I 2000-årene hadde administrasjonen problemer med bander med kriminelle som raste gjennom Afghanistans landbruksområder, fjerning av vrakgods (og særlig nedgravde landminer som ingen hadde merket av på kart) fra tiår med borgerkrig fra landbruksområdene og å gjenoppbygge den afghanske økonomien. Politisk vold er også et problem. Hamid Karzai var målet for et attentat 5. september 2002. Utallige bomber mot de internasjonale fredsbevarende styrkene eksploderte i Kabul.