Det var mye strid rundt fusjonen, først og fremst politisk strid som følge av at Bergen kommune var største eier i Gaia. Mindertallsbyrådet var mot fusjonen, mens opposisjonen hovedsakelig var for. Samtidig var byrådet bundet av budsjettavtalen med Arbeiderpartiet og kunne derfor ikke gå inn for salg i denne valgperioden.