I 2007 ble hun valgt til partileder i Liberalna demokracija Slovenije. Hun stilte deretter til valg og ble innvalgt i Slovenias nasjonalforsamling. Partiet gikk i regjeringssamarbeid og dannet en sentrum-venstreregjering under ledelse av sosialdemokraten Borut Pahor fra Socialni demokrati. Kresal ble innenriksminister. Hun gikk i august 2011 av som minister etter kontroverser om en korrupsjonssak som involverte en bekjent og der Kresal uttrykte uenighet med Slovenias korrupsjonsbekjempelseskommisjon i saken. Hun gikk i desember samme år av som partileder etter at LDS ikke kom inn i parlamentet.