Morgan Kanes foreldre var irske immigranter, Brendan og Gwen Cairn. I 1855 kjøpte de seg plass i et reisefølge med vogner vestover på vognsporet fra Oregon. De krysset Texas Panhandle på veien mot Santa Fe i New Mexico. Gwen Cairn var gravid under reisen. Kort tid etter Morgan Kanes fødsel ble begge foreldrene drept i et indianeroverfall. Etter som gutten vokste endret han navnet sitt fra Cairn til Kane.