I 2005 ble en utvidelse av spillet, kalt "Hearts of Iron II: Doomsday" sluppet. Denne utvidelsen selges som en såkalt "stand-alone"-ekspansjon, og dette innebærer at eierskap av originale Hearts of Iron II ikke er nødvendig. Doomsday utvider spillet til 1953, og innfører derfor en rekke ledere, eventer, teknologier og enheter som tidligere ikke var med. En ny kampanje kan Doomsday også skilte med. Denne kampanjen heter, ikke overraskende, "Doomsday", og tar for seg en potensiell tredje verdenskrig som starter med sovjetisk aggresjon mot sentraleuropeiske stater, som fører til en amerikansk atombombe plassert i Moskva som svaret på sovjetisk krigserklæring mot de vestlige allierte sent i 1945. En nokså god kampanje-editor følger også med i Doomsday.