I 2016 tok Sowers en stilling som wide receivers coaching intern med Atlanta Falcons i National Football League. I 2017 gikk hun over til San Francisco 49ers som en del av Bill Walsh Diversity Coaching Fellowship. Hun ble en seasonal intern før hun fikk en fulltidsstilling som offensive assistant. I hennes første sesong med laget vant 49ers NFC Championship og gikk videre til Super Bowl LIV, som gjorde Sowers til den første kvinnelige og den første åpent lesbiske treneren i et Super Bowl. Kontrakten med 49ers utgikk etter 2020-sesongen. Hun tok en trenerjobb med Kansas City Chiefs før -sesongen. I oktober 2021 ble Sowers utnevnt til director of athletic strategic initiatives på Ottawa University, hvor hun også er trener for kvinnelaget i flaggfotball.