Et arbeidsutvalg på ti medlemmer (Executive Committee) er ansvarlig overfor generalforsamlingen og skal iverksette den generelle politikken til IUCr slik den fastsettes av generalforsamlingen. Arbeidsutvalget fastsetter underutvalg til å hjelpe seg med å utføre sitt arbeid. Fra 2014 er toppvervene fordel som følger: President Marvin L. Hackert, visepresident Anthony M. Glazer,, generalsekretær og kasserer Luc van Meervelt og ekspresident Gautam R. Desiraju.