Zogu valgte til slutt å flytte til Paris. Etter lengre tids sviktende helse døde han på et sykehus i Paris i april 1961. Han ble 65 år gammel. I forbindelse med 100-årsjubileet for Albanias uavhengighetserklæring, ble Zogs levninger i november 2012 fraktet fra Paris og gitt en statsbegravelse i et nybygd mausoleum i Tirana.