I løpet av den etiopiske borgerkrigen (1974 – 1991) fikk troppene til «Den etiopiske demokratiske union» kontroll over store deler av Begemder, og i løpet av 1977 opererte de innenfor noen mil av Gonder, og synes å være klare til å erobre byen. Som en del av Operasjon Tewodros mot slutten av krigen ble Gonder erobret av «Det etiopiske folkets revolusjonære demokratiske front» i mars 1991.