Mongoose baserte seg først og fremst på bruken av eksil-cubanere, trent av CIA, som skulle infiltrere Cuba og bygge opp en motstandsbevegelse. På sikt skulle denne vokse seg sterkere og etter hvert gå i fra å være en skjult motstandsbevegelse til å bli en gerilja som kunne utfordre Castro militært, og ta fra han styringen. Trass i President John F. Kennedys mistro til en invasjon av den amerikanske hæren, ble det vurdert. Hvis opprørerne klarte å skaffe seg kontroll over territorier på Cuba, og sette opp en USA vennlig regjering var det aktuelt for USA å komme med støtte for dette. Det ble også utviklet planer om å iscenesette en falsk aggresjon fra det cubanske militæret som et påskudd for amerikansk invasjon. I tillegg til de rent militære planene var det også igangsatt et omfattende propaganda arbeid mot den cubanske regjeringen, i håp om å svekke dens legitimitet ovenfor befolkningen. Å ta livet var Castro var også aktuelt.