ВЕКТОРНЫЕ ПЛАЗМИДЫ ДЛЯ КЛОНИРОВАНИЯ МОДУЛЕЙ ДНК И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Вектор для стыковки доменных модулей, состоящий из клонирующего ДНК-вектора, содержащего модуль множественного клонирования (MC) для субклонирования представляющего интерес генетического материала в модуле MC, при этом модуль MC содержит
a) первый генный шарнир (GP), содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые можно подвергать обработке для определения 5'-части модуля MC;
b) последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую сайт множественного клонирования (MCS), который содержит множество сайтов рестрикции, выбранных из широко распространенных сайтов рестрикции, которые являются уникальными в векторе для стыковки доменных модулей, чтобы обеспечить сайты клонирования для клонирования представляющего интерес генетического материала в модуле MC; и
c) второй генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые можно подвергать обработке для определения 3'-части модуля MC.
2. Вектор для стыковки доменных модулей по п.1, в котором первый генный шарнир и второй генный шарнир независимо содержат по меньшей мере 3, и не более 4, невариабельных редких сайтов рестрикции.
3. Вектор для стыковки доменных модулей по п.1, в котором представляющий интерес генетический материал выбран из группы, состоящей из домена промотора, домена экспрессии и 3'-регуляторного домена.
4. Вектор для стыковки доменных модулей по п.1, в котором невариабельный редкий сайт рестрикции выбран из группы, состоящей из AsiS I, Pac I, Sbf I, Fse I, Asc I, Mlu I, SnaB I, Not I, Sal I, Swa I, Rsr II, BSiW I, Sfo I, Sgr AI, AflIII, Pvu I, Ngo MIV, Ase I, Flp I, Pme I, Sda I, Sgf I, Srf I и Sse8781 I.
5. Вектор для стыковки доменных модулей по п.4, в котором в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом промотора, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из AsiS I, Pac I и Sbf I, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из Fse I, Asc I и Mlu I;
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом экспрессии, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из Fse I, Asc I и Mlu I, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из SnaB I, Not I и Sal I; и
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является 3'-регуляторным доменом, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из SnaB I, Not I и Sal I, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из Swa I, Rsr II и BSiW I.
6. Вектор для стыковки доменных модулей по п.5, в котором в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом промотора, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из AsiS I, Pac I и Sbf I в указанном порядке, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из Fse I, Asc I и Mlu I в указанном порядке;
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом экспрессии, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из Fse I, Asc I и Mlu I в указанном порядке, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из SnaB I, Not I и Sal I в указанном порядке; и
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является 3'-регуляторным доменом, первый группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из SnaB I, Not I и Sal I в указанном порядке, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из Swa I, Rsr II и BSiW I в указанном порядке.
7. Стыковочный вектор PE3, состоящий из клонирующего ДНК-вектора, содержащего модуль клонирования PE3, который содержит множество модулей клонирования, скомпонованных для клонирования множества доменных модулей в модуле клонирования PE3, при этом модуль клонирования PE3 содержит
a) первый генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании можно подвергать обработке для определения 5'-части модуля промотора;
b) модуль первого вкладыша, состоящий из первой последовательности нуклеиновой кислоты, содержащей вкладыш, который при клонировании заменяют модулем промотора;
c) второй генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании можно подвергать обработке для определения области соединения в одно целое между 3'-частью модуля промотора и 5'-частью модуля экспрессии;
d) модуль второго вкладыша, состоящий из второй последовательности нуклеиновой кислоты, содержащей вкладыш, который при клонировании заменяют модулем экспрессии;
e) третий генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании можно подвергать обработке для определения области соединения в одно целое между 3'-частью модуля экспрессии и 5'-частью 3'-регуляторного модуля;
f) модуль третьего вкладыша, состоящий из третьей последовательности нуклеиновой кислоты, содержащей вкладыш, который при клонировании заменяют 3'-регуляторным модулем; и
g) четвертый генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании могут быть подвергнуты обработке для определения 3'-части 3'-регуляторного модуля.
8. Стыковочный вектор PE3 по п.7, в котором первый генный шарнир и второй генный шарнир независимо содержат по меньшей мере 3, и не более 4, невариабельных редких сайтов рестрикции.
9. Стыковочный вектор PE3 по п.7, в котором невариабельный редкий сайт рестрикции выбран из группы, состоящей из AsiS I, Pac I, Sbf I, Fse I, Asc I, Mlu I, SnaB I, Not I, Sal I, Swa I, Rsr II, BSiW I, Sfo I, Sgr AI, AflIII, Pvu I, Ngo MIV, Ase I, Flp I, Pme I, Sda I, Sgf I, Srf I и Sse8781 I.
10. Вектор для стыковки доменных модулей по п.9, в котором в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом промотора, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из AsiS I, Pac I и Sbf I, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из Fse I, Asc I и Mlu I;
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом экспрессии, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из Fse I, Asc I и Mlu I, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из SnaB I, Not I и Sal I; и
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является 3'-регуляторным доменом, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из SnaB I, Not I и Sal I, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции выбрана из группы, состоящей по меньшей мере из Swa I, Rsr II и BSiW I.
11. Вектор для стыковки доменных модулей по п.10, в котором в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом промотора, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из AsiS I, Pac I и Sbf I в указанном порядке, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из Fse I, Asc I и Mlu I в указанном порядке;
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является доменом экспрессии, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из Fse I, Asc I и Mlu I в указанном порядке, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из SnaB I, Not I и Sal I в указанном порядке; и
в том случае, когда представляющий интерес генетический материал является 3'-регуляторным доменом, первая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из SnaB I, Not I и Sal I в указанном порядке, а вторая группа невариабельных редких сайтов рестрикции состоит из Swa I, Rsr II и BSiW I в указанном порядке.
12. Стыковочный вектор PE3 по п.7, дополнительно содержащий средства для встраивания модуля PE3 в мультигенный стыковочный вектор.
13. Стыковочный вектор PE3 для множественного клонирования (MC), состоящий из клонирующего ДНК-вектора, содержащего модуль клонирования PE3, скомпонованный для клонирования модулей промотора, экспрессии и 3'-регуляторной области в модуле клонирования PE3, при этом модуль клонирования PE3 содержит
a) первый генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании могут быть подвергнуты обработке для определения 5'-части модуля промотора;
b) первую последовательность нуклеиновой кислоты;
c) второй генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании могут быть подвергнуты обработке для определения области соединения в одно целое между 3'-частью модуля промотора и 5'-частью модуля экспрессии;
d) вторую последовательность нуклеиновой кислоты;
e) третий генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании могут быть подвергнуты обработке для определения области соединения в одно целое между 3'-частью модуля экспрессии и 5'-частью 3'-регуляторного модуля;
f) третью последовательность нуклеиновой кислоты; и
g) четвертый генный шарнир, содержащий по меньшей мере два невариабельных редких сайта рестрикции, которые при клонировании могут быть подвергнуты обработке для определения 3'-части 3'-регуляторного модуля;
в котором по меньшей мере одна из первой, второй и третьей последовательностей нуклеиновых кислот является модулем множественного клонирования, содержащим сайт множественного клонирования (MCS), включающий множество сайтов рестрикции, выбранных из широко распространенных сайтов рестрикции, которые являются уникальными в стыковочном векторе PE3, обеспечивая сайты клонирования для клонирования представляющего интерес генетического материала в модуле множественного клонирования, а остальные последовательности нуклеиновых кислот представляют собой вкладыши.
14. Стыковочный вектор PE3 MC по п.13, в котором первая последовательность нуклеиновой кислоты является модулем множественного клонирования и в котором первый генный шарнир выбран из группы, состоящей по меньшей мере из AsiS I, Pac I и Sbf I, а второй генный шарнир выбран из группы, состоящей по меньшей мере из Fse I, Asc I и Mlu I.
15. Стыковочный вектор PE3 MC по п.13, в котором вторая последовательность нуклеиновой кислоты является модулем множественного клонирования и в котором второй генный шарнир выбран из группы, состоящей по меньшей мере из Fse I, Asc I и Mlu I, а третий генный шарнир выбран из группы, состоящей по меньшей мере из SnaB I, Not I и Sal I.
16. Стыковочный вектор PE3 MC по п.13, в котором последовательность нуклеиновой кислоты является модулем множественного клонирования и в котором второй генный шарнир выбран из группы, состоящей по меньшей мере из SnaB I, Not I и Sal I, а третий генный шарнир выбран из группы, состоящей по меньшей мере из Swa I, Rsr II и BSiW I.
17. Стыковочный вектор PE3 MC по п.13, в котором первый генный шарнир состоит из AsiS I, Pac I и Sbf I в указанном порядке, второй генный шарнир состоит из Fse I, Asc I и Mlu I в указанном порядке, третий генный шарнир состоит из SnaB I, Not I и Sal I в указанном порядке, и четвертый генный шарнир состоит из Swa I, Rsr II и BSiW I в указанном порядке.
18. Стыковочный вектор PE3 MC по п.13, дополнительно содержащий средства для высвобождения модуля PE3 из вектора PE3 для встраивания в мультигенный стыковочный вектор.