Den 9. september 2009, 40 dager etter moren Corazón «Cory» Aquinos død, kunngjorde han sitt kandidatur til presidentvalget i mai 2010. Aquino vant presidentvalget med 15 208 678 stemmer. Moren hadde vært en svært populær president, og hennes død turde ha aksentuert valgoppslutningen om sønnen. På annenplass i presidentvalget kom tidligere president Joseph E. Estrada med  stemmer.