Også denne etappen ble preget av et lengre brudd som ble innkjørt mot slutten av etappen. Akkurat som på 2. etappe. Erik Dekker (RAB), Nicolas Portal (A2R) og Rubens Bertogliati (SDV) gikk i brudd etter 27 km og opparbeidet seg en ledelse som på det meste var på hele fem og et halvt minutt. Dekker holdt unna for hovedfeltet til det gjensto 3 km til mål. Massespurten ble som på 2. etappe vunnet av Tom Boonen som gjorde en ny glimrende spurt. Thor Hushovd startet spurten for tidlig og selv om han ledet en stund ble han stiv mot slutten og endte med det på en 9.-plass. Kurt Asle Arvesen gjorde en jobb for laget og kom i mål midt i hovedfeltet på 54.-plass. Robbie McEwen ble diskvalifisert og nedgradert til 186.-plass (sisteplass i hovedfeltet) på etappen etter at han hindret O'Grady i spurten. Denne hendelsen sendte McEwen midlertidig ut av tetkampen om den grønne trøya, noe som på dette tidspunktet var svært gode nytt for O'Grays hardeste konkurrenter, Boonen og Hushovd. David Zabriskie, innehaveren av den gule trøya, kom til mål med hovedfeltet og han beholdt med det ledelsen i rittet, foran Armstrong og Bodrogi.