Zongo ble født i Koudougou i Fransk Øvre Volta. Han har bred erfaring innen økonomi og regnskap. Han ble ministerdelegat for budsjett og planlegging, under Ministeriet for økonomi, finans og planlegging, i juni 1995. I februar 1996 ble han regjeringens talsmann i tillegg til sin rolle som ministerdelegat. Han fortsatte som regjeringstalsmann inntil november 2000. Posten hans ble endret til ministerdelegat for finans og økonomisk utvikling, under statsministeren, i september 1996. Han ble senere forfremmet til minister for økonomi og finans den 10. juni 1997. Zongo ble på den siste posten inntil november 2000. Den 14. februar 2002 ble han utnevnt til ambassadør i USA, en post han tjenestegjorde i inntil han ble utnevnt til statsminister i juni 2007.