Mariettes hovedverk er (1857–1882), hvor de siste utgivelsene ble utgitt av Gaston Maspero, (3 bind, 1870–1880), (6 bind, 1870–1876), (1875), (1877) og (3 bind, 1871–1877). Hans etterlatte papier ble innkjøpt av den franske staten og deler av materialet ble også utgitt med statlig støtte. Posthumt utkom for eksempel (1882–1886).