Johanna bestemmer seg for å bruke sin mannlige forkledning igjen, og reiser som pilegrim til Roma. Hun bruker sin medisinske kunnskap for å kurere pave Sergius II som har problemer på grunn av urinsyregikt. pave Sergius gjør Johanna deretter til hans personlige doktor. I mellomtiden planlegger Lothair og hans allierte, Anastasius, å myrde Sergius for å bli innsatt som pave selv. Men folket velger Johanna som pavens etterfølger ved akklamasjon. Imidlertid blir Johanna gravid, og hennes regjeringstid som pave blir dermed satt i alvorlig fare.