Han var misjonær blant færøyske sjøfolk i Aberdeen fra 1942 til 1950, blant lokalbefolkning og færøyske sjøfolk på Island (i all hovedsak på Vestmannaeyjar) i 1950-årene, blant færøyske sjøfolk i områdene rundt Kangerluarsoruseq på Grønland i 1960-årene, og i Etiopia tidlig i 1970-årene. Fra 1970 til 1988 var Ellingsgaard formann i Kirkjuliga Missiónsfelagið, som er den færøyske sjømanns- og hedningsmisjonen og en avlegger av Kirkjuliga Heimamissiónin í Føroyum.