Abd al-Latifs regjeringstid ble av kort varighet. Allerede etter seks måneder ble han drept i en sammensvergelse av adelsmenn og klanledere, og de satte Abdullah Mirza fri og utropte ham til emir i Samarkand. Timuridriket var nå i praksis delt i flere regioner som følge av arvestriden etter Shah Rukhs død. Sultan Muhammad regjerte i Fars-provinsen, og Abu Sa'id Mirza (sønn av Shah Rukhs bror Miran Shah) hadde kontrollen i Bukhara.