Institutt for musikkvitenskap ved Ruhr-Universität Bochum og forskningsinstituttet ved arbeider med å bygge opp en internettbasert verkfortegnelse over Stölzels . Store deler av hans instrumentalmusikk og hans operaer er gått tapt, men mer enn halvparten av hans over kjente kirkekantater har overlevd. Det finnes også flere messer, pasjonsverker og serenader i behold.