Fichtenau var sønn av Heinrich von Fichtenau og Maria Schachermeyr, søster av historikeren Fritz Schachermeyr. Han studerte historie og kunsthistorie ved Universitetet i Wien og avsluttet utdannelsen ved Instituttet for østerriksk historieforskning (IÖG) i 1935. I 1936 ble han assistent for Hans Hirsch ved utgivelsen av Konrad IIIs diplomer for Monumenta Germaniae Historica. Under 2. verdenskrig var han soldat på østfronten.