McCartney og hans kjæreste Jane Asher var i Rishikesh, India i perioden 20. februar – 25. mars 1968 hvor han studerte transcendental meditasjon sammen med de øvrige medlemmene i The Beatles samt andre venner/bekjente. Mens de var der, ga Maharishi Yogi en leksjon om hvordan menneske og naturen forenes sammen. Dette avfødte to komposisjoner; «Child of Nature» fra John Lennon og «Mother Nature's Son» fra McCartney. McCartney fikk idéen for sin sang i India, men skrev mesteparten av den senere på våren mens han besøkte sin far i Liverpool. Noe av inspirajonen fikk han fra sangen «Nature's Boy» med Nat King Cole fra 1947. Han fikk muligens også litt hjelp fra Lennon til å skrive den ferdig.