I Polen var det nye museet kontroversielt allerede før det ble åpnet. Direktøren, som har ledet gjennomføring av prosjektet, bygning og utstilling, ble i januar 2017 avsatt. Polens nye regjering ønsket en annen tilnærming til Polens krigshistorie. Hendelsen førte til mange avisoppslag i hele Europa.