I 2012 vant hun Vasaloppet og satte ny løyperekord i kvinneklassen med 4.08,24. Laila Kveli tok sølvet og sikret dobbelt norsk. Dette var første gangen en norsk kvinne vant Vasaloppet etter at det ble en offisiell kvinneklasse i 1997. Jörgen Brink satte ny løyperekord i herreklassen og mottok en Volkswagen Tiguan TSI 160 i premie. Skofterud fikk derimot kun blomster. Etter løpet ble det fra flere hold rettet kritikk mot arrangøren og sponsor Volkswagen for ikke å tilby en lik premie i kvinneklassen. Volkswagen hadde opprinnelig en avtale med arrangøren om å belønne en eventuell rekord i herreklassen, samt en tilsvarende avtale for kvinneløpet Tjejvasan. Kritikken førte til at Volkswagen ga henne en bil i premie. I mellomtiden hadde hun allerede mottatt en bil i bonus av sin personlige bilsponsor, BMW.