I 1965 ble stasjonen fjernstyrt uten bemanning, og i 1983 ble stasjonen nedlagt og gjort om til et fjernstyrt kryssingsspor. Ved åpningen av nytt dobbeltspor med tunnel i desember 2015 ble Morskogen stasjon liggende utenfor banens trasé, og den tidligere togtraseen på stedet er gjort om til gang- og sykkelvei.