Etter at Frederiksberg stasjon ble nedlagt som godsstasjon, ble den dobbeltsporede forbindelse fra Frederiksberg til Godsringbanen mot nord nedlagt i 1996 og den sydlige enkeltsporete forbindelse ble lukket i 1998 og stasjonen ble fri bane i mellom Solbjerg stasjon og Vanløse. Etter en periode, hvor S-tog kjørte forbi den betjente kommandopost, som lå hvor sporene fra nord, syd og vest møtes mot Frederiksberg, ble den nordlige forgrening lagt under Vanløse stasjon i den 1. november 1999. Forbindelsen til Vanløse fra ringbanen ble lukket i 2001, da den nåværende Flintholm stasjon skulle anlegges.