Den nåværende klubben ble offisielt etablert i 1997, men i to tidligere inkarnasjoner, går klubbens historie tilbake til 1908. De vant Northern Premier League Cup i 1971. Klubben ble re-etablert i 1977 som Fleetwood Town FC, med mange av det opprinnelige spillerne fremdeles på laget. Opprinnelig ble laget plassert i Division One i Cheshire League, før ble de i 1982 ble flyttet til North West Counties League Division Two, og deretter rykket frem til førstedivisjon i 1984. De nådde finalen i FA Vase i 1985 der de tapte 3-1 for Halesowen Town FC foran et publikum på 16 000 på Wembley Stadion.