Anlegget ble utvidet med flere bygninger i 1991. I 1996 gjorde det italienske helseministerium instituttet til det medisinsk forskningsinstitutt (, IRCCS), og i de første årene av den 21. århundre ble det en nasjonal søyle i beredskapen mot bioterrorisme. INMI er spesialisert på behandling av alborlige og nyartede infeksjonssykdommer som SARS, viral hemoragisk feber og MERS.