Den 5. februar 2017 var Ebner en del av laget som vant Super Bowl LI. Han hadde en takling i kampen, hvor Patriots slo Atlanta Falcons 34–28 på overtid. Patriots hadde det største comebacket i Super Bowls historie, etter å ha ligget under 28–3 i tredje kvarter, og vant kampen på overtid, den første gangen en Super Bowl-kamp hadde nådd overtid.