Fra 1974 til 1980 var han politiadjutant og undervisningsleder ved Politiskolen. I 1980 ble han utnevnt til politimester i Bodø, og samtidig sjef for Hovedredningssentralen Nord-Norge og Overvåkningstjenesten i nord. Fra 1985 til 1990 var han ekspedisjonssjef i Justisdepartementet og direktør for Fengselsstyret, dvs. øverste leder for det norske fengselsvesenet. Fra 1990 til 1992 var Wegner sjef for Politihøgskoleprosjektet og ledet arbeidet med å forberede opprettelsen av Politihøgskolen.