Imidlertid, selv om islam virkelig var ekstremt viktig i deler av Kaukasus, og også var en samlende styrke for motstand mot Russland, ble politisk islam utfordret av mange forskjellige grupper. Islam i Sentral- og Nord-Dagestan og Tsjetsjenia var overveldende Naqshbandi på denne tiden. Imidlertid hadde Naqshbandiism, som var svært mystisk i sin natur, indre splittelser om hvorvidt den skulle være politisk, eller om politisk sufisme faktisk smittet religionens renhet. Spesielt stasjonen for å etablere sharialoven ble motarbeidet på mange fronter. Først og fremst motsatte de innfødte kaukasiske statene som ble drevet av Avarerne, Kumykkene, Lezginerne, Laks og andre (spesielt enkeherskeren Pakhu Bike, dronningen av Khanatet i Avaria) det fordi det så ut til å ta legitimitet fra sine egne posisjoner. Sharia kolliderte også med adat, det opprinnelige lovsystemet som mange, spesielt folk som tsjetsjenerne, så på som overlegen sharia. Av disse grunner, og andre mer subtile, ble Imamatet på de fleste områder hevdet som sitt området, faktisk, ganske enkelt sett på som det mindre onde for Russland.