Europeiske kolonister døde ofte unge på grunn av tropisk feber, så vel som av voldelig slavemotstand på slutten av det attende århundre. I 1791, under den franske revolusjonen, brøt det ut et stort slaveopprør på Saint-Domingue. Da den franske republikken avskaffet slaveriet i koloniene 4. februar 1794, var det en europeisk første.[49] Den tidligere slavehæren slo seg sammen med Frankrike i krigen mot sine europeiske naboer. I den andre Basel-traktaten fra 1795 (22. juli) avstod Spania de østlige to tredjedeler av øya Hispaniola, for senere å bli Den dominikanske republikk. Franske nybyggere hadde begynt å kolonisere noen områder på den spanske siden av territoriet.