IntelliJ har integrasjoner med byggeverktøy som grynt, Bower, gradle, Maven og SBT. Den støtter versjonskontrollsystemer som Git, Mercurial, og SVN. Databaser som Microsoft SQL Server, Oracle, PostgreSQL, SQLite og MySQL kan arbeides med, direkte fra IDEen i Ultimate edition, gjennom en innebygd versjon av databaseverktøyet DataGrip.