Odenkirk ble født i Berwyn i Illinois og er oppvokst ikke langt derfra i Naperville. Han var en av Barbara og Walter Odenkirks syv unger. Hans foreldre jobbet i en trykkeriforretning. Hans far hadde problemer med alkohol og hans foreldre ble senere skilt. Han likte seg ikke godt i Naperville, og følte at det var som en blindvei. Han har sagt at han ikke kunne vente å flytte til en ny og større by hvor han kunne være sammen med mer interessante og spennende folk. Han begynte senere på Columbia College Chicago.