Beck erkjente offentlig sin tilknytning til scientologikirken for første gang i et intervju med New York Times Magazine 6. mars 2005. Ytterligere bekreftelse kom i et intervju i Irish Sunday Tribune i juni 2005, hvor han skal være sitert slik: "Ja, jeg er scientolog. Min far har vært en scientolog i 35 år, så jeg vokste opp i og rundt det." Når han ble spurt om scientologiens kjernetro svarer han heller vagt om området.