Pavedømmet befant seg da midt i en krig mot keiser Fredrik II av Det hellige romerske rike av tysk nasjon. Celestin rakk ikke å utføre særlig meget under sitt pontifikat, ettersom han døde allerede etter femten dager, den 10. november, innen han hadde rukket å bli installert. Det eneste han rakk, var å ekskommunisere Matteo Orsini.