Композиции и способы лечения, направленные на литические и лизогенные вирусы

1. Композиция для лечения, направленная на лизогенный или литический вирус, содержащая выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую два или более средств для редактирования генов, выбранных из группы, состоящей из средств для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную ДНК, средств для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную РНК, композиции, нацеливающейся на вирусную РНК, и их комбинаций.
2. Композиция по п. 1, где указанные средства для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную ДНК, выбраны из группы, состоящей из нуклеаз, ассоциированных с CRISPR, и gDNA эндонуклеаз Argonaute.
3. Композиция по п. 2, где указанные нуклеазы, ассоциированные с CRISPR, выбраны из группы, состоящей из gRNA Cas9 и gRNA Cpf1.
4. Композиция по п. 1, где указанные средства для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную РНК, выбраны из группы, состоящей из С2с2 и РНК РНКазы Р.
5. Композиция по п. 1, где указанная композиция обеспечивает удаление необходимого для репликации сегмента вирусной ДНК или РНК.
6. Композиция по п. 1, где указанная композиция обеспечивает вырезание всего вирусного генома указанного лизогенного вируса из клетки-хозяина.
7. Композиция по п. 1, где указанная композиция включена в вектор.
8. Композиция по п. 1, где указанный лизогенный вирус выбран из группы, состоящей из вируса гепатита А, гепатита В, гепатита D, HSV-1, HSV-2, цитомегаловируса, вируса Эпштейна-Барр, вируса ветряной оспы, HIV1, HIV2, HTLV1, HTLV2, вируса саркомы Рауса, вируса HPV, вируса желтой лихорадки, вируса Зика, вируса денге, вируса лихорадки Западного Нила, вируса японского энцефалита, вируса бешенства, везикуловируса, циторабдовируса, вируса Хантаан, вируса лихорадки Рифт-Валли, вируса Буньянвера, вируса Ласса, вируса Хунин, вируса Мачупо, вируса Сабия, вируса Такарибе, вируса Флексал, вируса Уайтуотер Арройо, вируса Эбола, вируса Марбург, вируса JC и вируса BK.
9. Композиция по п. 1, где указанная композиция, нацеливающаяся на вирусную РНК, выбрана из группы, состоящей из siRNA, miRNA, shRNA, RNAi, нуклеаз, ассоциированных с CRISPR, gDNA эндонуклеаз Argonaute, С2с2 и РНК РНКазы Р.
10. Композиция по п. 1, где указанная композиция обеспечивает вырезание всего вирусного генома указанного литического вируса из клетки-хозяина.
11. Композиция по п. 1, где указанный литический вирус выбран из группы, состоящей из вируса гепатита А, гепатита С, гепатита D, вируса Коксаки, HSV-1, HSV-2, цитомегаловируса, вируса Эпштейна-Барр, вируса ветряной оспы, HIV1, HIV2, HTLV1, HTLV2, вируса саркомы Рауса, ротавируса, сеадорнвируса, колтивируса, вируса JC и вируса BK.
12. Способ лечения, направленный на лизогенный или литический вирус, включающий стадии:
введения композиции, содержащей выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую два или более средств для редактирования генов, выбранных из группы, состоящей из средств для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную ДНК, средств для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную РНК, композиций, нацеливающихся на вирусную РНК, и их комбинаций, индивидууму, имеющему лизогенный или литический вирус; и
инактивации лизогенного или литического вируса.
13. Способ по п. 12, где средства для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную ДНК, выбраны из группы, состоящей из нуклеаз, ассоциированных с CRISPR, и gDNA эндонуклеаз Argonaute.
14. Способ по п. 13, где нуклеазы, ассоциированные с CRISPR, выбраны из группы, состоящей из gRNA Cas9 и gRNA Cpf1.
15. Способ по п. 12, где средства для редактирования генов, которые нацеливаются на вирусную РНК, выбраны из группы, состоящей из С2с2 и РНК РНКазы Р.
16. Способ по п. 12, где указанная стадия инактивации включает удаление необходимого для репликации сегмента вирусной ДНК или РНК.
17. Способ по п. 12, где указанная стадия инактивации включает вырезание всего вирусного генома лизогенного вируса из клетки-хозяина.
18. Способ по п. 12, где композиция включена в вектор.
19. Способ по п. 12, где лизогенный вирус выбран из группы, состоящей из вируса гепатита А, гепатита В, гепатита D, HSV-1, HSV-2, цитомегаловируса, вируса Эпштейна-Барр, вируса ветряной оспы, HIV1, HIV2, HTLV1, HTLV2, вируса саркомы Рауса, вируса HPV, вируса желтой лихорадки, вируса Зика, вируса денге, вируса лихорадки Западного Нила, вируса японского энцефалита, вируса бешенства, везикуловируса, циторабдовируса, вируса Хантаан, вируса лихорадки Рифт-Валли, вируса Буньянвера, вируса Ласса, вируса Хунин, вируса Мачупо, вируса Сабия, вируса Такарибе, вируса Флексал, вируса Уайтуотер Арройо, вируса Эбола, вируса Марбург, вируса JC и вируса BK.
20. Способ по п. 12, где композиция, нацеливающаяся на вирусную РНК, выбрана из группы, состоящей из siRNA, miRNA, shRNA, RNAi, нуклеаз, ассоциированных с CRISPR, gDNA эндонуклеаз Argonaute, С2с2 и РНК РНКазы Р.
21. Способ по п. 12, где литический вирус выбран из группы, состоящей из вируса гепатита А, гепатита С, гепатита D, вируса Коксаки, HSV-1, HSV-2, цитомегаловируса, вируса Эпштейна-Барр, вируса ветряной оспы, HIV1, HIV2, HTLV1, HTLV2, вируса саркомы Рауса, ротавируса, сеадорнвируса, колтивируса, вируса JC и вируса BK.