VIS er eid av Helse Bergen (33,4 %), Universitetet i Bergen (33,4 %), Havforskningsinstituttet (14,5 %), Siva (13,5 %), Høgskulen på Vestlandet (3,8 %) og Norges Handelshøyskole (1,2 %). Styret består av representanter fra bedriftens eiere.