Modellen ble først vist på bilutstillingen i Paris i 2002 og forhåndssolgt i 343 eksemplarer til lojale kunder av Ferrari. Senere bygget fabrikken etter eget sigende ytterligere 50 stykk. Den 8. november 2005 annonserte Ferrari at nok et eksemplar av Enzo skulle bygges, slik at det totale antallet ble 400. Denne bilen, med chassisnummer #ZFFCZ56B000141920, ble auksjonert bort av auksjonsfirmaet Sotheby's den 28. juni 2005, til inntekt for ofre etter tsunamien i Indiahavet 2004. Bilen ble solgt for 1 274 229 amerikanske dollar, nesten dobbelt så mye som listeprisen. Enzo Ferrari ble også solgt til Norge til en estimert pris på seks millioner kroner.