Ved Sametingsvalget 2009 stilte han som tredjekandidat for partiet Árja i valgkrets 2 (Ávjovári valgkrets). Han ble ikke valgt inn, men 25. februar 2010 besluttet Sametingets plenumsmøte at sametingsrådets medlemmer skal tre ut av Sametingets plenum, og bli erstattet av sine varamedlemmer. Alf Isaksen overtok da Láilá Susanne Vars sin plass som sametingsrepresentant.