ОБНАРУЖЕНИЕ ИЗМЕНЕНИЙ КОНФОРМАЦИИ ПОЛИМЕРАЗЫ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ С ПОМОЩЬЮ НАНОТРУБКИ

1. Способ обнаружения изменения конформации полимеразы нуклеиновой кислоты, включающий:
(i) контактирование полимеразы нуклеиновой кислоты, нековалентно прикрепленной к однослойной углеродной нанотрубке (SWNT), с первым нуклеотидом или первым нуклеотидным аналогом, и последовательностью матрицы нуклеиновой кислоты, в результате чего образуется конформационно измененная полимераза нуклеиновой кислоты, связанная с первым нуклеотидом или первым нуклеотидным аналогом, и последовательностью матричной нуклеиновой кислоты;
(ii) обнаружение конформационно измененной полимеразы нуклеиновой кислоты путем измерения первого изменения электропроводности в SWNT между полимеразой нуклеиновой кислоты и конформационно измененной полимеразой нуклеиновой кислоты.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанная полимераза нуклеиновой кислоты находится в контакте с первым нуклеотидным аналогом.
3. Способ по п. 1 или 2, дополнительно включающий (iii) идентификацию указанного первого нуклеотидного или первого нуклеотидного аналога на основе первого сигнала, полученного при указанном первом изменении электропроводности.
4. Способ по п. 3, дополнительно включающий: (iv) разрешение указанной конформационно измененной полимеразе нуклеиновой кислоты высвобождать указанный первый нуклеотидный или первый нуклеотидный аналог, тем самым реформируя указанную полимеразу нуклеиновой кислоты.
5. Способ по п. 4, дополнительно включающий:
(v) контактирование полимеразы нуклеиновой кислоты, нековалентно прикрепленной к однослойной углеродной нанотрубке (SWNT), со вторым нуклеотидом или вторым нуклеотидным аналогом, и указанной последовательностью матрицы нуклеиновой кислоты, в результате чего образуется конформационно измененная полимераза нуклеиновой кислоты, связанная со вторым нуклеотидом или вторым нуклеотидным аналогом, и последовательностью матричной нуклеиновой кислоты; и
(vi) обнаружение конформационно измененной полимеразы нуклеиновой кислоты путем измерения изменения электропроводности в SWNT между полимеразой нуклеиновой кислоты и конформационно измененной полимеразой нуклеиновой кислоты, связанной со вторым нуклеотидом или вторым нуклеотидным аналогом и последовательностью матричной нуклеиновой кислоты.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что указанная полимераза нуклеиновой кислоты контактирует со вторым нуклеотидным аналогом.
7. Способ по п. 5 или 6, дополнительно включающий (vii) идентификацию указанного второго нуклеотида или второго нуклеотидного аналога на основе второго сигнала, полученного указанным вторым изменением электропроводности; и идентификацию последовательности в матричной нуклеиновой кислоте.
8. Способ по п. 7, отличающийся тем, что упомянутый первый нуклеотидный аналог или упомянутый второй нуклеотидный аналог гибридизуется с указанной последовательностью матричной нуклеиновой кислоты с не Уотсон-Криковским спариванием оснований.
9. Способ по п. 7, отличающийся тем, что указанный первый нуклеотидный аналог или указанный второй нуклеотидный аналог представляет собой 2-тио-dCTP, 2-тио-dTTP или 6-Cl-dGTP, 6-аза-dTTP, α-тио-dATP, или α-тио-dТТР.
10. Способ по п. 7, отличающийся тем, что указанный первый нуклеотидный аналог или указанный второй нуклеотидный аналог модифицирован в трифосфатном остатке.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что указанный трифосфатный остаток содержит α-тио замену.
12. Способ по п. 11, отличающийся тем, что указанный первый нуклеотидный аналог или указанный второй нуклеотидный аналог представляет собой α-тио-dАТР, α-тио-dGТР, α-тио-dCTP или α-тио-dТТР.
13. Способ по п. 10, отличающийся тем, что указанный первый нуклеотидный аналог или указанный второй нуклеотидный аналог дополнительно включает замещение в нуклеотидном основании.
14. Способ по п. 13, отличающийся тем, что указанный первый нуклеотидный аналог или указанный второй нуклеотидный аналог представляет собой α-тио-2-тио-dTTP, α-тио-2-тио-dCTP, α-тио-6-Cl-20APTP или 6-Cl-2APTP.