Den 2. april 2020 døde Jesdanun i en alder av 51 av COVID-19 etter å ha blitt smittet med SARS-CoV-2-infeksjon. Han hadde ingen underliggende sykdommer, og var egentlig i god form: Han hadde siden 2002 løpt i alt 83 maratonløp, 15 av dem i New York.