Lofotakvariet har 23 små og store akvarier hvor man kan studere Lofotens undersjøiske verden, og har egne bassenger for sel og oter. Akvariet har også kafé og multimedia-fremvisninger. Flere aktører i petroleumsindustrien er blant Lofotakvariets samarbeidspartnere, og i 2008 åpnet utstillingen «Sameksistens på havet» som tar for seg temaet fisk og petroleumsutvinning.