I 1660-årene bosatte paret seg på Christianshavn ved København. Anna Pelt ble enke da Cort Adeler døde den 5. november 1675. Han hadde tidligere solgt sitt gods til broren Niels Adeler, men Anna fikk kjøpt det tilbake etter ektemannens død. Fra Christianshavn overvåket hun som enke bestyrelsen av Gjemsøgodset i Bratsberg i Norge. Den daglige ledelse var dog overlatt til en fullmektig og hans ansatte.