I 1960 begynte Kaddoumi i Fatahs avdeling i De forente arabiske emirater. I perioden 1965–1966 arbeidet han i Helsedepartementet i Kuwait, men ble i 1966 utvist fra landet på grunn av anti-statlige aktiviteter knyttet til PLO. Etter 1973 ledet Kaddoumi sin egen politiske avdeling i Damaskus, Syria. Kaddoumi var bosatt i Tunis siden tidlig på 1980-tallet, hvor PLO hadde sin base etter at de evakuerte fra Libanon.