I 1988 kjøpte Claris en integrert programvarepakke kalt GS Works fra StyleWare og døpte den om til AppleWorks GS, og brakte dermed AppleWorks til 16-bits maskinen Apple IIgs, selv om ikke noe av programkoden fra 8-bits versjonen til Apple II ble brukt. I tillegg til tekstbehandling, regneark og databasefunksjoner, hadde AppleWorks GS også moduler for telekommunikasjon, sideombrekking og grafikk.