Byruinene ble opprinnelig gravd ut mot slutten av 1800-tallet av de engelske arkeologene James E. Quibell og F. W. Green. I hovedavleiringen av Nekhentempelet fant de et viktig seremonigjenstander fra tidlig førdynastisk tid som Narmerpaletten og septer med skorpionhode som har gitt betegnelse til «Skorpionkongen». Seinere ble det foretatt ytterligere utgravninger av en flernasjonalt gruppe av arkeologer, egyptologer, geologer, og andre typer vitenskapsfolk, som ble koordinert av Michael Hoffman inntil hans død i 1990, da Barbara Adams fra University College London og Renee Friedman, som representerte University of California, Berkeley og British Museum, inntil Barbara Adams' død 2001 da Renee Friedman fortsatte.