Den 3. juni 2020, under protestene etter George Floyds død, fortalte Brees Yahoo! Finance at han stod ved sine utsagn fra 2016 om at kneling under nasjonalsangen var respektløst overfor flagget og USA. Flere av hans lagkamerater og andre profesjonelle idrettsutøvere uttrykte sinne og skuffelse over uttalelsene. Dagen etter postet han en beklagelse på sin personlige Instagram-konto.