СПОСОБ УВЕЛИЧЕНИЯ ЗАНЯТОСТИ УЧАСТКОВ N-ЛИКОЗИЛИРОВАНИЯ НА ТЕРАПЕВТИЧЕСКИХ ГЛИКОПРОТЕИНАХ, ПРОДУЦИРУЕМЫХ В P PASTORIS

1. Способ получения гетерологичного гликопротеина, включающий:
(a) предоставление клетки-хозяина, содержащей по меньшей мере одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую гетерологичную состоящую из одной субъединицы олигосахарилтрансферазу, и молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую гетерологичный гликопротеин, и где экспрессированы эндогенные гены клетки-хозяина, кодирующие белки, составляющие эндогенный ОТазный комплекс; и
(b) культивирование клетки-хозяина в условиях экспрессии гетерологичного гликопротеина с получением гетерологичного гликопротеина.
2. Способ по п.1, где состоящая из одной субъединицы олигосахарилтрансфераза представляет собой белок STT3A, белок STT3B, белок STT3C, белок STT3D вида Leishmania sp. или их сочетания.
3. Способ по п.1, где состоящая из одной субъединицы олигосахарилтрансфераза представляет собой белок STT3D Leishmania major.
4. Способ по п.1, где по меньшей мере 70% гетерологичных гликопротеинов, продуцируемых клеткой-хозяином, содержат полностью занятые участки N-гликозилирования.
5. Способ по п.1, где клетка-хозяин генетически сконструирована для продуцирования гликопротеинов, содержащих один или более характерных для млекопитающих или для человека N-гликанов.
6. Способ по п.1, где гетерологичный белок представляет собой эритропоэтин (EPO); цитокины, такие как интерферон α, интерферон β, интерферон γ и интерферон ω; и гранулоцитарный колониестимулирующий фактор (GCSF); гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF); факторы свертывания, такие как фактор VIII, фактор IX и белок C человека; антитромбин III; тромбин; α-цепь растворимого рецептора IgE; иммуноглобулины, такие как IgG, фрагменты IgG, слияния IgG и IgM; иммуноадгезины и другие слитые с Fc белки, такие как слитые белки растворимого рецептора TNF-Fc; слитые белки RAGE-Fc; интерлейкины; урокиназу; химазу; ингибитор трипсина мочи; IGF-связывающий белок; эпидермальный фактор роста; фактор высвобождения гормона роста; слитый белок аннексина V; ангиостатин; фактор роста эндотелия сосудов-2; миелоидный предшественник ингибирующего фактора-1; остеопротегерин; α-1-антитрипсин; α-фетопротеины; ДНКазу II; домен "двойной петли" 3 плазминогена человека; глюкоцереброзидазу; связывающий TNF белок 1; фолликулостимулирующий гормон; ассоциированный с цитотоксическими T-лимфоцитами антиген 4-Ig; трансмембранный активатор и модулятор кальция и лиганд циклофилина; глюкагоноподобный белок 1 или агонист рецептора IL-2.
7. Способ по п.1, где гетерологичный белок представляет собой антитело к Her2, антитело к RSV (респираторно-синцитиальному вирусу), антитело к TNFα, антитело к VEGF, антитело к рецептору CD3, антитело 7E3 к CD41, антитело к CD25, антитело к CD52, антитело к CD33, антитело к IgE, антитело к CD11a, антитело к рецептору EGF или антитело к CD20.
oryzae, Trichoderma reesei, Chrysosporium lucknowense
8. Способ по п.1, где клетка-хозяин выбрана из группы, состоящей из Pichia pastoris, Pichia finlandica, Pichiatrehalophila, Pichia koclamae, Pichia membranaefaciens, Pichia opuntiae, Pichia thermotolerans, Pichia salictaria, Pichiaguercuum, Pichia pijperi, Pichia stiptis, Pichia methanolica, Pichia minuta (Ogataea minuta, Pichia lindneri), видовPichia, Saccharomyces cerevisiae, видовSaccharomyces, Hansenulapolymorpha, видовKluyveromyces, Kluyveromyces lactis, Candidaalbicans,Aspergillus nidulans, Aspergillusniger, Aspergillus, видовFusarium, Fusarium gramineum, Fusarium venenatum, Neurosporacrassa, клеток растений, клеток насекомых и клеток млекопитающих.
9. Способ по п.1, где клетка-хозяин представляет собой мутант P. pastoris по och1.
10. Способ получения композиции гликопротеина, в котором по меньшей мере 70% участков N-гликозилирования на гликопротеинах в композиции заняты N-гликанами, включающий:
(a) предоставление рекомбинантной клетки-хозяина, содержащей по меньшей мере одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую гетерологичную состоящую из одной субъединицы олигосахарилтрансферазу, и молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую гликопротеин, и где экспрессированы гены клетки-хозяина, кодирующие эндогенный ОТазный комплекс; и
(b) культивирование рекомбинантной клетки-хозяина в условиях экспрессии гликопротеина с получением композиций, в которых по меньшей мере 70% участков N-гликозилирования на гликопротеинах в композиции заняты N-гликанами.
11. Способ по п.10, где состоящая из одной субъединицы олигосахарилтрансфераза представляет собой белок STT3A, белок STT3B, белок STT3C, белок STT3D вида Leishmaniaили их сочетания.
12. Способ по п.10, где состоящая из одной субъединицы олигосахарилтрансфераза представляет собой белок STT3D Leishmania major.
13. Способ по п.10, где гетерологичный белок представляет собой эритропоэтин (EPO); цитокины, такие как интерферон α, интерферон β, интерферон γ и интерферон ω; и гранулоцитарный колониестимулирующий фактор (GCSF); гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF); факторы свертывания, такие как фактор VIII, фактор IX и белок C человека; антитромбин III; тромбин; α-цепь растворимого рецептора IgE; иммуноглобулины, такие как IgG, фрагменты IgG, слияния IgG и IgM; иммуноадгезины и другие слитые с Fc белки, такие как слитые белки растворимого рецептора TNF-Fc; слитые белки RAGE-Fc; интерлейкины; урокиназу; химазу; ингибитор трипсина мочи; IGF-связывающий белок; эпидермальный фактор роста; фактор высвобождения гормона роста; слитый белок аннексина V; ангиостатин; фактор роста эндотелия сосудов-2; миелоидный предшественник ингибирующего фактора-1; остеопротегерин; α-1-антитрипсин; α-фетопротеины; ДНКаза II; домен "двойной петли" 3 плазминогена человека; глюкоцереброзидазу; связывающий TNF белок 1; фолликулостимулирующий гормон; ассоциированный с цитотоксическими T-лимфоцитами антиген 4-Ig; трансмембранный активатор и модулятор кальция и лиганд циклофилина; глюкагоноподобный белок 1 или агонист рецептора IL-2.
14. Способ по п.10, где гетерологичный белок представляет собой антитело к Her2, антитело к RSV (респираторно-синцитиальному вирусу), антитело к TNFα, антитело к VEGF, антитело к рецептору CD3, антитело 7E3 к CD41, антитело к CD25, антитело к CD52, антитело к CD33, антитело к IgE, антитело к CD11a, антитело к рецептору EGF или антитело к CD20.
15. Способ по п.10, где рекомбинантная клетка-хозяин представляет собой клетку-хозяина дрожжей или нитевидного гриба.
16. Клетка-хозяин, содержащая:
(a) первую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую по меньшей мере одну гетерологичную состоящую из одной субъединицы олигосахарилтрансферазу; и
(b) вторую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую гетерологичный гликопротеин; и
клетка-хозяин экспрессирует гены, кодирующие белки, составляющие эндогенный олигосахарилтрансферазный (ОТазный) комплекс.
17. Клетка-хозяин по п.16, где состоящая из одной субъединицы олигосахарилтрансфераза представляет собой белок STT3A, белок STT3B, белок STT3C или белок STT3D вида Leishmania.
18. Клетка-хозяин по п.16, где состоящая из одной субъединицы олигосахарилтрансфераза представляет собой белок STT3D Leishmania major.
19. Клетка-хозяин по п.16, где клетка-хозяин генетически сконструирована для продуцирования гликопротеинов, содержащих один или более характерных для млекопитающих или для человека N-гликанов.
20. Клетка-хозяин по п.16, где гетерологичный гликопротеин представляет собой эритропоэтин (EPO); цитокины, такие как интерферон α, интерферон β, интерферон γ и интерферон ω; и гранулоцитарный колониестимулирующий фактор (GCSF); гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF); факторы свертывания, такие как фактор VIII, фактор IX и белок C человека; антитромбин III; тромбин; α-цепь растворимого рецептора IgE; иммуноглобулины, такие как IgG, фрагменты IgG, слияния IgG и IgM; иммуноадгезины и другие слитые с Fc белки, такие как слитые белки растворимого рецептора TNF-Fc; слитые белки RAGE-Fc; интерлейкины; урокиназу; химазу; ингибитор трипсина мочи; IGF-связывающий белок; эпидермальный фактор роста; фактор высвобождения гормона роста; слитый белок аннексина V; ангиостатин; фактор роста эндотелия сосудов-2; миелоидный предшественник ингибирующего фактора-1; остеопротегерин; α-1-антитрипсин; α-фетопротеины; ДНКазу II; домен "двойной петли" 3 плазминогена человека; глюкоцереброзидазу; связывающий TNF белок 1; фолликулостимулирующий гормон; ассоциированный с цитотоксическими T-лимфоцитами антиген 4-Ig; трансмембранный активатор и модулятор кальция и лиганд циклофилина; глюкагоноподобный белок 1 или агонист рецептора IL-2.
21. Клетка-хозяин по п.16, где гетерологичный гликопротеин представляет собой антитело к Her2, антитело к RSV (респираторно-синцитиальному вирусу), антитело к TNFα, антитело к VEGF, антитело к рецептору CD3, антитело 7E3 к CD41, антитело к CD25, антитело к CD52, антитело к CD33, антитело к IgE, антитело к CD11a, антитело к рецептору EGF или антитело к CD20.
22. Клетка-хозяин по п.16, где клетка-хозяин выбрана из группы, состоящей из Pichia pastoris, Pichia finlandica, Pichia trehalophila, Pichia koclamae, Pichia membranaefaciens, Pichia opuntiae, Pichia thermotolerans, Pichia salictaria, Pichia guercuum, Pichia pijperi, Pichia stiptis, Pichia methanolica, Pichia minuta (Ogataea minuta, Pichia lindneri), видовPichia, Saccharomyces cerevisiae, видов Saccharomyces, Hansenulapolymorpha, видовKluyveromyces, Kluyveromyces lactis, Candida albicans, Aspergillus nidulans, Aspergillus niger, Aspergillusoryzae, Trichoderma reesei, Chrysosporium lucknowense, видовFusarium, Fusarium gramineum, Fusarium venenatum, Neurosporacrassa, клеток растений, клеток насекомых и клеток млекопитающих.
23. Композиция гликопротеина, содержащая:
5
2
множество антител, где по меньшей мере у 70% молекул антител в композиции заняты оба участка N-гликозилирования и приблизительно от 50 до 70 молярных % N-гликанов представляют собой G0, 15-25 мол.% N-гликанов представляют собой G1 и приблизительно от 5 до 15 мол.% N-гликанов содержат коровую структуру ManGlcNAc, и фармацевтически приемлемый носитель.
24. Композиция по п.23, где антитела содержат антитело, выбранное из группы, состоящей из антитела к Her2, антитела к RSV (респираторно-синцитиальному вирусу), антитела к TNFα, антитела к VEGF, антитела к рецептору CD3, антитела 7E3 к CD41, антитела к CD25, антитела к CD52, антитела к CD33, антитела к IgE, антитела к CD11a, антитела к рецептору EGF и антитела к CD20.
25. Рекомбинантная клетка-хозяин Pichia pastoris с генотипом, который является таким же, как генотип рекомбинантного штамма Pichia pastoris YGLY14401.
26. Применение рекомбинантных Pichia pastoris для получения композиции антител, содержащей антитела к RSV, с профилем N- и O-гликозилирования
Man5
Приблизительно 9,5%
G0
Приблизительно 59,9%
G0F
0%
G1
Приблизительно 20%
G1F
0%
G2
Приблизительно 2,8%
G2F
0%
A2
0%
Гибрид
Приблизительно 7,8%
Занятость O-гликанами (моль/моль)
Приблизительно 3,0
Манноза (одна манноза)
Приблизительно 96%
Маннобиоза (два остатка маннозы)
Приблизительно 4%
и фармацевтически приемлемый носитель.