Nedbørfeltet omfatter alpine fjell med isbreer og innsjøer, og størstedelen ligger i høyfjellet. Vannet er svært klart med få arter. Indre Sunnmøre er kjennetegnet ved dype fjorder og daler som skjærer seg inn i alpine fjell. Geirangerdalen er bratt med flere markerte trappetrinn i lengdeprofilen. Hovedelven og sideelvene har skåret seg dypt ned i grunnen og vann går derfor i mange fosser og stryk, blant annet i Flydalsjuvet og Storsæterfossen. Klimaet i nedbørfeltet er svakt oseanisk med årsnedbør på 1000-1500 mm i lavlandet og 1500-2000 i høyden. Elven er kanalisert gjennom jordbruksområdene i Flydal og Opplendskedal, og forbygd gjennom bebyggelsen i sentrum.