Han debuterte i Bundesligaen for Borussia Dortmund den 21. november 2020 mot , hvor han kom inn som innbytter for Erling Braut Haaland. Han ble med det den yngste spilleren i Bundesligaen noensinne i en alder av 16 år og 1 dag. Ifølge dokumentaren «Tricks, Cheats, Deception - The Million Dollar Business with Football Talents» som ble sendt av den tyske kanalen ProSieben i 2024, skal imidlertid en mann ha tilstått å ha forfalsket dokumenter som viser at Muokoko er hans sønn og at hans fødselsår er 2004. I en offisiell uttalelse fra Borussia Dortmund fremgår det at klubben anser dokumentene som ekte og forholder seg til at Muokoko er født i 2004.