Etter å ha vært i lære i Milano flyttet han til Roma, hvor han en kort tid arbeidet med Domenico Fontana. Kardinal Scipione Caffarelli-Borghese ga i 1605 Ponzio i oppdrag å tegne Palazzo Pallavicini Rospigliosi på plassen foran keiser Konstantins termer på Quirinalhøyden. Ponzio fullbyrdet også Palazzo Borghese, som han hadde påbegynt av Vignola for kardinal Camillo Borghese.