Under andre verdenskrig ble Stray arrestert 22. februar 1944 av de tyske okkupantene i Norge, og satt først i fengsel i Kristiansand, før han ble overført til Grini fangeleir, hvor han satt fra 11. mars til 7. september. Han ble igjen arrestert 1. november. På grunn av helsen ble han holdt i husarrest frem til han ble fridd da krigen var over i mai 1945.