Det var på dette tidspunktet Archie Knox ble tilknyttet landslaget, da han brukte tre år som assistent for A-landslaget, først under Criag Brown. Korte opphold som assisterende manager i Millwall og Coventry City fulgte, under henholdsvis Mark McGhee og Eric Black. I november 2004 ble han Richard Goughs assistent i Livingston. Samtidig var igjen Knox trener for landslaget. I juli 2006 ble Knox U-21 landslagssjef for Skottland, da Rainer Bonhof gikk av.