På Tahiti pågikk det en strid mellom franske, katolske og britiske, protestantiske misjonærer. Britene ble ledet av misjonær og konsul George Pritchard, som også hadde innflytelse på dronning Pomare IV av Tahiti. Mens Pritchard var i Storbritannia grep Du Petit-Thouars i 1842 inn på vegne av de franske misjonærene og tvang Pomare IV til å tillate katolske misjonærer. Høvdingene ble samlet og presset til å godkjenne en avtale som gjorde Tahiti til fransk protektorat. I 1843 utnevnte han Armand Joseph Bruat til den første franske guvernør.