Luftvernartilleribataljonen flyttet fra stasjonen i 1994, til tross for at kommunen etablerte en kampanje for å beholde bataljonen. I prosessen ble Andøya og Bardufoss flystasjon vurdert opp mot hverandre som mulige lokaliseringssteder, og Bardufoss ble til slutt anbefalt av Forsvaret og departementet og vedtatt av Stortinget i 1994. Andøya flystasjon ble sittende igjen med en lite kadreavdeling som hadde ansvaret for å sette opp LVA-Bn ved øvelser og mobilisering.