I 1959 giftet Kragerud seg med teologen Dagny Kaul, som ble en pioner innen feministteologi og barneteologi. Gjennom ektefellen ble han svigersønn av arkitekt og maler Maja Melandsø, og svoger av professer ved NTNU og sakprosaforfatter Hjørdis Kaul og av billedkunstner og forfatter Sigrun Kaul.