Avempace ble født i Zaragoza i det som i dag er Aragon, Spania, rundt 1085. Zaragoza var da en del av Al-Andalus, det muslimske området på Den iberiske halvøy. Han tilhørte en familie av jurister og embetsmenn, og fikk en god utdannelse i ulike vitenskaper og kunstarter. Han studerte blant annet under Abu Jafar ibn Harun av Trujillo, en fysiker i Sevilla.