Da Australian Women's Army Service (AWAS) ble etablert i oktober 1941, ble Manning medlem av denne organisasjonen og fikk graden major. Etter å ha gjennomgått offisersutdannelse ved Yarra Junction i Victoria i november 1941 vendte hun tilbake til Sydney for å fortsette sin militære utdannelse. Sammen med sin stab var hun ansvarlig for rekruttering og den innledende opplæringen av alle nye medlemmer som sluttet seg til Australian Women's Army Service i New South Wales. Manning ble også utnevnt til sjef for Australian Women's Services Officer's Training School, som lå i Darley i Victoria.