Zack Fair har en god venn og mentor i Angeal Hewley, men er også gode venner med andre soldater Sephiroth og Genesis. Alle operatørene arbeider direkte under direktør Lazard, den uekte sønnen til president Shinra. Zack er også venn med tyrkerne, spesielt deres leder Tseng, og en av deres kvinnelige agenter, Cissnei. I løpet av spillet møter og blir Zack venn med den unge kvinnen Aerith. Han blir også bekjent med Cloud, en Shinra-infanterist. Zack Fair og Angeal Hewley blir sendt til Wutai, for å støtte Shinra-krigsinnsatsen. Men under konflikten forsvinner Angeal, og Zack blir utpekt til å finne både Angeal og en annet savnet soldat: Genesis Rhapsodos.