Versjon 1.0 fløy fem ganger fra juni 2010 til mars 2013, versjon 1.1 fløy femten ganger fra september 2013 til januar 2016, og den nåværende Full Thrust-versjonen har vært i tjeneste siden desember 2015. Derivatet Falcon Heavy er en større rakett som tar utgangspunkt i å sette sammen tre førstesteg av Falcon 9 for å øke maksimallasten. Den har en debut i 2018. SpaceX har til hensikt å sertifisere Falcon 9 til å være tilpasset mennesker for transport av NASA-astronauter til ISS som en del av Commercial Crew Development-programmet. I oktober 2016 annonserte SpaceX administrerende direktør Elon Musk en kommende «siste oppgradering» kalt Falcon 9 Block 5, som vil øke motorens skyvekraft ytterligere og dessuten inneholde oppgraderte landingsben sammen med mindre forbedringer for å hjelpe gjenvinning og gjenbruk av raketten.