Den første kjent bruken av «pseudovitenskap» er fra 1797 da historikeren James Pettit Andrew omtalte alkemi som en «fantastical pseudo-science». Betegnelsen har vært jevnlig brukt siden 1880 og har hatt en klart nedsettende betydning. Karl Popper mente at psykoanalyse er pseudovitenskap fordi den ikke er falsifiserbar. Popper mente også at marxistisk teori er pseudovitenskapelig. Frenologi ble tidlig på 1800-tallet beskrevet som pseudovitenskap.