Han fikk aldri kommandoen i felten igjen, men han returnerte for å tjene i den kontinentale arméen. Etter at kongressen trakk tilbake sin resolusjon som krevde en undersøkelseskomité i forbindelse med Camdenkatastrofen i 1782, sluttet Gates seg til Washingtons stab ved Newsburgh i New York. Selv om rykter forbandt noen av hans hjelpere i Newsburgh-komspirasjonen i 1783, hadde Gates ingen forbindelse til saken.