Han har dømt flere landskamper på U-17, U-19 og U-21-nivå, blant annet flere kamper under sluttspill av europamesterskap for U-17 og U-19. Ekberg debuterte internasjonalt som hoveddommer på øverste nivå den 15. november 2013, da han dømte vennskapskampen mellom og (3–0). Hans første europacupkamp kom den 4. juli 2013, da han dømte første kvalifiseringskamp til Europaligaen mellom Videoton FC og FK Mladost Podgorica (2–1). Ekberg har siden dømt flere kvalifiseringskamper både i Mesterligaen og Europaligaen gjennom flere sesonger, i tillegg til gruppespill i sistnevnte turnering.