Kefallinia har en flyplass, Kefallinias internasjonale flyplass, med en rullebane som er rundt 2,4 km lang. Det ligger rundt 10 km sør for Argostoli. Bortimot hver faste rute er gjort med flyselskapet Olympic Airlines som flyr til og fra Athen, skjønt det er også en lite selskap som dekker De joniske øyer som 3 ganger i uken går til Zakynthos (Zante) og Lefkada (Lefkas). Om sommeren tar flyplassen imot chartertrafikk fra hele Europa.