Viruset finnes primært hos småbarn, og eldre og immunkompromitterte pasienter med akutt luftveissykdom. I temperert klima kan det være sesongbestemt. En undersøkelse utført i Amsterdam estimerte tilstedeværelsen av HCoV-NL63 i ca. 4,7% av de alminnelige luftveissykdommer. Viruset viste seg å stamme fra flaggermus og infiserte palmesivetter ().