Religionsspørsmålet hadde i lang tid vært et bittert stridstema i Det lombardiske rike. Kongene hadde i flere tiår avvekslende tilhørt katolisismen eller arianismen. Perctarit gjeninnførte katolisismen som offisiell religion (etter arianisten Grimuald), men uten å anerkjenne pavens overhøyhet. Han er i ettertid mer kjent for sitt religiøse engasjement enn sitt militære. Blant annet fikk han bygd flere kirker ved Pavia. Han fikk videre i stand fred med Østromerriket. I 678 fikk han sin sønn Cunincpert utropt som medkonge.