I tillegg til bosetningene ved Jisre’el og Megiddo har det vært en rekke andre historiske steder i dalen, blant annet Beit She'an og Shimron. Den største moderne bosetningen i Jisreeldalen er byen Afula (hebraisk: עפולה‎, arabisk: عفولة‎), også kalt for «Jisreeldalens hovedstad» (hebraisk: בירת העמק‎) hvor de arkeologiske undersøkelsene har indikert nær uavbrutt bosetning på stedet via Ghassulienkulturen i kobberalderen (ca. 4500–3300 f.Kr.) og til det muslimske Ajjubide-dynastiet på 1000–1200-tallet e.Kr. Det er ansett å ha vært den bibelske byen Ofra som identifiserer som hjembyen til Gideon.