I motsetning til bygger ikke videre på tidligere sesonger. Denne sesongen foregår i en annen verden, og første og andre sesong er i denne verdenen en TV-serie. En nyhet i denne serien er at hovedpersonene kan gjøre digimonene sterkere uten digimering, ved å dra digimonkort gjennom en kortleser. Serien foregår for det meste i den virkelige verdenen, i motsetning til den første serien som i hovedsak foregår i den digitale verdenen. De reiser imidlertid en tur til den digitale verdenen i denne sesongen også.