Rattus henter tematikken fra et pestbefengt Europa på 1300-tallet. Spillerne gjør bruk av ulike samfunnsklasser fra middelalderen i kampen mot pesten – og rottene. Bøndene gir for eksempel ekstra befolningsvekst, munkene holder rottene unna, mens de rike kjøpmennene rømmer når pesten kommer.