Den er sjelden i Norge og er funnet på bråter og sandig eng- og skogsjord, som på Østlandet og i Nord-Norge. Best synes arten å holde seg på indre Østlandet (Hedmark, Oppland), men også her er den i tilbakegang. Årsaker til tilbakegangen er ikke kjent, men gjengroing er mest sannsynlig. Høstmarinøkkel er fredet i Norge.