Iditarod 2006 ble startet i Anchorage lørdag 4. mars 2006. De 83 kjørerne kjørte en 18 km transportetappe gjennom byens sentrum med spann på 12 hunder. Deretter ble deltakerne fraktet cirka 10 mil til Wasilla som er stedet hvor Iditarod 2006 egentlig starter.