Etter videregående deltok Chalamet i Columbia University i ett år, med hovedfag i kulturantropologi. Senere overførte han til New York University Gallatin School of Individualised Study for å satse mer på skuespillerkarrieren, etter å ha funnet det vanskelig å assimilere seg til Columbia rett etter filmingen av Interstellar. Da han forlot Columbia, flyttet Chalamet til Concourse, Bronx.