Marie Antoinette von Lowzow var datter av lensgreve Hendrik Bille-Brahe-Selby (1870-1938) og Ellen Basse Fønss (1876-1949). Moren var teosof, frimurer og homeopat. Marie Antoinette von Lowzow fikk privatundervisning og studerte fysikk og kjemi på egen hånd. Hun tok faglærereksamen i stenografi, avla studentereksamen ved N. Zahles Skole i 1919 og filosofikum i 1920. Hun studerte deretter ved Polyteknisk Læreanstalt med ambisjoner om å bli elektroingeniør. Hun oppga imidlertid planene i forbindelse med at hun i 1923 ble gift med kommandør Knud Krieger von Lowzow. Hun ble en engasjert frimurer og var leder av den skandinaviske avdeling for losjen Det Universelle Co-Frimureri.