Den andre sesongen med Rayo Vallecano endte med nedrykk fra toppdivisjonen. Etter nedrykket ønsket ikke Rayo Vallecano satse videre på ham, men Cortijo insisterte på å kjempe for plassen på laget. Etter en halv sesong uten spilletid, signerte Cortijo for under vinterens overgangsvindu. Numancia befant seg for første gang på andre nivå i ligasystemet og hadde behov for en veteran som Cortijo til å hjelpe dem holde seg oppe. I sin andre sesong for Numancia presterte laget å rykke opp til toppdivisjonen. Den da 33 år gamle Cortijo valgte så å vende tilbake til Cádiz, hvor han spilte de siste tre sesongene av karrieren på ligasystemets tredje nivå.