Biskopen av Lezhë, Francesco Malčinski, som var østerriker av ukrainsk opphav, suspenderte ham fra alt religiøst virke. Doçi skjulte seg i Vuthaj, nær Gusinje. Doçi ble imidlertid funnet og tatt til fange, bodde først i eksil i Istanbul, men fikk takket være intervensjon fra den armenske patriark Stefan Azarian senere reise ut til Roma. Betingelsen for at osmanene lot ham dra, var at han ikke skulle finne veien tilbake til Albania.