Alle medlemmer av "Big Five" (løve, leopard, elefant, bøffel, neshorn) finnes her hele året. Antallet neshorn var ganske mange fram til 1960, men den ble kraftig redusert av krypskyting på 1970 og begynnelsen av 1980-tallet, og falt til et lavt nivå på 15 individer. Antall har økt sakte, men antallet var fortsatt bare på anslagsvis 23 i 1999. Masai Mara er det eneste reservatet i Kenya med en neshornpopulasjon. miniatyr|Masaiene Flodhest og krokodiller finnes i store grupper i elvene Mara og Talek. Også hyener, gepard, sjakaler, servaler og ørehund kan du finne i reservatet.