Verkenselva er ei viktig elv for ørret som fram til utbyggingen av Dikemark kraftverk med reguleringen av Dikemarkvannene var en del av samme stamme som ørreten i disse. I dag her ørreten i elva sine viktigste gyteområder i de øvre delene av elva. Det er også registrert ål i elva, samt elvemusling og edelkreps. Langs bredden er den rødlistede starrarten stautstarr funnet.