СПОСОБ ЭКСПРЕСС-АНАЛИЗА ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОЛИМОРФИЗМА ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К ДИАГНОСТИРУЕМОМУ ЗАБОЛЕВАНИЮ И БИОЧИП

1. Способ экспресс-анализа генетического полиморфизма для выявления генетической предрасположенности к диагностируемому заболеванию, включающий верификацию патогенных мутаций в клиническом образце нуклеиновой кислоты (НК) путем дифференцированной гибридизации меченых зондов из НК пациента, предусматривающем следующие стадии:
иммобилизация на микрочипе олигонуклеотидов;
выделение нуклеиновых кислот из образца крови пациента;
получение меченого зонда для гибридизации;
гибридизация полученного меченого зонда с иммобилизованными на микрочипе олигонуклеотидами;
отмывание не специфически связавшегося зонда в условиях, дискриминирующих мутантные генотипы;
сканирование микрочипа и получение результатов;
общая оценка результатов анализа;
отличающийся тем, что на микрочипе иммобилизуют олигонуклеотиды длиной 25-60 оснований, содержащие и не содержащие генетический маркер (по 3 повтора каждого олигонуклеотида), а также олигонуклеотиды из генов домашнего хозяйства человека и из генов других организмов, не имеющих гомологии в человеческом геноме;
меченый зонд получают методом реакции обратной транскрипции с одновременным мечением флуоресцентной меткой для РНК в качестве клинического образца, или мечение методом ник-трансляции для ДНК в качестве клинического образца, причем используют тотальную РНК или ДНК.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что в качестве олигонуклеотидов для иммобилизации на микрочипе, содержащих и не содержащих генетический маркер, используют олигонуклеотиды с последовательностью, приведенной в табл. 1.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что в качестве олигонуклеотидов для иммобилизации на микрочипе, содержащих и не содержащих генетический маркер, используют олигонуклеотиды с последовательностью, приведенной в табл. 2.
4. Способ по любому из пп. 1 или 2, или 3, отличающийся тем, что олигонуклеотиды для иммобилизации на микрочипе из генов домашнего хозяйства человека и из генов других организмов, не имеющих гомологии в человеческом геноме, используют с последовательностью, приведенной в табл. 3.
5. Биочип, представляющий собой подложку с набором иммобилизованных на ней олигонуклеотидов, отличающийся тем, что подложка выполнена из прозрачного материала с покрытием, обеспечивающим прочное связывание олигонуклеотида с поверхностью подложки, набор иммобилизованных олигонуклеотидов включает последовательности длиной 25-60 оснований, содержащие и не содержащие генетический маркер (по 3 повтора каждого олигонуклеотида), а также олигонуклеотиды из генов домашнего хозяйства человека и из генов других организмов, не имеющих гомологии в человеческом геноме.
6. Биочип по п. 6, отличающийся тем, что на подложке иммобилизованы олигонуклеотиды, содержащие генетический маркер, с последовательностью, приведенной в табл. 1.
7. Биочип по п. 6, отличающийся тем, что на подложке иммобилизованы олигонуклеотиды, содержащие генетический маркер, с последовательностью, приведенной в табл. 2.
8. Биочип по любому из пп. 5 или 6, или 7, отличающийся тем, что на подложке иммобилизованы олигонуклеотиды из генов домашнего хозяйства человека и из генов других организмов, не имеющих гомологии в человеческом геноме в последовательности, приведенной в табл. 3.
9. Набор олигонуклеотидов для идентификации патогенных мутаций РМЖ с последовательностями, представленными в табл. 1.
10. Набор олигонуклеотидов для идентификации патогенных мутаций сколиозов с последовательностями, представленными в табл. 2.