Norberto do Amaral gikk på katolsk barneskole på fødestedet hans, Ainaro. Deretter gikk han inn på -seminaret i bispedømmet Dili. Amaral studerte filosofi (1981 til 1983) og katolsk teologi (1985 til 1988) ved det interdiocesane seminaret i Ritapiret på Flores (Indonesia). Han hadde sjelesorgsoppdrag blent annet i Ossu i 1984.