Israel har et stort utvalg pattedyr på grunn av landets geografiske og klimatiske mangfold. For mange pattedyr er Israel grensen for deres territorium. Territoriene til arter som kommer fra den palearktiske sone stopper normalt før ørkenen, og de artene som kommer fra Afrikas ørkener stopper vanligvis på kysten av Middelhavet. De fleste pattedyrene i Israel er av Palearktis opprinnelse og rundt en tiendedel er opprinnelig fra Midtøsten. Landet Israel hadde engang en stor variasjon av pattedyr, men i nyere tider har mange arter, som vånd, gepard og det persiske ekornet, blitt lokalt utryddet. I morderne tid risikerer mange arter, som den arabiske leoparden og sandkatten, å bli utryddet. Det er totalt 57 arter av pattedyr som er truet(fra 2002) av de 104 artene totalt. Det største levende råvdyret i Israel er stripehyenen, som også er en truet art. Det er 33 arter flaggermus i Israel (siden 2002), den største ordenen av de ti ordrene av pattedyr klassen, mesteparten av flaggermusen lever av insekter.