РЕГУЛЯТОРЫ МИКРОБИОМА И СООТВЕТСТВУЮЩИЕ ВАРИАНТЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Лекарственная форма, содержащая композицию, содержащую регулятор микробиома, характеризующаяся тем, что указанная лекарственная форма обеспечивает нацеленное высвобождение указанной композиции по существу в одном или более отделах из: желудка, тонкого кишечника или толстого кишечника, при этом:
i) указанный регулятор микробиома содержит сахар, сахарный спирт, аминокислоту, пептид, микронутриент, жирную кислоту или полифенол;
ii) указанный регулятор микробиома не содержит фрагмента алкенила, алкинила, арила, гетероарила, циклоалкила, галогена, ацила, тиола, циано, нитро или сульфонила;
iii) указанный регулятор микробиома содержит молекулу, содержащую меньше приблизительно 12 атомов углерода и меньше приблизительно 12 гетероатомов, при этом гетероатом выбран из кислорода, азота, серы или фосфора;
или iv) указанная композиция содержит больше приблизительно 50% (масс./масс.) указанного регулятора микробиома.
2. Лекарственная форма по п. 1, характеризующаяся тем, что указанная композиция выполнена в виде дозированной лекарственной формы.
3. Лекарственная форма по п. 2, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма содержит жидкость, гель, крем, мазь, порошок, таблетку, пилюлю, капсулу, депо, одноразовый аппликатор или медицинское устройство (например, шприц).
4. Лекарственная форма по любому из пп. 2-3, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма содержит жидкую лекарственную форму или твердую лекарственную форму.
5. Лекарственная форма по любому из пп. 2-4, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма выполнена с возможностью перорального введения.
6. Лекарственная форма по п. 4, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма представляет собой жидкую лекарственную форму, выполненную с возможностью перорального введения.
7. Лекарственная форма по п. 6, характеризующаяся тем, что указанная жидкая лекарственная форма для перорального введения содержит раствор, сироп, суспензию, эмульсию, настойку или эликсир.
8. Лекарственная форма по п. 4, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма представляет собой твердую лекарственную форму, выполненную с возможностью перорального введения.
9. Лекарственная форма по п. 8, характеризующаяся тем, что указанная твердая лекарственная форма для перорального введения содержит пилюлю, таблетку или капсулу.
10. Лекарственная форма по п. 9, характеризующаяся тем, что указанная твердая лекарственная форма для перорального введения покрыта кишечнорастворимой оболочкой, покрыта оболочкой для отсроченного высвобождения или покрыта оболочкой для контролируемого высвобождения.
11. Лекарственная форма по любому из пп. 2-4, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма выполнена с возможностью энтерального введения.
12. Лекарственная форма по п. 4, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма представляет собой жидкую лекарственную форму, выполненную с возможностью энтерального введения.
13. Лекарственная форма по п. 12, характеризующаяся тем, что указанная жидкая лекарственная форма для энтерального введения содержит раствор, сироп, суспензию, эмульсию, настойку или эликсир.
14. Лекарственная форма по п. 4, характеризующаяся тем, что указанная дозированная лекарственная форма представляет собой твердую лекарственную форму, выполненную с возможностью энтерального введения.
15. Лекарственная форма по п. 14, характеризующаяся тем, что указанная твердая лекарственная форма для энтерального введения содержит пилюлю, таблетку, капсулу, мазь, суппозиторий или клизму.
16. Лекарственная форма по любому из пп. 1-15, характеризующаяся тем, что указанная лекарственная форма нацелена на тонкий кишечник, например, в двенадцатиперстную кишку, тощую кишку или подвздошную кишку.
17. Лекарственная форма по любому из пп. 1-15, характеризующаяся тем, что указанная лекарственная форма нацелена на толстый кишечник, например, в слепую кишку, толстую кишку или прямую кишку.
18. Лекарственная форма по любому из предшествующих пунктов, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит по меньшей мере два регулятора микробиома.
19. Лекарственная форма по любому из пп. 1-17, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит по меньшей мере три регулятора микробиома.
20. Лекарственная форма по любому из пп. 1-17, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт.
21. Лекарственная форма по п. 20, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит глюкозу, галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
22. Фармацевтическая композиция для применения в прививании или улучшении колонизации бактериальным таксоном в микробиоте желудочно-кишечного тракта субъекта, содержащая:
i) регулятор микробиома; и
ii) бактериальный таксон, который требуется привить или колонизацию которым требуется улучшить;
причем указанная композиция выполнена в виде лекарственной формы или режима введения для высвобождения указанного регулятора микробиома по существу в одном или более отделах из: желудка, тонкого кишечника или толстого кишечника.
23. Композиция по п. 22, характеризующаяся тем, что указанная лекарственная форма нацелена на тонкий кишечник, например, в двенадцатиперстную кишку, тощую кишку или подвздошную кишку.
24. Композиция по п. 23, характеризующаяся тем, что указанная лекарственная форма нацелена на толстый кишечник, например, в слепую кишку, толстую кишку или прямую кишку.
25. Композиция по любому из пп. 22-25, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар, сахарный спирт, аминокислоту, пептид, микронутриент, жирную кислоту или полифенол.
26. Композиция по любому из пп. 22-25, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт.
27. Композиция по п. 26, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит глюкозу, галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
28. Композиция по любому из пп. 22-27, характеризующаяся тем, что указанный бактериальный таксон представляет собой пробиотик.
29. Композиция по любому из пп. 22-28, характеризующаяся тем, что указанный субъект не является хозяином указанного бактериального таксона (например, у субъекта по существу отсутствует указанный бактериальный таксон).
30. Композиция по любому из пп. 22-29, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома по существу способствует росту указанного бактериального таксона.
31. Композиция по п. 28, характеризующаяся тем, что указанный пробиотик оказывает воздействие на состояние здоровья указанного субъекта или обеспечивает терапевтический эффект у субъекта.
32. Фармацевтическая композиция для применения в модулировании бактериального таксона в микробиоте желудочно-кишечного тракта субъекта, содержащая регулятор микробиома, выполненная в виде лекарственной формы или вводимая согласно режиму введения для высвобождения указанной композиции по существу в желудочно-кишечном тракте указанного субъекта, с обеспечением модуляции указанного бактериального таксона.
33. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что модулирование бактериального таксона включает увеличение или уменьшение численности указанного таксона.
34. Композиция по п. 33, характеризующаяся тем, что модулирование бактериального таксона включает увеличение или уменьшение численности указанного таксона относительно численности указанного бактериального таксона в отсутствие указанной композиции.
35. Композиция по любому из пп. 32-34, характеризующаяся тем, что модулирование бактериального таксона включает увеличение или уменьшение численности указанного таксона относительно численности второго бактериального таксона.
36. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что введение указанной композиции субъекту модулирует разнообразие микроорганизмов у субъекта.
37. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что введение указанной композиции субъекту модулирует функцию микробиоты.
38. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что модулирование бактериального таксона включает модулирование (например, стимуляцию или понижающую регуляцию) метаболического пути.
39. Композиция по п. 38, характеризующаяся тем, что указанное модулирование метаболического пути включает увеличение или уменьшение уровня противомикробного агента, вторичной желчной кислоты, с короткой цепью жирной кислоты, сидерофора или метаболита, перечисленных в таблице 2, за счет микробиоты.
40. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар, сахарный спирт, аминокислоту, пептид, микронутриент, жирную кислоту или полифенол.
41. Композиция по п. 40, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт.
42. Композиция по п. 41, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит глюкозу, галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
43. Композиция по п. 41, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
44. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который метаболизируется хозяином.
45. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который не метаболизируется хозяином.
46. Композиция по п. 41, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит больше приблизительно 50% (масс./масс.) сахара или сахарного спирта (например, больше приблизительно 55%, приблизительно 60%, приблизительно 65%, приблизительно 70%, приблизительно 75%, приблизительно 80%, приблизительно 85%, приблизительно 90%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% или более).
47. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит молекулу, содержащую меньше приблизительно 12 атомов углерода (например, меньше приблизительно 10 атомов углерода, приблизительно 9 атомов углерода, приблизительно 8 атомов углерода, приблизительно 7 атомов углерода, приблизительно 6 атомов углерода или приблизительно 5 атомов углерода) и меньше приблизительно12 гетероатомов (например, меньше приблизительно 10 гетероатомов, меньше приблизительно 9 гетероатомов, меньше приблизительно 8 гетероатомов, меньше приблизительно 7 гетероатомов, меньше приблизительно 6 гетероатомов или меньше приблизительно 5 гетероатомов), при этом гетероатом выбран из кислорода, азота, серы или фосфора.
48. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома не содержит фрагмента алкенила, алкинила, арила, гетероарила, циклоалкила, галогена, ацила, тиола, циано, нитро или сульфонила.
49. Композиция по п. 41, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает низкой степенью сладости по сравнению с сахарозой.
50. Композиция по п. 48, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает степенью сладости меньше приблизительно 1 относительно сахарозы (например, меньше приблизительно 0,95, приблизительно 0,9, приблизительно 0,85, приблизительно 0,8, приблизительно 0,75, приблизительно 0,7, приблизительно 0,65, приблизительно 0,6, приблизительно 0,55, приблизительно 0,5 или меньше).
51. Композиция по п. 48, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает степенью сладости меньше приблизительно 2 относительно сахарозы (например, меньше приблизительно 3, приблизительно 4, приблизительно 5, приблизительно 10, приблизительно 20, приблизительно 25, приблизительно 50, приблизительно 75, приблизительно 100, приблизительно 250, приблизительно 500, приблизительно 1000 или более).
52. Композиция по п. 41, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает низким коэффициентом всасывания относительно глюкозы.
53. Композиция по п. 51, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает коэффициентом всасывания меньше 0,15 (например, меньше приблизительно 0,14, приблизительно 0,13, приблизительно 0,12, приблизительно 0,11, приблизительно 0,10, приблизительно 0,09, приблизительно 0,08, приблизительно 0,07, приблизительно 0,06, приблизительно 0,05, приблизительно 0,04, приблизительно 0,03, приблизительно 0,02, приблизительно 0,01 или меньше).
54. Композиция по п. 44, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в нижних отделах ЖКТ (например, в тонком кишечнике или толстом кишечнике).
55. Композиция по п. 54, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в тонком кишечнике, например, в двенадцатиперстной кишке, тощей кишке или подвздошной кишке.
56. Композиция по п. 54, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в толстом кишечнике, например, в слепой кишке, толстой кишке или прямой кишке.
57. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит аминокислоту (например, L-аминокислоту или D-аминокислоту).
58. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит микронутриент.
59. Композиция по п. 58, характеризующаяся тем, что указанный микронутриент содержит витамин, элемент или минеральное вещество.
60. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит жирную кислоту.
61. Композиция по п. 60, характеризующаяся тем, что указанная жирная кислота содержит жирную кислоту с короткой цепью (ЖККЦ), жирную кислоту со средней цепью (СЦЖК), жирную кислоту с длинной цепью (ДЦЖК) или жирную кислоту с очень длинной цепью (ОДЦЖК).
62. Композиция по п. 32, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит полифенол.
63. Композиция по п. 62, характеризующаяся тем, что указанный полифенол содержит катехин, эллагитаннин, изофлавон, флавонол, флаванон, антоциан или лигнин.
64. Фармацевтическая композиция для применения в лечении субъекта, страдающего дисбиозом микробиоты желудочно-кишечного тракта, содержащая регулятор микробиома, выполненная в виде лекарственной формы или вводимая согласно режиму введения для высвобождения указанной композиции по существу в желудочно-кишечном тракте, с обеспечением лечения указанного субъекта.
65. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный дисбиоз представляет собой идиопатический дисбиоз (например, у субъекта отсутствует по существу видимая причина дисбиоза).
66. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный дисбиоз ассоциирован с заболеванием, нарушением или состоянием у субъекта.
67. Композиция по п. 66, характеризующаяся тем, что указанное заболевание, нарушение или состояние включает инфекционное заболевание, воспалительное заболевание, метаболическое заболевание, аутоиммунное заболевание, неврологическое заболевание или раковое заболевание.
Clostridium difficile
C. difficile
Candida albicans
Campylobacter jejuni
Helicobacter pylori
Clostridium difficile
68. Композиция по п. 67, характеризующаяся тем, что инфекционное заболевание включает инфекцию  (КДИ); инфекцию устойчивыми к ванкомицину энтерококками (VRE), инфекционный колит, вызванный  колит, микоз (например, инфекцию, инфекцию или инфекцию), ассоциированную с диарею (КДАД), ассоциированную с антибиотиками диарею (ААД), индуцированную антибиотиками диарею, диарею путешественников (ДП), диарею детского возраста или (острую) инфекционную диарею.
69. Композиция по п. 67, характеризующаяся тем, что указанное воспалительное заболевание включает воспалительное заболевание кишечника (ВЗК), язвенный колит (ЯК), болезнь Крона (БК), идиопатическое воспаление тонкой кишки, неопределенный колит, воспаление илеоанального кармана, синдром раздраженного кишечника (СРК), некротизирующий энтероколит (НЭК), воспаление кишечного тракта, запор, микроскопический колит, диарею, болезнь «трансплантат против хозяина» (БТПХ), аллергия (например, пищевую аллергию), псевдомембранозный колит, несварение, неязвенную диспепсию, дивертикулез, дивертикулит, ишемический колит, радиационный колит, радиационный энтерит, коллагенозный колит, гастроэнтерит или полипы.
70. Композиция по п. 67, характеризующаяся тем, что указанное метаболическое заболевание включает ожирение, (инсулинорезистентный) преддиабет, диабет II типа, высокий уровень сахара в крови натощак (гипергликемию), метаболический синдром или фактор риска сердечно-сосудистых заболеваний (например, высокий уровень холестерина в крови, высокий уровень ЛПНП, высокое кровяное давление (гипертензию), высокие уровни триглицеридов, низкий уровень ЛПВП).
71. Композиция по п. 67, характеризующаяся тем, что указанное аутоиммунное заболевание включает аутоиммунный артрит, диабет I типа, рассеянный склероз, псориаз, аллергию, астму или атопический дерматит.
72. Композиция по п. 67, характеризующаяся тем, что указанное неврологическое заболевание включает аутизм, гипераммониемию или гепатическую энцефалопатию.
73. Композиция по п. 67, характеризующаяся тем, что указанное раковое заболевание включает рак головного мозга, кожи, крови, костей, глаз, молочной железы, легких, предстательной железы, печени или желудочно-кишечного тракта.
74. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный дисбиоз ассоциирован с заболеванием желудочно-кишечного тракта.
75. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома представляет собой сахар, сахарный спирт, аминокислоту, пептид, микронутриент, жирную кислоту или полифенол.
76. Композиция по п. 75, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт.
77. Композиция по п. 76, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит глюкозу, галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
78. Композиция по п. 76, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
79. Композиция по п. 76, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который метаболизируется хозяином.
80. Композиция по п. 76, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который не метаболизируется хозяином.
81. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит больше приблизительно 50% (масс./масс.) сахара или сахарного спирта (например, больше приблизительно 55%, приблизительно 60%, приблизительно 65%, приблизительно 70%, приблизительно 75%, приблизительно 80%, приблизительно 85%, приблизительно 90%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% или более).
82. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит молекулу, содержащую меньше приблизительно 12 атомов углерода (например, меньше приблизительно 10 атомов углерода, приблизительно 9 атомов углерода, приблизительно 8 атомов углерода, приблизительно 7 атомов углерода, приблизительно 6 атомов углерода или приблизительно 5 атомов углерода) и меньше приблизительно 12 гетероатомов (например, меньше приблизительно 10 гетероатомов, меньше приблизительно 9 гетероатомов, меньше приблизительно 8 гетероатомов, меньше приблизительно 7 гетероатомов, меньше приблизительно 6 гетероатомов или меньше приблизительно 5 гетероатомов), при этом гетероатом выбран из кислорода, азота, серы или фосфора.
83. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома не содержит фрагмента алкенила, алкинила, арила, гетероарила, циклоалкила, галогена, ацила, тиола, циано, нитро или сульфонила.
84. Композиция по п. 76, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает низкой степенью сладости по сравнению с сахарозой.
85. Композиция по п. 84, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает степенью сладости меньше приблизительно 1 относительно сахарозы (например, меньше приблизительно 0,95, приблизительно 0,9, приблизительно 0,85, приблизительно 0,8, приблизительно 0,75, приблизительно 0,7, приблизительно 0,65, приблизительно 0,6, приблизительно 0,55, приблизительно 0,5 или меньше).
86. Композиция по п. 84, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает степенью сладости меньше приблизительно 2 относительно сахарозы (например, меньше приблизительно 3, приблизительно 4, приблизительно 5, приблизительно 10, приблизительно 20, приблизительно 25, приблизительно 50, приблизительно 75, приблизительно 100, приблизительно 250, приблизительно 500, приблизительно 1000 или более).
87. Композиция по п. 76, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает низким коэффициентом всасывания относительно глюкозы.
88. Композиция по п. 87, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт обладает коэффициентом всасывания меньше 0,15 (например, меньше приблизительно 0,14, приблизительно 0,13, приблизительно 0,12, приблизительно 0,11, приблизительно 0,10, приблизительно 0,09, приблизительно 0,08, приблизительно 0,07, приблизительно 0,06, приблизительно 0,05, приблизительно 0,04, приблизительно 0,03, приблизительно 0,02, приблизительно 0,01 или меньше).
89. Композиция по п. 78, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в нижних отделах ЖКТ (например, в тонком кишечнике или толстом кишечнике).
90. Композиция по п. 88, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в тонком кишечнике, например, в двенадцатиперстной кишке, тощей кишке или подвздошной кишке.
91. Композиция по п. 88, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в толстом кишечнике, например, в слепой кишке, толстой кишке или прямой кишке.
92. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит аминокислоту.
93. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит микронутриент (например, витамин, элемент или минеральное вещество).
94. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит жирную кислоту.
95. Композиция по п. 94, характеризующаяся тем, что указанная жирная кислота содержит жирную кислоту с короткой цепью (ЖККЦ), жирную кислоту со средней цепью (СЦЖК), жирную кислоту с длинной цепью (ДЦЖК) или жирную кислоту с очень длинной цепью (ОДЦЖК).
96. Композиция по п. 64, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит полифенол.
97. Композиция по п. 96, характеризующаяся тем, что указанный полифенол содержит катехин, эллагитаннин, изофлавон, флавонол, флаванон, антоциан или лигнин.
98. Фармацевтическая композиция для применения для снижения индуцированного лекарственным средством или лечением симптома у субъекта, содержащая регулятор микробиома, выполненная в виде лекарственной формы или вводимая согласно режиму введения для высвобождения указанной композиции по существу в желудочно-кишечном тракте, со снижением таким образом указанного симптома у субъекта.
99. Композиция по п. 98, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит что-либо одно или более из:
i) регулятора микробиома, содержащего сахар, сахарный спирт, аминокислоту, пептид, микронутриент, жирную кислоту или полифенол;
ii) регулятора микробиома, который не содержит фрагмента алкенила, алкинила, арила, гетероарила, циклоалкила, галогена, ацила, тиола, циано, нитро или сульфонила;
iii) регулятора микробиома, содержащего молекулу, содержащую меньше приблизительно 12 атомов углерода (например, меньше приблизительно 10 атомов углерода, приблизительно 9 атомов углерода, приблизительно 8 атомов углерода, приблизительно 7 атомов углерода, приблизительно 6 атомов углерода или приблизительно 5 атомов углерода) и меньше приблизительно 12 гетероатомов (например, меньше приблизительно 10 гетероатомов, меньше приблизительно 9 гетероатомов, меньше приблизительно 8 гетероатомов, меньше приблизительно 7 гетероатомов, меньше приблизительно 6 гетероатомов или меньше приблизительно 5 гетероатомов), при этом гетероатом выбран из кислорода, азота, серы или фосфора;
и iv) композиции, содержащей больше приблизительно 50% (масс./масс.) регулятора микробиома (например, больше приблизительно 55%, приблизительно 60%, приблизительно 65%, приблизительно 70%, приблизительно 75%, приблизительно 80%, приблизительно 85%, приблизительно 90%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% или более).
100. Композиция по любому из пп. 98-99, характеризующаяся тем, что указанная индуцированный лекарственным средством или лечением симптом представляет собой метеоризм, диарею, рвоту, тошноту и запор.
101. Композиция по п. 100, характеризующаяся тем, что указанный индуцированный лекарственным средством или лечением симптом представляет собой диарею.
102. Композиция по п. 100, характеризующаяся тем, что указанный индуцированный лекарственным средством или лечением симптом представляет собой запор.
103. Композиция по п. 98, характеризующаяся тем, что указанную композицию вводят до введения, совместно с введением или после введения лекарственного средства.
104. Композиция по п. 99, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует по меньшей мере двум из i), ii), iii) или iv).
105. Композиция по п. 99, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует по меньшей мере трем пунктам из i), ii), iii) или iv).
106. Композиция по п. 99, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует пунктам i), ii), iii) и iv).
107. Композиция по п. 99, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт.
108. Композиция по п. 107, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который метаболизируется хозяином.
109. Композиция по п. 107, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который не метаболизируется хозяином.
110. Композиция по п. 108, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в нижних отделах ЖКТ (например, в тонком кишечнике или толстом кишечнике).
111. Композиция по п. 110, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в тонком кишечнике, например, в двенадцатиперстной кишке, тощей кишке или подвздошной кишке.
112. Композиция по п. 110, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в толстом кишечнике, например, в слепой кишке, толстой кишке или прямой кишке.
113. Фармацевтическая композиция для применения в лечении субъекта, страдающего заболеванием, нарушением или состоянием, при котором требуется контроль уровня сахара в крови (например, уровень глюкозы в крови) указанного субъекта, и характеризующаяся тем, что для указанного субъекта будет благоприятным лечение композицией, содержащей регулятор микробиома, выполненной в виде лекарственной формы или вводимый согласно режиму введения для высвобождения по существу в нижних отделах желудочно-кишечного тракта (например, в тонком кишечнике или толстом кишечнике), таким образом по существу ограничивая системное воздействие указанного регулятора микробиома.
114. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар, сахарный спирт, аминокислоту, пептид, микронутриент, жирную кислоту или полифенол.
115. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт.
116. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который метаболизируется хозяином.
117. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который не метаболизируется хозяином.
118. Композиция по п. 115, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит глюкозу, галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
119. Композиция по п. 115, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит глюкозу.
120. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанное заболевание, нарушение или состояние включает раковое заболевание.
121. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанное заболевание, нарушение или состояние представляет собой метаболическое заболевание.
122. Композиция по п. 121, характеризующаяся тем, что указанное метаболическое заболевание, нарушение или состояние включает диабет.
123. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанное благоприятное действие лечения композицией, содержащей регулятор микробиома, включает что-либо одно или более из:
i) лечения дисбиоза у субъекта;
ii) уменьшения индуцированного лекарственным средством или лечением симптома у субъекта; или
iii) модулирования бактериального таксона в микробиоте желудочно-кишечного тракта указанного субъекта для обеспечения благоприятного действия на состояние здоровья субъекта.
124. Композиция по п. 123, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствуте по меньшей мере двум из i), ii) или iii).
125. Композиция по п. 123, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует пунктам i), ii) и iii).
126. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома не содержит фрагмента алкенила, алкинила, арила, гетероарила, циклоалкила, галогена, ацила, тиола, циано, нитро или сульфонила.
127. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит молекулу, содержащую меньше приблизительно 12 атомов углерода (например, меньше приблизительно 10 атомов углерода, приблизительно 9 атомов углерода, приблизительно 8 атомов углерода, приблизительно 7 атомов углерода, приблизительно 6 атомов углерода или приблизительно 5 атомов углерода) и меньше приблизительно 12 гетероатомов (например, меньше приблизительно 10 гетероатомов, меньше приблизительно 9 гетероатомов, меньше приблизительно 8 гетероатомов, меньше приблизительно 7 гетероатомов, меньше приблизительно 6 гетероатомов или меньше приблизительно 5 гетероатомов), при этом гетероатом выбран из кислорода, азота, серы или фосфора.
128. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит больше приблизительно 50% (масс./масс.) регулятора микробиома (например, больше приблизительно 55%, приблизительно 60%, приблизительно 65%, приблизительно 70%, приблизительно 75%, приблизительно 80%, приблизительно 85%, приблизительно 90%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% или более).
129. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в тонком кишечнике, например, в двенадцатиперстной кишке, тощей кишке или подвздошной кишке.
130. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в толстом кишечнике, например, в слепой кишке, толстой кишке или прямой кишке.
131. Композиция по п. 113, характеризующаяся тем, что указанная композиция представляет собой жидкую лекарственную форму или твердую лекарственную форму, выполненную с возможностью перорального или энтерального введения.
132. Фармацевтическая композиция для применения в модулировании разнообразия микроорганизмов в микробиоте желудочно-кишечного тракта субъекта, содержащая регулятор микробиома, выполненная в виде лекарственной формы или вводимая согласно режиму введения для высвобождения указанной композиции по существу в желудочно-кишечном тракте, с обеспечением модуляции разнообразия микроорганизмов у субъекта.
133. Композиция по п. 132, характеризующаяся тем, что указанное разнообразие микроорганизмов включает разнообразие бактерий.
134. Композиция по п. 132, характеризующаяся тем, что разнообразие по Шеннону микробиоты увеличивается или уменьшается по меньшей мере приблизительно на 5% (например, по меньшей мере приблизительно на 10%, приблизительно на 15%, приблизительно на 20%, приблизительно на 25%, приблизительно на 30%, приблизительно на 35%, приблизительно на 40%, приблизительно на 45%, приблизительно на 50% или более).
135. Композиция по п. 132, характеризующаяся тем, что разнообразие по Шеннону микробиоты увеличивается или уменьшается по меньшей мере приблизительно на 0,1 по логарифмической шкале (например, приблизительно на 0,2 по логарифмической шкале, приблизительно на 0,3 по логарифмической шкале, приблизительно на 0,4 по логарифмической шкале, приблизительно на 0,5 по логарифмической шкале, приблизительно на 0,6 по логарифмической шкале, приблизительно на 0,7 по логарифмической шкале, приблизительно на 0,8 по логарифмической шкале, приблизительно на 0,9 по логарифмической шкале, приблизительно на 1 по логарифмической шкале, приблизительно на 1,5 по логарифмической шкале приблизительно на 2 по логарифмической шкале или более).
136. Фармацевтическая композиция для применения в лечении субъекта, страдающего заболеванием желудочно-кишечного тракта, содержащая регулятор микробиома, выполненная в виде лекарственной формы или вводимая согласно режиму введения для высвобождения указанной композиции по существу в желудочно-кишечном тракте указанного субъекта, при условии, что в том случае, если указанный регулятор микробиома содержит глюкозу, указанный регулятор микробиома представлен в лекарственной форме, которая покрыта кишечнорастворимой оболочкой.
137. Композиция по п. 136, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома представляет собой сахар или сахарный спирт, соответствующий одному или более из:
i) содержащий моносахарид, дисахарид, трисахарид, тетрасахарид или пентасахарид, который метаболизируется хозяином; при этом в том случае, если указанный сахар или сахарный спирт представляет собой дисахарид, трисахарид, тетрасахарид или пентасахарид:
a) по меньшей мере одна, по меньшей мере две, по меньшей мере три, по меньшей мере четыре или более гликозидных связей содержат 1->2 гликозидную связь, 1->3 гликозидную связь, 1->4 гликозидную связь или 1->6 гликозидную связь; и
b) по меньшей мере одна, по меньшей мере две, по меньшей мере три, по меньшей мере четыре или более гликозидных связей присутствуют в альфа- или бета-конфигурации;
ii) имеющий молекулярную массу меньше приблизительно 1000 г/моль (например, меньше приблизительно 950 г/моль, приблизительно 900 г/моль, приблизительно 850 г/моль, приблизительно 800 г/моль, приблизительно 750 г/моль, приблизительно 700 г/моль, приблизительно 650 г/моль, приблизительно 600 г/моль, приблизительно 500 г/моль, приблизительно 450 г/моль, приблизительно 400 г/моль, приблизительно 350 г/моль, приблизительно 300 г/моль, приблизительно 250 г/моль, приблизительно 200 г/моль или меньше);
iii) содержащий меньше приблизительно 30 атомов углерода (например, меньше приблизительно 25 атомов углерода, приблизительно 20 атомов углерода, приблизительно 18 атомов углерода, приблизительно 15 атомов углерода, приблизительно 12 атомов углерода, приблизительно 10 атомов углерода, приблизительно 9 атомов углерода, приблизительно 8 атомов углерода, приблизительно 7 атомов углерода, приблизительно 6 атомов углерода или приблизительно 5 атомов углерода);
iv) содержащий меньше приблизительно 30 гетероатомов (например, меньше приблизительно 25 гетероатомов, приблизительно 20 гетероатомов, приблизительно 18 гетероатомов, меньше приблизительно 15 гетероатомов, меньше приблизительно 12 гетероатомов, меньше приблизительно 10 гетероатомов, меньше приблизительно 9 гетероатомов, меньше приблизительно 8 гетероатомов, меньше приблизительно 7 гетероатомов, меньше приблизительно 6 гетероатомов или меньше приблизительно 5 гетероатомов); или
v) не содержащий фрагмента алкенила, алкинила, арила, гетероарила, циклоалкила, галогена, ацила, тиола, циано, нитро или сульфонила.
138. Композиция по п. 137, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствуте по меньшей мере двум из i), ii), iii), iv) или v).
139. Композиция по п. 137, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует по меньшей мере трем пунктам из i), ii), iii), iv) или v).
140. Композиция по п. 137, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует по меньшей мере четырем пунктам из i), ii), iii), iv) или v).
141. Композиция по п. 137, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует пунктам i), ii), iii), iv) и v).
142. Композиция по п. 136, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит сахар или сахарный спирт, и соответствует одному или более из следующих пунктов:
i) по существу не содержит сахара или сахарного спирта, который не метаболизируется хозяином; и
ii) по существу не содержит агентов помимо регулятора микробиома, например, терапевтического агента (например, пептида, нуклеиновой кислоты, олигосахарида, полисахарида, белка, непептидной малой молекулы; или пролекарства или его метаболита), или
полимера (например, полиэтиленгликоля (ПЭГ), полипропиленгликоля (ППГ), поливинилпирролидина (ПВГ), поливинилового спирта (ПВС), полиакриловой кислоты (ПАК), полиакриламида, N-(2-гидроксипропил)метилакриламида (ГМПА), дивинилового эфира/малеинового ангидрида (DIVEMA), полиоксазолинов, полифосфатов, ксантановой камеди, пектина, хитина, хитозана, декстрана, каррагинана, гуаровой камеди, целлюлозы (например, гидроксипропилметилцеллюлозы (МГПЦ), гидроксипропилцеллюлозы (ГПЦ), гидроксиэтилцеллюлозы (ГЭЦ), карбоксиметилцеллюлозы натрия (Na-КМЦ)), гиалуроновой кислоты, гиалуронана, альбумина, гепарина, хондроитина, крахмала или их производных).
143. Композиция по п. 142, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует пунктам i) и ii).
144. Композиция по п. 142, характеризующаяся тем, что указанный агент, отличающийся от регулятора микробиома, представляет собой терапевтический агент и соответствует одному или более из следующих пунктов:
i) содержит пептид, нуклеиновую кислоту, олигосахарид, полисахарид, белок, непептидную малую молекулу; или пролекарство или его метаболит;
ii) имеет молекулярную массу, превышающую приблизительно 500 г/моль;
iii) содержит больше приблизительно 6 атомов углерода;
iv) обладает специфичностью в отношении рецептора клеточной поверхности, ионного канала, транспортера, фермента, антитела или другой биологической мишени; или
v) содержит агент, применяемый в лечении заболевания, нарушения или состояния.
145. Композиция по п. 144, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует по меньшей мере двум из i), ii), iii), iv) или v).
146. Композиция по п. 144, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует по меньшей мере трем пунктам из i), ii), iii), iv) или v).
147. Композиция по п. 144, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует по меньшей мере четырем пунктам из i), ii), iii), iv) или v).
148. Композиция по п. 145, характеризующаяся тем, что указанная композиция соответствует пунктам i), ii), iii), iv) и v).
149. Композиция по п. 136, дополнительно характеризующаяся тем, что проводится идентификация субъекта, нуждающегося в лечении заболевания желудочно-кишечного тракта.
150. Композиция по п. 149, характеризующаяся тем, что субъекта, нуждающегося в лечении заболевания желудочно-кишечного тракта, идентифицируют на основании оценки статуса микробиоты указанного субъекта.
151. Композиция по п. 150, характеризующаяся тем, что указанная оценка включает получение (например, прямое или непрямое) информации либо о специфической OTU, либо о разнообразии микроорганизмов микробиоты желудочно-кишечного тракта указанного субъекта.
152. Композиция по п. 149, характеризующаяся тем, что идентификация включает получение (например, прямое или непрямое) образца от субъекта (например, образца фекалий).
153. Композиция по любому из пп. 150 или 152, характеризующаяся тем, что эффективное количество композиции, содержащей регулятор микробиома, вводят на основании результатов указанной оценки.
154. Композиция по п. 136, дополнительно характеризующаяся тем, что проводится идентификация субъекта, страдающего дисбиозом.
155. Фармацевтическая композиция, содержащая регулятор микробиома, содержащий сахар, сахарный спирт, аминокислоту, пептид, микронутриент, жирную кислоту или полифенол, выполненная в виде лекарственной формы или вводимая согласно режиму введения для обеспечения нацеленного высвобождения указанной композиции по существу в желудочно-кишечном тракте.
156. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт.
157. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит глюкозу, галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
158. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный сахар или сахарный спирт содержит галактозу, фруктозу, фукозу, маннозу, ксилозу, арабинозу, рамнозу, рибозу, сахарозу, сорбозу, лактозу, сорбит, мальтозу, маннит, лактулозу, лактит, эритрит, тагатозу, койибиозу, нигерозу, изомальтозу, трегалозу, софорозу, ламинарибиозу, гентиобиозу, туранозу, мальтулозу, палатинозу, гентиобиулозу, маннобиозу, мелибиулозу, рутинулозу или ксилобиозу.
159. Композиция по п. 156, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который метаболизируется хозяином.
160. Композиция по п. 156, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит сахар или сахарный спирт, который не метаболизируется хозяином.
161. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанная композиция содержит больше приблизительно 50% (масс./масс.) сахара или сахарного спирта (например, больше приблизительно 55%, приблизительно 60%, приблизительно 65%, приблизительно 70%, приблизительно 75%, приблизительно 80%, приблизительно 85%, приблизительно 90%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% или более).
162. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит молекулу, содержащую меньше приблизительно 12 атомов углерода (например, меньше приблизительно 10 атомов углерода, приблизительно 9 атомов углерода, приблизительно 8 атомов углерода, приблизительно 7 атомов углерода, приблизительно 6 атомов углерода или приблизительно 5 атомов углерода) и меньше приблизительно 12 гетероатомов (например, меньше приблизительно 10 гетероатомов, меньше приблизительно 9 гетероатомов, меньше приблизительно 8 гетероатомов, меньше приблизительно 7 гетероатомов, меньше приблизительно 6 гетероатомов или меньше приблизительно 5 гетероатомов), при этом гетероатом выбран из кислорода, азота, серы или фосфора.
163. Композиция по п. 159, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в нижних отделах ЖКТ (например, в тонком кишечнике или толстом кишечнике).
164. Композиция по п. 163, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в тонком кишечнике, например, в двенадцатиперстной кишке, тощей кишке или подвздошной кишке.
165. Композиция по п. 163, характеризующаяся тем, что существенная часть сахара или сахарного спирта, который метаболизируется хозяином, метаболизируется в толстом кишечнике, например, в слепой кишке, толстой кишке или прямой кишке.
166. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит аминокислоту.
167. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит микронутриент.
168. Композиция по п. 167, характеризующаяся тем, что указанный микронутриент содержит витамин, элемент или минеральное вещество.
169. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит жирную кислоту.
170. Композиция по п. 169, характеризующаяся тем, что указанная жирная кислота содержит жирную кислоту с короткой цепью (ЖККЦ), жирную кислоту со средней цепью (СЦЖК), жирную кислоту с длинной цепью (ДЦЖК) или жирную кислоту с очень длинной цепью (ОДЦЖК).
171. Композиция по п. 155, характеризующаяся тем, что указанный регулятор микробиома содержит полифенол.
172. Композиция по п. 171, характеризующаяся тем, что указанный полифенол содержит катехин, эллагитаннин, изофлавон, флавонол, флаванон, антоциан или лигнин.