КОМПОЗИЦИИ КОКТЕЙЛЯ, СОДЕРЖАЩИЕ АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЕ ФАГИ, И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Композиция, содержащая по меньшей мере два различных выделенных штамма бактериофага, причем каждый из указанных штаммов характеризуется геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:1 (F44/10), SEQ ID NO:2 (F125/10), SEQ ID NO:3 (F770/05), SEQ ID NO:4 (F510/08) и SEQ ID NO:5 (F1245/05), или ее вариант, причем указанный вариант характеризуется по меньшей мере 95%-ной идентичностью последовательности относительно указанной последовательности нуклеиновой кислоты и демонстрирует антибактериальную активность против по меньшей мере одного из Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa и/или Acinetobacter baumannii.
2. Композиция по п. 1, в которой один из указанных по меньшей мере двух штаммов бактериофага представляет собой штамм, характеризующийся геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO:2 или ее указанный вариант.
3. Композиция по п. 1, в которой указанные по меньшей мере два штамма бактериофага представляют собой штаммы, характеризующиеся геномами, которые содержат последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID ΝΟ:1 и SEQ ID NO:2 или их указанные варианты.
4. Композиция по п. 3, дополнительно содержащая по меньшей мере третий штамм бактериофага, причем указанный третий штамм характеризуется геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4 и SEQ ID NO:5, или ее указанный вариант.
5. Композиция по п. 3, дополнительно содержащая по меньшей мере третий и четвертый штаммы бактериофага, причем каждый из указанных третьего и четвертого штаммов характеризуется геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4 и SEQ ID NO:5, или ее указанный вариант.
6. Композиция по п. 1, в которой один из указанных по меньшей мере двух штаммов бактериофага представляет собой штамм, характеризуюзийся геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:3 или SEQ ID NO:4, или ее указанный вариант.
7. Композиция по п. 1, в которой указанные по меньшей мере два штамма бактериофага представляют собой штаммы, характеризующиеся геномами, которые содержат последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:3 и SEQ ID NO:4 или их указанный вариант.
8. Композиция по п. 7, дополнительно содержащая по меньшей мере третий штамм бактериофага, причем указанный третий штамм характеризуется геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2 и SEQ ID NO:5, или ее указанный вариант.
9. Композиция по п. 7, дополнительно содержащая по меньшей мере третий и четвертый штаммы бактериофага, причем каждый из указанных третьего и четвертого штаммов характеризуется геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2 и SEQ ID NO:5, или ее указанный вариант.
10. Композиция по п. 1, в которой один из указанных по меньшей мере двух штаммов бактериофага представляет собой штамм, характеризующийся геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты согласно SEQ ID NO:5 или ее указанный вариант.
11. Композиция по п. 10, дополнительно содержащая по меньшей мере третий штамм бактериофага, причем указанный третий штамм характеризуется геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3 и SEQ ID NO:4, или ее указанный вариант.
12. Композиция по п. 10, дополнительно содержащая по меньшей мере третий и четвертый штаммы бактериофага, причем каждый из указанных третьего и четвертого штаммов характеризуется геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3 и SEQ ID NO:4, или ее указанный вариант.
13. Композиция, содержащая по меньшей мере пять выделенных штаммов бактериофага, причем указанные штаммы характеризуются геномами, которые содержат последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4 и SEQ ID NO:5 или их вариант, причем указанный вариант характеризуется по меньшей мере 95%-ной идентичностью последовательности относительно указанной последовательности нуклеиновой кислоты и демонстрирует антибактериальную активность против по меньшей мере одного из Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa и/или Acinetobacter baumannii.
14. Композиция по п. 13, в которой указанные штаммы бактериофага, характеризуются геномами, которые содержат последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, 2, 4 и 5 или их указанные варианты, и каждый присутствует в указанной композиции в количестве, приблизительно в 10 раз большем, чем указанный штамм бактериофага, характеризующийся геномом, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты согласно SEQ ID NO:3 или ее указанный вариант.
15. Композиция по п. 13, причем указанная композиция содержит указанные штаммы бактериофага, характеризующиеся геномами, которые содержат последовательности нуклеиновой кислоты согласно SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4 и SEQ ID NO:5.
16. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по любому из пп. 1-15 и фармацевтически приемлемый носитель.
17. Фармацевтическая композиция по п. 16, причем указанная композиция составлена для местного применения.
18. Фармацевтическая композиция по п. 16, причем указанная композиция содержит дополнительный стерильный буфер.
4
2
19. Фармацевтическая композиция по п. 18, в которой указанный буфер содержит приблизительно 0,05 M трис-HCl, приблизительно 0,1 M NaCl и приблизительно 10 мМ MgSO·7HO.
20. Фармацевтическая композиция по п. 16, причем указанная композиция содержится в ампуле.
21. Фармацевтическая композиция по п. 16, дополнительно содержащая дополнительное средство, причем указанное дополнительное средство выбрано из группы, состоящей из антибиотика и противовоспалительного средства, противовирусного средства, местно-анестезирующего средства, фактора роста и кортикостероида.
22. Фармацевтическая композиция по п. 21, в которой указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, причем указанный антибиотик характеризуется антибактериальной активностью против Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и/или Staphylococcus aureus.
23. Фармацевтическая композиция по п. 21, в которой указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, причем указанный антибиотик характеризуется антибактериальной активностью против бактерий, отличных от Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и Staphylococcus aureus.
3
13
2
24. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 16-23, причем указанная композиция предусмотрена для применения в лечении бактериальной инфекции, связанной с областью неинтактной кожи, и каждый из указанных штаммов фага присутствует в указанной композиции в количестве 10-10 фаговых частиц/см указанной области.
7
9
2
25. Фармацевтическая композиция по п. 24, в которой каждый из указанных штаммов фага присутствует в указанной композиции в количестве 10-10 фаговых частиц/см указанной области.
26. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по любому из пп. 2-5 и фармацевтически приемлемый носитель.
27. Фармацевтическая композиция по п. 26, причем указанная композиция составлена для местного применения.
28. Фармацевтическая композиция по п. 26 или 27, дополнительно содержащая дополнительное средство, причем указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, характеризующийся антибактериальной активностью против Staphylococcus aureus.
29. Фармацевтическая композиция по п. 26 или 27, дополнительно содержащая дополнительное средство, причем указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, характеризующийся антибактериальной активностью против бактерий, отличных от Staphylococcus aureus.
30. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по любому из пп. 6-9 и фармацевтически приемлемый носитель.
31. Фармацевтическая композиция по п. 30, причем указанная композиция составлена для местной доставки.
32. Фармацевтическая композиция по п. 30 или 31, дополнительно содержащая дополнительное средство, причем указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, характеризующийся антибактериальной активностью против Pseudomonas aeruginosa.
33. Фармацевтическая композиция по п. 30 или 31, дополнительно содержащая дополнительное средство, причем указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, характеризующийся антибактериальной активностью против бактерий, отличных от Pseudomonas aeruginosa.
34. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по любому из пп. 10-12 и фармацевтически приемлемый носитель.
35. Фармацевтическая композиция по п. 34, причем указанная композиция составлена для местного применения.
36. Фармацевтическая композиция по п. 34 или 35, дополнительно содержащая дополнительное средство, причем указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, характеризующийся антибактериальной активностью против Acinetobacter baumannii.
37. Фармацевтическая композиция по п. 34 или 35, дополнительно содержащая дополнительное средство, причем указанное дополнительное средство представляет собой антибиотик, характеризующийся антибактериальной активностью против бактерий, отличных от Acinetobacter baumannii.
38. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по любому из пп. 13-15 и фармацевтически приемлемый носитель.
39. Фармацевтическая композиция по п. 38, причем указанная композиция составлена для местного применения.
7
9
2
40. Фармацевтическая композиция по п. 38 или 39, причем указанная композиция предусмотрена для применения в лечении бактериальной инфекции, связанной с областью неинтактной кожи, и каждый из указанных штаммов фага присутствует в указанной композиции в количестве 10-10 фаговых частиц/см указанной области.
41. Способ лечения или профилактики бактериальной инфекции у нуждающегося в этом субъекта, предусматривающий введение указанному субъекту терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции по любому из пп. 16-25.
42. Способ по п. 41, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию, вызванную одним или несколькими из Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и Staphylococcus aureus.
43. Способ по п. 41 или 42, при котором фармацевтическую композицию вводят местно.
44. Способ по п. 43, при котором указанный субъект представляет собой млекопитающее.
45. Способ по п. 44, при котором указанное млекопитающее представляет собой человека.
46. Способ по п. 41 или 42, при котором указанная бактериальная инфекция связана с хронической язвой.
47. Способ по п. 41 или 42, при котором указанная бактериальная инфекция связана с ожоговой раной.
48. Способ по п. 41 или 42, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию диабетической стопы.
49. Способ по п. 48, при котором указанная инфекция диабетической стопы включает в себя кожную язву.
50. Способ по п. 41 или 42, при котором указанная бактериальная инфекция связана с областью неинтактной кожи, выбранной из повреждения кожи, связанного с воспалением подкожной клетчатки, рожистым поражением, пролежнем и намином.
51. Способ лечения или профилактики бактериальной инфекции у нуждающегося в этом субъекта, предусматривающий введение указанному субъекту терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции по любому из пп. 26-29.
52. Способ по п. 51, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию, вызванную Staphylococcus aureus.
53. Способ по п. 51 или 52, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию диабетической стопы.
54. Способ лечения или профилактики бактериальной инфекции у нуждающегося в этом субъекта, предусматривающий введение указанному субъекту терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции по любому из пп. 30-33.
55. Способ по п. 54, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию, вызванную Pseudomonas aeruginosa.
56. Способ по п. 54 или 55, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию диабетической стопы.
57. Способ лечения или профилактики бактериальной инфекции у нуждающегося в этом субъекта, предусматривающий введение указанному субъекту терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции по любому из пп. 34-37.
58. Способ по п. 57, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию, вызванную Acinetobacter baumannii.
59. Способ по п. 57 или 58, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию диабетической стопы.
60. Способ лечения или профилактики бактериальной инфекции у нуждающегося в этом субъекта, предусматривающий введение указанному субъекту терапевтически эффективного количества фармацевтической композиции по любому из пп. 38-40.
61. Способ по п. 60, при котором указанная бактериальная инфекция представляет собой инфекцию диабетической стопы.
62. Способ по п. 61, при котором указанное лечение предусматривает местное введение указанной композиции на кожную язву, связанную с указанной инфекцией диабетической стопы.
63. Способ по п. 62, при котором указанное введение следует за механическим иссечением нежизнеспособных тканей указанной язвы.
64. Способ по п. 62 или 63, при котором указанное введение предусматривает применение по меньшей мере одного из повязки, инсталляционного устройства и прибора для терапии ран отрицательным давлением.
65. Способ по п. 62 или 63, при котором указанную фармацевтическую композицию вводят каждые 4 или каждые 6 ч в течение первых 24 ч.
66. Способ по п. 65, при котором после указанных первых 24 ч указанную фармацевтическую композицию вводят каждые 12 или каждые 24 ч в течение по меньшей мере 3 дополнительных дней.
67. Способ по п. 66, при котором указанную фармацевтическую композицию вводят каждые 12 или каждые 24 ч в течение по меньшей мере 4 дополнительных дней.
68. Способ по п. 61 или 62, причем указанный способ использует в комбинации со стандартной терапией для инфекции диабетической стопы.
69. Способ по п. 68, при котором указанную стандартную терапию выбирают из группы, состоящей из заместительной терапии внеклеточным матриксом, влажной терапии раны, терапии раны отрицательным давлением, терапии путем артериальной реваскуляризации, гипербарической оксигенотерапии, введения антибиотика и введения фактора роста.
70. Способ по п. 69, при котором указанная влажная терапия раны предусматривает применение пленки с адгезивной основой, покрытой силиконом пены, гидрогеля и/или гидроколлоида.
71. Способ по п. 69 или 70, при котором указанная заместительная терапия внеклеточным матриксом предусматривает применение биоконструкционной ткани.
72. Способ по п. 69 или 70, при котором указанный антибиотик характеризуется антибактериальной активностью против Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и/или Staphylococcus aureus.
73. Способ по п. 72, при котором введение указанного антибиотика предусматривает системное введение.
74. Способ по п. 69 или 70, при котором указанный фактор роста представляет собой по меньшей мере один фактор роста, выбранный из группы, состоящей из тромбоцитарного фактора роста, гранулоцитарного колониестимулирующего фактора, эпидермального фактора роста, фактора роста фибробластов, фактора роста нервов и фактора роста сосудистого эндотелия.
75. Способ по п. 74, при котором введение указанного фактора роста предусматривает местное введение.
76. Способ по любому из п. 61 или 62, причем указанный способ используют в комбинации с нестандартной терапией для инфекции диабетической стопы, причем указанная инфекция диабетической стопы рефрактерна к стандартной терапии.