Mark Hanna avslo en plass i president McKinleys regjering og lot seg heller oppnevne til senator for Ohio, etter at senator Sherman ble utenriksminister. Hanna ble gjenvalgt som senator av Ohios lovgivende forsamling i 1898 og 1904. Etter at McKinley ble drept i et attentat i 1901, arbeidet senator Hanna for en utbyggingsavtale for Panamakanalen, som åpnet i 1914. Selv døde han av tyfoidfeber i 1904.