Alnæs var redaktør for tidsskriftet fra 1902 til 1913 og Kirkedepartementets konsulent i rettsskrivningsspørsmål fra 1907. Fra 1913 til 1917 var han medlem av departementets rettskrivningskomité. Han var formann i Filologenes og Realistenes landsforening fra 1922 til 1925 og ble medlem av Videnskabs-Akademiet i Oslo i 1928.