På 1990-tallet skjedde det store strukturendringer i rutebilbransjen som også omfattet Storfjord Rutebilar. I februar 1996 ble Mørebil overtatt av Møre og Romsdal Fylkesbåtar (MRF). Det fortsatte med oppkjøp av Stranda og Sykkylven Billag i februar 1996, Storfjord Rutebilar i april 1996, og av Sørøy-Buss i oktober 1996. Fra 1998 ble det full sammenslutning mellom de fire selskapene med MRF som hovedaksjonær, og under navnet Mørebil AS. Hovedkontoret ble lagt til Furene i Volda. Dermed var tiden over for Storfjord Rutebilar som eget selskap.. Den videre historien kan leses under Mørebil.