Han gikk av som redaktør for i 1894, og startet deretter , et ukeblad for sjømenn. Fra 1896 til 1901 drev Andersen eksport- og importforretning, samtidig som han drev sjøfartsavisen . Andersen ble utnevnt til sjøfartsdirektør i 1903, i det nyopprettede Sjøfartskontoret. Han var tidvis kontroversiell i stillingen, og gikk av i 1911, da over på ventelønn. I 1913 ble han mønstringssjef i Kristiania, noe han var til han gikk av for aldersgrensen i 1927.