Etter ti år i ungdomsligaen ble Ling Jihua i desember 1995 overført til generalbyrået for det kinesiske kommunistpartis sentralkomite, og ble der leder for forskningsbyråets tredje gruppe. I desember 1999 ble han visedirektør for partiets generalbyrå. Senere var han også viseminister for generalbyrået fot Statsrådets statskommisjon for reform av offentlig sektor, og direktør for Hu Jintaos kontor.