منشاء ویروس ها در تاریخ تکاملی زندگی واضح نیست: بعضی ها ممکن از پلاسمید ها – توته های DNA که میان حجرات حرکت کرده میتواند تکامل یافته باشند – در حالیکه دیگران ممکن از بکتریا تکامل یافته باشند.