I perioden 2007 til 2008 var Brattskar Utenriksdepartementets spesialrådgiver for fredsbyggende operasjoner. Deretter ble han utnevnt til leder for regjeringens klima og skogprosjekt frem til han i 2011 ble ekspedisjonssjef i Miljøverndepartementet. Han var i Miljøverndepartementet frem til 2013, da han i en periode av året var Norges ambassadør til Kenya samt Norges representant til FNs organisasjoner i Nairobi, før Solberg-regjeringen utnevnte han til statssekretær. Brattskar var ambassadør til FN og andre internasjonale organisasjoner i Geneve fra 2016 til 2020.