Han studerte matematikk, fysikk, kjemi og astronomi ved Københavns Universitet i noen år, men tok aldri eksamen. Han underviste ved Tórshavns realskole og lærerseminar fra 1914 til 1919. I 1919 fikk han i oppdrag av Lagtinget å organisere Færøyenes bibliotekvesen. Jacobsen var bibliotekar ved Færø Amts Bibliotek fra 1921 og frem til sin død. Fra 1928 var han også styreformann i Færøernes Museumsforening og direktør ved Færøernes Museum.