I 1980 var McCarthy en nøkkelfigur med organiseringen av assistanse under Marielkrisen. Et år etter kjempet han for rettighetene til haitiske immigranter som ble internert under det som skulle bli kjent som Wet Foot, Dry Foot-politikken. Som svar på disse hendelsene foresto han samme år åpningen av i Miami. Imidlertid ble han også angrepet av haitiskfødte katolske prest Gérard Jean-Juste, som kritiserte ham for ikke å gjøre mer for haitiske flyktninger og tilskrev McCarthys påståtte likegyldighet til rasisme. Som straff ble Jean-Juste forbudt av sine overordnede i kirken fra å feire messe i området.