Det er ikke kjent når Håkon var født, hvem som var Håkons foreldre eller hvor i landet han kom fra. Det er sannsynlig at han var fra Østlandet, ettersom han virket i Oslo før han ble erkebiskop. Håkon hadde også en sønn, Tore, kalt Tore Biskopssønn, og denne holdt til på Lekum i Eidsberg i Borgarsyssel (Østfold). Enkelte historikere, som Edvard Bull d.e., har hevdet at Håkon må ha vært gift. Bakgrunnen for dette er at sønnen Tore, som var en mektig mann med titler som baron og kansler, neppe kunne ha vært et uekte barn. Dersom Håkon virkelig var gift, var han trolig den siste gifte katolske biskopen i Norge.