Nasjonalparken ligger i Lom, Vågå og Vang kommuner i Innlandet samt Luster og Årdal kommuner i Vestland, og omfatter de sentrale deler av fjellområdet Jotunheimen. Utladalen landskapsvernområde grenser opp til selve nasjonalparken. I Jotunheimen finnes flere av de høyeste fjelltoppene i Nord-Europa.