Ramphele har fått atten æresgrader og flere priser, blant annet: Honorary Doctor of Law fra University of Cambridge i 2001. Honorary Doctorate i Humane Letters fra Hunter College ved City University of New York i 1984. Honorary Doctor of Science fra Tufts University i 1991. Honorary Doctorate in Medicine fra University of Natal. The Medal of Distinction fra Barnard College i USA. Honorary Doctorate of Humane Letters fra New York University i 2007. Ramphele er også en tidligere fellow ved Bunting Institute og ble valgt til æresmedlem ved Alpha og Iota-chapterne av Phi Beta Kappa ved Radcliffe College og Harvard College.