Gbagbo ble pågrepet og satt i husarrest den 11. april 2011. I oktober 2011 igangsatte Den internasjonale straffedomstolen etterforskning av voldshandlingene som ble utført etter valget. Straffedomstolen utstedte arrestordre på Gbagboa. Han ble anklaget for forbrytelser mot menneskeheten, nærmere bestemt drap, voldtekt og andre former for seksuell undertrykkelse, forfølgelse og «andre umenneskelige handlinger» begått mellom 16. desember 2010 og 12. april 2011. Gbagbo ble arrestert i Korhogo og satt på et fly til Haag. Gbagbo er den første tidligere statslederen som blir stilt for retten av den den internasjonale straffedomstolen .