Kerularius hadde en rolle ved forhandlingen som endte med at keiser Mikael VI Stratiotikos abdiserte. Han overbeviste ham om å trekke seg tilbake den 31. august 1057, til fordel for den opprørske general Isak Komnenos, som hæren hadde gått inn for den 8. juni. Keiseren fulgte patriarkens råd og ble munk i et kloster.