Merkitmongolene bebodde elvedalene til Selenge og Orkhon (nedre del). De ble etter alt å dømme absorbert av andre mongolske stammer (oirater, burjater) og andre som flyktet til kiptsjakerne ble innblandet med dem. Etter Yuandynastiets fall ble de en klan av et banner i Nordlige Yuan. Merkitene var den dominerende gruppen i det senere Burjatia.