Runde er det sørligste og tredje største av fuglefjellene i Norge, med over 120.000 hekkende sjøfuglpar. De vanligste artene er lunde og krykkje. Registreringer viste 40.000 hekkende krykkjepar i 2005 og 17.000 i 2010, mens det var 100.000 par lunde i 2005 og 81.000 i 2010.