СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ СОЕДИНЕНИЯ, СОДЕРЖАЩЕГО ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ КОМПОНЕНТ И ОЛИГОНУКЛЕОТИД (ВАРИАНТЫ), ВЫШЕУКАЗАННОЕ СОЕДИНЕНИЕ (ВАРИАНТЫ), СПОСОБ СИНТЕЗА БИБЛИОТЕКИ СОЕДИНЕНИЙ, БИБЛИОТЕКА СОЕДИНЕНИЙ (ВАРИАНТЫ), СПОСОБ ИДЕНТИФИКАЦИИ СОЕДИНЕНИЯ, СВЯЗЫВАЮЩЕГОСЯ С БИОЛОГИЧЕСКОЙ МИШЕНЬЮ (ВАРИАНТЫ)

1. Способ получения соединения, содержащего функциональный компонент, который эффективно связан с кодирующим олигонуклеотидом, в котором в качестве исходного соединения используют соединение-инициатор, которое состоит из исходного функционального компонента, эффективно связанного с исходным олигонуклеотидом, при этом исходный функциональный компонент содержит n структурных фрагментов, где n равно целому числу 1 или более, и по крайней мере одну реакционноспособную группу, осуществляют взаимодействие указанного соединения-инициатора со структурным фрагментом, содержащим по крайней мере одну реакционноспособную группу, которая комплементарна по меньшей мере одной реакционноспособной группе исходного функционального компонента, в условиях, пригодных для образования ковалентной связи между комплементарными реакционноспособными группами, вводят новый олигонуклеотид, определяющий структурный фрагмент, и осуществляют взаимодействие исходного олигонуклеотида с вводимым олигонуклеотидом в присутствии фермента, который катализирует лигирование исходного олигонуклеотида и вводимого олигонуклеотида в условиях, пригодных для лигирования исходного олигонуклеотида и вводимого олигонуклеотида с образованием кодирующего олигонуклеотида, а в результате осуществления вышеперечисленных стадий получают соединение, содержащее функциональный компонент, который эффективно связан с кодирующим олигонуклеотидом, при этом функциональный компонент содержит n+1 структурных фрагментов.
2. Способ по п.1, в котором функциональный компонент соединения, полученного в результате указанных стадий, содержит реакционноспособную группу, и указанные стадии повторяют по меньшей мере 1 раз, и таким образом проводят от 1 до i циклов, где i равно целому числу 2 или более, с использованием продукта, полученного в результате указанных стадий цикла s, где s равно целому числу i-1 или менее, причем указанный продукт в цикле s+1 является соединением-инициатором.
3. Способ по п.1, в котором взаимодействие указанного соединения-инициатора с указанным структурным фрагментом осуществляют после или до взаимодействия исходного олигонуклеотида с вводимым олигонуклеотидом.
4. Способ по п.1. в котором по меньшей мере один из структурных фрагментов является аминокислотой или активированной аминокислотой.
5. Способ по п.1, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей аминогруппу, карбоксильную группу, сульфонильную группу, фосфонильную группу, эпоксидную группу, азиридиновую группу и изоцианатную группу.
6. Способ по п.1, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей гидроксильную группу, карбоксильную группу, сульфонильную группу, фосфонильную группу, эпоксидную группу, азиридиновую группу и изоцианатную группу.
7. Способ по п.1, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей аминогруппу и альдегидную или кетогруппу.
8. Способ по п.7, в котором реакцию между реакционноспособной группой и комплементарной реакционноспособной группой проводят в восстанавливающих условиях.
9. Способ по п.1, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей фосфорилидную группу и альдегидную или кетогруппу.
10. Способ по п.1, в котором реакцию между реакционноспособной группой и комплементарной реакционноспособной группой проводят в условиях циклоприсоединения с образованием циклической структуры.
11. Способ по п.10, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей алкин и азид.
12. Способ по п.10, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей галогенированную гетероароматическую группу и нуклеофил.
13. Способ по п.12, в котором галогенированную гетероароматическую группу выбирают из группы, включающей хлорированные пиримидины, хлорированные триазины и хлорированные пурины.
14. Способ по п.12, в котором нуклеофилом является аминогруппа.
15. Способ по п.1, в котором фермент выбирают из группы, включающей ДНК-лигазу, РНК-лигазу, ДНК-полимеразу, РНК-полимеразу и топоизомеразу.
16. Способ по п.1, в котором исходный олигонуклеотид является двухцепочечным или одноцепочечным.
17. Способ по п.16, в котором исходный олигонуклеотид содержит последовательность праймера ПЦР.
18. Способ по п.16, в котором исходный олигонуклеотид является одноцепочечным и новый вводимый олигонуклеотид является одноцепочечным, или исходный олигонуклеотид является двухцепочечным и новый вводимый олигонуклеотид является двухцепочечным.
19. Способ по п.18, в котором исходный функциональный компонент и исходный олигонуклеотид связаны посредством связующей группы.
20. Способ по п.19, в котором исходный олигонуклеотид является двухцепочечным а связующая группа ковалентно связана с исходным функциональным компонентом и с обеими цепями исходного олигонуклеотида.
21. Способ по п.1, в котором новый вводимый олигонуклеотид включает от 3 до 10 нуклеотидов.
22. Способ по п.2, в котором новый вводимый олигонуклеотид в цикле i включает в конце последовательности праймер ПЦР.
23. Способ по п.2, дополнительно включающий в цикле i стадию, на которой проводят лигирование олигонуклеотида, содержащего праймер ПЦР в конце последовательности с кодирующим олигонуклеотидом.
24. Способ по п.23, в котором проводят лигирование олигонуклеотида, содержащего в конце последовательности праймер ПЦР, с кодирующим олигонуклеотидом в присутствии фермента, катализирующего указанное лигирование.
25. Способ по п.2, дополнительно включающий после цикла i стадию циклизации функционального компонента.
26. Способ по п.25, в котором функциональный компонент содержит алкинильную группу и азидную группу, а соединение обрабатывают в условиях, пригодных для циклоприсоединения алкинильной группы и азидной группы с образованием триазольной группы, и приводящих к циклизации функционального компонента.
27. Способ синтеза библиотеки соединений, в которой соединения содержат функциональный компонент, эффективно связанный с исходным олигонуклеотидом, при этом функциональный компонент содержит по меньшей мере 2 структурных фрагмента, а олигонуклеотид определяет структуру функционального компонента, включающий получение исходного раствора, содержащего m соединений-инициаторов, где m равно целому числу 1 или более, которые содержат функциональный компонент, эффективно связанный с исходным олигонуклеотидом, при этом функциональный компонент содержит n структурных фрагментов, где n равно целому числу 1 или более, а исходный олигонуклеотид определяет n структурных фрагментов, распределение полученного раствора в r реакционных сосудов, причем r равно целому числу 2 или более, при этом получают r аликвотных частей раствора, взаимодействие соединений-инициаторов в каждом реакционном сосуде с одним из r структурных фрагментов с образованием r аликвотных частей, включающих соединения, содержащих функциональный компонент, содержащий n+1 структурных фрагментов, который эффективно связан с исходным олигонуклеотидом и взаимодействие исходного олигонуклеотида в составе каждой аликвотной части с одним из набора r отдельных новых вводимых олигонуклеотидов в присутствии фермента, который катализирует лигирование нового вводимого и исходного олигонуклеотидов в условиях, пригодных для ферментативного лигирования нового вводимого и исходного олигонуклеотидов с образованием кодирующего олигонуклеотида, при этом получают r аликвотных частей, содержащих соединения, которые включают функциональный компонент, эффективно связанный с кодирующим олигонуклеотидом, при этом функциональный компонент содержит n+1 структурных фрагментов, а кодирующий олигонуклеотид определяет n+1 структурных фрагментов.
28. Способ по п.27, который дополнительно включает стадию объединения по меньшей мере двух r аликвотных частей с образованием раствора, содержащего соединения, которые включают функциональный компонент, эффективно связанный с кодирующим олигонуклеотидом, при этом функциональный компонент содержит n+1 структурных фрагментов, а кодирующий олигонуклеотид определяет n+1 структурных фрагментов.
29. Способ по п.28, в котором r аликвотных частей объединяют.
30. Способ по п.28, в котором все стадии повторяют по меньшей мере один раз, при этом проводят от 1 до i циклов, где i равно целому числу 2 или более, причем в цикле s+1, где s равно целому числу i-1 или менее, исходным раствором, включающим m соединений-инициаторов, является раствор, полученным на стадии объединения по меньшей мере двух r аликвотных частей цикла s.
31. Способ по п.27 или 28, в котором по меньшей мере в одном цикле 1-i взаимодействие исходного олигонуклеотида в составе каждой аликвотной части с одним из набора r отдельных новых вводимых олигонуклеотидов предшествует взаимодействию соединений-инициаторов в каждом реакционном сосуде с одним из r структурных фрагментов.
32. Способ по п.28, в котором по меньшей мере один структурный фрагмент является аминокислотой.
33. Способ по п.27, в котором фермент выбирают из группы, включающей ДНК-лигазу, РНК-лигазу, ДНК-полимеразу, РНК-полимеразу или топоизомеразу.
34. Способ по п.28, в котором исходный олигонуклеотид является двухцепочечным.
35. Способ по п.34, в котором новый вводимый олигонуклеотид является двухцепочечным.
36. Способ по п.28, в котором соединения-инициаторы включают связующее звено, содержащее первую функциональную группу, которая способна связываться со структурным фрагментом, вторую функциональную группу, способную связываться с 5'-концевым участком олигонуклеотида, и третью функциональную группу, способную связываться с 3'-концевым участком олигонуклеотида.
37. Способ по п.36, в котором связующее звено является структурой формулы
где А означает функциональную группу, которая может образовывать ковалентную связь со структурным фрагментом,
В означает функциональную группу, которая может образовывать связь с 5'-концевым участком олигонуклеотида,
С означает функциональную группу, которая может образовывать связь с 3'-концевым участком олигонуклеотида,
S означает атом или молекулярный каркас,
D означает химическую структуру, соединяющую группу А с группой S,
Е означает химическую структуру, соединяющую группу В с группой S, и
F означает химическую структуру, соединяющую группу C с группой S.
38. Способ по п.37, в котором
А означает аминогруппу,
В означает фосфатную группу и
С означает фосфатную группу.
39. Способ по п.37, в котором D, Е и F каждый независимо выбран из группы, включающей алкиленовую группу или олиго(этиленгликольную) группу.
40. Способ по п.37, в котором S выбран из группы, включающей атом углерода, атом азота, атом фосфора, атом бора, фосфатную группу, циклическую группу или полициклическую группу.
41. Способ по п.40, в котором связующее звено означает группу формулы
,
где каждый n, m и p независимо равен целому числу от 1 до приблизительно 20.
42. Способ по п.41, в котором каждый n, m и p независимо равен целому числу от 2 до 8.
43. Способ по п.42, в котором каждый n, m и p независимо равен целому числу от 3 до 6.
44. Способ по п.41, в котором связующее звено означает группу формулы
45. Способ по п.27, в котором каждое из упомянутых соединений-инициаторов и каждый из упомянутых структурных фрагментов г содержат комплементарные друг другу реакционноспособные группы.
46. Способ по п.45, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей аминогруппу, карбоксильную группу, сульфонильную группу, фосфонильную группу, эпоксидную группу, азиридиновую группу и изоцианатную группу.
47. Способ по п.45, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей гидроксильную группу, карбоксильную группу, сульфонильную группу, фосфонильную группу, эпоксидную группу, азиридиновую группу и изоцианатную группу.
48. Способ по п.45, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей аминогруппу и альдегидную или кетогруппу.
49. Способ по п.45, в котором реакцию между реакционноспособной группой и комплементарной реакционноспособной группой проводят в восстанавливающих условиях.
50. Способ по п.45, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей фосфороилидную группу и альдегидную или кетогруппу.
51. Способ по п.45, в котором реакцию между реакционноспособной группой и комплементарной реакционноспособной группой проводят в условиях циклоприсоединения с образованием циклической структуры.
52. Способ по п.51, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей алкин и азид.
53. Способ по п.45, в котором реакционноспособную группу и комплементарную реакционноспособную группу выбирают из группы, включающей галогенированную гетероароматическую группу и нуклеофил.
54. Способ по п.53, в котором галогенированную гетероароматическую группу выбирают из группы, включающей хлорированный пиримидин, хлорированный триазин и хлорированный пурин.
55. Способ по п.53, в котором нуклеофилом является аминогруппа.
56. Способ по п.28, который дополнительно включает после цикла i стадию циклизации по меньшей мере одного функционального компонента.
57. Способ по п.56, в котором функциональный компонент на стадии циклизации содержит азидную группу и алкинильную группу.
58. Способ по п.57, в котором функциональный компонент обрабатывают в условиях, пригодных для циклоприсоединения азидной группы и алкинильной группы с образованием триазольной группы, приводящих к циклизации функционального компонента.
59. Способ по п.58, в котором реакцию циклоприсоединения проводят в присутствии медного катализатора.
60. Способ по п.59, в котором по меньшей мере один из одного или более функциональных компонентов на стадии циклизации содержит по меньшей мере две сульфгидрильные группы, и упомянутый функциональный компонент обрабатывают в условиях, пригодных для взаимодействия двух сульфгидрильных групп с образованием дисульфидной связи, при этом получают циклический функциональный компонент.
61. Способ по п.27, в котором исходный олигонуклеотид содержит последовательность праймера ПЦР.
62. Способ по п.28, в котором новый вводимый олигонуклеотид в цикле i содержит в конце последовательности праймер ПЦР.
63. Способ по п.28, дополнительно включающий после цикла i стадию лигирования олигонуклеотида, содержащего в конце последовательности праймер ПЦР, с кодирующим олигонуклеотидом.
64. Способ по п.63, в котором проводят лигирование олигонуклеотида, содержащего в конце последовательности праймер ПЦР, с кодирующим олигонуклеотидом в присутствии фермента, катализирующего указанное лигирование.
65. Соединение формулы
где
Х означает функциональный компонент, содержащий один или более структурных фрагментов,
Z означает олигонуклеотид, соединенный по 3'-концевому участку с группой В,
Y означает олигонуклеотид, соединенный по 5'-концевому участку с группой С,
А означает функциональную группу, которая образует ковалентную связь с фрагментом X,
В означает функциональную группу, которая образует связь с 3'-концевым участком олигонуклеотида Z,
С означает функциональную группу, которая образует связь с 5'-концевым участком олигонуклеотида Y,
D, F и Е каждый независимо означает бифункциональную связующую группу, а
S означает атом или молекулярный каркас.
66. Соединение по п.65, в котором D, F и Е каждый независимо выбирают из группы, включающей алкиленовую цепь или олиго(этиленгликольную) цепь.
67. Соединение по п.65, в котором Y и Z являются в основном комплементарными и ориентированы в соединении таким образом, чтобы обеспечивать образование пары Уотсона-Крика и дуплекс в пригодных условиях.
68. Соединение по п.65, в котором Y и Z имеют одинаковую или различную длину.
69. Соединение по п.68, в котором Y и Z имеют одинаковую длину.
70. Соединение по п.65, в котором каждый Y и Z включает 10 или более оснований и комплементарные участки, содержащие 10 или более пар оснований.
71. Соединение по п.65, в котором S выбран из группы, включающей атом углерода, атом бора, атом азота, атом фосфора и многоатомный каркас.
72. Соединение по п.71, в котором S выбран из группы, включающей фосфатную группу или циклическую группу.
73. Соединение по п.72, в котором S выбран из группы, включающей циклоалкил, циклоалкенил, гетероциклоалкил, гетероциклоалкенил, арил и гетероарил.
74. Соединение по п.65, в котором связующее звено означает структуру формулы
,
где каждый n, m и p независимо равен целому числу от 1 до приблизительно 20.
75. Соединение по п.74, в котором каждый n, m и p независимо равен целому числу от 2 до 8.
76. Соединение по п.75, в котором каждый n, m и p независимо равен целому числу от 3 до 6.
77. Соединение по п.65, в котором связующее звено означает структуру формулы
78. Соединение по п.65, в котором Х и Y содержат последовательность праймера ПЦР.
2
79. Библиотека соединений, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений, причем упомянутые соединения включают функциональный компонент, содержащий по меньшей мере два структурных фрагмента, и эффективно соединенный с олигонуклеотидом, который определяет структуру функционального компонента.
5
80. Библиотека соединений по п.79, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 копий каждого из отдельных соединений.
6
81. Библиотека соединений по п.79, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 копий каждого из отдельных соединений.
4
82. Библиотека соединений по п.79, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
6
83. Библиотека соединений по п.79, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
8
84. Библиотека соединений по п.79, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
10
85. Библиотека соединений по п.79, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
12
86. Библиотека соединений по п.79, которая содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
87. Библиотека соединений по п.79, которая содержит множество соединений, которые независимо представлены формулой I
где
Х означает функциональный компонент, содержащий один или более структурных фрагментов,
Z означает олигонуклеотид, соединенный по 3'-концевому участку с группой В,
Y означает олигонуклеотид, соединенный по 5'-концевому участку с группой С,
А означает функциональную группу, которая образует ковалентную связь с фрагментом X,
В означает функциональную группу, которая образует связь с 3'-концевым участком олигонуклеотида Z,
С означает функциональную группу, которая образует связь с 5'-концевым участком олигонуклеотида Y,
D, F и Е каждый независимо означает бифункциональную связующую группу, а
S означает атом или молекулярный каркас.
88. Библиотека соединений по п.87, в которой каждый из А, В, С, D, Е, F и S имеет одинаковое значение для каждого соединения формулы I.
89. Библиотека соединений по п.87, включающая в основном множество соединений формулы I.
90. Библиотека соединений по п.87, в которой D, F и Е каждый независимо выбран из группы, включающей алкиленовую цепь или олиго(этиленгликольную) цепь.
91. Библиотека соединений по п.87, в которой Y и Z являются в основном комплементарными и ориентированы в соединении таким образом, чтобы обеспечивать образование пары Уотсона-Крика и дуплекс в пригодных условиях.
92. Библиотека соединений по п.87, в которой Y и Z имеют одинаковую или различную длину.
93. Библиотека соединений по п.87, в которой Y и Z имеют одинаковую длину.
94. Библиотека соединений по п.87, в которой каждый Y и Z включает по меньшей мере 10 оснований и комплементарные участки, содержащие по меньшей мере 10 пар оснований.
95. Библиотека соединений по п.87, в которой S выбран из группы, включающей атом углерода, атом бора, атом азота, атом фосфора и многоатомный каркас.
96. Библиотека соединений по п.87, в которой S выбран из группы, включающей фосфатную группу или циклическую группу.
97. Библиотека соединений по п.96, в которой S выбран из группы, включающей циклоалкил, циклоалкенил, гетероциклоалкил, гетероциклоалкенил, арил или гетероарил.
98. Библиотека соединений по п.87, в которой связующее звено означает структуру формулы
,
где каждый n, m и p независимо равен целому числу от 1 до приблизительно 20.
99. Библиотека соединений по п.98, в которой каждый n, m и p независимо равен целому числу от 2 до 8.
100. Соединение по п.99, в котором каждый n, m и p независимо равен целому числу от 3 до 6.
101. Соединение по п.87, в котором связующее звено является структурой формулы
102. Библиотека соединений по п.87, в которой Х и Z содержат последовательность праймера ПЦР.
103. Соединение, полученное способом по п.1.
104. Библиотека соединений, полученная способом по п.27.
105. Способ идентификации по меньшей мере одного соединения, которое связывается с биологической мишенью, включающий контактирование биологической мишени с соединением библиотеки, полученной способом по п.27, в условиях, пригодных для связывания по меньшей мере одного члена библиотеки с мишенью, отделение членов библиотеки, не связанных с мишенью, амплификация кодирующих олигонуклеотидов по меньшей мере одного члена библиотеки соединений, который связывается с мишенью, секвенирование кодирующих олигонуклеотидов, полученных на стадии амплификации и использование последовательностей, определенных на стадии секвенирования, для определения структуры функциональных компонентов членов библиотеки соединений, которые связываются с биологической мишенью, при этом идентифицируют по меньшей мере одно соединение, которое связывается с биологической мишенью.
2
106. Способ идентификации соединения, которое связывается с биологической мишенью, включающий контактирование биологической мишени с соединением библиотеки, содержащей по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений, которые включают функциональный компонент, эффективно связанный с олигонуклеотидом, при этом функциональный компонент содержит по меньшей мере два структурных фрагмента, а олигонуклеотид определяет структуру функционального компонента, в условиях, пригодных для связывания по меньшей мере одного члена библиотеки с мишенью, отделение членов библиотеки, несвязанных с мишенью, амплификация кодирующих олигонуклеотидов по меньшей мере одного члена библиотеки соединений, который связывается с мишенью, секвенирование кодирующих олигонуклеотидов, полученных на стадии амплификации и использование последовательностей, определенных на стадии секвенирования, для определения структуры функциональных компонентов членов библиотеки соединений, которые связываются с биологической мишенью, при этом идентифицируют по меньшей мере одно соединение, которое связывается с биологической мишенью.
5
107. Способ по п.106, в котором библиотека содержит по меньшей мере приблизительно 10 копий каждого из отдельных соединений.
6
108. Способ по п.106, в котором библиотека содержит по меньшей мере приблизительно 10 копий каждого из отдельных соединений.
4
109. Способ по п.106, в котором библиотека содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
6
110. Способ по п.106, в котором библиотека включает по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
8
111. Способ по п.106, в котором библиотека содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
10
112. Способ по п.106, в котором библиотека содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
12
113. Способ по п.106, в котором библиотека содержит по меньшей мере приблизительно 10 отдельных соединений.
114. Способ по п.106, в котором библиотека соединений содержит множество соединений, которые независимо представлены формулой I
где
Х означает функциональный компонент, содержащий по меньшей мере один структурный фрагмент,
Z означает олигонуклеотид, соединенный по 3'-концевому участку с группой В,
Y означает олигонуклеотид, соединенный по 5'-концевому участку с группой С,
А означает функциональную группу, которая образует ковалентную связь с компонентом X,
В означает функциональную группу, которая образует связь с 3'-концевым участком олигонуклеотида Z,
С означает функциональную группу, которая образует связь с 5'-концевым участком олигонуклеотида Y,
D, F и Е каждый независимо означает бифункциональную связующую группу, а
S означает атом или молекулярный каркас.
115. Способ по п.114, в котором каждый из А, В, С, D, Е, F и S имеет одинаковое значение для каждого соединения формулы I.
116. Способ по п.114, в котором библиотека соединений содержит в основном множество соединений формулы I.
117. Способ по п.114, в котором D, F и Е каждый независимо выбирают из группы, включающей алкиленовую цепь или олиго(этиленгликольную) цепь.
118. Способ по п.114, в котором Y и Z являются в основном комплементарными и ориентированы в соединении таким образом, чтобы обеспечивать образование пары Уотсона-Крика и дуплекс в пригодных условиях.
119. Способ по п.114, в котором Y и Z имеют одинаковую или различную длину.
120. Способ по п.119, в котором Y и Z имеют одинаковую длину.
121. Способ по п.114, в котором каждый Y и Z содержит по меньшей мере 10 оснований и комплементарные участки, содержащие по меньшей мере 10 или более пар оснований.
122. Способ по п.114, в котором S выбран из группы, включающей атом углерода, атом бора, атом азота, атом фосфора и многоатомный каркас.
123. Способ по п.114, в котором S выбран из группы, включающей фосфатную группу или циклическую группу.
124. Способ по п.123, в котором S выбран из группы, включающей циклоалкил, циклоалкенил, гетероциклоалкил, гетероциклоалкенил, арил и гетероарил.
125. Способ по п.114, в котором связующее звено является структурой формулы
,
где каждый n, m и p независимо равен целому числу от 1 до приблизительно 20.
126. Способ по п.125, в котором каждый n, m и p независимо равен целому числу от 2 до 8.
127. Способ по п.126, в котором каждый n, m и p независимо равен целому числу от 3 до 6.
128. Способ по п.127, в котором связующее звено является структурой формулы
129. Способ п.114, в котором Х и Z включают последовательность праймера ПЦР.