Den 14. november 1942 utnevnte pave Pius XII ham til titulærbiskop av og koadjutor-biskop av bispedømmet Cleveland. Med biskop Joseph Schrembs' død 2. november 1945, etterfulgte han ham som biskop av Cleveland. De første årene av hans embetsperiode var preget av utvidelse og renovering av katedralen , som tidligere hadde blitt utsatt på grunn av andre verdenskrig. Hoban var i stand til å innvie den fornyede katedralen 4. september 1948.