Arkipelet er av vulkansk opphav, har et areal på ca. 181 km² og består av tre større øyer: Isla Robinson Crusoe, ca. 93 km², hovedøya Isla Santa Clara, ca. 5 km², ca. 1,5 km sørvest for hovedøya Isla Alejandro Selkirk, ca. 85 km², ca. 181 km vest for hovedøya I tillegg kommer flere småøyer, blant dem rett nord for hovedøya.