Med spillere som Dimitar Berbatov og Wayne Rooney var det ventet at han ville få sterk konkurranse. Rooneys utroskapskandale gjorde spissituasjonen i Manchester United noe forandret. Rooney, som hadde en fantastisk 09/10 sesong, slet med matchformen og var en skygge av seg selv. Her tok Hernández godt vare på sin mulighet, og scoret i debuten for sin nye klubb etter en scoring med ansiktet. Han ble også tomålscorer mot Stoke, i 9.serierunde, der resultatet ble 2-1 til United, som dermed tok med 3 poeng på bortebane. Hernández scoret også de to første målene i Uniteds 4–0-seier over Wigan.