Dubois studerte teologi i Paris blant oratorianerne og ble ordinert til prest 28. september 1787. Den franske revolusjon satte mange geistlige i et dilemma, for det nye regime avkrevde en ed der man avsverget til troskap til Roma og anerkjente den franske regjerings myndighet over kirken. Mange sulpicianere flyktet til England, og tidlig i ledet 1791 Charles Nagot en gruppe som seilte ti lBaltimore i Maryland, der de åpnet et seminar, Saint Mary's. Dubois hadde studert ved Collège Louis LeGrand sammen med Maximilien Robespierre, og han hjalp den forkledte 27-årige presten til i juni 1791 å unnslippe det som skulle bli en massaker av prester som nektet å avlegge eden.