БИОМАРКЕР

1. Специфичный биомаркер рака мочевого пузыря, содержащий:
(i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую SEQ ID NO:1, или ее фрагмент или вариант, или молекулу нуклеиновой кислоты, которая содержит указанную последовательность нуклеиновой кислоты; или
(ii) аминокислотную последовательность, содержащую SEQ ID NO:2, или ее фрагмент или вариант, или молекулу аминокислоты, которая содержит указанную аминокислотную последовательность.
2. Биомаркер по п.1, в котором его фрагменты или варианты содержат:
(i) последовательность нуклеиновой кислоты, которая имеет по меньшей мере приблизительно 50% или по меньшей мере приблизительно 60%, или по меньшей мере приблизительно 70%, или по меньшей мере приблизительно 75%, или по меньшей мере приблизительно 80%, или по меньшей мере приблизительно 85%, или по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере приблизительно 95%, или по меньшей мере приблизительно 96%, или по меньшей мере приблизительно 97%, или по меньшей мере приблизительно 98%, или по меньшей мере приблизительно 99% идентичности с последовательностью нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, последовательность нуклеиновой кислоты, которая способна гибридизоваться с ней в строгих условиях, и/или последовательность нуклеиновой кислоты, которая ей комплементарна;
(ii) аминокислотную последовательность, которая имеет по меньшей мере приблизительно 50%, или по меньшей мере приблизительно 60%, или по меньшей мере приблизительно 70%, или по меньшей мере приблизительно 75%, или по меньшей мере приблизительно 80%, или по меньшей мере приблизительно 85%, или по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере приблизительно 95%, или по меньшей мере приблизительно 96%, или по меньшей мере приблизительно 97%, или по меньшей мере приблизительно 98%, или по меньшей мере приблизительно 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO:2, или
(iii) аминокислотную последовательность, кодируемую последовательностью нуклеиновой кислоты (i).
3. Биомаркер по п.1 или 2, в котором его фрагменты содержат (i) по меньшей мере четыре, предпочтительно по меньшей мере пять, предпочтительно по меньшей мере шесть, предпочтительно по меньшей мере семь, предпочтительно по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO:2 или (ii) фрагмент последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, который кодирует по меньшей мере четыре, предпочтительно по меньшей мере пять, предпочтительно по меньшей мере шесть, предпочтительно по меньшей мере семь, предпочтительно по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO:2.
4. Биомаркер по п. 1 или 2, в котором его фрагменты или варианты представляют собой его функциональные фрагменты или варианты.
5. Способ диагностики рака мочевого пузыря у пациента или идентификации пациента, имеющего риск развития рака мочевого пузыря, где указанный способ включает:
(a) определение количества специфичного для рака биомаркера по любому из предыдущих пунктов в образце, полученном от пациента;
(b) сравнение в образце, полученном от пациента, количества определенного специфичного для рака биомаркера с количеством специфичного для рака биомаркера в нормальном контроле;
в котором разница между количеством специфичного для рака биомаркера в образце, полученном от пациента, и количеством специфичного для рака биомаркера в нормальном контроле связана с наличием рака мочевого пузыря или связана с риском развития рака мочевого пузыря.
6. Способ по п.5 для выявления рака на ранней стадии, в котором повышение между контролем и образцом, полученным от пациента, указывает на наличие рака на ранней стадии.
7. Способ по п.5 для выявления рака на поздней стадии, в котором повышение между контролем и образцом, полученным от пациента, указывает на наличие рака на поздней стадии.
8. Способ мониторинга прогрессирования рака мочевого пузыря у пациента, где указанный способ включает:
(a) определение количества специфичного для рака биомаркера по любому из пп.1-4 в образце, полученном от пациента;
(b) сравнение в образце, полученном от пациента, количества определенного специфичного для рака биомаркера с количеством специфичного для рака биомаркера в нормальном контроле; и
(с) повторение этапов (a) и (b) через два или более интервалов времени,
в котором увеличение с течением времени количества специфичного для рака биомаркера в образце, полученном от пациента, связано с увеличением прогрессирования рака мочевого пузыря, а уменьшение с течением времени количества специфичного для рака биомаркера в образце, полученном от пациента, связано с уменьшением прогрессирования рака мочевого пузыря.
9. Способ по п.8 для мониторинга изменения стадии рака, в котором увеличение относительно образца более ранней стадии или контроля указывает на прогрессирование рака с более ранней стадии до более поздней стадии заболевания.
10. Способ мониторинга эффективности лечения рака мочевого пузыря, включающий выявление и/или количественную оценку наличия специфичного для рака биомаркера по любому из пп.1-4 в образце, полученном от пациента.
11. Способ по любому из пп.5-10, в котором образец включает биологическую жидкость или ткань, полученную от пациента.
12. Способ по п.11, в котором биологическая жидкость или ткань включает мочу.
13. Способ лечения пациента, страдающего раком мочевого пузыря, где способ включает введение пациенту терапевтически эффективного количества (i) биомаркера по любому из пп.1-4, или (ii) антитела или его фрагмента, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.1-4.
14. Способ по п.13, в котором антитело конъюгировано с цитотоксическим агентом.
15. Способ визуализации рака мочевого пузыря у пациента, где способ включает введение пациенту антитела или его фрагмента, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.1-4.
16. Способ по любому из пп.13-15, в котором антитело конъюгировано с поддающимся обнаружению маркером.
17. Композиция, содержащая биомаркер по любому из пп.1-4, или антитело или его фрагмент, которые связываются с биомаркером по любому из пп.1-4.
18. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по п.17.
19. Вакцина от рака мочевого пузыря, содержащая биомаркер по любому из пп.1-4.
20. Применение специфичного для рака биомаркера по любому из пп.1-4, поддающегося обнаружению в жидкости организма, в качестве биомаркера рака мочевого пузыря.
21. Применение (i) биомаркера по любому из пп.1-4, или (ii) антитела, или его фрагмента, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.1-4, для изготовления лекарственного средства для лечения рака мочевого пузыря.
22. Композиция, содержащая (i) биомаркер по любому из пп.1-4, или (ii) антитело, или его фрагмент, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.1-4, где указанная композиция предназначена для применения в лечении рака мочевого пузыря.
23. Антитело или его фрагмент, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.1-4, для применения в способе визуализации рака мочевого пузыря у пациента.
24. Набор для применения в способе по любому из пп.5-16 или применения по п.20, где указанный набор включает лиганд, способный связываться или специфическим образом распознавать специфичный для рака биомаркер по любому из пп.1-4 и поддающийся обнаружению в жидкости организма, а также репортерные средства.
25. Специфичный биомаркер рака легкого, содержащий:
(i) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую SEQ ID NO:1, или ее фрагмент или вариант, или молекулу нуклеиновой кислоты, которая содержит указанную последовательность нуклеиновой кислоты; или
(ii) аминокислотную последовательность, содержащую SEQ ID NO:2, или ее фрагмент или вариант, или молекулу аминокислоты, которая содержит указанную аминокислотную последовательность.
26. Биомаркер по п.25, в котором его фрагменты или варианты содержат:
(i) последовательность нуклеиновой кислоты, которая имеет по меньшей мере приблизительно 50%, или по меньшей мере приблизительно 60%, или по меньшей мере приблизительно 70%, или по меньшей мере приблизительно 75%, или по меньшей мере приблизительно 80%, или по меньшей мере приблизительно 85%, или по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере приблизительно 95%, или по меньшей мере приблизительно 96%, или по меньшей мере приблизительно 97%, или по меньшей мере приблизительно 98%, или по меньшей мере приблизительно 99% идентичности с последовательностью нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, последовательность нуклеиновой кислоты, которая способна гибридизоваться с ней в строгих условиях, и/или последовательность нуклеиновой кислоты, которая ей комплементарна;
(ii) аминокислотную последовательность, которая имеет по меньшей мере приблизительно 50%, или по меньшей мере приблизительно 60%, или по меньшей мере приблизительно 70%, или по меньшей мере приблизительно 75%, или по меньшей мере приблизительно 80%, или по меньшей мере приблизительно 85%, или по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере приблизительно 95%, или по меньшей мере приблизительно 96%, или по меньшей мере приблизительно 97%, или по меньшей мере приблизительно 98%, или по меньшей мере приблизительно 99% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO:2, или
(iii) аминокислотную последовательность, кодируемую последовательностью нуклеиновой кислоты (i).
27. Биомаркер по п.25 или 26, в котором его фрагменты содержат (i) по меньшей мере четыре, предпочтительно по меньшей мере пять, предпочтительно по меньшей мере шесть, предпочтительно по меньшей мере семь, предпочтительно по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO:2 или (ii) фрагмент последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, который кодирует по меньшей мере четыре, предпочтительно по меньшей мере пять, предпочтительно по меньшей мере шесть, предпочтительно по меньшей мере семь, предпочтительно по меньшей мере восемь последовательных аминокислот из SEQ ID NO:2.
28. Биомаркер по пп.25 или 26, в котором его фрагменты или варианты представляют собой его функциональные фрагменты или варианты.
29. Способ диагностики рака легкого у пациента или идентификации пациента, имеющего риск развития рака легкого, где указанный способ включает:
(a) определение количества специфичного для рака биомаркера по любому из пп.25-28 в образце, полученном от пациента;
(b) сравнение в образце, полученном от пациента, количества определенного специфичного для рака биомаркера с количеством специфичного для рака биомаркера в нормальном контроле;
в котором разница между количеством специфичного для рака биомаркера в образце, полученном от пациента, и количеством специфичного для рака биомаркера в нормальном контроле связана с наличием рака легкого или связана с риском развития рака легкого.
30. Способ по п.29 для выявления рака на ранней стадии, в котором повышение между контролем и образцом, полученным от пациента, указывает на наличие рака на ранней стадии.
31. Способ по п.29 для выявления рака на поздней стадии, в котором повышение между контролем и образцом, полученным от пациента, указывает на наличие рака на поздней стадии.
32. Способ мониторинга прогрессирования рака легкого у пациента, где указанный способ включает:
(a) определение количества специфичного для рака биомаркера по любому из пп.25-28 в образце, полученном от пациента;
(b) сравнение в образце, полученном от пациента, количества определенного специфичного для рака биомаркера с количеством специфичного для рака биомаркера в нормальном контроле и
(с) повторение этапов (a) и (b) через два или более интервалов времени,
в котором увеличение с течением времени количества специфичного для рака биомаркера в образце, полученном от пациента, связано с увеличением прогрессирования рака легкого, а уменьшение с течением времени количества специфичного для рака биомаркера в образце, полученном от пациента, связано с уменьшением прогрессирования рака легкого.
33. Способ по п.32 для мониторинга изменения стадии рака, в котором увеличение относительно образца более ранней стадии или контроля указывает на прогрессирование рака с более ранней стадии до более поздней стадии заболевания.
34. Способ мониторинга эффективности лечения рака легкого, включающий выявление и/или количественную оценку наличия специфичного для рака биомаркера по любому из пп.25-28 в образце, полученном от пациента.
35. Способ по любому из пп.29-34, в котором образец включает биологическую жидкость или ткань, полученную от пациента.
36. Способ по п.35, в котором биологическая жидкость или ткань включает мокроту.
37. Способ лечения пациента, страдающего раком легкого, где способ включает введение пациенту терапевтически эффективного количества (i) биомаркера по любому из пп.25-28, или (ii) антитела, или его фрагмента, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.25-28.
38. Способ по п.37, в котором антитело конъюгировано с цитотоксическим агентом.
39. Способ визуализации рака легкого у пациента, где способ включает введение пациенту антитела или его фрагмента, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.25-28.
40. Способ по любому из пп.37-39, в котором антитело конъюгировано с поддающимся обнаружению маркером.
41. Композиция, содержащая биомаркер по любому из пп.25-28, или антитело или его фрагмент, которые связываются с биомаркером по любому из пп.25-28.
42. Фармацевтическая композиция, содержащая композицию по п.41.
43. Вакцина от рака легкого, содержащая биомаркер по любому из пп.25-28.
44. Применение специфичного для рака биомаркера по любому из пп.25-28, поддающегося обнаружению в жидкости организма, в качестве биомаркера рака легкого.
45. Применение (i) биомаркера по любому из пп.25-28, или (ii) антитела, или его фрагмента, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.25-28, для изготовления лекарственного средства для лечения рака легкого.
46. Композиция, содержащая (i) биомаркер по любому из пп.25-28, или (ii) антитело или его фрагмент, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.25-28, где указанная композиция предназначена для применения в лечении рака легкого.
47. Антитело или его фрагмент, которые специфическим образом связываются с биомаркером по любому из пп.25-28, для применения в способе визуализации рака легкого у пациента.
48. Набор для применения в способе по любому из пп.29-40 или применения по п.44, где указанный набор включает лиганд, способный связываться или специфическим образом распознавать специфичный для рака биомаркер по любому из пп.25-28 и поддающийся обнаружению в жидкости организма, а также репортерные средства.