Da Bratlie mot slutten av 1980-årene overlot stadig mer av ansvaret for menigheten på verdensbasis til Smith, ble det også rettet kritikk mot Smith personlig av de som ikke ønsket han som leder. Ifølge Smith, gjaldt hoveddelen av kritikken hans mer liberale holdning til regler og påbud om klesdrakt og livsførsel. Det ble også rettet anklager mot ham av økonomisk karakter, noe som utløste en granskning av økonomien til både Smith og hans eiendomsselskap, som opplevde eiendomsmarkedets fall i samme tidsrom. Mange mente at Bratlie burde stoppe det de kalte en forfølgelse av Smith, men Bratlie mente det bare var bra at Smith, som jo skulle overta ansvaret etter ham, ble gått etter litt i sømmene, noe Smith ikke motsatte seg. Bratlies holdning var Resultatet av undersøkelsene overbeviste imidlertid ikke Bratlie om at Smith var uskikket for oppgaven, og både Bratlie og medforstander Aksel J. Smith uttalte siden at mye av årsaken til anklagene var misunnelse.