Hun var datter av svensk riksråd Ture Trolle (d. 1555) og Magdalena Eriksdotter Gyllenstiena. I 1564 giftet hun seg i Arboga med franskmannen, friherre Charles de Mornay. Etter bryllupet dro Mornay igjen i strid, men havnet i dansk fangenskap. I hans fravær styrte Anna Kronoberg Mornays andre forleninger. I de ti år de var gift, levet de kun sammen som ektemaker i et halvt år. Som følge av intrigemakeri mot Johan III ble Mornay henrettet på Stortorget i Stockholm i 1574.