Midna tilhører et folkeslag som nedstammer fra en gruppe overløpere som i fortiden forsøkte å ta kontroll over Sacred Realm en parallellverden til Hyrule hvor det mektige Triforce-symbolet befant seg. De tre gudinnene, som skapte Hyrule og Triforcen straffet dem ved å forvise dem inn i en tussmørk parallelldimensjon kjent som Twilight Realm fordi det alltid var innhyllet i skumringsmørke. De splittet også opp den mørke kraften de hadde klart å mestre til sin vilje og som de ville bruke til å oppnå sitt mål. Denne kraften ble kjent som Fused Shadows og ble en forbudt kraft.