СОЗДАНИЕ САЙТОВ САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКОЙ ИНТЕГРАЦИИ ДЛЯ СЛОЖНЫХ ЛОКУСОВ ПРИЗНАКОВ В КУКУРУЗЕ И СОЕ, А ТАКЖЕ СПОСОБЫ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса, имеющие в своем геноме геномное окно, содержащее по меньшей мере один трансгенный целевой сайт для сайт-специфической интеграции (SSI), интегрированный по меньшей мере в один целевой сайт двухнитевого разрыва, где указанное геномное окно фланкировано:
a) по меньшей мере первым маркером, включающим в себя SYN12545, SYN12536, SYN14645, PZE-101023852, PZE-101024424, SYN25022, SYN31156, SYN31166 или SYN22238; и
b) по меньшей мере вторым маркером, включающим в себя SYN12536, SYN14645, PZE-101023852, PZE-101024424, SYN25022, SYN31156, SYN31166, SYN22238 или SYN20196.
2. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 1, где указанный по меньшей мере один целевой сайт двухнитевого разрыва выбран из группы, состоящей из целевого сайта для эндонуклеазы с цинковыми пальцами, сконструированного целевого сайта для эндонуклеазы, целевого сайта для мегануклеазы, целевого сайта для TALEN и целевого сайта для эндонуклеазы Cas9.
3. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 1, где указанное геномное окно составляет не более 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 1, 2, 5 или 10 cM в длину.
4. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 1, где указанное геномное окно дополнительно содержит трансген.
5. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 4, где трансген обеспечивает признак, выбранный из группы, состоящей из толерантности к гербицидам, устойчивости к насекомым, устойчивости к заболеваниям, мужской стерильности, сайт-специфической рекомбинации, толерантности к абиотическому стрессу, измененного содержания фосфора, измененного содержания антиоксидантов, измененного содержания жирных кислот, измененного содержания незаменимых аминокислот, измененного содержания углеводов, толерантности к гербицидам, устойчивости к насекомым и устойчивости к заболеваниям.
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
6. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 1, где указанное геномное окно дополнительно содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или 31 трансгенный целевой сайт для сайт-специфической интеграции, интегрированный по меньшей мере во 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или 31 целевой сайт двухнитевого разрыва.
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
7. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 6, где указанный по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или 31 целевой сайт двухнитевого разрыва выбран из группы, состоящей из целевого сайта для цинковых пальцев, целевого сайта для эндонуклеазы, целевого сайта для мегануклеазы, целевого сайта для TALEN, целевого сайта для эндонуклеазы Cas9 и любой их комбинации.
8. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 1, где указанный по меньшей мере один трансгенный целевой сайт для сайт-специфической интеграции содержит первый сайт рекомбинации и второй сайт рекомбинации, где указанный первый и указанный второй сайты рекомбинации отличаются друг от друга.
9. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 8, где указанный по меньшей мере один трансгенный целевой сайт для сайт-специфической интеграции дополнительно содержит представляющий интерес полинуклеотид, фланкированный указанным первым сайтом рекомбинации и указанным вторым сайтом рекомбинации.
10. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 8, где отличающиеся сайты рекомбинации указанного трансгенного целевого сайта для сайт-специфической интеграции включают в себя сайт LOX, мутантный сайт LOX, сайт FRT или мутантный сайт FRT.
11. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 8, где указанный первый сайт рекомбинации и указанный второй сайт рекомбинации выбраны из группы, состоящей из сайта FRT1, сайта FRT5, сайта FRT6, сайта FRT12 и сайта FRT87.
12. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 1, где указанное геномное окно дополнительно содержит трансгенный целевой сайт для сайт-специфической интеграции, расположенный за пределами целевого сайта для эндонуклеазы Cas9.
13. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса, имеющие в своем геноме геномное окно, содержащее по меньшей мере один целевой сайт двухнитевого разрыва, где указанное геномное окно фланкировано:
a. по меньшей мере первым маркером, включающим в себя SYN12545, SYN12536, SYN14645, PZE-101023852, PZE-101024424, SYN25022, SYN31156, SYN31166 или SYN22238; и
b. по меньшей мере вторым маркером, включающим в себя SYN12536, SYN14645, PZE-101023852, PZE-101024424, SYN25022, SYN31156, SYN31166, SYN22238 или SYN20196,
где указанное геномное окно содержит трансген.
14. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 13, где трансген обеспечивает признак, выбранный из группы, состоящей из толерантности к гербицидам, устойчивости к насекомым, устойчивости к заболеваниям, мужской стерильности, сайт-специфической рекомбинации, толерантности к абиотическому стрессу, измененного содержания фосфора, измененного содержания антиоксидантов, измененного содержания жирных кислот, измененного содержания незаменимых аминокислот, измененного содержания углеводов, толерантности к гербицидам, устойчивости к насекомым и устойчивости к заболеваниям.
15. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 13, где указанное геномное окно составляет не более 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 1, 2, 5, 10 cM в длину.
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
16. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 13, где указанное геномное окно дополнительно содержит по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или 31 целевой сайт двухнитевого разрыва.
17. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 13, где указанный по меньшей мере один целевой сайт двухнитевого разрыва выбран из группы, состоящей из целевого сайта для эндонуклеазы с цинковыми пальцами, целевого сайта для эндонуклеазы, целевого сайта для мегануклеазы, целевого сайта для TALEN и целевого сайта для эндонуклеазы Cas9.
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
18. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 16, где указанный по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или 31 целевой сайт двухнитевого разрыва выбран из группы, состоящей из целевого сайта для цинковых пальцев, целевого сайта для эндонуклеазы, целевого сайта для мегануклеазы, целевого сайта для TALEN, целевого сайта для эндонуклеазы Cas9 и любой их комбинации.
19. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 13, где указанное геномное окно дополнительно содержит по меньшей мере один трансгенный целевой сайт для сайт-специфической интеграции, где указанный трансгенный целевой сайт содержит первый сайт рекомбинации и второй сайт рекомбинации, где указанный первый и указанный второй сайты рекомбинации отличаются друг от друга.
20. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 19, где отличающиеся сайты рекомбинации указанного по меньшей мере одного трансгенного целевого сайта для сайт-специфической интеграции включают в себя сайт LOX, мутантный сайт LOX, сайт FRT или мутантный сайт FRT.
21. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 20, где указанный первый сайт рекомбинации и указанный второй сайт рекомбинации выбраны из группы, состоящей из сайта FRT1, сайта FRT5, сайта FRT6, сайта FRT12 и сайта FRT87.
22. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса, имеющие в своем геноме геномное окно, содержащее по меньшей мере один измененный целевой сайт двухнитевого разрыва, где указанное геномное окно фланкировано:
a) по меньшей мере первым маркером, включающим в себя SYN12545, SYN12536, SYN14645, PZE-101023852, PZE-101024424, SYN25022, SYN31156, SYN31166 или SYN22238; и
b) по меньшей мере вторым маркером, включающим в себя SYN12536, SYN14645, PZE-101023852, PZE-101024424, SYN25022, SYN31156, SYN31166, SYN22238 или SYN20196.
23. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 22, где указанное геномное окно составляет не более 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 1, 2, 5, 10 cM в длину.
24. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 22, где указанный измененный целевой сайт двухнитевого разрыва получен из сайта двухнитевого разрыва, выбранного из группы из целевого сайта для цинковых пальцев, целевого сайта для эндонуклеазы, целевого сайта для мегануклеазы, целевого сайта для TALEN, целевого сайта для эндонуклеазы Cas9.
25. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 22, где указанный измененный целевой сайт двухнитевого разрыва содержит представляющий интерес полинуклеотид.
26. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 25, где указанный представляющий интерес полинуклеотид содержит трансген, нативный ген, подвергнутый редактированию ген или любую их комбинацию.
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
27. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 22, где указанное геномное окно дополнительно содержит по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или 31 целевой сайт двухнитевого разрыва.
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ый
ой
ий
ый
ый
ой
ой
ой
ый
ый
ый
28. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 27, где указанный по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 или 31 целевой сайт двухнитевого разрыва выбран из группы из целевого сайта для цинковых пальцев, целевого сайта для эндонуклеазы, целевого сайта для мегануклеазы, целевого сайта для TALEN, целевого сайта для эндонуклеазы Cas9 или любой их комбинации.
29. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 28, где представляющий интерес полинуклеотид обеспечивает признак, включающий в себя мужскую стерильность, сайт-специфическую рекомбинацию, толерантность к абиотическому стрессу, измененное содержание фосфора, измененное содержание антиоксидантов, измененное содержание жирных кислот, измененное содержание незаменимых аминокислот, измененное содержание углеводов, толерантность к гербицидам, устойчивость к насекомым или устойчивость к заболеваниям.
30. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 22, где указанное геномное окно дополнительно содержит по меньшей мере один трансгенный целевой сайт для сайт-специфической интеграции, содержащий первый сайт рекомбинации и второй сайт рекомбинации, где указанный первый и указанный второй сайты рекомбинации отличаются друг от друга.
31. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 30, где отличающиеся сайты рекомбинации указанного по меньшей мере одного трансгенного целевого сайта для сайт-специфической интеграции включают в себя сайт LOX, мутантный сайт LOX, сайт FRT или мутантный сайт FRT.
32. Растение маиса, часть растения маиса или семя маиса по п. 30, где первый сайт рекомбинации и второй сайт рекомбинации выбраны из группы, состоящей из сайта FRT1, сайта FRT5, сайта FRT6, сайта FRT12 и сайта FRT87.