Sammen med Norrström, som ligger mellom Gamla Stan og Norrmalm, danner Söderström det naturlige utløpet fra Mälaren til havet. Mesteparten av vannføringen går via Norrström, mens vannføringen i Söderström går i en tunnel dannet av den nå nedlagte Nils Ericsons sluss, som brukes til regulering av vannstanden i Mälaren.