Berglund spilte 2,5 år i Esbjerg før han ble solgt til det danske storlaget F.C. København sommeren 2006. Han spilte bare en sesong i klubben, og rakk 52 kamper (Liga, cup, Royal League og Mesterligaen) med 18 mål. Han spilte igjen sammen med tidligere lagkamerat Tobias Linderoth.