I sin levetid ble han i tråd med tidens skikk vanligvis omtalt med fornavn og patronym, og omtales f.eks. som Johannes Paulinus (Paullinus) Asloensis [fra Oslo] under studiene ved Københavns Universitet. Som prest ble han omtalt med tiltaleformen «herr» som da ble brukt om prester og adelsmenn. Slektsnavnet Paus var imidlertid også i bruk i hans levetid, og en akademisk orasjon av sønnen Anders Hansson Paus fra 1644 omtalte faren som .