Trond Bjørndal, som hadde vært assistenttrener under Johansson, var sammen med Morten Damhagen Løv-Hams trenere denne sesongen. Oppturen fra andre halvdel av sesongen 2005 fortsatte i første halvdel av 2006, men i høstsesongen stoppet det fullstendig opp for Løv-Ham. Laget raste på tabellen og sikret ellevteplass og fortsatt spill i første divisjon for 2007-sesongen da de utliknet til 2–2 mot serievinner Strømsgodset da det gjenstod syv minutter av sesongen. I cupen ble Løv-Ham slått ut av Aalesunds fotballklubb i tredje runde. Den 9. november ble det klart at Bjørndal og Damhagen sluttet som trenerteam i Løv-Ham. Styret i klubben og trenerne selv ble enige om ikke å forlenge samarbeidet. 12. desember 2006 presenterte klubben Trond Amundsen som ny trener, etter at flere andre navn hadde vært inne i bildet.