Historien er om en mann som havner i koma etter en trafikkulykke. I komatilstanden opplever han at han er i byen Mercy Falls, en oppdiktet by, hvor det blant annet er en mystisk ensom dame i et hus. Han tror at hvis han kan redde damen så er det veien ut av Mercy Falls, med andre ord komaen. I det virkelige liv gir sønnen hans benmarg for å redde livet til faren, men faktum er at moren har hatt en affære og sønnen er ikke hans, dermed mislykkes transplantasjonen.