Hovedformålet med Det 12. Direktoratets eksistens er å på en sikker måte skille "sluttbrukere " av atomvåpen fra deres faktiske atomvåpen i fredstid. Bare i tilfelle av reell nødvendighet vil de som skal ha atomvåpen få dem, og det kan bare skje når det autorisert av det øverste politiske lederskapet. For tiden er det bare noen få kjernefysiske stridshoder som alltid utstedes til sluttbrukere, eksempelvis stridshoder knyttet til ballistiske missiler innen De strategiske rakettstyrker, men det meste av det russiske atomvåpenarsenalet blir sikkert holdt av 12.Hoveddirektoratets enheter og kan bare utstedes til andre i nødstilfeller..