Fylket grenser til både Uganda i vest, Sør-Sudan i nord, herunder det omstridte Ilemi-triangelet og Etiopia i nordøst, og Turkanasjøen i øst. I øst og øst grenser fylket fylkene West Pokot, Baringo og Samburu fylker, mens Marsabit fylke ligger på den andre, det vil si østre bredden av Turkanasjøen.