Emma Adenauer led av en ryggradsforkrumming, som etter den første fødselen skadet hennes nyrefunksjon. Dette forverret seg med årene. Hun fikk i 1916 en soppforgiftning som ifølge familien førte til hennes død. Ifølge historikeren Henning Köhler kunne denne soppforgiftningen likevel ikke føre til nyresvikten, som medførte at hun døde 6. oktober 1916, 36 år gammel.