Flyet ble truffet av to missiler avfyrt fra det amerikanske marinefartøyet. Det hadde vært sammenstøt mellom amerikanske og iranske styrker i området like før nedskytningen fant sted. To iranske kanonbåter ble senket og en skadet. USA beklaget nedskytningen, men hevdet samtidig at den skjedde i selvforsvar. Kommandanten ombord på Vincennes, William C. Rogers, hevdet at han trodde skipet var i ferd med å bli angrepet av jagerfly, og avfyrte missilene for å forsvare seg. Iran betegnet nedskytingen som en massakre av uskyldige passasjerer og truet USA med full krig.