Etter flere år med pastoralt arbeid og som leder for novisiatet, ble han regionalseperior for de tysk-sveitsiske kapusinere og i 1989 provinsial for de sveitsiske kapusinere. I 1994 ble Paul Hinder valgt inn i kapusinerordenens hovedråd med ansvar for de tysk- og fransktalende provinser og for kapusinerne i Midtøsten.