Bekken var kommunalpolitisk engasjert i årene i Tromsø. Blant annet var han initiativtager til Kristent Arbeiderforum, et møtested for kirke og fagbevegelse. I 1992 ble han valgt inn i Oslo bystyre. I 1995 ble han byråd for kultur og byutvikling i Oslo, i byrådet til Rune Gerhardsen. Som kulturbyråd var han blant annet opptatt av kulturtilbudet til barn og ungdom. Bekken gikk sammen med resten av byrådet av i januar 1997. I perioden 1989–93 var Bekken vararepresentant nr. 5 for Oslo på Stortinget.