Biskop Méndez deltok i 1972 på . Han var den viktigste pådriveren for en diskusjon om sosialistisk sosial teori, spesielt marxistisk teori, sosial endring, religiøse fenomener og deres effekter på sosial utvikling i Latin-Amerika. Han virket ved (CIDOC). Resultatet av disse aktivitetene var at Vatikanet ekskluderte ham fra alle kirkelige embeder og fra deltakelse på kursene for utvikling av CIDOC-programmet.