Eichmann ga Dannecker oppdrag å gjennomføre deportasjoner fra Frankrike. Dannecker forsto ikke at det tyskvennlige Vichy-regimet betraktet landets jødiske innbyggere som franskmenn. I sin tid i Frankrike begynte Dannecker forretningsvirksomhet i form av en kjede nattklubber som han tjente godt på. Dannecker ble da fjernet fra Frankrike og tiltalt for korrupsjon. Deportasjoner fra det okkuperte Frankrike begynte i 1942 og ble kamuflert som «forflytninger».