Disse fjellkjedene tjener som en viktig korridor hvor den utrydningstruede asiatiske elefanten vandrer i migrasjonstiden. I Nilgiri-fjellene holder også de fleste asiatiske elefanter til. Tiger-reservatene Brahmagiri og Pushpagiri er viktige tilholdssteder for elefantene. I Karnatakas fjell er det over seks tusen elefanter (2004) og ti prosent av Indias utrydningstruede bengaltigre Den største stamme av Indias tigre utenfor Nilgiri er I Sundarbans' skoger mellemTamil Nadu og Kerala. Den største stamme av de utrydningstruede og sårbare gaur finnes også her, i nasjonalparkene Bandipur og Nagarhole som tilsammen huser over fem tusen gaur. Vest for Skogene I Kodagu finnes en betydelig stamme av den utrydningstruede Nilgiri langur.