For en virksomhets systemer gir kodefrie verktøy noen sikkerhetsmessige utfordringer siden det gjør programvareutvkling tilgjengelig for flere. På den andre siden kan det også gi noen sikkerhetsmessige fordeler siden en del sikkerhet kan håndteres automatisk i verktøyene. Med slike verktøy bør IT derfor ha et større fokus på styring.