Den 15. juni 1889 ble Poggenburg ordinert til prest. Etter å vært kapellan i Bocholt og som rektor for filialkirken i Untermeiderich ved Duisburg, fulgte det oppgaver innen ungdomsomsorgen og som leder av et guttekonvikt. I 1911 utnevnte biskop Felix von Hartmann ham til generalvikar.