I 1909 ble Noel medlem av Oxford University Officers' Training Corps Medical Unit og ble forfremmet til Lance-Sergeant i mai året etter. Chavasse gjorde ferdig studiene i Oxford i juli 1909 og returnerte til Liverpool for å fortsette utdanningen innen medisinfaget. Som en del av utdanningen flyttet Chavasse en periode til Dublin for å ha praksis ved Rotunda Hospital. I 1912 bestod Chavasse eksamen i medisin og ble tildelt universitetets fremste medisinpris, The Derby Exhibition, i mars samme år. Han begynte etter studiene å jobbe som lege frem til han meldte seg til tjeneste i den britiske hæren tidlig i 1913.