Scacchi var en produktiv komponist som skrev messer, madrigaler og kirkekonserter. Et oratorium og nesten all scenemusikken er tapt. Han benyttet seg flittig av en venetianskinspirert flerkorsteknikk og stilen kan beskrives som en syntese av læreren Anerios romerske stil og stilen til Claudio Monteverdi.