Et internasjonalt råd, bestående av representanter fra den innfødte befolkningen, ledende forskere, spesialister på etikk, og deltagende organisasjoner holder oppsikt over samarbeidet med den innfødte befolkningen som deltar i prøvetakingen av DNA. Rådet fremmer streng prøvetaking og forskningsprotekoller som er kun relatert til prosjektet. Genografisk prosjekt gjør en utstrakt rådspørring med innfødte grupper verden over. Prosjektet offentlige deltagersett er tilgjengelig via et kommersielt selskap, Family Tree DNA (FTDNA), som benytter det amerikanske forskningslaboratoriet ved Universitetet i Arizona.