Exner instruerte fire katolske skoler om å trekke seg ut av fra bankforbindelsen Vancity i september 2003. Dette, ble det hevdet, hadde sammenheng med at kredittunionen Vancity hadde kjørt en reklamekampanje med to menn kinn mot kinn, og med teksten «I want to bank with people who value all partnerships». Men i et brev sendt til og publisert i forklarte Exner beslutningen, og sa at det kokte ned til at Vancitys «støtte til agendaer brøt med katolsk moral [og som gikk] meget lengre enn å avbilde samkjønnede par». Han sa at kredittunionen offentlig tok aktivt del i «agendaer som er bekymringsfulle og skadelige for kirke og samfunn». Beslutningen førte til illsint kritikk, og det ble sendt et budskap til erkebispedømmet som lenket Exner (som var tysk-kanadier) til nazismen. Det kom til at protesterende samlet seg foran Exners bosted sent om kvelden og ropte obskjøniteter og trusler mot ham. Det førte til at Vancouver Police Department etterforsket truslene og så anbefalte for erkebiskopen å foreta tiltak for å passe på sin personlige sikkerhet når han var ute i det offentlige rom.