Månekrateret Väisälä fikk i 1974 hans navn. Asteroidene 1573 Väisälä og 2804 Yrjö er likeledes oppkalt etter ham. De to kometene som ble oppdaget av Väisälä, bærer begge hans navn: Väisälä 1 og Väisälä-Oterma.