To av de viktigste sykdommer som i betydelig grad kan skade Japansk mint ( var. og begrense avkastningen er rustsopp og muggangrep. Melduggangrep forekommer vanligvis bare på vestkysten av USA, hvor været kan være tåkete og fuktig. Rustsopp er en sykdom som er felles for de fleste planter i slekten . Om disse sykdommene skulle ramme et dyrket område er de nærmest ukontrollerbare. Hvis de oppdages vil man gjerne skjære av alt for å unngå at resten av bladene blir smittet.