Museet ligger i Apotekergården, Sagveien 28 på Sagene, ut mot den brosteinslagte plassen med Beierbrua, Vøien Bomuldsspinderi (Graahs spinneri) og Hjula Væverier, på hver sin side. Huset, som ble bygget i 1869/70 for apoteker Nicolai Lindgaard, er to og en halv etasje, i pusset tegl med midtgesims med medaljonger. Det var en brann i huset i 1943, og det har tidligere vært cafédrift her. Huset er i privat eie. Oslo Museum ønsker at museet skal bli et naturlig samlingspunkt for elvevandringer, med faste og skiftende utstillinger om livet langs Akerselva og byens arbeiderkultur.