Etter at Hovik Abrahamjan gikk av som statsminister, ble Karapetjan foreslått som en etterfølger. Statusen hans som statsminister ble offentliggjort under et møte med Armenias republikanske parti, og offisielt bekreftet av president Serzj Sargsian 13. september 2016. President Sargsian har sagt at Karapetjan hadde mulighet til å lede en stor bølge med forandringer i landet, spesielt innen økonomi og politikk.