Margaret Heafield Hamilton (født 17. august 1936) er en amerikansk informatiker, programvareutvikler og bedriftseier. Hun var direktør for Software Engineering Division ved MIT Instrumentation Laboratory, som utviklet programvare om bord på NASAs Apollo-program, blant annet til den første månelandingen. Senere grunnla hun to programvareselskaper, Higher Order Software i 1976 og Hamilton Technologies i 1986, begge i Cambridge, Massachusetts.