En lang periode synes hans forhold til Christian II å ha vært godt; men dette ble endret da kongen ble mer autokratisk og samtidig la nye byrder på kirkens personer og eiendommer for å skaffe midler til sine felttog i Sverige. Dertil kom kongens fremferd ikke bare ved fengslingen av biskop Jens Andersen Beldenak i Odense, men især mot de svenske biskoper, som han «uden Skriftemål» lot henrette, og endelig hans innsettelse av en så uverdig person som avlatskremmeren Diderik Slagheck på Lunds erkebispesete.