out) på hans nye soloalbum, , utgitt senere samme år. Året etter ble «It's Not Over» innspilt av Starship, og ble en topp ti-hit for gruppen. I 1989 spilte Thompson inn singelen «The Challenge (Face It)» som den offisielle temasangen for Wimbledon Tennis Championships i 1989. Han skrev sangen sammen med Harold Faltermeyer. Et år senere, i 1990, jobbet Thompson igjen med Faltermeyer for å skrive 1990-sangen til Wimbledon, «Hold the Dream».