Luigi Padovese sluttet seg til kapusinerordenen i 1965, avla løftene i 1968 og ble presteviet den 16. juni 1973. Han studerte teologi ved Det pavelige universitet Antonianum og patristikk og ordenshistorie ved Det pavelige universitet Gregoriana, begge i Roma. I 1976 flyttet han til Det bayerske Julius-Maximilian-universitetet i Würzburg i Vest-Tyskland. I 1978 fikk han doktorgraden fra i Roma.