議案名稱：「自由貿易經濟特區特別條例草案」，請審議案。
案由：本院委員曾銘宗、費鴻泰、賴士葆、羅明才、黃昭順、沈智慧等27人，鑑於臺灣正面臨國際經貿網路遭邊緣化、產業結構升級陷入瓶頸、人才嚴重外流及長期低薪困境等重大經濟挑戰。為提升經濟發展及國家競爭力，落實「貨出得去、人進得來」之目標，鬆綁法規推動自由貿易經濟特區，由點到面逐步推動台灣邁向經濟自由島，以融入世界經濟貿易體系，爰擬具「自由貿易經濟特區特別條例」草案。是否有當？敬請公決。
提案單位/提案委員：本院委員曾銘宗等27人
提案人：曾銘宗
費鴻泰
賴士葆
羅明才
黃昭順
沈智慧
連署人：王育敏
鄭天財 Sra Kacaw
陳宜民
蔣乃辛
童惠珍
林為洲
林德福
陳超明
徐志榮
柯志恩
廖國棟Sufin‧Siluko
顏寬恒
李彥秀
許毓仁
林麗蟬
許淑華
呂玉玲
孔文吉
林奕華
蔣萬安
陳雪生
提案來源：委員提案
議案類別：法律案
屆：第9屆
會議：第9屆第7會期第6次會議
提案日期：2019-03-22
字號：院總第454號委員提案第23025號
相關法律：自由貿易經濟特區特別條例
議案狀態：交付審查
議案流程：
會期: 09-07-06
院會/委員會: 院會
狀態: 排入院會 (交經濟委員會)
日期: 2019-03-22
2019-03-26
會期: 09-07-06
院會/委員會: 院會
狀態: 交付審查
日期: 2019-03-22
2019-03-26
院會/委員會: 經濟委員會
狀態: 委員會審查
日期: 2019-04-15
院會/委員會: 經濟委員會
狀態: 委員會審查
日期: 2019-04-29
關連議案：
對照表：
law_id: 07153
law_name: 自由貿易經濟特區特別條例草案
立法種類: 增訂條文
title: 自由貿易經濟特區特別條例草案
rows: 說明: 章名
增訂: 第一章　總　　則
說明: 一、明定本條例之立法目的。

二、因應臺灣經濟結構轉型之需要及國際區域經貿整合之趨勢，並強化臺灣之國際競爭力。在發展活力經濟政策上，以規劃設置自由貿易經濟特區，作為提升經貿自由化與國際化之試驗基地。期藉此範例試行，降低國內自由化阻力，並營造加入「跨太平洋夥伴全面進步協定（CPTPP）」與「區域全面經濟夥伴關係（RCEP）」之有利條件。為達成國際接軌、融入國際經濟整合之目標，以強化經濟成長動能，釋放企業活力，爰訂定本條例。
增訂: 第一條　為提升經濟成長動能及國家競爭力，參與國際區域經貿整合，以特區先行模式，便捷人員、貨物、技術之流通，特制定本條例。
說明: 一、明定本條例之法律適用順序。

二、在本條法律適用順序下，本條例所規定之事項，具有優先適用之地位；於本條例未規定或未明文排除相關法令適用時，應適用其他相關法令之規定；另外，雖然本條例在原則上具有優先適用之地位，但本條例所規定之事項，如其他法律亦有規定且其規定較本條例更為有利，則仍容許本條例規範之特區與指定事業主張適用最有利之法律，爰訂定第一項。

三、為妥適監管，確保本條例適用對象遵法，罰則應無競合之規定，仍應由各主管機關逕行依各自主管法律課處相對應之處罰，爰訂定第二項。
增訂: 第二條　自由貿易經濟特區（以下稱特區）與指定事業之設置及管理，依本條例之規定；本條例未規定者，適用其他有關法律之規定。但其他法律之規定，較本條例更有利者，適用最有利之法律。

前項但書規定，於第八章罰則不適用之。
說明: 明定本條例之用詞：

一、為明確自由貿易經濟特區係指依本條例第十三條及第十四條核定之實體區域，爰訂定第一款。

二、指定事業定義，包括第一類及第二類指定事業。第一類指定事業係指經許可於實體特區從事產業活動之事業。另考量特區重點在自由化，而不在「實體區」，爰推動方式應配合事業特性，故針對具輸出利基、可協助國內業者朝國際化發展且具時效性之服務業，明定為第二類指定事業，可於區內外營運，爰訂定第二款。

三、第三款明定特區內得進駐之事業，除指定事業外，包括與其相關之周邊支援性事業，稱區內一般事業，俾利產業發展。

四、第四款明定特區內適用本條例之相關事業範圍。

五、第五款明定申請設置特區機關之定義。

六、第六款明定國際醫療機構定義。
增訂: 第三條　本條例用詞定義如下：

一、自由貿易經濟特區：指經行政院依本條例核定之經貿特別區域。

二、指定事業：指第一類及第二類指定事業。

三、區內一般事業：指與第一類指定事業相關之周邊、支援性事業。

四、區內事業：指於自由貿易經濟特區內營運之指定事業、區內一般事業及於區內設置執行業務、營業或聯絡處所之事業。

五、申設機關：指依本條例提出申請設置自由貿易經濟特區之主管機關、中央目的事業主管機關、直轄市或縣（市）政府。

六、國際醫療機構：指經中央衛生福利主管機關許可於自由貿易經濟特區內設置專辦國際醫療之醫療機構。
說明: 明定經濟部為本條例之主管機關，負責以下事項：

一、本條例之相關解釋、子法規之訂定或會同訂定。

二、有關特區申請設置之相關審核事項。
增訂: 第四條　本條例之主管機關為經濟部。
說明: 一、管理機關之選定，由申設機關提出，爰訂定第一項。另考量管理機關負有特區監管之任務，為使各申設機關所選定之管理機關具有執行上述任務之能力，宜由主管機關提出選定原則做為參考。

二、如選定之管理機關，非申設機關之所屬機關者，應另徵詢被選定機關及其上級機關之同意，爰訂定第二項。
增訂: 第五條　特區之管理機關（以下簡稱管理機關）由申設機關選定適當機關擔任。

前項申設機關所選定之管理機關，如非其所屬機關者，應徵詢該被選定機關及其上級機關之同意。
說明: 一、第一項明定管理機關之掌理事項。管理機關掌理區內各項行政事務，為有效執行特區、指定事業之管理工作及便利區內事業之各項行政手續，爰於第一項詳細列舉其統籌掌理事項，以發揮管理特區事務「單一窗口」之功能：

(一)管理機關除辦理推動指定事業之申設、促進特區營運環境之優化等主管事務外，為實施單一窗口管理，得執行各行政機關依法委任、委託或委辦之公權力事項，如特區相關勞工行政、勞工安全衛生及勞動檢查事務、工商登記證照核發、僑外專門性或技術性人員聘僱許可之核發及特區環境保護許可之審查等事務。

(二)為因應直轄市或縣（市）政府申設之特區可能由地方機關擔任管理機關，爰規定中央行政機關得依法將公權力事項委辦其執行之。

二、在充分發揮管理機關以單一窗口簡化行政申辦程序及整合各行政業務執行之功能下，管理機關執行事項涉及主管機關以外之機關者，相關機關得依法委任、委託或委辦管理機關，爰訂定第二項。
增訂: 第六條　管理機關掌理下列事項：

一、依主管機關所定辦法，辦理其依本條例所主管之相關事務。

二、依區內事業之需求，本於職權，擔任單一窗口，辦理區內事業與主管機關、目的事業主管機關以及其他中央及地方機關之聯繫協調事務。

三、推動指定事業之申設。

四、管理及維護特區之安全、環保及設施等事項。

五、促進特區營運環境之優化。

六、特區勞工行政、勞工安全衛生及勞動檢查事務。

七、區內事業業務及財務狀況之查核。

八、特區工商登記證照之核發。

九、特區用電證明之核發。

十、特區外籍或僑居國外專門性或技術性人員聘僱許可之核發。

十一、特區申請稅捐減免所須相關證明之核發。

十二、特區出進口廠商登記、貨物輸出入許可文件、原產地證明書、加工證明書及再出口證明之核發。

十三、特區土地使用管制及建築管理。

十四、特區環境保護許可之審查。

十五、預防走私措施。

十六、其他特區及指定事業相關行政管理事項。

十七、其他基於相關目的事業主管機關之委任、委託或委辦，辦理目的事業主管機關所轄事務。

前項各款所定事項與主管機關以外之機關有關者，得由相關機關依法委任、委託或委辦管理機關辦理之。
說明: 一、第一項明定管理機關得為開發及管理之必要，設置基金。

二、第二項明定特區之相關基金設置，應以具自償性為原則。

三、特區相關基金之設置，涉及特區及其周邊與指定事業之權益，爰於第三項及第四項訂定基金之來源及用途，以杜爭議，並維持其收支正當性。
增訂: 第七條　管理機關得為開發及管理之必要，設置基金。

前項基金之設置，應以具自償性為原則。

第一項基金之來源如下：

一、特區管理費、服務費及相關必要費用等。

二、貨物之通關、簽證或核准機關，提供夜間與假日申辦通關、簽證或核准服務收取之服務費或其他相關費用。

三、融貸資金之利息。

四、特區開發完成後之結餘款。

五、由政府循預算程序之撥款。

六、基金孳息。

七、其他有關之收入。

第一項基金之用途如下：

一、供特區開發、擴充或更新之支出。

二、特區內土地、建築物或設施，長期未能租售，致租售價格超過附近使用性質相同之土地或建築物者，其所增加開發成本利息之補貼。

三、特區內或周邊相關公共設施之興建、維護或改善。

四、管理機關因開發管理所生之支出。

五、特區內或周邊受影響區域環境之改善。

六、特區之相關研究、規劃或宣導。

七、特區相關事業之投資。

八、貨物之通關、簽證或核准機關提供夜間與假日申辦通關、簽證或核准服務之加班支出。

九、其他有關之支出。
說明: 一、為使管理機關得維護與管理特區周邊環境及公共設施之安全，並就辦理本條例第六條第一項掌理事項及第四十一條貨物之通關、簽證或核准機關辦理夜間及假日通關、簽證或核准服務，以提供高效率服務，明定管理機關得收取管理費、服務費或相關必要費用，爰訂定第一項。

二、參酌產業創新條例第五十三條第三項規定，於第二項明定特區內繳納義務人未依規定期限繳納各類費用時，應向其徵收滯納金，俾促使其儘速繳交，以示公平；並訂定滯納金之上限，以維持合理性。

三、第一項所定相關費用之收費標準，由各管理機關擬訂，報請各該主管機關核定，爰訂定第三項。

四、考量依第十三條設置之特區，其既有園區多已定有相關收費標準及未依規定期限繳納相關費用之處理方式，爰訂定第四項。
增訂: 第八條　管理機關為維護與管理特區與周邊環境及公共設施之安全，得向區內事業收取管理費；為辦理第六條第一項規定之掌理事項及第四十一條第二項夜間及假日通關、簽證或核准服務，得收取服務費或相關必要費用。

前項費用，如繳納義務人未依規定期限繳納者，每逾二日按滯納數額加徵百分之一滯納金；加徵之滯納金額，以應納費額之百分之十五為限。

第一項所定管理費、服務費或相關必要費用之收費標準，由管理機關擬訂並報請各該主管機關核定。

前二項之規定，於依第十三條規定申請設置之特區，不適用之。
說明: 一、為使進駐特區之事業，符合特區政策規劃，並考量本條例所定相關優惠限定適用主體資格，擬進駐特區從事產業活動之事業，得向管理機關申請許可為第一類指定事業，爰訂定第一項。

二、為防範部分產業衝擊過大，例如農業於朝向科技化、國際化發展之同時，恐對於國內初級農業造成影響，爰訂定第二項規定，明定第一類指定事業製造或加工之農產品，應經中央農業主管機關核准後，始得輸往國內課稅區，賦予中央目的事業主管機關，就從事農業加值之第一類指定事業使用管制性原料製造之非管制性產品是否以外銷為主、國內原料採購數量是否與內銷產品相當、若使用管制性原料是否造成取代國內原料等項目進行審查之權限。

三、訂定第三項，各管理機關之中央各該主管機關與主管機關，應本於職權會商相關機關（例如主管第五章之財政部），依據特區之整體規劃與發展等因素，就事業之範圍、資格條件、審查基準、申請程序、核定機關、管理、查核、廢止及其他相關事項，訂定授權辦法。

四、申設機關為直轄市或縣（市）政府者，應先釐清該特區主要指定活動樣態，再洽請該活動之中央各該主管機關會同主管機關訂定指定事業許可辦法。
增訂: 第九條　於特區內從事產業活動之事業，得向管理機關申請許可為第一類指定事業。

第一類指定事業製造或加工之農產品輸往國內課稅區時，應經中央農業主管機關核准。

前二項事業之範圍、資格條件、審查基準、申請程序、核定機關、管理、查核、廢止及其他相關事項之管理辦法，由管理機關之中央各該主管機關會同主管機關定之。
說明: 一、鑒於特區之政策重點在於自由化，而不在實體區，其推動方式應配合產業特性，就無法或無須限於實體區試行者，將以虛擬方式示範，不限地區推動。故因產業營運特性無法侷限在本條例所定實體特區內試行之產業，如具發展潛力及示範效果，中央目的事業主管機關得會同主管機關公告得適用本條例之服務業指定活動，爰訂定第一項。

二、中央目的事業主管機關得本於職權，據其就指定活動之整體規劃與發展等因素，准駁事業之申請，爰訂定第二項。

三、指定事業之資格條件、審查基準，申請程序、核定機關、管理、查核、廢止及其他相關事項之管理辦法，涉本條例設立目的及整體政策規劃，由中央目的事業主管機關會同主管機關訂定相關辦法，爰訂定第三項。
增訂: 第十條　服務業之指定活動，由中央目的事業主管機關會同主管機關公告之。

經營前項指定活動之事業，得向中央目的事業主管機關申請許可為第二類指定事業。

前項事業之資格條件、審查基準、申請程序、核定機關、管理、查核、廢止及其他相關事項之管理辦法，得由中央目的事業主管機關會同主管機關定之。
說明: 一、考量特區內仍應有與指定事業營運相關之周邊、支援性事業（例如國際醫療機構相關之生技、醫材事業），俾發揮特區產業鏈結功效，明定該類事業為區內一般事業，爰訂定第一項。

二、為符合實務需求，就區內一般事業進駐特區之申請資格條件、程序、管理、查核、廢止、變更及其他相關事項，授權由管理機關擬訂，報請主管機關核定，爰訂定第二項。
增訂: 第十一條　從事與第一類指定事業相關之周邊、支援性事業，得申請許可為區內一般事業。

前項事業之申請資格條件、程序、管理、查核、廢止、變更及其他相關事項之管理辦法，由管理機關擬訂，報請主管機關核定之。
說明: 一、為提供特區便捷之生活服務，特區內除指定事業與區內一般事業外，得進駐輔助性事業，提供餐飲、百貨、旅館或其他銷售或服務等生活服務。考量輔助性事業無適用本條例相關優惠，且其進駐特區受低度管理，爰訂定第一項，輔助性事業僅須向管理機關辦理登記。

二、於特區內提供生活服務之事業，其登記之申請條件、程序、管理、廢止及其他相關事項之管理辦法，授權管理機關定之，爰訂定第二項。
增訂: 第十二條　於特區內設置執行業務、營業或聯絡處所，提供生活服務之輔助性事業，應向管理機關辦理登記。

前項事業，其登記之申請條件、程序、管理、廢止及其他相關事項之辦法，由管理機關定之。
說明: 章名
增訂: 第二章　特區之申設與管理
說明: 一、本條規範既有園區申設為特區之審核程序。另依特區規劃方案，於第一階段指定之特區，於本條例通過後，其申請程序宜予簡化，以符實際，爰訂定第一項。

二、另外，本條第一項第六款選定之區域，有別於第十四條新設區位，主要指經中央或地方政府選定已劃編之工業或產業用地，係指都市計畫劃定之工業區、產業專用區，或非都市編定之丁種建築用地、工業區及特定專用區等，本款適用對象將於第二項之授權辦法中明訂。

三、有關特區核定之申請資格條件、區位、規模、程序、應檢附之書圖文件及其他相關事項之辦法，由主管機關擬訂，報請行政院核定之，爰訂定第二項。

四、既有園區依本條申設為特區者，其區內事業，除依第九條申請核准為第一類指定事業者適用本條例外，依各該原條例核准之既有事業，仍依其原適用之法律規定辦理。

五、既有園區申設為特區後，有擴充面積之需求者，該部分土地納為特區範圍之程序，應先由既有園區之原主管機關依原條例所定擴增程序，使該部土地納為既有園區之一部後，再依本條規定報請行政院核定。
增訂: 第十三條　下列園區之原主管機關得向本條例主管機關申請，由本條例主管機關報請行政院核定設置為特區：

一、依自由貿易港區設置管理條例設立之自由貿易港區。

二、依農業科技園區設置管理條例設立之農業科技園區。

三、依加工出口區設置管理條例設立之加工出口區。

四、依科學工業園區設置管理條例設立之科學工業園區。

五、依產業創新條例管理之產業園區。

六、其他經中央目的事業主管機關、直轄市或縣（市）政府選定已劃編之工業或產業用地。

前項核定之申請資格條件、區位、規模、程序、應檢附之書圖文件及其他相關事項之辦法，由主管機關擬訂，報請行政院核定之。
說明: 一、第一項及第二項明定新設特區之申設主體得為主管機關、中央目的事業主管機關、直轄市或縣（市）政府。

二、新設特區之申請，採行先由申設機關提具可行性規劃報告及營運計畫書，於經行政院核定後始進行後續土地變更等作業程序，以簡化程序、提升特區設置效率，爰於第一項、第二項及第四項予以明定。

三、上開特區之申設機關無論為中央或地方，涉及土地徵收條例施行細則第二條之一之中央目的事業主管機關時，仍應視其特區之事業性質而定。因此，本條例之「中央目的事業主管機關」與土地徵收條例施行細則所定之中央目的事業主管機關並無不同。

四、直轄市或縣（市）政府提出者，其申請範圍跨越不同行政轄區者，應由各該直轄市或縣（市）政府共同提出申請，爰訂定第三項。

五、有關新設特區之申請資格條件、區位、規模、程序、應檢附書圖文件及其他相關事項之辦法，由主管機關會商相關機關定之，爰訂定第五項。
增訂: 第十四條　中央目的事業主管機關、直轄市或縣（市）政府得勘選適當地點，擬具新設特區之可行性規劃報告及營運計畫書，向主管機關提出申請，經初步審核同意後，報請行政院核定特區之設置。

主管機關亦得勘選適當地點，並於完成前項可行性規劃報告及營運計畫書後，報請行政院核定特區之設置。

第一項申請如屬直轄市或縣（市）政府提出者，其申請範圍跨越不同行政轄區者，應由各該直轄市或縣（市）政府共同提出申請。

第一項及第二項特區土地如需辦理土地使用變更者，應於行政院核定特區之設置後，依本條例規定辦理。

新設特區之申請資格條件、區位、規模、程序、應檢附書圖文件及其他相關事項之辦法，由主管機關會商相關機關定之。
說明: 一、特區屬直轄市或縣（市）政府新設者，其新訂都市計畫由該直轄市或縣（市）政府依都市計畫法有關規定辦理。特區屬主管機關、中央目的事業主管機關申請新設者，得依都市計畫法第十二條新訂特定區計畫，並得由申設機關商請中央都市計畫主管機關訂定，以符合實際需求，爰訂定第一項。

二、各級都市計畫委員會審查時程，個別審議時間不得超過九十日，加速辦理，以避免因審議時程過長延宕整體開發進度，爰訂定第二項。
增訂: 第十五條　依第十四條規定設置之特區涉及新訂都市計畫，屬直轄市或縣（市）政府申設者，由直轄市或縣（市）政府依都市計畫法相關規定辦理；屬主管機關、中央目的事業主管機關申設者，得商請中央都市計畫主管機關擬訂特區之特定區計畫。

特區都市計畫擬定、變更之審議期限，各級都市計畫委員會自受理至完成審議，以不超過九十日為限。
說明: 一、就新設特區之開發，涉及非都市土地使用分區變更者，為簡化申請流程並尊重地方政府權責，爰第一項明定申設機關應向直轄市或縣（市）政府申請並同時副知中央區域計畫主管機關，並於查核基本書圖文件資料後，報請中央區域計畫主管機關辦理許可審議。

二、地方政府應限期完成相關審查，另為使中央區域計畫主管機關，於地方未依限辦理查核時，掌有許可審議權，爰訂定第二項。

三、開發計畫核定後之變更程序，準用第一項、第二項辦理，爰訂定第三項。

四、為排除離島建設條例第七條第三項由縣（市）政府核定之規定，與其他相關程序調整為一致，採中央一級一審，受理機關為中央區域計畫主管機關，爰訂定第四項。

五、就中央逕為審議者，避免因審議時程過長延宕整體開發進度，爰訂定第五項。

六、為縮短審查時程，避免因土地使用限制繁雜、開發審議機關眾多，影響投資時程與意願，爰於第六項明定水土保持計畫程序得與雜項執照或建造執照平行審查，以簡化土地開發之相關程序；至現行水土保持法第十二條第三項規定之水土保持規劃書程序，考量山坡地開發安全於土地規劃階段仍有其必要且簡化該程序實益不大，應予維持，即仍應於區域計畫主管機關審議開發計畫階段辦理。

七、為鬆綁土地管制，量身訂作以符合產業屬性，各特區可自行擬具非都市土地使用管制要點或計畫，經中央區域計畫主管機關核可後因地制宜容許使用及實施管制，爰訂定第七項。
增訂: 第十六條　依第十四條規定設置之特區之開發，涉及非都市土地使用分區變更者，申設機關應依區域計畫法規定擬具開發計畫，檢同有關文件，向直轄市或縣（市）政府申請並同時副知中央區域計畫主管機關。直轄市或縣（市）政府查核基本書圖文件資料後，報請中央區域計畫主管機關辦理許可審議。

直轄市或縣（市）政府受理前項申請後，應於三十日內完成基本資料之查核，未依限辦理者，中央區域計畫主管機關得逕為辦理許可審議。

開發計畫核定後之變更程序，準用前二項辦理。

特區位於離島者，得適用前項規定，不適用離島建設條例第七條第三項由縣（市）政府核定之規定。

中央區域計畫主管機關應於受理後九十日內將審議結果通知申請人。

非都市土地特區開發涉及應實施水土保持之處理及維護者，其水土保持計畫並得與雜項執照或建造執照平行審查。

依第十四條規定設置之特區，其申設機關得於第一項開發計畫中自行擬具非都市土地使用分區管制計畫，經中央區域計畫主管機關審議通過後，實施管制。
說明: 一、既有各類園區申請為特區涉及土地使用變更者，為加速審議程序，都市地區得辦理逕為變更，爰訂定第一項。

二、非都市土地在屬事業同性質、具高度相容性且未增加土地使用強度等條件下，得逕由主管機關擬定土地使用分區管制計畫送內政部核備之簡化機制（例如：事業申設主體改變，但符合前述之規定，得以備查辦理），爰訂定第二項。

三、按既有園區申請為特區，在面積未增加、污染總量未增加之情形下，其區內坵塊整併或分割、配置調整或建物樓地板面積變更及引進產業類別變更屬服務業者，對環境之影響不會有因轉型而有加重之虞，應無再提出環境差異影響分析報告之必要，為加速作業，得經特區主管機關審核同意後，送原環境影響評估審查主管機關備查，以避免延宕開發期程。並參照現行環境影響評估法施行細則第三十七條第一項但書規定：於計畫產能或規模降低、基地內設施局部調整位置、提昇環保設施之處理等級或效率、既有設備提昇產能而污染總量未增加、變更內容對環境品質維護有利者、屬環境監測計畫者或其他經主管機關認定者，其環境影響評估變更得以檢附變更內容對照表方式辦理，爰訂定第三項。

四、依其他法規規定應辦理書件變更者，為簡化審查時程，由既有園區主管機關擬具書件，送請各該法規主管機關備查，爰訂定第四項。
增訂: 第十七條　特區涉及都市計畫變更者，得由申設機關商請都市計畫主管機關依都市計畫法第二十七條規定辦理逕為變更。

依第十三條規定設置之特區，涉及非都市土地變更，屬事業同性質或具高度相容性，且未變更主要公共設施、公用設備或必要性服務設施之服務品質及未增加全區土地使用強度者，申設機關得製作變更內容對照表送請中央區域計畫主管機關備查，不適用區域計畫法第十五條之一第一項第二款及第二項之規定。

依第十三條規定設置之特區，如其變更內容屬依環境影響評估法規定得檢附變更內容對照表，在未增加面積或未超出原核定污染總量，且變更內容符合下列要件之一者，得由申設機關檢附變更說明之相關資料送原環境影響評估審查主管機關備查，不適用環境影響評估法第十六條第一項不得變更原申請內容之規定：

一、區內坵塊整併或分割。

二、區內配置調整或建物樓地板面積變更。

三、引進產業類別變更屬服務業者。

依第十三條規定設置之特區，除前三項外，如涉及其他法規規定應辦理變更者，由原主管機關擬具書件，送請各該法規主管機關備查。
說明: 一、新設特區，如管理機關取得土地所有權者，且已劃設開闢一定比例之公共設施、或向進駐廠商酌收相關公共設施開闢、維護管理費用，為避免重複課徵，影響投資意願，免捐贈可建築土地、樓地板面積，或收取一定金額、回饋金、開發影響費，得由管理機關，於其依第七條所設置之基金內提撥一定金額，爰訂定第一項。

二、提撥金額比率由主管機關會同中央區域計畫主管機關定之，爰訂定第二項。
增訂: 第十八條　依第十四條規定設置之特區之開發，管理機關以協議價購方式取得私有土地者，於辦理都市計畫變更、非都市土地開發、農業用地變更或山坡地開發時，得視區內外公共設施用地劃設、興建、開闢或維護管理情形，並於第七條所定基金提撥一定比率金額，用於特區周邊相關公共設施之興建、維護或改善及受影響區域環境保護之改善者，免再提供或捐贈可建築土地、樓地板面積、一定金額、回饋金或開發影響費，不適用都市計畫法第二十七條之一第一項、區域計畫法第十五條之三第一項與第四項、農業發展條例第十二條第一項與第二項及森林法第四十八條之一第一項之規定。

前項提撥金額比率，由主管機關會同中央區域計畫主管機關定之。
說明: 一、第一項明定新設特區經行政院核定後，管理機關之相關土地取得方式。

二、參酌產業創新條例第四十二條，第二項明定各該出售公有不動產機關辦理讓售之讓售價格計價標準。
增訂: 第十九條　依第十四條規定設置之特區，其區內不動產屬公有者，管理機關應徵得該不動產管理機關同意後，辦理撥用或由各該出售公有不動產機關逕行讓售，不受土地法第二十五條及地方公產管理法令規定之限制；屬私有者，得由管理機關協議價購、租用、設定地上權或合作開發。

前項公有不動產讓售價格按一般公有財產處分計價標準計算。
說明: 一、特區開發業務涉及事項眾多，基於專業及開發模式彈性考量，並減輕政府負擔，參酌產業創新條例第三十七條第一項規定，管理機關得自行或委託公民營事業辦理特區內土地之申請設置、規劃、開發、處分或管理等業務，爰訂定第一項。

二、為使委託開發作業更具彈性且因應開發需要調整，管理機關為開發特區需要，採委託公民營事業辦理開發作業時，其資金由受託之公民營事業籌措者，得以公開甄選方式為之；其辦理不適用政府採購法或促進民間參與公共建設法之規定。另考量我國已簽署臺紐經濟合作協定，該協定之政府採購章所定適用範圍，包含民間投資興建營運之公共工程案件，如涉及我國締結之條約或協定者，仍應遵循條約或協定之規定，爰訂定第二項。

三、委託開發之公民營事業資格、委託條件、委託業務之範圍、公開甄選之條件、程序、開發契約期程屆期之處理及其他相關事項之辦法，由主管機關定之，俾利委託開發作業進行，爰訂定第三項。
增訂: 第二十條　管理機關得自行或委託公民營事業辦理特區內土地之申請設置、規劃、開發、處分或管理等業務。

前項委託業務，其資金由受託之公民營事業籌措者，得以公開甄選方式為之；其辦理不適用政府採購法或促進民間參與公共建設法之規定，但條約或協定另有規定者，從其規定。

第一項公民營事業之資格、委託條件、委託業務之範圍與前項公開甄選之條件、程序、開發契約期程屆期之處理及其他相關事項之辦法，由主管機關定之。
說明: 一、特區內若有包括築堤填海造地之土地時，考量其築堤填海造地對公共安全及海域生態環境之衝擊，應特別加強其施工管理，爰參酌產業創新條例第三十八條規定，於第一項明定所欲開發之特區屬築堤填海造地者，應提具造地施工管理計畫，並於繳交審查費後，送請主管機關審查核定。另為確保依造地施工管理計畫執行，申請人應繳交開發保證金及與主管機關簽訂開發契約後，始得施工，既有園區申請為特區者亦同。

二、造地施工管理計畫之書件內容、申請程序、開發保證金、取得土地權屬及其他相關事項之辦法等事項，授權由主管機關訂定辦法，爰訂定第二項。
增訂: 第二十一條　特區內土地涉築堤填海造地者，於造地施工前，管理機關應提具造地施工管理計畫及繳交審查費後，報主管機關審查核定，並繳交開發保證金及與主管機關簽訂開發契約後，始得施工。

前項造地施工管理計畫之書件內容、申請程序、開發保證金、取得土地權屬及其他相關事項之辦法，由主管機關定之。
說明: 一、新設特區之土地，仍維持原有產業使用者，其所有權人應按一定比率負擔開發建設費用，爰訂定第一項。

二、第二項明定開發建設費用及負擔比率，由申設機關審定。
增訂: 第二十二條　依第十四條規定設置之特區，該區內土地仍供原有產業使用者，其所有權人應按一定比率，負擔特區開發建設費用。

特區開發建設費用及負擔比率，由申設機關審定。
說明: 一、第一項明定新設特區之管理機關就區內土地、建築物及設施之利用方式。

二、新設特區內土地、建築物或設施為私有者，經管理機關核准後得為處分，爰訂定第二項。

三、第三項明定管理機關以價購方式取得不動產之辦理方式。

四、既有園區申設為特區者，其區內土地、建築物及設施之利用方式，依該園區原有法令辦理，爰訂定第四項。

五、特區內土地、建築物與設施之使用、收益、管理及處分之程序、條件及相關事項之辦法，由管理機關定之，爰訂定第五項。

六、特區內土地或建築物，多為廠商為進行商業活動或產業利用而租用，因事涉整體產業發展及區內事務之特殊性，與一般私人間土地或建築物之租賃關係有所不同，倘一體適用土地法及民法有關租金及擔保金、租用建築房屋收回期間限制、遲付租金及地租終止或塗銷地上權登記之限制規定，易造成園區內土地及廠房閒置，無法有效運用園區內土地，爰參酌產業創新條例第四十五條第二項規定，於第六項明文排除土地法相關規定之限制。
增訂: 第二十三條　依第十四條規定設置之特區，其區內土地、建築物及設施，管理機關得依相關規定使用、收益及管理，並得出租或設定地上權予區內營業之事業使用，不受土地法第二十五條、國有財產法第二十八條、第六十六條及地方公產管理法令之限制。出租予區內指定事業者，其租金得予優惠；其租金優惠之辦法，由主管機關定之。

前項土地、建築物或設施為私有者，經管理機關核准後得辦理處分。

管理機關價購取得之不動產，得由主管機關審定價格後辦理出售，不受土地法第二十五條、國有財產法第二十八條及地方公產管理法令之限制。

依第十三條規定設置之特區，其土地、建築物與設施之使用、收益、管理及處分，按該園區原有法令規定辦理。

第一項及第三項土地、建築物與設施之使用、收益、管理、土地租用、費用計收、設定地上權與出售之程序、條件及相關事項之辦法，由管理機關定之。

第一項出租之租金及擔保金之計算，不受土地法第九十七條、第九十九條第一項及第一百零五條規定之限制；其終止租約或收回，不受民法第四百四十條第二項、第三項及土地法第一百條、第一百零三條規定之限制；以設定地上權方式辦理者，不受民法第八百三十六條第一項撤銷地上權須積欠地租達二年總額規定之限制。
說明: 一、廠房之興建及出租方式，包括區內事業自行興建、管理機關自行興建出租、公民營事業投資申請核准興建出租等，爰訂定第一項。

二、另特區有以營運機構作為開發營運單位者，如目前自由貿易港區之臺灣港務股份有限公司及桃園國際機場股份有限公司亦得自行興建出租。

三、第二項明定管理機關自行興建之廠房，排除國有財產法、預算法等其他法規限制。

四、公民營事業投資興建之申請核准興建程序、審查、出租及收回辦法，授權主管機關定之，爰訂定第三項。
增訂: 第二十四條　依第十四條規定設置之特區，其區內廠房之興建及出租，得依下列方式辦理：

一、由區內事業自行興建。

二、由管理機關自行興建出租。

三、由公民營事業投資申請核准興建出租。

前項第二款由管理機關興建出租者，其出租及收益辦法，由主管機關定之，不受國有財產法第七條、第二十八條及第六十六條、預算法第二十五條、第二十六條及第八十六條規定之限制。

第一項第三款公民營事業投資申請核准興建程序、審查、出租及收回辦法，由主管機關定之。
說明: 一、第一項明定開放民間投資興建出租員工宿舍之規定。

二、另特區有以營運機構作為開發營運單位者，如目前自由貿易港區之臺灣港務股份有限公司及桃園國際機場股份有限公司亦得自行興建出租。

三、為放寬員工宿舍租金標準，賦予較大彈性，爰訂定第二項。

四、開放民間事業投資興建員工宿舍之申請核准興建程序、審查、出租及收回管理辦法，授權主管機關定之，爰訂定第三項。
增訂: 第二十五條　依第十四條規定設置之特區，其區內之員工宿舍，得由區內事業請准自建或由管理機關興建出租；必要時，得開放民間事業投資興建出租。

前項員工宿舍以租與區內從業人員為限；其租金標準，由投資興建人擬定，報請管理機關核定，不受土地法第九十四條及第九十七條規定之限制。

第一項開放民間事業投資興建員工宿舍之申請核准興建程序、審查、出租、收回及管理辦法，由主管機關定之。
說明: 一、為防止開發特區時，發生土地投機情事，增加土地取得之困難，爰參酌產業創新條例第四十一條規定，於第一項明定依第十四條規定設置之特區於核定設置後進行開發前，由當地之直轄市或縣（市）政府公告停止區內土地及建築物所有權之移轉，並停止受理建築之申請；另為避免過度限制人民權益，並明定限制期限不得超過二年。若已領有建造執照與雜項執照者，則應經管理機關同意後，始得興建。

二、因繼承、強制執行、徵收、法院判決或其他非因法律行為所為之移轉，係屬非因法律行為而發生之不動產物權移轉，承受人於登記前已取得不動產物權，爰於第二項明定不受第一項所定之移轉限制。

三、參照產業創新條例施行細則第十四條規定，於第三項明定直轄市或縣（市）政府依第一項規定，公告停止土地及建築物所有權之移轉，應將特區地籍圖及土地清冊送當地地政機關，囑託於土地及建築物登記簿內配合註記公告停止移轉事宜。
增訂: 第二十六條　依第十四條規定設置之特區於核定設置後進行開發前，由直轄市或縣（市）政府公告停止土地及建築物所有權之移轉，並停止受理建築之申請；其公告停止之期限，不得逾二年；已領有建造執照與雜項執照者，應經管理機關同意後，始得興建。

前項所定公告停止土地及建築物所有權之移轉，不包括因繼承、強制執行、徵收或法院判決或其他非因法律行為所為之移轉。

直轄市或縣（市）政府依第一項規定，公告停止土地及建築物所有權之移轉，應將特區地籍圖及土地清冊送當地地政機關，囑託於土地及建築物登記簿內註記公告日期、文號、限制所有權移轉及停止受理建築申請之期限。
說明: 一、為確保特區內私有土地、建築物或設施轉讓給其他廠商時，仍符合特區發展目標及引進產業內容，爰於第一項訂定區內私有土地、建築物或設施之轉讓，應經管理機關核准。

二、為促使區內土地、建築物或設施活化利用，避免廠商惡意囤地或哄抬價格情形發生，爰於第二項明定特區內土地、建築物或設施未依本條例規定使用，管理機關得照價收買，或依該所有權人原取得價格購回。

三、有關特區內私有土地之管理處分等相關事項，授權由主管機關另訂辦法，爰訂定第三項。
增訂: 第二十七條　依第十四條規定設置之特區，其區內私有土地、建築物或設施之轉售、轉租、設定地上權，或以其他方式供他人使用，應經管理機關核准。

前項土地、建築物或設施未依本條例規定使用，管理機關得照價收買，或依該所有權人原取得價格購回。

前二項轉售、轉租、設定地上權或以其他方式供他人使用申請、照價收買價格與程序、核准條件及其他相關事項之辦法，由主管機關定之。