I 1550 slo Stradanus seg ned i Firenze og gikk i tjeneste hos Giorgio Vasari og Medici-familien. Sammen med Francesco Salviati arbeidet han på utsmykkingen av Belvedere i nærheten av Vatikanet. Tilbake i Firenze var han engasjert i utsmykkingen av Palazzo Vecchio og i Poggio a Caiano.