Inntil alle disse problemene ble tatt ordentlig opp, følte befolkningen at amerikanske myndigheter ignorerte deres sikkerhet og økonomiske velferd. Å legge til whisky-avgiften til disse eksisterende klagene økte problemene i området. Mange innbyggere begjærte at whisky-avgiften ikke skulle innføres i det hele tatt. Når det mislyktes, organiserte en del innbyggere i vestlige Pennsylvania andre metoder for å oppheve loven. Motstand mot skatten var spesielt utbredt i fire sør-vestlige fylker: Allegheny, Fayette, Washington og Westmoreland. Eldre beretninger om Whisky-opprøret fremstilte motstanden som begrenset til det vestlige Pennsylvania. Men det fantes også motstand mot whisky-skatten i både Maryland, Virginia, North Carolina, South Carolina og i Georgia.