Ved dumavalget i desember 1999 kom Nemtsov tilbake som en av grunnleggerne av Unionen av høyrekrefter, en liberaldemokratisk koalisjon som fikk nær 6 millioner stemmer, eller 8,6 % av stemmene. Etter Sergej Kirijenkos avgang i mai 2000 ble Nemtsov leder for koalisjonen.