Under andre verdenskrig fortsatte Butler å operere i et begrenset omfang, og også produsere materiell til den australske krigsinnsatsen på en kostnadseffektiv måte. På slutten av krigen ble Butler Air Transport Ltd. registrert som et aksjeselskap. Det ble det mest vellykkede flyselskap i New South Wales, operererte tre DC-3, Avro Anson, de Havilland Herom og tre Airspeed Ambassador høyre|miniatyr|Vickers Viscount fra Butler Air Transport på Blackbushe Airport i 1956 kort tid før levering til Australia Butler oppfordret sine ansatte til eierskap i selskapet, og i 1947 eide de 51 prosent.