Kaptein Barbossa, Will Turner og Elizabeth Swann seiler til verdens ende for å hente Jack Sparrow og The Black Pearl fra Davy Jones' Locker, og deretter seile til Shipwreck Island for å samle en allianse av alle verdens sjørøverhøvdinger. Etter at Barbossas forslag om å frigjøre gudinnen Calypso fra hennes menneskelige form blir nedstemt, så blir Elizabeth Swann valgt til piratkonge etter at Jack bryter tradisjonen med at alle høvdingene stemmer på seg selv. Hun gir ordre om at piratene skal kjempe mot Beckett. Etter at piratene blir overrasket av en kjempearmada av skip fra East India Company så frigjør Barbossa Calypso i et rituale. Hun er rasende på Davy Jones og skaper en malstrøm som The Black Pearl og The Flying Dutchman blir dratt inn i. Etter en hard kamp blir Will stukket i brystet av Davy Jones, og for å redde livet hans, hjelper Jack og Elizabeth han med å stikke ett sverd i Jones sitt hjerte. Dermed blir Will den nye kapteinen på The Flying Dutchman. Mannskapet på Den Flyvende Hollender skjærer ut Wills hjerte og legger det i Dead Man's Chest. Sammen med Jack på Den Sorte Perle, senker Will Becketts skip og dreper Beckett.