Enkelte politiske kommentatorer har trukket i tvil hans standpunkt for EU og NATO. Mickoski har slått fast at han og hans parti støtter medlemskap i EU og NATO, men ikke i form av kapitulasjon eller avvisning av Prespa-avtalen med Hellas som avsluttet den makedonske navnekonflikten sikret Nord-Makedonia mulighet til å bli NATO-medlem. Hellas hadde tidligere blokkert muligheten for dette på grunn av striden om navnet Makedonia. Han og hans parti var sentrale i makedonernes protest mot det franske forslaget til rammeavtale om Nord-Makedonias medlemskap i EU i 2022 etter at Bulgaria først hadde motsatt seg medlemskap. I august 2022 lovte Mickoski at han ville gå ut av politikken dersom bulgarerne i Nord-Makedonia ble anerkjent i landets konstitusjon, et krav som ble fremmet i medlemskapsforhandlingene med EU. I september foreslo han at vennskapspakten mellom Bulgaria og Nord-Makedonia skulle annulleres. Mickoski har sterke bånd til Ungarns statsminister Viktor Orbán og Serbias president Aleksandar Vučić som fremstår som forbilder for politikere på Balkan med autokratiske tendenser.