Hartmann Schedel studerte først humaniora i Leipzig fra 1456 til 1462. Deretter fulgte han sin lærer Peter Luder til Padova, der han studerte medisin. Han studerte samme sted, som en av de første tyskere, klassisk gresk under Demetrios Khalkondydes. I 1466 tok han doktorgrad i medisin, men faget forble et sidespor i hans liv; det var bøker og humaniora som opptok ham mest.