I 1926 ankommer den britiske trollmannen og zoolog Newton «Newt» Scamander til New York City. Han observerer Mary Lou Barebone, den ikke-magiske lederen for New Salem Philanthropic Society, som forkynner at hekser og trollmenn er ekte - men veldig farlige. I et forsøk på å få tak i en Niffler, som hadde stukket av fra kofferten hans som inneholder magiske skapninger. Newt møter Jacob Kowalski, en aspirerende baker - og de bytter kofferter uten å være klar over det. Porpentina «Tina» Goldstein, en degradert Auror fra Magical Congress of the United States (MACUSA) som arresterer Newt for å ha brutt magiske lover.