I Bayern München høstet Beckenbauer en rekke seire. Laget vant blant annet serievinnercupen tre år på rad (1974–1976) og flere liga- og cupmesterskap. Mot slutten av karrieren flyttet Beckenbauer til USA, der han spilte for New York Cosmos, men gjorde comeback i Bundesliga for Hamburger SV i 1980. Beckenbauer la opp som spiller i 1982.