Fontanelle satset heller på en litterær karriere og hjulpet fram av onkelen Thomas Corneille ble han raskt en populær lyriker, komedieforfatter, operalibrettist og forfatter av en brevroman, og ikke minst en ettersøkt deltaker i Paris' litterære salonger. Han skrev om filosofer og vitenskapsmenn, og var en ivrig forsvarer av tradisjonen etter René Descartes.