Skuffet og ved dårlig helse overlot han kommando til André Masséna. Han fortsatte deretter sin politiske virksomhet og var en fremtredende motstander av 18 brumaire-kuppet, hvorpå han ble ekskludert fra rådet av fem hundre (fransk: Conseil des Cinq-Cents). Han ble imidlertid raskt forsonet med det nye regimet og aksepterte nye militære og sivile beordringer fra Napoleon. I år 1800 ble han generalinspektør for kavaleri og infanteri og representerte franske interesser i Den cisalpinske republikken.