Cole blir forhørt av forskerne som bruker en forvrengt melding som hevder at Army of the Twelve Monkeys skal ha stått bak viruset. Cole får også vist fotografier av en rekke mennesker som mistenkes for å være involvert, inkludert Jeffrey Goines. Forskerne gir Cole en ny mulighet til å fullføre oppdraget, og sender ham tilbake i tid. Cole kommer tilfeldigvis til en slagmark under første verdenskrig, blir skutt i beinet og deretter plutselig transportert til 1996.