Under den amerikanske revolusjonen begynte Warren det som skulle bli storverket hennes, en historisk skildring av opptakten til selve revolusjonen og hendelsene etter den. I tiden etter revolusjonen arbeidet Warren mot føderalismen som utviklet seg i det selvstendige USA, med en sterkere føderalmakt og en president som henne og andre anti-føderalister fryktet kunne utvikle seg i retning av en mektig monark. I 1788 ga hun ut hvor hun mælte mot de føderalistiske tendensene i den amerikanske grunnloven. I 1790 gav Warren ut Poems, Dramatic and Miscellaneous, en samling som inneholdt dikt og de to nye skuespillene og .