Klubben har per dags vunnet det andorranske seriemesterskapet seks ganger og det nasjonale cupmesterskapet ni ganger. FC Santa Coloma har også vunnet Supercopa Andorrana fire ganger. Klubben har ved flere anledninger deltatt i kvalifiseringsspill og innledende kamper både i Mesterligaen (tre ganger) og Europaligaen (seks ganger), men møtte større motstand i alle kamper og kvalifiserte seg ikke videre til sluttspill.