БИОМАРКЕРЫ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ РАКА ПРИ ПОМОЩИ АПИЛИМОДА

1.Композиция для лечения рака, характеризующегося наличием раковых клеток, суперэкспрессирующих ассоциированный с микрофтальмией (MiT) транскрипционный фактор, где композиция включает терапевтически эффективное количество апилимода или его фармацевтически приемлемой соли.
2. Композиция по п.1, где апилимод представляет собой апилимода димезилат.
3. Композиция по п.1 или 2, где MiT транскрипционный фактор выбран из группы, состоящей из TFEB, TFE3, TFEC и MITF.
4. Композиция по п.3, где MiT транскрипционный фактор представляет собой TFEB или TFE3.
5. Композиция по п.3 или 4, где рак представляет собой неходжкинскую В-клеточную лимфому, почечно-клеточную карциному, меланому, карциному щитовидной железы, светлоклеточную карциному, альвеолярную саркому мягких тканей или периваскулярную эпителиоидноклеточную опухоль.
6. Композиция по п.5, где рак представляет почечно-клеточную карциному.
7. Композиция по п.6, где почечно-клеточная карцинома содержит TFEB транслокацию.
8. Композиция по п.7, где TFEB транслокация представляет собой t(6;11) (p21; q12) транслокацию.
9. Композиция по п.6, 7 или 8, где почечно-клеточная карцинома выбрана из группы, состоящей из папиллярной карциномы I или II типа, хромофобной, гибридной карциномы, онкоцитомы, карциномы, обусловленной транслокацией, ангиомиолипомы, онкоцитарной, медуллярной карциномы и карциномы собирательных протоков.
10. Композиция по п.6, 7 или 8, где почечно-клеточная карцинома выбрана из светлоклеточной почечно-клеточной карциномы, переходноклеточной карциномы, опухоли Вильмса (нефробластомы), саркомы почки и доброкачественных (незлокачественных) опухолей почки, аденомы почки, онкоцитомы и ангиомиолипом.
11. Композиция по п.6, где рак почки имеет мутацию в гене Гиппеля-Линдау (VHL).
12. Композиция по любому из пп. 1-11, дополнительно включающая по меньшей мере одно дополнительное действующее вещество.
13. Композиция по п.12, где по меньшей мере одно дополнительное действующее вещество представляет собой лекарственное средство или нелекарственное средство или комбинацию лекарственного средства и нелекарственного средства.
14. Композиция по п.13, где по меньшей мере одно дополнительное действующее вещество представляет собой лекарственное средство, выбранное из группы, состоящей из ингибитора протеинкиназы, ингибитора сигнального пути PD-1/PDL-1, ингибитора контрольных точек, противоопухолевого средства на основе платины, ингибитора топоизомеразы, ингибитора метаболизма нуклеозидов, алкилирующего средства, интеркалирующего средства, тубулин-связывающего средства и комбинаций вышеперечисленных веществ.
15. Композиция по п.14, где лекарственное средство представляет собой ингибитор фактора роста эндотелия сосудов (VEGF).
16. Композиция по п.15, где ингибитор VEGF выбран из группы, состоящей из сунитиниба, пазопаниба, бевацизумаба, сорафениба, кабозантиниба и акситиниба.
17. Композиция по п.14, где лекарственное средство представляет собой ингибитор mTOR.
18. Композиция по п.17, где ингибитор mTOR представляет собой эверолимус или темсиролимус.
19. Композиция по п.14, где лекарственное средство представляет собой ингибитор протеинкиназы.
20. Композиция по п.19, где ингибитор протеинкиназы представляет собой пазопаниб или сорафениб или их комбинацию.
21. Композиция по п.14, где лекарственное средство представляет собой ингибитор сигнального пути PD-1/PDL-1.
22. Композиция по п.14, где лекарственное средство выбрано из пембролизумаба (Кейтруда), авелумаба, атезолизумаба (MPDL3280A), ниволумаба (BMS-936558), пидилизумаба (CT-011), MSB0010718C и MEDI4736.
23. Композиция по любому из пп. 1-22, дополнительно включающая нелекарственное средство, выбранное для улучшения одного или более побочных эффектов апилимода.
24. Композиция по п.13, где по меньшей мере одно дополнительное действующее вещество представляет собой нелекарственное средство.
25. Композиция по п.23 или 24, где нелекарственное средство выбрано из группы, состоящей из ондансетрона, гранисетрона, доласетрона и палоносетрона.
26. Композиция по п.23 или 24, где нелекарственное средство выбрано из группы, состоящей из пиндолола и рисперидона.
27. Композиция по любому из пп. 1-26, где композиция включает количество апилимода димезилата, эффективное для ингибирования активности PIKfyve киназы в раковых клетках пациента.
28. Композиция по любому из пп. 1-27, где рак является рефрактерным к стандартному лечению или является метастатическим.
29. Композиция по любому из пп. 1-17, где композиция находится в форме, подходящей для перорального или внутривенного введения.
30. Способ лечения рака у пациента, имеющего раковые клетки, суперэкспрессирующие один или более ассоциированных с микрофтальмией (MiT) транскрипционных факторов, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества композиции, включающей апилимод или его фармацевтически приемлемую соль.
31. Способ по п.30, дополнительно включающий стадию анализа образца раковых клеток перед лечением для определения суперэкспрессии одного или более MiT транскрипционных факторов.
32. Способ по п.31, где анализ включает определение одного или более TFEB, TFE3, TFEC и MITF.
33. Способ по п.32, где анализ включает определение TFEB или TFE3.
34. Способ по п.32, где анализ проводят с применением иммуногистохимии.
35. Способ по любому из пп. 30-34, где апилимод представляет собой апилимода димезилат.
36. Способ по п.35, где терапевтически эффективное количество апилимода представляет собой количество, эффективное для ингибирования активности PIKfyve-киназы в раковых клетках пациента.
37. Способ ингибирования пролиферации раковой клетки, включающий контактирование раковой клетки с количеством апилимода или его фармацевтически приемлемой соли, эффективным для ингибирования пролиферации клетки.
38. Способ ингибирования выживания раковой клетки, включающий контактирование раковой клетки с количеством апилимода или его фармацевтически приемлемой соли, эффективным для ингибирования активности PIKfyve -киназы в раковой клетке.
39. Способ по любому из пп.37 или 38, где раковая клетка суперэкспрессирует MiT транскрипционный фактор.
40. Способ по п.39, где MiT транскрипционный фактор выбирают из TFEB, TFE3, TFEC и MITF.
41. Способ по п.40, где MiT транскрипционный фактор представляет собой TFEB или TFE3.
42.Композиция, включающая терапевтически эффективное количество апилимода или его фармацевтически приемлемой соли, для применения в способе лечения рака у пациента, который характеризуется тем, что пациент имеет рак, содержащий клетки, суперэкспрессирующие ассоциированный с микрофтальмией (MiT) транскрипционный фактор.
43.Композиция для применения по п.42, дополнительно определенная в любом из пп. 2-29.
44. Способ идентификации пациента, имеющего рак, который является чувствительным к лечению апилимодом, включающий анализ образца раковых клеток, полученных от пациента, на предмет суперэкспрессииодного или более MiT транскрипционных факторов, где суперэкспрессия является показателем того, что пациент имеет рак, который является чувствительным к лечению апилимодом.
(
45.Способ по п.44, где анализ включает определение одного или более TFEB, TFE3, TFEC и MITF.
46.Способ по п.45, где анализ включает определение TFEB или TFE3.
47.Способ по любому из пп. 44-46, где анализ проводят с применением иммуногистохимии.