Wellesley hadde ansvaret for å opprette en felles britisk-indisk ekspedisjonsstyrke i Trincomalee øst i dagens Sri Lanka tidlig i 1801 for å erobre Batavia (dagens Jakarta) og Mauritius fra Frankrike. Rett før de var klare til å reise, kom det imidlertid ordre fra Storbritannia om at de isteden skulle reise til Egypt for å samarbeide med Ralph Abercromby for å forvise franskmennene fra Egypt. Wellesley hadde blitt utnevnt som andrekommanderende med Baird, men grunnet dårlig helse fulgte han ikke ekspedisjonen den 9. april 1801. Det viste seg å være heldig for Wellesley da det skipet han skulle ha reist med gikk ned i Rødehavet med alle ombord.