Magnor stasjon fikk installert sikringsanlegg i oktober 1953, og ble omklassifisert som en fjernstyrt stasjon betjent for ekspedering av reisende og gods i april 1967. Stasjonen ble i praksis nedlagt da den fra januar 1985 fikk ny status som en fjernstyrt stasjon uten fast bemanning. Fra 1996 har Magnar stasjon status som fjernstyrt kryssingsspor.