Klosteret ble grunnlagt i 1243 av erkebiskop Uffe Thrugotsen og lå sydøst for Mariakirken i det nåværende kvarteret . Åhus var et viktig handelssted innenfor det danske riket, og klosteret ble med tiden et av de betydeligste læresetene i Skandinavia.‎ Etter reformasjonen ble det underlagt Kronen, og i 1617 inndro kong Christian IV Åhus' kjøpstadsprivilegier. Store deler av byens befolkning ble deretter tvangsflyttet til den nye byen Christianstad. Åhus kloster begynte heretter å falle sammen.