Siden midten av 1990-årene har Gentofte blitt kritisert fordi kommunen ikke ønsker å ta imot flyktninger og asylsøkere i samme omfang som hovedstadsregionens øvrige kommuner. Den politiske ledelsen har vist til vanskeligheter med å skaffe rimelige og tilgjengelige boliger, som følge av kommunens tette bebyggelse og mangel på sosial boligbygging. I 2004 begynte kommunen å oppføre flyktningeboliger på et omdiskutert område midt i forgreningen mellom Lyngby- og Helsingørmotorveiene, hvor også jernbanen mot Hillerød går, og hvor det er markant trafikkstøy.