СПОСОБ АНАЛИЗА СОМАТИЧЕСКИХ МУТАЦИЙ В ГЕНЕ P13K С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ LNA-БЛОКИРУЮЩЕЙ МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ПЦР И ПОСЛЕДУЮЩЕЙ ГИБРИДИЗАЦИЕЙ С ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫМ БИОЛОГИЧЕСКИМ МИКРОЧИПОМ (БИОЧИПОМ)

1. Способ выявления соматических мутаций E542K, E545K, Q546K, H1047L и H1047R в гене PI3K, предусматривающий следующие стадии:
(а) - амплификация фрагментов гена PI3K с помощью LNA-блокирующей мультиплексной «гнездовой» ПЦР, в которой в качестве матрицы для амплификации используется образец опухолевой ДНК:
в первой реакции I этапа ПЦР используются праймеры (SEQ ID NO: 1, 2) и LNA-олигонуклеотид (SEQ ID NO: 7);
во второй реакции I этапа ПЦР используются праймеры (SEQ ID NO: 1, 2, 4, 5) и LNA-олигонуклеотиды (SEQ ID NO: 8, 9);
в первой реакции II этапа ПЦР используются праймеры (SEQ ID NO: 1, 3);
во второй реакции II этапа ПЦР используются праймеры (SEQ ID NO: 1, 3, 4, 6); в результате образуется флуоресцентно меченый ПЦР-продукт;
(б) - обеспечение биочипа для идентификации соматических мутаций в гене PI3K, содержащего набор иммобилизованных олигонуклеотидов с последовательностями, представленными в SEQ ID NO: 10-18;
(в) - гибридизация меченого ПЦР-продукта на биочипе;
(г) - регистрация и интерпретация результатов гибридизации.
2. Способ по п. 1, в котором регистрацию результатов гибридизации проводят с помощью устройства, способного регистрировать и записывать сигналы флуоресценции.
3. Способ по п. 1, в котором для идентификации соматических мутаций в гене PI3K, амплифицированных с помощью набора праймеров и LNA-олигонуклеотидов, охарактеризованных в п.1, используется биочип, представляющий собой подложку с набором иммобилизованных на ней олигонуклеотидов с последовательностями, представленными в SEQ ID NO: 10-18.