Mikhail var omgitt av ustyrlige bojarer; noen hadde ambisjoner om selv å bli tsar. Kongene i Sverige og Polen samlet tropper for å angripe ham, khanen herjet sørpå, og sønnen til «Falske Dmitrij 2» og «heksen Marinka» som hadde giftet seg med kosakkhøvdingen Zarutskij, bodde i Astrakhan. Men Mikhail innvilget i å ikke la noen henrette «uten etter rettferdig rettergang og etter enighet med bojarene». Da troppene hans tok Marinka, hennes mann og sønn til fange, lot han likevel Zarutskij spidde på en påle opp i rektum på Den røde plass. Marinka ble sultet i hjel, og sønnen hengt fra Kremls murer. Mikhail oppnådde at svenskene inngikk fred i Stolbova i oktober 1615, og Novgorod ble russisk igjen. Men Russland var blitt avskåret fra Østersjøen.