Fram til 1950-tallet var Beddawi en liten landsby omgitt av åkre og hadde mindre enn 1000 innbyggere. I 1955 bygde de palestinske flyktningene en leir nær byen og kalte den Beddawi-leiren. I 1983 gjennomgikk byen flere kamper innen palestinske militser, og deler av den ble alvorlig skadet.