Loyson holdt fast ved katolisismen slik han forstod den, men ønsket å se den reformert. Han lå på linje med Ignaz von Döllinger og fikk inn for at dogmet om pavens ufeilbarlighet - som fikk tilslutning ved Første Vatikankonsil - skulle forkastes, at morsmålet skulle benyttes i kult, at prestene skulle få rett til å gifte seg, at biskopene skulle velges av presteskapet og menighetene, og at skriftemålet skulle bli fri.