Fra august 1547 til oktober 1548 var han stiftssuperintendent ved Domkirken i Merseburg. Han vendte den 21. mars 1548 tilbake til Wittenberg, var så fra desember 1551 til slutten av 1552 generalsuperintendent i Eisleben ved St. Andreaskirken og forble så til livets slutt prost ved Slottskirken i Wittenberg. Major var i løpet av sin akademiske karriere i mange år dekan for det teologiske fakultet i Wittenberg og fire ganger (vintersemesteret 1540, vintersemesteret 1544, sommersemesteret 1561, sommersemesteret 1567) rektor ved universitetet, og i sommersemesteret 1559 prorektor.