Spillet begynner med en snakkende Pikachu, som påstår å være en flink detektiv. En dag møter Pikachu en ung gutt som heter Tim Goodman, som er i stand til å forstå hva Pikachu forsøker å si. De forsøker straks å finne igjen et stjålet kjede fra en tyv som heter Aipom.