I «The Day of the Doctor» opptrer han som en gammel mann, og antyder at det har gått mange år mellom hendelsene i mini-episoden og jubileumsepisoden. Episoden handler om beleiringen og undergangen til Gallifrey, hvor Krigs-doktoren til slutt blir stilt ovenfor det moralske dilemmaet å utslette dalekene sammen med Gallifrey, eller å redde hjemplaneten og derved la dalekene ødelegge resten av universet. Doktoren bryter seg inn i Gallifreys lager for ulovlige våpen og sjeler masseødeleggelsesvåpenet «Øyeblikket». Både den tiende (David Tennant) og ellevte doktoren (Matt Smith) møter ham i løpet av episoden, og hjelper ham med å finne en løsning.