Hun slo gjennom på seniornivå i 2021, det året hun fylte 16 år. Hun fikk sølv på 3000 meter under det danske innendørsmesterskapet i friidrett, og hun kom på fjerdeplass på 1500 meter. Den 26. juni vant hun 1500 meter under det danske mesterskapet i friidrett. Hun vant 1500 meter under Bauhaus Juniorengala i juli, og ble tatt ut til å delta i U20-EM i friidrett 2021, der hun ble nummer to på 1500 meter, bak Ilona Mononen fra Finland. Thøgersen satte der U18-bestenotering i Europa på 1500 meter, med 9:16,43.