Da man bygget Atlantis baserte man seg på de erfaringer man hadde gjort med de foregående ferjene. Fergens vekt kunne dermed reduseres med 3 tonn sammenlignet med Columbias. I tillegg var byggetiden bare halvparten i forhold til de foregående byggene. Man passet også på å produserer deler til Endeavour, som var den neste fergen som skulle bygges.