I løpet av de første krigsårene ble flere hurtigruteskip senket, og MS «Ragnvald Jarl» var et kjærkomment tilskudd til hurtigruteflåten. 30. oktober 1942 ble skipet satt inn i fast rotasjon i hurtigruten, som på dette tidspunktet hadde Tromsø som nordligste anløp. 21. september 1944 ble MS «Ragnvald Jarl» rekvirert av den tyske okkupasjonsmakten og brukt til troppetransporter og som hospitalskip. Da Tyskland kapitulerte i mai 1945 lå skipet på verksted, og ble straks tilbakelevert til rederiet. I juli 1945 kom hurtigruten i gang igjen, og MS «Ragnvald Jarl» fortsatte i fast rotasjon. I 1947 ble skipet utleid til Fiskeridepartementet som arrangerte en tur til Lofotfisket med utenlandske politikere og diplomater ombord. I februar 1956 måtte skipet gi fra seg navnet til det nye hurtigruteskipet som var under bygging i Hamburg, og skipet ble omdøpt til MS «Harald Jarl».