Den ligger i samme avløpsløse bekken som Akşehirsjøen lenger sørøst, og de to innsjøene er forbundet med en kanal. Vannet er litt salt og alkalisk, og vannstanden svinger mye i løpet av året. Ebersjøen er grunn med store sivbelter og mange små øyer og er omgitt av grassletter. I Ebersjøen og Akşehirsjøen finnes det til sammen 67 vannfugler; 23 av dem er bare i området om sommeren, og 21 er vintergjester. Av fugleartene i Ebersjøen kan nevnes hvitpelikan, skjestork, enghauk, stylteløper og smalnebbmåke. Mange ender fra nordlige strøk overvintrer i innsjøen og blir jaktet på av lokalbefolkningen.