Kommunearkivet skiftet i 1997 navn til Trondheim byarkiv og flyttet samtidig fra Holtermanns veg 1 til den den tidligere ubåtbunkeren Dora I. I 2006 flyttet Byarkivet sammen med flere andre arkivinstitusjoner inn i det nybygde Arkivsenteret Dora. Arkivsamlingene oppbevares i magasiner inne i bunkeren, der Byarkivet disponerer en arkivkapasitet på 30 000 hyllemeter.