HMS «Lincoln» forlot St. John's 3. november og ankom Belfast i Nord-Irland 9. november. Hun ble videre overført til Londonderry Port hvor hun ble en del av First Escort Group, Western Approaches Command. I nesten et år møtte hun troppetransportskip og godskonvoier ute i Atlanterhavet og eskorterte dem inn til De britiske øyer. Mellom september 1941 og februar 1942 ble jageren bygget om på Woolwich Dockyard. HMS «Lincoln» ble modifisert for eskortetjeneste ved å endre bestykningen for å redusere vekt og gjøre mer plass til synkeminer.