Gortyns framståenhet ble overgått av framveksten av Faistos i løpet av 1000-tallet f.Kr. og som ble den mest betydningsfulle byen på Kreta i løpet av minoisk tid. Gortyn kom derimot tilbake i hellenistisk tid og overgikk andre byer på Kreta i styrke og rikdom. Den overtok herredømmet på øya, og dominerte hele dalen fra Messara til Levina, og senere på 200-tallet f.Kr. etter at Gortyn fikk ødelagt Faistos, var byens makt utvidet helt til Matala.