Mellom 1960 og 1962 var Folkman utstasjonert i den amerikanske marinen som løytnant, hvor han studerte veksten av blodårene ved National Naval Medical Center i Bethesda i Maryland. Under sin militærtjeneste i US Navy oppfant Folkman en implanterbar enhet for tidsbestemt frigjøring av narkotika i menneskekroppen og han donerte denne oppfinnelsen patentfritt til World Population Council. I 2000 saksøkte et farmasøytisk selskap Folkman og anklaget ham for å ha stjålet æren for å utvikle et lovende medikament som stenger av blodtilførselen til svulster. Folkman gikk til motsøksmål for å forsvare sitt rykte.