I tiden mellom den første og den andre verdenskrigen mistet Negotin mer av sin relative betydning i Serbia og Zaječar ble det nye regionale sentrumet. I 1930-årene startet regjeringen et omfattende prosjekt med å drenere våtmarksområdene rundt byen, for å skaffe landbruksjord til den voksende befolkningen. Noen få industrielle etableringer kom til men byen fortsatte i sin rolle som handelsby.