Donau skiller den fra de tre andre «kvartalene», (fra vest) Innviertel, Hausruckviertel og Traunviertel. I sydøst danner Donau dessuten grensen mot den niederösterrikske regionen Mostviertel. Videre grenser Mühlviertel mot Niederösterreichs Waldviertel i øst, mot det tsjekkiske Sydböhmen i nord og mot den tyske delstaten Bayern i vest.