Angelo Scolas far var lastebilsjåføren Carlo Scola, og moren var Regina Colombo. Han var den yngre av deres ro sønner; hans storebror Pietro døde i 1983. Habs videregående utdannelse var ved Manzoni-lyceet i Lecco, der han ble i ungdomsbevegelsen . Angelo Scola studerte katolsk teologi og filosofi i Milano og Fribourg (Sveits), og tok doktorgraden i begge fag.