АНТИТЕЛА, КОТОРЫЕ СПЕЦИФИЧНО СВЯЗЫВАЮТ АЛЬФА-ТОКСИН STAPHYLOCOCCUS AUREUS, И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Очищенное/выделенное антитело или фрагмент антитела, где антитело или фрагмент иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus и содержит:
(a) CDR1 VH, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 7, 10, 13 или 69 или содержащую 1, 2 или 3 замены аминокислотных остатков по отношению к ним;
(b) CDR2 VH, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 8, 11, 14, 17, 70 или 75 или содержащую 1, 2 или 3 замены аминокислотных остатков по отношению к ним, и
(c) CDR3 VH, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 или 78 или содержащую 1, 2 или 3 замены аминокислотных остатков по отношению к ним.
2. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где CDR1 VH, CDR2 VH и CDR3 VH представлены посредством SEQ ID NO: 7, 8 и 9; SEQ ID NO: 10, 11 и 12; SEQ ID NO: 13, 14 и 15; SEQ ID NO: 7, 17 и 18; SEQ ID NO: 7, 8 и 16; SEQ ID NO: 7, 8 и 65; SEQ ID NO: 7, 8 и 66; SEQ ID NO 7, 8 и 67; SEQ ID NO: 7, 8 и 78; SEQ ID NO: 69, 70 и 71; SEQ ID NO: 7, 8 и 72; SEQ ID NO: 69, 75 и 71; SEQ ID NO: 69, 75 и 76 или SEQ ID NO: 69, 70 и 71.
3. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus и включает:
(a) CDR1 VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, 10, 13 или 69;
(b) CDR2 VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, 11, 14, 17, 70 или 75;
(c) CDR3 VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 или 78;
(d) CDR1 VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или 4;
(e) CDR2 VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, 5, 73 или 77; и
(f) ,CDR3 VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3. 6, 64, 68 или 74.
4. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 3, где CDR1 VH, CDR2 VH, CDR3 VH, CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL соответствуют аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 7, 8, 9, 1, 2 и 3; SEQ ID NO: 10, 11, 12, 1, 2 и 3; SEQ ID NO: 13, 14, 15, 4, 5 и 6; SEQ ID NO: 7, 17, 18, 1, 2 и 3; SEQ ID NO: 7, 8, 16, 1, 2 и 64; SEQ ID NO: 7, 8, 65, 1, 2 и 64; SEQ ID NO: 7, 8, 66, 1, 2 и 64; SEQ ID NO: 7, 8, 67, 1, 2 и 68; SEQ ID NO: 7, 8, 67, 1, 2 и 64; SEQ ID NO: 7, 8, 78, 1, 2 и 64; SEQ ID NO: 7, 8, 65, 1, 2 и 68; SEQ ID NO: 69, 70, 71, 1, 2 и 68; SEQ ID NO: 7, 8, 72, 1, 73 и 74; SEQ ID NO: 69, 75, 71, 1, 2 и 68; SEQ ID NO: 69, 75, 76, 1, 2 и 68; SEQ ID NO: 69, 75, 76, 1, 77 и 74; SEQ ID NO: 69, 70, 71, 1, 77 и 74.
5. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (i) содержит VH-домен цепи, содержащий три CDR, и VL-домен цепи, содержащий три CDR; и (ii) иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus, где три CDR VH-домена цепи содержат:
(a) CDR1 VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, 10, 13 или 69;
(b) CDR2 VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, 11, 14, 17, 70 или 75; и
(c) CDR3 VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 или 78.
6. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 5, где CDR1 VH, CDR2 VH и CDR3 VH соответствуют аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 7, 8 и 9; SEQ ID NO: 10, 11 и 12; SEQ ID NO: 13, 14 и 15; SEQ ID NO: 7, 17 и 18; SEQ ID NO: 7, 8 и 16; SEQ ID NO: 7, 8 и 65; SEQ ID NO: 7, 8 и 66; SEQ ID NO 7, 8 и 67; SEQ ID NO: 7, 8 и 78; SEQ ID NO: 69, 70 и 71; SEQ ID NO: 7, 8 и 72; SEQ ID NO: 69, 75 и 71; SEQ ID NO: 69, 75 и 76; или SEQ ID NO: 69, 70 и 71.
7. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (i) содержит VH-домен цепи, содержащий три CDR, и VL-домен цепи, содержащий три CDR; и (ii) иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus, где три CDR VL-домена цепи содержат:
(a) CDR1 VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или 4;
(b) CDR2 VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, 5, 73 или 77; и
(c) CDR3 VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, 6, 64, 68 или 74.
8. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 7, где CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL соответствуют аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 1, 2 и 3; SEQ ID NO: 4, 5 и 6; SEQ ID NO: 1, 2 и 64; SEQ ID NO: 1, 2 и 68; SEQ ID NO: 1, 73 и 74 или SEQ ID NO: 1, 77 и 74.
9. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые (i) иммуноспецифично связываются с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus, (ii) содержат вариабельный домен тяжелой цепи, который по меньшей мере на 90% идентичен аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 или 62, и (iii) содержат вариабельный домен легкой цепи, который по меньшей мере на 90% идентичен аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 или 63.
10. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 9, где VH и VL соответствуют аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 20 и 19; SEQ ID NO: 22 и 21; SEQ ID NO: 24 и 23; SEQ ID NO: 26 и 25; SEQ ID NO: 28 и 27; SEQ ID NO: 41 и 42; SEQ ID NO: 43 и 44; SEQ ID NO: 45 и 46; SEQ ID NO: 47 и 48; SEQ ID NO: 47 и 48; SEQ ID NO: 49 и 50; SEQ ID NO: 51 и 52; SEQ ID NO: 51 и 52; SEQ ID NO: 53 и 54; SEQ ID NO: 55 и 56; SEQ ID NO: 57 и 58; SEQ ID NO: 59 и 60; SEQ ID NO: 61 и 58; SEQ ID NO: 62 и 58; SEQ ID NO: 62 и 63; SEQ ID NO: 79 и 63.
11. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельный домен тяжелой цепи с SEQ ID NO 20, 22, 24, 26, 28, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 79, 59, 61 или 62 и вариабельный домен легкой цепи с SEQ ID NO: 19, 21, 23, 25, 27, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60 или 63.
12. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 11, где VH и VL соответствуют аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 20 и 19; SEQ ID NO: 22 и 21; SEQ ID NO: 24 и 23; SEQ ID NO: 26 и 25; SEQ ID NO: 28 и 27; SEQ ID NO: 41 и 42; SEQ ID NO: 43 и 44; SEQ ID NO: 45 и 46; SEQ ID NO: 47 и 48; SEQ ID NO: 47 и 48; SEQ ID NO: 49 и 50; SEQ ID NO: 51 и 52; SEQ ID NO: 51 и 52; SEQ ID NO: 53 и 54; SEQ ID NO: 55 и 56; SEQ ID NO: 57 и 58; SEQ ID NO: 59 и 60; SEQ ID NO: 61 и 58; SEQ ID NO: 62 и 58; SEQ ID NO: 62 и 63; SEQ ID NO: 79 и 63.
13. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-12, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus и характеризуется одной или несколькими характеристиками, выбранными из группы, состоящей из следующего:
D
(a) константа аффинности (K) в отношении альфа-токсина составляет приблизительно 13 нМ или менее;
(b) связывается с мономерами альфа-токсина, но не ингибирует связывание альфа-токсина с рецептором альфа-токсина;
(c) ингибирует образование олигомеров альфа-токсина по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%;
(d) снижает цитолитическую активность альфа-токсина по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95% (например, при определении посредством анализов на основе клеточного лизиса и гемолиза); и
(e) снижает клеточную инфильтрацию и высвобождение провоспалительных цитокинов (например, в животной модели пневмонии).
14. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит дополнительное средство.
15. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 14, где дополнительным средством является антибиотик.
16. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 14, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связаны с терапевтическим средством посредством линкера.
17. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит диагностическое средство.
18. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 17, где диагностическое средство включает визуализирующее средство.
19. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 17, где диагностическое средство включает детектируемую метку.
20. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 17, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связаны с диагностическим средством посредством линкера.
21. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где полипептид альфа-токсина Staphylococcus aureus является нативным полипептидом токсина.
22. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где полипептид альфа-токсина Staphylococcus aureus включает аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39 или SEQ ID NO: 40.
23. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 13, где клетка является клеткой крови или легкого.
24. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 13, где клеточный лизис определен с помощью анализа образования гемолитических бляшек in vitro или анализа на лактатдегидрогеназу in vitro.
25. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus и содержит CDR3 VH, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 или 78 или содержащую 1, 2 или 3 замены аминокислотных остатков по отношению к ним, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент нейтрализует полипептид альфа-токсина Staphylococcus aureus.
26. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus и содержит CDR3 VL, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 3, 6, 64, 68 или 74 или содержащую 1, 2 или 3 замены аминокислотных остатков по отношению к ним, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент нейтрализует полипептид альфа-токсина Staphylococcus aureus.
27. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus и содержит CDR3 VH, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 9, 12, 15, 18, 16, 65, 66, 67, 71, 72, 76 или 78 или содержащую 1, 2 или 3 замены аминокислотных остатков по отношению к ним, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент ингибирует олигомеризацию полипептида альфа-токсина Staphylococcus aureus.
28. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus и содержит CDR3 VL, содержащий аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 3, 6, 64, 68 или 74 или содержащую 1, 2 или 3 замены аминокислотных остатков по отношению к ним, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент ингибирует олигомеризацию полипептида альфа-токсина Staphylococcus aureus.
29. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 13, где ингибирование олигомеризации определено при помощи in vitro анализа связывания и/или электрофоретической подвижности.
30. Композиция, содержащая антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-30.
31. Набор, содержащий:
(a) антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-30 или композицию по п. 31;
(b) инструкции для применения композиции или указания касательно получения инструкций для применения композиции.
32. Набор по п. 32, где антитело в композиции связано с твердой подложкой.
33. Набор по п. 33, где твердой подложкой является гранула.
34. Набор по п. 34, где гранула является гранулой сефарозы.
35. Набор по любому из пп. 32-35, где инструкции для применения включают одно или несколько из выделения, очистки, детекции и количественного определения полипептида альфа-токсина Staphylococcus aureus.
36. Набор по п. 32, содержащий буфер, твердую подложку или буфер и твердую подложку.
37. Набор по п. 37, где твердая подложка представляет собой одно или несколько из гранулы, фильтра, мембраны и многослойной пластины.
38. Набор по п. 37, который включает буфер и мембрану, подходящие для вестерн-блоттинга.
39. Набор по п. 37, который включает загрузочный буфер и элюирующий буфер.
40. Набор по п. 37, который включает буфер, подходящий для твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA).
41. Способ предупреждения, лечения или контроля пневмонии у субъекта, включающий:
введение антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31 нуждающемуся в этом субъекту в количестве, эффективном для предупреждения, лечения или контроля пневмонии.
42. Способ по п. 42, который является способом предупреждения пневмонии.
43. Способ по п. 42 или п. 43, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с конформационным эпитопом в пределах SEQ ID NO: 39.
44. Способ предупреждения, лечения или контроля состояния, вызванного кожной инфекцией, у субъекта, включающий: введение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые иммуноспецифично связываются с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus, нуждающемуся в этом субъекту в количестве, эффективном для предупреждения, лечения или контроля состояния, вызванного кожной инфекцией.
45. Способ по п. 45, где состоянием, вызванным кожной инфекцией, является дерматонекроз.
46. Способ по п. 45 или 46, где состояние, вызванное кожной инфекцией, включает инфекцию кожи Staphylococcus aureus.
47. Способ по п. 45, который является способом предупреждения состояния, вызванного кожной инфекцией.
48. Способ предупреждения, лечения или контроля состояния, связанного с инфекцией Staphylococcus aureus, включающий введение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые иммуноспецифично связываются с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus, нуждающемуся в этом субъекту в количестве, эффективном для снижения олигомеризации полипептида токсина.
49. Способ по п. 49, который является способом предупреждения состояния, связанного с инфекцией Staphylococcus aureus.
50. Способ предупреждения, лечения или контроля состояния, связанного с инфекцией Staphylococcus aureus, включающий введение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые иммуноспецифично связываются с полипептидом альфа-токсина Staphylococcus aureus, нуждающемуся в этом субъекту в количестве, эффективном для снижения лизиса эритроцитов.
51. Способ по п. 51, который является способом предупреждения состояния, связанного с инфекцией Staphylococcus aureus.
52. Способ по п. 51 или  52, где эритроцит является клеткой крови или легкого.
53. Способ по любому из пп. 45, 49 и 51, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент характеризуется одной или несколькими характеристиками, выбранными из группы, состоящей из следующего:
D
(a) константа аффинности (K) в отношении альфа-токсина составляет приблизительно 13 нМ или менее;
(b) связывается с мономерами альфа-токсина, но не ингибирует связывание альфа-токсина с рецептором альфа-токсина;
(c) ингибирует образование олигомеров альфа-токсина по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%;
(d) снижает цитолитическую активность альфа-токсина по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95% (например, при определении посредством анализов на основе клеточного лизиса и гемолиза); и
(e) снижает клеточную инфильтрацию и высвобождение провоспалительных цитокинов (например, в животной модели пневмонии).
54. Способ по п. 54, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифично связывается с конформационным эпитопом в пределах SEQ ID NO: 39.
55. Способ по любому из пп. 45, 49 и 51, где антитело, или антигенсвязывающий фрагмент, или композиция, вводимые субъекту, соответствуют любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31.
56. Способ, включающий:
введение антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31 в клетки; и
детекцию наличия, отсутствия или величины биологического эффекта, связанного с введением композиции в клетки.
57. Способ, включающий:
введение антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31 субъекту; и
детекцию наличия, отсутствия или величины биологического эффекта у субъекта, связанного с введением композиции.
58. Способ, включающий:
введение антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31 субъекту; и
отслеживание состояния субъекта.
59. Способ нейтрализации полипептида альфа-токсина Staphylococcus aureus путем введения нуждающемуся в этом субъекту эффективного количества антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31 для нейтрализации полипептида токсина.
60. Способ предупреждения, лечения или контроля состояния, опосредованного альфа-токсином Staphylococcus aureus, у нуждающегося в этом субъекта, причем способ включает введение субъекту эффективного количества антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31 для предупреждения, лечения или контроля состояния.
61. Способ лечения, предупреждения или облегчения симптомов расстройства, опосредованного альфа-токсином Staphylococcus aureus, у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение эффективного количества антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31 субъекту для лечения, предупреждения или облегчения симптомов.
62. Способ диагностики состояния, опосредованного альфа-токсином Staphylococcus aureus, у субъекта, включающий отбор субъекта, нуждающегося в диагностике, и введение субъекту диагностически эффективной дозы антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31.
63. Способ по любому из пп. 42, 45, 49, 51, 57, 58, 59, 60, 61, 62 и 63, где субъектом является домашнее животное.
64. Способ по любому из пп. 42, 45, 49, 51, 57, 58, 59, 60, 61, 62 и 63, где субъектом является человек.
65.. Способ ингибирования образования олигомеров альфа-токсина Staphylococcus aureus по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95% при помощи антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31.
66. Способ по п. 66, где ингибирование образования олигомеров альфа-токсина Staphylococcus aureus ингибирует образование активного порообразующего комплекса.
67. Способ уменьшения цитолитической активности альфа-токсина Staphylococcus aureus по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95% при помощи антитела или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-30 или композиции по п. 31, где цитолитическую активность определяют при помощи анализов на основе клеточного лизиса и/или гемолиза.
68. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые иммуноспецифично связываются с фрагментом альфа-токсина Staphylococcus aureus с SEQ ID NO: 39.
69. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 69, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с фрагментом, содержащим аминокислоты 261-272 из SEQ ID NO: 39.
70. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 69 или п. 70, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент контактирует с остатками T261, T263, N264, K266 и K271 из SEQ ID NO: 39.
71. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 69 или п. 70, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с фрагментом, содержащим аминокислоты 173-201 из SEQ ID NO: 39.
72. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 69, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент контактирует с остатками N177, W179, G180, P181, Y182, D183, D185, S186, W187, N188, P189, V190, Y191 и R200 из SEQ ID NO: 39.
73. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 69, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент контактирует с остатками T261, T263, N264, K266, K271, N177, W179, G180, P181, Y182, D183, D185, S186, W187, N188, P189, V190, Y191 и R200 из SEQ ID NO: 39.
74. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые иммуноспецифично связываются с фрагментом альфа-токсина Staphylococcus aureus, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с фрагментом, содержащим аминокислоты 248-277 из SEQ ID NO: 39.
75. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые иммуноспецифично связываются с альфа-токсином Staphylococcus aureus, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент предупреждает образование гептамера альфа-токсина, и где указанное антитело или антигенсвязывающий фрагмент контактирует с одним или несколькими остатками, выбранными из группы, состоящей из T261, T263, N264, K266, K271, N177, W179, G180, P181, Y182, D183, D185, S186, W187, N188, P189, V190, Y191 и R200 из SEQ ID NO: 39.
76. Способ по п. 42, который является способом лечения пневмонии.
77. Способ по п. 45, который является способом лечения состояния, вызванного кожной инфекцией.
78. Способ по п. 49, который является способом лечения состояния, связанного с инфекцией Staphylococcus aureus.
79. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 15, где антибиотиком является ванкомицин.
80. Способ ингибирования образования олигомеров альфа-токсина, включающий приведение в контакт мономера альфа-токсина с выделенным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые иммуноспецифично связываются с альфа-токсином Staphylococcus aureus, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент контактирует с одним или несколькими остатками, выбранными из группы, состоящей из T261, T263, N264, K266, K271, N177, W179, G180, P181, Y182, D183, D185, S186, W187, N188, P189, V190, Y191 и R200 из SEQ ID NO: 39.
81. Способ по п. 81, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент контактирует с T261, T263, N264, K266 и K271.
82. Способ по п. 82, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент дополнительно контактирует с N177, W179, G180, P181, Y182, D183, D185, S186, W187, N188, P189, V190, Y191 и R200.
83. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент с вариантным участком Fc, где выделенное антитело содержит SEQ ID NO: XX и SEQ ID NO: YY.