МОЛЕКУЛЫ мРНК ВАРИАНТОВ KRAS

1. Молекула мРНК, включающая последовательность мРНК, которая кодирует аминокислотную последовательность, содержащую сигнальный пептид CTLA4, вариант пептида KRAS, производную от PADRE последовательность Т-хелперного эпитопа и трансмембранный домен CTLA4 или его часть.
2. Молекула мРНК по п. 1, где вариант пептида KRAS содержит аминокислотный остаток G12C варианта KRAS, аминокислотный остаток G12D варианта KRAS, аминокислотный остаток G12V варианта KRAS, аминокислотный остаток G12R варианта KRAS или аминокислотный остаток G13D варианта KRAS.
3. Молекула мРНК по п. 1 или 2, где молекула мРНК не кодирует пептид или полипептид стимулятора генов интерферона.
4. Молекула мРНК по любому из пп. 1-3, дополнительно включающая элемент 3' UTR альфа-глобина.
5. Молекула мРНК по п. 4, где мРНК, кодирующая вариант пептида KRAS, расположена с 5'-конца элемента 3'-UTR альфа-глобина.
6. Молекула мРНК по любому из пп. 1-5, где вариант пептида KRAS содержит последовательность SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11 или SEQ ID NO: 12.
7. Молекула мРНК по любому из пп. 1-5, в которых молекула содержит SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56 или SEQ ID NO: 57.
8. Молекула мРНК по любому из пп. 1-5, где молекула мРНК представлена в последовательностях SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66 или SEQ ID NO: 67.
9. Молекула мРНК по любому из пп. 1-5, где молекула мРНК представлена в последовательностях SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61 или SEQ ID NO: 62.
10. Молекула мРНК по любому из пп. 1-5, где молекула мРНК кодирует вариант пептида KRAS, представленный в последовательностях SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51 или SEQ ID NO: 52.
11. Фармацевтическая композиция, включающая молекулу мРНК по любому из пп. 1-10, и один или несколько фармацевтически приемлемых носителей или эксципиентов.
12. Фармацевтическая композиция по п. 11, которая содержит 1, 2, 3, 4 или 5 разных молекул мРНК, причем каждая молекула мРНК кодирует отдельный вариант пептида KRAS.
13. Фармацевтическая композиция по п. 11, которая содержит молекулу мРНК, кодирующую единственный вариант пептида KRAS.
14. Фармацевтическая композиция по п. 11, которая содержит две разные молекулы мРНК, причем каждая молекула мРНК кодирует отдельный вариант пептида KRAS.
15. Фармацевтическая композиция по п. 11, которая содержит три молекулы мРНК, причем каждая молекула мРНК кодирует отдельный вариант пептида KRAS.
16. Фармацевтическая композиция по п. 11, которая содержит четыре молекулы мРНК, причем каждая молекула мРНК кодирует отдельный вариант пептида KRAS.
17. Фармацевтическая композиция по п. 11, где композиция содержит пять молекул мРНК, причем каждая молекула мРНК кодирует отдельный вариант пептида KRAS.
18. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 13-17, дополнительно содержащая катионный липид, стерол, нейтральный липид и ПЭГ-липид.
19. Фармацевтическая композиция по п. 18, где катионный липид имеет формулу:
или его фармацевтически приемлемой соли, где
1
2
x
L или L каждый независимо означает -O(С=O)-, -(С=O)O-, -С(=O)-, -О-, -S(O)-, -S-S-, -C(=O)S-, -SC(=O)-,
a
a
a
a
a
a
1
2
-NRC(=O)-, -C(=O)NR-, -NRC(=O)NR-, -OC(=O)NR- или -NRC(=O)O-, предпочтительно L или L означает -O(C=O)- или
-(C=O)O-;
1
2
1
12
1
12
G и G каждый независимо означает незамещенный C-C алкилен или C-С алкенилен;
3
1
24
1
24
3
8
3
8
G означает С-С алкилен, С-С алкенилен, С-С циклоалкилен или С-C циклоалкенилен;
a
1
12
R означает Н или С-С алкил;
1
2
6
24
6
24
R и R каждый независимо означает С-С алкил или С-Салкенил;
3
5
4
4
5
4
R означает Н, OR, CN, -C(=O)OR, -OC(=O)R или -NRC(=O)R;
4
1
12
R означает C-C алкил;
5
1
6
R означает Н или C-С алкил; и
х означает 0, 1 или 2.
1
2
3
3
5
1
24
1
24
20. Фармацевтическая композиция по п. 19, где: L и L каждый независимо означает -O(С=O)- или (С=O)-O-; G означает С-С алкилен или C-C алкенилен; и R означает Н или OR.
1
2
1
2
21. Фармацевтическая композиция по п. 19 или 20, где: L и L каждый независимо означает -O(С=O)- или (С=O)-O-; и R и R каждый независимо имеет одну из следующих структур:
3
22. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 18-20, где R является ОН.
23. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 19-22, где катионным липидом является
24. Фармацевтическая композиция по п. 18, в которой ПЭГ-липид имеет формулу:
8
9
где R и R каждый независимо является прямой или разветвленной, насыщенной или ненасыщенной алкильной цепью, содержащей от 10 до 30 атомов углерода, где алкильная цепь необязательно прерывается одной или несколькими эфирными связями; и среднее значение w варьирует от 30 до 60.
8
9
25. Фармацевтическая композиция по п. 24, в которой R и R в ПЭГ-липиде являются насыщенными алкильными цепями.
26. Фармацевтическая композиция по любому из пп 18, 24 или 25, где ПЭГ-липидом является
где среднее значение n варьирует от 30 до 60, предпочтительно, где среднее значение n примерно равно 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, наиболее предпочтительно, где среднее значение n равно 49.
27. Фармацевтическая композиция по п. 18 или 24-26, где ПЭГ-липидом является 2-тРЕС2000-n,n-дитетрадецилацетамид.
28. Фармацевтическая композиция по п. 18, в которой нейтральным липидом является дистеароилфосфохолин (DSPC), диолеоилфосфатидилхолин (DOPC), дипальмитоилфосфатидилхолин (DPPC), диолеоилфосфатидилглицерин (DOPG), дипальмитоилфосфатидилглицерин (DPPG), диолеоил-фосфатидилэтаноламин (DOPE), пальмитоилолеоилфосфатидилхолин (РОРС), пальмитоилолеил-фосфатидилэтаноламин (POPE) и диолеоил-фосфатидилэтаноламин 4-(N-малеимидометил)-циклогексан-1 карбоксилат (DOPE-mal), дипальмитоил фосфатидилэтаноламин (DPPE), димиристоил-фосфоэтаноламин (DMPE), дистеароил-фосфатидилэтаноламин (DSPE), 16-O-монометил РЕ, 16-О-диметил РЕ, 18-1-транс РЕ, 1-стеариоил-2-олеоил фосфатидилэтаноламин (SOPE) или 1,2-диелаидоил-sn-глицеро-3-фосфоэтаноламин (трансООРЕ).
29. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 18 или 28, в которой нейтральным липидом является дистеароилфосфохолин.
30. Фармацевтическая композиция по п. 29, в которой дистеароилфосфохолином является 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолин.
31. Фармацевтическая композиция по п. 18, в которой стеролом является холестерин.
32. Фармацевтическая композиция по п. 18, где ПЭГ-липидом является 2-mPEG2000-n,n-дитетрадецилацетамид, нейтральным липидом является 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолин, стеролом является холестерин и катионным липидом является
33. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 18-32, содержащая в мольном соотношении примерно 20-60% катионного липида, 5-25% нейтрального липида, 25-55% стерола и 0,5-15% ПЭГ-липида.
34. Фармацевтическая композиция по п. 33, содержащая в мольном соотношении примерно 50:10:38,5:1,5, 47,5:10:40,8:1,7 или 47,4:10:40,9:1,7 мольных % катионного липида: нейтрального липида: холестерина: ПЭГ-липида.
35. Фармацевтическая композиция по п. 18, включающая:
одну или несколько молекул мРНК, представленных в SEQ ID NO: 63-67;
холестерин;
2-mПЭГ2000-n,n-дитетрадецилацетамид;
1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолин; и
катионный липид
36. Фармацевтическая композиция по п. 35, где мольное соотношение катионного липида: 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолин: холестерин: 2-mПЭГ2000-n,n-дитетрадецилацетамид составляет приблизительно 50:10:38,5:1,5, 47,5:10:40,8:1,7 или 47,4:10:40,9:1,7 мол.%.
37. Фармацевтическая композиция по п. 18, включающая:
одну или несколько молекул мРНК, представленных в SEQ ID NOS: 58-62;
холестерин;
2-mПЭГ2000-n,n-дитетрадецилацетамид;
1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолин; и
катионный липид
38. Фармацевтическая композиция по п. 37, где мольное соотношение катионного липида: 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолина: холестерина: 2-mПЭГ2000-n,n-дитетрадецилацетамида составляет приблизительно 50:10:38,5:1,5, 47,5:10:40,8:1,7 или 47,4:10:40,9:1,7 мол.%.
39. Набор, содержащий мРНК по любому из пп. 1-17 и необязательно инструкции с информацией о введении и дозировке молекулы мРНК.
40. Способ лечения рака, включающий введение пациенту, который в этом нуждается, эффективного количества молекулы мРНК по любому из пп. 1-17 или фармацевтической композиции по любому из пп. 18-38, где рак является солидной опухолью, которая представляет собой рак мочевого пузыря, рак груди, рак шейки матки, колоректальный рак, рак эндометрия, рак головы и шеи, рак печени, рак легких, меланому, рак яичников, рак поджелудочной железы, рак простаты, рак почек, рак желудка, рак яичек, рак щитовидной железы, рак матки или уротелиальный рак.
41. Способ по п. 40, где рак является колоректальным раком, раком поджелудочной железы или раком легких.
42. Способ по п. 41, где рак легких является немелкоклеточным раком легких.
43. Способ по любому из пп. 40-42, где у субъекта типировали опухоль.
44. Способ по п. 43, где у субъекта типировали опухоль по одной или нескольким мутациям KRAS G12D, G12C, G12R, G12V или G13D.
45. Способ по любому из пп. 40-42, где у субъекта типировали опухоль по лейкоцитарному антигену человека (HLA).
46. Способ по любому из пп. 40-42, где у субъекта типировали опухоль и типировали HLA.
47. Способ по любому из пп. 40-46, где молекулу мРНК вводят внутримышечно.
48. Молекула мРНК по любому из пп. 1-17 или фармацевтическая композиция по пп. 18-38 для применения в терапии.
49. Молекула мРНК по любому из пп.1-17 или фармацевтическая композиция по любому из пп. 18-38 для применения в лечении рака, где рак является солидной опухолью, которая представляет собой рак мочевого пузыря, рак груди, рак шейки матки, колоректальный рак, рак эндометрия, рак головы и шеи, рак печени, рак легких, меланому, рак яичников, рак поджелудочной железы, рак простаты, рак почек, рак желудка, рак яичек, рак щитовидной железы, рак матки или уротелиальный рак.
50. Молекула мРНК для применения по п. 49, где рак является колоректальным раком, раком поджелудочной железы или раком легких.
51. Молекула мРНК для применения по п. 50, где рак легких является немелкоклеточным раком легких.
52. Применение молекулы мРНК по любому из пп. 1-17 или фармацевтической композиции по любому из пп. 18-38 для получения лекарственного средства для лечения рака, где рак является солидной опухолью, которая представляет собой рак мочевого пузыря, рак груди, рак шейки матки, колоректальный рак, рак эндометрия, рак головы и шеи, рак печени, рак легких, меланому, рак яичников, рак поджелудочной железы, рак простаты, рак почек, рак желудка, рак яичек, рак щитовидной железы, рак матки или уротелиальный рак.
53. Применение по п. 52, где рак является колоректальным раком, раком поджелудочной железы или раком легких.
54. Применение по п. 53, где рак легких является немелкоклеточным раком легких.