Munthe var nært knyttet til Yuan Shikai, som etter revolusjonen i 1911 ble Kinas første president. I 1911 gikk Munthe tilbake til den kinesiske hæren, nå som generalløytnant. Han ble tilknyttet president Yuan som rådgiver fra 1911 til 1916. Munthe virket fra 1911 også som rådgiver for Kinas Krigsdepartement.