Van Zandt's giftet seg for tredje gang med Jeanene Munsell. De traff hverandre 9. desember 1980, på en minnehøytidlighet for John Lennon. Da den dødssyke Dorothy Van Zandt fikk vite at hennes sønn hadde gjort Munsell gravid, forlangte hun at han skulle gifte seg med henne. sa han skilte seg fra sin andre hustru og giftet seg med Munsell 14. mars 1983. Deres første barn, William Vincent, ble født ti dager senere. Neste barn, Katie Belle, ble født 14. february 1992. Van Zandt og Munsell skilte seg 2. mai 1994. Likevel holdt de kontakten helt til Townes døde og Jeanene overtok styringen av eiendommen hans.