I VM i skiskyting 2020 i Antholz var hun med på det norske laget som tok gull på blandet stafett. Marte Olsbu Røiseland, Tarjei Bø og Johannes Thingnes Bø var de andre på det norske laget. Eckhoff gikk også på det norske laget som tok gull på 4 × 6 km stafett. Hun ble nummer to i verdenscupen i skiskyting 2019/20, like bak vinneren Dorothea Wierer.