I tillegg kommer Darth Maul, som slår seg sammen med Death Watch og andre kriminelle syndikater for å overta Mandalore og hevne seg på Obi-Wan. I tillegg får Ahsoka skylden for å ha bombet Jedi-tempelet, og hun må bevise sin uskyld samtidig som hun er på flukt fra republikken. Selv om hun til slutt blir frikjent for alle anklagene mot henne (etter at Anakin fanger den virkelige skyldige) velger Ahsoka likevel å forlate Jedi-ordenen, til tross for Anakins motvilje.