СПОСОБ ИДЕНТИФИКАЦИИ В ИММУННОМ РЕПЕРТУАРЕ CDR3 УЧАСТКОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

1. Способ разработки диагностического анализа для конкретного заболевания, включающий следующие стадии:
забор образца у каждого из многих субъектов в группе пациентов и в контрольной группе, где группа пациентов содержит субъектов, которые имеют одинаковое заболевание, и контрольная группа содержит субъектов, которые являются здоровыми;
амплификация и секвенирование иммунного репертуара каждого субъекта в каждой из двух групп для идентификации каждой уникальной последовательности CDR3, присутствующей в образцах, и для определения частоты встречаемости каждой уникальной последовательности CDR3;
идентификация последовательностей CDR3, которые являются общими между по меньшей мере двумя субъектами в каждой из контрольной группы и группы пациентов;
ранжирование последовательностей CDR3 по порядку частоты встречаемости;
идентификация связок из каждой группы; и
идентификация связок, которые в статистически значимой степени ассоциированы с группой пациентов, с предоставлением сигнатуры заболевания.
2. Способ по п. 1, в котором образец представляет собой кровь.
3. Способ по п. 1, в котором образец представляет собой ткань.
4. Способ по п. 1, в котором идентифицируют по меньшей мере примерно 1000 последовательностей CDR3, которые являются общими между по меньшей мере двумя субъектами в каждой из контрольной группы и группы пациентов.
5. Способ по п. 1, в котором идентифицируют по меньшей мере примерно 106 связок из каждой группы.
6. Способ по п. 1, в котором устанавливают минимальное число связок, ассоциированных с сигнатурой заболевания, в качестве диагностического числа, таким образом, что при идентификации по меньшей мере данного числа связок в образце крови субъекта, данный субъект диагностируют как имеющий заболевание.
7. Способ по п. 6, в котором диагностическое число составляет по меньшей мере примерно 500.
8. Способ разработки диагностического анализа для конкретного заболевания, включающий следующие стадии:
забор образца крови у каждого из многих субъектов в группе пациентов и в контрольной группе, где группа пациентов содержит субъектов, которые имеют одинаковое заболевание, и контрольная группа содержит субъектов, которые классифицируются как здоровые;
амплификация и секвенирование иммунного репертуара каждого субъекта в каждой из двух групп для идентификации каждой уникальной последовательности CDR3, присутствующей в образцах крови, и для определения частоты встречаемости каждой уникальной последовательности CDR3;
идентификация по меньшей мере примерно 1000 последовательностей CDR3, которые являются общими между по меньшей мере двумя субъектами в каждой из контрольной группы и группы пациентов;
ранжирование по меньшей мере примерно 1000 последовательностей CDR3 по порядку частоты встречаемости;
идентификация по меньшей мере примерно 106 связок из каждой группы; и
идентификация связок, которые в статистически значимой степени ассоциированы с группой пациентов с предоставлением сигнатуры заболевания;
где минимальное число связок, ассоциированных с сигнатурой заболевания, устанавливают в качестве диагностического числа, таким образом, что при идентификации по меньшей мере данного числа связок в образце крови субъекта данный субъект диагностируют как имеющий заболевание.