КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДЛЯ БИОЛОГИЧЕСКОГО ПОЛУЧЕНИЯ ЛАКТАТА ИЗ С1-СОЕДИНЕНИЙ С ПРИМЕНЕНИЕМ ТРАНСФОРМАНТОВ ЛАКТАТ ДЕГИДРОГЕНАЗЫ

1
1. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм, содержащий экзогенную нуклеиновую кислоту, кодирующую лактатдегидрогеназу (ЛДГ), причем указанный микроорганизм представляет собой бактерию.
1
1
2. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм, содержащий экзогенную нуклеиновую кислоту, кодирующую лактатдегидрогеназу, причем указанный C-метаболизирующий микроорганизм представляет собой метанотрофный микроорганизм.
1
1
3. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм, содержащий экзогенную нуклеиновую кислоту, кодирующую лактатдегидрогеназу, причем указанный C-метаболизирующий микроорганизм способен преобразовывать углеродное сырье в лактат, при этом указанное углеродное сырье выбрано из группы, состоящей из метана, диоксида углерода, монооксида углерода, сингаза и природного газа.
1
1
4. Не встречающийся в природе C-метабол изирующий микроорганизм, содержащий экзогенную нуклеиновую кислоту, кодирующую лактатдегидрогеназу, причем указанный C-метаболизирующий микроорганизм не является дрожжевым.
1
1
1
1
5. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм, содержащий экзогенную нуклеиновую кислоту, кодирующую лактатдегидрогеназу, причем указанный не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм способен продуцировать большее количество лактата по сравнению с соответствующим эталонным C-метаболизирующим микроорганизмом при культивировании в присутствии C-субстрата по меньшей мере при одной совокупности условий культивирования.
1
6. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по п. 3, отличающийся тем, что углеродное сырье представляет собой метан.
1
7. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по п. 3, отличающийся тем, что углеродное сырье представляет собой природный газ.
1
1
8. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1, 3 и 5-7, отличающийся тем, что указанный C-метаболизирующий микроорганизм представляет собой метилотрофную бактерию.
1
9. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по п. 8, отличающийся тем, что указанная метилотрофная бактерия представляет собой метанотрофную бактерию.
1
10. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 2 и 9, отличающийся тем, что указанная метанотрофная бактерия выбрана из группы, состоящей из метанотрофа I типа, метанотрофа II типа и метанотрофа X типа.
1
1
11. Не встречающийся в природе С-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 2, 3, 5-7 и 9, отличающийся тем, что указанный не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм выбран из группы, состоящей из факультативного метанотрофа и облигатного метанотрофа.
1
1
12. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7 и 9, отличающийся тем, что указанный не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм выбран из группы, состоящей из Methylococcus, Methylomonas, Methylobacter, Methylosinus, Methylocystis, Methylomicrobium, Methanomonas, Methylocella, Methylacidiphilum, Methyloacida, Methylibium и Methylocapsa.
1
13. He встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1, 2, 4 и 9, отличающийся тем, что указанная метанотрофная бактерия выбран из группы, состоящей из Methylococcus capsulatus, шт. Bath, Methylomonas methanica 16a (ATCC РТА 2402), Methylosinus trichosporium OB3b (NRRL B-11196), Methylomicrobium buryatense 5G, Methylosinus sporium (NRRL B-11197), Methylocystis parvus (NRRL B-11198), Methylomonas methanica (NRRL B-11199), Methylomonas albus (NRRL B-11200), Methylobacter capsulatus (NRRL B-11201), Methylobacterium organophilum (ATCC 27886), Methylomonas sp AJ-3670 (FERM P-2400), Methylocella silvestris, Methylocella palustris (ATCC 700799), Methylocella tundrae, Methylocystis daltona, штамм SB2, Methylocystis bryophila, Methylocapsa aurea KYG, Methylacidiphilum infernorum, Methylacidiphilum fumariolicum, Methyloacida kamchatkensis, Methylibium petroleiphilum и Methylomicrobium alcaliphilum.
1
14. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7 и 9, отличающийся тем, что указанная метанотрофная бактерия выбрана из группы, состоящей из Methylococcus capsulatus, шт. Bath, Methylosinus trichosporium ОВ3b (NRRL B-11196) и Methylomicrobium buryatense 5G.
1
15. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7 и 9, отличающийся тем, что указанная экзогенная нуклеиновая кислота кодирует лактатдегидрогеназу, содержащую аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85% идентичную эталонной аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из последовательностей SEQ ID NO: 34, 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 52, 53, 54, 55, 56, 57 и 58.
1
16. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по п. 15, отличающийся тем, что указанная эталонная аминокислотная последовательность выбрана из группы, состоящей из последовательностей SEQ ID NO: 34, 16 и 24.
1
17. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7 и 9, отличающийся тем, что указанная экзогенная нуклеиновая кислота кодирует лактатдегидрогеназу, содержащую аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из последовательностей SEQ ID NO: 34, 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 52, 53, 54, 55, 56, 57 и 58.
1
18. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7 и 9, отличающийся тем, что указанная экзогенная нуклеиновая кислота содержит последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из последовательностей SEQ ID NO: 33, 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19 21, 23, 25, 27, 29, 31, 35, 37, 39, 41, 43, 45 и 47.
1
19. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7 и 9, отличающийся тем, что указанная молекула экзогенной нуклеиновой кислоты кодирует ЛДГ из микроорганизма, выбранного из группы, состоящей из Listeria marthii, Actinomyces viscosus, Acinonyx jubatus, Archilochus colubris, Bacillus anthracis, Bacillus caldolyticus, Bacillus coagulans, Bacillus megaterium, Bacillus stearothermophilus (Q9p4b6) (также известного как Geobacillus stearothermophilus), Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis, Bacteroides pectinophilus, Bifidobacterium longum, Bos taurus, Canis familiaris, Canis lupus, Deinococcus radiodurans, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Equus ferus, Felis catus, Kluyveromyces lactis, Kluyveromyces maxxianus, Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus bulgaricus, Lactobacillus casei, Lactobacillus coryniformis sp.torquens, Lactobacillus delbrueckii (в том числе подвида bulgaricus), Lactobacillus fermentum, Lactobacillus helveticus, Lactobacillus johnsonii, Lactobacillus pentosus, Lactobacillus plantarum, Lactobacillus rhamnosus, Lactococcus lactis, Listeria monocytogenes, Plasmodium falciparum, Plasmodium ovale, Thermus thermophilus, Mus musculus, Oryctolagus cuniculus, Pediococcus acidilactici, Taeniopygia guttata, Rattus norvegicus, Rhizopus oryzae, Staphylococcus aureus, Streptococcus bovis, Streptococcus pasteurianus, Ruminococcus torques, Staphylococcus simiae, Staphylococcus vitulinus, Staphylococcus lentus, Macrococcus caseolyticus, Bacillus thuringiensis, серовариант konkukian, шт. 97-27, Bacillus thuringiensis, серологический вариант chinensis CT-43 и Bacillus mycoides,
1
1
20. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7, 9 и 16, отличающийся тем, что указанная последовательность экзогенной нуклеиновой кислоты, кодирующая ЛДГ, кодон-оптимизирована для экспрессии в C-метаболизирующем микроорганизме.
1
21. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7, 9 и 16, отличающийся тем, что указанная молекула экзогенной нуклеиновой кислоты, кодирующая указанную лактатдегидрогеназу, функционально связана с индуцируемым промотором.
1
22. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7, 9 и 16, отличающийся тем, что указанный лактатдегидрогеназа представляет собой L-лактатдегидрогеназу.
1
23. Не встречающийся в природе C-метаболизирующий микроорганизм по любому из пп. 1-7, 9 и 16, отличающийся тем, что указанная лактатдегидрогеназа представляет собой D-лактатдегидрогеназу.
1
1
24. Способ получения лактата, включающий культивирование не встречающегося в природе C-метаболизирующего микроорганизма по любому из пп. 1-23 в присутствии углеродного сырья, содержащего C-субстрат, в условиях, достаточных для получения лактата.
1
25. Способ по п. 24, отличающийся тем, что указанный C-субстрат выбран из группы, состоящей из метана, монооксида углерода и диоксида углерода.
1
26. Способ по п. 24, отличающийся тем, что указанный C-субстрат представляет собой метан.
27. Способ по любому из пп. 24-26, отличающийся тем, что углеродное сырье представляет собой природный газ.
1
28. Способ по любому из пп. 24-26, отличающийся тем, что условия, достаточные для получения лактата, включают культивирование не встречающегося в природе С-метаболизирующего микроорганизма в ферментационной среде, которая содержит буфер.
1
29. Способ по любому из пп. 24-26, дополнительно включающий этап выделения лактата из не встречающегося в природе C-метаболизирующего микроорганизма.
30. Способ по любому из пп. 24-26, также включающий этап очистки лактата.
31. Способ по любому из пп. 24-26, отличающийся тем, что указанный лактат представляет собой L-лактат.
3
3
о
13
32. Лактатная композиция, отличающаяся тем, что указанный лактат представляет собой соединение, выбранное из группы, состоящей из молочной кислоты, соли молочной кислоты, ангидрида молочной кислоты, аниона молочной кислоты, олигомера молочной кислоты или сложного эфира молочной кислоты, содержащего одну или большее количество СНС(ОН)С(O)-групп, и тем, что δC указанной(ых) СНС(ОН)С(O)-групп(ы) составляет менее чем приблизительно -30%.
13
3
o
о
33. Лактатная композиция по п. 32, отличающаяся тем, что δC СНС(ОН)С(O)-групп(ы) варьирует от приблизительно -70% до приблизительно -30%.
13
3
о
о
34. Лактатная композиция по п. 33, отличающаяся тем, что δC СНС(ОН)С(O)-групп(ы) варьирует от приблизительно -60% до приблизительно -40%.
35. Лактатная композиция, полученная с применением способа по любому из пп. 24-30.