Gardners formulering av foreldrefiendtlighetssyndrom har blitt kritisert for å mangle vitenskapelig grunnlag, og som en hypotese som tilhengerne ikke har lyktes i å styrke gjennom vitenskapelig dokumentasjon i en slik grad at den kan regnes som akseptert. De første publikasjonene om det foreslåtte syndromet ble publisert på eget forlag og var ikke fagfellevurdert, og selv om enkelte senere artikler har blitt publisert i vitenskapelige tidsskrifter bygger de stort sett på anekdotiske beviser; i tillegg har den begrensede forskningen på det foreslåtte syndromet manglet vitenskapelig validitet og pålitelighet. Mangelen på objektiv forskning og svakhetene ved den publiserte forskningen til støtte for hypotesen har ført til at foreldrefiendtlighetssyndrom har blitt beskrevet som pseudovitenskap eller «søppelforskning» (). Foreningen 2 Foreldre, som er tilhengere av hypotesen, skriver at den er lite anerkjent i norske fagmiljøer og rettspleie.