Den 18. oktober 2001 ble han utnevnt til biskop av Antipolo øst for Metro-Manila. I løpet av sin korte tid der opprettet han over ti menigheter og kvasimenigheter. Hans virke ble avbrutt da det utbrøt ebn skandale, som fikk ham til å be paven om avskjed den 19. oktober 2002. Det var kommet frem at han samme år var blitt far til et barn. Han fratrådte bispeembedet der den 7. desember 2002, og flyttet til USA.