Den private WinM.U.G.E.N beta hadde en liste med to figurer man kunne velge mellom, sperret spill modus, og påminnelse bilder. Etter som at betaen hadde blitt lekket ut og Elecbyte var borte, tok det ikke lang tid før en "no limit" hack dukket opp. Denne hacken, utgitt av Rou Hei i 2004 fjernet de fleste sperrene. Den ble fulgt opp av flere oppdateringer for takle bugs og slikt. Denne versjonen av M.U.G.E.N. er funksjonelt sett den samme som linux utgivelsen, men med små forskjeller og unike problemstillinger som sentrerer seg mest rundt rett musikk og musikk plugin støtte. På grunn av forandringene fra DOS- og Linux -figurer kreve i i hvert fall at SFF-filene bli modifisert til å vise palettene riktig (merkbart på portretter) i tillegg til noen forandringer i hvordan diverse CNS-skript kontrollers fungerte, noe gjorde noen litt sure og de som fortsatt kunne kjøre DOS-utgaven holdt som regel til det, i tillegg var det flere DOS-patcher til å kunne nedgradere figurene sine til å være kompatible med gamle versjoner av spillmotoren.