Hans første roman ble utgitt i 1990. Hans fjerde roman, (1999), ble nominert til Bookerprisen, det samme ble romanen (som er en fiksjonalisert fremstilling av forfatteren Henry James' indre liv). vant dessuten litteraturprisen International Dublin Literary Award for 2006. I 2014 ga han ut romanen , som er løselig basert på hans egen barndom; han og broren vokste opp hos sin mor. I et intervju på en litteraturfestival i Danmark i 2024 fortalte Tóibín at han fikk sin forlegger til å gi ut én dag for sent til at den kunne bli aktuell for Bookerprisen, ettersom nettopp denne romanen var så nært knyttet til hans eget liv og til hans nylig avdøde mor og bror at han ikke ønsket at den skulle bli gjenstand for pristildelinger og annen kommersialisering. Ikke desto mindre ble han tildelt Hawthornden Prize for denne romanen. For romanen (som er en fiksjonalisert versjon av Thomas Manns biografi) vant han litteraturprisen Folio Prize. I 2021 vant han David Cohen Prize, en litteraturpris som har blitt kalt «Storbritannias og Irlands nobelpris».