Способ прогнозирования биологической активности химических соединений с учетом их конформационного ансамбля и стереохимических особенностей

Способ прогнозирования биологической активности молекул, заключающийся в том, что
осуществляют доступ к базе данных молекулярных структур, а также значениям их биологической активности,
преобразуют молекулярные структуры в набор конформаций с заданными координатами атомов в 3D-пространстве,
попарно выравнивают конформации одной молекулы, рассчитывают среднеквадратическое отклонение позиций атомов,
выявляют пары схожих конформаций для каждой молекулы,
рассчитывают вектор дескрипторов конформаций всех молекул,
рассчитывают вектор дескрипторов молекулы на основе вектора дескрипторов конформаций,
используют полученные вектора дескрипторов молекул и значения их биологической активности для обучения моделей машинного обучения,
применяют обученные модели машинного обучения для прогнозирования биологической активности новых молекул,
отличающийся тем, что
при генерации конформаций используют быстрые стохастические методы, основанные на сборке 3D-конфигурации молекул из фрагментов,
после выявления пар схожих конформаций для каждой молекулы одну конформацию из пары схожих удаляют,
при расчете векторов дескрипторов конформаций всех молекул дескрипторы представляют собой вектора встречаемости фармакофорных квадруплетов с заданной пространственной ориентацией фармакофорных центров,
расчет вектора дескрипторов молекулы производят последовательно кластеризацией конформаций всех молекул с выделением K кластеров, определением, в какие кластера попадают конформации каждой молекулы и созданием битового вектора дескрипторов молекулы, кодирующего номера кластеров, в которые попадают конформации данной молекулы, или опционально-целочисленного вектора дескрипторов молекулы, кодирующего частоту попадания конформаций в заданный кластер.