Hans samling av fugler vokste til ni tusen og disse overført han til i 1886. Omtrent på samme tid ble museet utvidet med samlinger av Gould, Salvin og Godman, Hume, og andre til å bli den største i verden. Blant Sclaters viktigere bøker er (1866–69) og (1873) begge med Osbert Salvin, (1888–89) med W.H. Hudson, og (1894–1900) med Oldfield Thomas.