Den høyeste makta over hele den bulgarske ortodokse kirken utøves av den hellige synoden som omfatter patriarken av Bulgaria og biskopene for eparkiene. Forsamlingenes kirkeliv ledes av forsamlingsprester som er omtrent 1500 i alt. Dessuten har kirken rundt 120 klostere i Bulgaria med omkring 200 munker og nesten like mange nonner.