Fianna Fáil vant tilbake regjeringsmakten i 1957, denne gang med majoritet i Dáil. MacEntee ble denne gang helseminister, mens Lemass og andre som ønsket å gå over fra proteksjonisme til frihandel fikk hånd om det økonomiske. Denne gang gikk det bedre for MacEntee, som reorganiserte helsevesenet, etablerte separate avdelinger for helse og sosialtjenester og introduserte fluor i drikkevannet. I 1959 ble han tánaiste, mens Lemass ble taoiseach.