Kortklotrekrypere er standfugler, men trekker typisk ned fra store høyder vinterstid. Hannen bygger to–tre reder og lar hunnen velge. Prosessen tar normat opp mot 32 dager. Hannen er polygynius og kan pare seg med to hunner samtidig. Arten får normal to påfølgende kull årlig, av og til tre. Hunnen legger (normalt ) egg som ruges av henne i dager. Av og til kan to hunner legge, ruge og fø opp unger i samme rede. Ungene blir i redet i dager og mates av begge foreldrene til å begynne med. Hannen begynner å bygge et nytt rede noen dager etter klekkingen, men etter dager overtar hunnen byggingen av det nye redet, mens hannen forsetter matingen av avkommet i det første kullet. Det hender hunnen legger nye egg før ungene fra det første kullet er flygedyktige.