Hefter var først sjelesørger i St. Leonhard im Lavanttal og i Kellerberg (i Weissenstein). I 1896 sendte biskop Kahn ham til Universitetet i Innsbruck for å studere klassiske språk. Hefter besto lærereksamen og fikk doktorgrad i filosofi i 1901. Den unge professor måtte snart slutte som lærer i St. Paul im Lavanttal på grunn av nervøst sammenbrudd. Et opphold på et mentalsykehus førte til fullstendig bedring. Etter et år kom han til Landesgymnasium i Klosterneuburg. Her møtte han Friedrich Gustav Piffl, den senere erkebiskop av Wien, og også var politisk aktiv for Karl Lueger. I 1914 ble han kal t til lærerstilling i Mödling.