Det er den amerikanske (NLM) som har utviklet systemet og som oppdaterer det. MeSH brukes som emneordsregister i Medline, PubMed, SveMed+, Cochrane Library, av WHO og i Bibsys Ask og Alma/Oria. MeSH er bygd opp hierarkisk med over- og underordnede termer, og dette henvises ofte til som trær. Hver MeSH-term har et unikt ID-nummer som kopler begrepsdefinisjon, termer dekket av denne (synonymer og nærliggende begreper), begrepshistorikk og relasjoner. Indeksering og søk forenkles ved at det kun er behov for én term tilhørende en MeSH (hovedterm eller alternativ term) for å aktivere de øvrige med samme id-nummer. Det sikrer enklere indeksering og bedre gjenfinning enn ved tradisjonelt søk på enkelttermer.