I Giro d'Italia 2007 ble han nummer 2 på den sjette etappen og overtok sammenlagtledelsen. Han kjempet hardt for å beholde trøyen så lenge som mulig, men på den første fjelletappen etter at han tok trøyen ble han passert i sammendraget og falt til 9.-plass. Pinotti fortsatte å kjempe gjennom resten av Giroen, og endte til slutt på en 18.-plass sammenlagt.