Han var sønn av Bredo von Munthe af Morgenstierne og Anna Dorothea Smith, ble student i 1751 og juridisk kandidat i 1753. I 1758 ble han ansatt som sekretær i det Danske Kancelli og ble viselandsdommer på Sjælland og Møn, og fikk i 1765 «Survivance» som krigs- og landkommissær for Sjælland, Lolland-Falster og Møn, og tiltrådte embedet 2 år senere. På sesjonene skal han ha vært streng mot bøndene. Allerede i 1762 hadde han blitt justitsråd og steg raskt i de forskjellige gradene (etatsråd i 1768, konferensråd i 1776), til han i 1783 ble deputert i Generalitets- og Kommissariatskollegiet, der han ble et meget virksomt medlem, men allerede 1789 ble han avskjediget, kan hende fordi han var imot opphevelse av stavnsbåndet. Han var dypt fornærmet og irritert over avskjeden. 1759 hadde han overtatt Bækkeskov gods, som han utvidet, og i 1796 solgte til friherre Charles August Selby. Han døde 17. mars 1809.