Thor Hiorth Schøyen har skrevet en rekke publikasjoner, mange var såkalte populærvitenskapelige artikler om skadedyr i landbruk og skogbruk. Som statsentomolog har ga han ut en rekke vitenskapelige publikasjoner om sitt fagområde. Mest betydningsfull er hans , som kom med 2-3 års mellomrom. Disse inneholdt en rekke opplysninger om insekter i Norge, både funn av nye arter og interessante biologiske observasjoner.