Det ble grunnlagt i 1956 som Wuhan mikrobiologilaboratorium innen det kinesiske vitenskapsakademi (CAS) og gjennomgikk en rekke navnerendringer: Det sørkinesiske institutt for mikrobiologi (1961), Wuhan institutt for mikrobiologi (1962), Provinsen Hubeis institutt for mikrobiologi (1970), og fra 1978 det nåværende navn, Wuhan institutt for virologi.