Вакцины против Chlamydia sp.

1. Полипептид, содержащий 3 или более единиц иммуно-повтора, экспонированных на поверхности фрагментов МОМР-белка, где иммуно-повтор состоит из
a) одной единицы иммуно-повтора, содержащей аминокислотную последовательность, которая содержит один или несколько экспонированных на поверхности фрагментов МОМР-белка, из любого серотипа Chlamydia sp.; и
b) двух или более дополнительных единиц иммуно-повтора, содержащих аминокислотную последовательность, которая представляет собой ту же последовательность, что определена в а), или двух или более дополнительных единиц иммуно-повтора, содержащих VD4 область МОМР-белка из любого серотипа Chlamydia sp.
2. Полипептид по п. 1, где иммуно-повторы являются гомологичными или гетерологичными.
3. Полипептид по п. 1 или 2, где белок наружной мембраны представляет собой МОМР из С. pneumoniae, или серотипа D, Е, F, G, Ia или J Chlamydia trachomatis.
4. Полипептид по п. 1, содержащий один или несколько вариабельных доменов 1, 2, 3, 4 из МОМР.
5. Полипептид по п. 1, где аминокислотные последовательности необязательно линеаризованы.
6. Полипептид по п. 1, где аминокислотные последовательности, содержащие вариабельные домены 4 (VD4) из МОМР, находятся рядом друг с другом или разделены линкером.
7. Полипептид по п. 6, содержащий аминокислотную последовательность, определенную в формуле I
,
где VD4 независимо выбран из SEQ ID NO. 15-20 или аминокислотной последовательности, которая характеризуется по меньшей мере 80% идентичностью последовательности по отношению к таковой,
и
1
xx состоит из
i) аминокислотной последовательности
EWQASLALSYRLNMFTPYIGVKWSRASFDADTIRIAQPK (SEQ ID NO 21) или
ii) подпоследовательности аминокислотной последовательности из i), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-38 аминокислотных остатков, начиная с K на С-конце в аминокислотной последовательности из i),
и
2
хх состоит из
iii) аминокислотной последовательности
DTMQIVSLQLNKMKSRKSCGIAVGTTIVDA (SEQ ID NO 22) или
iv) подпоследовательности аминокислотной последовательности из iii), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-29 аминокислотных остатков, начиная с D на N-конце в аминокислотной последовательности из iii).
8. Полипептид по п. 6 или 7, где указанные последовательности выбраны из SEQ ID NO 23-28: 49-59.
9. Полипептид по п. 1, дополнительно содержащий фрагмент, который содержит вариабельные домены 1 (VD1) из МОМР, и где аминокислотные последовательности, содержащие (VD1) из МОМР, находятся рядом друг с другом или разделены линкером.
10. Полипептид по п. 9, содержащий аминокислотную последовательность, определенную в формуле II
,
где VD1 независимо выбран из SEQ ID NO. 1-6 или аминокислотной последовательности, которая характеризуется по меньшей мере 80% идентичностью последовательности по отношению к таковой,
и
1
yy состоит из
v) аминокислотной последовательности
DAISMRVGYYGDFVFDRVLKTDVNKEFQMG (SEQ ID NO 7) или
vi) подпоследовательности аминокислотной последовательности из v), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-30 аминокислотных остатков, начиная с G на С-конце в аминокислотной последовательности из v),
и
2
уу состоит из
vii) аминокислотной последовательности NPAYGRHMQDAEMFTNAA (SEQ ID NO 8) или
viii) подпоследовательности аминокислотной последовательности из vii), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-18 аминокислотных остатков, начиная с N на N-конце в аминокислотной последовательности из vii).
11. Полипептид по п. 9 или 10, где указанные последовательности выбраны из SEQ ID NO 9-14, 45-48.
12. Полипептид по п. 1, дополнительно содержащий фрагмент, который содержит вариабельные домены 2 (VD2) из МОМР, и где аминокислотные последовательности, содержащие (VD2) из МОМР, находятся рядом друг с другом или разделены линкером.
13. Полипептид по п. 12, содержащий аминокислотную последовательность, определенную в формуле III
,
где VD2 независимо выбран из SEQ ID NO 29-34 или аминокислотной последовательности, которая характеризуется по меньшей мере 80% идентичностью последовательности по отношению к таковой, и
1
zz состоит из
ix) аминокислотной последовательности
TLGATSGYLKGNSASFNLVGLFG (SEQ ID NO 35) или
x) подпоследовательности аминокислотной последовательности из ix), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-23 аминокислотных остатка, начиная с G на С-конце в аминокислотной последовательности из ix),
и
2
хх состоит из
xi) аминокислотной последовательности
VVELYTDTTFAWSVGARAALWE (SEQ ID NO 36) или
viii) подпоследовательности аминокислотной последовательности из xi), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-22 аминокислотных остатка, начиная с V на N-конце в аминокислотной последовательности из xi).
14. Полипептид по п. 1, дополнительно содержащий фрагмент, который содержит вариабельные домены 3 (VD3) из МОМР, и где аминокислотные последовательности, содержащие (VD3) из МОМР, находятся рядом друг с другом или разделены линкером.
15. Полипептид по п. 14, содержащий аминокислотную последовательность, определенную в формуле IV
,
где VD3 независимо выбран из SEQ ID NO. 37-42 или аминокислотной последовательности, которая характеризуется по меньшей мере 80% идентичностью последовательности по отношению к таковой,
и
1
qq состоит из
xiii) аминокислотной последовательности
ATLGASFQYAQSKPKVEELNVLCNAAEFTINKPKGYVG (SEQ ID NO. 43) или
xiv) подпоследовательности аминокислотной последовательности из xiii), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-22 аминокислотных остатка, начиная с G на С-конце в аминокислотной последовательности из xiii),
и
2
qq состоит из
xv) аминокислотной последовательности
TGTKDASIDYHEWQASLALSYRLNMFTPYIGVKWS (SEQ ID NO 44) или
xvi) подпоследовательности аминокислотной последовательности из xv), при этом указанная подпоследовательность содержит 1-35 аминокислотных остатков, начиная с Т на N-конце в аминокислотной последовательности из xv).
16. Полипептид по п. 1, дополнительно содержащий фрагмент, который способствует экспорту полипептида после того, как он получен рекомбинантно (например, сигнальные пептиды), фрагмент, который способствует очистке белка слияния (например, гистидиновые метки), и/или фрагмент, который усиливает иммуногенность (например, Т-клеточный антиген).
17. Полипептид по п. 16, где энхансером иммуногенности является дополнительная Т-клеточня мишень, которая выбрана из Ct антигена, такого как СТ043, СТ004, СТ414, СТ681, или его части.
18. Полипептид по п. 17, где указанные последовательности выбраны из SEQ ID NO. 60-68.
19. Полипептид по п. 1, при этом указанный полипептид обладает способностью
-3
a) нейтрализовать серовар D С. trachomatis in vitro с 50% титром нейтрализации 10 или менее при тестировании в постановке эксперимента, включающего введение гетерологичных иммуно-повторов;
b) нейтрализовать серовар D С. trachomatis in vivo по меньшей мере у 50% мышей на 7 сутки после инфицирования при тестировании на мышиной модели, включающем введение гетерологичных иммуно-повторов;
c) расширять иммунный ответ на несколько сероваров С. trachomatis in vitro при введении гетерологичных иммуно-повторов.
20. Нуклеиновая кислота, кодирующая полипептид по любому из предыдущих пунктов.
21. Фармацевтическая композиция, содержащая полипептид по любому из пп. 1-19 или нуклеиновую кислоту по п. 20.
22. Фармацевтическая композиция по п. 21, где соединение является вакциной.
23. Фармацевтическая композиция по п. 22, дополнительно содержащая фармакологически приемлемый носитель, вспомогательное средство, адъювант или иммуномодулятор.
24. Фармацевтическая композиция по п. 23, где адъювант представляет собой DDA/TDB или квасцы.
25. Фармацевтическая композиция по п. 23, где носитель представляет собой вирусоподобную частицу.
26. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 21-25 для профилактического или терапевтического применения против инфекций Chlamydia sp., включая инфекции Chlamydia trachomatis или С. pneumoniae.
27. Способ предупреждения, лечения и/или снижения частоты возникновения инфекций Chlamydia sp., включая инфекции Chlamydia trachomatis и С. pneumoniae, при этом указанный способ включает введение фармацевтической композиции по п. 26.