Han ble utnevnt av Francisco Franco til nasjonal konsultor for , og mellom 1943 og 1946 advokat til Cortes. Eijo Garay fremmet fra sin stilling som biskop i Madrid at Franco ved deltakelser i religiøse begivenheter skulle få sitte under en baldakin. Dette representerte synlig Kirkens maksimale støtte til diktatoren. Han var en del av regentrådet- ledet av Esteban de Bilbao Eguía - som fungerte som spansk statsstef fra 22. til 27. oktober 1949, under Francos offisielle reise til Portugal.