Etter 1759, da jesuittordenen i Brasil og Portugal var blitt oppløst som følge av startsminister Sebastião José de Carvalho e Melos kirkepolitikk, ble jesuittmisjonærene satt i fengsel. Pater Anselm Eckart satt fengslet i atten år i Lisboa før han til slutt ble løslatt i 1777.