Totonakisk er agglutinerende og polysyntetisk. Verbet kommer vanligvis først i setningene. Språket har seks vokalfonemer og 17 konsonantfonemer. Et særtrekk med totonakisk er lydsymbolisme, som vil si at et ords betydning kan modifiseres ved å bytte ut en konsonant med en annen, for eksempel for å uttrykke intensitet eller størrelse.