I oktober 1949 skrev han under profesjonell kontrakt med Manchester-klubben. Dette forårsaket protester og til og med en demonstrasjon der over 20 000 deltok. Han skulle gradvis få respekt av de aller fleste som protesterte. Han ble respektert av alle i 1956 da han med 15 minutter igjen å spille av FA-cupfinalen mellom Manchester City og Birmingham City FC kastet seg foran føttene på en Birmingham-spiller. Han ble tydelig skadet, men spilte videre og City vant 3–1. Under medaljeutdelingen kunne man se at Trautmann hadde en rar knekk på nakken. Røntgenbildene viste at nakken var brukket.