Etter teologistudier i hjembyen ble Bonporti i 1691 tatt opp ved i Roma. Han kan ha vært elev av Arcangelo Corelli, men det er ikke bekreftet. Rundt år 1700 finner man ham igjen som musiker i privatkapellet til keiser Josef I av Det tysk-romerske rike, fra 1715 til 1721 arbeidet han i hjembyen Trento, og deretter i Padova.