Området Matusadona nasjonalpark ligger i har to forskjellige klimatyper. Den sørlige delen har fjell-lignende terreng over 1 000 moh med åsrygger kledd med krattskog. Her er det kjøligere og tørrere enn den nordlige delen som utgjøres av Zambezi-dalen omkring 500 moh. Nord-delen har tropisk klima med varmt og fuktig vær. Temperaturen kan komme opp i 40 grader om sommeren, mens vintertemperaturen kan synke under 10 grader. Regntiden er fra november til april med januar som den våteste måneden.