Da kontrakten med Colorado Rapids utløp, ønsket Limpar seg hjem til svensk fotball. Han trente med AIK, men klubben var ikke interessert i å gi ham kontrakt. I stedet signerte han midtveis i november 2000 for byrival på en prestasjonsbasert toårskontrakt. Valget av ny klubb opprørte mange AIK-tilhengere. Få dager senere ble hans utested utsatt for hærverk. Oppholdet hos Djurgården ble kortvarig. Drøye to uker før avspark av 2001-sesong ga Limpar beskjed om at han ønsket å gi seg i klubben, da han fysisk sett ikke følte han lenger holdt mål for spill i Allsvenskan. Han valgte å trappe ned til tredje serienivå med gamleklubben Brommapojkarna i april 2001. Ved endt sesong var laget rykket opp til Superettan, hvor Limpar endte spillerkarrieren etter 2002-sesongen.