I oktober 2011 ble Fiskeridirektoratet slått sammen med FødevareErhverv og størstedelen av Plantedirektoratet til NaturErhvervstyrelsen som i 2017 skiftet navn til Landbrugsstyrelsen. Fiskeriområdet ble i 2017 flyttet til Udenrigsministeriet og samlet i Fiskeristyrelsen.