БИОМАРКЕРЫ ТУБЕРКУЛЕЗА

1. Способ диагностики TB у индивидуума, включающий:
(a) получение образца от указанного индивидуума, где указанный образец выбран из группы, состоящей из: крови, сыворотки и плазмы;
(b) определение в указанном образце концентраций следующих биомаркеров: ИЛ-1ra, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-12p70, основного FGF, IP-10 и VEGF;
(c) преобразование концентрации каждого биомаркера, определенной на стадии (b), в децильное значение; и
(d) преобразование каждого децильного значения в бинарное наличие или отсутствие посредством сравнения децильных значений (c) в следующие конкретные квантильные пороговые значения:
<b>Биомаркер</b>
<b>Конкретное квантильное пороговое значение</b>
ИЛ-1ra
3
ИЛ-6
6
ИЛ-7
8
ИЛ-8
9
ИЛ-12p70
9
Основной FGF
3
IP-10
4
VEGF
9
где децильное значение, совпадающее с конкретным квантильным пороговым значением или превышающее его, преобразуют в бинарное наличие биомаркера, и децильное значение ниже конкретного квантильного порогового значения преобразуют в бинарное отсутствие биомаркера;
где определение наличия каждого из указанных биомаркеров свидетельствует о том, что индивидуум имеет TB.
2. Способ по п.1, где стадия (c) преобразования каждой концентрации, определенной на стадии (b), в децильное значение включает стадии:
(ci) сравнения концентрации каждого биомаркера, определенной на стадии (b), в референсную плотность распределения концентраций указанного биомаркера; и
(cii) считывания децильного значения из плотности распределения для концентрации указанного биомаркера.
3. Способ по п.1 или 2, где определение концентрации каждого биомаркера включает:
(bi) детекцию посредством приведения образца в контакт с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, способным специфически связываться с биомаркером; и
(bii) количественный анализ указанного связывания.
4. Способ по п.1 или 2, где определение концентрации каждого биомаркера включает детекцию мРНК биомаркера, где детекция мРНК включает:
(bi) приведение образца в контакт с зондами или праймерами нуклеиновых кислот, специфическими для биомаркера; и
(bii) количественный анализ указанных зондов или праймеров.
5. Способ по любому из предшествующих пунктов, где указанный образец является образцом сыворотки или плазмы.
6. Способ по п. 5, где указанная сыворотка или плазма, по существу, не содержит клетки.
7. Способ по любому из предшествующих пунктов, где возраст индивидуума составляет 16 лет или менее, предпочтительно - 15 лет или менее.
8. Способ по любому из предшествующих пунктов, где возраст индивидуума составляет 2 года или более, предпочтительно - 5 лет или более.
9. Способ по любому из предшествующих пунктов, где возраст индивидуума составляет от 5 до 15 лет.
10. Способ по любому из предшествующих пунктов, где указанный способ дополнительно включает определение концентрации в указанном образце биомаркера EC-стимулированного VEGF (конкретное квантильное пороговое значение 2).
11. Набор, содержащий реагенты для специфической детекции каждого из следующих биомаркеров: ИЛ-1ra, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-12p70, основного FGF, IP-10 и VEGF.
12. Набор, содержащий реагенты для специфической детекции мРНК, кодирующей каждый из следующих биомаркеров: ИЛ-1ra, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-12p70, основного FGF, IP-10 и VEGF.
13. Устройство, содержащее набор материалов, которые совместно способны специфически связываться с каждым из следующих биомаркеров: ИЛ-1ra, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-12p70, основного FGF, IP-10 и VEGF, каждый материал в наборе способен специфически связываться с одним из указанных биомаркеров.
14. Устройство, содержащее набор материалов, которые совместно можно использовать для детекции мРНК, специфической для каждого из следующих биомаркеров: ИЛ-1ra, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-12p70, основного FGF, IP-10 и VEGF, с помощью каждого материала в наборе можно специфически определять одну из указанных мРНК.
15. Устройство по п.13 или 14, являющееся устройством для иммунохроматографического анализа.
16. Способ лечения индивидуума, включающий осуществление способа по любому из пп.1-10, где если определено, что индивидуум имеет TB, в отношении указанного индивидуума прменяют схему лечения 2HRZE/4HR (2 месяца HRZE, затем 4 месяца HR, где H=изониазид, R=рифампицин, Z=пиразинамид, E=этамбутол).
17. Применение HRZE, где H=изониазид, R=рифампицин, Z=пиразинамид, E=этамбутол, для лечения TB у индивидуума, где способ по любому из пп.1-10 осуществляют в отношении указанного индивидуума, где, если определено, что индивидуум имеет TB, то в отношении указанного индивидуума используют HRZE в течение двух месяцев, а затем в отношении указанного индивидуума используют HR в течение четырех месяцев.
18. Применение по п. 17, где выбирают схему лечения указанного индивидуума с введением по меньшей мере три раза в неделю в течение первых двух месяцев, предпочтительно, выбирают схему лечения указанного индивидуума с ежедневным введением в течение первых двух месяцев.
19. Таблетки H 75 мг+R 150 мг+Z 400 мг+E 275 мг для лечения TB у индивидуума, где способ по любому из пп.1-10 осуществляют в отношении указанного индивидуума, где, если определено, что индивидуум имеет TB, то в отношении указанного индивидуума используют HRZE в течение двух месяцев, а затем 3 таблетки H 75 мг+1,5 таблетки R 150 мг в течение четырех месяцев.
20. Способ выбора схемы лечения, включающий
осуществление способа по любому из пп.1-10, где, если определено, что индивидуум имеет TB, то выбирают схему лечения 2HRZE/4HR (2 месяца HRZE, а затем 4 месяца HR, где H=изониазид, R=рифампицин, Z=пиразинамид, E=этамбутол).
21. Применение комбинации материалов, каждый из которых распознает, специфически связывается или имеет аффинность к одному из следующих биомаркеров: ИЛ-1ra, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-12p70, основному FGF, IP-10 и VEGF, где указанная комбинация включает по меньшей мере один такой материал для каждого из указанных биомаркеров, для облегчения диагностики TB у индивидуума.
22. Применение по п.21, где указанный материал содержит антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
23. Применение комбинации материалов, каждый из которых распознает, специфически связывается или имеет аффинность к мРНК одного или нескольких из следующих биомаркеров: ИЛ-1ra, ИЛ-6, ИЛ-7, ИЛ-8, ИЛ-12p70, основного FGF, IP-10 и VEGF, для облегчения диагностики TB у индивидуума.
24. Применение по п.23, где указанный материал содержит праймер или зонд нуклеиновой кислоты.
25. Устройство, содержащее логический блок, сконфигурированный для осуществления способа по любому из пп.1-10.
26. Компьютерный программный продукт, функциональный при выполнении на компьютере, для осуществления стадий способа по любому из пп.1-10.