Nasjonalparkene Virunga nasjonalpark (Kongo), Volcanoes nasjonalpark (Rwanda) og Mgahinga Gorilla nasjonalpark (Uganda) ligger i fjellområdet. Virungafjellene er hjem til den truede fjellgorillaen, oppført på IUCNs røde liste over truede arter på grunn av tap av habitat, krypskyting, sykdom og krig. I 2018 var det til sammen 604 individer i hele fjellområdet, opp fra 480 i 2010.