Et av Gillbergs tidlige forskningsprosjekter, Göteborg-studiet, har blitt sentrum for en opphetet debatt i Sverige. Debatten går på spørsmålet om i hvilken grad offentlig innsyn, som i Sverige er en rettighet angående offentlige virksomheter, kan anvendes på sensitive data som er samlet inn i medisinske studier om menneskelige spørsmål.