Fram til 1689 var Nikolaus elev på latinskolen i Eisenach, deretter studerte han hos J.M. Knüpfer som var organist i Jena og sønn av Sebastian Knüpfer. Nicolaus etterfulgte J.M. Knüpfer som organist ved i Jena, og fikk senere også organistposten i byens . Disse stillingene beholdt han til rundt 80-årsalderen, da han ble syk og måtte finne en etterfølger.