Spilleren er en av disse agentene, og blir også nødt til å undersøke de mystiske forsvinningene til en rekke innbyggere fra New Providence. Men oppdager at de er blitt kidnappet av TerraNova i et forsøk på å hjernevaske og skape en hær av genetisk forbedrede super-soldater. Til slutt blir spilleren nødt til å angripe et tårn hvor Elizabeth Niemand befinner seg, og drepe henne.