Jan Lebeda ble ordinert til prest i erkebispedømmet i Praha i 1937. Han var først kapellan i Kolín. Etter det var han spiritual leder for Prahas presteseminar (1943-1951). Fra denne posten ble han fjernet av kommunistene og installert som administrator i Řevničov (okres Rakovník) (1952). Under dette ufrivillige og vanskelige eksil skrev han en serie litterære verk som senere dukket opp på trykk. Fra 1958 til 1968 arbeidet han i Kladno-Rozdělov.