СПОСОБ ДЕТЕКЦИИ НУКЛЕОСОМ, СОДЕРЖАЩИХ НУКЛЕОТИДЫ

1. Применение основания ДНК, связанного с внеклеточной нуклеосомой, в качестве биомаркера в образце биологической жидкости в диагностике рака, причем основание ДНК выбрано из: урацила, инозина, ксантина, гипоксантина или модифицированного основания.
2. Применение по п.1, где внеклеточная нуклеосома представляет собой мононуклеосому или олигонуклеосому.
3. Применение по п.1, где основание ДНК, связанное с внеклеточной нуклеосомой, измеряют в образце крови.
4. Применение по п.1, где рак представляет собой рак мочевого пузыря, молочной железы, ободочной кишки, шейки матки, пищевода, почки, толстой кишки, легкого, полости рта, яичника, поджелудочной железы, предстательной железы, прямой кишки, кожи или желудка.
5. Применение по п.4, где рак представляет собой рак ободочной кишки, легкого, полости рта или поджелудочной железы.
6. Применение по п.1, где модифицированное основание выбрано из: 5-метилцитозина, 5-гидроксиметилцитозина или 7,8-дигидро-8-оксогуанина.
7. Способ детекции присутствия в образце биологической жидкости основания ДНК, связанного с внеклеточной нуклеосомой, в качестве биомаркера, включающий следующие стадии:
(i) контакт образца биологической жидкости с первым связующим веществом, которое связывается с нуклеосомами;
(ii) контакт нуклеосом или образца биологической жидкости со вторым связующим веществом, которое связывается с основанием ДНК;
(iii) детекцию или количественное определение связывания указанного второго связующего вещества с основанием ДНК в образце биологической жидкости; и
(iv) использование присутствия или степени такого связывания в качестве меры присутствия в образце биологической жидкости основания ДНК, связанного с нуклеосомами,
причем основание ДНК выбрано из: урацила, инозина, ксантина, гипоксантина или модифицированного основания.
8. Способ по п.7, где модифицированное основание выбрано из: 5-метилцитозина, 5-гидроксиметилцитозина или 7,8-дигидро-8-оксогуанина.
9. Способ по п.7, где связующее вещество представляет собой антитело.
10. Способ по п.7, где образец биологической жидкости представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
11. Способ детекции присутствия в образце биологической жидкости основания ДНК, связанного с внеклеточной нуклеосомой, в качестве биомаркера, включающий следующие стадии:
(i) контакт образца биологической жидкости с первым связующим веществом, которое связывается с основанием ДНК;
(ii) контакт нуклеосом или образца биологической жидкости со вторым связующим веществом, которое связывается с нуклеосомами;
(iii) детекцию или количественное определение связывания указанного второго связующего вещества с нуклеосомами в образце биологической жидкости; и
(iv) использование присутствия или степени такого связывания в качестве меры присутствия в образце биологической жидкости основания ДНК, связанного с нуклеосомами,
причем основание ДНК выбрано из: урацила, инозина, ксантина, гипоксантина или модифицированного основания.
12. Способ по п.11, где модифицированное основание выбрано из: 5-метилцитозина, 5-гидроксиметилцитозина или 7,8-дигидро-8-оксогуанина.
13. Способ по п.11, где связующее вещество представляет собой антитело.
14. Способ по п.11, где образец представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
15. Способ детекции состояния заболевания животного субъекта или человека, включающий следующие стадии:
(i) детекцию или измерение основания ДНК, связанного с внеклеточной нуклеосомой, в качестве биомаркера в биологической жидкости субъекта; и
(ii) использование уровня связанного с нуклеосомами основания ДНК, измеренного для определения состояния заболевания субъекта,
причем основание ДНК выбрано из: урацила, инозина, ксантина, гипоксантина или модифицированного основания, и
причем заболевание представляет собой рак.
16. Способ по п.15, где основание ДНК, связанное с внеклеточной нуклеосомой, определяют или измеряют как один из параметров измерений.
17. Способ оценки животного субъекта или человека в отношении пригодности для терапевтического лечения, включающий следующие стадии:
(i) детекцию или измерение основания ДНК, связанного с внеклеточной нуклеосомой, в качестве биомаркера в биологической жидкости субъекта; и
(ii) использование уровня связанного с нуклеосомами основания ДНК, определяемого в качестве параметра при выборе подходящего лечения для субъекта,
причем основание ДНК выбрано из: урацила, инозина, ксантина, гипоксантина или модифицированного основания, и
причем лечение проводят для лечения рака.
18. Способ по п.17, в котором основание ДНК, связанное с внеклеточной нуклеосомой, определяют или измеряют как один из параметров измерений.
19. Способ наблюдения лечения животного субъекта или человека, включающий следующие стадии:
(i) детекцию или измерение основания ДНК, связанного с внеклеточной нуклеосомой, в качестве биомаркера в биологической жидкости субъекта;
(ii) повторную детекцию или измерение основания ДНК, связанного с внеклеточной нуклеосомой, в биологической жидкости субъекта в один или несколько моментов времени; и
(iii) использование любых изменений уровня связанного с нуклеосомами основания ДНК, определяемого в качестве параметра любых изменений состояния субъекта,
причем основание ДНК выбрано из: урацила, инозина, ксантина, гипоксантина или модифицированного основания, и
причем лечение проводят для лечения рака.
20. Способ по п.19, где основание ДНК, связанное с внеклеточной нуклеосомой, определяют или измеряют как один из параметров измерений.