Filmen handler om den litt ustyrlige piloten Pete «Maverick» Mitchell, som blir sendt til den prestisjetunge flyskolen på Miramar sammen med sin makker Goose for å konkurrere mot de beste av de beste om Top Gun-trofeet. Den eple-kjekke Maverick liker å teste grensene tross de advarslene han får. Der innleder han et forhold til den vakre kvinneen Charlotte Blackwood som er sivilt ansatt ved skolen. Samtidig må han slåss mot sine indre demoner som har sin bakgrunn i historien om hans egen far og hvordan han etter sigende var skyld i andres død da han gjorde en feil som pilot på 1970-tallet. En alvorlig hendelse på flyskolen blir et vendepunkt for Maverick. Han mister motivasjonen for å fortsette og må kjempe en hard kamp med seg selv.