I avslutningen av tredje sesong, , blir Picard assimilert av Borg og skal fungere som en bro mellom menneskeheten og Borg (under navnet Locutus of Borg). Picards assimilasjon og påfølgende gjenoppretting er et viktig punkt i karakterens utvikling, og danner bakgrunn for filmen og oppfølgerserien . Det har også betydning for utviklingen av Benjamin Sisko, hovedpersonen i i seriens første episode «Emissary». Stewart ba Roddenberry om å holde Picard som en Borg i noen episoder utover avslutningen av tredje sesong, da han mente det ville være mer interessant enn å bare gjenopprette ham i del to. Senere blir det avslørt i at deler av Borg maskineriet ble fjernet fra Picard, men at han fortsatt har traumatiske minner og vedvarende nevrologiske ettervirkninger fra assimilasjonen (som blir et avgjørende plottpunkt i ). En annen ettervirkning er den (fiktive) isselappsykdommen Irumodisk syndrom, som i tredje sesong av viser seg å skyldes Borg kollektivets endringer i Picards genmateriale.