Rooker ble utnevnt til biskop av Jaro den 12. juni 1903. Han ble bispeviet den 14. juli 1903 av kardinal Sebastiano Martinelli, O.E.S.A,, kardinalprest ved basilikaen Sant'Agostino i Roma, og Rookers tidligere overordnede ved den apostoliske delegasjon i Washington, D.C. Medkonsekratorer var erkebiskop Nicola Giuseppe (Nicolae Iosif) Camilli, O.F.M. Konv. (titulærerkebiskop av ) og biskop Raffaele Virili (titulærbiskop av ).