СПОСОБ БЛОКИРОВАНИЯ ЗАРАЖЕНИЯ ФЛАВИВИРУСАМИ МОЛЕКУЛЫ И ПРИМЕНЕНИЯ

1. Способ блокирования заражения флавивирусами, включающий нарушение взаимодействия белка вирусной оболочки с рецептором альфа-2 макроглобулина с последовательностью SEQ ID NO:NO:3, представленной в списке последовательностей, или с альфа-2 макроглобулином с последовательностью SEQ ID NO:NO:2, представленной в списке последовательностей.
2. Способ по п.1, в котором флавивирус представляет собой вирус денге, вирус желтой лихорадки, вирус японского энцефалита, вирус клещевого энцефалита, вирус энцефалита долины Мэррей, вирус энцефалита Западного Нила, вирус Куньин, вирус Повассан, вирус Лангат или вирус энцефалита Сан-Луи.
3. Способ по п.1 или 2, в котором последовательность вирусного белка, по меньшей мере, на 60% является гомологичной последовательности SEQ ID NO:1, представленной в списке последовательностей.
4. Способ по п.1 или 2, в котором фрагмент последовательности рецептора вируса представляет любой из фрагментов, расположенных между аминокислотными остатками 25-66 или 70-110, или 852-892, или 893-933, или 934-973, или 974-1013, или 1014-1053, или 1060-1099, или 1102-1142, или 1143-1182, или 2522-2563, или 2564-2602, или 2603-2641, или 2642-2690, или 2694-2732, или 2733-2771, или 2772-2814, или 2816-2855, или 2856-2899, или 2902-2940, или 3332-3371, или 3372-3410, или 3411-3450, или 3451-3491, или 3492-3533, или 3534-3572, или 3573-3611, или 3612-3649, или 3652-3692, или 3693-3733, или 3739-3778, в последовательности, относящейся к SEQ ID NO:3 в списке последовательностей.
5. Способ по п.1 или 2, в котором фрагмент последовательности рецептора вируса, по меньшей мере, на 60% является гомологичным любому из фрагментов, расположенных между аминокислотными остатками 25-66 или 70-110, или 852-892, или 893-933, или 934-973, или 974-1013, или 1014-1053, или 1060-1099, или 1102-1142, или 1143-1182, или 2522-2563, или 2564-2602, или 2603-2641, или 2642-2690, или 2694-2732, или 2733-2771, или 2772-2814, или 2816-2855, или 2856-2899, или 2902-2940, или 3332-3371, или 3372-3410, или 3411-3450, или 3451-3491, или 3492-3533, или 3534-3572, или 3573-3611, или 3612-3649, или 3652-3692, или 3693-3733, или 3739-3778, в последовательности, относящейся к SEQ ID NO:3 в списке последовательностей.
6. Способ по п.1 или 2, в котором последовательность белка, функционирующего в качестве носителя для вируса, по меньшей мере, на 60% является гомологичной последовательности SEQ ID NO:2, представленной в списке последовательностей.
7. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, является антителом или конкурентным лигандом рецептора, или последовательностью SEQ ID NO:26, представленной в списке последовательностей.
8. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, получают химическим синтезом или методами рекомбинантной ДНК, или из природного источника.
9. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса с рецептором, представляет собой один из пептидов с последовательностями SEQ ID NO:4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 и 18, представленными в списке последовательностей.
10. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса, является химической модификацией любого из пептидов, описанных в п.9.
11. Способ по п.10, в котором указанный пептид имеет химическую структуру, описанную формулой Nt-C1-F2-F3-F4-F5-F6-T7-T8-T9-T10-T11-T12-G13-G14-G15-G16-G17-C18-Ct, в которой
Nt представляет собой необязательное N-концевое удлинение, образованное химической группой, ковалентно связанной с N-концевой группой, например, ацетилирование, или метилирование, или любое ацилирование, или пептид, или полиэтиленгликоль;
С1: цистеин (образует дисульфидный мостик с другим цистеином в С18), лизин (глутаминовая кислота/аспарагиновая кислота), ковалентно связанный амидной связью с боковой цепью глутаминовой кислоты/аспарагиновой кислоты (лизина) в положении С18;
F2: серин, аспарагин, валин, изолейцин, треонин, фенилаланин, тирозин;
F3: тирозин, аспарагин, изолейцин;
F4: изолейцин, валин, треонин, фенилаланин, тирозин;
F5: валин, изолейцин, тирозин, треонин, фенилаланин;
F6: изолейцин, валин, треонин, фенилаланин, тирозин;
T7: глицин;
T8: валин, аланин, изолейцин, серин, треонин, аргинин;
T9: глицин, глутаминовая кислота;
T10: глутаминовая кислота, аспарагиновая кислота, треонин, аспарагин, пролин;
T11: лизин, аргинин, аспарагин, глицин, серин, треонин, глутамин;
T12: глутамин, аланин, аргинин;
T13: изолейцин, лейцин, валин, фенилаланин, треонин;
T14: лизин, аргинин, аспарагин, треонин;
Т15: лейцин, изолейцин, валин, фенилаланин, тирозин, треонин, гистидин;
Т16: аспарагин, аспарагиновая кислота, серин, гистидин, глутамин;
Т17: триптофан, фенилаланин, тирозин;
С18: цистеин (образует дисульфидный мостик с другим цистеином в С1), лизин (глутаминовая кислота/аспарагиновая кислота), ковалентно связанный амидной связью с боковой цепью глутаминовой кислоты/аспарагиновой кислоты (лизина) в положении С1;
Ct представляет собой необязательное С-концевое удлинение, химическую группу, ковалентно связанную с концевой карбонильной группой, ацетилирование, метилирование, пептид, полиэтиленгликоль, ацилирование.
12. Способ по п.1 или 2, в котором средство, которое блокирует заражение, нарушает взаимодействие белка с последовательностью SEQ ID NO:1, представленной в списке последовательностей, с одним или более остатками, определенными в качестве связывающего лиганд участка в белке с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей.
13. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса, по пп.7, 8, 9, 10, 11 и 12 представляет активный компонент фармацевтической композиции.
14. Способ по п.1 или 2, в котором нарушение взаимодействия вируса с рецептором включает блокирование экспрессии белка с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей.
15. Способ по п.14, в котором экспрессия белка с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, блокируется интерферирующей РНК.
16. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса с рецептором, получают
а) инкубацией рецептора флавивируса с последовательностью SEQ ID NO:3 с препаратом, содержащим белок вирусной оболочки с последовательностью SEQ ID NO:1 и блокирующим соединением;
b) количественным определением белка вирусной оболочки, связанного с рецептором;
с) сравнением с количеством связанного с рецептором белка вирусной оболочки в отсутствие блокирующего соединения.
17. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса с рецептором, получают
а) применением атомных координат модели трехмерной структуры пептида с последовательностью по п.9 или 10 в конформации структуры антипараллельной бета-«шпильки», которая содержит бета-виток в соединительной петле между бета-цепями;
b) применением атомных координат модели трехмерной структуры одного из связывающих лиганд доменов с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, которая определена экспериментально или моделирована с помощью компьютерных средств;
с) компьютерным методом “стыковки” молекул, который позволяет воспроизвести атомные детали взаимодействия структур по п.16а со структурами по п.16b;
d) применением метода компьютерной “стыковки” по п.16с для отбора из базы данных молекулярных структур таких соединений, которые воспроизводят характеристики взаимодействия по п.16с, в качестве блокирующих средств в отношении заражения вирусом.
18. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:2, представленной в списке последовательностей, является антителом или лигандом для альфа-2 макроглобулина, или пептидом.
19. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:2, представленной в списке последовательностей, получают химическим синтезом или методами рекомбинантной ДНК, или из природного источника.
20. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса по пп.18 и 19, представляет собой активный компонент фармацевтической композиции.
21. Применение средств, нарушающих взаимодействие вируса, по пп.7, 8, 9, 10, 11 и 12 для определения чувствительности клетки и/или организма к заражению вирусом денге.
22. Применение средств, нарушающих взаимодействие вируса по пп.18 и 19, для определения чувствительности организма к заражению вирусом денге.
23. Пептид из п.9 с последовательностями SEQ ID NO:4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18, где указанный пептид является средством, которое нарушает взаимодействие вируса с клеточным рецептором.
24. Пептид по п.23, где указанный пептид является средством, которое нарушает взаимодействие вируса с клеточным рецептором с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей.
25. Пептид по п.23 или 24, где указанный пептид представляет собой активный компонент фармацевтической композиции с противовирусными свойствами.