Nissen var med i bystyret, formannskapet og ligningsvesenet, og fra 1883 i middelskolens forstanderskap. Han var byens varaordfører i 1892 og med å stifte Redningsselskapet i 1894. I Hammerfest Sparekasses direksjon var han med i årene 1887-1890 og suppleant 1891-1897.