I Goebbels' Reichsministerium ble Taubert i 1936 forfremmet til Regierungsrat, i 1938 – "med avvikelse fra rikets prinsipper" – tidlig forfremmet til Oberregierungsrat av Hitler, og i 1942 til Ministerialdirektor. Hans arbeid på begynnelsen av 1930-tallet fokuserte hovedsakelig på ledelsen av avdelingen "Aktivpropaganda gegen die Juden", som ble utvidet med ansvar for "Antikomintern", noe som i praksis innebar overoppsyn med ministeriets propagandavirksomhet og de underordnede enhetene mot jøder, kommunister og intellektuelle. I 1937 ga Taubert ut de offisielle retningslinjene fra ministeriet for presse, film og kringkasting og andre propagandaenheter, hvor innhold, mål og form for deres virksomhet var kortfattet foreskrevet og forklart. I 1942 overtok han ledelsen av "Abteilung Ost" (Generalreferat Ostraum) i propagandaministeriet. Denne avdelingen, med rundt 450 ansatte under seg, var ansvarlig for ledelsen av alle propagandaenheter i de okkuperte østområdene. Tidlig i 1943 hadde "Abteilung Ost", som han ledet i Reichsministerium für Volksaufklärung und Propaganda, 93 ansatte. I tillegg kom 350 andre ansatte i den såkalte "Vineta"-organisasjonen, "distribusjonsorganet" til denne avdelingen. Hans offisielle kontaktperson i utenriksdepartementet i alle saker knyttet til østområdene var den senere forbundskansleren Kurt Georg Kiesinger.