Dessuten har pr 2013 det kinesiske vitenskapsakademi tolv filialer i Shenyang, Changchun, Shanghai, Nanjing, Wuhan, Guangzhou, Chengdu, Kunming, Xi’an, Lanzhou og Ürümqi. Det kinesiske vitenskapsakademi har 84 institutter, to universitetet (Kinas universitet for vitenskap og teknikk i Hefei i Anhui og Det kinesiske vitenskapsakademis universitet), to colleges, fire dokumentasjons- og informasjonssentra, tre sentra for teknologisk support og to redigeringsenheter. Disse filialer og byråer befinner seg i tyve kinesiske provinser. Det kinesiske vitenskapsakademi har i åtte industriavdelinger utstyrt eller opprettet over 430 høyteknologiske selskaper - hvorav åtte er børsnoterte.