Köngäs studerte folkloristikk ved Helsingfors universitet og fortsatte, etter å ha mottatt et Aslastipendium, sine studier ved Bloomington Indiana University. Her forsvarte hun i 1963 sin doktoravhandling om finsk-amerikanske folklore. Senere studerte hun ved Collège de France under personlig veiledning av den berømte franske antropologen Claude Lévi-Strauss.