I Beer sin forskning på operasjoner hjalp han tverrfaglige lag som søkte praktisk hjelp for vanskelige ledelsespørsmål. Ofte innebar dette utvikling av modeller lånt fra grunnforskning som ble satt i en isomorf relasjon med en organisatorisk situasjon. Først kalte Beer dette for operasjonsanalyse, men både han og Russell Ackoff ble han stadig mer misfornøyde med dette begrepet etterhvert som fagfeltet gikk mer over til å bruke forhåndsdefinerte matematiske verktøy på velformulerte problemer. Beer sin kritikk av tradisjonell operasjonsanalyse gikk delvis ut på at det ofte var eksperter i matematikk som jaktet på situasjoner som kunne tilpasses metodene deres. Beer mente istedet at det som var nødvendig for effektiv forskning på operasjoner var å først forstå hoveddynamikken i situasjonen før man valgte teorier eller metoder for å forstå situasjonen i detalj. Metodikken diskuteres i Beer sin bok «Decision and Control», særlig i kapittel 6.