MS «Venus» kom til Bergen den 6. september, etter at andre verdenskrig var brutt ut. På overfarten hadde et bombefly kretset rundt det flere ganger, men hadde ikke gått til angrep. Skipet gikk ikke flere turer over til England denne høsten og gikk i opplag i lag med MS «Vega» i Damsgårdssundet. Dette var verdifulle skip. Mindre verdifulle skip ble benyttet i Englandfarten i stedet. Under et uvær 10. november 1939 gav bunnfestene til bøyene skipet lå ved etter, og de ble flyttet til Kirkebukten, hvor de hadde landfester. På et tidspunkt før krigen brøt ut i Norge, ble disse to skipene, i tillegg til MUGG «Stellene Polaris», flyttet til Stanghelle i Osterfjorden.