Agnes var bare ett år da faren hennes ble drept av sin egen bror, Abel, som dermed satte sluttstrek for de danske borgerkrigene da han tok Danmarks trone. Dronning Jutta giftet seg på ny med borggreven av Magdeburg og flyttet hjem til Tyskland, så kong Eriks fire døtre vokste opp ved hoffet til sin farbror kong Christoffer og hans dronning Margarete Sambiria (på folkemunne kalt «Margrethe Sprenghest»).