Ponzu lages ved å småkoke mirin, riseddik, tang og katsuobushi (tørket og røkt tunfisk som har blitt raspet til tynne flak) over middels varme. Væsken blir deretter avkjølt, silt for å fjerne katsuobushiflakene, og til slutt tilsatt saften fra en eller flere av følgende sitrusfrukter: yuzu, sudachi, daidai, kabosu eller sitron – i noen tilfeller også grapefrukt, lime, bergamot, etc.