Elektroniske fakturaer fra bedrift til bedrift (B2B på engelsk) kjenntegnes ved at de er beregnet for å kunne importeres i kundens økonomisystem. Noen eksempler er EDIFACT, ebXML,de norske e2b og eFaktura B2B samt det nye norske xml-formatet EHF(ehandelsformatet). EHF-standarden ser ut til å vokse frem som den ledende standarden for elektroniske fakturaer i B2B-markedet, takket være at statlige virksomheter og etter hvert også kommunale virksomheter krever at inngående fakturaer leveres på dette formatet.