LC-MS/MS СПОСОБ МОНИТОРИНГА МНОЖЕСТВЕННЫХ РЕАКЦИЙ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ТЕРАПЕВТИЧЕСКИХ АНТИТЕЛ В ОБРАЗЦАХ ЖИВОТНЫХ С ПОМОЩЬЮ КАРКАСНЫХ СИГНАТУРНЫХ ПЕПТИДОВ

1. Способ выявления человеческих или гуманизированных антител, включающий следующие стадии:
(a) обработка содержащего человеческое или гуманизированное антитело биологического образца расщепляющим ферментом с образованием образца расщепленного антитела, причем биологическим образцом является сыворотка, плазма крови, ткань или клетки от животного, которое было обработано человеческим или гуманизированным антителом; и
(b) анализ образца расщепленного антитела с помощью масс-спектрометрии с выявлением одного или нескольких человеческих каркасных пептидов, причем человеческие каркасные пептиды содержат одну или несколько последовательностей, выбранных из SEQ ID NO 1-8:
GPSVFPLAPSSK
SEQ ID NO:1
STSGGTAALGCLVK
SEQ ID NO:2
TPEVTCVVVDVSHEDPEVK
SEQ ID NO:3
FNWYVDGVEVHNAK
SEQ ID NO:4
VVSVLTVLHQDWLNGK
SEQ ID NO:5
ALPAPIEK
SEQ ID NO:6
GFYPSDIAVEWESNGQPENNYK
SEQ ID NO:7
TTPPVLDSDGSFFLYSK
SEQ ID NO:8
2. Способ по п. 1, в котором расщепляющим ферментом является трипсин.
3. Способ по п. 1, дополнительно включающий приведение в контакт образца расщепленного антитела со средой для аффинного захвата или хроматографическим адсорбентом и элюирование обогащенного образца расщепленного антитела.
4. Способ по п. 1, дополнительно включающий приведение в контакт биологического образца со средой для аффинного захвата или хроматографическим адсорбентом и элюирование обогащенного биологического образца, затем обработку обогащенного биологического образца расщепляющим ферментом.
5. Способ по п. 3 или 4, в котором среда для аффинного захвата представляет собой белок A/G на микроносителе.
6. Способ по п. 3 или 4, в котором хроматографический адсорбент представляет собой адсорбент для твердофазной экстракции (SPE).
7. Способ по п. 1, в котором биологический образец представляет собой сыворотку или плазму крови.
8. Способ по п. 1, в котором измеряют концентрацию образца расщепленного антитела.
9. Способ по п. 1, в котором человеческое или гуманизированное антитело связывается с одним или несколькими опухоль-ассоциированными антигенами или рецепторами клеточной поверхности, выбранными из (1)-(36):
(1) BMPR1B (рецептор костного морфогенетического белка типа IB);
(2) E16 (LAT1,SLC7A5);
(3) STEAP1 (шестой трансмембранный эпителиальный антиген предстательной железы);
(4) 0772Р (СА125, MUC16);
(5) MPF (MPF, MSLN, SMR, мегакариоцитарный потенцирующий фактор, мезотелин);
(6) Napi3b (NAPI-3B, NPTIIb, SLC34A2, семейство переносчиков растворенных веществ 34 (фосфат натрия), член 2, тип II натрийзависимый транспортер фосфата Зb);
(7) Sema 5b (FLJ10372, KIAA1445, Mm.42015, SEMA5B, SEMAG, семафорин 5b Hlog, sema-домен, семь тромоспондиновых повторов (тип 1 и подобный типу 1), трансмембранный домен (ТМ) и короткий цитоплазматический домен, (семафорин) 5В);
(8) PSCA hlg;
(9) ETBR (рецептор эндотелина типа В);
(10) MSG783 (RNF124, гипотетический белок FLJ20315);
(II) STEAP2 (HGNC_8639, IPCA-1, PCANAP1, STAMP1, STEAP2, STMP, ассоциированный со злокачественной опухолью предстательной железы ген 1, ассоциированный со злокачественной опухолью предстательной железы белок 1, шестой трансмембранный эпителиальный антиген предстательной железы 2, шестой трансмембранный эпителиальный белок предстательной железы);
(12) TrpM4 (BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, катионный канал для транзиторного рецепторного потенциала, подсемейство М, член 4);
(13) CRIPTO (CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, полученный из клеток тератокарциномы ростовой фактор);
(14) CD21 (CR2 (рецептор комплемента 2) или C3DR (С3d/рецептор вируса Эпштейна-Барр) или Hs.73792);
(15) CD79b (CD79B, CD790, IGb (иммуноглобулин-ассоциированный бета), В29);
(16) FcRH2 (IFGP4, IRTA4, SPAP1A (содержащий домен SH2 фосфатазный якорный белок la), SPAP1B, SPAP1C);
(17) HER2(ErbB2);
(18) NCA;
(19) MDP;
(20) IL20Rα;
(21) бревикан;
(22) EphB2R;
(23) ASLG659;
(24) PSCA;
(25) GEDA;
(26) BAFF-R (рецептор фактора активации В-клеток, BLyS-рецептор 3, BR3);
(27) CD22 (изоформа В-клеточного рецептора CD22-B);
(28) CD79a (CD79A, CD79α, иммуноглобулин-ассоциированный альфа);
(29) CXCR5 (рецептор лимфомы Беркитта 1);
(30) HLA-DOB (бета-субъединица молекулы МНС II класса (антиген 1а));
(31) Р2Х5 (управляемый лигандами пуринергического рецептора Р2Х ионный канал 5);
(32) CD72 (антиген дифференцировки В-клеток CD72, Lyb-2);
(33) LY64 (лимфоцитарный антиген 64 (RP105), мембранный белок I типа семейства богатых лейциновыми повторами (LRR) белков);
(34) FcRHl (Fc-рецепторподобный белок 1);
(35) IRTA2 (FcRH5, ассоциированный с транслокациями рецепторный белок иммуноглобулинового суперсемейства 2) и
(36) TENB2 (предполагаемый трансмембранный протеогликан).
10. Способ по п. 1, в котором человеческое или гуманизированное антитело выбирают из трастузумаба, окрелизумаба, пертузумаба, антитела к PDL1, антитела к нейропилину-1, антитела к MUC16, ритуксимаба, антитела к мезотелину и антитела к LY6E.
11. Способ по п. 1, в котором человеческое или гуманизированное антитело конъюгируют с лекарственной частью.
12. Способ по п. 1, в котором лекарственную часть выбирают из майтанзиноида, доластатина, ауристатина, калихеамицина, пирролобензодиазепина (PBD), PNU-159682, антрациклина, дуокармицина, алкалоида барвинка, таксана, трихотецена, СС1065, дуокармицина, кампотецина, элинафида и их стереоизомеров, изостеров, аналогов или производных.