Han studerte fengselsvesenet i nabolandene, og forfattet kriminologiske og medisinske arbeider. Daae var først direktør ved Trondhjems Strafanstalt og så fra 1892 til 1910 var han direktør for Botsfengselet i Kristiania. Daae innførte fingeravtrykk i norsk kriminalteknikk.