Hodeskallene til apostlene Peter og Paulus skal befinne seg i relikvarier i baldakinen over høyalteret. I selve alteret er det innfelt deler av en bordplate fra antikken, hentet fra senator Pudens' hus (kirken Santa Pudenziana ved St. Maria Maggiore-kirken). Peter skal ha feiret nattverden ved den bordplaten.