Elva har utspring fra Isvatnan i høyfjellsområdene sør på Ringvassøya, hvor den heter Iselva. Den renner mot nord og faller bratt ned dalsida på vestsida av Instebotndalen. I dalbunnen møter den elva fra Austbotndalen, og danner Botnelva, som fortsetter nordover til den munner ut i Vassbotn, lengst sør i Skogsfjordvatnet.