Leo gjenforenes med Splinter og brødrene hans. Men Splinter forbyr Ninja Turtles å bekjempe kriminalitet til de kan fungere som et team igjen. De møter et av de 13 skapningene: Bigfoot. Gjengen havner i slåsskamp mot Bigfoot, noe som går mot Leonardo og Splinters ordre, og havner også i konflikt med Foot Clan i prosessen. Når Turtles og Foot Clan slåss, blir en flyktende Bigfoot tatt av generalene. Dagen etter ser Splinter på nyhetene om alle ødeleggelsene etter slaget, og irettesetter dem for å ha vært ulydige mot ham. Raphael besøker senere Casey, og de møter Vampire Succubor, en annen av monstrene. Raphael slutter snart fra hele teamet, og etterforsker videre på egen hånd. Leo, Donnie og Mikey planlegger deres neste trekk, og Donatello oppdager hvor neste portal kommer til å åpne.