Han ble ridder av St. Olavs Orden i 1998 for forskningen innenfor teologi. Medlem av Vitenskapsakademiet og av Det kungliga Vetenskapssamhället i Uppsala. Borgen var prorektor ved AVH 1984–1987, preses i Det Kongelige Norske Videnskabers Selskab 1996–1999 og president i fra 1998 til 1999. I perioden 1986–1991 satt han i Metodistkirkens Verdensråd og fra 1973 til 1993 var han medlem av Metodistkirkens europeiske teologiske kommisjon.