ABCC-kommisjonen fokuserte også på Nishiyama-distriktet i Nagasaki. Mellom episenteret og Nishiyama lå det fjell som hindret stråling og varme fra eksplosjonen i å nå Nishiyama direkte, og det var ingen direkte skader. Likevel viste det seg å være betydelige mengder stråling på grunn av nedfall fra aske og regn. Etter krigen ble det derfor gjennomført helseundersøkelser uten at innbyggerne ble informert om hensikten. Opprinnelig ble undersøkelsene i Nishiyama utført av den amerikanske hæren, men senere ble de overført til ABCC.