I tillegg til overvåking og kartlegging finansierer også SEAPOP en rekke spesialiserte korttidsstudier på sjøfugløkologi og habitatbruk. Dette er typisk studier som retter seg mot arter som er spesielt sårbare overfor visse miljøpåvirkninger eller som på en eller annen måte er spesielt interessante eller verdifulle med hensyn til bevaring. SEAPOP har også en oppdatert liste over vitenskapelige publikasjoner med tilknytning til programmet, og oppsummeringer av de viktigste resultatene presenteres i årlige rapporter.