МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ СПОСОБ ОБНАРУЖЕНИЯ МЕСТОРОЖДЕНИЯ УГЛЕВОДОРОДОВ

1. Способ обнаружения присутствия месторождения углеводородов в географическом местоположении, включающий следующие стадии:
обнаружение присутствия в данной местности целевого полинуклеотида, кодирующего белок, способный метаболизировать углеводород, в котором присутствие целевого полинуклеотида указывает на присутствие месторождения углеводородов;
определение концентрации целевого полинуклеотида в данной местности; и
определение величины, имеющей отношение к концентрации бактерий в данной местности и расчет отношения концентрации целевого полинуклеотида к этой величине.
2. Способ по п.1, в котором стадия определения величины, имеющей отношение к концентрации бактерий в данной местности, включает стадию определения концентрации общего полинуклеотид, присутствующего у большинства различных типов бактерий.
3. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором стадия обнаружения присутствия целевого полинуклеотида включает обнаружение присутствия подпоследовательности последовательности целевого полинуклеотида.
4. Способ по п.3, в котором подпоследовательность включает консенсусную последовательность, присутствующую у большинства различных генов, кодирующих белок способный метаболизировать углеводород.
5. Способ по п.1 или 2, в котором целевой полинуклеотид представляет собой DNA.
6. Способ по п.1 или 2, в котором целевой полинуклеотид представляет собой RNA.
7. Способ по п.1 или 2, в котором углеводород представляет собой С1-С20-алкан, алкен, необязательно замещенный, с единственным кольцом или с несколькими кольцами ароматический углеводород, или нафтен, предпочтительно, С2- С20-алкан.
8. Способ по п.1 или 2, в котором белок способный метаболизировать углеводород представляет собой бифенил-диоксигеназу, толуол-монооксигеназу, алкан-гидроксилазу; катехол-2,3-диоксигеназу; нафталин-диоксигеназу; толуол-диоксигеназу; ксилол-монооксигеназу; бутан-монооксигеназу; бактериальную Р450-оксигеназу; или эукариотическую Р450-оксигеназу.
9. Способ по п.8, в котором целевой полинуклеотид представлял собой ген alkB.
10. Способ по п.1 или 2, в котором присутствие целевого полинуклеотида определяют с помощью PCR.
11. Способ по п.1 или 2, в котором концентрацию целевого полинуклеотида и необязательно концентрацию общего полинуклеотида определяют помощью количественной PCR.
12. Способ по п.1 или 2, в котором стадия обнаружения присутствия целевого полинуклеотида, включает получение образца почвы из этого местоположения и обнаружение присутствия целевого полинуклеотида в образце почвы.
13. Способ по п.12, в котором образец почвы представляет собой образец, полученный с глубины от 10 до 50 см ниже поверхности.
14. Способ по п.12, дополнительно включающий стадию стабилизации нуклеиновых кислот в образце почвы после получения образца почвы.
15. Способ по п.12, включающий стадию получения множества образцов почвы в различных местах географического местоположения и выполнения способа для каждого образца почвы.
16. Способ по п.15, дополнительно включающий стадию проведения корреляции между результатами способа для каждого образца почвы, и определения, таким образом, разброса в присутствии целевого полинуклеотида в различных местах внутри географического местоположения.
17. Способ по п.16, дополнительно включающий следующие стадии: определение концентрации целевого полинуклеотида и получение первого показателя, имеющего отношение к указанной концентрация для каждого места; определение концентрации свободного газообразного углеводорода в каждом месте и получение второго показателя, имеющего отношение к указанной концентрации свободного газообразного углеводорода в каждом месте; и объединение первого и второго показателей для каждого места географического местоположения.