Hedeager tok lærereksamen i 1970 og magistergrad i forhistorisk arkeologi ved Københavns Universitet i 1978. Hun tok graden som dr.phil. ved Århus Universitet 1990. Hun har tidligere vært ansatt ved Lunds universitet og Københavns Universitet. Hedeager er en av Nordens ledende eksperter på nordisk og europeisk jernalder og tidlig middelalder. Hun har arbeidet mye for tverrfaglig samarbeid .