Hans historiske betydning hviler på at han var forfatter av , en dristig traktat som han utga i 1700 som et kampskrift mot puritanske presikanter og geistlige ledere, særlig Cotton Mather, for deres rolle i hekseprosessene i Salem hvor et stort antall mennesker ble offer for justismord og henrettet som hekser. Ettersom ingen utgiver i Boston våget å utgi boken fikk han den trykket i England. Cotton Mather skrev tilfreds om sensuren i sin dagbok: «Det var med stor glede da vi hørte at våre bokselgere var så godt kjent med rettskaffenheten til våre prester, at ingen av dem kunne ha plass til noen av de nidskriftene som ble solgt i deres butikker.» Prost Increase Mather, far til Cotton Mather, demonstrerte mot boken ved å la den offentlige brente boken på Harvard Yard ved Harvard.