I 1522 hyrte Niklaus Manuel seg nok en gang som feltskriver for Albrecht von Stein. Han deltok da i et felttog inn i Lombardia. Ved Novara ble han såret i den hånden. Seinere tok han del i slaget ved Bicocca. I 1523 ble han guvernør over Erlach, Echallens og Nidau. År 1526 var han en kort periode utsending til landdagen i Baden. Fra april 1528 ble han for første gang nevnt som medlem av byrådet i Bern. Dette embetet hadde han til han døde.