Etter mordet på biskop Juan José Gerardi Conedera den 26. april 1998 ble Ríos Montt utnevnt til hjelpebiskop av erkebispedømmet Guatemala, og overtok biskop Gerardis oppgaver i (erkebispedømmet Guatemalas menneskerettighetskontor). Rios Montt kritiserte det tidligere militærregime for brutalitet og de senere sivile regimer for korrupsjon.