Den 31. mars 1984 ble han utnevnt til koadjutor-erkebiskop av Cagayan de Oro av pave Johannes Paul II og innsatt i embedet den 31. mai samme år. Da Patrick H. Cronin SSCME gikk av med pensjon den 5. januar 1988, etterfulgte han ham i embetet som erkebiskop av Cagayan de Oro.