ВАКЦИНА ПРОТИВ ВИРУСА ГРИППА ШИРОКОГО СПЕКТРА ДЕЙСТВИЯ

1. Вакцина против вируса гриппа, содержащая:
по меньшей мере один полинуклеотид рибонуклеиновой кислоты (РНК), имеющий открытую рамку считывания, кодирующую по меньшей мере один антигенный полипептид вируса гриппа или его иммуногенный фрагмент, составленная в липидной наночастице.
2. Вакцина против гриппа по п.1, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид представляет собой гемагглютинин 1 (HA1), гемагглютинин 2 (HA2) вируса гриппа, иммуногенный фрагмент HA1 или HA2 или комбинацию любых двух или более вышеуказанных компонентов.
3. Вакцина против гриппа по п.1, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид представляет собой HA1, HA2 или комбинацию HA1 и HA2, и по меньшей мере один антигенный полипептид выбран из группы, состоящей из нейраминидазы (NA), нуклеопротеина (NP), белка матрикса 1 (M1), белка матрикса 2 (M2), неструктурного белка 1 (NS1) и неструктурного белка 2 (NS2).
4. Вакцина против гриппа по п.3, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид представляет собой HA2 и по меньшей мере один антигенный полипептид выбран из группы, состоящей из NA, NP, M1, M2, NS1 и NS2.
5. Вакцина против гриппа по п.4, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид представляет собой HA2 и по меньшей мере один антигенный полипептид выбран из группы, состоящей из NA, NP, M1, M2, NS1 и NS2.
6. Вакцина против гриппа по любому из пп. 1-5, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид получен из штамма вируса гриппа H1/Пуэрто Рико/8/1934, H1/Новая Каледония/20/1999, H1/Калифорния/04/2009, H5/Вьетнам/1194/2004, H2/Япония/305/1957, H9/Гонконг/1073/99, H3/Айти/2/1968, H3/Брисбан/10/2007, H7/Аньхой/1/2013, H10/Цзянси-Донгу/346/2013, H3/Висконсин/67/2005, H1/Вьетнам/850/2009 или их комбинации.
7. Вакцина по любому из пп. 1-6, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид содержит аминокислотную последовательность, определяемую любой из SEQ ID NO: 1-444, 458, 460, 462-479.
8. Вакцина по любому из пп. 1-7, отличающаяся тем, что по меньшей мере один полинуклеотид РНК кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты, определяемой любой из SEQ ID NO: 447-457, 459, 461, и/или отличающаяся тем, что по меньшей мере один полипептид РНК содержит последовательность нуклеиновой кислоты, определяемую любой из SEQ ID NO: 491-503.
9. Вакцина по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид имеет аминокислотную последовательность, которая имеет по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью, определяемой любой из SEQ ID NO: 1-444, 458, 460, 462-479.
10. Вакцина по любому из пп. 1-9, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид имеет аминокислотную последовательность, которая имеет 95%-99% идентичности с аминокислотной последовательностью, определяемой любой из SEQ ID NO: 1-444, 458, 460, 462-479.
11. Вакцина по любому из пп. 1-10, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид имеет аминокислотную последовательность, которая имеет по меньшей мере 90% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1-444, 458, 460, 462-479 и отличающаяся тем, что указанный антигенный полипептид или его иммуногенный фрагмент имеет активность, вызывающую слияние мембран, присоединяется к клеточным рецепторам, вызывает слияние вирусной и клеточной мембран и/или отвечает за связывание вируса с инфицируемой клеткой.
12. Вакцина по любому из пп. 1-11, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид имеет аминокислотную последовательность, которая имеет 90%-99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1-444, 458, 460, 462-479 и отличающаяся тем, что указанный антигенный полипептид или его иммуногенный фрагмент имеет активность, вызывающую слияние мембран, присоединяется к клеточным рецепторам, вызывает слияние вирусной и клеточной мембран и/или отвечает за связывание вируса с инфицируемой клеткой.
13. Вакцина по любому из пп. 1-2, отличающаяся тем, что открытая рамка считывания является кодон-оптимизированной.
14. Вакцина по любому из пп. 1-3, отличающаяся тем, что вакцина является мультивалентной.
15. Вакцина по любому из пп. 1-4, составленная в эффективном количестве для того, чтобы вызывать антиген-специфический иммунный ответ.
16. Способ индукции иммунного ответа у пациента, включающий введение пациенту вакцины по любому из пп. 1-15 в количестве, эффективном для того, чтобы вызывать антиген-специфический иммунный ответ у пациента.
17. Способ по п.16, отличающийся тем, что антиген-специфический иммунный ответ включает Т-клеточный ответ или В-клеточный ответ.
18. Способ по п.16 или 17, отличающийся тем, что пациенту вводят одну дозу вакцины.
19. Способ по п.16 или 17, отличающийся тем, что пациенту вводят бустерную дозу вакцины.
20. Способ по любому из пп. 16-19, отличающийся тем, что вакцину вводят пациенту путем внутрикожной инъекции или внутримышечной инъекции.
21. Способ по любому из пп. 16-20, отличающийся тем, что титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, повышен по меньшей мере на 1 log по сравнению с контролем.
22. Способ по любому из пп. 16-21, отличающийся тем, что титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, повышен на 1-3 log по сравнению с контролем.
23. Способ по любому из пп. 16-22, отличающийся тем, что титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, повышен по меньшей мере в 2 раза по сравнению с контролем.
24. Способ по любому из пп. 16-23, отличающийся тем, что титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, повышен в 2-10 раз по сравнению с контролем.
25. Способ по любому из пп. 21-24, отличающийся тем, что контроль представляет собой титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, которому не вводили вакцину против вируса.
26. Способ по любому из пп. 21-24, отличающийся тем, что контроль представляет собой титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, которому вводили живую аттенуированную вакцину или инактивированную вакцину против вируса.
27. Способ по любому из пп. 21-24, отличающийся тем, что контроль представляет собой титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, которому вводили рекомбинантную белковую вакцину или очищенную белковую вакцину против вируса.
28. Способ по любому из пп. 21-24, отличающийся тем, что контроль представляет собой титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, которому вводили VLP-вакцину против вируса.
29. Способ по любому из пп. 16-28, отличающийся тем, что эффективное количество представляет собой дозу, эквивалентную по меньшей мере 2-кратно сниженной соответствующей стандарту лечения дозе рекомбинантной белковой вакцины или очищенной белковой вакцины против вируса, и при этом титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, равен титру антител к антигенному полипептиду, продуцируемому у контрольного пациента, которому вводили соответствующую стандарту лечения дозу рекомбинантной белковой вакцины или очищенной белковой вакцины против вируса соответственно.
30. Способ по любому из пп. 16-28, отличающийся тем, что эффективное количество представляет собой дозу, эквивалентную по меньшей мере 2-кратно сниженной соответствующей стандарту лечения дозе живой аттенуированной вакцины или инактивированной вакцины против вируса, и при этом титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, равен титру антител к антигенному полипептиду, продуцируемому у контрольного пациента, которому вводили соответствующую стандарту лечения дозу живой аттенуированной вакцины или инактивированной вакцины против вируса соответственно.
31. Способ по любому из пп. 16-28, отличающийся тем, что эффективное количество представляет собой дозу, эквивалентную по меньшей мере 2-кратно сниженной соответствующей стандарту лечения дозе VLP-вакцины против вируса, и при этом титр антител к антигенному полипептиду, продуцируемый у пациента, равен титру антител к антигенному полипептиду, продуцируемому у контрольного пациента, которому вводили соответствующую стандарту лечения дозу VLP-вакцины против вируса.
32. Способ по любому из пп. 16-31, отличающийся тем, что эффективное количество представляет собой общую дозу, составляющую 50 мкг - 1000 мкг.
33. Способ по п.32, отличающийся тем, что эффективное количество представляет собой дозу, составляющую 25 мкг, 100 мкг, 400 мкг или 500 мкг, которую вводят пациенту в целом за два раза.
34. Способ по любому из пп. 16-33, отличающийся тем, что эффективность вакцины против вируса превышает 65%.
35. Способ по любому из пп. 16-34, отличающийся тем, что вакцина иммунизирует пациента против вируса на срок до 2 лет.
36. Способ по любому из пп. 16-34, отличающийся тем, что вакцина иммунизирует пациента против вируса на срок более 2 лет.
37. Способ по любому из пп. 16-36, отличающийся тем, что пациент контактировал с вирусом, пациент инфицирован вирусом или пациент имеет риск инфицирования вирусом.
38. Способ по любому из пп. 16-37, отличающийся тем, что пациент имеет ослабленный иммунитет.
39. Вакцина по любому из пп. 1-15 для применения в способе индукции антиген-специфического иммунного ответа у пациента, включающем введение пациенту вакцины в количестве эффективном для того, чтобы получить антиген-специфический иммунный ответ у пациента.
40. Применение вакцины по любому из пп. 1-15 в получении лекарственного средства для применения в способе индукции антиген-специфического иммунного ответа у пациента, включающем введение пациенту вакцины в количестве эффективном для того, чтобы получить антиген-специфический иммунный ответ у пациента.
41. Сконструированная нуклеиновая кислота, кодирующая по меньшей мере один полинуклеотид РНК вакцины по любому из пп. 1-15.
42. Экспрессионный вектор, содержащий сконструированную нуклеиновую кислоту, кодирующую по меньшей мере один полинуклеотид РНК вакцины по любому из пп. 1-15.
43. Клетка-хозяин, содержащая сконструированную нуклеиновую кислоту, кодирующую по меньшей мере один полинуклеотид РНК вакцины по любому из пп. 1-16.
44. Способ получения полипептида, включающий культивирование клетки-хозяина по п.43 в среде в условиях, обеспечивающих экспрессию полипептида, кодируемого нуклеиновой кислотой, и очистку полипептида из культивируемой клетки или среды клетки.
45. Многонаправленная вакцина на основе консенсуса подтипов, содержащая по меньшей мере один полинуклеотид рибонуклеиновой кислоты (РНК), имеющий открытую рамку считывания, кодирующую по меньшей мере один антигенный полипептид вируса гриппа или его иммуногенный фрагмент, при этом указанная вакцина обеспечивает перекрестную реактивность против разных штаммов гриппа, причем вакцина содержит по меньшей мере один консенсусный антиген гемагглютинина.
46. Вакцина по п.45, отличающаяся тем, что консенсусный антиген гемагглютинина выбран из группы, состоящей из гемагглютинина 1 (HA1), гемагглютинина 2 (HA2) вируса гриппа, иммуногенного фрагмента HA1 или HA2 или комбинации любых двух или более вышеуказанных компонентов.
47. Вакцина по п.45, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид представляет собой HA1, HA2 или комбинацию HA1 и HA2, и по меньшей мере один антигенный полипептид выбран из группы, состоящей из нейраминидазы (NA), нуклеопротеина (NP), белка матрикса 1 (M1), белка матрикса 2 (M2), неструктурного белка 1 (NS1) и неструктурного белка 2 (NS2).
48. Вакцина по п.47, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид представляет собой HA2 и по меньшей мере один антигенный полипептид выбран из группы, состоящей из NA, NP, M1, M2, NS1 и NS2.
49. Вакцина по п.48, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид представляет собой HA2 и по меньшей мере один антигенный полипептид выбран из группы, состоящей из NA, NP, M1, M2, NS1 и NS2.
50. Вакцина по любому из пп. 45-49, отличающаяся тем, что по меньшей мере один антигенный полипептид получен из штамма вируса гриппа H1/Пуэрто Рико/8/1934, H1/Новая Каледония/20/1999, H1/Калифорния/04/2009, H5/Вьетнам/1194/2004, H2/Япония/305/1957, H9/Гонконг/1073/99, H3/Айти/2/1968, H3/Брисбан/10/2007, H7/Аньхой/1/2013, H10/Цзянси-Донгу/346/2013, H3/Висконсин/67/2005, H1/Вьетнам/850/2009 или их комбинации.
51. Вакцина по любому из пп. 45-49, составленная в липидной наночастице.
52. Вакцина по п.51 или по любому из пп. 1-15, отличающаяся тем, что наночастица имеет средний диаметр 50-200 нм.
53. Вакцина по п.51 или по любому из пп. 1-15, отличающаяся тем, что липидная наночастица содержит катионный липид, PEG-модифицированный липид, стерин и некатионный липид.
54. Вакцина по п.53, отличающаяся тем, что носитель на основе липидной наночастицы содержит в молярном соотношении около 20-60% катионного липида, 0,5-15% PEG-модифицированного липида, 25-55% стерина и 25% некатионного липида.
55. Вакцина по п.54, отличающаяся тем, что катионный липид представляет собой ионизируемый катионный липид, а некатионный липид представляет собой нейтральный липид, и стерин представляет собой холестерин.
56. Вакцина по п.54, отличающаяся тем, что катионный липид выбран из 2,2-дилинолеил-4-диметиламиноэтил-[1,3]-диоксолана (DLin-KC2-DMA), дилинолеил-метил-4-диметиламинобутирата (DLin-MC3-DMA) и ди((Z)-нон-2-ен-1-ил) 9-((4-(диметиламино)бутаноил)окси)гептадекандиоата (L319).
57. Вакцина по любому из пп. 51-56, отличающаяся тем, что наночастица характеризуется значением полидисперсности менее 0,4.
58. Вакцина по любому из пп. 51-57, отличающаяся тем, что наночастица имеет суммарный нейтральный заряд при нейтральном значение рН.
59. Вакцина по любому из пп. 1-15 или 45-58, отличающаяся тем, что по меньшей мере один полинуклеотид РНК содержит по меньшей мере одну химическую модификацию.
60. Вакцина по п.59, отличающаяся тем, что химическая модификация выбрана из псевдоуридина, N1-метилпсевдоуридина, N1-этилпсевдоуридина, 2-тиоуридина, 4'-тиоуридина, 5-метилцитозина, 5-метилуридина, 2-тио-1-метил-1-деаза-псевдоуридина, 2-тио-1-метил-псевдоуридина, 2-тио-5-аза-уридина, 2-тио-дигидропсевдоуридина, 2-тио-дигидроуридина, 2-тио-псевдоуридина, 4-метокси-2-тио-псевдоуридина, 4-метокси-псевдоуридина, 4-тио-1-метил-псевдоуридина, 4-тио-псевдоуридина, 5-аза-уридина, дигидропсевдоуридина, 5-метоксиуридина и 2'-O-метилуридина.
61. Способ индукции перекрестной реактивности против разных штаммов гриппа у млекопитающего, включающий введение нуждающемуся в этом млекопитающему вакцины по любому из пп. 1-15 или 45-60.
62. Способ по п.61, отличающийся тем, что по меньшей мере два полинуклеотида рибонуклеиновой кислоты (РНК), имеющих открытые рамки считывания, каждый из которых кодирует консенсусный антиген гемагглютинина, вводят млекопитающему раздельно.
63. Способ по п.61, отличающийся тем, что по меньшей мере два полинуклеотида рибонуклеиновой кислоты (РНК), имеющих открытые рамки считывания, каждый из которых кодирует консенсусный антиген гемагглютинина, вводят млекопитающему одновременно.
64. Фармацевтическая композиция для применения в вакцинации пациента, содержащая
эффективную дозу мРНК, кодирующей антиген вируса гриппа,
причем указанной эффективной дозы достаточно для выработки выявляемых уровней антигена согласно измерениям в сыворотке крови пациента через 1-72 часа после введения.
65. Композиция по п.64, отличающаяся тем, что пороговый индекс для антигена составляет 1-2.
66. Фармацевтическая композиция для применения в вакцинации пациента, содержащая
эффективную дозу мРНК, кодирующей антиген вируса гриппа,
причем указанной эффективной дозы достаточно для выработки титра нейтрализации, составляющего 1000-10000, обеспечиваемого нейтрализующим антителом против указанного антигена, согласно измерениям в сыворотке крови пациента через 1-72 часа после введения.