Til gjengjeld bidro han i 1146 til å få stanset en rekke pogromer i Rhinlandet. I 1130 ble han benyttet som megler for å avslutte det pavelige skisma. Da pave Honorius II i 1130 døde, ble to kandidater nominert til paveembetet – Anaklet II og Innocens II. Det lyktes Bernhard å avgjøre dette til fordel for pave Innocens II som levde i landflyktighet i Frankrike, og Anaklet II ble sendt bort fra Roma.