Sesongen starter i mars og varer til slutten av november. De 10 klubbene i Meistriliiga spiller mot hverandre fire ganger. Etter hver sesong rykker laget som ender sist ned, mens vinneren av Esiliiga rykker opp. Lagene som ender henholdsvis nest sist i Meistriliiga og som nummer 2 i Esiliiga, spiller to kvalifiseringskamper for å beholde plassen / rykke opp til Meistriliiga.