Da Universitetet i Bergen ble etablert i 1946, ble biblioteket en integrert del av det akademiske miljøet. Det eksisterende museumsbiblioteket, som hadde begrenset kapasitet, ble midlertidig brukt som universitetsbibliotek. Men etter hvert som universitetet vokste, ble behovet for et eget universitetsbibliotek mer presserende. Bygningens kapasitet ble snart sprengt, og i 1955 mottok universitetet en donasjon på 5 millioner kroner fra J. Ludwig Mowinckels rederi, som muliggjorde et nytt bibliotek som ble åpnet i 1961. I 2001 ble et nytt bibliotek åpnet, tilpasset mer moderne forskningsmetoder som digitalisering og elektronisk tilgang.