På 1600-tallet ble den gamle kirken ødelagt i en storm. En del av kirkegården skal ha blitt skylt på havet, men kistene ble berget i Hvannasund og på nytt begravd på Viðareiði. Dagens Viðareiðis kirkja stammer fra 1892. Til den hører prestegården Ónagerði, som er av stor historisk betydning og vesentlig eldre enn dagens kirke. Ónagerði ble prestegård for hele prestegjeldet på Norðoyar i 1661. Kirkesølvet ble gitt i gave av den britiske regjeringen som takk til bygdefolket, etter at de reddet deler av mannskapet da briggen «Marwood» forliste øst for Viðareiði under en vinterstorm i 1847.