Opprinnelig ble pallaskatten klassifisert blant småkattene i slekten , under det vitenskapelige navnet , men den er såpass forskjellig fra huskatten og dens nærmeste slektninger at den ble plassert i sin egen slekt – . Nyere forskning viser at og er søsterslekter, som til sammen danner den såkalte leopardkattlinjen. En nyere studie (fra 2019) med mitokondrielt genom indikerer at pallaskatten er nærmere beslektet med huskatt og dens nærmeste slektninger enn med artene i . Dette reiser på nytt spørsmål om pallaskatten bør plasseres som basal i slekten og kanskje flyttes til tamkattlinjen, med dette har ikke blitt avklart og krever mer forskning. Pallaskatten har 19 kromosompar.