I 1957 flyttet Twombly til Roma, hvor han møtte den italienske kunstneren Tatiana Franchetti. De giftet seg i New York i 1959, og deretter kjøpte de sitt eget palass i Roma. Tatiana Franchetti døde i 1979. Twombly døde i Roma i juli 2011 etter å ha vært innlagt på sykehus i flere dager. Han hadde hatt kreft i mange år. Hans sønn, Cyrus Alessandro Twombly, var kunstmaler og bosatt i Roma.