Kometkameratene handler om seks romvesener i form av dukker som bor i et romskip. De har i oppdrag å finne ut hva menneskene holder på med. I hver episode undersøker de nysgjerrige romvesenene et menneskelig begrep som de i utgangspunktet ikke har noe kunnskap om. Som en del av dette sendes to av dem ned til jorden for å undersøke menneskelige begreper for å lære av menneskene.