Han ble født inn i Færøyenes øvre bondestand som sønn av kongsbonde og sysselmann Joen (Jógvan) Petersen Weihe og hustru Anne Sophie Debes på Útbøgarður i Søldarfjørður. Foreldrene var søskenbarn. På farssiden var han brorsønn av sorenskriver Peder Pedersen Weyhe, sønnesønn av sysselmann og sorenskriver Peder Samuelsen Weyhe (Lamhauge) og oldebarn av lagmann Samuel Pedersen Lamhauge. På morssiden var han dattersønn av lagmann Hans Jacobsen Debes og oldebarn av lagmann Samuel Pedersen Lamhauge. Lamhauge-slekten nedstammer fra Færøyenes første lutherske prest, Heini Havreki.