Plant pattedyr finnes rødrev, kanin, og myotis (flaggermus). De best kjente er berberaper som har gjort naturreservatet sitt hjem. Gibraltar har introdusert på nytt disse haleløse apene, den eneste ville apearten i Europa. Det er funnet fossiler av berberaper i Europa, men DNA-analyser viser at disse stammer fra Marokko og Algerie, således ikke de siste overlevende av de europeiske apene. Berberapene på Gibraltar kan finnes ved Ape's Den nær den midtre taubanen, ved toppen, og nærheten av beleiringstunnelene på nordsiden. Per 2012 var det mellom 200 og 250 berberaper, og alle av dem levde innenfor naturreservatet. Det er forbudt å mate dem, men det blir ikke alltid etterfulgt. Som et resultat har en del av dem blitt aggressive og avhengig av mat fra mennesker. I 2008 måtte myndighetene beordre en gruppe berberaper bli avlivet etter at de hadde begynt å herje i søppelet i byens sentrum.