Den nåværende kommunen Markersdorf ble opprettet den 1. januar 1994 gjennom en sammenslåing av de syv kommunene Markersdorf, Deutsch-Paulsdorf (sorbisk: ), Friedersdorf, Gersdorf, Holtendorf, Jauernick-Buschbach og Pfaffendorf. De syv tidligere kommunene er idag syv distrikter i kommunen, som symboliseres i kommunevåpenet gjennom de syv bladene på et tre.