Under Johannes pontifikat invaderte slaverne hans hjemland Dalmatia og Istria, og han forsøkte å gjøre hva han kunne for å berge det som kunne berges. Han sendte en stor sum penger med en abbed ved navn Martin for å frikjøpe krigsfanger, og lot hente dalmatinske helgenrelikvier til Roma der han oppførte et fortsatt bevart oratorium for dem. Oratoriet lot han utsmykke med mosaikker, som blant annet forestiller ham selv med modellen av oratoriet i sine hender, og som fortsatt kan beskues. Han var tross alt innstilt på å kristne slaverne, og det er mulig at han lot sende kristne lærere til den kroatiske prinsen Porga, noe som antydes av keiser Konstantin VII Porfyrogennetos.