Ved 1500-tallets reformasjon minket kirkens autoritet, og på 16- og 1700-tallet ble nasjonalismen en kraft å regne med. Begge deler første til kollisjon mellom pavelig makt og staters streben etter nasjonal suverenitet, og mest tydelig i Frankrike. Lignende streben etter selvstendighet i en nasjonal versjon av den katolske kirke kalles iblant også for gallikanisme. Lignende historiske strømninger i andre land, som febronianisme i Tyskland og josefinisme i Østerrike, anses påvirket av gallikanismen.