Et nytt flagg ble innført 29. juli 2010, etter at den sittende regjeringen foreslo det, og ble gjort til landets offisielle flagg lørdag 31. juli 2010. Dette ble imidlertid senket igjen etter at daværende president Bingu wa Mutharika døde. I Mutharikas flagg ble stripene omorganisert til å følge mønsteret til Det pan-afrikanske flagget, med den røde stripen på topp, den sorte stripen i midten, og den grønne stripen på bunn. Den stigende røde solen ved flaggets topp ble byttet ut med en hel, sentrert hvit sol, som skulle representere landets økonomiske fremgang siden uavhengigheten i 1964. Opposisjonen gjorde rettslig motstand mot endringen av flagget. Malawis president, Bingu wa Mutharika, godtok og innførte det nye flagget 29. juli 2010.