I årene 1921-25 studerte Best rettsvitenskap i Frankfurt am Main, Freiburg, Gießen og Heidelberg, hvor han i 1927 tok tysk doktorgrad i juss.<ref>[https://www.holocausthistoricalsociety.org.uk/contents/germanbiographies/wernerbest.html «Werner best», Deutschnationaler JugendbundFreistaatSS-ObergruppenführerAmt IUdtaler min bedste tak. Christian RexjudenreinEinsatzDänemark in Hitlers Hand'' («Danmark i Hitlers hånd»). At Best fremstod så aktiv og frisk av helse i sitt offentlige liv, var trolig årsak til at tysk rettsvesen gjenåpnet saken hans. 5. juli 1989 offentliggjorde statsadvokaten i Düsseldorf en anklage mot ham for 8 723 mord; men Best var død tolv dager tidligere, 85 år gammel.