Вопрос: Почему не могу найти работу Junior'ом C#?

Лучший ответ: Это не резюме, это набор слов, ничем Вас не выделяет из общей массы и даже делает низовым в списке общей массы.
1. Такой кучи тегов даже у меня нет)) Если Вы знаете названия технологий, не говорит о том, что Вы знаете сами технологии. С Вашим опытом никто не поверит, что Вы имели реальный опыт со всем этим, а не просто hello world написали. Выберите те, в которых по Вашему мнению Вы лучше всего разбираетесь.
2. Отличное знание WinForms, ASP.NET, LINQ и WPF. Паттерны: MVVM, MVP, Repository, IoC.
Для третьекурсника звучит самонадеяно. При такой формулировке на техническом собеседовании будут проверять "отличное" знание и я почти уверен, что Вы его провалите. Лучше сказать что-то подобие: имел опыт работы с, для реализации использовал технологии, имею <начальные> навыки работы с и т.д. 
3. Занимался исправлением мелких багов, написанием небольших SQL-запросов и unit-тестов, решал небольшие задачи.
Этим занимаются все разработчики, даже мидлы с сеньорами. Из Вашей фразы не понятно, какого уровня проект, какой стек, какие конкретно задачи Вы решали, как успешно Вы их решали. Работодателю нужно понимать Ваш реальный опыт и Ваши реальные возможности, а не нечто эфемерное "решал небольшие задачи".
4. Если вспомнить css и html 
Вот такое никогда не пишите. Лучше соврать или преувеличить, или даже написать "Отличное знание", но не так как Вы здесь сформулировали.
5. Не нужно оставлять ссылки на каждый проект в репозитории. Либо один, самый интересный на Ваш взгялд, либо одна ссылка на сам репозиторий. Работодатель пойдет туда только, если Вы заинтересуете его, не раньше. И ему пары файлов хватит оценить ваш уровень. Он не будет делать ревью всех Ваших проектов.
6. Опыта одного проекта мало. Где опенсерс проекты, где участия в хакатонах, где амбиции стартапов, посещение конференций? Работодатель хочет понимать как Вы заинтересованы развиваться, какие у Вас планы для дальнейшего роста. Он берет вас нулевым не из альтруистических побуждений, а с надеждой, что Вы быстро вырастите и вернете ему прибылью затраченное на Вас время. Из Вашего резюме видно только одно: я студент - дайте работу. А почему Вам, за какие такие заслуги и что с этого будет иметь работодатель - не понятно.
7. Я посмотрел Ваш код. Я бы не хотел, чтобы так писали у меня в проекте, начиная от именований и заканчивая некоторой логикой. Вас надо очень осторожно подпускать к реальным задачам и контролить, что Вы там напишете, просто чувствуется маленький опыт и до "отличных знаний" там далеко.
В общем, вывод. Пока у Вас за плечами нет списка реальных проектов, чтобы Вас пригласили, надо себя выпячивать, хвастаться достижениями, демонстрировать амбиции, свою уникальность. Нужно убеждать работодателя, что Вы именно тот, кто ему нужен. В резюме этого нет. Когда у Вас будет пяток законченных проектов, будет наоборот, работодатель будет за Вами бегать и убеждать, что Вам у него будет лучше всего. И на hh студентов практикантов не ищут, поэтому только Вы должны делать отклики на вакансии, обязательно с сопроводительным письмом, в котором парой фраз Вы сможете заинтересовать работодателя.

Худший ответ: Да, я всего лишь джун, но в некоторых компаниях что-то дико завышенные требования на эту вакансию.
Вы не джун.
Вы трейни (trainee).
А хотите на вакансию джуна.... ну и результат закономерен.