Eckersberg arbeidet som historiemaler, men i samtiden var han kjent for portrettene sine samt marine-, landskaps- og arkitekturmalerier. Han benyttet hjelpemidler som sekstant og sannsynligvis et camera obscura til landskapsbildene. Til tross for at han fikk bestillinger på portretter av borgerskapet og kongehuset og offentlige oppdrag som altertavler og malerier til Christiansborg, hadde han ikke noe stort publikum og han fikk mindre betalt enn mange av sine elever.