Den som var biskop William Delanys foretrukne til å etterfølge seg var Henry Neville, dekanen i Cork, men han var ikke velsett av erkebiskop Thomas Croke av Cashel, og O'Callaghan var den som ble valgt, den 15. juni 1884. Han ble ordinert den 29. juni 1884 i til biskop som koadjutor til biskopen av Cork i 1884 av kardinal Giovanni Simeoni, prefekt for Kongregasjonen for troens utbredelse; medkonsekrerende var titulærerkebiskop Vincenzo Leone Sallua O.P. og titulærbiskop Tobias Kirby.