Lenge før Ustasjas tid hadde mange i Kroatias katolske presteskap støttet landets nasjonalisme. Erkebiskop Ivan Šarić av Sarajevo (1871-1960) var medlem og sammenlignet Pavelić med Kristus. Også erkebiskop Alojzije Stepinac av Zagreb (som ble saligkåret i 1998) hilste Pavelić velkommen, selv om han i private brev til ham kritiserte enkelte av bevegelsens overgrep. Her gjorde spesielt franciskanerordenen seg bemerket, også som fangevoktere i konsentrasjonsleire, der de pinte eller tvangsomvendte serbere. Da bondepartilederen Maćek spurte en franciskanervokter hvordan dette var forenlig med samvittigheten hans, svarte han at han innså at han kom til å brenne i helvete for sine handlinger, men at kom han iallfall til å brenne for Kroatia.