Landområdet i dette område var gjenstand for stigende havnivå, jordskjelv, tsunamier, og store deler synes å ha blitt så gjennomtrukket av vann at grunnen gikk etter en gang mot slutten av det 2. århundre før Kristus. De østlige deler av bebyggelsen av Kanopus brøt sammen, rester av bebyggelsen er å finne under havet, mens de vestlige deler er under den moderne kystbyen Abu Qir.