Joseph Werth ble først utnevnt av pave Johannes Paul II den 13. april 1991 til den latinske katolske kirkes apostoliske administrator for et kirkedistrikt som omfattet hele Sibir, og omfattet 4,2 millioner kvadratkilometer (10,3 prosent av all landmasse på jorden) og strakk seg gjennom ni av verdens tjuefire tidssoner. Han ble bispeviet av titulærerkebiskop Francesco Colasuonno, apostolisk delegat i Russland og senere kardinal, den 16. juni 1991; medkonsekrerende var biskop Tadeusz Kondrusiewicz, som samme dag var blitt administrator i europeisk Russland, og Juozas Tunaitis, hjelpebiskop i Vilnius.