СПОСОБ И НАБОР ДЛЯ ДЕТЕКТИРОВАНИЯ МИКРООРГАНИЗМА

1. Способ детектирования живой клетки микроорганизма в тест-пробе, предусматривающий стадии:
a) добавления сшивающего агента, способного сшивать ДНК при облучении светом, имеющим длину волны 350-700 нм, к этой тест-пробе;
b) облучения тест-пробы, к которой добавлен сшивающий агент, светом, имеющим длину волны 350-700 нм;
c) удаления сшивающего агента, содержащегося в тест-пробе, облученной светом;
d) добавления среды к тест-пробе, из которой удален сшивающий агент, и инкубирования этой тест-пробы;
e) добавления опять сшивающего агента, способного сшивать ДНК при облучении светом, имеющим длину волны 350-700 нм, к инкубируемой тест-пробе;
f) облучения тест-пробы, к которой добавлен сшивающий агент, светом, имеющим длину волны 350-700 нм;
g) экстракции ДНК из этой тест-пробы и амплификации района-мишени экстрагированной ДНК при помощи способа амплификации нуклеиновых кислот; и
h) анализа амплифицированного продукта.
2. Способ по п.1, в котором этот амплифицированный продукт анализируют на основе калибровочной кривой, которая создана с использованием стандартной пробы микроорганизма и показывает зависимость между количеством этого микроорганизма и амплифицированного продукта.
3. Способ по п.1, в котором способом амплификации нуклеиновых кислот является способ ПЦР, LAMP, SDA, LCR или способ микроматрицы ДНК.
4. Способ по п.2, в котором способом амплификации нуклеиновых кислот является способ ПЦР, LAMP, SDA, LCR или способ микроматрицы ДНК.
5. Способ по п.3, в котором способ ПЦР выполняют с использованием ПЦР реального времени и выполняют одновременно ПЦР и анализ амплифицированного продукта.
6. Способ по п.4, в котором способ ПЦР выполняют с использованием ПЦР реального времени и выполняют одновременно ПЦР и анализ амплифицированного продукта.
7. Способ по п.1, в котором тест-пробой является пищевой продукт, проба крови, проба мочи, проба спинальной жидкости, проба синовиальной жидкости, проба плеврального выпота, промышленная вода, водопроводная вода, грунтовая вода, речная вода или дождевая вода.
8. Способ по п.2, в котором тест-пробой является пищевой продукт, проба крови, проба мочи, проба спинальной жидкости, проба синовиальной жидкости, проба плеврального выпота, промышленная вода, водопроводная вода, грунтовая вода, речная вода или дождевая вода.
9. Способ по п.3, в котором тест-пробой является пищевой продукт, проба крови, проба мочи, проба спинальной жидкости, проба синовиальной жидкости, проба плеврального выпота, промышленная вода, водопроводная вода, грунтовая вода, речная вода или дождевая вода.
10. Способ по п.4, в котором тест-пробой является пищевой продукт, проба крови, проба мочи, проба спинальной жидкости, проба синовиальной жидкости, проба плеврального выпота, промышленная вода, водопроводная вода, грунтовая вода, речная вода или дождевая вода.
11. Способ по п.5, в котором тест-пробой является пищевой продукт, проба крови, проба мочи, проба спинальной жидкости, проба синовиальной жидкости, проба плеврального выпота, промышленная вода, водопроводная вода, грунтовая вода, речная вода или дождевая вода.
12. Способ по п.6, в котором тест-пробой является пищевой продукт, проба крови, проба мочи, проба спинальной жидкости, проба синовиальной жидкости, проба плеврального выпота, промышленная вода, водопроводная вода, грунтовая вода, речная вода или дождевая вода.
13. Способ по любому из пп.1-12, в котором сшивающий агент выбран из группы, состоящей из моноазида этидия, диазида этидия, псоларена, 4,5',8-триметилпсоларена и 8-метоксипсоралена.
14. Способ по любому из пп.1-12, в котором длина района-мишени равна 50-5000 оснований.
15. Способ по п.13, в котором длина района-мишени равна 50-5000 оснований.
16. Способ по любому из пп.1-12, в котором этот микроорганизм является патогенной бактерией.
17. Способ по п.13, в котором этот микроорганизм является патогенной бактерией.
18. Способ по п.14, в котором этот микроорганизм является патогенной бактерией.
19. Способ по п.15, в котором этот микроорганизм является патогенной бактерией.
20. Способ по п.16, в котором районом-мишенью является патогенный ген.
21. Способ по п.17, в котором районом-мишенью является патогенный ген.
22. Способ по п.18, в котором районом-мишенью является патогенный ген.
23. Способ по п.19, в котором районом-мишенью является патогенный ген.
24. Способ детекции живой клетки микроорганизма в тест-пробе по п.1, который включает использование набора, содержащего следующие компоненты:
сшивающий агент, способный сшивать ДНК при облучении светом, имеющим длину волны 350-700 нм; среду и
праймер (праймеры) для амплификации района-мишени ДНК микроорганизма, который является мишенью детектирования, способом амплификации нуклеиновых кислот.
25. Способ по п.24, где способом амплификации нуклеиновых кислот является способ ПЦР, LAMP, SDA, LCR или способ микроматрицы ДНК.
26. Способ по п.24 или 25, в котором сшивающий агент выбран из группы, состоящей из моноазида этидия, диазида этидия, псоларена, 4,5',8-триметилпсоларена и 8-метоксипсоларена.