Garrincha ble født 28. oktober 1933 i Pau Grande, i staten Rio de Janeiro. Han var det femte barnet, . og hadde flere misdannelser da han ble født: ryggraden hans var deformert, det høyre beinet bøyd utover og det venstre bein var seks centimeter kortere og buet innover, hvorav ingen hindret han å i spille fotball på høyeste nivå. Han ble operert for å korrigere sykdommen, noe som ikke hjalp. Legene mente likevel at barnet ville fint kunne leve med misdannelsene . Ifølge andre kilder ble helseproblemer forårsaket fordi Garrincha led av polio .