Uenigheter rundt suvereniteten til Gibraltar og lufthavnen har i mange år hatt en sterk innvirkning på selve driften og flyoperasjonene. Men den 2. desember 1987 kom begge partene til enighet om en avtale som åpnet for felles, sivilt bruk av flyplassen. Men avtalen ble aldri signert, ei heller gjenopptatt da gibraltarske myndigheter protesterte mot den.