Bach skrev systematisk for to ulike orgeltyper – hver sats er entydig skrevet enten for et stort orgel med flere manualer og pedal eller for et lite orgel uten pedal. For hver koralmelodi finnes det altså to versjoner; satsen for stort orgel følger en versjon uten pedal. Det innledende preludiet og den avsluttende femstemmige fugen bærer overskriften og forutsetter dermed et stort orgel med pedal. Samlingen inneholder ytterligere fire tostemte komposisjoner for pedalløst spill som betegnes som .