Som manager for Englands U-21 landslag vant han Europamesterskapet to ganger, i 1982 og 1984. Dette var en deltidsjobb han hadde i 13 år, fra 1977 til 1990, da Lawrie McMenemy overtok jobben fordi Graham Taylor var blitt ny landslagssjef og ønsket forandringer i staben. Sexton ble så høyt verdsatt av FA at han fikk jobben som teknisk direktør på «The FA National School» i Lilleshall i perioden 1990-94. Da Taylor fikk sparken som landslagssjef, overtok han igjen U-21 landslaget etter McMenemy, i perioden 1994-96, før Peter Taylor fikk jobben. Sexton fungerte også som assisterende manager for landslagssjef Bobby Robson.