تفاوت در این جاست که کود ژنیتیکی به عوض اینکه با استفاده از ویژگی های آنعده نباتات که در رشد و تکامل آنها نقش دارد، بطور غیر مستقیم مورد استفاده قرار گیرد، برعکس، این کود به خاطر تعیین ارتباطات که میان نباتات از لحاظ رشد و تکامل وجود دارد، استفاده میگردد.