Høeg var formann i Den norske santalmisjon fra 1917 til 1937 og fra 1946 frem til han døde i 1957. Med pastor Oldenburg reiste han for santalmisjonen til India i 1922 og 1923 og skrev ei bok fra turen. For Lutherstiftelsen var han i styret (direksjonen) fra 1921 til 1945. Forlaget utga i 1941 ei bok om kirkehistorie som han skrev sammen med presten Lars Johan Danbolt (1895–1981). Mellom 1932 og 1945 var han i Oslo bispedømmeråd. Fra 1935 til 1947 var han formann i Landsrådet for Norges kristelige student- og gymnasiastlag (stiftet 1924), senere døpt om til Norges Kristelige Student- og Skoleungdomslag. Under den andre verdenskrig satt han i som ledet an i Kirkekampen, der norske kirkelige kjempet mot tyskerten.