LaBeouf har fått stor oppmerksomhet for kontroversielle uttalelser. Han har kritisert filmer han selv har spilt i, som og . Han har også uttalt at han hadde et seksuelt forhold til sin -medspiller Megan Fox mens hun var sammen med sin daværende ektemann Brian Austin Green. Han har senere beklaget uttalelsene sine og lovet å være mer forsiktig med hva han sier til mediene i fremtiden.