Frankenthaler studerte på Dalton under den meksikanske kunstneren Rufino Tamayo, og senere på Bennington College under Paul Feeley. Sistnevnte er kreditert for å ha påvirket hennes interesse i tidlige verk for å jobbe med avarter av kubisme. Hun studerte senere også med Wallace Harrison og Hans Hofmann, men var også inspirert av Clement Greenberg og Jackson Pollock.