De fleste glassvamper lever på dyp som i minimal grad er påvirket av menneskelige aktiviteter. Den kanadiske regjeringen utpekte 2140 km² av Hecate-stredet og Queen Charlotte-sundet som et marint beskyttet område på grunn av de gruntlevende svampene som finnes der. Dette området inneholder fire glasssvamprev. De nye forskriftene forbyr bunnkontaktfiske innenfor 200 meter fra svamprevene. Selv om menneskelige aktiviteter bare påvirker noe får områder der det finnes glasssvamper, er de fortsatt utsatt for trusselen om klimaendringer. Eksperimenter med arten har vist at økning i temperatur og forsuring kan føre til svekket skjelettstyrke og -stivhet. I 1995 kollapset en isbre i Antarktis på grunn av klimaendringer. Siden den gang har studier av området vist at glassvamprevene har økt i størrelse til tross for klimaendringene.