I Metal Gear er Snake et helt ferskt medlem i FOXHOUND som får i oppdrag å finne og ødelegge Metal Gear-våpenet lokalisert i Outer Heaven-festningen. I løpet av spillet møter han Gray Fox, en FOXHOUND-veteran i Outer Heaven sitt fangenskap. Etter suksess, blir Snake konfrontert av hans egen overordnede og veileder Big Boss som sin hovedfiende.