Cecilys eldste sønn Edvard fortsatte med hell kampen mot huset Lancaster. Da Cecily flyttet til Baynard's Castle i London, ble yorkistenes hovedkvarter, og etter at Edvard beseiret lancasterne og tok tronen, ble Cecily dronningmoren. Ved begynnelsen av Edvards styre opptrådte Cecily ved hans side og utøvde stor innflytelse. I 1461 reviderte hun sitt våpenskjold for å inkludere det kongelige våpenskjoldet til England, og hentydet således at hennes ektemann York hadde vært den rettmessige kongen. Da Edvard giftet seg med Elizabeth Woodville fikk han bygd nye dronningkvarterer for henne og lot sin mor bli boende i dronningens kvartalene hvor hun hadde vært boende.