НАБОР ДИФФЕРЕНЦИРУЮЩИХ И СПЕЦИФИЧЕСКИХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ ДНК ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ОСТРЫХ КИШЕЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ, СПОСОБ ИДЕНТИФИКАЦИИ ОКИ, МИКРОЧИП И ДИАГНОСТИЧЕСКАЯ СИСТЕМА ДЛЯ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ СПОСОБА

1. Набор специфических олигонуклеотидов для экспресс-анализа видовой идентификации возбудителей острых кишечных инфекций, последовательность которых определена в Перечне последовательностей (SEQ ID NO: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17).
2. Набор дифференцирующих олигонуклеотидов для экспресс-анализа видовой идентификации возбудителей острых кишечных инфекций, последовательность которых определена в Перечне последовательностей (SEQ ID NO: 3, 6, 9, 12, 15, 18, 19).
3. Набор рекомбинантных плазмид для экспресс-анализа видовой идентификации возбудителей острых кишечных инфекций, перечень которых приведен в табл.1.
4. Биочип для экспресс-анализа видовой идентификации возбудителей острых кишечных инфекций, представляющий собой подложку с набором иммобилизованных на ней олигонуклеотидов, охарактеризованных в п.2.
5. Способ видовой идентификации возбудителей острых кишечных инфекций в клиническом образце, полученном от больного ОКИ, предусматривающий следующие стадии:
(а) приготовление биологического микрочипа, охарактеризованного в п.4, заключающееся в модификации поверхности подложки и в последующей иммобилизации дифференцирующих олигонуклеотидов, охарактеризованных в п.2;
(б) осуществление выделения ДНК из клинического образца и использование рекомбинантной плазмиды, охарактеризованной в п.3 для контроля процесса выделения ДНК;
(в) проведение мультиплексных симметричных полимеразных цепных реакций (ПЦР) образцов выделенных ДНК с использованием набора, содержащего биотин меченные праймеры, охарактеризованные в п.1, а также дополнительное проведение симметричных ПЦР с набором рекомбинантных плазмид, охарактеризованных в п.3 для осуществления положительного и отрицательного контроля процесса ПЦР;
(г) обработка продуктов амплифицированных ДНК экзонуклеазой фага лямбда;
(д) гибридизация амплифицированного меченого продукта на биочипе с образованием совершенных и несовершенных дуплексов и обеспечение положительного и отрицательного контроля процесса гибридизации;
(е) проведение реакции формирования комплекса с флуоресцентно-меченным стрептавидином;
(ж) регистрация и интерпретация результатов гибридизации путем сравнения полученной картины с шаблонами;
6. Диагностическая система выявления и идентификации ДНК возбудителей острых кишечных инфекций, включающая:
а) по меньшей мере, один микрочип для проведения разовой диагностики, содержащий один или более дифференцирующих олигонуклеотидов, специфичных к идентифицируемым маркерам ОКИ и представленных в SEQ ID NO: 3, 6, 9, 12, 15, один или более дифференцирующих олигонуклеотидов в качестве положительного контроля, представленных в SEQ ID NO:18, и один или более дифференцирующих олигонуклеотидов в качестве отрицательного контроля, и представленных в SEQ ID NO:19,
б) реагенты, которые выбирают из реагентов для подготовки образца, реагентов для проведения ПЦР, реагентов для проведения гибридизации и их комбинации и фермента экзонуклеазы,
в) специфические олигонуклеотиды в качестве праймеров ПЦР для выявления маркеров ОКИ, с последовательностями, которые выбирают из группы SEQ ID NO: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13, 14, 16, 17.
7 Диагностическая система по п.6, отличающаяся тем, что дополнительно содержит чип-детектор «Флуоген-2».
8. Диагностическая система по п.6, отличающаяся тем, что дополнительно содержит наклейки с названием торговой марки и штрих-кодом, в котором указан номер серии и дата выпуска диагностической системы.