I 1909 giftet Geoffrey de Havilland seg med Louise Thomas, som tidligere hadde vært guvernante for de Havillands søstre. De fikk tre sønner, Peter, Geoffrey og John. To av sønnene døde som testflygere av de Havilland fly. Hans yngste sønn, John, døde i en kollisjon i lufta mellom to Mosquitoer i 1943. Geoffrey Jr utførte den første flygningen med Mosquito og Vampire og ble drept i 1946 da han fløy den jetdrevne DH 108 Swallow mens han utførte et stup i eller nær lydens hastighet. Louise fikk et nervøst sammenbrudd etter dødsfallene og døde selv i 1949. de Havilland giftet seg på nytt i 1951, med Joan Mary Frith (1900-1974). De forble gift til hans død.