I løpet av de årene Fletcher ikke arbeidet hos NASA, var han aktiv som rådgiver for flere sentrale nasjonale ledere som var involvert i planleggingen av USAs videre politikk når det gjaldt nye amerikanske romferger og verdensrommet. Blant hans andre aktiviteter, var han involvert i utviklingen av Strategic Defense Initiative. Fletcher hadde ansvaret for virksomheten da en romferge endelig kom tilbake fra reisen i verdensrommet, den 29. september 1988. Som administrator for NASA, godkjente han programmet Hubble Space Telescope.