I Meijiperioden (fra 1868 til 1912) ble mange japanske borger revet. Himejiborgen ble forlatt i 1871 og flere korridorer og porter ble revet for å skape plass til brakker for den japanske keiserlige arme. De japanske myndighetene hadde planlagt å rive borgen, men den ble reddet av en oberst i den japanske keiserlige arme ved navn Nakamura Shigeto. Et monument i stein ble plassert i borgkomplekset innenfor den første porten; , for å hedre Nakamura. Selv om Himejiborgen ble reddet, har mange andre japanske borger foreldet og vært en kilde til store restaureringskostnader.