Sadeq al-Mahdi fortsatte å lede Umma Party, som sto i opposisjon til Omar al-Bashir, siden han ble avsatt i 1989. Han tilbrakte en periode i eksil, men etter hvert returnerte han til Sudan i november 2000. I juli 2008 støttet han Bashir etter at sistnevnte var blitt anklaget for folkemord av påtalemyndigheten i den internasjonale straffedomstolen.