Stammen nevnes først i journaler fra 1792 ført i pennen av kaptein Robert Gray. I 1805 kom Lewis og Clark-ekspedisjonen i kontakt med dem i 1805 ved utløpet av Colombiafloden. Ekspedisjonen kalte sin siste leir der for Fort Clatsop, oppkalt etter stammen, hvis nærmeste landsby var om lag unna. Stammen ble også navnegivende for det senere Clatsop County i Oregon. Ifølge William Clarks nedtegnelser bestod clatsopstammen den gang av rundt 200 personer i tre landsbyer, og de bodde i hus av sederplanker. Clatsoper besøkte fortet for å bedrive handel.