Både Ali Pasja og hans motpart Juan de Austria var ganske unge. Han var dessuten ikke egentlig noen sjøsoldat, men mer en landsoldat. Og han var mer pågående enn omhyggelig taktiker. Straks styrkene lå overfor hverandre den 7. oktober gikk han inn i direkte duell med motstanderen. Hans flaggskip, , kjempet dekk mot dekk mot Juan de Austrias . Snart ble Ali truffet av en muskettsalve, falt sammen alvorlig såret, og ble - til tross for ordren om at han skulle fanges levende - halshugd av en spansk soldat. Hans hode ble satt høyt opp på stake. Dette, og erobringen av Kalifenes banner, svekket kampmoralen hos den tyrkiske flåte, og dette bidro til deres nederlag.