Hubert Luthe var den eldste av åtte barn til boktrykkeren Hermann Luthe og hans hustru Amalie, født Hasert. Fra 1936 til 1946 gikk han på Dreikönigsgymnasium i Köln. Under andre verdenskrig var han luftvernartellerihjelper fra 1943 til 1945, og deretter krigsfange i Danmark. Etter å ha studert katolsk teologi og filosofi i Bonn og München fra 1946 til 1953, gikk han på erkebispedømmet Kölns presteseminar i Bensberg.