Den 21. februar 1997 utnevnte pave Johannes Paul II ham til titulærbiskop av Menefessi og til hjelpebiskop i Guadalajara. Erkebiskopen av Guadalajara, kardinal Juan Sandoval Íñiguez, ordinerte ham til biskop den 19. mars samme år; medkonsekratorer var den apostoliske nuntius til Mexico, erkebiskop Girolamo Prigione, og hjelpebiskop i Guadalajara Adolfo Hernández Hurtado.