Den 23. juni 1957 ble han ordinert til prest av biskop Franciszek Jop i Opole. Deretter studerte han ved Det katolske universitet i Lublin og tok doktorgraden i 1962 med avhandlingen . Fra 1961 underviste han ved presteseminaret i Nysa og i 1977 ble han utnevnt til adjunkt ved det katolske universitet i Lublin. Alfons Nossol habiliterte med en avhandling om Karl Barths kristologi og dens innflytelse på samtidens katolske kristologi. I 1982 ble han utnevnt til førsteamanuensis, i 1988 universitetsprofessor for dogmatikk ved KUL, senere også professor og storkansler ved det teologiske fakultet ved Universitetet i Opole. Han hadde flere gjesteprofessorater, blant annet ett ved Johannes Gutenberg-universitetet i Mainz i 1977.