Pape har først og fremst forsket på rusmiddelbruk blant ungdom i den generelle befolkningen. Hennes faglige interesseområde omfatter også nærliggende tema som alkoholpolitikk, rusforebygging, alkohol- og narkotikaproblemer blant innsatte og alkoholrelatert kriminalitet, samt partnervold. Hun har vært interessert i forebygging og rusmiddelpolitiske virkemidler, og evidensbaserte tiltak.