Etter at CTU ble overtatt av Department of Homeland Security, og Jack ble etterlyst av korrupte President Charles Logan, begynte Chloe å jobbe mot sine overordnede for å hjelpe Jack og Audrey Raines med å frata Logan makten. Chloe ble satt i varetekt, men hun klarte å rømme, og dro til Bill Buchanan. Etter at hun brukte CTU systemet ble hun oppdaget, men Karen Hayes ringte og advarte dem, etter at hun selv hadde begynt å tro at presidenten var korrupt.