Lisinski komponerte den første kroatiske operaen, (Ljubav i zloba, 1846), som han skrev etter oppfordring fra den kroatiske komponisten Alberto Ognjen Štriga. I 1851 skrev han operaen i tillegg til en rekke verk for orkester, kor og solister. Han var også en av grunnleggerne av Illyrismen, en bevegelse som jobbet for å styrke kroatisk og sør-slavisk kulturarv. Bevegelsen var en reaksjon på magyariseringen under det østerriksk-ungarske styret.