I 1998 vendte han tilbake til menighetspastoralt arbeid etter eget ønske og arbeidet i menigheter i Jablonné nad Orlicí og omegn. I 2001 ble han administrator igjen i Pardubice, den nest største byen i bispedømmet. Fra 1998 arbeidet han også som biskoppelig vikar for åndelige kall. I Den tsjekkiske bispekonferanse var han ansvarlig for fengselssjelesorgen. Etter reinstallasjonen av s katedralkapittel i Hradec Králové, ble han utnevnt til prost for domkapittelet den 10. november.