КОМПОЗИЦИИ ЦЕЛЛЮЛАЗЫ И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ ДЛЯ УЛУЧШЕННОГО ПРЕВРАЩЕНИЯ ЛИГНОЦЕЛЛЮЛОЗНОЙ БИОМАССЫ В ФЕРМЕНТИРУЕМЫЕ САХАРА

1. Выделенный полипептид, содержащий:
a) аминокислотную последовательность, которая характеризуется по меньшей мере приблизительно 70% идентичностью с SEQ ID NO:135; или
b) N-концевую последовательность и C-концевую последовательность, где N-концевая последовательность содержит первую аминокислотную последовательность, происходящую из первой β-глюкозидазы, имеет длину по меньшей мере 200 остатков и содержит одну или несколько или все из SEQ ID NO:164-169, и где C-концевая последовательность содержит вторую аминокислотную последовательность, происходящую из второй β-глюкозидазы, имеет длину по меньшей мере 50 остатков и содержит SEQ ID NO:170,
при этом полипептид обладает β-глюкозидазной активностью.
2. Выделенный полипептид по п. 1, содержащий аминокислотную последовательность, которая характеризуется по меньшей мере приблизительно 80% идентичностью с SEQ ID NO:135 или по меньшей мере приблизительно 90% идентичностью с SEQ ID NO:135.
3. Выделенный полипептид по п. 1, содержащий N-концевую последовательность, происходящую из первой β-глюкозидазы, и C-концевую последовательность, происходящую из второй β-глюкозидазы, при этом первая β-глюкозидаза и вторая β-глюкозидаза отличаются друг от друга.
4. Выделенный полипептид по п. 1, где N-концевая последовательность и C-концевые последовательности не связаны непосредственно, а являются функционально связанными через линкерный домен.
5. Выделенный полипептид по п. 4, где N-концевая последовательность, C-концевая последовательность или линкерный домен содержит последовательность петлевого участка длиной 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или 11 аминокислотных остатков, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:171 или 172.
6. Выделенный полипептид по п. 1, который обладает улучшенной стабильностью в сравнении с первой β-глюкозидазой или второй β-глюкозидазой, необязательно, где улучшенная стабильность представляет собой повышенную устойчивость к протеолитическому расщеплению в условиях хранения или условиях получения.
7. Выделенный полипептид по п. 3, где:
(a) N-концевая последовательность содержит аминокислотную последовательность, которая характеризуется по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с последовательностью той же длины из SEQ ID NO:54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78 или 79, где C-концевая последовательность содержит мотив последовательности с SEQ ID NO:170; или
(b) N-концевая последовательность содержит один или несколько или все из мотивов последовательности с SEQ ID NO:164-169, и C-концевая последовательность содержит аминокислотную последовательность, которая характеризуется по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с последовательностью той же длины с SEQ ID NO:54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78 или 79.
8. Выделенный полипептид по п. 7, где в N-концевой последовательности прослеживаются 3 или более, 4 или более, 5 или более из мотивов последовательности с SEQ ID NO:136-148 и где в C-концевой последовательности прослеживаются 2 или более, 3 или более или 4 или более из мотивов последовательности с SEQ ID NO:149-156.
9. Композиция, содержащая выделенный полипептид по п. 1.
10. Композиция по п. 9, дополнительно содержащая:
(a) одну или несколько целлюлаз, необязательно, где одна или несколько целлюлаз выбраны из эндоглюканаз, GH61/эндоглюканаз, целлобиогидролаз и других бета-глюкозидаз; или
(b) одну или несколько гемицеллюлаз, необязательно, где одна или несколько гемицеллюлаз выбраны из ксиланаз, β-ксилозидаз или L-α-арабинофуранозидаз.
11. Композиция по п. 9, где β-глюкозидаза присутствует в количестве от 1 вес. % до 75 вес. % относительно общего количества белков в композиции.
12. Композиция по п. 9, где композиция представляет собой культуральную смесь или ферментационный бульон.
13. Выделенный полинуклеотид:
a) содержащий нуклеотидную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 70% идентичностью последовательности с SEQ ID NO:83; или
b) содержащий нуклеотидную последовательность, которая способна к гибридизации с SEQ ID NO:83 или с ее комплементарной последовательностью в условиях высокой жесткости; или
c) кодирующий выделенный полипептид, обладающий β-глюкозидазной активностью, содержащий аминокислотную последовательность, которая характеризуется по меньшей мере приблизительно 70% идентичностью с SEQ ID NO:135; или выделенный полипептид, обладающий β-глюкозидазной активностью, содержащий N-концевую последовательность и C-концевую последовательность, где N-концевая последовательность содержит первую аминокислотную последовательность, происходящую из первой β-глюкозидазы, имеет длину по меньшей мере 200 остатков и содержит одну или несколько или все из SEQ ID NO:164-169, и где C-концевая последовательность содержит вторую аминокислотную последовательность, происходящую из второй β-глюкозидазы, имеет длину по меньшей мере 50 остатков и содержит SEQ ID NO:170.
14. Вектор, содержащий полинуклеотид по п. 13.
15. Рекомбинантная клетка-хозяин, сконструированная для экспрессии полипептида, кодируемого полинуклеотидом по п. 13, необязательно, где рекомбинантная клетка-хозяин является бактериальной или грибной клеткой, и необязательно, где бактериальная клетка выбрана из Bacillus или E. coli, и необязательно, где грибная клетка выбрана из клетки Trichoderma, Aspergillus, Chrysosporium или дрожжей.
16. Композиция ферментационного бульона или культуральной смеси, полученная путем ферментации рекомбинантной клетки-хозяина по п. 15.
17. Способ гидролиза материала на основе целлюлозной биомассы, включающий приведение в контакт материала на основе биомассы с полипептидом по п. 1.
18. Способ по п. 17, отличающийся тем, что материал на основе биомассы выбирают из семян, зерен, клубней, растительных отходов или побочных продуктов производства пищевых продуктов или промышленной переработки, стеблей, стержней кукурузных початков, соломы, листьев, трав, многолетних тростников, древесины, бумаги, пульпы и бумаги вторичной переработки, картофеля, сои, ячменя, ржи, разновидностей овса, пшеницы, разновидностей свеклы и жома сахарного тростника.
19. Способ по п. 17, отличающийся тем, что материал на основе биомассы подвергают предварительной обработке, необязательно, где предварительная обработка включает предварительную обработку кислотой, или предварительную обработку основанием, или сочетание предварительной обработки кислотой и предварительной обработки основанием.