Klimaet i grevskapet Kilkenny er, i likhet med klimaet i Irland, et foranderlig havklima med få ytterpunkter. Det er definert som et temperert maritimt klima, eller på Köppens klimaklassifisering. Kilkenny ligger i herdighetssone 9. Værmessig er grevskapet generelt representativt for brede elvedaler i regionen med lave temperaturer på skyfrie netter, og er betydelig ved at det registrerer noen av de høyeste sommer- og laveste vintertemperaturene i Irland. Den høyeste lufttemperaturen noensinne registrert i Irland var 33,3 °C ved Kilkenny Castle 26. juni 1887.