Etter den andre verdenskrigen ble Ledwinka anklaget for samarbeid med Nazi-Tysklands okkupasjonsstyrker og satt fengslet i fem år i Tsjekkoslovakia. Etter at han ble sluppet fri i 1951 nektet han å arbeide videre for Tatra, og trakk seg tilbake til München hvor han døde i 1967.