Antroposofisk medisin først og fremst er et perspektiv eller filosofi på sykebehandling, og vurdering av behovet for forskning er derfor noe annerledes innenfor antroposofisk medisin enn det man ser i skolemedisinen. Noe av vegringen mot å bruke store randomiserte dobbelblind-undersøkelser baseres på tanken om individualisert pasientbehandling. Noen av prinsippene for antroposofisk medisin mangler også vitenskapelig støtte, deriblant teorien om at det ikke er hjertet som pumper blodet rundt i kroppen eller at et menneskes sykdomsbilde påvirkes av tidligere liv.