Naxos har godt med ferskvann og er svært fruktbar, særlig de nedre delene nær nordvestkysten og oppover terrassehagene i de mange fjellandsbyene. Det dyrkes frukt og grønnsaker, vinranker, olivenolje og korn (hovedsakelig som dyrefôr). Husdyrproduksjon gir melkeprodukter som ost og yoghurt.