Vllaznia Shkodër har deltatt i europeisk sammenheng ved flere anledninger, men uten å kvalifisere seg videre til sluttspill. Klubben har deltatt i blant annet Serievinnercupen & Mesterligaen (1978/1979 og 2001/2002), Cupvinnercupen (1987/1988), UEFA Intertoto Cup (2000, 2004 og 2007) samt UEFA-cupen & Europaligaen (1991/1992, 1999/2000, 2003/2004, 2008/2009, 2009/2010 og 2011/2012).