Men etter hvert risikerer Echo å bli sendt til «the Attic» som er et permanent hvilested for «ødelagte» dukker, eller andre ansatte fra Dollhouse som kan forårsake ulike problemer for bedriften. Men en annen dukke, Alpha, et geni og seriemorder som har blitt sprø etter å ha blitt implantert med minnene til dusinvis av andre mennesker, og han planlegger å stikke av fra hele systemet. Men hver eneste karakter i Dollhouse blir etter hvert tvunget til å konfrontere deres egen moralske medvirkning, til erkjennelsen av at det Dollhouse holder på med til syvende og sist er umoralsk og ekstremt farlig. Den siste episoden av serien er satt til år 2020.