JFS ble lansert i februar 1990 i versjon 3,1 av UNIX-avarten AIX. Det finnes to generasjoner av filsystemet, som refereres til som henholdsvis og . Andre generasjon av filsystemet ble etterhvert adoptert av operativsystemene OS/2, eComStation og Linux. Det siste er tilgjengelig som fri programvare under GNU General Public License.