Eckhoff utmerket seg også som kirkearkitekt og har tegnet Ask kirke, Fjæra kapell, Skånevik kirke, Bjoa kirke, Sandeid kirke, Eksingedalen kirke, ‎Nesheim kirke, ‎ Varhaug kirke, ‎Bore kirke,‎ Haukedalen kirke og Sandnes kirke.