Ottadalen er et av områdene i Norge med minst nedbør (ned mot 300 millimeter årlig i gjennomsnitt) noe som har skapt utfordringer for jordbruket. Ottadalen ligger i en regnskygge særlig for vær fra vest. Snødybden i dalen er liten noe som gjør at jorden får lite vann om våren. Sandflukt har vært en utfordring i snøfattige vintre. Det er mye mer nedbør i fjellet enn nede i dalen og lengst vest. Klimaet er kontinentalt med varme somre og kalde vintre.