Matkultursenteret og dets leder Andreas Viestad har vært utsatt for sterk kritikk fra ulike hold. Rundt 2015 startet Viestad en prosess for å få bygge et «undervisningsdrivhus» på eiendommen i Oslo. Etter hvert som de konkrete planene ble kjent, vekket det sterke protester fra ulike hold. Det ble fremholdt at drivhusplanene kom i konflikt med driften av skolehager og hageparseller på samme område. Lederen av Naturvernforbundets lokallag på stedet, Henrik Hovland, hevdet at selv om Oslo kommune hadde utlyst en «konseptkonkurranse» om utvikling av området, var vilkårene «skreddersydde for Geitmyra Matkultursenter»; Hovland viste også til at ingen utenom matkultursenteret hadde levert inn konkurransebidrag.