I 1996 gav Pearl Jam ut sitt fjerde album – et album som var mye smalere enn de tidligere utgivelsene. Bandet fortsatte å eksperimentere på sitt neste album , men returnerte til det man kan kalle deres opprinnelige lydbilde på fra 2000. På dette tidspunktet hadde Irons forlatt gruppa av helsemessige årsaker, og blitt erstattet av Matt Cameron. Deres neste album var Riot Act som blir sett som et veldig svakt album, men i 2006 gav bandet ut deres comebackalbum Pearl Jam som var det første siden No Code til og komme på 1.-plass på Billboard 200.