Allerede på andre etappe kom den første bakkeavslutningen, på Alto de Ardales (3. kategori). Esteban Chaves vant etappen, og overtok alle fire ledertrøyene. Etter målgang ble en av forhåndsfavorittene, Vincenzo Nibali, diskvalifisert. Etter en massevelt tre mil før mål hadde han holdt i lagbilen for å komme tilbake til hovedfeltet.