Etter at han la opp som spiller, returnerte Kuhn til FC Zürich i 1979 som trener i ungdomsavdelingen. I 1995 tok han over som ungdomstrener i det sveitsiske fotballforbundet. Han ledet U18-landslaget under EM 1997, og ledet deretter U21-laget til EM-sluttspill for første gang.