Etter å ha begynt som journalist i Lofotposten i 1959, arbeidet Mortensen fra 1962 til 1966 som journalist i Associated Press i Oslo. Der var han alene på jobb da han i 1963 som den første i Norge mottok meldingen om attentatet på president John F. Kennedy. og sendte den videre til norske redaksjoner. Fra 1966 til 1972 var han utenriksjournalist i Aftenposten, deretter informasjonssjef i Norges almenvitenskapelige forskningsråd (NAVF) og redaktør for bladet Forskningsnytt. Han grunnla forlaget Atlantic Press i 1995 og var også fast skribent i Maritimt Magasin Historie.