Regionen inkluderte tre underregioner («Sous-Regions» på fransk): Nord-Kivu, Sør-Kivu og Maniema, som er de samme som de tre nåværende provinsene som ble opprettet i 1988. Hovedstaden i Kivuregionen var i Bukavu, og hovedstedene i de tre underregionene var i Goma, Uvira og Kindu.