Da partiet ble splittet i 1929 fremsto Linderot som en av hovedfigurene på Komintern-siden sammen med Hugo Sillén, som etter ordre fra Moskva ekskluderte et flertall av partimedlemmene, lederne inkludert. Linderot erstattet den ekskluderte Nils Flyg som partiformann, et verv han holdt frem til 1951.