Tomáš Galis ble presteviet for bispedømmet Banská Bystrica den 6. juni 1976. Den 28. august 1999 utnevnte pave Johannes Paul II ham til titulærbiskop av og til hjelpebiskop i Banská Bystrica. Biskopen av Banská Bystrica, Rudolf Baláž, ordinerte ham til biskop den 25. september samme år; Medkonsekratorer var tidligere hjelpebiskop i Banská Bystrica, Peter Dubovský SJ, og den apostoliske nuntius til Slovakia, erkebiskop Luigi Dossena.