Etter en tid ble Boggs overbevist om at ekteskap og virke i politikken ikke var kompatible størrelser i hennes liv, gitt hennes uavhengighetstrang i det som var og forble et ganske patriarkalsk samfunn. Figueres ble president på nytt i 1953. Boggs skilte seg fra ham i 1954, og tok med seg barna til New York City, der hun arbeidet for Costa Ricas FN-delegasjon mens hun virket som forfatter.