ПОЛИМЕРНЫЕ КОМПОЗИЦИИ С УЛУЧШЕННОЙ СТАБИЛЬНОСТЬЮ ДЛЯ ПРОДУКТОВ АЗОТФИКСИРУЮЩИХ МИКРООРГАНИЗМОВ

1. Композиция микроорганизмов, содержащая:
одну или более выделенных бактерий; и
полимерную композицию, содержащую один или более полимеров,
причем один или более полимеров являются экзогенными в отношении одной или более выделенных бактерий.
2. Композиция микроорганизмов по п. 1, дополнительно содержащая:
одну или более биопленок, экзогенных в отношении одной или более выделенных бактерий.
Pseudomonas
Kosakonia
Bacillus
Azospirillum
Candida
Saccharomyces
Agrobacterium
3. Композиция микроорганизмов по п. 2, в которой одна или более биопленок содержат виды, относящиеся к роду, выбранному из следующих родов: , , , , ,  и .
Kosakonia sacchari
4. Композиция микроорганизмов по п. 2, в которой одна или более биопленок содержат .
Klebsiella
Kosakonia
5. Композиция микроорганизмов по п. 2, в которой одна или более выделенных бактерий относятся к роду , а одна или более биопленок содержат микроорганизм из рода .
Klebsiella variicola
Kosakonia sacchari
6. Композиция микроорганизмов по п. 2, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой , а одна или более биопленок содержат .
Klebsiella variicola
Kosakonia sacchari
7. Композиция микроорганизмов по п. 2, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой  штамм 137-1036, а одна или более биопленок содержат .
8. Композиция микроорганизмов по п. 2, в которой одна или более биопленок включают две биопленки, продуцированные двумя различными биопленкообразующими микроорганизмами.
Achromobacter, Agrobacterium, Anabaena, Azorhizobium, Azospirillum, Azotobacter
Bacillus
Bradyrhizobium, Candida, Clostridium, Enterobacter, Klebsiella, Kluyvera, Kosakonia, Mesorhizobium
Microbacterium, Pseudomonas, Rahnella, Rhizobium, Saccharomyces, Sinorhizobium
9. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий выбраны из следующих родов: , , , и их комбинаций.
Achromobacter marplatensis
Achromobacter spiritinus
Azospirillum lipoferum
Enterobacter sp
Klebsiella variicola
Kluyvera intermedia
Kosakonia pseudosacchari
Kosakonia sacchari
Microbacterium murale
Rahnella aquatilis
10. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий выбраны из: , , , ., , , , , ,  и их комбинаций.
Klebsiella
11. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий относятся к роду .
Klebsiella variicola
12. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой .
Klebsiella variicola
13. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой  штамм 137-1036.
14. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой один или более полимеров выбраны из: поливинилпирролидона (PVP), поливинилпирролидон-винилацетата (PVP-VA), карбоксиметилцеллюлозы (CMC), гидроксипропилметилцеллюлозы, альгината и их комбинаций.
15. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой один или более полимеров представляют собой поливинилпирролидон-винилацетат (PVP-VA).
16. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой один или более полимеров представляют собой полимер, полученный способом электроформования.
17. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой один или более полимеров включают сополимер.
18. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий способны фиксировать азот.
19. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой жизнеспособность одной или более выделенных бактерий повышается по сравнению с контрольной композицией, содержащей одну или более выделенных бактерий, не содержащей один или более полимеров.
20. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой жизнеспособность одной или более выделенных бактерий повышается при хранении на протяжении по меньшей мере 30 суток, по сравнению с контрольной композицией, содержащей одну или более выделенных бактерий, не содержащей один или более полимеров.
21. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой жизнеспособность одной или более выделенных бактерий повышается при хранении в жидкой культуре.
22. Композиция микроорганизмов по п. 1, причем композиция является твердой.
23. Композиция микроорганизмов по п. 1, причем композиция является жидкой.
24. Композиция микроорганизмов по п. 1, причем композиция является полутвердой.
25. Композиция микроорганизмов по п. 1, причем композиция микроорганизмов представляет собой покрытие семени, присутствующее на семени растения или другом материале для размножения растений.
26. Композиция микроорганизмов по п. 1, причем композиция микроорганизмов представляет собой покрытие семени, присутствующее на семени кукурузы, которое имеет инсектицид, гербицид, фунгицид или нематоцид.
27. Композиция микроорганизмов по п. 1, причем композиция микроорганизмов представляет собой состав для внесения в борозды.
28. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий являются эндофитными, эпифитными или ризосферными.
29. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии дикого типа.
30. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой трансгенные бактерии.
31. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями.
таблицы 1
32. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями, выбранные из , или их потомки или производные.
33. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий способны фиксировать атмосферный азот.
34. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями, способные фиксировать атмосферный азот в присутствии экзогенного азота.
35. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями, содержащие: по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.
36. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий содержат введенную управляющую последовательность, функционально связанную по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.
37. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит гетерологичный промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.
nifA, nifL, ntrB, ntrC
glnA, glnB, glnK, drat, amtB
glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ
38. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную в член, выбранный из группы, состоящей из: , полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, , полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, , гена, связанного с биосинтезом фермента нитрогеназы, или их комбинаций.
NifA
NifL
NtrB
GlnB
GlnK
DraT
AmtB
GlnE
GlnD
39. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота, которая приводит к одному или более из: повышенной экспрессии или активности  или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности , , глутаминсинтетазы, , , , ; пониженной активности выведения аденилила ; или пониженной активности выведения уридила .
nifL
nifL
40. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене .
glnE,
41. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген который образует усеченный белок GlnE, лишенный домена выведения аденилила (AR).
amtB,
amtB
42. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена .
nifL
nifL
glnE
GlnE
amtB
amtB
43. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере один из: мутантного гена , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене ; мутантного гена , который образует усеченный белок , лишенный домена выведения аденилила (AR); мутантного гена , который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена , и их комбинаций.
nifL
nifL
glnE
44. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене  и мутантный ген , который образует усеченный белок GlnE, лишенный домена выведения аденилила (AR).
nifL
nifL
glnE
amtB
amtB
45. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит: мутантный ген , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене ; мутантный ген , который образует усеченный белок GlnE, лишенный домена выведения аденилила (AR), и мутантный ген , который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена .
46. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную в гены, задействованные в пути, выбранном из группы, состоящей из: продуцирования экзополисахаридов, эндополигалатуроназы, трегалозы и преобразования глутамина.
bcsii
bcsiii
yjbE
fhaB
pehA
otsB
treZ
glsA2
47. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную в гены, выбранные из группы, состоящей из: , , , , , , ,  и их комбинаций.
48. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий включают бактерии, выбранные из: бактерии, депонированной как NCMA 201701002, бактерии, депонированной как NCMA 201708004, бактерии, депонированной как NCMA 201708003, бактерии, депонированной как NCMA 201708002, бактерии, депонированной как NCMA 201712001, бактерии, депонированной как NCMA 201712002, и их комбинаций.
49. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий включают бактерии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, которая имеет по меньшей мере около 90%, 95% или 99% идентичности с последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260, 296-303 и 458-469.
50. Композиция микроорганизмов по п. 1, в которой одна или более выделенных бактерий включают бактерии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из SEQ ID NO: 177-260, 296-303 и 458-469.
51. Способ повышения жизнеспособности бактериальной композиции, включающий объединение:
одной или более выделенных бактерий; и
полимерной композиции, содержащей один или более полимеров,
причем один или более полимеров являются экзогенными в отношении одной или более выделенных бактерий, и при этом повышение жизнеспособности происходит по сравнению с контрольной композицией, содержащей одну или более выделенных бактерий, не содержащей один или более полимеров.
52. Способ по п. 51, дополнительно включающий объединение с a) и b):
одной или более биопленок, экзогенных в отношении одной или более выделенных бактерий.
Pseudomonas
Kosakonia
Bacillus
Azospirillum
Candida
Saccharomyces
Agrobacterium
53. Способ по п. 52, в котором одна или более биопленок содержат вид, относящийся к роду, выбранному из следующих родов: , , , , ,  и .
Kosakonia sacchari
54. Способ по п. 52, в котором одна или более биопленок содержат .
Klebsiella
Kosakonia
55. Способ по п. 52, в котором одна или более выделенных бактерий относятся к роду , а одна или более биопленок содержат микроорганизм из рода .
Klebsiella variicola
Kosakonia sacchari
56. Способ по п. 52, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой , а одна или более биопленок содержат .
Klebsiella variicola
Kosakonia sacchari
57. Способ по п. 52, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой штамм 137-1036 , а одна или более биопленок содержат .
58. Способ по п. 52, в котором одна или более биопленок включают две биопленки, продуцированные двумя различными биопленкообразующими микроорганизмами.
Achromobacter, Agrobacterium, Anabaena, Azorhizobium, Azospirillum, Azotobacter
Bacillus
Bradyrhizobium, Candida, Clostridium, Enterobacter, Klebsiella, Kluyvera, Kosakonia, Mesorhizobium
Microbacterium, Pseudomonas, Rahnella, Rhizobium, Saccharomyces, Sinorhizobium
59. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий выбраны из следующих родов: , , , и их комбинаций.
Achromobacter marplatensis
Achromobacter spiritinus
Azospirillum lipoferum
Enterobacter sp
Klebsiella variicola
Kluyvera intermedia
Kosakonia pseudosacchari
Kosakonia sacchari
Microbacterium murale
Rahnella aquatilis
60. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий выбраны из: , , , ., , , , , ,  и их комбинаций.
Klebsiella
61. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий относятся к роду .
Klebsiella variicola
62. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой .
Klebsiella variicola
63. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой штамм 137-1036 .
64. Способ по п. 51, в котором один или более полимеров выбраны из: поливинилпирролидона (PVP), поливинилпирролидон-винилацетата (PVP-VA), карбоксиметилцеллюлозы (CMC), гидроксипропилметилцеллюлозы, альгината и их комбинаций.
65. Способ по п. 51, в котором один или более полимеров представляют собой поливинилпирролидон-винилацетат (PVP-VA).
66. Способ по п. 51, в котором один или более полимеров представляют собой полимер, полученный способом электроформования.
67. Способ по п. 51, в котором один или более полимеров включают сополимер.
68. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий способны фиксировать азот.
69. Способ по п. 51, в котором жизнеспособность одной или более выделенных бактерий повышается по сравнению с контрольной композицией, содержащей одну или более выделенных бактерий, не содержащей один или более полимеров.
70. Способ по п. 51, в котором жизнеспособность одной или более выделенных бактерий повышается при хранении на протяжении по меньшей мере 30 суток, по сравнению с контрольной композицией, содержащей одну или более выделенных бактерий, не содержащей один или более полимеров.
71. Способ по п. 51, в котором жизнеспособность одной или более выделенных бактерий повышается при хранении в жидкой культуре.
72. Способ по п. 51, в котором композиция является твердой.
73. Способ по п. 51, в котором композиция является жидкой.
74. Способ по п. 51, в котором композиция является полутвердой.
75. Способ по п. 51, в котором композиция микроорганизмов представляет собой покрытие семени, присутствующее на семени растения или другом материале для размножения растений.
76. Способ по п. 51, в котором композиция микроорганизмов представляет собой покрытие семени, присутствующее на семени кукурузы, которое имеет инсектицид, гербицид, фунгицид или нематоцид.
77. Способ по п. 51, в котором композиция микроорганизмов представляет собой состав для внесения в борозды.
78. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий являются эндофитными, эпифитными или ризосферными.
79. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии дикого типа.
80. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой трансгенные бактерии.
81. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями.
82. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями, выбранные из таблицы 1, или их потомки или производные.
83. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий способны фиксировать атмосферный азот.
84. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями, способные фиксировать атмосферный азот в присутствии экзогенного азота.
85. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий представляют собой бактерии, не являющиеся межродовыми ремоделированными бактериями, содержащие: по меньшей мере одно генетическое изменение, введенное по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.
86. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий содержат введенную управляющую последовательность, функционально связанную по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.
87. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит гетерологичный промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.
nifA, nifL, ntrB, ntrC
glnA, glnB, glnK, drat, amtB
glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ
88. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную в член, выбранный из группы, состоящей из: , полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, , полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, , гена, связанного с биосинтезом фермента нитрогеназы, или их комбинаций.
NifA
NifL
NtrB
GlnB
GlnK
DraT
AmtB
GlnE
GlnD
89. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота, которая приводит к одному или более из: повышенной экспрессии или активности  или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности , , глутамин-синтетазы, , , , ; пониженной активности выведения аденилила ; или пониженной активности выведения уридила .
nifL
nifL
90. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене .
glnE,
91. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген который образует усеченный белок GlnE, лишенный домена выведения аденилила (AR).
amtB,
amtB
92. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена .
nifL
nifL
glnE
GlnE
amtB
amtB
93. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере один из: мутантного гена , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене ; мутантного гена , который образует усеченный белок , лишенный домена выведения аденилила (AR); мутантного гена , который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена , и их комбинаций.
nifL
nifL
glnE
94. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит мутантный ген , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене  и мутантный ген , который образует усеченный белок GlnE, лишенный домена выведения аденилила (AR).
nifL
nifL
glnE
amtB
amtB
95. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит: мутантный ген , который содержит гетерологичный промотор в указанном гене ; мутантный ген , который образует усеченный белок GlnE, лишенный домена выведения аденилила (AR), и мутантный ген , который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена .
96. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную в гены, задействованные в пути, выбранном из группы, состоящей из: продуцирования экзополисахаридов, эндополигалатуроназы, трегалозы и преобразования глутамина.
bcsii
bcsiii
yjbE
fhaB
pehA
otsB
treZ
glsA2
97. Способ по п. 51, в котором каждая из одной или более выделенных бактерий содержит по меньшей мере одну генетическую вариацию, введенную в гены, выбранные из группы, состоящей из: , , , , , , ,  и их комбинаций.
98. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий включают бактерии, выбранные из: бактерии, депонированной как NCMA 201701002, бактерии, депонированной как NCMA 201708004, бактерии, депонированной как NCMA 201708003, бактерии, депонированной как NCMA 201708002, бактерии, депонированной как NCMA 201712001, бактерии, депонированной как NCMA 201712002, и их комбинаций.
99. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий включают бактерии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, которая имеет по меньшей мере около 90%, 95% или 99% идентичности с последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260, 296-303 и 458-469.
100. Способ по п. 51, в котором одна или более выделенных бактерий включают бактерии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из SEQ ID NO: 177-260, 296-303 и 458-469.