Fredrikke Waaler viste tidlig en usedvanlig musikalsk begavelse, og da foreldrene i 1878 solgte gårdsbruket Nes i Eidsvoll, ble hun elev av de anerkjente fiolinpedagogene Fredrik Ursin og Gudbrand Bøhn. Senere fordypet hun seg i musikkteori hos Ludvig Mathias Lindeman og Johannes Haarklou.