Harley Quinn har ingen superkrefter, men hun bruker hennes uforutsigbarhet, gymnastiske ferdigheter, våpen og kampferdigheter til å bekjempe sine fiender. Etter overgangen hennes til hoved-DC-universet i 1999, fikk Harley Quinn immunitet mot giftstoffer og forbedret styrke, smidighet, holdbarhet, og reflekser, som som følge av å ha fått et serum laget av Poison Ivy.