Brady hadde tre touchdownpasninger og en fjerde rushing touchdown da Patriots slo Baltimore Ravings 35–31 i divisjonsrunden, og slo Curtis Martin klubbrekord for rushing touchdowns i sluttspillet; Brady slo også Joe Montanas rekord for touchdowns i sluttspillet med 46. Etter at Ravens scoret på sine to første drives lå Patriots under 14–0, før Brady først utlignet til 14–7 med en rushing touchdown etter en 78-yard drive på åtte plays, og til 14–16 etter en 15-yard touchdownpasning til Danny Amendola. Etter en interception mot slutten av første halvdel scoret derimot Ravens en 11-yard touchdown fra Joe Flacco til tight end Owen Daniels, og Raven økte ledelsen videre til 28–14 før Brady og Patriots igjen utlignet til uavgjort medan touchdownpasning til Rob Gronkowski og en lateral pass til Julian Edelman, som hev en 51-yard pasning til Amendola for en touchdown. Ravens' kicker Justin Tucker sikret en 31–28 ledelse i fjerde kvarter før Brady fant Brandon LaFell med en 23-yard touchdownpasning. Med en mislykket hail mary fra Flacco sikret Brady sitt niende AFC Championship Game, fjerde på rad, og tredje mot Indianapolis Colts. Patriots vant overlegent, 45–7, og med sitt sjette Super Bowl tangerte Brady John Elways rekord for flest Super Bowl-kamper for en quarterback. Brady kastet for 226 yards med tre touchdowns og én interception mot Colts.