যাইহোক, যেহেতু সমস্ত জীবন্ত প্রাণী কিছু পরিমাণের সাথে সম্পকির্ত, এমনকি যে অঙ্গগুলির গঠনগত মিল কম বা কোন মিল নেই, যেমন আথ্রোর্পড, স্কুইড এবং মেরুদণ্ডী চোখ, বা আথ্রোর্পড এবং মেরুদন্ডী প্রাণীদের অঙ্গ এবং ডানাগুলি একটি সাধারণ সেটের উপর নিভর্র করতে পারে। সমজাতীয় জিন যা তাদের সমাবেশ এবং কাজ নিয়ন্ত্রণ করে; একে বলা হয় গভীর হোমোলজি।