Zaballa var blant de trettitalls profesjonelle syklister som i 2006 ble navngitt som klienter av dopinglegen Eufemiano Fuentes. I 2011 ble han suspendert i 9 måneder etter å ha testet positivt på efedrin under Vuelta a Asturias. Han gjorde comeback i 2013 for Christina Watches-Onfone.