Hundseid ble arrestert etter frigjøringen, den 9. mai 1945, og ble satt i varetekt. I landssvikoppgjøret ble han anklaget for landsforræderi ved å ha meldt seg inn i NS, for å ha oppfordre andre til NS-medlemskap og for å støtte NS-systemet i avisartikler. Dette var mindre alvorlige forhold sett i sammenheng med tiltalene mot andre under landssvikoppgjøret, men lagmannsretten fant det skjerpende at en tidligere partileder og statsminister hadde stilt seg til rådighet for NS og okkupasjonsmakten. Lagmannsrettens flertall fant ingen formildende forhold og dømte ham til tolv års tvangsarbeid.