FSV Frankfurt hadde blitt utfordret også hjemme. SG Praunheim hadde blitt stadig bedre, og utfordret FSV Frankfurt om talenter og ressurser. I den første samlede Bundesliga vant FSV Frankfurt, og ble seriemester for siste gang. Etter sesongen forsvant to store personligheter; Birgit Prinz til rivalen FFC Frankfurt, og Sandra Smicek til Duisburg. Sistnevnte lag slo for øvrig FSV Frankfurt i cupfinalen med klare 6-2. Etter denne sesongen ble FSV Frankfurt forandret til en middelhavsfarer som unntaksvis kom over midtstreken. I 2005-06-sesongen rykket FSV Frankfurt ned etter en liten oppsving året før. Laget tok bare ett poeng, og endte klart sist. Etter sesongen ble laget oppløst med umiddelbar virkning.