Han var kritisk til bauksittgruvedrift i det sentrale høylandet i Vietnam, og den 13. juni 2009 ble han arrestert av det vietnamesiske sikkerhetspolitiet, som hevdet at han hadde krenket «den nasjonale sikkerheten». Det internasjonale samfunnet protesterte kraftig mot arrestasjonen. Lê Công Định ble i 2009 oppført på Amnesty Internationals liste over samvittighetsfanger.