In vielen anderen ökologischen Wechselbeziehungen sind die daran beteiligten beiden Parteien keine Antagonisten, sondern nützlich füreinander: also Mutualisten oder Symbionten.
Zum einen kann der Antagonist an anderen Wirkarealen oder Rezeptoren angreifen als der Agonist und auf diese Weise funktionell unerwünschte Wirkungen abmildern oder aufheben.