Flommene startet med kraftig regnvær i østlige deler av Alpene, som resulterte i flommer i Nord-Italia, Bayern og de østerrikske statene Salzburg og Oberösterreich. Flommene beveget seg gradvis østover langs Donau, selv om ødeleggelser i de store byene langs breddene ikke var så alvorlige som de flomområdene som ble skapt senere.