СПОСОБ СКРИНИНГА НОВОРОЖДЕННЫХ НА МОНОГЕННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ И БИОЧИП ДЛЯ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ ЭТОГО СПОСОБА

1. Способ скрининга новорожденных на моногенные заболевания и биочип для осуществления этого способа включающий: (а) выделение геномной ДНК из клинического образца и амплификацию гена и получение одноцепочечного флюоресцентно меченого продукта; (б) приготовление биочипа с иммобилизованными нуклеотидами; (в) гибридизацию амплифицированного меченого продукта на биочипе; (г) регистрацию и (д) интерпретацию результатов гибридизации путем сравнения интенсивности флюоресцентных сигналов, полученных при совершенной и несовершенной гибридизации, отличающийся тем, что
на стадии (а) используют амплификацию РАН, CFTR, PAX8, GALT генов и получение одноцепочечного флюоресцентно меченого продукта методом ник-трансляции и рестрикции;
на стадии (б) приготавливают биочип для скрининга новорожденных, содержащий набор иммобилизованных олигонуклеотидов SEQ ID 1-82;
на стадии (в) осуществляют гибридизацию меченого амплифицированного продукта на указанном биочипе;
на стадии (г) регистрацию результатов проводят на длине волны 635 нм и 532 нм для красителей Су5 и Су3 соответственно;
на стадии (д) интерпретацию результатов гибридизации осуществляют путем сравнения интенсивности флюоресцентных сигналов, полученных при совершенной и несовершенной гибридизации: если в ячейке первого ряда такого участка интенсивность сигнала выше, чем в остальных рядах, и выше порогового уровня определяемого отрицательным контролем, образец относят к дикому типу по данному нуклеотиду (не имеющему мутации в данном положении); если интенсивность сигнала в ячейке 2-го, 3-го или 4-го ряда отдельно или попарно (например, ячейки 2-го и 3-го ряда) выше, чем в остальных рядах, и выше порогового уровня определяемого отрицательным контролем, образец относят к мутантному типу по данному нуклеотиду; если интенсивность сигнала в ячейке первого ряда и одной из ячеек 2-го, 3-го или 4-го ряда выше, чем в остальных ячейках участка, и выше порогового уровня определяемого отрицательным контролем, то образец относят к гетерозиготному типу.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что клинический образец включает пуповинную кровь новорожденного.
3. Способ по п.1, отличающийся тем, что на стадии (а) применяется рестриктаза DPN2.
4. Способ по п.1, отличающийся тем, что размер амплифицированного одноцепочечного флюоресцентно меченого фрагмента составляет около 60 п.о.
5. Биочип для скрининга новорожденных, содержащий набор иммобилизованных олигонуклеотидов SEQ ID 1-82 и 10 неспецифичных олигонуклеотидов в качестве контроля, применение которого позволяет детектировать точечные мутации и делеции в генах РАН, CFTR, PAX8, GALT с высокой специфичностью, а порядок размещения олигонуклеотидов обеспечивает возможность наиболее достоверно оценить наличие или отсутствие мутации и ее точную локализацию.
6. Биочип по п.5, отличающийся тем, что биочип содержит набор олигонуклеотидов SEQ ID 1-82 и 10 неспецифичных олигонуклеотидов в качестве контроля, а также олигонуклеотиды комплементарные олигонуклеотидам SEQ ID 1-82.
7. Биочип по п.5, отличающийся тем, что он содержит от 1 до 4 копий набора олигонуклеотидов SEQ ID 1-82.