I perioden fra november 2005, da Sjupartialliansen offisielt startet sitt samarbeid med NKP (Maobadi), og fram til diktaturet falt i april 2006, ble det klart at det var stadig større motsetninger mellom to fløyer i JMN ledet av kommunistveteranen Mohan Bikram Singh og Amik Sherchan.