Da ville keiseren at paven skulle abdisere (som hans forgjenger Konstans II hadde gjort med pave Martin I som endte sine dager i Chersonesus på Krim), men det romerske folk og det italienske militæret fra eksarkatet Ravenna nektet å la keiserens utsendte magistrianus ta Sergius og bringe ham med seg til Konstantinopel. Folket beskyttet således paven, og Justinian selv ble avsatt ikke lenge etter (695).