СПОСОБЫ АНАЛИЗА ПРОФИЛЯ АКТИВНОСТИ БОЛЕЗНИ С ЦЕЛЬЮ ПРОВЕДЕНИЯ ИНДИВИДУАЛЬНОГО ЛЕЧЕНИЯ

1. Неинвазивная модель измерения заживления слизистой у индивидуума с поставленным диагнозом воспалительная болезнь кишечника (IBD), получающего курс лечения, данный способ включает:
(a) измерение уровней набора маркеров заживления слизистой в образце, полученном от индивидуума;
(b) сравнение уровней набора маркеров заживления слизистой у индивидуума с уровнями контроля для вычисления индекса заживления слизистой у индивидуума, при этом индекс заживления слизистой включает отображение степени заживления слизистой; и
(c) определение, следует ли продолжать курс лечения индивидуума, претерпевающего заживление слизистой,
2. Способ контролирования терапевтической эффективности у индивидуума с воспалительной болезнью кишечника (IBD), получающего курс лечения, данный способ включает:
(a) измерение уровней набора маркеров заживления слизистой в образце, полученном от индивидуума, в некотором количестве временных точек в процессе лечения индивидуума терапевтическим антителом;
(b) использование статистического алгоритма в отношении уровня одного или более маркеров, определенных на стадии (а), для получения индекса заживления слизистой;
(c) сравнение индекса заживления слизистой у индивидуума с индексом контроля; и
(d) определение, является ли лечение подходящим для оказания содействия заживлению слизистой у индивидуума.
3. Способ выбора режима лечения для индивидуума с воспалительной болезнью кишечника (IBD), данный способ включает:
(a) измерение уровней набора маркеров заживления слизистой в образце, полученном от индивидуума, в некотором количестве временных точек в процессе лечения данного индивидуума терапевтическим антителом;
(b) использование статистического алгоритма в отношении уровня одного или более маркеров, определенных на стадии (а), для получения индекса заживления слизистой;
(c) сравнение индекса заживления слизистой у индивидуума с индексом контроля; и
(d) выбор соответствующего режима лечения для индивидуума, при котором режим лечения оказывает содействие заживлению слизистой.
4. Способ по любому из пп.1-3, согласно которому IBD включает болезнь Крона или язвенный колит.
5. Способ по любому из пп.1-3, согласно которому IBD включает болезнь Крона.
6. Способ по любому из пп.1-3, согласно которому маркер заживления слизистой выбирают из группы, состоящей из AREG, EREG, HB-EGF, HGF. NRG1, NRG2, NRG3, NRG4, ВТС, EGF, IGF, TGF-α, VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, FGF1, FGF2, FGF7, FGF9, TWEAK и их комбинаций.
7. Способ по любому из пп.1-3, согласно которому маркеры измеряют в образце, выбранном из группы, состоящей из сыворотки, плазмы, цельной крови, кала, мононуклеарных клеток периферической крови (РВМС), полиморфноядерных (PMN) клеток и биопсии ткани.
8. Способ по любому из пп.1-3, согласно которому лечение выбирают из группы, состоящей из TNFα ингибирующей терапии, иммуносупрессорного средства, кортикостероида, лекарственного средства, направленного на другой механизм, пищевой терапии и их комбинаций.
9. Способ по п.8, в котором TNFα-ингибирующая терапия включает анти-TNFα антитело.

10. Способ по п.9, согласно которому анти-TNFα антитело выбирают из группы, состоящей из РЕМИКЕЙД™ (инфликсимаба), ENBREL™ (этанерцепта). ХУМИРЫ™ (адалимумаба), СИМЗИИ (цертолизумаб пегола) и их комбинаций.
11. Способ по п.8, согласно которому иммуносупрессорное средство выбирают из группы, состоящей из азатиоприна, 6-меркаптопурина, метотрексата и их комбинаций.
12. Способ по п.8, согласно которому лекарственное средство, направленное на другой механизм, выбирают из группы, состоящей из антитела, ингибирующего IL-6, анти-интегриновой молекулы, JAK-2 ингибитора, ингибитора тирозинкиназы и их комбинаций.
13. Способ по п.8, согласно которому пищевое питание включает специальную углеводистую диету.
14. Способ по любому из пп.1-3, согласно которому набор маркеров заживления слизистой дополнительно включает, по меньшей мере, один, выбранный из группы, состоящей из анти-TNFα антитела, антилекарственного антитела (ADA), воспалительного маркера, противовоспалительного маркера, маркера заживления слизистой и их комбинаций.

15. Способ по п.14, согласно которому анти-TNFα антитело выбирают из группы, состоящей из РЕМИКЕЙД™ (инфликсимаб), ENBREL™ (этанерцепт), ХУМИРЫ™ (адалимумаб), СИМЗИИ (цертолизумаб пегол) и их комбинаций.
16. Способ по п.14, согласно которому антилекарственное антитело (ADA) выбирают из группы, состоящей из человеческого антихимерного антитела (НАСА), человеческого анти-гуманизированного антитела (НАНА), человеческого анти-мышиного антитела (НАМА) и их комбинаций.
17. Способ по п.14, согласно которому маркер заживления слизистой выбирают из группы, состоящей из AREG, EREG, HB-EGF, HGF, NRG1, NRG2, NRG3, NRG4, ВТС, EGF, IGF, TGF-α, VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, FGF1, FGF2, FGF7, FGF9, TWEAK и их комбинаций.
18. Способ по п.14, согласно которому воспалительный маркер выбирают из группы, состоящей из GM-CSF, IFN-γ, IL-1β, IL-2, IL-6, IL-8, TNF-α, sTNF RII и их комбинаций.
19. Способ по п.14, согласно которому противовоспалительный маркер выбирают из группы, состоящей из IL-12p70, IL-10 и их комбинаций.
20. Способ уменьшения или сведения к минимуму риска хирургического вмешательства у индивидуума с поставленным диагнозом воспалительная болезнь кишечника (IBD) при проведении курса лечения, указанный способ включает:
(a) измерение набора маркеров заживления слизистой в некотором количестве временных точек в процессе лечения терапевтическим антителом;
(b) получение индекса заживления слизистой у индивидуума, включающего отображение наличия и/или уровней концентрации каждого маркера в течение некоторого времени;
(c) сравнение индекса заживления слизистой у индивидуума с индексом контроля; и
(d) выбор соответствующего режима лечения для уменьшения или сведения к минимуму риска хирургического вмешательства.
21. Способ по п.20, согласно которому маркер заживления слизистой выбирают из группы, состоящей из AREG, EREG, HB-EGF, HGF, NRG1, NRG2, NRG3, NRG4, ВТС, EGF, IGF, TGF-α, VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, FGF1, FGF2, FGF7, FGF9, TWEAK и их комбинаций.
22. Способ по п.20 или 21, согласно которому контроль является контролем от здорового индивидуума.
23. Способ по любому из пп.20 и 21, согласно которому терапевтическое антитело включает анти-TNF-антитело.

24. Способ по п.23, согласно которому анти-TNF антитело выбирают из группы, состоящей из РЕМИКЕЙД™ (инфликсимаб), ENBREL™ (этанерцепт). ХУМИРЫ™ (адалимумаб), СИМЗИИ (цертолизумаб пегол) и их комбинаций.
25. Способ по любому из пунктов 20-21, согласно которому маркеры измеряют в образце, выбранном из группы, состоящей из сыворотки, плазмы, цельной крови, кала, мононуклеарных клеток периферической крови (РВМС), полиморфноядерных (PMN) клеток и биопсии ткани.
26. Способ по любому из пп.20 и 21, согласно которому множество моментов времени включает, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 или более моментов времени.
27. Способ по любому из пп.20 и 21, согласно которому IBD включает болезнь Крона или язвенный колит.
28. Способ по любому из пп.20 и 21, согласно которому первый момент времени во множестве моментов времени является моментом времени до проведения курса лечения терапевтическим антителом.
29. Способ по любому из пп.20 и 21, согласно которому первый момент времени во множестве моментов времени является моментом времени в течение курса лечения терапевтическим антителом.
30. Способ выбора режима лечения для оказания содействия заживлению слизистой у индивидуума с поставленным диагнозом воспалительная болезнь кишечника (IBD), указанный способ включает:
0
0
(a) измерение уровней набора маркеров заживления слизистой в момент времени t для получения индекса заживления слизистой в t;
1
1
(b) измерение уровней набора маркеров заживления слизистой в момент времени t для получения индекса заживления слизистой в t;
0
1
(c) сравнение изменения индекса заживления слизистой от t до t; и
(d) выбор режима лечения индивидуума для оказания содействия заживлению слизистой.
31. Способ по п.30, согласно которому маркер заживления слизистой выбирают из группы, состоящей из AREG, EREG, HB-EGF, HGF, NRG1, NRG2, NRG3, NRG4, ВТС, EGF, IGF, TGF-α, VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, FGFL FGF2, FGF7, FGF9, TWEAK и их комбинаций.
32. Способ по п.30 или 31, согласно которому индекс заживления слизистой определяют, используя статистический алгоритм.
33. Способ по любому из пп.30 и 31, согласно которому режим лечения включает анти-TNF-антитело.

34. Способ по п.32, согласно которому анти-TNF-антитело выбирают из группы, состоящей из РЕМИКЕЙД™ (инфликсимаба), ENBREL™ (этанерцепта), ХУМИРЫ™ (адалимумаба), СИМЗИИ (цертолизумаб пегола) и их комбинаций.
35. Способ по любому из пунктов 30-31, согласно которому маркеры измеряют в образце, выбранном из группы, состоящей из сыворотки, плазмы, цельной крови, кала, мононуклеарных клеток периферической крови (РВМС), полиморфноядерных (PMN) клеток и биопсии ткани.
36. Способ по любому из пп.30 и 31, согласно которому уровни набора маркеров заживления слизистой измеряются в 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 или более дополнительных моментов времени.
37. Способ по любому из пп.30 и 31, согласно которому IBD включает болезнь Крона или язвенный колит.