Frem til 1400-tallet lå Varel på frisisk område. I år 1577 ble Varel en selvstendig del av grevskapet Oldenburg. I 1663 ble Varel og Kniphausen forent til et fideikommiss. Byens slott ble ødelagt i 1751 i en stor brann. I årene 1810-1813 var hele landet, også Varel, okkupert av Frankrike. I årene 1813-1854 var Varel igjen en selvstendig del av storhertugdømmet Oldenburg, men ble deretter inkorporert i Oldenburg.