På samme tid skrev Magnard musikkanmeldelser i avisen og pådro seg noen fiender med dette. På den andre siden nektet han å dra nytte av sin fars sosiale relasjoner. I 1896 giftet Magnard seg med Julie Creton og underviste i kontrapunkt på Schola Cantorum, som var grunnlagt i 1894 av d'indy, de to årene etterpå og skrev sin . Omtrent på denne tiden begynte Magnards hørsel å bli dårligere.