Pignedoli var blant kardinalelektorene under de to konklavene i 1978, som valgte pave Johannes Paul I (august) og pave Johannes Paul II (oktober). Han ble av mange selv ansett som en ved begge konklavene. I det første konklavet i 1978, som pave Johannes Paul I skulle komme ut av, var hans kandidatur støttet av den progressive fløyen som stod i motsetning til kardinal Giuseppe Siri, en kandidat fra den konservative side.