Jesuittenes generalsuperior, pater Arturo Sosa, kunngjorde deretter den 14. desember 2022 at Rupnik etter en anklage fra året 2019 var blitt dømt og sanksjoner av Vatikanet for å ha gitt sakramental absolusjon for en skriftende som bekjente en synd mot det sjette bud som Rupnik selv hadde vært involvert i. Dette er et kirkerettslig delikt straffbart i henhold til kanonisk lov (; kan. 1378 §1 CIC). Rupnik hadde gitt absolusjon til en kvinne som han hadde overtalt til å delta i seksuell aktivitet med ham. Straffen Rupnik var ilagt var ekskommunikasjon. Men den ble imidlertid opphevet etter at han innrømmet og angret. Til tross for den tidligere uttalelse av 2. desember 2022, stammet restriksjonene for Rupniks tjeneste Det er mulig at det var pave Frans som initierte eller gjennomførte reverseringen av ekskommunikasjonen av sin medbror i jesuittordenen. Det er ukjent når og hvor absolusjonsdeliktet hadde funnet sted. Ordenen sa at Rupnik ikke ville bli ilagt flere straffer bortsett fra sanksjoner av forsiktighets- eller forebyggende hensyn. er , Rupniks saksmappe ble .