β-D-2'-ДЕЗОКСИ-2'-α-ФТОР-2'-β-С-ЗАМЕЩЕННЫЕ-2-МОДИФИЦИРОВАННЫЕ-N6-ЗАМЕЩЕННЫЕ ПУРИНОВЫЕ НУКЛЕОТИДЫ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ ВЫЗВАННЫХ HCV ЗАБОЛЕВАНИЙ
β-D-2ʹ-DEOXY-2ʹ-α-FLUORO-2ʹ-β-C-SUBSTITUTED-2-MODIFIED-N6-SUBSTITUTED PURINE NUCLEOTIDES FOR TREATMENT OF DISEASES CAUSED BY HCV

Ссылка на родственные заявки
Согласно настоящей заявке испрашивается приоритет в соответствии с заявкой на выдачу патента США с серийным №62/129319, поданной 6 марта 2015 года, заявкой на выдачу патента США с серийным №62/253958, поданной 11 ноября 2015 года, а также заявкой на выдачу патента США с серийным №62/276597, поданной 8 января 2015 года, каждая из которых включена в настоящий документ посредством отсылки во всей своей полноте.
Область техники, к которой относится настоящее изобретение
Настоящее изобретение относится к нуклеотидным соединениям и композициям, а также к их применениям для лечения вызванных вирусом гепатита С («HCV») заболеваний.
Предшествующий уровень техники настоящего изобретения
Вирус гепатита С (HCV) является содержащим однонитевую РНК вирусом и представителем рода Hepacivirus. По имеющимся оценкам, 75% всех случаев заболеваний печени вызываются HCV. Инфекция HCV может приводить к циррозу и злокачественной опухоли печени, а при прогрессировании к печеночной недостаточности, которая может потребовать трансплантации печени. Приблизительно 170-200 миллионов людей в мире являются инфицированными, при этом в Соединенных Штатах Америки насчитывают 3-4 миллиона случаев инфекции.
РНК-полимераза является ключевым компонентом в нацеливании на содержащие однонитевую РНК вирусы. РНК-зависимая РНК-полимераза -неструктурный белок NS5B - HCV является ключевым ферментом, отвечающим за инициацию и катализ синтеза вирусной РНК. По этой причине в настоящий момент NS5B HCV представляет собой привлекательную мишень для поиска и разработки лекарственных средств против HCV. Существуют два основных подкласса ингибиторов NS5B: нуклеозидные аналоги, которые анаболизируются до их активных трифосфатов, которые действуют как альтернативные субстраты для полимеразы, и ненуклеозидные ингибиторы (NNI), которые связываются с аллостерическими участками в белке. Нуклеозидные или нуклеотидные ингибиторы имитируют естественный субстрат полимеразы и действуют как терминаторы цепи. Они ингибируют инициацию транскрипции РНК и удлинение растущей цепи РНК.
Кроме того, при нацеливании на РНК-полимеразу другие белки содержащего РНК вируса также могут быть мишенью для комбинированных терапевтических средств. Например, белками HCV, которые также представляют собой мишени для терапевтических подходов, являются NS3/4A (серинпротеаза) и NS5A (неструктурный белок, который является незаменимым компонентом репликазы HCV и оказывает ряд эффектов на клеточные пути).

В декабре 2013 года был одобрен первый нуклеозидный ингибитор NS5B полимеразы софосбувир (Sovaldi, Gilead Sciences). Sovaldi представляет собой уридин-фосфорамидатное пролекарство, которое поглощается гепатоцитами и подвергается внутриклеточной активации с получением активного метаболита 2'-дезокси-2'-α-фтор-β-С-метилуридин-5'-трифосфата; см. приведенные ниже структуры:

Sovaldi,
2'-дезокси-2'-α-фтор-α-С-метилуридин-5'-трифосфат.

Sovaldi является первым лекарственным средством, которое продемонстрировало безопасность и эффективность в лечении некоторых типов инфекции HCV без потребности совместного введения интерферона. Sovaldi является третьим лекарственным средством, получившим статус принципиально нового лекарственного средства при одобрении FDA.

В 2014 году FDA США одобрило Harvoni (ледиспасвир, ингибитор NS5A, и софосбувир) для лечения хронической инфекции вируса гепатита С 1 генотипа. Harvoni является первой комбинированной пилюлей, одобренной для лечения хронической инфекции HCV 1 генотипа. Это также первый одобренный режим, который не требует введения интерферона или рибавирина. Кроме того, FDA одобрило симепревир (Olysio™) в комбинации с софосбувиром (Sovaldi) как не предусматривающее интерферон и рибавирин лечение один раз в сутки, все перорально, для взрослых с инфекцией HCV 1 генотипа.
В 2014 году FDA США также одобрило VIEKIRA Pak™ компании AbbVie, упаковку с множеством пилюль, содержащую дасабувир (ненуклеозидный ингибитор полимеразы NS5B), омбитасвир (ингибитор NS5A), паритапревир (ингибитор NS3/4A) и ритонавир. VIEKIRA Pak™ может быть использован с рибавирином или без него для лечения инфицированных HCV 1 генотипа больных, в том числе больных компенсированным циррозом. VIEKIRA Pak™ не требует совместного лечения интерфероном.

В 2015 году FDA США одобрило Technivie™ и Daklinza™ для лечения инфекции HCV 4 генотипа и HCV 3 генотипа, соответственно. Technivie™ (омбитасвир/паритапревир/ритонавир) был одобрен для применения в комбинации с рибавирином для лечения инфекции HCV 4 генотипа у больных без рубцевания и цирроза и является первым вариантом для инфицированных HCV-4 больных, который не требует совместного введения интерферона. Daklinza™ был одобрен для применения с Sovaldi при лечении инфекций HCV 3 генотипа. Daklinza™ является первым лекарственным средством, которое продемонстрировало безопасность и эффективность в лечении инфекции HCV 3 генотипа без необходимости совместного введения интерферона или рибавирина.
В октябре 2015 года FDA США предупредило о том, что лечение инфекции HCV с помощью Viekira Раk и Technivie может вызывать серьезное поражение печени, прежде всего у больных с первопричинным запущенным заболеванием печени, и потребовало добавить дополнительную информацию о безопасности на этикетку.

Другие одобренные на данный момент терапевтические средства против HCV включают в себя интерферон альфа-2b или пегилированный интерферон альфа-2b (Pegintron), который может быть введен с рибавирином (Rebetol), NS3/4A телапревир (Incivek, Vertex и Johnson & Johnson), боцепревир (Victrelis™, Merck), симепревир (Olysio™, Johnson & Johnson), паритапревир (AbbVie), омбитасвир (AbbVie), (NNI) дасабувир (ABT-333) и Zepatier™ компании Merck (комбинация в одной таблетке двух лекарственных средств гразопревира и элбасвира).
В настоящее время разрабатываются дополнительные ингибиторы NS5B полимеразы. Merck является разработчиком пролекарства нуклеотида уридина MK-3682 (ранее называвшегося Idenix IDX21437). Данное лекарственное средство в настоящее время проходит комбинированные испытания II фазы.
Патенты Соединенных Штатов Америки и WO заявки, которые описывают нуклеозидные ингибиторы полимеразы для лечения Flaviviridae, в том числе HCV, включают в себя поданные компаниями Idenix Pharmaceuticals (6812219; 6914054; 7105493; 7138376; 7148206; 7157441; 7163929; 7169766; 7192936; 7365057; 7384924; 7456155; 7547704; 7582618; 7608597; 7608600; 7625875; 7635689; 7662798; 7824851; 7902202; 7932240; 7951789; 8193372; 8299038; 8343937; 8362068; 8507460; 8637475; 8674085; 8680071; 8691788, 8742101, 8951985; 9109001; 9243025; US 2016/0002281; US 2013/0064794; WO 2015/095305; WO 2015/081133; WO 2015/061683; WO 2013/177219; WO 2013/039920; WO 2014137930; WO 2014/05263 8; WO 2012/154321); Merck (6777395; 7105499; 7125855; 7202224; 7323449; 7339054; 7534767; 7632821; 7879815; 8071568; 8148349; 8470834; 8481712; 8541434; 8697694; 8715638, 9061041; 9156872 и WO2013/009737); Emory University (6348587; 6911424; 7307065; 7495006; 7662938; 7772208; 8114994; 8168583; 8609627; US 2014/0212382 и WO 2014/1244430); Gilead Sciences/Pharmasset Inc. (7842672; 7973013; 8008264; 8012941; 8012942; 8318682; 8324179; 8415308; 8455451; 8563530; 8841275; 8853171; 8871785; 8877733; 8889159; 8906880; 8912321; 8957045; 8957046; 9045520; 9085573; 9090642 и 9139604) и (6908924; 6,949,522; 7094770; 7211570; 7429572; 7601820; 7638502; 7718790; 7772208; RE42015; 7919247; 7964580; 8093380; 8114997; 8173621; 8334270; 8415322; 8481713; 8492539; 8551973; 8580765; 8618076; 8629263; 8633309; 8642756; 8716262; 8716263; 8735345; 8735372; 8735569; 8759510 и 8765710); Hoffman La-Roche (6660721), Roche (6784166; 7608599, 7608601 и 8071567); Alios BioPharma Inc. (8895723; 8877731; 8871737, 8846896, 8772474; 8980865; 9012427; US 2015/0105341; US 2015/0011497; US 2010/0249068; US 2012/0070411; WO 2015/054465; WO 2014/209979; WO 2014/100505; WO 2014/100498; WO 2013/142159; WO 2013/142157; WO 2013/096680; WO 2013/088155; WO 2010/108135), Enanta Pharmaceuticals (US 8575119; 8846638; 9085599; WO 2013/044030; WO 2012/125900), Biota (7268119; 7285658; 7713941; 8119607; 8415309; 8501699 и 8802840), Biocryst Pharmaceuticals (7388002; 7429571; 7514410; 7560434; 7994139; 8133870; 8163703; 8242085 и 8440813), Alla Chem, LLC (8889701 и WO 2015/053662), Inhibitex (8759318 и WO 2012/092484), Janssen Products (8399429; 8431588, 8481510, 8552021, 8933052; 900629 и 9012428), University of Georgia Foundation (6348587; 7307065; 7662938; 8168583; 8673926, 8816074; 8921384 и 8946244), RFS Pharma, LLC (8895531; 8859595; 8815829; 8609627; 7560550; US 2014/0066395; US 2014/0235566; US 2010/0279969; WO 2010/091386 и WO 2012/158811) University College Cardiff Consultants Limited (WO 2014/076490, WO 2010/081082; WO 2008/062206), Achillion Pharmaceuticals, Inc. (WO 2014/169278 и WO 2014/169280), Cocrystal Pharma, Inc. (US 9173893), Katholieke Universiteit Leuven (WO 2015/158913), Catabasis (WO 2013/090420) и Regents из University of Minnesota (WO 2006/004637).
Тем не менее, в медицине сохраняется острая необходимость в разработке терапевтических средств против HCV, которые являлись бы безопасными, эффективными и хорошо переносимыми. Потребность усугубляется ожиданием устойчивости к тем лекарственным средствам. Более эффективные противовирусные средства прямого действия могут значительно сократить продолжительность лечения и улучшить соблюдение режима лечения и частоту SVR для больных, инфицированных всеми генотипами HCV.
Поэтому, целью настоящего изобретения является обеспечение соединений, фармацевтических композиций, а также способов и применений для лечения и/или предупреждения инфекций HCV.
Краткое раскрытие настоящего изобретения
6
Выяснили, что соединения формулы I, формулы II, формулы III, формулы IV, формулы V, формулы VI, формулы VII и в том числе β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-N-(моно- или диметил)пуриновые нуклеотиды являются высокоактивными против вируса HCV при введении в эффективном количестве хозяину при необходимости этого. Хозяином может быть человек или любое животное, которые несут вирусную инфекцию.
Раскрываемые нуклеотиды включают в себя нуклеотиды с наномолярной активностью в отношении HCV in vitro и терапевтическими индексами, которые варьируют до 25000 или больше.
6
6
Удивительно, что исходные N-(метил)пуриновые нуклеозиды раскрываемых соединений не были разработаны или конкретно раскрыты в качестве кандидатов на лекарственные средства до настоящего изобретения. Например, в 2010 году сообщалось, что 3'-азидо-N-диметил-2,6-диаминопурин фактически не дезаминируется аденозиндезаминазой в течение длительного периода (120 минут), и по этой причине он считался несоответствующим соединением для дериватизации в качестве лекарственного средства (см., например, WO 2010/091386, страница 86, и соответствующий патент США №8609627).
6
6
Однако теперь обнаружили, что соединения в соответствии с настоящим изобретением анаболизируются до 5-монофосфата N-замещенного-пурина без существенного N-дезаминирования, а затем анаболизируются по 6-положению с образованием активных гуанинтрифосфатных соединений способом, который обеспечивает исключительные активность и терапевтический индекс.
6
6
6
6
6
50
50
50
50
50
50
В частности, выявили, что 5'-стабилизированное фосфатное пролекарство или производное β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеотида, а также β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуринового нуклеотида и другие β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-2-модифицированные-N-замещенные пуриновые нуклеотиды, раскрываемые ниже, являются высокоактивными в отношении HCV. И это удивительно, поскольку активность исходного нуклеозида β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопурина а анализе репликонов (ЕС=15,7 микромоль) указывает на то, что он не является приемлемым для применения в качестве лекарственного средства для человека из-за недостаточной активности (в комбинации со ссылкой на WO 2010/091386, страница 86, и соответствующим патентом США №8609627, в которых утверждается, что N-метил-2,6-диаминопурины не дезаминируются in vivo), однако, стабилизированное рацемическое фосфатное пролекарство (фосфорамидат) демонстрирует ЕС=26 наномоль (нМ) в анализе репликонов, что является повышением активности по меньшей мере в 600 раз. Соответствующий (S)-фосфорамидат демонстрирует ЕС=4 нМ, что что является повышением активности по меньшей мере в 3900 раз; см. приведенную ниже структуру и соединение 5-2 в таблице 7. С ТС, превышающей сто микромоль, соединение, таким образом, характеризуется терапевтическим индексом более 25000. Для сравнения, софосбувир характеризуется ЕС=53 нМ, ТС более ста микромоль и терапевтическим индексом более 1920.
Соединение 5-2 (таблица 7)
6
50
50
50
Подобным образом, активность исходного нуклеозида β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопурина в анализе репликонов (ЕС=10,7 микромоль, «мкМ») указывает на то, что он также не подходит для применения в качестве лекарственного средства для человека из-за недостаточной активности, однако, стабилизированное рацемическое фосфатное пролекарство (фосфорамидат) демонстрирует ЕС=12 нМ, в анализе репликонов, что является повышением активности более чем в 890 раз. Соответствующий (S)-фосфорамидат (соединение 25, таблица 7) также демонстрирует ЕС=4 нМ, что является повышением активности по меньшей мере в 2600 раз; см. приведенную ниже структуру. Кроме того, соединение 25 также характеризуется терапевтическим индексом более 25000.
50
50
В другом примере соединение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метил-N-циклопропил-амино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)-фенокси-фосфорил)-L-аланинат демонстрировало ЕС=7 нМ, и соответствующий (S)-фосфорамидат демонстрировал ЕС=5 нМ в анализе репликонов; см. соединение 27 в таблице 7 и приведенную ниже структуру.
6
6
50
Как указано выше, метаболизм β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида в виде фосфорамидата вовлекает продуцирование 5'-монофосфата и последующий анаболизм N-метил-2,6-диаминопуринового основания с образованием β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанинового нуклеозида в виде 5'-монофосфата. Затем монофосфат далее анаболизируется до активного соединения - 5'-трифосфата. β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанинтрифосфат характеризуется IC=0,15 мкМ в отношении NS5B полимеразы HCV 1b генотипа.
Таким образом, согласно одному варианту осуществления настоящее изобретение относится к:
где:
1
2
Y представляет собой NRR;
1
25
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
2
3
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой С-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), C-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF, CFCH и CFCF), С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил), -OR, -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -C(O)OCH, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR, каждый из которых может быть необязательно замещен;
2
3C
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
0
2
3
6
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
0
2
0
2
0
2
R представляет собой водород, С-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), С-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF и CFCF), -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -C(O)OCH), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(гетероарил); и
1
2
2
2
3
где по меньшей мере один из R и R представляет собой метил, CHF, CHF или CF;
3
3C
R представляет собой водород, , дифосфат, трифосфат, необязательно замещенную аминокислоту с карбонильной связью или -C(O)R;
3A
-
R может быть выбран из О, ОН, -О- необязательно замещенного арила, -О- необязательно замещенного гетероарила или необязательно замещенного гетероциклила;
3B
-
R может быть выбран из О, ОН, необязательно замещенной N-связанной аминокислоты или сложного эфира необязательно замещенной N-связанной аминокислоты;
3C
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
R представляет собой алкил, алкенил, алкинил, -(С-С)(циклоалкил), -(С-С)(гетероцикло), -(С-С)(арил), -(С-С)(гетероарил), -О-алкил, -О-алкенил, -О-алкинил, -О-(С-С)(циклоалкил), -O-(С-С)(гетероцикло), -O-(С-С)(арил) или -O-(С-С)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
4
R представляет собой монофосфат, дифосфат, трифосфат или стабилизированное фосфатное пролекарство, включающее в себя без ограничения фосфорамидат, тиофосфорамидат или любой другой фрагмент, который метаболизируется до монофосфата, дифосфата или трифосфата in vivo у человека-хозяина или животного-хозяина; или
3
4
R и R вместе с атомами кислорода, с которыми они связаны, могут образовывать 3',5'-циклическое пролекарство, включая в себя без ограничения 3',5'-циклическое пролекарство;
12
3
2
2
3
R представляет собой СН, CHF, CHF, CF или этинил.
Согласно одному варианту осуществления настоящее изобретение относится к:
где:
1
2
Y представляет собой NRR;
1
25
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
2
3
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой С-С алкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), С-С галогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF, CFCH и CFCF), С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил), -OR, -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR, каждый из которых может быть необязательно замещен;
2
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой водород, необязательно замещенный С-С алкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), C-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF и CFCF), необязательно замещенный -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероцикл), необязательно замещенный -(С-Салкил)(арил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероарил), -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -C(O)OCH), -C(S)R или -SOR; и
1
2
2
2
3
где по меньшей мере один из R и R представляет собой метил, CHF, CHF или CF;
3
3C
R представляет собой водород, , дифосфат, трифосфат, необязательно замещенную аминокислоту с карбонильной связью или -C(O)R;
3A
-
R может быть выбран из О, ОН, -О- необязательно замещенного арила, -О- необязательно замещенного гетероарила или необязательно замещенного гетероциклила;
3B
-
R может быть выбран из О, ОН, необязательно замещенной N-связанной аминокислоты или сложного эфира необязательно замещенной N-связанной аминокислоты;
3C
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
R представляет собой алкил, алкенил, алкинил, -(С-С)(циклоалкил), -(С-С)(гетероцикло), -(С-С)(арил), -(С-С)(гетероарил), -О-алкил, -О-алкенил, -О-алкинил, -О-(С-С)(циклоалкил), -O-(С-С)(гетероцикло), -O-(С-С)(арил), -O-(С-С)(гетероарил), -S-алкил, -S-алкенил, -S-алкинил, -S-(С-С)(циклоалкил), -S-(С-С)(гетероцикло), -S-(C-С)(арил) или -S-(С-С)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
3D
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
R представляет собой алкил, алкенил, алкинил, -(С-С)(циклоалкил), -(С-С)(гетероцикло), -(С-С)(арил), -(С-С)(гетероарил), -О-алкил, -О-алкенил, -О-алкинил, -О-(С-С)(циклоалкил), -O-(С-С)(гетероцикло), -O-(С-С)(арил) или -O-(С-С)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
4
R представляет собой монофосфат, дифосфат, трифосфат или стабилизированное фосфатное пролекарство, включающее в себя без ограничения фосфорамидат, тиофосфорамидат или любой другой фрагмент, который метаболизируется до монофосфата, дифосфата или трифосфата in vivo у человека-хозяина или животного-хозяина; или
3
4
R и R вместе с атомами кислорода, с которыми они связаны, могут образовывать 3',5'-циклическое пролекарство, включая в себя без ограничения 3',5'-циклическое пролекарство;
5
25
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой С-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), C-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF и CFCF), С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил), -OR, -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -C(O)OCH), -C(S)R или -SOR, каждый из которых может быть необязательно замещен;
6
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой водород, необязательно замещенный С-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), C-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF and CFCF), необязательно замещенный -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероцикл), необязательно замещенный -(С-Салкил)(арил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероарил), -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR; или
5
6
R и R вместе с атомом азота, с которым они связаны, могут образовывать гетероциклическое кольцо;
12
3
2
2
3
R представляет собой СН, CHF, CHF, CF или этинил;
22
3
1
6
2
6
2
6
1
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой Cl, Br, F, CN, N, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил);
23
24
25
25
26
26
27
27
27
27
27
28
27
29
27
29
29
29
29
29
30
29
29
30
5
6
2
1-4
2
2
2
2
2
-ONHC(=O)OR, -NHOR, -OR, -SR, -NH(CH)N(R), -NHNHR, -N=NR, -NHC(O)NHNHR, -NHC(S)NHNHR, -C(O)NHNHR, -NRSOR, -SONRR, -C(O)NRR, -COR, -SOR, , -P(O)H(OR), -P(O)(OR)(OR), -P(O)(OR)(NRR) или -NRR;
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
3
3
3
2
5
2
3
2
5
2
2
2
2
2
2
3
2
2
3
3
2
3
2
2
2
2
3
2
2
3
2
3
2
3
2
2
3
3
2
2
3
2
2
3
2
2
2
2
3
2
2
3
2
2
2
3
3
3
3
2
3
3
2
3
2
3
3
2
3
2
3
3
2
2
2
3
2
2
2
3
2
2
2
2
3
например, включая в себя без ограничения следующими вариантами осуществления, хлор, бром, фтор, циано, азидо, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и н-пентил, 1,1-диметилпропил, 2,2-диметилпропил, 3-метилбутил, 1-метилбутила, 1-этилпропил, винил, аллил, 1-бутинил, 2-бутинил, ацетиленил, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, -(СН)-циклопропил, -(СН)-циклобутил, -(СН)-циклопентил, -(СН)-циклогексил, азиридин, оксиран, тииран, азетидин, оксетан, тиэтан, пирролидин, тетрагидрофуран, тиолан, пиразолидин, пиперидин, океан, тиан, -(CH)-азиридин, -(СН)-оксиран, -(СН)-тииран, -(СН)-азетидин, -(СН)-оксетан, -(СН)-тиэтан, -(СН)-пирролидин, -(СН)- тетрагидрофуран, -(СН)-тиолан, -(СН)-пиразолидин, -(СН)-пиперидин, -(СН)-оксан, -(СН)-тиан, фенил, пиридил, -ONHC(=O)ОСН, ONHC(=O)OCHCH, -NHOH, NHOCH, -ОСН, ОСН, -OPh, OCHPh, -SCH, -SCH, -SPh, SCHPh, -NH(CH)NH, -NH(CH)N(CH), -NHNH, -NHNHCH, -N=NH, -N=NCH, -N=NCHCH, -NHC(O)NHNH, -NHC(S)NHNH, -C(O)NHNH, -NHSOCH, -NHSOCHCH, -SONHCH, -SON(CH), -C(O)NH, -C(O)NHCH, -C(O)N(CH), -COCH, -COCHCH, -COPh, -COCHPh, -SOCH, -SOCHCH, -SOPh, -SOCHPh, , , -P(O)H(OH), -P(O)H(OCH), -P(O)(OH)(OH), -P(O)(OH)(OCH), -Р(O)(ОСН)(ОСН), -P(O)(OH)(NH), -P(O)(OH)(NHCH), -P(O)(OH)N(CH), -NHC(O)CH, -NHC(O)СНСН, -NHC(O)CH(CH), -NHC(O)OCH, -NHC(O)OCHCH, -NHC(O)OCH(CH), NHC(O)OCHCHCH, -NHC(O)OCHCHCHCH и -NHC(O)OCHCHCHCHCH;
23
1
5
0
2
3
6
0
2
0-2
0
2
R представляет собой C-Салкил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(C-Салкил)(гетероцикл)-(Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
24
1
6
1
2
3
6
1
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(C-Салкил)(С-Сгетероцикл) -(С-Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен;
25
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен;
26
1
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
R независимо выбран из водорода, C-Салкил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен;
27
1
6
R представляет собой водород или необязательно замещенный C-С алкил;
28
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой С-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
29
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен; или
27
29
R и R вместе с атомом азота, с которым они связаны, могут образовывать гетероциклическое кольцо;
30
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(ССциклоалкил), -(С-Салкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен; или
29
30
R и R могут быть связаны вместе с образованием гетероциклического кольца;
х равно 1, 2 или 3.
6
6
Метаболизм β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуринового нуклеотида предусматривает как образование трифосфата β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуринового нуклеозида, так и образование соответствующего трифосфата гуанинового нуклеозида. См. схемы 2 и 3.
6
2
6
2
2
6
6
2
2'-Дезокси-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-N-замещенные-2,6-диаминопуриновые нуклеотиды могут быть далее замещены по N-положению путем алкилирования или ацилированы, что может модифицировать липофильность, фармакокинетические показатели и/или нацеливание нуклеотида на печень. Выявили, что 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-N-замещенные-2,6-диаминопуриновые нуклеотиды, модифицированные по 2-положению диаминопурина, могут быть деалкилированы или деацилированы ферментами печени с дальнейшим повышением специфичности нуклеотидных производных как in vitro, так и in vivo, если только N-аминогруппа не заменена другим фрагментом, как описывается в настоящем документе, таким как фтор. Например, фосфорамидат нуклеозида - фосфорамидат 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида деалкилируется до фосфорамидата 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида при инкубации с фракцией S9 печени человека in vitro до 60 минут, эти условия имитируют in vivo условия. Согласно одному варианту осуществления модификации N будут повышать клеточную проницаемость и нацеливание на печень.
6
6
6
Несмотря на объем литературы по противовирусным нуклеозидам и поданных патентных документов 5'-стабилизированное фосфатное производное 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида, 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуриновый нуклеозид и другие производные β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеозида, описываемые в настоящем документе, не были конкретно раскрыты, а также не были описаны их положительные эффекты.
4
Если не указано иное, соединения, описываемые в настоящем документе, представлены в β-D-конфигурации. Подобным образом, при фосфорамидной или тиофосфорамидатной форме аминокислотная часть может иметь L- или D-конфигурацию. Согласно альтернативному варианту осуществления соединения могут быть представлены в β-L-конфигурации. Подобным образом, любая группа заместителей, которая обладает хиральностью, может быть представлена в рацемической, энантиомерной, диастереомерной форме или любой их смеси. Если фосфорамидат, тиофосфорамидат или другое стабилизированное содержащее фосфор пролекарство, в котором фосфор обладает хиральностью, используют в качестве R-стабилизированного фосфатного пролекарства, то они могут быть обеспечены в виде R или S хирального фосфорного производного или его смеси, в том числе рацемической смеси. Все комбинации этих стереоконфигураций включены в настоящее изобретение, описываемое в настоящем документе.
Следовательно, настоящее изобретение относится к соединению формулы I-VII или его к фармацевтически приемлемой композиции, соли или пролекарству, описываемым в настоящем документе,
формула I.
4
Согласно одному конкретному варианту осуществления исходный нуклеозид, т.е. нуклеозид, в котором R представляет собой водород, и 5'-положение, таким образом, содержит гидроксильную группу, фактически не дезаминируется аденозиндезаминазой при условиях, которые имитируют in vivo окружение (например, окружающую температуру и водный физиологический рН), в течение периода 7 минут, 10 минут, 30 минут, 60 минут или 120 минут. Если не указано иное, временной период составляет 30 минут. Согласно данному варианту осуществления термин «фактически не дезаминируется» означает, что исходное соединение не превращается в соответствующее гуаниновое производное или 6-оксопроизводное в количестве, достаточном для обеспечения терапевтического эффекта in vivo.
Соединения, способы и композиции предназначены для лечения хозяина, инфицированного вирусом HCV, путем введения эффективного количества соединения или его фармацевтически приемлемой соли.
Соединения и композиции также могут быть использованы для лечения родственных состояний, таких как состояния, которые сопровождаются наличием антител против HCV и антигенов, вызванное вирусом хроническое воспаление печени, злокачественная опухоль печени, вызванная запущенным гепатитом С, цирроз, хронический или острый гепатит С, молниеносный гепатит С, хронический персистирующий гепатит С и утомление, вызванное образованием антител против HCV. Соединение или составы, которые включают в себя соединения, также могут быть использованы профилактически для предупреждения или ограничения прогрессирования клинической болезни у индивидуумов с наличием антител против HCV или наличием антигенов, или которые подверглись воздействию вируса гепатита С.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы Ia:
где:
3
4
Y, R и R определены выше.
3
Согласно одному варианту осуществления формулы Ia R представляет собой водород.
1
2
1
2
Согласно одному варианту осуществления формулы Ia, если Y представляет собой NRR, R представляет собой метил и R представляет собой водород.
1
2
1
2
Согласно одному варианту осуществления формулы Ia, если Y представляет собой NRR, оба R и R представляют собой метил.
1
2
1
2
Согласно одному варианту осуществления формулы Ia, если Y представляет собой NRR, R представляет собой метил и R представляет собой циклопропил.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы Ib:
где:
3
4
Y, R и R определены выше.
3
Согласно одному варианту осуществления формулы Ib R представляет собой водород.
1
2
1
2
Согласно одному варианту осуществления формулы Ib, если Y представляет собой NRR, R представляет собой метил и R представляет собой водород.
1
2
1
2
Согласно одному варианту осуществления формулы Ib, если Y представляет собой NRR, оба R и R представляют собой метил.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы II:
где:
3
4
12
22
Y, R, R, R и R определены выше.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы IIa:
где:
3
4
22
Y, R, R и R определены выше.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы IIb:
где:
3
4
22
Y, R, R и R определены выше.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы III:
3
7
8
9a
9b
10
12
22
где переменные Y, R, R, R, R, R, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы IV:
3
7
8
9a
9b
10
22
где переменные Y, R, R, R, R, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы V:
3
7
8
9a
9b
10
22
где переменные Y, R, R, R, R, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы VI:
где:
41
3
3
2
R представляет собой галоген (в частности, F или Cl), OR, N, NH или CN; и
3
4
12
переменные Y, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы VII:
3
4
12
41
где переменные Y, R, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
Фосфор в любой из приведенных выше формул может быть хиральным и, таким образом, может быть представлен в виде R- или S-энантиомера или их смеси, в том числе рацемической смеси.
Соединение 5 разделяли на энантиомерные соединения 5-1 и 5-2. Соединение 5-2 также получали с помощью хирального синтеза и обозначали как соединение 24.
6

Согласно одному варианту осуществления соединения, способы и композиции предназначены для лечения хозяина, инфицированного вирусом гепатита С или подвергнувшегося воздействию такового, как описывается в настоящем документе. Соединения в соответствии с настоящим изобретением могут быть введены в эффективном количестве отдельно или в комбинации с другим лекарственным средством против HCV для лечения инфицированного хозяина. Согласно некоторым вариантам осуществления полезно вводить комбинацию лекарственных средств, которые модулируют один и тот же путь или разные пути или ингибируют другую мишень в вирусе. Когда раскрываемое β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-2-модифицированные-N-замещенные пуриновые нуклеотиды являются ингибиторами NS5B полимеразы, полезно вводить соединение хозяину в комбинации с ингибитором протеазы, таким как ингибитор NS3/4A протеазы (например, телапревир (Incivek), боцепревир (Victrelis™), симепревир (Olysio™) или паритапревир, или ингибитор NS5A (например, омбитасвир). Соединения в соответствии с настоящим изобретением также можно вводить в комбинации с структурно отличающимся ингибитором NS5B полимеразы, таким как другое соединение, описываемое в настоящем документе выше или ниже, в том числе Sovaldi компании Gilead. Соединения в соответствии с настоящим изобретением также можно вводить в комбинации с интерфероном альфа-2а, который может быть пегилированным или иным образом модифицированным, и/или рибавирином.
6
β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-2-модифицированные-N-замещенные пуриновые нуклеотиды в соответствии с настоящим изобретением, как правило, вводятся перорально, например, в форме пилюли или таблетки, но могут вводиться другим путем, который определяет лечащий врач, в том числе внутривенным, чрескожным, подкожным, местным, парентеральным или другим приемлемым путем.
Краткое раскрытие графических материалов
На фиг. 1 представлена простая хроматограмма полупрепаративного хроматографирования, иллюстрирующая разделение стереоизомеров соединения 5 с использованием колонки Phenominex Luna, как раскрывается в примере 9. По оси у показаны mAU, а по оси х показаны измерения в минутах.
50
50
50
50
На фиг. 2 представлен график кривых ингибирования репликации HCV для соединения 5-2 (таблица 7) и софосбувира. Соединение 5-2 характеризуется ЕС=4 нМ, ТС, превышающей сто микромоль, и терапевтическим индексом более чем 25000. Софосбувир характеризуется ЕС=53 нМ, ТС, превышающей сто микромоль, и терапевтическим индексом более чем 1920. По оси у показан вирусный контроль, а по оси х -концентрация лекарственного средства в мкМ.
50
50
50
50
На фиг. 3 представлен график кривых ингибирования репликации HCV для соединения 25 (таблица 7) и софосбувира. Как описывается в примере 27, соединение 25 характеризуется ЕС=4 нМ, ТС, превышающей 100 мкМ, и терапевтическим индексом более чем 25000. Софосбувир характеризуется ЕС=53 нМ, ТС, превышающей сто микромоль, и терапевтическим индексом более чем 1920. По оси у показан вирусный контроль, а по оси х - концентрация лекарственного средства в мкМ.
На фиг. 4 представлено сравнение внутри анализа активности в отношении HCV для соединений 5-2, 25, 27 (таблица 7) и софосбувира. По оси у показан вирусный контроль, а по оси х - концентрация лекарственного средства в мкМ. См. пример 27.
2
2
2
2
На фиг. 5 представлен график, который показывает стабильность соединений 5-2, N-ацетата соединения 5-2, N-бутирата соединения 5-2, N-метильного производного соединения 5-2 и N-н-пентилкарбамата соединения 5-2 в организме человека. По оси х показано время инкубации, измеренное в минутах, а по оси у показано измерение оставшегося исходного соединения в процентах.
2
6
6
На фиг. 6 представлен график, демонстрирующий in vitro зависимость от времени деалкилирования фосфорамидата 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида до фосфорамидата 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида в присутствии фракции S9 печени человека. По оси х показаны измерения в минутах, а по оси у представлено измерение концентрации оставшегося соединения в нМ.
2
2
2
2
На фиг. 7 представлен график, который показывает стабильность соединений 5-2, N-ацетата соединения 5-2, N-бутирата соединения 5-2, N-метильного производного соединения 5-2 и N-н-пентилкарбамата соединения 5-2 в присутствии фракции S9 печени человека. По оси х показаны измерения в минутах, а по оси у показано измерение оставшегося исходного соединения в процентах.
6
На фиг. 8 показаны преобладающие метаболиты соединения 25, образовавшиеся в гепатоцитах человека. По оси х показано время инкубации в часах. По оси у показана внутриклеточная концентрация в пмоль/10 клеток. См. пример 33.
6
На фиг. 9 показаны преобладающие метаболиты соединения 27, образовавшиеся в гепатоцитах человека. По оси х показано время инкубации в часах. По оси у показана внутриклеточная концентрация в пмоль/10 клеток. См. пример 33.
6
На фиг. 10 показаны преобладающие метаболиты соединения 5-2, образовавшиеся в гепатоцитах человека. По оси х показано время инкубации в часах. По оси у показана внутриклеточная концентрация в пмоль/10 клеток. См. пример 33.
На фиг. 11 представлен график, который показывает пути активации для соединений 25, 27 и 5-2. Ка можно видеть, соединения 25, 27 и 5-2 превращаются в их соответствующие монофосфатные аналоги, которые затем метаболизируются до общего MP аналога - монофосфата β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанина. Монофосфат затем постадийно фосфорилируется до активного трифосфата - трифосфата β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанина. См. пример 33.
Подробное раскрытие настоящего изобретения
Настоящее изобретение, раскрываемое в настоящем документе, относится к соединению, способу и композиции для лечения инфекций у людей и других животных-хозяев вируса HCV или для воздействия на таковых, при этом предусматривается введение эффективного количества соединения формул I-VII, описываемых в настоящем документе, или его фармацевтически приемлемой соли или пролекарства, необязательно в фармацевтически приемлемом носителе. Соединения в соответствии с настоящим изобретением либо обладают противовирусной активностью, либо метаболизируются до соединения, которое проявляет такую активность.
Соединения и композиции также могут быть использованы для лечения состояний, связанных с воздействием вируса HCV или возникающих в результате такового. Например, активное соединение может быть использовано для лечения состояний, которые сопровождаются наличием антител против HCV и антигенов, вызванного вирусом хронического воспаления печени, злокачественной опухоли печени, вызванной запущенным гепатитом С, цирроза, хронического или острого гепатита С, молниеносного гепатита С, хронического персистирующего гепатита С и утомления, вызванного образованием антител против HCV. Согласно одному варианту осуществления соединения или составы, которые включают в себя соединения, также могут быть использованы профилактически для предупреждения или замедления прогрессирование прогрессирования клинической болезни у индивидуумов с наличием антител против HCV или наличием антигенов HCV, или которые подверглись воздействию вируса гепатита С.
6
6
6
6
6
50
50
50
50
В частности, выявили, что 5'-стабилизированное фосфатное пролекарство или производное β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеотида, а также β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуриновый нуклеотид и другие β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-2-модифицированные-N-замещенные пуриновые нуклеотиды, раскрываемые ниже, являются высокоактивными в отношении HCV. И это удивительно, поскольку активность исходного нуклеозида β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопурина а анализе репликонов (ЕС=15,7 микромоль) указывает на то, что он не является приемлемым для применения в качестве лекарственного средства для человека из-за недостаточной активности, однако, стабилизированное фосфатное пролекарство (фосфорамидат) демонстрирует ЕС=26 наномоль в анализе репликонов, что является повышением активности по меньшей мере в 870 раз. Подобным образом, активность исходного нуклеозида β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопурина в анализе репликонов (ЕС=10,7 микромоль, «мкМ») указывает на то, что он также не подходит для применения в качестве лекарственного средства для человека из-за недостаточной активности, однако, стабилизированное фосфатное пролекарство (фосфорамидат) демонстрирует ЕС=12 наномоль («нМ») в анализе репликонов, что является повышением активности более чем в 1300 раз.
6
6
6
Несмотря на объем литературы по противовирусным нуклеозидам и поданных патентных документов 5'-стабилизированное фосфатное производное 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида, 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуриновый нуклеозид и другие производные β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеозида, описывамые в настоящем документе, не были конкретно раскрыты.
4
Если не указано иное, соединения, описываемые в настоящем документе, представлены в β-D-конфигурации. Согласно альтернативному варианту осуществления соединения могут быть представлены в β-L-конфигурации. Подобным образом, любая группа заместителей, которая обладает хиральностью, может быть представлена в рацемической, энантиомерной, диастереомерной форме или любой их смеси. Если фосфорамидат, тиофосфорамидат или другое стабилизированное содержащее фосфор пролекарство, в котором фосфор обладает хиральностью, используют в качестве R-стабилизированного фосфатного пролекарства, оно может быть обеспечено в виде R или S хирального фосфорного производного или его смеси, в том числе рацемической смеси. Аминокислота фосфорамидата или тиофосфорамидата может быть в L- или D-конфигурации или их смеси, в том числе рацемической смеси. Все комбинации этих стереоконфигураций включены в настоящее изобретение, описываемое в настоящем документе.
Настоящее изобретение включает в себя следующие признаки:
(a) соединение формул I-VII, описываемое в настоящем документе, и его фармацевтически приемлемые соли и пролекарства;
(b) соединение формул I-VII, описываемое в настоящем документе, и его фармацевтически приемлемые соли и пролекарства для применения в лечении или профилактике инфекции вируса гепатита С;
(c) применение соединения формул I-VII, описываемого в настоящем документе, и его фармацевтически приемлемых солей и пролекарств в изготовлении медикамента для лечения инфекции вируса гепатита С;
(d) способ изготовления медикамента, предназначенного для терапевтического применения при лечении инфекции вируса гепатита С, характеризующийся тем, что в изготовлении используют соединение формул I-VII, описываемое в настоящем документе;
(e) фармацевтический состав, содержащий эффективное для лечения хозяина количество соединения формул I-VII или его фармацевтически приемлемой соли или пролекарства вместе с фармацевтически приемлемым носителем или разбавителем;
(f) соединение формул I-VII, описываемое в настоящем документе, при отсутствии, по сути, стереоизомеров описываемого соединения, или выделенное, по сути, из других химических соединений; и
(g) процессы получения терапевтических продуктов, которые содержат эффективное количество соединения формул I-VII, описываемого в настоящем документе.
6
I. 2'-Деокси-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-2-модифицированные-N-замещенные пуриновые нуклеотиды по настоящему изобретению
Активными соединениями по настоящему изобретению являются такие соединения, которые изображены, например, при помощи формулы I, которые могут быть обеспечены в виде их фармацевтически приемлемой композиции, соли или пролекарства:
где:
1
2
Y представляет собой NRR;
1
25
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
2
3
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой С-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), С-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF, CFCH и CFCF), С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил), -OR, -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR, каждый из которых может быть необязательно замещен;
2
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой водород, необязательно замещенный C-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), C-С галогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF и CFCF), необязательно замещенный -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероцикл), необязательно замещенный -(С-Салкил)(арил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероарил), -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR; и
1
2
2
2
3
где по меньшей мере один из R и R представляет собой метил, CHF, CHF или CF;
3
3C
R представляет собой водород, , дифосфат, трифосфат, необязательно замещенную аминокислоту с карбонильной связью или -C(O)R;
3A
-
R может быть выбран из О, ОН, -О- необязательно замещенного арила, -О- необязательно замещенного гетероарила или необязательно замещенного гетероциклила;
3B
-
R может быть выбран из О, ОН, необязательно замещенной N-связанной аминокислоты или сложного эфира необязательно замещенной N-связанной аминокислоты;
3C
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
R представляет собой алкил, алкенил, алкинил, -(С-С)(циклоалкил), -(С-С)(гетероцикло), -(С-С)(арил), -(С-С)(гетероарил), -О-алкил, -О-алкенил, -О-алкинил, -О-(С-С)(циклоалкил), -O-(С-С)(гетероцикло), -O-(С-С)(арил) или -O-(С-С)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
4
R представляет собой монофосфат, дифосфат, трифосфат или стабилизированное фосфатное пролекарство, включающее в себя без ограничения фосфорамидат, тиофосфорамидат или любой другой фрагмент, который метаболизируется до монофосфата, дифосфата или трифосфата in vivo у человека-хозяина или животного-хозяина; или
3
4
R и R вместе с атомами кислорода, с которыми они связаны, могут образовывать 3',5'-циклическое пролекарство, включая в себя без ограничения 3',5'-циклическое пролекарство;
12
3
2
2
3
R представляет собой СН, CHF, CHF, CF или этинил.
Стабилизированное фосфатное пролекарство представляет собой любой фрагмент, который может доставлять моно-, ди- или трифосфат.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы Ia:
где:
3
4
Y, R и R определены выше.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы Ib:
где:
3
4
Y, R и R определены выше.
Согласно другому варианту осуществления соединение представляет собой соединение формулы Ic:
где:
7
7'
7'
7''
7'
7''
11
7
1-6
3-7
1-6
2-6
2-6
1-6
1-6
2
1-6
2
1-6
2
2
2
1-6
1-6
2
R представляет собой водород, Cалкил; Сциклоалкил; гетероарил, гетероциклический радикал или арил, который включает в себя без ограничения фенил или нафтил, где фенил или нафтил необязательно замещены Cалкилом, Салкенилом, Салкинилом, Cалкокси, F, Cl, Br, I, нитро, циано, Cгалогеналкилом, -N(R), Cациламино, NHSOCалкилом, -SON(R), COR и -SOCалкил; (R независимо представляет собой водород или Cалкил; R представляет собой -OR или -N(R));
8
9a
9b
8
1-6
2
n
R представляет собой водород, Cалкил или R или R и R оба представляют собой (СН) таким образом, что образуют циклическое кольцо, которое содержит смежные атомы N и С; где n равно 2-4;
9a
9b
9'
9''
9a
9b
9a
9b
9a
9b
8
9b
9a
8
9'
9''
11
11'
9a
9b
9a
9b
1-6
2
c
2
1-6
2
2
2
2
3
2
2
c
1-3
1-6
1-6
1-6
2
r
2
n
2
n
1-6
2
3
2
3
3
2
2
3
2
3
2
3
2
2
2
2
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
2
3
2
3
3
2
2
3
2
3
2
3
2
2
2
2
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
2
R и R (i) независимо выбраны из водорода, Cалкила, циклоалкила, -(CH)(NR), Cгидроксиалкила, --CHSH, -(CH)S(O)(Me, -(CH)NHC(=NH)NH, (1Н-индол-3-ил)метила, (1Н-имидазол-4-ил)метила, -(CH)COR, арила и арил(Cалкил)-, арильные группы необязательно могут быть замещены группой, выбранной из гидроксила, Cалкила, Cалкокси, галогена, нитро и циано; (ii) R и R оба представляют собой Cалкил; (iii) R и R оба представляют собой (СН) таким образом, что образуют спирокольцо; (iv) R представляет собой водород и R и R оба представляют собой (СН) таким образом, что образуют циклическое кольцо, которое содержит смежные атомы N и С (v) R представляет собой водород и R и R оба представляют собой (СН) таким образом, что образуют циклическое кольцо, которое содержит смежные атомы N и С, где с равно 1-6, n равно 2-4, r равно 2-5 и где R независимо представляет собой водород или C алкил и R представляет собой -OR или -N(R)); (vi) R представляет собой водород и R представляет собой водород, СН, СНСН, СН(СН), СНСН(СН), СН(СН)СНСН, CHPh, СН-индол-3-ил, -CHCHSCH, CHCOH, CHC(O)NH, СНСНСООН, CHCHC(O)NH, CHCHCHCHNH, -CHCHCHNHC(NH)NH, СН-имидазол-4-ил, СНОН, СН(ОН)СН, CH((4'-OH)-Ph), CHSH или низший циклоалкил; или (vii) R представляет собой СН, СНСН, СН(СН), СНСН(СН), СН(СН)СНСН, CHPh, CH-индол-3-ил, -CHCHSCH, СНСОН, CHC(O)NH, СНСНСООН, CHCHC(O)NH, CHCHCHCHNH, -CHCHCHNHC(NH)NH, СН-имидазол-4-ил, CHOH, СН(ОН)СН, CH((4'-OH)-Ph), CHSH или низший циклоалкил и R представляет собой водород;
10
1-6
1-6
3-7
R представляет собой водород, Cалкил, необязательно замещенный алкокси, ди(низший алкил)амино или галогеном, Cгалогеналкил, Сциклоалкил, гетероциклоалкил, аминоацил, арил, такой как фенил, гетероарил, такой как пиридинил, замещенный арил или замещенный гетероарил;
11
1-6
2-6
2-6
1-6
R представляет собой необязательно замещенный Cалкил, необязательно замещенный циклоалкил; необязательно замещенный Салкинил, необязательно замещенный Салкенил или необязательно замещенный ацил, который включает в себя без ограничения С(O)(С алкил); и
3
12
Y, R и R определены в настоящем описании.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы II:
где:
1
2
Y представляет собой NRR;
1
25
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
2
3
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой С-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), С-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF, CFCH и CFCF), С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил), -OR, -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR, каждый из которых может быть необязательно замещен;
2
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой водород, необязательно замещенный C-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), C-С галогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF и CFCF), необязательно замещенный -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероцикл), необязательно замещенный -(С-Салкил)(арил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероарил), -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR; и
1
2
2
2
3
где по меньшей мере один из R и R представляет собой метил, CHF, CHF или CF;
3
3C
R представляет собой водород, , дифосфат, трифосфат, необязательно замещенную аминокислоту с карбонильной связью или -C(O)R;
3A
-
R может быть выбран из О, ОН, -О- необязательно замещенного арила, -О- необязательно замещенного гетероарила или необязательно замещенного гетероциклила;
3B
-
R может быть выбран из О, ОН, необязательно замещенной N-связанной
аминокислоты или сложного эфира необязательно замещенной N-связанной аминокислоты;
3C
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
R представляет собой алкил, алкенил, алкинил, -(С-С)(циклоалкил), -(С-C)(гетероцикло), -(С-C)(арил), -(С-C)(гетероарил), -О-алкил, -О-алкенил, -О-алкинил, -О-(С-C)(циклоалкил), -O-(С-C)(гетероцикло), -O-(С-C)(арил), -O-(С-C)(гетероарил), -S-алкил, -S-алкенил, -S-алкинил, -S-(С-C)(циклоалкил), -S-(С-C)(гетероцикло), -S-(С-C)(арил) или -S-(С-C)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
3D
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
0
2
R представляет собой алкил, алкенил, алкинил, -(С-C)(циклоалкил), -(С-C)(гетероцикло), -(С-C)(арил), -(С-C)(гетероарил), -О-алкил, -О-алкенил, -О-алкинил, -О-(С-C)(циклоалкил), -O-(С-C)(гетероцикло), -O-(С-C)(арил) или -O-(С-C)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
4
R представляет собой монофосфат, дифосфат, трифосфат или стабилизированное фосфатное пролекарство, включающее в себя без ограничения фосфорамидат, тиофосфорамидат или любой другой фрагмент, который метаболизируется до монофосфата, дифосфата или трифосфата in vivo у человека-хозяина или животного-хозяина; или
3
4
R и R вместе с атомами кислорода, с которыми они связаны, могут образовывать 3',5'-циклическое пролекарство, включая в себя без ограничения 3',5'-циклическое пролекарство;
5
25
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой C-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), С-С галогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF и CFCF), С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл), -(С-Салкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил), -OR, -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)OСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR, каждый из которых может быть необязательно замещен;
6
3C
3D
28
1
5
1
5
2
2
3
2
3
2
3
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
3
2
3
3
2
3
2
5
3
7
4
9
5
11
2
R представляет собой водород, необязательно замещенный С-Салкил (включая метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и пентил), C-Сгалогеналкил (включая CHF, CHF, CF, CHCF и CFCF), необязательно замещенный -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероцикл), необязательно замещенный -(С-Салкил)(арил), необязательно замещенный -(С-Салкил)(гетероарил), -C(O)R (включая -С(O)СН, -С(O)СНСН-С(O)СН(СН), -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН, -С(O)ОСН и -С(O)ОСН), -C(S)R или -SOR; или
5
6
R и R вместе с атомом азота, с которым они связаны, могут образовывать гетероциклическое кольцо;
12
3
2
2
3
R представляет собой СН, CHF, CHF, CF или этинил;
22
23
24
25
25
26
26
27
27
27
27
27
28
27
29
27
29
29
29
29
29
30
29
29
30
5
6
3
1
6
2
6
2
6
1
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
2
1-4
2
2
2
2
2
R представляет собой Cl, Br, F, CN, N, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(C-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Cалкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Cалкил)(арил), -(С-Салкил)(гетероарил); -ONHC(=O)OR, -NHOR, -OR, -SR, -NH(CH)N(R), -NHNHR, -N=NR, -NHC(O)NHNHR, -NHC(S)NHNHR, -C(O)NHNHR, -NRSOR, -SONRR, -C(O)NRR, -COR, -SOR, , -P(O)H(OR), -P(O)(OR)(OR), -P(O)(OR)(NRR) или -NRR;
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
3
3
3
2
5
2
3
2
5
2
2
2
2
2
2
3
2
2
3
3
2
3
2
2
2
2
3
2
2
3
2
3
2
3
2
2
3
3
2
2
3
2
2
3
2
2
2
2
3
2
2
3
2
2
2
3
3
3
3
2
3
3
2
3
2
3
3
2
3
2
3
3
2
2
2
3
2
2
2
3
2
2
2
2
3
например, включая в себя без ограничения следующими вариантами осуществления, хлор, бром, фтор, циано, азидо, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и н-пентил, 1,1-диметилпропил, 2,2-диметилпропил, 3-метилбутил, 1-метилбутил, 1-этилпропил, винил, аллил, 1-бутинил, 2-бутинил, ацетиленил, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, -(СН)-циклопропил, -(CH)-циклобутил, -(CH)-циклопентил, -(CH)-циклогексил, азиридин, оксиран, тииран, азетидин, оксетан, тиэтан, пирролидин, тетрагидрофуран, тиолан, пиразолидин, пиперидин, оксан, тиан, -(CH)-азиридин, -(СH)-оксиран, -(СН)-тииран, -(CH)-азетидин, -(CH)-оксетан, -(CH)-тиэтан, -(CH)-пирролидин, -(СН)-тетрагидрофуран, -(СН)-тиолан, -(CH)-пиразолидин, -(CH)-пиперидин, -(CH)-оксан, -(СН)-тиан, фенил, пиридил, -ONHC(=O)OCH, -ONHC(=O)OCHCH, -NHOH, NHOCH, -ОСН, OCH, -OPh, OCHPh, -SCH, -SCH, -SPh, SCHPh, -NH(CH)NH, -NH(CH)N(CH), -NHNH, -NHNHCH, -N=NH, -N=NCH, -N=NCHCH, -NHC(O)NHNH, -NHC(S)NHNH, -C(O)NHNH, -NHSOCH, -NHSOCHCH, -SONHCH, -SON(CH), -C(O)NH, -C(O)NHCH, -C(O)N(CH), -COCH, -COCHCH, -COPh, -COCHPh, -SOCH, -SOCHCH, -SOPh, -SOCHPh, , , -P(O)H(OH), -P(O)H(OCH), -P(O)(OH)(OH), -P(O)(OH)(OCH), -Р(O)(ОСН)(ОСН), -P(O)(OH)(NH), -P(O)(OH)(NHCH), -P(O)(OH)N(CH), -NHC(O)CH, -NHC(O)CHCH, -NHC(O)CH(CH), -NHC(O)OCH, -NHC(O)OCHCH, -NHC(O)OCH(CH), -NHC(O)OCHCHCH, -NHC(O)OCHCHCHCH и -NHC(O)OCHCHCHCHCH;
23
1
5
0
2
3
6
0
2
0-2
0
2
R представляет собой C-Салкил, -(С-Cалкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Салкил)(гетероцикл)-(Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
24
1
6
1
2
3
6
1
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(C-Салкил)(С-Сгетероцикл) -(С-Cалкил)(арил) или -(С-Cалкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен;
25
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Cалкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Cалкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Салкил)(арил) или -(С-Cалкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен;
26
1
6
0
2
3
6
0
2
0
2
0
2
R независимо выбран из водорода, C-Салкил, -(С-Cалкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Cалкил)(гетероцикл), -(С-Cалкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен;
27
1
6
R представляет собой водород или необязательно замещенный C-Салкил;
28
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Cалкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Cалкил)(арил) или -(С-Cалкил)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен;
29
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Cалкил)(С-Сциклоалкил), -(С-Cалкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Cалкил)(арил) или -(С-Cалкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен; или
27
29
R и R вместе с атомом азота, с которым они связаны, могут образовывать гетероциклическое кольцо;
30
1
6
2
6
2
6
0
2
3
6
0
2
3
6
0
2
0
2
R представляет собой водород, C-С алкил, С-С алкенил, С-С алкинил, -(С-Салкил)(ССциклоалкил), -(С-Салкил)(С-Сгетероцикл), -(С-Салкил)(арил) или -(С-Салкил)(гетероарил), где, за исключением водорода, каждый из которых может быть необязательно замещен; или
29
30
R и R могут быть связаны вместе с образованием гетероциклического кольца;
х равно 1, 2 или 3.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы IIа:
где:
3
4
22
Y, R, R и R определены выше.
Согласно другому варианту осуществления раскрыты соединения формулы IIb:
где:
3
4
22
Y, R, R и R определены выше.
Согласно типичному варианту осуществления соединение представляет собой β-D изомер на основании соответствующего нуклеозида (т.е., во встречающейся в природе конфигурации). В альтернативной конфигурации соединение представлено в виде β-L изомера. Соединение типично по меньшей мере на 90% свободно от противоположного энантиомера и может быть по меньшей мере на 98%, 99% или даже на 100% свободно от противоположного энантиомера. Если не описано иное, соединение по меньшей мере на 90% свободно от противоположного энантиомера.
Согласно другому варианту осуществления соединение представляет собой соединение формулы III:
где:
7
7'
7'
7''
7'
7''
11
7
1-6
3-7
1-6
2-6
2-6
1-6
1-6
2
1-6
2
1-6
2
2
2
1-6
1-6
2
R представляет собой водород, Cалкил; Сциклоалкил; гетероарил, гетероциклический радикал или арил, который включает в себя без ограничения фенил или нафтил, где фенил или нафтил необязательно замещены Cалкилом, Салкенилом, Cалкинилом, Cалкокси, F, Cl, Br, I, нитро, циано, Cгалогеналкилом, -N(R), Cациламино, NHSOCалкилом, -SON(R), COR и -SOCалкилом; (R независимо представляет собой водород или Cалкил; R представляет собой -OR или -N(R));
8
9a
9b
8
1-6
2
n
R представляет собой водород, Cалкил или R или R и R оба представляют собой (CH) таким образом, что образуют циклическое кольцо, которое содержит смежные атомы N и С; где n равно 2-4;
9a
9b
9'
9''
9a
9b
9a
9b
9a
9b
8
9b
9a
8
9'
9''
11
11'
9a
9b
9a
9b
1-6
2
c
2
1-6
2
2
2
2
3
2
2
c
1-3
1-6
1-6
1-6
2
r
2
n
2
n
1-6
2
3
2
3
3
2
2
3
2
3
2
3
2
2
2
2
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
2
3
2
3
3
2
2
3
2
3
2
3
2
2
2
2
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
2
R и R (i) независимо выбраны из водорода, Cалкила, циклоалкила, -(CH)(NR), Cгидроксиалкила, -CHSH, -(CH)S(O)(Me, -(CH)NHC(=NH)NH, (1H-индол-3-ил)метила, (1Н-имидазол-4-ил)метила, -(CH)COR, арила и арил(Cалкил)-, арильные группы необязательно могут быть замещены группой, выбранной из гидроксила, Cалкила, Cалкокси, галогена, нитро и циано; (ii) R и R оба представляют собой Cалкил; (iii) R и R оба представляют собой (СH) таким образом, что образуют спирокольцо; (iv) R представляет собой водород и R и R оба представляют собой (CH) таким образом, что образуют циклическое кольцо, которое содержит смежные атомы N и С (v) R представляет собой водород и R и R оба представляют собой (CH) таким образом, что образуют циклическое кольцо, которое содержит смежные атомы N и С, где с равно 1-6, n равно 2-4, r равно 2-5 и где R независимо представляет собой водород или С алкил и R представляет собой -OR или -N(R)); (vi) R представляет собой водород и R представляет собой водород, СН, CHCH, СН(СН), СНСН(СН), СН(СН)СНСН, CHPh, СН-индол-3-ил, -CHCHSCH, CHCOH, CHC(O)NH, CHCHCOOH, CHCHC(O)NH, CHCHCHCHNH, -CHCHCHNHC(NH)NH, СН-имидазол-4-ил, CHOH, CH(OH)CH, CH((4'-OH)-Ph), CHSH или низший циклоалкил; или (vii) R представляет собой СН, CHCH, СН(СН), СНСН(СН), СН(СН)СНСН, CHPh, СН-индол-3-ил, -CHCHSCH, CHCOH, CHC(O)NH, CHCHCOOH, CHCHC(O)NH, CHCHCHCHNH, -CHCHCHNHC(NH)NH, СН-имидазол-4-ил, СНОН, СН(ОН)СН, CH((4'-OH)-Ph), CHSH или низший циклоалкил и R представляет собой водород;
10
1-6
1-6
3-7
R представляет собой водород, Cалкил, необязательно замещенный алкокси, ди(низший алкил)амино или галогеном, Cгалогеналкил, Сциклоалкил, гетероциклоалкил, аминоацил, арил, такой как фенил, гетероарил, такой как пиридинил, замещенный арил или замещенный гетероарил;
11
1-6
2-6
2-6
1-6
R представляет собой необязательно замещенный Cалкил, необязательно замещенный циклоалкил; необязательно замещенный Салкинил, необязательно замещенный Салкенил или необязательно замещенный ацил, который включает в себя без ограничения C(O)(C алкил); и
3
12
22
Y, R R и R определены выше.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы IV:
3
7
8
9a
9b
10
22
где переменные Y, R, R, R, R, R, R и R раскрыты в настоящем описании. Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы V:
3
7
8
9a
9b
10
22
где переменные Y, R, R, R, R, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
Согласно альтернативному варианту осуществления соединения, способы и композиции представлены для лечения хозяина, инфицированного или подвергнутого воздействию гепатита С.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы VI:
где:
41
3
3
2
R представляет собой галоген (в частности, F или Cl), OR (включая ОН), N, NH или CN; и
3
4
12
переменные Y, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
Согласно одному варианту осуществления раскрыты соединения формулы VII:
3
4
12
41
где переменные Y, R, R, R и R раскрыты в настоящем описании.
6
Метаболизм β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенных-N-замещенных-2,6-диаминопуриновых нуклеотидов
6
6
6
50
Метаболизм фосфорамидата β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида предусматривает продуцирование 5'-монофосфата и последующий анаболизм N-метил-2,6-диаминопуринового основания с образованием β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанинового нуклеозида в виде 5'-монофосфата. Затем монофосфат далее анаболизируется до активных соединений - 5'-трифосфата. Трифосфат β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанина характеризуется IC=0,15 мкМ в отношении NS5B полимеразы HCV 1b генотипа. Метаболический путь для фосфорамидата β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида показан на приведенной ниже схеме 1.
6
6
Метаболизм β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуринового нуклеотида предусматривает как образование трифосфата β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-диметил-2,6-диаминопуринового нуклеозида, так и образование соответствующего трифосфата гуанинового нуклеозида. Эти метаболические пути показаны на приведенных ниже схемах 2 и 3.
Стабилизированные фосфатные пролекарства
4
Стабилизированные фосфатные пролекарства являются фрагментами, которые могут доставлять моно-, ди- или трифосфат in vivo. Например, McGuigan раскрывал фосфорамидаты в патентах США №№8933053, 8759318, 8658616, 8263575, 8119779, 7951787 и 7115590. Alios раскрывал тиофосфорамидаты в патентах США №№8895723 и 8871737, включенных в настоящий документ посредством ссылки. Alios также раскрывал циклические нуклеотиды в патенте США №8772474, включенном в настоящий документ посредством ссылки. Idenix раскрывал циклические фосфорамидаты и фосфорамидатные/SATE производные в WO 2013/177219, включенной в настоящий документ посредством ссылки. Idenix также раскрывал замещенные карбонилоксиметилфосфорамидатные соединения в WO 2013/039920, включенной в настоящий документ посредством ссылки. Hostetler раскрывал пролекарства на основе фосфата липида, см., например, патент США №7517858. Hostetler также раскрывал липидные конъюгаты фосфонатных пролекарств, см., например, патенты США №№8889658, 8846643, 8710030, 8309565, 8008308 и 7790703. В WO 2014/124430 Emory University раскрываются нуклеотидные сфингоидные и липидные производные. В WO 2010/091386 RFS Pharma раскрываются пролекарства монофосфата пуринового нуклеозида. Cocrystal Pharma Inc. также раскрывали пролекарства монофосфата пуринового нуклеозида в патенте США №9173893, включенном в настоящий документ посредством ссылки. Технология HepDirect™ раскрывается в статье "Design, Synthesis, and Characterization of a Series of Cytochrome P(450) 3A-Activated Prodrugs (HepDirect Prodrugs) Useful for Targeting Phosph(on)ate-Based Drugs to the Liver," (J. Am. Chem. Soc. 126, 5154-5163 (2004). Дополнительные фосфатные пролекарства включают в себя без ограничения фосфаты сложных эфиров, 3',5'-циклические фосфаты, в том числе CycloSAL, SATE производные (сложные S-ацил-2-тиоэфиры) и DTE (дитиодиэтиловые) пролекарства. Для обзоров литературы, в которой раскрываются неограничивающие примеры, см. A. Ray and K. Hostetler, "Application of kinase bypass strategies to nucleoside antivirals," Antiviral Research (2011) 277-291; M. Sofia, "Nucleotide prodrugs for HCV therapy," Antiviral Chemistry and Chemotherapy 2011; 22-23-49; и S. Peyrottes et al., "SATE Pronucleotide Approaches: An Overview," Mini Reviews in Medicinal Chemistry 2004, 4, 395. Согласно одному варианту осуществления 5'-пролекарство, описанное в любом из этих поданных патентных документов или литературных источников, может быть использовано в R-пoлoжeнии представленных соединений.
Согласно одному альтернативному варианту осуществления стабилизированные фосфатные пролекарства включают в себя без ограничения такие пролекарства, описанные в патенте США №9173893 и патенте США №8609627, которые включены путем ссылки, включая способы получения. Например, 5'-пролекарства формулы I-V могут быть представлены группой:
.
Согласно альтернативному варианту осуществления 3',5'-пролекарства формулы I-V могут быть представлены группой:
где:
p
p
если хиральность находится возле фосфорного центра, она может быть полностью или частично R или S или их смесью.
Z представляет собой О или S;
33
34
R выбран из OR, ,  или  и производного жирного спирта (например, без исключения:
, ),
34
35
36
где R, R и R определены ниже;
31
32
31
32
2
R и R, при введении in vivo, способны обеспечивать нуклеозидный монофосфат или тиомонофосфат, который может быть или не быть частично или полностью устойчивым к 6-NH дезаминированию в биологической системе. Характерные R и R независимо выбраны из:
34
34
37
37
2
0-6
2
2
0-6
2
(a) OR, где R выбран из Н, Li, Na, K, фенила и пиридинила; фенил и пиридинил замещены одним-тремя заместителями, независимо выбранными из группы, состоящей из (CH)COR и (CH)CON(R);
37
1-20
1-20
3-10
1-5
1-5
3-10
R независимо представляет собой Н, C алкил, углеродную цепь, полученную из жирного спирта (такого как олеиловый спирт, октакозанол, триаконтанол, линолеиловый спирт и т.п.) или C алкил, замещенный низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, С циклоалкилом, циклоалкилом, алкил, циклогетероалкил, арил, такой как фенил, гетероарил, такой как пиридинил, замещенный арил или замещенный гетероарил; где заместители представляют собой C алкил или C алкил, замещенный низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, C циклоалкилом или циклоалкилом;
(b) или
(c) сложного эфира D-аминокислоты или L-аминокислоты
,
36
где R ограничен такими боковыми цепями, которые встречаются в L-аминокислотах природного происхождения, и
35
1-20
1-20
3-10
1-5
1-5
3-10
R представляет собой Н, С алкил, углеродную цепь, полученную из жирного спирта (такого как олеиловый спирт, октакозанол, триаконтанол, линолеиловый спирт и т.п.) или С алкил, замещенный низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, С циклоалкилом, циклоалкилом, алкил, циклогетероалкил, арил, такой как фенил, гетероарил, такой как пиридинил, замещенный арил или замещенный гетероарил; где заместители представляют собой С алкил или С алкил, замещенный низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, С циклоалкилом или циклоалкилом;
31
32
(d) R и R могут быть соединены вместе с образованием кольца
38
1-20
1-20
1-20
3-10
1-5
1-5
3-10
где R представляет собой Н, С алкил, С алкенил, углеродную цепь, полученную из жирного спирта (такого как олеиловый спирт, октакозанол, триаконтанол, линолеиловый спирт и т.п.) или С алкил, замещенный низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, С циклоалкилом, циклоалкилом, алкил, циклогетероалкил, арил, такой как фенил, гетероарил, такой как пиридинил, замещенный арил или замещенный гетероарил; где заместители представляют собой C алкил или C алкил, замещенный низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, С циклоалкилом или циклоалкилом;
31
32
(e) R и R могут быть соединены вместе с образованием кольца, выбранного из
, ,  и
39
где R представляет собой О или NH, и
40
1-20
1-20
1-20
3-10
1-5
1-5
3-10
R выбран из Н, С алкила, С алкенила, углеродной цепи, полученной из жирной кислоты (такой как масляная кислота, линолевая кислота и т.п.), и С алкила, замещенного низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, С циклоалкилом, циклоалкилом, алкила, циклогетероалкила, арила, такого как фенил, гетероарила, такого как пиридинил, замещенный арил или замещенный гетероарил; где заместители представляют собой C алкил или C алкил, замещенный низшим алкилом, алкокси, ди(низший алкил)-амино, фтором, С циклоалкилом или циклоалкилом.
Соединения могут быть получены, например, получением 5'-ОН аналогов, затем их превращением в монофосфатные аналоги.
Варианты осуществления
Согласно конкретным вариантам осуществления:
1
2
1
2
3
4
(i) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(ii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(iii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(iv) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(v) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(vi) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
3
4
(vii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат;
1
2
1
2
3
4
(viii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(ix) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(x) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xi) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(хii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(xiii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xiv) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xv) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xvi) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R is циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xvii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R is циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xviii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xix) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(xx) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой метил и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xxi) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xxii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой пропил, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xxiii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой пропил, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xxiv) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой пропил, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xxv) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой пропил, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xxvi) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой пропил, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(xxvii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой пропил, R представляет собой водород и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
1
2
3
4
(xxviii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой пропил, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xxix) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой этил, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xxx) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой этил, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xxxi) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой этил, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xxxii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой этил, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат:
1
2
1
2
3
4
(хххiii) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой этил, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(xxxiv) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой этил, R представляет собой водород и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xxxv) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой этил, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xxxvi) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xxxvii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xxxviii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xxxix) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xl) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(xli) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xlii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой метил, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xliii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xliv) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(xlv) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xlvi) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(xlvii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(xlviii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
3
4
(xlix) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой водород, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат;
1
2
1
2
3
4
(1) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород, R представляет собой стабилизированное фосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(li) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой стабилизированное тиофосфатное пролекарство;
1
2
1
2
3
4
(lii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой фосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(liii) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой тиофосфорамидат;
1
2
1
2
3
4
(liv) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой монофосфат;
1
2
1
2
3
4
(lv) в формуле Ib Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой метил и R представляет собой дифосфат;
1
2
1
2
3
4
(lvi) в формуле Ia Y представляет собой NRR, R представляет собой метил, R представляет собой циклопропил, R представляет собой водород и R представляет собой трифосфат.
22
22
22
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
3
3
3
2
5
2
3
2
5
2
2
2
2
2
2
3
2
2
3
3
2
3
2
2
2
2
3
2
2
3
2
3
2
3
2
2
3
3
2
2
3
2
2
3
2
2
2
2
3
2
2
3
2
2
2
3
3
3
3
2
3
3
2
3
2
3
3
2
3
2
3
3
2
2
2
3
2
2
2
3
2
2
2
2
3
Согласно любому из вышеуказанных альтернативных вариантов осуществления соединение содержит R заместитель. Согласно некоторым конкретным вариантам осуществления R представляет собой F, амид или карбамат. Согласно другим конкретным аспектам вышеуказанных вариантов осуществления R представляет собой хлор, бром, циано, азидо, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изо-бутил, втор-бутил, трет-бутил и н-пентил, 1,1-диметилпропил, 2,2-диметилпропил, 3-метилбутил, 1-метилбутил, 1-этилпропил, винил, аллил, 1-бутинил, 2-бутинил, ацетиленил, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, -(CH)-циклопропил, -(CH)-циклобутил, -(СН)-циклопентил, -(СH)-циклогексил, азиридин, оксиран, тииран, азетидин, оксетан, тиэтан, пирролидин, тетрагидрофуран, тиолан, пиразолидин, пиперидин, оксан, тиан, -(СН)-азиридин, -(СН)-оксиран, -(СН)-тииран, -(CH)-азетидин, -(СH)-оксетан, -(СН)-тиэтан, -(СН)-пирролидин, -(СН)-тетрагидрофуран, -(CH)-тиолан, -(СН)-пиразолидин, -(СН)-пиперидин, -(СН)-оксан, -(СН)-тиан, фенил, пиридил, -ONHC(=O)OCH, -ONHC(=O)OCHCH, -NHOH, NHOCH, -ОСН, OCH, -OPh, OCHPh, -SCH, -SCH, -SPh, SCHPh, -NH(CH)NH, -NH(CH)N(CH), -NHNH, -NHNHCH, -N=NH, -N=NCH, -N=NCHCH, -NHC(O)NHNH, -NHC(S)NHNH, -C(O)NHNH, -NHSOCH, -NHSOCHCH, -SONHCH, -SON(CH), -C(O)NH, -C(O)NHCH, -C(O)N(CH), -COCH, -COCHCH, -COPh, COCHPh, -SOCH, -SOCHCH, -SOPh, -SOCHPh, , ,-P(O)H(OH), -Р(О)H(ОСН), -P(O)(OH)(OH), -P(O)(OH)(OCH), -P(O)(OCH)(OCH), -P(O)(OH)(NH), -P(O)(OH)(NHCH), -P(O)(OH)N(CH), -NHC(O)CH, -NHC(O)CHCH, -NHC(O)CH(CH), -NHC(O)OCH, -NHC(O)OCHCH, -NHC(O)OCH(CH), -NHC(O)OCHCHCH, -NHC(O)OCHCHCHCH и -NHC(O)OCHCHCHCHCH;
Согласно альтернативным вариантам осуществления соединений (i)-(lvi) L-нуклеозид использовали в формуле I-VII.
12
2
Согласно альтернативному варианту осуществления формулы I переменная R представляет собой CHF.
12
2
Согласно альтернативному варианту осуществления формулы I переменная R представляет собой CHF.
12
3
Согласно альтернативному варианту осуществления формулы I переменная R представляет собой CF.
Согласно одному варианту осуществления представлено соединение формулы Iа. Неограничивающие примеры соединений формулы Iа включают в себя:
и
Согласно одному варианту осуществления представлен тиофосфорамидат формулы Iа. Неограничивающие примеры тиофосфорамидатов формулы Iа включают в себя без ограничения:
и
Согласно одному варианту осуществления представлено стабилизированное фосфатное пролекарство формулы Ia. Неограничивающие примеры стабилизированных фосфатных пролекарств формулы Iа представлены ниже:
и
Согласно другому варианту осуществления представлено соединение формулы Iа. Неограничивающие примеры соединений формулы Iа включают в себя:
и
.
Согласно одному варианту осуществления представлен тиофосфорамидат формулы Ia. Неограничивающие примеры тиофосфорамидатов формулы Ia включают в себя без ограничения:
и .
Согласно одному варианту осуществления представлено стабилизированное фосфатное пролекарство формулы Ia. Неограничивающие примеры стабилизированных фосфатных пролекарств формулы Ia представлены ниже:
и
.
Согласно одному варианту осуществления представлено соединение формулы II. Неограничивающие примеры соединений формулы II включают в себя:
.
Согласно одному варианту осуществления представлено соединение формулы I. Неограничивающие примеры соединений формулы I включают в себя:
Согласно одному варианту осуществления представлено соединение формулы II. Неограничивающие примеры соединений формулы II включают в себя:
и
.
4
Согласно одному варианту осуществления R представляет собой
Согласно одному варианту осуществления представлено соединение формулы II. Неограничивающие примеры соединений формулы II включают в себя:
и
.
3
4
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой Н и R представляет собой .
3
4
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой Н и R представляет собой .
3
4
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой Н и R представляет собой .
Согласно одному варианту осуществления представлено соединение формулы II. Неограничивающие примеры соединений формулы II включают в себя:
и
.
3
4
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой Н и R представляет собой .
3
4
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой Н и R представляет собой .
3
4
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой Н и R представляет собой .
1
2
3
4
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой СН, R представляет собой Н, R представляет собой Н и R представляет собой .
1
2
3
4
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой СН, R представляет собой Н, R представляет собой Н и R представляет собой .
1
2
3
4
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой СН, R представляет собой Н, R представляет собой Н и R представляет собой .
1
2
3
3
4
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой СН, R представляет собой СН, R представляет собой Н и R представляет собой .
1
2
3
4
3
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой СН, R представляет собой СН, R представляет собой Н и R представляет собой .
1
2
3
4
3
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой СН, R представляет собой СН, R представляет собой Н и R представляет собой .
1
2
3
4
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой циклопропил, R представляет собой СН, R представляет собой Н и R представляет собой
1
2
3
4
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой циклопропил, R представляет собой CH, R представляет собой Н и R представляет собой
1
2
3
4
3
Согласно некоторым вариантам осуществления R представляет собой циклопропил, R представляет собой CH, R представляет собой Н и R представляет собой
II. Определения
Для описания настоящего изобретения использовали следующие термины. В случаях, если термин точно не определен в настоящем описании, такой термин представлен в принятом в данной области значении специалистом, использующим такой термин в контексте его применения при описании настоящего изобретения.
1
8
1
6
1
4
В контексте термина «алкил» следует понимать полностью насыщенный углеводородный радикал или алкильную группу с неразветвленной или разветвленной цепью, которые могут быть необязательно замещенными (например, галогеном, включая F). Например, алкильная группа может содержать 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 атомов углерода (т.е., C-C алкил), 1, 2, 3, 4, 5 или 6 атомов углерода (т.е., C-C алкил) или 1-4 атома углерода (т.е., С-С алкил). Примеры подходящих алкильных групп включают в себя без ограничения метил, этил, н-пропил, изо-пропил, н-бутил, изобутил, втор-бутил, трет-бутил, пентил, изопентил, трет-пентил, неопентил, гексил, 2-метилпентил, 3-метилпентил, 2,2-диметилбутил и 2,3-диметилбутил.
2
8
2
4
2
2
2
2
3
2
2
Термин «алкенил» относится к неароматической углеводородной группе, которая содержит по меньшей мере одну двойную связь между смежными атомами углерода и характеризуется структурой, подобной алкильной группе, как иным образом описано в настоящем изобретении. Например, алкенильная группа может содержать от 2 до 8 атомов углерода (т.е., С-С алкенил) или от 2 до 4 атомов углерода (т.е., С-С алкенил). Примеры подходящих алкенильных групп включают в себя без ограничения этенил или винил (-СН=СН), аллил (-СНСН=СН), 1-бутенил (-С=СН-СНСН) и 2-бутенил (-СНСН=СНСН). Алкенильная группа может быть необязательно замещенной, как описано в настоящем изобретении.
2
8
2
4
Термин «алкинил» относится к неароматической углеводородной группе, содержащей по меньшей мере одну тройную связь между смежными атомами углерода и характеризуется структурой, подобной алкильной группе, как иным образом описано в настоящем изобретении. Например, алкинильная группа может содержать от 2 до 8 атомов углерода (т.е., С-С алкин) или от 2 до 4 атомов углерода (т.е., С-С алкинил). Примеры алкинильных групп включают в себя без ограничения ацетилен или этинил и пропаргил. Алкинильная группа может быть необязательно замещена, как описано в настоящем изобретении.
1
4
1
4
1
4
Термин «ацил» относится к фрагменту -C(O)R, в котором карбонильный фрагмент связан с R, например, -С(O)алкил. R может быть выбран из алкокси, алкила, циклоалкила, низшего алкила (т.е., С-С); алкоксиалкила, включая метоксиметил; аралкил-, включая бензил, арилоксиалкил-, такой как феноксиметил; арила, включая фенил, необязательно замещенный галогеном, C-С алкила или C-С алкокси. Согласно одному варианту осуществления термин «ацил» относится к моно-, ди- или трифосфату.
1
4
Термин «низший ацил» относится к ацильной группе, в которой карбонильный фрагмент представляет собой низший алкил (т.е., С-С).
0
2
0
2
0
2
0
2
Термин «алкокси» относится к группе -OR', где -OR' представляет собой -O-алкил, -O-алкенил, -O-алкинил, -O-(C-C)(циклоалкил), -O-(C-C)(гетероцикло), -O-(C-C)(арил) или -O-(C-C)(гетероарил), каждый из которых может быть необязательно замещен.
2
Термин «амино» относится к группе -NH.
Термин «аминокислота» или «остаток амонокислоты» относится к D- или L-аминокислоте природного или не природного происхождения. Характерные аминокислоты включают в себя без ограничения аланин, β-аланин, аргинин, аспарагин, аспарагиновую кислоту, цистеин, цистин, глутаминовую кислоту, глутамин, глицин, фенилаланин, гистидин, изолейцин, лизин, лейцин, метионин, пролин, серии, треонин, валин, триптофан или тирозин в том числе.
3
Термин «азидо» относится к группе -N.
Термин «арил» или «ароматическое соединение» в контексте относится к замещенному (как описано далее в настоящем изобретении) или незамещенному моновалентному ароматическому радикалу, содержащему простое кольцо (например, фенил или бензил) или конденсированные кольца (например, нафтил, антраценил, фенантренил и т.п.), и он может быть связан с соединением по настоящему изобретению в любом доступном стабильном положении кольца(колец) или как иным образом обозначено в представленной химической структуре. Арильная группа необязательно может быть замещена, как описано в настоящем изобретении.
«Циклоалкил», «карбоцикл» или «карбоциклил» относится к насыщенному (т.е., циклоалкилу) или частично ненасыщенному (например, циклоалкенилу, циклоалкандиенилу и т.п.) кольцу, содержащему от 3 до 7 атомов углерода в виде моноцикла. Моноциклические карбоциклы содержат от 3 до 7 кольцевых атомов, еще более типично 5 или 6 кольцевых атомов. Неограничивающие примеры циклоалкильных групп включают в себя циклопропил, циклобутил, циклопентил, 1-циклопент-1-енил, 1-циклопент-2-енил, 1-циклопент-3-енил, циклогексил, 1-циклогекс-1-енил, 1-циклогекс-2-енил и 1-цикло-гекс-3-енил.
Термин «циано» относится к группе -CN.
Термин «галоген» или «гало» относится к хлору, брому, фтору или йоду.
Гетероарильная кольцевая система представляет собой насыщенное или ненасыщенное кольцо с одним или несколькими атомами азота, кислорода или серы в кольце (моноциклическом), включающем в себя без ограничения имидазол, фурил, пиррол, фуранил, тиен, тиазол, пиридин, пиримидин, пурин, пиразин, триазол, оксазол, или конденсированные кольцевые системы, такие как индол, хинолин и т.п., наряду с прочим, которые могут быть необязательно замещенными, как описано выше. Гетероарильные группы включают в себя азотсодержащие гетероарильные группы, такие как пиррол, пиридин, пиридон, пиридазин, пиримидин, пиразин, пиразол, имидазол, триазол, триазин, тетразол, индол, изоиндол, индолизин, пурин, индазол, хинолин, изохинолин, хинолизин, фталазин, нафтиридин, хиноксалин, хиназолин, циннолин, птеридин, имидазопиридин, имидазотриазин, пиразинопиридазин, акридин, фенантридин, карбазол, карбазолин, перимидин, фенантролин, фенацен, оксадиазол, бензимидазол, пирролопиридин, пирролопиримидин и пиридопиримидин; серосодержащие ароматические гетероциклы, такие как тиофен и бензтиофен; кислородсодержащие ароматические гетероциклы, такие как фуран, пиран, циклопентапиран, бензофуран и изобензофуран; и ароматические гетероциклы, содержащие два или более гетероатомов, выбранных среди атомов азота, серы и кислорода, такие как тиазол, тиадиазол, изотиазол, бензоксазол, бензотиазол, бензотиадиазол, фенотиазин, изоксазол, фуразан, феноксазин, пиразолоксазол, имидазотиазол, тиенофуран, фуропиррол, пиридоксазин, фуропиридин, фуропиримидин, тиенопиримидин и оксазол, наряду с прочим, все из которых могут быть необязательно замещенными.
Термин «гетероцикл» или «гетероцикло» относится к циклической группе, которая содержит по меньшей мере один гетероатом, т.е., О, N или S, и может быть ароматической (гетероарил) или неароматической. Приводимые в качестве примера неароматические гетероциклические группы для применения в настоящем изобретении включают в себя, например, пирролидинил, пиперидинил, пиперазинил, N-метилпиперазинил, имидазолинил, пиразолидинил, имидазолидинил, морфолинил, тетрагидропиранил, азетидинил, оксетанил, оксатиоланил, пиридон, 2-пирролидон, этиленмочевину, 1,3-диоксолан, 1,3-диоксан, 1,4-диоксан, фталимид и сукцинимид, наряду с прочим, все из которых могут быть необязательно замещенными.
Термин «гидроксил» относится к группе -ОН.
2
Термин «нитро» относится к группе -NO.
6
Термин «фармацевтически приемлемая соль» или «пролекарство» использовали по всему описанию для описания любой фармацевтически приемлемой формы (такой как сложный эфир, фосфорамидат, тиофосфорамидат, фосфатный сложный эфир, соль сложного эфира или связанная группа) β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеотида, который после введения пациенту обеспечивает требуемое активное соединение. Примерами фармацевтически приемлемых солей являются органические кислотно-аддитивные соли, образованные с кислотами, которые образуют физиологически приемлемый анион, например, тозилат, метансульфонат, ацетат, цитрат, малонат, тартрат, сукцинат, бензоат, аскорбат, α-кетоглутарат и α-глицерофосфат. Подходящие неорганические соли также могут быть образованы, включая сульфатные, нитратные, бикарбонатные и карбонатные соли. Фармацевтически приемлемые соли могут быть получены с применением стандартных способов, хорошо известных из области техники, например, путем осуществления взаимодействия достаточно основного соединения, такого как амин, с подходящей кислотой с получением физиологически приемлемого аниона. Также могут быть получены соли щелочного металла (например, натрия, калия или лития) или соли щелочноземельного металла (например, кальция) карбоновой кислоты.
6
«Фармацевтически приемлемое пролекарство» относится к соединению, которое метаболизируется, например, гидролизуется или окисляется, у хозяина с образованием соединения по настоящему изобретению. Типичные примеры пролекарств включают в себя соединения, содержащие биологически лабильные защитные группы на функциональном фрагменте активного соединения. Пролекарства включают в себя соединения, которые могут быть окислены, восстановлены, аминированы, деаминированы, гидроксилированы, дигидроксилированы, гидролизированы, дегидролизированы, алкилированы, деалкилированы, ацилированы, деацилированы, фосфорилированы, дефосфорилированы, тиофосфорамидированы, детиофосфорамидированы, фосфорамидированы или дефосфорамидированы, с получением активного соединения. Соединения по настоящему изобретению обладают противовирусной активностью по отношению к HCV или метаболизированы в соединение, которое проявляет такую активность. β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенный-2-модифицированный-N-замещенный пуриновый нуклеозид также может быть введен в виде 5'-фосфоэфирного липида, бисфосфорамидата, 3',5'-циклического фосфорамидата, 3',5'-циклического тиофосфорамидата, конъюгата DTE, смешанного производного фосфорамидата-SATE или «производного SATE».
2
Термин «фосфоновая кислота» относится к группе -Р(O)(ОН).
6
6
6
6
6
6
6
6
6
2
2
5
5
5
5
5
5
5
5
5
5
5
2
2
0
4
0
4
Согласно одному варианту осуществления термин пурин или пиримидиновое основание включает в себя без ограничения аденин, N-алкилпурины, N-ацилпурины (где ацил представляет собой -С(O)алкил, -С(O)(арил)C-Cалкил или -С(O)(C-Cалкил)арил), N-бензилпурин, N-галогенпурин, N-винилпурин, N-ацетиленовый пурин, N-ацилпурин, N-гидроксиалкилпурин, N-тиоалкилпурин, N-алкилпурины, N-алкил-6-тиопурины, тимин, цитозин, 5-фторцитозин, 5-метилцитозин, 6-азапиримидин, включая 6-азацитозин, 2- и/или 4-меркаптопиримидин, урацил, 5-галогенурацил, включая 5-фторурацил, С-алкилпиримидины, С-бензилпиримидины, С-галогенпиримидины, С-винилпиримидин, С-ацетиленовый пиримидин, С-ацилпиримидин, С-гидроксиалкилпурин, С-амидопиримидин, С-цианопиримидин, С-нитропиримидин, С-аминопиримидин, N-алкилпурины, N-алкил-6-тиопурины, 5-азацитидинил, 5-азаурацилил, триазолопиридинил, имидазолопиридинил, пирролопиримидинил и пиразолопиримидинил. Пуриновые основания включают в себя без ограничения гуанин, аденин, гипоксантин, 2,6-диаминопурин и 6-хлорпурин. Кислородные и азотные функциональные группы на основании могут быть защищены при требовании или необходимости. Подходящие защитные группы хорошо известны специалистам настоящей области техники и включают в себя бензил, триметилсилил, диметилгексилсилил, трет-бутилдиметилсилил, трет-бутилдифенилсилил, тритил, алкильные группы и ацильные группы, такие как ацетил и пропионил; метансльфонил и пара-толуолсульфонил. Альтернативно, пуриновое или пиримидиновое основание необязательно может быть замещено таким образом, что образует эффективное пролекарство, которое может расщепляться in vivo. Примеры соответствующих заместителей включают в себя ацильный фрагмент.
3
2
2
3
1
6
1
6
0
2
3
8
0
2
3
8
0
2
1
6
2
1
6
1
6
1
6
2
0
2
3
8
0
2
3
8
0
2
Термин «замещенный» или «необязательно замещенный» означает, что фрагмент может содержать по меньшей мере один дополнительный заместитель, включая без ограничения галоген (F, Cl, Br, I), ОН, фенил, бензил, N, CN, ацил, алкил, включая метил; алкенил, алкинил, алкокси, галогеналкил; включая CHF, CHF и CF; и т.п. Согласно одному варианту осуществления термин «замещенный» или «необязательно замещенный» означает, что фрагмент может содержать по меньшей мере один дополнительный заместитель, включая без ограничения азидо, циано, галоген (фтор, хлор, бром или йод), алкил, алкенил, алкинил, циклоалкил, гетероцикл, арил, гетероарил, галогеналкил, гидроксил, алкокси, амино, -NH(C-C незамещенный алкил), -NH(C-C замещенный алкил), -NH-(C-Cалкил)(С-Cциклоалкил), -NH-(C-Cалкил)(C-Cгетероцикл), -NH-(C-Cалкил)(арил), -N(C-C незамещенный алкил), -N(C-C незамещенный алкил)(C-C замещенный алкил), -N(C-C замещенный алкил), -NH-(C-Cалкил)(C-Cциклоалкил), -NH-(C-Cалкил)(C-Сгетероцикл), -NH-(C-Cалкил)(арил), ацил, нитро, сульфоновую кислоту, сульфат, фосфоновую кислоту, фосфат, фосфонат или тиол.
14
15
14
14
15
2
Термин «сульфонатные сложные эфиры», представленные формулой RS(O)OR, содержит R, где R представляет собой алкил, галогеналкил, аралкил или арил. R представляет собой алкил, арил или аралкил.
2
Термин «сульфоновая кислота» относится к группе -SOOH.
Термин «тиол» относится к группе -SH.
Используемый в настоящем описании термин «азотсодержащая группа» относится к фрагменту, который ковалентно присоединен к азоту и который может быть удален, и типично заменен водородом при необходимости. Например, азотсодержащая группа может быть группой, которую удаляли in vivo после введения хозяину, in vitro при помощи клетки или она может быть удалена в процессе производства. Подходящие азотсодержащие группы, применимые в настоящем изобретении, описаны у Greene and Wuts in Protective Groups in Organic Synthesis (1991) New York, John Wiley and Sons, Inc.
Используемый в настоящем описании термин «кислородсодержащая группа» относится к фрагменту, который ковалентно присоединен к кислороду и который может быть удален, и типично заменен водородом при необходимости. Например, кислородсодержащая группа может быть группой, которую удаляли in vivo после введения хозяину, in vitro при помощи клетки или она может быть удалена в процессе производства. Подходящие кислородсодержащие группы, применимые в настоящем изобретении, описаны у Greene and Wuts in Protective Groups in Organic Synthesis (1991) New York, John Wiley and Sons, Inc.
2.
«Фосфат» относится к группе -ОР(O)(ОН)
«Фосфатный сложный эфир» относится к моно-, ди- и трифосфатам, если не отмечено иное.
Термин «фосфоамидат», «фосфорамидат» или «фосфороамидат» относится к фрагменту, который содержит фосфорную связь с тремя кислородными группами и амином (который может быть необязательно замещен). Подходящие фосфорамидаты, применимые в настоящем изобретении, описаны у Madela, Karolina and McGuigan in 2012, «Progress in the development of anti-hepatitis С virus nucleoside and nucleotide prodrugs», Future Medicinal Chemistry 4(5), pages 625-650 10:1021/jm300074y and Dominique, McGuigan and Balzarini in 2004, «Aryloxy Phosphoramidate Triesters as Pro-Tides», Mini Reviews in Medicinal Chemistry 4(4), pages 371-381. Дополнительные фосфорамидаты, применимые в настоящем изобретении, описаны в патентах США №№5233031, 7115590, 7547704, 7879815, 7888330, 7902202, 7951789, 7964580, 8071568; 8148349, 8263575, 8324179, 8334270, 8552021, 8563530, 8580765, 8735372, 8759318; ЕР 2120565; ЕР 1143995; 6455513 и 8334270. Другие фосфорамидаты описаны в нуклеозидных патентах в предпосылках изобретения.
Фосфорамидатные группы для применения в настоящем изобретении включают в себя такие структуры:
и
Другие фосфорамидаты для применения в настоящем изобретении включают в себя следующие структуры:
где:
P1
R представляет собой необязательно замещенную неразветвленную, разветвленную или циклическую алкильную группу или необязательно замещенную арильную, гетероарильную или гетероциклическую группу или их соединенную комбинацию; и
P2
N1
N2
R представляет собой группу -NRR или группу В';
где:
N1
N2
1-8
3
7
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R и R каждый независимо представляет собой H, Cалкил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил- или (гетероарил)C-Cалкил-; который может быть необязательно замещенным; или
N1
N2
R и R вместе с атомом азота, к которому они присоединены, связаны с образованием 3-7-членного гетероциклического кольца;
В' представляет собой группу
где:
16
16
1
8
2
8
2
8
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (С-С)алкил, (C-C)алкенил, (С-С)алкинил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил-, (гетероарил)C-Cалкил- или боковую цепь аминокислоты, например, боковую цепь аминокислоты (как далее описано в настоящем изобретении), часто выбранной из группы, состоящей из аланина, β-аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, цистина, глутаминовой кислоты, глутамина, глицина, фенилаланина, гистидина, изолейцина, лизина, лейцина, метионина, пролина, серина, треонина, валина, триптофана или тирозина (часто R представляет собой водород, метил, изопропил или изобутил);
17
17
1
8
2
8
2
8
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (С-С)алкил, (C-C)алкенил, (C-C)алкинил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил-, (гетероарил)C-Cалкил- или боковую цепь аминокислоты, например, боковую цепь аминокислоты (как далее описано в настоящем изобретении), часто выбранной из группы, состоящей из аланина, β-аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, цистина, глутаминовой кислоты, глутамина, глицина, фенилаланина, гистидина, изолейцина, лизина, лейцина, метионина, пролина, серина, треонина, валина, триптофана или тирозина (часто R представляет собой водород, метил, изопропил или изобутил);
18
1
3
R представляет собой водород или C-Cалкил; или
16
17
3
7
3
7
R и R могут образовывать (C-C)циклоалкильную или (C-C)гетероциклическую группу; или
18
16
17
3
6
R и R или R могут образовывать (C-C)гетероциклическую группу; и
19
1
6
3
6
3
6
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (С-С)алкил, (C-C)алкенил, (C-C)алкинил, (C-Сциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил-, (гетероарил)C-Cалкил-; или
В' представляет собой группу  где:
20
1
3
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (C-C)алкил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил- или (гетероарил)C-Cалкил-;
21
1
3
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (C-C)алкил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил- или (гетероарил)C-Cалкил-; и
18
19
R и R определены выше.
P1
Предпочтительные группы R включают в себя необязательно замещенные фенильные, нафтильные и моноциклические гетероарильные группы, особенно такие группы (в частности, липофильные группы), которые усиливают биологическую доступность соединений в клетки пациента и которые проявляют уменьшенную токсичность, улучшенный терапевтический индекс и улучшенную фармакокинетику (соединения метаболизировались и выделялись более медленно).
Термин фосфорамидат использовали по всему описанию для описания группы, которая встречается в 5' или 3' положении фуранозного кольца нуклеозидного соединения и образует пролекарственную форму нуклеозидного соединения. Согласно одному варианту осуществления фосфорамидаты могут встречаться в обоих 5' и 3' положениях фуранозного кольца нуклеозидного соединения и образовывать пролекарственную форму нуклеозидного соединения. Согласно другому варианту осуществления фосфорамидат, который встречается в 5' положении фуранозного кольца нуклеозида, может образовывать циклическое фосфорамидатное соединение путем образования связи с З'-гидроксильным заместителем в 3' положении фуранозного кольца нуклеозидного соединения и образует пролекарственную форму нуклеозидного соединения.
Термин «тиофосфоамидат», «тиофосфорамидат» или «тиофосфороамидат» представляет собой фрагмент, содержащий фосфорную связь с серой, двумя кислородными группами и амином (который может быть необязательно замещен). Тиофосфорамидаты, применимые в настоящем изобретении, описаны в патенте США №8772474 и WO 2012/040124.
Тиофосфорамидатные группы для применения в настоящем изобретении включают в себя структуры:
и
Другие тиофосфорамидаты включают в себя структуры:
где:
P1
R представляет собой необязательно замещенную неразветвленную, разветвленную или циклическую алкильную группу или необязательно замещенную арильную, гетероарильную или гетероциклическую группу или их связанную комбинацию; и
P2
N1
N2
R представляет собой группу -NRR или группу В';
где:
N1
N2
1
8
3
7
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R и R каждый независимо представляет собой Н, C-C алкил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил- или (гетероарил)C-Cалкил-; или
N1
N2
R и R вместе с атомом азота, к которому они присоединены, связаны с образованием 3-7-членного гетероциклического кольца;
В' представляет собой группу
где:
16
16
1
8
2
8
2
8
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (С-С)алкил, (C-C)алкенил, (С-С)алкинил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил-, (гетероарил)C-Cалкил- или боковую цепь аминокислоты, например, боковую цепь аминокислоты (как далее описано в настоящем изобретении), часто выбранной из группы, состоящей из аланина, β-аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, цистина, глутаминовой кислоты, глутамина, глицина, фенилаланина, гистидина, изолейцина, лизина, лейцина, метионина, пролина, серина, треонина, валина, триптофана или тирозина (часто R представляет собой водород, метил, изопропил или изобутил);
17
17
1
8
2
8
2
8
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (С-С)алкил, (C-C)алкенил, (С-С)алкинил, (C-Cциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил-, (гетероарил)C-Cалкил- или боковую цепь аминокислоты, например, боковую цепь аминокислоты (как далее описано в настоящем изобретении), часто выбранной из группы, состоящей из аланина, β-аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, цистина, глутаминовой кислоты, глутамина, глицина, фенилаланина, гистидина, изолейцина, лизина, лейцина, метионина, пролина, серина, треонина, валина, триптофана или тирозина (часто R представляет собой водород, метил, изопропил или изобутил);
18
1
3
R представляет собой водород или С-Салкил; или
16
17
3
7
3
7
R и R могут образовывать (С-С)циклоалкил или (С-С)гетероциклическую группу; или
18
16
17
3
6
R и R или R могут образовывать (C-C)гетероциклическую группу; и
19
1
6
3
6
3
6
3
8
0
4
0
4
3
6
0
4
0
4
R представляет собой водород, (С-С)алкил, (C-C)алкенил, (C-C)алкинил, (С-Сциклоалкил)C-Cалкил-, (арил)C-Cалкил-, (C-Cгетероцикло)C-Cалкил-, (гетероарил)C-Cалкил-; или
В' представляет собой группу  и
18
19
20
21
R, R, R и R определены выше.
P1
Предпочтительные группы R включают в себя необязательно замещенные фенильные, нафтильные и моноциклические гетероарильные группы, особенно такие группы (в частности, липофильные группы), которые усиливают биологическую доступность соединений в клетки пациента и которые проявляют уменьшенную токсичность, улучшенный терапевтический индекс и улучшенную фармакокинетику (соединения метаболизировались и выделялись более медленно).
Тиофосфорамидат может быть в 5' или 3' положении фуранозного кольца нуклеозидного соединения с образованием пролекарственной формы нуклеозидного соединения. Согласно одному варианту осуществления тиофосфорамидаты могут встречаться в обоих 5' и 3' положениях фуранозного кольца нуклеозидного соединения и образовывать пролекарственную форму нуклеозидного соединения. Согласно другому варианту осуществления, тиофосфорамидат, который встречается в 5' положении фуранозного кольца нуклеозида, может образовывать циклическое тиофосфорамидатное соединение путем образования связи с 3'-гидрокс ильным заместителем в 3' положении фуранозного кольца нуклеозидного соединения и образует пролекарственную форму нуклеозидного соединения.
Используемый в контексте настоящего изобретения термин «D-конфигурация» относится к основной конфигурации, которая имитирует природную конфигурацию сахарных фрагментов по сравнению с не встречающимися в природе нуклеозидами или «L» конфигурацией. Термин «β» или «β-аномер» используют для обозначения нуклеозидных аналогов, в которых нуклеозидное основание сконфигурировано (расположено) над плоскостью фуранозного фрагмента в нуклеозидном аналоге.
Термины «совместно вводить» и «совместное введение» или комбинированная терапия используют для описания введения по меньшей мере одного из 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-C-нуклеозидных соединений в соответствии с настоящим изобретением в комбинации по меньшей мере с одним другим активным средством, например, в случае необходимости, по меньшей мере с одним дополнительным средством против HCV, в том числе с другими 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-C-нуклеозидными средствами, которые раскрываются в настоящем документе. Время осуществления совместного введения лучше всего определять медицинскому специалисту, лечащему больного. Иногда предпочтительно вводить средства в одно и то же время. В качестве альтернативы, лекарственные средства, выбранные для комбинированной терапии, могут быть введены больному в разные моменты времени. Конечно, при наличии более чем одной вирусной или иной инфекции или другого состояния соединения в соответствии с настоящим изобретением при необходимости могут быть объединены с другими средствами для лечения этих других инфекции или состояния.
Используемый в настоящем документе термин «хозяин» относится к одноклеточному или многоклеточному организму, в котором вирус HCV может реплицироваться, в том числе к клеточным линиям, животным и, как правило, людям. Термин «хозяин», в частности, относится к инфицированным клеткам, клеткам, трансфицированным полным геномом HCV или его частью, и животным, в частности, приматам (в том числе шимпанзе) и людям. При большинстве применений для животных в соответствии с настоящим изобретением хозяином является больной человек. Тем не менее применения в ветеринарии, при определенных показаниях, явно предусматриваются настоящим изобретением (например, для шимпанзе). Хозяином могут быть, например, бычьи, лошадиные, птицы, собачьи, кошачьи и т.д.
1. Изотопное замещение
2
3
13
14
Настоящее изобретение включает в себя соединения и применение соединений с требуемыми изотопными замещениями атомов в количествах, что выше распространенности изотопа в природе, т.е., обогащенные. Изотопы представляют собой атомы с одинаковым атомным числом, но разными массовыми числами, т.е., одинаковое число протонов, но разное число нейтронов. В качестве общего примера и без ограничения, изотопы водорода, например, дейтерий (Н) и тритий (Н), могут быть использованы в любом месте в описанных структурах. Альтернативно или в дополнение, могут быть использованы изотопы углерода, например, С и С. Предпочтительным изотопным замещением является дейтерий для водорода в одном или нескольких местах молекулы для улучшения характеристики лекарственного средства. Дейтерий может быть связан в месте разрыва связи во время метаболизма (кинетический изотопный эффект α-дейтерия) или рядом с или возле места разрыва связи (кинетический изотопный эффект β-дейтерия). В Achillion Pharmaceuticals, Inc. (WO/2014/169278 и WO/2014/169280) описано дейтерирование нуклеотидов для улучшения их фармакокинетики или фармакодинамики, включая 5-положение в молекуле.
1
2
3
Замещение изотопами, такими как дейтерий, может позволять определенные терапевтические преимущества, возникающие вследствие большей устойчивости при метаболизме, такие как, например, увеличенный in vivo период полураспада или уменьшенные дозировки. Замещение дейтерия водородом на месте метаболического расщепления может уменьшать скорость или убирать метаболизм при такой связи. В любом положении соединения, в котором может присутствовать атом водорода, атом водорода может быть любым изотопом водорода, включая протий (Н), дейтерий (Н) и тритий (Н). Таким образом, ссылка в настоящем изобретении на соединения охватывает все возможные изотопные формы, если в контексте четко не указано иное.
13
13
1
2
Термин «изотопно меченый» аналог относится к аналогу, который представляет собой «деитерированный аналог», «С-меченый аналог» или «дейтерированный/С-меченый аналог». Термин «дейтерированный аналог» означает описанное в настоящем изобретении соединение, в соответствии с чем Н-изотоп, т.е., водород/протий (Н), замещен Н-изотопом, т.е., дейтерием (Н). Замещение дейтерием может быть частичным или полным. Частичное замещение дейтерием означает, что по меньшей мере один атом водорода замещен по меньшей мере одним дейтерием. Согласно определенным вариантам осуществления изотоп на 90, 95 или 99% или более обогащен изотопом в любом нужном месте. Согласно некоторым вариантам осуществления он представляет собой дейтерий, который на 90, 95 или 99% обогащен в требуемом положении. Если не отмечено иное, дейтерирование занимает по меньшей мере 80% в выбранном положении. Дейтерирование нуклеозида может проходить при любом заменяемом атоме водорода, который обеспечивает требуемые результаты.
III. Способы лечения или профилактики
Используемый в настоящем документе термин «лечение» относится к введению активного соединения хозяину, который инфицирован вирусом HCV.
Используемый в настоящем документе термин «профилактическое» или «предупреждающее» относится к введению активного соединения для предупреждения или снижения вероятности возникновения вирусного нарушения. Настоящее изобретение относится как к лечебным, так и к профилактическим или предупреждающим терапевтическим средствам. Согласно одному варианту осуществления активное соединение вводят хозяину, который подвергся инфекции вируса гепатита С и, таким образом, рискует стать инфицированным таковым.
6
Настоящее изобретение относится к способу лечения или профилактики заболеваний, вызванных вирусом гепатита С, в том числе устойчивыми к лекарственному средству и устойчивыми к нескольким лекарственным средствам формами HCV, а также родственных болезненных состояний, состояний или осложнений инфекции HCV, в том числе цирроза и родственных гепатотоксичностей, а также других состояний, являющихся вторичными по отношению к инфекции HCV, таких как наряду с прочими слабость, потеря аппетита, потеря веса, увеличение молочной железы (особенно у мужчин), сыпь (особенно на ладонях), затруднение свертывания крови, звездчатые сосуды на коже, спутанность сознания, кома (энцефалопатия), накопление жидкости в брюшной полости (асциты), расширение вен пищевода, портальная гипертензия, почечная недостаточность, увеличение селезенки, уменьшение кровяных клеток, анемия, тромбоцитопения, желтуха и печеночноклеточная злокачественная опухоль. Способ включает введение хозяину при необходимости этого эффективного количества по меньшей мере одного β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-C-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеотида, описываемого в настоящем документе, необязательно в комбинации по меньшей мере с одним дополнительным биоактивным средством, например, дополнительным средством против HCV, дополнительно в комбинации с фармацевтически приемлемыми носителем, добавкой и/или вспомогательным веществом.
Согласно другому аспекту настоящее изобретение относится к способу предупреждения или профилактики инфекции HCV, или болезненного состояния, или родственного, или последующего болезненного состояния, состояния или осложнения инфекции HCV, в том числе цирроза и родственных гепатотоксичностей, также других состояний, являющихся вторичными по отношению к инфекции HCV, таких как наряду с прочими слабость, потеря аппетита, потеря веса, увеличение молочной железы (особенно у мужчин), сыпь (особенно на ладонях), затруднение свертывания крови, звездчатые сосуды на коже, спутанность сознания, кома (энцефалопатия), накопление жидкости в брюшной полости (асциты), расширение вен пищевода, портальная гипертензия, почечная недостаточность, увеличение селезенки, уменьшение кровяных клеток, анемия, тромбоцитопения, желтуха и печеночноклеточная злокачественная опухоль, при этом указанный способ включает введение больному с риском эффективного количества по меньшей мере одного соединения в соответствии с настоящим изобретением, как описывается выше, в комбинации с фармацевтически приемлемыми носителем, добавкой или вспомогательным веществом, необязательно в комбинации с другим средством против HCV. Согласно другому варианту осуществления активные соединения в соответствии с настоящим изобретением могут быть введены больному после связанной с гепатитом трансплантации печени для защиты нового органа.
6
5'-Стабилизированный β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенный-2-модифицированный-N-замещенный пуриновый нуклеотид может быть введен при необходимости в виде каких-либо соли или пролекарства, которые при введении реципиенту способны обеспечивать непосредственно или опосредованно исходное соединение или которые сами ингибируют активность. Неограничивающими примерами являются фармацевтически приемлемые соли и соединение, которые были модифицированы по функциональной группе, такой как функциональная гидроксильная или аминогруппа, для модификации биологической активности, фармакокинетических показателей, периода полувыведения, контролированной доставки, липофильности, кинетических показателей поглощения, облегчения фосфорилирования до активного 5'-трифосфата или эффективности доставки с использованием желаемого пути введения соединения. Способы модификации свойств активного соединения с целью достижения целевых свойств известны специалистам в данной области или могут быть легко оценены стандартными способами, например, ацилирование, фосфорилирование, тиофосфорамидирование, фосфорамидирование, фосфонирование, алкилирование или пегилирование.
IV. Фармацевтические композиции
6
Согласно аспекту настоящего изобретения фармацевтические композиции в соответствии с настоящим изобретением содержат эффективное против вируса HCV количество по меньшей мере одного из соединений 5'-стабилизированного β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеотида, описываемых в настоящем документе, необязательно в комбинации с фармацевтически приемлемыми носителем, добавкой или вспомогательным веществом, кроме того, необязательно в комбинации или при чередовании по меньшей мере с одним другим активным соединением.
6
Согласно аспекту настоящего изобретения фармацевтические композиции в соответствии с настоящим изобретением содержат эффективное против вируса HCV количество по меньшей мере одного из активных соединений β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеотида, описываемых в настоящем документе, необязательно в комбинации с фармацевтически приемлемыми носителем, добавкой или вспомогательным веществом, кроме того, необязательно в комбинации по меньшей мере с одним другим противовирусным средством, таким как средство против HCV.
6
6
Настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям, которые включают в себя количество, эффективное для лечения инфекции вируса гепатита С, одного из соединений β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеотида в соответствии с настоящим изобретением или их соли или пролекарства в фармацевтически приемлемом носителе или вспомогательном веществе. Согласно альтернативному варианту осуществления настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям, которые включают в себя количество, эффективное для предупреждения инфекции вируса гепатита С, одного из соединений β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеотида в соответствии с настоящим изобретением или их соли или пролекарства в фармацевтически приемлемом носителе или вспомогательном веществе.
Специалисту в данной области будет очевидно, что терапевтически эффективное количество будет варьировать в зависимости от инфекции или состояния, подлежащих лечению, их тяжести, применяемого режима лечения, фармакокинетических показателей используемого средства, а также больного или субъекта (животного или человека), подлежащего лечению, и такое терапевтическое количество может быть определено лечащим врачом или специалистом.
6
Соединения 5'-стабилизированного β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенного-2-модифицированного-N-замещенного пуринового нуклеотида в соответствии с настоящим изобретением могут быть составлены в смеси с фармацевтически приемлемым носителем. Как правило, предпочтительно вводить фармацевтическую композицию в перорально вводимой форме, но некоторые составы можно вводить парентеральным, внутривенным, внутримышечным, местным, чрескожным, буккальным, подкожным, с помощью суппозитория или другим путем, в том числе интраназальным распылением. Внутривенные и внутримышечные составы часто вводят в стерильном солевом растворе. Специалист в данной области может модифицировать составы, чтобы сделать их более растворимыми в воде или другой среде-носителе, например, это можно легко осуществить с помощью небольших модификаций (солеобразования, эстерификации и т.д.), которые хорошо известны специалисту в данной области. Также специалисту в данной области хорошо известно, как модифицировать путь введения и режим дозирования конкретного соединения для регулирования фармакокинетических показателей соединений в соответствии с настоящим изобретением для максимально полезного эффекта для больных.
В некоторых фармацевтических дозированных формах предпочтительной является пролекарственная форма соединений, в том числе ацилированные (ацетилированные или иные) и эфирные (алкиловые и родственные) производные, фосфатные сложные эфиры, тиофосфорамидаты, фосфорамидаты и различные солевые формы соединений в соответствии с настоящим изобретением. Специалисту в данной области будет понятно, как легко модифицировать соединения в соответствии с настоящим изобретением в пролекарственные формы с целью облегчения доставки активных соединений в целевой участок организма хозяина или больного. Специалист также сможет использовать благоприятные фармакокинетические параметры пролекарственных форм при применении в доставке соединений в соответствии с настоящим изобретением в целевой участок организма хозяина или больного для максимизации предполагаемого эффекта соединения.
3
Количество соединения, включенного в терапевтически активные составы в соответствии с настоящим изобретением, представляет собой количество, эффективное для лечения инфекции HCV, снижения вероятности возникновения инфекции HCV или ингибирования, снижения и/или устранения HCV или его вторичных эффектов, в том числе болезненных состояний, состояний и/или осложнений, которые являются вторичными по отношению к инфекции HCV. Как правило, терапевтически эффективное количество соединения в соответствии с настоящим изобретением в фармацевтической дозированной форме обычно варьирует от приблизительно 0,001 мг/кг до приблизительно 100 мг/кг в сутки или больше, чаще, от чуть менее приблизительно 0,1 мг/кг до более чем приблизительно 25 мг/кг массы тела больного в сутки или существенно больше, в зависимости от используемого соединения, подлежащих лечению состояния или инфекции и пути введения. Активное нуклеозидное соединение в соответствии с настоящим изобретением часто вводят в количествах, варьирующих от приблизительно 0,1 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг массы тела больного в сутки, в зависимости от фармакокинетических показателей средства у больного. Данный диапазон дозировки, как правило, обеспечивает эффективные уровни концентраций активного соединения в крови, которые могут варьировать от приблизительно 0,001 до приблизительно 100, от приблизительно 0,05 до приблизительно 100 микрограммов/см крови у больного.
Часто для лечения, предупреждения или замедления начала этих инфекций и/или для снижения вероятности инфекции вируса HCV или вторичного болезненного состояния, состояния или осложнения инфекции HCV композиции будут вводить в пероральной дозированной форме в количествах, варьирующих от приблизительно 250 микрограммов до приблизительно 500 мг или больше по меньшей мере один раз в сутки, например, по меньшей мере 25, 50, 100, 150, 250 или 500 миллиграммов, до четырех раз в сутки. Соединения в соответствии с настоящим изобретением часто вводятся перорально, но могут быть введены парентерально, местным путем или в форме суппозитория, а также интраназально, в виде назального распыления, или иным описываемым в настоящем документе способом.
В случае совместного введения соединений в соответствии с настоящим изобретением в комбинации с другим соединением против HCV, как иным образом описывается в настоящем документе, количество соединения в соответствии с настоящим изобретением, подлежащее введению, варьирует от приблизительно 0,01 мг/кг массы тела больного до приблизительно 500 мг/кг массы тела больного или больше или значительно больше, в зависимости от второго средства, подлежащего совместному введению, и его эффективности против вируса, состояния больного и тяжести заболевания или инфекции, подлежащих лечению, а также от пути введения. Другое средство против HCV может быть введено, например, в количествах, варьирующих от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 500 мг/кг. Согласно некоторым предпочтительным вариантам осуществления эти соединения часто можно вводить в количестве, варьирующем от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 50 мг/кг или больше (как правило, до приблизительно 100 мг/кг), как правило, в зависимости от фармакокинетических показателей двух средств у больного. Такие диапазоны дозировки, как правило, обеспечивают эффективные уровни концентраций активного соединения в крови у больного.
Для целей настоящего изобретения профилактическое или превентивное эффективное количество композиций в соответствии с настоящим изобретением попадает в тот же диапазон концентраций, что изложен выше для терапевтически эффективного количества, и обычно является таким же, как и терапевтически эффективное количество.
Введение активного соединения может варьировать от непрерывного (внутривенного капельного введения) до нескольких пероральных или интраназальных введений в сутки (например, Q.I.D.) или чрескожного введения и может предусматривать пероральное, местное, парентеральное, внутримышечное, внутривенное, подкожное, чрескожное (которое может предусматривать усиливающее проницаемость средство), буккальное введение и введение с помощью суппозитория, среди прочих путей введения. Покрытые энтеросолюбильной оболочкой пероральные таблетки также могут быть использованы для усиления биодоступности соединений для перорального пути введения. Наиболее эффективная дозированная форма будет зависеть от биодоступности/фармакокинетических показателей конкретного выбранного средства, а также от тяжести заболевания у больного. Пероральные дозированные формы являются особенно предпочтительными из-за простоты введения и предполагаемого благоприятного соблюдения больным режима лечения.
Для получения фармацевтических композиций в соответствии с настоящим изобретением терапевтически эффективное количество одного или нескольких соединений в соответствии с настоящим изобретением зачастую тщательно смешивают с фармацевтически приемлемым носителем согласно традиционным методикам фармацевтического составления для получения дозы. Носитель может принимать разнообразные формы в зависимости от формы препарата, желаемой для введения, например, пероральной или парентеральной. При получении фармацевтических композиций в пероральной дозированной форме может быть использована любая из обычных фармацевтических сред. Таким образом, для жидких пероральных препаратов, таких как суспензии, эликсиры и растворы, могут быть использованы приемлемые носители и добавки, в том числе вода, гликоли, масла, спирты, ароматизаторы, консерванты, красители и т.п. Для твердых пероральных препаратов, таких как порошки, таблетки, капсулы, и для твердых препаратов, таких как суппозитории, могут быть использованы приемлемые носители и добавки, в том числе крахмалы, сахарные носители, такие как декстроза, manifold, лактоза, а также родственные носители, разбавители, гранулирующие средства, смазки, связующие, разрыхлители и т.п. При необходимости таблетки или капсулы могут быть покрыты энтеросолюбильным покрытием или обеспечены с замедленным высвобождением с помощью стандартных методик. Применение таких дозированных форм может существенно улучшить биодоступность соединений у больного.
В парентеральных составах носитель, как правило, будет содержать стерильную воду или водный раствор натрия хлорида, хотя также могут быть включены другие ингредиенты, в том числе те, которые обеспечивают дисперсию. Конечно, если должна быть использована стерильная вода при сохранении ее стерильности, композиции и носители также должны быть стерилизованными. Также могут быть получены инъекционные суспензии, и в этом случае могут быть использованы подходящие жидкие носители, суспендирующие средства и т.п.
Липосомные суспензии (в том числе липосомы, нацеленные на вирусные антигены) также могут быть получены традиционными способами получения фармацевтически приемлемых носителей. Они могут подходить для доставки свободных нуклеозидов, ацил/алкилнуклеозидов или пролекарственных форм фосфатов сложных эфиров нуклеозидных соединений в соответствии с настоящим изобретением.
Согласно типичным вариантам осуществления в соответствии с настоящим изобретением соединения и композиции используют для лечения, предупреждения или задержки инфекции HCV или вторичного болезненного состояния, состояния или осложнения HCV.
V. Комбинированная и чередующаяся терапия
6
Хорошо известно, что устойчивые к лекарственному средству варианты вирусов могут появляться после длительного лечения противовирусным средством. Чаще всего устойчивость к лекарственному средству, как правило, возникает из-за мутации гена, который кодирует фермент, используемый в вирусной репликации. Эффективность лекарственного средства против инфекции HCV может быть пролонгирована, усилена или восстановлена путем введения соединения в комбинации или при чередовании с другим, а возможно даже с двумя или тремя другими противовирусными соединениями, которые индуцируют другую мутацию или действуют через другой путь, по сравнению с основным лекарственным средством. В качестве альтернативы, фармакокинетические показатели, биораспределение, период полувыведения или другой параметр лекарственного средства могут быть изменены такой комбинированной терапией (которая может включать в себя чередующуюся терапию, если считается совместимой). Поскольку раскрываемые β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенные-2-модифицированные-N-замещенные пуриновые нуклеотиды являются ингибиторами NS5B полимеразы, может быть полезно вводить соединение хозяину в комбинации, например, с
(1) ингибитором протеазы, таким как ингибитор NS3/4A протеазы;
(2) ингибитором NS5A;
(3) другим ингибитором NS5B полимеразы;
(4) несубстратным ингибитором NS5B;
(5) интерфероном альфа-2а, который может быть пегилированным или иным образом модифицированным, и/или рибавирином;
(6) несубстратным ингибитором;
(7) ингибитором геликазы;
(8) антисмысловым олигодезоксинуклеотидом (S-ODN);
(9) аптамером;
(10) устойчивым к нуклеазе рибозимом;
(11) iRNA, в том числе microRNA и SiRNA;
(12) антителом, частичным антителом или доменным антителом против вируса или
(13) вирусным антигеном или частичным антигеном, который индуцирует образование антител у хозяина.
6
Неограничивающими примерами средств против HCV, которые можно вводить в комбинации с β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенными-2-модифицированными-N-замещенными пуриновыми нуклеотидами в соответствии с настоящим изобретением, являются
(i) ингибиторы протеазы, такие как телапревир (Incivek), боцепревир (Victrelis™), симепревир (Olysio™), паритапревир (АВТ-450), АСН-2684, AZD-7295, BMS-791325, данопревир, филибувир, GS-9256, GS-9451, МК-5172, сетробувир, совапревир, тегобувир, VX-135, VX-222 и ALS-220;
(ii) ингибитор NS5A, такой как АСН-2928, АСН-3102, IDX-719, даклатасвир, ледиспасвир и омбитасвир (АВТ-267);
(iii) ингибиторы NS5B, такие как АСН-3422, AZD-7295, клемизол, ITX-5061, PPI-461, PPI-688, Sovaldi, MK-3682 и мерицитабин;
(iv) ингибиторы NS5B, такие как АВТ-333, МВХ-700; и
(v) антитело, такое как GS-6624.
6
Если β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенный-2-модифицированный-N-замещенный пуриновый нуклеотид вводят для лечения запущенного вирусного гепатита С, приводящего к злокачественной опухоли печени или циррозу, согласно одному варианту осуществления соединение может быть введено в комбинации или при чередовании с другим лекарственным средством, которое, как правило, используют для лечения гепатоклеточной карциномы (НСС), например, как описано Andrew Zhu в "New Agents on the Horizon in Hepatocellular Carcinoma" Therapeutic Advances in Medical Oncology, V 5(1), January 2013, 41-50. Примеры приемлемых соединений для комбинированной терапии, если хозяин страдает НСС или рискует заболеть НСС, включают в себя противоангиогенные средства, сунитиниб, бриваниб, линифаниб, рамуцирумаб, бевацизумаб, цедираниб, пазопаниб, TSU-68, ленватиниб, антитела против EGFR, ингибиторы mTor, ингибиторы MEK и ингибиторы гистондеацетилазы.
Лекарственными средствами, которые на данный момент одобрены для гриппа, являются амантадин, римантадин и оселтамивир. Любые из этих лекарственных средств могут быть использованы в комбинации или при чередовании с активным соединением, представленным в настоящем документе, для лечения вирусной инфекции, восприимчивой к таковому. Рибавирин используются для лечения кори, гриппа А, гриппа В, парагриппа, тяжелого вызванного RSV бронхиолита и SARS, а также других вирусных инфекций, и, поэтому, особенно применимы в комбинации с соединением в соответствии с настоящим изобретением для лечения хозяина, инфицированного содержащим однонитевую РНК вирусом. Паливизумаб одобрен для применения детям с высоким риском инфекции RSV.
На данный момент имеются неодобренные лекарственные средства против вируса Западного Нила. Врачи рекомендуют проводить интенсивную поддерживающую терапию, которая может предусматривать госпитализацию, внутривенные жидкости, использование вентилятора для облегчения дыхания, лекарства для контроля приступов, отека головного мозга, тошноты и рвоты, а также применение антибиотиков для предотвращения бактериальных инфекций, осложняющих заболевание. Это подчеркивает важность соединений в соответствии с настоящим изобретением для противовирусной лекарственной терапии.
6
VI. Процесс получения β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-С-замещенных-2-модифицированных-N-замещенных пуриновых нуклеотидов в соответствии с настоящим изобретением
Общие способы обеспечения соединений в соответствии с настоящим изобретением известны в уровне техники или описываются в настоящем документе. Синтез 2'-хлорнуклеотидов описывается в US 20150366888, WO 2014058801; WO 2015/066370 и WO 2015200219.
В схемах синтеза используют следующие сокращения.
4
CBr: тетрабромид углерода.
DBU: 1,8-диазабицикло[5,4,0]ундец-7-ен.
DCM: дихлорметан.
THF: тетрагидрофуран (THF), безводный.
EtOAc: этилацетат.
EtOH: этанол.
3
Li(OtBu)AlH: три-трет-бутоксиалюминия гидрид лития.
2
4
NaSO: сульфат натрия (безводный).
MeCN: ацетонитрил.
2
MeNH: метиламин.
МеОН: метанол.
2
4
NaSO: сульфат натрия.
3
NaHCO: бикарбонат натрия.
4
NHCl: хлорид аммония.
4
NHOH: гидроксид аммония.
РЕ: петролейный эфир.
3
PhP: трифенилфосфин.
Силикагель (230-400 меш, Sorbent).
t-BuMgCl: хлорид трет-бутилмагния.
t-BuOK: трет-бутоксид натрия.
t-BuOH: трет-бутанол.
ПРИМЕРЫ
Общие способы
1
19
31
3
3
6
Спектры Н, F и Р ЯМР регистрировали при 300 МГц на спектрометре с преобразованием Фурье производства . Спектры получали из образцов, полученных в пробирках диаметром 5 мм в CDCl, CDOD или DMSO-d. Спиновые мультиплетности обозначали символами с (синглет), д (дублет), т (триплет), м (мультиплет) и ушир. (уширенный). Константы взаимодействия (J) выражали в Гц. Масс-спектры получали с использованием ионизации электрораспылением (ESI) на квадрупольном масс-спектрометре Agilent Technologies 6120. Реакции, как правило, проводили в атмосфере осушенного азота с использованием безводных растворителей производства Sigma-Aldrich. Все обычные химические вещества приобретали из коммерческих источников.
Пример 1. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
Стадия 1. Получение ((2R,3R,4R,5R)-3-(бензоилокси)-5-бром-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метилбензоата (2).
4
2
4
3
4
3
3
1
19
К раствору (2R)-3,5-ди-O-бензоил-2-фтор-2-С-метил-D-рибозо-γ-лактона (24,8 г, 66,6 ммоль) в безводном THF (333 мл), находящемуся в атмосфере азота и охлажденному до -30°C, по каплям добавляли три-трет-бутоксиалюмогидрид лития (1,0 М в THF, 22,6 мл, 22,6 ммоль). После завершения добавления, реакционную смесь медленно нагревали до -15°C в течение 90 мин, затем добавляли EtOAc (300 мл), и смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (200 мл). Полученный раствор фильтровали на Celite, и дважды экстрагировали фильтрат EtOAc. Объединенные органические фазы сушили (NaSO), фильтровали и концентрировали. Остаток поглощали безводным DCM (225 мл) в атмосфере азота, охлаждали до -20°C, а затем добавляли PPh (19,1 г, 72,8 ммоль). После 10 мин перемешивания при -20°C, добавляли CBr (26,0 г, 78,4 ммоль), и оставляли реакционную смесь медленно нагреваться до 0°C в течение 2 ч. Полученную смесь выливали на колонку с силикагелем и элюировали РЕ/EtOAc (градиент 100/0 → 80/20). Фракции, содержащие α-бромфуранозид, собирали и концентрировали с получением продукта 2 (18,1 г, 41,3 ммоль, 62% в два этапа) в виде плотного бесцветного масла. Н-ЯМР (300 МГц, CDCl) δ 8,15-8,11 (м, 2Н), 8,04-8,01 (м, 2Н), 7,64-7,55 (м, 2Н), 7,51-7,41 (м, 4Н), 6,34 (д, J=1,6 Гц, 1Н), 5,29 (дд, J=5,5, 3,1 Гц, 1H), 4,89-4,85 (м, 1H), 4,78 (дд, J=12,5, 3,2 Гц, 1H), 4,63 (дд, J=12,5, 4,5 Гц, 1H), 1,72 (д, J=21,6 Гц, 3Н). F-ЯМР (282 МГц, CDCl) δ - 150,0.
Стадия 2. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(бензоилоксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-илбензоата (3).
4
2
4
3
3
25
22
5
5
1
19
+
2-Амино-6-хлорпурин (2,63 г, 15,5 ммоль) суспендировали в трет-BuOH (54 мл) в атмосфере азота. Реакционную смесь нагревали до 30°C, а затем добавляли трет-бутоксид калия (1,69 г, 15,1 ммоль). Спустя 45 мин, добавляли раствор бромфуранозида 2 (2,24 г, 5,12 ммоль), растворенного в безводном MeCN (6 мл), реакционную смесь нагревали до 65°C в течение 16 ч, а затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водн. раствор NHCl (70 мл), и экстрагировали полученный раствор EtOAc (3×60 мл). Объединенные органические фазы сушили (NaSO), фильтровали и концентрировали. Остаток дважды очищали методом колоночной хроматографии (градиент PE/EtOAc 80/20 → 0/100, затем 60/40 → 20/80) с получением продукта 3 (1,56 г, 2,96 ммоль, 57%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDCl) δ 8,05-8,02 (м, 2Н), 7,95-7,92 (м, 2Н), 7,88 (с, 1H), 7,63-7,57 (м, 1H), 7,53-7,41 (м, 3Н), 7,35-7,30 (м, 2Н), 6,43 (дд, J=22,6, 9,1 Гц, 1Н), 6,12 (д, J=18,3 Гц, 1Н), 5,34 (ушир. с, 2Н), 5,00 (дд, J=11,9, 4,5 Гц, 1H), 4,79-4,73 (м, 1Н), 4,60 (дд, J=11,9, 5,3 Гц, 1Н), 1,34 (д, J=22,6 Гц, 3H). F-ЯМР (282 МГц, CDCl) δ - 157,0. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 526,9; обнаружено 527,0.
Стадия 3. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (4).
2
3
3
12
19
6
3
1
19
+
К раствору соединения 3 (575 мг, 1,09 ммоль) в МеОН (9 мл) добавляли метиламин (33% в абсолютном EtOH, 1,7 мл, 1,81 ммоль). Реакционную смесь нагревали до 85°C в герметизированной пробирке в течение 16 ч, охлаждали до комнатной температуры и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 85/15), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент НО/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 4 (286 мг, 0,91 ммоль, 84%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,06 (с, 1Н), 6,11 (д, J=18,1 Гц, 1H), 4,41 (дд, J=24,4, 9,1 Гц, 1H), 4,07-4,01 (м, 2Н), 3,86 (дд, J=12,9, 3,3 Гц, 1H), 3,04 (ушир. с, 3H), 1,16 (д, J=22,3 Гц, 3H). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ - 163,7. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 313,1; обнаружено 313,2.
Стадия 4. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (5).
4
2
4
2
3
2
3
3
24
34
7
7
1
19
31
+
К раствору соединения 4 (114 мг, 365 мкмоль) в безводном THF (4 мл), находящемуся в атмосфере азота и охлажденному до 0°C, в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 0,66 мл, 660 мкмоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°C, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°C, а затем в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)-феноксифосфорил)-L-аланината (Ross, B.S., Reddy, P.G., Zhang, H.R., Rachakonda, S., and Sofia, M.J., J. Org, Chem., (2011)) (253 мг, 558 мкмоль), растворенного в безводном THF (1 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°C в течение 30 мин, затем в течение 18 ч при комнатной температуре, затем гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили, фильтровали (NaSO) и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 5 (смесь диастереоизомеров, 101 мг, 174 мкмоль, 48%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,83 (с, 0,55Н), 7,82 (с, 0,45Н), 7,38-7,16 (м, 5Н), 6,15 (д, J=18,5 Гц, 0,45Н), (д, J=18,8 Гц, 0,55Н), 4,99-4,88 (перекрывается с HO, м, 1Н), 4,65-4,36 (м, 3H), 4,25-4,17 (м, 1Н), 3,97-3,85 (м, 1H), 3,05 (ушир. с, 3H), 1,32-1,28 (м, 3H), 1,25-1,15 (м, 9Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ - 162,8 (с), - 163,3 (с). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,10 (с), 3,99 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 582,2; обнаружено 582,2.
Пример 2. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (7).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9Н-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (6).
2
3
3
13
20
6
3
1
19
+
К раствору полученного в примере 1 соединения 3 (500 мг, 0,95 ммоль) в МеОН (6 мл) добавляли диметиламина гидрохлорид (783 мг, 9,6 ммоль) и 1,8-диазабицикло[5.4.0]ундец-7-ен (1,43 мл, 9,6 ммоль). Реакционную смесь нагревали при 85°C в герметизированной пробирке в течение 6 ч, охлаждали до комнатной температуры и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 85/15), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100), с получением продукта 6 (200 мг, 0,61 ммоль, 64%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,07 (с, 1H), 6,14 (д, J=18,1 Гц, 1Н), 4,41 (дд, J=24,4, 9,2 Гц, 1H), 4,08-4,02 (м, 2Н), 3,87 (дд, J=12,8, 2,9 Гц, 1Н), 3,42 (ушир. с, 6Н), 1,16 (д, J=22,0 Гц, 3H). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ - 163,8. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 327,2; обнаружено 327,2.
Стадия 2. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (7).
4
2
4
2
3
2
3
3
25
36
7
7
1
19
31
+
К раствору соединения 6 (80 мг, 245 мкмоль) в безводном THF (4 мл), находящемуся в атмосфере азота и охлажденному до 0°C, в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 0,64 мл, 640 мкмоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°C, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°C, а затем в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)-феноксифосфорил)-L-аланината (167 мг, 367 мкмоль), растворенного в безводном THF (4 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°C в течение 30 мин и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили, фильтровали (NaSO) и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 7 (смесь диастереоизомеров, 35 мг, 58 мкмоль, 24%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,83 (с, 0,5Н), 7,82 (с, 0,5Н), 7,34-7,16 (м, 5Н), 6,15 (д, J=18,7 Гц, 0.5Н), 6,13 (д, J=18,8 Гц, 0,5Н), 4,99-4,85 (перекрывается с HO, м, 1Н), 4,65-4,26 (м, 3H), 4,27-4,12 (м, 1H), 3,99-3,81 (м, 1Н), 3,42, 3,41 (2 ушир. с, 6Н), 1,36-1,25 (м, 3H), 1,24-1,11 (м, 9Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ - 162,7 (с), - 163,2 (с). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,08 (с), 4,00 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 596,5; обнаружено 596,2.
Пример 3. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклопропиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (9).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклопропиламино)-9Н-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (8).
4
3
3
15
22
6
3
1
19
+
К раствору соединения 3 (600 мг, 1,14 ммоль) в МеОН (10 мл) добавляли N-метилциклопропиламина гидрохлорид (366 мг, 3,40 ммоль) и триэтиламин (470 мкл, 3,40 ммоль). Реакционную смесь нагревали при 100°С в герметизированной пробирке в течение 15 ч, и охлаждали до комнатной температуры. Добавляли 30% водный раствор NHOH (4 мл), реакционную смесь нагревали при 100°С в герметизированной пробирке в течение 2 ч, охлаждали и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта 8 (351 мг, 0,99 ммоль, 87%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,13 (с, 1Н), 6,15 (д, J=18,0 Гц, 1H), 4,40 (дд, J=24,3, 9,0 Гц, 1Н), 4,06-4,02 (м, 2Н), 3,89-3,83 (м, 1H), 3,32 (м, 3Н), 3,18-3,11 (м, 1Н), 1,16 (д, J=22,2 Гц, 3Н), 0,96-0,89 (м, 2Н), 0,74-0,69 (м, 2Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ -163,8. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 353,2; обнаружено 353,2.
Стадия 2. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклопропиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (9).
4
2
4
2
3
2
3
27
38
7
7
1
31
+
К раствору соединения 8 (200 мг, 0,57 ммоль) в безводном THF (15 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 680 мкл, 0,68 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланината (283 мг, 0,62 ммоль), растворенного в безводном THF (4 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 9 (смесь 2 диастереоизомеров, 160 мг, 0,26 ммоль, 45%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,85 (м, 1Н), 7,38-7,16 (м, 5Н), 6,18 (д, J=18,6 Гц) и 6,16 (д, J=18,9 Гц, 1Н), 4,95-4,90 (перекрывается с HO, м, 1Н), 4,58-4,47 (м, 3Н), 4,22-4,19 (м, 1Н), 3,95-3,87 (м, 1Н), 3,36-3,34 (перекрывается с МеОН, м, 3Н), 3,19-3,12 (м, 1Н), 1,32-1,22 (м, 12H), 0,96-0,89 (м, 2Н), 0,74-0,69 (м, 2Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,11 (с), 4,02 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 622,2; обнаружено 622,2.
Пример 4. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2,6-бис-метиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (12).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2,6-дихлор-9H-пурин-9-ил)-2-(бензоилоксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-илбензоата (10).
4
2
4
3
3
25
20
2
4
5
1
19
+
2,6-Дихлорпурин (1,30 г, 6,86 ммоль) суспендировали в трет-BuOH (25 мл) в атмосфере азота. Порциями добавляли трет-бутоксид калия (778 мг, 6,92 ммоль), а затем перемешивали реакционную смесь при комнатной температуре. Спустя 1 ч, добавляли раствор бромфуранозида 2 (1,0 г, 2,29 ммоль), растворенного в безводном MeCN (20 мл), реакционную смесь нагревали при 65°С в течение ночи, а затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водн. раствор NHCl, и экстрагировали полученный раствор EtOAc (трижды). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент РЕ/EtOAc 100/0 → 0/100) с получением продукта 10 (148 мг, 0,27 ммоль, 12%) в виде липкого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDCl) δ 8,31 (с, 1H), 8,12-8,09 (м, 2Н), 8,02-7,99 (м, 2Н), 7,64-7,39 (м, 6Н), 6,38 (д, J=17,2 Гц, 1Н), 6,02 (дд, J=21,2, 8,9 Гц, 1H), 4,90-4,68 (м, 3Н), 1,33 (д, J=22,4 Гц, 3Н). F-ЯМР (282 МГц, CDCl) δ -158,0. MS (ESI) m/z рассчит. для CHClFNO [М+Н] 546,4; обнаружено 546,3.
Стадия 2. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2,6-бис-метиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (11).
2
3
3
13
20
6
3
1
19
+
Раствор соединения 10 (148 мг, 0,27 ммоль) в метиламине (33% в EtOH, 30 мл) нагревали при 130°С в герметизированной пробирке в течение 4 суток, охлаждали до комнатной температуры и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 50/50), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100), с получением продукта 11 (33 мг, 0,10 ммоль, 37%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,00 (с, 1Н), 6,12 (д, J=18,5 Гц, 1Н), 4,51 (дд, J=24,4, 9,5 Гц, 1Н), 4,06-3,85 (м, 3Н), 3,04 (с, 3Н), 2,93 (с, 3Н), 1,20 (д, J=22,4 Гц, 3Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ -163,2. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 327,2; обнаружено 327,2.
Стадия 3. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2,6-бис-метиламино-9Н-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (12).
4
2
4
3
2
3
3
25
36
7
7
1
19
31
+
К раствору соединения 11 (55 мг, 0,17 ммоль) в безводном THF (2 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1 M в THF, 304 мкл, 0,30 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем в течение 15 мин при комнатной температуре. Раствор охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)-феноксифосфорил)-L-аланината (115 мг, 0,25 ммоль), растворенного в безводном THF (1 мл). Смесь медленно нагревали до комнатной температуры и перемешивали в течение 4 суток. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl и экстрагировали EtOAc (трижды). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 50/50) с получением продукта 12 (смесь диастереоизомеров, 13 мг, 0,02 ммоль, 13%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,78 (с, 1Н), 7,35-7,12 (м, 5Н), 6,13 (д, J=19,1 Гц, 0,53Н), 6,10 (д, J=19,2 Гц, 0,47Н), 4,99-4,78 (перекрывается с HO, м, 1Н), 4,72-4,46 (м, 3Н), 4,24-4,15 (м, 1H), 3,79-3,92 (м, 1Н), 3,02 (ушир. с, 3Н), 2,92 (с+с, 3Н), 1,29-1,11 (м, 12Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ -162,0 (с), -162,3 (с). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 3,97 (с), 3,89 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 596,6; обнаружено 596,2.
Пример 5. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-изобутирамидо-6-метиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (16).
Стадия 1. Получение соединения 13.
4
2
4
24
44
6
4
2
+
К раствору соединения 4 (286 мг, 0,92 ммоль) и имидазола (370 мг, 5,43 ммоль) в безводном DMF (6 мл) при 0°С добавляли 1,3-дихлор-1,1,3,3-тетраизопропилдисилоксан (300 мкл, 0,94 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 2 ч при к.т., разбавляли EtOAc (50 мл), и промывали суспензию насыщенным водн. раствором NHCl и солевым раствором (по 40 мл каждого). Органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент PE/EtOAc 7/3 → 3/7) с получением продукта 13 (283 мг, 0,51 ммоль, 56%) в виде белого твердого вещества. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOSi [М+Н] 555,8; обнаружено 555,2.
Стадия 2. Получение соединения 14.
28
50
6
5
2
+
К раствору соединения 13 (200 мг, 0,36 ммоль) в безводном пиридине (3 мл) при 0°С добавляли изобутирилхлорид (38 мкл, 0,36 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 2 ч при к.т. Реакционную смесь гасили добавлением воды (500 мкл). Смесь концентрировали и упаривали совместно с толуолом (3×10 мл). Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент РЕ/EtOAc 1/0 → 1/1) с получением продукта 14 (99 мг, 0,16 ммоль, 44%) в виде белого твердого вещества. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOSi [М+Н] 625,9; обнаружено 625,3.
Стадия 3. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-изобутирамидо-6-метиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (15).
2
3
3
16
24
6
4
1
19
+
К раствору соединения 14 (90 мг, 0,14 ммоль) в безводном THF (2 мл) добавляли фторид тетрабутиламмония (1 M в THF, 38 мкл, 0,38 ммоль). Смесь перемешивали в течение 2 ч при к.т. и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 10/0 → 9/1), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент НО/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 15 (42 мг, 0,11 ммоль, 77%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,31 (с, 1Н), 6,29 (д, J=17,9 Гц, 1Н), 4,70-4,60 (м, 1Н), 4,07-3,98 (м, 2Н), 3,89 (дд, J=12,5, 3,4 Гц, 1H), 3,10 (ушир. с, 3Н), 2,87 (ушир. с, 1H), 1,23-1,16 (м, 9Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ -163,8. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 383,4; обнаружено 383,2.
Стадия 4. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-изобутирамидо-6-метиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (16).
4
2
4
2
3
2
3
3
28
40
7
8
1
31
31
+
К раствору соединения 15 (27 мг, 0,07 ммоль) в безводном THF (1 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 130 мкл, 0,13 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланината (50 мг, 0,11 ммоль), растворенного в безводном THF (1 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин, затем в течение 18 ч при комнатной температуре, а затем гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (2 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 95/5), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 16 (смесь 2 диастереоизомеров, 25 мг, 0,04 ммоль, 54%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,05 (с, 1Н), 7,33-7,13 (м, 5Н), 6,27 (д, J=18,6 Гц) и 6,21 (д, J=19,1 Гц, 1Н), 5,10-4,95 (м, 1Н), 4,93-4,78 (перекрывается с HO, м, 1H), 4,60-4,42 (м, 2Н), 4,26-4,18 (м, 1H), 3,90-3,80 (м, 1Н), 3,09 (ушир. с, 3Н), 2,84-2,80 (м, 1Н), 1,33-1,15 (м, 18Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 3,69 (с). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,11 (с), 3,99 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 652,6; обнаружено 652,3.
Пример 6. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилэтиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (18).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилэтиламино)-9Н-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (17).
1
19
+
3
3
14
22
6
3
К раствору соединения 3 (150 мг, 0,29 ммоль) в МеОН (4 мл) добавляли N-метилэтиламин (245 мкл, 2,90 ммоль). Реакционную смесь нагревали при 100°С в герметизированной пробирке в течение 15 ч, охлаждали до комнатной температуры и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта 31 (89 мг, 0,26 ммоль, 89%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,06 (с, 1H), 6,13 (д, J=18,0 Гц, 1Н), 4,40 (дд, J=24,9, 8,7 Гц, 1Н), 4,11-4,01 (м, 4Н), 3,98-3,83 (м, 1H), 3,34 (ушир. с, 3Н), 1,24-1,11 (м, 6Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ -163,7. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 341,2; обнаружено 341,2.
Стадия 2. Получение изопропил-((((R,S-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилэтиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (18).
4
2
4
3
2
3
26
38
7
7
1
31
+
К раствору соединения 17 (30 мг, 0,09 ммоль) в безводном THF (2 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 110 мкл, 0,11 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланинат (48 мг, 0,11 ммоль), растворенный в безводном THF (1 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта 18 (смесь 2 диастереоизомеров, 22 мг, 0,04 ммоль, 40%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,69 (м, 1Н), 7,26-7,04 (м, 5Н), 6,05 (д, J=18,6 Гц) и 6,03 (д, J=18,9 Гц, 1H), 4,86-4,79 (перекрывается с HO, м, 1Н), 4,50-4,32 (м, 3Н), 4,12-4,06 (м, 1Н), 3,96-3,79 (м, 3Н), 3,25 (ушир. с, 3Н), 1,24-1,02 (м, 15Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,07 (с), 4,00 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 609,3; обнаружено 609,2.
Пример 7. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилпропиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (20).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилпропиламино)-9Н-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (19).
2
3
3
15
24
6
3
1
19
+
К раствору соединения 3 (150 мг, 0,29 ммоль) в МеОН (4 мл) добавляли N-метилпропиламин (295 мкл, 2,90 ммоль). Реакционную смесь нагревали при 100°С в герметизированной пробирке в течение 15 ч, охлаждали до комнатной температуры и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 19 (80 мг, 0,23 ммоль, 78%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,04 (с, 1Н), 6,13 (д, J=18,3, 1H), 4,40 (дд, J=24,2, 9,2 Гц, 1H), м, 4,06-3,84 (м, 5Н), 1,68 (sept, J=7,5 Гц, 2Н), 1,15 (д, J=22,2 Гц, 3Н), 0,93 (т, J=7,5 Гц, 3Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ -163,8. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 355,2; обнаружено 355,2.
Стадия 2. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилпропиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (20).
4
2
4
3
2
3
27
40
7
7
1
31
+
К раствору соединения 19 (30 мг, 0,09 ммоль) в безводном THF (2 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 110 мкл, 0,11 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланината (46 мг, 0,11 ммоль), растворенного в безводном THF (1 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта 20 (смесь 2 диастереоизомеров, 22 мг, 0,03 ммоль, 33%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,78, 7,77 (с+с, 1Н), 7,37-7,13 (м, 5Н), 6,15 (д, J=18,6 Гц) и 6,13 (д, J=18,9 Гц, 1Н), 4,97-4,89 (перекрывается с HO, м, 1H), 4,63-4,30 (м, 3Н), 4,22-4,14 (м, 1Н), 4,02-3,84 (м, 2Н), 1,74-1,63 (3Н, m), 1,32-1,27 (м, 3Н), 1,23-1,13 (м, 9Н), 0,94 (т, J=7,4 Гц) и 0,93 (т, J=7,4 Гц, 3Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,05 (с), 4,00 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 623,3; обнаружено 623,2.
Пример 8. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклобутиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (22).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклобутиламино)-9Н-пурин-9-ил)-4-фтор-2-(гидроксиметил)-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (21).
4
3
3
16
24
6
3
1
19
+
К раствору соединения 3 (150 мг, 0,29 ммоль) в МеОН (4 мл) добавляли N-метилциклобутиламина гидрохлорид (105 мг, 0,90 ммоль) и триэтиламин (190 мкл, 1,00 ммоль). Реакционную смесь нагревали при 100°С в герметизированной пробирке в течение 15 ч и охлаждали до комнатной температуры. Добавляли 30% водный раствор NHOH (1 мл), реакционную смесь нагревали при 100°С в герметизированной пробирке в течение 2 ч, охлаждали и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта 21 (90 мг, 0,25 ммоль, 86%) в виде бледно-желтого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 8,09 (с, 1Н), 6,14 (д, J=18,0 Гц, 1H), 5,80-5,70 (м, 1Н), 4,44-4,33 (м, 1Н), 4,06-4,02 (м, 2Н), 3,88-3,84 (м, 1Н), 3,34 (с, 3Н), 2,38-2,19 (м, 4Н), 1,79-1,71 (м, 2Н), 1,17 (д, J=22,2 Гц, 3Н). F-ЯМР (282 МГц, CDOD) δ -163,8. MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNO [М+Н] 367,2; обнаружено 367,2.
Стадия 2. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклобутиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (22).
4
2
4
2
3
3
28
40
7
7
1
31
+
К раствору соединения 21 (50 мг, 0,14 ммоль) в безводном THF (2 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 210 мкл, 0,21 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланинат (74 мг, 0,16 ммоль), растворенного в безводном THF (2 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10), а затем методом обращенно-фазовой колоночной хроматографии (градиент HO/МеОН 100/0 → 0/100) с получением продукта 22 (смесь 2 диастереоизомеров, 24 мг, 0,04 ммоль, 28%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,79 (с, 0,2Н), 7,77 (с, 0,8Н), 7,38-7,12 (м, 5Н), 6,18 (д, J=17,6 Гц) и 6,16 (д, J=17,5 Гц, 1Н), 4,95-4,81 (м, 2Н), 4,62-4,43 (м, 3Н), 4,25-4,18 (м, 1H), 3,96-3,83 (м, 1Н), 3,38 (с) и 3,36 (с, 3Н), 2,38-2,21 (м, 4Н), 1,75-1,63 (м, 2Н), 1,32-1,16 (м, 12Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,04 (с), 3,97 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 636,3; обнаружено 636,2.
Модификация 2-аминогруппы активных соединений
6
6
2
6
2
6
Средний специалист в данной области техники может добавить заместитель 2-аминогруппы пуринового фрагмента способами, хорошо известными специалистам в данной области техники. Один неограничивающий способ представлен в настоящем документе, а другие могут быть легко адаптированы. ((2R,3R,4R,5R)-3-(бензоилокси)-5-бром-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метилбензоат обрабатывают коммерчески доступным 2,6-дихлорпурином, основанием и смесью органических растворителей при повышенной температуре с получением (2R,3R,4R,5R)-5-(2,6-дихлор-9H-пурин-9-ил)-2-(бензоилоксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-илбензоата. Согласно одному варианту осуществления, основание представляет собой трет-бутоксид калия. Согласно другому варианту осуществления, смесь органических растворителей содержит трет-бутанол и ацетонитрил. Соединение, (2R,3R,4R,5R)-5-(2,6-дихлор-9H-пурин-9-ил)-2-(бензоилоксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-илбензоат, обрабатывают амином, основанием и органическим растворителем при температуре окружающей среды с получением 2-хлор-N-замещенных пуринов. Согласно одному варианту осуществления, амин представляет собой метиламин. Согласно одному варианту осуществления, основание представляет собой триэтиламин. Согласно одному варианту осуществления, органический растворитель представляет собой этанол. Специалисту в данной области техники следует понимать, что после обработки амином и основанием бензоатные группы нуклеозида будут одномоментно удалены с получением фуранозного фрагмента со снятой защитой. Затем, 2-хлор-N-замещенные пурины могут быть обработаны амином и органическим растворителем в герметизированной пробирке при повышенной температуре около 100°С с получением N,N-дизамещенных пуриновых нуклеозидов согласно настоящему изобретению. Согласно одному варианту осуществления, амин представляет собой метиламин. Согласно одному варианту осуществления, органический растворитель представляет собой этанол. N,N-дизамещенные пуриновые нуклеозиды согласно настоящему изобретению могут быть обработаны основанием, изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланинатом и органическим растворителем при пониженной температуре с получением соединений формул I-V. Согласно одному варианту осуществления, основание представляет собой трет-бутилмагнийхлорид. Согласно одному варианту осуществления, органический растворитель представляет собой тетрагидрофуран.
Получение стереоспецифических энантиомеров по фосфору
Определенные активные соединения, описанные в настоящем документе, характеризуются наличием хирального фосфорсодержащего фрагмента. Любое из активных соединений, описанных в настоящем документе, может быть предоставлено в виде выделенной энантиомерной по фосфору формы, например, R- или S-энантиомера с чистотой, по меньшей мере, 80, 90, 95 или 98%, с использованием способов, известных специалистам в данной области техники. Например, существует целый ряд публикаций, в которых описано получение таких соединений с использованием без ограничения метода колоночной хроматографии, например, как описано ниже в примере 17 и патентах США №№8,859,756; 8,642,756 и 8,333,309, полученных Ross, et al.
Пример 9. Разделение стереоизомеров соединения 5.
Стереоизомеры соединения 5 разделяли на колонке Phenominex Luna с использованием следующих условий:
Колонка: Phenominex Luna 5 мкм С18 (2) 250×10 мм; кат. № OOG-4252-BO
Концентрация образца: приблизительно 50 мг/мл в ацетонитриле
Вводимый объем: 50 мкл
Подвижная фаза А: вода с чистотой «для HPLC»
Подвижная фаза В: ацетонитрил с чистотой «для HPLC»
Скорость потока: 5 мл/мин
УФ: 283 нм
Градиент:
Время прогона: 45 мин
Температура колонки: 40°С
Пример хроматограммы полупрепаративного прогона представлен на фигуре 1.
Объединенные фракции оценивали с использованием аналитической колонки в следующих условиях:
Колонка: Phenominex Luna 5 мкм С18 (2) 250×2 мм; кат. № OOG-4252-BO
Вводимый объем: 10 мкл
Подвижная фаза А: вода с чистотой «для HPLC»
Подвижная фаза В: ацетонитрил с чистотой «для HPLC»
Скорость потока: 0,2 мл/мин
УФ: 283 нм
Градиент:
Время прогона: 45 мин
Температура колонки: 40°С
Объединенные фракции для каждого стереоизомера упаривали досуха с использованием роторного испарителя с температурой бани 30°С. Полученные твердые вещества растворяли в 1 мл ацетонитрила, переносили в пробирки для микроцентрифугирования объемом 1,7 мл, и выпаривали растворитель на вакуумной центрифуге при температуре 30°С.
Данные для конечных образцов являются следующими:
1. Элюируемый первым пик: соединение 5 #1 (5-1) (21,7 мг - 97,8% э.и.).
2. Элюируемый вторым пик: соединение 5 #2 (5-2) (13,2 мг - 95,9% э.и.).
Окончательные массы для 1-го и 2-го пиков хорошо соотносятся с их процентным содержанием в начальной смеси (62,2% и 37,8%, соответственно).
Стереоспецифический синтез соединений формул I-VII
Пример 10. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(гидроксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (23).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(гидроксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (23).
Соединение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(бензоилоксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-илбензоат (3, 80 г, 140 ммоль) добавляли к раствору триметиламина в метаноле (7 М, 800 мл), и перемешивали при к.т. в течение ночи. Смесь концентрировали, а затем очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 100/1) с получением (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(гидроксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (23) (40 г, 90%).
Пример 11. Получение ((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (4).
2
+
К раствору (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(гидроксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (2,0 г, 1,0 экв.) в диоксане (15 мл) добавляли вводный раствор MeNH (5,0 экв.). После перемешивания в течение ночи при к.т., методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Смесь концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 40/1 → 30/1) с получением (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ола в виде белого порошка (1,6 г, 81,6%). [М+Н] = 313,5
Стадия 2. Получение ((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
2
4
2
4
3
1
+
Соединение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ол (1,47 г, 1,0 экв.) и PPAL-S (2,35 г, 1,1 экв.) растворяли в безводном THF (29 мл). После охлаждения смеси до -10°С, под слоем N медленно добавляли трет-BuMgCl (5,8 мл, 1,7 М, 2,1 экв.). После перемешивания при к.т. в течение 45 мин, смесь гасили добавлением насыщенного водн. NHCl, и экстрагировали EtOAc (20 мл × 3). Объединенные органические слои промывали водой, солевым раствором (30 мл), сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 50/1 → 20/1) с получением ((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината в виде белого порошка (1,1 г, 40,3%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,81 (с, 1Н), 7,33-7,16 (м, 5Н), 6,10 (д, J=18,4 Гц, 1H), 4,90-4,84 (м, 5Н), 4,55-4,46 (м, 3Н), 4,20-4,16 (м, 1Н), 3,91-3,87 (м, 1Н), 3,30 (м, 1Н), 3,03 (с, 3Н), 1,30-1,20 (м, 12Н). [М+Н] = 582,8.
Пример 12. Получение изопропил-((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (25).
Стадия 1. Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ола
1
3
К раствору (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(гидроксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (2,8 г, 8 ммоль) в диоксане (20 мл) добавляли водный раствор диметиламина (5 мл). После перемешивания при к.т. в течение 3 ч, методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Смесь концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 60/1) с получением (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (2,2 г). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 8,08 (с, 1Н), 6,13 (д, J=18,0 Гц, 1Н), 4,43 (дд, J=9,2, 9,2 Гц, 1Н), 4,06 (д, J=10,8 Гц, 2Н), 3,90 (м, 1Н), 3,37 (с, 3Н), 3,06 (с, 3Н), 1,18 (д, J=22 Гц, 3Н).
Стадия 2. Получение изопропил-((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (25).
2
4
2
4
3
3
1
31
Соединение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ол (8 г, 1,0 экв.) и PPAL-S (11,1 г, 1 экв.) растворяли в безводном THF (100 мл). Смесь охлаждали до -5 - 0°С, и в атмосфере N медленно добавляли трет-BuMgCl (30,5 мл, 1,7 М, 2,1 экв.). После перемешивания при к.т. в течение 2 ч, смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl и экстрагировали EtOAc (70 мл × 3). Объединенные органические слои промывали водой, солевым раствором (30 мл), сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 50/1) с получением изопропил-((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)-феноксифосфорил)-L-аланината в виде белого порошка (9,5 г, 65%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,81 (с, 1H), 7,35-7,19 (м, 5Н), 6,15 (д, J=18,8 Гц, 1Н), 4,90 (м, 1H), 4,54-4,49 (м, 3Н), 4,22-4,19 (м, 1Н), 3,90 (м, 1H), 3,43 (с, 3Н), 1,32 (д, J=7,2 Гц, 3Н), 1,24-1,17 (м, 9Н). Р-ЯМР (160 МГц, CDOD) δ 3,89.
Пример 13. Получение изопропил-((((R)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината (26).
2
4
2
4
3
3
1
31
Соединение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ол (3 г, 1,0 экв.) и PPAL-R (4,17 г, 1 экв.) растворяли в безводном THF (60 мл). Смесь охлаждали до -5 - 0°С, и в атмосфере N медленно добавляли трет-BuMgCl (11,4 мл, 1,7 М, 2,1 экв.). После перемешивания при к.т. в течение 16 ч, смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl и экстрагировали EtOAc (50 мл × 3). Объединенные органические слои промывали водой, солевым раствором (30 мл), сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 50/1) с получением изопропил-((((R)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(диметиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)-феноксифосфорил)-L-аланинат в виде белого порошка (2,2 г, 41%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,8 (с, 1Н), 7,35-7,29 (м, 5Н), 6,18 (д, J=18,8 Гц, 1Н), 4,92 (м, 1Н), 4,60 (м, 1Н), 4,51-4,23 (м, 3Н), 3,90 (м, 1Н), 3,44 (с, 6Н), 1,29 (д, J=6 Гц, 3Н), 1,22-1,16 (м, 10Н). Р-ЯМР (160 МГц, CDOD) δ 3,98.
Пример 14. Получение изопропил-((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
Стадия 1: Получение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ол (8).
2
3
3
1
+
К водному раствору N-метилциклопропанамина гидрохлорида (100 мл) добавляли КСО (53 г, 500 ммоль). После перемешивания при к.т.в течение 10 мин, добавляли раствор (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-хлор-9H-пурин-9-ил)-2-(гидроксиметил)-4-фтор-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (35 г, 109 ммоль) в диоксане (300 мл). Смесь перемешивали при к.т. в течение 16 ч, и методом HPLC обнаруживали завершение реакции. Смесь концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 60/1) с получением (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ола (30 г, 82%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 8,16 (с, 1H), 6,17 (д, J=18,0 Гц, 1Н), 4,41 (дд, J=9,2, 9,2 Гц, 1Н), 4,06 (м, 2Н), 3,90 (м, 1H), 3,37 (с, 3Н), 3,16 (м, 1H), 1,18 (д, J=22,4 Гц, 3Н), 0,94 (м, 2Н), 0,74 (м, 2Н). [М+Н] = 353,2.
Стадия 2: Получение изопропил-((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
2
4
2
4
3
3
1
31
Соединение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ол (8 г, 1,0 экв.) и PPAL-S (10,3 г, 1 экв.) растворяли в безводном THF (100 мл). После охлаждения смеси до -5 - 0°С, в атмосфере Nмедленно добавляли трет-BuMgCl (28 мл, 1,7 М, 2,1 экв.). Смесь перемешивали при к.т. в течение 1 ч, гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl и экстрагировали EtOAc (70 мл × 3). Объединенные органические слои промывали водой, солевым раствором (30 мл), сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 100/1 → 50/1) с получением изопропил-((((S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината в виде белого порошка (9,5 г, 65%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,86 (с, 1H), 7,35-7,19 (м, 5Н), 6,17 (д, J=19,2 Гц, 1Н), 4,91 (м, 1Н), 4,52 (м, 3Н), 4,21 (м, 1Н), 3,93 (м, 1Н), 3,35 (с, 3Н), 3,16 (м, 1Н), 2,0 (с, 1Н), 1,26-1,16 (м, 12Н), 0,93 (м, 2Н), 0,73 (м, 2Н). Р-ЯМР (160 МГц, CDOD) δ 3,90
Пример 15. Получение изопропил-((((R)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
2
4
2
4
3
3
1
31
Соединение (2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(метилциклопропанамино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-метилтетрагидрофуран-3-ол (3 г, 1,0 экв.) и PPAL-R (2,8 г, 1 экв.) растворяли в безводном THF (60 мл). После охлаждения смеси до -5 - 0°С, в атмосфере N медленно добавляли трет-BuMgCl (7,6 мл, 1,7 М, 2,1 экв.). Затем, смесь перемешивали при к.т. в течение 1 ч, гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl и экстрагировали EtOAc (50 мл × 3). Объединенные органические слои промывали водой, солевым раствором (30 мл), сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 100/1 → 50/1) с получением продукта в виде белого порошка (3 г, 55%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,81 (с, 1H), 7,30-7,25 (м, 5Н), 6,16 (д, J=24,8 Гц, 1H), 4,84 (м, 1H), 4,84-4,50 (м, 3Н), 4,22-4,19 (м, 1Н), 3,88 (м, 1Н), 3,33 (с, 3Н), 3,14 (м, 1Н), 2,0 (с, 1H), 1,28-1,13 (м, 12Н), 0,92 (м, 2Н), 0,90 (м, 2Н). Р-ЯМР (160 МГц, CDOD) δ 3,99.
Пример 16. Получение соединения 139.
Стадия 1. Получение соединения 29.
2
3
2
4
К раствору 6 (3,0 г, 1,0 экв.) в пиридине (30 мл) при 0°С добавляли TIPDSCl (4,35 г, 1,5 экв.). После перемешивания при к.т. в течение 4 ч, методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Смесь разбавляли EtOAc, промывали 1М водн. раствором HCl, насыщенным водным раствором NaHCO, солевым раствором, сушили над безводным NaSO и концентрировали с получением 29 в виде желтого масла (6,3 г, 100%).
Стадия 2. Получение соединения 30.
3
2
4
3
1
К смеси соединения 29 (800 мг, 1,0 экв.), DMAP (16 мг, 0,1 экв.), пиридина (1,6 мл) и DCM (10 мл) при 0°С добавляли изобутирилхлорид (209 мг, 1,5 экв.). После перемешивания при к.т. в течение 2 ч, методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Смесь гасили добавлением воды, промывали 1М водн. раствором HCl, насыщенным водным раствором NaHCO, солевым раствором, сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии с получением продукта 30 в виде белого масла (563 мг, 62,3%). Н-ЯМР (400 МГц, CDCl) δ 7,98 (с, 1Н), 787 (с, 1Н), 6,20 (д, J=16,0 Гц, 1Н), 4,32-4,07 (м, 4Н), 3,50 (с, 6Н), 2,3 (м, 1H), 1,29-1,05 (м, 45Н).
Стадия 3. Получение соединения 31.
3
3
3
1
К смеси соединения 30 (560 мг, 1,0 экв.) в THF (10 мл) при к.т. добавляли EtN⋅3HF (706 мг, 5 экв.) и EtN (890 мг, 10 экв.). После перемешивания при к.т. в течение 1,5 ч, методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Смесь концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии с получением соединения 31 в виде белого порошка (288 мг, 83%). Н-ЯМР (400 МГц, CDCl) δ 7,72 (с, 1Н), 5,96 (д, J=44,0 Гц, 1Н), 5,22 (м, 1Н), 4,13-3,99 (м, 4Н), 3,42 (с, 6Н), 2,83-2,63 (м, 2Н), 1,29-1,17 (м, 9Н).
Стадия 4. Получение соединения 32.
2
4
2
4
3
1
+
Соединение 31 (280 мг, 1,0 экв.) и PPAL-S (320 мг, 1 экв.) растворяли в безводном THF (10 мл). После охлаждения смеси до -5°С, в атмосфере N медленно добавляли трет-BuMgCl (0,87 мл, 1,7 М, 2,1 экв.). Смесь перемешивали при к.т. в течение 2 ч, гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl, и экстрагировали EtOAc (10 мл × 3). Объединенные органические слои промывали водой, солевым раствором (20 мл), сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии с получением продукта в виде белого порошка (260 мг, 50%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,98 (с, 1Н), 7,25 (м, 5Н), 6,23 (д, J=18,8 Гц, 1H), 4,52 (м, 3Н), 4,38 (м, 1H), 3,81 (м, 1Н), 3,75 (м, 1H), 3,48 (с, 6Н), 2,81 (м, 1Н), 1,32 (м, 18Н). [М+Н] = 666,9.
Пример 17. Получение соединения 35.
Стадия 1. Получение соединения 33.
3
2
4
3
1
+
К смеси соединения 29 (2,0 г, 1,0 экв.), DMAP (0,04 г, 0,1 экв.), пиридина (4 мл) и DCM (20 мл) при 0°С добавляли AcCl (0,414 г, 1,5 экв.). После перемешивания при к.т. в течение 2 ч, методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Смесь гасили добавлением воды, промывали 1М водн. раствором HCl, насыщенным водным раствором NaHCO, а затем солевым раствором, сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии с получением продукта 33 в виде белого масла (1,73 г, 80,8%). Н-ЯМР (400 МГц, CDCl) δ 7,99 (с, 1H), 7,74 (с, 1H), 6,20 (д, J=20,0 Гц, 1H), 4,33-4,11 (м, 4Н), 3,50 (с, 6Н), 2,63 (с, 3Н), 2,3 (м, 1Н), 1,26-1,05 (м, 29Н). [М+Н] = 611,9.
Стадия 2. Получение соединения 34.
3
3
К смеси соединения 33 (1,58 г, 1,0 экв.) в THF (20 мл) при к.т. добавляли EtN⋅3HF (2,1 г, 5 экв.) и EtN (2,6 г, 10 экв.). После перемешивания при к.т.в течение 1,5 ч, методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Смесь концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии с получением соединения 34 в виде белого порошка (782 мг, 82%). [М+Н]+ = 369,6.
Стадия 3. Получение соединения 35.
2
4
2
4
3
3
3
1
31
19
Соединение 34 (136 мг, 1,0 экв.) и PPAL-S (184 мг, 1,1 экв.) растворяли в безводном THF (3 мл). После охлаждения смеси до -5°С, в атмосфере N медленно добавляли трет-BuMgCl (0,5 мл, 1,7 М, 2,1 экв.). Смесь перемешивали при к.т. в течение 30 мин, гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl и экстрагировали EtOAc (10 мл × 3). Объединенные органические слои промывали водой, солевым раствором (20 мл), сушили над безводным NaSO и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 50/1 → 20/1) с получением фосфорамидата 35 в виде белого порошка (150 мг, 63,8%). Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,81 (с, 1Н), 7,35-7,16 (м, 5Н), 6,10 (д, J=18,4 Гц, 1H), 4,87 (м, 1Н), 4,52-4,46 (м, 3Н), 4,21 (м, 1H), 3,91-3,87 (м, 1H), 3,03 (с, 3Н), 1,30-1,13 (м, 12Н). Р-ЯМР (160 МГц, CDOD) δ 3,84. F-ЯМР (376 МГц, CDOD) δ -162,79.
6
Синтез β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-этинил-N-замещенных-2,6-диаминопуриновых нуклеотидов
6
Пример 18. Общий путь получения β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-этинил-N-замещенных-2,6-диаминопуриновых нуклеотидов
Стадия 1. Получение соединения 36.
2
2
К раствору 6-хлоргуанозина (100 г, 332 ммоль) в пиридине (400 мл) при -5~5°С в атмосфере N по каплям добавляли TPDSCl (110 мл, 1,05 экв.). После перемешивания при указанной температуре в течение 2 ч, методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Добавляли DCM (600 мл), а затем при 0-5°С по каплям добавляли TMSCl (85 мл, 2 экв.). После перемешивания при указанной температуре в течение 2 ч, методом TLC обнаруживали расходование промежуточного продукта.
При 0-5°С по каплям добавляли изобутирилхлорид. После перемешивания при указанной температуре в течение 2 ч, методом TLC обнаруживали расходование промежуточного продукта. Добавляли воду, и экстрагировали содержимое DCM. Органическую фазу затем промывали 0,5н HCl для удаления пиридина.
2
3
2
4
6
1
После корректировки содержимого до рН 5~6, при 0-5°С добавляли pTSA⋅НО (9,2 г, 484,5 ммоль). После перемешивания при указанной температуре в течение 1 ч, методом TLC обнаруживали расходование промежуточного продукта. Затем, добавляли воду, и промывали органическую фазу водой, насыщенным водным NaHCO и солевым раствором. После сушки над NaSO, растворитель удаляли в условиях вакуума. Затем, остаток очищали методом колоночной хроматографии (РЕ/ЕА = 100 → 10/1) с получением продукта в виде светло-желтого твердого вещества (82 г, 40%). Н-ЯМР (400 МГц, DMSO-d) δ 10,88 (с, 1H), 8,55 (с, 1H), 5,91 (д, J=1,6 Гц, 1Н), 5,53 (д, J=4,6 Гц, 1Н), 4,72-4,58 (м, 2Н), 4,16 (дд, J=12,4, 4,8 Гц, 1H), 4,00 (ддд, J=7,7, 4,8, 2,6 Гц, 1Н), 3,93 (дд, J=12,4, 2,7 Гц, 1Н), 2,78 (h, J=6,9 Гц, 1Н), 1,26-1,12 (м, 3Н), 1,10 (д, J=6,7 Гц, 6Н), 1,09-0,88 (м, 24Н).
Стадия 2. Получение соединения 37.
2
2
3
2
4
К раствору соединения 36 (10,0 г, 16,3 ммоль) в DCM (100 мл) при к.т. добавляли перйодинан Десс-Мартина, и перемешивали реакционную смесь в течение 12 ч. Методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Реакционную смесь затем разбавляли DCM (200 мл) и промывали насыщенным водным NaSO и солевым раствором. Органическую фазу затем сушили над NaSO и концентрировали с получением неочищенного соединения 37 в виде светло-желтого твердого вещества (12 г). Неочищенное соединение 53 может быть использовано непосредственно на следующей стадии без очистки.
Стадия 3. Получение соединения 38.
2
4
2
4
К раствору этинилтриметилсилана (18,6 мл, 142,7 ммоль) в THF (240 мл) при -15~20°С в атмосфере N по каплям добавляли n-BuLi (46 мл, 2,5 М, 115,0 ммоль). После перемешивания в течение 30 мин, реакционную смесь охлаждали до -70°С, и при указанной температуре добавляли соединение 37 (неочищ., 16,3 ммоль) в THF (60 мл). Содержимое затем нагревали до 0°С. Методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Добавляли насыщенный водный NHCl, и трижды экстрагировали реакционную смесь ЕА (100 мл). Органическую фазу объединяли, а затем промывали солевым раствором, а затем сушили над NaSO. После концентрирования в условиях вакуума, остаток очищали методом колоночной хроматографии (РЕ/ЕА = 100 → 10/1) с получением светло-желтого твердого вещества (6,0 г, 52%).
Стадия 4. Получение соединения 39.
2
3
2
4
К раствору соединения 38 (6,0 г, 8,4 ммоль) в DCM (240 мл) в атмосфере N добавляли пиридин (4,2 мл, 52,9 ммоль). Реакционную смесь охлаждали до -70°С, и добавляли DAST (12 мл, 90,4 ммоль). Содержимое затем нагревали до -30°С. Методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Реакционную смесь вливали в насыщенный водный NaHCO, а затем экстрагировали DCM (200 мл). Органическую фазу промывали солевым раствором и сушили над NaSO. После концентрирования в условиях вакуума, остаток очищали методом колоночной хроматографии (РЕ/ЕА = 100 → 10/1) с получением светло-желтого твердого вещества (3,8 г, 63%).
Стадия 5. Получение соединения 40.
К раствору соединения 39 (3,8 г, 5,3 ммоль) в THF (120 мл) при к.т. добавляли АсОН (1,3 г, 22 ммоль) и TBAF (4,2 г, 15,9 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при к.т. в течение 30 мин. Методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. После концентрирования в условиях вакуума, остаток очищали методом колоночной хроматографии (ЕА) с получением продукта в виде белого твердого вещества (2,0 г, 95%).
Общая методика замещения амином и снятия защиты с аминогруппы:
1
К раствору соединения 40 (350 мг, 0,88 ммоль) в диоксане (20 мл) при к.т. добавляли метанольный или водный раствор соответствующего амина (свободное основание или гидрохлорид плюс DIEA). Содержимое перемешивали при к.т.в течение 1-12 ч. Методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. После концентрирования в условиях вакуума, остаток использовали непосредственно на следующей стадии без очистки. Упомянутый выше остаток растворяли в метаноле (10 мл). Добавляли водный NaOH (2,5н, 10 мл). После перемешивания в течение ночи при к.т., методом TLC обнаруживали расходование исходного вещества. Значение рН содержимого корректировали до 7-8 добавлением 1н HCl. Раствор концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии (DCM/MeOH = 100 → 20/1) с получением продукта в виде не совсем белого твердого вещества (выход: 40-80% в два этапа). В таблице 1 представлены структуры соединений 57-63 и соответствующие масс-спектры и спектры Н-ЯМР для соответствующих соединений.
Пример 19. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-диметиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-этинилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
Стадия 1. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-диметиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-этинилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
4
2
4
3
3
26
34
7
7
1
31
+
К раствору соединения 41 (30 мг, 0,09 ммоль) в безводном THF (2 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 125 мкл, 0,13 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланината (49 мг, 0,11 ммоль), растворенного в безводном THF (2 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта (смесь 2 диастереоизомеров, 12 мг, 0,02 ммоль, 24%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,79 (с, 0,45Н), 7,77 (с, 0,55Н), 7,36-7,14 (м, 5Н), 6,28 (д, J=17,4 Гц) и 6,26 (д, J=17,5 Гц, 1Н), 5,00-4,44 (м, 5Н), 4,23-4,16 (м, 1H), 3,69-3,81 (м, 1H), 3,42 (ушир. с, 3Н), 3,40 (ушир. с, 3Н), 1,32-1,26 (м, 3Н), 1,20-1,15 (м, 6Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,04 (с), 3,98 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 606,2; обнаружено 606,2.
Пример 20. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-метиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-этинилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
Стадия 1. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-метиламино-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-этинилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
4
2
4
3
2
3
25
32
7
7
1
31
+
К раствору соединения 42 (30 мг, 0,09 ммоль) в безводном THF (2 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 125 мкл, 0,13 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланината (49 мг, 0,11 ммоль), растворенного в безводном THF (2 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта (смесь 2 диастереоизомеров, 9 мг, 0,02 ммоль, 18%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,81, 7,79 (0,9с+0,1с, 1H), 7,36-7,14 (м, 5Н), 6,26 (д, J=17,4 Гц, 0,1Н) и 6,24 (д, J=17,4 Гц, 0,9Н), 4,93-4,89 (перекрывается с HO, м, 1Н), 4,80-4,78 (м, 1Н), 4,53-4,49 (м, 2Н), 4,21-4,18 (м, 1Н), 3,95-3,84 (м, 1Н), 3,23-3,20 (м, 1H), 3,04 (ушир. с, 1Н), 1,31-1,14 (м, 9Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,06 (с), 3,97 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 592,2; обнаружено 592,2.
Пример 21. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклопропиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-этинилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
Стадия 1. Получение изопропил-((((R,S)-(2R,3R,4R,5R)-5-(2-амино-6-(N-метилциклопропиламино)-9H-пурин-9-ил)-4-фтор-3-гидрокси-4-этинилтетрагидрофуран-2-ил)метокси)феноксифосфорил)-L-аланината
4
2
4
3
2
3
28
36
7
7
1
31
+
К раствору соединения 43 (40 мг, 0,11 ммоль) в безводном THF (2 мл) при 0°С в течение 10 мин по каплям добавляли трет-бутилмагнийхлорид (1,0 М в THF, 160 мкл, 0,16 ммоль). Реакционную смесь перемешивали в течение 15 мин при 0°С, а затем дополнительно в течение 15 мин при комнатной температуре. Реакционную смесь охлаждали до 0°С, и в течение 10 мин по каплям добавляли раствор изопропил-((R,S)-(пентафторфенокси)феноксифосфорил)-L-аланината (55 мг, 0,12 ммоль), растворенного в безводном THF (2 мл). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 30 мин и в течение 18 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl (4 мл) и экстрагировали EtOAc (3×5 мл). Объединенные органические фазы сушили над NaSO и концентрировали. Остаток очищали методом колоночной хроматографии (градиент DCM/MeOH 100/0 → 90/10) с получением продукта (смесь 2 диастереоизомеров, 18 мг, 0,03 ммоль, 26%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (300 МГц, CDOD) δ 7,84, 7,82 (с+с, 1Н), 7,35-7,14 (м, 5Н), 6,30 (д, J=17,4 Гц) и 6,26 (д, J=17,6 Гц, 1Н), 4,99-4,89 (перекрывается с HO, м, 1Н), 4,82-4,69 (м, 1H), 4,59-4,46 (м, 2Н), 4,21 (м, 1H), 3,96-3,82 (м, 1Н), 3,24-3,22 (м, 1Н), 3,17-3,11 (м, 1H) 1,31-1,26 (м, 3Н), 1,20-1,15 (м, 6Н), 0,93-0,89 (м, 2Н), 0,75-0,68 (м, 2Н). Р-ЯМР (121 МГц, CDOD) δ 4,06 (с), 3,98 (с). MS (ESI) m/z рассчит. для CHFNOP [М+Н] 632,2; обнаружено 632,2.
Пример 22. Получение PPAL-S
Стадия 1. Получение рацемического PPAL
К перемешанному раствору фенилдихлорфосфата (250 г) в EtOAc (800 мл) при -10°С добавляли изопропил-L-аланинат (200 г) в триэтиламине (120 г). Реакционную смесь перемешивали при -10°С в течение 1 ч. При -5°С добавляли соединение 2,3,4,5,6-пентафторфенол (220 г) в триэтиламине (120 г) и EtOAc (400 мл), и перемешивали при указанной температуре в течение 0,5 ч. Реакционную смесь оставляли нагреваться до 25°С и перемешивали при указанной температуре в течение 2 ч. Раствор фильтровали и промывали EtOAc (2×200 мл), и упаривали объединенные органические фазы в условиях вакуума с получением твердого PPAL-RS (рацемат).
Стадия 2. Получение PPAL-RS
2
4
1
13
К перемешанному раствору PPAL-RS в EtOAc (200 мл) и н-гептане (1,4 л) добавляли 2,3,4,5,6-пентафторфенол (10,1 г) в триэтиламине (6 г), и продолжали перемешивание приблизительно в течение 4-8 ч. После того, как R-изомера в твердом веществе становилось менее 0,5%, твердое вещество фильтровали. Твердое вещество растворяли в EtOAc (4 л), промывали водой (2×100 мл), солевым раствором (1 л), сушили над безводным NaSO и фильтровали, растворитель удаляли в условиях вакуума с получением PPAL-S (350 г). Н-ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ = 7,42-7,40 (м, 2Н), 7,24-7,22 (м, 3Н), 6,87 (дд, J=14,1, 9,9 Гц, 1Н), 4,90-4,84 (м, 1Н), 3,94-3,88 (м, 1Н), 1,27 (дд, J=7,1, 1,1 Гц, 3Н), 1,15 (дд, J=6,2, 1,2 Гц, 6Н) м.д.. Р-ЯМР (160 МГц, DMSO-d6) δ=0,37 м.д..
Пример 23. Получение PPAL-R
1
13
6
6
В трехгорлую круглодонную колбу, оснащенную магнитной мешалкой, добавляли фенилдихлорфосфат (189,6 г, 0,90 моль) и безводный EtOAc (750 мл). Раствор охлаждали до -10°С в атмосфере азота. К полученному выше раствору добавляли изопропил L-аланинат (118 г, 0,90 ммоль) и триэтиламин (100 г, 1,1 экв.). предварительно охлажденную (ниже 10°С) смесь 2,3,4,5,6-пентафторфенола (165 г, 1 экв.) и триэтиламина (90,5 г, 1 экв.) в EtOAc (300 мл) добавляли при -5°С к смеси через капельную воронку, и перемешивали полученную смесь при 20-25°С в течение 1 часа. Белый осадок (TEA⋅HCl) отфильтровывали и промывали EtOAc. Фильтрат концентрировали в условиях пониженного давления с получением приблизительно 280 г PPAL-RS (S/R=1/1) в виде белого твердого вещества. PPAL-RS (280 г) растирали с 300 мл смеси гептан/EtOAc (20/1) при комнатной температуре в течение 5 мин. Белую суспензию фильтровали, и промывали твердое вещество смесью гептан/EtOAc (20/1). Фильтрат охлаждали до 8°С, и собирали твердое вещество путем фильтрования. Неочищенный PPAL-R (10 г) получали с хиральной чистотой 95%. Неочищенный продукт очищали, следуя описанной выше процедуре. PPAL-R (5 г) получали с хиральной чистотой не менее 98%. Н-ЯМР (400 МГц, DMSO-d) δ=7,43-7,39 (м, 2Н), 7,27-7,22 (м, 3Н), 6,87 (дд, J=14,1, 9,9 Гц, 1Н), 4,89-4,85 (м, 1Н), 3,95-3,90 (м, 1Н), 1,27 (дд, J=7,1, 1,1 Гц, 3Н), 1,14 (дд, J=6,2, 1,2 Гц, 6Н). Р-ЯМР (160 МГц, DMSO-d) δ=0,35.
Пример 24: Получение соединения 52.
Стадия 1. Получение соединения 49.
3
2
2
4
К раствору соединения 48 (1,81 г, 3,23 ммоль) в диоксане (18 мл) добавляли 40% водный раствор CHNH (16,2 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 40°С в течение 2 ч. Смесь концентрировали, разбавляли EtOAc (50 мл), промывали водой и солевым раствором. Органический слой сушили над безводным NaSO, фильтровали и концентрировали с получением белого твердого соединения 49 (1,66 г, 92%).
Стадия 2. Получение соединения 50.
1
К раствору соединения 49 (1,34 г, 2,42 ммоль) и 1-метилимидазола (794 мг, 9,68 ммоль) в DCM (14 мл) при 0°С медленно добавляли пентилхлороформиат (547 мг, 3,63 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при к.т. в течение ночи. Смесь концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии (PE/EtOAc = 5/1→2/1) с получением 50 (1,01 г, 62%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (400 МГц, DMSO) δ 7,96 (с, 1Н), 6,73 (с, 1Н), 6,06-6,10 (д, J=16,0 Гц, 1Н), 4,09-4,30 (м, 2Н), 3,97-4,09 (м, 4Н), 3,28 (с, 3Н), 1,39-1,46 (м, 2Н), 1,0-1,2 (м, 35Н), 0,73-0,76 (т, J=8,0 Гц, 3Н).
Стадия 3. Получение соединения 51.
3
3
2
2
К раствору соединения 50 (1,00 г, 1,5 ммоль) в THF (11 мл) при 0°С добавляли EtN (2,0 мл, 15 ммоль) и EtN,3HF (1,21 г, 7,5 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при к.т. в течение 1,5 ч. Смесь концентрировали и очищали методом колоночной хроматографии (MeOH/CHCl = 50/1) с получением соединения 51 (460 мг, 72,2%) в виде белого порошка.
Стадия 4. Получение соединения 52.
2
4
2
3
2
4
2
2
1
+
К раствору соединения 51 (460 мг, 1,08 ммоль) и PPAL-S (538 мг, 1,19 ммоль) в безводном THF (9 мл) при 5-10°С в атмосфере N медленно добавляли трет-BuMgCl (2,27 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при к.т. в течение 40 мин. Смесь гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl, экстрагировали EtOAc, промывали 5% водн. раствором KCO и солевым раствором, сушили над безводным NaSO, фильтровали и концентрировали. Неочищенный продукт очищали методом колоночной хроматографии (CHCl/MeOH = 15/1) с получением соединения 52 (280 мг, 37,3%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (400 МГц, DMSO) δ 8,12 (с, 1Н), 7,34-7,38 (м, 2Н), 7,18-7,23 (м, 3Н), 6,74 (с, 2Н), 6,11-6,16 (д, J=16,0 Гц, 1Н), 5,99-6,05 (м, 1Н), 5,84 (м, 1Н), 4,77-4,81 (м, 1Н), 4,30-4,41 (м, 3Н), 4,03-4,11 (м, 3Н), 3,78-3,80 (м, 1Н), 3,3 (с, 3Н), 1,44-1,51 (м, 2Н), 1,00-1,21 (м, 16Н), 0,76-0,80 (т, J=8,0 Гц, 3Н). [М+Н]=696,6.
Пример 25: Получение соединения 56.
Стадия 1. Получение соединения 48.
2
2
2
К раствору соединения 23 (600 мг, 1 экв.) в пиридине (30 мл) при 0°С добавляли TIPDSCl (1,5 экв.). Полученный раствор оставляли отстаиваться при комнатной температуре в течение 2 ч. Смесь гасили добавлением воды со льдом и экстрагировали EtOAc. Органический слой промывали 1М водн. раствором HCl, насыщенным водным бикарбонатом натрия и насыщенным водным хлоридом натрия, сушили над безводным сульфатом натрия, и концентрировали с получением неочищенного остатка. Остаток очищали методом хроматографии (MeOH/CHCl = 1/50) с получением соединения 48 (998 мг, 94,4%) в виде белой твердой пены.
Стадия 2. Получение соединения 53.
2
2
Смесь соединения 48 (800 мг, 1 экв.), пиридина (3,2 мл), DMAP (34,9 мг, 0,2 экв.) в DCM (20 мл) перемешивали при комнатной температуре. При 0°С по каплям добавляли N-амилхлороформиат (3,2 мл), и перемешивали смесь при комнатной температуре в течение 1 суток. Органический слой промывали 1М водным раствором HCl, насыщенным водным бикарбонатом натрия и насыщенным водным хлоридом натрия, сушили над безводным сульфатом натрия и evaporated в условиях вакуума. Остаток очищали методом хроматографии на силикагеле (МеОН/CHCl = 1/50) с получением соединения 53 (255 мг, 26%) в виде белой твердой пены.
Стадия 3. Получение соединения 54.
3
2
К раствору соединения 53 (270 мг, 1 экв.) в 1,4-диоксане (10 мл), по каплям добавляли 40% водный раствор CHNH (225,7 мг, 5 экв.). Смесь перемешивали в течение 2 ч при комнатной температуре, а затем концентрировали в условиях вакуума. Остаток подвергали хроматографии на силикагеле (метанол/дихлорметан = 1/40) с получением соединения 54 (220 мг, 81,7%) в виде белой твердой пены.
Стадия 4. Получение соединения 55.
3
2
2
К охлажденному на льду раствору соединения 54 (668 мг, 1 экв.) в THF (10 мл) добавляли триэтиламин (1011,9 мг, 10 экв.) и EtN⋅3HF (806,05 мг, 5 экв.), и перемешивали смесь в течение 2 ч при комнатной температуре. Смесь концентрировали и подвергали хроматографии на силикагеле (MeOH/CHCl = 1/30) с получением соединения 55 (492 мг, 84%) в виде белой твердой пены.
Стадия 5. Получение соединения 56.
4
1
31
+
К смеси соединения 55 (113 мг, 1 экв.) и PPAL-S (120 мг, 1 экв.) в THF (4 мл) при -10°С по каплям добавляли 1,7 М трет-BuMgCl в THF (0,327 мл, 2,1 экв.). Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 1 ч, а затем гасили добавлением насыщенного води. раствора NHCl. Водную фазу экстрагировали EtOAc, органическую фазу промывали солевым раствором, сушили и концентрировали с получением неочищенного остатка. Остаток подвергали флэш-хроматографии с получением соединения 56 (126 мг, 68,5%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (400 МГц, DMSO) δ 8,00 (с, 1Н), 7,10-7,45 (м, 5Н), 6,15-6,20 (д, J=20,0 Гц, 1Н), 5,00-5,25 (с, 1Н), 4,80-4,86 (м, 1Н), 4,45-4,70 (м, 2Н), 4,12-4,19 (м, 3Н), 3,80-3,85 (м, 1Н), 3,04 (с, 3Н), 1,60-1,75 (м, 2Н), 1,10-1,40 (м, 16Н), 0,76-0,80 (т, J=8,0 Гц, 3Н). Р-ЯМР (160 МГц, DMSO) δ 3,57. [М+Н]=696,5.
Пример 26: Получение соединения 60.
Стадия 1. Получение соединения 57.
3
2
К раствору соединения 6 (20 г, 1 экв.) в CHCN (100 мл) при 5±5°С последовательно добавляли имидазол (16,6 г) и TIPDSCl (28,9 г, 1,5 экв.). Полученный раствор оставляли отстаиваться при комнатной температуре в течение 4 ч. Смесь гасили добавлением воды со льдом и экстрагировали EtOAc. Органический слой промывали водой, насыщенным водным бикарбонатом натрия и насыщенным водным хлоридом натрия, сушили над безводным сульфатом натрия и концентрировали с получением неочищенного остатка (32 г).
Стадия 2. Получение соединения 58.
4
К раствору соединения 57 (9,8 г, 1 экв.) в THF (4 мл) при 0-5°С по каплям добавляли 1,7 М трет-BuMgCl в THF (50 мл, 4,8 экв.). Смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 0,5 ч, и медленно добавляли н-амилхлороформиат (2,7 г, 1,05 экв.). Смесь перемешивали при 0-5°С в течение 3-4 ч. Смесь гасили добавлением насыщенного води. раствора NHCl. Водную фазу экстрагировали EtOAc (200 мл), органическую фазу промывали солевым раствором, сушили и концентрировали с получением соединения 58 (10,7 г) в виде масла.
Стадия 3. Получение соединения 59.
3
2
2
К охлажденному на льду раствору соединения 58 (7,3 г, 1 экв.) в THF (100 мл) добавляли триэтиламин (10,119 г) и EtN⋅3HF (8,6 г, 5 экв.), и перемешивали смесь в течение 1 ч при комнатной температуре. Смесь концентрировали и подвергали хроматографии на силикагеле (MeOH/CHCl = 1/30) с получением соединения 59 (4,3 г, 91%) в виде белого твердого вещества.
Стадия 4. Получение соединения 60.
4
3
1
+
К смеси соединения 59 (2 г, 1 экв.) и PPAL-S (2,3 г, 1,1 экв.) в THF (40 мл) при -5°С по каплям добавляли 1,7 М трет-BuMgCl в THF (5,6 мл, 2,1 экв.). Смесь перемешивали при -20±5°С в течение 1 ч, а затем гасили добавлением насыщенного водн. раствора NHCl. Водную фазу экстрагировали EtOAc, органическую фазу промывали солевым раствором, сушили и концентрировали с получением неочищенного остатка. Остаток подвергали флэш-хроматографии с получением соединения 60 (1,5 г, 47%) в виде белого твердого вещества. Н-ЯМР (400 МГц, CDOD) δ 7,9 (с, 1Н), 7,1~7,2 (м, 5Н), 6,2 (д, J=20 Гц, 1Н), 5,1 (ушир., 1Н), 4,84 (м, 1Н), 4,49 (м,, 2Н), 4,16 (м, 1Н), 4,13 (м, 2Н), 3,86 (м, 1Н), 3,45 (ушир., 6Н), 1,70 (м, 2Н), 1,26 (м, 4Н), 1,20 (м, 6Н), 1,14 (м, 6Н), 0,93 (м, 3Н). [М+Н]=710,5.
Биологические данные
Пример 27. Методика анализа и дополнительные биологические данные
3
50
50
50
50
50
50
50
50
Клетки Huh-7 luc/neo ЕТ, несущие бицистронный репликон репортера люциферазы HCV 1b генотипа, высевали при 7,5×10 клеток/мл в дублированные 96-луночные планшеты для параллельного определения противовирусной эффективности (EC) и цитотоксичности (TC). Планшеты культивировали в течение 24 часов перед добавлением соединений. Готовили шесть серийных разбавлений в полулогарифмическом масштабе тестируемых изделий (высокая тестируемая концентрация 100,0 мкМ или высокая тестируемая концентрация 1,0 мкМ) и человеческого интерферона-альфа 2b (высокая тестируемая концентрация 10,0 ед./мл) в клеточной культуральной среде и добавляли культивируемые клетки в лунки в трех повторностях для каждого разведения. В шесть лунок тестируемых планшетов помещали среду отдельно в качестве необрабатываемого контроля. После 72 часов культивирования в присутствии соединения один из планшетов использовали для определения цитотоксичности путем окрашивания с помощью ХТТ, а другой - для противовирусной эффективности путем определения активности репортера люциферазы. Собирали данные цитотоксичности и эффективности и импортировали их в специализированную рабочую книгу Excel для определения значений TC и EC. Данные для соединений формул I-VII показаны в приведенной ниже таблице 7. Кроме того, на фиг. 2 показаны кривые ингибирования репликации HCV для соединения 5-2 и софосбувира. Как можно видеть на фиг. 2, соединение 5-2 характеризуется ЕС=4 нМ, тогда как софосбувир характеризуется ЕС=53 нМ. По оси y показан вирусный контроль, а по оси x - концентрация лекарственного средства в мкМ. На фиг. 3 показаны кривые ингибирования репликации HCV для соединения 25 и софосбувира. Соединение 25 характеризуется ЕС=4 нМ, а софосбувир характеризуется ЕС=53 нМ. По оси y показан вирусный контроль, а по оси x - концентрация лекарственного средства в мкМ. На фиг. 4 показано сравнение внутри анализа активности против HCV для соединений 5-2, 25, 27 и софосбувира. По оси y показан вирусный контроль, а по оси x - концентрация лекарственного средства в мкМ.
50
Различные генотипы полученных от больных HCV, включающие в себя дикий тип и ассоциированные с устойчивостью варианты, использовали для определения их относительной чувствительности репликации к тестируемым соединениям. Получали репликоновые векторы для тестирования устойчивости (RTV), содержащие геномные области NS5B, с использованием вирусной РНК, выделенной из плазмы инфицированных HCV больных. Каждую область NS5B амплифицировали полимеразной цепной реакцией с обратной транскриптазой и клонировали в репликоновый RTV HCV, который затем переносили с помощью электропорации в клетки Huh-7. После инкубации в отсутствии и присутствии серийно разбавленных тестируемых соединений в течение 72-96 часов измеряли вирусную репликацию по активности люциферазы и определяли 50% ингибиторные концентрации (значения IC).
50
95
В таблице 2 представлены значения IC и IC для соединений 25, 27, 5-2 и софосбувира в отношении различных клинических изолятов, включающих в себя дикий тип и ассоциированные с устойчивостью варианты.
Все соединения были существенно более эффективными против репликации HCV, чем софосбувир, и ни соединения 25, 27, ни соединение 5-2 не демонстрировали какой-либо признак перекрестной устойчивости у мутантов L159F, L159F и S282T, а также C316N.
3
Выполняли анализ временной трансфекции для определения чувствительности мутанта S282T дикого типа HCV к тестируемым соединениям. Клетки Huh-7 электропорировали в присутствии РНК, транскрибированной из плазмид с репликоном дикого типа или S282T HCV от промотора Т7. Трансфицированные клетки высевали в 96-луночные планшеты при 7,5×10 клеток на лунку на модифицированную по способу Дульбекко среду Игла. После 24 часов инкубации среду удаляли и заменяли свежей средой, не содержащей или содержащей различные концентрации тестируемых соединений. После дополнительной 96-часовой инкубации измеряли активность против HCV с помощью люциферазной конечной точки с набором для люминесцентного определения репортерного гена Britelite™ Plus (Perkin Elmer, Shelton, CT). дублированные планшеты обрабатывали и инкубировали параллельно для оценки клеточной токсичности с помощью окрашивания тетразолиевым красителем ХТТ.
50
95
В таблице 3 представлены значения IC и IC для соединений 25, 27, 5-2 и софосбувира в отношении репликонов дикого типа и S282T HCV.
Все соединения были существенно более эффективными против репликации HCV, чем софосбувир, и ни соединения 25, 27, ни соединение 5-2 не демонстрировали какой-либо признак перекрестной устойчивости у варианта S282T.
Стабильность выбранных соединений в свежей цельной крови человека и во фракции S9 печени человека определяли с помощью инкубации с 10 мкМ тестируемого соединения. После инкубации в течение 0, 30, 60 минут и до 120 минут аликвоты удаляли и сразу же экстрагировали с 3 объемами ледяного метанола/ацетонитрила (1:1, объем/объем). Экстракты центрифугировали, а супернатант анализировали с помощью LC-MS/MS по концентрациям не изменившегося тестируемого соединения и потенциальных метаболитов.
На фиг. 5 показана высокая стабильность соединения 5-2 и всех 2-аминопроизводных в крови человека.
2
6
6
Интересно отметить, что на фиг. 6 показана in vitro зависимость от времени деалкилирования фосфорамидата 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида до фосфорамидата 2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-N-метил-2,6-диаминопуринового нуклеозида с фракцией S9 печени человека. Более того, наблюдали неожиданную более высокую и более экстенсивную скорость отщепления карбаматного фрагмента фракцией S9 печени человека по сравнению с соединением 5-2 и другими его 2-аминопроизводными (фиг. 7).
Пример 28. Анализ NS5B полимеразы HCV (gt1b)
50
Ингибирование NS5B полимеразы HCV (gt1b) определяли в трех повторностях путем измерения de novo полимеризации в реакционных смесях, содержащих серийные разбавления ТА, in vitro транскрибированную вирусную РНК, комплементарную (-) нитевой 3'UTR области HCV, полимеразу, меченный радиоактивным изотопом рибонуклеотид, 250 мкМ неконкурирующих rNTP и 1 мкМ конкурирующего rNTP. Концентрации ТА, которые обеспечивали 50% ингибирование (IC), определяли по полученным в результате кривым ингибирования.
Пример 29. Анализ клеток-предшественников костного мозга
5
50
Добавляли свежие клетки-предшественники костного мозга (Invitrogen), суспендированные либо в BFU-E-, либо в GM-CSF-специфической культуральной среде, по 10 клеток/лунка в серийные разбавления ТА в трех повторностях в 6-луночных планшетах. После 14-суточных инкубации использовали подсчет колоний для определения значения СС. Колонии BFU-E подтверждали с использованием бензидинового метода.
Соединения 25, 27 и 5-2 не показали цитотоксичность в отношении стволовых клеток костного мозга in vitro.
Пример 30. Анализ кардиомиоцитов iPS
4
50
Кардиомиоциты iPS (Cellular Dynamics) высевали в микролитровые планшеты при 1,5×10 клеток на лунку. После 48-часовой инкубации клетки промывали и добавляли поддерживающую среду, содержащую серийно разбавленный ТА в трех повторностях. После инкубации в течение дополнительных 3 суток измеряли жизнеспособность клеток с помощью окрашивания ХТТ и вычисляли значения CC.
Соединения 25, 27 и 5-2 не демонстрировали цитотоксичность в отношении кардиомиоцитов iPS in vitro.
Пример 31. Анализы ДНК-полимеразы человека
32
32
50
Ингибирование ДНК-полимераз α, β и γ человека (CHIMERx) определяли в трех повторностях в реакционных смесях серийно разбавленного ТА, 0,05 мМ dCTP, dTTP и dATP, 10 мкКи [P]-α-dGTP (800 Ки/ммоль), 20 мкг активированной ДНК из зобной железы теленка и дополнительных реагентов, специфических для каждой полимеразы. После 30-минутных инкубации измеряли включение [α-P]-GTP, а полученные в результате кривые инкубации использовали для вычисления значений IC.
Трифосфат, β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанина трифосфат, а также трифосфатные аналоги соединений 25, 27 и 5-2 не ингибируют ДНК-полимеразы α, β или γ человека.
Пример 32. Совместные культуры гепатоцитов человека
Цитотоксичность и жизнеспособность гепатоцитов оценивали в трех повторностях путем измерения высвобождения ALT, продуцирования мочевины, секреции альбумина и содержания АТФ в клетках микроструктурированной совместной культуры гепатоцитов (HepatoPac, Hepregen Corporation), полученных путем высевания криоконсервированных гепатоцитов женщины (один донор) и фибробластов мыши 3Т3 J2 в микротитрационные планшеты согласно процедурам, установленным Hepregen. Культуральные среды заменяли свежими средами, содержащими ТА, тестируемое изделие, (0, 1, 10 или 30 мкМ) каждые 2 или 3 суток до дня 16. Использованные культуральные среды анализировали на предмет ALT и содержания мочевины в дни 2, 5, 7, 9, 12, 16 и 21, а на предмет содержания альбумина в дни 2, 5, 7 и 9. Клеточные уровни АТФ измеряли в дни 9 и 21. Сигналы АТФ в содержащих только стромальные клетки контрольных культурах (мышиные фибробласты 3Т3) вычитали из сигналов совместных культур HepatoPac человека с получением гепатоцит-специфических эффектов. См. приведенные ниже таблицы 4, 5 и 6.
Соединение 5-2 при концентрациях до 30 мкМ не демонстрировало признаков цитотоксичности, измеряемой с помощью высвобождения ALT, секреции альбумина, продуцирования мочевины и содержания АТФ в клетках, при инкубировании до 12 суток с гепатоцитами человека в микроструктурированной совместной культуре. Небольшие признаки цитотоксичности, обнаруживаемые при длительном воздействии (до 21 суток культивирования), были значительно меньше, чем наблюдаемые с софосбувиром. См. приведенные ниже таблицы 4, 5 и 6.
INX-189 был высоко цитотоксичным по отношению к совместно культивируемым гепатоцитам человека, демонстрируя пониженную секрецию альбумина уже в день 2 и цитотоксичность по всем показателям. Софосбувир демонстрировал более высокую цитотоксичность, чем АТ-511 при тех же условиях.
Пример 33. Метаболические исследования
6
6
Метаболизм соединений 25, 27 и 5-2 при концентрации 10 мкМ изучали в свежих первичных культурах гепатоцитов человека, собаки и мыши. Высеянные гепатоциты людей (XenoTech, обоих полов, объединенные от 10 доноров), самца собаки породы бигль (BioreclamationIVT) и самцов мышей ICR/CD-1 (BioreclamationIVT, 8 доноров) в 6-луночных планшетах, покрытых матригелем, инкубировали в синглете с 10 мкМ ТА. Через 2, 4, 6, 8 или 24 часа количественно оценивали внутриклеточные уровни нуклеотидных пролекарств и их потенциальных метаболитов (пролекарств, монофосфатов, трифосфатов и нуклеозидов) с помощью LC-MS/MS. Концентрации ниже нижнего предела количественного определения (1,5 пмоль/10 клеток для пролекарств, монофосфатов и нуклеозидов и 12 пмоль/10 клеток для трифосфатов) экстраполировали из стандартных кривых.
50
Соединение трифосфат β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанина является преобладающим метаболитом соединений 25, 27 и 5-2, наблюдаемым в культивируемых гепатоцитах человека, и является эффективным ингибитором NS5B полимеразы HCV (gt1b) с IC 0,15 мкМ.
На фиг. 8 показаны преобладающие метаболиты соединения 25 в гепатоцитах человека.
На фиг. 9 показаны преобладающие метаболиты соединения 27 в гепатоцитах человека.
На фиг. 10 показаны преобладающие метаболиты соединения 5-2 в гепатоцитах человека.
На фиг. 11 показаны пути активации для соединений 25, 27 и 5-2. Как можно видеть, соединения 25, 27 и 5-2 превращаются в соответствующие им монофосфатные аналоги, которые затем метаболизируются в общий МР аналог - монофосфат β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанина (соединение 61). Монофосфат затем постадийно фосфорилируется до активного трифосфата - трифосфата β-D-2'-дезокси-2'-α-фтор-2'-β-метил-гуанина (соединения 62).
Пример 34. Контроли
INX-189 (INX-08189/BMS-986094) и софосбувир использовали в качестве контролей в приведенных выше примерах.
50
Два наиболее эффективных нуклеотидных пролекарства - соединения 25 и 27 -демонстрировали высокую селективность со значениями СС более 100 мкМ в отношении клеток Huh-7, стволовых клеток костного мозга человека и кардиомиоцитов человека. Не наблюдали ингибирование ДНК-полимеразы α, β или γ человека, активность в отношении других содержащих РНК или ДНК вирусов и токсичность в отношении всех линий клеток-хозяев при концентрациях до 100 мкМ.
50
95
50
Таблица 7 представляет собой таблицу, иллюстрирующую тестируемые соединения в анализе репликонов HCV вместе с результатами EC/EC (мкМ) и CC (мкМ).
6
β-D-2'-D-2'-α-фтор-2'-β-C-замещенные-2-модифицированные-N-замещенные пуриновые нуклеотиды, описываемые в настоящем документе, демонстрируют значительную активность против вируса HCV. Соединения в соответствии с настоящим изобретением анализировали на предмет желаемой относительной активности с использованием хорошо известных и традиционных анализов, найденных в литературе.
Например, активность против HCV и цитотоксичность соединений могут быть измерены с помощью системы анализа репликонов субгеномной РНК HCV в клетках Huh7 ЕТ. (См. Korba, et al., Antiviral Research 2008, 77, 56). Результаты могут быть кратко описаны в сравнении с положительным контролем - 2'-С-Ме-цитозином {2'-С-Ме-С} (Pierra, et al., Journal of Medicinal Chemistry 2006, 49, 6614).
Другой in vitro анализ на предмет активности против вируса гепатита С описывается Stuyver, et al. в патенте США №7718790, принадлежащем Pharmasset, Inc.
Настоящее раскрытие описано со ссылкой на варианты осуществления настоящего изобретения. В соответствии с изложенным в настоящем документе специалист в данной области сможет модифицировать настоящее изобретение для достижения желаемой цели, и такие вариации рассматриваются в объеме настоящего изобретения.