Fra april 2000 fulgte en periode som medlem av Rajya Sabha. I oktober 2000 ble hun på nytt minister for informasjon og kringkasting før hun i januar 2003 ble minister for helse, familievelferd og parlamentariske saker, en statsrådspost hun hadde til 22. mai 2004. Deretter var hun engasjert i arbeidet i overhuset og ulike komiteer der. Swaraj ble valgt til en ny periode i overhuset i 2006, men stilte i 2009 igjen med hell til valg til underhuset Lok Sabha.