Det første frie presidentvalget i Guinea-Bissau fant sted den 3. juli 1994. I den første valgomgangen fikk president João Bernardo Vieira, som har sittet ved makten siden 1980, 46,2 % av stemmene, etterfulgt av Ialá med 21,88 %. Den 7. august 1994 vant Vieira andre valgomgang med 52,02 % mens Ialá fikk 47,98 %. Utenlandske observatører beskrev valget som korrekt, men Ialá protesterte mot resultatet, til ingen nytte. Han godtok resultatet den 20. august, men nektet sitt parti å delta i regjeringen.