Han ble oppdaget av en væpnet sikkerhetsvakt – som for øvrig også var politibetjent i Orlando Police Department, men hadde bijobb som sikkerhetsvakt. Sikkerhetsvakten åpnet skudd mot Mateen i et forsøk på å hindre ham i å ta seg inn i nattklubben; skuddvekslingen startet klokka 2.02 på natta lokal tid. Mateen klarte å komme inn i bygningen, og begynte å skyte menneskene der inne.