I 1940 ble Norge invadert og okkupert av Nazi-Tyskland. Den tyske okkupasjonsmakten grep raskt inn i NRKs virksomhet. I september 1940 ble kringkastingen underlagt det nylig etablerte Kultur- og folkeopplysningsdepartementet med Gulbrand Lunde som «minister». NRKs administrerende direktør Egil Sundt og riksprogramsjef Olav Midttun ble avskjediget, og Bødtker overtok stillingen som forvaltningsdirektør. Han var én av fire underdirektører under Riksfullmektig Wilhelm Frimann Koren Christie, som i sin tur svarte for det tyske Reischkommissariat Norwegen. NRK vasr preget av indre stridigheter og motsetninger på den tiden.