Toledo har inka-indiansk bakgrunn og ble utdannet i økonomi ved amerikanske Stanford University. I 1994 grunnla han partiet Perú Posible og i 2000 stilte han som presidentkandidat, men tapte mot Alberto Fujimori i et omstridt valg. Han vant deretter presidentvalget i 2001 over Alan García. Han satt som president til 2006.