Fra 5. mai 2011 til 8. mai 2014 var han også visepresident for den ecuadorianske biskopskonferanse og fra 2014 til 2017 president i Kommisjonen for lekfolk. I 2012 ble han kjent for en kontrovers med Ecuadors president Rafael Correa da han kritiserte fjerningen av religiøse bilder fra et sykehus. Den 29. mars 2014 kalte pave Frans ham medlem av Kongregasjonen for institutter for konsekrert liv og for samfunn av apostolisk liv.