Storfloduglen er aktiv på kveld og natt, hvor den sitter i trær og på grener over vann, hvor den ser etter fisk. Den kan fange fisk på opp til 2 kg, men oftest fanger den fisk på 100-200 g. På dagtid hviler den i trær lengre unna vannet. Hunner og hanner hviler ofte i par.