Gruppen har fått kritikk for å anvende påstander uten vitenskapelig støtte, blant annet ved å referere til den høyreorienterte organisasjonen American College of Pediatricians. Southern Poverty Law Center har beskrevet Family Research Council som en anti-LHBT+-hatgruppe på grunn av gruppens «falske påstander om LHBT-personer på grunnlag av diskreditert forskning og søppelforskning».