Da han kom tilbake til hjemlandet, ble Aerath superior for Bethany Ashram og rektor for Order of the Discipline of Christs presteseminar i Pune. Han var også professor og dekan ved Instituttet for pastoral- og moralteologi ved Jnana Deepa Vidhyapeeth i Pune. Aerath underviste også som gjesteprofessor ved Malankara Major Seminary.