I tillegg til religiøse studier og forfatterskap, brukte Heitmann mye av sin ledige tid på naturvitenskapelige studier, men hans bøker om emnet ble først utgitt av hans sønn Johan jr., etter farens død. Disse inkluderte utgitt i 1741, og året etter kom . Jevngamle Ludvig Holberg roste Heitmanns bok om Solen og nordlyset. De kjente trolig hverandre fra borgerskapet i København.