I etterkrigstiden ble Scavenius sterkt kritisert for sin tyskvennlige politikk under okkupasjonen, men slapp tiltale under rettsoppgjøret. Da den danske motstandsbevegelsen hevdet at Danmark på slutten hadde vært i krig med Tyskland, svarte han at det var det da godt at tyskerne ikke hadde oppdaget dette! På samme vis forsvarte han utenriksdepartementets embetsmenn, som kom i knipe i rettsoppgjøret. At Scavenius selv ikke ble stilt for riksrett, skyldtes at han med sin skarpe tunge og logiske sans lett kunne påpekt det felles politiske ansvaret for samarbeidspolitikken. Det ville ikke politikerne risikere.