Derksen er født i Nijmegen og begynte å spille golf 14 år gammel da det ble anlagt en ny golfbane i nabolaget. Han vant det nederlandske amatørmesterskapet fire år på rad fra 1993–1996 og ble profesjonell i 1996. Han ble medlem av Europatouren for første gang i 1998-sesongen, men har ikke alltid vært i stand til å beholde spilleretten, og har derfor vært nødt til å spille noen sesonger på Challenge-touren. Han har imidlertid to turneringsseire på Europatouren: Dubai Desert Classic i 2003, da han den siste dagen tok igjen forspranget på tre slag som Ernie Els fra Sør-Afrika (verdens nest beste golfspiller) hadde. Premiesummen var på 280.000 euro. Madeira Island Open i 2005.