Omkring klokken 20 eksploderte «Christian VIII» etter at brannen hadde nådde kruttmagasinet. De sårede ble drept, sammen med det gjenværende mannskapet som fremdeles var ombord for å hjelpe dem. Flere av tilskuere på land ble drept av flygende deler fra skipet, og bare noen få som var på skipet overlevde. Mellom 130 og 200 omkom i eksplosjonen.