Saint-Thierry var den første til å utfordre Pierre Abelards teologi, og formane Bernhard mot denne. I denne hensikt skrev han , der han i tolv rubrikker behandler hva som senere, ved kirkemøtet i Sens, skulle fordømmes som feilslutninger hos Abelard. Etter Abelard hadde skrevet sin apologi forfattet Guillaume som svar. I forsvarte han den gjeldende oppfatning om treenigheten mot teorier som vat blitt fremlagt av Guillaume de Conches. Dertil skrev han en del av Berhards hagiografi.