Wikus begynner å gå gjennom en mutasjon til romvesen etter å ha blitt eksponert for drivstoffet deres. Han blir straks tatt med til ett laboratorium hvor forskere fra MNU oppdager at Wikus sitt nye DNA gir ham muligheten til å ta i bruk utenomjordiske våpen og teknologi, noe som er vanskelige å bruke for vanlige mennesker. Men Wikus klarer å overmanne personalet, og slipper unna. Han blir jaktet av soldater, og Wikus sin kone og datter Tania får høre en historie om at Wikus er på flukt fra loven etter å ha fått en smittsom sykdom etter at han hadde sex med romvesen. Wikus søker tilflukt i Distrikt 9, og oppdager Christopher med et lite romfartøy. Christopher forklarer at det konfiskerte drivstoffet er avgjørende for planen hans for å aktivere fartøyet deres på nytt. Hvis han kan få dem fra dette fartøyet over til moderskipet, kan han kurere Wikus.