КОНЪЮГАТ АНТИТЕЛО ПРОТИВ MUC1-ЛЕКАРСТВЕННОЕ СРЕДСТВО

1. Конъюгат, содержащий антитело, конъюгированное с цитотоксическим средством, где антитело способно связываться с MUC1, и где антитело содержит
(i) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую определяющие комплементарность области (CDR) CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, и
(ii) вариабельную область легкой цепи, содержащую определяющие комплементарность области (CDR) CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6.
2. Конъюгат по п. 1, где аминокислота в положении 8 SEQ ID NO: 2 выбрана из группы, состоящей из глутамина, гистидина, триптофана, тирозина, лизина и аргинина, или где CDR-H2 имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7.
3. Конъюгат по п. 1, где вариабельная область тяжелой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9 или аминокислотную последовательность, являющуюся по меньшей мере на 90% идентичной аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 9.
4. Конъюгат по п. 1, где вариабельная область тяжелой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10 или аминокислотную последовательность, являющуюся по меньшей мере на 90% идентичной аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 10.
5. Конъюгат по п. 1, где вариабельная область легкой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12 или аминокислотную последовательность, являющуюся по меньшей мере на 90% идентичной аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 12.
6. Конъюгат по п. 1, где вариабельная область тяжелой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, и вариабельная область легкой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12.
7. Конъюгат по п. 1, где антитело содержит Fc-область и, предпочтительно, является антителом IgG1-, IgG2- или IgG4-типа.
8. Конъюгат по п. 1, где тяжелая цепь антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, в частности, SEQ ID NO: 22, и легкая цепь антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16.
9. Конъюгат по п. 1, где CDR-H2 имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8.
10. Конъюгат по п. 1, где вариабельная область тяжелой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11 или аминокислотную последовательность, являющуюся по меньшей мере на 90% идентичной аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 11.
11. Конъюгат по п. 10, где вариабельная область легкой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12 или аминокислотную последовательность, являющуюся по меньшей мере на 90% идентичной аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 12.
12. Конъюгат по п. 1, где вариабельная область тяжелой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, и вариабельная область легкой цепи антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12.
13. Конъюгат по п. 1, где антитело содержит Fc-область и, предпочтительно, является антителом IgG1-, IgG2- или IgG4-типа.
14. Конъюгат по п. 1, где тяжелая цепь антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, и легкая цепь антитела имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16.
15. Конъюгат по п. 7, где антитело содержит профиль гликозилирования, имеющий одну или более из следующих характеристик:
(i) детектируемое количество гликанов, несущих остаток GlcNAc в точке ветвления;
(ii) относительное количество гликанов, несущих по меньшей мере один остаток галактозы, по меньшей мере 25% общего количества гликанов, соединенных с участками гликозилирования Fc антитела в композиции.
16. Конъюгат по п. 1, где антитело можно получать посредством продукции в клетке млекопитающего.
17. Конъюгат по п. 1, где антитело можно получать посредством продукции в линии клеток человека, выбранной из группы, состоящей из NM-H9D8 (DSM ACC 2806), NM-H9D8-E6 (DSM ACC 2807), NM-H9D8-E6Q12 (DSM ACC 2856) и линий клеток, полученных из них.
18. Конъюгат по п. 1, где антитело можно получать посредством продукции в линии клеток CHO или линии клеток, полученной из нее.
19. Конъюгат по п. 1, где антитело можно получать способом получения, включающим стадии (i) получения клетки-хозяина, содержащей нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, определенное в п. 1, (ii) культивирования клетки-хозяина в условиях, подходящих для экспрессии антитела, и (iii) получения антитела, экспрессируемого клеткой-хозяином.
20. Конъюгат по п. 1, где антитело конкурирует с антителом, содержащим вариабельную область тяжелой цепи с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10 и вариабельную область легкой цепи с аминокислотной последовательность SEQ ID NO: 12, или антителом, содержащим вариабельную область тяжелой цепи с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 11 и вариабельную область легкой цепи с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 12, за связывание с TA-MUC1.
21. Конъюгат по п. 1, где антитело имеет активность, интернализуясь в MUC1-экспрессирующие клетки посредством связывания с MUC1.
22. Конъюгат по п. 1, где цитотоксическое средство является противоопухолевым средством.
23. Конъюгат по п. 1, где цитотоксическое средство является химиотерапевтическим средством.
24. Конъюгат по п. 23, где химиотерапевтическое средство выбрано из группы, состоящей из ингибитора микротрубочек, ингибитора топоизомеразы I, ДНК-повреждающего средства, ДНК алкилирующего средства и средства, связывающееся с малой бороздкой ДНК.
25. Конъюгат по п. 24, где химиотерапевтическое средство является ингибитором топоизомеразы I.
26. Конъюгат по п. 25, где ингибитор топоизомеразы I является противоопухолевым соединением, представленным следующей формулой:
[Формула 1]
.
27. Конъюгат по п. 1, где антитело конъюгируют с цитотоксическим средством через линкер, имеющий любую структуру, выбранную из группы, состоящей из следующих формул (a)-(f):
2
2
2
2
2
(a) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCH-C(=O)-GGFG-NH-CHCHCH-C(=O)-,
2
2
2
2
2
2
2
2
(b) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCHCHCHCH-C(=O)-GGFG-NH-CHCHCH-C(=O)-,
2
2
2
2
2
2
2
(c) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCHCHCHCH-C(=O)-GGFG-NH-CH-O-CH-C(=O)-,
2
2
2
2
2
2
2
2
(d) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCHCHCHCH-C(=O)-GGFG-NH-CHCH-O-CH-C(=O)-,
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
(e) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCH-C(=O)-NH-CHCHO-CHCHO-CHCH-C(=O)-GGFG-NH-CHCHCH-C(=O)- и
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
(f) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCH-C(=O)-NH-CHCHO-CHCHO-CHCHO-CHCHO-CHCH-C(=O)-GGFG-NH-CHCHCH-C(=O)-,
где антитело соединяют с концом -(сукцинимид-3-ил-N), цитотоксическое средство соединяют с карбонильной группой в самой крайней из формул (a)-(f) с атомом азота аминогруппы в положении 1 в качестве положения соединения, GGFG представляет собой аминокислотную последовательность, состоящую из глицин-глицин-фенилаланин-глицин, соединенных пептидными связями,
-(сукцинимид-3-ил-N)- имеет структуру, представленную следующей формулой:
[Формула 2]
,
соединенную с антителом в положении 3 и соединенную с метиленовой группой в линкерной структуре, содержащей эту структуру на атоме азота в положении 1.
28. Конъюгат по п. 27, где линкер представлен любой формулой, выбранной из группы, состоящей из следующих формул (a)-(c):
2
2
2
2
2
2
2
(a) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCHCHCHCH-C(=O)-GGFG-NH-CH-O-CH-C(=O)-,
2
2
2
2
2
2
2
2
(b) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCHCHCHCH-C(=O)-GGFG-NH-CHCH-O-CH-C(=O)- и
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
(c) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCH-C(=O)-NH-CHCHO-CHCHO-CHCH-C(=O)-GGFG-NH-CHCHCH-C(=O)-.
29. Конъюгат по п. 27, где линкер представлен следующей формулой (a):
2
2
2
2
2
2
2
(a) -(сукцинимид-3-ил-N)-CHCHCHCHCH-C(=O)-GGFG-NH-CH-O-CH-C(=O)-.
30. Конъюгат по пп. 26 или 27, где антитело конъюгируют с лекарственным средством-линкером, представленным следующей формулой (где символом "*" обозначена точка соединения с антителом) посредством тиоэфирной связи:
[Формула 3]
.
31. Конъюгат по п. 26 или 27, представленный следующей формулой;
[Формула 4]
,
где AB представляет собой антитело, y представляет собой среднее количество единиц структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированных с антителом, на антитело, и антитело конъюгируют с лекарственным средством-линкером, представленным указанной выше формулой, посредством тиоэфирной связи.
32. Конъюгат по п. 30, где антитело содержит любую из следующих комбинаций a)-d) вариабельной области тяжелой цепи и вариабельной области легкой цепи или тяжелой цепи и легкой цепи:
(a) вариабельная область тяжелой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, и вариабельная область легкой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12,
(b) вариабельная область тяжелой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, и вариабельная область легкой цепи имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12,
(c) тяжелая цепь имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, и легкая цепь имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, и
(d) тяжелая цепь имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, и легкая цепь имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16.
33. Конъюгат, представленный следующей формулой,
[Формула 5]
,
где AB представляет собой антитело, антитело содержит вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, и вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, y представляет собой среднее количество единиц структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированных с антителом, на антитело, и антитело конъюгируют с лекарственным средством-линкером, представленным указанной выше формулой, посредством тиоэфирной связи.
34. Конъюгат, представленный следующей формулой,
[Формула 6]
,
где AB представляет собой антитело, антитело содержит вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, и вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, y представляет собой среднее количество единиц структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированных с антителом, на антитело, антитело конъюгируют с лекарственным средством-линкером, представленным указанной выше формулой, посредством тиоэфирной связи.
35. Конъюгат, представленный следующей формулой,
[Формула 7]
,
где AB представляет собой антитело, антитело содержит тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, и легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, y представляет собой среднее количество единиц структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированных с антителом, на антитело, и антитело конъюгируют с лекарственным средством-линкером, представленным указанной выше формулой, посредством тиоэфирной связи.
36. Конъюгат, представленный следующей формулой,
[Формула 8]
,
где AB представляет собой антитело, антитело содержит тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, и легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, y представляет собой среднее количество единиц структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированных с антителом, на антитело, и антитело конъюгируют с лекарственным средством-линкером, представленным указанной выше формулой, посредством тиоэфирной связи.
37. Конъюгат по п. 1, где антитело содержит одну или более модификаций, выбранных из группы, состоящей из дефукозилирования, сниженного содержания фукозы, N-связанного гликозилирования, O-связанного гликозилирования, N-концевого процессинга, C-концевого процессинга, дезамидирования, изомеризации аспарагиновой кислоты, окисления метионина, замены двух остатков лейцина (L) аланином (A) в положении 234 и 235 тяжелой цепи (LALA), амидирования остатка пролина и делеции или отсутствия одной или двух аминокислот на карбоксильном конце.
38. Конъюгат по п. 37, где антитело содержит делецию, или в нем отсутствуют, одной или двух аминокислот на карбоксильном конце тяжелой цепи.
39. Конъюгат по п. 38, где антитело содержит две тяжелые цепи, в обеих из которых отсутствует один карбокси-концевой аминокислотный остаток.
40. Конъюгат по п. 1, где среднее количество y цитотоксических средств, в частности, структур лекарственное средство-линкер, конъюгированных на антитело, составляет в диапазоне от 1 до 10.
41. Конъюгат по п. 1, где среднее количество y цитотоксических средств, в частности, единиц выбранной одной структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированной на антитело, составляет в диапазоне от 2 до 8.
42. Конъюгат по п. 1, где среднее количество y цитотоксических средств, в частности, единиц выбранной одной структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированной на антитело, составляет в диапазоне от 3 до 8.
43. Конъюгат по п. 1, где среднее количество y цитотоксических средств, в частности, единиц выбранной одной структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированной на антитело, составляет в диапазоне от 7 до 8.
44. Конъюгат по п. 1, где среднее количество y цитотоксических средств, в частности, единиц выбранной одной структуры лекарственное средство-линкер, конъюгированной на антитело, составляет в диапазоне от 7,5 до 8.
45. Конъюгат по п. 1, где количество конъюгированных цитотоксических средств на молекулу антитела составляет 8.
46. Композиция, содержащая конъюгат по любому из пп. 1-45.
47. Конъюгат по п. 1 для применения в медицине.
48. Конъюгат по п. 47 или композиция по п. 46 для применения в лечении злокачественного новообразования, инфекции, аутоиммунного заболевания или нарушения с иммунодефицитом.
49. Конъюгат или композиция по п. 48, где злокачественное новообразование отличается экспрессией TA-MUC1.
50. Конъюгат или композиция по п. 49, где злокачественное новообразование выбрано из группы, состоящей из рака яичников, рака молочной железы, рака поджелудочной железы, рака легких, рака толстого кишечника, рака желудка, рака печени, рака почки, гемобластоза, рака эндометрия, рака щитовидной железы, лейкозов, семином, меланом, карцином, тератом, лимфом, сарком, мезотелиом, нейробластом, глиом, рака прямой кишки, рака надпочечников, рака кожи, злокачественного новообразования головного мозга, рака шейки матки, злокачественного новообразования кишечника, злокачественного новообразования кишечника, рака головы и шеи, злокачественного новообразования желудочно-кишечного тракта, злокачественного новообразования лимфоузлов, рака пищевода, колоректального рака, злокачественного новообразования уха, носа и горла (ЛОР), рака предстательной железы, рака мочевого пузыря, рака матки и их метастазов.
51. Конъюгат по п. 47 или композиция по п. 46, где конъюгат или композицию применяют в комбинации с дополнительным средством.
52. Способ лечения злокачественного новообразования у нуждающегося в этом индивидуума, включающий введение индивидууму со злокачественным новообразованием терапевтически эффективного количества конъюгата по любому из пп. 1-45 или композиции по п. 46.
53. Способ по п. 52, где злокачественное новообразование отличается экспрессией TA-MUC1.
54. способ лечения злокачественного новообразования по п. 52, где злокачественное новообразование выбрано из группы, состоящей из рака яичников, рака молочной железы, рака поджелудочной железы, рака легких, рака толстого кишечника, рака желудка, рака печени, рака почки, гемобластоза, рака эндометрия, рака щитовидной железы, лейкозов, семином, меланом, карцином, тератом, лимфом, сарком, мезотелиом, нейробластом, глиом, рака прямой кишки, рака надпочечников, рака кожи, злокачественного новообразования головного мозга, рака шейки матки, злокачественного новообразования кишечника, злокачественного новообразования кишечника, рака головы и шеи, злокачественного новообразования желудочно-кишечного тракта, злокачественного новообразования лимфоузлов, рака пищевода, колоректального рака, злокачественного новообразования уха, носа и горла (ЛОР), рака предстательной железы, рака мочевого пузыря, рака матки и их метастазов.
55. Способ лечения злокачественного новообразования по п. 54, дополнительно включающий введение дополнительного терапевтического средства.