Den 3. april 2003 anla bispedømmet San Bernardino søksmål mot erkebispedømmet Boston. Bispedømmet anklaget erkebispedømmet for å ha gitt falsk informasjon om Paul R. Shanley, en prest som ble overført til bispedømmet fra Boston i 1990. Trass i at Shanley hadde vært straffet for seksuelle overgrep, hadde erkebispedømmet beskrevet ham til bispedømmet som Senere i 1990 var Shanley blitt anklaget for å ha misbrukt en tenåring på et hotell i Palm Springs i California. Den 6. juli 2003, etter å ha drøftet anliggendet med den nye erkebiskopen av Boston, Sean O'Malley, bestemte Barnes seg for å trekke søksmålet.