I slår Picard seg sammen med kaptein James T. Kirk fra «Enterprise» i det 23. århundre for å kjempe mot filmens skurk, Dr. Tolian Soran. Etter at «Enterprise-D» blir ødelagt i , tar Picard kommandoen over det nye stjerneskipet USS «Enterprise-E». Der møter han igjen Borg kollektivet og deres dronning i . Senere forsvarer han (en ikke-innblandingsregel for å beskytte mindre utviklede sivilisasjoner) og kjemper mot tvangsflyttingen av Ba'ku folket i . I står han overfor Shinzon, en Romulansk klone av seg selv, og opplever at Data ofrer seg for å beseire Shinzon og bidra til å gjenopprette politisk stabilitet på Romulus.