Befolkningen ønsket franskmennene velkommen og som tok kontroll over de administrative og lovmessige systemer, men senere førte tung skattlegging til raseri blant øyboerne. I løpet av denne korte historiske perioden kom nye ideer om system og sosial struktur til prege befolkningen. Mot slutten av 1798 ble franskmennene fordrevet av Russland og Det osmanske rike i fellesskap (1798–1807). Korfu ble den nye hovedstaden for de joniske stater og dens styre var demokratisk med et senat bestående av fjorten medlemmer hvor Ithaka hadde en av dem.