Flatvarp-vraket lå på bunnen i 19-20 meter dybde, og var godt bevart, inkludert rester av skipets øvre deler som kunne undersøkes. Klinkbygde vrak som en regel over tiden falt sammen etter hvert som jernsømmen som holdt sammen skroget rustet bort i vannet. I dag minner vraket om et gigantisk mikadospill med bordgangene og bjelker spredt rundt på havbunnen. Det var mulig for marinarkeologene å oppdage en bevarte mesanmast akterut i vraket, og kunne konstatere etter å ha sett hvordan stormasten var plassert, at det var en fokkemast forut i skipet. Dekket var også meget godt bevart.