МОЛЕКУЛЫ ИСКУССТВЕННОЙ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ, СОДЕРЖАЩИЕ 5′UTP TOP

1. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты, содержащая
a. по меньшей мере один элемент 5′-нетранслируемой области (элемент 5′UTR), который содержит или состоит из нуклеиновой кислотной последовательности, которая получена из 5′UTR гена ТОР или получена из варианта 5′UTR гена ТОР и
b. по меньшей мере одну открытую рамку считывания (ORF).
2. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1, дополнительно содержащая по меньшей мере один элемент 3′UTR, который содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, полученной из 3′UTR гена хордового животного, предпочтительно гена позвоночного, более предпочтительно гена млекопитающего, наиболее предпочтительно гена человека, или из варианта 3′UTR гена хордового животного, предпочтительно из варианта 3′UTR гена позвоночного, более предпочтительно из варианта 3′UTR гена млекопитающего, наиболее предпочтительно из варианта 3′UTR гена человека;
где по меньшей мере один элемент 3′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 3′UTR гена, обеспечивающего стабильную мРНК, или из варианта 3′UTR гена, обеспечивающего стабильную мРНК.
3. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где элемент 3′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 3′UTR гена, выбранного из группы, состоящей из гена альбумина, гена α-глобина, гена β-глобина, гена тирозингидроксилазы, гена липооксигеназы и гена коллагена альфа или из варианта 3′UTR гена, выбранного из группы, состоящей из гена альбумина, гена α-глобина, гена β-глобина, гена тирозингидроксилазы, гена липооксигеназы и гена коллагена альфа.
4. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где по меньшей мере один элемент 3′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, полученной из 3′UTR гена альбумина позвоночного или из его варианта, предпочтительно из 3′UTR гена альбумина млекопитающего или из его варианта, более предпочтительно из 3′UTR гена альбумина человека или его варианта, еще более предпочтительно из 3′UTR гена альбумина человека с инвентарным номером в GenBank NM_000477.5 или из его варианта.
5. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где по меньшей мере один элемент 3′UTR имеет длину по меньшей мере примерно 50 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 75 нуклеотидов, более предпочтительно по меньшей мере примерно 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 125 нуклеотидов, наиболее предпочтительно по меньшей мере примерно 150 нуклеотидов.
6. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где элемент 5′UTR и открытая рамка считывания являются гетерологичными, и где в 5′UTR отсутствует 5′ТОР-мотив или 5′UTR не содержит функциональный 5′ТОР-мотив, например, в результате инсерций, делеций или замен 5′ТОР-мотива.
7. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где элемент 5′UTR подходит для повышения продукции белка из молекулы искусственной нуклеиновой кислоты.
8. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где элемент 5′UTR не содержит ТОР-мотив, предпочтительно, где нуклеиновокислотная последовательность получена из 5′UTR гена ТОР, предпочтительно элемент 5′UTR начинается на его 5′-конце с нуклеотида, находящегося в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 справа от ТОР-мотива 5′UTR гена ТОР.
9. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где нуклеиновокислотная последовательность получена из 5′UTR гена ТОР, предпочтительно элемент 5′UTR заканчивается на его 3′-конце нуклеотидом, находящимся в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 слева от старт-кодона открытой рамки считывания гена или мРНК, из которой он получен.
10. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где нуклеиновокислотная последовательность, которая получена из 5′UTR гена ТОР, получена из 5′UTR эукариотического гена ТОР или его варианта, предпочтительно из 5′UTR гена ТОР растения или животного, или его варианта, более предпочтительно из 5′UTR гена ТОР хордового животного или его варианта, еще более предпочтительно из 5′UTR гена ТОР позвоночного или его варианта, наиболее предпочтительно из 5′UTR гена ТОР млекопитающего, такого как ген ТОР человека или из его варианта.
11. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, где по меньшей мере один элемент 3′UTR и по меньшей мере один элемент 5′UTR функционируют по меньшей мере аддитивно, предпочтительно синергически, с повышением продукции белка из указанной молекулы искусственной нуклеиновой кислоты.
12. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п.1,
дополнительно содержащая
d. поли(А)-последовательность и/или сигнал полиаденилирования.
13. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 12, где сигнал полиаденилирования находится внутри элемента 3′UTR.
14. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по .п. 12 или 13, где сигнал полиаденилирования содержит консенсусную последовательность NN(U/T)ANA, где N=A или U, предпочтительно АА(U/T)AAA или A(U/T)(U/T)AAA.
15. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 12 или 13, где сигнал полиаденилирования, предпочтительно консенсусная последовательность NNUANA, находится меньше чем примерно на 50 нуклеотидов слева от 3′-конца 3′UTR.
16. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 12 или 13, где поли(А)-последовательность имеет длину примерно от 20 до примерно 300 адениновых нуклеотидов, предпочтительно примерно от 4 0 до примерно 200 адениновых нуклеотидов, более предпочтительно примерно от 50 до примерно 100 адениновых нуклеотидов.
17. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12 или 13, где элемент 5′UTR получен из 5′UTR гена ТОР, кодирующего рибосомальный белок большой субъединицы (RPL), или из варианта 5′UTR гена ТОР, кодирующего рибосомальный белок большой субъединицы (RPL), где в 5′UTR отсутствует 5′ТОР-мотив, или 5′UTR не содержит функциональный 5′ТОР-мотив, например, в результате инсерций, делеций или замен 5′ТОР-мотива.
18. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1, где элемент 5′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, показанной в SEQ ID No: 67, 259, 1284-1318, 1344, 1346, 1348-1354, 1357, 1358, 1421 или 1422, или с соответствующей последовательностью РНК, предпочтительно без 5′ТОР-мотива, или где по меньшей мере один элемент 5′UTR содержит или состоит из фрагмента нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с 5′UTR нуклеиновокислотной последовательности, показанной в SEQ ID No:67, 259, 1284-1318, 1344, 1346, 1348-1354, 1357, 1358, 1421 или 1422, или с соответствующей последовательностью РНК, предпочтительно без 5′ТОР-мотива.
19. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13 или 18, где элемент 5′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 5′UTR гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32), гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35), гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21), гена АТФ-синтазы, Н+транспортирующей, митохондриального комплекса F1, альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1), гена 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4), андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1), гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (СОХ6С) или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1) или из их варианта, предпочтительно из гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32) позвоночного, гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35) позвоночного, гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21) позвоночного, гена АТФ-синтазы, Н+ транспортирующей, митохондриального комплекса F1, альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1) позвоночного, гена 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4) позвоночного, андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1) позвоночного, гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (COX6C) позвоночного или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1) позвоночного, или из их варианта, более предпочтительно из гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32) млекопитающего, гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35) млекопитающего, гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21) млекопитающего, АТФ-синтазы млекопитающего, Н+ транспортирующей, митохондриального комплекса F1, альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1) млекопитающего, гена 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4) млекопитающего, андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1) млекопитающего, гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (COX6C) млекопитающего или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1) млекопитающего, или из их варианта, наиболее предпочтительно из гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32) человека, гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35) человека, гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21) человека, АТФ-синтазы человека, Н+ транспортирующей, митохондриального комплекса F1, альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1) человека, гена 17-бетагидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4) человека, андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1) человека, гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (COX6C) человека или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1) человека, или из их варианта, где предпочтительно элемент 5′UTR не содержит 5′ТОР-мотив указанного гена.
20. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1, где элемент 5′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, показанной в SEQ ID No: 1368 или SEQ ID No: 1412-1420, или с соответствующей последовательностью РНК, или где по меньшей мере один элемент 5′UTR содержит или состоит из фрагмента нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, показанной в SEQ ID No: 1368 или SEQ ID No: 1412-1420, или с соответствующей последовательностью РНК.
21. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 18 или 20, где фрагмент состоит из непрерывного участка нуклеотидов, соответствующего непрерывному участку нуклеотидов в полноразмерной последовательности, который составляет по меньшей мере 20%, предпочтительно по меньшей мере 30%, более предпочтительно по меньшей мере 40%, более предпочтительно по меньшей мере 50%, еще более предпочтительно по меньшей мере 60%, еще более предпочтительно по меньшей мере 70%, еще более предпочтительно по меньшей мере 80% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 90% от полноразмерной последовательности, из которого фрагмент получен.
22. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18 или 20, где по меньшей мере один элемент 5′ UTR имеет длину по меньшей мере примерно 20 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 30. нуклеотидов, более предпочтительно по меньшей мере примерно 40 нуклеотидов.
23. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 1, где по меньшей мере один элемент 3′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, выбранной из последовательностей SEQ ID No: 1369-1393, или с соответствующей последовательностью РНК, или где по меньшей мере один элемент 3′UTR содержит или состоит из фрагмента нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, выбранной из последовательностей SEQ ID No: 1369-1393, или с соответствующей последовательностью РНК.
24. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п.23, где фрагмент состоит из непрерывного участка нуклеотидов, соответствующего непрерывному участку нуклеотидов в полноразмерной последовательности, который составляет по меньшей мере 20%, предпочтительно по меньшей мере 30%, более предпочтительно по меньшей мере 40%, более предпочтительно по меньшей мере 50%, еще более предпочтительно по меньшей мере 60%, еще более предпочтительно по меньшей мере 70%, еще более предпочтительно по меньшей мере 80% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 90% от полноразмерной последовательности, из которой фрагмент получен.
25. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по п. 23 или 24, где фрагмент имеет длину по меньшей мере примерно 50 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 75 нуклеотидов, более предпочтительно по меньшей мере примерно 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 125 нуклеотидов, наиболее предпочтительно по меньшей мере примерно 150 нуклеотидов.
26. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18, 20, 23 или 24, где по меньшей мере один элемент 3′UTR имеет длину по меньшей мере примерно 50 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 75 нуклеотидов, более предпочтительно по меньшей мере примерно 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 125 нуклеотидов, наиболее предпочтительно по меньшей мере 150 нуклеотидов.
27. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18, 20, 23 или 24, где открытая рамка считывания не кодирует репортерный белок, такой как белок GFP, белок люциферазы, белок глобина, человеческий гормон роста или человеческий альбумин, предпочтительно не альбумин.
28. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18, 20, 23 или 24, дополнительно содержащая 5′-кэп структуру, поли(С)-последовательность и/или IRES-мотив.
29. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18, 20, 23 или 24, дополнительно содержащая последовательность, содержащую промотор.
30. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18, 20, 23 или 24, где молекула искусственной нуклеиновой кислоты, предпочтительно открытая рамка считывания, представляет по меньшей мере частично модифицированную по содержанию G/C, где предпочтительно содержание G/C в открытой рамке считывания повышено по сравнению с открытой рамкой считывания дикого типа.
31. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18, 20, 23 или 24, где открытая рамка считывания содержит кодон-оптимизированную область, где предпочтительно открытая рамка считывания является кодон-оптимизированной.
32. Молекула искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1, 2, 12, 13, 18, 20, 23 или 24, которая является РНК, предпочтительно молекулой мРНК.
33. Вектор, содержащий
а. по меньшей мере, один элемент 5′-нетранслируемой области (элемент 5′UTR), который содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 5′UTR гена ТОР или которая получена из варианта 5′UTR гена ТОР; и
b. по меньшей мере, одну открытую рамку считывания (ORF) и один сайт клонирования.
34. Вектор по п. 33, дополнительно содержащий
c. по меньшей мере, один элемент 3′-UTR, который содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, полученной из 3′UTR гена хордового животного, предпочтительно гена позвоночного, предпочтительно гена млекопитающего, наиболее предпочтительно гена человека, или из варианта 3′UTR гена хордового животного, более предпочтительно из варианта 3′UTR гена позвоночного, более предпочтительно из варианта 3′UTR гена млекопитающего, наиболее предпочтительно из варианта 3′UTR гена человека;
где по меньшей мере один элемент 3′UTR предпочтительно содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 3′UTR гена, обеспечивающего стабильную мРНК, или из варианта 3′UTR гена, обеспечивающего стабильную мРНК.
35. Вектор по одному из пп. 33 или 34, где элемент 3′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, полученной из 3′UTR гена, выбранного из группы, состоящей из гена альбумина, гена α-глобина, гена β-глобина, гена тирозингидроксилазы, гена липооксигеназы и гена коллагена альфа, или из варианта 3′UTR гена, выбранного из группы, состоящей из гена альбумина, гена α-глобина, гена β-глобина, гена тирозингидроксилазы, гена липооксигеназы и гена коллагена альфа.
36. Вектор по п. 33 или 34, где по меньшей мере один элемент 3′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, полученной из 3′UTR гена альбумина позвоночного или из его варианта, предпочтительно из 3′UTR гена альбумина млекопитающего или из его варианта, более предпочтительно из 3′UTR гена альбумина человека или его варианта, еще более предпочтительно из 3′UTR гена альбумина человека с инвентарным номером в GenBank NM_000477.5 или из его варианта.
37. Вектор по п. 33 или 34, где элемент 5′UTR и открытая рамка считывания являются гетерологичными.
38. Вектор по п. 33 или 34, где элемент 5′UTR подходит для повышения продукции белка из вектора.
39. Вектор по п. 33 или 34, где элемент 5′UTR не содержит ТОР-мотив, предпочтительно, где нуклеиновокислотная последовательность получена из 5′UTR гена ТОР, предпочтительно элемент 5′UTR начинается на его 5′-конце с нуклеотида, находящегося в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 справа от ТОР-мотива 5′UTR гена ТОР.
40. Вектор по п. 33 или 34, где нуклеиновокислотная последовательность получена из 5′UTR гена ТОР, предпочтительно элемент 5′UTR заканчивается на его 3′-конце нуклеотидом, находящимся в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 слева от старт-кодона открытой рамки считывания гена или мРНК, из которой он получен.
41. Вектор п. 33 или 34, где нуклеиновокислотная последовательность, которая получена из 5′UTR гена ТОР, получена из эукариотического гена ТОР, предпочтительно из гена ТОР растения или животного, более предпочтительно из гена ТОР хордового животного, еще более предпочтительно из гена ТОР позвоночного, наиболее предпочтительно из гена ТОР млекопитающего, такого как ген ТОР человека.
42. Вектор п. 33 или 34, где по меньшей мере один элемент 3′UTR и по меньшей мере один элемент 5′UTR функционируют по меньшей мере аддитивно, предпочтительно синергически, с повышением продукции белка из указанной молекулы искусственной нуклеиновой кислоты.
43. Вектор по п. 33, дополнительно содержащий
d. поли(А)-последовательность и/или сигнал полиаденилирования.
44. Вектор по п. 43, где сигнал полиаденилирования находится внутри элемента 3′UTR.
45. Вектор по п. 43 или 44, где сигнал полиаденилирования содержит консенсусную последовательность NN(U/T)ANA, где N=A или U, предпочтительно АА(U/T)AAA или A(U/T)(U/Τ)AAA.
46. Вектор по п. 43 или 44, где сигнал полиаденилирования, предпочтительно консенсусная последовательность NNUANA, расположена меньше чем примерно на 50 нуклеотидов слева от 3′-конца 3′UTR.
47. Вектор по п. 43 или 44, где поли(А)-последовательность имеет длину примерно от 20 до примерно 300 адениновых нуклеотидов, предпочтительно примерно от 40 до примерно 200 адениновых нуклеотидов, более предпочтительно примерно от 50 до примерно 100 адениновых нуклеотидов.
48. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43 или 44, где элемент 5′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 5′UTR гена ТОР, кодирующего рибосомальный белок, или варианта 5′UTR гена ТОР, кодирующего рибосомальный белок, предпочтительно из 5′UTR рибосомального белка, выбранного из RPSA, RPS2, RPS3, RPS3A, RPS4, RPS5, RPS6, RPS7, RPS8, RPS9, RPS10, RPS11, RPS12, RPS13, RPS14, RPS15, RPS15A, RPS16, RPS17, RPS18, RPS19, RPS20, RPS21, RPS23, RPS24, RPS25, RPS26, RPS27, RPS27A, RPS28, RPS29, RPS30, RPL3, RPL4, RPL5, RPL6, RPL7, RPL7A, RPL8, RPL9, RPL10, RPL10A, RPL11, RPL12, RPL13, RPL13A, RPL14, RPL15, RPL17, RPL18, RPL18A, RPL19, RPL21, RPL22, RPL23, RPL23A, RPL24, RPL26, RPL27, RPL27A, RPL28, RPL29, RPL30, RPL31, RPL32, RPL34, RPL35, RPL35A, RPL36, RPL36A, RPL37, RPL37A, RPL38, RPL39, RPL40, RPL41, RPLPO, RPLP1, RPLP2, RPLP3, UBA52, более предпочтительно из 5′UTR нуклеиновокислотной последовательности, показанной в SEQ ID No: 67, 170, 193, 244, 259, 554, 650, 675, 700, 721, 913, 1016, 1063, 1120, 1138 и 1284-1360, соответствующей последовательности РНК, их гомолога или варианта, как здесь описано, предпочтительно без мотива 5′ТОР.
49. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43 или 44, где элемент 5′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 5′UTR гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32), гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35), гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21), АТФ-синтазы, Н+ транспортирующей, митохондриального комплекса F1,
альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1), гена 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4), андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1), гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (COX6C) или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1), или из их варианта, предпочтительно из гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32) позвоночного, гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35) позвоночного, гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21) позвоночного, АТФ-синтазы, Н+ транспортирующей, митохондриального комплекса F1, альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1) позвоночного, гена 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4) позвоночного, андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1) позвоночного, гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (COX6C) позвоночного или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1) позвоночного, или из их варианта, более предпочтительно из гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32) млекопитающего, гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35) млекопитающего, гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21) млекопитающего, АТФ-синтазы, Н+транспортирующей, митохондриального комплекса F1, альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1) млекопитающего, гена 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4) млекопитающего, андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1) млекопитающего, гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (COX6C) позвоночного или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1) млекопитающего, или из их варианта, наиболее
предпочтительно из гена рибосомального белка большой субъединицы 32 (RPL32) человека, гена рибосомального белка большой субъединицы 35 (RPL35) человека, гена рибосомального белка большой субъединицы 21 (RPL21) человека, АТФ-синтазы, Н+ транспортирующей, митохондриального комплекса F1, альфа-субъединицы 1, гена сердечной мышцы (АТР5А1) человека, гена 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 4 (HSD17B4) человека, андроген-индуцируемого гена 1 (AIG1) человека, гена субъединицы VIc цитохром-с-оксидазы (СОХ6С) позвоночного или гена N-ацилсфингозинамидогидролазы 1 (кислой церамидазы) (ASAH1) человека, или из их варианта, где предпочтительно элемент 5′UTR не содержит 5′ТОР указанного гена.
50. Вектор по п. 33, где элемент 5′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, показанной в SEQ ID No: 1368 или SEQ ID No: 1412-1420, или с соответствующей последовательностью РНК, или где по меньшей мере один элемент 5′UTR содержит или состоит из фрагмента - нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, показанной в SEQ ID No: 1368 или SEQ ID No: 1412-1420, или с соответствующей последовательностью РНК.
51. Вектор по п. 50, где фрагмент состоит из непрерывного участка нуклеотидов, соответствующего непрерывному участку нуклеотидов в полноразмерной последовательности, который составляет по меньшей мере 20%, предпочтительно по меньшей мере 30%, более предпочтительно по меньшей мере 40%, более предпочтительно по меньшей мере 50%, еще более предпочтительно по меньшей мере 60%, еще более предпочтительно по меньшей мере 70%, еще более предпочтительно по меньшей мере 80% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 90% от полноразмерной последовательности, из которой получен фрагмент.
52. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50 или 51, где по меньшей мере один элемент 5′UTR имеет длину по меньшей мере примерно 20 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 30 нуклеотидов, более предпочтительно по меньшей мере примерно 40 нуклеотидов.
53. Вектор по п. 34, где по меньшей мере один элемент 3′UTR содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по
меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, выбранной из последовательностей SEQ ID No: 1369-1393, или с соответствующей последовательностью РНК, или где по меньшей мере один элемент 3′UTR содержит или состоит из фрагмента нуклеиновокислотной последовательности, которая имеет идентичность по меньшей мере примерно 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 99%, с нуклеиновокислотной последовательностью, выбранной из SEQ ID No: 1369-1393, или с соответствующей последовательностью РНК.
54. Вектор по п. 53, где фрагмент состоит из непрерывного участка нуклеотидов, соответствующего непрерывному участку нуклеотидов в полноразмерной последовательности, который составляет по меньшей мере 20%, предпочтительно по меньшей мере 30%, более предпочтительно по меньшей мере 40%, более предпочтительно по меньшей мере 50%, еще более предпочтительно по меньшей мере 60%, еще более предпочтительно по меньшей мере 70%, еще более предпочтительно по меньшей мере 80% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 90% от полноразмерной последовательности, из которой получен фрагмент.
55. Вектор по одному из пп. 53 или 54, где фрагмент имеет длину по меньшей мере примерно 40 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 50 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 75 нуклеотидов, более предпочтительно по меньшей мере примерно 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 125 нуклеотидов, наиболее предпочтительно по меньшей мере примерно 150 нуклеотидов.
56. Вектор по одному из пп. 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, где по меньшей мере один элемент 3′UTR имеет длину по меньшей мере примерно 40 нуклеотидов по меньшей мере примерно 50 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере примерно 75 нуклеотидов, более предпочтительно по меньшей мере примерно 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно 125 нуклеотидов, наиболее предпочтительно по меньшей мере 150 нуклеотидов.
57. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, где открытая рамка считывания не кодирует репортерный белок, такой как белок GFP, белок люциферазы, белок глобина, человеческий гормон роста или человеческий альбумин, предпочтительно не кодирует альбумин.
58. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, дополнительно содержащий 5′-кэп структуру, поли(С)-последовательность и/или IRES-мотив.
59. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, дополнительно содержащий последовательность, содержащую промотор.
60. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, где вектор, предпочтительно открытая рамка считывания, представляет по меньшей мере частично модифицированный по содержанию G/C, где предпочтительно содержание G/C в открытой рамке считывания повышено по сравнению с открытой рамкой считывания дикого типа.
61. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, где открытая рамка считывания содержит кодон-оптимизированную область, где предпочтительно открытая рамка считывания является кодон-оптимизированной.
62. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, который представляет РНК-вектор.
63. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, который представляет ДНК-вектор.
64. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, который является плазмидным вектором или вирусным вектором, предпочтительно плазмидным вектором.
65. Вектор по одному из пп. 33, 34, 43, 44, 50, 51, 53 или 54, который содержит или кодирует молекулу искусственной нуклеиновой кислоты по одному из п.п. 1-39.
66. Вектор по одному из пп. 33-65, который является циклической молекулой.
67. Вектор по п. 66, где за ORF, поли(А)-последовательностью или элементом 3′UTR кодирующей цепи следует в направлении 5′→3′ сайт рестрикции для линеаризации циклической молекулы вектора.
68. Клетка, содержащая молекулу искусственной нуклеиновой кислоты по одному из п.п. 1-32 или вектор по одному из п.п. 33-67.
69. Клетка по п. 68, которая является клеткой млекопитающего.
70. Клетка по п. 68 или 69, которая является клеткой млекопитающего, предпочтительно выделенной клеткой млекопитающего, предпочтительно человека.
71. Фармацевтическая композиция, содержащая молекулу искусственной нуклеиновой кислоты по одному из п.п. 1-32, вектор по одному из пп. 33-67 или клетку по одному из п.п. 68-70.
72. Фармацевтическая композиция по п. 71, дополнительно содержащая один или более фармацевтически приемлемых разбавителей и/или эксципиентов, и/или один или более адъювантов.
73. Применение молекулы искусственной нуклеиновой кислоты по одному из 1-32, вектора по одному из п.п. 33-67, клетки по одному из пп. 68-70 или фармацевтической композиции по пп. 71 или 72 в качестве лекарственного препарата.
74. Применение молекулы искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-32, вектора по одному из пп. 33-67, клетки по одному из пп. 68-70 или фармацевтической композиции по п. 71 или 72 в качестве вакцины или в генной терапии.
75. Способ лечения или профилактики расстройства, включающий введение молекулы искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-32, вектора по одному из пп. 33-67, клетки по одному из пп. 68-70 или фармацевтической композиции по п. 71 или 72 субъекту, нуждающемуся в этом.
76. Способ лечения или профилактики расстройства, включающий трансфекцию клетки молекулой искусственной  нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-32 или вектором по одному из пп. 33-67.
77. Способ по п. 76, где трансфекция проводится in vitro/ex vivo, и трансфектированная клетка вводится субъекту, нуждающемуся в этом, предпочтительно человеку.
78. Способ по п. 77, где клетка, предназначенная для трансфекции in vitro, является выделенной клеткой субъекта, предпочтительно человека.
79. Способ по одному из пп. 75-78, который представляет вакцинацию или генную терапию.
80. Способ повышения продукции белка из молекулы искусственной нуклеиновой кислоты, включающий стадию обеспечения молекулы искусственной нуклеиновой кислоты:
i. по меньшей мере, одним 5′-элементом нетранслируемой области (элементом 5′UTR), который содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 5′UTR гена ТОР или которая получена из варианта 5′UTR гена ТОР.
81. Способ по п. 80, где элемент 5′UTR не содержит ТОР-мотив, предпочтительно, где нуклеиновокислотная последовательность получена из 5′UTR гена ТОР, предпочтительно элемент 5′UTR начинается на его 5′-конце с нуклеотида, находящегося в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 справа от ТОР-мотива 5′UTR гена ТОР.
82. Способ по одному из пп. 80 или 81, где элемент 5′UTR не содержит функциональный 5′ТОР-мотив, например, в результате инсерций, делеций или замен 5′ТОР-мотива.
83. Способ по п. 80 или 81, дополнительно включающий обеспечение молекулы искусственной нуклеиновой кислоты:
ii. по меньшей мере, одним элементом 3′UTR, который содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, полученной из 3′UTR гена хордового животного, предпочтительно гена позвоночного, более предпочтительно гена млекопитающего, наиболее предпочтительно гена человека, или из варианта 3′UTR гена хордового животного, предпочтительно из варианта 3′UTR гена позвоночного, более предпочтительно из варианта 3′UTR гена млекопитающего, наиболее предпочтительно из варианта 3′UTR гена человека.
84. Применение элемента 5′UTR, который содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, которая получена из 5′UTR гена ТОР или которая получена из варианта 5′UTR гена ТОР, для повышения продукции белка из молекулы нуклеиновой кислоты.
85. Применение по п. 84, где элемент 5′UTR не содержит ТОР-мотив, где предпочтительно нуклеиновокислотная последовательность получена из 5′UTR гена ТОР, предпочтительно элемент 5′UTR начинается на его 5′-конце с нуклеотида, находящегося в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 справа от ТОР-мотива 5′UTR гена ТОР.
86. Применение по одному из пп. 84 или 85, где в 5′UTR отсутствует 5′ТОР-мотив или 5′UTR не содержит функциональный 5′ТОР-мотив, например, в результате инсерций, делеций или замен 5′ТОР-мотива.
87. Применение по п. 84 или 85, где элемент 5′UTR используется в комбинации с элементом 3′UTR, который содержит или состоит из нуклеиновокислотной последовательности, полученной из 3′UTR гена хордового животного, предпочтительно гена позвоночного, более предпочтительно гена млекопитающего, наиболее предпочтительно гена человека, или из варианта 3′UTR гена хордового животного, предпочтительно из варианта 3′UTR гена позвоночного, более предпочтительно из варианта 3′UTR гена млекопитающего, наиболее предпочтительно из варианта 3′UTR гена человека.
88. Набор или набор частей, содержащий молекулу искусственной нуклеиновой кислоты по одному из пп.1-32, вектор по одному из пп. 33-67, клетку по одному из пп. 68-70 и/или фармацевтическую композицию по пп. 71 или 72.
89. Набор по п. 88, дополнительно содержащий инструкции по применению, клетки для трансфекции, адъювант, средства для введения фармацевтической композиции, фармацевтически приемлемый носитель и/или фармацевтически приемлемый раствор для растворения или разведения молекулы искусственной нуклеиновой кислоты, вектора, клетки или фармацевтической композиции.