Rune Tangen var assistenttrener i Moss FK frem til 2009. Som en del av jobben som assistenttrener for a-laget var han også trener for klubbens andrelag fra 2005. Tangen avsluttet karrièren i Moss FK for godt på slutten av 2009-sesongen etter at klubben ikke hadde økonomi til å la han fortsette.