Under krigen var sykehuset overtatt av tyskerne, og de bygget en militærbrakke på eiendommen. rekvirerte Florida Sykehus, da under navnet . Brakkebygningen ble også brukt som militærsykehus under krigen for tyskerne. Etter krigen tok det norske Forsvaret over brakkebygningen. Halvparten ble brukt av Forsvarets forskningsinstitutt, mens den andre halvdelen tjente som norsk militærsykehus en kortere tid før forskningsintituttet tok over hele brakkebygningen.