Falabellaen er oppkalt etter familien Falabella, som avlet den fram på ranchen Recreo de Roca utenfor for Buenos Aires. Selv om rasen ikke er mere enn hundre år gammel, finnes det ingen opplysninger om hvordan rasen ble avlet fram. Det er derfor vanskelig å finne ut av rasens nøyaktige opprinnelse. En myte forteller at Falabella nedstammer fra en liten fullblodshest som familien hadde, og som ble avlet med de minste shetlandsponniene. En annen myte forteller, at Señor Falabella så en masse indianere når de hver dag kom for la hestene deres drikke i elven som renner gjennom familiens ranch. En dag la han merke til at de hadde en svært liten hingst med seg, og som hadde noe de kalte «dvergsyke». Señor Falabella syntes det var en merkelig og fascinerende hingst, kjøpte den og avlet fram små hester fra den til datteren sin.