Før sesongen 2010 ble han tilbudt jobb som assistenttrener under Kjetil Rekdal i Tippeligaklubben Aalesunds FK og takket ja til dette, noe flere spillere i spillergruppen til Aalesunds FK uttalte seg meget positivt om. Allerede fra starten i sin trenergjerning var det klart at Bergersens evner til å utvikle individuelle egenskaper hos spillerne ville være hans fokus i klubben, mens hovedtrener Kjetil Rekdal vil konsentrere seg mer om strategi og spillestil. Han har siden fungert som assistent under Rekdal og siden under Jan Jönsson fra 2010.