I 1956 fikk delstatsflagget nytt utseende, da slik at flaggets frie ende ble byttet ut med det såkalte Sørstatskorset, fanen konføderasjonens tropper førte i borgerkrigen. Endringen skjedde i tiden da sørstatenes raseskillepolitikk sto under sterkt press av føderale myndigheter. Innførelsen av Sørstatskorset må anses som en symbolsk handling på motstand mot opphevelse av raseskillepolitikken, selv om endringen i ettertid offisielt ble forklart som et ønske om å hedre upolitiske soldatverdier som lojalitet, mot og tapperhet fra borgerkrigstiden. Kampanjen tok sikte på å få til flaggskifte til de olympiske leker i Atlanta i 1996, men dette lykkes ikke, da flagget fra 1956 hadde mange tilhengere og stor støtte både blant politikere og befolkningen ellers, da særlig delstatens hvite befolkning.