I 1927 møtte han legen og antroposofen Ita Wegman, som inviterte ham til å jobbe på hennes institutt for mennesker med særlige behov i Arlesheim i Sveits. Han ble gift med Mathilde Maasberg i 1929. Etter å ha jobbet i Arlesheim ble König barnelege ved det Rudolf Steiner-inspirerte Schloß Pilgrimshain-instituttet i Striegau i Schlesien, hvor han jobbet til 1936. Han reiste da tilbake til Wien, hvor han etablerte en vellykket praksis som barnelege.