ПРОЛИН-БОГАТЫЕ ПЕПТИДЫ, ЗАЩИЩАЮЩИЕ ОТ S.pneumoniae

1. Липопептидный структурный элемент, состоящий из
(1) пептидной цепи, содержащей параллельный биспиральный домен, который, в качестве самостоятельного не содержащего липидов пептида, образует параллельный димерный, тримерный или высшего порядка олигомерный спиральный пучок,
(2) пролин-богатого (PR) пептидного антигена, содержащего, по меньшей мере, одну отрицательно и, по меньшей мере, одну положительно заряженную аминокислоту, и где по меньшей мере 15% аминокислот представляют собой пролин, необязательно связанного с другим антигеном, и
(3) липидной составляющей, содержащей две или три длинных углеводородных цепи; причем пептидная цепь, PR-пептидный антиген и липидная составляющая ковалентно связаны, либо непосредственно, либо через линкер.
2. Липопептидный структурный элемент по п. 1, в котором пептидная цепь содержит от 21 до 200 аминокислотных остатков.
3. Липопептидная структурный элемент по п. 1 или 2, в котором пептидная цепь содержит биспиральный домен, состоящий из трех - восьми гептадных мотивов.
a
d
abcdefg
a
d
a
d
4. Липопептидный структурный элемент по п. 3, в котором в положениях  и  каждого гептадного мотива () биспирального домена содержатся альфа-аминокислоты с малыми-средними гидрофобными боковыми цепями и/ или ароматическими или гетероароматическими боковыми цепями, в нуле, одном или двух из всех положений  и  аминокислота с полярным незаряженным остатком и в нуле или одном из всех положений  и  аминокислота с полярным катионным остатком или ацилированным производным этого или с полярным анионным остатком, или глицин.
5. Липопептидный структурный элемент по п. 4, в котором
альфа-аминокислоты с малым-средним размером гидрофобной боковой цепи представляют собой аланин, изолейцин, лейцин, метионин и валин;
альфа-аминокислоты с ароматической или гетероароматической боковой цепью представляют собой фенилаланин, тирозин, триптофан и гистидин;
альфа-аминокислоты с полярными незаряженными остатками представляют собой аспарагин, цистеин, глутамин, серин и треонин;
альфа-аминокислоты с полярным катионным остатком представляют собой аргинин, лизин и гистидин;
и альфа-аминокислоты с полярным анионным остатком представляют собой аспарагиновую кислоту и глутаминовую кислоту.
6. Липопептидный структурный элемент по любому из пп. 1-5, в котором пролин-богатый пептидный антиген содержит, по меньшей мере, один остаток глутаминовой кислоты и, по меньшей мере, один остаток лизина или аргинина.
Streptococci
Staphylococci
7. Липопептидный структурный элемент по любому из пп. 1-6, в котором пролин-богатый пептидный антиген получен из белков и/или .
8. Липопептидный структурный элемент по любому из пп. 1-6, в котором пролин-богатый пептидный антиген является производным от белков PspA и/или PspC.
9. Липопептидный структурный элемент по любому из пп. 1-8, в котором пролин-богатый пептидный антиген содержит пептид с последовательностью от SEQ ID NO: 27 до 112, и такими пептидами, в которых одна, две или три аминокислоты заменены другими аминокислотами.
1
8
10. Липопептидный структурный элемент по любому из пп. 1-9, в котором липидная составляющая представляет собой один из типов Z - Z
1
2
в которых R и R представляют собой длинный углеводородный остаток или длинный углеводород-C=О и Y представляет собой Н или СООН,
1
2
3
1
2
3
в котором R, R and R представляют собой длинный углеводородный остаток или длинный углеводород-C=О или R и R представляют собой длинный углеводородный остаток или длинный углеводород-C=О и Rпредставляет собой Н или ацетил или низший алкил-С=О,
1
2
в которых R и R представляют собой длинный углеводородный остаток или длинный углеводород-C=О и n представляет собой 1, 2, 3 или 4,
1
2
в котором R и R представляют собой длинный углеводородный остаток, Х представляет собой О или NH, а n представляет собой 1, 2, 3 или 4, или
1
2
в которых R и R представляют собой длинный углеводородный остаток.
и в котором длинный углеводородный остаток представляет собой линейный или разветвленный алкил или алкенил, содержащий от 8 до 25 атомов углерода и необязательно одну, две или три двойных связи в цепи.
Z3
1
2
3
11. Липопептидный структурный элемент по п. 10, в котором липидная составляющая представляет собой дипальмитоил-S-глицерилцистеинил с формулой , в которой R и R представляют собой пальмитоил и R представляет собой Н или ацетил.
12. Липопептидный структурный элемент по любому из пп. 1-11, в котором пептидная цепь, содержащая параллельную биспираль, связана одним концом с PR-пептидным антигеном и другим концом с липидной составляющей.
13. Липопептидный структурный элемент по п. 12, в котором пептидная цепь PC ковалентно связан с липидной составляющей LM на или вблизи одного конца пептидной цепи, либо непосредственно, как в
LM - PC (1)
или через линкер (L), как в
LM - L - PC (2)
где линкер L выбран из
где Х представляет собой O или NH, m составляет от 1 до 45 и n составляет от 1 до 45.
14. Синтетические вирусоподобные частицы, состоящие из спиральных липопептидных пучков, содержащих два, три, четыре, пять, шесть или семь липопептидных структурных элементов по любому из пп. 1-13.
15. Вакцина, содержащая синтетическую вирусоподобную частицу по п. 14.
16. Способ вакцинации против заболевания, вызываемого грамотрицательными бактериями, в котором иммуногенно эффективное количество синтетической вирусоподобной частицы по п. 14 вводят пациенту, нуждающемуся в этом.