I Metal Gear Solid 2: Sons of Liberty danner han og Solid Snake en gruppe ved navn Philanthropy for å ødelegge Metal Gear-maskiner over hele verden etter at Revolver Ocelot solgte Metal Gear REX sine blåkopier på det svarte markedet. Senere i spillet teamer han og Snake opp med Raiden for å beseire Sons of Liberty. Samtidig finner vi ut hva som skjedde med faren hans, og vi får oppleve døden til stesøstra hans.