Etter at Collins la skoene på hylla i 2003, bodde han i lengre tid sammen med familien i Monaco, mens han også tok utdannelse som trener etter UEFAs reglement. Den 31. oktober 2006 ble Collins utnevnt til manager for Hibernian. Collins ledet Hibernian til deres første trofé på over 15 år, da de slo Kilmarnock 5–1 i ligacupfinalen i 2007.