Han fungerte som assisterende generalsekretær for United States Conference of Catholic Bishops (USCCB - Den amerikanske katolske bispekonferanse) fra 1989 til 1995; i løpet av sin periode hadde han oppsynet med han de avdelingene som omhandlet utdanning, nasjonal og internasjonal sosialpolitikk og kommunikasjon. Schnurr arrangerte 1993 World Youth Day i Denver i Colorado. Han ble valgt til generalsekretær for USCCB i 1994.