Et særtrekk for diacetyl (og andre nærliggende diketoner) er det lange C-C-bondet som forbinder karbonylsentrene. Denne bånddistansen er ca. 1,54 Å, sammenlignet med 1,45 Å for den tilsvarende C-C-bindingen i 1,3-butadien. Forlengelsen skyldes avstøt mellom de polariserte karbonylkarbonesentrene.