Ayala ble enig om en overgang til Liverpool i september 2007 etter å ha forkastet en profesjonell kontrakt med , hvor han kom gjennom på juniorlaget. Liverpool betalte en kompensasjonsavgift til Sevilla og Ayala ble tilbudt en tre-års kontrakt med dem. I 2007/2008 sesongen ble han hovedsakelig kjennetegnet i U18 lag, mens i 2008/2009 sesongen fikk han delt sin tid mellom U-18 og reservelaget. Han spilte med skade i FA Youth Cup under 2008-2009 sesongen og tapet mot Arsenal.