Fra 1924 til 1928 fungerte han som president for Royal Society of Antiquaries of Ireland og deretter til 1931 som preäsident for Royal Irish Academy. I denne rollen gikk han inn for beskyttelsen av arkeologiske funnfelt. Mange av hans forslag ble realisert i av 1930. Som følge av denne loven ble grunnlagt. Macalister var dets første formann. Han tilhørte også den nordirske ekvivalent av komiteen.