Gjensynet med 1. divisjon ble kortvarig, for Manglerud Star endte på 13.-plass og rykket rett ned til 2. divisjon igjen foran 2007-sesongen. Noen få sentrale spillere forlot nå klubben, og det samme gjorde trener Geir Midtsian. Ny trener før 2007-sesongen ble den unge Håkon Grøttland, og det kom også til noen nye, spennende spillere til MS Toppfotball.