Håndballen kom inn i bildet allerede på 1940-tallet. Sesongen 1944/1945 kom HF Åbo IFK opp i høyeste håndballserien i Finland for første gang og har vært et stabilt lag der siden. Under alle dissa årene har herrenes representasjonslag aldri tatt hjem noen medalje, men fire ganger har herrelaget sluttet på fjerdeplass. Oldboyslaget har derimot vunnet flere FM-medaljer og 1976 gullet.