Hun har arbeidet med de fleste norske symfoniorkestre, deriblant Filharmonien i Oslo. Hun har også arbeidet som dirigent i Vietnam, Nederland og Sverige, og var første kvinne som dirigerte i Hanoi Operahouse i 2006. Rønning har arbeidet mye med samtidsmusikk og samarbeider med de norske ensemblene Cikada, Oslo Sinfonietta og BIT20. I 2010 var Halldis Rønning også å se som mentor i NRK-serien Maestro, der forskjellige kjendiser fikk prøve seg som orkesterdirigent. Rønning dirigerte sommeren 2013 Norsk Ungdomssymfoniorkester i Wien, med solistene Mari Silje Samuelsen og Håkon Samuelsen. I 2019 var Rønning dommer i forbindelse med norgesmesterskapet for brassband.