Totalt ble 27 278 mannlige fanger sendt til Ebensee mellom 1943 og 1945. Mellom 8 500 og 11 000 fanger døde i leiren, de fleste av sult eller underernæring. Jøder utgjorde omtrent en tredjedel av fangene, og fangene kom fra mer enn 20 forskjellige nasjonaliteter.