III./KG 26 opererte i Middelhavet, Frankrike og Norge fra juli 1942 til august 1944. Dens mest bemerkelsesverdige handling var angrepet på Konvoi PQ 18 i september 1942, mens den opererte fra Banak, Norge. III. Gruppe mistet 8 He 111-fly under den oppdraget. Oppdragene fortsatte mot Torch, Anzio og Normandie-landgangene. Innen juni 1944 hadde III./KG 26 lidd 50% tap og redusert antall oppdrag til 3 eller 4 per uke med noen få fly. I august 1944 ble den trukket tilbake til Tyskland for å bli utstyrt med Ju 88A-3 i september - oktober 1944. I desember ble enheten flyttet til Gardermoen, Norge.