I 1898 emigrerte Laufer – oppfordret av Franz Boas − til USA. På denne tiden – fra 1896 til 1900 – var Boas stedfortredende vitenskapelig leder ved American Museum of Natural Historys antropologiske avdeling. Ved dette museet arbeidet Laufer, etter sin tilbakekomst fra to ekspedisjoner, som assistent for etnologi fra 1904 til 1906.