Pave Tawadros II begynte i sitt høye embede på en tid da Egypt gjennomlevde omskiftende endringer. Han uttalte at den ortodokse kirke gikk inn for å beholde artikkel 2 intakt i utkastet til konstitusjon, det vil si slik som den sto i den gamle konstitusjon. Han gikk senere inn for ar de egyptiske kirker trakk seg fra den konstitusjonsforberedende forsamling, trass i presidentskapets oppfordringer at de skulle forbli/vende tilbake.