Chelseas kvinnelag ble grunnlagt som på begynnelsen av 1990-tallet, og stort sett tilhørt toppen av den nest øverste divisjonen i engelsk kvinnefotball, men det var først i juni 2004 at det ble bestemt at Chelsea LFC skulle bli del av Chelsea FC. Klubben rykket deretter opp til FA Women's Premier League i 2005, og debuterte i den øverste sesongen i 2005-06-sesongen. Etter en dårlig start fikk manager George Michealas sparken. Det endte uansett på sisteplass, men ettersom ligaen skulle bli utvidet, spilte Chelsea i stedet kvalifisering mot Liverpool LFC og vant 4-1. Dermed beholdt Chelsea plassen.