Green ble arrestert av FBI 30. juni 2006. 10. juli samme år ble fire andre soldater arrestert for den samme forbrytelsen. Medsoldatene Paul E. Cortez, James P. Barker, Jesse V. Spielman og Bryan L. Howard ble dømt til lange fengselsstraffer. Green ble dømt 7. mai 2009 for å ha deltatt i en gjengvoldtekt av Abeer Qassim al-Janabi, en 14 år gammel irakisk jente, for deretter å ha drept henne, og for å drept jentas mor, far og fem år gamle søster, samt satt fyr på huset deres, mens han gjorde tjeneste i landsbyen Mahmudiyah i Irak. De forkledde seg som irakere for at mistanken skulle kastes på opprørerne. Påtalemyndigheten ba om dødsstraff, men juryen kunne ikke bli enige, så han ble dermed dømt til livsvarig fengsel.