Magufulis regjering drev igjennom en rekke infrastrukturprosjekter, blant annet bygging av en havn i Bagamoyo, en ny internasjonal lufthavn i Dodoma og jernbaneprosjekter. Magufuli fortsatte sin forgjenger Jakaya Kikwetes prosjekt for en modernisering av jernbanene med oppbygging av normalsporstrekninger i Øst- og Sentral-Afrika. Men først hadde han avbrutt dem da han tiltrådte som president på grunn av en rettsprosess mot en kinesisk oppdragsgiver for uregelmessigheter. I januar 2021 ble det meldt at Magufuli hadde sikret kinesisk finansiering på 1,32 milliarder amerikanske dollar for byggingen av en 341 km langt strekning mellom Mwanza og Isaka.