НАРУШЕНИЯ, ОПОСРЕДОВАННЫЕ ИНТЕРФЕРОНОМ I ТИПА

1. Способ лечения заболевания, опосредованного IFN I типа, у субъекта, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества антитела к IFNAR, где пациента идентифицируют как характеризующегося повышенным профилем экспрессии белков, связанным с интерфероном (IFNPS), характеризующимся повышенной экспрессией белков EPHB2, BLC, LAG-3 и IP-10 в сыворотке крови по сравнению с субъектом, не страдающим заболеванием, опосредованным IFN I типа.
2. Способ по п. 1, где антитело к IFNAR представляет собой анифролумаб и его функциональное производное.
3. Способ по п. 2, включающий введение 300 мг анифролумаба, где необязательно способ включает внутривенное введение 300 мг анифролумаба один раз в 4 недели.
4. Способ по любому из предыдущих пунктов, где лечение подавляет IFNPS.
5. Способ по любому из предыдущих пунктов, где заболевание, опосредованное IFN I типа, представляет собой SLE.
6. Способ по п. 5, где лечение приводит к улучшению в отношении индекса активности заболевания SLE (SLEDAI) у субъекта.
7. Способ по п. 5 или 6, где лечение приводит к улучшению в отношении показателя активности, представляющего собой индекс распространенности и степени тяжести кожной красной волчанки (CLASI), у субъекта.
8. Способ по любому из пп. 1-4, где заболевание, опосредованное IFN, представляет собой миозит.
9. Способ по любому из предыдущих пунктов, где субъекта идентифицируют как не характеризующегося повышенным профилем экспрессии IFNGS по сравнению с субъектом, не страдающим заболеванием, опосредованным IFN этого типа.
10. Способ по любому из предыдущих пунктов, где лечение снижает повышенный профиль экспрессии IFNPS.
11. Фармацевтическая композиция для применения в лечении заболевания, опосредованного интерфероном I типа, у субъекта, где фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество антитела к IFNAR, и где субъект идентифицируется как характеризующийся повышенным профилем экспрессии белков, связанным с IFN, характеризующимся повышенной экспрессией белков EPHB2, BLC, LAG-3 и IP-10.
12. Фармацевтическая композиция для применения по п. 10, где антитело к IFNAR представляет собой анифролумаб.
13. Фармацевтическая композиция для применения по п. 11, где фармацевтическая композиция содержит 300 мг анифролумаба.
14. Фармацевтическая композиция для применения по п. 13, где применение включает введение 300 мг анифролумаба один раз в четыре недели.
15. Фармацевтическая композиция для применения по пп. 10-13, где лечение подавляет IFNPS.
16. Способ по любому из пп. 10-14, где заболевание, опосредованное IFN I типа, представляет собой SLE.
17. Фармацевтическая композиция для применения по п. 15, где лечение приводит к улучшению в отношении индекса активности заболевания SLE (SLEDAI) у субъекта.
18. Фармацевтическая композиция для применения по п. 16 или 17, где лечение приводит к улучшению в отношении показателя активности, представляющего собой индекс распространенности и степени тяжести кожной красной волчанки (CLASI), у субъекта.
19. Фармацевтическая композиция для применения по п. 10, где заболевание, опосредованное IFN, представляет собой миозит.
20. Фармацевтическая композиция для применения по любому из пп. 10-19, где субъект идентифицируется как не характеризующийся повышенным профилем экспрессии IFNGS по сравнению с субъектом, не страдающим заболеванием, опосредованным IFN этого типа.
in vitro
in vitro
21. Способ  выявления повышенной активности IFN в образце, выделенном от субъекта, при этом способ  включает количественное определение экспрессии белков EPHB2, BLC, LAG-3 и IP-10 в образце и сравнение экспрессии белков в образце с экспрессией белков EPHB2, BLC, LAG-3 и IP-10 в образце от здорового донора.
22. Способ идентификации субъекта, подходящего для лечения заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, с помощью терапевтического средства, которое модулирует активность интерферона I типа, при этом указанный способ включает выявление повышенного уровня первого белка в образце от субъекта и повышенного уровня второго белка в образце от субъекта,
где первый белок представляет собой EPHB2,
где второй белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа, и
где повышенный уровень первого белка и повышенный уровень второго белка сравнивают с:
a) уровнем первого белка и уровнем второго белка соответственно в образце из ткани или от человека, не страдающего заболеванием или нарушением, опосредованными интерфероном I типа, или
b) уровнем одного или нескольких контрольных белков в образце от субъекта.
23. Способ идентификации субъекта, подходящего для лечения заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, с помощью терапевтического средства, которое модулирует активность интерферона I типа, включающий:
i) выявление повышенного уровня первого белка в образце от субъекта и повышенного уровня второго белка в образце от субъекта,
где первый белок представляет собой EPHB2,
где второй белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа, и
где повышенный уровень первого белка и повышенный уровень второго белка сравнивают с:
a) уровнем первого белка и уровнем второго белка соответственно в образце из ткани или от человека, не страдающего заболеванием или нарушением, опосредованными интерфероном I типа, или
b) уровнем одного или нескольких контрольных белков в образце от субъекта;
ii) введение терапевтического средства.
24. Антитело к интерферону I типа или антитело к рецептору интерферона I типа, которые модулируют активность интерферона I типа, для применения в лечении заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, у субъекта, где субъект был идентифицирован посредством выявления повышенного уровня первого белка в образце от субъекта и повышенного уровня второго белка в образце от субъекта,
где первый белок представляет собой EPHB2,
где второй белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа, и
где повышенный уровень первого белка и повышенный уровень второго белка сравниваются с:
a) уровнем первого белка и уровнем второго белка соответственно в образце из ткани или от человека, не страдающего заболеванием или нарушением, опосредованными интерфероном I типа, или
b) уровнем одного или нескольких контрольных белков в образце от субъекта.
25. Способ лечения заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, у субъекта, при этом способ включает введение антитела к интерферону I типа или антитела к рецептору интерферона I типа, которые модулируют активность интерферона I типа, где субъект был идентифицирован посредством выявления повышенного уровня первого белка в образце от субъекта и повышенного уровня второго белка в образце от субъекта,
где первый белок представляет собой EPHB2,
где второй белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа, и
где повышенный уровень первого белка и повышенный уровень второго белка сравнивают с:
a) уровнем первого белка и уровнем второго белка соответственно в образце из ткани или от человека, не страдающего заболеванием или нарушением, опосредованными интерфероном I типа, или
b) уровнем одного или нескольких контрольных белков в образце от субъекта.
26. Способ по любому из пп. 22-23 или 25 или антитело для применения по п. 3, дополнительно включающие выявление повышенного уровня по меньшей мере одного другого белка в образце от субъекта, где по меньшей мере один другой белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа; и где повышенный уровень по меньшей мере одного другого белка сравнивают с
a) уровнем по меньшей мере одного другого белка в образце из ткани или от человека, не страдающего заболеванием или нарушением, опосредованными интерфероном I типа, или
b) уровнем одного или нескольких контрольных белков в образце от субъекта.
27. Способ мониторинга или прогнозирования прогрессирования у субъекта заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, включающий:
i) идентификацию уровня экспрессии первого белка в исходном образце от субъекта и уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в исходном образце от субъекта;
ii) идентификацию уровня экспрессии первого белка в дополнительном образце от субъекта и уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в дополнительном образце от субъекта;
где повышение уровня экспрессии первого белка и повышение уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в дополнительном образце по сравнению с исходным образцом от субъекта дают возможность прогнозировать прогрессирование заболевания; или
где снижение уровня экспрессии первого белка и снижение уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в дополнительном образце по сравнению с исходным образцом от субъекта дают возможность прогнозировать регрессию заболевания;
где первый белок представляет собой EPHB2; и
где по меньшей мере один другой белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа.
28. Способ мониторинга прогрессирования заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, у субъекта, получающего лечение терапевтическим средством, которое модулирует активность интерферона I типа, включающий:
i) идентификацию уровня экспрессии первого белка в исходном образце от субъекта и уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в исходном образце от субъекта;
ii) идентификацию уровня экспрессии первого белка в дополнительном образце от субъекта и уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в дополнительном образце от субъекта;
iii) введение субъекту терапевтического средства, которое модулирует активность интерферона I типа, где терапевтическое средство вводится до стадии i) или между стадиями i) и ii); и
iv) сравнение уровней экспрессии первого белка и по меньшей мере одного другого белка в исходном образце от субъекта с уровнями экспрессии первого белка и по меньшей мере одного другого белка соответственно в дополнительном образце от субъекта;
где изменение уровней экспрессии первого белка и по меньшей мере одного другого белка указывает на уровень эффективности терапевтического средства, которое модулирует активность интерферона I типа;
где первый белок представляет собой EPHB2; и
где по меньшей мере один другой белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа.
29. Способ идентификации кандидатного терапевтического средства для лечения заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, включающий:
i) идентификацию уровня экспрессии первого белка в исходном образце от субъекта и уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в исходном образце от субъекта;
ii) введение кандидатного терапевтического средства субъекту;
iii) идентификацию уровня экспрессии первого белка в дополнительном образце от субъекта и уровня экспрессии по меньшей мере одного другого белка в дополнительном образце от субъекта; и
iv) сравнение уровней экспрессии первого белка и по меньшей мере одного другого белка в исходном образце от субъекта с уровнями экспрессии первого белка и по меньшей мере одного другого белка соответственно в дополнительном образце от субъекта;
где изменение уровней экспрессии первого белка и по меньшей мере одного другого белка включает снижение положительной регуляции уровней экспрессии первого белка и по меньшей мере одного другого белка соответственно, что указывает на то, что средство является кандидатным терапевтическим средством;
где первый белок представляет собой EPHB2; и
где по меньшей мере один другой белок характеризуется экспрессией гена, индуцируемой интерфероном I типа, и демонстрирует коэффициент корреляции Пирсона, составляющий более 0,3, по сравнению с профилем экспрессии генов, связанным с интерфероном I типа.
30. Способ по любому из пп. 22, 23 или 25-29 или антитело для применения по п. 3 или 5, где каждый из второго белка и/или по меньшей мере одного другого белка независимо выбран из ALCAM, ангиопоэтина-2, AREG, рецепторной тирозинкиназы AXL (AXL); b2-микроглобулина, бета-2-микроглобулина (B2M), C1q, моноцитарного хемотаксического белка-4 (MCP-4), MIP-3b, MCP-1, MCP-3, моноцитарного хемотаксического белка-2 (MCP-2), sCD163, B7-H1, CLM6, CD5L, ST4S6, SCGF-альфа, SCGF-бета, CO8A1, CSF-1, R M-CSF, катепсина S, фракталкина/CX3CL-1, IP-10, I-TAC, BLC, растворимого CXCL16, монокина, индуцируемого гамма-интерфероном (MIG), DLL1, DERM, EMR2, EPHB2, bFGF, VEGF sR3, PHI, TIMD3, молекулы межклеточной адгезии 1 (ICAM-1), IGFBP-4, Ra1 IL-13, интерлейкина-18 (IL-18), IL-18 BPa, антагониста рецептора интерлейкина-1 (IL-1ra), TCCR, Ra IL-3, JAG1, KYNU, LAG-3, LDH-H 1, LG3BP, ILT-4, MAPK14, MMP-14, MMP-7, NAGK, Notch-3, рецептора глюкокортикоидов, PARK7, PD-L2, PDGF-CC, PLPP, оксидоредуктазы NADPH-P450, SAA, a1-антитрипсина, сиалоадгезина, Siglec-7, SLAF7, остеопонтина, BGH3, R III TGF-b, тенасцина, TNF-a, sR-II TNF, CD30, BAFF и TS.
31. Способ по п. 30 или антитело для применения по п. 30, где уровень по меньшей мере одного из (i) первого белка и (ii) второго белка или по меньшей мере одного другого белка характеризуют площадью под кривой (AUC) при SLE по сравнению со здоровым донором (HD), составляющей более 0,5, относительно:
a. уровня первого белка или уровня второго белка или по меньшей мере одного другого белка соответственно в образце из ткани или от человека, не страдающего заболеванием или нарушением, опосредованными интерфероном I типа, или
b. уровня одного или нескольких контрольных белков в образце от субъекта.
32. Способ по любому из пп. 22, 23 или 25-31 или антитело для применения по любому из пп. 24, 26 или 30-31, где уровень по меньшей мере одного из (i) первого белка и (ii) второго белка или по меньшей мере одного другого белка отличается на величину по меньшей мере одного стандартного отклонения от среднего значения для здорового донора относительно:
a. уровня первого белка или уровня второго белка или по меньшей мере одного другого белка соответственно в образце из ткани или от человека, не страдающего заболеванием или нарушением, опосредованными интерфероном I типа, или
b. уровня одного или нескольких контрольных белков в образце от субъекта.
33. Способ по любому из пп. 30-32 или антитело для применения по любому из пп. 30-32, где каждый из второго белка и/или по меньшей мере одного другого белка независимо выбран из BLC, LAG-3 и IP-10.
34. Способ по любому из пп. 22, 23 или 25-33 или антитело для применения по любому из пп. 24, 26 или 30-33, где второй белок и/или по меньшей мере один другой белок образуют часть биологического сигнального пути, независимого от биологического сигнального пути первого белка.
35. Способ по любому из пп. 22, 23, 25-28 или 30-34 или антитело для применения по любому из пп. 24, 26 или 30-34, где уровень по меньшей мере одного из:
первого белка,
второго белка или по меньшей мере одного другого белка
повышен на по меньшей мере 10%.
36. Способ по любому из пп. 22, 23, 25-28 или 30-34 или антитело для применения по любому из пп. 24, 26 или 30-34, где среднее значение
уровня первого белка,
уровня второго белка и/или уровня по меньшей мере одного другого белка
повышено на по меньшей мере 10%.
37. Способ по любому из пп. 22, 23, 25 или 28-36, где терапевтическое средство представляет собой антитело к интерферону I типа или антитело к рецептору интерферона I типа.
38. Способ по п. 37, где антитело к рецептору интерферона I типа представляет собой анифролумаб.
39. Способ по п. 37 или антитело для применения по любому из пп. 24-5 или 9-15, где антитело к интерферону I типа представляет собой сифалумимаб.
40. Способ по любому из пп. 22, 23 или 25-39 или антитело для применения по любому из пп. 24, 26, 30-37 или 39, где субъект нуждается в лечении заболевания или нарушения, опосредованных интерфероном I типа, выбранных из системной красной волчанки, дискоидной волчанки, волчаночного нефрита, дерматомиозита, полимиозита, псориаза, SSc, васкулита, саркоидоза, синдрома Шегрена и идиопатического воспалительного миозита.
41. Способ по п. 40 или антитело для применения по п. 40, где субъект нуждается в лечении системной красной волчанки.
42. Способ записи данных, полученных посредством способов по пп. 22, 23 или 25-41, на носителе данных.
43. Способ лечения заболевания, опосредованного IFN I типа, у пациента, включающий отбор пациента, лечение пациента.