Da kirkekommisjonen i 1828 fikk rede på at Thorvaldsen holdt på med en knelende engel med dåpsfat, spurte kommisjonen ham om man kunne få den til kirken. Døpefonten kom til København i 1833, fire år etter at kirken ble innviet. Fra 1833 til mai 1839 sto gipsmodellen oppstilt i kirken. Marmorutgaven kom på plass i pinsen 1839, da kunstneren Hermann Ernst Freund holdt overoppsyn med utplasseringen av flere av Thorvaldsens marmorskulpturer i Vor Frue kirke. Døpefonten ble benyttet første gang 19. mai 1839. Da ble Freunds datter døpt, med Thorvaldsen som fadder.