I 1981 stiftet Hanneman det amerikanske thrash metal-bandet Slayer sammen med gitaristen Kerry King. Jeff Hanneman var siden gitarist for Slayer frem til et edderkoppbitt i 2011 tvang ham til å ta en pause. Foruten et kortvarig punkprosjekt, Pap Smear, var Slayer det eneste bandet han spilte i.