Johann Ernst var en musikalsk begavelse. Han ble i sin tidlige ungdom utdannet av den weimarske hoffmusikeren Eilenstein og komponerte rundt 19 konserter. Han hadde innflytelse på den tiden Johann Sebastian Bach var i Weimar. Bachs en transkripsjon av et av prins Johann Ernsts verk. Etter Johann Ernsts død publiserte Georg Philipp Telemann konsertene hans.