I januar 2000 hadde teamet vurderte en kobling mellom preisdent Kocharyan og hans krets til skytingen. Flere personer nær Kocharyan ble arrestert, inkludert Aleksan Harutiunyan, presidentens viserådgiver, og Harutiun Harutiunyan, assisterende direktør i den statlige kringkastingsetaten. Men i løpet av sommeren det året de ble løslatt. Etter hvert klarte ikke Jhangiryan å finne bevis som knyttet Kocharyan til skytingen. Rettssaken startet i februar 2001 og 2. desember 2003 ble de fem hovedpersonene dømt til livstid i fengsel.