Den 3. august 1946 utnevnte pave Pius XII ham til titularbiskop av og hjelpebiskop i erkebispedømmet Los Angeles. Han ble bispeviet av hjelpebiskop av Los Angeles Joseph Thomas McGucken den 15. oktober samme år. Medkonsekrerende var generalsuperioren for Maryknoll-misjonærene, biskop James Edward Walsh M.M., og hjelpebiskop Thomas Arthur Connolly fra San Francisco. Timothy Manning ble kansler av erkebispesetet; fra 1955 ledet han dessuten som generalvikar forvaltningen av erkebispedømmet Los Angeles.