Den 15. mars 1957 ble han utnevnt til biskop av San Fernando, etter Cesare Marie Guerrero, og to måneder senere, den 11. mai 1957, ble han bispeviet av den apostoliske nuntius til Filippinene, Egidio Vagnozzi. Medkonsekratorer var Alejandro Olalia, biskop av Lipa, og Hernando Antiporda, hjelpebiskop av erkebispedømmet Manila. Mellom 1962 og 1965 deltok han i alle sesjoner av Det andre Vatikankonsil.