Under de følgende fem år virket Levada som menighetsprest i erkebispedømmet Los Angeles, blant annet i Santa Monica. Han arbeidet også som lærer. Deretter vendte han tilbake til Roma for å fortsette studier ved Pontifical North American College. Han avla doktorseksamen i teologi i 1971, og underviste i noen år ved St. John's Seminary School of Theology i Camarillo.