De tre øverste dekkene dekker skipets overbygg. Dekkene under de tre øverste dekkene om bord i NS «Savannah» strekker seg fra aktre del av skipet, og helt frem. Disse fire dekkene kalles A, B, C og D. På A-dekket er hovedlobbyen, sykestue, frisør, og rom for overvåkning av atomreaktoren. Alle tretti lugarer som finnes om bord ligger på A-dekket. Lugarene har eget bad og sengeplass for én til tre passasjerer. På B-dekket ligger skipets kabysse (kjøkken) og spisestue. På C-dekket er det mannskapskvarter, vaskeri og en slakterbutikk. På D-dekket ligger maskinrommet, lasterom og atomreaktoren.