Han begynte på høyere religiøse studier ved Darul Uloom Haqqania, et deobandi-islamsk seminar (darul uloom), i Pakistan i 1964. Han ble uteksaminert i 1970 med en høy kvalifisering som innebar at han kunne rettelig kalle seg mawlawi, og han tilføye «Haqqani til sitt navn, likesom flere andre uteksaminerte fra Darul Uloom Haqqania hadde gjort.