Som karakteren Link skal spilleren utforske en hule under Hyrule Castle. Et giftig stoff har sivet ut og gjør folk syke. Der finner Link et stort veggmaleri som skildrer grunnleggelsen av Hyrule, og en påfølgende konflikt kjent som fengslingskrigen – en eldgammel konflikt mot et vesen bare referert til som "Demon King" og Link bestemmer seg for å våge seg dypere ned i mørket. Men dette utløser oppvåkningen av en mumie som angriper Link med dysterhet. Links høyre arm blir hardt skadet, og sverdet hans blir ødelagt.