Tusseflaggermus er nært beslektet med dvergflaggermusen som finnes i Norge. Frem til 1999 ble disse regnet for å være samme art, eller dvergflaggermus på norsk. Da nåværende dvergflaggermus ble skilt ut som egen art, fikk den det nye vitenskapelige navnet . Nytt norsk navn for ble først endelig fastsatt i forbindelse med presentasjonen av et sannsynlig funn i Stavanger .