Die Ergebnisse der Phylogenie beruhen in erster Linie auf der Abstammungslehre und sind in ihrer Konsequenz Beleg für die Evolution.
Die Möglichkeit, alle Lebewesen in ein natürliches System zu ordnen, ist ein Beweis für die Abstammungslehre, nach der das heutige Organismenreich einen Querschnitt durch den Prozess der Stammesentwicklung darstellt.