Cooper ble plukket opp av Oakland Raiders i sjette runde (#184) i NFLs draft i 2001. Han spilte i ti kamper og startet i én, og hadde 22 taklinger, to sacks og én interception i -sesongen. Året etter spilte han i alle sesongens 16 kamper, og startet i én, og hadde 19 taklinger, én sack, én forsvart pasning og forårsaket én fumble. I divisjonsrunden av sluttspillet mot New York Jets hadde han 3 taklinger, og spilte også på special teams. I AFC Championship-kampen mot Tennesee Titans hadde han 3 taklinger. I Super Bowl XXXVII, mot Tampa Bay Buccaneers, hadde han også tre taklinger.