Etter sin spillerkarriere var Knudsen i flere år keepertrener på Norges Toppidrettsgymnas. I 2014 var han keepertrener for LSK Kvinner, og fra 2016 til 2018 hadde han samme rolle i Strømmen. I desember 2018 ble han ansatt som keepertrener for Lillestrøm.