Byamugisha sier at han aldri følte seg skyldig for smitten: «The only regret I have is that I lacked information. I have all this education—two degrees, one first class—but I failed a HIV test.» (). I 1996 ble han syk, og gikk ned fordi han ikke hadde tilgang på antiretrovirale medisiner (ARV). Da han så fikk beskjed om at han kun ville leve et halvt år uten ARV brukte biskopen i Kampala kirkens nettverk til å finne givere (en fra USA og en fra Singapore) som begynte å sende medisiner i 1997.