Herakleios inngikk diplomatiske forbindelser med kroatene og serberne på Balkan. Han forsøkte å motvirke skismaet i den kristne kirken ved å fremme en doktrine som kalles monoteletisme, men dette prosjektet mislyktes. Monoteletismen ble sterkt motarbeidet av blant andre Maximus bekjenneren, og ble forkastet som vranglære av det tredje konsilet i Konstantinopel i 680-681.