Effie forlot Ruskin og søkte om at ekteskapet skulle bli annullert grunnet at det aldri var blitt fullbyrdet, og skilsmissen skapte en betydelig offentlig skandale. I 1855, etter at hennes ekteskap med Ruskin var blitt avsluttet, ble Effie og John Millais gift. I løpet av hennes nye ekteskap fødte hun hele åtte barn. Hun poserte også for en rekke av hans verker, mest betydningsfullt kanskje hans (1856) som idealiserer henne som et ikon for skjønnhet og fruktbarhet.