Han oppsøkte nazistiske ledere og protesterte mot arrestasjoner og drap av syke og mentalt tilbakestående, og mot forfølgelsen av jødene. Til å begynne med avfeide nazistene presten som en plageånd. Fader Lichtenberg ble advart at han risikerte å bli arrestert for sin virksomhet, men han sluttet ikke likevel. Han kritiserte konsentrasjonsleirsystemet som for eksempel leiren Dachau, og organiserte protestdemonstrasjoner utenfor visse av leirene.