СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ КЛИНИЧЕСКОГО ОТВЕТА НА ХИМИОТЕРАПИЮ У СУБЪЕКТА, ИМЕЮЩЕГО РАК

1. Способ прогнозирования in vitro клинического ответа субъекта, страдающего от рака, на химиотерапевтическое лечение, включающий определение уровня экспрессии гена холинкиназы альфа (ChoKα) в образце от субъекта.
2. Способ по п. 1, где способ дополнительно включает сравнение уровня экспрессии ChoKα с референсным значением, где изменение уровня экспрессии гена ChoKα в указанном образце в сравнении с указанным референсным значением является показателем низкого клинического ответа субъекта на указанное химиотерапевтическое лечение или высокого клинического ответа субъекта на указанное химиотерапевтическое лечение.
3. Способ in vitro по п. 2, где изменение уровней экспрессии ChoKα представляет повышение указанного уровня экспрессии в сравнении с указанным референсным значением, и где повышение указанного уровня экспрессии является показателем низкого клинического ответа, или где изменение уровня экспрессии ChoKα представляет снижение указанного уровня экспрессии в сравнении с указанным референсным значением, и где снижение указанного уровня экспрессии является показателем высокого клинического ответа.
4. Способ разработки in vitro индивидуальной терапии для субъекта, страдающего от рака, включающий определение уровня экспрессии гена холинкиназы альфа (ChoKα) в образце от субъекта.
5. Способ in vitro по п. 4, где способ дополнительно включает сравнение уровня экспрессии ChoKα с референсным значением,
где снижение или отсутствие изменения уровня экспрессии гена ChoKα в указанном образце в сравнении с референсным значением является показателем того, что субъект является кандидатом для терапии, основанной на указанном химиотерапевтическом лечении,
где повышение уровня экспрессии гена ChoKα в указанном образце в сравнении с указанным референсным значением является показателем того, что субъект является кандидатом для лечения препаратом, выбранным из группы, состоящей из:
(i) ингибитора ChoKα,
(ii) антиметаболита фолатов,
(iii) антимикротубулярного препарата,
(iv) препарата, нацеленного на EGFR,
(v) комбинации одного или более из вышеуказанных препаратов (i)-(iv).
6. Способ in vitro по п. 5, где химиотерапевтическое лечение представляет собой химиотерапевтическое лечение, основанное на препаратах платины.
7. Способ in vitro по любому из пп. 1-4, где рак представляет собой немелкоклеточный рак легких (NSCLC).
8. Способ in vitro по п. 7, где NSCLC выбран из плоскоклеточной карциномы легких, крупноклеточной карциномы легких и аденокарциномы легких.
9. Способ in vitro по п. 7, где NSCLC представляет NSCLC на поздних стадиях, предпочтительно, стадиях IIIA, IIIB или IV.
10. Способ in vitro по п. 1 или 4, где образец представляет собой образец ткани, предпочтительно образец опухолевой ткани, более предпочтительно образец опухолевой ткани легких.
11. Применение реагента, с помощью которого возможно определять уровни экспрессии гена холинкиназы альфа (ChoKα) в образце от субъекта, страдающего от рака, для прогнозирования клинического ответа указанного субъекта на химиотерапевтическое лечение и разработки индивидуальной терапии для субъекта, страдающего от указанного рака.
12. Применение по п. 11, где рак представляет немелкоклеточный рак легких (NSCLC).
13. Применение по п. 11 или 12, где химиотерапевтическое лечение представляет собой химиотерапевтическое лечение, основанное на препаратах платины.
14. Химиотерапевтическое лечение, основанное на препаратах платины, для применения в лечении NSCLC у субъекта, где образец указанного субъекта показывает низкие или такие же уровни экспрессии гена ChoKα в сравнении с референсными значениями.
15. Ингибитор ChoKα, антиметаболит фолатов, препарат, нацеленный на EGFR, или комбинация одного или более вышеуказанных препаратов для применения в терапии субъекта, страдающего NSCLC, где образец указанного субъекта показывает высокие уровни экспрессии гена ChoKα в сравнении с референсными значениями.
16. Способ in vitro идентификации пациента, имеющего вероятность ответа на терапию препаратом, выбранным из группы, состоящей из:
(i) ингибитора ChoKα;
(ii) антиметаболита фолатов;
(iii) антимикротубулярного препарата;
(iv) препарата, нацеленного на EGFR;
(v) комбинации одного или более вышеуказанных препаратов (i)-(iv),
включающий определение уровня экспрессии гена ChoKα в образце указанного пациента и сравнение указанного уровня с референсным значением,
где повышение уровня экспрессии гена ChoKα в указанном образце в сравнении с указанным референсным значением является показателем того, что пациент имеет вероятность ответа на указанную терапию, или
где снижение или отсутствие изменения уровня экспрессии гена ChoKα в указанном образце в сравнении с указанным референсным значением является показателем того, что пациент не имеет вероятности ответа на указанную терапию.
17. Способ по п. 16, где препарат является ингибитором ChoKα.
18. Способ по п. 17, где ингибитор ChoKα представляет соединение, выбранное из таблицы 2.
19. Способ по п. 18, где ингибитор ChoKα имеет формулу:
или его аналог, соль или сольват.
20. Способ по любому из пп. 16-19, где пациент страдает от рака.
21. Способ по п. 20, где рак выбран из группы, состоящей из рака легких, рака молочной железы, рака ободочной кишки и рака поджелудочной железы.
22. Способ по п. 21, где рак представляет рак легких.
23. Способ по п. 22, где рак легких представляет немелкоклеточный рак легких (NSCLC).
24. Способ по п. 23, где NSCLC выбран из плоскоклеточной карциномы легких, крупноклеточной карциномы легких и аденокарциномы легких.
25. Способ по любому из п.п. 23 или 24, где NSCLC представляет NSCLC на поздних стадиях, предпочтительно стадиях IIIA, IIIB или IV.
26. Способ по п. 16, где образец представляет собой образец ткани, предпочтительно образец опухолевой ткани, более предпочтительно, образец опухолевой ткани легких.
27. Способ по п. 16, где уровни экспрессии гена ChoKα определяют анализом уровней мРНК, кодированной указанным геном, или анализом уровней белка ChoKα или его вариантов.
28. Способ по п. 27, где уровни экспрессии мРНК определяют количественной ПЦР, предпочтительно ПЦР в режиме реального времени, и/или где уровни экспрессии белка ChoKα, или его вариантов определяют вестерн-блоттингом или иммуногистохимией.
29. Применение реагента, с помощью которого можно определять уровни экспрессии гена ChoKα в образце от субъекта, страдающего от рака, для прогнозирования клинического ответа или отсутствия клинического ответа у указанного субъекта на лечение препаратом, выбранным из группы, состоящей из:
(i) ингибитора ChoKα;
(ii) антиметаболита фолатов;
(iii) антимикротубулярного препарата;
(iv) препарата, нацеленного на EGFR;
(v) комбинации одного или более вышеуказанных препаратов (i)-(iv).
30. Применение по п. 29, где препарат является ингибитором ChoKα.
31. Применение по п. 30, где ингибитор ChoKα выбран из таблицы 2.
32. Применение по п. 31, где ингибитор ChoKα имеет формулу:
или его аналог, соль или сольват.
33. Применение по любому из пп. 29-32, где пациент страдает от рака.
34. Применение по п. 33, где рак выбран из группы, состоящей из рака легких, рака молочной железы, рака ободочной кишки и рака поджелудочной железы.
35. Применение по п. 34, где рак представляет собой рак легких.
36. Применение по п. 35, где рак легких представляет собой немелкоклеточный рак легких (NSCLC).
37. Применение по п. 36, где NSCLC выбран из плоскоклеточной карциномы легких, крупноклеточной карциномы легких и аденокарциномы легких.
38. Применение по любому из п.п. 36 или 37, где NSCLC представляет NSCLC на поздних стадиях, предпочтительно стадиях IIIA, IIIB или IV.
39. Применение по п. 29, где образец представляет собой образец ткани, предпочтительно образец опухолевой ткани, более предпочтительно образец опухолевой ткани легких.
40. Применение по п. 29, где уровни экспрессии гена ChoKα определяют анализом уровня мРНК, кодированной указанным геном, или анализом уровней белка ChoKα или его вариантов.
41. Применение по п. 30, где уровни экспрессии мРНК определяют количественной ПЦР, предпочтительно, ПЦР в режиме реального времени, и/или где уровни экспрессии белка ChoKα или его вариантов определяют вестерн-блоттингом или иммуногистохимией.