Mellom 1932 og 1938 jobbet Mallowan for British Museum, og gravde ut relativt ukjente steder som for eksempel Arpachiyah, Chagar Bazar og Tell Brak. Mallowan gravde også ut steder i Det nære østen, som for eksempel ved Nimrud i Irak. Derfra dro han til London og jobbet som professor ved University of London mellom 1942 og 1960. Han jobbet også som direktør ved British School of Archaeology i Irak mellom 1947 og 1961.