Hun var elev ved Elligers skole, og i 1885 tok hun guvernanteeksamen i Christiania. To år senere ble Bonnevie lærer ved Vaterland skole, men ble tvunget til å slutte etter et par år fordi helsen sviktet. Hun sluttet ikke å undervise, men opprettet en liten privatskole hjemme hos seg selv, og drev den til helsen gjorde det umulig å fortsette.