АВТОМАТИЗИРОВАННЫЙ СПОСОБ И СИСТЕМА ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИГОТОВЛЕНИЯ ОБРАЗЦА МИКРООРГАНИЗМА КАК ДЛЯ ИНДЕНТИФИКАЦИИ, ТАК И ДЛЯ ТЕСТОВ НА ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К АНТИБИОТИКАМ

1. Способ определения местоположения и выбора колонии микроорганизмов на чашке для культивирования и приготовления суспензии одного образца с выбранной колонией для нескольких анализов, причем способ включает автоматизированные стадии:
определения местоположения и выбора колонии микроорганизмов на чашке для культивирования;
получения образца выбранной колонии микроорганизмов;
переноса полученного образца в контейнер, имеющий количество среды для суспензии, причем контейнер адаптирован для приема нефелометром;
приготовления суспензии образца посредством переноса по меньшей мере части полученного образца в среду для суспензии с применением роботизированного инструмента для сбора;
автоматического получения аликвоты приготовленной суспензии;
дозирования порции суспензии на приемный сосуд для первого анализа;
переноса приемного сосуда для первого анализа с образцом в аппарат для осуществления масс-спектрометрии для идентификации образца выбранной колонии микроорганизмов;
определения того, находится ли мутность суспензии в рамках предварительно определенных технических требований для второго анализа с применением автоматизированного нефелометра, и, если она находится в рамках технических требований, определения дозируемого объема для второго анализа, исходя из измеренной мутности; и
автоматической инокуляции контейнера для образца для второго анализа суспензией, если определено, что суспензия находится в рамках технических требований;
причем, если определено, что суспензия не находится в рамках технических требований для применения во втором анализе без разведения, автоматической коррекции объема для обеспечения предварительного определенного количества образца, подходящей для второго анализа, перед инокуляцией контейнера для второго анализа;
автоматического получения аликвоты суспензии в контейнере для второго анализа и автоматической инокуляции приемного сосуда для второго анализа адаптированной суспензией.
2. Способ по п. 1, причем способ включает автоматизированную стадию выбора колоний для сбора посредством обеспечения изображений колоний, при этом на основании информации с изображений делается выбор перед автоматизированной стадией определения местоположения и выбора колонии микроорганизмов на чашке для культивирования, стадию обеспечения чашки для культивирования, содержащей ряд колоний микроорганизмов, получения первоначального изображения чашки для культивирования, включающего в себя все колонии микроорганизмов, отображения первоначального изображения чашки для культивирования, включающего в себя все колонии микроорганизмов, на дисплее и выбора в ручном режиме по меньшей мере одной колонии микроорганизмов на первоначальном изображении.
3. Способ по п. 2, причем чашка для культивирования обеспечена индивидуальными идентификационными данными, идентифицирующими чашку для культивирования, такими как штрих-код, и при этом способ включает стадию сохранения первоначального изображения чашки для культивирования, включающего в себя все колонии, сохранения информации, которая касается по меньшей мере одной выбранной вручную колонии микроорганизмов, сохранения идентификационных данных чашки для культивирования в памяти центрального управляющего компьютера.
4. Способ по п. 1, дополнительно включающий идентификацию допустимой области для сбора образца на планшете для культивирования и опускание инструмента для сбора, который переносится роботизированным инструментом для сбора, в контакт с образцом на поверхности планшета для культивирования в идентифицированной допустимой области.
5. Способ по п. 1, причем роботизированный инструмент для сбора переносит инструмент для сбора, несущий полученный образец из чашки для культивирования, в контейнер для образца для первого анализа, при этом дополнительно предусмотрен подъем инструмента для сбора от поверхности планшета для культивирования с применением роботизированного инструмента для сбора и мониторинг инструмента для сбора, когда он поднимается от поверхности чашки для культивирования для выявления образования нити образца, тянущейся от инструмента для сбора.
6. Способ по п. 5, причем инструмент для сбора подвергают мониторингу с применением одного из электрической емкости или визуализации.
7. Автоматизированная система для приготовления суспензии одного образца, аликвоты из которой отбираются как для идентификации (ID) микроорганизмов в образце, так и для определения чувствительности к антибиотикам (AST) у микроорганизмов, причем система содержит:
первую секцию для приготовления образца для ID анализа, причем первая секция содержит:
средство для получения засеянной культуры в планшете для культивирования;
при этом система находится в сообщении с визуализирующим средством для получения изображения засеянной культуры и средством для идентификации колонии на засеянной культуре и обозначения такой колонии для автоматизированного сбора образцов, исходя из информации с изображения;
первый робот для автоматического манипулирования инструментом для сбора;
средство для сообщения местоположения колонии первому роботу;
средство для управления сбором колонии первым роботом, причем первый робот дополнительно сконфигурирован для переноса собранного образца к первой станции для приготовления суспензии образца;
средство для обеспечения жидкости для суспензии в пробирку для суспензии на первой станции для приготовления образца, причем роботизированный инструмент для сбора сконфигурирован таким образом, чтобы осаждать собранный образец в жидкость для суспензии;
нефелометр на первой станции для измерения мутности суспензии, причем автоматизированная система в ответ на результат измерения мутности, который находится вне предварительно определенного значения мутности, корректирует одно из количества образца или количества суспензии в пробирке для суспензии для обеспечения суспензии с концентрацией образца в предварительно определенном диапазоне;
второй робот, причем второй робот представляет собой пипетатор, который получает первую аликвоту суспензии на первой станции и инокулирует приемный сосуд для применения в ID анализе;
средства для переноса пробирки для суспензии с остальной частью суспензии с первой станции для приготовления суспензии образца на вторую станцию для приготовления суспензии образца;
причем второй робот дополнительно сконфигурирован для коррекции концентрации образца в пробирке для суспензии до предварительно определенной концентрации для второго анализа, а также для получения второй аликвоты суспензии образца, имеющей скорректированную концентрацию, и инокуляции пробирки для образца для AST анализа второй аликвотой суспензии; и
вторую секцию для инокуляции панели для AST анализа; причем автоматизированная система имеет средство для переноса инокулированной пробирки для образца от первой секции ко второй секции; при этом вторая секция имеет третий робот, представляющий собой пипетатор, который получает аликвоту из инокулированной пробирки для образца и инокулирует панель для AST полученной аликвотой; и
загрузочный робот, который загружает инокулированную панель в аппарат, в котором осуществляется AST.
8. Система по п. 7, причем аппарат для AST сконфигурирован таким образом, что он имеет по меньшей мере две двери, причем первая дверь получает панель от загрузочного робота для переноса инокулированной панели для AST, при этом загрузочный робот представляет собой захватывающее приспособление для панели, включающее в себя захватывающий планшет, причем захватывающий планшет соединен со штангой управляемого по трем осям шаговым электродвигателем крепления таким образом, чтобы захватывающий планшет мог поворачиваться относительно оси соединительного элемента из первого положения во второе положение; и при этом захватывающий планшет включает в себя захватывающую поверхность, которая выполнена с возможностью захвата объектов.
9. Система по п. 7, дополнительно содержащая детектор для выявления того, образуется ли нить образца, когда первый робот переносит инструмент для сбора, несущий образец, от чашки для культивирования.
10. Система по п. 9, причем нить выявляется посредством оптического или электрического мониторинга инструмента для сбора, когда инструмент для сбора поднимается от чашки для культивирования.
11. Система по п. 10, дополнительно содержащая механизм для срезания нити, причем механизм выбран из группы, состоящей из режущего инструмента, ультразвуковой обработки, высушивания и заморозки.
12. Система по п. 11, причем режущий инструмент выбран из группы, состоящей из лазера, стержня, провода и лезвия.
13. Система по п. 12, причем режущий инструмент выполнен с возможностью нагрева.
14. Автоматизированная система для приготовления суспензии одного образца, аликвоты из которой отбираются как для идентификации (ID) микроорганизмов в образце, так и для определения чувствительности к антибиотикам (AST) у микроорганизмов, причем система содержит:
первую станцию, на которой готовится суспензия, причем первая станция содержит контроллер, который управляет приготовлением суспензии образца, аликвоты из которой получают для ID и AST;
первый робот, сконфигурированный для автоматического получения, переноса и удаления инструмента для сбора, в сообщении с контроллером, причем инструмент для сбора представляет собой наконечник пипетки, и первый робот управляется контроллером для получения наконечника пипетки; применения наконечника пипетки для сбора образца с чашки для культивирования, полученной первой станцией, контроллер, направляющий первый робот для переноса инструмента для сбора в местоположение на чашке для культивирования, в котором находится колония, обозначенная как подлежащая сбору, при этом первый робот приводит наконечник пипетки в контакт с обозначенной колонией и переносит собранный образец для сбора в пробирку для суспензии, в которой располагается разбавитель для суспензии, причем первый робот помещает наконечник пипетки, несущей образец, в контакт с суспензией, высвобождает образец в пробирку для суспензии;
дозатор разбавителя для суспензии в сообщении с контроллером для дозирования разбавителя для суспензии в пробирку для суспензии;
нефелометр в сообщении с контроллером, причем нефелометр измеряет мутность суспензии, а контроллер отвечает на результат нефелометрического измерения, причем контроллер, если результат нефелометрического измерения находится за передами предварительно определенного значения или диапазона значений, будет корректировать концентрацию образца в суспензии посредством одного из действия, приводящего к добавлению большего количества разбавителя дозатором разбавителя для суспензии, тем самым снижая мутность образца, действия, приводящего к сбору и осаждению большего количества образца в суспензии инструментом для сбора, тем самым повышая мутность образца, или посредством обоих этих действий, тем самым корректируя концентрацию образца в суспензии;
первую станцию, дополнительно содержащую первый роботизированный пипетатор, причем, когда контроллер, исходя из полученных измерений мутности, определяет, что мутность суспензии находится в пределах предварительно определенных значений мутности, контроллер направляет первому роботизированному пипетатору инструкции по получению первой аликвоты суспензии образца для ID анализа и по инокуляции приемного сосуда для ID анализа полученной аликвотой;
первое переносящее устройство в сообщении с контроллером, причем контроллер направляет переносящему устройству инструкции по переносу пробирки для суспензии из первого местоположения во второе местоположение в первой секции после того, как первая аликвота была отобрана из пробирки для суспензии;
при этом контроллер, в ответ на измеренную мутность суспензии, управляет первым роботизированным пипетатором для коррекции объема образца в суспензии для обеспечения предварительно определенного количества образца для AST теста, при этом контроллер дополнительно управляет первым роботизированным пипетатором для получения аликвоты суспензии, имеющей объем, который будет нести предварительно определенное количество образца, и инокуляции пробирки для анализа для AST теста;
второе переносящее устройство в сообщении с контроллером, причем контроллер направляет переносящему устройству инструкции по переносу инокулированной пробирки для AST анализа ко второй станции; контроллер находится в сообщении со вторым пипетатором на второй станции, причем контроллер направляет второму пипетатору инструкции по получению аликвоты из инокулированной пробирки для анализа и по дозированию аликвоты в панель для AST теста; и вторая станция дополнительно содержит переносящий робот для переноса инокулированной панели для AST от второй станции.
15. Система по п. 14, причем переносящий робот для переноса инокулированной панели для AST представляет собой захватывающее приспособление для панели, включающее в себя захватывающий планшет, причем захватывающий планшет соединен со штангой управляемого по трем осям шаговым электродвигателем крепления таким образом, чтобы захватывающий планшет мог поворачиваться относительно оси соединительного элемента из первого положения во второе положение; и при этом захватывающий планшет включает в себя захватывающую поверхность, которая выполнена с возможностью захвата объектов.
16. Система по п. 14, дополнительно содержащая детектор для выявления того, образуется ли нить образца, когда первый робот переносит инструмент для сбора, несущий образец, от чашки для культивирования; причем нить выявляется посредством оптического или электрического мониторинга инструмента для сбора, когда инструмент для сбора поднимается от чашки для культивирования, причем система дополнительно содержит механизм для срезания нити, выбранный из группы, состоящей из режущего инструмента, ультразвуковой обработки, высушивания и заморозки.
17. Лабораторный инструмент, содержащий:
корпус, определяющий внутреннее пространство для приема картриджа, содержащего анализируемый материал для проведения тестов;
первую дверь, соединенную с корпусом на его первой стороне и сконфигурированную для получения множества картриджей для проведения тестов во внутреннем пространстве корпуса, причем картриджи получают в ручном режиме; вторую дверь, соединенную с корпусом на его второй стороне; и
исполнительный механизм привода двери, связанный со второй дверью и сконфигурированный для обеспечения функционирования двери при автоматической активации исполнительного механизма привода двери для получения множества картриджей для проведения тестов во внутреннем пространстве корпуса, причем картриджи получают в автоматическом режиме.
18. Лабораторный инструмент по п. 17, в котором первая дверь включает в себя шарнир, связанный с корпусом, причем первая дверь может поворачиваться относительно шарнира при приложении силы в ручном режиме в местоположении, смещенном относительно шарнира.
19. Лабораторный инструмент по п. 18, в котором корпус включает в себя направляющую, по меньшей мере частично определяющую проем второй двери, причем вторая дверь прикреплена к направляющей и выполнена с возможностью скольжения по направляющей при активации исполнительного механизма привода двери.
20. Лабораторный инструмент по п. 19, в котором исполнительный механизм привода двери управляется автоматическим контроллером.
21. Лабораторный инструмент по п. 19, в котором исполнительный механизм привода двери представляет собой линейный исполнительный механизм.
22. Лабораторный инструмент по п. 21, в котором линейный исполнительный механизм представляет собой один из ходового винта, реечной передачи и пневматического поршня.
23. Лабораторный инструмент по п. 17, причем корпус представляет собой корпус, в котором проводятся тесты на чувствительность к антибиотикам.
24. Лабораторный инструмент по п. 17, причем корпус включает в себя интерфейс для ввода данных, который имеет функцию переключения на ручное управление, сконфигурированный для деактивации исполнительного механизма привода двери.
25. Лабораторный инструмент по п. 24, причем интерфейс для ввода данных сконфигурирован для активации запирающего механизма, соединенного с первой дверью, когда первая дверь находится в закрытом состоянии.
26. Электромеханический узел для перемещения панелей для микробиологических тестов, причем узел содержит: управляемое по трем осям шаговым электродвигателем крепление, имеющее штангу, причем верхняя поверхность штанги включает в себя криволинейную часть на конце, отдаленном от управляемого электродвигателем крепления;
захватывающее приспособление для панели, включающее в себя захватывающий планшет, причем захватывающий планшет соединен со штангой управляемого по трем осям шаговым электродвигателем крепления таким образом, чтобы захватывающий планшет мог поворачиваться относительно оси соединительного элемента из первого положения во второе положение; и
при этом захватывающий планшет включает в себя захватывающую поверхность, которая выполнена с возможностью захвата объектов.
27. Узел по п. 26, причем первое положение характеризуется тем, что захватывающая поверхность находится под углом примерно тридцать градусов относительно оси, перпендикулярной продольной оси штанги, и второе положение характеризуется тем, что захватывающая поверхность находится под углом, примерно равным оси, перпендикулярной продольной оси штанги.
28. Узел по п. 27, причем захватывающий планшет включает в себя один или более боковых рельсов.
29. Узел по п. 26, причем захватывающая поверхность дополнительно включает в себя чашечную присоску на своей поверхности, соединенную с внешним вакуумным насосом, причем чашечная присоска обеспечивает давление воздуха ниже атмосферного.
30. Узел по п. 26, причем поворот захватывающего планшета относительно штанги осуществляется с использованием торсионной пружины.
31. Способ перемещения панелей для микробиологических тестов, причем способ включает:
применение автоматизированной системы, включающей в себя штангу и захватывающее приспособление для панели, имеющее захватывающий планшет, при этом захватывающий планшет прикреплен на дальнем конце штанги, причем захватывающий планшет первоначально находится в первом положении, первое положение находится под углом, в результате чего верхнее положение захватывающего планшета находится близко к центральной области автоматизированной системы относительно нижней части;
перемещение захватывающего планшета к панели, подлежащей извлечению, пока нижняя часть захватывающего планшета не будет находиться близко к нижней части панели;
продолжение перемещения захватывающего планшета вперед, устанавливающего контакт с панелью и вызывающего поворот захватывающего планшета ко второму положению, причем второе положение, определяющееся осью, выравнивается с поверхностью панели;
извлечение панели из места ее хранения после того, как захватывающая поверхность захватывающего планшета находится во втором положении, причем захватывающий планшет поворачивается к первому положению после извлечения панели; и
функционирование автоматизированной системы с обеспечением переноса штанги и захватывающего приспособления для панели к предназначенному инструменту для высвобождения панели.
32. Способ по п. 31, причем первое положение захватывающего планшета определяется захватывающей поверхностью на верхней части захватывающего планшета, который располагается под углом примерно тридцать градусов относительно оси, перпендикулярной продольной оси штанги.
33. Автоматизированная система для приготовления суспензии одного образца, аликвоты из которого отбираются для идентификации (ID) микроорганизмов в образце и второго теста, причем система содержит:
по меньшей мере первую секцию для приготовления образца для ID анализа, при этом первая секция содержит:
средство для получения засеянной культуры;
причем автоматизированная система находится в сообщении с визуализирующим средством для обеспечения информации от изображения засеянной колонии, которая применяется для идентификации колонии на засеянной культуре и обозначения такой колонии для автоматизированного сбора образца;
роботизированный инструмент для сбора;
средство для сообщения местоположения колонии роботизированному инструменту для сбора;
средство для управления сбором колонии роботизированным инструментом для сбора, причем роботизированный инструмент для сбора дополнительно сконфигурирован для переноса собранного образца к первой станции для приготовления суспензии образца;
средство для обеспечения жидкости для суспензии в пробирку для суспензии на первой станции приготовления образца, причем роботизированный инструмент для сбора сконфигурирован таким образом, чтобы осаждать собранный образец в жидкость для суспензии;
нефелометр на первой станции для измерения мутности суспензии, причем автоматизированная система в ответ на измерение мутности, которое находится вне предварительно определенного значения мутности, корректирует одно из количества образца или количества суспензии в пробирке для суспензии для обеспечения суспензии с концентрацией образца в предварительно определенном диапазоне;
первый роботизированный пипетатор, причем первый роботизированный пипетатор получает первую аликвоту суспензии на первой станции и инокулирует сосуд для применения в ID анализе; и
средства для переноса пробирки для суспензии с остальной частью суспензии с первой станции для приготовления суспензии образца на вторую станцию для приготовления суспензии образца;
причем первый роботизированный пипетатор дополнительно сконфигурирован для того, чтобы получить объем образца в пробирке для суспензии для получения предварительно определенного количества образца для второго анализа.
34. Автоматизированная система по п. 33, дополнительно содержащий:
вторую секцию для инокуляции панели для AST анализа; причем автоматизированная система имеет средство для переноса инокулированной пробирки для образца из первой секции во вторую секцию; причем вторая секция имеет второй роботизированный пипетатор, который получает аликвоту из инокулированной пробирки для образца и инокулирует панель для полученной аликвотой.
35. Автоматизированная система по п. 34, дополнительно содержащая робот, который загружает инокулированную панель в аппарат, в котором осуществляют AST, аппарат для AST, сконфигурированный таким образом, чтобы он имел по меньшей мере две двери, причем первая дверь получает панель от робота, загружающего панель, причем робот для переноса инокулированной панели для AST представляет собой захватывающее приспособление для панели, включающее в себя захватывающий планшет, причем захватывающий планшет соединен со штангой управляемого по трем осям шаговым электродвигателем крепления таким образом, чтобы захватывающий планшет мог поворачиваться относительно оси соединительного элемента из первого положения во второе положение; и при этом захватывающий планшет включает в себя захватывающую поверхность, которая выполнена с возможностью захвата объектов;
детектор для выявления того, образуется ли нить образца, когда роботизированный инструмент для сбора переносит образец от чашки для культивирования, причем нить выявляется посредством оптического или электрического мониторинга инструмента для сбора, когда инструмент для сбора поднимается от чашки для культивирования;
механизм для срезания нити, выбранный из группы, состоящей из режущего инструмента, ультразвуковой обработки, высушивания и заморозки;
корпус, определяющий внутреннее пространство для приема картриджа, содержащего анализируемый материал для проведения тестов;
первую дверь, соединенную с корпусом на его первой стороне и сконфигурированную для получения множества панелей для проведения AST тестов во внутреннем пространстве корпуса, причем панели получают при функционировании в ручном режиме; вторую дверь, соединенную с корпусом на его второй стороне; и
исполнительный механизм привода двери, связанный со второй дверью и сконфигурированный для обеспечения функционирования двери при автоматической активации исполнительного механизма привода двери для получения множества панелей для проведения тестов во внутреннем пространстве корпуса, причем панели получают при функционировании в автоматическом режиме из второй секции.