Som leder for Sikkerhetspolitiet i Stavanger var Wilkens ansvarlig for en brutal undertrykkelse av motstandsbevegelsen. Hans avdeling benyttet tortur, henrettelser og omfattende overvåkning for å stanse opposisjon mot naziregimet. Nesten 2000 personer fra Rogaland ble arrestert, internert eller deportert under hans ledelse.