I kontinentalcupen 2016/17 endte han på pallen fire ganger. Den gode hoppingen hans der gjorde at landslagstrener Alexander Stöckl belønnet Aune med verdenscupdeltakelse ut sesongen. Han debuterte i verdenscupen i Holmenkollen 12. mars 2017, hvor han kom på en 21. plass, hvor han også tok sine første verdenscuppoeng. Han fulgte opp dette med en 18. plass på hjemmebane i Granåsen i Trondheim, som er hans beste plassering i verdenscupen. Han kvalifiserte seg ikke til rennet i Vikersund, og endte dermed på en 38. plass i første utgaven av Raw Air. Under kvalifiseringen til sesongens nest siste renn i Planica satte han personlig rekord med 204 meter, men klarte ikke å kvalifisere seg.