Colbjørnsen var i 2006-2008 medlem i Likelønnskommisjonen. Han tok dissens i kommisjonens anbefalinger til regjeringen, og mente de foreslåtte tiltakene ville ha liten innvirkning på å minke lønnsforskjellene. Han foreslo i stedet bla økt vekt på lokale lønnforhandlinger i kvinnedominerte sektorer.