Mousa Broch ble i 1861 ryddet for rusk og naturlig avfall og kulturlag. Potensialet for informasjon fra slike lag var ukjent den gang. Det ble funnet store mengder dyrebein, spesielt av oter (som sannsynligvis bebodde den øde ruinen) ble funnet. Det ble også funnet biter av en leirgryte, grytelokk av stein, en skiferstein på omtrent 30 cm «som en trehjørnet fil» og en «utskåret modell av en norsk båt fra gran» som omtrent 1 meter lang. Interiøret ble ryddet igjen av Office of Works i 1919, og få ekstra funn dukket opp. I National Museum of Scotland i Edinburgh er noen keramikkskår lagret, blant annet et stort svart-brint kantskår, sannsynligvis funnet under rydningen på 1800-tallet. Det var stor restaurering av brochen fra 1967 til 1980-tallet.