Fra midten av sommeren 2012 var byen under angrep fra væpnede militante sunnimuslimer fra nabobyene. Mange sjiamuslimwr og pro-statlige familier ble fordrevne fra sine hjem sør i Damaskus og søkte tilflukt i Sayyidah Zaynab. Bombeangrep ble mer vanlige i denne hovedsaklig sjiamuslimske byen. I januar 2013 landet en bombe på Sayyidah Zaynab-moskéen og førte til noe skade på en av minaretene.