Artyoms skjebne avhenger av valgene som spilleren tok under reisen; i den ene avslutningen dør Artyom av strålingsforgiftningen, mannskapet og en sørgende Anna holder en begravelse for ham og Artyom og Millers ånder våkner opp på en falleferdig versjon av , og blir værende der for evigheten i en spøkelsesaktig skjærsild. I den gode avslutningen overlever Artyom, men Miller blir begravet, og Artyom blir valgt til å erstatte ham som leder av mannskapet. Nå som de har funnet et sted å bo uten radioaktiv stråling, bestemmer Artyom og gjengen seg for å returnere til Moskva slik at de kan avsløre sannheten om verden til de andre overlevende fra metroen.