Hovedkontoret ligger i bydelen Tyholt i Trondheim, ved foten av Tyholttårnet siden 1987. NRK Trøndelag er hovedsete for radioens NRK P1 og NRK P1+, har den største avdelingen for radioens ungdomskanal NRK P3, og har et særskilt ansvar for vitenskap og livssyn. NRK Trøndelag er også hovedkontor for NRKs regionale sendeflate i radioens P1 og TV-kanalen NRK1 (Midtnytt). Fra 1. januar 2021 overtok Eivind Undrum Jacobsen jobben som ny regionredaktør for NRK Trøndelag og erstattet Sigrid Gjellan. Administrasjonssjef er Jo Ragnar Tremoen.