Frode Vartdal ble uteksaminert med graden cand.med fra Universitetet i Oslo i 1975 og tok medisinsk doktorgrad i 1984. Han har siden 1978 vært tilknyttet det faglige miljøet innen immunologi og transfusjonsmedisin ved Rikshospitalet, nå Oslo universitetssykehus HF, Rikshospitalet. Siden 1990 har han vært ansatt som professor ved Universitetet i Oslo.