Moderne mikroøkonomi stammer fra nyklassisk økonomisk tenkning (på slutten av 1800-tallet) og gjør i stor utstrekning bruk av matematikk. Mikroøkonomi har blitt utvidet til omfatte deler av det som tradisjonelt regnes som makroøkonomi og moderne makroøkonomi bygger på mikroøkonomi (antakelser om individers, husholdningers og bedrifters atferd). Mange økonomiske tema er spesialområder eller spesielle anvendelser av mikroøkonomi for eksempel næringsøkonomi. Flere premisser for mikroøkonomisk teori har blitt kritisert blant annet menneskelig evne til å ta beslutninger (for eksempel av psykologene Amos Tversky og Daniel Kahneman) og betydningen av lover, sosiale normer og andre utenforliggende forhold.