Det finnes ørret, røye og ål i vannet. Røya ble innført på 1940-tallet fra Røyravatnet, og den forsvant fra Røyravatnet som følge av sur nedbør på 1970-tallet. Nå settes røye den motsatte vegen. I Fjellgardsvatnet har ørreten god og stabil rekruttering, mens røya viser større årlige variasjoner. Ørreten har generelt bedre tilvekst enn røya, og viser mindre variasjon mellom år. Trolig tillater ikke næringsgrunnlaget at fisken blir større enn rundt 30 cm, noe som i hovedsak skyldes en forholdsvis tett ørretbestand.