Sommerne er milde, varmest sør og øst i Estland og kaldere på øyene. Temperaturene kan nå opp til 30–35 °C, men ligger vanligvis rundt 20 °C. Den varmeste måneden er juli, men varmerekorden på 35,6 °C ble satt i august. Tordenstormer er ikke uvanlig på ettermiddagene.