Han var interessert i filosofi, og skrev til Milan Machovec ved Karlsuniversitetet i Praha, som arrangerte det slik at han kunne arbeide med sin doktorgrad i klassisk filosofi ved universitetet. Tomin fikk sin PhD og ble ansatt ved universitetets filosofiavdeling fra 1966 til 1970. I 1968 hevdet han at den russiske invasjonen av Tsjekkoslovakia var en tragedie ikke på grunn av invasjonen i seg selv, men fordi den ødela den nasjonale kommunismen som tsjekkerne hadde forsøkt å opprette. I 1969–1970 besøkte han University of Hawaii som professor, men ble nektet en akademisk stilling da han kom tilbake til Tsjekkoslovakia, angivelig på grunn av sin tilknytning til reform-bevegelser. Han begynte å jobbe som en turbinmekaniker, men ble oppsagt da det ble oppdaget at han i skjul underviste sine kolleger i filosofi. Efter dette jobbet han som nattvekter i en dyrepark.