Giovanni Sammartinis første verk, en samling vokalkomposisjoner som senere er gått tapt, stammer fra 1725. Ikke lenge etter ble han ved , og i 1728 i . Posten ved Sant'Ambrogio holdt han til sin død. Han ble senere kapellmester ved flere andre av Milanos kirker og skal ved sin død ha arbeidet ved åtte eller flere kirker.