I september 2014 ble Gröning tiltalt for medvirkning til tilfeller av mord. Saken fokuserte på drapene på de ungarske jødene sommeren 1944. Rettergangen ble innledet i Lüneburg 21. april 2015. Det var ingen vitner eller andre beviser for Grönings rolle i Auschwitz. Retten mente at det var tilstrekkelig at han hadde tjenestegjort i leiren og derfor var del av drapsmaskineriet. For retten var det vesentlig at Gröning hadde vært til stede ved sortering av jøder på perrongen i Auschwitz og dermed hadde medvirket til drapene, eller om han kun var bokholder (i tysk presse ble han omtalt som «bokholderen fra Auschwitz»).