I 1912 ble Krogness ansatt som direktør for observatoriet på Haldde. Han flyttet dit med familien, og fikk i 1915 selskap av Olaf Devik med familie. Sammen foreslo de to opprettelsen av et geofysisk institutt i Tromsø, og de flyttet dit i 1918. Krogness ble leder for Værvarslinga i Nord-Norge fram til 1922. Han var styremedlem for Tromsø museum fra 1919 til 1923 og styreformann fra 1923 til 1928. foreslo etableringen av et universitet samme sted.