Mara renner gjennom nasjonalparkene Masai Mara i Kenya, som den har fått navnet sitt fra, og Serengeti i Tanzania. Elva ligger på tvers av vandringsruten til den årlige migrasjonen av gnuer, sebraer og gaseller mellom Serengeti og Masai Mara, der millioner av dyr må krysse elven omtrent ved grensen mellom Kenya og Tanzania. Krokodiller og flodhester finnes i store deler av elven.