Byen og provinsen var underlagt Thailand på 1800-tallet, men etter press fra Frankrike ble den tilbakeført til Kambodsja i 1907. Under Lon Nols regime (1970–1975) økte befolkningen betraktelig, men da Røde Khmer overtok makten i landet i 1975 ble Battambang som de fleste andre urbane områder i Kambodsja tømt for mennesker. Selv etter Demokratisk Kampucheas fall i 1979 var Røde Khmers innflytelse sterk i et tiår framover, men byen har vokst kraftig og er i dag en av de største i Kambodsja.