Ifølge tradisjonen har det blitt hevdet at orglet i Hole kirke, som nå står i Bønsnes kirke, fra cirka 1840 ble levert av Gomnæs, men ifølge Fiskvik & Kolnes (2010) er dette tvilsomt, siden Gomnæs da ikke var fylt 20 år og da neppe hadde de nødvendige kvalifikasjonene til å bygge et slikt orgel. Gomnæs bygget imidlertid orgelet til nye Hønefoss kirke i 1862. Dette orgelet er nå oppstilt i gravkapellet ved Hole kirke. I 1861 fikk også Gomnæs oppdraget med å bygge nytt orgel til Norderhov kirke, men dette ble ikke ferdig før i 1865. Sistnevnte orgel skulle erstatte et kirken hadde fått i gave av Anna Colbjørnsdatter i 1727. Gomnæs fikk det gamle orgelet som en del av betalingen for det nye. Dette satte han i stand og solgte det videre til verkseier Adolf Friedrich Roscher ved Ringerikes Nikkelverk, som ga det videre i gave til Tyristrand kirke, der det ble installert i 1861. I 1875 utvidet Gomnæs orgelet på Tyristrand til tretten stemmer.