Den siste abbed av klosteret var kardinal David Beaton, som i 1522 etterfulgte sin onkel James for å bli erkebiskop av St Andrews. Klosteret ble fraflyttet etter reformasjonen, og forfalt deretter i ruiner. Fra 1590 og framover ble det tatt steiner fra klosterbygninger som ble benyttet som byggematerialer for hus i Arbroath. Det fortsatte helt fram til 1815 da det ble besluttet at de gjenværende ruinene skulle bevares.