АНТИТЕЛО, НЕЙТРАЛИЗУЮЩЕЕ КОРОНАВИРУС SARS-COV-2 (ВАРИАНТЫ), СПОСОБ, НАБОР И УСТРОЙСТВО

1. Способ диагностики или выявления COVID-19 у индивидуума, включающий этапы:
(a) определение наличия или количества спайк белка SARS-CoV-2, соответствующего SEQ ID NO 1, или его фрагментов, или его природных мутантов, с помощью антитела в образце указанного индивидуума, где антитело имеет тяжелую цепь вариабельного домена, соответствующую SEQ ID NO 2 или последовательности, имеющей как минимум 90% идентичности с последовательностью SEQ ID NO 2, и легкую цепь вариабельного домена, соответствующую SEQ ID NO 3 или последовательности, имеющей как минимум 90% идентичности с последовательностью SEQ ID NO 3;
(b) заключение о наличии или уровне COVID-19 в образце на основании определения наличия или уровня указанного антитела, связавшегося со спайк белком SARS-CoV-2 в тестируемом образце, полученном на стадии (a).
2. Способ диагностики или выявления COVID-19 у индивидуума, включающий этапы:
(a) определение наличия или уровня спайк белка SARS-CoV-2, соответствующего SEQ ID NO 1, или его фрагментов, или его природных мутантов с помощью антитела в образце указанного индивидуума, где антитело имеет следующие участки последовательности, определяющие комплементарность (CDRH и CDRL):
CDRH1, соответствующий последовательности SEQ ID NO 4,
CDRH2, соответствующий последовательности SEQ ID NO 5,
CDRH3, соответствующий последовательности SEQ ID NO 6,
CDRL1, соответствующий последовательности SEQ ID NO 7,
CDRL2, соответствующий последовательности SEQ ID NO 8 и
CDRL3, соответствующий последовательности SEQ ID NO 9,
или соответствующие последовательности, имеющие по меньшей мере 85% идентичности с аминокислотными последовательностями SEQ ID NO: 4-9;
(b) заключение о наличии или уровне COVID-19 в образце на основании определения наличия или уровня указанного антитела, связавшегося со спайк белком SARS-CoV-2 в тестируемом образце, полученном на стадии (a).
3. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию (c): сравнение уровней, определенных на этапе (b), с соответствующими референсными значениями для спайк белка SARS-CoV-2.
4. Способ по п. 1 или 3, где последовательности антител тяжелой цепи вариабельного домена и легкой цепи вариабельного домена имеют как минимум 90% или 95% идентичности с последовательностями SEQ ID NO 2 и SEQ ID NO 3, соответственно.
5. Способ по любому из пп. 1, 3, 4, в котором указанный индивидуум является человеком или млекопитающим.
6. Способ по п. 2, дополнительно включающий стадию (c): сравнение уровней, определенных на этапе (b), с соответствующими референсными значениями для спайк белка SARS-CoV-2.
7. Способ по п. 2 или 6, в котором последовательности CDRH и CDRL имеют как минимум 85% идентичности с последовательностями с соответствующими номерами SEQ ID NO: 4-9.
8. Способ по любому из пп. 2, 6, 7, в котором указанный индивидуум является человеком или млекопитающим.
9. Способ мониторинга эффективности лечения COVID-19 у индивидуума, включающий следующие этапы:
(а) определение количества спайк белка SARS-CoV-2, как описано в любом из пп. 1-8,
в первом образце индивидуума,
(б) определение количества спайк белка SARS-CoV-2
во втором образце данного индивидуума,
(c) сравнение количества спайк белка SARS-CoV-2, определенного на этапе (а), с количеством спайк белка SARS-CoV-2, определенного на этапе (b), где увеличение количества, определенного на этапе (b) по сравнению с количеством, определенным на этапе (а), указывает на то, что для данного индивидуума продолжение указанного лечения нежелательно, а уменьшение количества SARS-CoV-2 спайк белка, определенное на этапе (b), по сравнению с количеством, определенным на этапе (а), указывает на перспективность продолжения указанного лечения для данного индивидуума.
10. Способ по п. 9, в котором указанный первый образец получают до начала или в начале указанного лечения, а второй образец получают после начала лечения.
11. Способ по п. 9 или 10, в котором указанный индивидуум является человеком или млекопитающим.
12. Способ по любому из пп. 1, 3-5, дополнительно включающий анализ нуклеопротеина SARS-CoV-2, где комбинация уровня спайк белка SARS-CoV-2 и нуклеопротеина SARS-CoV-2 указывает на наличие COVID-19.
13. Способ по любому из пп. 2, 6-8, дополнительно включающий анализ нуклеопротеина SARS-CoV-2, где комбинация уровня спайк белка SARS-CoV-2 и нуклеопротеина SARS-CoV-2 указывает на наличие COVID-19.
14. Способ по любому из пп. 1, 3-5, 12, в котором образец представляет собой кровь, плазму крови, сыворотку крови, мазок из носа, мазок из носоглотки, слюну, мочу или образец пота.
15. Способ по любому из пп. 2, 6-8, 13, в котором образец представляет собой кровь, плазму крови, сыворотку крови, мазок из носа, мазок из носоглотки, слюну, мочу или образец пота.
16. Набор для осуществления способа по любому из пп. 1-15, где указанный набор содержит инструкции для выполнения указанного способа, и
(а) средство для определения количества спайк белка SARS-CoV-2 в образце индивидуума, где указанное средство включает в себя антитело, описанное в любом из пп. 1-6, и
(b) средства для сравнения указанных количеств с соответствующими референсными количествами, посредством чего делается
(c) заключение о наличии COVID-19.
17. Набор по п. 16, дополнительно содержащий реагенты и средства для определения нуклеопротеина SARS-CoV-2.
18. Набор по п. 16 или 17, где образец представляет собой кровь, плазму крови, сыворотку крови, мазок из носа, мазок из носоглотки, слюну, мочу или образец пота.
19. Набор по любому из пп. 16-18, в котором указанный индивидуум является человеком или млекопитающим.
20. Устройство для диагностики COVID-19 у индивидуума, содержащее средство для определения количества спайк белка SARS-CoV-2 в образце индивидуума и средство для сравнения указанного количества с соответствующими референсными количествами, где указанное устройство включает в себя антитело, описанное в любом из пп. 1-6.
21. Устройство по п. 20, где образец представляет собой кровь, плазму крови, сыворотку крови, мазок из носа, мазок из носоглотки, слюну, мочу или образец пота.
22. Устройство по п. 20 или 21, в котором указанный индивидуум является человеком или млекопитающим.
23. Способ лечения или замедления прогрессирования COVID-19 у индивидуума, включающий введение антитела индивидууму, для которого необходимо лечение, где антитело содержит тяжелую цепь вариабельного домена, соответствующую аминокислотной последовательности SEQ ID NO 2 или последовательности, имеющей как минимум 90% идентичности с последовательностью SEQ ID NO 2, и легкую цепь вариабельного домена, соответствующую аминокислотной последовательности SEQ ID NO 3 или последовательности, имеющей как минимум 90% идентичности с последовательностью SEQ ID NO 3.
24. Способ лечения или замедления развития COVID-19 у индивидуума, включающий введение антитела индивидууму, для которого необходимо лечение, где антитело включает в себя следующие участки CDRH и CDRL:
CDRH1, соответствующий последовательности SEQ ID NO 4,
CDRH2, соответствующий последовательности SEQ ID NO 5,
CDRH3, соответствующий последовательности SEQ ID NO 6,
CDRL1, соответствующий последовательности SEQ ID NO 7,
CDRL2, соответствующий последовательности SEQ ID NO 8 и
CDRL3, соответствующий последовательности SEQ ID NO 9,
или соответствующие последовательности, имеющие по меньшей мере 85% идентичности с аминокислотными последовательностями SEQ ID NO: 4-9.
25. Способ по п. 23, где последовательности тяжелой цепи вариабельного домена и легкой цепи вариабельного домена антитела имеют как минимум 90% идентичности с последовательностями SEQ ID NO 2 и SEQ ID NO 3, соответственно.
26. Способ по п. 23 или 25, в котором указанный индивидуум является человеком или млекопитающим.
27. Способ по п. 24, в котором последовательности CDRH и CDRL имеют как минимум 85% идентичности с последовательностями с соответствующими номерами SEQ ID NO: 4-9.
28. Способ по п. 24 или 27, в котором указанный индивидуум является человеком или млекопитающим.
29. Антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий по меньшей мере 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO 2, и вариабельный домен легкой цепи, имеющий по меньшей мере 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO 3, где указанное антитело связывается со спайк белком SARS-CoV-2, имеющим аминокислотную последовательность SEQ ID NO 1, его фрагментом или его природным мутантом.
30. Антитело по п. 29, где указанный вариабельный домен тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 2, а указанный вариабельный домен легкой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 3.
31. Антитело по п. 30, где указанный вариабельный домен тяжелой цепи состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO 2, а указанный вариабельный домен легкой цепи состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO 3.
32. Антитело по любому из пп. 29-31, отличающееся тем, что указанное антитело содержит следующие аминокислотные последовательности:
SEQ ID NO 4 (CDRH1): VKLSCKASGYTFTSYYMC
SEQ ID NO 5 (CDRH2): EINPSNGGTN
SEQ ID NO 6 (CDRH3): WGLRLPFAY
SEQ ID NO 7 (CDRL1): ASESVDKYGISFMN
SEQ ID NO 8 (CDRL2): GASNQGY и
SEQ ID NO 9 (CDRL3): QQSKEVPFT.
33. Антитело по любому из пп. 29-32 для применения при лечении COVID-19.
34. Антитело, включающее в себя следующие участки аминокислотной последовательности:
SEQ ID NO 4 (CDRH1): VKLSCKASGYTFTSYYMC
SEQ ID NO 5 (CDRH2): EINPSNGGTN
SEQ ID NO 6 (CDRH3): WGLRLPFAY
SEQ ID NO 7 (CDRL1): ASESVDKYGISFMN
SEQ ID NO 8 (CDRL2): GASNQGY, and
SEQ ID NO 9 (CDRL3): QQSKEVPFT, или соответствующие последовательности, имеющие по меньшей мере 85% идентичности с аминокислотными последовательностями SEQ ID NO: 4-9.
35. Антитело по п. 34 для применения при лечении COVID-19.