SI ble etablert den 1. juli 1990 som et forvaltningsorgan underlagt Justisdepartementet. Den 1. januar 2001 ble virksomheten flyttet til Finansdepartementet. Fra 1. januar 2015 ble SI en del av Skatteetaten, og fra 2019 organisert som oppdragssvdelingen i Skatteetatens innkrevingsdivisjon.