Kristian Siem er gift med britiske Karen Ann Moross. De er foreldre til musikeren Sasha Kathrine Siem (født 1984), fiolinisten Charles Maximilian Siem (født 1986), Sophie Madeleine Siem (født 1988) og Louisa Tatiana Kristianne Siem, alle oppvokst i London der Siem bosatte seg i 1980-årene.