Foruten Forsvarets Høyskole gikk generalmajor Thommessen på en rekke høyere militære skoler og tok flere kurs, blant annet i regi av NATO. I vel et halvt år i 1946 var han adjutant for H.K.H. Kronprins Olav, og i 1959 og 1960 var han overadjutant ved adjutantstaben til H.M. Kong Olav V.