Makkena startet sin skuespillerkarriere i 1986 og dukket opp i TV-showet Santa Barbara. Hun fikk sin første filmrolle i Eight Men Out. Hun har gjort flere gjesteopptredener i TV-serier som , , og . I 1992 fikk Makkena hovedrollen i den populære filmen Sister Act som den sjenerte men talentfulle syngende nonnen Mary Robert, en rolle hun hadde i oppfølgeren . I 1997 hadde hun en rolle i komedien .