Etter at han ble 21 år, innså Didier Drogba at han måtte etablere seg som fotballspiller snart, ellers ville han ha liten sjanse til å bli en profesjonell fotballspiller. Han gjorde sin debut for Le Mans kort tid etter og signerte sin første profesjonelle kontrakt i 1999. Drogbas personlige liv var også stadig mer alvorlig ved at han nå var gift med maliske Lalla Diakité og de hadde fått sitt første barn, Isaac. Han vokste til sitt nye ansvar, uttalte senere at: «Isaks fødsel var et vendepunkt i livet mitt, det rettet meg opp». Hans første sesong, der han scoret syv mål i 30 kamper, lovet godt for fremtiden. Men i sesongen etter greide han ikke å leve opp til forventningene, og Didier Drogba mistet plassen sin til Daniel Cousin på grunn av en skade. Da han kom tilbake etter skaden, klarte han ikke å score et eneste mål resten av sesongen. Imidlertid kom han tilbake den neste sesongen, der han scoret 5 mål på 21 kamper.