Selv i tilfeller med langvarig borreliainfeksjon kan det være vanskelig å påvise antistoffer, men uteblivelse av antistoffer er svært sjelden i tilfeller der pasientene har sterke symptomer. På den annen side trenger ikke en positiv prøve bety aktiv infeksjon, da antistoffene kan sitte igjen i måneder og år etter at kroppen har nedkjempet infeksjonen.