Kongsvikelva er relativt klar, og noe stri. Vannføringa varierer sterkt, og flommene kan være sterke. Den har få store kulper og blokkmateriale hvor fisken kan stå i kritiske perioder. Bunnsubstratet er brukbart i en del områder, men det er noe sand mellom steinene, og en relativ sparsom begroing tyder på en noe urolig botn.