Før 2020-sesongen ble Klæboe assistenttrener for Fredrikstad Fotballklubb. I september 2022 ble han midlertidig hovedtrener for FFK, etter at Bjørn Johansen fikk sparken som hovedtrener. Etter 2022-sesongen ble han enig med Fredrikstad om å avslutte samarbeidet.