Flyverhjemmeværnets primære oppgave er overvåkning ved hjelp av de to fly samt bevoktning og nærforsvar av Flyvevåbnets fasiliteter. Flyverhjemmeværnet inngår i Hjemmeværnets generelle beredskap til støtte for det sivile samfunn i relasjon til miljø- og katastrofeinnsats.