I 2021 skrev Fosso og Nøland at MDPIs vekst «kan nesten alene forklares av forlagets aggressive fokus på spesialutgivelser, eller såkalte 'special issues'» og at «taktikken er å oversvømme markedet med hastepubliserte spesialnumre for ren profitt. Du som forsker kan oppfattes som en brikke i et større spill om penger og markedsandeler.» Forskerne Anders Skyrud Danielsen og Lars Mølgaard Saxhaug uttalte at MDPI har «beveget seg bort fra rollen som en seriøs vitenskapelig forlegger og over i en slags pengemaskinsvindel».