Bosch arbeidet for lokale kirker, men også hoffet, og etter hans død samlet Filip 2. av Spania maleriene hans. Den fineste samlinga er fortsatt i Prado-museet i Madrid. Han inspirerte samtidige kunstnere og fikk stor innflytelse gjennom trykk av arbeidene. Groteske Bosch-skapninger, -demoner og -uhyrer, som ofte er satt sammen av elementer fra mennesker, dyr og gjenstander, kan gjenfinnes i for eksempel Domenico Campagnolas kobberstikk. Pieter Brueghel d.e. innlemmet bildespråket fra Bosch på en selvstendig måte i sine egne malerier.