Ordenen etablerte seg i andre kristne land og i senmiddelalderen var den også til stede i Skandinavia, der den var aktiv til reformasjonen. Ordenen overtok noen steder såkalte helligåndshus, institusjoner for syke og fattige etablert fra 1100-tallet av, men mange slike institusjoner kunne også være uavhengige av ordenen. I Danmark etablerte Helligåndsordenen seg i 1451 i Aalborg, da det overtok et helligåndshus grunnlagt i 1431.