Способы скрининга рака

1. Способ III скрининга рака, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака, отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем проведение детектирования статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце рака или предопухолевых изменений по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что образцом для детектирования является мазок по Папаниколау, асцитическая жидкость, кровь, моча, кал, мокрота, клетки слизистой оболочки полости рта, желудочный сок, желчь, клетки эпителия шейки матки или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27, при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
6. Способ скрининга рака шейки матки, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца для детектирования в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака шейки матки, отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем проведение детектирования статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце рака шейки матки или предопухолевых изменений шейки матки по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
7. Способ по п. 6, отличающийся тем, что образцом для детектирования является мазок по Папаниколау, кровь, моча, клетки эпителия шейки матки или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
8. Способ по п. 6, отличающийся тем, что образцом для детектирования является мазок по Папаниколау с отклонениями от нормы.
9. Способ по п. 6, отличающийся тем, что образцом для детектирования является образец клеток эпителия шейки матки с положительным результатом анализа на вирус папилломы человека.
10. Способ по п. 6, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
11. Способ по п. 6, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
12. Способ по п. 6, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11, статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27, при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
13. Способ скрининга рака яичников, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака яичников, отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем проведение детектирование статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНКобразца, после этого определение наличия в образце рака яичников по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
14. Способ по п. 13, отличающийся тем, что образцом для детектирования является ткань новообразования яичников, асцитическая жидкость, кровь, моча или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
15. Способ по п. 13, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
16. Способ по п. 13, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
17. Способ по п. 13, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27, при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
18. Способ скрининга рака печени, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака печени, отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем проведение детектирования статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце рака печени по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
19. Способ по п. 18, отличающийся тем, что образцом для детектирования является ткань печени, кал, желудочный сок, желчь, асцитическая жидкость, кровь, моча или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
20. Способ по п. 18, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
21. Способ по п. 18, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
22. Способ по п. 18, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27; при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
23. Способ скрининга рака толстой кишки, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака толстой кишки, отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем проведение детектирования статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце рака толстой кишки или предопухолевых изменений толстой кишки по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
24. Способ по п. 23, отличающийся тем, что образцом для детектирования является ткань толстой кишки, асцитическая жидкость, кровь, моча, кал или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
25. Способ по п. 23, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
26. Способ по п. 23, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
27. Способ по п. 23, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27; при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
28. Способ скрининга рака молочной железы, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака молочной железы, отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования; затем детектирование статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце рака молочной железы по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
29. Способ по п. 28, отличающийся тем, что образцом для детектирования является кровь, моча, грудное молоко, выделения из молочных желез, киста, пунктат или биоптат или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
30. Способ по п. 28, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующем высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
31. Способ по п. 28, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
32. Способ по п. 28, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27; праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
33. Способ скрининга рака полости рта, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака полости рта; отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем детектирование статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце рака полости рта или предопухолевых изменений полости рта по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
34. Способ по п. 33, отличающийся тем, что образцом для детектирования является кровь, клетки из смыва при полоскании, мокрота, клетки слизистой оболочки полости рта или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
35. Способ по п. 33, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
36. Способ по п. 33, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
37. Способ рта по п. 33, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27, при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
38. Способ скрининга рака эндометрия, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия рака эндометрия, отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем детектирование статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце рака эндометрия по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
39. Способ по п. 38, отличающийся тем, что образцом для детектирования является кровь, моча, смывы из влагалища, менструальные выделения, ткани, полученные при дилатации и кюретаже матки или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
40. Способ по п. 38, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
41. Способ по п. 38, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
42. Способ по п. 38, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27; при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.
43. Способ скрининга саркомы, включающий детектирование статуса метилирования целевого гена в клетках образца в качестве скринингового показателя наличия или отсутствия саркомы; отличающийся тем, что он включает в себя сначала обеспечение образца для детектирования, затем детектирование статуса метилирования последовательности CpG, по крайней мере, в одном целевом гене, которыми являются ADRA1D, AJAP1, HS3ST2, MAGI2, POU4F2, POU4F3, PTGDR, SOX17 и SYT9 в геномной ДНК образца, и после этого определение наличия в образце саркомы по статусу метилирования целевого гена или использование статуса метилирования в качестве прогностического индикатора после лечения.
44. Способ по п. 43, отличающийся тем, что образцом для детектирования является кровь, моча или in vitro образец ткани опухоли после хирургического вмешательства.
45. Способ по п. 43, отличающийся тем, что детектирование статуса метилирования последовательности CpG целевого гена осуществляют в специфичной для метилирования полимеразной цепной реакции, специфичной для метилирования количественной полимеразной цепной реакции, бисульфитном секвенировании, микроматричном анализе, масс-спектрометрии, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии или пиросеквенировании.
46. Способ по п. 43, отличающийся тем, что целевой ген ADRA1D имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 1; целевой ген AJAP1 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 2; целевой ген HS3ST2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 3; целевой ген MAGI2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 4; целевой ген POU4F2 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 5; целевой ген POU4F3 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 6; целевой ген PTGDR имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 7; целевой ген SOX17 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 8; целевой ген SYT9 имеет последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 9.
47. Способ по п. 43, отличающийся тем, что статус метилирования целевого гена ADRA1D детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 10-11; статус метилирования целевого гена AJAP1 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 12-13; статус метилирования целевого гена HS3ST2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 14-15; статус метилирования целевого гена MAGI2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 16-17; статус метилирования целевого гена POU4F2 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 18-19; статус метилирования целевого гена POU4F3 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 20-21; статус метилирования целевого гена PTGDR детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 22-23; статус метилирования целевого гена SOX17 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 24-25; статус метилирования целевого гена SYT9 детектируют парами праймеров, имеющих последовательность нуклеотидов по SEQ ID NO: 26-27; при этом праймеры содержат последовательности, которые не менее чем на 80% идентичны, комплементарны или имеют не менее 10 последовательных нуклеотидов, идентичных последовательностям соответствующих генов.