Karikó tok doktorgrad ved Szegeds universitet i 1982 og var postdoktor ved det ungarske vitenskapsakademi frem til 1985. Hun var deretter assistant professor ved University of Pennsylvania frem til hun ble nestleder av det farmasøytiske selskapet BioNTech RNA Pharmaceuticals. Hun har vært professor ved Szegeds universitet og adjungert professor ved Perelman School of Medicine ved University of Pennsylvania.