Naltrexon må ikke forveksles med naloxon (som brukes i nødstilfeller ved opioidoverdoser) eller nalorfin. Bruk av naloxon når man egentlig skal bruke naltrexon kan forårsake akutte symptomer på opioid-abstinens, og omvendt kan bruk av naltrexon i stedet for naloxon ved en opiodoverdose føre til at kroppen ikke klarer å motvirke opiodet og dermed ikke klarer å reversere overdosen.