Klin har vært kjent siden 1317. I 1482 ble den innlemmet i Storfyrstedømmet Moskva sammen med resten av fyrstedømmet Tver. Blant byens mange kirker er den mest bemerkelsesverdige 1500-tallskirken i Maria Himmelfartsklosteret, og den barokke Gjenoppstandelseskatedralen fra 1712.