Hovedområdet i den antikke byen var den lille øya Ortigia/Ortygia. De greske kolonistene fant landet fruktbart og de innfødte stammene til å være rimelig akseptable til deres tilstedeværelse. Byen vokste og var framgangsrik, og for en tid var Siracusa den mektigste greske byen i hele Middelhavet. Byens vekst førte til at den selv opprettet kolonier, blant annet grunnlagt ved Akrai (664 f.Kr.), Kasmenai (643 f.Kr.), Akrillai (600-tallet f.Kr.), Heloros (600-tallet f.Kr.) og Kamarina (598 f.Kr.).