Modahl ble arrestert av tyskerne i 1940, på et tidspunkt da NKPs folk fortsatt levde i legalitet. Han ble tatt etter et større møte hvor Peder Furubotn hadde talt, og hensikten var å forberede illegal virksomhet. Etter frigjøringen i 1945 ble han igjen redaktør i , og fra 1946 medlem av formannsskapet i Bergen. Han var også formann i arbeidsløshetsnevnden og medlem i ligningsrådet.