Müller var blitt jaktet av flere av Europas storklubber da kjøpte ham i 1988. Til tross for klubbens ambisjoner, endte den første sesong hans i klubben med nedrykk. På sommeren 1989 avslo Torino et tilbud fra . Oppholdet hos Torino ble preget av en rekke displinære problemer og skriverier i mediene om familiære problemer. Etter at hans elleve mål bidro til at Torino rykket opp på første forsøk, førte ustabile prestasjoner til at han på høsten i 1990 ble satt ut av laget. På nyåret 1991 hadde Torino fått nok, og lot ham forlate klubben for å vende tilbake til .