Etter omkalfatringen som fulgte etter første verdenskrig ble Černý engasjert i administrasjonen i Mähren. Ved den revolusjonære etablering av Tsjekkoslovakia var han den høyestrangerende tsjekkisktalende keiserlige statstjenestemann i Mähren, og ble da leder for lokalregjeringen i den nye staten den 29. november 1918.