Kootenai Countys totale areal er 3 408 km² hvorav 183 km² er vann. I 2005 hadde fylket 127 668 innbyggere og administrasjonssenteret ligger i byen Coeur d'Alene som også er fylkets største by. Fylket ble grunnlagt i 1864 og har fått sitt navn etter indianerstammen Kootenai.