Grunnet innføringen av en ny regionmodell for de videregående skolene i Troms ble Heggen den 15. februar 2007 slått sammen med Skånland videregående skole under det nye navnet Vågsfjord videregående skole. På grunn av nedleggelsen av Skånland videregående skole i 2010, het skolen fra skoleåret 2010/2011 igjen Heggen videregående skole.