Når et japansk frakteskip, Eiko-maru, blir ødelagt i nærheten av Odo Island, blir et annet skip - kalt Bingo Maru - sendt for å undersøke situasjonen. Men dette skipet møter den samme skjebnen, med få overlevende. En fiskebåt fra Odo Island blir også ødelagt, med bare en overlevende. Muligheten til å få tak i fisk i området faller på mystisk vis til null, og skylden blir lagt på eldgamle sjødyr kjent som Godzilla. Flere reportere ankommer Odo Island, for å undersøke situasjonen nærmere. En landsbyboer forteller til en av reporterne, at noe i havet ødelegger alle fiske-mulighetene deres. Den kvelden rammer en gigantisk storm hele øya, som også ødelegger journalistenes helikopter. Godzilla ødelegger 17 husstander, dreper ni mennesker, og tar 20 av landsbyboernes husdyr. Flere av Odo-innbyggere reiser til Tokyo for å kreve hjelp.