På den tiden var Jaunpur et sentrum for urdu språk og sufistisk kultur, og muslimer og hinduer levde i fred med hverandre. I 1480 ble sultanatet avsatt av Sikandar Lodi i Dehlisultanatet, og selv om sultanene i Jaunpursultanatet prøvde å vinne tilbake makten, lyktes de ikke med det.