Yūsufs regjeringstid var en urolig periode kjennetegnet av stadige opprør mot Spania og Frankrike. Det største av disse var det berberske opprøret i Riffjellene ledet av ʿAbd al-Karīm. Selv om dette opprøret startet i Spansk Marokko, den nordlige delen av landet, spredte det seg til den franske delen av landet og ble ikke slått ned av en forent fransk-spansk styrke før i 1925. For å sikre sin egen sikkerhet flyttet Yūsuf sitt hoff fra Fās til ar-Ribāṭ, som siden har vært landets hovedstad.