Holocaust har vært et ømtålig tema i Litauen etter uavhengigheten i 1991, særlig på grunn av det store antallet lokal kollaboratører. Trolig medvirket flere hundre eller tusen frivillige i masseskytingene. Etter frigjøringen har den i litauisk offentlighet vært opptatt av at litauerne var offer for sovjetisk undertrykking og at Sovjetunionen som den store overgriperen under andre verdenskrig. Jødene blir ofte betraktet som allierte med den sovjetiske okkupanten. I offentligheten har litauere motstrebende erkjent litauisk medvirkning til massedrapene. En håndfull har blitt dømt og få eller ingen har sonet straff.