Konstantinopel ble i 1453 erobret av osmanene. Patriarkene ble heretter innsatt av de osmanske sultanene. Disse ga imidlertid også tillatelse til at den armenske apostoliske kirke (som av rikskirken hadde blitt sett på som kjettersk) kunne utnevne en patriark av Konstantinopel. Fra 1461 fantes det derfor to patriarker i Konstaninopel (i tillegg til den katolske titulærpatriarken): se liste over armenske patriarker av Konstantinopel for de armensk-apostoliske patriarkene; se under for de ortodokse patriarkene.