I 1906 grunnla han grossistfirmaet Helmer & Paus i Drammen; tre år senere skiftet firmaet navn til Paus & Paus da broren Nicolay trådte inn som partner. I 1914 flyttet firmaet til Christiania og det ble i 1917 omdannet til aksjeselskap med Alf Paus som administrerende direktør og hovedaksjonær; firmaet kjøpte i 1920 den store bygården Kongens gate 14 der det hadde hovedkontor; firmaet hadde lager i Skippergata i Oslo samt i Drammen og Bergen. Firmaet var særlig aktivt i eksport av tremasse og cellulose og i import av kjemikalier, råstoffer og rekvisita til treforedlingsindustrien, og utvidet senere virksomheten til andre kjemikalier, jern, stål og metaller. Fra 1918 var firmaet aktivt i import av rør til vannverk og stål til skipsbygging og annen byggevirksomhet; firmaet var etter andre verdenskrig også aktivt i farmasøytiske spesialiteter og hadde interesser i rederivirksomhet. I 1966 hadde firmaet rundt 65 ansatte og en årsomsetning på godt over 100 millioner; Paus & Paus-gruppen bestod da av totalt 11 firmaer.