Fuglestvedt er forfatter og/eller medforfatter av ca. 60 fagartikler i publikasjoner med fagfelle-vurdering (peer-review). Han har vært bidragsyter til flere rapporter fra FNs klimapanel (IPCC) og WMO/UNEP Ozone assessments. I IPCCs femte hovedrapport (AR5) bidrar han som hovedforfatter (Lead Author) i kapitlet «Anthropogenic and NaturalRadiative Forcing». I arbeidet med rapporten er han medlem av for synteserapporten.