Diagnose kan være vanskelig av flere årsaker. Det er typisk kun i bruk serologitester for to typer Bartonella, og . Ifølge professor Breitschwerdt er det mange tilfeller av falske negative serologitester. For å fange opp flere typer Bartonella samt øke sensitiviteten har professor Breitschwerdt jobbet med å utvikle optimale dyrkingsmedium for Bartonellabakterier. PCR er også tatt i bruk ved enkelte laboratorier.