Portens lokalisering er bestemt av byens topografi. Den står på det punkt hvor dalen som følger Jaffaveien møter bymuren på den øvre enden av en tverrgående dal, som halverer Gamlebyen i en grovt sett vest-øst-retning, mellom den nordvestlige ryggen og den sørlige åsen som er kjent som Sionfjellet. I 2010 fullførte de israelske oldtidsmyndighetene (Israel Antiquities Authority, IAA) en restaurering og rengjøring av Jaffaporten i løpet av 2 måneder. Det var en del av prosjekt på 4 millioner dollar som begynte i 2007 for renovere Gamlebyens bymurer. Oppussing inkluderte å erstatte brukne og ødelagte steiner, rense murene fra resultatet av tiår med bileksos, og sette inn igjen en detaljert arabisk inskripsjon som ble reist ved portens opprinnelige dedikasjon i 1593. Fragmenter fra kulehull fra kampene under den arabisk-israelske krig 1948 ble bevart av historiske grunner. Arbeidet på infrastrukturen på innsiden av Jaffaporten avdekket også en antikk akvedukt fra 100- eller 200-tallet e.Kr.