Hun giftet seg i 1912 med den russiske legen Paul (Pavel) Scheftel, og Spielrein observerte utviklingen av deres datter Renata (også kalt Irma Renata) som ledd i sitt vitenskapelige arbeid. Ved utbruddet av første verdenskrig ble Pavel innkalt, og Sabina reiste til Geneve med håp om å tjene mer penger. Freud betalte for medlemskapet i det psykoanalytiske selskapet i Wien, mens Emil Oberholzer, en ledende og velstående sveitsisk psykiater, betalte for Spielreins medlemskap i den sveitsiske foreningen. I 1920 flyttet hun til Geneve og arbeidet der sammen med Édouard Claparède og Jean Piaget ved Rousseau-instituttet. Piaget gikk i psykoanalyse hos Spielrein «hver morgen» i åtte måneder.