Stubb var Samlingspartiets presidentkandidat i presidentvalget i 2024. Han fikk flest stemmer i første valgomgang og gikk videre til andre valgomgang mot Pekka Haavisto 11. februar 2024. Stubb vant også i andre valgomgang og etterfulgte Sauli Niinistö som president 1. mars 2024.