Den 23. mai 1624 giftet han seg med Sophie Hedvig av Sachsen-Lauenburg, datter av hertug Franz II av Sachsen-Lauenburg (1547–1619). Hun døde i 1660, han tre år senere, begge ble begravet på Glücksborg. Parret fikk flere barn, hvorav sønnen Christian (1627–1698) etterfulgte sin far som hertug.