Den 9. juni 2004 signerte Morten Bisgaard for den engelske klubben Derby County, og han debuterte for denne klubben 7. august 2004 i en kamp mot Leeds United. Sitt første mål for klubben fra Derbyshire var mot Brighton & Hove Albion i en ligakamp den 5. februar 2005. Totalt spilte han 36 ligakamper og scoret fire mål for i 2004/05-sesongen. Han spilte også begge play-off kampene i mai 2005 da Derby ble slått ut av Preston North End.