ИДЕНТИФИКАЦИЯ ПАЦИЕНТОВ, НУЖДАЮЩИХСЯ В СОВМЕСТНОЙ ТЕРАПИИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ИНГИБИТОРА PD-L1
IDENTIFICATION OF PATIENTS IN NEED OF COMBINED THERAPY WITH PD-L1 INHIBITOR

Настоящее изобретение относится к средствам и способам определения нуждается ли пациент в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1. Пациент рассматривается как нуждающийся в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если in vitro в образце из организма пациента выявлен низкий уровень или отсутствие экспрессии ER и повышенный по сравнению с контролем уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1). Пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) (типа трастузумаба) и химиотерапевтическое средство (типа додетаксела), или такая терапия показана для пациента. В настоящем описании представлены также средства и способы лечения рака у ракового больного, для которого показана терапия, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) (типа трастузумаба) и химиотерапевтическое средство (типа додетаксела), где пациента можно подвергать совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1.
neu
HER-семейство рецепторных тирозинкиназ является важными медиаторами роста, дифференцировки и выживания клеток. Семейство рецепторов включает четыре различных представителя, включая рецептор эпидермального фактора роста (EGFR, ErbB1 или HER1), HER2 (ErbB2 или p185), HER3 (ErbB3) и HER4 (ErbB4 или tyro2).
EGFR, кодируемый геном erbB1, является этиологическим фактором злокачественных заболеваний человека. В частности, повышенная экспрессия EGFR обнаружена при раке молочной железы, мочевого пузыря, легкого, головы, шеи и желудка, а также глиобластомах. Повышенная экспрессия EGFR-рецептора часто ассоциирована с повышенным производством лиганда EGFR, такого как трансформирующий фактор роста-альфа (TGF-α), одними и теми же опухолевыми клетками, что приводит к активации рецептора с помощью аутокринного пути стимуляции (Baselga и Mendelsohn, Pharmac. Ther., 64, 1994, сс. 127-154). Моноклональные антитела, направленные против EGFR или его лигандов, т.е. TGF-α и EGF, были исследованы в качестве терапевтических средств, предназначенных для лечения указанных злокачественных заболеваний (см., например, Baselga и Mendelsohn., выше; Masui и др., Cancer Research, 44, 1984, сс. 1002-1007 и Wu и др., J. Clin. Invest., 95, 1995, сс. 1897-1905).
neu
Второй представитель семейства HER, р185, впервые был идентифицирован как продукт трансформирующего гена из нейробластом обработанных химическими средствами крыс. Активированная форма протоонкогена neu является результатом точечной мутации (замена валина на глутаминовую кислоту) в трансмембранной области кодируемого белка. Амплификация человеческого гомолога neu обнаружена при раке молочной железы и яичника и коррелирует с плохим прогнозом (Slamon и др., Science, 235, 1987, сс. 177-182; Slamon и др., Science, 244, 1989, сс. 707-712 и US №4968603). К настоящему времени в человеческих опухолях не описаны никакие аналоги точкой мутации, приводящие к появлению протоонкогена neu. Сверхэкспрессия HER2 (часто, но не всегда, обусловленная амплификацией гена) обнаружена также при других карциномах, включая карциномы желудка, эндометрия, слюнной железы легкого, почки, ободочной кишки, щитовидной железы, поджелудочной железы и мочевого пузыря (см. среди прочего King и др., Science, 229, 1985, с. 974; Yokota и др., Lancet, 1, 1986, сс. 765-767; Fukushige и др., Mol Cell Biol., 6, 1986, сс. 955-958; Guerin и др., Oncogene Res., 3, 1988, сс. 21-31; Cohen и др., Oncogene, 4, 1989, сс. 81-88; Yonemura и др., Cancer Res., 51, 1991, с. 1034; Borst и др., Gynecol. Oncol, 38, 1990, с. 364; Weiner и др., Cancer Res., 50, 1990, сс. 421-425; Kern и др., Cancer Res., 50, 1990, с. 5184; Park и др., Cancer Res., 49, 1989, с. 6605; Zhau и др., Mol. Carcinog., 3, 1990, сс. 254-257; Aasland и др., Br. J. Cancer 57, 1988, сс. 358-363; Williams и др., Pathobiology, 59, 1991, сс. 46-52 и McCann и др., Cancer, 65, 1990, сс. 88-89). Может иметь место сверхэкспрессия HER2 при раке предстательной железы (Gu и др., Cancer Lett., 99, 1996, сс. 185-189; Ross и др., Hum. Pathol. 28, 1997, сс. 827-833; Ross и др., Cancer, 79, 1997, сс. 2162-2170 и Sadasivan и др., J. Urol., 150, 1993, сс. 126-131).
neu
neu
neu
Описаны антитела, направленные против белковых продуктов крысиного p185 и человеческого HER2. Drebin с коллегами получили антитела к продукту крысиного гена neu, p185 (см., например, Drebin и др., Cell, 41, 1985, сс. 695-706; Myers и др., Meth. Enzym., 198, 1991, сс. 277-290 и WO 94/22478). У Drebin и др., Oncogene, 2, 1988, сс. 273-277 описано, что смеси антител, дающие реакцию с двумя различными областями р185, обладают синергетическим противоопухолевым действием в отношении трансформированных neu клеток линии NIH-3T3, имплантированных бестимусным мышам (см., также US 5824311, выданный 20 октября 1998 г.)
У Hudziak и др., Mol. Cell. Biol., 9(3), 1989, сс. 1165-1172 описано создание панели антител к HER2, которые характеризовали с использованием человеческих клеток опухоли молочной железы линии SK-BR-3. Относительную пролиферацию SK-BR-3-клеток после воздействия антител определяли путем окрашивания монослоев кристаллическим фиолетовым через 72 ч. С помощью такого анализа установлено, что максимальное ингибирование имело место при применении антитела, обозначенного как 4D5, которое ингибировало клеточную пролиферацию на 56%. В этом анализе другие антитела из этой панели снижали клеточную пролиферацию в меньшей степени. Установлено также, что антитело 4D5 повышало чувствительность сверхэкспрессирующих HER2 линий клеток опухолей молочной железы к цитотоксическим действиям TNF-α (см. также US №5,677,171 выданный 14 октября 1997 г.). Антитела к HER2, которые описаны у Hudziak с соавторами, дополнительно охарактеризованы у Fendly и др., Cancer Research, 50, 1990, сс. 1550-1558; Kotts и др., In Vitro, 26(3), 1990, с. 59А; Sarup и др., Growth Regulation, 1, 1991, сс. 72-82; Shepard и др., J. Clin. Immunol., 11(3), 1991, сс. 117-127; Kumar и др., Mol. Cell. Biol., 11(2), 1991, сс. 979-986; Lewis и др., Cancer Immunol. Immunother., 37, 1991, сс. 255-263; Pietras и др., Oncogene, 9, 1991, сс. 1829-1838; Vitetta и др., Cancer Research, 54, 1991, сс. 5301-5309; Sliwkowski и др., J. Biol. Chem., 269(20), 1991, сс. 14661-14665; Scott и др., J. Biol. Chem., 266, 1991, сс. 14300-14305; D'souzan др., Proc. Natl. Acad. Sci., 91, 1991, cc. 7202-7206; Lewis и др., Cancer Research, 56, 1996, cc. 1457-1465 и Schaefer и др., Oncogene, 15, 1997, cc. 1385-1394).
Для рекомбинантной гуманизированной версии мышиного антитела к HER2 4D5 (huMAb4D5-8, rhuMAb HER2, трастузумаб или Herceptin™; US 5821337) была выявлена клиническая активность в отношении пациентов со сврехэкпрессирующим HER2 метастатическим раком молочной железы, которые получали экстенсивную противораковую терапию (Baselga и др., J. Clin. Oncol., 14, 1996, сс. 737-744). В сентябре 1998 г. Департамент по контролю за качеством пищевых продуктов, медикаментов и косметических средств одобрил продажу трастузумаба для лечения пациентов с метастатическим раком молочной железы в тех случаях, когда в опухолях имеет место сверхэкспрессия белка HER2.

Гуманизированные антитела к ErbB2 включают huMAb4D5-1, huMAb4D5-2, huMAb4D5-3, huMAb4D5-4, huMAb4D5-5, huMAb4D5-6, huMAb4D5-7 и huMAb4D5-8 (HERCEPTIN), которые описаны в таблице 3 в US 5821337, который специально включен в настоящее описание в качестве ссылки; гуманизированное антитело 520С9 (WO 93/21319) и гуманизированные антитела 2С4, описанные в WO 01/000245, которая специально включена в настоящее описание в качестве ссылки.
Пертузумаб (см., например, WO 01/000245) является первым из нового класса агентов, известных как ингибиторы димеризации HER (HDI). Пертузумаб связывается с HER2 в его домене димкризации, ингибируя тем самым его способность образовывать активные димерные рецепторные комплексы и блокируя таким образом последующий каскад передачи сигналов, который в конце концов приводит к росту и делению клеток (см. Franklin М.С., Cancer Cell, 5, 2004, сс. 317-328). Пертузумаб представляет собой полностью гуманизированное рекомбинантное моноклональное антитело, направленное против внеклеточного домена HER2. Связывание пертузумаба с HER2 на человеческих эпителиальных клетках мешает HER2 образовывать комплексы с другими представителями семейства HER (включая EGFR, HER3, HER4) и вероятно также препятствует гомодимеризации HER2. Путем блокады образования комплексов пертузумаб предупреждает стимулирующие рост действия и сигналы выживания клеток, которые активируются лигандами HER1, HER3 и HER4 (например, EGF, TGF-альфа, амфирегулин и херегулины). Другим названием пертузумаба является 2С4. Пертузумаб представляет собой полностью гуманизированное рекомбинантное моноклональное антитело на основе каркасных последовательностей человеческого IgG1(K). Структура пертузумаба состоит из двух тяжелых цепей (449 остатков) и двух легких цепей (214 остатков). От трастузумаба (Herceptin) пертузумаб отличается 12 аминокислотами в легкой цепи и 29 аминокислотами в тяжелой цепи IgG1.
Другие антитела к HER2 с различными свойствами описаны у Tagliabue и др., Int. J. Cancer, 47, 1991, сс. 933-937; McKenzie и др., Oncogene, 4, 1989, сс. 543-548; Maier и др., Cancer Res., 51, 1991, сс. 5361-5369; Bacus и др., Molecular Carcinogenesis, 3, 1990, сс. 350-362; Stancovski и др., PNAS (USA), 88, 1991, сс.8691-8695; Bacus и др., Cancer Research, 52, 1992, сс. 2580-2589; Xu и др., Int. J. Cancer, 53, 1993, сс. 401-408; WO 94/00136; Kasprzyk и др., Cancer Research, 52, 1992, cc. 2771-2776; Hancock и др., Cancer Res., 51, 1991, cc. 4575-4580; Shawver и др., Cancer Res., 54, 1994, cc. 1367-1373; Arteaga и др., Cancer Res., 54, 1994, cc. 3758-3765; Harwerth и др., J. Biol. Chem., 267, 1992, cc. 15160-15167; US №5783186 и Klapper и др., Oncogene, 14, 1997, cc. 2099-2109.
Скрининг на основе гомологии привел к идентификации двух других представителей семейства рецепторов HER: HER3 (US 5183884 и 5480968, а также Kraus и др., PNAS (USA), 86, 1989, сс. 9193-9197) и HER4 (заявка на европейский патент №599274; Plowman и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 1993, cc. 1746-1750 и Plowman и др., Nature, 366, 1993, cc. 473-475). Для обоих указанных рецепторов обнаружена повышенная экспрессия по меньшей мере в некоторых клеточных линиях рака молочной железы.
Рецепторы HER, как правило, встречаются в различных комбинациях в клетках и гетеродимеризация, вероятно, приводит к увеличению разнообразия клеточных ответов на различные лиганды HER (Earp и др., Breast Cancer Research and Treatment, 35, 1995, cc. 115-132). EGFR связывается шестью различными лигандами: эпидермальным фактором роста (EGF), трансформирующим фактором роста-альфа (TGF-α), амфирегулином, гепаринсвязывающим эпидермальным фактором роста (HB-EGF), бетацеллулином и эпирегулином (Groenen и др., Growth Factors, 11, 1994, сс. 235-257). Белки семейства херегулинов, образующиеся в результате альтернативного сплайсинга одного гена, являются лигандами для HER3 и HER4. Семейство херегулинов включает альфа-, бета и гамма-херегулины (Holmes и др., Science, 256, 1992, сс. 1205-1210; US 5641869 и Schaefer и др., Oncogene, 15, 1997, сс. 1385-1394); neu-факторы дифференцировки (NDF), глиальные факторы роста (GGF); факторы, индуцирующие активность ацетилхолинового рецептора (ARIA), и фактор, выведенный из сенсорных и моторных нейронов (SMDF) (см. обзор у Groenen и др., Growth Factors 11, 1994, сс. 235-257; Lemke G. Molec. & Cell. Neurosci. 7, 1996, cc. 247-262 и Lee и др., Pharm. Rev., 47, 1995, cc. 51-85). В последние годы идентифицировано три дополнительных лиганда HER: нейрегулин-2 (NRG-2), который, как описано, связывается либо с HER3, либо с HER4 (Chang и др., Nature, 387, 1997, сс.509-512 и Carraway и др., Nature, 387, 1997, сс. 512-516); нейрегулин-3, который связывается с HER4 (Zhang и др., PNAS (USA), 94(18), 1997, сс. 9562-9567); и нейрегулин-4, который связывается с HER4 (Harari и др., Oncogene, 18, 1999, сс. 2681-2689), HB-EGF, бетацеллулин и эпирегулин также связываются с HER4.
Хотя EGF и TGFα не связываются с HER2, EGF стимулирует образование гетеродимера EGFR и HER2, который активирует EGFR и приводит к трансфосфорилированию HER2 в гетеродимере. Димеризация и/или трансфосфорилирование, вероятно, активируют тирозинкиназу HER2 (см. Earp и др., выше). Аналогично этому, при совместной экспрессии HER3 с HER2 образуется активный передающий сигналы комплекс, и антитела, направленные против HER2, обладают способностью разрушать этот комплекс (Sliwkowski и др., J. Biol. Chem., 269(20), 1994, сс. 14661-14665). Кроме того, аффинность HER3 к херегулину (HRG) возрастает до более высокого уровня аффинности при его совместной экспрессии с HER2 (см. также Levi и др., Journal of Neuroscience 15 1995 сс. 1329-1340; Morrissey и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92, 1995, cc. 1431-1435 и Lewis и др., Cancer Res., 56, 1996, сс. 1457-1465 данные, касающиеся белкового комплекса HER2-HER3). HER4, аналогично HER3, образует активный передающий сигналы комплекс с HER2 (Carraway и Cantley, Cell, 78, 1994, сс. 5-8).
В данной области описаны также композиции вариантов антител. В US №6339142 описана композиция антител к HER2, содержащая смесь антитела к HER2 и один или несколько его кислотных вариантов, в которой количество кислотного(ых) варианта(ов) ниже, чем примерно 25%. Трастузумаб является примером антитела к HER2. Reid с соавторами в постере «Effects of Cell Culture Process Changes on Humanized Antibody Characteristics)), представленном на конференции Well Characterized Biotech Pharmaceuticals (январь, 2003 г.), описали не имеющую названия композицию гуанизированного антитела в виде IgG1 с N-концевыми гетерогенностями в результате комбинаций с сигнальным пептидом VHS, N-концевым глутамином и пироглутаминовой кислотой на его тяжелой цепи. Harris с соавторами в докладе «The Ideal Chromatographic Antibody Characterization Method)), представленном на конференции IBC Antibody Production (февраль 2002 г.) описали VHS-удлинение на тяжелой цепи Е25, гуманизированного антитела к IgE. Rouse с соавторами в постере, представленном на конференции WCBP «Glycoprotein Characterization by High Resolution Mass Spectrometry and Its Application to Biopharmaceutical Development)) (6-9 января 2004 г.), описали композицию моноклонального антитела с N-концевой гетерогенностью в результате присоединения сигнального пептида AHS или HS к его легкой цепи. В частности, на конференции IBC (сентябрь 2000 г.) «Strategic Use of Comparability Studies and Assays for Well Characterized Biologicals» Jill Porter представил полученную в результате последней элюции форму ZENAPAX™ с тремя дополнительными аминокислотными остатками на тяжелой цепи. В US 2006/0018899 описана композиция, содержащая основную форму антитела пертузумаб и его вариант с удлинением на аминоконце с помощью лидерной последовательности, а также другие варианты антитела пертузумаб.
Относящиеся к антителам к HER патентные публикации включают: US 5677171, US 5720937, US 5720954, US 5725856, US 5770195, US 5772997, US 6165464, US 6387371, US 6399063, US 2002/0192211 A1, US 6015567, US, 333169, US 4968603, US 5821337, US 6054297, US 6407213, US 6719971, US 6800738, US 2004/0236078 A1, US 5648237, US 6267958, US 6685940, US 6821515, WO 98/17797, US 6127526, US 6333398, US 6797814, US 6339142, US 6417335, US 6489447, WO 99/31140, US 2003/0147884 A1, US 2003/0170234 A1, US 2005/0002928 A1, US 6573043, US 2003/0152987 A1, WO 99/48527, US 2002/0141993 A1, WO 01/00245, US 2003/0086924, US 2004/0013667 A1, WO 00/69460, WO 01/00238, WO 01/15730, US 6627196B1, US 6632979B1, WO 01/00244, US 2002/0090662 A1, WO 01/89566, US 2002/0064785, US 2003/0134344, WO 04/24866, US 2004/0082047, US 2003/0175845 A1, WO 03/087131, US 2003/0228663, WO 2004/008099A2, US 2004/0106161, WO 2004/048525, US 2004/0258685 A1, US 5985553, US 5747261, US 4935341, US 5401638, US 5604107, WO 87/07646, WO 89/10412, WO 91/05264, EP 412116 B1, EP 494135 B1, US 5824311, EP 444181 B1, EP 1006194 A2, US 2002/0155527 A1, WO 91/02062, US 5571894, US 5939531, EP 502812 B1, WO 93/03741, EP 554441 B1, EP 656367 A1, US 5288477, US 5514554, US 5587458, WO 93/12220, WO 93/16185, US 5877305, WO 93/21319, WO 93/21232, US 5,856,089, WO 94/22478, US 5,910,486, US 6028059, WO 96/07321, US 5804396, US 5846749, EP 711565, WO 96/16673, US 5783404, US 5977322, US 6512097, WO 97/00271, US 6270765, US 6395272, US 5837243, WO 96/40789, US 5783186, US 6458356, WO 97/20858, WO 97/38731, US 6214388, US 5925519, WO 98/02463, US 5922845, WO 98/18489, WO 98/33914, US 5994071, WO 98/45479, US 6358682 B1, US 2003/0059790, WO 99/55367, WO 01/20033, US 2002/0076695 A1, WO 00/78347, WO 01/09187, WO 01/21192, WO 01/32155, WO 01/53354, WO 01/56604, WO 01/76630, WO 02/05791, WO 02/11677, US 6582919, US 2002/0192652 A1, US 2003/0211530 A1, WO 02/44413, US 2002/0142328, US 6602670 B2, WO 02/45653, WO 02/055106, US 2003/0152572, US 2003/0165840, WO 02/087619, WO 03/006509, WO 03/012072, WO 03/028638, US 2003/0068318, WO 03/041736, EP 1357132, US 2003/0202973, US 2004/0138160, US 5705157, US 6123939, EP 616,812 B1, US 2003/0103973, US 2003/0108545, US 6403630 B1, WO 00/61145, WO 00/61185, US 6333348 B1, WO 01/05425, WO 01/64246, US 2003/0022918, US 2002/0051785 A1, US 6767541, WO 01/76586, US 2003/0144252, WO 01/87336, US 2002/0031515 A1, WO 01/87334, WO 02/05791, WO 02/09754, US 2003/0157097, US 2002/0076408, WO 02/055106, WO 02/070008, WO 02/089842 и WO 03/86467.
Пациентов для лечения антителом к HER2 трастузумабом/Herceptin™ выбирают для терапии на основе сверхэкспрессии белка HER2/амплификации гена, см., например, WO 99/31140 (Paton и др.,), US 2003/0170234А1 (на имя Hellmann S.) и US 2003/0147884 (на имя Paton и др.,); а также WO 01/89566, US 2002/0064785 и US 2003/0134344 (Mass и др.) (см. также US 2003/0152987 на имя Cohen и др., касательно применения иммуногистохимии (ИГХ) и флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) для выявления сверхэкспрессии и амплификации HER2. WO 2004/053497 и US 2004/024815 A1 (на имя Bacus и др.), а также в US 2003/0190689 (на имя Crosby и Smith) касаются определения или прогнозирования ответа на терапию на основе трастузумаба. US 2004/013297 A1 (на имя Bacus и др.) касается определения или прогнозирования ответа на терапию на основе антитела к EGFR АВХ0303. В WO 2004/000094 (на имя Bacus и др.) описано определение ответа на GW 572016, малую молекулу, которая является ингибитором тирозинкиназы EGFR-HER2. WO 2004/063709 на имя Amler и др. касается биомеркеров и методов определения чувствительности к ингибитору EGFR, такому как . US 2004/0209290 на имя Cobleigh и др. касается экспрессии генных маркеров для прогнозирования рака молочной железы.
Пациентов, подлежащих лечению с помощью ингибитора димеризации HER2 (типа пертузумаба, который описан более подробно выше), можно отбирать для терапии на основе активации или димеризации HER. Патентные публикации, касающиеся пертузумаба и отбора пациентов для терапии на его основе, включают: WO 01/00245 (Adams и др.); US 2003/0086924 (Sliwkowski М.); US 2004/0013667 A1 (Sliwkowski М.), а также WO 2004/008099 A2 и US 2004/0106161 (на имя Bossenmaier и др.).
Herceptin™/трастузумаб известны в данной области для лечения пациентов с метастатическим раком молочной железы, опухоли которых характеризуются сверхэкспрессией белка HER2 или присутствием амплификации гена HER2:
а) в качестве монотерапии для лечения указанных пациентов, которых подвергали по меньшей мере двум химиотерапевтическим схемам лечения их метастатического заболевания. Предшествующая химиотерапия должна была включать по меньшей мере антрациклин и таксан, если для пациентов такие варианты лечения не являются неприемлемыми. Пациенты с позитивным по рецепторам гормонов статусом должны получать также гормональную терапию, если для пациентов такие варианты лечения не являются неприемлемыми;
б) в сочетании с паклитакселом для лечения пациентов, которых не подвергали химиотерапии для лечения у них метастатического заболевания и для которых антрациклин не является приемлемым; и
в) в сочетании с доцетакселом для лечения пациентов, которых не подвергали химиотерапии для лечения у них метастатического заболевания.
Herceptin™/трастузумаб можно применять также в качестве адъювантной терапии на ранней стадии рака молочной железы. Herceptin™/трастузумаб разрешен также для лечения пациентов с HER2-позитивным раком молочной железы на ранней стадии после хирургического вмешательства, химиотерапии (неоадъювантной (т.е. до хирургии) или адъювантной) и лучевой терапии (если это можно применять). Кроме того, Herceptin™ в сочетании с капецитабином или 5-фторурацилом и цисплатином показан для лечения пациентов с HER2-позитивной местно-распространенной или метастатической аденокарциномой желудка или гастроэзофагеального соединения, которых ранее не подвергали противораковому лечению по поводу их метастатического заболевания. Эффективность и безопасность неоадъювантной терапии на основе пертузумаба и трастузумаба оценивали на фазе 2 испытания (NEOSPHERE); Gianni, Lancet Oncol, 13, 2012, сс. 25-32.
В данной области лечение пациентов с раком молочной железы с помощью Herceptin™/трастузумаба, например, рекомендовано и является общепринятым для пациентов с HER2-позитивным раком. Считается, что рак является HER2-позитивным, если в образцах, полученных из организма пациента, таких как биопсии ткани молочной железы или резекции ткани молочной железы, или ткани, полученной из областей метастазов, обнаружен высокий уровень экспрессии HER2 (белка) с помощью иммуногистохимических методов (например, HER2 (+++)) или обнаружена амплификация гена HER2 с помощью in-situ-гибридизации (ISH) (например, ISH-позитивный статус, например, когда количество копий гена HER2 превышает 4 копии гена HER2 на опухолевую клетку, или в том случае, когда соотношение количества копий гена HER2 и количества сигналов зонда CEP17 ≥ 2,0), или обнаружено и то, и другое.
В WO 2011/109789, WO 2011/066342, WO 2009/089149 и WO 2006/133396 описано терапевтическое применение ингибиторов PD-L1. Кроме того, в WO 2010/077634 описаны антитела к PD-L1 и их терапевтическое применение.
Настоящее изобретение относится к способу определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, (I) где терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, показана для пациента, или (II) где пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) и лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1),
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если измеренные на стадии (а) уровень экспрессии ER является низким или отсутствует и уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) является повышенным по сравнению с контролем.
Таким образом, в настоящем изобретении предложен способ определения потребности пациента в совместной терапии с использованием модулятора PD-L1 в сочетании с модулятором пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическим средством, заключающийся в том, что осуществляют стадии, на которых
-тестируют образец опухоли пациента, для которого показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, или которого подвергают указанной терапии;
- определяют уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) и лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) в указанном образце опухоли,
в котором низкий уровень экспрессии ER или его отсутствие и повышенный уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем служит признаком того, что модулятор PD-L1 можно успешно применять для совместной терапии указанного пациента.
Как продемонстрировано в прилагаемом примере, при создании изобретения неожиданно было установлено, что раковые пациенты, негативные по рецептору эстрогена (ER) (ЕR(-)-пациенты) (раковые пациенты с низким уровнем экспрессии ER или даже с ее отсутствием), подвергающиеся терапии с использованием модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) (типа Herceptin™/трастузумаба) и химиотерапевтического средства (типа додетаксела/Taxotere), характеризуются существенно более плохим полным патологическим ответом (pCR) на терапию по сравнению с позитивными по рецептору эстрогена (ER) раковыми пациентами (ER(+)-пациенты), если уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) в образце ER-негативных (ER(-)) раковых пациентов повышен по сравнению с контролем.
Понятия «лиганд программированной (клеточной) гибели-1», «CD274» и «PD-L1» в контексте настоящего описания используют взаимозаменяемо. Таким образом, на ER-негативных (ER(-)) раковых пациентов с повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной (клеточной) гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем должна оказывать благоприятное действие дополнительная совместная терапия с использованием ингибитора PD-L1. Можно ожидать, что уровень полного патологического ответа (pCR) в этой группе пациентов должен возрастать, если пациентов подвергают совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1 в дополнение к терапии на основе модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) (типа Herceptin™/трастузумаба) и химиотерапевтического средства (типа додетаксела/Taxotere). Другими словами, ER-негативные (ER(-)) раковые пациенты должны получать ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) в дополнение к модулятору пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) (типа трастузумаба) и химиотерапевтическому средству (типа додетаксела/Taxotere), если уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) в образце из организма пациента повышен по сравнению с контролем. Ниже ER-негативных раковых пациентов или (биологические образцы/образцы опухоли), полученные из организма ER-негативных раковых пациентов, обозначают в контексте настоящего описания как «ER(-)». Аналогично этому ER-позитивных раковых пациентов или (биологические образцы/образцы опухоли), полученные из организма ER-позитивных раковых пациентов, обозначают в контексте настоящего описания как «ER(+)».
Согласно вышесказанному, настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которому показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для которого установлено, что рак отличается низким уровнем или отсутствием экспрессии ER и отличается повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и вводят пациенту в эффективном количестве модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1. Кроме того, настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которого подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для которого установлено, что рак отличается низким уровнем или отсутствием экспрессии ER и отличается повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и вводят пациенту в эффективном количестве ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1). Таким образом, настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), которая предназначена для лечения рака, где, как установлено, рак отличается низким уровнем или отсутствием экспрессии ER и отличается повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем.
Согласно вышесказанному, предложенный в настоящем описании способ определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1 может включать дополнительную стадию перед стадией а), где указанная стадия представляет собой или включает получение образца из организма указанного ракового пациента. Таким образом, в настоящем изобретении предложен способ определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, (I) где терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, показана для пациента, или (II) где пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, где указанный способ включает стадию получения образца из организма указанного пациента, способ заключается также в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) и лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1),
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если измеренные на стадии (а) уровень экспрессии ER является низким или отсутствует и уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) является повышенным по сравнению с контролем.
Кроме того, при создании настоящего изобретения установлено и продемонстрировано в прилагаемом примере, что пациента, нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, можно определять еще более надежно, если измерять уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) в образце из организма пациента помимо уровня экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1). При создании изобретения установлено, что пациенты с низким уровнем или отсутствием экспрессии ER имеют существенно худший полный патологических ответ на терапию на основе модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтического средства, если уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) повышен и если уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) понижен.
Таким образом, способы, представленные в настоящем описании, дополнительно предусматривают измерение уровня экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) в образце из организма пациента, при этом пациента классифицируют как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) снижен по сравнению с контролем. Согласно вышесказанному, предпочтительным объектом настоящего изобретения является способ определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, (I) где для пациента показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, или (II) где пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, где указанный способ заключается в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER), лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ),
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если измеренные на стадии (а) уровень экспрессии ER является низким или отсутствует, уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) является повышенным по сравнению с контролем и уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) является пониженным по сравнению с контролем.
Таким образом, уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), который снижен относительно контроля, служит признаком того, что модулятор PD-L1 можно успешно применять для совместной терапии указанного пациента. С учетом вышесказанного представленная в настоящем описании фармацевтическая композиция предназначена для лечения рака, если установлено, что указанный рак отличается низким уровнем или отсутствием экспрессии ER, если установлено, что указанный рак отличается повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и установлено, что рак отличается пониженным уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) по сравнению с контролем. Таким образом, представленная в настоящем описании фармацевтическая композиция, содержащая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), показана для лечения рака, если установлено, что указанный рак отличается низким уровнем или отсутствием экспрессии ER, если установлено, что указанный рак отличается повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и установлено, что рак отличается пониженным уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) по сравнению с контролем.
В контексте настоящего описания понятие «раковый пациент» относится к пациенту, который, как ожидается, может страдать раком, уже страдает раком или предрасположен к раку. Рак, подлежащий лечению согласно настоящего изобретению, может представлять собой солидный (трабекулярный) рак, такой как рак молочной железы или рак желудка. Кроме того, рак может представлять собой рак яичника или колоректальный рак. Рак предпочтительно представляет собой «HER2-позитивный» рак.
Предпочтительно рак представляет собой рак молочной железы, типа раннего рака молочной железы. Рак молочной железы может представлять собой раннюю стадию рака молочной железы или метастатический рак молочной железы. Таким образом, подразумевается, что раковый пациент (подлежащий лечению) может страдать солидным раком, страдает солидным раком или предрасположен к солидному раку, где солидный рак может представлять собой рак молочной железы или рак желудка. Предпочтительно рак представляет собой рак молочной железы, типа ранней стадии рака молочной железы. Пациент предпочтительно представляет собой человека.
Как указано выше, уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) и лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и необязательно интерферона-гамма (IFN-γ) можно измерять in vitro в образце из организма пациента. Предпочтительно представленные в настоящем описании способы включают измерение уровня интерферона-гамма (IFN-γ) in vitro в образце из организма пациента. Предпочтительно в контексте настоящего описания подлежащий оценке/анализу образец представляет собой образец опухолевой ткани. Пациента (или группу пациентов) классифицируют как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если уровень экспрессии ER является низким или отсутствует и уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) повышен по сравнению с контролем и необязательно уровень экспрессии интерферона гамма (IFNγ) понижен по сравнению с контролем, при измерении in vitro в указанном образце.
Понятие «ER» является сокращенным обозначением понятия «рецептор эстрогена». Аналогично этому, понятия «PD-L1» и «IFN-γ» являются сокращенными обозначениями понятий «лиганд программированной клеточной гибели» и «интерферон-гамма» соответственно. Таким образом, в контексте настоящего описания понятие «ER» можно применять взаимозаменяемо с понятием «рецептор эстрогена». Аналогично этому, в контексте настоящего описания понятия «PD-L1» и «IFN-γ» можно применять взаимозаменяемо с понятиями «лиганд программированной клеточной гибели» и «интерферон-гамма» соответственно.
Предпочтительно (опухолевый/биологический) образец из организма пациента и/или рака отличается или с ним ассоциирован низкий уровень или отсутствие экспрессии рецептора эстрогена (ER). Предпочтительно образец из организма пациента представляет собой образец опухоли. Уровень экспрессии ER может быть ER-негативным (ER(-)). Понятии «ER(-)» можно применять взаимозаменяемо с понятием «ER-негативный».
ER-негативный» уровень экспрессии можно определять с помощью рутинных и стандартных процедур, описанных, например, в руководстве по тестирования рецепторов гормонов при раке молочной железы (Guideline on Hormone Receptor Testing in Breast Cancer, S. Nofech-Mozes, E. Vella, S. Dhesy-Thind и W. Hanna (A Quality Initiative of the Program in Evidence-Based Care (PEBC), Cancer Care Ontario (ССО); дата отчета 8 апреля 2011 г.). Руководства и процитированные в них ссылки полностью включены в настоящее описание. Эти руководства доступны в Интернете на сайте cancercare.on.ca) и в PEBC Pathology & Laboratory Medicine page на:
https://www.cancercare.on.ca/toolbox/qualityguidelines/clin-program/pathlabebs/
рутинные и стандартные процедуры определения «ER-негативного» уровня экспрессии описаны в этих руководствах, а также в приведенных ниже ссылках:
Nofech-Mozes S., Vella Е.Т., Dhesy-Thind S., Hagerty K.L., Mangu P.В., Temin S., и др., Systematic review on hormone receptor testing in breast cancer. Applied Immunohistochem Mol Morphol. 20(3), май 2012 г., cc. 214-263. doi: 10.1097/PAI.0b013e318234aa12, Epub 11 ноября 2011 г.
Nofech-Mozes S., Vella E.T., Dhesy-Thind S., Hanna W.M. Cancer Care Ontario guideline recommendations for hormone receptor testing in breast cancer. Clin Oncol (R Coll Radiol), Epub 17 мая 2012 г.
Экспрессия является «ER-негативной», если по данным, полученным, например, с помощью ИГХ (иммуногистохимия), уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует и/или уровень экспрессии рецептора прогестерона (PR) является низким или она отсутствует. Сокращение «PR» в контексте настоящего описании применяют взаимозаменяемо с понятием «рецептор прогестерона». В контексте настоящего описания образец или пациенты можно оценивать как «ER-негативные» согласно следующей картине окрашивания (по данным ИГХ):
Следует оценивать только окрашивание ядер (не цитоплазмы).
Окрашивание классифицируют на три категории:
Позитивное: окрашивание ER или PR ≥ 10%.
Слабое позитивное: окрашивание ER или PR - от 1% до 9%.
Негативное: окрашивание ER или PR < 1%.
Таким образом, согласно настоящему описанию образец или пациенты могут оцениваться, в частности, как «ER-негативные», если для образца обнаружена с помощью ИГХ следующая картина окрашивания: окрашивание ER или PR составляет < 1%.
Согласно настоящему описанию образец или пациенты могут оцениваться, в частности, как «ER-позитивные», если для образца обнаружена «позитивная» картина окрашивания с помощью ИГХ: окрашивание ER или PR составляет ≥ 1% (т.е. более одного процента 1% изученных/оцененных клеток имеют рецепторы эстрогена или рецепторы прогестерона/характеризуются окрашиванием по данным ИГХ (иммуногистохимия), свидетельствующим о присутствии рецепторов эстрогена.
Предпочтительно согласно настоящему описанию образец или пациенты оцениваются как «ER-негативные», если для образца обнаружена следующая картина окрашивания с помощью ИГХ: окрашивание ER составляет < 1% (т.е. менее 1% изученных/оцененных клеток имеют рецепторы эстрогена/характеризуются окрашиванием по данным ИГХ (иммуногистохимия), свидетельствующим о присутствии рецептора(ов) эстрогена. Более предпочтительно образец или пациенты рассматривается(ются) как «ER-негативные», если для ядер в образце опухолевой ткани с помощью ИГХ обнаружено окрашивание ER, составляющее <1%. Таким образом, из трех представленных выше категорий оценка как «ER-негативный» базируется только на окрашивании ER с помощью ИГХ, составляющем < 1%.
Аналогичным образом «ER-негативную» экспрессию можно определять другими рутинными методами, применяемыми в данной области. Например, экспрессию можно рассматривать как «ER-негативную», если уровень экспрессии мРНК/РНК является низким или отсутствует. Рутинные методы, которые можно применять, включают (но, не ограничиваясь только ими): балльную шкалу Оллреда, IRS, балльную шкалу Реммеля или любой другой пригодный биохимический метод определения. Специалисту в данной области должно быть очевидно, что отсекающее значение для указанных методов должно соответствовать отсекающему значению, определенному, как описано выше, с помощью ИГХ.
Нуклеотидные последовательности и аминокислотные последовательности рецептора прогестерона (PR), рецептора эстрогена (ER) лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и/или интерферона-гамма (IFNγ), которые можно применять в настоящем изобретении, хорошо известны и их можно найти в базах данных, таких как NCBI. Приведенные в качестве примера последовательности представлены в настоящем описании (см., например, SEQ ID NO: 38-51).
Методы и типы образцов, применяемые для установления отсекающего значения маркера (типа лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и/или интерферона гамма (IFN-γ)) и для оценки образца, полученного из организма индивидуума или пациента, подлежащего анализу, соответствуют друг другу или являются одинаковыми. Отсекающие значения, т.е. значения, выше которых признается наличие сверхэкспрессии (например, повышенной экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем), можно получать с использованием контрольной группы. Отсекающие значения, т.е. значения, ниже которых признается наличие пониженной экспрессии (например, пониженной экспрессии интерферона-гамма (IFN-γ) по сравнению с контролем), можно получать с использованием контрольной группы.
Контрольную группу, в которой получают отсекающие значения, выбирают так, чтобы она соответствовала группе подлежащих исследованию индивидуумов/пациентов, другими словами, если способ, предлагаемый в изобретении, применяют для определения потребности в совместной терапии с использованием PD-L1 у пациентов с раком молочной железы или раком желудка соответственно, то контрольная группа также включает пациентов с раком молочной железы или раком желудка соответственно. Контрольная группа, которую применяют для определения отсекающих значений и для PDL-1, и для IFN-γ соответственно, содержит по меньшей мере 40 или по меньшей мере 50, или по меньшей мере 100 индивидуумов/пациентов. Уровень экспрессии или соответствующее значение, превышающее отсекающее, рассматриваются как соответствующие сверхэкпрессии, а значение на уровне или ниже отсекающего рассматривается как соответствующее пониженной экспрессии.
В одном из вариантов осуществления изобретения уровень экспрессии «IFN-γ» в образце опухолевой ткани индивидуума/пациента сравнивают с отсекающим значением. Значение, превышающее отсекающее, рассматривается как соответствующее сверхэкспрессии IFN-γ, а значение на уровне или ниже отсекающего рассматривается как соответствующее пониженной экспрессии IFN-γ. В одном из вариантов осуществления изобретения признается наличие пониженной экспрессии, если уровень экспрессии IFN-γ находится на уровне или является более низким, чем наивысший квинтиль, квартиль или тертиль соответственно, установленный для контрольной группы. В одном из вариантов осуществления изобретения отсекающее значение для IFN-γ представляет собой наивысший тертиль. В одном из вариантов осуществления изобретения отсекающее значение представляет собой значение между 70-ым и 80-ым перцентилем. В одном из вариантов осуществления изобретения отсекающее значение для IFN-γ представляет собой 73-ий перцентиль, т.е. значение, превышающее указанное отсекающее значение, рассматривается как соответствующее сверхэкспрессии IFN-γ, а значение равное или более низкое, чем 73-ий перцентиль, рассматривается как соответствующее пониженному уровню экспрессии IFN-γ. В одном из вариантов осуществления изобретения индивидуумов/пациентов классифицируют как нуждающихся в совместной терапии с использованием PD-L1, если экспрессия IFN-γ в образце (таком как образец опухолевой ткани) снижена (т.е. ниже или находится на уровне отсекающего значения для IFN-γ). В одном из вариантов осуществления изобретения индивидуумов/пациентов классифицируют как не нуждающихся в совместной терапии с использованием PD-L1, если имеет место сверхэкспрессия IFN-γ (т.е. превышает указанное выше отсекающее значение для IFN-γ).
В одном из вариантов осуществления изобретения уровень экспрессии PD-L1 в образце опухолевой ткани индивидуума/пациента сравнивают с отсекающим значением. Значение, превышающее отсекающее, рассматривается как соответствующее сверхэкспрессии PD-L1, а значение на таком же уровне или более низкое, чем отсекающее, рассматривается как соответствующее пониженной экспрессии PD-L1. В одном из вариантов осуществления изобретения признается наличие сверхэкспрессии PDL-1, если уровень экспрессии PDL-1 превышает отсекающее значение, находящееся между 50-ым перцентилем и 75-ым перцентилем, установленным для контрольной группы. В одном из вариантов осуществления изобретения признается наличие сверхэкспрессии PDL-1, если уровень экспрессии PDL-1 превышает отсекающее значение, находящееся между 50-ым перцентилем и 70-ым перцентилем, установленным для контрольной группы. В одном из вариантов осуществления изобретения индивидуумы/пациенты классифицируются как нуждающиеся в совместной терапии с использованием PDL-1, если имеет место сверхэкспрессия PDL-1 (т.е. выявленный уровень экспрессии PDL-1 превышает отсекающее значение для PDL-1).
В одном из дополнительных вариантов осуществления изобретения сверхэкспрессия PDL-1 обнаружена в подгруппе индивидуумов/пациентов, имеющих пониженный уровень экспрессии IFN-γ в образце опухолевой ткани. В одном из вариантов осуществления изобретения признается наличие сверхэкспрессии PDL-1, если уровень экспрессии PDL-1 превышает отсекающее значение, находящееся между 40-ым перцентилем и 65-ым перцентилем, установленным для этой подгруппы. В одном из вариантов осуществления изобретения признается наличие сверхэкспрессии PDL-1, если уровень экспрессии PDL-1 превышает отсекающее значение, находящееся между 50-ым перцентилем и 60-ым перцентилем, установленным для этой подгруппы. В одном из вариантов осуществления изобретения индивидуумы/пациенты классифицируются как нуждающиеся в совместной терапии с использованием PDL-1, если уровень экспрессии PDL-1 в подгруппе с пониженным уровнем экспрессии IFN-γ превышает 54-ый перцентиль.
В одном из вариантов осуществления изобретения индивидуумы/пациенты классифицируются как нуждающиеся в совместной терапии с использованием PDL-1, если уровень экспрессии IFN-γ в образце опухолевой ткани понижен (т.е. ниже или находится на уровне отсекающего значения для IFN-γ), а уровень экспрессии PDL-1 повышен (т.е. превышает отсекающее значение для PDL-1).
Понятие «уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), повышенный по сравнению с контролем» в контексте настоящего описания можно применять взаимозаменяемо с понятием «уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), превышающий отсекающее значение для PDL-1», что определено и объяснено выше.
Понятие «уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), пониженный по сравнению с контролем» в контексте настоящего описания можно применять взаимозаменяемо с понятием «уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), более низкий, чем отсекающее значение для IFNγ, или равный ему».
Под объем настоящего изобретения подпадают следующие объекты.
Настоящее изобретение относится к способу определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, (I) в котором пациенту показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство или (II) в котором пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER), лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ),
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если измеренный на стадии (а) уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует (например, является ER(-)/ER-негативным), уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) превышает отсекающее значение для PD-L1 и уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) является более низким, чем отсекающее значение для IFNγ, или равным ему.
Настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которому показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для рака которого установлен низкий уровень экспрессии ER или выявлено ее отсутствие (например, ER(-)/ER-негативный) и установлен уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), превышающий отсекающее значение для PD-L1, и установлен уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) более низкий, чем отсекающее значение для IFNγ, или равный ему, и вводят пациенту в эффективном количестве модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
Настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которого подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для рака которого установлен низкий уровень экспрессии ER или выявлено его отсутствие (например, ER(-)/ER-негативный) и установлен уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), превышающий отсекающее значение для PD-L1, и установлен уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) более низкий, чем отсекающее значение для IFNγ или равный ему, и вводят пациенту в эффективном количестве ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
Настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), предназначенной для лечения рака, для которого установлено, что рак отличается низким уровнем экспрессии ER или ее отсутствием (например, ER(-)/ER-негативный) и отличается уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), превышающим отсекающее значение для PD-L1, и отличается уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) более низким, чем отсекающее значение для IFNγ, или равным ему.
Все пояснения и определения, представленные в настоящем описании для «ингибитора PD-L1», «совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1», «рака», «ракового пациента», «модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2)», «химиотерапевтического средства», «образца», «уровня экспрессии» и т.п., применимы с соответствующими изменениями к описанным выше объектам настоящего изобретения.
Уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER), лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и интерферона-гамма (IFNγ) в образце из организма пациента можно измерять in vitro одновременно или последовательно в любой комбинации. Например, уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER), лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и интерферона-гамма (IFNγ) можно измерять одновременно. Уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) можно измерять первым, после чего измерять уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и интерферона-гамма (IFNγ). Уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) можно измерять первым, после чего измерять (одновременно или последовательно) уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) и интерферона-гамма (IFNγ). Уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) можно измерять первым, после чего измерять (одновременно или последовательно) уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) и лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1). В контексте настоящего описания можно рассматривать и применять любой порядок/комбинацию измерений уровня экспрессии рецептора эстрогена (ER), лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и интерферона-гамма (IFNγ) в образце из организма пациента.
В контексте настоящего описания подразумевается, что пациента можно классифицировать как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если на первой стадии (1) установлено, что уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует (например, ER(-)/ER-негативный) и, если на второй стадии (2) установлено, что уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) находится ниже отсекающего значения для IFNγ или равен ему, и, если на третьей стадии (3) установлено, что уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) превышает отсекающее значение для PDL-1.
Под объем настоящего изобретения подпадают следующие объекты.
Настоящее изобретение относится к способу определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, (I) в котором пациенту показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, или (II) в котором пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER), лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ),
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если на первой стадии (1) установлено, что уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует (например, ER(-) /ER-негативный) и, если на второй стадии (2) установлено, что уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) находится ниже отсекающего значения для IFNγ или равен ему, и, если на третьей стадии (3) установлено, что уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) превышает отсекающее значение для PDL-1.
Настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которому показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для рака которого на первой стадии (1) установлено, что уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует (например, ER(-)/ER-негативный), и на второй стадии (2) установлено, что уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) находится ниже отсекающего значения для IFNγ или равен ему, и на третьей стадии (3) установлено, что уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) превышает отсекающее значение для PDL-1, и вводят пациенту в эффективном количестве модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
Настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которого подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для рака которого на первой стадии (1) установлено, что уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует (например, ER(-)/ER-негативный), и на второй стадии (2) установлено, что уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) находится ниже отсекающего значения для IFNγ или равен ему, и на третьей стадии (3) установлено, что уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) превышает отсекающее значение для PDL-1, и вводят пациенту в эффективном количестве ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
Настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), предназначенной для лечения рака, для которого установлено, что рак отличается низким уровнем экспрессии ER или она отсутствует (например, ER(-)/ER-негативный), отличается уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) более низким, чем отсекающее значение для IFNγ или равным ему, отличается уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), превышающим отсекающее значение для PD-L1.
Все пояснения и определения, представленные в настоящем описании для «ингибитора PD-L1», «совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1», «рака», «ракового пациента», «модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2)», «химиотерапевтического средства», «образца», «уровня экспрессии» и т.п., применимы с соответствующими изменениями к описанным выше объектам настоящего изобретения.
Ниже представлены примеры отсекающих значений, позволяющие классифицировать пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, согласно настоящему изобретению. С помощью рутинных методик (таких как Affymetrix) можно легко определять, находится ли уровень экспрессии PD-L1 и/или IFN-гамма в образце из организма пациента ниже или выше указанных отсекающих значений.
Если анализ генной экспрессии свидетельствует о том, что уровень экспрессии IFN-гамма превышает или равен 4,8, то комбинированное лечение (мишенью которого является HER2 и мишенью которого является PDL1) не рекомендуется и не требуется дополнительной оценки PDL1. Если анализ генной экспрессии свидетельствует о том, что уровень экспрессии IFN-гамма ниже 4,8, то необходима параллельная оценка PDL-1. Если затем анализ экспрессии гена PDL-1 свидетельствует о том, что уровень экспрессии превышает или равен 5,3, то рекомендуется комбинированное лечение (мишенью которого является HER2 и мишенью которого является PDL1). Указанный приведенный в качестве примера протокол проиллюстрирован на фиг.19.
В этом контексте Affymetrix можно осуществлять следующим образом: Общую РНК из опухолевых клеток экстрагировали из фиксированных в формалине и заключенных в парафиновые блоки (FFPE) срезов опухолей с использованием набора для РНК для системы LightCycler Pertuzumab FFPET (фирма Roche Diagnostics). РНК обрабатывали для гибридизации с помощью системы WT-Ovation FFPE V2 (фирма Nugen) и гибридизовали с массивами человеческого генома Affymetrix GeneChip U133 Plus 2.0. Гибридизованные массивы промывали и окрашивали с использованием станции Affymetrix Fluidics Station 450 и сканировали с помощью сканера Affymetrix GeneChip 3000 7G.
Как отмечалось выше, уровень экспрессии PD-L1 и/или IFN-гамма в образце из организма пациента можно определять рутинными методами, такими как Affymetrix. Ниже описан приведенный в качестве примера протокол такого определения (который обозначен также в контексте настоящего описания как определение профиля генной экспрессии):
Профили генной экспрессии в образцах биопсии опухолей можно определять с помощью платформы AFFYMETRIX HG-U133Plus 2 с микромассивами полного человеческого генома. Можно применять набор HighPure для экстракции РНК фирмы Roche, набор для амплификации фирмы NuGen и стандартные протоколы гибридизации и сканирования, прилагаемые к системе AFFYMETRIX. Эти и другие протоколы включены в настоящее описание в качестве ссылки. Все массивы сканов, как правило, подвергали контролю качества (QC) с помощью стандартной программы AFFYMETRIX QC.
Для предварительной обработки «сырых» сигналов можно использовать робастный алгоритм для микромассивов (RMA) (Irizarry и др, 2003. World wide web at .ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12925520; публикация включена в настоящее описание в качествен ссылки). Все наборы зондов, доступные для представляющих интерес генов, можно получать как описано ниже. Для гена CD274, когда доступно несколько наборов зонда для описания этого гена, то для описания гена выбирали набор зондов с наиболее высоким средним уровнем экспрессии (который определяли как арифметическое среднее уровней экспрессии данного набора зондов):
CD274 (PDL1)
223834_at выбран для PDL1
227458_at
Выбранный набор зондов соответствует последнему экзону/3'UTR гена и охватывает все известные RefSEq мРНК (см. фиг. 6).
IFNG
210354_at
Этот набор зондов также соответствует последнему экзону/3'UTR гена и охватывает все известные RefSEq мРНК (см. фиг. 7).
Как описано выше, уровень экспрессии интерферона-гамма можно измерять до измерения уровня экспрессии рецептора эстрогена (ER) и/или до измерения уровня экспрессии лиганда программированной гибель клеток-1 (PD-L1). Стадия оценки уровня экспрессии рецептора эстрогена (ER) и уровня экспрессии лиганда программированной гибель клеток-1 (PD-L1) даже может отсутствовать.
Как продемонстрировано в прилагаемом примере, совместная терапия с использованием PD-L1, например, может не рекомендоваться, если уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), определенный с помощью рутинных методов типа Affymetrix, превышает или равен (примерно) 4,8.
Таким образом, в настоящем изобретении предложен способ определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, когда пациенту показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство или когда пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ),
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) при оценке на стадии (а) с помощью рутинных методов типа Affymetrix превышает или равен (примерно) 4,8.
Если уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) ниже чем (примерно) 4,8 при определении с помощью рутинных методов типа Affymetrix, то уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и необязательно рецептора эстрогена (ER) можно измерять in vitro в образце из организма указанного пациента.
Таким образом, в настоящем изобретении предложен способ определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, когда пациенту показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство или когда пациента подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), рецептора эстрогена (ER) и лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) при определении с помощью рутинных методов типа Affymetrix превышает или равен (примерно) 4,8, и, если на стадии (а) установлен низкий уровень или отсутствие экспрессии ER и необязательно повышенный по сравнению с контролем уровень лиганда программированной гибели клеток-1 (PD-L1).
Согласно настоящему изобретению пациента можно классифицировать как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), измеренный в образце из организма пациента, повышен по сравнению с контролем. Например, уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), определенный с помощью рутинных методов типа Affymetrix, может превышать или быть равным (примерно) 5,3.
Все пояснения и определения, представленные в настоящем описании для «ингибитора PD-L1», «совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1», «рака», «ракового пациента», «модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2)», «химиотерапевтического средства», «образца», «уровня экспрессии» и т.п.применимы с соответствующими изменениями к описанным выше объектам настоящего изобретения.
Таким образом, настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которому показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для рака которого установлено, что уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует, и установлено, что уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) повышен по сравнению с контролем, и уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), определенный с помощью рутинных методов типа Affymetrix, ниже чем (примерно) 4,8, и вводят пациенту в эффективном количестве модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
Кроме того, настоящее изобретение относится к способу лечения рака у ракового пациента, которого подвергают терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающемуся в том, что отбирают ракового пациента, для рака которого установлено, что уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует, и установлено, что уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) повышен по сравнению с контролем, и уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), определенный с помощью рутинных методов типа Affymetrix, ниже чем (примерно) 4,8, и вводят пациенту в эффективном количестве ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
Настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), предназначенной для лечения рака, если установлено, что рак отличается низким уровнем экспрессии ER или ее отсутствием и отличается повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем и уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), определенным помощью рутинных методов типа Affymetrix, более низким чем (примерно) 4,8.
Фармацевтическая композиция, предназначенная для применения для лечения рака, может содержать также химиотерапевтическое средство.
Согласно вышеизложенному представленные в настоящем описании способы могут включать стадию измерения уровня экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) в указанном образце и классификации пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если установлено, что уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) понижен по сравнению с контролем. Например, «пониженный уровень экспрессии» интерферона-гамма (IFNγ) может представлять собой уровень экспрессии, определенный с помощью рутинных методов типа Affymetrix, более низкий чем (примерно) 4,8. Таким образом, рак, отличающийся уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ), определенным с помощью рутинных методов типа Affymetrix, более низким чем (примерно) 4,8, можно рассматривать как рак, для которого характерен пониженный уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) по сравнению с контролем.
В настоящем описании учитывается, что уровень экспрессии может найти свое отражение в активности генного продукта/белка. Таким образом, согласно настоящему изобретению можно также измерять и оценивать активность ER, PD-L1 и/или IFN-γ в дополнение или в качестве альтернативы уровню экспрессии. Специалисту в данной области очевидны соответствующие средства и методы определения и оценки уровня экспрессии и/или активности ER, PD-L1 и IFN-γ. Примеры методов, которые можно применять, включают (но, не ограничиваясь только ими) молекулярные анализы, такие как Вестерн-блоттинг, Нозерн-блоттинг, ПЦР в реальном времени и т.п. Указанные методы подробно изложены в настоящем описании.
Уровень экспрессии ER, PD-L1 и/или IFN-γ может представлять собой уровень экспрессии мРНК ER, PD-L1 и/или IFN-γ. Если генный продукт представляет собой РНК, в частности мРНК (например, не подвергнутую сплайсингу, подвергнутую частичному или полному сплайсингу мРНК), то определение можно осуществлять, воспользовавшись методиками на основе Нозерн-блоттинга, гибридизации in situ, гибридизации на микромассивах или ДНК-чипах, несущих один или несколько зондов или наборы зондов, специфических для мРНК-транскриптов, или с помощью методов на основе ПЦР, например, методов типа количественной ПЦР, такой как ПЦР в реальном времени. Эти и другие методы, пригодные для оценки связывания (специфической) мРНК, хорошо известны в данной области и описаны, например, у Sambrook и Russell (2001, loc. cit.). Специалист в данной области может определять количество компонента, в частности, указанных генных продуктов, воспользовавшись оценкой корреляции, предпочтительно линейной корреляции, между интенсивностью обнаруженного сигнала и количеством генного продукта, подлежащего определению.
Уровень экспрессии может представлять собой уровень экспрессии белка ER, PD-L1 и/или IFN-γ. Количественную оценку уровня экспрессии белка можно осуществлять, воспользовавшись хорошо известными методами, такими как методы на основе Вестерн-блоттинга, иммуноанализы, методы на основе геля, блоттов, ИГХ, масс-спектрометрия, проточная цитометрия, FACS и т.п. Как правило, специалисту в данной области очевидны методы количественной оценки полипептида(ов)/белка(ов). Количество очищенного полипептида в растворе можно определять физическими методами, например, фотометрией. Методы количественной оценки конкретного полипептида в смеси могут быть основаны на специфическом связывании, например, антител. Методы специфического обнаружения и количественной оценки на основе специфичности антител включают, например, иммуногистохимию (in situ). Вестерн-блоттинг объединяет разделение смеси белков путем электрофореза и специфическое обнаружение с помощью антител. Электрофорез может представлять собой электрофорез для многомерного разделения, такой как 2D-электрофорез. Как правило, полипептиды разделяют с помощью 2D-электрофореза по их кажущейся молекулярной массе в одном направлении и по их изоэлектрической точке в другом направлении. Альтернативно этому, методы количественной оценки белков могут включать (но, не ограничиваясь только ими) методы масс-спектрометрии или твердофазного иммуноферментного анализа.
В контексте настоящего изобретения можно применять также высокопроизводительный скрининг (HTS). Приемлемые для рассматриваемой цели (HTS)-подходы известны в данной области. Специалисту в данной области должно быть очевидно как легко адаптировать указанные протоколы или известные HTS-подходы для осуществления способов, предлагаемых в настоящем изобретении. Такие анализы, как правило, осуществляют в жидкой фазе, при этом для каждой подлежащей тестированию клетки/ткани/культуры клеток приготавливают по меньшей мере одну порцию реакционной смеси. Типичные применяемые контейнеры представляют собой титрационные микропланшеты, имеющие 384, 1536 или 3456 лунок (т.е. кратное количество по сравнению с «исходными» 96-луночными реакционными устройствами). Робототехника, программы для обработки и контроля данных и чувствительные детекторы также представляют собой широко применяемые компоненты устройства для HTS. Часто автоматическую систему используют для переноса титрационных микопланшетов из станции в станцию для добавления и смешения образца(ов) и реагента(ов), включая реагенты и конечные выходные данные (детекция). Как правило, HTS можно применять для одновременного приготовления, инкубации и анализа нескольких планшетов. Анализ можно осуществлять в виде одностадийной реакции (что, как правило, является предпочтительным), однако он может включать также стадии промывки и/или переноса. Обнаружение (детекцию) можно осуществлять на основе радиоактивности, люминисценции или флуоресценции, типа флуоресцентного резонансного переноса энергии (FRET) и флуоресцентной поляризации (FP) и т.п. В этом контексте можно применять также биологические образцы, указанные в настоящем описании. Для HTS можно применять, в частности, клеточные анализы и анализы in vivo. Для клеточных анализов можно применять также клеточные экстракты, т.е. экстракты клеток, тканей и т.п. Однако согласно настоящему описанию предпочтительным является применение клетки(ок) или ткани(ей) в качестве биологического образца (в частности, образца, полученного из организма/индивидуума, страдающего раком или предрасположенного к раку), при этом, анализы in vivo являются наиболее ценными для валидации модуляторов/ингибиторов/химиотерапевтических средств, подлежащих применению в контексте настоящего описания. В зависимости от результатов первого анализа последующие анализы можно осуществлять путем повторения эксперимента для сбора дополнительных данных с использованием уменьшенного набора (например, образцов, выявленных в качестве «позитивных» в первом анализе), подтверждая и уточняя полученные результаты.
В контексте предлагаемых в изобретении способов примером «контроля» предпочтительно является (но, не ограничиваясь только ими) контрольный пациент, который не нуждается в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, например, образец/клетка/ткань из организма одного или нескольких здоровых индивидуумов или одного или нескольких пациентов, страдающих раком/опухолью, и для которых известно, что они не нуждаются в лечении, включающем совместную терапию с использованием ингибитора PD-L1. Например, указанный контроль (образец) может быть из организма пациента, на которого не оказывает благоприятное действие дополнительная совместная терапия с использованием ингибитора PD-L1. Другим примером «контроля» является (но, не ограничиваясь только ими) «внутренний стандарт», например, смесь очищенных или полученных путем синтеза белков и/или пептидов, или РНК, в котором количество каждого из таких компонентов как белок/пептид/РНК калибруют, используя описанный выше контроль.
Другим примером «контроля» может являться (но, не ограничиваясь только ими) «здоровый» контроль, например, образец/клетка/ткань здорового индивидуума или пациента, который не страдает раком/опухолью, или клетка, полученная из организма такого индивидуума. Согласно вышесказанному референс-уровень или контрольный уровень экспрессии ER, PD-L1 и/или IFN-γ определяют в (образце) соответствующего здорового контрольного индивидуума/пациента, т.е., имеющего «нормальный» статус ER, PD-L1 и/или IFN-γ. Контроль может представлять собой также образец/клетку/ткань, полученный/полученную из организма индивидуума или пациента, который, как предполагается, может страдать раком, при условии, что образец/клетка /ткань не содержат опухолевых или раковых клеток. В еще одном альтернативном варианте «контроль» может представлять собой образец/клетку/ткань, взятый/взятую из организма индивидуума или пациента, страдающего раком, до развития или диагностирования указанного рака.
Образец, подлежащий оценке согласно представленному в настоящем описании способу, может содержать непораженные болезнью клетки и/или пораженные болезнью клетки, т.е. нераковые клетки и/или раковые клетки. Однако содержание раковых клеток среди нераковых клеток должно превышать, например 50%. Образец может также (или даже исключительно) содержать раковую(ые)/опухолевую(ые) клетку(и), например, раковую(ые)/опухолевую(ые) клетку(и) молочной железы. Понятие «образец», как правило, может означать любой биологический образец, полученный из опухоли пациента. Образец можно получать путем резекции ткани или биопсии ткани. Образец может также представлять собой метастатическое повреждение или срез метастатического повреждения или образец крови, который, как известно или как предполагается, содержит циркулирующие опухолевые клетки. Согласно вышесказанному биологический образец может содержать раковые клетки и в определенном количестве, т.е., менее, например, 50%, нераковые клетки (другие клетки). Специалист в области патоморфологии может провести дифференциацию раковых клеток и клеток здоровой ткани. Методы получения биопсий ткани, резекций ткани и общей воды организма и т.п. из организма млекопитающих, таких как люди, хорошо известны в данной области.
Как описано выше, раковый пациент, который согласно настоящего изобретению классифицирован в качестве нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, подвергается терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, или такая терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, показана пациенту. Терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, показана пациентам с «HER2-позитивным раком», например, пациенту, который, как ожидается, может страдать HER2-позитивным раком, страдает HER2-позитивным раком или предрасположен к HER2-позитивному раку. Предпочтительно рак, подлежащий лечению согласно настоящему изобретению, представляет собой «HER2-позитивный рак», прежде всего «HER2-позитивный рак молочной железы». «HER2-позитивный рак» может представлять собой «HER2-позитивный рак молочной железы» или «HER2-позитивный рак желудка». Кроме того, HER2-позитивный рак может представлять собой рак яичника, рак легкого, колоректальный рак, рак почки, рак кости, рак костного мозга, рак мочевого пузыря, рак кожи, рак предстательной железы, рак пищевода, рак слюнной железы, рак поджелудочной железы, рак печени, рак головы и шеи, рак ЦНС (прежде всего головного мозга), рак шейки матки, рак хряща, рак ободочной кишки, рак мочеполовой системы, рак желудочно-кишечного тракта, рак поджелудочной железы, рак синовиальной оболочки, рак яичек, рак тимуса, рак щитовидной железы и рак матки.
В контексте настоящего описания «HER2-позитивный рак» относится к раковой/опухолевой ткани и т.д., которая содержит раковые клетки, в которых уровень HER2 превышает нормальные уровни. Для целей настоящего изобретения «HER2-позитивный рак» имеет иммуногистохимический (ИГХ) балл, составляющий по меньшей мере 2+, и/или коэффициент амплификации при оценке путем гибридизации in situ (ISH), составляющий ≥2,0 (т.е. является ISH-позитивным). Таким образом, считается, что имеет место HER2-позитивный рак, если обнаружен высокий уровень экспрессии HER2 (белка), например, иммуногистохимическими методами, и/или обнаружена амплификация гена HER2, выявленная путем гибридизации in situ (ISH-позитивный статус, например, когда количество копий гена HER2 превышает 4 копии гена HER2 на опухолевую клетку, или при наличии соотношения количества копий гена HER2 и количества сигналов зонда CEP17) ≥ 2,0 в образцах, полученных из организма пациента, например, в биопсиях ткани молочной железы или резекциях ткани молочной железы или в ткани, полученной из областей метастазов. В одном из вариантов осуществления изобретения «HER2-позитивный рак» имеет иммуногистохимический (ИГХ) балл HER2(3+) и/или является ISH-позитивным.
Уровень экспрессии HER2 можно определять иммуногистохимическим методом, а указанный статус амплификации гена HER2 можно измерять методами гибридизации in situ, типа методик флуоресцентной гибридизации in situ (FISH). Соответствующие анализы и наборы хорошо известны в данной области для анализов экспрессии белков, а также для обнаружения амплификаций генов. Альтернативно этому, можно использовать другие методы типа qOT-ПЦР для определении уровней экспрессии гена HER2.
Уровень экспрессии HER2 можно определять среди прочего иммуногистохимическим методом. Указанные методы хорошо известны в данной области и в продажу поступают соответствующие наборы. Примером наборов, которые можно применять согласно настоящему изобретению, являются среди прочего HerceptTest™, который выпускается и распространяется фирмой Dako, или тест, обозначенный как Ventana Pathway™. Уровень экспрессии белка HER2 можно оценивать, используя реагенты, входящие в набор HercepTest™, и согласно прилагаемому к нему протоколу. Специалисту в данной области должны быть известны другие средства и методы определения уровня экспрессии HER2 иммуногистохимическими методами (см., например, WO 2005/117553). Таким образом, специалист в данной области без чрезмерных усилий может с помощью простого и воспроизводимого метода определять уровень экспрессии HER2. Однако для гарантии точности и воспроизводимости результатов тестирование следует осуществлять в специализированной лаборатории, которая может гарантировать валидацию процедур тестирования.
Уровень экспрессии HER2 можно классифицировать как низкий уровень экспрессии, умеренный уровень экспрессии и высокий уровень экспрессии. В контексте настоящего изобретения предпочтительно определяют HER2-позитивное заболевание по высокому уровню экспрессии HER2 (например, HER2(3+) по данным ИГХ), например, определенному в образце, взятом из организма ракового пациента.
Рекомендованная балльная система оценки картины ИГХ-окрашивания, которая отражает уровни экспрессии HER2, обозначенные в настоящем описании как HER2(0), HER2(+), HER2(++) и HER2(+++), представлена ниже:
Приведенные выше картины ИГХ-окрашивания, как правило, применяют для определения HER2-позитивного рака молочной железы. Понятия (обозначения) HER2(+), HER2(++) и HER2(+++), применяемые в настоящем описании, эквиваленты понятиям (обозначениям) HER2(1+), HER2(2+) и HER2(3+). В контексте настоящего описания «низкий уровень экспрессии белка» соответствует баллу 0 или 1+ («негативная оценка» в приведенной выше таблице), «уровень экспрессии белка от слабого до умеренного» соответствует баллу 2+ («сверхэкспрессия от слабой до умеренной», см. выше в таблице) и «высокий уровень экспрессии белка» соответствует баллу 3+ («сильная сверхэкспрессия», см. выше в таблице). Как подробно описано выше в контексте настоящего описания, оценка уровня экспрессии белка (т.е. балльная система, представленная в таблице) базируется на результатах, полученных иммуногистохимическими методами. Таким образом, в качестве стандартного или общепринятого метода для определения статуса HER-2 применяют иммуногистохимический метод с использованием одного из двух разрешенных FDA поступающих в продажу наборов; таких как Dako Herceptest™ и Ventana Pathway™. Они представляют собой полуколичественные анализы, которые позволяют стратифицировать уровни экспрессии на следующие группы: 0 (<20000 рецепторов на клетку, отсутствие видимой экспрессии при ИГХ-окрашивании), 1+ (~100000 рецепторов на клетку, частичное окрашивание мембраны, <10% клеток, сверхэкспрессирующих HER-2), 2+ (~500000 рецепторов на клетку, полное окрашивание мембраны от слабого до умеренного, >10% клеток, сверхэкспрессирующих HER-2) и 3+ (~2000000 рецепторов на клетку, сильное полное окрашивание мембраны, >10% клеток, сверхэкспрессирующих HER-2).
Альтернативному этому, можно применять другие методы оценки уровня экспрессии белка HER2, например, Вестерн-блоттинг, системы детекции на основе ELISA и т.д.
HER2-позитивный рак можно диагностировать также путем оценки статуса амплификации гена HER2. Таким образом, HER2-позитивный рак диагностируют, если указанная оценка с помощью ISH является позитивной. Согласно указанной оценке HER2-позитивный рак может среди прочего иметь место, когда среднее количество копией гена HER2 превышает 4 копии гена HER2 на опухолевую клетку (при применении тест-систем без контрольного зонда внутреннего центромерного домена) или когда соотношение HER2/CEP17 ≥ 2,0 (при применении тест-систем, в которых используется контрольный зонд внутреннего центромерного домена хромосомы 17). Другим словами, HER2-позитивный рак может среди прочего иметь место, когда количество копий гена HER2 превышает 4. Уровень амплификации гена HER2 легко можно идентифицировать путем гибридизации in situ (ISH), типа флуоресцентной гибридизации in situ (FISH), хромогенной гибридизации in situ (CISH) и усиленная серебром гибридизации in situ (SISH). Эти методы известны специалистам в данной области. Принципы этих методов можно почерпнуть из стандартных учебников. Доступны поступающие в продажу наборы для определения статуса амплификации гена HER2 путем гибридизации in situ.
Ниже представлены картины ИГХ-окрашивания для определения HER2-позитивного рака желудка (см. вкладыш в упаковке к набору Dako Herceptest): «…при окрашивании биопсий с помощью Hercep Test рекомендовано оценивать кластер, включающий по меньшей мере 5 окрашенных опухолевых клеток. Кластер по меньшей мере из 5 окрашенных опухолевых клеток состоит из 5 смежных окрашенных в отношении HER2 опухолевых клеток».
Руководство на основе Hofmann и др. (40)»
Ниже представлены более точные картины ИГХ-окрашивания для определения HER2-позитивного рака желудка:
Как указано выше, HER2-позитивный рак, подлежащий лечению согласно настоящему изобретению, может представлять собой рак молочной железы, например, рак молочной железы ранней стадии. В контексте настоящего описания понятие «рак молочной железы ранней стадии» относится к раку молочной железы, который еще не распространился за пределы молочной железы или аксиллярных лимфатических узлов. Указанный рак, как правило, можно лечить с помощью неоадъювантной или адъювантной терапии. В контексте настоящего описания понятие «неоадъювантная терапия» относится к системной терапии, применяемой до хирургической операции. Понятие «адъювантная терапия» относится к системной терапии, применяемой после хирургической операции. Согласно вышесказанному лечение рака молочной железы ранней стадии можно осуществлять с помощью неоадъювантной или адъювантной терапии.
Согласно вышесказанному подлежащий оценке образец можно получать (получали) из организма пациента с HER2-позитивным раком, описанным выше. Например, образец можно получать из опухолевой ткани, опухоли(ей), и соответственно он представляет собой опухолевую(ые) клетку(и) или опухолевую(ые) ткань(и), предположительно HER2-позитивной опухоли типа опухоли молочной железы и т.п. Специалист в данной области может идентифицировать указанные опухоли и/или индивидуумов/пациентов, страдающих соответствующим раком, с использованием стандартных методик, известных в данной области, и методов, представленных в настоящем описании. Как правило, указанную опухолевую клетку или раковую клетку можно получать из биологического источника/организма, в частности, любого биологического источника/организма, страдающего указанным выше раком. В контексте настоящего изобретения наиболее ценные клетки представляют собой предпочтительно человеческие клетки. Эти клетки можно получать, например, из биопсий или из биологических образцов. Опухоль/рак/опухолевая клетка/раковая клетка представляет собой солидную опухоль/рак/опухолевую клетку/раковую клетку. Согласно вышесказанному раковая/опухолевая клетка может представлять собой раковую/опухолевую клетку молочной железы, или указанный образец содержит раковую/опухолевую клетку, такую как раковую/опухолевую клетку молочной железы. В свете вышеизложенного указанная/указанный опухоль/рак может представлять собой опухоль/рак молочной железы.
Модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) может представлять собой ингибитор HER2, например, ингибитор димеризации/передачи сигналов HER. Ингибитор димеризации HER может представлять собой ингибитор димеризации HER2. Ингибитор димеризации HER может ингибировать гетеродимеризацию HER или гомодимеризацию HER. Ингибитор димеризации HER может представлять собой антитело к HER. В контексте настоящего описания понятие «антитело» применяют в его наиболее широком смысле, и оно, в частности, включает интактные моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифические антитела), образованные по меньшей мере из двух интактных антител и фрагменты антител, если они сохраняют требуемую биологическую активность. Под понятие подпадают также человеческие и гуманизированные антитела, а также антитела с трансплантированными CDR.
Антитело к HER может связываться с HER-рецептором, выбранным из группы, состоящей из EGFR, HER2 и HER3. Предпочтительно антитело связывается с HER2. Антитело к HER2 может связываться с доменом II внеклеточного домена HER2. Антитело может связываться с областью стыка между доменами I, II и III внеклеточного домена HER2. Антитело к HER2 может представлять собой пертузумаб.
Для целей настоящего описания «пертузумаб» и «rhuMAb 2С4», которые применяют взаимозаменяемо, относится к антителу, содержащему вариабельный домен легкой цепи и вариабельный домен тяжелой цепи (их аминокислотные последовательности представлены в SEQ ID NO: 5 и 6 соответственно на фиг. 2). Вариабельный домен легкой цепи и вариабельный домен тяжелой цепи варианта 574/пертузумаба также представлены на фиг. 2 (их аминокислотные последовательности представлены в SEQ ID NO: 7 и 8 соответственно на фиг. 2). Если пертузумаб представляет собой интактное антитело, то он предпочтительно представляет собой антитело IgG1-типа; в одном из вариантов осуществления изобретения содержащий аминокислотную последовательность легкой цепи, предпочтительно содержащий аминокислотные последовательности легкой цепи и тяжелой цепи, которые представлены на фиг. 3А/3Б и 5А/5Б (на фиг. 5А/5Б показаны аминокислотные последовательности легкой цепи и тяжелой цепи варианта пертузумаба). Аминокислотные последовательности тяжелых цепей пертузумаба, представленные на фиг. 3Б, могут необязательно содержать дополнительную аминокислоту «К» в положении 449 на С-конце. Антитело необязательно получают с помощью рекомбинантных клеток яичника китайского хомячка (СНО). В контексте настоящего описания под понятия «пертузумаб» и «rhuMAb 2С4» подпадают биологически подобные версии лекарственного средства согласно принятой в США номенклатуре лекарственных средств (USAN) или согласно международному непатентованному названию (INN): пертузумаб. И в этом случае, соответствующие последовательности представлены на фиг. 2-5.
Модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) может представлять собой ингибитор отщепления HER, например, ингибитор отщепления HER2. Ингибитор отщепления HER может ингибировать гетеродимеризацию HER или гомодимеризацию HER. Указанный ингибитор отщепления HER может представлять собой антитело к HER.
В контексте настоящего описания понятие «антитело» применяют в его наиболее широком смысле, и оно, в частности, включает интактные моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифические антитела), образованные по меньшей мере из двух интактных антител и фрагменты антител, если они сохраняют требуемую биологическую активность. Под понятие подпадают также человеческие и гуманизированные антитела, а также антитела с трансплантированными CDR.
Антитело к HER может связываться с HER-рецептором, выбранным из группы, состоящей из EGFR, HER2 и HER3. Предпочтительно антитело связывается с HER2. Антитело к HER2 может связываться с субдоменом IV внеклеточного домена HER2. Предпочтительно антитело к HER2 представляет собой Herceptin™/трастузумаб.
Для целей настоящего описания понятия «Herceptin™»/«трастузумаб» и «rhuMAb4D5-8», которые применяют взаимозаменяемо, относятся к антителу, содержащему вариабельные домены легкой цепи и вариабельные домены тяжелых цепей (их аминокислотные последовательности представлены на фиг. 4 соответственно; домены обозначены стрелками). Если трастузумаб представляет собой интактное антитело, то он предпочтительно представляет собой антитело IgG1-типа; в одном из вариантов осуществления изобретения содержащий аминокислотную последовательность легкой цепи и аминокислотную последовательность тяжелой цепи, которые представлены на фиг. 4. Антитело необязательно получают с помощью рекомбинантных клеток яичника китайского хомячка (СНО). В контексте настоящего описания под понятия «трастузумаб» и «rhuMAb4D5-8» подпадают биологически подобные версии лекарственного средства согласно принятой в США номенклатуре лекарственных средств (USAN) или согласно международному непатентованному названию (INN): трастузумаб.
Ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) может представлять собой антитело, специфически связывающееся с PD-L1 (антитело к PD-L1). И в этом случае понятие «антитело» применяют в его наиболее широком смысле, и оно, в частности, включает интактные моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифические антитела), образованные по меньшей мере из двух интактных антител и фрагменты антител, если они сохраняют требуемую биологическую активность. Под понятие подпадают также человеческие и гуманизированные антитела, а также антитела с трансплантированными CDR.
Примеры антител к PD-L1 описаны в WO 2010/077634, которая полностью включен в настоящее описание в качестве ссылки. Соответствующие приведенные в качестве примеров антитела е PD-L1, которые можно применять согласно настоящему изобретению, описаны ниже.
Антитело к PD-L1 может содержать полипептид вариабельной области тяжелой цепи, содержащий последовательность HVR-H1, HVR-H2 и HVR-H3, в котором:
(а) последовательность HVR-H1 представляет собой GFTFSX1SWIH (SEQ ID NO: 1);
(б) последовательность HVR-H2 представляет собой AWIX2PYGGSX3YYADSVKG (SEQ ID NO: 2);
(в) последовательность HVR-H3 представляет собой RHWPGGFDY (SEQ ID NO: 3);
кроме того, в котором: X1 обозначает D или G; Х2 обозначает S или L; X3 обозначает Т или S. X1 может обозначать D; Х2 может обозначать S и X3 может обозначать Т.
Полипептид может содержать также последовательности каркасных участков вариабельной области тяжелой цепи, расположенные между HVR, что соответствует следующей схеме: (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4). Последовательности каркасных участков можно выводить из консенсусных последовательностей человеческих каркасных участков. Последовательности каркасных участков могут представлять собой консенсусный каркасный участок VH подгруппы III. Одна или несколько последовательностей каркасных участков может представлять собой следующие последовательности:
HC-FR1, которая представляет собой EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS (SEQ ID NO: 4),
HC-FR2, которая представляет собой WVRQAPGKGLEWV (SEQ ID NO: 5),
HC-FR3, которая представляет собой RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR (SEQ ID NO: 6),
HC-FR4, которая представляет собой WGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 7).
Полипептид тяжелой цепи может присутствовать в сочетании с вариабельной областью легкой цепи, содержащей HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, где:
(а) последовательность HVR-L1 представляет собой RASQX4X5X6TX7X8A (SEQ ID NO: 8);
(б) последовательность HVR-L2 представляет собой SASX9LX10S (SEQ ID NO: 9) и
(в) последовательность HVR-L3 представляет собой QQX11Х12Х13Х14РХ15Т (SEQ ID NO: 10);
где, кроме того: Х4 обозначает D или V; Х5 обозначает V или I; Х6 обозначает S или N; Х7 обозначает А или F; Х8 обозначает V или L; Х9 обозначает F или Т; X10 обозначает Y или А; X11 обозначает Y, G, F или S; X12 обозначает L, Y, F или W; Х13 обозначает Y, N, А, Т, G, F или I; Х14 обозначает Н, V, Р, Т или I; X15 обозначает A, W, R, Р или Т.
Х4 может обозначать D; Х5 может обозначать V; Х6 может обозначать S; Х7 может обозначать A; Х8 может обозначать V; Х9 может обозначать F; X10 может обозначать Y; X11 может обозначать Y; X12 может обозначать L; X13 может обозначать Y; Х14 может обозначать Н; X15 может обозначать А.
Полипептид может содержать также последовательности каркасных участков вариабельной области легкой цепи, расположенные между HVR, что соответствует следующей схеме: (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4). Последовательности каркасных участков можно выводить из консенсусных последовательностей человеческих каркасных участков. Последовательности каркасных участков могут представлять собой консенсусный каркасный участок VL каппа I. Одна или несколько последовательностей каркасных участков может(гут) представлять собой следующие последовательности:
LC-FR1, которая представляет собой DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC (SEQ ID NO: 11);
LC-FR2, которая представляет собой WYQQKPGKAPKLLIY (SEQ ID NO: 12);
LC-FR3, которая представляет собой GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC (SEQ ID NO: 13);
LC-FR4, которая представляет собой FGQGTKVEIKR (SEQ ID NO: 14).
Антитело к PD-L1 (или его антигенсвязывающий фрагмент) может содержать последовательность вариабельной области тяжелой цепи и легкой цепи, где:
(а) тяжелая цепь содержит HVR-H1, HVR-H2 и HVR-H3, в которых также:
(I) последовательность HVR-H1 представляет собой GFTFSX1SWIH (SEQ ID NO: 1);
(II) последовательность HVR-H2 представляет собой AWIX2PYGGSX3YYADSVKG (SEQ ID NO: 2);
(III) последовательность HVR-H3 представляет собой RHWPGGFDY (SEQ ID NO: 3); и
(б) легкая цепь содержит HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, в которых также:
(IV) последовательность HVR-L1 представляет собой RASQX4X5X6TX7X8A (SEQ ID NO: 8);
(V) последовательность HVR-L2 представляет собой SASX9LX10S (SEQ ID NO: 9);
(VI) последовательность HVR-L3 представляет собой QQX11X12X13X14PX15T (SEQ ID NO: 10);
в которых: X1 обозначает D или G; Х2 обозначает S или L; X3 обозначает T или S; Х4 может обозначать D или V; Х5 может обозначать V или I; Х6 может обозначать S или N; Х7 может обозначать A или F; Х8 может обозначать V или L; Х9 может обозначать F или T; X10 может обозначать Y или А; X11 может обозначать Y, G, F или S; X12 может обозначать L, Y, F или W; X13 может обозначать Y, N, А, Т, G, F или I; X14 может обозначать Н, V, P, Т или I; X15 может обозначать A, W, R, Р или Т.
X1 может обозначать D; X2 может обозначать S и X3 может обозначать T. Кроме того, положения могут представлять собой: X4=D, Х5=V, Х6=S, Х7=A и Х8=V, Х9=F и Х10=Y, X11=Y, Х12=L, Х13=Y, Х14=Н и/или Х15=А. Кроме того, положения могут представлять собой: X1=D, X2=S и X3=T, Х4=D, Х5=V, Х6=S, Х7=A и Х8=V, Х9=F и Х10=Y, X11=Y, Х12=L, Х13=Y, Х14=Н и Х15=А.
Антитело (его антигенсвязывающий фрагмент) может содержать также
(а) последовательности каркасных участков вариабельной области тяжелой цепи, расположенные между HVR, что соответствует следующей схеме: (НС-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4), и
(б) последовательности каркасных участков вариабельной области легкой цепи, расположенные между HVR, что соответствует следующей схеме: (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4). Последовательности каркасных участков можно выводить из консенсусных последовательностей человеческих каркасных участков.
Последовательности каркасных участков вариабельной области тяжелой цепи могут представлять собой консенсусный каркасный участок VH подгруппы III. Одна или несколько последовательностей каркасных участков может(гут) представлять собой следующие последовательности:
HC-FR1, которая представляет собой
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS (SEQ ID NO: 4),
HC-FR2, которая представляет собой
WVRQAPGKGLEWV (SEQ ID NO: 5),
HC-FR3, которая представляет собой
RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR (SEQ ID NO: 6),
HC-FR4, которая представляет собой
WGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 7).
Последовательности каркасных участков вариабельной области легкой цепи могут представлять собой консенсусный каркасный участок VL каппа I. Одна или несколько последовательностей каркасных участков может представлять собой следующие последовательности:
LC-FR1, которая представляет собой
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC (SEQ ID NO: 11);
LC-FR2, которая представляет собой
WYQQKPGKAPKLLIY (SEQ ID NO: 12);
LC-FR3, которая представляет собой
GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC (SEQ ID NO: 13);
LC-FR4, которая представляет собой FGQGTKVEIKR (SEQ ID NO: 14).
Антитело (или его антигенсвязывающий фрагмент) может представлять собой или может содержать
(а) следующие последовательности каркасного участка вариабельной области тяжелой цепи:
(I) HC-FR1, которая представляет собой EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS (SEQ ID NO: 4);
(II) HC-FR2, которая представляет собой
WVRQAPGKGLEWV (SEQ ID NO: 5);
(III) HC-FR3, которая представляет собой
RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR (SEQ ID NO: 6);
(IV) HC-FR4, которая представляет собой
WGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 7); и
(б) следующие последовательности каркасного участка вариабельной области легкой цепи:
(I) LC-FR1, которая представляет собой
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC (SEQ ID NO: 11);
(II) LC-FR2, которая представляет собой
WYQQKPGKAPKLLIY (SEQ ID NO: 12);
(III) LC-FR3, которая представляет собой
GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC (SEQ ID NO: 13);
(IV) LC-FR4, которая представляет собой
FGQGTKVEIKR (SEQ ID NO: 14).
Антитело (или его фрагмент) может содержать также человеческую константную область. Константную область можно выбирать из группы, состоящей из IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4. Константная область может представлять собой константную область IgG1. Антитело (или его фрагмент) может содержать также мышиную константную область. Константную область можно выбирать из группы, состоящей из IgG1, IgG2A, IgG2B и IgG3. Константная область может представлять собой константную область IgG2A.
Антитело (или его фрагмент) может область пониженной или минимальной эффекторной функцией. Минимальная эффекторная функция может являться результатом снижающей эффекторную функцию (effector-less) мутации в Fc-области. Снижающая эффекторную функцию мутация в Fc-области может представлять собой N297A. Снижающая эффекторную функцию мутация в Fc-области может представлять собой D265A/N297A. Минимальная эффекторная функция может являться результатом агликозилирования.
Антитело (или его фрагмент) может содержать последовательность вариабельной области тяжелой цепи и легкой цепи, где:
(а) тяжелая цепь содержит HVR-H1, HVR-H2 и HVR-H3, которые обладают по меньшей мере 85%-ной идентичностью по всей длине последовательности с GFTFSDSWIH (SEQ ID NO: 15), AWISPYGGSTYYADSVKG (SEQ ID NO: 16) и RHWPGGFDY (SEQ ID NO: 3) соответственно, и
(б) легкая цепь содержит HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, которые обладают по меньшей мере 85%-ной идентичностью по всей длине последовательности с RASQDVSTAVA (SEQ ID NO: 17), SASFLYS (SEQ ID NO: 18) и QQYLYHPAT (SEQ ID NO: 19) соответственно.
Идентичность последовательностей может составлять по меньшей мере 90%.
Антитело (или его фрагмент) может содержать также:
(а) последовательности каркасных участков вариабельной области тяжелой цепи (VH), расположенные между HVR, что соответствует следующей схеме: (HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4) и
(б)) последовательности каркасных участков вариабельной области легкой цепи (VL), расположенные между HVR, что соответствует следующей схеме: (LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4).
Антитело (или его фрагмент) может содержать также каркасную область VH и VL, выведенную из человеческой консенсусной последовательности. Последовательность каркасного участка VH может быть выведена из последовательности подгруппы I, II или III по Кэботу. Последовательность каркасного участка VH может представлять собой консенсусную последовательность каркасного участка подгруппы III по Кэботу. Последовательности каркасных участков VH могут представлять собой следующие последовательности:
HC-FR1, которая представляет собой
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS (SEQ ID NO: 4);
HC-FR2, которая представляет собой
WVRQAPGKGLEWV (SEQ ID NO: 5);
HC-FR3, которая представляет собой
RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR (SEQ ID NO: 6);
HC-FR4, которая представляет собой
WGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 7).
Последовательность каркасного участка VL можно выводить из последовательности подгруппы каппа I, II, III или IV по Кэботу. Последовательность каркасного участка VL может представлять собой консенсусную последовательность каркасного участка подгруппы каппа I по Кэботу.
Последовательности каркасных участков VL могут представлять собой следующие последовательности:
LC-FR1, которая представляет собой
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC (SEQ ID NO: 11);
LC-FR2, которая представляет собой
WYQQKPGKAPKLLIY (SEQ ID NO: 12);
LC-FR3, которая представляет собой
VPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC (SEQ ID NO: 13);
LC-FR4, которая представляет собой
FGQGTKVEIKR (SEQ ID NO: 14).
Антитело (или его фрагмент) может содержать последовательность вариабельной области тяжелой цепи и легкой цепи, где:
(а) последовательность тяжелой цепи идентична по меньшей мере на 85% последовательности тяжелой цепи:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGF DYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 20) и
(б) последовательность легкой цепи идентична по меньшей мере на 85% последовательности легкой цепи:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYH PATFGQGTKVEIKR (SEQ ID NO: 21).
Идентичность последовательностей может составлять по меньшей мере 90%.
Антитело (или его фрагмент) может содержать последовательность вариабельной области тяжелой цепи и легкой цепи, где:
(а) тяжелая цепь содержит последовательность:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGF DYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 20) и
(б) легкая цепь содержит последовательность:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYH PATFGQGTKVEIKR (SEQ ID NO: 21).
Кроме того, антитело к PD-L1 может кодироваться нуклеиновой кислотой. Таким образом, в настоящем изобретении описана выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая описанный выше полипептид/антитело (или его фрагмент).
В настоящем описании представлена выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая последовательность вариабельной области легкой цепи и тяжелой цепи антитела к PD-L1 или антигенсвязывающего фрагмента, в котором:
(а) тяжелая цепь содержит также последовательность HVR-H1, HVR-H2 и HVR-H3, которая по меньшей мере на 85% идентична последовательности GFTFSDSWIH (SEQ ID NO: 15), AWISPYGGSTYYADSVKG (SEQ ID NO: 16) и RHWPGGFDY (SEQ ID NO: 3) соответственно, или
(б) легкая цепь содержит также последовательность HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, которая по меньшей мере на 85% идентична последовательности RASQDVSTAVA (SEQ ID NO: 17), SASFLYS (SEQ ID NO: 18) и QQYLYHPAT (SEQ ID NO: 19) соответственно.
Идентичность последовательностей может составлять 90%. Антитело к PD-L1 может содержать также каркасные участки VL и VH, выведенные из человеческой консенсусной последовательности. VH-последовательность можно выводить из последовательности подгруппы I, II или III по Кэботу. VL-последовательность можно выводить из последовательности подгруппы каппа I, II, III или IV по Кэботу. Антитело к PD-L1 может содержать константную область, выведенную из мышиного антитела. Антитело к PD-L1 может содержать константную область, выведенную из человеческого антитела. Константная область может представлять собой константную область IgG1. Антитело, кодируемое нуклеиновой кислотой, может обладать пониженной или минимальной эффекторной функцией. Минимальная эффекторная функция может являться результатом снижающей эффекторную функцию мутации в Fc-области. Снижающая эффекторную функцию мутация в Fc-области может представлять собой N297A.
Кроме того, в настоящем описании представлен вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, клетка-хозяин, содержащая вектор. Клетка хозяин может представлять собой эукариотическую клетку. Клетка-хозяин может представлять собой клетку млекопитающего. Клетка-хозяин может представлять собой клетку яичника китайского хомячка (СНО). Клетка-хозяин может представлять собой прокариотическую клетку. Клетка-хозяин может представлять собой клетку Е. coli. Кроме того, в настоящем описании представлен способ получения антитела к PD-L1, заключающийся в том, что культивируют указанную выше клетку-хозяина в условиях, пригодных для экспрессии вектора, кодирующего антитело к PD-L1 или антигенсвязывающий фрагмент, и выделяют антитело или фрагмент.
Ниже описаны более подробно представленные в настоящем описании средства и способы лечения рака и/или ракового пациента.
Таким образом, настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) (типа трастузумаба) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели -1 (PD-L1) (типа антитела к PD-L1, указанного в настоящем описании), предназначенной для применения для лечения рак, если установлено, что рак характеризуется низким уровнем или у него отсутствует экспрессия ER и характеризуется повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем. Рак может характеризоваться пониженным уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) по сравнению с контролем. Фармацевтическая композиция может содержать также химиотерапевтическое средство (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)).
Согласно вышесказанному в настоящем изобретении предложен способ лечения рака, заключающийся в том, что вводят в эффективном количестве модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) индивидууму, который нуждается в этом. Рак может характеризоваться пониженным уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) по сравнению с контролем.
В настоящем изобретении предложены модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), предназначенные для лечения рака, если установлено, что рак характеризуется низким уровнем или у него отсутствует экспрессия ER и характеризуется повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем. Кроме того, в настоящем изобретении предложены модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и химиотерапевтическое средство (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)), предназначенные для лечения рака, если установлено, что рак обладает низким уровнем или у него отсутствует экспрессия ER и обладает повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем. Рак может характеризоваться пониженным уровнем экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) по сравнению с контролем.
Как описано выше, в настоящем изобретении предложен способ лечения рака у ракового пациента, которому показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, что отбирают ракового пациента, для которого установлено, что рак характеризуется низким уровнем или у него отсутствует экспрессия ER и характеризуется повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и вводят пациенту в эффективном количестве модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1). Аналогично этому, в настоящем изобретении предложен способ лечения рака у ракового пациента, который подвергается терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, что отбирают ракового пациента, для которого установлено, что рак характеризуется низким уровнем или у него отсутствует экспрессия ER и характеризуется повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и вводят пациенту в эффективном количестве ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
Все пояснения и определения представленные в настоящем описании для «рака», «ракового пациента», «ингибитора PD-L1», «терапии с использованием ингибитора PD-L1», «модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2)», «химиотерапевтического средства», «низкого уровня или отсутствия экспрессии ER», «повышенного уровня экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1)», «пониженного уровня экспрессии интерферона-гамма (IFN-γ)» и т.п. применимы с соответствующими изменениями к описанным выше объектам настоящего изобретения.
Понятия «лечение», «лечить» и т.п. в контексте настоящего описания, в целом, означают получение требуемого фармакологического и/или физиологического действия. Действие может быть профилактическим в понятиях полного или частичного предупреждения заболевания или симптомов и/или терапевтическим в понятиях частичного или полного излечивания заболевания и/или побочных действий, связанных с заболеванием. В контексте настоящего описания под понятие «лечение» подпадают любые варианты лечения заболевания у пациента, и оно включает: (а) предупреждение заболевания у пациента, который может быть предрасположен к заболеванию; (б) ингибирование заболевания, т.е. прекращение его развития; или (в) ослабление заболевания, т.е. обеспечение регресса заболевания.
«Пациент» для целей настоящего изобретения включает как людей, так и других животных, прежде всего млекопитающих, и другие организмы. Так, способы можно применять как для лечения людей, так и в ветеринарии. Предпочтительно пациент представляет собой человека.
Ниже более подробно описаны лечение/терапия согласно настоящему изобретению этих пациентов/этой группы пациентов.
Фармацевтическую композицию следует приготавливать и дозировать в соответствии с надлежащей клинической практикой с учетом клинического состояния индивидуального пациента, области введения фармацевтической композиции, способа введения, схемы введения и других факторов, известных практикующим специалистам. «Эффективное количество» фармацевтической композиции для целей настоящего описания определяют с учетом указанных положений.
Специалисту в данной области известно, что эффективное количество любого(ых) из указанных ингибитора(ов) PD-L1, модулятора(ов) пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтического(их) средства(в) в фармацевтической композиции, вводимой индивидууму, должно среди прочего зависеть от природы соединения. Например, если указанное соединение представляет собой (поли)пептид или белок, то общее фармацевтически эффективное количество фармацевтической композиции, вводимой парентерально, на дозу должно составлять примерно от 1 мкг белка/кг/день до 10 мг белка/кг веса тела пациента/день, хотя, как отмечалось выше, это должно определяться терапевтической необходимостью. Более предпочтительно эта доза составляет по меньшей мере 0,01 мг белка/кг/день и наиболее предпочтительно для людей применять примерно от 0,01 и до 1 мг белка/кг/день.
В случае трастузумаба можно применять следующие варианты введения:
Позология (дозология) и метод введения
Тестирование HER2 является обязательным до начала терапии. Лечение герцептином можно начинать только по решению лечащего врача, имеющего опыт в области применения цитотоксической химиотерапии.
Метастатический рак молочной железы (МВС)
Трехнедельная схема
Рекомендованная начальная ударная доза составляет 8 мг/кг веса тела. Рекомендованная поддерживающая доза, вводимая с трехнедельными интервалами, составляет 6 мг/кг веса тела, начиная через 3 недели после введения ударной дозы.
Еженедельная схема
Рекомендованная начальная ударная доза герцептина составляет 4 мг/кг веса тела. Рекомендованная еженедельная поддерживающая доза герцептина составляет 2 мг/кг веса тела, начиная через 1 неделю после введения ударной дозы.
Введение в сочетании с паклитакселом или доцетакакселом
В основных исследованиях (H0648g, М77001) паклитаксел или доцетакаксел вводили через 1 день после первой дозы герцептина (касательно доз см. сводную характеристику препарата (Summary of Product Characteristics) для паклитаксела или доцетакаксела) и немедленно после последующих доз герцептина, если предыдущая доза герцептина хорошо переносилась.
Введение в сочетании с ингибитором ароматазы
В основном исследовании (ВО16216) герцептин и анастрозол вводили, начиная со дня 1. Не накладывались ограничения на время обработки герцептином и анастрозолом (касательно доз см. сводную характеристику препарата (Summary of Product Characteristics) для анастрозола или других ингибиторов ароматазы).
Ранний (операбельный) рак молочной железы (ЕВС)
Трехнедельная и недельная схема
В трехнедельной схеме рекомендованная начальная ударная доза герцептина составляет 8 мг/кг веса тела. Рекомендованная поддерживающая доза, вводимая с трехнедельными интервалами, составляет 6 мг/кг веса тела, начиная через 3 недели после введения ударной дозы.
При еженедельной схеме (начальная ударная доза составляет 4 мг/кг, после чего еженедельно вводят дозу, составляющую 2 мг/кг) одновременно с паклитакселом с последующей химиотерапией доксорубицином и циклофосфамидом.
(см. раздел 5.1. касающийся дозирования комбинированной химиотерапии).
Метастатический рак желудка (MGC)
Трехнедельная схема
Рекомендованная начальная ударная доза составляет 8 мг/кг веса тела. Рекомендованная поддерживающая доза, вводимая с трехнедельными интервалами, составляет 6 мг/кг веса тела, начиная через 3 недели после введения ударной дозы.
Рак молочной железы (МВС и ЕВС) и рак желудка (MGC)
Продолжительность лечения
Пациентов с МВС или MGC можно лечить герцептином до прогрессирования заболевания. Пациентов с ЕВС можно лечить герцептином в течение 1 года или вплоть до рецидива болезни, в зависимости от того, что наступает первым.
Снижение доз
Во время клинических испытаний не снижали дозу герцептина. Пациентов можно продолжать лечит в течение периодов обратимой индуцированной химиотерапией миелосупрессии, но в этот период времени требуется осуществлять тщательный мониторинг осложнений в виде нейтропении (см. в сводной характеристике препарата (Summary of Product Characteristics) информацию касательно снижения доз или задержки их применения для паклитаксела, доцетакаксела или ингибитора ароматазы).
Пропущенные дозы
Если пациент пропустил дозу герцептина на 1 неделю или меньше, то ему максимально быстро следует ввести обычную поддерживающую дозу (еженедельная схема: 2 мг/кг; трехнедельная схема: 6 мг/кг). Не следует ожидать следующего запланированного цикла. Последующие поддерживающие дозы (еженедельная схема: 2 мг/кг; трехнедельная схема: 6 мг/кг) затем следует вводить согласно применяемой ранее схеме.
Если пациент пропустил дозу герцептина более чем на 1 неделю, то ему следует вводить в течение примерно 90 мин повторную ударную дозу (еженедельная схема: 4 мг/кг; трехнедельная схема: 8 мг/кг). Затем, начиная с этого момента, следует вводить поддерживающие дозы герцептина (еженедельная схема: 2 мг/кг; трехнедельная схема: 6 мг/кг) (еженедельная схема: каждую неделю; трехнедельная схема: каждые 3 недели)
Конкретные популяции пациентов
Клинические данные продемонстрировали, что распределение герцептина не изменяется в зависимости от возраста и уровня креатинина в сыворотке. В клинических испытаниях престарелые пациенты не получали пониженные дозы герцептина. Не были проведены специальные фармакокинетические испытания на престарелых пациентах и пациентах с почечной или печеночной недостаточностью. Однако в популяционном фармакокинетическом анализе установлено, что возраст и почечная недостаточность не влияли на распределение трастузумаба.
Метод введения
Ударную дозу герцептина следует вводить в виде 90-минутной внутривенной инфузии. Не следует осуществлять введение в виде внутривенного импульсного введения или в виде болюса. Внутривенную инфузию герцептина должно осуществлять лицо, обеспечивающее медико-санитарную помощь, подготовленное для контроля за анафилактической реакцией, и имеющее доступный набор для выхода из наркоза. Пациенты должны наблюдаться по меньшей мере в течение 6 ч после начала первой инфузии и в течение 2 ч после начала последующих инфузий в отношении симптомов типа лихорадки и озноба или других связанных с инфузией симптомов (см. разделы 4.4 и 4.8). Прерывание или замедление скорости инфузии может способствовать контролю указанных симптомов. Инфузию можно продолжать после уменьшения симптомов.
Если начальная ударная доза хорошо переносилась, то последующие дозы можно вводить в виде 30-минутной инфузии. Фармацевтические композиции, предлагаемые в изобретении, можно применять парентерально.
Фармацевтические композиции, предлагаемые в изобретении, предпочтительно содержат фармацевтически приемлемый носитель. Под «фармацевтически приемлемым носителем» подразумевается нетоксичный твердый, полутвердый или жидкий наполнитель, разбавитель, капсулирующий материал или вспомогательное вещество любого типа. Понятие «парентеральный» в контексте настоящего описания относится к путям введения, которые включают внутривенную, внутримышечную, внутрибрюшинную, надчревную, подкожную и внутрисуставную инъекцию и инфузию. Введение представленных в настоящем описании композиций может среди прочего включать введение дважды в день, каждый день, каждые два дня, каждые три дня, каждые четыре дня, каждые пять дней, один раз в неделю, один раз в две недели, один раз в три недели, один раз в месяц и т.д.
Фармацевтическую композицию можно вводить также с помощью систем для замедленного высвобождения. Приемлемые примеры композиций с замедленным высвобождением включают полупроницаемые полимерные матрицы в форме изделий определенной формы, например, пленок, микрокапсул. Матрицы с замедленным высвобождением включают полилактиды (US 3773919, EP 58481), сополимеры L-глутаминовой кислоты и гамма-этил-L-глутамата (Sidman U. и др., Biopolymers 22, 1983, сс. 547-556), поли(2-гидроксиэтилметакрилат) (R. Langer и др., J. Biomed. Mater. Res. 15, 1981, сс. 167-277 и R. Langer, Chem. Tech. 12, 1982, cc. 98-105), этиленвинилацетат (R. Langer и др., выше) или поли-D-(-)-3-гидроксимасляную кислоту (ЕР 133988). Фармацевтическая композиция с замедленным высвобождением включает также заключенное в липосому соединение. Липосомы, содержащие фармацевтическую композицию, получают хорошо известными методами: DE 3218121; Epstein и др., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 82, 1985, cc. 3688-3692; Hwang и др., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 77, 1980, cc. 4030-4034); EP 52322; EP 36676; EP 88046; EP 143949; EP 142641; заявка на японский патент 83-118008; US 4485045 и 4544545 и ЕР 102324. Как правило, липосомы представляют собой небольшие (примерно 200-800 Å) структуры однослойного типа, в которых более примерно 30 мол. % от содержания липидов приходится на долю холестерина, выбранная пропорция является наиболее оптимальной для терапии.
Для парентерального введения фармацевтическую композицию приготавливают, как правило, путем смешения ее, имеющей требуемую степень чистоты, с получением стандартной дозы инъецируемой формы (раствор, суспензия или эмульсия) с фармацевтически приемлемым носителем, т.е. с соединением, нетоксичным для реципиента в применяемых дозах и концентрациях и совместимым с другими ингредиентами препаративной формы.
Как правило, препаративные формы получают путем приведения в тесный и однородный контакт компонентов фармацевтической композиции с жидкими носителями или тонкоизмельченными твердыми носителями или с носителями обоих типов. Затем, если это является необходимым, продукт формуют с получением требуемой препаративной формы. Предпочтительно носитель представляет собой носитель, пригодный для парентерального применения, более предпочтительно раствор, изотоничный крови. Примеры указанных наполнителей-носителей включают воду, физиологический раствор, раствор Рингера и раствор декстрозы. Согласно настоящему изобретению пригодными являются также неводные наполнители, такие как нелетучие масла и этилолеат, а также липосомы. Носитель может содержать минорные количества добавок, таких как субстанции, повышающие изотоничность и химическую стабильность. Указанные продукты являются нетоксичным для реципиента в применяемых дозах и концентрациях и включают буферы, такие как фосфатный, цитратный, сукцинатный, на основе уксусной кислоты и других органических кислот и их солей; антиоксид анты, такие как аскорбиновая кислота; низкомолекулярные (состоящие менее чем из 10 остатков) (поли)пептиды, например, полиаргинин или трипептиды; белки, такие как сывороточный альбумин, желатин или иммуноглобулины; гидрофильные полимеры, такие как поливини л пиррол и дон; аминокислоты, такие как глицин, глутаминовая кислота, аспарагиновая кислота или аргинин; моносахариды, дисахариды и другие углеводы, включая целлюлозу или ее производные, глюкозу, маннозу или декстрины; хелатирующие агенты, такие как ЭДТК; сахарные спирты, такие как манит или сорбит; противоионы, такие как натрий и/или неионогенные поверхностно-активные вещества, такие как полисорбаты, полоксамеры или ПЭГ.
Компоненты фармацевтической композиции, подлежащей терапевтическому введению, должны быть стерильными. Для достижения стерильности можно осуществлять фильтрацию через стерильные фильтрующие мембраны (например, мембраны с размером пор 0,2 мкм). Терапевтические компоненты фармацевтической композиции, как правило, помещают в контейнер со стерильным портом доступа, например, в мешок для внутривенного раствора или пузырек с пробкой, проницаемой для иглы для подкожной инъекции.
Компоненты фармацевтической композиции, как правило, следует хранить в однодозовых или многодозовых контейнерах, например, запечатанных ампулах или пузырьках, в виде водного раствора или в виде лиофилизированной препаративной формы, подлежащей восстановлению. В качестве примера лиофилизированной препаративной формы 10-миллилитровые флаконы заполняют 5 мл стерилизованного фильтрацией 1% (мас./об.) водного раствора и полученную смесь лиофилизируют. Раствор для инфузии приготавливают путем восстановления лиофилизированного(ых) соединения(ий) с помощью бактериостатической воды для инъекций.
В настоящем описании предложено лечение рака, включающее применение модулятора пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), ингибитора лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и химиотерапевтического средства (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)), которое можно осуществлять путем одновременного, последовательного или раздельного введения индивидууму компонентов указанного лечения. Например, один или несколько модулятор(ов) пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), указанный(ых) в настоящем описании (типа трастузумаба), можно вводить одновременно с одним или несколькими указанным(ми) в настоящем описании ингибитором(ами) лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) (типа предложенных и указанных в настоящем описании антител к PD-L1). Кроме того, согласно настоящему изобретению можно осуществлять последовательное введение модулятора(ов) пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), указанного(ых) в настоящем описании (типа трастузумаба) и одного или нескольких указанного(ых) в настоящем описании ингибитора(ов) лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) (типа предложенных и указанных в настоящем описании антител к PD-L1). Согласно настоящему описанию указанные модуляторы пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), указанные в настоящем описании (типа трастузумаба), и один или несколько указанный(ые) в настоящем описании ингибитор(ы) лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) (типа предложенных и указанных в настоящем описании антител к PD-L1), можно применять также раздельно. Например, один или несколько модулятор(ов) пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), указанный(ых) в настоящем описании (типа трастузумаба), можно применять на первой стадии с последующим введением на второй стадии одного или нескольких указанного(ых) в настоящем описании ингибитора(ов) лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) (типа предложенных и указанных в настоящем описании антител к PD-L1) и наоборот. Аналогично этому, химиотерапевтическое средство можно применять одновременно, последовательно или раздельно. Под объем настоящего изобретения подпадает любая комбинация одновременного, последовательного или раздельного введения модулятора(ов) пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), ингибитора(ов) лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и химиотерапевтического(их) средства(в) (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)).
Представленное в настоящем описании лечение рака, включающее модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и химиотерапевтическое средство (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)), можно применять в качестве единственной терапии. Однако ее можно применять с одной или несколькими другими терапиями (т.е. в виде дополнительной совместной терапии с ними), например, с общепринятыми путями лечения, такими как хирургия, лучевая терапия и/или применение одного или нескольких дополнительного(ых) химиотерапевтического(их) средства(в).
Хирургия может включать стадию частичной или полной резекции опухоли до, в процессе или после применения предложенного в настоящем описании лечения рака, включающего модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и химиотерапевтическое средство (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)). Представленные в настоящем описании модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и химиотерапевтическое средство (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)) можно применять в неоадъювантном или адъювантном режиме (в частности неоадъювантного или адъювантного лечения рака).
Модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) можно применять в неоадъювантном режиме. Модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) можно применять в адъювантном режиме или для лечения метастазов.
Таким образом, предложенные в настоящем описании модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) и химиотерапевтическое средство (типа таксола или производного таксола, такого как додетаксел (Taxotere)) можно вводить пациенту, нуждающемуся в таком лечении, в процессе или после хирургического вмешательства/резекции раковой ткани. Таким образом, в настоящем изобретении предложена неоадъювантная терапия, т.е. лечение с помощью представленной в настоящем описании терапии пациента/группы пациентов, нуждающегося(ихся) в этом, перед хирургическим вмешательством. Указанную терапию можно использовать также в качестве адъювантной терапии (т.е. после хирургического вмешательства).
Предназначенное для применения согласно настоящему изобретению химиотерапевтическое средство предпочтительно представляет собой таксан (понятие «таксол» в контексте настоящего описания применяют взаимозаменяемо с понятием «таксан») или производное таксана (производное таксола), типа додетаксела (Taxotere) или паклитаксела. В контексте настоящего описания наиболее предпочтительно применять додетаксел/(Taxotere).
(Дополнительное(ые)) химиотерапевтическое(ие) средство(а) может(гут) представлять собой одно или несколько из следующих, приведенных в качестве не ограничивающих объем изобретения примеров, лекарственных средств или агентов:
цисплатин, винорелбин, карбоплатин, паклитаксел, гемцитабин, доцетакаксел, бевацизумаб, пеиетрексед, этопозид, иринотекан, ифосфамид, топотекан;
антиангиогенное(ые) средство(а) типа блокатора VEGF (такого как бевацизумаб/авастин или сутент (сунитиниба малат-SU-11248)), линомид, ингибиторы функции интегрина αvβ3, ангиостатин, разоксин, талидомид и, включая агенты сосудистой направленности (например, комбретастатина фосфат или N-ацетилколхинол-O-фосфат));
цитостатическое(ие) средство(а), типа антиэстрогенов (например, тамоксифен, торемифен, ралоксифен, дролоксифен, йодоксифен), прогестогены (например, мегестрола ацетат), ингибиторы ароматазы (например, анастрозол, летразол, воразол, экземестан), антипрогестогены, антиандрогены (например, флутамид, нилутамид, бикалутомид, ципротерона ацетат, агонисты и антагонисты LHRH (например, гозерелина ацетат, лупролид), ингибиторы тестостерон-5α-дигидроредуктазы (например, финастерид), антиинвазионные средства (например, ингибиторы металлопротеиназ типа маримастата и ингибиторы функции рецептора урокиназного активатора плазминогена) и ингибиторы функции фактора роста (указанные факторы роста включают, например, тромбоцитарный фактор роста и гепатоцитарный фактор роста, указанные ингибиторы включают антитела к факторам роста, антитела к рецепторам факторов роста, ингибиторы тирозинкиназ и ингибиторы сериновой/треониновой киназы);
модификаторы биологического ответа (например, интерферон); антиметаболическое(ие) средство(а) (например, гемцитабин); антигормональное(ые) соединения(е), такое(ие) как антиэстроген(ы); антитела (например, эдреколомаб); адъювантная(ые) (анти)гормональная(ые) терапия(и) (т.е. терапия с использованием адъювантного(ых) (анти)гормонального(ых) лекарственного средства(в), например, тамоксифена; подходы на основе генной терапии (типа антисмысловых терапий); и/или подходы на основе иммунотерапии.
Химиотерапия может включать также (дополнительно) применение одного или нескольких антипролиферативных/антинеопластических лекарственных средств и их комбинаций, применяемых в медицинской онкологии, таких как ингибитор(ы) тирозинкиназ, ингибитор(ы) raf, ингибитор(ы) ras, двойной(ые) ингибитор(ы) тирозинкиназ, таксол, таксан(ы) (типа паклитаксела или доцетакаксела), антрациклин(ы) типа доксорубицина или эпирубицина, ингибиторы ароматазы (такие как анастрозол или летрозол) и/или винорелбин; циклофосфамид, метотрексат или фторурацил (который обозначают также как 5-FU), которые можно использовать в указанной совместной терапии индивидуально или в форме совместной терапии, включающей указанные три лекарственных средства («CMF-терапия»), необязательно в сочетании с любыми другими представленными в настоящем описании дополнительными терапиями. Конкретными примерами химиотерапевтических средств, предназначенных для применения в сочетании с совместной терапией, предлагаемой в настоящем изобретении, являются пеметрексед, ралтитрексед, этопозид, винорелбин, паклитаксел, доцетакаксел, цисплатин, оксалиплатин, карбоплатин, гемцитабин, иринотекан (СРТ-1 1), 5-фторурацил (5-ФУ, (включая капецитабин)), доксорубицин, циклофосфамид, темозоломид, гидроксимочевина, антипролиферативные/антинеопластические лекарственные средства и их комбинации, применяемые в медицинской онкологии, такие как антиметаболиты (например, антифолаты типа метотрексата, фторпиримидины типа 5-фторурацила, аналоги пурина и аденозина, цитозинарабинозид); противоопухолевые антибиотики (например, антрациклины типа доксорубицина, дауномицина, эпирубицина и идарубицина, митомицина-C, дактиномицина, митрамицина); производные платины (например, цисплатин, карбоплатин); алкилирующие вещества (такие, например, как производные азотистых ипритов, мелфалан, хлорамбуцил, бусульфан, циклофосфамид, ифосфамид, нитрозомочевины, тиотепа); антимитотические средства (например, алкалоиды барвинака типа винкристина и таксойды типа таксола, таксотера); ингибиторы топоизомеразы (например, эпиподофиллотоксины типа этопозида и тенипозида, амсакрина, топотекана, а также иринотекана); а также ферменты (например, аспарагиназа); и ингибиторы тимидилатсинтазы (например, ралтитрексед) и дополнительные типы химиотерапевтических средств.
Ингибиторы/модуляторы/химиотерапевтические средства, предназначенные для применения согласно настоящему изобретению, указаны в настоящем описании и, как правило, представляют собой известные и/или поступающие в продажу ингибиторы/модуляторы/химиотерапевтические средства. Однако также согласно настоящему изобретению подразумевается применение ингибиторов, которые еще будут созданы, или известных соединений, которые будут протестированы в отношении их ингибирующей активности.
Следующим объектом настоящего изобретения является применение нуклеиновой(ых) кислоты(т) или антитела(антител), с помощью которых можно оценивать уровень экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ, для определения потребности пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1 в сочетании с модулятором пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическим средством. Соответствующие объяснения этих понятий представлено выше и их применяют с соответствующими изменениями.
Предпочтительно нуклеиновая кислота (например, олигонуклеотид(ы) состоит(ят) примерно из 15-100 нуклеотидов. Специалист в данной области на основе его общих знаний и представленных в настоящем описании сведений, легко может идентифицировать и/или получать олиго- или полинуклеотид, обладающий способностью определять уровень экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ. В частности эту(и) нуклеиновую(ые) кислоту(ы) (например, олиго- или полинуклеотиды) можно применять в качестве зонда(ов) в способах, представленных в настоящем описании, например, при измерении уровня экспрессии. Специалисту в данной области должны быть известны, например, компьютерные программы, которые можно применять для идентификации соответствующих зондов, которые можно применять согласно изобретению. Например, нуклеиновую кислоту, кодирующую рецептор эстрогена (или часть нуклеиновой кислоты) (например, SEQ ID NO: 38), нуклеиновую кислоту, кодирующую PD-L1 (или часть нуклеиновой кислоты) (например, SEQ ID NO: 42) и необязательно нуклеиновую кислоту, кодирующую IFNγ (или часть нуклеиновой кислоты) (например, SEQ ID NO: 44) можно применять в контексте настоящего описания для идентификации специфических зондов для определения уровня экспрессии ER, PD-L1 и IFNγ соответственно. Примеры нуклеотидных последовательностей, кодирующих ER, PD-L1 и IFNγ, доступны в соответствующих базах данных, таких как база данных NCBI (см. на сайте www ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez).
Кроме того, в настоящем описании представлена композиция, представляющая собой диагностическую композицию, которая дополнительно необязательно содержит средства детекции/определения/оценки уровня экспрессии ER, PD-L1 и IFNγ. Вышеуказанные средства детекции представляют собой, например, вышеописанные нуклеотиды и/или антитела. Таким образом, настоящее изобретение относится к таким средствам (например, указанным нуклеотидам и/или антителам), предназначенным для получения диагностической композиции, предназначенной для определения потребности пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1.
Альтернативным объектом настоящего изобретения являются указанные средства детекции (например, описанные выше нуклеиновые кислоты и/или антитела, и/или «связывающие молекулы», описанные ниже в связи с набором, который можно применять согласно настоящему изобретению), предназначенные для применения для определения потребности пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1.
Предпочтительно настоящее изобретение относится к антителу/антителам, предназначенному(ым) для применения для определения потребности пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1.
Кроме того, настоящее изобретение относится также к набору, который можно применять для осуществления предложенных способов, где набор содержит нуклеиновую кислоту или антитело, которые можно применять для определения уровня экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ. Под объем изобретения подпадает также применение представленного в настоящем описании набора для осуществления предлагаемых способов. Указанный набор, который можно применять для осуществления способов и вариантов применения, указанных в настоящем описании, может содержать олигонуклеотиды или полинуклеотиды, которые могут определять уровень экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ. Например, указанный набор может содержать соединение(я), требуемое(ые) для специфического измерения уровня экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ. Кроме того, настоящее изобретение относится также к применению соединения(ий), требуемого(ых) для специфического измерения уровня экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ, для приготовления набора для осуществления способов и вариантов применения, предлагаемых в настоящем изобретении. На основе доктрины настоящего изобретения специалисту в данной области очевидно, какое(ие) соединение(ия) требуется(ются) для специфического измерения уровня экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ. Например, указанное(ые) соединение(я) может(гут) представлять собой «связывающую(ие) молекулу(ы)». В частности, такое(ие) соединение(я) может(гут) представлять собой (нуклеотидный(ые) зонд(ы), праймер(ы) (пара(ы) антител и/или аптамеров, специфических для (генного) продукта гена/кодирующей последовательности ER, гена/кодирующей последовательности PD-L1 и необязательно гена/кодирующей последовательности IFNγ. Набор (в данном контексте подлежащий приготовлению), предлагаемый в настоящем изобретении, может представлять собой диагностический набор.
Набор (в данном контексте подлежащий приготовлению), предлагаемый в настоящем изобретении, или способы и варианты применения, предлагаемые в изобретении, могут дополнительно содержать инструкцию(и) по применению или могут поставляться вместе с ними. Например, указанная(ые) инструкция(ии) по применению может(гут) являться руководством для специалиста в данной области по определению (референс-/контрольного) уровня экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ или по определению потребности пациента в терапии с использованием ингибитора PD-L1. В частности, указанная(ые) инструкция(ии) по применению может(гут) содержать руководство, касающееся применения и приложения представленных в настоящем описании способов или вариантов применения. Набор (в данном контексте подлежащий приготовлению), предлагаемый в настоящем изобретении, может содержать также субстанции/химические соединения и/или оборудование, пригодные/требуемые для осуществления способов и вариантов применения настоящего изобретения. Например, указанные субстанции/химические соединения и/или оборудование представляют собой растворители, разбавители и/или буферы для стабилизации и/или хранения соединения(ий), требуемого(ых) для специфического измерения уровня экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ.
В контексте настоящего описания понятия «содержащий» и «включающий» или их грамматические варианты следует рассматривать как понятия, определяющие указанные признаки, целые числа, стадии или компоненты, но не исключающие добавление одного или нескольких из дополнительных признаков, целых чисел, стадий, компонентов или групп. Это понятие включает понятия «состоит из» и «практически состоит из». Таким образом, понятия «содержащий/включающий/имеющий» предусматривают, что может присутствовать любой дополнительный компонент (или также особенности, целые числа, стадии и т.п.).
Понятие «состоящий из» означает, что не может присутствовать никакой дополнительный компонент (или также особенности, целые числа, стадии и т.п.).
Понятие «практически состоящий из» или его грамматические варианты в контексте настоящего описания следует рассматривать как понятия, определяющие указанные признаки, целые числа, стадии или компоненты, но не исключающие добавление одного или нескольких их дополнительных признаков, целых чисел, стадий, компонентов или групп, но только, если их дополнительные особенности, целые числа, стадии, компоненты или группы не изменяют существенно основу или новые характеристики заявляемой композиции, устройства или способа. Так, понятие «практически состоящий из» означает, что указанные дополнительные компоненты (или также особенности, целые числа, стадии и т.п.) могут присутствовать, а именно те из них, которые не оказывают существенного влияния на основные характеристики композиции, способа или устройства. Другими словами, понятие «практически состоящий из» (которое в контексте настоящего описания можно применять взаимозаменяемо с понятием «практически содержащий») допускает присутствие других компонентов в композиции, устройстве, способе помимо обязательных компонентов (или также особенностей, целых чисел, стадий и т.п.), при условии, что основные характеристики устройства или способа не существенно изменяются из-за присутствия других компонентов.
Понятие «метод» относится к порядку действия, средствам, технологиям и процедурам, предназначенным для решения данной задачи, включая (но, не ограничиваясь только ими) те порядки действия, средства, технологии и процедуры, которые либо известны или легко создаются на основе известных порядков действий, средств, технологий и процедур практикующими специалистами в области химии, биологии и биофизики.
В контексте настоящего описания понятие «выделенный» относится к композиции, которая отделена от ее места нахождения in vivo (например, водного организма или мха). Предпочтительно выделенные композиции, предлагаемые в настоящем изобретении, практически свободны от других субстанций (например, от других белков, которые не обладают антиадгезивными действиями), которые присутствуют в месте их нахождения in vivo (т.е. являются очищенными или полуочищенными).
В контексте настоящего изобретения понятие «примерно» означает ± 10%.
Следующими объектами настоящего изобретения являются также:
1. Способ определения потребности ракового пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1,
(I) в котором терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, показана для пациента, или (II) в котором пациент подвергается терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, что осуществляют стадии, на которых
а) измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии рецептора эстрогена (ER) и лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1),
б) классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если измеренные на стадии (а) уровень экспрессии ER является низким или она отсутствует и уровень экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) является повышенным по сравнению с контролем.
2. Способ лечения рака у ракового пациента, которому показана терапия, включающая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, отбирают ракового пациента, для которого установлено, что рак характеризуется низким уровнем экспрессии ER или ее отсутствием и характеризуется повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и вводят пациенту в эффективном количестве модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), химиотерапевтическое средство и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
3. Способ лечения рака у ракового пациента, который подвергается терапии, включающей модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическое средство, заключающийся в том, отбирают ракового пациента, для которого установлено, что рак характеризуется низким уровнем экспрессии ER или ее отсутствием и характеризуется повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем, и вводят пациенту в эффективном количестве ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1).
4. Фармацевтическая композиция, содержащая модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1), предназначенная для применения для лечения рака, если установлено, что указанный рак характеризуется низким уровнем экспрессии ER или ее отсутствием и характеризуется повышенным уровнем экспрессии лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) по сравнению с контролем.
5. Фармацевтическая композиция, предназначенная для лечения рака по п.4, дополнительно содержащая химиотерапевтическое средство.
6. Способ по одному из п.п. 1-3, дополнительно заключающийся в том, что измеряют in vitro в образце из организма указанного пациента уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) и классифицируют пациента как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, если измеренный уровень экспрессии интерферона-гамма (IFNγ) является пониженным по сравнению с контролем.
7. Способ по одному из п.п. 1, 2, 3 и 6; или фармацевтическая композиция по п. 4 и п. 5, где уровень экспрессии ER представляет собой ER(-).
8. Способ по одному из п.п. 1, 2, 3, 6 и 7; или фармацевтическая композиция по одному из п.п.4, 5 и 7, где указанный модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) представляет собой антитело к HER2 герцептин/трастузумаб.
9. Способ по одному из п.п. 1, 2, 3, 6, 7 и 8; или фармацевтическая композиция по одному из п.п. 5, 7 и 8, где указанное химиотерапевтическое средство представляет собой таксол или производное таксола.
10. Способ по одному из п.п. 1, 2, 3, 6, 7 и 8-9; или фармацевтическая композиция по одному из п.п.4, 5 и 7-9, где указанный ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) представляет собой антитело, специфически связывающееся с PD-L1 (антитело к PD-L1).
11. Способ по одному из п.п. 1, 2, 3 и 6-10; или фармацевтическая композиция по одному из п.п. 4, 5 и 7-10, где указанный рак представляет собой солидный рак.
12. Способ по п.11; или фармацевтическая композиция по п.11, где указанный солидный рак представляет собой рак молочной железы или рак желудка.
13. Способ по одному из п.п. 1, 2, 3 и 6-12; или фармацевтическая композиция по одному из п.п. 4, 5 и 7-12, где уровень экспрессии PD-L1 представляет собой уровень экспрессии мРНК.
14. Применение нуклеиновой кислоты или антитела, которые можно использовать для определения уровня экспрессии ER, PD-L1 и необязательно IFNγ, для определения потребности пациента в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1 в сочетании с модулятором пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2) и химиотерапевтическим средством.
15. Способ по одному из п.п. 1, 2, 3 и 6-14; или фармацевтическая композиция по одному из п.п.4, 5 и 7-14, в котором указанный модулятор пути передачи сигналов HER2/neu (ErbB2), указанное химиотерапевтическое средство и указанный ингибитор лиганда программированной клеточной гибели-1 (PD-L1) следует применять в неоадъювантном режиме.
Настоящее изобретение дополнительно описано со ссылкой на не ограничивающие изобретение чертежи и примеры. Если не указано иное, то применяют принятые методы рекомбинантной генной технологии, описанные, например, у Sambrook, Russell в: «Molecular Cloning, A Laboratory Manual», Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y., 2001), публикация полностью включена в настоящее описание в качестве ссылки.
На чертежах показано:
на фиг. 1 - схематическое изображение структуры белка HER2 и аминокислотные последовательности доменов I-IV соответственно его внеклеточного домена;
L
H
L
H
L
H
на фиг. 2А и 2Б - сравнительный анализ первичной структуры аминокислотных последовательностей вариабельного домена легкой (V) (фиг. 2А) и вариабельного домена тяжелой (V) (фиг. 2Б) мышиного моноклонального антитела 2С4 (SEQ ID NO: 5 и 6 соответственно); V- и V-доменов варианта 574/пертузумаба (SEQ ID NO: 7 и 8 соответственно) и консенсусных каркасных участков человеческих V и V (hum κ1, легкая каппа-цепь, подгруппа I; humIII, тяжелая цепь подгруппа III) (SEQ ID NO: 9 и 10 соответственно). Звездочками обозначены различия между вариабельными доменами пертузумаба и мышиного моноклонального антитела 2С4 или между вариабельными доменами пертузумаба и человеческим каркасным участком. Гипервариабельные участки (CDR) взяты в скобки;
на фиг. 3А и 3Б - аминокислотные последовательности легкой цепи (фиг. 3А) и тяжелой цепи (фиг. 3Б) пертузумаба. CDR выделены жирным шрифтом. Рассчитанная молекулярная масса легкой цепи и тяжелой цепи составляет 2352622 Да и 4921656 Да (цистеины в восстановленной форме). Углеводный остаток присоединен к Asn 299 тяжелой цепи;
на фиг. 4А и 4Б - аминокислотные последовательности легкой цепи (фиг. 4А) и тяжелой цепи (фиг. 4Б) трастузумаба соответственно. Стрелками обозначены пограничные последовательности вариабельного домена легкой цепи и вариабельного домена тяжелой цепи;
на фиг. 5А и 5Б - последовательность легкой цепи варианта пертузумаба (фиг. 5А) и последовательность тяжелой цепи варианта пертузумаба (фиг. 5Б) соответственно.
Представленные ниже примеры служат для иллюстрации изобретения.
Пример 1: На раковых пациентов, подвергающихся HER2-направленной терапии и химиотерапии оказывает благоприятное действие совместная терапия с использованием ингибитора PD-L1, если уровень экспрессии ER низкий или она отсутствует (ER-негативный статус) и если уровень экспрессии PD-L1 повышен
Изучение генной экспрессии осуществляли с помощью пакета программ R Bioconductor 'affy', R-версия 2.15.0. Все исследовательские анализы и прогностические модели создавали с помощью SAS JMP, версия 10.0.
48 биопсий HER2(+)-, ER(+)- и 39 биопсий HER2(+)-, ER(-)-рака молочной железы получали из клинического испытания NeoSphere. Образцы брали у пациентов при установлении диагноза, после чего их лечили доцетакселом и трастузумабом в неоадъювантном режиме. Распределение основных клинических ковариат на исходном (уровне, а также клинический ответ (оцененный при хирургическом вмешательстве) для включенной в испытание популяции является следующим:
ER-негативные образцы:
Возраст пациентов (см. фиг. 17)
Квантили
Тип рака
pT (патологические стадии опухоли)
pN (патологические стадии узлов)
G (степень дифференцировки злокачественной опухоли)
ER-позитивные образцы:
Возраст пациентов (см. фиг. 18)
Квантили
Типа рака
pT
pN
G
Анализ сопряженности признаков полного патологического ответа (pCR) и статуса рецептора эстрогена (ER)
Профиль генной экспрессии
Определяли профиль генной экспрессии в образцах биопсии опухолей с использованием платформы микромассивов полного человеческого генома AFFYMETRIX HG-U133Plus 2. Использовали набор HighPure для экстракции РНК фирмы Roche, набор для амплификации фирмы NuGen и стандартные протоколы гибридизации и сканирования, прилагаемые к системе AFFYMETRIX. Все сканы массивов, как правило, подвергали контролю качества с помощью стандартной программы AFFYMETRIX QC.
Для предварительной обработки «сырых» сигналов применяли робастный алгоритм для множества массивов (RMA) (Irizarry и др, 2003, см. в сети Интернет на сайте.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12925520). Все наборы зондов, пригодные для представляющих интерес генов, можно получать как описано ниже. В случае гена CD274, когда для описания этого гена доступно несколько наборов зондов, для описания гена выбирали набор зондов с наиболее высоким средним уровнем экспрессии (который определяли как арифметическое среднее уровней экспрессии данного набора зондов):
CD274 (PDL1)
223834_at выбран для PDL1
227458_at
Выбранный набор зондов соответствует последнему экзону/3'UTR гена и охватывает все известные RefSEq мРНК (см. фиг. 6).
IFNG
210354_at
Этот набор зондов также соответствует последнему экзону/3'UTR гена и охватывает все известные RefSEq мРНК (см. фиг. 7).
На фиг. 8 представлено связанное распределение экспрессии вышеуказанных генов в образцах обеих ER(-)- и ER(+)-пoпyляций. Типы символов соответствуют конечному статусу pCR (закрашенные символы: pCR достигнут, незакрашенные символы: pCR не достигнут).
Более подробные сведения о распределении CD274 и экспрессии IFNG среди страт ER и pCR представлены в приложении I.
Для каждой ER-субпопуляции создавали логистическую регрессионную модель, связывающую экспрессию выбранных генов с клиническим ответом, в зависимости от возраста пациента, типа рака и состояния узлов:
Ответ ~ возраст пациента + тип рака + pN + CD274 + IFNG
1. ER(-)-популяция
Ниже представлены обобщенные выходные данные для модели. Отношения шансов (OR) представлены на единицу изменения уровня биомаркера. Поскольку величины экспрессии даны в log2-масштабе, то изменение на одну единицу должно соответствовать 2-кратной сверхэкспрессии. Более подробное описание см. в приложении.
Конечная модель для прогнозирования вероятности ответа конкретного пациента на лечения включала экспрессию CD274 и IFNG и представляла собой:
p(pCR)=-3,737+1,607*CD274-1,069*IFNG
2. ER(+)-популяция
Ниже представлены обобщенные выходные данные для модели. Отношения шансов (OR) представлены на единицу изменения уровня биомаркера. Поскольку величины экспрессии даны в log2-MacuiTa6e, то изменение на одну единицу должно соответствовать 2-кратной сверхэкспрессии. Более подробное описание см. в приложении.
Роль экспрессии PDL1 является очевидной в ER(-)-cyбпoпyляции пациентов с HER2(+)-раком молочной железы, которые подвергались комбинированному лечению трастузумабом и химиотерапией в неоадъювантном режиме. А именно, выявленная при установлении диагноза сверхэкспрессия PDL1 соответствовала более низкому уровню ответа на неоадъювантную терапию (т.е. более низкому уровню ответа на комбинированное лечение трастузумабом и химиотерапией). Это не зависело от возраста пациента, типа рака или статуса лимфатических узлов. Оценка на исходном уровне генной экспрессии любого из двух биомаркеров, PDL1 и INFG, соответственно позволяла определять вероятность более благоприятного воздействия на пациента PDL-1-направленной терапии, при ее добавлении к трастузумабу и химиотерапии.
Ниже представлены данные, касающиеся отсекающего значения, позволяющего классифицировать пациента, как нуждающегося в совместной терапии с использованием ингибитора PD-L1, предлагаемой в настоящем изобретении.
Если анализ генной экспрессии свидетельствует о том, что уровень экспрессии IFNG превышает или равен 4,8, то не рекомендуется никакое совместное лечение (HER2-направленное и PDL1-направленное) и не следует осуществлять какую-либо дополнительную оценку PDL1. Если анализ генной экспрессии свидетельствует о том, что уровень экспрессии IFNG ниже 4,8, то необходимо проводить параллельную оценку PDL-1. Если затем анализ генной экспрессии PDL-1 свидетельствует о том, что уровень превышает или равен 5,3, то рекомендуется комбинированная терапия (HER2-направленная и PDL1-направленная) (см. фиг. 19).
Приложение I
(ER-)-субпопуляция
Однофакторный анализ экспрессии CD274 с помощью pCR ER=ERneg (см. фиг. 9А)
t-критерий
Да-нет
Допускаемые неравные дисперсии
Результаты представлены также на фиг. 9Б.
Однофакторный анализ экспрессии IFNG с помощью pCR ER=Erneg
Результаты представлены на фиг. 10А
t-критерий
Да-нет
Допускаемые неравные дисперсии
Результаты представлены на фиг. 10Б.
ER(+)-субпопуляция
Однофакторный анализ экспрессии CD274 с помощью pCR ER=ERpos
Результаты представлены на фиг. 11А.
t-критерий
Да-нет
Допускаемые неравные дисперсии
Результаты представлены на фиг. 11Б
Однофакторный анализ экспрессии IFNG с помощью pCR ER=ERpos
Результаты представлены на фиг. 12А
t-критерий
Да-нет
Допускаемые неравные дисперсии
Результаты представлены на фиг. 12Б.
Приложение II
Номинальная логистическая аппроксимация для pCR ER=ERneg Сходимость по методу градиентного спуска, 5 итераций
Полный модельный тест
Для log-шансов нет/да
Роль тестов для соотношения правдоподобия
Отношение шансов
для pCR-шансов «нет» относительно «да»
Тесты и доверительные интервалы отношений шансов основаны на соотношении правдоподобия
Единицы отношения шансов
на единицу изменения независимой переменной в уравнении регрессии
Отношения шансов для типа рака
Отношения шансов для pN
Операционная характеристика приемника
(см. фиг. 13)
Принимая, что pCR=«да» обозначает позитивный уровень
Матрица неточностей
Фактическая
Предсказанная
Lift-фактор
(см. фиг. 14)
Профили прогнозирования
(см. фиг. 15)
Номинальная логистическая аппроксимация для pCR ER=ERpos
Сходимость по методу градиентного спуска, 19 итераций
Полный модельный тест
Без аппроксимации
Оценка параметров
Роль тестов для соотношения правдоподобия
Отношение шансов
для pCR-шансов «нет» относительно «да»
Тесты и доверительные интервалы отношений шансов основаны на соотношении правдоподобия
Единицы отношения шансов
на единицу изменения независимой переменной в уравнении регрессии
Соотношения шансов для типа рака
Отношения шансов для pN
Операционная характеристика приемника
(см. фиг. 16)
Принимая, что pCR=«да» обозначает позитивный уровень
Матрица неточностей
Фактическая
Предсказанная
Настоящее изобретение относится к следующим нуклеотидным и аминокислотным последовательностям:
Последовательности, представленные в настоящем описании, среди прочего, доступны в базе данных NCBI и описаны в WO 2010/077634, их можно найти в Интернете на web-сайте ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene; эти последовательности включают также аннотированные и модифицированные последовательности. Настоящее изобретение относится также к технологиям и методам, в которых используют гомологичные последовательности и укороченные варианты последовательностей, представленных в настоящем описании.
SEQ ID NO: 1-21 соответствуют антителу к PD-L1, которое можно применять согласно настоящему изобретению. SEQ ID NO: 1-21 представлены в перечне последовательностей.
SEQ ID NO: 22-37 представляют собой последовательности аминокислотных последовательностей доменов I-IV белка HER2 (SEQ ID NO: 22-25, см. также фиг. 1) и последовательности антител к HER2 (SEQ ID NO: 26-37; см. также фиг. 2-5).
SEQ ID NO: 26:
L
Аминокислотная последовательность вариабельного домена легкой цепи (V) (фиг. 2А) мышиного моноклонального антитела 2С4 (SEQ ID NO: 5 и 6 соответственно), представленная на фиг. 2.
SEQ ID NO: 27:
H
Аминокислотная последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (V) (фиг. 2Б) мышиного моноклонального антитела 2С4, представленная на фиг. 2.
SEQ ID NO: 28:
L
Аминокислотная последовательность вариабельного домена легкой цепи (V) (фиг. 2А) варианта 574/пертузумаба, представленная на фиг. 2.
SEQ ID NO: 29:
H
Аминокислотная последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (V) (фиг. 2Б) варианта 574/пертузумаба, представленная на фиг. 2.
SEQ ID NO: 30:
L
Человеческие консенсусные каркасные участки V (hum κ1, легкая каппа-цепь, подгруппа I; humIII, тяжелая цепь, подгруппа III), представленные на фиг. 2.
SEQ ID NO: 31:
H
Человеческие консенсусные каркасные участки V (hum κ1, легкая каппа-цепь, подгруппа I; humIII, тяжелая цепь, подгруппа III), представленные на фиг. 2.
SEQ ID NO: 32:
Аминокислотные последовательности легкой цепи пертузумаба, представленные на фиг. 3A.
SEQ ID NO: 33:
Аминокислотные последовательности тяжелой цепи пертузумаба, представленные на фиг. 3Б.
SEQ ID NO: 34:
Аминокислотная последовательность домена легкой цепи трастузумаба, представленная на фиг. 4А. Пограничные последовательности домена вариабельной области легкой цепи обозначены стрелками.
SEQ ID NO: 35:
Аминокислотная последовательность тяжелой цепи трастузумаба, представленная на фиг. 4Б. Пограничные последовательности домена вариабельной области тяжелой цепи обозначены стрелками.
SEQ ID NO: 36:
Аминокислотная последовательность варианта последовательности легкой цепи пертузумаба (фиг. 5А).
SEQ ID NO: 37:
Аминокислотная последовательность варианта последовательности тяжелой цепи пертузумаба (фиг. 5Б).
SEQ ID NO: 38
Нуклеотидная последовательность, кодирующая рецептор прогестерона (PR) Homo sapiens.
NCBI референс-последовательность: NC_000011.9
>gi|224589802:c101000544-100900355 Homo sapiens, хромосома 11, GRCh37.p10 первичная сборка
SEQ ID NO: 39
Аминокислотная последовательность рецептора прогестерона (PR) Homo sapiens.
PRGR_HUMAN длина: 933 07 декабря 2012 г., 15:10 тип: P Check: 6067.
SEQ ID NO: 40:
Нуклеотидная последовательность, кодирующая рецептор эстрогена (ER) Homo sapiens. (NM_000125.3)
SEQ ID NO: 41:
Нуклеотидная последовательность, кодирующая рецептор эстрогена (ER) Homo sapiens.
NCBI референс-последовательность: NC_000006.11
>gi|224589818:152011631-152424409 Homo sapiens хромосома 6, GRCh37.p10 первичная сборка
SEQ ID NO: 42:
Аминокислотная последовательность рецептора эстрогена (ER) Homo sapiens.
>ENST00000206249_6
SEQ ID NO: 43:
Нуклеотидная последовательность, кодирующая лигад программированной клеточной гибели-1(PD-L1) Homo sapiens.
NCBI референс-последовательность: NC_000009.11
>gi|224589821:5450503-5470567 Homo sapiens хромосома 9, GRCh37.p10 первичная сборка
SEQ ID NO: 44
Нуклеотидная последовательность, кодирующая мРНК-транскрипт варианта 1 лиганда программированной клеточной гибели-1(PD-L1) (CD274) Homo sapiens
NCBI референс-последовательность: NM_014143.3
>gi|292658763|reflNM_014143.3| Homo sapiens молекула CD274 (CD274), транскрипт, вариант 1, мРНК
SEQ ID NO: 45:
Аминокислотная последовательность лиганда программированной гибели-1 (PD-L1) Homo sapiens (изоформа 1 предшественника лиганда программированной клеточной гибели-1 [Homo sapiens])
NCBI референс-последовательность: NP_054862.1
>gi|7661534|ref|NP_054862.1| изоформа 1 предшественника лиганда программированной клеточной гибели-1 [Homo sapiens].
SEQ ID NO: 46:
Нуклеотидная последовательность, кодирующая мРНК-транскрипт варианта 2 лиганда программированной клеточной гибели-1(PD-L1) (CD274) Homo sapiens
NCBI референс-последовательность: NM_001267706.1
>gi|390979638|ref|NM_001267706.1| Homo sapiens молекула CD274 (CD274), транскрипт, вариант 2, мРНК.
SEQ ID NO: 47:
Аминокислотная последовательность лиганда программированной гибели-1 (PD-L1) Homo sapiens (изоформа b предшественника лиганда 1 программированной клеточной гибели-1 [Homo sapiens])
NCBI референс-последовательность: NP_001254635.1
>gi|390979639|ref|NP_001254635.11 изоформа b предшественника лиганда 1 программированной клеточной гибели 1 [Homo sapiens].
SEQ ID NO: 48:
Нуклеотидная последовательность, кодирующая лиганд программированной клеточной гибели-1(PD-L1) Homo sapiens (молекула CD274 (CD274) Homo sapiens, транскрипт, вариант 3, некодирующая РНК)
NCBI референс-последовательность: NR_052005.1
>gi|390979640|ref|NR_052005.1| Homo sapiens молекула CD274 (CD274), транскрипт, вариант 3, некодирующая РНК.
SEQ ID NO: 49:
Нуклеотидная последовательность, кодирующая интерферон-гамма
(Homo sapiens (Homo sapiens хромосома 12, GRCh37.pl0 первичная сборка) NCBI референс-последовательность: NC_000012.11
>gi|224589803:c68553521-68548550 Homo sapiens хромосома 12, GRCh37.p10 первичная сборка
SEQ ID NO: 50:
Нуклеотидная последовательность, кодирующая мРНК интерферона-гамма Homo sapiens.
NCBI референс-последовательность: NM_000619.2
>gi|56786137|ref|NM_000619.2| Homo sapiens интерферон, гамма (IFNG), мРНК.
SEQ ID NO. 51:
Аминокислотная последовательность интерферона-гамма Homo sapiens, предшественник интерферона-гамма [Homo sapiens]
NCBI референс-последовательность: NP_000610.2
>gi|56786138|ref|NP_000610.2| интерферон-гамма, предшественник [Homo sapiens].
Все процитированные в настоящем описании ссылки полностью включены в него в качестве ссылки. После ознакомления с полностью описанным изобретением специалист в области, к которой относится изобретение, может воплотить его на практике с использованием широкого и эквивалентного диапазона условий, параметров и т.п. без отклонения от сущности и объема изобретения или любых вариантов его осуществления.