I 2001 innrømmet Limbaugh at han var blitt nesten helt døv, men han fortsatte likevel sitt populære radioshow. Ved hjelp av implantater fikk han igjen mye av hørselen. I 2003 arbeidet Limbaugh i en kortere periode som fotballkommentator, frem til han et par uker inn i NFL-sesongen samme år trakk seg.