ПЛАТФОРМЫ ДЛЯ ДВУХРЕЖИМНОГО МИКРОЖИДКОСТНОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА И СПОСОБЫ ДВУХРЕЖИМНОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ТАКИХ ПЛАТФОРМ

1. Платформа для двухрежимного генетического анализа, содержащая:
микрожидкостную платформу;
термоблок для полимеразной цепной реакции и
многоканальный детектор оптического излучения, причем указанная микрожидкостная платформа состоит из двух модулей, включая:
модуль анализа числа копий и
модуль генотипирования,
при этом указанный модуль анализа числа копий пространственно отдален и отделен от указанного модуля генотипирования и каждый из них оптически связан с отдельным каналом многоканального детектора оптического излучения,
указанные модуль анализа числа копий и модуль генотипирования состоят каждый из реакционных сосудов и, кроме того,
указанные модуль для анализа числа копий и модуль для генотипирования находятся каждый в тепловом контакте с указанным термоблоком.
2. Платформа по п.1, в которой указанный многоканальный детектор оптического излучения включает ПЗС-устройство, первый канал которого соединен с реакционными сосудами указанного модуля анализа числа копий, а второй канал соединен с реакционными сосудами указанного модуля генотипирования, причем реакционные сосуды модуля генотипирования пространственно удалены от реакционных сосудов модуля анализа числа копий, что обеспечивает возможность регистрации отдельных оптических сигналов от каждого модуля.
3. Платформа по п.2, в которой указанный первый канал, соединенный с указанным модулем генотипирования, дополнительно содержит электронное управление, выполненное с возможностью регистрации оптического сигнала в отдельный момент времени; а
второй канал, соединенный с указанным модулем анализа числа копий, дополнительно содержит электронное управление, выполненное с возможностью регистрации нескольких дискретных оптических сигналов на протяжении некоторого периода времени.
4. Платформа по п.3, в которой указанный первый канал дополнительно оборудован электронным управлением, выполненным с возможностью регистрации сигналов на нескольких длинах волн.
5. Платформа по п.4, в которой каждая длина волны соответствуют своему особому варианту одного однонуклеотидного полиморфизма.
6. Платформа по п.3, в которой указанный второй канал дополнительно оборудован электронным управлением, обеспечивающим возможность регистрации детектором оптического излучения возвратного оптического сигнала, интенсивность которого варьируют в пределах по меньшей мере двух порядков величины.
7. Платформа по п.1, которая дополнительно содержит химические реагенты, известные как реагенты для ПЦР типа ′TaqMan′.
8. Платформа по п.7, в которой указанные реагенты TaqMan представлены в форме двух композиций, причем одна композиция TaqMan предназначена для использования в модуле генотипирования, а другая композиция TaqMan предназначена для использования в модуле анализа числа копий.
9. Платформа по п.8, в которой композиция реагентов TaqMan, связанная с модулем анализа числа копий, дополнительно содержит контрастное вещество.
10. Платформа по п.6, в которой указанный модуль анализа числа копий дополнительно содержит эталонный аллель, способный реагировать с реагентами TaqMan, что порождает оптический сигнал, позволяющий проводить сравнение с исследуемыми аллелями.
11. Платформа по п.7, в которой указанные реагенты TaqMan включают генетические зонды с цветными репортерными флюорохромами нескольких цветов, по одному оптическому репортеру для каждого варианта SNP.
12. Платформа по п.1, дополнительно содержащая образец ДНК, причем по меньшей мере одна приемная ячейка модуля генотипирования и по меньшей мере одна приемная ячейка модуля анализа числа копий получают части одного и того же образца ДНК.
13. Способ двухрежимного генетического анализа, включающий следующие этапы:
i) размещение реагентов TaqMan в приемных ячейках двух раздельных модулей анализа, причем указанные два раздельных модуля включают модуль генотипирования и модуль анализа числа копий;
ii) размещение по меньшей мере одного образца ДНК в приемных ячейках двух раздельных модулей анализа, включающих модуль генотипирования и модуль анализа числа копий;
iii) смешивание указанных реагентов TaqMan по меньшей мере с одним образцом ДНК;
iv) повторяющееся выполнение цикла индукции репликации ДНК и образования множества копий, причем указанный цикл включает:
a) нагрев генетического материала в реакционном сосуде для денатурации двойной спирали ДНК в образце;
b) охлаждение генетического материала в реакционном сосуде для гибридизации и репликации ДНК в образце;
c) освещение модуля анализа копий светом высокой интенсивности для стимуляции флюоресценции в реакционных сосудах модуля;
d) регистрацию возвратного оптического сигнала из модуля анализа числа копий;
e) определение, является ли последний выполненный цикл конечным циклом заданной последовательности температурных циклов;
v) освещение модуля генотипирования светом высокой интенсивности, что вызывает флюоресценцию в реакционных ячейках модуля; и
vi) регистрацию пространственно распределенного оптического сигнала от модуля генотипирования.
14. Способ по п.13, в котором при указанном размещении химических реагентов TaqMan дополнительно выполняют загрузку реагентов TaqMan в приемные ячейки модуля анализа числа копий; и загрузку других реагентов TaqMan в приемные ячейки модуля генотипирования.
15. Способ по п.14, в котором при указанной загрузке в приемные ячейки модуля анализа числа копий дополнительно снабжают композицию TaqMan добавкой для повышения контрастности.
16. Способ по п.13, в котором при указанном размещении по меньшей мере одного образца ДНК дополнительно размещают эталонный олигонуклеотид по меньшей мере в одной приемной ячейке модуля анализа числа копий.
17. Способ по п.13, в котором при указанной регистрации возвратного оптического сигнала из модуля анализа числа копий дополнительно регистрируют сигналы в ходе выполнения последовательности температурных циклов с построением графика интенсивности возвратного сигнала в зависимости от выполненной последовательности температурных циклов, который может служить основанием для определения числа копий.
18. Способ по п.13, в котором при указанной регистрации возвратного оптического сигнала из модуля генотипирования дополнительно регистрируют и сравнивают с пороговым значением оптического сигнала в конце последовательности температурных циклов, что может служить основанием для определения генотипа.
19. Способ по п.17, в котором при указанной регистрации возвратного оптического сигнала из модуля генотипирования дополнительно регистрируют двухцветный сигнал, что позволяет выполнить определение гетерозиготы, гомозиготы, основных и минорных аллелей.
20. Способ по п.13, в котором при указанном размещении по меньшей мере одного образца ДНК дополнительно размещают ДНК из одного организма по меньшей мере в одну приемную ячейку модуля генотипирования и по меньшей мере в одну приемную ячейку модуля анализа числа копий.