Parken består i hovedsak av kupert terreng som ligger 1600 til 1950 meter over havet, og som er dekket av regnskoger, gressletter og våtmaker som danner grunnlaget for et rikt dyre- og planteliv. Nyungweskogen har ca. 85 pattedyrarter og 275 fuglearter. Dette inkluderer 13 primatarter, deriblant guerezacolobus, sjimpanse og svartluemarekatt. Vanlige fugler inkluderer solfugler og frankoliner og 26 fuglearter som er endemiske for den vestlige delen av Riftdalen (Albertineriften), inkludert den utrydningstruede hutusangeren, som har sin største bestand i nasjonalparken.