Etter vedtak i NFF fikk Sarpsborg Sparta likevel spille i 1. divisjon, og med ny trener og 4-4-2 briljerte Thioune på sentral midtbane hele sesongen. Med ni målgivende var han tredje best i 1. divisjon, og endte på 2.-plass på VG-børsen. I sesongavslutningen knuste Sarpsborg divisjonsvinneren Odd med hele 5-1 og Thioune var overlegen i midtbaneduellen med Tommy Svindal Larsen. Molde var på tribunen, og bestemte seg for at de ville kjøpe. Sarpsborg og Thorvaldsen ville få opp prisen ved å selge til Stabæk fordi de mente han passet perfekt i deres system, men Stabæk svarte at de ikke visste hvem han var. Viking var interesserte, men valgte å kjøpe Tomasz Sokołowski. Vålerenga, Brann og Lyn var ikke interesserte i Thioune når de ble forespurt.