Goudimel er mest kjent for firstemmige arrangementer av salmemelodier publisert i den protestantiske salmeboka (1565), basert på Clément Marot og Théodore de Bèzes salmetekster. I en av sine fire komplette utgaver legger han uvanlig nok for sin tid melodien til overstemmen – en praksis som har holdt seg til vår tid.