Favre holdt flere rekorder ved Southern Miss før de fleste ble slått av Austin Davis ved slutten av 2011-sesongen. Favre hadde 15 kamper med over 200 pasningsyards, som den fjerde i skolens historie. I de kampene var fem av dem over 300 yards, som var fler enn noen annen quarterback ved skolen. Han ledet også sesongen i pasningsspill og angrep totalt i alle sine fire sesonger.