Frn 10. februar 2015 anklaget Statsadvokaten i Dortmund ( Hanning for medvirkning ved forskjellige «drapshandlinger» i egenskap av hans tilhørighei til vaktmannskapene ved KZ Auschwitz I og KZ Auschwitz-Birkenau, særlig i forbindelse med den såkalte «Ungarn-Aktion», med masseskytinger, seleksjon og medansvar for fangenes levebetingelser. Hanning bestred tidlig å ha tatt del i noen drapshandlinger. Men han innrømmet for sine advokater å ha vært kjent med massemyrderiene. Den 29. april 2016 leste Hanning, etter lenge å ha holdt stille om anklagene mot ham, opp en personlig erklæring der han uttrykte beklagelse og bad om unnskyldning. Men han tilstod ikke noen medvirkning. Blant vitnene var de tidligere fangene Leon Schwarzbaum, Justin Sonder og Erna de Vries.