Omtrent 2-3 år med Ivan Romanovs styre begynte store problemer for den bulgarske katolske kirke. Allerede høsten 1945 begynte de nye kommunistiske makthavere å utrede mulighetene for inndragning av faste eiendomn i kirkens eie. Frem til 1948 fikk kirken onnkreve husleiene fra egne eiendommer, og så ble disse inntektene stoppet, på grunn av ny lovgivning- Kirken ble fratatt sine skoler, sykehus, barnehjem og andre veldedige institusjoner.