I 1946 ble han valgt til det franske parlament som radikal. Mens hans partis popularitet falt til under 10% ved valgene, var ingen av de andre partiene i stand til å få et klart flertall. Derfor spilte hans parti ofte en uforholdsmessig viktig rolle i dannelsen av regjeringer. Han ledet dermed kabinettet i 1952, og fra 1955 til 1956. Faure var leder for partiets mer konservative fløy, og motarbeidet partiets venstre, under Pierre Mendès-France.