I 1956 forårsaket MacColl en skandale da han ble forelsket i den 21 år gamle Peggy Seeger, som hadde kommet til England fra USA for å transkribere musikken til Alan Lomaxs antologi, (utgitt i 1961). På denne tiden var MacColl, som var tyve år eldre enn Peggy, fremdeles gift med sin andre kone, danseren Jean Newlove (født i 1923), mor til to av hans barn, Hamish (f. 1950) og Kirsty (1959–2000).