Limonen og dets oksidasjonsprodukter virker irriterende på hud og åndedrettsorganer. Ved hudeksponering over lang tid kan det fremkalles appelsinallergi. Limonen er brennbart med et lavt flammepunkt (50 grader) men er ikke eksplosjonsfarlig. Limonen er biologisk nedbrytbart, men bør likevel behandles som spesialavfall på grunn av brennbarheten.