Jaguars har en geografisk rival i Miami Dolphins, det eneste andre AFC-laget i Florida. De to lagene møttes under en Monday Night Football-kamp i . Begge lagene møttes senere i divisjonsrunden i 1999 i det som endte opp med å bli quarterback Dan Marinos siste kamp. Jacksonvilles var klare favoritter før kampen etter en 9–7 sesong for Miami Dolphins og siste seed i sluttspillet, hvor Jacksonville endte sesongen 14–2 under Pro Bowl quarterback Mark Brunell; Jaguars vant kampen 62–7. Jaguars sikret også en overraskende seier i 2021, en særs svak sesong for laget under den kontroversielle hovedtreneren Urban Meyer, da de sikret en comebackseier over Dolphins i London i uke 6. Sammenlagt er stillingen 5–5, mens Jacksonville leder 1–0 i sluttspillet.