De første studentene ble immatrikulert i 1874 det året Gunderson tiltrådte. Gunnerson hadde ansvaret for kirkehistorie, Sverdrup for Det gamle testamente, og Oftedal for det nye. Etter en del stridigheter ble det brudd i 1883 og Gundersen meldte overgang til Hauges Synodes Theologiske Seminar, som var etablert 1876 i Red Wing i Minnesota. Der ble han i ett år, før han returnerte til Norge sommeren 1884.