Van Buren giftet seg med sin barndomskjæreste Hannah Hoes, en slektning på morssiden. Ut fra brevene hennes var ekteskapet lykkelig. Paret fikk en sønn mens de bodde i Kinderhook, og tre sønner til i Hudson, men den yngste døde som spedbarn. I 1816 flyttet familien til Albany, der husholdningen ble utvidet med mannens forretningspartner og tre . Her fikk Hannah sin femte sønn i januar 1817, men vinteren etter ble hun syk av tuberkulose og døde 5. februar 1819. Van Buren giftet seg aldri igjen og flyttet inn i det hvite hus i 1837 som enkemann med fire ugifte sønner. Han nevner ikke en gang Hannahs navn i sin selvbiografi; den gang ble en dame utskjemt om en herre navnga henne offentlig.