Claude Dupuy kom fra en familie som stammet fra Saint-Galmier i Forez, der hans fettere var slottsherrer. Den første i rekken hvis navn er belagt i kildene er Pierre Barbier, Dupuy, kjøpmann i Saint-Galmier, nevnt i et skrift fra 30. juli 1434. Claudes far, Clément Dupuy (1506-22. august 1554), var velrenommert advokat ved parlementet i Paris. Den 23. august 1539 giftet faren seg med Philippe Poncet (død 1586), og i 1550 kjøpte han seigneuriet Saint-Germain-Laval i Forez. Paret hadde tre barn som levde opp: Claude, Clément og Judith. Sistnevnte giftet seg med Claude Séguier, Sieur de La Verrière. Clément, som ble jesuitt, var provinsial for jesuittordenen i Frankrike flere ganger, og døde i Bordeaux 16. april 1598.