Rundt 1904 ble universitetets struktur vesentlig endret. Da ble det filosofiske fakultetet delt i to adskilte fakulteter: et for filosofi og et for vitenskap, sistnevnte besto av avdelingene for fysikk og matematikk og skolen for farmasi. I 1919 ble det også opprettet en avdeling for kjemifaget, og i 1922 ble skolen for farmasi omgjort til en avdeling. Ytterligere en endring kom da skolen for tannlegevitenskap ble innordnet under det medisinske fakultetet.