Opprinnelig var Jinanuniversitetet i Nanjing og Shanghai. Etter at Folkerepublikken Kina ble utropt i 1949 ble det opphevet ved at dets avdelinger ble tildelt andre universiteter som for eksempel Fudanuniversitetet. Men i 1958 ble Jinanuniversitetet gjenopprettet i Guangzhou.