Elizabeth Keen begynner å grave dypere i løgnene som den falske Reddington har fortalt. Sesongen begynner med å nøste opp hvem den falske Reddington egentlig kan være, og hva som har skjedd med den ekte Raymond Reddington. Etter hvert blir Reddington, Elizabeth Keen og resten av FBI Task Force møtt med nye konspirasjoner som truer med å ødelegge dem alle for alltid. En ny antagonist dukker også opp: En amerikansk assisterende riksadvokat og rådgiver for presidenten (spilt av Jennifer Ferrin) som viser seg å være hovedarkitekten bak konspirasjon mot dem, og som samarbeider med en annen person i deres uhyggelige kriminelle plan.