Kort tid etter at ble lansert, kom det en patch til PlayStation 3 som lot spill belønne spillere med trofeer for å gjennomføre spesifikke oppgaver i spillet. I august 2009, litt over et år etter at spillet ble lansert, ble Sean Eyestone fra Kojima Productions spurt om det kom til å komme en oppdatering med trofeer til MGS4, og han svarte med å fortelle at folk måtte være tålmodige ("Be patient!"). Flere ganger ble det annonsert at en oppdatering med trofeer var på vei, men alle viste seg å være falske. Den 11. juni 2012 ble det endelig annonsert at en oppdatering med trofeer ville komme, og oppdateringen ble tilgjengelig 6. august 2012 sammen med en billig utgave av spillet i Japan (kjent som Platinum-utgave her i Europa).