I 1912, da Jenckes var 34 år, giftet hun seg med 68 år gamle Ray Greene Jenckes, en bonde og kornhandler fra Terre Haute. Sammen drev de en gård på 1300 hektar langs elven Wabash i det vestlige Indiana. Etter ektemannens død i 1921 arvet hun gården og kornhandelen og tok over ansvaret for driften alene. Deres eneste barn, en datter ved navn Virginia, ble født i 1913 og døde av tuberkulose i 1936, bare 22 år gammel.