Ett unntak var imidlertid på Gendün Drubs tid, han som posthumt skulle bli betraktet som den første Dalai Lama. Fra 1438 til 1475 var han en og dermed Gelugpas overhode. På hans tid var Ganden Thripa understilt ham i rang. Så enestående skal Gendün Drub ha vært at ingen våget å etterfølge ham etter hans død. Dermed måtte posisjonen som Gyelwa foreløpig stå ubesatt.