Hovedpersonen, Sofie, mottar uventet flere mystiske brev med filosofiske spørsmål. Mange av brevene står under navnet Hilde Møller Knag. Etter hvert får hun et helt brevkurs i filosofiens historie som starter med mytene om de første greske filosofene. Deretter fortsetter kurset med Sokrates, Platon og Aristoteles helt opp til middelalderen. En dag møter hun filosofilæreren, Alberto Knox, som tar henne tilbake til middelalderen og forklarer om tidens filosofitenking. Under reisen møter hun viktige personer som Kant, Kierkegaard, Darwin og Freud.