Fra 1992 til 2007 var Maartmann-Moe medlem av Landsstyret i Den norske legeforening. 1999–2001 var Maartmann-Moe styremedlem i Allmennlegeforeningen. Han var deretter foreningens leder i årene 2002–2005. I kraft av disse vervene var han med å innføre og etablere fastlegeordningen.