De startet opp innspillingen av «Savoy Truffle» 3. oktober i Trident Studios i London hvor grunnkompet (trommer, bassgitar og elektrisk gitar) først ble festet til åttesporsteip. John Lennon var sannsynligvis ikke tilstede i studio denne dag. Det ble spilt inn kun en tagning, men det er nærliggende å tro at de brukte en del av studiotiden til å øve inn sangen. To dager senere la Harrison på vokal i samme studio. Siden Paul McCartney høres på harmonivokal, er det nærliggende å tro at harmoni-innslaget også ble innspilt samme dato. Seks dager senere (11. oktober) fikk sangen pålegg av seks saksofoner i Abbey Road Studios. Chris Thomas lagde blåser-arrangementet. Harrison fortalte lydteknikeren at han ville overstyre lyden av saksofonene. Da blåser-musikerne (Ronald Ross, Bernard George, Art Ellefson, Danny Moss, Harry Klein og Derek Collins) hørte resultatet etterpå, ble de på forhånd advart av Harrison om hvordan det ville lyde, og at han som komponist ville at resultatet skulle være nettopp slik. Antageligvis ville han det slik for å musikalsk illustrere hvordan tannpine er.