Noll hadde planer om å gå på Notre Dame, men før en treningsøkt i sitt år som freshman hadde han et epilepsianfall på banen. Notre Dames trener Frank Leahy nektet å ta sjansen på å la Noll spille, og Noll endte derfor opp med å ta et fotballstipend ved University of Dayton. Han ble uteksaminert med en grad i "secondary education". Han spilte lineman, linebacker og var medkaptein på skolens fotballag, Dayton Flyers, og fikk kallenavnet "the Pope" for hans kunnskap om sporten.