I 2005 ble klubben kjøpt opp av Red Bull, som har sitt hovedkontor i Salzburg. Navnet ble gjort om til Red Bull Salzburg, logoen ble gjort om slik at Red Bull-oksen ble inkorporert, og klubbfargene ble gjort om fra lilla-hvit til rød-hvit. Den nye klubbledelsen ville dessuten at stiftelsesåret skulle bli 2005, istedenfor 1933, men det østerrikske fotballforbundet sa nei. En del fans har gått sterkt ut mot alt dette, og blant annet har og protestklubben med det originale navnet SV Austria Salzburg blitt stiftet. Noen fans som har brukt den gamle klubbdrakta på kamp har ikke fått slippe inn.