Tidlig i 1950 forlot Añoveros Navarra og kom til Andalusia. Han ble utnevnt til domkannik i Málaga. Han ble etterhvert også rektor for presteseminaret, og hadde dessuten noen andre mindre oppgaver. Han fikk et tett samarbeid med den karismatiske Málaga-biskopen Angel Herrera Oria, ble Añoveros i 1952 gjort til bispedømmets generalvikar.