I motsetning til andre ioniseringsmetoder som elektrosprayionisering (ESI) og kjemisk ionisering ved atmosfærisk trykk (APCI), tillater APLI generering av ioner uavhengig av elektriske felt, fordi sonen for ionedannelse bare styres av laserlyset. Dette tillater noen spesielle metoder, for eksempel måling av det romlige oppløste ionesignalet (distribusjon av ionaksept - DIA) med APLI for eksempel, som brukes i utviklingen av nye ionkilder.