Suksessen i Saunier Duval-laget førte til at en rekke store lag fikk øynene opp for den lille spanjolen, og Rodríguez signerte før 2006-sesongen kontrakt med Caisse d'Epargne. I det nye laget fikk han rollen som hjelperytter, men han fikk også muligheten til å kjøre egne sjanser i enkelt løp. 2006-sesongen var foruten seieren på 5. etappe under Paris–Nice, en sesong preget av få resultater.