СПОСОБ КЛАССИФИКАЦИИ ПРОКАРИОТ ИЗ СЕМЕЙСТВА RICKETTSIACEAE С ПОМОЩЬЮ ЧИСЛОВОЙ ХАРАКТЕРИСТИКИ СРЕДНЕЙ УДАЛЁННОСТИ НУКЛЕОТИДОВ В ПОЛНОРАЗМЕРНЫХ ГЕНОМАХ

Способ классификации прокариот из семейства Rickettsiaceae, заключающийся в получении, сравнении и ранжировании значений показателя средней удаленности нуклеотидов (g), позволяющего отображать расположение нуклеотидов в полноразмерных геномах, определяемое суммированием логарифмов всех интервалов между ближайшими вхождениями нуклеотидов данной однородной цепи, с последующим суммированием частичных сумм всех однородных цепей нуклеотидов (A, G, C, T), и наконец, делением на размер генома (в парах оснований), рассчитываемый по формуле:
,
ij
j
где Δ - интервал от i-го до (i+1)-го вхождения j-го символа (интервал между двумя ближайшими одинаковыми нуклеотидами); n - число вхождений j-го символа; m=4 - мощность алфавита (число различных нуклеотидов в последовательности); n - длина последовательности (генома).