Chari er født i Milwaukee i Wisconsin og vokste opp i Cedar Falls i Iowa. Han var elev ved Columbus High School. I 1999 gikk han ut fra U.S. Air Force Academy som offiser i U.S. Air Force med en bachelorgrad i luft- og romfartsteknikk. Han ble ansatt i en forskerstilling ved Charles Stark Draper Laboratory ved Massachusetts Institute of Technology, som resulterte i en mastergrad innen luft- og romfartsteknikk.