Marcus Paus har også skrevet kirkemusikk, som (2008) og (2014), sistnevnte skrevet sammen med Ole Paus. Paus' (2007) er et av hans internasjonalt mest spilte verk og ble utgitt på Zurich Chamber Singers' album (Berlin Classics, 2020); musikkritiker Jan Brachmann skrev i at Paus' oversetter «det harmoniske språket fra lydspor for mystiske thrillere til from andakt, nærmest etter parolen: 'Du, jul, er som en film av David Lynch, men med lykkelig slutt og uten døde'».