Han var Thailands hærsjef under det blodige opprøret i 2010, som ble slått ned av militæret da han ga etter for statsminister Abhisit Vejjajivas anmodning om å fjerne demonstrantene. Han var assistentdirektør for Senteret for løsning av krisesituasjonen (CRES), som ble satt opp i 2010 for å håndtere demonstrasjonene. Forfatter James Stent mener at Anupong, sammen med den politiske ledelsen som valgte en militær løsning på konflikten, er medansvarlig for de nitti dødsfallene og de hundrevis av skadede etter aksjonen.