Joseph Machebeuf var den eldste av fem barn, foreldrene var Michael og Gilberte ( Plauc) Machebeuf. Han fikk den tidlige utdannelse av De kristne skolebrødre, og studerte klassikerne på kollegiet i hjembyen. Han gikk deretter på det sulphucianerdrevne presteseminaret i Montferrand i 1831.