Kritikken av den planlagte utstillingen, særlig fra American Legion og Air Force Association, gikk på at utstillingen fokuserte for mye på de japanske tapene som ble påført av atombomben, snarere enn på motivasjonene for bombingen eller diskusjon av bombingens rolle for å få slutt på konflikten med Japan. Utstillingen ga nasjonal oppmerksomhet til de akademiske og politiske spørsmålene, i den langvarige debatten rundt atombombingen av Hiroshima og Nagasaki knyttet til de retrospektive synene på bombene. Som et resultat ble utstillingen avlyst den 30. januar 1995, etter mange mislykkede forsøk på å endre utstillingen for å møte de forskjellige interessegruppene. Martin O. Harwit, direktør for National Air and Space Museum, ble tvunget til å trekke seg på grunn av kontroversen rundt saken. Den fremre delen av flykroppen ble stilt ut 28. juni 1995. 2. juli 1995, ble tre personer arrestert for å kaste aske og menneskelig blod på flyskroget. Det hadde tidligere blitt kastet rød maling over galleriets tepper av en demonstrant. Utstillingen ble avsluttet 18. mai 1998 og flykroppen ble returnert til Garber Facility for endelig restaurering.