Foreningen er inndelt i 13 selvstendige fagnettverk, hvor hvert nettverk har sitt eget styre utpekt av nettverksmedlemmene. Fagnettverkene utgjør kjernen i foreningens tilbud, ved å være ansvarlig for foreningens medlemsaktivitet i form av arrangering av møter, prosjekter og annet samarbeid Medlemmer av Polyteknisk Forening har tilgang til arrangementer i regi av samtlige fagnettverk.