Museet består av flere bygninger, hvorav kjernen er et omtrent 550 år gammel bindingsverksverkshus med adresse Frauenplan 21. På midten av 1800-tallet ble bygningen feilaktig identifisert som Bachs fødested, og Neue Bachgesellschaft etablerte i 1907 et museum og minnested for komponisten i det som fortsatt ble regnet som Bachs fødehus. Det sannsynlige fødestedet lå i virkeligheten omtrent 100 meter lengre nord, i «Fleischgaß», der Bachs far eide et bolighus. Bygningen, som lå der Lutherstrasse 35 nå ligger, ble revet allerede på 1700-tallet.