ПЕПТИДНЫЕ МАКРОЦИКЛЫ ПРОТИВ ACINETOBACTER BAUMANNII
PEPTIDE MACROCYCLES AGAINST ACINETOBACTER BAUMANNII

Область изобретения
Согласно настоящему изобретению предложены соединения, проявляющие активность против бактерий, в частности, против грамотрицательных бактерий, таких как Acinetobacter baumannii, их получение, фармацевтические композиции, содержащие их, и их применение в качестве лекарственных средств для лечения заболеваний и инфекций, вызываемых бактериями.
Предшествующий уровень техники
Acinetobacter baumannii представляет собой грамотрицательную аэробную неферментирующую бактерию, которая, как признано в последние десятилетия, представляет собой возвращающийся патоген с очень ограниченными возможностями для лечения.
Согласно заключению центров США по контролю и профилактике заболеваний считается, что A. baumannii представляет собой серьезную угрозу и принадлежит так называемым патогенам группы ESKAPE (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и Enterobacter species & E. coli), которые в настоящее время вызывают большинство нозокомиальных инфекций и эффективно "ускользают" от воздействия антимикробных агентов.
A. baumannii наиболее часто обнаруживают в отделениях интенсивной терапии и хирургических палатах, при этом широкое применение антибиотиков позволило ей выработать устойчивость в отношении всех известных антимикробных средств, и при этом она вызывает инфекции, которые включают бактериемию, пневмонию, менингит, инфекцию мочевыводящих путей и раневую инфекцию.
A. baumannii обладает исключительной способностью активировать и приобретать детерминаты устойчивости и демонстрирует стойкость к воздействию окружающей среды, что позволяет ей выживать и распространяться в условиях пребывания в больнице, делая этот микроорганизм частой причиной вспышек инфекции и эндемическим, связанным с оказанием медицинской помощи патогеном.
Вследствие возрастающей антибиотикорезистентности к большинству, если не ко всем имеющимся возможным методам лечения, инфекции, вызываемые А. baumanniii с множественной лекарственной устойчивостью (MDR), особенно инфекции, вызываемые карбапенем-устойчивой бактерией A. baumannii, являются чрезвычайно трудно или почти неподдающимися лечению инфекциями с высоким уровнем смертности, а также с более высокой частотой заболевания и продолжительностью пребывания в отделении интенсивной терапии.
Acinetobacter baumannii была определена и до сих пор остается "наглядным примером несоответствия между неудовлетворенными медицинскими потребностями и текущим состоянием научных и технологических разработок в области антимикробных средств" согласно Целевой группе по доступности антимикробных средств (AATF) Американского сообщества специалистов по инфекционным болезням (IDSA). Таким образом, имеется высокий спрос и необходимость в выявлении соединений, подходящих для лечения заболеваний и инфекций, вызываемых Acinetobacter baumannii.
В WO 2017/072062 описаны пептидные макроциклические соединения, обладающие активностью против Acinetobacter baumannii. Однако все еще имеется высокая неудовлетворенная потребность в улучшенных соединениях, подходящих для лечения заболеваний и инфекций, вызываемых Acinetobacter baumannii.
Краткое изложение сущности изобретения
Согласно первому аспекту настоящего изобретения предложены соединение формулы (I)
или его фармацевтически приемлемая соль,
где:
1
X представляет собой СН или N;
2
X представляет собой СН или N;
А выбран из:
1
1-6
1-6
R выбран из атома водорода, галогена, С-алкокси и С-алкила;
2
1-6
R представляет собой атом водорода или С-алкил;
3
1-6
R представляет собой С-аминоалкил;
4
1-6
1-6
R представляет собой С-аминоалкил или карбамоил-С-алкил;
5
1-6
2-6
R выбран из карбокси, карбокси-С-алкила и карбокси-С-алкенила; и
6
1-6
1-6
R выбран из атома водорода, галогена, гидрокси, С-алкокси и С-алкилсульфонила;
при условии, что указанное соединение формулы (I) не представляет собой:
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-амино-бутил)-11-(3-амино-пропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентааза-трицикло[19.4.0.0*3,8*]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-бензойную кислоту.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложен способ получения соединений формулы (I), описанных в данной заявке, включающий:
1
2
5
6
30
40
1
2
а) отщепление всех амино-, индол- и карбокси-защитных групп, присутствующих в соединении формулы (VI), где R, R, R, R, R, R, X и X являются такими, как определено в данном описании,
с получением указанного соединения формулы (I).
1
2
8
20
1-6
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложен способ получения соединений формулы (IXa) или (IXb), где PG представляет собой подходящую защитную группу для атома азота индола, PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, и R и R каждый независимо представляет собой С-алкил,
включающий:
1
2
8
20
1-6
асимметричное гидрирование соединения формулы (VIII), где PG представляет собой подходящую защитную группу для атома азота индола, PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, и R и R каждый независимо представляет собой С-алкил, в присутствии гомогенного катализатора
с получением указанного соединения формулы (IXa) или (IXb).
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложено соединение формулы (I), описанное в данной заявке, полученное способом, описанным в данной заявке.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложена фармацевтическая композиция, содержащая соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемую соль и один или более чем один фармацевтически приемлемый эксципиент.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль либо фармацевтическая композиция, описанная в данной заявке, для применения в качестве терапевтически активного вещества.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль либо фармацевтическая композиция, описанная в данной заявке, для применения в качестве антибиотика.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль либо фармацевтическая композиция, описанная в данной заявке, для применения в лечении или предупреждении инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых Acinetobacter baumannii.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложен способ лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых Acinetobacter baumannii, при этом данный способ включает введение соединения формулы (I), описанного в данной заявке, или его фармацевтически приемлемой соли либо фармацевтической композиции, описанной в данной заявке, человеку или животному.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложено применение соединения формулы (I), описанного в данной заявке, или его фармацевтически приемлемой соли либо фармацевтической композиции, описанной в данной заявке, для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых Acinetobacter baumannii.
Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложено применение соединения формулы (I), описанного в данной заявке, или его фармацевтически приемлемой соли либо фармацевтической композиции, описанной в данной заявке, для приготовления лекарственного средства для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых Acinetobacter baumannii.
Подробное описание изобретения
Определения
Если не указано иное, все технические и научные термины, использованные в данном описании, имеют точно такое же значение, которое обычно понимается специалистом средней квалификации в области техники, к которой данное изобретение относится.
Несмотря на то, что при практическом применении или испытании данного изобретения могут быть использованы способы и материалы, аналогичные или эквивалентные изложенным в данном описании, подходящие способы и материалы описаны ниже.
Следует понимать, что признаки, целые числа, характеристики, соединения, химические группировки или группы, описанные в отношении конкретного аспекта, воплощения или примера по изобретению, применимы в случае любого другого аспекта, воплощения или примера, описанного в данной заявке, если при этом отсутствует противоречие. Все признаки, описанные в данной заявке (в том числе в любой части из прилагаемых формулы изобретения, реферата и графических материалов), и/или все стадии любого метода или способа, описанного таким образом, можно комбинировать в любом сочетании за исключением тех сочетаний, где по меньшей мере один из таких признаков и/или одна из таких стадий являются взаимоисключающими. Изобретение не ограничивается подробностями любых вышеупомянутых воплощений. Данное изобретение распространяется на любой новый признак или любое новое сочетание признаков, описанных в данной заявке (в том числе в любой части из прилагаемых формулы изобретения, реферата и графических материалов), или на любую новую стадию или любое новое сочетание стадий любого метода или способа, описанного таким образом.
Все публикации, патентные заявки, патенты и другие ссылки, упомянутые в данном описании, включены посредством ссылки во всей своей полноте.
Использованная в этой заявке номенклатура базируется на систематической номенклатуре Международного союза по теоретической и прикладной химии (IUPAC), если не указано иное.
Для создания химических названий в соответствии с IUPAC использовали программу OpenEye Lexichem, версию 1.2.0, электронный ноутбук от PerkinElmer для построения химических структур или аналитической обработки данных для Excel 2017 R2.
Любая свободная валентность, имеющаяся на атоме углерода, кислорода, серы или азота в структурах, представленных в данном описании, указывает на наличие атома водорода, если не указано иное.
1
2
3
Термин "группировка" относится к атому или группе соединенных химическими связями атомов, который(ая) присоединен(а) к другому атому или другой молекуле посредством одной или более химических связей, образуя тем самым часть молекулы. Например, переменные R, R и R в формуле (I) относятся к группировкам, которые присоединены к центральной части структуры формулы (I) ковалентной связью.
При указании числа заместителей термин "один или более" относится к диапазону от одного заместителя до максимально возможного числа замещений, т.е. к замене, по количеству, от одного атома водорода до замены всех атомов водорода на заместители.
Термин "возможный" или "возможно" означает, что описываемое далее событие или обстоятельство может иметь место, но происходит не обязательно, и что данное описание включает случаи, когда это событие или обстоятельство происходит, и случаи, в которых это не так.
Термин "заместитель" означает атом или группу атомов, заменяющих атом водорода на исходной молекуле.
Термин "замещенный" означает, что конкретная группа несет один или более заместителей. В том случае, когда какая-либо группа может нести несколько заместителей и предложен ряд возможных заместителей, тогда заместители выбираются независимо и необязательно будут одинаковыми. Термин "незамещенный" означает, что указанная конкретная группа не несет никаких заместителей. Термин "возможно замещенный" означает, что указанная конкретная группа не замещена или замещена одним или более заместителями, независимо выбранными из группы возможных заместителей. При указании числа заместителей термин "один или более" означает "от одного заместителя до максимально возможного числа замещений", т.е. замену от одного атома водорода до замены всех атомов водорода на заместители.
Термин "соединение(ия) по данному изобретению" и "соединение(ия) по настоящему изобретению" относится к соединениям, описанным в данной заявке, и их стерео изо мерам, таутомерам, сольватам и солям (например, фармацевтически приемлемым солям).
Когда соединения по изобретению представляют собой твердые вещества, специалистам в данной области техники понятно, что эти соединения и их сольваты и соли могут существовать в разных твердых формах, в частности, разных кристаллических формах, и подразумевается, что все они включены в объем настоящего изобретения и конкретных формул.
Термин "фармацевтически приемлемые соли" означает соли, которые не являются нежелательными в биологическом или в каком-либо ином отношении. Фармацевтически приемлемые соли включают соли присоединения как кислоты, так основания.
Термин "фармацевтически приемлемая соль присоединения кислоты" означает те фармацевтически приемлемые соли, которые образованы с неорганическими кислотами, такими как соляная кислота, бромистоводородная кислота, серная кислота, азотная кислота, угольная кислота, фосфорная кислота, и с органическими кислотами, выбранными из классов алифатических, циклоалифатических, ароматических, аралифатических, гетероциклических, карбоновых и сульфоновых органических кислот, таких как муравьиная кислота, уксусная кислота, пропионовая кислота, гликолевая кислота, глюконовая кислота, молочная кислота, пировиноградная кислота, щавелевая кислота, яблочная кислота, малеиновая кислота, малоновая кислота, янтарная кислота, фумаровая кислота, винная кислота, лимонная кислота, аспарагиновая кислота, аскорбиновая кислота, глутаминовая кислота, антраниловая кислота, бензойная кислота, коричная кислота, миндальная кислота, эмбоновая кислота, фенилуксусная кислота, метансульфоновая кислота, этансульфоновая кислота, п-толуолсульфоновая кислота и салициловая кислота.
Термин "фармацевтически приемлемая соль присоединения основания" означает те фармацевтически приемлемые соли, которые образованы с органическим или неорганическим основанием. Примеры солей приемлемых неорганических оснований включают соли натрия, калия, аммония, кальция, магния, железа, цинка, меди, марганца и алюминия. Соли, происходящие из фармацевтически приемлемых органических нетоксичных оснований, включают соли первичных, вторичных и третичных аминов, замещенных аминов, в том числе природных замещенных аминов, циклических аминов и основных ионообменных смол, таких как изопропиламин, триметиламин, диэтиламин, триэтиламин, трипропиламин, этаноламин, 2-диэтиламиноэтанол, триметамин, дицикпогексиламин, лизин, аргинин, гистидин, прокаин, гидрабамин, холин, бетаин, этилендиамин, глюкозамин, метилглюкамин, пурины, пиперазин, пиперидин, N-этилпиперидин и полиаминные смолы.
В данном описании в основном использованы стереохимические определения и правила, представленные в S.P. Parker, Ed., McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms (1984), McGraw-Hill Book Company, New York; и Eliel E. and Wilen S., "Stereochemistry of Organic Compounds", John Wiley & Sons, Inc., New York, 1994. При описании оптически активного соединения для обозначения абсолютной конфигурации молекулы относительно ее хирального(ых) центра(ов) используют префиксы D и L или R и S. Рассматриваемые заместители, присоединяемые к хиральному центру, ранжируют в соответствии с правилом последовательного старшинства Кана, Ингольда и Прелога (Cahn et al., Angew. Chem. Inter. Edit., 1966, 5, 385; errata 511). Для обозначения знака направления вращения плоскополяризованного света соединением применяют префиксы D и L или (+) и (-), при этом (-) или L означает, что соединение является левовращающим. Соединение с префиксом (+) или D является правовращающим.
Термины "галоген", "атом галогена" и "галогенид" используются в данном описании взаимозаменяемо и означают фтор, хлор, бром или йод особыми примерами галогена являются фтор и хлор.
Термин "циано" относится к группе -CN (к нитрилу).
Термин "карбокси" относится к группе -С(O)ОН.
Термин "алкил" означает одновалентную линейную или разветвленную насыщенную углеводородную группу из 1-12 атомов углерода. В конкретных воплощениях алкил имеет 1-6 атомов углерода и в более конкретных воплощениях 1-4 атома углерода. Примеры алкила включают метил, этил, пропил, изопропил, н-бутил, изобутил, втор-бутил или трет-бутил. Особыми примерами алкила являются метил, этил, изопропил, н-бутил, втор-бутил и трет-бутил, наиболее конкретно метил и этил.
3
Термин "алкокси" означает группу формулы -O-R', где R' представляет собой алкильную группу. Примеры алкоксигруппировок включают метокси, этокси, изопропокси и трет-бутокси. Особым примером алкокси является метокси (-ОСН).
Термин "защитная группа" означает группу, которая избирательно блокирует реакционноспособный участок в многофункциональном соединении, благодаря чему химическая реакция может протекать избирательно по другому незащищенному реакционноспособному участку в том смысле, который обычно ассоциируется с этим в области химического синтеза. В соответствующий момент времени защитные группы могут быть удалены. Типичные защитные группы представляют собой амино-защитные группы, карбокси-защитные группы или гидрокси-защитные группы.
nd
Термин "амино-защитная группа" означает группы, предназначенные для защиты аминогруппы, и включает в себя бензил, бензилоксикарбонил (карбобензилокси, CBZ), Fmoc (9-флуоренилметилоксикарбонил), п-метоксибензилоксикарбонил, п-нитробензилоксикарбонил, трет-бутокси карбон ил (ВОС) и трифторацетил. Другие примеры этих групп можно найти в T.W. Greene and P.G.M. Wuts, "Protective groups in Organic Synthesis", 2 ed., John Wiley & Sons, Inc., New York, NY, 1991, chapter 7; E. Haslam "Protecting groups in Organic Chemistry", J.G.W. McOmie, Ed., Plenum Press, New York, NY, 1973, chapter 5, и T.W. Greene, "Protective groups in Organic Synthesis", John Wiley and Sons, New York, NY, 1981. Термин "защищенная аминогруппа" относится к аминогруппе, замещенной амино-защитными группами.
Термин "защитная группа для атома азота индола" означает группы, предназначенные для защиты группы NH индола. Защитные группы для атома азота индола общеизвестны в данной области техники и в значительной степени совпадают с амино-защитными группами, описанными в данной заявке. Особым, и тем не менее неограничивающим, примером защитной группы для атома азота индола является трет-бутокси карбон ил (ВОС).
nd
Термин "карбокси-защитная группа" означает группы, предназначенные для защиты карбоксигруппы, и включает в себя сложноэфирные группы и гетероциклоалкильные группы. Примеры таких сложноэфирных групп включают группы замещенных арилалкиловых эфиров, в том числе эфиров с замещенными бензилами, такими как 4-нитробензил, 4-метоксибензил, 3,4-диметоксибензил, 2,4-диметоксибензил, 2,4,6-триметоксибензил, 2,4,6-триметилбензил, пентаметилбензил, 3,4-метилендиоксибензил, бензгидрил, 4,4'-диметоксибензгидрил, 2,2',4,4'-тетраметоксибензгидрил, эфиров с алкилом или замещенным алкилом, таким как метил, этил, трет-бутил, аллил или трет-амил, трифенилметил (тритил), 4-метокситритил, 4,4'-диметокситритил, 4,4',4''-триметокситритил, 2-фенилпроп-2-ил, тиоэфиров, таких как трет-бутиловый тиоэфир, силиловых эфиров, таких как триметилсилиловый, трет-бутилдиметилсилиловый эфиры, фенацил, 2,2,2-трихлорэтил, бета-(триметилсилил)этил, бета-(ди(н-бутил)метилсилил)этил, л-толуолсульфонилэтил, 4-нитробензилсульфонилэтил, аллил, циннамил и 1-(триметилсилилметил)проп-1-ен-3-ил. Другим примером карбокси-защитных групп являются гетероциклоалкильные группы, такие как 1,3-оксазолинил. Другие примеры этих групп можно найти в T.W. Greene and P.G.M. Wuts, "Protective Groups in Organic Synthesis", 2 ed., John Wiley & Sons, Inc., New York, N.Y., 1991, chapter 5; E. Haslam "Protecting groups in Organic Synthesis", J. G. W. McOmie, Ed., Plenum Press, New York, N.Y., 1973, Chapter 5 и T.W. Greene "Protective groups in Organic Synthesis", John Wiley and Sons, New York, NY, 1981, Chapter 5. Термин "защищенная карбоксигруппа" означает группу карбокси, замещенную карбокси-защитной группой.
nd
Термин "гидрокси-защитная группа" означает группы, предназначенные для защиты группы гидрокси, включает в себя группы, образующие сложные эфиры и простые эфиры, в частности, группы тетрагидропиранилокси-, бензоил-, ацетокси-, карбамоилокси-, бензиловых и группы силиловых простых эфиров (например, TBS (трет-бутилдиметилсилил), TBDPS (трет-бутилдифенилсилил)). Другие примеры этих групп можно найти в T.W. Greene and P.G.M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis", 2 ed., John Wiley & Sons, Inc., New York, NY, 1991, chapters 2-3; E. Haslam "Protecting groups in Organic Synthesis", J. G. W. McOmie, Ed., Plenum Press, New York, NY, 1973, Chapter 5 и T.W. Greene "Protective groups in Organic Synthesis", John Wiley and Sons, New York, NY, 1981. Термин "защищенная гидрокси группа" относится к группе гидрокси, замещенной гидрокси-защитной группой.
Термин "удаление защиты" или "удаление защитной группы" означает способ, согласно которому защитную группу удаляют после завершения избирательного взаимодействия. Реагенты удаления защиты включают кислоты, основания или водород, в частности, карбонаты калия или натрия, гидроксид лития в спиртовых растворах, цинк в метаноле, уксусную кислоту, трифторуксусную кислоту, палладиевые катализаторы или трибромид бора.
Термин "реагент сочетания" относится к реагенту, который используют в пептидном синтезе для облегчения образования амидных связей. Реагенты сочетания для применения в пептидном синтезе хорошо известны в данной области техники. Некоторыми неограничивающими примерами реагентов сочетания являются 2-хлор-1-метилпиридиния иодид (реагент Мукаямы), карбодиимиды, такие как дициклогексилкарбодиимид (DCC), диизопропилкарбодиимид (DIC) и 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимид (EDC), и соли аминия/урония и фосфония, такие как О-(7-азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония гексафторфосфат (HATU), 2-(1Н-бензотриазол-1-ил)-1,1,3,3-тетраметилурония гексафторфосфат (HBTU), 2-(1Н-бензотриазол-1-ил)-1,1,3,3-тетраметиламиния тетрафторборат (TBTU), O-(1Н-6-хлорбензотриазол-1-ил)-1,1,3,3-тетраметилурония гексафторфосфат (HCTU), бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфат (РуВОР) и (7-азабензотриазол-1-илокси)трипирролидинофосфония гексафторфосфат (РуАОР). Особыми примерами реагентов сочетания являются реагент Мукаямы и HATU.
Термин "смола" относится к твердой подложке для пептидного синтеза, которая состоит из полимерной матрицы, функционализированной реакционноспособными "линкерными" группами (такими как амино- или гидроксильные группы), с которыми могут связываться пептидные цепи. Смолы для твердофазного пептидного синтеза хорошо известны в данной области техники. Неограничивающим примером подходящей полимерной матрицы является сополимер стирола и дивинилбензола, также известный как полистирол, перекрестно сшитый дивинилбензолом (DVB), сополимер стирола и дивинилбензола или стирол-DVB (100-200 меш). Неограничивающими примерами линкерных групп являются группы 2-хлор-тритилхлорид, амино и гидрокси.
Термин "активный фармацевтический ингредиент" (или "API") означает соединение или молекулу в фармацевтической композиции, обладающее(ую) конкретной биологической активностью.
Термины "фармацевтический препарат" и "фармацевтическая композиция" (или "композиция") используются взаимозаменяемо и означают смесь или раствор, содержащую(ий) терапевтически эффективное количество активного фармацевтического ингредиента вместе с фармацевтически приемлемыми эксципиентами, подлежащую(ий) введению млекопитающему, например, человеку, нуждающемуся в этом.
Термин "фармацевтически приемлемый" означает то, что полезно при изготовлении фармацевтической композиции, то есть, как правило, является безопасным, нетоксичным и не является нежелательным ни в биологическом, ни в каком-либо ином отношении, и включает в себя то, что приемлемо для ветеринарии, а также для использования в производстве фармацевтических продуктов для людей.
Термины "фармацевтически приемлемый эксципиент", "фармацевтически приемлемый носитель" и "терапевтически инертный эксципиент" можно использовать взаимозаменяемо, и они означают любой фармацевтически приемлемый ингредиент в фармацевтической композиции, не обладающий никакой терапевтической активностью и являющийся нетоксичным для субъекта при его введении, такой как разрыхлители, связующие вещества, наполнители, растворители, буферы, вещества, регулирующие тоничность, стабилизаторы, антиоксиданты, поверхностно-активные вещества, носители, разбавители или смазывающие вещества, используемые при изготовлении фармацевтических продуктов.
Термин "терапевтически эффективное количество" означает количество соединения или молекулы по настоящему изобретению, которое при введении субъекту (1) лечит или предотвращает конкретное заболевание, состояние или расстройство, (2) ослабляет, уменьшает интенсивность или устраняет один или более симптомов данного конкретного заболевания, состояния или расстройства либо (3) предотвращает или задерживает начало развития одного или более симптомов конкретного заболевания, состояния или расстройства, описанного в данной заявке. Терапевтически эффективное количество будет варьировать в зависимости от соединения, подлежащего лечению болезненного состояния, тяжести подлежащего лечению заболевания, возраста и относительного состояния здоровья субъекта, пути и формы введения, проницательности лечащего врача или ветеринара и других факторов.
Термин "подвергание лечению" или "лечение" болезненного состояния включает в себя ингибирование болезненного состояния, т.е. приостановку развития болезненного состояния или его клинических симптомов, либо облегчение болезненного состояния, т.е. вызывание временной или постоянной ремиссии болезненного состояния или его клинических симптомов.
Термин "предупреждение" или "предупреждение болезненного состояния" означает предотвращение развития клинических симптомов болезненного состояния у субъекта, который может быть подвергнут или предрасположен к данному болезненному состоянию, но все еще не испытывает или не проявляет симптомов этого болезненного состояния.
Термин "аминокислота", использованный в данном описании, означает органическую молекулу, имеющую аминогруппировку, расположенную в α-положении по отношению к карбоксильной группе. Примеры аминокислот включают: аргинин, глицин, орнитин, 2,4-диаминомасляную кислоту, лизин, гистидин, глутаминовую кислоту, аспарагиновую кислоту, изолейцин, лейцин, аланин, фенилаланин, тирозин, триптофан, метионин, серии и пролин. В каждом случае используемая аминокислота находится в L-форме.
Термин "основание" относится к любому основанию, которое соответствует представленной стадии реакции. Некоторыми особыми, и тем не менее неограничивающими, примерами оснований, которые могут быть использованы в способах по настоящему изобретению, являются диизопропилэтиламин, карбонат натрия, фосфат калия, гидроксид лития, гидроксид натрия и гидроксид калия. В случае реакций сочетания между карбоновыми кислотами и аминами предпочтительны основания типа диизопропилэтиламина. В случае гидролиза сложных эфиров карбоновых кислот предпочтительными основаниями являются гидроксиды щелочных металлов типа гидроксида лития, гидроксида натрия и гидроксида калия. В случае катализируемых переходным металлом реакций перекрестного сочетания типа реакций сочетания Сузуки-Мияуры предпочтительны основания типа карбоната натрия и фосфата калия.
Термин "гомогенный катализатор" относится к катализатору, находящемуся в том же фазовом состоянии, что и реагенты. В частности, гомогенный катализатор представляет собой катализатор, который растворяется в растворителе, в котором протекает данная реакция. Примером гомогенного катализатора является [(1,2,5,6-η)-1,5-циклооктадиен][(2S,2'S,5S,5'S)-1,1'-(1,2-фенилен)бис[2,5-диэтилфосфолан-кР]]-родия(1+) трифторметансульфонат (CAS-RN (регистрационный номер в Химической реферативной службе) 142184-30-3).
Термин "асимметричное гидрирование" относится к химической реакции, в ходе которой два атома водорода предпочтительно добавляются к одной из двух сторон молекулы ненасыщенного субстрата, такого как алкен.
Соединения по изобретению
Согласно первому аспекту настоящего изобретения предложены соединение формулы (I)
или его фармацевтически приемлемая соль,
где:
1
X представляет собой СН или N;
2
X представляет собой СН или N;
А выбран из:
1
1-6
1-6
R выбран из атома водорода, галогена, С-алкокси и С-алкила;
2
1-6
R представляет собой атом водорода или С-алкил;
3
1-6
R представляет собой С-аминоалкил;
4
1-6
1-6
R представляет собой С-аминоалкил или карбамоил-С-алкил;
5
1-6
2-6
R выбран из карбокси, карбокси-С-алкила и карбокси-С-алкенила; и
6
1-6
1-6
R выбран из атома водорода, галогена, гидрокси, С-алкокси и C-алкилсульфонила;
при условии, что указанное соединение формулы (I) не представляет собой:
*
*
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-амино-бутил)-11-(3-амино-пропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентааза-трицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-бензойную кислоту.
1
2
1
6
1
2
1
6
Следует понимать, что каждое воплощение, относящееся к конкретным X, X, R - R и А, как они описаны в данной заявке, может быть скомбинировано с любым другим воплощением, относящимся к другим X, X, R - R и А, как они описаны в данной заявке.
1
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где X представляет собой СН.
1
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где X представляет собой N.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая
соль, где А выбран из:
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где А выбран из:
при этом:
волнистая линия указывает место присоединения к остальной части соединения формулы (I);
*
5
указывает место присоединения R; и
**
6
указывает место присоединения R.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где:
А выбран из:
5
R выбран из карбокси и карбоксиметила; и
6
R представляет собой атом водорода.
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где А представляет собой фенил.
1
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R выбран из атома водорода и галогена.
1
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R выбран из атома водорода и хлора.
1
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R выбран из атома водорода, хлора, фтора, метила и метокси.
1
В особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой атом водорода.
2
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой атом водорода или метил.
2
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой атом водорода.
3
2-4
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой С-аминоалкил.
3
4
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой С-аминоалкил.
3
В особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой 4-аминобутил.
3
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R выбран из 2-аминоэтила, 3-аминопропила и 4-аминобутила.
4
1-6
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой С-аминоалкил.
4
2-3
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой С-аминоалкил.
4
3
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой С-аминоалкил.
4
В особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой 3-аминопропил.
4
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R выбран из 2-аминоэтила, 3-аминопропила и 3-амино-3-оксо-пропила.
5
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R выбран из карбокси, карбоксиметила и (Z)-2-карбоксивинила.
5
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой карбокси или карбокси метил.
5
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой карбокси.
5
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой карбоксиметил.
6
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R представляет собой атом водорода.
6
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где R выбран из атома водорода, хлора, фтора, гидрокси, метокси и метилсульфонила.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где:
1
X представляет собой СН;
2
X представляет собой СН или N;
А выбран из:
1
R представляет собой атом водорода или галогена;
2
R представляет собой атом водорода;
3
2-4
R представляет собой С-аминоалкил;
4
2-3
R представляет собой С-аминоалкил;
5
1-6
R представляет собой карбокси или карбокси-С-алкил; и
6
R представляет собой атом водорода.
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где:
1
X представляет собой СН;
2
X представляет собой СН или N;
А выбран из:
1
R представляет собой атом водорода или галогена;
2
R представляет собой атом водорода;
3
4
R представляет собой С-аминоалкил;
4
3
R представляет собой С-аминоалкил;
5
1-6
R представляет собой карбокси или карбокси-С-алкил; и
6
R представляет собой атом водорода.
В особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где:
1
X представляет собой СН;
2
X представляет собой СН или N;
А выбран из:
1
R представляет собой атом водорода или хлора;
2
R представляет собой атом водорода;
3
R представляет собой 4-аминобутил.
4
R представляет собой 3-аминопропил;
5
R представляет собой карбокси или карбоксиметил; и
6
R представляет собой атом водорода.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где:
1
X представляет собой СН или N;
2
X представляет собой СН или N;
А выбран из:
1
R выбран из атома водорода, хлора, фтора, метила и метокси;
2
R представляет собой атом водорода или метил;
3
R выбран из 2-аминоэтила, 3-аминопропила и 4-аминобутила;
4
R выбран из 2-аминоэтила, 3-аминопропила и 3-амино-3-оксо-пропила;
5
R выбран из карбокси, карбокси метила и (Z)-2-карбоксивинила; и
6
R выбран из атома водорода, хлора, фтора, гидрокси, метокси и метилсульфонила.
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, где группа
представляет собой
В предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, выбранные из:
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-амино-3-оксо-пропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-ил метил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,7,10,13,16,19-гексаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
2-хлор-4-[рац-(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,7,10,13,16,19-гексаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,7,10,13,16,19-гексаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]-2-фтор-бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-метилсульфонил-бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-амино-3,3-дифтор-бутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-16-метил-17-[(2-метил-1Н-индол-3-ил)метил]-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3,5,7,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-16-метил-17-[(2-метил-1Н-индол-3-ил)метил]-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3,5,7,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
5-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3,5,7,21,23-гексаен-22-ил]пиридин-2-карбоновой кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-16-метил-17-[(2-метил-1Н-индол-3-ил)метил]-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3,5,7,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(113,148,178)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16,25-диметил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3(8),4,6,22,24-гексаен-22-ил]-2-гидрокси-бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(2-аминоэтил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
2-метокси-4-[рац-(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,7,10,13,16,19-гексаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1 (25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
2-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]уксусной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-25-метокси-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
5-[(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]пиридин-2-карбоновой кислоты;
2-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]уксусной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(2-аминоэтил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-11-(2-аминоэтил)-14-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
2-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16,25-диметил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]уксусной кислоты;
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19,24-гексаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
2-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-16-метил-17-[(2-метил-1Н-индол-3-ил)метил]-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]уксусной кислоты;
(Е)-3-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]проп-2-еновой кислоты и
5-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]пиразоло[1,5-а]пиридин-2-карбоновой кислоты;
или их фармацевтически приемлемой соли.
В особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, выбранные из:
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-ил метил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
2-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]уксусной кислоты и
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19,24-гексаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойной кислоты;
или их фармацевтически приемлемой соли.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены фармацевтически приемлемые соли соединений формулы (I), описанных в данной заявке, в особенности гидрохлоридные соли. В другом конкретном воплощении настоящего изобретения предложены соединения формулы (I), описанные в данной заявке.
Способы получения
1
2
1
4
Соединения по настоящему изобретению могут быть получены любым традиционным образом. Подходящие способы синтеза этих соединений, а также их исходных веществ, показаны на приведенных ниже схемах и в разделе Примеры. Все заместители, в частности, X, X, R - R и А являются такими, как определено выше, если не указано иное. Кроме того и если прямо не указано иное, все реакции, реакционные условия, сокращения и символы имеют значения, хорошо известные специалисту средней квалификации в области органической химии.
1. Общий синтез связывающего соединения
Промежуточное связывающее соединение формулы (III) можно получить, следуя стандартным способам, известным в данной области техники, в частности, согласно способам, описанным в разделе Примеры.
1
2
1
В соединении (III) PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, такую как 9-флуоренилметоксикарбонил, Hal представляет собой галоген, предпочтительно Br или I, и X, X и R являются такими, как определено в данном описании.
2. Общий синтез трипептида
30
t
40
t
2
1-6
1-6
1-6
3
Трипептид формулы (IV), где R представляет собой -С-алкил-МН-COOBu; R представляет собой -С-алкил-NH-COOBu или -C-алкил-C(О)-NH-CPh, и R является таким, как определено в данном описании, можно получить, следуя стандартным методам, известным в данной области техники.
Последовательность трипептидов (IV), например, может быть синтезирована с использованием современных протоколов твердофазного пептидного синтеза, которые приведены ниже.
a) На смолу (например, 2-хлор-тритильную смолу) в качестве твердой подложки загружают первую N-защищенную аминокислоту и диизопропилэтиламин (N,N-диизопропилэтиламин или N,N-диизопропилэтиламин), затем осуществляют отщепление защитной группы.
b) Проводят реакцию сочетания второй N-защищенной аминокислоты в присутствии реагента сочетания и диизопропилэтиламина, затем осуществляют отщепление защитной группы (например, 9-флуоренилметоксикарбонила).
c) Проводят реакцию сочетания третьей N-защищенной аминокислоты в присутствии реагента сочетания и диизопропилэтиламина, затем осуществляют отщепление защитной группы.
В конкретном воплощении N-защищенные аминокислоты защищены 9-флуоренилметилоксикарбонилом.
В конкретном воплощении на смолу на стадии а) загружают 0,1-1,0 эквивалента первой аминокислоты и избыток диизопропилэтиламина в дихлорметане.
В конкретном воплощении после проведения реакции сочетания на стадии а) смолу тщательно промывают диметилформамидом (N,N-диметилформамидом) и дихлорметаном (дихлорметаном).
В конкретном воплощении 9-флуоренилметоксикарбонильную защитную группу отщепляют на стадии а), используя смесь 50% пиперидина в дихлорметане/N,N-диметилформамиде (1:1).
В конкретном воплощении после удаления защиты на стадии а) смолу тщательно промывают N,N-диметилформамидом, дихлорметаном и метанолом, после чего сушат под вакуумом и взвешивают.
В конкретном воплощении реагентом сочетания на стадии b) является 2-хлор-1-метилпиридиния иодид.
В конкретном воплощении на стадии b) проводят реакцию сочетания второй аминокислоты в присутствии 4 эквивалентов 2-хлор-1-метилпиридиния иодида в качестве реагента сочетания и 6 эквивалентов диизопропилэтиламина в смеси N,N-диметилформамид/дихлорметан (1:1).
В конкретном воплощении после проведения реакции сочетания на стадии b) смолу тщательно промывают N,N-диметилформамидом и дихлорметаном.
В конкретном воплощении 9-флуоренилметоксикарбонильную защитную группу отщепляют на стадии b), используя смесь 50% пиперидина в дихлорметане/N,N-диметилформамиде (1:1).
В конкретном воплощении после удаления защиты на стадии b) смолу тщательно промывают N,N-диметилформамидом и дихлорметаном, после чего сушат под вакуумом и взвешивают.
В конкретном воплощении реагентом сочетания на стадии с) является O-(7-азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония гексафторфосфат.
В конкретном воплощении на стадии с) проводят реакцию сочетания третьей аминокислоты в присутствии 4 эквивалентов О-(7-азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония гексафторфосфата в качестве реагента сочетания и 6 эквивалентов диизопропилэтиламина в смеси N,N-диметилформамид/дихлорметан (1:1).
В конкретном воплощении после проведения реакции сочетания на стадии с) смолу тщательно промывают N,N-диметилформамидом и дихлорметаном.
В конкретном воплощении 9-флуоренилметоксикарбонильную защитную группу отщепляют на стадии с), используя смесь 20% пиперидина в N,N-диметилформамиде.
В конкретном воплощении после удаления защиты на стадии с) смолу тщательно промывают N,N-диметилформамидом и дихлорметаном, после чего сушат под вакуумом и взвешивают.
3. Общая методика сочетания трипептида со связывающим соединением
30
t
40
t
1
2
1
2
1-6
1-6
1-6
3
Промежуточные соединения формулы (V) могут быть получены, например, исходя из соединений формулы (III) и формулы (IV) в соответствии со схемой 1. Hal представляет собой галоген, предпочтительно Br или I, R представляет собой -С-алкил-NH-COOBu; R представляет собой -С-алкил-NH-COOBu или -C-алкил-С(O)-NH-CPh, и X, X, R и R являются такими, как определено в данном описании.
Схема 1
Сочетание связывающего соединения - альдегида формулы (III) с трипептидом формулы (IV) (схема 1, стадия а) может быть осуществлено, например, путем растворения указанного связывающего соединения - альдегида формулы (III) в смеси 1-метил-2-пирролидона, триметил-ортоформиата и уксусной кислоты и добавления к данному раствору смолы, содержащей данный трипептид формулы (IV). После перемешивания смеси добавляют восстанавливающий агент, такой как цианоборгидрид натрия, получая соединение формулы (II).
На схеме 1, стадии b, защитную группу (PG) на связывающем соединении отщепляют, например, используя смесь 20% пиперидина в N,N-диметилформамиде. Смолу можно отщепить от трипептида, например, путем добавления 20%-ного гексафторизопропанола в дихлорметане и отфильтровывания. Окончательно промежуточное соединение формулы (V) получают посредством циклизации отщепленного соединения формулы (II), используя, например, O-(7-азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония гексафторфосфат и диизопропилэтиламин.
30
t
40
t
1
2
1
2
1-6
1-6
1-6
3
4. Общая методика для введения субъединицы карбоновой кислоты Соединения формулы (I) могут быть получены, например, исходя из соединений формулы (V) в соответствии со схемой 2. Hal представляет собой галоген, предпочтительно Br или I; R представляет собой -С-алкил-NH-COOBu; R представляет собой -С-алкил-NH-COOBu или -С-алкил-С(О)-NH-CPh, и А, X, X, R и R являются такими, как определено в данном описании.
Схема 2
30
t
40
t
1
2
1
2
6
5'
7
7
7
7
1-6
1-6
1-6
3
1-6
2-6
На стадии а схемы 2 галоген-содержащий макроцикл (V) приводят во взаимодействие с бороновой кислотой (VIIA) или диоксобороланом (VIIB), получая соединения формулы (VI), где R представляет собой -С-алкил-NH-COOBu; R представляет собой -С-алкил-NH-COOBu или -С-алкил-С(O)-NH-CPh; А, X, X, R, R и R являются такими, как определено в данном описании, и R выбран из R, групп -С-алкил-R и -C-алкенил-R, при этом R выбран из карбокси и группы защищенной карбоновой кислоты. Особыми, и тем не менее неограничивающими, примерами защищенных карбоновых кислот являются их алкиловые и арилалкиловые сложные эфиры, такие как метиловый эфир и трет-бутиловый эфир.
Данную реакцию проводят в присутствии подходящего палладиевого катализатора, например, тетракис(трифенилфосфин)палладия(0) или [1,1'-бис(дифенилфосфино)ферроцен]-дихлорпалладия(II), в растворителе, таком как вода, 1,4-диоксан, N,N-диметилацетамид, тетрагидрофуран, 2-метилтетрагидрофуран или их смеси, в присутствии основания, например, карбоната натрия или фосфата калия, при температурах от 20°С до 150°С, возможно в условиях облучения микроволнами.
На стадии b схемы 2 защитные группы отщепляют, используя методы и реагенты, известные в данной области техники. Например, глобальное удаление защитных групп может быть выполнено с использованием трифторуксусной кислоты в дихлорметане с последующим выпариванием растворителя и гидролизом в воде или водном растворе соляной кислоты при комнатной температуре. Согласно этой последовательности могут быть удалены, например, следующие защитные группы:
30
• трет-бутоксикарбонильная группа в R,
40
• трет-бутоксикарбонильная группа или тритильная группа в R,
• трет-бутоксикарбонильная группа при субъединице индола,
5'
• группа трет-бутилового сложного эфира при R.
5'
В конкретном воплощении, где R бор-содержащего реагента (VIIA) или (VIIB), использованного на стадии а, представляет собой группу метилового сложного эфира, сначала осуществляют гидролиз промежуточного соединения (VI), используя основание, например, гидроксид натрия, в подходящей смеси растворителей, например, вода/тетрагидрофуран или вода/этанол, при температурах от 20°С до 100°С. Эту же методику используют для отщепления трет-бутоксикарбонильной группы от атома азота индола. На второй стадии для отщепления оставшихся защитных групп используют соляную кислоту в подходящей смеси растворителей, например, вода/тетрагидрофуран, при температурах от 0°С до 50°С. Согласно этой последовательности реакций удаления защиты получают соединения формулы (I).
Соответственно, согласно одному из аспектов настоящего изобретения предложен способ получения соединений формулы (I), описанных в данной заявке, включающий:
1
2
5'
6
30
40
1
2
b) отщепление всех амино-, индол- и карбокси-защитных групп, присутствующих в соединении формулы (VI), где R, R, R, R, R, R, X и X являются такими, как определено в данном описании,
с получением указанного соединения формулы (I).
5'
7
7
7
7
1-6
2-6
В одном из воплощений способа по изобретению R выбран из R, групп CaлкилR и -С-алкенил-R, где R выбран из карбокси и группы защищенной карбоновой кислоты.
5'
7
7
7
7
1-6
2-6
В предпочтительном воплощении способа по изобретению R выбран из R, групп -С-алкил-R и -С-алкенил-R, где R выбран из карбокси и группы защищенной карбоновой кислоты, при этом указанная группа защищенной карбоновой кислоты представляет собой группу алкилового или арилалкилового сложного эфира.
5'
7
7
7
7
1-6
2-6
В особенно предпочтительном воплощении способа по изобретению R выбран из R, групп -С-алкил-R и -С-алкенил-R, где R выбран из карбокси и группы защищенной карбоновой кислоты, при этом указанная группа защищенной карбоновой кислоты представляет собой группу метилового сложного эфира или трет-бутилового сложного эфира.
В одном из воплощений способа по изобретению указанное соединение формулы (VI) получают путем:
1
2
30
40
1
2
с) приведения во взаимодействие галоген-содержащего макроцикла формулы (V), где R, R, R, R, X и X являются такими, как определено в данном описании,
с бороновой кислотой (VIIA)
5'
6
или диоксобороланом (VIIB), где R и R являются такими, как определено в данном описании.
В одном из воплощений способа по изобретению указанный галоген-содержащий макроцикл формулы (V) получают путем:
1
2
30
40
1
2
d) циклизации соединения формулы (На), где R, R, R, R, X и X являются такими, как определено в данном описании, используя реагент сочетания в присутствии основания.
В одном из воплощений способа по изобретению указанное соединение формулы (На) получают путем:
1
2
30
40
1
2
e) удаления защитной группы (PG) и отщепления смолы от соединения формулы (II), где R, R, R, R, X, X и PG являются такими, как определено в данном описании.
В одном из воплощений способа по изобретению указанное соединение формулы (II) получают путем:
1
2
1
f) восстановительного аминирования альдегида формулы (III), где X, X, R и PG являются такими, как определено в данном описании,
2
30
40
с использованием амина формулы (IV), где R, R и R являются такими, как определено в данном описании.
В особенно предпочтительном воплощении настоящего изобретения предложен способ получения соединений формулы (I), описанных в данной заявке, включающий:
1
2
1
2
30
40
1
2
30
40
1
2
a) восстановительное аминирование соединения формулы (III), где X, X, R и PG являются такими, как определено в данном описании, с использованием соединения формулы (IV), где R, R и R являются такими, как определено в данном описании, с получением соединения формулы (II), где R, R, R, R, X, X и PG являются такими, как определено в данном описании;
1
2
30
40
1
2
b) удаление защитной группы (PG) и отщепление смолы от соединения формулы (II) с получением соединения формулы (IIa), где R, R, R, R, X и X являются такими, как определено в данном описании;
1
2
30
40
1
2
c) циклизацию соединения формулы (IIa) с использованием реагента сочетания в присутствии основания с получением галоген-содержащего макроцикла формулы (V), где R, R, R, R, X и X являются такими, как определено в данном описании;
d) приведение во взаимодействие указанного галоген-содержащего макроцикла формулы (V) с бороновой кислотой (VIIA)
5'
6
или диоксобороланом (VIIB), где R и R являются такими, как определено в данном описании,
1
2
5
6
30
40
1
2
с получением соединения формулы (VI), где R, R, R, R, R, R, X и X являются такими, как определено в данном описании; и
e) отщепление всех амино-, индол- и карбокси-защитных групп, присутствующих в соединении формулы (VI), с получением указанного соединения формулы (I).
th
Отщепление защитных групп обычно осуществляют, используя методы и реагенты, известные в данной области техники (типичные защитные группы и их применение в органическом синтезе описаны, например, в Т.W. Greene and P.G.M. Wuts, "Protective groups in Organic Synthesis", 5 Ed., 2014, John Wiley & Sons, N.Y.).
В конкретном воплощении первичные или вторичные амины получают, исходя из трет-бутилкарбаматных производных, путем взаимодействия с подходящей кислотой, например, трифторуксусной кислотой или хлористым водородом, в растворителях, таких как дихлорметан, вода, 1,4-диоксан, 2-пропанол, ацетонитрил или их смеси, возможно в присутствии акцептора карбокатиона, например, триизопропилсилана или триэтилсилана. В этих условиях N-(трет-бутоксикарбонил)индолы, N-(триметилфенил)-амиды и О-трет-бутил-диметилсилиловые простые эфиры параллельно превращаются в свободные индолы, амиды и спирты, соответственно.
В конкретном воплощении карбоновые кислоты получают, исходя из их производных сложных алкиловых эфиров, посредством омыления с использованием основания, такого как гидроксид лития, гидроксид натрия или гидроксид калия, в системе растворителей, такой как вода/этанол или вода/тетрагидрофуран.
1
2
8
20
2
1-6
1-6
Соединения формулы (IXa) и (IXb), где PG представляет собой подходящую защитную группу для атома азота индола, PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, и R и R каждый независимо представляет собой С-алкил, являются важными промежуточными соединениями для процедур синтеза трипептидов, которые используются в качестве структурных единиц для процедур синтеза соединений формулы (I), где R представляет собой С-алкил (см. промежуточное соединение 4, стадию 3).
2
1-6
Соответственно, в одном из воплощений предложен способ получения соединений формулы (I), где R представляет собой С-алкил, включающий:
1
2
8
20
1-6
a) асимметричное гидрирование соединения формулы (VIII), где PG представляет собой подходящую защитную группу для атома азота индола, PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, и R и R каждый независимо представляет собой С-алкил, в присутствии гомогенного катализатора
1
2
8
20
1-6
с получением соединения формулы (IXa) или (IXb), где PG представляет собой подходящую защитную группу для атома азота индола, PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, и R и R каждый независимо представляет собой С-алкил,
2
1-6
b) далее приведение во взаимодействие указанного соединения формулы (IXa) или (IXb), описанного в данной заявке, с получением указанного соединения формулы (I), где R представляет собой С-алкил.
В одном из воплощений указанный гомогенный катализатор представляет собой [(1,2,5,6-η)-1,5-циклооктадиен][(2S,2'S,5S,5'S)-1,1'-(1,2-фенилен)бис[2,5-диэтилфосфолан-кР]]-родия(1+) трифторметансульфонат (CAS-RN 142184-30-3).
В предпочтительном воплощении после асимметричного гидрирования соединения формулы (VIII) получают соединение формулы (IXa).
Подходящие амино-защитные группы хорошо известны специалисту в данной области техники, при этом некоторые неограничивающие примеры описаны в данной заявке.
1
В одном из воплощений PG в каждом случае представляет собой ВОС (трет-бутоксикарбонил).
2
В одном из воплощений PG в каждом случае представляет собой Cbz (бензилоксикарбонил).
8
В одном из воплощений R в каждом случае представляет собой метил.
20
В одном из воплощений R в каждом случае представляет собой метил.
1
2
8
20
1-6
Согласно одному из аспектов настоящего изобретения предложен способ получения соединений формулы (IXa) или (IXb), где PG представляет собой подходящую защитную группу для атома азота индола, PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, и R и R каждый независимо представляет собой С-алкил,
включающий:
1
2
8
20
1-6
асимметричное гидрирование соединения формулы (VIII), где PG представляет собой подходящую защитную группу для атома азота индола, PG представляет собой подходящую амино-защитную группу, и R и R каждый независимо представляет собой С-алкил, в присутствии гомогенного катализатора
с получением указанного соединения формулы (IXa) или (IXb).
Фармацевтические композиции
Согласно другому аспекту изобретения предложены фармацевтические композиции или лекарственные средства, содержащие соединения по изобретению и терапевтически инертный носитель, разбавитель или фармацевтически приемлемый эксципиент, а также способы применения соединений по изобретению для приготовления таких композиций и лекарственных средств.
Композиции готовят, дозируют и вводят способом, соответствующим надлежащей медицинской практике. Факторы, рассматриваемые в этом контексте, включают конкретное подвергаемое лечению расстройство, конкретное подвергаемое лечению млекопитающее, клиническое состояние отдельного пациента, причину расстройства, место доставки агента, способ введения, схему введения и другие факторы, известные врачам.
Соединения по изобретению можно вводить любым подходящим способом, включая пероральное, местное (в том числе трансбуккальное и сублингвальное), ректальное, вагинальное, трансдермальное, парентеральное, подкожное, внутрибрюшинное, внутрилегочное, интрадермальное, интратекальное, эпидуральное и интраназальное введение, и, если необходимо для местного лечения, введение в область поражения. Парентеральные инфузии включают внутримышечное, внутривенное, интраартериальное, внутрибрюшинное или подкожное введение.
В предпочтительном воплощении предложена фармацевтическая композиция, содержащая одно или более соединений по изобретению, при этом указанная фармацевтическая композиция подходит для внутривенного введения.
Соединения по настоящему изобретению можно вводить в любой удобной для введения форме, например, в таблетках, порошках, капсулах, растворах, дисперсиях, суспензиях, сиропах, спреях, суппозиториях, гелях, эмульсиях, пластырях и так далее. Такие композиции могут содержать компоненты, традиционно используемые в фармацевтических препаратах, например, разбавители, носители, модификаторы рН, консерванты, солюбилизаторы, стабилизаторы, увлажняющие агенты, эмульгаторы, подсластители, красители, корригенты, соли для изменения осмотического давления, буферы, маскирующие агенты, антиоксиданты и другие активные агенты. Вместе с тем они также могут содержать и другие терапевтически полезные вещества.
Типичную композицию готовят путем смешивания соединения по настоящему изобретению и носителя или эксципиента. Подходящие носители и эксципиенты хорошо известны специалистам в данной области техники и подробно описаны, например, в Ansel Н.С. et al., Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems (2004), Lippincott, Williams and Wiikins, Philadelphia; Gennaro A.R, et al., Remington: The Science and Practice of Pharmacy (2000), Lippincott, Williams and Wilkins, Philadelphia; и Rowe R.C. Handbook of Pharmaceutical Excipients (2005), Pharmaceutical Press, Chicago. Композиции также могут включать в себя одно или более чем одно вещество из следующих: буферы, стабилизирующие агенты, поверхностно-активные вещества, увлажняющие агенты, смазывающие вещества, эмульгаторы, суспендирующие агенты, консерванты, антиоксиданты, придающие непрозрачность агенты, глиданты, технологические добавки, красители, подсластители, отдушки, корригенты, разбавители и другие известные вспомогательные вещества для обеспечения наилучшей презентации лекарственного средства (т.е. соединения по настоящему изобретению или фармацевтической композиции на его основе) или содействия производству фармацевтического продукта (т.е. лекарственного средства).
Дозировку, в которой могут быть введены соединения по изобретению, можно варьировать в широких пределах, и несомненно, в каждом конкретном случае она будет подобрана с учетом индивидуальных потребностей. Как правило, в случае внутривенного введения соответствующая суточная дозировка соединения общей формулы (I) должна составлять примерно 1-1000 мг на одного субъекта, хотя при необходимости верхний предел также может быть превышен.
Примером подходящей внутривенной лекарственной формы является стерильный водный раствор, содержащий от примерно 1 мг до примерно 500 мг соединения по изобретению. Такой стерильный водный раствор для внутривенного введения может быть приготовлен, например, путем растворения от 1 мг до примерно 500 мг соединения по изобретению в воде (например, примерно в 50 мл) и подведения рН до 4-8, предпочтительно примерно до 7, путем добавления водного раствора гидроксида натрия. Процедура заканчивается завершающей стерилизацией с использованием способов, известных в данной области техники.
Типичная аэрозольная композиция может быть приготовлена путем растворения соединения по изобретению, например, 10-100 мг, в подходящем буферном растворе, например, в фосфатном буфере, добавления, при желании, регулирующего тоничность вещества, например, соли, такой как хлорид натрия. Раствор можно профильтровать, например, с использованием фильтра с диаметром пор 0,2 мкм для удаления примесей и загрязняющих веществ.
Применения
Соединения формулы (I) и их фармацевтически приемлемые соли обладают полезными фармакологическими свойствами для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, видами Acinetobacter, наиболее конкретно видом Acinetobacter baumannii.
Соединения формулы (I) и их фармацевтически приемлемые соли демонстрируют активность в качестве антибиотиков, в частности, в качестве антибиотиков против видов Acinetobacter, более конкретно, в качестве антибиотиков против Acinetobacter baumannii, наиболее конкретно, в качестве патоген-специфичных антибиотиков против Acinetobacter baumannii.
Соединения формулы (I) и их фармацевтически приемлемые соли можно использовать в качестве антибиотиков, т.е. в качестве антибактериальных фармацевтических ингредиентов, подходящих для лечения и предупреждения бактериальных инфекций, в частности, для лечения и предупреждения бактериальных инфекций, вызываемых видами Acinetobacter, более конкретно, для лечения и предупреждения бактериальных инфекций, вызываемых Acinetobacter baumannii.
Соединения по настоящему изобретению можно использовать либо по отдельности, либо в комбинации с другими лекарственными средствами для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, вызываемых видами Acinetobacter, наиболее конкретно, видом Acinetobacter baumannii.
Один из аспектов настоящего изобретения относится к фармацевтическим композициям, содержащим соединения формулы (I), которые определены выше, или их фармацевтически приемлемые соли, которые определены выше, и один или более чем один фармацевтически приемлемый эксципиент.
Другой аспект настоящего изобретения относится к фармацевтическим композициям, содержащим соединения формулы (I) или их фармацевтически приемлемые соли, которые определены выше, и один или более чем один фармацевтически приемлемый эксципиент, для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, вызываемых видами Acinetobacter, наиболее конкретно, видом Acinetobacter baumannii.
Другой аспект настоящего изобретения относится к соединениям формулы (I) или их фармацевтически приемлемым солям, которые определены выше, для применения в качестве терапевтически активных веществ, особенно для применения в качестве терапевтически активных веществ для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, вызываемых видами Acinetobacter, наиболее конкретно, видом Acinetobacter baumannii.
Другой аспект настоящего изобретения относится к соединениям формулы (I) или их фармацевтически приемлемым солям, которые определены выше, для применения в лечении или предупреждении инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, вызываемых видами Acinetobacter, наиболее конкретно, видом Acinetobacter baumannii.
Другой аспект настоящего изобретения относится к способу лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, вызываемых видами Acinetobacter, наиболее конкретно, видом Acinetobacter baumannii, при этом данный способ включает введение соединений формулы (I) или их фармацевтически приемлемых солей, которые определены выше, субъекту.
Другой аспект настоящего изобретения относится к применению соединений формулы (I) или их фармацевтически приемлемых солей, которые определены выше, для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, вызываемых видами Acinetobacter, наиболее конкретно, видом Acinetobacter baumannii.
Другой аспект настоящего изобретения относится к применению соединений формулы (I) или их фармацевтически приемлемых солей, которые определены выше, для приготовления лекарственных средств для лечения или предупреждения инфекций и возникающих в результате заболеваний, в частности, бактериемии, пневмонии, менингита, инфекции мочевыводящих путей и раневой инфекции, вызываемых патогенами, в частности, бактериями, более конкретно, вызываемых видами Acinetobacter, наиболее конкретно, видом Acinetobacter baumannii. Такие лекарственные средства содержат соединения формулы (I) или их фармацевтически приемлемые соли, которые определены выше.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль для применения в лечении инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых грамотрицательными бактериями.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль для применения в лечении инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых патогенами группы ESKAPE (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и Enterobacter species & E. coli), или их комбинацией.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль для применения в лечении нозокомиальных инфекций.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль для применения в лечении инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых бактериями с множественной лекарственной устойчивостью (MDR), в частности, бактериями A. baumanniii с MDR.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль для применения в лечении инфекций и возникающих в результате заболеваний, вызываемых карбапенем-устойчивыми бактериями, в частности, карбапенем-устойчивыми A. baumannii.
Примеры
Изобретение будет более полно понято со ссылкой на следующие далее примеры. Однако их не следует истолковывать как ограничивающие объем данного изобретения.
Все соединения из примеров и промежуточные соединения получали в атмосфере азота, если не указано иное.
Использованные сокращения
Водн. означает водный; CAS-RN означает регистрационный номер в Химической реферативной службе; HPLC означает высокоэффективную жидкостную хроматографию; MPLC означает жидкостную хроматографию среднего давления; MS означает масс-спектр; насыщ. означает насыщенный.
Пример 1
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
трет-Бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1; 2,15 г; 1,97 ммоль), 4-(трет-бутоксикарбонил)фенилбороновую кислоту (CAS-RN 850568-54-6; 675 мг; 2,95 ммоль) и карбонат натрия (521 мг; 4,91 ммоль) растворяли в смеси 6:1 диоксан/вода (22 мл). Реакционную смесь барботировали аргоном в течение 2 мин, обрабатывая при этом содержимое сосуда ультразвуком в ультразвуковой ванне. Затем добавляли тетракис(трифенилфосфин)-палладий(0) (459 мг; 393 мкмоль), дегазирование продолжали в течение еще 2 мин, после чего сосуд герметично закрывали и нагревали при 120°С в условиях облучения микроволнами в течение 30 мин. После охлаждения реакционную смесь распределяли между этилацетатом и 1 М водн. раствором карбоната натрия. Объединенные органические слои промывали рассолом, сушили над сульфатом магния, фильтровали и упаривали, получая неочищенный продукт (1,95 г; светло-оранжевая пена). Вещество очищали посредством MPLC, используя С18-носитель для обращенно-фазовой хроматографии RediSep Rf Gold (в колонке на 100 г, размер частиц 20-40 мкм) в качестве неподвижной фазы и градиент от воды (с 0,05% трифторуксусной кислоты) до ацетонитрила в качестве элюента. После лиофилизации получали 2,21 г светло-желтого продукта. Это вещество растворяли в дихлорметане (22 мл) и обрабатывали при комнатной температуре трифторуксусной кислотой (22 мл; 295 ммоль), затем через 90 мин реакционную смесь упаривали в вакууме. Остаток растворяли в воде (22 мл), перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч, затем лиофилизировали. Остаток растворяли в смеси 10:1 вода/ацетонитрил и очищали препаративной HPLC, используя С18-колонку для обращенно-фазовой хроматографии (Phenomenex Gemini-NX, 5 мкм, 110A, 100×30 мм) и градиент от воды (с 0,05% трифторуксусной кислоты) до ацетонитрила в качестве элюента. После лиофилизации чистых фракций получали указанное в заголовке соединение в виде тетракис(трифторацетат)ной соли (1,65 г; 67%). Белый лиофилизированный порошок, MS: 791,7 [М+Н].
Пример 2
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентааз атрицикло[19.4.0,03,8]пентакоза-1(25), 3(8), 4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-метилсульфонил-бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат и 4-(трет-бутоксикарбонил)фенилбороновую кислоту на трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)-бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)-пропил)-20-хлор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]-пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетра-азациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат (CAS-RN 2097294-18-1) и трет-бутил-2-(метилсульфонил)-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензоат (промежуточное соединение 6), соответственно. Белый лиофилизированный порошок, MS: 903,3 [М+Н].
Соединения из приведенных далее примеров получали по аналогии с примером 2, заменяя трет-бутил-2-(метилсульфонил)-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензоат на соответствующий бор-содержащий реагент.
Пример 3
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1H-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03.8]пентакоза-1(21), 3(8), 4,6,22,24-гексаен-22-ил]-2-гидрокси-бензойная кислота
Стадия 1. трет-Бутил-3-(((7S,10S,13S)-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-17-(3-гидрокси-4-(метоксикарбонил)фенил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат
трет-Бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат (CAS-RN 2097294-18-1; 250 мг; 0,23 ммоль) растворяли в 1,4-диоксане (6 мл) и воде (1 мл), затем добавляли метил-2-гидрокси-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензоат (CAS-RN 1073371-99-9; 256 мг; 922 мкмоль) и карбонат калия (95 мг; 0,69 ммоль). Реакционную смесь барботировали аргоном в течение 2 мин, обрабатывая при этом содержимое сосуда ультразвуком в ультразвуковой ванне. Затем добавляли 1,1'-бис(дифенилфосфино)ферроцен-дихлорпалладий(II) (51,3 мг; 69,2 мкмоль) и дегазирование продолжали в течение еще 2 мин. Далее сосуд герметично закрывали и нагревали при 100°С в условиях облучения микроволнами в течение 90 мин, затем реакционную смесь распределяли между водой и этилацетатом. Органический слой сушили над сульфатом магния, фильтровали и упаривали. Неочищенный продукт очищали хроматографией (силикагель; градиент гептан-(этилацетат/метанол, 9:1)), получая указанное в заголовке соединение (160 мг; 60%) в виде белого твердого вещества.
Стадия 2: 4-((7S,10S,13S)-13-((1Н-индол-3-ил)метил)-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,819,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-17-ил)-2-гидроксибензойная кислота
К раствору трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-17-(3-гидрокси-4-(метоксикарбонил)фенил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилата (160 мг; 138 мкмоль) в тетрагидрофуране (1 мл) добавляли раствор гидроксида натрия (80 мг; 2,0 ммоль) в воде (1 мл). Реакционную смесь промывали сильной струей аргона и герметично закрывали, затем нагревали при 50°С в течение 16 ч, после этого подкисляли до рН 3 путем добавления 1 М водн. раствора соляной кислоты. Реакционную смесь экстрагировали этилацетатом, органический слой сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали. После хроматографирования (силикагель; градиент гептан-(этилацетат/метанол, 9:1)) получали указанное в заголовке соединение (30 мг; 21%) в виде белого твердого вещества.
Стадия 3: 4-[(11S,14S,17S)-14-(4-аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3(8),4,6,22,24-гексаен-22-ил]-2-гидрокси-бензойная кислота
+
Смесь 4-((7S,10S,13S)-13-((1Н-индол-3-ил)метил)-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-17-ил)-2-гидроксибензойной кислоты (30 мг; 28,8 мкмоль), 37%-ного водн. раствора соляной кислоты (500 мкл) и тетрагидрофурана (500 мкл) перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч, затем разбавляли водой (20 мл) и промывали сильной струей азота для удаления большей части тетрагидрофурана. После лиофилизации получали указанное в заголовке соединение (23 мг; 96%). Белый лиофилизированный порошок, MS: 841,3 [М+Н].
Пример 4
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Амино-3,3-дифтор-бутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21), 3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)-3,3-дифторбутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.09). Белый лиофилизированный порошок, MS: 861,4 [М+Н].
Пример 5
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-амино-3-оксо-пропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0,03,8]пентакоза-1(21), 3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-11-{2-[(трифенилметил)карбамоил]этил}-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.05). Белый лиофилизированный порошок, MS: 839,6 [М+Н].
Пример 6
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-16-метил-17-[(2-метил-1Н-индол-3-ил)метил]-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0,03,8]пентакоза-1(25), 3,5,7,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.12). Белый лиофилизированный порошок, MS: 805,5 [М+Н].
Пример 7
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-16-метил-17-[(2-метил-1Н-индол-3-ил)метил]-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0,03,8]пентакоза-1(25), 3,5,7,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.11). Белый лиофилизированный порошок, MS: 839,6 [М+Н].
Пример 7.01
2-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-16-метил-17-[(2-метил-1Н-индол-3-ил)метил]-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25), 3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]уксусная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 7, заменяя 4-(трет-бутоксикарбонил)фенилбороновую кислоту на (1-(2-(трет-бутокси)-2-оксоэтил)-2-оксо-1,2-дигидропиридин-4-ил)бороновую кислоту (промежуточное соединение 7). Белый лиофилизированный порошок, MS: 870,7 [М+Н].
Пример 8
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,7,10,13,16,19-гексаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,7,10,13,16,19-гексаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.01). Белый лиофилизированный порошок, MS: 826,3 [М+Н].
Соединения из приведенных далее примеров получали по аналогии с примером 8, заменяя 4-(трет-бутоксикарбонил)фенилбороновую кислоту на соответствующий бор-содержащий реагент.
Пример 9
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25), 3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-(((75,1 OS, 13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-фтор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.02). Белый лиофилизированный порошок, MS: 809,4 [М+Н].
Соединения из приведенных далее примеров получали по аналогии с примером 2, заменяя 4-(трет-бутоксикарбонил)фенилбороновую кислоту на соответствующий бор-содержащий реагент.
Пример 10
4-[(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16,25-диметил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25), 3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((75,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12,20-диметил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.06). Белый лиофилизированный порошок, MS: 805,4 [М+Н].
Пример 10.01
2-[4-[(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16,25-диметил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0,03,8]пентакоза-1(25), 3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]-2-оксо-1-пиридил]уксусная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 10, заменяя 4-(трет-бутоксикарбонил)фенилбороновую кислоту на (1-(2-(трет-бутокси)-2-оксоэтил)-2-оксо-1,2-дигидропиридин-4-ил)бороновую кислоту (промежуточное соединение 7). Белый лиофилизированный порошок, MS: 836,4 [М+Н].
Пример 11
4-1(11S,14S,178)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-25-метокси-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25), 3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-метокси-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.10). Белый лиофилизированный порошок, MS: 821,6 [М+Н].
Пример 12
4-1(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-Аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11,14-бис(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.03). Белый лиофилизированный порошок, MS: 811,3 [М+Н].
Пример 13
4-1(11S,14S,17S)-14-(2-Аминоэтил)-11-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25), 3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(2-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}этил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.13). Белый лиофилизированный порошок, MS: 797,5 [М+Н].
Пример 14
4-[(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-Аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19,4.0,03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11,14-бис(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-фтор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.04). Белый лиофилизированный порошок, MS: 795,3 [М+Н].
Пример 14.01
5-1(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-Аминопропил)-25-фтор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19,4.0,03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]пиридин-2-карбоноеая кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 14, заменяя 4-(трет-бутоксикарбонил)фенилбороновую кислоту на трет-бутил-5-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)пиколинат (CAS-RN 1354356-24-3). Белый лиофилизированный порошок, MS: 796,6 [М+Н].
Пример 15
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(2-аминоэтил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(2-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}этил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.07). Белый лиофилизированный порошок, MS: 811,4 [М+Н].
Пример 16
4-1(11S,14S,17S)-11-(2-Аминоэтил)-14-(3-аминопропил)-25-хлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19,4.0,03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11-(2-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}этил)-14-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.08). Белый лиофилизированный порошок, MS: 797,6 [М+Н].
Пример 17
4-1(11S,14S,17S)-11,14-бис(3-Аминопропил)-17-(1H-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11,14-бис(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.14). Белый лиофилизированный порошок, MS: 777,4 [М+Н].
Пример 18
4-1(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19,24-гексаазатрицикло[19.4,0,03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-22-ил]бензойная кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с примером 1, заменяя трет-бутил-3-(((73,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1]тиа[5,8,11,14]тетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат на трет-бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19,24-гексаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат (промежуточное соединение 1.15). Белый лиофилизированный порошок, MS: 792,7 [М+Н].
Промежуточные соединения
Общая методика для синтеза пептидных макроциклов 1. Твердофазный пептидный синтез
Последовательность трипептидов синтезировали вручную с использованием современных протоколов твердофазного пептидного синтеза (химических превращений с использованием группы Fmoc), как указано, например, в: Kates and Albericio, Eds., "Solid Phase Synthesis: A practical guide", Marcel Dekker, New York, Basel, 2000.
В качестве твердой подложки использовали 2-хлор-тритилхлоридную смолу (1,6 мэкв./г, 100-200 меш). На эту смолу загружали первую аминокислоту (0,6 эквивалента) и диизопропилэтиламин (8 эквивалентов) в безводном дихлорметане в течение ночи при комнатной температуре. После интенсивной промывки N,N-диметилформамидом и дихлорметаном проводили отщепление 9-флуоренилметоксикарбонильной защитной группы, используя смесь 50% пиперидина в дихлорметане/N,N-диметилформамиде (1:1) в N,N-диметилформамиде в течение 30 мин при комнатной температуре. После промывки N,N-диметилформамидом, дихлорметаном и метанолом смолу сушили под вакуумом при комнатной температуре в течение ночи. Загрузку смолы определяли по увеличению веса.
Проводили сочетание второй аминокислоты в присутствии 4 эквивалентов 2-хлор-1-метилпиридиния иодида в качестве реагента сочетания, 6 эквивалентов N,N-диизопропилэтиламина в смеси дихлорметан/N,N-диметилформамид (1:1) в течение ночи при комнатной температуре. Смолу интенсивно промывали N,N-диметилформамидом и дихлорметаном и степень сочетания контролировали, используя контрольное отщепление.
Отщепление 9-флуоренилметоксикарбонильной группы от дипептида проводили, используя смесь пиперидин/дихлорметан/N,N-диметилформамид (2:1:1) в течение не более 5 мин, после чего промывали N,N-диметилформамидом и дихлорметаном. Степень отщепления вновь контролировали, используя контрольное отщепление.
Проводили сочетание третьей аминокислоты, используя 4 эквивалента O-(7-азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония гексафторфосфата в качестве реагента сочетания и 6 эквивалентов диизопропилэтиламина. Полное сочетание осуществляли при комнатной температуре в течение 2-4 часов, при этом степень сочетания вновь контролировали, используя контрольное отщепление.
Отщепление 9-флуоренилметоксикарбонильной группы от трипептида проводили, обрабатывая смесью 20% пиперидина в N,N-диметилформамиде два раза по 15-20 мин при комнатной температуре, после чего промывали N,N-диметилформамидом и дихлорметаном (контрольное отщепление).
2. Восстановительное аминирование
Смолу с трипептидом промывали дихлорметаном, готовили раствор соответствующего связывающего соединения в смеси 1-метил-2-пирролидон/триметил-ортоформиат/уксусная кислота (49,7/49,7/0,6) и этот раствор добавляли к смоле. Смесь встряхивали при комнатной температуре в течение от 30 мин до 3 ч, затем добавляли 10 эквивалентов цианоборгидрида натрия и реакционную смесь встряхивали при комнатной температуре в течение ночи. Окончательно смолу промывали N,N-диметилформамидом, дихлорметаном, смесью метанол/дихлорметан (1:1) и N,N-диметилформамидом.
Отщепление 9-флуоренилметоксикарбонильной группы на связывающем соединении проводили, обрабатывая смесью 20% пиперидина в N,N-диметилформамиде два раза по 15-20 мин при комнатной температуре, после чего промывали N,N-диметилформамидом и дихлорметаном (контрольное отщепление).
3. Отщепление
Смесь для отщепления, состоящую из 20% гексафторизопропанола в дихлорметане, добавляли к смоле и эту смесь перемешивали в течение 2 ч при комнатной температуре. Смолу отфильтровывали и раствор упаривали досуха. Остаток растворяли в смеси вода/ацетонитрил и лиофилизировали.
4. Циклизация
Циклизацию полученного неочищенного линейного соединения проводили, растворяя порошок в N,N-диметилформамиде. Добавляли 1,2 эквивалента O-(7-азабензотриазол-1-ил)-N,N,N',N'-тетраметилурония гексафторфосфата и 5 эквивалентов диизопропилэтиламина и реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре. Развитие реакции регистрировали по HPLC. По завершении реакционную смесь разбавляли этилацетатом, промывали водой и рассолом, сушили над сульфатом магния, фильтровали и упаривали. Остаток хроматографировали на силикагеле с использованием градиента гептан-этилацетат в качестве элюента, получая неочищенный продукт.
5. Очистка
Неочищенный продукт очищали обращенно-фазовой высокоэффективной жидкостной хроматографией (RP-HPLC), используя колонку Phenomenex Gemini-NX, 5 мкм, 110A (100×30 мм) в качестве неподвижной фазы и градиент от воды (с 0,05% трифторуксусной кислоты) до ацетонитрила в качестве элюента. Фракции собирали и анализировали посредством LC/MS. Образцы чистого продукта объединяли и лиофилизировали. Идентификацию продукта осуществляли посредством масс-спектрометрии.
Промежуточное соединение 1
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0,0^{3,8}]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол- 1-карбоксилат
6
2
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-лизин (CAS-RN 71989-26-9) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1 -диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (промежуточное соединение 2) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1051,7 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.01
трет-Букил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиразино[2,3-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 1, заменяя 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат на 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-(3-формилпиразин-2-ил)сульфанил-фенил]метил]карбамат (промежуточное соединение 3). Беловатое твердое вещество, MS: 1084,9 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.02
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11,14-бис(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-фтор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 1, заменяя 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат на (9Н-флуорен-9-ил)метил-6-бром-3-фтор-2-((3-формилпиридин-2-ил)тио)бензилкарбамат (промежуточное соединение 2.01). Белое твердое вещество, MS: 1067,7 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.03
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11,14-бис(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
5
2
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1069,8 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.04
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11,14-бис(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-фтор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 1.03, заменяя 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат на (9Н-флуорен-9-ил)метил-6-бром-3-фтор-2-((3-формилпиридин-2-ил)тио)бензилкарбамат (промежуточное соединение 2.01). Белое твердое вещество, MS: 1053,7 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.05
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-11-{2-[(трифенилметил)карбамоил]этил}-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19,4.0,0^{3,8}]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
6
2
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-лизин (CAS-RN 71989-26-9) в качестве второй аминокислоты, N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-(трифенилметил)-L-глутамин (CAS-RN 132327-80-1) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1239,9 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.06
трет-Бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)бутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-12,20-диметил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазациклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 1, заменяя 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат на 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]-3-метил-фенил]метил]карбамат (промежуточное соединение 2.02). Белое твердое вещество, MS: 1063,6 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.07
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(2-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}этил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19,4.0,0^{3,8}]пентакоза-1(21), 3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
6
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-лизин (CAS-RN 71989-26-9) в качестве второй аминокислоты, (S)-4-[[(1,1-диметилэтокси)карбонил]амино]-2-[[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]амино]-бутановую кислоту (CAS-RN 125238-99-5) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1069,8 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.08
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11-(2-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}этил)-14-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве второй аминокислоты, (S)-4-[[(1,1-диметилэтокси)карбонил]амино]-2-[[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]амино]-бутановую кислоту (CAS-RN 125238-99-5) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1055,8 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.09
трет-Бутил-3-(((7S,10S,13S)-17-бром-10-(4-((трет-бутоксикарбонил)амино)-3,3-дифторбутил)-7-(3-((трет-бутоксикарбонил)амино)пропил)-20-хлор-12-метил-8,11,14-триоксо-5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16-додекагидробензо[b]пиридо[3,2-р][1,5,8,11,14]тиатетраазаи,иклогептадецин-13-ил)метил)-1Н-индол-1-карбоксилат
5
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, (2S)-6-(трет-бутоксикарбониламино)-2-(9Н-флуорен-9-илметоксикарбониламино)-5,5-дифтор-гексановую кислоту (промежуточное соединение 5) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1119,1 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.10
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-метокси-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19,4.0,0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 1, заменяя 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат на 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]-3-метокси-фенил]метил]карбамат (промежуточное соединение 2.03). Беловатое твердое вещество, MS: 1079,8 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.11
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19,4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21), 3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат
6
2
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя (2S)-2-[9Н-флуорен-9-илметоксикарбонил(метил)амино]-3-[2-метил-1-[(2-метилпропан-2-ил)оксикарбонил]индол-3-ил]пропановую кислоту (промежуточное соединение 4) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-лизин (CAS-RN 71989-26-9) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1097,5 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.12
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0,0^{3,8}]пентакоза-1(21), 3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат
6
2
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя (2S)-2-[9Н-флуорен-9-илметоксикарбонил(метил)амино]-3-[2-метил-1-[(2-метилпропан-2-ил)оксикарбонил]индол-3-ил]пропановую кислоту (промежуточное соединение 4) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-лизин (CAS-RN 71989-26-9) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (промежуточное соединение 2) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1063,7 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.13
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(2-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}этил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-25-хлор-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, (S)-4-[[(1,1-диметилэтокси)карбонил]амино]-2-[[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]амино]-бутановую кислоту (CAS-RN 125238-99-5) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1056,0 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.14
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-11,14-бис(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.0^{3,8}]пентакоза-1(21), 3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
5
2
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]карбамат (CAS-RN 2097290-48-5) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1035,5 [М+Н].
Промежуточное соединение 1.15
трет-Бутил-3-{[(11S,14S,17S)-22-бром-14-(4-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}бутил)-11-(3-{[(трет-бутокси)карбонил]амино}пропил)-16-метил-12,15,18-триоксо-2-тиа-4,10,13,16,19,24-гексаазатрицикло[19.4,0,0^{3,8}]пентакоза-1(21),3,5,7,22,24-гексаен-17-ил]метил}-1Н-индол-1-карбоксилат
6
2
5
2
+
Указанное в заголовке соединение получали согласно общей методике синтеза пептидных макроциклов, используя 1-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-N-метил-L-триптофан (CAS-RN 197632-75-0) в качестве первой аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-лизин (CAS-RN 71989-26-9) в качестве второй аминокислоты, N-[(1,1-диметилэтокси)карбонил]-N-[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил]-L-орнитин (CAS-RN 109425-55-0) в качестве третьей аминокислоты и 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[3-бром-5-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]-4-пиридил]метил]карбамат (промежуточное соединение 2.04) в качестве связывающего соединения. Белое твердое вещество, MS: 1050,8 [М+Н].
Промежуточное соединение 2
9Н-Флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]метил]-карбамат
Стадия 1: метил-2-(3-бром-2-формил-фенил)сульфанилпиридин-3-карбоксилат
+
К перемешиваемому раствору 2-бром-6-фторбензальдегида (37,0 г; 182 ммоль) в N,N-диметилформамиде (370 мл) добавляли mpem-бутилат калия (40,9 г; 365 ммоль) и реакционную массу перемешивали при 25°С в течение 30 мин. Затем добавляли 2-меркаптоникотиновую кислоту (CAS-RN38521-46-9; 31,1 г; 200 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 4 ч. После охлаждения до комнатной температуры добавляли карбонат калия (75,5 г; 547 ммоль), затем добавляли подметан (77,6 г; 547 ммоль), далее через 16 ч проводили распределение реакционной смеси между этилацетатом и водой. Отделенный органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали при пониженном давлении. После хроматографии (силикагель; гексан/дихлорметан, 85:15) получали указанное в заголовке соединение (27,5 г; 43%). Желтое твердое вещество, MS: 351,9 [М+Н].
Стадия 2: этил-2-[3-бром-2-[(Е)-трет-бутилсульФинилиминометил]фенил]сульфанилпиридин-3-карбоксилат
К перемешиваемому раствору метил-2-(3-бром-2-формил-фенил)сульфанилпиридин-3-карбоксилата (27,0 г; 76,7 ммоль) в тетрагидрофуране (270 мл) добавляли 2-метил-2-пропансульфинамид (CAS-RN 146374-27-8; 9,29 г; 76,7 ммоль), этилат титана (73,9 г; 384 ммоль) и реакционную смесь нагревали при 70°С в течение 4 ч. После охлаждения реакционную смесь обрабатывали рассолом, затем нерастворенное вещество удаляли фильтрованием через диатомовую землю. Фильтрат экстрагировали этилацетатом, отделенный органический слой промывали водой, сушили над сульфатом натрия и упаривали при пониженном давлении, получая указанное в заголовке соединение (28,5 г; 79%) в виде желтого смолообразного вещества.
Стадия 3: N-[[2-бром-6-[[3-(гидроксиметил)-2-пиридил]сульфанил]фенил]метил]-2-метил-пропан-2-сульфинамид
К перемешиваемому раствору этил-2-[3-бром-2-[(Е)-трет-бутилсульфинилиминометил]фенил]сульфанилпиридин-3-карбоксилата (28,4 г; 60,5 ммоль) в тетрагидрофуране (284 мл) добавляли раствор алюмогидрида лития (2,5 М в тетрагидрофуране; 48,4 мл; 121 ммоль) при -40°С и реакционную смесь перемешивали при -40°С в течение 2 ч, затем избыток реагента разрушали, добавляя насыщ. водн. раствор сульфата натрия. Реакционную смесь экстрагировали этилацетатом, органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали, получая указанное в заголовке соединение (22,6 г; 87%) в виде желтого полутвердого вещества.
Стадия 4: [2-[2-(аминометил)-3-бром-фенил]сульфанил-3-пиридил]метанола гидрохлорид
К перемешиваемому раствору N-[[2-бром-6-[[3-(гидроксиметил)-2-пиридил]сульфанил]фенил]метил]-2-метил-пропан-2-сульфинамида (58,0 г; 135 ммоль) в тетрагидрофуране (550 мл) и метаноле (10 мл) добавляли раствор хлористого водорода (4 M в 1,4-диоксане; 67,5 мл; 270 ммоль) при комнатной температуре, затем через 2 ч реакционную смесь концентрировали, получая указанное в заголовке соединение (46,1 г; 94%) в виде беловатого твердого вещества.
Стадия 5: 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[[3-(гидроксиметил)-2-пиридил]сульфанил]фенил]метил1карбамат
К перемешиваемой суспензии [2-[2-(аминометил)-3-бром-фенил]сульфанил-3-пиридил]метанола гидрохлорида (46 г; 127 ммоль) в 5%-ном водн. растворе гидрокарбоната натрия (150 мл) добавляли сложный эфир на основе (флуоренилметоксикарбонил)гидроксисукцинимида (CAS-RN 82911-69-1; 51,5 г; 153 ммоль) в 1,4-диоксане (25 мл) при комнатной температуре, затем через 15 ч проводили распределение реакционной смеси между водой и смесью 9:1 дихлорметан/метанол. Органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали. После хроматографии (силикагель; дихлорметан/этилацетат, 19:1) получали указанное в заголовке соединение (34,3 г; выход 49%) в виде беловатого твердого вещества.
Стадия 6: 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[(3-формил-2-пиридил)сульфанил]фенил]-метил]карбамат
+
К раствору 9Н-флуорен-9-илметил-N-[[2-бром-6-[[3-(гидроксиметил)-2-пиридил]сульфанил]фенил]метил]карбамата (16,0 г; 29,2 ммоль) в дихлорметане (160 мл) добавляли 1,1,1-трис(ацетилокси)-1,1-дигидро-1,2-бензиодоксол-3(1Н)-он (CAS-RN 87413-09-0; 18,6 г; 43,8 ммоль) при 0°С, затем реакционную смесь оставляли нагреваться до комнатной температуры в течение 1 ч. Проводили распределение реакционной смеси между насыщ. водн. раствором гидрокарбоната натрия и дихлорметаном. Органический слой промывали водой и рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали. После хроматографии (силикагель; дихлорметан/этилацетат, 19:1) получали указанное в заголовке соединение (11,9 г; выход 68%). Беловатое твердое вещество, MS: 545,2 [М+Н].
Следующие далее промежуточные соединения получали по аналогии с промежуточным соединением 2, заменяя 2-бром-6-фторбензальдегид на соответствующий альдегид.
Промежуточное соединение 3
9Н- Флуорен- 9-илметил-N-[[6-бром-3-хлор-2-(3-формилпиразин-2-ил)сульфанил-фенил]метил]карбамат
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 2, заменяя 2-бром-6-фторбензальдегид на стадии 1 на 6-бром-3-хлор-2-фторбензальдегид и 2-меркаптоникотиновую кислоту на стадии 1 на 3,4-дигидро-3-тиоксо-2-пиразинкарбоновую кислоту (CAS-RN 36931-81-4). Белое твердое вещество, MS: 580,0 [М+Н].
Промежуточное соединение 4
(2S)-2-[9Н-Флуорен-9-илметоксикарбонил(метил)амино]-3-[2-метил-1-[(2-метилпропан-2-ил)оксикарбонил]индол-3-ил]пропановая кислота
Стадия 1: трет-бутил-3-[(1Z)-2-{[(бензилокси)карбонил]амино}-3-метокси-3-оксопроп-1-ен-1-ил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат
+
К перемешиваемому раствору триметилового сложного эфира (±)-бензилоксикарбонил-альфа-фосфоноглицина (CAS-RN 88568-95-0; 28,7 г; 86,9 ммоль) в дихлорметане (250 мл) добавляли 1,8-диазабицикло[5.4.0]ундец-7-ен (13,2 г; 86,7 ммоль) при комнатной температуре. Через 10 мин добавляли раствор трет-бутил-3-формил-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилата (CAS-RN 885524-92-5; 15,0 г; 57,9 ммоль) в дихлорметане (50 мл), затем через 16 ч реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении. Остаток распределяли между этилацетатом и насыщ. водн. раствором гидрокарбоната натрия, органический слой промывали водой и рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали. После хроматографии (силикагель; градиент гексан/этил ацетат) получали указанное в заголовке соединение (22 г; 81%). Беловатое твердое вещество, MS: 465,2 [М+Н].
Стадия 2: трет-бутил-3-[(2S)-2-(бензилоксикарбониламино)-3-метокси-3-оксо-пропил]-2-метил-индол-1-карбоксилат
-1
+
2
В защитном боксе, оснащенном перчатками (меньше 2 млн O), объединяли трет-бутил-3-[(1Z)-2-{[(бензилокси)карбонил]амино}-3-метокси-3-оксопроп-1-ен-1-ил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат (10,5 г; 22 ммоль), [(1,2,5,6-η)-1,5-циклооктадиен][(2S,2'S,5S,5'S)-1,1'-(1,2-фенилен)бис[2,5-диэтилфосфолан-кР]]-родия(1+) трифторметансульфонат (CAS-RN 142184-30-3; 107 мг; 0,148 ммоль) и метанол (100 мл) в стальном автоклаве. Оранжево-желтый раствор трижды продували сильной струей водорода (18 бар (1,8 МПа)), затем перемешивали при 30°С в течение 24 ч в атмосфере водорода (50 бар (5 МПа)), после чего реакционную смесь концентрировали под вакуумом. Остаток растворяли в этилацетате (100 мл) и обрабатывали активированным углем (1,5 г), перемешивали в течение 1 ч, затем фильтровали через набивку силикагеля. После выпаривания растворителя получали указанное в заголовке соединение (10,5 г; 100%; энантиомерное соотношение 97,1: 2,9). Светло-желтое вязкое масло, MS: 467,2 [М+Н].
Стадия 3: трет-бутил-3-[(2S)-2-амино-3-метокси-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат
+
К дегазированному раствору трет-бутил-3-[(2S)-2-{[(бензилокси)карбонил]амино}-3-метокси-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилата (18,3 г; 39,2 ммоль) в метаноле (200 мл) добавляли палладий (10%-ный на активированном угле; 3,5 г) при 25°С и реакционную смесь перемешивали в атмосфере водорода (1 бар (100 кПа)) в течение 6 ч, затем фильтровали через диатомовую землю. Фильтрат упаривали, получая указанное в заголовке соединение (12,5 г; 95%). Бесцветное вязкое масло, MS: 333,2 [М+Н].
Стадия 4: трет-бутил-3-[(2S)-3-метокси-2-[(2-нитробензол)сульфонамидо]-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат
+
К раствору трет-бутил-3-[(2S)-2-амино-3-метокси-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилата (13,0 г; 39,1 ммоль) в смеси насыщ. водн. раствора бикарбоната натрия (300 мл) и диоксана (300 мл) добавляли 2-нитробензолсульфонилхлорид (10,4 г; 46,9 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 25°С в течение 16 ч. По завершении реакции рН водного раствора подводили до 7,0, используя 0,5 М водн. раствор соляной кислоты, и экстрагировали этилацетатом. Органический слой промывали водой и рассолом, сушили над сульфатом натрия и концентрировали при пониженном давлении. После хроматографии (силикагель; градиент гексан/этилацетат) получали указанное в заголовке соединение (17,5 г; 86%). Желтое вязкое твердое вещество, MS: 518,4 [М+Н].
Стадия 5: трет-бутил-3-[(2S)-3-метокси-2-[N-метил(2-нитробензол)сульфонамидо]-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат
+
К перемешиваемой смеси трет-бутил-3-[(2S)-3-метокси-2-[(2-нитробензол)сульфонамидо]-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилата (17,5 г; 33,8 ммоль) и карбоната калия (16,4 г; 118 ммоль) в N,N-диметилформамиде (150 мл) добавляли метилиодид (24,0 г; 169 ммоль) и перемешивали при 25°С в течение 16 ч. По завершении реакции смесь выливали в холодную воду и полученное твердое вещество отфильтровывали, повторно промывали водой, затем гексанами и окончательно сушили под высоким вакуумом, получая указанное в заголовке соединение (15 г; 83%). Бледно-желтое твердое вещество, MS: 532,2 [М+Н].
Стадия 6: трет-бутил-3-[(2S)-3-метокси-2-(метиламино)-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилат
+
К раствору трет-бутил-3-[(2S)-3-метокси-2-[N-метил(2-нитробензол)сульфонамидо]-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилата (14,0 г; 26,3 ммоль) в N,N-диметилформамиде (140 мл) добавляли тиофенол (3,48 г; 31,6 ммоль) и карбонат калия (11,0 г; 79,0 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч, затем распределяли между водой и этилацетатом. Органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали. После хроматографии (силикагель; гексан/этилацетат, 1:3) получали указанное в заголовке соединение (7,3 г; 80%). Бесцветная жидкость, MS: 346,7 [М+Н].
Стадия 7: (2S)-3-{1-[(трет-бутокси)карбонил]-2-метил-1Н-индол-3-ил)-2-(метиламино)пропановая кислота
+
К раствору трет-бутил-3-[(2S)-3-метокси-2-(метиламино)-3-оксопропил]-2-метил-1Н-индол-1-карбоксилата (14,2 г; 41,0 ммоль) в тетрагидрофуране (270 мг) и воде (90 мл) добавляли гидроксида лития моногидрат (2,0 г; 48,8 ммоль) и перемешивали при 25°С в течение 16 ч. По завершении реакции растворитель выпаривали при пониженном давлении и рН водного раствора подводили до 3,0, используя 0,5 М водн. раствор соляной кислоты. Осадок собирали фильтрованием, промывали водой и гексаном и сушили, получая указанное в заголовке соединение (13,5 г; 99%). Белое твердое вещество, MS: 248,2 [М+Н].
Стадия 8: (2S)-3-{1-[(трет-бутокси)карбонил]-2-метил-1Н-индол-3-ил}-2-{[(9Н-флуорен-9-илметокси)карбонил](метил)амино}пропановая кислота
+
К раствору (2S)-3-{1-[(трет-бутокси)карбонил]-2-метил-1Н-индол-3-ил}-2-(метиламино)пропановой кислоты (13,5 г; 40,6 ммоль) в 5%-ном водн. растворе гидрокарбоната натрия (200 мл) добавляли раствор N-(9-флуоренилметилоксикарбонил)оксисукцинимида (CAS-RN для Fmoc-OSu CAS 82911-69-1; 16,5 г; 48,7 ммоль) в ацетонитриле (200 мл) при 0°С. Реакционную смесь перемешивали при 25°С в течение 16 ч, затем органический растворитель выпаривали при пониженном давлении. Водную часть нейтрализовали, используя 0,5 М водн. раствор соляной кислоты, и экстрагировали этилацетатом. Органический слой сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали. После хроматографии (силикагель; градиент гексан/этилацетат) получали указанное в заголовке соединение (13,5 г; 60%). Белое твердое вещество, MS: 555,4 [М+Н].
Промежуточное соединение 5
(2S)-6-(трет-Бутоксикарбониламино)-2-(9Н-флуорен-9-илметоксикарбониламино)-5,5-дифтор-гексановая кислота
Стадия 1: (S)-метил-6-азидо-2-(((бензилокси)карбонил)амино)-5,5-дифторгексаноат
2
+
К раствору (S)-метил-2-(((бензилокси)карбонил)амино)-5,5-дифтор-6-(((трифторметил)сульфонил)окси)гексаноата (CAS-RN 667464-89-3; 1,39 г; 3,00 ммоль) в N,N-диметилформамиде (15 мл) в виде одной порции при комнатной температуре добавляли азид натрия (585 мг; 9,00 ммоль). Раствор перемешивали при 30°С в течение 20 ч, затем распределяли между водой и этилацетатом. Органический слой сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали. После хроматографии (градиент гептан/этилацетат) получали указанное в заголовке соединение (650 мг; 61%), MS: 329 [M-N+H].
Стадия 2: (S)-метил-6-амино-2-(((бензилокси)карбонил)амино)-5,5-дифторгексаноат
+
К раствору (S)-метил-6-азидо-2-(((бензилокси)карбонил)амино)-5,5-дифторгексаноата (1,30 г; 3,65 ммоль) в тетрагидрофуране (10,5 мл) добавляли воду (10,5 мл) и трифенилфосфин (1,24 г; 4,74 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи, затем распределяли между водой и этилацетатом. Органический слой сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали, получая указанное в заголовке соединение (1,21 г; 100%), MS: 331 [М+Н].
Стадия 3: (S)-метил-2-(((бензилокси)карбонил)амино)-6-((трет-бутоксикарбонил)амино)-5,5-дифторгексаноат
К раствору (S)-метил-6-амино-2-(((бензилокси)карбонил)амино)-5,5-дифторгексаноата (991 мг; 3,0 ммоль) в тетрагидрофуране (5 мл) и воде (5 мл) добавляли карбонат натрия (191 мг; 1,8 ммоль) и ди-трет-бутилдикарбонат (720 мг; 3,3 ммоль) при комнатной температуре, затем через 2 ч реакционную смесь распределяли между насыщ. водн. раствором гидрокарбоната натрия и этилацетатом. Органический слой сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали. После хроматографии (силикагель; градиент гептан/этилацетат) получали указанное в заголовке соединение (1,10 г; 85%).
Стадия 4: (S)-метил-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-6-((трет-бутоксикарбонил)амино)-5,5-дифторгексаноат
2
+
К раствору (S)-метил-2-(((бензилокси)карбонил)амино)-6-((трет-бутоксикарбонил)амино)-5,5-дифторгексаноата (1,20 г; 2,79 ммоль) в тетрагидрофуране (20 мл) добавляли палладий (10%-ный на активированном угле; 0,40 г; 2,8 ммоль) и реакционную смесь перемешивали в атмосфере водорода (1 бар (100 кПа)) в течение 4 ч при комнатной температуре, затем нерастворенное вещество удаляли фильтрованием. Фильтрат концентрировали и остаток растворяли в тетрагидрофуране (10 мл) и воде (10 мл) и обрабатывали карбонатом натрия (295 мг; 2,79 ммоль) и 9-флуоренилметилхлорформиатом (938 мг; 3,62 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 5 ч, затем экстрагировали смесью 1:1 петролейный эфир/этил ацетат (РЕ/ЕА). Органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали. Эту смесь экстрагировали смесью 2/1 РЕ/ЕА и промывали рассолом. После хроматографии (силикагель; градиент гептан/этилацетат) получали указанное в заголовке соединение (1,00 г; 69%), MS: 419 [М-изобутен-CO+Н].
Стадия 5: (2S)-6-(трет-бутоксикарбониламино)-2-(9Н-флуорен-9-илметоксикарбониламино)-5,5-дифтор-гексановая кислота
+
К раствору (S)-метил-2-((((9Н-флуорен-9-ил)метокси)карбонил)амино)-6-((трет-бутоксикарбонил)амино)-5,5-дифторгексаноата (1,00 г; 1,93 ммоль) в тетрагидрофуране (2 мл) добавляли 1 М раствор хлорида кальция (1 M в смеси 6:5 2-пропанол/вода; 22 мл; 22 ммоль) и раствор гидроксида натрия (193 мг; 4,82 ммоль) в воде (2 мл). Реакционную смесь перемешивали при 32°С в течение 3 ч, затем подкисляли до рН 5, используя 1 М водн. раствор соляной кислоты, и экстрагировали этилацетатом. Органический слой сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали, получая указанное в заголовке соединение (800 мг; 82%), MS: 505 [М+Н].
Промежуточное соединение 6
трет-Бутил-2-(метилсульфонил)-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензоат
Стадия 1: трет-бутил-4-бром-2-(метилсульфонил)бензоат
+
К суспензии 4-бром-2-(метилсульфонил)бензойной кислоты (CAS-RN 142994-02-3; 0,89 г; 3,19 ммоль) в безводном толуоле (2 мл) добавляли N,N-диметилформамида ди-трет-бутилацеталь (4,68 г; 20,7 ммоль) и смесь нагревали до 80°С в течение 2 ч, затем реакционную смесь распределяли между этилацетатом и насыщ. водн. раствором гидрокарбоната натрия. Органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом натрия, фильтровали и концентрировали в вакууме. После хроматографии (силикагель; градиент гептан/этилацетат) получали указанное в заголовке соединение (698 мг; 65%). Светло-желтое твердое вещество, MS: 280,9 [М+Н-изобутен].
Стадия 2: трет-бутил-2-(метилсульфонил)-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензоат
Светло-желтую суспензию трет-бутил-4-бром-2-(метилсульфонил)бензоата (0,698 г; 2,08 ммоль), ацетата калия (715 мг; 7,29 ммоль) и бис(пинаколато)дибора (701 мг; 2,71 ммоль) в диметилсульфоксиде (5,95 мл) в сосуде для работы под давлением барботировали аргоном в течение 5 минут, обрабатывая при этом содержимое сосуда ультразвуком в ультразвуковой ванне. Затем добавляли [1,1'-бис(дифенилфосфино)ферроцен]дихлорпалладий(II) (76,2 мг; 104 мкмоль), дегазирование продолжали в течение 3 минут, сосуд герметично закрывали и реакционную смесь нагревали до 80°С в течение 3 часов. После охлаждения нерастворенное вещество удаляли фильтрованием и реакционную смесь распределяли между этилацетатом и рассолом. Органический слой сушили над сульфатом натрия, фильтровали и упаривали. После хроматографии (силикагель; градиент гептан/этилацетат) получали указанное в заголовке соединение в виде белого твердого вещества (602 мг; 76%).
Промежуточное соединение 6.01
трет-Бутил-2-метокси-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензоат
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 6 из 4-бром-2-метоксибензойной кислоты (CAS-RN 72135-36-5).
Промежуточное соединение 7
[1-(2-трет-Бутокси-2-оксо-этил)-2-оксо-4-пиридил]бороновая кислота
+
Суспензию трет-бутил-2-(4-бром-2-оксопиридин-1(2Н)-ил)ацетата (CAS-RN 1630192-25-4; 1,28 г; 4,44 ммоль), бис(пинаколато)дибора (1,69 г; 6,66 ммоль) и ацетата калия (1,31 г; 13,3 ммоль) в 1,4-диоксане (20 мл) вакуумировали и продували аргоном в течение 5 мин, затем добавляли [1,1'-бис(дифенилфосфино)ферроцен]-дихлорпалладий(II) (325 мг; 444 мкмоль). После продувания аргоном в течение еще 2 мин реакционный сосуд герметично закрывали и нагревали при 100°С в течение 16 ч. Затем смесь охлаждали до комнатной температуры, фильтровали через диатомовую землю. Фильтрат распределяли между этилацетатом и водой, органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом магния, фильтровали и упаривали. Неочищенное вещество очищали обращенно-фазовой препаративной HPLC с использованием градиента от воды (с 0,05% трифторуксусной кислоты) до ацетонитрила в качестве элюента, получая указанное в заголовке соединение (937 мг; 83%). Белое твердое вещество, MS: 254,2 [М+Н].
Промежуточное соединение 8
[2-[(2-Метилпропан-2-ил)оксикарбонил]пиразоло[1,5-а]пиридин-5-ил]бороновая кислота
Стадия 1: трет-бутил-5-бромпиразоло[1,5-а]пиридин-2-карбоксилат
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 6, со стадии 1, из 5-бромпиразоло[1,5-а]пиридин-2-карбоновой кислоты (CAS-RN 1363381-10-5). Белое твердое вещество, MS: 297,0 [М+Н].
Стадия 2: [2-[(2-метилпропан-2-ил)оксикарбонил]пиразоло[1,5-а]пиридин-5-ил]бороновая кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 7, заменяя 4-бром-2-(метилсульфонил)бензойную кислоту на трет-бутил-5-бромпиразоло[1,5-а]пиридин-2-карбоксилат. Белое твердое вещество, MS: 207,2 [N-изобутен+Н].
Промежуточное соединение 9
(Е)-(1-(3-(трет-Бутокси)-3-оксопроп-1-ен-1-ил)-2-оксо-1,2-дигидропиридин-4-ил)бороновая кислота
Стадия 1: трет-бутил-(Е)-3-(4-бром-2-оксопиридин-1 (2Н)-ил)акрилат

+
Карбонат калия (477 мг; 3,45 ммоль) добавляли к суспензии 4-бромпиридин-2(1Н)-она (CAS-RN 13466-38-1; 300 мг; 1,72 ммоль) и mpem-бутил-3-бромпропаноата (433 мг; 2,07 ммоль) в N,N-диметилформамиде (10 мл) и смесь перемешивали в течение 30 мин при 60°С. Затем реакционную смесь распределяли между водой и этилацетатом. Органический слой промывали рассолом, сушили над сульфатом магния, фильтровали и концентрировали. Остаток очищали препаративной HPLC с использованием С18-колонки RediSep Gold в качестве неподвижной фазы и градиента от воды (с 0,05% трифторуксусной кислоты) до ацетонитрила в качестве элюента, получая указанное в заголовке соединение (320 мг; 62%). Белое твердое вещество, MS: 300,0 [М+Н].
Стадия 2: (Е)-(1-(3-(трет-бутокси)-3-оксопроп-1-ен-1-ил)-2-оксо-1,2-дигидропиридин-4-ил)бороновая кислота
+
Указанное в заголовке соединение получали по аналогии с промежуточным соединением 7, заменяя трет-бутил-2-(4-бром-2-оксопиридин-1(2Н)-ил)ацетат на трет-бутил-(Е)-3-(4-бром-2-оксопиридин-1(2Н)-ил)акрилат. Беловатое твердое вещество, MS: 266,3 [М+Н].
Изобретение будет более полно понято со ссылкой на следующие далее примеры. Однако их не следует истолковывать как ограничивающие объем данного изобретения.
Пример 19
50
Тестирование чувствительности к антимикробным средствам: определение концентрации, вызывающей ингибирование роста на 50% (IC)
Антимикробную активность соединений in vitro определяли альтернативным методом в соответствии с приведенной далее методикой.
В данном анализе использовали бульонную питательную среду IsoSensitest для количественного измерения активности соединений in vitro по 10 точкам против A. baumannii АТСС (Американская коллекция типовых культур) 17978.
5
Готовили двукратные серийные разведения концентрированных растворов соединений в диметилсульфоксиде (DMSO) (например, в диапазоне для конечной концентрации от 50 до 0,097 мкМ или от 10 до 0,020 мкМ) в 384-луночных микротитрационных планшетах и инокулировали 49 мкл бактериальной суспензии в среде IsoSensitest, чтобы получить конечную концентрацию клеток приблизительно 5×10 колонне образующих единиц (КОЕ)/мл в конечном объеме/лунка, равном 50 мкп/лунка. Микротитрационные планшеты инкубировали при 35±2°С.
Рост бактериальных клеток определяли, измеряя оптическую плотность при λ=600 нм каждые 20 минут в динамике в течение 16 ч.
50
90
Ингибирование роста рассчитывали в логарифмической фазе роста бактериальных клеток, определяя концентрацию, вызывающую ингибирование роста на 50% (IC) и 90% (IC).
50
В Таблице 1 приведены значения концентрации соединений по настоящему изобретению, вызывающей ингибирование роста на 50% (IC), полученные против штамма A. baumannii АТСС 17978, в микромолях на один литр.
50
Особые соединения по настоящему изобретению демонстрируют IC (в отношении АТСС 17978)≤10 мкмоль/л.
50
Заслуживающие более особого внимания соединения по настоящему изобретению демонстрируют IC (в отношении АТСС 17978)≤1 мкмоль/л.
50
Заслуживающие наиболее особого внимания соединения по настоящему изобретению демонстрируют IC (в отношении АТСС 17978)≤0,5 мкмоль/л.
Пример 20
Скрининговый анализ осаждения плазмы крови
Принцип
Аликвоту (10 мкл) соединения, солюбилизированного в физиологическом буфере, или композиции, используемой для парентерального введения ее in vivo, и в различных их разведениях в забуференном фосфатом физиологическом растворе (PBS), смешивают 1:1 с плазмой крови крыс. Через 10 минут инкубирования при комнатной температуре измеряют поглощение для смесей в ультрафиолетовой (УФ) области и сравнивают с поглощением для контрольной плазмы крови или плазмы крови с раствором разбавителя. Значительное (часто зависящее от концентрации) увеличение значения поглощения указывает на выпадение в осадок.
Материалы и методы
Цельную кровь получают от крыс WISTAR (Hanbrl:Wist, беспатогенных (SPF)) под терминальной анестезией после внутрибрюшинной инъекции раствора пентобарбитала (от животных, подвергнутых эвтаназии с целью сбора ткани для других экспериментальных целей). Кровь собирают в пробирки емкостью 1,2 мл с гепарином S-Monovette (Sarstedt) для приготовления гепаринизированной плазмы.
Затем пробирки центрифугируют в течение 5 мин при 5200 g при комнатной температуре для выделения плазмы крови в виде супернатанта. Плазму используют в данном анализе в пределах 48 ч после сбора (хранение при 4°С).
Тестируемые соединения получают в виде порошка или на их основе готовят композиции. При получении в виде порошка их растворяют в 0,9%-ном водн. растворе хлорида натрия для получения наиболее высокой подлежащей тестированию концентрации. Растворимость проверяют визуально и растворы фильтруют, используя гидрофильные фильтры из поливинилидендифторида (PVDF) с размером пор 0,45 мкм (Durapore, Darmstadt, Germany), для удаления возможных твердых примесей. Значение рН этого исходного раствора можно измерить в отфильтрованных концентрированных растворах, после чего приступить к приготовлению серии разведений соединения в PBS (с последовательными разбавлениями 1:1).
Анализ проводят в 384-луночных планшетах. По 10 мкл плазмы крови крыс добавляют к 10 мкл растворов различных соединений. Анализ проводят в двух повторах. Добавленные к плазме крови 10 мкл разбавителя (0,9%-ного водн. раствора хлорида натрия, PBS) используют в качестве отрицательного контроля. Поглощение измеряют при 362 нм.
(11S,14S,17S)-14-(4-Аминобутил)-11-(3-аминопропил)-22,25-дихлор-17-(1Н-индол-3-илметил)-16-метил-2-тиа-4,10,13,16,19-пентаазатрицикло[19.4.0.03,8]пентакоза-1(25),3(8),4,6,21,23-гексаен-12,15,18-трион (CAS-RN 2097284-11-0), который, как известно, вызывает осаждение белков в плазме крови, включают во все процедуры анализа в качестве положительного контроля и соединения сравнения.
362
Полученные начальные данные представляют собой данные по поглощению. Рассчитывают разницу между поглощением от образца и средним поглощением от разбавителя. Минимальную эффективную концентрацию (МЕС) определяют как самую низкую концентрацию, дающую разницу в поглощении OD≥0,05.
Результаты приведены выше в Таблице 1.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, при этом указанное соединение имеет пороговую концентрацию для осаждения плазмы крови, превышающую 470 мкМ, предпочтительно превышающую 760 мкМ, более предпочтительно превышающую 870 мкМ, в особенности превышающую 1000 мкМ.
В одном из воплощений настоящего изобретения предложены соединение формулы (I), описанное в данной заявке, или его фармацевтически приемлемая соль, при этом указанное соединение имеет пороговую концентрацию для осаждения плазмы крови, превышающую 470 мкМ, предпочтительно превышающую 760 мкМ, более предпочтительно превышающую 870 мкМ, в особенности превышающую 1000 мкМ, причем указанную пороговую концентрацию для осаждения плазмы крови определяют, следуя анализу, приведенному в примере 20 настоящего изобретения.
Примеры сравнения
Пример 21
Фармакокинетическое исследование для разовой дозы на самцах крыс
Трем самцам крыс вводили композицию на основе соединения (3 мг/мл в 0,9%-ном физиологическом растворе) в виде внутривенного болюса в дозе 6 мг/кг. Образцы крови отбирали в моменты времени 0,08; 0,25; 0,5; 1, 2, 4, 7 и 24 часа после введения и пробирки с собранной кровью центрифугировали в течение 5 мин при 5200 g при комнатной температуре для выделения плазмы крови в виде супернатанта.
Концентрации соединения в плазме крови анализировали, используя метод LC-MS в калибровочном диапазоне 1-2500 нг/мл. Значения клиренса рассчитывают, используя методы, описанные в данной области техники, и результаты суммируют в примере 23.
Пример 22
Фармакокинетическое исследование для разовой дозы на самцах яванских макак
Трем самцам обезьян вводили композицию на основе соединения (2 мг/мл в 0,9%-ном физиологическом растворе) в виде внутривенного болюса в дозе 1 мг/кг.
Образцы крови отбирали в моменты времени 0,08, 0,25, 0,5, 1, 2, 4, 7 и 24 часа после введения и пробирки с собранной кровью центрифугировали в течение 5 мин при 5200 g при комнатной температуре для выделения плазмы крови в виде супернатанта.
Концентрации соединения в плазме крови анализировали, используя метод LC-MS в калибровочном диапазоне 0,5-2500 нг/мл, и результаты суммированы в примере 23.
Пример 23
Масштабирование данных по захвату гепатоцитами для предсказания клиренса in vivo
Принцип
Соединения по настоящему изобретению выводятся посредством печеночного захвата, что может быть определено экспериментально in vitro с использованием методов, описанных в данной области техники (например, в К. Menochet, К.Е. Kenworthy, J.В. Houston, A. Galetin, Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2012, 34, 2). В тех случаях, когда масштабированные данные клиренса при захвате гепатоцитами in vitro соответствуют клиренсу, наблюдаемому у животных, значимое предсказание клиренса у человека можно сделать на основании данных захвата гепатоцитами у человека in vitro.
Материалы и методы
(a) Анализ захвата гепатоцитами
Анализ захвата гепатоцитами проводили вручную в 24-луночных планшетах по аналогии с протоколом, описанным в литературе (К. Ménochet, К.Е. Kenworthy, J. В. Houston, A. Galetin, Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2012, 34, 2). Кратко, первичные гепатоциты, выделенные от представителей разных видов (крыс, людей, обезьян), вносили в многолуночные планшеты, где они прикреплялись и образовывали монослой на дне каждой лунки в течение нескольких часов с инкубированием при 37°С. Для анализа инкубацию клеток завершали и их и промывали в буфере для захвата (в сбалансированном солевом растворе Хенкса (HBSS) с кальцием и магнием (Gibco Invitrogen, 14065056), 20 мМ HEPES (2-гидроксиэтил-пиперазин-2-этансульфоновая кислота), 37°С) и оставляли адаптироваться в течение нескольких минут. Захват инициировали путем добавления буфера для захвата вместе с тестируемым соединением в присутствии/отсутствие коктейля пан-ингибиторов, который может блокировать все основные пути транспорта лекарственного средства, и инкубировали в течение установленного промежутка времени (обычно в течение 1-3 минут). Захват останавливали, добавляя избыток охлажденного на льду буфера (HBSS с кальцием и магнием+0,2% бычьего сывороточного альбумина), который незамедлительно останавливает активный захват и разбавляет введенное соединение. За этим следовали два быстрых цикла промывки теплым буфером (HBSS с кальцием и магнием + 0,2% бычьего сывороточного альбумина, 37°С, затем HBSS с кальцием и магнием, 37°С). Последнюю стадию выполняли для сведения к минимуму неспецифического связывания и удаления несвязанного избытка соединения из лунки. Далее проводили лизис клеточного монослоя, используя смесь 3:1 ацетонитрил/вода, и концентрацию внутри клетки измеряли с использованием жидкостной хроматографии в сочетании с тандемной масс-спектрометрией (LC-MS/MS).
(b) Масштабирование данных по захвату гепатоцитами
uptake
passive
Значения клиренса в случае общего (CL) и пассивного захвата (CL) измеряли по начальным скоростям захвата в отсутствие и в присутствии ингибиторов. Скорости захвата рассчитывали за промежуток времени 10 минут при 37°С по углу наклона графика зависимости концентрации клеток от времени, полученного методом линейной регрессии. Значения клиренса в случае общего и пассивного захвата рассчитывали путем деления значения угла наклона на исходную концентрацию субстрата и нормировали по содержанию белка.
int,h
Значения собственного клиренса in vitro для крыс (CL), выраженные в виде мкл/мин/мг белка, масштабировали для получения значения, эквивалентного целой печени in vivo, путем умножения на общее количество белка в печени (200 мг/г печени) и среднюю массу печени из расчета 40 г печени/кг массы тела, предполагая, что общая масса тела составляет 250 г.
int,h
6
Значения CL для яванского макака и человека, выраженные в виде мкл/мин/мг белка, преобразовывали в мкл/мин/10 клеток в предположении, что 1 мг белка соответствует 1,5 миллиона клеток, и масштабировали для получения значения, эквивалентного целой печени in vivo, путем умножения на значение насыщенности печени клетками (120 миллионов клеток/г печени) и среднюю массу печени из расчета 30 и 21,4 г печени/кг массы тела для яванского макака и человека, соответственно.
int,h
Значения CL in vivo оценивали, используя модель печени с тщательным перемешиванием (K.S. Pang, М. Rowland, Journal of Pharmacokinetics and Biopharmaceutics, 1977, 5, 625):
h
u
где Q означает поток крови у крыс (55,2 мл/мин/кг), обезьян (43,6 мл/мин/кг) или людей (21 мл/мин/кг); в предположении, что значение f было равно 1. Масштабированные значения клиренса для крыс, яванских макак и человека приведены ниже в таблице.
Результаты
В приведенной ниже таблице суммированы масштабированные значения клиренса in vitro и in vivo для крысы и обезьяны. Как можно видеть, предсказанное на основании масштабированных значений клиренса in vitro значение клиренса in vivo для крысы и яванского макака может отличаться в пределах 2 раз. Масштабированное значение клиренса для человека в случае соединения из примера 1 выгодно отличается от клиренса ранее описанной структурно схожей молекулы, что приводит к низкому прогнозируемому клиренсу (0,46 мл/мин/кг) у человека.