Ved sin tilbakevenden til fødebyen Trier kom han i konflikt med det lokale presteskap og med den katolske erkebiskop, Johann von der Leyen som tvang han bort fra hans lærergjerning med makt, under henvisning til den nye ordning (som innebar at «Den som landet regjerer, hans religion skal være den herskende»). En rekke av Triers protestanter, utover Caspar Olevian, ble fengslet, og de ble ikke sluppet fri før de hadde høytidelig lovet å enten vende tilbake til den rette katolske tro, eller å forlate byen. Mange erklærte at de ville bli katolikker; ikke få borgere utvandret. Med dette var reformasjonen i Trier slått feil.