Neste dag kom Grays tilbake og Ann ble mistenksom da Burke ikke ville la henne nærme seg sengen, hvor hun hadde glemt sine strømper. Da de ble alene i huset tidlig på kvelden, lette Grays i halmen og fant Dochertys legeme som viste blod og spytt i ansiktet. På sin vei for å varsle politiet, møtte de på McDougal som forsøkte å bestikke dem med et tilbud på 10 pund i uken, men de nektet. Mens Grays rapporterte drapet til politiet, fjernet Burke og Hare kroppen og tok det Knox. Politiet lette og fant Dochertys blodstenkte klær gjemt under sengen. Burke og hans kone ga forskjellige tider for da Docherty forlot huset, som nok hevet politiets mistanke og tok dem inn til avhør. Tidlig neste morgen gikk politiet til Knox' disseksjonsrom hvor de fant Dochertys legeme. James Gray identifiserte henne som den kvinnen han hadde sett sammen med Burke og Hare. Hare og hans kone ble arrestert samme dag. Alle nektet ethvert kjennskap til drapet.