I juli 2015 vedtok MPP at Kaboré var deres kandidat til presidentvalget 29. november 2015. Ved dette valget fikk Kaboré 53,5% av stemmene i første (og dermed eneste) valgomgang. og han ble tatt i ed som ny president 29. desember samme år. Han utnevnte økonomen Paul Kaba Thieba til ny statsminister 7. januar 2016. Thieba og hans regjering gikk av 19. januar 2019. President Kaboré ga ingen begrunnelse da han kunngjorde avgangen. Han oppnevnte to dager senere Christophe Joseph Marie Dabiré til ny statsminister.