Atlas ble også brukt i flere ferder, både bemannede og ubemannede, i det amerikanske Mercury-programmet: Mercury-Atlas 6, Første amerikaner i omløp rundt Jorden. Mercury-Atlas 7, Scott Carpenter gjør tre omløp rundt Jorden. Mercury-Atlas 8, Wally Schirra gjør seks omløp rundt Jorden. Mercury-Atlas 9 – Siste ferd i Mercury-programmet. Første Mercury-ferd over en dag i lengde.