I slutten av 2001 opphørte Microsofts kundestøtte overfor private brukere av Windows 3.1x. Windows 3.1x ble likevel fortsatt brukt i innebygde systemer frem til 1. november 2008. Så sent som den 11. november 2008, rapporterte at den danske nasjonalbanken fortsatt benyttet Windows 3.11 i en seddelsorteringsmaskin.