I perioden 1864–1870 var Benedetti fransk ambassadør i Berlin. Ikke uten diplomatisk talent fikk han en svært vanskelig oppgave, å fremme franske interesser mot den drevne Bismarck på ordre fra den ubesluttsomme keiser Napoleon III. Benedetti fikk sitt navn knyttet til den franske politikkens tunge nederlag da man i 1866 under krigen mellom Østerrike og Preussen, forgjeves forsøkte å erverve tysk område på den vestre Rhinbredden. Etter krigen forsøkte Benedetti å utnytte antydningene om en kompensasjon til Frankrike i Belgia, som Bismarck hadde gjort på det kritiske tidspunktet, men Bismarck svarte unnvikende og publiserte til slutt i 1870 de franske planene for utvidelse til belgisk territorium. Benedettis forsøk på å fremstille Bismarck som planens egentlige opphavsmann, mislyktes.