Under modernismens til hørte Turmel til de toneangivende. Allerede i 1886 hadde han, ifølge seg selv, mistet sin katolske tro. Men han forble medlem av kirken. Han begynte å skrive, under eget navn og under psevdonymer (for eksempel Henri Delafosse), å forfatte og offentliggjøre artikler. To artikler som anfektet treenighetslæren og den marianske dogmer ( og ) ble forøkt tilhordnet ham, men det lot seg ikke beviseg. I 1910 avla han antimodernisteden. Undersøkelseer ble gjenopptatt i 1928, og førte til at han ble ekskommunisert den 6. november 1930.