TETZ-БЕЛКИ И ПРИОНОПОДОБНЫЕ БЕЛКИ И СВЯЗАННЫЕ С НИМИ СПОСОБЫ

1. Применение Tetz-белков для диагностики, оценки течения заболевания и/или лечения различных заболеваний.
2. Применение по п. 1, где Tetz-белок представляет собой термостабильный Tetz-белок и/или нетермостабильный Tetz-белок и/или в котором один или несколько полипептидов содержат прионоподобный домен (PrD) бактериальный, архейный, грибковый или вирусный белок, бактериофаг или вирус животного.
3. Вакцина против рака, нейродегенеративных и других мультифакторных заболеваний, а также старения, приготовленная из термостабильного Tetz-белка и/или нетермостабильного Tetz-белка и/или в котором один или несколько полипептидов содержат прионоподобный домен (PrD) бактериальный, и/или архейный, и/или грибковый и/или вирусный белок, и/или бактериофаг или вирус животного.
4. Способ диагностики или определения состояния заболевания, включающий
a) нагревание образца, взятого у субъекта, в течение от 10 секунд до 48 часов при температуре от 43°C до 200°C,
b) выделение белковой фракции в образце после завершения нагревания,
c) определение уровня одного или нескольких полипептидов во фракции белка, выделенной на стадии (b),
d) сравнение уровня одного или нескольких полипептидов, идентифицированных на стадии (c), с контрольным уровнем (-ями) указанного полипептида (-ов), и
e) (i) идентификация субъекта как страдающего заболеванием, когда уровень (уровни) указанного одного или нескольких полипептидов отличается на 10% или более от контрольного уровня (уровней), или (ii) идентификация того, что субъект не страдает заболеванием, если уровень (уровни) указанного одного или нескольких полипептидов отличается от контрольного уровня (уровней) менее чем на 10%.
f) (i) определение прогрессирования заболевания, когда уровень (уровни) одного или нескольких полипептидов, идентифицированных на стадии (d), выше, чем уровень (уровни) указанного полипептида (-ов), идентифицированного на стадии (c), или (ii) определение того, что заболевание не прогрессирует, когда уровень (уровни) одного или нескольких полипептидов, идентифицированных на этапе (d), не превышает уровень (уровни) указанного полипептида (-ов), идентифицированного на этапе (c).
g) использование препаратов, воздействующих на Tetz-белки
(i) определение того, что лечение является эффективным, когда уровень (уровни) одного или нескольких полипептидов, идентифицированных на этапе (d), такой же или ниже, чем уровень (уровни) указанного полипептида (-ов), идентифицированного на этапе ( c) или (ii) определение того, что лечение неэффективно, если уровень (уровни) одного или нескольких полипептидов, идентифицированных на этапе (d), выше, чем уровень (уровни) указанного полипептида (-ов), идентифицированного на этапе (c).
5. Способ по п. 4, дополнительно включающий добавление к образцу, взятому у субъекта, протеазы и инкубацию образца с указанной протеазой
6. Способ по п. 4 или 5, отличающийся тем, что образец представляет собой образец физиологической жидкости, такой как образец цельной крови, плазмы, сыворотки, спинномозговой жидкости, амниотической жидкости, мочи и слюны, или образец клеток, клеточный лизат, образец ткани, опухоли и матрикса микробной биопленки.
7. Способ по любому из пп. 4-6, в котором заболевание выбрано из рака, инфекции, нейродегенеративного заболевания, заболевания нервной системы, аномальной беременности, аутоиммунного заболевания и других мультифакторных болезней и старения.
8. Способ по любому из пп. 4-7, отличающийся тем, что заболевание представляет собой рак, причем указанный способ включает измерение уровня одного или нескольких белков, выбранных из сывороточного альбумина, фибронектина, фактора комплемента B, белка, связывающего витамин D, константной области тяжелой цепи гамма 2 иммуноглобулина, плазминогена, тяжелой цепи H4 ингибитора интер-альфа-трипсина, тяжелой цепи H2 ингибитора интер-альфа-трипсина, аполипопротеина B-100, аполипопротеина L1, Альфа-1-кислотного гликопротеина 2, бета-цепи связывающего C4b белка, константной области тяжелой цепи гамма 1 иммуноглобулина, аполипопротеина A-II, альфа-1-кислотного гликопротеина 2, аполипопротеина B-100, субъединицы гемоглобина альфа, антигеноподобного CDS, селенопротеина P, константной области цепи лямбда 3 иммуноглобулина, эукариотического фактора инициации трансляции 5A-1, кластера кератина, цитоскелета типа II 1, кератина, цитоскелета типа I 9, кератина, цитоскелета типа I 10, вариабельной каппа-цепи иммуноглобулина 1-27, хромодомен-геликаза-ДНК-связывающего белка 7, фетуина-B, константной области тяжелой цепи гамма 1 иммуноглобулина, константной области тяжелой цепи гамма 4 иммуноглобулина, вариабельной лямбда-цепи иммуноглобулина 3-27, калликреина-2, N-лизинметилтрансферазы SETD6, белка SON, индуцирующего реверсию обогащенного цистеином белка с Kazal-мотивами, CON_Q2UVX4, серотрансферрина, гельсолина, комплемента C2, фактора комплемента H-родственного белка 1, фактора пигментного эпителия, субъединицы гемоглобина альфа, комплемента CS, комплемента C1q, константной области лямбда-цепи 7 иммуноглобулина, актина, цитоплазматического фактора 1, коагуляционного фактора XII , Компонента комплемента C6, кальмодулина-1, тропомиозина альфа-4, тропомиозина бета, белка эпидидимиса 189, тропомиозина альфа-1 и тропомиозина альфа-3 и/или CON_Q2UVX4, серотрансферрина, белка 1, связанного с фактором комплемента H, происходящего из пигментного эпителия фактора, кластера субъединицы гемоглобина альфа, субъединицы гемоглобина альфа, CON_P01966, комплемента CS, константной области лямбда-цепи 7 иммуноглобулина и/или комплемента C3, CON_Q2UVX4, серотрансферрина, гельсолина, константной области лямбда-цепи 7 иммуноглобулина, и тяжелой цепи H3 ингибитора интер-альфа-трипсина.
9. Способ по любому из пп. 4-8, дополнительно включающий проведение лечения путем ингибирования экспрессии или активности указанных одного или нескольких полипептидов и/или воздействие полипептид-специфичных антител и/или обработку высокоспецифической протеазой и/или разрушение внеклеточной ДНК в том числе ДНКазой и/или в случае наличия прионоподобного домена (PrD), лечение включает использование лекарственного средства против PrD.
10. Способ лечения заболевания, включающий введение нуждающемуся в этом субъекту эффективного количества соединения в том числе полинуклеотидов, которое ингибирует экспрессию или активность одного или нескольких полипептидов, выбранных из термостабильных Tetz-белков, нетермостабильных Tetz-белков, связанных с заболеванием, белков, содержащих PrD, прионоподобных белков и их фрагментов.
11. Способ по п. 10, где указанное заболевание представляет собой рак, инфекцию (в том числе вирусную, бактериальную, грибковую, протозойную), нейродегенеративное заболевание (в том числе скрепи, болезнь Крейтцфельда-Якоба, болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона), амилоидоз, болезнь Хантингтона, фатальную семейную бессонницу, заболевание нервной системы, аномальную беременность, аутоиммунное заболевание и другие мультифакторные болезни и старение.
12. Способ по п. 10 или 11, который, включает введение эффективного количества соединения, которое ингибирует экспрессию или активность одного и/или нескольких белков, перечисленных в таблицах 4, 5, 6, 7, 8, 9. 10, 11, 19, 23 или 24.
13. Способ по любому из пп. 10-12, где лечение включает воздействие полипептид-специфичных антител, и/или высокоспецифичную протеазную обработку и/или разрушение внеклеточной ДНК и/или использование полинуклеотидов и/или вирусный белок, содержащий прионоподобный домен, способен изменять прионогенный белок в том числе (тау-протеин, бетта-амилоид, P53, SOD1, TDP43, или альфа-синуклеин) и/или вирусный белок, содержащий прионоподобный домен, способен неправильно укладывать прионогенный белок и/или.лекарственное средство против PrD (в том числе такролимуса, полисульфата пентозана, хинакрина, антитела против амилоидного белка, антитела против нуклеазы, антитела против протеазы и ритуксимаба), антитела против амилоидного белка (антитела против бета-амилоида), и/или антитела против нуклеазы (антитела против ДНКазы) и/или антитела против протеиназы K, и/или соединение , которое ингибирует взаимодействие человеческой клетки или человеческого белка с вирусным белком, содержащим прионоподобный домен, (не ограничиваясь указанными, представляет собой вирусный белок из HIV, HHV-1, HHV-5, HHV-6, или HНV-8 и/или гликопротеин gp160 (E5RVW7), Gag белок (C1JH95), белок Pol (Q3S7Q7), гликопротеин оболочки gp120 (Q2ME99), вирус простого герпеса человека типа 8 RF1 (U5NM22); вирус простого герпеса человека типа 8 LANA (E5LC01), вирус простого герпеса человека типа 8 ORF 73 (A0A0N9S3L8), вирус простого герпеса человека типа 6 (U95 белок), большой белок тегумента вируса простого герпеса человека типа 1 cleneclclylase, гликопротеина оболочки I вируса простого герпеса человека типа 1, гликопротеина 2 оболочки вируса простого герпеса человека типа 2, или белок, взаимодействующий с капсомером ветряной оспы).