I offseason kontaktet Jets Holmes med ønske om å omstrukturere kontrakten hans, noe Holmes gikk med på. Holmes' rehabiliteringsprosess etter å ha operert foten varte inn i treningsleiren og sesongoppkjøringen. Holmes ble tatt av "physically unable to perform"-listen (PUP) og lagt til den aktive spillerstallen 23. august 2013.