Naturlig forekommende yttrium består utelukkende av den stabile isotopen . I tillegg er 33 kunstig fremstilte ustabile (og dermed radioaktive) isotoper kjent. De mest stabile av disse isotopene er med halveringstid 106,65 døgn, med halveringstid 58,51 døgn, med halveringstid 3,322 døgn, og med halveringstid 2,66 døgn. Alle de resterende isotopene har halveringstider kortere enn 1 døgn, og de fleste kortere enn 1 time.