I desember 2004 havnet Ju Wenjun på en tredjeplass i det asiatiske sjakkmesterskapet for kvinner i Beirut. Dette kvalifiserte henne til å spille sitt første verdensmesterskap i sjakk for kvinner i 2006. Hun konkurrerte i dette arrangementet også i 2008, 2010, 2012, 2015 og 2017.