Ettersom det er et programmeringsspråk baserer R seg på kommandolinjegrensesnitt. Men brukere benytter gjerne integrerte utviklingsmiljø når de skriver R-kode, hvorav Rstudio. og kodenotatblokksystemet Jupyter er særlig utbredt blant R-brukere. Mange teksteditorer og integrerte utviklingsmiljø har støtte for R (som Visual Studio Code, PyCharm og Eclipse).