КОНСТРУКЦИИ, НАПРАВЛЕННЫЕ НА КОМПЛЕКСЫ ПЕПТИДА HPV16-E7/МНС, И ВИДЫ ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ

1. Выделенная конструкция к E7MC, содержащая фрагмент молекулы антитела, который специфически связывается с комплексом, содержащим пептид E7 вируса папилломы человека 16 подтипа (HPV16) и белок главного комплекса гистосовместимости (MHC) I класса (комплекс HPV16-E7/MHC I класса или E7MC).
2. Выделенная конструкция к E7MC по п. 1, где белок MHC I класса выбран из группы, состоящей из HLA-A*02:01, HLA-A*02:02, HLA-A*02:06, HLA-A*02:07 и HLA-A*02:11.
3. Выделенная конструкция к E7MC по п. 2, где белок MHC I класса представляет собой HLA-A*02:01.
4. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-3, где пептид HPV16-E7 содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3-14.
5. Выделенная конструкция к E7MC по п. 4, где пептид HPV16-E7 содержит аминокислотную последовательность YMLDLQPET (SEQ ID NO: 4).
6. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-5, где фрагмент молекулы антитела представляет собой полноразмерное антитело, Fab, Fab', (Fab')2, Fv или одноцепочечный Fv (scFv).
7. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-6, где выделенная конструкция к E7MC связывается с комплексом HPV16-E7/MHC I класса с K
приблизительно от 0,1 пМ приблизительно до 500 нМ.
d
8. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-7, где фрагмент молекулы антитела содержит:
i) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий определяющую комплементарность область тяжелой цепи (HC-CDR) 1, содержащую аминокислотную последовательность G-F/G/Y-S/T-F-S/T-S-Y-A/G (SEQ ID NO: 183) или ее вариант, содержащий приблизительно до 3 замены аминокислот, HC-CDR2, содержащую аминокислотную последовательность I-N/I-P-X-X-G-G/T/I-T/A/P или I-S-X-S/D-G/N-G/S-N-T/I/K (SEQ ID NO: 184 или 185) или ее вариант, содержащий приблизительно до 3 замены аминокислот, и HC-CDR3, содержащую аминокислотную последовательность любой из of A-R-S/R-Y/S/G-Y/V-Y/W-G-X-Y-D, A-R-G-X-X-X-Y-Y/G/S или A-R-G-X-X-Y-Q/W-W-S-X-D-D (SEQ ID NO: 186-188), или ее вариант, содержащий приблизительно до 3 замены аминокислот; и
ii) вариабельный домен легкой цепи, содержащий определяющую комплементарность область легкой цепи (LC-CDR) 1, содержащую аминокислотную последовательность N-I-G-S-N/K или L-R-S/N-X-Y (SEQ ID NO: 189 или 190), или ее вариант, содержащий приблизительно до 3 замены аминокислот, и LC-CDR3, содержащую аминокислотную последовательность A/Q/N-S/A/V-W/Y/R-D-S/D-S-L/S/G-X-X-X-V (SEQ ID NO: 191) или ее вариант, содержащий приблизительно до 3 замены аминокислот, где X может представлять собой любую аминокислоту.
9. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-7, где фрагмент молекулы антитела содержит:
i) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащую аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 57-77 или ее вариант, содержащий приблизительно до 5 замены аминокислот, HC-CDR2, содержащую аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 78-98 или ее вариант, содержащий приблизительно до 5 замены аминокислот, и HC-CDR3, содержащую аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 99-119, 244 и 245; или ее вариант, содержащий приблизительно до 5 замены аминокислот; и
ii) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащую аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 120-140 и 246 или ее вариант, содержащий приблизительно до 5 замены аминокислот, LC-CDR2, содержащую аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 141-161 или ее вариант, содержащий приблизительно до 3 замены аминокислот, и LC-CDR3, содержащую аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 162-182 и 247-250; или ее вариант, содержащий приблизительно до 5 замены аминокислот.
10. Выделенная конструкция к E7MC по п. 9, где фрагмент молекулы антитела содержит a) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 15-35 и 233-237, или ее вариант, обладающий по меньшей мере приблизительно 95% идентичностью последовательности с любой из SEQ ID NO: 15-35 и 233-237; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 36-56 и 238-243, или ее вариант, обладающий по меньшей мере приблизительно 95% идентичностью последовательности с любой из SEQ ID NO: 36-56 и 238-243.
11. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-10, где выделенная конструкция к E7MC является полиспецифической.
12. Выделенная конструкция к E7MC по п. 11, где выделенная конструкция к E7MC представляет собой тандемный scFv, диатело (Db), одноцепочечное диатело (scDb), переориентирующееся антитело с двойной аффинностью (DART), антитело с двойным вариабельным доменом (DVD), антитело "выступ во впадину" (KiH), антитело "замок на причале" (dock and lock) (DNL), химически сшитое антитело, гетеромультимерное антитело или гетероконъюгированное антитело.
13. Выделенная конструкция к E7MC по п. 12, где выделенная конструкция к E7MC представляет собой тандемный scFv, содержащий два scFv, связанных пептидным линкером.
14. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 11-13, где выделенная конструкция к E7MC дополнительно содержит второй фрагмент молекулы антитела, который специфически связывается со вторым антигеном.
15. Выделенная конструкция к E7MC по п. 14, где второй антиген выбран из группы, состоящей из CD3γ, CD3δ, CD3ε, CD3ζ, CD28, OX40, GITR, CD137, CD27, CD40L и HVEM.
16. Выделенная конструкция к E7MC по п. 14, где второй антиген представляет собой CD3ε, и где выделенная конструкция к E7MC представляет собой тандемный scFv, содержащий scFv, специфический к комплексу HPV16-E7/MHC I класса, на N-конце и scFv, специфический к CD3ε, на C-конце.
17. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-10, где выделенная конструкция к E7MC представляет собой химерный антигенный рецептор, содержащий внеклеточный домен, содержащий фрагмент молекулы антитела, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, содержащий внутриклеточную сигнальную последовательность CD3ζ и внутриклеточную сигнальную последовательность CD28.
18. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-10, где выделенная конструкция к E7MC представляет собой иммуноконъюгат, содержащий фрагмент молекулы антитела и эффекторная молекула, где эффекторная молекула представляет собой терапевтическое средство, выбранное из группы, состоящей из лекарственного средства, токсина, радиоактивного изотопа, белка, пептида и нуклеиновой кислоты.
19. Выделенная конструкция к E7MC по любому из пп. 1-10, где выделенная конструкция к E7MC представляет собой иммуноконъюгат, содержащий фрагмент молекулы антитела и метку.
20. Фармацевтическая композиция, содержащая выделенную конструкцию к E7MC по любому из пп. 1-18.
21. Клетка-хозяин, экспрессирующая выделенную конструкцию к E7MC по любому из пп. 1-19.
22. Нуклеиновая кислота, кодирующая полипептидные компоненты выделенной конструкции к E7MC по любому из пп. 1-19.
23. Эффекторная клетка, экспрессирующая выделенную конструкцию к E7MC по п. 17.
24. Эффекторная клетка по п. 23, где эффекторная клетка представляет собой T-клетку.
25. Способ детекции клетки, презентирующей комплекс, содержащий пептид HPV16-E7 и белок MHC I класса на своей поверхности, включающий приведение клетки в контакт с выделенной конструкцией к E7MC по п. 19 и детекцию наличия метки на клетке.
26. Способ лечения индивидуума, страдающего HPV16-E7-положительным заболеванием, включающий введение индивидууму:
a) эффективного количества фармацевтической композиции по п. 20; или
b) эффективного количества эффекторной клетки по п. 23 или 24.
27. Способ диагностики у индивидуума, страдающего HPV16-E7-положительным заболеванием, включающий:
a) введение эффективного количества выделенной конструкции к E7MC по п. 19 индивидууму; и
b) определение уровня метки у индивидуума, где уровень метки выше уровня порогового значения указывает на то, что индивидуум страдает HPV16-E7-положительным заболеванием.
28. Способ диагностики у индивидуума, страдающего HPV16-E7-положительным заболеванием, включающий:
a) приведение образца, получаемого у индивидуума, в контакт с выделенной конструкцией к E7MC по п. 19; и
b) определение числа клеток, связанных с выделенной конструкцией к E7MC в образце, где величина числа клеток, связанных с выделенной конструкцией к E7MC выше уровня порогового значения указывает на то, что индивидуум страдает HPV16-E7-положительным заболеванием.
29. Способ по любому из пп. 26-28, где HPV16-E7-положительное заболевание представляет собой HPV16-E7-положительную злокачественную опухоль.
30. Способ по п. 29, где HPV16-E7-положительная злокачественная опухоль представляет собой плоскоклеточную карциному.
31. Способ по п. 29, где HPV16-E7-положительная злокачественная опухоль представляет собой рак шейки матки, аногенитальную злокачественную опухоль, рак головы и шеи или рак ротоглотки.