Han var sønn av svensken Erik Olufsen Anker (1644–99), en innflytter til Christiania i 1666, som der hadde slått seg opp som kjøpmann og giftet seg med Maren Lauritzdatter (1651–1725), datter av Lauritz Lauritzen (Lars Larsen). De bebodde gården Huseby. ''Se Anker (slekt) for mer om efterslekten Etter artium fra Københavns universitet i 1697, tok han embetseksamen i faget teologi i 1701. Så bars det til Land (Oppland) og fra 23. juni 1703 være kapellan for presten Christopher Hansen Tanche (1641–1718), en nær slektning. Videre giftet han seg med Tanche's datter Karen. Bernt overtok som prest i 1718, men slapp å gifte seg med enken da han hadde giftet seg med dattera. Men, han arvet svigerfarens bibliotek som supplerte hans egen samling av bøker innen astronomi og andre naturvitenskaper fra tiden i København.