Ti måneder etter han var reist til Palestine sendte hans kone Esther et brev der hun skrev at hun ønsket å skille seg. I sitt svar skrev Agnon om sin store kjærlighet og lengsel for henne, og om hans omsorg for deres barn. Det endte med at paret forble sammen, og to måneder etter at Esther hadde skrevet brevet der hun sa hun ville skille seg reiste hun og barna til Palestina. De ankom Jerusalem den 14. november 1925.