ПРИМЕНЕНИЕ ДЕФЕНСИНОВ ПРИ ТУБЕРКУЛЕЗЕ

1. Применение варианта исходного дефенсина, содержащего замену в одном или нескольких положениях, соответствующих положениям 5, 9, 11, 13, 14, 17, 20, 23, 26, 31, 36 и 38 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2, для получения лекарственного средства для терапии заболеваний, вызываемых Mycobacterium, например туберкулеза; причем указанный вариант способен уничтожать или ингибировать клетки Mycobacterium tuberculosis; и где исходный дефенсин представляет собой полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:2 или полипептиду, кодируемому полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях высокой жесткости с последовательностью, кодирующей зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:1, или ее комплементарной цепью.
2. Применение по п.1, при котором исходный дефенсин представляет собой полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая на 95% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:2, предпочтительно, где исходный дефенсин содержит или состоит из зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2.
3. Применение по п.1, где замена в положении, соответствующем
положению 5, представляет собой Gly, Ser или Arg;
положению 9, представляет собой Gly, Ser или Asn;
положению 11, представляет собой Asn или Gly;
положению 13, представляет собой Leu, Val или Lys;
положению 14, представляет собой Leu, Phe, Lys или Arg;
положению 17, представляет собой Val или Gln;
положению 20, представляет собой Arg;
положению 23, представляет собой Arg;
положению 26, представляет собой Arg;
положению 31, представляет собой Ser или Thr;
положению 36, представляет собой Leu; и
положению 38, представляет собой Arg.
4. Применение по п.1, при котором вариант содержит замены в положениях, соответствующих положениям, выбранным из группы, состоящей из (а) положений 5 и 9; положений 5 и 13; положений 5 и 14; положений 9 и 13; положений 9 и 14; положений 13 и 14; положений 11 и 5; положений 11 и 9; положений 11 и 13; или положений 11 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2; (b) положений 5, 9 и 13; положений 5, 13 и 14; положений 9, 13 и 14; или положений 5, 9 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2 и (с) положений 5, 9, 13 и 14; или положений 5, 9, 11, 13 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2.
5. Применение по п.1, при котором вариант содержит одну или несколько замен, выбранных из группы, состоящей из:
N5G, N5S или N5R;
D9G, D9S или D9N;
D11N или D11G;
M13L, M13V или M13K;
Q14L, Q14F, Q14K или Q14R;
N17V или N17Q;
K20R;
K23R;
K26R;
A31S или A31T;
V36L; и
K38R.
6. Применение по п.1, при котором вариант содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична и предпочтительно по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26 или SEQ ID NO:27.
7. Применение по п.1, при котором вариант содержит или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26 или SEQ ID NO:27.
8. Способ уничтожения или ингибирования клеток Mycobacterium, включающий приведение в контакт клеток Mycobacterium с вариантом исходного дефенсина, содержащим замену в одном или нескольких положениях, соответствующих положениям 5, 9, 11, 13, 14, 17, 20, 23, 26, 31, 36 и 38 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2, где исходный дефенсин представляет собой полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:2 или полипептиду, кодируемому полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях высокой жесткости с последовательностью, кодирующей зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:1, или ее комплементарной цепью.
9. Способ по п.8, где исходный дефенсин представляет собой полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая на 95% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:2, предпочтительно, где исходный дефенсин содержит или состоит из зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2.
10. Способ по п.8, где замена в положении, соответствующем
положению 5, представляет собой Gly, Ser или Arg;
положению 9, представляет собой Gly, Ser или Asn;
положению 11, представляет собой Asn или Gly;
положению 13, представляет собой Leu, Val или Lys;
положению 14, представляет собой Leu, Phe, Lys или Arg;
положению 17, представляет собой Val или Gin;
положению 20, представляет собой Arg;
положению 23, представляет собой Arg;
положению 26, представляет собой Arg;
положению 31, представляет собой Ser или Thr;
положению 36, представляет собой Leu; и
положению 38, представляет собой Arg.
11. Способ по п.8, где вариант содержит замены в положениях, соответствующих положениям, выбранным из группы, состоящей из (а) положений 5 и 9; положений 5 и 13; положений 5 и 14; положений 9 и 13; положений 9 и 14; положений 13 и 14; положений 11 и 5; положений 11 и 9; положений 11 и 13; или положений 11 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2; (b) положений 5, 9 и 13; положений 5, 13 и 14; положений 9, 13 и 14; или положений 5, 9 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2 и (с) положений 5, 9, 13 и 14; или положений 5, 9, 11, 13 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2.
12. Способ по п.8, где вариант содержит одну или несколько замен, выбранных из группы, состоящей из
N5G, N5S или N5R;
D9G, D9S или D9N;
D11N или D11G;
M13L, M13V или M13K;
Q14L, Q14F, Q14K или Q14R;
N17V или N17Q;
K20R;
K23R;
K26R;
A31S или A31T;
V36L; и
K38R.
13. Способ по п.8, где вариант содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична и предпочтительно по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26 или SEQ ID NO:27.
14. Способ по п.8, где вариант содержит или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26 или SEQ ID NO:27.
15. Способ лечения заболеваний, вызываемых Mycobacterium, включающий введение пациенту при необходимости соответствующего лечения, эффективного, например эффективного против микобактерий; количества варианта исходного дефенсина, где вариант содержит замену в одном или нескольких положениях, соответствующих положениям 5, 9, 11, 13, 14, 17, 20, 23, 26, 31, 36 и 38 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2, и где исходный дефенсин представляет собой полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:2 или полипептиду, кодируемому полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях высокой жесткости с последовательностью, кодирующей зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:1, или ее комплементарной цепью.
16. Способ по п.15, где исходный дефенсин представляет собой полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая на 95% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:2, предпочтительно, где исходный дефенсин содержит или состоит из зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2.
17. Способ по п.15, где замена в положении, соответствующем
положению 5, представляет собой Gly, Ser или Arg;
положению 9, представляет собой Gly, Ser или Asn;
положению 11, представляет собой Asn или Gly;
положению 13, представляет собой Leu, Val или Lys;
положению 14, представляет собой Leu, Phe, Lys или Arg;
положению 17, представляет собой Val или Gln;
положению 20, представляет собой Arg;
положению 23, представляет собой Arg;
положению 26, представляет собой Arg;
положению 31, представляет собой Ser или Thr;
положению 36, представляет собой Leu; и
положению 38, представляет собой Arg.
18. Способ по п.15, где вариант содержит замены в положениях, соответствующих положениям, выбранным из группы, состоящей из (а) положений 5 и 9; положений 5 и 13; положений 5 и 14; положений 9 и 13; положений 9 и 14; положений 13 и 14; положений 11 и 5; положений 11 и 9; положений 11 и 13; или положений 11 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2; (b) положений 5, 9 и 13; положений 5, 13 и 14; положений 9, 13 и 14; или положений 5, 9 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2 и (с) положений 5, 9, 13 и 14; или положений 5, 9, 11, 13 и 14 зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2.
19. Способ по п.15, где вариант содержит одну или несколько замен, выбранных из группы, состоящей из
N5G, N5S или N5R;
D9G, D9S или D9N;
D11N или D11G;
M13L, M13V или M13K;
Q14L, Q14F, Q14K или Q14R;
N17V или N17Q;
K20R;
K23R;
K26R;
A31S или А31Т;
V36L; и
K38R.
20. Способ по п.15, где вариант содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична и предпочтительно по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26 или SEQ ID NO:27.
21. Способ по п.15, где вариант содержит или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:26 или SEQ ID NO:27.