I løpet av sine år i Roma ble Spellman venn med Gaetano Bisleti, Francesco Borgongini Duca og Domenico Tardini. Han led imidlertid av lungebetennelse, som svekket hans helse i den grad at seminarets ledelse ville sende ham hjem. Men han ble, og klarte å sluttføre sine teologiske studier.