Navnet Canary Wharf stammer fra tiden da et to-etasjers varehus ble bygget i 1937 for å bli leid ut til Fruit Lines Limited, eid av Fred Dessen & Company. Selskapet skulle bruke varehuset i sin frukthandel med Kanariøyene og middelhavsområdet. Etter ønske fra Fred Dessen & Company ble stedet kalt Canary Wharf. Flere personer var sentrale i den tidlige utviklingen av Canary Wharf, blant annet Michael von Clemm, G Ware Travelstead, Reg Ward og Paul Reichman.