Naturlig forekommende krypton består av 6 stabile isotoper: (0,35 %), (2,28 %), (11,58 %), (11,49 %), (57,%) og (17,3 %). I tillegg er 26 kunstig fremstilte ustabile (og dermed radioaktive) isotoper kjent. De mest stabile av disse er med halveringstid 2,293 × 10 år, med halveringstid 10,756 år og med halveringstid 35,04 timer. Alle de resterende isotopene har halveringstider kortere enn 1 døgn, og de fleste kortere enn 1 time.