Det har i ettertid kommet frem at Bordaberry vant presidentvalget i 1972 på grunn av betydelig valgfusk. I 1973 oppløste Bordaberry den uruguayanske nasjonalforsamlingen og uenigheter med militæret førte til at han ble styrtet fra makten i 1976, før hans opprinnelige perioden som president var utløpt. Den 23. januar 2007, ble Bordaberry innlagt på sykehus i Montevideo med alvorlige pusteproblemer. På grunn av hans helseproblemer ble det beordret at Bordaberry skulle sone resten av straffen for brudd på menneskerettigheter, i husarrest. Den 17. juli 2011, døde Bordaberry i hans eget hjem, da han var 83 år gammel. Han hadde vært plaget av pusteproblemer og andre sykdommer i lengre tid.