Maleku har et forholdsvis enkelt fonemsystem. Verbalsystemet er ergativt, og verba bøyes i modus og ikke tempus. Substantiva markeres for flertall, men ikke for bestemthet, og de bøyes ikke i kasus. Språket har ingen fast konstituentrekkefølge, men den mest frekvente rekkefølga er subjekt–objekt–verbal.