Fra starten av var Slavia en toppklubb sammen med Sparta Praha og rivaliseringen mellom disse to klubbene er den mest kjente i tsjekkisk fotball. Slavia vant 16 titler, flere tsjekkiske cupmesterskap, og en gang Mitropa Cup i 1938. Den siste store suksessen var i 2007-2008 sesongen, da Slavia klarte å vinne Gambrinus Liga og avanserte til semifinalen i UEFA-cupen. I 2007 kvalifiserte de seg for gruppespillet i Mesterligaen for første gang.