Firmaet har sine røtter i 1909, da det ble stiftet som Luftfahrzeug-Motorenbau GmbH av Wilhelm Maybach, og hans sønn Karl Maybach. I 1912 flyttet de bedriften fra fra Bietigheim-Bissingen til sin nåværende hjemby Friedrichshafen. I 1918 byttet firmaet navn til Maybach-Motorenbau GmbH. MTU Friedrichshafen er et resultat av sammenslåinger av Daimler Benz, Maybach Motoenbau og MAN Turbo sine divisjoner som produserte hurtigløpende dieselmotorer med sylindervolum under 12 liter pr sylinder.