To tenåringer kommer over en tilsynelatende forlatt militær installasjon om natten. De utnytter det som ser ut til å være et utendørs svømmebasseng for å prøve nakenbading. De blir angrepet av en usett kraft i bassenget, og forsvinner snart under vannet. Maggie McKeown får i oppdrag å finne de savnede tenåringene i nærheten av Lost River Lake. Hun ansetter Paul Grogan som hennes guide. De kommer snart over den forlatte installasjonen. De oppdager bisarre eksemplarer på forskning, og ting som indikerer at noen bor der. Maggie finner en dreneringsbryter for det utvendige bassenget, og ønsker å tømme bassenget for å se bunnen. Men i det øyeblikket hun aktiverer bryteren, dukker det opp en mann og forsøker å stoppe henne. De oppdager et skjelett i det tomme bassenget, og ser at bassenget var fylt med saltvann. Mannen som dukket opp stjeler bilen deres, men krasjer den på grunn av sin desorientering. Mannen blir tatt med til Grogans hjem hvor de overnatter. De bruker deretter Grogans flåte nedover en elv, hvor mannen forteller at bassenget var fylt med dødelig piranha, og at Maggie har nå ført fisken ut i selve elven. Maggie og Grogan er skeptiske frem til de oppdager liket til Grogans venn Jack, som har blødd i hjel.