НУКЛЕИНОКИСЛОТНЫЕ И АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ АДЕНОВИРУСА ОБЕЗЬЯН, ВЕКТОРЫ, СОДЕРЖАЩИЕ УКАЗАННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ, И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ

1. Выделенный полинуклеотид, который кодирует аденовирусный фибриллярный белок или его функциональное производное и который выбирается из группы, состоящей из:
(a) полинуклеотида, кодирующего полипептид, который имеет аминокислотную последовательность согласно любой из SEQ ID NO: 14-19, 50 и 53;
(b) полинуклеотида, кодирующего функциональное производное полипептида согласно любой из SEQ ID NO: 14-19, 50 и 53, в котором указанное функциональное производное содержит делецию, инсерцию и/или замену одного или более аминокислотных остатков, и
(c) полинуклеотида, кодирующего функциональное производное, имеющее аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, на 85% идентична по всей своей длине любой аминокислотной последовательности из SEQ ID NO: 14-19, 50 и 53.
2. Выделенный полинуклеотид, который кодирует аденовирусный белок гексон или его функциональное производное и который выбирается из группы, состоящей из:
(a) полинуклеотида, кодирующего полипептид, который имеет аминокислотную последовательность согласно любой из SEQ ID NO: 20-25, 51 и 54;
(b) полинуклеотида, кодирующего функциональное производное полипептида согласно любой из SEQ ID NO: 20-25, 51 и 54, в котором указанное функциональное производное содержит делецию, инсерцию и/или замену одного или более аминокислотных остатков, и
(c) полинуклеотида, кодирующего функциональное производное, имеющее аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, на 95% идентична по всей своей длине любой аминокислотной последовательности из SEQ ID NO: 20-25, 51 и 54.
3. Выделенный полинуклеотид, который кодирует аденовирусный белок пентон или его функциональное производное и который выбирается из группы, состоящей из:
(a) полинуклеотида, кодирующего полипептид, который имеет аминокислотную последовательность согласно любой из SEQ ID NO: 26-31, 52 и 55;
(b) полинуклеотида, кодирующего функциональное производное полипептида согласно любой из SEQ ID NO: 26-31, 52 и 55, в котором указанное функциональное производное содержит делецию, инсерцию и/или замену одного или более аминокислотных остатков, и
(с) полинуклеотида, кодирующего функциональное производное, имеющее аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, на 85% идентична по всей своей длине любой аминокислотной последовательности из SEQ ID NO: 26-31, 52 и 55.
4. Полинуклеотид, включающий, по меньшей мере, один выделенный полинуклеотид по любому из пп.1, 2 и 3.
5. Выделенный полинуклеотид по любому из пп.1-4, содержащий, по меньшей мере, одно из следующего:
(a) аденовирусный 5′-конец, предпочтительно аденовирусный 5′ обращенный концевой повтор;
(b) аденовирусную область Е1а или ее фрагмент, выбранный из областей 13S, 12S и 9S;
(c) аденовирусную область E1b или ее фрагмент, выбранный из группы, состоящей из областей малого Т, большого Т и IX;
(d) аденовирусную область E2b или ее фрагмент, выбранный из группы, состоящей из областей малого рТР, полимеразы и IVa2;
(e) аденовирусную область L1 или ее фрагмент, причем указанный фрагмент кодирует аденовирусный белок, выбранный из группы, состоящей из белка 28,1 кДа, полимеразы, агнопротеина, белка 52/55 кДа и белка IIIa;
(f) аденовирусную область L2 или ее фрагмент, причем указанный фрагмент кодирует аденовирусный белок, выбранный из группы, состоящей из белка пентона по п.3 и белков VII, V и Mu;
(g) аденовирусную область L3 или ее фрагмент, причем указанный фрагмент кодирует аденовирусный белок, выбранный из группы, состоящей из белка VI, белка гексона по п.2 и эндопротеазы;
(h) аденовирусную область Е2а;
(i) аденовирусную область L4 или ее фрагмент, причем указанный фрагмент кодирует аденовирусный белок, выбранный из группы, состоящей из белка 100 кДа, гомолога 33 кДа и белка VIII;
(j) аденовирусную область ЕЗ или ее фрагмент, выбранный из группы, состоящей из Е3 ORF1, Е3 ORF2, Е3 ORF3, Е3 ORF4, Е3 ORF5, Е3 ORF6, Е3 ORF7, Е3 ORF8 и Е3 ORF9;
(k) аденовирусную область L5 или ее фрагмент, причем указанный фрагмент кодирует фибриллярный белок по п.1;
(l) аденовирусную область Е4 или ее фрагмент, выбранный из группы, состоящей из Е4 ORF7, Е4 ORF6, Е4 ORF5, Е4 ORF4, Е4 ORF3, Е4 ORF2 и Е4 ORF1,
и/или
(m) аденовирусный 3′-конец, предпочтительно аденовирусный 3′ обращенный концевой повтор.
6. Выделенный полинуклеотид по п.4, состоящий из или содержащий полинуклеотид, который, по меньшей мере, на 90% идентичен по всей своей длине последовательности, состоящей, в основном, из любой одной из SEQ ID NO: 13, 62, 63 или 65, либо последовательности, состоящей из любой одной из SEQ ID NO: 13, 62, 63 или 65, но в которой отсутствуют геномные области Е1А, Е1В, Е2А, Е2В, Е3 и/или Е4 последовательности SEQ ID NO: 13, 62, 63 или 65.
7. Выделенный аденовирусный капсидный полипептид, кодируемый выделенным полинуклеотидом по любому из пп.1-3, или его функциональное производное.
8. Вектор, содержащий выделенный полинуклеотид по любому из пп.1-6.
9. Вектор по п.8, который не содержит ген в геномной области, выбираемой из группы геномных областей, состоящей из Е1А, Е1В, Е2А, Е2В, Е3 и Е4, и/или содержит, по меньшей мере, один ген геномной области, выбираемой из группы, состоящей из Е1А, Е1В, Е2А, Е2В, Е3 и Е4, в котором указанный, по меньшей мере, один ген содержит делецию и/или мутацию, которая делает, по меньшей мере, этот один ген нефункциональным.
10. Рекомбинантный аденовирус, предпочтительно репликационно-некомпетентный аденовирус, содержащий выделенный полинуклеотид по любому из пп.1-6 и/или, по меньшей мере, один выделенный аденовирусный капсидный полипептид по п.7.
11. Рекомбинантный аденовирус по п.10, содержащий молекулу для доставки в целевую клетку.
12. Рекомбинантный аденовирус по п.10, в котором аденовирус показывает серопревалентность менее 5% в человеческих субъектах и предпочтительно вообще не показывает серопревалентности в человеческих субъектах.
13. Рекомбинантный аденовирус по п.10, в котором аденовирус способен инфицировать клетку млекопитающего.
14. Рекомбинантный аденовирус по п.11, в котором молекула для доставки в целевую клетку является полинуклеотидом, кодирующим антигенный белок или его фрагмент.
15. Рекомбинантный аденовирус по любому из пп.10-14, в котором аденовирус был депонирован и имеет депозитарный номер, выбираемый из группы, состоящей из 08110601 (ChAd83), 08110602 (ChAd73), 08110603 (ChAd55), 08110604 (ChAd147) и 08110605 (ChAd146).
16. Композиция, содержащая адъювант и, по меньшей мере, один компонент из следующих (i)-(iv):
(i) один или более выделенных аденовирусных капсидных полипептидов по п.7;
(ii) выделенный полинуклеотид по любому из пп.1-6;
(iii) вектор по любому из пп.8-9;
(iv) рекомбинантный аденовирус по любому из пп.10-15, и необязательно фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
17. Композиция по п.16, в которой адъювант является агонистом рецептора, выбираемого из группы, состоящей из рецепторов цитокина 1-го типа, рецепторов цитокина 2-го типа, TNF рецепторов, рецептора витамина D, действующего как фактор транскрипции, и Толл-подобных рецепторов 1 (TLR1), TLR-2, TLR 3, TLR4, TLR5, TLR-6, TLR7 и TLR9.
18. Композиция по п.17, в которой адъювант является агонистом Толл-подобного рецептора 4 или 9.
19. Клетка, содержащая, по меньшей мере, один компонент из следующих:
(i) один или более выделенных аденовирусных капсидных полипептидов по п.7;
(ii) выделенный полинуклеотид по любому из пп.1-6;
(iii) вектор по любому из пп.8-9;
(iv) рекомбинантный аденовирус по любому из пп.10-15.
20. Клетка по п.19, которая является клеткой-хозяином, экспрессирующей, по меньшей мере, один аденовирусный ген, выбираемый из группы, состоящей из E1a, E1b, Е2а, E2b, Е4, L1, L2, L3, L4 и L5.
21. Применение выделенных аденовирусных капсидных полипептидов по п.7; выделенного полинуклеотида по любому из пп.1-6; вектора по любому из пп.8-9; рекомбинантного аденовируса по любому из пп.10-15 и/или композиции по п.18 для терапии или профилактики заболевания.
22. Применение по п.21, в котором терапия или профилактика является вакцинацией.
23. Применение по п.21, в котором терапия является генной терапией.