Rockne døde i 1931 i en flystyrt med et Fokker F-10A nær Cottonwood Falls i Kansas på vei for å delta i produksjonen av filmen . President Herbert Hoover omtalte tapet av Rockne som et nasjonalt tap. Han er gravlagt på Highland Cemetery i South Bend. Studentenes idrettsbygning på universitetet har fått Rockne sitt navn, likedan en gate i South Bend, og et par andre steder i Kansas og Indiana. Kong Haakon VII av Norge slo Rockne posthumt til ridder og sendte en personlig utsending, Olaf Bernts, norsk konsul i Chicago, til Rocknes begravelse.