Ledger ble født i Perth som sønn av Sally Ledger Bell (født Ramshaw) og Kim Ledger. Ledgers mor stammer fra Campbell-klanen i Skottland og hans far kommer fra en familie kjent i Perth for deres eierskap av Ledger Engineering Foundry. Heath og hans søster Katherine ble oppkalt etter romanfigurene i Emily Brontës bok . The Sir Frank Ledger Charitable Trust ble oppkalt etter hans olderfar.