Sáenz Peña ble åpna 1. desember 1913, som del av den første strekninga på undergrunnsbanen, som gikk mellom Plaza de Mayo og Plaza Miserere. Gata som stasjonen er oppkalt etter, har navn fra Argentinas 12. president, Luis Sáenz Peña, som var president fra 1892 til 1895.