I august 2012 ble han beskyldt for plagiat. En kommentar om våpenkontroll som han skrev for hadde flere likheter med en artikkel skrevet av Jill Lepore for i april samme år. Zakaria beklaget til Lepore og leserne, og hans faste kommentar ble suspendert for en måned. Programmet hans på CNN ble også midlertidig suspendert.