Etter sin prestevielse i 1992 tok fader Pei etter ett år som kapellan i katedralen videre teologisk utdannelse ved St. Charles Borromeo Seminary i Philadelphia i USA der han tok mastergrad i bibelvitenskap. Etter at han vendte tilbake til Kina i 1996 ble han viserektor og studierektor ved seminaret i Shenyang.