Fernando Prado Ayuso gikk på augustinerordenens i Loiu. Deretter studerte han informasjonsvitenskap ved Universidad del País Vasco, og ble uteksaminert i 1993. I 1992 sluttet Prado Ayuso seg til claretianerne og avla sine første løfter den 27. august 1994 i Vitoria-Gasteiz. I 1998 tok han en grad i katolsk teologi fra Universidad de Deusto i Bilbao. Den 27. september samme år avla han sine evige ordensløfter. Fra 1998 til 2002 var Prado Ayuso ansvarlig for arbeidet blant barn og unge i menigheten i San Sebastián og var lærer ved skolen med samme navn.