Etter utbruddet av andre verdenskrig i 1939 begynte selskapet å produsere karabiner og motor- og maskindeler. I 1937 mottok Hermann Göring en Merkel-hagle gravert med jaktmotiv. Det er antatt at gaven ble bestilt til Göring av general Franco i Spania. Etter slutten av krigen ble haglen tatt som krigsbytte og presentert for general Dwight Eisenhower, og den er nå utstilt på NRA-museumet i Fairfax. I 1942 døde Karl Paul Merkel, og i 1943 stoppet produksjon av jaktvåpen i praksis opp.