Etter krigen levde Frauendorfer lenge under falsk navn. Senere ble han direktør for forsikringsselskapet , Stuttgart og , Westberlin-München. I tillegg var han visekasserer i det bayerske kristenkonservative partiet CSU. På slutten av 1950- og 1960-tallet prøvde Frauendorfer å komme inn i den tyske Forbundsdagen gjennom partiet CSU, men måtte nøye seg med en plass som vararepresentant. Hans kandidatur vakte oppsikt i mediene og en tysk-israelsk studentgruppe organiserte protester. Det ble også stilt spørsmål om hvorvidt han hadde deltatt i motstandsbevegelsen mot Hitler (slik han selv hevdet) og hvorfor han hadde levde under falsk navn så lenge etter krigen.