Blant Duques valgkampsaker var blant annet å forenkle skattesystemet og stimulere utenlandske investeringer. Han ville innta en hard linje mot geriljagruppen ELN og mot kokainproduksjon og ønsket fornyet samarbeid med USA for å bekjempe narkotikasmugling. Duque er motstander av legalisering av narkotiske rusmidler. I valgkampen distanserte han seg fra enkelte av partiets mest høyreorienterte standpunkter.