I rettsalen ble han konfrontert med tyske kontakter han hadde hatt under den illegale trafikken. Maier ble dømt til døden for høyforræderi, ved halshugging. Han reddet imidlertid livet ved at Hitler ga allmenn amnesti til alle dødsdømte sudettyskere, som en gest til «nye landsmenn». Han endte opp i konsentrasjonsleiren Sachsenhausen, som politisk fange.