Gjennom hele livet hadde han et problematisk forhold til det greske kongehus som han var en del av. Hans ekteskap med Irene tilspisset situasjonen ytterligere. Derfor ble han ikke gravlagt sammen med kongefamilien fra Hellas. I stedet ble han gravlagt i Danmark, i Gentofte. Han døde i 1980 i London av en hjerneblødning. Fra sin fødsel til grunnlovsendringen i 1953 hadde prins Peter arverett til den danske trone. Han og prinsesse Irene fikk ingen efterkommere.