Pandev satte nasjonal rekord på 100 meter den 15. juni 2013, med 10,61 sekunder. Han deltok i VM i friidrett 2013, der han ble slått ut i kvalifiseringsrunden med 17. beste tid på 10,97 sekunder. Han deltok i EM i friidrett innendørs 2013 i juni, der han løp på 6,95 i kvalifiseringen. Dette var 20. beste tid av de 22 som deltok, så han gikk ikke videre til semifinalene. FYR Makedonia deltok i Third League (3. divisjon) under Lag-EM i friidrett 2013, der Pandev kom på andreplass på 100 meter med 10,75, bak slovakiske Adam Zavacký. Senere i juni deltok han også i Middelhavslekene 2013, der han deltok både på 100 og 200 meter. På 100 meter kom han på 13.-plass i innledningsheatet, og nådde ikke finalen. På 200 meter satte han personlig rekord med tiden 22,04, men kom på sisteplass i kvalifiseringen, og nådde heller ikke der finalen.