Tre mekanismer for resistens mot vemurafenib (som dekker 40% av tilfellene) har blitt oppdaget: Kreftcellene begynner å overprodusere et overflateprotein PDGFRB som hjelper til å lage en alternativ overlevelse for cellen. Et annet onkogen som kalles NRAS muterer og reaktiverer normal overlevelse for BRAF. Stromal cellesekresjon av hepatocytisk vekstfaktor (HGF).