Johnson og hennes barn kom til Boston, hvor de ble ivaretatt av nord-abolisjonistene, inkludert Lucretia Mott. De fortsatte å leve fritt, bosatte seg i Boston. Johnson giftet seg med Lawrence Woodford kort tid etter sin ankomst. Hun ble enke i 1861 og giftet seg igjen, med William Harris i 1864. Johnson gjemte rømte slaver i Boston ved minst to anledninger.