Hélène Cixous ble født i Oran i det dengang franske Algerie. Faren var fra en sefardisk jødisk familie som på 1800-tallet flyttet til Oran i Algerie fra Marokko. Moren var askenasisk jødisk og født i Osnabrück i Tyskland og en fransk (fransk statsborger i Algerie), men hennes forfedre hadde bodd i blant annet det som nå er Slovakia, Tyskland og Alsace. I hennes barndomshjem ble det, foruten tysk som ble hennes morsmål, dessuten talt fransk, spansk, arabisk, engelsk og hebraisk.