Han vendte tilbake til Peru i mai 1981, og ble nominert i oktober 1981 til Perus ambassadør til Brasil. Perus kongress blokkerte imidlertid utnevnelsen av Pérez de Cuéllar og flere andre ambassadører for dermed å ydmyke landets president, noe som førte til at Pérez de Cuéllar i protest sa opp seg fra diplomatkorpset.