Fram til 1980-tallet ble de fleste smerlinger regnet til familien Cobitidae. Algeeterne utgjorde en egen familie, og det fantes en familie Homalopteridae, som delvis tilsvarer dagens Balitoridae. Oppsplitting i flere familier er gjort på forskjellige måter hos ulike forskere. På norsk wikipedia brukes systematikken til Kottelat (2012) med ti familier av smerlinger.