Spilleren kontrollerer et romfartøy som er i stand til å reise raskere enn lyset. Den tilhører den galaktiske føderasjonen, som er på randen av nederlag i en krig mot en fremmed opprørsfraksjon. Spillerens mannskap får tak i informasjon som kan føre til problemer for opprørerne og sikre seier for føderasjonen. Ved spillets start skal spilleren velge et romfartøy som kan inneholder forskjellige våpen, motor, mannskap og så videre. Det er åtte forskjellige arter som skal fungere som mannskap i løpet av spillet: Mennesker, Engi, Zoltan, Mantis, Rockmen, Slug, Lanius eller Crystal. Medlemmer av disse artene kan brukes av spilleren, eller bemanne fiendtlige romskip. Hver rase har forskjellige styrker og svakheter, basert på deres fysiologi. Rockmen er for eksempel immune mot brann og har høy helse, Men de beveger seg betydelig saktere enn andre arter, noe som hindrer deres evne til å reagere på konflikter i tide.