Taksonomien til muslingkrepsene er omstridt og baserer seg på studier av morfologi snarere enn genetikk. Det er generelt omstridt å fin-inndele organismer taksonomisk. En moderne oppdatering av systematikken gis av Martin and Davis, som for øvrig foreslår at Polycopidae-artene er distinkte fra Halocyprida-artene og kan rettferdiggjøre en egen orden, som følgende oversikt følger ned til nivået orden, mens lavere nivåer i enkelte tilfeller følger : - og i hovedregel -databasen.