АНТИТЕЛА К ICOS
ANTIBODIES TO ICOS

ПЕРЕКРЕСТНЫЕ ССЫЛКИ НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ
[0001] В данной заявке испрашивается приоритет по предварительной заявке на патент США №62/137034, поданной 23 марта 2015 г.; 62/147484, поданной 14 апреля 2015 г.; 62/156588 поданной 4 мая 2015 г.; 62/242489, поданной 16 октября 2015 г. и 62/255635, поданной 16 ноября 2015 г., каждая из которых включена в данный документ в полном объеме путем ссылки для любых целей.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
[0002] В настоящую заявку включен перечень последовательностей, который был подан в электронной форме в формате ASCII через сеть EFS-Web и тем самым в полном объеме включен в данный документ путем ссылки. Указанная копия ASCII, созданная 15 марта 2016 г., имеет название 2016-03-22_01140-0001-00PCT_ST25.txt и размер, составляющий 81925 байт.
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ
[0003] Предложены антитела, которые связываются с индуцибельным костимулятором Т-клеток (ICOS). Предложены также способы лечения, включающие введение анти-ICOS антител.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
[0004] ICOS является представителем суперсемейства иммуноглобулинов B7/CD28/CTLA-4 и специфически экспрессируется на Т-клетках. В отличие от CD28, который конститутивно экспрессируется на Т-клетках и обеспечивает костимулирующие сигналы, необходимые для полной активации покоящихся Т-клеток, ICOS экспрессируется только после начальной активации Т-клеток.
[0005] ICOS вовлечен в разнообразные аспекты реакций Т-клеток (обзор в Simpson et al., 2010, Curr.Opin.Immunol., 22:326-332). Он играет роль в образовании зародышевых центров, кооперации Т/В-клеток и переключении класса иммуноглобулинов. ICOS-дефицитные мыши демонстрируют нарушение образования зародышевого центра и показывают уменьшенную продукцию интерлейкина IL-10. Данные дефекты специфически связаны с недостаточностью в Т-фолликулярных хелперных клетках.
[0006] ICOS также играет роль в развитии и функционировании субпопуляций Т-клеток, включающих Th1, Th2 и Th7. Примечательно, что ICOS костимулирует пролиферацию Т-клеток и секрецию цитокинов, связанных как с Th1-, так и Th2-клетками. Соответственно, ICOS KO-мыши демонстрируют нарушение развития аутоиммунных фенотипов во множестве моделей заболевания, включая диабет (Th1), воспаление верхних дыхательных путей (Th2) и ЕАЕ нейровоспалительные модели (Th17).
[0007] В дополнение к его роли в модуляции функционирования Т-эффекторных (Teff) клеток, ICOS также модулирует Т-регуляторные клетки (Treg). На высоких уровнях ICOS экспрессируется на Treg, и вовлечен в гомеостаз и функционирование Treg).
[0008] При активации ICOS, связанный через дисульфиды гомодимер, индуцирует сигнал посредством механизмов PI3K и АKТ. Последующие события передачи сигнала приводят к экспрессии линии специфических факторов транскрипции (например, T-bet, GATA-3) и, в свою очередь, влияют на пролиферацию и выживаемость Т-клеток).
[0009] Лиганд ICOS (ICOSL; В7-Н2; B7RP1; CD275; GL50), также представитель суперсемейства В7, является единственным лигандом для ICOS и экспрессируется на клеточной поверхности В-клеток, макрофагов и дендритных клеток. При своем взаимодействии с ICOS, ICOSL функционирует как нековалентно связанный гомодимер на клеточной поверхности. Сообщали, что ICOSL человека, но не ICOSL мыши, связывается с CD28 и CTLA-4 человека (Yao et al., 2011, Immunity, 34:729-740).
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ СУЩНОСТИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
[0010] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывает ICOS, причем данное антитело является агонистом CD4 Т-клеток (таких как CD4 Т-эффекторные (Teff) клетки). В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывает ICOS, причем данное антитело является агонистом CD4 Т-клеток (таких как CD4 Teff-клетки) и истощает Т-регуляторные (Treg) клетки. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывает ICOS, причем данное антитело истощает Treg-клетки, но не истощает Teff-клетки. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывает ICOS, причем данное антитело индуцирует передачу сигнала pAKT на CD4 Т-клетки. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывает ICOS, причем данное антитело индуцирует передачу сигнала pAKT на CD4 Т-клетки и истощает Treg-клетки. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывается с ICOS, причем данное антитело содержит:
i) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 12; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 13; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 14; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 15; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 16; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 17; или
ii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 42; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 43; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 44; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 45; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 46; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 47; или
iii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 62; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 63; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 64; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 65; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 66; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 67; или
iv) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 22, 62, 72, 82, 92, 102 и 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 23, 63, 73, 83, 93, 103 и 113; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 24, 64, 74, 84, 94, 104 и 114; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 25, 65, 75, 85, 95, 105 и 115; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 26, 66, 76, 86, 96, 106 и 116; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 27, 67, 77, 87, 97, 107 и 117; или
v) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 32, 162, 172 и 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 33,163,173 и 183; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 34, 164, 174 и 184; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 35, 165,175 и 185; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 36, 166, 176 и 186; and (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 37, 167, 177 и 187; или
vi) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 52, 122, 132, 142 и 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 53,123,133, 143 и 153; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 54, 124, 134, 144 и 154; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 55,125,135, 145 и 155; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 56, 126, 136, 146 и 156; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 57,127,137, 147 и 157; или
vii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 22; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 23; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 24; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 25; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 26; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 27; или
viii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 32; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 33; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 34; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 35; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 36; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 37; или
ix) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 52; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 53; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 54; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 55; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 56; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 57; или
x) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 72; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 73; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 74; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 75; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 76; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 77; или
xi) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 82; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 83; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 84; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 85; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 86; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 87; или
xii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 92; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 93; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 94; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 95; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 96; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 97; или
xiii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 102; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 103; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 104; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 105; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 106; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 107; или
xiv) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 113; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 114; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 115; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 116; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 117; или
xv) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 122; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 123; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 124; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 125; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 126; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 127; или
xvi) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 132; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 133; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 134; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 135; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 136; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 137; или (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 142; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 143; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 144; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 145; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 146; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 147; или
xvii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 153; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 154; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 155; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 156; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 157; или
xviii) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 162; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 163; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 164; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 165; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 166; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 167; или
xix) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 172; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 173; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 174; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 175; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 176; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 177; или
xx) (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 183; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 184; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 185; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 186; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 187.
H
L
[0011] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено антитело, которое связывается с ICOS, причем данное антитело содержит вариабельный участок тяжелой цепи (V) и вариабельный участок легкой цепи (V), при этом:
H
L
i) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 10, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 11; или
H
L
ii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 20, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 21; или
H
L
iii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 30, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 31; или
H
L
iv) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 40, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 41; или
H
L
v) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 50, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 51; или
H
L
vi) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 60, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 61; или
H
L
vii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 70, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 71; или
H
L
viii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 80, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 81; или
H
L
ix) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 90, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 91; или
H
L
x) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 100, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 101; или
H
L
xi) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 110, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 111; или
H
L
xii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 120, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 121; или
H
L
xiii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 130, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 131; или
H
L
xiv) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 140, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 141; или
H
L
xv) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 150, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 151; или
H
L
xvi) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 160, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 161; или
H
L
xvii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 170, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 171; или
H
L
xviii) V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 180, a V является по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичным аминокислотной последовательности SEQ ID NO 181).
H
L
[0012] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено антитело, которое связывается с ICOS, причем данное антитело содержит вариабельный участок тяжелой цепи (V) и вариабельный участок легкой цепи (V), при этом:
H
L
i) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 10, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 11; или
H
L
ii) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 20, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 21; или
H
L
iii) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 30, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 31; или
H
L
iv) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 40, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 41; или
H
L
v) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 50, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 51; или
H
L
vi) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 60, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 61; или
H
L
vii)V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 70, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 71; или
H
L
viii) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 80, а V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 81; или
H
L
ix) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 90, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 91; или
H
L
x) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 100, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 101; или
H
L
xi) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 110, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 111; или
H
L
xii)V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 120, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 121; или
H
L
xiii) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 130, а V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 131; или
H
L
xiv) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 140, а V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 141; или
H
L
xv) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 150, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 151; или
H
L
xvi) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 160, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 161; или
H
L
xvii) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 170, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 171; или
H
L
xviii) V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 180, a V содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO 181.
2
[0013] В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой моноклональное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой химерное антитело или гуманизированное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой фрагмент антитела, выбранный из фрагмента Fab, Fab', Fv, scFv или (Fab'). В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой полноразмерное антитело).
[0014] В некоторых вариантах реализации предложено выделенное антитело, которое связывается с ICOS, причем данное антитело содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO 188, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO 189.
[0015] В некоторых вариантах реализации изобретения введение антитела млекопитающему приводит к увеличению Т-эффекторных (Teff) клеток в организме млекопитающего. В некоторых вариантах реализации изобретения введение антитела млекопитающему приводит к активации Т-эффекторных (Teff) клеток в организме млекопитающего. В некоторых вариантах реализации изобретения введение антитела млекопитающему увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения введение антитела млекопитающему приводит к уменьшению Т-регуляторных (Treg) клеток в организме млекопитающего. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками.
D
D
2
[0016] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывается с ICOS человека, причем данное антител также связывается с ICOS мыши и/или ICOS крысы. В некоторых вариантах реализации изобретения выделенное антитело связывается с ICOS человека с аффинностью (K) менее 5 нМ. В некоторых вариантах реализации изобретения выделенное антитело связывается с ICOS крысы с аффинностью (K) менее 10 нМ. В некоторых вариантах реализации изобретения аффинность определяют с использованием интерферонометрии в биослое (см., например, Abdiche et al., 2008, Anal Biochem, 377:209-217; и система ForteBio Octet). В некоторых вариантах реализации изобретения антитело связывается с ICOS человека, ICOS мыши и ICOS крысы. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело связывается с ICOS яванского макака. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой моноклональное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой химерное антитело или гуманизированное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой фрагмент антитела, выбранный из фрагмента Fab, Fab', Fv, scFv или (Fab'). В некоторых вариантах реализации изобретения антитело представляет собой полноразмерное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения введение антитела млекопитающему приводит к увеличению Т-эффекторных (Teff) клеток в организме млекопитающего. В некоторых вариантах реализации изобретения введение антитела млекопитающему приводит к активации Т-эффекторных (Teff) клеток в организме млекопитающего. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения введение антитела млекопитающему приводит к уменьшению Т-регуляторных (Treg) клеток в организме млекопитающего. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающее выбирают из мыши, крысы, яванского макака и человека).
[0017] В некоторых вариантах реализации изобретения после лечения опухолевой ткани легкого с помощью антитела, предложенного в данном документе, уровень хемокина или цитокина, выбранного из GZMa, GZMb, CSF2, IL2, CXCL9, CXCL10, CXCL11 и CXCL13 обеспечивает по меньшей мере 2-кратное, или по меньшей мере 3-кратное превышение уровня такого хемокина после лечения опухолевой ткани легкого с помощью контрольного антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень мРНК. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень белка. В некоторых вариантах реализации изобретения контрольное антитело представляет собой изотипно соответствующее антитело, которое связывается с неродственным антигеном и которое, как предполагается, не обладает влиянием на уровни хемокинов. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 1 час, 2 часа, 3 часа, 4 часа, 5 часов или 6 часов после лечения. В некоторых вариантах реализации изобретения хемокин представляет собой CXCL11. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 6 часов, 8 часов, 10 часов, 12 часов, 14 часов, 16 часов, 18 часов, 20 часов, 22 часа, 24 часа, 36 часов или 48 часов после лечения. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 24 часа после лечения. В некоторых вариантах реализации изобретения опухолевая ткань легкого представляет собой опухолевую ткань легкого человека.
[0018] В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, предложенное в данном документе, увеличивает уровень по меньшей мере одного хемокина и/или цитокина, выбранного из GZMa, GZMb, CSF2, IL2, CXCL9, CXCL10, CXCL11 и CXCL13, в организме млекопитающего, которому ввели антитело, по меньшей мере в 2 раза. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 1 час, 2 часа, 3 часа, 4 часа, 5 часов или 6 часов после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень мРНК. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень белка. В некоторых вариантах реализации изобретения хемокин представляет собой CXCL11. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 6 часов, 8 часов, 10 часов, 12 часов, 14 часов, 16 часов, 18 часов, 20 часов, 22 часа, 24 часа, 36 часов или 48 часов после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 24 часа после введения антитела.
[0019] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело-агонист, предложенное в данном документе, причем данное антитело увеличивает уровень по меньшей мере одного хемокина и/или цитокина, выбранного из GZMa, GZMb, CSF2, IL2, CXCL9, CXCL10, CXCL11 и CXCL13, в организме млекопитающего, которому ввели антитело, по меньшей мере в 2 раза. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело-агонист, предложенное в данном документе, причем данное антитело увеличивает уровень по меньшей мере одного хемокина и/или цитокина, выбранного из GZMa, GZMb, CSF2, IL2, CXCL9, CXCL10 и CXCL11, в организме млекопитающего, которому ввели антитело, по меньшей мере в 2 раза. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 1 час, 2 часа, 3 часа, 4 часа, 5 часов или 6 часов после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень мРНК. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень белка. В некоторых вариантах реализации изобретения хемокин представляет собой CXCL11. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 6 часов, 8 часов, 10 часов, 12 часов, 14 часов, 16 часов, 18 часов, 20 часов, 22 часа, 24 часа, 36 часов или 48 часов после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 24 часа после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающее является человеком. В некоторых вариантах реализации человек болен раковым заболеванием. В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), почечноклеточной карциномы (RCC), рака желудка, рака мочевого пузыря, диффузной В-крупноклеточной лимфомы (DLBCL), лимфомы Ходжкина, рака яичника, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, рака желудка, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC).
[0020] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено антитело, которое связывается с ICOS, причем данное антитело увеличивает уровень лиганда для NKp46 (NKp46-L) на Т-клетках. В некоторых вариантах реализации изобретения увеличенный уровень NKp46-L на Т-клетках определяют с использованием растворимого внеклеточного домена NKp46 в анализе проточной цитометрии. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело увеличивает уровень NKp46-L на Treg-клетках больше, чем антитело увеличивает уровень NKp46-L на Teff-клетках. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело увеличивает сбрасывание CD 16 на NK-клетках).
[0021] В некоторых вариантах реализации предложена выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело, описанное в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложен вектор, содержащий данную нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации изобретения клетка-хозяин содержит предложенный вектор. В некоторых вариантах реализации изобретения предложена клетка-хозяин, которая продуцирует антитело, описанное в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложен способ получения анти-ICOS антитела, включающий культивирование клетки-хозяина в условиях, подходящих для экспрессии антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения способ включает выделение антитела, которое продуцируется клеткой-хозяином.
[0022] В некоторых вариантах реализации предложена фармацевтическая композиция, содержащая анти-ICOS антитело, описанное в настоящем документе, и фармацевтически приемлемый носитель.
[0023] В некоторых вариантах реализации изобретения предложены способы лечения ракового заболевания, включающие введение эффективного количества анти-ICOS антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), почечноклеточной карциномы (RCC), рака желудка, рака мочевого пузыря, диффузной В-крупноклеточной лимфомы (DLBCL), лимфомы Ходжкина, рака яичника, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, рака желудка, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC).
[0024] В некоторых вариантах реализации изобретения предложен способ увеличения количества Т-эффекторных (Teff) клеток в организме млекопитающего, включающий введение эффективного количества анти-ICOS антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения способ дополнительно включает активацию Teff-клеток. В некоторых вариантах реализации изобретения предложен способ активации Т-эффекторных (Teff) клеток в организме млекопитающего, включающий введение эффективного количества анти-ICOS антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложен способ увеличения соотношения Teff-клеток к Treg-клеткам в организме млекопитающего, включающий введение эффективного количества анти-ICOS антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения способ дополнительно включает уменьшение количества Т-регуляторных (Treg) клеток.
[0025] В некоторых вариантах реализации изобретения предложен способ уменьшения количества Т-регуляторных (Treg) клеток в организме млекопитающего, включающий введение эффективного количества анти-ICOS антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками).
[0026] В некоторых вариантах реализации изобретения предложен способ увеличения уровня по меньшей мере одного хемокина и/или цитокина, выбранного из GZMa, GZMb, CSF2, IL2, CXCL9, CXCL10, CXCL11 и CXCL13, в организме млекопитающего, включающий введение млекопитающему антитела, предложенного в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень по меньшей мере одного хемокина увеличивается по меньшей мере в 2 раза или по меньшей мере в 3 раза. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 1 час, 2 часа, 3 часа, 4 часа, 5 часов или 6 часов после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень мРНК. В некоторых вариантах реализации изобретения данный уровень представляет собой уровень белка. В некоторых вариантах реализации изобретения хемокин представляет собой CXCL11. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 6 часов, 8 часов, 10 часов, 12 часов, 14 часов, 16 часов, 18 часов, 20 часов, 22 часа, 24 часа, 36 часов или 48 часов после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения уровень хемокина измеряют через 24 часа после введения антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающее является человеком. В некоторых вариантах реализации человек болен раковым заболеванием. В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), почечноклеточной карциномы (RCC), рака желудка, рака мочевого пузыря, диффузной В-крупноклеточной лимфомы (DLBCL), лимфомы Ходжкина, рака яичника, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, рака желудка, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC).
[0027] В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающее является человеком.
[0028] В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающему вводят по меньшей мере одно дополнительное лекарственное средство. В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство вводят одновременно или последовательно с анти-ICOS антителом. В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет собой терапию PD-1. В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство выбирают из анти-PD-1 антитела и анти-PD-L1 антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с ниволумабом. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с пембролизумабом. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с атезолизумабом. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с авелумабом. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с дурвалумабом.
[0029] В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет собой противораковую вакцину. В некоторых таких вариантах реализации изобретения противораковую вакцину разрабатывают с использованием неоантигена. В некоторых вариантах реализации изобретения противораковая вакцина представляет собой ДНК-вакцину. В некоторых вариантах реализации изобретения противораковая вакцина представляет собой сконструированный вирус, содержащий раковый антиген, такой как PROSTVAC (рилимоген галвацирепвек/рилимоген глафоливек). В некоторых вариантах реализации изобретения противораковая вакцина содержит сконструированные опухолевые клетки, такие как GVAX).
[0030] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с анти-ОХ40 антителом-агонистом. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с анти-CTLA4 антителом. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с ипилимумабом.

[0031] В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет собой химиотерапевтическое средство. Неограничивающие типовые химиотерапевтические средства включают капектиабин, циклофосфамид, дакарбазин, темозоломид, циклофосфамид, доцетаксел, доксорубицин, даунорубицин, цисплатин, карбоплатин, эпирубицин, эрибулин, 5-ФУ, гемцитабин, иринотекан, иксабепилон, метотрексат, митоксантрон, оксалиплатин, паклитаксел, наб-паклитаксел, ABRAXANE (связанный с белком паклитаксел), пеметрексед, винорелбин и винкристин. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с ABRAXANE (Celgene). В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с по меньшей мере одним ингибитором киназ. Неограничивающие типовые ингибиторы киназ включают эрлотиниб, афатиниб, гефитиниб, кризотиниб, дабрафениб, траметиниб, вемурафениб и кобиметаниб.
[0032] В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет собой ингибитор IDO. Неограничивающие типовые ингибиторы IDO включают индоксимод (New Link Genetics), INCB024360 (Incyte Corp), 1-метил-D- триптофан (New Link Genetics) и GDC-0919 (Genentech). В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет иммуномодулирующее средство. Неограничивающие типовые IMiD включают талидомид, леналидомид и помалидомид.
[0033] В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающее получает терапию CAR-T в дополнение к введению анти-ICOS антитела, описанного в данном документе.
[0034] В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающее подвергают хирургическому вмешательству и/или радиационной терапии дополнительно к введению анти-ICOS антитела, описанного в данном документе, с дополнительным лекарственным средством или без него. В некоторых вариантах реализации изобретения млекопитающее подвергают радиационной терапии дополнительно к введению анти-ICOS антитела, описанного в данном документе, с дополнительным лекарственным средством или без него).
[0035] В некоторых вариантах реализации изобретения применение антитела, описанного в данном документе, предусмотрено для производства лекарственного средства для лечения ракового заболевания. В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), почечноклеточной карциномы (RCC), рака желудка, рака мочевого пузыря, диффузной В-крупноклеточной лимфомы (DLBCL), лимфомы Ходжкина, рака яичника, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, рака желудка, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения лекарственное средство предназначается для введения с по меньшей мере одним дополнительным лекарственным средством. В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство выбирают из анти-PD-1 антитела и анти-PD-L1 антитела.
[0036] В некоторых вариантах реализации изобретения применение антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе, предусмотрено для лечения ракового заболевания. В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), почечноклеточной карциномы (RCC), рака желудка, рака мочевого пузыря, диффузной В-крупноклеточной лимфомы (DLBCL), лимфомы Ходжкина, рака яичника, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, рака желудка, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC).
[0037] В некоторых вариантах реализации изобретения для лечения ракового заболевания предусмотрено применение антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе, и по меньшей мере одного дополнительного лекарственного средства. В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство выбирают из анти-PD-1 антитела и анти-PD-L1 антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), почечноклеточной карциномы (RCC), рака желудка, рака мочевого пузыря, диффузной В-крупноклеточной лимфомы (DLBCL), лимфомы Ходжкина, рака яичника, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, рака желудка, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC).
[0038] В некоторых вариантах реализации изобретения предусмотрено применение антитела, описанного в данном документе, или фармацевтической композиции, описанной в данном документе, для лечения ракового заболевания. В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), почечноклеточной карциномы (RCC), рака желудка, рака мочевого пузыря, диффузной В-крупноклеточной лимфомы (DLBCL), лимфомы Ходжкина, рака яичника, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). В некоторых вариантах реализации изобретения раковое заболевание выбирают из меланомы, рака желудка, плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC).
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ
[0039] Фигура 1А-В. Уровни мРНК ICOS, определенные среди множества опухолей человека.А) На диаграмму нанесены средняя интенсивность и 75% доверительные интервалы нормализованных уровней мРНК ICOS при различных показаниях. Отмечены (точками) образцы с интенсивностями, выходящими за пределы 75% доверительного интервала. В) Процентное значение каждого отмеченного типа опухоли, демонстрирующее окрашивание ICOS 0, 1+, 2+ или 3+ методом иммуногистохимии (ИГХ)).
[0040] Фигура 2. Корреляция экспрессии ICOS с инфильтрацией Т-клеток. Уровни мРНК ICOS из ~450 опухолей HNSCC сравнивали с 12 генным показателем хемокиновой сигнатуры, связанной с Т-клетками или уровнями мРНК FoxP3. Уровни нормализованной хемокиновой сигнатуры или мРНК FoxP3 для каждой опухоли откладывали на Y-оси, а уровни мРНК ICOS откладывали на Х-оси. Корреляция взаимосвязи Спирмана (R) показана на графике [Corr(S)]. Корреляция >0,75 (R Спирмана) показана как отсечение для сильной корреляции.
[0041] Фигура 3. Экспрессию мРНК ICOS сравнивали для ~450 опухолей HNSCC с использованием данных секвенирования TCGA РНК (NCI). Уровни нормализованной мРНК CTLA-4 или PD-1, или PD-L1 для каждой опухоли откладывали на Y-оси, а уровни мРНК ICOS откладывали на Х-оси. Корреляция взаимосвязи Спирмана (R) показана на графике [Corr(S)]. Уровни экспрессии ICOS значимо коррелировали с экспрессией молекул контрольных точек CTLA-4, PD-1. Наблюдалась слабая корреляция между ICOS и PD-L1. Корреляция >0,75 (R Спирмана) показана как отсечение для сильной корреляции).
[0042] Фигура 4. Репрезентативные изображения различающихся интенсивностей окрашивания ICOS в опухоли NSCLC человека.
[0043] Фигура 5. Распределение плотности клеток ICOS в опухолях человека. Плотность клеток ICOS определяли в каждой из опухолей человека и среднюю плотность ICOS из каждого типа опухоли откладывали на Y-оси [NSCLC (N=100); HNSCC (N=102); рак молочной железы, все основные подтипы (N=94); трижды негативный подтип рака молочной железы, TNBC (N=95); рак яичника (N=94)]. Статистический анализ проводили с использованием дисперсионного анализа ANOVA.
[0044] Фигура 6. Разнообразие плотности клеток ICOS в образцах NSCLC.A) Плотность экспрессии ICOS оценивали в наборе образцов опухолей легкого (N=98) и опухоли ранжировали на основе плотности ICOS+позитивных клеток / мм2.В) Разнообразие экспрессии ICOS во второй независимой когорте клинических образцов NSCLC (N=204)).
[0045] Фигура 7. Распределение плотности клеток ICOS в различных субпопуляциях Т-клеток из раковых образований человека.А) Репрезентативное изображение, отображающее окрашивание ICOS в различимых компартментах Т-клеток. Стрелки указывают на ICOS+ FOXP3+ Treg-клетки или ICOS+ CD8- CD4 эффекторы.В) Плотность клеток ICOS из отдельных опухолей анализировали в FoxP3-позитивных CD4 Treg-клетках или СВ8-позитивных Т-клетках или CD8-негативных и FoxP3-негативных CD4 eff-клетках. Отмечены средняя плотность ICOS и стандартное отклонение для каждого из этих типов опухолей). [Рак легкого (N=100); HNSCC (N=102); трижды негативный подтип рака молочной железы, TNBC (N=95); рак яичника (N=94)].
[0046] Фигура 8А-В. Высокую экспрессию ICOS наблюдали в опухолях NSCLC с высоким уровнем PD-L1. С помощью использования PD-L1/ICOS/PD-1 мультиплексного анализа ИГХ авторы оценивали уровни ICOS и PD-L1 в наборе аденокарциномы из NSCLC (n=150).А) Репрезентативные изображения опухоли с высоким уровнем PD-L1 (левое изображение) или низким уровнем PD-L1 (правое изображение), окрашенных ICOS, PD-1 и PD-L1.B) Количественное определение плотности клеток ICOS в клетках с высоким уровнем PD-L1 (>5% клеток позитивные по PD-L1) или с низким уровнем PD-L1 (<5% клеток позитивные по PD-L1) плоскоклеточной карциномы (левое изображение) и аденокарциномы (правое изображение).
[0047] Фигура 9А-С. Т1Е-анализ опухолей человека показывает экспрессию ICOS в Treg-клетках и CD4-эффекторах.А) Репрезентативные контурные графики экспрессии PD-1 и ICOS в различных субпопуляциях Т-клеток от пациентов с HNSCC (N=4).В) Показана частота встречаемости клеток, позитивных только по ICOS, или ICOS PD-1 дважды позитивных клеток в компартменте Т-клеток (HNSCC N=4; NSCLC N=3; яичник N=4).C) Сравнение уровней ICOS в CD4 Treg-клетках и CD4 Teff-клетках. На графике отложена интенсивность окрашивания ICOS, измеренная по средней интенсивности флуоресценции (MFI; или среднее геометрическое ICOS) в субпопуляциях CD4 Т-клеток из образцов опухолей пациентов.
[0048] Фигура 10А-С.А) Показано влияние анти-ICOS антител на пролиферацию первичных CD4+ Т-клеток человека в связанной с планшетом форме в присутствии субоптимальной концентрации анти-CD3. На графике отмечен процент делящихся клеток.В) Показано влияние анти-ICOS антител на пролиферацию CD4+ Т-клеток человека в растворенной форме в присутствии субоптимальной концентрации РМА. На графике отмечен процент делящихся клеток.С) Влияние анти-ICOS антитела 37A10S713-hIgG1 на пролиферацию первичных CD4+ Т-клеток человека в связанной с планшетом форме в присутствии субоптимальной концентрации анти-CD3.
[0049] Фигура 11А-В. Показана оценка анти-ICOS антител в анализе по репортерному гену NF-kB. На графиках показаны процентные содержания клеток GFP+).
[0050] Фигура 12. Показана оценка растворимых анти-ICOS антител в анализе с использованием РВМС со стимуляцией суперантигеном (SEB). Считанные данные представляют собой продукцию IFNg.
[0051] Фигура 13. Оценивали анти-ICOS антитела на потенциальный суперагонизм в анализе пролиферации Т-клеток человека в отсутствии анти-CD3. Считанные в этом анализе данные представляют собой процентное значение пролиферации).
[0052] Фигура 14А-В. Оценка анти-ICOS антитела в анализе фосфо-AKT (pAKT) в присутствии или отсутствии вторичного кросс-линкера. Считанные данные представляют собой процент CD4 Т-клеток, являющихся pAKT-позитивными.А) Результаты в отсутствии вторичного кросс-линкера.В) Результаты в присутствии вторичного кросс-линкера).
[0053] Фигура 15А-В. Оценивали анти-ICOS антитела в синергической модели Sa1/N фибросаркомы. Величина роста опухоли отложена на y-оси.А) Пунктирные линии указывают рост опухоли у отдельных мышей; сплошная линия указывает кривую среднего роста для данной группы. Указано количество безопухолевых мышей на группу.В) Средний объем опухоли в каждой группе лечения.
[0054] Фигура 16. Безопухолевым мышам, которым предварительно вводили анти-ICOS 7F12, повторно имплантировали опухоли Sa1/N. Величина роста опухоли отмечена на y-оси.
[0055] Фигура 17. Влияние анти-ICOS антитела хомячка 37А10 с Fc mG1 и mG2a на рост опухолей Sa1/N. Пунктирные линии указывают индивидуальный рост опухоли у отдельных мышей; сплошная линия указывает кривую среднего роста для данной группы. Указано количество безопухолевых мышей на группу.
[0056] Фигура 18. Оценка анти-ICOS антител в качестве единственных средств или в комбинации с анти-PD1 в синергической модели опухоли СТ26. Пунктирные линии указывают отдельных мышей; сплошная линия указывает кривую среднего роста для данной группы. Указа но количество безопухолевых мышей на группу).
[0057] Фигура 19. Истощение FoxP3+ Treg в опухолях Sa1/N при лечении анти-ICOS антителом. Показана частота встречаемости CD8, CD4 Teff- и Treg-клеток в селезенке и опухоли и количество Treg на мг опухоли. Каждый значок показывает отдельную мышь).
[0058] Фигура 20. Истощение Treg и активация в Teff-клеток в опухолях Sa1/N при лечении анти-ICOS антителом. Верхний ряд: Частота встречаемости CD8, CD4 Teff- и Treg-клеток, соотношение CD8 и Treg и частота встречаанти-ICOS антитела хомячка 37А10 с Fc mG1 и mG2a на рост опухолей Sa1/N. Пунктирные линии указывают индивидуальный рост опухоли у отдельных мышей; сплошная линия указывает кривую среднего роста для данной группы. Указано количество безопухолевых мышей на группу.
[0059] Фигура 21. Оценка анти-ICOS антитела в модели опухоли Sa1/N после истощения Т-клеток. На графике отложен рост опухоли с течением времени. Указано количество безопухолевых мышей.
[0060] Фигура 22А-В.А) Уменьшение Teg-клеток в анализе с использованием РВМС при лечении гуманизированным анти-ICOS антителом.В) Treg- и Teff-клетки экспрессируют сходные уровни ICOS после пяти дней лечения IL-2.
[0061] Фигура 23. Повторное имплантирование опухолей после лечения анти-ICOS антителом. Левое изображение показывает объем опухоли у мышей после введения одной из двух доз анти-ICOS антитела. Правое изображение показывает объем опухоли у контрольных мышей или мышей, которые были безопухолевыми после анти-ICOS антитела, с последующим повторным имплантированием опухолей.
[0062] Фигура 24А-В. Увеличение экспрессии ICOSL у несущих опухоли Sa1/N мышей (А) и яванских макак (В), которым вводили анти-ICOS антитело.
[0063] Фигура 25. Изменение экспрессии хемокина Th-1 и цитокинов после лечения ткани опухоли легкого анти-ICOS антителом (правые изображения) или анти-PD-1 антителом (левые изображения), через 6 часов (верхние изображения) или 24 часов (нижние изображения).
[0064] Фигура 26. Уровни лигандов NKp46 на Teff-клетках (А, С, Е) и Treg-клетках (В, D, F) от трех различных доноров, после лечения агонистическим и антагонистическим анти-ICOS антителом.
[0065] Фигура 27. Потеря CD16 (сбрасывание CD16) с NK-клеток, обработанных анти-ICOS антителом-агонистом.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ НЕКОТОРЫХ ВАРИАНТОВ РЕАЛИЗАЦИИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
[0066] Предложены антитела, которые связывают ICOS. Предложены также тяжелые цепи и легкие цепи антител, которые способны образовывать антитела, связывающие ICOS. В дополнение к этому, предложены антитела, тяжелые цепи и легкие цепи, содержащие один или более конкретных определяющих комплементарность участков (CDR). Предложены полинуклеотиды, кодирующие антитела к ICOS. Предложены также полинуклеотиды, кодирующие тяжелые цепи или легкие цепи антител. Предложены способы получения и/или очистки антител к ICOS. Предложены способы лечения с использованием антител к ICOS. Такие способы включают, но не ограничиваются способом лечения ракового заболевания. Предложены методы выявления ICOS. Такие методы включают методы идентификации индивида, который может получить пользу от лечения анти-ICOS антителом, контроля лечения индивида анти-ICOS антителом и улучшения терапевтической эффективности анти-ICOS антитела у индивида.
[0067] Названия разделов, используемые в настоящем документе, предназначены лишь для организационных целей, и их не следует толковать как ограничение описанного объекта изобретения.
[0068] Все упомянутые в данном документе источники, включая патентные заявки, патентные публикации и номера доступа Genbank, полностью включены в настоящий документ путем ссылок, как если бы каждый отдельный источник был специально и по отдельности включен путем ссылки в полном объеме.
[0069] Способы и процедуры, описанные или упомянутые в настоящем документе, в целом хорошо известны и обычно применяются специалистами в данной области техники с использованием обычной методики, такой как, например, широко используемые методики, описанные в Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3rd. edition (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY (F.M. Ausubel, et al. eds., (2003)); серии METHODS IN ENZYMOLOGY (Academic Press, Inc.): PCR 2:A PRACTICAL APPROACH (M.J. MacPherson, B.D. Hames and G.R. Taylor eds. (1995)), Harlow and Lane, edc. (1988) ANTIBODIES, A LABORATORY MANUAL и ANIMAL CELL CULTURE (R.I. Freshney, ed. (1987)); Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait, ed., 1984); Methods in Molecular Biology, Humana Press; Cell Biology: A Laboratory Notebook (J.E. Cellis, ed., 1998%) Academic Press; Animal Cell Culture (R.I. Freshney), ed., 1987); Introduction to Cell and Tissue Culture (J.P. Mather and P.E. Roberts, 1998) Plenum Press; Cell and Tissue Culture Laboratory Procedures (A. Doyle, J.B. Griffiths, and D.G. Newell, eds., 1993-8) J.Wiley and Sons; Handbook of Experimental Immunology (D.M. Weir and C.C. Blackwell, eds.); Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J.M. Miller and M.P. Calos, eds., 1987); PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., eds., 1994); Current Protocols in Immunology (J.E. Coligan et al., eds., 1991); Short Protocols in Molecular Biology (Wiley and Sons, 1999); Immunobiology (C.A. Janeway and P. Travers, 1997); Antibodies (P. Finch, 1997); Antibodies: A Practical Approach (D.Catty., ed., IRL Press, 1988-1989); Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (P.Shepherd and C.Dean, eds., Oxford University Press, 2000); Using Antibodies: A Laboratory Manual (E.Harlow and D.Lane (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999); The Antibodies (M.Zanetti and J.D. Capra, eds., Harwood Academic Publishers, 1995); and Cancer: Principles and Practice of Oncology (V.T. DeVita et al., eds., J.B. Lippincott Company, 1993) и их обновленных версиях.
I. Определения
[0070] Если не определено иное, научные и технические термины, используемые в связи с настоящим описанием, будут иметь значения, которые обычно понятны средним специалистам в данной области техники. Дополнительно, если по контексту не требуется иное или это не выражается явным образом, термины в единственном числе будут включать множественное число, а термины во множественном числе будут включать единственное число. При любом конфликте в определениях между различными источниками или ссылками, управляющим будет определение, предложенное в данном документе).
[0071] Следует понимать, что и варианты реализации изобретения, описанные в данном документе, включают определения «состоящие» и/или «состоящие по существу из». В настоящем документе формы единственного числа включают определяемые объекты во множественном числе, если не указано иное. Применение в данном документе термина «или» не подразумевает ввиду, что альтернативные варианты являются взаимоисключающими.
[0072] В данной заявке использование «или» означает «и/или», если явным образом не указано или специалистом в данной области не понимается иное. В контексте множества независимых пунктов формулы изобретения, применение «или» возвращает к рассмотрению более одного предыдущего независимого или зависимого пункта).
[0073] Как понятно специалисту в данной области техники, указание «около» при значении или параметре в настоящем документе включает (и описывает) варианты реализации изобретения, направленные на само это значение или параметр. Например, описание, ссылаясь на «около X», включает описание «X».
[0074] Термины «молекула нуклеиновой кислоты», «нуклеиновая кислота» и «полинуклеотид» могут применяться взаимозаменяемо и относиться к полимеру нуклеотидов. Такие полимеры нуклеотидов могут содержать природные и/или не встречающиеся в природе нуклеотиды, и включают, но не ограничиваются ими, ДНК, РНК и ПНК. «Нуклеотидная последовательность» относится к линейной последовательности нуклеотида, которая содержит молекулу нуклеиновой кислоты или полинуклеотид).
[0075] Термины «полипептид», «пептид» и «белок» в данном документе используются взаимозаменяемо и относятся к полимеру из аминокислотных остатков и не ограничены минимальной длиной. Такие полимеры из аминокислотных остатков могут содержать природные или не встречающиеся в природе аминокислотные остатки и включать, но не ограничиваться ими, пептиды, олигопептиды, димеры, тримеры и мультимеры аминокислотных остатков. Данным определением охватываются как полноразмерные белки, так и их фрагменты. Термины также включают модификации полипептида после экспрессии, например, гликозилирование, сиалирование, ацелирование, фосфорилирование и тому подобное. Кроме того, для целей настоящего описания, «полипептид» относится к белку, который включает модификации, такие как делеции, добавления и замены (в целом консервативные по природе), в нативную последовательность, при условии, что белок сохраняет требуемую активность. Эти модификации могут быть преднамеренными, как в случае сайт-направленного мутагенеза, или могут быть случайными, такими как мутации хозяев, которые продуцируют белки, или ошибки при амплификации ПЦР).
[0076] «ICOS» и «костимуляция индуцибельных Т-клеток», как используется в данном документе, относится к любому нативному ICOS, который приводит к экспрессии и процессингу ICOS в клетке. Данный термин включает ICOS любого вида позвоночных, в том числе млекопитающих, например, приматов (например, людей и яванских макак) и грызунов (например, мышей и крыс), если не указано иное. Данный термин также включает варианты ICOS природного происхождения, например, сплайс-варианты или аллельные варианты. Аминокислотная последовательность типичного белка-предшественника ICOS человека с сигнальной последовательностью (сигнальная последовательность, аминокислоты 1-20) показана в SEQ ID NO 1. Аминокислотная последовательность типичного зрелого ICOS человека показана в SEQ ID NO 2. Аминокислотная последовательность типичного белка-предшественника ICOS мыши с сигнальной последовательностью (сигнальная последовательность, аминокислоты 1-20) показана в SEQ ID NO 3. Аминокислотная последовательность типичного зрелого ICOS мыши показана в SEQ ID NO 4. Аминокислотная последовательность типичного белка-предшественника ICOS крысы с сигнальной последовательностью (сигнальная последовательность, аминокислоты 1-20) показана в SEQ ID NO 190. Аминокислотная последовательность типичного зрелого ICOS крысы показана в SEQ ID NO 191. Аминокислотная последовательность типичного белка-предшественника ICOS яванского макака с сигнальной последовательностью (сигнальная последовательность, аминокислоты 1-20) показана в SEQ ID NO 5. Аминокислотная последовательность типичного зрелого ICOS яванского макака показана в SEQ ID NO 6.
[0077] Термин «специфически связывает» по отношению к антигену или эпитопу представляет собой термин, который хорошо понятен в данной области техники, и способы определения такого специфического связывания также хорошо известны в данной области техники. Говорят, что молекула проявляет «специфическое связывание» или «предпочтительное связывание», если она реагирует или ассоциируется чаще, быстрее, более продолжительно и/или с большей аффинностью с конкретной клеткой или веществом, по сравнению со связыванием с альтернативными клетками или веществами. Антитело «специфически связывается» или «предпочтительно связывается» с мишенью, если оно связывается с более высокой аффинностью, авидностью, легче и/или на более продолжительно, по сравнению со связыванием с другими мишенями. Например, антитело, специфически или предпочтительно связывающееся с эпитопом ICOS, представляет собой антитело, связывающее этот эпитоп с более высокой аффинностью, авидностью, легче и/или более продолжительно по сравнению со связыванием с другими эпитопами ICOS и эпитопами, отличными от ICOS. Из этого определения становится также понятно, например, что антитело (или фрагмент или эпитоп), которое специфически или предпочтительно связывается с первой мишенью, может или не может специфически или предпочтительно связываться со второй мишенью. Как таковое, «специфическое связывание» или «предпочтительное связывание» необязательно требует (хотя оно может и включать в себя) исключительное связывание. В целом, но не обязательно, упоминание связывания означает предпочтительное связывание. «Специфичность» относится к способности связывающего белка к селективному связыванию антигена).
[0078] Как используется в данном документе, «практически чистый» относится к веществу, которое является по меньшей мере на 50% чистым (а именно, свободным от загрязняющих веществ), предпочтительнее по меньшей мере на 90% чистым, предпочтительнее по меньшей мере на 95% чистым, еще предпочтительнее по меньшей мере на 98% чистым и предпочтительнее всего по меньшей мере на 99% чистым).
[0079] Как используется в данном документе, термин «эпитоп» относится к сайту на молекуле-мишени (например, антигене, таком как белок, нуклеиновая кислота, углевод или липид), с которой связывается антигенсвязывающая молекула (например, антитело, фрагмент антитела или каркасный белок, содержащий связывающие участки антитела). Эпитопы, как правило, содержат химически активные поверхностные группировки молекул, таких как аминокислоты, полипептиды или боковые цепи сахаров, и обладают специфическими характеристиками трехмерной структуры, а также специфическими зарядовыми характеристиками. Эпитопы могут быть образованы как из последовательных, так и/или находящихся рядом непоследовательных остатков (например, аминокислот, нуклеотидов, сахаров, липидного фрагмента) молекулы-мишени. Эпитопы, образованные из последовательных аминокислот (например, аминокислот, нуклеотидов, сахаров, липидного фрагмента) обычно сохраняются при воздействии денатурирующих растворителей, тогда как эпитопы, образованные третичной укладкой обычно могут теряться при обработке денатурирующими растворителями. Эпитоп может включать, но не ограничиваться, по меньшей мере 3, по меньшей мере 5 или 8-10 остатками (например, аминокислот или нуклеотидов). В некоторых примерах эпитоп представляет собой менее 20 остатков (например, аминокислот или нуклеотидов) в длину, менее 15 остатков или менее 12 остатков. Два антитела могут связывать тот же эпитоп в пределах антигена, если они проявляют конкурентное связывание с данным антигеном. В некоторых вариантах реализации изобретения эпитоп можно идентифицировать по определенному минимальному расстоянию с остатком CDR на антигенсвязывающей молекуле. В некоторых вариантах реализации изобретения эпитоп можно идентифицировать по вышеуказанному расстоянию и дополнительно ограничить по остаткам, вовлеченным в связь (например, водородную связь) между остатком антитела и остатком антигена. Эпитоп можно также идентифицировать путем проведения различных сканирований, например, сканирование аланином или аргинином может показать один или более остатков, с которыми может взаимодействовать антигенсвязывающая молекула. Если явно не отмечено иное, набор остатков в виде эпитопа не исключает того, что другие остатки являются частью эпитопа конкретного антитела. Скорее наличие такого набора определяет минимальную серию (или набор типов) эпитопов. Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения, набор остатков, идентифицированных как эпитоп, скорее определяет соответствие минимального эпитопа антигену, чем исключительный перечень остатков эпитопа на антигене.
[0080] «Нелинейный эпитоп» или «конформационный эпитоп» содержит непоследовательные полипептиды, аминокислоты и/или сахара в пределах антигенного белка, к которому антитело специфично по связыванию эпитопа. В некоторых вариантах реализации изобретения по меньшей мере один из остатков будет непоследовательным с другими отмеченными остатками эпитопа; однако, один или более остатков также могут быть последовательными с другими остатками.
[0081] «Линейный эпитоп» содержит последовательные полипептиды, аминокислоты и/или сахара в пределах антигенного белка, к которому антитело специфично по связыванию эпитопа. В некоторых вариантах реализации изобретения отмечается, что не каждый из остатков в пределах линейного эпитопа требует непосредственной связи (или участия в связи) с антителом. В некоторых вариантах реализации изобретения линейные эпитопы могут получать при иммунизациях пептидом, который эффективно состоит из последовательности линейного эпитопа, или из структурных частей белка, которые относительно изолированы от остатков белка (с которыми может взаимодействовать антитело, по меньшей мере первоначально), только с такой частью последовательности).
[0082] Термин «антитело» в настоящем документе используется в самом широком смысле и охватывает различные структуры антител, включая моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифические (такие как Bi-специфические Т-клеточные активаторы) и триспецифические антитела) и фрагменты антител, при условии, что они проявляют требуемую антигенсвязывающую активность, но не ограничивается ими.
2
2
')2
[0083] Термин антитело включает, но не ограничивается ими, фрагменты, которые способны к связыванию антигена, такие как Fv, одноцепочечный Fv (scFv), Fab, Fab', ди-scFv, sdAb (однодоменное антитело) и (Fab') (включая химически связыванный F(ab')). При расщеплении антител папаином образуются два идентичных антигенсвязывающих фрагмента, называемых «Fab»-фрагментами, каждый из которых содержит один антигенсвязывающий сайт и остаточный «Fc»-фрагмент, название которого отражает его способность к кристаллизации. Обработка пепсином позволяет получать F(ab-фрагмент, содержащий два антигенсвязывающих сайта и по-прежнему способный к перекрестному связыванию антигена. Термин антитело также включает, но не ограничивается ими, химерные антитела, гуманизированные антитела и антитела различных видов, таких как мышь, человек, яванского макак и т.д. Кроме того, для антительных конструкций, предложенных в данном документе, также подразумеваются варианты, имеющие последовательности, взятые у других организмов. Таким образом, если раскрыта человеческая версия антитела, то специалисту в данной области техники будет понятно как трансформировать последовательность человека в основе антитела в последовательность мыши, крысы, кошки, собаки, лошади и т.д. Фрагменты антител также включают любую ориентацию одноцепочечных scFv, тандемных ди-scFv, диател, тандемных три-sdcFv, минител и т.д. Фрагменты антител также включают нанотела (sdAb, антитело, имеющее один мономерный домен, такой как пара вариабельных доменов тяжелых цепей, без легкой цепи). В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент антитела может относится к такому из конкретных видов (например, scFv человека или scFv мыши). Это скорее отмечает последовательности по меньшей мере не-CDR участков, а не источник конструкции.
[0084] Термин «моноклональное антитело» относится к антителу, полученному из популяции практически однородных антител, т.е. отдельные антитела, составляющие популяцию, являются идентичными, за исключением мутаций природного происхождения, которые могут присутствовать в незначительных количествах. Моноклональные антитела являются высокоспецифичными и направлены против единственного антигенного сайта. Кроме того, в отличие от препаратов поликлональных антител, которые, как правило, включают различные антитела, направленные против различных детерминант (эпитопов), каждое моноклональное антитело направлено против одной детерминанты на антиген. Таким образом, образец моноклональных антител может связываться с тем же эпитопом на том же антигене. Модификатор «моноклональное» указывает на то, что антитело получено из практически однородной популяции антител; и его не следует интерпретировать как требование о продукции антитела посредством какого-либо конкретного способа. Например, моноклональные антитела, которые можно получать методом гибридом, впервые описанным Kohler and Milstein, 1975, Nature 256:495, или можно получать методами рекомбинантных ДНК, такими как описано в пат. США №4816567. Моноклональные антитела также можно выделять из фаговых библиотек, созданных с использованием методик, описанных, например, в McCafferty et al., 1990, Nature 348:552-554.
H
[0085] Термином «CDR» отмечается определяющий комплементарность участок, как определено по меньшей мере одним способом идентификации и признано специалистом в данной области техники. В некоторых вариантах реализации изобретения CDR можно определять в соответствии с любыми схемами нумерации Чотиа, схеме нумерации Кабата, комбинации схемы Кабата и Чотиа, определения АЬМ, определения контакта и/или комбинаций определений по Кабату, Чотиа, AbM и/или для контакта. Типовые CDR (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3, CDR-H1, CDR-H2, и CDR-H3) встречаются по аминокислотным остаткам 24-34 L1, 50-56 L2, 89-97 L3, 31-35В H1, 50-65 Н2 и 95-102 H3. (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)). Определение AbM может включать, например, CDR (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3, CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3) по аминокислотным остаткам 24-34 L1, 50-56 L2, 89-97 L3, Н26-Н35В H1, 50-58 Н2 и 102 Н3. Определение контакта может включать, например, CDR (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3, CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3) по аминокислотным остаткам 30-36 L1, 46-55 L2, 89-96 L3, 30-35 H1, 47-58 Н2 и 93-101 Н3. Определения по Чотиа может включать, например, CDR (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3, CDR-H1, CDR-H2, и CDR-H3) по аминокислотным остаткам 24-34 L1, 50-56 L2, 89-97 L3, 26-32 … 34 H1, 52-56 Н2 и 95-102 H3. CDR можно также представлять, как показано в любой одной или более сопровождающих фигур. За исключением CDR1 в V, CDR обычно содержат аминокислотные остатки, образующие гипервариабельные петли. Различные CDR в пределах антитела могут обозначаться по их соответствующему номеру и типу цепи, включая, без ограничения: a) CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3, CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3; b) CDRL1, CDRL2, CDRL3, CDRH1, CDRH2 и CDRH3; с) LCDR-1, LCDR-2, LCDR-3, HCDR-1, HCDR-2 и HCDR-3 или d) LCDR1, LCDR2, LCDR3, HCDR1, HCDR2 и HCDR3; и т.д. Термин «CDR», используемый в данном документе, также охватывает HVR или «гипервариабельный участок», включая гипервариабельные петли. Типовые гипервариабельные петли находятся на аминокислотных остатках 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (Н2) и 96-101 (H3). (Chothia and Lesk, J.Mol.Biol. 196: 901-917 (1987).)
[0086] Термин «вариабельный участок тяжелой цепи», как используется в данном документе, относится к участку, содержащему по меньшей мере три CDR тяжелой цепи. В некоторых вариантах реализации изобретения вариабельный участок тяжелой цепи содержит три CDR и по меньшей мере FR2 и FR3. В некоторых вариантах реализации изобретения вариабельный участок тяжелой цепи содержит по меньшей мере HCDR1 тяжелой цепи, каркасный (FR) 2, HCDR2, FR3 и HCDR3. В некоторых вариантах реализации изобретения вариабельный участок тяжелой цепи также содержит по меньшей мере часть FR1 и/или по меньшей мере часть FR4.
H
H
H
1
3
4
1
2
[0087] Термин «константный участок тяжелой цепи», как используется в данном документе, относится к участку, содержащему по меньшей мере три константных домена тяжелой цепи C1, C2, and C3. Конечно, если не отмечено иное, в пределах объема термином «константный участок тяжелой цепи» охвачены не изменяющие функционирование делеции и изменения внутри доменов. Неограничивающие типовые константные участки тяжелой цепи включают γ, δ и α. Неограничивающие типовые константные участки тяжелой цепи также включают ε и μ. Каждый тяжелый константный участок соответствует изотипу антитела. Например, антитело, содержащее константный участок γ, представляет собой антитело-IgG, антитело, содержащее константный участок δ, представляет собой антитело-IgD, а антитело, содержащее константный участок α, представляет собой антитело-IgA. Дополнительно, антитело, содержащее константный участок μ, представляет собой антитело-IgM, а антитело, содержащее константный участок ε, представляет собой антитело-IgE. Определенные изотипы могут дополнительно подразделяться на подклассы. Например, антитела-IgG включают, но не ограничиваются ими, IgG1 (содержащий константный участок γ), IgG2 (содержащий константный участок γ2), IgG3 (содержащий константный участок γ) и IgG4 (содержащий константный участок γ); антитела-IgA включают, но не ограничиваются ими, IgA1 (содержащий константный участок α) и IgA2 (содержащий константный участок α); и антитела IgM включают, но не ограничиваются IgM1 и IgM2.
[0088] Термин «тяжелая цепь», как используется в данном документе, относится к полипептиду, содержащему по меньшей мере вариабельный участок тяжелой цепи, с лидерной последовательностью или без нее. В некоторых вариантах реализации изобретения тяжелая цепь также содержит по меньшей мере часть константного участка тяжелой цепи. Термин «полноразмерная тяжелая цепь», как используется в данном документе, относится к полипептиду, содержащему по меньшей мере вариабельный участок тяжелой цепи и константный участок тяжелой цепи, с лидерной последовательностью или без нее.
[0089] Термин «вариабельный участок легкой цепи», как используется в данном документе, относится к участку, содержащему по меньшей мере три CDR легкой цепи. В некоторых вариантах реализации изобретения вариабельный участок легкой цепи содержит три CDR и по меньшей мере FR2 и FR3. В некоторых вариантах реализации изобретения вариабельный участок легкой цепи содержит по меньшей мере LCDR1 легкой цепи, каркасный (FR) 2, LCDR2, FR3 и LCDR3. Например, вариабельный участок легкой цепи может содержать CDR1 легкой цепи, каркасный (FR) 2, CDR2, FR3 и CDR3. В некоторых вариантах реализации изобретения вариабельный участок легкой цепи также содержит по меньшей мере часть FR1 и/или по меньшей мере часть FR4.
L
[0090] Термин «константный участок легкой цепи», как используется в данном документе, относится к участку, включающему константный домен легкой цепи, C. Неограничивающие типовые константные участки легкой цепи включают λ и κ. Конечно, если не отмечено иное, в пределах объема термина «константный участок легкой цепи» охвачены не изменяющие функционирование делеции и изменения внутри доменов).
[0091] Термин «легкая цепь», как используется в данном документе, относится к полипептиду, содержащему по меньшей мере вариабельный участок легкой цепи, с лидерной последовательностью или без нее. В некоторых вариантах реализации изобретения легкая цепь также содержит по меньшей мере часть константного участка легкой цепи. Термин «полноразмерная легкая цепь», как используется в данном документе, относится к полипептиду, содержащему по меньшей мере вариабельный участок легкой цепи и константный участок легкой цепи, с лидерной последовательностью или без нее).
L
H
L
L
[0092] «Акцепторный каркас человека» для целей настоящего изобретения представляет собой каркас, содержащий аминокислотную последовательность каркаса вариабельного домена легкой цепи (V) или каркаса вариабельного домена тяжелой цепи (V), происходящий из каркаса иммуноглобулина человека или консенсусной последовательности каркаса человека, как указано ниже. Акцепторный каркас человека, происходящий из каркаса иммуноглобулина человека или консенсусной последовательности каркаса человека, может содержать совпадающую с ними аминокислотную последовательность или может содержать изменения аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах реализации количество аминокислотных изменений составляет 10 или менее, 9 или менее, 8 или менее, 7 или менее, 6 или менее, 5 или менее, 4 или менее, 3 или менее, или 2 или менее. В некоторых вариантах реализации последовательность акцепторного каркаса человека V идентична последовательности каркаса иммуноглобулина человека V или консенсусной последовательности каркаса человека.
D
D
[0093] Термин «аффинность» относится к интенсивности суммарных общих нековалентных взаимодействий между одиночным сайтом связывания молекулы (например, антитела) и ее партнера по связыванию (например, антигена). Аффинность молекулы X для ее партнера Y, в целом, можно представить в виде константы диссоциации (K). Аффинность можно измерять при помощи общепринятых в данной области техники методов (таких как, например, ELISA K, KinExA, интерферометрия в биослое (BLI) и/или на устройствах поверхностного плазмонного резонанса (таких как устройство BIAcore), включая те, которые описаны в данном документе).
D
[0094] Термин «K», как используется в данном документе, относится к равновесной константе диссоциации взаимодействия антитело-антиген.
D
d
on
off
D
off
on

6
-1c-1
[0095] В некоторых вариантах реализации изобретения «K», «K», «Kd» или «значение Kd» антитела измеряется путем использования анализов поверхностного плазмонного резонанса с использованием прибора BIACORE-2000 или BIACORE-3000 (BIAcore, Inc., г. Пискатауэй, штат Нью-Джерси) при 25°С с чипами СМ5 с иммобилизированным антигеном при ~10 единицах ответа (RU). Вкратце, чипы биосенсора с карбоксиметилированным декстраном (СМ5, BIACORE, Inc.) активируют N-этил-N'-(3-диметиламинопропил)-карбодиимид гидрохлоридом (EDC) и N-гидроксисукцинимидом (NHS) согласно инструкциям поставщика. До введения антиген разбавляют 10 мМ раствором ацетата натрия, рН 4,8, до 5 мкг/мл (~0,2 мкМ) и вводят при скорости потока 5 мкл/минуту до достижения приблизительно 10 единиц ответа (RU) связанного белка. После введения антигена вводят 1 М раствор этаноламина для блокирования непрореагировавших групп. Для измерения кинетики вводят серийные разведения полипептида, например, полноразмерного антитела в ФСБ (фосфатно-солевой буфер), содержащем 0,05% TWEEN-20™ в качестве поверхностно-активного вещества (PBST), при 25°С на скорости потока приблизительно 25 мкл/мин. Скорости ассоциации (k) и скорости диссоциации (k) рассчитывают, используя простую взаимно однозначную модель связывания Ленгмюра (программа для обработки данных BIACORE, версия 3.2) путем одновременной подгонки сенсограмм ассоциации и диссоциации. Равновесную константу диссоциации (K) рассчитывают как соотношение k/k. См., например, Chen et al., J.Mol.Biol. 293: 865-881 (1999). Если скорость ассоциации согласно вышеописанному анализу поверхностного плазмонного резонанса превышает 10 М, то ее можно определить с помощью методики гашения флуоресценции, измеряющей увеличение или снижение интенсивности испускания флуоресценции (возбуждение = 295 нм; испускание = 340 нм, полоса пропускания 16 нм) при 25°С в 20 нМ растворе антител против антигена в ФСБ, рН 7,2, в присутствии возрастающих концентраций антигена, с измерением на спектрометре, например, на спектрофотометре с устройством остановки потока (Aviv Instruments) или спектрофотометре SLM-AMINCO™ серии 8000 (ThermoSpectronic) с перемешиваемой кюветой.
d
[0096] В некоторых вариантах реализации изобретения разница между указанными двумя значениями как функция значения эталонного соединения/соединения сравнения (например, значениями K) оказывается практически одинаковой, например, менее около 50%, менее около 40%, менее около 30%, менее около 20% и/или менее около 10%).
d
[0097] В некоторых вариантах реализации изобретения разница между указанными двумя значениями составляет (например, значениями K) составляет более чем около 10%, более чем около 20%, более чем около 30%, более чем около 40% и/или более около 50% в зависимости от значения для эталонного соединения/соединения сравнения).
[0098] Под «поверхностным плазмонным резонансом» понимается оптический феномен, который позволяет анализировать биоспецифические реакции в реальном времени путем выявления изменений в концентрациях белков в пределах биосенсорной матрицы, например, используя систему BIAcore™ (BIAcore International АВ, компания GE Healthcare, г. Уппсала, Швеция и г. Пискатауэй, штат Нью-Джерси, США). Для получения дополнительных описаний см. Jonsson et al. (1993) Ann. Biol.Clin. 51:19-26).
[0099] «Интерферометрия в биослое» относится к оптической аналитической методике, которая анализирует профиль интерференции света, отраженного от слоя иммобилизированного белка на острие биосенсора и внутреннего эталонного слоя. Изменения в количестве молекул, связанных с острием биосенсора, вызывает сдвиги в профиле интерференции, которые можно измерять в реальном времени. Неограничивающим типовым устройством для интерферометрии в биослое является система ForteBio Octet RED96 (Pall Corporation). См., например, Abdiche et al., 2008, Anal. Biochem. 377:209-277.
on
on
off
on
on
[00100] Обозначение «k», как используется в данном документе, относится к константе скорости связывания антитела с антигеном. А именно, константы скорости (k и k) равновесные константы диссоциации измеряют с использованием IgG (бивалентных) с моновалентным антигеном ICOS. Понятия «K», «k», «константа скорости ассоциации» или «ka» используют в данном документе взаимозаменяемо. Данное значение показывает скорость связывания связывающего белка с его антигеном-мишенью или скорость образования комплекса между антителом и антигеном, показанную уравнением: Антитело(«Ab»)+Антиген(«Ag»)→Ab-Ag.
off
off
off
Обозначение «k», как используется в данном документе, относится к константе скорости диссоциации антитела от комплекса антитело/антиген. Обозначение k также обозначается как «K» или «скорость константы диссоциации». Это значение показывает скорость диссоциации антитела от своего антигена-мишени или разделение комплекса Ab-Ag с течением времени на свободное антитело и антиген, как показано уравнением:
Ab+Ag←Ab-Ag.
[00101] Термин «биологическая активность» относится к любому из одного или более биологических свойств молекулы (существующей в природе, найденной in vivo, или получаемой или добываемой рекомбинантными средствами). Биологические свойства включают, но не ограничиваются ими, связывание рецептора, индуцирование пролиферации клеток, ингибирование роста клеток, индуцирование других цитокинов, включая апоптоз, и ферментативную активность. В некоторых вариантах реализации изобретения биологическая активность белка ICOS включает, например, костимуляцию пролиферации Т-клеток и секретирование цитокинов, ассоциированные с клетками Th1 и Th2; модуляцию Treg-клеток; влияние на дифференцировку Т-клеток, включая модуляцию фактора транскрипции генной экспрессии; индукцию передача сигнала посредством механизмов PI3K и AKT и опосредование АЗКЦ.
[00102] Антитело с «созревшей аффинностью» относится к антителу с одной или более модификациями в одном или более CDR по сравнению с исходным антителом, которое не содержит таких изменений, причем такие изменения приводят к улучшению аффинности антитела к антигену.
[00103] «Химерное антитело», как используется в данном документе, относится к антителу, у которого фрагмент тяжелой и/или легкой цепи происходит из конкретного источника или биологического вида, в то время как по меньшей мере остальная часть тяжелой и/или легкой цепи происходит из другого источника или биологического вида. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное антител относится к антителу, содержащему по меньшей мере один вариабельный участок из первого вида (такого как мышь, крыса, яванский макак и т.д.) и по меньшей мере один константный участок из второго вида (такого как человек, яванский макак и т.д.). В некоторых вариантах реализации изобретения химерное антитело содержит по меньшей мере один вариабельный участок мыши и по меньшей мере один константный участок человека. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное антитело содержит по меньшей мере один вариабельный участок яванского макака и по меньшей мере один константный участок человека. В некоторых вариантах реализации изобретения все вариабельные участки химерного антитела происходят из первого вида, а все константные участки химерного антитела - из второго вида. Как отмечено выше, химерная конструкция также может быть функциональным фрагментом.
2
2
[00104] «Гуманизированное антитело», как используется в данном документе, относится к антителу, в котором по меньшей мере одна аминокислота в каркасном участке нечеловеческого вариабельного участка была заменена на соответствующую аминокислоту из вариабельного участка человека. В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное антитело содержит по меньшей мере один константный участок или его фрагмент. В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное антитело представляет собой фрагмент антитела, такой как Fab, scFv, (Fab') т.д. Термин «гуманизированный» также обозначает формы нечеловеческих (например, мышиных) антител, которые являются химерными иммуноглобулинами, цепями иммуноглобулинов или их фрагментами (такими как Fv, Fab, Fab', F(ab') или другие антигенсвязывающие подпоследовательности антител), содержащие минимальную последовательность нечеловеческого иммуноглобулина. Гуманизированные антитела включают иммуноглобулины человека (реципиентное антитело), в которых остатки из определяющего комплементарность участка (CDR) реципиента заменены остатками из CDR, отличных от человека видов (донорное антитело), таких как мышь, крыса или кролик, обладающие требуемой специфичностью, аффинностью и емкостью. В некоторых случаях остатки Fv-каркасного участка (FR) иммуноглобулина человека заменены соответствующими остатками нечеловеческого происхождения. Кроме того, гуманизированное антитело может содержать остатки, которые отсутствуют как в реципиентном антителе, так и в импортированном CDR или каркасных последовательностях, но они включаются для дополнительного улучшения и оптимизации характеристик антитела. В основном, гуманизированное антитело может содержать практически все из по меньшей мере одного, а чаще двух вариабельных доменов, в которых все или практически все участки CDR соответствуют таковым в нечеловеческом иммуноглобулине, а все или практически все участки FR соответствуют консенсусной последовательности иммуноглобулина человека. В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное антитело также может содержать по меньшей мере часть константного участка или домена иммуноглобулина (Fc), обычно человеческого иммуноглобулина. Другие формы гуманизированных антител имеют один или более CDR (CDR L1, CDR L2, CDR L3, CDR H1, CDR Н2 и/или CDR Н3), которые изменены относительно исходного антитела, которые также называются как один или более CDR «происходящие из» одного или более CDR из исходного антитела. Как будет понятно, гуманизированную последовательность можно идентифицировать по ее первичной последовательности и необязательно отмечать способ, которым создано антитело).
[00105] «CDR-привитое антитело», как используется в данном документе, относится к гуманизированному антителу, у которого один или более определяющих комплементарность участков (CDR) первого (нечеловеческого) вида, были привиты на каркасные участки (FR) второго вида (человека).

[00106] «Антитело человека», как используется в данном документе, охватывает антитела, продуцируемые в организме людей, антитела, продуцируемые у отличных от человека животных, которые содержат ген иммуноглобулина человека, таких как мыши XenoMouse, и антитела, отобранные с использованием методов in vitro, таких как фаговый дисплей (Vaughan et al.,1996, Nature Biotechnology, 14: 309-314; Sheets et al., 1998, Proc.Natl.Acad.Sci. (USA) 95: 6157-6162; Hoogenboom and Winter, 1991, J.Mol.Biol., 227:381; Marks et al., 1991, J.Mol.Biol., 222:581), где репертуар антител основан на последовательности иммуноглобулина человека. Термин «антитело человека» обозначает род последовательностей, которые являются человеческими последовательностями. Таким образом, данный термин не обозначает способ, которым было получено антитело, но род соответствующих последовательностей.
[00107] «Функциональный Fc-участок» обладает «эффекторной функцией» нативной последовательности Fc-участка. Типовые «эффекторные функции» включают связывание рецептора Fc; связывание C1q; КЗЦ; АЗКЦ; фагоцитоз; подавление экспрессии рецепторов на поверхности клетки (например, рецептора В-клеток; BCR) и т.д. Для таких эффекторных функций обычно необходимо объединение Fc-участка со связывающим доменом (например, вариабельным доменом антитела); их оценку можно выполнять с использованием различных анализов.
[00108] «Нативная последовательность Fc-участка» содержит аминокислотную последовательность, идентичную аминокислотной последовательности Fc-участка, обнаруженной в природе. Нативная последовательность Fc-участков человека включает нативную последовательность Fc-участка IgG1 человека (аллотипы не -А и А); нативную последовательность Fc-участка IgG2 человека; нативную последовательность Fc-участка IgG3 человека и нативную последовательность Fc-участка IgG4 человека, а также их варианты природного происхождения.
[00109] «Вариантный Fc-участок» содержит аминокислотную последовательность, которая отличается от нативной последовательности Fc-участка за счет модификации по меньшей мере одной аминокислоты. В некоторых вариантах реализации изобретения «вариантный Fc-участок» содержит аминокислотную последовательность, которая отличается от нативной последовательности Fc-участка за счет модификации по меньшей мере одной аминокислоты, при сохранении по меньшей мере одной эффекторной функции нативной последовательности Fc-участка. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную замену по сравнению с нативной последовательностью Fc-участка или с Fc-участком исходного полипептида, например, содержит от около одной до около десяти аминокислотных замен и предпочтительно от около одной до около пяти аминокислотных замен в нативной последовательности Fc-участка или в Fc-участке исходного полипептида. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок в данном документе будет обладать по меньшей мере около 80% идентичностью последовательностей с нативной последовательностью Fc-участка и/или с Fc-участком исходного полипептида, по меньшей мере около 90% идентичностью последовательностей с ними, по меньшей мере около 95%, по меньшей мере около 96%, по меньшей мере около 97%, по меньшей мере около 98% или по меньшей мере около 99% идентичностью последовательностей с ними).
[00110] «Рецептор Fc» или «FcR» описывает рецептор, который связывается с Fc-участком антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения FcγR является нативным FcR человека. В некоторых вариантах реализации изобретения FcR представляет собой рецептор, который связывает антитело IgG (гамма-рецептор) и включает рецепторы подклассов FcγRI, FcγRII и FcγRIII, включая аллельные варианты и альтернативно сплайсированные формы этих рецепторов. Рецепторы FcγRII включают FcγRIIA («активирующий рецептор») и FcγRIIB («ингибирующий рецептор»), которые имеют сходные аминокислотные последовательности, которые главным образом отличаются по их цитоплазматическим доменам. Активирующий рецептор FcγRIIA содержит в своем цитоплазматическом домене иммунорецепторный тирозиновый активирующий мотив (ITAM). Ингибирующий рецептор FcγRIIB содержит в своем цитоплазматическом домене иммунорецепторный тирозиновый ингибирующий мотив (ITIM). (См., например, Daeron, Annu.Rev.Immunol. 15: 203-234 (1997)). Обзор FcR представлен, например, в Ravetch and Kinet, Annu.Rev.Immunol 9:457-92 (1991); Capel et al., Immunomethods 4:25-34 (1994); and de Haas et al., J.Lab.Clin.Med. 126:330-41 (1995). Другие FcR, включают те, которые будут идентифицированы в будущем, и охватываются в данном документе термином «FcR»).
[00111] Термин «рецептор Fc» или «FcR» также включает неонатальный рецептор, FcRn, который отвечает за перенос материнских IgG плоду (Guyer et al., J.Immunol. 117:587 (1976) and Kim et al., J.Immunol. 24:249 (1994)) и регулирование гомеостаза иммуноглобулинов. Методы измерения связывания с FcRn хорошо известны (см., например, Ghetie and Ward., Immunol. Today 18(12): 592-598 (1997); Ghetie et al., Nature Biotechnology, 15(7): 637-640 (1997); Hinton et al., 279(8): 6213-6216 (2004); WO 2004/92219 (Hinton et al.)).
[00112] «Эффекторные функции» относятся к биологическим видам активности, приписываемым Fc-участку антитела, которые зависят от изотипа антитела. Примеры эффекторных функций антител включают: связывание C1q и комплементзависимую цитотоксичность (КЗЦ); связывание Fc-рецептора; антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (АЗКЦ); фагоцитоз; понижающую регуляцию рецепторов клеточной поверхности (например, В-клеточного рецептора) и активацию В-клеток.
[00113] «Эффекторные клетки человека» представляют собой лейкоциты, которые экспрессируют один или более FcR и выполняют эффекторные функции. В некоторых вариантах реализации изобретения клетки экспрессируют по меньшей мере FcγRIII и выполняют эффекторную (-ые) функцию (-и) АЗКЦ. Примеры лейкоцитов человека, которые опосредуют АЗКЦ, включают мононуклеарные клетки периферийной крови (РВМС), естественные клетки-киллеры (NK), моноциты, цитотоксические Т-клетки и нейтрофилы. Эффекторные клетки могут быть выделены из нативного источника, например, из крови.
[00114] «Антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность» или «АЗКЦ» относится к форме цитотоксичности, при которой секретируемый Ig, связанный на Fc-рецепторах (FcR), присутствует на определенных цитотоксических клетках (например, NK-клетках, нейтрофилах и макрофагах), давая возможность этим цитотоксическим эффекторным клеткам специфически связываться с несущими антигены клетками-мишенями и впоследствии уничтожать данные клетки-мишени с помощью цитотоксинов. Первичные клетки для опосредования АЗКЦ, NK-клетки, экспрессируют только FcγRIII, тогда как моноциты экспрессируют FcγRI, FcγRII и FcγRIII. Данные по экспрессии FcR на гемопоэтических клетках собраны в таблице 3 на странице 464 статьи Ravetch and Kinet, Annu.Rev.Immunol 9:457-92 (1991). Для оценки АЗКЦ-активности; интересующей молекулы можно выполнять анализ АЗКЦ in vitro, такой как описанный в пат. США №5500362 или 5821337, или пат. США №6737056 (Presta). Эффекторные клетки, пригодные для такого анализа, включают клетки РВМС и NK-клетки. В альтернативном или дополнительном варианте АЗКЦ-активность интересующей молекулы можно оценивать in vivo, например, на животной модели, такой как описано в dynes et al. Proc.Natl.Acad.Sci.(USA) 95:652-656 (1998). Дополнительные варианты полипептидов с измененными аминокислотными последовательностями Fc-участка (полипептиды с вариантным Fc-участком) и повышенной или пониженной способностью активностью АЗКЦ, описаны, например, в пат. США №7923538 и пат. США №7994290.
[00115] «Комплементзависимая цитотоксичность» или «КЗЦ» относится к лизису клетки-мишени в присутствии комплемента. Активация классического пути комплемента инициируется связыванием первого компонента системы комплемента (C1q) с антителами (соответствующего подкласса), которые связаны с распознаваемым ими антигеном. Для оценки активации комплемента, можно выполнять анализ КЗЦ, например, как описано в Gazzano-Santoro et al. J.Immunol. Methods 202:163 (1996). Описаны варианты полипептидов с измененными аминокислотными последовательностями Fc-участка (полипептиды с вариантным Fc-участком) и повышенной или пониженной способностью связывания C1q, например, в пат. США №6194551 В1, пат. США №7923538, пат. США №7994290 и WO 1999/51642. См. также, например, Idusogie et al., J.Immunol. 164:4178-4184 (2000)).
[00116] Вариант полипептида с «измененной» аффинностью связывания FcR или активностью АЗКЦ является таковым, который обладает либо усиленной, либо ослабленной активностью связывания FcR и/или активностью АЗКЦ по сравнению с исходным полипептидом или полипептидом, содержащим нативную последовательность Fc-участка. Вариант полипептида, который «показывает повышенное связывание» с FcR, связывает по меньшей мере один FcR с большей аффинностью, чем исходный полипептид. Вариант полипептида, который «показывает пониженное связывание» с FcR, связывает по меньшей мере один FcR с меньшей аффинностью, чем исходный полипептид. Такие варианты, которые отображают увеличение связывания с FcR могут обладать низким или не обладать существенным связыванием с FcR, например, связывание с FcR на уровне 0-20% по сравнению с нативной последовательностью Fc-участка IgG.
[00117] Полипептидный вариант, который «опосредует антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (АЗКЦ) в присутствии эффекторных клеток человека более эффективно» чем исходное антитело, является таким, который в анализе in vitro или in vivo является более эффективным в опосредовании АЗКЦ, когда количества полипептидного варианта и исходного антитела, используемого в анализе, являются по существу одинаковыми. В целом, такие варианты будут идентифицированы с использованием анализа АЗКЦ in vitro, как описано в данном документе, но подразумеваются и другие анализы или методы для определения активности АЗКЦ, например на модели животного и т.п.
[00118] Термин «практически сходный» или «практически такой же», как используется в данном документе, обозначает достаточно высокую степень сходства между двумя или более численными значениями, так что специалист в данной области техники может считать различие между двумя или более указанными значениями малым или не имеющим биологической и/или статистической значимости в контексте биологической характеристики, измеренной указанным значением. В некоторых вариантах реализации изобретения два или более практически сходных значений отличаются не более чем приблизительно на любое одно из значений 5%, 10%, 15%, 20%, 25% или 50%).
[00119] Фраза «существенно отличающийся», как используется в данном документе, обозначает достаточно высокую степень различия между двумя численными значениями, так что специалист в данной области техники может считать различие между двумя указанными значениями имеющим статистическую значимость в контексте биологической характеристики, измеренной указанными значениями. В некоторых вариантах реализации изобретения два практически отличающихся численных значения отличаются на более чем приблизительно любое одно из значений 10%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 100%.
[00120] Фраза «практически уменьшенный», как используется в данном документе, обозначает достаточно высокую степень уменьшения между численным значением и эталонным численным значением, так что специалист в данной области техники может считать различие между двумя значениями имеющим статистическую значимость в контексте биологической характеристики, измеренной указанными значениями. В некоторых вариантах реализации изобретения практически сниженные численные значения отличаются на более чем приблизительно любое одно из значений 10%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 100% по сравнению с эталонным значением.
[00121] Термин «лидерная последовательность» относится к последовательности аминокислотных остатков, расположенных на N-конце полипептида, который способствует секреции полипептида из клетки млекопитающего. Лидерная последовательность может отщепляться при экспортировании полипептида из клетки млекопитающего, образуя зрелый белок. Лидерные последовательности могут быть природными или синтетическими, и они могут быть гетерологичными или гомологичными по отношению к белку, к которому они присоединены.
[00122] Полипептид с «нативной последовательностью» представляет собой полипептид, который имеет такую же аминокислотную последовательность, как полипептид природного происхождения. Таким образом, полипептид с нативной последовательностью может иметь аминокислотную последовательность человеческого полипептида природного происхождения из любого млекопитающего. Такой полипептид с нативной последовательностью может быть выделен из природы или может быть получен рекомбинантными или синтетическими способами. Термин полипептид с «нативной последовательностью» конкретно охватывает усеченные или секретированные формы полипептида природного происхождения (например, последовательность внеклеточного домена), вариантные формы природного происхождения (например, формы альтернативного сплайсинга) и аллельные варианты полипептида природного происхождения.
[00123] Полипептидный «вариант» означает биологически активный полипептид, имеющий по меньшей мере около 80% идентичности аминокислотной последовательности с нативной последовательностью полипептида после выравнивания последовательностей и введения гэпов, при необходимости, для достижения максимального процента идентичности последовательности и без учета любых консервативных замен как части идентичности последовательностей. Такие варианты включают, к примеру, полипептиды, в которых добавлены или удалены в N- или С-конец полипептида один или более аминокислотных остатков. В некоторых вариантах реализации изобретения вариант будет иметь по меньшей мере около 80% идентичности аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах реализации изобретения вариант будет иметь по меньшей мере около 90% идентичности аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах реализации изобретения вариант будет иметь по меньшей мере около 95% идентичности аминокислотной последовательности с нативной последовательностью полипептида).
[00124] Как используется в данном документе, «процент (%) идентичности аминокислотной последовательности» по отношению к пептиду, полипептиду или последовательности антитела определяют как процентное содержание аминокислотных остатков в исследуемой последовательности, идентичных аминокислотным остаткам в конкретной пептидной или полипептидной последовательности, после выравнивания последовательностей и, при необходимости, внедрения гэпов для достижения максимальной процентной идентичности последовательности, без учета любых консервативных замен как части идентичности последовательностей. Выравнивание для целей определения процента идентичности аминокислотных последовательностей можно достигать различными способами, известными специалисту в данной области техники, например, используя общедоступное компьютерное программное обеспечение, например, программное обеспечение BLAST, BLAST-2, ALIGN или MEGALIGN™ (DNASTAR). Специалисты в данной области техники могут определять соответствующие параметры для измерения степени выравнивания, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине сравниваемых последовательностей.
[00125] Аминокислотная замена может включать, но не ограничивается, заменой одной аминокислоты в полипептиде другой аминокислотой. Типовые замены показаны в таблице 1. В интересующее антитело можно внедрять аминокислотные замены и отбирать продукты посредством скрининга на предмет требуемой активности, например, сохранения/улучшения связывания антигена, снижения иммуногенности или улучшения АЗКЦ или КЗЦ.
[00126] Аминокислоты можно группировать по общим свойствам боковой цепи:
(1) гидрофобные: Норлейцин, Met, Ala, VA1, Leu, Ile;
(2) нейтральные гидрофильные: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) кислотные: Asp, Glu;
(4) основные: His, Lys, Arg;
(5) остатки, влияющие на ориентацию цепи: Gly, Pro;
(6) ароматические: Trp, Tyr, Phe.
[00127] Неконсервативные замены приводят к замене представителя одного из этих классов на представителя другого класса.
[00128] Термин «вектор» для описания полинуклеотида, который может быть сконструирован так, чтобы содержать клонированный полинуклеотид или полинуклеотиды, которые могут быть синтезированы в клетке-хозяине. Вектор может включать один или более из следующих элементов: точку начала репликации, одну или более регуляторных последовательностей (таких как, например, промоторы и/или энхансеры), которые управляют экспрессией интересующего полипептида, и/или один или более селектируемых маркерных генов (таких как, например, гены устойчивости к антибиотикам и гены, которые могут быть задействованы для колориметрического анализа, например, β-галактозидаза). Термин «экспрессионный вектор» относится к вектору, применяемый для экспрессии интересующего полипептида в клетке-хозяине).

[00129] «Клетка-хозяин» относится к клетке, которая может быть или была реципиентом вектора или выделенного полинуклеотида. Клетки-хозяева могут быть прокариотическими клетками или эукариотическими клетками. Типовые эукариотические клеток включают клетки млекопитающих, такие как клетки животных приматов или не приматов; клетки грибов, таких как дрожжи; клетки растений и клетки насекомых. Неограничивающие типовые клетки млекопитающих включают, но не ограничиваются ими, клетки NSO, клетки PER.C6 (Crucell) и клетки 293 и СНО, и их производные, такие как клетки 293-6Е и DG44, соответственно. Клетки-хозяева включают потомство единственной клетки-хозяина, причем указанное потомство необязательно должно быть полностью идентичным (морфологически или на уровне комплементарной геномной ДНК) исходной родительской клетке, в силу природной, случайной или преднамеренной мутации. Клетка-хозяин включает клетки, трансфицированные in vivo полинуклеотидом (-ами), предложенным (-и) в данном документе.
[00130] Термин «выделенный», как используется в данном документе, относится к молекуле, которую отделили от по меньшей мере некоторых компонентов, с которыми она обычно находится в природе или синтезируется. Например, полипептид называется «выделенным», когда его отделили от по меньшей мере некоторых компонентов клетки, в которой он получен. Если полипептид секретируется клеткой после экспрессии, то физическое отделение супернатанта, содержащего полипептид из клетки, которая его синтезировала, считается «выделением» полипептида. Аналогичным образом, полинуклеотид называется «выделенным», когда он не является частью большего полинуклеотида (такого как, например, геномная ДНК или митохондриальная ДНК, в случае полинуклеотида ДНК), в котором он обычно находится в природе, или его отделили от по меньшей мере некоторых компонентов клетки, в которой он синтезирован, например, в случае полинуклеотида РНК. Таким образом, полинуклеотид ДНК, который содержится в векторе внутри клетки-хозяина, может называться «выделенным».
[00131] Термин «индивид» или «субъект» применяется взаимозаменяемо в данном документе по отношению к животному; например, млекопитающему. В некоторых вариантах реализации изобретения предложены способы лечения животных, включающих, но не ограничивающихся ими, людей, грызунов, обезьян, кошачьих, псовых, лошадей, крупный рогатый скот, свиней, овечьих, коз, лабораторных животных-млекопитающих, сельскохозяйственных животных млекопитающих, животных-млекопитающих для спортивных соревнований и домашних животных-млекопитающих. В некоторых примерах «индивид» или «субъект» относится к индивиду или субъекту, нуждающемуся в лечении заболевания или нарушения. В некоторых вариантах реализации изобретения субъект, требующих получения лечения, может быть пациентом, отмечая факт, что субъект был идентифицирован как имеющий нарушение, относящееся к лечению, или подвержен достаточному риску развития нарушения.
[00132] «Заболевание» или «нарушение», как используется в данном документе, относится к патологическому состоянию, при котором требуется и/или желательно лечение.
[00133] «Рак» и «опухоль», как используется в данном документе, являются взаимозаменяемыми терминами, которые относятся к любому аномальному росту клетки или ткани, или пролиферации в организме животного. Как используется в данном документе, термины «рак» и «опухоль» охватывают солидные и гематологические/лимфатические раковые заболевания, а также охватывают злокачественный, предраковый и доброкачественный рост, такой как дисплазия. Примеры рака включают, но не ограничиваются ими, карциному, лимфому, бластому, саркому и лейкоз. Более конкретные неограничивающие примеры таких видов рака включают плоскоклеточный рак, мелкоклеточный рак легкого, рак гипофиза, рак пищевода, астроцитому, саркому мягких тканей, немелкоклеточный рак легкого, аденокарциному легкого, плоскоклеточную карциному легкого, рак брюшины, гепатоцеллюлярный рак, рак желудочно-кишечного тракта, рак поджелудочной железы, глиобластому, рак шейки матки, рак яичника, рак печени, рак мочевого пузыря, гепатому, рак молочной железы, рак ободочной кишки, колоректальный рак, карциному эндометрия или матки, карциному слюнных желез, рак почки, рак печени, рак предстательной железы, рак вульвы, рак щитовидной железы, карциному печени, рак головного мозга, рак эндометрия, рак яичка, холангиокарциному, карциному желчного пузыря, рак желудка, меланому и различные типы рака головы и шеи.
[00134] Как используется в данном документе, «лечение» представляет собой подход для получения благоприятных или требуемых клинических результатов. «Лечение», как используется в данном документе, охватывает любое введение или применение лекарственного средства для лечения заболевания у млекопитающего, включая человека. Для целей этого описания, благоприятные или требуемые клинические результаты включают, но не ограничиваются любым одним или более из: облегчения одного или более симптомов, уменьшения степени заболевания, предотвращения или задержки распространения (например, метастазов, например метастазов в легкое или лимфатический узел) заболевания, предотвращения или задержки рецидива заболевания, задержки или замедления прогрессирования заболевания, облегчения течения заболевания, подавления заболевания или прогрессирования заболевания, подавления или замедления заболевания или его прогрессирования, остановки его развития и ремиссии (либо частичной, либо полной). Под «лечением» также понимается снижение патологических последствий пролиферативного заболевания. Способы, предложенные в данном документе, подразумевают любой один или более аспектов лечения. Наряду с вышеизложенным, термин лечение не требует стопроцентное прекращение всех аспектов нарушения).
[00135] «Облегчение» означает ослабление или улучшение одного, или более симптомов по сравнению с отсутствием введения анти-ICOS антитела. «Облегчение» также включает сокращение или уменьшение длительности проявления симптома.
[00136] В контексте ракового заболевания термин «лечение» включает любое или все из: ингибирования роста раковых клеток, ингибирования репликации раковых клеток, ослабления общей опухолевой нагрузки и облегчения одного или более симптомов, связанных с данным заболеванием.
[00137] Термин «биологический образец» означает количество вещества, взятого из живого существа или бывшего раннее живого существа. Такие субстанции включают, но не ограничиваются ими, кровь (например, цельная кровь), плазму, сыворотку, мочу, амниотическую жидкость, синовиальную жидкость, эндотелиальные клетки, лейкоциты, моноциты, другие клетки, органы, ткани, костный мозг, лимфатические узлы и селезенку).
BЫСОКИЙ
[00138] Образец, у которого имеется «повышенный уровень ICOS» или «ICOS экспрессируется на повышенном уровне», или существует «ICOS», означает, что уровень ICOS такой, что специалист в данной области может заключать, что рак можно лечить с помощью анти-ICOS лекарственного средства, такого как антитело, предложенное в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения «повышенный уровень ICOS» представляет собой такой уровень, при котором 1% клеток внутри образца опухоли проявляет окрашивание по ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения «высокий уровень» по отношению к ICOS представляет собой 1% или более окрашивания, например, 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100% клеток внутри образца опухоли проявляют окрашивание. В некоторых вариантах реализации изобретения уровни ICOS можно измерять методом хромогенного ИГХ или иммунофлуоресцентного ИГХ (показатель Aqua).
ВЫСОКИМ
[00139] Для образца, который «экспрессирует ICOS» или обладает «позитивным окрашиванием по ICOS», или является «ICOS-позитивным», понимается, что 1% или более клеток в образце проявляют окрашивание по ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения образец, являющийся ICOS-позитивным, проявляет по меньшей мере слабое, умеренное и/или сильное окрашивание клеток (основанное на мембранной экспрессии ICOS). Образец с умеренным или сильным окрашиванием клеток по ICOS также считается имеющим «ICOS»
НИЗКИЙ
[00140] Для образца, у которого имеется «низкий уровень PD-L1» или экспрессируется «PD-L1 на низком уровне», или имеется «PD-L1», понимается, что уровень PD-L1 находится ниже порогового уровня экспрессии для ракового заболевания, который является обычным показанием для лечения с помощью PD-1 терапии. В некоторых вариантах реализации изобретения «низкий уровень PD-L1» представляет собой такой, при котором менее 5% клеток в опухоли проявляют окрашивание мембран по PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения «низкий уровень» по отношению к PD-L1 представляет собой менее 5% окрашивания, например, 4%, 3%, 2%, 1% или 0% клеток опухоли проявляют окрашивание. В некоторых вариантах реализации изобретения уровни PD-L1 можно измерять методом хромогенного ИГХ или иммунофлуоресцентного ИГХ (показатель Aqua). Об образце, который не экспрессирует выявляемого PD-L1, также можно сказать, что он «экспрессирует низкий уровень PD-L1». Таким образом, термином «низкий» охватывается невыявляемый PD-L1.
BЫСОКИЙ
[00141] Образец, у которого имеется «повышенный уровень PD-L1» или «PD-L1 экспрессируется на повышенном уровне», или существует «PD-L1», означает, что уровень PD-L1 такой, что специалист в данной области может заключать, что рак можно лечить с помощью PD-1 терапии. В некоторых вариантах реализации изобретения «повышенный уровень PD-L1» представляет собой такой, при котором 5% или более клеток в опухоли проявляют окрашивание мембран по PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения «высокий уровень» по отношению к PD-L1 представляет собой 5% или более окрашивания, например, 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100% клеток опухоли проявляют окрашивание. В некоторых вариантах реализации изобретения уровни PD-L1 можно измерять методом хромогенного ИГХ или иммунофлуоресцентного ИГХ (показатель Aqua).
ВЫСОКИМ
[00142] Для образца, который «экспрессирует PD-L1» или обладает «позитивным окрашиванием по PD-L1», или является «PD-L1-позитивным», понимается, что 1% или более клеток проявляют окрашивание мембран по PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения образец, являющийся PD-L1-позитивным, проявляет по меньшей мере слабое, умеренное и/или сильное окрашивание клеток (основанное на мембранной экспрессии PD-L1). Образец с умеренным или сильным окрашиванием клеток по PD-L1 также считается имеющим «PD-L1»
HИ3КИM
[00143] Для образца, в котором «отсутствует экспрессия PD-L1» или имеется «негативное окрашивание по PD-L1», или являющийся «PD-L1-негативным», понимается, что экспрессия PD-L1 на поверхности клеток образца оказывается невыявляемой методом ИГХ, таким как хромогенный ИГХ или иммунофлуоресцентный ИГХ (показатель Aqua). PD-L1-негативный образец также считается «PD-L1».

ВЫСОКИМ
[00144] В некоторых вариантах реализации изобретения можно применять любой метод для измерения уровня PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения он может включать использование ИГХ-исследования PD-L1 22С3 pharmDx (Dako Inc., г. Карпинтерия, штат Калифорния, США), которое является клинически валидированным и утвержденным FDA исследованием для оценки экспрессии PD-L1 при NSCLC. Анализ ИГХ PD-L1 22С3 pharmDx представляет собой качественный иммуногистохимический анализ, использующий моноклональное анти-PD-L1 антитело мыши (клон 22С3), который можно применять при выявлении белка PD-L1 в фиксированных формалином и залитых парафином (FFPE) тканях немелкоклеточного рака легкого (NSCLC). Данный анализ можно выполнять на системе Autostainer Link 48 и визуализировать с использованием системы EnVision FLEX. Экспрессию белка PD-L1 количественно определяют с использованием опухолевого пропорционального показателя (TPS), который представляет собой процентное содержание жизнеспособных клеток опухоли, показывающих частичное или полное окрашивание мембран. В некоторых вариантах реализации изобретения образец считается PD-L1-позитивным, если TPS≥50% жизнеспособных клеток опухоли проявляет окрашивание мембран при любой интенсивности. Анализ ИГХ PD-L1 22С3 pharmDx показан как помощь для лечения пациентов с NSCLC с помощью KEYTRUDA (пембролизумаб). Дополнительные подробности по системе присвоения показателей и ответной реакции на пембролизумаб описаны в статье Garon et al. (N Engl J Med 2015; 372: 2018-28). В некоторых вариантах реализации изобретения образцы пациентов с NSCLC могут считаться позитивными по экспрессии PD-L1, если опухолевый пропорциональный показатель составляет ≥50% от жизнеспособных клеток опухоли, проявляющих окрашивание мембраны (частичное или полное) при любой интенсивности (т.е. ≥1+). В некоторых вариантах реализации изобретения это конкретно может относиться к антителу клона 22С3. В некоторых вариантах реализации изобретения, если TPS = от 5% до 50% жизнеспособных клеток опухоли проявляют окрашивание мембран при любой интенсивности, то образец и/или пациент считается PD-L1-положительным. В некоторых вариантах реализации изобретения, если TPS≥50% жизнеспособных клеток опухоли проявляют окрашивание мембран при любой интенсивности, то образец и/или пациент считается PD-L1.
[00145] Термин «контроль» относится к композиции, о которой известно, что она не содержит анализируемое вещество («негативный контроль») или содержит анализируемое вещество («позитивный контроль»). Позитивный контроль может содержать известную концентрацию анализируемого вещества. «Контроль», «позитивный контроль» и «калибровочный стандарт» может применятся в данном документе взаимозаменяемо по отношению к композиции, включающей известную концентрацию анализируемого вещества. «Позитивный контроль» может использоваться для определения рабочих характеристик анализа и является полезным индикатором чистоты реактивов (например, анализируемых веществ).
[00146] «Предопределенное граничное значение» и «предопределенный уровень» обычно относится к анализируемому граничному значению, которое используется для оценки результатов диагностической/прогностической/терапевтической эффективности путем сравнения результатов анализа по предопределенному граничному значению/уровню, которое уже было связано или ассоциировано с различными клиническими параметрами (например, тяжестью заболевания, прогрессированием/отсутствием прогрессирования/улучшением и т.д.). Поскольку в настоящем описании могут обеспечиваться типовые предопределенные уровни, хорошо известно, что граничные значения могут изменяться в зависимости от природы иммуноанализа (например, примененных антител и т.п.). Дополнительно, специалисту в данной области техники хорошо удается адаптировать описание данного документа для других иммуноанализов для получения специфических для иммуноанализов граничных значений для других иммуноанализов на основе этого описания. В то время как точное значение предопределенного граничного значения/уровня, может варьировать между анализами, обычно можно применять корреляции (если существуют), как описано в данном документе).
[00147] Термин «ингибирование» или «ингибировать» относится к уменьшению или прекращению любой фенотипической характеристики или уменьшению, или прекращению встречаемости, степени или вероятности такой характеристики. Под термином «уменьшать» или «ингибировать» понимается уменьшение, снижение или блокировка активности, функционирования и/или количества по сравнению с эталоном. В некоторых вариантах реализации изобретения «уменьшать» или «ингибировать» означает возможность вызывать общее уменьшение на 20% или более. В некоторых вариантах реализации изобретения «уменьшать» или «ингибировать» означает возможность вызывать общее уменьшение на 50% или более. В некоторых вариантах реализации изобретения «уменьшать» или «ингибировать» означает возможность вызывать общее уменьшение на 75%, 85%, 90%, 95% или более. В некоторых вариантах реализации изобретения количество, отмеченное выше, ингибируется или уменьшается в течение некоторого времени относительно контрольной дозы (такой как плацебо) в течении того же периода времени. Как используется в данном документе, «эталонный образец» относится к любому образцу, стандарту или уровню, который используется для целей сравнения. Эталон можно получать из образца, полученного от здорового и/или не заболевшего субъекта. В некоторых примерах эталон можно получать из образца, полученного от не лечившегося субъекта. В некоторых примерах, эталон получают из образца от не заболевшего или не лечившегося субъекта-индивида. В некоторых примерах образец получают от одного или более здоровых индивидов, не являющихся субъектом или пациентом).
[00148] Как используется в данном документе «задержка развития заболевания» означает отсрочку, мешающее влияние, замедление, задержку, стабилизацию, подавление и/или отдаление сроков развития заболевания (такого как рак). Эта задержка может быть различной по времени, в зависимости от истории болезни и/или индивида, подвергаемого лечению. Как очевидно специалисту в данной области техники, достаточная или значительная задержка фактически может охватывать понятие профилактики, при которой у индивида не развивается заболевание. Например, возможна задержка развития поздней стадии рака, например, развития метастазов.
[00149] «Предотвращение», как используется в данном документе, включает предоставление профилактики применительно к возникновению или повторному проявлению заболевания у субъекта, который может быть предрасположен к заболеванию, но у которого еще не диагностировали данное заболевание. Если только не указано иное, термины «снижать», «ингибировать» или «предотвращать» не отмечают или требуют полного предотвращения на все время.
[00150] Как используется в данном документе, «подавлять» функционирование или активность означает снижать функционирование или активность по сравнению с в другом случае аналогичными условиями, за исключением интересующего условия или параметра, или в альтернативном варианте, по сравнению с другим условием. Например, антитело, которое подавляет рост опухоли, снижает скорость роста опухоли по сравнению со скоростью роста опухоли в отсутствии антитела.
[00151] «Терапевтически эффективное количество» вещества/молекулы, агониста или антагониста может варьировать в зависимости от таких факторов, как стадия заболевания, возраст, пол и масса тела индивида, и способности вещества/молекулы, агониста или антагониста вызывать требуемую реакцию в организме индивида. Терапевтически эффективное количество также представляет собой количество, при котором любые токсические или вредные эффекты вещества/молекулы, агониста или антагониста перевешиваются терапевтически полезными эффектами. Терапевтически эффективное количество может доставляться за одно или более введений. «Терапевтически эффективное количество» относится к количеству, эффективному в дозах и в течение периодов времени, необходимых для достижения требуемого терапевтического и/или профилактического результата.
[00152] «Профилактически эффективное количество» относится к количеству, эффективному в дозах и в течение периодов времени, необходимых для достижения требуемого профилактического результата. Поскольку профилактическую дозу используют для субъектов, находящихся до заболевания или его на ранней стадии, обычно, но не обязательно, профилактически эффективное количество оказывается меньше терапевтически эффективного количества.
[00153] Термин «фармацевтический состав» или «фармацевтическая композиция» относится к препарату, который находится в такой форме, чтобы обеспечить биологическую активность активного (-ых) ингредиента (-ов), и не содержит дополнительных компонентов, являющихся неприемлемо токсичными для субъекта, которому должен вводиться данный состав. Такие составы могут быть стерильными).
[00154] «Фармацевтически приемлемый носитель» относится к нетоксическому твердому, мягкому или жидкому наполнителю, разбавителю, инкапсулирующему материалу, вспомогательному веществу состава или носителю, принятому в данной области техники, для применения с лекарственным средством, которые вместе составляют «фармацевтический состав» для введения субъекту. Фармацевтически приемлемый носитель обычно является нетоксичным для реципиентов в используемых дозировках и концентрациях, и является совместимым с другими ингредиентами состава. Фармацевтически приемлемый носитель является соответствующим для применяемой лекарственной формы.
[00155] «Стерильный» состав является аспептическим или по существу не содержит живых микроорганизмов и их спор.

[00156] «Терапия PD-1» охватывает любую терапию, которая модулирует связывание PD-1 с PD-L1 и/или PD-L2. Лекарственные средства PD-1 могут, к примеру, непосредственно взаимодействовать с PD-1 и/или PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения лекарственное средство PD-1 включает молекулу, которая непосредственно связывается с PD-1 и/или влияет на его активность. В некоторых вариантах реализации изобретения лекарственное средство PD-1 включает молекулу, которая непосредственно связывается с PD-L1 и/или влияет на его активность. Таким образом, антитело, которое связывается с PD-1 или PD-L1 и блокирует взаимодействие PD-1 с PD-L1, является лекарственным средством по отношению к PD-1. Когда подразумевается терапия для требуемого подтипа PD-1, то она будет обозначена фразой «специфическая к PD-1» для лекарственного средства, содержащего молекулу, которая непосредственно взаимодействует с PD-1, или «специфическая к PD-L1» для молекулы, которая непосредственно взаимодействует с PD-L1, соответственно. Если только не указано иное, все описание, содержащееся в данном документе касательно терапии PD-1 применяется обычно к терапии PD-1, а также к специфической к PD-1 и/или специфической к PD-L1 терапиям. Неограничивающие типовые лекарственные средства для PD-1 терапии включают ниволумаб (анти-PD-1 антитело; BMS-936558, MDX-1106, ONO-4538; OPDIVO; Bristol-Myers Squibb); пидилизумаб (анти-PD-1 антитело, CureTech), пембролизумаб (анти-PD-1 антитело; KEYTRUDA, МК-3475, ламбролизумаб); дурвалумаб (анти-PD-L1 антитело, MEDI-4736; AstraZeneca/Medlmmune); RG-7446; MSB-0010718C; АМР-224; BMS-936559 (анти-PD-L1 антитело; Bristol-Myers Squibb); АМР-514; MDX-1105; ANB-011; анти-LAG-3/PD-1; анти-PD-1 Ab (CoStim); анти-PD-1 Ab (Kadmon Pharm.); анти-PD-1 Ab (Immunovo); анти-TIM-3/PD-1 Ab (AnaptysBio); анти-PD-L1 Ab (CoStim/Novartis); атезолизумаб (анти-PD-L1 антитело, Genentech/Roche); авелумаб (анти-PD-L1 антитело, MSB0010718C, Pfizer); KD-033, антагонист PD-1 (Agenus); STI-A1010; STI-A1110; TSR-042; и другие антитела, направленные против белка программированной гибели-1 (PD-1) или лиганда белка программированной гибели 1 (PD-L1).
[00157] Термин «ингибитор IDO» относится к средству, способному к ингибированию активности индоламин-2,3-диоксигеназы (IDO) и, тем самым, сохранению IDO-опосредованной иммуносупрессии. Ингибитор IDO может ингибировать IDO1 и/или IDO2 (INDOL1). Ингибитор IDO может быть обратимым или необратимым ингибитором IDO. «Обратимый ингибитор IDO» представляет собой соединение, которое необратимо ингибирует ферментную активность IDO, либо в каталитическом участке, либо в некаталитическом участке, а «необратимый ингибитор IDO» представляет собой соединение, которое необратимо ингибирует ферментную активность IDO путем образования ковалентной связи с данным ферментом. Неограничивающие типовые ингибиторы IDO включают индоксимод (New Link Genetics), INCB024360 (Incyte Corp), 1-метил-D-триптофан (New Link Genetics) и GDC-0919 (Genentech).
[00158] «Терапия Т-клетками с химерным антигенным рецептором» или «терапия CAR-T» относится к лекарственному средству, содержащему генетически модифицированные Т-клетки для экспрессии рецептора, который распознает антиген, экспрессируемый опухолевой клеткой. Антиген может быть антигеном, специфически экспрессируемым опухолью, или антигеном, экспрессируемым как злокачественными клетками, так и здоровыми тканями. В некоторых вариантах реализации изобретения терапия CAR-T представляет собой адоптивную терапию CAR-T, при которой удаляют Т-клетки пациентов и модифицируют их для экспрессии химерного антигенного рецептора, а затем возвращают их пациенту. См., например, Dai et al., 2016, J Natl Cancer Inst, 108 (7): djv439, doi: 10.1093/jnci/djv439; Gill et al., 2015, Blood Rev, pii: S0268-960X(15)00080-6, doi: 10.1016/j.blre.2015.10.003; Gill et al., 2015, Immunol Rev, 263(1): 68-89. doi: 10.1111/imr.12243.
[00159] Введение «в комбинации с» одним или более дополнительными лекарственными средствами включает одновременное (параллельное) введение и последовательное введение в любом порядке.
[00160] Термин «параллельно» используется в данном документе касательно введения двух или более лекарственных средств, когда по меньшей мере часть введения перекрывается по времени или когда одно лекарственное средство попадает в короткий период времени относительно введения другого лекарственного средства. Например, два или более лекарственных средств вводят с разделением по времени на не более чем около определенного количества минут.
[00161] Термин «последовательно» используется в данном документе касательно введения двух или более лекарственных средств, когда введение одного или более средств продолжается после прекращения введения одного или более других средств, или при этом введение одного или более средств начинается перед введением одного или более других средств. Например, введение двух или более лекарственных средств проводят с разделением по времени на не более чем около определенного количества минут.
[00162] Как используется в данном документе, термин «совместно с» относится к применению одного способа лечения в дополнение к другому способу лечения. Таким образом, «совместно с» относится к проведению одного способа лечения до, во время или после проведения другого способа лечения у индивида.
[00163] Термин «вкладыш в упаковку» используется для инструкций, в обычном порядке вкладываемых в упаковки терапевтических продуктов для продажи, содержащие информацию о показаниях, применении, дозировке, приеме, комбинированной терапии, противопоказаниях и/или предостережениях, касающихся применения таких терапевтических продуктов.
[00164] «Изделие» представляет собой любое изделие (например, пакет или контейнер) или набор, содержащий по меньшей мере один реактив, например, лекарственное средство для лечения заболевания или нарушения (например, рака), или зонд для специфического обнаружения биомаркера, описанного в данном документе. В некоторых вариантах реализации изделие или набор популяризируют, распространяют или продают в виде блока для осуществления способов, описанных в данном документе.
3
14
35
90
99
111
125
131
177
166
153
[00165] Термин «метка» и «выявляемая метка» означает фрагмент, присоединений к антителу или его анализируемому веществу для прохождения выявляемой реакции (например, связывания) между представителями специфически связывающейся пары. Меченый представитель специфически связывающейся пары называется «выявляемой меткой». Таким образом, термин «меченый связывающий белок» относится к белку с меткой, включенной так чтобы обеспечивать идентификацию связывающего белка. В некоторых вариантах реализации изобретения метка представляет собой выявляемый маркер, который может генерировать сигнал, выявляемый путем визуальных или инструментальных средств, например, внедрения радиоизотопно меченой аминокислоты или присоединения к полипептиду фрагментов биотина, которые могут выявляться маркированным авидином (например, стрептавидином, содержащим флуоресцентный маркер или ферментативную активность, которую можно выявлять оптическими или калориметрическими методами). Примеры меток для полипептидов включают, но не ограничиваются ими, следующие:радиоизотопы или радионуклиды (например, Н, С, S, Y, Тс, In, I, I, Lu, Ho или Sm); хромогены, флуоресцентные метки (например, ФИТЦ, родамин, люминофоры на основе комплексов лантанидов), ферментные метки (например, пероксидаза хрена, люцифераза, щелочная фосфатаза), хемилюминесцентные маркеры, биотинильные группы; предопределенные полипептидные эпитопы, распознаваемые вторичным репортером (например, парные последовательности лейциновых молний, участки связывания вторичных антител, металлсвязывающие домены, эпитопные метки) и магнитные средства, такие как хелаты гадолиния. Репрезентативные примеры меток, обычно применяемых для иммуноанализов, включают фрагменты, которые создают свет, например, соединения акридина и фрагменты, которые создают флуоресценцию, например, флуоресцеин. В связи с этим, сам по себе фрагмент может не быть выявляемо меченым, но может становиться выявляемым при реакции с еще одним фрагментом.
[00166] Термин «конъюгат» относится к антителу, которое химически связано со вторым химическим фрагментом, таким как терапевтическое или цитотоксическое средство. Термин «средство» включает химическое соединение, смесь химических соединений, биологическую макромолекулу или экстракт, полученный из биологических материалов. В некоторых вариантах реализации изобретения лекарственные или цитотоксические средства включают, но не ограничиваются ими, коклюшный токсин, таксол, цитохалазин В, грамицидин D, бромид этидия, эметин, митомицин, этопозид, тенопозид, винкристин, винбластин, колхицин, доксорубицин, даунорубицин, дигидроксиантрациндион, митоксантрон, митрамицин, актиномицин D, 1-дегидротестостерон, глюкокортикоиды, прокаин, тетракаин, лидокаин, пропранолол и пуромицин, и их аналоги или гомологи. Применительно к контексту иммуноанализа, конъюгат антитела может быть выявляемо меченым антителом, используемым как антитело для выявления.
II. Анти-ICOS антитела
[00167] Предложены новые антитела, направленные против ICOS. Анти-ICOS антитела включают, но не ограничиваются ими, гуманизированные антитела, химерные антитела, антитела мыши, антитела человека и антитела, содержащие тяжелую цепь и/или легкую цепь CDR, обсуждаемые в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено выделенное антитело, которое связывается с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено моноклональное антитело, которое связывается с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело представляет собой анти-ICOS антитело-агонист. В некоторых вариантах реализации изобретения введение анти-ICOS антител, описанных в данном документе, увеличивает количество Teff-клеток, активирует Teff-клетки, истощает Treg-клетки в организме субъекта и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками.
[00168] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть CDR, выбранных из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 12; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 13; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 14; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 15; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 16; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 17.
[00169] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть CDR, выбранных из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 42; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 43; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 44; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 45; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 46; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 47.
[00170] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 62; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 63; (c) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 64; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 65; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 66; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 67.
[00171] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть CDR, выбранных из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 22, 62, 72, 82, 92, 102 и 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 23, 63, 73, 83, 93, 103 и 113; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 24, 64, 74, 84, 94, 104 и 114; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 25, 65, 75, 85, 95, 105 и 115; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 26, 66, 76, 86, 96, 106 и 116; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 27, 67, 77, 87, 97, 107 и 117.
[00172] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть CDR, выбранных из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 32, 162, 172 и 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 33, 163, 173 и 183; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 34, 164, 174 и 184; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 35, 165, 175 и 185; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 36, 166, 176 и 186; and (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 37, 167, 177 и 187.
[00173] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть CDR, выбранных из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 52, 122, 132, 142 и 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 53, 123, 133, 143 и 153; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 54, 124, 134, 144 и 154; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 55, 125, 135, 145 и 155; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 56, 126, 136, 146 и 156; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO 57, 127, 137, 147 и 157.
[00174] В некоторых вариантах реализации анти-ICOS антитело содержит вариабельный участок тяжелой цепи и вариабельный участок легкой цепи. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну тяжелую цепь, содержащую вариабельный участок тяжелой цепи и по меньшей мере часть константного участка тяжелой цепи, и по меньшей мере одну легкую цепь, содержащую вариабельный участок легкой цепи и по меньшей мере часть константного участка легкой цепи. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере две тяжелые цепи, причем каждая тяжелая цепь содержит вариабельный участок тяжелой цепи и по меньшей мере часть константного участка тяжелой цепи, и две легкие цепи, причем каждая легкая цепь содержит вариабельный участок легкой цепи и по меньшей мере часть константного участка легкой цепи. Как используется в данном документе, одноцепочечное Fv (scFv) или любое другое антитело, содержащее, например, одну полипептидную цепь, включающую все шесть CDR (три CDR тяжелой цепи и три CDR легкой цепи), считается имеющим тяжелую цепь и легкую цепь. В некоторых вариантах реализации изобретения тяжелая цепь представляет собой участок анти-ICOS антитела, который содержит три CDR тяжелой цепи. В некоторых вариантах реализации изобретения легкая цепь представляет собой участок анти-ICOS антитела, который содержит три CDR легкой цепи.
[00175] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 12; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 13; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 14; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 15; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 16; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 17.
[00176] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 22; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 23; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 24; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 25; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 26; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 27.
[00177] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 32; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 33; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 34; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 35; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 36; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 37.
[00178] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 42; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 43; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 44; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 45; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 46; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 47.
[00179] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 52; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 53; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 54; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 55; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 56; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 57.
[00180] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 72; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 73; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 74; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 75; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 76; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 77.
[00181] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 82; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 83; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 84; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 85; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 86; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 87.
[00182] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 92; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 93; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 94; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 95; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 96; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 97.
[00183] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 102; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 103; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 104; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 105; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 106; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 107.
[00184] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 113; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 114; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 115; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 116; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 117.
[00185] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 122; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 123; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 124; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 125; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 126; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 127.
[00186] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 132; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 133; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 134; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 135; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 136; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 137.
[00187] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 142; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 143; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 144; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 145; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 146; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 147.
[00188] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 153; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 154; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 155; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 156; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 157.
[00189] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 162; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 163; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 164; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 165; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 166; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 167.
[00190] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 172; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 173; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 174; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 175; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 176; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 177.
[00191] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, включающих: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 183; (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 184; (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 185; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 186; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 187.
[00192] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, описанных выше, и связывается с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения введение анти-ICOS антитело содержит шесть CDR, описанных выше, связывается с ICOS и увеличивает количество Teff-клеток, и/или активирует Teff-клетки, и/или уменьшает количество Treg-клеток, и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам в организме млекопитающего, такого как человек. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и/или CD8+ Т-клетками.
[00193] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено анти-ICOS антитело, которое конкурирует с анти-ICOS антителом, описанным в данном документе, за связывание с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения можно получать и/или использовать антитело, конкурирующее за связывание с любым из антител, предложенных в данном документе.
[00194] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 12; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 13; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 14.
[00195] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 22; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 23; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 24.
[00196] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 32; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 33; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 34.
[00197] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 42; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 43; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 44.
[00198] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 52; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 53; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 54.
[00199] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 62; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 63; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 64.
[00200] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 72; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 73; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 74.
[00201] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 82; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 83; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 84.
[00202] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 92; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 93; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 94.
[00203] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 102; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 103; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 104.
[00204] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 113; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 114.
[00205] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 122; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 123; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 124.
[00206] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 132; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 133; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 134.
[00207] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 142; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 143; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 144.
[00208] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 153; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 154.
[00209] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 162; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 163; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 164.
[00210] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 172; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 173; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 174.
[00211] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 183; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 184.
[00212] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 15; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 16; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 17.
[00213] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 25; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 26; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 27.
[00214] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 35; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 36; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 37.
[00215] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 45; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 46; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 47.
[00216] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 55; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 56; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 57.
[00217] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 65; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 66; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 67.
[00218] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 75; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 76; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 77.
[00219] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 85; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 86; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 87.
[00220] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 95; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 96; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 97.
[00221] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 105; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 106; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 107.
[00222] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 115; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 116; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 117.
[00223] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 125; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 126; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 127.
[00224] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 135; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 136; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 137.
[00225] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 145; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 146; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 147.
[00226] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 155; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 156; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 157.
[00227] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 165; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 166; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 167.
[00228] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 175; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 176; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 177.
[00229] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один, по меньшей мере два или все три CDR VL, выбранные из таких: (а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 185; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 186; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 187.
[00230] В некоторых вариантах реализации изобретения любой из шести CDR, предложенных в данном документе, можно комбинировать в виде субчастей с любыми другими CDR, предложенными в данном документе, для всех их шести CDR в конструкции. Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения два CDR из первого антитела (например, HCDR1 и HCDR2) можно комбинировать с четырьмя CDR из второго антитела (HCDR3, LCDR1, LCDR2 и LCDR3). В некоторых вариантах реализации изобретения два или менее остатка в одном или более CDR можно заменять для получения его варианта. В некоторых вариантах реализации изобретения два или менее остатка можно заменять в 1, 2, 3, 4, 5 или 6 CDR.
[00231] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 12; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 13; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 14; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 15; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 16; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 17.
[00232] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 22; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 23; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 24; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 25; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 26; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 27.
[00233] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 32; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 33; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 34; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 35; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 36; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 37.
[00234] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 42; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 43; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 44; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 45; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 46; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 47.
[00235] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 52; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 53; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 54; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 55; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 56; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 57.
[00236] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 62; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 63; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 64; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 65; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 66; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 67.
[00237] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 72; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 73; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 74; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 75; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 76; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 77.
[00238] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 82; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 83; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 84; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 85; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 86; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 87.
[00239] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 92; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 93; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 94; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 95; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 96; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 97.
[00240] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 102; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 103; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 104; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 105; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 106; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 107.
[00241] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 113; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 114; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 115; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 116; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 117.
[00242] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 122; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 123; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 124; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 125; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 126; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 127.
[00243] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 132; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 133; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 134; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 135; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 136; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 137.
[00244] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 142; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 143; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 144; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 145; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 146; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 147.
[00245] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 153; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 154; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 155; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 156; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 157.
[00246] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 162; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 163; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 164; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 165; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 166; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 167.
[00247] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR VH, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 172; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 173; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 174; и (II) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL CDR, выбранные из таких: (d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 175; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 176; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 177.
H
L
L
[00248] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR V, выбранные из таких: (a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 183; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 184; и (II) домен V, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности CDR V, выбранные из таких: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 185; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 186; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 187.
[00249] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (VH), обладающую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 или 180. В некоторых вариантах реализации изобретения последовательность VH, обладающая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичностью, содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, однако анти-ICOS антитело, содержащее указанную последовательность, сохраняет способность связываться с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения были заменены, вставлены и/или удалены всего от 1 до 10 аминокислот из SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 или 180. В некоторых вариантах реализации замены, вставки или делеции присутствуют на участках, расположенных вне CDR (т.е. в FR). Необязательно анти-ICOS антитело содержит последовательность VH в SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 или 180, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности.
[00250] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 12; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 13; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 14.
[00251] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 22; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 23; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 24.
[00252] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 32; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 33; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 34.
[00253] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 42; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 43; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 44.
[00254] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 52; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 53; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 54.
[00255] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 62; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 63; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 64.
[00256] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 72; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 73; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 74.
[00257] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 82; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 83; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 84.
[00258] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 92; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 93; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 94.
[00259] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 102; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 103; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 104.
[00260] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 113; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 114.
[00261] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 122; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 123; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 124.
[00262] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 132; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 133; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 134.
[00263] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 142; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 143; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 144.
[00264] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 153; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 154.
[00265] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 162; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 163; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 164.
[00266] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 172; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 173; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 174.
[00267] В некоторых вариантах реализации изобретения VH содержит:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 183; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 184.
[00268] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено анти-ICOS антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи (VL), обладающий по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 или 181. В некоторых вариантах реализации изобретения последовательность VL, обладающая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичностью, содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции по сравнению с эталонной последовательностью, однако анти-ICOS антитело, содержащее указанную последовательность, сохраняет способность связываться с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения были заменены, вставлены и/или удалены всего от 1 до 10 аминокислот из SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 или 181. В некоторых вариантах реализации замены, вставки или делеции присутствуют на участках, расположенных вне CDR (т.е. в FR). Необязательно анти-ICOS антитело содержит последовательность VL в SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 или 181, включая посттрансляционную модификацию указанной последовательности.
[00269] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 15; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 16; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 17.
[00270] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 25; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 26; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 27.
[00271] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 35; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 36; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 37.
[00272] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 45; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 46; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 47.
[00273] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 55; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 56; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 57.
[00274] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 65; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 66; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 67.
[00275] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 75; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 76; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 77.
[00276] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 85; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 86; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 87.
[00277] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 95; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 96; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 97.
[00278] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 105; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 106; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 107.
[00279] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 115; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 116; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 117.
[00280] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 125; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 126; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 127.
[00281] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 135; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 136; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 137.
[00282] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 145; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 146; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 147.
[00283] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 155; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 156; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 157.
[00284] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 165; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 166; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 167.
[00285] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 175; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 176; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 177.
[00286] В некоторых вариантах реализации изобретения VL содержит:(а) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 185; (b) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 186; и (с) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 187.
[00287] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (VH), обладающую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 или 180, и вариабельного домена легкой цепи (VL), обладающую по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 или 181. В некоторых вариантах реализации изобретения последовательность VH, обладающая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или 99% идентичностью, содержит замены (например, консервативные замены), вставки или делеции относительно эталонной последовательности, и последовательность VL, обладающая по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичностью, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции относительно эталонной последовательности, но анти-ICOS антитело, содержащее указанную последовательность, сохраняет способность связываться с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения были заменены, вставлены и/или удалены всего от 1 до 10 аминокислот из SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140,150, 160,170 или 180. В некоторых вариантах реализации изобретения были заменены, вставлены и/или удалены всего от 1 до 10 аминокислот из SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 или 181. В некоторых вариантах реализации замены, вставки или делеции присутствуют на участках, расположенных вне CDR (т.е. в FR). Необязательно анти-ICOS антитело содержит последовательность VH в SEQ ID NO 10, 20, 30,40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 или 180, и последовательность VL SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 или 181, включая посттрансляционные модификации одной или обеих последовательностей.
[00288] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 12; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 13; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 14; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 15; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 16; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 17.
[00289] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 22; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 23; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 24; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 25; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 26; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 27.
[00290] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 32; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 33; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 34; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 35; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 36; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 37.
[00291] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 42; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 43; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 44; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 45; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 46; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 47.
[00292] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 52; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 53; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 54; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 55; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 56; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 57.
[00293] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 62; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 63; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 64; и (II) домен VL, содержащий: (d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 65; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 66; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 67.
[00294] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 72; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 73; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 74; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 75; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 76; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 77.
[00295] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 82; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 83; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 84; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 85; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 86; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 87.
[00296] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 92; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 93; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 94; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 95; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 96; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 97.
[00297] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 102; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 103; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 104; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 105; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 106; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 107.
[00298] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 112; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 113; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 114; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 115; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 116; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 117.
[00299] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 122; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 123; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 124; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 125; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 126; и (I) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 127.
H
[00300] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен V, содержащий:(а) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 132; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 133; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 134; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 135; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 136; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 137.
[00301] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 142; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 143; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 144; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 145; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 146; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 147.
[00302] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 152; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 153; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 154; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR 1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 155; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 156; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 157.
[00303] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 162; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 163; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 164; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 165; (e) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 166; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 167.
H
[00304] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен V, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 172; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 173; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 174; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 175; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 176; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 177.
[00305] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит (I) домен VH, содержащий:(a) HCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 182; (b) HCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 183; и (с) HCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 184; и (II) домен VL, содержащий:(d) LCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 185; (е) LCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 186; и (f) LCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO 187.
[00306] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело содержит VH, такой как в любом из вариантов реализации изобретения, предложенных в данном документе, и VL, такой как в любом из вариантов реализации изобретения, предложенных в данном документе. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 10 и SEQ ID NO 11, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 20 и SEQ ID NO 21, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 30 и SEQ ID NO 31, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 40 и SEQ ID NO 41, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 50 и SEQ ID NO 51, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 60 и SEQ ID NO 61, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 70 и SEQ ID NO 71, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 80 и SEQ ID NO 81, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 90 и SEQ ID NO 91, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 100 и SEQ ID NO 101, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 110 и SEQ ID NO 111, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 120 и SEQ ID NO 121, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 130 и SEQ ID NO 131, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 140 и SEQ ID NO 141, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 150 и SEQ ID NO 151, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 160 и SEQ ID NO 161, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 170 и SEQ ID NO 171, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей. В одном варианте реализации изобретения антитело содержит последовательности VH и VL в SEQ ID NO 180 и SEQ ID NO 181, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.
[00307] В некоторых вариантах реализации изобретения, предложены антитела, которые конкурируют за связывание с ICOS с анти-ICOS антителами, предложенными в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения антитела конкурируют за связывание с ICOS с анти-ICOS антителами, предложенными в данном документе.
[00308] В некоторых вариантах реализации изобретения для идентификации моноклональных антител, которые конкурируют за связывание с ICOS с анти-ICOS антителами, описанными в данном документе (такими как 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 или 35A9S89), можно применять конкурентные анализы. Для определения того, связываются ли два антитела с одним и тем же эпитопом путем распознавания идентичных или пространственно перекрывающихся эпитопов, или того что одно антитело конкурентно ингибирует связывание другого антитела с антигеном, можно использовать конкурентные анализы. В некоторых вариантах реализации изобретения такое конкурирующее антитело связывается с тем же эпитопом, который связывается антителом, описанным в данном документе. Типовые конкурентные анализы включают, но не ограничиваются, обычными анализами, такими как предложенные в Harlow and Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual ch. 14 (Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.). Подробные примеры методы картирования эпитопа, с которым связывается антитело, представлены в Morris (1996) "Epitope Mapping Protocols," в Methods in Molecular Biology vol. 66 (Humana Press, Totowa, N.J.). В некоторых вариантах реализации изобретения указывается, что два антитела связываются с одним и тем же эпитопом, если каждое из них блокирует связывание другого на 50% или больше. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, которое конкурирует с анти-ICOS антителом, описанным в данном документе, представляет собой химерное, гуманизированное или человеческое антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено антитело, которое конкурирует с химерным, гуманизированным или человеческим анти-ICOS антителом, как описано в данном документе.
[00309] В некоторых вариантах реализации изобретения предложены антитела, которые связываются с любым одним или более из указанных эпитопов, что и антитела, предложенные в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложены антитела, которые связывают и перекрывают эпитоп, с которым связываются данные антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено антитело, которое конкурирует с по меньшей мере одним из антител, предложенных в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено антитело, которое конкурирует с по меньшей мере двумя из антител, предложенных в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено антитело, которое конкурирует с по меньшей мере тремя из антител, предложенных в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело связывается с перекрывающимся эпитопом, как антитело, описанное в примерах данного документа. В некоторых вариантах реализации изобретения конкурирующим антителом связывается и/или блокируется целый эпитоп. В некоторых вариантах реализации изобретения конкурирующим антителом связывается и/или блокируется часть эпитопа. В некоторых вариантах реализации изобретения паратоп конкурирующего антитела связывается с по меньшей мере частью эпитопа антитела, предложенного в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения паратоп конкурирующего антитела связывает мишень, а отличающаяся область структуры конкурирующего антитела блокирует по меньшей мере часть эпитопа антитела, предложенного в данном документе.
Типовые химерные антитела
[00310] В некоторых вариантах реализации антитело, предложенное в данном документе, представляет собой химерное антитело. Некоторые химерные антитела описаны, например, впатенте США №4816567 и Morrison et al., (1984) Proc.Natl.Acad.Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)). В одном примере химерное антитело содержит вариабельный участок нечеловеческого происхождения (например, вариабельный участок, происходящий от антитела мыши, крысы, хомяка, кролика или примата, не являющегося человеком, например, обезьяны) и константный участок человека. В дополнительном примере химерное антитело представляет собой антитело с «переключенным классом», в котором изменен класс или подкласс по сравнению с исходным антителом. Термин «химерные антитела» включают антигенсвязывающие фрагменты таких антител).
[00311] Неограничивающие типовые химерные антитела включают химерные антитела, содержащие вариабельные участки тяжелой и/или легкой цепи антитела, выбранного из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 или 35A9S89. Дополнительные неограничивающие типовые химерные антитела включают химерные антитела, содержащие CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи и/или CDR1, CDR2 и CDR3 легкой цепи антитела, выбранного из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 или 35A9S89. Еще дополнительные неограничивающие типовые химерные антитела включают химерные антитела, содержащие CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи и/или CDR1, CDR2 и CDR3 легкой цепи антитела, выбранного из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 или 35A9S89. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное анти-ICOS антитело содержит вариабельные участки, описанные выше, и связывается с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное анти-ICOS антитело содержит вариабельные участки, описанные выше, связывается с ICOS и увеличивает количество Teff-клеток, и/или активирует Teff-клетки, и/или уменьшает количество Treg-клеток, и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками.
[00312] В некоторых вариантах реализации изобретения химерное анти-ICOS антитело содержит тяжелую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 или 180, причем данное антитело связывает ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное анти-ICOS антитело содержит легкую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 или 181, причем данное антитело связывает ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное анти-ICOS антитело содержит тяжелую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 и 180; и легкую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 и 181; причем данное антитело связывает ICOS.
[00313] Типовые химерные анти-ICOS антитела также включают химерные антитела, которые конкурируют за связывание с ICOS с антителом или его фрагментом, описанными в данном документе. Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения предложено химерное анти-ICOS антитело, которое конкурирует за связывание с ICOS с антителом, выбранным из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89, или его фрагментом. В некоторых вариантах реализации изобретения данное антитело конкурирует за связывание с ICOS и увеличивает количество Teff-клеток, и/или активирует Teff-клетки, и/или уменьшает количество Treg-клеток, и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками.
[00314] В некоторых вариантах реализации изобретения химерное антитело, описанное в данном документе, содержит один или более константных участков человека. В некоторых вариантах реализации изобретения константный участок тяжелой цепи представляет собой изотип, выбранный из IgA, IgG и IgD. В некоторых вариантах реализации изобретения константный участок легкой цепи представляет собой изотип, выбранный из к и X. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное антитело, описанное в данном документе, содержит константный участок IgG человека. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное антитело, описанное в данном документе, содержит константный участок тяжелой цепи IgG4 человека. В некоторых вариантах реализации изобретения химерное антитело, описанное в данном документе, содержит константный участок IgG4 человека и легкую цепь к человека.
[00315] Как отмечено выше, то будет востребована эффекторная функция или нет, может зависеть от конкретного способа обработки, предполагаемого для антитела. Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения, когда требуется эффекторная функция, выбирают химерное анти-ICOS антитело, содержащее константный участок тяжелой цепи IgG1 человека или константный участок тяжелой цепи IgG3 человека. В некоторых вариантах реализации изобретения, когда не требуется эффекторная функция, выбирают химерное анти-ICOS антитело, содержащее константный участок тяжелой цепи IgG4 или IgG2 человека.
Типовые гуманизированные антитела
[00316] В некоторых вариантах реализации изобретения предложены гуманизированные антитела, которые связывают ICOS. Гуманизированные антитела применяются в качестве терапевтических молекул, поскольку гуманизированные антитела снижают или исключают иммунный ответ человека по сравнению с антителами нечеловеческого происхождения, которые могут приводить к иммунному ответу к лекарственным средствам на основе антител (таким как ответ организма человека против антител мыши (НАМА)) и снижать эффективность данного терапевтического средства.
[00317] В некоторых вариантах реализации химерное антитело представляет собой гуманизированное антитело. Как правило, антитело нечеловеческого происхождения гуманизируют с целью снижения иммуногенности для человека, сохраняя при этом специфичность и аффинность исходного антитела нечеловеческого происхождения. Обычно, гуманизированное антитело содержит один или более вариабельных доменов, в которых CDR (или их части) происходят от антитела нечеловеческого происхождения, a FR (или их части) происходят от последовательностей антитела человека. Необязательно гуманизированное антитело также может содержать по меньшей мере часть константного участка антитела человека. В некоторых вариантах реализации изобретения некоторые остатки FR в гуманизированном антителе заменены соответствующими остатками антитела нечеловеческого происхождения (например, антитела, из которого получены остатки CDR), например, с целью восстановления или улучшения специфичности, или аффинности антитела.
[00318] Гуманизированные антитела и способы их получения рассмотрены, например, в Almagro and Fransson, (2008) Front.Biosci. 13: 1619-1633 и дополнительно описаны, например, в Riechmann et al., (1988) Nature 332: 323-329; Queen et al., (1989) Proc.Natl Acad.Sci. USA 86:10029-10033; патенты США №5821337, 7527791, 6982321 и 7087409; Kashmiri et al., (2005) Methods 36:25-34; Padlan, (1991) Mol.Immunol.2S: 489-498 (описание «изменения поверхности»);  et al., (2005) Methods 36:43-60 (описание «перетасовки FR»); и Osbourn et al., (2005) Methods 36:61-68 и Klimka et al., (2000) Br. J. Cancer, 83: 252-260 (описание подхода «направленного отбора» к перетасовке FR)).
[00319] Человеческие каркасные участки, которые могут быть использованы для гуманизации, включают, но не ограничиваются ими : каркасные участки, отобранные с использованием способа «максимального соответствия» (см., например, Sims et al. (1993) J. Immunol А 51:2296); каркасные участки, происходящие от консенсусной последовательности антител человека конкретной подгруппы вариабельных участков легкой или тяжелой цепи (см., например, Carter et al. (1992) Proc.Natl.Acad.Sci. USA, 89:4285; и Presta et al. (1993) J.Immunol, 151:2623); зрелые (содержащие соматические мутации) каркасные участки человека или эмбриональные каркасные участки человека (см., например, Almagro and Fransson, (2008) Front.Biosci. 13:1619-1633); и каркасные участки, полученные при скрининге библиотек FR (см., например, Baca et al., (1997). J.Biol.Chem. 212: 10678-10684 и Rosok et al., (1996) J.Biol.Chem. 271:22611 -22618)).
[00320] Неограничивающие типовые гуманизированные антитела включают 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89, описанные в данном документе. Неограничивающие типовые гуманизированные антитела также включают антитела, содержащие вариабельный участок тяжелой цепи антитела, выбранного из 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89, и/или вариабельный участок легкой цепи антитела, выбранного из 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89. Неограничивающие типовые гуманизированные антитела включают антитела, содержащие вариабельный участок тяжелой цепи, выбранный из SEQ ID NO 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 и 180, и/или вариабельный участок легкой цепи, выбранный из SEQ ID NO 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 и 181. Типовые гуманизированные антитела также включают, но не ограничиваются ими, гуманизированные антитела, содержащие CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи и/или CDR1, CDR2 и CDR3 легкой цепи антитела, выбранного из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89. В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит CDR, описанные выше, и связывается с ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит CDR, описанные выше, связывается с ICOS и увеличивает количество Teff-клеток, и/или активирует Teff-клетки, и/или уменьшает количество Treg-клеток, и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками.
[00321] В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи и/или CDR1, CDR2 и CDR3 легкой цепи антитела, выбранного из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89.
[00322] В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит тяжелую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 и 180, и причем данное антитело связывает ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит легкую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 и 181, причем данное антитело связывает ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит тяжелую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170 и 180; и легкую цепь, содержащую последовательность вариабельного участка, которая является на по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98% или по меньшей мере 99% идентичной последовательности, выбранной из SEQ ID NO 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 и 181; причем данное антитело связывает ICOS.
[00323] В некоторых вариантах реализации изобретения сохраняется любая одна или более из последовательностей CDR, предложенных в данном документе, при этом остается участок тяжелой, легкой или тяжелой и легкой цепей (который представляет собой, FR1, FR2, FR3 и FR4), имеющий по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 96%, по меньшей мере 97%, по меньшей мере 98%, или по меньшей мере 99% идентичности с последовательностью, выбранной из SEQ ID NO 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 11, 21, 31, 41, 51, 61, 71, 81, 91, 101, 111, 121, 131, 141, 151, 161, 171 и 181.
[00324] В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один из CDR, обсуждаемых в данном документе. Иначе говоря, в некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один CDR, выбранный из CDR1 тяжелой цепи, обсуждаемого в данном документе, CDR2 тяжелой цепи, обсуждаемого в данном документе, CDR3 тяжелой цепи, обсуждаемого в данном документе, CDR1 легкой цепи, обсуждаемого в данном документе, CDR3 легкой цепи, обсуждаемого в данном документе, и CDR3, обсуждаемого в данном документе. Дополнительно, в некоторых вариантах реализации изобретения, гуманизированное анти-ICOS антитело содержит по меньшей мере один мутировавший CDR на основе CDR, обсуждаемого в данном документе, причем мутировавший CDR содержит 1, 2, 3 или 4 аминокислотные замены относительно CDR, обсуждаемого в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения одна или более из аминокислотных замен являются консервативными аминокислотными заменами. Специалист в данной области техники может выбирать одну или более подходящих консервативных аминокислотных замен для конкретной последовательности CDR, причем предположительно подходящие консервативные аминокислотные замены значительно не изменяют свойства связывания антитела, содержащего мутировавший CDR).
[00325] Типовые гуманизированные анти-ICOS антитела также включают антитела, которые конкурируют за связывание с ICOS с антителом или его фрагментом, описанными в данном документе. Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения предложено гуманизированное анти-ICOS антитело, которое конкурирует за связывание с ICOS с антителом или его фрагментом, выбранным из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89, или его фрагментом. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено гуманизированное анти-ICOS антитело, которое конкурирует за связывание с ICOS с антителом или его фрагментом, выбранным из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89, и увеличивает количество Teff-клеток, и/или активирует Teff-клетки, и/или уменьшает количество Treg-клеток, и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками.
[00326] В некоторых вариантах реализации изобретения гуманизированное анти-ICOS антитело содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO 188, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO 189.
Типовые антитела человека
[00327] В некоторых вариантах реализации анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, представляет собой антитело человека. Антитела человека можно получать, используя различные методики, известные в данной области техники. Человеческие антитела описаны в общих чертах в публикации van Dijk and van de Winkel, (2001) Curr.Opin.Pharmacol.5:36%-314 и Lonberg, (2008) Curr.Opin.Immunol. 20:450-459. В некоторых вариантах реализации антитело человека не является антителом природного происхождения. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело человека представляет собой моноклональное антитело; таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения каждое из антител человека в наборе может связываться с таким же эпитопом на антигене.

[00328] Антитела человека можно получать путем введения иммуногена трансгенному животному, модифицированному с целью продукции интактных антител человека или интактных антител с вариабельными участками человека в ответ на антигенную стимуляцию. Такие животные, как правило, содержат все или часть локусов иммуноглобулинов человека, замещающих эндогенные локусы иммуноглобулинов или локализованных вне хромосом, или случайным образом интегрированных в хромосомы животного. Обычно у таких трансгенных мышей инактивированы эндогенные локусы иммуноглобулинов. Обзор способов получения человеческих антител с использованием трансгенных животных см. в Lonberg, (2005) Nat.Biotech. 23:1117-1125. См. также, например, патенты США №6075181 и 6150584, описывающие технологию XENOMOUSE™; патент США №5770429, описывающий технологию HUMAB; патент США №7041870, описывающий технологию K-М MOUSE и публикацию заявки на патент США № US 2007/0061900, описывающую технологию VELOCIMOUSE). Вариабельные участки человека из интактных антител, генерируемых такими животными, можно дополнительно модифицировать, например, путем объединения с другим константным участком человека.
[00329] Антитела человека также можно получать с помощью способов на основе гибридом. Описаны линии клеток миеломы человека и гетеромиеломы мыши-человека для продукции моноклональных антител человека.(См., например, Kozbor (1984) J.Immunol, 133:3001; Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp.51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987); и Boerner et al., (1991). J.Immunol., 147:86).Человеческие антитела, полученные посредством технологии на основе В-клеточной гибридомы человека, также описаны в Li et al., (2006) Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 103:3557-3562. Дополнительные способы включают, например, способы, описанные впатенте США №7189826 (в котором описана продукция моноклональных IgM-антител человека гибридомными линиями клеток) и в работе Ni, (2006)Xiandai Mianyixue, 26(4):265-268 (в которой описаны полностью человеческие гибридомы). Технология на основе гибридом человека (технология триом) также описана в статьях Vollmers and Brandlein, (2005) Histology and Histopathology, 20(3): 927-937 (2005) и Vollmers and Brandlein, (2005) Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 27(3): 185-191).
[00330] Антитела человека также можно получать путем выделения Fv-клона последовательностей вариабельного домена, выбранных из библиотек фагового дисплея человеческого происхождения. Такие последовательности вариабельного домена затем можно объединять с требуемым константным доменом человека. Методики отбора антител человека из библиотек антител описаны ниже.
[00331] Антитело можно выделять путем скрининга комбинаторных библиотек на предмет антител с требуемой активностью или активностями. Например, в данной области техники известны различные способы получения библиотек фагового дисплея и скрининг таких библиотек на предмет антител, обладающих требуемыми характеристиками связывания. Такие методы рассмотрены, например, в публикации Hoogenboom et al. в Methods in Molecular Biology 178:1-37 ( et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001) и дополнительно описаны, например, в McCafferty et al, (1990) Nature 348:552-554; Clackson et al, (1991) Nature 352:624-628; Marks et al, (1992) J.Mol.Biol 222:581-597; Marks and Bradbury, в Methods in Molecular Biology 248:161-175 (Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003); Sidhu et al, (2004) J.Mol.Biol.338(2): 299-310; Lee et al., (2004) J.Mol.Biol.340(5): 1073-1093; Fellouse, (2004) Vroc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34):12467-12472; и Lee et al, (2004) J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132 и публикации согласно PCT WO 99/10494).
H
L
[00332] В некоторых способах на основе фагового дисплея репертуары генов V и V по отдельности клонируют посредством полимеразной цепной реакции (ПНР) и случайным образом рекомбинируют в фаговых библиотеках, которые затем можно подвергать скринингу на наличие антигенсвязывающего фага, как описано в Winter et al., (1994) Ann. Rev. Immunol, 12:433-455. Фаг обычно отображает фрагменты антитела в виде одноцепочечных Fv-фрагментов (scFv) или Fab-фрагментов. Библиотеки из иммунизированных источников позволяют получать антитела с высокой аффинностью к иммуногену без необходимости конструирования гибридом. В альтернативном варианте можно клонировать наивный репертуар (например, человека) для получения единого источника антител к широкому спектру чужеродных антигенов и аутоантигенов без иммунизации, как описано в работе Griffiths et al., (1993) EMBO J 12:725-734. Наконец, наивные библиотеки можно также получать путем синтеза, клонируя сегменты V-генов стволовых клеток, не подвергавшиеся реаранжировке, и используя ПЦР-праймеры, содержащие случайную последовательность для кодирования гипервариабельных участков CDR3 и осуществления реаранжировки in vitro, как описано в работе Hoogenboom and Winter (1992), J.Mol.Biol, 227:381-388. Патентные публикации, в которых описаны фаговые библиотеки антител человека, включают, например: патент США №5750373 и публикации патентов США №2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/0292936 и 2009/0002360.
[00333] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело человека связывается с полипептидом, имеющим последовательность SEQ ID NO 1 или 2. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело человека связывается с ICOS и увеличивает количество Teff-клеток, и/или активирует Teff-клетки, и/или уменьшает количество Treg-клеток, и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками.
[00334] Типовые анти-ICOS антитела человека также включают антитела, которые конкурируют за связывание с ICOS с антителом человека или его фрагментом, описанными в данном документе. Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения предложено анти-ICOS антитело человека, которое конкурирует за связывание с ICOS с антителом или его фрагментом, выбранным из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89, или его фрагментом. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено анти-ICOS антитело человека, которое конкурирует за связывание с ICOS с антителом или его фрагментом, выбранным из 7F12, 37А10, 35А9, 36Е10, 16G10, 37A10S713, 37A10S714, 37A10S715, 37A10S716, 37A10S717, 37A10S718, 16G10S71, 16G10S72, 16G10S73, 16G10S83, 35A9S79, 35A9S710 и 35A9S89, и увеличивает количество Teff-клеток, и/или активирует Teff-клетки, и/или уменьшает количество Treg-клеток, и/или увеличивает соотношение Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками.
[00335] В некоторых вариантах реализации изобретения предложено химерное анти-ICOS антитело человека, причем данное антитело содержит вариабельный участок из антитела человека, который связывает ICOS и константный участок из другого антитела человека. В некоторых вариантах реализации изобретения предложено химерное анти-ICOS антитело человека, причем данное антитело содержит CDR из антитела человека, который связывает ICOS и каркасный участок из другого антитела человека. В некоторых вариантах реализации антитело не является человеческим антителом природного происхождения).
[00336] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело человека, содержит один или более константных участков человека. В некоторых вариантах реализации изобретения константный участок тяжелой цепи представляет собой изотип, выбранный из IgA, IgG и IgD. В некоторых вариантах реализации изобретения константный участок легкой цепи представляет собой изотип, выбранный из к и X. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело человека, описанное в данном документе, содержит константный участок IgG человека. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело человека, описанное в данном документе, содержит константный участок тяжелой цепи IgG4 человека. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело человека, описанное в данном документе, содержит константный участок IgG4 человека и легкую цепь к человека.
[00337] В некоторых вариантах реализации изобретения, когда требуется эффекторная функция, выбирают анти-ICOS антитело человека, содержащее константный участок тяжелой цепи IgG1 человека или константный участок тяжелой цепи IgG3 человека. В некоторых вариантах реализации изобретения, когда не требуется эффекторная функция, выбирают анти-ICOS антитело человека, содержащее константный участок тяжелой цепи IgG4 или IgG2 человека.
[00338] Как отмечено в данном документе, термин «антитело человека» скорее указывает на род возможных последовательностей для конструкции антитела, чем на источник происхождения антитела.
Типовые константные участки антител
[00339] В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, описанное в данном документе, содержит один или более константных участков человека. В некоторых вариантах реализации изобретения константный участок тяжелой цепи представляет собой изотип, выбранный из IgA, IgG и IgD. В некоторых вариантах реализации изобретения константный участок легкой цепи представляет собой изотип, выбранный из κ и λ,. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, описанное в данном документе, содержит константный участок IgG человека. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, описанное в данном документе, содержит константный участок тяжелой цепи IgG4 человека. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, описанное в данном документе, содержит константный участок IgG4 человека и легкую цепь к человека.
[00340] Во всем настоящем описании и формуле изобретения, если только конкрентно не указано иное или известно специалисту в данной области техники, нумерация остатков тяжелой цепи иммуноглобулинов выполняется согласно индексу EU, как указано в статье Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed.Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991), явным образом включенной в данный документ путем ссылки. «Индекс EU по Кабату» относится к нумерации остатков человеческого EU IgG1-антитела.
[00341] Как отмечено выше, то будет востребована эффекторная функция или нет, может зависеть от конкретного способа обработки, предполагаемого для антитела. Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения, когда требуется эффекторная функция, выбирают анти-ICOS антитело, содержащее константный участок тяжелой цепи IgG1 человека или константный участок тяжелой цепи IgG3 человека. В некоторых вариантах реализации изобретения, когда не требуется эффекторная функция, выбирают анти-ICOS антитело, содержащее константный участок тяжелой цепи IgG4 или IgG2 человека).
[00342] В некоторых вариантах реализации изобретения антитело содержит вариантный Fc-участок, имеющий по меньшей мере одну аминокислотную замену по сравнению с Fc-участком IgG дикого типа или антитела дикого типа. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок имеет две или более аминокислотных замен в Fc-участке антитела дикого типа. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок имеет три или более аминокислотных замен в Fc-участке антитела дикого типа. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок имеет по меньшей мере одну, две или три, или более аминокислотных замен Fc-участка, описанного в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок в данном документе будет обладать по меньшей мере около 80% гомологией с нативной последовательностью Fc-участка и/или с Fc-участка исходного полипептида. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок в данном документе будет обладать по меньшей мере около 90% гомологией с нативной последовательностью Fc-участка и/или с Fc-участка исходного полипептида. В некоторых вариантах реализации изобретения вариантный Fc-участок в данном документе будет обладать по меньшей мере около 95% гомологией с нативной последовательностью Fc-участка и/или с Fc-участка исходного полипептида.
[00343] В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, предложенное в данном документе, модифицируют с целью увеличения или уменьшения степени гликозилирования антитела. Добавление или делецию сайтов гликозилирования в антителе можно легко осуществлять путем модификации аминокислотной последовательности, приводящей к созданию или удалению одного, или более сайтов гликозилирования).
[00344] Если антитело содержит Fc-участок, то можно модифицировать углевод, присоединенный к нему. Нативные антитела, продуцируемые клетками млекопитающих, обычно содержат разветвленный двуантенарный олигосахарид, обычно присоединенный с помощью N-связи к Asn297 в СН2-домене Fc-участка. См., например, Wright et al. TIBTECH 15:26-32 (1997). Указанный олигосахарид может содержать различные углеводы, например, маннозу, N-ацетилглюкозамин (GlcNAc), галактозу и сиаловую кислоту, а также фукозу, присоединенную к GlcNAc в «стебле» двухантенарной олигосахаридной структуры. В некоторых вариантах реализации изобретения можно выполнять модификации олигосахарида в антителе с целью создания вариантов антител с определенными улучшенными свойствами.
[00345] В некоторых вариантах реализации изобретения предложены варианты антител, содержащие углеводную структуру без фукозы, присоединенной (прямо или опосредованно) к Fc-участку. Например, количество фукозы в таком антителе может составлять от 1% до 80%, от 1% до 65%, от 5% до 65% или от 20% до 40%. Количество фукозы определяют путем расчета среднего количества фукозы в углеводной цепи при Asn297 по отношению к сумме всех углеводных структур, присоединенных к Asn 297 (например, сложных гибридных структур с высоким содержанием маннозы), измеренного с помощью ВП-МАЛДИ масс-спектрометрии, как описано, например, в WO 2008/077546. Asn297 относится к остатку аспарагина, расположенному приблизительно в положении 297 в Fc-участке (EU-нумерация остатков Fc-участка); однако Asn297 также может располагаться на расстоянии около ±3 аминокислоты выше или ниже положения 297, а именно между положениями 294 и 300, из-за незначительной изменчивости последовательности антител. Такие варианты фукозилирования могут обладать улучшенной АЗКЦ-функцией. См., например, публикации патентов CШA US 2003/0157108 (Presta, L.); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Примеры публикаций, связанных с «дефукозилированными» или «фукозодефицитными» вариантами антител включают: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO2005/053742; WO 2002/031140; Okazaki et al. J.Mol.Biol. 336: 1239-1249 (2004); Yamane-Ohnuki et al. Biotech.Bioeng.87: 614 (2004). Примеры клеточных линий, способных продуцировать дефукозилированные антитела, включают клетки Lec13 СНО, дефектные по фукозилированию белков (Ripka et al. Arch.Biochem.Biophys. 249: 533-545 (1986); заявка на патент США №US 2003/0157108 A1, Presta, L; и WO 2004/056312 A1, Adams et  al., особенно в примере 11) и нокаутированные клеточные линии, такие как нокаутированные клетки СНО по гену альфа-1,6-фукозилтрансферазы, FUT8, (см., например, Yamane-Ohnuki et al. Biotech.Bioeng. 87: 6l4 (2004); Kanda, Y. et al.,Biotechnol.Bioeng., 94(4): 680-688 (2006); и WO 2003/085107).
[00346] Дополнительно предложены варианты антител с олигосахаридами, разделенными пополам, например, в которых двухантенарный олигосахарид, присоединенный к Fc-участку антитела, разделен пополам GlcNAc. Такие варианты антител могут характеризоваться сниженным фукозилированием и/или улучшенной АЗКЦ-функцией. Примеры таких вариантов антител описаны, например, в WO 2003/011878 (Jean-Mairet et al.); патент США №6602684 (Umana et al.); и US 2005/0123546 (Umana et al.). Предложены также варианты антител с по меньшей мере одним остатком галактозы в олигосахариде, присоединенному к Fc-участку. Такие варианты антител могут обладать улучшенной КЗЦ-функцией. Такие варианты антител описаны, например, в WO 1997/30087 (Patel et al.); WO 1998/58964 (Raju, S.) и WO 1999/22764 (Raju, S.).
[00347] Предложены также варианты антител с аминоконцевыми лидерными удлинениями. Например, на аминоконце любой одной или более тяжелой или легкой цепей антитела присутствует один или более аминокислотных остатков аминоконцевой лидерной последовательности. Типовое аминоконцевое лидерное удлинение содержит или состоит из трех аминокислотных остатков, VHS, присутствующих на одной или более легких цепей варианта антитела.
[00348] Можно анализировать связывание in vivo или период полувыведения из сыворотки полипептидов с высокой аффинностью связывания с человеческим FcRn, например, на трансгенных мышах, в организме людей или на приматах, не являющихся человеком, которым вводят полипептиды, содержащие вариантный Fc-участок. См. также, например, Petkova et al. International Immunology 18(12): 1759-1769 (2006).
[00349] В некоторых вариантах реализации изобретения вариант антитела опосредует АЗКЦ в присутствии эффекторных клеток человека более эффективно, чем исходное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения вариант антитела практически является более эффективным в опосредовании АЗКЦ in vitro, когда количества варианта полипептида и исходного антитела, используемого в анализе, являются по существу одинаковыми. В некоторых вариантах реализации изобретения вариант антитела практически является более эффективным в опосредовании АЗКЦ in vivo, когда количества варианта полипептида и исходного антитела, используемого в анализе, являются по существу одинаковыми. В целом, такие варианты будут идентифицированы с использованием анализа АЗКЦ in vitro, как описано в данном документе, но подразумеваются и другие анализы или методы для определения активности АЗКЦ, например, на модели животного и т.п.
Типовые конъюгаты антител
[00350] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело конъюгировано с другой молекулой. В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительная молекула может быть выявляемым маркером, таким как метка. В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительная молекула может быть терапевтической молекулой, такой как цитотоксическое средство. В некоторых вариантах реализации изобретения метка и/или цитотоксическое средство может быть конъюгированно с антителом. Как используется в данном документе, метка представляет собой фрагмент, который облегчает обнаружение антитела и/или облегчает обнаружение молекулы, с которой данное антитело связывается. Неограничивающие типовые метки включают, но не ограничивается ими, радиоизотопы, флуоресцентные группы, ферментные группы, хемилюминесцентные группы, биотин, эпитопные маркеры, металлосвязывающие маркеры и т.п. Специалист в данной области техники может выбирать подходящую метку в соответствии с конкретным применением.
[00351] Как используется в данном документе, цитотоксическое средство представляет собой фрагмент, который снижает пролиферативную способность одной или более клеток. Клетка обладает пониженной пролиферативной способностью, когда она становится менее способной к пролиферации, например, из-за того, что клетка претерпевает апоптоз или погибает иным образом, у клетки нарушается прохождение по клеточному циклу и/или нарушается деление, клетка дифференцируется и т.п. Неограничивающие типовые цитотоксические средства включает, но не ограничиваются ими, радиоизотопы, токсины и химиотерапевтические средства. Специалист в данной области техники может выбирать подходящее цитотоксическое средство в соответствии с предполагаемым применением. В некоторых вариантах реализации изобретения цитотоксическое средство представляет собой по меньшей мере одно средство из антиметаболита, алкилирующего средства, антибиотика, фактора роста, цитокина, анти-ангиогенного средства, антимитотического средства, антрациклина, токсина или апоптического средства.
[00352] В некоторых вариантах реализации изобретения метка и/или цитотоксическое средство конъюгировано с антителом с использованием химических метов in vitro. Неограничивающие типовые химические методы конъюгации известные в данной области техники и включают услуги, методы и/или реактивы, коммерчески доступные, например, в компании Thermo Scientific Life Science Research Produces (бывшая Pierce; г. Рокфорд, штат Иллинойс), Prozyme (г. Хейворд, штат Калифорния), SACRI Antibody Services (г. Калгари, Канада), AbD Serotec (г. Роли, штат Северная Каролина) и т.д. В некоторых вариантах реализации изобретения, когда метка и/или цитотоксическое средство представляет собой полипептид, то данная метка и/или цитотоксическое средство может экспрессироваться из того же экспрессионного вектора с по меньшей мере одной цепью антитела для продуцирования полипептида, содержащего метку и/или цитотоксическое средство, слитое с цепью антитела. Специалист в данной области техники может выбирать подходящий способ конъюгирования метки и/или цитотоксического средства с антителом в соответствии с предполагаемым применением.
[00353] В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгация может быть ковалентной. В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгация может быть нековалентной. В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгация может происходить посредством специфического взаимодействия связывания, например, посредством связывания вторичного антитела.
Типовые лидерные последовательности
[00354] Для того чтобы некоторые секретируемые белки экспрессировались и секретировались в больших количествах, может требоваться лидерная последовательность из гетерологичного белка. В некоторых вариантах реализации изобретения может быть целесообразным применение гетерологичных лидерных последовательностей, в которых результирующий зрелый полипептид может оставаться неизмененным, так как лидерная последовательность удаляется в ЭР по время процесса секреции. Добавление гетерологичной лидерной последовательности может быть полезным для экспрессии и секретирования некоторых белков.
[00355] Последовательности определенных типовых лидерных последовательностей описаны, например, в доступной в сети базе данных лидерных последовательностей, поддерживаемой отделом биохимии Национального университета Сингапура. См. Choo et al., ВМС Bioinformatics, 6:249 (2005) и публикацию согласно РСТ №WO 2006/081430.
IV. Экспрессия и продукция антител
Молекулы нуклеиновых кислот, кодирующие анти-ICOS антитела
[00356] В данном документе предложены молекулы нуклеиновых кислот, содержащие полинуклеотиды, которые кодируют одну или более цепей анти-ICOS антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения молекула нуклеиновой кислоты содержит полинуклеотид, который кодирует тяжелую цепь или легкую цепь анти-ICOS антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения молекула нуклеиновой кислоты содержит как полинуклеотид, который кодирует тяжелую цепь, так и полинуклеотид, который кодирует легкую цепь, анти-ICOS антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения первая молекула нуклеиновой кислоты содержит первый полинуклеотид, который кодирует тяжелую цепь, а вторая молекула нуклеиновой кислоты содержит второй полинуклеотид, который кодирует легкую цепь.
[00357] В некоторых вариантах реализации изобретения тяжелая цепь и легкая цепь экспрессируются на одной молекуле нуклеиновой кислоты или на двух отдельных молекулах нуклеиновой кислоты, как два отдельных полипептида. В некоторых вариантах реализации изобретения, в которых антитело представляет собой scFv, единственный полинуклеотид кодирует единственный полипептид, содержащий и тяжелую цепь и легкую цепь, соединенные вместе.
[00358] В некоторых вариантах реализации изобретения полинуклеотид, кодирующий тяжелую цепь или легкую цепь анти-ICOS антитела, содержит нуклеотидную последовательность, которая кодирует по меньшей мере один из CDR, предложенных в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения полинуклеотид, кодирующий тяжелую цепь или легкую цепь анти-ICOS антитела, содержит нуклеотидную последовательность, которая кодирует по меньшей мере 3 из CDR, предложенных в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения полинуклеотид, кодирующий тяжелую цепь или легкую цепь анти-ICOS антитела, содержит нуклеотидную последовательность, которая кодирует по меньшей мере 6 из CDR, предложенных в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения полинуклеотид, кодирующий тяжелую цепь или легкую цепь анти-ICOS антитела, содержит нуклеотидную последовательность, которая кодирует лидерную последовательность, которая после трансляции расположена на N-конце тяжелой цепи или легкой цепи. Как обсуждается выше, лидерная последовательность может быть нативной лидерной последовательностью тяжелой или легкой цепи, или может быть другой гетерологичной лидерной последовательностью.
[00359] В некоторых вариантах реализации изобретения нуклеиновая кислота представляет собой такую, которая кодирует любую из аминокислотных последовательностей антител в таблице последовательностей данного документа. В некоторых вариантах реализации изобретения нуклеиновая кислота представляет собой такую, которая является на по меньшей мере 80% идентичной нуклеиновой кислоте, кодирующей любую из аминокислотных последовательностей антител в таблице последовательностей данного документа, например, идентичной на по меньшей мере 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99%. В некоторых вариантах реализации изобретения нуклеиновая кислота представляет собой такую, которая гибридизируется с любой одной или более из последовательностей нуклеиновых кислот, предложенных в данном документе. В некоторых из вариантов реализации изобретения гибридизация проходит в умеренных условиях. В некоторых вариантах реализации изобретения гибридизация проходит в очень жестких условиях, таких как: по меньшей мере приблизительно 6Х SSC и 1% SDS при 65°С, с первой промывкой в течении 10 минут при около 42°С с приблизительно 20% (об./об.) формамида в 0,1Х SSC и с последующей промывкой 0,2 X SSC и 0,1% SDS при 65°С.
[00360] Молекулы нуклеиновых кислот можно конструировать с использованием методик рекомбинантных ДНК, традиционных в данной области техники. В некоторых вариантах реализации изобретения молекула нуклеиновой кислоты представляет собой экспрессионный вектор, который является подходящим для экспрессии в выбранной клетке-хозяине. Векторы
[00361] Предложены векторы, содержащие полинуклеотиды, которые кодируют тяжелые цепи анти-ICOS и/или легкие цепи анти-ICOS. Предложены также векторы, содержащие полинуклеотиды, которые кодируют тяжелые цепи анти-ICOS и/или легкие цепи анти-ICOS. Такие векторы включают, но не ограничивается ими, ДНК-вектор, фаговый вектор, вирусный вектор, ретровирусный вектор, т.д. В некоторых вариантах реализации изобретения вектор содержит первую полинуклеотидную последовательность, кодирующую тяжелую цепь, и вторую полинуклеотидную последовательность, кодирующую легкую цепь. В некоторых вариантах реализации изобретения тяжелая цепь и легкая цепь экспрессируются на векторе как два отдельных полипептида. В некоторых вариантах реализации изобретения тяжелая цепь и легкая цепь экспрессируются как часть одного полипептида, такого как, например, в случае антитела scFv.
[00362] В некоторых вариантах реализации изобретения первый вектор содержит первый полинуклеотид, который кодирует тяжелую цепь, а второй вектор содержит второй полинуклеотид, который кодирует легкую цепь. В некоторых вариантах реализации изобретения первый вектор и второй вектор трансфицируют в клетки-хозяева в одинаковых количествах (таких как одинаковые мольные количества или одинаковые массовые количества). В некоторых вариантах реализации изобретения в клетки-хозяева трансфицируют мольное или массовое соотношение первого вектора и второго вектора между 5:1 и 1:5. В некоторых вариантах реализации изобретения используют массовое соотношение между 1:1 и 1:5 для вектора, кодирующего тяжелую цепь, и вектора, кодирующего легкую цепь. В некоторых вариантах реализации изобретения используют массовое соотношение 1:2 для вектора, кодирующего тяжелую цепь, и вектора, кодирующего легкую цепь.
[00363] В некоторых вариантах реализации изобретения выбирают вектор, который оптимизирован для экспрессии полипептидов в клетках СНО или происходящих от СНО клетках, или в клетках NSO. Такие типовые векторы описаны, например, в Running Deer et al., Biotechnol.Prog. 20: 880-S89 (2004).
Клетки-хозяева

[00364] В некоторых вариантах реализации изобретения тяжелые цепи анти-ICOS антитела и/или легкие цепи анти-ICOS антитела могут экспрессироваться в прокариотических клетках, таких как бактериальные клетки; или в эукариотических клетках, таких как клетки грибов (такие как дрожжи), клетки растений, клетки насекомых и клетки млекопитающих. Такая экспрессия может выполняться, например, в соответствии с процедурами, известными в данной области техники. Типовые эукариотические клетки, которые можно использовать для экспрессии полипептидов включают, но не ограничивается ими, клетки COS, включая клетки COS 7; клетки 293, включая клетки 293-6Е; клетки СНО, включая CHO-S, DG44. Клетки Lec13 СНО и клетки FUT8 СНО; клетки PER.C6 (Crucell) и клетки NSO. В некоторых вариантах реализации изобретения тяжелые цепи анти-ICOS антитела и/или легкие цепи анти-ICOS антитела могут экспрессироваться в дрожжах. См., например, публикацию США №US 2006/0270045 A1. В некоторых вариантах реализации изобретения конкретная эукариотическая клетка-хозяин выбирается на основе ее способности выполнять требуемые посттрансляционные модификации в отношении тяжелых цепей анти-ICOS антитела и/или легких цепей анти-ICOS антитела. Например, в некоторых вариантах реализации изобретения клетки СНО продуцируют полипептиды, которые имеют более высокий уровень сиалирования, чем такой же полипептид, полученный в клетках 293.
rd
[00365] Введение одной или более нуклеиновых кислот в требуемую хозяйскую клетку может выполняться любым способом, включая, но не ограничиваясь, трансфекцией с помощью фосфата кальция, опосредованной ДЭАЭ-декстраном трансфекцией, опосредованной катионными липидами трансфекцией, электропорацией, трансдукцией, инфекцией и т.п. Неограничивающие типовые способы описаны, например, в Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory ManuA1, 3 ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press (2001). Нуклеиновые кислоты могут быть транзиенто или стабильно трансфицированы в требуемые клетки-хозяева в соответствии с любым подходящим способом).
[00366] Также предложены клетки-хозяева, содержащие любой из полинуклеотидов или векторов, описанных в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения предложена клетка-хозяин, содержащая анти-ICOS антитело. Для целей выделения генов, кодирующих данное антитело, полипептид или интересующий белок, можно использовать любые клетки-хозяева, способные сверхэкспрессировать гетерологичные ДНК. Неограничивающие примеры клеток-хозяев млекопитающих включают, но не ограничиваются клетками COS, HeLa и СНО. См. также публикацию согласно РСТ №WO 87/04462. Подходящие клетки-хозяева, не относящиеся к млекопитающим, включают прокариоты (такие как Е. coli или В. subtillis) и дрожжи (такие как S. cerevisae, S. pombe или K. lactis).
Очистка антител
[00367] Анти-ICOS антитела можно очищать любым подходящим методом. Такие методы включают, но не ограничиваются ими, применение аффинных матриц или хроматографии гидрофобных взаимодействий. Подходящие аффинные лиганды включают ROR1 ECD и лиганды, которые связывают константные участки антител. Например, для связывания константного участка и очистки анти-ICOS антитела можно применять аффинную колонку с белком А, белком G, белком A/G или антителом. Хроматография гидрофобных взаимодействий, например, бутильная или фенильная колонка, также может подходить для очистки некоторых полипептидов, таких как антитела. Ионообменная хроматография (например анионообменная хроматография и/или катионообменная хроматография) также может подходить для очистки некоторых полипептидов, таких как антитела. Хроматография смешанного режима (например обращеннофазная/анионообменная, обращеннофазная/катионообменная, гидрофобных взаимодействий/анионообменная, гидрофобных взаимодействий/катионообменная, и т.д.) также может подходить для очистки некоторых полипептидов, таких как антитела. В данной области техники известно много методов очистки полипептидов.
Бесклеточноя продукция антител
[00368] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело продуцируют в бесклеточной системе. Неограничивающие типовые бесклеточные системы описаны, например, в Sitaraman et al., Methods Mol.Biol. 498: 229-44 (2009); Spirin, Trends Biotechnol. 22: 538-45 (2004); Endo et al., Biotechnol.Adv. 21: 695-713 (2003).
Композиции
[00369] В некоторых вариантах реализации изобретения предложены антитела, полученные описанными выше способами. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело получают в клетке-хозяине. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело получают в бесклеточной системе. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело является очищенным. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, получаемое в клетке-хозяине или бесклеточной системе, является химерным антителом. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, получаемое в клетке-хозяине или бесклеточной системе, является гуманизированным антителом. В некоторых вариантах реализации изобретения антитело, получаемое в клетке-хозяине или бесклеточной системе, является антителом человека. В некоторых вариантах реализации изобретения предложена культуральная среда клеток, содержащая анти-ICOS антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения предложена культуральная жидкость клеток-хозяев, содержащая анти-ICOS антитело.
[00370] В некоторых вариантах реализации изобретения предложены композиции, содержащие антитела, полученные описанными выше способами. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит антитело, полученное в клетке-хозяине. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит антитело, полученное в бесклеточной системе. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит очищенное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит химерное антитело, полученное в клетке-хозяине или бесклеточной системе. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит гуманизированное антитело, полученное в клетке-хозяине или бесклеточной системе. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит антитело человека, полученное в клетке-хозяине или бесклеточной системе.
[00371] В некоторых вариантах реализации изобретения предложена композиция, содержащая анти-ICOS антитело в концентрации более чем около любого из значений 10 мг/мл, 20 мг/мл, 30 мг/мл, 40 мг/мл, 50 мг/мл, 60 мг/мл, 70 мг/мл, 80 мг/мл, 90 мг/мл, 100 мг/мл, 125 мг/мл, 150 мг/мл, 175 мг/мл, 200 мг/мл, 225 мг/мл, или 250 мг/мл. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит химерное антитело, полученное в клетке-хозяине или бесклеточной системе. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит гуманизированное антитело, полученное в клетке-хозяине или бесклеточной системе. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит антитело человека, полученное в клетке-хозяине или бесклеточной системе.
V. Терапевтические композиции и способы
Способы лечения заболеваний с использованием анти-ICOS антител
[00372] Для применения в способах лечения людей и животных предложены антитела и композиции, содержащие антитела. Предложены также способы лечения заболевания, включающие введение анти-ICOS антител. Неограничивающие типовые заболевания, которые могут излечиваться с помощью анти-ICOS антител включают, но не ограничиваются раковым заболеванием.
[00373] В некоторых вариантах реализации изобретения предложен способ лечения опухоли, в котором клетки внутри образца опухоли экспрессируют ICOS. В некоторых таких вариантах реализации изобретения опухоль может считаться ICOS-позитивной или экспрессировать ICOS. Экспрессию ICOS можно определять методом ИГХ, например, как обсуждается в данном документе. В некоторых вариантах реализации изобретения считается, что опухоль экспрессирует ICOS, когда образец из опухоли показывает 1+, 2+ или 3+ окрашивание по ICOS методом ИГХ. В некоторых вариантах реализации изобретения образец из опухоли показывает 2+ или 3+ окрашивание по ICOS методом ИГХ. В некоторых вариантах реализации изобретения образец опухоли, полученный от субъекта, анализируют на экспрессию ICOS и субъект отбирают для лечения с помощью антител, описанных в данном документе, если образец опухоли показывает экспрессию ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают, если образец опухоли показывает повышенную экспрессию ICOS.
НИ3КИЙ
ВЫСОКИЙ
НИ3КИЙ
BЫCОКИЙ
BЫCОКИЙ
[00374] В некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают для лечения с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, если опухоль субъекта представляет собой PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают для лечения с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, если опухоль субъекта представляет собой ICOS/PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают для лечения с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, если опухоль субъекта представляет собой ICOS/PD-L1.
[00375] Анти-ICOS антитело можно вводит субъектам по мере необходимости. Определение частоты введения может выполняться специалистами в данной области, такими как лечащий врач, на основе соображений относительно подлежащего лечению патологического состояния, возраста подлежащего лечению субъекта, тяжести подлежащего лечению патологического состояния, общего состояния здоровья подлежащего лечению субъекта и тому подобного. В некоторых вариантах реализации изобретения субъекту вводится эффективная доза анти-ICOS антитела один или более раз. В некоторых вариантах реализации изобретения субъекту вводится эффективная доза анти-ICOS антитела раз в месяц, менее раза в месяц, так как, например, каждые два месяца или каждые три месяца. В некоторых вариантах реализации изобретения эффективная доза анти-ICOS антитела вводится менее раза в месяц, так как, например, раз каждые три недели, раз каждые две недели или раз в неделю. В некоторых вариантах реализации изобретения субъекту вводится эффективная доза анти-ICOS антитела по меньшей мере один раз. В некоторых вариантах реализации изобретения эффективную дозу анти-ICOS антитела можно вводить множество раз, включая периоды по меньшей мере одного месяца, по меньшей мере шести месяцев или по меньшей мере один год.
[00376] В некоторых вариантах реализации изобретения фармацевтические композиции вводят в количестве, эффективном для лечения (включая профилактику) ракового заболевания. Терапевтически эффективное количество, как правило, зависит от массы подлежащего лечению субъекта, его или ее физического состояния или состояния здоровья, запущенности подлежащего лечению патологического состояния или возраста подлежащего лечению субъекта. В общем, анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 10 мкг/кг массы тела до около 100 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 50 мкг/кг массы тела до около 5 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 100 мкг/кг массы тела до около 10 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 100 мкг/кг массы тела до около 20 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 0,5 мг/кг массы тела до около 20 мг/кг массы тела на дозу.
[00377] Фармацевтические композиции вводят в количестве, эффективном для увеличения количества Teff-клеток; активации Teff-клеток; истощения Treg-клеток и/или увеличения соотношения Teff-клеток к Treg-клеткам. В некоторых вариантах реализации изобретения Treg-клетки являются CD4+ FoxP3+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD8+ Т-клетками. В некоторых вариантах реализации изобретения Teff-клетки являются CD4+ FoxP3- Т-клетками и CD8+ Т-клетками).
[00378] В некоторых вариантах реализации изобретения лечение с помощью анти-ICOS антитела приводит к такому показателю фармакодинамики, как повышение регуляции лиганда ICOS (ICOSL). В некоторых вариантах реализации изобретения наблюдается повышение регуляции ICOSL на поверхности В-клеток. В некоторых вариантах реализации изобретения наблюдается повышение регуляции ICOSL на поверхности гранулоцитов. В некоторых вариантах реализации изобретения наблюдается повышение регуляции ICOSL на поверхности нейтрофилов. Повышение регуляции ICOSL можно наблюдать на клетках в опухоли; на клетках в селезенке; на клетках в периферической крови. Повышение регуляции ICOSL на поверхности клеток можно наблюдать, например, методом проточной цитометрии. В некоторых вариантах реализации изобретения растворимый ICOSL увеличивается в сыворотке после лечения с помощью анти-ICOS антитела. Растворимый ICOSL также можно обнаруживать способами, включающими, но ограничивающимися ELISA, MSD и масс-спектрометрией. В некоторых вариантах реализации изобретения захват мишени ICOS, при измерении по доступности свободного рецептора, анти-ICOS антителами также можно использовать как показатель фармакодинамики. В некоторых таких вариантах реализации изобретения при лечении анти-ICOS антителом можно количественно определять рецепторы ICOS на поверхности Т-лимфоцитов, которые свободны для связывания дополнительных антител. Уменьшение наблюдаемых доступных рецепторов может служить индикатором, что анти-ICOS антитела связываются со своей молекулой-мишенью.
[00379] Терапевтически эффективное количество, как правило, зависит от массы подлежащего лечению субъекта, его или ее физического состояния или состояния здоровья, запущенности подлежащего лечению патологического состояния или возраста подлежащего лечению субъекта. В общем, анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 10 мкг/кг массы тела до около 100 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 50 мкг/кг массы тела до около 5 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 100 мкг/кг массы тела до около 10 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 100 мкг/кг массы тела до около 20 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 0,5 мг/кг массы тела до около 20 мг/кг массы тела на дозу.
Фармацевтические композиции
th
rd
[00380] В некоторых вариантах реализации изобретения предложены композиции, содержащие анти-ICOS антитела в лекарственных формах с широким диапазоном фармацевтически приемлемых носителей (см., например, Gennaro, Remington:The Science and Practice of Pharmacy with Facts and Comparisons:Drugfacts Plus, 20th ed. (2003); Ansel et al., Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, 7 ed., Lippencott Williams and Wilkins (2004); Kibbe et al., Handbook of Pharmaceutical Excipients, 3 ed., Pharmaceutical Press (2000)). Доступны различные фармацевтически приемлемые носители, которые включают носители, адъюванты и разбавители. Более того, доступны также различные фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества, такие как регулирующие рН и буферизирующие средства, регулирующие тоничность средства, стабилизаторы, увлажняющие средства и тому подобное. Неограничивающие типовые носители включают солевой раствор, забуференный солевой раствор, декстрозу, воду, глицерин, этанол и их комбинации.
[00381] В некоторых вариантах реализации изобретения предложена фармацевтическая композиция, содержащая анти-ICOS антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения фармацевтическая композиция содержит химерное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения фармацевтическая композиция содержит гуманизированное антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения фармацевтическая композиция содержит антитело, полученное в клетке-хозяине или бесклеточной системе. В некоторых вариантах реализации изобретения фармацевтическая композиция содержит фармацевтически приемлемый носитель.
[00382] В некоторых вариантах реализации изобретения фармацевтические композиции вводят в количестве, эффективном для лечения (включая профилактику) ракового заболевания. Терапевтически эффективное количество, как правило, зависит от массы подлежащего лечению субъекта, его или ее физического состояния или состояния здоровья, запущенности подлежащего лечению патологического состояния или возраста подлежащего лечению субъекта. В общем, анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 0,05 мг/кг массы тела до около 100 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 10 мкг/кг массы тела до около 100 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 50 мкг/кг массы тела до около 5 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 100 мкг/кг массы тела до около 10 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 100 мкг/кг массы тела до около 20 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 0,5 мг/кг массы тела до около 20 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 0,5 мг/кг массы тела до около 10 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 0,05 мг/кг массы тела до около 20 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 0,05 мг/кг массы тела до около 10 мг/кг массы тела на дозу. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить в количестве в диапазоне от около 5 мг/кг массы тела или менее, например, менее чем 4, менее чем 3, менее чем 2 или менее чем около 1 мг/кг антитела.
[00383] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела могут присутствовать в количестве в диапазоне от около 50 мкг/кг массы тела до около 5 мг/кг массы тела на дозу. Например, в некоторых вариантах реализации изобретения доза для лица массой 20 кг может находиться в диапазоне от около 1 мг до около 100 мг. В некоторых вариантах реализации изобретения доза может находиться в диапазоне от 2 мг до 200 мг анти-ICOS антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения доза может находиться в диапазоне от 10 мг до 400 мг анти-ICOS антитела.
Пути введения
[00384] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитела можно вводить in vivo различными путями, включающими, но ограничивающимися ими, внутривенный, внутриартериальный, парентеральный, внутриопухолевый, внутриперитонеальный или подкожный. Соответствующая лекарственная форма и путь введения может выбираться в соответствии с предполагаемым применением.
Комбинированная терапия
[00385] Анти-ICOS антитела можно вводить самостоятельно или с другими способами лечения. Их можно вводить перед, практически одновременно с и/или после других способов лечения, например, хирургической, химиотерапии, радиационной терапии или введения биологического препарата, такого как другое терапевтическое антитело. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело вводят в сочетании с другим противораковым средством.
[00386] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело назначается одновременно со вторым лекарственным средством. Например, два или более лекарственных средств вводят с разделением по времени не более чем около 60 минут, например, не более чем около любого разделения из 30, 15, 10, 5 или 1 минуты. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело назначается последовательно со вторым лекарственным средством. Например, введение двух или более лекарственных средств проводят с разделением по времени не более чем около 15 минут, например, около любого разделения из 20, 30, 40, 50 или 60 минут, 1 дня, 2 дней, 3 дней, 1 недели, 2 недель или 1 месяца, или дольше.
[00387] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело вводят со вторым терапевтическим способом лечения. Таким образом, введение антитела, предложенного в данном документе, может происходить в комбинации с другой системой лечения.

[00388] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с PD-1 терапией. Типовые лекарственные средства для PD-1 терапии включают, но не ограничиваются ими, ниволумаб (OPDIVO, BMS-936558, MDX-1106, ONO-4538); пидилизумаб, ламбролизумаб/пембролизумаб (KEYTRUDA, MK-3475); дурвалузумаб (анти-PD-L1 антитело, MEDI-4736; AstraZeneca/Medlmmune); RG-7446; авелумаб (анти-PD-L1 антитело; MSB-0010718C Pfizer); AMP-224; BMS-936559 (анти-PD-L1 антитело); AMP-514; MDX-1105; ANB-011 анти-LAG-3/PD-1; анти-PD-1 антитело (CoStim); анти-PD-1 антитело (Kadmon Pharm.) анти-PD-1 антитело (Immunovo); анти-ТГМ-3/PD-1 антитело (AnaptysBio); анти-PD-L1 антитело (CoStim/Novartis); RG7446/MPDL3280A (анти-PD-L1 антитело, Genentech/Roche); KD-033, антагонист PD-1 (Agenus); STI-A1010; STI-A1110; TSR-042 и другие антитела, которые направлены против белка-1 программируемой гибели (PD-1) или лиганда 1 белка программируемой гибели 1 (PD-L1).
BЫCОКИЙ
BЫCОКИЙ
BЫCОКИЙ
BЫCОКИЙ
[00389] В некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают для лечения с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, и PD-1 терапии, если опухоль субъекта экспрессирует PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают для лечения с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, и PD-1 терапии, если опухоль субъекта определяется как имеющая PD-высокий Q некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают для лечения с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, и PD-1 терапии, если опухоль субъекта экспрессирует ICOS и PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения субъект отбирают для лечения с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, и PD-1 терапии, если опухоль субъекта определяется как имеющая ICOS/PD-L1. Можно проводить определение уровня PD-L1 и/или ICOS, например, с использованием ИГХ. В некоторых вариантах реализации изобретения считается, что опухоль пациента экспрессирует PD-L1, когда 1% или более, или 5% или более опухолевых клеток в образце показывают окрашивание мембраны по PD-L1 методом ИГХ. В некоторых вариантах реализации изобретения более чем 50% опухолевых клеток в образце показывают окрашивание мембраны по PD-L1 методом ИГХ. В некоторых таких вариантах реализации изобретения опухоль субъекта считается имеющей PD-L1. В некоторых вариантах реализации изобретения считается, что опухоль пациента экспрессирует ICOS, когда 1% или более клеток в образце показывают окрашивание по ICOS методом ИГХ. В некоторых вариантах реализации изобретения субъект сначала лечат с помощью PD-1 терапии, а позже лечат с помощью анти-ICOS антитела, предложенного в данном документе, с продолжением PD-1 терапии или без ее продолжения. Таким образом, предложенные в данном документе способы включают лечение субъекта с помощью анти-ICOS антитела, причем субъекта раннее лечили с помощью PD-1 терапии.

[00390] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с анти-ОХ40 антителом-агонистом (таким как Medi6469, MedImmune; MOXR0916/RG7888, Roche). В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с анти-СТLА4 антителом (таким как ипилимумаб, YERVOY, BMS).

[00391] В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет собой химиотерапевтическое средство. Типовые химиотерапевтические средства, которые можно комбинировать с анти-ICOS антителами, предложенными в данном документе, включают, но не ограничиваются ими, капектиабин, циклофосфамид, дакарбазин, темозоломид, циклофосфамид, доцетаксел, доксорубицин, даунорубицин, цисплатин, карбоплатин, эпирубицин, эрибулин, 5-ФУ, гемцитабин, иринотекан, иксабепилон, метотрексат, митоксантрон, оксалиплатин, паклитаксел, наб-паклитаксел, ABRAXANE (связанный с белком паклитаксел), пеметрексед, винорелбин и випкристин. В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят с по меньшей мере одним ингибитором киназ. Неограничивающие типовые ингибиторы киназ включают эрлотиниб, афатиниб, гефитиниб, кризотиниб, дабрафениб, траметиниб, вемурафениб и кобиметаниб).
[00392] В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет собой ингибитор IDO. Неограничивающие типовые ингибиторы IDO описаны, например, в US 2016/0060237 и US 2015/0352206. Неограничивающие типовые ингибиторы IDO включают индоксимод (New Link Genetics), INCB024360 (Incyte Corp), 1-метил-D-триптофан (New Link Genetics) и GDC-0919 (Genentech).
[00393] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят в комбинации с иммунномодулирующим лекарственным средством (IMiD). Неограничивающие типовые IMiD включают талидомид, леналидомид и помалидомид.
[00394] В некоторых вариантах реализации изобретения дополнительное лекарственное средство представляет собой противораковую вакцину. Противораковые вакцины исследовали в качестве потенциального подхода для переноса антигенов и активации дендритных клеток. В частности, продемонстрировано доказательство, что вакцинация в комбинации с иммунологическими контрольными точками или агонистами для костимулирующих механизмов преодолевает устойчивость и создает увеличенный противоопухолевый ответ. Испытали ряд противораковых вакцин, которые применяют различные подходы для улучшения иммунного ответа против опухоли (см., например, Emens LA, Expert Opin Emerg Drugs 13(2):295-308 (2008)). Были разработаны подходы для усиления ответа В-клеток, Т-клеток или специализированных антигенпрезентирующих клеток против опухолей. Типовые типы противораковых вакцин включают, но не ограничиваются ими, вакцины на основе пептидов, которые используют нацеливание на разные опухолевые антигены, которые могут доставляться как пептиды/белки или как генетически сконструированные ДНК-векторы, вирусы, бактерии или тому подобное; и подходы клеточной биологии, например, для разработки противораковых вакцин против менее четко определенных мишеней, включая, но ограничиваясь ими, вакцинами, разработанными на основе полученных из организма пациента дендритных клеток, аутологичных опухолевых клеток или лизатов опухолевых клеток, аллогенных опухолевых клеток и тому подобного.
[00395] Таким образом, в некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, может применяться в комбинации с противораковой вакциной. Типовые противораковые вакцины включают, но не ограничиваются ими, вакцины на основе дендритных клеток, онколитические вирусы, вакцины на основе опухолевых клеток т.п. В некоторых вариантах реализации изобретения такие вакцины увеличивают противоопухолевый ответ. Примеры противораковые вакцины, которые можно использовать в комбинации с анти-ICOS антителами, предложенными в данном документе, включают, но не ограничиваются ими, вакцину MAGE3 (например, против меланомы и рака мочевого пузыря), вакцину MUC1 (например против рака молочной железы), EGFRv3 (такую как Rindopepimut, например против рака головного мозга, включая многоформную глиобластому) или ALVAC-CEA (например, против СЕА+ раковых заболеваний).
[00396] Неограничивающие типовые противораковые вакцины также включают Sipuleucel-T, которая получена из аутологичных мононуклеарных клеток периферической крови (РВМС), включающих антигенпрезентирующие клетки (см., например, Kantoff PW et al., N Engl J Med 363:411-22 (2010)). При получении Sipuleucel-T активируют РВМС пациента ex vivo с помощью РА2024, рекомбинантный белок слияния простатической кислой фосфатазы (простатический антиген) и гранулоцитарно-макрофагально колониестимулирующего фактора (активатора иммунных клеток). Другой подход к вероятной противораковой вакцине заключается в создании иммунного ответа против специфических полипептидов, мутировавших в опухолевой ткани, такой как меланома (см., например, Carreno ВМ et al., Science 348:6236 (2015)). Такие мутировавшие пептиды могут, в некоторых вариантах реализации изобретения, называться неоантигенами. В качестве неограничивающего примера применения неоантигенов в противоопухолевых вакцинах, у отдельных пациентов с раковым заболеванием, таким как меланома, идентифицируют неоантигены в опухоли, которые, как предполагается, связываются с белком главного комплекса гистосовместимости HLA-A*02:01. Дендритные клетки из организма пациента созревают ex vivo, затем инкубируют с неоантигенами. Активированные дендритные клетки затем переносят вводят в организм пациента. В некоторых вариантах реализации изобретения после введения противораковой вакцины выявляется устойчивый Т-клеточный иммунитет против данного неоантигена.
[00397] В некоторых таких вариантах реализации изобретения противораковую вакцину разрабатывают с использованием неоантигена. В некоторых вариантах реализации изобретения противораковая вакцина представляет собой ДНК-вакцину. В некоторых вариантах реализации изобретения противораковая вакцина представляет собой сконструированный вирус, содержащий раковый антиген, такой как PROSTVAC (рилимоген галвацирепвек/рилимоген глафоливек). В некоторых вариантах реализации изобретения противораковая вакцина содержит сконструированные опухолевые клетки, такие как GVAX, которые представляют собой вакцину на основе опухолевых клеток, трансфицированных геном гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора (GM-CSF) (см., например, Nemunaitis, 2005, Expert Rev Vaccines, 4:259-74)).
[00398] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, описанное в данном документе, вводят перед, одновременно и/или после противораковой вакцины. В некоторых вариантах реализации изобретения противораковую вакцину, разработанную с использованием неоантигенов, применяют в комбинации с анти-ICOS антителами, описанными в данном документе. В некоторых таких вариантах реализации изобретения данную комбинацию используют для лечения ракового заболевания с высокой мутационной нагрузкой, такого как меланома, рак легкого, мочевого пузыря или колоректальный рак.
[00399] В некоторых вариантах реализации изобретения анти-ICOS антитело, предложенное в данном документе, вводят в комбинации с Т-клеточной терапией с химерным антигенным рецептором (терапия CAR-T).
Диагностические применения
[00400] В данном документе предложены способы применения анти-ICOS антител, полипептидов и полинуклеотидов для выявления, диагностики и мониторинга заболевания, нарушения или патологического состояния, связанного с экспрессией эпитопа анти-ICOS антитела (либо увеличенной, либо уменьшенной относительно нормального образца, и/или недопустимой экспрессией, такой как наличие экспрессии в ткани (-ях) и/или клетке (-ах), у которых в норме отсутствует экспрессия данного эпитопа). Предложенные в данном документе способы предназначены для определения того, будет ли пациент отвечать на терапию анти-ICOS антителами.
[00401] В некоторых вариантах реализации изобретения способ включает выявление с использованием анти-ICOS антител наличия в организме пациента клеток, которые экспрессируют ICOS. В некоторых вариантах реализации изобретения способ выявления включает приведение в контакт образца с антителом, полипептидом или полинуклеотидом и определение отличия уровня связывания от такого уровня эталонного образца или образца сравнения (такого как контроль). В некоторых вариантах реализации изобретения способ можно применять для определения того, являются ли антитела или полипептиды, описанные в данном документе, подходящим лечением для субъекта).
[00402] В некоторых вариантах реализации изобретения клетки или лизат клеток/тканей приводят в контакт с анти-ICOS антителом и определяют связывание антитела и клетки. Если исследуемые клетки показывают активность связывания по сравнению с эталонной клеткой такого же типа ткани, то это может указывать на то, что субъект может получать пользу от лечения с помощью анти-ICOS антитела. В некоторых вариантах реализации изобретения исследуемые клетки происходят из тканей человека.
125
131
35
3
32
[00403] Можно применять различные способы, известные в данной области техники, для выявления специфического связывания антитело-антиген. Типовые иммуноанализы, которые можно проводить, включают иммуноанализ с поляризацией флуоресценции (FPIA), флуоресцентный иммуноанализ (FIA), ферментный иммуноанализ (EIA), нефелометрический иммуноанализ ингибирования (NIA), твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA) и радиоиммунологический анализ (RIA). Индикаторный фрагмент, или маркерную группу, можно присоединять к исследуемым антителам и отбирать так чтобы соответствовать требованиям различных применений способа, которые часто обусловлены доступностью аналитического оборудования и совместимых иммуноаналитических процедур. Подходящие метки включают, без ограничения, радионуклиды (например I, I, S, Н или Р), ферменты (например, щелочная фосфотаза, пероксидаза хрена, люцифераза или β-галактозидаза), флуоресцентные фрагменты или белки (например, флуоресцеин, родамин, фикоэритрин GFP или BFP) или люминесцентные фрагменты (например, наночастицы Qdot™, поставляемые Quantum Dot Corporation, г. Пало-Альто, штат Калифорния). Общие методики, используемые для выполнения различных иммуноанализов, отмеченных выше, известны средним специалистам в данной области техники.
[00404] Для целей диагностики полипептид, включающий антитела, может быть маркирован выявляемым фрагментом, включающим, но ограничивающимся, радиоизотопами, флуоресцентными метками и различными фермент-субстратными метками, известными в данной области техники. Методы конъюгирования меток с антителом известны в данной области техники.
[00405] В некоторых вариантах реализации изобретения нет необходимости, чтобы анти-ICOS антитела были маркированы, и их присутствие можно выявлять с использованием второго меченого антитела, которое связывается с первым анти-ICOS антителом).
[00406] В некоторых вариантах реализации изобретения можно применять анти-ICOS антитело в любом известном аналитическом методе, таком как конкурентные анализы связывания, прямые и непрямые сэндвич-анализы и анализы иммунопреципитации. Zola, Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, pp. 147-158 (CRC Press, Inc. 1987)).
111
99
14
131
125
3
[00407] Анти-ICOS антитела и полипептиды можно также применять для диагностических анализов in vivo, таких как визуализация in vivo. В целом, антитело или полипептид меченный радионуклидом (таким как In, Тс, С, I, I, Н, или любая другая радионуклидная метка, включая отмеченные в данном документе) является таким что интересующие клетки или ткани можно локализировать с использованием иммуносцинтиграфии.
[00408] Данное антитело также можно применять как реактив для окрашивания в патологическом исследовании с использованием методик, хорошо известных в данной области техники.
[00409] В некоторых вариантах реализации изобретения первое антитело используют для диагностики, а второе антитело используют в качестве терапевтического средства. В некоторых вариантах реализации изобретения первое и второе антитела различаются. В некоторых вариантах реализации изобретения первое антитело представляет собой антитело нечеловеческого происхождения, тогда как терапевтическое средство представляет собой антитело человека. В некоторых вариантах реализации изобретения первое и второе антитела могут оба связываться с антигеном одновременно, путем связывания с отдельными эпитопами.
Наборы/изделия
[00410] В данном документе также предложены наборы, лекарственные препараты, композиции и стандартные лекарственные формы для применения в любом из способов, описанных в данном документе.
[00411] Наборы могут включать один или более контейнеров, включающих анти-ICOS антитело (или стандартные лекарственные форм и/или изделия). В некоторых вариантах реализации изобретения предложена стандартная лекарственная форма, содержащая предварительно определенное количество композиции, содержащей анти-ICOS антитело, с одним или более дополнительных средств или без них. В некоторых вариантах реализации изобретения такая стандартная лекарственная форма поставляется в предварительно наполненном шприце для инъекции однократного применения. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция, содержащаяся в стандартной лекарственной форме может содержать солевой раствор, сахарозу или тому подобное; буферный раствор, такой как фосфатный или подобный; и/или быть приготовленным в пределах стабильного и эффективного диапазона рН. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция может быть представлена в виде лиофилизированного порошка, который можно растворять при добавлении соответствующей жидкости, например, стерильной воды. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит одно или более полинуклеотидных веществ, которые ингибируют агрегацию белков, включая, но не ограничиваясь, сахарозой и аргинином. В некоторых вариантах реализации изобретения композиция содержит гепарин и/или протеогликан.
[00412] В некоторых вариантах реализации изобретения количество анти-ICOS антитела, применяемого в лекарственной форме, может составлять любое количество, предложенное в данном документе, для различных описанных способов и/или композиций).
[00413] В некоторых вариантах реализации изобретения наборы дополнительно содержат инструкции по применению для лечения ракового заболевания в соответствии с любым из способов, описанных в данном документе. Набор может дополнительно содержать описание выбора подходящего индивида для лечения. Инструкции, поставляемые в наборах, как правило, представляют собой письменные инструкции на этикетке или вкладыше в упаковке (например, бумажном листе, включенным в набор), но машиночитаемые инструкции (например, инструкции, записанные на магнитном или оптическом накопительном диске) также являются приемлемыми. В некоторых вариантах реализации набор дополнительно содержит другое терапевтическое средство).
[00414] Наборы находятся в подходящей упаковке. Подходящая упаковка включает, но не ограничивается ими, флаконы, бутылки, сосуды, гибкую упаковку (например, герметические майларовые или пластиковые пакеты) и тому подобное. Наборы необязательно могут обеспечиваться дополнительными компонентами, такими как буферные растворы, и интерпретирующую информацию. Таким образом, в настоящей заявке также предложены изделия, которые включают флаконы (такие как герметично закрытые флаконы), бутылки, сосуды, гибкую упаковку и тому подобное.
ПРИМЕРЫ
[00415] Примеры, обсуждаемые ниже, предназначены только для иллюстрирования данного изобретения и не должны считаться как ограничивающие изобретение каким-либо способом. Примеры не предназначены для представления того, что описанные ниже эксперименты являются всеми или единственными выполняемыми экспериментами. Были предприняты усилия для обеспечения точности в отношении использованных числовых значений (например, количеств, температуры и т.п.), но должны учитываться некоторые экспериментальные ошибки и отклонения. Если не указано иное, части являются частями по массе, молекулярная масса представляет собой средневзвешенную молекулярную массу, температура представлена в градусах Цельсия, а давление равно или близко к атмосферному.
Пример 1. Биоинформационный анализ экспрессии мРНК ICOS в опухолях человека.
[00416] Использовали данные секвенирования РНК, собранные как часть TCGA, экспрессию ICOS в ~7500 опухолях сравнивали по 24 различным показателям. Обнаружены высокие уровни мРНК ICOS в субпопуляциях плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC), немелкоклеточного рака легкого (NSCLC) и трижды негативного рака молочной железы (TNBC). См. фигуру 1А.
[00417] Исследовали связь между инфильтрацией Т-клеток и уровнями экспрессии ICOS. Экспрессия набора из 12 генов хемокинов была связана с высокими уровнями инфильтрации Т-клеток и образованием структур, подобных лимфоузлам (Messina et al., 2012, Sci Reports. 2: 165-111). Для каждого образца рассчитывали показатель сигнатуры хемокинов для каждого образца на основе средней экспрессии этих 12 генов хемокинов. Этот показатель сигнатуры рассчитывали для всех образцов плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC). Уровни сигнатуры хемокинов или маркера Treg-клеток (FoxP3) коррелировали с уровнями ICOS в опухолях HNSCC. См. фигуру 2. Существовала сильная корреляция между сигнатурой хемокинов и уровнями ICOS (R=0,83; корреляция Спирмана) или ICOS и FoxP3, маркера Treg-клеток (R=0.88; корреляция Спирмана). Эти данные демонстрируют, что экспрессия ICOS тесно связанна с инфильтрацией Т-клеток и Treg-клеток. Сходные данные наблюдали в случае заболеваний NSCLC и TNBC).
[00418] В опухолях HNSCC экспрессии ICOS в значительной степени коррелировала (R=0,93 и 0,78 соответственно) с уровнями экспрессии других молекул контрольных точек, такими как CTLA-4 и PD-1. См. фигуру 3. Корреляция ICOS с PD-L1 была слабой (R=0,62). Сходные данные наблюдали в случае других показаний, таких как NSCLC. Эти данные дают возможность предположить, что ICOS может экспрессироваться на одих и тех же Т-клетках, которые экспрессируют другие молекулы контрольных точек, таких как CTLA-4 и PD-1. Более слабая корреляция с PD-L1 и ICOS предполагает, что может существовать субпопуляция пациентов с высоким уровнем ICOS, которая может иметь низкий или негативный показатель по PD-L1. Эти данные подтверждают, что ICOS является единственным фактором у PD-L1 негативных пациентов, и также определяют комбинированную стратегию с использованием видов терапии с анти-PD-1 или анти-CTLA-4 средствами.
Пример 2. Анализ ИГХ опухолей человека
[00419] Уровни экспрессии белка ICOS определяли с использованием иммунногистохимического (ИГХ) анализа. Этот анализ с использованием анти-ICOS моноклонального антитела кролика (SP98, Spring Biosciences, г. Плезантон, штат Калифорния) валидировали на аналитическую специфичность, аналитическую прецизионность (межлабораторные, внутрилабораторные анализы и воспроизводимость от серии к серии) и чувствительность. Валидационные исследования выполняли с использованием срезов, фиксированных формалином и залитых парафином (FFPE) тканей и контрольных линий клеток (СНО, сконструированные для экспрессии ICOS человека (положительный контроль) или контрольная линия клеток СНО с вектором, неэкспрессирующим ICOS (отрицательный контроль)). Анализ выполняли на платформе для автоматического окрашивания Leica-Bond Rx, выявляли ICOS в положительном контроле клеток СНО и в субпопуляциях Т-клеток в нормальных миндалинах человека).
[00420] Срезы оценивал квалифицированный патоморфолог с использованием следующих критериев для хромогенного окрашивания:
[00421] Микромассивы тканей из 11 различных типов опухолей окрашивали и классифицировали с использованием этой системы определения показателей. См. фигуру 1В. Данные ИГХ подтвердили данные на основе мРНК о том, что HNSCC, NSCLC и TNBC содержали больший процент инфильтрации иммунных клеток с высоким уровнем ICOS+ (т.е. 3+). См. фигуру 1В. В дополнение к этому данные опухоли, субпопуляции клеток пациентов из меланомы, колоректальный рак и аденокарцинома желудочно-кишечного тракта имели умеренные уровни инфильтрации ICOS-позитивных клеток. См. фигуру 1В.
[00422] Для оценки преобладания и природы Т-Т-клеток, которые экспрессируют ICOS, разрабатывали мультиплексный иммунофлуоресцентный анализ ИГХ для обнаружения ICOS, FOXP3 и CD8. Использовали маркер ДНК (DAPI) для учета общего количества ядер в срезах опухолей человека.
[00423] Экспрессию ICOS определяли с использованием иммуногистохимического анализа с клоном моноклонального антитела кролика, которое распознает ICOS человека (Spring Biosciences Inc.r. Плезантон, штат Калифорния). Специфичность и чувствительность анализа ИГХ для ICOS подтвердили, используя клетки миндалин человека и линии клеток, конститутивно сверхэкспрессирующие ICOS. Интенсивность окрашивания оценивал обученный квалифицированный патоморфолог с использованием следующих критериев. Все типы позитивного окрашивания оценивали на основе экспрессии на мембраны у по меньшей мере двух-третей клеток.
[00424] Репрезентативное изображение схемы оценивания показано на фигуре 4. Оценивание выполняли на основе следующих критериев для иммунофлуоресценции:
0 (негативное) = Нет или менее 0,1% клеток имеют окрашивание мембраны
1 + (умеренное) = позитивны от 0,1 до 5% клеток
2 + (среднее) = позитивны от 5 до 10% клеток
3 + (сильное) = позитивны от >10 до 50% клеток
[00425] Преобладание экспрессии ICOS в различных субпопуляциях NSCLC или соседних нормальных образцах легкого обобщено в таблице 2. У больных раком пациентов не наблюдали сильной экспрессии ICOS в соседней нормальной ткани легкого. Во всех основных подтипах рака легкого наблюдали сильную экспрессию ICOS. Около 29-31% из наиболее часто встречающихся подтипов NSCLC (аденокарцинома или плоскоклеточная карцинома) имело сильное окрашивание ICOS.
.
[0100]
[00426] Применяли также автоматизированную методологию для измерения ICOS-позитивных клеток, используя программное обеспечение для анализа изображений (Strataquest из Tissuegnostics Inc., г. Тарзана, штат Калифорния). Плотность ICOS-позитивных клеток в фиксированной области опухолевой ткани устанавливали путем определения количества ICOS-позитивных клеток на живом участке опухолевой ткани человека, как определено окрашиванием участка по DAPI. Плотность клеток ICOS определяли из отобранного набора из приблизительно 500 отдельных пациентов по 4 основным типам [NSCLC (N=100); HNSCC (N=102); рак молочной железы, все основные подтипы (N=94); трижды негативный подтип рака молочной железы, TNBC (N=95); рак яичника (N=94)]. Обобщающие результаты анализа показаны на фигуре 5. В соответствии с анализом на мРНК ICOS опухоли HNSCC и NSCLC имели значительно более высокую плотность ICOS-позитивных опухолей, по сравнению с раком яичника или молочной железы. Хотя экспрессия ICOS при раке молочной железы является низкой, наблюдали высокие уровни экспрессии ICOS в подтипе TNBC, который составляли около 10% случаев рака молочной железы. См. фигуру 5. Этот подтип TNBC рака молочной железы является наиболее агрессивным подтипом с ограниченными возможностями лечения и наибольшей неудовлетворенной потребностью в медицинском лечении.
[00427] Вариабельность среди пациентов в экспрессии ICOS в двух различных когортах с типами опухолей с высокой экспрессией ICOS (NSCLC) показана на фигурах 6А и 6В. Диапазон плотности клеток ICOS наблюдали у NSCLC из 98 образцов рака легкого (фигура 6А), доступных у коммерческого поставщика. Сходное разнообразие наблюдали при экспрессии ICOS с использованием независимой клинической когорты (фигура 6В) с NSCLC (N=204).
[00428] Анализировали и количественно определяли ICOS, FoxP3 (маркер Treg-клеток) и CD8 из образцов опухолей человека, описанных выше, с помощью мультиплексного ИГХ использованием программного обеспечения для анализа изображений (Strataquest из Tissuegnostics Inc., г. Тарзана, штат Калифорния). Репрезентативное изображение множественного окрашивания ICOS этих маркеров Т-клеток показано на фигуре 7A.ICOS-позитивные клетки, которые являются также FOXP3-позитивными, называют ICOS CD4 Treg-клетками. ICOS-позитивные и CD8-позитивные клетки называют ICOS CD8-клетками. ICOS-позитивные, но негативные по CD8 и FoxP3, называют ICOS+CD4 Teff-клетками. Плотность различных субпопуляций ICOS-позитивных Т-клеток количественно определяли с использованием программного обеспечения для анализа изображений, как описано ниже. В образцах легкого (N=100) и TNBC (n=95) существовало высокое количество как CD4-эффекторов, так и CD4 Treg-клеток, которые были ICOS-позитивными (фигура 7В). В противоположность этому наблюдали немного ICOS-позитивных клеток при раке яичника (n=94). Опухоли HNSCC (N=102) имели большую популяцию ICOS-позитивных CD4 Treg-клеток. В них наблюдали лишь очень небольшую популяцию ICOS-позитивных CD8 Т-клеток во всех исследованных типах опухолей. Эти данные позволяют предположить, что ICOS предпочтительно экспрессировался в компартменте CD4 по сравнению с CD8 Т-клетками и что среди показаний наблюдалась вариация по относительным пропорциям Treg по сравнению с Teff.
[00429] Для того чтобы понять, связана ли экспрессия ICOS непосредственно со статусом PD-L1, оценивали корреляцию между уровнями PD-L1 и экспрессией ICOS. Данные анализов с помощью средств биоинформатики позволили предположить, что экспрессия PD-L1 и уровни ICOS слабо коррелировали (R=0,62). Уровни PD-L1, ICOS и PD-1 оценивали мультиплексным анализом ИГХ. Показано репрезентативное изображение данных мультиплексного анализа ИГХ из опухоли легкого с высоким и низким уровнем PD-L1. См. фигуру 8. Оценивали PD-L1 и ICOS в 154 подтипах аденокарциномы опухолей NSCLC. Опухоли подразделяли на опухоли с высоким или низким уровнем PD-L1 на основе 5% клеток, которые были позитивными по PD-L1. Результаты указали, что PD-L1 позитивные опухоли имели более высокую плотность экспрессии ICOS.
Пример 3. Анализ проточной цитометрии
[00430] Для подтверждения данных экспрессии ICOS, полученных методом ШС, и для сравнения относительных значений интенсивности ICOS, экспрессированного в различных популяциях Т-клеток, экспрессию ICOS в инфильтрующих опухоль лимфоцитах оценивали с использованием многоцветной проточной цитометрии. Анализировали образцы, полученные от четырех пациентов с HNSCC, трех пациентов с раком легкого и четырех пациентов с раком яичника. В соответствии с данными анализа ИГХ, экспрессию ICOS преимущественно наблюдали на CD4 Т-клетках. См. фигуру 9 (HNSCC). Частота встречаемости ICOS-позитивных клеток в популяции CD8 оказывается очень низкой в большинстве из этих опухолей. Авторы также наблюдали, что большинство CD4-эффекторных клеток совместно экспрессируют ICOS и PD-1. Эти данные подтверждают необходимость разработки терапевтического средства в отношении ICOS для клинического применения самостоятельно или в комбинации с анти-PD-1 видами терапии. Измерение экспрессии ICOS в различных популяциях Т-клеток обеспечивалось средней интенсивностью флуоресценции (MFI) окрашивания ICOS. Значение MFI ICOS-позитивных клеток среди Treg-клеток было в 2-3 раза выше, чем для CD4-эффекторов. См. фигуру 9С. Следует отметить, что существуют небольшие популяции CD4-эффекторов, которые имеют высокое значение MFI ICOS. Подтверждение разницы плотностей рецептора ICOS в Teff по сравнению с Treg, согласуется с данными из текущих анализов АЗКЦ для оценки различной чувствительности Teff и Treg к истощению, может подтверждать разработку антитела-агониста с активным Fc, которое потенциально позволяет истощать Treg-клетки.
[00431] Исследования трансляции показывают высокие уровни инфильтрации опухоли ICOS позитивными Т-клетками в субпопуляции опухолей человека (таких как HNSCC, NSCLC и т.д.). Экспрессия ICOS коррелирует с экспрессией других регуляторов ключевых точек, таких как CTLA-4 и PD-1. Анализ субпопуляций Т-клеток показал, что экспрессия ICOS преимущественно ограничена компартментом CD4 Т-клеток. ICOS экспрессируется и в FoxP3-позитивных Treg-клетках, а также в CD4 Teff-клетках. Исследования показывают соответствие с литературными данными, в том что уровень экспрессии ICOS является выше в Treg-клетках по сравнению с CD4 Teff-клетками.
Пример 4. Получение антител
Реактивы
[00432] Белки ICOS, репрезентирующие организм человека, виды мышей, крыс и яванских макак, получали в виде гомодимерных Fc-слияний (скелет IgG1), и в качестве антигенов для гуманизации белков грызунов использовали ICOS-hFc человека и мыши. ICOS-hFc человека включал аминокислоты ICOS человека от 1 до 141 (от 21 до 141 в зрелой конструкции); ICOS-hFc мыши включал аминокислоты ICOS мыши от 1 до 142 (от 21 до 142 в зрелой конструкции).
[00433] Получали ICOS-Fc как в виде бивалентных, так и моновалентных гибридных молекул с Fc для оценки авидного и моновалентного связывания антител с ICOS, соответственно.
[00434] Для целей скрининга получали стабильные линии клеток СНО, сверхэкспрессирующие полноразмерный ICOS человека или мыши (ICOS+СНО клетки или «клетки СНО-ICOS») в виде конструкций, кодирующих полноразмерный ICOS яванского макака или крысы для обеспечения скрининга после транзиентной трансфекции.
Компания антител грызунов
[00435] Работу с компаниями антител грызунов выполняли в Precision Antibody. Мышей (10), крыс (6), сирийских хомяков (6) и армянских хомяков (6) иммунизировали с помощью hICOS-hFc или mICOS-hFc. Получали гибридомы и проводили отбор супернатантов методом ELISA на связывание с hICOS и mICOS, а также проводили множественный скрининг методом FACS на связывание с клетками CHO-hICOS и CHO-mICOS. Гибридомы дополнительно оценивали на способность блокировать связывание ICOSL с клетками СНО-ICOS. Клоны, которые оценивали, как позитивные на связывание с ICOS мыши и человека, отбирали для очистки белка. Очищенные антитела впоследствии повторно отбирали в анализах на связывание и блокирование, и антитела, получившие позитивную оценку, проходили оценку in vitro, как отмечено ниже. Все антитела, отобранные для дальнейшего исследования в подходе с иммунизацией, происходили от слитых белков армянского хомяка.
Определение биохимических характеристик антител
[00436] Измерения аффинности проводили с использованием технологии интерферонометрии в биослоях (BLI) (ForteBio Octet RED96). Значения моновалентной аффинности получали с вариантами IgG антител с моновалентными, гетеродимерными формами рецептора ICOS. Значения авидной аффинности получали с использованием полноразмерных IgG по сравнению с гомодимерными формами рецептора ICOS. Мономерные и бивалентные аффинности hICOS выбранных антител хомяка показаны в таблице 3.
[00437] Определяли также аффинность связывания антител для ICOS яванского макака, мыши и крысы, и выявили антитела, связывающие все виды со сравнимой аффинностью. Измерения перекрестной реактивности проводили с использованием технологии ВLI с наборами антител, которые подвергали отбору на связывание со слитыми белками ICOS-Fc человека, мыши и яванского макака (гомодимерная бивалентная формы). В таблице 4 показаны репрезентативные данные по связыванию для нескольких антител хомяка с ICOS человека и яванского макака.
[00438] Для оценки специфичности связывания методом проточной цитометрии отдельно анализировали клетки СНО ICOS+ человека и клетки СНО ICOS мыши. В качестве контроля для отбора пан-реактивных антител также проверяли окрашивание клеток СНО без экспрессии рецептора ICOS. Все выбранные антитела связывали клетки СНО ICOS+человека, но не с клетками СНО без экспрессии ICOS.
[00439] Для дополнительной оценки специфичности анти-ICOS антител, их подвергали скринингу на связывание с дополнительными представителями семейства белков CD28 (CD28, BTLA, PD-1 и CTLA-4). Для отобранных антител не наблюдали перекрестной реактивности в отношении CD28, BTLA, PD-1 или CTLA4 человека или мыши. А именно, оценивали связывание со слитыми белками Fc (с CD28, BTLA, PD-1 и CTLA-4) в виде димерных форм и не наблюдали связывания. Для поднабора представителей семейства CD28, белок мыши или человека сверхэкспрессировался на поверхности клеток НЕК293 и СНОK1. Не наблюдали связывания антитела выше фонового уровня относительно нетрансдуцированных исходных клеток.
[00440] Обнаружили также, что антитела не связываются ни с находящимися в избытке белками сыворотки, ни с фибробластами или эритроцитами.
[00441] Сортировку эпитопов проводили с использованием BLI. Проводили сортировку антител также по отношению к слитому белку ICOSL-Fc (гомодимерная бивалентная форма). Обнаружили, что все отобранные антитела находятся в одном и том же эпитопном бине и все они блокировали связывание ICOS с лигандом ICOS.
Гуманизация
[00442] Отобранные антитела гуманизировали выполнением исследований гомологии между вариабельными каркасными участками антител человека и хомяка. Предложен набор первичных разработок для анализа и затем получали антитела для сравнения с антителом дикого типа (хомяка или химерной формы). Сразу после получения гуманизированных наборов характеризовали лидерные последовательности и упорядочивали их на основе аффинности и активности in vitro. Выполняли дополнительные разработки по гуманизации для снижения неустойчивости последовательностей и иммуногеннных сайтов с низкими показателями, возникающие в результате незначительных вариаций последовательностей. Считается, что неустойчивость последовательностей включает наличие свободных цистеинов и потенциальных сайтов для химической деградации (дезаминирование аспарагина, изомеризация аспартата, метионин/триптофан и неферментативное гликирование лизина).
D
D
[00443] Измеряли аффинность гуманизированного антитела, имеющего вариабельные участки 37A10S713 для мономерных форм ICOS человека, яванского макака и крысы технологией интерферометрии в биослое (ВЫ) (ForteBio Octet RED96) и значения K показаны в табл. 5. Оказалось, что значения K были сравнимы среди видов, поскольку они находились в от 2- до 5-кратных пределах. Функциональность связывания подтвердили оценкой активности индукции пролиферации первичных CD4+ Т-клеток, выделенных из каждого вида.
А
B
значения аффинности показаны в виде среднего ± SEM из 6 экспериментов;  показан диапазон для 4 доноров
Пример 5. Определение функциональных характеристик анти-ICOS антител in vitro
[00444] Для оценки активности анти-ICOS mAb использовали ряд анализов in vitro. Основной целью которых был отбор антител с агонистическими/костимулирующими свойствами. Поскольку клеточная система (первичные клетки по сравнению с трансфицированной линией клеток) и способ презентации антител (растворимые по сравнению со связанными с планшетом или перекрестно-связанные) может влиять на агонистическую активность, то использовали ряд различных форматов анализов. В дополнение к этому, также использовали анализ для обнаружения нежелательной сверхагонистической активности (см. Suntharalingam et al., 2006, N.Eng.J.Med., 355: 1018-28)).
[00445] Проводили анализы, разработанные для поиска агонистической/костимулирующей активности анти-ICOS mAb, на типах клеток, отмеченных ниже, с первым сигналом для Т-клеток (сигнал 1), при условии использования любых субоптимальных концентраций анти-CD3 или РМА, или в анализе с РВМС со стимуляцией с помощью суперантигена (SEB):
1. Анализ с первичными CD4+ Т-клетками человека
a. Форма антитела, связанного с планшетом/перекрестно связанного, с костимуляцией анти-CD3
b. Форма растворимого антитела с костимуляцией РМА
2. Анализ с Jurkat (линия репортерных клеток с трансфицированными конструкциями ICOS человека или мыши)
a. Форма связанного с планшетом/перекрестно связанного антитела либо с анти-CD3, либо с РМА
b. Форма растворимого антитела с костимуляцией РМА
3. Анализ с РВМС человека
а. Форма растворимого антитела с суперантигеном (SEB)
[00446] Наборы анти-ICOS mAb хомяка подвергали отбору в вышеперечисленных анализах для идентификации антител с агонистическими свойствами. Пример агонистической активности при отборе анти-ICOS антител хомяка наблюдали в анализе с использованием первичных CD4+ Т-клеток человека, костимулированных субоптимальной концентрацией анти-CD3 с добавлением связанного с планшетом анти-ICOS антителом, показан на фигуре 10А. В этом анализе CD4+ Т-клетки человека, выделенные из РВМС, активировали субоптимальной концентрацией связанным с планшетом анти-СВ3 в присутствии связанных с планшетом анти-ICOS антител хомяка (7F12, 37А10 и 16G10) при четырех концентрациях (мкг/мл). В качестве позитивных контролей использовали связанное с планшетом hICOSL и растворимое анти-CD28 в присутствии анти-CD3. На графике отмечен % деленных клеток. Множество анти-ICOS антител в этом анализе проявляют активность. На фигуре 10В показаны результаты анализа с использованием растворимого антитела и костимуляции с субоптимальным РМА. Из РВМС отрицательным отбором и маркированием CFSE выделяли CD4+ Т-клетки. Клетки активировали в 96-луночных планшетах субоптимальной концентрацией одного РМА (0,25 нг/мл) или в присутствии различных вариантов Fc (хомяка, mG1, mG2a, mG3Agly или hG1) анти-ICOS антитела 37А10 при указанных концентрациях (мкг/мл). В качестве контроля использовали растворимое анти-CD28 антитело. На сутки 3 анализировали пролиферацию методом проточной цитометрии. Варианты IgG1 мини и IgG1-agly мили показали в данном анализе активность вместе с исходшм полшм антителом хомяка. Как минимум антитело 37А10 показало агонистическую активность как в растворимой форме, так и связанной с планшетом форме. См. фигуры 10А и 10В.
[00447] На фигуре 10С показана агонистическая активность результирующего 37A10S713 антитела с IgG1 человека в анализе с первичными CD4+ Т-клетками человека. Выделяли CD4+ Т-клетки из РВМС, взятых у 4 здоровых доноров, метили их красителем CFSE и затем инкубировали в планшетах, покрытых субоптимальной концентрацией анти-CD3, и с различными концентрациями любо 37A10S713-hIgG1, либо отрицательным контролем антитела-IgG1 человека (против респираторно-синцитиального вируса (RSV)). После 3 суток определяли процент деленных клеток с использованием проточной цитометрии. Исследовали значения ЕС50 в диапазоне от 4,27-49,75 нМ для 4 доноров. Значения пролиферации отмечены на графике в виде процента деленных клеток (измерено разведением CFSE с использованием проточной цитометрии) и означают средние значения двух анализов. На фигуре 10С показаны данные репрезентативного донора).
[00448] Другой пример анализа, в котором антитела хомяка демонстрируют агонистическую активность, представляет репортерный анализ с Jurkat. Репортерный анализ с Jurkat разработали в компании авторов изобретения путем трансдуцирования химерной конструкции экспрессии hICOS-hCD28 в линию репортерных клеток Jurkat NFkB. Репортерные клетки Jurkat-hICOS-hCD28 активировали в течение 5 часов с помощью РМА и растворимого анти-ICOS антитела 37А10 хомяка с различными Fc-концами при 11 концентрациях (мкг/мл). В качестве контролей использовали растворимые анти-CD28 и hICOSL-Fc. На графике отмечен % GFP+ клеток. Репрезентативные данные, полученные репортерным анализом с Jurkat с использованием анти-ICOS антител хомяка, показаны на фигуре 11. На фигуре 11А показаны результаты для различных вариантов Fc анти-ICOS антитела 37А10 (hG1, mG1, mG2a, mG1Agly) в указанных концентрациях (мкг/мл). Все варианты Fc анти-ICOS антитела, включая вариант mG1-agly (т.е. с минимальной эффекторной функцией Fc) показывают активность в данном анализе. На фигуре 11В показаны результаты для гуманизированных антител 37A10S713, 37A10S715, 37A10S716 и 37A10S718 в указанных концентрациях (мкг/мл). Все четыре исследованных гуманизированных антитела показали агонистическую активность в данном анализе).
[00449] Другой формат анализа, показывающий агонистическую активность, представляет собой анализ с РВМС с использованием продукции цитокинов с помощью суперантигенного энтеротоксина В стафилоккока (SEB) (например IFNg) в качестве показателя. Данному анализу обычно свойственно небольшое окно 1,5 - 3-кратного изменения на высвобождение цитокинов. В соответствии с опубликованными данными для анти-PD-1, индукция цитокинов с помощью анти-ICOS антител составляет ~2 кратное увеличение, но оно воспроизводимо в данном анализе среди множества доноров. См., например, Korman et al., 2014, Cancer Res., 2:846-856. Данные репрезентативного анализа показаны на фигуре 12. Замороженные РВМС, полученные от здоровых доноров, стимулировали с помощью SEB и растворимого анти-ICOS антитела 37А10 (с mG1, mG1-agly или hG1 Fc) в указанных концентрациях (мкг/мл) в течение 3 суток. Собирали супернатанты и измеряли уровни IFNg в анализе цитокина с гранулами с использованием проточной цитометрии. В качестве контролей использовали анти-CD28 антитело и изотип IgG1 мыши. IFNg индуцировался клетками РВМС после стимуляции SEB в присутствии растворимых анти-ICOS антител. В данном формате анализа вариант mG1-agly 37А10 показал пониженную активность.
[00450] Для скрининга любых потенциальных суперагонистов применяли анализ, в котором первичные CD4+ Т-клетки человека инкубировали с растворимыми или связанными с планшетом анти-ICOS антителами в отсутствии сигнала 1, с использованием в качестве положительного контроля известного анти-CD28 антитела-суперагониста. CD4 Т-клетки человека, активированные в отсутствии анти-CD3, могли пролиферировать только когда их обрабатывали анти-CD28 антителом-суперагонистом (клон CD28.2/5D10) в растворимой форме, но не когда их обрабатывали ICOSL-Fc или анти-ICOS антителом 37А10 (антитело хомяка и варианты hG1 Fc), или анти-CD28 (CD28.2) антителом-несуперагонистом. Ни одно из исследованных анти-ICOS mAb не проявило суперагонистическую активность в этом анализе. Репрезентативные данные представлены на фигуре 13.
[00451] Хорошо установлено, что ICOS может сигнализировать посредством механизма передача сигнала AKT (обзор в Simpson et al., 2010, Curr.Opin.Immunol., 22: 326-332). Способность анти-ICOS антитела индуцировать передачу сигнала посредством AKT оценивали, как дополнительные способы для демонстрации агонистической активности антитела.
[00452] CD4 Т-клетки, выделенные из РВМС человека, стимулировали в течение 24 часов с помощью анти-CD3/анти-CD28, а затем оставляли без стимуляции в течение 24 часов в культуральной среде. Затем клетки инкубировали с анти-ICOS 37A10-mG2a, hICOSL-mG2a Fc или ФСБ в течение 2, 5, 15 или 30 минут с перекрестно связанным антимышиным антителом-IgG или без него. После инкубации клетки фиксировали, увеличивали их проницаемость и затем окрашивали с помощью анти-фосфо-AKT антитела. Анализировали процент pAKT-позитивных клеток методом проточной цитометрии.
[00453] Как показано на фигурах 14А-В, pAKT индуцировался на CD4 Т-клетках после обработки 37A10-mG2a со сходной кинетикой по сравнению с обработкой hICOSL-mG2a. Индукция передачи сигнала pAKT наблюдали только в присутствии вторичного перекрестно связывающего средства.
Пример 6. Определение функциональных свойств анти-ICOS антител in vivo
[00454] Антитела, выбранные в описанных выше анализах скрининга, оценивали in vivo с использованием сингенных опухолевых моделей.
[00455] Модель фибросаркомы Sa1N (Ostrand-Rosenberg, 2001, Curr.Protoc.Immunol., Chapter 20) можно использовать для оценки анти-ICOS антител in vivo. Определение иммунного профиля мышиной модели Sa1/N показало, что она сильно инфильтрована CD4 Т-клетками и что CD4 Т-клетки экспрессируют высокие уровни ICOS. Этот иммунный профиль является сходным с иммунными профилями образцов NSCLC пациентов, в которых наблюдали высокие уровни инфильтрации CD4 с экспрессией ICOS, главным образом ограниченной компартментом CD4.
[00456] Вторая модель, использованная для оценки эффективности анти-ICOS антител, представляет собой модель карциномы СТ26 толстой кишки (Wang et al., 1995, J.Immunol., 9:4685-4692). Определение иммунного профиля мышиной модели СТ26 показало высокие уровни инфильтрации CD8. В этой модели наблюдали экспрессию ICOS в субпопуляции CD8 Т-клеток. Небольшая пропорция образцов NSCLC человека сходным образом показывает экспрессию ICOS в CD8 Т-клетках.
Формы антител для оценки in vivo
[00457] IgG1 человека (hIgG1) может параллельно связывать множество рецепторов Fc, включая сильное связывание с активирующими рецепторами Fc, которые способны к перекрестному связыванию рецепторов и опосредованию АЗКЦ и КЗЦ. Обеспечивая способность связывать активирующие рецепторы Fc, hIgG1 обычно способен истощать клетки, которые экспрессируют высокий уровень мишени. Наиболее близкий мышиный эквивалент для hIgG1 является мышиным IgG2a (mIgG2a). Таким образом, в качестве примера, в экспериментах in vivo для оценки антитела-агониста к ICOS с истощающей способностью могут использовать mIgG2a для имитации свойств hIgG1.
[00458] В терапевтических случаях, когда не требуется истощение, можно использовать IgG4 человека (hIgG4), хотя hIgG4 способен к некоторому уровню истощения. В общих чертах, хотя и не точно, по активности он согласуется с IgG1 мыши (mIgG1), который практически исключительно связывает ингибирующие рецепторы FcγRII и является, таким образом, способен перекрестно связываться, но не конкретно конкурировать при истощении.
[00459] Относительно анти-ICOS антител, антитела хомяка первоначально оценивали in vivo, как полные Ab хомяка. Ab хомяка содержат IgG1 хомяка, который обладает свойствами связывания FcR, сходными с mIgG1. Интересующие антитела хомяка клонировали в виде химер с мышиными Fc-участками, либо в виде mIgG2a, либо mIgG1.
Модель фибросаркомы Sa1N
6
3
[00460] Для скрининга эффективности потенциальных анти-ICOS антител в качестве первичной модели in vivo использовали модель фибросаркомы Sa1N. Таким образом, антитела, выбранные в описанных выше анализах скрининга, оценивали в модели Sa1N. В начальных исследованиях несколько антител хомяка (клоны 7F12, 36Е10, 37А10, 16G10 и 35А9) продемонстрировали устойчивую противоопухолевую активность, при введении в качестве единственных средств в дозе 8 мг/кг в модели Sa1N. См. фигуру 15. Клетки фибросаркомы Sa1N (1×10) инъецировали п. К. в правый бок наивных мышей A/J (возраст 6-8 недель, самки). Когда объемы опухоли достигли 50-100 мм на 7 сутки, мышей рандомизировали. Мыши получали дозу анти-ICOS хомяка (7F12, 36Е10, 37А10, 16G10 и 35А9) или изотипного антитела-IgG хомяка в. Б. на сутки 7, 10, 14 и 17. Проводили мониторинг роста опухолей два раза в неделю. N=10.
[00461] Потенциально полезное свойство противоракового иммуннотерапевтического препарата является способность создавать постоянный и длительный иммунный ответ против опухоли. Определяли способность мыши, которую раннее лечили анти-ICOS антителом, впоследствии отторгать опухоль. Мышей лечили антителом в дозе 8 мг/кг на сутки 7, 10, 14 и 17. Впоследствии, мышам без опухолей затем повторно имплантировали опухоль на сутки 60. Все мыши, предварительно пролеченные анти-ICOS антителом 7F12 (n=7), отторгали вновь имплантированную опухоль, в отличии от наивных мышей (n=10), у всех, из которых вырастали опухоли. См. фигуру 16.
[00462] Антитела хомяка клонировали в виде химерных антител с Fc-участками мыши (mG1 или mG2a) для возможности оценивания влияния эффекторной функции Fc в активность in vivo. Мыши получали всего 4 дозы дважды в неделю по 4 мг/кг антитела, начиная с суток 11. Анти-СТLА-4 антитело было включено в качестве положительного контроля. Начальный эксперимент по скринингу выполняли в дозе 4 мг/кг и эффективность наблюдали и для формы mG1, и для формы mG2a. Репрезентативные данные для одного из антител хомяка, 37А10, показаны на фигуре 17.
Сингенная опухолевая модель СТ26 толстой кишки
[00463] Сингенная опухолевая модель СТ26 толстой кишки использовалась как для оценки активности единственного средства, а также в качестве комбинированной терапии с анти-PD-1 антителом.
[00464] В модели СТ26 несколько анти-ICOS антител хомяка (например, 7F12, 35А9, 36Е10, 37А10) проявляли активность как единственное средство. См. фигуру 18. Модель СТ26 также использовали для оценки потенциальной комбинированной активности с анти-PD-l. Когда анти-ICOS антитела комбинировали с анти-PD-1 антителом, была отмечена усиленная противоопухолевая активность. Мышей, которые несли опухоли СТ26, лечили дважды в неделю (по 4 дозы начиная с суток 3), с анти-ICOS антителом (8 мг/кг) самостоятельно или в комбинации с анти-PD-1 антителом (8 мг/кг). Следует отметить, что комбинация анти-PD-1 с анти-ICOS антителом 37А10 приводит к 9/10 мышам без опухолей. См. фигуру 18.
Пример 7. Избирательное истощение Treg влияет на эффективность анти-ICOS антител
[00465] Выполняли исследования ex vivo для определения характеристик статуса инфильтратов иммунных клеток после введения доз анти-ICOS антител. Исследования в модели Sa1N показали уменьшение популяции Treg после обработки с помощью 7F12. Мыши получали две дозы анти-ICOS хомяка 7F12, 7F12-mG1 или 7F12-mG2a в количестве 8 мг/кг на сутки 7 и 10. На сутки 12 собирали и анализировали опухоли и селезенки. Отмечено значительное уменьшение Tregs, но не Teff-клеток, но незначительное влияние на популяции Т-клеток в лимфоидных органах, таких как селезенка или лимфоузел. См. фигуру 19.
[00466] Сходные результаты также наблюдали с другими анти-ICOS антителами, такими как 37А10. См. фигуру 20. Мыши получали две дозы анти-ICOS антител в количестве 8 мг/кг на сутки 7 и 10. На сутки 12 собирали и анализировали опухоли. Сходное уменьшение популяции Treg также наблюдали в модели СТ26, после введения доз анти-ICOS антитела).
[00467] Собранные вместе, данные исследований TIL (инфильтрирующие опухоли лимфоциты) подтверждают гипотезу, что Treg-клетки избирательно истощаются анти-ICOS антителами, описанными в данном документе, без соответствующего истощения популяций Teff-клеток и исключительно в опухолях, но не других органах или на периферии.
[00468] Для формальной демонстрации влияния иммунной системы на эффективность анти-ICOS антитела, выполняли эксперименты по истощению клеток в контексте опухолевой модели Sa1N. Конкретно, у мышей истощали CD8 Т-клетки, CD4 Т-клетки или комбинация CD4+ CD8 Т-клеток. На сутки 6 и 13 после имплантации опухолей мышей лечили с помощью анти-CD8, анти-CD4, анти-CD4 + анти-CD8 или контрольного антитела-Ig (n=10 на группу). Анти-ICOS антитело 7F12 вводили в дозе 8 мг/кг антитела на сутки 7, 10, 14 и 17. Проводили мониторинг роста опухолей два раза в неделю).
[00469] Наблюдали заметное уменьшение противоопухолевой эффективности 7F12, когда мыши были истощены по CD4, CD8 или CD4+CD8 Т-клеткам. См. фигуру 21.
Пример 8. Избирательное уменьшение Treg гуманизированным анти-ICOS антителом
2
[00470] РВМС человека инкубировали при 37°С с 100 нг/мл рекомбинантного IL-2 человека в течение 48 часов во влажном инкубаторе с 5% СО. Через 48 часов, добавляли антитело 37A10S713 в указанных концентрациях. Антитело готовили в виде 10-кратных серийных разведений в культуральной среде, содержащей IL-2. Смеси антител/клеток оставляли дополнительно инкубироваться 72 часа. После инкубации клетки окрашивали на CD3, CD4, CD8, CD25 и FoxP3 согласно стандартных методик и анализировали методом проточной цитометрии. Выполняли количественное определение клеток Treg (CD4+ CD25+ FoxP3+) и Teff (CD4+ CD25- FoxP3-) для каждой концентрации и обработки. Данные для каждой концентрации нормализовали по процентному содержанию каждой субпопуляции в леченной трастузумабом группе.
[00471] Результаты данного эксперимента показаны на фигуре 22А. Антитело 37A10S713 вызывало дозозависимое уменьшение Treg-клеток. Как показано на фигуре 22В, Teff- и Treg-клетки экспрессировали сходные уровни ICOS после пяти дней лечения IL-2.
Пример 9. Повторное имплантирование опухоли после лечения анти-ICOS антителом
6
3
3
[00472] Самкам мышей А/J возрастом от шести до восьми недель подкожно в правый бок инокулировали 1×10 клеток Sa1/N cells в 100 мкл ФСБ, используя шприцы для введения туберкулина с иглами 27-го калибра. Рост опухолей отслеживали на сутки 7, животных перераспределяли в новые клетки после нормализации среднего объема опухолей в пределах 100-150 мм для каждой группы лечения. В каждую группу лечения включали десять мышей. Животных лечили антителами посредством внутрибрюшинной инъекции 0,25 мг/кг анти-ICOS антитела (37A10S713 VH и VL (SEQ ID NO 60 и 61) с мышиным IgG2a) или изотипным контролем. Дозирование выполняли на сутки 7 для однократной дозы или на сутки 7 и 14 для 2 доз. Рост опухоли и массы тела животных отслеживали два раза в неделю. Мышей умерщвляли, когда объем опухоли достигал ~2000 мм или, если имели место признаки клинического тяжелого недомогания, такого как сильное изъязвление, в соответствии с протоколом IACUC.
[00473] На фигуре 23, левое изображение, показывает объем опухоли у мышей, которым вводили однократную дозу анти-ICOS антитела (n=10) или две дозы анти-ICOS антитела (n=10).
[00474] Выполняли эксперимент с повторным имплантированием опухоли для оценки продолжительности ответа. Для 7 мышей, с имплантированными раннее клетками Sa1/N, у которых были удалены опухоли с помощью однократной дозы или двух доз из 0,25 мг/кг антитела 37A10S713-mIgG2a, повторно имплантировали в противоположный бок клетки Sa1/N через 10 недель после начальной имплантации опухоли. В качестве контроля, наивным мышам также имплантировали клетки Sa1/N (N=10). Животные оценивали нарост опухоли на основе двухнедельного периода.
[00475] Как показано на фигуре 23, правое изображение, ни у одной из мышей, у которых раннее были удалены опухоли с помощью лечения анти-ICOS антителом, не был отмечен рост опухоли в эксперименте с повторным имплантированием.
Пример 10. Экспрессия лиганда ICOS (ICOS) у мышей и яванских макак, несущих опухоли Sa1/N, вводили анти-ICOS антитело
3
[00476] Самкам мышей возрастом восемь недель А/J инокулировали опухолевые клетки Sa1/N на нулевые сутки. На сутки 7, когда опухоли достигали ~100 мм, мышам вводили однократную в. Б. дозу из 5 или 100 мкг антитела 37А10 либо с мышиным IgG1 или IgG2a, либо изотипное контрольное антитело. Мышам вводили последующую дозу из антитела на сутки 10 и собирали ткани (кровь, селезенку и опухоль) на сутки 12. После обработки тканей клетки инкубировали с 5% Fc-блокирующим раствором (5% растворенная нормальная сыворотка крысы, мыши и человека, 5% фетальная сыворотка теленка, 0,1 мг/мл Fc-блокирующим Ab 2.4G2, 0,01% азидом натрия) в течение 15 мин на льду в проточном окрашивающем буферном растворе (FSB:5% FBS, 0,01% азид натрия в 1хФСБ). После Fc-блокирующего раствора клетки окрашивали смесью для внеклеточного окрашивания (анти-CD45-BV510, анти-CD19-BV605, анти-ICOSL-PE, краситель с возможность фиксации жизнеспособности eFluor 780) в FSB в течение 1 ч на льду. Клетки промывали дважды с помощью FSB. Клетки фиксировали с помощью раствора для фиксации/пермебилизации в течение 30 мин на льду. Клетки промывали дважды с помощью 1х буферного раствора для пермебилизации, затем окрашивали смесью для внутриклеточного окрашивания (анти-СD3-BUV496, в буферном растворе для пермебилизации в течение 1 ч на льду. Клетки промывали дважды буферным раствором для пермебиализации, затем ресуспендировали в растворе FSB с 1,5% PFA. Клетки анализировали на приборе BD Fortessa, а данные анализировали с использованием программного обеспечения FlowJo.
[00477] Образцы анализовали на проточном цитометре BD Fortessa. Для анализа экспрессии ICOSL, анализировали окрашивание ICOSL на жизнеспособных CD45+ CD3- CD19+ В-клетках. Получали средние интенсивности флуоресценции (MFI) ICOSL.
[00478] Антитело 37A10S713 с IgG1 человека вводили посредством 1 часовой внутривенной инфузии трем яванским макакам на группу дозы (0,5 мг/кг, 5 мг/кг, 75 мг/кг и только носитель). Отбирали кровь перед введением первой дозы (сутки 1), через 48 часа после первой дозы (сутки 3), через 7 суток после первой дозы (перед второй дозой; сутки 8) и через 48 часов после второй дозы (сутки 10). Образцы по 95 мл цельной крови сначала блокировали по Fc с помощью 5 мкл красителя Human TraStain в течение 15 мин на льду. После блокирования Fc добавляли 100 мкл смеси антител, содержавшей анти-CD3 FITC, анти-СD20 РЕ, анти-CDH РЕ/Су7, краситель для определения жизнеспособности е780 и cynoICOS-Fc DyLight 650. Кровь и смесь антител инкубировали на льду в течение 60 мин. После инкубации образцы центрифугировали при 500xg в течение 5 мин. Супернатанты декантировали и образцы ресуспендировали в 200 мкл окрашивающего буферного раствора для FACS. Этапы окрашивания повторяли три раза с последним ресуспендированием в 200 мкл буферного раствора для окрашивания +0,1% параформальдегида).
[00479] Образцы анализовали на проточном цитометре BD Fortessa. Для анализа экспрессии ICOSL анализировали окрашивание ICOSL меченым DyLight 650 белком cynoICOS-Fc на жизнеспособных CD3- CD20+ В-клетках. Значения MFI ICOSL нормализовали на носителе для каждого момента времени.
[00480] Результаты этих экспериментов показаны на фигурах 24А и 24В. Наблюдали дозозависимое увеличение экспрессии ICOS-L для обработок всеми антителами и дозами, и во всех тканях относительно мышей, пролеченных изотипным контролем. См. фигуру 24А. Сходным образом, наблюдали дозозависимое увеличение экспрессии ICOS-L во всех моментах времени групп дозирования 0,5 и 5 мг/кг у яванских макак относительно носителя и образцов предварительного исследования. См. фигуру 24В. Введение ICOSL также наблюдали в группе 75 мг/кг, но наблюдавшаяся экспрессия может быть недостаточно презентированной из-за потенциального влияния лекарственного средства, поскольку анти-ICOS антитело способно связывать реактив для окрашивания (cynoICOS-Fc).
[00481] Захват мишени ICOS также можно оценивать по измерению анализом доступности рецепторов, например, следующим образом. Наивным мышам в. Б. инъецировали либо изотипный контрольный mIgG2a в дозе 2,5 мг/кг, либо 37A10S713 с мышиным IgG2a в дозе 2,5 мг/кг. В различные моменты времени после инъекции собирали кровь в покрытые ЭДТК микропробирки посредством подчелюстного отбора.
[00482] Цельную кровь блокировали по Fc с использованием мышиного красителя TruStain (BioLegend) в течение 5 минут на льду. После инкубации добавляли 100 мкл 2х концентрированную смесь антител для внеклеточного окрашивания для каждого образца в течение 30 минут при 4°С. Центрифугировали образцы, фиксировали и увеличивали их проницаемость в буферном растворе для Foxp3 (eBioSciences) в течение 30 минут при 4°С. Затем центрифугировали образцы и ресуспендировали их в растворе антитела для внутриклеточного окрашивания в течение 30 минут при 4°С. Центрифугировали образцы и ресуспендировали их в 0,1% PFA. Анализировали образцы на приборе BD LSRII Fortessa. Идентифицировали Treg как живые CD45+ CD3+ CD4+ Foxp3+. Идентифицировали Teff-клетки как живые CD45+ CD3+ CD4+ Foxp3-. Идентифицировали CD8+ клетки как живые CD45+ CD3+ CD8+. В качестве реактива для окрашивания ICOS использовали флуоресцентно меченные 37A10S713-mG2a (конъюгированы с DyLight 650). Доступность рецептора для каждого момента времени определяли с использованием следующей формулы:
% доступности рецептора в момент времени t=((MFI 37A10S713-mG2aDy650 в момент t-MFI изотипн. Dy650 в момент t))/((MFI 37A10S713-mG2aDy650 предв. исслед.-MFI изотипн. Dy650 предв. исслед.))×100
[00483] Результаты показывают, что после введения анти-ICOS антител, уровни свободного рецептора не выявляются, давая основание предложить, что антитела насыщают все доступные целевые молекулы ICOS.
Пример 11. Индукция хемокинов Th-1 и цитокинов после лечения анти-ICOS антителом
[00484] Свежие опухоли легкого пациентов получали в течение 24 часов после хирургической операции. Из опухоли вручную удаляли мягкую ткань и оставшуюся солидную опухоль погружали в 4% низкоплавкий агар в контейнере для литья и позволяли затвердеть на льду. Погруженную в гель опухоль разрезали вибратомом (Leica) (скорость: 2, частота: 9) для получения срезов толщиной 300 мкм. Если опухоль была слишком мягкой и ее было невозможно разрезать вибратомом, то ткань вручную разрезали лезвием.
2
[00485] Срезы помещали в межлуночный фильтр на 40 мкм (Millipore) (~1 срез/лунку) и модуль переносили на лунки 6-луночного планшета, которые содержали 1,5 мл среды для гистокультуры (заполненные RPMI 1640/AIM-V). Затем в среду соответствующей лунки добавляли соответствующее средство для обработки. Обработки включали 10 мкг/мл анти-hIgG1 (Lake Pharma, серия №3086-849598) в качестве изотипного контроля, 10 мкг/мл антитела 37A10S713 с IgG человека (SEQ ID NO 188 и 189), или 10 мкг/мл анти-PD-1 (IgG4) антитела. Параллельные планшеты готовили в различные моменты времени в диапазоне 6-72 часов. Планшеты помещали в инкубатор при 37°С, 5% СО.
[00486] В требуемые моменты времени срезы опухоли собирали и погружали в RNALater (Ambion). Экстрагировали РНК с использованием мининабора RNeasy (Qiagen, № по кат. 74106) в соответствии с инструкциями производителя. После экстракции РНК использовали 1 мкг РНК для обратной транскрипции, используя набор для синтеза кДНК Bio-Rad iScript (№ по кат. 170-8891). Продукт ОТ разбавляли 1 к 7 и для каждой кПЦР реакции использовали 3 мкл раствора. Проводили кПЦР путем использования мастер-микса для генной экспрессии TaqMan из Thermo Fisher Scientific (№ по кат. 4369016), применяя систему реального времени Bio-Rad. Проведенные анализы TaqMan перечислены в табл. 6.
[00487] Значения экспрессии нормализовали к CD45, с рассчитанным кратным изменением:
[00488] Результаты данного эксперимента показаны на фигуре 25. В момент времени 6 часов инкубирования с образцом опухоли легкого 1, анти-ICOS антитело приводило к увеличению экспрессии GZMa, GZMb, CSF2, IL2, CXCL9, CXCL10, CXCL11 и CXCL13. Анти-PD-1 антитело также увеличивало экспрессию GZMa, GZMb, CSF2, CXCL9 и CXCL10, хотя и в меньшей степени, и показывало сходное увеличение CXCL11. Для образца опухоли легкого 2 в момент времени 24 часа обработка анти-ICOS антитела показала устойчивое увеличение CXCL11 и несколько продлившееся повышение IL2, CXCL9 и L10. Анти-PD-1 антитело показало лишь слабое повышение CXCL11 в момент 24 часов.
Пример 12. Индукция лиганда NKp46 на Treg-клетках после обработки анти-ICOS антителом
[00489] Мононуклеарные клетки периферической крови выделяли у здоровых доноров (Research Blood Components) используя центрифугирование на фиколле (GE Life Sciences), замораживали в BamBanker (Wako-Chem) и хранили до использования при -150°С. РВМС инкубировали с растворимым анти-ICOS антителом и помещали на планшет, покрытый античеловеческим CD3 (покрытие 1 мкг/мл, Biolegend, ОКТЗ) при 37°С в среде RPMI (Gibco) с добавкой 10% фетальной бычей сыворотки (Sigma-Aldrich) и 1% пенициллина/стрептомицина (Gibco). В анализе исследовали три антитела: сильное антитело-агонист 37A10S713, слабое антитело-агонист и слабое антитело-антагонист. Через четверо суток РВМС осторожно отделяли от планшетов и промывали раствором DPBS (Gibco), содержавшим 1% фетальной бычьей сыворотки, 0,05% азида натрия (Ricco) и 2 мМ ЭДТК (Ambion). Затем клетки блокировали с помощью красителя Human TruStain FcX (Biolegend). Для выявления лиганда NKp46 клетки инкубировали с 2 мкг/мл NKp46-hIgG1 Fc (R&D Systems, 1850-NK). NKp46-hIgG1 Fc, связанный с клетками, выявляли с использованием конъюгированного с РЕ античеловеческого IgG (Biolegned, поликлональный). Клетки снова блокировали красителем Human TruStain FcX, а затем окрашивали с помощью античеловеческого CD56 (Biolgend, Brilliant Violet 711, HCD56), античеловеческого CD 16 (Biolegend, Brilliant Violet 785, 3G8), античеловеческого CD4 (Biolegend, Brilliant Violet 510, OKT4), античеловеческого CD8 (BD Biosciences, BUV395, RPA-T8), античеловеческого CD25 (Biolegend, Brilliant Violet 605, BC96) и фиксирующего жизнеспособность красителя (eBioscience, eFluor 780). После окрашивания клетки фиксировали и повышали проницаемость с помощью набора буферных растворов для окрашивания Foxp3 / фактора транскрипции (eBioscience). После повышения проницаемости клетки окрашивали внутриклеточно с помощью античеловеческого CD3 (BD Biosceinces, PE-CF594, UCHT1) и античеловеческого Foxp3 (eBioscience, APC, PCH101). Затем клетки фиксировали в параформальдегиде (Alfa Aesar). Данные получали на приборе BD LSRII Fortessa и анализировали на программном обеспечении FlowJo v 10.1).
[00490] Результаты данного эксперимента показаны на фигуре 26 и фигуре 27. Обработка анти-ICOS антителом-агонистом 37A10S713 приводила к сильной индукции лиганда NKp46 на Treg-клетках из трех различных доноров. См. фигуры 26A-F (на фигурах Фиг. 26А-В показаны данные от донора 1, на фигурах 26C-D показаны данные от донора 2, а на фигурах 26E-F показаны данные от донора 3). Индукция лиганда NKp46 на Teff-клетках была не такой сильной, как на Treg-клетках. См. Фиг. 26A-F. В дополнение к этому, обработка анти-ICOS антителом-агонистом 37A10S713 приводила к потере CD16 (сбрасывание CD16) на NK-клетках, что предполагает активацию NK-клеток. См. фигуру 27.
[00491] Без приверженности к какой-либо конкретной теории, авторами постулируется, что анти-ICOS антитело-агонист 37A10S713 существенно увеличивает уровни лиганда NKp46 на Treg-клетках, а также активирует NK-клетки, приводя к избирательному истощению Treg.
[00492] Данное описание изобретения может быть воплощено в других конкретных формах без отхода от его сущности или существенных характеристик. Поэтому приведенные выше варианты реализации изобретения должны во всех аспектах считаться скорее иллюстративными, чем ограничивающими данное описание. Объем данного описания, таким образом, обозначен прилагаемой формулой изобретения, а не приведенным выше описанием, и все изменения, подпадающие под смысл и диапазон эквивалентности прилагаемой формулы изобретения, должны быть включены в ее объем.
--->
SEQUENCE LISTING
<110>  JOUNCE THERAPEUTICS, INC.
<120>  ANTIBODIES TO ICOS
<130>  01140-0001-00PCT
<150>  US 62/137,034
<151>  2015-03-23
<150>  US 62/147,484
<151>  2015-04-14
<150>  US 62/156,588
<151>  2015-05-04
<150>  US 62/242,489
<151>  2015-10-16
<150>  US 62/255,635
<151>  2015-11-16
<160>  191
<170>  PatentIn version 3.5
<210>  1
<211>  199
<212>  PRT
<213>  Homo sapien
<400>  1
Met Lys Ser Gly Leu Trp Tyr Phe Phe Leu Phe Cys Leu Arg Ile Lys
1               5                   10                  15
Val Leu Thr Gly Glu Ile Asn Gly Ser Ala Asn Tyr Glu Met Phe Ile
20                  25                  30
Phe His Asn Gly Gly Val Gln Ile Leu Cys Lys Tyr Pro Asp Ile Val
35                  40                  45
Gln Gln Phe Lys Met Gln Leu Leu Lys Gly Gly Gln Ile Leu Cys Asp
50                  55                  60
Leu Thr Lys Thr Lys Gly Ser Gly Asn Thr Val Ser Ile Lys Ser Leu
65                  70                  75                  80
Lys Phe Cys His Ser Gln Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu
85                  90                  95
Tyr Asn Leu Asp His Ser His Ala Asn Tyr Tyr Phe Cys Asn Leu Ser
100                 105                 110
Ile Phe Asp Pro Pro Pro Phe Lys Val Thr Leu Thr Gly Gly Tyr Leu
115                 120                 125
His Ile Tyr Glu Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Phe Trp Leu Pro
130                 135                 140
Ile Gly Cys Ala Ala Phe Val Val Val Cys Ile Leu Gly Cys Ile Leu
145                 150                 155                 160
Ile Cys Trp Leu Thr Lys Lys Lys Tyr Ser Ser Ser Val His Asp Pro
165                 170                 175
Asn Gly Glu Tyr Met Phe Met Arg Ala Val Asn Thr Ala Lys Lys Ser
180                 185                 190
Arg Leu Thr Asp Val Thr Leu
195
<210>  2
<211>  179
<212>  PRT
<213>  Homo sapien
<400>  2
Glu Ile Asn Gly Ser Ala Asn Tyr Glu Met Phe Ile Phe His Asn Gly
1               5                   10                  15
Gly Val Gln Ile Leu Cys Lys Tyr Pro Asp Ile Val Gln Gln Phe Lys
20                  25                  30
Met Gln Leu Leu Lys Gly Gly Gln Ile Leu Cys Asp Leu Thr Lys Thr
35                  40                  45
Lys Gly Ser Gly Asn Thr Val Ser Ile Lys Ser Leu Lys Phe Cys His
50                  55                  60
Ser Gln Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu Tyr Asn Leu Asp
65                  70                  75                  80
His Ser His Ala Asn Tyr Tyr Phe Cys Asn Leu Ser Ile Phe Asp Pro
85                  90                  95
Pro Pro Phe Lys Val Thr Leu Thr Gly Gly Tyr Leu His Ile Tyr Glu
100                 105                 110
Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Phe Trp Leu Pro Ile Gly Cys Ala
115                 120                 125
Ala Phe Val Val Val Cys Ile Leu Gly Cys Ile Leu Ile Cys Trp Leu
130                 135                 140
Thr Lys Lys Lys Tyr Ser Ser Ser Val His Asp Pro Asn Gly Glu Tyr
145                 150                 155                 160
Met Phe Met Arg Ala Val Asn Thr Ala Lys Lys Ser Arg Leu Thr Asp
165                 170                 175
Val Thr Leu
<210>  3
<211>  200
<212>  PRT
<213>  Mus musculus
<400>  3
Met Lys Pro Tyr Phe Cys Arg Val Phe Val Phe Cys Phe Leu Ile Arg
1               5                   10                  15
Leu Leu Thr Gly Glu Ile Asn Gly Ser Ala Asp His Arg Met Phe Ser
20                  25                  30
Phe His Asn Gly Gly Val Gln Ile Ser Cys Lys Tyr Pro Glu Thr Val
35                  40                  45
Gln Gln Leu Lys Met Arg Leu Phe Arg Glu Arg Glu Val Leu Cys Glu
50                  55                  60
Leu Thr Lys Thr Lys Gly Ser Gly Asn Ala Val Ser Ile Lys Asn Pro
65                  70                  75                  80
Met Leu Cys Leu Tyr His Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu
85                  90                  95
Asn Asn Pro Asp Ser Ser Gln Gly Ser Tyr Tyr Phe Cys Ser Leu Ser
100                 105                 110
Ile Phe Asp Pro Pro Pro Phe Gln Glu Arg Asn Leu Ser Gly Gly Tyr
115                 120                 125
Leu His Ile Tyr Glu Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Leu Trp Leu
130                 135                 140
Pro Val Gly Cys Ala Ala Phe Val Val Val Leu Leu Phe Gly Cys Ile
145                 150                 155                 160
Leu Ile Ile Trp Phe Ser Lys Lys Lys Tyr Gly Ser Ser Val His Asp
165                 170                 175
Pro Asn Ser Glu Tyr Met Phe Met ala Ala Val Asn Thr Asn Lys Lys
180                 185                 190
Ser Arg Leu Ala Gly Val Thr Ser
195                 200
<210>  4
<211>  180
<212>  PRT
<213>  Mus musculus
<400>  4
Glu Ile Asn Gly Ser Ala Asp His Arg Met Phe Ser Phe His Asn Gly
1               5                   10                  15
Gly Val Gln Ile Ser Cys Lys Tyr Pro Glu Thr Val Gln Gln Leu Lys
20                  25                  30
Met Arg Leu Phe Arg Glu Arg Glu Val Leu Cys Glu Leu Thr Lys Thr
35                  40                  45
Lys Gly Ser Gly Asn Ala Val Ser Ile Lys Asn Pro Met Leu Cys Leu
50                  55                  60
Tyr His Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu Asn Asn Pro Asp
65                  70                  75                  80
Ser Ser Gln Gly Ser Tyr Tyr Phe Cys Ser Leu Ser Ile Phe Asp Pro
85                  90                  95
Pro Pro Phe Gln Glu Arg Asn Leu Ser Gly Gly Tyr Leu His Ile Tyr
100                 105                 110
Glu Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Leu Trp Leu Pro Val Gly Cys
115                 120                 125
Ala Ala Phe Val Val Val Leu Leu Phe Gly Cys Ile Leu Ile Ile Trp
130                 135                 140
Phe Ser Lys Lys Lys Tyr Gly Ser Ser Val His Asp Pro Asn Ser Glu
145                 150                 155                 160
Tyr Met Phe Met ala Ala Val Asn Thr Asn Lys Lys Ser Arg Leu Ala
165                 170                 175
Gly Val Thr Ser
180
<210>  5
<211>  199
<212>  PRT
<213>  Macaca fascicularis
<400>  5
Met Lys Ser Gly Leu Trp Tyr Phe Phe Leu Phe Cys Leu His Met Lys
1               5                   10                  15
Val Leu Thr Gly Glu Ile Asn Gly Ser Ala Asn Tyr Glu Met Phe Ile
20                  25                  30
Phe His Asn Gly Gly Val Gln Ile Leu Cys Lys Tyr Pro Asp Ile Val
35                  40                  45
Gln Gln Phe Lys Met Gln Leu Leu Lys Gly Gly Gln Ile Leu Cys Asp
50                  55                  60
Leu Thr Lys Thr Lys Gly Ser Gly Asn Lys Val Ser Ile Lys Ser Leu
65                  70                  75                  80
Lys Phe Cys His Ser Gln Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu
85                  90                  95
Tyr Asn Leu Asp Arg Ser His Ala Asn Tyr Tyr Phe Cys Asn Leu Ser
100                 105                 110
Ile Phe Asp Pro Pro Pro Phe Lys Val Thr Leu Thr Gly Gly Tyr Leu
115                 120                 125
His Ile Tyr Glu Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Phe Trp Leu Pro
130                 135                 140
Ile Gly Cys Ala Thr Phe Val Val Val Cys Ile Phe Gly Cys Ile Leu
145                 150                 155                 160
Ile Cys Trp Leu Thr Lys Lys Lys Tyr Ser Ser Thr Val His Asp Pro
165                 170                 175
Asn Gly Glu Tyr Met Phe Met Arg Ala Val Asn Thr Ala Lys Lys Ser
180                 185                 190
Arg Leu Thr Gly Thr Thr Pro
195
<210>  6
<211>  179
<212>  PRT
<213>  Macaca fascicularis
<400>  6
Glu Ile Asn Gly Ser Ala Asn Tyr Glu Met Phe Ile Phe His Asn Gly
1               5                   10                  15
Gly Val Gln Ile Leu Cys Lys Tyr Pro Asp Ile Val Gln Gln Phe Lys
20                  25                  30
Met Gln Leu Leu Lys Gly Gly Gln Ile Leu Cys Asp Leu Thr Lys Thr
35                  40                  45
Lys Gly Ser Gly Asn Lys Val Ser Ile Lys Ser Leu Lys Phe Cys His
50                  55                  60
Ser Gln Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu Tyr Asn Leu Asp
65                  70                  75                  80
Arg Ser His Ala Asn Tyr Tyr Phe Cys Asn Leu Ser Ile Phe Asp Pro
85                  90                  95
Pro Pro Phe Lys Val Thr Leu Thr Gly Gly Tyr Leu His Ile Tyr Glu
100                 105                 110
Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Phe Trp Leu Pro Ile Gly Cys Ala
115                 120                 125
Thr Phe Val Val Val Cys Ile Phe Gly Cys Ile Leu Ile Cys Trp Leu
130                 135                 140
Thr Lys Lys Lys Tyr Ser Ser Thr Val His Asp Pro Asn Gly Glu Tyr
145                 150                 155                 160
Met Phe Met Arg Ala Val Asn Thr Ala Lys Lys Ser Arg Leu Thr Gly
165                 170                 175
Thr Thr Pro
<210>  7
<400>  7
000
<210>  8
<400>  8
000
<210>  9
<400>  9
000
<210>  10
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  10
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Gly Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35                  40                  45
Gly Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Thr Thr Tyr Tyr Ala Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Lys Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Val Lys Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Tyr Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  11
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  11
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Asp Lys Val Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Asn Tyr Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Thr Gly Gln Ala Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Met Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Ser Leu Thr Ile Asn
65                  70                  75                  80
Ser Phe Gln Thr Glu Asp Leu Gly Asp Tyr Tyr Cys Gln His His Tyr
85                  90                  95
Ser Thr Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100                 105                 110
<210>  12
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  12
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  13
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  13
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Thr Thr Tyr Tyr Ala Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  14
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  14
Trp Gly Arg Tyr Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  15
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  15
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Ala
1               5                   10                  15
<210>  16
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  16
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  17
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  17
Gln His His Tyr Ser Thr Pro Pro Thr
1               5
<210>  18
<400>  18
000
<210>  19
<400>  19
000
<210>  20
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  20
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35                  40                  45
Gly Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Val Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Val Lys Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  21
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  21
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly
1               5                   10                  15
Asp Arg Val Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Thr Gly Gln Ala Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Met Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asn
65                  70                  75                  80
Ser Phe Gln Thr Glu Asp Leu Gly Asp Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Leu Glu Leu Arg
100                 105                 110
<210>  22
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  22
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  23
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  23
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  24
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  24
Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser
1               5
<210>  25
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  25
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  26
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  26
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  27
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  27
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  28
<400>  28
000
<210>  29
<400>  29
000
<210>  30
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  30
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35                  40                  45
Gly Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Val Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Val Lys Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ser Arg Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  31
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  31
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly
1               5                   10                  15
Asp Arg Val Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Thr Gly Gln Ala Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Met Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asn
65                  70                  75                  80
Ser Phe Gln Thr Glu Asp Leu Gly Asp Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Leu Glu Leu Arg
100                 105                 110
<210>  32
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  32
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  33
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  33
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  34
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  34
Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  35
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  35
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  36
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  36
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  37
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  37
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  38
<400>  38
000
<210>  39
<400>  39
000
<210>  40
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  40
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35                  40                  45
Gly Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Val Lys Asn Ile Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Val Lys Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  41
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  41
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Asp Arg Val Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe His Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Thr Gly Gln Ala Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Met Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asn
65                  70                  75                  80
Ser Phe Gln Thr Glu Asp Leu Gly Asp Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Leu Glu Leu Arg
100                 105                 110
<210>  42
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  42
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  43
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  43
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  44
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  44
Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  45
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  45
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe His Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  46
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  46
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  47
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  47
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  48
<400>  48
000
<210>  49
<400>  49
000
<210>  50
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  50
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35                  40                  45
Gly Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Val Lys Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ala Arg Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  51
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  51
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly
1               5                   10                  15
Asp Lys Val Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser
20                  25                  30
Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile Trp Tyr Gln Gln Lys Thr Gly Gln Ala Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ile Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Thr
65                  70                  75                  80
Ser Phe Gln Thr Glu Asp Leu Gly Asp Tyr Tyr Cys Gln His His Tyr
85                  90                  95
Ser Ser Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100                 105                 110
<210>  52
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  52
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  53
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  53
Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  54
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  54
Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  55
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  55
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile
1               5                   10                  15
<210>  56
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  56
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  57
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Mesocricetus auratus
<400>  57
Gln His His Tyr Ser Ser Pro Pro Thr
1               5
<210>  58
<400>  58
000
<210>  59
<400>  59
000
<210>  60
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 heavy chain variable region
<400>  60
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  61
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 light chain variable region
<400>  61
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  62
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 VH CDR1
<400>  62
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  63
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 VH CDR2
<400>  63
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  64
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 VH CDR3
<400>  64
Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser
1               5
<210>  65
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 VL CDR1
<400>  65
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  66
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 VL CDR2
<400>  66
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  67
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 VL CDR3
<400>  67
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  68
<400>  68
000
<210>  69
<400>  69
000
<210>  70
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 heavy chain variable region
<400>  70
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  71
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 light chain variable region
<400>  71
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Glu Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  72
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 VH CDR1
<400>  72
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  73
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 VH CDR2
<400>  73
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  74
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 VH CDR3
<400>  74
Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser
1               5
<210>  75
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 VL CDR1
<400>  75
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  76
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 VL CDR2
<400>  76
Tyr Ala Ser Thr Arg Glu Thr
1               5
<210>  77
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S714 VL CDR3
<400>  77
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  78
<400>  78
000
<210>  79
<400>  79
000
<210>  80
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 heavy chain variable region
<400>  80
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  81
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 light chain variable region
<400>  81
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  82
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 VH CDR1
<400>  82
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  83
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 VH CDR2
<400>  83
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  84
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 VH CDR3
<400>  84
Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser
1               5
<210>  85
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 VL CDR1
<400>  85
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  86
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 VL CDR2
<400>  86
Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr
1               5
<210>  87
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S715 VL CDR3
<400>  87
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  88
<400>  88
000
<210>  89
<400>  89
000
<210>  90
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 heavy chain variable region
<400>  90
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  91
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 light chain variable region
<400>  91
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  92
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 VH CDR1
<400>  92
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  93
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 VH CDR2
<400>  93
Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  94
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 VH CDR3
<400>  94
Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser
1               5
<210>  95
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 VL CDR1
<400>  95
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  96
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 VL CDR2
<400>  96
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  97
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S716 VL CDR3
<400>  97
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  98
<400>  98
000
<210>  99
<400>  99
000
<210>  100
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 heavy chain variable region
<400>  100
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  101
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 light chain variable region
<400>  101
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Glu Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  102
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 VH CDR1
<400>  102
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  103
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 VH CDR2
<400>  103
Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  104
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 VH CDR3
<400>  104
Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser
1               5
<210>  105
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 VL CDR1
<400>  105
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  106
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 VL CDR2
<400>  106
Tyr Ala Ser Thr Arg Glu Thr
1               5
<210>  107
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S717 VL CDR3
<400>  107
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  108
<400>  108
000
<210>  109
<400>  109
000
<210>  110
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 heavy chain variable region
<400>  110
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  111
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 light chain variable region
<400>  111
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  112
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 VH CDR1
<400>  112
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  113
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 VH CDR2
<400>  113
Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  114
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 VH CDR3
<400>  114
Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser
1               5
<210>  115
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 VL CDR1
<400>  115
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  116
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 VL CDR2
<400>  116
Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr
1               5
<210>  117
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S718 VL CDR3
<400>  117
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  118
<400>  118
000
<210>  119
<400>  119
000
<210>  120
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 heavy chain variable region
<400>  120
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ala Arg Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  121
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 light chain variable region
<400>  121
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser
20                  25                  30
Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His His Tyr
85                  90                  95
Ser Ser Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  122
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 VH CDR1
<400>  122
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  123
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 VH CDR2
<400>  123
Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  124
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 VH CDR3
<400>  124
Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  125
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 VL CDR1
<400>  125
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile
1               5                   10                  15
<210>  126
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 VL CDR2
<400>  126
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  127
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S71 VL CDR3
<400>  127
Gln His His Tyr Ser Ser Pro Pro Thr
1               5
<210>  128
<400>  128
000
<210>  129
<400>  129
000
<210>  130
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 heavy chain variable region
<400>  130
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ala Arg Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  131
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 light chain variable region
<400>  131
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser
20                  25                  30
Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Glu Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His His Tyr
85                  90                  95
Ser Ser Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  132
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 VH CDR1
<400>  132
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  133
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 VH CDR2
<400>  133
Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  134
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 VH CDR3
<400>  134
Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  135
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 VL CDR1
<400>  135
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile
1               5                   10                  15
<210>  136
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 VL CDR2
<400>  136
Tyr Ala Ser Thr Arg Glu Thr
1               5
<210>  137
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S72 VL CDR3
<400>  137
Gln His His Tyr Ser Ser Pro Pro Thr
1               5
<210>  138
<400>  138
000
<210>  139
<400>  139
000
<210>  140
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 heavy chain variable region
<400>  140
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ala Arg Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  141
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 light chain variable region
<400>  141
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser
20                  25                  30
Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His His Tyr
85                  90                  95
Ser Ser Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  142
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 VH CDR1
<400>  142
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  143
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 VH CDR2
<400>  143
Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  144
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 VH CDR3
<400>  144
Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  145
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 VL CDR1
<400>  145
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile
1               5                   10                  15
<210>  146
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 VL CDR2
<400>  146
Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr
1               5
<210>  147
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S73 VL CDR3
<400>  147
Gln His His Tyr Ser Ser Pro Pro Thr
1               5
<210>  148
<400>  148
000
<210>  149
<400>  149
000
<210>  150
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 heavy chain variable region
<400>  150
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Val Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ala Arg Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  151
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 light chain variable region
<400>  151
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Val Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser
20                  25                  30
Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His His Tyr
85                  90                  95
Ser Ser Pro Pro Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100                 105                 110
<210>  152
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 VH CDR1
<400>  152
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  153
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 VH CDR2
<400>  153
Asn Ile Asp His Asp Gly Asn Ile Ile Asn Phe Ala Pro Ser Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  154
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 VH CDR3
<400>  154
Trp Gly His Tyr Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  155
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 VL CDR1
<400>  155
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Ser Gly Tyr Asn Tyr Leu Ile
1               5                   10                  15
<210>  156
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 VL CDR2
<400>  156
Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr
1               5
<210>  157
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  16G10S83 VL CDR3
<400>  157
Gln His His Tyr Ser Ser Pro Pro Thr
1               5
<210>  158
<400>  158
000
<210>  159
<400>  159
000
<210>  160
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 heavy chain variable region
<400>  160
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ser Arg Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  161
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 light chain variable region
<400>  161
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  162
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 VH CDR1
<400>  162
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  163
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 VH CDR2
<400>  163
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  164
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 VH CDR3
<400>  164
Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  165
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 VL CDR1
<400>  165
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  166
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 VL CDR2
<400>  166
Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr
1               5
<210>  167
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S79 VL CDR3
<400>  167
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  168
<400>  168
000
<210>  169
<400>  169
000
<210>  170
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 heavy chain variable region
<400>  170
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ser Arg Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  171
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 light chain variable region
<400>  171
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100                 105                 110
<210>  172
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 VH CDR1
<400>  172
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  173
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 VH CDR2
<400>  173
Asn Ile Asp Glu Ser Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  174
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 VH CDR3
<400>  174
Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  175
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 VL CDR1
<400>  175
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  176
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 VL CDR2
<400>  176
Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr
1               5
<210>  177
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S710 VL CDR3
<400>  177
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  178
<400>  178
000
<210>  179
<400>  179
000
<210>  180
<211>  117
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 heavy chain variable region
<400>  180
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Ser Arg Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210>  181
<211>  111
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 light chain variable region
<400>  181
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Ala Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Val Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100                 105                 110
<210>  182
<211>  10
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 VH CDR1
<400>  182
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Trp Met Asp
1               5                   10
<210>  183
<211>  17
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 VH CDR2
<400>  183
Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Ala Glu Tyr Ser Pro Phe Val Lys
1               5                   10                  15
Gly
<210>  184
<211>  8
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 VH CDR3
<400>  184
Trp Gly Arg Phe Ala Phe Asp Ser
1               5
<210>  185
<211>  15
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 VL CDR1
<400>  185
Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly Ser Phe Asn Tyr Leu Thr
1               5                   10                  15
<210>  186
<211>  7
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 VL CDR2
<400>  186
Tyr Ala Ser Thr Arg Gln Thr
1               5
<210>  187
<211>  9
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  35A9S89 VL CDR3
<400>  187
His His His Tyr Asn Ala Pro Pro Thr
1               5
<210>  188
<211>  447
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 human IgG1 heavy chain
<400>  188
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1               5                   10                  15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20                  25                  30
Trp Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Val Trp Val
35                  40                  45
Ser Asn Ile Asp Glu Asp Gly Ser Ile Thr Glu Tyr Ser Pro Phe Val
50                  55                  60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85                  90                  95
Thr Arg Trp Gly Arg Phe Gly Phe Asp Ser Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100                 105                 110
Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu
115                 120                 125
Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys
130                 135                 140
Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser
145                 150                 155                 160
Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser
165                 170                 175
Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser
180                 185                 190
Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn
195                 200                 205
Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His
210                 215                 220
Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val
225                 230                 235                 240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr
245                 250                 255
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu
260                 265                 270
Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys
275                 280                 285
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser
290                 295                 300
Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
305                 310                 315                 320
Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile
325                 330                 335
Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro
340                 345                 350
Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu
355                 360                 365
Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn
370                 375                 380
Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser
385                 390                 395                 400
Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg
405                 410                 415
Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu
420                 425                 430
His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
435                 440                 445
<210>  189
<211>  218
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence
<220>
<223>  37A10S713 human kappa light chain
<400>  189
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Ser Gly
20                  25                  30
Ser Phe Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35                  40                  45
Lys Leu Leu Ile Phe Tyr Ala Ser Thr Arg His Thr Gly Val Pro Asp
50                  55                  60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65                  70                  75                  80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His His His Tyr
85                  90                  95
Asn Ala Pro Pro Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys Arg
100                 105                 110
Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln
115                 120                 125
Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr
130                 135                 140
Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser
145                 150                 155                 160
Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr
165                 170                 175
Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys
180                 185                 190
His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro
195                 200                 205
Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210                 215
<210>  190
<211>  200
<212>  PRT
<213>  Rattus norvegicus
<400>  190
Met Lys Pro Tyr Phe Ser Cys Val Phe Val Phe Cys Phe Leu Ile Lys
1               5                   10                  15
Leu Leu Thr Gly Glu Leu Asn Asp Leu Ala Asn His Arg Met Phe Ser
20                  25                  30
Phe His Asp Gly Gly Val Gln Ile Ser Cys Asn Tyr Pro Glu Thr Val
35                  40                  45
Gln Gln Leu Lys Met Gln Leu Phe Lys Asp Arg Glu Val Leu Cys Asp
50                  55                  60
Leu Thr Lys Thr Lys Gly Ser Gly Asn Thr Val Ser Ile Lys Asn Pro
65                  70                  75                  80
Met Ser Cys Pro Tyr Gln Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu
85                  90                  95
Asp Asn Ala Asp Ser Ser Gln Gly Ser Tyr Phe Leu Cys Ser Leu Ser
100                 105                 110
Ile Phe Asp Pro Pro Pro Phe Gln Glu Lys Asn Leu Ser Gly Gly Tyr
115                 120                 125
Leu Leu Ile Tyr Glu Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Leu Trp Leu
130                 135                 140
Pro Val Gly Cys Ala Ala Phe Val Ala Ala Leu Leu Phe Gly Cys Ile
145                 150                 155                 160
Phe Ile Val Trp Phe Ala Lys Lys Lys Tyr Arg Ser Ser Val His Asp
165                 170                 175
Pro Asn Ser Glu Tyr Met Phe Met ala Ala Val Asn Thr Asn Lys Lys
180                 185                 190
Ser Arg Leu Ala Gly Met Thr Ser
195                 200
<210>  191
<211>  180
<212>  PRT
<213>  Rattus norvegicus
<400>  191
Glu Leu Asn Asp Leu Ala Asn His Arg Met Phe Ser Phe His Asp Gly
1               5                   10                  15
Gly Val Gln Ile Ser Cys Asn Tyr Pro Glu Thr Val Gln Gln Leu Lys
20                  25                  30
Met Gln Leu Phe Lys Asp Arg Glu Val Leu Cys Asp Leu Thr Lys Thr
35                  40                  45
Lys Gly Ser Gly Asn Thr Val Ser Ile Lys Asn Pro Met Ser Cys Pro
50                  55                  60
Tyr Gln Leu Ser Asn Asn Ser Val Ser Phe Phe Leu Asp Asn Ala Asp
65                  70                  75                  80
Ser Ser Gln Gly Ser Tyr Phe Leu Cys Ser Leu Ser Ile Phe Asp Pro
85                  90                  95
Pro Pro Phe Gln Glu Lys Asn Leu Ser Gly Gly Tyr Leu Leu Ile Tyr
100                 105                 110
Glu Ser Gln Leu Cys Cys Gln Leu Lys Leu Trp Leu Pro Val Gly Cys
115                 120                 125
Ala Ala Phe Val Ala Ala Leu Leu Phe Gly Cys Ile Phe Ile Val Trp
130                 135                 140
Phe Ala Lys Lys Lys Tyr Arg Ser Ser Val His Asp Pro Asn Ser Glu
145                 150                 155                 160
Tyr Met Phe Met ala Ala Val Asn Thr Asn Lys Lys Ser Arg Leu Ala
165                 170                 175
Gly Met Thr Ser
180
<---