I første halvdel av den niende sesongen har englene falt til jorden og to fraksjoner kjemper mot hverandre - samtidig jakter de på Castiel. Korrupte engler streifer rundt på jorden, og forårsaker problemer. Castiel er nå menneskelig, og må tilpasse seg sitt nye liv. Samtidig blir Crowley holdt fanget av Sam og Dean, som forsøker å bruke et gammelt blod-rituale for å forvandle demonen Crowley tilbake til et menneske. Sam er nesten døden nær etter Guds prøvelser og Dean blir tvunget til å la en engel, som påstår å være Esekiel, eie Sam for å helbrede ham fra innsiden.