Honorius døde 30. september 653, som den siste av de gregorianske misjonærer. Han ble begravet i St. Augustine's kirke i Canterbury. Han bøe senere venerert som helgen, med festdag 30. september. Hans relikvier bøe overført til en ny grav i 1091, og omtrent på den samme tid ble hans hagiografi nedtegnet av Goscelin. I 1120-årene vites det at hans relikvier fortsatt var i St. Augustine's.