Sergio Pagano var professor i arkivstudier ved Det pavelige diplomatakademi fra 1978, akademiker ved Accademia di San Carlo Borromeo og medlem av International Archives Council. Pave Johannes Paul II utnevnte ham til rådgiver for Kongregasjonen for helligkåringer (1985) og Den pavelige kommisjon for kirkens kulturarv (1997). Fra 1989 til 2001 var han direktør for i Roma.