Edvard Dahlerup var overlege ved Frederiks hospital fra 1860 til 1873 og medlem av Sundhedskollegiet, som førte tilsyn med helsevesenet, fra 1862 til sin død i 1882. Han hadde styreverv ved flere sykehus. Som overlege underviste han også medisinstudenter. Han var titulær professor fra 1848, men drev ingen større forskningsarbeider.