Zell tok over presteembetet i Strasbourg, et ettertraktet embete, i 1518, da han var 41 år gammel. Han lot seg raskt inspirere av Martin Luthers lære om reform av kirken. I 1521 var Zell selv protestantisk. Zell ble selv svært populær blant menigheten i Strasbourg. Zell spilte en viktig rolle i å inspirere Martin Bucer.