Fugloy har vært bosatt siden vikingtiden, og har vært et fiskerbondesamfunn. Fra siste halvdel av 1800-tallet har fiskeriene på Færøyene blitt spesialisert. Fugloy har ikke hatt naturgitte forhold eller nødvendig infrastruktur for å kunne bli noen moderne fiskerihavn, og har siden opplevd avfolking. Det drives fortsatt sauehold på øya.