Klar kan ha ødelagt sine egne sjanser for å bli benådet da han i 2007 skrev et brev som ble gjengitt på Rosa Luxemburg-konferansen i Berlin, arrangert av den venstreorienterte avisen Junge Welt. I brevet skrev han blant annet om behovet for å «fullende nederlaget for kapitalens planer og åpne døren for en annen fremtid». Klars uttalelser vakte sterke reaksjoner, blant annet fra CSUs generalsekretær Martin Söder og lederen for Freie Demokratische Partei, Guido Westerwelle, som begge markerte seg mot benådning. I mai 2007 avslo president Horst Köhler søknaden om benådning.