Bjørgvin kalvskinn fra 1300-tallet omtaler Loen-kirkens jordeiendom. På 1600-tallet ble det til erstatning reist et laftet bygg med kor og våpenhus i stavkonstruksjon; koret kan ha stått igjen fra stavkirken. På 1600-1700-tallet var det stadig reparasjoner av tak og våpenhus blant annet etter storm.