SYNGR4 В КАЧЕСТВЕ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ ДЛЯ ТЕРАПИИ И ДИАГНОСТИКИ РАКА

1. Способ диагностики рака легкого, где указанный способ включает следующие стадии:
(a) определение уровня экспрессии гена в полученном из организма субъекта биологическом образце одним из способов, выбранных из группы, состоящей из:
(i) детектирования мРНК гена SYNGR4,
(ii) детектирования белка SYNGR4;
(iii) детектирования биологической активности белка SYNGR4; и
(b) сопоставление повышения в уровне экспрессии, определяемом на стадии (a), по сравнению с нормальным контрольным уровнем гена, с наличием рака легкого.
2. Способ по п.1, согласно которому уровень экспрессии, определяемый на стадии (a), по меньшей мере на 10% выше, чем нормальный контрольный уровень.
3. Способ по п.1, согласно которому уровень экспрессии, определяемый на стадии (a), определяется путем детектирования связывания антитела против белка SYNGR4.
4. Способ по п.1, согласно которому полученный из организма субъекта биологический образец включает биопсию, мокроту, кровь, плевральный выпот или мочу.
5. Способ оценки или определения прогноза в отношении пациента с раком легкого, где указанный способ включает следующие стадии:
(a) детектирование уровня экспрессии гена в полученном из организма субъекта биологическом образце;
(b) сравнение детектируемого уровня экспрессии с контрольным уровнем; и
(c) определение прогноза в отношении пациента на основе сравнения (b),
при этом геном является ген SYNGR4.
6. Способ по п.5, согласно которому контрольный уровень является прогностически хорошим контрольным уровнем, а повышение уровня экспрессии по сравнению с указанным контрольным уровнем определяется как плохой прогноз.
7. Способ по п.5, согласно которому указанное повышение по меньшей мере на 10% выше, чем указанный контрольный уровень.
8. Способ по п.5, согласно которому уровень экспрессии определяется любым из способов, выбранных из группы, состоящей из:
(a) детектирования мРНК [гена] SYNGR4,
(b) детектирования белка SYNGR4; и
(c) детектирования биологической активности белка SYNGR4.
9. Способ по п.5, согласно которому полученный из организма субъекта биологический образец включает биопсию, мокроту или кровь, плевральный выпот или мочу.
10. Набор для диагностики рака легкого или для оценки или определения прогноза в отношении пациента с раком легкого, включающий реагент, выбранный из группы, состоящей из:
(a) реагента для детектирования мРНК гена;
(b) реагента для детектирования белка, кодируемого указанным геном; и
(c) реагента для детектирования биологической активности указанного белка, при этом геном является ген SYNGR4.
11. Набор по п.10, в котором указанным реагентом является зонд к генному транскрипту указанного гена.
12. Набор по п.10, в котором указанным реагентом является антитело против белка, кодируемого указанным геном.
in vivo
13. Изолированная двухцепочечная молекула, которая, при введении ее в клетку, ингибирует  экспрессию SYNGR4, а также клеточную пролиферацию, при этом указанная молекула содержит смысловую цепь и комплементарную ей антисмысловую цепь, причем указанные цепи гибридизуются друг с другом с образованием двухцепочечной молекулы.
14. Двухцепочечная молекула по п.13, в которой смысловая цепь содержит последовательность, соответствующую последовательности-мишени, выбранной из группы, состоящей из последовательностей SEQ ID NO: 11, 12, 19 и 20.
15. Двухцепочечная молекула по п.14, в которой смысловая цепь гибридизуется с антисмысловой цепью последовательности-мишени, с образованием двухцепочечной молекулы, имеющей в длину от 19 до 25 пар нуклеотидов.
16. Двухцепочечная молекула по п.13, которая состоит из одноцепочечного нуклеотида, содержащего обе цепи, смысловую и антисмысловую, соединенные одноцепочечным интроном.
17. Двухцепочечная молекула по п.16, которая имеет общую формулу 5'-[A]-[B]-[A']-3', в которой [A] представляет собой смысловую цепь, содержащую последовательность, соответствующую последовательности-мишени, выбранной из группы, состоящей из последовательностей SEQ ID NO: 11, 12, 19 и 20, [B] представляет собой одноцепочечный интрон, состоящий из 3-23 нуклеотидов, и [A'] представляет собой антисмысловую цепь, содержащую последовательность, комплементарную [A].
18. Вектор, кодирующий двухцепочечную молекулу по пп.13-17.
19. Вектор, содержащий комбинацию полинуклеотида, содержащего смысловую цепь нуклеиновой кислоты и антисмысловую цепь нуклеиновой кислоты, где указанная смысловая цепь нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 11, 12, 19 или 20, а указанная антисмысловая цепь нуклеиновой кислоты состоит из последовательности, комплементарной смысловой цепи, причем транскрипты указанной смысловой цепи и указанной антисмысловой цепи гибридизуются друг с другом с образованием двухцепочечной молекулы, и при этом указанный вектор, при введении его в клетку, экспрессирующую ген SYNGR4, ингибирует экспрессию указанного гена.
20. Способ лечения злокачественной опухоли, экспрессирующей по меньшей мере один ген, выбранный из группы, состоящей из гена SYNGR4, где указанный способ включает стадию введения по меньшей мере одной изолированной двухцепочечной молекулы по п.13 или вектора по п.18 или 19.
21. Способ по п.20, согласно которому подлежащей лечению злокачественной опухолью является рак легкого.
22. Композиция для лечения злокачественной опухоли, экспрессирующей ген SYNGR4, при этом указанная композиция включает по меньшей мере одну изолированную двухцепочечную молекулу по п.13 или вектор по п.18 или 19.
23. Композиция по п.22, в которой подлежащей лечению злокачественной опухолью является рак легкого.
24. Способ скрининга соединения-кандидата, предназначенного для лечения или профилактики рака легкого, или же для ингибирования роста злокачественных клеток рака легкого, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) приведение тестируемого соединения в контакт с полипептидом, кодируемым полинуклеотидом SYNGR4;
(b) детектирование активности связывания между полипептидом и тестируемым соединением; и
(c) выбор соединения, которое связывается с указанным полипептидом.
25. Способ скрининга соединения-кандидата, предназначенного для лечения или профилактики рака легкого, или же для ингибирования роста злокачественных клеток рака легкого, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) приведение тестируемого соединения в контакт с полипептидом, кодируемым полинуклеотидом SYNGR4;
(b) детектирование биологической активности полипептида со стадии (a); и
(c) выбор тестируемого соединения, которое вызывает супрессию биологической активности полипептида, кодируемого полинуклеотидом SYNGR4, по сравнению с биологической активностью указанного полипептида в отсутствие указанного тестируемого соединения.
26. Способ по п.25, согласно которому указанная биологическая активность выбрана из группы, состоящей из облегчения клеточной пролиферации и клеточной инвазии.
27. Способ скрининга соединения-кандидата, предназначенного для лечения или профилактики рака легкого, или же для ингибирования роста злокачественных клеток рака легкого, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) приведение соединения-кандидата в контакт с клеткой, экспрессирующей SYNGR4; и
(b) выбор соединения-кандидата, которое уменьшает уровень экспрессии SYNGR4 по сравнению с уровнем экспрессии, детектируемым в отсутствие указанного тестируемого соединения.
28. Способ скрининга соединения-кандидата, предназначенного для лечения или профилактики рака легкого, или же для ингибирования роста злокачественных клеток рака легкого, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) приведение соединения-кандидата в контакт с клеткой, в которую встроен вектор, содержащий область регуляции транскрипции SYNGR4 и репортерный ген, который экспрессируется под контролем области регуляции транскрипции;
(b) измерение уровня экспрессии или активности указанного репортерного гена; и
(c) выбор соединения-кандидата, которое снижает уровень экспрессии или активности указанного репортерного гена по сравнению с контролем.
29. Композиция для лечения или профилактики рака легкого, где указанная композиция включает фармацевтически эффективное количество анти-SYNGR4-антитела или его фрагмента.
30. Способ лечения или профилактики рака легкого у субъекта, предусматривающий введение указанному субъекту анти-SYNGR4-антитела или его фрагмента.
31. Способ скрининга соединения-кандидата, предназначенного для ингибирования связывания между полипептидом SYNGR4 и полипептидом GRB2, или же лечения или профилактики злокачественной опухоли, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) приведение полипептида SYNGR4 или его функционального эквивалента в контакт с полипептидом GRB2 или его функциональным эквивалентом в присутствии тестируемого соединения;
(b) детектирование связывания между указанными полипептидами;
(c) сравнение уровня связывания, детектируемого на стадии (b), с таковыми, детектируемыми в отсутствие тестируемого соединения; и
(d) выбор тестируемого соединения, которое ослабляет или ингибирует уровень связывания по сравнению с таковыми, детектируемыми в отсутствие тестируемого соединения на стадии (с).
32. Способ по п.31, согласно которому функциональный эквивалент SYNGR4 содержит тирозин-46.
33. Способ скрининга соединения-кандидата, предназначенного для ингибирования фосфорилирования SYNGR4 или для лечения или профилактики злокачественной опухоли, включающий стадии:
(a) приведение полипептида SYNGR4 или его функционального эквивалента в контакт с тестируемым соединением в условиях, которые позволяют осуществление фосфорилирования указанного полипептида;
(b) детектирование уровня фосфорилирования остатка тирозина-46 полипептида, описанного на стадии (a);
(c) сравнение уровня фосфорилирования остатка тирозина-46 в полипептиде с уровнем фосфорилирования остатка тирозина-46 в белке, детектируемым в отсутствие указанного соединения; и
(d) выбор соединения, которое снижает уровень фосфорилирования остатка тирозина-46 указанного полипептида, в качестве соединения-кандидата.
34. Способ скрининга соединения-кандидата, предназначенного для ингибирования активности SYNGR4 фосфорилирования низлежащих эффекторов, или же для лечения или профилактики злокачественной опухоли, включающий стадии:
(a) приведение тестируемого соединения в контакт с полипептидом, кодируемым полинуклеотидом SYNGR4 в присутствии полипептида, кодируемого полинуклеотидом GRB2 и PAK1, в условиях, которые позволяют осуществление фосфорилирования по меньшей мере одного из низлежащих эффекторов SYNGR4, выбранных из группы, состоящей из PAK1, c-Raf, MEK1, MEK1/2 и ERK1/2;
(b) детектирование уровня фосфорилирования низлежащего эффектора SYNGR4; и
(c) выбор тестируемого соединения, которое вызывает супрессию уровня фосфорилирования низлежащего эффектора SYNGR4 по сравнению с уровнем фосфорилирования низлежащего эффектора SYNGR4, детектируемым в отсутствие тестируемого соединения.
35. Способ по п.34, согласно которому подлежащий детектированию уровень фосфорилирования низлежащего эффектора SYNGR4 соответствует уровню фосфорилирования Thr423 полипептида PAK1, Ser338 полипептида c-Raf, Ser 298 полипептида MEK1, Ser217/221 полипептида MEK1/2 и Thr202/204 полипептида ERK1/2, соответственно.
36. Способ по любому из пп.31-35, согласно которому указанной злокачественной опухолью является рак легкого.