Den bulgarske ortodokse kirken regnes som et uadskillelig medlem av den eneste, hellige, synodiske og apostoliske kirken og er organisert som en selvstyrende enhet med navnet patriarkat. Den er delt inn i tretten eparkier i Bulgaria og ytterligere to for bulgarerne i Vest- og Sentral-Europa samt Nord- og Sør-Amerika og Australia. Eparkiene er delt inn i 58 kirkeprovinser som i sin tur er inndelt i cirka 2600 forsamlinger.