Hans hell snudde imidlertid etter at keiserdømmet forfalt etter trippelalliansekrigen, og da han døde hadde Mauá tapt mesteparten av sin formue. I en tid hvor Brasil var dominert av regjeringsbeskyttede landeiere som prioriterte eksport i en slavebasert økonomi, forsvarte Mauá fri konkurranse, liberalisme, industrialisering og avskaffelse av slaveri. Byen Visconde de Mauá er oppkalt etter han.