Niwano ble organisasjonens første president og Naganuma den første visepresidenten. Ettersom organisasjonen vokste sa han opp jobben som melkemann og gikk inn i organisasjonen på heltid. Han ble involvert i inerreligiøse aktiviteter, og ble av Vatikanet innbudt til å være observatør under Annet Vatikankonsil.