Etter reformasjonen kom øya inn under hertugen av Pommern igjen. Under tredveårskrigen, den 26. juni 1630, gikk den svenske hæren med kong Gustav II Adolf i land ved Peenemünde. Usedom ble annektert av Sverige etter krigen og var svensk fram til 1720 da den ble solgt for 2 millioner daler til den prøyssiske kongen Fredrik Vilhelm I. I 1740 anla Fredrik II av Preussen havnebyen Swinemünde.