Obi-Wan møter også Jar Jar Binks, som bor i eksil fra Gungan-byen Otoh Gunga. Etter å ha reist til Otoh Gunga blir Jar-Jar arrestert og fengslet, så Obi-Wan må navigere seg gjennom byen for å redde ham. Qui-Gon møter også Anakin Skywalker som barn, og må inngå en avtale med den kriminelle Jabba the Hutt - hvor Qui-Gon må drepe et av Jabbas beist i bytte mot en sum penger. Deretter blir Qui-Gon angrepet av en mystisk Sith-kriger: Darth Maul.