Om bord på Flight 93 så nøler kaprerne og er uenige om når det er best å slå til. Til slutt stormer én av terroristene inn på toalettet, lager en kunstig bombe ut av modelleire og elektriske kabler, og gir signalet. De andre terroristene stormer dermed førerkabinen og bruker kniver til å både skremme flypersonellet og til å drepe én passasjer. Inne i førerkabinen legger de et bilde av U. S. Capitol, deres mål, på flyets dashbord.