Den 28. juni 2018 signerte Rooney en 3,5 år avtale med D.C. United i Major League Soccer i USA, der han fikk trøye nummer 9. Han ble utnevnt til lagkaptein etter tre kamper, og 28. juli scoret han sitt første mål for klubben. Han ble utnevnt til «MLS Player of the Month» for oktober 2018, og på slutten av sesongen ble han kåret til klubbens MVP (mest verdifulle spiller), og vinner av «golden boot», etter at han hadde scoret 12 mål på 21 kamper. D.C. united endte på niendeplass totalt i Major League Soccer 2018.