Koželuh ble raskt en feiret pianist. Det keiserlige hoffet tiltrodde ham oppgaven som lærer for erkehertuginne Maria Elisabeth, datter av keiserinne Maria Teresia, etter Georg Christoph Wagenseil. Etter Mozarts død i 1792 ble Koželuhkammer livsvarig kapellmester og hoffkomponist. Enkelte elever, som den blinde pianisten Maria Theresia Paradis, gav han privatundervisning i hjemmet.