Man får også tilgang til en transceiver for å kunne kommunisere med Snakes sjef, Big Boss eller et av medlemmene av motstandsgruppen som opererer i hemmelighet i nærheten av Outer Heaven (Schneider, Diane eller Jennifer). Hver av Snakes allierte er spesialiserte innenfor et enkelt emne. Spilleren må holde styr på sine alliertes frekvensnummer for å kunne kontakte dem.