ПРОТЕОМНЫЕ МАРКЕРЫ ИЛФ

1. Способ определения уровня экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, у субъекта, который имеет фиброзное заболевание легких или подвержен риску его развития, отличающийся тем, что указанный способ включает:
(i) получение биологического образца от указанного субъекта; и
(ii) определение уровня экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, в указанном биологическом образце.
2. Способ по п. 1, дополнительно включающий отбор субъекта, который имеет фиброзное заболевание легких или подвержен риску его развития.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанное фиброзное заболевание легких представляет собой идиопатический легочный фиброз или семейную интерстициальную пневмонию.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанный маркерный белок фиброзного заболевания легких представляет собой маркерный белок прогрессирующего фиброзного заболевания легких.
5. Способ по п. 4, отличающийся тем, что указанный субъект имеет прогрессирующее фиброзное заболевание легких или подвержен риску его развития.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что указанное прогрессирующее фиброзное заболевание легких представляет собой прогрессирующий идиопатический легочный фиброз.
7. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанный биологический образец представляет собой биологический образец от указанного субъекта, полученный из крови.
8. Способ по п. 7, отличающийся тем, что указанный биологический образец, полученный из крови, представляет собой цельную кровь, сыворотку или плазму.
9. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанный биологический образец представляет собой мочу, слюну, легочную ткань, образец бронхоальвеолярного лаважа или конденсат выдыхаемого воздуха.
10. Способ по п. 1, отличающийся тем, что определяется уровень экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А.
11. Способ по п. 10, дополнительно включающий введение указанному субъекту эффективного количества модулятора указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А..
12. Способ по п. 11, отличающийся тем, что указанный модулятор является антагонистом.
13. Способ по п. 12, отличающийся тем, что указанный антагонист представляет собой пептид, малую молекулу, нуклеиновую кислоту, антитело или аптамер.
14. Способ по п. 12, отличающийся тем, что указанный уровень экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А, является повышенным по сравнению со стандартным контролем.
15. Способ по п. 1, отличающийся тем, что определяется уровень экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2B.
16. Способ по п. 15, дополнительно включающий введение указанному субъекту эффективного количества модулятора указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2B.
17. Способ по п. 16, отличающийся тем, что указанный модулятор является агонистом.
18. Способ по п. 16, отличающийся тем, что указанный агонист представляет собой пептид, малую молекулу, нуклеиновую кислоту, антитело или аптамер.
19. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный уровень экспрессии указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2B, является пониженным по сравнению со стандартным контролем.
20. Способ по п. 11 или 16, дополнительно включающий введение указанному субъекту эффективного количества дополнительного терапевтического агента.
21. Способ по п. 20, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент представляет собой препарат для лечения идиопатического легочного фиброза.
22. Способ по п. 20, отличающийся тем, что указанный препарат для лечения идиопатического легочного фиброза представляет собой муколитический препарат.
23. Способ определения наличия у субъекта фиброзного заболевания легких или риска его развития; при этом указанный способ включает:
(i) определение у субъекта уровня экспрессии одного или более маркерных белков фиброзного заболевания легких, приведенных в Таблице 2А или Таблице 2B;
(ii) определение повышения или снижения указанного уровня экспрессии по сравнению со стандартным контролем, причем повышенный уровень экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких в Таблице 2А или сниженный уровень экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких в Таблице 2B по сравнению с указанным стандартным контролем свидетельствуют о том, что у указанного субъекта есть фиброзное заболевание легких или риск его развития; и
(iii) по меньшей мере частично, на основании указанного уровня экспрессии в этапе (ii), определение наличия у указанного субъекта фиброзного заболевания легких или риска его развития.
24. Способ по п. 23, дополнительно включающий отбор субъекта, имеющего фиброзное заболевание легких или подверженного риску его развития.
25. Способ по п. 23, отличающийся тем, что указанное фиброзное заболевание легких представляет собой идиопатический легочный фиброз или семейную интерстициальную пневмонию.
26. Способ по п. 23, отличающийся тем, что указанный один или более маркерных белков фиброзного заболевания легких представляет собой маркерный белок прогрессирующего фиброзного заболевания легких.
27. Способ по п. 26, отличающийся тем, что указанный субъект имеет прогрессирующее фиброзное заболевание легких или подвержен риску его развития.
28. Способ по п. 27, отличающийся тем, что указанное прогрессирующее фиброзное заболевание легких представляет собой прогрессирующий идиопатический легочный фиброз.
29. Способ по п. 23, отличающийся тем, что указанный уровень экспрессии одного или более маркерных белков фиброзного заболевания легких, приведенных в Таблице 2А или Таблице 2B, обнаруживается в биологическом образце от указанного субъекта.
30. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанный биологический образец представляет собой биологический образец от указанного субъекта, полученный из крови.
31. Способ по п. 30, отличающийся тем, что указанный биологический образец, полученный из крови, представляет собой цельную кровь, сыворотку или плазму.
32. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанный биологический образец представляет собой мочу, слюну, легочную ткань, образец бронхоальвеолярного лаважа или конденсат выдыхаемого воздуха.
33. Способ по п. 23, дополнительно включающий введение указанному субъекту эффективного количества модулятора указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А.
34. Способ по п. 33, отличающийся тем, что указанный модулятор является антагонистом.
35. Способ по п. 34, отличающийся тем, что указанный антагонист представляет собой пептид, малую молекулу, нуклеиновую кислоту, антитело или аптамер.
36. Способ по п. 23, дополнительно включающий введение указанному субъекту эффективного количества модулятора указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2B.
37. Способ по п. 36, отличающийся тем, что указанный модулятор является агонистом.
38. Способ по п. 37, отличающийся тем, что указанный агонист представляет собой пептид, малую молекулу, нуклеиновую кислоту, антитело или аптамер.
39. Способ по любому из пп. 33 или 36, дополнительно включающийвведение указанному субъекту эффективного количества дополнительного терапевтического агента.
40. Способ по п. 39, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент представляет собой препарат для лечения идиопатического легочного фиброза.
41. Способ по п. 40, отличающийся тем, что указанный препарат для лечения идиопатического легочного фиброза представляет собой муколитический препарат.
42. Способ определения того, подвергается ли пациент с фиброзным заболеванием легких риску прогрессирования фиброзного заболевания легких; при этом указанный способ включает:
(i) определение у указанного пациента в первой точке времени первого уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B;
(ii) определение у указанного пациента во второй точке времени второго уровня экспрессии белка, указанного в Таблице 2А или Таблице 2B;
(iii) сравнение указанного второго уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, с указанным первым уровнем экспрессии белка, приведенным в Таблице 2А или Таблице 2B,
причем когда указанный второй уровень экспрессии белка, приведенный в Таблице 2А, выше, чем указанный первый уровень белка, приведенный в Таблице 2А,
или когда указанный второй уровень экспрессии белка, приведенный в Таблице 2B, ниже, чем указанный первый уровень белка, приведенный в Таблице 2B, пациент подвержен риску прогрессирования фиброзного заболевания легких.
43. Способ по п. 42, дополнительно включающий назначение лечения по поводу фиброзного заболевания легких после указанного определения на этапе (i).
44. Способ по п. 42, дополнительно включающий прогнозирование скорости прогрессирования указанного фиброзного заболевания легких у указанного пациента на основании указанного сравнения.
45. Способ по п. 42, отличающийся тем, что указанное определение указанного первого уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, и определение указанного второго уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, включает нормализацию указанного первого уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, и указанного второго уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, к белку, экспрессированному из стандартного гена в организме указанного пациента.
46. Способ по п. 45, отличающийся тем, что указанный стандартный ген представляет собой GAPDH или бета-актин.
47. Способ по п. 46, отличающийся тем, что указанный первый уровень экспрессии обнаруживается в первом биологическом образце указанного субъекта и указанный второй уровень экспрессии обнаруживается во втором биологическом образце указанного субъекта.
48. Способ по п. 47, отличающийся тем, что указанный первый биологический образец представляет собой первый образец жидкости организма и указанный второй биологический образец представляет собой второй образец жидкости организма.
49. Способ определения активности фиброзного заболевания легких у пациента; при этом указанный способ включает:
(i) определение у указанного пациента в первой точке времени первого уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B;
(ii) определение у указанного пациента во второй точке времени второго уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B;
(iii) сравнение указанного второго уровня экспрессии белка, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, с указанным первым уровнем экспрессии белка, приведенным в Таблице 2А или Таблице 2B, определяя тем самым активность указанного фиброзного заболевания легких у указанного пациента.
50. Способ по п. 49, дополнительно включающий назначение лечения фиброзного заболевания легких после указанного определения на этапе (i).
51. Способ лечения фиброзного заболевания легких у субъекта, имеющего для этого показания; при этом указанный способ включает введение указанному субъекту эффективного количества модулятора маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А или Таблице 2B, тем самым проводя лечение фиброзного заболевания легких у указанного субъекта.
52. Способ по п. 51, включающий введение указанному субъекту эффективного количества модулятора указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А.
53. Способ по п. 52, отличающийся тем, что указанный модулятор является антагонистом.
54. Способ по п. 53, отличающийся тем, что указанный антагонист представляет собой пептид, малую молекулу, нуклеиновую кислоту, антитело или аптамер.
55. Способ по п. 51, включающий введение указанному субъекту эффективного количества модулятора указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2B.
56. Способ по п. 55, отличающийся тем, что указанный модулятор является агонистом.
57. Способ по п. 56, отличающийся тем, что указанный агонист представляет собой пептид, малую молекулу, нуклеиновую кислоту, антитело или аптамер.
58. Способ лечения фиброзного заболевания легких у пациента, имеющего для этого показания; при этом указанный способ включает:
(i) определение того, экспрессирует ли субъект повышенный уровень маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А, или пониженный уровень маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2B, по сравнению со стандартным контролем; и
(ii) при обнаружении повышенного уровня экспрессии указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких из Таблицы 2А или пониженного уровня экспрессии указанного маркерного белка фиброзного заболевания легких из Таблицы 2B по сравнению с указанным стандартным контролем, назначение указанному субъекту лечения фиброзного заболевания легких с применением антагониста маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2А, или агониста маркерного белка фиброзного заболевания легких, приведенного в Таблице 2B, тем самым проводя лечение указанному субъекту.
59. Способ по п. 58, отличающийся тем, что указанное лечение фиброзного заболевания легких предусматривает назначение муколитического препарата.
60. Способ определения того, подвергается ли пациент с фиброзным заболеванием легких риску прогрессирования фиброзного заболевания легких; при этом указанный способ включает:
(i) определение у пациента уровня экспрессии одного или более маркерных белков фиброзного заболевания легких, приведенных в Таблице 2А или 2B;
(ii) определение того, модулирован ли указанный уровень экспрессии по сравнению со стандартным контролем,
причем модулированный уровень экспрессии маркерного белка фиброзного заболевания легких в Таблице 2А или 2B по сравнению с указанным стандартным контролем свидетельствует о том, что указанный пациент с фиброзным заболеванием легких подвержен риску прогрессирования указанного фиброзного заболевания легких; и (iii) по меньшей мере частично, на основании указанного уровня экспрессии в этапе (ii), определение того, подвержен ли указанный пациент с фиброзным заболеванием легких риску прогрессирования указанного фиброзного заболевания легких.
61. Способ по п. 60, отличающийся тем, что указанное определение того, является ли уровень экспрессии модулированным по сравнению со стандартным контролем, предусматривает определение, является ли уровень экспрессии повышенным или пониженным по сравнению с другими пациентами, имеющими фиброзное заболевание легких.