Pedersen har utgitt et stort antall vitenskapelige artikler i internasjonale fagtidsskrifter. Han har også utgitt flere fagbøker, som blant annet (1979), (1994), (1998), (2005), (2006) og (2010) (sammen med Sveinung Sandberg). Han har også vært spaltist i og , og bokanmelder i dagspressen. Fra 2009 til 2011 ledet han en komite som utpekte de 25 mest innflytelsesrike tekstene i norsk sosiologi, «Norsk sosiologisk kanon».