Byen er oppkalt etter den daværende dansk-norske kongen som grunnla byen, Christian IV. I hans kunngjøring om grunnleggelsen fra 5. juli 1641, skrev han at byen på «Sanden» skulle kalles . Fram til slutten av 1800-tallet, var det flere skrivemåter brukt for byen, inkludert , , og . I 1877 ble skrivemåten innført i Norges statskalender, etterfulgt av Kristiansand fra 1890. I 1929 bekreftet Justisdepartementet at byens navn skrives med « og én .» Skrivemåten har sett bruk i navn på en del bedrifter og foreninger også etter 1800-tallet, blant annet Christianssands Bryggeri, Christianssands Kunstforening, Christianssands Seilforening og .