Waldemar Sommertag ble presteviet for tjeneste i bispedømmet Pelplin den 30. mai 1993. Han tok en utdannelse i kirkerett og inntrådte i det pavelige diplomati 19. juni 2000. Han arbeidet i nuntiaturer i Tanzania, Nicaragua, Bosnia og Herzegovina, Israel, Palestina og Kypros, og i Statssekretariatet i Vatikanet.