I 1486 kom ble Provence lagt inn under Frankrike. Deretter startet en utvikling som gjorde Toulon til Frankrikes fremste militærhavn i Middelhavet. En allianse mellom Frankrike og Tyrkia mot Habsburgerne førte til en avtalt okkupasjon av Toulon av den ottomanske hæren og marinen i vinteren 1543/44.