Han var gift to ganger. Først med prestedatteren fra Stubbekjøbing Ingeborg Andersdatter Beske. Hun ble mor til seks barn og døde kort tid før han dro til Norge. Andre gang ble han gift med Anna Kristensdatter Trane, som var enke etter den tidligere biskopen Thomas Kortsen Wegner. De hadde med seg sju egne barn inn i ekteskapet. Anna Kristensdatter Trane døde i 1696.