Han er mindre kjent for de verker han utførte i Spania hvor han blitt overtalt til å utvandre til i 1583. Han fullførte en monumental fresko i 1583 i katedralen i Sevilla, . Han malte i 1587 det samme emnet for kirken i San Miguel, og malte også andre oppbyggelige og religiøse motiver i Sevilla. Ulikt mange andre malere på 1500-tallet praktiserte og kultiverte d’Aleccio kunsten med gravering på kopperplater, kobberstikk. Etter flere år i Spania følte han at hans verker ble verdsatt mindre enn andres, spesielt de til Luis de Vargas, og dro kanskje tilbake til Roma.