Pater Guido Alfanis etterlatte papirer omfatter hans korrespondanse og hans personlige vitenskapelige notater. Denne dokumentasjonen oppbevares i det historiske arkivet for den toskanske provinsen av piaristenes orden, og befinner seg på Ximeniano-observatoriet (opprettet blant annet av ham selv) og holdes atskilt fra observatoriets offisielle korrespondanse.