I 1969 Todd og hans kone var med og etablerte New Alchemy Institute for både biologisk grunnforskning og å bruke biologisk vitenskap på teknologi. Todd med kolleger har designet miniatyr økosystemer, nesten selvgående, som bruker økologiske prinsipper for menneskelige formål. I tillegg til å designe og lage prototyper for mat-produserende systemer og samfunnsløsninger, har arbeidet resultert i innovative nye tilnærminger for å behandle kloakk og industrielt avløpsvann. Todd's tilnærming omfatter bruk av mikroorganismer, fisk og planter (fytoremediering).