ЗАЩИЩЕННАЯ ПЕРЕДАЧА ГЕНОМНЫХ ДАННЫХ

1. Система для преобразования данных, полученных путем секвенирования из генома и обработанных с получением файла определения варианта (VCF), содержащая
первый модуль обработки, содержащий компьютерный процессор и компьютерочитаемый материальный носитель и выполненный с возможностью:
сжимать файл VCF до аннотированного файла VCF, который содержит первоначально неизбыточные данные варианта из файла VCF, на основе справочных данных;
кодировать аннотированный файл VCF;
сохранять кодированный файл VCF; и
второй модуль обработки, содержащий компьютерный процессор и компьютерочитаемый материальный носитель и выполненный с возможностью:
принимать кодированный файл VCF и
заполнять кодированный файл VCF с использованием справочных данных.
2. Система по п. 1, в которой справочные данные включают данные эталонного и альтернативного аллеля из базы данных коротких геномных вариаций (SNP).
3. Система по п. 1, в которой кодирование аннотированного файла VCF включает преобразование данных номера хромосомы и положения хромосом аннотированного файла VCF с использованием математической системы координат.
4. Реализуемый на компьютере способ преобразования данных, секвенированных из генома пациента и обработанных с получением файла определения варианта (VCF), включающий :
обеспечение наличия компьютерного процессора, выполненного с возможностью:
сжатия файла VCF до аннотированного файла VCF, который содержит первоначально неизбыточные данные варианта из файла VCF;
кодирования аннотированного файла VCF и
сохранения кодированного файла VCF на компьютерочитаемом материальном носителе.
5. Способ по п. 4, в котором сжатие файла VCF включает удаление определений вариантов, в которых связанные с качеством данные не соответствуют заданному пороговому значению.
6. Способ по п. 4, в котором сжатие файла VCF включает удаление известных вариантов с использованием данных из справочной базы данных коротких геномных вариаций (SNP).
7. Способ по п. 6, в котором известные варианты содержат информацию об эталонном и/или альтернативном аллеле.
8. Способ по п. 4, в котором кодирование аннотированного файла VCF включает преобразование данных номера хромосом и положения хромосом аннотированного файла VCF с использованием математической системы координат.
9. Способ по п. 8, в котором преобразование данных номера хромосом и положения хромосом аннотированного файла VCF с использованием математической системы координат включает преобразование данных номера хромосом и положения хромосом аннотированного файла VCF в системе циклических координат на основе значения модуля.
10. Способ по п. 9, дополнительно включающий шифрование значения модуля и инициирование передачи шифрованного значения модуля и закодированного файла VCF во второй терминал через сетевое подключение.
11. Способ по п. 8, в котором кодирование аннотированного файла VCF включает преобразование данных номера хромосом и положения хромосом аннотированного файла VCF с использованием прямоугольных координат, полярных координат или линейных координат.
12. Способ по п. 8, дополнительно включающий применение преобразования частотной области к аннотированному файлу VCF перед кодированием аннотированного файла VCF.
13. Способ по п. 4, дополнительно включающий передачу кодированного файла VCF во второй терминал через сетевое подключение.
14. Реализуемый на компьютере способ преобразования данных, секвенированных из генома пациента и преобразованных в файл определения варианта (VCF), включающий
обеспечение наличия компьютерного процессора, выполненного с возможностью:
приема файла VCF, кодированного с использованием математической системы координат, и
заполнения кодированного файла VCF данными эталонного и альтернативного аллеля с использованием данных справочной базы данных коротких геномных вариаций (SNP).
15. Способ по п. 14, дополнительно включающий декодирование кодированного файла VCF с использованием значения модуля.