Will Rodman (James Franco) jobber med en kur for alzheimers sykdom ved å utføre tester på aper. Den første testpersonen er moren til Caesar. Moren til Caesar dør, men får videreført kuren videre til han da han ble født. Denne «kuren» endrer genetisk hans måte å tenke på å lage en ny type ape med menneskelignende intelligens. Caesar lærer godt, men menneskelig autoritet fortsetter å teste ham og beholder ham. Til slutt beviser han at han er smart nok til å bryte seg fri fra buret sitt og slipper kuren blant andre aper, som påvirker andre aper som Caesar. Millioner av aper begynner å samle opp en revolusjon. Snart bryter det ut krig mellom mennesker og aper. Rodman kan være den eneste som kan stoppe dem før aperevolusjonen lykkes dem å bli den dominerende arten på planeten.