Mange øyer og øygrupper ligger i dette havavsnittet, som Bawean, Karimunjawa-øyene eller Kepulauan Seribu. Særlig viktige havner inntil havet er Tanjung Priok (Indonesias største, nær Jakarta), Cirebon, Semarang, Surabaya (alle på Java) og Banjarmasin (på Borneo).