Den 17. januar 1772 fant det sted et kupp som medførte at Struensee og hans venn Enevold Brandt ble arrestert. Det samme ble dronning Caroline Mathilde. Det er ikke påvist at enkedronning Juliane Marie var den drivende kraft, men hun tok del i utførelsen. Det var kjent også at Juliane Marie gjerne hadde sett sin egen sønn som tronarving i stedet for den sinnssyke kongen. Struensee og Brandt ble henrettet og dronning Caroline Mathilde forvist til Celle.