I desember 2021 ble Isaksen ansatt som samfunnsredaktør i nettavisen E24. Den nye stillingen medførte at han meldte seg ut av Høyre, i tråd med Schibsted-konsernets retningslinjer om at redaksjonsmedlemmer i konsernets publikasjoner ikke skal være medlem av noe politisk parti. Han uttalte samtidig at han anså sin politikerkarriere for avsluttet. Den 1. september 2024 ble Isaksens stilling i endret fra samfunnsredaktør til politisk redaktør.