Han giftet seg 13. desember 1779 i Noisy-le-Grand med Joséphine Tascher de la Pagerie (1763-1814), som senere giftet seg med Napoléon Bonaparte og er kjent under navnet Joséphine de Beauharnais. De fikk to barn: Eugène de Beauharnais (3. september 1781 – 21. februar 1824). Hortense de Beauharnais (10. april 1783 – 5. oktober 1837), mor til Napoleon III av Frankrike.