Navnet Skåbu kommer fra norrønt hvor førsteleddet er genitiv entall av . Betydningen av er ikke sikker, men kan være i betydningen skade (muligens fordi gården har vært skadd) eller mer sannsynlig, at det har vært et mannsnavn som ut over å ha gitt navn til Skåbu er ukjent. Elven Skåbyggja har fått navn etter bygda.