Den 7. juli 1927 ble han av pave Pius XI utnevnt til biskop av Cordoba. Han ble ordinert til biskop 16. oktober 1927 av den apostoliske nuntius i Argentina, erkebiskop Filippo Cortesi; medkonsekratorer var biskopen av La Plata, Francisco Alberti, og biskopen av San Juan de Cuyo, José Américo Orzali. Den 20. april 1934 ble bispedømmet Cordoba av pave Pius XII elevert til metropolitanerkebispedømme, og biskop Fermín Lafitte ble da dets første erkebiskop.