Byens navn stammer fra det arabiske ordet (فسطاط), som betyr et større telt eller paviljong. Ifølge tradisjonen ble beliggenheten til Fustat bestemt ved hjelp av en fugl: En due la et egg i teltet til den muslimske erobreren Amr ibn al-Ass, akkurat da han skulle marsjere mot Alexandria. På det tidspunktet befant leiren hans seg like nord for det gamle romerske festet Babylon. Amr hevdet at egget var hellig, og teltet ble stående urørt da troppene ga seg av sted til fronten. Etter at de vendte tilbake fra kampen som seierherrer, ga Amr soldatene sine ordre om å sette opp teltene sine ved siden av hans eget, og han ga sin nye hovedstad navnet Miṣr al-Fusṭāṭ, eller Fusṭāṭ Miṣr, ofte oversatt til «Teltets by», selv om dette ikke er en ordrett oversettelse. Ordet Miṣr var det gammel-semittiske navnet på Egypt, men på arabisk kan det også bety «stor by» (eller, som verb, «å sivilisere»), så navnet Miṣr al-Fusṭāṭ kan bety «teltets store by». Fusṭāṭ Miṣr skulle da bety «Egypts paviljong». Den dag i dag kaller egypterne byen Kairo for Miṣr eller Maṣr, selv om dette strengt tatt er navnet på hela landet Egypt. Landets første islamske moské, Amr-moskeen, ble senere bygget på samme sted som lederens telt, i år 642.