Parham har fått noe kritikk mot seg i ettertid. Han skal ha vært negativt innstilt og kommet med kritikk ovenfor vekkelsen i Azusa street og William J. Seymour. Muligens fordi Seymour var farget (afroamerikaner). Parham skal visstnok også ha vært medlem i Ku Klux Klan. Han ble også i 1907 anklaget for overgrep på to yngre kvinner i San Antonio, Texas. Anklagen ble senere droppet.