I februar 2013 ble den første arrestasjonen som kan knyttes direkte til nettstedet gjennomført. En australsk kokain- og MDMA-selger ble tatt da myndighetene beslagla narkotika han hadde importert gjennom posten. Etter å ha undersøkt datamaskinen hans fant de brukernavnet hans på Silk Road og dermed tilknytningen til nettsiden. Australsk politi og det amerikanske DEA har hatt fokus på nettstedet, og gjennomført flere arrestasjoner, men har hatt problemer med å få fellende dommer i sakene.