Fadden var medlem av representantenes hus fos Queensland fra 1936 til 1958. I august 1941 gikk Robert Menzies av som statsminister og Fadden ble utnevnt til den nye lederen for Country Party of Australia, han var leder for partiet til 1958. Etter valget i 1946 gjenopptok Fadden det politiske samarbeidet med tidligere statsminister Robert Menzies. Fadden var alltid kjent som en frittalende konservativ politiker, men slutten av 1940-tallet ble han en sterkt anti-kommunistisk i sin tankegang.