Svart gallebær er en gammel medisinplante. Dioskorides anbefalte den mot koldbrann, og i antikken ble den brukt mot epilepsi, høydeskrekk, lammelse, gikt og hoste. Rota ble brukt til å forfalske alrunerot. Rota inneholder glykosider, cucurbitaciner, tanniner, alkaloidet bryonicin og harpiks. I Norge er planten klassifisert som et reseptpliktig legemiddel. Det er usikkert om gallebær har noen medisinsk effekt, men preparatet blir fortsatt brukt i blant annet homøopatien.