Johan Martin Schønheyder ble student i 1765 og juridisk kandidat i 1772. Samme år ble han utnevnt til prokurator ved hoff- og statsretten, i 1774 ble han utnevnt til høyesterettsadvokat, og i 1785 ble han utnevnt til kammeradvokat. Den sistnevnte stillingen hadde han frem til 1828. I 1828 ble han utnevnt til assessor i høyesterett.