Etter utbruddet av Første verdenskrig i 1914 forble han på sin post i Warszawa. Fra tidlig av hadde erkebiskop Kakowski alltid hatt en veldig nær rekasjon til russerne, men dette ville begynne å endre seg med fremveksten av det som ble til den russiske revolusjon og deretter tsarmonarkiets fall. Dette førte til at de viktigste polske myndigheter nærmet seg keiserdømmet Tyskland, spesielt etter at der ble den viktigste okkupasjonsmakten i de polske områder.