5-[4-(1,3-БЕНЗОТИАЗОЛ-2-ИЛ)ФЕНИЛ]-10,15,20-ТРИС(1-МЕТИЛПИРИДИНИЙ-3-ИЛ)ПОРФИРИН ТРИИОДИД, ПРОЯВЛЯЮЩИЙ СВОЙСТВО СВЯЗЫВАНИЯ СПАЙКОВОГО БЕЛКА ВИРУСА SARS-CoV-2
5-[4-(1,3-BENZOTHIAZOL-2-YL)PHENYL]-10,15,20-TRIS(1-METHYLPYRIDINIUM-3-YL)PORPHYRIN TRIIOODIDE, SHOWING THE BINDING PROPERTY OF THE SARS-CoV-2 VIRUS SPIKE PROTEIN

Изобретение относится к химической промышленности, а именно к получению соединения, которое может быть использовано в медицине в качестве активной основы лекарственного препарата, обладающего ингибирующей способностью по отношению к спайковому белку SARS-CoV-2.
Широко применяющимися органическими соединениями с ингибирующей способностью по отношению к РНК/ДНК или белкам вирусов являются те, которые при определенных условиях могут генерировать активные формы кислорода или хлора, катионные поверхностно-активные вещества (четвертичные аммониевые соли, третичные алкиламины, производные гуанидина, альдегиды и спирты). Свойства действующих веществ определяют особенности антивирусного ингибирующего действия, уровень активности (концентрация и время воздействия) и длительность действия. Вирулицидной активностью по отношению к вирусам ВИЧ-1, гепатита С, вируса Денге, вируса табачной мозаики и некоторым другим вирусам с оболочкой обладают порфириновые соединения, способные связываться с поверхностными белками проявлять химическое ингибирование стадии прикрепления вириона к поверхности клетки хозяина.
Известна фармацевтическая композиция [Pat. 20210246431 A1 United States, Int. C1. C12N 7700, GOIN 33/569, C120 1/70, C12N 9/48, A61K 35/76, GOIN 33/573, CO7K 16/10, CO7K 14/005, COZK 14/705. Human Betacoronavirus Lineage С and Identification of N-Terminal Dipeptidyl Peptidase As Its Virus Receptor [Text] / Haagmans B. L. (Rotterdam, NL), Bestebroer Т. M. (Rotterdam, NL), van Boheemen S. (Rotterdam, NL), Fouchier R. A. M. (Rotterdam, NL), Osterhaus A. D. M. E. (Rotterdam, NL), Zaki A. M. (Rotterdam, NL), Raj V. S. (Rotterdam, NL), Bosch B. J. (Rotterdam, NL); Assignee Erasmus University Medical Center Rotterdam (Rotterdam, NL), Dr. Soliman Fakech Hospital (Jeddah, SA). - Appl. №17/027,295; Filed Sep.21, 2020; Pub. Date Aug. 12, 2021. - 128 p.: pic], которая может использоваться в способе лечения или профилактики инфекции ближневосточного респираторного синдрома, вызываемого коронавирусом MERS-CoV. В состав фармацевтической композиции входит фрагменты вируса MERS-CoV, нуклеиновая кислота, белковая молекула или ее фрагмент, антиген и/или антитело. Антитело, нейтрализующее коронавирус или его функциональный компонент -спайковый белок MERS-CoV. Для инактивации вируса SARS CoV предлагается использовать природные поликлональные или моноклональные антитела, которые нейтрализующуют коронавирус за счет связывания со спайковым белком MERS-CoV.
Известно также в качестве противовирусного средство [Pat. 20190351049 A1 United States, Int. C1. A61K 39/215, GOIN 33/569, CO7K 14/165, A61K 45/06, A61K 39/12, CO7K 16/10. Human Antibodies to Middle East Respiratory Syndrome - Coronavirus Spike Protein [Text] / Kyratsous C. (Irvington, NY, US), Stahl N. (Carmel, NY, US), Sivapalasingam S. (Brooklyn, NY, US); Assignee Regeneron Pharmaceuticals, Inc. (Tarrytown, NY, US). Appl. №16/530,140; Filed Aug. 2, 2019; Pub. Date Nov. 21, 2019. - 149 p.: pic], в котором в качестве терапевтического средства для предотвращения или лечения инфекции предложено антитело IgG1 или IgG4 полностью или антитело может включать только антигенсвязывающую часть (например, фрагмент Fab, F (ab’) 2 или scFv). Эффект терапевтического средства основан на специфическом связывании со спайковым белком коронавируса и ингибирования или нейтрализации его активности. Антитела представляют собой полностью человеческие моноклональные антитела либо их модифицированные антигенсвязывающие фрагменты.
Известна также иммуногенная композиция [Pat. ЕР 1618127 B1, Int. С1. С07К 14/165. Immunogenic composition comprising a spike protein of the SARS coronavirus [Text] / Rappuoli R. (Emeryville, US), Masignani V. (Emeryville, US), Stadler K. (Emeryville, US), Gregersen J.-P. (Emeryville, US), Chien D. (Emeryville, US), Han J. (Emeryville, US), Polo J. (Emeryville, US), Weiner A. (Emeryville, US), Houghton M. (Emeryville, US), Song H. C. (Emeryville, US), Seo M. Y. (Emeryville, US), Donnelly J. J. (Emeryville, US), Klenk H. D. (Emeryville, US), Valiante N. (Emeryville, US); Assignee Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc. (Emeryville, US). Appl. №04750188.7; Filed 09.04.2004; Pub. Date 10.12.2014; Bulletin 2014/50. - 212 p.: pic], содержащая выделенный или очищенный полипептид, содержащий: аминокислотную последовательность полипептида спайкового вируса тяжелого острого респираторного синдрома (SARS) SEQ ID NO: 6042 или аминокислотную последовательность, имеющая>80% идентичности последовательности с SEQ ID NO: 6042, или фрагмент из не менее 10 последовательных аминокислот SEQ ID NO: 6042;
Известно также средство [Pat. WO 2021180604 A1, Int. C1. A61P 31/14, C07K 16/10. Sars-cov-2 (sars2, covid-19) antibodies [Text] / Grosveld F. G. (Rotterdam, NL), Drabek D. (Rotterdam, NL), Haperen R. van (Rotterdam, NL), Bosch B.J. (Utrecht, NL), Fedry J. (Utrecht, NL), Hurdiss D. L. (Utrecht, NL), Kuiken T. (Rotterdam, NL), Haagmans B. L. (Rotterdam, NL), Rockx В. H. G. (Rotterdam, NL). Assignee Harbour Antibodies Bv (Rotterdam, NL), Universiteit Utrecht Holding B.V. (Utrecht, NL). Appl. № PCT/EP 2021/055693; Filed 03.04.2021; Pub. Date 16.09.2021. - 346 p.: pic], в котором предложено использование полностью человеческого моноклонального антитела IgG1 или его антигенсвязывающих фрагментов для распознавания спайкового белка SARS-Cov-2 (SARS2-S). В некоторых вариантах реализации антитела связываются с SARS2-S с высокой аффинностью и/или ингибируют инфекцию SARS-Cov-2. В некоторых вариантах реализации антитела обеспечивают предотвращение, лечение или облегчение течения заболевания COVID-19.
Известно также средство [Патент 2744274 С1, Российская Федерация, МПК C12N 1/00, С07К 14/165, С07К 16/10, C12N 15/13. Моноклональное антитело к RBD фрагменту в составе S белка вируса SARS-CoV-2 [Текст] / Шахпаронов М.И. (RU), Павлюков М. С.(RU), Антипова Н.В. (RU); заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН), патентообладатель Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН); заявл. 20.11.2020; опубл. 04.03.2021. Бюл. №7.], связанное с получением мышиных моноклональных антител к RBD фрагменту в составе S белка вируса SARS-CoV-2. Специфичность моноклонального антитела к RBD фрагменту в составе S белка вируса SARS-CoV-2 подтверждена методами иммуноферментного анализа, иммуноблоттинга, иммуноцитохимического и иммуногистохимического окрашивания.
Существенным недостатком перечисленных изобретений является их узкая направленность. Известно, что из всех генов коронавируса, ген, кодирующий спайковый белок, наиболее изменчив, поэтому эффективность антител, предложенных для вируса MERS-CoV, не очевидна в отношении SARS-CoV-2. Кроме того, постоянные мутации спайкового белка SARS-CoV-2 могут привести к потере эффективности антител. Другим существенным недостатком используемого подхода к ингибированию функций спайкового белка коронавируса за счет связывания с антителами заключается в том, что природные поликлональные или моноклональные антитела могут быть выделены только из плазмы переболевших людей, что вызывает определенные этические и экономические трудности, связанные с необходимым исследованиями здоровья доноров. Кроме того, антитела - полипептиды, имеют белковую природу и могут вызывать тяжелые аллергические реакции.
Известен ингибитор коронавирусов не белковой природы [Sisk, J.M. Coronavirus S protein-induced fusion is blocked prior to hemifusion by Abl kinase inhibitors / J.M. Sisk, M.B. Frieman, С.E. Machamer // J. Gen. Virol. - 2018. - Vol. 99. - N 5. - P. 619-630. - doi: 10.1099/jgv.0.001047] - противолейкозный цитостатический препарат иматиниб, в котором слияние мембран (как вирус-клетка, так и клетка-клетка) блокируется в присутствии имантиниба.
Недостаток применения данного препарата для перепрофилирования лечения COVID-19 - множественное побочное действие.
Известно противокоронавирусное средство для комбинированной терапии COVID-19 (SARS-CoV-2) [Патент 2742116 С1 Российская Федерация, МПК А61К 38/16, A61K 31/495, А61Р 31/14. Противокоронавирусное средство для комбинированной терапии COVID-19 (SARS-CoV-2) [Текст] / Иващенко А.В. (US), Иващенко A.A. (RU), Савчук Н.Ф. (US), Иващенко A.A. (US), Логинов В.Г. (RU), Топр М. (US); заявитель Общество с ограниченной ответственностью «Авирон» (ООО «Авирон») (RU), патентообладатель Общество с ограниченной ответственностью «Авирон» (ООО «Авирон») (RU); заявл. 08.11.2020; опубл. 02.02.2021. Бюл. №4.] основанное на применении двух лекарственных препаратов, один из которых включает апротинин и фавипиравир. Апротинин олипептид, получаемый из легких крупного рогатого скота, блокирует калликреин-кининовую систему. Фавипиравир (6-фторо-3-гидроксипиразин-2-карбоксамид) позицианируется как ингибитор репликации SARS-CoV-2.
Однако препарат фавипиравир в нем имеет низкую эффективность.
За прототип принят препарат ритонавир - низкомолекулярное вещество (Мм 720.95 г/моль) не белковой природы, является ингибитором антиретровирусной протеазы, используется как обычный антиретровирусный препарат в сочетании с другими ингибиторами протеазы. Согласно данным [Deshpande, R. R. In silico molecular docking analysis for repurposing therapeutics against multiple proteins from SARS-CoV-2 / R.R Deshpande, A.P. Tiwari, N. Nyayanit, M. Modak // Eur. J. Pharmacol. - 2020. - Vol. 886. - P. 173430. - doi: 10.1016/j.ejphar.2020.173430] ритонавир связывается с рецепторсвязывающим доменом спайкового белка SARS-CoV-2, образуя водородные и пи-сигма -связи с аминокислотными остатками РНЕ361, SER362 Цепь А, а также с GLY368 цепь Цепь С.
Основным недостатком прототипа является низкая энергия связывания препарата с RBD сайтом спайкового белка (7,6 ккал/моль) и, соответственно, ритонавир будет слабо ингибировать связывание спайкового белка с ангиотензин-превращающим ферментом клеток человека.
Задачей изобретения является получение катионного порфирина с высоким выходом, который имел бы один фрагмент серусодержащего гетероцикла для создания условий Н-связывания с аминокислотными фрагментами вирусного белка SARS-CoV-2.
Задача решена 5-[4-(1,3-Бензотиазол-2-ил)фенил]-10,15,20-трис(1-метилпиридиний-3-ил)порфирин трииодидом формулы:
Поставленная задача решена за счет того, что получено новое порфириновое соединение с остатком бензотиазола, структура которого подтверждена физико-химическими методами анализа. Выбор порфирина обусловлен следующими причинами: фрагмент гетероцикла, с одной стороны, создает условия для Н-связывания с аминокислотными фрагментами белка, а с другой стороны, придает порфириновому соединению клиновидную форму, которая также способствует связыванию с белком. N-алкилирование трипиридилзамещенного порфирина метилиодидом приводит к N-метилпиридиниевым солям, которые придают растворимость гетарилзамещенному порфирину в воде и также первичному связыванию со спайковым белком SARS-CoV-2. Проведенный молекулярный докинг несимметричного гетарилзамещенного порфирина со спайковым белком SARS-CoV-2 SARS-CoV-2, показал, что аффинность такого соединения по отношению к спайковым белкам SARS-CoV-2 существенно выше, чем у препаратов, разрешенных Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (США). Проанализировано строение комплекса спайкового белка SARS-CoV-2 SARS-CoV-2 с исследуем лм макрогетероциклическим соединением и показано, что оно способно ингибировать и полностью дезактивировать спайковый белок SAR-CoV-2 блокируя присоединение к рецептору АСЕ2 клеток человека. Высокое сродство несимметричного гетарилзамещенного порфирина к спайковому белку SARS-CoV-2 позволяет рассчитывать, что полученный порфирин будет активен и в отношении вирусов, использующих для интернализации вируса в клетку хозяина поверхностный рецептор АСЕ2.
Для получения этого соединения используют следующие вещества:
- 3-пиридилкарбоксальдегид - коммерческий продукт TCI EUROPE N.V.;
- 4-бромбензальдегид - коммерческий продукт TCI EUROPE N.V.;
- пиррол - ТУ 6-09-07-242-84;
- пропионовая кислота - ТУТ CP 1150Н-63, хч;
- пропионовый ангидрид - ТУ 6-09-08-1176-77;
- ацетат цинка - ГОСТ 5852-78;
- оксид алюминия - ТУ 6-09-426-75;
- хлороформ - ТУ 263-44493179-01 с изм. №1,2;
- метанол - ГОСТ 2222-95;
- трифенилфосфин - коммерческий продукт TCI EUROPE N.V.;
- поташ (карбонат калия) - ГОСТ 4221-76;
- ацетат меди - ГОСТ 5852-79;
- ацетат палладия - ТУ 2625-024-00205067-2003;
- бензотиазол - коммерческий продукт TCI EUROPE N.V.;
- хлористый метилен - ТУ 2631-44493179-98 с изм. №1, 2, 3;
- гексан - ТУ 6-09-06-4521-77;
- диметилформамид - ГОСТ 20289-74 с изм. №1,2;
- бензол - ГОСТ 5955-75 с изм. №1,2;
- метилиодид - ТУ: 6-09-3988-83.
Изобретение поясняется чертежами, где на фиг. 1 показан результат молекулярной стыковки спайкового белка в составе тримера (цепи «А» (зеленая), «В» (голубая), «С» (розовая)) с бензотиазолзамещенным порфирином; на фиг. 2 представлен детализированный фрагмент комплекса 2, включающий RBD сайта цепи «А» и фрагмент RBD сайта цепи «В», взаимодействующие с бензотиазолзамещенным порфирином; на фиг. 3 представлен детализированный фрагмент комплекса, включающий RBD сайт (голубая и оранжевая), с выделенной областью связывания порфирина (оранжевая) и АСЕ2 (зеленая.
Заявленное соединение получают следующим образом:
Вначале получают 5-(4'-бромфенил)-10,15,20-трис-(3'-пиридил)порфин следующим образом:
В трехгорловую круглодонную колбу, снабженную обратным холодильником, трубкой для подвода воздуха и капельной воронкой, помещают 500 мл пропионовой кислоты, 35 мл (0,27 моль) пропионового ангидрида и при кипении и пропускании прикапывают смесь 10 мл (0,144 моль) пиррола, 6,66 г (0,036 моль) 4-бромбензальдегида и 10,15 мл (0,108 моль) 4-пиридилкарбоксальдегида.
Далее смесь кипятят 1,5 часа при пропускании воздуха, отгоняют пропионовую кислоту под вакуумом на водяной бане. Остаток разбавляют 300 мл метанола и 30 мл концентрированного раствора аммиака. Осадок порфирина отфильтровывают, промывали метанолом и высушивают.Для очистки порфирин растворяют в хлористом метилене и хроматографируют на оксиде алюминия III степени активности по Брокману, собирая третью фракцию. Для более полной очистки порфирин повторно хроматографируют на окиси алюминия. Выход: 3,95 г 15,8%
max
3
41
26
7
1
+
ЭСП λ, нм (log ε): 416(5,91); 512(4,60); 547(4,58); 588(4,48); 643(4,58) (ДХМ). Н ЯМР δ, м.д.: 9.50 s (3Н, 2'-НРу), 9.10 d (3Н, 6'-НРу, J=5.5), 9.02 d (2Н, 8,12-Н, J=4.5), 8.89 s (4Н, 3,7,13,17-Н), 8.57 d (2Н, 2,18-Н, J=4.5), 8.44 d (3Н, 4'-НРу, J=5.5), 8.07 d (2Н, 2",6"-HPh, J=8.0), 7.91 d (4H, 5'-HPy, 3",4"-HPh, J=8.0), -2.78 s (2H, NH). (CDCl). MS MALDI-TOF MS: m/z рассчитано: CHBrN: 696,60; Найдено: 696,68 [M].
Затем получают 5-(4-Бромфенил)-10,15,20-трис(3'-пиридин)порфиринат цинка:
max
3
41
26
7
1
+
Растворяли 3 г (4.3 ммоль) 5-(4-бромфенил)-10,15,20-трис(пиридин-3-ил)порфирина и 4.7 г (0.021 моль) безводного ацетата цинка в смеси 200 мл метанола и 100 мл хлористого метилена. Смесь кипятили 1.5 ч, контролируя протекание реакции с помощью ЭСП. Смесь охлаждали, отгоняли избыток растворителя, остаток хроматографировали на колонке с А120з (активность III по Брокману), элюируя смесью этанол - хлористый метилен, 10:1. Растворитель отгоняли в вакууме, остаток промывали водой, отфильтровывали и высушивали при комнатной температуре до постоянной массы. Выход 3.2 г. (98%). Rf 0.67 (силуфол, дихлорметанэтанол, 10:1). ЭСП (дихлорметан), λ, нм (lgε): 416 (6.06), 549 (4.62), 590 (4.71). Спектр ЯМР Н (CDCl), δ, м. д. (J, Гц): 9.50 с (3Н, Н2', Ру), 9.10 д (3Н, Н6', Ру, J 5.5), 9.02 д (2Н, Н8Д2, J 4.5), 8.89 с (4Н, Н3,7,13,17), 8.57 д (2Н, Н2Д8, J 4.5), 8.44 д (3Н, Н4', Ру, J 5.5), 8.07 д (2Н, Н2",6", Ph, J 8.0), 7.92 д (5Н, 5'-НРу, Н3",5", Ph, J 8.0). Масс-спектр (MALDI-TOF), m/z: 760.03 [М]. CHBrNZn. М 759.97.
Далее получают 5-[4-(1,3-Бензотиазол-2-ил)фенил]-10,15,20-трис(3'-пиридил)порфирин:
2
2
2
2
3
2
3
max
3
48
30
8
1
+
Смесь 0.03 г Pd(OAc) (20 мол %), 0.026 г Cu(ОАс)⋅HO (20 мол %), 0.176 г трифенилфосфина (1 экв.), 0.51 г 5-(4-бромфенил)-10,15,20-трис(пиридин-3-ил)порфината цинка (0.671 ммоль), 45 мл толуола, 0,185 г карбоната калия, 146 мкл (2 экв., 1.342 ммоль) бензотиазола кипятили при перемешивании 48 ч, охлаждали до комнатной температуры и добавляли 50 мл хлористого метилена и фильтровали. Осадок промывали 10 мл хлористого метилена, объединенные органические фракции упаривали в вакууме. Остаток растворяли в 30 мл хлористого метилена и хроматографировали на AlO (активность III по Брокману), элюируя сначала дихлорментаном, а затем смесью этанол:хлористый метилен, 1:10. Собирали вторую фракцию. Цинковый комплекс растворяли в дихлорметане и для разрушения комплекса добавляли 3 мл конц. HCl, обрабатывали водным раствором аммиака, органическую фракцию промывали водой. Раствор осушали безводным сульфатом натрия и упаривали в вакууме. Хроматографировали на AlO (активность III по Брокману), элюируя сначала дихлорментаном, а затем смесью этанол:хлористый метилен, 1:10, собирали вторую фракцию, растворитель упаривали под вакуумом. Выход 0.345 г (67%), зелено-фиолетовый кристаллический порошок. Rf 0.73 (силуфол, дихлорметан:этанол, 10:1). ЭСП (дихлорметан), λ, нм (lgε): 420 (5.96), 516 (4.66), 550 (4.57), 590 (4.60), 646 (4.59). Спектр ЯМР Н (CDCl), δ, м. д. (J, Гц): 9.50 с (3Н, Н2', Ру), 9.10 д (3Н, Н6', Ру, J 5.5), 9.02 д (2Н, Н8,12, J4.5), 8.89 с (4Н, Н3,7,13,17), 8.57 д (2Н, Н2Д8, /4.5), 8.44 д (3Н, Н4', Ру, J 5.5), 8.27 д (2Н, Н2",6", Ph, J6.0), 7.82-7.79 м (5Н, Н5', Ру, Н3",5", Ph), 8.02 д (2Н, бензотиазол, J 8.2), 7.46-7.54 м (2Н, бензотиазол), -2.78 с (2Н, NH). Масс-спектр (MALDI-TOF), m/z.750.89 [М]. CHNS. М750.87.
Получение заявляемого соединения 5-[4-(1,3-Бензотиазол-2-ил)фенил]-10,15,20-трис(1-метилпиридиний-3-ил)порфирин трииодида:
max
51
39
3
8
1
+
Смесь 0.22 г (0.29 ммоль) 5-[4-(1,3-бензотиазол-2-ил)фенил]-10,15,20-трис(пиридин-3-ил)порфирина и 0.5 мл (0.46 ммоль) метилиодида кипятили в диметилформамиде (30 мл) 1 ч. Раствор охлаждали и разбавляли бензолом, 1:1. Осадок отфильтровывали, промывали последовательно бензолом, ацетоном и высушивали при комнатной температуре до постоянного веса. Выход 0.21 г (98%). ЭСП (вода), λ, нм (lgε): 418 (6.09), 516 (4.69), 549 (4.63), 585 (4.65), 634 (4.65). Спектр ЯМР Н (ДМСО-d6), δ, м. д.: 9.52 с (3Н, Н2', Ру), 9.11 д (3Н, Н6', Ру, J 5.3), 9.02 д (2Н, Н8,12, J 4.4), 8.89 с (4Н, Н3,7,13,17), 8.57 д (2Н, Н2,18, J 4.4), 8.44 д (3Н, Н4', Ру, J 5.2), 8.27 д (2Н, Н2",6", Ph, J 5.9), 7.82-7.79 м (5Н, Н5', Ру, Н3",5", Ph), 7.94-8.11 м (2Н, бензотиазол), 7.46-7.54 м (2Н, бензотиазол), 4.72 с (9Н, CH3N), -2.78 уш. с (2Н, NH). Масс-спектр (MALDI-TOF), m/z: 1176.73 [M] CHINS. М 1176.69.
Пример применения заявляемого соединения (связывания со спайковым белком SARS-CoV-2)
Коронавирусы проникают в клетки за счет спайкового белка (S-белок, белок-шиг) на их оболочке. Спайковый белок коронавируса представляет собой заякоренный в мембране тример и содержит две субъединицы: S1 субъединицу для связывания рецептора и S2 субъединицу, обеспечивающую слияние мембран вируса и клетки хозяина. S1 Субьединица спайкового белка содержит рецептор связывающий домен (RBD) в составе которого содержится рецептор связывающий мотив (RBM) обеспечивающий первичное распознавание и связывание с рецептором клеток хозяина. В качестве рецептора вирусы SARS CoV и SARS CoV-2 используют ангиотензин-превращающий фермент 2 (АСЕ2). Для диагностики, профилактики и/или лечения вирусной инфекции необходимы вещества способные ингибировать основные функции спайкового белка - связывания с рецептором клеток хозяина и слияния мембран.
На фиг. 1 в качестве примера представлен результат молекулярной стыковки гетерилзамещенного порфирина, содержащего остаток бензотриазола с S-белком. Стыковка порфирина спайковым белком происходит на поверхности RBD каждой цепи, точнее между RBD областями двух соседних цепей, при этом порфирин одновременно взаимодействует с обеими RBD аминокислотными последовательностями (таблица).
Результат молекулярной стыковки спайкового белка в составе тримера (цепи «А» (зеленая), «В» (голубая), «С» (розовая)) с бензотиазолзамещенным порфирином представлен на фиг. 2. На фиг. 3 представлен детализированный фрагмент комплекса сайт (голубая и оранжевая), с выделенной областью связывания порфирина (оранжевая) и АСЕ2 (зеленая). Высокая энергия связывания бензотриазолилзамещенного порфирина со спайковым белком SARS-CoV-2 обеспечивается множественными специфическими и вандервалльсовыми взаимодействиями. Аминокислотные остатки спайкового белка, участвующие в этом взаимодействии, отмечены на фиг. 3 оранжевым цветом.