Økte nivåer av metylmalonsyre kan indikere vitamin B-mangel. Den er imidlertid sensitiv (de som har mangelen, tester nesten alltid positivt), men ikke spesifikk (de som ikke har vitamin B-mangel, kan få påvist forhøyede nivåer av metylmalonsyre). 90-98 % av pasientene med B-mangel har forhøyede nivåer av metylmalonsyre. Den har lavere spesifisitet ettersom 20-25 % av pasientene over 70 år har forhøyede nivåer av metylmalonsyre, men 25-33 % av dem har ikke B-mangel. Av denne grunn anbefales ikke metylmalonsyretest rutinemessig hos eldre.