ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ

1. Способ определения чувствительности роста опухолевых клеток к ингибированию с помощью ингибитора киназы EGFR, включающий определение статуса метилирования гена ERBB2 в опухолевой клетке образца, причем пониженный уровень метилирования гена ERBB2 указывает на то, что рост опухолевых клеток чувствителен к ингибированию с помощью ингибитора EGFR.
2. Способ выявления больного злокачественной опухолью, на которого может оказать благоприятный эффект лечение с помощью ингибитора EFGR, включающий определение статуса метилирования гена ERBB2 из образца злокачественной опухоли больного, причем больного выявляют как такого, на которого может оказать благоприятный эффект лечения с помощью ингибитора EGFR, если статус метилирования гена ERBB2 определяют как пониженный уровень метилирования.
3. Способ по п. 1 или п. 2, где статус метилирования определяют у части гена ERBB2.
4. Способ по п. 3, где часть гена ERBB2 представляет собой энхансер.
5. Способ по п. 3, где часть гена ERBB2 представляет собой энхансер и промотор.
6. Способ по п. 3, где часть гена ERBB2 включает участок с 6-ю повторами CpG.
7. Способ по п. 3, где часть гена ERBB2 включает последовательность нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 1.
8. Способ по п. 6, где часть гена ERBB2 состоит из последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 2.
9. Способ по п. 1 или 2, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 50% метилирование гена ERBB2.
10. Способ по п. 9, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 20% метилирование гена ERBB2.
11. Способ по п. 3, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 50% метилирование части гена ERBB2.
12. Способ по п. 11, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 20% метилирование части гена ERBB2.
13. Способ по п. 2, дополнительно включающий введение больному терапевтически эффективного количества ингибитора EGFR, если больного выявляют как такого, на которого сможет оказать благоприятный эффект лечение с помощью ингибитора EGFR.
14. Способ лечения злокачественной опухоли у больного, включающий введение терапевтически эффективного количества ингибитора EGFR больному, причем больному до введения ингибитора EGFR был поставлен диагноз злокачественной опухоли, которая характеризуется пониженным уровнем метилирования гена ERBB2, и причем пониженный уровень метилирования гена ERBB2 указывает на терапевтическую восприимчивость объектом ингибитора EGFR.
15. Способ выбора терапии для больного со злокачественной опухолью, включающий
a. определение статуса метилирования гена ERBB2 из образца злокачественной опухоли больного и
b. выбор ингибитора EGFR для терапии при определении гена ERBB2 как имеющего пониженный уровень метилирования.
16. Способ по п. 15, дополнительно включающий введение больному терапевтически эффективного количества ингибитора EGFR.
17. Способ по п. 15 или 16, где ингибитором EGFR является эрлотиниб, цетуксимаб или панитумумаб.
18. Способ определения сверхэкспрессии гена ERBB2 в клетке, включающий определение статуса метилирования гена ERBB2 в клетке, причем пониженный уровень метилирования гена ERBB2 указывает на сверхэкспрессию ERBB2 в клетке.
19. Способ по п. 18, где статус метилирования определяют у части гена ERBB2.
20. Способ по п. 19, где часть гена ERBB2 представляет собой энхансер.
21. Способ по п. 19, где часть гена ERBB2 представляет собой энхансер и промотор.
22. Способ по любому из пп. 18-21, где часть гена ERBB2 включает участок с 6-ю повторами CpG.
23. Способ по любому из пп. 18-21, где часть гена ERBB2 включает последовательность нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 1.
24. Способ по п. 22, где часть гена ERBB2 содержит последовательность нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 2.
25. Способ по п. 18, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 50% метилирование гена ERBB2.
26. Способ по п. 25, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 20% метилирование гена ERBB2.
27. Способ по любому из пп. 19-21, 24, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 50% метилирование части гена ERBB2.
28. Способ по п. 27, где на пониженный уровень метилирования указывает менее чем приблизительно 20% метилирование части гена ERBB2.
29. Способ лечения злокачественной опухоли у больного, включающий введение терапевтически эффективного количества ингибитора HER2 больному, причем больному до введения ингибитора HER2 поставили диагноз злокачественной опухоли, которая характеризуется пониженным уровнем метилирования гена ERBB2, и причем пониженный уровень метилирования гена ERBB2 указывает на терапевтическую восприимчивость объектом ингибитора HER2.
30. Способ выбора терапии для больного со злокачественной опухолью, включающий
a. определение статуса метилирования гена ERBB2 из образца злокачественной опухоли больного и
b. выбор ингибитора HER2 для терапии при определении гена ERBB2 как имеющего пониженный уровень метилирования.
31. Способ по п. 30, дополнительно включающий введение больному терапевтически эффективного количества ингибитора HER2.
32. Способ по п. 31, где ингибитором HER2 является трастузумаб или трастузумаб-DM1.
33. Способ по п. 30, где статус метилирования определяют с помощью пиросеквенирования.
34. Способ по п. 30, где ген ERBB2 получают из зафиксированной в формалине и залитой парафином (FFPE) ткани или из свежезамороженной ткани.
35. Способ по п. 34, где выделенный из образца ткани ген ERBB2 перед пиросеквенированием предварительно амплифицируют.
36. Способ по п. 1, где опухолевая клетка представляет собой клетку опухоли NSCLC.
37. Способ по любому из пп. 2, 14 или 15, где злокачественная опухоль представляет собой NSCLC.