Han gikk en periode ut av politikken, men stilte opp ved presidentvalgene i 1991 og 2001, begge ganger uten å lykkes. Det gjorde han i presidentvalget i 2011 og 3. september 2001 etterfulgte han Fradique de Menezes i presidentembetet. I 2016 ble han selv etterfulgt som president av Evaristo Carvalho.