Knudsen ble i 1867 gift med (1846–1925), datter av kaptein Hagbarth Resch og ektefelle Hanna Bruun. Blant Jørgen og Mimmis 11 barn var skipsreder og ordfører i Eidanger, (1868–1955) og NS-fylkesmannen i Telemark, (1873–1964). De var også foreldre til bl.a. (1875-19??), gift med ingeniør Karl K. von Krogh, (1877–1970), Oslo, (1879-1977), som var gift med den britiske diplomaten Christopher Lintrup Paus (1881–1963), samt til (1881–1974), gift med ingeniør Robert Rafn (1878–1964), Moss, og (1883–1972), gift med godseier Inggard Sundt (1881–1940), Værne Kloster. I 1917 var Dunde Paus den første kvinnen som fikk førerkort for bil i Oslo.