ОПРЕДЕЛЕНИЕ АКТИВНОСТИ ТКАНИ ПОСРЕДСТВОМ КОЛИЧЕСТВЕННОГО ГИСТОМОРФОЛОГИЧЕСКОГО АНАЛИЗА

1. Способ обучения классификатора ткани для осуществления количественной гистопатологической оценки, включающий:
преобразование изображения предметного стекла в бинарное изображение предметного стекла, при этом изображение предметного стекла выбрано из библиотеки контрольных изображений, при этом каждое изображение предметного стекла в библиотеке контрольных изображений ассоциировано с удовлетворительной классификацией или неудовлетворительной классификацией;
обнаружение одного или более ядер в пределах бинарного изображения предметного стекла;
извлечение признака из обнаруженного ядра для каждого обнаруженного ядра, при этом признак представляет собой свойство обнаруженного ядра в пределах бинарного изображения предметного стекла и содержит по меньшей мере одно из площади обнаруженного ядра, периметра обнаруженного ядра, интегральной плотности обнаруженного ядра или округлости обнаруженного ядра;
для каждого обнаруженного ядра, генерацию отличительного признака, ассоциируемого с бинарным изображением предметного стекла, на основании признака, при этом отличительный признак представляет собой численное значение, вычисленное из обработки признака;
включение бинарного изображения предметного стекла в кластер, при этом кластер содержит множество изображений, при этом каждое из множества изображений ассоциировано с соответствующим отличительным признаком, и при этом включение основано на сравнении отличительного признака с соответствующим отличительным признаком;
применение предельного верхнего значения к древовидной кластерной схеме для образования множества групп, при этом предельное верхнее значение минимизирует количество групп в пределах множества групп на основании многомерного анализа дисперсионного анализа кластера;
категоризацию первой группы в пределах множества групп как положительной контрольной группы, если первая группа содержит первые изображения предметного стекла, ассоциированные с удовлетворительной классификацией; и
категоризацию второй группы в пределах множества групп как отрицательной контрольной группы, если вторая группа содержит вторые изображения предметного стекла, ассоциированные с неудовлетворительной классификацией.
2. Способ по п. 1, в котором классификатор ткани выполнен с возможностью определения активности или качества ткани для трансплантации в тело субъекта.
3. Способ по п. 2, в котором ткань представляет собой ткань тимуса.
4. Способ по п. 3, в котором ткань представляет собой срезы аллогенного культивированного продукта, полученного из постнатальной ткани тимуса, для имплантации в субъекта-человека.
5. Способ по п. 4, в котором субъект-человек страдает полным синдромом Ди Георга, связанным с делецией 22q11.2; колобомой, пороком сердца, атрезией хоан, задержкой роста или развития, генитальной гипоплазией и аномалиями уха или глухотой - синдромом CHARGE, или атимией, связанной с дефицитом белка N1 семейства forkhead (FOXN1).
6. Способ по п. 2, в котором классификатор ткани определяет активность или качество ткани для трансплантации в тело субъекта неизвестной ткани для трансплантации посредством генерации отличительных признаков обнаруженных ядер в пределах изображений предметного стекла в контрольной библиотеке и кластеризации изображений предметного стекла на основании их соответствующих отличительных признаков.
7. Способ по п. 6, в котором неизвестная ткань представляет собой ткань тимуса.
8. Способ по п. 7, в котором ткань тимуса подвергали процессу культивирования в среде органа тимуса на протяжении периода времени для частичного обеднения ткани тимуса тимоцитами.
9. Способ по п. 8, в котором период времени составляет до 21 дня.
10. Способ по п. 8, в котором период времени составляет от приблизительно 12 дней до приблизительно 21 дня.
11. Способ по п. 8, в котором период времени составляет от приблизительно 5 до приблизительно 9 дней.
12. Способ по п. 8, в котором процесс культивирования сохраняет функциональное строение стромы тимуса.
13. Способ по п. 12, в котором строма тимуса содержит эпителиальные клетки тимуса и фибробласты.
14. Способ по п. 1, в котором ткань выбрана из группы, содержащей сосудистую ткань, ткань кожи, печёночную ткань, ткань поджелудочной железы, нервную ткань, мочеполовую ткань, желудочно-кишечную ткань, ткань скелета, включая кости и хрящи, жировую ткань, соединительную ткань, включая сухожилия и связки, амниотическую ткань, хориальную ткань, твёрдую мозговую оболочку, перикард, мышечную ткань, железистую ткань, ткань лицевой области, глазную ткань.
15. Способ по п. 1, в котором отличительный признак генерируют из измерений, содержащих численные значения площади обнаруженного ядра, периметра обнаруженного ядра, интегральной плотности обнаруженного ядра и округлости обнаруженного ядра.
16. Способ осуществления количественной гистопатологической оценки неклассифицированного изображения ткани на предметном стекле, включающий:
обнаружение гематоксилинового канала из неклассифицированного изображения предметного стекла, при этом гематоксилиновый канал ассоциирован с клеточным ядром в пределах неклассифицированного изображения ткани на предметном стекле;
извлечение признака из обнаруженного гематоксилинового канала, при этом признак представляет собой свойство ядра в пределах бинарного изображения предметного стекла и содержит по меньшей мере одно из площади ядра, периметра ядра, интегральной плотности ядра или округлости ядра;
генерацию, на основании признака, отличительного признака, ассоциированного с неклассифицированным изображением предметного стекла, при этом отличительный признак представляет собой численное значение, вычисленное из обработки признака;
совместную кластеризацию отличительного признака с первой группой отличительных признаков, категоризированной как положительная контрольная группа, или со второй группой отличительных признаков, категоризированной как отрицательная контрольная группа, при этом:
первую группу и вторую группу образуют путём применения предельного верхнего значения к древовидной кластерной схеме, и
положительная контрольная группа содержит первый набор изображений предметного стекла, ассоциированный с удовлетворительной классификацией, а отрицательная контрольная группа содержит второй набор изображений предметного стекла, ассоциированный с неудовлетворительной классификацией; и
определение, на основании совместной кластеризации, является ли отличительный признак ассоциированным с удовлетворительной классификацией или с неудовлетворительной классификацией.
17. Способ по п. 16, в котором отличительный признак выполнен с возможностью определения активности или качества ткани для трансплантации в тело субъекта.
18. Способ по п. 17, в котором ткань представляет собой ткань тимуса.
19. Способ по п. 18, в котором ткань представляет собой срезы аллогенного культивированного продукта, полученного из постнатальной ткани тимуса, для имплантации в субъекта-человека.
20. Способ по п. 19, в котором субъект-человек страдает полным синдромом Ди Георга, связанным с делецией 22q11.2; колобомой, пороком сердца, атрезией хоан, задержкой роста или развития, генитальной гипоплазией и аномалиями уха или глухотой - синдромом CHARGE, или атимией, связанной с дефицитом белка N1 семейства forkhead (FOXN1).
21. Способ по п. 17, в котором отличительный признак определяет активность или качество ткани для трансплантации в тело субъекта неизвестной ткани посредством генерации отличительных признаков обнаруженных ядер в пределах изображений предметного стекла в контрольной библиотеке и кластеризации изображений предметного стекла на основании их соответствующих отличительных признаков.
22. Способ по п. 21, в котором неизвестная ткань представляет собой ткань тимуса.
23. Способ по п. 22, в котором ткань тимуса подвергали процессу культивирования в среде органа тимуса на протяжении периода времени для частичного обеднения ткани тимуса тимоцитами.
24. Способ по п. 23, в котором период времени составляет до 21 дня.
25. Способ по п. 23, в котором период времени составляет от приблизительно 12 дней до приблизительно 21 дня.
26. Способ по п. 23, в котором период времени составляет от приблизительно 5 до приблизительно 9 дней.
27. Способ по п. 23, в котором процесс культивирования сохраняет функциональное строение стромы тимуса.
28. Способ по п. 27, в котором строма тимуса содержит эпителиальные клетки тимуса и фибробласты.
29. Способ по п. 16, в котором ткань выбрана из группы, содержащей сосудистую ткань, ткань кожи, печёночную ткань, ткань поджелудочной железы, нервную ткань, мочеполовую ткань, желудочно-кишечную ткань, ткань скелета, включая кости и хрящи, жировую ткань, соединительную ткань, включая сухожилия и связки, амниотическую ткань, хориальную ткань, твёрдую мозговую оболочку, перикард, мышечную ткань, железистую ткань, ткань лицевой области, глазную ткань.
30. Способ по п. 17, в котором отличительный признак генерируют из измерений, содержащих численные значения площади обнаруженного ядра, периметра обнаруженного ядра, интегральной плотности обнаруженного ядра и округлости обнаруженного ядра.
31. Система классификации объектов в пределах цифровых изображений ткани, содержащая:
средство для преобразования изображения предметного стекла в бинарное изображение предметного стекла, при этом изображение предметного стекла выбрано из библиотеки контрольных изображений, при этом каждое изображение предметного стекла в библиотеке контрольных изображений ассоциировано с удовлетворительной классификацией или неудовлетворительной классификацией;
средство для обнаружения одного или более ядер в пределах бинарного изображения предметного стекла;
средство для извлечения признака для каждого обнаруженного ядра, при этом признак представляет собой свойство обнаруженного ядра в пределах бинарного изображения предметного стекла и содержит по меньшей мере одно из площади обнаруженного ядра, периметра обнаруженного ядра, интегральной плотности обнаруженного ядра или округлости обнаруженного ядра;
средство для генерации отличительного признака, ассоциируемого с бинарным изображением предметного стекла, на основании признака, при этом отличительный признак представляет собой численное значение, вычисленное из обработки признака;
средство для включения бинарного изображения предметного стекла в кластер, при этом кластер содержит множество изображений, при этом каждое из множества изображений ассоциировано с соответствующим отличительным признаком, и при этом включение основано на сравнении отличительного признака с соответствующим отличительным признаком;
средство для применения предельного верхнего значения к древовидной кластерной схеме для образования множества групп, при этом предельное верхнее значение минимизирует количество групп в пределах множества групп на основании многомерного анализа дисперсионного анализа кластера;
средство для категоризации первой группы в пределах множества групп как положительной контрольной группы, если первая группа содержит первые изображения предметного стекла, ассоциированные с удовлетворительной классификацией; и
средство для категоризации второй группы в пределах множества групп как отрицательной контрольной группы, если вторая группа содержит вторые изображения предметного стекла, ассоциированные с неудовлетворительной классификацией.
32. Система по п. 31, выполненная с возможностью определения активности или качества ткани для трансплантации в тело субъекта.
33. Система по п. 32, в которой ткань представляет собой ткань тимуса.
34. Система по п. 33, в которой ткань тимуса представляет собой срезы аллогенного культивированного продукта, полученного из постнатальной ткани тимуса, для имплантации в субъекта-человека.
35. Система по п. 34, в которой субъект-человек страдает полным синдромом Ди Георга, связанным с делецией 22q11.2; колобомой, пороком сердца, атрезией хоан, задержкой роста или развития, генитальной гипоплазией и аномалиями уха или глухотой - синдромом CHARGE, или атимией, связанной с дефицитом белка N1 семейства forkhead (FOXN1).
36. Система по п. 31, выполненная с возможности классификации активности или качества ткани для трансплантации в тело субъекта неизвестной ткани посредством генерации отличительных признаков обнаруженных ядер в пределах изображений предметного стекла в контрольной библиотеке и кластеризации изображений предметного стекла на основании их соответствующих отличительных признаков.
37. Система по п. 36, в которой неизвестная ткань представляет собой ткань тимуса.
38. Система по п. 37, в которой ткань тимуса подвергнута процессу культивирования в среде органа тимуса на протяжении периода времени для частичного обеднения ткани тимуса тимоцитами.
39. Система по п. 38, в которой период времени составляет до 21 дня.
40. Система по п. 38, в которой период времени составляет от приблизительно 12 дней до приблизительно 21 дня.
41. Система по п. 38, в которой период времени составляет от приблизительно 5 до приблизительно 9 дней.
42. Система по п. 38, в которой процесс культивирования сохраняет функциональное строение стромы тимуса.
43. Система по п. 42, в которой строма тимуса содержит эпителиальные клетки тимуса и фибробласты.
44. Система по п. 31, в которой ткань выбрана из группы, содержащей сосудистую ткань, ткань кожи, печёночную ткань, ткань поджелудочной железы, нервную ткань, мочеполовую ткань, желудочно-кишечную ткань, ткань скелета, включая кости и хрящи, жировую ткань, соединительную ткань, включая сухожилия и связки, амниотическую ткань, хориальную ткань, твёрдую мозговую оболочку, перикард, мышечную ткань, железистую ткань, ткань лицевой области, глазную ткань.
45. Система по п. 36, в которой отличительный признак сгенерирован из измерений, содержащих численные значения площади обнаруженного ядра, периметра обнаруженного ядра, интегральной плотности обнаруженного ядра и округлости обнаруженного ядра.
46. Классификатор, содержащий:
средство для обнаружения гематоксилинового канала из неклассифицированного изображения предметного стекла, при этом гематоксилиновый канал ассоциирован с клеточным ядром в пределах неклассифицированного изображения ткани на предметном стекле;
средство для извлечения признака из обнаруженного гематоксилинового канала, при этом признак представляет собой свойство ядра в пределах бинарного изображения предметного стекла и содержит по меньшей мере одно из площади ядра, периметра ядра, интегральной плотности ядра или округлости ядра;
средство для генерации, на основании признака, отличительного признака, ассоциированного с неклассифицированным изображением предметного стекла, при этом отличительный признак представляет собой численное значение, вычисленное из обработки признака;
средство для совместной кластеризации отличительного признака с первой группой отличительных признаков, категоризированной как положительная контрольная группа, и со второй группой отличительных признаков, категоризированной как отрицательная контрольная группа, при этом:
первая группа и вторая группа образованы путём применения предельного верхнего значения к древовидной кластерной схеме, и
положительная контрольная группа содержит первый набор изображений предметного стекла, ассоциированный с удовлетворительной классификацией, а отрицательная контрольная группа содержит второй набор изображений предметного стекла, ассоциированный с неудовлетворительной классификацией; и
средство для определения, на основании совместной кластеризации, является ли отличительный признак ассоциированным с удовлетворительной классификацией или с неудовлетворительной классификацией.
47. Классификатор по п. 46, в котором система выполнена с возможностью определения активности или качества ткани для трансплантации в тело субъекта.
48. Классификатор по п. 47, в котором ткань представляет собой ткань тимуса.
49. Классификатор по п. 48, в котором ткань тимуса представляет собой срезы аллогенного культивированного продукта, полученного из постнатальной ткани тимуса, для имплантации в субъекта-человека.
50. Классификатор по п. 49, в котором субъект-человек страдает полным синдромом Ди Георга, связанным с делецией 22q11.2; колобомой, пороком сердца, атрезией хоан, задержкой роста или развития, генитальной гипоплазией и аномалиями уха или глухотой - синдромом CHARGE, или атимией, связанной с дефицитом белка N1 семейства forkhead (FOXN1).
51. Классификатор по п. 46, в котором система выполнена с возможностью классификации активности неизвестной ткани посредством генерации отличительных признаков обнаруженных ядер в пределах изображений предметного стекла в контрольной библиотеке и кластеризации изображений предметного стекла на основании их соответствующих отличительных признаков.
52. Классификатор по п. 51, в котором неизвестная ткань представляет собой ткань тимуса.
53. Классификатор по п. 52, в котором ткань тимуса подвергнута процессу культивирования в среде органа тимуса на протяжении периода времени для частичного обеднения ткани тимуса тимоцитами.
54. Классификатор по п. 53, в котором период времени составляет до 21 дня.
55. Классификатор по п. 53, в котором период времени составляет от приблизительно 12 дней до приблизительно 21 дня.
56. Классификатор по п. 53, в котором период времени составляет от приблизительно 5 до приблизительно 9 дней.
57. Классификатор по п. 53, в котором процесс культивирования сохраняет функциональное строение стромы тимуса.
58. Классификатор по п. 57, в котором строма тимуса содержит эпителиальные клетки тимуса и фибробласты.
59. Классификатор по п. 46, в котором ткань выбрана из группы, содержащей сосудистую ткань, ткань кожи, печёночную ткань, ткань поджелудочной железы, нервную ткань, мочеполовую ткань, желудочно-кишечную ткань, ткань скелета, включая кости и хрящи, жировую ткань, соединительную ткань, включая сухожилия и связки, амниотическую ткань, хориальную ткань, твёрдую мозговую оболочку, перикард, мышечную ткань, железистую ткань, ткань лицевой области, глазную ткань.
60. Классификатор по п. 46, в котором отличительный признак сгенерирован из измерений, содержащих численные значения площади обнаруженного ядра, периметра обнаруженного ядра, интегральной плотности обнаруженного ядра и округлости обнаруженного ядра.