Innen 14. oktober hadde de fleste av opprørerne forlatt Lincoln. Deres åndelige leder, sogneprest Thomas Kendal fra Louth, ble arrestert og henrettet. I løpet av det neste året ble også de fleste lokale lederne henrettet. I virkeligheten så Henrik på opprørerne som forrædere og mente at han ikke var forpliktet til å holde løftene sine til dem, så da ytterligere vold skjedde etter Henriks tilbud om benådning, var han rask til å bryte sitt løfte om nåde. Lederne, også Robert Aske, ble arrestert og henrettet for forræderi. Totalt ble rundt 200 opprørere henrettet, og uroen tok slutt. Selv om dette opprøret endte i løpet av kort tid skulle det inspirere andre.