Den utspringer i Gallatin National Forest i Absaroka Range i det sørlige Park County. Den renner nordover gjennom fjellcanyons, en katarakt under en naturlig bro, og nordvest i en stadig bredere dal forbi McLeod. Den tømmer seg i Yellowstone ved Big Timber. Landskapet rundt Boulder River har tiltrukket seg to kjente filminnspillinger: og .