B-2-flåten er basert på Whiteman Air Force Base i Missouri. Depotvedlikehold finner sted ved Oklahoma City Air Logistics Center, Tinker Air Force Base i Oklahoma. De har også flere andre flyplasser der det er tilrettelagt for dem, blant annet på Andersen Air Force Base på Guam i Stillehavet, på Diego Garcia i Indiahavet, og på RAF Fairford i England.