Gjennom det etablerte partiet GANA kunne Bukele stille ved presidentvalget i 2019. Valgkampen fokuserte på kampen mot korrupsjon. Bukele vant valget i første valgomgang mot kandidater fra venstresidens Frente Farabundo Martí para la Liberación Nacional (FMLN) og høyresidens Alianza Republicana Nacionalista (ARENA), de to partiene som har dominert salvadoransk politikk siden 1990-årene. Med Bukele som presidentkandidat vant GANA valget med 53,1 % av stemmene. GANA fikk 11 av 84 seter i El Salvadors lovgivende forsamling, slik at Bukele ikke fikk en majoritet å støtte seg på der for sin politikk.