Etter sin emeritering gikk han tilbake til vanlig prestelig tjeneste, og ble kapellan ved det hospits for terminalt syke. Han sa at denne tiden var hans mest personlig meningsfulle og tilfredsstillende for ham som prest. Biskop Daly skrev to memoarer, (2000) og (2011). I sin andre bok funderte han om prestenes sølibat var nødvendig.