President Frederick Chiluba utnevnte Mwanawasa til visepresident i desember 1991. Den 8. desember 1991 var Mwanawasa innblandet i en alvorlig trafikkulykke, der hans assistent døde på stedet. Mwanawasa fikk store skader, og ble fløyet til Johannesburg i Sør-Afrika for å få medisinsk behandling. Han ble liggende på sykehuset i tre måneder. Mwanawasa fungerte som visepresident til han gikk av i 1994.