I forbindelse med Kommunalreformen 2005–07 ble sammenleggingen av de to kommunene foretatt etter en særskilt avtale mellom innenriksministeren og kommunene. Man søkte å tilgodese borgerne i tidligere Værløse kommune på grunn av den økonomiske ulikheten mellom kommunene, som skyldtes rot i økonomien i Farum kommune (Farum-saken). Avtalen gikk blant annet ut på at den nye kommunen skulle motta et årlig statlig tilskudd frem til år 2040.