ЭНДОФИТНЫЕ КОМПОЗИЦИИ СО STREPTOMYCES И СПОСОБЫ УЛУЧШЕНИЯ АГРОНОМИЧЕСКИХ ПРИЗНАКОВ У РАСТЕНИЙ

1. Синтетическая композиция, которая содержит репродуктивную часть растения, обработанную препаративной формой, содержащей очищенную популяцию эндофитов рода Streptomyces, причём указанный эндофит рода Streptomyces является гетерологическим по отношению к репродуктивной части растения и содержит по меньшей мере одну композицию, выбранную из группы, которая состоит из:
a. по меньшей мере 600 нуклеотидов, идентичных по меньшей мере на 95% последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID № 2 – SEQ ID № 18;
b. депозитарный штамм, который выбран из группы, которая состоит из: _____ ID депозитарного штамма _____ или ID 081111-06 IDAC депозитария; или
c. вид рода Streptomyces, который выбран из группы, которая состоит из: S. albidoflavus, S. albus, S. aureofaciens, S. ginsengisoli, S. griseus, S. lydicus, S. mutabilis, S. neyagawaensis, S. praecox или SMCD2215,
отличающаяся тем, что эндофит присутствует в синтетической композиции в количестве, способном модулировать по меньшей мере одно из указанного: признак, имеющий агрономическую ценность, экспрессию гена, уровень транскрипта, экспрессию белка, уровень гормона, уровень метаболита или популяцию эндогенных микробов в растениях, выращенных из указанной репродуктивной части растения, по сравнению с изолинией растения, которое выращено из репродуктивной части растения, которая не была обработана указанным эндофитом рода Streptomyces.
2. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что указанное растение выбрано из группы, которая состоит из сои или кукурузы.
3. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что препаративная форма содержит очищенную популяцию эндофитов рода Streptomyces в концентрации по меньшей мере около 10^2 КОЕ/мл в жидкой препаративной форме или около 10^2 КОЕ/мг в нежидкой препаративной форме.
4. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что указанный эндофит рода Streptomyces способен к продукции ауксина, фиксации азота, продукции антимикробного соединения, солюбилизации минерального фосфата, продукции сидерофора, продукции целлюлазы, продукции хитиназы, продукции ксиланазы или продукции ацетоина.
5. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что указанный признак, имеющий агрономическую ценность, выбран из группы, которая состоит из: устойчивости к болезням, устойчивости к засухе, теплостойкости, холодостойкости, солеустойчивости, металлоустойчивости, устойчивости к гербицидам, устойчивости к химическому загрязнению, улучшенной эффективности использования воды, улучшенного использования азота, улучшенной фиксации азота, устойчивости к вредителям, устойчивости к поеданию растительноядными животными, устойчивости к патогенам, повышения урожайности, повышения урожайности в условиях недостатка воды, усиления фитосанитарии, улучшения мощности, улучшения роста, улучшения фотосинтетической способности, усиления усвоения питательных веществ, изменения содержания белков, изменения содержания масел, увеличения биомассы, увеличения длины побегов, увеличения длины корней, улучшения строения корней, увеличения массы семян, измененной углеводной композиции семян, измененной масляной композиции семян, увеличения длины корешка, увеличения количества стручков, замедленного старения, способности оставаться зелёным, измененная белковой композиции семян, увеличения сухого веса зрелых репродуктивных частей растения, увеличение сырого веса зрелых репродуктивных частей растения, увеличение числа зрелых растительных репродуктивных частей на растение, увеличения содержания хлорофилла, увеличения количества стручков на растение, увеличения длины стручков на растение, уменьшения числа увядших листьев на растение, уменьшения числа сильно увядших листьев на растение, увеличения числа не увядших листьев на растение или улучшенного внешнего вида растения.
6. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что указанный эндофит рода Streptomyces способен локализоваться в части растения, которое выращено из указанного семени, при этом указанная часть растения  выбрана из группы, которая состоит из: цельного растения, проростка, меристематической ткани, основной ткани, сосудистой ткани, покровной ткани, семени, листа, корня, побега, стебля, цветка, плода, столона, луковицы, клубня, клубнелуковицы, деток или почки.
7. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что указанная репродуктивная часть растения представляет собой семя.
8. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что указанная репродуктивная часть растения помещена в субстрат, который способствует росту растений.
9. Синтетическая композиция по п. 8, отличающаяся тем, что указанный субстрат, который способствует росту растений, представляет собой почву.
10. Синтетическая композиция по п. 9, отличающаяся тем, что множество указанных репродуктивных частей растения помещают в почву рядами, по существу с равным интервалом между каждым семенем в каждом ряду.
11. Синтетическая композиция по любому из пп. 1-10, отличающаяся тем, что указанная препаративная форма дополнительно содержит одно или более из следующего: стабилизатор, консервант, носитель, поверхностно-активное вещество, антикомплексный агент или любую их комбинацию.
12. Синтетическая композиция по любому из пп. 1-10, отличающаяся тем, что указанная препаративная форма дополнительно содержит одно или более из следующего: фунгицид, нематицид, бактерицид, инсектицид или гербицид.
13. Синтетическая композиция по любому из пп. 1-10, отличающаяся тем, что указанная препаративная форма дополнительно содержит по меньшей мере один дополнительный бактериальный эндофит.
14. Синтетическая композиция по любому из пп. 1-10, отличающаяся тем, что указанная репродуктивная часть растения представляет собой трансгенное семя.
15. Множество синтетических композиций по п. 1, отличающееся тем, что указанные композиции удерживаются в пределах объекта, выбранного из группы, которая состоит из: бутылки, банки, ампулы, упаковки, сосуда, мешка, коробки, лотка, конверта, картона, контейнера, бункера, грузового контейнера, платформы грузовика или футляра.
16. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что эндофит рода Streptomyces присутствует в репродуктивной части растения в количестве, способном обеспечить преимущество указанной репродуктивной части растения или растению, которое получено из указанной репродуктивной части растения.
17. Синтетическая композиция по п. 1, отличающаяся тем, что бактериальный эндофит присутствует по меньшей мере в двух компартментах семени, выбранных из группы, которая состоит из: эмбриона, семенной кожуры, эндосперма, семядоли, гипокотиля или корешка.
18. Множество синтетических комбинаций по п. 1, отличающееся тем, что синтетические комбинации являются пригодными для длительного хранения.
19. Растение, выращенное из синтетической комбинации по п. 1 в условиях ограниченного полива, отличающееся тем, что указанное растение включает по меньшей мере одну особенность, которая выбрана из группы, которая состоит из:
эндофита, который содержит по меньшей мере 600 нуклеотидов идентичных по меньшей мере на 95% последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID № 2 – SEQ ID № 18;
эндофита, который включает депозитарный штамм, который выбран из группы, которая состоит из: _____ ID депозитарного штамма _____ или ID 081111-06 IDAC депозитария;
эндофита, который включает вид рода Streptomyces который выбран из группы, которая состоит из: S. albidoflavus, S. albus, S. aureofaciens, S. ginsengisoli, S. griseus, S. lydicus, S. mutabilis, S. neyagawaensis, S. praecox или SMCD2215;
по меньшей мере одного гена с повышенной экспрессией в ткани корней, который выбран из генов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
по меньшей мере одного гена с повышенной о экспрессией в ткани листьев, который выбран из генов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
по меньшей мере одного гена с повышенной о экспрессией в ткани стеблей, который выбран из генов с повышенной х экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
по меньшей мере одного гена со сниженной экспрессией в ткани корней, который выбран из генов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
по меньшей мере одного гена со сниженной экспрессией в ткани листьев, который выбран из генов с со сниженной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
по меньшей мере одного гена со сниженной экспрессией в ткани стеблей, который выбран из генов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
повышения экспрессии по меньшей мере одного гена-транспортёра сахаров, который выбран из таблицы 9;
по меньшей мере одного транскрипта с повышенной экспрессией в ткани корней, который выбран из транскриптов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
по меньшей мере одного транскрипта с повышенной экспрессией в ткани листьев, который выбран из транскриптов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
по меньшей мере одного транскрипта с повышенной экспрессией в ткани стеблей, который выбран из транскриптов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
по меньшей мере одного транскрипта со сниженной экспрессией в ткани корней, который выбран из транскриптов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
по меньшей мере одного транскрипта со сниженной экспрессией в ткани листьев, который выбран из транскриптов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
по меньшей мере одного транскрипта со сниженной экспрессией в ткани стеблей, который выбран из транскриптов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
по меньшей мере одного транскрипта транспортёров сахаров с повышенной экспрессией в ткани листьев или в ткани корней;
снижения уровня гормона в ткани корней, выбранного из группы, которая состоит из: абсцизовой кислоты, салициловой кислоты, коричной кислоты, жасминовой кислоты, жасминовой кислоты-изолейцина, травматиновой кислоты, 12-оксо-фитодиеновой кислоты или 10-оксо-11-фитоеновой кислоты;
повышения уровня гормона в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из: 12-оксо-фитодиеновой кислоты или 10-оксо-11-фитоеновой кислоты;
снижения уровня гормона в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из: абсцизовой кислоты, салициловой кислоты, коричной кислоты, жасминовой кислоты, жасминовой кислоты-изолейцина или травматиновой кислоты;
повышения уровня гормона в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из: салициловой кислоты, коричной кислоты, 12-оксо-фитодиеновой кислоты или 10-оксо-11-фитоеновой кислоты;
снижения уровня гормона в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из: абсцизовой кислоты, жасминовой кислоты, жасминовой кислоты-изолейцина или травматиновой кислоты;
повышения уровня метаболита в ткани корней, выбранного из группы, которая состоит из: пипеколиновой кислоты, гексадекановой кислоты или октадекановой кислоты;
снижения уровня метаболита в ткани корней, выбранного из группы, которая состоит из: триптофана, тирозина, бензойной кислоты, никотиновой кислоты, тирозина, хинной кислоты, синаповой кислоты, феруловой кислоты, кофейной кислоты, хинной кислоты, даидзеина, додеканола, аланина, аллантоина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, глутаминовой кислоты, глутамина, гистидина, лейцина, метионина, пролина, треонина, триптофана, тирозина, валина, D-глюкопиранозы, салициловой кислоты, пирогаллола, бета-токоферола или галактуроновой кислоты;
повышения уровня метаболита в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из: триптофана, феруловой кислоты, аллантоина, глутамина, гистидина, лейцина, триптофана, валина, D-глюкопиранозы, салициловой кислоты, гексадекановой кислоты, октадекановой кислоты, гесперетина, этаноламина, глицерина или ванильной кислоты;
снижения уровня метаболита в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из сфингозина;
повышения уровня метаболита в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из люмихрома;
снижения уровня метаболита в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из: сфингозина, триптофана, феруловой кислоты, аллантоина, глутамина, гистидина, лейцина, триптофана, валина, салициловой кислоты, октадекановой кислоты, гесперетина, этаноламина, ванильной кислоты, тирозина, бензойной кислоты, никотиновой кислоты, тирозина, хинной кислоты, синаповой кислоты, кофейной кислоты, хинной кислоты, даидзеина, додеканола, аланина, глутаминовой кислоты, метионина, пролина, треонина, тирозина, фенилаланина, триптамина, фенилаланина, шикимовой кислоты, шикимовой кислоты, этаноламина фосфата, октадекановой кислоты, кампестерола, β-аланина, изолейцина, фенилаланина, серина, галактозы, ликсозы, треозы, трегалозы или галловой кислоты;
снижения численности организмов родов Escherichia-Shigella в микробиомном сообществе листьев растения;
повышения численности организмов рода Rhizophagus в микробиомном сообществе корней растения;
повышения численности организмов рода Glomus в микробиомном сообществе корней растения;
снижения численности организмов семейства Enterobacteriaceae в микробиомном сообществе листьев растения;
повышения численности организмов семейства Nectriaceae в микробиомном сообществе корней растения;
повышения численности организмов семейства Glomeraceae в микробиомном сообществе корней растения;
в совокупности не более 18% микроорганизмов из родов Escherichia-Shigella в совокупном микробиоме в микробиомном сообществе корней растения;
в совокупности по меньшей мере 5% микроорганизмов из рода Glomus в совокупном микробиоме в микробиомном сообществе корней растения;
в совокупности по меньшей мере 8% микроорганизмов из рода Rhizophagus в совокупном микробиоме в микробиомном сообществе корней растения;
в совокупности не более 18% микроорганизмов из семейства Enterobacteriaceae в совокупном микробиоме в микробиомном сообществе листьев  растения;
в совокупности по меньшей мере 25% микроорганизмов из семейства Nectriaceae в совокупном микробиоме в микробиомном сообществе корней растения;
в совокупности по меньшей мере 5% микроорганизмов из семейства Glomeraceae e в совокупном микробиоме в микробиомном сообществе корней растения;
наличия по меньшей мере одной ОТЕ (Операционная Таксономическая Единица), которая описана в таблице 13А или в таблице 13B;
увеличения количества по меньшей мере одной ОТЕ, которая описана в таблице 13C; или
обогащения по меньшей мере одним геном, который описан в таблице 15А, 15B, 15C или 15D.
20. Растение, выращенное из синтетической комбинации по п. 1, демонстрирующее признак, имеющий агрономическую пользу, выбранный из группы, которая состоит из: устойчивости к болезням, устойчивости к засухе, теплостойкости, холодостойкости, солеустойчивости, металлоустойчивости, устойчивости к гербицидам, устойчивости к химическому загрязнению, улучшенной эффективности использования воды, улучшенного использования азота, улучшенной фиксации азота, устойчивости к вредителям, устойчивости к поеданию растительноядными животными, устойчивости к патогенам, повышения урожайности, повышения урожайности в условиях недостатка воды, усиления фитосанитарии, улучшения мощности, улучшения роста, улучшения фотосинтетической способности, усиления усвоения питательных веществ, изменения содержания белков, изменения содержания масел, увеличения биомассы, увеличения длины побегов, увеличения длины корней, улучшения строения корней, увеличения массы семян, измененной углеводной композиции семян, измененной масляной композиции семян, увеличения длины корешка, увеличения количества стручков, замедленного старения, способности оставаться зелёным, измененная белковой композиции семян, увеличения сухого веса зрелых репродуктивных частей растения, увеличение сырого веса зрелых репродуктивных частей растения, увеличение числа зрелых растительных репродуктивных частей на растение, увеличения содержания хлорофилла, увеличения количества стручков на растение, увеличения длины стручков на растение, уменьшения числа увядших листьев на растение, уменьшения числа сильно увядших листьев на растение, увеличения числа не увядших листьев на растение или улучшенного внешнего вида растения.
21. Растение по п. 20, отличающееся тем, что указанное растение выбрано из группы, которая состоит из сои или кукурузы.
22. Растение или потомство растения по п. 20, отличающееся тем, что указанное растение или потомство растения содержит по меньшей мере в одной из своих частей растения указанный эндофит рода Streptomyces.
23. Способ приготовления композиции для репродуктивной части растения, который включает обработку репродуктивной части растения препаративной формой, которая содержит очищенную микробную популяцию, которая включает эндофит рода Streptomyces, который является гетерологическим по отношению к репродуктивной части растения, и содержит по меньшей мере одну композицию, выбранную из группы, которая состоит из:
по меньшей мере 600 нуклеотидов идентичных по меньшей мере на 95% к последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID № 2 – SEQ ID № 18;
депозитарный штамм, который выбран из группы, которая состоит из: _____ ID депозитарного штамма _____ или ID 081111-06 IDAC депозитария; или
вид рода Streptomyces, который выбран из группы, которая состоит из: S. albidoflavus, S. albus, S. aureofaciens, S. ginsengisoli, S. griseus, S. lydicus, S. mutabilis, S. neyagawaensis, S. praecox или SMCD2215;
отличающийся тем, что эндофит присутствует в препаративной форме в количестве, способном модулировать по меньшей мере одно из указанного: признак, имеющий агрономическую ценность, транскрипцию гена, уровень транскрипта, экспресию белка, уровень гормона, уровень метаболита и популяцию эндогенных микробов в растениях, которые выращены из указанных репродуктивных частей растения, по сравнению с изолиниями растений, которые выращены из репродуктивных частей растения, которые не были обработаны препаративной формой.
24. Способ модулирования признака, имеющего агрономическую ценность, в растении, которое получено из репродуктивной части растения, который включает обработку репродуктивной части растения препаративной формой, которая содержит эндофит рода Streptomyces, который включает по меньшей мере один признак, выбранный из группы, которая состоит из:
по меньшей мере в 2 раза более высокую продукцию ацетоина по сравнению с штаммом, который представлен в SEQ ID № 1;
по меньшей мере в 1,5 раза более высокую продукцию сидефора по сравнению с штаммом, который представлен в SEQ ID № 1;
большей способности к использованию источника первичного углерода, который выбран из группы, которая состоит из: D-галактозы, глицерина, альфа-D-глюкозы, сахарозы, бета-метил-D-глюкозида, D-целлобиозы, L-аланина, L-аланил-глицина, монометилсукцината, глицил-L-пролина, L-ликсозы по сравнению с штаммом, который представлен в SEQ ID № 1;
секретирует по меньшей мере один белок, указанный в таблице 5C, со скоростью по меньшей мере в 0,4 раза большей по сравнению с штаммом, который представлен в SEQ ID № 2;
секретирует по меньшей мере один выбранный белок, указанный в таблице 5D, со скоростью по меньшей мере в 0,7 раза меньшей по сравнению с штаммом, который представлен в SEQ ID № 2;
содержит в своём геноме по меньшей мере 3 гена-транспортёра арабинозы;
секретирует по меньшей мере один белок, который выбран из таблицы 5А; или
не секретирует белок, который выбран из белков, перечисленных в таблице 5B.
25. Способ модулирования биологической характеристики в растении, полученном из репродуктивной части растения в условиях ограниченного полива, который включает связывание указанной репродуктивной части растения с препаративной формой, которая содержит эндофит рода Streptomyces, который является гетерологическим по отношению к репродуктивной части растения, по сравнению с изолинией растения, выращенного из репродуктивной части, которая не была обработана указанным эндофитом рода Streptomyces; причём указанный эндофит рода Streptomyces включает признак, выбранный из группы, которая состоит из:
по меньшей мере 600 нуклеотидов идентичных по меньшей мере на 95% последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID № 2 – SEQ ID № 18;
депозитарный штамм, который выбран из группы, которая состоит из: _____ID депозитарного штамма _____ или ID 081111-06 IDAC депозитария; или
вид рода Streptomyces, который выбран из группы, которая состоит из: S. albidoflavus, S. albus, S. aureofaciens, S. ginsengisoli, S. griseus, S. lydicus, S. mutabilis, S. neyagawaensis, S. praecox или SMCD2215;
и при этом указанная биологическая характеристика в растении выбрана из группы, которая состоит из:
повышения экспрессии по меньшей мере одного гена в ткани корней, который выбран из генов с повышеннойэкспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C,  8D и 8E;
повышения экспрессии по меньшей мере одного гена в ткани листьев, который выбран из генов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
повышения экспрессии по меньшей мере одного гена в ткани стеблей, который выбран из генов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
снижения экспрессии по меньшей мере одного гена в ткани корней, который выбран из генов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
снижения экспрессии по меньшей мере одного гена в ткани листьев, который выбран из генов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
снижения экспрессии по меньшей мере одного гена в ткани стеблей, который выбран из генов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблицах 8А, 8B, 8C, 8D и 8E;
экспрессии по меньшей мере одного гена-транспортёра сахаров, который выбран из таблицы 9;
повышения уровня по меньшей мере одного транскрипта в ткани корней, который выбран из транскриптов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
повышения уровня по меньшей мере одного транскрипта в ткани листьев, который выбран из транскриптов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
повышения уровня по меньшей мере одного транскрипта в ткани стеблей, который выбран из транскриптов с повышенной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
снижения уровня по меньшей мере одного транскрипта в ткани корней, который выбран из транскриптов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
снижения уровня по меньшей мере одного транскрипта в ткани листьев, который выбран из транскриптов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
снижения уровня по меньшей мере одного транскрипта в ткани стеблей, который выбран из транскриптов со сниженной экспрессией, перечисленных в таблице 8F;
повышения уровня транскрипта транспортёра сахаров в ткани листьев или в ткани корней;
снижения уровня гормона в ткани корней, выбранного из группы, которая состоит из: абсцизовой кислоты, салициловой кислоты, коричной кислоты, жасминовой кислоты, жасминовой кислоты-изолейцина, травматиновой кислоты, 12-оксо-фитодиеновой кислоты, 10-оксо-11-фитоеновой кислоты;
повышения уровня гормона в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из: 12-оксо-фитодиеновой кислоты, 10-оксо-11-фитоеновой кислоты;
снижения уровня гормона в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из: абсцизовой кислоты, салициловой кислоты, коричной кислоты, жасминовой кислоты, жасминовой кислоты-изолейцина, травматиновой кислоты;
повышения уровня гормона в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из: салициловой кислоты, коричной кислоты, 12-оксо-фитодиеновой кислоты, 10-оксо-11-фитоеновой кислоты;
снижения уровня гормона в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из: абсцизовой кислоты, жасминовой кислоты, жасминовой кислоты-изолейцина, травматиновой кислоты;
повышения уровня метаболита в ткани корней, выбранного из группы, которая состоит из: пипеколиновой кислоты, гексадекановой кислоты, октадекановой кислоты;
снижения уровня метаболита в ткани корней, выбранного из группы, которая состоит из: триптофана, тирозина, бензойной кислоты, никотиновой кислоты, тирозина, хинной кислоты, синаповой кислоты, феруловой кислоты, кофейной кислоты, хинной кислоты, даидзеина, додеканола, аланина, аллантоина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, глутаминовой кислоты, глутамина, гистидина, лейцина, метионина, пролина, треонина, триптофана, тирозина, валина, D-глюкопиранозы, салициловой кислоты, пирогаллола, бета-токоферола, галактуроновой кислоты;
повышения уровня метаболита в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из: триптофана, феруловой кислоты, аллантоина, глутамина, гистидина, лейцина, триптофана, валина, D-глюкопиранозы, салициловой кислоты, гексадекановой кислоты, октадекановой кислоты, гесперетина, этаноламина, глицерина, ванильной кислоты;
снижения уровня метаболита в ткани стеблей, выбранного из группы, которая состоит из сфингозина;
повышения уровня метаболита в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из люмихрома;
снижения уровня метаболита в ткани листьев, выбранного из группы, которая состоит из: сфингозина, триптофана, феруловой кислоты, аллантоина, глутамина, гистидина, лейцина, триптофана, валина, салициловой кислоты, октадекановой кислоты, гесперетина, этаноламина, ванильной кислоты, тирозина, бензойной кислоты, никотиновой кислоты, тирозина, хинной кислоты, синаповой кислоты, кофейной кислоты, хинной кислоты, даидзеина, додеканола, аланина, глутаминовой кислоты, метионина, пролина, треонина, тирозина, фенилаланина, триптамина, фенилаланина, шикимовой кислоты, шикимовой кислоты, этаноламина фосфата, октадекановой кислоты, кампестерола, β-аланина, изолейцина, фенилаланина, серина, галактозы, ликсозы, треозы, трегалозы, галловой кислоты;
снижения численности организмов родов Escherichia-Shigella в микробиомном сообществе листьев растения;
повышения численности организмов рода Rhizophagus в микробиомном сообществе корней растения;
повышения численности организмов рода Glomus в микробиомном сообществе корней растения;
снижения численности организмов семейства Enterobacteriaceae в микробиомном сообществе листьев растения;
повышения численности организмов семейства Nectriaceae в микробиомном сообществе корней растения;
повышения численности организмов семейства Glomeraceae в микробиомном сообществе корней растения;
наличия по меньшей мере одной ОТЕ, которая описана в таблице 13А или в таблице 13B;
увеличения количества по меньшей мере одной ОТЕ, которая выбрана из таблицы 13C; или
обогащения по меньшей мере одним геном, который описан в таблице 15А, 15B, 15C или 15D.
26. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанное растение выбрано из группы, которая состоит из сои или кукурузы.
27. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что препаративная форма содержит очищенную популяцию эндофитов рода Streptomyces в концентрации по меньшей мере около 10^2 КОЕ/мл в жидкой препаративной форме или около 10^2 КОЕ/мг в нежидкой препаративной форме.
28. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанный эндофит рода Streptomyces способен к продукции ауксина, фиксации азота, продукции антимикробного соединения, солюбилизации минерального фосфата, продукции сидерофора, продукции целлюлазы, продукции хитиназы, продукции ксиланазы или продукции ацетоина.
29. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанный признак, имеющий агрономическую ценность, выбран из группы, которая состоит из: устойчивости к болезням, устойчивости к засухе, теплостойкости, холодостойкости, солеустойчивости, металлоустойчивости, устойчивости к гербицидам, устойчивости к химическому загрязнению, улучшенной эффективности использования воды, улучшенного использования азота, улучшенной фиксации азота, устойчивости к вредителям, устойчивости к поеданию растительноядными животными, устойчивости к патогенам, повышения урожайности, повышения урожайности в условиях недостатка воды, усиления фитосанитарии, улучшения мощности, улучшения роста, улучшения фотосинтетической способности, усиления усвоения питательных веществ, изменения содержания белков, изменения содержания масел, увеличения биомассы, увеличения длины побегов, увеличения длины корней, улучшения строения корней, увеличения массы семян, измененной углеводной композиции семян, измененной масляной композиции семян, увеличения длины корешка, увеличения количества стручков, замедленного старения, способности оставаться зелёным, измененная белковой композиции семян, увеличения сухого веса зрелых репродуктивных частей растения, увеличение сырого веса зрелых репродуктивных частей растения, увеличение числа зрелых растительных репродуктивных частей на растение, увеличения содержания хлорофилла, увеличения количества стручков на растение, увеличения длины стручков на растение, уменьшения числа увядших листьев на растение, уменьшения числа сильно увядших листьев на растение, увеличения числа не увядших листьев на растение или улучшенного внешнего вида растения.
30. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанный эндофит рода Streptomyces способен локализоваться в растительной части указанного растения, при этом указанная часть растения выбрана из группы, которая состоит из: цельного растения, проростка, меристематической ткани, основной ткани, сосудистой ткани, покровной ткани, семени, листа, корня, побега, стебля, цветка, плода, столона, луковицы, клубня, клубнелуковицы, деток или почки.
31. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанная репродуктивная часть растения представляет собой семя.
32. Способ по п. 31, отличающийся тем, что указанное семя представляет собой трансгенное семя.
33. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанная репродуктивная часть растения помещена в субстрат, который способствует росту растений.
34. Способ по п. 33, отличающийся тем, что указанный субстрат, который способствует росту растений, представляет собой почву.
35. Способ по п.34, отличающийся тем, что множество указанных репродуктивных частей растения помещают в почву рядами, по существу с равным интервалом между ними в каждом ряду.
36. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанная препаративная форма дополнительно содержит одно или более из следующего: стабилизатор, консервант, носитель, поверхностно-активное вещество, антикомплексный агент или любую их комбинацию.
37. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанная препаративная форма дополнительно содержит одно или более из следующего: фунгицид, нематицид, бактерицид, инсектицид или гербицид.
38. Способ по любому из пп. 23-25, отличающийся тем, что указанная препаративная форма дополнительно содержит по меньшей мере один дополнительный бактериальный эндофит.
39. Способ по п. 23, отличающийся тем, что указанная репродуктивная часть растения представляет собой семя, и отличающийся тем, что эндофит рода Streptomyces присутствует по меньшей мере в двух компартментах семени, выбранных из группы, которая состоит из: эмбриона, семенной кожуры, эндосперма, семядоли, гипокотиля или корешка.
40. Способ по п. 23, отличающийся тем, что эндофит рода Streptomyces присутствует в репродуктивной части растения в количестве, способном обеспечить преимущество растению, которое получено из репродуктивной части растения, по сравнению с растением, которое получено из репродуктивной части растения, не обработанного указанным эндофитом рода Streptomyces.