Den 1. februar 2018 tiltrådte han stillingen som generalsekretær i Human-Etisk Forbund, og tok over etter Kristin Mile. Den 1. mars 2021 ble han valgt som styreleder i Samarbeidsrådet for tros- og livssynssamfunn (STL). Trond Enger jobbet også for Norge som et livssynsåpent samfunn da han satt i Oslo kommunes tros- og livssynsutvalg i 2019–2020. Utvalget fremmet en rekke konkrete forslag for forbedring av byens mangfoldspolitikk.