Alle Englands fotballklubber er medlemmer av forbundet. Selv om FA ikke er ansvarlig for den engelske eliteserien Premier League, har de vetorett ved utnevnelse av ligaens formann og administrerende direktør og ved endringer av ligaens regler. The Football League, landets nest beste liga, som består av The Championship, Football League One og Football League Two, er derimot helt selvstyrende.