I hele Tsjekkoslovakia utgjorde jøder 75-80 % av alle dødsofre under andre verdenskrig. Flere tusen sigøynere (opptil 7 000 ifølge Sniegon) ble deportert til Auschwitz eller drept på annen måte Av de 92 199 jødiske innbyggere i Riksprotektoratet ved begynnelsen av okkupasjonen ble drept av okkupasjonsmakten, 14 045 overlevde. I republikken Slovakia ble minst drept. Områdene annektert av Ungarn (det sørlige Slovakia og Transkarpatia) hadde i 1939 en jødisk befolkning på –, hvorav – ble drept ved holocaust i Ungarn. I alt ble av Tsjekkoslovakias omkring jøder drept (regnet etter grensene av 1937).