СПОСОБЫ УВЕЛИЧЕНИЯ ВЫХОДА БИОМАССЫ

1. Способ идентификации аллеля, который ассоциирован с выходом биомассы собираемого урожая сельскохозяйственной культуры, включающий: получение образца растения сельскохозяйственной культуры; амплификацию ДНК, присутствующей в указанном образце, и обнаружение присутствия полинуклеотидной последовательности, идентичной, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 в амплифицированной ДНК.
2. Способ селекции сельскохозяйственной культуры посредством отбора аллеля, ассоциированного с выходом биомассы собираемого урожая, где указанный аллель представляет собой аллель полинуклеотидной последовательности, причем указанная полинуклеотидная последовательность идентична, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25, где указанный способ включает: обнаружение присутствия одного или более маркеров, которые генетически связаны с указанным полинуклеотидом, или обнаружение присутствия указанного полинуклеотида.
3. Способ по п.1 или 2, где растение сельскохозяйственной культуры представляет собой однодольное и двудольное кормовое растение сельскохозяйственной культуры, фуражное растение сельскохозяйственной культуры, декоративное растение сельскохозяйственной культуры, плодовое растение сельскохозяйственной культуры, растение продовольственной сельскохозяйственной культуры, водоросли, лесное дерево, растение сельскохозяйственной культуры для получения биоэнергии или растение сельскохозяйственной культуры для получения биотоплива, Acacia spp., Acer spp., Actinidia ssp., Agave spp., Agropyron spp., Agrostis spp., Allium spp., Alnus spp., Alopecurus spp., Amaranthus spp., Ananas spp., Apium spp., Arachis spp., Areca spp., Arundo spp., Arrhenatherum spp., Asparagus spp; Avena spp., Atriplex spp., Attalea spp., Beta spp., Betula spp., Brassica spp., Bromus spp., Bouteloua spp., Camelina spp., Camellia spp., Cannabis spp., Capsicum spp., Carica spp., Carex spp., Carthamus spp., Castanea spp., Carum spp., Cinnamomum spp., Citrus spp., Cocos spp., Coffea spp., Corchorus spp., Cotoneatser spp., Cucurbita spp., Cupressus spp., Cynodon spp., Daucus spp., Dactylis spp., Eucalyptus spp., Elaeis spp., Eleusine spp., Fagus spp., Festuca spp., Ficus spp., Fraxinus spp., Geranium spp., Ginkgo spp., Glycine spp., Gossypium spp., Helianthus spp., Hemerocallis spp., Heracleum spp., Hedysarum spp., Hibiscus spp., Hordeum spp., Indigo spp., Ipomoea spp., Lettuca spp., Jatropha spp., Lotus spp., Lactuca spp., Lathyrus spp., Lens spp., Linum spp., Lolium spp., Lupinus spp., Lezula spp., Lycopersicon spp., Malus spp., Manihot spp., Medicago spp., Melilotus spp., Mentha spp., Miscanthus spp., Musa spp., Nicotiana spp., Olea spp., Onobrychis spp., Ophiopogon spp., Oryza spp., Panicum spp., Papaver spp., Petunia spp., Phaseolus spp., Pennisetum spp., Phalaris spp., Phoenix spp., Phleum spp., Phyllostachys spp., Physalis spp., Panicum spp., Picea spp., Pinus spp., Pistacia spp., Pisum spp., Poa spp., Podocarpus spp., Pogmania spp., Populus spp., Prunus spp., Quercus spp., Ribes spp., Robinia spp., Rosa spp., Raphanus spp., Rheum spp., Ricinus spp., Rubus spp., Salix spp., Sequoia spp., Sesamum spp., Setaria spp., Saccharum spp., Sambucus spp., Secale spp., Sinapis spp., Solanum spp., Sorghum spp., Trifolium spp., Triticum spp., Triticosecale spp., Trisetum spp., Tagetes spp., Theobroma spp., Triadica spp., Vicia spp., Vitis spp., Vigna spp., Viola spp., Watsonia spp. или Zea spp.
4. Способ по п.1 или 2, где сельскохозяйственная культура представляет собой член рода Salix или Populus.
5. Способ по п.1 или 2, где маркер находится в интервале менее чем 45, 40, 35, 30, 25, 20, 15, 10, 5, 4, 3, 2, 1 или 0 сантиморган (сМ) от указанного полинуклеотида.
6. Способ получения трансгенного растения сельскохозяйственной культуры, включающий введение в немодифицированное растение сельскохозяйственной культуры экзогенного полинуклеотида, где указанный полинуклеотид включает нуклеотидную последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 или соответствующей последовательности кДНК.
7. Способ получения трансгенного растения сельскохозяйственной культуры, включающий введение в немодифицированное растение сельскохозяйственной культуры экзогенного полинуклеотида, где указанный полинуклеотид включает нуклеотидную последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% нуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 или 39.
8. Способ получения трансгенного растения сельскохозяйственной культуры, которое экспрессирует рекомбинантный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 или 39, включающий введение экзогенного полинуклеотида, содержащего кДНК, кодирующую указанный рекомбинантный полипептид, в немодифицированное растение сельскохозяйственной культуры.
9. Способ по любому из пп.6-8, где экзогенный полинуклеотид происходит из растения-донора рода Salix или Populus.
10. Способ по любому из пп.6-8, где экзогенный полинуклеотид ассоциирован с промоторной последовательностью, способной направлять конститутивную экспрессию белка, кодируемого экзогенным полинуклеотидом в растении.
11. Способ по любому из пп.6-8, где первичное трансгенное растение генерируют путем введения экзогенного полинуклеотида, и вторичное трансгенное растение получают из первичного трансгенного растения.
12. Способ по любому из пп.6-8, где первичное трансгенное растение, генерированное путем введения экзогенного полинуклеотида, содержит одну копию экзогенного полинуклеотида.
13. Способ по любому из пп.6-8, где выход биомассы собранного урожая, по меньшей мере, на 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 200 или 250% превышает выход биомассы немодифицированного растения.
14. Способ по любому из пп.6-8, где ряд трансгенных растений генерируют посредством независимой трансформации ряда немодифицированных растений с помощью экзогенного полинуклеотида.
15. Способ по п.14, дополнительно включающий определение выхода биомассы собранного урожая каждого из трансгенных растений или их потомства.
16. Способ по п.15, дополнительно включающий отбор одного или более трансгенных растений, имеющих увеличенный выход биомассы собранного урожая по сравнению с немодифицированным растением, и размножение трансгенных растений, имеющих повышенный выход биомассы собранного урожая.
17. Способ по любому из пп.6-8, где сельскохозяйственная культура представляет собой однодольное и двудольное кормовое растение сельскохозяйственной культуры, фуражное растение сельскохозяйственной культуры, декоративное растение сельскохозяйственной культуры, плодовое растение сельскохозяйственной культуры, растение продовольственной сельскохозяйственной культуры, водоросли, лесное дерево, растение сельскохозяйственной культуры для получения биоэнергии или растение сельскохозяйственной культуры для получения биотоплива, Acacia spp., Acer spp., Actinidia ssp., Agave spp., Agropyron spp., Agrostis spp., Allium spp., Alnus spp., Alopecurus spp., Amaranthus spp., Ananas spp., Apium spp., Arachis spp., Areca spp., Arundo spp., Arrhenatherum spp., Asparagus spp; Avena spp., Atriplex spp., Attalea spp., Beta spp., Betula spp., Brassica spp., Bromus spp., Bouteloua spp., Camelina spp., Camellia spp., Cannabis spp., Capsicum spp., Carica spp., Carex spp., Carthamus spp., Castanea spp., Carum spp., Cinnamomum spp., Citrus spp., Cocos spp., Coffea spp., Corchorus spp., Cotoneatser spp., Cucurbita spp., Cupressus spp., Cynodon spp., Daucus spp., Dactylis spp., Eucalyptus spp., Elaeis spp., Eleusine spp., Fagus spp., Festuca spp., Ficus spp., Fraxinus spp., Geranium spp., Ginkgo spp., Glycine spp., Gossypium spp., Helianthus spp., Hemerocallis spp., Heracleum spp., Hedysarum spp., Hibiscus spp., Hordeum spp., Indigo spp., Ipomoea spp., Lettuca spp., Jatropha spp., Lotus spp., Lactuca spp., Lathyrus spp., Lens spp., Linum spp., Lolium spp., Lupinus spp., Lezula spp., Lycopersicon spp., Malus spp., Manihot spp., Medicago spp., Melilotus spp., Mentha spp., Miscanthus spp., Musa spp., Nicotiana spp., Olea spp., Onobrychis spp., Ophiopogon spp., Oryza spp., Panicum spp., Papaver spp., Petunia spp., Phaseolus spp., Pennisetum spp., Phalaris spp., Phoenix spp., Phleum spp., Phyllostachys spp., Physalis spp., Panicum spp., Picea spp., Pinus spp., Pistacia spp., Pisum spp., Poa spp., Podocarpus spp., Pogmania spp., Populus spp., Prunus spp., Quercus spp., Ribes spp., Robinia spp., Rosa spp., Raphanus spp., Rheum spp., Ricinus spp., Rubus spp., Salix spp., Sequoia spp., Sesamum spp., Setaria spp., Saccharum spp., Sambucus spp., Secale spp., Sinapis spp., Solanum spp., Sorghum spp., Trifolium spp., Triticum spp., Triticosecale spp., Trisetum spp., Tagetes spp., Theobroma spp., Triadica spp., Vicia spp., Vitis spp., Vigna spp., Viola spp., Watsonia spp. или Zea spp.
18. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры, содержащее экзогенный ген, где указанный ген включает последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25.
19. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры, содержащее экзогенный ген, где указанный ген включает последовательность, кодирующую полипептид, идентичный, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% полипептиду SEQ ID NO: 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 или 39.
20. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры, экспрессирующее рекомбинантный полипептид, идентичный, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 или 39.
21. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по любому из пп.18-20, где экзогенный ген происходит из растения рода Salix или Populus.
22. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по любому из пп.18-20, где экзогенный полинуклеотид ассоциирован с промоторной последовательностью, способной направлять конститутивную экспрессию белка, кодируемого экзогенным полинуклеотидом в трансгенном растении.
23. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по любому из пп.18-20, где растение представляет собой первичное трансгенное растение, генерированное путем введения экзогенного полинуклеотида в растение дикого типа.
24. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по п.23, где первичное трансгенное растение содержит одну копию экзогенного полинуклеотида.
25. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по любому из пп.18-20, где растение представляет собой трансгенное растение второго или последующего поколений, происходящих из размножения первичного трансгенного растения сельскохозяйственной культуры, где первичное трансгенное растение генерируют путем введения экзогенного полинуклеотида в растение дикого типа.
26. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по п.25, где трансгенное растение второго или последующего поколений является гомозиготным по экзогенному полинуклеотиду.
27. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по любому из пп.18-20, где выход биомассы собранного урожая, по меньшей мере, на 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 200 или 250% превышает выход биомассы собранного урожая немодифицированного растения.
28. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры по любому из пп.18-20, где сельскохозяйственная культура представляет собой однодольное и двудольное кормовое растение сельскохозяйственной культуры, фуражное растение сельскохозяйственной культуры, декоративное растение сельскохозяйственной культуры, плодовое растение сельскохозяйственной культуры, растение продовольственной сельскохозяйственной культуры, водоросли, лесное дерево, растение сельскохозяйственной культуры для получения биоэнергии или растение сельскохозяйственной культуры для получения биотоплива, Acacia spp., Acer spp., Actinidia ssp., Agave spp., Agropyron spp., Agrostis spp., Allium spp., Alnus spp., Alopecurus spp., Amaranthus spp., Ananas spp., Apium spp., Arachis spp., Areca spp., Arundo spp., Arrhenatherum spp., Asparagus spp; Avena spp., Atriplex spp., Attalea spp., Beta spp., Betula spp., Brassica spp., Bromus spp., Bouteloua spp., Camelina spp., Camellia spp., Cannabis spp., Capsicum spp., Carica spp., Carex spp., Carthamus spp., Castanea spp., Carum spp., Cinnamomum spp., Citrus spp., Cocos spp., Coffea spp., Corchorus spp., Cotoneatser spp., Cucurbita spp., Cupressus spp., Cynodon spp., Daucus spp., Dactylis spp., Eucalyptus spp., Elaeis spp., Eleusine spp., Fagus spp., Festuca spp., Ficus spp., Fraxinus spp., Geranium spp., Ginkgo spp., Glycine spp., Gossypium spp., Helianthus spp., Hemerocallis spp., Heracleum spp., Hedysarum spp., Hibiscus spp., Hordeum spp., Indigo spp., Ipomoea spp., Lettuca spp., Jatropha spp., Lotus spp., Lactuca spp., Lathyrus spp., Lens spp., Linum spp., Lolium spp., Lupinus spp., Lezula spp., Lycopersicon spp., Malus spp., Manihot spp., Medicago spp., Melilotus spp., Mentha spp., Miscanthus spp., Musa spp., Nicotiana spp., Olea spp., Onobrychis spp., Ophiopogon spp., Oryza spp., Panicum spp., Papaver spp., Petunia spp., Phaseolus spp., Pennisetum spp., Phalaris spp., Phoenix spp., Phleum spp., Phyllostachys spp., Physalis spp., Panicum spp., Picea spp., Pinus spp., Pistacia spp., Pisum spp., Poa spp., Podocarpus spp., Pogmania spp., Populus spp., Prunus spp., Quercus spp., Ribes spp., Robinia spp., Rosa spp., Raphanus spp., Rheum spp., Ricinus spp., Rubus spp., Salix spp., Sequoia spp., Sesamum spp., Setaria spp., Saccharum spp., Sambucus spp., Secale spp., Sinapis spp., Solanum spp., Sorghum spp., Trifolium spp., Triticum spp., Triticosecale spp., Trisetum spp., Tagetes spp., Theobroma spp., Triadica spp., Vicia spp., Vitis spp., Vigna spp., Viola spp., Watsonia spp. или Zea spp.
29. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры, содержащее нуклеотидную последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25, где указанная нуклеотидная последовательность функционально связана с гетерологичным регуляторным элементом.
30. Трансгенное растение сельскохозяйственной культуры, содержащее нуклеотидную последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% нуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 или 39, где указанная нуклеотидная последовательность функционально связана с гетерологичным регуляторным элементом.
31. Применение экзогенного полинуклеотида, содержащего последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 или соответствующей последовательности кДНК, для улучшения выхода биомассы собираемого урожая растения сельскохозяйственной культуры путем трансформации растения сельскохозяйственной культуры с помощью экзогенного полинуклеотида.
32. Применение экзогенного полинуклеотида, содержащего последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% нуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 или 39, для улучшения выхода биомассы собираемого урожая растения сельскохозяйственной культуры путем трансформации растения сельскохозяйственной культуры с помощью экзогенного полинуклеотида.
33. Применение по п.31 или 32, где растение сельскохозяйственной культуры представляет собой однодольное и двудольное кормовое растение сельскохозяйственной культуры, фуражное растение сельскохозяйственной культуры, декоративное растение сельскохозяйственной культуры, плодовое растение сельскохозяйственной культуры, растение продовольственной сельскохозяйственной культуры, водоросли, лесное дерево, растение сельскохозяйственной культуры для получения биоэнергии или растение сельскохозяйственной культуры для получения биотоплива, Acacia spp., Acer spp., Actinidia ssp., Agave spp., Agropyron spp., Agrostis spp., Allium spp., Alnus spp., Alopecurus spp., Amaranthus spp., Ananas spp., Apium spp., Arachis spp., Areca spp., Arundo spp., Arrhenatherum spp., Asparagus spp; Avena spp., Atriplex spp., Attalea spp., Beta spp., Betula spp., Brassica spp., Bromus spp., Bouteloua spp., Camelina spp., Camellia spp., Cannabis spp., Capsicum spp., Carica spp., Carex spp., Carthamus spp., Castanea spp., Carum spp., Cinnamomum spp., Citrus spp., Cocos spp., Coffea spp., Corchorus spp., Cotoneatser spp., Cucurbita spp., Cupressus spp., Cynodon spp., Daucus spp., Dactylis spp., Eucalyptus spp., Elaeis spp., Eleusine spp., Fagus spp., Festuca spp., Ficus spp., Fraxinus spp., Geranium spp., Ginkgo spp., Glycine spp., Gossypium spp., Helianthus spp., Hemerocallis spp., Heracleum spp., Hedysarum spp., Hibiscus spp., Hordeum spp., Indigo spp., Ipomoea spp., Lettuca spp., Jatropha spp., Lotus spp., Lactuca spp., Lathyrus spp., Lens spp., Linum spp., Lolium spp., Lupinus spp., Lezula spp., Lycopersicon spp., Malus spp., Manihot spp., Medicago spp., Melilotus spp., Mentha spp., Miscanthus spp., Musa spp., Nicotiana spp., Olea spp., Onobrychis spp., Ophiopogon spp., Oryza spp., Panicum spp., Papaver spp., Petunia spp., Phaseolus spp., Pennisetum spp., Phalaris spp., Phoenix spp., Phleum spp., Phyllostachys spp., Physalis spp., Panicum spp., Picea spp., Pinus spp., Pistacia spp., Pisum spp., Poa spp., Podocarpus spp., Pogmania spp., Populus spp., Prunus spp., Quercus spp., Ribes spp., Robinia spp., Rosa spp., Raphanus spp., Rheum spp., Ricinus spp., Rubus spp., Salix spp., Sequoia spp., Sesamum spp., Setaria spp., Saccharum spp., Sambucus spp., Secale spp., Sinapis spp., Solanum spp., Sorghum spp., Trifolium spp., Triticum spp., Triticosecale spp., Trisetum spp., Tagetes spp., Theobroma spp., Triadica spp., Vicia spp., Vitis spp., Vigna spp., Viola spp., Watsonia spp. или Zea spp.
34. Применение по п.31 или 32, где экзогенная полинуклеотидная последовательность происходит из растения рода Salix пли Populus.
35. Применение по п.31 или 32, где экзогенный полинуклеотид ассоциирован с промоторной последовательностью, способной направлять конститутивную экспрессию белка, кодируемого экзогенным полинуклеотидом, в трансгенном растении.
36. Генетическая конструкция, содержащая (а) нуклеотидную последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 или соответствующей последовательности кДНК, и (b) промоторную последовательность, способную направлять экспрессию белка, кодируемого нуклеотидной последовательностью, в растении, содержащем генетическую конструкцию.
37. Генетическая конструкция, содержащая (а) нуклеотидную последовательность, идентичную, по меньшей мере, на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 97, 98, 99 или 100% нуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид SEQ ID NO: 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38 или 39, и (b) промоторную последовательность, способную направлять экспрессию белка, кодируемого нуклеотидной последовательностью, в растении, содержащем генетическую конструкцию.
38. Генетическая конструкция по п.36 или 37, где промоторная последовательность способна направлять конститутивную экспрессию белка, кодируемого нуклеотидной последовательностью, в растении, содержащем генетическую конструкцию.