Sobek ble dyrket enten fullstendig i dyreskikkelse, eller i hybridfigur med krokodillehode. Fra Mellomriket av var et av de viktigste kultstedene Shedet (Krokodilopolis) i Faiyum og Kom Ombo i Øvre Egypt i gresk-romersk tid. I overensstemmelse med at det hellige dyrets leveområde var Nilen var Sobek også en fruktbarhetsgud.