Til tross for en smertefull armskade hadde Filchock et solid første år i New York, med 1 262 pasningsyards og 12 touchdowns. Han hadde også 371 yards på løp og ble utnevnt All-Pro halfback og lagets MVP. Pasningsangrepet hans var det Giants trengte for å få Owens angrep til å virke, og Filchock ledet laget fra et sesongresultat på 3–6–1 i 1945 til 7–3–1 og førsteplass i Eastern Conference i 1946. Dette ledet til en tittelkamp mot Chicago Bears på søndag den 15. desember.