Etter hustruens død i 1798 flyttet han inn i Altenburggården i Skien hos datteren Hedevig og svigersønnen Johan Andreas Altenburg. Han døde i Altenburggården før oktober 1799, et knapt halvår etter at barnebarnet Marichen Altenburg ble født der. Marichen fikk også navnet Cornelia etter morfaren. Svigersønnens søster, da 39 år gamle Kristine Cathrine Ploug («faster Ploug»), flyttet også inn hos dem samme år som Cornelius Paus døde. Cornelius Paus beskrives av B. Blom som «en særdeles dygtig Træskjærer og en sjelden snil og god Mand».