I 1993 fikk han sin doktorgrad i teologi fra det katolske teologiske fakultetet ved Comeniusuniversitetet i Bratislava. Stanislav Stolárik tok sin doktorgrad i filosofi ved Det pavelige teologiske akademi i Kraków i 1998. og han tok en ytterligere doktorgrad ved Det filosofiske fakultet ved Comeniusuniversitetet i Bratislava. I 1999 fullførte han sin habilitering i filosofihistorie ved Det filosofiske fakultet ved Universitetet i Prešov.