Sideelvene omfatter Río Sulaco, Río Humuya, Río Blanco, Río Otoro, Río Jicatuyo, og nederst den meget store Río Chamelecon som deler deltaet med Ulúa-elva. er ei mindre sideelv og renner blant annet gjennom byen Comayagua 80 km fra hovedstaden Tegucigalpa. Den er regulert gjennom El Cajón-demningen.