Han vant Kniksenprisen som årets dommer ti ganger mellom 1990 og 2000. Kun Roy Helge Olsen med sin seier i 1993 stod i veien for at Pedersen kunne vinne prisen 11 ganger på rad. Han vant også Kniksens hederspris i 1998. Samme år dømte han to kamper under VM i Frankrike. Til og med 2014 var Pedersen ansatt som dommersjef i Norges Fotballforbund.