Som biskop av Eichstätt var han også storkansler (Magnus Cancellarius) for det katolske universitetet Eichstätt-Ingolstadt. 1997 ble han medlem av det europeiske vitenskaps- og kunstakademiet (ASAE). Samme år ble han medlem av Ridderordenen av den hellige grav i Jerusalem. I 1998 tok Mixa dessuten initiativet til etableringen av Collegium Orientale.