Flesch kom til Norge sammen med Terboven 23. april 1940. Flesch var (tilsvarende oberstløytnant i ) og kommandør for i Bergen fra sommeren 1940, og fra 11. oktober 1941 (juni 1941 ifølge Sivertsen) i Trondheim og frem til kapitulasjonen. Han var -sjef for Midt-Norge - dvs. fra Dovre og Stad til polarsirkelen. Etter invasjonen av Sovjetunionen i 1941 ble Trondheim og ubåtbasen der regnet som strategisk viktig. Flesch fikk spesielt ansvar for hele kysten fra Bergen til Troms.