Jahangir var en av Timurs fire sønner som levde opp, og han var den eneste som var født av en fri kvinne, Uljay-Turkan Aga. Kildene er usikre på om Jahangir eller broren Umar Shaikh var eldst, men forskere heller til at Jahangir var yngst av de to.. Hans mor var Timurs favorittkone og fulgte med ham på hans reiser. Hun var sannsynligvis datter av emir Kazagan, en av lederne i Tsjagataikhanatet.