I brevet blir Timoteus oppfordret til å være utholdende i tjenesten, og være tro mot det som er overlevert han. Dette må han gjøre selv om han blir utsatt for prøvelser, og her blir Paulus holdt fram som et forbilde. Som i første timoteusbrev legges det vekt på at Timoteus må avvise vranglærere, og lede de som er kommet på villspor tilbake.