Men i et tilbakeblikk arbeider hun fremdeles som undercover for FBI, som en CIA-rekrutt - for å avdekke AIC, en korrupt fraksjon innenfor FBI. I den nåværende tidslinjen blir det tatt flere gisler under et G20-toppmøte i New York City initiert av Citizens Liberation Front - en terror-fraksjon. To uker etter denne krisen grunnlegger USAs president Claire Haas og CIA-direktør Matthew Keyes en hemmelig arbeidsgruppe med agenter fra både CIA og FBI arbeidsgruppe. Den tredje sesongen er satt til tre år senere. Etter å ha bodd i all hemmelighet i Italia, blir Parrish tvunget til å returnere til USA. Hun må deretter rekruttere en rekke av hennes tidligere kollegaer, til ett nytt hemmelig oppdrag.