Etter hans flytting til Washington hjalp han til med å etablere National Geographic Society og tjente som dets første president. I dag utgis Hubbard-medaljen for fremragende oppdagelser og forskning. I 1897 bidro han også til å redde A. A. A. S, American Association for Advancement of Science (grunnlagt i 1848) fra finansiell risiko og nedleggelse, ved å sette den istand til å kjøpe sin publikasjon,