I 1960, den første sesongen for American Football League, deltok Patriots i flere kamper og hendelser som var det første av sitt slag. Den første sesongoppkjøringskampen i AFL ble spilt på bortebane mot Buffalo Bills på lørdag 30. juli, hvor Boston vant. De spilte på hjemmebane i den første seriekampen, en fredagskveld hvor de tapte 13–10 mot Denver Broncos i Boston University Field den 9. september. Patriots startet sesongen 2–2 før de tapte tre strake og vant tre strake, men avsluttet sesongen med fire nederlag på rad. Med et sesongresultat på 5–9 endte de på sisteplass i AFLs Eastern Division, med nest dårligst resultat blant de åtte lagene i ligaen, kun foran Denver.