Samtidig blir Dirk Pitt, sammen med hans beste venn Al Giordino, i all hast fløyet til et forskningsfartøy utenfor kysten av Nigeria. De blir informert av sjefen deres, admiral James Sandecker, om en alge-oppblomstring, som vokser unaturlig raskt. Disse algene truer med å tære opp verdens oksygen-tilførsel og slukke nesten alt liv på jorden. Hastigheten som algene vokser i, mistenkes å være drevet av en eller annen type økologisk forurensning. Dirk, Al og Rudi Gunn blir beordret til å reise oppover Niger-elven for å undersøke forurensningen videre, og finne ut hvordan dette kommer inn i elven. De gjør dette om bord på Calliope, en super-yacht, utstyrt med omfattende vitenskapelige laboratorier, en rekke våpensystemer, og forskjellig utstyr til kommunikasjon. De identifiserer etter hvert forurensningen, og finner til slutt området hvor den dukker opp i elven. Men det eksisterer ingen kjemiske anlegg i nærheten, og de finner ingen andre tegn til at noe kommer inn i elven.