Den 9. august skåret Borini i sin debutkamp for Liverpool på Anfield, i returmøtet av Europaligakampen mot FC Gomel. Han deburte i Premier League 18. august 2012, i 3–0 tapet borte mot West Bromwich Albion på The Hawthorns. I oktober 2012 bekreftet Liverpool at Borini var skadet i 3 måneder på grunn av brudd i beinet, som han pådro seg i en kamp mot Manchester United. Borini returnerte for Liverpool den 13. januar 2013, når han kom inn som innbytter for Raheem Sterling i en bortekamp mot Manchester United.