I 1852 ble Kjerulf ansatt som kopist i Justisdepartementet, hvor han samme år ble byråsjef for første sivilkontor og i 1860 ekspedisjonssekretær. Fra 1858 til 1859 var han en periode konstituert amtmann i Kristians amt (dagens Oppland). I 1876 ble han utnevnt til justitiarius i Kristiania stiftsoverrett. Han beholdt denne stillingen til sin død.