Atlantersypress vokser på våte steder nær kysten. Den danner som regel rene bestander, men av og til kan den finnes sammen med andre trær som sumpsypress, weymouthfuru og andre furuarter, , , , rødlønn, sumptre, gulbjørk, gråbjørk, kanadahemlokk og . I undervegetasjonen finnes konvallbusk, , og andre busker.