Børge Hovedskou var gift med "Pepi" Hovedskou, født Agnethe Christense Dahlt i Aggersund, like ved Nibe, 27. mars 1911, den yngste av syv barn. Børge og Pepi møttes på Kunstakademiet. Pepi var en kunstmaler, men laget en mengde fine motivmalerier i tiden etter Børges død.