Rhône-dalen skiller Bern-Alpene fra Chablais-massivet i vest, og fra Wallis-Alpene i sør. Den øvre delen av Rhône-dalen skiller de fra de lepontinske Alpene i sørøst, mens Grimselpasset og Aare-dalen skiller de fra Uri-Alpene i øst. Nordgrensen for Bern-Alpene er mindre klar, men kan sies å ligge på en linje mellom Genèvesjøen og Vierwaldstättersjøen.