I hans tid som erkebiskop der begynte peronismen å vokse frem i Argentina, og til å begynne med ble erkebiskopen ansett som en tilhenger av general Peróns politikk. Et hyrdebrev fra januar 1946 forbød katolikker å stemme på partier som støttet skille av kirke og stat, eller skilsmisse.. Han uttrykte imidlertid senere bekymring over regjeringens innblanding i de politiske valgprosessene og kontroll av læreres religiøse tilhørighet, noe som var knyttet til at religion var obligatorisk fag i landets offentlige skoler.