Siden 2007 har han vært ved Høgskolen i Sogn og Fjordane, først som førsteamanuensis, etterhvert som professor. Bondevik mottok Reuschmedaljen i 2001 fra Norsk geologisk forening for artikkelen . I 2001 året vant han Universitetet i Tromsø sin forskerpris på 50 000 kroner for yngre forskning. Ved University of Washington var han gjesteforsker ved 1998 og 2003–04.