Bunnahabain har to «Wash-stills» og to «Spirits-stills». Wash er vørter, altså den ferdig gjærede væsken fra det maltede kornet. I en wash-still destilleres vørteren til det som kalles for «low-wines» som har en alkoholprosent på 21-28 %, før den destilleres i en spirit-still og vil da ha en alkoholprosent på rundt 70 %. Bunnahabain har en årlig kapasitet på liter whisky årlig. Vannet som brukes kommer fra elven Margadale.