Leschallier de Lisle var kapellan i pastoralregionen Savigny-le-Temple, Cesson, Nandy og Vert-Saint-Denis fra 2001 til 2004. Fra 2003 var han også en følgesvenn til pastorene som jobbet i offentlige skoler og åndelig assistent for skolens pastorale omsorg i bispedømmet Meaux. Fra 2006 til 2010 virket Guillaume Leschallier de Lisle i bispedømmets katekestjeneste. I 2008 ble han også sogneprest i Marne-la-Vallée. Fra 2013 til 2019 var Leschallier de Lisle ansvarlig for kallspastoralt arbeid i bispedømmet Meaux. Han var også sogneprest i solidum i Val d'Europe og fra 2014 som sogneprest i Melun.