Spilleren får rollen som en militær leder fra et hus, som spilleren kan velge selv. De første oppdragene går ut på å etablere en base ved et ellers ubebodd territorium i Arrakis, å høste mest mulig krydder, og å beseire inntrengere eller andre motstandere. Senere, når de tre husene deler Arrakis mellom seg, må spilleren angripe og holde på fiendtlige territorier. Når spilleren dominerer Arrakis på verdenskartet, allierer de to andre fiendtlige fraksjonene seg mot deres felles fiende. Hva slags Våpen og gjenstander som spilleren kan få tilgang til, varierer også ettersom hva slags hus spilleren velger å tilhøre.