Aleksander Helios ble født og utdannet i Alexandria. Han var den nest eldste av Kleopatras sønner. Cæsarion, som hun hadde med Julius Cæsar, var den eldste. I slutten av 34 f.Kr., ved den religiøs-politiske avtalen donasjonene i Alexandria ble Aleksander Helios gitt tittelen «konge av konger». Han foreldre gjorde ham også i navnet til hersker av oldtidens kongedømme Armenia, Media og Partia, og land mellom elvene Eufrat i vest og Indus i øst, til tross for at disse landene sto langt utenfor deres kontroll på denne tiden, men var i sin tid en del av Aleksander den stores veldige rike. I 33 f.Kr. ble Aleksander allerede forlovet til sin fjerne slektning Iotapa, datter av kong Artavasdes I av Media Atropatene. Imidlertid ble Antonius og Kleopatra beseiret av Octavianus i slaget ved Actium i 31 f.Kr. Deretter invaderte Octavianus Egypt det påfølgende året og de begikk selvmord for ikke å bli tatt til fange av ham. Iotapa forlot Egypt for å reise tilbake til sin far og senere giftet hun seg med sin fetter på morsiden, kong Mithridates III av Kommagene, som var av gresk og armensk avstamning.