ТАГМЕНТАЦИЯ С ПРИМЕНЕНИЕМ ИММОБИЛИЗОВАННЫХ ТРАНСПОСОМ С ЛИНКЕРАМИ

1. Комплекс транспосомы, содержащий:
(i) транспозазу,
(ii) первый транспозон, содержащий:
(a) 3'-часть, содержащую концевую последовательность первого транспозона; и
(b) первую адапторную последовательность на 5'-конце концевой последовательности первого транспозона;
(iii) второй транспозон, содержащий концевую последовательность второго транспозона, комплементарную по меньшей мере части концевой последовательности первого транспозона; и
(iv) линкер, не являющийся нуклеиновой кислотой, имеющий первый конец, присоединенный к 3'-концу второго транспозона, и второй конец, присоединенный к аффинному элементу.
2. Комплекс по п. 1, отличающийся тем, что указанные линкер и аффинный элемент имеют структуру формулы (I):
,
где
АЭ представляет собой аффинный элемент;
2-6
Y представляет собой Салкилен;
1
1
X представляет собой О, NR или S;
1
1-10
где R представляет собой Н или алкил C;
n представляет собой целое число от 1 до 6;
2
2
X представляет собой О, СН или S;
a
R представляет собой Н или -ОН; и
a
a
2
Z отсутствует, если R представляет собой Н, или представляет собой CH, если R представляет собой Н или ОН;
при этом символом  обозначена точка присоединения ко второму транспозону.
3. Комплекс по п. 2, отличающийся тем, что фосфатная группа в формуле (I) соединена с 3'-гидроксилом концевого нуклеотида указанного второго транспозона.
4. Комплекс по п. 2, отличающийся тем, что АЭ содержит или представляет собой необязательно замещенный биотин или аминогруппу.
5. Комплекс по п. 2, отличающийся тем, что указанный линкер и аффинный элемент имеют структуру формулы (I')
,
2
отличающийся тем, что Z отсутствует или представляет собой CH.
6. Комплекс по п. 2, отличающийся тем, что указанный линкер и аффинный элемент имеют структуру формулы (Ia)
7. Комплекс по п. 2, отличающийся тем, что указанный линкер и аффинный элемент имеют структуру формулы (Ib) или (Ic)
где n представляет собой 1 или 2;
2
2
X представляет собой О или СН; и
2
Z отсутствует или представляет собой CH.
8. Комплекс по п. 2, отличающийся тем, что указанный линкер и аффинный элемент имеют структуру, выбранную из группы, состоящей из
9. Комплекс по п. 1, отличающийся тем, что указанная транспозаза представляет собой транспозазу Tn5.
10. Комплекс по п. 9, отличающийся тем, что концевая последовательность первого транспозона и концевая последовательность второго транспозона представлены ME и ME'.
11. Комплекс по п. 1, отличающийся тем, что первая адапторная последовательность содержит последовательность праймера.
12. Первый комплекс по п. 11, отличающийся тем, что указанная первая адапторная последовательность содержит первую последовательность праймера, в смеси, содержащей второй комплекс по п. 11, причем указанная первая адапторная последовательномть второго комплекса содержит вторую последовательность праймера.
13. Комплексы по п. 12, отличающиеся тем, что первая последовательность праймера содержит А14, а вторая последовательность праймера содержит В15.
14. Комплекс по п. 1, отличающийся тем, что указанный аффинный элемент связан с партнером для аффинного связывания на твердой подложке, за счет чего указанный комплекс связан с указанной твердой подложкой.
15. Комплекс по п. 14, отличающийся тем, что указанный аффинный элемент представляет собой биотин, а партнер для аффинного связывания представляет собой стрептавидин.