Etter at Latvias uavhengighet ble gjenopprettet i 1990, inviterte Jānis Pujats, erkebiskop av Riga, Justs til å holde teologiske foredrag i hjemlandet. Den katolske kirke i Latvia ble avskåret fra teologisk utvikling over hele verden under den andre okkupasjon av Latvia av Sovjetunionen. I 1992 ble Justs åndelig leder ved Riga-seminaret, og dets rektor i 1994.