Assiniboine er tett knyttet til nakodafolket (også omtalt som «Stoney») i Alberta på språket. De to sistnevnte stammene snakker varianter av nakotaspråket, en fjern, men ikke direkte gjensidig forståelig variant av siouxspråket. Nakotaspråket (eller stoneyspråket) kan ha utvikla seg fra assiniboine, eller så kan både nakotaspråket og assiniboine ha utviklet seg fra et felles opphavsspråk.