Den store pesten drepte beregnet rundt 100 000 mennesker, bortimot en fjerdedel av Londons befolkning. Pesten var forsaket av , en bakterie som tilhører familien enterobakterier, som forårsaker byllepest og lungepest. Den er vanligvis overført via bittet til infiserte lopper på rotter. Selv om omfanget var langt mindre enn den tidligere Svartedauen, huskes den i Storbritannia som «Den store pesten» ettersom den var det siste store utbruddet av pest i Europa.