Avdelingen etterforsker både «intern» og «ekstern» kriminalitet som involverer kystvakten, herunder typiske militærpolitioppgaver slik som etterforskning av lovbrudd begått av kystvaktens egne soldater, og lovbrudd som angår kystvaktens generelle mandat, slik som overtredelser av sjøfarts- og miljølovgivning.