Israel er i dag hjem til om lag 1 728 arter fisk, 410 av disse holder til i Middelhavet og 1 270 i Rødehavet. Resten er kultivert eller vill ferskvannsfisk. Fiske populasjonen har sunket drastisk og fisk som naturlig hører hjemme i Israel, som acanthobrama telavivensis og nemacheilus dori er blitt truet. Acanthobrama hulensis ble utryddet på 1970-tallet som et følge av lav populasjon etter tørke i Hulasjøen.