Wenige Wochen etter at Raeder ble erstattet av Karl Dönitz som øverstkommanderende for marinen, ble Boehm i mars 1943 avsatt fra sin stilling i Norge. Hans offisielle avskjed fant sted den 31. mai 1943, og den 1. juni 1943 ble han til slutt stilt til disposisjon for Kriegsmarine.