Tsarfamilien ble gravd opp i 1991, formelt identifisert med DNA-prøver og deretter gravlagt i katedralen i St Petersburg. Men to familiemedlemmer ble ikke funnet, likene etter prinsesse Maria og tsarevitsj Aleksej. Funn i arkiver tydet på at disse to ble begravd adskilt fra de andre. Først sommeren 2007 kom en gruppe amatørhistorikere på leting etter de to forsvundne likene, over en liten hulning tilgrodd med nesler i en lysning mellom bjørketrær. Det hørtes knasing fra enten kull eller knokler, og snart grov de frem knokkelrester og tilkalte arkeologer. «» Arkeologene bekreftet å ha funnet rester av en 10-13 år gammel gutt og en 18-23 år gammel kvinne, overensstemmende med Maria og Aleksej. Funnstedet nord for Jekaterinburg lå ikke langt fra der resten av familien ble funnet i 1976, og siden gravd opp fra i 1991. Ved de to sist fundne lå det også syv tenner, tre kuler, en bit av en kjole, og biter av japanske keramikkflasker som hadde inneholdt svovelsyren som ble helt over de døde.