Han ble innmeldt i Nasjonal Samling i januar 1942, men var aldri aktiv i partiet. Under krigen opprettet Smedal sammen med Adolf Hoel , som skulle fortsette arbeidet med å sikre Norges interesser i arktiske områder. Som NS-medlem ble Smedal tilbudt flere maktposisjoner, bl.a. stillinger som høyesterettsjustitiarius, dommer i høyesterett og professorater. Han avslo alle tilbudene, men mottok et æresprofessorat ved Universitetet i Oslo i 1943.