Det var også i de såkalte Gro- og Sol-sakene at Karlsen viste seg som en av de mest markante atferdsviterne i Norge. I 1976 gikk han ut fra Universitetet i Oslo. Arne Skouen, en kjent motstander av atferdsterapi, angrep i Dagbladet UiO for å ha gitt Karlsen en altfor god karakter.