Mikkelsen dirigerer også jevnlig St. Petersburg Filharmoniske Orkester og Moskva Radio og TV-orkester og har vært gjestedirigent for bl.a. Warsaw Philharmonic, Köln Radioorkester (WDR), Hamburg Radioorkester (NDR), Rotterdam Filharmoniske Orkester, Belgisk Radioorkester, BBC Welsh Symphony Orchestra, BBC Concert Orchestra, China National Symphony Orchestra, Vietnam National Symphony Orchestra, Thailand Philharmonic Orchestra, München Radioorkester og Philharmonia Hungarica. Han har ledet en rekke turnéer med både sine faste orkestre og andre. Med Tchaikovsky Symphony Orchestra ga han i 2008 to konserter i Disney Hall, Los Angeles, samt 15 i England og 2 på Festspillene i Nord-Norge i 2010. I Spania har han dirigert over 100 konserter med bl.a. Thuringen Philharmonie, Latvia Nasjonale Symfoniorkester, Shanghai Symfoniorkester, Jena Filharmoniske orkester, München Radioorkester, Academy of St. Martin in the Fields, Ukraina Nasjonale symfoniorkester og Norrlandsoperaen.. Med det Tsjekkiske Nasjonalorkesteret besøkte han Storbritannia i 2011 og med Russian State Symphony Orchestra (Jevgenij Svetlanov Orchestra) Sør-Amerika i 2015 . Han har også gjort en rekke produksjoner mot jazz, rock (som Keith Emerson ), film (som Andreaskorset, Suffløsen og Den siste kontrakten) og underholdningsmusikk også for radio og TV. Med Keith Emerson, gitaristen Marc Bonilla og BBC Concert Orchestra hadde han en fremføring av i Barciban Hall i London i juli 2015.