ИСКУССТВЕННАЯ мкРНК С СООТВЕТСТВИЕМ ДЛЯ КОНТРОЛЯ ЭКСРЕССИИ ГЕНОВ И ЕЕ ПРИМЕНЕНИЕ

1. Искусственная мкРНК с соответствием, которая представляет собой одноцепочечную нуклеиновую кислоту, содержащую область X и область Y, где
3ʹ-конец указанной области X и 5ʹ-конец указанной области Y связаны через линкерную область, имеющую ненуклеотидную структуру,
указанная область X содержит последовательность направляющей цепи зрелой мкРНК, и
указанная область Y содержит последовательность, полностью комплементарную указанной области X.
2. Искусственная мкРНК с соответствием по п.1, где, когда указанную область Y и указанную X выравнивают, указанная область Y имеет выступающий 3ʹ-конец.
3. Искусственная мкРНК с соответствием по п.2, где указанный выступающий конец имеет длину 0-4 основания.
4. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-3, где указанная область X содержит указанную последовательность направляющей цепи и дополнительную последовательность, и указанная дополнительная последовательность связана с 3ʹ-концом указанной последовательности направляющей цепи.
5. Искусственная мкРНК с соответствием по п.4, где указанная дополнительная последовательность в указанной области X имеет длину 0-5 оснований.
6. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-5, где указанная область X имеет длину 19-33 оснований.
7. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-6, где указанная область Y имеет длину 21-35 оснований.
8. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-7, где полная длина составляет 40-68 оснований.
9. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-8, где указанная линкерная область содержит по меньшей мере один элемент, выбранный из группы, состоящей из аминокислотного остатка, остатка полиамина и остатка поликарбоновой кислоты.
10. Искусственная мкРНК с соответствием по п.9, где указанная линкерная область содержит остаток поликарбоновой кислоты.
11. Искусственная мкРНК с соответствием по п.10, где указанный остаток поликарбоновой кислоты представляет собой остаток терефталевой кислоты.
12. Искусственная мкРНК с соответствием по п.9, где указанная линкерная область содержит аминокислотный остаток.
13. Искусственная мкРНК с соответствием по п.12, где указанный аминокислотный остаток представляет собой остаток глицина, остаток амида терефталевой кислоты, остаток пролина или остаток лизина.
14. Искусственная мкРНК с соответствием по п.12 или 13, где указанный аминокислотный остаток включает множество аминокислотных остатков, связанных друг с другом.
15. Искусственная мкРНК с соответствием по п.14, где указанное множество аминокислотных остатков связаны с образованием остатка димера или тримера глицина.
16. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-15, где указанный линкерный остаток соответствует следующей химической формуле (I-0):
в указанной химической формуле (I-0),
11
12
2
каждый из Q и Q независимо представляет собой одинарную связь, CH (группа метилена), NH (иминогруппа), C=O (карбонильная группа), C=S (тиокарбонильная группа), C=NH (группа иминометилена), O или S,
1
2
2
каждый из Q и Q независимо представляет собой одинарную связь, CH (группа метилена), NH (иминогруппа), C=O (карбонильная группа), C=S (тиокарбонильная группа), C=NH (группа иминометилена), O или S,
1
2
2
каждый из Y и Y независимо представляет собой одинарную связь, CH, NH, O или S;
1
a
a
a
b
a
2
L представляет собой алкиленовую цепь, имеющую n атомов углерода, и атом водорода на атоме углерода алкилена может быть замещен OH, OR, NH, NHR, NRR, SH или SR, или может быть незамещенным, или
1
L представляет собой простую полиэфирную цепь, полученную путем замещения по меньшей мере одного атома углерода на упомянутой выше алкиленовой цепи атомом кислорода,
1
1
1
1
1
при условии, что: когда Y представляет собой NH, O или S, атом, связанный с Y в L представляет собой углерод, атом, связанный с OR в L, представляет собой углерод, и атомы кислорода не являются соседними друг с другом;
2
c
c
c
d
c
2
L представляет собой алкиленовую цепь, имеющую m атомов углерода, и атом водорода на атоме углерода алкилена может быть замещен OH, OR, NH, NHR, NRR, SH, или SR, или может быть незамещенным, или
2
L представляет собой простую полиэфирную цепь, полученную путем замещения по меньшей мере одного атома углерода на упомянутой выше алкиленовой цепи атомом кислорода,
2
2
2
2
2
при условии, что: когда Y представляет собой NH, O или S, атом, связанный с Y в L, представляет собой углерод, атом, связанный с OR в L, представляет собой углерод, и атомы кислорода не являются соседними друг с другом;
a
b
c
d
каждый из R, R, R и R независимо представляет собой заместитель или защитную группу;
m представляет собой целое число в диапазоне от 0 до 30;
n представляет собой целое число в диапазоне от 0 до 30;
1
2
каждая из указанных областей X и Y связана с указанным линкерным остатком через -OR- или -OR-,
1
2
1
2
где R и R могут присутствовать или могут не присутствовать и, когда они присутствуют, каждый из R и R независимо представляет собой нуклеотидный остаток или указанную структуру (I-0); и
A представляет собой любую атомную группу.
11
12
17. Искусственная мкРНК с соответствием по п.16, где каждый из Q и Q в указанной химической формуле (I-0) представляет собой карбонильную группу.
1
2
18. Искусственная мкРНК с соответствием по п.17, где каждый из Q и Q в указанной химической формуле (I-0) представляет собой иминогруппу.
19. Искусственная мкРНК с соответствием по п.17 или 18, где следующая ниже химическая формула (Iα) имеет структуру, соответствующую следующей ниже химической формуле (Iα2):
в указанной химической формуле (Iα2),
100
R представляет собой любой заместитель, который может присутствовать или может не присутствовать, когда он присутствует, он может присутствовать в единственном числе или в множественном числе, и, когда он присутствует в множественном числе, они могут быть одинаковыми или могут отличаться друг от друга.
20. Искусственная мкРНК с соответствием по п.14, где указанная химическая формула (Iα2) имеет структуру, соответствующую следующей химической формуле (Iα3):
.
11
12
21. Искусственная мкРНК с соответствием по п.16, где каждый из Q и Q в указанной химической формуле (I-0) представляет собой иминогруппу.
1
2
22. Искусственная мкРНК с соответствием по п.21, где каждый из Q и Q в указанной химической формуле (I-0) представляет собой карбонильную группу.
23. Искусственная мкРНК с соответствием по п.16 или 17, где следующая ниже химическая формула (Iβ) имеет структуру, соответствующую следующей ниже химической формуле (Iβ2):
в указанной химической формуле (Iβ2),
100
R представляет собой любой заместитель, который может присутствовать или может не присутствовать, когда он присутствует, он может присутствовать в единственном числе или в множественном числе, и, когда он присутствует в множественном числе, они могут быть одинаковыми или могут отличаться друг от друга.
24. Искусственная мкРНК с соответствием по п.23, где указанная химическая формула (Iβ2) имеет структуру, соответствующую следующей химической формуле (Iβ3):
.
25. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-3 и 6-10, где указанная линкерная область содержит аминокислотный остаток, и указанный аминокислотный остаток соответствует следующей химической формуле (I):
в указанной химической формуле (I),
1
2
2
каждый из X и X независимо представляет собой H, O, S или NH;
1
2
2
каждый из Y и Y независимо представляет собой одинарную связь, CH, NH, O или S;
1
a
a
a
b
a
2
L представляет собой алкиленовую цепь, имеющую n атомов углерода, и атом водорода на атоме углерода алкилена может быть замещен OH, OR, NH, NHR, NRR, SH или SR, или может быть незамещенным, или
1
L представляет собой простую полиэфирную цепь, полученную путем замещения по меньшей мере одного атома углерода на указанной цепи алкилена атомом кислорода,
1
1
1
1
1
при условии, что: когда Y представляет собой NH, O, или S, атом, связанный с Y в L, представляет собой углерод, атом, связанный с OR в L, представляет собой углерод, и атомы кислорода не являются соседними друг с другом;
2
c
c
c
d
c
2
L представляет собой алкиленовую цепь, имеющую m атомов углерода, и атом водорода на атоме углерода алкилена может быть замещен OH, OR, NH, NHR, NRR, SH или SR, или может быть незамещенным, или
2
L представляет собой простую полиэфирную цепь, полученную заменой по меньшей мере одного атома углерода на указанной алкиленовой цепи атомом кислорода,
2
2
2
2
2
при условии, что: когда Y представляет собой NH, O, или S, атом, связанный с Y в L, представляет собой углерод, атом, связанный с OR в L, представляет собой углерод, и атомы кислорода не являются соседними друг с другом;
a
b
c
d
каждый из R, R, R и R независимо представляет собой заместитель или защитную группу;
m представляет собой целое число в диапазоне от 0 до 30;
n представляет собой целое число в диапазоне от 0 до 30;
1
2
каждая из указанных областей X и Y связана с указанным аминокислотным остатком через -OR- или -OR-,
1
2
1
2
где R и R могут присутствовать или могут не присутствовать, и, когда они присутствуют, каждый из R и R независимо представляет собой нуклеотидный остаток или указанную структуру (I); и
A представляет собой любую атомную группу при условии, что следующая химическая формула (Ia) представляет собой аминокислоту или пептид:
.
26. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-3, 6-10 и 20, где указанная аминокислота в указанном аминокислотном остатке представляет собой по меньшей мере одну из природной аминокислоты и искусственной аминокислоты.
27. Искусственная мкРНК с соответствием по п.26, где указанная природная аминокислота представляет собой аминокислоту, которая составляет белок.
28. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-9, 12-15, 25 и 26, где указанная аминокислота в указанном природном аминокислотном остатке представляет собой по меньшей мере один тип, выбранный из группы, состоящей из глицина, α-аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, цистина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, гидроксилизина, метионина, фенилаланина, серина, треонина, тирозина, валина, пролина, 4-гидроксипролина, триптофана, β-аланина, 1-амино-2-карбоксициклопентана, аминобензойной кислоты, аминопиридинкарбоновой кислоты и аминокислоты, соответствующей следующей химической формуле (Ia2), и необязательно дополнительно имеет заместитель или защитную группу:
в указанной химической формуле (Ia2),
100
R представляет собой любой заместитель, который может присутствовать или может не присутствовать, когда он присутствует, он может присутствовать в единственном числе или в множественном числе, и, когда он присутствует в множественном числе, они могут быть одинаковыми или могут отличаться друг от друга.
29. Искусственная мкРНК с соответствием по п.28, где указанная химическая (Ia2) имеет структуру, соответствующую следующей химической формуле (Ia3):
.
30. Искусственная мкРНК с соответствием по п.16 или 25, где указанная химическая формула (I-0) или (I) имеет структуру следующих ниже химических формул (I-1)-(I-7), и в следующих ниже химических формулах (I-1)-(I-7), n представляет собой целое число, равное 0-30, и m представляет собой целое число, равное 0-30:
.
31. Искусственная мкРНК с соответствием по п.30, где в указанной химической формуле (I-1), n=11 и m=12, или n=5 и m=4.
32. Искусственная мкРНК с соответствием по п.30, где в указанной химической формуле (I-4), n=5 и m=4.
33. Искусственная мкРНК с соответствием по п.30, где в указанной химической формуле (I-6), n=4 и m=4.
34. Искусственная мкРНК с соответствием по п.30, где в указанной химической формуле (I-7), n=5 и m=4.
35. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-9, 12 и 13, где ненуклеотидная структура указанной линкерной области содержит по меньшей мере один элемент из скелета пирролидина и скелета пиперидина.
36. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-8, где указанная ненуклеотидная структура соответствует следующей формуле (II):
где
1
2
2
каждый из X и X независимо представляет собой H, O, S или NH;
1
2
2
каждый из Y и Y независимо представляет собой одинарную связь, CH, NH, O или S;
3
R представляет собой атом водорода или заместитель, который связан с C-3, C-4, C-5 или C-6 на кольце A,
1
a
a
a
b
a
2
L представляет собой алкиленовую цепь, имеющую n атомов, и атом водорода на атоме углерода алкилена может быть замещен OH, OR, NH, NHR, NRR, SH или SR, или может быть незамещенным, или
1
L представляет собой простую полиэфирную цепь, полученную путем замещения по меньшей мере одного атома углерода на вышеупомянутой алкиленовой цепи атомом кислорода,
1
1
1
1
1
при условии, что: когда Y представляет собой NH, O или S, атом, связанный с Y в L, представляет собой углерод, атом, связанный с OR в L, представляет собой углерод, и атомы кислорода не являются соседними друг с другом;
2
c
c
c
d
c
2
L представляет собой алкиленовую цепь, имеющую m атомов, и атом водорода на атоме углерода алкилена может быть замещен OH, OR, NH, NHR, NRR, SH, или SR, или может быть незамещенным, или
2
L представляет собой простую полиэфирную цепь, полученную путем замещения по меньшей мере одного атома углерода на вышеупомянутой алкиленовой цепи атомом кислорода,
2
2
2
2
2
при условии, что: когда Y представляет собой NH, O или S, атом, связанный с Y в L, представляет собой углерод, атом, связанный с OR в L, представляет собой углерод, и атомы кислорода не являются соседними друг с другом;
a
b
c
d
каждый из R, R, R и R независимо представляет собой заместитель или защитную группу;
l равно 1 или 2;
m представляет собой целое число в диапазоне от 0 до 30;
n представляет собой целое число в диапазоне от 0 до 30; и
в кольце A, один атом углерода, отличный от упомянутого выше C-2 на кольце A, может быть замещен азотом, кислородом или серой, и может содержать в упомянутом выше кольце A, углерод-углеродную двойную связь или углерод-азотную двойную связь,
1
2
каждая из указанных областей (X) и (Y) связана с указанной ненуклеотидной структурой через -OR- или -OR-,
1
2
1
2
где R и R могут присутствовать или могут не присутствовать и, когда они присутствуют, каждый из R и R независимо представляет собой нуклеотидный остаток или указанную структуру (I).
37. Искусственная мкРНК с соответствием по любому из пп.1-36, где указанная область X содержит последовательность направляющей цепи зрелой мкРНК, выбранной из группы, состоящей из hsa-miR-34, hsa-miR-29 и hsa-let-7.
38. Искусственная мкРНК с соответствием по п.37, где указанная зрелая мкРНК представляет собой hsa-miR-34a.
39. Искусственная мкРНК с соответствием по п.38, где нуклеотидная последовательность представляет собой нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 9 и 17-28.
40. Искусственная мкРНК с соответствием по п.37, где указанная зрелая мкРНК представляет собой hsa-let-7a.
41. Искусственная мкРНК с соответствием по п.40, где нуклеотидная последовательность представляет собой нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 36-38.
42. Искусственная мкРНК с соответствием по п.37, где указанная зрелая мкРНК представляет собой hsa-miR-29b.
43. Искусственная мкРНК с соответствием по п.42, где нуклеотидная последовательность представляет собой нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 43-45.
44. Композиция для подавления экспрессии гена-мишени, содержащая искусственную мкРНК с соответствием по любому из пп.1-43.
45. Фармацевтическая композиция, содержащая искусственную мкРНК с соответствием по любому из пп.1-43.
46. Способ подавления экспрессии гена-мишени, включающий применение искусственной мкРНК с соответствием по любому из пп.1-43.
47. Способ по п.46, включающий стадию введения указанной искусственной мкРНК с соответствием в клетку, ткань или орган.
in vivo
in vitro
48. Способ по п.46 или 47, где указанную искусственную мкРНК с соответствием вводят  или .
49. Способ по п.46 или 47, где указанную искусственную мкРНК с соответствием вводят не являющемуся человеком животному.
50. Способ лечения заболевания, включающий стадию введения искусственной мкРНК с соответствием по любому из пп.1-43 пациентам, где указанная последовательность направляющей цепи указанной искусственной мкРНК с соответствием представляет собой последовательность направляющей цепи зрелой мкРНК, которая подавляет экспрессию гена, вовлеченного в указанное заболевание.
51. Одноцепочечная нуклеиновая кислота для применения для лечения заболевания, которая представляет собой искусственную мкРНК с соответствием по любому из пп.1-43, где указанная последовательность направляющей цепи указанной искусственной мкРНК с соответствием представляет собой последовательность направляющей цепи зрелой мкРНК, которая подавляет экспрессию гена, вовлеченного в указанное заболевание.