Blokkchiffer kan skilles fra flytchiffer (flytkryptogram) ved at et flytchiffer opererer på individuelle tegn – en av gangen, og transformeringen varierer under den pågående krypteringen. Skillet mellom disse to typene chiffer er ikke alltid helt klart, for når et blokkchiffer brukes i enkelte blokkoperasjonsmodus, så er virker det i realiteten som et flytchiffer.