Kristendommen kom relativt sent til Jaffa. Ved konsilet i Nikea i 325 var byen ennå ikke representert og var kun oppført ved konsilet i Efesos i 431. Den omtales i Det nye testamente i fortellingen om at apostelen Peter vekket enken Tabita, på gresk Dorkas, til live igjen etter at hun døde (!). Han hadde også kommet «i ekstase og fikk et syn» i Jaffa. Jaffa ser ut til å ha tiltrukket seg seriøse jødiske lærde på 400- og 500-tallet. (Den jerusalemske Talmud) (kompilert fra 300- og 400-tallet) i refererer til Rabi Akha bar Khanina fra Jaffa, og , skrevet på 800-tallet, nevner R. Tanchum av Jaffa.