Under annen verdenskrig ble øya okkupert av japanerne, som begynte landsettingen av styrker i april 1942. Nordmannen Brynjolv Baardson hadde vervet seg til de amerikanske styrkene på Filippinene i januar 1942, og ga i 1981 ut boken der han blant annet forteller om det japanske angrepet på Cebu. I mars 1945 inntok amerikanske styrker Cebu og fordrev japanerne.