Han var en av lederne av den katolske liga, men også guvernør i Picardie og hos kongen. Han ledet et opprør i Picardie i 1587, et forspill til den åpne krigen mellom hertugdømmet Guise og Henrik III av Frankrike. Karl ble den 17. mai 1589 bekjempet ved slaget ved Senlis av Henrik III og Henrik av Navarras forente krefter. Sistnevnte tok ham til fange ved slaget ved Ivry, hvoretter han gikk i eksil.