Gegen Frühsommer-Meningoenzephalitis (FSME) gibt es keine ursächliche Behandlung. Es sind keine Medikamente bekannt, die gegen das Virus helfen.
Bei einem Prozent aller Erkrankten, die eine Beteiligung des Zentralnervensystems aufweisen, endet die Frühsommer-Meningoenzephalitis tödlich.