Denne tendens drev ham til samarbeide med jesuittene i Roma og så i Venezia. I mars 1544 ble han til og med novise for jesuittene. Her forsøkte han å overbevise jesuittene at det bestod en fullstendig harmoni mellom hans og deres stifter Ignatius' tanker. Han var ydmyk og meget from, men hans opplevelse av profetisk inspirasjon gjorde at han ikke var i stand til å tøyle sine oratoriske talegaver. Hans utlegninger var kilde til forlegenhet, til og med anstøt, og han ble tvunget til å forlate novisiatet etter ett og et halvt år (9. desember 1545). Både hans opptreden og ikke minst hans overbevisninger var for inkompatible med jesuittordenens i mange henseender til at han kunne bli fullt medlem i ordenen.