Schneider-Ammann er medlem av Det frie demokratiske partiet. Den 22. september 2010 ble Schneider-Ammann medlem av Forbundsrådet, den sveitsiske regjeringen, som etterfølger etter Hans-Rudolf Merz. Han er siden 1. november 2010 økonomiminister i regjeringen. Schneider-Ammann kunngjorde før han tiltrådte regjeringsposten at han ville tre ut av og avvikle sine næringslivsengasjementer og fratre sine styreverv.