Arborelius vokste opp i Lund, og konverterte til katolisismen tyve år gammel. Da han var 22 år trådte han inn i karmelittordenen i Norraby i Skåne. Han studerte filosofi i Brugge og Roma, og ble presteviet i 1979 av biskop Hubertus Brandenburg. Siden 29. desember 1998 er han biskop av Stockholm; som den første svenske siden reformasjonen.