Kuffner var produktiv som forfatter og oversetter. Han oversatte blant annet Plautus' lystspill. Han satte også tekst til Haydns oratorium «Die vier letzten Dinge» og Ignaz Aßmayers «Sauls Tod». Kuffner fikk i 1808 oppdrag å lage teksten til Beethovens «Korfantasi». Teksten fremgår ikke i oversiktene over Kuffners verker, men i 1852 opplyste Beethovens elev Carl Czerny at Kuffner var forfatteren. Nyere forskning har bekreftet dette, ved gjenfinningen av en anonym anmeldelse i , februar-heftet 1809, der det også fremgår at Kuffner var forfatteren. Kuffners tekst understreker musikkens og ordets evne til å bringe kjærlighet og fred.