Det er usikkerhet om hvordan fremmedstoffer i laksefôr påvirker næringskjeden i havet. Av laksens fôr ender mellom 5 og 10 prosent på havbunnen. Laksefôr tilsatt medisin fører til at medisinen ender opp i skall- og krepsdyr og sedimenter nær oppdrettsanlegg.