Forskningssenteret har (per 2020) mer enn 3 000 ansatte spredt på kontorer i Brussel, Geel, Ispra, Karlsruhe, Petten og Sevilla. Det ble grunnlagt innenfor Kommisjonens rammeprogram Horisont 2020 i sitt ikke-nukleære arbeid og av Euratom for den delen som gjelder kjernekraft. JCR er en del av Horisont Europa.