ТЕРАПЕВТИЧЕСКИЕ, ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ И ПРОГНОСТИЧЕСКИЕ СПОСОБЫ ДЛЯ РАКА МОЧЕВОГО ПУЗЫРЯ

1. Способ лечения пациента, который страдает раком мочевого пузыря; данный способ включает введение пациенту терапевтически эффективного количества противораковой терапии, при том что уровень экспрессии по меньшей мере одного из следующих генов: FGFR3, ТР53 и EGFR, в образце, полученном от пациента, был определен как повышенный относительно контрольного уровня по меньшей мере одного вышеупомянутого гена.
2. Способ диагностики рака мочевого пузыря у пациента; данный способ включает следующие этапы:
а) определение уровня экспрессии по меньшей мере одного из следующих генов: FGFR3, ТР53 и EGFR, в образце, полученном от пациента; и
б) сравнение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена с контрольным уровнем по меньшей мере одного вышеупомянутого гена, причем увеличение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце пациента относительно контрольного уровня указывает на то, что пациент страдает раком мочевого пузыря.
3. Способ по п. 2, который дополнительно включает (в) информирование пациента о том, что у него рак мочевого пузыря.
4. Способ по п. 2 или 3, который дополнительно включает (г) выбор противораковой терапии для лечения указанного пациента, когда обнаружено увеличение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце пациента относительно контрольного уровня.
5. Способ по любому из пп. 2-4, который дополнительно включает (д) введение пациенту терапевтически эффективного количества противораковой терапии.
6. Способ прогноза пациента, который страдает раком мочевого пузыря; данный способ включает:
а) определение уровня экспрессии по меньшей мере одного из следующих генов: FGFR3, ТР53 и EGFR, в образце, полученном от пациента;
б) сравнение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена с контрольным уровнем по меньшей мере одного вышеупомянутого гена; и
в) определение прогноза пациента, причем отмечается неблагоприятный прогноз, если уровень экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце пациента повышен относительно контрольного уровня.
7. Способ по п. 6, где прогноз представляет собой прогноз выживаемости.
8. Способ по п. 6 или 7, где способ проводят до введения пациенту противораковой терапии.
9. Способ по любому из пп. 6-8, который дополнительно включает (г) определение пациента, на которого применение противораковой терапии, вероятно, окажет положительный эффект, когда у пациента определен неблагоприятный прогноз выживаемости.
10. Способ по любому из пп. 6-9, который дополнительно включает (д) введение пациенту терапевтически эффективного количества противораковой терапии, если у пациента определен неблагоприятный прогноз выживаемости.
11. Способ по любому из пп. 6-10, где выживаемость представляет собой выживаемость без признаков заболевания или общую выживаемость.
12. Способ определения для пациента, который страдает раком мочевого пузыря, вероятности ответа на лечение противораковой терапией; данный способ включает:
а) определение уровня экспрессии по меньшей мере одного из следующих генов: FGFR3, ТР53 и EGFR, в образце, полученном от пациента; и
б) сравнение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена с контрольным уровнем по меньшей мере одного вышеупомянутого гена, причем увеличение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце пациента относительно контрольного уровня указывает на пациента, который, вероятно, ответит на лечение, которое включает противораковую терапию.
13. Способ оптимизации терапевтической эффективности противораковой терапии для пациента, который срадает раком мочевого пузыря; данный способ включает:
а) определение уровня экспрессии по меньшей мере одного из следующих генов: FGFR3, ТР53 и EGFR, в образце, полученном от пациента; и
б) сравнение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена с контрольным уровнем по меньшей мере одного вышеупомянутого гена, причем увеличение уровня экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце пациента относительно контрольного уровня указывает на пациента, который, вероятно, ответит на лечение, которое включает противораковую терапию.
14. Способ по п. 12 или 13, который дополнительно включает (в) введение пациенту терапевтически эффективного количества противораковой терапии.
15. Способ по любому из пп. 1, 4, 5 или 8-14, где противораковая терапия включает антагонист FGFR3, антагонист ТР53 и/или антагонист EGFR.
16. Способ по п. 15, где противораковая терапия включает антагонист FGFR3 и антагонист EGFR.
17. Способ по п. 15 или 16, где антагонист FGFR3, антагонист EGFR или антагонист ТР53 представляет собой антитело или его функциональный фрагмент.
18. Способ по п. 17, где антагонист FGFR3 представляет собой антитело против FGFR3 или его функциональный фрагмент.
19. Способ по п. 17, где антагонист EGFR представляет собой антитело против EGFR или его функциональный фрагмент.
20. Способ по п. 17, где антагонист ТР53 представляет собой антитело против ТР53 или его функциональный фрагмент.
21. Способ по п. 15 или 16, где антагонист FGFR3, антагонист ТР53 или антагонист EGFR представляет собой низкомолекулярный антагонист.
22. Способ по п. 21, где антагонист FGFR3 или антагонист EGFR представляет собой ингибитор тирозинкиназы.
23. Способ по п. 22, где антагонист EGFR представляет собой эрлотиниб (TARCEVA™).
24. Способ по любому из пп. 15-23, где противораковая терапия дополнительно включает: (i) агент, выбранный из группы, которая состоит из антинеопластического агента, химиотерапевтического агента, агента, ингибирующего рост, и цитотоксического агента, (ii) лучевую терапию или (iii) их комбинацию.
25. Способ по любому из пп. 1-24, где уровень экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце, полученном от пациента, определяют путем измерения мРНК.
26. Способ по п. 25, где уровень экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце, полученном от пациента, определяют с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР).
27. Способ по п. 26, где ПЦР анализ представляет собой количественный ПЦР анализ.
28. Способ по любому из пп. 1-24, где уровень экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце, полученном от пациента, определяют путем измерения белка.
29. Способ по п. 28, где уровень экспрессии по меньшей мере одного вышеупомянутого гена в образце, полученном от пациента, определяют с помощью иммуногистохимического (ИГХ) метода.
30. Способ по любому из пп. 1-29, где образец, полученный от пациента, представляет собой образец опухоли.
31. Способ по п. 30, где образец опухоли представляет собой зафиксированный в формалине и залитый парафином (ЗФЗП) образец опухоли.
32. Способ по любому из пп. 1-31, который дополнительно включает определение уровня экспрессии по меньшей мере двух из этих генов.
33. Способ по п. 32, который дополнительно включает определение уровня экспрессии всех трех из этих генов.
34. Способ по любому из пп. 1-33, где уровень экспрессии FGFR3 был определен как повышенный по меньшей мере в 2 раза относительно контрольного уровня.
35. Способ по п. 34, где уровень экспрессии FGFR3 был определен как повышенный по меньшей мере в 4 раза относительно контрольного уровня.
36. Способ по любому из пп. 1-35, где уровень экспрессии EGFR был определен как повышенный по меньшей мере в 4 раза относительно контрольного уровня.
37. Способ по п. 36, где уровень экспрессии EGFR был определен как повышенный по меньшей мере в 8 раз относительно контрольного уровня.
38. Способ по любому из пп. 1-37, который дополнительно включает определение уровня экспрессии по меньшей мере одного дополнительного гена, выбранного из группы, которая состоит из DUSB3, FRS2, TSC1, ERBB3, CDKN1A, CCND1, ТР63, ММР2, ZEB2, PIK3CB, PIK3R1, MDM2, SNAI2, AXL, ZEB1, BCL2B, TSC2, RB1, FGFR32, PIK3IP1, MTOR, PIK3CA, PTEN, АКТ1, BCL2A, FRS3, ERBB2, FGFR31, FGF1, SNAI1, FGFR34, FGF9 и FGF2, в образце, полученном от пациента, при этом уровень экспрессии по меньшей мере одного дополнительного гена изменяется относительно контрольного уровня по меньшей мере одного дополнительного гена.
39. Способ по любому из пп. 1-38, где рак мочевого пузыря представляет собой немышечно-инвазивный рак мочевого пузыря, мышечно-инвазивный рак мочевого пузыря или метастатический рак мочевого пузыря.
40. Способ по п. 39, где немышечно-инвазивный рак мочевого пузыря представляет собой рецидивирующий немышечно-инвазивный рак мочевого пузыря.
41. Способ лечения пациента, который страдает раком мочевого пузыря; данный способ включает введение пациенту терапевтически эффективного количества противораковой терапии, отличной от вакцины бациллы Кальметта-Герена (БЦЖ), причем уровень экспрессии ТР53 в образце, полученном от пациента, был определен как повышенный относительно контрольного уровня ТР53.
42. Способ по п. 41, где противораковая терапия включает антагонист FGFR3, антагонист EGFR и/или антагонист ТР53.
43. Способ по п. 42, где противораковая терапия включает антагонист FGFR3 и антагонист EGFR.
44. Способ по п. 42 или 43, где антагонист FGFR3, антагонист EGFR или антагонист ТР53 представляет собой антитело или его функциональный фрагмент.
45. Способ по п. 44, где антагонист FGFR3 представляет собой антитело против FGFR3 или его функциональный фрагмент.
46. Способ по п. 44, где антагонист EGFR представляет собой антитело против EGFR или его функциональный фрагмент.
47. Способ по п. 44, где антагонист ТР53 представляет собой антитело против ТР53 или его функциональный фрагмент.
48. Способ по п. 42 или 43, где антагонист FGFR3, антагонист ТР53 или антагонист EGFR представляет собой низкомолекулярный антагонист.
49. Способ по п. 48, где низкомолекулярный антагонист представляет собой ингибитор тирозинкиназы.
50. Способ по п. 49, где антагонист EGFR представляет собой эрлотиниб (TARCEVA™).
51. Способ по любому из пп. 41-50, где противораковая терапия дополнительно включает: (i) агент, выбранный из группы, которая состоит из антинеопластического агента, химиотерапевтического агента, агента, ингибирующего рост, и цитотоксического агента, (ii) лучевую терапию или (iii) их комбинацию.
52. Способ по любому из пп. 41-51, где уровень экспрессии ТР53 в образце, полученном от пациента, определяют путем измерения мРНК.
53. Способ по любому из пп. 41-51, где уровень экспрессии ТР53 в образце, полученном от пациента, определяют путем измерения белка.