Anne Hutchinson ble født og vokste opp i Alford i Lincolnshire (England) der faren Francis Marbury var en anglikansk prest. Hun ble som ung voksen tilhenger av predikanten John Cotton i nabobyen Boston i Lincolnshire. Cotton reiste til Massachusetts i 1633. Hutchinson giftet seg i 1612 med kjøpmannen William Hutchinson. Hutchinson reiste med mann og barn fra England til Boston i Massachusetts våren 1634 og arbeidet der som jordmor.