Christian Pløyen tok examen artium ved Metropolitanskolen i 1821, og ble cand.jur. i 1826. Han var ansatt ved Rentekammeret i 1827–1828, og ansatt i Kammerkanselliet i 1829. Pløyen var landsfogd på Færøyene 1830–1837, og amtmann og kommandant 1837–1848. Som amtmann var han høyt respektert og godt likt blant færøyingene, som han viste en varm interesse for. I 1848 var han kongevalgt medlem av den Grundlovgivende Rigsforsamling for Færøyene. Han var egentlig amtmann i Velje fra 1849, men virket heller som amtmann i Holbæk frem til sin død.