Etter at Tony Mowbray fikk sparken som Celtic-manager 25. mars 2010, ble Neil Lennon utnevnt til midlertidig manager. Han utnevnte Johan Mjällby som sin assistent. Den 9. juni 2010 fikk han stillingen på permanent basis. I sesongen 2011-2012 ble han skotsk mester som trener for Celtic og utnevnt til årets manager.