Universitetet i Buffalo ble opprinnelig etablert i 1846 som et privat universitet med medisinsk fakultet, og det ble i 1962 ble fusjonert med State University of New York. I dag er Universitetet i Buffalo (State University of New York at Buffalo) med sine studenter (2008) og forskningsmidler på dollar (2007) selve flaggskipet i det delstatlige universitetssystemet i New York. Byen Buffalo huser også andre private og offentlige universiteter og høyskoler, blant annet Canisius College og SUNY Buffalo State College.