Jansen ble professor i Louvain i 1630 og biskop av Ieper i 1636. Jansen gjorde det til sitt prosjekt å ved å vendte tilbake til Augustins lære om synden og nådevalget bekjempe de pelagianske tendenser som han anså kom frem særlig ved jesuittenes innflytelse innen katolsk teologi. Med sin bok (3 bind, 1640) la han grunnlaget for det som etter hans død ble kalt jansenismen.