Способ биотехнологического получения, по меньшей мере, одной жирной кислоты, по меньшей мере, с 5 атомами углерода и/или ее производного из газа, содержащего H2, CO2 и O2

2
2
2
1. Способ биотехнологического получения, по меньшей мере, одной жирной кислоты, по меньшей мере, с 5 атомами углерода и/или ее производного из газа, содержащего H, СО и O, причем указанный способ включает следующие этапы:
(a) предоставление генетически модифицированной водород-окисляющей бактерии в водной среде; и
2
2
2
(b) контактирование водной среды с газом, содержащим Н, СО и О, в массовом отношении 20 к 70:10 к 45:5 к 35;
1
2
при этом водород-окисляющая бактерия является генетически модифицированной по отношению к бактерии дикого типа для увеличения экспрессии фермента E, который способен выступать в качестве катализатора при конверсии ацетил-КоА в ацил-АСР через малонил-КоА и для увеличения экспрессии фермента Е, который способен выступать в качестве катализатора при конверсии ацил-АСР в жирную кислоту.
1
1a
1b
1c
1d
2
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что E выбирают из группы, состоящей из E ассА (ЕС 6.4.1.2), E ассВ (ЕС 6.4.1.2), E ассС (ЕС 6.4.1.2) и E accD (ЕС 6.4.1.2) и их комбинаций, и/или Е представляет собой, по меньшей мере, одну тиоэстеразу (ЕС 3.1.2.14 и ЕС 3.1.2.22).
1a
1b
1c
1d
3. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что водород-окисляющая бактерия генетически модифицирована относительно бактерии дикого типа для увеличения экспрессии фермента E, E, E и E.
4. Способ по п. 2, отличающийся тем, что
1a
(a) E имеет, по меньшей мере, 50% идентичности последовательности с полипептидом с номером доступа ААС73296 или EG11647 и их комбинациями,
1b
(b) E имеет, по меньшей мере, 50% идентичности последовательности с полипептидом с номером доступа EG10275 и его комбинациями,
1c
(с) E имеет, по меньшей мере, 50% идентичности последовательности с полипептидом с номером доступа EG10276 и его комбинациями, и
1d
(d) E имеет, по меньшей мере, 50% идентичности последовательности с полипептидом с номером доступа EG10217 и его комбинациями,
или с функциональным фрагментом любого из полипептидов, которые способны выступать в качестве катализатора при конверсии ацетил-КоА в ацил-АСР через малонил-КоА.
2
5. Способ по п. 2, отличающийся тем, что Е представляет собой ацил-АСР тиоэстеразу.
2
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что Е имеет, по меньшей мере, 50% идентичности последовательности с полипептидом с номером доступа, выбранным из группы, состоящей из ААС72881.1, АВВ71579.1, САС19934.1, ААС49180.1, ААС49783.1, ААС49179.1, САВ60830.1, АВВ71581.1, ААС49269.1, САС19933.1, САА54060.1, ААС72882.1, Q39513.1, ААС49784.1, ААС72883.1, Q41635.1 и ААС49001.1, и его комбинациями.
3
4
5
6
7
8
9
l0
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
7. Способ по любому из пп. 1 или 2, отличающийся тем, что водород-окисляющая бактерия дополнительно генетически модифицирована относительно бактерии дикого типа для увеличения экспрессии, по меньшей мере, одного фермента, выбранного из группы, состоящей из Е асеЕ (ЕС 1.2.4.1, 2.3.1.61, 2.3.1.12), Е aceF (ЕС 1.2.4.1, 2.3.4.16, 2.3.1.12), Е асрР (ААС74178), E fadD (ЕС 2.3.1.86), Е cerl (ЕС 4.1.99.5), E fabA (ЕС4.2.1.60), E fabB (ЕС 2.3.1.41), E fabD (ЕС 2.3.1.39), E fabG (ЕС 1.1.1.100), E fabH (ЕС 2.3.1.180), E fabl (ЕС 1.3.1.9), Е fabZ (EC 4.2.1.-), Е lipase (ЕС 3.1.1.3), Е malonyl-CoA декарбоксилазы (ЕС 4.1.1.9, 4.1.1.41), E panD (ЕС 4.1.1.11), Е panK (ЕС 2.7.1.33), Е pdh (ЕС 1.2.4.1), Е udhA (ЕС 1.6.1.1) и их комбинаций.
8. Способ по любому из пп. 1 или 2, отличающийся тем, что водород-окисляющая бактерия выбрана из группы, состоящей из Achromobacter, Acidithiobacillus, Acidovorax, Alcaligenes, Anabena, Aquifex, Arthrobacter, Azospirillum, Bacillus, Bradyrhizobium, Cupriavidus, Derxia, Helicobacter, Herbaspirilium, Hydrogenobacter, Hydrogenobaculum, Hydrogenophaga, Hydrogenophilus, Hydrogenothermus, Hydrogenovibrio, Ideonella sp. 01, Kyrpidia, Metallosphaera, Methanobrevibacter, Myobacterium, Nocardia, Oligotropha, Paracoccus, Pelomonas, Polaromonas, Pseudomonas, Pseudonocardia, Rhizobium, Rhodococcus, Rhodopseudomonas, Rhodospirillum, Streptomyces, Thiocapsa, Treponema, Variovorax, Xanthobacter и Wautersia.
21
9. Способ по любому из пп. 1 или 2, отличающийся тем, что водород-окисляющая бактерия дополнительно генетически модифицирована для увеличения экспрессии относительно бактерии дикого типа фермента Е синтазы воскового эфира (ЕС 2.3.1.75).
26
10. Способ по любому из пп. 1 или 2, отличающийся тем, что водород-окисляющая бактерия дополнительно генетически модифицирована для увеличения экспрессии относительно бактерии дикого типа фермента Е метилтрансферазы жирной кислоты (ЕС 2.1.1.15).
11. Способ по любому из пп. 1 или 2, отличающийся тем, что бактерия содержит экзогенную нуклеотидную последовательность, кодирующую АСР, Sfa или их комбинации.