I 638 ble han på den tredje dag etter pave Honorius I' død valgt til pave. De pavelige (utsendinger) som skulle innhente approbasjon av pavevalgte i Konstantinopel fra keiser Herakleios, ble først avvist der. Ettersom Severinus vegret seg mot å undertegne keiserens monoteletiske trosformel . mini|left|160px|Solidus med Herakleios (t.v.) og Konstantin III. Bakgrunnen for denne trosformel var en viktig utvikling i den teologiske strid som da raste. Før sin død hadde patriarken av Konstantinopel, Sergius I utformet dette som respons til et ortodoks synodisk brev fra Sofronius, den greske patriark av Jerusalem.