КОНЪЮГАТЫ АНТИТЕЛА И ЛЕКАРСТВЕННОГО СРЕДСТВА ДЛЯ РАЗРУШЕНИЯ ГЕМОПОЭТИЧЕСКИХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК

1. Способ кондиционирования пациента, подлежащего трансплантации гемопоэтических стволовых клеток, причем способ предусматривает введение пациенту эффективного количества конъюгата или фармацевтической композиции и обеспечение достаточного периода времени, чтобы конъюгаты вывелись из кровяного русла пациента перед проведением трансплантации гемопоэтических стволовых клеток пациенту,
где конъюгат представляет собой конъюгат формулы (I) или его фармацевтически приемлемую соль;
B
n
y
A–(L–(D))
Формула (I),
где:
A представляет собой фрагмент антитела, который специфически связывается с cKIT человека;
B
L представляет собой линкер;
D представляет собой цитотоксическое средство;
n составляет целое число от 1 до 10, и
y составляет целое число от 1 до 10,
а фармацевтическая композиция содержит указанный выше конъюгат и фармацевтически приемлемый носитель.
2. Способ по п. 1, где пациент имеет наследственное иммунодефицитное заболевание, аутоиммунное нарушение, нарушение гемопоэза или врожденное нарушение обмена веществ.
3. Способ по п. 2, где нарушение гемопоэза выбрано из острого миелоидного лейкоза (AML), острого лимфобластного лейкоза (ALL), острого моноцитарного лейкоза (AMoL), хронического миелоидного лейкоза (CML), хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), миелопролиферативных нарушений, миелодиспластических синдромов, множественной миеломы, неходжкинской лимфомы, болезни Ходжкина, апластической анемии, истинной эритроцитарной аплазии, пароксизмальной ночной гемоглобинурии, анемии Фанкони, большой талассемии, серповидноклеточной анемии, тяжелого комбинированного иммунодефицита, синдрома Вискотта–Олдрича, гемофагоцитарного лимфогистиоцитоза.
4. Способ по п. 2, где врожденное нарушение обмена веществ выбрано из мукополисахаридоза, болезни Гоше, метахроматических лейкодистрофий или адренолейкодистрофий.
5. Способ по п. 1, где пациент имеет незлокачественное заболевание или состояние, выбранное из тяжелой апластической анемии (SAA), синдрома Вискотта–Олдрича, синдрома Гурлера, FHL, CGD, синдрома Костмана, тяжелого иммунодефицитного синдрома (SCID), других аутоиммунных нарушений, таких как SLE, рассеянный склероз, IBD, болезнь Кролма, синдром Шегрена, васкулит, волчанка, миастения гравис, болезнь Вегенера, врожденных нарушений обмена веществ и/или других иммунодефицитов.
6. Способ по п. 1, где пациент имеет злокачественное заболевание или состояние, выбранное из миелодиспластических синдромов (MDS), острого лимфобластного лейкоза (ALL), острого миелогенного лейкоза (AML), острого моноцитарного лейкоза (AMoL), хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), хронического миелогенного лейкоза (CML), волосатоклеточного лейкоза (HCL), T–клеточного пролимфоцитарного лейкоза (T–PLL), лейкоза из больших зернистых лимфоцитов, Т–клеточного лейкоза взрослых, лейкоза/лимфомы из предшественников T–клеток, лимфомы Беркитта, фолликулярной лимфомы, диффузной В–крупноклеточной лимфомы, лимфомы из клеток мантийной зоны, B–клеточного хронического лимфоцитарного лейкоза/лимфомы, лимфомы MALT, фунгоидного микоза, неуточненной периферической T–клеточной лимфомы, формы ходжкинской лимфомы с нодулярным склерозом, смешанноклеточного подтипа ходжкинской лимфомы.
7. Антитело или фрагмент антитела, которые специфически связываются с cKIT человека, где антитело или фрагмент антитела выбраны из любого из следующих:
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 (определяющую комплементарность область 1 тяжелой цепи) под SEQ ID NO: 1, (b) HCDR2 (определяющую комплементарность область 2 тяжелой цепи) под SEQ ID NO: 2 и (c) HCDR3 (определяющую комплементарность область 3 тяжелой цепи) под SEQ ID NO: 3; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 (определяющую комплементарность область 1 легкой цепи) под SEQ ID NO: 16, (e) LCDR2 (определяющую комплементарность область 2 легкой цепи) под SEQ ID NO: 17 и (f) LCDR3 (определяющую комплементарность область 3 легкой цепи) под SEQ ID NO: 18;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 4, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 5, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 3; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 19, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 20 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 21;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 6, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 2, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 3; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 16, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 17 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 18;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 7, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 8, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 9; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 22, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 20 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 18;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 27, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 28, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 29; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 42, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 17 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 43;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 30, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 31, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 29; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 44, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 20 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 45;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 32, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 28, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 29; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 42, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 17 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 43;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 33, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 34, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 35; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 46, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 20 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 43;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 60, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 61, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 62; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 75, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 76 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 77;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 63, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 64, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 62; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 78, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 79 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 80;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 65, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 61, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 62; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 75, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 76 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 77;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 66, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 67, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 68; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 81, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 79 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 77;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 86, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 87, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 88; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 101, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 102 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 103;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 89, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 90, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 88; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 104, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 105 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 106;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 91, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 87, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 88; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 101, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 102 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 103;
антитела или фрагмента антитела, содержащих (i) вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит (a) HCDR1 под SEQ ID NO: 92, (b) HCDR2 под SEQ ID NO: 93, (c) HCDR3 под SEQ ID NO: 94; и (ii) вариабельную область легкой цепи, которая содержит: (d) LCDR1 под SEQ ID NO: 107, (e) LCDR2 под SEQ ID NO: 105 и (f) LCDR3 под SEQ ID NO: 103;
антитела или фрагмента антитела, содержащих вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая содержит SEQ ID NO: 10, и вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит SEQ ID NO: 23;
антитела или фрагмента антитела, содержащих VH, которая содержит SEQ ID NO: 36, и VL, которая содержит SEQ ID NO: 47;
антитела или фрагмента антитела, содержащих VH, которая содержит SEQ ID NO: 69, и VL, которая содержит SEQ ID NO: 82;
антитела или фрагмента антитела, содержащих VH, которая содержит SEQ ID NO: 95, и VL, которая содержит SEQ ID NO: 108;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 14, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 25;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 40, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 49;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 73, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 84;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 99, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 110;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 118, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 122;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 118, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 123;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 124, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 128;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 124, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 129;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 130, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 134;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 130, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 135;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 136, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 140;
антитела или фрагмента антитела, содержащих тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 141, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 145;
антитела, содержащего тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 12, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 25;
антитела, содержащего тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 38, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 49;
антитела, содержащего тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 71, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 84; или
антитела, содержащего тяжелую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 97, и легкую цепь, которая содержит SEQ ID NO: 110.
8. Антитело или фрагмент антитела по п.7, где антитело или фрагмент антитела специфически связывается с внеклеточным доменом cKIT человека (SEQ ID NO: 112).
9. Антитело или фрагмент антитела по п.7, где антитело или фрагмент антитела специфически связывается с эпитопом в доменах 1–3 cKIT человека (SEQ ID NO: 113).
10. Антитело или фрагмент антитела по любому из пп.7-9, где антитело или фрагмент антитела представляют собой человеческое или гуманизированное антитело или фрагмент антитела.
11. Антитело или фрагмент антитела по любому из пп.7-10, где фрагмент антитела представляет собой Fab или Fab'.
12. Антитело или фрагмент антитела по любому из пп.7-11, где фрагмент антитела представляет собой человеческий или гуманизированный Fab или Fab'.
13. Антитело или фрагмент антитела по любому из пп.7-12, где антитело или фрагмент антитела содержат одну или несколько замен аминокислот.
14. Антитело или фрагмент антитела по п.13, где одна или несколько замен аминокислот находятся в константной области.
15. Антитело или фрагмент антитела по п.13 или 14, где одна или несколько замен аминокислот представляют собой цистеин.
16. Антитело или фрагмент антитела по п.15, включающие цистеин в одном или нескольких из следующих положений (нумерация всех положений согласно EU):
положение 152 тяжелой цепи,
положение 114 или 165 легкой каппа–цепи или
положение 143 легкой лямбда–цепи.
17. Антитело или фрагмент антитела по любому из пп.7-16, где антитело или фрагмент антитела не индуцируют дегрануляцию мастоцитов.
18. Нуклеиновая кислота, кодирующая антитело или фрагмент антитела по любому из пп. 7-17.
19. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п. 18.
20. Клетка–хозяин, содержащая вектор по п. 19.
21. Способ получения антитела или фрагмента антитела, причем способ предусматривает культивирование клетки–хозяина по п. 20 и извлечение антитела или фрагмента антитела из культуры.
22. Фармацевтическая композиция, содержащая антитело или фрагмент антитела по любому из пп.7–17 и фармацевтически приемлемый носитель.
23. Фармацевтическая композиция по п.22, дополнительно содержащая другое терапевтическое средство.
24. Фармацевтическая композиция по п.22, где композиция представляет собой лиофилизат.
25. Применение антитела или фрагмента антитела по любому из пп.7–17 или фармацевтической композиции по п.22 в изготовлении лекарственного препарата для:
разрушения гемопоэтических стволовых клеток у пациента, нуждающегося в этом;
кондиционирования пациента, подлежащего трансплантации гемопоэтических стволовых клеток.
26. Применение по п.25, где пациент имеет наследственное иммунодефицитное заболевание, аутоиммунное нарушение, нарушение гемопоэза или врожденное нарушение обмена веществ.
27. Применение по п.26, где нарушение гемопоэза выбрано из острого миелоидного лейкоза (AML), острого лимфобластного лейкоза (ALL), острого моноцитарного лейкоза (AMoL), хронического миелоидного лейкоза (CML), хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), миелопролиферативных нарушений, миелодиспластических синдромов, множественной миеломы, неходжкинской лимфомы, болезни Ходжкина, апластической анемии, истинной эритроцитарной аплазии, пароксизмальной ночной гемоглобинурии, анемии Фанкони, большой талассемии, серповидноклеточной анемии, тяжелого комбинированного иммунодефицита, синдрома Вискотта–Олдрича, гемофагоцитарного лимфогистиоцитоза.
28. Применение по п.26, где врожденное нарушение обмена веществ выбрано из мукополисахаридоза, болезни Гоше, метахроматических лейкодистрофий или адренолейкодистрофий.
29. Применение по п.25, где пациент имеет незлокачественное заболевание или состояние, выбранное из тяжелой апластической анемии (SAA), синдрома Вискотта–Олдрича, синдрома Гурлера, FHL, CGD, синдрома Костмана, тяжелого иммунодефицитного синдрома (SCID), других аутоиммунных нарушений, таких как SLE, рассеянный склероз, IBD, болезнь Кролма, синдром Шегрена, васкулит, волчанка, миастения гравис, болезнь Вегенера, врожденных нарушений обмена веществ и/или других иммунодефицитов.
30. Применение по п.25, где пациент имеет злокачественное заболевание или состояние, выбранное из миелодиспластических синдромов (MDS), острого лимфобластного лейкоза (ALL), острого миелогенного лейкоза (AML), острого моноцитарного лейкоза (AMoL), хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), хронического миелогенного лейкоза (CML), волосатоклеточного лейкоза (HCL), T–клеточного пролимфоцитарного лейкоза (T–PLL), лейкоза из больших зернистых лимфоцитов, Т–клеточного лейкоза взрослых, лейкоза/лимфомы из предшественников T–клеток, лимфомы Беркитта, фолликулярной лимфомы, диффузной В–крупноклеточной лимфомы, лимфомы из клеток мантийной зоны, B–клеточного хронического лимфоцитарного лейкоза/лимфомы, лимфомы MALT, фунгоидного микоза, неуточненной периферической T–клеточной лимфомы, формы ходжкинской лимфомы с нодулярным склерозом, смешанноклеточного подтипа ходжкинской лимфомы.