Det er en rekke miljøutfordringer knyttet til utvinning av geotermisk energi. Lekkasje fra rør kan skape forurensing av grunnvann, grunnet at vannet som strømmer i røret blant annet inneholder gasser som CO og HS. Det er også et problem knyttet til utbygging av geotermiske systemer ved at det kan dannes forkastninger i berggrunnen som kan føre til seismisk aktivitet som små jordskjelv i områder rundt kraftverket.