Etter at Karl III av Spania hadde erobret Napoli i 1734 forsøkte Giannone å vende tilbake, men ble nektet innreise av de bourbonske myndighetene. Det neste året bodde han i Venezia. Her forsøkte den pavelige nuntiusen å overtale regjeringen til å utlevere Giannone til Kirkestaten. I 1735 ble han arrestert og bragt over på kirkestatlig territorium, men klarte å rømme til Modena og senere til Milano. Her innså han at han ikke lenger var trygg i noen italiensk stat, og besluttet å slå seg ned i det protestantiske Genève.