En av de viktigste pådriverne for operasjonen i tillegg til President Kennedy, var hans bror, Robert F. Kennedy, som var justisminister i denne perioden. Hjulpet av denne støtten fra høyeste hold var Mongoose sikret massiv støtte i form av penger og politisk vilje. Et voldsomt apparat var satt opp for å gjennomføre prosjektet, med samarbeid mellom flere store institusjoner i tillegg til CIA: utenriksdepartementet, forsvarsdepartementet og FBI. Trass i støtten klarte Mongoose aldri å oppnå sitt mål om å styrte Castro. Dog klarte USA å bygge opp et godt etterretningsapparat på øya. De kom blant annet med viktig informasjon som førte til oppdagelsen av de russiske missilene som kunne treffe USA med atomvåpen, 16 oktober 1962, som førte til Cuba-krisen. Som følge av krisen ble Mongoose lagt på is midlertidig for å ikke eskalere den allerede svært spente situasjonen. Man regner avslutningen av Mongoose til 4. januar 1963, dette var dog ikke slutten for USAs forsøk på å velte det cubanske regimet.