Makedonias første kvalifisering var til EM i 2009, der de arrangerte innledende gruppe 5 med Wales, Kasakhstan og Færøyene. Makedonia tapte alle kampene og havnet sist. I kvalifiseringen til VM 2011 var laget det svakeste i Europa, med åtte tap og 3–68 i målforskjell. Det beste resultatet laget klarte var 1–6 mot Belarus. Dette skyldtes at de i stor grad stilte med et tilnærmet U20-landslag mesteparten av tiden.