Valper av mårhunder har mange fiender – de voksne har noe færre. Ulven – der den er vanlig – er mårhundens hovedfiende. Også gaupa har mårhund på menyen. Enkelte mårhunder blir drept av rødrev og grevling. Hubro, havørn og kongeørn er i stand til å ta voksne mårhunder.      Trolig er både rødrev, grevling, mår og mink konkurrenter i kosten, men i hvilken grad vet man ikke.