Glassvaren er en forholdsvis stor flyndrefisk som kan bli opptil 60 centimeter og 3 kg. I likhet med andre arter i varfamilien er den nesten alltid venstrevridd. Kroppen er avlang og ganske flat, men dette varierer noe med kondisjonen. Munnen er påfallende stor og kan også vrenges kraftig ut. Øynene sitter midt oppe på den fargede siden av hodet. Oversiden er gulbrun til rødbrun med mørkere, uregelmessige flekker. Blindsiden er vanligvis helt hvit. Oversiden har nokså store skjell (til flyndre å være) og kjennes ru, i motsetning til mange andre flyndrer har den ikke noe tykt slimlag.