Hun vokste opp i Trondheim, eldst i en søskenflokk på 12. Hennes far la vekt på at kvinners hodeskalle er mindre enn menns, med flere av de trekk som kjennetegnet «lavere raser», så i hans øyne var kvinner til hinder for fremskritt og utvikling. I 1883 giftet hun seg med overlærer og major Peter Anker Ragnvald Munch (1853–1920; se Munch), en fetter av maleren Edvard Munch. Paret fikk datteren Signe i januar 1884, men ekteskapet ble senere oppløst. Anna hadde tatt eksamen på Nissens Pigeskoles voksenkurs, men da hun som gift kone ønsket å skrive, skal ektefellen ha nektet henne dette og angivelig «».