Under et oppdrag for å beskytte Grace og forskeren Norm Spellman (Joel David Moore) mens de samler prøver, blir Jake angrepet av en thanator, et stort rovdyr. Han løper inn i skogen og mister kontakt med Grace og Norm. Der blir han angrepet av ulvelignende skapninger, men blir reddet av Neytiri (Zoë Saldaña), en na'vi fra Omaticaya-klanen. Jake følger etter Neytiri og sier at han vil lære av dem, men hun svarer at «himmelfolket» ikke kan bli lært. Plutselig blir Jake omringet av små, eteriske, selvlysende skapninger som ifølge Neytiri er Ewyas frø. Hun tolker dette som et tegn og tar Jake med til klanen sin. Der møter han Neytiris foreldre, Eytucan (Wes Studi) og Mo'at (C.C.H. Pounder), som er klanens konge og dronning, og Tsu'tey (Laz Alonso), den neste i arverekkefølgen. Mo'at ber Neytiri trene opp Jake til å bli en del av samfunnet deres. Idet han sovner i en kokong i klanens såkalte «Hometree», våkner Jakes menneskekropp.