I 1958 flyttet han med sin familie til New York City, men det var ikke lett for ham å få fotfeste i jazzmiljøene der. I 1960 flyttet familien til Los Angeles i håp om å unnslippe den prekære arbeidssituasjonen. I 1962 og 1963 spilte ham med Charles Lloyd i Gerald Wilsons storband. Han arbeidet med Horace Tapscott og med Harold Land og ledsaget sangeren Nancy Wilson. Så tilhørte han Tommy Peltiers Jazz Corps, som opptrådte på Lighthouse Cafe i Hermosa Beach. Sammen med ham spilte han inn plater på merket Pacific Jazz, og likeså med Roland Kirk. Tom Lord opplister fire innspillinger av Rodriguez mellom 1963 og 1965.