УЛУЧШЕННЫЕ ВАРИАНТЫ АЛЬФА-АМИЛАЗЫ BACILLUS LICHENIFORMIS

1. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая вариант SEQ ID NO:1, где этот вариант содержит по меньшей мере одну аминокислотную замену, вставку или делецию в сравнении с SEQ ID NO:1 и где этот кодируемый вариант проявляет α-амилазную активность.
2. Нуклеиновая кислота по п.1, где эта по меньшей мере одна аминокислотная замена, вставка или делеция приводит к кодируемому варианту, содержащему аминокислотный остаток, который соответствует аминокислотному остатку α-амилазы Bacillus sp. no. 707, представленной в SEQ ID NO:2.
3. Нуклеиновая кислота по п.1, где эта по меньшей мере одна аминокислотная замена, вставка или делеция произведена в отношении заряженного остатка, расположенного на поверхности кодируемого варианта, или в отношении аминокислотного остатка активного центра, например, в отношении аминокислотного остатка, другого, чем остаток в положении 1.
4. Нуклеиновая кислота по п.1, где этот вариант содержит домен А, простирающийся на протяжении остатков 2-105 и остатков 208-396, домен В, простирающийся на протяжении остатков 106-207; и домен С, простирающийся от остатка 397 до С-конца указанного кодируемого варианта.
5. Нуклеиновая кислота по п.4, где этот кодируемый вариант имеет по меньшей мере одну аминокислотную замену, вставку или делецию в домене А, домене В или домене С.
6. Нуклеиновая кислота по п.1, где этот кодируемый вариант содержит по меньшей мере две аминокислоты, по меньшей мере пять аминокислот или по меньшей мере десять аминокислот, которые заменены, вставлены или делетированы.
7. Нуклеиновая кислота по п.6, где этот кодируемый вариант содержит от 11 до 70, например от 11 до 30 аминокислотных замен, вставок или делеций.
8. Нуклеиновая кислота по п.1, где этот кодируемый вариант имеет аминокислотную последовательность, показанную в любом из полипептидов SEQ ID NO:4-15.
9. Нуклеиновая кислота по п.1, где этот кодируемый вариант содержит одну или несколько из следующих аминокислотных замен, вставок или делеций: K23N; Q26R; A33K; T49A; A52N; H68N; E82Q; K88N; H91K; R93N; D94G; D114L; T116R; D121N; A123N; D124N; R127Q; V128E; I129V; H133Y; L134T; K136E; H140Y; H142D; S148N; Y150H; D152N; H156R; T163V; E167Q; K170R; вставку N в положении 172; Q178R; A181G; S187D; N188T; N190F; K213R; R214N; E222T; F238Y; E250S; K251A; E255N; Y262F; Q264K; H293Y; T297K; R305Q; K306N; K319H; G332E; Q333E; S334A; Q340E; T341E; замену или делецию остатков 369-377 из TKGDSQREI в IPTHGV---, где эти дефисы представляют делеции; K389E; K392Q; Q393K; A398R; H400N; D416N; V419H; R437W; N444K; E447Q; H450S; E458G; E469N или H471S.
10. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по любому из пп.1-9.
11. Выделенная клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по любому из пп.1-9 или вектор по п.10.
12. Клетка-хозяин по п.11, где микроорганизм, например бактерия или гриб, например, где бактерия является грамположительной бактерией, выбранной из группы, состоящей из Bacillus subtilis, B. licheniformis, B. lentus, B. brevis, B. stearothermophilus, B. alkalophilus, B. amyloliquefaciens, B. coagulans, B. circulans, B. lautus, B. thuringiensis, Streptomyces lividans или S. murinus; или грамотрицательной бактерией, где указанной грамотрицательной бактерией является Escherichia coli или Pseudomonas sp.
13. Вариант, кодируемый нуклеиновой кислотой по любому из пп.1-9.
14. Детергентная добавка, детергентная композиция, гидролизующая биопленку композиция, композиция для переработки крахмала, композиция для расшлихтовки текстиля или композиция для выпекания, содержащая вариант по п.13.
15. Способ получения варианта α-амилазы B. licheniformis, включающий
(1) сравнение структуры α-амилазы B. licheniformis дикого типа с модельной α-амилазой, которая обладает по меньшей мере одним предпочтительным свойством относительно указанной α-амилазы B. licheniformis дикого типа;
(2) идентификацию по меньшей мере одной аминокислоты или структурной области α-амилазы B. licheniformis дикого типа, которая является структурно консервативной с модельной α-амилазой;
(3) конструирование варианта α-амилазы B. licheniformis дикого типа, который модифицирован в аминокислотном остатке или структурной области, идентифицированных в стадии (2) выше; и
(4) испытание этого варианта для определения, передано ли по меньшей мере одно предпочтительное свойство этому варианту,
где этот вариант имеет по меньшей мере одно измененное свойство в сравнении с α-амилазой B. licheniformis дикого типа, например, где модельной α-амилазой является α-амилаза Bacillus sp. no. 707.