Fernando Belaúnde Terry var det andre av fire barn til en velstående politisk aktiv familie i Liman. Hans bestefar, Mariano A. Belaúnde, var peruansk finansminister, hans onkel, Víctor Andrés Belaúnde, var i 1959/60 president for FNs generalforsamling. Familien dro til Frankrike hvor Fernando gikk på skolen.