Manuel Larraín Errázuriz var sønn av Manuel Larraín Bulnes og Regina Errázuriz Mena. Han hadde skole, han gikk op skolen og var fra 1909 var han skolekamerat til Alberto Hurtado, som ble en av den katolske kirkes helgener. Han studerte jus ved Det pavelige katolske universitet i Chile, og begynte deretter på presteseminar og fullførte studiene ved Det pavelige gregorianske universitet i Roma.