ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЙ ИНДИВИДУАЛЬНЫЙ ПРОТЕОМ-ОСНОВАННЫЙ ТАРГЕТНЫЙ КЛЕТОЧНЫЙ ПРЕПАРАТ, СПОСОБ ЕГО ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЕ ЭТОГО ПРЕПАРАТА ДЛЯ ТЕРАПИИ РАКА И ДРУГИХ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ НОВООБРАЗОВАНИЙ

1. Способ получения противоопухолевого индивидуального протеом-основанного таргетного клеточного препарата для персонализированной терапии рака и других новообразований, включающий в себя:
забор, выделение и изоляцию постнатальных тканеспецифичных мультипотентных аутологичных стволовых клеток (АСК) и/или аутологичных прогениторных клеток (АПК) для их последующего протеомного и полнотранскриптомного анализов, причем тип указанных АСК и/или АПК выбирают в соответствии с диагностированной у пациента нозологией онкологического заболевания и локализацией неопластического процесса;
забор, выделение и изоляцию постнатальных тканеспецифичных мультипотентных АСК, и/или АПК, и/или мультипотентных аллогенных HLA-гаплоидентичных стволовых клеток для последующего ремоделирования их протеомного профиля, причем тип этих клеток выбирают в соответствии с диагностированной у пациента нозологией онкологического заболевания и локализацией неопластического процесса;
забор, выделение и изоляцию раковых стволовых клеток (РСК) из опухоли пациента по соответствующим специфическим маркерам клеточной поверхности;
проведение протеомного анализа лизатов изолированных АСК и/или АПК и указанных РСК с картированием и получением протеомных профилей нормализованной сигнальной интенсивности белков этих клеток;
проведение полнотранскриптомного анализа экспресии генов изолированных АСК и/или АПК и РСК с картированием и получением полнотранскриптомных профилей нормализованной сигнальной интенсивности экспрессии генов этих клеток;
инвентаризация и определение видоспецифичного набора белков, каждый из которых содержится в полученных протеомных профилях как изолированных АСК и/или АПК, так и указанных РСК;
проведение «грубого» и «тонкого» сравнительного биоинформационного анализа ранее определенного набора белков протеомного профиля АСК (АПК) и РСК для идентификации в указанных РСК одного или нескольких внутриклеточных сигнальных путей, не подвергшихся неопластической трансформации в результате канцерогенеза, и определения одного или нескольких белков-мишеней, являющихся мембранными акцепторами идентифицированных сигнальных путей;
проведение биоинформационного анализа полнотранскриптомного профиля экспрессии генов РСК и подтверждение сохранности и функциональной значимости основных структурных компонентов идентифицированных сигнальных путей в РСК;
определение белков-лигандов, способных активировать белки-мишени диагностированных функционально сохранных сигнальных путей РСК;
проведение сравнительного анализа ранее полученных полнотранскриптомных профилей, изолированных АСК и/или АПК с транскриптомными профилями, содержащимися в известных международных базах данных транскриптомов, для определения одного или нескольких пертурбогенов, способных модифицировать профиль экспрессии генов стволовых клеток, выделенных для дальнейшего ремоделирования их протеомного профиля и таргетной модификации транскриптомного профиля, в направлении секреции ранее определенных белков-лигандов, способных регуляторно воздействовать на идентифицированные сигнальные пути;
ремоделирование протеомного профиля выделенных для этого стволовых клеток ранее определенными пертурбогенами с получением в результате этого модифицированного транскриптомного профиля различных клеточных систем (стволовых клеток, прогенеторов, иммунокомпетентных клеток и т.д.), способных оказывать регуляторное воздействие на РСК пациента.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что белки-лиганды определяют с использованием известных баз данных белок-белковых взаимодействий.
3 Способ по п.1, отличающийся тем, что сравнительный анализ транскриптомных профилей проводят с использованием метода распознавания образов.
4. Способ по п.1, отличающийся тем, что в качестве пертурбогенов используют фармацевтические препараты, белковые препараты, антитела к белкам, микроРНК, матричные РНК, низкомолекулярные химические вещества, цитокины, факторы роста, нейротрофины, гормоны.
5. Способ по п.1, отличающийся тем, что ремоделирование протеомного профиля выделенных для этого стволовых клеток проводят путем добавления ранее определенных пертурбогенов в культуру ремоделируемых клеток, выдержки пертурбогенов в культуре и последующей отмывки ремоделированных клеток от пертурбогенов.
6. Способ по п.1, отличающийся тем, что в качестве указанных АСК, и/или АПК, и/или HLA-CK используют гемопоэтические, нейральные или мезенхимальные стволовые клетки.
7. Противоопухолевый индивидуальный протеом-основанный таргетный клеточный препарат, содержащий постнатальные тканеспецифичные мультипотентные аутологичные стволовые клетки, и/или аутологичные прогениторные клетки, и/или мультипотентные аллогенные HLA-гаплоидентичные стволовые клетки с ремоделированным протеомным профилем, полученные способом по любому из пп.1-6.
8. Применение противоопухолевого индивидуального протеом-основанного таргетного клеточного препарата, полученного способом по любому из пп.1-6, для персонализированной терапии злокачественных и доброкачественных новообразований у человека или другого млекопитающего.