Den 26. april 2013 forhandlet Packers og Rodgers frem en fem-årig kontraktforlengelse til en verdi av $110 millioner, som gjorde ham til den best betalte spilleren i NFLs historie. Packers begynte 2013-sesongen mot de regjerende NFC-mestrene San Francisco 49ers, som også var laget som hadde slått packers ut av sluttspillet året før. Rodgers fullførte 21 av 37 pasninger for 333 yards, tre touchdowns og én interception da Packers tapte 34–28. Uken etter satte Rodgers en personlig rekord med 480 pasningsyards, som også tangerte lagrekorden, da de vant 38–20 mot Washington Redskins. Rodgers ble utpekt til NFC Offensive Player of the Week for hans prestasjoner i kampen. Med 335 pasningsyards i første havldel satte han også en lagrekord. Han ble den første quarterbacken siden Y. A. Tittle i 1962 med minst 480 pasningsyards, fire touchdowns og ingen interceptions i én kamp. Uken etter ble hans rekke på 41 kamper på rad uten mer enn en interception avsluttet da Packers tapte 34–30 mot Cincinnati Bengals.