Før 2004-sesongen ble Hansen spillende hovedtrener for Stord/Moster Fotballklubb i 3. divisjon. Han ledet klubben til opprykk til 2. divisjon i 2004. I september 2005 trakk han seg som trener etter økonomiske problemer i klubben og utestående lønn, og vendte tilbake til Strømsgodset hvor han spilte ut sesongen.