Pedersen ble utdannet som navigatør i Little Norway under krigen. Var senere navigatør på Stockholmsruten som var forbindelsesleddet mellom regjeringen i London og Sverige før han ble overført til 330 skvadron på Shetland. Han var med i den besetningen som fløy det første flyet til Norge den 8. mai 1945 med den britiske forhandlingsdelegasjonen.