Södertäljeleden begynner ved fyret Landsort og går deretter over Krabbfjärden og Svärdsfjärden, forbi øyene Fifång og Mörkö, gjennom Skanssundet og videre over Himmerfjärden og Näslandsfjärden samt Järnafjärden inn i den smale Hallsfjärden til Södertälje. Her går skipsleden under Igelstabron, før den ender opp i sørmunningen av Södertälje kanal. Nord for kanalen ligger Södertäljeviken, som er en del av Mälaren.