Alisson signerte for den italienske klubben AS Roma i juli 2016, og spilte sin første kamp den 17. august 2016, da han startet UEFA Champions League-kampen mot FC Porto. Han spilte bare 15 i alle konkurranser den sesongen, da Wojciech Szczęsny var Romas førstevalg. Da Szczęsny forlot Roma for fikk Alisson draktnummer 1.