ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ, ПРОИЗВОДЯЩИЕ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЕ ИЛИ МОДУЛИРОВАНИЕ СПЛАЙСИНГА ПРЕ-РНК И СОДЕРЖАЩИЕ БИЦИКЛИЧЕСКИЕ КАРКАСНЫЕ ФРАГМЕНТЫ, С УЛУЧШЕННЫМИ ХАРАКТЕРИСТИКАМИ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ

1. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид, состоящий из 10-33 связанных мономерных субъединиц РНК, где
a) по меньшей мере один мономер имеет формулу I
,
где B представляет собой нуклеиновое основание;
X представляет собой F, амино или -OR;
1
1
2
1
R представляет собой алкенил или необязательно замещенный алкил, где необязательные заместители, при их наличии, представляют собой галоген, OR, NRR или SR;
1
R представляет собой H, алкил, циклоалкил, арил, гетероциклоалкил или гетероарил, каждый из которых независимо необязательно замещен галогеном, гидрокси или алкилом;
2
R представляет собой H или алкил; и
указывает точку присоединения к остатку олигонуклеотида;
b) где по меньшей мере один мономер в концевом положении олигонуклеотида представляет собой запертую нуклеиновую кислоту (LNA), имеющую формулу II
1
где B представляет собой нуклеиновое основание;
2
n
Z-Y представляет собой -(CH)O-;
n равно 1 или 2; и
указывает точку присоединения к остальной части олигонуклеотида;
c) где мономеры связаны фосфотиоатными остовными связями; и
1
d) где по меньшей мере одно нуклеиновое основание, выбранное из B и B в олигонуклеотиде представляет собой 5-метилцитозиновое основание, и
олигонуклеотид состоит из последовательности, которая комплементарна, или связывается, или целенаправленно взаимодействует, или гибридизируется по меньшей мере с частью последовательности распознавания экзона (ERS), экзонного сайленсера сплайсинга (ESS) или сайта связывания белка SR экзона 51 пре-мРНК дистрофина.
3
2. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по п.1, в котором R представляет собой CH.
1
3
3. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором R представляет собой CH.
4. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-3, в котором X представляет собой F или -OR.
3
5. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-4, в котором X представляет собой F или -OCH.
2
6. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-5, в котором Z-Y представляет собой -CHO-.
7. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид, состоящий из 10-33 связанных мономерных субъединиц РНК, включающий
i) только 2’-замещенные мономеры, связанные фосфотиоатными остовными связями,
ii) по меньшей мере один мономер, содержащий 5-метилцитозиновое основание, и
iii) по меньшей мере один мономер, содержащий в концевом положении олигонуклеотида включающего запертую нуклеиновую кислоту (LNA),
где указанный олигонуклеотид комплементен, или связывается, или целенаправленно взаимодействует, или гибридизируется по меньшей мере с частью последовательности распознавания экзона (ERS), экзонного сайленсера сплайсинга (ESS) или сайта связывания белка SR экзона 51 пре-мРНК дистрофина.
8. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-7, отличающийся тем, что олигонуклеотид включает последовательность GGAAGAUGGCAU (SEQ ID NO: 6072).
9. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-8, отличающийся тем, что длинна указанного олигонуклеотида составляет менее чем 24 нуклеотида.
10. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-9, отличающийся тем, что олигонуклеотид имеет длину 18, 19, 20, 21 или 22 мономерные субъединицы.
11. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-10, отличающийся тем, что олигонуклеотид имеет длину 18, 20 или 22 мономерные субъединицы.
12. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-11, отличающийся тем, что олигонуклеотид имеет SEQ ID NO: 453-457, 459-463, 465-469, 471-475, 477-481, 483-487, 489-493, 495-499, 501-505, 507-511, 513-517, 519-523, 525-529, 531-535, 537-541, 543-547, 1592-1605, 1607, 4528-4560, 6072 или 6085.
13. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-12, отличающийся тем, что олигонуклеотид представляет собой SEQ ID NO: 459.
14. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-13, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид состоит из 1, 2, 3 или 4 мономеров LNA.
15. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-14, где 5'-концевое положение олигонуклеотида представляет собой мономер LNA.
16. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-15, где 3'-концевое положение олигонуклеотида представляет собой мономер LNA.
17. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-16, отличающийся тем, что два мономера, ближайшие к 5'-положению олигонуклеотида, представляют собой мономеры LNA.
18. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по п.7, в котором указанный 2'-замещенный мономер представляет собой 2'-O-метил-мономер.
19. Переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-18, в котором все цитозиновые основания представляют собой 5-метилцитозиновые основания.
20. Композиция, содержащая переключающий сплайсинг олигонуклеотид по любому из пп.1-19 и по меньшей мере одно вспомогательное вещество.
21. Композиция по п.20, в которой указанное вспомогательное вещество улучшает целенаправленное взаимодействие указанной композиции или указанного олигонуклеотида с тканью и/или клеткой.
22. Способ предупреждения, лечения и/или отсрочки мышечной дистрофии Дюшенна (DMD), включающий введение субъекту переключающего сплайсинг олигонуклеотида по любому из пп.1-19 или композиции по п.20 или 21.