Zoë var en av de få bysantinske keiserinner som var en , det vil si at hun var født i det i keiserpalasset som ektefødt barn av en regjerende keiser. Hun var andre datter av Konstantin VIII og Helena, datter av Alypius. Hennes far var blitt medkeiser i 962 og enekeiser i 1025 etter broren Basileios II’s død. Hans regjeringstid som enekeiser varte mindre enn tre år, fra 15. desember 1025 til 15. november 1028.