Bacon hadde en rolle i den militære dramafilmen . Senere samme år vendte han tilbake til teateret for å spille i , regissert av Michael Greif. I 1994 fikk Bacon en Golden Globe-nominasjon for sin rolle i der han spilte mot Meryl Streep. I 1995 hadde han hovedrollen i storfilmen , og året etter hadde en rolle i som sto i sterk kontrast til hans opptredener i muntre romantiske komedier. Bacon dannet et band kalt «The Bacon Brothers» sammen med sin bror, Michael. Duoen har gitt ut seks album. Mellom 2013 og 2015 hadde Bacon en rolle i TV-serien The Following.