Frem til Estlands nye uavhengighet var derfor den apostoliske administrasjonen vakant (ubesatt). Det var lenge uvisst om Profittlich var levende og død; under den kalde krigen var det ikke liketil å finne ut av hvordan det gikk med folk sovjeterne deporterte. Men i 1990 ble det opplyst fra sovjetiske myndigheter at han døde, og når.