Rett etter krigen fikk Hobbelhagen en stilling som midlertidig sekretær i Norsk Kjemisk Industriarbeiderforbund. Da han stilte til valg som forbundssekretær på det første landsmøtet etter krigen ble han imidlertid vraket. Begrunnelsen var blant annet at han hadde motarbeidet kommunistene, og de angivelige tendensene til «silkefront» under krigen.