ИСКУССТВЕННО СОЗДАННАЯ СИСТЕМА УПРАВЛЕНИЯ ФУНКЦИЕЙ ШК

1. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, который представляет собой ген PMP22, и который имеет модификацию последовательности нуклеиновой кислоты.
2. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где модификацию последовательности нуклеиновой кислоты искусственно вызывают с помощью комплекса гидовая нуклеиновая кислота-белок-редактор.
3. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где последовательность нуклеиновой кислоты гена PMP22 является одной или более, выбранными из группы, состоящей из регуляторного участка, некодирующего участка и кодирующего участка, который имеет модификацию последовательности нуклеиновой кислоты.
4. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где ген представляет собой фактор, управляющий функцией ШК, искусственно измененный с помощью комплекса гидовая нуклеиновая кислота-белок-редактор,
причем искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, содержит одну или более модификаций нуклеиновых кислот, которые являются:
по меньшей мере одним из делеции или вставки одного или более нуклеотидов, замещения одним или более нуклеотидами, отличными от гена дикого типа, и вставки одного или более чужеродных нуклеотидов в последовательность мотива, примыкающего к протоспейсеру (PAM), в последовательности нуклеиновой кислоты, составляющей фактор, связанный с неоваскуляризацией, или в непрерывном участке последовательности оснований из 1-50 п.н., примыкающем к ее 5'-концу и/или 3'-концу,
или
химической модификацией одного или более нуклеотидов в последовательности нуклеиновой кислоты, составляющей фактор, управляющий функцией ШК.
5. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где модификация нуклеиновой кислоты происходит в промоторном участке гена.
6. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где модификация нуклеиновых кислот происходит в экзонном участке гена.
7. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где модификация нуклеиновых кислот происходит в энхансерном участке гена.
8. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где модификация нуклеиновых кислот происходит в интронном участке гена.
9. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.1, где модификация нуклеиновых кислот происходит в одной или более последовательностях, выбранных из группы, состоящей из Промотора, TATA-бокса, CAAT-бокса, Сайта Инициации, Сайта Терминации, Донорного Сайта Сплайсинга, Акцепторного Сайта Сплайсинга, Поли(А)-Сайта, Энхансера, 3′-НТУ (Нетранслируемого участка), 5′-НТУ, Аттенюатора и GC-бокса.
10. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.4, где PAM-последовательность представляет собой одну или более из следующих последовательностей (описанных в направлении от 5' к 3'):
NGG (N представляет собой A, T, C или G);
NNNNRYAC (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой C или T);
NNAGAAW (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G, а W представляет собой A или T);
NNNNGATT (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G);
NNGRR(T) (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G); и
TTN (N представляет собой A, T, C или G).
11. Искусственно измененный фактор, управляющий функцией ШК, по п.2, где белок-редактор включает один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, полученного из Streptococcus pyogenes, белка Cas9, полученного из Campylobacter jejuni, белка Cas9, полученного из Streptococcus thermophilus, белка Cas9, полученного из Streptococcus aureus, белка Cas9, полученного из Neisseria meningitidis, и белка Cpf1.
12. Гидовая нуклеиновая кислота, способная образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из одной или более последовательностей, выбранных из группы, состоящей из Промотора, TATA-бокса, CAAT-бокса, Сайта Инициации, Сайта Терминации, Донорного Сайта Сплайсинга, Акцепторного Сайта Сплайсинга, Поли(А)-Сайта, Энхансера, 3′-НТУ (Нетранслируемого участка), 5′-НТУ, Аттенюатора и GC-боксав последовательностях нуклеиновых кислот PMP22, соответственно.
13. Гидовая нуклеиновая кислота по п.12, которая способна образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из SEQ ID NO: 1-66 в последовательностях нуклеиновых кислот гена PMP22, соответственно.
14. Гидовая нуклеиновая кислота по п.13, которая включает одну или более гидовых нуклеиновых кислот, выбранных из группы, состоящей из:
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из SEQ ID NO: 1-8, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из SEQ ID NO: 14-29, соответственно;
гидовых нуклеиновых кислот, способных образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из SEQ ID NO: 41-53, соответственно;
15. Гидовая нуклеиновая кислота по п.13, где гидовые нуклеиновые кислоты способны образовывать комплементарные связи по отношению к одной или более последовательностям-мишеням из SEQ ID NO: 1, 3, 25, 27, 28, 41, 44 или 45.
16. Гидовая нуклеиновая кислота по п.13, где гидовая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеотидную молекулу из 18-23 п.н.
17. Композиция для генной манипуляции, содержащая:
гидовую нуклеиновую кислоту, которая способна образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из одной или более последовательностей, выбранных из группы, состоящей из Промотора, TATA-бокса, CAAT-бокса, Сайта Инициации, Сайта Терминации, Донорного Сайта Сплайсинга, Акцепторного Сайта Сплайсинга, Поли(А)-Сайта, Энхансера, 3′-НТУ (Нетранслируемого участка), 5′-НТУ, Аттенюатора и GC-боксав последовательностях нуклеиновых кислот PMP22, соответственно; и белок-редактор или кодирующую его последовательность нуклеиновой кислоты.
18. Композиция для генной манипуляции по п.17, содержащая:
гидовую нуклеиновую кислоту, которая способна образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из SEQ ID NO: 1-66 в последовательностях нуклеиновой кислоты гена PMP22, соответственно, или кодирующую ее последовательность нуклеиновой кислоты; и белок-редактор или кодирующую его последовательность нуклеиновой кислоты.
19. Композиция для генной манипуляции по п.17, где белок-редактор включает один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, полученного из Streptococcus pyogenes, белка Cas9, полученного из Campylobacter jejuni, белка Cas9, полученного из Streptococcus thermophilus, белка Cas9, полученного из Streptococcus aureus, белка Cas9, полученного из Neisseria meningitidis, и белка Cpf1.
20. Композиция для генной манипуляции по п.17, где генная манипуляция включает одну или более модификаций нуклеиновых кислот, которая является:
по меньшей мере одним из делеции или вставки одного или более нуклеотидов, замещения одним или более нуклеотидами, отличными от гена дикого типа, и вставки одного или более чужеродных нуклеотидов в последовательность мотива, примыкающего к протоспейсеру (PAM), в последовательности нуклеиновой кислоты, составляющей фактор, управляющий функцией ШК, или в непрерывном участке последовательности оснований из 1-50 п.н., примыкающем к ее 5'-концу и/или 3'-концу,
или
химической модификацией одного или более нуклеотидов в последовательности нуклеиновой кислоты, составляющей фактор, управляющий функцией ШК.
21. Композиция для генной манипуляции по п.20, где PAM-последовательность включает одну или более следующих последовательностей (описано в направлении от 5' к 3'):
NGG (N представляет собой A, T, C или G);
NNNNRYAC (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой C или T);
NNAGAAW (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G, а W представляет собой A или T);
NNNNGATT (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G);
NNGRR(T) (каждый из N независимо представляет собой A, T, C или G, R представляет собой A или G, а Y представляет собой C или T); и
TTN (N представляет собой A, T, C или G).
22. Композиция для генной манипуляции по п.17, где композиция для генной манипуляции представляет собой форму рибонуклеопротеина (RNP).
23. Композиция для генной манипуляции по п.17, где композиция для генной манипуляции образована в вирусной векторной системе.
24. Композиция для генной манипуляции по п.23, где вирусный вектор включает один или более вирусов, выбранных из ретровируса, лентивируса, аденовируса, аденоассоциированного вируса (AAV), вируса коровьей оспы, поксвируса и вируса простого герпеса.
25. Набор для генной манипуляции, содержащий:
(а) гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из SEQ ID NO: 1-66 в последовательностях нуклеиновых кислот гена PMP22, соответственно, или кодирующую ее последовательность нуклеиновой кислоты; и
(b) белок-редактор, представляющий собой один или более белков, выбранных из группы, состоящей из белка Cas9, полученного из Streptococcus pyogenes, белка Cas9, полученного из Campylobacter jejuni, белка Cas9, полученного из Streptococcus thermophilus, белка Cas9, полученного из Streptococcus aureus, белка Cas9, полученного из Neisseria meningitidis, и белка Cpf1, соответственно, или кодирующую его последовательность нуклеиновой кислоты.
26. Композиция для лечения нарушения из-за дисфункции ШК, содержащая:
гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарные связи по отношению к последовательностям-мишеням из одной или более последовательностей, выбранных из группы, состоящей из Промотора, TATA-бокса, CAAT-бокса, Сайта Инициации, Сайта Терминации, Донорного Сайта Сплайсинга, Акцепторного Сайта Сплайсинга, Поли(А)-Сайта, Энхансера, 3′-НТУ (Нетранслируемого участка), 5′-НТУ, Аттенюатора и GC-боксав последовательностях нуклеиновых кислот PMP22, соответственно; или кодирующую ее последовательность нуклеиновой кислоты; и
белок-редактор или кодирующую его последовательность нуклеиновой кислоты.
27. Композиция для лечения нарушения из-за дисфункции ШК по п.26, содержащая:
гидовую нуклеиновую кислоту, способную образовывать комплементарные связи по отношению к одной или более последовательностям-мишеням в последовательностях нуклеиновых кислот гена PMP22, соответственно, или кодирующую ее последовательность нуклеиновой кислоты; и
белок-редактор или кодирующую его последовательность нуклеиновой кислоты.
28. Композиция для лечения нарушения из-за дисфункции ШК по п.26, где последовательность-мишень представляет собой одну или более последовательностей из последовательностей-мишеней из SEQ ID NO: 1-66.
29. Композиция для лечения нарушения из-за дисфункции ШК по п.26, где белок-редактор представляет собой белок Cas9, полученный из Streptococcus pyogenes.
30. Композиция для лечения нарушения из-за дисфункции ШК по п.26, где нарушение из-за дисфункции ШК представляет собой нарушение функции шванновских клеток, вызванное сверхэкспрессией гена PMP22 вследствие дупликации PMP22.
31. Композиция для лечения нарушения из-за дисфункции ШК по п.30, где заболевание, связанное с фактором, управляющим функцией ШК, представляет собой болезнь Шарко-Мари-Тута Типа 1А (CMT 1А), болезнь Дежерина-Сотта (DSS), врожденную гипомиелинизирующую нейропатию (CHN), или синдром Русси-Леви (RLS).