I årene 1837-1838 var han på studiereise i Tyskland, Østerrike og Frankrike. I 1839 ble han utnevnt til assisterende overlege ved Serafimerlasarettet og begynte der den 1. august samme år i den første moderne medisinske klinikken i Sverige. Ved denne klinikken ble det innført fysikalske undersøkningsmetoder i samsvar med et nøye studium av den patologiske anatomien. Ved Magnus Huss' store fagkunnskap og iherdighet i sin lange tjenestetid som klinikkens leder kan den ovennevnte dagen med stor sannsynlighet sies å være et vendepunkt i den svenske medisinens historie.