Arkivene etter Senja og Tromsø sorenskriveri oppbevares ved Statsarkivet i Tromsø. Svært lite av det bevarte arkivmaterialet er kommet bort. Fra 1892 ble arkivene avlevert puljevis fra sorenskriverne i Troms til Statsarkivet i Trondheim. Første avlevering på 25 protokoller ble mottatt fra Sorenskriveren i Tromsø 18.2.1892. I 1896 kom 17 protokoller, de fleste fra tida før 1855. Det var nye avleveringer i 1910 og 1911. I 1924 kom 28 kasser arkivsaker, nå fra Malangen sorenskriveri, som enda hadde arkivsaker fra 1700-tallet. Fra samme sorenskriveri kom en avlevering i 1951, men denne inneholdt ikke arkivmateriale fra Senja og Tromsø sorenskriveri.