I 2007 ble det offentlig kjent at Wood og Marilyn Manson hadde et forhold. I 2008 ble det kjent at de var forlovet, men forholdet tok slutt samme år. I desember 2009 kunngjorde de at de hadde funnet tilbake til hverandre, og 5. januar 2010 ble det kjent at de igjen var forlovet. Forlovelsen ble brutt i august samme år. I oktober 2012 giftet hun seg med den engelske skuespilleren Jamie Bell, men i mai 2014 ble de separert. De fikk ett barn sammen.