I 2000 gikk han til Inter Milan for 13 000 000 pund. Det var manager Marcello Lippi som sørget for å få Keane til klubben, og Keane kom da på lag med spillere som Ronaldo og Christian Vieri. Hans drøm om å bli stjerne i italiensk fotball ble snart knust, ettersom Lippi fikk sparken like etter at Keane ankom, og Lippis etterfølger Marco Tardelli ikke ville ha Keane med på førstelaget.