КОМБИНИРОВАННАЯ ТЕРАПИЯ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ РАКА ПУТЕМ ВНУТРИВЕННОГО ВВЕДЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО MVA И АНТИТЕЛА

1. Фармацевтическая комбинация снижения размера опухоли и/или повышении выживаемости онкологического пациента, содержащая:
a) рекомбинантный модифицированный вирус осповакцины Анкара (MVA), содержащий первую нуклеиновую кислоту, кодирующую первый гетерологичный опухолеассоциированный антиген (ОАА), который при внутривенном введении индуцирует как усиленный ответ естественных клеток-киллеров (NK), так и усиленный ответ Т-клеток по сравнению с ответом NK-клеток и ответом Т-клеток, индуцированным невнутривенным введением рекомбинантного вируса MVA, содержащего нуклеиновую кислоту, кодирующую гетерологичный ОАА; и
b) антитело, где антитело содержит Fc-домен и является специфическим к антигену, который экспрессируется на клеточной мембране опухолевой клетки;
причем введение a) и b) онкологическому пациенту снижает размер опухоли и/или повышает уровень выживаемости онкологического пациента по сравнению с не-в/в введением a) или введением b) отдельно.
2. Фармацевтическая комбинация по п. 1, дополнительно содержащая CD40L.
3. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1, 2, отличающаяся тем, что CD40L кодируется рекомбинантным вирусом MVA.
4. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-3, отличающаяся тем, что рекомбинантный MVA дополнительно содержит вторую нуклеиновую кислоту, кодирующую второй гетерологичный ОАА.
c
1
2
5. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-4, отличающаяся тем, что первый и/или второй ОАА выбраны из группы, состоящей из: 5-α-редуктазы, α-фетопротеина («AFP»), AM-1, APC, April, гена антигена меланомы B («BAGE»), β-катенина, Bcl12, bcr-abl, Brachyury, CA-125, каспазы-8 («CASP-8», также известный как «FLICE»), катепсинов, CD19, CD20, CD21/рецептора комплемента 2 («CR2»), CD22/BL-CAM, CD23/FεRII, CD33, CD35/рецептора комплемента 1 («CR1»), CD44/PGP-1, CD45/общего антигена лейкоцитов («LCA»), CD46/мембранного кофакторного белка («MCP»), CD52/CAMPATH-1, CD55/фактора ускорения распада («DAF»), CD59/протектина, CDC27, CDK4, карциноэмбрионального антигена («CEA»), c-myc, циклооксигеназы-2 («cox-2»), удаленного при колоректальном раке гена («DCC»), DcR3, E6/E7, CGFR, EMBP, Dna78, фарнезилтрансферазы, фактора роста фибробластов-8a («FGF8a»), фактора роста фибробластов-8b («FGF8b»), FLK-1/KDR, рецептора фолиевой кислоты, G250, семейства генов антигена меланомы G («GAGE-семейство»), гастрина 17, гастрин-высвобождающего гормона, ганглиозида 2 («GD2»)/ганглиозида 3 («GD3»)/ганглиозида-моносиаловой кислоты-2 («GM2»), гонадотропин-высвобождающего гормона («GnRH»), UDP-GlcNAc:RMan(α1-6)R [GlcNAc до Man(α1-6)] β1,6-N-ацетилглюкозаминилтрансферазы V («GnT V»), GP1, gp100/Pme117, gp-100-in4, gp15, gp75/тирозин-родственного белка-1 («gp75/TRP-1»), человеческого хорионического гонадотропина («hCG»), гепараназы, HER2, вируса опухоли молочной железы человека («HMTV»), белка теплового шока 70 кДа («HSP70»), человеческой обратной транскриптазы теломеразы («hTERT»), рецептора инсулин-подобного фактора роста-1 («IGFR-1»), рецептора интерлейкина-13 («IL-13R»), индуцибельной синтазы оксида азота («iNOS»), Ki67, KIAA0205, K-ras, H-ras, N-ras, KSA, LKLR-FUT, гена, кодирующего антиген меланомы 1 («MAGE-1»), гена, кодирующего антиген меланомы 2 («MAGE-2»), гена, кодирующего антиген меланомы 3 («MAGE-3»), гена, кодирующего антиген меланомы 4 («MAGE-4»), маммаглобина, MAP17, мелан-A/антигена меланомы, распознаваемого Т-клетками 1 («MART-1»), мезотелина, MIC A/B, MT-MMP, муцина, специфического для семенников антигена NY-ESO-1, остеонектина, p15, P170/MDR1, p53, p97/меланотрансферрина, PAI-1, тромбоцитарного фактора роста («PDGF»), μPA, PRAME, пробазина, прогенипоиетина, простатического специфического антигена («PSA»), простат-специфического мембранного антигена («PSMA»), RAGE-1, Rb, RCAS1, SART-1, SSX-семейства, STAT3, STn, TAG-72, трансформирующего фактора роста альфа («TGF-α»), трансформирующего фактора роста бета («TGF-β»), тимозина-бета-15, фактора некроза опухоли альфа («TNF-α»), TP1, TRP-2, тирозиназы, фактора роста эндотелия сосудов («VEGF»), ZAG, p16INK4 и глутатион-S-трансферазы («GST»).
6. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-5, отличающаяся тем, что первый и/или второй ОАА содержат одну или более мутаций для предотвращения связывания антитела с первым и/или вторым ОАА.
7. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-6, отличающаяся тем, что первый ОАА представляет собой HER2.
8. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-7, отличающаяся тем, что антиген HER2 содержит по меньшей мере одну мутацию для предотвращения a) связывания антитела к HER2 с антигеном HER2; b) предотвращения внеклеточной димеризации антигена HER2; c) предотвращения тирозинкиназной активности антигена HER2; и/или d) предотвращения фосфорилирования антигена HER2.
9. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что антиген HER2 содержит по меньшей мере одну мутацию, выбранную из группы, состоящей из: E580A, F595A, K615A, H318A, L317A, D277R, E280K, K753M и Y1023A.
10. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что антиген HER2 содержит по меньшей мере одну мутацию, выбранную из группы, состоящей из: E580A, F595A, K615A, H267A, F279A, V308A, S310A, H318A, L317A, K333A, P337A, D277R, E280K, K753M и Y1023A.
11. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота кодирует антиген HER2, имеющий по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:1.
12. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота кодирует антиген HER2, имеющий по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO: 13.
13. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота кодирует SEQ ID NO: 1.
14. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота кодирует SEQ ID NO: 13.
15. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота содержит нуклеиновую кислоту, имеющую по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO: 2.
16. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота содержит нуклеиновую кислоту, имеющую по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO: 14.
17. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота содержит нуклеиновую кислоту, выбранную из SEQ ID NO:2 и SEQ ID NO:3.
18. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота содержит SEQ ID NO:2.
19. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-8, отличающаяся тем, что первая нуклеиновая кислота содержит SEQ ID NO: 14.
20. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-19, отличающаяся тем, что второй ОАА представляет собой Brachyury.
21. Фармацевтическая комбинация по п. 20, отличающаяся тем, что антиген Brachyury содержит одну или более мутаций для предотвращения ядерной локализации.
22. Фармацевтическая комбинация по п. 21, отличающаяся тем, что вторая нуклеиновая кислота кодирует антиген Brachyury, имеющий по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:3.
23. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 21, 22, отличающаяся тем, что вторая нуклеиновая кислота кодирует антиген Brachyury, содержащий SEQ ID NO:3.
24. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 21, 22, отличающаяся тем, что вторая нуклеиновая кислота содержит нуклеиновую кислоту, имеющую по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:4.
25. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 21-24, отличающаяся тем, что вторая нуклеиновая кислота содержит SEQ ID NO:4.
26. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-25, отличающаяся тем, что антитело выбрано из группы, состоящей из: анти-CD20 (например, ритуксимаб; офатумумаб; тозитумомаб), анти-CD52 (например, алемтузумаб Кампат), анти-EGFR (например, цетуксимаб Эрбитукс, панитумумаб), анти-CD2 (например, сиплизумаб), анти-CD37 (например, BI836826), анти-CD123 (например, JNJ-56022473), анти-CD30 (например, XmAb2513), анти-CD38 (например, даратумумаб Дарзалекс), анти-PDL1 (например, авелумаб, атезолизумаб, дурвалумаб), анти-GD2 (например, 3F8, ch14.18, KW-2871, динутуксимаб), анти-CEA, анти-MUC1, анти-FLT3, анти-CD19, анти-CD40, анти-SLAMF7, анти-CCR4, анти-B7-H3, анти-ICAM1, анти-CSF1R, анти-CA125 (например ореговомаб), анти-FRα (например MOv18-IgG1, мирветуксимаб соравтанзин (IMGN853), MORAb-202), анти-мезотелина (например MORAb-009) и анти-HER2.
27. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-26, отличающаяся тем, что антитело является специфическим к антигену HER2.
28. Фармацевтическая комбинация по пп. 1-27, отличающаяся тем, что антитело выбрано из пертузумаба, трастузумаба, Герзумы, ABP 980 и адо-трастузумаба эмтанзина.
29. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-28, отличающаяся тем, что MVA представляет собой MVA-BN или производное MVA-BN.
30. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-29, отличающаяся тем, что a) вводят одновременно или после b).
31. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-30, отличающаяся тем, что a) и b) вводят онкологическому пациенту в виде примирующего введения с последующими одним или более бустерными введениями a) и b) онкологическому пациенту.
32. Фармацевтическая комбинация по любому из пп. 1-31, отличающаяся тем, что онкологический пациент имеет и/или у него диагностирован рак, выбранный из группы, состоящей из: рака молочной железы, рака легкого, рака головы и шеи, рака щитовидной железы, меланомы, рака желудка, рака мочевого пузыря, рака почки, рака печени, меланомы, рака поджелудочной железы, рака предстательной железы, рака яичника или колоректального рака.
33. Фармацевтическая комбинация по п. 32, отличающаяся тем, что рак молочной железы представляет собой рак молочной железы со сверхэкспрессией HER2.
34. Синтетический полипептид HER2, отличающийся тем, что одна или более аминокислот HER2 мутированы для предотвращения связывания антигена HER2 с антителом к HER2.
35. Синтетический полипептид HER2, отличающийся тем, что одна или более аминокислот HER2 мутированы для предотвращения внеклеточной димеризации, тирозинкиназной активности и/или фосфорилирования антигена HER2.
36. Синтетический полипептид HER2 по любому из пп. 34, 35, отличающийся тем, что одна или более мутаций введены по меньшей мере в одну из 3 петель околомембранной области HER2.
37. Синтетический полипептид HER2 по любому из пп. 34-36, отличающийся тем, что 3 петли околомембранной области HER2 выбраны из аминокислот 579-583 (петля 1), 592-595 (петля 2) и 615-625 (петля 3).
38. Синтетический полипептид HER2 по любому из пп. 34-37, отличающийся тем, что полипептид HER2 содержит по меньшей мере одну мутацию по меньшей мере в одной из аминокислот H267, Y274, S310, L317, H318, K333, E580, D582, P594, F595, K615 и Q624.
39. Синтетический полипептид HER2 по любому из пп. 34-38, отличающийся тем, что полипептид HER2 содержит по меньшей мере одну мутацию, выбранную из группы, состоящей из: E580A, F595A, K615A, H267A, F279A, V308A, S310A, H318A, L317A, K333A, P337A, D277R, E280K, K753M и Y1023A.
40. Синтетический полипептид HER2 по любому из пп. 34-39, отличающийся тем, что полипептид HER2 содержит по меньшей мере одну мутацию в аминокислотах 1139-1248.
41. Синтетический полипептид HER2 по любому из пп. 34-40, отличающийся тем, что полипептид HER2 содержит по меньшей мере одну делецию в аминокислотах 1139-1248.
42. Синтетический полипептид HER2 по любому из пп. 34-41, отличающийся тем, что полипептид HER2 содержит делецию аминокислот 1139-1248.
43. Синтетический полипептид HER2, имеющий по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:1.
44. Синтетический полипептид HER2, содержащий SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO: 13.
45. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HER2, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO: 13.
46. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HER2, содержащий SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO: 13.
47. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, имеющая по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:2 или SEQ ID NO: 14.
48. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO:2 или SEQ ID NO: 13.
49. Синтетический полипептид Brachyury, отличающийся тем, что одна или более аминокислот мутированы для предотвращения ядерной локализации.
50. Синтетический полипептид Brachyury по п. 49, отличающийся тем, что Brachyury содержит одну или более мутаций в домене сигнала ядерной локализации (СЯЛ).
51. Синтетический полипептид Brachyury по любому из пп. 49, 50, отличающийся тем, что в полипептиде Brachyury удален домен СЯЛ.
52. Синтетический полипептид Brachyury по пп. 49-51, отличающийся тем, что в антигене Brachyury удален домен СЯЛ.
53. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая модифицированный полипептид Brachyury, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:3.
54. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая модифицированный полипептид Brachyury, содержащий SEQ ID NO:3.
55. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, имеющая по меньшей мере 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичности с SEQ ID NO:4.
56. Синтетическая последовательность нуклеиновой кислоты, содержащая SEQ ID NO:4.
57. Рекомбинантный поксвирус, содержащий синтетическую нуклеиновую кислоту по любому из пп. 34-56.
58. Рекомбинантный поксвирус по п. 57, отличающийся тем, что поксвирус выбран из ортопоксвируса и авипоксвируса.
59. Рекомбинантный поксвирус по п. 58, отличающийся тем, что ортопоксвирус выбран из вируса осповакцины, модифицированного вируса осповакцины Анкара (MVA), MVA-BN и производных MVA-BN.
60. Рекомбинантный поксвирус по п. 59, отличающийся тем, что авипоксвирус представляет собой поксвирус кур.
61. Способ снижения размера опухоли и/или повышении выживаемости онкологического пациента, включающий введение пациенту фармацевтической комбинации по любому из пп. 1-33.