Howard ble oppdratt av John Foxe, en protestantisk martyrolog, som hele livet ble understøttet av Howard. Hans far døde før bestefaren slik at Howard arvet hertugdømmet Norfolk da hans bestefar, Thomas Howard, 3. hertug av Norfolk, døde i 1554. Howard fikk tilliten til dronning Elisabeth I med en posisjon til tross for familiens historie og hans egen tidligere støtte for katolisismens sak, skjønt han hevdet selv å være en protestant.