Innen religionsfilosofien har han blant annet konstruert en moderne variant av det ontologiske gudsbevis. Han er også kjent som en lederskikkelse innen den såkalte reformerte epistemologien. Stor oppmerksomhet fikk Plantingas artikkel om den frie viljes forsvar, som behandler det logiske problemet med ondskapen og Guds eksistens..