Naggum var leder for SGML SIGhyper, en interessegruppe for hypertekst og multimedia (se HyTime). Hans tekniske kommentarer til ISO 8879:1986, tilgjengelig i arkivene til comp.text.sgml, ble høyt verdsatt, både på grunn av sin høye kvalitet og sitt store volum. Senere tok han avstand fra SGML – spesielt XML – og kritiserte det han mente var galt med dem.