Det fortryllende eventyret fortsetter i den fredfylte grønne dalen, hvor dinosauren Lillefot og vennene hans bor og leker under foreldrenes vaktsomme øyne. Littlefoot og vennene hans, Cera, Ducky, Petrie og Spike, lever et bekymringsløst liv i Great Valley under familiens beskyttelse. En dag forsøker gjengen å komme seg til et annet område for å leke, men blir fanget i kvikksand. De voksne dinosaurene redder dem, og refser de unge dinosaurene for deres bekymringsløshet. Men den neste kvelden har de yngre dinosaurene et hemmelig møte, og bestemmer seg for å bevise deres tapperhet og modenhet ved å begi seg inn i Mysterious Beyond, et sted utenfor Great Valley som er bebodd av Sharpteeth.