Myskemaure vokser i steinrik barskog og andre fuktige og skyggefulle steder. Den er vanlig i Nord-Amerika fra Alaska, Canada og sørlige Grønland til Mexico. I Europa finnes den i Fennoskandia, Sveits, Baltikum, Belarus og Russland. I Asia forekommer myskemaure i Sibir inkludert Kamtsjatka og lenger sørover i Himalaya, sentrale Kina, Korea og Japan.