Under den tyske invasjonen av Polen i 1939 ble store deler av Gamlebyen sterkt skadd av tyske Luftwaffe, som siktet inn missilene mot byens boligområder og historiske landemerker som ledd i den utstrakte terrorbombingen under andre verdenskrig. De gjenværende mursteinshusene ble systematisk sprengt i luften av den tyske hæren under Warszawaoppstanden.