Henrettelsen av den bøhmiske reformatoren Jan Hus i 1415 utslukket ikke hans lære, men førte i Bøhmen snarere til et nytt selvforståelse og nasjonal selvbevissthet. Etter alvorlige nederlag for den katolske side, utstedte paven en korstogsbulle, som også ble proklamert i Salzburg. Erkebiskop Johann organiserte en egen leiesoldattropp for å kjempe mot hussittene, ledet av Wiguleius von Volkersdorf og Jörg von Nussdorf. Etter mange fremganger ble hussittene grundig beseiret i 1436 nær Lipany øst for Praha. I striden om ytterligere pengemidler for Albrecht V av Østerrikes felttog mot husittene, måtte Johann II i 1437 påta seg å betale ytterligere 7000 gylden til Albrecht.