Fra 1804 til 1814 var Sonnleithner sekretær ved hoffteateret i Wien. Han skrev en rekke libretti, blant annet til Beethovens , av Luigi Cherubini og av Adalbert Gyrowetz. Sonnleithner var medgrunnlegger av Gesellschaft der Musikfreunde i Wien og en av de tidligste innsamlerne av folkemelodier i Østerrike. Han knyttet et nært vennskap med Franz Schubert og sin nevø Grillparzer, og var Beethovens venn og advokat.