Den 16. desember 1935 ble han utnevnt til erkebiskop av Bordeaux. Under Andre verdenskrig og det franske nederlaget sommeren 1940 støttet Feltin til å begynne med opp om marskalk Philippe Pétain. Men i ly av dette hjalp han også jøder som flyktet fra tyskokkupert fransk område, og hjalp Frankrikes storrabbiner til å unnslippe Gestapo.