I 1583 beseiret han jursjenerne og tok deres høvding til fange. Det sies at han var så god leder at noen av de andre offiserene anklaget ham for å være desertør. Yi forlot hæren i tre år etter at han fikk vite at faren var død. Da han kom tilbake ble han med en gang anklaget for desertering, men denne gangen av general Yl ll som mente at det var Yi som var grunnen at de tapte i slaget ved Sangju. Han mistet sin rang, ble fengslet og torturert.