ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ЛОКУС, АССОЦИИРОВАННЫЙ С ГНИЛЬЮ КОРНЯ И СТЕБЛЯ, ОБУСЛОВЛЕННОЙ PHYTOPHTHORA, У СОИ

Phytophthora
1. Способ идентификации растения сои, которое проявляет повышенную устойчивость к гнили корня и стебля, обусловленной (PRSR), при этом способ включает обнаружение в зародышевой плазме растения сои по меньшей мере одного аллеля маркерного локуса, где
a. маркерный локус расположен в пределах хромосомного интервала, содержащего BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C и фланкированного ними; и
b. по меньшей мере один аллель ассоциирован с повышенной устойчивостью к PRSR.
2. Способ по п. 1, где маркерный локус расположен в пределах хромосомного интервала, содержащего BARCSOYSSR_07_0295 и InDel_1 и фланкированного ними.
3. Способ по п. 1, где маркерный локус выбран из группы, состоящей из BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T, BARCSOYSSR_07_0286, BARCSOYSSR_07_0289, BARC_1_01_Gm07_5442375_T_C, BARC_1_01_Gm07_5457696_C_T, Gm07_5480878_G_A, BARC_1_01_Gm07_5481829_T_C, BARCSOYSSR_07_0295, BARC_1_01_Gm07_5488504_A_G, BARC_1_01_Gm07_5490895_G_T, BARC_1_01_Gm07_5495895_G_A, BARC_1_01_Gm07_5500269_T_G, BARC_1_01_Gm07_5504994_G_T, BARC_1_01_Gm07_5519521_G_A, InDel_2, InDel_1, BARCSOYSSR_07_0297, BARC_1_01_Gm07_5555040_T_G, BARC_1_01_Gm07_5580414_T_C, BARC_1_01_Gm07_5762798_C_T, BARC_1_01_Gm07_5599140_A_C, BARC_1_01_Gm07_5601844_G_A, BARC_1_01_Gm07_5610838_T_C, BARCSOYSSR_07_0300 и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C.
4. Растение сои, идентифицированное с помощью способа по п. 1.
5. Способ по п. 1, где маркерный локус содержит ген, выбранный из группы, состоящей из Glyma.07G62500, Glyma.07G62600, Glyma.07G62700, Glyma.07G62800 и Glyma.07G62900.
6. Способ по п. 5, где ген представляет собой Glyma.07G62900.
Phytophthora
7. Способ идентификации растения сои, которое проявляет повышенную устойчивость к гнили корня и стебля, обусловленной (PRSR), при этом способ включает обнаружение в зародышевой плазме растения сои гаплотипа, содержащего аллели в одном или более маркерных локусах, где:
a. один или более маркерных локусов расположены в пределах хромосомного интервала, содержащего BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C и фланкированного ними; и
b. гаплотип ассоциирован с повышенной устойчивостью к PRSR.
8. Способ по п. 7, где один или более маркерных локусов расположены в пределах хромосомного интервала, содержащего BARCSOYSSR_07_0295 и InDel_1 и фланкированного ними.
9. Способ по п. 7, где маркерный локус выбран из группы, состоящей из BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T, BARCSOYSSR_07_0286, BARCSOYSSR_07_0289, BARC_1_01_Gm07_5442375_T_C, BARC_1_01_Gm07_5457696_C_T, Gm07_5480878_G_A, BARC_1_01_Gm07_5481829_T_C, BARCSOYSSR_07_0295, BARC_1_01_Gm07_5488504_A_G, BARC_1_01_Gm07_5490895_G_T, BARC_1_01_Gm07_5495895_G_A, BARC_1_01_Gm07_5500269_T_G, BARC_1_01_Gm07_5504994_G_T, BARC_1_01_Gm07_5519521_G_A, InDel_2, InDel_1, BARCSOYSSR_07_0297, BARC_1_01_Gm07_5555040_T_G, BARC_1_01_Gm07_5580414_T_C, BARC_1_01_Gm07_5762798_C_T, BARC_1_01_Gm07_5599140_A_C, BARC_1_01_Gm07_5601844_G_A, BARC_1_01_Gm07_5610838_T_C, BARCSOYSSR_07_0300 и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C.
10. Растение сои, идентифицированное с помощью способа по п. 7, где растение сои содержит в зародышевой плазме гаплотип, ассоциированный с повышенной устойчивостью к PRSR, при этом гаплотип содержит аллели в одном или более маркерных локусах, расположенных в пределах хромосомного интервала, содержащего BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C и фланкированного ними.
11. Способ по п. 7, где маркерный локус содержит ген, выбранный из группы, состоящей из Glyma.07G62500, Glyma.07G62600, Glyma.07G62700, Glyma.07G62800 и Glyma.07G62900.
12. Способ по п. 11, где ген представляет собой Glyma.07G62900.
13. Способ селекции с помощью маркера, включающий:
Phytophthora
a. получение первого растения сои по меньшей мере с одним аллелем маркерного локуса, где маркерный локус расположен в пределах хромосомного интервала, содержащего BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C и фланкированного ними, при этом аллель маркерного локуса ассоциирован с повышенной устойчивостью к гнили корня и стебля, обусловленной (PRSR);
b. скрещивание первого растения сои со вторым растением сои;
c. оценивание потомства в отношении меньшей мере одного аллеля и
d. отбор растений, относящихся к потомству, которые содержат по меньшей мере один аллель.
14. Способ по п. 13, где маркерный локус расположен в пределах хромосомного интервала, содержащего BARCSOYSSR_07_0295 и InDel_1 и фланкированного ними.
15. Способ по п. 13, где маркерный локус выбран из группы, состоящей из BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T, BARCSOYSSR_07_0286, BARCSOYSSR_07_0289, BARC_1_01_Gm07_5442375_T_C, BARC_1_01_Gm07_5457696_C_T, Gm07_5480878_G_A, BARC_1_01_Gm07_5481829_T_C, BARCSOYSSR_07_0295, BARC_1_01_Gm07_5488504_A_G, BARC_1_01_Gm07_5490895_G_T, BARC_1_01_Gm07_5495895_G_A, BARC_1_01_Gm07_5500269_T_G, BARC_1_01_Gm07_5504994_G_T, BARC_1_01_Gm07_5519521_G_A, InDel_2, InDel_1, BARCSOYSSR_07_0297, BARC_1_01_Gm07_5555040_T_G, BARC_1_01_Gm07_5580414_T_C, BARC_1_01_Gm07_5762798_C_T, BARC_1_01_Gm07_5599140_A_C, BARC_1_01_Gm07_5601844_G_A, BARC_1_01_Gm07_5610838_T_C, BARCSOYSSR_07_0300 и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C.
16. Растение сои, относящееся к потомству, отобранное с помощью способа по п. 13, где растение содержит по меньшей мере один аллель маркерного локуса, где маркерный локус расположен в пределах хромосомного интервала, содержащего BARC_1_01_Gm07_5383355_C_T и BARC_1_01_Gm07_5629128_A_C и фланкированного ними.
17. Способ по п. 13, где маркерный локус содержит ген, выбранный из группы, состоящей из Glyma.07G62500, Glyma.07G62600, Glyma.07G62700, Glyma.07G62800 и Glyma.07G62900.
18. Способ по п. 17, где ген представляет собой Glyma.07G62900.