Som elleveåring ble Messi diagnostisert med veksthormonmangel, som medførte at han stoppet å vokse og måtte få hormonbehandling i tre år, i form av en daglig injeksjon. Siden Argentina på den tiden var i en økonomisk krise, fikk han ikke dekket behandlingen og familien hans betalte cirka kroner i måneden for å kunne fortsette med den. Messi var bekymret over høyden sin og redd for at sykdommen ville påvirke fotballkarrieren hans negativt. Helt siden barndommen hadde han et ønske om å bli profesjonell fotballspiller. 13 år gammel flyttet han til Spania for å bli fotballspiller. betalte de medisinske kostnadene hans og trente ham.