Den 12. mars 2014 ble kardinal Marx valgt til formann av Den tyske bispekonferanse, for en periode på seks år. Den 11. februar 2020 gjorde han bekjent at han ikke sod til disposisjon for gjenvalg. Den 3. mars 2020 valgte bispekonferansen Limburgs biskop Georg Bätzing til hans etterfølger.