Etter et lite opphold hos Muslim League, ble Gillani del av Pakistans folkeparti (PPP) i 1988 og har siden vært lojal til PPP. I Benazir Bhuttos regjering fra 1988–1990, var Gillani igjen en minister: Turistminister fra mars 1989 til januar 1990 og igjen som «Minister of Housing and Works» fra januar 1990 til august 1990.