Etter en dannelsesreise i Europa returnerte han til København, der han fikk fast ansettelse i Økonomi- og kommersekollegiet. I 1786 ble han «Assessor auscultant», og jobbet blant annet med kontroll av offentlige bedrifter og initiativ til nye foretak. Dette var et springbrett til forretningsverdenen. Det gikk imidlertid dårlig for Mathiesen. Han etablerte en klesfabrikk (kledesmanufaktur) i Moss, men bedriften gikk med tap.