Han kom i ung alder til Risør, ble handelsbestyrer hos konsul Niels Peter Boyesen. Prebensen begynte med sin egen forretning i 1833, som etterhvert omfattet kjøpmannshandel, skipsrederi, skipshandel, skipsverft, trelasthandel, mølle- og sagbruk. I 1876 overdro han sine vesentlige forretninger til sønnen Jacob Christian Wetlesen Prebensen og bosatte seg i Kristiania, der han døde i 1892.