Marmaray betyr samtidig en oppgradering av hele Istanbuls forstadsbanenett på 76 km mellom Gebze og Halkali. Togene skal kunne kjøre med en toppfart på 100 km/t og en frekvens på to minutter, noe som betyr at kapasiteten øker fra 10 000 til 75 000 passasjerer per time.