Boodberg kom fra en baltertysk slekt som hadde bodd i Estland i århundrer. Den kunne spore sine røtter tilbake til 1006, og kom som tyske innflyttere fra Mainz til Estland på 1200-tallet. Etter at Russland annekterte Estland i 1721 ble de til en prominent diplomat- og offisersfamilie i Det russiske rike.