I 1966 omgjorde en lov alle private universiteter til statlige, og i 1968 ble Al-Hikma nasjonalisert ved nok en lov. I november ble det amerikanske fakultetet utvist av Ba'ath-regjeringen, og institusjonen ble integrert i Bagdad-universitetet. Jesuittenes eiendommer ble konfiskert, og året etter ble alle utenlandsake lærekrefter utvist.