Gertner ble i 1944 satt til å arbeide i masseutryddelsesleiren Auschwitz-Birkenau, der hennes oppgave var å sortere klær, penger og andre verdisaker som var konfiskert fra jøder drept i gasskamrene. Her ble hun kjent med Rózia Robota, en polsk-jødisk kvinne som tilhørte en hemmelig motstandsgruppe i Auschwitz. Da hun senere ble satt til å arbeide ved en ammunisjonsfabrikk, klarte hun ved hjelp av andre fanger å skaffe sprengstoff til Sonderkommando som forberedte et fluktforsøk.