Musikken på albumet bærer preg av eksperimentering. Tittelsporet «Atom Heart Mother» og avslutningssporet «Alan's Psychedelic Breakfast» er eksempler på dette. Om det siste er det også blitt kommentert at det er det perfekte sporet for å teste stereoanlegg. Låtene fra albumet har sjelden blitt framført under konserter etter utgivelsen av albumet i 1973. Albumet inneholder blant annet to meget lange, ressurskrevende melodier. Tittelsporet fordrer blant annet et middels stort kor og en tilhørende gruppe strykere og blåsere. «Alan's Psychedelic Breakfast» benytter seg av mange forskjellige «naturlige» lyder som knasing av frokostblandinger, gange rundt i rom, helling av melk og andre liknende lyder.