Våpenene som Edward har til disposisjon, er omtrent de samme som i Assassin's Creed III, men med noen unntak. Edward vil kunne ha opptil 4 pistoler, to sverd, to , et blåserør med berserk- og sovepiler, noen som var introdusert i Assassin's Creed III, røykbomber og knyttnevene. Edward har også tilgang til musketter, økser og kastekniver, samt muligheten til å kaste penger foran seg. På skipet har spilleren valget mellom kanonkuler (bredside), som brukes for å sprenge kruttlagre på skipene, for bombing og ildtønner bak på skipet for å hindre skip ifølge etter.