I løpet av 1800-tallet begynte chipewyanerne å bli gjenstand for en stadig sterkere akkulturasjon. Katolsk misjon fra 1840-tallet gjorde dem til katolikker. Da Hudson's Bay Company solgte Ruperts Land til Canada i 1870, begynte den kanadiske føderasjonen å stille krav til chipewyanerne sitt hjemland. Gjennom og ga de fra seg retten til land og vann for fem dollar livrente per person og år, ammunisjon, garn og mer, og fikk tildelt begrensede indianerreservat. Etter hvert gikk de over til et mer bosatt liv. Den økte kontakten med omverdenen førte også til at mange epidemiske sykdommer, som tuberkulose, influensa og meslinger, begynte å spre seg i større grad, noen ganger med ødeleggende konsekvenser. Fra 1940-tallet begynte mange barn å bli sendt til statlige internatskoler for indianere, og fra 1960-tallet begynte staten å etablere barneskoler i de lokale chipewyanerbosetninger.