På innsiden er iPhone 3G lik originalen, men har flere nye maskinvareegenskaper, slik som GPS, 3G og UMTS/HSDPA. Telefonen ble fra starten solgt med det nye operativsystemet iPhone OS 2.0 ferdiginstallert. Denne versjonen av operativsystemet hadde flere nye egenskaper, blant annet App Store og push e-post.