Orgelet, som opprinnelig også skal stamme fra Københavns slott, har en formentlig senere tilføyd orgelfasade, med Christian VI og Sophie Magdalenes speilmonogrammer øverst på flanketårnene. I det midtre tårnets toppstykke er innfelt en urskive. Orgelen (minus fasaden) ble siden ombygget av orgelbyggerfirmaet Daniel Köhne i 1878.