I juli 2016 skrev Prescott i kommantrar for boulevardavisen Sunday Mirror at han, når han skuet tilbake, angret veldig på at han gikk med på britisk deltakelse i Irak-krigen i 2003. Invasjonen av amerikanske tropper og britiske tropper på den tiden var ulovlig, mente han; medlemmene av Tony Blairs regjeringskabinett mottok ikke nok dokumenter til å kunne ta denne avgjørelsen.