БЕНЗИМИДАЗОЛЫ, ПРИМЕНИМЫЕ В КАЧЕСТВЕ ИНГИБИТОРОВ ПРОТЕИНКИНАЗ
BENZIMIDAZOLES USED AS PROTEIN KINASE INHIBITORS

Область техники, к которой относится изобретение
Данное изобретение относится к соединениям, которые являются ингибиторами протеинкиназы, композициям, содержащим такие соединения, способам получения таких соединений и способам применения. Конкретнее, соединения являются ингибиторами FLT-3, PDK1 и Aurora киназ, и являются применимыми для лечения болезненных состояний, таких как рак, которые облегчаются данными ингибиторами киназы.
Уровень техники
Белки Aurora - это семейство трех в высокой степени родственных серин/треонин киназ (названных Aurora-A, -B и -C), которые являются существенными для развития в митотической фазе клеточного цикла. В частности, Aurora-A играет решающую роль в мейозе центросомы и сегрегации, образовании митотического веретена и правильной сегрегации хромосом. Aurora-B является хромосомным белком-пассажиром, который играет центральную роль в регулировании расположения хромосом на метафазной пластинке, контролировании сборки веретена и для правильного завершения цитокинеза.
Сверхэкспрессию Aurora-A, -B и -C наблюдали в ряду раковых заболеваний человека, включающих колоректальный рак, рак яичников, рак желудка и инвазивную аденокарциному протока.
Ряд исследований к настоящему моменту показали, что уменьшение количества или ингибирование Aurora-A или -B в линиях человеческих раковых клеток посредством siРНК, преобладающих отрицательных или нейтрализующих антител прерывает развитие митоза с накоплением клеток с 4н ДНК, а в некоторых случаях после этого следует эндоредупликация и смерть клетки.
FLT-3 играет важную роль в сохранении, росте и развитии гематопоэтических и негематопоэтических клеток [Scheijen B., Griffin J.D., Oncogene, 2002, 21, 3314-3333 и Reilly J.T., British Journal of Hematology, 2002, 116, 744-757]. FLT-3 - рецепторная тирозинкиназа, которая регулирует сохранение стволовой клетки/пулов раннего предшественника, а также развитие зрелых лимфоидных и миелоидных клеток [Lyman S., Jacobsen S., Blood, 1998, 91, 1101-1134].
Показано, что FLT-3 играет роль в многообразии гематопоэтических и негематопоэтических злокачественных новообразованиях. Мутации, которые вызывают лиганд-независимую активацию FLT-3, вовлечены в острый миелобластный лейкоз (ОМЛ), острый лимфоцитарный лейкоз (ОЛЛ), мастоцитоз и желудочно-кишечную стромальную опухоль (GIST). Кроме активирующих мутаций лиганд-зависимая (аутокринная или паракринная) стимуляция сверхэкспрессированного дикого типа FLT-3 также может вносить вклад в злокачественный фенотип [Scheijen B., Griffin J.D., Oncogene, 2002, 21, 3314-3333].
PDK1 (3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа-1) играет ключевую роль в медиировании множества разных клеточных событий посредством фосфорилирования ключевых регуляторных белков, которые играют важные роли, контролируя процессы, такие как клеточная выживаемость, рост, пролиферация и регуляция глюкозы [(Lawlor M.A. et al., J. Cell Sci., 114, p. 2903-2910, 2001), (Lawlor M.A. et al., EMBO J., 21, p. 3728-3738, 2002)]. Множество видов рака человека, включая рак предстательной железы и НМРЛ (немелкоклеточный рак легкого), повышают функцию сигнального пути PDK1, являющуюся следствием ряда различных генетических событий, таких как PTEN мутации или сверхэкспрессия определенных ключевых регуляторных белков [(Graff J.R., Expert Opin. Ther. Targets, 6, p. 103-113, 2002), (Brognard J., et al., Cancer Res., 61, p. 3986-3997, 2001)]. Ингибирование PDK1 как механизм лечения рака был продемонстрирован посредством трансфекции линии клеток PTEN-негативного рака человека (U87MG) антисмысловыми олигонуклеотидами, направленными против PDK1. Конечное уменьшение белковых уровней PDK1 приводит к уменьшению клеточной пролиферации и выживаемости (Flynn P., et al., Curr. Biol., 10, p. 1439-1442, 2000).
Протеинкиназы являются привлекательными и проверенными мишенями для новых терапевтических агентов для лечения ряда заболеваний человека, с примерами, включающими Гливек и Тарцева. Aurora, FLT-3 и PDK1 киназы особенно привлекательны из-за их ассоциации с многочисленными видами человеческого рака и ролей, которые они играют в пролиферации данных раковых клеток. Следовательно, существует необходимость в соединениях, которые ингибируют протеинкиназы.
Сущность изобретения
Данное изобретение представляет соединения и их фармацевтически приемлемые композиции, которые являются применимыми в качестве ингибиторов протеинкиназ, таких как протеинкиназы Aurora (Aurora A, Aurora B, Aurora C), FLT-3 киназа, PDK1 киназа. Данные соединения имеют формулу I:
1
2
или их фармацевтически приемлемые соли, где Q, R и R имеют значения, определенные ниже.
Данные соединения и их фармацевтически приемлемые композиции применимы для лечения или предотвращения многообразия болезней, нарушений или патологических состояний, включая, но, не ограничиваясь, рак и другие пролиферативные нарушения.
Соединения, предоставляемые данным изобретением, также применимы для исследования киназ на биологические и патологические явления; исследования путей внутриклеточной сигнальной трансдукции, опосредованной подобными киназами; и сравнительной оценки новых ингибиторов киназы.
Данное изобретение также представляет способы получения соединений данного изобретения.
Подробное описание изобретения
Настоящее изобретение относится к соединениям формулы I:
или их фармацевтически приемлемым солям, где Q выбирают из группы, состоящей из:
и ;
1
R
1-6
3-8
R означает H, Cалифатическую или Cциклоалифатическую группу, необязательно замещенную 0-4 J;
2
R
R
R
R
R
R
каждый R независимо Z, M, (L)-Z или (X)-M;
Q
Q
Q
Q
Q
Q
Q
каждый J независимо Z, M, (L)-Z или (X)-M;
R
Q
R
Q
1-6
2
2
2
2
2
каждый L, L, X и X независимо: Cалкил, необязательно прерванный до 2 случаев -NR-, -O-, -S-, -CO-, -OC(O)-, -C(O)CO-, -C(O)-, -C(O)NR-, -C(=N-CN), -C(=N-OH), -NRCO-, -NRC(O)O-, -SONR-, -NRSO-, -NRC(O)NR-, -OC(O)NR-, -NRSONR-, -SO- или -SO-; где
R
LR
каждый L независимо и необязательно замещен 0-2 J;
Q
LQ
каждый L независимо и необязательно замещен 0-2 J;
R
XR
каждый X независимо и необязательно замещен 0-2 J;
Q
XQ
каждый X независимо и необязательно замещен 0-2 J;
R
Q
1-6
каждый Z и Z независимо: H; Cалифатическая группа, 3-8-членное насыщенное, частично ненасыщенное или полностью ненасыщенное моноциклическое кольцо, имеющее 0-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы; или 8-12-членная насыщенная, частично ненасыщенная или полностью ненасыщенная бициклическая кольцевая система, имеющая 0-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы; где
R
ZR
каждый Z независимо и необязательно замещен 0-4 J;
Q
ZQ
каждый Z независимо и необязательно замещен 0-4 J;
R
Q
3
2
2
каждый M и M независимо: галоген, CN, CF, NO, OR, SR или N(R);
R
1-6
1-6
1-3
2
каждый J независимо: Cалифатическая группа, Cгалогеналкил, галоген, OH, Cалкокси, NO или CN;
LR
LQ
XR
XQ
ZR
ZQ
V
M
1-6
1-3
2
каждый J, J, J, J, J и J независимо: V, M, (L)-V, (L)-M, Cгалогеналкил, галоген, OH, Cалкокси, NO или CN;
1-6
6-10
1-6
6-10
3-8
1-6
3-8
1-6
каждый R независимо: H, Cалифатическая группа, Cарил, -(Cалифатический)-(Cарил), Cциклоалифатическая, -C(=O)(Cалифатическая), -C(=O)(Cциклоалифатическая) или -C(=O)O(Cалифатическая) группы; где каждый R независимо и необязательно замещен 0-2 J;
V
M
1-6
2
2
2
2
2
каждый L и L независимо: Cалкил, необязательно прерванный до 2 случаев -NR-, -O-, -S-, -CO-, -OC(O)-, -C(O)CO-, -C(O)-, -C(O)NR-, -C(=N-CN), -C(=N-OH), -NRCO-, -NRC(O)O-, -SONR-, -NRSO-, -NRC(O)NR-, -OC(O)NR-, -NRSONR-, -SO- или -SO-; где
V
LV
каждый L независимо и необязательно замещен 0-2 J;
M
LM
каждый L независимо и необязательно замещен 0-2 J;
1-6
V
каждый V независимо: H; Cалифатическая группа, 3-8-членное насыщенное, частично ненасыщенное или полностью ненасыщенное моноциклическое кольцо, имеющее 0-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы; или 8-12-членная насыщенная, частично ненасыщенная или полностью ненасыщенная бициклическая кольцевая система, имеющая 0-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы; где каждый V независимо и необязательно замещен 0-2 J;
LV
LM
V
3-6
1-6
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
каждый J, J, J и J независимо: R', Cциклоалкил, Cгалогеналкил, галоген, NO, CN, OH, OR', SH, SR', NH, NHR', N(R'), COH, COR', CONH, CONHR', CON(R'), NHCOR', NR'COR', NHCONH, NHCONHR', NHCON(R'), NR'CONH, NR'CONHR', NR'CON(R'), SONH, SONHR', SON(R'), NHSOR' или NR'SOR';
1-6
R' означает незамещенную Cалифатическую группу; или две R' группы вместе с атомом, с которым они связаны, образуют незамещенное 3-8-членное насыщенное или частично насыщенное моноциклическое кольцо, имеющее 0-1 гетероатома, независимо выбранный из азота, кислорода и серы;
3
2
1-6
1-6
2
1-6
1-6
2
каждый M независимо: галоген, CN, CF, NO, OH, O(Cалкил), SH, S(Cалкил), NH, NH(Cалкил) или N(Cалкил).
Один вариант осуществления предлагает то, что
2
когда Q является , то R не является  в 5 или 6 положении бензимидазольного кольца;
2
Q
3
3
3
2
3
1-3
когда Q является  или , а R является H, F, Cl, CH, CF, OCH или OCHCH в 5 или 6 положении бензимидазольного кольца, тогда J не является -O-(Cалифатической) группой;
Q
когда Q является  или , тогда J не является  необязательно замещенным метилом;
1
2
;
когда R и R означают H, тогда Q не является  или
Q
2
когда Q - , тогда J не является Cl, NH,  или NR''-Ar, где
Ar означает необязательно замещенную группу, выбранную из фенила, пиперонила или пиридила; а
1-6
R'' означает H или необязательно замещенную Cалифатическую группу.
th
th
Соединения данного изобретения включают в основном соединения, описанные в контексте данного документа, и, кроме того, иллюстрируются классами, подклассами и образцами, раскрытыми в контексте данного документа. Применяются следующие определения, использованные в контексте данного документа, если не указано особо. Для целей настоящего изобретения химические элементы идентифицируют в соответствии с периодической таблицей элементов, CAS-вариант, Handbook of Chemistry и Physics, 75 Ed. Кроме того, общие принципы органической химии описываются в «Organic Chemistry», Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito: 1999, и «March's Advanced Organic Chemistry», 5 Ed., Ed.: Smith M.B. and March J., John Wiley & Sons, New York: 2001, полное содержание которых включается в настоящий документ путем ссылки.
Как описано в контексте данного документа, специфический числовой диапазон атомов включает любое целое число, находящееся в нем. Например, группа, имеющая от 1-4 атомов, могла бы иметь 1, 2, 3 или 4 атома.
Как описано в контексте данного документа, нумерация бензимидазольного кольца показана ниже.
Как описано в контексте данного документа, соединения изобретения необязательно могут быть замещены одним или более заместителями, такими, которые в основном иллюстрируются выше, или, примерами которых являются конкретные классы, подклассы и образцы изобретения. Следует принять во внимание, что фразу «необязательно замещенный» применяют взаимозаменяемо с фразой «замещенный или незамещенный». В общем, понятие «замещенный», с предшествующим ли понятием «необязательно» или нет, относится к замещению водородных радикалов в данной структуре радикалом конкретного заместителя. Если не указано особо, необязательно замещенная группа может иметь заместитель при каждом замещаемом положении группы, и когда более одного положения в той или иной структуре могут быть замещены более чем одним заместителем, выбранным из конкретной группы, то заместители в каждом положении могут быть или одинаковыми или разными. Комбинации заместителей, рассматриваемых данным изобретением, являются предпочтительно комбинациями, которые приводят к образованию устойчивых или химически возможных соединений.
Понятие «устойчивый», использованное в контексте данного документа, относится к соединениям, которые существенно не изменяются в условиях, обеспечивающих их получение, детекцию и предпочтительно их выделение, очистку и применение для одной или нескольких целей, раскрытых в контексте данного документа. В некоторых вариантах осуществления устойчивое соединение или химически возможное соединение - это соединение, которое существенно не изменяется при хранении при температуре 40°C или менее, в отсутствии влаги или других химически реакционно-способных условий, в течение, по крайней мере, недели.
н
втор
н
трет
Понятие «алифатический» или «алифатическая группа», использованное в контексте данного документа, означает нормальную (т.е., неразветвленную) или разветвленную, замещенную или незамещенную углеводородную цепь, которая является полностью насыщенной или содержит одно или более ненасыщенных звеньев, которая имеет единственную точку присоединения к остальной части молекулы. Если не оговорено иное, алифатические группы содержат 1-20 алифатических атомов углерода. В некоторых вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-10 алифатических атомов углерода. В других вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-8 алифатических атомов углерода. В еще одних вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-6 алифатических атомов углерода и в еще одних вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-4 алифатических атомов углерода. Подходящие алифатические группы включают, но не ограничиваются, линейные или разветвленные, замещенные или незамещенные алкильные, алкенильные или алкинильные группы. Конкретные примеры включают, но не ограничиваются, метил, этил, изопропил, -пропил, -бутил, винил, -бутенил, этинил и -бутил.
3
8
8
12
Понятие «циклоалифатический» (или «карбоцикл» или «карбоциклил» или «циклоалкил») относится к моноциклическому C-C углеводороду или бициклическому C-C углеводороду, который является полностью насыщенным или содержит одно или более ненасыщенных звеньев, но не является ароматическим, который имеет единственную точку присоединения к остальной части молекулы, причем любое отдельное кольцо в указанной бициклической кольцевой системе имеет 3-7 членов. Подходящие циклоалифатические группы включают, но не ограничиваются, циклоалкильные и циклоалкенильные группы. Конкретные примеры включают, но не ограничиваются, циклогексил, циклопропенил и циклобутил. В некоторых вариантах осуществления упомянутая циклоалифатическая группа может быть «мостиковой».
«Мостиковое» кольцо состоит из кольца, содержащего дополнительную алкильную цепь, причем каждый конец упомянутой цепи связан с кольцевым членом кольца, при условии, что оба конца цепи не связаны с одним и тем же кольцевым членом. Упомянутая алкильная цепь необязательно может быть прервана гетероатомом, выбранным из O, N и S. Примеры мостиковых циклоалифатических групп включают, но не ограничиваются, бицикло[3,3,2]декан, бицикло[3,1,1]гептан и бицикло[3,2,2]нонан.
Понятие «гетероцикл», «гетероциклил», «гетероциклоалифатический» или «гетероциклический», использованное в контексте данного документа, означает неароматические, моноциклические, бициклические или трициклические кольцевые системы, в которых один или более кольцевых членов являются независимо выбранным гетероатомом. В некоторых вариантах осуществления «гетероцикл», «гетероциклил», «гетероциклоалифатическая» или «гетероциклическая» группа имеет от трех до четырнадцати кольцевых членов, из которых один или более кольцевых членов является гетероатомом, независимо выбранным из кислорода, серы, азота или фосфора, а каждое кольцо в системе содержит от 3 до 7 кольцевых членов. В некоторых вариантах осуществления упомянутое кольцо может быть мостиковым. Примеры мостиковых гетероциклов включают, но не ограничиваются, 7-аза-бицикло[2,2,1]гептан и 3-аза-бицикло[3,2,2]нонан.
Подходящие гетероциклы включают, но не ограничиваются, 3-1H-бензимидазол-2-он, 3-(1-алкил)бензимидазол-2-он, 2-тетрагидрофуранил, 3-тетрагидрофуранил, 2-тетрагидротиофенил, 3-тетрагидротиофенил, 2-морфолиновую, 3-морфолиновую, 4-морфолиновую, 2-тиоморфолиновую, 3-тиоморфолиновую, 4-тиоморфолиновую, 1-пирролидинил, 2-пирролидинил, 3-пирролидинил, 1-тетрагидропиперазинил, 2-тетрагидропиперазинил, 3-тетрагидропиперазинил, 1-пиразолинил, 3-пиразолинил, 4-пиразолинил, 5-пиразолинил, 1-пиперидинил, 2-пиперидинил, 3-пиперидинил, 4-пиперидинил, 2-тиазолидинил, 3-тиазолидинил, 4-тиазолидинил, 1-имидазолидинил, 2-имидазолидинил, 4-имидазолидинил, 5-имидазолидинил, индолинил, тетрагидрохинолинил, тетрагидроизохинолинил, бензотиолан, бензодитиан и 1,3-дигидроимидазол-2-он.
+
Понятие «гетероатом» означает один или более кислород, серу, азот, фосфор или кремний (включая любую окисленную форму азота, серы, фосфора или кремния; четвертичную форму любого азотистого основания или замещаемого азота гетероциклического кольца, например, N (как в 3,4-дигидро-2H-пирролиле), NH (как в пирролидиниле) или NR (как в N-замещенном пирролидиниле)).
Понятие «ненасыщенный», использованное в контексте данного документа, означает, что молекула имеет одно или более ненасыщенных звеньев.
Понятие «алкокси» или «тиоалкил», использованное в контексте данного документа, относится к алкильной группе, как предварительно определено, присоединенной к главной углеродной цепи через атом кислорода («алкокси») или серы («тиоалкил»).
Понятия «галогеналкил», «галогеналкенил» и «галогеналкокси» означают алкил, алкенил или алкокси, в зависимости от конкретного случая, замещенные одним или более атомами галогена. Понятие «галоген» означает F, Cl, Br или I.
Понятие «арил», используемое отдельно или как часть большего фрагмента, как в «аралкиле», «аралкокси» или «арилоксиалкиле», относится к моноциклической, бициклической и трициклической кольцевым системам, имеющим всего от пяти до четырнадцати кольцевых членов, из которых, по крайней мере, одно кольцо в системе является ароматическим и при этом каждое кольцо в системе содержит от 3 до 7 кольцевых членов. Понятие «арил» может использоваться взаимозаменяемо с понятием «арильное кольцо».
Понятие «гетероарил», используемое отдельно или как часть большего фрагмента, как в «гетероаралкиле» или «гетероарилалкокси», относится к моноциклической, бициклической и трициклической кольцевым системам, имеющим всего от пяти до четырнадцати кольцевых членов, из которых, по крайней мере, одно кольцо в системе является ароматическим, по крайней мере, одно кольцо в системе содержит один или более гетероатомов и при этом каждое кольцо в системе содержит от 3 до 7 кольцевых членов. Понятие «гетероарил» может использоваться взаимозаменяемо с понятием «гетероарильное кольцо» или с понятием «гетероароматический». Подходящие гетероарильные кольца включают, но не ограничиваются, 2-фуранил, 3-фуранил, N-имидазолил, 2-имидазолил, 4-имидазолил, 5-имидазолил, бензимидазолил, 3-изоксазолил, 4-изоксазолил, 5-изоксазолил, 2-оксазолил, 4-оксазолил, 5-оксазолил, N-пирролил, 2-пирролил, 3-пирролил, 2-пиридил, 3-пиридил, 4-пиридил, 2-пиримидинил, 4-пиримидинил, 5-пиримидинил, пиридазинил (например, 3-пиридазинил), 2-тиазолил, 4-тиазолил, 5-тиазолил, тетразолил (например, 5-тетразолил), триазолил (например, 2-триазолил и 5-триазолил), 2-тиенил, 3-тиенил, бензофурил, бензотиофенил, индолил (например, 2-индолил), пиразолил (например, 2-пиразолил), изотиазолил, 1,2,3-оксадиазолил, 1,2,5-оксадиазолил, 1,2,4-оксадиазолил, 1,2,3-триазолил, 1,2,3-тиадиазолил, 1,3,4-тиадиазолил, 1,2,5-тиадиазолил, пуринил, пиразинил, 1,3,5-триазинил, хинолинил (например, 2-хинолинил, 3-хинолинил, 4-хинолинил) и изохинолинил (например, 1-изохинолинил, 3-изохинолинил или 4-изохинолинил).
2
1-2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
0-2
1-6
2
Арильная (включая аралкил, аралкокси, арилоксиалкил и тому подобное) или гетероарильная (включая гетероаралкил и гетероарилалкокси и тому подобное) группа может содержать один или более заместителей и, таким образом, может быть «необязательно замещенной». Если выше и в контексте данного документа не оговорено иное, то подходящие заместители на ненасыщенном атоме углерода арильной или гетероарильной группы обычно выбираются из галогена; -R°; -OR°; -SR°; фенила (Ph), необязательно замещенного R°; -O(Ph), необязательно замещенного R°; -(CH)(Ph), необязательно замещенного R°; -CH=CH(Ph), необязательно замещенного R°; 5-6-членного арильного или гетероарильного кольца, необязательно замещенного R°; -NO; -CN; -N(R°); -NR°C(O)R°; -NR°C(S)R°; -NR°C(O)N(R°); NR°C(S)N(R°); -NR°COR°; -NR°NR°C(O)R°; -NR°NR°C(O)N(R°); -NR°NR°COR°; -C(O)C(O)R°; -C(O)CHC(O)R°; -COR°; -C(O)R°; -C(S)R°; -C(O)N(R°); -C(S)N(R°); -OC(O)N(R°); -OC(O)R°; -C(O)N(OR°)R°; -C(NOR°)R°; -S(O)R°; -S(O)R°; -SON(R°); -S(O)R°; -NR°SON(R°); -NR°SOR°; -N(OR°)R°; -C(=NH)-N(R°); -P(O)R°; -PO(R°); -OPO(R°); или -(CH)NHC(O)R°; причем каждый независимый случай R° выбирается из водорода, необязательно замещенной Cалифатической группы, незамещенного 5-6-членного гетероарильного или гетероциклического кольца, фенила, -O(Ph) или -CH(Ph) или, вопреки определению, данному выше, два независимых случая R° на одном и том же заместителе или на разных заместителях, взятые вместе с атомом(амии), к которому присоединяется каждая R° группа, образуют необязательно замещенное 3-12-членное насыщенное, частично ненасыщенное или полностью ненасыщенное моноциклическое или бициклическое кольцо, имеющее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.
2
1-4
1-4
2
1-4
1-4
2
2
2
1-4
1-4
1-4
1-4
Необязательные заместители на алифатической группе R° выбираются из NH, NH(Cалифатической), N(Cалифатической), галогена, Cалифатической, OH, O(Cалифатической), NO, CN, COH, CO(Cалифатической), O(галоCалифатической) или галоCалифатической групп, причем каждая из предшествующих Cалифатических групп R° является незамещенной.
*
*
*
*
*
2
2
1-6
Алифатическая группа или неароматическое гетероциклическое кольцо может содержать один или более заместителей и таким образом могут быть «необязательно замещенными». Если выше и в контексте данного документа не оговорено иное, то подходящие заместители на насыщенном атоме углерода алифатической или гетероалифатической группы, или неароматического гетероциклического кольца выбираются из заместителей, перечисленных выше для ненасыщенного атома углерода арильной или гетероарильной группы, и дополнительно включают следующие: =O, =S, =NNHR, =NN(R), =NNHC(O)R, =NNHCO(алкил) или =NR, причем каждый R независимо выбирается из водорода или необязательно замещенной Cалифатической группы.
+
+
+
+
+
+
+
+
+1
+
+
+
+
+
+
2
2
2
2
2
2
2
2
2
1-6
2
2
1-2
Если выше и в контексте данного документа не оговорено иное, то необязательные заместители на азоте неароматического гетероциклического кольца в основном выбираются из -R, -N(R), -C(O)R, -COR, -C(O)C(O)R, -C(O)CHC(O)R, -SOR, -SON(R), -C(=S)N(R), -C(=NH)-N(R) или -NRSOR; где R - водород, необязательно замещенная Cалифатическая группа, необязательно замещенный фенил, необязательно замещенный -O(Ph), необязательно замещенный -CH(Ph), необязательно замещенный -(CH)(Ph), необязательно замещенный -CH=CH(Ph) или незамещенное 5-6-членное гетероарильное или гетероциклическое кольцо, имеющее от одного до четырех гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота или серы, или, вопреки определению, данному выше, два независимых случая R на одном и том же заместителе или на разных заместителях, взятые вместе с атомом(амии), к которому присоединяется каждая R группа, образуют необязательно замещенное 3-12-членное насыщенное, частично ненасыщенное или полностью ненасыщенное моноциклическое или бициклическое кольцо, имеющее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.
+
+
2
1-4
1-4
2
1-4
1-4
2
2
2
1-4
1-4
1-4
1-4
Необязательные заместители на алифатической группе или фенильном кольце R выбираются из -NH, -NH(Cалифатической), -N(Cалифатической), галогена, Cалифатической, -OH, -O(Cалифатической), -NO, -CN, -COH, -CO(Cалифатической), -O(галоCалифатической) или гало(Cалифатической) групп, причем каждая из предшествующих Cалифатических групп R является незамещенной.
Понятие «алкилиденовая цепь» относится к линейной или разветвленной углеродной цепи, которая может быть полностью насыщена или имеет одно или более ненасыщенных звеньев и имеет две точки присоединения к остальной части молекулы.
+
Понятие «защитная группа», использованное в контексте данного документа, относится к агенту, имеющему обыкновение временно блокировать одно или более желаемых реакционно-способных мест в многофункциональном соединении. В определенных вариантах осуществления защитная группа имеет одну или более, или предпочтительно все следующие характеристики: a) реагирует селективно, с хорошим выходом, давая защищенный субстрат, который является устойчивым к реакциям, происходящим в одном или более других реакционно-способных мест; и b) селективно удаляется с хорошим выходом посредством реагентов, которые не атакуют регенерированную функциональную группу. Примерные защитные группы подробно описаны в Greene T.W., Wuts P.G. «Protective Groups in Organic Synthesis», 3 Ed., John Wiley & Sons, New York: 1999, полное содержание которой включается в настоящий документ путем ссылки. Понятие «защитная группа азота», использованное в контексте данного документа, относится к агенту, имеющему обыкновение временно блокировать одно или более желаемых азотных реакционно-способных мест в многофункциональном соединении. Предпочтительные защитные группы азота также обладают характеристиками, приведенными выше, и определенные примерные защитные группы азота также подробно описаны в Главе 7 в Greene T.W., Wuts P.G. «Protective Groups in Organic Synthesis», 3 Ed., John Wiley & Sons, New York: 1999, полное содержание которой включается в настоящий документ путем ссылки. Как подробно описано выше, в некоторых вариантах осуществления два независимых случая R° (или R, R, R' или любой другой вариации, подобной определенным в контексте данного документа) берутся вместе с атомом(ами), к которому они присоединяются, чтобы образовать необязательно замещенное 3-12-членное насыщенное, частично ненасыщенное или полностью ненасыщенное моноциклическое или бициклическое кольцо, имеющее 0-4 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.
+
+
+
Примеры колец, которые образуются когда два независимых случая R° (или R, R, R' или любой другой вариации подобной определенным в контексте данного документа) берутся вместе с атомом(ами), к которому они присоединяются, включают, но не ограничиваются, следующие: a) два независимых случая R° (или R, R, R' или любой другой вариации, подобной определенным в контексте данного документа), которые связаны с одним и тем же атомом и берутся вместе с данным атомом, чтобы образовать группу пиперидин-1-ила, пиперазин-1-ила или морфолин-4-ила; и b) два независимых случая R° (или R, R, R' или любой другой вариации, подобной определенным в контексте данного документа), которые связаны с разными атомами и берутся вместе с двумя данными атомами, чтобы образовать кольцо, например, где фенильная группа замещена двумя случаями OR° , причем данные два случая R° берутся вместе с атомами кислорода, к которым они присоединены, чтобы образовать конденсированное 6-членное, кислородсодержащее кольцо: .
+
Следует заметить, что может быть образовано множество других колец, когда два независимых случая R° (или R, R, R' или любой другой вариации, подобной определенным в контексте данного документа) берутся вместе с атомом(ами), к которому присоединяется каждая вариация и, что примеры, подробно описанные выше и в контексте данного документа, не подразумеваются ограниченными.
2
2
2
2
2
2
2
3
2
3
2
3
2
2
В некоторых вариантах осуществления алкильная или алифатическая цепь может быть необязательно прервана другим атомом или группой. Это значит, что метиленовое звено алкильной или алифатической цепи необязательно заменено названным другим атомом или группой. Примеры таких атомов или групп включают, но не ограничиваются, -NR-, -O-, -S-, -CO-, -OC(O)-, -C(O)CO-, -C(O)-, -C(O)NR-, -C(=N-CN), -NRCO-, -NRC(O)O-, -SONR-, -NRSO-, -NRC(O)NR-, -OC(O)NR-, -NRSONR-, -SO- или -SO, причем R определяется в контексте данного документа. Если не указано особо, то необязательные замены образуют химически устойчивое соединение. Необязательные прерывания могут встречаться как внутри цепи, так и на любом конце цепи; т. е. как в точке присоединения, так и/или также на терминальном конце. Две необязательные замены могут также быть смежными друг с другом внутри цепи, при условии, что это приводит к химически устойчивому соединению. Если не указано особо, то если замена или прерывание встречается на терминальном конце, то заменяющий атом связан с атомом H на терминальном конце. Например, если -CHCHCH необязательно прерывалось -O-, то конечное соединение могло бы быть -OCHCH, -CHOCH или -CHCHOH.
Если не оговорено иное, то также имеется в виду, что структуры, описанные в контексте данного документа, включают все изомерные (например, энантиомерные, диастереомерные и геометрические (или конформационные)) формы структуры; например, R и S конфигурации для каждого центра асимметрии, (Z) и (E) изомеры двойной связи и (Z) и (E) конформационные изомеры. Следовательно, отдельные стереохимические изомеры, а также энантиомерные, диастереомерные и геометрические (или конформационные) смеси данных соединений входят в объем данного изобретения.
Если не оговорено иное, то все таутомерные формы соединений изобретения входят в объем данного изобретения.
Если не оговорено иное, то заместитель может свободно вращаться вокруг любых, способных к вращению связей. Например, заместитель, изображенный как , представляет собой также .
13
14
Кроме того, если не оговорено иное, то также имеется в виду, что структуры, описанные в контексте данного документа, включают соединения, которые отличаются только наличием одного или более изотопно обогащенных атомов. Например, соединения, имеющие данные структуры, за исключением замены водорода дейтерием или тритием, или замены углерода C- или C-обогащенным углеродом, входят в объем данного изобретения.
Такие соединения применимы, например, в качестве аналитических средств или образцов в биологических анализах.
Применяют следующие аббревиатуры:
DBU - диазабициклоундекан
DCM - дихлорметан
DIPEA - диизопропилэтиламин
ДМСО - диметилсульфоксид
DMF - диметилформамид
EtOAc - этилацетат
HPLC - высокоэффективная жидкостная хроматография
i-PrOH - изопропиловый спирт
MeCN - ацетонитрил
TEA - триэтиламин
TFA - трифторуксусная кислота
TMP - 2,2,6,6-тетраметилпиперидин
Rt - время удерживания
LCMS - жидкостная хроматография масс-спектрометрия
1
H NMR - ядерный магнитный резонанс
Согласно одному их вариантов осуществления изобретения R' означает H.
В другом варианте осуществления Q означает
или
В некоторых вариантах осуществления Q означает
или
В некоторых вариантах осуществления Q означает
или
В других вариантах осуществления Q означает
или
В еще одних вариантах осуществления Q означает
Q
Q
Q
Q
Q
В некоторых вариантах осуществления J означает (L)-Z или (X)-M.
Q
В некоторых вариантах осуществления данного изобретения Q является монозамещенным J, как показано в формуле II
Q
Q
Q
В некоторых вариантах осуществления J означает (L)-Z.
Q
1-6
2
2
В определенных вариантах осуществления L означает Cалкил, необязательно прерванный до 2 случаев -NR-, -O-, -S-, -C(O)-, -C(O)NR-, -NRCO-, -SONR- или -NRSO-.
Q
1-6
В других вариантах осуществления L означает Cалкил, необязательно прерванный до 2 случаев -NR-, -O- или -S-.
Q
1-6
В некоторых вариантах осуществления L означает Cалкил, необязательно прерванный 1 случаем -NR-. В определенных вариантах осуществления 1 случай -NR- присоединяется непосредственно к кольцу Q.
Q
1-5
1-5
1-6
В некоторых вариантах осуществления L означает -NH-, -NR-, -NH(Cалкил)- или -NR(Cалкил)-; где R означает Cалкил.
LQ
1-6
1-6
В некоторых вариантах осуществления данного изобретения J - независимо галоген, Cалифатическая группа или Cгалоалкил.
Q
1-6
3-10
В другом варианте осуществления данного изобретения Z выбирается из H или необязательно замещенной группы, выбранной из Cалифатической, Cциклоалифатической, фенила, 5-8-членного гетероарила и 5-8-членного гетероциклила.
Q
1-6
В некоторых вариантах осуществления Z означает H или необязательно замещенную Cалифатическую группу.
Q
В других вариантах осуществления Z означает необязательно замещенный фенил.
Q
Q
В еще одних вариантах осуществления Z означает 5-8-членный гетероциклил, содержащий вплоть до 2 гетероатомов, выбранных из группы, состоящей из O, N и S. В некоторых вариантах осуществления Z означает 5-8-членный гетероциклил, содержащий вплоть до 2 атомов азота. В некоторых вариантах осуществления упомянутый гетероциклил - это пиперидин, пиперазин, гомопиперидин или гомопиперазин. В некоторых вариантах осуществления упомянутый гетероциклил - это пиперидин или пиперазин.
Q
Q
Q
В другом варианте осуществления данного изобретения J означает (X)-M.
Q
Q
Q
1-6
2
2
1-6
1-6
В некоторых вариантах осуществления X означает Cалкил, необязательно прерванный до 2 случаев -NR-, -O-, -S-, -C(O)-, -C(O)NR-, -NRCO-, -SONR- или -NRSO-. В некоторых вариантах осуществления X означает Cалкил, необязательно прерванный до 2 случаев -NR-, -O- или -S-. В других вариантах осуществления X означает Cалкил, необязательно прерванный 1 случаем -NR-. В еще других вариантах осуществления 1 случай -NR- присоединяется непосредственно к кольцу Q.
XQ
1-6
1-6
В некоторых вариантах осуществления данного изобретения J означает независимо галоген, Cалифатическую группу или Cгалоалкил.
Q
Q
2
2
В определенных вариантах осуществления M означает OR или N(R). В других вариантах осуществления M означает NH.
Q
Q
Q
Q
Q
Q
Q
В некоторых вариантах осуществления J означает Z или M. В некоторых вариантах осуществления J означает Z. В других вариантах осуществления J означает M.
Q
2
1-3
2
В некоторых вариантах осуществления J означает необязательно замещенную группу, выбранную из N(R), -NR-(Cалкил)-N(R) или -NR-(5-8-членного гетероциклила).
Q
XQ
2
2
2
2
2
2
.
В одном варианте осуществления данного изобретения J означает NH, -NHCHCHNH, -NHCH(J)CHNH или
Q
XQ
2
2
В некоторых вариантах осуществления J означает -NHCH(J)CHNH.
XQ
втор
трет
В некоторых вариантах осуществления J означает H, метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил, -бутил или -бутил.
2
R
R
В другом варианте осуществления R выбирается из Z или M.
R
R
R
1-6
3-6
3-6
1-6
1-6
3-6
3-6
В определенных вариантах осуществления Z означает H или необязательно замещенную группу, выбранную из Cалифатической, Cциклоалифатической и Cгетероциклила. В некоторых вариантах осуществления Z означает H или необязательно замещенную Cалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления Z означает необязательно замещенную группу, выбранную из Cалифатической, Cциклоалифатической и Cгетероциклила.
R
3
2
2
1-3
В некоторых вариантах осуществления M означает галоген, CN, CF, NO, OR или N(R), где R означает H или Cалкил.
Один вариант осуществления данного изобретения можно представить с помощью формулы II-a:
Другой вариант осуществления данного изобретения можно представить с помощью формулы III:
Другой вариант осуществления данного изобретения можно представить с помощью формулы III-a:
2
2
2
R
R
2
R
R
2
R
2
2
1-3
В некоторых вариантах осуществления данного изобретения, по крайней мере, один R не является H. В некоторых вариантах осуществления ни один R не является H. В некоторых вариантах осуществления каждый R независимо Z или M. В некоторых вариантах осуществления обе R группы являются Z или M. В некоторых вариантах осуществления обе R группы являются Z. В других вариантах осуществления R означает Cалкил. В некоторых вариантах осуществления R означает метил.
R
R
1-6
1-6
В некоторых вариантах осуществления Z означает Cалифатическую группу, 3-8-членное насыщенное, частично ненасыщенное или полностью ненасыщенное моноциклическое кольцо, имеющее 0-3 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы; или 8-12-членную насыщенную, частично ненасыщенную или полностью ненасыщенную бициклическую кольцевую систему, имеющую 0-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления Z означает Cалифатическую группу.
Вариации некоторых вариантов осуществления отображены соединениями Таблицы 1.
Характерные соединения данного изобретения предлагаются ниже в Таблице 1.
Примеры соединений формулы I
Таблица
Примеры соединений формулы I
<img file="00000036.tif" he="25" wi="35" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000037.tif" he="24" wi="34" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000038.tif" he="30" wi="43" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000039.tif" he="24" wi="33" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000040.tif" he="29" wi="42" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000041.tif" he="30" wi="48" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000042.tif" he="27" wi="51" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000043.tif" he="34" wi="48" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000044.tif" he="36" wi="42" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000045.tif" he="24" wi="31" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000046.tif" he="26" wi="34" img-content="undefined" img-format="tif" />
<img file="00000047.tif" he="33" wi="48" img-content="undefined" img-format="tif" />
Соединения данного изобретения обычно можно получить способами, известными специалистам в данной области техники, для аналогичных соединений, как проиллюстрировано на схемах ниже.
Q
Q
Схема I представляет способ получения соединений, где Q означает 2,4-пиримидин. NHR' представляет собой J группы, причем J присоединен к пиримидину через атом азота.
Схема I'
Q
Q
Схема I' представляет способ получения соединений, где Q означает 2,4-пиримидин. NH-JJ представляет собой J группы, причем J присоединен к пиримидину через атом азота.
Схема I-a
Схема I-a представляет способ получения соединений, где Q означает
или  и
1
2
Q
R, R и J имеют значения, определенные в контексте данного документа.
Примеры подходящих оснований, которые могут быть применены в способе Схемы I-a, включают, но не ограничиваются, DIPEA, TEA, DBU и TMP.
Примеры подходящих растворителей, которые могут быть применены в способе Схемы I-a, включают, но не ограничиваются, ДМФ, i-PrOH, н-бутанол, т-бутанол, ацетонитрил, ТГФ (тетрагидрофуран) и диоксан.
Схема I-b
Схема I-b представляет способ получения соединений, где Q -  или
1
2
Q
R, R и J имеют значения, определенные в контексте данного документа;
x
2
а -B(OR) представляет собой бороновые эфиры или кислоты, известные специалисту в данной области техники.
Специалисту в данной области техники следует учитывать, что бороновые кислоты и эфиры могут сочетаться с атомом азота бензимидазола посредством ряда известных условий. Обычно условия включают, но не ограничиваются, катализатор, основание и лиганд в подходящем растворителе.
2
2
3
Примеры подходящих катализаторов включают, но не ограничиваются, Pd(OAc) и Pd(dba).
Примеры подходящих растворителей включают, но не ограничиваются, толуол, ксилол и диоксан.
трет
трет
2
3
Примеры подходящих оснований включают, но не ограничиваются, -бутилат натрия,-бутилат калия и CsCO.
Примеры подходящих лигандов включают, но не ограничиваются, BINAP, DPPF, (o-tol)3P и (±) PPF-OMe.
Схема II
2
Схема II представляет способ получения соединений, где R означает арил или гетероарил.
Один вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы I:
1
2
Q
где R, R и J имеют значения, определенные в контексте данного документа;
а кольцо Q означает  или ;
a
включающий взаимодействие соединения формулы :
,
1
2
где R и R имеют значения, определенные в контексте данного документа;
b
с соединением формулы :
где кольцо Q означает  или ;
Q
а J имеет значения, определенные в контексте данного документа;
в подходящих условиях сочетания бороновой кислоты/эфира.
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы I:
1
2
Q
где R, R и J имеют значения, определенные в контексте данного документа;
а кольцо Q означает
или ;
a
включающий взаимодействие соединения формулы :
,
1
2
где R и R имеют значения, определенные в контексте данного документа;
c
с соединением формулы :
Q
где J имеет значения, определенные в контексте данного документа; а
кольцо Q означает
или ;
в подходящих условиях замещения.
c
В некоторых вариантах осуществления галоген в формуле  является хлором.
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы I:
,
1
2
Q
7
где R, R, кольцо Q и J имеют значения, определенные в контексте данного документа; включающий циклизацию соединения формулы :
,
2
где R и кольцо Q имеют значения, определенные в контексте данного документа;
с CN-Br в подходящих условиях циклизации. Примеры условий циклизации включают, но не ограничиваются, перемешивание в MeOH при КТ в течение 30 часов.
7
6
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы , включающий восстановление соединения формулы :
,
2
7
2
где R и кольцо Q имеют значения, определенные в контексте данного документа; в условиях восстановления, известных специалисту в данной области техники для образования соединения формулы . Примеры условий восстановления включают, но не ограничиваются, SnCl/EtOH, Fe/AcOH, In/HCl и Pd/C.
6
5
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы , включающий взаимодействие соединения формулы :
,
2
6
3
2
3
где R имеет значения, определенные в контексте данного документа; с , где кольцо Q имеет значения, определенные в контексте данного документа; в подходящих условиях замещения для образования соединения формулы . Подходящие условия замещения включают, но не ограничиваются, основание и растворитель. Примеры подходящих оснований включают, но не ограничиваются, CsCO и KCO. Подходящие растворители включают, но не ограничиваются, DMF и EtOH.
5
4
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы , включающий снятия защитных групп соединения формулы :
,
5
2
4
в подходящих условиях снятия защитных групп, известных специалисту в данной области техники для образования соединения формулы . Примеры подходящих условий снятия защитных групп включают, но не ограничиваются, применение кислоты (такой как HCl или HSO) в подходящем растворителе (таком как MeOH, EtOH).
4
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы , включающий взаимодействие соединения формулы
2
3
3
4
с HN-C(CH) в подходящих условиях замещения для образования соединения формулы . Подходящие условия замещения включают, но не ограничиваются, подходящее основание, такое как DIPEA, TEA, DBU или TMP, в подходящем растворителе, таком как DMF, диоксан или THF.
3
3
2
X
2
X
2
2
3
2
2
3
4
2
2
3
2
3
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы , включающий сочетание  с R-B(OR), где R имеет значения, определенные в контексте данного документа, а -B(OR) представляет собой бороновые эфиры или кислоты, известные специалисту в данной области техники; в подходящих условиях сочетания Сузуки (бороновая кислота/эфир), известных специалисту в данной области техники для образования соединения формулы . Подходящие условия сочетания Сузуки обычно включают применение катализатора, основания и бороновой кислоты или эфира в подходящем растворителе. Примеры подходящих катализаторов включают, но не ограничиваются, Pd(PPh)Cl, Pd(PPh)и PdCl(dppf). Подходящие основания включают, но не ограничиваются, KCO и NaCO. Подходящие растворители включают, но не ограничиваются, тетрагидрофуран, диоксан, толуол и этанол.
1
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы :
a
включающий взаимодействие соединения формулы :
,
1
2
где R и R имеют значения, определенные в контексте данного документа;
1
с  в подходящих условиях замещения для образования соединения формулы . Подходящие условия замещения включают, но не ограничиваются, подходящее основание, такое как DIPEA, TEA, DBU или TMP, в подходящем растворителе, таком как DMF, диоксан или THF.
2
Другой вариант осуществления представляет способ получения соединения формулы :
1
2
2
Q
включающий нагревание соединения формулы с NH-JJ (J группа, которая содержит реакционно-способную аминогруппу), в подходящих условиях замещения для образования соединения формулы . Подходящие условия замещения включают, но не ограничиваются, нагревание подходящего основания, такого как DIPEA, TEA, DBU или TMP, в подходящем растворителе, таком как DMF, изопропанол, диоксан или THF.
I
Один аспект данного изобретения относится к способу лечения болезненного состояния у пациентов, которое облегчается лечением ингибитором протеинкиназы, который включает введение пациенту, нуждающемуся в подобном лечении, терапевтически эффективного количества соединения формулы .
Способ является, в частности, пригодным для лечения болезненного состояния, которое облегчается применением ингибитора киназы Aurora (Aurora A, Aurora B, Aurora C), FLT-3 или PDK1.
in vitro, in vivo
in vitro
in vitro
Активность соединений в качестве ингибиторов протеинкиназы можно проанализировать  или на линии клеток. Анализы  включают анализы, которые определяют ингибирование либо киназной активности, либо АТФ-азной активности активированной киназы. Альтернативные исследования  производят количественный анализ способности ингибитора связываться с протеинкиназой, и она может быть измерена либо введением радиоактивной метки в ингибитор перед связыванием, выделением комплекса ингибитор/киназа и определением количества связанной радиоактивной метки, либо проведением конкурентного эксперимента, в котором новые ингибиторы инкубируются с киназой, связанной с известными мечеными лигандами.
Другой аспект данного изобретения направлен на способ лечения рака у субъекта, нуждающегося в этом, включающий последовательное или совместное введение соединения данного изобретения или его фармацевтически приемлемой соли и противоракового агента. В некоторых вариантах осуществления указанный противораковый агент выбирается из камптотецина, доксорубицина, идарубицина, цисплатина, таксола, таксотера, винкристина, тарцева, MEK ингибитора, U0126, KSP ингибитора или вориностата.
Ингибиторы протеинкиназы или их фармацевтические соли могут быть получены в виде фармацевтических композиций для введения животным или людям. Данные фармацевтические композиции, которые содержат количество ингибитора протеинкиназы эффективное для лечения или предотвращения Aurora, FLT-3 или PDK1 опосредованного патологического состояния и фармацевтически приемлемый носитель, являются другим вариантом осуществления настоящего изобретения.
Понятие «протеинкиназа-опосредованное патологическое состояние», использованное в контексте данного документа, означает любое заболевание или другое пагубное патологическое состояние, в котором, как известно, играет роль протеинкиназа. Подобные состояния включают, без ограничения, аутоиммунные заболевания, воспалительные заболевания, неврологические и нейродегенеративные заболевания, рак, сердечнососудистые заболевания, аллергию и астму.
Оральный
Кардиальный
Легкого
Желудочно-кишечный
Мочеполовой системы
Печени
Кости
Нервной системы
Гинекологический
Гематологический
Кожи
Щитовидной железы
Надпочечников
Понятие «рак» включает, но не ограничивается, следующие виды рака: эпидермоидный : полости рта, губы, языка, рта, глотки; : саркома (ангиосаркома, фибросаркома, рабдомиосаркома, липосаркома), миксома, рабдомиома, фиброма, липома и тератома; : бронхогенный рак (плоскоклеточный или эпидермоидный, недифференцированный мелкоклеточный, недифференцированный крупноклеточный, аденокарцинома), альвеолярная (бронхиолярная) карцинома, аденома бронха, саркома, лимфома, хондроматозная гамартома, мезотелиома; : пищевода (плоскоклеточная карцинома, рак гортани, аденокарцинома, лейомиосаркома, лимфома), желудка (карцинома, лимфома, лейомиосаркома), поджелудочной железы (аденокарцинома протока, инсулинома, глюкагонома, гастринома, карциноидные опухоли, ВИПома), тонкой кишки или тонкого кишечника (аденокарцинома, лимфома, карциноидные опухоли, саркома Капоши, лейомиома, гемангиома, липома, нейрофиброма, фиброма), толстой кишки или толстого кишечника (аденокарцинома, тубулярная аденома, ворсинчатая аденома, гамартома, лейомиома), толстой кишки, ободочной и прямой кишки, колоректальный, прямой кишки; : почек (аденокарцинома, опухоль Вильмса [аденосаркома почки], лимфома, лейкоз), мочевого пузыря и мочеиспускательного канала (плоскоклеточная карцинома, переходно-клеточная карцинома, аденокарцинома), предстательной железы (аденокарцинома, саркома), яичка (семинома, тератома, эмбриональный рак, тератокарцинома, хориокарцинома, саркома, интерстициальноклеточная карцинома, фиброма, фиброаденома, аденоматоидные опухоли, липома); : гепатома (злокачественная гепатома), холангиокарцинома, гептобластома, ангиосаркома, гепатоцеллюлярная аденома, гемангиома, рак желчных протоков; : остеобластическая саркома (остеосаркома), фибросаркома, злокачестенная фиброзная гистиоцитома, хондросаркома, саркома Юинга, злокачестенная лимфома (ретикулоклеточная саркома), множественная миелома, злокачестенная гигантоклеточная хордома, остеохронфрома (костно-хрящевые экзостозы), доброкачественная хондрома, хондробластома, хондромиксофиброма, остеоид-остеома и гигантоклеточные опухоли; : черепа (остеома, гемангиома, гранулема, ксантома, деформирующий остит), мягких оболочек мозга (менингиома, менингиосаркома, глиоматоз), мозга (астроцитома, медуллобластома, глиома, эпендимома, герминома [пинеалома], мультиформная глиома, олигодендроглиома, шваннома, ретинобластома, врожденные опухоли), спинного мозга (нейрофиброма, менингиома, глиома, саркома); : матки (карцинома эндометрия), шейки матки (карцинома шейки матки, доопухолевая цервикальная дисплазия), яичников (карцинома яичника [серозная цистаденокарцинома, мукоидная цистаденокарцинома, неклассифицированная карцинома], гранулезные тека клеточные опухоли, клеточные опухоли Sertoli-Leydig, дисгерминома, злокачественная тератома), женских наружных половых органов (плоскоклеточная карцинома, внутриэпителиальный рак, аденокарцинома, фибросаркома, меланома), влагалища (светлоклеточный рак, плоскоклеточная карцинома, ботриоидная саркома (эмбриональная рабдомиосаркома) фаллопиевых труб (карцинома), молочной железы; : крови (миелоидный лейкоз [острый и хронический], острый лимфобластный лейкоз, хронический лимфоцитарный лейкоз, миелопролиферативные заболевания, множественная миелома, миелодиспластический синдром), болезнь Ходжкина, неходжкинская лимфома [злокачественная лимфома] волосатоклеточный лейкоз; лимфоидные нарушения; : злокачественная меланома, базальноклеточная карцинома, плоскоклеточная карцинома, саркома Капоши, кератоакантома, диспластическая невоидная опухоль, липома, ангиома, дерматофиброма, келоиды, псориаз, : сосочковая карцинома щитовидной железы, фолликулярная карцинома щитовидной железы; медуллярная карцинома щитовидной железы, недифференцированный рак щитовидной железы, множественная эндокринная неоплазия типа 2A, множественная эндокринная неоплазия типа 2B, наследственный медуллярный рак щитовидной железы, феохромоцитома, параганглиома; и : нейробластома. Таким образом, понятие «раковая клетка», определенное в контексте данного документа, включает клетку, пораженную любым одним из вышеопределенных патологических состояний. В некоторых вариантах осуществления рак выбирают из колоректального, рака щитовидной железы или рака молочной железы.
Понятие «Aurora-опосредованное патологическое состояние» или «Aurora-опосредованное заболевание», использованное в контексте данного документа, означает любое заболевание или другое пагубное патологическое состояние, в котором, как известно, играет роль Aurora (Aurora A, Aurora B и Aurora C). Подобные патологические состояния включают, без ограничения, рак, такой как колоректальный, рак щитовидной железы или рак молочной железы; и миелопролиферативные нарушения, такие как истинная полицитемия, тромбоцитемия, миелоидная метаплазия с миелофиброзом, хронический миелогенный лейкоз (ХМЛ), хронический миеломоноцитный лейкоз, гипереозинофильный синдром, ювенильный миеломоноцитный лейкоз и системное заболевание мастоцитов.
Понятие «FLT-3-опосредованное заболевание» или «FLT-3-опосредованное патологическое состояние», использованное в контексте данного документа, означает любое заболевание или другое пагубное патологическое состояние, в котором, как известно, играет роль семейство киназ FLT-3. Подобные патологические состояния включают, без ограничения, гематопоэтичские нарушения, в частности, острый миелогенный лейкоз (ОМЛ), хронический миелогенный лейкоз (ХМЛ), острый промиелоцитный лейкоз (ОПЛ) и острый лимфоцитарный лейкоз (ОЛЛ).
Вдобавок к соединениям данного изобретения фармацевтически приемлемые производные или пролекарства соединений данного изобретения также могут применяться в композициях для лечения или предотвращения вышеопределенных нарушений.
«Фармацевтически приемлемое производное или пролекарство» означает любую фармацевтически приемлемую соль, сложный эфир, соль сложного эфира или другое производное соединения данного изобретения, которое при введении реципиенту способно обеспечить либо прямо, либо косвенно соединение данного изобретения или активный в качестве ингибитора метаболит или его остаток. В частности, предпочтительные производные или пролекарства - это производные, которые увеличивают биодоступность соединений данного изобретения, когда подобные соединения вводят пациенту (например, посредством того, что перорально введенному соединение легче абсорбируется в крови), или повышают доставку родительского соединения в биологический компартмент (например, мозг или лимфатическая система) по отношению к исходным соединениям.
Фармацевтически приемлемые пролекарства соединений данного изобретения включают, без ограничения, сложные эфиры, аминокислотные эфиры, фосфатные эфиры, соли металлов и эфиры сульфокислоты.
Данное изобретение также включает фармацевтически приемлемые соли соединений данного изобретения.
Фармацевтически приемлемые соли соединений данного изобретения включают соли, полученные из Фармацевтически приемлемых неорганических и органических кислот и оснований. Примеры подходящих кислотных солей включают, но не ограничиваются, ацетат, адипат, альгинат, аспартат, бензоат, бензолсульфонат, бисульфат, бутират, цитрат, камфорат, камфорсульфонат, циклопентанпропионат, диглюконат, додецилсульфат, этансульфонат, формиат, фумарат, глюкогептаноат, глицерофосфат, гликоляты, хемисульфат, гептаноат, гексаноат, гидрохлорид, гидробромид, гидройодид, 2-гидроксиэтансульфонат, лактат, малеат, малонат, метансульфонат, 2-нафталинсульфонат, никотинат, нитрат, оксалат, пальмоат, пектинат, персульфат, 3-фенилпропионат, фосфат, пикрат, пивалат, пропионат, салицилат, сукцинат, сульфат, тартрат, тиоцианат, тозилат и ундеканоат. Другие кислоты, такие как щавелевая кислота, несмотря на то, что они сами не являются фармацевтически приемлемыми, могут быть применены при получении солей, пригодных в качестве промежуточных продуктов для получения соединений данного изобретения и их фармацевтически приемлемых солей присоединения кислоты.
+
1-4
4
Соли, полученные из подходящих оснований, включают, но не ограничиваются, соли щелочных металлов (например, натрия и калия), щелочноземельных металлов (например, магния), соли аммония и N(Cалкил). Данное изобретение также предусматривает кватернизацию любых основных азотсодержащих групп соединений, раскрытых в контексте данного документа. Водо- или маслорастворимые, или диспергируемые продукты могут быть получены подобной кватернизацией.
Фармацевтически приемлемые носители, которые могут быть применены в данных фармацевтических композициях, включают, но не ограничиваются, ионообменники, окись алюминия, стеарат алюминия, лецитин, сывороточные белки, такие как человеческий сывороточный альбумин, буферные вещества, такие как фосфаты, глицин, сорбиновая кислота, сорбат калия, смеси неполных глицеридов насыщенных растительных жирных кислот, вода, соли или электролиты, такие как протаминсульфат, двузамещенный фосфорнокислый натрий, двузамещенный фосфорнокислый калий, хлорид натрия, цинковые соли, коллоидная окись кремния, трисиликат магния, поливинилпирролидон, основанные на целлюлозе вещества, полиэтиленгликоль, натрий карбоксиметилцеллюлоза, полиакрилаты, воски, полиэтилен-полиоксипропилен-блок-сополимеры и ланолин.
Композиции настоящего изобретения можно вводить орально, парентерально, посредством ингаляционного спрея, местно, ректально, назально, букально, вагинально или через искусственный имплантат. Понятие «парентеральный», использованное в контексте данного документа, включает подкожное, внутривенное, внутримышечное, внутрисуставное, интрасиновиальное, надчревное, интратекальное, внутрипеченочное, введение внутрь пораженных тканей и внутричерепное введение или инфузионные методики. Предпочтительно композиции вводят орально, внутрибрюшинно или внутривенно.
Стерильные инъекционные формы композиций данного изобретения могут быть водной или маслянистой суспензией. Данные суспензии могут быть получены в соответствии с методиками, известными в данной области техники, используя подходящие диспергирующие или смачивающие агенты и суспендирующие агенты. Стерильный инъекционный препарат может также быть стерильным инъекционным раствором или суспензией в нетоксичном парентерально приемлемом разбавителе или растворителе, например, как раствор в 1,3-бутандиоле. Среди приемлемых сред и растворителей, которые можно применять, - вода, раствор Рингера и изотонический раствор хлорида натрия. Кроме того, в качестве растворителя или суспендирующей среды обычно применяют стерильные нелетучие масла. Для этой цели может применяться любое легкое нелетучее масло, включая синтетические моно- или диглицериды. Жирные кислоты, такие как олеиновая кислота и ее глицеридные производные, пригодны для получения инъекций, которые являются натуральными фармацевтически приемлемыми маслами, такими как оливковое масло или касторовое масло, особенно в их полиоксиэтилированных модификациях. Данные масляные растворы или суспензии могут также содержать длинноцепочечный спиртовой разбавитель или диспергирующий агент, такой как карбоксиметилцеллюлоза или подобные диспергирующие агенты, которые обычно применяют для получения фармацевтически приемлемых дозированных форм, включающих эмульсии и суспензии. Другие обычно применяемые поверхностно-активные вещества, такие как Tweeens, Spans и другие эмульгирующие агенты или увеличители биодоступности, которые обычно применяют в производстве фармацевтически приемлемых твердых, жидких или других дозированных форм, также могут применяться для целей получения препарата.
Фармацевтические композиции данного изобретения могут вводиться орально в любой орально приемлемой дозированной форме, включая, но, не ограничиваясь, капсулы, таблетки, водные суспензии или растворы. В случае таблеток для орального применения, обычно применяемые носители включают, но не ограничиваются, лактозу и кукурузный крахмал. Также обычно добавляют лубриканты, такие как стеарат магния. Для орального введения в форме капсулы пригодные разбавители включают, но не ограничиваются, лактозу и сухой кукурузный крахмал. Когда для орального применения требуются водные суспензии, активный ингредиент комбинируют с эмульгирующим и суспендирующим агентами. Если желательно, то могут также быть добавлены определенные подсластители, ароматизаторы и окрашивающие вещества.
Альтернативно фармацевтические композиции данного изобретения могут вводиться в форме суппозиториев для ректального введения. Суппозитории могут быть получены посредством смешивания агента с подходящим не раздражающим вспомогательным веществом, которое является твердым при комнатной температуре, но жидким при ректальной температуре и, следовательно, будет плавиться в прямой кишке с высвобождением лекарственного средства. Подобные вещества включают, но не ограничиваются, масло какао, пчелиный воск и полиэтиленгликоли.
Фармацевтические композиции данного изобретения могут также вводиться местно, особенно когда мишень лечения включает ткани или органы хорошо доступные посредством местного применения, включая заболевания глаза, кожи или нижнего кишечника. Подходящие препараты для наружного применения легко получают для каждой из данных тканей и органов.
Местное применение для нижнего кишечника может быть эффективным в виде ректального суппозитория (смотри выше) или в виде подходящего состава для клизмы. Также могут применяться местные трансдермальные пластыри.
Для местных применений фармацевтические композиции могут быть получены в виде подходящей мази, содержащей активный компонент, суспендированный или растворенный в одном или более носителях. Носители для местного введения соединения данного изобретения включают, но не ограничиваются, минеральное масло, жидкий вазелин, медицинский вазелин, пропиленгликоль, полиоксиэтилен, полиоксипропиленовое соединение, эмульгирующий парафин и воду. Альтернативно фармацевтические композиции могут быть получены в виде подходящего лосьона или крема, содержащего активные компоненты, суспендированные или растворенные в одном или более фармацевтически приемлемых носителях. Подходящие носители включают, но не ограничиваются, минеральное масло, сорбитанмоностеарат, полисорбат 60, парафин цетилового эфира, цетиариловый спирт, 2-октилдодеканол, бензиловый спирт и воду.
Для офтальмического применения фармацевтические композиции могут быть получены в виде микронизированных суспензий в изотоническом стерильном физиологическом растворе с постоянным pH или предпочтительно в качестве растворов в изотоническом стерильном физиологическом растворе с постоянным pH либо с, либо без консерванта, такого как бензилалкония хлорид. Альтернативно для офтальмического применения фармацевтические композиции могут быть получены в виде мази, такой как вазелин.
Фармацевтические композиции данного изобретения можно также вводить посредством назального аэрозоля или ингаляции. Подобные композиции получают в соответствии с методиками, хорошо известными в данной области техники получения фармацевтического препарата, и могут быть получены в качестве растворов в физиологическом растворе, с применением бензилового спирта или других подходящих консервантов, промоторов абсорбции для усиления биодоступности, фторуглеводородов и/или других подходящих солюбилизирующих или диспергирующих агентов.
Количество ингибитора киназы, которое можно объединить с веществами носителя, для того чтобы получить единичную дозированную форму, будет изменяться в зависимости от конкретного способа введения, которому был подвергнут реципиент. Предпочтительно композиции должны быть получены таким образом, чтобы пациенту, получающему данные композиции, можно было вводить дозу ингибитора 0,01-100 мг/кг массы тела/день.
Следует также понимать, что конкретная доза и режим лечения для любого конкретного пациента будет зависеть от многообразия факторов, включающих активность конкретного соединения, которое применяется, возраст, массу тела, общее состояние здоровья, пол, рацион, время введения, скорость экскреции, комбинацию лекарств, и заключение лечащего врача и тяжесть конкретного заболевания, которое лечат. Количество ингибитора также зависит от конкретного соединения в композиции.
Один вариант осуществления данного изобретения представляет способ лечения или предупреждения Aurora-опосредованного патологического состояния, включающий стадию введения пациенту одного из соединений или фармацевтических композиций, описанных в контексте данного документа. Понятие «пациент», использованное в контексте данного документа, означает животное, предпочтительно человека.
I
Другой вариант осуществления представляет способ лечения или предупреждения FLT-3-опосредованного патологического состояния, включающий стадию введения пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей вышеупомянутое соединение.
I
Еще один вариант осуществления представляет способ лечения или предупреждения пролиферативного нарушения или рака, включающий стадию введения пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей указанное соединение.
I
Другой аспект изобретения относится к ингибированию активности Aurora и FLT-3 в организме пациента, способу, который включает введение пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей указанное соединение.
I
Один вариант осуществления представляет способ ингибирования активности Aurora протеинкиназы в организме пациента, включающий введение пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей указанное соединение.
I
Другой вариант осуществления представляет способ ингибирования активности FLT-3 протеинкиназы в организме пациента, включающий введение пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей указанное соединение.
I
Еще один вариант осуществления представляет способ ингибирования активности PDK1 протеинкиназы в организме пациента, включающий введение пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей указанное соединение.
В некоторых вариантах осуществления данные способы применяются для лечения или предупреждения патологического состояния, выбранного из видов раковых заболеваний, таких как рак молочной железы, толстой кишки, предстательной железы, кожи, поджелудочной железы, мозга, мочеполовой системы, лимфатической системы, желудка, гортани и легкого, включая аденокарциному легкого, мелкоклеточный рак легкого; удара, сахарного диабета, миеломы, гепатомегалии, кардиомегалии, болезни Альцгеймера, кистозного фиброза и вирусного заболевания или любого конкретного заболевания или нарушения, описанного в контексте данного документа.
В соответствии с другим вариантом осуществления изобретение представляет способы лечения или предупреждения патологического состояния, выбранного из пролиферативного нарушения или рака, включающие стадию введения пациенту одного из соединений или фармацевтических композиций, описанных в контексте данного документа.
В некоторых вариантах осуществления изобретение представляет способы лечения или предупреждения рака, включающие стадию введения пациенту одного из соединений или фармацевтических композиций, описанных в контексте данного документа. В некоторых вариантах осуществления упомянутый рак выбирается из рака мозга (глиома), молочной железы, толстой кишки, головы и шеи, почки, легкого, печени, меланомы, рака яичников, поджелудочной железы, предстательной железы, саркомы или рака щитовидной железы. В других вариантах осуществления упомянутый рак выбирается из меланомы, миеломы, лейкоза, лимфомы, нейробластомы или видов рака, выбранных из рака толстой кишки, молочной железы, желудка, яичников, шейки матки, легкого, центральной нервной системы (ЦНС), почечного, предстательной железы, мочевого пузыря или поджелудочной железы. В еще одних вариантах осуществления упомянутый рак выбирается из рака поджелудочной железы, предстательной железы или яичников.
I
В соответствии с другим вариантом осуществления данное изобретение представляет способы лечения или предупреждения FLT-3-опосредованного патологического состояния, включающие стадию введения пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей указанное соединение.
Предпочтительно данный способ применяется для лечения или предупреждения патологического состояния, выбранного из гематопоэтических нарушений, в частности острого миелогенного лейкоза (ОМЛ), острого промиелоцитного лейкоза (ОПЛ), хронического миелогенного лейкоза (ХМЛ) и острого лимфоцитарного лейкоза (ОЛЛ).
I
Другой аспект изобретения относится к ингибированию активности Aurora, FLT-3 или PDK1 в организме пациента, способу, который включает введение пациенту соединения формулы  или композиции, содержащей указанное соединение.
I
in vitro
ex vivo
Другой аспект изобретения относится к ингибированию активности Aurora, FLT-3 или PDK1 в биологическом образце или в организме пациента, способу, который включает контактирование указанного биологического образца с соединением формулы  или композицией, содержащей указанное соединение. Понятие «биологический образец», использованное в контексте данного документа, означает  или  образцы и включает, без ограничения, клеточные культуры или их экстракты; материал биопсии, полученный из животного или его экстракты; и кровь, слюну, мочу, экскременты, семенную жидкость, слезы или другие жидкости организма или их экстракты.
Ингибирование активности Aurora, FLT-3 или PDK1 в биологическом образце применяется для многообразия целей, которые известны специалисту в данной области техники. Примеры таких целей включают, но не ограничиваются, переливание крови, трансплантацию органов, хранение биологических образцов и биологические анализы.
I
Другой вариант осуществления представляет способ лечения рака у пациента, который в этом нуждается, включающий стадию нарушения митоза раковых клеток посредством ингибирования Aurora соединением формулы или композицией, содержащей указанное соединение.
I
Другой вариант осуществления представляет способ лечения рака у пациента, который в этом нуждается, включающий стадию нарушения митоза раковых клеток посредством ингибирования FLT-3 соединением формулы или композицией, содержащей указанное соединение.
В зависимости от конкретных заболеваний или патологических состояний, которые нужно лечить или предупреждать, дополнительные лекарства, которые обычно вводят для лечения или предупреждения данного патологического состояния, можно вводить совместно с ингибиторами данного изобретения. Например, химиотерапевтические средства или другие антипролиферативные средства можно комбинировать с Aurora, FLT-3 или PDK1 ингибиторами данного изобретения для лечения пролиферативных заболеваний.
Данные дополнительные средства можно вводить отдельно, в качестве части схемы множественного дозирования от Aurora, FLT-3 или PDK1 ингибитор-содержащего соединения или композиции. Альтернативно данные средства могут быть частью единичной дозированной формы, смешанной совместно с Aurora, FLT-3 или PDK1 ингибитором в единую композицию.
Для того чтобы более полно уяснить данное изобретение, предлагаются следующие примеры получения и испытаний. Данные примеры служат только для иллюстрации, а не интерпретируются как ограничение объема притязаний изобретения во всяком случае.
Пример 1
H
d
1-(6-хлорпиримидин-4-ил)-5,6-диметил-1-бензо[]имидазол-2-амин (1):
1
3
В круглодонную колбу загружали 4,6-дихлоропиримидин (1,69 г, 11,3 ммоль), 2-амино-5,6-диметилбензимидазол (1,83 г, 11,3 ммоль), DIPEA (1,92 мл, 11,3 ммоль) и DMF (50 мл). Реакционную смесь интенсивно перемешивали при 80°C в течение 6 дней, а затем охлаждали до комнатной температуры. Летучие компоненты реакционной смеси удалили затем под вакуумом, а оставшееся адсорбировали на двуокись кремния и затем очищали колоночной хроматографией, используя в качестве элюента гексан (40-60)/EtOAc от 0% до 100%, для того чтобы получить желтое твердое вещество (1,09 г, 35%). H ЯМР (CDCl): 2,35 (3H, с), 2,39 (3H, с), 6,43 (2H, уш.с), 7,25 (2H, м), 7,75 (1H, с), 8,93 (1H, с). LC/MS 374,30 [M+H] 372,50 [M-H].
S
1-(6-(()-1-амино-3-метилбутан-2-иламино)пиримидин-4-ил)-
1
6
5,6-диметил-1H-бенао[d]имидааол-2-амин, соль диТFА (Соединение 2): В пробирку загружали 1-(6-хлоропиримидин-4-ил)-5,6-диметил-1H-бензо[d]имидазол-2-амин (1) (0,27 г, 1,0 ммоль), трет-бутил-(S)-2-амино-3-метилбутилкарбамат (0,20 г, 1,0 ммоль), DIPEA (0,34 мл, 2,0 ммоль) и изопропиловый спирт (5 мл), а затем герметизировали и нагревали до 120°С в течение 2 дней. После охлаждения до комнатной температуры удаляли летучие компоненты под вакуумом, а оставшееся очищали колоночной хроматографией, используя в качестве элюента гексан (40-60)/EtOAc от 0% до 100%, для того чтобы получить воскообразное твердое вещество белого цвета. Данное вещество растворяли в DCM (5 мл) и TFA (2 мл) и перемешивали при комнатной температуре в течение 2 часов. Летучие компоненты реакционной смеси удаляли затем под вакуумом, а оставшееся очищали посредством препаративной HPLC на обращенно-фазовой колонке С-18, используя в качестве элюента от 0% до 100% градиент MeCN и вода/0,05% вес./об. TFA. Фракции, содержащие продукт, затем лиофилизовали, получая при этом желаемый продукт в виде белого твердого вещества (0,13 г, 29,6%). Н ЯМР (ДМСО-d): 0,94 (6Н, м), 1,95 (1Н, м), 2,31 (6Н, с), 2,87 (1Н, м), 3,11 (1Н, м), 4,34 (1Н, с), 6,90 (1Н, с), 7,25 (1Н, с), 7,36 (1Н, с), 7,94 (4Н, м), 8,55 (1Н, с), 8,84 (2Н, с); LC/MS 340,45 [М+Н] 338,63 [М-Н].
Соединения 1а-15 и 19-44 были получены способом подобным Примеру 1. Соединения 45-58 также могут быть получены способом подобным Примеру 1.
Пример 2
3-(4-фтор-3-нитрофенил)пиридин:
3
2
2
4
3
2 г 3-пиридинбороновой кислоты, 3,22 г 4-бром-1-фтор-2-нитробензола и 285 мг Pd(PPh)Cl последовательно добавляли к 50 мл дегазированного 1,4-диоксана и смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 20 минут. Добавляли 50 мл дегазированного водного раствора карбоната натрия (1M) и реакционную смесь нагревали в атмосфере аргона при кипячении с обратным холодильником в течение 1,5 часов. Растворитель удаляли под вакуумом, добавляли этилацетат и раствор отфильтровывали через целит. Фильтрат промывали соляным раствором, сушили над MgSO и выпаривали, для того чтобы получить неочищенное соединение 3 в виде твердого вещества темно-коричневого цвета. Неочищенную смесь очищали колоночной хроматографией на колонке с 60-120 меш. силикагелем, используя 2% MeOH/CHCl в качестве элюента, до получения желтого твердого вещества (1,58 г, 80%), температура плавления 87-88°C;
трет
N--бутил-2-нитро-4-(пиридин-3-ил)аминобензол
трет
К перемешиваемому раствору 1,58 г 3-(4-фтор-3-нитрофенил)пиридина в 5,0 мл DMF добавляли 1,124 г N-этилдиизопропиламина, а затем 2,116 г -бутиламина в атмосфере азота. Реакционную смесь поддерживали при 50°C в течение 5 часов. Реакционную смесь разбавляли этилацетатом и водой. Органический слой отделяли и промывали водой, а затем соляным раствором. Органический слой сушили над сульфатом натрия и выпаривали до получения оранжевого твердого вещества (1,57 г, 85%), температура плавления 67-69°C;
2-нитро-4-(пиридин-3-ил)аминобензол
трет
3
К перемешиваемому раствору 1,5 г N--бутил-2-нитро-4-(пиридин-3-ил)аминобензола в 15 мл метанола добавляли 9 мл 6 н. HCl. Раствор нагревали при кипении с обратным холодильником в течение 3 часов. Затем реакционную массу разбавляли хлороформом и доводили pH до 7, используя насыщенный раствор NaHCO. Органический слой отделяли, промывали водой, а затем соляным раствором, высушивали над сульфатом натрия и выпаривали до получения оранжевого твердого вещества (1,06 г, 90%).
2-(2-нитро-4-(пиридин-3-ил)фениламино)пиридин-3-карбонитрил
2
3
К перемешиваемому раствору 0,5 г 2-нитро-4-(пиридин-3-ил)аминобензола в 3 мл DMF добавляли 2,267 г CSCO, а затем 0,386 г 2-хлор-3-цианопиридина. Реакционную смесь нагревали до 130°C в течение 5 часов в атмосфере азота. Реакционную смесь разбавляли этилацетатом и водой. Органический слой отделяли, промывали водой, а затем соляным раствором, высушивали над сульфатом натрия и выпаривали до получения желтого твердого вещества (0,440 г, 60%), температура плавления 91-92°C.
2-(2-амино-4-(пиридин-3-ил)фениламино)пиридин-3-карбонитрил
К перемешиваемому раствору 0,3 г 2-(2-нитро-4-(пиридин-3-ил)фениламино)пиридин-3-карбонитрила в 15 мл этанола добавляли 0,471 г хлорида олова при комнатной температуре. Реакционную смесь нагревали при кипении с обратным холодильником в течение 2,5 часов. Реакционную массу разбавляли 20 мл этилацетата, 15 мл воды и затем подщелачивали до pH 8-9, используя насыщенный раствор бикарбоната натрия. Органический слой отделяли и промывали водой, а затем соляным раствором, высушивали над сульфатом натрия и упаривали до получения желтого твердого вещества (0,217 г, 80%), температура плавления 67-68°C.
H
d
2-(2-амино-5-(пиридин-3-ил)-1-бензо[]имидазол-1-ил)пиридин-3-карбонитрил (Соединение 18)
3
3
1
К перемешиваемому раствору 170 мг 2-(2-амино-4-(пиридин-3-ил)фениламино)пиридин-3-карбонитрила в 5 мл метанола и 5 мл воды добавляли 65 мг бромциана при 0°C. Реакционную смесь доводили до комнатной температуры и перемешивали при данной температуре в течение 3 часов в атмосфере азота. Реакционную массу разбавляли 20 мл этилацетата, 15 мл воды и затем подщелачивали до pH 8, используя насыщенный раствор бикарбоната натрия. Органический слой отделяли и промывали водой, а затем соляным раствором, высушивали над сульфатом натрия и выпаривали до получения неочищенного твердого вещества. Неочищенное соединение очищали на препаративной TLC, используя 5% MeOH/CHCl в качестве элюента, до получения бледно-желтого твердого вещества (25 мг, 10,6%). LC/MS 313,2 [M+H] H ЯМР (300 МГц, CDCl): 8,99 (уш.д, J=3,0 Гц, 1H), 8,83 (дд, J=8,1 Гц, 1H), 8,73 (д, J=8,4 Гц, 1H), 8,57 (дд, J=3,3 Гц, 1H), 8,24 (уш.с, 1H), 8,18 (дт, J=2,1 Гц, 1H), 7,96 (д, 1H, J=1,5 Гц), 7,65 (м, 3H), 7,51 (кв, 2Н, J=4,8 Гц).
Соединения 16-18 были получены способом, подобным Примеру 2.
Таблица 2 ниже отображает данные для определенных иллюстративных соединений. Номера соединений соответствуют номерам соединений, отображенным в таблице 1.
Применяли следующие аналитические способы.
Способ A
Масс-спектрометрические образцы анализировали на MicroMass Quattro Micro масс-спектрометре, работающем в одномодальном режиме с ионизацией электрораспылением. Образцы вводили в масс-спектрометр, используя хроматографию. Подвижная фаза всех масс-спектрометрических анализов состояла из 10 мM pH 7 ацетата аммония и смеси 1:1 ацетонитрил-метанол, градиентные параметры колонки 5%-100% смеси ацетонитрил-метанол при времени градиента 4,5 минут и продолжительности пробега 6,2 минуты на колонке ACE C8 3,0×75 мм. Скорость потока 1,0 мл/мин.
Способ B
Масс-спектрометрические образцы анализировали на MicroMass ZQ, ZMD или Quattro II масс-спектрометре, работающем в одномодальном режиме с ионизацией электрораспылением. Образцы вводили в масс-спектрометр, используя анализ методом впрыскивания в поток или хроматографию. Подвижная фаза всех масс-спектрометрических анализов состояла из смесей ацетонитрил-вода, либо с 0,2% муравьиной кислоты, либо с 0,1% TFA в качестве модификатора. Градиентные параметры колонки 10%-90% ацетонитрила при времени градиента 3 минуты и продолжительности пробега 5 минут на колонке Waters YMC Pro-CIS 4,6×50 мм. Скорость потока 1,5 мл/мин.
Способ С
Аналогично Способу В, за исключением того, что градиентные параметры колонки: 5%-45% ацетонитрила при времени градиента 5 минут и продолжительности пробега 7 минут на колонке Waters YMC Pro-CIS 2×50 мм. Скорость потока 1,0 мл/мин.
Таблица 2
№
M+1 (набл.)
<sup>1</sup>Н ЯМР
Rt (мин)
Масс-спектр. метод
1a
312,5
<sup>1</sup>Н ЯМР (ДМСO-d<sub>6</sub>): 0,94 (6H, с), 1,95 (1H, м), 2,86 (1H, уш.с), 3,13 (1H, уш.с), 4,34 (1H, м), 6,92 (1H, с), 7,28 (1H, т), 7,32 (1H, т), 7,45 (1H, д), 7,55 (1H, д), 7,93 (4H, м), 8,56 (1H, с), 8,83 (2H, уш.с)
.6,796
А
2
340,45
<sup>1</sup>Н ЯМР (ДМСO-d<sub>6</sub>): 0,94 (6H, м), 1,95 (IН, м), 2,31 (6H, с), 2,87 (1H, м), 3,11 (1H, м), 4,34 (1H, с), 6,90 (1H, с), 7,25 (1H, с), 7,36 (1H, с), 7,94 (4H, м), 8,55 (1H, с), 8,84 (2H, с)
7,939
А
3
310,49
<sup>1</sup>Н ЯМР (ДМСO-d<sub>6</sub>): 1,58 (1H, м), 1,75 (1H, м), 1,92 (2H, м), 2,88 (2H, м), 3,16 (1H, м), 3,38 (1H, м), 4,33 (1H, уш.с), 6,93 (1H, с), 7,27 (1H, т), 7,31 (1H, т), 7,49 (1H, д), 7,54 (1H, д), 8,46 (1H, м), 8,61 (1H, с), 9,11 (2H, с), 9,24 (1H, с), 9,35 (1H, с)
5.S74
А
4
33S.43
<sup>1</sup>Н ЯМР (ДМСO-d<sub>6</sub>): 1,62 (1H, м), 1,74 (1H, м), 1,94 (1H, д), 2,03 (1H, д), 2,30 (6H, д), 2,84 (2H, м), 3,22 (1H, д), 3,42 (1H, д), 4,27 (1H, уш.с), 6,85 (1H, с), 7,25 (1H, с), 7,34 (1H, с), 8,22 (1H, д), 8,60 (1H, с), 8,85 (1H, м), 8,97 (3H, м)
7,134
А
Биологические способы
Пример 1: Анализ ингибирования Aurora B (радиометрический)
2
33
33
33
33
Готовили буферный раствор для анализа, который состоит из 25 мM HEPES (pH 7,5), 10 мM MgCl, 0,1% BSA и 10% глицерина. Готовили 22 нM раствор Aurora B, также содержащий 1,7 мM DTT и 1,5 мM кемптида (LRRASLG), в буферном растворе для анализа. К 22 мкл раствора Aurora B в 96-луночном планшете добавляли 2 мкл исходного раствора соединения в ДМСО и оставляли смесь на 10 минут при 25°C, для приведения ее в равновесие. Ферментативную реакцию инициировали добавлением 16 мкл исходного раствора [γ-P]-ATP (~20 нКи/мкл), приготовленного в буферном растворе для анализа, до конечной аналитической концентрации 800 мкM. Реакцию останавливали через 3 часа добавлением 16 мкл 500 мкM фосфорной кислоты, а уровни включения P в пептидный субстрат определяли следующим способом. Фосфоцеллюлозный 96-луночный планшет (Millipore, Cat no. MAPHNOB50) предварительно обрабатывали 100 мкл 100 мM фосфорной кислоты перед добавлением реакционной смеси фермента (40 мкл). Раствор оставляли пропитываться на фосфоцеллюлозной мембране в течение 30 минут и планшет впоследствии промывали четыре раза 200 мкл 100 мM фосфорной кислоты. В каждую лунку сухого планшета добавляли 30 мкл жидкой сцинтилляционной смеси Optiphase 'SuperMix' (Perkin Elmer) перед измерением активности сцинтилляционным методом (1450 жидкостной сцинтилляционный счетчик Microbeta, Wallac). Уровни неферментативно катализируемой фоновой радиоактивности определяли добавлением 16 мкл 500 мM фосфорной кислоты, для того чтобы контролировать лунки, содержащие все компоненты анализа (которая действует, денатурируя фермент) перед добавлением раствора [γ-P]-ATP. Уровни ферментативно катализируемого включения P вычисляются вычитанием среднего значений показателей фона из среднего значений, измеренных при каждой концентрации ингибитора. Для каждого определения Ki было получено 8 точек данных, обычно охватывающих концентрационный диапазон соединения 0-10 мкM, из двух повторов (исходные растворы в ДMСO были приготовлены из исходного раствора соединения с концентрацией 10 мM последовательной серией разбавлений 1:2,5). Величины Ki вычисляли из данных начальной скорости реакции посредством нелинейной регрессии, используя пакет программного обеспечения Prism (Prism 3.0, Graphpad Software, San Diego, CA).
Следующие соединения ингибировали Aurora B с величиной Ki<1 мкМ: Соединения 1-4, 14 и 28.
Пример 2: Анализ ингибирования FLT-3
33
2
Был проведен скрининг соединений по их способности ингибировать активность FLT-3 с применением радиометрического анализа вещества по степени его связывания с мембранным фильтром. Данный анализ отслеживает включение P в субстрат поли(Glu, Tyr) 4:1 (pE4Y). Реакции проводили в растворе, содержащем 100 мM HEPES (pH 7,5), 10 мM MgCl, 25 мM NaCl, 1 мM DTT, 0,01% BSA и 2,5% ДMСO. Конечные концентрации субстрата в анализе были 90 мкM ATP и 0,5 мг/мл pE4Y (и тот и другой из Sigma Chemicals, St Louis, MO). Конечная концентрация соединения настоящего изобретения обычно была в пределах от 0,01 до 5 мкM. Обычно проводили 12-точечное титрование посредством получения серии разбавлений из 10 мM исходного раствора анализируемого соединения в ДМСО. Реакции проводили при комнатной температуре.
2
2
50
33
33
Готовили два раствора для анализа. Раствор 1 содержал 100 мM HEPES (pH 7,5), 10 мM MgCl, 25 мM NaCl, 1 мг/мл pE4Y и 180 мM ATP (содержащего 0,3 мКи [γ-P]-ATP для каждой реакции). Раствор 2 содержал 100 мM HEPES (pH 7,5), 10 мM MgCl, 25 мM NaCl, 2 мM DTT, 0,02% BSA и 3 нM FLT-3. Анализ проводили на 96-луночном планшете посредством смешивания друг с другом Раствора 1 и 2,5 мл соединений настоящего изобретения. Реакцию инициировали Раствором 2. После термостатирования в течение 20 минут при комнатной температуре реакцию останавливали добавлением 50 мкл 20% TCA, содержащей 0,4 мM ATP. Затем весь реакционный объем перемещали на плоский фильтр и промывали 5% TCA посредством Harvester 9600 из TOMTEC (Hamden, CT). Количество включения P в pE4Y анализировали посредством микропланшетного сцинтилляционного счетчика Packard Top Count (Meriden, CT). Данные аппроксимировали с применением программного обеспечения Prism для получения IC или Ki.
Следующие соединения ингибировали FLT-3 с величиной Ki<1 мкМ: Соединения 1-5, 8-17, 20-42 и 44.
Пример 3: Анализ ингибирования PDK1
1
2
32
Проводили скрининг соединений по их способности ингибировать активность PDK1 с применением анализа включения радиоактивно меченого фосфата (Pitt and Lee, J. Biomol. Screen., (1996) , 47). Анализы проводили в смеси 100 мM HEPES (pH 7,5), 10 мM MgCl, 25 мM NaCl, 2 мM DTT. Конечные концентрации субстрата в анализе - 40 мкM ATP (Sigma Chemicals) и 65 мкM пептид (PDKtide, Upstate, Lake Placid, NY). Анализы проводили при 30°C и 25 нM PDK1 в присутствии ~27,5 нКи/мкл [γ-P]-ATP (Amersham Pharmacia Biotech, Amersham, UK). Готовили исходный буферный раствор для анализа, содержащий все перечисленные выше реагенты, за исключением ATP и анализируемого соединения, представляющего интерес. 15 мкл исходного раствора помещали в 96-луночный планшет, после чего добавляли 1 мкл 0,5 мM исходного раствора анализируемого соединения в ДМСО (конечная концентрация соединения 25 мкM, конечная концентрация ДМСО 5%). Планшет предварительно термостатировали при 30°C в течение порядка 10 минут, а реакцию инициировали добавлением 4 мкл ATP (конечная концентрация 40 мкM).
Реакцию останавливали через 10 минут добавлением 100 мкл 100 мM фосфорной кислоты, 0,01% Tween-20. Фосфоцеллюлозный 96-луночный планшет (Millipore, Cat no. MAPHNOB50) предварительно обрабатывали 100 мкл 100 мM фосфорной кислоты, 0,01% Tween-20 перед добавлением реакционной смеси (100 мкл). Пятнышки оставляли впитываться в течение, по крайней мере, 5 минут перед тем, как промыть следы (4×200 мкл 100 мM фосфорной кислоты, 0,01% Tween-20). После высушивания в каждую лунку добавляли 20 мкл жидкой сцинтилляционной смеси Optiphase 'SuperMix' (Perkin Elmer) перед измерением активности сцинтилляционным методом (1450 жидкостной сцинтилляционный счетчик Microbeta, Wallac).
50
Соединения, показывающие ингибирование более 50% по сравнению со стандартными лунками, содержащими смесь для анализа и ДМСО без анализируемого соединения, титровали, чтобы определить величины IC.
Несмотря на то, что здесь описан ряд вариантов осуществления данного изобретения, очевидно, что основные примеры можно заменить для обеспечения других вариантов осуществления, которые используют соединения, способы и процессы данного изобретения. Следовательно, следует принять во внимание, что объем данного изобретения определяется прилагаемой формулой изобретения, а не конкретными вариантами осуществления, которые были представлены в качестве примера в контексте данного документа.