Det stammer fra misjonsaktiviteten startet av London Missionary Society i 1797 og overtatt av Société des missions évangéliques de Paris i 1863. Gjennom misjonsselskapet i Paris var kirken knyttet til Den franske reformerte kirke. Kirken ble selvstendig i 1963 med navnet Église évangélique de Polynésie français (EEPF). I 2004 skiftet den navn til Église protestante ma'ohi.