Anadyrskij Liman består av tre deler; den nordlige rekken av innsjøer, den sørlige innsjøen, og den store lagunen i øst. Byen Anadyr ligger på sørbredden, lengst vest i den store lagunen. Tre større elver munner ut i Anadyrskij Liman: Anadyr, Kantsjalan og Velikaja.