Michelsen var regionssekretær i Natur og Ungdom (NU) 1994 til 1995, fylkessekretær i Naturvernforbundet mellom 1996 og 1999 og prosjektleder i miljøheimevernet (senere Grønn Hverdag) i 1999. I periodene 1999-2003 og 2007 - 2013 var han også sentralstyremedlem i Naturvernforbundet og fra 1998 til 2009 var han sentralstyremedlem i Blekkulfs Miljødetektiver/Miljøagentene.