Stolt-Nielsen jr. leda konsernet fram til 2000, da han overlot sjefsstillinga til sønnen Niels Gregers. Jacob Stolt-Nielsen var imidlertid fortsatt styreleder fram til 2009, og deretter styremedlem. Han trakk seg først tilbake fra styret 15. desember 2014, 83 år gammel. __NOTOC__ Stolt-Nielsen jr. var en av stifterne av Det Norske Oljeselskap.