I Europacupen i paraalpint 2016/17 kom Schaffelhubel på femteplass sammenlagt i klassen for sittende utøvere. I Verdenscupen i paraalpint 2016/17 vant hun slalåm, storslalåm, utfor og super-G, og kom på femteplass i superkombinasjonen. Hun fikk tre nye gullmedaljer under VM i paraalpint 2017 i Tarvisio i Italia, der hun vant slalåm, utfor og super-G. Hun fikk sølv i storslalåm og super-G, bak Claudia Lösch.