Høsten 1939 ble Otte sjef for «Führungsstabes Wirtschaft» i Hamburg og dermed den øverste økonomiske lederen i Hansestaden. I 1942 ble Otte utnevnt til senator for skipsfart, handel og industri og rådmann i Hansestaden Hamburg. På grunn av sine oppgaver i Norge utførte han imidlertid ikke disse funksjonene på heltid.