I 1987 ble Berstad leder for gastroseksjonen på Haukeland sykehus i Bergen, og professor ved medisinsk fakultet ved Universitetet i Bergen. Han fortsatte sitt engasjement for pasienter med fordøyelsessykdommer, knyttet til seg flere medarbeidere, og publiserte en rekke avhandlinger om funksjonell dyspepsi, og reflux av magesyre til spiserøret. Den såkalte «Bergensgruppen» innførte en original forskningsstrategi der de benyttet kombinasjoner av ulike teknikker slik som ultralyd, dynamiske måltidsundersøkelser og endoskopier. Samarbeid med andre avdelinger slik som psykologi, mikrobiologi og informasjonsteknologi. Arnold var tidlige en pådriver for elektronisk journaler og samling av resultater i databaser. Dette gav rast fruktbare resultater, mange publikasjoner og fullførte doktorgradsprosjekter og internasjonal oppmerksomhet. Spesielt mye internasjonal oppmerksomhet fikk studiene om forbedret livskvalitet hos pasienter med magesår som hadde blitt behandlet for infeksjon med . Dette dannet grunnlaget for at Helsedepartementet i 2001 opprettet et nasjonalt kompetansesenter for gastroenterologisk ultralyd ved Haukeland universitetssjukehus.