СПОСОБ ДЕТЕКЦИИ ВИРУСА ГЕРПЕСА В ТЕСТИРУЕМОМ ОБРАЗЦЕ

1. Способ детекции вирусов HSV-1, HSV-2 и VZV, включающий амплификацию в единственной пробирке образца, включающего вирусный генетический материал с парой праймеров:
HSV1S-18 (CCTTCGAACAGCTCCTGG) и HSV1-AS
(ATGACGCCGATGTACTTTTTCTT);
HSV2S-20 (TCCATTTTCGTTTTGTGCCG) и HSV1-AS
(ATGACGCCGATGTACTTTTTCTT); и
VV1S (AAGGTTATATATGGAGATACGGA) и VV1AS
(ATTACCCCAATGTACTTTTTCTT),
для получения продуктов амплификации, включающих части генетического материала вирусов HSV-1, HSV-2 и VZV, если таковые присутствуют в образце.
2. Способ по п.1, дополнительно включающий денатурирование продукта амплификации и гибридизацию продуктов со специфическими к целевой последовательности зондами.
3. Способ по пп.1 и 2, включающий:
a) взаимодействие образца с набором праймеров для амплификации;
b) проведение реакции амплификации нуклеиновой кислоты в тестируемом образце, смешанном с набором праймеров для амплификации, реакция амплификации, предназначенная для амплификации целевых последовательностей, присутствующих в образце;
c) получение одноцепочечных олигонуклеотидов из любого продукта амплификации;
d) создание возможности для одноцепочечных олигонуклеотидов по пункту с) гибридизоваться с совокупностью специфических к целевой последовательности зондов, и
e) детекцию гибридизованных олигонуклеотидов.
4. Способ по п.1, в котором праймер HV1S-18 представляет собой немеченый праймер и праймер HSV1-AS представляет собой меченый праймер, таким образом, что соответствующий продукт амплификации включает одну меченую амплифицированную цепь и один немеченую амплифицированную цепь.
5. Способ по п.4, дополнительно включающий денатурацию продукта амплификации; и гибридизацию продукта амплификации с одним или несколькими зондами, которые могут быть специфическими и неспецифическими к целевой последовательности зондами; характеризуемый тем, что меченая нить, полученная из меченого праймера HSV1-AS, может гибридизоваться со специфическим к целевой последовательности зондом, а немеченая нить, полученная из немеченого праймера HV1S-18, может гибридизоваться с неспецифическим к целевой последовательности зондом, если таковые присутствуют в образце.
6. Набор для детекции и идентификации вирусов HSV-1, HSV-2 и VZV в тестируемом образце, включающий:
i) смесь нуклеиновых кислот для амплификации, включающая пару праймеров для амплификации HSV1S-18 и HSV1-AS, HSV2S-20 и HSV1-AS, и VV1S и VV1AS
ii) сосуд с микропанелью или набор сосудов с микропанелью, каждый, включающий микропанель, в которой обеспечены специфические к целевой последовательности зонды,
iii) реагенты для применения при визуально регистрируемой гибридизации нуклеиновых кислот с зондами микропанели.
7. Набор по п.6, дополнительно включающий реагенты для экстракции и/или очистки нуклеиновой кислоты.
8. Набор по пп.6 и 7, в котором пара праймеров, составленная из HSV1S-18 и HSV1-AS, включает немеченый праймер HSV1S-18 и меченый праймер HSV1-AS.
9. Набор по пп.6 и 7, дополнительно включающий в качестве внутреннего контроля, праймеры для амплификации RTS (GCTTGGGCGTGTCTCAAAATCT) и RTA (GTCGCCACGGTTGATGAGAGCT), а также нуклеиновую кислоту, способную к амплификации с помощью таких праймеров.
10. Набор по пп.6 и 7, в котором сосуд с микропанелью представляет собой пробирку с микропанелью.
11. Набор по пп.6 и 7, в котором набор сосудов с микропанелью представляет собой стрип с микропанелями.
12. Набор по п.6, в котором молекулы зонда микропанели прикреплены к твердой подложке, твердая подложка, представляющая собой дно сосуда с микропанелью.
13. Набор по п.6, в котором молекулы зонда микропанели прикреплены к твердой подложке, твердая подложка прикреплена ко дну сосуда с микропанелью.
14. Набор по любому из пп.6, 12 или 13, в котором микропанель включает зонды, которые связываются со своими соответствующими целевыми последовательностями в таких же условиях гибридизации.
15. Применение способа по любому из пп.1-5, или набора по любому из пп.6-14, для детекции и идентификации, одного или нескольких вирусных агентов, которые выбирают из группы, включающей вирусы HSV-1, HSV-2 и VZV, если таковые присутствуют в тестируемом образце.