Etter 1950 arbeidet han suksessivt i kirkelig administrasjon i Rostín ved Zlín (den gang Gottwaldov), Velehrad (1954–1959) og Uherské Brod (1959–1963). Deretter kom han til Olomouc, hvor han ble kannik og vikar for domkapitlet. Denne forfremmelsen, oppnådd hovedsakelig på grunn av press fra kommunistiske myndigheter, var wn følge hans fleksibilitet og vilje til å tilpasse seg kravene til Statens kontor for kirkesaker. Fra 1964 samarbeidet han med statssikkerhetstjenesten som agent.