كتستعمل أشجار تطور السلالات من الأنواع ونظام التصنيف الأعلى لدراسة تطور الصفات (كمثال، دراسة الخصائص التشريحية أو الجزيئية) وتوزيع الكائنات الحية (الجغرافيا الحيوية).