Petitpierre ble valgt inn som medlem av sveitsiske Forbundsrådet 14. desember 1944 og han forlot dette embetet den 30. juni 1961. Petitpierre var tilknyttet det sveitsiske Det frie demokratiske partiet. Under hans tid i Forbundsrådet var Petitpierre president for den sveitsiske konføderasjonen i tre omganger, henholdsvis i 1950, 1955 og for siste gang i 1960. Samt at han var leder for det sveitsiske utenriksdepartementet (UD) mellom 1944 og 1961. Petitpierre døde en fredelig død av naturlige årsaker i mars 1994, i en alder av 95 år.