I 2008 dannet Pahor koalisjonsregjering bestående av sosialdemokrater og liberale. Regjeringen ble innsatt 22. november 2008. Pahors statsministerperiode ble preget av økonomiske krisetider. Regjeringen tapte 20. september 2011 et tillitsvotum i parlamentet. Da det ikke lyktes å finne støtte for en ny regjering, ble det bestemt å holde nyvalg 4. desember 2011. Pahors SD tapte valget og Janez Janša ble 28. januar 2012 innsatt som ny statsminister.