ЛЕЧЕНИЕ РАКА ПУТЕМ МАНИПУЛЯЦИЙ С КОММЕНСАЛЬНОЙ МИКРОФЛОРОЙ

1. Способ лечения или профилактики рака у субъекта, включающий модулирование уровней одного или более комменсальных микроорганизмов в организме субъекта с обеспечением: (А) усиления иммунного ответа субъекта, (В) ингибирования роста или распространения рака, (С) ингибирования ускользания рака от иммунологического надзора и/или (D) повышения эффективности терапевтического средства.
2. Способ по п. 1, в котором уровни одного или более комменсальных микроорганизмов модулируют в кишечнике субъекта.
3. Способ по п. 1, в котором модулирование уровней одного или более комменсальных микроорганизмов включает увеличение и/или уменьшение уровней одной или нескольких бактерий, выбранных из родов Adlercreutzia, Oscillopira, Mollicutes, Butyrivibrio, Bacteroides, Clostridium, Fusobacterium, Eubacterium, Ruminococcus, Peptococcus, Peptostreptococcus, Bifidobacterium, Rikenella, Alistipes, Marinilabilia, Anaerostipes, Escherichia и/или Lactobacillus.
4. Способ по п. 1, в котором модулирование уровней одного или более комменсальных микроорганизмов включает введение полезных микроорганизмов в организм субъекта.
5. Способ по п. 4, в котором полезные микроорганизмы представляют собой бактерии.
6. Способ по п. 5, в котором бактерий выбирают из родов Adlercreutzia, Oscillopira, Mollicutes, Butyrivibrio, Bacteroides, Clostridium, Fusobacterium, Eubacterium, Ruminococcus, Peptococcus, Peptostreptococcus, Bifidobacterium, Rikenella, Alistipes, Marinilabilia, Anaerostipes, Escherichia и/или Lactobacillus.
7. Способ по n. 6, в котором бактерии представляют собой Bifidobacterium.
8. Способ по п. 7, в котором Bifidobacterium включают бактерии, выбранные из группы, состоящей из Bifidobacterium lactis, Bifidobacterium bifidium, Bifidobacterium longum, Bifidobacterium animalis, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium infantis, Bifidobacterium catenulatum, Bifidobacterium pseudocatenulatum, Bifidobacterium adolescentis и Bifidobacterium angulatum.
9. Способ по п. 4, в котором полезные микроорганизмы вводят в виде пробиотической композиции или посредством трансплантации микрофлоры от донора.
10. Способ по п. 1, в котором модулирование уровней одного или более комменсальных микроорганизмов включает введение одного или более противомикробных средств.
11. Способ по п. 10, в котором противомикробное средство уничтожает вредоносные микроорганизмы.
12. Способ по п. 11, в котором противомикробное средство представляет собой антибиотик.
13. Способ по п. 12, дополнительно включающий введение полезных микроорганизмов субъекту.
14. Способ по п. 1, дополнительно включающий применение у субъекта средства лечения рака.
15. Способ по п. 14, в котором модулирование уровней одного или более комменсальных микроорганизмов в организме субъекта усиливает иммунный ответ субъекта и/или ингибирует ускользание рака от иммунологического надзора, а средство для лечения рака представляет собой иммунотерапевтическое средство.
16. Способ по п. 15, в котором иммунотерапия включает введение антител против CTLA-4 и/или антител против PD-L1 или против PD-1.
17. Способ по п. 14, в котором модулирование уровней одного или более комменсальных микроорганизмов в организме субъекта повышает эффективность терапевтического средства, а средство для лечения рака представляет собой указанное терапевтическое средство.
18. Способ по п. 17, в котором указанное терапевтическое средство включает химиотерапевтическое средство.
19. Способ по п. 1, дополнительно включающий анализ ускользания рака у субъекта от иммунологического надзора.
20. Способ по п. 1, дополнительно включающий хирургическое, лучевое и/или химиотерапевтическое вмешательство по поводу рака.
21. Набор или композиция, содержащие полезный комменсальный микроорганизм и средство для лечения рака, причем указанные композиция или компоненты указанного набора выполнены с возможностью терапевтической доставки в организм субъекта.
22. Полезный комменсальный микроорганизм для применения в качестве лекарственного средства в лечения рака и/или ингибировании ускользания от иммунологического надзора.
23. Способ лечения или профилактики рака у субъекта, включающие введение субъекту бактериального препарата, содержащего бактерии родов Bifidobacterium, Rikenella, Alistipes, Marinilabilia или Anaerostipes.
24. Способ по п. 23, в котором по меньшей мере 50% бактерий в бактериальном препарате относятся к родам Bifidobacterium, Rikenella, Alistipes, Marinilabilia или Anaerostipes.
25. Способ по п. 23, в котором по меньшей мере 90% бактерий в бактериальном препарате представляют собой бактерии родов Bifidobacterium, Rikenella, Alistipes, Marinilabilia или Anaerostipes.
26. Способ по п. 23, в котором бактериальный препарат содержит бактерии рода Bifidobacterium.
27. Способ по п. 26, в котором по меньшей мере 50% бактерий в бактериальном препарате относятся к роду Bifidobacterium.
28. Способ по п. 26, в котором по меньшей мере 90% бактерий в бактериальном препарате представляют собой бактерии рода Bifidobacterium.
29. Способ по любому из пп. 26-28, в котором бактерии рода Bifidobacterium выбраны из группы, состоящей из Bifidobacterium lactis, Bifidobacterium bifidium, Bifidobacterium longum, Bifidobacterium animalis, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium infantis, Bifidobacterium catenulatum, Bifidobacterium pseudocatenulatum, Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium angulatum, Bifidobacterium asteroides, Bifidobacterium boum, Bifidobacterium choerinum, Bifidobacterium coryneforme, Bifidobacterium cuniculi, Bifidobacterium denticolens, Bifidobacterium dentium, Bifidobacterium gallicum, Bifidobacterium gallinarum, Bifidobacterium indicum, Bifidobacterium inopinatum, Bifidobacterium magnum, Bifidobacterium merycicum, Bifidobacterium minimum, Bifidobacterium pseudolongum, Bifidobacterium pullorum, Bifidobacterium psychraerophilum, Bifidobacterium ruminantium, Bifidobacterium saeculare, Bifidobacterium scardovii, Bifidobacterium simiae, Bifidobacterium subtile, Bifidobacterium therammcidophilum, Bifidobacterium thermophilum, Bifidobacterium tsurumiense, Bifidobacterium urinalis и Bifidobacterium sp.
30. Способ по любому из пп. 23-29, в котором рак представляет собой рак, выбранный из группы, состоящей из острого нелимфоцитарного лейкоза, хронического лимфоцитарного лейкоза, острого гранулоцитарного лейкоза, хронического гранулоцитарного лейкоза, острого промиелоцитарного лейкоза, Т-клеточного лейкоза взрослых, алейкемического лейкоза, лейкемического лейкоза, базофильного лейкоза, недифференцируемого лейкоза, лейкоза крупного рогатого скота, хронического миелоцитарного лейкоза, поражения кожи при лейкозе, эмбрионального лейкоза, эозинофильного лейкоза, лейкоза Гросса, лейкоза из клеток Ридера, лейкоза Шиллинга, недифференцированного бластного лейкоза, сублейкемического лейкоза, недифференцированного лейкоза, волосатоклеточного лейкоза, гемобластного лейкоза, гемоцитобластного лейкоза, гистиоцитарного лейкоза, недифференцированного бластного лейкоза, острого моноцитарного лейкоза, лейкопенического лейкоза, лимфолейкоза, лимфобластного лейкоза, лимфоцитарного лейкоза, лимфогенного лейкоза, лимфоидного лейкоза, лейкоза из клеток лимфосаркомы, тучноклеточного лейкоза, мегакариоцитарного лейкоза, микромиелобластного лейкоза, моноцитарного лейкоза, миелобластного лейкоза, миелоцитарного лейкоза, миелоидного гранулоцитарного лейкоза, миеломоноцитарного лейкоза, лейкоза Негели, плазмоклеточного лейкоза, плазмоцитарного лейкоза, промиелоцитарного лейкоза, ацинарной карциномы, аденокарциномы, аденокистозной карциномы, железисто-кистозной карциномы, аденоматозной карциномы, карциномы коры надпочечников, альвеолярной карциномы, альвеолярноклеточной карциномы, базалиомы, базальноклеточной карциномы, базалоидной карциномы, базальной плоскоклеточной карциномы, бронхоальвеолярной карциномы, бронхиолярной карциномы, бронхогенной карциномы, мозговидной карциномы, холангиоцеллюлярной карциномы, хориокарциномы, коллоидной карциномы, комедокарциномы, карциномы тела матки, криброзной карциномы, распространенной карциномы плевры, карциномы кожи, цилиндроэпителиальной карциномы, цилиндроклеточной карциномы, протоковой карциномы, карцинома твердой мозговой оболочки, эмбриональной карциномы, медуллярной карциномы, эпидермоидной карциномы, эпителиально-аденоидной карциномы, экзофитной карциномы, рака из язвы, фиброзной карциномы, желеобразной карциномы, студенистой карциномы, гигантоклеточной карциномы, перстневидноклеточной карциномы, недифференцированной карциномы, мелкоклеточной карциномы, соланоидную карциному, карциномы из сферических клеток, веретеноклеточной карциномы, губчатой карциномы, плоскоклеточной карциномы, плоскоклеточного рака, четковидной карциномы, телеангиэктатической карциномы, карциномы с сосудистым компонентом, переходноклеточной карциномы, туберозной карциномы, бугорчатой карциномы, бородавчатой карциномы, ворсинчатой карциномы, гигантоклеточной карциномы, железистой карциномы, гранулезоклеточной карциномы, базальноклеточной карциномы, гематоидной карциномы, гепатоцеллюлярной карциномы, карциномы из клеток Гюртле, гиалиновой карциномы, гипернефроидной карциномы, эмбриональной карциномы на ранней стадии, карциномы in situ, внутриэпидермальной карциномы, внутриэпителиальной карциномы, карциному Кромпехера, карциномы из клеток Кульчитского, крупноклеточной карциномы, линзовидной карциномы, лентикулярной карциномы, липоматозной карциномы, лимфоэпителиальной карциномы, медуллярной карциномы, мозговидной карциномы, меланокарциномы, мягкой карциномы, муцинозной карциномы, мукоидной карциномы, слизистоклеточной карциномы, мукоэпидермоидной карциномы, мукозной карциномы, карциномы слизистых, миксоматозной карциномы, карциномы носоглотки, овсяноклеточной карциномы, оссифицирующей карциномы, остеоидной карциномы, папиллярной карциномы, перипортальной карциномы, прединвазивной карциномы, шиловидно-клеточной карциномы, мацерированной карциномы, почечноклеточной карциномы почек, резервноклеточной карциномы, саркоматозной карциномы, карциномы слизистой носа, уплотненной карциномы, карциномы мошонки, хондросаркомы, фибросаркомы, лимфосаркомы, меланосаркомы, миксосаркомы, остеосаркомы, саркомы эндометрия, саркомы стромы, саркомы Юинга, фасциальной саркомы, фибробластной саркомы, гигантоклеточной саркомы, саркомы Абернети, злокачественной липомы, липосаркомы, альвеолярной саркомы мягких тканей, амелобластосаркомы, ботриоидной саркомы, хлоромы, хориокарциномы, эмбриональной саркомы, саркомы Вильмса, гранулоцитарной саркомы, саркомы Ходжкина, идиопатической множественной геморрагической саркомы, иммунобластной В-клеточной саркомы, лимфомы, иммунобластной Т-клеточной саркомы, саркомы Йенсена, саркомы Капоши, саркомы из купферовых клеток, ангиосаркомы, лейкосаркомы, злокачественной мезенхимомы, паростальной саркомы, ретикулоцитарной саркомы, саркомы Рауса, серозно-кистозной саркомы, синовиальной саркомы, телеангиэктатической саркомы, болезни Ходжкина, неходжкинской лимфомы, множественной миеломы, нейробластомы, рака молочной железы, рака яичников, рака легких, рабдомиосаркомы, первичного тромбоцитоза, первичной макроглобулинемии, мелкоклеточных опухолей легкого, первичных опухолей головного мозга, рака желудка, рака толстой кишки, злокачественной инсулиномы поджелудочной железы, злокачественного карциноида, предраковых кожных поражений, рака яичка, лимфом, рака щитовидной железы, нейробластомы, рака пищевода, рака мочеполовой системы, злокачественной гиперкальциемии, рака шейки матки, рака эндометрия, рака коры надпочечников, меланомы Хардинга-Пасси, ювенильной меланомы, лентиго-меланомы, злокачественной меланомы, акральной лентигинозной меланомы, беспигментной меланомы, доброкачественной ювенильной меланомы, меланомы Клаудмана, меланомы S91, нодулярной меланома, подногтевой меланомы и поверхностно распространенной меланомы.
31. Способ по любому из пп. 23-30, в котором субъект является человеком.
32. Способ по любому из пп. 23-31, в котором бактериальный препарат вводят путем перорального введения, ректального введения, местного введения, ингаляции или инъекции.
33. Способ по п. 26, в котором бактериальный препарат вводят путем перорального введения.
34. Способ по п. 27, в котором бактериальный препарат представляет собой пищевой продукт.
6
35. Способ по любому из пп. 23-34, в котором бактериальный препарат содержит по меньшей мере приблизительно 5×10 KOE бактерий.
36. Способ по любому из пп. 23-35, в котором бактериальный препарат вводят субъекту в виде двух или более доз.
37. Способ по п. 36, в котором введение по меньшей мере двух или более доз разделяют промежутком времени, равным по меньшей мере 1 день.
38. Способ по п. 37, в котором введение по меньшей мере двух или более доз разделяют промежутком времени, равным по меньшей мере 1 неделе.
39. Способ по любому из пп. 23-38, дополнительно включающий введение субъекту антибиотика.
40. Способ по п. 39, в котором антибиотик вводят субъекту до бактериального препарата.
41. Способ по п. 40, в котором антибиотик вводят субъекту по меньшей мере за 1 день до введения бактериального препарата субъекту.
42. Способ по любому из пп. 23-42, дополнительно включающий введение субъекту ингибитора ключевого компонента иммунного ответа.
43. Способ по п. 42, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой белок или полипептид, специфически связывающийся с белком-ключевым компонентом иммунного ответа.
44. Способ по п. 43, в котором белок-ключевой компонент иммунного ответа выбирают из группы, состоящей из CTLA4, PD-1, PD-L1, PD-L2, A2AR, В7-Н3, В7-Н4, BTLA, KIR, LAG3, TIM-3 или VISTA.
45. Способ по п. 43 или 44, в котором указанный полипептид или белок представляет собой антитело или его антиген-связывающий фрагмент.
46. Способ по п. 42, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой молекулу интерферирующей нуклеиновой кислоты.
47. Способ по п. 46, в котором молекула интерферирующей нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу миРНК, молекулу кшРНК или молекулу антисмысловой РНК.
48. Способ по п. 42, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа выбирают из группы, состоящей из ниволумаба, пембролизумаба, пидилизумаба, АМР-224, АМР-514, STI-A1110, TSR-042, RG-7446, BMS-936559, BMS-936558, МК-3475, СТ O11, MPDL3280A, MEDI-4736, MSB-0020718С, AUR-012 и STI-A1010.
49. Способ по любому из пп. 42-48, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят до бактериального препарата.
50. Способ по п. 49, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят по меньшей мере за один день до бактериального препарата.
51. Способ по любому из пп. 42-48, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят приблизительно в то же время, что и бактериальный препарат.
52. Способ по п. 51, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят в тот же день, что и бактериальный препарат.
53. Способ по любому из пп. 42-48, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят после бактериального препарата.
54. Способ по п. 49, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят по меньшей мере через один день после бактериального препарата.
55. Способ по любому из пп. 42-54, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят путем инъекции.
56. Способ по п. 55, в котором инъекция представляет собой внутривенную, внутримышечную, внутриопухолевую или подкожную инъекцию.
57. Способ лечения рака у субъекта-человека, включающий введение субъекту ингибитора ключевого компонента иммунного ответа и бактериального препарата, содержащего бактерии рода Bifidobacterium.
58. Способ по п. 57, в котором по меньшей мере 50% бактерий в бактериальном препарате представляют собой бактерии рода Bifidobacterium.
59. Способ по п. 57, в котором по меньшей мере 90% бактерий в бактериальном препарате представляют собой бактерии рода Bifidobacterium.
60. Способ по п. 57, в котором бактерии рода Bifidobacterium включают бактерии видов Bifidobacterium lactis, Bifidobacterium bifidium, Bifidobacterium longum, Bifidobacterium animalis, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium infantis, Bifidobacterium catenulatum, Bifidobacterium pseudocatenulatum, Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium angulatum, Bifidobacterium asteroides, Bifidobacterium boum, Bifidobacterium choerinum, Bifidobacterium coryneforme, Bifidobacterium cuniculi, Bifidobacterium denticolens, Bifidobacterium dentium, Bifidobacterium gallicum, Bifidobacterium gallinarum, Bifidobacterium indicum, Bifidobacterium inopinatum, Bifidobacterium magnum, Bifidobacterium merycicum, Bifidobacterium minimum, Bifidobacterium pseudolongum, Bifidobacterium pullorum, Bifidobacterium psychraerophilum, Bifidobacterium ruminantium, Bifidobacterium saeculare, Bifidobacterium scardovii, Bifidobacterium simiae, Bifidobacterium subtile, Bifidobacterium therammcidophilum, Bifidobacterium thermophilum, Bifidobacterium tsurumiense, Bifidobacterium urinalis или Bifidobacterium sp.
61. Способ по п. 57, в котором бактериальный препарат вводят путем перорального введения или ректального введения.
62. Способ по п. 61, в котором бактериальный препарат вводят путем перорального введения.
6
63. Способ по п. 57, в котором бактериальный препарат содержит по меньшей мере приблизительно 5×10 KOE бактерий рода Bifidobacterium.
64. Способ по п. 1, в котором бактериальный препарат вводят субъекту в виде двух или более доз.
65. Способ по п. 64, в котором введение двух или более доз разделяют промежутком времени, равным по меньшей мере 1 неделе.
66. Способ по п. 57, дополнительно включающий введение антибиотика субъекту до введения бактериального препарата.
67. Способ по п. 66, в котором антибиотик вводят субъекту по меньшей мере за 1 день до введения бактериального препарата субъекту.
68. Способ по п. 57, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой белок или полипептид, связывающийся с белком-ключевым компонентом иммунного ответа.
69. Способ по п. 68, в котором белок-ключевой компонент иммунного ответа представляет собой CTLA4, PD-1, PD-L1, PD-L2, A2AR, В7-Н3, В7-Н4, BTLA, KIR, LAG3, TIM-3 или VISTA.
70. Способ по п. 69, в котором белок-ключевой компонент иммунного ответа представляет собой PD-1 или PD-L1.
71. Способ по п. 57, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой антитело или его антиген-связывающий фрагмент, связывающийся с белком-ключевым компонентом иммунного ответа.
72. Способ по п. 71, в котором белок-ключевой компонент иммунного ответа представляет собой CTLA4, PD-1, PD-L1, PD-L2, A2AR, В7-Н3, В7-Н4, BTLA, KIR, LAG3, TIM-3 или VISTA.
73. Способ по п. 72, в котором белок - ключевой компонент иммунного ответа представляет собой PD-1 или PD-L1.
74. Способ по п. 57, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой ниволумаб, пембролизумаб, пидилизумаб, АМР-224, АМР-514, STI-A1110, TSR-042, RG-7446, BMS-936559, BMS-936558, МК-3475, СТ O11, MPDL3280A, MEDI-4736, MSB-0020718C, AUR-012 и STI-А1010.
75. Способ по п. 57, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят посредством внутривенной инъекции, внутримышечной инъекции, внутриопухолевой инъекции или подкожной инъекции.
6
76. Способ лечения рака у субъекта-человека, включающий введение субъекту бактериального препарата, содержащего по меньшей мере 5×10 KOE бактерий рода Bifidobacterium, причем по меньшей мере 50% бактерий в бактериальном препарате представляют собой бактерии рода Bifidobacterium.
77. Способ по п. 76, в котором по меньшей мере 90% бактерий в бактериальном препарате представляют собой бактерии рода Bifidobacterium.
78. Способ по п. 76, в котором бактерии рода Bifidobacterium включают бактерии видов Bifidobacterium lactis, Bifidobacterium bifidium, Bifidobacterium longum, Bifidobacterium animalis, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium infantis, Bifidobacterium catenulatum, Bifidobacterium pseudocatenulatum, Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium angulatum, Bifidobacterium asteroides, Bifidobacterium boum, Bifidobacterium choerinum, Bifidobacterium coryneforme, Bifidobacterium cuniculi, Bifidobacterium denticolens, Bifidobacterium dentium, Bifidobacterium gallicum, Bifidobacterium gallinarum, Bifidobacterium indicum, Bifidobacterium inopinatum, Bifidobacterium magnum, Bifidobacterium merycicum, Bifidobacterium minimum, Bifidobacterium pseudolongum, Bifidobacterium pullorum, Bifidobacterium psychraerophilum, Bifidobacterium ruminantium, Bifidobacterium saeculare, Bifidobacterium scardovii, Bifidobacterium simiae, Bifidobacterium subtile, Bifidobacterium therammcidophilum, Bifidobacterium thermophilum, Bifidobacterium tsurumiense, Bifidobacterium urinalis или Bifidobacterium sp.
79. Способ по п. 76, в котором бактериальный препарат вводят путем перорального введения или ректального введения.
80. Способ по п. 79, в котором бактериальный препарат вводят путем перорального введения.
81. Способ по п. 76, в котором бактериальный препарат вводят субъекту в виде двух или более доз.
82. Способ по п. 76, дополнительно включающий введение антибиотика субъекту до введения бактериального препарата субъекту.
83. Способ по п. 76, дополнительно включающий введение субъекту ингибитора ключевого компонента иммунного ответа.
84. Способ по п. 83, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой антитело или его антиген-связывающий фрагмент, связывающийся с CTLA4, PD-1, PD-L1, PD-L2, A2AR, В7-Н3, В7-Н4, BTLA, KIR, LAG3, TIM-3 или VISTA.
85. Способ по п. 83, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой антитело или его антиген-связывающий фрагмент, связывающийся с PD-1 или PD-L1.
86. Способ по п. 83, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой ниволумаб, пембролизумаб, пидилизумаб, АМР-224, АМР-514, STI-A1110, TSR-042, RG-7446, BMS-936559, BMS-936558, МК-3475, СТ O11, MPDL3280A, MEDI-4736, MSB-0020718C, AUR-012 и STI-А1010.
87. Способ лечения или профилактики рака у субъекта-реципиента, причем указанный способ включает введение субъекту-реципиенту бактериального препарата, содержащего микрофлору, полученную от субъекта-донора, причем организм субъекта-донора содержит микрофлору, способствующую лечению рака посредством иммунотерапии с применением основе ингибитора ключевого компонента иммунного ответа.
88. Способ по п. 87, дополнительно включающий введение субъекту-реципиенту ингибитора ключевого компонента иммунного ответа.
89. Способ по п. 88, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой белок или полипептид, специфически связывающийся с белком-ключевым компонентом иммунного ответа.
90. Способ по п. 88, в котором белок-ключевой компонент иммунного ответа выбирают из группы, состоящей из CTLA4, PD-1, PD-L1, PD-L2, A2AR, В7-Н3, В7-Н4, BTLA, KIR, LAG3, TIM-3 или VISTA.
91. Способ по п. 89 или 90, в котором указанный полипептид или белок представляет собой антитело или его антиген-связывающий фрагмент.
92. Способ по п. 88, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой молекулу интерферирующей нуклеиновой кислоты.
93. Способ по п. 92, в котором молекула интерферирующей нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу миРНК, молекулу кшРНК или молекулу антисмысловой РНК.
94. Способ по п. 88, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа выбирают из группы, состоящей из ниволумаба, пембролизумаба, пидилизумаба, АМР-224, АМР-514, STI-A1110, TSR-042, RG-7446, BMS-936559, BMS-936558, МК-3475, СТ O11, MPDL3280A, MEDI-4736, MSB-0020718С, AUR-012 и STI-A1010.
95. Способ по любому из пп. 88-94, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят до бактериального препарата.
96. Способ по п. 95, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят по меньшей мере за один день до бактериального препарата.
97. Способ по любому из пп. 88-94, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят приблизительно в то же время, что и бактериальный препарат.
98. Способ по п. 97, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят в тот же день, что и бактериальный препарат.
99. Способ по любому из пп. 88-94, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят после бактериального препарата.
100. Способ по любому из пп. 88-94, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят по меньшей мере через один день после бактериального препарата.
101. Способ по любому из пп. 88-100, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят путем инъекции.
102. Способ по п. 101, в котором инъекция представляет собой внутривенную, внутримышечную, внутриопухолевую или подкожную инъекцию.
103. Способ по любому из пп. 87-102, в котором микрофлора, полученная от субъекта-донора, представляет собой материал фекалий.
104. Способ по любому из пп. 87-102, в котором один или более паразитических или вредоносных микроорганизмов удаляют из микрофлоры до введения субъекту-реципиенту.
105. Способ по любому из пп. 87-102, в котором бактериальный препарат вводят субъекту-реципиенту путем перорального введения или ректального введения.
106. Способ по любому из пп. 87-105, в котором бактериальный препарат вводят субъекту в виде двух или более доз.
107. Способ по п. 106, в котором введение двух или более доз разделяют промежутком времени, равным по меньшей мере 1 неделе.
108. Способ по любому из пп. 87-107, дополнительно включающий введение антибиотика субъекту до введения бактериального препарата.
109. Способ по п. 108, в котором антибиотик вводят субъекту по меньшей мере за 1 день до введения бактериального препарата субъекту.
110. Способ по любому из пп. 87-109, дополнительно включающий этап получения микрофлоры от субъекта-донора.
111. Бактериальный препарат, содержащий микрофлору, полученную от субъекта-донора, причем организм субъекта-донора содержит микрофлору, способствующую лечению рака посредством иммунотерапии с применением основе ингибитора ключевого компонента иммунного ответа.
112. Бактериальный препарат по п. 111, содержащий материал фекалий субъекта-донора.
113. Бактериальный препарат по п. 111 или 112, в котором один или более вредоносных микроорганизмов, изначально присутствующих в микрофлоре, удален или уничтожен.
114. Бактериальный препарат по любому из пп. 111-113, в котором микрофлора обогащена одним или более микроорганизмов.
115. Бактериальный препарат по п. 114, в котором микрофлора обогащена бактериями родов Bifidobacterium, Rikenella, Alistipes, Marinilabilia или Anaerostipes.
6
116. Бактериальный препарат по п. 115, в котором бактериальный препарат содержит по меньшей мере приблизительно 5×10 KOE бактерий родов Bifidobacterium, Rikenella, Alistipes, Marinilabilia или Anaerostipes.
117. Бактериальный препарат по п. 114, в котором микрофлора обогащена бактериями рода Bifidobacterium.
6
118. Бактериальный препарат по п. 117, в котором бактериальный препарат содержит по меньшей мере приблизительно 5×10 KOE бактерий рода Bifidobacterium.
6
119. Бактериальный препарат по любому из пп. 111-118, в котором бактериальный препарат содержит по меньшей мере 5×10 KOE бактерий.
120. Бактериальный препарат по любому из пп. 111-119, в котором бактериальный препарат дополнительно содержит фармацевтически приемлемый носитель.
121. Бактериальный препарат по п. 120, в котором бактериальный препарат представляет собой твердый препарат.
122. Бактериальный препарат по п. 121, в котором бактериальный препарат представлен в форме порошка, таблетки, пилюли, капсулы, саше, суппозитория или диспергируемой гранулы.
123. Бактериальный препарат по п. 120, в котором бактериальный препарат представляет собой жидкий препарат.
124. Бактериальный препарат по п. 123, в котором бактериальный препарат представлен в форме эмульсии, сиропа, эликсира, водного раствора или водной суспензии.
125. Бактериальный препарат по любому из пп. 111-124, выполненный с возможностью пероральной доставки.
126. Бактериальный препарат по любому из пп. 111-124, выполненный с возможностью ректальной доставки.
127. Способ лечения или профилактики рака у субъекта-реципиента, причем указанный способ включает введение субъекту-реципиенту бактериального препарата по любому из пп. 111-126.
128. Способ по п. 127, дополнительно включающий введение субъекту-реципиенту ингибитора ключевого компонента иммунного ответа.
129. Способ по п. 128, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой белок или полипептид, специфически связывающийся с белком-ключевым компонентом иммунного ответа.
130. Способ по п. 128, в котором белок-ключевой компонент иммунного ответа выбирают из группы, состоящей из CTLA4, PD-1, PD-L1, PD-L2, A2AR, В7-Н3, В7-Н4, BTLA, KIR, LAG3, TIM-3 или VISTA.
131. Способ по п. 129 или 130, в котором указанный полипептид или белок представляет собой антитело или его антиген-связывающий фрагмент.
132. Способ по п. 128, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа представляет собой молекулу интерферирующей нуклеиновой кислоты.
133. Способ по п. 132, в котором молекула интерферирующей нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу миРНК, молекулу кшРНК или молекулу антисмысловой РНК.
134. Способ по п. 128, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа выбирают из группы, состоящей из ниволумаба, пембролизумаба, пидилизумаба, АМР-224, АМР-514, STI-A1110, TSR-042, RG-7446, BMS-936559, BMS-936558, МК-3475, СТ O11, MPDL3280A, MEDI-4736, MSB-0020718С, AUR-012 и STI-A1010.
135. Способ по любому из пп. 128-134, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят до бактериального препарата.
136. Способ по п. 135, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят по меньшей мере за один день до бактериального препарата.
137. Способ по любому из пп. 128-134, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят приблизительно в то же время, что и бактериальный препарат.
138. Способ по п. 137, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят в тот же день, что и бактериальный препарат.
139. Способ по любому из пп. 128-134, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят после бактериального препарата.
140. Способ по любому из пп. 128-134, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят по меньшей мере через один день после бактериального препарата.
141. Способ по любому из пп. 128-140, в котором ингибитор ключевого компонента иммунного ответа вводят путем инъекции.
142. Способ по п. 141, в котором инъекция представляет собой внутривенную, внутримышечную, внутриопухолевую или подкожную инъекцию.
143. Способ по любому из пп. 127-142, в котором бактериальный препарат вводят субъекту-реципиенту путем перорального введения или ректального введения.
144. Способ по любому из пп. 127-143, в котором бактериальный препарат вводят субъекту в виде двух или более доз.
145. Способ по п. 144, в котором введение двух или более доз разделяют промежутком времени, равным по меньшей мере 1 неделе.
146. Способ по любому из пп. 127-145, дополнительно включающий введение антибиотика субъекту до введения бактериального препарата.
147. Способ по п. 146, в котором антибиотик вводят субъекту по меньшей мере за 1 день до введения бактериального препарата субъекту.
148. Способ по любому из пп. 127-147, дополнительно включающий этап получения микрофлоры от субъекта-донора.
149. Способ по любому из пп. 127-148, в котором субъекта-донора выбирают на основании реакции на иммунотерапию с применением ингибитора ключевого компонента иммунного ответа и/или вида рака у субъекта-донора.
150. Бактериальный препарат по любому из пп. 111-126, характеризующийся тем, что донор выбран на основании реакции донора на иммунотерапию с применением ингибитора ключевого компонента иммунного ответа и/или вида рака у субъекта-донора.