Hypoksi kan forårsakes av lavt lufttrykk, lite oksygen i lufta, trange luftveier, svak lungefunksjon, eksempelvis hos pasienter med kronisk obstruktiv lungesykdom (KOLS), spesielt emfysem. Det kan også oppstå som følge av sirkulasjonsforstyrrelser, for eksempel av ulike hjertefeil.