I 1560 ble Wigand kalt til professor i teologi i Jena, men ble avsatt i 1561 på grunn av sin heftige fremferd. I 1562 ble han utnevnt til superintendent i Wismar. I 1563 tok Wigand doktorgraden i teologi ved universitetet i Rostock. Han ble tilbakekalt i 1568 til Jena i egenskap av professor samt pastor og superintendent.