ИНТЕГРИРОВАННОЕ ФЕНОТИПИРОВАНИЕ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ПРИЗНАКОВ ТЕКСТУРЫ ИЗОБРАЖЕНИЯ

1. Постоянный запоминающий носитель, который хранит инструкции, исполняемые с помощью устройства обработки электронных данных для того, чтобы осуществлять способ, который включает в себя:
вычисление значений признаков текстуры изображения для набора признаков текстуры изображения по изображению анатомического признака, представляющего интерес, у субъекта; и
классификацию субъекта, соответствующего молекулярному признаку, представляющему интерес, на основе значений признаков текстуры изображения, вычисляемых для набора признаков текстуры изображения, и пространственной структуры набора признаков текстуры изображения.
2. Постоянный запоминающий носитель по п. 1, в котором вычисление значений признаков текстуры изображения содержит:
вычисление одной или более матриц совместной встречаемости уровней яркости (GLCM) для изображения анатомического признака, представляющего интерес, у субъекта; и
вычисление значений признаков текстуры изображения на основе одной или более GLCM.
3. Постоянный запоминающий носитель по п. 2, в котором вычисление одной или более GLCM включает в себя вычисление одной или более симметризованных и нормализованных GLCM для изображения анатомического признака, представляющего интерес, у субъекта.
4. Постоянный запоминающий носитель по п. 2, в котором вычисление значений признаков текстуры изображения дополнительно включает в себя квантование уровней яркости изображения анатомического признака, представляющего интерес, у субъекта перед вычислением одной или более GLCM.
5. Постоянный запоминающий носитель по п. 2, в котором вычисление одной или более GLCM включает в себя вычисление двух или более GLCM, которые имеют по меньшей мере одно из отличающихся смещений и отличающихся пространственных расположений.
6. Постоянный запоминающий носитель по п. 1, в котором набор признаков текстуры изображения включает в себя признаки текстуры изображения Haralick и/или включает в себя признаки текстуры изображения Tamura.
7. Постоянный запоминающий носитель по п. 1, в котором способ дополнительно содержит:
вычисление эталонных значений признаков текстуры изображения по меньшей мере для набора признаков текстуры изображения по изображениям анатомического признака, представляющего интерес, у эталонных субъектов эталонной популяции;
деление эталонных значений признаков текстуры изображения на различные популяционные группы, представляющие различные значения молекулярного признака, представляющего интерес, на основе известных значений молекулярного признака, представляющего интерес, для эталонных субъектов; и
обучение классификатора, используемого при классификации, чтобы различать различные популяционные группы на основе эталонных значений признаков текстуры изображения.
8. Постоянный запоминающий носитель по п. 7, в котором эталонные значения признаков текстуры изображения вычисляют для расширенного набора признаков текстуры изображения, содержащего набор признаков текстуры изображения, и обучение содержит:
осуществление одномерного анализа для того, чтобы количественно определять статистическую значимость каждого признака текстуры изображения из расширенного набора признаков текстуры изображения, чтобы различать различные популяционные группы; и
выбор набора признаков текстуры изображения в качестве поднабора из расширенного набора признаков текстуры изображения, которые имеют наивысшую статистическую значимость.
9. Постоянный запоминающий носитель по п. 8, в котором одномерный анализ содержит использование критерия суммы рангов Вилкоксона или t-критерия Стьюдента для того, чтобы количественно определять статистическую значимость.
10. Постоянный запоминающий носитель по п. 1, в котором изображение анатомического признака, представляющего интерес, у субъекта представляет собой магнитно-резонансное (MR) изображение.
11. Постоянный запоминающий носитель по п. 10, в котором молекулярный признак, представляющий интерес, представляет собой ген, группу генов, путь активации гена, некодирующую РНК или множество некодирующих РНК.
12. Постоянный запоминающий носитель по п. 11, в котором анатомический признак, представляющий интерес, представляет собой повреждение молочной железы, а молекулярный признак, представляющий интерес, представляет собой маркер эстрогенового рецептора (ER).
13. Устройство, содержащее:
постоянный запоминающий носитель по любому из пп. 1-12 и
устройство обработки электронных данных, выполненное с возможностью исполнять инструкции, сохраненные в постоянном запоминающем носителе.
14. Способ, содержащий:
вычисление эталонных значений признаков текстуры изображения для множества признаков текстуры изображения по изображениям анатомического признака, представляющего интерес, у эталонных субъектов эталонной популяции;
деление эталонных значений признаков текстуры изображения на различные популяционные группы, представляющие различные значения молекулярного признака, представляющего интерес, на основе известных значений молекулярного признака, представляющего интерес, для эталонных субъектов; и
обучение классификатора различать различные популяционные группы на основе эталонных значений признаков текстуры изображения и пространственных структур набора эталонных признаков текстуры изображения;
причем вычисление, деление и обучение осуществляют с помощью устройства обработки электронных данных.
15. Способ по п. 14, дополнительно содержащий:
(i) вычисление значений признаков текстуры изображения по меньшей мере для некоторых из множества признаков текстуры изображения по изображению анатомического признака, представляющего интерес, у тестируемого субъекта; и
(ii) классификацию тестируемого субъекта, соответствующего молекулярному признаку, представляющему интерес, с использованием обученного классификатора;
причем операции (i) и (ii) осуществляют посредством устройства обработки электронных данных.