Rajai ble den 9. juli nominert til presidentkandidat for Det islamske republikanske parti, og ble valgt til president den 24. juli. På valgdagen ble flere personer drept, og drøyt 60 personer i opposisjonen ble arrestert. Til statsminister nominerte Rajai Mohammed Javad Bahonar. I august ble det henrettet omkring 700 personer, de fleste anklaget for å være kontrarevolusjonære.