Поиск маркеров риска развития аллергического ринита на основе изучения полиморфного варианта rs7216389 гена GSDMB

УДК: 616.211-002 : 575.174.015.3

ПОИСК МАРКЕРОВ РИСКА РАЗВИТИЯ АЛЛЕРГИЧЕСКОГО РИНИТА НА ОСНОВЕ ИЗУЧЕНИЯ ПОЛИМОРФНОГО ВАРИАНТА rs7216389 ГЕНА GSDMB М.М. Шаймухаметова, Т.Г. Кутлина, Д.О. Каримов, А.У. Шаталина, А.Б. Бакиров

ФБУН «Уфимский НИИ медицины труда и экологии человека», Уфа, Россия

Цель настоящего исследования заключалась в изучении частот полиморфного варианта гена GSDMB у больных аллергическим ринитом и здоровых индивидов в Республике Башкортостан, а также анализ возможных ассоциаций генотипов этого гена с развитием аллергического ринита. В результате исследования было показано, что носители аллеля Т полиморфного локуса rs7216389 гена GSDMB имеют повышенный риск развития АР (OR=1,78). Также было установлено, что протективным маркером аллергического ринита является аллель С (OR=0,73).

Ключевые слова: аллергический ринит, риск, генетические маркеры, протективные генетические маркеры, гасдермин В

A SEARCH FOR RISK MARKERS FOR THE DEVELOPMENT OF ALLERGIC RHINITIS BASED ON THE STUDY OF A POLYMORPIC rs7216389 VARIANT OF GSDMB GENE M.M. Shaimukhametova, T.G. Kutlina, D.O. Karimov, A.B. Bakirov

Ufa Institute of Occupational Health and Human Ecology, Ufa,Russia

The aim of this work was to investigate the frequency of polymorphic variants of GSDMB gene in patients with allergic rhinitis and healthy individuals in the Republic of Bashkortostan, as well as to analyse possible associations of this gene genotypes with the development of AR. The results of the study have shown that carriers of the allele T polymorphic variants of the gene GSDMB have an increased risk of developing AR (OR=1,78 ). It has also been established that protective markers of the allergic rhinitis is an allele C (OR=0,73).

Key words: allergic rhinitis, risk, genetic markers, protective genetic markers, gasdermin B.

Аллергический ринит (АР) является довольно распространенным заболеванием, часто приводящим к развитию бронхиальной астмы[2]. Около 80% пациентов с астмой как следствие имеют аллергический ринит, и от 19% до 38% пациентов с аллергическим ринитом подвержены астме [1]. Аллергический ринит и бронхиальная астма тесно связаны как с патофизиологической, так и с клинической точки зрения [3]. АР является фактором обострения воспалительных заболеваний дыхательных путей. Помимо бронхиальной астмы, он является предшественником таких заболеваний как риносинусит и хронический отит.

Заболеваемость АР в последние годы резко возросла, и сейчас по данным эпидемиологических исследований АР страдает примерно 10-20% населения Земли [2], что составляет около 400 миллионов людей [5]. За последнее десятилетие наблюдается отрицательная тенденция к смещению в структуре заболеваемости. Отмечен значительный

прирост частоты приступов и увеличение тяжести течения заболевания, что приводит к ухудшению производительности труда и снижению качества жизни [2].

Аллергические реакции являются следствием сложного взаимодействия между генетическими факторами и факторами окружающей среды. Было выявлено большое количество генов, задействованных в патогенезе данных заболеваний. Из числа подобных генов наименее изученным остается ген GSDMB.

Ген GSDMB кодирует белок гасдермин В. Эти белки участвуют в многочисленных клеточных процессах, которые связаны с ростом и прогрессией опухолей, в дифференцировке клеток, в управлении клеточным циклом и апоптозом. Роль гасдермина В при развитии аллергических заболеваний, в частности при АР до сих пор не ясна, но известно, что гасдермин В участвует в терминальной дифференцировке эпителиальных клеток. GSDMB , возможно, также играет важную роль в пролиферации стволовых клеток.

Исследования показали как положительные, так и отрицательные ассоциации между полиморфным вариантом rs7216389 гена GSDMB и аллергическими заболеваниями. В исследовании Галантера с соавт., популяция пуэрториканцев показала положительную ассоциацию полиморфного варианта rs7216389 с бронхиальной астмой, в то время как популяция афроамериканцев и мексиканцев показала отрицательную ассоциацию. Верлаан с соавт. также обнаружил ассоциацию данного полиморфного варианта с астмой у испанцев Коста-Рики [4].

Учитывая неоднозначность результатов исследований ассоциации полиморфизмов гена GSDMB с аллергическими заболеваниями в различных популяциях, анализ полиморфного локуса ^7216389в выборке больных АР, проживающих на территории Республики Башкортостан, представляется актуальным.

Материалы и методы. Материалом для молекулярно-генетического анализа послужили образцы ДНК, выделенные из лимфоцитов периферической венозной крови стандартным фенольно-хлороформным методом.

Группу исследования составили 160 больных аллергическим ринитом. Средний возраст больных составил 45,95±11,04 лет. Все больные находились на стационарном лечении в отделе аллергологии Уфимского НИИ медицины труда и экологии человека. Среди обследованных пациентов было 54 мужчин (33,75%) и 111 женщин (66,25%). По этническому составу татары - 54 (33,75%), башкиры - 39 (24,37%), русские - 51 (31,88%) и другие национальности - 16 (10,00%).

Клиническое обследование больных проводилось врачами больницы и включало в себя обязательные и дополнительные методы исследования.

В качестве контроля были использованы образцы ДНК 238 практически здоровых индивидов, отобранные с учетом возраста (50,51±12,19), половой принадлежности (125 мужчин - 52,52%, 113 женщин - 47,48%), и этнического состава (75 русских (31,51%), 90 татар (37,82%), 54 башкир (22,69%), 19 других национальностей ( 7,98%)).

Изучение полиморфных локусов проводилось методом полимеразной цепной реакции синтеза ДНК. Для генотипирования использовались локусспецифические олигонуклеотидные праймеры (табл.1).

Таблица 1

Праймеры и зонды использованные при генотипировании

GSDMB Праймеры GSDMB - F TCAGAACCAAGGCCCTTATTA

rs7216389 GSDMB - R TCTGTCGCTGTTGTTTGTATG

Зонды GSDMB- -T FAM-CCGAGTCCATGCATGTTTGTGACT RTQ-1

GSDMB - C Cy5 -CCGAGTCCATGCGTGTTTGTGACT BHQ-3

Математическую обработку результатов исследования проводили в программах Statistica, Microsoft Excel.

Достоверность различий в распределении частот аллелей и генотипов между группами выявляли, сравнивая выборки с использованием критерия х2 с поправкой Йэйтса. Статистически значимыми считали различия при p<0,05. Относительный риск заболевания по конкретному признаку вычисляли как отношение шансов, доверительный интервал для относительного риска.

Результаты и обсуждение. Нами было проанализировано распределение частот генотипов и аллелей полиморфного локуса rs7216389 гена GSDMB в выборках больных аллергическим ринитом и практически здоровых индивидов. Данные о распределении частот аллелей и генотипов приведены в таблице 2. Было показано, что носители аллеля Т (х2=4,51, p=0,034) полиморфного локуса rs7216389 гена GSDMB имеют повышенный риск развития АР. Также было установлено, что аллель С (х2=4,51, p=0,034) является фактором устойчивости к развитию заболевания. В группе больных был повышен уровень встречаемости генотипа ТТ (х2=2,86, p=0,091), но статистической значимости данные показатели не достигли. Статистической значимости также не достигло преобладание в группе контроля генотипа СС (х2=2,47, p=0,096).

Таблица 2

Распределении частот генотипов и аллелей полиморфного локуса rs7216389 гена GSDMB

Полиморфный вариант Генотипы, аллели Больные N=160 Контроль N=238 Х2 p OR 95% CI

GSDMB TT 31,25% 23,11% 2,86 0,091 1,51 0,97 - 2,37

rs7216389 CT 50,00% 50,42% 0,00 0,985 0,98 0,66 - 1,47

CC 18,75% 26,47% 2,47 0,096 0,64 0,39 - 1,05

C 43,75% 51,68% 4,51 0,034 0,73 0,55 - 0,97

T 56,25% 48,32% 4,51 0,034 1,38 1,04 - 1,83

Таким образом, в результате проведённого анализа, установлен маркер риска развития аллергического ринита: аллель Т (OR=1,38), и маркер устойчивости к данному заболеванию: аллель С (OR=0,73) полиморфного локуса гз7216389 гена вБОМБ.

Список литературы:

1. Каримов, Д.О. Оценка риска развития хронического лимфолейкоза с помощью молеку-лярногенетических маркеров / Каримов Д.О., Байзигитов Д.Р., Мухаммадиева Г.Ф., Баки-ров Б.А. // Санитарный врач. 2013. № 10. С. 66-68.

2. Шаталина, А.У. Прогнозирование риска развития профессиональных аллергических заболеваний кожи / А.У. Шагалина, А.Б.Б акиров, Л.М. Масягутова, Д.О. Каримов // Медицина труда и экология человека. 2015. № 1 (1). С. 52-56.

3. Carole Ober. The Genetics of Asthma and Allergic Disease: A 21st Century Perspective / Carole Ober, Tsung-Chieh Yao//Immunol Rev. -2011. - Vol. - 242 (1) -P. 10 - 30.

4. Effectiveness of moxibustion for allergic rhinitis: protocol for a systematic review / Sheng Chen, ShengnanGuo,Jun Wang, Eunhae Ha, Federico Marmori, Yanping Wang, and Jiping Zhao // MJ 0pen.-2015. - Vol. - 5 (5).

5. Severity of allergic rhinitis and asthma development in children / Giuseppe Di Cara, Alessia-Carelli, Arianna Latini, Elisa Panfili, IlariaBizzarri, Giorgio Ciprandi,Serena Buttafava,FrancoFrati, and Alberto Verrotti// World Allergy Organ J. - 2015. - Vol. - 8 (1) : 13.

6. The Association of GSDMB and 0RMDL3 Gene Polymorphisms With Asthma: A Meta-Analysis / Chun-Ni Zhao, Ye Fan, Jian-Jun Huang, Hai-Xia Zhang, Tao Gao, Cong Wang, Tong Wang, and Li-Fang Hou// Allergy Asthma Immunol Res. - 2015. - Vol. - 7 (2).-P. 175 - 185.

7. The international survey on the management of allergic rhinitis by physicians and patients (IS-MAR). Carlos E Baena-Cagnani, Giorgio W Canónica, Mohamed ZakyHelal, René Maximiliano Gómez, Enrico Compalati,Mario E Zernotti, Mario Sanchez-Borges, Fabio F Morato Castro, Margarita Murrieta Aguttes, Aida López-Garcia,Faheem A Tadros, and ISMAR Study Group //World Allergy Organ J. - 2015. - Vol. - 8 (1): 10.