Bergljot Schønheyder giftet seg med Bredo Henrik Berntsen (1877-1957), som i likhet med henne selv var utdannet til arkitekt ved Den kongelige tegneskole (senere SHKS). Ekteparet fikk én datter og tre sønner; en av dem var Kaare Berntsen som i mange år drev antikvitetshandel i Oslo. I 1910 var familien bosatt i Kristiania, og Bergljot Berntsen var registrert i folketellingen i 1910 som husmor.