I 1807 ble H.J.S. stilt «a la suite», og virket derefter som kongelig landmåler på Island. - «Den første trigonometriske opmåling af Ísland blev besluttet i 1800, før den tid havde der været stor usikkerhed om landets facon. Opmålingen blev udført i 1801 – 1819 af 2-3 danske/norske officerer, og resultatet blev udgivet i 5 kystkort i 1818 – 1823.» Hans Frisak (1773 - 1834) og Scheel utførte hovedparten af opmålingsarbeidet, Frisak i årene 1803 - 1814, og Scheel 1807 - 1815. Dessuten deltok Scheel i udarbeidelsen av kartene. Antagelig har de kun vært på Ísland om sommeren, og så beregnet og udarbeidet kart i Danmark eller Norge om vinteren. I 1815 søkte H.J.S. avskjed som kaptein ved danske Liv-regiment. Samme år ble han ridder av Dannebrogordenen og tok ny avskjed som major. I 1816 ble han så Inspektør ved Det Kjøbenhavnske Klasselotteri. Klasselotteriet er et pengelotteri, opprettet i 1753.