Da Napoleon returnerte til Frankrike (de hundre dagene) trakk Berthier seg tilbake til Bamberg i Bayern. Der døde han noen få uker senere ved et fall fra et vindu. Bakgrunnen for hans død er uviss, ifølge noen kilder ble han myrdet, mens andre hevder at han ble drevet til vanvidd av å se prøyssiske styrker marsjere forbi på vei til å invadere Frankrike og derfor tok livet av seg.