Tidlig i 2003 feiret Fiat at 5 000 000 Punto var bygget, og samme år fikk modellen en ny oppdatering. 1.2-litersmotoren gikk ut av produksjon og ble erstattet av en ny 1.4-liters motor med 16 ventiler, samt to nye HGT-utgaver: 1.9-liters diesel og 1.8-liters bensin med 16 ventiler. Dessuten ble en 1.3-liters common rail dieselmotor introdusert.