En første kirke ble bygget på dette stedet i år 425. Senere ble den erstattet med en ny kirke av korsfarerne på 1100-tallet. Den ble restaurert i 1856. Den har arkitektoniske og strukturelle likheter med den gamle St. Johannes døperens katedral (som ble omgjort til Den store moské i Gaza kort etter den muslimske erobring).