Handlingen flyttes så 300 år fram i tid, til et futuristisk New York. Eks-soldaten og drosjesjåføren Korben Dallas får en uvanlig passasjer, og dermed dras han inn i jakten på "det femte elementet", som er det eneste som kan redde menneskeheten fra undergang. Mot seg har de den samvittighetsløse våpensmugleren Jean-Baptiste Emanuel Zorg, en gruppe utenomjordiske krigere og en mystisk "Mr. Shadow". Et gammelt presteskap med tilknytning til en utenomjordisk superintelligent skapninger vet hvordan ondskapen skal bekjempes, men de trenger hjelp av det Femte Element. Det er en superskapning som viser seg å være Leeloo, kvinnen søkte tilflukt i drosjen til Korben Dallas.