ПОЛИПЕПТИДЫ Е2 ПАПИЛЛОМАВИРУСА, ПРИМЕНЯЕМЫЕ ДЛЯ ВАКЦИНАЦИИ

1. Вектор экспрессии, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид Е1 папилломавируса, и молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид Е2 папилломавируса, где любой непрерывный участок из 40 или более нуклеотидов указанной E1-кодирующей молекулы нуклеиновой кислоты и указанной Е2-кодирующей молекулы нуклеиновой кислоты проявляют процент идентичности менее 75%.
2. Вектор экспрессии по п.1, где указанный полипептид Е2 папилломавируса имеет происхождение из HR-HPV, выбранного из группы, состоящей из HPV-16, HPV-18, HPV-30, HPV-31, HPV-33, HPV-35, HPV-39, HPV-45, HPV-51, HPV-52, HPV-56, HPV-58, HPV-59, HPV-66, HPV-68, HPV-70 и HPV-85, предпочтительно указанный полипептид Е2 папилломавируса имеет происхождение из HPV-16, HPV-18, HPV-33 или HPV-52 или любой их комбинации.
3. Вектор экспрессии по п.1, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид Е2 папилломавируса, модифицирована таким образом, что она кодирует полипептид Е2 дефектный по меньшей мере в части его активирующей репликацию и/или транскрипцию активности, предпочтительно указанный полипептид Е2 имеет происхождение из HPV-16 и включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:1 за исключением того, что по меньшей мере остаток Glu в позиции 39 (Е39) и/или остаток Ile в позиции 73 (I73) замещен(ы) любым аминокислотным остатком, кроме Glu или Ile в соответствующих позициях 39 и 73, предпочтительно Glu-остаток в позиции 39 и/или Ile-остаток в позиции 73 замещены остатком Ala.
4. Вектор экспрессии по п.1, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид Е2 папилломавируса, модифицирована таким образом, что она кодирует присутствующий в мембране полипептид Е2, предпочтительно указанный присутствующий в мембране полипептид Е2 модифицирован путем слияния указанного полипептида Е2 папилломавируса с секреторными и закрепленными на мембране последовательностями, где указанные секреторные и/или закрепленные на мембране последовательности предпочтительно имеют происхождение из гидрофобного гликопротеина, гликопротеина оболочки HIV вируса или F протеина кори, или являются синтетическими.
5. Вектор экспрессии по п.1, где указанный вектор выбран из группы, состоящей из:
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е2, предпочтительно полипептид Е2, включающий аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:2;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-18 Е2;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-33 Е2;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-52 Е2.
6. Вектор экспрессии по п.1, где указанная E1-кодирующая молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:6 или в SEQ ID NO:7.
7. Вектор экспрессии по п.1, где указанный вектор выбран из группы, состоящей из:
- Вектора экспрессии, содержащего (i) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е2, (ii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е1;
- Вектора экспрессии, содержащего (i) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е2, (ii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е1, (iii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-18 Е2, и (iv) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-18 Е1;
- Вектора экспрессии, содержащего (i) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е2, (ii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е1; (iii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е6, (iv) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е7;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды HPV-16 Е1, Е2, Е6 и Е7 и HPV-18 Е1, Е2, Е6 и Е7.
8. Вектор экспрессии по п.7, где указанный полипептид HPV-16 Е2 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:2; и/или указанный полипептид HPV-18 Е2 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:29.
9. Вектор экспрессии по п.7, где указанный полипептид HPV-16 Е1 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:3; и/или указанный полипептид HPV-18 E1 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:32; и/или указанный полипептид HPV-16 E6 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:4; и/или указанный полипептид HPV-16 Е7 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:5.
10. Вектор экспрессии по п.7, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-16 Е2, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:8, и/или указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-18 Е2, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:33; и/или указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-16 E1, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:7; и/или указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-18 E1, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:38.
11. Вектор экспрессии по п.1, где указанный вектор представляет собой поксвирусный вектор, полученный из птичьего вируса (canarypox), вируса оспы кур (fowlpox) или вируса осповакцины (vaccinia), предпочтительно указанный вирус осповакцины представляет собой копенгагенский штамм (Copenhagen strain), штамм Вайет (Wyeth strain), NYVAC или модифицированный штамм Анкара (MVA), более предпочтительно указанный вирусный вектор имеет происхождение от копенгагенского вируса осповакцины, где указанная молекула нуклеиновой кислоты встроена в ген тимидинкиназы, или указанный вирусный вектор имеет происхождение от вируса осповакцины MVA, где указанная молекула нуклеиновой кислоты встроена в делецию III.
12. Вектор экспрессии по п.11, где указанная Е2- и/или Е7-кодирующая молекула нуклеиновой кислоты помещена под контролем промотора H5R вируса осповакцины, а E1- и/или Е6-кодирующая молекула нуклеиновой кислоты под контролем промотора р7.5K.
13. Вектор экспрессии, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид E1 папилломавируса, и молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид Е2 папилломавируса, где 3'-участок указанной El-кодирующей молекулы нуклеиновой кислоты, который в природном окружении на 100% идентичен 5'-участку Е2-кодирующей молекулы нуклеиновой кислоты, модифицирован таким образом, что проявляет процент идентичности менее чем 75% с указанным участком указанной Е2-кодирующей молекулы нуклеиновой кислоты.
14. Вектор экспрессии по п.13, где указанный полипептид Е2 папилломавируса имеет происхождение из HR-HPV, выбранного из группы, состоящей из HPV-16, HPV-18, HPV-30, HPV-31, HPV-33, HPV-35, HPV-39, HPV-45, HPV-51, HPV-52, HPV-56, HPV-58, HPV-59, HPV-66, HPV-68, HPV-70 и HPV-85, предпочтительно указанный полипептид Е2 папилломавируса имеет происхождение из HPV-16, HPV-18, HPV-33 или HPV-52 или любой их комбинации.
15. Вектор экспрессии по п.13, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид Е2 папилломавируса, модифицирована таким образом, что она кодирует полипептид Е2 дефектный по меньшей мере в части его активирующей репликацию и/или транскрипцию активности, предпочтительно указанный полипептид Е2 имеет происхождение из HPV-16 и включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:1 за исключением того, что по меньшей мере остаток Glu в позиции 39 (Е39) и/или остаток Ile в позиции 73 (I73) замещен(ы) любым аминокислотным остатком, кроме Glu или Не в соответствующих позициях 39 и 73, предпочтительно Glu-остаток в позиции 39 и/или Ile-остаток в позиции 73 замещены остатком Ala.
16. Вектор экспрессии по п.13, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид Е2 папилломавируса, модифицирована таким образом, что она кодирует присутствующий в мембране полипептид Е2, предпочтительно указанный присутствующий в мембране полипептид Е2 модифицирован путем слияния указанного полипептида Е2 папилломавируса с секреторными и закрепленными на мембране последовательностями, где указанные секреторные и/или закрепленные на мембране последовательности предпочтительно имеют происхождение из гидрофобного гликопротеина, гликопротеина оболочки HIV вируса или F протеина кори, или являются синтетическими.
17. Вектор экспрессии по п.13, где указанный вектор выбран из группы, состоящей из:
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е2, предпочтительно полипептид Е2, включающий аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:2;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-18 Е2;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-33 E2;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-52 E2.
18. Вектор экспрессии по п.13, где указанная E1-кодирующая молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:6 или в SEQ ID NO:7.
19. Вектор экспрессии по п.13, где указанный вектор выбран из группы, состоящей из:
- Вектора экспрессии, содержащего (i) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 E2, (ii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е1;
- Вектора экспрессии, содержащего (i) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 E2, (ii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е1, (iii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-18 E2, и (iv) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-18 Е1;
- Вектора экспрессии, содержащего (i) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 E2, (ii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е1; (iii) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е6, (iv) молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид HPV-16 Е7;
- Вектора экспрессии, содержащего молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды HPV-16 Е1, E2, Е6 и Е7 и HPV-18 Е1, E2, Е6 и Е7.
20. Вектор экспрессии по п.19, где указанный полипептид HPV-16 E2 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:2; и/или указанный полипептид HPV-18 E2 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:29.
21. Вектор экспрессии по п.19, где указанный полипептид HPV-16 Е1 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:3; и/или указанный полипептид HPV-18 Е1 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:32; и/или указанный полипептид HPV-16 Е6 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:4; и/или указанный полипептид HPV-16 Е7 включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO:5.
22. Вектор экспрессии по п.19, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-16 E2, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:8, и/или указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-18 E2, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:33; и/или указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-16 Е1, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:7;и/или указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид HPV-18 Е1, включает нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:38.
23. Вектор экспрессии по п.13, где указанный вектор представляет собой поксвирусный вектор, полученный из птичьего вируса (canarypox), вируса оспы кур (fowlpox) или вируса осповакцины (vaccinia), предпочтительно указанный вирус осповакцины представляет собой копенгагенский штамм (Copenhagen strain), штамм Вайет (Wyeth strain), NYVAC или модифицированный штамм Анкара (MVA), более предпочтительно указанный вирусный вектор имеет происхождение от копенгагенского вируса осповакцины, где указанная молекула нуклеиновой кислоты встроена в ген тимидинкиназы, или указанный вирусный вектор имеет происхождение от вируса осповакцины MVA, где указанная молекула нуклеиновой кислоты встроена в делецию III.
24. Вектор экспрессии по п.23, где указанная E2- и/или Е7-кодирующая молекула нуклеиновой кислоты помещена под контролем промотора H5R вируса осповакцины, а Е1- и/или Е6-кодирующая молекула нуклеиновой кислоты под контролем промотора р7.5K.
25. Вектор экспрессии по любому из пп.1-24 для применения а) при лечении персистентной папилломавирусной инфекции в организме животного или человека, b) для индукции или активации иммунного ответа в организме животного или человека, или с) для обеспечения антивирусного ответа в организме животного или человека.
26. Инфекционная вирусная частица, содержащая вектор экспрессии по любому из пп.1-24, применяемая для а) лечения персистентной папилломавирусной инфекции в организме животного или человека, b) индукции или активации иммунного ответа в организме животного или человека, или с) обеспечения антивирусного ответа в организме животного или человека.
27. Композиция, содержащая вектор экспрессии по любому из пп.1-24, или инфекционную вирусную частицу по п.26, или любую их комбинацию, предпочтительно приготовленная в виде препарата, пригодного для инъекции, в частности осуществляемой внутримышечным или подкожным введением, и применяемая для а) лечения персистентной папилломавирусной инфекции в организме животного или человека, b) индукции или активации иммунного ответа в организме животного или человека, или с) обеспечения антивирусного ответа в организме животного или человека.
28. Применение вектора по любому из пп.1-24, инфекционной вирусной частицы по п.26 или композиции по п.27 для приготовления препарата, предназначенного для лечения организма-хозяина, страдающего от персистентной инфекции папилломавируса, вызванной по меньшей мере одним папилломавирусом, предпочтительно по меньшей мере одним HR-HPV.
29. Применение по п.28, где указанные вектор или инфекционная вирусная частица, либо любая их комбинация включены в композицию, предпочтительно указанная композиция приготовлена в форме препарата, пригодного для инъекции, предпочтительно указанную инъекцию осуществляют путем внутримышечного или подкожного введения.
30. Применение по п.28 для лечения организма-хозяина:
a) страдающего инфекцией, вызванной по меньшей мере одним из HPV16, HPV31, HPV33, HPV35, HPV52 и HPV58, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая Е2, кодирует полипептид Е2, имеющий происхождение от HPV-16, или
b) страдающего инфекцией, вызванной по меньшей мере одним из HPV-18, HPV-39, HPV-45, HPV-51, HPV-56, HPV-59, HPV-68, HPV-70 и HPV-85, где указанная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая Е2, кодирует полипептид Е2, имеющий происхождение от HPV-18.
31. Применение по п.28, где указанное применение включает первую серию введений, осуществляемых последовательно через интервал времени, варьирующий от нескольких суток до 4 недель, с последующей второй серией введений, осуществляемых в пределах от одного до 6 месяцев после последнего введения первой серии, предпочтительно первая серия введений включает три последовательных введения с недельным интервалом, а вторая серия включает одно введение в пределах 5 или 6 месяцев после первой серии.
32. Применение по п.28, где указанные вектор, инфекционную вирусную частицу или композицию применяют для обеспечения антивирусного ответа против по меньшей мере одного из инфекционных папилломавирусов, или для индукции или активации иммунного ответа в организме животного или человека.