Misjonsstasjonen ble hovedkvarteret for misjonsstasjonene i Alta California under ledelse av den hellige Junípero Serra og også sete for hans etterfølger, , pater Fermin Francisco de Lasuen. Misjonsstasjones bygninger forfalt på midten av 1800-tallet, etter den meksikanske loven om sekularisering av samfunnet av 1833, men ble fra 1884 restaurert og istandsatt. Kirkebygningen fungerer i dag som en sognekirkene for den lokale katolske menigheten.