Karapetjan gikk av som ordfører 28. oktober 2011, noe som førte til at Taron Margarjan tok over for han i november 2011. Etter at han gikk av som ordfører dro han til Russland igjen for å jobbe for Gazprom. Han ble utvalgt som statsminister av Serzj Sargsian 13. oktober 2016.