Harryhausen hadde sin debut som animatør i 1942 med kortfilmen , der han står kreditert som sjefs-animatør. Samme år hadde han sin debut som produsent på filmen . Harryhausens mest innflytelsesrike film var (1958), hvor man for første gang i filmhistorien så mytologiske vesener slik som drager og kykloper opptre som livaktige, tredimensjonale vesener, side om side med levende skuespillere, og i farver. Den mest populære av hans filmer er (1963), hvorfra man kanskje i særdeleshet husker scenen hvor den greske sagnhelten Jason sloss mot en dødningehær. Harryhausens effekter gjorde et voldsomt inntrykk på datidens publikum.