Ekspedisjonsbygningen ble oppført i sveitserstil i 1865 etter tegninger av arkitekt Georg Andreas Bull. Bygningen er i hovedtrekk basert på den første ekspedisjonsbygningen til Hokksund stasjon på Randsfjordbanen, også tegnet av Bull, men som brant ned til grunne i 1895. Dagens ekspedisjonsbygning på Hokksund har ingen likheter med Magnor og er av teglstein oppført etter tegninger av Paul Due i 1897. Magnor stasjon var tradisjonelt sett den siste stasjonen før svenskegrensen på norsk side, men er i dag redusert til et krysningspunkt.