Etter flere år i 3. divisjon rykket Mjøndalen opp til 2. divisjon før 2007-sesongen. Etter en god høstsesong endte Mjøndalen på 2.-plass i 2. divisjon avd. 4. I 2008 vant laget sin avdeling og rykket opp til 1. divisjon. I 1. divisjon i 2009 endte MIF på 11.-plass, og i 2010 og i 2011 ble klubben nummer 10. I 2012 var Mjøndalen for alvor med i kampen om opprykk til Eliteserien, men endte på fjerdeplass og kvalifisering til eliteserien. Klubben tapte mot Bodø/Glimt i første runde av kvalifiseringen.