I en tidlig fase av etterforskningen ble det spekulert i at flyet kunne ha styrtet på grunn av lynnedslag. Airbus-maskinen fløy også gjennom et område med kraftig turbulens. Mange erfarne piloter fra Norge og andre land mener på sin side at lynnedslag ikke kan være grunnen til at flyet styrtet. Brasilianske myndigheter iverksatte leting etter flyet utenfor øygruppen Fernando de Noronha.