Forrestal sa opp embetet som forsvarsminister den 28. mars 1949 på grunn av ett nervøst sammenbrudd, og la seg selv inn på Bethesda Naval Hospital fem dager senere. Ifølge hans doktor George Raines var diagnosen depresjon eller reaktiv depresjon. Forrestals tilstand virket senere å være i bedring, men på morgenen den 22. mai fant de han død nedenfor et kjøkkenvindu. Kjøkkenet var i 16. etasje og motsatt av Forrestals rom.