Hatutu er av vulkansk opprinnelse. Den er 6,2 km lang og 1,3 km bred og dekker et areal på 6,6 km². Naturen på Hatutu er vel bevart og har sjeldne og vernede plante- og fuglearter. Åtte av planteartene på øya finnes bare på Marquesasøyene. Hatutu og havet omkring er vernet.