I 1999 ble Abramovitsj valgt inn i den russiske Statsdumaen som representant for en fattig region i det russiske Fjerne østen. Han startet en veldedig organisasjon for å hjelpe folket i regionen, spesielt barn, og i desember 2000 ble han valgt til guvernør i Tsjukotka, da han erstattet Aleksandr Nazarov. Abramovitsj satt som guvernør i Tsjukotka fra 2000 til 2005, da han ble utnevnt til guvernør i en periode til av daværende president Vladimir Putin. Det har blitt anslått at Ambramovitsj brukte over 1,3 milliarder dollar av sine egne penger på regionen, som nå har en av de høyeste fødselsratene i Russland.