I mars 2016 ble Aagaard-Nilsen tildelt Musikkforleggerprisen i kategorien årets verk, klassisk/samtidsmusikk for stykket «Dirty Dancing» komponert for og urfremført av Christiania Blåseensemble i 2015. Han ble også nominert i samme kategori for «Boreas Syng (Boreas Sing)» samme år, og for «Three Fancies For Wind Ensemble» i 2023 og i klassen årets verk - stort ensemble sammen med for i 2025.