I Den spanske bispekonferanse fungerte Díaz Merchán også som leder for kommisjonen for sosialpastoral omsorg fra 1972 til 1978. Fra 1981 til 1987 var han formann for den spanske bispekonferansen. Díaz Merchán fungerte deretter i eksekutivkomiteen fra 1987 til 1996 og igjen fra 1999 til 2002. Han var også leder av pastoralkommisjonen fra 1996 til 1999.