Ifølge den danske kirkehistoriker Christopher Giessing (1723–91), sluttet Krog som munk på grunn av reformasjonen som er tidfestet til 1537. I stedet gikk Krog hen og studerte den nye lutherske teologi ved Københavns universitet under blant andre Peder Palladius (1503–60). Christen Krog ble den første lektor i teologi ved Oslo katedralskole og var også (sjefskannik).