I den andre perioden fra 24. februar 1860 til 31. desember 1863 var Hall også utenriksminister. Fra den 30. mars 1861 til 31. desember 1863 også minister for Holstein og Lauenburg. Hall støttet det eiderdanske parti, som gikk inn for delingen av Elbe-hertugsømmene og Slesvigs samtidige fullstendige integrering i den danske stat. Dette ble knesatt ved forfatningen av 1863 og i mange diplomatiske noter til stormaktene. Det tyske forbund hadde et annet stansdpunkt. I tillit til støtte fra andre stormakter holdt den danske regjering hardnakket fast på sitt syn, og konflikten med de tyske makter førte til at Halls regjering den 24. desember 1863 søkte om avskjed. Deretter påtok Monrad, som hadde vært medlem av Halls ministerium, seg å danne det nye kabinett. Halls rolle ble i den nærmeste tid derfor vesentlig en tilskuers. Han reiste ingen opposisjon mot sin etterfølger, støttet ham også til sider hans vanskelige stilling, men billiget sikkert ikke alltid hans politikk.