I Mega Man X5 så dør han, igjen, etter at man har drept Sigma – uavhengig om det skjedde med X eller Zero. Men også i Mega Man X5 kan Zero bli maverick igjen, og da blir også avslutningen litt annen enn om han ikke ble maverick. Dette er fordi Keiji Inafune (det er han som laget Mega Man og Mega Man X) ville gi alternative avslutninger. Men for at det skal skje så må man mislykkes med sine oppdrag om å redde Tellus (jorden) fra sin undergang.