Det første driftsselskapet gikk konkurs i 1991. I perioden 1991–2000 ble planetariet drevet av et selskap med Tromsø kommune, Universitetet i Tromsø (UiT) og Troms Fylkes Dampskibsselskap AS som eiere, og med Statsbygg som eier av bygningen. Planetariet er en del av Nordnorsk vitensenters besøkssenter på UiT.