Den 23. juli 1850 ble han utnevnt av pave Pius IX til biskop for det nye apostoliske vikariat for delstaten New Mexico, og samtidig til titulærbiskop av , og det tok noe tid før denne nyheten nådde ham. Han ble bispeviet den 24. november 1850 averkebiskop Martin Spalding av Louisville; medkonsekrerende var biskop Jacques-Maurice De Saint Palais av Vincennes og biskop Louis Amadeus Rappe av Cleveland.