Krigen varte i fire år, og under hele konflikten hersket det bekymring på den kenyanske siden for at Somalia kunne komme til å intervenere på vegne av separatistene. Det kenyanske forsvaret brukte nogenlunde de samme taktikkene Storbritannia hadde benyttet seg av under Mau Mau-opprøret. I 1967 ble en våpenhvileavtale mellom partene inngått etter mekling av Zambias president Kenneth Kaunda, en avtale som skulle vare inntil Siad Barre i 1969 tok makta i Somalia.