I 1998 fikk Horten sykehus og Vestfold sentralsykehus i Tønsberg felles ledelse. I 2000 ble Vestfold sentralsykehus (Tønsberg og Horten) slått sammen med Sandefjord sykehus og Larvik sykehus til ett sykehus under navnet Sentralsykehuset i Vestfold (fra 2002 kalt Sykehuset i Vestfold HF), som nå eies av Helse Sør-Øst. I 2000 ble akuttmottaket ved sykehuset i Horten lagt ned og i 2005 ble gjenværende aktivitet ved SiV-Horten overført til SiV-Sandefjord.