Han var #7 noensinne i passer rating med 115,1, og ble sammen med Brady en av to aktive quarterbacks til å nå en passer rating på 110 eller høyere i mer enn en sesong. Broncos fortsatte med en 24–17 seier over San Diego Chargers i divisjonsrunden av sluttspillet. Manning fullførte 25 av 36 pasninger for 230 yards, en touchdown, og en interception. I nok et møte mellom Manning og Brady i sluttspillet kom Broncos ut seriende, 26–16, i AFC Championship Game. Manning fullførte 32 av 43 pasninger for 400 yards og to touchdowns. Manning ble den tredje startende quarterbacken til å nå Super Bowl med to lag, etter Craig Morton og Kurt Warner.