Norkirken Bergen holdt til i Sankt Jakobs kirke, som fram til desember 2002 var en vanlig soknekirke i Bergen sentrum. Norkirken Bergen tar derimot ikke utgangspunkt i det geografiske soknet, men er en «kategorialmenighet». Navnet «Norkirken Bergen» brukes ikke om selve kirkebygget, men om menigheten som fellesskap eller som organisasjon.