Bauhaus i Dessau ble stengt i 1932 under press fra nazipartiet og flyttet kort tid til Berlin, og stengte permanent et år senere i august 1933. Albers, som var jødisk, flyttet sammen med mannen sin og Bauhaus til Berlin, men flyktet deretter til North Carolina, hvor paret ble invitert av Philip Johnson til å undervise ved det eksperimentelle Black Mountain College. Albers fungerte som assisterende professor i kunst. Skolen var fokusert på "learning by doing" eller "hands-on læring." På begynnelsen av 1940-tallet da Albers flyttet klasserom og vevene ennå ikke var satt opp, lot hun elevene gå ut og finne sitt eget vevmateriale. Dette var en grunnleggende øvelse om materiale og struktur. Albers eksperimenterte jevnlig med forskjellig materiale i arbeidet sitt, og dette tillot elevene å forestille seg hvordan det kunne ha vært for de gamle veverne. Anni og Josef Albers underviste begge ved Black Mountain til 1949. I løpet av disse årene ble Albers sitt designarbeid, inkludert veving, vist over hele USA. Hun fikk sitt amerikanske statsborgerskap i 1937. I 1940 og 1941 kuraterte Albers en vandreutstilling om smykker med en av Black Mountain-studentene, Alex Reed, som åpnet i Willard Gallery i New York City.