Totalt scoret Harper 199 (siden beregnet til 205 mål) mål i alle turneringer for Aberdeen FC, noe som fortsatt er klubbrekord. Av disse 205 målene ble 122 scoret i ligaen, 70 i nasjonale cupturneringer (som innbefatter Dryborough Cup) og sju mål i europacupspill. Hans legendariske status blant Aberdeen-supporterne ble synliggjort da han var blant de første spillerne til å bli inkludert i klubbens ”Hall of Fame”. Joe Harpers nære forhold til Aberdeen-supporterne gav ham også tilnavnet ”King of the Beach End” (som tradisjonelt sett var navnet på hjemmetribunen på Pittodrie).