Han trådte inn i lasaristordenen (også kalt vincentinerne eller paulistene) og ble presteviet den 12. juli 1959. Pater Rios Montt ble tiltrukket til en venstreorientert frigjøringsteologi. Han engasjerte seg ved støtte til katolske kirkefolks kritikk av regjeringen, mot undertrykkelse, for en aktiv sosialpolitikk og kamp mot fattigdommen.