Marinejegerkommandoen opererte i Helmand-provinsen i Sør-Afghanistan fra 12. november frem til februar 2006 som Task Force ORCA (TF ORCA). Kompetansen ved avdelingen hadde videreutviklet seg, som betydde at både biler, samband, FAC, etterretning og skarpskyttere ble utnyttet bedre, og MJK hadde i tillegg med seg minedykkere fra MDK som EOD-personell. Avdelingen gjennomførte to operasjoner før og etter julen 2005, med utgangspunkt fra hovedkvarteret på basen ved Bagram flyplass hvor avdelingsstøtten var lokalisert. Motstanden avdelingen møtte i provinsen var kraftigere og mer vedvarende enn ved noen tidligere deployeringer, og skvadronen opererte under ekstrem trussel. I hoveddelen av operasjonen deltok en gruppe med afghanske soldater og afghansk politi. Styrken disponerte 14 biler med enten 12,7 mm mitraljøser eller 40 mm granatkastere, i tillegg til seks sekshjulinger med tilhengere og påmonterte våpen. TF ORCA utførte rekognoseringsoppdrag og innhentet etterretningsinformasjon ved å kjøre rundt i det nordlige Helmand og den vestlige Oruzgan-provinsen. Gjennom oppdragene fikk marinejegerne etterforsyninger i felt ved hjelp av dropp fra amerikanske MC-130. Det var ved gjentatte anledninger både kort- og langvarig stridskontakt med Taliban, totalt to harde trefninger i tillegg til 14-15 sammenstøt med opprørerne, men marinejegerne unnslapp alltid uten egne tap. Styrken benyttet flystøtte fra luft-til-bakke angrepsfly av typene A-10 og B-52, enten for bruk av ildstøtte, lave overflyvninger (såkalt show of force) eller for hjelp til rekognosering. IED-trusselen var i tillegg påfallende gjennom hele oppdragsperioden. Makt ble kun benyttet i selvforsvar og proporsjonalt med det situasjonen tilsa, noe som hindret sivile tap. TF ORCA rapporterte betydelig etterretning til CJSOTF, og ISAF benyttet denne til videre planlegging også etter MJKs avslutning i OEF-deltakelsen i februar 2006. Marinejegeren Trond Bolle ble senere berømmet med Krigskorset med sverd for arbeidet som skvadronsleder for MJK under denne MJK-deployeringen.