Jaap van Praag var en av de første professorer innenfor humanistiske studier ved Universitetet i Leiden, der han var ansatt i perioden 1964–1979. Han spilte en viktig rolle i opprettelsen av den internasjonale organisasjonen International Humanist and Ethical Union (IHEU) som ble grunnlagt i Amsterdam i 1952. Van Praag ble etterfulgt i denne rollen av den første ledertroikaen som bestod av Mihailo Marković, Howard Radest og Piet Thones i 1975.