ШЕРОХОВАТЫЕ МУТАНТЫ Bacillus И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ ДЛЯ УСКОРЕНИЯ РОСТА РАСТЕНИЙ, УЛУЧШЕНИЯ ЗДОРОВЬЯ РАСТЕНИЙ И БОРЬБЫ С БОЛЕЗНЯМИ И ВРЕДИТЕЛЯМИ

1. Композиция, содержащая спорообразующие бактериальные клетки с мутацией в ортологе swrA, уменьшающей способность к роению бактериальных клеток по сравнению с изогенными бактериальными клетками без мутации, и в которой по меньшей мере примерно 70% бактериальных клеток являются спорами.
2. Композиция по п.1, для которой способность к роению измеряют на основании роста на нежидкой поверхности.
3. Композиция по п.1, в которой спорообразующие бактериальные клетки с мутацией относятся к виду Bacillus в кладе Bacillus subtilis.
4. Композиция по п.1, в которой спорообразующие бактериальные клетки с мутацией составляют по меньшей мере 3,5% от всех бактериальных клеток в композиции.
5. Композиция по п.3, в которой спорообразующие бактериальные клетки с мутацией содержат ортолог sfp дикого типа.
6. Композиция по п.5, в которой спорообразующие бактериальные клетки с мутацией дополнительно содержат ортолог degQ дикого типа и ортолог epsC дикого типа.
7. Композиция по п.6, в которой каждый из ортолога sfp, ортолога degQ и ортолога epsC имеет по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с геном sfp, геном degQ и геном epsC, соответственно, из любой из B. subtilis, B. amyloliquefaciens, B. pumilus, B. licheniformis или B. atrophaeus.
8. Композиция по п.6, в которой по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности имеется с геном sfp, геном degQ и геном epsC из любого из B. subtilis штамма 3610, B. amyloliquefaciens штамма FZB42, B. pumilus штамма SAFR-032, B. licheniformis штамма 14580 или B. atrophaeus штамма 1942.
9. Композиция по п.3, в которой мутация дополнительно приводит к образованию более прочной биопленки по сравнению с изогенными бактериальными клетками без мутации.
10. Композиция по п.9, у которой более прочная биопленка является более плоской, сухой и плотной, чем биопленка изогенных бактериальных клеток без мутации.
11. Композиция по п.10, у которой более прочная биопленка содержит клетки с диаметром, по меньшей мере примерно в 1,5 раза превышающим диаметр изогенных бактериальных клеток без мутации.
12. Композиция по п.11, у которой более прочная биопленка содержит клетки, имеющие дополнительную клеточную оболочку по сравнению с изогенными бактериальными клетками без мутации.
13. Композиция по п.10, в которой бактериальные клетки образуют немногочисленные цепочки в жидкой культуре, но не агрегируют.
14. Композиция по любому из пп.3-13, в которой ортолог swrA имеет по меньшей мере примерно 90% идентичности с геном swrA дикого типа из того же вида Bacillus, что и бактериальные клетки с мутацией.
15. Композиция по п.14, в которой ортолог swrA имеет по меньшей мере примерно 95% идентичности с геном swrA дикого типа из того же вида Bacillus, что и бактериальные клетки с мутацией.
16. Композиция по п.15, в которой ген swrA дикого типа относится к тому же штамму, что и бактериальные клетки с мутацией.
17. Композиция по п.15, в которой вид выбран из группы, состоящей из B. pumilus, B. atrophaeus, B. amyloliquefaciens, B. subtilis и B. licheniformis.
18. Композиция по п.17, в которой вид представляет собой B. subtilis или B. amyloliquefaciens.
19. Композиция по п.3, в которой ортолог имеет по меньшей мере примерно 90% идентичности с любой из нуклеотидных последовательностей swrA, приведенных в SEQ ID NOS: 1 и 5-10.
20. Композиция по п.3, в которой мутация находится в положении, соответствующем одному или более из положений 26-34 в гене swrA, приведенном в SEQ ID NO. 1, или в положении, соответствующем одному или более из положений 1-3 в гене swrA, приведенном в SEQ ID NO: 1.
21. Композиция по п.20, в которой мутация представляет собой вставку или делецию.
22. Способ обработки растения для ускорения роста растения, улучшения здоровья растения или борьбы с болезнями растения, включающий нанесение композиции по любому из пп.1-20 на растение, часть растения и/или место нахождения растения.
23. Способ по п.22, включающий нанесение композиции на почву.
24. Способ по п.23, в котором композицию наносят до, во время или после того, как растение или часть растения соприкасается с почвой.
25. Способ по п.22, в котором часть растения выбрана из группы, состоящей из семени, корня, клубнелуковицы, клубня, луковицы и корневища.
26. Композиция, содержащая спорообразующие бактериальные swrA' клетки, при этом по меньшей мере примерно 70% от всех бактериальных клеток в композиции являются спорами.
27. Композиция по п.26, в которой swrA' клетки составляют по меньшей мере 3,5% от всех бактериальных клеток в композиции.
28. Применение спорообразующих бактериальных клеток с мутацией в ортологе swrA, снижающей способность к роению у бактериальных клеток, для ускорения роста растения, улучшения здоровья растения, либо борьбы с болезнями или вредителями растения.
29. Применение по п.28, в котором бактериальные клетки относятся к виду Bacillus в кладе Bacillus subtilis.
30. Применение по п.29, в котором ортолог swrA имеет по меньшей мере примерно 90% идентичности с геном swrA дикого типа из того же вида Bacillus, что и бактериальные клетки с мутацией.
31. Применение по п.30, в котором ген swrA дикого типа относится к тому же штамму, что и бактериальные клетки с мутацией.
32. Применение по п.28, в котором ортолог swrA имеет по меньшей мере примерно 90% идентичности с одной из нуклеотидных последовательностей swrA, приведенных в SEQ ID NOS: 1 и 5-10.
33. Применение по п.29, в котором вид выбирают из группы, состоящей из B. pumilus, B. atrophaeus, B. amyloliquefaciens, B. subtilis и B. licheniformis.
34. Применение по п.33, в котором вид представляет собой B. subtilis или B. amyloliquefaciens.
35. Применение по п.28, в котором мутация находится в положении, соответствующем одному или более из положений 26-34 в гене swrA, приведенном в SEQ ID NO: 1, или в положении, соответствующем одному или более из положений 1-3 в гене swrA, приведенном в SEQ ID NO: 1.
36. swrA' клетки Bacillus subtilis QST713, депонированные под регистрационным номером NRRL B-50420.
37. swrA' клетки по п.36, содержащие изменение по меньшей мере одной пары оснований нуклеиновой кислоты в стартовом кодоне и/или вставку или делецию по меньшей мере одной пары оснований нуклеиновой кислоты в гене swrA.
38. swrA' клетки по п.37, в которых вставка или делеция в гене swrA имеет место в одной или более пар оснований в положениях 26-34 в SEQ ID NO. 1.
39. swrA' клетки по п.36, выбранные из группы, состоящей из штамма AQ30002 (также называемого QST30002) и штамма AQ30004 (также называемого QST30004), депонированных под регистрационными номерами NRRL B-50421 и NRRL B-50455, соответственно.
40. Композиция, содержащая swrA' клетки по любому из пунктов 36-39.
41. Композиция по п.40, дополнительно содержащая по меньшей мере один носитель.
42. Композиция по любому из пп.40-41, дополнительно содержащая по меньшей мере один другой активный ингредиент в дополнение к swrA' клеткам.
43. Композиция по п.42, в которой активный ингредиент представляет собой химическое вещество или другой штамм бактерий.
44. Композиция по п.42, в которой ингредиент выбран из группы, состоящей из гербицида, фунгицида, бактерицида, инсектицида, нематоцида, майтицида, регулятора роста растений, стимулятора роста растений и удобрения.
45. Способ обработки растения для ускорения роста растения или улучшения здоровья растения и борьбы с болезнями или вредителями растения, включающий нанесение swrA' клеток или композиции по любому из пп. 36-44 на растение, на часть растения и/или на место нахождения растения.
46. Способ по п.45, включающий нанесение композиции на почву.
47. Способ по п.46, в котором композицию наносят до, во время или после того, как растение или часть растения соприкасается с почвой.
48. Способ по п.46 или 47, включающий нанесение композиции методом нанесения, выбранным из группы, состоящей из орошения почвы, внесения в почву при вспахивании, инъекции или внесения в борозды.
49. Способ по п.45, в котором часть растения выбирают из группы, состоящей из семени, корня, клубнелуковицы, клубня, луковицы и корневища.
50. Способ по п.45, в котором вредитель растения является паразитической нематодой растения.
51. Способ по п.45, в котором болезнь растения вызвана передающимся с почвой патогеном.
52. Способ по п.51, в котором передающийся с почвой патоген выбирают из группы, состоящей из Aphanomyces cochlioides, Cylindrocladium parasiticum, Fusarium avenaceum, Fusarium culmorum, Phytophthora capsici, Phytophthora cinnamomi, Pythium ultimum, Rhizoctonia solani, Sclerotinia sclerotiorum, Sclerotinia minor, Sclerotium rolfsii, Ustilago hordei, Stagonospora nodorum, Aspergillus fumigatus, Verticillium dahliae, Tapesia yallunde, Alternaria alternata и Penicillium expansum.