Ganon sin historie er uklar og det er ikke mye man vet om hans fortid. Han blir imidlertid som oftest fremstilt som en mektig kjeltring med en sterk tørst etter makt. I løpet av spillene er hans bakgrunn og personlighet blitt mer fordypet. Tidligere var han bare en nådeløs antagonist, mens han i er mer kompleks og har et tydelig motiv om å ville kontrollere Hyrule.