СПОСОБ И УСТРОЙСТВО ДЛЯ ОТБОРА БАКТЕРИАЛЬНЫХ ПРОБ

1. Устройство для взятия образцов и определения присутствия в них бактерий, включающее
культуральную среду для взятия образцов для получения бактериальной пробы;
большое количество бактериофагов, содержащихся на (в) культуральной среде для взятия образцов, где каждый бактериофаг включает в себя нуклеиновую кислоту, кодирующую белок, способный испускать свет эмиссионной длина волны.
2. Устройство по п.1, где нуклеиновая кислота кодирует флуоресцирующий белок, где флуоресцирующий белок отвечает на воздействие света возбуждающей длины волны посредством испускания света эмиссионной длины волны.
3. Устройство по п.2, где флуоресцирующий белок представляет собой зеленый флюоресцентный белок (GFP), возбуждающая длина волны для которого составляет 395 нм, а эмиссионная длина волны составляет 510 нм.
4. Устройство по п.1, где нуклеиновая кислота кодирует хемилюминесцентный белок, способный испускать свет эмиссионной длины волны в присутствии люминесцентного субстрата.
5. Устройство по п.4, где хемилюминесцентный белок представляет собой люциферазу и люминесцентным субстратом является луциферин.
6. Устройство по п.1, где бактериофаги являются специфичными к заражению и/или лизису одного штамма бактерий.
7. Устройство по п.6, где штамм бактерий представляет собой штамм метициллинустойчивого Staphylococcus Aureus (MRSA).
8. Устройство по п.7, где бактериальный штамм представляет собой штамм MRSA 3, 15 либо 16.
9. Устройство по любому из предшествующих пунктов, где бактериофаги представляют собой штамм, имеющий коллекционное название NCIMB 9563, и, кроме того, содержат в себе нуклеиновую кислоту, кодирующую белок, способный испускать свет.
10. Устройство по любому из пп.1-6, где штамм бактерий представляет собой штамм Bacillus anthracis.
11. Устройство по п.10, где бактериофаги представляют собой фаг Gamma Bacillus anthracis и, кроме того, содержат в себе нуклеиновую кислоту, кодирующую белок, способный испускать свет.
12. Устройство по п.1, где культуральная среда для взятия образцов представляет собой твердый субстрат.
13. Устройство по п.12, где бактериофаги иммобилизованы на субстрате.
14. Устройство по п.13, где бактериофаги иммобилизованы на субстрате посредством формирования ковалентной связи.
15. Устройство по п.14, где ковалентная связь между бактериофагом и субстратом дополнена посредством связующего вещества.
16. Устройство по п.15, где субстрат включает в себя нейлон либо другой полимер, имеющий поверхностные амино- либо карбоксильные группы, и где связующим веществом является карбодиимид либо глутаровый альдегид; субстрат включает целлюлозу либо другой гидроксилсодержащий полимер, и связующее вещество включает в себя винилсульфонилэтиленовый эфир либо триазин; субстрат включает полиэтилен либо схожий полимер, и связующее вещество включает коронный разряд либо окисленную соль марганцевой кислоты.
17. Устройство по любому из пп.13-16, где бактериофаги иммобилизованы через их головную часть, таким образом, что хвостовая часть остается свободной.
18. Устройство по любому из пп.12-16, где субстрат включает в себя пластический материал (пластик).
19. Устройство по п.1, также содержащее водную питательную культуральную среду, предпочтительно, содержащую глюкозу.
20. Устройство по п.1, также имеющее в своем составе резервуар для размещения культуральной среды для взятия образцов.
21. Устройство по п.20, где резервуар представляет собой планшет, используемый при осуществлении метода твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA).
22. Устройство по любому из пп.1-5, содержащее большое количество штаммов бактериофагов, каждый из которых является специфичным к заражению и/или лизису различных штаммов бактерий, и где бактериофаги каждого штамма содержат в себе нуклеиновые кислоты, кодирующие белки, способные испускать свет различных эмиссионных длин волн.
23. Устройство для определения присутствия бактерий, включающее углубление для размещения устройства для взятия образцов и определения присутствия в них бактерий, соответствующее любому из предшествующих пунктов; и световой детектор, способный детектировать свет эмиссионной длины волны, исходящий из места расположения углубления.
24. Устройство по п.23, дополнительно содержащее источник света, способный испускать свет возбуждающей длины волны в место расположения углубления.
25. Устройство по п.23, дополнительно включающее пользовательский интерфейс, связанный со световым детектором, для предоставления показаний о детекции света эмиссионной длины волны.
26. Устройство по п.25, дополнительно включающее процессор, размещенный между световым детектором и пользовательским интерфейсом, где процессор служит для рассчетов изменения интенсивности света эмиссионной длины волны, детектируемой с течением времени, и для предоставления показаний об изменении интенсивности через пользовательский интерфейс.
27. Устройство по любому из п.23 или 24, где световой детектор способен детектировать свет, соответствующий большому количеству различных эмиссионных длин волн.
28. Устройство по любому из п.23 или 24, дополнительно включающее устройство для взятия образцов и определения присутствия в них бактерий по любому из пп.1-8.
29. Применение бактериофагов для определения бактерий, где бактериофаг способен связываться с бактерией, в результате чего в ответ на связывание бактериофага с бактерией продуцируется сигнал.
30. Применение устройства для взятия образцов и определения присутствия в них бактерий по любому из пп.1-8, либо устройства для определения присутствия бактерий по п.23, для определения присутствия бактерий в образце.
31. Способ определения присутствия бактерий в образце, включающий следующие стадии:
a) подвергание образца воздействию бактериофагов, где каждый бактериофаг, содержит в себе нуклеиновую кислоту, кодирующую белок, способный испускать свет эмиссионной длины волны, таким образом, что бактерии в пробе заражаются бактериофагами и нуклеиновая кислота экспрессируется в бактерии;
b) детектирование испускаемого пробой света эмиссионной длины волны, где детекция света свидетельствует о присутствии бактерий.
32. Способ по п.31, где нуклеиновая кислота кодирует флуоресцирующий белок, где флуоресцирующий белок отвечает на воздействие света возбуждающей длины волны посредством испускания света эмиссионной длины волны, и где способ также включает в себя стадию подвергания пробы (образца) воздействию света возбуждающей длины волны.
33. Способ по п.31, где нуклеиновая кислота кодирует хемилюминесцентный белок, и способ также включает в себя стадию внесения в образец хемилюминесцентного субстрата.
34. Способ по любому из пп.31-33, где бактериофаг является специфичным для штамма бактерий, и где детекция света эмиссионной длины волны свидетельствует о присутствии данного штамма.
35. Способ по п.34, где штамм представляет собой штамм MRSA, предпочтительно, штамм MRSA 3, 15 либо 16.
36. Способ по п.34, где бактериальный штамм представляет собой Bacillus anthracis.
37. Способ по любому из пп.31-33, где бактериофаги представляют собой часть устройства для взятия образцов и определения присутствия в них бактерий, соответствующего любому из пп.1-8.
38. Способ по п.37, являющемуся зависимым от любого из пп.1-8, где стадия а) включает в себя стадию протирания субстрата для получения образца.
39. Способ по п.31, где стадия а) также включает в себя стадию выращивания бактерий, после заражения бактериофагами, в водной питательной культуральной среде, предпочтительно, содержащей глюкозу.
40. Способ по любому из п.31 или 39, где стадия b) включает в себя детектирование света эмиссионной длины волны, в результате заражения бактерий бактериофагом, где детекция возрастающей интенсивности света эмиссионной длины волны свидетельствует о присутствии бактерий.
41. Способ по п.31, где образец подвергается воздействию большого количества штаммов бактериофагов, где каждый штамм является специфичным для различных бактериальных штаммов, и бактериофаги каждого из штаммов кодируют белки, способные испускать свет различных эмиссионных длин волн, способ также включает в себя стадию детектирования света, испускаемого образцом, каждой эмиссионной длины волны, где детекция света определенной длины волны свидетельствует о присутствии соответствующего штамма бактерий.
42. Способ по п.31, дополнительно включающий стадию уничтожения бактериофагами бактерий в образце.
43. Бактериофаг, имеющий геном штамма, имеющего коллекционное название NCIMB 9563, и, кроме того, включающий нуклеиновую кислоту, кодирующую белок, способный испускать свет.