Utslipp fra aluminiumsverket i Mosjøen har ført til at de indre deler av fjorden er forurenset. PAH i bunnsedimentene gjør at det ikke anbefales å spise skjell fanget i fjorden (2002). Overgang til ny teknologi ved aluminiumsverket gjør at man forventer at fjorden skal friskmeldes i løpet av noen år.