I mellomtiden begynner en terror-gruppe kalt KVA, ledet av en teknofobisk mann ved navn Joseph «Hades» Chkheidze, å iscenesette en rekke terror-angrep. Atlas blir sendt for å stoppe terroristene. Mitchell, sammen med Gideon, Joker og en rekke andre Atlas-soldater redder den nigerianske statsministeren og kidnapper en KVA-teknolog i Lagos, Nigeria under et toppmøte om teknologi. Innen 2055 har imidlertid KVAs angrep blitt langt mer sofistikerte, og Mitchell og teamet hans klarer ikke å forhindre KVA fra å tvinge frem en atomreaktor-nedsmelting på Bainbridge Island i Washington.