Som nyvalgt riksdagsrepresentant 2006 ble Runeson vara i utenrikskomiteen, hvor hun ble fast medlem i 2008. Fra januar 2007 ble Runeson også vara i sosialkomiteen, og fra mars 2009 vara i Nordisk råds svenske delegasjon. I forbindelse med valget i 2010 forlot Runeson sosialkomiteen og Nordisk råds svenske delegasjon, og ble vara for Sveriges OSSE-delegasjon. Runeson har også i flere omganger vært vara i den sammensatte utenriks- og forsvarskomiteen.