Ifølge egne tall består flåten til JetBlue består av 95 Airbus A320 med 156 seter for bruk på større og tyngre ruter og 18 Embraer 190 med 100 seter på mindre ruter. Hele flyflåten er utstyrt med lærseter og TV for hver passasjer. For å oppmuntre passasjerer til å trekke bakover i flyet har seteradene bak vingen om lag 5 cm mer plass til beina enn setene foran. De fleste flyene har navn med «Blue» eller «Bleu» i seg.