I august 1955 flyttet avdelingen til Bodø flystasjon. I 1958 var 331 operative med North American F-86 Sabre og kunne nå foreta identifiseringer og avskjæringer i mørket og i dårlig vær. Lockheed F-104 Starfighter ble innfaset i august 1963, men ble omstridt på grunn av høye tapstall. Norge mistet totalt 7 av 19 Starfightere, og fire flyvere omkom.