Barre først flyttet til Nairobi i Kenya, men opposisjonsgrupper der protesterte på hans ankomst. Som svar på presset og fiendtlighetene, flyttet han to uker senere til Nigeria. Barre døde 2. januar 1995 i Lagos av hjerteinfarkt. Hans levninger ble gravlagt i Garbahaarreey-distriktet i Gedo-regionen i Somalia.