Njabulo Ndebele var Vice-Chancellor og rektor ved University of Cape Town fra juli 2000 til juni 2008, hvorpå han ble gjesteforeleser ved Ford Foundations hovedkvarter i headquarters in New York. Han sluttet seg til stiftelsen i september 1998, rett etter at han i fem år hadde vært Vice-Chancellor og rektor ved University of Limpopo i Sovenga i det som da het Northern Province. Da hadde han tidligere også jobbet som Vice-Chancellor ved University of the Western Cape. Hans første akademiske posisjoner var som leder for avdelingen for afrikansk litteratur ved University of the Witwatersrand samt Pro-Vice-Chancellor], rektor og leder for engelskavdelingen ved National University of Lesotho.