Miljøverndepartementet ved Miljødirektoratet har eiendomsrettighetene til alle prøver som samles inn og lagres i miljøprøvebanken. Forskningsmiljøer kan søke om uttak av prøver til relevante miljøgiftprosjekter. Det er ønskelig at norske forskningsmiljøer er deltakere i prosjektene som får ut prøver fra banken. Prosjektene må ha en tilknytning til norske forvaltnings- og/eller forskningsinstitusjoner. Miljødirektoratet kan gi føringer i forkant av søknader for hva som er forvaltningens behov for kunnskaper om miljøgifter. Miljøprøvebankens ekspertgruppe skal vurdere søknader om uttak og bruk av prøver. Det vil bli mulig å søke om uttak av prøver fra og med 2015.