McEwan har vært gift to ganger. Hans 13 år gamle ekteskap med håndspåleggeren og terapeuten Penny Allen endte i skilsmisse i 1995 og ble fulgt av en bitter juridisk strid over foreldreretten til deres to sønner. Hans andre hustru, Annalena McAfee, var tidligere redaktør av avisen seksjon for bokanmeldelser.