Bernardo Pasquini studerte hos Mariotto Bocciantini i Uzzano. Senere flyttet han til Ferrara der han i perioder var organist ved byens . I desember 1655 gikk han i tjeneste hos den romerske adelsmannen Innocenzo Conti, og fulgte ham til Roma. En vanlig antakelse om at Pasquini studerte hos Antonio Cesti og Loreto Vittori, er sannsynligvis basert på en feiltakelse.