Han var sønn av lensherre Knud Axelsen Urne til Aarsmarke (1564–1622) og Margrethe Eilersdatter Grubbe til Alslev (1568–1654). Urnes karriere fulgte den vanlige veien for datidens adelsgutter, godt hjulpet av at familien sto på god fot med kong Christian IV, og av hans egne evner. Han var til oppfostring hos slektninger, gikk på Sorø adelsskole 1605-09, reiste/studerte 6 år i Europa sammen med sine brødre, og begynte deretter i 1615 i kanselliet. Etter 10 år ved Rentekammeret ble han i 1627 lensherre over Nykøbing og Aalholm.