I tillegg til sitt pastorale arbeid var José Daniel Falla Robles medlem av erkebiskopens tiendekommisjon fra 1996, økonom i San José-seminaret og direktør for og fra 1997 et medlem av styret for og (MASC). Falla Robles ble også medlem av presterådet for erkebispedømmet Bogotá i 2002 og medlem av konsultorkollegiet i 2005. I tillegg var han fra 2006 medlem av styret i og fra 2007 åndelig veileder for Katolsk Aksjon i erkebispedømmet Bogotá og medlem av erkebispedømmets kommisjonen for prestenes videreutdannelse.