Mia Wasikowska er født og vokste opp i Canberra. Moren er fotograf fra Polen, faren australsk fotograf og kollasj-kunstner. Hun er den midterste i en søskenflokk på tre med en eldre søster og en yngre bror. Foreldrene tok henne ofte med på gallerier i Europa, med et opphold på et år i Polen da hun var åtte. På fritiden er Mia Wasikowska en ivrig fotograf.