Skeiv Ungdom ble stiftet som egen organisasjon 6. august 2004 på Utøya i Buskerud, som en videreføring av det tidligere ungdomsutvalget under Landsforeningen for lesbiske, homofile, bifile og transpersoner (nå Fri – foreningen for kjønns- og seksualitetsmangfold). Jane-Victorius G. Bonsaksen er leder fra 2022.