Kaspersky har et stort forskerteam som oppsøker og analyserer skadevare og virus. Det var således forskere fra Kaspersky Lab som i 2012 oppdaget det kjente viruset og senere kunne dokumentere at det hadde forbindelser til det beryktede , som er verdens hittil mest avanserte malware, målrettet som Midtøsten og især Iran, herunder landets atomanlegg. I februar 2015 avslørte Kaspersky , en hel ny type spyware som i motsetning til tradisjonell programvarebasert malware infiserer harddiskens firmware – hvilket gjør det stort sett umulig å oppdage, ettersom tradisjonell antivirusprogramvare ikke har adgang til, eller noen kontroll over, platelagerets firmware.