I juli 2008 gikk det rykter om at han hadde uregelmessige blodverdier, men han avviste disse, blant annet med bakgrunn i et brev fra UCI som bekreftet at alt var normalt.14. august ble Rabobank og Dekker enige om å skille lag, og han var fri til å signere for andre. Dekker inngikk en toårskontrakt med Silence-Lotto i september 2008.