I år 1249 fikk Hildesheim kjøpstadsrettigheter. Omkring 1300 ble biskopen tvunget til å oppgi makten over byen som så fikk egne byrettigheter og sitt eget segl. I 1367 ble byen medlem i Hanseforbundet. Etter 1542 er flere av kirkene i Hildesheim blitt lutherske, men domkirken er forblitt katolsk.