Hos mennesker forbindes melaniner først og fremst med huden og hudfarge; melanin er det stoffet som er viktigst for å bestemme fargen på et individs hud. Melanin finnes også i håret, i netthinnen, i nyrens marg og i binyrens , i det indre øret, og på noen steder i hjernen: (som er latin for «svart substans») og («blå flekk»).