Januar 1612 giftet Ferrabosco seg med Ellen Lanier (død 1638), datter av Nicholas Lanier (ca. 1523–1612). De hadde tre kjente sønner som alle ble musikere, Alfonso Ferrabosco (død 1652), Henry Ferrabosco (død 1658?), og John Ferrabosco (døpt 1626, død 1682).