Neste endring av jurisdiksjonsområdet skjedde i 1964. Selve endringa skjedde innen den nye storkommunen som nå Tromsø by ble. Malangen sorenskriveri dekket fra nå av de nye storkommunene Målselv og Balsfjord, og fastlandsområdet av Tromsø by. Dette siste var det samme som fastlandsområdet av gamle Tromsøysund, i tillegg til den delen av Ullsfjord som ble lagt til Tromsø. Begge disse nye områdene lå tidligere under Lyngen sorenskriveri. Samtidig ble Øverbygd herred slått sammen med Målselv og Malangen herred sammen med Balsfjord og således en del av Malangen sorenskriveri.