Karl Haushofer kom fra familie med mange kunstnere og vitenskapsmenn. Faren het Max Haushofer og var en økonomiprofessor, og moren het Adele Haushofer (født Fraas). Etter avsluttende eksamen ved gymnaset i München så han egentlig for seg en akademisk karriere, men militærtjenesten i Bayern viste seg å være så interessant at han fortsatte med å jobbe som instruktør ved militærakademier og i generalstaben.