Etter den nederlandske mobile arméen vendte hjem i 1816 etter felttoget i Frankrike ble Rebecque utnevnt til sjef for den nederlandske generalstaben (en stilling han hadde inntil han pensjonerte seg). Han organiserte hæren og vernepliktsystemet i nært samarbeid med prins Fredrik. I 1816 ble han forfremmet til generalløytnant. I 1826 ble han utnevnt til lærer (fransk: gouverneur) til de unge sønnene til prinsen av Oranien, som han hadde vært lærer for fra 1805. Da kong Vilhelm i 1830 ble anmodet om å megle i konflikten over grensene mellom den amerikanske delstaten Maine og New Brunswick i Canada (the Northeastern Boundary Dispute, en sak som ble endelig avgjort med the Webster-Ashburton Treaty i 1842).) Rebecque ledet kommisjonen som la frem meglingsforslaget.