I 1978 ble han ansatt ved University of Warwick, og ble professor i religion og utdanning der i 1995. I 1994 ble University of Warwicks avdeling for religions- og utdanningsvitenskap, The Warwick Religions and Education Research Unit (WRERU), opprettet under Jacksons ledelse. Han var direktør for avdelingen til 2012. I 1996 ble WRERU tildelt Templeton UK Award for sitt bidrag til interkulturell forståelse gjennom studier av religiøst mangfold i utdanning. Jackson er medlem av WRERU også som pensjonist, nå med tittelen Founding Director.