McKinney kom tilbake til Kongressen i 2004 etter å i to år ha vært blant de fremste kritikerne nasjonalt av USA i Irak og krigen mot terror generelt. Etter at Ralph Nader stilte som uavhengig kandidat var McKinney nevnt som mulig presidentkandidat for Green Party, men hun avslo for igjen å stille til Kongressen. Etter at hun ble valgt holdt hun en forholdsvis lav profil i forhold til utenrikspolitikken, og satset mer på innenrikspolitiske spørsmål. Hun var eksempelvis en krass kritiker av myndighetenes håndtering av orkanen Katrina. Selv om hun holdt en lav utenrikspolitisk profil forhindret det imidlertid ikke at hun, som en av få kritikere av retningen i USAs utenrikspolitikk, ble omtalt for sitt syn. I 2005 var hun en av tre representanter som stemte for umiddelbar tilbaketrekning fra Irak.