Gjenstandssamlingen består av godt over 40.000 registrerte objekter. Disse fordeler seg på kunst- og kulturhistorie fra Arendal og Aust-Agder, sjøfart og drakthistorie er to hovedtemaer i samlingen, dessuten geologi og mineralogi, naturhistorie, etnografi, numismatikk. KUBEN har den største arkeologiske samlingen mellom Oslo og Stavanger, samt en av landets største etnografiske samlinger; dette er gjenstander som i stor grad er samlet inn av lokale sjømenn, som senere er gitt i gave til museet.