Selv om ekteskapet var arrangert, var forholdet mellom ektefellene tilsynelatende godt, i alle fall de første årene av ekteskapet. Selv om Frederik tilsynelatende følte stor respekt for henne og alltid behandlet henne med respekt, var han angivelig ikke forelsket i henne og fortsatte utskeielsene etter ekteskapet deres. Men Frederik følte seg komfortabel med henne, og Louise lot som hun ikke la merke til utroskapen hans. Paret fikk fem barn, hvorav bare den eldste sønnen, tronarvingen kronprins Christian, døde i tidlig barndom. Louise gjorde seg raskt populær i det danske hoffet, og til og med svigerfaren, som i utgangspunktet hadde vært motvillig til å ha henne som sin svigerdatter, bemerket i et brev til en venn at han syntes hun var snill og hyggelig. Hun ble også møtt med stor entusiasme fra Københavns innbyggere på grunn av hennes naturlige og ukompliserte oppførsel. I motsetning til sin svigermor, dronning Sophie Magdalene, anstrengte hun seg for å lære dansk, og studerte dansk språk umiddelbart etter ankomsten til Danmark under hoffprest Erik Pontoppidan. Hon ansatte også lærere slik at barna hennes kunne lære å snakke sitt lands språk.