Spillet handler om hovedpersonen som blir utvalgt som «Inquisitor» og prøver å løse borgerkrigen på kontinentet Thedas og lukke en mystisk åpning i himmelen kalte «Breach», som slipper løs farlige demoner i verdenen. «Inquisitor»-en blir sett av noen som «den utvalgte» siden karakteren har et merke på hånden sin som gjør han/henne i stand til å lukke «Breach». Spilleren bygger opp inkvisisjonen i et forsøk på å stoppe Corypheus, en gammel «darkspawn», som åpnet bruddet for å erobret Thedas.