De tre første ioniseringsmekanismene som er diskutert ovenfor har analoger i NI-FD-MS. I feltionisering kan molekylære anioner (M) genereres. Anionfeste kan også føre til dannelse av negative ioner for noen molekyler, for eksempel (M+Cl) . Termisk desorpsjon produserer vanligvis anionet (A) og klyngeioner (f.eks. CA) for salter.