СПОСОБЫ И УСТРОЙСТВА

1. Способ амплификации нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, который включает
(a) контакт устройства для забора образцов с источником нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, так чтобы после контакта указанный материал, содержащий нуклеиновую кислоту из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, налипал, по меньшей мере, на часть устройства для забора образцов, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, изготовлено из полимерного материала;
(b) введение устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, в реакционный сосуд, который содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации нуклеиновой кислоты без какой-либо предварительной обработки материала, содержащего нуклеиновую кислоту; и
(c) осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты.
2. Применение устройства для забора образцов для получения образца материала из высших эукариот, содержащего нуклеиновую кислоту, и для введения образца без предварительной обработки в реакционный сосуд, содержащий реакционную смесь для амплификации нуклеиновой кислоты, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из полимерного материала, на который материал, содержащий нуклеиновую кислоту, налипает при контакте.
3. Способ по п.1, где полимерный материал выбран из любого материала из числа поликарбоната, стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
4. Способ по п.1, где источник нуклеиновых кислот из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, по существу, является сухим.
5. Способ амплификации нуклеиновой кислоты из источника из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, который включает
(а) контакт устройства для забора образцов с источником нуклеиновой кислоты из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, так чтобы после контакта указанный материал, содержащим нуклеиновую кислоту из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, налипал, по меньшей мере, на часть устройства для забора образцов, где источник нуклеиновых кислот из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, по существу, является сухим;
(b) введение устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, в реакционный сосуд, который содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации нуклеиновой кислоты без какой-либо предварительной обработки материала, содержащего нуклеиновую кислоту; и
(c) осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты.
6. Способ по п.5, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из любого материала из числа стекла, поликарбоната, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
7. Способ по п.1, где реакционная смесь, по существу, не содержит хаотропных агентов.
8. Способ поп.1, где реакционная смесь, по существу, не содержит агентов, лизирующих клетку.
9. Способ поп.1, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обеспечивает закупорку реакционного сосуда.
10. Применение устройства для забора образцов нуклеиновой кислоты для получения нуклеиновой кислоты из источника высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, и последующего введения источника нуклеиновой кислоты высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, в реакционный сосуд, содержащий реакционную смесь реакции амплификации нуклеиновых кислот, без предварительной обработки, где источник нуклеиновых кислот из высших эукариот, таких как млекопитающее или растение, по существу, является сухим.
11. Применение по п.10, где нуклеиновая кислота налипает на устройство для забора образцов или на его часть, причем устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделано из любого материала из числа поликарбоната, стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
12. Способ получения реакционного сосуда, содержащего реакционную смесь и материал, который содержит нуклеиновую кислоту, готового к проведению реакции амплификации нуклеиновой кислоты, который включает
(a) обеспечение закупоренного реакционного сосуда с единственной ячейкой, которая содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации;
(b) обеспечение устройства для забора образцов;
(c) контакт устройства для забора образцов с материалом, содержащим нуклеиновую кислоту, так чтобы после него указанный материал, содержащий нуклеиновую кислоту, налипал, по меньшей мере, на часть устройства для забора образцов;
(d) раскупоривание реакционного сосуда;
(e) помещение устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, в реакционный сосуд, так чтобы материал, содержащий нуклеиновую кислоту, контактировал с реакционной смесью;
(f) повторное воздухонепроницаемое закупоривание реакционного сосуда с помощью устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, все еще присутствующую в реакционном сосуде.
13. Способ по п.12, где несколько реакционных сосудов соединены вместе и подготавливаются одновременно.
14. Способ по п.12, где устройство для забора проб или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, конструируется с учетом возможности распределения материала, содержащего нуклеиновую кислоту, между несколькими реакционными сосудами.
15. Способ по п.12 или 13, где раскупоривание реакционного сосуда (стадия (d)) проводят перед контактом устройства для забора образцов с материалом, содержащим нуклеиновую кислоту (стадия (с)).
16. Способ по п.12 или 13, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обеспечивает закупоривание реакционного сосуда в стадии (f).
17. Способ по пп.12 и 13, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из любого материала из числа стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, поликарбоната, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
18. Способ по пп.12 и 13, где реакционная смесь, по существу, не содержит хаотропных агентов.
19. Способ по пп.12 и 13, где реакционная смесь, по существу, не содержит агентов, лизирующих клетку.
20. Способ по пп.12 и 13, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, помещают непосредственно в реакционный сосуд без дополнительной обработки после забора образца.
21. Способ по пп.12 и 13, где реакционная смесь предназначена для проведения любой реакции из числа полимеразной цепной реакции (ПЦР), лигазной цепной реакции (LCR), петлевой изотермической амплификации (LAMP), транскрипционно-опосредованной амплификации (ТМА), технологии сигнально-опосредованной амплификации РНК (SMART), амплификации с замещением цепи (SDA), амплификации по типу катящегося кольца (RCA), изотермической амплификации с множественным вытеснением цепи (IMDA), геликаза-зависимой амплификации (HAD), изотермической амплификации с единственным праймером (SPIA), циклической хеликаза-зависимой амплификации (CDHA) или амплификации на основе последовательности нуклеиновых кислот (NASBA).
22. Способ по пп.12 и 13, где материал, содержащий нуклеиновую кислоту, происходит из млекопитающего, такого как человек.
23. Способ по пп.12 и 13, где материал, содержащий нуклеиновую кислоту, по существу, является сухим.
24. Способ амплификации нуклеиновой кислоты, который включает приготовление реакционного сосуда по любому из пп.12-23, и осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты в реакционном сосуде.
25. Способ амплификации нуклеиновой кислоты, который включает осуществление способа по любому из пп.12-23, удаление устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту, и помещение его в дополнительный реакционный сосуд и осуществление реакции амплификации нуклеиновой кислоты в дополнительном реакционном сосуде.
26. Способ по п.25, где дополнительный реакционный сосуд готовят по п.1.
27. Способ по п.1, где образец, содержащий нуклеиновую кислоту, представляет собой любые клетки, такие как клетки кожи, высушенная кровь, высушенная семенная жидкость, высушенная слюна или клеточный материал, депонированный на поверхности посредством касания.
28. Набор реактивов, включающий (а) закупоренный реакционный сосуд, который содержит реакционную смесь для проведения реакции амплификации нуклеиновой кислоты, и (b) устройство для забора образцов, по меньшей мере, на часть которого может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, после контакта с указанным материалом, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, может быть введено в реакционный сосуд, а реакция амплификации нуклеиновой кислоты может быть осуществлена в сосуде в присутствии устройства для забора образцов или его части, на которую налип материал, содержащий нуклеиновую кислоту.
29. Набор реактивов по п.28, включающий несколько реакционных сосудов, соединенных вместе.
30. Набор реактивов по п.28 или 29, где устройство для забора образцов или его часть, на которую может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, конструируется с учетом возможности распределения материала, содержащего нуклеиновую кислоту, между несколькими реакционными сосудами.
31. Набор реактивов по п.28 или 29, где устройство для забора образцов или его часть, на которую может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обеспечивает закупоривание реакционного сосуда после удаления исходного затвора.
32. Набор реактивов по п.28 или 29, где устройство для забора образцов или его часть, на которую может налипнуть материал, содержащий нуклеиновую кислоту, сделан из любого материала из числа поликарбоната, стекла, сополимера циклического олефина, такого как Topas, акрилового полимера, такого как РММА, кристаллического полистирола, полипропилена, HDPE, полистирола средней ударной прочности, PVC, жидкокристаллического полимера 30%, Trans ABS, сополимера ацеталя, полиэфира, полиэтилена, нейлона, полиэфира полиуретана, блок-сополимера стирола и бутадиена, статистического сополимера полипропилена, этиленвинилацетата, силоксана, такого как PDMS, и термопластического эластомера, такого как сантопрен.
33. Набор реактивов по п.28 или 29, где реакционная смесь, присутствующая в реакционном сосуде, определяется по любому из пп.18, 19 или 21.
34. Способ конструкции носителя данных, который записывает генотип, ассоциированный с нуклеиновой кислотой из материала, содержащего нуклеиновую кислоту, причем способ включает проведение способа по любому из пп.1, 5 или 24, определение генотипа нуклеиновой кислоты в материале, содержащем нуклеиновую кислоту, и запись генотипа на носитель данных.
35. Устройство для забора нуклеиновой кислоты, включающее зонд для удержания образца нуклеиновой кислоты; и манипулятор, который присоединяется к зонду с учетом возможности маневрирования зондом, причем зонд способен отделяться от манипулятора, где зонд включает несколько элементов зонда, которые способны перемещаться друг относительно друга между сближенной и взаимно удаленной конфигурациями, причем каждый элемент зонда имеет наконечник, который, в момент когда элементы зонда перемещаются в сближенную конфигурацию, объединяется с другими наконечниками, образуя составной наконечник, который способен контактировать с нуклеиновой кислотой с целью доставки ее образца.
36. Устройство по п.35, где образованный составной наконечник имеет несколько контактов с нуклеиновой кислотой, соответствующих количеству прикрепленных наконечников, так что при контакте нуклеиновой кислоты с составным наконечником каждый из контактов нуклеиновой кислоты имеет, как правило, одинаковое количество нуклеиновой кислоты.
37. Устройство по п.35 или 36, где манипулятор имеет активатор элемента зонда для вызова избирательного движения элементов зонда между сближенной и взаимно удаленной конфигурациями.
38. Устройство по п.36, где манипулятор имеет удлиненный корпус; а активатор элемента зонда способен двигаться вдоль корпуса для того, чтобы вызвать избирательное движение элементов зонда сближенной и взаимно удаленной конфигурациями.
39. Устройство по п.38, где корпус является пустотелым, а активатор элемента зонда по существу расположен в нем и способен перемещаться во внутреннем пространстве корпуса.
40. Устройство по п.39, где корпус имеет сквозное отверстие, образованное в нем; а активатор элемента зонда способен контактировать посредством сквозного отверстия с целью его движения внутри стержня.
41. Устройство по п.37, где манипулятор имеет вращаемый элемент, который функционально связан с активатором элемента зонда, так что вращение вращаемого элемента вызывает передвижение активатором элементов зонда между сближенной и взаимно удаленной конфигурациями.
42. Устройство по п.37, где каждый элемент зонда включает упруго деформируемый, удлиненный элемент, имеющий на одном конце указанный наконечник; где удлиненные элементы расположены в одной связке вдоль друг друга со своими наконечниками на одном конце связки; где каждый элемент зонда изогнут так, чтобы наконечники отклонялись друг от друга; и где активатор элемента зонда имеет оболочку, которая окружает связку способна передвигаться вдоль элементов связки, и где оболочка при приближении к наконечникам вызывает схождение наконечников в направлении, противоположном упругой деформации элементов зонда, в результате чего образуется составной наконечник, а перемещение оболочки от наконечников вдоль связки позволяет наконечникам отклоняться друг от друга из-за их изогнутой формы и способности к упругой деформации.
43. Устройство по п.42, включающее один или несколько высвобождаемых фиксаторов для сохранения оболочки в определенном положении.
44. Устройство по п.37, включающее упруго деформируемый лист, служащий основанием для нескольких элементов зонда, каждый из которых имеет свободный конец, включающий наконечник, где лист способен к преобразованию между конфигурацией, в которой части наконечников отдалены друг от друга, и деформированной конфигурацией, в которой элементы зонда сближаются так, что наконечники образуют композитный наконечник.
45. Устройство по п.35, дополнительно включающее приемник, имеющий закупориваемое отверстие для контакта одного или нескольких реактивов и образца нуклеиновой кислоты; функциональную часть манипулятора, которая обуславливает или обеспечивает вставку зонда через отверстие для помещения образца в приемник.
46. Устройство по п.45, зонд которого имеет закупоривающее устройство, которое при помещении образца в приемник закрывает приемник от выхода или входа материала, содержащего нуклеиновую кислоту.
47. Устройство по п.46, где закупоривающее устройство представляет собой или включает непроницаемый для жидкостей затвор, который присоединен к зонду или является составной частью зонда.
48. Устройство по п.46, включающее закупоривающее устройство, которое присоединено к нескольким зондам или является их составной частью.
49. Устройство по любому из пп.45-48, где закупоривающее устройство и манипулятор избирательно могут быть отделены друг от друга.
50. Устройство по п.35, где манипулятор включает источник, удерживающий несколько зондов так, чтобы они были отделены от окружающей среды; и распределяющий механизм для последовательного представления зондов так, чтобы привести, по меньшей мере, часть из них в контакт с нуклеиновой кислотой.
51. Устройство по п.50, где источник представляет собой или включает сосуд, содержащий один или несколько зондов, причем сосуд имеет отверстие, через которое указанный зонд может выдвигаться при функционировании распределяющего механизма.
52. Устройство по п.51, где выдвигающийся зонд закрывает отверстие сосуда при распределении.
53. Устройство по п.35, где манипулятор имеет один или несколько эжекторов для извлечения, по меньшей мере, одного указанного зонда из манипулятора при его отделении от зонда, причем каждый эжектор функционирует из места на манипуляторе, которое отдалено от извлекаемого зонда.
54. Устройство по п.53, включающее несколько зондов и общий эжектор для извлечения более чем одного зонда из манипулятора.
55. Устройство по п.53, включающее несколько зондов и соответствующее множество эжекторов, причем указанный эжектор способен извлекать указанный зонд.
56. Устройство по п.35, где каждый зонд может быть сконфигурирован для образования наконечника, который можно применять для контакта с нуклеиновой кислотой с целью введения ее образца в приемник при функционировании манипулятора.
57. Устройство по п.56, где, по меньшей мере, один наконечник сделан из полимерного материала или включает полимерный материал, на который налипает ДНК или материал, содержащий нуклеиновую кислоту высших эукариот.
58. Устройство по п.56, где полимерный материал выбран из списка, включающего поликарбонат, стекло, сополимер циклического олефина, такого как Topas, акриловый полимер, такой как РММА, кристаллический полистирол, полипропилен, HDPE, полистирол средней ударной прочности, PVC, жидкий кристаллический полимер 30%, Trans ABS, сополимер ацеталя, полиэфир, полиэфиримид, полиэтилен, нейлон, полиэфир полиуретана, блок-сополимер стирола и бутадиена, статистический сополимер полипропилена, этиленвинилацетат, силоксан, такой как PDMS, и термопластический эластомер, такой как сантопрен.
59. Способ или применение или набор реактивов или устройство по любому из предыдущих пунктов, где устройство для забора образцов или его часть, на которую налипает материал, содержащий нуклеиновую кислоту, обрабатывается так, чтобы оно было ДНК-стерильным, или зонд для удержания указанного образца нуклеиновой кислоты обрабатывается так, чтобы он был ДНК-стерильным.