Cooper startet sin karriere i Darley Dale før han i 1885 gikk til Derby County der han spilte sin første obligatoriske kamp den 14. november 1885 mot Aston Villa. Sitt første obligatoriske mål for scoret han 30. oktober 1886 da Derby vant 4-1 over Aston Unity. Etter et par sesonger i Derby County spilte Lewis en periode for Grimsby Town før han returnerte til Derby County i juni 1888.