I 2017 forsøkte han forgjeves å bli sitt partis presidentkandidat. Fra august 2018 til november 2019 var han utenriksminister; og deretter og til sin død forsvarsminister i Iván Duques kabinett. Trujillo var først medlem av Partido Liberal Colombiano, men ble så en av de nærmester rådgivere til president Álvaro Uribe Vélez (fra 2002) og så medlem av det høyrekonservative parti som han grunnla i 2013, .