Skolen ble grunnlagt som kommunal middelskole i 1916, og fikk gymnasklasser fra 1934. Skolen holdt opprinnelig til i den gamle bygningen til Storetveit skole. Den nåværende skolebygningen er fra 1957, tegnet av arkitekt Fr. Theodor Olsen. I 1965 ble skolen overtatt av fylkeskommunen og gitt navnet Fana gymnas.