Han ble utnevnt til norsk konsul på Færøyene i 1934, forfremmet til generalkonsul i 1942, og fikk avskjed i nåde etter søknad i 1959. Hans medarbeider Leif Waagstein ble samtidig utnevnt til ny generalkonsul. Thorstein Petersen ble i 1947 utnevnt til kommandør av St. Olavs Orden for sine fortjenester for Norges sak under krigen, i hjelpearbeidet for den norske marinen og handelsflåten.