Fredrik var i en tid involvert i planer om kupp i Danmark-Norge. Hans hustru Dorothea var Christian IIs eldste datter, som var styrtet etter den danske adelsoppstanden i 1523. Den landflyktige Christian II ble kontaktet av erkebiskop Olav Engelbrektsson, som også var riksrådets leder, i 1529, om å gjenerobre den norske trone fra den protestantvennlige kong Fredrik I. Christian II var selv blitt protestant, man var også svoger til keiser Karl V, og lovet å støtte den katolske sak i Norge. Christian II forsøkte å gjenvinne Norge i 1531, men led nederlag i 1532. Han ble så tatt til fange og satt fengslet de neste 27 årene i Danmark.