Forskjellige handlinger i løpet av spillet, kan belønne spilleren med erfaringspoeng som gjør at spilleren med jevne mellomrom kan komme til et høyere nivå, eller skaffe seg forskjellige oppgraderinger til Bat-Suit, nytt utstyr eller bedre ferdigheter. Nytt utstyr kan også bli tilgjengelig i løpet av spillet, for eksempel en Cryptographic Sequencer, som brukes til hacking av sikkerhetskonsoller, eller overvåke kortbølgeradio-kanaler. Andre gjenstander som kommer tilbake fra det første spillet inkluderer en eksplosiv gel, som kan detoneres for å slå ut fiender ned i kamp.