Akhtar hadde urdu-talende foreldre som hadde innvandret fra Mumbai i India til Karachi i den nye statsdannelsen Pakistan i forbindelse med Britisk Indias deling. Hans far, Muhammad Ibrahim Mehboob, som døde 92 år gammel noen få måneder etter Akhtar, var født i Muradabad, i den senere indiske delstat Uttar Pradesh.