Presidentbeskyttelsen er i dag etatens mest kjente oppgave. Personlig beskyttelse skiller seg fra hva etaten ellers holder på med. Grunnen for denne kombinasjonen av oppgaver er at når behovet for beskyttelse av presidenten oppstod på slutten av 1800-tallet, var det bare noen ytterst få føderale etater som kunne håndtere dette. Etater som FBI, CIA, ATF og DEA var ennå ikke opprettet. Det eneste andre logiske valget ville ha vært U.S. Marshal Service, og denne etaten utførte faktisk jobben på et tidspunkt. Til slutt falt imidlertid valget på Secret Service.