Heaton var regnet som et stort keepertalent, men fikk aldri kamper for Manchester Uniteds A-lag. Han hadde flere utlånsperioder fra Man. United, før han ble kjøpt av Cardiff City FC i 2010. Han fikk sitt store gjennombrudd for Burnley FC etter han gikk dit i 2013 og etablerte seg som en av Premier Leagues beste målvakter.