Chen ble født i Shanghai 8. oktober 1981, og bodde der inntil 2003. Faren hans jobbet med å utvikle programvare, og har tidligere jobbet hos «en av de tidligste datamaskin gigantene i Kina». Selv om Chen var interessert i kunst og tegning når han var ung, så ble han påvirket av faren sin mot datamaskiner og programmering. Har var også med på flere programmeringskonkurranser så tidlig som ti år gammel. Han var interessert i videospillene han så der, men ikke like interessert i selve programmeringen. Mens han var ungdom, hadde han noen følelsesrike opplevelser med spill han spilte, blant annet , noe sier fordi han ikke leste bøker, så ikke på filmer eller TV, og opplevde ikke andre slike ting, så videospillene han spillet fylte tomrommet. Dette førte til at han ville gjenskape de følelsene som voksen. Det var når han gikk på High School at han valgte sitt engelske navn, Jenova. Han fikk navnet fra en karakter i , siden han ville ha et unikt navn, siden det ville være «tusenvis av folk som heter Jason Chen».