Det er uenighet om når biblioteket ved Serapis-templet ble etablert. Selve templet ble bygget av Ptolemaios III og var lagt til det høyeste sted i byen. Serapis var en gud oppfunnet av ptolemeerne for å skape en allianse mellom gresk og egyptisk religion . Simon Singh skriver at Kleopatra reetablerte biblioteket i Serapis-templet. Hannam mener imidlertid at dette finnes ingen beviser for, se også diskusjon over.