I sesong fire fokuserer en historie på 501st Legion, som må opptre uavhengig for første gang når Jedi-generalen de har blitt midlertidig tildelt å tjene under blir avslørt for å være en forræder. Generalen forsøkte å manipulere dem til å drepe hverandre. Andre historier handler om Obi-Wan som forfalsker sin egen død, og går undercover som dusørjeger for å hindre et komplott for å kidnappe kansler Palpatine.