Josefus forteller om tre ulike ekteskap. Berenikes første mann, Marcus Julius Alexander (16–44 e.Kr.) døde ganske snart etter at ekteskapet ble inngått. Da han døde, giftet hun seg med sin farbror Herodes av Chalkis, og levde med ham frem til han døde, da Berenike var bare rundt 20 år gammel. Med Herodes av Chalkis fikk hun to sønner.