Stockton begynte som advokat i 1754. Han var en god venn av George Washington. Hans kone var poeten Annis Boudinot Stockton, søster av statsmannen Elias Boudinot fra New Jersey. Stockton viste i utgangspunktet lite interesse for politikk. I 1766 og 1767 besøkte han England, Skottland og Irland. Han døde på families eiendom i Princeton i februar 1781. Stockton og hans kone hadde fire døtre og to sønner.