Vielsen skal finne sted i deres nye hjem. Butterfly var så spent på å gifte seg med en amerikaner, at hun tidligere - i hemmelighet - hadde konvertert til kristendommen. Men etter bryllupsseremonien kommer hennes ubudne onkel, en Bhikkhu, som har oppdaget Cio-Cio-sans religiøse omvendelse. Han forbanner henne, og beordrer alle gjestene å reise sin vei. Pinkerton og Butterfly synger deretter en kjærlighetsduett, og forbereder seg på å tilbringe sin første natt sammen.