Hospitalskirken er en av de få relativt bygningene i Trondheim fra tidlig 1700-tall som ikke har endret seg betydelig, til tross for bybranner og ombygginger som har endret byens preg. Kirken ble ikke berørt av bybrannen i 1708, og unnslapp også bybrannen i 1842. Bygget er oppført i tømmer som er kledd med panel. Takene over kor og våpenhus er valmet. Pedersen beskriver skipet som en svakt langstrakt åttekant.