Ifølge stuerten Clarence Hare var han «den mest populære av offiserene blant mannskapet, og var en god blander». Påstander om at dette var et uoffisielt rivaliserende lederskap til Scott er imidlertid ikke støttet. Scott valgte Shackleton til å bli med Wilson og seg selv på ekspedisjonens sørlige ferd, en marsj sørover for å nå den høyeste mulige breddegraden i retning av Sørpolen. Denne marsjen var ikke et seriøst forsøk på å nå polpunktet, selv om det var viktig for Scott å nå en så høy breddegrad som mulig. Inklusjonen av Shackleton indikerte en høy grad av personlig tillit.