I 1967 oppdages et virus kalt "Motaba" som forårsaker dødelig feber, i den afrikanske jungelen. Amerikanske myndigheter ønsker å holde viruset hemmelig, og offiser Donald McClintock og William Ford ødelegger hele området der flere amerikanske soldater ble smittet. 28 år senere blir oberst Sam Daniels, en virolog fra U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases, sendt for å undersøke et virus-utbrudd i Zaire. Daniels og hans mannskap, oberstløytnant Casey Schuler (spilt av Kevin Spacey) og Major Salt (spilt av Cuba Gooding Jr.) skal samle informasjon før de reiser tilbake til USA. Offiser Wlliam Ford, nå brigadiergeneral og Daniels overordnede offiser, avviser Daniels sin bekymring for at viruset kommer til å spre seg.