I 2004 vant han hele 11 ATP-titler, inkludert tre Grand Slam-titler. Størstedelen av sesongen (fra februar) var Federer rangert som nummer en i verden. I 2005 tangerte Federer prestasjonen med 11 ATP-titler, inkludert to Grand Slam-seire. Dette året var han rangert som verdensener gjennom samtlige uker.