Набор STR-маркеров Y-хромосомы для определения этно-территориального происхождения индивида по образцу его ДНК

1. Синтетические олигонуклеотидные праймеры, представляющие собой нуклеотидные последовательности SNP ID NO: 1-70, комплементарные соответствующим участкам пятнадцати микросателлитных локусов Y-хромосомы, отличающиеся тем, что представляют собой пары праймеров, из которых один имеет флуоресцентную метку, а второй является немеченым, при этом, прямые праймеры для каждого из локусов несут на 5'-конце флуоресцентную метку: ТЕТ (4, 7, 2', 7'-тетрахлоро-6-карбоксифлуоресцеин) для DYS385, DYS390, DYS391, DYS426, DYS436 и DYS439; FAM (6-карбоксифлуоресцеин) для DYS392, DYS393, DYS437 и DYS438; и HEX (4, 7, 2', 4', 5',7'-гексахлоро-6-карбоксифлуоресцеин) для DYS394, DYS389I, DYS389II DYS388 и DYS434, также, синтетические олигонуклеотидные праймеры имеют следующий нуклеотидный состав:
DYS385 (SNP ID NO: 1) F: 5'-TET-AGCATGGGTGACAGAGCTA-3'
DYS385 (SNP ID NO: 2) R: 5 '-TGGGATGCTAGGTAAAGCTG
DYS389 (SNP ID NO: 3) F: 5'-HEX-CCAACTCTCATCTGTATTATCTATG
DYS389 (SNP ID NO: 4) R: 5'-TCTTATCTCCACCCACCAGA
DYS390 (SNP ID NO: 5) F: 5'-TET-TATATTTTACACATTTTTGGGCC
DYS390 (SNP ID NO: 6) R: 5 '-TGACAGTAAAATGAACACATTGC
DYS391 (SNP ID NO: 7) F: 5'-TET-CTATTCATTCAATCATACACCCA
DYS391 (SNP ID NO: 8) R: GATTCTTTGTGGTGGGTCTG
DYS392 (SNP ID NO: 9) F: 5'-FAM-TCATTAATCTAGCTTTTAAAAACAA
DYS392 (SNP ID NO: 10) R: 5'-AGACCCAGTTGATGCAATGT
DYS393 (SNP ID NO: 11) F: 5'-FAM-GTGGTCTTCTACTTGTGTCAATAC
DYS393 (SNP ID NO: 12) R: 5'-AACTCAAGTCCAAAAAATGAGG
DYS394 (SNP ID NO: 13) F: 5'-HEX-CTACTGAGTTTCTGTTATAGT
DYS394 (SNP ID NO: 14) R: 5'-ATGGCATGTAGTGAGGACA
DYS437 (SNP ID NO: 15) F: 5'-FAM-GACTATGGGCGTGAGTGCAT-3'
DYS437 (SNP ID NO: 16) R: 5'-GAGACCCTGTCATTCACAGATGA
DYS438 (SNP ID NO: 17) F: 5'-FAM-CCAAAATTAGTGGGGAATAGTTG-3'
DYS438 (SNP ID NO: 18) R: 5'-GATCACCCAGGGTCTGGAGTT-3'
DYS439 (SNP ID NO: 19) F: 5'-TET-TCGAGTTGTTATGGTTTTAGGTCT-3'
DYS439 (SNP ID NO: 20) R: 5'-GTGGCTTGGAATTCTTTTACCC-3'
DYS442 (SNP ID NO: 21) F: 5'-HEX-CCCCAAGTCCCCAAAGTGTGT-3'
DYS442 (SNP ID NO: 22) R: 5'-CACTCATTGATTGATGGGCGTTT-3'
DYS445 (SNP ID NO: 23) F: 5'-FAM-AGTTAAGAGCCCCACCTTCCTG-3'
DYS445 (SNP ID NO: 24) R: 5'-TTTTGGTGGCATAATCTCAGCTC-3'
DYS448 (SNP ID NO: 25) F: 5'-FAM-TGGGAGAGGCAAGGATCCAA-3'
DYS448 (SNP ID NO: 26) R: 5'-CCAGACCGGCCAGAAATATGAC-3'
DYS449 (SNP ID NO: 27) F: 5'-FAM-TTTTCCCTTAACTTGTGTGATTTTT-3'
DYS449 (SNP ID NO: 28) R: 5'-AGGTTGGACAACAAGAGTAAGACAG-3'
DYS456 (SNP ID NO: 29) F: 5'-FAM-GGACCTTGTGATAATGTA-3'
DYS456 (SNP ID NO: 30) R: 5'-GTTTTGGGCTGAGTTGATGGG-3'
DYS458 (SNP ID NO: 31) F: 5'-FAM-AGCAACAGGAATGAAACTCCAAT-3'
DYS458 (SNP ID NO: 32) R: 5'-GGAGGGTGGGCGTGGTGG-3'
DYS460 (SNP ID NO: 33) F: 5'-ROX-GAGGAATCTGACACCTCTGACA-3'
DYS460 (SNP ID NO: 34) R: 5'-GTCCATATCATCTATCCTCTGCCTA-3'
DYS481 (SNP ID NO: 35) F: 5'-JOE-AGGAATGTGGCTAACGCTGT-3'
DYS481 (SNP ID NO: 36) R: 5'-ACAGCTCACCAGAAGGTTGC-3'
DYS504 (SNP ID NO: 37) F: 5'-HEX-TCTACACCACTGTGCCAAGC-3'
DYS504 (SNP ID NO: 38) R: 5'-GGCAACAGAGCAACCCTCT-3'
DYS505 (SNP ID NO: 39) F: 5'-FAM-TCTGGCGAAGTAACCCAAAC-3'
DYS505 (SNP ID NO: 40) R: 5'-TCGAGTCAGTTCACCAGAAGG-3'
DYS518 (SNP ID NO: 41) F: 5'-JOE-GGCAACACAAGTGAAACTGC-3'
DYS518 (SNP ID NO: 42) R: 5'-TCAGCTCTTACCATGGGTGAT-3'
DYS525 (SNP ID NO: 43) F: 5'-HEX-ATTCACACCATTGCACTCCA-3'
DYS525 (SNP ID NO: 44) R: 5'-GAGGCGGAGCTTTTAGTGAG-3'
DYS531 (SNP ID NO: 45) F: 5'-FAM-GACCCACTGGCATTCAAATC-3'
DYS531 (SNP ID NO: 46) R: 5'-TGCTCCCTTTCTTTGTAGACG-3'
DYS533 (SNP ID NO: 47) F: 5'-JOE-CATCTAACATCTTTGTCATCTACC-3'
DYS533 (SNP ID NO: 48) R: 5'-TGATCAGTTCTTAACTCAACCAA-3'
DYS537 (SNP ID NO: 49) F: 5'-HEX-GGTCTCCAATTCCATCCAGA-3'
DYS537 (SNP ID NO: 50) R: 5'-TGGAACATGCCCATTAATCA-3'
DYS552 (SNP ID NO: 51) F: 5'-FAM-CCATAGTGCCGAGGTCAAGT-3'
DYS552 (SNP ID NO: 52) R: 5'-AACACCTGATGCC TGGTTG-3'
DYS570 (SNP ID NO: 53) F: 5'-ROX-GAACTGTCTACAATGGCTCACG-3'
DYS570 (SNP ID NO: 54) R: 5'-TCAGCATAGTCAAGAAACCAGACAAC-3'
DYS576 (SNP ID NO: 55) F: 5'-ROX-TGGGCTGAGGAGTTCAATC-3'
DYS576 (SNP ID NO: 56) R: 5'-GGCAGTCTCATTTCCTGGAGATG
DYS635 (SNP ID NO: 57) F: 5'-FAM-AGTGTCTCACTTCAAGCACCAAGCAC-3'
DYS635 (SNP ID NO: 58) R: 5'-ACATTTTTCCAACTGTGAATTTTGCTGC-3'
DYS643 (SNP ID NO: 59) F: 5'-FAM-AAGCCATGCCTGGTTAAACT-3'
DYS643 (SNP ID NO: 60) R: 5'-TGTAACCAAACACCACCCATT-3'
YCAII (SNP ID NO: 61) F: 5'-HEX-TGTCAAAATTTAACCCACAATCA-3'
YCAII (SNP ID NO: 62) R: 5'-GCAGTCTTTCACCATAAGGTTAGC-3'
GATA H4.1 (SNP ID NO: 63) F: 5'-HEX-ATGCTGAGGAGAATTTCCAA-3'
GATA H4.1 (SNP ID NO: 64) R: 5'-GCTATTCATCCATCTAATCTATCCATT-3'
Y-GATA-A10 (SNP ID NO: 65)
F: 5'-NED-CCTGCCATCTCTATTTATCTTGCATATA-3'
Y-GATA-A10 (SNP ID NO: 66) R: 5'-ATAAATGGAGATAGTGGGTGGATT-3'
GGAAT1B07 (SNP ID NO: 67) F: 5'-NED-CATTAACCATAGCATTTCTTTCC-3'
GGAAT1B07 (SNP ID NO: 68) R: 5'-GAAGTAGAGTGGAATGGACTGC-3'
DYF387S1 (SNP ID NO: 69) F: 5'-FAM-GCCTGGGTGACAGAGCTAGA-3'
DYF387S1 (SNP ID NO: 70) R: 5'-GCCACAGTGTGAGAAGTGTGA-3'.
2. Способ выявления генотипов для идентификации личности с помощью системы микросателлитных ДНК-маркеров Y-хромосомы, отличающийся тем, что используют праймеры по п. 1, при этом, проводят генотипирование 15 коротких тандемных повторов, локализованных на нерекомбинирующем участке Y-хромосомы (YSTR), на генетическом ДНК-анализаторе с помощью капиллярного гель-электрофореза, с применением метода ПЦР и фрагментного анализа флуоресцентно меченых ДНК-ампликонов, используют образцы ДНК мужчин, выделенную из любого биологического материала в соответствии со стандартными методами, обеспечивающими качественную очистку ДНК от белков и примесей и предотвращающими деградацию материала в ходе выделения, при проведении капиллярного электрофореза фрагменты, синтезированные в ходе ПЦР, имеющие флуоресцентную метку ТЕТ (4, 7, 2', 7'-тетрахлоро-6-карбоксифлуоресцеин) в диапазоне длин 360-420 п. о. соответствуют аллелям 9-23 тандемных повтора в локусе DYS385, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку ТЕТ в диапазоне длин 196-224 п.о. соответствуют аллелям 19-26 тандемных повторов в локусе DYS390, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку ТЕТ в диапазоне длин 277-289 п.о. соответствуют аллелям 9-12 тандемных повторов в локусе DYS391, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку ТЕТ в диапазоне длин 232-260 п.о. соответствуют аллелям 8-15 тандемных повторов в локусе DYS439, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM (6-карбоксифлуоресцеин) в диапазоне длин 243-259 п.о. соответствуют аллелям 10-15 тандемных повторов в локусе DYS392, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 116-128 п.о. соответствуют аллелям 12-15 тандемных повторов в локусе DYS393, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 174-190 п.о. соответствуют аллелям 6-10 тандемных повторов в локусе DYS437, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 311-326 п.о. соответствуют аллелям 9-12 тандемных повторов в локусе DYS438, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 311-326 п.о. соответствуют аллелям 9-12 тандемных повторов в локусе DYS438, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 251-263 п.о. соответствуют аллелям 9-12 тандемных повторов в локусе DYS445, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 307-343 п.о. соответствуют аллелям 18-24 тандемных повторов в локусе DYS448, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 264-313 п.о. соответствуют аллелям 25-37 тандемных повторов в локусе DYS449, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 141-157 п.о. соответствуют аллелям 17-17 тандемных повторов в локусе DYS456, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 106-156 п.о. соответствуют аллелям 12-24 тандемных повторов в локусе DYS458, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 165-181 п.о. соответствуют аллелям 11-15 тандемных повторов в локусе DYS505, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 102-127 п.о. соответствуют аллелям 8-14 тандемных повторов в локусе DYS531, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 236-256 п.о. соответствуют аллелям 7-12 тандемных повторов в локусе DYS552, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 238-274 п.о. соответствуют аллелям 17-26 тандемных повторов в локусе DYS635, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 123-158 п.о. соответствуют аллелям 7-14 тандемных повторов в локусе DYS643, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку FAM в диапазоне длин 240-272 п.о. соответствуют аллелям 27-35 тандемных повторов в локусе DYF387, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX (4, 7, 2', 4', 5', 7'-гексахлоро-6-карбоксифлуоресцеин) в диапазоне длин 190-206 п. о. соответствуют аллелям 13-17 тандемных повторов в локусе DYS394, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 242-262 п.о. соответствуют аллелям 7-12 тандемных повторов в локусе DYS389I, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 360-382 п.о. соответствуют локусу DYS389II, аллели локуса DYS389II определяют вычитанием из значения длины фрагмента диапазона 360-382 значения длины фрагмента DYS389I, диапазон 110-134 п.о. соответствует 14-20 тандемным повторам, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 298-322 п.о. соответствуют аллелям 10-16 тандемных повторов в локусе DYS442, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 265-296 п.о. соответствуют аллелям 12-20 тандемных повторов в локусе DYS504, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 305-321 п.о. соответствуют аллелям 9-13 тандемных повторов в локусе DYS525, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 155-179 п.о. соответствуют аллелям 7-13 тандемных повторов в локусе DYS537, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 147-165 п.о. соответствуют аллелям 17-26 тандемных повторов в локусе YCAII, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку HEX в диапазоне длин 134-152 п.о. соответствуют аллелям 9-14 тандемных повторов в локусе Y-GATA-H4.1, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку ROX (карбокси-Х-родамин) в диапазоне длин 102-122 п.о. соответствуют аллелям 8-13 тандемных повторов в локусе DYS460, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку ROX в диапазоне длин 242-282 п.о. соответствуют аллелям 13-23 тандемных повторов в локусе DYS570, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку ROX в диапазоне длин 168-204 п.о. соответствуют аллелям 13-22 тандемных повторов в локусе DYS576, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку JOE в диапазоне длин 117-157 п.о. соответствуют аллелям 189-32 тандемных повторов в локусе DYS481, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку JOE (6-карбокси-4',5'-дихлор-2',7'-диметоксифлуоресцеин) в диапазоне длин 252-296 п.о. соответствуют аллелям 25-36 тандемных повторов в локусе DYS518, фрагменты, имеющие флуоресцентную метку JOE в диапазоне длин 200-224 п.о. соответствуют аллелям 9-15 тандемных повторов в локусе DYS533.