Arbeidet til kommisjonen bygger på NEAFC-konvensjonen, som ble vedtatt i sin nåværende form i november 1982. Konvensjonen omfatter i utgangspunktet alle fiskeressurser i området. Sjøpattedyr er ikke omfattet av konvensjonen, og heller ikke langtmigrerende arter som er omfattet av andre avtaler, som tunfisk. NEAFC har en samordnende funksjon for fiskebestander som vandrer mellom de økonomiske sonene og åpent hav. Dette gjelder makrell, kolmule, norsk vårgytende sild og uer.