Engel ble i 1889 utnevnt til full professor i Leipzig, men overtok likevel et annet professorat i Greifswald fra 1904 og deretter et i Giessen i 1913. Der ble han til han gikk av i 1931. I denne perioden utga han de samlete verker til Hermann Grassmann og på den måten gjorde hans banebrytende studier kjent. Likedan oversatte han arbeidene til Nikolaj Lobatsjevskij om hyperbolsk geometri til tysk slik at de fikk en større utbredelse. Dette fulgte han opp med egne arbeid innen ikke-euklidsk geometri. I de siste årene av sitt aktive liv ga han ut i samarbeid med Poul Heegaard ved Universitetet i Oslo, Lies samlete arbeid i seks bind.