Guadet ble en merket mann etter Girondens fall. Da arrestordre mot ham ble utstedt den 2. juli 1793, flyktet han til Caen, og deretter gjemte han seg i sin fars hus i Saint-Émilion. Han ble oppdaget, og ført til Bordeaux. Der, etter at hans identitet var blitt bragt på det rene, ble han giljotinert.