Til tross for tre interceptions fullførte Manning 30 av 38 pasningsforsøk for 268 yards og en touchdown da Colts slo Kansas City Chiefs 23–8 i wildcard-runden. Uken etter fikk Colts kun fem field goals og ingen touchdowns, men vant allikevel 15–6 over Baltimore Ravens. Manning fullførte 15 av 30 pasninger for 170 yards og to interceptions i divisjonsrunden. I AFC Championship-kampen mot rivalene Patriots lå Colts under 14–3 da Manning kastet en interception som ble returnert for en touchdown av Asante Samuel, som gav New England ledelsen 21–3. Manning ledet Colts til 32 poeng i andre halvdel og sikret en 38–34 seier, hvor den siste scoringen kom sent i fjerde kvarter da Manning ledet Colts på et 80-yard drive som sikret ledelsen for første gang i kampen. Han hadde 349 pasningsyards, én touchdownpasning og én touchdown på løp. Comebacket var det største noensinne i en mesterskapskamp for conference.