Begynnelsen av 1990-tallet var preget av hyppige utskiftninger av regjeringer og vekslende politiske koalisjoner. Det regjerende politiske partiet CDU tapte det andre Landsdagsvalget etter gjenforeningen, til fordel for SPD, som regjerte i en mindretalls-koalisjon sammen med Bündnis 90/Die Grünen med støtte fra Die Linkspartei. Ministerpresidenten Reinhard Höppner styrte delstaten i to perioder med store omstruktureringer i næringslivet og arbeidsmarkedet, og deretter i en tredje periode hvor SPD regjerte alene med støtte fra Bündnis 90/Die Grünen og Die Linkspartei.