Etter å ha blitt innvilget asyl i Tyskland, bodde han fra 1980 i mer enn 10 år i Hamburg. Sepúlveda ble lastesbilsjåfør, og kjørte mellom Hamburg og Istanbul. Fra 1982 til 1987 var han mannskap på et Greenpeace-skip og engasjerte seg mot hvalfangst. Han virket også som journalist for Der Spiegel (blant annet under krigen i Angola) og for UNESCO.