Navnet stammer muligens fra det gammeltyske, eller gotiske, «Mulda», som betyr «støv», og som er i slekt med det norske ordet for mold. Mer sannsynlig kommer det fra det tyske ordet «mahlen», som betyr «å kverne». Mulde betyr mest sannsynlig «den kvernende elven» etter de mange vannkvernene som i tidligere tider lå langs elven. I dag ligger det et vannkraftverk langs elven.