I 1951 dannet Fianna Fáil en mindretallsregjering. MacEntee ble igjen finansminister, og la vekt på å ta seg av utenlandsgjeld. Han la frem et meget stramt budsjett samme år, med økt inntektsskatt og tollavgifter på importvarer. Målet var å kutte ned på offentlig pengebruk og å begrense import, men en bivirkning var en kraftig økning i arbeidsløsheten. Dette ble forverret gjennom budsjettene i 1952 og 1953. Mange har hevdet at det var MacEntees budsjetter som førte til at Fianna Fáil tapte valget i 1954. Hans politiske karriere ble skadet av dette; han hadde vært en sannsynlig kandidat til vervet som taoiseach (statsminister), men etter budsjettproblemene rykket Lemass opp som «tronarving».