Under hans opphold i USA ble Bedini forfulgt av itaienske patrioter under ledelse av den tidligere prest Alessandro Gavazzi, på grunn av hans angivelige medvirkning til henrettelsen av Ugo Bassi. De organiserte offentlige protester mot Bedini. Etter en voldelig protestaksjon i Cincinnati ble anførerne arrestert og utvist fra USA. Resten av tiden i USA kunne Bedini virke virke i relativ ro og fred.