Med de to gjenværende flyene oppholdt Byrd-ekspedisjonen seg i base camp, Little America gjennom den antarktiske vinteren 1929. Feltarbeidet ble gjenopptatt i oktober, og etter flere forberedelser valgte de å fly ekspedisjonen Tri-Motor over Sydpolen. De tok av sørover 28. november. Dette var første overflyvning av Antarktisplatået. Selve ruten var kjent for Byrd og hans menn for de fløy nær ruta som var brukt av Roald Amundsen på hans vellykkede ekspedisjon til Sydpolen i november 1911. Med vanskeligheter klarte Tri-Motoren å klatre over Dronning Mauds Fjell (etter først å ha måttet dumpe alt, bl. a reserveprovianten) og fløy over Sydpolen. Ombord i flyet, morset June et radiosignal: . Denne ble videresendt til amerikanske aviser, denne morsekode meldingen annonsert at ekspedisjonens viktigste mål var vellykket nådd.