Siden juni 2008 har Aerocondor ikke hatt noen fly lenger på grunn av økonomiske problemer. De hadde planer om å kjøpe eller lease Boeing 757 eller 767 fly for å kunne utvide, men måtte heller erklære konkurs. Tidligere hadde de fly som inkluderte ATR 42-300, Dornier 228, Shorts 360 og Piper Chieftain (for lufttaxitjenester).