Før Fristaden Christiania oppstod i 1971, lå her Bådmansstrædes Kasterne, hvor bygningen som Loppen befinner seg i fungerte som artillerimagasin. Den 17. mai 1973 ble spillestedet innviet og gikk dengang under navnet . Senere skiftet spillestedet navn og ble således oppkalt etter det loppermarked som lå under de nåværende lokaer. Loppen var fra 2000 til 2016 utnevnt til regionalt spillested og mottok støtte fra Statens Kunstfond og Københavns kommune.