Fra 1978 til 1981 var Ahmed Zia sjef for Qarargah of Paryan i Haut-Panjsher, og ledet motstanden i hele dalen. Mellom 1981 og april 1992, gjorde hans kommandant (Ahmed Shah Massoud) han til sin spesielle representant i Jamiat-e-Islami partiet i Peshawar Pakistan, der de syv viktigste partiene i den afghanske motstanden møttes. I denne perioden vedlikeholdt og økte han sine kontakter med de afghanske politiske lederne, inklusive diplomater og internasjonale organisasjoner; i tillegg reiste han utenlands for å arbeide for motstandssaken.