I tråd med intensiteten i terroristsaksjonene av de tamilske separatistene, forsøkte regjeringsstyrkene å invadere Vanni-regionen i flere operasjoner, men klarte ikke å drive ut LTTE og led stor tap mot de etter hvert mer farligere tamiltigrene. LTTE gikk på nytt i offensiven ved november 1999 og startet flere offensiver som ledet til store seire på Vanni-regionen og nådde fram til Elefantspasset som ble tatt i april 2000. Militært sett hadde regjeringen i Colombo blitt påførte meget smertelige tilbakeslager, men de klarte å holde stand på Jaffna-halvøya og Jaffna by fremdeles var under regjeringens kontroll.