БЕЛКИ, ОБЛАДАЮЩИЕ АКТИВНОСТЬЮ В ОТНОШЕНИИ РАЗРУШЕНИЯ КАПСУЛЫ ПНЕВМОКОККА, И СПОСОБЫ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Генетически модифицированная клетка, содержащая зрелый белок Pn3Pазу, где белок имеет Pn3Pазную активность.
2. Генетически модифицированная клетка, содержащая полинуклеотид, содержащий кодирующую область, где кодирующая область содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую зрелый белок Pn3Pазу, и где белок имеет Pn3Pазную активность.
3. Генетически модифицированная клетка по п.1 или 2, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:2, где аминоконцевая аминокислота выбрана из любого из остатков 2-64 из SEQ ID NO:2, и карбоксиконцевая аминокислота представляет собой остаток 1545 из SEQ ID NO:2.
4. Генетически модифицированная клетка по п.3, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотами 41-1545 из SEQ ID NO:2.
5. Генетически модифицированная клетка по п.1 или 2, где клетка представляет собой эукариотическую клетку.
6. Генетически модифицированная клетка по п.5, где клетка представляет собой клетку млекопитающего, дрожжевую клетку или клетку насекомого.
7. Генетически модифицированная клетка по п.1 или 2, где клетка представляет собой прокариотическую клетку.
8. Генетически модифицированная клетка по п.7, где клетка представляет собой E. coli.
9. Генетически модифицированная клетка по п.1 или 2, где белок содержит гетерологичную аминокислотную последовательность.
10. Генетически модифицированная клетка по п.9, где гетерологичная аминокислотная последовательность содержит метку.
11. Композиция, содержащая генетически модифицированную клетку по п.1 или п.2.
12. Композиция, содержащая выделенный зрелый белок P3nPазу, где белок имеет Pn3Pазную активность.
13. Композиция по п.12, где белок является очищенным.
14. Композиция, содержащая выделенный полинуклеотид, где полинуклеотид содержит кодирующую область, кодирующую зрелый белок Pn3Pазу, и где белок имеет Pn3Pазную активность.
15. Композиция по п.12 или 14, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:2, где аминоконцевая аминокислота выбрана из остатков 2-64 из SEQ ID NO:2, и карбоксиконцевая аминокислота представляет собой остаток 1545 из SEQ ID NO:2.
16. Композиция по п.15, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотами 41-1545 из SEQ ID NO:2.
17. Композиция по п.12 или 14, где композиция содержит фармацевтически приемлемый носитель.
18. Способ, включающий инкубацию клетки в условиях, подходящих для экспрессии белка, обладающего Pn3Pазной активностью, где клетка содержит полинуклеотид, содержащий кодирующую область, где кодирующая область содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую зрелый белок Pn3Pазу, где белок имеет Pn3Pазную активность, и где клетка экспрессирует зрелый белок Pn3Pазу.
19. Способ по п.18, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:2, где аминоконцевая аминокислота выбрана из любого из остатков 2-64 из SEQ ID NO:2, и карбоксиконцевая аминокислота представляет собой остаток 1545 из SEQ ID NO:2.
20. Способ по п.19, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотами 41-1545 из SEQ ID NO:2.
21. Способ по п.18, где клетка представляет собой генетически модифицированную клетку, и полинуклеотид представляет собой экзогенный полинуклеотид.
22. Способ по любому из пп. 18-21, дополнительно включающий выделение белка.
23. Способ по любому из пп. 18-21, дополнительно включающий очистку белка.
24. Способ по любому из пп. 18-21, где клетка представляет собой эукариотическую клетку.
25. Способ по п.24, где клетка представляет собой клетку млекопитающего, дрожжевую клетку или клетку насекомого.
26. Способ по любому из пп. 18-21, где клетка представляет собой прокариотическую клетку.
27. Способ по п.26, где прокариотическая клетка представляет собой E. coli.
28. Способ по любому из пп. 18-21, где белок содержит гетерологичную аминокислотную последовательность.
29. Способ по п.28, где гетерологичная аминокислотная последовательность содержит метку.
30. Способ, включающий
приведение в контакт Streptococcus pneumoniae, содержащей капсульный полисахарид III типа, со зрелым белком Pn3Pазой, имеющим Pn3Pазную активность, где приведение в контакт происходит в условиях, подходящих для ферментативного гидролиза капсульного полисахарида III типа, где количество капсульного полисахарида III типа на поверхности S. pneumoniae снижается по сравнению с таковым у S. pneumoniae, которую не приводят в контакт с белком Pn3Pазой.
31. Способ увеличения накопления по меньшей мере одного компонента комплемента на поверхности Streptococcus pneumoniae, включающий
приведение в контакт Streptococcus pneumoniae, содержащей капсульный полисахарид III типа, со зрелым белком Pn3Pазой, имеющим Pn3Pазную активность, где накопление по меньшей мере одного компонента комплемента на поверхности S. pneumoniae увеличивается по сравнению с таковым у S. pneumoniae, которую не приводят в контакт с белком Pn3Pазой.
32. Способ по п.30 или 31, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:2, где аминоконцевая аминокислота выбрана из любого из остатков 2-64 из SEQ ID NO:2, и карбоксиконцевая аминокислота представляет собой остаток 1545 из SEQ ID NO:2.
33. Способ по п.32, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотами 41-1545 из SEQ ID NO:2.
34. Способ по п.30 или 31, где S. pneumoniae находится в условиях, подходящих для размножения S. pneumoniae.
35. Способ по п.30 или 31, где зрелый белок Pn3Pаза представляет собой выделенный белок Pn3Pазу.
36. Способ по п.31 или 32, где приведение в контакт включает воздействие на S. pneumoniae генетически модифицированной клетки, которая экспрессирует зрелый белок Pn3Pазу.
37. Способ по п.31 или 32, где S. pneumoniae характеризуется повышенной восприимчивостью к фагоцитозу макрофагами, повышенным уровнем опосредованного комплементом уничтожения нейтрофилами или их комбинацией по сравнению с S. pneumoniae, которую не приводят в контакт с белком Pn3Pазой.
38. Способ по п.31 или 32, где S. pneumoniae присутствует у пациента.
39. Способ лечения инфекции у пациента, включающий
введение эффективного количества композиции, содержащей зрелый белок Pn3Pазу, имеющий Pn3Pазную активность, пациенту, имеющему инфекцию, вызванную S. pneumoniae серотипа 3, или подверженному риску ее возникновения.
40. Способ лечения симптома у пациента, включающий введение эффективного количества композиции, содержащей зрелый белок Pn3Pазу, имеющий Pn3Pазную активность, пациенту, имеющему инфекцию, вызванную S. pneumoniae серотипа 3, или подверженному риску ее возникновения.
41. Способ снижения степени колонизации у пациента, включающий введение эффективного количества композиции, содержащей зрелый белок Pn3Pазу, обладающий Pn3Pазной активностью, пациенту, подверженному колонизации или подверженному риску колонизации S. pneumoniae серотипа 3.
42. Способ по любому из пп. 39-41, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотной последовательностью, выбранной из SEQ ID NO:2, где аминоконцевая аминокислота выбрана из любого из остатков 2-64 из SEQ ID NO:2, и карбоксиконцевая аминокислота представляет собой остаток 1545 из SEQ ID NO:2.
43. Способ по п.42, где белок содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80% идентичностью с аминокислотами 41-1545 из SEQ ID NO:2.
44. Способ по любому из пп. 39-41, где пациент представляет собой человека.