I 2015 ble CRISPR/Cpf1 systemet fra bakterien beskrevet. Egenskapene til Cpf1, også kalt Cas12a , gir den noen fordeler sammenlignet med Cas9, som at den er billigere og kan endre mer komplekse strukturer. I 2016 ble Cas13a, tidligere kalt C2c2, systemet fra bakterien beskrevet. Cas13 deler mRNA.