Mostar er kjent som en turistby, men den viktigste næringsvirksomheten er aluminium- og metallindustri. Den største utfordringen til Mostar er som resten av landet, høy arbeidsledighet og korrupsjon. Med arbeidsledighet på 30% i landet er det kun Kosovo som har lavere BNP. Det er likevell en viss usikkerhet rundt tallene da det er høy andel korrupsjon og svart økonomi.