I 2022 vedtok National Education Union, Europas største fagforening for lærere, en uttalelse om at FiLiA er en transfobisk organisasjon. I 2022 arrangerte FiLiA en konferanse i Cardiff der bl.a. den angivelige trusselen fra «transideologien» ble diskutert. Blant innlederne var antitransaktivistene Maya Forstater, Helen Joyce, Julie Bindel, Rosie Duffield og Sheila Jeffreys, og blant arrangementene var et panel som fremmet ideen om «kjønnskritisk» ideologi. Blant deltagerne på konferansen var også antitransgruppen «Get The L Out» som er kjent for å forstyrre Pride-arrangementer. I forkant av konferansen undertegnet flere organisasjoner i Cardiff et opprop for alle jenters og kvinners rettigheter, både transkvinner og ciskvinner, og mange virksomheter i Cardiff reagerte med å flagge med transflagget for å markere solidaritet med transpersoner og ta avstand fra transfobi. Under konferansen i 2022 oppsøkte FiLiA-deltagere lokale virksomheter for å klage på transflagg eller tilstedeværelsen av transpersoner, og to FiLiA-deltagere ble arrestert for trakassering av transpersoner.