Av Muratoris skrifter kan nevnes (25 bind, 1723–51), (seks bind, 1738–42), (fire bind, 1739–42) og (12 bind, 1744–49). En større samling av hans arbeider utkom i 48 bind 1790–1810. Hans brevveksling ble utgitt av Matteo Campori (flere bind, 1901 ff.). Hans bidrag til Italias historie var særlig viktig.