Hansen var innvalgt i kommunestyret i Klaksvík 1989–1998, fra 1993 som viseborgermester. I likhet med faren representerte han Tjóðveldisflokkurin, hvor han senere ble nestformann. Han var Færøyenes finans- og økonomiminister 1998–2003. I 2004 ble han innvalgt på Lagtinget fra Norðoyar, og satt som medlem av finanskomiteen og nestformann i kontrollkomiteen. Hansen brøt med Tjóðveldisflokkurin i 2006 over lovforbudet mot diskriminering av homofile, der han ikke ønsket et slikt innført. Kort tid etter meldte han seg inn i Miðflokkurin. I 2008 ble han innvalgt på Lagtinget for dette partiet, og satt som finansminister i en kortvarig regjeringsdannelse med venstresiden. Deretter var han nestformann i Lagtingets velferdskomité. Hansen var helseminister i en borgerlig flertallsregjering 2011–2015 og Miðflokkurins 1. vara til Lagtinget 2011–2019.