АНАЛИЗ

1. Способ быстрого определения чувствительности микроорганизма к противомикробному средству, предусматривающий стадии:
a) обеспечения контакта первого образца, содержащего микроорганизм, с первой средой для выращивания для того, чтобы образовать первую смесь, причем первая среда для выращивания выбрана для обеспечения возможности пролиферации микроорганизма и/или стимуляции клеточного цикла микроорганизма к началу пролиферации;
b) обеспечения контакта второго образца, содержащего микроорганизм, со второй средой для выращивания для того, чтобы образовать вторую смесь, причем вторая среда для выращивания является практически такой же, как и первая среда для выращивания, за исключением того, что дополнительно содержит первое противомикробное средство, которое может ингибировать или замедлять пролиферацию микроорганизма;
c) инкубирования первой и второй смесей в течение менее чем 20 минут в условиях, подходящих для обеспечения возможности или стимуляции пролиферации микроорганизма;
d) оценки первой и второй смеси или их части с помощью цитометра для того, чтобы оценить один или несколько биохимических и/или биофизических параметров микроорганизмов в обеих смесях и
e) сравнения параметров микроорганизмов в первой смеси с параметрами второй смеси после инкубирования с целью выявления того, ингибирует или замедляет первое противомикробное средство пролиферацию микроорганизма для того, чтобы определить чувствительность микроорганизма к указанному средству.
2. Способ по п. 1, причем стадия b) дополнительно предусматривает обеспечение контакта одного или нескольких дополнительных образцов, содержащих микроорганизм, с одной или несколькими дополнительными средами для выращивания для того, чтобы образовать одну или несколько дополнительных смесей, причем одна или несколько дополнительных сред для выращивания являются такими же, как первая среда для выращивания, за исключением того, что дополнительно содержат одно или несколько дополнительных противомикробных средств, которые могут ингибировать или замедлять пролиферацию микроорганизма, при этом указанные одно или несколько дополнительных противомикробных средств отличаются друг от друга и отличаются от первого противомикробного средства.
3. Способ по любому предыдущему пункту, причем один или несколько биохимических и/или биофизических параметров микроорганизмов выбраны из одного или нескольких из следующего: размер клеток, количество клеток, энергетический статус клеточной мембраны и/или содержание и/или распределение нуклеиновых кислот.
4. Способ по любому предыдущему пункту, причем один или несколько биохимических и/или биофизических параметров микроорганизмов определяют посредством оценки поглощения одного или нескольких флуоресцентных или других красителей.
5. Способ по любому предыдущему пункту, причем цитометр представляет собой проточный цитометр.
6. Способ по любому предыдущему пункту, причем параметр представляет собой размер клеток, количество клеток и/или энергетический статус клеточной мембраны, и при этом среда дополнительно содержит карбоцианиновый краситель, или перед стадией d) карбоцианиновый краситель добавляют к смеси или части смеси.
7. Способ по п. 6, причем карбоцианиновый краситель содержит йодид 3,3'-дипропилтиадикарбоцианина (di-S-С3(5)).
8. Способ по любому из пп. 6 или 7, причем карбоцианиновый краситель присутствует в смесях в концентрации в диапазоне от приблизительно 1 мкМ до приблизительно 5 мкМ.
9. Способ по п. 8, причем карбоцианиновый краситель присутствует в смесях в концентрации в диапазоне приблизительно 3 мкМ.
10. Способ по любому из пп. 6-9, причем в основе работы проточного цитометра лежит возбуждение при длине волны 640 нм, и параметры оценивают при длине волны 675±15 нм.
11. Способ по любому предыдущему пункту, причем параметр представляет собой нуклеиновую кислоту, и указанная нуклеиновая кислота содержит ДНК.
12. Способ по п. 10, причем перед стадией d) митрамицин и/или краситель для нуклеиновой кислоты добавляют к смеси или части смеси и, необязательно, распределение ДНК оценивают на проточном цитометре при длине волны около 572 нм.
13. Способ по п. 12, причем краситель для нуклеиновой кислоты содержит SYBR Green или бромистый этидий.
14. Способ по любому предыдущему пункту, причем среда для выращивания содержит бульон Terrific.
15. Способ по любому предыдущему пункту, причем стадия с) проходит при температуре в диапазоне приблизительно от 35°С до 40°С.
16. Способ по п. 15, причем стадия с) проходит при температуре приблизительно 37°С.
17. Способ по любому предыдущему пункту, причем часть первой и второй смеси или часть одной или нескольких дополнительных смесей в случае, когда пункт является зависимым от п. 2, оценивают в несколько моментов времени.
18. Способ по п. 16, причем несколько моментов времени включают один или несколько из следующих моментов времени: 0 минут, 5 минут, 10 минут, 15 минут и/или менее чем 20 минут.
19. Способ по любому из пп. 1-15, причем стадия с) занимает период в диапазоне от приблизительно 15 минут до менее чем приблизительно 20 минут.
20. Способ по любому предыдущему пункту, причем стадию d) проводят до и после стадии с).
21. Способ по любому предыдущему пункту, причем микроорганизм получают из биологического образца, полученного от индивида, который, как полагают, страдает от инфекции микроорганизмом.
22. Способ по п. 21, причем биологический образец представляет собой мочу.
23. Способ по п. 21, причем инфекция микроорганизмом представляет собой инфекцию мочевыводящих путей (UTI).
24. Способ по любому предыдущему пункту для определения противомикробного средства для применения в лечении инфекции микроорганизмом у индивида, причем способ предусматривает забор биологического образца у индивида, оценку чувствительности микроорганизма в биологическом образце к двум или более противомикробным средствам и идентификацию того, какое противомикробное средство вводить индивиду, исходя из того какое противомикробное средство ингибирует или замедляет пролиферацию микроорганизма.
25. Набор для быстрого определения чувствительности микроорганизма к противомикробному средству, содержащий:
a) обогащенную среду для выращивания;
b) одно или несколько противомикробных средств и
c) карбоцианиновый краситель.
26. Набор по п. 25, причем набор дополнительно содержит:
d) проточный цитометр.
27. Набор по п. 25 или 26, причем обогащенная среда для выращивания содержит бульон Terrific.
28. Набор по п. 26, причем проточный цитометр содержит по меньшей мере один красный лазер.
29. Набор по любому из п. 25 или 28, причем набор предназначен для применения в способе по любому из пп. 1-24.