Svendsen åpnet verdenscupen 2008/09 med en tredjeplass på normaldistansen i Östersund før han vant sprinten, tross en bom. På jaktstarten tok han sin tredje pallplass av tre mulige, en tredjeplass. Fem dager senere vant han den første sprinten i Hochfilzen med nesten et halvt minutt. Svendsen hadde aldri greid å vinne en jaktstart etter å ha startet som nummer en, men det endret seg da han også vant jaktstarten foran Ole Einar Bjørndalen og polske Tomasz Sikora. På dette tidspunktet ledet Svendsen verdenscupen klart foran Sikora.