Dens belyggenhet ble gjenoppdaget i moderne tid, og utgravninger ble foretatt på stedet mellom 1981 og 1996, noe som førte til at Ekron er en av de best dokumenterte filisteiske byer. Ekron nevnes både i den hebraiske Bibelen (i Josvas bok og i Første Samuelsbok og Andre Kongebok) og i ikke-hebraiske kilder, for eksempel i den assyriske kong Sargon IIs palass i Khorsabad.