Etter avslutningen av andre verdenskrig ble Lemnitzer tildelt ansvaret for en komité tilhørende Joint Chiefs of Staff, og han ble senere utnevnt til kommandant i den amerikanske National War College. I 1950, i en alder av 51 år, gjennomførte Lemnitzer fallskjermtrening og ble deretter gitt kommandoen over 11th Airborne Division. Lemnitzer ble tildelt kommandoen over den syvende infanteridivisjon i november 1951 og han ble forfremmet til generalløytnant i august 1952. Lemnitzer ble forfremmet til general få år senere.