Da Christiania ble grunnlagt i 1624, lå området hvor Jernbanetorget nå ligger, under vann. Det ble først fylt opp og utbygd etter 1739. Plassen har også gjennomgått store endringer, både ved anleggingen av jernbanen og Østbanestasjonen som sto ferdig i 1854, og da T-banen ble anlagt på 1960-tallet.