Heinze ble skadet i Mesterliga-kampen mot Villarreal den 13. september og var ute av spill resten av sesongen. United fikk et stort hull å tette i Heinzes fravær, noe som forsterket inntrykket av hvor viktig argentineren var for Manchester-klubben. Kieran Richardson, John O'Shea og Patrice Evra hadde alle spilt på Heinzes venstrebackposisjon med svært varierende suksess. Ferguson uttalte at laget hans savner Heinzes rutine og lederegenskaper.