Lisensen tillater bruk av biblioteket til å utvikle fri og åpen programvare, men Qt er likevel et kommersielt og proprietær produkt. Lisensen er ikke kompatibel med GNU General Public License, som ikke tillater kobling mellom proprietær og fri programvare. Free Software Foundation startet av denne grunn utviklingen av GTK+ i 1997 som er et fritt og åpent bibliotek.