Han arbeidet ved paleontologisk museum som vitenskapelig assistent og stipendiat 1970-1981. I 1975 fikk Kongens gullmedalje for forskning om fossile pigghuders evolusjon. Det var særlig geologien i Oslofeltet som interesserte ham. Bockelie oppnådde professorkompetanse. Han forlot akademia og arbeidet senere i privat næringsliv som forsker og konsulent innen oljegeologi. Han tok doktorgraden (dr.philos.) om fossiler.