Obersten planlegger å drepe mennesker som har denne nye mutasjonen, for å stoppe dem fra regresjon. Han torturerer Caesar med hypotermi og sult, for å tvinge alle apene til å jobbe. Den stumme jenta, kalt Nova, smyger seg inn på anlegget for å gi Caesar mat og vann. For å avlede oppmerksomheten fra Nova, lar Rocket seg fange og blir slått av Red. Caesar, Rocket, Maurice og Bad Ape frigjør apene i en tunnel som fører ut av anlegget. Caesar konfronterer obersten, akkurat i det området blir angrepet av militæret. Apene som forsøker å rømme blir fanget i kryssilden mellom Alpha-Omega og militæret.