Microchip har primært blitt assosiert med merking av husdyr som hunder og katter. Dyr får som regel chipen implantert under hunden i nakkeregionen. En slik chip er utstyrt med et unikt identitetsnummer som avleses ved hjelp av spesielle chipavlesere. Hensikten er å sikre at dyr som kommer bort fra eieren kan tilbakeføres til sin eier.