Den største byen er hovedstaden Kigali sentralt i landet, med over én million innbyggere. Byens raske befolkningsvekst legger press på infrastrukturen. I 2012 var grensebyen Gisenyi i nordvest den nest største byen, med innbyggere. Andre større byer er Ruhengeri, Butare og Muhanga, som alle har under innbyggere.