Helligdommen er dedikert til de tre døtrene til den japanske stormguden Susanoo. Øya har blitt ansett som et hellig sted så vanlige borgere har i det meste av historien ikke fått sette sin fot på øya. For at pilgrimer skulle kunne hit ble helligdommen bygget som en bro over vannet, slik at den så ut til å flyte, skilt fra land, og ble derfor ansett for å eksistere på grensen mellom det hellige og det profane. Helligdommens karakteristiske røde inngangsport, eller torii, ble bygget ute i vannet av noenlunde samme grunn. Vanlige folk måtte styre båtene sine gjennom porten for å få lov til å nærme seg helligdommen.