Trondsen var tilbake i Rosenborg før 2002-sesongen, men klarte ikke å spille seg til fast plass på laget og ble solgt til etter sesongen. Fredrikstad spilte i 1. divisjon i 2003, men rykket opp i Tippeligaen til 2004-sesongen, som ble Trondsens siste sesong som aktiv spiller. I åpningskampen borte mot fikk han en hodeskade i duell med Lillestrøm-keeper Emile Baron og ble byttet ut i pausen. Trondsen spilte fire kamper senere i sesongen, men ettervirkningene etter flere hodeskader gjorde ham 70% ufør og han måtte legge fotballskoene på hylla etter sesongen.