I eller kort etter mai 1843 dro Meignan tilbake til Paris og ble opptatt i erkebispedømmet Paris' presteskap. Han var vikar ved St-Jacques-du-Haut-Pas, men måtte av helsegrunner allerede i 1845 til Roma. Han kom seg raskt, og kunne i mars 1846 erverve teologisk doktorgrad fra universitetet La Sapienza. Også i Roma ble han kjent med betydelige skikkelser som skulle bli gode rådgivere. Det gjaldt for eksempel Giovanni Perrone og Olympe-Philippe Gerbet. Han hørte også forelesninger av Carlo Passaglia, Francis Xavier Patrizi og Augustin Theiner.