I sesongen 2007/08 endte AFC Wimbledon på en tredjeplass, noe som holdt til play-off igjen. Denne gangen vant de play-off og rykket opp til Conference South. Denne divisjonen ble vunnet første året, og dermed bar det videre til Conference National, nivå 5 på den engelske fotballpyramiden. Første sesong på dette nivået manglet det noen få poeng til playoff-plass. Sesongen 2010/11 endte med opprykk til Football League Two.