Hawksmoor kom til London 1679 eller 1680 og ble assistent for Christopher Wren. Omkrimg 1684 ble han Wrens personlige sekretær, og arbeidet på en rekke av Wrens prosjekter i og omkring London, bl.a. St. Paul's Cathedral, flere av kirkene i City som var ødelagt av brannen 1666, Chelsea Hospital, Greenwich Hospital og Hampton Court Palace.