På sin egen fødselsdag, elleve år gammel, skjøt Fonda seg selv i magen med en pistol. Kulen gikk gjennom magesekken, traff leveren og ødela den ene nyren. Hjertet hans stoppet på operasjonsbordet, og han tilbrakte noen uker på sykehus. Fonda fortalte The Beatles om denne hendelsen da bandet var på turne i USA i 1965, og John Lennon skrev She Said She Said på inspirasjon av Fondas uttalelse "I know what it's like to be dead".