Første studio innspilling av «Mr. Tambourine Man» foregikk 9. juni 1964 da ble spilt inn i sin helhet. Ramblin’ Jack Elliott ble bedt om å synge harmoni på refrengene. Opptaket kom ikke med på albumet, og ble først utgitt i 2005 på albumet . Samme måned lagde Dylan en piano demo av sangen. I 2010 ble denne demo utgitt offentlig på albumet .