Langtids alkoholmisbruk kan føre til mangel på tiamin som igjen kan gi hjerneskade. Kortikal dysfunksjon kan ha opphav i tiamin-mangel, alkoholforgiftning og/eller strukturelle skader i mellomhjernen. Hos Korsakoff-pasienter med uttalt anterograd og retrograd amnesi har man sett regelmessig uttalt nevrontap, , som er et resultat av skader på støtteceller i sentralnervesystemet og blødning, , i (de mammillære legemer). Skader i de dorsomediale kjerner i talamus er også assosiert til dette syndromet.