Han er sønn av Edith Lamhauge og adoptivsønn av fiskernes fagforeningsmann Jákup í Jákupsstovu. Hans biologiske far døde da han var spedbarn. Flere av hans slektninger har gjort seg bemerket innen kunst og vitenskap. Hjalti í Jákupsstovu giftet seg i 1962 med kontorist Elin Hentze. Deres sønn Sigurð í Jákupsstovu har vært universitetsrektor.