Hankes foreldre, læreren Franz Hanke og hans hustru Elisabeth, levde før tyskerne ble fordrevet fra Tsjekkoslovakia i Landkreis Troppau i Sudetenland. Med sine fem barn kom de i 1946 til Mittelfranken, der Franz (den senere Gregor Maria) ble født som yngstemann. To av hans brødre ble prester, de andre søsknene ble gift.