КОМПОЗИЦИИ, НАЦЕЛЕННЫЕ НА РАСТВОРИМЫЙ ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ ДОМЕН Е-КАДГЕРИНА, И СВЯЗАННЫЕ С НИМИ СПОСОБЫ ЛЕЧЕНИЯ ОНКОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ

1. Способ лечения пациента с онкологическим заболеванием, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества агента, который специфически нацелен на один или более из второго, третьего, четвертого или пятого субдоменов (ЕС2, ЕСЗ, ЕС4 и ЕС5, соответственно) растворимого Е-кадгерина (sEcad), но не на первый субдомен (ЕС1) sEcad.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что агент специфически нацелен на ЕС4 и/или ЕС5.
3. Способ по п. 2, отличающийся тем, что агент специфически нацелен на ЕС4.
4. Способ по п. 2, отличающийся тем, что агент специфически нацелен на ЕС5.
5. Способ по п. 1, в котором агент представляет собой каркасный белок.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что каркасный белок представляет собой антитело или его фрагмент, которые специфически связываются с эпитопом, содержащим аминокислотные остатки в одном или более из субдоменов ЕС2, ЕСЗ, ЕС4 и ЕС5 белка sEcad, но не в субдомене ЕС1 sEcad.
7. Способ по п. 6, отличающийся тем, что антитело представляет собой гуманизированное, химерное или человеческое антитело.
8. Способ по п. 6, отличающийся тем, что антитело представляет собой одноцепочечное антитело.
9. Способ по п. 6, отличающийся тем, что антитело представляет собой моноклональное или поликлональное антитело.
10. Способ по п. 6, отличающийся тем, что антитело представляет собой иммуноглобулин класса G (IgG) или иммуноглобулин класса М (IgM).
11. Способ по п. 1, отличающийся тем, что агент содержит детектируемую метку.
12. Способ по п. 1, отличающийся тем, что агент уничтожает злокачественные клетки, экспрессирующие Е-кадгерин, и не уничтожает незлокачественные клетки.
13. Способ по п. 12, отличающийся тем, что агент уничтожает злокачественные клетки, экспрессирующие Е-кадгерин, по механизму запрограммированной клеточной гибели, остановки роста, аноикиса, некроза или аутофагии.
14. Способ по п. 1, отличающийся тем, что агент вводят в фармацевтическом составе, который не содержит цитотоксических количеств какого-либо вспомогательного вещества.
15. Способ по п. 1, отличающийся тем, что агент доставляют в фармацевтическом составе, который:
(а) при введении пациенту обеспечивает уровень агента в сыворотке от примерно 1 до примерно 10 мг/кг или,
(б) при добавлении к культуре клеток обеспечивает концентрацию агента от примерно 1 до примерно 500 мкг/мл клеточной культуральной среды.
16. Способ по п. 15, отличающийся тем, что фармацевтический агент обеспечивает уровень агента в сыворотке пациента от примерно 1 до примерно 5 мг/кг или концентрацию в клеточной культуральной среде от примерно 1 до примерно 400 мкг/мл.
17. Способ по п. 1, отличающийся тем, что агент доставляют в фармацевтическом составе путем перорального введения, внутривенного введения, назального или ингаляционного введения, внутримышечного, интраперитонеального введения, введения через слизистую или чрескожного введения.
18. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию получения биологического образца от пациента и определения, содержит ли образец повышенный уровень sEcad или другого прогностического биомаркера онкологического заболевания.
19. Способ по п. 18, отличающийся тем, что биологический образец представляет собой образец мочи, слюны, спинномозговой жидкости, крови или биоптат.
20. Способ по п. 18, отличающийся тем, что указанную стадию осуществляют перед введением агента, и повышенный уровень sEcad указывает на то, что пациент является подходящим кандидатом для лечения.
21. Способ по п. 18, отличающийся тем, что указанную стадию осуществляют один или несколько раз после введения агента, и пониженный уровень sEcad указывает на то, что пациент хорошо отвечает на лечение.
22. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию введения второго средства для лечения онкологического заболевания.
23. Способ по п. 22, отличающийся тем, что второе средство для лечения онкологического заболевания включает введение химиотерапевтического агента, лучевую терапию, лечение антителом или хирургическое вмешательство.
24. Способ по п. 1, отличающийся тем, что онкологическое заболевание локализовано в эпителизированной ткани.
25. Способ по п. 1, отличающийся тем, что онкологическое заболевание представляет собой онкологическое заболевание желудочно-кишечного тракта, центральной нервной системы, молочной железы, кожи, половой системы, легких или мочевых путей.
26. Способ по п. 25, отличающийся тем, что онкологическое заболевание желудочнокишечного тракта представляет собой онкологическое заболевание полости рта, горла, пищевода, желудка, кишечника, прямой кишки или ануса.
27. Способ по п. 25, отличающийся тем, что онкологическое заболевание кожи представляет собой плоскоклеточную карциному или меланому.
28. Способ по п. 25, отличающийся тем, что онкологическое заболевание половой системы представляет собой рак шейки матки, рак матки, рак яичников, рак вульвы или губ, рак предстательной железы, рак яичек или рак мужских половых путей.
29. Способ снижения вероятности того, что у пациента разовьется рак, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества (а) антигенного полипептида, который содержит аминокислотную последовательность из одного или более субдоменов ЕС2-ЕС5 sEcad, исключая субдомен ЕС1, или обладающего антигенной активностью фрагмента или другого его варианта, или (б) вектора экспрессии, содержащего последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую указанный антигенный полипептид или обладающий антигенной активностью фрагмент или другой его вариант.
30. Способ по п. 29, отличающийся тем, что антигенный полипептид содержит аминокислотную последовательность из ЕС4 и/или ЕС5.
31. Способ по п. 29, отличающийся тем, что антигенный полипептид содержит аминокислотную последовательность из ЕС4.
32. Способ по п. 29, отличающийся тем, что антигенный полипептид содержит аминокислотную последовательность из ЕС5.
33. Способ по п. 29, отличающийся тем, что антигенный полипептид вызывает выработку антител, которые специфически связываются с sEcad, но не связываются с Екадгерином, который экспрессируется незлокачественными клетками в организме пациента.
34. Способ по п. 29, отличающийся тем, что антигенный полипептид или вектор экспрессии доставляют в виде фармацевтического состава путем перорального введения, внутривенного введения, назального введения или ингаляционного введения, внутримышечного введения, интраперитонеального введения, введения через слизистую, или чрескожного введения.
35. Способ по п. 29, отличающийся тем, что онкологическое заболевание локализовано в эпителизированной ткани.
36. Способ по п. 29, отличающийся тем, что онкологическое заболевание представляет собой онкологическое заболевание желудочно-кишечного тракта, центральной нервной системы, молочной железы, кожи, половой системы, легких или мочевых путей.
37. Способ по п. 36, отличающийся тем, что онкологическое заболевание желудочнокишечного тракта представляет собой онкологическое заболевание полости рта, горла, пищевода, желудка, кишечника, прямой кишки или ануса.
38. Способ по п. 36, отличающийся тем, что онкологическое заболевание кожи представляет собой плоскоклеточную карциному или меланому.
39. Способ по п. 36, отличающийся тем, что онкологическое заболевание половой системы представляет собой рак шейки матки, рак матки, рак яичников, рак вульвы или рак губ, рак предстательной железы, рак яичек или рак мужских половых путей.
40. Фармацевтически приемлемая композиция, содержащая терапевтически эффективное количество (а) антитела, которое специфически связывается с эпитопом, содержащим аминокислотные остатки в одном или более из субдоменов ЕС2, ЕСЗ, ЕС4 и ЕС5 sEcad, но не в субдомене ЕС1 sEcad; (б) антигенного полипептида, который содержит аминокислотную последовательность из одного или более из субдоменов ЕС2-ЕС5 sEcad, исключая субдомен ЕС1, или обладающего антигенной активностью фрагмента или другого его варианта; или (с) вектора экспрессии, содержащего последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую указанный антигенный полипептид или обладающий антигенной активностью фрагмент или другой его вариант.
41. Способ идентификации эпитопа в sEcad, включающий:
(а) получение полипептида, содержащего sEcad, или его фрагмента или другого его варианта;
(б) введение полипептида в организм животного;
(в) выделение антител, продуцируемых животным в ответ на полипептид; и
(г) обработку злокачественных клеток антителами или полученными из них моноклональными антителами, причем гибель злокачественных клеток означает, что полипептид содержит эпитоп sEcad, который может быть использован в качестве мишени или агента при лечении, профилактике или визуализации онкологического заболевания.
42. Способ по п. 41, отличающийся тем, что полипептид содержит аминокислотную последовательность из одного или более из субдоменов ЕС2, ЕСЗ, ЕС4 или ЕС5 sEcad, но не включает аминокислотную последовательность из субдомена ЕС1 sEcad.
43. Способ по п. 42, отличающийся тем, что полипептид содержит аминокислотную последовательность из одного или более из ЕС4 или ЕС5.
44. Способ по п. 43, отличающийся тем, что полипептид содержит аминокислотную последовательность из ЕС4.
45. Способ по п. 43,отличающийся тем, что полипептид содержит аминокислотную последовательность из ЕС 5.