Det er diverse medisinske tilstander og andre legemidler som kontraindiserer avanafil, eller som kan ha en interaksjon med legemiddelet. CYP3A4-hemmere er kontraindisert til avanafil. Dette er stoff som bryter ned enzymet CYP3A4, og inkluderer flukonazol (behandling mot soppinfeksjon), ritanovir (HIV/AIDS medisin), og grapefruktjuice. Stoffer som er CYP3A4-hemmere kan få en høyere konsentrasjon i kroppen slik at bivirkninger lettere oppstår. Konsumering av grapefrukt juice er kontraindikert til mange legemidler. NO-donorer, bruk av nitrater og guanylatsyklasestimulatorer er kontraindikert. Både reseptpliktige legemidler, reseptfrie legemidler, urtemedisin og matvarer (f.eks alkohol og grapefrukt) kan ha en interaksjon med avanafil, og før bruk bør pasienten alltid lese pakningsvedlegget for å være klar over alle disse.