Marduks opprinnelige vesen er uklar, men han ble senere assosiert med vann, vegetasjon, dom, og magi. Hans ektefelle var gudinnen Sarpanitu. Han var også sett på som sønn av Ea (Enki i sumerisk mytologi) og Damkina (Ninhursag i sumerisk mytologi) og arvingen av Anu, men uansett hvilke særskilte trekk Marduk kan ha hatt, ble de overskygget av den politiske utviklingen langs Eugfrat og som etter hvert fikk folket smelte ham sammen med trekk som tilhørte guder som i eldre perioder ble forstått som overhoder av gudeverden. Det er særskilt to guder — Ea og Enlil — hvis makt og attributter som ble overført til Marduk.