Annaba var kjent som Hippo Regius i romertiden, og ble trolig grunnlagt av fønikerne i det 12. århundret f.kr. Hippo Regius var senere et av de viktigste sentrene for tidlige kristne, og Augustin av Hippo, en av historiens mest innflytelsesrike kristne teologer var biskop her fra 396 til 430.