Etter å ha fulgt undervisningen ved Christian Krohgs malerskole i Kristiania en kort tid, dro Otto Hjort i 1886 til München for å utdanne seg videre ved kunstakademiet der. Gjennom tre semestre studerte han malerkunsten med professorene Karl Raupp og Gabriel Hack som veiledere. I perioden 1891–1892 var han assistent for maleren Philip Fleischer i samme by.