КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ АНАЛИЗА РАКА ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

1. Способ диагностики рака предстательной железы у испытуемого субъекта, предусматривающий:
a) контактирование раковых клеток эпителиального происхождения с антителом, которое специфически связывается с простата-специфическим маркером, где раковые клетки являются клетками из образца крови, взятого у испытуемого субъекта; и
b) определение, экспрессируют ли раковые клетки простата-специфический маркер, где присутствие раковых клеток, которые экспрессируют простата-специфический маркер, является прогнозирующим наличие рака предстательной железы у испытуемого субъекта.
2. Способ по п. 1, дополнительно предусматривающий определение количества раковых клеток, которые экспрессируют простата-специфический маркер, где такое количество является прогнозирующим стадию рака предстательной железы у испытуемого субъекта.
3. Способ по любому из пп. 1-2, дополнительно предусматривающий определение уровня экспрессии простата-специфического маркера на раковых клетках.
4. Способ по любому из пп. 1-2, дополнительно предусматривающий распределение по группам раковых клеток на основе их уровня экспрессии простата-специфического маркера и определение процентного содержания раковых клеток в каждой группе.
5. Способ по любому из пп. 1-2, дополнительно
предусматривающий расчет оценки группы для каждой группы умножением процентного содержания раковых клеток в указанной группе с уникальным номером группы, репрезентативным для уровня экспрессии простата-специфического маркера в указанной группе, и суммирование всех оценок группы для получения Н-оценки, где Н-оценка указывает стадию рака предстательной железы у испытуемого субъекта.
6. Способ по п. 1, где раковые клетки идентифицируют из образца крови с захватывающей композицией, содержащей лиганд, который специфически связывается с раковыми клетками эпителиального происхождения.
7. Способ по п. 6, где лиганд является антителом, которое специфически связывается с эпителиальным антигеном, преимущественно экспрессируемым на раковых клетках.
8. Способ по п. 7, где эпителиальный антиген является Молекулой Адгезии Эпителиальных Клеток (EpCAM).
9. Способ по любому из пп. 6-8, где идентифицированные раковые клетки обогащены в клеточной фракции, отделенной от образца крови.
10. Способ по п. 9, где клеточную фракцию отделяют с использованием магнитного поля.
11. Способ по п. 10, где лиганд в захватывающей композиции связан с магнитной частицей (например, коллоидной магнитной частицей, например, коллоидными магнитными наночастицами).
12. Способ по п. 11, где лиганд содержит антитело EpCAM.
13. Способ по любому из пп. 1, 2, 6-8, 10-12, где простата-специфический маркер выбран из группы, состоящей из: Шесть-Трансмембранного эпителиального Антигена Предстательной железы (STEAP), простата-специфического мембранного антигена (PSMA), опухолевого антигена рака предстательной железы (PCTA-1) и антигена стволовых клеток предстательной железы (PSCA).
14. Способ по п. 1, где антитело, которое специфически связывается с простата-специфическим маркером, включает анти-STEAP-1-антитело.
D
15. Способ по п. 14, где анти-STEAP-1-антитело связывается со STEAP-1 с K≤1000 нМ.
16. Способ по любому из пп. 14-15, где анти-STEAP-1-антитело является поликлональным антителом или моноклональным антителом.
17. Способ по п. 16, где aнти-STEAP-1-антитело является мышиным моноклональным антителом.
18. Способ по п. 17, где aнти-STEAP-1-антитело является 15A5, продуцируемым клеткой гибридомы, имеющей номер депонирования микроорганизмов PTA-12259.
19. Способ по любому из пп. 14, 15, 17 или 18, где aнти-STEAP-1-антитело конъюгировано с первой детектируемой меткой.
20. Способ по п. 1, где раковые клетки идентифицируют с одним или несколькими реагентами, которые позволяют детектировать раковые клетки эпителиального происхождения.
21. Способ по п. 20, где реагенты содержат лиганд, который специфически связывается с цитокератином, и где лиганд необязательно конъюгирован со второй детектируемой меткой.
22. Способ по любому из пп. 20-21, где реагенты дополнительно содержат краситель, который отличает клетки от неклеточных компонентов.
23. Способ по п. 22, где краситель является 4',6-диамидино-2-фенилиндолом (DAPI).
24. Способ по любому из пп. 20, 21 или 23, где реагенты дополнительно содержат лиганд, который специфически связывается с лейкоцитным маркером, и где лиганд является необязательно конъюгированным с третьей детектируемой меткой.
25. Способ по п. 24, где лиганд к лейкоцитному маркеру является антителом CD45.
26. Способ по любому из пп. 1-2, 6-8, 10-12, 14, 15, 17, 18, 20, 21, 23 или 25, где определение является способом на основе иммунофлуоресцентной микроскопии, проточной цитометрии, волоконно-оптической сканирующей цитометрии или лазерной сканирующей цитометрии.
27. Способ прогнозирования эффективности терапии рака предстательной железы у испытуемого субъекта, предусматривающий:
a) контактирование раковых клеток эпителиального происхождения с антителом, которое специфически связывается с простата-специфическим маркером, где раковые клетки являются клетками из образца крови, взятого у испытуемого субъекта; и
b) определение, экспрессируют ли любые из раковых клеток простата-специфический маркер, где присутствие раковых клеток, которые экспрессируют простата-специфический маркер, является прогнозирующим эффективность терапии рака предстательной железы у испытуемого субъекта.
28. Способ мониторинга реакции на терапию рака предстательной железы у испытуемого субъекта, предусматривающий:
a) контактирование первой группы раковых клеток эпителиального происхождения с антителом, которое специфически связывается с простата-специфическим маркером, где первая группа раковых клеток является клетками из первого образца крови, взятого у испытуемого субъекта; и
b) определение количества раковых клеток в первой группе, которые экспрессируют простата-специфический маркер, и/или уровня экспрессии простата-специфического маркера в раковых клетках;
c) контактирование второй группы раковых клеток эпителиального происхождения с антителом, которое специфически связывается с простата-специфическим маркером, где вторая группа раковых клеток является клетками из второго образца крови, взятого у испытуемого субъекта после тест-периода терапии рака предстательной железы;
d) определение количества раковых клеток во второй группе, которые экспрессируют простата-специфический маркер, и/или уровня экспрессии простата-специфического маркера в раковых клетках; и
e) сравнение количества раковых клеток, которые экспрессируют простата-специфический маркер, и/или уровня экспрессии простата-специфического маркера, как определено в b), с этими показателями в d),
где уменьшение в количестве раковых клеток, экспрессирующих простата-специфический маркер, и/или уменьшение в уровне экспрессии простата-специфического маркера в раковых клетках указывает на реакцию на терапию рака предстательной железы у испытуемого субъекта.
29. Способ по любому из пп. 27-28, где терапия рака предстательной железы включает антитело или конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC), который связывается с простата-специфическим маркером.
30. Способ по п. 29, где простата-специфическим маркером является STEAP-1.
31. Способ по любому из пп. 27-28 или 30, где ADC содержит анти-STEAP-1-антитело, ковалентно связанное с цитотоксическим агентом.
32. Способ по п. 31, где цитотоксический агент выбран из токсина, химиотерапевтического агента, лекарственной части, монометилауристатина Е (ММАЕ), антибиотика, радиоактивного изотопа и нуклеолитического фермента.
33. Антитело, которое связывается по существу с тем же самым эпитопом, с которым связывается антитело 15A5, где антитело 15A5 продуцируется клеткой гибридомы, имеющей номер депонирования микроорганизмов: PTA-12259.
34. Антитело по п. 33, которое содержит по меньшей мере один из CDR-участков антитела 15A5.
35. Антитело по п. 34, которое содержит шесть CDR-участков антитела 15A5.
36. Антитело по любому из пп. 33-35, которое содержит вариабельную область тяжелой цепи антитела 15A5.
37. Антитело по любому из пп. 33-35, которое содержит вариабельную область легкой цепи антитела 15A5.
38. Антитело по любому из пп. 33-35, которое является антителом 15A5 или его антигенсвязывающим фрагментом.
39. Антитело по любому из пп. 33-35, дополнительно конъюгированное с детектируемой меткой.
40. Выделенный полинуклеотид, кодирующий антитело по любому из пп. 33-39.
41. Клетка-хозяин, содержащая полинуклеотид по п. 40.
42. Гибридомная клеточная линия, имеющая номер депонирования микроорганизмов PTA-12259.
43. Применение антитела по любому из пп. 33-39 или его антигенсвязывающего фрагмента в приготовлении диагностического агента для рака предстательной железы.
44. Тест-набор для детектирования присутствия клеток рака предстательной железы, экспрессирующих STEAP-1, в образце крови, содержащий антитело, которое специфически связывается со STEAP-1.
45. Тест-набор по п. 44, где антитело конъюгировано с детектируемой меткой.
46. Тест-набор по п. 44 или 45, где антитело является антителом по любому из пп. 33-39.