Etter å ha studert teologi i Tübingen ble Paul Leopold Haffner ordinert til prest for bispedømmet Rottenburg den 10. august 1852, hvoretter han var foreleser ved i Tübingen. I 1855 ble han utnevnt til professor i filosofi ved Mainz-seminaret. I 1864 ble han inkardinert i bispedømmet Mainz og i 1866 ble han utnevnt til generalvikar for bispedømmet Mainz. I 1877 ble han tvunget til pensjonering som en følge av den antikatolske .