Under utenlandsbesøket forsvarte han sin oppdagelse mot dansken Thomas Bartholin, som hevdet å ha kommet med oppdagelsen før ham. Denne striden, hvor Rudbeck deltok med to skrifter, pågikk lenge, men til slutt ble det konsensus om at Rudbeck hadde vært først. Gasparo Aselli (død i 1625) og Jean Pecquet (1622–1674) var andre, europeiske vitenskapsmenn som tidlig oppdaget lymfesystemet.