Dundee FC ble stiftet i 1893 da Our Boys FC og East End FC slo seg sammen. Klubben ble valgt inn i Scottish Football League (Division 1) samme år. De gjorde det bra i ligaen, men deres første store høydepunkt kom i 1910, da de vant den skotske FA-cupen. Dundee slo Clyde 2-1 i tredje finalekamp etter to uavgjorte kamper.