Johnston ble valgt til lagkaptein, og ledet klubben til finalen i FA-cupen tre ganger, i 1948, 1951 og i 1953. De første to finalene tapte Blackpool, men i 1953 ble han den hittil eneste kapteinen for Blackpool som har løftet FA-cuptroféet da de slo Bolton i den berømte . Han spilte totalt 398 ligakamper for Blackpool og scoret 11 mål.