Til alles gledelige overraskelse ble Pixies samlet igjen i 2004, etter å ha vært oppløst siden starten av 1990-årene. Alle de fire originale medlemmene ble samlet igjen, selv om flere av dem slet privat. Kim Deal misbrukte lenge alkohol og krevde derfor at det ikke skulle være alkohol i nærheten av scenen og garderoben, og trommisen, David Lovering, slet med pillemisbruk. Pixies turnerte i Nord-Amerika og dro også over Atlanterhavet til blant annet Frankrike og England. De besøkte også Kristiansand i Norge i 2004. Bandet spilte inn en ny låt kalt 'Bam Thwok' som ble skrevet av Kim Deal alene. Dette har i ettertid blitt oppfattet som en forsonende gest fra Charles Thompsons side.