СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ЗАБОЛЕВАНИЙ, ВЫЗЫВАЕМЫХ C. PERFRINGENS, У ЖИВОТНЫХ

1. Способ выявления заболеваний, вызываемых C. perfringens, у животных, при этом способ включает:
a) сбор материала образца от конкретного животного или от конкретной группы животных в последовательные моменты времени;
b) определение количества первого маркера и второго маркера, содержащихся в материале образца; и
c) определение соотношения уровней первого маркера и второго маркера, содержащихся в материале образца;
где первый маркер содержит полинуклеотидную последовательность, специфичную для подвида C. perfringens, вызывающего целевое заболевание;
а второй маркер содержит полинуклеотид, специфичный для вида C. perfringens; и
где увеличение соотношения уровней первого маркера и второго маркера в материале анализируемого образца с течением времени указывает на целевое заболевание.
2. Способ по п. 1, где первый маркер представляет собой либо маркерный ген, кодирующий специфический токсин, либо остров патогенности.
3. Способ по любому из предыдущих пунктов, где первый маркер расположен на плазмиде с геном токсина C. perfringens, а второй маркер расположен на хромосоме C. perfringens.
4. Способ по любому из предыдущих пунктов, где первый маркер выбран из группы, состоящей из cpe, бета-токсина (cpb), бета2-токсина (cpb2), эпсилон-токсина (etx), netF и netB и их гомологов и фрагментов.
5. Способ по любому из предыдущих пунктов, где второй маркер представляет собой cpa.
6. Способ по любому из предыдущих пунктов, где материал образца получен от стада птиц.
7. Способ по любому из предыдущих пунктов, где материал образца представляет собой объединенный образец, выбранный из группы, состоящей из образцов пыли, образцов помета, образцов жидкого навоза, образцов меха, образцов перьев, образцов кожи и образцов экскрементов организма и их растворов или суспензий.
8. Способ по любому из предыдущих пунктов, где материал образца представляет собой объединенный образец фекалий.
9. Способ по любому из предыдущих пунктов, где маркерные гены, содержащиеся в материале образца, выявляют и определяют количественно посредством ПЦР.
10. Способ по любому из предыдущих пунктов, где заболевание, вызываемое C. perfringens, представляет собой некротический энтерит, предпочтительно в субклиническом или латентном состоянии.
11. Способ по п. 10, где некротический энтерит находится в субклиническом или латентном состоянии.
12. Способ по любому из предыдущих пунктов, где первый маркер представляет собой netB, второй маркер представляет собой cpa, а заболевание, вызываемое C. perfringens, представляет собой некротический энтерит.
13. Способ по п. 12, где олигонуклеотиды, выбранные из группы, состоящей из:
a) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO:3;
b) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 4;
c) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 5;
d) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 6;
e) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 7;
f) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO:8;
g) олигонуклеотидов, комплементарных олигонуклеотидам в соответствии с (a)-(f);
h) олигонуклеотидов, содержащих любой из олигонуклеотидов в соответствии с (a) - (g) и удлиненных на не более чем 5 пар оснований по сравнению с олигонуклеотидами в соответствии с (a)-(g);
применяют в качестве праймера для ПЦР и/или в качестве зонда для ПЦР.
14. Диагностический набор, содержащий праймер и зонды для выявления netB и cpa.
15. Диагностический набор по п. 14, содержащий один или более олигонуклеотидов, выбранных из группы, состоящей из:
a) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO:3;
b) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 4;
c) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 5;
d) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 6;
e) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO: 7;
f) олигонуклеотидов, характеризующихся по меньшей мере 80%, предпочтительно по меньшей мере 85%, 90% или 95%, наиболее предпочтительно 100% идентичностью последовательности с полинуклеотидом, представленным под SEQ ID NO:8;
g) олигонуклеотидов, комплементарных олигонуклеотидам в соответствии с (a)-(f);
h) олигонуклеотидов, содержащих любой из олигонуклеотидов в соответствии с (a)-(g) и удлиненных на не более чем 5 нуклеотидов по сравнению с олигонуклеотидами в соответствии с (a)-(g).