Martyn fortsetter å kjempe med sin alkoholisme, men gjenopptok karrieren i 1990 med og 1992's . Han ga også ut et album med nyinnspillinger av sine klassiske låter med et musikalsk stjernelag som Phil Collins, David Gilmour fra Pink Floyd, og Levon Helm fra The Band, samt ulike samleplater og live-innspillinger. Etter fire år ga Martyn ut , et album med sterke jazz, trip-hop og funk overtoner, etterfulgt i 1998 av , en samling coverlåter. I 1999 ga han også ut et dobbelt live-album fra en klassisk konsert fra The Shaw Theatre i 1990 med tittelen .