Byen ble grunnlagt i 1827 da fundamentet for en ny havn ble lagt. Den het da . Tre år senere fikk byen navnet (Ny Nagoisk). I 1841 fikk byen sitt nåværende navn etter elven Berda som renner ut i havet like ved. Mellom 1939 og 1958 het imidlertid byen , oppkalt etter den sovjetiske helten Polina Osypenko. Dette navnet er nå brukt på en av nabobyene, hvor Osypenko ble født. Polina Osypenko var militær pilot og hun gjennomførte blant annet i 1938 verdens lengste sammenhengende flytur.