Klapperslangene er de største naturlige fiendene til de californiske jordekornene. De blir også jaktet på av ørn, vaskebjørn, rev, grevling og røyskatt. Tverrfaglig forskning ved University of California, Davis, har vist at ekornene bruker en rekke teknikker for å redusere klapperslange-predasjon. Flere bestander av californiske jordekorn har varierende grad av immunitet mot klapperslangegift som voksne, men de blir ikke immune før de er en måned gamle. Ekornet bruker sandkasting og andre angrep for å få slangen til å rasle med halen, noe som gjør det mulig for ekornet å bedømme slangens størrelse og kroppstemperatur. En annen taktikk ekornet bruker er å øke temperaturen i halen, noe som fungerer som en advarsel til klapperslangene som jakter ved help av infrarød stråling. Hunnekorn pleier også å tygge på skinn som klapperslanger har felt for så å slikke seg og ungene sine for å skjule duften sin.