Det russiske keiserdømmet invaderte Kaukasus i 1795, mens Agha Mohammad Khan, grunnleggeren av Qajar-dynastiet, gjenerobret de østlige provinsene i Iran. Dermed ble Agha Mohammad tvunget til å trekke tilbake hæren sin og marsjere mot Kaukasus uten å konsolidere sin makt i øst, inkludert i Herat. Den russiske hæren trakk seg tilbake før han kunne nå Kaukasus, og Agha Mohammad ble myrdet i 1797 i Sjusja. Selv om hans rike aldri nådde det fjerne øst for Stor-Khorasan, ble han anerkjent som Shahanshah av Ahmed Shah Durrani, som erklærte sin troskap i en offentlig . Agha Mohammad Khan ble etterfulgt av sin nevø, Fath-Ali Shah (da kalt Baba Khan). Under regimet til Fath-Ali Shah eskalerte spenningen i forholdet mellom Iran og Russland og utviklet seg til to fullskala kriger som så Iran bli beseiret i flere faser. Ifølge traktatene Gulistan og Turkmenchay ble store deler av riket skilt fra, og Iran ble tvunget til å gi mange innrømmelser til Russland. Krigen skadet også Irans globale omdømme som en svak stat med ustabile grenser, og kastet en skygge over iransk stolthet.