Frederik Christian ble døpt den 17. november 1681 som sønn av Norges stattholder Ulrik Frederik Gyldenløve og hans tredje hustru Antoinette Augusta von Aldenburg. Som eldste overlevende sønn arvet han tittelen greve av Laurvig. I 1691 kom han på det nyopprettede i København, to år senere ble han kammerherre. I 1694 reiste han utenlands for å studere ved Universitetet i Utrecht. 12. mai 1696 fikk han pass til hjemreisen, men døde allerede måneden etter i Köln av et slagtilfelle. Den 23. september samme år ble han bisatt fra Vor Frue i København.