Han har to ektefeller. Han giftet seg første gang i 1986 med Azizah Aminah Maimunah (født 1960), datter av sultan Iskandar av Johor. De har fire sønner og to døtre. Hun er dronning i Malaysia så lenge Abdullah er konge. Han giftet seg for andre gang i 1991 med Cik Puan Julia Rais, en tidligere skuespiller, som han har tre døtre med.