ПРАЙМЕРЫ И ЗОНДЫ ДЛЯ ДЕТЕКТИРОВАНИЯ ВИРУСА ГЕПАТИТА С

1. Праймер для амплификации вируса гепатита С в тестируемом образце, где праймер имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6 и их комплементов.
2. Зонд для детектирования вируса гепатита С в тестируемом образце, где зонд имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, и их комплементов.
3. Набор праймеров для амплификации вируса гепатита С в тестируемом образце, где набор праймеров содержит:
(a) по меньшей мере, один прямой праймер, имеющий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, их комплементов и любых их комбинаций; и
(b) по меньшей мере, один обратный праймер, имеющий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, их комплементов и любых их комбинаций.
4. Набор праймеров и зондов для детектирования вируса гепатита С в тестируемом образце, содержащий:
(a) два прямых праймера, имеющих последовательность: SEQ ID NO:1 и SEQ ID NO:2, или их комплементы, и четыре обратных праймера, имеющих последовательность: SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:6 или их комплементы; и
(b) два зонда, имеющих последовательность: SEQ ID NO: 7 и SEQ ID NO: 8 или их комплементы.
5. Способ детектирования вируса гепатита С в тестируемом образце, причем способ включает стадии:
(a) приведения тестируемого образца в контакт по меньшей мере с одним прямым праймером, имеющим последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:1 и SEQ ID NO:2 или их комплементов, и, по меньшей мере, с одним обратным праймером, имеющим последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5 и SEQ ID NO:6 или их комплементов, в условиях амплификации с получением первой целевой последовательности; и
(b) детектирования гибридизации между первой целевой последовательностью и, по меньшей мере, одним зондом в качестве показателя присутствия вируса гепатита С в тестируемом образце, где, по меньшей мере, один зонд имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO:8 или их комплементов.
6. Способ по п.5, где условия амплификации включают подвергание тестируемого образца реакции амплификации, проводимой в присутствии подходящих реагентов амплификации.
7. Способ по п.6, где реакция амплификации включает, по меньшей мере, одну из:
a) ПЦР;
b) ПЦР в реальном времени или
c) ПЦР с обратной транскриптазой (ОТ-ПЦР).
8. Способ по п.5, где, по меньшей мере, один зонд помечен с помощью детектируемой метки.
9. Способ по п.8, где детектируемая метка прямо присоединена, по меньшей мере, к одному зонду.
10. Способ по п.8, где детектируемая метка косвенно присоединена, по меньшей мере, к одному зонду.
11. Способ по п.8, где детектируемую метку можно детектировать непосредственно.
12. Способ по п.8, где детектируемую метку можно детектировать косвенно.
13. Способ по п.8, где детектируемая метка содержит флуоресцентный компонент, присоединенный к 5'-концу, по меньшей мере, одного зонда.
14. Способ по п.13, где, по меньшей мере, один зонд дополнительно содержит компонент гасителя, присоединенный к 3'-концу, по меньшей мере, одного зонда.
15. Способ по п.5, дополнительно включающий стадии:
(a) проведения тестируемого образца в контакт с прямым праймером, имеющим последовательность SEQ ID NO: 1 или ее комплемента, и с обратным праймером, имеющим последовательность SEQ ID NO: 3 или ее комплемента, в условиях амплификации с получением второй целевой последовательности; и
(b) детектирование гибридизации между второй целевой последовательностью и зондом, имеющим последовательность SEQ ID NO:7 или ее комплемента, в качестве показателя присутствия HCV в тестируемом образце.
16. Набор реагентов для детектирования вируса гепатита C в тестируемом образце, причем набор реагентов содержит:
(a) по меньшей мере один прямой праймер, имеющий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, их комплементов и любых их комбинаций;
(b) по меньшей мере, один обратный праймер, имеющий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, их комплементов и любых их комбинаций; и
(c) реагентов амплификации.
17. Набор реагентов по п.16, дополнительно содержащий по меньшей мере один зонд, где по меньшей мере один зонд выбран из группы, состоящей из: SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8 и их комплементов.