Pater Stres underviste ved universitetet i Ljubljana fra 1974. I 1990 fikk han fullt professorat. Fra 1983 til 1993 var han leder for Institutt for filosofi, og fra 1999 til 2000 dekan ved fakultetet. I løpet av sin akademiske karriere skrev han 18 bøker og over 300 vitenskapelige artikler.