I 1992 fikk Beckham sin debut for Manchester United i den engelske ligacupen mot Brighton & Hove Albion FC, og signerte sin første profesjonelle kontrakt kort tid etterpå. I 1993 kom Uniteds berømte juniorlag til FA Youth Cup-finalen igjen, men tapte for Leeds United FC denne gangen. I 1994 vant Beckham reserveligaen med United. I februar og mars 1995 var Beckham på utlån til Preston North End FC hvor han spilte fem kamper og scoret to mål. Deretter debuterte han i Premier League mot Leeds United 2. april 1995, 19 år gammel. Året etter kom han i søkelyset etter en kamp mot Wimbledon FC, der han oppdaget at keeperen var langt ute, og lobbet ballen i mål fra midtbanen. På grunn av Eric Cantonas utestengelse det meste av sesongen 1995–1996 på grunn av sitt angrep på en tilskuer, fikk Beckham en sentral rolle i klubbens markedsføring, samt i lagets oppbygning. Han hjalp klubben til å vinne både ligaen og FA-cupen. I sesongen 1998–1999 var han med å vinne «The Treble» – Premier League, FA-cupen og Mesterligaen, noe ingen lag hadde gjort før dem. Fra sesongen 2001–2002 begynte forholdet mellom manager Alex Ferguson og Beckham å bli vanskeligere, og det toppet seg i sesongen 2002–2003. Etter at laget hadde tapt en kamp mot Arsenal FC, skjelte Ferguson ut spillerne i garderoben og sparket til en fotballstøvel som traff Beckham over øyet, slik at han måtte sy flere sting. Etter denne episoden florerte ryktene om overganger til andre klubber, blant annet Chelsea FC og FC Barcelona. Beckham spilte sin siste kamp for Manchester United i siste serierunde i FA Premier League 2002–2003 mot Everton FC. Han scoret 1–1-målet på et frispark, og Manchester United vant senere kampen etter mål av Ruud van Nistelrooy. Beckham scoret totalt 86 mål på 397 kamper for Manchester United.