Геномный полиморфизм штаммов Mycobacterium avium subsp. Hominissuis

2014, Т. 4, № 1

Материалы научно-практической конференции «От эпидемиологии к диагностике актуальных инфекций...»

сии генов. Полученные плазмиды были трансформированы в штаммы L. monocytogenes EGDeAinlA и EGDeAinlB с делециями соотвествующих хромосомных генов. Изогенные рекомбинантные штаммы были использованы для инфекции эпителиальных клеток человека HEK293. Разработанная система позволяет оценить различия в эффективности инвазии, связанные с вариантами в последовательности бактериальных факторов патогенности InlA и InlB.

ГЕНОМНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM AVIUM SUBSP. HOMINISSUIS

Д.А. Старкова1, А.А. Вязовая1, И.В. Мокроусов1, Т.Ф. Оттен2, Б.И. Вишневский2, О.В. Нарвская1

1ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

2ФГБУСанкт-Петербургский НИИфтизиопульмонологии МЗ РФ

Нетуберкулезные микобактерии вида Mycobacterium avium — типичные обитатели окружающей среды. M. avium subsp. hominissuis (MAH) способны вызывать микобактериоз у человека. За последние десять лет в Санкт-Петербурге и Ленинградской области наблюдается рост числа случаев микобактериоза легких у иммунокомпетентных лиц и диссеминиро-ванных форм у ВИЧ-инфицированных (Оттен Т.Ф., 2005).

Целью исследования явилось изучение геномного полиморфизма клинических изолятов MAH с использованием VNTR- и IS1245-RFLP-типирования.

Изучены 90 штаммов M. avium, выделенных в 2008— 2011 гг. от жителей Санкт-Петербурга и Ленинградской области. Аллельный полиморфизм штаммов MAH оценивали методом VNTR-типирования по 8 вариабельным локусам (TR292, X3, 25, 47, 3, 7, 10 и 32) (Thibault et al., 2007). Прямое секвенирование (по Сенгеру) амплифицированного фрагмента ло-куса TR10 осуществляли c использованием анализатора «ABI Prism» 3130. Генотипирование штаммов MAH с помощью метода IS1245-RFLP проводили согласно D. van Soolingen (1998), C. Guerrero (1995).

В результате 8-локусного VNTR-типирования у 90 штаммов МАН было выявлено 17 вариантов профилей VNTR. Индивидуальные восьмизначные числовые профили VNTR имели 9 штаммов. Остальные 81 штамм входили в состав девяти кластеров. Наиболее крупный кластер с числовым профилем 22221128 включал 46 (51,1%) штаммов; кластеры — 24221128 и 2533112'8 — 13 и 7 штаммов соответственно; остальные кластеры содержали 2—4 штамма. Штаммы кластера 2533112'8 отличались от остальных «усеченным» локусом TR10 за счет внутренней делеции 15 п.н. (обозначен 2') (GenBank accession no. JQ918769.1). Наибольшим полиморфизмом отличались локусы TRX3 и TR25 (HGDI 0,624 и 0,392 соответственно).

В результате IS1245-RFLP-типирования выявлен 51 тип профилей. Из них, 47 профилей были индивидуальны, а остальные были представлены кластерами Mav1-Mav4, в состав которых входили от двух до трех штаммов с идентичными профилями IS1245.

Полученные данные согласуются с общепринятым мнением о роли объектов окружающей среды в качестве источника инфицирования (в том числе внутрибольничного) человека MAH.

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ АНОГЕНИТАЛЬНЫМИ (ВЕНЕРИЧЕСКИМИ) БОРОДАВКАМИ В ОТДЕЛЬНЫХ РЕГИОНАХ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

О.Ю. Стебелько1, Н.Ю. Гульцева2, О.В. Гайворонская2, Е.В. Каткявичене3, Ю.С. Егорова4

1 ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

2Санкт-Петербургское ГБУЗ Городской кожно-венерологический диспансер

3ГБУЗ Республики Карелия Республиканский кожно-венерологический диспансер, г. Петрозаводск 4ГБУЗ Ленинградский областной центр, Санкт-Петербург

Важность эпидемиологической оценки заболеваемости аногенитальными бородавками обусловлена внедрением и расширением объемов специфической профилактики данной патологии во многих регионах РФ, что требует развития системы эпидемиологического надзора за папилломавирусной инфекцией в условиях вакцинопрофилактики и оценки эффективности проводимых мероприятий. Этиологическим фактором развития аногенитальных бородавок в 90% случаев является вирус папилломы человека 6 и 11 генотипов. Данная нозологическая форма составляет одну их многих клинических проявлений папилломавирусной инфекции. В связи с изложенным целью исследования явилось изучение особенностей заболеваемости данной патологией на территориях Санкт-Петербурга, Ленинградской области и Республики Карелия.

Анализ данных федерального государственного статистического наблюдения по формам № 9 и № 34 по указанным территориям показал снижение уровней заболеваемости населения аногенитальными бородавками в 2013 г. относительно 2011 г. Показатели инцидентности за рассматриваемый период в Республике Карелия и Санкт-Петербурге, в отличие от Ленинградской области, достоверно превышали среднестатистические показатели по РФ в целом (р < 0,001). Наиболее высокие показатели заболеваемости аногенитальными бородавками в 2011—2013 гг. отмечались в Республике Карелия (средний уровень заболеваемости за 3 года составил 62,5 на 100 000 населения). В Санкт-Петербурге и Ленинградской области средние показатели за 2011—2013 гг. оказались равными 52,7 и 12,9 на 100 000 населения соответственно.

Результаты исследования свидетельствуют о наличии территориальных особенностей развития эпидемического процесса данной патологией на территории РФ и необходимости дальнейшего изучения проблемы.

ОСОБЕННОСТИ НАДЗОРА ЗА ГРИППОМ В РОССИИ И ЗА РУБЕЖОМ

Т.И. Сысоева, Л.С. Карпова

ФГБУ НИИ гриппа МЗ РФ, Санкт-Петербург

На базе Всемирной организации здравоохранения с 1952 г. работает глобальная сеть по надзору за гриппом Она включает 6 сотрудничающих референс-исследовательских центров ВОЗ по гриппу в Атланте и Мемфисе (США), Лондоне (Великобритания), Токио (Япония), Мельбурне (Австралия) и Пекине (Китай) и 141 национальный центр по гриппу в 118 странах.