Forlaget var fra 2008 til 2010 registrert som en vitenskapelig publiseringskanal på nivå 1 i Norsk vitenskapsindeks. Et av kravene for slik registrering, og som regel for å regnes som vitenskapelig i vitenskapssamfunnet, er at forlaget har fagfellevurdering og at publikasjoner ellers gjennomgår normal redaksjonell behandling, krav som VDM Verlag aldri har oppfylt. Publiseringsutvalget i Universitets- og høgskolerådet vedtok i august 2010, etter å ha fått en rekke bekymringsmeldinger om forlaget, å nedjustere forlaget til nivå 0 (ikke-tellende) med virkning fra 1. januar 2011 på bakgrunn av "manglende rutiner for fagfellevurdering", og forlaget er etter dette ikke lenger anerkjent som en vitenskapelig publiseringskanal i Norsk vitenskapsindeks.