Fordrevet av urolighetene i området, ble han tvunget til å flykte fra sitt bispedømme, sammen med de fortsatt gjenværende misjonærene. Etter at forfølgelsene hadde roet seg, ble han sendt av safavidenes Shah Hosein i 1699 som dennes ambassadør til Europa med det oppdrag å bevege de kristne fyrster der til å danne en allianse mot tyrkerne. Da han var på vei tilbake fra dette vanskelige oppdraget, døde han den 3. november 1708 i Bahia (i Brasil), under hellighets ry.