Den europeiske ombudsmannen utnevnes av Europaparlamentet for en periode som tilsvarer perioden mellom to valg til Europaparlamentet og utnevningen kan fornyes. Ombudsmannen kan på oppfordring fra Europaparlamentet avsettes av Den europeiske unions domstol, ved grov uforstand i utførelsen av embetet eller at vedkommende av andre grunner ikke lenger er skikket til å inneha embetet.