I Syria forsøkte hun forgjeves å få sin nevø Selevkos II Kallinikos (246–225 f.Kr.) til å hevne den fornærmelse hun var blitt utsatt for ved å erklære krig mot den makedonske kongen. I henhold til en annen redegjørelse håpet hun på å overtale Selevkos til gifte seg med henne, men monarken var helt og holdent opptatt av å gjenerobre Babylonia og de østlige provinsene av riket. Mens han var opptatt i øst, grep Stratonike, som en prinsesse av Selevkideriket, anledningen til å gjøre opprør mot ham i Antiokia, men da Selevkos kom vestover igjen ble hun forvist fra byen av dens borgere. Hun søkte da tilflukt østover i byen Seleukia ved bredden av Tigris. Selevkos fulgte etter, beleiret byen, tok henne til fange og fikk henne henrettet. Kanskje i år 235 f.Kr.