Nils var sønn av politikeren Peter Martin Anker. Han var bror til Herman Anker, Christian August Anker og Dikka Møller, onkel til Katti Anker Møller, Ella Anker og Johan Anker og grandonkel til Øyvind Anker, Synnøve Anker Aurdal, Peter Martin Anker og Tove Mohr.