Båtsfjord var det stedet som ble minst skadet i tyskernes nedbrenning høsten 1944. Selv om 27 hus ble totalskadd, var det ellers forholdsvis lite skader. Stedet ble derfor brukt som forsyningsbase for det befridde Finnmark etter tyskernes tilbaketrekking. Mange som ble evakuert vestover under nedbrenningen, returnerte til Båtsfjord som første sted vinteren 1945–1946.