Den 2. mars 1848 ble han valgt til generalsuperior for spiritanerne. Han ble samtalepartner med anti­slaveri­politikeren Victor Schœlcher som var blitt marineminister under den franske provisoriske regjering i 1848. Hans ministerpost gjorde ham sentral for de franske oversjøiske besittelser, der det var meget slaveri. Da fader Monnet fikk vite at slaveriet var i ferd med å bli avskaffet i april 1848, sendte han et brev til presteskapet på Réunion for å be dem om å overbevise nybyggerne om å frigjøre sine slaver uten å vente på anvendelsen av dekretet på øya. Det nådde han ikke gjennom med. Men slaveriet ble avskaffet på Bourbon (Réunion) den 20. desember 1848.