Schultz Jørgensen ble utdannet folkeskolelærer i 1955, cand.psych. i 1968 og dr.phil. i 1983. Han arbeidet som adjunkt og senere lektor ved Københavns Universitet i perioden 1971-1981. I 1981 ble han forskningsleder ved Socialforskningsinstituttet og fra 1991 tilknyttet Danmarks Pædagogiske Universitet som professor i sosialpsykologi. Schultz Jørgensen har bl.a. forsket på familieforhold, barns sosiale identitet og utsatte barn og unge.