Hans urolige sønn Philip Burne-Jones (1861–1926) ble etter hvert en suksessfull portrettmaler. Hans elskede datter Margaret Burne-Jones (1866–1953) giftet seg med John William Mackail (1850–1945); venn, forfatter og professor i poesi ved Oxford fra 1911 til 1916, og som skrev biografien til William Morris.