Når Ryans sjef og mentor, admiral James Greer (James Earl Jones), blir alvorlig syk, blir Ryan utnevnt til fungerende etterretningssjef i CIA. Samtidig med dette blir en amerikansk forretningsmann, som er en nær venn av presidenten, funnet myrdet om bord på en båt i Karibia. Mordet knyttes til kokain-kartell i Colombia, og det viser seg at amerikaneren hadde interesser der. Denne drapssaken blir Ryans første prøve som sjef. Men uten at han er klar over det, sender CIA av gårde den livsfarlige leiesoldaten Clark (Willem Dafoe) for å lede en paramilitær styrke mot de colombianske narkotikafyrstene. Narkotikakartellet er ikke overbegeistret, og det ender med en rekke voldelige gjengjeldelser fra begge parter. Ryan blir involvert på stort sett alle punkter, og blir lurt til Colombia av presidenten for å rydde opp. Noe som kan ende med at han selv får skylden for alt sammen. Ryan tar imidlertid saken i egne hender og satser livet og karrieren for det eneste han fremdeles tror på - sannheten.