Turbomolekylære pumper må operere med veldig høye hastigheter, og friksjonsvarmeoppbyggingen pålegger designbegrensninger. Noen turbomolekylære pumper bruker magnetiske lagre for å redusere friksjon og oljeforurensning. Fordi de magnetiske lagrene og temperatursyklusene bare tillater en begrenset klaring mellom rotor og stator, blir bladene ved høytrykksstadiene utartet til en enkelt spiralformet folie hver. Laminær strømning kan ikke brukes til pumping, fordi laminære turbiner stopper når de ikke brukes ved den planlagte strømningen. Pumpen kan kjøles ned for å forbedre kompresjonen, men skal ikke være så kald at den kondenserer is på bladene. Når en turbopumpe stoppes, kan oljen fra støttepumpen strømme tilbake gjennom turbopumpen og forurense kammeret. En måte å forhindre dette på er å innføre en laminær strøm av nitrogen gjennom pumpen. Overgangen fra vakuum til nitrogen og fra en løpende til en stille turbopumpe må synkroniseres nøyaktig for å unngå mekanisk belastning på pumpen og overtrykk ved eksosen. En tynn membran og en ventil ved eksosen skal tilsettes for å beskytte turbopumpen mot overdreven mottrykk (f.eks. Etter strømbrudd eller lekkasjer i støttepumpen).