I det 17. århundre opplevet klosteret tilbakeslag. Tredveårskrigen bragte død og ødeleggelser i området. 1697 ødela en brann ikke bare de fleste bygningene, men også mange av abbediets kunstskatter. I tiden etter oppstod dagens bygninger, bygget i barokkstil av byggmester Franz Beer fra Vorarlberg, og riksstiftet opplevet en glansfull renessanse.