I 2016 vant Okparaebo 60 meter i NM i friidrett innendørs 2016, som ble arrangert i Rudhallen i Bærum. Hun løp på 7,17 sekunder, som var ny mesterskapsrekord og 0,07 sekunder fra hennes egen norgesrekord. Hun innledet utendørssesongen 30. april i Clermont i Florida i USA, i PURE Athletics Spring Invitational, der hun løp 100 meter på 11,28, og oppfylte med det kravet til Sommer-OL 2016.