Ifølge de opprinnelige planene fra første halvdel av 1800-tallet, skulle Markermeer dreneres som , på samme måte som Sør- og Øst-Flevoland eller Noordoostpolder. På grunn av endrede prioriteringer og tvil om dens økonomiske gjennomførbarhet, ble Markerwaardpolder utsatt på ubestemt tid på 1980-tallet. Markermeer har siden begynt å bli en økologisk og rekreasjonsmessig ressurs i seg selv, noe som gjør gjennomføringen av planen usannsynlig.