Parken er tilknyttet Thayatal nasjonalpark på elva Dyjes høyre bredd i Østerrike, og sammen danner de en internasjonal park. Podyjí er den minste av de fire nasjonalparkene i Tsjekkia. Den beskytter naturlige skoger i den dype Dyjedalen, langs en strekning på 40 kilometer av elva fra Vranov nad Dyjí til Znojmo.