Flere utgaver av Kopernikus' navn er dokumentert. Frem til midten av 1530-årene undertegnet han seg som . Senere tok han i bruk den latiniserte utgaven av navnet sitt, , i samsvar med datidens akademiske skikk. I 1776 innførte Johann Gottfried von Herder skrivemåten (som erstattet hver med ) som ble populært i tyske skrifter. Den polske versjonen er ; etternavnet betyr «den som arbeider med kobber».