Pr 2017 består Hiddensee primært av de tre byene Kloster (på øyas nordside), Vitte (som ligger midt på øya) og Neuendorf (i sør). Det går ferge til øya, både fra Schaprode på Rügen, og fra Stralsund på det tyske fastlandet. Privatbilisme er ikke tillatt på Hiddensee, og derfor er det svært få biler på øya.