Maïga tilhørte ikke den offisersgruppen som ble ledet av oberst Assimi Goïta og som tok makten ved et militærkupp i Mali i august 2020. Ved dette militærkuppet ble president Ibrahim Boubacar Keïta avsatt og Bah Ndaw fungerte som ny president inntil Assimi Goïta gjennomførte et nytt statskupp i mai 2021 hvor Bah Ndaw ble avsatt og Goïta selv overtok presidentembetet. Maïga er ansett som en nær alliert med Goïta og han ble etter mai-kuppet talsmann for kuppmakernes politikk. I juni 2021 ble han statsråd med ansvar for territoriell administrasjon og desentralisering, og fra 1. desember var han pressetalsmann for regjeringen. Fra 21. august 2022 har han vært Malis statsminister.