I løpet av sin 12-årige periode som biskop markerte han sen under den amerikanske borgerkrig som motstander av negerslaveriet. Da en oljebrønn ble oppdaget i Titusville i 1859, og et stort oljerush brøt ut, måtte Young bygge mange kirker langs Alleghenyelven og dens sideelv Oil Creek for de katolske nybyggerne. Ved begynnelsen av hans embetsperiode var det 28 katolske kirker i bispedømmet hans, ved slutten var det over 50 kirker. Samtidig grunnla han en rekke katolske skoler og barnehjem. Han introduserte også Sisters of St. Joseph fra Buffalo i New York til sitt bispedømme.