Japantrane er hvit med sort strupe og hals og rød krone. Fuglene er hvite fra bakkant av øynene og bakover i nakken. Arten har helhvite håndsvingfjær, men sorte armsvingfjær. De indre armsvingfjæra er modifiserte og ender i lange fjærtufser, som gir fuglene en svart stuss når vingene er sammenslåtte. Øynene har mørk brun eller mørk grønn iris.