Både han og broren Jørgen hadde et anstrengt forhold til Skiens presteskap, hvorfor de i perioder nektet å gå i kirke. De ga dog gjerne kirkegaver, som f.eks. da Vestre Porsgrunn kirke ble bygget i årene 1756–1757. Mot slutten av sitt liv ga Zacharias Simonsen også store gaver i form av altertavle og prekestol samt penger til oppførelsen av kirken i Drøbak, hvor hans datter Martha bodde med sin ektemann Niels Carlsen.