Watt var igjen klar for sesongåpningen, denne gangen mot New England Patriots. Etter å ha gått uten en sack i sesongens to første uker, fikk han tre sacks og åtte taklinger i uke 3, da Texans tapte 27–22 mot New York Giants, hans første sacks siden uke 2 i 2016. Han fulgte det opp med to sacks uken derpå, i en OT-seier mot Indianapolis Colts. Han ble utpekt til AFC Defensive Player of the Month for september etter fem sacks, 30 taklinger og fire fumbles forårsaket. I uke 12 hadde Watt ni takling, 1,5 sacks og en fumble forårsaket i en 34–17 seier over Tennessee Titans, som vant ham tittelen som AFC Defensive Player of the Week. Etter å kun ha hatt 1,5 sacks i sine to forrige sesonger, avsluttet Watt 2018-sesongen med 16 sacks, nummer to i ligaen bak Aaron Donald, og ble utvalgt til All-Pro førstelag for femte gang i sin karriere. Watt ble den andre spilleren til å ha fire sesonger med minst 15 sacks siden ligaen begynte å registrere statistikken i 1982 (Reggie White hadde fem sesonger).