Klubben ble nasjonalt kjent da de tapte knepent 0-1 hjemme mot Rangers i FA-cupen i januar 1948, foran et rekordstort publikum. Året etter ble de valgt inn i C Division (nivå 3) i Scottish Football League. Denne divisjonen besto for det meste av reservelagene til klubbene i de to øverste divisjonene, samt noen få førstelag. Stranraer og de fire andre førstelagene i C Division ble valgt inn som fulle medlemmer i ligaen (nivå 2) da C Division ble nedlagt i 1955.