I sluttspillet fikk 49ers en bye i første runde som første seed fra NFC. I divisjonsrunden slo de Minnesota Vikings 27–10. 49ers dominerte kampen, og ledet i ballinnehav (38:27–21:33), første downs (21–7), yards på løp (186–21) og yards totalt (308–147). I NFC Championship Game sikret 49ers en ledelse på 27–0 til halftime over Green Bay Packers på vei til en 37–20 seier. 49ers satte en NFC Championship-rekord for færrest pasninger i en kamp med kun åtte. På bakken løp de for 285 yards, og Raheem Mostert satte en lagrekord med 220 yards og fire touchdowns på løp.