Første Gestapo-sjef i Trondheim var SS-Hauptsturmführer og Kriminalkommissar Gerhard Stubs, som kom i mai 1940. Sommeren 1942 ble Misjonshotellet overtatt av Sipo og brukt som kontorer, kantine og bolig for tjenestemenn, samt som fengsel. SS-Hauptsturmführer Walter Hollack ledet avdeling IV og V, Gestapo og Kripo, fra slutten av 1941 til slutten av januar 1944. SS-Obersturmführer Julius Nielson ledet Referat IV 2, som hørte til de Gestapo-kontorer i Norge med flest krigsforbrytere.