I sin første sesong som hovedtrener for KFUM Oslo endte de på en 7.-plass i sin avdeling i 2. divisjon. Året etter gikk det vesentlig bedre, og Isnes ledet laget til en 2.-plass og kvalifisering til OBOS-Ligaen. Der slo de Fredrikstad og Åsane og rykket opp til OBOS-Ligaen.