СТАБИЛЬНЫЕ И РАСТВОРИМЫЕ АНТИТЕЛА

1. Способ уменьшения способности агрегации антитела, которое представляет собой гетеродимерный комплекс, включающий вариабельный домен легкой цепи и вариабельный домен тяжелой цепи, где способ включает стадии:
(а) обеспечения полного атомно-молекулярного представления антитела;
(b) определения свободной энергии взаимодействия двух доменов;
(c) выбора одного или более аминокислотных остатков, участвующих во взаимодействии, для замены посредством предоставления молекулярной модели антитела, содержащего одну или более замен в выбранных положениях, и определения свободной энергии взаимодействия в представлении молекулы с заменой(ами);
(d) выбора аминокислотного остатка для замены, если свободная энергия взаимодействия в модели молекулы с заменой(ами) меньше свободной энергии взаимодействия в исходной молекулярной модели.
2. Способ по п. 1, в котором свободную энергию взаимодействия определяют с помощью расчета разницы между энергией комплекса и суммой энергий отдельных доменов в рамках способа с использованием неявно заданного растворителя.
3. Способ по п. 2, в котором растворителем является GBMV или PBSA.
4. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию
(i) моделирования распределения зарядов в белке, причем эту стадию выполняют в рамках стадии a и b.
5. Способ по п. 4, в котором моделирование распределения зарядов осуществляют на основе электростатических сил или сил Ван-дер-Ваальса.
6. Способ по п. 1, в котором стадия (c) включает дополнительную стадию минимизации энергии в области вокруг мутации.
7. Способ по п. 1, в котором антителом является одноцепочечный Fv-фрагмент (scFv).