Hertug Hans Christian døde den 30. juni 1653 og etterlot sitt len i dyp gjeld og pengenød. Hertuginne Anna styrte heretter som formynderske for sin sønn Christian Adolf (1641-1702), som ble forlent i november 1663. Sitt enkesete tilbrakte Anna på Gammelgaard herregård på Als. Hun døde den 12. desember 1668.