Det kommer også frem at etter sin mors død, tilbrakte Tony mye av barndommen på kostskoler og sommerskole. Dette ga ham lite tid sammen med sin far, noe som igjen forårsaket et anstrengt forhold dem imellom. Andre familie-medlemmer som blir nevnt i forskjellige NCIS-episoder inkluderer en bestefar som samlet på knapper og testamenterte Tony tusen aksjer i et dot-com selskap. Han har mange onkler inkludert onkel Vincenzo, en slakter bosatt på Long Island. En annen onkel var en vellykket forretningsmann, og en tredje avdød onkel var velstående.