I likhet med andre domstoler har den kirkelige også ulike rettsinstanser. I første instans er det tribunalene i bispedømmene som dømmer. Andre instans er erkebispedømmenes domstoler. Norge har ikke noe erkebispedømme, derfor blir norske saker ført for erkebispedømmet Westminsters Tribunal i London. Tredje rettsinstans er Vatikanet.