Kristendommen ble grundig etablert utover på 500- og 600-tallet. Den skotske katolske keltiske kirken hadde klare liturgiske og ekklesiologiske særegenheter i forhold til resten av kirken med latinsk ritus, da den ble ledet av klostrene. Noen av disse særegenhetene ble innordnet i forhold til den øvrige kirken mot slutten av 600-tallet på synoden i Whitby og etter at Columba trakk seg tilbake til Iona. Men den skotske kirken ble ikke fullt integrert i det katolske fellesskap for på 1000-tallet.