Sammenlignet med SQL:2003 har SQL:2006 utvidelser til del 14 (ISO/IEC 9075-14:2006). Denne delen definerer måter SQL kan brukes sammen med XML. Standarden definerer måter å importere og lagre XML-data i en SQL-database, manipulere dem i databasen og publisere både XML-data og konvensjonelle SQL-data i XML-form. I tillegg gjør den det mulig for applikasjoner å integrere inn mot SQL-kode ved bruk av XQuery, som er et XML-spørrespråket publisert av World Wide Web Consortium (W3C), for samtidig tilgang til vanlige SQL-data og XML-dokumenter.