Etter å ha blitt guvernør i byen Balkh styrte Abd al-Latif Mirza under sin far. Under arvestridene som fulgte etter at emiren Shah Rukh (Abd al-Latifs farfar) døde i 1447 okkuperte han byen Herat, men etter at faren Ulugh Beg forlot byen i slutten av 1448 ble den erobret av Abul-Qasim Babur Mirza.