Pave Johannes Paul II utnevnte ham til biskop av Rochester den 23. april 1979. Paven bispeviet ham personlig den 27. mai samme år; medkonsekratorer var Duraisamy Simon Lourdusamy, sekretær for Kongregasjonen for folkenes evangelisering, og Eduardo Martínez Somalo, i Statssekretariatet. Innsettelsen i bispedømmet Rochester fant sted 26. juni samme år.