Med økende internasjonalt press og president Cristianis økende tvil om hærens evne til å knekke FMLN, begynte fredsforhandlingene i juli 1990 etter initiativ fra FN. Begge parter undertegnet avtalen om menneskerettigheter. Denne avtalen hadde som oppgave å etablere en FN-misjon som skulle overvåke menneskerettighetsspørsmål i landet, og dermed ble ONUSAL grunnlagt.