Sancar ble valgt til medlem ved National Academy of Sciences i 2005 som det første tyrkisk-amerikanske medlemmet. Han er gift med Gwen Boles Sancar, som også er professor. Hun er professor i biokjemi og biofysikk ved University of North Carolina. Sammen grunnla de , som er en ideell organisasjon som jobber for å fremme tyrkisk kultur og støtte tyrkiske studenter i USA.