Etter at hennes mann keiser Henrik III døde den 5. oktober 1056, fungerte Agnes som regent for sin mindreårige sønn Henrik IV. Henrik III hadde på sitt dødsleie sikret at sønnen ble valgt til sin etterfølger. Agnes videreførte sin manns politikk med hjelp av sine støttespillere abbed Hugo av Cluny og pave Viktor II.