ЛЕЧЕНИЕ ПАЦИЕНТОВ С ДИАГНОЗОМ АДЕНОКАРЦИНОМА ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МОНОКЛОНАЛЬНЫХ АНТИТЕЛ К РЕЦЕПТОРУ ЭПИДЕРМАЛЬНОГО ФАКТОРА РОСТА (EGFR)

1. Способ лечения популяции пациентов с диагнозом аденокарцинома протоков поджелудочной железы (PDAC), причем указанная аденокарцинома протоков поджелудочной железы экспрессирует белок дикого типа по меньшей мере одного члена семейства генов RAS, выбранного из KRAS дикого типа, HRAS дикого типа или NRAS дикого типа, причем указанный способ включает введение указанному пациенту моноклонального антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или пептида, который специфично связывается с рецептором эпидермального фактора роста (EGFR), при этом указанное антитело представляет собой химерное или гуманизированное моноклональное антитело, которое содержит следующие определяющие комплементарность участки (CDR):
CDR1 легкой цепи: RSSQNIVHSNGNTYLD (SEQ ID NO: 1),
CDR2 легкой цепи: KVSNRFS (SEQ ID NO: 2),
CDR3 легкой цепи: FQYSHVPWT (SEQ ID NO: 3),
CDR1 тяжелой цепи: NYYIY (SEQ ID NO: 4),
CDR2 тяжелой цепи: GINPTSGGSNFNEKFKT (SEQ ID NO: 5),
CDR3 тяжелой цепи: QGLWFDSDGRGFDF (SEQ ID NO: 6).
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанный KRAS дикого типа характеризуется тем, что он имеет последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 24, указанный HRAS дикого типа характеризуется тем, что он имеет последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 8 или SEQ ID NO: 25, и указанный NRAS дикого типа характеризуется тем, что он имеет последовательность, соответствующую SEQ ID NO: 9.
3. Способ по п. 1 или 2, отличающийся тем, что указанный KRAS дикого типа характеризуется способностью ингибировать путь передачи сигнала, катализируя гидролиз гуанозинтрифосфатов (ГТФ) до гуанозиндифосфатов.
4. Способ по п. 3, отличающийся тем, что указанный NRAS или HRAS дикого типа не содержит мутации в кодоне G12, G13 или Q61.
5. Способ по п. 3, отличающийся тем, что указанный KRAS дикого типа не содержит мутации в любом из аминокислотных остатков кодона G12, G13, Q61, А146 или D154.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что отсутствующая мутация в KRAS выбрана из группы, состоящей из G12D, G12A, G12R, G12C, G12S, G12V и G13D.
7. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанное химерное моноклональное антитело содержит вариабельную область легкой цепи, соответствующую DVLMTQIPLSLPVSLGDQASISCRSSQNIVHSNGNTYLDWYLQKPGQSPNLLIYKVSNRFSG VPDRFRGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCFQYSHVPWTFGGGTKLEIKRA (SEQ ID NO: 10), и вариабельную область тяжелой цепи, соответствующую QVQLQQPGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTNYYIYWVKQRPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNE KFKTKATLTVDESSTTAYMQLSSLTSEDSAVYYCTRQGLWFDSDGRGFDFWGQGTTLTVSS (SEQ ID NO: 11).
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
8. Способ по любому из пп. 1-6, отличающийся тем, что указанное гуманизированное моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид содержит вариабельную область легкой цепи, соответствующую DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQNIVHSNGNTYLDWYQQTPGKAPKLLIYKVSNRFSG VPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCFQYSHVPWTFGQGTKLQITRE (SEQ ID NO: 12), и вариабельную область тяжелой цепи, соответствующую: QVQLQQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTNYYIYWVRQAPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNE KFKTXXTITVDESXXTAYMELSSLRSEDTAFYFCXRQGLWFDSDGRGFDFWGQGSTVTV SS, где X представляет собой R или K; X представляет собой V или А; X представляет собой Т или S; X представляет собой N или Т; и X представляет собой А или Т (SEQ ID NO: 13); или
вариабельную область легкой цепи, соответствующую DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQNIVHSNGNTYLDWYQQTPGKAPKLLIYKVSNRFSGVP SRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCFQYSHVPWTFGQGTKLQITRE (SEQ ID NO: 14), и вариабельную область тяжелой цепи, соответствующую QVQLQQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTNYYIYWVRQAPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNEKF KTRVTITVDESSTTAYMELSSLRSEDTAFYFCTRQGLWFDSDGRGFDFWGQGSTVTVSS (SEQ ID NO: 15); или
вариабельную область легкой цепи, соответствующую DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQNIVHSNGNTYLDWYQQTPGKAPKLLIYKVSNRFSGVP SRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCFQYSHVPWTFGQGTKLQITRE (SEQ ID NO: 16), и вариабельную область тяжелой цепи, соответствующую QVQLQQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTNYYIYWVRQAPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNEKF KTKATITVDESSTTAYMELSSLRSEDTAFYFCTRQGLWFDSDGRGFDFWGQGSTVTVSS (SEQ ID NO: 17); или
вариабельную область легкой цепи, соответствующую DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQNIVHSNGNTYLDWYQQTPGKAPKLLIYKVSNRFSGVP SRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCFQYSHVPWTFGQGTKLQITRE (SEQ ID NO: 18), и вариабельную область тяжелой цепи, соответствующую QVQLQQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTNYYIYWVRQAPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNEKF KTRVTITVDESSTTAYMELSSLRSEDTAFYFCARQGLWFDSDGRGFDFWGQGSTVTVSS (SEQ ID NO: 19); или
вариабельную область легкой цепи, соответствующую DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQNIVHSNGNTYLDWYQQTPGKAPKLLIYKVSNRFSGVP SRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCFQYSHVPWTFGQGTKLQITRE (SEQ ID NO: 20), и вариабельную область тяжелой цепи, соответствующую QVQLQQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTNYYIYWVRQAPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNEKF KTRVTITVDESTNTAYMELSSLRSEDTAFYFCTRQGLWFDSDGRGFDFWGQGSTVTVSS (SEQ ID NO: 21); или
вариабельную область легкой цепи, соответствующую DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQNIVHSNGNTYLDWYQQTPGKAPKLLIYKVSNRFSGVP SRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCFQYSHVPWTFGQGTKLQITRE (SEQ ID NO: 22), и вариабельную область тяжелой цепи, соответствующую QVQLQQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTNYYIYWVRQAPGQGLEWIGGINPTSGGSNFNEKFKTKATITVDESTNTAYMELSSLRSEDTAFYFCTRQGLWFDSDGRGFDFWGQGSTVTVSS (SEQ ID NO: 23).
9. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанные константные области тяжелой цепи указанного антитела, его антигенсвязывающего фрагмента или пептида, содержат аминокислотную последовательность гамма-1 цепи иммуноглобулина человека, и указанные константные области легкой цепи указанного антитела содержат аминокислотную последовательность каппа-цепи иммуноглобулина человека.
10. Способ по любому из пп. 1-6, отличающийся тем, что указанное моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид вырабатывается клеточной линией h-R3, депонированной под номером доступа ЕСАСС 951110101.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что указанное моноклональное антитело представляет собой нимотузумаб.
12. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанное моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид обладают по меньшей мере одним из следующих свойств:
a). способны ингибировать связывание EGF с его рецептором;
b). способны ингибировать рост EGF-зависимых опухолевых клеток;
c). способны вызвать антитело-зависимую клеточную цитотоксичность;
d). имеют противоангиогенное действие;
e). имеют проапоптотическое действие;
f). влияют на CD133-положительные раковые стволовые клетки;
g). способны вызывать комплемент-опосредованную цитотоксическую активность;
h). индуцируют остановку клеточного цикла;
i). способны оказывать синергетическое действие при ингибировании пролиферации опухолевых клеток в комбинации с GM3 N-ацетилганглиозидом;
j). способны оказывать синергетическое действие при ингибировании пролиферации опухолевых клеток в комбинации с моноклональным антителом против EGF;
k). способны восстанавливать микросателлитную нестабильность опухоли, вызванную радиотерапией.
13. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанное моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид распознают EGFR человека, присутствующий в нормальных клетках, и EGFR, присутствующий в опухолевых клетках.
14. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанную популяцию пациентов выбирают путем определения наличия или отсутствия мутированного варианта KRAS и/или KRAS дикого типа, мутированного варианта HRAS или HRAS дикого типа, мутированного варианта NRAS или NRAS дикого типа в образце опухоли PDAC каждого пациента, причем пациентов, в образцах опухолей которых детектируют мутированные варианты KRAS, HRAS или NRAS и/или не детектируют KRAS, HRAS или NRAS дикого типа, не отбирают для лечения, тогда как пациентов, в образцах опухолей которых детектируют KRAS, HRAS или NRAS дикого типа, и/или не детектируют мутированные варианты KRAS, HRAS или NRAS, отбирают для лечения.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что определение экспрессии KRAS, HRAS или NRAS дикого типа в образце опухоли PDAC включает амплификацию нуклеиновой кислоты KRAS, HRAS или NRAS из указанной опухоли и секвенирование указанной нуклеиновой кислоты, и/или включает детектирование мутированного варианта полипептида и/или полипептида дикого типа KRAS, HRAS или NRAS в образце указанной опухоли PDAC.
16. Способ по любому из предшествующих пунктов, дополнительно включающий совместное введение противоракового агента.
17. Способ по п. 16, отличающийся тем, что указанный противораковый агент выбран из группы, состоящей из химиотерапевтического агента, антинеопластического агента и биологической молекулы.
18. Способ по любому из пп. 16-17, отличающийся тем, что указанный противораковый агент вводят до, одновременно и/или после совместного введения моноклонального антитела, его антигенсвязывающего фрагмента или пептида.
19. Способ по любому из пп. 16-18, отличающийся тем, что указанный противораковый агент выбран из гемтабицина, FOLFIRINOX, эрлотиниба, 5-фторурацила, паклитаксела, наб-паклитаксела, доцетаксела, капецитабина, оксалиплатина, цисплатина, FOLFOXIRI, абраксана, антитела к CD40, ореговомаба, нелфинавира, цетуксимаба, тегафура, лейковорина.
20. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что у указанных пациентов была диагностирована местно-распространенная и/или метастатическая аденокарцинома протоков поджелудочной железы (PDAC).
21. Способ по любому из пп. 11-20, отличающийся тем, что указанное антитело представляет собой нимотузумаб, и указанных пациентов лечат с использованием нимотузумаба в диапазоне дозировок от 200 до 400 мг один раз в неделю.
22. Способ по п. 21, отличающийся тем, что еженедельное лечение с использованием дозировок нимотузумаба от 200 до 400 мг осуществляют в течение периода времени в 12, 24 или 36 недель.
23. Способ по п. 22, отличающийся тем, что после еженедельного лечения в течение 12, 24 или 36 недель указанный пациент получает нимотузумаб в дозировке от 200 до 400 мг один раз каждые 3 недели.
24. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанное моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид вводят путем внутривенной инфузии.
25. Фармацевтическая композиция, содержащая моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид, или нуклеиновую кислоту, кодирующую моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид, определенные в любом из предшествующих пунктов, для применения в лечении популяции пациентов, у которых была диагностирована аденокарцинома протоков поджелудочной железы (PDAC), причем указанная аденокарцинома протоков поджелудочной железы экспрессирует белок дикого типа по меньшей мере одного члена семейства генов RAS, выбранного из KRAS дикого типа, NRAS дикого типа и HRAS дикого типа.
26. Фармацевтическая композиция для применения по п. 25, дополнительно содержащая по меньшей мере одно фармацевтическое вспомогательное вещество и/или по меньшей мере один противораковый агент.
27. Фармацевтическая композиция для применения по п. 25, отличающаяся тем, что указанный по меньшей мере один противораковый агент выбран из группы, состоящей из химиотерапевтического агента, антинеопластического агента и биологической молекулы.
28. Фармацевтическая композиция для применения по п. 26 или 27, отличающаяся тем, что указанный противораковый агент выбран из гемтабицина, FOLFIRINOX, эрлотиниба, 5-фторурацила, паклитаксела, наб-паклитаксела, доцетаксела, капецитабина, оксалиплатина, цисплатина, FOLFOXIRI, абраксана, антитела к CD40, ореговомаба, нелфинавира, цетуксимаба, тегафура, лейковорина.
29. Фармацевтическая композиция для применения по любому из пп. 25-28, отличающаяся тем, что указанная композиция содержит дозировку от 200 до 400 мг.
30. Фармацевтическая композиция для применения по п. 29, отличающаяся тем, что указанное антитело представляет собой нимотузумаб.
31. Моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид, который специфично связывается с рецептором эпидермального фактора роста (EGFR), для применения в лечении популяции пациентов, у которых была диагностирована аденокарцинома протоков поджелудочной железы (PDAC), причем указанная аденокарцинома протоков поджелудочной железы экспрессирует белок дикого типа по меньшей мере одного члена семейства генов RAS, выбранного из группы, состоящей из KRAS дикого типа, NRAS дикого типа и HRAS дикого типа, и при этом указанное антитело представляет собой химерное или гуманизированное антитело, которое содержит следующие определяющие комплементарность участки (CDR):
CDR1 легкой цепи: RSSQNIVHSNGNTYLD (SEQ ID NO: 1),
CDR2 легкой цепи: KVSNRFS (SEQ ID NO: 2),
CDR3 легкой цепи: FQYSHVPWT (SEQ ID NO: 3),
CDR1 тяжелой цепи: NYYIY (SEQ ID NO: 4),
CDR2 тяжелой цепи: GINPTSGGSNFNEKFKT (SEQ ID NO: 5),
CDR3 тяжелой цепи: QGLWFDSDGRGFDF (SEQ ID NO: 6).
32. Способ прогнозирования невосприимчивости пациента, страдающего аденокарциномой протоков поджелудочной железы (PDAC), к лечению моноклональным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом или пептидом, определенными в любом из пп. 1-10, включающий определение наличия или отсутствия мутации KRAS, HRAS или NRAS в опухоли PDAC у указанного пациента; при этом наличие мутации KRAS, HRAS или NRAS указывает на то, что указанный пациент будет невосприимчив к лечению указанным антителом, его антигенсвязывающим фрагментом или пептидом.
33. Способ по п. 32, отличающийся тем, что указанная мутация KRAS находится в кодоне по меньшей мере одного аминокислотного остатка G12, G13, Q61, А146 или D154 последовательности SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 24.
34. Способ по п. 32, отличающийся тем, что указанная мутация NRAS или HRAS находится в кодоне по меньшей мере одного аминокислотного остатка G12, G13 или Q61 в последовательности SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 25 или SEQ ID NO: 9.
35. Способ по любому из пп. 32-34, отличающийся тем, что у указанного пациента была диагностирована местно-распространенная и/или метастатическая аденокарцинома протоков поджелудочной железы (PDAC).
36. Способ прогнозирования невосприимчивости аденокарциномы протоков поджелудочной железы (PDAC) к лечению моноклональным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом или пептидом, определенными в любом из пп. 1-14, включающий определение наличия или отсутствия мутации KRAS, HRAS или NRAS в указанной опухоли PDAC; при этом наличие мутации KRAS, HRAS или NRAS указывает на то, что указанная опухоль будет невосприимчива к лечению указанным антителом.
37. Способ по п. 36, отличающийся тем, что указанная мутация NRAS или HRAS находится в кодоне по меньшей мере одного аминокислотного остатка G12, G13 или Q61 последовательности SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 25 или SEQ ID NO: 9.
38. Способ по п. 36, отличающийся тем, что указанная мутация KRAS находится в кодоне по меньшей мере одного аминокислотного остатка G12, G13, Q61, А146 или D154 последовательности SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 24.
39. Способ по любому из пп. 36-38, отличающийся тем, что определение наличия или отсутствия мутации KRAS, HRAS или NRAS в опухоли PDAC включает амплификацию нуклеиновой кислоты KRAS, HRAS или NRAS из указанной опухоли и секвенирование указанной нуклеиновой кислоты, и/или включает детектирование мутированного варианта полипептида KRAS, HRAS или NRAS в образце указанной опухоли.
40. Способ лечения популяции пациентов, у которых была диагностирована аденокарцинома протоков поджелудочной железы (PDAC), причем указанная аденокарцинома протоков поджелудочной железы экспрессирует белок дикого типа по меньшей мере одного члена семейства генов RAS, выбранного из KRAS дикого типа, HRAS дикого типа или NRAS дикого типа, при этом указанный способ включает введение указанному пациенту нуклеиновой последовательности, кодирующей моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или пептид, который специфично связывается с рецептором эпидермального фактора роста (EGFR), причем указанное антитело представляет собой химерное или гуманизированное моноклональное антитело, которое содержит следующие определяющие комплементарность участки (CDR):
CDR1 легкой цепи: RSSQNIVHSNGNTYLD (SEQ ID NO: 1),
CDR2 легкой цепи: KVSNRFS (SEQ ID NO: 2),
CDR3 легкой цепи: FQYSHVPWT (SEQ ID NO: 3),
CDR1 тяжелой цепи: NYYIY (SEQ ID NO: 4),
CDR2 тяжелой цепи: GINPTSGGSNFNEKFKT (SEQ ID NO: 5),
CDR3 тяжелой цепи: QGLWFDSDGRGFDF (SEQ ID NO: 6).