Jofamilien er trolig søstergruppen til alkefamilien (Alcidae). HBW Alive deler familien inn i to slekter; og . En genetisk studie av Cohen (1997) fant imidlertid ut at storjo og polarjo var søsterarter. Dette har imidlertid Braun & Brumfield (1998) reist tvil om, i det de hevder at alle «skuer» i så fall må være søsterarter til polarjoen. Derfor har de fleste siden valgt å behandle artene i samme slekt; , som for eksempel Birds of the World. Hva som er riktig er det fortsatt ikke full konsensus om. En studie fra 2009 viser at artene tilhører i to slekter, mens en studie fra 2008 viser at joene på den sørlige halvkule er svært nært beslektet med hverandre og tilhører samme slekt.