En rettsmedisinsk undersøkelse av Dochertys legeme konkluderte med at hun sannsynligvis var blitt kvalt, men dette kunne ikke bevises. Selv om politiet mistenkte mennene for andre drap, var det ingen fysiske bevis som knyttet dem til drapene. Hare fikk tilbud om immunitet fra straffeforfølgelse hvis han stilte som kronvitne. Han ga opplysninger om drapet på Docherty og tilstod hele 16 drap. Formell sak ble reist mot Burke og hans kone for tre drap. I den påfølgende rettssaken ble Burke funnet skyldig i ett mord og dømt til døden. En skotsk juridisk dommer valgte å frikjenne konen til Burke, men erklærte henne ikke uskyldig. Burke ble hengt kort tid etterpå, og liket hans ble dissekert. Hans skjelett står utstilt på Anatomisk Museum i Edinburgh.