Mot slutten av serien får MacGyver vite at han har en sønn, Sean Angus Malloy, også kalt Sam. Hans mor, som MacGyver var sammen med, Katherine «Kate» Malloy ble henrettet av rødgarister i Beijing. Budskapet om sønnen kommer som et «sjokk» på MacGyver som alltid har trodd at bestefaren var hans siste gjenlevende slektning.