Han var sønn av snekker og kirkeverge i Tórshavn Niels Christopher Winther og Sigga Maria Karbech. Både farfaren og morfaren var bøkkere i Tórshavn. Hans yngste bror var folketings- og lagtingsmann Niels Christopher Winther, som regnes som Færøyenes første virkelige politiker. Deres søster Maren giftet seg med Jens Wenningsted, som også ble lagtingsmann.