I 1931 splittet de mer militante medlemmene ut av Haganah av og dannet den mer militante organisasjonen Irgun. Under og etter andre verdenskrig organiserte Haganah jødisk innvandring til Palestina i strid med britenes immigrasjonsrestriksjoner. Cirka jøder på flukt fra Holocaust ble brakt til Palestina med flere hundre skip. Haganah organiserte også demonstrasjoner mot innvandringskvotene satt av det britiske Palestinamandatet.