Sanne Houby-Nielsen vokste opp i Danmark og har vært bosatt i Sverige siden slutten av 1980-årene. Hun utdannet seg til arkeolog i Tyskland og Storbritannia og disputerte ved Københavns Universitet i klassisk arkeologi i 1993. Hun har arbeidet ved Den Kongelige Afstøbingssamling ved Statens Museum for Kunst i København og som forskningleder ved det dansk-greske utgravingsprosjektet i Chalkis i Hellas.