СПОСОБ ВЫБОРА ДНК-ЗОНДОВ ДЛЯ МИКРОЧИПОВОЙ ДИАГНОСТИКИ, БИОЧИП И СПОСОБ ТИПИРОВАНИЯ ГЕНА НЕЙРАМИНИДАЗЫ ВИРУСА ГРИППА А

1. Способ выбора ДНК-зондов для микрочиповой диагностики высоковариабельных геномов, отличающийся тем, что выбор таких ДНК-зондов осуществляется на основе анализа белковых последовательностей и проводится в два этапа:
а) на первом этапе проводят анализ аминокислотных последовательностей белков микроорганизма, выявляют консервативные олигопептиды и определяют внутри них короткие дискриминирующие микроорганизм пептиды;
б) с помощью генетического кода определяют структуру ДНК-зондов, кодирующих дискриминирующие микроорганизм пептиды.
2. Биочип для типирования гена нейраминидазы вируса гриппа А, содержащий типирующие гибридизационные зонды, ковалентно присоединенные непосредственно к стеклянной микроматрице, имеющие структуру дискриминирующих ДНК-полинуклеотидов, приведенных в Таблице 2.
3. Способ типирования гена нейраминидазы вируса гриппа А, включающий выделение суммарной РНК из природного образца, проведение ОТ-ПЦР для амплификации сегмента генома вируса гриппа, кодирующего ген нейраминидазы в асимметричном режиме с использованием специфичных олигонуклеотидов-праймеров для получения флуоресцентно меченных преимущественно одноцепочечных ДНК, проведение ДНК-ДНК гибридизации полученных ампликонов с дискриминирующими зондами, входящими в состав биочипа, регистрацию флуоресцентного сигнала меченного образца с помощью регистрирующего устройства и интерпретацию полученных результатов, отличающийся тем, что при амплификации используют набор олигонуклеотидов-праймеров
NA_F1 5'-CTATAGGGAGCAAAAGCAGGAGT-3' и
NA_R1 5'-TAACAGGA(G/A)CA(C/T)TCCTC(A/G)TA(G/A)TG-3';
NA_F2 5'-CA(C/T)TA(C/T)GAGGA(G/A)TG(C/T)TCCTGTTA-3' и
NA_R2 5'-CACTATAGAAGTAGAAACAAGGAGTTTTTT-3'), а в качестве биочипа - микроматрицу, охарактеризованную в п.2.