I 2004 ble institusjonen overtatt av Staten. Fire år senere ble driften lagt om. Nyli Gård gikk fra å være et barnehjem til å bli en ungdomsavdeling. I 2013 ble hovedbygningen fredet av Riksantikvaren, for å bevare anlegget som et eksempel på en barnehjemsbygning fra første halvdel av 1900-tallet.