Johann Crüger skrev en rekke konsertverk og musikkpedagogiske skrifter. I 1643 ble han kjent med den berømte salmedikteren Paul Gerhardt, som han skrev flere salmemelodier for. Crüger gav ut i 1640, fra andre utgave 1647 under tittelen («Fromhetsøvelser på vers»), som regnes blant de mest betydelige tyskspråklige salmebøkene på 1600-tallet. I en annen samling med 161 sanger, derav 15 av Crüger, er det bevart tre tonesettinger av landsmannen Johann Franck.