ЛЕЧЕНИЕ НЕПРАВИЛЬНОЙ УКЛАДКИ БЕЛКОВ

1. dsRNA для ингибирования функциональной экспрессии белка Aha в клетке, где указанная dsRNA включает смысловую цепь и антисмысловую цепь,
где указанная антисмысловая цепь включает область комплементарности, имеющую последовательность, по существу, комплементарную последовательности-мишени Aha, где указанная последовательность-мишень имеет длину менее 30 нуклеотидов,
где указанная смысловая цепь, по существу, комплементарна указанной антисмысловой цепи и
где указанная dsRNA при контакте с клеткой, экспрессирующей функциональный белок Aha, ингибирует функциональную экспрессию белка Aha по крайней мере на 20%.
2. dsRNA по п.1, где указанная последовательность-мишень Aha включает последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12-56.
3. dsRNA по п.1, где указанная dsRNA включает смысловую цепь, имеющую последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 71, SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75, SEQ ID NO: 77, SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 87, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 111, SEQ ID NO: 113, SEQ ID NO: 115, SEQ ID NO: 117, SEQ ID NO: 119, SEQ ID NO: 121, SEQ ID NO: 123, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 133, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 143 и SEQ ID NO: 145;
и антисмысловую цепь, комплементарную смысловой цепи, имеющую последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 72, SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76, SEQ ID NO: 78, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 86, SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 110, SEQ ID NO: 112, SEQ ID NO: 114, SEQ ID NO: 116, SEQ ID NO: 118, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 122, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 132, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 144 и SEQ ID NO: 146.
4. dsRNA по п.1, где указанная dsRNA включает смысловую цепь, имеющую последовательность SEQ ID NO: 57, и антисмысловую цепь, комплементарную смысловой цепи, имеющую последовательность SEQ ID NO: 58.
5. dsRNA по п.1, где указанная dsRNA включает смысловую цепь, имеющую последовательность SEQ ID NO: 69, и антисмысловую цепь, комплементарную смысловой цепи, имеющую последовательность SEQ ID NO: 70.
6. dsRNA по п.1, где указанная dsRNA включает смысловую цепь, имеющую последовательность SEQ ID NO: 81, и антисмысловую цепь, комплементарную смысловой цепи, имеющую последовательность SEQ ID NO: 82.
7. Вектор для экспрессии shRNA для ингибирования функциональной экспрессии Aha1 в клетке, где указанный вектор включает смысловую цепь, шпилечный линкер и антисмысловую цепь,
где указанная смысловая цепь включает область комплементарности, имеющую последовательность, по существу комплементарную последовательности-мишени Aha, где указанная последовательность-мишень имеет длину менее 30 нуклеотидов,
где указанная антисмысловая цепь, по существу, комплементарна указанной смысловой цепи и
где указанная dsRNA при контакте с клеткой, экспрессирующей функциональный белок Aha, ингибирует функциональную экспрессию белка Aha по крайней мере на 20%.
8. Вектор по п.7, где указанная последовательность-мишень Aha включает последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12-56.
9. Вектор по п.7, где указанный вектор включает смысловую цепь, имеющую последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 149 и SEQ ID NO: 151; и
антисмысловую цепь, имеющую последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 150 и SEQ ID NO: 152.
10. shRNA для ингибирования функциональной экспрессии белка Aha1 в клетке, где указанная shRNA включает область комплементарности, имеющую последовательность, по существу, комплементарную последовательности-мишени Aha, и где указанная последовательность-мишень имеет длину менее 30 нуклеотидов, и
где указанная shRNA при контакте с клеткой, экспрессирующей функциональный белок Aha, ингибирует функциональную экспрессию белка Aha по крайней мере на 20%.
11. shRNA по п.10, где указанная последовательность-мишень Aha включает последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12-56.
12. shRNA по п.10, где указанная shRNA включает последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 154 и SEQ ID NO: 155.
13. Клетка или клеточная популяция, включающая dsRNA по п.1.
14. Клетка или клеточная популяция, включающая вектор по п.7.
15. Клетка или клеточная популяция, включающая shRNA по п.10.
16. Изолированное антитело, которое специфично связывается с функциональным Aha1, сайтом связывания функционального Aha1 в Hsp90 АТФ-азе, и/или комплексом функционального Aha1-Hsp90 АТФ-азы.
17. Агент, который уменьшает внутриклеточные уровни функционального белка Aha1, где указанный агент выбран из группы, состоящей из малой молекулы, антитела, антисмысловой нуклеиновой кислоты, аптамера, dsRNA, рибозима и любой их комбинации.
18. Способ лечения заболевания, ассоциированного с неправильной укладкой белка, где способ включает введение нуждающемуся в этом субъекту терапевтически эффективного количества по крайней мере одного агента, который уменьшает внутриклеточные уровни функционального белка Aha1, где указанный агент выбран из группы, состоящей из малой молекулы, антитела, антисмысловой нуклеиновой кислоты, аптамера, siRNA, рибозима и их комбинаций.
19. Способ по п.18, в котором заболевание выбрано из группы, состоящей из кистозного фиброза (CF), синдрома Марфана, болезни Фабри, болезни Гоше, пигментного ретинита, наследуемого по хромосоме 3, болезни Альцгеймера, диабета типа II, болезни Паркинсона и болезнь Крейцфельда-Якоба.
20. Способ по п.18, в котором заболевание является CF.
21. Способ по п.18, в котором неправильно уложенный белок является неправильно уложенным CFTR.
22. Способ по п.18, в котором неправильно уложенный белок является белком ΔF508.
23. Способ лечения заболевания, ассоциированного с неправильной укладкой белка, где способ включает введение нуждающемуся в этом субъекту терапевтически эффективного количества по крайней мере одного dsRNA-ингибитора функциональной экспрессии Aha1, где указанная dsRNA включает смысловую цепь и антисмысловую цепь,
где указанная антисмысловая цепь включает область комплементарности, имеющую последовательность, по существу, комплементарную последовательности-мишени Aha, где указанная последовательность-мишень имеет длину менее 30 нуклеотидов,
где указанная смысловая цепь, по существу, комплементарна указанной антисмысловой цепи и
где указанная dsRNA при контакте с клеткой, экспрессирующей функциональный белок Aha, ингибирует функциональную экспрессию белка Aha по крайней мере на 20%.
24. Способ по п.23, в котором заболевание выбрано из группы, состоящей из кистозного фиброза (CF), синдрома Марфана, болезни Фабри, болезни Гоше, пигментного ретинита, наследуемого по хромосоме 3, болезни Альцгеймера, диабета типа II, болезни Паркинсона и болезни Крейцфельда-Якоба.
25. Способ по п.23, в котором заболевание является CF.
26. Способ по п.23, в котором неправильно уложенный белок является неправильно уложенным CFTR.
27. Способ по п.23, в котором неправильно уложенный белок является белком ΔF508.
28. Способ лечения заболевания, ассоциированного с неправильной укладкой белка, включающий введение нуждающемуся в этом субъекту терапевтически эффективного количества по крайней мере одного dsRNA-ингибитора функциональной экспрессии Aha1, где dsRNA ингибитор включает последовательность, выбранную на основе
a) dsRNA, включающей последовательность смысловой цепи из приблизительно 19 нуклеотидов - приблизительно 25 нуклеотидов и последовательность антисмысловой цепи из приблизительно 19 нуклеотидов - приблизительно 25 нуклеотидов; и
b) последовательность смысловой цепи или последовательность антисмысловой цепи включает не более 15 непрерывных нуклеотидов, идентичных непрерывной последовательности, образованной 5' нетранслируемой областью, 3' нетранслируемой областью, интроном или экзоном любого гена или mRNA, отличных функционального Aha1.
29. Способ по п.28, в котором заболевание выбрано из группы, состоящей из кистозного фиброза (CF), синдрома Марфана, болезни Фабри, болезни Гоше, пигментного ретинита, наследуемого по хромосоме 3, болезни Альцгеймера, диабета типа II, болезни Паркинсона и болезни Крейцфельда-Якоба.
30. Способ по п.28, в котором заболевание является CF.
31. Способ по п.28, в котором неправильно уложенный белок является неправильно уложенным CFTR.
32. Способ по п.28, в котором неправильно уложенный белок является белком ΔF508.
33. Способ скрининга агента для лечения заболевания, ассоциированного с неправильной укладкой белка, включающий:
получение клетки или клеточной популяции, экспрессирующей функциональный Aha1;
введение агента-кандидата в клетку или клеточную популяцию;
количественное определение функциональной активности Aha1 в клетке или клеточной популяции и
определение, уменьшает ли агент-кандидат функциональную активность Aha1 в клетке или клеточной популяции, в соответствии с чем уменьшение функциональной активности Aha1 является показателем уменьшения неправильной укладки белка.
34. Способ по п.33, в котором агент-кандидат представляет собой dsRNA, которая ингибирует функциональную экспрессию Aha1.
35. Способ по п.34, в котором dsRNA включает a) последовательность из приблизительно 19 нуклеотидов - приблизительно 25 нуклеотидов и b) последовательность, включающую не более 15 непрерывных нуклеотидов, идентичных непрерывной последовательности, образованной 5' нетранслируемой областью, 3' нетранслируемой областью, интроном или экзоном любого гена или mRNA, отличных от гена Aha или mRNA Aha.
36. Способ по п.35, в котором ген Aha или mRNA Aha является человеческим геном Aha или mRNA Aha.
37. Способ по п.33, в котором заболевание выбрано из группы, состоящей из кистозного фиброза (CF), синдрома Марфана, болезни Фабри, болезни Гоше, пигментного ретинита, наследуемого по хромосоме 3, болезни Альцгеймера, диабета типа II, болезни Паркинсона и болезни Крейцфельда-Якоба.
38. Способ по п.33, в котором заболевание является CF.
39. Способ по п.33, в котором неправильно уложенный белок выбран из группы, состоящей из неправильно уложенного CFTR, неправильно уложенного фибриллина, неправильно уложенной альфа-галактозидазы, неправильно уложенной бета-глюкоцереброзидазы, неправильно уложенного родопсина, агрегированного амилоида бета и тау, агрегированного амилина, агрегированного альфа-синуклеина и агрегированного приона.
40. Способ по п.33, в котором неправильно уложенный белок является неправильно уложенным CFTR.
41. Способ по п.33, в котором неправильно уложенный белок является белком ΔF508.
42. Способ скрининга агента для лечения заболевания, ассоциированного с неправильной укладкой белка, включающий:
получение клетки или клеточной популяции, которая экспрессирует функциональный Aha1;
введение агента-кандидата в клетку или клеточную популяцию; количественное определение комплекса Hsp90/АДФ, комплекса Hsp90/АТФ или их комбинации в клетке или клеточной популяции и
определение, уменьшает ли агент-кандидат количество комплекса Hsp90/АДФ, комплекса Hsp90/АТФ или их комбинации в клетке или клеточной популяции, в соответствии с чем уменьшение количества комплекса Hsp90/АДФ или комплекса Hsp90/АТФ является показателем уменьшения неправильной укладки белка.
43. Способ по п.42, в котором агент-кандидат является dsRNA, которая ингибирует функциональную экспрессию Aha1.
44. Способ по п.43, в котором dsRNA включает a) последовательность из приблизительно 19 нуклеотидов - приблизительно 25 нуклеотидов и b) последовательность, включающую не более 15 непрерывных нуклеотидов, идентичных непрерывной последовательности, образованной 5' нетранслируемой областью, 3' нетранслируемой областью, интроном или экзоном любого гена или mRNA, отличных от гена Aha или mRNA Aha.
45. Способ по п.44, в котором ген Aha или mRNA Aha является человеческим геном Aha или mRNA Aha.
46. Способ по п.42, в котором заболевание выбрано из группы, состоящей из кистозного фиброза (CF), синдрома Марфана, болезни Фабри, болезни Гоше, пигментного ретинита, наследуемого по хромосоме 3, болезни Альцгеймера, диабета типа II, болезни Паркинсона и болезни Крейцфельда-Якоба.
47. Способ по п.42, в котором заболевание является CF.
48. Способ по п.42, в котором неправильно уложенный белок выбран из группы, состоящей из неправильно уложенного CFTR, неправильно уложенного фибриллина, неправильно уложенной альфа-галактозидазы, неправильно уложенной бета-глюкоцереброзидазы, неправильно уложенного родопсина, агрегированного амилоида бета и тау, агрегированного амилина, агрегированного альфа-синуклеина и агрегированного приона.
49. Способ по п.42, в котором неправильно уложенный белок является неправильно уложенным CFTR.
50. Способ по п.42, в котором неправильно уложенный белок является белком ΔF508.