Grevskapet Wexford var det eneste området som ble påført utbredte grusomheter av opprørerne under Wexford-opprøret. Massakrer av lojalistiske fanger fant sted i Vinegar Hill-leiren ved Enniscorthy og på Wexford-broen. Etter nederlaget til et angrep av opprørne ved New Ross, skjedde Scullabogue Barn-massakren, der mellom 80 og 200, for det meste protestantiske menn, kvinner og barn som ble fengslet i en låve som deretter ble satt i brann. I Wexford by ble den 20. juni rundt 70 lojalistiske fanger marsjert til broen, først strippet nakne, ifølge historikeren James Lydon,) og deretter stukket ihjel med spyd.