Politisk var han aktiv i Venstre og i avholdsbevegelsen. Vaksdal ble valgt inn i Bergen bystyre i 1914, og han var også i mange år i formannskapet. Han var varamann på Stortinget fra valgkretsen Bergen og møtte mens Johan Ludwig Mowinckel satt i regjering i 1922–1924, i 1933 og i 1933–1934, før Vaksdal ble valgt inn på fast plass i perioden 1937–1945.