Bokor Hill ble forlatt første gang av franskmennene på 1940-tallet, under den første indokinesiske krig, på grunn av lokale opprør ledet av Khmer Issarak, og deretter for godt i 1972, da Røde Khmer tok over området. Under den vietnamesiske invasjonen i 1979 forskanset Khmer Rouge seg og holdt ut i flere måneder. Tidlig på 1990-tallet var Bokor Hill fortsatt en av de siste skansene for Røde Khmer.