Han gikk til Ligier for 1988, ironisk nok sammen med mannen han erstattet i Ferrari, René Arnoux, men teamets første bil uten turbo siden , JS31, designet av Michel Beaujon og drevet av en Judd V8-motor, var overhodet ikke konkurransedyktig. Ligier tok ingen poeng og klarte ofte heller ikke å kvalifisere seg til løpene, selv mot team med langt mindre budsjetter, som AGS og Rial. Årets laveste punkt for det franske teamet var da både Johansson og Arnoux ikke klarte å kvalifisere seg til Frankrikes Grand Prix på Paul Ricard den første helga i juli).