Den katolske tro, samt kristendommen som sådann, ble introdusert til Japan gjennom portugisiske oppdagere og misjonærer, særlig jesuitter, som spanieren Francis Xavier og italieneren Alessandro Valignano. Byen Nagasaki ble grunnlagt av portugisiske katolikker, og var lenge et viktig senter for kristendommen i Det fjerne østen, frem til byen ble utslettet av atombomben som ble sluppet over byen mot slutten av andre verdenskrig.