Spillet krever at spilleren samler inn et minimum antall "Power Moons" fra hvert kongerike, for å komme videre til det neste kongeriket. Å samle inn nok "Power Moons" gjør det mulig å kjøpe ekstra antrekk, eller låse opp to ekstra bonus-områder. Ett av disse områdene heter Dark Side, som krever 250 Power Moons før man kan komme inn til området. Det andre bonus-området er et nivå kalt Darker Side som kombinerer forskjellige elementer i spillet, og krever 500 Power Moons før området åpnes. I tillegg finnes det også et nivå basert på Peach's Castle fra Super Mario 64.