Den 24. oktober 1960 utnevnte pave Johannes XXIII Ioannis Perris til erkebiskop av Naxos, Andros, Tinos og Minos. Den 12. januar 1961 ble han ordinert til biskop av biskopen av Syros og Milos, Georgios Xenopoulos; medkonsekrerende var Athens erkebiskop Venediktos Printesis og biskopen av det apostoliske eksarkat i Hellas, Hyakinthos Gad.