Den 11. juni 1978 ble Limasawa bestemt å gjøres til egen kommuneekrets. Men beslutningen ble ikke iverksatt. Det skulle bli under president Corazon Aquino, som forordnet en folkeavstemning i Padre Burgos i 1989, som i henhold til folkeviljen satte i kraft sin forgjenger president Ferdinand Marcos' beslutning. Slik fikk Limasawa den 27. august 1989 endelig offisielt status som egen kommune.