Driften av NATO-anlegget for en stor del bevilget over budsjettet til tyske Bundeswehr, da vesentlige deler av Bundesmarines forsyninger lagret i Nordeps installasjoner. Anlegget ble brukt til å lagre torpedoer og miner, men også deler til blant annet båter og fly. Det rommet dessuten et feltsykehus med inntil 1000 senger,samt et verksted.