НЕ РЕСТРИКТИРОВАННЫЕ ПО HLA T-КЛЕТОЧНЫЕ РЕЦЕПТОРЫ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ

1. Рекомбинантный T-клеточный рецептор (TCR), содержащий антигенсвязывающую цепь, которая содержит внеклеточный антигенсвязывающий домен и константный домен, где данный рекомбинантный TCR связывается с антигеном HLA-независимым образом, где константный домен содержит нативный или модифицированный пептид TRAC и/или нативный или модифицированный пептид TRBC.
TRAC
TRBC
2. Рекомбинантный TCR по п. 1, где данный рекомбинантный TCR экспрессируется из кассеты экспрессии, помещенной в эндогенный локус  и/или локус  иммунореактивной клетки.
3. Рекомбинантный TCR по п. 2, где помещение кассеты экспрессии рекомбинантного TCR нарушает или прекращает экспрессию эндогенного TCR, содержащего нативную α-цепь TCR и/или нативную β-цепь TCR, в иммунореактивной клетке.
4. Рекомбинантный TCR по п. 2, где помещение кассеты экспрессии рекомбинантного TCR предотвращает или устраняет ошибочное спаривание между рекомбинантным TCR и нативной α-цепью TCR и/или нативной β-цепью TCR в иммунореактивной клетке.
5. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-4, где константный домен способен образовывать гомодимер или гетеродимер с другим константным доменом.
6. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-5, где антигенсвязывающая цепь способна связываться с полипептидом CD3ζ.
7. Рекомбинантный TCR по п. 6, где антигенсвязывающая цепь после связывания с антигеном способна активировать полипептид CD3ζ, связанный с антигенсвязывающей цепью.
8. Рекомбинантный TCR по п. 7, где активация полипептида CD3ζ способна активировать иммунореактивную клетку.
9. Рекомбинантный TCR по п. 6, где полипептид CD3ζ является эндогенным и интегрирован в нативный комплекс CD3.
10. Рекомбинантный TCR по п. 6, где полипептид CD3ζ является экзогенным и, необязательно, интегрирован с костимулирующей молекулой, выбранной из группы, состоящей из полипептида CD28, полипептида 4-1BB, полипептида OX40, полипептида ICOS, полипептида DAP-10 и любой их комбинации.
11. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-10, где антигенсвязывающая цепь дополнительно содержит костимулирующую область, где данный рекомбинантный TCR после связывания с антигеном способен стимулировать иммунореактивную клетку.
12. Рекомбинантный TCR по п. 11, где костимулирующая область содержит костимулирующую молекулу, выбранную из группы, состоящей из полипептида CD28, полипептида 4-1BB, полипептида OX40, полипептида ICOS, полипептида DAP-10 и любой их комбинации.
13. Рекомбинантный TCR по п. 12, где костимулирующая область содержит полипептид CD28.
14. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-13, где данный рекомбинантный TCR способен интегрироваться с комплексом CD3 и обеспечивать HLA-независимое распознавание антигена.
15. Рекомбинантный TCR по п. 14, где комплекс CD3 является эндогенным.
16. Рекомбинантный TCR по п. 15, где данный рекомбинантный TCR заменяет эндогенный TCR в комплексе CD3/TCR.
17. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-16, где внеклеточный антигенсвязывающий домен способен к димеризации с другим внеклеточным антигенсвязывающим доменом.
18. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-17, где внеклеточный антигенсвязывающий домен содержит лиганд рецептора клеточной поверхности, рецептор лиганда клеточной поверхности, антигенсвязывающую часть антитела или его фрагмента или антигенсвязывающую часть TCR.
19. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-18, где внеклеточный антигенсвязывающий домен содержит одну или две вариабельные области иммуноглобулина.
H
20. Рекомбинантный TCR по п. 18, где внеклеточный антигенсвязывающий домен содержит вариабельную область тяжелой цепи (V) антитела.
L
21. Рекомбинантный TCR по п. 18, где внеклеточный антигенсвязывающий домен содержит вариабельную область легкой цепи (V) антитела.
22. Рекомбинантный TCR по п. 18, где внеклеточный антигенсвязывающий домен способен к димеризации с другим внеклеточным антигенсвязывающим доменом.
H
H
L
23. Рекомбинантный TCR по п. 20, где внеклеточный антигенсвязывающий домен содержит V антитела, где V способна к димеризации с другим внеклеточным антигенсвязывающим доменом, содержащим V антитела, и образованию вариабельного фрагмента (Fv).
L
L
H
24. Рекомбинантный TCR по п. 21, где внеклеточный антигенсвязывающий домен содержит V антитела, где V способна к димеризации с другим внеклеточным антигенсвязывающим доменом, содержащим V антитела, и образованию вариабельного фрагмента (Fv).
25. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-24, где данный рекомбинантный TCR связывается с опухолевым антигеном.
26. Рекомбинантный TCR по п. 25, где опухолевый антиген выбирают из группы, состоящей из CD19, MUC16, MUC1, CAlX, CEA, CD8, CD7, CD10, CD20, CD22, CD30, CLL1, CD33, CD34, CD38, CD41, CD44, CD49f, CD56, CD74, CD133, CD138, EGP-2, EGP-40, EpCAM, erb-B234, FBP, фетального ацетилхолинового рецептора, фолатного рецептора-a, GD2, GD3, HER-2, hTERT, IL-13R-a2, легкой цепи K, KDR, LeY, молекулы клеточной адгезии L1, MAGE-A1, мезотелина, ERBB2, MAGEA3, p53, MART1, GP100, протеиназы 3 (PR1), тирозиназы, сурвивина, hTERT, EphA2, лигандов NKG2D, NY-ES0-1, онкофетального антигена (h5T4), PSCA, PSMA, ROR1, TAG-72, VEGF-R2, WT-1, BCMA, CD123, CD44V6, NKCS1, EGF1R, EGFR-VIII и CD99, CD70, ADGRE2, CCR1, LILRB2, LILRB4, PRAME и ERBB.
27. Рекомбинантный TCR по п. 25 или 26, где опухолевый антиген представляет собой CD19.
28. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-27, где данный рекомбинантный TCR проявляет большую чувствительность к антигену, чем CAR, нацеленный на тот же антиген.
29. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-28, где данный рекомбинантный TCR способен вызывать иммунный ответ, когда связывается с антигеном, который имеет низкую плотность на поверхности опухолевой клетки.
30. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-28, где антиген, который имеет низкую плотность на клеточной поверхности, имеет плотность менее приблизительно 10000 молекул на клетку.
31. Иммунореактивная клетка, содержащая рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-30.
32. Иммунореактивная клетка по п. 31, где кассета экспрессии по меньшей мере одной антигенсвязывающей цепи рекомбинантного TCR помещена в локус эндогенного гена данной иммунореактивной клетки.
33. Иммунореактивная клетка по п. 32, где кассеты экспрессии двух антигенсвязывающих цепей рекомбинантного TCR помещены в локус эндогенного гена данной иммунореактивной клетки, где данные две антигенсвязывающие цепи способны к димеризации.
CD3δ
CD3ε
CD247
B2M
TRAC
TRBC
TRDC
TRGC
34. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 31-33, где локус эндогенного гена представляет собой локус , локус , локус , локус , локус , локус , локус  и/или локус .
TRAC
TRBC
35. Иммунореактивная клетка по п. 34, где локус эндогенного гена представляет собой локус  и/или локус .
36. Иммунореактивная клетка по п. 35, где помещение кассеты экспрессии рекомбинантного TCR нарушает или прекращает экспрессию эндогенного TCR, содержащего нативную α-цепь TCR и/или нативную β-цепь TCR, в иммунореактивной клетке, тем самым предотвращая или устраняя ошибочное спаривание между рекомбинантным TCR и нативной α-цепью TCR и/или нативной β-цепью TCR в иммунореактивной клетке.
37. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 32-36, где локус эндогенного гена содержит модифицированную область терминатора транскрипции.
38. Иммунореактивная клетка по п. 37, где модифицированная область терминатора транскрипции содержит геномный элемент, выбранный из группы, состоящей из терминатора транскрипции TK, терминатора транскрипции GCSF, терминатора транскрипции TCRA, терминатора транскрипции HBB, терминатора транскрипции бычьего гормона роста, терминатора транскрипции SV40 и элемента P2A.
39. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 32-38, где, когда один локус эндогенного Т-клеточного рецептора в клетке модифицирован для экспрессии по меньшей мере одной антигенсвязывающей цепи рекомбинантного TCR, один или более других локусов эндогенного Т-клеточного рецептора в клетке модифицированы для устранения экспрессии цепи эндогенного TCR.
40. Иммунореактивная клетка по п. 39, где один или более других локусов эндогенного Т-клеточного рецептора дополнительно модифицированы для экспрессии представляющего интерес гена.
41. Иммунореактивная клетка по п. 40, где представляющий интерес ген представляет собой противоопухолевый цитокин, лиганд костимулирующей молекулы, ген отслеживания или ген самоубийства.
42. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 31-41, где данную клетку выбирают из группы, состоящей из T-клетки, цитотоксического T-лимфоцита (CTL), регуляторной T-клетки, естественной киллерной T-клетки (NKT-клетки), человеческой эмбриональной стволовой клетки и плюрипотентной стволовой клетки, из которой могут дифференцироваться лимфоидные клетки.
43. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 31-42, где данная иммунореактивная клетка является аутологичной.
44. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 31-43, дополнительно содержащая по меньшей мере один экзогенный костимулирующий лиганд.
45. Иммунореактивная клетка по п. 44, где экзогенный костимулирующий лиганд выбирают из группы, состоящей из CD80, CD86, 41BBL, CD275, CD40L, OX40L и любой их комбинации.
46. Иммунореактивная клетка по п. 44 или 45, где данная клетка дополнительно содержит или включает в себя один экзогенный костимулирующий лиганд.
47. Иммунореактивная клетка по п. 46, где один экзогенный костимулирующий лиганд представляет собой CD80 или 4-1BBL.
48. Иммунореактивная клетка по п. 44 или 45, где данная клетка дополнительно содержит или включает в себя два экзогенных костимулирующих лиганда.
49. Иммунореактивная клетка по п. 48, где два экзогенных костимулирующих лиганда представляют собой CD80 и 4-1BBL.
50. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 31-49, дополнительно содержащая по меньшей мере один химерный костимулирующий рецептор (CCR).
51. Иммунореактивная клетка по п. 50, где CCR содержит костимулирующую молекулу, выбранную из группы, состоящей из полипептида CD28, полипептида 4-1BB, полипептида OX40, полипептида ICOS, полипептида DAP-10 и любой их комбинации.
52. Фармацевтическая композиция, содержащая эффективное количество иммунореактивной клетки по любому из пп. 31-47 и фармацевтически приемлемый эксципиент.
53. Фармацевтическая композиция по п. 52, которая предназначена для лечения новообразования.
54. Способ снижения опухолевой нагрузки у субъекта, где данный способ содержит введение субъекту эффективного количества иммунореактивных клеток по любому из пп. 31-51 или фармацевтической композиции по п. 52 или 53.
55. Способ лечения или предупреждения новообразования, где данный способ содержит введение субъекту эффективного количества иммунореактивных клеток по любому из пп. 31-51 или фармацевтической композиции по п. 52 или 53.
56. Способ по п. 55, где новообразование выбирают из группы, состоящей из рака крови, B-клеточного лейкоза, множественной миеломы, острого лимфобластного лейкоза (ALL), острого миелоидного лейкоза (AML), хронического лимфоцитарного лейкоза, неходжкинской лимфомы и аденокарцином.
57. Способ по п. 55 или 56, где новообразование представляет собой B-клеточный лейкоз, множественную миелому, острый лимфобластный лейкоз (ALL), хронический лимфоцитарный лейкоз или неходжкинскую лимфому, и рекомбинантный TCR связывается с CD19.
58. Способ по п. 55 или 56, где новообразование представляет собой B-клеточный лейкоз, множественную миелому, острый лимфобластный лейкоз (ALL), острый миелоидный лейкоз (AML), хронический лимфоцитарный лейкоз или неходжкинскую лимфому, и рекомбинантный TCR связывается с BCMA, ADGRE2, CCR1, CD22, CD70 или их комбинациями.
+
59. Способ по любому из пп. 55-58, где новообразование представляет собой CD19 ALL.
60. Способ получения антиген-специфической иммунореактивной клетки, где данный способ содержит введение в иммунореактивную клетку последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей рекомбинантный TCR по любому их пп. 1-30.
61. Способ по п. 60, где последовательность нуклеиновой кислоты содержится в векторе.
62. Способ по п. 60 или 61, где кассета экспрессии по меньшей мере одной антигенсвязывающей цепи рекомбинантного TCR помещена в локус эндогенного гена иммунореактивной клетки.
63. Способ по п. 62, где кассеты экспрессии двух антигенсвязывающих цепей рекомбинантного TCR помещены в локус эндогенного гена иммунореактивной клетки, где данные две антигенсвязывающие цепи способны к димеризации.
CD3δ
CD3ε
CD247
B2M
TRAC
TRBC
TRDC
TRGC
64. Способ по п. 62 или 63, где локус эндогенного гена представляет собой локус , локус , локус , локус , локус , локус , локус и/или локус .
TRAC
TRBC
65. Способ по п. 64, где локус эндогенного гена представляет собой локус  и/или локус .
66. Способ по любому из пп. 63-65, где помещение кассеты экспрессии рекомбинантного TCR нарушает или прекращает экспрессию эндогенного TCR, содержащего нативную α-цепь TCR и/или нативную β-цепь TCR, в иммунореактивной клетке, тем самым предотвращая или устраняя ошибочное спаривание между рекомбинантным TCR и нативной α-цепью TCR и/или нативной β-цепью TCR в иммунореактивной клетке.
67. Способ по любому из пп. 62-66, где локус эндогенного гена содержит модифицированную область терминатора транскрипции.
68. Способ по п. 67, где модифицированная область терминатора транскрипции содержит геномный элемент, выбранный из группы, состоящей из терминатора транскрипции TK, терминатора транскрипции GCSF, терминатора транскрипции TCRA, терминатора транскрипции HBB, терминатора транскрипции бычьего гормона роста, терминатора транскрипции SV40 и элемента P2A.
69. Способ по любому из пп. 62-68, где, когда один локус эндогенного Т-клеточного рецептора в клетке модифицирован для экспрессии по меньшей мере одной антигенсвязывающей цепи рекомбинантного TCR, один или более других локусов эндогенного Т-клеточного рецептора в клетке модифицированы для устранения экспрессии цепи эндогенного TCR.
70. Способ по п. 69, где один или более других локусов эндогенного Т-клеточного рецептора дополнительно модифицированы для экспрессии представляющего интерес гена.
71. Способ по п. 70, где представляющий интерес ген представляет собой противоопухолевый цитокин, лиганд костимулирующей молекулы, ген отслеживания или ген самоубийства.
72. Способ увеличения продолжительности жизни субъекта, имеющего новообразование, где данный способ содержит введение субъекту эффективного количества иммунореактивных клеток по любому из пп. 31-51 или фармацевтической композиции по п. 52 или 53.
73. Нуклеиновая кислота, кодирующая рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-30.
74. Композиция нуклеиновой кислоты, содержащая рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-30.
75. Композиция нуклеиновой кислоты по п. 74, где последовательности нуклеиновой кислоты содержатся в векторе.
76. Вектор, содержащий композицию нуклеиновой кислоты по п. 74 или 75.
77. Набор, содержащий рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-30, иммунореактивную клетку по любому из пп. 31-51, фармацевтическую композицию по п. 52 или 53, композицию нуклеиновой кислоты по п. 74 или 75 или вектор по п. 76.
78. Набор по п. 77, где данный набор дополнительно содержит письменные инструкции по лечению и/или предупреждению новообразования, патогенной инфекции, аутоиммунного нарушения или аллогенного трансплантата.
79. Рекомбинантный TCR по любому из пп. 1-30 для применения в терапии.
80. Фармацевтическая композиция по п. 51 или 52 для применения в терапии.
81. Иммунореактивная клетка по любому из пп. 31-51 для применения в терапии.
82. Применение иммунореактивных клеток по любому из пп. 31-51 или фармацевтической композиции по п. 52 или 53 для снижения опухолевой нагрузки у субъекта.
83. Применение иммунореактивных клеток по любому из пп. 31-51 или фармацевтической композиции по п. 52 или 53 для лечения или предупреждения новообразования.
84. Применение иммунореактивных клеток по любому из пп. 31-51 или фармацевтической композиции по п. 52 или 53 для увеличения продолжительности жизни субъекта, имеющего новообразование (например, рак).