I november 2013 bekreftet han at han ville signere en kontrakt med i januar 2014, slik at han kunne gå vederlagsfritt til Bayern i sommervinduet. 1. juli gjennomførte han overgangen og ble Bayerns nye superspiss. Samtidig brente han mange broer i Dortmund da han valgte å gå til erkerivalen og tittelutfordreren Bayern.