Guzmán tok magistereksamen i juss og filosofi, med hovedoppgaver om Immanuel Kant og «det borgerlige demokratiet». I 1962 ble han utnevnt til professor i filosofi ved universitetet i Ayacucho av universitetets rektor, Efrain Morote Best, en antropolog som ifølge enkelte senere skulle bli Perus Kommunistiske Partis intellektuelle leder. Rektoren inspirerte ham til å studere quechua, som er språket til Perus urbefolkning, og han ble i økende grad aktiv i venstrebevegelsen. Han samlet likesinnede unge akademikere rundt seg, og de satte seg som mål å gjennomføre en revolusjon i Peru. I 1965 besøkte han for første gang Kina. I løpet av 1970-tallet gikk han under jorden. Han hadde over en periode ledet universitetet.