Winnipegosis er i likhet med den nærliggende Winnipegsjøen i vest, svært grunn. I og etter istiden inngikk bekkenet i en langt større innsjø – Lake Agassiz. Winnipegosis er svært langstrakt og smal, hele 240 km lang. Den er den nest største av en gruppe innsjøer som henger sammen via elveløp, størst er Winnipegsjøen mens Manitobasjøen er noe mindre.