Institut for Menneskerettigheder arbeider dels i Danmark og dels i utlandet. Hjemme overvåker instituttet Danmarks overholdelse av menneskerettighetene. Instituttet utgir blant annet en årlig statusrapport om menneskerettighetenes status i Danmark, og rådgir regjeringen og Folketinget. Instituttet er også en forskningsinstitusjon, og har blant annet forsket på statsborgerskap, internettrettigheter, terrorlovgivning og religion i et menneskerettighetsperspektiv. Instituttet står også bak en rekke prosjekter som skal fremme likebehandling i Danmark. I utlandet arbeider Institut for Menneskerettigheder sammen med lokale samarbeidspartnere i en rekke land om å styrke menneskerettighetene. Instituttet arbeider også med internasjonale virksomheters innflytelse på menneskerettighetene, og rådgir virksomheter som arbeider i utviklingsland.