ИДЕНТИФИКАЦИЯ И ПРИМЕНЕНИЕ МУТАНТНЫХ KRP У РАСТЕНИЙ

1. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение, содержащие по меньшей мере один ген белка (KRP), родственного белку-ингибитору киназы (KIP), где функция одной или нескольких копий гена KRP нарушена, и где нарушение обусловлено одним или несколькими изменениями нуклеотидов гена KRP дикого типа, как изложено в таблицах 2-12, 25 и 29-37.
2. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 1, где растение является однодольным растением, и одно или несколько изменений нуклеотидов гена KRP дикого типа изложены в таблицах 2-12 и 25.
3. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 2, где однодольное растение является видом трибы Triticeae, и одно или несколько изменений нуклеотидов гена KRP дикого типа изложены в таблицах 2-12.
4. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 3, где растение трибы Triticeae является растением рода Triticum.
5. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 4, где растение рода Triticum является пшеницей.
6. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 5, где растение пшеницы является тетраплоидным или гексаплоидным.
7. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 2, где однодольное растение принадлежит виду трибы Oryzeae, и одно или несколько изменений нуклеотидов гена KRP дикого типа изложены в таблице 25.
8. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 7, где растение трибы Oryzeae является растением рода Oryza.
9. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 8, где растение рода Oryza является рисом.
10. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 1, где растение является двудольным растением, и одно или несколько изменений нуклеотидов гена KRP дикого типа изложены в таблицах 29-37.
11. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 10, где двудольное растение принадлежит виду семейства Fabaceae.
12. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 11, где растением семейства Fabaceae является соя.
13. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 12, где растением является Glycine max.
14. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение пшеницы, содержащие по меньшей мере один ген белка (KRP), родственного белку-ингибитору киназы (KIP), где функция одной или нескольких копий гена KRP нарушена, и где нарушение обусловлено одним или несколькими изменениями нуклеотидов гена KRP дикого типа, выбранного из группы, включающей TaKRP1, TaKRP2, TaKRP4, TaKRP5 и TaKRP6.
15. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение пшеницы по п. 14, где пшеница является тетраплоидным растением пшеницы, и нарушенным геном KRP является TaKRP1A, TaKRP1B, TaKRP2A, TaKRP2B, TaKRP4A, TaKRP4B, TaKRP5A, TaKRP5B, TaKRP6A и/или TaKRP6B, и где KRP гексаплоидной пшеницы является TaKRP1A, TaKRP1B,
TaKRP1D, TaKRP2A, TaKRP2B, TaKRP2D, TaKRP4A, TaKRP4B, TaKRP4D, TaKRP5A, TaKRP5B, TaKRP5D, TaKRP6A, TaKRP6B и/или TaKRP6D.
16. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение риса, содержащие по меньшей мере один ген белка (KRP), родственного белку-ингибитору киназы (KIP), где функция одной или нескольких копий гена KRP нарушена, и где нарушение обусловлено одним или несколькими изменениями нуклеотидов гена KRP дикого типа, выбранного из группы, включающей OsKRP1, OsKRP2, OsKRP4 и OsKRP5.
17. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение сои, содержащие по меньшей мере oдин ген белка (KRP), родственного белку-ингибитору киназы (KIP), где функция одной или нескольких копий гена KRP нарушена, и где нарушение обусловлено изменениями одного или нескольких нуклеотидов гена KRP дикого типа, выбранного из группы, включающей Gm0003x00821, Gm0013x00399, Gm0043, Gm0053x00526, Gm0087x00306, Gm0102x00087, Gm0119x00131, Gm0151x00019 и Gm0067x00001.
18. Способ увеличения веса органов, размера органов, количества органов и/или урожая растения трибы Triticeae, трибы Oryzeae или семейства Fabaceae, включающий нарушение одного или нескольких KRP в растении.
19. Способ по п. 18, где органом является семя.
20. Способ по п. 19, где растение трибы Triticeae, является растением рода Triticum, где растение трибы Oryzeae является растением рода Oryza, и где растение семейства Fabaceae является растением рода Glycine.
21. Способ по п. 20, где растение рода Triticum является растением пшеницы, где растение рода Oryza является растением риса, и где растение рода Glycine является растением сои.
22. Способ по п. 18, где KRP в пшенице является TaKRP1, TaKRP2, TaKRP4, TaKRP5 или TaKRP6, KRP в рисе является OsKRP1, OsKRP2, OsKRP4 или OsKRP5, и KRP в сое является Gm0003x00821, Gm0013x00399, Gm0043, Gm0053x00526, Gm0087x00306, Gm0102x00087, Gm0119x00131, Gm0151x00019 или Gm0067x00001.
23. Способ по п. 22, где KRP в тетраплоидном растении пшеницы является TaKRP1A, TaKRP1B, TaKRP2A, TaKRP2B, TaKRP4A, TaKRP4B, TaKRP5A, TaKRP5B или TaKRP6, и где KRP в гексаплоидной пшенице является TaKRP1A, TaKRP1B, TaKRP1D, TaKRP2A, TaKRP2B, TaKRP2D, TaKRP4A, TaKRP4B, TaKRP4D, TaKRP5A, TaKRP5B, TaKRP5D, TaKRP6A, TaKRP6B и TaKRP6C.
24. Способ по п. 18, где функция гена KRP нарушена посредством замены нуклеотида, делеции, вставки, гомологичной рекомбинации, T-ДНК, транспозона, антисмыслового олигонуклеотида, двухцепочечного олигонуклеотида, siRNA, shRNA, инвертированного повтора олигонуклеотидов или их комбинации.
25. Способ по п. 21, где растение пшеницы содержит одну или несколько мутаций, выбранных из любой из мутаций, перечисленных в таблицах 2–12 для определенного гена KRP; где растение риса содержит одну или несколько мутаций, выбранных из любой из мутаций, перечисленных в таблице 25 для определенного гена KRP; и где растение сои содержит одну или несколько мутаций, выбранных из любой из мутаций, перечисленных в таблицах 29–37 для определенного гена KRP.
26. Способ получения растения с увеличенным размером органов, весом органов, количеством органов и/или урожаем по сравнению с растением дикого типа, включающий
i) проведение скрещивания первого растения со вторым растением для получения растения F1, где первое растение трибы Triticeae, трибы Oryzeae или семейства Fabaceae содержит один или несколько нарушенных генов KRP.
27. Способ по п. 26, где способ дополнительно включает
ii) возвратное скрещивание растения F1 с первым или вторым растением и
iii) повторение этапа возвратного скрещивания для получения практически изогенной линии, где один или несколько нарушенных KRP из первого растения интегрированы в геном практически изогенной линии.
28. Способ по п. 26 или 27, где растение трибы Triticeae является растением рода Triticum, где растение трибы Oryzeae является растением рода Oryza, и где растение семейства Fabaceae является растением рода Glycine.
29. Способ по п. 28, где растение рода Triticum является растением пшеницы, где растение рода Oryza является растением риса, и где растение рода Glycine является растением сои.
30. Способ по п. 29, где KRP в пшенице является TaKRP1, TaKRP2, TaKRP4, TaKRP5 или TaKRP6, KRP в рисе является OsKRP1, OsKRP2, OsKRP4 или OsKRP5, и KRP в сое является Gm0003x00821, Gm0013x00399, Gm0043, Gm0053x00526, Gm0087x00306, Gm0102x00087, Gm0119x00131, Gm0151x00019 или Gm0067x00001.
31. Способ по п. 30, где KRP в тетраплоидном растении пшеницы является TaKRP1A, TaKRP1B, TaKRP2A, TaKRP2B, TaKRP4A, TaKRP4B, TaKRP5A, TaKRP5B, TaKRP6A и/или TaKRP6B, и где KRP в гексаплоидной пшенице является TaKRP1A, TaKRP1B, TaKRP1D, TaKRP2A, TaKRP2B, TaKRP2D, TaKRP4A, TaKRP4B, TaKRP4D, TaKRP5A, TaKRP5B, TaKRP5D, TaKRP6A, TaKRP6B и/или TaKRP6D.
32. Способ по п. 26 или 27, где функция гена KRP нарушена посредством замены нуклеотида, делеции, вставки, гомологичной рекомбинации, T-ДНК, транспозона, антисмыслового олигонуклеотида, двухцепочечного олигонуклеотида, siRNA, shRNA, инвертированного повтора нуклеотдиов или их комбинации.
33. Способ по п. 32, где растение является растением пшеницы, содержащим одну или несколько мутаций, выбранных из любой из мутаций, перечисленных в таблицах 2–12 для определенного гена KRP; где растение является растением риса, содержащим одну или несколько мутаций, выбранных из любой из мутаций, перечисленных в таблице 25 для определенного гена KRP; и где растение является растением сои, содержащим одну или несколько мутаций, выбранных из любой из мутаций, перечисленных в таблицах 29–37 для определенного гена KRP.
34. Выделенный полинуклеотид, содержащий последовательность, выбранную из группы, включающей (a) последовательности, представленные в SEQ ID NO: 138, 139, 141, 142, 144 и 145, и их части; (b) последовательности, комплементарные последовательностям, представленным в SEQ ID NO: 138, 139, 141, 142, 144 и 145, и их части; (c) последовательности, обратно комплементарные последовательностям, представленным в SEQ ID NO: 138, 139, 141, 142, 144 и 145, и их части; (d) обратные последовательности последовательностям, представленным в SEQ ID NO: 138, 139, 141, 142, 144 и 145, и их части; и (e) последовательности, обладающие по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью (a)-(d) или со специфическим участком последовательности (a)-(d).
35. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность выбранную из группы, включающей (a) последовательности, представленные в SEQ ID NO: 140, 143 и 146, и их части; (b) последовательности, обладающие по меньшей мере 90% идентичностью с последовательностью (a).
36. Рекомбинантный вектор, рекомбинантная нуклеиновая кислота, растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение, содержащие по меньшей мере один выделенный полинуклеотид по п. 34.
37. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 36, где растение является растением трибы Triticeae.
38. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 37, где растение является растением рода Triticum.
39. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 38, где растение рода Triticum является растением пшеницы.
40. Растительная клетка, часть растения, культура ткани растения или целое растение по п. 39, где растение пшеницы является тетраплоидным или гексаплоидным.