Larry McDonald ble født i den østlige delen av byen DeKalb County i Atlanta. Han var fetter av general George S. Patton. Som barn gikk han på privateog sneversynt skoler før han begynte ved en ikke-tverrkirkelig high school. Han brukte to år på high school før han avla eksamen der i 1951. Han studerte ved Davidson College fra 1951 og frem til 1953, der han brukte mye tid på å studere historie. Han gikk videre til å studere ved Emory University School of Medicine i en alder av 17 år, derfra ble han uteksaminert i 1957. Han ble senere utdannet urolog ved Grady Memorial Hospital.