JTF-N ble opprinnelig dannet som Joint Task Force Six (JTF-6) i november 1989 med utelukkende fokus på bekjempelse av narkotikahandel. I 2004, i kjølvannet av terrorangrepet 11. september 2001, ble kontraterrorisme tilføyet til oppdraget og navnet endret til JTF North.