Etter den mislykkede Vance-Owen-planen, som hovedsakelig gikk ut på å dele Bosnia i ti deler, tre til hver av henholdsvis serbere, kroater og muslimer, og et felles styre av Sarajevo. Kroatene prøvde å gjennomføre planen før den var vedtatt. Dette førte til det endelig utbrudd at av den kroatisk-bosniske krig. Dette førte til enda mer forvirring og etniske enklaver over hele landet. På dette tidspunktet holdt serberne ca. 70 % av landet, mens 20 % var holdt av kroatene og 10 % av bosnjakene (som utgjorde 44 % av befolkningen før krigen). Mostar var også omringet av kroatiske styrker fra tre sider i ni måneder og mye av byens historiske arv ble ødelagt av overlagt bombing av kroatene, inkludert den berømte broen.