Flere motstandere mot interne skatter samlet seg rundt kandidaturet til Thomas Jefferson, og hjalp ham med å beseire sittende president John Adams ved valget i 1800. I 1802 opphevet kongressen hele avgiften på destillert brennevin, og alle andre interne føderale skatter. Fram til krigen i 1812 hadde den føderale regjeringen utelukkende import-tariffer som statlige inntekter. Men etter hvert vokste nasjonens ekspanderende utenrikshandel, og dermed også statlige inntekter. Washington-administrasjonens undertrykkelse av Whisky-opprøret møtte bred godkjenning blant befolkningen. Hele whisky-avgiften ble endelig opphevet for godt, etter at president Thomas Jefferson og hans parti kom til makten i 1801.