Shane Patrick Lysaght MacGowan ble født 25, desember 1957 i Pembury, Kent, England. Han ble født i Kent da foreldrene, Maurice (fra Dublin) og Therese (fra Tipperary), besøkte slektninger der i julen. Shane MacGowans foreldre var irske, men bodde mange år flere steder i England, blant annet London og Brighton.