Dunn var igjen medlem av Booker T. & the M.G.'s etter at bandet ble gjenforent i 1994, og var også med i Blues Brothers-bandet. Dunn & the MGs var "husband" for Bob Dylans under konserten som feiret Dylans 30-årsjubileum i musikkbransjen, på Madison Square Garden. Her spilte han med Dylan, George Harrison, Eric Clapton, Tom Petty, Stevie Wonder, Sinéad O'Connor, Eddie Vedder og Neil Young. I juni 2004 var Dunn med i husbandet under Eric Claptons Crossroads Guitar.