Hun var datter av Anton Aldenburg (1633–1680), riksgreve og stattholder i grevskapene Oldenburg og Delmmenhorst for kongen av Danmark og Norge, og hans hustru grevinne Augusta Johanne av Sayn-Wittgenstein (1638–1666). Da moren døde i 1669 giftet faren seg på ny med hoffdame Charlotte Amélie de La Trémoïlle (1652–1732), som dermed ble Louise Charlottes stemor. Selv giftet hun seg i København i 1684 med offiseren Christoffer Bielke (1654–1704). Etter at han døde i 1704, giftet hun seg igjen i 1722 med riksgreve Gerhard I van der Nath (1668–1740).