Johan Arnold var fire ganger gift: 1. gang 1668 på Akershus med Anna Mogensdatter Stadsgaard. 2. gang 1677 med Sophia Amalia Gedde (død 1678), datter av berghauptmann Brostrup Gedde (1628-68) og Anna Sabina von Nostitz (1647 Ullersdorf ved Dresden i kurfyrstedømmet Sachsen-62 sst.), dtr. av Hans von Nostitz (1592-1657 Ullersdorf) (mor: Sophia von Falkenhayn) (gift 1. gang i 1616 i Krobnitz med Sabina v. Nostitz [1594-1631 Krobnitz]) og 2. hustru Anna Sophie (Sabina) von Gersdorff (1615 Sulzbach-73 Lindenau). 3. gang 1682 i København med Gertrud Iserberg (1654-1687), datter av Herman Iserberg og Elsebeth Klingenberg, en søster av etatsråd og generalpostdirektør Poul Klingenberg. 4. gang 1692 med Anne Clausdatter (1659-1713), enke etter Stig Andersen Tonsberg - en sønn av Anders Madsen - og datter av assessor i Overhoffretten og lagmann i Skien Claus Andersen.