Etter at hans kontrakt med Lillestrøm gikk ut ved sesongslutt 2009 stod han fritt til å søke etter andre klubber. Han var på prøvespill hos den tyske klubben Rot-Weiss Essen, men ble ikke enig om en kontrakt. I stedet skrev han under med Dynamo Dresden i januar 2010, som da spilte på tysk nivå tre i 3. liga. Til tross for en god start i sin nye klubb ble Gundersen leddbåndskadet i venstre ankel i midten av mars 2010, og måtte trene alternativt i to måneder. Han avsluttet deretter sesongen med ni kamper og to mål.