Jon Smør druknet ved Jarlsø før september 1483. Einar Fluga, som også var riksråd, druknet i samme hendelse. Det har blitt spekulert i om foranledningen kan ha vært en fysisk konfrontasjon mellom Jon og Einar. Dette kan imidlertid ikke stadfestes, ettersom vår eneste kilde til dødsfallene er visitasbøkene til Jens Nilssøn, skrevet vel hundre år etter.