Gol og Maia er fanget i roboten og synker ned i Siloen med Mørk Eco, som lukker seg og fanger dem, og sannsynligvis tar livet av dem; Men Samos er ikke sikker på om de er døde. Jak og Keira kysser nesten, men blir avbrutt av Daxter. Jak, Daxter, Samos og Kaira oppdager så en enorm Precursor Dør, som bare kan åpnes av energien til 100 Power Cells. Med dem åpnes døren og avslører at enormt objekt innhyllet i et blendende, hvitt lys; Detaljene blir forklart i det neste spillet, .