Totasjøen var et viktig religiøst senter for Muisca-kulturen. Den er nå kjent for sin regnbueørret og muligheter for vannsport. Selv om innføringen av regnbueørret har hatt verdifulle økonomiske virkninger så medførte den nesten fullstendig utryddelse av innsjøens opprinnelige fiskearter. Innsjøen er hekkeområde for flere truede fuglearter.