Han gikk inn for bruk mot covid-19 med en kombinasjon av tre medikamenter: Hydroksyklorokin, sinksulfat og azitromycin. Den 21. mars 2020 postet Zelenko en video på YouTube og Facebook der han rettet til USAs president Donald Trump hendet å med fremgang ha eksperimentelt utprøvd nevnte metode - i utgangspunktet noe som var i bruk for malaria - på hundrevis av pasienter med koronaviruslignende symptomer. Han postet et åpent brev til Trump om dette to dager etter. Dette var i en periode da en rekke grupper, også World Health Organization, forsøkte å finne ut om bruk av hydrosyklorokin og/eller azitromycin var relevant forr covid-19. I mars 2020 bemerket Alex Kasprak, som skrev om vitenskapsemner for Snopes, at ettersom Zelenko ikke beskrev nøyere sin metode eller publiserte noen data, var det umulig å verifisere det han hevdet.