Berchtesgaden-Apene omslutter med sin ringformete fjellkjede Berchtesgaden-dalen (), som består av de fem bayerske kommunene Berchtesgaden, Bischofswiesen, Marktschellenberg, Ramsau og Schönau am Königssee. Fra Berchtesgaden, som er dalens geografiske, kulturelle og historiske sentrum, strekker tre mindre sidedaler seg innover i fjellene: Sørfra kommer elva Königsseer Ache fra Königssee. I denne dalen ligger kommunen Schönau. Vestfra kommer elva Ramsauer Ache. Denne dalen hører til kommunen Ramsau og fortsetter nordover til Schwarzbachwachtpasset. I nordvest, på vei mot Hallthurmpasset, ligger Bischofswiesen. Denne dalens elv heter Bischofswiesener Ache. Nedstrøms fra (dvs. nord for) Berchtesgaden ligger Marktschellenberg.