Chaco er et sted med bemerkelsesverdige klimatiske ytterligheter. Temperaturen ligger vanligvis mellom -39 og 39 ° C, og temperaturen kan svinge hele 33 °C bare på en dag. Regionen har gjennomsnitt mindre enn 150 frostfrie dager hvert år, og det lokale klimaet svinger enormt fra år fra år med rikelig nedbør til perioder med langvarig tørke.