Etter ordinasjonen var han opprinnelig kapellan i San Rafael. Fra 1979 til 1986 arbeidett han som lærer, kapellan og rektor ved i Kentfield. Deretter var han i to år skoleinspektør for erkebispedømmets høyere katolske skoler. Erkebiskop John Raphael Quinn utnevnte ham til sin personlige sekretær og seremonimester i 1988. Fra 1993 til 1997 var han pastor i San Francisco og deretter ansvarlig for presteskapet.