Torrijos dødsfall generere diverse spekulasjoner om at han var offer for et attentat eller komplott. At Torrijos ble myrdet av amerikanske interesser, som hadde plantet en bombe om bord på flyet hans (organisert av agenter fra CIA) er den mest kjente spekulasjonen. Torrijos døde kort tid etter innsettelsen av USAs president Ronald Reagan, bare to måneder etter at Ecuadors president Jaime Roldós døde i påfallende lignende omstendigheter.