Salvator Niciteretse gikk på gutteseminaret i Kanyosha fra 1975 til 1979 og deretter på det forberedende presteseminar i Bujumbura, hvor han skaffet seg universitetskompetanse. Han fullførte sine filosofistudier ved presteseminaret i Bujumbura og studerte teologi ved presteseminaret i Burasira.