Havområdet rundt Galápagosøyene er et møtepunkt for varme og kalde strømmer som gir gode levevilkår for en rekke arter. Det er registrert havdyr. 25% av de havlevende organismene, og 24 arter marine pattedyr, lever kun i dette området. 37 arter er omfattet av CITES-konvensjonen.