Dette nederlaget for Jugoslavia gjorde at landet ble okkupert og delt mellom aksemaktenes marionettregimer; Den uavhengige staten Kroatia styrt av den italienskstøttede fascistlederen Ante Pavelić, Serbia under den jugoslaviske generalstabssjefen Milan Nedić og andre, og det italienske Albania og Ungarn. I Jugoslavia ble krigen etterfulgt av omfattende motstand fra to motstandsgrupper: de kommunistiske partisanene ledet av Josip Broz Tito, som overtok makten i landet etter krigen, og de rojalistiske tsjetnikene ledet av Draža Mihajlović, i det som har blitt kjent som eller i Jugoslavia.