Kvalifiseringen til Paralympics er hovedsakelig basert på verdensrankingen som ble presentert av Det internasjonale blindesportforbundet 30. mai 2016. Totalt 114 utøvere ble kvalifisert ut ifra denne rankingen, men kun de øverste 9 menn og 6 kvinner pr divisjon, for å sikre at hver nasjonale paralympiske komité kun får med én judoka pr divisjon.