Under andre verdenskrig fikk Gatty æresgrad som kaptein i Royal Australian Air Force (RAAF) og arbeidet for US Army Air Forces (USAAF) i Sør-Stillehavet. Han ble senere utnevnt til direktør i Air Transport for de Allierte styrkene, basert i Australia, under General Douglas MacArthur. Gatty flyttet til Washington, D.C. i 1943, hvor han arbeidet med et navigasjons- og overlevelses pakker og supplement for Air Force personell i fly over Stillehavet i tilfelle de måtte nødlande på havet.