Fowler overtok drakten etter Michael Chopra, og ble møtt av svært forventningsfulle Cardiff-supportere da han signerte for den walisiske klubben. Med Cardiff fikk han også spille en ny kamp på Anfield da Cardiff trakk Liverpool i Carling Cup, Rafa Benitez uttalte før kampen at hvis de ledet med mange mål så ville han kanskje be Reina la Fowler score sitt siste mål foran The Kop. Fowler ble etter hvert skadet og gikk glipp av store deler av sesongen.