Etter dette fikk han arbeid på et verft i Søndeled. Han hadde spart opp noe penger og gikk inn som deleier i ei skute som skulle bygges der. Dette var en lønnsom handel. I april 1870 kunne Lindstøl starte sitt eget verft på nabotomta til hjemgården (Lindstøls Skibs- & Baatbyggeri). I 1884 flyttet verftet til egen gård, som han hadde overtatt i 1875. Det første skipet de bygde, var barken «Frank» for skipsreder Bernt Olsen i Lyngør. Lindstøl tok eierandel også i dette og fikk gevinst. Andre slike handler gikk med tap.