I januar 1989 gikk Capcom Co., Ltd. sammen med Sambi Co., Ltd., noe som resulterte i den nåværende japanske grenen. Navnet Capcom er en sammensetning av «Capsule Computers», et begrep som er laget av firmaet for å beskrive spillmaskinene de produserte i sine tidligere år. Ordet kapsel var ment å vise til hvordan Capcom, lik programvaren, var «en kapsel fylt til randen med spillmoro». Samtidig var navnet et uttrykk for selskapets ønske om å beskytte sin intellektuelle eiendom med et hardt ytre skall, og forhindre ulovlige kopier og dårlige imitasjoner.