Etter at Jokeren angriper tinghuset i Gotham City, blir han fanget av Batman og fraktet til Arkham Asylum, som midlertidig huser flere andre medlemmer av Joker-gjengen - men som hadde blitt overført dit etter en brann ved Blackgate Prison. Men Batman tror at Jokeren lot seg fange med vilje, som en del av en mye større plan. Mer av Jokerens plan avsløres når hans medhjelper Harley Quinn tar kontroll over sikkerheten og Jokeren stikker av ved anlegget. De blir hjulpet av en korrupt vakt, som også kidnapper kommissær Jim Gordon.