Kirkebygningen ble sprengt i luften av tyskerne under Warszawaoppstanden under andre verdenskrig. Både barokkinnredningen fra 1630-tallet av Jan Henel og rokokkodekorasjonene fra 1750-tallet gikk tapt. Kirken ble gjenoppbygd etter krigen, og fikk da barokkfasade og en i stor grad moderne innredning.