I oppveksten gikk Lisa Murkowski på offentlige skoler i Fairbanks. Fra 1975 til 1977 studerte hun ved Willamette University i Salem i Oregon. Hun avsluttet sine økonomistudier i 1980 ved Georgetown University med en B.A., fem år etter fikk hun graden J.D. ved ved Willamette University. Hun ble advokat i Alaska og praktiserte fra 1987 til 1996 som jurist i Anchorage.