På Taiwan begynte Frikirken misjon i 1953. I 1973 ble en søsterkirke etablert også der. Fra starten av hadde virksomheten på Taiwan en tydelig diakonal profil. Arbeidet blant eldre i innlandsbyen Dongshi har fått nasjonal oppmerksomhet og utmerkelse. Fra 2002 har det ikke vært utsendinger fra Frikirken til søsterkirken, men de to kirkene samarbeider.