På Gjedsergaard fant flere mindre historiske begivenheter sted: i 1431 foregikk det fredsforhandlinger med Tyskland på stedet, og i 1586 døde Frederik Is datter Elisabeth på gården, da hun var på vei hjem til Mecklenburg etter et besøk hos Tycho Brahe på Hven. En gang var det et større skogsområde omkring Gjedsergaard, men det ble svidd av av svenske soldater under krigen med Sverige 1658–1660. På midten av 1700-tallet rev man den gamle gården ned. En ny gård ble oppført i 1767. Denne ble senere ombygd i 1872.