Det har gått fire år siden de katastrofale hendelsene ved dinosaur-parken. Sannheten om hva som egentlig skjedde er dysset ned, og dr. Ian Malcolms gode navn og rykte er svertet. Han kalles inn til den lett eksentriske millionæren John Hammond som har planer om en ny ekspedisjon. Det viser seg at det finnes enda en øy med dinosaurer, en øy der de ble avlet opp før de ble sendt til Jurassic Park-øya. Hammond vil sende et forskerteam som skal observere og dokumentere. Malcolm nekter først å være med, men ombestemmer seg når han får vite at kjæresten Sarah allerede befinner seg på øya. Teamet består ellers av fotografen Nick Van Owen, Eddie Carr – og en blindpassasjer. Etterhvert skjønner de at de ikke er de enste menneskene på øya. Det viser seg at Hammonds nevø har sendt sitt eget team av jegere til øya – av profittsøkende årsaker. Etter å ha blitt angrepet av to T-rexer, oppdages forskerteamet av fienden, og deretter handler det kun om å komme seg vekk fra øya i live.