Den 21. juni 1535 ble han nominert av keiser Karl V og utnevnt av pave Paul III til biskop av Antequera, nettopp opprettet som nytt bispedømme i Ny-Spania. Den 8. april 1537 ble han bispeviet i Madrid av Juan de Zumárraga, erkebiskop av Mexico, som da var i Spania. Så reiste han over Atlanterhavet til «den nye verden».