СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УСТОЙЧИВОГО ПОЛОЖЕНИЯ ИОНА В БЕЛКОВОЙ СТРУКТУРЕ

Способ определения устойчивого положения иона в белковой структуре включает формирование репрезентативной выборки путем исключения из известной базы белков гомологических белковых структур, расчет контактного взаимодействия между исходным ионом и атомами структуры на основе распределения частиц по энергии Больцмана, построение гистограмм энергетического взаимодействия для каждого из атомов, присутствующих в белке и исследуемым ионом в функции расстояния между ними с шагом 0,1 ангстрема, запись полученных распределений в ячейки видеокарт, последовательное наложение на геометрию структуры анализируемого белка сетки статистических потенциалов из записанных на видеокартах, расчет методами параллельного программирования с использованием видеочипов со встроенными мультипроцессорами и их глобального доступа к видеокартам энергетических потенциалов взаимодействия иона с атомами структуры во всех узлах сетки, выделение узлов максимального взаимодействия и отождествление их с наиболее вероятным положением иона в геометрии пространства белка, визуализация положения иона в белковой структуре с подчеркиванием тоном узлов с максимальной энергией.