Høegh har vært valgt til Folketinget fra Sjællands storkrets fra 2007 til 2015, etter å ha blitt nominert fra Guldborgsund krets. Han var medlem av Folketingets energiutvalg, matvareutvalg og grønlandske utvalg og nestformann i Europa-utvalget før han var matvareminister i Lars Løkke Rasmussens regjering 2010–2011. Fra 2011 er han Venstres miljøvernpolitiske ordfører og medlem av Folketingets miljøvernutvalg, matvareutvalg, Europa-utvalg og klima-, energi- og bygningsutvalg. I 2013 ble han innvalgt i Lolland kommunestyre med flest personlige stemmer.