I Shamil sitt fravær styrte en Imamen Gamzat-bek. Gamzat-bek hadde spilt en viktig rolle i å sikre Avarenes Khaner for Imamatet, og som siden hadde vært en naib for Shamil og Ghazi. Shamil kom tilbake ett år senere, bare for å få Gamzat-bek drept av de samme Khanene han hadde beseiret. Med ingen andre til å ta stillingen ble Shamil den tredje leder av Imamatet. Shamil skulle vise seg å være den største av imamene uten tvil og hersket i 27 år. Han ville erobre de vestlige muslimske stammene, og forvandle en gruppe små kranglete landsbyer til et samlet land. Imidlertid ville han også se store tap for folket sitt, spesielt i beleiringen av Akhoulgo hvor han personlig ville miste rundt 4500 av sitt eget folk. Men han ville fortsette å herske til 1859 da keiseren av Russland ville tilby Shamil en fredelig overgivelse, han ville til og med være gjest i det kongelige palasset. Shamil takket ja, og det Kaukasiske Imamatet ble oppløst. Kampene opphørte imidlertid ikke umiddelbart.