Hans kritikk av kirkelige misforhold førte til at han tiltrakk seg kritikk og mistanker. Han viste sig imidlertid som en av den katolske kirkes fremste samtidens apologeter ved sitt skriv til Genève i 1539 og oppfordret folk der å vende tilbake til den katolske tro. Det ble besvart av Jean Calvin og medvirket til dennes tilbakekallelse til Genève fra Strasbourg.