NSD hadde en egen seksjon for personvern som behandlet prosjektsøknader fra rundt 150 institusjoner og gav råd om personvern til forskere og studenter. Etter vedtak i Stortinget ble NSD med virkning fra 1. januar 2003 organisert som et aksjeselskap heleid av Kirke- og undervisningsdepartementet. NSD hadde hovedkontor i Bergen. NSD utgav to ganger i året nyhetsbrevet .