ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ СПОСОБЫ И КОМПОЗИЦИИ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ ГЛИОБЛАСТОМЫ

1. Способ (а) определения того, будет ли пациент, имеющий глиобластому с большой вероятностью отвечать на лечение антагонистом VEGF, (b) оптимизации терапевтической эффективности противораковой терапии у пациента, имеющего глиобластому, (с) выбора терапевтического средства для пациента, имеющего глиобластому, указанный способ включает:
(i) обнаружение экспрессии по меньшей мере одного из генов, представленных в Таблице 1, 2 или 3, в биологическом образце, полученном от указанного пациента, до введения указанному пациенту антагониста VEGF; и
(ii) сравнение уровня экспрессии указанного по меньшей мере одного гена с эталонным уровнем экспрессии указанного по меньшей мере одного гена, причем изменение указанного уровня экспрессии указанного по меньшей мере одного гена в образце, полученном от указанного пациента, относительно указанного эталонного уровня позволяет выявить пациента, который с большой вероятностью будет отвечать на лечение антагонистом VEGF.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанный пациент принадлежит к популяции пациентов, имеющих глиобластому и проанализированных на восприимчивость к антагонисту VEGF, и указанный эталонный уровень представляет собой медианный уровень экспрессии указанного по меньшей мере одного гена в популяции пациентов.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанный эталонный уровень представляет собой медианный уровень экспрессии указанного по меньшей мере одного гена у пациентов, имеющих глиобластому, и, как было установлено, не отвечающих на лечение антагонистом VEGF.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанное изменение уровня экспрессии указанного по меньшей мере одного гена в образце, полученном от пациента, представляет собой увеличение относительно указанного эталонного уровня.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанное изменение уровня экспрессии указанного по меньшей мере одного гена в образце, полученном от пациента, представляет собой уменьшение относительно указанного эталонного уровня.
6. Способ по п. 1, отличающийся тем, что экспрессию указанного по меньшей мере одного гена в указанном биологическом образце, полученном от указанного пациента, обнаруживают посредством измерения мРНК.
7. Способ по п. 1, отличающийся тем, что экспрессию указанного по меньшей мере одного гена в указанном биологическом образце, полученном от указанного пациента, обнаруживают посредством измерения уровней белка в плазме.
8. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанный биологический образец представляет собой ткань опухоли.
9. Способ по п. 1, дополнительно включающий обнаружение экспрессии по меньшей мере двух из указанных генов в указанном биологическом образце, полученном от указанного пациента.
10. Способ по п. 9, дополнительно включающий обнаружение экспрессии по меньшей мере трех из указанных генов в указанном биологическом образце, полученном от указанного пациента.
11. Способ по п. 10, дополнительно включающий обнаружение экспрессии по меньшей мере четырех из указанных генов в указанном биологическом образце, полученном от указанного пациента.
12. Способ по п. 11, дополнительно включающий обнаружение экспрессии по меньшей мере четверти из указанных генов в указанном биологическом образце, полученном от указанного пациента.
13. Способ по п. 12, дополнительно включающий обнаружение экспрессии по меньшей мере трети из указанных генов в указанном биологическом образце, полученном от указанного пациента.
14. Способ по по п. 1, отличающийся тем, что указанный антагонист VEGF представляет собой антитело против VEGF.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что указанное антитело против VEGF связывается с эпитопом А4.6.1.
16. Способ по п. 14, отличающийся тем, что указанное антитело против VEGF представляет собой бевацизумаб.
17. Способ по п. 14, отличающийся тем, что указанное антитело против VEGF содержит вариабельную тяжелую цепь (VH) и вариабельную легкую цепь (VL), причем указанная VH имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, и указанная VL имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1.
18. Способ по по п. 1, дополнительно включающий введение указанному пациенту антагониста VEGF.
19. Способ по п. 18, отличающийся тем, что указанный вводимый антагонист VEGF представляет собой антитело против VEGF.
20. Способ по п. 19, отличающийся тем, что указанное вводимое антитело против VEGF связывается с эпитопом А4.6.1.
21. Способ по п. 19, отличающийся тем, что указанное вводимое антитело против VEGF представляет собой бевацизумаб.
22. Способ по п. 19, отличающийся тем, что указанное вводимое антитело против VEGF содержит вариабельную тяжелую цепь (VH) и вариабельную легкую цепь (VL), причем указанная VH имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, и указанная VL имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1.
23. Способ по п. 18, дополнительно включающий осуществление терапии с применением (i) средства, которое выбрано из группы, состоящей из противоопухолевого средства, химиотерапевтического средства, средства, ингибирующего рост, и цитотоксического средства, (ii) лучевой терапии или (iii) их комбинации.
24. Способ по п. 18, дополнительно включающий введение указанному пациенту темозоломида (ТМЗ).
25. Способ по по п. 1, отличающийся тем, что восприимчивость к лечению антагонистом VEGF представляет собой увеличение общей выживаемости.
26. Способ по по п. 1, отличающийся тем, что указанный пациент, который, как было обнаружено, с большой вероятностью будет отвечать на лечение антагонистом VEGF, имеет глиобластому пронейрального типа.
27. Способ по любому пунктов 1-26, отличающийся тем, что по меньшей мере один указанный ген выбран из группы, состоящей из NCAM1, OMG, PRKCZ, GALNT13, GPR17, DNM3, FERMT1, SNAP91, ABHD6 и PFN2.
28. Способ по п. 27, отличающийся тем, что указанное изменение уровня экспрессии по меньшей мере одного гена в образце, полученном от пациента, представляет собой увеличение относительно эталонного уровня.
29. Способ по п. 1, дополнительно включающий информирование пациента о том, что у него присутствует увеличенная вероятность реакции на лечение антагонистом VEGF.
30. Способ по п. 1, дополнительно включающий предоставление рекомендации указанному пациенту о том, что в противораковую терапию следует включить антагонист VEGF.
31. Способ по п. 1, дополнительно включающий выбор терапии, включающей антагонист VEGF, если было обнаружено, что указанный пациент с большой вероятностью будет отвечать на лечение антагонистом VEGF, и предоставление указанному пациенту рекомендации относитльно указанной выбранной терапии, включающей антагонист VEGF.
32. Антагонист VEGF для применения при оптимизации терапевтической эффективности противораковой терапии у пациента, имеющего глиобластому, причем указанный пациент до какого-либо введения антагониста VEGF у экспрессирует по меньшей мере один из генов, представленных в Таблице 1, 2 или 3, на уровне, отличном от эталонного уровня экспрессии по меньшей мере одного гена.
33. Антагонист VEGF по п. 32, отличающийся тем, что указанный антагонист VEGF будет введен пациенту, у которого по меньшей мере один из генов, представленных в Таблице 1, 2 или 3, экспрессируется на уровне, отличном от эталонного уровня экспрессии по меньшей мере одного гена.
34. Антагонист VEGF для применения при лечении пациента, имеющего глиобластому, причем до введения антагониста VEGF указанный пациент экспрессирует по меньшей мере однин из генов, представленных в Таблице 1, 2 или 3, на отличном уровне.
35. Антагонист VEGF по п. 32 или 33, для применения при оптимизации терапевтической эффективности противораковой терапии у пациента, имеющего глиобластому, причем указанный пациент до какого-либо введения антагониста VEGF экспрессирует увеличенный уровень по меньшей мере одного гена, выбранного из группы, состоящей из NCAM1, OMG, PRKCZ, GALNT13, GPR17, DNM3, FERMT1, SNAP91, ABHD6 и PFN2, относительно эталонного уровня экспрессии указанного по меньшей мере одного гена.
36. Антагонист VEGF по п. 35, отличающийся тем, что указанный антагонист VEGF будет введен указанному пациенту, по меньшей мере один ген которого, выбранный из группы, состоящей из NCAM1, OMG, PRKCZ, GALNT13, GPR17, DNM3, FERMT1, SNAP91, ABHD6 и PFN2, экспрессируется на увеличенном уровне относительно эталонного уровня экспрессии по меньшей мере одного гена.
37. Антагонист VEGF по п. 34, при этом указанный пациент до введения антагониста VEGF экспрессирует увеличенный уровень по меньшей мере одного гена, выбранного из группы, состоящей из NCAM1, OMG, PRKCZ, GALNT13, GPR17, DNM3, FERMT1, SNAP91, ABHD6 и PFN2.
38. Набор для определения того, получит ли пациент пользу от лечения антагонистом VEGF, при этом указанный набор содержит:
(a) полипептиды или полинуклеотиды, способные к определению уровня экспрессии по меньшей мере одного из генов, представленных в Таблице 1, 2 или 3; и
(b) инструкции по применению указанных полипептидов или полинуклеотидов для определения уровня экспрессии по меньшей мере одного из генов, представленных в Таблице 1, 2 или 3, причем изменение указанного уровня экспрессии по меньшей мере одного из указанных генов относительно эталонного уровня свидетельствует, что указанный пациент получит пользу от лечения антагонистом VEGF.