Christian Cornelius (kalt Christian eller C.C.) Paus tilhørte «Skiensgrenen» av slekten Paus og var sønn av skipsfører, skipsreder og proprietær Ole Paus og Johanne Plesner. Moren hadde vært gift med skipsfører Henrich Ibsen i første ekteskap, og Christian var både halvbror til Knud Ibsen og fetter til Marichen Altenburg, dikteren Henrik Ibsens foreldre. Han ble født på gården Rising søndre i Gjerpen, dit foreldrene hadde flyttet samme år etter å ha solgt Ibsenhuset i Løvestrædet. Der vokste han opp sammen med bl.a. brødrene Knud Ibsen og Christopher Blom Paus, mens broren Henrik Johan Paus bodde i Altenburggården med onkelen, tanten og kusinen Marichen.