Værnes var tidligere det definitive maktsentrum i Stjørdalen og omegn, allerede i førkristen tid før år 1000. Snorre Sturlason skrev at det var høvdingen på Værnes, Torberg, som ledet blotingen i fylket sitt, Stjordølafylke. Værnes mistet mye av sin makt da Harald Hårfagre satte Håkon Ladejarl til å styre over hele Trøndelag, men skatt i form av landskyld (varer) gikk antageligvis fortsatt via Værnes før det gikk til Lade. Værnes kirke er fortsatt hovedkirke i Stjørdal (tidligere Værnes) sogn i Stjørdal prosti i Nidaros bispedømme. Værnes gård ble kjøpt av staten i 1887 og konvertert til en militærforlegning, Værnes garnison.