Kort tid senere, BOPEs treningsprogram foregår i løpet av et par uker i jungelen. Kurset viser en tøff utfordring: alle registrerte offiserer er utsatt for alvorlig fysisk og psykisk straff og trenes under ekstremt press. Nascimento forklarer at dette er «for å eliminere de svake og i hovedsak straffe de korrupte», slik at bare de ærlige og tøffe blir igjen. Mange offiserer avslutter programmet, inkludert Fabio etter at han får fotsopp, men Neto og Matias når endelig toppnivå, hvor de bringes Nascimentos avsluttende oppgave. Neto får også en BOPE tatovering.