КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДЛЯ БУСТИНГА ЭФФЕКТИВНОСТИ АДОПТИВНОЙ КЛЕТОЧНОЙ ИММУНОТЕРАПИИ

1. Способ улучшения адоптивной клеточной иммунотерапии, включающий:
(a) введение субъекту эффективного количества популяции модифицированных Т-клеток человека, содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует антигенсвязывающий белок, при этом антигенсвязывающий белок содержит гидрофобную часть, расположенную между внеклеточным связывающим компонентом и внутриклеточным эффекторным компонентом; и
(b) введение субъекту эффективного количества популяции модифицированных гемопоэтических клеток-предшественников человека, модифицированных клеток иммунной системы человека или их комбинации, содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует антиген, при этом внеклеточный связывающий компонент антигенсвязывающего белка из модифицированных Т-клеток человека этапа (а) является специфичным к антигену, кодируемому популяцией модифицированных клеток данного этапа (b);
тем самым осуществляя бустинг, увеличение или усиление эффективности адоптивной клеточной иммунотерапии.
2. Способ лечения заболевания у субъекта, включающий стадии улучшения адоптивной клеточной иммунотерапии:
(a) введение субъекту эффективного количества популяции модифицированных Т-клеток человека, содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует антигенсвязывающий белок, при этом антигенсвязывающий белок содержит гидрофобную часть, расположенную между внеклеточным связывающим компонентом и внутриклеточным эффекторным компонентом;
(b) введение субъекту эффективного количества популяции модифицированных гемопоэтических клеток-предшественников человека, модифицированных клеток иммунной системы человека или их комбинации, содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует антиген, при этом внеклеточный связывающий компонент антигенсвязывающего белка из модифицированных Т-клеток человека этапа (а) является специфичным к антигену, кодируемому популяцией модифицированных клеток данного этапа (b); и
(c) необязательно повторение этапа (а), этапа (b) или обоих этапов (а) и (b);
тем самым обеспечивая терапию заболевания с помощью адоптивной клеточной иммунотерапии.
3. Способ по п. 2, отличающийся тем, что заболевание представляет собой вирусное заболевание, бактериальное заболевание, рак, воспалительное заболевание, иммунопатологическое заболевание или возрастное заболевание.
4. Способ по п. 2, отличающийся тем, что заболевание представляет собой гиперпролиферативное заболевание.
5. Способ по п. 4, отличающийся тем, что гиперпролиферативное заболевание представляет собой гематологическую злокачественную опухоль или солидный рак.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что гематологическую злокачественную опухоль выбирают из острого лимфобластного лейкоза (ОЛЛ), острого миелоидного лейкоза (ОМЛ), хронического миелоидного лейкоза (ХМЛ), хронического эозинофильного лейкоза (ХЭЛ), миелодиспластического синдрома (МДС), неходжкинской лимфомы (НХЛ) или множественной миеломы (ММ).
7. Способ по п. 5, отличающийся тем, что солидный рак выбирают из рака желчного пузыря, рака мочевого пузыря, карциномы костей и мягких тканей, опухоли головного мозга, рака молочной железы, рака шейки матки, рака толстой кишки, колоректальной аденокарциномы, колоректального рака, десмоидной опухоли, эмбрионального рака, рака эндометрия, рака пищевода, рака желудка, аденокарциномы желудка, мультиформной глиобластомы, гинекологической опухоли, плоскоклеточной карциномы головы и шеи, рака печени, рака легких, злокачественной меланомы, остеосаркомы, рака яичников, рака поджелудочной железы, аденокарциномы протоков поджелудочной железы, первичной астроцитарной опухоли, первичного рака щитовидной железы, рака предстательной железы, рака почек, почечно-кпеточной карциномы, рабдомиосаркомы, рака кожи, саркомы мягких тканей, опухоли половых клеток яичка, уротелиального рака, саркомы матки или рака матки.
8. Способ по любому из пп. 2-7, отличающийся тем, что указанный связывающий компонент представляет собой вариабельный фрагмент антитела (Fv), вариабельный домен Т-клеточного рецептора (TCR), эктодомен рецептора или лиганд.
9. Способ по п. 8, отличающийся тем, что указанный связывающий компонент представляет собой одноцепочечный Fv-фрагмент (scFv) или одноцепочечный TCR (scTCR), содержащий линкер вариабельной области.
x
y
n
10. Способ по п. 9, отличающийся тем, что линкер вариабельной области содержит (GlySer), где х и у независимо представляют собой целые числа от 1 до 5, и n - целое число от 1 до 10.
11. Способ по любому из пп. 2-10, отличающийся тем, что указанная гидрофобная часть представляет собой трансмембранный домен.
12. Способ по п. 11, отличающийся тем, что указанный трансмембранный домен представляет собой трансмембранный домен CD4, CD8, CD28 или CD27.
Y
13. Способ по любому из пп. 2-12, отличающийся тем, что указанный внутриклеточный эффекторный компонент содержит внутриклеточную область CD3ε, CD3δ, CD3ζ, CD25, CD27, CD28, CD79A, CD79B, CD134, CD137, CARD11, DAP10, FcRα, FcRβ, FcR, Fyn, HVEM, ICOS, Lck, LAG3, LAT, LRP, NKG2D, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, ROR2, Ryk, SLAMF1, Slp76, pTα, TCRα, TCRβ, TRIM, Zap70, PTCH2, или любую их комбинацию.
14. Способ по любому из пп. 2-13, отличающийся тем, что указанный внутриклеточный эффекторный компонент содержит CD3ζ и один или более CD27, CD28, CD134 и CD137.
15. Способ по любому из пп. 2-13, отличающийся тем, что указанный внутриклеточный эффекторный компонент содержит LRP, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, ROR2 или Ryk.
16. Способ по любому из пп. 2-15, отличающийся тем, что указанный связывающий компонент является специфичным к α-фетопротеину (AFP), В7Н4, BTLA, CD3, CD19, CD20, CD25, CD22, CD28, CD30, CD40, CD44v6, CD52, CD56, CD79b, CD80, CD81, CD86, CD134 (ОХ40), CD137 (4-1ВВ), CD151, CD276, СА125, СЕА, СЕАСАМ6, c-Met, СТ-7, CTLA-4, EGFR, EGFRvIII, ErbВ2, ErbВ3, ErbB4, EphA2, FLT1, FLT4, Frizzled, O-ацетил-GD2, GD2, GHRHR, GHR, GITR, gp130, HVEM, IGF1R, IL6R, KDR, L1CAM, Lewis A, Lewis Y, LTβR, LIFRβ, LRP5, MAGE, мезотелину, MUC1, NY-ESO-1, специфическому для рака неоантигену, OSMRβ, PD1, PD-L1, PD-L2, PSMA, PTCH1, RANK, Robo1, ROR1, TERT, TGFBR2, TGFBR1, TLR7, TLR9, TNFRSF4, TNFR1, TNFR2, тирозиназе, TWEAK-R или WT-1.
17. Способ по любому из пп. 2-16, отличающийся тем, что указанный антигенсвязывающий белок представляет собой Т-клеточный рецептор (TCR) или химерный антигенный рецептор.
18. Способ по любому из пп. 2-17, отличающийся тем, что клетка иммунной системы представляет собой CD4+ Т-клетку, CD8 +Т-клетку, CD4-CD8- двойную негативную Т-клетку, уδ Т-клетку, клетку-естественного киллера, дендритную клетку или любую их комбинацию.
19. Способ по любому из пп. 2-18, отличающийся тем, что указанная модифицированная Т-клетка представляет собой наивную Т-клетку, Т-клетку центральной памяти, Т-клетку эффекторной памяти или любую их комбинацию.
20. Способ по любому из пп. 2-19, отличающийся тем, что первая популяция модифицированных Т-клеток состоит по существу из CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток или из CD4+ и CD8+ Т-клеток.
21. Способ по любому из пп. 2-20, отличающийся тем, что вторая популяция модифицированных клеток содержит модифицированные гемопоэтические клетки-предшественники человека.
22. Способ по любому из пп. 2-20, отличающийся тем, что вторая популяция модифицированных клеток содержит модифицированные клетки иммунной системы человека.
23. Способ по п. 22, отличающийся тем, что модифицированные клетки иммунной системы человека состоят по существу из CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток или из CD4+ и CD8+ Т-клеток.
24. Способ по любому из пп. 2-23, отличающийся тем, что указанные клетки рекомбинантно модифицированы ex vivo.
25. Способ по п. 24, отличающийся тем, что модифицированные ex vivo клетки модифицированы с использованием вирусного вектора.
26. Способ по п. 25, отличающийся тем, что указанный вирусный вектор представляет собой лентивирусный вектор или γ-ретровирусный вектор.
27. Способ по любому из пп. 2-26, отличающийся тем, что популяция модифицированных клеток является аллогенной, изогенной или аутологической.
28. Способ по любому из пп. 2-27, отличающийся тем, что указанный внеклеточный связывающий компонент антигенсвязывающего белка из модифицированных Т-клеток человека направлен против клетки, сверхэкспрессирующей антиген.
29. Способ по любому из пп. 2-28, отличающийся тем, что указанные модифицированные клетки вводят внутривенно.
30. Способ по любому из пп. 2-29, отличающийся тем, что способ включает введение субъекту множества доз модифицированных Т-клеток из этапа (а), множества доз модифицированных клеток из этапа (b) или их комбинацию.
31. Способ по п. 30, отличающийся тем, что множество доз модифицированных Т-клеток из этапа (а) вводят в интервалах между введениями, составляющими от приблизительно одной недели до приблизительно четырех недель.
32. Способ по любому из пп. 2-31, отличающийся тем, что модифицированные Т-клетки из этапа (а) вводят параллельно или последовательно с модифицированными клетками из этапа (b).
33. Способ по п. 32, отличающийся тем, что начальную дозу модифицированных клеток из этапа (b) вводят спустя от приблизительно 1 дня до приблизительно 28 дней после введения модифицированных Т-клеток из этапа (а).
34. Способ по п. 32, отличающийся тем, что модифицированные клетки из этапа (b) вводят последовательно в течение приблизительно 24 часов от введения модифицированных Т-клеток из этапа (а) или модифицированные Т-клетки из этапа (а) вводят последовательно в течение приблизительно 24 часов от введения модифицированных клеток из этапа (b).
35. Способ по п. 32, отличающийся тем, что первоначальное введение включает введение композиции, содержащей смесь модифицированных Т-клеток из этапа (а) и модифицированных клеток из этапа (b).
36. Способ по любому из пп. 32-35, отличающийся тем, что модифицированные клетки из этапа (b) дополнительно вводят в одной или более дозе в течение одного или более интервалов, составляющих до приблизительно 365 дней после введения модифицированных Т-клеток из этапа (а).
37. Способ по любому из пп. 32-36, отличающийся тем, что модифицированные клетки из этапа (b) представляют собой модифицированные гемопоэтические клетки-предшественники.
38. Способ по любому из пп. 32-36, отличающийся тем, что модифицированные клетки из этапа (b) представляют собой модифицированные Т-клетки.
6
2
11
2
6
2
11
2
39. Способ по любому из пп. 2-38, отличающийся тем, что модифицированные Т-клетки из этапа (а) вводят субъекту в дозе приблизительно 10 клеток/м до приблизительно 10 клеток/м и модифицированные Т-клетки из этапа (b) вводят субъекту в дозе приблизительно 10 клеток/м до приблизительно 10 клеток/м,
40. Способ по любому из пп. 2-39, отличающийся тем, что способ дополнительно включает введение цитокина.
41. Способ по п. 40, отличающийся тем, что цитокин представляет собой интерлейкин 2 (ИЛ-2), интерлейкин 15 (ИЛ-15), интерлейкин 21 (ИЛ-21) или любую их комбинацию.
42. Способ по п. 41, отличающийся тем, что цитокин представляет собой ИЛ-2 и вводится параллельно или последовательно с модифицированными Т-клетками из этапа (а).
43. Способ по п. 42, отличающийся тем, что цитокин вводят последовательно при условии, что субъекту вводили модифицированные Т-клетки из этапа (а) по меньшей мере три или четыре раза до введения цитокина.
44. Способ по любому из пп. 40-43, отличающийся тем, что цитокин представляет собой ИЛ-2 и ИЛ-2 вводят подкожно.
45. Способ по любому из пп. 2-44, отличающийся тем, что субъект дополнительно получает иммуносупрессивную терапию.
46. Способ по п. 45, отличающийся тем, что иммуносупрессивную терапию выбирают из ингибиторов кальциневрина, кортикостероидов, ингибиторов микротрубочек, низкой дозы пролекарства микофеноловой кислоты или любой их комбинации.
47. Способ по любому из пп. 2-46, отличающийся тем, что субъект получил немиелоаблативный или миелоаблативный трансплантат гемопоэтических стволовых клеток.
48. Способ по п. 47, отличающийся тем, что трансплантат гемопоэтических стволовых клеток является аутологическим.
49. Способ по п. 47, отличающийся тем, что трансплантат гемопоэтических стволовых клеток является аллогенным.
50. Способ по любому из пп. 47-49, отличающийся тем, что субъекту вводят модифицированные Т-клетки из этапа (а) и/или модифицированные клетки из этапа (b) спустя по меньшей мере три месяца после немиелоаблативного трансплантата гемопоэтических стволовых клеток или спустя по меньшей мере два месяца после миелоаблативного трансплантата гемопоэтических стволовых клеток.
51. Композиция адоптивной клеточной иммунотерапии, содержащая популяцию модифицированных гемопоэтических клеток-предшественников человека, модифицированных клеток иммунной системы человека или их комбинацию, при этом первая популяция модифицированных клеток представляет собой Т-клетки, содержащие молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует антигенсвязывающий белок, а вторая популяция представляет собой модифицированные клетки, содержащие молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует антиген,
при этом антигенсвязывающий белок содержит гидрофобную часть, расположенную между внеклеточным связывающим компонентом и внутриклеточным эффекторным компонентом, и
при этом внеклеточный связывающий компонент является специфичным к антигену, кодируемому второй популяцией модифицированных клеток.
52. Композиция по п. 51, отличающаяся тем, что указанный связывающий компонент представляет собой вариабельный фрагмент антитела (Fv), вариабельный домен Т-клеточного рецептора (TCR), эктодомен рецептора или лиганд.
53. Композиция по п. 52, отличающаяся тем, что указанный связывающий компонент представляет собой одноцепочечный Fv-фрагмент (scFv) или одноцепочечный TCR (scTCR), содержащий линкер вариабельной области.
x
y
n
54. Композиция по п. 53, отличающаяся тем, что линкер вариабельной области содержит (GlySer), где х и у независимо представляют собой целые числа от 1 до 5, и n -целое число от 1 до 10.
55. Композиция по любому из пп. 51-54, отличающаяся тем, что указанная гидрофобная часть представляет собой трансмембранный домен.
56. Композиция по п. 55, отличающаяся тем, что указанный трансмембранный домен представляет собой трансмембранный домен CD4, CD8, CD28 или CD27.
Y
57. Композиция по любому из пп. 51-56, отличающаяся тем, что указанный внутриклеточный эффекторный компонент содержит внутриклеточную область CD3ε, CD3δ, CD3ζ, CD25, CD27, CD28, CD79A, CD79B, CD134, CD137, CARD11, DAP10, FcRα, FcRβ, FcR, Fyn, HVEM, ICOS, Lck, LAG3, LAT, LRP, NKG2D, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, ROR2, Ryk, SLAMF1, Slp76, pTα, TCRα, TCRβ, TRIM, Zap70, PTCH2, или любую их комбинацию.
58. Композиция по любому из пп. 51-57, отличающаяся тем, что указанный внутриклеточный эффекторный компонент содержит CD3ζ и один или более CD27, CD28, CD134 и CD137.
59. Композиция по любому из пп. 51-57, отличающаяся тем, что указанный внутриклеточный эффекторный компонент содержит LRP, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, ROR2 или Ryk.
60. Композиция по любому из пп. 51-59, отличающаяся тем, что указанный связывающий компонент является специфичным к α-фетопротеину (AFP), В7Н4, BTLA, CD3, CD19, CD20, CD25, CD22, CD28, CD30, CD40, CD44v6, CD52, CD56, CD79b, CD80, CD81, CD86, CD134 (ОХ40), CD137 (4-1ВВ), CD151, CD276, СА125, СЕА, СЕАСАМ6, c-Met, СТ-7, CTLA-4, EGFR, EGFRvIII, ErbB2, ErbВ3, ErbB4, EphA2, FLT1, FLT4, Frizzled, O-ацетил-GD2, GD2, GHRHR, GHR, GITR, gp130, HVEM, IGF1R, IL6R, KDR, L1CAM, Lewis A, Lewis Y, LTβR, LIFRβ,
LRP5, MAGE, мезотелину, MUC1, NY-ESO-1, специфическому для рака неоантигену, OSMRβ, PD1, PD-L1, PD-L2, PSMA, РТСН1, RANK, Robo1, ROR1, TERT, TGFBR2, TGFBR1, TLR7, TLR9, TNFRSF4, TNFR1, TNFR2, тирозиназе, TWEAK-R или WT-1.
61. Композиция по любому из пп. 51-60, отличающаяся тем, что указанный антигенсвязывающий белок представляет собой Т-клеточный рецептор (TCR) или химерный антигенный рецептор.
62. Композиция по любому из пп. 51-61, отличающаяся тем, что клетка иммунной системы представляет собой CD4+ Т-клетку, CD8+ Т-клетку, CD4-CD8 - двойную негативную Т-клетку, γδ Т-клетку, клетку-естественного киллера, дендритную клетку или любую их комбинацию.
63. Композиция по любому из пп. 51-62, отличающаяся тем, что указанная Т-клетка представляет собой наивную Т-клетку, Т-клетку центральной памяти, Т-клетку эффекторной памяти или любую их комбинацию.
64. Композиция по любому из пп. 51-63, отличающаяся тем, что первая популяция модифицированных Т-клеток состоит по существу из CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток или из CD4+ и CD8+ Т-клеток.
65. Композиция по любому из пп. 51-64, отличающаяся тем, что вторая популяция модифицированных клеток содержит модифицированные гемопоэтические клетки-предшественники человека.
66. Композиция по любому из пп. 51-64, отличающаяся тем, что вторая популяция модифицированных клеток содержит модифицированные клетки иммунной системы человека.
67. Композиция по п. 66, отличающаяся тем, что модифицированные клетки иммунной системы человека состоят по существу из CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток или из CD4+ и CD8+ Т-клеток.
68. Композиция по любому из пп. 51-67, отличающаяся тем, что указанные клетки рекомбинантно модифицированы ex vivo.
69. Композиция по п. 68, отличающаяся тем, что модифицированные ex vivo клетки модифицированы с использованием вирусного вектора.
70. Композиция по п. 69, отличающаяся тем, что указанный вирусный вектор представляет собой лентивирусный вектор или γ-ретровирусный вектор.
71. Композиция по любому из пп. 51-70, отличающаяся тем, что популяция модифицированных клеток является аллогенной, изогенной или аутологической.
72. Композиция адоптивной клеточной иммунотерапии по любому из пп. 51-71, дополнительно содержащая фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель или вспомогательное вещество.
73. Форма единицы дозирования, содержащая композицию по любому из пп. 51-72.
74. Форма единицы дозирования, содержащая модифицированные Т-клетки из этапа (а), и форма единицы дозирования, содержащая модифицированные клетки из этапа (b) по любому из пп. 1-50.
75. Форма единицы дозирования по п. 66, отличающаяся тем, что модифицированные клетки из этапа (b) представляют собой модифицированные гемопоэтические клетки-предшественники человека или модифицированные Т-клетки человека.
75. Форма единицы дозирования по п. 66, отличающаяся тем, что модифицированные клетки из этапа (b) представляют собой модифицированные гемопоэтические клетки-предшественники человека или модифицированные Т-клетки человека.