Deretter ble han dømt til fem års fengsel av de kommunistiske herskerne i Sovjetunionen i 1947 og ført til en sovjetisk arbeidsleir ved Arkhangelsk der han ble satt til skogsarbeid. I leiren fortsdatte han å virke som prest så langt det rakk, og klarte av og til å feire den guddommelige liturgi med noen få brødsmuler og vindråper.