Han er medlem av Det Norske Akademi for Språk og Litteratur, styremedlem i Fondet for dansk-norsk samarbeid (1998–) og medlem av Det Norske Videnskaps-Akademi (2002–). Han har tidligere vært nestleder i Sosialistisk Venstreparti og styremedlem i (2003–2009). Rune Slagstad fikk Neshornet, Klassekampens kulturpris, for 2013.