Kort tid etter at basen ble reddet informerer Yuri spilleren at Romanov ble myrdet av General Vladimir. Yuri gir ordre til spilleren om å dra til Washington, D.C. for å eliminere Vladimir, som Yuri sier er en forræder. Spilleren vinner over Vladimirs styrker og kaprer Vladimir i Det hvite hus. I et annet oppdrag blir en sovjetisk spesialstyrke sendt til San Antonio og infiltrerer den amerikanske installasjonen ved Alamo og klarer dermed å styre tankene til den amerikanske presidenten Michael Dugan. Sovjeterne oppdager da at de allierte utvikler et nytt super våpen på De amerikanske Jomfruøyer, et våpen som kan tydeligvis kontrollere været og lage store stormer. Sovjeterne ødelegger basen og prototypen.