I 1808 gav Kopitar ut («Grammatikk over det slaviske språket i Krain, Kärnten og Steiermark»). Hovedverket hans er en utgave av et, den gang nyoppdaget, gammelkirkeslavisk håndskrift, (1836). Når det gjaldt det gammelkirkeslaviske språket, antok Kopitar feilaktig at det var slovensk, mens det i virkeligheten var bulgarsk. Han sto i et skarpt motsetningsforhold til samtidens slavister, særlig på grunn av sin kjølige holdning overfor panslavismen.