President James Madison utnevnte først politikeren og kongressmannen John Boyle fra Kentucky til guvernør, men etter 21 dager trådte han tilbake og gikk inn i stillingen som høyesterettsjustitiarius for Kentucky (Chief Justice), en stilling som Ninian Edwards hadde innehatt. Venner i Washington assisterte Edwards i å bli utnevnt til guvernør for territoriet. Inntil Edwards ble utnevnt var et av hans søskenbarn, Nathaniel Pope, stedfortredende guvernør. Blant annet var han med på å opprette Illinois' første fylker (counties) og utnevnte han funksjonærer til det nye styret. Ninan Edwards var da han ble utnevnt til guvernør bare 34 år, og dermed den yngste bestyreren av Illinois som stat eller territorium.