Solid Snake traff ikonisk status i Metal Gear Solid, der han blir tvunget av USA gjennom sin tidligere kommandør Roy Campbell å nøytralisere en terrororganisasjon på Shadow Moses-øya i Alaska som består av FOXHOUND-medlemmer. Her møter han blant annet Otacon, som han danner et merkelig vennskap med. Etter hvert får han vite at han ble kunstig unnfanget fra Big Boss' gener - at han er en klone - når han kjemper mot lederen av terroristene, sin tvilling, Liquid Snake.