Historikeren Arrianos har fortalt at Perdikkas var sønn av Orontes, en etterkommer av de uavhengige fyrstene i den makedonske provinsen Orestis (tilsvarende dagens Kastoria) i øvre Makedonia. Hans fødselsår er ukjent, men han synes å ha vært omtrentlig like gammel som Aleksander (født 356 f.Kr.).