I dag lever balihunden fritt på Bali, der den formerer seg uten menneskelig påvirkning. Forskere anslo at det fantes balihunder på på øya i perioden 2005–2008, og et overveiende flertall av dem levde under svært vanskelige forhold. En rabiesepidemi raderte imidlertid ut svært mange hunder, så i 2018 regnet man med at bestanden talte omkring individer. I så måte har organisasjonen , som har sitt hovedkvarter i Australia, igangsatt et betydelig arbeid med å hjelpe de to hundetypene på Bali.