Da die Durchführung der Mutagenese einzelsträngige DNA benötigt wird, inseriert man die zu mutierende DNA in Derivate von Einzelstrangphasen.
Im Zeitalter der Molekularbiologie ist die durch Oligonukleotide vermittelte, gerichtete Mutagenese ein wertvolles Werkzeug bei der gezielten Herstellung von Proteinen mit veränderten Eigenschaften.