Pacelli fikk sannsynligvis sin musikalske utdannelse i Roma. Fra 1594 var han kapellmester ved ulike romerske kirker. Etter kort tid ved Peterskirken, inviterte Sigismund III ham til å overta ledelsen av den polske kongens hoffkapell. Pacelli aksepterte og tilbrakte de siste tjue årene av sin levetid i Kraków og Warszawa. Forgjengeren, Luca Marenzio, hadde hevet hoffkapellets nivå, og Pacelli fortsatte å holde den høye musikalske standarden.