Om serieplasseringen ble en skuffelse, tok de hevn i 2005/06-sesongen, som de vant, blant annet ved å slå erkerival Frankfurt 6-2 og å slå dem i den tyske cupen for tredje gang på rad. Frankfurt fikk imidlertid hevn ved å ettertrykkelig slå Turbine Potsdam i en heltysk UEFA-cupfinale. Det fortsatte ikke veldig bra heller, da laget i 2006/07-sesongen endte på en tredjeplass, og de fulgte opp med en ny tredjeplass sesongen etter.