Arne Sæter gikk Nordmøre ungdomsskole og Orkdal landgymnas og studerte så ved Det teologiske menighetsfakultet i Oslo. Han ble mobilisert som vernepliktig soldat i aprildagene i 1940 og sluttet seg til motstandsbevegelsen (Sivorg) i Trøndelag. Han ble ordinært som prest like etter frigjøringen i 1945, men arbeidet i ti år som ungdomssekretær for Det Norske Misjonsselskap i Trøndelag.