Wang Zhongqis onkel Wang Heshou var kommunistisk politiker; hans storesøster Wang Kun var operasangerinne innen den revolusjonære sjanger. Han gikk på (senere kalt Beijing 101. middelskole). I 1952 begynte han på Harbins institutt for teknologi og tok slutteksamen der i 1956. I oktober 1960 ble han sendt for studier ved Moskvas energetiske institutt finansiert av den kommunistiske regjering, og tok vise-doktorat der i oktober 1962.