Vel hjem fra Peru fortsatte han å arbeide for Frank Leslie, men ga opp da hans helse sviktet. I 1873 skilte hans kone seg og giftet seg med Leslie ett år senere. I 1874 var hans helse blitt så alvorlig svekket at den var til hinder for videre egen forskning i felten, og selv om han senere kom seg tilstrekkelig for å lede den endelige utarbeidelse og revisjon av sitt arbeid om Peru for publisering, resulterterte dette i at han døde.