Christian I døde den 21. mai 1481 på Københavns slott. Han ble begravet i Roskilde domkirke, der han hadde finansiert gravkapellet sitt («Helligtrekongers kapell») ved å overdra Store Heddinge kirke på Stevns til domkirken i 1466. Han etterlot seg sønnene Hans og Frederik, som begge ble konger, samt datteren Margrete, som ble gift med Jakob III av Skottland. I den forbindelse pantsatte han Orknøyene og Hjaltland som medgift.