Etter en bye i uke 9 møtte Brady og Patriots Seattle Seahawks i en omkamp fra Super Bowl XLIX. Brady fullførte 23 av 32 pasninger for 316 yards, med én interception og null touchdowns i en kamp hvor ledelsen byttet side syv ganger for et sluttresultat på 31–24 i Seahawks' favør. I uke 11 møtte Patriots San Francisco 49ers, hvor Brady ble tildelt AFC Offensive Player of the Week-tittelen etter 24 av 40 pasninger for 280 yards med fire touchdowns og ingen interceptions. Med de fire touchdownpasningene nådde Brady 444 totalt i løpet av sin karriere for ett lag, og slo med det Brett Favres rekord med Green Bay Packers. Uken etter fikk Patriots sin 500. seier (inkludert sluttspill), og Brady ble den femte quarterbacken noensinne med 60 000 pasningsyards i løpet av sin karriere, da Patriots slo New York Jets 22–17. Uken derpå fikk Brady sin 201. seier etter en kamp mot Los Angeles Rams, og slo med det Peyton Mannings rekord på 200.