Gaines' Mill var den eneste klare konfødererte taktiske seieren i Peninsula-felttoget. Unionens tapstall blant de 34 214 som var satt inn i kampene var på 6837 (894 døde, 3107 sårede og 2836 savnede eller fanger). Av de 57 018 konfødererte som deltok, var tapene totalt på 7993 (1483 døde, 6402 sårede og 108 savnede eller fanger). Siden det konfødererte angrepet ble utført mot en liten del av unionshæren (V Corps, en femtedel av hæren), var hæren som kom ut av slaget i relativt god form. Men selv om McClellan allerede hadde planlagt å flytte sin forsyningsbase til James-elva, gjorde nederlag ham nervøs og han tok den forhastede beslutningen med å oppgi sin fremrykning mot Richmond.