Preindls far var organist i Marbach. Joseph Preindl var først korgutt i Mariazell hos Franz Xaver Widerhofer, før han 16 år gammel reiste til Wien og fikk undervisning av Johann Georg Albrechtsberger. I 1773 ble han lærer ved byens waisenhus, i 1775 organist ved kirka Maria am Gestade og hos karmelittene. I 1793 ble han organist ved Wiens Peterskirche, i 1797 ved Michaelerkirche. Dessuten var han fra 1795 Albrechtsbergers assistent ved Stefansdomen og ble i 1809 hans etterfølger som domkapellmester. Preindl skrev en og var sang- og klaverlærer.