Under den franske revolusjon ble han satt i fengsel i 1792 fordi han nektet å støtte sivilkonstitusjonen for kleresiet. Han klarte å rømme, og kom seg til England senere samme år. Der var han sjelesørger blant franske flyktninger til 1796. I 1796 reiste han til Boston i USA, og var frem til 1808 misjonær blant Penobscot-indianere og andre i delstaten Maine. I 1808 ble han utnevnt til Bostons første biskop, og var i årene 1810–1815 samtidig apostolisk administrator av det katolske bispedømmet New York.