МАРКЕРЫ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ, ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ ДЛЯ ПРОГНОЗА ИСХОДА РАКА ПРЯМОЙ И ОБОДОЧНОЙ КИШКИ

1. Способ предсказания исхода болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки после проведения хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1А-B, 2A-B, 3A-B, 4A-B, 5A-B, 6 и/или 7, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1A, 2A, 3A, 4A и/или 5A, или их соответствующих продуктов экспрессии, указывает на пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1B, 2B, 3B, 4B и/или 5B, или их соответствующих продуктов экспрессии, указывает на повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
2. Способ по п.1, где указанным индивидуумом является человек.
3. Способ по п.2, где наличие указанного уровня экспрессии определяют методом анализа профиля экспрессии генов.
4. Способ по п.3, где указанным способом является способ, основанный на ПЦР.
5. Способ по п.4, где указанные уровни экспрессии нормализуют относительно уровней экспрессии одного или более эталонных генов или их продуктов экспрессии.
6. Способ по п.2, где указанный исход болезни выражен такими терминами, как “интервал времени до появления рецидивов” (RFI), “общая продолжительность жизни после операции” (OS), “время жизни без рецидивов” (DFS) или “интервал времени от операции до появления рецидивов в периферических органах” (DRFI).
7. Способ по п.2, где указанным раковым заболеванием является рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса C (стадии III).
8. Способ по п.7, где указанным раковым заболеванием является рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III).
9. Способ по п.2, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, двух из указанных генов или их продуктов экспрессии.
10. Способ по п.2, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, трех из указанных генов или их продуктов экспрессии.
11. Способ по п.2, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, четырех из указанных генов или их продуктов экспрессии.
12. Способ по п.2, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, пяти из указанных генов или их продуктов экспрессии.
13. Способ по п.2, дополнительно включающий стадию создания отчета, суммирующего указанное предсказание.
14. Способ предсказания длительности интервала времени до появления рецидивов (RFI) у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после проведения хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1А и 1B, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1A или 5A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный RFI будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1B или 5B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный RFI будет более длительным.
15. Способ по п.14, где указанным индивидуумом является человек.
16. Способ по п.15, где наличие указанного уровня экспрессии определяют методом анализа профиля экспрессии генов.
17. Способ по п.16, где указанным способом является способ, основанный на ПЦР.
18. Способ по п.17, где, если предсказывается, что RFI будет более коротким, то указанный пациент подвергается дальнейшей терапии после указанной хирургической операции.
19. Способ по п.18, где указанной дальнейшей терапией является химиотерапия и/или лучевая терапия.
20. Способ по п.15, дополнительно включающий стадию создания отчета, суммирующего указанное предсказание.
21. Способ по п.15, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, двух из указанных генов или их продуктов экспрессии.
22. Способ по п.15, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, трех из указанных генов или их продуктов экспрессии.
23. Способ по п.15, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, четырех из указанных генов или их продуктов экспрессии.
24. Способ по п.15, включающий определение уровней экспрессии, по меньшей мере, пяти из указанных генов или их продуктов экспрессии.
25. Способ предсказания общей продолжительности жизни после операции (OS) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 2А и 2В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанная OS будет более короткой; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанная OS будет более длительной.
26. Способ предсказания времени жизни без рецидивов (DFS) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 3А и 3В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 3A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DFS будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 3B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DFS будет более длительным.
27. Способ предсказания длительности интервала времени от операции до появления рецидивов в периферических органах (DRFI) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 4А и 4В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 4A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DRFI будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 4B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DRFI будет более длительным.
28. Способ предсказания исхода болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса В (стадии II), после проведения хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, выбранных из группы, состоящей из ALCAM, CD24, CDH11, CENPE, CLTC, CYR61, EMR3, ICAM2, LOX, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SIR2, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1, WIF, CAPG, CD28, CDC20, CKS1B, DKK1, HSD17B2 и MMP7, или их соответствующих продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из ALCAM, CD24, CDH11, CENPE, CLTC, CYR61, EMR3, ICAM2, LOX, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SIR2, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1 и WIF, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из CAPG, CD28, CDC20, CKS1B, DKK1, HSD17B2 и MMP7, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
29. Способ предсказания исхода болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса С (стадии III), после проведения хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, выбранных из группы, состоящей из CAPG, CD28, CKS1B, CYR61, DKK1, HSD17B2, LOX, MMP7, SIR2, ALCAM, CD24, CDC20, CDH11, CENPE, CLTC, EMR3, ICAM2, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1 и WIF, или их соответствующих продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из CAPG, CD28, CKS1B, CYR61, DKK1, HSD17B2, LOX, MMP7 и SIR2, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из ALCAM, CD24, CDC20, CDH11, CENPE, CLTC, EMR3, ICAM2, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1 и WIF, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
30. Способ предсказания исхода болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки, после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1.2A-B, 2.2A-B, 3.2A-B, 4.2A-B, 5.2A-B, 6.2 и/или 7.2, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1.2A, 2.2A, 3.2A, 4.2A и/или 5.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1.2B, 2.2B, 3.2B, 4.2B и/или 5.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
31. Способ предсказания длительности интервала времени до появления рецидивов (RFI) у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III), после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1.2A, 1.2B, 5.2A и 5.2B, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1.2A или 5.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный RFI будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1.2B или 5.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный RFI будет более длительным.
32. Способ предсказания общей продолжительности жизни после операции (OS) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III), после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 2.2А и 2.2В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 2.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанная OS будет более короткой; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 2.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанная OS будет более длительной.
33. Способ предсказания времени жизни без рецидивов (DFS) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 3.2А и 3.2В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 3.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DFS будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 3.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DFS будет более длительным.
34. Способ предсказания длительности интервала времени от операции до появления рецидивов в периферических органах (DRFI) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 4.2А и 4.2В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 4.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DRFI будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 4.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DRFI будет более длительным.
35. Способ предсказания исхода болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки, после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1A-B, 1.2A-B, 2A-B, 2.2A-B, 3A-B, 3.2A-B, 4A-B, 4.2A-B, 5A-B, 5.2A-B, 6, 6.2, 7 и/или 7.2, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1А, 1.2A, 2А, 2.2A, 3А, 3.2A, 4А, 4.2A, 5А и/или 5.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1В, 1.2B, 2В, 2.2B, 3В, 3.2B, 4В, 4.2B, 5В и/или 5.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
36. Способ предсказания длительности интервала времени до появления рецидивов (RFI) у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1А, 1.2A, 1В, 1.2B, 5А, 5.2A, 5В и/или 5.2B, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1А, 1.2A, 5А и 5.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный RFI будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1В, 1.2B, 5В или 5.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный RFI будет более длительным.
37. Способ предсказания общей продолжительности жизни после операции (OS) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 2А, 2.2А, 2В и 2.2В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 2А или 2.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанная OS будет более короткой; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 2В или 2.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанная OS будет более длительной.
38. Способ предсказания времени жизни без рецидивов (DFS) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 3А, 3.2А, 3В и 3.2В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 3А или 3.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный DFS будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 3В или 3.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанный DFS будет более длительным.
39. Способ предсказания длительности интервала времени, прошедшего от операции до появления рецидивов в периферических органах (DRFI) у индивидуума, у которого был диагностирован рак толстой кишки на стадии Дюкса В (стадии II) или на стадии Дюкса С (стадии III) после хирургической резекции указанного рака, включающий определение уровня экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 4А, 4.2А, 4В и 4.2В, или их продуктов экспрессии в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 4А или 4.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DRFI будет более коротким; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблице 4В или 4.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает предсказание, что указанное DRFI будет более длительным.
40. Отчет, предсказывающий исход болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки, после хирургической резекции указанного рака, включающий прогноз исхода болезни, основанный на получении информации, включающей уровень экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1A-B, 2A-B, 3A-B, 4A-B, 5A-B, 6 и/или 7, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1А, 2А, 3А, 4А и/или 5A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1В, 2В, 3В, 4В и/или 5В, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
41. Отчет, предсказывающий исход болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки, после хирургической резекции указанного рака, включающий прогноз исхода болезни, основанный на получении информации, включающей уровень экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1.2A-B, 2.2A-B, 3.2A-B, 4.2A-B, 5.2A-B, 6.2 и/или 7.2, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1.2A, 2.2A, 3.2A, 4.2A и/или 5.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1.2B, 2.2B, 3.2B, 4.2B и/или 5.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
42. Отчет, предсказывающий исход болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки, после хирургической резекции указанного рака, включающий прогноз исхода болезни, основанный на получении информации, включающей уровень экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, перечисленных в таблицах 1A-B, 1.2A-B, 2A-B, 2.2A-B, 3A-B, 3.2A-B, 4A-B, 4.2A-B, 5A-B, 5.2A-B, 6, 6.2, 7 и/или 7.2, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1A, 1.2A, 2A, 2.2A, 3A, 3.2A, 4A, 4.2A, 5A и/или 5.2A, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, перечисленных в таблицах 1B, 1.2B, 2B, 2.2B, 3B, 3.2B, 4B, 4.2B, 5B и/или 5.2B, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
43. Отчет, предсказывающий исход болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса В (стадии II), после хирургической резекции указанного рака, включающий прогноз исхода болезни, основанный на получении информации, включающей уровень экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, выбранных из группы, состоящей из ALCAM, CD24, CDH11, CENPE, CLTC, CYR61, EMR3, ICAM2, LOX, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SIR2, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1, WIF, CAPG, CD28, CDC20, CKS1B, DKK1, HSD17B2 и MMP7, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из ALCAM, CD24, CDH11, CENPE, CLTC, CYR61, EMR3, ICAM2, LOX, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SIR2, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1 и WIF, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из CAPG, CD28, CDC20, CKS1B, DKK1, HSD17B2 и MMP7, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.
44. Отчет, предсказывающий исход болезни у индивидуума, у которого был диагностирован рак прямой и ободочной кишки на стадии Дюкса С (стадии III), после хирургической резекции указанного рака, включающий прогноз исхода болезни, основанный на получении информации, включающей уровень экспрессии одного или более прогностических РНК-транскриптов, выбранных из группы, состоящей из CAPG, CD28, CKS1B, CYR61, DKK1, HSD17B2, LOX, MMP7, SIR2, ALCAM, CD24, CDC20, CDH11, CENPE, CLTC, EMR3, ICAM2, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1 и WIF, или их продуктов экспрессии, в биологическом образце, содержащем раковые клетки, взятые у указанного индивидуума, где:
(a) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из CAPG, CD28, CKS1B, CYR61, DKK1, HSD17B2, LOX, MMP7 и SIR2, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает пониженную вероятность благоприятного исхода болезни; и
(b) наличие повышенного уровня экспрессии одного или более генов, выбранных из группы, состоящей из ALCAM, CD24, CDC20, CDH11, CENPE, CLTC, EMR3, ICAM2, MADH2, MGAT5, MT3, NUFIP1, PRDX6, SOS1, STAT5B, TFF3, TMSB4X, TP53BP1 и WIF, или их соответствующих продуктов экспрессии, означает повышенную вероятность благоприятного исхода болезни.