Vilnius' teologiske akademi ble etablert 1. juli 1833. Det ble undervist i teologi, Den hellige skrift, homiletikk, bibelsk hermeneutikk] og arkeologi, kirkehistorie, kirkerett, lofikk, etikk, klassiske språk, polsk og russisk språk og litteratur, verdenshistorie og russisk historie. Undervisningsspråkene var latin og russisk. Akademiet hadde om lag 40 studenter; sseksjonen viet til den armenske katolske kirke hadde syv studenter. Dets rektorer var Alojzy Osiński (som tidligere hadde undervist ved Liceum Krzemienieckie; 1770–1842) og Antoni Fijałkowski (tidligere professor ved Vilnius-universitetet; 1797–1883). Akademiet hadde åtte fakultetsmedlemmer, blant dem var filologen Leon Borowski, filosofen Anioł Dowgird og historikeren Paweł Kukolnik. Akademiet samarbeidet tett med presteseminaret i Vilnius.