Sligobukten er en naturlig havn kjent i flere tusen år, kjent for greske, fønikiske og romerske handelsmenn, ettersom området muligens kan være stedet merket som byen Nagnata på Klaudios Ptolemaios’ koordinerte kart over verden fra det andre århundre e.Kr. I løpet av tidlig middelalder ble stedet som er dagens Sligo overskygget av viktigheten av det store klosteret grunnlagt av Columba av Iona rundt 8 km mot nord ved Drumcliff. På 1100-tallet eksisterte det en bro og en liten bosetning på stedet for den nåværende byen.