БЫСТРОЕ НАЗНАЧЕНИЕ АДЕКВАТНОЙ НЕОАДЪЮВАНТНОЙ ХИМИОТЕРАПИИ ПАЦИЕНТАМ, СТРАДАЮЩИМ РАКОМ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ, ОСНОВАННОЕ НА ИДЕНТИФИКАЦИИ СИСТЕМНЫХ МУТАЦИЙ BRCA1

1. Способ раннего обнаружения пониженного клинического ответа на цитостатическую неоадъювантную химиотерапию у пациентов, страдающих раком, который включает обнаружение наследуемого изменения в последовательности гена BRCA1 в биологическом образце анализируемого субъекта, у которого генотип носителя мутации является показателем значительно пониженного клинического ответа на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, по меньшей мере, у пациентов, страдающих раком молочной железы.
2. Способ по п.1, где исследуемое структурное изменение обнаруживают посредством сравнения структуры измененного варианта BRCA1 с диким типом.
3. Способ по п.1, где исследуемый человек представляет собой индивидуум с, по меньшей мере, частично известным этническим происхождением.
4. Способ по пп.1-3, где наследуемые мутации-основатели гена BRCA1, свидетельствующие о значительно пониженном ответе на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, определяют с помощью набора или панели мутаций-основателей BRCA1, которые являются характеристическими для этнической популяции пациента.
5. Способ по п.1, где исследуемый человек представляет собой индивидуум неизвестного этнического происхождения.
6. Способ по пп.1, 2 и 5, где наследуемые мутации-основатели гена BRCA1, свидетельствующие о значительно пониженном ответе на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, определяют с помощью набора или панели мутаций-основателей BRCA1, который содержит все известные мутации-основатели BRCA1 или образец наиболее частых мутаций.
7. Способ по п.1, где способ обнаружения наследуемых мутаций BRCA1 основан на анализе ДНК, РНК или белков.
8. Способ по п.7, где ДНК- или РНК-тестирование проводят с использованием обычного способа прямого обнаружения мутаций, такого как секвенирование, но более предпочтительно с использованием любого обычного способа косвенного обнаружения мутаций, выбранного из таких как ASA-, ASO-, RFLP-PCR, Taqman RT-PCR или микрочипового способов, предпочтительно, основанных на обычных панелях мутаций-основателей.
9. Способ по п.7, где наличие полипептида, закодированного геном BRCA1 с наследуемым изменением, обнаруживают с использованием антител или других веществ, специфичных в отношении этого полипептида или его фрагмента.
10. Способ по п.1, где цитостатические лекарства, применяемые в фармакологии для химиотерапии рака, представляют собой, по меньшей мере, производные таксоидов, такие как паклитаксел (таксол) и доцетаксел (таксотер).
11. Способ по п.1, где генетическое тестирование назначают для проведения среди всех пациентов, страдающих раком молочной железы, которым предполагается проводить химиотерапию цитостатическими лекарствами, но особенно предпочтительно для случаев неоадъювантной терапии, для которых быстрое назначение правильной химиотерапии имеет клиническую значимость.
12. Применение специфических для популяции наследуемых изменений гена или полинуклеотида BRCA1 в биологическом образце анализируемого субъекта для предсказания значительно пониженного клинического ответа на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, по меньшей мере, у пациентов-носителей мутации, страдающих раком молочной железы, определенных с помощью набора или панели мутаций-основателей BRCA1, которые являются характеристическими для этнической популяции пациента, или других изменений BRCA1 с аналогичными свойствами, или имеющих общий гаплотип с первыми.
13. Применение по п.12, где указанный полинуклеотид содержит целую последовательность BRCA1 или его фрагмент, включающий исследуемое изменение.
14. Применение по пп.12 и 13, где наследуемое изменение обнаруживают с помощью специфичной для популяции предварительно выбранной панели мутаций-основателей, предпочтительно содержащей все мутации-основатели, которые являются характеристическими для этнической популяции пациента, с помощью способа, выбранного из любого способа прямого обнаружения мутации или косвенного обнаружения мутации на уровне ДНК, РНК или белка, но предпочтительно выбранного из ASA-, ASO-, RFPL-PCR, Taqman RT-PCR или микрочипового способов, дающего возможность для проведения быстрого и надежного анализа с целью назначения наиболее эффективной неоадъювантной химиотерапии в кратчайшее время.
15. Применение по п.12 или 13, где наследуемое изменение обнаруживают с помощью общей панели мутаций-основателей BRCA1, предпочтительно содержащей все мутации-основатели, которые являются характеристическими для этнической популяции пациента, способом, выбранным из каких-либо способов прямого обнаружения мутации или косвенного обнаружения мутации на уровне ДНК, РНК или белка, но предпочтительно выбранного из ASA-, ASO-, RFPL-PCR, Taqman RT-PCR или микрочипового способа, который дает возможность для проведения быстрого и надежного анализа с целью назначения наиболее эффективной неоадъювантной химиотерапии в кратчайшее время.
16. Композиция для предсказания пониженного ответа на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, по меньшей мере, у пациентов, страдающих раком молочной железы, содержащая, по меньшей мере, два различных олигонуклеотида, позволяющих амплификацию участка генома указанного человека, содержащего, по меньшей мере, одну мутацию из набора или панели мутаций-основателей RCA1, предпочтительно содержащего все мутации-основатели, которые являются характеристическими для этнической популяции пациента, или другие изменения BRCA1 с аналогичными свойствами, или имеющего общий гаплотип с первыми.
17. Применение полинуклеотида, кодирующего вариант белка BRCA1, содержащего, по меньшей мере, одну мутацию среди набора или панели мутаций-основателей BRCA1, предпочтительно содержащего все мутации-основатели, которые являются характеристическими для этнической популяции пациента, или другие изменения BRCA1 с аналогичными свойствами, или имеющего общий гаплотип с первыми, или полипептида, кодируемого указанным полинуклеотидом, или антител, специфичных в отношении этого полипептида, для производства прогностического средства для предсказания существенно пониженного ответа на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, по меньшей мере, у пациентов среди членов специфической этнической популяции, страдающих раком молочной железы.
18. Способ определения генетических маркеров, свидетельствующих о значительно пониженном ответе на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, отличающийся исследованием образцов, содержащих геномную ДНК пациентов, страдающих специфическим раком, и сравнением частоты структурных изменений в BRCA1, или участках неслучайного распределения, между исследуемыми пациентами и контролями из общей популяции, где изменение в значительной степени представлено у пациентов, страдающих специфическим злокачественным новообразованием, которое затем рассматривается как генетический маркер, свидетельствующий о значительно пониженном ответе на неоадъювантную химиотерапию цитостатическими лекарствами, по меньшей мере, у пациентов, страдающих раком молочной железы.