Yamamura ble født i Nagoya og studerte malerkunst ved Tokyo Zokei universitet. Kortfilmen fra 2002 ble nominert til Oscar for beste animerte kortfilm og vant førstepriser ved den internasjonale animasjonsfilmfestivalen i Annecy og Animafest i Zagreb. Han har siden laget en prisvinnende animert filmatisering av Franz Kafkas novelle "En landsens lege" og kortfilmen "Muybridge's strings", som er en samproduksjon med National Film Board of Canada.