Thowsen har gitt ut flere album under eget navn. Han vant Spellemannprisen 1977 i jazz sammen med Jon Christensen for albumet og Spellemannprisen 1979 i jazz for sitt album . Han har også deltatt på flere albuminnspillinger med andre, blant annet har han spilt på rundt ti album med Ketil Bjørnstad og deltatt på innspillinger med Ole Paus og Finn Kalvik, såvel som Sinikka Langeland.