MS «Estonia» hadde en maksimal passasjerkapasitet på 2 000 passasjerer, en passasjerlugarkapasitet på 505 passasjerlugarer og en køyekapasitet på 1 174 køyer. Den maksimale kjøretøyskapasiteten var på 460 personbiler, alternativt kunne fergen laste 370 personbiler og 45 lastebiler.