Den 15. august 1978 ble han presteviet samtidig som den senere erkebiskop av Los Angeles, José Horacio Gómez, av kardinal Franz König i Torreciudad, og fire år etter ble han inkardinert i personalprelaturet Opus Dei. I 1980 tok han doktorgrad i kirkerett ved Universitetet i Navarra. Han arbeidet under studieårene også som sjelesørger for arbeidere og bønder i regionen, og ved universitetet.