Martin fikk en demotape av Mike Pattons band Mr. Bungle etter en Faith No More-konsert. Etter at Mosley ble sparket, ble Patton kontaktet av Martin for å høre om han ønsket å overta som vokalist etter Mosley. Patton fikk ferdig musikk i hendene med beskjed om å skrive tekst og spille inn vokal. Dette gjorde han på to uker. I 1989 ble albumet utgitt. Albumet ble nominert til Grammy i 1989 og sangen «Epic» ble nominert i 1990. I 1991 ble bandets eneste konsertalbum utgitt. Albumet ble, som tittelen antyder, innspilt i Brixton Academy i London. Konserten ble utgitt på VHS under tittelen , og sammen med på DVD i 2006. I 1991 opptrådte Martin i filmen som «Sir James Martin», overhode av «Faith No More Spiritual and Theological Center». Bandet bidro med sangen «The Perfect Crime» på filmens soundtrack.