Selv om det er basert på Ubuntu, finnes det betydelige forskjeller: Ufri firmware har blitt fjernet fra Linux-kjernen. Det betyr at noen enheter, slik som visse trådløse nettverkskort ikke vil virke, siden det ikke finnes noen frie alternativer tilgjengelig. Ufri programvare-kilder blir ikke gjort tilgjengelig av gNewSense, slik som Ubuntus - og -komponenter. Ufri dokumentasjon, bilder, skrifter, o.l. blir fjernet. pakkekilden er tilgjengelig som standard. Mozilla Firefox, kalt 'BurningDog' i GNewSense, er byttet ut med Ephiphany i 2.x serien. build-essential (programvareutviklingsverktøy, slik som GCC, make, etc) blir installert som standard. bsdgames, NetHack og GNU Emacs blir installert som standard.