Gustavo Nakatani Ávila var sønn av Yoshigei Nakatani Moriguchi, en japansk innvandret entreprenør som hadde skapt og introdusert et peanøttprodukt i Mexico av japansk type, og den meksikanskfødte Ema Avíla Espinoza. Han var den yngste av deres åtte barn en annen var kunstneren Carlos Nakatani.