Byamugisha har blitt en viktig person i det internasjonale hiv/aids-miljøet. Han har jobbet som rådgiver for World Vision og har reist i mange land for å snakke om hiv/aids, blant annet på en konferanse i Det hvite hus i Washington i desember 2002. Byamugisha forfekter at hiv-relaterte spørsmål viser problemer i andre samfunnsområder som fattigdom, analfabetisme, sosial ulikhet, kjønnspørsmål, handel og myndighetenes politikk. Om man løser disse problemene mener han det vil ha en merkbar effekt på aids-epidemien i Afrika.