I 1887 grunnla han derfor , «Misjonærkongregasjonen for italienerne som hadde emigrert». Fedrene, også kalt etter deres grunnlegger, ble sendt utenlands for å gi pastoral omsorg til de italienske emigrantene og grunnla italiensktalende menighet der. I 1888 reiste den første gruppen av scalabrinianimisjonærer til USA og til Brasil. I 1895 opprettet biskop Scalabrini også en kvinnelig kongregasjon, , «Kongregasjonen av St. Karl Borromeos misjonssøstre for utvandrerne», også kalt etter grunnleggeren.