I 1675 ble han diakon, i 1676 mottok han prestevielsens sakrament av erkebiskop António Brandão av Goa. Joseph Vaz var ivrig i sin andakt til Jomfru Maria, og betegnet seg gjerne som en «Jomfru Marias knekt». På hjemstedet ble han raskt kjent som en god predikant og skriftefar.