Edén ble født som sønn av rektor Per Olof Edén (1830–1903) og Matilda Kristina Clausén (1838–1921). Slekten Edén er kjent fra 1600-tallet, med dens stamfar, den lutherske sognepresten i Njurunda socken, Jöns Svenonis Edenius (1597–1687). Edén giftet seg i 1904 med Marja Wallmark.