Anlegget ble etterhvert for trangt for sine mange formål, og forskjellige rådhusfunksjoner måtte flytte ut. Magistraten, kommunens sentraladministrasjon, flyttet i 1843 til nabogården Dronningens gate 11, Magistratgården. Etter at Møllergaten politistasjon sto ferdig i 1866 var det i «Gamle Rådhus» bare en underpolitistasjon med emigrantkontor tilbake, som var operativ fram til 1963.