Forsinkelsene i byggetiden hadde den positive følgen at hun i løpet av prosessen også ble modernisert, og hun ble bygget ferdig med blant annet et moderne vinklet flydekk og moderne radarsystemer. Hun ble utstyrt med fly fra juli 1960, opprinnelig av typene De Havilland Sea Vixen, Supermarine Scimitar og Fairey Gannet. Scimitar-flyene ble senere erstattet av Blackburn Buccaneer. Flydekket var imidlertid litt for kort for å operere moderne fly med tilstrekkelig sikkerhet, noe som førte til at man tok henne ut av tjeneste 14. juli 1970 for å bygge henne om til helikopterhangarskip. Hun ble operativ igjen 18. august 1973 utstyrt med Westland Wessex og Westland Sea King helikoptre. På slutten av 70-tallet begynte man å evaluere bruk av Sea Harrier VTOL-fly ombord på HMS «Hermes» og i 1980 fikk hun en 12° rampe i baugen for å kunne operere Sea Harrier-fly effektivt.