I 2003 sluttet Red Hat å arbeide med Red Hat Linux, til fordel for den frie distribusjonen Fedora (som utvikles av brukernettverket Fedora Project) og den kommersielle distribusjonen Red Hat Enterprise Linux (RHEL). Siste versjon var Red Hat Linux 9, som ble lansert 31. mars 2003. Oppdateringer ble lansert av prosjektet Fedora Legacy inntil dette ble nedlagt 9. februar 2007.