Den ble etablert på initiativ fra byens handelskammer i 1898, og er dermed en av verdens eldste handelsskoler. I 1946 ble den innlemmet i Universitetet i Leipzig, inntil den ble gjort delvis selvstendig igjen i 1969. Etter gjenforeningen av Tyskland ble HHL i 1992, atter på initiativ fra handelskammeret, gjenetablert som en selvstendig, privateid institusjon.