Big Boss er kjent som den beste soldaten som noensinne har levd, og før han fikk tittelen «Big Boss» gikk han under kodenavnet «Naked Snake». Han blir ikke en av seriens protanogister før Metal Gear Solid 3: Snake Eater, men har vært en antagonist og/eller hatt en fremtredende innflytelse på andre antagonister i alle spillene.