Dukketeaterets leder var fra starten av Else Isaksen, som også var leder for Ålesund Teaterforening i perioden 1976-1978. Med årene tok hennes datter Karoline Isaksen over som leder av dukketeateret. Ålesund Dukketeater var medlem av Norsk Dukketeaterforening, som senere skiftet navn til UNIMA Norge.