I 2018 ble Tom Mangersnes ansatt i Norges Fotballforbund en jobb han hadde til sommeren 2020. Allerede fra januar 2020 ble han ansatt som analyseansvarlig i Sportsklubben Brann, og på sommeren ønsket Brann at Mangersnes også ble utviklingssjef i Brann-Akademiet. Disse jobben kombinerte han frem til sommeren 2021 hvor han sa opp.