Winnsboro ble til etter opprettelsen av Franklin Parish. Franklin Parish ble dannet 1. mars 1843 fra deler av Oachita parish, Catahoula parish og Madison parish. Parishet ble stortsett opprettet grunnet arbeidet til den louisianske senatoren John Winn. Landområdet Winnsborough (som ble senere omkalt Winnsboro), som skulle bli til administrasjonssenteret av Franklin Parish, ble kjøpt i 1844. Senere, i 1846, ble det offisielt administrajonssenteret for parishen og ble innlemmet i parishen den 18. mars 1902.