Emmanuel Félémou gikk først på småseminaret i Kindia, og fra 1974 til 1980 på småseminaret i Nzérékoré. Deretter studerte han i to år dyremedisin i Beyla. I 1982 tok Félémou et teologisk propedeutikum ved seminaret i Bouaké i Elfenbenskysten, før han fra 1983 til 1989 studerte filosofi og katolsk teologi ved presteseminaret .