I perioden 2004–2006 var Kristjánsson sentralstyremedlem i Rød Ungdom. Kristjánsson var sammen med Magnus Marsdal og Åsmund Sunde Valseth også sentral i utviklingen av Rød Ungdoms strategi, og i utviklingen av organisasjonens ideologiske grunnlag fram mot landsmøtet i 2006.