Knaben var deretter universitetsstipendiat før hun ble universitetslektor ved Universitetet i Oslo. Taksonomi og kromosomforhold hos fjellplanter var de viktigste feltene i Knabens forskning. I 1954 skilte hun ut oslosildre som en egen art. Hun brukte mye tid på å studere fjellvalmuer med krysningsforsøk og kromosomstudier, og tok i 1960 dr.philos.-graden med en avhandling om dette temaet. I 1971 ble hun utnevnt til dosent ved Universitetet i Oslo.