Bonannos trygge stilling i kommisjonen var at han hadde tette bånd til Joseph Profaci, overhodet i en av de andre familiene. Ett av disse sterke båndene var Bonannos sønn Salvatore («Bill») som giftet seg med Profacis niese Rosaline i 1956. Hvis noen av de andre familiene hadde tanker om å presse ut Bonanno, fikk de sterke båndene til Profaci-familien (som senere ble Colombo-familien) dem til å tenke seg om to ganger. Men da Joseph Profaci døde i 1962, ble Bonannos posisjon truet.