Regjeringen til Massamba-Débat ble styrtet i et kupp den 4. september 1968 av Marien Ngouabi som var formann i det samme partiet som hadde brakt Massamba-Débat til makten. Massamba-Débat ble deretter tvunget til å forlate politikken for godt. Da Ngouabi ble myrdet i 1977 ble mange mennesker arrestert og tiltalt for å ha konspirert til drapet inkludert Massamba-Débat. Han ble dømt og henrettet i mars 1977 for forræderi, men det finne lite bevis på at han visste om drapsplanene på forhånd.