Bygginga av akvedukten starta 23. juni 1743, og den sto ferdig i 1751. Den var opprinnelig ti kilometer lang, og ble bygd for å løse problemene med vannforsyning i Villa de Guadalupe, hvor Guadalupe-basilikaen ligger, ved å frakte det fra Azcapotzalco og Tlalnepantla de Baz. 7. april 1932 ble Guadalupe-akvedukten offisielt erklært verneverdig.