I 1944, mens han var i, giftet Moore seg med Jenny McKean, som kom fra en privilegert bohemfamilie i Bostons North Shore og hadde gått på , og . Moren hennes var Margarett Sargent McKean, en kjent malerinne av i George Luks' tradisjon. Paul og Jenny hadde ni barn sammen, og på det tidspunkt han døde hadde Moore mange barnebarn. I 1968 ga Jenny McKean Moore ut en bok om sitt tiår i slummen i Jersey City, med tittelen , som fikk velvillige anmeldelser. Deres tidligere hjem, den boligblokklignende prestegården til , skulle senere få navnet til ære for Moore. I 1973 døde Jenny Moore av kreft.