Inntil nylig hadde klubben aldri kommet lenger enn til kvartfinalen i Mesterligaen, men i 2005–06 var Arsenal den første klubben fra London som nådde finalen i konkurransens femtiårige historie. Arsenal ble slått 2–1 av i finalen. Arsenal spilte med ti mann i store deler av kampen, etter at keeperen, Jens Lehmann ble utvist i det 18. spilleminutt av den norske dommeren Terje Hauge.