Magdahl er i dag fast representant i Hovedutvalg for Helse og Omsorg for Felleslista, som er et lokalpolitisk samarbeid mellom SV og Rødt i Færder. Han sitter i Færder kommunestyre for Felleslista. Magdahl ble først valgt inn i kommunestyret i 1987 og har vært fast representant siden. Jørn Magdahl er pensjonert fagleder ved Greveskogen videregående skole, hvor han blant annet underviste i politikk og menneskerettigheter, samt historie, filosofi og samfunnsfag.