De reiser på fire flåter, men får snart problemer. Tiden går snart ut for oppdraget, og Ursúa ønsker å reise tilbake til Pizarros gruppe. Aguirre leder et mytteri mot Ursúa, og forteller mennene at utallige rikdommer venter dem lenger fremme – og minner dem om at Hernan Cortez fant et imperium i Mexico ved å ikke adlyde ordre. Ekspedisjonen fortsetter videre på en enkelt, ny-bygd, stor flåte. Et innfødt par som nærmer seg fredelig med kano blir fanget av de oppdagelsesreisende, og når mannen uttrykker forvirring når han blir presentert for en bibel, dreper Carvajal dem for blasfemi.