Fujimori frasa seg presidentvervet (ved faks) og gikk i selvpålagt eksil i Japan, hvor han i desember 2000 fikk statsborgerlige rettigheter, ettersom hans fødsel hadde blitt registrert i Kumamoto da han ble født. Flere ledende japanske politikere har støttet Fujimori, delvis på grunn av hans innsats for å avslutte gisselaksjonen mot ambassaden i 1997.