МЕДИЦИНСКАЯ АНАЛИТИЧЕСКАЯ СИСТЕМА

1. Медицинская аналитическая система для доклинического и/или клинического анализа данных, полученных по меньшей мере от одного пациента, содержащая:
- внутреннюю базу данных (IDB), причем база данных содержит набор данных, результаты анализов, потоковые дефиниции и инструментальные дефиниции и другие связанные данные для инструментов, которые использует репозиторий базы данных,
- блок доступа к базе данных (DA), причем данный блок выполнен с возможностью предоставления доступа к внутренней базе данных,
- блок потоковых дефиниций (FD), причем данный блок обеспечивает исполнение конфигурируемого потока анализа и визуализации множества модальностей данных, при этом множество модальностей данных содержит:
- первую биомолекулярную модальность, содержащую биомолекулярные данные, относящиеся к пациенту, и
- вторую клиническую модальность, содержащую клинические данные, относящиеся к пациенту,
- машину исполнения инструментов (TEE), имеющую системный интерфейс для конфигурирования и реализации одного или нескольких инструментов, работающих с одной или несколькими модальностями данных,
- репозиторий инструментов, причем данный репозиторий содержит совокупность инструментов, для исполнения которых сконфигурирована система, указанные инструменты соответствуют набору правил для того, чтобы визуализировать их исполнение в графическом интерфейсе пользователя (GUI),
- одну или более связанных внешних баз данных (EDB), причем внешние базы данных представляют данные, хранящиеся в самой указанной системе или в базе данных, отличной от указанной внутренней базы данных (IDB), и
- графический интерфейс пользователя (GUI), причем указанный интерфейс одновременно визуализирует данные, результаты анализов и выход исполнения одного или нескольких инструментов, и указанный интерфейс дополнительно выполнен с возможностью одновременной визуализации:
1) выхода указанной первой биомолекулярной модальности, и
2) выхода указанной второй клинической модальности, причем выходы первой биомолекулярной модальности и второй клинической модальности основаны на машине исполнения инструментов, реализующей один или более инструментов в соответствии с потоковыми дефинициями.
2. Медицинская аналитическая система по п. 1, при этом медицинская аналитическая система применяется по меньшей мере к одному пациенту в доклинической ситуации.
3. Медицинская аналитическая система по п. 1, при этом указанная аналитическая система применяется к группе пациентов.
4. Медицинская аналитическая система по п. 1, при этом указанная аналитическая система применяется к одному пациенту в клинической ситуации.
5. Медицинская аналитическая система по п. 1, при этом медицинская аналитическая система выполняет функции системы поддержки принятия клинических решений (CDS).
6. Медицинская аналитическая система по п. 1, в которой указанная первая биомолекулярная модальность и указанная вторая клиническая модальность выполнены с возможностью интегрирования с помощью алгоритма машинного обучения, причем результат указанного интегрирования визуализируется в графическом интерфейсе пользователя.
7. Медицинская аналитическая система по п. 1, в которой указанная первая биомолекулярная модальность и указанная вторая клиническая модальность выполнены с возможностью интегрирования с помощью статистического алгоритма, причем результат указанного интегрирования визуализируется в графическом интерфейсе пользователя.
8. Медицинская аналитическая система по п. 1, в которой указанная первая биомолекулярная модальность и указанная вторая клиническая модальность выполнены с возможностью интегрирования на основании их соответствующей геномной аннотации, причем результат указанного интегрирования визуализируется в графическом интерфейсе пользователя.
9. Медицинская аналитическая система по п. 1, в которой указанная первая биомолекулярная модальность основана на модальности высокопроизводительной выборки данных.
10. Медицинская аналитическая система по п. 9, в которой образец, предоставленный с помощью указанной высокопроизводительной модальности выборки данных, содержит данные по меньшей мере о 100000 параметров/образцов.
11. Медицинская аналитическая система по п. 1, в которой указанная первая биомолекулярная модальность выбрана из группы,
состоящей из высокопроизводительного определения профиля генной экспрессии, определения профиля состояния метилирования ДНК, анализа сравнительной геномной гибридизации.
12. Медицинская аналитическая система по п. 1, в которой указанный блок потоковых дефиниций (FD) содержит по меньшей мере одну дополнительную биомолекулярную модальность.
13. Медицинская аналитическая система по любому из предыдущих пунктов, в которой указанная дополнительная биомолекулярная модальность выбрана из группы, состоящей из высокопроизводительного определения профиля генной экспрессии, определения профиля состояния метилирования ДНК, анализа сравнительной геномной гибридизации и SNP-профиля.
14. Медицинская аналитическая система по п. 13, в которой указанный пациент имеет клиническое состояние, выбранное из группы, состоящей из рака, сердечнососудистого заболевания, болезни обмена веществ, заболевания желудочно-кишечного тракта, неврологического заболевания.
15. Способ выявления биомолекулярной или клинической сигнатуры, ассоциированной со специфическим клиническим состоянием, который включает использование медицинской аналитической системы по п. 1.
16. Способ по п. 15, в котором клиническое состояние выбрано из группы, состоящей из рака, сердечнососудистого заболевания, болезни обмена веществ, заболевания желудочно-кишечного тракта, неврологического заболевания.
17. Способ по п. 16, в котором указанный рак представляет собой рак молочной железы или рак толстого кишечника.
18. Способ по п. 15, в котором указанная сигнатура представляет собой сигнатуру генной экспрессии, сигнатуру состояния метилирования ДНК, сигнатуру сравнительной геномной гибридизации и SNP-сигнатуру.
19. Способ поддержки принятия клинических решений, который включает использование медицинской аналитической системы по п. 1.
20. Способ по п. 19, в котором данные пациента применяются в системе для выявления биомолекулярной или клинической сигнатуры, ассоциированной с клиническим состоянием.
21. Компьютерно-читаемый носитель, содержащий инструкции для побуждения компьютерной системы, содержащей по меньшей мере один компьютер, имеющий связанное с ним запоминающее устройство данных, управлять медицинской аналитической системой по п. 1.