Fawcett forlot Cambridge i 1902, da hun ble utnevnt til lecturer for å utdanne matematikklærere ved Normal School i Johannesburg i Sør-Afrika. Hun forble her til 1905, og returnerte så til England for å ta del i utdanningsadministrasjonen for London County Council. Her, i arbeidet med å utvikle videregående skoler, oppnådde hun en posisjon av høy rang i London City Council.