payamvha/North_RAG huggingface dataset:
زیرا زهر جدید پیش از این که پروتئین‌های فعال آن همه پر شوند جایگزین می‌شود. کرم حلقوی. بسیاری از "کرم‌های حلقوی توانایی بازسازی دارند. برای نمونه " و "Branchiomma nigromaculata" می‌توانند هر دو بخش پیشین (جلویی) و پسین (عقبی) بدن خود را پس از تقسیم عرضی (latitudinal bisection) بازسازی کنند. رابطهٔ میانِ سلول‌های بنیادی "پیکری و زایا در سطح ملکولی روی کرم حلقوی " مطالعه شده است. زالو‌ها و ها که از شاخهٔ کرم‌های حلقوی هستند قادر به انجام بازسازی قطعه‌ای (segmental regeneration) نیستند. از همین شاخه، ‌ها قادر
regeneration) نیستند. از همین شاخه، ‌ها قادر هستند که بازسازی را از روی تنها تعداد کمی از قطعات بدن خود انجام دهند. بازسازی قطعه‌ای در این جانوران اپیمورفیک (epimorphic) است و با تشکیل بلاستما انجام می‌شود. توانایی بازسازی قطعه‌ای در میان کرم‌های حلقوی در طول تکامل بارها به دست آمده و از دست رفته است. برای مثال در تکامل کم‌تاران از این شاخه توان بازسازی سر سه بار از دست رفته است. موفولاکسی (morphallaxis) شامل تمایززُدایی (de-differentiation) و ترادیسی (transformation) و بازتمایزی (re-differentation) برای
و بازتمایزی (re-differentation) برای بازسازی بافت‌هاست. اپیمورفیسم به معنی بازسازی یک بخش مشخص از یک جاندار است که شامل تکثیر سلول‌های بنیادی پیکری، تمایززدایی، اصلاح و تشکیل بلاستما می‌شود. برخی پرتاران از شاخهٔ کرم‌های حلقوی مانند "Sabella pavonina" علاوه بر اپیمورفیسم، بازسازی بافتی را هم تجربه می‌کنند. هرچند اثبات نشده ولی احتمالاً بازسازی بافتی یک حالت رایج از بازسازی میان قطعه ای در کرم‌های حلقوی است. در "Lumbriculus variegatus" هنگام بازسازی پس از تقسیم عرضی، ممکن است قسمت عقبی به قسمت جلویی در بدن
عرضی، ممکن است قسمت عقبی به قسمت جلویی در بدن جانور جدید تبدیل شود که با بازسازی بافتی ممکن است. پلاناریا (کرم‌های پهن). کرم‌های پهن پلاناریا برای توانایی بالایشان برای بازسازی معروف هستند. اگر یکی از این کرم‌ها را به تعداد زیادی قطعهٔ کوچک تقسیم کنید، پس از چند روز با یک ظرف پر از پلاناریا روبرو می‌شوید. یا اگر آن را به صورت طولی، عرضی یا ضربدری تقسیم کنید دو تا پلاناریای جدید خواهید داشت. پژوهش‌ها نشان داده‌اند که یک قسمت از بدن پلاناریا که متناسب با ۱/۲۷۹ بدن او است، یا یک قطعه با ۱۰۰۰۰ سلول از بدن او
بدن او است، یا یک قطعه با ۱۰۰۰۰ سلول از بدن او می‌تواند در طی یک یا دو هفته به یک کرم کامل تبدیل شود. در سال‌های اخیر از این موضوع برای مطالعهٔ چگونگی و چرایی بازسازی استفاده شده است با این امید که بتوان از آن برای بازسازی بافت‌ها در بدن انسان استفاده کرد. بازسازی در پلاناریا به خاطر وجود سلول‌های بنیادینی به نام نوتَنده (neoblast) است. این سلول‌ها ۲۰ تا ۳۰ درصد سلول‌های پلاناریا را تشکیل می‌دهند و در تمام بدن پلاناریا پخش شده‌اند و در صورت قطع عضو، فعال می‌شوند تا بافت‌های قطع شده را بازسازی کنند.
فعال می‌شوند تا بافت‌های قطع شده را بازسازی کنند. نوتنده‌ها پس از قطع عضو بلاستمایی می‌سازند که بافت‌های از دست رفته را دوباره تولید می‌کند. دوزیستان. توانایی بالای بازسازی دست و پا در سمندر مکزیکی و سمندرک بسیار قابل توجه دانشمندان بوده است. برخی سمندرها و سمندرک‌ها بیشترین توانایی بازسازی دست و پا را در میان چهاراندامان دارند. آن‌ها می‌توانند اندام‌هایی چون دم، آرواره‌ها و شبکیهٔ چشم را با بازسازی اپیمورفیک (epimorphic regeneration) دوباره به دست آورند. این بازسازی دو مرحلهٔ مهم دارد. ادر مرحلهٔ اول،
این بازسازی دو مرحلهٔ مهم دارد. ادر مرحلهٔ اول، سلول‌های موضعی در محل آسیب‌دیدگی تمایززدایی می‌کنند و بلاستما را می‌سازند. در مرحلهٔ دوم، سلول‌های بلاستمایی (blastemal cells) تکثیر می‌شوند، الگوبندی می‌شوند، تمایز می‌یابند و رشد می‌کنند. با فرایندی شبیه به آنچه در رشدونمو رویان اتفاق می‌افتد؛ و در نهایت از سلول‌های بلاستمایی همهٔ سلول‌های اندام جدید ساخته می‌شوند. پس از قطع عضو، روپوست طی یک تا دو ساعت محل پارگی را می‌پوشاند و ساختاری به نام بافت پوششی زخم به وجود می‌آورند. سلول‌های روپوستی به پوشاندن این
به وجود می‌آورند. سلول‌های روپوستی به پوشاندن این بافت پوششی ادامه می‌دهند و یک ناحیهٔ ضخیم به وجود می‌آورند که به آن کلاهک پوششی رأسی (apical epithelial cap) گفته می‌شود. در روزهای بعدی تغییراتی در ناحیهٔ آسیب دیده رخ می‌دهد که باعث تشکیل بلاستما می‌شود. وقتی بلاستما تشکیل می‌شود -مانند HoxA و HoxD- مانند زمانی که اندام در زمان رویانی تشکیل می‌شد فعال می‌شوند. سپس اطلاعات دقیق مکان اندام از دست رفته در بلاستما ذخیره می‌شود. پس از آن نورون‌های حرکتی، ماهیچه‌ها و رگ‌های خونی در اندام جدید به وجود می‌آیند و
و رگ‌های خونی در اندام جدید به وجود می‌آیند و اتصال‌های بین اندام جدید و بقیهٔ بدن را می‌سازند. این فرایند با توجه به سن پلاناریا از یک تا سه ماه طول می‌کشد. در سال‌های اخیر با پیشرفته‌های حوزهٔ ژنگان‌شناسی، بیوانفورماتیک، تحویل ژن به سلول‌های پیکری مطالعهٔ بازسازی با اقبال زیادی روبرو شده است.
الگوریتم دوبه‌دو از روش‌های هم‌ترازسازی توالی در بیوانفورماتیک به‌شمار می‌آید. از کاربردهای آن می‌توان به هم‌ترازسازی یک رشتهٔ پروتئینی با ترجمهٔ پنجره‌های سه‌تایی یک رشتهٔ دی‌ان‌ای اشاره کرد. این الگوریتم از روش برنامه‌ریزی پویا استفاده می‌کند و از آن‌جا که اجازهٔ در نظر گرفتن جهش دگرقالب را در هم‌ترازسازی می‌دهد، نسبت به سایر الگوریتم‌های هم‌ترازسازی توالی بین پروتئین و رشتهٔ دنا انعطاف‌پذیری بیشتری دارد. مسئله. در مسئلهٔ هم‌ترازسازی رشتهٔ پروتئینی با رشتهٔ دی‌ان‌ای، رشتهٔ دی‌ان‌ای به پنجره‌های سه‌تایی
دی‌ان‌ای، رشتهٔ دی‌ان‌ای به پنجره‌های سه‌تایی تقسیم می‌شود که هر پنجره به یک پروتئین ترجمه می‌شود. سپس با استفاده از الگوریتم‌های هم‌ترازسازی توالی دو رشتهٔ پروتئینی هم‌ترازسازی می‌شوند. الگوریتم اسمیت واترمن یکی از این الگوریتم‌هاست که بهترین هم‌ترازسازی محلی بین دو رشته را پیدا می‌کند. در فرایند هم‌ترازسازی این الگوریتم، امتیاز تطابق و هزینه‌های آغاز و ادامه پیدا کردن یک فاصله در هم‌ترازسازی لحاظ می‌شوند. با این حال الگوریتم اسمیت واترمن در مقابل جهش دگرقالب مقاوم نیست. در این جهش تقسیم‌بندی رشتهٔ
دگرقالب مقاوم نیست. در این جهش تقسیم‌بندی رشتهٔ دی‌ان‌ای به پنجره‌های سه‌تایی دستخوش تغییر می‌شود و در نتیجه ترجمهٔ دی‌ان‌ای به رشتهٔ پروتئینی دچار خطا می‌شود. اما این الگوریتم قابلیت تشخیص این خطای به وجود آمده را ندارد و در نتیجه ممکن است فاصلهٔ بین دو رشته را بیش از حد گزارش کند. راه حل. در الگوریتم دوبدو علاوه بر امتیازها و هزینه‌های فوق، هزینهٔ بازشدن و ادامه پیدا کردن یک پنجره هم لحاظ شده‌است تا تفاوت‌های به وجود آمدهٔ ناشی از جهش دگرقالب هم قابل پیشبینی باشند. به این شکل که در رشتهٔ دی‌ان‌ای امکان
باشند. به این شکل که در رشتهٔ دی‌ان‌ای امکان تغییر تقسیم‌بندی رشته به پنجره‌های سه‌تایی با پرداخت یک هزینهٔ متناسب وجود دارد. در نتیجهٔ آن الگوریتم می‌تواند با جا انداختن بخش‌هایی از رشته با پرداخت هزینهٔ متناسب با آن به دنبال هم‌ترازسازی‌های بهتری بگردد. در واقع در الگوریتم‌های پیشین فرض بر نبود اختلال‌هایی مثل جهش دگرقالب بود اما در الگوریتم دوبدو امکان وجود چنین اختلال‌هایی هم لحاظ می‌شود. مثال. در گام نخست هم‌ترازسازی بدون امکان تغییر پنجره‌ها بین رشتهٔ دی‌ان‌ای و رشتهٔ پروتئینی صورت گرفته‌است و در
دی‌ان‌ای و رشتهٔ پروتئینی صورت گرفته‌است و در نتیجهٔ آن سه تطابق پیدا شده‌است. اما با در نظر گرفتن امکان تغییر پنجره‌ها با پرداخت هزینهٔ آن، هم‌ترازسازی بسیار بهتری پیدا می‌شود که در آن پنج تطابق داریم و الگوریتم توانسته نسبت به جهش دگرقالب مقاوم باشد و هم‌چنان یک هم‌ترازسازی مناسب پیدا کند.
آنالیز تصاویر زیستی زیرشاخه‌ای از بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی است. تمرکز این زیرشاخه بر روی بررسی تصاویر زیستی، مخصوصا تصاویر سلولی و مولکولی با تعداد بالا، با استفاده از روش‌های محاسباتی است. هدف از آنالیز این نوع تصاویر پیچیده و ناهمگون به دست آوردن دانشی سودمند است. به صورت مرسوم، آنالیز تصاویر زیستی به دست خود انسان انجام می‌شود. این روش کند و پرهزینه است و نتیجهٔ آن وابسته به شخصی است که تصاویر را آنالیز می‌کند. علاوه بر این، میکروسکوپ‌های خودکار مدرن قادر به تولید صدها تا هزاران تصویر در هر
مدرن قادر به تولید صدها تا هزاران تصویر در هر ساعت هستند، که آنالیز دستی این تصاویر را غیرممکن می‌کند. به همین دلیل، به روش‌های خودکار برای آنالیز این دسته از تصاویر روی آورده می‌شود. در برخی از موارد این سیستم‌های خودکار از انسان‌ها نیز بهتر عمل می‌کنند. در چنین مسئله‌هایی با حجم بالایی از تصاویر از روش‌های پردازش تصویر، بینایی ماشین، داده‌کاوی، پایگاه داده و تصویرسازی برای استخراج، مقایسه، جستجو و مدیریت دانش زیستی استفاده می‌شود. ماهیت داده‌ها. میکروسکوپ فلئورسانس. میکروسکوپ فلئورسانس به صورت گسترده‌ای
فلئورسانس. میکروسکوپ فلئورسانس به صورت گسترده‌ای در زیست‌شناسی و پزشکی استفاده می‌شود. از آن جایی که این نوع میکروسکوپ از ابزار پیچیده‌تر و گران‌تری نسبت به میکروسکوپ‌های نوری ساخته شده‌است، به‌طور معمول از آن در جاهایی استفاده می‌شود که کیفیت و حساسیت بسیار بالایی نیاز باشد. این میکروسکوپ قادر به شناسایی اجزائی است که از رزولوشن میکروسکوپ‌های نوری کوچک‌تر هستند. از مهمترین کاربدهای این میکروسکوپ می‌توان به مطالعهٔ سلول‌ها و بافت‌ها، ردیابی پروتئین‌ها به وسیلهٔ روش پادتن فلئورسانس و مطالعهٔ اسید نوکلئیک‌ها
روش پادتن فلئورسانس و مطالعهٔ اسید نوکلئیک‌ها با استفاده از هیبریداسیون درجا اشاره کرد. برای تهیهٔ تصویر از مولکول‌های هدف باید آن‌ها را با استفاده از پروتئین فلورسنت سبز، یا گونهٔ دیگری از پروتئین فلورسنت یا با پادتن فلورسنت برچسب‌گذاری کرد. از انواع میکروسکوپ‌هایی که استفاده می‌شوند می‌توان به میدان گسترده، و دو فتونی اشاره کرد. میکروسکوپ‌های خودکار می‌توانند تعداد زیادی تصویر را به صورت خودکار تهیه کنند که این عمل نسبت به آنالیز با چشم سرعت بالاتری دارد. با این وجود از آن‌جایی که این فرایند به صورت
با این وجود از آن‌جایی که این فرایند به صورت خودکار انجام می‌شود می‌تواند دارای خطا باشد. به همین دلیل آنالیز این تصاویر نسبت به تصاویر تهیه شده به صورت غیرخودکار سخت‌تر است. از طرفی دیگر، در صورتی که این فرایند توسط یک شخص انجام شود ممکن است سوگیری آن شخص در نتایج تأثیر گذاشته باشد. بافت‌شناسی. در بافت‌شناسی قطعه‌های بافت علامت‌گذاری شده و سپس در زیر میکروسکوپ بررسی می‌شوند. بر اساس این تصاویر می‌توان به محل قرارگیری زیرسلولی پروتئین‌های علامت‌گذاری شده نیز پی برد. مسئله‌های مهم. آنالیز محلی زیرسلولی.
نیز پی برد. مسئله‌های مهم. آنالیز محلی زیرسلولی. آنالیز محلی زیرسلولی یکی از مسئله‌های اولیه در این شاخه بوده‌است. در حالت با نظارت آن، هدف مسئله یافتن دسته‌بندی‌کننده‌ای است که بتواند اندامک‌های اصلی سلول را در تصاویر تشخیص دهد. روش‌هایی که برای این مسئله استفاده می‌شوند بر پایهٔ یادگیری ماشین هستند و سعی در ساخت یک دسته‌بندی‌کننده بر اساس ویژگی‌های عددی به دست آمده از تصویر دارند. این ویژگی‌ها می‌توانند ویژگی‌های کلی مورد استفاده در بینایی ماشین باشند یا به‌طور مخصوص بر اساس عامل‌های زیستی به دست آمده
به‌طور مخصوص بر اساس عامل‌های زیستی به دست آمده باشند. علاوه بر تحقیقات زیست‌شناسی سلولی، این مسئله در مکان‌یابی پروتئین در سلول نیز کاربرد دارد. این مکان‌یابی کمک شایانی به فهم عملکرد پروتئین و شبکه‌های تنظیم‌کنندهٔ آن در سلول می‌کند. تصاویر دوبعدی در مقایسه با رشتهٔ یک‌بعدی اسید آمینه‌ها اطلاعات بسیار بیشتری را برای شناختن ویژگی‌های حرکتی پروتئین در اختیارمان می‌گذارند. بخش‌بندی. بخش‌بندی سلول‌ها یکی از مهمترین زیرمسئله‌ها در این شاخه است که در مسائل دیگر از آن استفاده می‌شود. در برخی موارد به این مسئله
از آن استفاده می‌شود. در برخی موارد به این مسئله به عنوان مسئله‌ای مستقل نیز پرداخته می‌شود. هدف این مسئله مشخص کردن مرزهای سلول‌ها در تصاویر چندسلولی است. این بخش‌بندی به ما امکان بررسی هر سلول به‌طور جداگانه را می‌دهد. در بسیاری از تصاویر هستهٔ سلول علامت‌گذاری شده‌است، که در این موارد هستهٔ سلول بخش‌بندی می‌شود. این مسئله نیز می‌تواند به صورت مستقل سودمند باشد یا از آن در پایه‌گذاری آب‌پخشان استفاده کرد که به بخش‌بندی تصویر اصلی منجر می‌شود. ردیابی. ردیابی یکی دیگر از مسائل مرسوم پردازش تصویر است که در
یکی دیگر از مسائل مرسوم پردازش تصویر است که در آنالیز تصاویر زیستی نیز مطرح می‌شود. در این مسئله به یافتن روابط بین اجزاء در فریم‌های مختلف یک فیلم پرداخته می‌شود. حرکت یک عملکرد ضروری در سیستم سلولی است. فعل و انفعالات شیمیایی پروتئین‌ها وابسته به حرکات میکروسکوپی آن‌ها است که به انتشار، انتقال و برخورد آن‌ها خلاصه می‌شود. وزیکول‌های حامل پروتئین به مکان‌های خاصی در سلول برای انجام وظیفه‌شان حرکت می‌کنند. کروموزوم‌ها نیز برای جدا شدن در تقسیم سلولی باید حرکت کنند. خود سلول‌ها هم در ساختار چندسلولی حرکت
حرکت کنند. خود سلول‌ها هم در ساختار چندسلولی حرکت می‌کنند. اطلاعاتی که اندازه‌گیری این حرکات مختلف به ما دربارهٔ سیستم سلولی می‌دهد اجتناب‌ناپذیر است. پردازش تصویر دیجیتال به روشی متداول برای آنالیز کردن این حرکات در زیست‌شناسی سلول تبدیل شده‌است. روش‌های زیادی برای مسئلهٔ ردیابی ارائه شده‌اند. از جمله روش‌های ارائه شده می‌توان به کانتور فعال، آستانه‌گذاری و روش‌های پردازش ویدئو اشاره کرد.
در زیست‌شناسی مولکولی به مجموعهٔ همهٔ فعل و انفعالات مولکولی در یک سلول اینترکتوم گفته می‌شود. این نام برای اولین بار توسط گروهی از دانشمندان فرانسوی در سال ۱۹۹۹ میلادی به کار برده شد. اینترکتوم در شمار شبکه‌های زیستی قرار دارد. این شبکه بیشتر فعل و انفعالات فیزیکی مانند تعامل پروتئین-پروتئین، یا تعامل مولکول‌های کوچک با پروتئین را شامل می‌شود اما مجموعه ای از تعاملات غیر مستقیم میان ژن‌ها را نیز در بر می‌گیرد. برای مثال مخمر در اینترکتوم خود ۲۸۰۰۰ تعامل پروتئین-پروتئین دارد. در حالی که این مقدار برای انسان
دارد. در حالی که این مقدار برای انسان به ۶۵۰۰۰۰ عدد می‌رسد. از منظر ریاضی این شبکه معمولاً به صورت گراف نمایش داده می‌شود. شبکه‌های فعل و انفعالات مولکولی. فعل و انفعالات مولکولی می‌تواند میان مولکول‌هایی که به خانواده‌های متفاوت زیست شیمیایی (پروتئین‌ها، اسید نوکلئیک‌ها، لیپیدها، کربوهیدرات‌ها و …) تعلق دارند صورت گیرد. این تعاملات همچنین می‌توانند بین مولکول‌های هم خانواده نیز رخ دهند. هنگامی که این مولکول‌ها با یکدیگر تعامل فیزیکی شکل می‌دهند، شبکه‌های تعامل مولکولی تشکیل می‌دهند که به وسیلهٔ اجزای شرکت
مولکولی تشکیل می‌دهند که به وسیلهٔ اجزای شرکت کننده در تعامل دسته‌بندی می‌شوند. همان‌طور که پیشتر گفته شد، اینترکتوم بیشتر به تعاملات پروتئین-پروتئین و زیر مجموعه‌های آن‌ها می‌پردازد. برای مثال اینترکتوم سیرتوئین ۱ و اینترکتوم مرتبه دوم خانوادهٔ سیرتوئین شبکه‌هایی هستند که به ترتیب سیرتوئین ۱ و پروتئین‌هایی که مستقیماً با آن تعامل دارند، و پروتئین‌هایی که همسایهٔ مرتبه دوم سیرتوئین ۱(همسایهٔ همسایه‌ها) می‌پردازند. نوعی دیگر از اینترکتوم‌ها که به شدت مطالعه شده‌است، اینترکتوم پروتئین-دی‌ان‌ای یا شبکه‌های
شده‌است، اینترکتوم پروتئین-دی‌ان‌ای یا شبکه‌های تنظیم ژن است. این شبکه‌ها از عوامل رونویسی، کروماتین‌های تنظیم پروتئین و ژن‌های هدف آن تشکیل شده‌است. حتی شبکه‌های سوخت و ساز نیز جزئی از شبکه‌های تعامل مولکولی محسوب می‌شوند: متابولیت‌ها یا همان اجزای سوخت و ساز سلولی توسط آنزیم‌ها به یکدیگر تبدیل می‌شوند. در واقع همهٔ انواع اینترکوم‌ها با یکدیگر مرتبط هستند. برای مثال، اینترکتوم‌های پروتئینی شامل آنزیم‌هایی می‌شوند که از سویی شبکه‌های زیست شیمیایی را می‌سازند. همچنین شبکه‌های تنظیم ژن اشتراکات زیادی با
همچنین شبکه‌های تنظیم ژن اشتراکات زیادی با اینترکتوم‌های پروتئینی دارند. شبکه‌های فعل و انفعالات مولکولی. دو ژن ممکن است بر عملکرد یکدیگر تأثیرگذار باشند که در این صورت گفته می‌شود این دو ژن تعامل ژنتیکی با یکدیگر دارند. ژن‌هایی که از این طریق با یکدیگر در ارتباط هستند، شبکه‌های تعامل ژنتیکی را تشکیل می‌دهند. هدف ایجاد و مطالعه این شبکه‌ها، توسعهٔ نقشه کارکرد پردازش‌های سلولی، یافتن هدف‌های دارویی و تخمین عملکرد ژن‌های ناشناخته است. در سال ۲۰۱۰ میلادی کاملترین اینترکتوم ژنتیکی که تا به امروز تولید شده، از
اینترکتوم ژنتیکی که تا به امروز تولید شده، از مطالعه ۵٫۴ میلیون ژن به صورت دو به دو ایجاد شد. در این مطالعه حدوداً ۱۷۰۰۰۰ تعامل ژنتیکی مورد بررسی قرار گرفت و ژن‌ها بر اساس عملکرد خود دسته‌بندی شدند. با این روش پژوهشگران موفق شدند تا عملکرد ژن‌های شناخته شده را بهتر از قبل شناسایی کنند و همچنین عملکردهای جدید برای تعدادی از ژن‌ها پیدا شد. نکتهٔ قابل توجه که توسط این پژوهش یافته شد این است که تعداد تعاملات ژنتیکی منفی و مخرب نزدیک به دو برابر تعداد تعاملات ژنتیکی مثبت است. از این رو، ژن‌هایی که بیشتر با
ژنتیکی مثبت است. از این رو، ژن‌هایی که بیشتر با یکدیگر مرتبط بودند، هنگام اختلال احتمال بیشتری داشت که منجر به مرگ شوند. اینترکتومیک. اینترکتومیک شاخه ای از علم است که در آن از تلفیقی از علوم بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی استفاده می‌شود. این علم به مطالعه تعاملات زیستی و نتایج این تعاملات میان پروتئین‌ها و مولکول‌های درون سلول می‌پردازد. از این رو متخصصان این علم شبکه‌های تعاملات زیستی میان گونه‌های مختلف بررسی می‌کنند تا تغییرات و شباهت‌های این شبکه‌ها در میان این گونه‌های و همچنین تغییرات آن‌ها را در گذر
این گونه‌های و همچنین تغییرات آن‌ها را در گذر زمان بیابند. روش‌های تجربی در نگاشتن اینترکتوم‌ها. تعاملات پروتئین-پروتئین، اجزای پایه ای اینترکتوم‌ها هستند. با این که روش‌های مختلفی برای مطالعهٔ این تعاملات وجود دارد، تعداد کمی از این روش‌ها مورد استفاده قرار می‌گیرند. روش (Y2H) برای مطالعهٔ تعاملات دوتایی دو پروتئین به صورت همزمان مناسب است. در حالی که روش خالص سازی پیوستگی (به انگلیسی: affinity purification) و اسپکتومتری بیشتر برای یافتن ترکیب پروتئین‌ها کاربرد دارد&lt;ref
برای یافتن ترکیب پروتئین‌ها کاربرد دارد&lt;ref name="10.3389/fnmol.2014.00058"&gt;&lt;/ref&gt;. بررسی محاسباتی اینترکتوم‌ها. بعد از ساختن اینترکتوم، روش‌های زیادی برای مطالعهٔ ویژگی‌های آن وجود دارد. با این وجود دئ هدف بسیار مهم برای این بررسی‌های وجود دارد: این مطالعات بیشتر با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک انجام می‌شوند. از جمله انواع بررسی‌ها و آنالیزهای ممکن می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:
آتش‌بس تانگو یا آتش‌بس تانگکو به زبان ژاپنی: 塘沽協定، در هپبورن: "Tōko kyōtei"، در چینی ساده‌شده: 塘沽协定 در چینی سنتی: 塘沽協定 و در پین‌یین: "Tánggū Xiédìng" یک قرار آتش‌بس میان جمهوری چین و امپراتوری ژاپن بود که در ۳۱ مه ۱۹۳۳ در تیانجین، استان تانگو امضا شد و رسماً به حمله ژاپن به منچوری که دو سال پیش آغاز شده بود پایان داد. پیش زمینه. از آغاز یورش ژاپن به چین، چینی‌ها از جامعهٔ جهانی و همسایگان درخواست کمک کردند اما حمایتی صورت نگرفت. تنها هنگامی که چین درخواست یک جلسهٔ اضطراری جامعه ملل داد یک کمیتهٔ تحقیق تشکیل
جلسهٔ اضطراری جامعه ملل داد یک کمیتهٔ تحقیق تشکیل شد و نتیجهٔ آن ارائهٔ گزارش لیتون بود که در آن ژاپن به دلیل رفتارهایش محکوم شده بود اما هیچ پیشنهادی برای حل این مشکل ارائه نشده بود. در مقابل ژاپن هم در ۲۷ مارس ۱۹۳۳ از جامعهٔ ملل خارج شد. پادشاه وقت ژاپن، هیروهیتو ارتش این کشور را به شدت تغذیه کرده بود و می‌خواست که در منطقهٔ گسترده‌ای پس از دیوار بزرگ چین درگیری با چین نباشد. جایگاه ژاپن در مذاکرات بسیار قوی بود چون در آن زمان چین به شدت درگیر جنگ داخلی با کمونیست‌ها بود. خواست ژاپن. نخستین ملاقات
با کمونیست‌ها بود. خواست ژاپن. نخستین ملاقات چینی‌ها و ژاپنی‌ها برای پایان دادن جنگ در ۲۲ مه ۱۹۳۳ صورت گرفت. درخواست‌های ژاپن بسیار جاهطلبانه بود. ژاپن می‌خواست که یک منطقه غیرنظامی در فاصلهٔ ۱۰۰ کیلومتری از دیوار بزرگ چین از پکن تا تیانجین ایجاد شود که این منطقه به همراه خود دیوار چین در فرماندهی ژاپن باشد. هیچ کومینتانگ نظامی معمولی حق ورود به ناحیهٔ غیرنظامی را ندارد اما ژاپنی‌ها اجازه دارند هواگرد شناسایی یا نیروی شناسایی زمینی به منقطه بفرستند تا مطمئن شوند که پیمان آتش‌بس پابرجا است. همچنین یک نیروی
شوند که پیمان آتش‌بس پابرجا است. همچنین یک نیروی نظامی سبک مسئول حفظ نظم در این منطقهٔ غیرنظامی بود. پس از آتش‌بس. این آتش‌بس باعث شد تا مانچوکوئو از سوی دولت چین به رسمیت شناخته شود و از دست دادن استان رهه رسماً پذیرفته شود. همچنین برای مدتی جنگ پایان یافت و روابط میان دو کشور بهبود یافت. در ۱۷ مه ۱۹۳۵ سطح دیپلماتیک ژاپن در چین در حد سفارت بالا رفت و در ۱۰ ژوئن ۱۹۳۵ موافقت نامهٔ هه-اومژو (He-Umezu) امضا شد. این آتش‌بس به چیانگ کای‌شک فرصت داد تا نیروهای خود را بسیج کند و حزب کمونیست چین را سرکوب کند هرچن
را بسیج کند و حزب کمونیست چین را سرکوب کند هرچن که به قیمت شمال چین باشد. افکار عمومی در چین بر این باور بود که این آتش‌بس به شدت به نفع ژاپن است و برای چین تحقیرکننده است. با اینکه یک ناحیهٔ غیرنظامی میان چین و ژاپن تشکیل شده بود تا به عنوان منطقه حائل میان تنش‌ها عمل کند اما چشم طمع ژاپن همچنان به سوی چین بود تا اینکه جنگ دوم چین و ژاپن در ۱۹۳۷ آغاز شد.
استان رهه "Rèhé shěng" به معنی استان رود داغ که به آن جِهول هم می‌گویند در گذشته یک استان و منطقه ویژه اداری در چین بود. رهه در شمال دیوار بزرگ چین، غرب منچوری و شرق مغولستان بود و پایتخت آن چنگده بود. دومین شهر بزرگ این استان چاویانگ و پس از آن چیفنگ بود. این استان ۱۱۴ هزار کیلومترمربع گسترده بود.
درانگ ناخ استن به معنی «حرکت به سمت شرق» اصطلاحی بود که در قرن ۱۹ میلادی برای بیان گسترش آلمانی‌ها به سمت شرق ایجاد گشت. این عبارت یکی از شعارهای اصلی جنبش‌های ملی‌گرایانه آلمانی در قرن ۱۹ بود. در پاره‌ای از مباحث تاریخی لفظ درانگ ناخ اوستن ترکیبی است از اقامتگاه‌های تاریخی آلمانی‌ها در مرکز و شرق اروپا، لشکرکشی‌های قرون وسطی مانند آنچه که شوالیه‌های تتونیک انجام دادند (بنگرید به جنگ‌های صلیبی شمالی) و سیاست‌های آلمانی سازی دولت‌های مدرن آلمانی مانند آنچه نازی‌ها در سیاست لبنسراوم متجلی ساختند. در لهستان
نازی‌ها در سیاست لبنسراوم متجلی ساختند. در لهستان این عبارت جهت توصیف برنامه‌های آلمانی سازی لهستان به کار می‌رفت اما در آلمان این شعار جزئی از یک میل ملی‌گرایانه عمیق‌تر جهت بیان نظریه برتری فرهنگ آلمان و ستایش آلمانی‌ها شرقی بود. مفهوم درانگ ناخ استن یکی از پایه‌های اساسی ملی‌گرایی آلمانی و ایدئولوژی نازیسم بود. آنچنان که آدولف هیتلر در ۷ فوریه ۱۹۴۵ گفته‌است: «ریشه‌های نژاد ما تنها و تنها باید به سمت شرق گسترده گردد. این تقدیری است که خود طبیعت برای گسترش مردمان آلمانی تعیین نموده‌است.»
آدی هیملبلوی (؛ زادهٔ ) هنرپیشه، مدل، و مجری تلویزیون اهل اسرائیل است. زندگی و شغل. هیملبلوی در شهر خولون اسرائیل از پدر و مادری یهودی متولد شد. پدر وی از نژاد یهودیان روسیه و اشکنازی است در حالی که مادرش از نژاد یهودیان ترکیه و یهودیان ایرانی و از سفاردی‌ها است.
محمد ایهاتارن (؛ زادهٔ ) بازیکن فوتبال اهل هلندایران است. او اصالتاً پدر ایرانی است.
شش غزل از حافظ کتاب مصوری با تصویرگری بهرام خائف بر روی شش غزل از غزلیات حافظ به مناسبت کنگره جهانی بزرگداشت حافظ در ششصدمین سالگرد زاد روز حافظ در سال ۱۳۶۷ توسط انتشارات کانون پرورش فکری کودکان و نوجوانان منتشر شد. جعفر ابراهیمی این آلبوم تصویری را از ماندنی‌ترین آثار این هنرمند می‌داند. این کتاب به همراه کتاب حکایت‌نامه جزو کارهای برجسته این هنرمند می‌باشد که با استقبال منتقدان و خوانندگان همراه بوده‌است. تصويرها. بهرام خائف از تکنيک "آبرنگ" برای خلق تصاوير اين کتاب استفاده کرده است. وی بااستفاده از اين
اين کتاب استفاده کرده است. وی بااستفاده از اين تکنيک لايه های شفافی بوجود آورده که هر يک تصويری از شعر مربوطه است. تعدد لايه ها باعث ايجاد احساس سه بعدی بودن تصويرها و کنترل بروی غلظت رنگها سبب ايجاد حس بافتهای گوناگونی شده است. به نظر "شکوه حاجی نصرالله" اين تکنيک و روش تعدد لايه ها و و ايجاد عمق، کمک کرده است به احساس گذر طولانی زمان بر اشعار حافظ در اين تصاوير. در تصوير غزل اول بافت سياه رنگی شبيه تارپود پارچه بروی تصوير دروازه قرآن احساس غربت و دوری ازديار تشريح شده حافظ در اين غزل را نشان می دهد. در
تشريح شده حافظ در اين غزل را نشان می دهد. در تصاوير غزل دوم ، سوم و چهارم حرکت و ضربه قلموی آبرنگ (يا هر ابزار استفاده شده) بافت هايی در چندلايه و رنگ بوجود آورده است و از اين بافتها برای ساختار اجزای تصاوير استفاده شده است. اين روش در تصوير غزل دوم و سوم برای بوجود آوردن طرح وشکلی از درخت استفاده شده است. شيوه و تکنيک تشريح شده گذرزمان توسط "شکوه حاجی نصرالله" به راحتی در تصوير غزل آخر قابل تشخيص است با توجه به تشريح حافظ درباره گذر از شرايط ناخوشايند در متن غزل. جوایز. بهرام خائف دیپلم افتخار کمیسیون
متن غزل. جوایز. بهرام خائف دیپلم افتخار کمیسیون بین‌المللی کتاب برای کودکان و نوجوانان IBBY-International Board on Books for Young People رادرسال ۱۳۶۹خورشیدی (۱۹۹۰میلادی) برای تصویرگری شش غزل از حافظ دریافت کرد. کمیسیون بین‌المللی کتاب برای کودکان و نوجوانان (دفتر بین‌المللی کتاب برای نسل جوان) فهرستی دوسالانه ای از آثار برجسته در رشته نویسندگی٬تصویرگری و ترجمه برای ادبیات کودکان در سطح بین‌المللی منتشر می‌کند که شامل جوایز ارزشمندی چون جایزه هانس کریستیان آندرسن٬جایزه ترویج مطالعه آساهی و لیست/فهرست
آندرسن٬جایزه ترویج مطالعه آساهی و لیست/فهرست افتخار کمیسیون بین‌المللی کتاب برای کودکان و نوجوانان می‌باشد. هدف این انجمن از این جوایز تشویق و ترویج ادبیات کودکان با کیفیت و حمایت از حق کودکان به دسترسی به مطالعه می‌باشد. این دفتر تحت حمایت یونیسف فعالیت می‌کند و نامزدهای جوایز و لیست‌های خود را به کمک شعب ملی این دفتر در کشورهای مختلف جمع‌آوری می‌کند. در ایران شورای کتاب کودک لیست کاندیداها را تهیه می‌کند. بهرام خائف علاوه بر کتاب شش غزل از حافظ همچنین در سال ۱۳۷۹ (۲۰۰۲) به خاطر تصویرگری کتاب دنیای رنگین
سال ۱۳۷۹ (۲۰۰۲) به خاطر تصویرگری کتاب دنیای رنگین کمان در لیست افتخار کمیسیون بین‌المللی کتاب برای کودکان و نوجوانان قرار گرفت. تصویرگران ایرانی مانند نورالدین زرین‌کلک برای تصویرگری زال و سیمرغ(۱۳۵۱)و وقتی که من بچه بودم(۱۳۵۳)٬حسین محجوبی برای افسانه باران در ایران (۱۳۵۵)، بهمن دادخواه برای افسانه (۱۳۵۷)٬سیمین شهروان برای رسم ما، سهم ما(۱۳۶۳)٬نیره تقوی برای زیباترین آواز(۱۳۶۵)٬ابوالفضل همتی آهویی برای سرخ و صورتی (۱۳۶۹)، فیروزه گل محمدی برای شغالی که در خم رنگ افتاد (۱۳۷۱)، سارا ایروانی برای افسانه درخت
رنگ افتاد (۱۳۷۱)، سارا ایروانی برای افسانه درخت خرما و بز(۱۳۷۳)٬ویدا لشکری فرهادی برای قصه‌های من و مامان (۱۳۷۵)٬پژمان رحیمی زاده برای دیوانه و چاه (۱۳۸۰)٬فرشید شفیعی برای شهرزاد و بچه‌های قصه گو (۱۳۸۱)٬مرتضی زاهدی برای شب بخیر فرمانده (۱۳۸۳)٬علی بوذری برای روباه دم بریده (۱۳۸۵)٬علیرضا گلدوزیان برای خرس دانا چرا به این روز افتاده بود (۱۳۸۸)٬راشین خیریه برای دیگر در خانه پسرک هفت صندلی بود (۱۳۸۸)٬مانلی منوچهری برای زال و سیمرغ (۱۳۹۲)و نازنین عباسی برای احتیاط! خطر حمله موش‌ها و دیگران (۱۳۹۳) برنده این دیپلم
خطر حمله موش‌ها و دیگران (۱۳۹۳) برنده این دیپلم افتخار شده‌اند. عنصر شعر در آثار بهرام خائف. بسیاری از کارهای بهرام خائف در کانون برگرفته از کتابهای شعر می‌باشد. وی بیان می‌کند که شعر به عنوان یک هنر فراگیر نزدیکی زیادی به نقاشی دارد و از این رو علاقه وی به شعر بیش از بقیه هنرها است. نظر منتقدان درباره شش غزل از حافظ. جعفر ابراهیمی که انتخاب اشعار شش غزل از حافظ را به عهده داشته از این کار به عنوان حرکتی تازه در آثار دهه شصت بهرام خائف یاد می‌کند و این آلبوم را به نوعی برداشت شخصی وی می‌داند. جلاالدین