Han tiltrådte som president i Real Madrid 26. november 1995 etter at Ramón Mendoza ble nødt til å fratre på grunn av klubbens store økonomiske problemer. Sanz forsøkte å vende den negative trenden ved å verve storspillere og verdensstjerner som Davor Suker og Predrag Mijatovic. Dette førte til at Real Madrid vant Champions League for første gangen siden 1966, både i 1998 og i 2000. Men dette strakk likevel ikke til for å å dekke de finansielle problemer som fortsatt bestod i klubben, og ved presidentvalget i 2000 tapte Sanz mot Florentino Pérez.