Til hans publikasjoner hører en latinsk–tysk ordbok («Der Stowasser», 1894), oversettelser av greske epigrammer til tysk, og oversettelser fra tysk til gresk. Mange av disse ble klassikere og trykket i talløse opplag. En ny utgavet av «Der Stowasser» utkom 1994 med et omslag bearbeidet av hans etterkommer Friedrich Stowasser ().