De to opprinnelige linjene har 22 stasjoner, hvorav ni befinner seg under bakken og 12 over. Christianshavn tilbyr omstigningsmuligheter mellom de to metrolinjene; Flintholm, Nørreport og Vanløse tilbyr overgang til S-tog, mens overgang til regionaltog er mulig ved Lufthavnen, Nørreport og Ørestad. Cityringen har 17 stasjoner, med overgang til de øvrige linjene ved Christianshavn of Kongens Nytorv. De nye linjene har også et stopp ved Københavns hovedbanegård, den største jernbanestasjonen i Denmark. Systemet blir eid av Metroselskabet, et selskapet som igjen blir delvis eid av forvaltningen i København og Frederiksberg, og den danske stat. Metroen og dets 34 tog blir drevet av det private selskapet Metro Service. Systemet har fire soner, og billettprisene varierer avhengig av antall soner en passasjer reiser gjennom. Billettsystemet er integrert med kollektivtrafikksambandet Movia og det nasjonale jernbaneselskapet DSB. I 2009 transporterte metroen 50 million passasjerer. Ti år senere var antall reisende per år steget til 78,8 millioner, hvorav 66,6 mill var på de opprinnelige linjene M1 og M2.