Det er gjennomført få kliniske studier på metoden. I 2018 ble det publisert en studie som konkluderte med at LP var en effektiv behandling for ME-pasienter, men året etter ble det publisert en korreksjon til studien. Kritikere har hevdet at studien ikke holder et tilfredsstillende vitenskapelig nivå og at den burde ha vært trukket tilbake. NAFKAM sin rapport fra 2015 viser at 39 % hadde negativt forløp, uavhengig av diagnosekriterier. En planlagt norsk studie har også vært gjenstand for påstander om metodiske svakheter. Tilhengere mener at et flertall av pasientene blir friske eller mye bedre av sine tilstander eller sykdommer, og det hevdes at de som ikke blir friske ikke er «rustet til å ta ansvar for egen helse.». Kritikere peker på at det foreligger lite uavhengig forskning på at kurset har effekt, og at flere pasienter har fått sin tilstand forverret på lengre sikt og tilskrevet dette Lightning Process. I en spørreundersøkelse av 1096 ME pasienter gjennomført av den Norske ME foreningen, rapporterte 49% at de ble dårligere eller mye dårligere av kurset mot 21% som rapportere å ha blitt bedre eller mye bedre. Kurset koster rundt 21 000 NOK i Norge, og siden metoden er varemerkebeskyttet, må terapeuter videreformidle en andel av kursavgiften til Phil Parker.