Den 25. mars 1995 ble han utnevnt til apostolisk nuntius til Egypt og permanent observatør ved Den arabiske liga. Fra sine diplomatiske erfaring i Egypt, erindret han i ettertid han at en gang, mens han gikk nedover en gate, opplevde at en en gruppe barn kastet steiner på ham og kalte ham «vantro hund» fordi han var kristen. Menat han forsto at kirkens oppdrag i Egypt, til tross for den alvorlige trussel fra islamske fundamentalister, var at dens få medlemmer ved den måte de lever, elsker og vitner om Kristus og de katolske Kirkes sannheter.