I Malmö FF ble Larsson i 2009-sesongen klubbens mestscorende i ligaen med elleve mål. I løpet av 2010-sesongen etablerte Larsson seg som en nøkkelspiller for klubben, og bidro til klubbens seriemesterskap det året, ved å score ti mål, samt stå for ti målgivende pasninger. 2012-sesongen ble Larssons svakeste sesong for Malmö FF, med bare fire scoringer på 30 kamper.