Han var sønn av Miguel Ruiz de Otálora, tidligere minister for «El Real y Supremo Consejo de Indias» (). Hans bror Juan de Otálora ble dommer i Galicia og Valladolid. En annen bror, Alonso Núñez de Otálora, studerte ved Universitetet i Salamanca og nådde indisk råd som sin far.