I 1945, ved krigens slutt i Norge, ble Schei midlertidig forsynings- og gjenoppbyggingsminister (såkalt "sjeffunksjonær" i departementet), i påvente av at Nygaardsvold-regjeringen skulle komme tilbake. Etter at normale tilstander ble gjenopprettet i Norge, ble Schei utnevnt til fylkesmann i Sogn og Fjordane, en stilling han hadde frem til sin pensjonering i 1971.