СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ХАРАКТЕРИСТИК ПО МЕНЬШЕЙ МЕРЕ ОДНОГО МИКРООРГАНИЗМА С ПОМОЩЬЮ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ

1. Способ определения характеристик по меньшей мере одного микроорганизма из образца, который включает идентификацию указанного по меньшей мере одного микроорганизма и определение характеристик типирования, потенциальной устойчивости по меньшей мере к одному антимикробному средству и фактора вирулентности, отличающийся тем, что определение характеристик типирования, устойчивости по меньшей мере к одному антимикробному средству и фактора вирулентности для указанного по меньшей мере одного микроорганизма осуществляют масс-спектрометрией с использованием белков, пептидов и/или метаболитов в качестве маркеров указанных характеристик типирования, устойчивости по меньшей мере к одному антимикробному средству и фактора вирулентности.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что масс-спектрометрия, применяемая для определения характеристик типирования, потенциальной устойчивости по меньшей мере к одному антимикробному средству и фактора вирулентности, представляет собой спектрометрию типа MS/MS.
3. Способ по п.2, отличающийся тем, что спектрометрия MS/MS представляет собой MRM.
4. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что определение характеристик типирования, устойчивости по меньшей мере к одному антимикробному средству и фактора вирулентности осуществляют в одном устройстве для масс-спектрометрии.
5. Способ по п.4, отличающийся тем, что определение характеристик типирования, устойчивости по меньшей мере к одному антимикробному средству и фактора вирулентности осуществляют одновременно.
6. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что идентификацию указанного по меньшей мере одного микроорганизма также осуществляют масс-спектрометрией.
7. Способ по п.6, отличающийся тем, что масс-спектрометрия для идентификации указанного по меньшей мере одного микроорганизма представляет собой спектрометрию типа MS, типа MS/MS или типа MS с последующей спектрометрией типа MS/MS.
8. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что он включает дополнительную стадию подтверждения идентификации указанного по меньшей мере одного микроорганизма, которую осуществляют с помощью масс-спектрометрии.
9. Способ по п.8, отличающийся тем, что масс-спектрометрия стадии подтверждения представляет собой масс-спектрометрию типа MS/MS.
10. Способ по п.9, отличающийся тем, что масс-спектрометрия стадии подтверждения представляет собой MRM.
11. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что маркеры указанных характеристик типирования, устойчивости по меньшей мере к одному антимикробному средству и фактора вирулентности представляют собой белки указанного по меньшей мере одного микроорганизма.
12. Способ по п.11, отличающийся тем, что белки указанного микроорганизма расщепляют на пептиды.
13. Способ по п.12, отличающийся тем, что расщепление осуществляют с помощью фермента.
14. Способ по п.13, отличающийся тем, что фермент представляет собой трипсин.
15. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один микроорганизм представляет собой бактерию, и антимикробное средство представляет собой антибиотик.
16. Способ по п.15, отличающийся тем, что бактерия представляет собой Staphylococcus aureus.
17. Способ по п.16, отличающийся тем, что для определения характеристик типирования используется по меньшей мере один пептид, имеющий последовательностей SEQ ID NO:2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 19, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29, 30, 32, 34, 35, 37, 38, 40, 42, 44 или 45.
18. Способ по п.16 или 17, отличающийся тем, что для определения характеристик потенциальной устойчивости по меньшей мере к одному антибиотику используется по меньшей мере один пептид, имеющий любую из последовательностей SEQ ID NO:10-17.
19. Способ по п.16 или 17, отличающийся тем, что для определения вирулентности используется по меньшей мере один пептид, имеющий последовательность SEQ ID NO:19, 20, 21, 23 или 24.
20. Способ по п.16 или 17, отличающийся тем, что для идентификации используется по меньшей мере один пептид, имеющий последовательность SEQ ID NO:26, 27, 29, 30, 32, 34, 35, 37, 38, 40, 42, 44 или 45.
21. Способ по п.15, отличающийся тем, что бактерия представляет собой Escherichia coli.
22. Способ по п.21, отличающийся тем, что для определения характеристик типирования используется по меньшей мере один пептид, имеющий любую из последовательностей SEQ ID NO:46-87.
23. Способ по п.21 или 22, отличающийся тем, что для определения характеристик потенциальной устойчивости по меньшей мере к одному антибиотику используется по меньшей мере один пептид, имеющий последовательность SEQ ID NO:85, 86 или 87.
24. Способ по п.21 или 22, отличающийся тем, что для определения вирулентности используется по меньшей мере один пептид, имеющий любую из последовательностей SEQ ID NO:62-66.
25. Способ по п.21 или 22, отличающийся тем, что для идентификации используется по меньшей мере один пептид, имеющий любую из последовательностей SEQ ID NO:46-61.
26. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один микроорганизм представляет собой дрожжи, и антимикробное средство представляет собой противогрибковое средство.
27. Способ по п.26, отличающийся тем, что дрожжи представляют собой Candida albicans.
28. Способ по п.27, отличающийся тем, что для определения свойств типирования используется по меньшей мере один пептид, имеющий любую из последовательностей SEQ ID NO:88-125 и 177.
29. Способ по п.27 или 28, отличающийся тем, что для определения свойств потенциальной устойчивости по меньшей мере к одному противогрибковому средству используется по меньшей мереодин пептид, имеющий любую из последовательностей SEQ ID NO:117-122 и 177.
30. Способ по п.27 или 28, отличающийся тем, что для определения вирулентности используется по меньшей мере один пептид, имеющий любую из последовательностейь SEQ ID NO:123-125.
31. Способ по п.27 или 28, отличающийся тем, что для идентификации используется по меньшей мере один пептид, имеющий любую из последовательностей SEQ ID NO:88-116.
32. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что метаболит представляет собой эргостерин.
33. Пептид, имеющий последовательность SEQ ID NO:2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 19, 20, 21, 23, 24, 26, 27, 29, 30, 32, 34, 35, 37, 38, 40, 42, 44-125 или 177.