Det antas Florenskij han ble dømt av NKVD og deretter henrettet under 1930-tallets bolsjevikiske utrenskninger, etter nektet å avsløre skjulestedet til Sergius sitt hode som bolsjevikene ønsket ødelagt. Det ryktes at Florensky og en rekke andre teologer var involvert i et komplott for å redde og skjule relikviene til St. Sergius. Relikviene ble returnert av Pavel Golubtsov, til katedralen i Troitse-Sergijeva Lavra i 1946. Mye informasjon om Sergius, og hans handlinger, ble hentet fra skriften om hans liv komponert på 1400-tallet.