Hans far trakk seg tilbake som redaktør, og Ingebrethsen fungerte som redaktør fra 1941 til 1943. Han ble arrestert igjen i 1943, og satt fengslet i Møllergata 19 fra 14. juli til 6. august, og deretter i Grini fangeleir til 13. november. Han ble deretter sendt til konsentrasjonsleirer på det europeiske kontinentet. Han tilbrakte tid i Natzweiler-Struthof, Mauthausen og Melk, og døde der i januar 1945. To av hans brødre etterfulgte ham som redaktør.