Klosterstaten rundt fyrstabbediet St. Gallen hadde allerede vært et «vennligsinnet sted» (dvs. alliansepartner av det sveitsiske edsforbundet) siden 1451. Likevel er ikke dagens kanton noen historisk enhet, selv om det tidligere abbediet utgjør en stor del av den. Kantonen St. Gallen ble først grunnlagt i 1803 ved sammenslåingen av de to kantonene Linth (minus Glarus og Schwyz) og Säntis (minus Appenzell). Disse hadde i sin tur blitt dannet fem år tidligere ved en sammenslåing av diverse sveitsiske kantoner, vasallstater og uavhengige områder.