Alaskan klee kai kommer i tre anerkjente fargevarianter: svart og hvitt, grått og hvitt, eller rødt og hvitt (som kan vises som kanel eller mørk rødbrun). Helt hvit alaskan klee kai finnes også, men denne pelsfargens variasjon regnes som en diskvalifikasjon med hensyn til rasens standard. Helt hvit alaskan klee kai er ikke anerkjent av den britiske kennelklubben, og kan ikke registreres.