Fabiola ble truet på livet i juli 2009 og i januar og juli 2010. Før Belgias nasjonaldag den 21. juli 2010 skjerpet politiet vaktholdet rundt henne. Truslene var anonyme. Trusselen sommeren 2009 gikk ut på at Fabiola skulle drepes med et armbrøstskudd, noe hun svarte på ved å vifte med et eple mot slutten av nasjonaldagens militærparade, som henvisning til historien om Wilhelm Tell.