Et stipend fra byrådet i Danzig gjorde det mulig for Siefert å studere hos den berømte organisten Jan Pieterszoon Sweelinck i Amsterdam, sannsynligvis mellom 1607 og slutten av 1610. Senere ble han vikarierende organist i Danzig, og fra 1611 var han organist ved den gamle bykirka i Königsberg til han i 1616 ble organist ved Sigismund III Vasas hoffkapell i Warszawa. 23. september 1623 ble han utnevnt til Michael Weydas etterfølger som organist ved , en post han beholdt livet ut.