I løpet av denne sesongen klarer Batman å arrestere både The Joker, Penguin og Riddler. Samtidig blir det avslørt at kommisær Gordon er Batmans hemmelige allierte. Han utvikler blant annet en stor lyskaster, Bat-Signal, som lar Batman vite at politiet ønsker å snakke med ham. Denne sesongen introduserer en rekke nye kriminelle, inkludert Rag Doll, The Riddler (stemme gitt av Robert Englund) Killer Croc, SpellBinder og Solomon Grundy. Karakterene Yin og politimester Rojas gjør deres siste opptredener mot slutten av sesongen.