Etternavn forekommer med varierende hyppighet i ulike regioner; som for eksempel, navnene Chinen (), Higa og Shimabukuro er vanlige på Okinawa, men ikke i andre deler av Japan. Dette er i hovedsak på grunn av forskjeller mellom språket og kulturen til Yamatofolket og Okinawaene. Mange japanske slektsnavn kommer fra trekk ved landskapet, som for eksempel, Ishikawa som betyr «steinelv», Yamamoto som betyr «foten av fjellet» og Inoue som betyr «ovenfor brønnen».