Etter et mislykket angrep fra en tropp Alpha-Omega, fanger de overlevende fire soldatene, inkludert en som heter Preacher, pluss en gorilla ved navn Red. Caesar løslater menneskene, og håper å vise obersten at apene ikke er villmenn. Red slipper unna ved å skade albino-gorillaen Winter. Caesars eldste sønn, Blue Eyes, og løytnanten hans, Rocket, kommer tilbake fra en lang reise. Blue Eyes rapporterer at de fant et sted ved en ørken som er ideelt for apene. Til tross for en urolig og nervøs Winter som mener at apene burde reise med en gang, bestemmer Caesar at de må forberede seg bedre først. Den kvelden leder obersten et oppdrag for å infiltrere apene, som dreper Blue Eyes og Cæsars kone, Cornelia. Apene klarer ikke å finne Winter, som detror forrådte dem til obersten av feighet.