Haanæs cand odont i 1963, dr. odont og cand med i 1976 og spesialist i oral kirurgi og oral medisin. Han hadde praksis som tannlege frem til 1968 hvorpå han gikk over i en undervisningsstilling ved Det odontologiske fakultet ved UiO. Han ble doisent ved klinikk for oral kirurgi og oral medisin i 1979 og ble professor ved samme sted fra 1989. Mot slutten av 1990-tallet ble han prodekanus, og fra 1999 dekanus ved UiOs odontologiske fakultet.