Da han kom tilbake til Sveits, mottok han snart et tilbud fra erkebiskop Michael Heiss fra erkebispedømmet Milwaukee om å undervise i dogmatikk ved presteseminaret for Wisconsin. Zardetti ankom Wisconsin i slutten av 1881. I 1887 utnevnte biskop Marty Zardetti til generalvikar for Dakota-vikariatet.