Kirken skal ha ligget i ruiner mot slutten av 1500-tallet. Ved arkeologiske utgravninger i 1877 ledet av Peter Andreas Blix ble det funnet murrester fra en steinkirke samt graver, og dette er senere identifisert som Nikolaikirken av Gerhard Fischer. I dag er det ingen synlige rester på stedet, men under utgravningen av Follobanen ble det funnet skjeletter fra mennesker som trolig led av spedalskhet.