I henhold til kirkeretten søkte Wetter kort før sin 75-årsdag pave Johannes Paul II om avskjed. Paven aksepterte ikke avskjedssøknaden. Etter at pave Benedikt XVI ble valgt ble det regnet med at den nye paven ville akseptere en ny avskjedssøknad, noe han da også gjorde 2. februar 2007. Paven bad samtidig Wetter lede erkebispedømmet som apostolisk administrator frem til utnevnelsen av etterfølgeren. Etterfølgeren ble utnevnt 30. november samme år: Triers biskop Reinhard Marx.