I november 2014 ble al-Nimr dømt til døden av en spesialdomstol for å ha søkt utenlandsk innblanding i Saudi-Arabia, tatt til orde for opprør, og vært ulydig mot den muslimske øvrighet i havnebyen Qatif, den sjiittiske høyborg i landet. Det kom så mostridende meldinger i den arabiske presse om en benådning.