Nationalmuseet har per 2014 en lang rekke avdelinger, blant annet Brede Værk, Frihedsmuseet, Frilandsmuseet, Frøslevleiren, Fyrskipet Gedser Rev, Klunkehjemmet, Kommandørgården, Kongernes Jelling, Liselund, Musikmuseet, Orlogsmuseet, Tøjhusmuseet og Vikingeborgen Trelleborg.