Species 2000 er medlem av Global Biodiversity Information Facility (GBIF) og Taxonomic Databases Working Group (TDWG) og har MoU-er med Integrated Taxonomic Information System (ITIS), Encyclopedia of Life (EoL) og Consortium for the Barcode of Life (CBOL). Det er en liten til mellomstor bedrift (SME) registrert i Storbritannia med sekretariatet i Naturalis Biodiversity Center i Nederland, og kontorer i USA og på Filippinene. Species 2000 styres av et styre som er ansvarlig for juridiske og økonomiske forhold, og rådes av Catalog of Life Global Team om vitenskapelig politikk.