Alisson begynte i akademiet til Internacional i 2002 i en alder av ti. Etter flere år i ungdomslagene begynte Alisson å spille jevnlig på U-23 laget, før han spilte sin debut på seniorlaget den 17. februar 2013, hvor han startet i en bortekamp mot Cruzeiro. Série A debuten hans var den 25. august 2013 da han startet mot Goiás. Han spilte ferdig sesongen med seks kamper spilt.