Serra ble saligkåret av pave Johannes Paul II 25. september 1988, og helligkåret av pave Frans 23. september 2015, i en seremoni i Den ubesmittede unnfangelsens nasjonalhelligdom i Washington, D.C., under pavens første besøk til USA, og dette var første gangen en helligkåringseremoni ble holdt i USA. Den hellige stols erklæring av Serra som helgen var kontroversiell blant noen av den amerikanske urbefolkningen som kritiserte Serras behandling av deres forfedre og forbant ham med undertrykkelsen av deres kultur.