Mot Atlanta Falcons i uke 13 kastet Brees ingen touchdownpasninger og fem interceptions, det høyeste i sin karriere, som avsluttet hans rekke på kamper med minst én touchdownpasning etter 54. Uken etter, mot New York Giatns, kastet Brees for 354 yards og sikret sin syvende sesong på rad med minst 4 000 pasningsyards, og forbigikk Peyton Mannings rekord på seks sesonger på rad. Det var også hans femte sesong på rad med minst 30 touchdownpasninger of 4 000 pasningsyards, som også var en NFL-rekord. Brees avsluttet sesongen med 5 177 pasningsyards og 43 touchdowns, til tross for at laget hadde det svakeste forsvaret i NFL som satte en ligarekord med 7 042 tillatte yards, og laget avsluttet sesongen 7–9 og gikk glipp av sluttspillet.