ДЕСТРУКТОРЫ БЕЛКА ВЕТ
VET PROTEIN DECOMPOSERS

Предшествующий уровень техники
Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение предоставляет деструкторы бромодомен-содержащего белка BET и терапевтические способы лечения состояний и заболеваний, при которых разрушение одного или нескольких бромодомен-содержащих белков BET обеспечивает пользу.
Уровень техники
Геномы эукариотических организмов высокоорганизованы в ядре клетки. Длинные нити двухцепочечной ДНК накручены вокруг октамера гистоновых белков (обычно содержащих две копии гистонов H2A, H2B, H3 и H4) с образованием нуклеосомы, которая затем дополнительно упаковывается для образования высококонденсированной структуры хроматина. Возможнен целый ряд различных состояний уплотнения, и плотность структуры изменяется в течение клеточного цикла. Структура хроматина играет важную роль в регулировании транскрипции гена, которая не может совершаться эффективно из высококонденсированного хроматина. Структура хроматина контролируется рядом посттрансляционных модификаций гистоновых белков, в частности, гистонов H3 и H4. Эти модификации включают ацетилирование, метилирование, фосфорилирование, убиквитинирование и сумоилирование.
Ацетилирование гистонов обычно связано с активацией транскрипции генов, так как модификация ослабляет взаимодействие ДНК и гистонового октамера за счет изменения электростатики. В дополнение к этому физическому изменению, специфические белки связываются с ацетилированными остатками лизина в гистонах для считывания эпигенетического кода. Бромодомены представляют собой небольшие (порядка 110 аминокислот) отдельные домены в белках, которые связываются с ацетилированными остатками лизина в большинстве случаев применительно к гистонам, но не только к ним. Это семейство из приблизительно 50 белков, как известно, содержит бромодомены, и имеет целый ряд функций в клетке.
Семейство бромодомен-содержащих белков BET («бромодомены BET» или «BET-бромодоменные белки») включает четыре белка, то есть BRD2, BRD3, BRD4 и BRD-t, которые содержат тандемные бромдомены, способные связываться с двумя ацетилированными остатками лизина, расположенными в непосредственной близости, тем самым увеличивая специфичность взаимодействия. BRD2 и BRD3 ассоциированы с гистонами в активно транскрибируемых генах и могут быть вовлечены в облегчение транскрипционной элонгации, в то время как BRD4 может участвовать в рекрутинге комплекса pTEF-β в индуцибельных генах, вызывая фосфорилирование РНК-полимеразы и увеличение транскрипционного выхода. BRD4 или BRD3 также могут сливаться с NUT (ядерный белок в яичках), образуя новые слитые онкогены, BRD4-NUT или BRD3-NUT, при очень злокачественной форме эпителиальной неоплазии. Данные указывают на то, что слитые белки BRD-NUT способствуют канцерогенезу. BRD-t экспрессируется исключительно в яичках и яичниках. Сообщалось, что все члены семейства обладают некоторой функцией в аспектах контроля или исполнения клеточного цикла, и было показано, что они остаются в комплексе с хромосомами во время клеточного деления, что предполагает роль в поддержании эпигенетической памяти. Кроме того, некоторые вирусы используют эти белки для привязывания своих геномов к хроматину клетки-хозяина как часть процесса репликации вируса.
et al
Cell 146
et al
Bioorg. Med. Chem. Lett. 22
Описание белков BET можно найти в WO 2012/075456, WO 2012/075383 и WO 2011/054864. Описание ингибиторов BET бромодоменов, например, I-BET-151 и I-BET-762, можно найти в Delmore ., :904-917 (2011) и Seal ., :2968-2972 (2012).
Низкомолекулярные ингибиторы бромодоменов BET обладают терапевтическим потенциалом для лечения заболеваний и состояний, в которых бромодомены BET играют определенную роль, включая рак. Ингибиторы бромодоменов BET описаны в следующих патентах США: US 8044042, US 8476260, US 8114995, US 8557984 и US 8580957; в следующих публикациях патентных заявок США: US 20120059002, US 20120208800, US 2012202799, US 2012252781, US 20130252331, US 20140011862, US 20130184264, US 2013079335, US 20140011862, US 20140005169, US 20130331382, US 20130281450, US 20130281399, US 20120157428, US 20100286127, US 20140256706 и US 2015/0246923; и следующих международных заявках: WO 1998011111, WO 2006129623, WO 2008092231, WO 2009084693, WO 2009158404, WO 2010123975, WO 2011054843, WO 2011054844, WO 2011054845, WO 2011054846, WO 2011054848, WO 2011143651, WO 2011143660, WO 2011143669, WO 2011161031, WO 2012075383, WO 2012116170, WO 2012151512, WO 2012174487, WO 2013024104, WO 2013027168, WO 2013030150, WO 2013033268, WO 2013097601 и WO 2014164596.
См.,
et al
Science 327
et al
Science 348
Лекарственные средства на основе фталимида, например, талидомид или леналидомид, связываются с механизмом разрушения белков, например, цереблоном (CRBN; часть убихитин-лигазного комплекса Е3). Это может способствовать набору двух факторов транскрипции (IKZF1 и IKZF3), которые являются существенными для прогрессирования заболевания, приводя к вызванному лекарством убиквитилированию и деградации протеасом. например,Ito ., :1345-1350 (2010) и Winter ., :1376-1381 (2015).
см.
et al
Nat. Chem. Biol
См.,
et al.
Nucleic Acids Research 38
et al
J. Am. Chem. Soc. 134
et al
Angew, Chem. Int. Ed. Engl. 51
Nat Rev Cancer
et al
ACS Chem. Biol.
10
Высокоаффинный VHL-лиганд, Bondeson.,. 11:611-617 (2015), может рекрутировать белок-мишень к E3 убиквитинлигазе, что приводит к индуцированному лекарственным средством убиквитинированию и разрушению. например, van Hagen , : 1922-1931 (2010); Buckley ., :4465-4468 (2012); Buckley ., :11463-11467 (2012); Lipkowitz and Weissman,  11:629-643 (2011); и Zengerle ., :1770-1777 (2015).
Существует постоянная потребность в новых средствах, например, небольших молекулах, для лечения рака и других заболеваний, реагирующих на дерегуляцию активности бромодоменов BET и/или разрушение бромодомен-содержащих белков BET.
Краткое изложение сущности изобретения
В одном аспекте настоящее изобретение предоставляет соединения, представленные любой из формул I-XIII, ниже, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, совместно именуемые как «Соединения изобретения». Соединения изобретения представляют собой деструкторы бромодомен-содержащих белков BET и, таким образом, являются полезными при лечении заболеваний или состояний, где разрушение бромодоменов BET, например, BRD2, BRD3, BRD4, BRD-t, или их изоформы или мутанта, обеспечивает пользу.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет синтетические промежуточные соединения, представленные формулой XIV илиформулой XV, ниже, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, совместно именуемые как «Промежуточные соединения изобретения». Промежуточные соединения изобретения могут быть использованы для получения деструкторов бромодомен-содержащих белков BET с формулами I-XIII.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет способ лечения состояния или заболевания путем введения терапевтически эффективного количества соединения изобретения индивидууму, например, человеку, нуждающемуся в этом. Заболевание или состояние, представляющее интерес, представляет собой поддающееся лечению путем разрушения бромодоменсодержащих белков BET, например, рак, хроническое аутоиммунное нарушение, воспалительное состояние, пролиферативное нарушение, сепсис или вирусная инфекция. Также предоставлены способы предотвращения пролиферации нежелательных пролиферирующих клеток, например, при раке, у субъекта, включающие введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения субъекту, подверженному риску развития состояния, характеризующегося нежелательными пролиферирующими клетками. В некоторых вариантах осуществления соединения изобретения уменьшают пролиферацию нежелательных клеток путем индуцирования апоптоза в этих клетках.
L
L
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет способы лечения пациента, имеющего рак, включающие введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения пациенту, нуждающемуся в этом, где клетки пациента содержат биомаркер, например, сверхэкспрессия MCL-1 (также называют как MCL1), сверхэкспрессия BCL-X или совместная сверхэкспрессия MCL-1 и BCL-X.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет способы уменьшения бромодомен-содержащего белка BET в клетке индивидуума, нуждающегося в этом, включающие введение соединения изобретения индивидууму.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет способ разрушения бромодоменсодержащих белков BET у индивидуума, включающий введение индивидууму эффективного количества по меньшей мере одного соединения изобретения.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет фармацевтическую композицию, содержащую соединение изобретения и эксципиент и/или фармацевтически приемлемый носитель.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет композицию, содержащую соединение изобретения и эксципиент и/или фармацевтически приемлемый носитель для применения при лечении заболеваний или состояний, где разрушение бромодоменсодержащих белков BET обеспечивает пользу, например, рака.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет композицию, содержащую: (а) соединение изобретения; (b) второе терапевтически активное средство; и (с) необязательно эксципиент и/или фармацевтически приемлемый носитель.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет соединение изобретения для применения в лечении заболевания или состояния, представляющего интерес, например, рака.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет использование соединения изобретения для изготовления лекарственного средства для лечения заболевания или состояния, представляющего интерес, например, рака.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к набору, содержащему соединение изобретения, и, необязательно, упакованную композицию, содержащую второе терапевтическое средство, полезное для лечения заболевания или состояния, представляющего интерес, и листок вкладыш, содержащий инструкции для применения в лечение заболевания или состояния, например, рака.
В другом аспекте настоящее изобретение предоставляет способы получения соединений изобретения.
Дополнительные варианты осуществления и преимущества изобретения будут частично изложены в описании, которое следует ниже, и будут вытекать из описания или могут быть изучены при практическом использовании изобретения. Варианты осуществления и преимущества изобретения будут реализованы и достигнуты с помощью элементов и комбинаций, конкретно указанных в прилагаемой формуле изобретения.
Следует понимать, что как предшествующее общее описание, так и последующее подробное описание являются иллюстративными и пояснительными и не являются ограничивающими описание, заявленное в формуле изобретения.
Подробное описание чертежей
Фиг.1 представляет собой изображение, показывающее, что деструкторы белков BET индуцируют разрушение белков BET и апоптоз в лейкозных клетках MOLM-13 (в течение 2 часов).
Фиг.2 представляет собой изображение, показывающее, что деструкторы белков BET индуцируют разрушение белков BET и апоптоз в лейкозных клетках MOLM-13 (в течение 8 часов).
Фиг.3 представляет собой изображение, показывающее, что деструкторы белков BET индуцируют разрушение белков BET и апоптоз в клетках рака молочной железы MDA-MB-231 (в течение 2 часа).
Фиг.4 представляет собой изображение, показывающее, что деструкторы белков BET индуцируют разрушение белков BET и апоптоз в клетках рака молочной железы MDA-MB-231 (в течение 40 часов).
Фиг.5 представляет собой изображение, показывающее, что Соед. No 9 (10 мг/кг, внутривенное введение) индуцирует разрушение белков BET в опухолевой ткани MDA-MB-231 у мышей.
Фиг. 6 представляет собой изображение, показывающее, что Соед. No 4 (5 мг/кг, внутривенное введение) индуцирует разрушение белков BET в опухолевой ткани MDA-MB-231 у мышей.
Фиг.7 представляет собой линейный график, показывающий, что Соед. No. 9 снижает рост опухоли в модели ксенотрансплантата MDA-MB-231 у мышей.
Фиг.8 представляет собой линейный график, показывающий, что Соед. No. 4 снижает рост опухоли в модели WHIM24 PDX у мышей.
Фиг. 9 представляет собой линейный график, показывающий, что Соед. No. 4 снижает рост опухоли в модели ксенотрансплантата MDA-MB-453 у мышей.
Фиг. 10 представляет собой линейный график, показывающий, что Соед. No. 4 и 6 снижает рост опухоли в модели ксенотрансплантата MDA-MB-231 у мышей.
Фиг. 11 представляет собой линейный график, показывающий, что Соед. No. 4 и 6 снижают рост опухоли в модели ксенотрансплантата MDA-MB-468 у мышей.
Фиг. 12 представляет собой столбчатый график, показывающий, что Соед. No. 4 индуцирует апоптоз в клеточных линиях трижды негативного рака молочной железы (TNBC).
Фиг.13 представляет собой изображение, показывающее, что Соед. No. 4 индуцирует понижающую регуляцию белка MCL1 в клетках MDA-MB-468.
Фиг. 14 представляет собой столбчатый график, показывающий, что низкомолекулярные ингибиторы BCL-XL усиливают индукцию апоптоза с помощью Соед. No. 4 в клетках MDA-MB-468.
Фиг. 15 представляет собой столбчатый график, показывающий, что BM-1197 усиливает индукцию апоптоза с помощью Соед. No. 4 в клетках MDA-MB-213.
Фиг. 16 представляет собой столбчатый график, показывающий, что BM-1197 усиливает индукцию апоптоза с помощью Соед. No. 4 в клетках MDA-MB-453.
Подробное описание изобретения
Соединения изобретения разрушают бромодоменсодержащие белки BET.
В одном варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
B представляет собой моновалентный радикал лиганда для белка Е3 убиквитин-лигаза, например, B представляет собой:
;
1
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила и -N(H)R;
1
2
Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=;
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила и необязательно замещенного гетероарила;
2a
2b
2c
2
2
2
X выбран из группы, состоящей из -C(=O)N(R)-, -CHN(R)-, -CHO-, -N(R)-, -O- и -CH-;
2a
2b
2
2
2
2
где атом азота из -C(=O)N(R)- и -CHN(R)- присоединен к L, и атом кислорода из -CHO- присоединен к L;
2
4
2
m
2
n
2
m
2
u
2
v
L выбран из группы, состоящей из алкиленила, гетероалкиленила, -A-(CH)-W-(CH)- и -(CH)-W-(CH)-O-(CH)-;
4
A выбран из группы, состоящей из 5-членного гетероариленила и 6-членного гетероариленила; или
4
A отсутствует;
W выбран из группы, состоящей из фениленила, 5-членного гетероариленила, 6-членного гетероариленила, гетероцикленила и циклоалкиленила;
m имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
n имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
u имеет значение 0, 1, 2 или 3;
v имеет значение 1, 2, 3 или 4;
2
2
2
2d
2e
2f
2g
2h
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH-, -O-, -N(R)-, -C(=O)N(R)-, -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-; или
Y отсутствует;
2f
2g
2h
2c
2
2
2
где атом азота карбоксамида в -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-, и атом углерода в -C(=O)N(R)- присоединен к L;
2a
2b
2c
2d
2e
2f
2g
2h
1-4
R, R, R, R, R, R, R и R, каждый независимо, выбраны из группы, состоящей из водорода и C алкила;
2
Z выбран из группы, состоящей из -CH и -C(=O)-; и
5
R выбран из группы, состоящей из водорода, метила и фтора;
1
16a
A выбран из группы, состоящей из -C(R)= и -N=;
2
16b
A выбран из группы, состоящей из -C(R)= и -N=;
3
16c
A выбран из группы, состоящей из -C(R)= и -N=;
при условии, что Y отсутствует, когда B представляет собой B-2.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
и .
2
2
2
2
В другом варианте осуществления, m имеет значение 0. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1, 2, 3, 4 или 5. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-1. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-2.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
3
6
6
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
1-4
Q выбран из группы, состоящей из -O-, -S- и -N(R)-; и R выбран из группы, состоящей из водорода и C алкила. В другом варианте осуществления, m имеет значение 0. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1, 2, 3, 4 или 5. В другом варианте осуществления, n имеет значение 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-3. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-4. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-5. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-6. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-7. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-8. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-9.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
.
2
2
2
2
2
2
2
2
В другом варианте осуществления, m имеет значение 0. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1, 2, 3, 4 или 5. В другом варианте осуществления, n имеет значение 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-10. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-11. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-12. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-13.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
и
.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
В другом варианте осуществления, m имеет значение 1, 2 или 3. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, или 2. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-14. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-15. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-16. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-17. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-18.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
и .
2
2
2
2
В другом варианте осуществления, m имеет значение 1, 2 или 3. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1 или 2. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-19. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-20.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
и .
2
2
2
2
4
4
В другом варианте осуществления, m имеет значение 1, 2 или 3. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1, 2, 3, 4 или 5. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-21. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-22. В другом варианте осуществления, A представляет собой 5-членный гетероариленил. В другом варианте осуществления, A представляет собой 6-членный гетероариленил.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
3
6
6
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
4
4
1-4
Q выбран из группы, состоящей из -O-, -S-, и -N(R)-; и R выбран из группы, состоящей из водорода и C алкила. В другом варианте осуществления, m имеет значение 1, 2 или 3. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-23. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-24. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-25. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-26. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-27. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-28. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-29. В другом варианте осуществления, A представляет собой 5-членный гетероариленил. В другом варианте осуществления, A представляет собой 6-членный гетероариленил.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
.
2
2
2
2
2
2
2
2
4
4
В другом варианте осуществления, m имеет значение 1, 2 или 3. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-30. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-31. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-32. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-33. В другом варианте осуществления, A представляет собой 5-членный гетероариленил. В другом варианте осуществления, A представляет собой 6-членный гетероариленил.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
4
4
В другом варианте осуществления, m имеет значение 1, 2 или 3. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, или 2. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-34. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-35. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-36. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-37. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-38. В другом варианте осуществления, A представляет собой 5-членный гетероариленил. В другом варианте осуществления, A представляет собой 6-членный гетероариленил.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
и
2
2
2
2
4
4
В другом варианте осуществления, m имеет значение 1, 2 или 3. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 1 или 2. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-39. В другом варианте осуществления, L представляет собой L-40. В другом варианте осуществления, A представляет собой 5-членный гетероариленил. В другом варианте осуществления, A представляет собой 6-членный гетероариленил.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, и их фармацевтически приемлемые соли или сольваты, где B представляет собой B-1a. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-2. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-3.
I
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой :
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
B выбран из группы, состоящей из:
;
1
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила и -N(H)R;
1
2
Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=;
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила и необязательно замещенного гетероарила;
2a
2b
2c
2
2
2
X выбран из группы, состоящей из -C(=O)N(R)-, -CHN(R)-, -CHO-, -N(R)-, -O- и -CH-;
2a
2b
2
2
где атом азота из -C(=O)N(R)- и -CHN(R)- присоединен к L, и атом кислорода из -CHO- присоединен к L;
2
m
2
n
L выбран из группы, состоящей из алкиленила, гетероалкиленила и -(CH)-W-(CH)-;
W выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного фениленила, необязательно замещенного 5-членного гетероариленила и необязательно замещенного 6-членного гетероариленила;
m имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
n имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
2
2
2
2d
2e
2f
2g
2h
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH-, -O-, -N(R)-, -C(=O)N(R)-, -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-; или
Y отсутствует, т.е., B непосредственно присоединен к L;
2g
2g
2h
2e
2
2
где атом азота карбоксамида в -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)- и атом углерода в -C(=O)N(R)- присоединен к L;
2a
2b
2c
2d
2e
2f
2g
2h
1-4
R, R, R, R, R, R, R и R, каждый независимо, выбраны из группы, состоящей из водорода и C алкила;
2
Z выбран из группы, состоящей из -CH и -C(=O)-; и
5
R выбран из группы, состоящей из водорода, метила и фтора,
при условии, что Y отсутствует, когда B представляет собой B-2.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой II:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
1
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила и -N(H)R;
1
2
Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=;
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила и необязательно замещенного гетероарила;
2a
2b
2c
2
2
2
X выбран из группы, состоящей из -C(=O)N(R)-, -CHN(R)-, -CHO-, -N(R)-, -O- и -CH-;
2a
2b
2
2
где атом азота из -C(=O)N(R)- и -CHN(R)- присоединен к L, и атом кислорода из -CHO- присоединен к L;
2
m
2
n
L выбран из группы, состоящей из алкиленила, гетероалкиленила и -(CH)-W-(CH)-;
W выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного фениленила, необязательно замещенного 5-членного гетероариленила и необязательно замещенного 6-членного гетероариленила;
m имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
n имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
2
2
2
2d
2e
2f
2g
2h
Y выбран из группы, состоящей из - C≡C-, -CH-, -O-, -N(R)-, -C(=O)N(R)-, -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-; или
Y отсутствует;
2f
2g
2h
2
2
2
где атом азота карбоксамида в -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-, и атом углерода в -C(=O)N(R)- присоединен к L;
2a
2b
2c
2d
2e
2f
2g
2h
1-4
R, R, R, R, R, R, R и R, каждый независимо, выбраны из группы, состоящей из водорода и C алкила;
2
Z выбран из группы, состоящей из -CH и -C(=O)-; и
5
R выбран из группы, состоящей из водорода, метила и фтора.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой III:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
1
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила и -N(H)R;
1
2
Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=;
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила и необязательно замещенного гетероарила;
2a
2b
2c
2
2
2
X выбран из группы, состоящей из -C(=O)N(R)-, -CHN(R)-, -CHO-, -N(R)-, -O- и -CH-;
2a
2b
2
2
где атом азота из -C(=O)N(R)- и -CHN(R)- присоединен к L, и атом кислорода из -CHO- присоединен к L;
2
m
2
n
L выбран из группы, состоящей из алкиленила, гетероалкиленила и -(CH)-W-(CH)-;
W выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного фениленила, необязательно замещенного 5-членного гетероариленила и необязательно замещенного 6-членного гетероариленила;
m имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
n имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8; и
2a
2b
2c
1-4
R, R и R, каждый независимо, выбраны из группы, состоящей из водорода и C алкила.
1
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-A или I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=.
1
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-A или I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=.
1
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-A или I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=.
2
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-A или I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где X выбран из группы, состоящей из -C(=O)N(H)-, -CHO-, -CHN(H)-.
2
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, I или II, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -O-, -N(H)-, -C(=O)N(H)- -N(H)C(=O)CHO- и -N(H)C(=O)CHN(H)-. В другом варианте осуществления, Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -O-, -N(H)- и -C(=O)N(H)-. В другом варианте осуществления, Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -O- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой I-A, I или II, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Y отсутствует.
1-12
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L представляет собой C алкиленил.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
2
2
4
2
2
2
5
2
2
2
6
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из -CH-, -CHCH-, -CHCHCH-, -CH(CH)CH-, -CH(CH)CH-, -CH(CH)CH-, -CH(CH)CH- и -CH(CH)CH-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L представляет собой 3-20-членный гетероалкиленил.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
o
2
2
p
2
q
2
r
2
s
2
t
L выбран из группы, состоящей из -(CH)O-(CHCHO)-(CH)- и -(CH)O-(CH)-O(CH)-;
o имеет значение 2 или 3;
p имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
q имеет значение 2 или 3;
r имеет значение 2, 3 или 4;
s имеет значение 3, 4 или 5; и
t имеет значение 2 или 3.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из
2
2
2
2
-CHCHOCHCH-,
2
2
2
2
2
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
3
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
4
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
6
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
6
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
2
2
2
2
-CHCHCHOCHCHOCHCHCH-,
2
2
2
2
2
2
2
2
2
-CHCHCHO(CHCHO)CHCHCH-, и
2
2
2
2
4
2
2
2
-CHCHCHO(CH)OCHCHCH-.
2
m
2
n
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L представляет собой -(CH)-W-(CH)-. В другом варианте осуществления, m имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где W представляет собой фениленил.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, W представляет собой 5-членный гетероариленил.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где W представляет собой 6-членный гетероариленил.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
L выбран из группы, состоящей из:
3
6
Q выбран из группы, состоящей из -O-, -S- и -N(R)-; и
6
1-4
R выбран из группы, состоящей из водорода и C алкила.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из:
.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IV,
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
m имеет значение 1, 2 или 3;
n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой V:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
m имеет значение 0, 1 или 2;
n имеет значение 0, 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой V, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой V, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой V, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VI:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
6
R выбран из группы, состоящей из водорода и метила;
m имеет значение 0, 1, 2 или 3;
n имеет значение 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VII:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
6
R выбран из группы, состоящей из водорода и метила;
m имеет значение 0, 1, 2 или 3;
n имеет значение 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VIII:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует
m имеет значение 1, 2 или 3;
n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой VIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IX:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
m имеет значение 0, 1, или 2;
n имеет значение 0, 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IX, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IX, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой IX, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой X:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
m имеет значение 0, 1 или 2;
n имеет значение 0, 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой X, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой X, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой X, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XI:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
m имеет значение 0, 1, или 2;
n имеет значение 0, 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XII:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
m имеет значение 0, 1 или 2;
n имеет значение 0, 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIII:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-; или
Y отсутствует;
m имеет значение 0, 1 или 2;
n имеет значение 0, 1, 2 или 3; и
1
5
B, R, R и Z имеют значения, как определено для формулы I.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1, B-2 или B3. В другом варианте осуществления, B представляет собой B-1a.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-2 и Y отсутствует
1
1
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой необязательно замещенный арил. В другом варианте осуществления, R выбран из группы, состоящей из:
.
1
1
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой необязательно замещенный гетероарил. В другом варианте осуществления, R выбран из группы, состоящей из:
.
1
3
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой -N(H)R.
1
3
3
3
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой -N(H)R и R представляет собой необязательно замещенный арил. В другом варианте осуществления, R представляет собой:
1
3
3
3
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой -N(H)R и R представляет собой необязательно замещенный гетероарил. В другом варианте осуществления, R выбран из группы, состоящей из:
3
В другом варианте осуществления, R представляет собой:
.
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I, II или IV-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Z представляет собой -CH-.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I, II или IV-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и Z представляет собой -C(=O)-.
5
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I, II или IV-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1 и R представляет собой водород.
1
16a
16a
2
16b
16b
3
16c
16c
1
2
16b
3
16c
1
16a
2
3
16c
1
16a
2
16b
3
5
2
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I, II или IV-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-1a. В другом варианте осуществления, A представляет собой -C(R)= и R выбран из группы, состоящей из водорода и галогена. В другом варианте осуществления, A представляет собой -C(R)= и Rвыбран из группы, состоящей из водорода и галогена. В другом варианте осуществления, A представляет собой -C(R)= и R выбран из группы, состоящей из водорода и галогена. В другом варианте осуществления, A представляет собой -N=, A представляет собой -C(R)= и A представляет собой -C(R)=. В другом варианте осуществления, A представляет собой -C(R)=, A представляет собой -N= и A представляет собой -C(R)=. В другом варианте осуществления, A представляет собой -C(R)=, A представляет собой -C(R)= и A представляет собой -N=. В другом варианте осуществления, Z- представляет собой -CH-. В другом варианте осуществления, Z представляет собой -C(=O)-. В другом варианте осуществления, R представляет собой водород.
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул I, II или IV-XIII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где B представляет собой B-3.
В другом варианте осуществления, соединения изобретения представляют собой соединения из Таблицы 1 и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты.
Таблица 1
Промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, которые могут быть использованы в качестве синтетических промежуточных соединений для получения соединений изобретения. В одном варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIV:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
1
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила и -N(H)R;
1
2
Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=; и
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила и необязательно замещенного гетероарила;
7a
7b
R выбран из группы, состоящей из хлора и -OR; и
7b
1-4
R выбран из группы, состоящей из водорода и C алкила.
7a
7b
7b
В одном варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой -OR и R представляет собой водород.
1
1
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой необязательно замещенный арил. В другом варианте осуществления, R выбран из группы, состоящей из:
.
1
1
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой необязательно замещенный гетероарил. В другом варианте осуществления, R выбран из группы, состоящей из:
1
3
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой -N(H)R.
1
3
3
3
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой -N(H)R и R представляет собой необязательно замещенный арил. В другом варианте осуществления, R представляет собой:
1
3
3
3
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XIV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой -N(H)R и R представляет собой необязательно замещенный гетероарил. В другом варианте осуществления, R выбран из группы, состоящей из:
.
3
В другом варианте осуществления, R представляет собой:
.
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XV:
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
B выбран из группы, состоящей из:
;
2
m
2
n
L выбран из группы, состоящей из алкиленила, гетероалкиленила и -(CH)-W-(CH)-;
W выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного фениленила, необязательно замещенного 5-членного гетероариленила и необязательно замещенного 6-членного гетероариленила;
m имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
n имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
2
2
2
2d
2e
2f
2g
2h
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH-, -O-, -N(R)-, -C(=O)N(R)-, -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-; или
Y отсутствует;
2f
2g
2h
2e
2
2
где атом азота карбоксамида в -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-, и атом углерода в -C(=O)N(R)- присоединен к L;
2d
2e
2f
2g
2h
1-4
R, R, R, R и R, каждый независимо, выбраны из группы, состоящей из водорода и C алкила;
2
Z выбран из группы, состоящей из -CH и -C(=O)-; и
5
R выбран из группы, состоящей из водорода и фтора,
при условии, что Y отсутствует, когда B представляет собой B-2.
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XVI:
5
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L, Y, Z и R имеют значения, как определено для формулы XV.
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XVII:
XV
и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L имеет значения, как определено для формулы .
2
2
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулами XVилиXVI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -O-, -N(H)-, -C(=O)N(H)-, -N(H)C(=O)CHO- и -N(H)C(=O)CHN(H)-. В другом варианте осуществления, Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -O-, -N(H)- и -C(=O)N(H)-. В другом варианте осуществления, Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -O- и -N(H)-.
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулами XV или XVI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Y отсутствует.
,
1-12
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L представляет собой C алкиленил.
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
2
2
2
4
2
2
2
5
2
2
2
6
2
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из -CH-, -CHCH-, -CHCHCH-, -CH(CH)CH-, -CH(CH)CH-, -CH(CH)CH-, -CH(CH)CH- и -CH(CH)CH-.
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L представляет собой 3-20-членный гетероалкиленил.
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где:
2
o
2
2
p
2
q
2
r
2
s
2
t
L выбран из группы, состоящей из -(CH)O-(CHCHO)-(CH)- и -(CH)O-(CH)-O(CH)-;
o имеет значение 2 или 3;
p имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
q имеет значение 2 или 3;
r имеет значение 2, 3 или 4;
s имеет значение 3, 4 или 5; и
t имеет значение 2 или 3.
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из
2
2
2
2
-CHCHOCHCH-,
2
2
2
2
2
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
3
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
4
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
6
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
6
2
2
-CHCHO(CHCHO)CHCH-,
2
2
2
2
2
2
2
2
-CHCHCHOCHCHOCHCHCH-,
2
2
2
2
2
2
2
2
2
-CHCHCHO(CHCHO)CHCHCH- и
2
2
2
2
4
2
2
2
-CHCHCHO(CH)OCHCHCH-.
2
m
2
n
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулой XV, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L представляет собой -(CH)-W-(CH)-. В другом варианте осуществления, m имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4. В другом варианте осуществления, n имеет значение 0, 1, 2, 3 или 4.
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где W представляет собой фениленил.
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, W представляет собой 5-членный гетероариленил.
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где W представляет собой 6-членный гетероариленил.
I
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из L-1 и L2, как определено для формулы .
I
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из L-3, L-4, L-5, L-6 и L-7, как определено для формулы .
I
В другом варианте осуществления соединения изобретения представляют собой соединения, представленные любой из формул XV-XVII, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где L выбран из группы, состоящей из L-8 и L-9, как определено для формулы .
2
В другом варианте осуществления, промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулами XV или XVI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Z представляет собой -CH-.
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулами XV или XVI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где Z представляет собой -C(=O)-.
5
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения, представленные формулами XV или XVI, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где R представляет собой водород.
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения из Таблицы 2 и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты.
Таблица 2
В другом варианте осуществления промежуточные соединения изобретения представляют собой соединения из Таблицы 3 и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты.
Таблица 3
I
В другом варианте осуществления изобретение предоставляет способы получения соединения, имеющего формулу :
и его фармацевтически приемлемых солей и сольватов, где:
B выбран из группы, состоящей из:
1
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила и -N(H)R;
1
2
Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=;
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила и необязательно замещенного гетероарила;
X представляет собой -C(=O)N(H)-, где атом азота из -C(=O)N(H)- присоединен к L,
2
m
2
n
L выбран из группы, состоящей из алкиленила, гетероалкиленила и -(CH)-W-(CH)-;
W выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного фениленила, необязательно замещенного 5-членного гетероариленила и необязательно замещенного 6-членного гетероариленила;
m имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
n имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
2
2
2
2d
2e
2f
2g
2h
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH-, -O-, -N(R)-, -C(=O)N(R)-, -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-; или
Y отсутствует;
2f
2g
2h
2e
2
2
где атом азота карбоксамида в -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-, и атом углерода в -C(=O)N(R)- присоединен к L;
2d
2e
2f
2g
2h
1-4
R, R, R, R и R, каждый независимо, выбраны из группы, состоящей из водорода и C алкила;
2
Z выбран из группы, состоящей из -CH и -C(=O)-; и
5
R выбран из группы, состоящей из водорода и фтора,
при условии, что Y отсутствует, когда B представляет собой B-2,
способ, включающий:
(1) взаимодействие, например, конденсация, соединения, имеющего формулу XIV:
где:
1
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила, и -N(H)R;
1
2
Q представляет собой =CH- и Q представляет собой -N=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -CH=; или
1
2
Q представляет собой =N- и Q представляет собой -N=;
3
R выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного арила и необязательно замещенного гетероарила;
7a
7b
R выбран из группы, состоящей из хлора и -OR; и
7b
R представляет собой водород,
с соединением, имеющим формулу XV:
где:
B выбран из группы, состоящей из:
2
m
2
n
L выбран из группы, состоящей из алкиленила, гетероалкиленила и -(CH)-W-(CH)-;
W выбран из группы, состоящей из необязательно замещенного фениленила, необязательно замещенного 5-членного гетероариленила и необязательно замещенного 6-членного гетероариленила;
m имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7;
n имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
2
2
2
2d
2d
2f
2g
2h
Y выбран из группы, состоящей из -C≡C-, -CH-, -O-, -N(R)-, -C(=O)N(R)-, -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-; или
Y отсутствует;
2f
2g
2g
2c
2
2
где атом азота карбоксамида в -N(R)C(=O)CHO- и -N(R)C(=O)CHN(R)-, и атом углерода в -C(=O)N(R)- присоединен к L;
2d
2e
2f
2g
2h
1-4
R, R, R, R и R, каждый независимо, выбраны из группы, состоящей из водорода и C алкила;
2
Z выбран из группы, состоящей из -CH и -C(=O)-; и
5
R выбран из группы, состоящей из водорода и фтора,
при условии, что Y отсутствует, когда B представляет собой B-2,
в подходящем органическом растворителе, например, DMF, THF, и т.д., и
(2) выделение соединения, имеющего формулу I, и его фармацевтически приемлемых солей и сольватов.
В другом варианте осуществления изобретение предоставляет способы получения соединения, имеющего формулу II, и его фармацевтически приемлемых солей и сольватов, где X представляет собой -C(=O)N(H)- и атом азота в -C(=O)N(H)- присоединен к L, при этом способ включает:
7b
(1) взаимодействие, например, конденсация, соединения, имеющего формулу XIV, где R представляет собой водород, с соединением, имеющим формулу XVIв подходящем органическом растворителе; и
(2) выделение соединения, имеющего формулу III, и его фармацевтически приемлемых солей и сольватов.
В другом варианте осуществления, изобретение предоставляет способы получения соединения, имеющего формулу III, и их фармацевтически приемлемые соли и сольваты, где X представляет собой -C(=O)N(H)- и атом азота в -C(=O)N(H)- присоединен к L, способ, включающий:
7b
(1) взаимодействие, например, конденсация, соединения, имеющего формулу XIV, где R представляет собой водород, с соединением, имеющим формулу XVII,в подходящем органическом растворителе; и
(2) выделение соединения, имеющего формулу III, и его фармацевтически приемлемых солей и сольватов.
L
Соединения изобретения разрушают бромодоменсодержащие белки BET и являются полезными при лечении различных заболеваний и состояний. В частности, соединения изобретения являются полезными в способах лечения заболевания или состояния, где разрушение бромодоменсодержащих белков BET обеспечивает пользу, например, при раке и пролиферативных заболеваниях. Терапевтические способы изобретения включают введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения индивидууму, нуждающемуся в этом. Настоящие способы также включают введение второго терапевтического средства индивидууму в дополнение к соединению изобретения. Второе терапевтическое средство выбирают из лекарственных средств, известных как полезные при лечении заболевания или состояния, поражающего индивидуума, нуждающегося в этом, например, химиотерапевтического средства и/или облучения, известных как полезные для лечения конкретного типа рака. В одном варианте осуществления вторым терапевтическим средством является ингибитор MCL-1. В другом варианте осуществления вторым терапевтическим средством является ингибитор BCL-X, например, ABT-199 (венетоклакс).
Tetrahedron: Asymmetry, 8(6)
Соли, гидраты и сольваты соединений изобретения также могут быть использованы в способах, описанных в натоящем документе. Настоящее изобретение дополнительно включает все возможные стереоизомеры и геометрические изомеры соединений изобретения, и включает как рацемические соединения, так и оптически активные изомеры. Когда соединение изобретения желательно в виде отдельного энантиомера, его можно получить либо путем разделения конечного продукта, либо в результате стереоспецифического синтеза, либо из изомерно чистого исходного материала, либо с использованием хирального вспомогательного реагента, например, см. Z. Ma et al., , pages 883-888 (1997). Разделение конечного продукта, промежуточного соединения или исходного материала можно осуществить любым подходящим способом, известным в данной области техники. Кроме того, в тех случаях, когда возможны таутомеры соединений изобретения, настоящее изобретение включает все таутомерные формы соединений.
Настоящее изобретение включает получение и использование солей соединений изобретения. Как используется в настоящем описании, фармацевтическая «фармацевтически приемлемая соль» относится к солям или цвиттерионным формам соединений изобретения. Соли соединений изобретения могут быть получены во время окончательного выделения и очистки соединений или путем отдельного взаимодействия соединения с кислотой, имеющей подходящий катион. Фармацевтически приемлемые соли соединений изобретения могут представлять собой кислотно-аддитивные соли, образованные с фармацевтически приемлемыми кислотами. Примеры кислот, которые могут быть использованы для получения фармацевтически приемлемых солей, включают неорганические кислоты, такие как азотная, борная, хлористоводородная, бромистоводородная, серная и фосфорная, и органические кислоты, такие как щавелевая, малеиновая, янтарная и лимонная. Неограничивающие примеры солей соединений по изобретению включают, но не ограничиваются ими, гидрохлорид, гидробромид, гидроиодид, сульфат, бисульфат, 2-гидроксиэтансульфонат, фосфат, гидрофосфат, ацетат, адипат, альгинат, аспартат, бензоат, бисульфат, бутират, камфорат, камфорсульфонат, диглюконат, глицерофосфат, гемисульфат, гептаноат, гексаноат, формиат, сукцинат, фумарат, малеат, аскорбат, изетионат, салицилат, метансульфонат, мезитиленсульфонат, нафтиленсульфонат, никотинат, 2-нафталинсульфонат, оксалат, памоат, пектинат, персульфат, 3-фенилпропионат, пикрат, пивалат, пропионат, трихлорацетат, трифторацетат, фосфат, глутамат, бикарбонат, паратолуолсульфонат, ундеканоат, лактат, цитрат, тартрат, глюконат, метансульфонат, этандисульфонат, бензолсульфонат и п-толуолсульфонат. Кроме того, доступные аминогруппы, присутствующие в соединениях изобретения, могут быть кватернизованы метил, этил, пропил и бутил хлоридами, бромидами и иодидами; диметил, диэтил, дибутил и диамил сульфатами; децил, лаурил, миристил и стерил хлоридами, бромидами и иодидами; и бензил и фенетил бромидами. На основании вышесказанного, любые ссылочные соединения изобретения, представленные в настоящем опиании, предназначены для включения соединений соединений по изобретению, а также их фармацевтически приемлемых солей, гидратов или сольватов.
et al
J. Pharmaceut. Sci., 93(3)
et al.
AAPS Pharm. Sci. Tech., 5(1)
et al.
Chem. Commun.
Настоящее изобретение включает получение и использование сольватов соединений изобретения. Сольваты обычно не оказывают существенного влияния на физиологическую активность или токсичность соединений и как таковые могут дейтвовать как фармакологические эквиваленты. Термин «сольват», как используется в настоящем описании, представляет собой комбинацию, физическую связь и/или сольватацию соединения настоящего изобретения с молекулой растворителя, такую как, например, дисольват, моносольват или гемисольват, где отношение молекулы растворителя к соединению настоящего изобретения составляет приблизительно 2:1, приблизительно 1:1 или приблизительно 1:2, соответственно. Эта физическая ассоциация включает изменяющуюся степень ионного и ковалентного связывания, включая водородную связь. В некоторых случаях сольват может быть выделен, например, когда одна или несколько молекул растворителя включены в кристаллическую решетку кристаллического твердого вещества. Таким образом, «сольват» охватывает как фазу растворителя, так и способные к выделению сольваты. Соединения изобретения могут существовать в виде сольватированных форм с фармацевтически приемлемым растворителем, таким как вода, метанол и этанол, и предполагается, что изобретение включает как сольватированные, так и несольватированные формы соединений изобретения. Одним типом сольвата является гидрат. «Гидрат» относится к определенной подгруппе сольватов, где молекулой растворителя является вода. Сольваты обычно могут действовать как фармакологические эквиваленты. Получение сольватов известно в данной области. См., например M. Caira , :601-611 (2004), в которой описано получение сольватов флуконазола с этилацетатом и водой. Подобное получение сольватов, гемисольватов, гидратов и тому подобное описано Е. С. van Tonder , :Article 12 (2004), and A.L. Bingham ,  603-604 (2001). Типичный, неограничивающий способ получения сольвата будет включать растворение соединения изобретения в желаемом растворителе (органическом, воде или их смеси) при температурах приблизительно 20°С до приблизительно 25°С, затем охлаждение раствора со скоростью, достаточной для образования кристаллов, и выделение кристаллов известными способами, например, фильтрованием. Аналитические методы, такие как инфракрасная спектроскопия, могут быть использованы для подтверждения наличия растворителя в кристалле сольвата.
50
Настоящее изобретение предоставляет соединения изобретения в качестве деструкторов бромодомен-содержащих BET белков для лечения множества заболеваний и состояний, при которых разрушение бромодомен-содержащих BET белков имеет благоприятное действие. Соединения изобретения обычно имеют аффинность связывания (IC) с бромодоменами BET менее 100 мкМ, например, менее 50 мкМ, менее 25 мкМ и менее 5 мкМ, менее приблизительно 1 мкМ, менее приблизительно 0,5 мкМ или менее приблизительно 0,1 мкМ. В одном варианте осуществления, настоящее изобретение относится к способу лечения индивидуума, страдающего заболеванием или состоянием, при котором разрушение бромодомен-содержащих BET белков обеспечивает пользу, включающему введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения индивидууму, нуждающемуся в этом.
Поскольку соединения изобретения представляют собой деструкторы одного или некольких бромодоменсодержащих белков BET, ряд заболеваний и состояний, опосредуемых бромодоменсодержащими белками BET, можно лечить с использованием этих соединений. Таким образом, настоящее изобретение направлено, в основном, на способ лечения заболевания или состояния, реагирующего на разрушение BRD2, BRD3, BRD4, BRD-t или их изоформы или мутанта, у животного, например, человека, страдающего от или подверженного риску развития заболевания или состояния, включающий введение животному эффективного количества одного или нескольких соединений изобретения. В одном варианте осуществления, состояние или заболевание отвечает на разрушение BRD4.
Настоящее изобретение далее относится к способу разрушения бромодомен-содержащих белков BET у животного, нуждающегося в этом, указанный способ включает введение животному эффективного количества по меньшей мере одного соединения изобретения.
Настоящее изобретение также относится к способу лечения трижды негативного рака молочной железы у субъекта, включающему введение субъекту терапевтически эффективного количества деструктора бромодомена BET. В одном варианте осуществления, деструктор бромодомена BET представляет собой соединение изобретения.
Способы настоящего изобретения могут быть осуществлены путем введения соединения изобретения в виде чистого соединения или в виде фармацевтической композиции. Введение фармацевтической композиции или чистого соединения соединения по изобретению может быть осуществлено во время или после начала заболевания или состояния, представляющего интерес. Как правило, фармацевтические композиции являются стерильными и не содержат токсичных, канцерогенных или мутагенных соединений, которые могут вызывать нежелательную реакцию при введении. Кроме того, предоставляются наборы, содержащие соединение изобретения и необязательно второе терапевтическое средство, полезное для лечения заболеваний и состояний, в которых разрушение бромодоменов BET обеспечивает пользу, упакованное отдельно или вместе, и вкладыш с инструкциями для применения этих активных средств.
В одном варианте осуществления соединение изобретения вводят в сочетании со вторым терапевтическим средством, полезным для лечения заболевания или состояния, при котором разрушение бромодомен-содержащих белков BET обеспечивает пользу. Второе терапевтическое средство отличается от соединения изобретения. Соединение изобретения и второе терапевтическое средство можно вводить одновременно или последовательно для достижения желаемого эффекта. Кроме того, соединение изобретения и второе терапевтическое средство можно вводить в составе одной композиции или двух отдельных композиций.
Второе терапевтическое средтво вводят в количестве, обеспечивающем его желаемый терапевтический эффект. Диапазон эффективных доз для каждого второго терапевтического средства известен в данной области, и второе терапевтическое средство вводят индивидууму, нуждающемуся в этом, в таких установленных диапазонах.
Соединение изобретения и второе терапевтическое средство можно вводить вместе в виде единичной стандартной дозы или отдельно в виде нескольких стандартных доз, где соединение изобретения вводят перед вторым терапевтическим средством или наоборот. Можно вводить одну или несколько доз соединения изобретения и/или одну или несколько доз второго терапевтического средства. Таким образом, соединение изобретения может быть использовано в сочетании с одним или несколькими терапевтическими средствами, например, но не ограничиваясь ими, противораковыми средствами.
Заболевания и состояния, поддающиеся лечению способами настоящего изобретения, включают, но не ограничиваются ими, рак и другие пролиферативные заболевания, воспалительные заболевания, сепсис, аутоиммунные заболевания и вирусную инфекцию. В одном варианте осуществления, пациента человека подвергают лечению соединением изобретения или фармацевтической композицией, содержащей соединение изобретения, где соединение вводят в количестве, достаточном для разрушения бромодоменсодержащих белков BET у пациента.
В одном варианте осуществления заболевание, подлежащее лечению соединением изобретения, представляет собой рак. Примеры поддающихся лечению раковых заболеваний включают, но не ограничиваются ими, любой один или несколько видов рака из таблицы 9.
Таблицы 9
Рак надпочечников
ацинарно-клеточный рак
невринома слухового нерва
акральная лентигинозная меланома
акроспирома
острый эозинофильный лейкоз
острый эритроидный лейкоз
острый лимфобластный лейкоз
острый мегакариобластный лейкоз
острый моноцитарный лейкоз
острый промиелоцитарный лейкоз
аденокарцинома
аденокистозная карцинома
аденома
аденоматоидная одонтогенная опухоль
аденосквамозная карцинома
опухоли жировой ткани
адренокортикальная карцинома
Т-клеточный лейкоз/лимфома взрослых
Агрессивный NK-клеточный лейкоз
СПИД-ассоциированная лимфома
Альвеолярная рабдомиосаркома
альвеолярная саркома мягких тканей
амелобластическая фиброма
анапластическая крупноклеточная лимфома
анапластический рак щитовидной железы
ангиоиммунобластная Т-клеточная лимфома
ангиомиолипома
ангиосаркома
астроцитома
атипичная тератоидно-рабдоидная опухоль
В-клеточный хронический лимфолейкоз
В-клеточный пролимфоцитарный лейкоз
В-клеточная лимфома
базальноклеточная карцинома
рак желчных протоков
рак мочевого пузыря
бластома
рак костей
опухоль Бреннера
бурая опухоль
лимфома Беркитта
рак молочной железы
рак головного мозга
карцинома
карцинома in situ
карциносаркома
хрящевая опухоль
цементома
миелоидная саркома
хондрома
хордома
хориокарцинома
папиллома хориоидного сплетения
светлоклеточная саркома почки
краниофарингиома
кожная Т-клеточная лимфома
рак шейки матки
колоректальный рак
болезнь Дегоса
десмопластическая мелкокруглоклеточная опухоль
диффузная В-крупноклеточная лимфома
дизэмбриопластическая нейроэпителиальная опухоль
дисгерминома
эмбриональный рак
новообразования эндокринных желез
опухоль эндодермального синуса
Т-клеточная лимфома, связанная с энтеропатией
рак пищевода
плод включенный
фиброма
фибросаркома
фолликулярная лимфома
фолликулярный рак щитовидной железы
ганглионеврома
гастроинтестинальный рак
герминогенные опухоли
гестационная хориокарцинома
гигантоклеточная фибробластома
гигантоклеточная опухоль кости
глиальная опухоль
мультиформная глиобластома
глиома
Церебральный глиоматоз
глюкагонома
гонадобластома
гранулезоклеточная опухоль
гинандробластома
рак желчного пузыря
рак желудка
волосатоклеточный лейкоз
гемангиобластома
рак головы и шеи
гемангиоперицитома
гематологическая злокачественная опухоль
гептобластома
печеночно-селезеночная Т-клеточная лимфома
лимфома Ходжкина
Неходжкинская лимфома
инвазивный дольковый рак
интестинальный рак
рак почки
рак гортани
злокачественное лентиго
Смертельная срединная карцинома
лейкоз
опухоль из клеток Лейдига
липосаркома
рак легкого
лимфангиома
лимфангиосаркома
лимфоэпителиома
лимфома
острый лимфоцитарный лейкоз
острый миелоидный лейкоз
хронический лимфоцитарный лейкоз
рак печени
мелкоклеточный рак легкого
немелкоклеточный рак легкого
MALT-лимфома
Злокачественная фиброзная гистиоцитома
злокачественная опухоль оболочек периферических нервов
злокачественная тритон-опухоль
мантийноклеточная лимфома
В-клеточная лимфома маргинальной зоны
тучноклеточный лейкоз
герминогенная опухоль средостения
медуллярный рак молочной железы
медуллярный рак щитовидной железы
медуллобластома
меланома
менингиома
Рак клеток Меркеля
мезотелиома
метастатическая уротелиальная карцинома
смешанная опухоль Мюллера
муцинозная опухоль
множественная миелома
новообразования мышечной ткани
фунгоидный микоз
миксоидная липосаркома
миксома
миксосаркома
назофарингеальная карцинома
невринома
нейробластома
нейрофиброма
неврома
узловая меланома
рак глаза
олигоастроцитома
олигодендроглиома
онкоцитома
менингиома оболочки зрительного нерва
опухоль зрительного нерва
рак ротовой полости
остеосаркома
рак яичников
опухоль Панкоста
папиллярный рак щитовидной железы
параганглиома
пинеалобластома
пинеоцитома
питуицитома
аденома гипофиза
опухоль гипофиза
плазмоцитома
полиэмбриома
Т-лимфобластная лимфома из клеток-предшественников
первичная лимфома центральной нервной системы
первичная эффузионная лимфома
Первичный перитонеальный рак
рак предстательной железы
рак поджелудочной железы
фарингеальный рак
Псевдомиксома брюшной полости
почечно-клеточный рак
медуллярный рак почки
ретинобластома
рабдомиома
рабдомиосаркома
трансформация Рихтера
рак прямой кишки
саркома
шванноматоз
семинома
опухоль из клеток Сертоли
опухоли стромы полового тяжа
перстневидноклеточный рак
рак кожи
мелко-кругло-синеклеточные опухоли
мелкоклеточный рак
саркомы мягких тканей
соматостатинома
рак трубочистов
опухоль спинного мозга
лимфома маргинальной зоны селезенки
плоскоклеточный рак
синовиальная саркома
болезнь Сезари
рак тонкой кишки
сквамозная карцинома
рак желудка
Т-клеточная лимфома
рак яичка
текома
рак щитовидной железы
переходноклеточный рак
рак горла
рак мочевого протока
урогенитальный рак
уротелиальная карцинома
увеальная меланома
рак матки
веррукозная карцинома
глиома зрительного пути
рак вульвы
рак влагалища
макроглобулинемия Вальденстрема
опухоль Уортина
опухоль Вильмса
В другом варианте осуществления, рак представляет собой лейкоз, например, лейкоз, выбранный из острого моноцитарного лейкоза, острого миелоидного лейкоза, хронического миелоидного лейкоза, хронического лимфоцитарного лейкозa и лейкоза смешанного происхождения (MLL). В другом варианте осуществления рак представляет собой NUT-срединную карциному. В другом варианте осуществления рак представляет собой множественную миелому. В другом варианте осуществления рак представляет собой рак легкого, такой как мелкоклеточный рак легкого (SCLC). В другом варианте осуществления рак представляет собой нейробластому. В другом варианте осуществления рак представляет собой лимфому Беркитта. В другом варианте осуществления рак представляет собой рак шейки матки. В другом варианте осуществления рак представляет собой рак пищевода. В другом варианте осуществления рак представляет собой рак яичников. В другом варианте осуществления рак представляет собой колоректальный рак. В другом варианте осуществления, рак представляет собой рак предстательной железы. В другом варианте осуществления рак представляет собой рак молочной железы. В другом варианте осуществления рак представляет собой трижды негативный рак молочной железы (TNBC).
В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения доброкачественного пролиферативного нарушения, такого как, но не ограничиваясь ими, доброкачественные опухоли мягких тканей, опухоли кости, опухоли головного и спинного мозга, опухоли век и орбиты, гранулема, липома, менингиома, множественные эндокринные неоплазии, носовые полипы, опухоли гипофиза, пролактинома, доброкачественная внутричерепная гипертензия, себорейные кератозы, полипы желудка, узловой зоб, кистозные новообразования поджелудочной железы, гемангиомы, узелки на голосовых связках, полипы и кисты, болезнь Кастлемана, хроническое пилонидальное заболевание, дерматофиброма, пиларная киста, пиогенная гранулема и синдром ювенильного полипоза.
Соединения изобретения могут также лечить инфекционные и неинфекционные воспалительные явления и аутоиммунные и другие воспалительные заболевания путем введения эффективного количества настоящего соединения млекопитающему, в частности, человеку, нуждающегося в таком лечении. Примеры аутоиммунных и воспалительных заболеваний, расстройств и синдромов, подлежащих лечению с использованием описанных здесь соединений и способов, включают воспалительное заболевание таза, уретрит, солнечный ожог кожи, синусит, пневмонит, энцефалит, менингит, миокардит, нефрит, остеомиелит, миозит, гепатит, гастрит, энтерит, дерматит, гингивит, аппендицит, панкреатит, холицистит, агаммаглобулинемия, псориаз, аллергия, болезнь Крона, синдром раздраженной кишки, язвенный колит, болезнь Шегрена, отторжение тканевого трансплантата, сверхострое отторжение трансплантированных органов, астма, аллергический ринит, хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ), аутоиммунная полигландулярная болезнь (также известная как аутоиммунный полигландулярный синдром), аутоиммунная алопеция, пернициозная анемия, гломерулонефрит, дерматомиозит, рассеянный склероз, склеродермия, васкулит, аутоиммунные гемолитические и тромбоцитопенические состояния, синдром Гудпасчера, атеросклероз, болезнь Аддисона, болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера, диабет типа I, септический шок, системная красная волчанка (SLE), ревматоидный артрит, псориатический артрит, ювенильный артрит, остеоартрит, хроническая идиопатическая тромбоцитопеническая пурпура, макроглобулинемия Вальденстрема, миастения гравис, тиреоидит Хашимото, атопический дерматит, дегенеративное заболевание сустава, витилиго, аутоиммунный гипопитуитаризм, синдром Гийена-Барре, болезнь Бехчета, scleracierma, фунгоидный микоз, острые воспалительные реакции (такие как острый респираторный дистресс-синдром и ишемическое/реперфузионное повреждение) и болезнь Грейвса.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения синдромов системной воспалительной реакции, таких как LPS-индуцированный эндотоксический шок и/или индуцированный бактериями сепсис, путем введения эффективного количества соединения изобретения млекопитающему, в частности, человеку, нуждающемуся в такое лечении.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения вирусных инфекций и заболеваний. Примеры вирусных инфекций и заболеваний, подлежащих лечению с использованием описанных здесь соединений и способов, включают вирусы ДНК на основе эписомы, включая, но не ограничиваясь ими, вирус папилломы человека, вирус герпеса, вируса Эпштейна-Барра, вирус иммунодефицита человека, вирус гепатита В и вирус гепатита С.
in vivo
В другом варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет терапевтический способ модуляции метилирования белка, экспрессии генов, клеточной пролиферации, дифференцировки клеток и/или апоптоза  при упомянутых выше заболеваниях, в частности, рака, воспалительных заболеваний и/или вирусных заболеваний, путем введения терапевтически эффективного количества соединения изобретения субъекту, нуждающемуся в такой терапии.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет способ регулирования эндогенной или гетерологичной активности промотора путем контактирования клетки с соединением изобретения.
В другом варианте осуществления, изобретение предоставляет процедуры персонализированной медицины для пациентов, имеющих рак, например, трижды негативный рак молочной железы ("TNBC'), лейкоз, кастрационно-резистентный рак предстательной железы ("CRPC"), и включает выбор вариантов лечения с наибольшей вероятностью успешного исхода для отдельных пациентов с раком. В другом аспекте изобретение относится к использованию анализа(ов) для прогнозирования результатов лечения, например, вероятности благоприятных ответов или успешности лечения у пациентов, страдающих раком, таким как TNBC, лейкоз или CRPC.
L
L
В другом варианте осуществления, изобретение предоставляет способы выбора пациента, например, человека, для лечения рака соединением изобретения, включая получение от пациента биологического образца, например, клеток крови, тестирование биологического образца у пациента на наличие биомаркера и выбор пациента для лечения, если биологический образец содержит биомаркер. В другом варианте осуществления, способы дополнительно включают введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения пациенту, если биологический образец содержит биомаркер. Примеры биомаркеров включают, но не ограничиваются ими, сверхэкспрессия MCL-1, сверхэкспрессия BCL-X, и совместная сверхэкспрессия MCL-1 и BCL-X.
L
L
В другом варианте осуществления, изобретение предоставляет способы прогнозирования результатов лечения у пациента, имеющего рак, например, TNBC, лейкоз или CRPC, включающие получение биологического образца от пациента, тестирование биологического образца от пациента на наличие биомаркера, например, сверхэкспрессия MCL-1, сверхэкспрессия BCL-X и совместная сверхэкспрессия MCL-1 и BCL-X, где обнаружение биомаркера указывает на то, что пациент будет благоприятно реагировать на введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения. Благоприятные ответы включают, но не ограничиваются ими, гематологические ответы, например, нормализация анализа крови у пациента - лейкоциты, эритроциты и тромбоциты (обнаруживаемые с помощью простых анализов крови); цитогенетические ответы, например, уменьшение или исчезновение количества клеток, положительных по филадельфийской хромосоме у пациента (определяемое стандартными лабораторными методами) и/или молекулярные ответы, например, уменьшение или исчезновение в количествах аномального белка BCR-ABL у пациента (обнаруживаемое с помощью ПЦР-анализов).
L
L
В другом варианте осуществления, изобретение предоставляет способы лечения рака, например, TNBC, лейкоза или CRPC, включающие введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения пациенту, например, человеку, имеющему рак, где клетки пациента содержат биомаркер, например, сверхэкспрессия MCL-1, сверхэкспрессия BCL-X и совместная сверхэкспрессия MCL-1 и BCL-X. В одном варианте осуществления, пациент выбран для лечения соединением изобретения после того, как было определено, что клетки пациента содержат биомаркер.
В другом варианте осуществления, способ лечения пациента, имеющего рак, включает получение биологического образца от пациента, определение того, имеет ли биологический образец сверхэкспрессию MCL-1, и введение пациенту терапевтически эффективного количества соединения изобретения, если биологический образец имеет сверхэкспрессию MCL-1. В другом варианте осуществления, способ дополнительно включает введение терапевтически эффективного количества ингибитора MCL-1 пациенту.
L
L
L
В другом варианте осуществления, способ лечения пациента, имеющего рак, включает получение биологического образца от пациента, определение того, имеет ли биологический образец сверхэкспрессию BCL-X, и введение пациенту терапевтически эффективного количества соединения изобретения, если биологический образец имеет сверхэкспрессию BCL-X. В другом варианте осуществления, способ дополнительно включает введение терапевтически эффективного количества ингибитора BCL-X.
L
L
L
L
В другом варианте осуществления, способ лечения пациента, имеющего рак, включает получение биологического образца от пациента, определение того, имеет ли биологический образец совместную сверхэкспрессию MCL-1 и BCL-X, и введение пациенту терапевтически эффективного количества соединения изобретения, если биологический образец имеет совместную сверхэкспрессию MCL-1 и BCL-X. В другом варианте осуществления, способ дополнительно включает введение терапевтически эффективного количества ингибитора MCL-1, терапевтически эффективного количества ингибитора BCL-X или терапевтически эффективного количества как ингибитора MCL-1, так и ингибитора BCL-X.
in vivo
Термин «биомаркер», как используется в настоящем описании, относится к любому биологическому соединению, такому как белок, фрагмент белка, пептид, полипептид, нуклеиновая кислота и тому подобное, которые могут быть обнаружены и/или количественно определены у пациента  или в биологическом образце, полученном от пациента. Кроме того, биомаркер может представлять собой целую интактную молекулу или может быть ее частью или фрагментом. В одном варианте осуществления, измеряют уровень экспрессии биомаркера. Уровень экспрессии биомаркера можно измерить, например, путем определения уровня белка или РНК (например, мРНК) биомаркера. В некоторых вариантах осуществления части или фрагменты биомаркеров могут быть обнаружены или измерены, например, антителом или другим специфическим связывающим агентом. В некоторых вариантах осуществления измеримый аспект биомаркера связан с данным состоянием пациента, например, с определенной стадией рака. Для биомаркеров, которые обнаруживаются на уровне белка или РНК, такие измеримые аспекты могут включать, например, присутствие, отсутствие или концентрацию (то есть уровень экспрессии) биомаркера у пациента или в биологическом образце, полученном от пациента. Для биомаркеров, которые обнаруживают при уровне нуклеиновой кислоты, такие измеримые аспекты могут включать, например, аллельные варианты биомаркера или тип, скорость и/или степень мутации биомаркера, также упоминаемые здесь как статус мутации.
Для биомаркеров, которые обнаруживают на основе уровня экспрессии белка или РНК, уровень экспрессии, измеренный между различными фенотипическими статусами, можно считать различным, например, если средний или медианный уровень экспрессии биомаркера в различных группах вычисляется как статистически значимый. Обычные тесты для статистической значимости включают, среди прочего, t-тест, ANOVA, критерий Краскела-Уоллиса, критерий Уилкоксона, критерий Манна-Уитни, анализ значимости микрочипов, отношение шансов и тому подобное. С помощью биомаркеров, отдельно или в комбинации, можно измерить относительную вероятность того, что субъект принадлежит к одному фенотипическому статусу или другому. Поэтому они являются полезными, помимо всего прочего, в качестве маркеров заболевания и в качестве индикаторов того, что конкретные режимы терапевтического лечения, вероятно, приведут к благоприятным результатам лечения пациентов.
L
L
L
L
L
В одном варианте осуществления, биомаркер представляет собой MCL-1, BCL-X или MCL-1 и BCL-X. В другом варианте осуществления, измеряемый показатель MCL-1, BCL-X или MCL-1 и BCL-X представляет собой статус сверхэкспрессии, например, совместная сверхэкспрессия MCL-1 и BCL-X.
L
L
L
Таким образом, в некоторых аспектах изобретения биомаркер представляет собой MCL-1, BCL-X или MCL-1 и BCL-X, который дифференциально присутствует у субъекта одного фенотипического статуса (например, пациента, имеющего рак, например, TNBC, с совместной сверхэкспрессией MCL-1 и BCL-X) по сравнению с другим фенотипическим статусом (например, у здорового не пораженного заболеванием пациента или у пациента, имеющего рак без клеток, несущих мутацию).
Характеристики биомаркера могут быть заранее определены, определены одновременно или определены после получения биологического образца от субъекта. Характеристики биомаркера для применения со способами, описанными в настоящем документе, могут, например, включать данные из образцов от субъектов без рака; данные из образцов от субъектов с раком, например, TNBC, который не является прогрессирующим, рецидивирующим и/или метастатическим раком; и данные из образцов от субъектов с раком, например, TNBC, который является прогрессирующим, рецидивирующим и/или метастатическим раком. Сравнения могут быть сделаны для установления заданных пороговых значений характеристик биомаркера для разных классов субъектов, например, пациентов с заболеванием против пациентов не имеющих заболевание. Характеристики могут выполняться в одном и том же анализе или могут быть известными характеристиками из предыдущего анализа.
L
L
В дополнение к отдельным биологическим соединениям, например, MCL-1, BCL-X, термин «биомаркер», используемый в настоящем описании, подразумевает включение групп или наборов нескольких биологических соединений. Например, комбинация MCL-1 и BCL-X может содержать биомаркер. Таким образом, «биомаркер» может содержать один, два, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять, пятнадцать, двадцать, двадцать пять, тридцать или более биологических соединений.
L
Определение уровня экспрессии или статуса мутации биомаркера у пациента может быть выполнено с использованием любого из многих способов, известных в данной области. Любой способ, известный в данной области для количественного определения конкретных белков и/или обнаружения сверхэкспрессии MCL-1 и/или BCL-X у пациента или биологического образца, может быть использован в способах изобретения. Примеры включают, но не ограничиваютс ими, ПЦР (полимеразная цепная реакция) или ОТ-ПЦР, нозерн-блот, вестерн-блоттинг, ELISA (иммуноферментный анализ, связанный с ферментом), RIA (радиоиммуноанализ), анализ с генным чипом экспрессии РНК, иммуногистохимия или иммунофлуоресценция (См., например, Slagle et al. Cancer 83:1401 (1998)). Некоторые варианты осуществления изобретения включают способы, в которых определяют экспрессию биомаркеров РНК (транскрипция). Другие варианты осуществления изобретения включают способы, в которых определяют экспрессию белка в биологическом образце. См., например, Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, (1988) and Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York 3rd Edition, (1995). Для анализа нозерн-блот или ОТ-ПЦР РНК выделяют из образца опухолевой ткани с использованием методов, свободных от РНКазы. Такие методы широко известны в данной области.
При количественном определении у пациента in vivo, уровень экспрессии белков, таких как MCL-1 или их вариантов, может быть определен путем введения антитела, которое специфически связывается с MCL-1 (см., например, опубликованную заявку США 2006/0127945) и определяет степень связывания. Антитело может быть детектируемо мечено, например, радиоизотопом, таким как углерод-11, азот-13, кислород-15 и фтор-18. Затем метку можно обнаружить с помощью позитронно-эмиссионной томографии (ПЭТ).
В одном варианте осуществления изобретения биологический образец получают от пациента и клетки в биопсии анализируют для определения экспрессии биомаркера или статуса мутации.
В одном варианте осуществления изобретения ПЭТ-изображение используют для определения экспрессии биомаркера.
В другом варианте осуществления раскрывается нозерн-блот-анализ транскрипции биомаркера в образце опухолевой клетки.
В другом варианте осуществления осуществляют нозерн-блот-анализ транскрипции биомаркера в образце опухолевой клетки. Нозерн-блот-анализ является стандартным способом обнаружения и/или количественного определения уровней мРНК в образце. Первоначально РНК выделяют из образца, который анализируют с использованием нозерн-блот-анализа. В анализе образцы РНК сначала разделяют в соответствии с размером путем электрофореза в агарозном геле в условиях денатурирования. Затем РНК переносят на мембрану, сшивают и гибридизуют с меченым зондом. Как правило, нозерн гибридизация включает полимеризацию радиоактивно меченной или неизотопно меченной ДНК, in vitro, или получение олигонуклеотидов в качестве гибридизационных зондов. Как правило, мембрана, несущая образец РНК, предварительно гибридизуется или блокируется перед гибридизацией зонда, для предотвращения зонда от покрытия мембраны и, таким образом, уменьшить неспецифический фоновый сигнал. После гибридизации, как правило, негибридизированный зонд удаляют промыванием в нескольких заменах буфера. Жесткость условий промывки и гибридизации может быть разработана, выбрана и реализована любым практикующим специалистом в данной области техники. Обнаружение осуществляют с помощью детектируемых меченых зондов и подходящего способа обнаружения. Зонды, меченные радиоактивным изотопом и немеченные радиоактивным изотопом, и их использование хорошо известны в данной области техники. Присутствие и/или относительные уровни экспрессии биомаркера, подлежащего анализу, можно количественно оценить, используя, например, денситометрию.
Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51
В другом варианте осуществления изобретения экспрессию биомаркера и/или статус мутации определяют с использованием ОТ-ПЦР. ОТ-ПЦР позволяет обнаруживать прогресс ПЦР-амплификации гена-мишени в реальном времени. Конструкция праймеров и зондов, необходимых для обнаружения экспрессии и/или статуса мутации биомаркера изобретения, находится в пределах квалификации практикующего специалиста в данной области техники. ОТ-ПЦР может использоваться для определения уровня РНК, кодирующего биомаркер изобретения в образце опухолевой ткани. В одном из вариантов осуществления изобретения выделяют РНК из биологического образца, в условиях отсутствия РНКазы, чтобы преобразовать в ДНК путем обработки обратной транскриптазой. Способы для конверсии с обратной транскриптазой РНК в ДНК хорошо известны в данной области. Описание ПЦР приведено в следующих ссылках: Mullis et al., :263 (1986); EP 50424; EP 84796; EP 258017; EP 237362; EP 201184; патент США No. 4683202; 4582788; 4683194.
ОТ-ПЦР-зонды зависят от 5'-3'-нуклеазной активности ДНК-полимеразы, используемой для ПЦР, для гидролиза олигонуклеотида, который гибридизуется с целевым ампликоном (биомаркерный ген). ОТ-ПЦР-зонды представляют собой олигонуклеотиды, которые имеют флуоресцентный репортерный краситель, прикрепленный к 5'-концу, и фрагмент гасителя флуоресценции, связанный с 3'-концом (или наоборот). Эти зонды предназначены для гибридизации к внутренней области ПЦР-продукта. В негибридизованном состоянии, близость молекул фтора и гасителя предотвращает обнаружение флуоресцентного сигнала от зонда. Во время ПЦР-амплификации, когда полимераза реплицирует матрицу, на которой зонд ОТ-ПЦР связан, 5'-3'-нуклеазная активность полимеразы расщепляет зонд. Это отделяет флуоресцентные красители и гасители, а FRET больше не происходит. Таким образом, флуоресценция увеличивается в каждом цикле, пропорционально количеству расщепления зонда. Сигнал флуоресценции, испускаемый реакцией, может быть измерен или сопровождается с течением времени с использованием оборудования, которое является коммерчески доступным с использованием обычных и общепринятых методик.
В еще одном варианте осуществления изобретения экспрессию белков, кодируемых биомаркерами, детектируют вестерн-блот-анализом. Вестерн-блот (также известный как иммуноблот) является способом обнаружения белка в данном образце гомогената или экстракта ткани. Он использует гель-электрофорез для разделения денатурированных белков по массе. Затем белки переносят из геля и на мембрану (например, нитроцеллюлоза или поливинилиденфторид (PVDF)), где они обнаруживаются с использованием первичного антитела, которое специфически связывается с белком. Связанное антитело затем может быть обнаружено вторичным антителом, которое конъюгируют с детектируемой меткой (например, биотином, пероксидазой хрена или щелочной фосфатазой). Обнаружение сигнала вторичной метки указывает на наличие белка.
В еще одном варианте осуществления изобретения экспрессия белка, кодируемого биомаркером, детектируют с помощью иммуноферментного анализа (ELISA). В одном варианте осуществления изобретения «сэндвич-ELISA» включает покрытие планшета иммобилизованным антителом; добавление образца, в котором любой присутствующий антиген связывается с иммобилизованным антителом; добавление детектирующего антитела, которое также связывает антиген; добавление связанного с ферментом вторичного антитела, которое связывается с детектирующим антителом; и добавление субстрата, который превращается ферментом на вторичном антителе в детектируемую форму. Обнаружение сигнала от вторичного антитела указывает на наличие антигенного белка биомаркера.
В еще одном варианте осуществления изобретения экспрессию биомаркера оценивают с использованием генного чипа или микроматрицы. Такие методы находятся в пределах знаний специалиста в данной области.
L
Термин «биологический образец», как используется в настоящем описании, относится к любой ткани или жидкости от пациента, который подходит для обнаружения биомаркера, такого как статус экспрессии MCL-1 и/или BCL-X. Примеры подходящих биологических образцов включают, но не ограничиваются ими, биопсийные ткани и/или клетки, например, твердая опухоль, лимфатический узел, воспаленные ткани, ткани и/или клетки, участвующие в состоянии или заболевании, кровь, плазму, серозную жидкость, спинномозговую жидкость, слюну, мочу, лимфу, цереброспинальную жидкость и тому подобное. Другие подходящие биологические образцы будут хорошо известны специалистам в данных областях. Биологический образец может быть проанализирован на экспрессию и/или мутацию биомаркера с использованием любого метода, известного в данной области, и может быть получен с использованием методов, которые не выходят за рамки обычных знаний практикующего клинициста. В одном варианте осуществления изобретения биологический образец содержит клетки крови.
Настоящее изобретение содержит следующие конкретные варианты осуществления в отношении персонализированной медицины для пациентов, страдающих раком:
L
L
Вариант осуществления I: Способ лечения пациента, имеющего рак, включающий введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения пациенту, где клетки пациента имеют биомаркер, и биомаркер представляет собой сверхэкспрессию MCL-1, сверхэкспрессию BCL-X или совместную сверхэкспрессию MCL-1 и BCL-X.
Вариант осуществления II: Способ лечения пациента, имеющего рак, включающий:
L
L
L
L
(a) определение уровня экспрессии MCL-1, BCL-X или MCL-1 и BCL-X, в биологическом образце от пациента, и когда уровень экспрессии выше, чем уровень контрольного образца, например, образец от здорового пациента, непораженного заболеванием, или пациента, имеющего рак без сверхэкспрессии MCL-1, BCL-X, или MCL-1 и BCL-X,
(b) введение пациенту терапевтически эффективного количества соединения изобретения.
L
L
Вариант осуществления III: Способ лечения рака, который сверхэкспрессирует MCL-1, BCL-X, или MCL-1 и BCL-X, у пациента, включающий введение пациенту терапевтически эффективного количества соединения изобретения.
Вариант осуществления IV: Способ по любому из вариантов осуществления I-III, где пациенту вводят по меньшей мере одно дополнительное противораковое средство.
L
Вариант осуществления V: Способ по варианту осуществления IV, где по меньшей мере одно дополнительное противораковое средство представляет собой ингибитор BCL-X, например, ABT-199.
Вариант осуществления V: Способ по варианту осуществления IV, где по меньшей мере одно дополнительное противораковое средство представляет собой ингибитор MCL-1.
Вариант осуществления VI: Способ лечения человека, имеющего TNBC, включающий:
(a) получение биологического образца от пациента;
L
(b) определение будет ли биологический образец совместно сверхэкспрессировать MCL-1 и BCL-X; и
L
(c) введение пациенту терапевтически эффективного количества соединения изобретения, если биологический образец показывает совместную сверхэкспрессию MCL-1 и BCL-X.
Вариант осуществления VII: Способ лечения человека, имеющего рак, например, TNBC, включающий:
(a) измерение уровня экспрессии MCL-1 в биологическом образце, собранном у пациента, до введения соединения изобретения субъекту;
(b) определение того, является ли уровень экспрессии MCL-1 выше стандартного заданного порогового значения; и
(c) введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения и, необязательно, ингибитора MCL-1, пациенту, если уровень экспрессии MCL-1 выше, чем стандартное заданное пороговое значение.
Вариант осуществления VIII: Способ лечения человека, имеющего рак, например, TNBC, включающий:
L
(a) измерение уровня экспрессии BCL-X в биологическом образце, собранном у пациента, до введения соединения изобретения субъекту;
L
(b) определение того, является ли уровень экспрессии BCL-X выше стандартного заданного порогового значения; и
L
L
(c) введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения и, необязательно, ингибитора BCL-X, пациенту, если уровень экспрессии BCL-X выше, чем стандартное заданное пороговое значение.
Вариант осуществления IX: Способ лечения рака, например, TNBC, включающий введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения и, необязательно, ингибитора MCL-1, пациенту, имеющему повышенный уровень экспрессии MCL-1.
L
L
Вариант осуществления X: Способ лечения рака, например, TNBC, включающий введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения и, необязательно, ингибитора BCL-X, пациенту, имеющему повышенный уровень экспрессии BCL-X.
В другом варианте осуществления изобретение предоставляет способ лечения человека, имеющего TNBC, включающий введение пациенту терапевтически эффективных количеств соединения изобретения и ингибитора MCL-1.
L
В другом варианте осуществления изобретение предоставляет способ лечения человека, имеющего TNBC, включающий введение пациенту терапевтически эффективных количеств соединения изобретения и ингибитора BCL-X.
В способах настоящего изобретения терапевтически эффективное количество соединения изобретения, типично полученного в соответствии с фармацевтической практикой, вводят человеку, нуждающемуся в этом. Показано ли такое лечение, зависит от конкретного случая и подлежит медицинской оценке (диагностике), которая учитывает признаки, симптомы и/или нарушения, которые присутствуют, риски развития конкретных признаков, симптомов и/или нарушений, и другие факторы.
Соединение изобретения можно вводить любым подходящим способом, например, пероральным, буккальным, ингаляционным, сублингвальным, ректальным, вагинальным, интрацистернальным или интратекальным через поясничную пункцию, трансуретральным, назальным, чрескожным, т.е. трансдермальным или парентеральным (включая внутривенную, внутримышечную, подкожную, внутрикоронарную, внутрикожную, интрацистернальную, внутрибрюшинную, внутрисуставную, интратекальную, ретробульбарную, внутрилегочную инъекцию и/или хирургическая имплантация на конкретном участке) введением. Парентеральное введение может быть осуществлено с использованием иглы и шприца или с использованием методом высокого давления.
Фармацевтические композиции включают те, в которых соединение изобретения вводят в эффективном количестве для достижения намеченной цели. Правильную лекарственную форму, способ введения и дозировку определяются лечащим врачом с учетом диагностированного состояния или заболевания. Количество и интервал дозирования можно регулировать индивидуально для обеспечения уровней соединения изобретения, которые являются достаточными для поддержания терапевтического эффекта.
Токсичность и терапевтическая эффективность соединений изобретения могут быть определены стандартными фармацевтическими способами в клеточных культурах или экспериментальных животных, например, для определения максимальной переносимой дозы (МПД) соединения, которая определяется как наибольшая доза, не вызывающая токсичности у животных. Соотношение доз между максимальной переносимой дозой и терапевтическим эффектом (например, ингибирование роста опухоли) представляет собой терапевтический индекс. Дозировка может варьироваться в пределах этого диапазона в зависимости от используемой лекарственной формы и используемого способа введения. Определение терапевтически эффективного количества не выходит за рамки возможности специалиста в данной области, особенно в свете подробного описания, представленного в настоящем документе.
Терапевтически эффективное количество соединения, которое требуется для применения в терапии, варьируется в зависимости от характера состояния, подлежащего лечению, периода времени, в течение которого требуется активность, и возраста и состояния пациента, и в конечном счете определяется лечащим врачом. Размер дозировки и интервалы дозирования могут быть установлены индивидуально для обеспечения уровней в плазме деструктора бромодоменсодержащих белков BET, которые являются достаточными для поддержания желаемых терапевтических эффектов. Желаемую дозу удобно вводить в виде разовой дозы или в виде нескольких доз, вводимых через соответствующие интервалы, например, в виде одной, двух, трех, четырех или более поддоз в день. Часто требуется или желателен многократный прием. Например, соединение изобретения можно вводить с частотой: четырехкратная доза, принимаемая однократно в день при четырехдневном интервале (q4d×4); четырехкратная доза, принимаемая однократно в день при трехдневном интервале (q3d×4); однократная доза, принимаемая раз в день при пятидневном интервале (qd×5); однократная доза раз в неделю в течение трех недель (qwk3); пять ежедневных приемов, два дня отдыха, и следующие 5 ежедневных приема (5/2/5); или любой другой режим приема, установленный надлежащим образом для конкретных обстоятельств.
Соединение изобретения, используемое в способе настоящего изобретения, может быть введено в количестве от приблизительно 0,005 до приблизительно 500 миллиграммов на дозу, приблизительно 0,05 до приблизительно 250 миллиграммов на дозу или приблизительно 0,5 до приблизительно 100 миллиграммов на дозу. Например, соединение изобретения можно вводить, из расчета на дозу, в количестве приблизительно 0,005, 0,05, 0,5, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 100, 150, 200, 250, 300, 350, 400, 450 или 500 миллиграммов, включая все дозы в интервале от 0,005 до 500 миллиграммов.
Дозировка композиции, содержащей соединение изобретения, или композиции, содержащей тоже самое, может составлять от приблизительно 1 нг/кг до приблизительно 200 мг/кг, от приблизительно 1 мкг/кг до приблизительно 100 мг/кг или от приблизительно 1 мг/кг до приблизительно 50 мг/кг. Дозировка композиции может быть любой дозировкой, включая, но не ограничиваясь ими, приблизительно 1 мкг/кг. Дозировка композиции может быть любой дозировкой, включая, но не ограничиваясь ими, приблизительно 1 мкг/кг, приблизительно 10 мкг/кг, приблизительно 25 мкг/кг, приблизительно 50 мкг/кг, приблизительно 75 мкг/кг, приблизительно 100 мкг/кг, приблизительно 125 мкг/кг, приблизительно 150 мкг/кг, приблизительно 175 мкг/кг, приблизительно 200 мкг/кг, приблизительно 225 мкг/кг, приблизительно 250 мкг/кг, приблизительно 275 мкг/кг, приблизительно 300 мкг/кг, приблизительно 325 мкг/кг, приблизительно 350 мкг/кг, приблизительно 375 мкг/кг, приблизительно 400 мкг/кг, приблизительно 425 мкг/кг, приблизительно 450 мкг/кг, приблизительно 475 мкг/кг, приблизительно 500 мкг/кг, приблизительно 525 мкг/кг, приблизительно 550 мкг/кг, приблизительно 575 мкг/кг, приблизительно 600 мкг/кг, приблизительно 625 мкг/кг, приблизительно 650 мкг/кг, приблизительно 675 мкг/кг, приблизительно 700 мкг/кг, приблизительно 725 мкг/кг, приблизительно 750 мкг/кг, приблизительно 775 мкг/кг, приблизительно 800 мкг/кг, приблизительно 825 мкг/кг, приблизительно 850 мкг/кг, приблизительно 875 мкг/кг, приблизительно 900 мкг/кг, приблизительно 925 мкг/кг, приблизительно 950 мкг/кг, приблизительно 975 мкг/кг, приблизительно 1 мг/кг, приблизительно 5 мг/кг, приблизительно 10 мг/кг, приблизительно 15 мг/кг, приблизительно 20 мг/кг, приблизительно 25 мг/кг, приблизительно 30 мг/кг, приблизительно 35 мг/кг, приблизительно 40 мг/кг, приблизительно 45 мг/кг, приблизительно 50 мг/кг, приблизительно 60 мг/кг, приблизительно 70 мг/кг, приблизительно 80 мг/кг, приблизительно 90 мг/кг, приблизительно 100 мг/кг, приблизительно 125 мг/кг, приблизительно 150 мг/кг, приблизительно 175 мг/кг, приблизительно 200 мг/кг или более. Перечисленные выше дозировки являются приводимыми в качестве примера средними значениями, но могут включать индивидуальные случаи, при которых предпочтительна более высокая или низкая дозировка, и такие дозировки попадают в объем настоящего изобретения. На практике врач определяет фактический режим дозирования, который наилучшим образом подходит конкретному пациенту, который может варьироваться в зависимости от возраста, массы и ответа на лечение конкретного пациента.
Как указано выше, соединение изобретения можно вводить в комбинации со вторым терапевтически активным средством. В некоторых вариантах осуществления второе терапевтическое средство является эпигенетическим лекарственным средством. Как используется в настоящем описании, термин «эпигенетическое лекарственное средство» относится к терапевтическому средству, которое нацелено на эпигенетический регулятор. Примеры эпигенетических регуляторов включают метилтрансферазы лизина гистона, метилтрансферазы аргинина гистона, деметилазы гистона, гистондеацетилазы, ацетилазы гистона и ДНК-метилтрансферазы. Ингибиторы гистондеацетилазы включают, но не ограничиваются ими, вориностат.
В другом варианте осуществления химиотерапевтические средства или другие антипролиферативные средства могут быть объединены с соединением изобретения для лечения пролиферативных заболеваний и рака. Примеры терапий и противораковых средств, которые могут использоваться в комбинации с соединениями изобретения, включают хирургическое вмешательство, лучевую терапию (например, гамма-излучение, лучевая терапия нейтронным пучком, лучевая терапия электронным пучком, протонная терапия, брахитерапия и системные радиоактивные изотопы), эндокринную терапию, терапию с использованием модификаторов биологического ответа (например, интерферон, интерлейкин, фактор некроза опухоли (TNF), гипертермию и криотерапию, средство для ослабления любого неблагоприятного эффекта (например, противорвотное средство) и любое другое разрешенное химиотерапевтическое лекарственное средство.
Примеры антипролиферативных соединений включают, но не ограничиваются ими, ингибитор ароматазы; антиэстрогены; антиандрогены; агонисты гонадорелина; ингибиторы топоизомеразы I; ингибиторы топоизомеразы II; агенты, активные по отношению к микротрубочкам; алкилирующий агент; ретиноид, каротеноид или токоферол; ингибитор циклооксигеназы; ингибитор MMP; ингибитор mTOR; антиметаболиты; соединения платины; ингибитор метионин-аминопептидазы; бисфосфонат; антипролиферативное антитело; ингибитор гепараназы; ингибитор онкогенных Ras-изоформ; ингибитор теломеразы; ингибитор протеасомы; соединение, используемое для лечения гематологических злокачественных новообразований; ингибитор Flt-3; ингибитор Hsp90; ингибитор кинезинового белка веретена; ингибитор MEK; противоопухолевый антибиотик; нитрозомочевина; соединения, нацеленные/снижающие активность протеин- или липид-киназы; соединения, нацеленные/снижающие активность протеин- или липид-фосфатазы, или любое дополнительное антиангиогенное соединение.
Неограничивающие примеры ингибиторы ароматазы включают, но не ограничиваются ими, стероиды, такие как атаместан, экземестан и форместан, а также нестероиды, такие как аминоглутетимид, роглетимид, пиридоглутетимид, трилостан, тестолактон, кетоконазол, ворозол, фадрозол, анастрозол и летрозол.
Неограничивающие антиэстрогены включают, но не ограничиваются ими, тамоксифен, фулвестрант, ралоксифен и ралоксифен гидрохлорид. Антиандрогены включают, но не ограничиваются ими, бикалутамид. Агонисты гонадорелина включают, но не ограничиваются ими, абареликс, гозерелин и гозерелина ацетат.
Иллюстративные ингибиторы топоизомеразы I включают, но не ограничиваются ими, топотекан, гиматекан, иринотекан, камптотецин и его аналоги, 9-нитрокамптотецин и макромолекулярный конъюгат камптотецина PNU-166148. Ингибиторы топоизомеразы II включают, но не ограничиваются ими, антрациклины, такие как доксорубицин, даунорубицин, эпирубицин, идарубицин и неморубицин; антрахиноны, такие как митоксантрон и лосоксантрон; и подофиллотоксины, такие как этопозид и тенипозид.
Агенты, активные по отношению к микротрубочкам, включают стабилизирующие микротрубочки и дестабилизирующие микротрубочки соединения, и ингибиторы полимеризации микротубулина, включая, но не ограничиваясь ими, таксаны, такие как паклитаксел и доцетаксел; алкалоиды барвинка, такие как винбластин, винбластинсульфат, винкристин и винкристинсульфат, и винорелбин; дискодермолиды; кохицин и эпотилоны и их производные.
Неограничивающие примеры алкилирующих средств включают циклофосфамид, ифосфамид, мелфалан и нитрозомочевины, такие как кармустин и ломустин.
Неограничивающие примеры ингибиторов циклооксигеназы включают ингибиторы Cox-2, 5-алкилзамещенную 2-ариламинофенилуксусную кислоту и ее производные, такие как целекоксиб, рофекоксиб, эторикоксиб, валдекоксиб или 5-алкил-2-ариламинофенилуксусную кислоту, например, лумиракоксиб.
Неограничивающие примеры ингибиторов матриксных металлопротеиназ («ингибиторы MMP») включают коллагеновые пептидомиметические и непептидомиметические ингибиторы, производные тетрациклина, батимастат, маримастат, приномастат, метастат, BMS-279251, BAY 12-9566, TAA211, MMI270B и AAJ996.
Неограничивающие примеры ингибиторов mTOR включают соединения, которые ингибируют объект воздействия рапамицина у млекопитающих (mTOR) и обладают антипролиферативной активностью, такие как сиролимус, эверолимус, CCI-779 и ABT578.
Неограничивающие примеры антиметаболитов включают 5-фторурацил (5-FU), капецитабин, гемцитабин, деметилирующие ДНК соединения, такие как 5-азацитидин и децитабин, метотрексат и эдатрексат и антагонисты фолиевой кислоты, такие как пеметрексед.
Неограничивающие примеры соединений платины включают карбоплатин, цис-платин, цисплатин и оксалиплатин.
Неограничивающие примеры ингибиторов метионин-аминопептидазы включают бенгамид или его производное и PPI-2458.
Неограничивающие примеры бисфосфонатов включают этридоновую кислоту, клодроновую кислоту, тилудроновую кислоту, памидроновую кислоту, алендроновую кислоту, ибандроновую кислоту, ризедроновую кислоту и золедроновую кислоту.
Неограничивающие примеры антипролиферативных антител включают трастузумаб, трастузумаб-DMl, цетуксимаб, бевацизумаб, ритуксимаб, PR064553 и 2C4. Термин «антитело» включает интактные моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела, образованные по меньшей мере из двух интактных антител, и фрагменты антител, при условии, что они проявляют желаемую биологическую активность.
Неограничивающие примеры ингибиторов гепараназы включают соединения, которые нацеливаются, снижают или ингибируют разрушение сульфата гепарина, такие как PI-88 и OGT2115.
Термин «ингибитор онкогенных Ras-изоформ», такой как H-Ras, K-Ras или N-Ras, как используется в настоящем описании, относится к соединению, которое нацеливается, снижает или ингибирует онкогенную активность Ras, например, ингибитор фарнезилтрансферазы, такой как L-744832, DK8G557, типифарниб и лонафарниб.
Неограничивающие примеры ингибиторов теломеразы включают соединения, которые нацеливаются, снижают или ингибируют активность теломеразы, такие как соединения, которые ингибируют теломеразный рецептор, такой как теломестатин.
Неограничивающие примеры ингибиторов протеасомы включают соединения, которые нацеливаются, снижают или ингибируют активность протеасомы, включая, но не ограничиваясь ими, бортезомид.
Фраза «соединения, используемые для лечения гематологических злокачественных образований», как используется в настоящем описании, включает ингибиторы FMS-подобных тирозинкиназ, которые являются соединениями, нацеливающимися, уменьшающими или ингибирующими активность рецепторов FMS-подобных тирозинкиназ (Flt-3R); интерферон, Ι-β-D-арабинофурансилцитозин (ara-c) и бисульфан; и ингибиторы ALK, которые являются соединениями, которые нацеливаются, снижают или ингибируют киназы анапластической лимфомы.
Неограничивающие примеры ингибиторов Flt-3 включают PKC412, мидостаурин, производное стауроспорина, SU11248 и MLN518.
Неограничивающие примеры ингибиторов HSP90 включают соединения, которое оказывает направленное воздействие, ослабляет или ингибирует присущую HSP90 АТФазную активность; или расщепляет, оказывает направленное воздействие, ослабляет или ингибирует белки-клиенты HSP90 через убикитиновый протеосомный путь. Соединения, которые оказывают направленное воздействие, снижают или ингибируют присущую HSP90 АТФазную активность, представляют собой, в частности, соединения, белки или антитела, которые ингибируют АТФазную активность HSP90, например, 17-аллиламино,17-деметоксигелданамицин (17AAG), производное гелданамицина; другие родственные с гелданамицину соединения; радицикол и ингибиторы HDAC.
Фраза «соединение, нацеленное на/снижающее активность протеин- или липид-киназы; или активность протеин- или липид-фосфатазы, или любое дополнительное антиангиогенное соединение», как используется в настоящем описании, включает ингибиторы протеинтирозинкиназы и/или серин- и/или треонинкиназы или ингибиторы липидкиназы, как например, а) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность рецепторов фактора роста тромбоцитов (PDGFR), таких как соединение, которое нацелено на, уменьшает или ингибирует активность PDGFR, например, производные N-фенил-2-пиримидин-амина, такие как иматиниб, SUlOl, SU6668 и GFB-111; b) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность рецепторов фактора роста фибробластов (FGFR); c) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность рецептора инсулиноподобного фактора роста I (IGF-IR), такое как соединение, которое нацелено на, уменьшает или ингибирует активность IGF-IR; d) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность семейства Trk-рецепторных тирозинкиназ, или ингибиторов эфрина B4; e) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность семейства Axl-рецепторных тирозинкиназ; f) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность рецепторной тирозинкиназы Ret; г) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность рецепторной тирозинкиназы Kit/SCFR, такое как иматиниб; h) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность рецепторной тирозинкиназы c-Kit, такое как иматиниб; i) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность членов семейства c-Abl, продукты слияния их генов (например, Bcr-Abl киназа) и мутанты, такие как производное N-фенил-2-пиримидинамин, такое как иматиниб или нилотиниб; PD180970; AG957; NSC 680410; PD173955; или дазатиниб; j) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность членов протеинкиназы C (PKC) и Raf семейства серин/треониновых киназ, представителей MEK, SRC, JAK, FAK, PDK1, PKB/Akt, и Ras/MAPK членов семейства, и/или членов семейства циклинзависимых киназ (CDK), таких как производное стауроспорин, раскрытое в патенте США No. 5093330, такое как мидостаурин; примеры дополнительных соединений включают UCN-01, сафингол, BAY 43-9006, бриостатин 1, перифосин; илмофосин; RO 318220 и RO 320432; GO 6976; Isis 3521; LY333531/LY379196; соединение изохинолина; ингибитор фарнезилтрансферазы; PD184352 или QAN697, или AT7519; k) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность протеинтирозинкиназы, такое как иматиниба мезилат или тирфостин, такой как тирфостин A23/RG-50810; AG 99; тирфостин AG 213; тирфостин AG 1748; тирфостин AG 490; тирфостин B44; тирфостин B44 (+)энантиомер; тирфостин AG 555; AG 494; тирфостин AG 556, AG957 и адафостин (адамантиловый эфир 4-{[(2,5-дигидроксифенил)метил]амино}бензойной кислоты, NSC 680410, адафостин); 1) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность семейства рецепторных тирозинкиназ эпидермального фактора роста (EGFR, ErbB2, ErbB3, ErbB4 в виде гомо- и гетеродимеров) и их мутанты, такие как CP 358774, ZD 1839, ZM 105180; трастузумаб, цетуксимаб, гефинитиб, эрлотиниб, OSI-774, Cl-1033, EKB-569, GW-2016, антитела El.l, E2.4, E2.5, E6.2, E6.4, E2.11, E6.3 и E7.6.3 и производные 7H-пирроло[2,3-d] пиримидина; и m) соединение, нацеленное на, снижающее или ингибирующее активность рецептора c-Met.
Типичные соединения, которые нацеливаются на, уменьшают или ингибируют активность протеин или липид фосфатазы, включают ингибиторы фосфатазы 1, фосфатазы 2А или CDC25, такие как окадаиковая кислота или ее производное.
Другие антиангиогенные соединения включают соединения, имеющие другой механизм их активности, не связанный с ингибированием протеин- или липидкиназы, например, талидомид и TNP-470.
Дополнительные, неограничивающие, примеры химиотерапевтических соединений, одно или несколько из которых могут быть использованы в комбинации с настоящим деструктором ВЕТ-бромодомена, включают: даунорубицин, адриамицин, Ara-C, VP-16, тенипозид, митоксантрон, идарубицин, карбоплатин, PKC412, 6-меркаптопурин (6-МР), флударабин фосфат, октреотид, SOM230, FTY720, 6-тиогуанин, кладрибин, 6-меркаптопурин, пентостатин, гидроксимочевина, производные 2-гидрокси-1Н-изоиндол-1,3-диона, 1-(4-хлоранилино)-4-(4-пиридилметил)фталазин или его фармацевтически приемлемая соль, 1-(4-хлоранилино)-4-(4-пиридилметил)фталазин сукцинат, ангиостатин, эндостатин, амиды антраниловой кислоты, ZD4190, ZD6474, SU5416, SU6668, бевацизумаб, rhuMAb, rhuFab, макуген; ингибиторы FLT-4, ингибиторы FLT-3, IgGI-антитела VEGFR-2, RPI 4610, бевацизумаб, порфимер натрия, анекорват, триамцинолон, гидрокортизон, 11-а-эпигидрокотизол, кортексолон, 17a-гидроксипрогестерон, кортикостерон, дезоксикортикостерон, тестостерон, эстрон, дексаметазон, флуоцинолон, растительный алкалоид, гормональное соединение и/или антагонист, модификатор биологического ответа, такой как лимфокин или интерферон, антисмысловое олигонуклеотид или олигонуклеотидное производное, shRNA и siRNA.
Другие примеры вторых терапевтических средств, один или несколько из которых могут быть также объединены с настоящим деструктором ВЕТ-бромодомена, включают, но не ограничиваются ими: для лечения болезни Альцгеймера, такие как донепезил и ривастигмин; лечения болезни Паркинсона, такие как L-DOPA/карбидопа, энтакапон, ропинрол, прамипексол, бромокриптин, перголид, тригексифенидил и амантадин; средство для лечения рассеянного склероза (MS), такое как бета-интерферон (например, AVONEX (авонекс) и REBIF (рефиб)), глатирамера ацетат и митоксантрон; лечение астмы, такие как альбутерол и монтелукаст; средство для лечения шизофрении, такое как зипрекса, риспердал, сероквель и галоперидол; противовоспалительные средства, такие как кортикостероид, блокатор TNF, IL-1 RA, азатиоприн, циклофосфамид и сульфасалазин; иммуномодулирующее средство, включая иммунодепрессивные средства, такие как циклоспорин, такролимус, рапамицин, микофенолата мофетил, интерферон, кортикостероид, циклофосфамид, азатиоприн и сульфасалазин; нейротрофический фактор, такой как ингибитор ацетилхолинэстеразы, ингибитор МАО, интерферон, антиконвульсивное средство, блокатор ионного канала, рилузол или средство против болезни Паркинсона; средство для лечения сердечно-сосудистых заболеваний, такое как бета-блокатор, ингибитор ACE, диуретик, нитрат, блокатор кальциевых каналов или статин; средство для лечения заболевания печени, такое как кортикостероид, холестирамин, интерферон и противовирусное средство; средство для лечения заболеваний крови, такое как кортикостероид, противолейкозное средство или фактор роста; или средство для лечения иммунодефицитный состояний, такое как гамма-глобулин.
Вышеуказанные вторые терапевтически активные средства, один или несколько из которых могут быть использованы в комбинации с соединением изобретения, получают и вводят, как описано в данной области.
Соединения изобретения обычно вводят в смеси с фармацевтическим носителем, выбранным с учетом предполагаемого способа введения и стандартной фармацевтической практики. Фармацевтические композиции для применения в соответствии с настоящим изобретением изготавливают обычным образом с использованием одного или нескольких физиологически приемлемых носителей, включающих эксципиенты и/или вспомогательные вещества, которые облегчают переработку соединения изобретения.
Эти фармацевтические композиции могут быть получены, например, обычными способами смешивания, растворения, гранулирования, дражирования, эмульгирования, инкапсулирования, включения или лиофилизации. Правильный состав композиции зависит от выбранного пути введения. Когда терапевтически эффективное количество соединения изобретения вводят перорально, композиция обычно находится в форме таблетки, капсулы, порошка, раствора или эликсира. При введении в виде таблеток композиция дополнительно может содержать твердый носитель, такой как желатин или адъювант. Таблетка, капсула и порошок содержат от приблизительно 0,01% до приблизительно 95% и предпочтительно от приблизительно 1% до приблизительно 50% соединения изобретения. При введении в жидкой форме может быть добавлен жидкий носитель, такой как вода, петролеум или масла животного или растительного происхождения. Жидкая форма композиции может дополнительно содержать физиологический солевой раствор, декстрозу или другие сахаридные растворы или гликоли. При введении в жидкой форме композиция содержит от приблизительно 0,1% до приблизительно 90% и предпочтительно от приблизительно 1% до приблизительно 50% по массе соединения изобретения.
Когда терапевтически эффективное количество соединения изобретения вводят путем внутривенной, кожной или подкожной инъекции, композиция находится в форме апирогенного парентерально приемлемого водного раствора. Получение таких парентерально приемлемых растворов, имеющих соответствующие рН, изотоничность, стабильность и тому подобное, находится в пределах квалификации специалистов в данной области. Предпочтительная композиция для внутривенной, кожной или подкожной инъекции обычно содержит изотонический носитель.
Соединения изобретения могут быть легко объединены с фармацевтически приемлемыми носителями, хорошо известными в данной области. Стандартные фармацевтические носители описаны в Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, PA, 19th ed. 1995. Такие носители позволяют вводить активные средства в виде таблеток, пилюль, драже, капсул, жидкостей, гелей, сиропов, взвесей, суспензий и т.п. для перорального приема проходящим лечение пациентом. Фармацевтические препараты для перорального применения могут быть получены путем добавления соединения изобретения к твердому эксципиенту, необязательного измельчения полученной смеси и обработки смеси гранулами после добавления подходящих вспомогательных веществ, если желательно, для получения таблеток или ядер драже. Подходящие эксципиенты включают, например, наполнители и целлюлозные препараты. При желании можно добавлять дезинтегрирующие агенты.
Соединение изобретения может быть составлено для парентерального введения путем инъекции, например, путем болюсной инъекции или непрерывной инфузии. Составы для инъекций могут быть представлены в стандартной лекарственной форме, например, в ампулах или в многодозовых контейнерах, с добавлением консерванта. Композиции могут находиться в таких формах, как суспензии, растворы или эмульсии в масляных или водных носителях, и могут содержать вспомогательные вещества, такие как суспендирующие, стабилизирующие и/или диспергирующие агенты.
Фармацевтические композиции для парентерального введения включают водные растворы активного средства в водорастворимой форме. Кроме того, суспензии соединения изобретения могут быть получены в виде подходящих масляных суспензий для инъекций. Подходящие липофильные растворители или носители включают жирные масла или синтетические сложные эфиры жирных кислот. Водные суспензии для инъекций могут содержать вещества, которые повышают вязкость суспензии. Необязательно, суспензия также может содержать подходящие стабилизаторы или агенты, которые повышают растворимость соединений и позволяют получать высококонцентрированные растворы. Альтернативно, настоящая композиция может быть в виде порошка для получения перед использованием состава с подходящим носителем, например, со стерильной водой, не содержащей пирогенов.
Соединения изобретения также могут быть составлены в ректальных композициях, таких как суппозитории или удерживающие клизмы, например, содержащие обычные основы для суппозиториев. В дополнение к составам, описанным ранее, соединение изобретения также может быть составлено в виде депо-препарата. Такие составы с длительным действием можно вводить путем имплантации (например, подкожно или внутримышечно) или путем внутримышечной инъекции. Таким образом, например, соединение изобретения может быть составлено с использованием подходящих полимерных или гидрофобных материалов (например, в виде эмульсии в приемлемом масле) или ионообменных смол.
В частности, соединения изобретения могут вводиться перорально, буккально или сублингвально в форме таблеток, содержащих эксципиенты, такие как крахмал или лактоза, или в капсулах или овулах, отдельно или в смеси с эксципиентами, или в форме эликсиров или суспензий, содержащих ароматизаторы или красители. Такие жидкие препараты могут быть получены с фармацевтически приемлемыми добавками, такими как суспендирующие агенты. Соединение изобретения также можно вводить парентерально, например, внутривенно, внутримышечно, подкожно или интракоронарно. Для парентерального введения соединение изобретения обычно используют в виде стерильного водного раствора, который может содержать другие вещества, например, соли или моносахариды, такие как маннит или глюкоза, чтобы сделать раствор, изотоничным крови.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение предоставляет наборы, которые содержат соединение изобретения (или композицию, содержащую соединение изобретения), упакованное таким образом, чтобы облегчить их использование в осуществлении способов настоящего изобретения. В одном варианте осуществления, набор включает соединение изобретения (или композицию, содержащую соединение изобретения), упакованное в контейнер, например, герметичную флакон или сосуд, с инструкцией, прикрепленной к контейнеру или включенной в набор, которая описывает использование соединения или композиции для осуществления способа изобретения. В одном варианте осуществления, соединение или композицию упаковывают в стандартную лекарственную форму. Набор дополнительно может включать устройство, подходящее для введения композиции в соответствии с предполагаемым способом введения.
Термин «бромодомен BET» или «BET-бромодоменный белок» или «BET», как используется в настоящем описании, означает один или несколько из BRD2, BRD3, BRD4 и BRD-t или его изоформу или мутант.
2
3
2
«Моновалентный радикал лиганда для белка Е3 убиквитин-лигаза» получают из удаления водорода или другого подходящего атома, например Br, I, или группы, например, -OH, из исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза. Удаление атома водорода или другого подходящего атома или группы облегчает связывание исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза с ингибитором бромодомена BET с получением гетеробифункционального соединения, имеющего формулу I. В одном варианте осуществления атом водорода удаляют из любой подходящей -NH-группы исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза. В другом варианте осуществления атом водорода удаляют из любой подходящей -ОН-группы исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза. В другом варианте осуществления атом водорода удаляют из любой подходящей -N(H)-группы исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза. В другом варианте осуществления атом водорода удаляют из любой подходящей группы -CH, -CH-, -CH= исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза. В другом варианте осуществления, атом водорода удаляют из любой подходящей группы -OH исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза. В другом варианте осуществления, атом Br или I удаляют из любой подходящей арильной или гетероарильной группы исходного лиганда белка Е3 убиквитин-лигаза. Типичные неограничивающие моновалентные радикалы лигандов белка Е3 убиквитин-лигаза включают:
«Лиганд для белка Е3 убиквитин-лигаза» или «исходный лиганд для белка Е3 убиквитин-лигаза» или «лиганд белка Е3 убиквитин-лигаза» и тому подобное относится к соединению, которое связывает, например, ингибирует белок Е3 убиквитин-лигаза, включая белок фон Хиппеля-Линдау (VHL). Лиганды для белка Е3 убиквитин-лигаза известны специалистам в данной области. Типичные неограничивающие лиганды для белка Е3 убиквитин-лигаза включают лекарственные средства на основе фталимида, такие как талидомид.
Термин «заболевание или состояние, при котором разрушение бромодомен-содержащих белков BET обеспечивает пользу» относится к заболеванию или состоянию, при котором по меньшей мере один из BRD2, BRD3, BRD4 и BRD-t, и/или действие по меньшей мере одного из BRD2, BRD3, BRD4 и BRD-t является важным или необходимым, например, для начала, прогрессирования, экспрессии этого заболевания или состояние, или заболеванию или состоянию, которое, как известно, подлежит лечению ингибитором или деструктором бромодоменсодержащих белков BET. Примеры таких состояний включают, но не ограничиваются ими, рак, хроническое аутоиммунное заболевание, воспалительное заболевание, пролиферативное заболевание, сепсис и вирусную инфекцию. Специалист в данной области легко может определить, лечит ли соединение заболевание или состояние, опосредованное BET бромодоменом, для любого конкретного типа клетки, например, с помощью анализов, которые удобно использовать для оценки активности конкретных соединений.
Термин «второе терапевтическое срество» относится к терапевтическому средству, отличающемуся от соединения изобретения, и которое, как известно, лечит заболевание или состояние, представляющее интерес. Например, когда раком является заболевание или состояние, представляющее интерес, вторым терапевтическим средством может быть известное химиотерапевтическое средство, такое как таксол или излучение, например.
Термин «заболевание» или «состояние» обозначает нарушения и/или аномалии, которые, как правило, рассматриваются как патологические состояния или функции, и которые могут проявляться в виде определенных признаков, симптомов и/или дисфункций. Как показано ниже, соединение изобретения представляет собой деструктор бромодоменсодержащих белков BET и может использоваться для лечения заболеваний и состояний, при которых разрушение бромодоменсодержащих белков BET обеспечивает пользу.
Как ипользуется в настоящем описании, термины термины «проводить лечение», «лечить», «лечение», относятся к устранению, уменьшению или ослаблению заболевания или состояния и/или симптомов, связанных с ним. Хотя это не исключено, лечение заболевания или состояния не требует полного устранения заболевания, состояния или симптомов, связанных с ним. Как ипользуется в настоящем описании, термины термины «проводить лечение», «лечить», «лечение» может включать «профилактическое лечение», которое относится к уменьшению вероятности повторного развития заболевания или состояния, или повторения ранее контролируемого заболевания или состояния у субъекта, который не имеет, но подвержен риску или может быть восприимчив к восстановлению заболевания или состояния, или рецидиву заболевания или состояния. Термин «лечение» и синонимы предполагают введение терапевтически эффективного количества соединения изобретения индивидууму, нуждающемуся в таком лечении.
В значении изобретения «лечение» также включает профилактику рецидивов или фазовую профилактику, а также лечение острых или хронических признаков, симптомов и/или дисфункций. Лечение может быть ориентировано на симптоматическое лечение, например, для подавления симптомов. Оно может быть осуществлено в течение короткого периода времени, ориентировано на среднесрочное лечение или может быть долгосрочным лечением, например, в рамках поддерживающей терапии.
Термин «терапевтически эффективное количество» или «эффективная доза», как используется в настоящем описании, относится к количеству активного ингредиента(ов), которое является(являются) достаточным, когда вводится способом по изобретению, для эффективной доставки активного ингредиента(ов) для лечения состояния или заболевания, представляющего интерес, индивидууму, нуждающемуся в этом. В случае рака или другого пролиферативного заболевания, терапевтически эффективное количество средства может уменьшать (то есть замедлять в некоторой степени и предпочтительно останавливать) нежелательную клеточную пролиферацию; уменьшать количество раковых клеток; уменьшить размер опухоли; ингибировать (то есть замедлять в некоторой степени и предпочтительно останавливать) инфильтрацию раковых клеток в периферические органы; ингибировать (то есть замедлять в некоторой степени и предпочтительно останавливать) метастазы опухолей; ингибировать, в некоторой степени, рост опухоли; уменьшать передачу сигнала BET бромодомена в клетках-мишенях; и/или облегчать, в некоторой степени, один или несколько симптомов, связанных с раком. В зависимости от степени, в которой вводимое соединение или композиция предотвращает рост и/или уничтожает существующие раковые клетки, оно может быть цитостатическим и/или цитотоксическим.
Термин «контейнер» означает любую емкость и закупоривающую крышку к ней, пригодные для хранения, доставки, дозирования и/или обращения с фармацевтическим продуктом.
Термин «листовка-вкладыш» означает информацию, сопровождающую фармацевтический продукт, которая предоставляет описание того, как вводить продукт вместе с данными о безопасности и эффективности, необходимыми, чтобы дать возможность врачу, фармацевту и пациенту принять обоснованное решение относительно использования продукта. Листок-вкладыш обычно рассматривается как «этикетка» для фармацевтического продукта.
«Совместное введение», «введение в комбинации», «одновременное введение» и подобные фразы означают, что два или более средств вводят совместно субъекту, получающему лечение. Определение «совместно» означает, что каждое средство вводится либо в один момент времени, либо последовательно в любом порядке в разные моменты времени. Если же введение не одновременное, это означает, что средства вводятся индивидууму последовательно и достаточно близко по времени, с тем, чтобы обеспечить желаемый терапевтический эффект и возможность действовать сообща. Например, соединение изобретения может быть введено одновременно или последовательно в любом порядке в разные моменты времени со вторым терапевтическим средством. Соединение по изобретению и второе терапевтическое средство могут вводиться раздельно, в любом приемлемом виде или любым пригодным способом. Если соединение по изобретению и второе терапевтическое средство не вводятся совместно, следует понимать, что они могут вводиться в любой последовательности субъекту, нуждающемуся в этом. Например, соединение по изобретению может вводиться до (например, за 5 минут, 15 минут, 30 минут, 45 минут, 1 час, 2 часа, 4 часа, 6 часов, 12 часов, 24 часа, 48 часов, 72 часа, 96 часов, 1 неделю, 2 недели, 3 недели, 4 недели, 5 недель, 6 недель, 8 недель или за 12 недель до), одновременно, или после (например, через 5 минут, 15 минут, 30 минут, 45 минут, 1 час, 2 часа, 4 часа, 6 часов, 12 часов, 24 часа, 48 часов, 72 часа, 96 часов, 1 неделю, 2 недели, 3 недели, 4 недели, 5 недель, 6 недель, 8 недель или за 12 недель после) введения второго терапевтического средства данного способа лечения (например, радиационная терапия) индивидууму, нуждающемуся в этом. В различных вариантах осуществления соединение изобретения и второе терапевтическое средство вводят с разницей в 1 минуту, с разницей в 10 минут, с разницей в 30 минут, с разницей менее, чем 1 час, с разницей в 1 час, с разницей от 1 до 2 часов, с разницей от 2 до 3 часов, с разницей от 3 до 4 часов, с разницей от 4 до 5 часов, с разницей от 5 до 6 часов, с разницей от 6 до 7 часов, с разницей от 7 до 8 часов, с разницей от 8 до 9 часов, с разницей от 9 до 10 часов, с разницей от 10 до 11 часов, с разницей от 11 до 12 часов, с разницей не более, чем 24 часа или не более, чем 48 часов. В одном варианте осуществления компоненты комбинированной терапии вводят с разницей от приблизительно 1 минуты до приблизительно 24 часов.
Использование терминов в единственном числе и подобных указаний в контексте описания изобретения (особенно в контексте формулы изобретения) должно истолковываться как охватывающее как единственное, так и множественное число, если иное не было указано. Перечисление диапазонов значений в данном документе служит просто как способ сокращения индивидуальных ссылок на каждое отдельное значение, попадающее в диапазон, если не указано иное, и каждое отдельное значение включено в настоящее описание, как если бы оно было индивидуально отмечено здесь. Использование любого и всех примеров или описательного языка (например, «таких как»), представленных в настоящем документе, предназначено для лучшей иллюстрации изобретения и не является ограничением объема изобретения, если не указано иное. Никакая языковая форма в описании не должна толковаться как указание на любой незаявленный элемент как необходимый для применения изобретения.
Термин «приблизительно», как используется в настоящем описании, включает указанное число ±10%. Таким образом, «приблизительно 10» означает от 9 до 11.
В настоящем описании термин «галоген», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к -Cl, -F, -Br или -I.
2
В настоящем описании термин «нитро», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к -NO.
В настоящем описании термин «циано», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к -CN.
В настоящем описании термин «гидрокси», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к -OH.
1-20
1
2
3
1-3
1-10
1-6
1-4
1-10
3-10
1-6
3-6
1-4
3-4
3-4
1-10
1-4
В настоящем описании термин «алкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к незамещенным алифатическим углеводородам с прямой или разветвленной цепью, содержащим от одного до двенадцати атомов углерода, т.е. C алкил, или указанное число атомов углерода, например, C алкил, такой как метил, C алкил, такой как этил, C алкил, такой как пропил или изопропил, C алкил, такой как метил, этил, пропил или изопропил и т.п. В одном варианте осуществления алкил представляет собой C алкил. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил с прямой цепью. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил с разветвленной цепью. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил с прямой цепью. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил с разветвленной цепью. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил с прямой цепью. В другом варианте осуществления алкил представляет собой C алкил с разветвленной цепью. В другом варианте осуществления алкил представляет собой Cалкил с прямой или разветвленной цепью. Неограничивающие примеры C алкильных групп включают метил, этил, пропил, изопропил, бутил, втор-бутил, трет-бутил, изобутил, 3-пентил, гексил, гептил, октил, нонил и децил. Неограничивающие примеры Cалкильных групп включают метил, этил, пропил, изопропил, бутил, втор-бутил, трет-бутил и изобутил.
2
2
2
2
2
2
В настоящем описании термин «гетероалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к незамещенным алифатическим углеводородам с прямой или разветвленной цепью, содержащим от трех до тридцати атомов цепи, т.е. 3-30-членный гетероалкил, или количество указанных атомов цепи, где по меньшей мере один -CH- замещен по меньшей мере одним -O-, -N(H)- или -S-. -O-, -N(H)- или -S- могут независимо находиться в любом внутреннем положении алифатической углеводородной цепи, если каждая -O-, N(H)- или -S- группа разделена по меньшей мере двумя -CH- группами. В одном варианте осуществления одна -CH- группа замещена одной -О- группой. В другом варианте осуществления две -CH- группы замещены двумя -О- группами. В другом варианте осуществления три -CH- группы замещены тремя -O- группами. В другом варианте осуществления четыре -CH- группы замещены четырьмя -O- группами. Неограничивающие примеры гетероалкильных групп включают:
2
3
-CHOCH;
2
2
2
3
-CHOCHCHCH;
2
2
2
3
-CHCHCHOCH;
2
2
2
3
-CHOCHCHOCH; и
2
2
2
2
2
3
-CHOCHCHOCHCHOCH.
1-12
1-10
1-8
1-6
1-4
В настоящем описании термин «алкиленил», используемый в настоящем документе, сам по себе или как часть другой группы, относится к двухвалентной форме алкильной группы. В одном варианте осуществления алкиленил представляет собой двухвалентную форму C алкила. В одном варианте осуществления алкиленил представляет собой двухвалентную форму C алкила. В одном варианте осуществления алкиленил представляет собой двухвалентную форму C алкила. В одном варианте осуществления алкиленил представляет собой двухвалентную форму C алкила. В другом варианте осуществления алкиленил представляет собой двухвалентную форму C алкила. Неограничивающие примеры алкиленильных групп включают:
2
-CH-,
2
2
-CHCH-,
2
2
2
-CHCHCH-,
2
2
2
2
-CH(CH)CH-,
2
3
2
-CH(CH)CH-,
2
2
4
2
-CH(CH)CH-,
2
2
5
2
-CH(CH)CH-,
2
3
2
-CHCH(CH)CH-, и
2
3
2
2
-CHC(CH)CH-.
2
o
2
2
p
2
q
2
r
2
s
2
t
В настоящем описании термин «гетероалкиленил», используемый в настоящем документе, сам по себе или как часть другой группы, относится к двухвалентной форме гетероалкильной группы. В одном варианте осуществления гетероалкиленил представляет собой двухвалентную форму 3-12-членного гетероалкила. В другом варианте осуществления гетероалкиленил представляет собой двухвалентную форму 3-10-членного гетероалкила. В другом варианте осуществления гетероалкиленил представляет собой двухвалентную форму 3-8-членного гетероалкила. В другом варианте осуществления гетероалкиленил представляет собой двухвалентную форму 3-6-членного гетероалкила. В другом варианте осуществления, гетероалкиленил представляет собой двухвалентную форму 3-4-членного гетероалкила. В другом варианте осуществления гетероалкиленил представляет собой радикал формулы: -(CH)O-(CHCHO)-(CH)-, где o имеет значение 2 или 3; p имеет значение 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7; и q имеет значение 2 или 3. В другом варианте осуществления гетероалкиленил представляет собой радикал формулы: -(CH)O-(CH)-O(CH)-, где r имеет значение 2, 3 или 4; s имеет значение 3, 4 или 5; и t имеет значение 2 или 3. Неограничивающие примеры гетероалкиленильных групп включают:
2
2
-CHOCH-;
2
2
2
2
-CHCHOCHCH-;
2
2
2
2
-CHOCHCHCH-;
2
2
2
2
2
-CHCHOCHCHCH-;
2
2
2
2
2
2
-CHCHOCHCHOCHCH-; и
2
2
2
2
2
2
-CHCHOCHCHOCHCHO-.
2
2
2
2
2
3
2
2
2
2
2
2
3
2
2
2
6
11
В настоящем описании термин «необязательно замещенный алкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, означает, что определенный выше алкил является либо незамещенным, либо замещенным одним, двумя или тремя заместителями, независимо выбранными из нитро, галогеналкокси, арилокси, аралкилокси, алкилтио, сульфонамидо, алкилкарбонила, арилкарбонила, алкилсульфонила, арилсульфонила, карбокси, карбоксиалкила, циклоалкила и тому подобное. В одном варианте осуществления необязательно замещенный алкил замещен двумя заместителями. В другом варианте осуществления необязательно замещенный алкил замещен одним заместителем. Неограничивающие примеры необязательно замещенных алкильных групп включают -CHCHNO, -CHSOCH CHCHCOH, -CHCHSOCH, -CHCHCOPh и -CHCH.
3-12
3-8
3-6
В настоящем описании термин «циклоалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к насыщенным и частично ненасыщенным (содержащим одну или две двойных связи) циклическим алифатическим углеводородам, содержащим от одного до трех колец, содержащих от трех до двенадцати атомов углерода (т.е. C циклоалкил) или указанное число атомов углерода. В одном варианте осуществления циклоалкильная группа имеет два кольца. В одном варианте осуществления циклоалкильная группа имеет одно кольцо. В другом варианте осуществления циклоалкильная группа выбрана из C циклоалкильной группы. В другом варианте осуществления циклоалкильная группа выбрана из C циклоалкильной группы. Неограничивающие примеры циклоалкильных групп включают циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, циклогептил, циклооктил, норборнил, декалин, адамантил, циклогексенил и циклопентенил, циклогексенил.
В настоящем описании термин «необязательно замещенный циклоалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, означает, что циклоалкил, как определено выше, является либо незамещенным, либо замещенным одним, двумя или тремя заместителями, независимо выбранными из галогена, нитро, циано, гидрокси, амино, галогеналкила, гидроксиалкила, алкокси, галогеналкокси, арилокси, аралкилокси, алкилтио, карбоксамидо, сульфонамидо, алкилкарбонила, арилкарбонила, алкилсульфонила, арилсульфонила, карбокси, карбоксиалкила, алкила, необязательно замещенного циклоалкила, алкенила, алкинила, необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила, необязательно замещенного гетероцикло, алкоксиалкила, (амино)алкила, (карбоксамидо)алкила, меркаптоалкила и (гетероцикло)алкила. В одном варианте осуществления необязательно замещенный циклоалкил замещен двумя заместителями. В другом варианте осуществления необязательно замещенный циклоалкил замещен одним заместителем.
2-6
2-4
В настоящем описании термин «алкенил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алкильной группе, как определено выше, содержащей одну, две или три углерод-углеродные двойные связи. В одном варианте осуществления алкенильная группа выбрана из C алкенильной группы. В другом варианте осуществления алкенильная группа выбрана из C алкенильной группы. Неограничивающие примеры алкенильных групп включают этенил, пропенил, изопропенил, бутенил, втор-бутенил, пентенил и гексенил.
В настоящем описании термин «необязательно замещенный алкенил», используемый в настоящем документе сам по себе или как часть другой группы, означает, что алкенил, как определено выше, является либо незамещенным, либо замещенным одним, двумя или тремя заместителями, независимо выбранными из галогена, нитро, циано, гидрокси, амино, алкиламино, диалкиламино, галогеналкила, гидроксиалкила, алкокси, галогеналкокси, арилокси, аралкилокси, алкилтио, карбоксамидо, сульфонамидо, алкилкарбонила, арилкарбонила, алкилсульфонила, арилсульфонила, карбокси, карбоксиалкила, алкила, циклоалкила, алкенила, алкинила, арила, гетероарила или гетероцикло.
2-6
2-4
В настоящем описании термин «алкинил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к определенной выше алкильной группе, содержащей от одной до трех углерод-углеродных тройных связей. В одном варианте осуществления алкинил содержит одну углерод-углеродную тройную связь. В одном варианте осуществления алкинильная группа выбрана из C алкинильной группы. В другом варианте осуществления, алкинильная группа выбрана из C алкинильной группы. Неограничивающие примеры алкинильных групп включают этинильную, пропинильную, бутинильную, 2-бутинильную, пентинильную и гексинильную группы.
В настоящем описании термин «необязательно замещенный алкинил», используемый в настоящем документе сам по себе или как часть другой группы, означает, что алкинил, как определено выше, является либо незамещенным, либо замещенным одним, двумя или тремя заместителями, независимо выбранными из галогена, нитро, циано, гидрокси, амино, алкиламино, диалкиламино, галогеналкила, гидроксиалкила, алкокси, галогеналкокси, арилокси, аралкилокси, алкилтио, карбоксамидо, сульфонамидо, алкилкарбонила, арилкарбонила, алкилсульфонила, арилсульфонила, карбокси, карбоксиалкила, алкила, циклоалкила, алкенила, алкинила, арила, гетероарила или гетероцикло.
1-4
В настоящем описании термин «галогеналкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алкильной группе, замещенной одним или несколькими атомами фтора, хлора, брома и/или йода. В одном варианте осуществления алкильная группа замещена одним, двумя или тремя атомами фтора и/или хлора. В другом варианте осуществления галогеналкильная группа выбрана из C галогеналкильной группы. Неограничивающие примеры галогеналкильных групп включают фторметильную, 2-фторэтильную, дифторметильную, трифторметильную, пентафторэтильную, 1,1-дифторэтильную, 2,2-дифторэтильную, 2,2,2-трифторэтильную, 3,3,3-трифторпропильную, 4,4,4-трифторбутильную и трихлорметильную группы.
В настоящем описании термин «гидроксиалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алкильной группе, замещенной одной или несколькими, например, одной, двумя или тремя гидроксигруппами. В одном варианте осуществления гидроксиалкильная группа представляет собой моногидроксиалкильную группу, то есть замещенную одной гидроксигруппой. В другом варианте осуществления гидроксиалкильная группа представляет собой дигидроксиалкильную группу, т.е. замещенную двумя гидроксигруппами, например,
1-4
В другом варианте осуществления гидроксиалкильная группа выбрана из C гидроксиалкильной группы. Неограничивающие примеры гидроксиалкильных групп включают гидроксиметильную, гидроксиэтильную, гидроксипропильную и гидроксибутильную группы, такие как 1-гидроксиэтил, 2-гидроксиэтил, 1,2-дигидроксиэтил, 2-гидроксипропил, 3-гидроксипропил, 3-гидроксибутил, 4-гидроксибутил, 2-гидрокси-1-метилпропил и 1,3-дигидроксипроп-2-ил.
1-4
1-4
В настоящем описании термин «алкокси», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к необязательно замещенному алкилу, необязательно замещенному циклоалкилу, необязательно замещенному алкенилу или необязательно замещенному алкинилу, присоединенному к концевому атому кислорода. В одном варианте осуществления алкоксигруппа выбрана из C алкоксигруппы. В другом варианте осуществления алкоксигруппа выбрана из C алкила, присоединенного к концевому атому кислорода, например, метокси, этокси и трет-бутокси.
1-4
3
2
3
В настоящем описании термин «алкилтио», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к атому серы, замещенному необязательно замещенной алкильной группой. В одном варианте осуществления алкилтиогруппа выбрана из C алкилтиогруппы. Неограничивающие примеры алкилтиогрупп включают -SCH и -SCHCH.
В настоящем описании термин «алкоксиалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алкильной группе, замещенной алкоксигруппой. Неограничивающие примеры алкоксиалкильных групп включают метоксиметил, метоксиэтил, метоксипропил, метоксибутил, этоксиметил, этоксиэтил, этоксипропил, этоксибутил, пропоксиметил, изопропоксиметил, пропоксиэтил, пропоксипропил, бутоксиметил, трет-бутоксиметил, изобутоксиметил, втор-бутоксиметил и пентилоксиметил.
В настоящем описании термин «галогеналкокси», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к галогеналкилу, присоединенному к концевому атому кислорода. Неограничивающие примеры галогеналкоксигрупп включают фторметокси, дифторметокси, трифторметокси и 2,2,2-трифторэтокси.
6
14
В настоящем описании термин «арил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к моноциклической или бициклической ароматической кольцевой системе, содержащей от шести до четырнадцати атомов углерода (то есть C-Cарил). Неограничивающие примеры арильных групп включают фенильную (сокращенный как ʺPhʺ), нафтильную, фенантрильную, антрацильную, инденильную, азуленильную, бифенильную, бифениленильную и флуоренильную группы. В одном варианте осуществления арильная группа выбрана из фенила или нафтила.
В настоящем описании термин «необязательно замещенный арил», как используется в настоящем описании, сам по себе или как часть другой группы, означает, что определенный выше арил является или незамещенным, или замещенным одним-пятью заместителями, независимо выбранными из галогена, нитро, циано, гидрокси, амино, алкиламино, диалкиламино, галогеналкила, гидроксиалкила, алкокси, галогеналкокси, арилокси, аралкилокси, алкилтио, карбоксамидо, сульфонамидо, алкилкарбонила, арилкарбонила, алкилсульфонила, арилсульфонила, карбокси, карбоксиалкила, алкила, необязательно замещенного циклоалкила, алкенила, алкинила, необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила, необязательно замещенного гетероцикло, алкоксиалкила, (амино)алкила, (карбоксамидо)алкила, меркаптоалкила или (гетероцикло)алкила.
В одном варианте осуществления необязательно замещенный арил представляет собой необязательно замещенный фенил. В одном варианте осуществления необязательно замещенный фенил имеет четыре заместителя. В другом варианте осуществления необязательно замещенный фенил имеет три заместителя. В другом варианте осуществления необязательно замещенный фенил имеет два заместителя. В другом варианте осуществления необязательно замещенный фенил имеет один заместитель. Неограничивающие примеры замещенных арильных групп включают 2-метилфенил, 2-метоксифенил, 2-фторфенил, 2-хлорфенил, 2-бромфенил, 3-метилфенил, 3-метоксифенил, 3-фторфенил, 3-хлорфенил, 4-метилфенил, 4-этилфенил, 4-метоксифенил, 4-фторфенил, 4-хлорфенил, 2,6-дифторфенил, 2,6-дихлорфенил, 2-метил, 3-метоксифенил, 2-этил, 3-метоксифенил, 3,4-диметоксифенил, 3,5-дифторфенил 3,5-диметилфенил, 3,5-диметокси, 4-метилфенил, 2-фтор-3-хлорфенил и 3-хлор-4-фторфенил. Термин необязательно замещенный арил означает группы, содержащие конденсированные необязательно замещенные циклоалкильные и конденсированные необязательно замещенные гетероциклические кольца. Неограничивающие примеры включают:
В настоящем описании термин «фениленил», используемый в настоящем документе сам по себе или как часть другой группы, относится к двухвалентной форме необязательно замещенной фенильной группы. Неограничивающие примеры включают:
В настоящем описании термин «арилокси», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к необязательно замещенному арилу, присоединенному к концевому атому кислорода. Неограничивающий пример арилоксигруппы представляет собой PhO-.
2
В настоящем описании термин «аралкилокси», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к аралкильной группе, присоединенной к концевому атому кислорода. Неограничивающей примерной аралкилоксигруппой является PhCHO-.
5
14
В настоящем описании термин «гетероарил» или «гетероароматический» относится к моноциклическим и бициклическим ароматическим кольцевым системам, содержащим 5-14 кольцевых атомов (т.е. C-C гетероарил), где по меньшей мере один атом углерода одного из колец замещен гетероатомом, независимо выбранным из группы, состоящей из кислорода, азота и серы. В одном варианте осуществления гетероарил содержит 1, 2, 3 или 4 гетероатома, независимо выбранных из группы, состоящей из кислорода, азота и серы. В одном варианте осуществления гетероарил имеет три гетероатома. В другом варианте осуществления гетероарил имеет два гетероатома. В другом варианте осуществления гетероарил имеет один гетероатом. Неограничивающие примеры гетероарильных групп включают тиенил, бензо[b]тиенил, нафто[2,3-b]тиенил, тиантренил, фурил, бензофурил, пиранил, изобензофуранил, бензоксазонил, хроменил, ксантенил, 2Н-пирролил, пирролил, имидазолил, пиразолил, пиридил, пиразинил, пиримидинил, пиридазинил, изоиндолил, 3Н-индолил, индолил, индазолил, пуринил, изохинолил, хинолил, фталазинил, нафтиридинил, циннолинил, хиназолинил, птеридинил, 4аН-карбазолил, карбазолил, β-карболинил, фенантридинил, акридинил, пиримидинил, фенантролинил, феназинил, тиазолил, изотиазолил, фенотиазолил, изоксазолил, фуразанил и феноксазинил. В одном варианте осуществления гетероарил выбран из тиенила (например, тиен-2-ил и тиен-3-ил), фурила (например, 2-фурил и 3-фурил), пирролила (например, 1Н-пиррол-2-ил и 1Н-пиррол-3-ил), имидазолила (например, 2Н-имидазол-2-ил и 2Н-имидазол-4-ил), пиразолила (например, 1Н-пиразол-3-ил, 1Н-пиразол-4-ил и 1Н-пиразол-5-ил), пиридила (например, пиридин-2-ил, пиридин-3-ил и пиридин-4-ил), пиримидинила (например, пиримидин-2-ил, пиримидин-4-ил и пиримидин-5-ил), тиазолила (например, тиазол-2-ил, тиазол-4-ил и тиазол-5-ил), изотиазолила (например, изотиазол-3-ил, изотиазол-4-ил и изотиазол-5-ил), оксазолила (например, оксазол-2-ил, оксазол-4-ил и оксазол-5-ил), изоксазолила (например, изоксазол-3-ил, изоксазол-4-ил и изоксазол-5-ил) и индазолила (например, 1Н-индазол-3-ил). Также подразумевается, что термин «гетероарил» включает возможные N-оксиды. Неограничивающим примером N-оксида является пиридил-N-оксид.
В одном варианте осуществления гетероарил представляет собой 5- или 6-членный гетероарил. В одном варианте осуществления гетероарил представляет собой 5-членный гетероарил, т.е. гетероарил представляет собой моноциклическую ароматическую кольцевую систему, содержащую 5 кольцевых атомов, где по меньшей мере один атом углерода кольца замещен гетероатомом, независимо выбранным из азота, кислорода и серы. Неограничивающие примеры 5-членных гетероарильных групп включают тиенил, фурил, пирролил, оксазолил, пиразолил, имидазолил, тиазолил, изотиазолил и изоксазолил.
В другом варианте осуществления гетероарил представляет собой 6-членный гетероарил, например, гетероарил представляет собой моноциклическую ароматическую кольцевую систему, содержащую 6 кольцевых атомов, где по меньшей мере один атом углерода кольца замещен атомом азота. Неограничивающие примеры 6-членных гетероарильных групп включают пиридил, пиразинил, пиримидинил и пиридазинил.
В настоящем описании термин «необязательно замещенный гетероарил», используемый сам по себе или как часть другой группы, означает, что определенный выше гетероарил является либо незамещенным, либо замещенным одним-четырьмя заместителями, например, одним или двумя заместителями, независимо выбранными из галогена, нитро, циано, гидрокси, амино, алкиламино, диалкиламино, галогеналкила, гидроксиалкила, алкокси, галогеналкокси, арилокси, аралкилокси, алкилтио, карбоксамидо, сульфонамидо, алкилкарбонила, арилкарбонила, алкилсульфонила, арилсульфонила, карбокси, карбоксиалкила, алкила, необязательно замещенного циклоалкила, алкенила, алкинила, необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила, необязательно замещенного гетероцикло, алкоксиалкила, (амино)алкила, (карбоксамидо)алкила, меркаптоалкила или (гетероцикло)алкила. В одном варианте осуществления необязательно замещенный гетероарил имеет один заместитель. Любой доступный атом углерода или азота может быть замещен. Неограничивающие примеры необязательно замещенных 5-членных гетероарильных групп включают, но не ограничиваются ими:
и .
Термин необязательно замещенный гетероарил также означает группы, содержащие конденсированные необязательно замещенные циклоалкильные и конденсированные необязательно замещенные гетероциклические кольца. Неограничивающие примеры включают:
В настоящем описании термин «гетероариленил», используемый в настоящем документе сам по себе или как часть другой группы, относится к двухвалентной форме необязательно замещенной гетероарильной группы. В одном варианте осуществления гетероариленил представляет собой 5-членный гетероариленил. Неограничивающие примеры 5-членного гетероариленила включают:
В одном варианте осуществления гетероариленил представляет собой 6-членный гетероариленил. Неограничивающие примеры 6-членного гетероариленила включают:
2
В настоящем описании термин «гетероцикл» или «гетероцикло», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к насыщенным и частично ненасыщенным (например, содержащим одну или две двойные связи) циклическим группам, содержащим один, два или три кольца, содержащих от трех до четырнадцати членов кольца (т.е. 3-14-членный гетероцикло), где по меньшей мере один атом углерода одного из колец замещен гетероатомом. Каждый гетероатом независимо выбран из группы, состоящей из атомов кислорода, серы, включая сульфоксид и сульфон, и/или азота, которые могут быть окислены или кватернизованы. Термин «гетероцикло» означает группы, где кольцо -CH- замещено -C(=O)-, например, циклические уреидогруппы, такие как 2-имидазолидинон, и циклические амиды, такие как β-лактам, γ-лактам, δ-лактам, ε-лактам и пиперазин-2-он. Термин «гетероцикло» также означает группы, содержащие конденсированные необязательно замещенные арильные группы, например, индолинил, хроман-4-ил. В одном варианте осуществления гетероциклогруппа выбрана из 5- или 6-членной циклической группы, содержащей одно кольцо и один или два атома кислорода и/или азота. Гетероцикло может быть необязательно связан с оставшейся частью молекулы через любой доступный атом углерода или азота. Неограничивающие примеры гетероциклогрупп включают диоксанил, тетрагидропиранил, 2-оксопирролидин-3-ил, пиперазин-2-он, пиперазин-2,6-дион, 2-имидазолидинон, пиперидинил, морфолинил, пиперазинил, пирролидинил и индолинил.
3
В настоящем описании термин «необязательно замещенный гетероцикло», используемый в настоящем описании сам по себе или как часть другой группы, означает, что определенный выше гетероцикло является либо незамещенным, либо замещенным одним-четырьмя заместителями, независимо выбранными из галогена, нитро, циано, гидрокси, амино, алкиламино, диалкиламино, галогеналкила, гидроксиалкила, алкокси, галогеналкокси, арилокси, аралкилокси, алкилтио, карбоксамидо, сульфонамидо, алкилкарбонила, алкоксикарбонила, CFC(=O)-, арилкарбонила, алкилсульфонила, арилсульфонила, карбокси, карбоксиалкила, алкила, необязательно замещенного циклоалкила, алкенила, алкинила, необязательно замещенного арила, необязательно замещенного гетероарила, необязательно замещенного гетероцикло, алкоксиалкила, (амино)алкила, (карбоксамидо)алкила, меркаптоалкила или (гетероцикло)алкила. Замещение может происходить на любом доступном атоме углерода или азота, или на обоих. Неограничивающие примеры необязательно замещенных гетероциклогрупп включают:
10a
10b
10a
10b
10a
10b
2
3
В настоящем описании термин «амино», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к -NRR, где R и R, каждый независимо, представляют собой водород, алкил, гидроксиалкил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероцикло или необязательно замещенный гетероарил, или R и R взяты вместе с образованием 3-8-членного необязательно замещенного гетероцикло. Неограничивающие примеры аминогрупп включают -NH и -N(H)(CH).
2
2
2
2
2
3
2
2
3
2
2
В настоящем описании термин «(амино)алкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к алкильной группе, замещенной аминогруппой. Неограничивающие примеры аминоалкильных групп включают -CHCHNH и -CHCHN(H)CH, -CHCHN(CH) и -CHN(H)циклопропил.
9a
9b
9a
9b
9a
9b
9a
9b
9a
9b
2
3
3
2
В настоящем описании термин «карбоксамидо», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к радикалу формулы -C(=O)NRR, где R и R каждый независимо представляют собой водород, необязательно замещенный алкил, гидроксиалкил, необязательно замещенный циклоалкил, необязательно замещенный арил, необязательно замещенный гетероцикло или необязательно замещенный гетероарил, или R и R, взятые вместе с азотом, к которому они присоединены, образуют 3-8-членную необязательно замещенную гетероциклогруппу. В одном варианте осуществления R и R, каждый независимо, представляют собой водород или необязательно замещенный алкил. В одном варианте осуществления R и R взяты вместе, взятые вместе с азотом, к которому они присоединены, образуют 3-8-членную необязательно замещенную гетероциклогруппу. Неограничивающие примеры карбоксамидогрупп включают, но не ограничиваются ими, -CONH, -CON(H)CH, -CON(CH), -CON(H)Ph,
2
2
2
2
3
2
8a
8b
8a
8b
8a
8b
В настоящем описании термин «сульфонамидо», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к радикалу формулы -SONRR, где R и R, каждый независимо представляют собой водород, необязательно замещенный алкил или необязательно замещенный арил, или R и R, взятые вместе с азотом, к которому они присоединены, образуют 3-8-членную гетероциклогруппу. Неограничивающие примеры сульфонамидогрупп включают -SONH, -SON(H)CH и -SON(H)Ph.
3
В настоящем описании термин «алкилкарбонил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к карбонильной группе, т.е. -C(=O)-, замещенной алкильной группой. Неограничивающим примером алкилкарбонильной группы является -COCH.
В настоящем описании термин «арилкарбонил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к карбонильной группе, т.е. -C(=O)-, замещенной необязательно замещенной арильной группой. Неограничивающим примером арилкарбонильной группы является -COPh.
В настоящем описании термин «алкоксикарбонил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к карбонильной группе, т.е. -C(=O)-, замещенной алкоксигруппой. Неограничивающие примеры алкоксикарбонильных групп включают -C(=O)OMe, -C(=O)OEt и -C(=O)OtBu.
2
2
3
В настоящем описании термин «алкилсульфонил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к сульфонильной группе, т.е. -SO-, замещенной любой из вышеупомянутых необязательно замещенных алкильных групп. Неограничивающим примером алкилсульфонильной группы является -SOCH.
2
2
В настоящем описании термин «арилсульфонил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к сульфонильной группе, т.е. -SO-, замещенной любой из вышеупомянутых необязательно замещенных арильных групп. Неограничивающим примером арилсульфонильной группы является -SOPh.
В настоящем описании термин «меркаптоалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к любой из вышеуказанных алкильных групп, замещенных группой -SH
В настоящем описании термин «меркаптоалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к любой из вышеуказанных алкильных групп, замещенных группой -SH.
В настоящем описании термин «карбокси», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к радикалу формулы -COOH.
2
2
В настоящем описании термин «карбоксиалкил», используемый сам по себе или как часть другой группы, относится к любой из вышеуказанных алкильных групп, замещенных -СООН. Неограничивающим примером карбоксиалкильной группы является -CHCOH.
1-4
1
2
1
2
2
2
2
2
3
2
В настоящем описании термины «аралкил» или «арилалкил», используемые сами по себе или как часть другой группы, относятся к алкильной группе, замещенной одной, двумя или тремя необязательно замещенными арильными группами. В одном варианте осуществления необязательно замещенная аралкильная группа представляет собой C алкил, замещенный одной необязательно замещенной арильной группой. В одном варианте осуществления необязательно замещенная аралкильная группа представляет собой C или C алкил, замещенный одной необязательно замещенной арильной группой. В одном варианте осуществления необязательно замещенная аралкильная группа представляет собой C или C алкил, замещенный одной необязательно замещенной фенильной группой. Неограничивающие примеры необязательно замещенных аралкильных групп включают бензил, фенетил, -CHPh, -CH(4-F-Ph), -CH(4-Me-Ph), -CH(4-CF-Ph) и -CH(4-F-Ph).
1-4
В настоящем описании термины «(гетероцикло)алкил», используемые сами по себе или часть другой группы, относятся к алкильной группе, замещенной необязательно замещенной гетероциклогруппой. В одном варианте осуществления (гетероцикло)алкил представляет собой C алкил, замещенный одной необязательно замещенной гетероциклогруппой. Неограничивающие примеры (гетероцикло)алкильных групп включают:
.
Общий синтез соединений
См.
Соединения изобретения получали с использованием способов, известных специалистам в данной области с учетом данного раскрытия, или с помощью иллюстративнымх способов, показанных на общих схемах ниже. В любой из общих схем, при синтезе при необходимости можно использовать подходящую защиту.  Wuts, P. G. M.; Greene, T. W., "Greene's Protective Groups in Organic Synthesis", 4th Ed., J. Wiley & Sons, NY, 2007.
Общая схема 1
7b
XV,
I
См.
Tetrahedron 61
На общей схеме 1 соединение, имеющее формулу XIV, где R обозначает водород, подвергают взаимодействию с соединением, имеющим формулу  в органическом растворителе с получением соединения, имеющего формулу , где X представляет собой -C(=O)N(H)-. Соединения, имеющие формулу XIV, могут быть получены, как описано в US 2014/0256706 и US 2015/0246923. Соединения, имеющие формулу ХV, могут быть получены с использованием способов, известных в данной области, и/или, как показано в примерах ниже. Подходящие реагенты для сочетания амин-амид и условия, например, HATU/основание, HBTU/основание или EDCI/HOBt/основание, хорошо известны в данной области.  Montalbetti and Falque, :10827-10852 (2005).
Общая схема 2
,
,
7b
На общей схеме 2 соединение, имеющее формулу XIVгде R представляет собой водород, подвергают взаимодействию с соединением, имеющим формулу XVI в органическом растворителе с получением соединения, имеющего формулу II, где X представляет собой -C(=O)N(H)-.
Общая схема 3
,
,
7b
На общей схеме 3 соединение, имеющее формулу XIVгде R представляет собой водород, подвергают взаимодействию с соединением, имеющим формулу XVII в органическом растворителе с получением соединения, имеющего формулу III, где X представляет собой -C(=O)N(H)-.
Примеры
Пример 1
Синтез Соед. No. 1
Общая схема получения этил 2-амино-6-(3,5-диметилизоксазол-4-ил)-5-метокси-1H-индол-3-карбоксилата (K6)
Стадия 1: Синтез K4
см.
J. Med. Chem. 55
2
4
3
1
K3 (2,26 г, 20 ммоль) растворяли в безводном DMF (50 мл) и раствор охлаждали до 0°C. NaH (1,2 г, 60% в минеральном масле, 30 ммоль) добавляли небольшими порциями. Полученную реакционную смесь перемешивали в течение 0,5 ч при 0°C и добавляли безводный раствор DMF известных соединений K1 и K2 (20 ммоль, :449-464 (2012). Полученный раствор перемешивали при 0°C в течение 3 часов перед гашением 1 н HCl. Водный слой экстрагировали этилацетатом и объединенные органические слои промывали насыщенным солевым раствором и сушили над безводным NaSO. Летучие компоненты удаляли на роторном испарителе и остаток очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии. Целевой продукт K4 выделяли в виде бесцветного масла с примесью другого региоизомера (4,17 г, 61% выход). H ЯМР (300 МГц, CDCl): 8,41 (с, 1H), 7,11 (с, 1H), 5,60 (с, 1H), 4,24 (кв, J=7,03 Гц, 2H), 4,01 (с, 3H), 1,25 (т, J=7,14 Гц, 3H).
Стадия 2: Синтез K5
2
3
3
4
2
4
3
1
J
J
K4 (1,43 г, 4,2 ммоль), 3,5-диметил-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)изоксазол (2,34 г, 10,5 ммоль) и KCO (2,03 г, 14,7 ммоль) добавляли в круглодонную колбу. Добавляли DME (30 мл) и воду (15 мл) при комнатной температуре. Раствор дегазировали, затем добавляли Pd(PPh) (242 мг, 0,21 ммоль) одной порцией. Раствор снова дегазировали, затем нагревали с обратным холодильником в течение 14 ч. Водный слой экстрагировали этилацетатом, объединенные органические слои промывали насыщенным солевым раствором, затем сушили над безводным NaSO. Летучие компоненты удаляли на роторном испарителе и остаток очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии. Целевой продукт K5 выделяли при > 80% выход (1,47 г, загрязненый изомерами и компонентами пинакола).H ЯМР (CDCl, 300 МГц): 8,10 (с, 1H), 7,27 (с, 1H), 5,78 (с, 1H), 4,35 (кв, =7,12 Гц, 2H), 3,99 (с, 3H), 2,33 (с, 3H), 2,18 (с, 3H), 1,37 (т, =7,14 Гц, 3H).
Стадия 3: Синтез K6
1
+
3
17
20
3
4
J
J
К AcOH (30 мл) раствору K5 (1,47 г) при 80°C, 0,8 г порошка Zn добавляли небольшими порциями. Смесь перемешивали при 80°C в течение 1 ч, добавляли еще 0,8 г порошка Zn, и реакцию выдерживали при той же температуре в течение 2 ч. Реакционную смесь охлаждали, фильтровали и промывали AcOH. Раствор AcOH объединяли и летучие компоненты удаляли на роторном испарителе. Очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии, получая желаемый продукт K6 (0,55 г, ca, 40% выход). H ЯМР (CDCl, 300 МГц): 8,01 (шир. с, 1H), 7,44 (с, 1H), 6,78 (с, 1H), 5,73 (шир. с, 2H), 4,40 (кв, =7,08 Гц, 2H), 3,82 (с, 3H), 2,29 (с, 3H), 2,15 (с, 3H), 1,45 (т, =7,08 Гц, 3H). ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]: 330,15, Найдено: 330,25.
Стадия 4: Синтез ZBA89
17
15
4
5
+=
В круглодонную колбу, K6 (0,37 г, 1,1 ммоль) и этилцианоформиат (3 мл) добавляли при комнатной температуре. Добавляли раствор хлорида водорода в диоксане и реакционную смесь нагревали до кипения с обратным холодильником (82°C) в течение 2,5 ч. Затем реакционную смесь охлаждали до комнатной температуры и летучие компоненты удаляли на роторном испарителе. К этой неочищенной смеси добавляли 10% водный раствор NaOH (20 мл) и EtOH (50 мл) и раствор нагревали с обратным холодильником в течение 6 часов. Затем летучие компоненты удаляли на роторном испарителе и водный остаток подкисляли водным раствором 2н HCl. Продукт ZBA89 оставляли осаждаться при 0°C. Фильтрация смеси давала чистый ZBA89 в виде твердого вещества в 0,31 г (80% выход, 2 стадии). ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]355,10, Найдено: 355,45.
Стадия 5: Синтез ZBA97
1
4
В круглодонной колбе, EDCI (0,7g) и DMAP (0,1 г) добавляли к раствору ZBA89 (0,2 г) в MeOH (100 мл) и DCM (30 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 2 дней и летучие компоненты удаляли на роторном испарителе. Затем добавляли этилацетат (40 мл). Продукт ZBA97 оставляли осаждаться. Фильтрация смеси давала чистый ZBA97 в виде твердого вещества в 0,12 г (60% выход). H ЯМР (300 МГц, MeOD-d) δ 7,86 (с, 1H), 7,39 (с, 1H), 4,07 (с, 3H), 3,93 (с, 3H), 2,34 (с, 3H), 2,17 (с, 3H).
Стадия 6: Синтез ZBA104
3
3
4
1
В круглодонную колбу, добавляли ZBA97 (0,278 г) и POCl (8 мл). Смесь нагревали при 90°C в течение 6 ч. Реакционную смесь охлаждали до комнатной температуры и летучие компоненты удаляли на роторном испарителе. Добавляли воду (20 мл) и этилацетат (20 мл) и рН доводили до 8, используя насыщенный водный раствор NaHCO. Фильтрование смеси давало ZBA104 в виде коричневого твердого вещества в 0,208 г.H ЯМР (300 МГц, MeOD-d) δ 8,02 (с, 1H), 7,55 (с, 1H), 4,07 (с, 3H), 3,99 (с, 3H), 2,37 (с, 3H), 2,20 (с, 3H).
Стадия 7: Синтез Соед. No. 138
2
3
3
4
2
3
2
25
26
7
4
+
Pd(dba) (18 мг) и BINAP (26 мг) смешивали в безводном толуоле. И смесь кипятили с обратным холодильником в течение 3-4 минут. Эту смесь переносили в круглодонную колбу, содержащую ZBA104 (60 мг), 3-циклопропил-1-этил-1H-пиразол-5-амин (84 мг), KPO (130 мг) и толуол (2 мл). Смесь кипятили с обратным холодильником в течение ночи перед гашением метанолом. Затем добавляли MeOH(4 мл), HO (4 мл) и LiOH (10 мг) и реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 часов. Затем реакционную смесь подкисляли водным раствором 2 н. HCl и очищали с помощью ВЭЖХ с получением Соед. No. 138 в виде CFCOH соли в 10 мг. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=488,20; Найдено: 488,4.
Стадия 8: Синтез S1
1
d
J
J
J
J
J
6
В круглодонной колбе, 3-гидроксифталиевый ангидрид (1 г, 6,09 ммоль) и 3-аминоперидин-2,6-дион гидрохлорид (1,0 г, 6,09 ммоль) смешивали в 50 мл толуола. Добавляли триэтиламин (0,93 мл, 6,7 ммоль). Полученную реакционную смесь нагревали до кипения с обратным холодильником в течение 12 ч с насадкой Дина-Старка. После охлаждения до температуры окружающей среды, выпаривание большей части растворителя с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с DCM:EA с получением желаемого продукта в виде слегка желтого твердого вещества S1 (1,5 г, 90% выход). H ЯМР (400 МГц, DMSO-) δ (ppm) 11,16 (с, 1H), 11,08 (с, 1H), 7,65 (т, =7,6 Гц, 1H), 7,32 (д, =7,2 Гц, 1H), 7,25 (д, =8,4 Гц, 1H), 5,07 (дд, =12,8 Гц, =5,2 Гц, 1H), 2,93-2,84 (м, 1H), 2,61-2,46 (м, 1H), 2,05-2,01 (м, 1H).
Стадия 9: Синтез S2
3
2
4
6
6
1
13
d
J
J
J
J
J
d
В круглодонной колбе, S1 (1,5 г, 5,5 ммоль) растворяли в 10 мл DMF. К перемешиваемому раствору, добавляли KI (91 мг, 0,55 ммоль) и KHCO (826 мг, 8,25 ммоль). Затем трет-бутил бромацетат (0,98 мл, 6,6 ммоль) добавляли по каплям. Полученную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 12 ч. После нормальной обработки EtOAc и насыщенным солевым раствором, объединенный органический слой сушили над NaSO. После фильтрования и выпаривания, остаток очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с DCM:EA с получением желаемого продукта S2 в виде белого твердого вещества (1,7 г, 80% выход). H ЯМР (400 МГц, DMSO-) δ (ppm) 11,13 (с, 1H), 7,80 (т, =8,0 Гц, 1H), 7,48 (д, =7,2 Гц, 1H), 7,38 (д, =8,4 Гц, 1H), 5,13 (дд, =12,8 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,97 (с, 2H), 2,97-2,85 (м, 1H), 2,65-2,52 (м, 2H), 2,14-2,03 (м, 1H), 1,43 (с, 9H);C ЯМР (100 МГц, DMSO-) δ (ppm) 173,2, 170,3, 167,5, 167,2, 165,6, 155,5, 137,2, 133,7, 120,4, 116,9, 116,3, 66,0, 60,2, 49,3, 31,4, 28,1, 22,5.
Стадия 10: Синтез S3
15
13
2
7
6
+
1
d
J
J
J
J
J
В круглодонной колбе, S2 (1,7 г, 4,4 ммоль) растворяли в 8,0 мл TFA. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. После выпаривания растворителя остаток использовали на следующих стадиях без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=333,07, найдено: 333,17. H ЯМР (400 МГц, DMSO-) δ (ppm) 13,16 (с, 1H), 11,11 (с, 1H), 7,80 (т, =8,0 Гц, 1H), 7,48 (д, =7,2 Гц, 1H), 7,40 (д, =8,8 Гц, 1H), 5,11 (дд, =12,8 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,99 (с, 2H), 2,95-2,86 (м, 1H), 2,63-2,48 (м, 2H), 2,08-2,03 (м, 1H).
Стадия 11: Синтез S4
В круглодонной колбе, S3 (99,7 мг, 0,3 ммоль) растворяли в 2 мл безводного DMF. N-Boc-1,4-бутандиамин (68 мг, 0,36 ммоль), HATU (137 мг, 0,36 ммоль) и DIPEA (157 мк л, 0,9 ммоль) добавляли последовательно. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч, и затем очищали с помощью ВЭЖХ с получением желаемого соединения S4 в виде слегка желтого твердого вещества (128 мг, 85% выход).
Стадия 12: Синтез S5
19
23
4
6
+
В круглодонной колбе, S4 (15,1 мг, 0,03 ммоль) растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 ч, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта S5, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=403,16, найдено: 403,17.
Стадия 13: Синтез Соед. No. 1
3
2
44
46
11
9
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг) и S5 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением Соед. No. 1 в виде CFCOH соли в 10 мг. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=872,3; Найдено: 872,5.
Пример 2
Синтез Соед. No. 2
Стадия 1: Синтез S7
В круглодонной колбе, S3 (99,7 мг, 0,3 ммоль) растворяли в 2 мл безводного DMF. Трет-бутил (3-(2-(2-(3-аминопропокси)этокси)этокси)пропил)карбамат (68 мг, 0,36 ммоль), HATU (137 мг, 0,36 ммоль) и DIPEA (157 мкл, 0,9 ммоль) добавляли последовательно. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч, и затем очищали с помощью ВЭЖХ с получением желаемого соединения S7 в виде слегка желтого твердого вещества (128 мг, 85% выход).
Стадия 2: Синтез Соед. No. 74
25
35
4
9
+
В круглодонной колбе, S7 (15 мг) растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 ч, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 74, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=535,24, найдено: 535,14.
Стадия 3: Синтез Соед. No. 2
3
2
50
58
11
12
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 74 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением Соед. No. 2 в виде CFCOH соли в 11 мг. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=1004,4; Найдено: 1004,6.
Пример 3
Синтез Соед. No. 3
Стадия 1: Синтез S16
3
2
4
В круглодонной колбе, 3-нитрофталевый ангидрид (5,79 г, 30 ммоль) и п-толуолсульфоновая кислота моногидрат (571 мг, 3 ммоль) смешивали в 20 мл бензилового спирта. Смесь нагревали до 100°C с перемешиванием в течение ночи. После охлаждения до комнатной температуры, добавляли бензил бромид (7,1 мл, 45 ммоль), KI (498 мг, 3 ммоль), KHCO (9,0 г, 90 ммоль) и DMF (25 мл). Смесь нагревали до 100°C в течение 6 ч. Затем реакционную смесь охлаждали до комнатной температуры, растворитель выпаривали как можно больше и выливали в большее количество воды. Раствор экстрагировали этилацетатом. Объединенный органический слой промывали насыщенным солевым раствором и сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с гексаном/этилацетатом с получением S16 в виде слегка желтого твердого вещества (9,4 г, 80% выход).
Стадия 2: Синтез S17
3
2
4
В круглодонной колбе, соединение S16 (9,4 г, 24 ммоль) растворяли в 100 мл этилацетата. Затем олова(II) хлорид дигидрат (11,3 г, 50 ммоль) добавляли частями к реакционной смеси. Полученную реакционную смесь нагревали до 50°C, перемешивая в течение ночи. К реакционной смеси добавляли водный раствор NaOH и NaHCO для гашения реакции. Реакционную смесь фильтровали через целит и промывали этилацетатом. Фильтрат экстрагировали этилацетатом и насыщенным солевым раствором. Объединенный органический слой сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с гексаном/этилацетатом с получением соединения S17 в виде слегка желтого твердого вещества (7,8 г, 90% выход).
Стадия 3: Синтез S18
В круглодонной колбе, соединение S17 (2,0 г, 5,54 ммоль) и KI (100 мг, 0,56 ммоль) добавляли к 10 мл безводного DMF. Трет-бутил бромацетат (2,4 мл, 16,6 ммоль) и DIPEA (4,8 мл, 27,7 ммоль) добавляли к реакционной смеси. Реакционную смесь нагревали до 90°C с перемешиванием в течение ночи. После охлаждения до комнатной температуры, большую часть растворителя выпаривали и остаток очищали с помощью колоночной хроматографии с гексаном/этилацетатом с получением соединения S18 в виде слегка желтого твердого вещества (1,05 г, 40% выход).
Стадия 4: Синтез S19
2
2
4
В круглодонной колбе, соединение S18 (1,0 г, 2,1 ммоль) растворяли в 20 мл метанола. Добавляли 100 мг Pd/C (10% масс.). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в 1 атм в атмосфере H. Как только исходное вещество исчезло в соответствии с TLC, смесь фильтровали через целит и промывали метанолом. После выпаривания растворителя, добавляли 3-аминопиперидин-2,6-дион гидрохлорид (380 мг, 2,31 ммоль) и 20 мл пиридина. Реакционную смесь нагревали до 110°C с перемешиванием в течение ночи. После охлаждения до комнатной температуры, растворитель выпаривали как можно больше и остаток выливали в воду. После экстракции этилацетатом трижды, объединенный органический слой промывали насыщенным солевым раствором и сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с DCM/этилацетатом с получением соединения S19 в виде желтого твердого вещества (325 мг, 40% выход).
Стадия 5: Синтез S20
1
13
d
J
J
J
J
J
J
J
d
6
6
В круглодонной колбе, S19 (1,7 г) растворяли в 8,0 мл TFA. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. После выпаривания растворителя остаток использовали на следующих стадиях без дополнительной очистки. H ЯМР (400 МГц, DMSO-) δ (ppm) 12,91 (с, 1H), 11,10 (с, 1H), 7,59 (т, =8,0 Гц, 1H), 7,08 (д, =6,80 Гц, 1H), 6,99 (д, =8,4 Гц, 1H), 6,86 (т, =5,6 Гц, 1H), 5,08 (дд, =13,2 Гц, =5,6 Гц, 1H), 4,12 (д, =5,2 Гц, 2H), 2,94-2,85 (м, 1H), 2,63-2,49 (м, 2H), 2,09-2,07 (м, 1H); C ЯМР (100 МГц, DMSO-) δ (ppm) 173,3, 171,9, 170,5, 169,3, 167,8, 146,3, 136,6, 132,5, 118,2, 111,5, 110,1, 60,2, 49,1, 31,5, 22,6.
Стадия 6: Синтез S21
30
43
5
10
+
Следуя процедуре синтеза S4, соединение S21 синтезировали с S20 (99,7 мг, 0,3 ммоль), амином (115 мг, 0,36 ммоль), HATU (137 мг, 0,36 ммоль) и DIPEA (157 мк л, 0,9 ммоль). ESI-MS рассчитано для CHNNaO [M+Na]=656,29, найдено: 656,26.
Стадия 7: Синтез Соед. No. 75
В круглодонной колбе, S21 (15,1 мг) растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 75, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
Стадия 8: Синтез Соед. No. 3
3
2
50
59
12
11
+
1
J
J
J
J
J
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 75 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением Соед. No. 3 в виде CFCOH соли в 14 мг. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=1003,4; Найдено: 1003,5. H ЯМР (400 МГц, MeOD) δ 7,51 (с, 1H), 7,44 (т, =7,7 Гц, 1H), 7,26 (с, 1H), 6,95 (д, =7,0 Гц, 1H), 6,76 (д, =8,5 Гц, 1H), 6,11 (с, 1H), 5,00 (дд, =12,7, 5,3 Гц, 1H), 4,25-4,14 (м, 2H), 3,92 (с, 2H), 3,87 (с, 3H), 3,69-3,40 (м, 16H), 2,91-2,58 (м, 3H), 2,35 (с, 3H), 2,19 (с, 3H), 2,12-1,96 (м, 2H), 1,97-1,86 (м, 2H), 1,76-1,65 (м, 2H), 1,47 (т, =7,1 Гц, 3H), 1,08-1,01 (м, 2H), 0,84-0,74 (м, 2H).
Пример 4
Синтез Соед. No. 4
Стадия 1: Синтез S13
13
10
2
4
6
+
1
d
J
J
В круглодонной колбе, 3-фторфталевый ангидрид (6,64 г, 40 ммоль), 3-аминопиперидин-2,6-дион гидрохлорид (6,58 г, 40 ммоль) и ацетат натрия (3,94 г, 48 ммоль) смешивали в 120 мл уксусной кислоты. Полученную реакционную смесь кипятили с обратным холодильником при 140°C в течение 12 ч. После охлаждения до комнатной температуры, большую часть уксусной кислоты выпаривали и остаток очищали колоночной флэш-хроматографией с DCM/MeOH с получением S13 в виде слегка желтого твердого вещества (9,7 г, 88% выход). ESI-MS рассчитано для CHFNO [M+H]=277,06, найдено: 277,02.H ЯМР (400 МГц, DMSO-) δ (ppm) 11,15 (с, 1H), 7,98-7,93 (м, 1H), 7,80-7,72 (м, 2H), 5,17 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 2,95-2,86 (м, 1H), 2,64-2,47 (м, 2H), 2,10-2,06 (м, 1H);
Стадия 2: Синтез S14
2
4
2
28
41
4
9
+
В круглодонной колбе, S13 (276 мг, 1,0 ммоль) растворяли в 3,0 мл безводного DMF. Добавляли амин (320 мг, 1,0 ммоль) и DIPEA (259 мг, 2,0 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 90°C в течение 12 ч. Смесь охлаждали до комнатной температуры, выливали в воду и дважды экстрагировали этилацетатом. Объединенный органический слой промывали насыщенным солевым раствором, сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток очищали с помощью ВЭЖХ с HO/MeCN с получением соединения S14 в виде бесцветного масла (172 мг, 30% выход). ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=577,2; Найдено: 577,3.
Стадия 3: Синтез Соед. No. 76
В круглодонной колбе, S14 (15 мг) растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 76, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки.
Стадия 4: Синтез Соед. No. 4
3
2
48
56
11
10
+
1
J
J
J
J
J
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг) и Соед. No. 76 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 14 мг Соед. No. 4 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=946,4; Найдено: 946,5. H ЯМР (400 МГц, MeOD) δ 7,55 (с, 1H), 7,39-7,30 (м, 2H), 6,86 (д, =8,6 Гц, 1H), 6,80 (д, =7,0 Гц, 1H), 6,20 (с, 1H), 4,97 (дд, =11,7, 4,4 Гц, 1H), 4,23 (кв, =7,1 Гц, 2H), 3,88 (с, 3H), 3,71-3,48 (м, 16H), 2,86-2,57 (м, 3H), 2,36 (с, 3H), 2,19 (с, 3H), 2,08-1,99 (м, 2H), 1,95-1,86 (м, 2H), 1,83-1,74 (м, 2H), 1,48 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,12-1,04 (м, 2H), 0,87-0,80 (м, 2H).
Пример 5
Синтез Соед. No.5
Стадия 1: Синтез S9
1
+
3
13
27
6
В круглодонной колбе, 2-(2-(2-(2-аминоэтокси)этокси)этокси)этанол (2,9 г, 15 ммоль) разбавляли в 10 мл этанола. Ди-трет-бутил дикарбонат (3,6 г, 16,5 ммоль) растворяли в 10 мл этанола и раствор добавляли по каплям в течение 10 мин. Полученную реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 ч. После выпаривания растворителя остаток очищали с помощью колоночной хроматографии с DCM/MeOH с получением S9 в виде бесцветного масла (3,69 г, 80% выход).H ЯМР (400 МГц, CDCl) δ (ppm) 5,49 (с, 1H), 3,46-3,25 (м, 14H), 3,02 (с, 2H), 1,18 (с, 9H); ESI-MS рассчитано для CHNNaO [M+Na]=316,17, найдено: 316,18.
Стадия 2: Синтез S10
3
2
4
3
20
33
8
1
+
J
J
В круглодонной колбе, S9 (3,69 г, 12 ммоль) разбавляли в 100 мл DCM. После охлаждения до 0°C, 4-толуолсульфонилхлорид (2,75 г, 14,4 ммоль) и триэтиламин (2,51 мл, 18 ммоль) добавляли последовательно. Полученную реакционную смесь перемешивали при 0°C в течение 30 мин и затем при комнатной температуре в течение 2 ч. После обработки с DCM и насыщенным раствором NaHCO, объединенный органический слой сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания остаток очищали с помощью колоночной хроматографии смесью гексан:этилацетат с получением S10 в виде бесцветного масла (4,98 г, 90% выход).H ЯМР (400 МГц, CDCl) δ (ppm) 7,76 (д, =8,4 Гц, 2H), 7,31 (д, =8,4 Гц, 2H), 4,12 (м, 2H), 3,67-3,47 (м, 12H), 3,25-3,23 (м, 2H), 2,40 (с, 3H), 1,39 (с, 9H); ESI-MS рассчитано для CHNNaOS [M+Na]=470,18, найдено: 470,20.
Стадия 3: Синтез S11
3
25
36
3
10
+
В круглодонной колбе, S1 (274 мг, 1,0 ммоль) и S10 (492 мг, 1,1 ммоль) смешивали в 5,0 мл безводного DMF. KI (17 мг, 0,1 ммоль) и KHCO (150 мг, 1,5 ммоль) добавляли последовательно. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 12 ч. После выпаривания большей части растворителя, остаток очищали с помощью колоночной хроматографии с DCM/MeOH с получением S11 в виде бесцветного масла (453 мг, 82% выход). ESI-MS рассчитано для CHNONa [M+Na]=572,22, найдено: 572,13.
Стадия 4: Синтез Соед. No. 77
21
28
3
8
+
В круглодонной колбе, S11 (15 мг) растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 77, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+Na]=450,19, найдено: 450,20.
Стадия 5: Синтез Соед. No. 5
3
2
46
51
10
11
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 77 (40 мг) в DMF (1-мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением Соед. No. 5 в виде CFCOH соли в 14 мг. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=919,3; Найдено: 919,5.
Пример 6
Синтез Соед. No. 6
Стадия 1: Синтез S23
3
3
13
12
2
3
+
В круглодонной колбе, метил 3-бром-2-(бромметил)бензоат (50 мг) и EtN (60 мг) добавляли к раствору 3-аминопиперидин-2,6-диона (30 мг) в CHCN (5 мл). Смесь перемешивали в течение 10 часов при 60°C и очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением S23 в 30 мг. ESI-MS рассчитано для CHBrNO [M+H]=323,0; Найдено: 323,2.
Стадия 2: Синтез S24
3
2
2
3
23
28
3
5
+
В круглодонной колбе, S23 (50 мг) и трет-бутил пент-4-ин-1-илкарбамат (50 мг) добавляли к раствору CuI (6,3 мг) и Pd(PPh)Cl (11 мг) в THF (5 мл) и EtN (2 мл). Смесь перемешивали в течение 10 часов при 70°C в атмосфере Ar и очищали непосредственно с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением S24 в 20 мг. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=426,2; Найдено: 426,4.
Стадия 3: Синтез Соед. No. 78
2
.
18
24
3
3
+
S24 (30 мг) растворяли в МеОН (10 мл). Добавляли 5 мг 10% Pd/C. Реакционную смесь дегазировали 2 раза, каждый раз заменяя вакуум водородом, затем перемешивали при комнатной температуре в атмосфере H в течение ночиСмесь фильтровали и концентрировали на роторном испарителе с получением неочищенного продукта, который растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 78, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=330,1; Найдено: 330,4.
Стадия 4: Синтез Соед. No. 6
3
2
43
47
10
6
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 78 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 10 мг Соед. No. 6 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=799,3; Найдено: 799,5.
Пример 7
Синтез Соед. No. 9
Стадия 1: Синтез Соед. No. 81
2
4
2
17
21
4
4
+
В круглодонной колбе, S13 (276 мг, 1,0 ммоль) растворяли в 3,0 мл безводного DMF. Добавляли трет-бутил (4-аминобутил)карбамат (320 мг) и DIPEA (259 мг, 2,0 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 90°C в течение 12 ч. Смесь охлаждали до комнатной температуры, выливали в воду и дважды экстрагировали этилацетатом. Объединенный органический слой промывали насыщенным солевым раствором, сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью ВЭЖХ с HO/ MeCN с получением соединения Соед. No. 81 в виде бесцветного масла (100 мг). ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=345,1; Найдено: 345,4.
Стадия 2: Синтез Соед. No. 9
3
2
42
44
11
7
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 81 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 17 мг Соед. No. 9 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=814,3; Найдено: 814,5.
Пример 8
Синтез Соед. No. 13
Стадия 1: Синтез Соед. No. 85
2
4
2
19
25
4
6
+
В круглодонной колбе, S13 (276 мг, 1,0 ммоль) растворяли в 3,0 мл безводного DMF. Добавляли трет-бутил (2-(2-(2-аминоэтокси)этокси)этил)карбамат (320 мг) и DIPEA (259 мг, 2,0 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при 90°C в течение 12 ч. Смесь охлаждали до комнатной температуры, выливали в воду и дважды экстрагировали этилацетатом. Объединенный органический слой промывали насыщенным солевым раствором, сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью ВЭЖХ с HO/ MeCN с получением Соед. No. 85 в виде бесцветного масла (130 мг). ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=405,1; Найдено: 405,4.
Стадия 2: Синтез Соед. No. 13
3
2
44
48
11
9
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 85 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 12 мг Соед. No. 13 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=874,3; Найдено: 874,2.
Пример 9
Синтез Соед. No. 59
Стадия 1: Синтез S28
3
2
2
3
23
28
3
6
+
В круглодонной колбе, S23 (50 мг) и трет-бутил (2-(проп-2-ин-1-илокси)этил)карбамат (60 мг) добавляли к раствору CuI (6,3 мг) и Pd(PPh)Cl (11 мг) в THF (5 мл) и EtN (2 мл). Смесь перемешивали в течение 10 часов при 70°C в атмосфере Ar и очищали непосредственно с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением 22 мг S28. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=442,1; Найдено: 442,3.
Стадия 2: Синтез Соед. No. 95
2
.
18
24
3
4
+
S28 (30 мг) растворяли в МеОН (10 мл). Добавляли 5 мг 10% Pd/C. Реакционную смесь дегазировали 2 раза, каждый раз заменяя вакуум водородом, затем перемешивали при комнатной температуре в атмосфере H в течение ночиСмесь фильтровали и концентрировали на роторном испарителе с получением неочищенного продукта, который растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 95, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=346,1; Найдено: 346,3.
Стадия 3: Синтез Соед. No. 59
3
2
43
47
10
7
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 95 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 10 мг Соед. No. 59 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=815,3; Найдено: 815,4.
Пример 10
Синтез Соед. No. 60
Стадия 1: Синтез S30
13
10
2
4
+
В круглодонной колбе, 3-бромфталевый ангидрид (6,64 г), 3-аминопиперидин-2,6-дион гидрохлорид (6,58 г, 40 ммоль) и ацетат натрия (3,94 г, 48 ммоль) смешивали в 120 мл уксусной кислоты. Полученную реакционную смесь кипятили с обратным холодильником при 140°C в течение 12 ч. После охлаждения до комнатной температуры, большую часть уксусной кислоты выпаривали и остаток очищали колоночной флэш-хроматографией с DCM/MeOH с получением S130 в виде твердого вещества (7 г). ESI-MS рассчитано для CHBrNO [M+H]=336,9, найдено: 336,9.
Стадия 2: Синтез S31
3
2
2
3
23
26
3
6
+
В круглодонной колбе, S30 (50 мг) и трет-бутил пент-4-ин-1-илкарбамат (50 мг) добавляли к раствору CuI (6,3 мг) и Pd(PPh)Cl (11 мг) в THF (5 мл) и EtN (2 мл). Смесь перемешивали в течение 10 часов при 70°C в атмосфере Ar и очищали непосредственно с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением 14 мг S31. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=440,1; Найдено: 440,3.
Стадия 3: Синтез Соед. No. 125
2
18
22
3
4
+
S31 (30 мг) растворяли в МеОН (10 мл). Добавляли 5 мг 10% Pd/C. Реакционную смесь дегазировали 2 раза, каждый раз заменяя вакуум водородом, затем перемешивали при комнатной температуре в атмосфере H в течение ночи. Смесь фильтровали и концентрировали на роторном испарителе с получением неочищенного продукта, который растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 125, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=344,1; Найдено: 344,4.
Стадия 4: Синтез Соед. No. 60
3
2
43
45
10
7
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 125 (40 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 10 мг Соед. No. 60 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=813,3; Найдено: 813,4.
Пример 11
Синтез Соед. No. 61
Стадия 1: Синтез S33
3
2
2
3
27
34
3
9
+
В круглодонной колбе, S30 (50 мг) и трет-бутил (2-(2-(2-(проп-2-ин-1-илокси)этокси)этокси)этил)карбамат (60 мг) добавляли к раствору CuI (6,3 мг) и Pd(PPh)Cl (11 мг) в THF (5 мл) и EtN (2 мл). Смесь перемешивали в течение 10 часов при 70°C в атмосфере Ar и очищали непосредственно с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением S33 в 18 мг. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=544,2; Найдено: 544,4.
Стадия 2: Синтез Соед. No. 126
2
22
30
3
7
+
S33 (30 мг) растворяли в МеОН (10 мл) и добавляли 5 мг 10% Pd/C. Реакционную смесь дегазировали 2 раза, каждый раз заменяя вакуум водородом, затем перемешивали при комнатной температуре в атмосфере H в течение ночи. Смесь фильтровали и концентрировали на роторном испарителе с получением неочищенного продукта, который растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 126, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=448,2; Найдено: 448,3.
Стадия 3: Синтез Соед. No. 61
3
2
47
53
10
10
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 126 (50 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 15 мг Соед. No. 61 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=917,3; Найдено: 917,4.
Пример 12
Синтез Соед. No. 62
Стадия 1: Синтез S35
3
2
2
3
23
26
3
7
+
В круглодонной колбе, S30 (50 мг) и трет-бутил (2-(проп-2-ин-1-илокси)этил)карбамат (60 мг) добавляли к раствору CuI (6,3 мг) и Pd(PPh)Cl (11 мг) в THF (5 мл) и EtN (2 мл). Смесь перемешивали в течение 10 часов при 70°C в атмосфере Ar и очищали непосредственно с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением 19 мг S35. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=456,1; Найдено: 456,3.
Стадия 2: Синтез Соед. No. 127
2
18
22
3
5
+
S35 (30 мг) растворяли в МеОН (10 мл). Добавляли 5 мг 10% Pd/C. Реакционную смесь дегазировали 2 раза, каждый раз заменяя вакуум водородом, затем перемешивали при комнатной температуре в атмосфере H в течение ночи. Смесь фильтровали и концентрировали на роторном испарителе с получением неочищенного продукта, который растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа, растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта Соед. No. 127, который использовали на следующей стадии без дополнительной очистки. ESI-MS рассчитано для CHNO[M+H]=360,1; Найдено: 360,2.
Стадия 3: Синтез Соед. No. 62
3
2
43
45
10
8
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 127 (50 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 15 мг Соед. No. 62 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=829,3; Найдено: 829,5.
Пример 13
Синтез Соед. No. 63
Стадия 1: Синтез Соед. No. 128
2
4
20
27
4
6
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору 3-(4-амино-1-оксоизоиндолин-2-ил)пиперидин-2,6-диона (20 мг), HATU (30 мг), и 2,2-диметил-4-оксо-3,8,11-триокса-5-азатетрадекан-14-овой кислоты (50 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и растворитель выпаривали как можно больше и остаток выливали в воду. После экстракции этилацетатом трижды, объединенный органический слой промывали насыщенным солевым раствором и сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением Соед. No. 128. ESI-MS рассчитано для CHNO[M+H]=419,1; Найдено: 419,2.
Стадия 2: Синтез Соед. No. 63
3
2
45
50
11
9
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 128 (50 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 13 мг Соед. No. 63 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=888,3; Найдено: 888,5.
Пример 14
Синтез Соед. No. 64
Стадия 1: Синтез Соед. No. 129
2
4
22
31
4
7
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору 3-(4-амино-1-оксоизоиндолин-2-ил)пиперидин-2,6-диона (20 мг), HATU (30 мг) и 2,2-диметил-4-оксо-3,8,11,14-тетраокса-5-азагептадекан-17-овой кислоты (50 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и растворитель выпаривали как можно больше и остаток выливали в воду. После экстракции этилацетатом трижды, объединенный органический слой промывали насыщенным солевым раствором и сушили над безводным NaSO. После фильтрования и выпаривания неочищенный остаток растворяли в 3 мл DCM и TFA (2:1). После перемешивания в течение 1 часа растворитель выпаривали с получением неочищенного продукта, который очищали с помощью колоночной флэш-хроматографии с получением Соед. No. 129. ESI-MS рассчитано для CHNO[M+H]=463,2; Найдено: 463,4.
Стадия 2: Синтез Соед. No. 64
3
2
47
54
11
10
+
В круглодонной колбе, N,N-диизопропилэтиламин (50 мг) добавляли к раствору Соед. No. 138 (20 мг), HATU (20 мг), и Соед. No. 129 (50 мг) в DMF (1 мл) при комнатной температуре. Смесь перемешивали в течение 30 мин и очищали с помощью ВЭЖХ с получением 17 мг Соед. No. 64 в виде CFCOH соли. ESI-MS рассчитано для CHNO [M+H]=932,4; Найдено: 932,5.
Пример 15
Следующие соединения изобретения получали с использованием иллюстративных способов, описанных в общих схемах, примерах 1-14, и/или способов, известных специалистам в данной области с учетом настоящего изобретения.
Соед. No. 14
1
+
+
d
J
J
J
J
J
4
46
51
11
10
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,48-7,43 (м, 2H), 7,37-7,33 (м, 1H), 6,86 (д, =8,6 Гц, 1H), 6,82 (д, =7,0 Гц, 1H), 5,02 (дд, =12,7, 5,5 Гц, 1H), 4,26 (кв, =7,3 Гц, 2H), 3,89 (с, 3H), 3,73-3,65 (м, 4H), 3,38-3,32 (м, 10H), 2,68 (с, 2H), 2,37 (с, 3H), 2,20 (с, 3H), 2,12-2,03 (м, 1H), 1,51 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,21-1,14 (м, 2H), 0,94-0,90 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 918,38 найдено 918,32.
Соед. No. 65
1
+
+
d
J
J
J
J
J
4
44
47
11
9
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,42 (с, 1H), 7,30 (с, 1H), 7,13-7,06 (м, 1H), 6,70 (д, =8,6 Гц, 1H), 6,57 (д, =7,0 Гц, 1H), 5,00 (дд, =12,7, 5,5 Гц, 1H), 4,24 (кв, =7,3 Гц, 2H), 3,88 (с, 3H), 3,80-3,63 (м, 4H), 3,36-3,24 (м, 8H), 2,90-2,74 (м, 2H), 2,73-2,61 (м, 1H), 2,37 (с, 3H), 2,20 (с, 3H), 2,17-2,14 (м, 1H), 2,14-2,00 (м, 1H), 1,49 (т, =7,3 Гц, 3H), 1,17-1,12 (м, 2H), 0,93-0,86 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 874,36 найдено 874,45.
Соед. No. 11
1
+
+
d
J
J
J
J
4
44
47
11
7
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,54 (с, 1H), 7,46 (с, 1H), 7,39-7,36 (м, 1H), 7,02 (д, =7,4 Гц, 1H), 6,93 (д, =7,1 Гц, 1H), 5,49 (с, 1H), 5,05-4,98 (м, 1H), 4,24-4,17 (кв, =7,3 Гц, 2H), 3,98 (с, 2H), 3,89 (с, 3H), 3,37-3,22 (м, 6H), 3,00 (с, 2H), 2,88-2,84 (м, 2H), 2,68-2,64 (м, 2H), 2,34 (с, 3H), 2,17 (с, 3H), 1,98-1,91 (м, 1H), 1,73-1,68 (м, 2H), 1,48 (т, =7,3 Гц, 3H), 1,15-1,05 (м, 2H), 0,89-0,81 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 842,37 найдено 842,36.
Соед. No. 8
1
+
+
d
J
J
J
J
J
4
41
41
11
7
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,55-7,49 (м, 2H), 7,39 (с, 1H), 7,04 (д, =8,8 Гц, 1H), 6,98 (д, =7,1 Гц, 1H), 4,89-4,81 (м, 1H), 4,18 (кв, =7,3 Гц, 2H), 3,89 (с, 3H), 3,70-3,56 (м, 2H), 3,52-3,42 (м, 2H), 3,35 (д, =1,4 Гц, 2H), 2,34 (с, 3H), 2,17 (с, 3H), 2,05-2,01 (м, 4H), 1,88-1,79 (м, 1H), 1,44 (т, =7,3 Гц, 3H), 1,09-1,01 (м, 2H), 0,82-0,73 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 800,32 найдено 800,23.
Соед. No. 10
1
+
+
d
J
J
J
J
4
43
45
11
7
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,51-7,42 (м, 2H), 7,38 (с, 1H), 6,98 (д, =8,9 Гц, 1H), 6,88 (д, =7,0 Гц, 1H), 6,08 (с, 1H), 4,93-4,97 (м, 1H), 4,15 (кв, =7,0 Гц, 2H), 3,88 (с, 3H), 3,52-3,48 (м, 2H), 3,35 (с, 4H), 2,74-2,53 (м, 2H), 2,34 (с, 3H), 2,17 (с, 3H), 2,05-1,93 (м, 4H), 1,78-1,64 (м, 2H), 1,42 (т, =7,0 Гц, 3H), 1,40-1,34 (м, 1H), 1,08-0,96 (м, 2H), 0,80-0,73 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 828,35 найдено 828,35.
Соед. No. 7
1
+
+
d
J
J
J
J
4
40
39
11
7
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,55-7,48 (м, 1H), 7,46 (с, 1H), 7,33-7,27 (м, 1H), 7,20 (д, =8,6 Гц, 1H), 7,01 (д, =7,1 Гц, 1H), 6,16 (с, 1H), 5,05-4,95 (м, 1H), 4,20 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,87 (с, 3H), 3,72-3,70 (м, 2H), 3,66-3,62 (м, 2H), 2,83-2,73 (м, 1H), 2,71-2,58 (м, 2H), 2,33 (с, 3H), 2,16 (с, 3H), 1,99-1,97 (м, 1H), 1,46 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,11-1,02 (м, 2H), 0,83-0,79 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 786,30 найдено 786,18.
Соед. No. 12
1
+
+
d
J
J
J
4
42
43
11
8
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,56 (с, 1H), 7,49 (с, 1H), 7,43-7,39 (м, 1H), 7,03 (д, =8,6 Гц, 1H), 6,78-6,74 (м, 1H), 4,97-4,93 (м, 1H), 4,25 (кв, =7,3 Гц, 2H), 3,93 (с, 3H), 3,83-3,73 (м, 4H), 3,71-3,69 (м, 2H), 3,51-3,48 (м, 2H), 2,67-2,65 (м, 2H), 2,50-2,45 (м, 1H), 2,37 (с, 3H), 2,20 (с, 3H), 2,09-1,97 (м, 1H), 1,46 (т, =7,3 Гц, 3H), 1,18-1,10 (м, 2H), 0,90-0,87 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO(M+H): 830,33 найдено 830,23.
Соед. No. 15
1
+
+
d
J
J
J
J
J
J
J
J
4
48
55
11
9
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,47-7,38 (м, 2H), 7,23 (с, 1H), 6,94-6,86 (м, 2H), 6,05 (с, 1H), 5,03-4,97 (м, 1H), 4,16 (кв, =7,5 Гц, 2H), 3,85 (д, =1,4 Гц, 3H), 3,60-3,52 (м, 6H), 3,50-3,42 (м, 2H), 3,42-3,34 (м, 2H), 2,89-2,77 (м, 1H), 2,66 (д, =1,4 Гц, 2H), 2,33 (д, =1,3 Гц, 3H), 2,16 (д, =1,3 Гц, 3H), 2,11-2,03 (м, 1H), 1,98-1,93 (м, 1H), 1,89 (т, =6,2 Гц, 2H), 1,79 (т, =6,2 Гц, 2H), 1,65 (с, 6H), 1,44 (т, =7,5 Гц, 3H), 1,05-0,91 (м, 2H), 0,78-0,73 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 930,42 найдено 930,32.
Соед. No. 16
1
+
+
d
J
J
J
J
J
J
J
J
J
4
54
67
11
14
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,51-7,43 (м, 2H), 7,35 (с, 1H), 6,99 (д, =8,5 Гц, 1H), 6,96 (д, =7,1 Гц, 1H), 5,04-4,98 (м, 1H), 4,22 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,88 (д, =1,2 Гц, 3H), 3,72-3,49 (м, 24H), 3,42 (т, =5,2 Гц, 2H), 3,38-3,34 (м, 2H), 3,28-3,23 м, 2H), 2,76-2,68 (м, 1H), 2,66 (д, =1,2 Гц, 4H), 2,34 (д, =1,2 Гц, 3H), 2,17 (д, =1,2 Гц, 3H), 2,09-1,98 (м, 1H), 1,48 (т, =7,2 Гц, 2H), 1,13-1,07 (м, 2H), 0,87-0,81 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 1094,49 найдено 1094,36.
Соед. No. 17
1
+
+
d
J
J
J
6
42
45
11
6
H ЯМР (400 МГц, DMSO-) δ 12,14 (с, 1H), 11,07 (с, 1H), 9,22 (с, 1H), 7,89 (с, 1H), 7,53-7,47 (м, 1H), 7,35 (с, 1H), 7,05 (д, =8,6 Гц, 1H), 6,97 (д, =7,0 Гц, 1H), 6,60-6,52 (м, 1H), 5,94 (с, 1H), 5,03 (м, 1H), 4,60 (с, 2H), 3,87 (с, 3H), 3,33-3,25 (м, 2H), 2,94-2,80 (м, 1H), 2,57-2,53 (м, 2H), 2,48-2,43 (м, 2H), 2,30 (с, 3H), 2,10 (с, 3H), 2,03-1,94 (м, 2H), 1,85-1,77 (м, 2H), 1,55-1,50 (м, 2H), 1,23 (т, =7,2 Гц, 3H), 0,80-0,73 (м, 2H), 0,59-0,53 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO(M+H): 800,36 найдено 800,71.
Соед. No. 18
1
+
+
d
J
6
42
44
10
7
H ЯМР (400 МГц, DMSO-) δ 11,95 (с, 1H), 11,07 (с, 1H), 9,02 (с, 1H), 7,95 (с, 1H), 7,56-7,49 (м, 1H), 7,26 (с, 1H), 7,21 (с, 1H), 7,10-7,06 (м, 2H), 7,02-6,94 (м, 1H), 5,87 (с, 1H), 5,07-4,98 (м, 1H), 4,48-4,39 (м, 2H), 3,82 (с, 3H), 3,37-3,34 (м, 2H), 2,89 (с, 3H), 2,73 (с, 3H), 2,33-2,29 (м, 4H), 1,64-1,55 (м, 4H), 1,29 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,23 (с, 2H), 0,85-0,81 (м, 2H), 0,63-0,57 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 801,34 найдено 801,51.
Соед. No. 19
1
+
+
d
J
J
J
J
J
J
J
J
J
J
4
42
47
11
5
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,98 (с, 1H), 7,51 (с, 1H), 7,36-7,27 (м, 2H), 7,07 (д, =7,4 Гц, 1H), 6,87 (д, =7,8 Гц, 1H), 5,91 (д, =1,6 Гц, 1H), 5,18-5,12 (м, 1H), 4,33-4,28 (м, 4H), 4,04 (кв, =7,3 Гц, 2H), 3,88 (д, =1,6 Гц, 3H), 3,00 (д, =1,5 Гц, 4H), 2,86 (д, =1,5 Гц, 4H), 2,33 (д, =1,6 Гц, 3H), 2,16 (д, =1,5 Гц, 3H), 1,92-1,86 (м, 2H), 1,40 (кв, =7,3 Гц, 3H), 0,97-0,91 (м, 2H), 0,71-0,66 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 786,38 найдено 786,34.
Соед. No. 20
1
+
+
d
J
J
J
J
J
4
48
57
11
9
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,42 (с, 1H), 7,39-7,33 (м, 1H), 7,32 (с, 1H), 6,87 (д, =3,8 Гц, 1H), 6,85 (д, =5,3 Гц, 1H), 5,91 (с, 1H), 5,05-5,00 (м, 1H), 4,35 (с, 2H), 4,03 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,85 (с, 3H), 3,73 (т, =5,4 Гц, 2H), 3,70-3,65 (м, 4H), 3,65-3,60 (м, 2H), 3,52-3,46 м, 4H), 3,29-3,23 (м, 2H), 2,86-2,79 (м, 2H), 2,73-2,66 (м, 2H), 2,33 (с, 3H), 2,16 (с, 3H), 2,04-1,99 (м, 2H), 1,96-1,88 (м, 2H), 1,84-1,78 (м, 2H), 1,39 (т, =7,2 Гц, 3H), 0,98-0,89 (м, 2H), 0,72-0,66 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 932,43 найдено 932,42.
Соед. No. 21
1
+
+
d
J
J
J
J
J
J
4
48
57
11
8
H ЯМР (400 МГц, метанол-) δ 7,46 (с, 1H), 7,45-7,41 (м, 1H), 7,34 (с, 1H), 6,97 (д, =7,1 Гц, 1H), 6,91 (д, =8,6 Гц, 1H), 5,91 (с, 1H), 5,05-5,00 (м, 1H), 4,32 (с, 2H), 4,04 (кв, =7,3 Гц, 2H), 3,86 (с, 3H), 3,63 (т, =5,6 Гц, 2H), 3,51 (т, =5,4 Гц, 2H), 3,41-3,36 (м, 2H), 3,37-3,34 (м, 12H), 2,66 (с, 2H), 2,31 (с, 3H), 2,15 (с, 3H), 1,95-1,90 (м, 1H), 1,80-1,73 (м, 2H), 1,67-1,61 (м, 2H), 1,40 (т, =7,3 Гц, 3H), 0,97-0,91 (м, 2H), 0,72-0,66 (м, 2H). UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 916,44 найдено 916,47.
Соед. No. 22
1
+
+
3
42
46
11
7
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,48 (с, 1H), 7,39 (с, 1H), 7,23 (т, =8,0 Гц, 1H), 6,70-6,75 (м, 2H), 6,23 (с, 1H), 5,06 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,34 (с, 2H), 4,24 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,90 (с, 3H), 3,77-3,72 (м, 4H), 3,70-3,65 (м, 2H), 3,45 (т, =5,2 Гц, 2H), 2,86-2,76 (м, 1H), 2,69-2,64 (м, 1H), 2,40-2,30 (м, 1H), 2,35 (с, 3H), 2,18 (с, 3H), 2,08-1,98 (м, 1H), 1,48 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,13-1,08 (м, 2H), 0,88-0,83 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 816,36 найдено 816,14.
Соед. No. 24
1
+
+
3
46
54
11
9
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,46 (с, 1H), 7,29-7,23 (м, 2H), 7,10 (д, =7,2 Гц, 1H), 6,86 (д, =8,2 Гц, 1H), 6,12 (с, 1H), 5,13 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,33 (с, 2H), 4,2 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,89 (с, 3H), 3,69-3,62 (м, 12H), 3,39-3,29 (м, 4H), 2,89-2,79 (м, 2H), 2,48-2,44 (м, 1H), 2,35 (с, 3H), 2,18 (с, 3H), 2,03-1,99 (м, 1H), 1,48 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,07-1,04 (м, 2H), 0,82-0,78 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 904,41 найдено 904,36.
Соед. No. 66
1
+
+
3
42
46
11
6
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,48 (с, 1H), 7,41-7,37 (м, 2H), 7,24 (д, =7,6 Гц, 1H), 7,11 (д, =8,0 Гц, 1H), 6,27 (с, 1H), 5,16 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,46-4,39 (м, 2H), 4,26 (кв, =7,6 Гц, 2H), 3,89 (с, 3H), 3,52-3,25 (м, 4H), 2,96-2,76 (м, 2H), 2,50-2,43 (м, 1H), 2,34 (с, 3H), 2,17 (с, 3H), 2,03-1,98 (м, 4H), 1,49 (т, =7,6 Гц, 3H), 1,15-1,10 (м, 2H), 0,88-0,84 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 800,36 найдено 800,39.
Соед. No. 125
1
+
+
3
48
58
11
10
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (300МГц, CDOD) δ(ppm) 7,46 (с, 1H), 7,32-7,27 (м, 2H), 7,12 (д, =7,5 Гц, 1H), 6,89 (д, =8,1 Гц, 1H), 6,10 (с, 1H), 5,14 (дд, =13,2 Гц, =5,4 Гц, 1H), 4,33 (с, 2H), 4,19 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,88 (с, 3H), 3,67-3,59 (м, 16H), 3,37-3,33 (м, 4H), 2,88-2,74 (м, 2H), 2,48-2,45 (м, 1H), 2,35 (с, 3H), 2,18 (с, 3H), 2,05-1,96 (м, 1H), 1,47 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,06-1,02 (м, 2H), 0,80-0,77 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 948,44 найдено 948,42.
Соед. No. 25
1
+
+
3
44
50
11
8
J
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,48 (с, 1H), 7,38 (с, 1H), 7,20 (т, =8,0 Гц, 1H), 7,11 (д, =7,6 Гц, 1H), 6,95 (д, =7,6 Гц, 1H), 6,27 (с, 1H), 5,09 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,36 (с, 2H), 4,25 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,89 (с, 3H), 3,70-3,60 (м, 8H), 3,42-3,33 (м, 4H), 2,86-2,75 (м, 2H), 2,46-2,41 (м, 1H), 2,34 (с, 3H), 2,17 (с, 3H), 2,05-2,01 (м, 1H), 1,48 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,14-1,11 (м, 2H), 0,88-0,86 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 860,38 найдено 860,24.
Соед. No. 67
1
+
+
3
48
58
11
9
J
J
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,41 (с, 1H), 7,22 (т, =8,0 Гц, 1H), 7,10 (с, 1H), 7,01 (д, =7,2 Гц, 1H), 6,77 (д, =8,4 Гц, 1H), 5,91 (с, 1H), 5,11 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,27 (д, =2,4 Гц, 2H), 4,11 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,83 (с, 3H), 3,65-3,51 (м, 12H), 3,37-3,35 (м, 2H), 3,27-3,23 (м, 2H), 2,89-2,82 (м, 1H), 2,77-2,71 (м, 1H), 2,45-2,40 (м, 1H), 2,33 (с, 3H), 2,16 (с, 3H), 1,96-1,91 (м, 1H), 1,86-1,82 (м, 4H), 1,42 (т, =7,2 Гц, 3H), 0,97-0,91 (м, 2H), 0,70-0,65 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 932,44 найдено 932,40.
Соед. No. 68
1
+
+
3
47
56
11
9
J
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,42 (с, 1H), 7,25 (т, =8,0 Гц, 1H), 7,14 (с, 1H), 7,05 (д, =7,2 Гц, 1H), 6,81 (д, =8,0 Гц, 1H), 5,11 (дд, =13,2 Гц, =4,4 Гц, 1H), 4,29 (с, 2H), 4,14 (кв, =7,0 Гц, 2H), 3,85 (с, 3H), 3,65-3,26 (м, 16H), 2,87-2,82 (м, 1H), 2,78-2,72 (м, 1H), 2,45-2,41 (м, 1H), 2,33 (с, 3H), 2,16 (с, 3H), 1,99-1,86 (м, 3H), 1,44 (т, =6,8 Гц, 3H), 0,99-0,96 (м, 2H), 0,74-0,69 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 918,43 найдено 918,35.
Соед. No. 69
1
+
+
3
45
52
11
8
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,44 (с, 1H), 7,17-7,14 (м, 2H), 6,98 (д, =8,0 Гц, 1H), 6,74 (д, =8,0 Гц, 1H), 5,06 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,25 (с, 2H), 4,12 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,84 (с, 3H), 3,65-3,25 (м, 12H), 2,87-2,79 (м, 1H), 2,72-2,68 (м, 1H), 2,41-2,36 (м, 1H), 2,32 (с, 3H), 2,15 (с, 3H), 1,94-1,84 (м, 3H), 1,42 (т, =7,2 Гц, 3H), 0,97-0,93 (м, 2H), 0,70-0,66 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 874,40 найдено 874,30.
Соед. No. 70
1
+
+
3
49
59
10
10
J
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,57 (д, =6,8 Гц, 1H), 7,47 (с, 1H), 7,41-7,37 (м, 3H), 6,18 (с, 1H), 5,13 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,46 (д, =6,4 Гц, 2H), 4,23 (кв, =7,2 Гц, 2H), 3,88 (с, 3H), 3,70-3,56 (м, 12H), 3,50-3,47 (м, 2H), 3,39-3,26 (м, 4H), 2,88-2,83 (м, 1H), 2,78-2,73 (м, 1H), 2,71 (т, =7,6 Гц, 2H), 2,55-2,43 (м, 1H), 2,33 (с, 3H), 2,16 (с, 3H), 2,05-2,01 (м, 1H), 1,89-1,81 (м, 2H), 1,48 (т, =7,2 Гц, 3H), 1,12-1,08 (м, 2H), 0,85-0,83 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 947,44 найдено 947,37.
Соед. No. 71
1
+
+
3
48
57
10
9
J
J
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,55 (дд, =2,0 Гц, =6,0 Гц, 1H), 7,41 (с, 1H), 7,38-7,33 (м, 2H), 7,10 (с, 1H), 5,92 (с, 1H), 5,13 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,44 (д, =4,8 Гц, 2H), 4,10 (кв, =7,6 Гц, 2H), 3,84 (с, 3H), 3,66-3,49 (м, 12H), 3,38-3,27 (м, 2H), 2,93-2,84 (м, 1H), 2,79-2,73 (м, 1H), 2,69 (т, =7,6 Гц, 2H), 2,55-2,44 (м, 1H), 2,32 (с, 3H), 2,15 (с, 3H), 1,95-1,91 (м, 1H), 1,91-1,81 (м, 4H), 1,43 (т, =7,2 Гц, 3H), 0,97-0,94 (м, 2H), 0,70-0,67 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 917,43 найдено 917,35.
Соед. No. 72
1
+
+
3
48
53
10
9
J
J
J
J
J
J
H ЯМР (400 МГц, CDOD) δ(ppm) 7,64 (д, =7,6 Гц, 1H), 7,51 (д, =7,6 Гц, 1H), 7,45 (с, 1H), 7,41-7,37 (м, 1H), 7,09 (с, 1H), 5,94 (с, 1H), 5,12 (дд, =13,2 Гц, =5,2 Гц, 1H), 4,44 (с, 2H), 4,39 (с, 2H), 4,13 (кв, =7,6 Гц, 2H), 3,83 (с, 3H), 3,69-3,52 (м, 10H), 3,35-3,27 (м, 2H), 2,90-2,72 (м, 2H), 2,53-2,42 (м, 1H), 2,33 (с, 3H), 2,17 (с, 3H), 1,97-1,86 (м, 3H), 1,43 (т, =7,6 Гц, 3H), 0,97-0,94 (м, 2H), 0,70-0,68 (м, 2H); UPLC-MS (ESI): m/z рассчитано для CHNO (M+H): 913,40 найдено 913,45.
Пример 16
in vitro
Активность
2
50
Активность ингибирования роста клеток репрезентативных деструкторов BET бромодомена определяли с помощью люминесцентного анализа жизнеспособности клеток CellTiter-Glo. Клетки высевали в 384-луночные белые непрозрачные планшеты для культуры клеток с плотностью 2000 клеток/лунку с серийно разведенными соединениями и инкубировали при 37°С в атмосфере 95% воздуха и 5% СО в течение 4 дней. Жизнеспособность клеток определяли с использованием набора для люминесцентного анализа жизнеспособности клеток CellTiter-Glo (Promega, Madison, WI) в соответствии с инструкцией изготовителя. Вкратце, объем реагента CellTiter-Glo, равный объему клеточной культуральной среды, добавляли в каждую лунку, и затем планшеты инкубировали при комнатной температуре в течение 10-20 минут. Люминесцентный сигнал измеряли с использованием мультимодального микропланшетного ридера Tecan Infinite M1000 (Tecan, Morrisville, NC). Полумаксимальную ингибирующую концентрацию (IC) рассчитывали с использованием программного обеспечения GraphPad Prism 5 (GraphPad Software, La Jolla, CA).
Таблица 4
Соед. No.
MDA-MB-231IC<sub>50</sub> (нM)
MOLM-13IC<sub>50</sub> (нM)
1
49,5
12,2
2
75,6
16,3
3
94,8
18,2
4
3,5
0,7
5
50,0
6,9
6
1,0
<0,8
7
452,7
65,0
8
57,6
6,3
9
5,6
1,2
10
4,8
0,9
11
8,0
1,6
12
108,7
17,8
13
266,6
8,0
14
33,0
1,2
15
1,7
0,7
16
128,4
10,2
17
329,7
114,6
18
5,4
2,9
19
1416
378,7
20
3,2
0,9
21
543,1
84,6
22
63,8
12,4
23
83,4
16,7
24
74,9
12,1
25
25,1
3,5
59
24,4
0,64
60
11,2
1,2
61
69,6
1,5
62
24,7
3,4
63
230,8
41,5
64
98,7
23,6
65
438,0
47,1
66
274,8
47,3
67
2,0
0,7
68
4,1
1,2
69
16,1
2,9
70
41,0
8,5
72
4,2
1,2
Пример 17
Ингибирование роста клеток деструкторами BET в репрезентативных клеточных линиях немелкоклеточного рака легкого
См.
2
50
Активность ингибирования роста клеток репрезентативных деструкторов BET бромодоменов в репрезентативных клеточных линиях немелкоклеточного рака легкого определяли с помощью люминесцентного анализа жизнеспособности клеток CellTiter-Glo. Таблица 5. Клетки высевали в 384-луночные белые непрозрачные планшеты для культуры клеток с плотностью 2000 клеток/лунку с серийно разведенными соединениями и инкубировали при 37°С в атмосфере 95% воздуха и 5% СО в течение 4 дней. Жизнеспособность клеток определяли с использованием набора для люминесцентного анализа жизнеспособности клеток CellTiter-Glo (Promega, Madison, WI) в соответствии с инструкцией изготовителя. Вкратце, объем реагента CellTiter-Glo, равный объему клеточной культуральной среды, добавляли в каждую лунку, и затем планшеты инкубировали при комнатной температуре в течение 10-20 минут. Люминесцентный сигнал измеряли с использованием мультимодального микропланшетного ридера Tecan Infinite M1000 (Tecan, Morrisville, NC). Полумаксимальную ингибирующую концентрацию (IC) рассчитывали с использованием программного обеспечения GraphPad Prism 5 (GraphPad Software, La Jolla, CA). Соед. A представляет собой ингибитор бромодомена BET, см.US Appl. No. 62/121637, имеющий следующую структуру:
См.
et al
Science 348
dBET1 представляет собой деструктор BET. Winter ., :1376-1381 (2015).
Таблица 5
IC<sub>50</sub> (мкM)
Линия раковых клеток
dBET1
Соед. A
Соед. No. 9
Соед. No. 4
CALU-1
3,1
2,52
0,009
0,002
SKLU-1
>5
0,04
0,011
0,003
H1975
>5
0,04
0,016
0,003
H520
4,2
0,28
0,011
0,003
H2444
3,0
2,72
0,028
0,004
H1650
2,3
0,43
0,008
0,004
H1648
>5
0,14
0,022
0,005
H1869
>5
0,06
0,093
0,009
CALU6
>5
0,63
0,033
0,009
H2009
>5
0,17
0,034
0,016
H322
>5
0,34
0,093
0,044
H1792
>5
0,13
0,151
0,048
H1299
>5
0,06
0,228
0,069
H2170
>5
0,02
0,195
0,099
A549
>5
0,02
0,157
0,119
H2030
>5
0,11
0,269
0,137
H2228
>5
2,40
0,610
0,174
H1437
>5
0,14
0,818
0,329
H460
>5
1,79
50,960
0,505
H647
>5
0,08
0,789
0,598
H23
>5
0,13
3,072
0,612
Пример 18
Ингибирование роста клеток деструкторами BET в репрезентативных клеточных линиях рака молочной железы
См.
2
50
Активность ингибирования роста клеток репрезентативных деструкторов BET бромодоменов в репрезентативных клеточных линиях рака молочной железы определяли с помощью люминесцентного анализа жизнеспособности клеток CellTiter-Glo. Таблица 6. Линии клеток SUM-52 и SUM-159 были созданы в University of Michigan Comprehensive Cancer Center. Все другие линии клеток рака молочной железы были получены из ATCC (Manassas, VA). Клетки высевали в 384-луночные планшеты для культуры клеток с плотностью 1000-2500 клеток/лунку с серийно разведенными соединениями и инкубировали при 37°С в атмосфере 95% воздуха и 5% СО в течение 4 дней. Жизнеспособность клеток определяли с использованием набора для люминесцентного анализа жизнеспособности клеток CellTiter-Glo (Promega, Madison, WI) в соответствии с инструкцией изготовителя. Вкратце, объем реагента CellTiter-Glo, равный объему клеточной культуральной среды, добавляли в каждую лунку, и затем планшеты инкубировали при комнатной температуре в течение 20-60 минут. Люминесцентный сигнал измеряли с использованием мультимодального микропланшетного ридера Tecan Infinite M1000 (Tecan, Morrisville, NC). Полумаксимальную ингибирующую концентрацию (IC) рассчитывали с использованием программного обеспечения GraphPad Prism 5 (GraphPad Software, La Jolla, CA). "Thd" представляет собой талидомид.
Таблица 6
Клеточная линия
IC<sub>50</sub> (мкM)
dBET
Соед. A
Thd+Соед. A(1:1)
Соед. No. 4
MDA-MB-157
1,17
0,86
0,46
0,002
MDA-MB-468
1,39
0,51
0,21
0,002
MDA-MB-453
>5
0,04
0,03
0,002
HCC1187
>5
0,96
1,45
0,003
HCC38
3,70
0,06
0,82
0,004
HCC1954
3,76
1,62
1,58
0,004
HBL-100
>5
0,10
0,14
0,004
MDA-MB-231
1,83
0,22
0,19
0,004
SUM-52
>5
0,39
0,42
0,008
HCC1937
>5
>5
>2,5
0,008
HCC1428
>5
0,05
0,08
0,013
BT-20
>5
2,41
>2,5
0,025
HCC70
>5
0,58
0,64
0,035
SUM-159
>5
0,51
0,44
0,166
HCC1395
>5
1,05
1,14
0,277
Пример 19
Деструкторы BET индуцируют разрушение белков BET и апоптоз в лейкозных клетках MOLM-13
См.
.
Клетки обрабатывали лекарственными средствами в указанных концентрациях для указанных временных точек. фиг 1 и фиг. 2. Собранные клетки лизировали в буфере для лизиса [1% CHAPS, 150 мM NaCl, 20 мM Tris-HCl, 1 мM. EDTA, 1 мM EGTA и ингибитор протеазы COMPLETE (Roche)] в течение 30 минут на льду. Концентрации белка определяли с использованием реагента Bio-Rad Protein Assay Dye. Лизаты цельных клеток опухоли (20 мкг) разделяли на 4-20% гелях Novex (Invitrogen). Разделенные белки переносили на PVDF-мембрану (BIO-RAD) и PVDF-мембрану затем промокали с помощью 5% блокатора Blotting-Grade (BIO-RAD) в течение 1 часа при комнатной температуре. Используемые первичные антитела: BRD4 кроличьи поликлональные антитела [Bethyl Laboratories, Inc, cat # A301], BRD3 кроличьи поликлональные антитела [Bethyl Laboratories, Inc, cat # A302], PARP (46D11) кроличьи mAb [Cell Signaling Technology, CST #9532], Bcl-2 (50E3) кроличьи mAb [Cell Signaling Technology, CST #2870] и GAPDH кроличьи поликлональные антитела (Santa Cruz Biotechnology, cat # sc-25778 HRP). Используемое вторичное антитело представляло собой козьи анти-кроличьи антитела, конъюгированные с пероксидазой хрена (Thermo Scientific Cat# 31460). Субстраты BIO-RAD Clarity Western ECL (BIO-RAD) и пленку HyBlot CL (Denville) использовали для проявления и обнаружения сигналов с использованием настольного процессора SRX-101A (Konica Minolta).
Пример 20
Деструкторы BET индуцируют разрушение белков BET и апоптоз в клетках MDA-MB-231 рака молочной железы
См.
.
Клетки обрабатывали лекарственными средствами в указанных концентрациях для указанных временных точек. Собранные клетки лизировали в буфере для лизиса [1% CHAPS, 150 мM NaCl, 20 мM Tris-HCl, 1 мM. EDTA, 1 мM EGTA, и ингибитор протеазы COMPLETE (Roche)] в течение 30 минут на льду. Концентрации белка определяли с использованием реагента Bio-Rad Protein Assay Dye. Лизаты цельных клеток опухоли (20 мкг) разделяли на 4-20% гелях Novex (Invitrogen). Разделенные белки переносили на PVDF-мембрану (BIO-RAD) и PVDF-мембрану затем промокали с помощью 5% блокатора Blotting-Grade (BIO-RAD) в течение 1 часа при комнатной температуре. Используемые первичные антитела: BRD4 кроличьи поликлональные антитела [Bethyl Laboratories, Inc, cat # A301], BRD3 кроличьи поликлональные антитела [Bethyl Laboratories, Inc, cat # A302], PARP (46D11) кроличьи mAb [Cell Signaling Technology, CST #9532], Bcl-2 (50E3) кроличьи mAb [Cell Signaling Technology, CST #2870] и GAPDH кроличьи поликлональные антитела (Santa Cruz Biotechnology, cat # sc-25778 HRP). Используемое вторичное антитело представляло собой козьи анти-кроличьи антитела, конъюгированные с пероксидазой хрена (Thermo Scientific Cat# 31460). Субстраты BIO-RAD Clarity Western ECL (BIO-RAD) и пленку HyBlot CL (Denville) использовали для проявления и обнаружения сигналов с использованием настольного процессора SRX-101A (Konica Minolta). фиг 3 и фиг. 4. Деструкторы BET индуцируют разрушение BRD3 и BRD4 в клетках MDA-MB-231 рака молочной железы.
Пример 21
Деструкторы BET индуцируют разрушение белков BET в опухолевой ткани MDA-MB-231 у мышей
См.
.
См.
.
Фармакодинамические исследования ксенотрансплантатных опухолей MDA-MB-231, обработанных деструкторами BET Соед. No. 9, фиг 5, и Соед. No. 4. фиг 6. Ксенотрансплантаты MDA-MB-231 были обработаны лекарственными средствами в течение указанных временных точек. Резецированные ткани ксенотрансплантатной опухоли измельчали в порошок в жидком азоте и лизировали в буфере для лизиса [1% CHAPS, 150 мM NaCl, 20 мM Tris-HCl, 1 мM. EDTA, 1 мM EGTA, и ингибитор протеазы COMPLETE (Roche)] в течение 2 циклов замораживания-оттаивания (от -80°C до комнатной температуры), затем еще 30 минут на льду. Концентрации белка определяли с использованием реагента для анализа Bio-Rad Protein Assay Dye. Лизаты цельных клеток опухоли (20 мкг) разделяли на 4-20% гелях Novex (Invitrogen). Разделенные белки переносили на PVDF-мембрану (BIO-RAD) и PVDF-мембрану затем промокали с помощью 5% блокатора Blotting-Grade (BIO-RAD) в течение 1 часа при комнатной температуре. Используемые первичные антитела представляли собой: BRD4 кроличье поликлональное антитело [Bethyl Laboratories, Inc, cat # A301], PARP (46D11) Rabbit mAb [CST #9532] и GAPDH кроличье поликлональное антитело (Santa Cruz Biotechnology, cat # sc-25778 HRP). Используемое вторичное антитело представляло собой козьи анти-кроличьи антитела, конъюгированные с пероксидазой хрена (Thermo Scientific Cat# 31460). Субстраты BIO-RAD Clarity Western ECL (BIO-RAD) и пленку HyBlot CL (Denville) использовали для проявления и обнаружения сигналов с использованием настольного процессора (Konica Minolta).
Пример 22
Эффективность Соед. No. 9 в ксенотрансплантатной модели MDA-MB-231
Получение соединения
Соед. No. 9 растворяли в 3 мл 10% PCP [10% PEG400 (Sigma)+3% Cremophor (Sigma)+87% PBS (Gibco)]. Значение рH раствора лекарственного средства проверяли перед использованием и доводили 0,5 н NaOH до рН 6,5 и 8,0 для внутривенного введения.
Культура клеток
Опухолевые клетки молочной железы MDA-MB-231 человека (ATCC) поддерживали при 37°C, 95% воздуха, 5% углекислого газа в улучшенной MEM (Richter's Mod.), дополненной 10% фетальной бычьей сывороткой, 100 единиц/мл пенициллина и 100 единиц/мл стрептомицина (GIBCO™, Invitrogen Corp.) и пассировали два раза в неделю.
Введение клетки ксенотрансплантатной опухоли
6
Опухолевые клетки для ксенотрансплантатов собирали с помощью трипсина (0,05%)-EDTA (0,53 мM) (GIBCO™, Invitrogen Corp.), добавляли среду для выращивания и клетки помещали на лед. Клетки промывали один раз 1X PBS (GIBCO™, Invitrogen Corp.) и ресуспендировали в PBS. После промывки в PBS, клетки ресуспендировали в ледяной смеси 1:1 PBS и матригеля (Matrigel) (BD Biosciences, Invitrogen Corp.) для конечной концентрации белка Matrigel 5 мг/мл. Клетки при 5×10 клеток в 0,1 мл вводили подкожно (п.к.) в боковую область каждой мыши с использованием иглы 25 калибра. Все опухоли инокулировали мышам SCID (штамм:236) C.B-17 SCID, Charles River.
Контроль роста ксенотрансплантатной опухоли и массы
3
Размер опухолей, растущих у мышей, измеряли в двух измерениях с помощью калиперов. Объем опухоли (мм)=(A×B2)/2, где A и B представляли собой длину и ширину опухоли (в мм), соответственно. Во время лечения объем опухоли и массу тела измеряли три раза в неделю. После прекращения лечения объем опухоли и массу тела измеряли не реже одного раза в неделю.
Оценка токсичности и конечной точки
Опухолям не давали превышать 10% от общей массы тела животного. Если у животного было две или несколько опухолей, общая масса всех опухолей не превышала 10% от общей массы тела животного. В конце экспериментального периода или когда размер опухоли приближался к 10% от общей массы тела, животное подвергали эвтаназии. Животные, которые показали глубокую заболеваемость или потерю массы более 20% массы тела, были подвергнуты эвтаназии.
Определение противоопухолевой эффективности in vivo Соед. No. 9
3
См. фиг.
До начала лечения опухолям давали вырасти до 100-200 мм в объеме, после чего кровеносный сосуд, идущий в опухоль, должен был быть хорошо установлен. Мышей с опухолями в пределах допустимого диапазона размеров рандомизировали в группы лечения из 7 мышей. Соед. No. 9 давали внутривенно. Контрольная группа получила только носитель.  7.
Пример 23
Ингибирование роста клеток деструкторами BET в репрезентативных клеточных линиях рака толстой кишки
см.
Активность ингибирования роста клеток репрезентативных деструкторов BET бромодомена в репрезентативных клеточных линиях рака толстой кишки, таблицу 7, определяли, как описано в примере 17.
Таблица 7
IC<sub>50</sub> (мкM)
Клеточная линия
dBET1
Соед. A
Соед. No. 9
Соед. No. 4
Lovo
>5
0,044±0,017
0,046±0,049
0,013±0,014
SKCO-1
>5
1,08±0,24
0,023±0,01
0,008±0,004
SW48
2,78
0,0457
0,008
0,006
RKO
>5
0,272±0,235
0,241±0,027
0,046±0,001
SW620
>5
>2,5
1,037±1,045
0,038±0,005
SW480
>5
0,567±0,01
0,247±0,06
0,037±0,01
HT-29
>5
0,069±0,001
0,048±0,002
0,032±0,02
HCT116
>5
1,159±0,179
0,585±0,07
0,13±0,03
SW837
>5
0,084±0,02
0,23±0,067
0,076±0,03
SW948
>5
>2,5
1,00±1,07
0,197±0,16
SW403
>5
0,102±0,023
0,219±0,19
0,042±0,01
H508
>5
0,167±0,09
0,41±0,15
0,054±0,03
SW1463
2,73±0,3
>2,5
0,191±0,03
0,031±0,01
T84
>5
0,413±0,1
0,69±0,3
0,11±0,03
LS513
>5
0,915±0,67
0,185±0,06
0,070±0,02
LS123
>5
0,739±0,68
0,074±0,05
0,011±0,01
LS411N
>5
0,11±0,09
0,56±0,38
0,1±0,06
LS1034
>5
0,455±0,43
0,368±0,17
0,097±0,02
SW1412
>5
0,04±0,02
0,034±0,02
0,009±0,004
Пример 24
Ингибирование роста клеток деструкторами BET в репрезентативных линиях лейкозных клеток
Активность ингибирования роста клеток репрезентативных деструкторов BET бромодомена в репрезентативных линиях лейкозных клеток, см. Таблицу 8, определяли, как описано в примере 17.
Таблица 8
IC<sub>50</sub> (мкM)
Клеточная линия
dBET1
Соед. No. 4
MV4;11
33
0,16
MOLM-13
106
1,0
HL-60
153
0,6
AML-3
0,4
MOLM16
0,3
Mono-Mac6
1,4
SKML
0,2
RS4;11
0,05
K61
11,8
AML-193
0,04
AML-5
0,5
Пример 25
in vivo
Противоопухолевая активность
3
3
2
Для экспериментов по эффективности in vivo этого примера, когда опухоли достигали 80-200 мм, мышей SCID рандомизированы в группы. Соед. A, Соед. No. 4, Соед. No. 6, или контрольный носитель (10% PEG400: 3% Cremophor: 87% PBS, или 2% TPGS:98% PEG200) давали при указанной дозе и продолжительности. Размеры опухоли и массу животных измеряли 2-3 раза в неделю. Объем опухоли (мм)=(длина×ширина)/2. Ингибирование роста опухоли рассчитывали как TGI (%)=(Vc-Vt)/(Vc-Vo)*100, где Vc, Vt представляют собой медиану контрольных и обработанных групп в конце исследования и Vo в начале. Все исследования in vivo проводили в соответствии с протоколом по обращению с животными, одобренным University Committee on Use and Care of Animals of the University of Michigan, в соответствии с рекомендациями Guide for the Care and Use of Laboratory Animals of the National Institutes of Health.
in vivo
et al.
Cell Rep
4
E380Q
.
Противоопухолевую активность  Соед. No. 4 определяли в "Washington Human in Mouse (WHIM)" 24 (WHIM24), модели ксенотрансплантата, полученного от пациента (PDX), развитой от пациента с лекарственно-устойчивым раком молочной железы (ESR, PR- и HER2-) (Li :1116-30 (2013)).
Соед. № 4 при 5 мг/кг, ВВ, 3 раза в неделю в течение 3 недель эффективно ингибирует рост опухоли WHIM24, аналогично противоопухолевой активности Соед. А при 50 мг/кг, ежедневно, пероральное введение, 5 дней в неделю в течение 3 недель. Соед. No. 4 при 10 мг/кг, 3 раза в неделю в течение 3 недель, индуцировало частичную регрессию опухоли во время лечения (фиг. 8). Как Соед. A так и Соед. No. 4 вызвало значительную потерю массы (данные не показаны) или заметную токсичность в этой модели. PD анализ показал, что однократная доза при ВВ Соед. No. 4 (10 мг/кг) уменьшала уровни белков BET на >80% уже через 1 ч, и этот эффект продолжался по меньшей мере 9 ч в опухолях WHIM24 (данные не показаны). Примечательно, что уровни белка MCL1 в опухолях заметно снижались уже через 3 часа после лечения Соед. No. 4 (данные не показаны). Но уровни белка BRD2, BRD4 и MCL1 начали возвращаться через 12 часов, что указывает на то, что разрушение BET при помощи Соед. No. 4 является обратимым после того, как лекарственное средство выводится из опухолевой ткани. Фармакокинетический (PK) анализ показал, что, хотя однократная доза Соед. No. 4 (10 мг/кг) мышам-опухоленосителям, достигала разумного воздействия препарата в плазме и опухолях WHIM24 через 1 и 3 часа, концентрации лекарственного средства быстро снижались как в плазме, так и в опухолях (данные не показаны).
Противоопухолевая активность in vivo Соед. No. 4 определяли в ксенотрансплантатных моделях опухоли клеточных линий TNBC.
В ксенотрансплантатной модели MDA-MB-453, Соед. No. 4 при 5 мг/кг значительно ингибировало рост опухоли с TGI (%) 85% в конце исследования (фиг.9). Соед. A при 50 мг/кг, ежедневно, 5 дней в неделю в течение 2 недель, не ингибировало рост опухоли. Никакая значительная потеря массы (данные не показаны) или выраженная токсичность не наблюдалась с Соед. A или Соед. No. 4.
Соед. No. 4 при 10 мг/кг, ВВ, 3 раза в неделю в течение 2-3 недель, имело ограниченную или не имело противоопухолевую активность в моделях MDA-MB-231 (фиг. 10) и MDA-MB-468 (фиг. 11). Фармакокинетический (PK) анализ показал, что Соед. No. 4 имело ограниченную экспозицию лекарственного средства в ткани ксенотрансплантатной опухоли в этих двух моделях (данные не показаны), в отличие от хорошей экспозиции лекарственного средства в ткани ксенотрансплантатной опухоли WHIM24.
Соед. No. 6 при 5 мг/кг, ВВ, 3 раза в неделю в течение 3 недель проявляло противоопухолевую активность в обоих ксенотрансплантатных моделях MDA-MB-231 (фиг. 10) и MDA-MB-468 (фиг. 11). Противоопухолевая активность Соед. No. 6 была сопоставима с или сильнее, чем у Соед. А при 50 мг/кг, ежедневное пероральное введение, 5 дней в неделю в течение 3 недель в этих моделях.
Пример 26
Апоптоз, индуцированный деструктором BET
Соед. No. 4 индуцирует более сильный апоптоз, чем Соед. A в нескольких клеточных линиях TNBC (фиг.12). MCL1 является известным регулятором апоптоза. В связи с этим, Соед. No. 4 индуцирует быструю и зависящую от времени даун-регуляцию белка MCL1 в клетках MDA-MB-468 (фиг.13) и других клеточных линиях TNBC (данные не показаны). Даун-регуляцию мРНК MCL1 при Соед. No. 4 наблюдали на уровне всего 10 нМ, аналогично наблюдаемому для MYC (данные не показаны). Напротив, белок MCL1 не подвергается даун-регуляции при Соед. A в клетках MDA-MB-468 (фиг. 13) или любой из других тестируемых клеточных линиях TNBC, но вместо этого был активирован в MDA-MB-157, MDA-MB-231 и MDA-MB-468 (данные не показаны). Экспрессия антиапоптотических BCL-2 и BCL-XL в этих клеточных линиях не была существенно изменена либо Соед. A либо Соед. No. 4 (фиг. 13).
Эти данные показывают, что даун-регуляция MCL1 Соед. No. 4 может играть роль в индукции апоптоза в клетках TNBC.
Пример 27
Деструкторы BET в комбинации с ингибиторами BCL
et al
Cell Death Differ 22
et al
Mol. Cancer Ther. 14
et al
Cancer Cell 24
Adv. Cancer Res.
et al.
Cancer Res. 68
et al.
et al.
5
et al.
Nat. Med. 19
MCL1 и BCL-XL являются важными, но независимыми детерминантами выживаемости клеток в TNBC (Goodwin ., :2098-106 (2015); Xiao ., :1837-47 (2015); Petrocca ., :182-96 (2013)). Панель клеточных линий TNBC обрабатывали Соед. No. 4 в комбинации с ингибиторами BCL-2 и/или BCL-XL, и избыточное ингибирование роста рассчитывали по модели независимости Блисса для каждой пары комбинации (Berenbaum, , 35:269-335 (1981)). ABT-263 (Tse , :3421-8 (2008)) и BM-1197 (Bai , PLoS One 2014;9(6):e99404 doi 10.1371/journal.pone.0099404) были выбраны в качестве двойных ингибиторов BCL-2/BCL-XL, A-1153463 в качестве селективного ингибитора BCL-XL (Tao , ASC Med. Chem. Lett. :1088-93 (2014)) и ABT-199 в качестве селективного ингибитора BCL-2 (Souers , :202-8 (2013)).
Взаимодействие от умеренного до сильного между Соед. No. 4 и BCL-XL-нацеленным BM-1197, ABT-263 и A-1155463 наблюдали в 6 из 7 тестируемых клеточных линий TNBC (данные не показаны). Иммуноблоттинг и/или окрашивание аннексином-PI подтвердили, что BM-1197 (250 нM), ABT-263 (250 нM) и A-1155463 (250 нM) усиливают Соед. No. 4-индуцированный апоптоз (50 нM), в MDA-MB-468 (фиг. 14) и других клеточных линиях TNBC (данные не показаны). Синергическая индукция апоптоза Соед. No. 4 в сочетании с ABT-199 наблюдалась только в MDA-MB-468 (фиг. 14), что указывает на то, что BCL-XL, но не BCL2, является фактором устойчивости для Соед. No. 4-индуцированного апоптоза в этих клеточных линиях. Не наблюдалось явного синергизма для Соед. A с или BM-1197 (фиг. 15 и 16) или ABT-263 (данные не показаны). Синергическая индукция апоптоза с помощью комбинации Соед. No. 4 и BM-1197 также была обнаружена в дополнительных клеточных линиях TNBC, реагирующих на Соед. No. 4-индуцированный апоптоз (BT-20 и MDA-MB-157) (данные не показаны), что также подтверждает, что ингибиторы BCL-XL усиливают Соед. No. 4-индуцированный апоптоз в TNBC.
Эти данные свидетельствуют о том, что механизмы действия, наблюдаемые для Соед. No. 4 и Соед. A в клетках TNBC, не зависят от их химических классов.
Следует понимать, что вышеприведенные варианты осуществления и примеры не предназначены для ограничения в любом отношении объема изобретения и что формула изобретения, представленная в настоящем документе, предназначены для охвата всех вариантов осуществления и примеров, независимо от того, в явном виде ли они представлены в настоящем документе.
Все патенты и публикации, приведенные в настоящем описании, полностью включены в качестве ссылки в полном объеме.