I januar 1940 ble Glen sendt til Beograd som assisterende marineattaché ved den britiske legasjonen. I mars 1941, da den 17-årige Petar II av Jugoslavia kom til makten etter et militærkupp støttet av britene, var den tyske reaksjonen massiv bombing av byen. Den britiske legasjonen forlot Beograd via Albania, Italia, Frankrike og Spania. Glen deltok senere i hemmelige operasjoner i Jugoslavia, Albania og Bulgaria.