Fast bestemt på ikke å begå de samme feiltagelsene som sin bror, viste Afonso III særskilt oppmerksomhet til hva middelklassen, bestående av handelsfolk i byene og små landeiere, hadde å si. I 1254 i byen Leiria holdt han det første , rådsmøte bestående av representanter fra adelen, middelklassen, geistlige og representanter fra alle distrikter. Han opprettet også lover som hadde til hensikt å legge begrensninger for overklassen å misbruke sin makt og myndighet på de laveste samfunnsklassene. Han grunnla også flere byer, ga bystatus til andre og omorganiserte den offentlige administrasjonen.