Den 18. desember 2000 var hun ute og dykket med sønnene sine. Hun var en ivrig dykker. Plutselig så hun en båt komme mot dem i full fart. Båten kom rett mot sønnen Jamie, men Kirsty MacColl klarte å dytte ham unna, og han fikk bare mindre skader i ribbeina og hodet. Men hun selv ble truffet, og hun ble drept umiddelbart. Kisten hennes ble sendt hjem til Storbritannia, og hun ble begravet i London.