Spillet handler om Link, som etter å ha sovet i 100 år våkner opp av en stemme. Stemmen leder Link mens han utforsker eventyrverden Hyrule. introduserer flere nye måter for Link å påvirke miljøet i spillet på. Blant annet kan Link hugge ned et tre for å lage bru over et gap, eller stable blokker for å nå nye steder. Spillet introduserer også nye spillmekanikker til -serien, som å la Link kunne klatre på vertikale overflater, egen knapp for hopping og la han bli påvirket av temperaturer i miljøene i spillet avhengig av hvordan han kler seg.