Bouhler var leder for T4, men deltok lite i daglig drift som var overlatt til sin nestkommanderende Viktor Brack. Brack var landbrukesutdannet og ikke medisiner. T4 og Hitlers privatkansellis ledende rolle ble kamuflert. Barneaksjonen ble kamuflert som en nasjonal komite, mens voksenprogrammet ble kamuflert bak fire virksomheter kalt veldedige stiftelser og regnskapskontor. Regnskapskontoret krevde inn betaling for pleie av pasienter som var avlivet og fikk dermed et overskudd som finansierte den hemmelige driften. Transport til de seks avlivingssentrene ble utført av forkortet Gekrat.