هناك أربع مجموعات من مجموعة من الانزيمات الهندسية: الميغانوكلياز، نوكلياز صباع الزنك، نوكليازات المستجيب اللي شبه منشط النسخ (تالين)، ونظام Cas9-دليل RNA (متاخد من كريسبر).