СПОСОБ ОЦЕНКИ РИСКА ЗАБОЛЕВАНИЯ У ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ НА ОСНОВАНИИ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДАННЫХ И ДАННЫХ О СОСТАВЕ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА

1. Способ оценки риска заболевания у пользователя на основании генетических данных и данных о составе микробиоты кишечника, результатов опросника, включающий следующие шаги
получают генетические данные, данные о составе микробиоты кишечника, генетические факторы риска, внешние факторы риска по меньшей мере одного пользователя, а также встречаемость по меньшей мере одного заболевания;
определяют скорректированное отношение шансов по меньшей мере одного пользователя заболеть заболеванием в группе с фактором риска к шансу заболеть во всей популяции для каждого фактора риска на основании полученных генетических данных пользователя и внешних факторов риска;
формируют промежуточное значение риска заболевания у пользователя на основании встречаемости заболевания и скорректированного отношения шансов, полученного на предыдущем шаге;
определяют относительную представленность микробных таксонов кишечника пользователя на основании данных о составе микробиоты кишечника посредством картирования чтений на референсный набор геномов;
определяют меру отличия полученных данных о составе микробиоты кишечника от микробиоты пациентов с данным заболеванием по данным о составе метагенома кишечника данного пользователя;
формируют итоговое значение риска заболевания у пользователя на основании промежуточного значения риска и меры отличия.
2. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что дополнительно получают среднюю встречаемость заболевания в популяции и/или данные о связи микробиоты с заболеванием.
3. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что генетическим фактором риска являются однонуклеотидные полиморфизмы (SNP).
4. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что получают автоматически внешние факторы риска из статей, показывающих статистически значимую связь между риском и фактором.
5. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что показатели внешних факторов риска для пользователя получают из заполняемого пользователем опросника.
6. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что внешние факторы риска моделируются с использованием исследований ассоциации эпигеномов (EWAS).
7. Способ по п. 1, характеризующийся тем, что данные о составе микробиоты кишечника предоставлены в форматах FASTQ или FASTA.