I slutten av november og begynnelsen av desember 2012, ble det meldt at det var uenigheter mellom rådgiverne til Sterling og Liverpool FC om en ny kontrakt, bl.a skal uttalelser fra Brendan Rodgers om at Sterling ville være «dum» om han avslo kontrakten med klubben, ha hisset opp stemningen mellom partene. Samtidig meldte britiske medier om at klubber som Chelsea og Manchester City var ute etter signaturen til Raheem. Den 21. desember bekreftet imidlertid Liverpool at Sterling hadde signert en ny forlenget kontrakt med klubben. Sterling skåret sitt andre seriemål 2. januar 2013 i kampen mot Sunderland. Sterling endte 2012-13 sesongen med totalt 24 seriekamper og 2 seriemål, 36 kamper totalt.