I landssvikoppgjøret ble Johannesen i 1948 frifunnet for noen befatning med dyrene fra Telavåg, for å ha villet utskrive lærerne til arbeidsinnsats, og for avskjedigelse av en kommunal funksjonær. Men han ble dømt til 2 års tvangsarbeid med fradrag av 518 dager i varetekt, tap av stemmerett i 10 år og tap av stilling som marineintendant for alltid, samt en inndragning av kr 10.000, men frifunnet for erstatningskrav pga sin økonomiske stilling.