Eudoxias rolle i de kirkelige spørsmål er ganske godt dokumentert. Hun anerkjente Den nikenske trosbekjennelse og, ifølge Socrates Scholasticus, arrangerte hun anti-arianske prosesjoner i Konstantinopel. Hun deltok også i feiringer og nattevake i forbindelse med at nye relikvier ankom byen, noe Arcadius selv ikke gjorde.