Hun scoret sitt 59. mesterligamål i finalen i 2022 da hun hjalp laget til mesterligatriumf for sjette gang etter seier over Barcelona. Lyon vant også serien denne sesongen 2021/2022, men Hegerberg fikk en skade i VM-kvalifiseringskamp i september og var igjen ute av klubblaget, denne gang i over et halvt år. Etter 204 dager ute av fotballen tok det henne 1 minutt å score i sin første kamp for Lyon etter skadeavbruddet. I sesongen 2022/2023 vant Lyon serien og cupen.