I første halvdel av 1500-tallet gikk befolkningen i erkebispedømmet over til reformasjonen. Den siste erkebiskopen som var godkjent av paven, Sigismund, døde i 1566, etter å ha gått over til protestantismen i 1561. Dermed anså Den hellige stol erkebispedømmet som oppløst, og la området til det apostoliske vikariat i nord.