Kondrasjins diskografi er stor og deles som regel inn i tre segmenter: den første består av mange innspillinger som ble spilt inn mens han arbeidet som sjefsdirigent i Moskva Filharmoniske Orkester. Den andre består av opptak tatt opp med orkesteret, både for den sovjetiske opptaksorganisasjonen Melodya, og utenlandske selskaper. Den tredje og siste består av opptak som ble gjort mot slutten av hans liv og internasjonale karriere.