Boye er medlem av Det norske Vitenskapsakademi, der han har sittet i styret i flere år og har hatt lengre forskningsopphold ved universitetene i Chicago, Stockholm, Stanford, Sevilla og København. Han har mottatt Stiansens biomedisinske forskningspris og vært leder av et fagpanel i European Research Council. Han er opptatt av forskningsformidling, noe som har gjort ham til en aktiv formidler opp igjennom årene, blant annet i NRK, norske aviser og ulike tidsskrifter.