CISA er en videreføring av National Protection and Programs Directorate (NPPD), en avdeling som ble etablert i DHS i 2007. CISA har blant annet ansvar for Federal Protective Service (FPS), Office av Biometric Identy Management (OBIM), Office of Cyber and Infrastructure Analysis (OCIA), Office of Cybersecurity &amp; Communications (OC&C) og Office of Infrastructure Protection (OIP).