Den 26. mars 2020 signerte Ebner en 1-årig kontrakt med New York Giants, og ble dermed gjenforent med tidligere special teams coordinator for Patriots og nylig ansatt hovedtrener for Giants Joe Judge. Den 7. september 2021 signerte Ebne ny kontrakt med Giants. Den 24. november 2021 ble Ebner plassert på injured reserve.