Etter doktorgraden var Skattebøl ansatt i forskningsavdelingen til Union Carbide i Brussel, hvor han arbeidet med industrielle anvendelser av organisk syntese. Senere vendte han tilbake til Norge og var ansatt ved SINTEF i Trondheim. Han hadde også en sentral rolle som sjefsingeniør ved Norsk Hydros forskningsavdeling, hvor han var involvert i utvikling av nye kjemiske prosesser og materialer.