СПОСОБЫ ВЫЯВЛЕНИЯ НЕЙРОДЕГЕНЕРАТИВНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ ИЛИ НАРУШЕНИЙ

1. Способ диагностики нейродегенеративного нарушения у индивидуума, причем способ включает определение того, содержит ли индивидуум клетку, которая экспрессирует по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2 на уровне, превышающем уровень экспрессии соответствующих генов в эталонном образце, где присутствие указанной клетки указывает на то, что индивидуум имеет нейродегенеративное нарушение.
2. Способ по п.1, где клетка представляет собой нейрон.
3. Способ по п.1, где способ дополнительно включает получение биологического образца от индивидуума.
4. Способ по п.3, где биологический образец выбран из группы, состоящей из цереброспинальной жидкости, ткани головного мозга, цельной крови, плазмы и сыворотки.
in vivo
5. Способ по п.1, где определение того, содержит ли индивидуум клетку, которая экспрессирует по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2, проводят .
6. Способ по п.1, где уровень экспрессии по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют на основе экспрессии РНК, или экспрессии белка, или их комбинации.
7. Способ по п.1, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации.
8. Способ по п.1, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием иммуноанализа.
9. Способ по п.8, где иммуноанализ представляет собой ELISA.
10. Способ по п.1, где экспрессию dleu2 измеряют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации, и экспрессию tbx6 измеряют с использованием иммуноанализа.
11. Способ по п.1, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа визуализации, выбранного из группы, состоящей из магнитно-резонансной томографии (MRI), позитронно-эмиссионной томографии (PET), однофотонной эмиссионной томографии (SPECT), рентгеновской компьютерной томографии (CT), опосредуемой флуоресценцией молекулярной томографии (FMT), визуализации отражения флуоресценции (FRI), биолюминесцентной визуализации (BLI), гамма-визуализации и магнитно-резонансной спектроскопии.
12. Способ по п.1, где определяют экспрессию как tbx6, так и dleu2.
2
2
13. Способ по любому из пп.1-12, где нейродегенеративное нарушение выбрано из группы, состоящей из болезни Альцгеймера (AD), деменции с тельцами Леви, синдрома Дауна, наследственной мозжечковой геморрагии с амилоидозом (голландского типа); дементного комплекса Паркинсона Гуам; а также других заболеваний, которые основаны на или обусловлены амилоид-подобными белками, таких как прогрессирующий надъядерный паралич, рассеянный склероз, болезнь Крейцфельда-Якоба, болезнь Паркинсона, обусловленная ВИЧ деменция, ALS (боковой амиотрофический склероз), диабет зрелого возраста, старческий амилоидоз сердца, эндокринные опухоли, глаукома, болезнь Александера, болезнь Альперса, атаксия-телеангиэктазия, болезнь Баттена (также известная как болезнь Шпильмайера-Фогта-Баттена), губкообразная энцефалопатия крупного рогатого скота (BSE), болезнь Канавана, синдром Кокейна, кортикобазальная дегенерация, болезнь Гентингтона, болезнь Кеннади, болезнь Краббе, болезнь Мачадо-Джозефа (спинально-церебеллярная атаксия 3 типа), полисистемная атрофия, нейроборрелиоз, болезнь Пелицеуса-Мерцбахера, болезнь Пика, первичный латеральный склероз, прионные заболевания, болезнь Рефсума, болезнь Сендхоффа, болезнь Шильдера, подострая комбинированная дегенерация спинного мозга, вторичная для пернициозной анемии, шизофрения, спинально-церебеллярная атаксия (множество типов с различными характеристиками), спинальная мышечная атрофия, болезнь Стила-Ричардсона-Ольшевского, сухотка спинного мозга, болезнь Шарко-Мари-Тута, средиземноморская лихорадка, синдром Макла-Уэлса, идиопатическая миелома, амилоидная полиневропатия, амилоидная кардиомиопатия, системный старческий амилоидоз, амилоидная полиневропатия, наследственная мозжечковая геморрагия с амилоидозом, синдром Дауна, синдром Герстманна-Штреусслера-Шейнкера, медуллярная карцинома щитовидной железы, изолированный предсердный амилоидоз, β-микроглобулиновый амилоидоз у пациентов на диализе, миозит с тельцами включения, отложения β-амилоида при мышечной атрофии, инсулинома островков Лангерганса при диабете типа II и другие связанные с амилоидозом заболевания.
14. Способ по п.13, где нейродегенеративное нарушение представляет собой болезнь Альцгеймера (AD).
15. Способ мониторинга заболевания у индивидуума, которого подвергают лечению от нейродегенеративного нарушения, причем указанный способ включает определение того, имеется ли у индивидуума клетка, которая экспрессирует по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2 на уровне, превышающем уровень экспрессии соответствующих генов в эталонном образце, где присутствие указанной клетки указывает на то, что индивидуум нуждается в продолжении лечения от указанного нейродегенеративного нарушения.
16. Способ по п.15, где клетка представляет собой нейрон.
17. Способ по п.15, где способ дополнительно включает получение биологического образца от индивидуума.
18. Способ по п.17, где биологический образец выбран из группы, состоящей из цереброспинальной жидкости, ткани головного мозга, цельной крови, плазмы и сыворотки.
in vivo
19. Способ по п.15, где определение того, содержит ли индивидуум клетку, которая экспрессирует по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2, проводят .
20. Способ по п.15, где уровень экспрессии по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют на основе экспрессии РНК, или экспрессии белка, или их комбинации.
21. Способ по п.15, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации.
22. Способ по п.15, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием иммуноанализа.
23. Способ по п.22, где иммуноанализ представляет собой ELISA.
24. Способ по п.15, где экспрессию dleu2 измеряют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации, и экспрессию tbx6 измеряют с использованием иммуноанализа.
25. Способ по п.15, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа визуализации, выбранного из группы, состоящей из магнитно-резонансной томографии (MRI), позитронно-эмиссионной томографии (PET), однофотонной эмиссионной томографии (SPECT), рентгеновской компьютерной томографии (CT), опосредуемой флуоресценцией молекулярной томографии (FMT), визуализации отражения флуоресценции (FRI), биолюминесцентной визуализации (BLI), гамма-визуализации и магнитно-резонансной спектроскопии.
26. Способ по п.15, где определяют экспрессию как tbx6, так и dleu2.
2
2
27. Способ по любому из пп.15-26, где нейродегенеративное нарушение выбрано из группы, состоящей из болезни Альцгеймера (AD), деменции с тельцами Леви, синдрома Дауна, наследственной мозжечковой геморрагии с амилоидозом (голландского типа); дементного комплекса Паркинсона Гуам; а также других заболеваний, которые основаны на или обусловлены амилоид-подобными белками, таких как прогрессирующий надъядерный паралич, рассеянный склероз, болезнь Крейцфельда-Якоба, болезнь Паркинсона, обусловленная ВИЧ деменция, ALS (боковой амиотрофический склероз), диабет зрелого возраста, старческий амилоидоз сердца, эндокринные опухоли, глаукома, болезнь Александера, болезнь Альперса, атаксия-телеангиэктазия, болезнь Баттена (также известная как болезнь Шпильмайера-Фогта-Баттена), губкообразная энцефалопатия крупного рогатого скота (BSE), болезнь Канавана, синдром Кокейна, кортикобазальная дегенерация, болезнь Гентингтона, болезнь Кеннади, болезнь Краббе, болезнь Мачадо-Джозефа (спинально-церебеллярная атаксия 3 типа), полисистемная атрофия, нейроборрелиоз, болезнь Пелицеуса-Мерцбахера, болезнь Пика, первичный латеральный склероз, прионные заболевания, болезнь Рефсума, болезнь Сендхоффа, болезнь Шильдера, подострая комбинированная дегенерация спинного мозга, вторичная для пернициозной анемии, шизофрения, спинально-церебеллярная атаксия (множество типов с различными характеристиками), спинальная мышечная атрофия, болезнь Стила-Ричардсона-Ольшевского, сухотка спинного мозга, болезнь Шарко-Мари-Тута, средиземноморская лихорадка, синдром Макла-Уэлса, идиопатическая миелома, амилоидная полиневропатия, амилоидная кардиомиопатия, системный старческий амилоидоз, амилоидная полиневропатия, наследственная мозжечковая геморрагия с амилоидозом, синдром Дауна, синдром Герстманна-Штреусслера-Шейнкера, медуллярная карцинома щитовидной железы, изолированный предсердный амилоидоз, β-микроглобулиновый амилоидоз у пациентов на диализе, миозит с тельцами включения, отложения β-амилоида при мышечной атрофии, инсулинома островков Лангерганса при диабете типа II и другие связанные с амилоидозом заболевания.
28. Способ по п.27, где нейродегенеративное нарушение представляет собой болезнь Альцгеймера (AD).
29. Способ оценки предрасположенности индивидуума к развитию нейродегенеративного нарушения, причем указанный способ включает определение того, имеется ли у индивидуума клетка, которая экспрессирует по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2 на уровне, превышающем уровень экспрессии соответствующих генов в эталонном образце, где присутствие указанной клетки указывает на предрасположенность индивидуума к развитию нейродегенеративного нарушения.
30. Способ по п.29, где клетка представляет собой нейрон.
31. Способ по п.29, где способ дополнительно включает получение биологического образца от индивидуума.
32. Способ по п.31, где биологический образец выбран из группы, состоящей из цереброспинальной жидкости, ткани головного мозга, цельной крови, плазмы и сыворотки.
in vivo
33. Способ по п.29, где определение того, содержит ли индивидуум клетку, которая экспрессирует по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2, проводят .
34. Способ по п.29, где уровень экспрессии по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют на основе экспрессии РНК, или экспрессии белка, или их комбинации.
35. Способ по п.29, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации.
36. Способ по п.29, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием иммуноанализа.
37. Способ по п.36, где иммуноанализ представляет собой ELISA.
38. Способ по п.29, где экспрессию dleu2 измеряют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации, и экспрессию tbx6 измеряют с использованием иммуноанализа.
39. Способ по п.29, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа визуализации, выбранного из группы, состоящей из магнитно-резонансной томографии (MRI), позитронно-эмиссионной томографии (PET), однофотонной эмиссионной томографии (SPECT), рентгеновской компьютерной томографии (CT), опосредуемой флуоресценцией молекулярной томографии (FMT), визуализации отражения флуоресценции (FRI), биолюминесцентной визуализации (BLI), гамма-визуализации и магнитно-резонансной спектроскопии.
40. Способ по п.29, где определяют экспрессию как tbx6, так и dleu2.
2
2
41. Способ по любому из пп.29-40, где нейродегенеративное нарушение выбрано из группы, состоящей из болезни Альцгеймера (AD), деменции с тельцами Леви, синдрома Дауна, наследственной мозжечковой геморрагии с амилоидозом (голландского типа); дементного комплекса Паркинсона Гуам; а также других заболеваний, которые основаны на или обусловлены амилоид-подобными белками, таких как прогрессирующий надъядерный паралич, рассеянный склероз, болезнь Крейцфельда-Якоба, болезнь Паркинсона, обусловленная ВИЧ деменция, ALS (боковой амиотрофический склероз), диабет зрелого возраста, старческий амилоидоз сердца, эндокринные опухоли, глаукома, болезнь Александера, болезнь Альперса, атаксия-телеангиэктазия, болезнь Баттена (также известная как болезнь Шпильмайера-Фогта-Баттена), губкообразная энцефалопатия крупного рогатого скота (BSE), болезнь Канавана, синдром Кокейна, кортикобазальная дегенерация, болезнь Гентингтона, болезнь Кеннади, болезнь Краббе, болезнь Мачадо-Джозефа (спинально-церебеллярная атаксия 3 типа), полисистемная атрофия, нейроборрелиоз, болезнь Пелицеуса-Мерцбахера, болезнь Пика, первичный латеральный склероз, прионные заболевания, болезнь Рефсума, болезнь Сендхоффа, болезнь Шильдера, подострая комбинированная дегенерация спинного мозга, вторичная для пернициозной анемии, шизофрения, спинально-церебеллярная атаксия (множество типов с различными характеристиками), спинальная мышечная атрофия, болезнь Стила-Ричардсона-Ольшевского, сухотка спинного мозга, болезнь Шарко-Мари-Тута, средиземноморская лихорадка, синдром Макла-Уэлса, идиопатическая миелома, амилоидная полиневропатия, амилоидная кардиомиопатия, системный старческий амилоидоз, амилоидная полиневропатия, наследственная мозжечковая геморрагия с амилоидозом, синдром Дауна, синдром Герстманна-Штреусслера-Шейнкера, медуллярная карцинома щитовидной железы, изолированный предсердный амилоидоз, β-микроглобулиновый амилоидоз у пациентов на диализе, миозит с тельцами включения, отложения β-амилоида при мышечной атрофии, инсулинома островков Лангерганса при диабете типа II и другие связанные с амилоидозом заболевания.
42. Способ по п.41, где нейродегенеративное нарушение представляет собой болезнь Альцгеймера (AD).
43. Способ определения того, имеет ли нейрон риск и/или претерпевает ли он нейрональную дегенерацию, включающий определение того, экспрессирует ли нейрон по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2 на уровне, превышающем уровень экспрессии соответствующего гена в нейроне, не претерпевающем нейрональную дегенерацию, где увеличенная экспрессия по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 указывает на то, что нейрон имеет риск и/или претерпевает нейрональную дегенерацию.
44. Способ по п.43, где уровень экспрессии по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют на основе экспрессии РНК, или экспрессии белка, или их комбинации.
45. Способ по п.43, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации.
46. Способ по п.43, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием иммуноанализа.
47. Способ по п.46, где иммуноанализ представляет собой ELISA.
48. Способ по любому из пп.43-47, где экспрессию dleu2 измеряют с использованием способа ПЦР, микрочипа или их комбинации, и экспрессию tbx6 измеряют с использованием иммуноанализа.
49. Способ по любому из пп.43-47, где экспрессию по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 определяют с использованием способа визуализации, выбранного из группы, состоящей из магнитно-резонансной томографии (MRI), позитронно-эмиссионной томографии (PET), однофотонной эмиссионной томографии (SPECT), рентгеновской компьютерной томографии (CT), опосредуемой флуоресценцией молекулярной томографии (FMT), визуализации отражения флуоресценции (FRI), биолюминесцентной визуализации (BLI), гамма-визуализации и магнитно-резонансной спектроскопии.
50. Способ по любому из пп.43-47, где определяют экспрессию как tbx6, так и dleu2.
51. Набор, содержащий зонды для выявления экспрессии по меньшей мере одного из генов tbx6 и dleu2 и инструкции по применению зондов для определения того, содержит ли индивидуум клетку, которая экспрессирует по меньшей мере один из генов tbx6 и dleu2 на уровне, превышающем уровень экспрессии соответствующих генов в нормальном эталонном образце.
52. Набор по п.51, где наличие указанной клетки указывает на то, что индивидуум имеет нейродегенеративное нарушение.
53. Набор по п.51, где наличие указанной клетки указывает на то, что индивидуум нуждается в продолжении лечения от указанного нейродегенеративного нарушения.
54. Набор по п.51, где наличие указанной клетки указывает на предрасположенность индивидуума к развитию нейродегенеративного нарушения.
55. Набор по п.51, где наличие указанной клетки указывает на то, что клетка претерпевает нейродегенерацию или предрасположена к ней.
56. Набор по п. 51, где клетка представляет собой нейрон.
57. Набор по п.51, где зонды являются мечеными.
58. Набор по п.51, где зонды выбраны из группы, состоящей из полинуклеотидов, антител или их комбинации.
2
59. Набор по п.58, где антитела выбраны из группы, состоящей из моноклонального антитела, химерного антитела, гуманизированного антитела, Fv-фрагмента, Fab-фрагмента, Fab'-фрагмента и F(ab')-фрагмента.
60. Набор по п.58, где полинуклеотид представляет собой антисмысловой полинуклеотид.
61. Набор по п.58, где полинуклеотид представляет собой пептидную нуклеиновую кислоту (PNA).
62. Набор по п.51, где зонд конъюгирован с нацеливающим на головной мозг пептидом.
63. Набор по п.62, где нацеливающий на головной мозг пептид выбран из группы, состоящей из инсулина, трансферрина, антитела против рецептора трансферрина или их фрагментов.
2
2
64. Набор по любому из пп. 51-63, где нейродегенеративное нарушение выбрано из группы, состоящей из болезни Альцгеймера (AD), деменции с тельцами Леви, синдрома Дауна, наследственной мозжечковой геморрагии с амилоидозом (голландского типа); дементного комплекса Паркинсона Гуам; а также других заболеваний, которые основаны на или обусловлены амилоид-подобными белками, таких как прогрессирующий надъядерный паралич, рассеянный склероз, болезнь Крейцфельда-Якоба, болезнь Паркинсона, обусловленная ВИЧ деменция, ALS (боковой амиотрофический склероз), диабет зрелого возраста, старческий амилоидоз сердца, эндокринные опухоли, глаукома, болезнь Александера, болезнь Альперса, атаксия-телеангиэктазия, болезнь Баттена (также известная как болезнь Шпильмайера-Фогта-Баттена), губкообразная энцефалопатия крупного рогатого скота (BSE), болезнь Канавана, синдром Кокейна, кортикобазальная дегенерация, болезнь Гентингтона, болезнь Кеннади, болезнь Краббе, болезнь Мачадо-Джозефа (спинально-церебеллярная атаксия 3 типа), полисистемная атрофия, нейроборрелиоз, болезнь Пелицеуса-Мерцбахера, болезнь Пика, первичный латеральный склероз, прионные заболевания, болезнь Рефсума, болезнь Сендхоффа, болезнь Шильдера, подострая комбинированная дегенерация спинного мозга, вторичная для пернициозной анемии, шизофрения, спинально-церебеллярная атаксия (множество типов с различными характеристиками), спинальная мышечная атрофия, болезнь Стила-Ричардсона-Ольшевского, сухотка спинного мозга, болезнь Шарко-Мари-Тута, средиземноморская лихорадка, синдром Макла-Уэлса, идиопатическая миелома, амилоидная полиневропатия, амилоидная кардиомиопатия, системный старческий амилоидоз, амилоидная полиневропатия, наследственная мозжечковая геморрагия с амилоидозом, синдром Дауна, синдром Герстманна-Штреусслера-Шейнкера, медуллярная карцинома щитовидной железы, изолированный предсердный амилоидоз, β-микроглобулиновый амилоидоз у пациентов на диализе, миозит с тельцами включения, отложения β-амилоида при мышечной атрофии, инсулинома островков Лангерганса при диабете типа II и другие связанные с амилоидозом заболевания.
65. Набор по п.64, где нейродегенеративное нарушение представляет собой болезнь Альцгеймера.