Kort etter til tiltreden havnet pave Sergius i konflikt med keiser Lothar I, som mente sine interesser forbigått, og derfor sendte sin sønn Ludvig II med en hær mot Roma. Det lyktes pave Sergius i siste minutt å dempe konflikten og forhindre en væpnet strid om Roma. For videre å sikre freden kronet han Ludvig II til konge og gav den keiserlige rådgiver Drogo, som var biskop av Metz, pavelig gesandtverdighet for Øst- og Vestfrankerriket.