I 2019 ble Herlof Nilssen oppnevnt som ny styreleder i Norsk Helsenett. I desember 2020 ble han styreleder i det statlige foretaket Sykehuspartner. I januar 2021 ble Nilssen styreleder i Nasjonalt kunnskapssenter om vold og traumatisk stress (NKVTS). i Sykehuspartner. Han ble i juni 2021 dessuten oppnevnt som styremedlem ved Universitetet i Bergen.