Horthy var som statsoverhode medansvarlig for holocaust. Bildet av Horthy-regimets bidrag til holocaust er tvetydig. Etter massakrene i Novi Sad i 1942 (utført av ungarske styrker) stanset ungarske myndigheter ytterligere antijødiske aksjoner og flere ungarske offiserer ble dømt til lange fengselsstraffer ved militærdomstolen i Budapest. Horthy utnevnte i mars 1942 Miklós Kállay til statsminister og Kallay forsøkte gjøre Ungarn mer uavhengig fra Tyskland. Horthy var til forskjell fra Kallay ikke særlig innstilt på å straffe de ansvarlige offiserne fra Novi Sad. Den amerikanske historikeren Thomas L. Sakmyster skriver i boken (1994) at ettertidens negative bilde av Horthy langt på vei ikke er fortjent. Sakmyster nevner blant annet Horthy stanset deportasjonene av jøder til Auschwitz og fengslede kommunister i Ungarn var relativt trygge. Sakmyster fremholder at tidlig i sin regjeringstid brukte Horthy lang tid på å distansere seg fra høyre-radikale offiseren som utførte den «hvite terror». Sakmyster mener at Horthy manglet kunnskaper og ferdigheter til å være statsleder, var tankeløs og korttenkt i beslutningstaking, og hadde et foreldet perspektiv på de politiske forholdene; Sakmyster er kritisk til Horthy-regimets nasjonalistiske og revisjonsisiske agenda. Sakmyster mener at Horthy utholdende i sin embetstjeneste.