Jan Paweł Lengas familie, som var av polsk bakgrunn og etnisitet, flyttet fra Horodok til Latviske SSR. Der arbeidet han i jernbanen. Lenga hadde et novisiat hos marianerne, gjennomført under de vanskelige forhold sområdet i Sovjetunionen, ved å ukentlig besøke en åndelig veileder som var munk i ordenen. Fra Latvia flyttet han til Kaunas i Litauiske SSR, der ett av de kun to katolske presteseminarer i hele Sovjetunionen var. Han var seminarist tilknyttet dette, i hemmelighet. Utad var han yrkesaktiv i et museum i Kaunas.