Museet ble åpnet i 1986, 200 år etter at kanalbyggeren Engebret Soot ble født. Museet holder til på området til det nedlagte tresliperiet Ørje Brug ved Ørje sluser. Fra starten eide museet tre bygninger på området. Det var bestyrerboligen, kalt Wang-huset, som huset den første utstillingen som stod klar ved åpningen i 1986, uthusbygningen og Lundinstua. Museet overtok etter hvert et bolighus kalt Brakka på området, hvor en ny og mer omfattende utstilling om Haldenvassdraget ble presentert. Lundinstua er innredet som en bolig ved århundreskiftet (1900). Etter ti års drift i 1996 ble industribygningen på Ørje Brug kjøpt sammen med bolighuset Færjeriet.