På grunn av en ryggskade mistet Arnór mesteparten av 2009/2010-sesongen i Eredivisie. Han ble sendt til klinikken som Bayer Munich klubb doktor Hans-Wilhelm Müller-Wolfahrt, som behandlet han på våren 2010. Arnór returnerte på banen samme år, der han fikk to kamper i løpet av sesongen. På den samme tiden, kommuniserte Heerenveen med Arnór at han kom til å forlate klubben som bosman-spiller den neste sommeren, på grunn av klubbens finansielle problemer.