Han var bror av Jean Frédéric Oberlin. Mens han studerte teologi ved universitetet rettet han spesiell oppmerksomhet mot bibelsk arkeologi. I 1755 ble han knyttet til gymnasiet i hjembyen, ble bibliotekar ved universitetet i 1763, professor i retorikk i 1770 og i logikk og metafysikk i 1782.