Forsvaret eier alle Nyboderboligene. De administreres av Forsvarets Bygnings Etablissement (FBE) med et lokalt boligkontor kalt Lokalt Støtte Element Nyboder (LSENYB). Forsvaret begynte i 2011 å selge flere av boligblokkene i Nyboder-kvarteret, men dette gjaldt kun utenfor De Gule Stokke. De Gule Stokke ble samtidig renovert, flere i samarbeid med A.P. Møller og Hustru Chastine Mærsks Fond, som også har betalt istandsettelse av Nyboder Mindestue. Devar igjen klar til å huse forsvarets ansatte fra 2013.