Naturlig forekommende indium består av 2 isotoper. Den ene er stabil: (4,29 %), og den andre er ustabil (og dermed radioaktiv): (95,71 %) med halveringstid 4,408 × 10 år (den lange halveringstiden gjør at strålingen er meget svak og regnes som ufarlig). I tillegg er 37 kunstig fremstilte ustabile isotoper kjent. De mest stabile av disse isotopene er med halveringstid 49,51 døgn og med halveringstid 2,8047 døgn. Alle de resterende isotopene har halveringstider kortere enn 5 timer, og de fleste kortere enn 1 time.