Middelalderfilosofien er i sitt vesen teologisk. Emner diskutert eller utviklet i denne perioden er blant annet: Problemet med kompatibiliteten med de guddommelige attributter: Hvordan er attributtene tradisjonelt tilskrevet det øverste vesen, slike som ubegrenset makt, kunnskap om alle ting, uendelig godhet, eksistens hinsides tid og sted, ulegemlighet, og videre, logisk konsistent med hverandre? Ondskapens problem: Antikkens filosofer hadde spekulert om ondskapens vesen, men problemet hvor en allmektig og god Gud kunne skape et system med ting hvor det onde eksisterte, det var et filosofisk-teologisk problem som først oppsto i middelalderen. Problemet med fri vilje: Et tilsvarende problem var å forklare «guddommelig forhåndskjennskap», hvordan Guds kunnskap om alt som vil skje i framtiden var i overensstemmelse med vår egen frie vilje.