Favipiravir er blitt, eller blir, testet mot en rekke andre virussykdommer. Foruten mot ebola og covid-19, gjelder dette nipahvirus, vestnilfeber, gulfebervirus, munn-og-klovsykevirus, og en rekke andre flaviviruser, arenaviruser, bunyaviruset og alfaviruser. Aktivitet mot enteroviruser og Rift Valley-febervirus er også blitt påvist. Favipiravir har vist begrenset effektivitet mot Zikavirus i dyrestudier, men da med mindre effekt en andre antivirale midler som for eksempel MK-608. Virkestoffet viste også noe effekt mot rabies, og er blitt benyttet eksperimentelt på noen mennesker smittet med det viruset.