Like før utbruddet av andre verdenskrig stengte departementet skolen som opplæringssted. Med på grunn av behovet for å trene med luftfartøyer i store mengder, ble det omformet til RAF College Flying Training School, og det gikk ikke tilbake til sin tidligere funksjon frem til 1947. Det var også i 1947 at kadetter til utstyrs- og sekretariatsgrener ble tatt opp til skolen ved siden av de tradisjonelle flykadettene.