MAO-hemmere, som mange andre antidepressiva, kan ha begrenset varig effekt på selve forløpet av lidelsen, og seponering kan føre til tilbakefall til den opprinnelige tilstanden. Dette gjør overgangen mellom MAO-hemmere og SSRI mer komplisert, da det er nødvendig å rense kroppen for det ene medikamentet før man starter med det andre. En medisinsk organisasjon anbefaler å trappe ned dosen over minst fire uker, etterfulgt av en to ukers "utvaskingsperiode". Som følge av dette må pasienten håndtere depresjon uten medikamentell støtte i denne perioden, noe som ofte er bedre enn å risikere farlige interaksjoner mellom de to legemidlene. miniatyr| Bånddiagram av en monomer av human MAO-A, med FAD og klorgilin bundet, orientert som om den var festet til den ytre membranen til en mitokondrie . Fra PDB : 2BXS MAO-hemmere virker ved å hemme aktiviteten til monoaminoksidase, og forhindrer dermed nedbrytningen av monoamin-nevrotransmittere og øker dermed tilgjengeligheten deres. Det er to isoformer av monoaminoksidase, MAO-A og MAO-B. MAO-A deaminerer fortrinnsvis serotonin, melatonin, epinefrin og noradrenalin . MAO-B deaminerer fortrinnsvis fenetylamin og visse andre sporaminer ; I kontrast deaminerer MAO-A fortrinnsvis andre sporaminer, som tyramin, mens dopamin er like deaminert av begge typer.