Katzir oppholdt seg ved Harvard University da Golda Meir kontaktet ham og ba ham om å overta vervet som Israels president. Den 10. mars 1973 ble han valgt av Knesset til dette; han ble Israels fjerde president. Han fikk 66, mens 41 stemmer gikk til hans opponent Ephraim Urbach. Han tiltrådte vervet 24. mai 1973.