Etter 30 år uten partipolitikk meldte han seg i 2009 inn i Arbeiderpartiet, men oppsummerte etter noen år der at det var «langt fattigere indre demokrati» i AP enn i hans gamle parti AKP. I 2016 tok Høibraaten orde for å endre formålet med Oljefondet, til kun å sikre Forsvaret og til bruk innen utdanning og forskning. Han ville også at én million kroner skulle deles ut til hver person i Norge.