Clarke var et av 21 medlemmer i Det konservative parti som 3. september 2019 stemte med opposisjonen i Underhuset, for et forslag om å hastebehandle en lov mot å gå ut av EU uten en handelsavtale. Dette medvirket sterkt til at den første voteringen i Underhuset i Boris Johnsons regjeringstid endte med et nederlag for regjeringen. Clarke ble deretter kastet ut av partiet, og endte sin karriere i Underhuset som uavhengig representant.