I oktober 1987 signerte han kontrakt med den skotske eliteklubben Dundee United for en overgangssum på £100.000. Paatelainen scoret 33 ganger på 133 kamper for Dundee United, og ble dermed deres toppscorer i to sesonger. På slutten av 1991 meldte han overgang til Aberdeen for £400.000. I løpet av hans tre sesonger der scoret han 23 mål på 75 ligakamper.