Også tyske soldater ble gravlagt på kirkegården i Arendal under 2. verdenskrig, men disse gravene ble etter krigen flyttet, først til Eiganes i Stavanger, deretter til Havstein krigskirkegård i Trondheim der tilnærmet alle tyske krigsgraver fra Agder og Rogaland er samlet. Det var også tyske soldatgraver fra første verdenskrig på Arendal kirkegård; disse er flyttet til Alfaset i Oslo.