Den 25. juni 1960 ble McCormick utnevnt av pave Johannes XXIII til biskop av Altoona-Johnstown. Innsettelsen i embedet fra sted den 21. september 1960. Han deltok han på Det andre Vatikankonsil fra 1962 til 1965. I løpet av sin periode hadde McCormick tilsyn med en rekke kirkelige prosjekter, inkludert bygging av et sykehjem og en barnehage.