СПОСОБ СОЗДАНИЯ ДИАГНОСТИЧЕСКОГО МАРКЕРА

1. Способ создания диагностического маркера в организме, включающий стадии:
- выбора интересующего признака;
- определения локуса, который связан с признаком;
- определения положения локуса на генетической карте;
- идентификации маркера, который расположен в пределах генетического расстояния от локуса;
- получения популяции организма, в которой каждый представитель популяции содержит маркер;
- определения нуклеотидной последовательности маркера для каждого из представителей популяции;
- выравнивания нуклеотидных последовательностей маркеров;
- выбора по меньшей мере одного положения в последовательности маркера, которое содержит один и тот же нуклеотид во всех маркерах популяции;
- конструирования олигонуклеотида, который способен к гибридизации с последовательностью маркера, прилегающей к обеим сторонам от по меньшей мере одного положения, и где олигонуклеотид дополнительно содержит нуклеотид (маркерный нуклеотид) по меньшей мере в одном положении, который отличается от нуклеотида по меньшей мере в одном положении в маркере;
- встраивания маркерного нуклеотида в ДНК организма, применяя направленную замену нуклеотида с использованием олигонуклеотида, тем самым встраивая уникальный и селектируемый SNP в маркере, связанном с признаком.
2. Способ по п.1, в котором маркер идентифицируют, применяя молекулярные маркерные технологии.
3. Способ по п.1 или 2, в котором маркер расположен на расстоянии, самое большое, 1 см, предпочтительно, самое большое, 0,1 см от признака.
4. Способ по п.1 или 2, в котором созданы два или более маркеров, которые независимо расположены на расстоянии, самое большое, 2 см, предпочтительно, самое большое, 0,2 см от признака.
5. Способ по п.1 или 2, в котором организм представляет собой растение, животное или микроорганизм.
Gossipyum hirsutum
Glycine max
Solanum esculentum
Citrullus lanatus
Cucumis sativa
6. Способ по п.1 или 2, в котором организм представляет собой организм с низким уровнем полиморфизма, такой как хлопок (), соевые бобы (), культурный томат (), арбуз (), огурец ().
7. Способ по п.1 или 2, в котором молекулярная маркерная технология выбрана из множественных маркерных технологий, предпочтительно, из группы, состоящей из AFLP, RAPD, SSR, SFP и/или SNP.
8. Способ по п.4, в котором по меньшей мере два молекулярных маркера независимо получены при помощи множественных маркерных технологий из группы, состоящей из AFLP, RAPD, SSR, SFP и/или SNP.
9. Способ по п.1 или 2, в котором ДНК организма происходит из линии-донора, подходящей для селекции.
10. Способ по п.1 или 2 для встраивания уникального и селектируемого маркера в многокопийный участок ДНК.
11. Применение способа для создания одного или нескольких искусственных маркеров в имеющемся селекционном материале.
12. Применение способа для встраивания одного или нескольких искусственных маркеров в генетически модифицированный материал.
13. Применение TNE для получения уникальных молекулярных маркеров в селекционном материале.