Javier Echevarría var et yngste i en søskenflokk på åtte, Han fikk skolegangen hos marianistene i San Sebastian og Madrid. Han begynte på juridiske studier ved Universitetet i Madrid, som han viderførte i Roma. Echevarría tok doktorgrad i kirkerett i 1953 ved i Roma, og i 1955 i sivilrett ved Lateranuniversitetet. Siden studentårene i Madrid (1948) tilhørte han .