Utstein klosterkyrkje er rektangulær og er innvendig ca. 37x7m. Den er delt i tre deler, med et steintårn, som er plassert på midten. Plasseringen av steintårnet er enestående i norsk sammenheng. Det kan være laget slik for å tilrettelegge for et framtidig tverrskip. Kirkeskipet, tårndelen og koret har dermed omtrent samme lengde og bredde.