Han ble i 1804 «student med Udmærkelse» fra Trondhjems skole (i dag Trondheim katedralskole) og cand.theol. i 1808. I sin studietid ble han fanget av grundtvigianismen etter å ha holdt mye lag med sitt søskenbarn Svend Borchmann Hersleb (1784–1836) som var brevvenn med den danske N.F.S. Grundtvig (1783–1872). Altså mente han at man måtte holde fast ved den opprinnelige lutherske rettroenhet, og ikke ta inn over seg denne nye rasjonalismen der man vektla fornuft og tenkning. Kjerschow hadde vært utenlands også, men kom tilbake og jobbet 1810 til 1815 som lærer i historie og geografi ved et akademi for landkadetter.