I 1994 ble han valgt til leder av Ekofisk-Komiteen. Han var leder frem til 2003. I den perioden nektet Harald Sjonfjell og resten av klubbledelsen å iverksette en sympatistreik i 1996. Dette førte til en konflikt mellom Ekofisk-komiteen og OFS. Konflikten ble så hard at Ekofisk-komiteen som hadde vært med å stifte OFS, forlot forbundet. Samme år opprettet Harald Sjonfjell i Ekofisk-komiteen en samarbeidsavtale med NOPEF som var OFS sin erkekonkurrent. Samarbeidsavtalen varte til 1999, da ble Ekofiskkomiteen fullverdige medlem av NOPEF (nå Industri Energi).