Nesten alle kvartalsnavn i Gamla stan ble til i løpet av 1600-tallet og senere, de fleste er oppkalt etter personer og hendelser (i hovedsak guder) fra gresk og romersk mytologi. "Latona" er det latinske navnet på Leto, som i gresk mytologi er en titan og elskerinnen til Zeus. Med ham hadde hun to sønner Apollo og Artemis.