Link må deretter få tak i de åtte essensene som ligger spredt over åtte forskjellige fangehull, som er spredt over hele Holodrum og Subrosia. Spilleren må bringe alle disse sverdene til Maku-treet, som bruker sverdene for å lage et stort Maku-frø, et hellig frø som gjør at Link kan komme inn i et slott. I slottet må Link beseire Onox og forsøke å redde Din. Link mottar et sverd fra Impa, og kommer seg til Maku-treet i Lynna City, hovedstaden i Labrynna. Men treet blir beordret ødelagt, og Link må finne en tidsportal for å reise til fortiden og hindre at treet blir skadd. Maku-treet forteller Link at han behøver de åtte essensene for å beseire en fiende. Link må deretter få tak i de åtte essensene, skjult i åtte fangehull over hele Labrynnas fortid og nåtid.