СОЕДИНЕНИЯ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ ДЛЯ СВЯЗЫВАНИЯ РОСТОВОГО ФАКТОРА ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ 11

1. Аптамер, который связывает GDF11 с аффинностью, составляющей менее 10 нМ, при этом в аналогичных условиях указанный аптамер связывает GDF8 с аффинностью, которая по меньшей мере в 10 раз слабее, чем аффинность к GDF11, или не связывает GDF8.
2. Аптамер по п. 1, отличающийся тем, что указанный аптамер связывает GDF8 с аффинностью, которая по меньшей мере в 20 раз слабее или по меньшей мере в 30 раз слабее, или по меньшей мере в 50 раз слабее, чем аффинность к GDF11.
3. Аптамер по п. 1 или 2, отличающийся тем, что указанный аптамер связывает GDF8 с аффинностью, составляющей более 50 нМ или более 100 нМ, или более 150 нМ, или более 200 нМ, или более 250 нМ, или более 300 нМ.
4. Аптамер по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что указанный аптамер связывает GDF11 с аффинностью, составляющей менее 8 нМ или менее 7 нМ, или менее 6 нМ, или менее 5 нМ, или менее 4 нМ, или менее 3 нМ, или менее 2 нМ, или менее 1 нМ.
5. Аптамер по п. 1, отличающийся тем, что указанный аптамер не связывает GDF8.
6. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что аффинность определяется с помощью анализа связывания, включающего полианионный ингибитор.
7. Аптамер по п. 6, отличающийся тем, что данный полианионный ингибитор выбран из декстрансульфата, гепарина, Z-блока, поли-dI/dC, разрушенной ультразвуком или деградированной в результате гидродинамического сдвига ДНК из молок лососевых, ДНК из тимуса теленка и дНТФ.
n
n
m
n
n
m
n
n
n
n
n
m
n
n
m
n
n
n
8. Аптамер по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность 5'-RWMCCPPGMMPPPAACMCRWPPGPASGC-3' (SEQ ID №: 110) или 5'-RWMCCPPGMMPPPAACMCRWPPGPASGS-3' (SEQ ID №: 151), где:
каждый P независимо и в каждом случае представляет собой C-5-модифицированный пиримидин;
R представляет собой A или G;
каждый W независимо и в каждом случае представляет собой A, T или U;
каждый M независимо и в каждом случае представляет собой A или C;
каждый S независимо и в каждом случае представляет собой G или C;
каждый n независимо и в каждом случае равен 0 или 1; и
каждый m независимо и в каждом случае равен 0 или 1.
n
n
m
n
n
m
n
n
n
n
n
m
n
n
m
n
n
n
9. Аптамер, который связывает GDF11, при этом указанный аптамер содержит последовательность 5'-RWMCCPPGMMPPPAACMCRWPPGPASGC-3' (SEQ ID №: 110) или 5'-RWMCCPPGMMPPPAACMCRWPPGPASGS-3' (SEQ ID №: 151), где:
каждый P независимо и в каждом случае представляет собой C-5-модифицированный пиримидин;
R представляет собой A или G;
каждый W независимо и в каждом случае представляет собой A, T или U;
каждый M независимо и в каждом случае представляет собой A или C;
каждый S независимо и в каждом случае представляет собой G или C;
каждый n независимо и в каждом случае равен 0 или 1; и
каждый m независимо и в каждом случае равен 0 или 1.
10. Аптамер по п. 8 или 9, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность, выбранную из:
n
n
m
n
n
m
n
n
n
(а) 5'-RWACCPPGMMPPPAACMCRWPPGPASGC-3' (SEQ ID №: 111);
n
n
m
n
n
m
n
n
n
(б) 5'-RWACCPPGMMPPPAACMCRWPPGPASGS-3' (SEQ ID №: 152);
n
n
m
n
n
m
n
n
n
(в) 5'-RWMCCPPGMMPPPAACMCGWPPGPASGC-3' (SEQ ID №: 112);
n
n
m
n
n
m
n
n
n
(г) 5'-RWMCCPPGMMPPPAACMCGWPPGPASGS-3' (SEQ ID №: 153);
m
n
n
m
n
n
(д) 5'-RMCPPGMMPPPAACMCRWPPPASGC-3' (SEQ ID №: 113); и
m
n
n
m
n
n
(е) RMCPPGMMPPPAACMCRWPPPASGS-3' (SEQ ID №: 154).
11. Аптамер по любому из пп. 8-10, при этом, если R представляет собой G, первый W представляет собой A и при этом, если R представляет собой A, первый W представляет собой C.
12. Аптамер по любому из пп. 8-11, отличающийся тем, что по меньшей мере 1, по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5 или по меньшей мере 6 n равны 0.
13. Аптамер по любому из пп. 8-11, отличающийся тем, что каждый n равен 0.
14. Аптамер по любому из пп. 8-11, отличающийся тем, что по меньшей мере 1, по меньшей мере 2, по меньшей мере 3 n равны 1.
15. Аптамер по любому из пп. 8-14, отличающийся тем, что по меньшей мере 1 m равен 0.
16. Аптамер по любому из пп. 8-14, отличающийся тем, что по меньшей мере 1 m равен 1.
17. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность 5'-CPPGMPPP-3' (SEQ ID №: 114), где каждый P независимо и в каждом случае представляет собой C-5-модифицированный пиримидин и, где M представляет собой C или A.
18. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность 5'-PPPAGC-3'(SEQ ID №: 115) или 5'-PPPAGG-3' (SEQ ID №: 155), где каждый P независимо и в каждом случае представляет собой C-5-модифицированный пиримидин.
x
x
19. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность 5'-CPPGMPPPNPPPAGC-3' (SEQ ID №: 160) или 5'-CPPGMPPPNPPPAGG-3' (SEQ ID №: 116), где каждый P независимо и в каждом случае представляет собой C-5-модифицированный пиримидин, где x равен 2, 3, 4 или 5, где M представляет собой C или A и, где каждый N независимо и в каждом случае выбран из А, С, G, T и U.
20. Аптамер по п. 16, отличающийся тем, что х равен 3 или 4.
x
21. Аптамер по п. 19 или 20, отличающийся тем, что N содержит последовательность 5'-AAG-3' или 5'-ACG-3', или 5'-AGG-3'.
22. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность 5'-NNCPPGRPPPAMGPPPAGS-3' (SEQ ID №: 141), где каждый P независимо и в каждом случае представляет собой C-5-модифицированный пиримидин, R представляет собой A или G; каждый N независимо и в каждом случае представляет собой A, G или C; M представляет собой A или C; и S представляет собой G или C.
23. Аптамер по любому из пп. 8-22, отличающийся тем, что каждый Р независимо и в каждом случае выбран из:
5-(N-бензилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (BndU),
5-(N-бензилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-бензилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-фенэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (PEdU),
5-(N-тиофенилметилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (ThdU),
5-(N-изобутилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (iBudU),
5-(N-тирозилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (TyrdU),
5-(N-3,4-метилендиоксибензилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (MBndU),
5-(N-4-фторбензилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (FBndU),
5-(N-3-фенилпропилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (PPdU),
5-(N-имидизолилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (ImdU),
5-(N-изобутилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-изобутилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-триптаминокарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (TrpdU),
R
5-(N--треонинилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (ThrdU),
5-(N-триптаминокарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-триптаминокарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-[1-(3-триметиламмоний)пропил]карбоксиамид)-2'-дезоксиуридинхлорида,
5-(N-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (NapdU),
5-(N-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-[1-(2,3-дигидроксипропил)]карбоксиамид)-2'-дезоксиуридина),
5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (2NapdU),
5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-1-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (NEdU),
5-(N-1-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-1-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-2-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (2NEdU),
5-(N-2-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-2-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-3-бензофуранилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (BFdU),
5-(N-3-бензофуранилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-3-бензофуранилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-3-бензотиофенилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (BTdU),
5-(N-3-бензотиофенилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина, и
5-(N-3-бензотиофенилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина.
24. Аптамер по любому из пп. 8-22, отличающийся тем, что каждый Р независимо и в каждом случае выбран из:
5-(N-1-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (NapdU),
5-(N-1-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-1-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (2NapdU),
5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-1-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (NEdU),
5-(N-1-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-1-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-2-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (2NEdU),
5-(N-2-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-2-нафтилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-3-бензофуранилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (BFdU),
5-(N-3-бензофуранилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина,
5-(N-3-бензофуранилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина,
5-(N-3-бензотиофенилэтилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (BTdU),
5-(N-3-бензотиофенилэтилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина, и
5-(N-3-бензотиофенилэтилкарбоксиамид)-2'-фторуридина.
25. Аптамер по любому из пп. 8-22, отличающийся тем, что каждый из по меньшей мере 1, по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5 или по меньшей мере 6 P независимо выбран из 5-(N-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (NapdU), 5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина и 5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-фторуридина.
26. Аптамер по любому из пп. 8-22, отличающийся тем, что каждый Р независимо выбран из 5-(N-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-дезоксиуридина (NapdU), 5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-O-метилуридина и 5-(N-2-нафтилметилкарбоксиамид)-2'-фторуридина.
27. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность, выбранную из SEQ ID №: 12, 13, 15-109 и 117-140.
28. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит последовательность, выбранную из SEQ ID №: 12, 15, 26, 105-109 и 142-150.
29. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер состоит из 18-200 нуклеотидов или 18-150 нуклеотидов, или 18-100 нуклеотидов, или 18-75 нуклеотидов, или 18-50 нуклеотидов, или 20-150 нуклеотидов, или 20-100 нуклеотидов, или 20-75 нуклеотидов, или 20-50 нуклеотидов, при этом каждый нуклеотид может независимо представлять собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид.
30. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный аптамер содержит детектируемую метку.
31. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что GDF11 представляет собой GDF11 человека и GDF8 представляет собой GDF8 человека.
32. Аптамер по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что GDF11 представляет собой зрелый GDF11 человека, содержащий последовательность SEQ ID №: 118, и GDF8 представляет собой зрелый GDF8 человека, содержащий последовательность SEQ ID №: 119.
33. Способ детектирования GDF11 в образце, включающий приведение в контакт белков из образца с аптамером по любому из пп. 1-32.
34. Способ по п. 33, отличающийся тем, что аптамер связывает GDF8 с аффинностью, которая по меньшей мере в 10 раз слабее, чем аффинность к GDF11, или не связывает GDF8.
35. Способ определения того, содержит ли образец GDF11, включающий приведение в контакт белков из образца с аптамером по любому из пп. 1-32.
36. Способ по п. 35, отличающийся тем, что образец содержит GDF8.
37. Способ по любому из пп. 33-36, отличающийся тем, что указанный способ включает приведение в контакт образца с аптамером в жестких условиях.
38. Способ по п. 37, отличающийся тем, что указанные жесткие условия включают полианионный ингибитор.
39. Способ по п. 38, отличающийся тем, что данный полианионный ингибитор выбран из декстрансульфата, гепарина, Z-блока, поли-dI/dC, разрушенной ультразвуком или деградированной в результате гидродинамического сдвига ДНК из молок лососевых, ДНК из тимуса теленка и дНТФ.
40. Способ по любому из пп. 33-39, отличающийся тем, что образец представляет собой образец, взятый у человека.
41. Способ по п. 40, отличающийся тем, что образец выбран из образца крови, сыворотки, плазмы, слюны, мочи и ткани.
42. Способ по п. 41, отличающийся тем, что образец ткани выбран из ткани сердечной мышцы, ткани скелетных мышц, ткани поджелудочной железы, хрящевой ткани и нервной ткани.
43. Способ по любому из пп. 33-42, отличающийся тем, что белки отделяли по меньшей мере от одного другого компонента образца.
44. Способ по любому из пп. 33-42, отличающийся тем, что белки не отделяли от других компонентов образца.
45. Композиция, содержащая аптамер по любому из пп. 1-32 и белки из образца.
46. Композиция по п. 45, отличающаяся тем, что образец содержит GDF8.
47. Композиция по п. 45 или 46, содержащая полианионный ингибитор.
48. Композиция по п. 47, отличающаяся тем, что данный полианионный ингибитор выбран из декстрансульфата, гепарина, Z-блока, поли-dI/dC, разрушенной ультразвуком или деградированной в результате гидродинамического сдвига ДНК из молок лососевых, ДНК из тимуса теленка и дНТФ.
49. Композиция по любому из пп. 45-48, отличающаяся тем, что образец представляет собой образец, взятый у человека.
50. Композиция по п. 49, отличающаяся тем, что образец выбран из образца крови, сыворотки, плазмы, слюны, мочи и ткани.
51. Композиция по п. 50, отличающаяся тем, что образец ткани выбран из ткани сердечной мышцы, ткани скелетных мышц, ткани поджелудочной железы, хрящевой ткани и нервной ткани.
52. Композиция по любому из пп. 45-51, отличающаяся тем, что белки отделяли по меньшей мере от одного другого компонента образца.
53. Композиция по любому из пп. 45-51, отличающаяся тем, что белки не отделяли от других компонентов образца.