Med disiplin, og litt magi, forvandler hun familiens liv. Barna, ledet av Simon, forsøker å spille henne en narrestrek. Men barna begynner gradvis å respektere McPee og spørre henne etter råd. Over tid blir barna litt mer ansvarlige, og hjelper deres klønete far med å løse familie-problemene - noe som også gjør Nanny McPhee mindre og mindre nødvendig i hjemmet deres. Familien støttes økonomisk av Cedrics dominerende og nærsynte svigertante Lady Adelaide Stitch, som krever omsorgsretten over et av barna. Hun ønsker først få den nest yngste datteren Chrissie. Hun truer også med å slutte å støtte familien, med mindre Cedric gifter seg på nytt i løpet av en måned. Hvis dette mislykkes, kommer familien til å miste hjemmet deres - og kan bli tvunget til å skilles.