Vysokovsk ble grunnlagt i 1879. I forbindelse med byggingen av en tekstilfabrikk ble to mindre bosetninger opprettet: (russisk: Высо́кое) og (russisk: Но́вый База́р). De vokste etter hvert sammen til en mindre by, som i 1928 fikk navnet (russisk: Высоко́вский). Den fikk bystatus og sitt nåværende navn, Vysokovsk, i 1940.