Fritzsche var til stede i førerbunkeren i Berlin under Adolf Hitlers siste dager. Etter Hitlers død, 1. mai 1945, gikk han over til de sovjetiske troppene for å tilby å overgi byen til Den røde armé. Han ble da tatt til fange og deretter tiltalt for krigsforbrytelser, i Nürnbergprosessen. Der ble Fritzsche frikjent, men han ble senere dømt til ni års fengsel av en tysk rett. Han ble sluppet ut i 1950 og døde av kreft tre år senere.