Ecuador var med på sitt første Søramerikamesterskap i 1995. Ecuador greide seg tålelig og fikk en 4.-plass av fem lag. De var bak Chile på målforskjell, men godt bak Argentina og Brasil. i 1998 gikk det litt bedre. På grunn av øk interesse, var søramerikamesterskapet omgjort til to puljer der vinner og nummer to kom til semifinale. Ecuador kom videre i sin gruppe sammen med Argentina. I semifinalen møtte Ecuador Brasil, som var ustoppelige i denne turneringen. Brasil vant komfotabelt 11-0. Ecuador møtte Peru i bronsefinalen, og tapte på straffespark. I 2003 kom ikke Ecuador videre fra sin innledende pulje på grunn av målforskjell. Heller ikke i 2006 kom de videre, etter at de tapte siste gruppespillsmatch mot Uruguay med ett mål.