I mellomkrigstiden var han med på to lange turer sammen med flere andre soldater og offiser fra den britiske hæren til India. I 1939 ble Morgan forfremmet til brigadegeneral og han overtok kommandoen over den 1. Support Group fra den første Armoured Division, som han hadde kommandoen over under slaget om Frankrike. I mai 1942 ble han ble utnevnt til generalløytnant og han ble gitt kommandoen over enda en gruppe soldater.