Det andre epidemiske utbruddet skjedde samtidig som ankomsten av general George Don i 1814 som den nye guvernøren av Gibraltar. Han beordret at alle nye bygninger skulle ha en cisterne, og instruerte at eksisterende vannbeholdere skulle dekkes til. Det siste grepet kan muligens å ha avhjulpet problemet med mygg, men det var antagelig ikke generalens hensikt da forholdet mellom mygg og gulfeber ennå ikke var kjent. Årsaken for utbruddet av sykdommen hadde blitt lagt på , en feilaktig teori om det var dårlig luft og lukt fra råttent søppel som eksisterte overalt på Gibraltar.