I episode 10 av sesong 5 blir det avslørt at Gibbs var kraftig imot USAs invasjon av Irak i 2003, og han uttaler at han ikke støtter krigen, men han støtter de menn og kvinner i uniform som utkjemper krigen". På slutten av episoden «Murder 2.0» i sesong seks, blir Gibbs tildelt sin syvende tjeneste-medalje for sine tjenester for landet, men som i likhet med de seks andre gangene, deltok han ikke på prisutdelingen, og spesialagent Tony DiNozzo aksepterte medaljen på hans vegne. Gibbs viser ingen interesse for medaljene sine, og Tony DiNozzo legger dem i en eske i skrivebordsskuffen som inneholder flere lignende medaljer som Gibbs har mottatt for hans mange militære og sivile prestasjoner.