Utover 1990-tallet ble Lars-Erik ter Jung mye brukt som spillende leder for ulike kammerorkestre, og han ble engasjert som konsertmester i flere norske og svenske orkestre. Fra 1994 har han vært frilanser og initiert og drevet en rekke egne prosjekt, bl.a. annet innenfor kammermusikk og samtidsmusikk. Dette resulterte i opprettelsen av flere ensembler - improvisasjonstrioen JKL, med Knut Vaage (piano treatments) og Jørgen Træen (electronic treatments), strykesekstetten TER JUNG SEXTET og duoen Twitter Machine med gitaristen Thomas Kjekstad. I tillegg har han i perioder også hatt det administrative ansvaret for Telemark Kammerorkester, ikke minst i forbindelse med det store EØS samarbeidet med musikkakademiet i Lodz, Polen. Alle disse ensemblene har dokumentert sin virksomhet med CD utgivelser av en rekke nye verk, som i det vesentlige er initiert av ter Jung og urfremført med disse ensemblene.