Eric Voegelin ble værende i Baton Rouge frem til 1958 da han aksepterte tilbudet fra Ludwig-Maximilians-Universität i München om å overta Max Webers stilling i samfunnsvitenskap, som inntil da hadde vært ubesatt siden Webers død i 1920. I München grunnla Voegelin Institut für Politische Wissenschaft.