SOK hadde en rekke myndighetsoppgaver i og omkring de danske farvann, blant annet farvannsovervåkning, ettersøknings- og redningstjeneste, isbrytning, overvåkning av havmiljø og bekjempelse av forurensning. Løsningen av oppgavene skjedde i samarbeide med politiet, kommunene, Søfartsstyrelsen, Farvandsvæsenet, Beredskabsstyrelsen, Danmarks Meteorologiske Institut og SKAT.