I 2007/2008–sesongen signerte han en kontraktsforlengelse med Bordeaux og oppnådde totalt 26 kamper og to mål ved sesongslutt, dette til tross for at han som oftest ble brukt som innbytter av manager Laurent Blanc. I den påfølgende sesongen ble dette gjentatt, men han imponerte kritikere og kommentatorer med sitt spill og var en avgjørende faktor i lagets seier mot Guingamp i Coupe de la Ligue. På grunn av lite spilletid ble Obertan lånt ut til FC Lorient for resten av sesongen. I Lorient fikk han 15 kamper og ett mål før han returnerte til Bordeaux ved sesongslutt.