Молекулярно-генетический маркер рекс-фенотипа у домашних кошек породы Уральский рекс и способ выявления особей, являющихся носителем аллелей, обуславливающих формирование данного рекс-фенотипа

1. Способ выявления особи кошки породы Уральский рекс (Ural rex), являющейся носителем не менее чем одного аллеля, обуславливающего формирование желаемого рекс-фенотипа шерсти, включающий генотипирование животного для выявления у него маркерной полиморфной вариации, ассоциированной с наличием у животного аллеля, проявляющегося в развитии определенного рексового типа шерсти, отличающийся тем, что в качестве маркеров используют нуклеотидные вариации в геноме, появление которых приводит к изменению физиологической активности белка, выбранного из LIPH.
2. Способ выявления особи кошки по п. 1, где генотипирование животного проводят для выявления у него маркерного варианта, и в качестве маркера наличия аллеля Ur используют делецию в гене LIPH.
3. Способ по п. 2, где маркерный вариант (делеция) представляет собой LIPH (с. 478_483del).
4. Способ по п. 3, где маркерный вариант (делеция) является маркером проявления рекс-фенотипа у животного, гомозиготного по Ur аллелю, несущего данную делению (Ur/Ur).
5. Способ по п. 1, где полиморфная нуклеотидная вариация выбрана из делеции, инсерции, SNP, расположенных в структурном участке гена, кодирующего белок, выбранный из LIPH, и наличие любого из указанных полиморфных изменений коррелирует с изменением структуры белка, кодируемого этим геном, в том числе изменений, внесенных искусственно методом геномного редактирования.
6. Способ по п. 1, где полиморфная нуклеотидная вариация выбрана из SNP, инсерции, делеции, расположенных в регуляторном участке гена, кодирующего белок, выбранный из LIPH, и наличие любого из указанных полиморфных изменений коррелирует с изменением активности соответствующего гена, в том числе изменений, внесенных искусственно методом геномного редактирования.
7. Способ по п. 1, включающий в себя: а) определение нуклеотидной последовательности фрагмента ДНК, включающего в себя последовательность, выбранную из SEQ ID NO:1; б) синтезируемые праймеры - олигонуклеотиды, обладающие наибольшей специфичностью к выбранным участкам ДНК и фланкирующие полиморфизмы выбранных участков для проведения полимеразно-цепной реакции (ПЦР); в) сравнение последовательности указанной ДНК с последовательностью, выбранной из SEQ NO:1; г) выявление наличия или отсутствия полиморфной вариации в амплифицированной последовательности; д) определение рекс-фенотипа шерсти у особи, несущей указанную полиморфную вариацию с гомозиготном состоянии; е) в случае, если выявляется рекс-фенотип шерсти, устанавливается, что данный фенотип обусловлен наличием выявленной полиморфной вариации; ж) в случае, если рекс-фенотип не выявляется, устанавливается, что указанная особь является носителем мутации рекс-фенотипа.
8. Способ по п. 7, где в качестве референсной последовательности части гена LIPH, ассоциированной с фенотипом Уральский рекс, используют последовательность, включающую Seq NO:1.
9. Способ по п. 7, отличающийся тем, что пара олигонуклеотидных праймеров для амплификации маркерного полиморфного варианта (делеции) представляет собой SEQ ID NO:2 и SEQ ID NO:3.
10. Способ по п. 7, где определение нуклеотидной последовательности ДНК проводят: а) секвенированием по методу Сенгера; б) методом ПЦР-ПДРФ; в) методом TaqMan Real-Time PCR: г) методом аллель-специфичной ПЦР; методом гибридизации на чипах.
11. Выделенная ДНК для осуществления способа по п. 1, кодирующая участок генома кошки породы Уральский рекс, включающая последовательность, выбранную из SEQ ID NO:1.
12. Диагностический набор (тест-система) для осуществления способа по п. 1, используемый для детектирования присутствия у особи кошки маркерного полиморфного варианта, связанного с рексовым типом шерсти, включающий, по крайней мере, одну нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3; и их комбинаций.
13. Применения способа по п. 1 для отбора особей кошек, являющихся носителем аллеля Ur с делецией в гомозиготной форме, обуславливающей формирование рекс-фенотипа, среди имеющегося поголовья домашних кошек.
14. Применение способа по п. 12, где отобранных животных используют для получения от них потомства с желаемым рекс-фенотипом, характеризующим породу Уральский рекс.