Bjerkaker skole er organisert i læringsbaser samt egne avdelinger for praktisk – estetiske fag. Lærerne jobber i team på klassetrinnene. Høsten 2011 fikk Bjerkaker skole status som Universitetsskole med et tett samarbeid med Universitetet i Tromsø i forhold til lærerutdanning og forskning. Bjerkaker skole tar imot rundt 20 studenter dette skoleåret.