Nyatanga, som gikk på Derby County sitt fotballakademi, skrev under på sin første profesjonelle kontrakt med Derby County, en 2-årskontrakt, den 18. august 2005. Sin første obligatoriske kamp for spilte han den 24. august 2005 mot Grimsby Town i den første runden av Ligacupen. I ligasammenheng debuterte han i hjemmekampen mot Stoke City den 15. oktober 2005, og den 22. november 2005 scoret Nyatanga sitt første mål for Derby i bortekampen mot Stoke. Totalt fikk han med seg 24 ligakamper og han laget 1 ligamål i 2005/06-sesongen.