Ekström har også spilt for landslagsfotball for Sverige, og står notert med fem kamper og to scoringer. Ekström spilte samtlige landslagskamper før fylte tjue år. Han var med i et tidlig uttak av Sveriges tropp til VM i 1958, men ble, sammen med IFK Norrköping-spilleren Torbjörn Johnsson i siste øyeblikk erstattet med to andre spillere.