Gentoo tilbyr 3 forskjellige nivåer å installere fra. Nivå 1 inneholder bare det aller nødvendigste for at brukeren skal kunne bygge sitt eget operativsystem. Å installere fra nivå 2 tar kortere tid, men gir færre valgmuligheter. Nivå 3 er gir færrest valgmuligheter, men er kjappest, særlig fordi man kan velge en ferdigkompilert linuxkjerne, genkernel, i stedet for å kompilere den selv.