Som musiker spiller han ulike blåseinstrumenter, tangentinstrumenter og et stort antall ulike strengeinstrumenter, som for eksempel lutt, mandola og bouzouki. Han begynte musikerkarrieren som jazztrompetist, men har blitt mest kjent som folkemusiker. Han lærte seg å spille bouzouki i Hellas, der han i tre år var med i Neo Minores orkester, som ofte hadde den kjente greske komponisten og musikeren Mikis Theodorakis på besøk, både som solist og som dirigent. Bouzoukien fortsatte å være et av Ale Möllers favorittinstrumenter, også etter at han gikk over til å arbeide hovedsakelig med musikk med mer eller mindre tradisjonelt nordisk preg, iblant med sterke innslag av world music. På begynnelsen av 1990-tallet begynte han imidlertid i stadig større grad å bytte ut bouzoukien med ulike typer av oktavmandola, hvorav først og fremst bør nevnes den som Ale Möller selv utviklet i samarbeid med instrumentbyggeren Christer Ådin.