Bauer har siden begynnelsen av 1990-tallet bemerket seg som en innflytelsesrik formidler av samtidig kunst og film, med særlig fokus på transdisiplinære og intermediale prosjekter. Hun har vært kunstnerisk direktør ved Künstlerhaus Stuttgart (1990–94), og professor ved Kunstakademiet i Wien fra 1996. Fra 1999 til 2002 var Bauer engasjert som del av kuratorgruppen for den toneangivende documenta-utstillingen («documenta11») i Kassel i Tyskland. I perioden 2002-2005 ble hun første direktør ved Office for Contemporary Art Norway (OCA) i Oslo. Bauer forlot OCA til fordel for en stilling ved det ledende universitetet MIT i Boston, USA, hvor hun var leder for kunstavdelingen ved instituttet for arkitektur.