Beaglekanalen er bare 5 km bred på det smaleste. Kanalen strekker seg fra øya Nueva i øst til Cookbukta i vest. Den sørvestlige delen går mellom Isla Hoste og Isla Gordon, før kanalen munner ut i Cookbukta. Den nordvestlige delen går inn i Darwinsundet mellom Isla Gordon og Isla Grande. Darwinsundet knytter seg til Stillehavet via to kanaler: O'Brienkanalen og Ballenerokanalen, som går på hver sin side av Isla O'Brien.