Selevkos har vært bortimot ukjent for historikerne inntil nylig: fra mynter preget av ham og hans mor, den ptolemeiske prinsessen Kleopatra Selene I (død ca. 69 f.Kr.), datter av kong Ptolemaios VIII av Egypt. Det er antatt at han var hennes sønn med Antiokos X Eusebes (død en gang rundt 90 f.Kr.). Han var da en yngre bror av Antiokos XIII Asiatikos.