Lappugla deles tradisjonelt inn i to underarter: Populasjonen i Khentijfjellene i det nordlige Mongolia har blitt beskrevet som ssp. , men det er tvilsomt om den skiller seg særlig fra . En nyere studie av den nordamerikanske populasjonen indikerer imidlertid, at individer i Sierra Nevada (California) kan representere ei distinkt linje, og ssp. har blitt foreslått. Populasjonen skiller seg blant annet gjennom fjærdrakten, morfometriske og vokale forskjeller. Ytterligere studier er imidlertid ønskelig før spørsmålet om underartstatus avgjøres.