I krigsårene gjorde Furubotn en stor innsats som leder for redaksjonen, men gikk selv mer eller mindre til grunne. Han hadde liksom sin far lenge hatt problemer med drikking, men i løpet av krigsårene tok alkoholen fullstendig styringen for Gilbert. Han beskrives av kolleger i Radio Moskva som «et høyutviklet og et fint menneske», men også som en «ikke behandlet alkoholiker». Han var kunnskapsrik og arbeidet hardt, men kunne være «full i tre og fire dager i strekk» og «drakk rein vodka som vann». I 1944 havnet han til slutt på sykehus. Kollegaer i radioen samlet inn penger, slik at han kunne få et opphold på et behandlingshjem. Det hjalp, men løste ikke problemet.