The Ninja Turtles, og deres mester Splinter, blir forskrekket over å se en video på TV av The Turtles som slåss mot Purple Dragons. Turtles planlegger å bryte seg inn i Purple Dragons sitt hovedkvarter for å komme til bunns i disse doppeltgjengerne. Men der oppdager gjengen at disse "bedragerne" egentlig var alternative versjoner av dem selv. Men Turtles fra 2003 kommer ikke overens gjengen fra 1987. Turtles fra 1987 forklarer at de havnet i 2003 etter å ha slåss mot Shredder og Krang i 1987. Under denne konflikten fungerte en dimensjonal teleport feil, og sendte alle sammen til 2003-dimensjonen.