Moussaron var erkebiskop av Albi under Vichy-regimet, som startet deportasjonene av jøder sommeren 1942. Oppsamlingen av jøder på en sykkelvelodrom ved Paris var en alvorlig vekker. Sammen med biskopene Jules Saliège, Pierre-Marie Gerlier og Pierre-Marie Théas publiserte han et protestbrev mot den umenneskelige behandlingen av jødene.