Desflèches ble presteviet for La Société des Missions Etrangères den 23. desember 1837. Den 18. mars 1840 ble han utnevnt av pave Gregor XVI til titularbiskop av Sinitis. Den 28. april 1844 ble han bispeviet av Jacques-Léonard Pérocheau og ble titularbiskop av Maxula Prates.