Det welserske handelshus ble etterhvert delt i et handelshus i Nürnberg og et i Augsburg. Handelshuset i Nürnberg ble avviklet i 1610. Handelshuset i Augsburg ble insolvent i 1614. Handelshuset hadde store utestående lån hos Spania, Frankrike og Nederlandene. Gjennom statsbankerotter drev disse tre skyldnerne handelshuset Welser ut i ruin. Welserfamilien i århundrene som fulgte var likevel velstående, om enn ikke eventyrlig rike som på 1500-tallet, og eide og bygget en rekke slott. Bartholomeus V. Welser ble opptatt i den tysk-romerske riksadelen i 1532 og flere andre familiegrener har mottatt adelskap og adelstitler. Hovedlinjen av slekten, Augsburg-linjen, døde ut i mannslinjen i 1797, Nürnberg-grenen døde ut i 1878, og i dag eksisterer bare den yngre Ulm-grenen, som ble utnevnt til riksfriherrer i 1713. Welsersche Familienstiftung, grunnlagt 1. april 1539, eksisterer fortsatt og har eid og eier en rekke slott i Tyskland. Etter at de eldre familiegrenene døde ut ble Ulm-grenen administratorer for familiestiftelsen.