Nylig har gassfase-ionaktiveringsmetoder blitt brukt for å få ny innsikt i komplekse strukturer. Kollisjonsindusert utfolding (CIU) er en teknikk der ionets indre energi økes gjennom kollisjoner med en buffergass før IM-MS-analyse. Utfolding av ionet observeres gjennom større CCSer, og energien der utfolding skjer tilsvarer delvis ikke-kovalente interaksjoner i ionet. Denne teknikken har blitt brukt for å skille polyubikvitinkoblinger og intakte antistoffer.