Aleksej Ridiger ble født som sønn av den tysk-baltiske Mikhail Aleksandrovitsj Rüdiger (Михаил Александрович Ридигер) og Jelena Iosifovna Pisareva (Елена Иосифовна Писарева). Familien var dypt troende og dro flere ganger årlig på pilegrimsreise til klostre i regionen. Faren ble viet til diakon i 1940 og senere til prest.