I løpet av sin 20-årige historie flyselskapet fikk fire dødelig, og fem ikke-fatale ulykker. Den 25. november 1950 havarerte en Eagle Aviation Handley Page Halifax C.8 (registrering G-AIAP) under takeoff fra Kolkata internasjonale lufthavn. Flyet var chartret av BOAC og var underveis til Singapore. Av seks besetning omkom to. Det var ingen passasjerer om bord. Natten til 1. mai 1957 havarerte en Eagle Vickers Viking på Blackbushe. Flyet var på vei til Libya med soldater. Under retur til flyplasser etter en avbrutt take-of ble det forsøkt en nødlanding to minutter etter takeoff. Høyre vingespiss kom i kontakt med bakken ved Star Hill like før baneterskelen. Flyet tok fyr og 34 Av de 35 om bord omkom. Den 9. august 1961 havarerte en Cunard Eagle Vickers 610 Viking 3B (registrering: G-AHPM), Under en flyvning fra London Heathrow nær Stavanger under innflyvning til Stavanger lufthavn, Sola. Flyet kom fra Heathrow. Ulykken førte til at alle 39 om bord (3 besetning, 34 skolegutter og to lærere) omkom. Skoleguttene kom The Archbishop Lanfranc School i Thornton Heath, London. Havarikommisjonen konkluderte at piloten var ute av kurs av ukjente årsaker. Flyet havarerte i Holtaheia og er kjent som Holtaheia-ulykken. Den 29. februar 1964 traff en Bristol 175 Britannia 312 registrering: G-AOVO operating flight EG 802/6 i rute fra London Heathrow til Innsbruck den bratte østre side av Glungezer-fjellet, under innflyvning gjennom skydekket til Innsbruck Kranebitten Airport. Alle 83 om bord, åtte besetning og 75 passasjerer omkomon. Dette var selskapets verste ulykke . Den primære årsak var den fatale beslutning om å gå under sikker minimumshøyde. Den 20. april 1967 måtte en British Eagle Bristol 175 Britannia 308F (registrering: G-ANCG) Inder en charter-tur med passasjerer fra London Heathrow til Kuwait nødlande på RAF Manston etter at besetningen oppdaget problemer med å låse understellet etter at det var trukket inn. Det var ingen omkomne blant de 65 om bord, (eleve besetning og 54 passasjerer).. Den 9. august 1968 havarerte en British Eagle Vickers Viscount 739A (registration: G-ATFN) i Vest-Tyskland på München—Nürnberg highway nær Langenbrück. Flyet opererte en rute fra Gatwick til Insbruck. Flyet gikk i oppløsning da det traff bakken. Alle 48 om bord (fire besetning og 44 passasjerer) omkom.