I 1798 publiserte han resultatene fra 23 tilfeller i . Imens utførte han flere forsøk – også på sin egen elleve måneder gamle sønn. Han publiserte i 1799 og 1800 ytterligere to skrifter om dette. Til å begynne med ble Jenner møtt med kritikk og mistro, men snart spredte Jenners vaksinasjonsmetode seg over hele verden. I Danmark-Norge ble det innført tvungen koppevaksinering for alle i 1810.