For å få slutt på striden ga biskopen ordre om at søstrene skulle forlate klosteret og returnere for å bo med familiene sine. Katarina forlot motvillig søsterfellesskapet. Noen dager senere kom hun tilbake til klosteret sammen med fem andre kvinner. I 1431 grunnla hun et klarissekloster der, og i 1456 et annet i Bologna, som hun ledet til slutten av sitt liv.