I Hajarfjellene finnes en rekke fuglearter, slik som åtselgribb og øregribb (). Blant pattedyr kan nevnes arabisk gasell og arabisk tahr (), som er endemisk til Hajarfjellene. Blant andre endemiske arter kan nevnes en rekke gekkoer og øgler: , og en underart av finnes bare i Oman mens , , , og finnes bare i Hajarfjellene. Ifølge det omanske miljøverndepartementet finnes den utrydningstruede arabiske leoparden fortsatt på Musandam-halvøya.