Nils Slaatto ble født på Lillehammer, Oppland, Norge den 23. juni 1923. Faren, O. Eindride Slaatto, var arkitekt i Oslo årene mellom de to verdenskrigene som arbeidet innen funksjonalismen. Moren, Anine Wollebæk, som kom fra Lillehammer og var også utdannet arkitekt, men praktiserte aldri yrket.