Flagete fødested Contournat er senere blitt del av kommunen Saint-Julien-de-Coppel. Han ble foreldreløs i en tidlig alder, og han og søsknene ble oppdratt av sin tante på morssiden, hjulpet av deres farbror, en kannik ved kollegialkirken i Billom. I en alder av 17 år gikk han inn i sulpicianernes presteorden i Clermont-Ferrand.