I tillegg til omstendighetene rundt kjøpet kom at flyet ble kjent for en rekke havarier og tekniske problemer. Av de 916 flyene som Bundeswehr kjøpte, styrtet en tredel, og førte til at 116 piloter omkom. I årene 1965–1966 styrtet 44 fly innenfor en periode på 18 måneder. Ett av flyene styrtet på Emmenes ved Narvik i desember 1965. Det tyske forsvaret tok den siste Starfighter ut av tjeneste i 1991.