Embetsperioden ble avsluttet ved at hennes slektning hærsjefen Luis García Meza Tejada ble diktator etter et blodig militærkupp den 17. juli 1980. Hans regime var brutalt, og involvert i narkotikahandel. Gueiler forlot landet etter kuppet og bodde i Frankrike til diktaturets fall i 1982.