ГЕННАЯ ЭКСПРЕССИЯ ПРИ ОТВЕТЕ ДЕНДРИТНОЙ КЛЕТКИ, ИХ КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Способ модулирования одного или нескольких ответов дендритных клеток, причем способ включает приведение дендритной клетки или популяции дендритных клеток в контакт с модулятором в количестве, достаточном для модифицирования одного или нескольких ответов дендритных клеток по сравнению с одним или несколькими ответами дендритной клетки или популяции дендритных клеток в отсутствие модулятора.
2. Способ по п. 1, где модулятором является средство, которое модулирует экспрессию, активность и/или функцию одного или нескольких целевых генов или одного или нескольких продуктов одного или нескольких целевых генов, которые регулируют один или несколько генов, выбранных из приведенных в таблицах 1-5А.
3. Способ по п. 2, где предпочтительный ген или комбинацию целевых генов выбирают и идентифицируют в качестве положительного регулятора одного или нескольких ответов дендритных клеток или отрицательного регулятора одного или нескольких ответов дендритных клеток.
4. Способ по п. 3, где модулятор находится в количестве, достаточном для модулирования одного или нескольких ответов дендритной клетки, выбранных из группы, состоящей из модулирования одного или нескольких генов, которые регулируют созревание дендритной клетки; модулирования одного или нескольких генов, которые регулируют иммунный ответ дендритной клетки; модулирования одного или нескольких генов, которые регулируют противовирусный иммунный ответ дендритной клетки, и модулирования одного или нескольких генов, которые регулируют воспалительный иммунный ответ дендритной клетки.
5. Способ по п. 1 где модулятором является антитело, растворимый полипептид, полипептидное средство, пептидное средство, средство на основе нуклеиновой кислоты, лиганд на основе нуклеиновой кислоты или средство на основе малой молекулы.
6. Способ по п. 5, где средством является антитело.
7. Способ по п. 6, где антителом является моноклональное антитело.
8. Способ по п. 6, где антитело является химерным, гуманизированным или полностью человеческим моноклональным антителом.
9. Способ по любому из пп. 1-8, где модулятором является одно или несколько средств, выбранных из киназы, трансмембранного рецептора, химического лекарственного средства, биологического лекарственного средства, средства, которое модулирует киназу, средства, которое модулирует трансмембранный рецептор, средства, которое модулирует химическое лекарственное средство, и средства, которое модулирует биологическое лекарственное средство.
10. Способ идентификации сигнатурного гена, генной сигнатуры или другого генетического элемента, связанного с ответом дендритной клетки, включающий
a) приведение дендритной клетки в контакт с ингибитором ответа дендритной клетки или средством, которое усиливает ответ дендритной клетки; и
b) идентификацию сигнатурного гена, генной сигнатуры или другого генетического элемента, экспрессия которого модулируется при помощи стадии (а).
11. Способ по п. 10, дополнительно включающий
c) нарушение экспрессии сигнатурного гена, генной сигнатуры или генетического элемента, идентифицированных на стадии (b) в дендритной клетке, которая контактировала с ингибитором ответа дендритной клетки или средством, которое усиливает ответ дендритной клетки; и
d) идентификацию целевого гена, экспрессия которого модулируется при помощи стадии (с).
12. Способ по п. 10, где ингибитором ответа дендритной клетки является средство, которое ингибирует экспрессию, активность и/или функцию целевого гена или одного или нескольких продуктов одного или нескольких целевых генов, которые регулируют один или несколько генов, выбранных из приведенных в таблицах 1-5А.
13. Способ по п. 10, где средством, которое усиливает ответ дендритной клетки, является средство, которое усиливает экспрессию, активность и/или функцию целевого гена или одного или нескольких продуктов одного или нескольких целевых генов, которые регулируют один или несколько генов, выбранных из приведенных в таблицах 1-5А.
14. Способ по п. 12 или 13, где средством является антитело, растворимый полипептид, полипептидный антагонист, пептидный антагонист, антагонист на основе нуклеиновой кислоты, лиганд на основе нуклеиновой кислоты или антагонист на основе малой молекулы.
15. Способ диагностики иммунного ответа у субъекта, включающий определение уровня экспрессии, активности и/или функции одного или нескольких сигнатурных генов или одного или нескольких продуктов одного или нескольких сигнатурных генов, выбранных из приведенных в таблицах 1, 1А, 2, 2А, 3, 3А, 4, 4А, 5 и 5А, и сравнение определенного уровня с контрольным уровнем экспрессии, активности и/или функции сигнатурного гена или продукта гена, где отличие между определенным уровнем и контрольным уровнем указывает на наличие иммунного ответа у субъекта.
16. Способ по п. 15, где иммунный ответ представляет собой аутоиммунный ответ.
17. Способ по п. 15, где иммунный ответ представляет собой воспалительный ответ.
18. Способ мониторинга иммунного ответа у субъекта, включающий определение первого уровня экспрессии, активности и/или функции одного или нескольких сигнатурных генов или одного или нескольких продуктов одного или нескольких сигнатурных генов, выбранных из приведенных в таблицах 1, 1А, 2, 2А, 3, 3А, 4, 4А, 5 и 5А, в первой временной точке, определение второго уровня экспрессии, активности и/или функции одного или нескольких сигнатурных генов или одного или нескольких продуктов одного или нескольких сигнатурных генов, выбранных из приведенных в таблицах 1, 1А, 2, 2А, 3, 3А, 4, 4А, 5 и 5А, во второй временной точке, и сравнение первого определенного уровня экспрессии, активности и/или функции со вторым определенным уровнем экспрессии, активности и/или функции, где изменение в первом и втором определенных уровнях указывает на изменение в иммунном ответе у субъекта.
19. Способ по п. 18, где иммунный ответ представляет собой аутоиммунный ответ.
20. Способ по п. 18, где иммунный ответ представляет собой воспалительный ответ.
21. Способ диагностики аберрантного ответа дендритной клетки у субъекта, включающий определение уровня экспрессии, активности и/или функции одного или нескольких сигнатурных генов или одного или нескольких продуктов одного или нескольких сигнатурных генов, выбранных из приведенных в таблицах 1, 1А, 2, 2А, 3, 3А, 4, 4А, 5 и 5А, и сравнение определенного уровня с контрольным уровнем экспрессии, активности и/или функции сигнатурного гена или продукта гена, где отличие между определенным уровнем и контрольным уровнем указывает на наличие аберрантного ответа дендритной клетки у субъекта.
22. Способ по п. 21, где аберрантный ответ дендритной клетки представляет собой аутоиммунный ответ.
23. Способ по п. 21, где иммунный ответ представляет собой воспалительный ответ.
24. Способ мониторинга аберрантного ответа дендритной клетки у субъекта, включающий определение первого уровня экспрессии, активности и/или функции одного или нескольких сигнатурных генов или одного или нескольких продуктов одного или нескольких сигнатурных генов, выбранных из приведенных в таблицах 1, 1А, 2, 2А, 3, 3А, 4, 4А, 5 и 5А, в первой временной точке, определение второго уровня экспрессии, активности и/или функции одного или нескольких сигнатурных генов или одного или нескольких продуктов одного или нескольких сигнатурных генов, выбранных из приведенных в таблицах 1, 1А, 2, 2А, 3, 3А, 4, 4А, 5 и 5А, во второй временной точке, и сравнение первого определенного уровня экспрессии, активности и/или функции со вторым определенным уровнем экспрессии, активности и/или функции, где изменение в первом и втором определенных уровнях указывает на изменение в ответе дендритной клетки у субъекта.
25. Способ по п. 24, где аберрантный ответ дендритной клетки представляет собой аутоиммунный ответ.
26. Способ по п. 24, где аберрантный ответ дендритной клетки представляет собой воспалительный ответ.