Den 1. november 2007 ble han ansatt som hovedtrener i tippeligaklubben Bodø/Glimt. Klubben varslet 26. mai 2011 at samarbeidet var avsluttet, etter en skuffende sesongstart i Adeccoligaen. Han var fra juli 2012 til juli 2014 assistenttrener i . 21. juli 2014 ble han midlertidig hovedtrener for Rosenborg ut sesongen 2014. 20. november 2014 ble han permanent trener, med en treårskontrakt tilbudt av RBK-styret, og i juli 2016 forlenget de kontrakten til å vare frem til 2020.