Stasjonen lå mellom Borgen og Smestad og ble åpnet 17. november 1912. Den var opprinnelig den nest siste stasjonen på Smestadbanen. Ved Heggeli stasjon krysset Heggeliveien både trikkeskinnene og Sørkedalsveien (den gangen omfattet Heggeliveien også nedre del av Heggelibakken). Etter at Røabanen ble oppgradert til T-banestandard ble stasjonen lagt ned 18. mai 1995. Allerede flere år før dette hadde stasjonen vært truet med nedleggelse, men den fikk et forlenget liv takket være et sterkt engasjement fra blant andre skuespilleren Svein Erik Brodal.