Fra Rådhusbrygge 3 går blant annet båten til Bygdøy, med stopp ved Dronningen og Bygdøyneset. Fra 21. mars 2015, båtene til øyene i havnebassenget fra Rådhusbrygge 4: Hovedøya, Langøyene, Gressholmen, Lindøya, Bleikøya og Nakholmen. Videre benyttes Rådhusbrygge 4 som forhalingsplass eller venteplass for Nesoddbåtene, som nå går fra indre del av Tingvallakaia, også kjent som Aker brygge.