Flöha var kretshovedstad i Kreis Flöha fra 1952 til 1990, og i Landkreis Flöha fra 1990 til 1994. Fra 1. august 1994 frem til 1. august 2008 var byen innlemmet i Landkreis Freiberg, og siden 1. august 2008 har byen vært en del av Landkreis Mittelsachsen.