HEC Paris PhD-program i ledelse tilbyr opplæring for karrierer innen forskning og akademia. Det tilbyr 7 spesialiseringer og tar vanligvis 4-5 år å fullføre. Spesialiseringene som tilbys er regnskap og ledelseskontroll, økonomi og beslutningsvitenskap, økonomi, informasjonssystemer og driftsledelse, ledelse og personal, markedsføring og forretningsstrategi og politikk. Fra desember 2020 er det 59 studenter i programmet, som representerer 18 nasjonaliteter. Mer enn 90% av studentene går inn i en akademisk karriere etter fullføring. Alle doktorgradsstudenter får fritak for full semesteravgift, fem års levekostnader og forskningsmidler.