Bernt Aardal var styreleder for Institutt for fredsforskning (PRIO) fra 2007 til 2015 og var styremedlem samme sted 1998-2004. Han var også styreleder for Norsk samfunnsvitenskapelig datatjeneste fra 2003 til 2010. Han var medlem av Valglovutvalget 1997–2000 og er medlem av Valglovutvalget 2017-2020. Han har også ledet et faglig utvalg som utredet elektronisk stemmegivning, nedsatt av Kommunal- og regionaldepartementet 2004–2005.