Partiet ble opprettet i 1978 for å hjelpe Vietnam under krigen mot Pol Pot, og etter at krigen var over, installerte Vietnam et regime styrt av FUNSK. Da Vietnam trakk seg ut av Kambodsja i 1988, fortsatte den politiske ubalansen. I 1992 tok FN landet i forvalting i en treårig periode. Frie valg ble så holdt, men partiene mislykkes i å danne en koalisjonsregjering. I 1997 gjenerobret FUNSK makten ved et kupp, støttet av Vietnam.