Relasjonen mellom tsjekkere og slovaker forble et tema fra gjenoppretting av republikken etter andre verdenskrig til den fredelige oppløsningen i 1933. Demokratiske valg ble avholdt i 1990. Tsjekkerne var den dominerende befolkningsgruppen og i den slovakiske delen bodde over en halv million etniske ungarere. Etter lang diskusjon ble Tsjekkoslovakia offisielt kalt Den tsjekkiske og slovakiske føderative republikk. Tsjekkoslovakia ble 1. januar 1993 oppløst og delt mellom de nye statene Tsjekkia og Slovakia. Delingen av Tsjekkoslovakia er ofte blitt kalt en «fredelig skilsmisse» fordi begge parter var enige om delingen. Slovakia var den fattigste av de to delene med en økonomi der jord- og skogbruk spilte enn viktigere rolle enn i det mer industrialiserte Tsjekkia. Oppdelingen var trolig økonomisk ugunstig for Slovakia. Jordbruket i Tsjekkia spilte en relativt mindre rolle enn i Slovakia og industrien i Tsjekkia var mer allsidig. Havel ble Tsjekkias første president og Michael Kovac ble Slovakias første president.