Tilhørende liberal protestantisme, gikk han frivillig i eksil til Sveits under Det andre franske keiserdømme, fra 1866 til 1870, fordi han nektet å avlegge eden til de nye styresmaktene. Han var professor ved universitetet i Neuchâtel (fransk: Université de Neuchâtel). I 1867 deltok han på de tre internasjonale kongressene til Ligue de la paix et de la liberté (engelsk: League of Peace and Freedom). På den siste kongressen i Lausanne, i 1869, holdt han en tale. Samtidig prøvde han å opprette en liberal protestantisk kirke, og oppfordret pastorene Jules Steeg og Félix Pécaut til å støtte det.