I 1982 inngikk Microsoft en avtale med Santa Cruz Operation (SCO) om videreutvikling og markedsføring av Xenix. Samarbeidet varte til 1987, da Microsoft solgte Xenix til SCO og samtidig tok 25 % eierandel i selskapet. Omtrent samtidig startet SCO en utfasing av Xenix til fordel for SCO UNIX (senere kalt SCO OpenServer), basert på UNIX System V.3.