ПЕПТИДОМИМЕТИКИ

1. Пептидомиметик эпитопа аполипопротеина Α-I (АроА-I), причем указанный пептидомиметик имеет
(a) аминокислотную последовательность длиной 15-80 аминокислотных остатков;
(b) аминокислотную последовательность, содержащую какую-либо из последовательностей:
(i) SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:24 или их вариантов, или
(ii) аминокислотную последовательность, идентичную какой-либо из последовательностей по пункту (i) за тем исключением, что 1, 2, 3, 4, 5 или 6 аминокислотных остатков в указанной последовательности по пункту (i) заменены, делетированы, вставлены и/или химически модифицированы, не влияя при этом негативно на способность указанного пептидомиметика специфично связываться с антителами против аполипопротеина Α-I, или
(iii) любую комбинацию двух аминокислотных последовательностей по пункту (i) и/или по пункту (ii); и
(c) внутримолекулярную поперечную сшивку, соединяющую два не смежных аминокислотных остатка аминокислотной последовательности по пункту b);
причем указанный пептидомиметик способен специфично связываться с антителами против аполипопротеина A-I.
2. Пептидомиметик по п. 1, в котором аминокислотную последовательность по пункту (b) выбирают из последовательностей SEQ ID NO: 8 или SEQ ID NO: 9 или их вариантов.
2
2
2
4
3. Пептидомиметик по п. 1, в котором внутримолекулярная поперечная сшивка по пункту с) представляет собой лактамный мостик между двумя аминокислотными остатками Хаа в положениях n и n+4 аминокислотной последовательности указанного пептида, где Хаа в положении n является модифицированным аминокислотным остатком, имеющим формулу (I) -NH-C(H)(R)-С(О)-, где R представляет лактамный мостик -(CH)-CO-NH-(CH)-, присоединенный к другому остатку в положении n+4, и где Хаа в положении n+4 является модифицированным аминокислотным остатком, имеющим формулу (I) -NH-C(H)(R′)-С(О)-, где R′ представляет одинарную связь к лактамному мостику от указанного Хаа в положении n.
3
2
6
2
3
3
4. Пептидомиметик по п. 1, в котором внутримолекулярная поперечная сшивка по пункту с) представляет собой углеводородную сшивку, связывающую два аминокислотных остатка Хаа в положениях n и n+7 аминокислотной последовательности указанного пептида, где Хаа в положении n является модифицированным аланином, имеющим формулу (I) -NH-C(CH)(R)-C(O)-, где R представляет углеводородную сшивку -(СН)-СН=СН-(СН)-, присоединенную к другому остатку Хаа в положении n+7, и где Хаа в положении n+7 представляет модифицированный аланин, имеющий формулу (I): -NH-C(CH)(R′)-C(O)-, где R′ представляет одинарную связь к углеводородной сшивке от указанного Хаа в положении n.
3
2
6
2
3
3
5. Пептидомиметик по п. 1, в котором внутримолекулярная поперечная сшивка по пункту с) представляет собой углеводородную сшивку, связывающую два аминокислотных остатка Хаа в положениях n и n+4 аминокислотной последовательности указанного пептида, где Хаа в положении n является модифицированным аланином, имеющим формулу (I) -NH-C(CH)(R)-C(O)-, где R представляет углеводородную сшивку -(СН)-СН=СН-(СН)-, присоединенную к другому остатку Хаа в положении n+4, и где Хаа в положении n+4 представляет модифицированный аланин, имеющий формулу (I): -NH-C(CH)(R′)-C(O)-, где R′ представляет одинарную связь к углеводородной сшивке от указанного Хаа в положении n.
6. Пептидомиметик по любому из пп. 1-5, в котором
(i) аминокислотная последовательность по пункту b) содержит последовательность SEQ ID NO: 19, и внутримолекулярная поперечная сшивка по пункту с) представляет собой лактамный мостик, связывающий остаток глутаминовой кислоты (Е) в положении 19 и остаток лизина (K) в положении 23, причем указанные положения относятся к аминокислотной последовательности по пункту b); или
(ii) аминокислотная последовательность по пункту b) содержит последовательность SEQ ID NO: 15, и внутримолекулярная поперечная сшивка по пункту с) представляет собой углеводородную сшивку, связывающую (R)-2-(7′-октенил)-аланин в положении 16 и (S)-2-(4′-пентенил)-аланин в положении 23, причем указанные положения относятся к аминокислотной последовательности по пункту b); или
(iii) аминокислотная последовательность по пункту b) содержит последовательность SEQ ID NO: 16, и внутримолекулярная поперечная сшивка по пункту с) представляет собой углеводородную сшивку, связывающую (R)-2-(4′-пентенил)-аланин в положении 13 и (S)-2-(4′-пентенил)-аланин в положении 17, причем указанные положения относятся к аминокислотной последовательности по пункту b);
(iv) аминокислотная последовательность по пункту b) содержит последовательность SEQ ID NO: 17, и внутримолекулярная поперечная сшивка по пункту с) представляет собой углеводородную сшивку, связывающую (R)-2-(7′-октенил)-аланин в положении 9 и (S)-2-(4′-пентенил)-аланин в положении 16, причем указанные положения относятся к аминокислотной последовательности по пункту b).
7. Пептидомиметик по любому из пп. 1-5, содержащий последовательность SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20 или какой-либо из их вариантов.
8. Пептидомиметик по п. 1, содержащий последовательность SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 21, или SEQ ID NO: 23; или какой-либо из их вариантов.
9. Пептидомиметик по п. 6, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24 или какой-либо из их вариантов.
10. Пептидомиметик эпитопа аполипопротеина Α-I (АроА-I), причем указанный пептидомиметик имеет
(a) аминокислотную последовательность длиной 15-80 аминокислотных остатков,
(b) аминокислотную последовательность, содержащую какую-либо из последовательностей
(i) SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 21 или SEQ ID NO: 23 или их вариантов, или
(ii) SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, или SEQ ID NO: 25; или их вариантов, или
(iii) аминокислотную последовательность, идентичную любой из последовательностей по пункту (i) или (ii) за тем исключением, что 1, 2, 3, 4, 5 или 6 аминокислотных остатков указанной последовательности по пункту (i) или (ii) заменены, делетированы, вставлены или химически модифицированы, не влияя при этом негативно на способность указанного пептидомиметика специфично связываться с антителами против аполипопротеина Α-I, или
(iv) любую комбинацию из двух аминокислотных последовательностей по пункту (i), (ii) и/или (iii);
причем указанный пептидомиметик способен специфично связываться с антителами против аполипопротеина A-I.
11. Пептидомиметик по п. 10, в котором аминокислотная последовательность по пункту b) содержит последовательность SEQ ID NO: 5.
12. Пептидомиметик по п. 10, в котором аминокислотная последовательность по пункту b) содержит последовательность SEQ ID NO: 8.
13. Пептидомиметик по любому из пп. 8-12, в котором свободная N-концевая аминогруппа ацетилирована и свободная С-концевая карбоксильная группа амидирована.
14. Изолированный полинуклеотид, кодирующий пептидомиметик по любому из пп. 1-12.
15. Рекомбинантный вектор, содержащий полинуклеотид по п. 14.
16. Клетка-хозяин, содержащая рекомбинантный вектор по п. 15.
17. Способ получения пептидомиметика по любому из пп. 1-13, включающий этапы:
(a) культивирование клеток-хозяев по п. 16 в культуральной среде и отделение указанного пептида от культуральной среды или от лизата клеток-хозяев после их лизиса, и
(b) при необходимости создание поперечной сшивки через дисульфидный мостик между двумя не смежными аминокислотными остатками в пептиде, полученном на этапе а).
18. Диагностический препарат или препарат для иммунологического анализа, содержащий по меньшей мере один пептидомиметик по любому из пп. 1-13.
19. Фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере один пептидомиметик по любому из пп. 1-13.
20. Набор для выявления антител против аполипопротеина Α-I, играющих роль биологических маркеров сердечно-сосудистого заболевания, в образце биологической жидкости, включающий по меньшей мере один пептидомиметик по любому из пп. 1-13, или его вариант, или их комбинацию.
21. Способ выявления эндогенных антител против аполипопротеина Α-I в образце биологической жидкости, взятом у млекопитающего, включающий этапы
(a) забор образца биологической жидкости у млекопитающего;
(b) контактирование указанного образца биологической жидкости с твердой подложкой, с которой связан по меньшей мере один пептидомиметик по любому из пп. 1-13, причем это контактирование происходит в условиях, достаточных для связывания антител против аполипопротеина Α-I, присутствующих в указанном образце биологической жидкости, с указанным по меньшей мере одним пептидомиметиком путем взаимодействий по типу антиген-антитело;
(c) удаление любых не связанных антител с поверхности указанной твердой подложки;
(d) выявление присутствия комплексов антиген-антитело, связанных с указанной твердой подложкой;
при этом наличие указанных комплексов свидетельствует о том, что в данном образце биологической жидкости содержатся эндогенные антитела против аполипопротеина A-I.
22. Способ обнаружения сердечно-сосудистого заболевания по образцу биологической жидкости, взятому у млекопитающего, включающий этапы:
(a) забор образца биологической жидкости у млекопитающего;
(b) контактирование указанного образца биологической жидкости с твердой подложкой, с которой связан по меньшей мере один пептидомиметик по любому из пунктов 1-13, причем это контактирование происходит в условиях, достаточных для связывания антител против аполипопротеина Α-I, присутствующих в указанном образце биологической жидкости, с указанным по меньшей мере одним пептидомиметиком путем взаимодействий по типу антиген-антитело;
(c) удаление любых не связанных антител с поверхности указанной твердой подложки;
(d) выявление присутствия комплексов антиген-антитело, связанных с указанной твердой подложкой;
при этом наличие указанных комплексов свидетельствует о том, что в данном образце биологической жидкости содержатся антитела против аполипопротеина A-I, ассоциированные с одним или более сердечно-сосудистыми заболеваниями.
23. Способ по п. 21 или 22, в котором индивид страдает от острой боли в груди, острого коронарного синдрома, ревматоидного артрита, системной красной волчанки, тяжелого стеноза сонной артерии, терминальной стадии почечной недостаточности или периодонтита.
24. Способ предотвращения и/или лечения сердечно-сосудистого заболевания у нуждающегося в том индивида, включающий введение указанному индивиду пептидомиметика по любому из пп. 1-13, фармацевтической композиции по п. 19 или соединения, аналогичного по пространственной структуре пептидомиметику по любому из пп. 1-3.
25. Способ по п. 24, в котором индивид страдает от острой боли в груди, острого коронарного синдрома, ревматоидного артрита, системной красной волчанки, тяжелого стеноза сонной артерии, терминальной стадии почечной недостаточности или периодонтита и наличие у него сердечно-сосудистого заболевания выявлено способом по п. 22.
26. Способ предотвращения и/или лечения сердечно-сосудистого заболевания у индивида, страдающего от острой боли в груди, острого коронарного синдрома, ревматоидного артрита, системной красной волчанки, тяжелого стеноза сонной артерии, терминальной стадии почечной недостаточности или периодонтита, включающий этапы:
(a) выявление эндогенных антител против аполипопротеина Α-I в образце биологической жидкости, взятом у индивида, являющегося млекопитающим, способом по п. 21; и
(b) введение указанному индивиду по меньшей мере одного агента, выбираемого из (i) пептидомиметика по любому из пп. 1-13 или содержащей его фармацевтической композиции, (ii) соединения, аналогичного по пространственной структуре пептидомиметику по любому из пп. 1-13, (iii) фармацевтической композиции, содержащей аполипопротеин Α-I, и (iv) агента, пригодного для предотвращения и/или лечения сердечно-сосудистого заболевания.
27. Способ по п. 26, в котором агент на этапе (b) является пептидомиметиком по любому из пп. 1-13.