Selv om MS-baserte analyser av polymerer i stor grad er utført ved bruk av en-trinns MS, har tandem MS også blitt brukt til å karakterisere polymerkomponenter. CID er den vanligste metoden for dissosiasjon som brukes, men ETD har blitt brukt som en komplementær metode. Unike obligasjonsspaltninger som følge av ETD gir verdifull diagnostisk informasjon.