Brian Hugh Warner ble født i Canton i Ohio. Her prøvde han seg på , men forkastet snart kristendom som han så på som hykleri og ble mer innstilt på å skremme enn å praktisere religion. Han har nevnt at det kristne syn på dommedagen hadde en varig innflytelse på hans utseende. Etter å ha byttet skole til og etter avlagt eksamen, flyttet Brian og familien hans til Fort Lauderdale Florida. Mens han bodde der studerte han journalistikk og drama på Broward Community College og ble assisterende underholdningsredaktør for BCCs skoleavis, . Her startet han også bandet Marilyn Manson & the Spooky Kids, som senere ble kjent som bare Marilyn Manson.