Under Russlands invasjon av Ukraina 2022 rapporterte Novaya Gazeta mye om hva som skjedde i Ukraina, som en av få aviser i Russland. To journalister fra avisen ble arrestert 26. februar fordi de befant seg i nærheten av en demonstrasjon hvor en av protestdeltakerne brukte slagordet «No war»; dette slagordet ble sett på som ekstremisme. Novaya Gazeta måtte tilpasse seg sensurbegrensninger, hvilket for eksempel ga opphav til at invasjonen kunne bli omtalt som «hva vi kynisk ble forbudt å omtale ved vårt eget navn.» Avisen måtte tilpasse seg nytt lovverk som blant annet kunne gi opptil 15 års fengsel for å spre om det som skjedde i Ukraina, eller opptil 5 års fengsel for å russiske styrker. Det eneste som ble tillatt å skrive om, knyttet til det myndighetene kalte den , måtte hentes fra offisielle russiske kilder.