Den 15. oktober 1999 ble han utnevnt til biskop av Bissau, et bispedømme som på den tid og i drøye ett år til omfattet hele Guinea-Bissau. Bispevielsen fant sted den 12. februar 2000 i friluft nær katedralen i Bissau, og ble foretatt av titulærerkebiskop Jean-Paul Aimé Gobel, assistert av medkonsekrantene biskop Paulino do Livramento Évora, C.S.Sp. av Santiago de Cabo Verde og biskop Pierre Sagna, C.S.Sp. av Saint-Louis du Sénégal.