Contracts begynner med at 47 har blitt skutt, og entrer et hotellrom i Paris. Han føler seg dårlig og hallusinerer. Hver hallusinasjon bringer assosiasjoner til et oppdrag han tidligere har gjort, og innleder det neste. Det er altså ingen konkret sammenheng mellom oppdragene, som det var i Hitman 1 og 2. Etter hvert kommer det en fransk lege inn og gir ham en sprøyte med bedøvelse eller noe og fjerner kulen hans fra såret, noe som trolig redder ham.