Girga var hovedstaden i guvernementet Girga frem til 1960, da hovedstaden ble flyttet til Suhaj og navnet på guvernementet ble endret tilsvarende. I oldtidens Egypt var byen hjembyen og hovedstaden til Narmer, den første faraoen i det forente Egypt, det vil si etter den politiske sammenslåingen av Nedre og Øvre Egypt. Byen var enten identisk med oldtidsbyen Thinis, eller lå like i nærheten av Thinis. Den var en gang sentrum for det osmanske styret i sørlige Egypt, og var en av de største byene i Det osmanske riket.