Da Israel trakk seg ut av Sinai i 1982 ble gamle Rafah delt i to og delelinjen trukket gjennom byen. Rafah har Gazastripens eneste grenseovergang il Egypt. Tidigere ble Rafah-overgangen kontrollert av israelske militære styrker, men den kom over til palestinsk overhøyhet i september 2005 i samband med Israels tilbaketrekning fra Gazastripen. En kommisjon fra EU begynte å kontrollere grensen i november 2005 etter at Israel stilte seg kritisk til sikkerheten ved grensen, og i april 2006 tok Mahmoud Abbas' presidentgarde ansvar for grensen.