Qui-Gon lokaliserer snart de to fangede Jediene. Obi-Wan oppdager et enormt gruve / raffineri-kompleks under Obredaan bygget for å behandle kortose, et spesielt mineral som kan brukes til å produsere våpen som er ideelle for å bekjempe Jediene. De får også øye på et romskip fra Trade Federation, som forlater Obredaan. Når representanter fra Føderasjonen nekter for å vite noe som helst om Jin'has aktiviteter, får Qui-Gon og Obi-Wan et offisielt oppdrag om å møte med føderasjonens visekonge Nute Gunray og inspisere anleggene hans. Etter at de går om bord på visekongens romskip, blir Jediene plassert i et rom som sakte fylles opp med giftig gass. Samtidig som en gruppe droider ankommer, med ordre om å drepe Jediene. Qui-Gon gir lærlingen sin ordre om å sabotere romskipets kommunikasjon og deaktivere motorene, avskjære skipet fra resten av føderasjonsflåten og deretter tvinge skipet til å lande på den nærmeste planeten, Naboo.