Betegnelsen «katar» er avledet fra middelalderlatin , «den rene», fra den greske teksten i , , «å gjøre rent», avledet fra greske , «ren, ublandet». Selv kalte de seg for , «gode menn» i betydningen gode kristne. De ble også kjent som «albigensere» ettersom det var mange tilhengere i den franske byen Albi og det omliggende området på 1100- og 1200-tallet. Benevnelsen «katar» gav opphav til ordet «kjetter» (vranglærer) (via tysk «).