Rettssaken mot ham i Bergen tingrett startet 28. februar 2007, der aktor la ned påstand om syv og et halvt års fengsel. Seim ble i tingretten dømt til fem og et halvt års ubetinget fengsel, og ble fradømt retten til å drive næringsvirksomhet på livstid. Dommen ble anket, og i 2009 ble han dømt til fire års fengsel i Gulating lagmannsrett, og fradømt retten til å drive næringsvirksomhet i 10 år. Anke til Høyesterett førte ikke frem og dommen ble rettskraftig januar 2010. Medtiltalte i saken var Tor Arne Uppstrøm og advokat Bertrand Vedeler. Uppstrøm ble frikjent, mens Vedeler ble dømt til 1,5 års fengsel for grovt underslag.