På reisen videre sørover anløp «Pourquoi-Pas?» Deceptionøya i øygruppen Sør-Shetlandsøyene. Der ble forsyninger etterfylt ved hvalfangststasjonen i Whalers Bay. En hvalfanger hadde fått koldbrann i en hånd, og Charcot reddet livet hans ved å amputere hånden.