Hodder tok sin Bachelor of Arts i forhistorisk arkeologi ved University of London i 1971 og en doktorgrad i Spatial Analysis in Archaeology ved University of Cambridge i 1975. Han var foreleser ved University of Leeds mellom 1974 og 1977 før han vendte tilbake til Cambridge, der han etterhvert ble professor i arkeologi i 1996. Han flyttet til Stanford i 1999 og ble i 2002. I 1996 ble han medlem av British Academy.