I 416 eller 415 f.Kr. foreslo Hyperbolos en utstøting ved ostrakisme, men det slo tilbake og han ble selv utstøtt. I 412/411 f.Kr. ble han myrdet på øya Samos. Ifølge Tukydid var den athenske generalen Karminos involvert i drapet. Theopompos har hevdet at Hyperbolos’ lik ble stappet inn i et vinskinn og kastet i havet, skjønt dette kan være avledet fra en komedie.