Forskjellige glyfer kan også representere samme grafem, noe som betyr at de er allografer. For eksempel kan den lille bokstaven bli sett i to varianter, med en «krok» øverst, og uten. Ikke alle glyfer er grafemer i den fonologiske betydningen; for eksempel representerer logogrammet det latinske ordet , som betyr , og består av to fonemer.