ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ

1. Способ, состоящий из системы детектирования для гомогенного анализа для процесса ПЦР с использованием FRET, для детектирования присутствия или отсутствия HaAHASLl-A122(At)Τ SNP внутри гена HaAHASLl, содержащий:
a. выделение образца геномной ДНК из Helianthus annum;
b. добавление набора олигонуклеотидных праймеров к указанному образцу выделенной геномной ДНК, где указанный набор олигонуклеотидных праймеров состоит из универсального праймера для детектирования мутантного аллеля, состоящего из SEQ ID NO:3, универсального праймера для детектирования аллеля дикого типа, состоящего из SEQ ID NO:4, «нижележащего» универсального праймера, состоящего из SEQ ID NO:5, и флуоресцентно-меченых праймеров;
c. подвергание указанного образца выделенной геномной ДНК и указанного набора олигонуклеотидных праймеров процессу амплификации; и
d. детектирование, по меньшей мере, одного продукта амплификации, где указанный продукт амплификации указывает на присутствие или отсутствие SNP HaAHASLl-A122(At)T.
2. Способ по п. 1, где указанный продукт амплификации состоит из 84 пар оснований.
3. Универсальный праймер для детектирования мутантного аллеля по п. 1, где указанный универсальный праймер для детектирования мутантного аллеля содержит хвостовую последовательность, которая является идентичной по последовательности первому флуоресцентно-меченому праймеру.
4. Первый флуоресцентно-меченый праймер по п. 3, содержащий флуоресцентный краситель.
5. Флуоресцентный краситель по п. 4, содержащий флуоресцентный краситель HEX, флуоресцентный краситель FAM, флуоресцентный краситель JOE, флуоресцентный краситель ΤΕΤ, флуоресцентный краситель Су 3, флуоресцентный краситель Су 3,5, флуоресцентный краситель Су 5, флуоресцентный краситель Су 5,5, флуоресцентный краситель Су 7 или флуоресцентный краситель ROX.
6. Универсальный праймер для детектирования аллеля дикого типа по п. 1, где указанный универсальный праймер для детектирования аллеля дикого типа содержит хвостовую последовательность, которая является идентичной по последовательности второму флуоресцентно-меченому праймеру.
7. Второй флуоресцентно-меченый праймер по п. 6, содержащий флуоресцентный краситель.
8. Флуоресцентный краситель по п. 7, содержащий флуоресцентный краситель HEX, флуоресцентный краситель FAM, флуоресцентный краситель JOE, флуоресцентный краситель ΤΕΤ, флуоресцентный краситель Су 3, флуоресцентный краситель Су 3,5, флуоресцентный краситель Су 5, флуоресцентный краситель Су 5,5, флуоресцентный краситель Су 7 или флуоресцентный краситель ROX.
9. Способ по п. 1, где указанный способ применяют, чтобы определить зиготность, содержащий:
а. произведение количественного анализа указанного первого флуоресцентного красителя флуоресцентно-меченого праймера, который является идентичным по последовательности хвосту универсального праймера для детектирования мутантного аллеля;
b. произведение количественного анализа указанного второго флуоресцентного красителя флуоресцентно-меченого праймера, который является идентичным по последовательности хвосту универсального праймера для детектирования аллеля дикого типа;
c. сравнение количества первого флуоресцентного красителя со вторым флуоресцентным красителем; и
d. определение зиготности посредством сравнения соотношений флуоресценции первого флуоресцентного красителя со вторым флуоресцентным красителем.
10. Способ по п. 1, где сайт указанного присутствующего или отсутствующего SNP расположен между SEQ ID NO:3 и SEQ ID NO:5 хромосомы 9 Helianthus annuus.
11. Способ по п. 1, где сайт указанного присутствующего или отсутствующего SNP расположен между SEQ ID NO:4 и SEQ ID NO:5 хромосомы 9 Helianthus annuus.
12. Способ по п. 1, где указанный способ применяют для селекционной интрогрессии внутрь второй линии Helianthus annuus.
13. Способ селекционной интрогрессии по п. 12, где указанная вторая линия Helianthus annuus не содержит аллель HaAHASLl-А122 (At) T.
14. Способ селекционной интрогрессии по п. 12, где указанный способ применяют для детекции присутствия или отсутствия SNP HaAHASLl-A122 (At) Τ внутри гена HaAHASL1 в растениях потомства.
15. Способ по п. 1, где указанный способ применяют для идентификации линии Helianthus annuus, которая обладает устойчивостью к гербицидам на основе имидазолинона.