Etter at USA ble med i første verdenskrig i 1917 ble Blue konfrontert med en rask knapphet av leger og pleiepersonell i hjemlandet. Mange hadde ledsaget styrkene til frontene i Europa. Dette ble en veldig utfordring da spanskesyken slo til i USA, særlig den andre bølgen som var svært meget aggressiv og dødeligere enn andre influensaer. Selv om han nokså tidlig var blitt advart om de skrekkelige utsikter som truet, reagerte Blue tilbakeholdende og i seneste laget. Riktignok hadde Public Health Service allerede tidlig i 1918 under den såkalte første bølgen, advart mot sykdommen, men det ble ikke anordnet karantener før i august, og heller halvhjertet, da den mer dødelige andrebølgen inntrådte.