Negrete ble leder i den nye regjeringen som tok over. Han hadde tittelen ikke tittelen president, hans etterfølger general Guadalupe Victoria ble den som intok stillingen som Mexicos første president. I sin tid som leder var Negrete blant annet ansvarlig for utformingen av en ny grunnlov. Den delte landet inn i 19 frie og suverene stater, 4 territorier som var avhengig av sentrum, og Federal District. Og så var regjeringen delt inn i lovgivende, utøvende og rettslige grener. Denne grunnloven var i stor grad inspirert av kontrollene og balansene i USAs grunnlov, den franske grunnloven og den i Cádiz. Den var i kraft fra 4. oktober 1824 til 30. april 1836, da den ble erstattet av Santa Annas sentralistiske omskrivning.