Merlin 1B ble forbedret over 1A med en turbinoppgradering og økte effekten fra 1500 kW (2000 hk) til 1900 kW (2500 hk). Turbinoppgraderingen ble oppnådd ved å legge til ekstra dyser, og snu den tidligere delvis opptaksdesignen til full opptak. Litt forstørrede løpehjul for både RP-1 og LOX var en del av oppgraderingen. Denne modellen snudde med raskere o/min. og utviklet høyere utløpstrykk. Turbopumpens vekt var uendret ved 68 kg (150 lb). En annen bemerkelsesverdig endring i forhold til 1A var overgangen til TEA – TEB (pyroforisk) tenning over fakkeltenning.