Athene var ikke bare skytsgudinnen til Athen, men også andre byer, blant dem Pergamon, Argos, Sparta, Gortyn, Lindos og Larisa. De forskjellige kultene til Athene var alle grener av hennes panhelleniske kult og frambrakte ofte forskjellige ritualer for innvielse for gresk ungdom, som for eksempel overgangen til statsborgerskap av unge menn eller overgangen til unge kvinner til ekteskap. Disse kultene var portaler for en ensartet sosialisering, også utenfor det greske fastlandet. Athene ble ofte likestilt med Afaia, en lokal gudinne på øya Egina, opprinnelig med opphav på Kreta og var også assosiert med Artemis og nymfen Britomartis. I Arkadia ble hun assimilert med den gamle gudinnen Alea og tilbedt som Athene Alea. Helligdommer dedikert til Athene Alea var lokalisert i de lakoniske byene Mantineia og Tegea. Templet til Athene Alea i Tegea var et viktig religiøst senter i antikkens Hellas. Geografen Pausanias ble informert om at var grunnlagt av kong Aleos.