H2R har en 6,0 liter V12-motor med BMWs Valvetronic- og Dobbel-VANOS-teknologi, som er basert på BMW 760i. H2Rs hydrogenversjonen av motoren yter 232 hk og har en toppfart på 302,4 km/t, i motsetning til bensinversjonen som yter 445 hk.