Den 5. november 2011 ble erkebiskop Betori utsatt for et mulig drapsforsøk. Den unidentifiserte attentatsmannen man konfronterte erkebiskopen utenfor kontoret hans, skjøt og såret hans sekretær i mageregionen og viftet med pistolen mot errkebiskopen før han rømte. Sekretæren, fader Paolo Brogi, ble operert. Betori og vitner sa at pistolmannen sa noe mens han gestikulerte med våpenet mot erkebiskopen, men uten å få tak i hva det dreide seg om. Firenzes prefekt Paolo Padoin forordnet sterkere politibeskyttelse for biskop Betori.