Landslaget har en lang historie, og kan spores tilbake til begynnelsen av 1900-tallet hvor et gibraltarsk lag spilte kamper mot lag som inneholdt besøkende soldater og offiserer fra Storbritannia. Deres første uoffisielle landskamp ble spilt i april 1923, da Gibraltar spilte vennskapskamper mot den spanske klubben Sevilla FC. Perioden fra 1949 til 1955 regnes for å være landslagets storhetsperiode, da større europeiske klubber som blant andre Real Madrid, Atlético Madrid, Real Valladolid og Admira Wacker la sine treningsopphold på Gibraltar, hvor de da spilte kamper mot landslaget. Gibraltars første kamp som UEFA-medlem, en vennskapskamp som fant sted 19. november 2013, endte 0–0 hjemme mot .