Japanhavet grenser til det russiske fastlandet og øya Sakhalin i nord, Koreahalvøya i vest og de japanske øyene Hokkaidō, Honshū og Kyūshū i øst. Japanhavet har forbindelse til Stillehavet gjennom Tsugarustredet, til Øst-Kina-havet via Koreastredet og til Okhotskhavet gjennom La Pérouse-stredet og Tatarstredet.