Dyrelivet på Stavernsøya er fattig, mest på grunn av det lille arealet, og fordi det er så mange mennesker der ofte. Men det lever blant annet fasaner der, frosk, salamander, mus, vånd, mink, gjøk, måke, biller, snegler og andre virvelløse dyr. Det hender at det kommer hubro inn til øya. Det har hendt at elg og rådyr har svømt over, men har svømt tilbake til fastlandet. Hvert år blir det satt ut villsau for å holde nedgroingen der i sjakk, men når sommeren er over blir de hentet inn. Øya er lite dekket av skog, mest på grunn av øya er av granitt, men øya er også dekket av store sletter.