I 1781 beleiret han og kona Bartolina Sisa (og senere også Andrés Túpac Amaru, Túpac Amarus nevø) La Paz i 184 dager, fra mars til juni og fra august til oktober, med en hær på rundt 40 000 mann. I april ble Túpac Katari tatt til fange, og beleiringen ble senere brutt av kolonitropper fra Lima og Buenos Aires.