ПОЛУЧЕНИЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ФОТОРАСЩЕПЛЯЕМЫХ ЛИНКЕРОВ

1. Способ получения олигомерного соединения, состоящего из двух или более индивидуальных олигомеров, в котором индивидуальные олигомеры разделены фоторасщепляемым линкером, и который включает стадию расщепления вышеупомянутого линкера.
2. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры независимо выбраны из группы, состоящей из олигонуклеотидов, олигосахаридов и олигопептидов.
3. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой олигонуклеотиды.
4. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой полностью или частично комплементарные олигонуклеотиды.
5. Способ по п.1, в котором индивидуальные олигомеры представляют собой полностью или частично комплементарные олигорибонуклеотиды.
6. Способ по п.1, в котором линкер стабилен в условиях снятия защиты с каждого индивидуального олигомера.
7. Способ по п.1, в котором линкер расщепляют под действием УФ облучения или видимого света.
8. Способ по п.4, в котором вышеназванные олигонуклеотиды представляют собой олигорибонуклеотиды.
9. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы I,
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)C-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из
3
6
4
6
5
СНОСН- и СН-.
или PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси соединения;
Х представляет собой О, N или S;
3
2
2
2
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, O-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', NH, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, и по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
по меньшей мере, один из заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 представляет собой фосфоамидит, фосфонат, или триэфир фосфорной кислоты, несущие группу, способную к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью.
3
2
2
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил.
10. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы II
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)C-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из;
3
6
4
6
5
СНОСН-, СН-,
или
PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси;
Х представляет собой О, N или S;
3
2
2
2
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', СНО, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', NH, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
3
2
2
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', СНО, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил;
U, V, W образуют цепь, которая одним своим концом заменяет один из остатков R1-R5, а другим концом заменяет один из остатков R7-R11;
2
2
2
U, V, W независимо могут отсутствовать или представлять собой алкиленовую (-R-), циклоалкиленовую (-R-), или ариленовую (-Ar-) группу, -O-, -S-, -NR'-, -C(O)-, -C(O)O-, -C(O)NR'-, -OC(O)O-, -OC(O)NR'-, -NR'C(O)NR''-, -OC(S)NR'-, -NR'C(S)NR''-, -S(O)-, -S(O)-, -S(O)NR'-, -OP(O)O-, и могут содержать метку или флуоресцентную группу, или группу, которая служит для улучшения фармакологического профиля олигонуклеотида;
3
2
2
2
R7, R8, R9, R10 и R11 могут быть независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', СНО, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', NH, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, и по меньшей мере один из заместителей R7-R11 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
3
2
2
R12 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил;
Y представляет собой О, N, или S;
Z представляет собой фосфоамидит, фосфонат, или триэфир фосфорной кислоты, способные к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью.
11. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы I
где PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х представляет собой О;
R1 представляет собой нитрогруппу;
2
2
2
2
R3 представляет собой -CH-O-P(N[iPr])-O-CH-CH-CN);
R2, R4, R5 и R6 представляет собой водород;
12. Способ по любому из пп.1-8, в котором линкер представляет собой соединение формулы II
где PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х и Y представляют собой О;
R1 и R7 представляют собой нитрогруппы;
R2, R4, R5, R6, R8, R10, R11 и R12 представляют собой водород;
U представляет собой кислород и замещает R3;
2
2
2
V представляет собой -СН-СН-СН-;
W представляет собой кислород и замещает R9;
2
2
2
Z представляет собой -P(N[iPr])-O-CH-CH-CN).
13. Соединение формулы I
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)С-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из
3
6
4
6
5
СНОСН- и СН-,
или
PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси;
Х представляет собой О, N или S;
3
2
2
2
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', NH, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
по меньшей мере один из заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 представляет собой фосфоамидит, фосфонат, или триэфир фосфорной кислоты, несущие группу, способную к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью;
3
2
2
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил.
14. Соединение по п.13, где
PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х представляет собой О;
R1 представляет собой нитрогруппу;
2
2
2
2
R3 представляет собой -CH-O-P(N[iPr])-O-CH-CH-CN);
R2, R4, R5, и R6 представляют собой водород;
15. Соединение формулы II
где PG представляет собой (Ar1)(Ar2)(Ar3)C-, где Ar1, Ar2, Ar3 независимо выбраны из группы, состоящей из
3
6
4
6
5
CHOCH- и СН-,
или
PG представляет собой замещенную силильную группу (R1')(R2')(R3')Si-,
где R1', R2', R3' независимо выбраны из группы, содержащей низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилокси или арилокси соединения;
Х представляет собой О, N или S;
3
2
2
2
R1, R2, R3, R4 и R5 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', NH, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, по меньшей мере один из заместителей R1-R5 представляет собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
два или более заместителей R1, R2, R3, R4 и R5 могут образовывать один или более циклов, которые могут быть далее замещены группами, описанными для R1, R2, R3, R4 и R5;
3
2
2
R6 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил.
U, V, W образуют цепь, которая одним своим концом заменяет один из остатков R1-R5, а другим концом заменяет один из остатков R7-R11;
2
2
2
U, V, W независимо могут отсутствовать или представлять собой алкиленовую (-R-), циклоалкиленовую (-R-), или ариленовую (-Ar-) группу, -O-, -S-, -NR'-, -C(O)-, -C(O)O-, -C(O)NR'-, -OC(O)O-, -OC(O)NR'-, -NR'C(O)NR''-, -OC(S)NR'-, -NR'C(S)NR''-, -S(O)-, -S(O)-, -S(O)NR'-, -OP(O)O-, и могут содержать метку или флуоресцентную группу, или группу, которая служит для улучшения фармакологического профиля олигонуклеотида;
3
2
2
2
R7, R8, R9, R10, и R11 независимо выбраны из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, галоген, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, ОН, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, SH, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', NH, N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил, и по меньшей мере один из заместителей R7-R11 представляют собой нитро-, нитрозо-, или диазогруппу;
3
2
2
R12 выбран из группы, содержащей водород, низшие алкилы, арилы, арил низшие алкилы, низшие алкиларилы, низшие алкилгалогены, CN, СООН, С(O)O-низший алкил/арил, CONR'R'', CHO, С(O)-низший алкил/арил, О-низший алкил/арил, ОС(O)-низший алкил/арил, S-низший алкил/арил, SOH, SOO-низший алкил/арил, SONR'R'', N-низший алкил/арил, NHC(O) низший алкил/арил;
Y представляет собой О, N, или S;
Z представляет собой фосфоамидит, фосфонат или триэфир фосфорной кислоты, несущие группу, способную к образованию фосфодиэфирной или фосфотиоэфирной связи с растущей олигонуклеотидной цепью, или амин, активированный сложный эфир карбоновой кислоты, изоцианат или изотиоцианат, способные образовывать амид, карбамат или тиокарбамат с растущей олигонуклеотидной цепью.
16. Соединение по п.15, где
PG представляет собой диметокситрифенилметил;
Х представляет собой О;
R1 представляет собой нитрогруппу;
2
2
2
2
R3 представляет собой -CH-O-P(N[iPr])-O-CH-CH-CN);
R2, R4, R5, и R6 представляют собой водород.