Vansjø har mange øyer, holmer og skjær, og Gudøya er omgitt av holmene Søndre Kreierten og Nordre Kreierten i vest, Mærraholmen i nordøst og Lille Gudøy i sør. Nærmeste store øy i Vansjø er Østenrødøya, som ligger øst for Gudøya.