I 1878 gjennomgår Haug kirke nye og store endringer, etter tegninger utarbeidet av arkitekt N.S.D. Eckhoff. Store deler av middelalderskipets vestre del blir revet, og på restene av langmurene ble nye murer oppført i tegl. Gavlveggene mures opp så de rekker over taket. De ble forlenget noe mot vest, og inntil den nye vestgavlen ble det reist et nytt vesttårn i tegl med høy hjelm. Inntil korets østgavl ble også et nytt sakristi oppført i tegl. Et større antall kister ble også tatt opp fra gulvet under skipet og flyttet til en fellesgrav i det sørvestre hjørnet av kirkegården. Gjenåpningen etter restaureringen fant sted den 19. januar 1879. Da er det blitt 508 sitteplasser der, men dette antallet har siden blitt redusert. Året etter får kirken nytt orgel, som bygges av orgelbygger August Nielsen. Prislappen er  kroner, og orgelet tas i bruk første gang den 7. august 1880.