Stoppestedet ble kalt «Trøgstad», men på grunn av forvekslinger med bygdenavnet Trøgstad i Østfold endret man i 1897 navnet til «Jessum». Dette navnet ble brukt «blasfemisk», for eksempel av rekrutter som sa de var kommet gjennom Bøn (tettsted nord for Jessheim) til Jessum. Prestene i bygda klagde derfor til biskopen som i 1900 tok opp saken med herredsstyret og foreslo formen «Jessheim». Man endret derfor skrivemåten til «Jesseim» i 1901. I 1921 endret Jernbanen skrivemåten til Jessheim.