ВЫБОР ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ТЕРАПИИ РАКА ЛЕГКИХ С ПОМОЩЬЮ МАТРИЦ НА ОСНОВЕ АНТИТЕЛ

1. Способ выбора подходящего противоракового лекарственного средства для лечения рака легких, который включает:
(a) выделение клеток опухоли легких после введения противоракового лекарственного средства или до инкубации с противораковым лекарственным средством;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) детектирование активационного состояния одного или более анализируемых веществ в клеточном экстракте методом анализа, включающим множество серий разведений захватывающих антител, специфичных к одному или более анализируемых веществ, причем захватывающие антитела фиксируют на твердой подложке; и
(d) определение того, подходит или не подходит это противораковое лекарственное средство для лечения рака легких путем сравнения активационного состояния, обнаруженного у одного или более анализируемых веществ, со стандартным активационным профилем, полученным в отсутствие противоракового лекарственного средства.
2. Способ идентификации реакции опухоли легких на лечение с помощью противоракового лекарственного средства, который включает:
(a) выделение клеток опухоли легких после введения противоракового лекарственного средства или до инкубации с противораковым лекарственным средством;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) детектирование активационного состояния одного или более анализируемых веществ в клеточном экстракте методом анализа, включающим множество серий разведении захватывающих антител, специфичных к одному или нескольким анализируемым веществам, причем захватывающие антитела фиксируют на твердой подложке; и
(d) идентификацию опухоли легких как реагирующей или не реагирующей на лечение с помощью противоракового лекарственного средства путем сравнения активационного состояния, обнаруженного у одного или более анализируемых веществ, со стандартным активационным профилем, полученным в отсутствие противоракового лекарственного средства.
3. Способ прогнозирования реакции субъекта, страдающего раком легких, на лечение с помощью противоракового лекарственного средства, который включает:
(а) выделение клеток опухоли легких после введения противоракового лекарственного средства или до инкубации с противораковым лекарственным средством;
(b) лизирование выделенных клеток для получения клеточного экстракта;
(c) детектирование активационного состояния одного или более анализируемых веществ в клеточном экстракте методом анализа, включающим множество серий разведений захватывающих антител, специфичных к одному или более анализируемых веществ, причем захватывающие антитела фиксируют на твердой подложке; и
(d) прогнозирование вероятности того, что субъект будет реагировать на лечение с помощью этого противоракового лекарственного средства путем сравнения активационного состояния, обнаруженного у одного или более анализируемых веществ, со стандартным активационным профилем, полученным в отсутствие противоракового лекарственного средства.
4. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором опухоль легких получена от субъекта с немелкоклеточным раком легких (NSCLC) типа плоскоклеточной карциномы, аденокарциномы, крупноклеточной карциномы, бронхоальвеолярной карциномы (ВАС) и овсяноклеточной карциномы.
5. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором клетки включают циркулирующие клетки опухоли легких типа циркулирующих опухолевых клеток, циркулирующих эндотелиальных клеток, циркулирующих предшественников эндотелиальных клеток, раковых стволовых клеток, диссеминированных опухолевых клеток и их комбинаций.
6. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором клетки выделяют из образца, выбранного из группы, состоящей из цельной крови, сыворотки, плазмы, мокроты, смыва из бронхов, мочи, аспирата из сосков, лимфы, слюны, аспирата тонкой иглой и их комбинаций.
7. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором клетки выделяют из опухолевой ткани.
8. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором противораковое лекарственное средство включает средство, которое нарушает функционирование активированных компонентов пути передачи сигналов в раковых клетках.
9. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором одно или более анализируемых веществ включают множество молекул передачи сигналов.
10. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором анализ на стадии (с) включает:
(i) инкубирование клеточного экстракта с множеством серий разведений захватывающих антител, получая множество захваченных анализируемых веществ;
(ii) инкубирование множества захваченных анализируемых веществ с зависимыми от активационного состояния антителами, специфичными к соответствующим анализируемым веществам, получая множество детектируемых захваченных анализируемых веществ;
(iii) инкубирование множества детектируемых захваченных анализируемых веществ с первым и вторым членами усиливающей сигнал пары, генерируя усиленный сигнал; и
(iv) детектирование усиленного сигнала, исходящего от первого и второго членов усиливающей сигнал пары.
11. Способ по пп.1, 2 или 3, в котором анализ на стадии (с) включает:
(i) инкубирование клеточного экстракта с множеством серий разведений захватывающих антител, получая множество захваченных анализируемых веществ;
(ii) инкубирование множества захваченных анализируемых веществ с детектирующими антителами, включающими множество независимых от активационного состояния антител и множество зависимых от активационного состояния антител, специфичных к соответствующим анализируемым веществам, получая множество детектируемых захваченных анализируемых веществ,
причем независимые от активационного состояния антитела мечены содействующей молекулой, зависимые от активационного состояния антитела мечены первым членом усиливающей сигнал пары, а содействующая молекула вырабатывает окислитель, который направляется к и реагирует с первым членом усиливающей сигнал пары;
(iii) инкубирование множества детектируемых захваченных анализируемых веществ со вторым членом усиливающей сигнал пары, генерируя усиленный сигнал; и
(iv) детектирование усиленного сигнала, исходящего от первого и второго членов усиливающей сигнал пары.
12. Применение матрицы, обладающей превосходным динамическим диапазоном, включающей множество серий разведений захватывающих антител, фиксированных на твердой подложке, причем захватывающие антитела в каждой серии разведений специфичны к одному или более анализируемых веществ, которые соответствуют компонентам пути передачи сигналов в клеточном экстракте, для выбора подходящего противоракового лекарственного средства для лечения рака легких.
13. Матрица по п.12, где путь передачи сигналов участвует в пролиферации клеток или ангиогенезе опухолей.
14. Матрица по п.12, где захватывающие антитела включают одного или более представителей группы, состоящей из антител, реагирующих с EGFR, ЕrbВ2, ЕrbВ3, ErbB4, Shc, PI3K, Erk, Rsk, Akt, P70S6K, VEGFR1, VEGFR2, Tie 2 и комплексом V-кадгерин-R2.
15. Матрица по п.12, где клеточный экстракт включает экстракт циркулирующих клеток солидной опухоли.