Under en veldedighetskonsert i Paris, Frankrike blir Dave alvorlig skadet. Når Dave ligger på sykehus ber han sin tante, Jackie, om å ta vare på Alvin og resten av gjengen. De skal også begynne ved en skole, West Eastman High School. Men når tante Jackie også havner i en ulykke, havner gjengen hos Toby, Jackies barnebarn. I mellomtiden bor Ian Hawke, som har blitt hjemløs og fullstendig blakk etter den første filmen, i kjelleren til JETT Records. Tre syngende kvinnelige jordekorn, Brittany, Jeanette og Eleanor, kjent under navnet , blir oppdaget og ansatt av Ian Hawke i et forsøk på å gjenopplive karrieren hans. På skolen blir Alvin, Simon og Theodore latterliggjort og mobbet av enkelte elever. Skolens rektor Rubin, er en stor fan av musikken deres. Hun hjelper dem med å melde dem på en musikk-konkurranse mellom forskjellige skoler, som heter Battle of the Bands.