СРЕДСТВА И СПОСОБЫ ПРЕДСКАЗАНИЯ ОТВЕТА НА ЛЕЧЕНИЕ ГЕПАТИТА B

1. Способ типирования образца пациента с гепатитом В, включающий установление SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, в нуклеиновой кислоте указанного образца, и/или определение уровня экспрессии карнитина или производного карнитина в указанном образце.
2. Способ по п. 1, в котором указанный пациент с гепатитом В страдает от хронического гепатита В.
3. Способ по п. 1, в котором содержащий нуклеиновую кислоту указанный образец является ДНК-содержащим образцом, предпочтительно мазком слюны или образцом крови или образцом сыворотки.
4. Способ по п. 1, в котором указанный положительный результат выбирают из группы, состоящей из исчезновения HBsAg, исчезновения HBsAg в сочетании с сероконверсией анти-НВ, устойчивого вирусологического ответа и уменьшения HBsAg более, чем на 1,5 log, в крови указанного пациента на или до 24 недели лечения.
5. Способ по п. 1, в котором указанное лечение гепатита В включает введение интерферона или другого иммуномодулятора, необязательно в комбинации с ингибитором вирусной ДНК-полимеразы, предпочтительно аналога нуклеозида или аналога нуклеотида.
6. Способ по п. 1, в котором указанный ассоциированный с положительным результатом SNP аллель содержит G аллель SNP rs12356193.
7. Способ по п. 1, в котором указанный ассоциированный с положительным результатом SNP аллель содержит HBV T784G аллель.
8. Способ по п. 1, включающий выявление SNP rs12356193 и/или HBV SNP в положении 784.
9. Способ по п. 1, включающий выявление SNP rs12356193 и/или HBV SNP в положении 784, в комбинации, по меньшей мере, с одним другим SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
10. Способ по п. 1, включающий сравнение количества карнитина или производного карнитина в указанном образце, по меньшей мере, с одним эталоном.
11. Способ по п. 1, включающий определение, что уровень экспрессии карнитина в образце плазмы указанного пациента с гепатитом В равен или меньше, чем 33,3 микромоль/литр, предпочтительно равен или меньше, чем 29 микромоль/литр, что указывает на пациента, отвечающего на лечение, или больше, чем 33,3 микромоль/литр, что указывает на пациента, не отвечающего на лечение.
12. Способ по п. 1, включающий определение, что уровень экспрессии ацетил-L-карнитина в плазме образца указанного пациента с гепатитом В равен или меньше, чем 3,89 микромоль/литр, что указывает на пациента, отвечающего на лечение, или больше, чем 3,89 микромоль/литр, что указывает на пациента, не отвечающего на лечение.
13. Способ по п. 1, включающий определение, что уровень экспрессии проприонил-L-карнитина в плазме образца указанного пациента с гепатитом В равен или меньше, чем 0,43 микромоль/литр, что служит признаком пациента, отвечающего на лечение, или больше, чем 0,43 микромоль/литр, что указывает на пациента, не отвечающего на лечение.
14. Способ по п. 1 в котором указанное производное карнитина содержит ацетил-L-карнитин и/или проприонил-L-карнитин.
15. Способ определения, имеется ли у пациента с гепатитом В повышенная вероятность положительного результата лечения гепатита В по сравнению со средней вероятностью в популяции пациентов с гепатитом В, включающий установление, содержит ли содержащий нуклеиновую кислоту образец указанного пациента с гепатитом В ассоциированный с положительным результатом аллель SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и/или определение, содержит ли образец указанного пациента с гепатитом В уровень экспрессии карнитина или производного карнитина, ассоциированный с положительным результатом лечения гепатита В.
16. Способ по п. 15, дополнительно включающий определение, наблюдается ли у указанного индивидуума исходное содержание HBsAg менее, чем 387 IU/мл, до начала лечения гепатита В.
17. Интерферон или другой иммуномодулятор необязательно в комбинации с ингибитором вирусной ДНК-полимеразы, предназначенный для использования при лечении гепатита В, отличающийся тем, что лечению подвергается пациент с гепатитом В, который при тестировании был определен, как позитивный в отношении, по меньшей мере, одного ассоциированного с положительным результатом SNP аллеля, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и/или который при тестировании был определен, как позитивный в отношении ассоциированного с положительным результатом уровня карнитина или производного карнитина.
18. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому лечению подвергается пациент с гепатитом В, который при тестировании был определен, как позитивный в отношении G аллеля SNP rs12356193 и/или T784G аллеля HBV генома.
19. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17 или 18, согласно которому лечению подвергается пациент с гепатитом В, который при тестировании был определен, как позитивный в отношении G аллеля SNP rs12356193 и/или T784G аллеля HBV, в сочетании, по меньшей мере, с одним другим ассоциированным с положительным результатом SNP аллелем, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
20. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому HBV-терапии подвергается пациент с гепатитом В, у которого был исследован уровень экспрессии карнитина в плазме, и у которого проверенный уровень экспрессии карнитина в плазме был равен или меньше, чем 33,3 микромоль/литр, предпочтительно равен или меньше, чем 29 микромоль/литр.
21. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому HBV-терапии подвергается пациент с гепатитом В, у которого был исследован уровень экспрессии ацетил-L-карнитина в плазме, и у которого проверенный уровень экспрессии ацетил-L-карнитина в плазме был равен или меньше, чем 3,89 микромоль/литр.
22. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому HBV-терапии подвергается пациент с гепатитом, у которого был исследован уровень экспрессии проприонил-L-карнитина в плазме, и у которого проверенный уровень экспрессии проприонил-L-карнитина в плазме был равен или меньше, чем 0,43 микромоль/литр.
23. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому указанное лечение гепатита В включает введение интерферона в комбинации с аналогом нуклеозида или аналогом нуклеотида.
24. Состоящий из частей набор или панель или микропанель, включающий, по меньшей мере, два полинуклеотида, содержащих SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и необязательно один или более эталонных полинуклеотидов, при этом, по меньшей мере, 70% полинуклеотидов указанного набора, состоящего из частей, или панели содержат SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
25. Состоящий из частей набор или панель или микропанель по п. 24, содержащий набор праймеров или зондов, причем каждый из указанных праймеров или зондов имеет в длину, независимо друг от друга, от 8 до 50 нуклеотидов, отличающийся тем, что указанные праймеры или зонды являются комплементарными SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
26. Состоящий из частей набор или панель или микропанель по п. 24 или 25, согласно которому указанный, по меньшей мере, один полинуклеотид является способным амплифицировать последовательность длиной в пределах от 50 до 600 нуклеотидов, от 100 до 400 нуклеотидов, более предпочтительно 150-250 нуклеотидов, при этом указанная последовательность содержит SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигура 2.
27. Применение, по меньшей мере, одного изолированного полинуклеотида, содержащего SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, для типирования содержащего нуклеиновую кислоту образца пациента с гепатитом В.
28. Применение состоящего из частей набора или панели или микропанели по п. 27 для типирования содержащего нуклеиновую кислоту образца пациента с гепатитом В.
29. Способ оценки наличия нуклеиновой кислоты, содержащей ассоциированный с положительным результатом SNP аллель, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, в образце, включающий контактирование указанного образца, по меньшей мере, с одним полинуклеотидом, содержащим SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и установление, гибридизируется ли указанный полинуклеотид с образцом нуклеиновой кислоты в строгих условиях.
30. Способ по п. 29, согласно которому используется полинуклеотид, комплементарный G аллелю SNP rs12356193 и/или T784G аллелю HBV.
31. Способ по п. 29 или 30, согласно которому указанный, по меньшей мере, один полинуклеотид является, по меньшей мере, на 80% комплементарным любой одной из последовательностей, изображенных на фигуре 1 и/или 2.
32. Применение способов определения уровня экспрессии карнитина и/или производного карнитина для типирования образца, полученного от пациента с гепатитом В.
33. Способ определения, имеет ли индивидуум генетическую предрасположенность к повышенной вероятности положительного результата лечения гепатита В по сравнению со средним значением в популяции пациентов с гепатитом В, включающий установление содержит ли геномная нуклеиновая кислота указанного индивидуума, по меньшей мере, один связанный с положительным результатом SNP аллель, как показано на фигуре 1, предпочтительно по меньшей мере, G аллель SNP rs12356193, и/или установление, содержит ли образец указанного индивидуума уровень экспрессии карнитина и/или производного карнитина, ассоциированный с положительным результатом лечения гепатита В.
34. Способ идентификации у пациента с гепатитом В гена, ассоциированного с повышенной вероятностью положительного результата лечения гепатита В по сравнению со средним значением в популяции пациентов с гепатитом В, включающий:
- идентификацию гена, содержащего SNP, как показано на фигуре 1, и
- сравнение экспрессии данного гена у индивидуума, имеющего ассоциированный с положительным результатом аллель SNP, как показано на фигуре 1, с экспрессией данного гена у индивидуума, не имеющего указанный ассоциированный с положительным результатом аллель SNP, с целью обнаружения различий, указывающих, что данный ген ассоциируется с повышенной вероятностью положительного результата лечения гепатита В.
35. Вектор, включающий, по меньшей мере, два полинуклеотида, содержащих SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и при необходимости, один или более эталонных полинуклеотидов, при этом, по меньшей мере, 70% полинуклеотидов указанного вектора содержат SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.