Han har påvist en ny type samarbeid mellom T- og B-celler (Idiotype-drevet T-B samarbeid) og hvordan et slikt samarbeid under uheldige omstendigheter kan føre til autoimmune sykdommer og lymfekreft. Bogen har videre vist at T-celler av CD4 typen, i samarbeid med makrofager, kan forkaste kreftsvulster. Han har også utviklet, med bidrag fra prof. Inger Sandlie ved Universitetet i Oslo, nye typer målstyrte vaksinemolekyler slik som Troybody og Vaccibody. Sistnevnte er patentert. Selskapet «Vaccibody» ble etablert av Bogen og medarbeidere i 2007 , og han er leder av det rådgivende panelet i selskapet siden 2007.