Navnet har hatt flere skrivemåter; Bossnes (1563), Bøgenes (1610), Bogsnes (1612), Boxnes (1612), Bogsnæs (1723). Senere er også brukt Boksnes, Boxnes og nå Bogsnes. Den siste delen av navnet kommer av den store halvøyen (neset) der gården ligger på eidet. Første del av navnet kommet av gammelnorsk bugr = bøyning (genitiv: bugs) som ofte blir brukt i stednavn der en bukt blir laget av en bøyning av strandlinjen. Navnet betyr derved "neset på eller ved bøyningen", da strandlinjen lager en stor innbøyning som avsluttes i Bogsnesvågen på østsiden av halvøyen.