En viktig del av profilen til orkesteret er moderne musikk. MKO har uroppført verker av blant annet Iannis Xenakis, Wolfgang Rihm, Tan Dun, Chaya Czernowin, Georg Friedrich Haas, Pascal Dusapin, Salvatore Sciarrino og Jörg Widmann. Videre har man også gitt komposisjonsoppdrag til blant annet Beat Furrer, Erkki-Sven Tüür, Thomas Larcher, Milica Djordjević, Clara Iannotta, Samir Odeh-Tamimi, Mark Andre, Stefano Gervasoni, Márton Illés, Miroslav Srnka, Lisa Streich, Johannes Maria Staud og Tigran Mansurian.