Navnet Jizera er av indoeuropeisk opprinnelse som ble tatt opp i keltisk, og som betyr noe slikt som «den rasende, den kraftige, den raske» Ordet er avledet fra det indoeuropeiske ordet i betydningen «heftig, rask, energisk», noe som tilsvarer sanskrit med samme definisjon. Tilsvarende betydning finnes for elven Isar i Tyskland og Isère i Frankrike. Også i andre ikke-keltiske områder finnes tilsvarende navn, eksempelvis elvene Istra i Møre og Romsdal og Istra i Russland, så den vanligste hypotesen for tiden er at navnet har en videre indoeuropesk opprinnelse hvor eller kan bety «strømmende vann». Se flere elver med samme språkopprinnelse under Eisack.