Den 21. august 2013 ble Wesołowski avsatt av pave Frans etter anklager om seksuelt misbruk av mindreårige. Ifølge medier i Den dominikanske republikk skulle diplomaten ha betalt syv mindreårige gutter for seksuelle handlinger. Som diplomat og vatikansk statsborger skulle han stilles for vatikansk domstol; strafferammen var ti års fengsel. Saken skulle begynne 12. juni 2015. I den kanoniske prosess ett år tidligere hadde Kongregasjonen for troslæren den 27. juni 2014 i første instans utelukket ham fra den klerikale stand. Wesołowski anket beslutningen, og annen instans behandling skulle opprinnelig finne sted i oktober 2014.