Node.js' pakkebehandler heter npm, og denne installeres automatisk sammen med Node.js. npm brukes til å holde orden på hvilke moduler og modul-versjoner et Node.js-program er avhengig av, og assisterer programvareutvikleren og systemoperatøren med å sørge for at samme modulversjoner kjøres under utvikling og i vanlig drift. Ved utgangen av 2014 var det pakker tilgjengelig i det offisielle npm-arkivet.