På grunn av Storbritannias akutte transporthelikoptermangel i Afghanistan, inngikk den britiske og danske regjering en avtale som medførte at «danske» Merlin i juni og juli 2007 ble ombygget til RAFs transporthelikopterstandard, og fikk RAF-typebetegnelsen HC.3A. Denne har nyere rotorblader (type BERP IV mot de danske BERP III), som gir 600 kg mer løfteevne eller en økt rekkevidde på ca. 100–150 km. Samtidig inngikk den britiske regjering en kontrakt med AgustaWestland-fabrikken om å bygge erstatningshelikoptre til Danmark, således at Flyvevåbnet senest i 2009 ville motta seks nye Merlin EH101-helikoptre.