СЕКРЕТОРНЫЕ БЕЛКОВЫЕ БИОМАРКЕРЫ ДЛЯ ВЫСОКОЭФФЕКТИВНОЙ ЭКСПРЕССИИ БЕЛКА

1. Способ выявления высокоэффективной клетки или клеточной культуры, включающий:
(a) определение уровня экспрессии биомаркера высокоэффективной клетки или клеточной культуры в клетке или клеточной культуре, и
(b) сравнение уровня экспрессии этого биомаркера высокоэффективной клетки или клеточной культуры в клетке или клеточной культуре с уровнем экспрессии биомаркера в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре,
где уровень экспрессии биомаркера более высокий, чем уровень в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре, является показателем высокоэффективной клетки или клеточной культуры, и уровень экспрессии биомаркера более низкий, чем уровень в известной высокоэффективной клетке или клеточной культуре, является показателем низкоэффективной клетки или клеточной культуры.
2. Способ по п.1, где биомаркер представляет собой секреторный белок.
3. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер представляет собой резидентный белок фракции эндоплазматического ретикулума.
4. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер представляет собой резидентный белок фракции Гольджи.
5. Способ по п.2, где уровень секреторного белкового биомаркера повышен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
6. Способ по п.2, где уровень секреторного белкового биомаркера понижен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
7. Способ по п.2, где определяют и сравнивают уровень множественных секреторных белковых биомаркеров.
8. Способ по п.7, где уровни всех секреторных белковых биомаркеров понижены в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
9. Способ по п.7, где уровни всех секреторных белковых биомаркеров повышены в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
10. Способ по п.7, где уровень одного или нескольких секреторных белковых биомаркеров повышен, в то время как уровень одного или нескольких секреторных белковых биомаркеров понижен в высокоэффективной клетке или клеточной культуре.
11. Способ по п.2, где секреторный белковый биомаркер выбран из группы, состоящей из предшественника эндоплазмина (GRP 94), серил-тРНК-синтетазы, дигидролиполилизинового остатка ацетилтрансферазы/метионинаминопептидазы 2, субъединицы альфа 2 кэпирующего белка F-актина, 60S кислого рибосомального белка PO, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K, субъединицы 7 эукариотического фактора инициации трансляции 3, предшественника эндоплазмина (GRP 94), фактора элонгации 1 бета, серил-тРНК-синтетазы/RAS активирующего ГТФ-азу связывающего белка 2, субъединицы 3 эукариотического фактора трансляции 3, фактора процессинга мРНК 19/субъединицы бета белка 1 Т-комплекса, фактора элонгации 1 гамма, цепи тубулина гамма-1/субъединицы 2 эукариотического фактора инициации трансляции 2, виментина, регуляторной легкой цепи миозина, гуанин нуклеотид-связывающего белка бета 1, 26S протеазной регуляторной субъединицы 6B, субъединицы 1 эукариотического фактора освобождения пептидной цепи, белка-предшественника дисульфид изомеразы A-3, тубулина альфа-2, предшественника эндоплазмина (GRP 94), белка-предшественника дисульфид-изомеразы A-6/белка NDRG1 (N-myc downstream-regulated gene 1), митохондриального предшественника белка теплового шока массой 60 кДа (Hsp60), субъединицы эпсилон белка 1 Т-комплекса, белка UPF0027, 26S протеасомной не-АТФазной регуляторной субъединицы 13, SH3 домена GRB2-подобного белка B1, субъединицы 4 комплекса сигналосомы COP9, промежуточной цепи цитоплазматического динеина 1, рибосома-связывающего белка 1, алкогольдегидрогеназы (NADP+), митохондриального предшественника глутаматдегидрогеназы 1, субъединицы 1 активаторного комплекса протеасомы, цитоплазматической изоформы 2 актина, аннексина A5, субъединицы эпсилон коатомера, глюкозидазы 2, триозофосфатизомеразы, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина F, цитоплазматической изоформы 2 актина, сортирующего нексина 6/гомолога VAT-1 мембраны синаптических пузырьков, 14-3-3 белка зета/дельта, виментина/цепи тубулина альфа-2, вакуолярной АТФ-синтазы, IgG гамма-1 цепь C, белка 4, содержащего EH-домен, белка теплового шока бета 1, субъединицы 3 фактора инициации трансляции 3, субъединицы бета АТФ-синтазы, 60S кислого рибосомального белка PO, эзрина, нуклеофосмина, кальретикулина, 14-3-3 белка гамма, септина-11, аннексина A2, белка 2R, подобного АДФ-рибозилирующему фактору, белка массой 71 кДа, родственного белкам теплового шока, легкого полипептида 6 миозина и белка, связанного с устойчивостью легких к терапии.
12. Набор для выявления изменений в экспрессии секреторного белкового биомаркера высокоэффективной экспрессии белка, включающий:
(a) детектируемое антитело, направленное против секреторного белкового биомаркера высокоэффективной экспрессии белка; и
(b) средство для детекции указанного антитела.
13. Набор по п.12, где секреторный белковый биомаркер высокоэффективной экспрессии белка выбран из группы, состоящей из предшественника эндоплазмина (GRP 94), серил-тРНК-синтетазы, дигидролиполилизинового остатка ацетилтрансферазы/метионинаминопептидазы 2, субъединицы альфа 2 кэпирующего белка F-актина, 60S кислого рибосомального белка PO, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K, субъединицы 7 эукариотического фактора инициации трансляции 3, предшественника эндоплазмина (GRP 94), фактора элонгации 1 бета, серил-тРНК-синтетазы/RAS активирующего ГТФ-азу связывающего белка 2, субъединицы 3 эукариотического фактора трансляции 3, фактора процессинга мРНК 19/субъединицы бета белка 1 Т-комплекса, фактора элонгации 1 гамма, цепи тубулина гамма-1/субъединицы 2 эукариотического фактора инициации трансляции 2, виментина, регуляторной легкой цепи миозина, гуанин нуклеотид-связывающего белка бета 1, 26S протеазной регуляторной субъединицы 6B, субъединицы 1 эукариотического фактора освобождения пептидной цепи, белка-предшественника дисульфид изомеразы A-3, тубулина альфа-2, предшественника эндоплазмина (GRP 94), белка-предшественника дисульфид изомеразы A-6/белка NDRG1 (N-myc downstream-regulated gene 1), митохондриального предшественника белка теплового шока массой 60 кДа (Hsp60), субъединицы эпсилон белка 1 Т-комплекса, белка UPF0027, 26S протеасомной не-АТФазной регуляторной субъединицы 13, SH3 домена GRB2-подобного белка B1, субъединицы 4 комплекса сигналосомы COP9, промежуточной цепи цитоплазматического динеина 1, рибосома-связывающего белка 1, алкогольдегидрогеназы (NADP+), митохондриального предшественника глутаматдегидрогеназы 1, субъединицы 1 активаторного комплекса протеасомы, цитоплазматической изоформы 2 актина, аннексина A5, субъединицы эпсилон коатомера, глюкозидазы 2, триозофосфатизомеразы, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина F, цитоплазматической изоформы 2 актина, сортирующего нексина 6/гомолога VAT-1 мембраны синаптических пузырьков, 14-3-3 белка зета/дельта, виментина/цепи тубулина альфа-2, вакуолярной АТФ-синтазы, IgG гамма-1 цепь C, белка 4, содержащего EH-домен, белка теплового шока бета 1, субъединицы 3 фактора инициации трансляции 3, субъединицы бета АТФ-синтазы, 60S кислого рибосомального белка PO, эзрина, нуклеофосмина, кальретикулина, 14-3-3 белка гамма, септина-11, аннексина A2, белка 2R, подобного АДФ-рибозилирующему фактору, белка массой 71 кДа, родственного белкам теплового шока, легкого полипептида 6 миозина и белка, связанного с устойчивостью легких к терапии.
14. Набор по п.13, где набор включает множественные детектируемые антитела, и где каждое антитело специфически связывается с различным секреторным белковым биомаркером, выбранным из группы, состоящей из предшественника эндоплазмина (GRP 94), серил-тРНК-синтетазы, дигидролиполилизинового остатка ацетилтрансферазы/метионинаминопептидазы 2, субъединицы альфа 2 кэпирующего белка F-актина, 60S кислого рибосомального белка PO, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K, субъединицы 7 эукариотического фактора инициации трансляции 3, предшественника эндоплазмина (GRP 94), фактора элонгации 1 бета, серил-тРНК-синтетазы/RAS активирующего ГТФ-азу связывающего белка 2, субъединицы 3 эукариотического фактора трансляции 3, фактора процессинга мРНК 19/субъединицы бета белка 1 Т-комплекса, фактора элонгации 1 гамма, цепи тубулина гамма-1/субъединицы 2 эукариотического фактора инициации трансляции 2, виментина, регуляторной легкой цепи миозина, гуанин нуклеотид-связывающего белка бета 1, 26S протеазной регуляторной субъединицы 6B, субъединицы 1 эукариотического фактора освобождения пептидной цепи, белка-предшественника дисульфид изомеразы A-3, тубулина альфа-2, предшественника эндоплазмина (GRP 94), белка-предшественника дисульфид изомеразы A-6/белка NDRG1 (N-myc downstream-regulated gene 1), митохондриального предшественника белка теплового шока массой 60 кДа (Hsp60), субъединицы эпсилон белка 1 Т-комплекса, белка UPF0027, 26S протеасомной не-АТФазной регуляторной субъединицы 13, SH3 домена GRB2-подобного белка B1, субъединицы 4 комплекса сигналосомы COP9, промежуточной цепи цитоплазматического динеина 1, рибосома-связывающего белка 1, алкогольдегидрогеназы (NADP+), митохондриального предшественника глутаматдегидрогеназы 1, субъединицы 1 активаторного комплекса протеасомы, цитоплазматической изоформы 2 актина, аннексина A5, субъединицы эпсилон коатомера, глюкозидазы 2, триозофосфатизомеразы, гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина F, цитоплазматической изоформы 2 актина, сортирующего нексина 6/гомолога VAT-1 мембраны синаптических пузырьков, 14-3-3 белка зета/дельта, виментина/цепи тубулина альфа-2, вакуолярной АТФ-синтазы, IgG гамма-1 цепь C, белка 4, содержащего EH-домен, белка теплового шока бета 1, субъединицы 3 фактора инициации трансляции 3, субъединицы бета АТФ-синтазы, 60S кислого рибосомального белка PO, эзрина, нуклеофосмина, кальретикулина, 14-3-3 белка гамма, септина-11, аннексина A2, белка 2R, подобного АДФ-рибозилирующему фактору, белка массой 71 кДа, родственного белкам теплового шока, легкого полипептида 6 миозина и белка, связанного с устойчивостью легких к терапии.
15. Набор по п.13, где набор содержит образец положительного контроля.
16. Набор по п.13, где набор содержит образец отрицательного контроля.