Margrethe var datter av Sune Ebbesen (–1186) og Cecilie og var i slekt med biskop Absalon og Sunnesønnene. Hun var gift med en Herlog, og hadde tre barn med ham. I 1176 ble hun myrdet av ektemannen, som hengte liket hennes i en bjelke for å få det til å se ut som om hun hadde begått selvmord.