Ved siden av kjøpmannsvirksomheten var Knudtzon medlem av Norges Banks representantskap 1827–1833, Norges Banks direksjon 1833–1851, Trondhjems Sparebanks direksjon 1835–1841, Trondhjems borgerlige realskoles direksjon 1826–1842, Angellske Stiftelsers inspeksjon 1828–1834 og Røros Kobberverks overdireksjon 1825–1849.