Link seiler deretter til Greatfish Isle hvor den store vannånden Lord Jabun holder til. Men det viser seg at øya har blitt knust av Ganondorfs krefter. Heldigvis har Jabun greid å flykte og oppholder seg nå på Links fødeøy, Outset Island. Etter en rask tur innom Windfall Island får Link hendene på en pakke bomber og bruker dem til å sprenge opp inngangen til Jabuns skjulested. King of Red Lions og Jabun diskuterer så sammen og Link får den siste av Gudinnenes perler; Nayru's Pearl.