I hovedbygningen er det en rekke faste utstillinger, hovedutstillingene «Til sjøs» og «Norge er havet» åpnet i jubileumsåret 2014. «På reise med Chiefen og Sally Jones» er en utstilling for barn og unge basert på den prisbelønte boken «Legenden om Sally Jones» av Jakob Wegelius (2008). I tillegg har museet en malerisamling, Supervideografen og skiftende utstillinger. I 2016 åpnet «Håp for havet?» og i 2017, «Torpedert».