Han tilhørte den hanseatiske bankierfamilien Berenberg, som kom fra Antwerpen i dagens Belgia til Hamburg sent på 1500-tallet, og var sønn av kjøpmann, bankier og senator i Hamburg Rudolf Berenberg (1680–1746) og Anna Elisabeth Amsinck (1690–1748). Moren tilhørte en hanseatisk familie av nederlandsk opprinnelse, og familien hadde i hans levetid fortsatt i stor grad en nederlandsk identitet. Hans morfar Paul Amsinck var kjøpmann i Lisboa og Hamburg. Han var også etterkommer etter Welserfamilien. Berenberg Bank hadde blitt etablert i 1590 av hans belgiskfødte tippoldefar, Hans Berenberg og dennes bror Paul Berenberg, som begge var gift med døtre av den kjente Antwerpen-kjøpmannen Andries Snellinck og Françoise de Rénialme.