Vatnet har utløp i vest til Sagelva, som renner ned til Sagvågsfjorden ved Sagvåg. Storavatnets tilløp kommer fra flere mindre elver, som Daleelvo og bekkene fra Hustredalsvatnet og Storedalen i nord, bekken fra Røyrtjødn til Valvatnaflæet i sør, og i øst Stølaelvo, som renner ut i Vassenden og kommer fra Nonstjørna og Mortjørna.