Yukon har åtte kommuner (), hvorav sju har status som og en, hovedstaden Whitehorse, har status som . Over to tredjedeler av befolkningen ( innbyggere, 69,9 %) er bosatt i Whitehorse, som er territoriets største kommune. Kommuneadministrasjoner kan bli opprettet av Yukons regjering i samsvar med fra 2001. Kommunene har blant annet ansvar for veier og annen infrastruktur, arealbruk, helsehjelp og offentlig sikkerhet innenfor sitt område.