CXCL8-СВЯЗЫВАЕЮЩИЕ НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ

1. Молекула L-нуклеиновой кислоты, способная связываться с человеческим CXCL8, где молекула L-нуклеиновой кислоты содержит центральный нуклеотидный фрагмент, где центральный нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность:
U
U
5’-GGAAGUACGUGGAAAGCCRA(X)RAGUGUGUCCCG-3’ [SEQ ID. NO: 27], где X представляет собой U или отсутствует.
2. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 1, где центральный нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность, выбранную из группы:
d) 5’ GGAAGUACGUGGAAAGCCAAUGAGUGUGUCCCG 3’ [SEQ. ID. NO: 28],
e) 5’ GGAAGUACGUGGAAAGCCGAUGAGUGUGUCCCG 3’ [SEQ. ID. NO: 29] и
f) 5’ GGAAGUACGUGGAAAGCCGAAAGUGUGUCCCG 3’ [SEQ. ID. NO: 30].
3. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 2, где центральный нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность:
5’ GGAAGUACGUGGAAAGCCGAAAGUGUGUCCCG 3’ [SEQ. ID. NO: 30] или 5’ GGAAGUACGUGGAAAGCCAAUGAGUGUGUCCCG 3’ [SEQ. ID. NO: 28], а предпочтительно, 5’ GGAAGUACGUGGAAAGCCGAAAGUGUGUCCCG 3’ [SEQ. ID. NO: 30].
4. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-3, где молекула L-нуклеиновой кислоты содержит в направлении 5'→3' первый концевой нуклеотидный фрагмент, центральный нуклеотидный фрагмент и второй концевой нуклеотидный фрагмент, где:
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит от трех до шести нуклеотидов и
второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит от трех до шести нуклеотидов,
где предпочтительно:
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит от пяти до шести нуклеотидов и
второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит от пяти до шести нуклеотидов,
где более предпочтительно
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит пять нуклеотидов, и
второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит пять нуклеотидов.
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
5. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 4, где первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-ZZZZZC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5’-GZZZZZ-3’, где
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
Z представляет собой G или отсутствует, Z представляет собой S или отсутствует; Z представляет собой K или отсутствует, Z представляет собой S;, Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M или отсутствует; Z представляет собой S или отсутствует, а Z представляет собой C или отсутствует;
где предпочтительно
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
gg) Z представляет собой G; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S, и Z представляет собой C; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
hh) Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S, а Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
ii) Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z отсутствует, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
jj) Z отсутствует; Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z отсутствует; Z отсутствует, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
kk) Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S, а Z представляет собой C; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
ll) Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S, и Z представляет собой C; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
mm) Z отсутствует; Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S, и Z представляет собой C; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
nn) Z представляет собой G; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
oo) Z представляет собой G; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z отсутствует, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
pp) Z представляет собой G; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z отсутствует; Z отсутствует, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
qq) Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z отсутствует, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
rr) Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z отсутствует; Z отсутствует, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
ss) Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S; и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
tt) Z отсутствует; Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z представляет собой S, и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
uu) Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой K; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z отсутствует; Z отсутствует; и Z отсутствует; или
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
vv) Z отсутствует; Z отсутствует; Z отсутствует; Z представляет собой S; Z представляет собой D; Z представляет собой H; Z представляет собой S; Z представляет собой M; Z отсутствует, и Z отсутствует.
6. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 4-5, где:
а) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-CUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAG-3';
b) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GCUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAGC-3'; или
c) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GCUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUGAGC-3';
d) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAC-3';
е) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность из 5'-UGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCA-3';
f) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCC-3';
g) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GCAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUGC-3';
h) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GGUC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GACC-3';
i) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-UGGC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GCCA-3';
j) первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUC-3';
где предпочтительно:
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-CUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAG-3'; или
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GCUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAGC-3' или
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAC-3';
где более предпочтительно:
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-CUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAG-3', или
первый концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUGAC-3', а второй концевой нуклеотидный фрагмент содержит нуклеотидную последовательность 5'-GUCAC-3'.
7. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-6, где молекула L-нуклеиновой кислоты содержит от 40 до 45 нуклеотидов, предпочтительно от 42 до 45 нуклеотидов, а более предпочтительно 42 нуклеотида.
8. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-7, где молекула L-нуклеиновой кислоты состоит из рибонуклеотидов.
9. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-8, где молекула L-нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, выбранную из группы SEQ ID NO: 14-26 и 39-44, или молекула L-нуклеиновой кислоты содержит молекулу L-нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере на 75% идентична молекуле L-нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, выбранную из группы SEQ  NO: 14-26 и 39-44, или молекула L-нуклеиновой кислоты содержит молекулу L-нуклеиновой кислоты, которая гомологична молекуле L-нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, выбранную из группы SEQ. ID NO: 14-26 и 39-44, где такая гомология составляет по меньшей мере 75%.
10. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 9, где молекула L-нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, выбранную из группы SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 20 и SEQ ID NO: 41-44, или молекула L-нуклеиновой кислоты содержит молекулу L-нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере на 75% идентична молекуле L-нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, выбранную из группы SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 20 и SEQ ID NO: 41-44, или молекула L-нуклеиновой кислоты содержит молекулу L-нуклеиновой кислоты, которая гомологична молекуле L-нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, выбранную из группы SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 20 и SEQ 41-44%, где гомология составляет по меньшей мере 75%.
11. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-10, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает способностью связываться с CXCL8, где предпочтительно CXCL8 представляет собой человеческий CXCL8, обезьяний CXCL8, кроличий CXCL8, свиной CXCL8, собачий CXCL8, овечий CXCL8 или CXCL8 морской свинки.
12. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-11, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает способностью специфически связываться с CXCL8, предпочтительно с человеческим CXCL8, обезьяньим CXCL8, кроличьим CXCL8, свиным CXCL8, собачьим CXCL8, овечьим CXCL8 или CXCL8 морской свинки, а более предпочтительно с человеческим CXCL8.
13. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-12, где молекула L-нуклеиновой кислоты не связывается или не обладает способностью связываться с ELR-позитивными хемокинами CXC, отличающимися от CXCL8, где ELR-позитивные хемокины CXC, отличающиеся от CXCL8, предпочтительно выбраны из группы, состоящей из CXCL1, CXCL2, CXCL3, CXCL5, CXCL6 и CXCL7.
14. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 13, где молекула L-нуклеиновой кислоты не связывается или не обладает способностью связываться с ELR-позитивными человеческими хемокинами CXC, отличающимися от человеческого CXCL8, где ELR-позитивные человеческие хемокины CXC, отличающиеся от человеческого CXCL8, предпочтительно выбраны из группы, состоящей из человеческого CXCL1, человеческого CXCL2, человеческого CXCL3, человеческого CXCL5, человеческого CXCL6 и человеческого CXCL7.
15. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-14, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с человеческим CXCL8, выраженной как KD и составляющей 10 нМ или менее, предпочтительно 1 нМ или менее, более предпочтительно 100 пМ или менее, а наиболее предпочтительно 30 пМ или менее.
50
16. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-15, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с человеческим CXCL8, выраженной как IC и составляющей 10 нМ или менее, предпочтительно 1 нМ или менее, более предпочтительно 100 пМ или менее, а наиболее предпочтительно 30 пМ или менее.
17. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-16, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с ELR-позитивными хемокинами CXC, отличающимися от CXCL8, выраженной как KD и составляющей 100 нМ или более, предпочтительно 500 нМ или более, а более предпочтительно 1000 нМ или более.
50
18. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-17, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с ELR-позитивными хемокинами CXC, отличающимися от CXCL8, выраженной как IC и составляющей 100 нМ или более, предпочтительно 500 нМ или более, а более предпочтительно 1000 нМ или более.
19. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-18, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с человеческим CXCL8, выраженной как KD и составлющей 10 нМ или менее, предпочтительно 1 нМ или менее, более предпочтительно 100 пМ или менее, а наиболее предпочтительно 30 пМ или менее, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с ELR-позитивными хемокинами CXC, отличающимися от CXCL8, выраженной как KD и составлющей 100 нМ или более, предпочтительно 500 нМ или более, а более предпочтительно 1000 нМ или более, и/или
50
50
молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с человеческим CXCL8, выраженной как IC и составлющей 10 нМ или менее, предпочтительно 1 нМ или менее, более предпочтительно 100 пМ или менее, а наиболее предпочтительно 30 пМ или менее, где молекула L-нуклеиновой кислоты обладает аффинностью связывания с ELR-позитивными хемокинами CXC, отличающимися от CXCL8, выраженной как IC и составлющей 100 нМ или более, предпочтительно 500 нМ или более, и более предпочтительно 1000 нМ или более.
20. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 15-19, где аффинность связывания определяют при комнатной температуре, а предпочтительно при 25°С.
21. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 15-19, где аффинность связывания определяют при 37°C.
22. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-21, где молекула L-нуклеиновой кислоты является антагонистом активности, опосредуемой CXCL8, а предпочтительно человеческим CXCL8, обезьяньим CXCL8, кроличьим CXCL8, свиным CXCL8, собачьим CXCL8, овечьим CXCL8 или CXCL8 морской свинки, а более предпочтительно человеческим CXCL8.
23. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 22, где молекула L-нуклеиновой кислоты не является антагонистом ELR-позитивных человеческих хемокинов CXC, отличающихся от человеческого CXCL8, или не способна подавлять активность, опосредуемую ELR-позитивными хемокинами CXC, отличающимися от CXCL8, где ELR-позитивные хемокины CXC, отличающиеся от CXCL8, предпочтительно выбраны из группы, состоящей из CXCL1, CXCL2, CXCL3, CXCL5, CXCL6 и CXCL7.
24. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 23, где молекула L-нуклеиновой кислоты не является антагонистом ELR-позитивных человеческих хемокинов CXC, отличающихся от человеческого CXCL8, или не способна подавлять активность, опосредуемую ELR-позитивными хемокинами CXC, отличающимися от CXCL8, где ELR-позитивные человеческие хемокины CXC, отличающиеся от человеческого CXCL8, предпочтительно выбраны из группы, состоящей из человеческого CXCL1, человеческого CXCL2, человеческого CXCL3, человеческого CXCL5, человеческого CXCL6 и человеческого СXCL7.
50
25. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 22-24, где антагонистическая активность молекулы L-нуклеиновой кислоты по отношению к активности, опосредуемой человеческими CXCR1 и/или CXCR2, и выраженной как IC, составляет 10 нМ или менее, предпочтительно 1 нМ или менее, более предпочтительно 100 пМ или менее, а наиболее предпочтительно 30 пМ или менее.
26. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 22-25, где антагонистическую активность молекулы L-нуклеиновой кислоты по отношению к активности, опосредуемой человеческим CXCL8, определяют при 37°C.
27. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-26, где молекула L-нуклеиновой кислоты содержит модифицирующую группу.
28. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 27, где модифицирующая группа присоединена к 5'-концевому нуклеотиду и/или 3'-концевому нуклеотиду молекулы L-нуклеиновой кислоты и/или к нуклеотиду молекулы L-нуклеиновой кислоты между 5'-концевым нуклеотидом молекулы L-нуклеиновой кислоты и 3'-концевым нуклеотидом молекулы L-нуклеиновой кислоты.
29. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 27 и 28, где модифицирующая группа присоединена к молекуле L-нуклеиновой кислоты посредством линкера.
30. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 29, где линкер представляет собой гидрофильный линкер, где гидрофильный линкер предпочтительно содержит одно или более звеньев этиленгликоля, а более предпочтительно, гидрофильный линкер содержит триэтиленгликоль, гексаэтиленгликоль или полиэтиленгликоль.
31. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 29, где линкер представляет собой биоразлагаемый линкер.
32. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 27-31, где скорость экскреции молекулы L-нуклеиновой кислоты, содержащей модифицирующую группу, из организма, снижается по сравнению со скоростью экскреции L-нуклеиновой кислоты, не содержащей модифицирующую группу.
33. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 27-31, где молекула L-нуклеиновой кислоты, содержащая модифицирующую группу, имеет более продолжительное время удерживания в организме по сравнению с временем удерживания в организме молекулы L-нуклеиновой кислоты, не содержащей модифицирующую группу.
34. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 32, 33, где организм представляет собой организм человека или животного, а предпочтительно организм человека.
35. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 27 и 34, где модифицирующая группа выбрана из группы, включающей биоразлагаемую модификацию и не-биоразлагаемую модификацию, и где модифицирующая группа предпочтительно выбрана из группы, включающей полиэтиленгликоль, полиэтиленгликоль с прямой цепью, разветвленный полиэтиленгликоль, гидроксиэтилированный крахмал, пептид, белок, полисахарид, стирол, полиоксипропилен, полиоксиамидат и поли(2-гидроксиэтил)-L-глутамин.
36. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 35, где модифицирующая группа представляет собой полиэтиленгликоль, предпочтительно полиэтиленгликоль с прямой цепью, или разветвленный полиэтиленгликоль, где молекулярная масса полиэтиленгликоля предпочтительно составляет приблизительно от 20000 до приблизительно 120000 Да, более предпочтительно, приблизительно от 30000 до приблизительно 80000 Да, а наиболее предпочтительно, приблизительно 40000 Да.
37. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 36, где молекулярная масса полиэтиленгликоля составляет приблизительно от 20000 до приблизительно 120000 Да, предпочтительно приблизительно от 30000 до приблизительно 80000 Да, а наиболее предпочтительно, приблизительно 40000 Да.
38. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 35, где модифицирующая группа представляет собой гидроксиэтилированный крахмал, где молекулярная масса гидроксиэтилированного крахмала предпочтительно составляет приблизительно от 50 до приблизительно 1000 кДа, более предпочтительно, приблизительно от 100 до приблизительно 700 кДа, а наиболее предпочтительно, от 200 до 500 кДа.
39. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 27-31, где модифицирующая группа предназначена для иммобилизации молекулы L-нуклеиновой кислоты.
40. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 39, где иммобилизация включает ковалентное связывание молекулы L-нуклеиновой кислоты с поверхностью, где предпочтительной поверхностью является поверхность реакционного сосуда, поверхность устройства в реакционном сосуде или поверхность биосенсора.
41. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 39, где иммобилизация включает нековалентное связывание молекулы L-нуклеиновой кислоты с поверхностью, где предпочтительной поверхностью является поверхность реакционного сосуда, поверхность устройства в реакционном сосуде или поверхность биосенсора.
42. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 39-41, где модифицирующая группа выбрана из группы, включающей карбоксил, гидроксил, фосфатидил, сложный эфир сульфоновой кислоты, амин, тиол, эпоксид, алкин, стерический циклоалкин, малеимид, азид, гидразид, где стерический циклоалкин предпочтительно выбран из группы, включающей дибензоциклооктил (DBCO), бицикло[6.1.0]нон-4-ин (BCN) и азадибензоциклооктин (ADIBO).
43. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 42, где модифицирующая группа представляет собой стерический циклоалкин, а предпочтительно дибензоциклооктил (DBCO).
44. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 41, где модифицирующая группа представляет собой биотин, бромдезоксиуридин, дигоксигенин или олигонуклеотид, а предпочтительно модифицирующая группа представляет собой биотин.
45. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 27-31, где модифицирующая группа позволяет детектировать молекулу L-нуклеиновой кислоты, а предпочтительно, модифицирующая группа представляет собой метку.
46. Молекула L-нуклеиновой кислоты по п. 45, где метка выбрана из группы, включающей биотин, бромдезоксиуридин, дигоксигенин, олигонуклеотид, флуоресцентную метку, электрохемилюминесцентную метку, радиоактивную метку, ферментную метку, УФ-метку, коллоидное золото, наночастицу и метку в виде молекулы, образующей хелатный комплекс.
47. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-46 для применения в способе лечения и/или профилактики заболевания.
48. Молекула L-нуклеиновой кислоты для применения по п. 47, где заболевание ассоциировано с CXCL8-опосредуемым патогенным механизмом и/или выбрано из группы, включающей воспалительное заболевание и рак, где воспалительное заболевание предпочтительно представляет собой воспалительное заболевание дыхательных путей, воспалительное заболевание кожи, аутоиммунное заболевание, воспалительное нервное заболевание, ишемическое заболевание, атеросклероз, отторжение трансплантата панкреатических островков, отторжение трансплантата органов, замедленную функцию органов, повреждение спинного мозга или цистит.
49. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-47 для применения в способе детектирования CXCL8.
50. Молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-47 для получения детектирующего средства или биосенсора.
51. Фармацевтическая композиция, содержащая молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, и необязательно дополнительный компонент, где дополнительный компонент выбран из группы, включающей фармацевтически приемлемый наполнитель, фармацевтически приемлемый носитель и фармацевтически активный агент.
52. Фармацевтическая композиция по п. 51, где фармацевтическая композиция содержит молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, и фармацевтически приемлемый носитель.
53. Применение молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 для получения лекарственного средства.
54. Применение по п. 53, где лекарственное средство предназначено для использования в медицине или в ветеринарии.
55. Применение по п. 54, где лекарственное средство предназначено для лечения и/или профилактики заболевания, которое ассоциируется с CXCL8-опосредуемым патогенным механизмом и/или выбрано из группы, включающей воспалительное заболевание и рак, где воспалительное заболевание предпочтительно представляет собой воспалительное заболевание дыхательных путей, воспалительное заболевание кожи, аутоиммунное заболевание, воспалительное нервное заболевание, ишемическое заболевание, атеросклероз, отторжение трансплантата панкреатических островков, отторжение трансплантата органов, замедленную функцию органов, повреждение спинного мозга или цистит.
56. Применение молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 для получения диагностического агента, диагностического средства или биосенсора.
57. Применение по п. 56, где диагностический агент или диагностическое средство имеет поверхность на реакционном сосуде или поверхность на устройстве в реакционном сосуде.
58. Применение по п. 56, где биосенсор имеет поверхность.
59. Применение по любому из пп. 56-58, где диагностический агент, диагностическое средство или биосенсор являются подходящими для детектирования, либо непосредственно, либо опосредованно, CXCL8, а предпочтительно человеческого CXCL8.
60. Применение по любому из пп. 56, 57, где CXCL8 детектируют посредством прямого связывания, в сэндвич-анализе на связывание или в анализе на конкурентное связывание.
61. Применение по п. 60, где прямое связывание включает способ детектирования, в котором используется только молекула L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, и в котором не используется или который не включает использование второй молекулы, отличающейся от молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, которая взаимодействует с CXCL8.
62. Применение по п. 60, где сэндвич-анализ представляет собой сэндвич-анализ на гибридизацию, в котором молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 иммобилизуют на поверхности, и комплекс молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 и CXCL8 детектируют с помощью детектирующего средства, которое связывается с эпитопом (эпитопами) CXCL8, который(е) отличается(ются) от эпитопа(ов), связанного(ых) с молекулой L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50.
63. Применение по п. 60, где сэндвич-анализ представляет собой сэндвич-анализ на гибридизацию, где средство, которое связывается с эпитопом (эпитопами) CXCL8, который(е) отличается(ются) от эпитопа(ов), связанного(ых) с молекулой L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, иммобилизуют на поверхности, и комплекс таких средств и CXCL8 детектируют с использованием молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50.
64. Применение по п. 60, где в анализе на конкурентное связывание, молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 иммобилизуют на поверхности, и связывание молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 с CXCL8 конкурирует с олигонуклеотидными зондами, комплементарными молекуле L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, или с CXCL8, где комплементарность предпочтительно представляет собой комплементарность оснований, а более предпочтительно, основана на спаривании оснований Уотсона-Крика.
65. Применение по п. 60, где в анализе на конкурентное связывание, молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 не иммобилизуют на поверхности, и связывание молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 с CXCL8 конкурирует с олигонуклеотидными зондами, комплементарными молекуле L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, или с CXCL8, где предпочтительно, олигонуклеотидные зонды, комплементарные молекуле L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 или CXCL8, иммобилизуют на поверхности, где комплементарность предпочтительно представляет собой комплементарность оснований, а более предпочтительно, такая комплементарность основана на спаривании оснований Уотсона-Крика.
66. Применение по любому из пп. 62-65, где для иммобилизации на поверхности используют молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 39-44.
67. Применение по любому из пп. 57-66, где поверхность, а предпочтительно поверхность биосенсора, выбрана из группы, состоящей из золота, серебра, титана, циркония, ванадия, хрома, марганца, кобальта, вольфрама, молибдена, платины, алюминия, железа, стали, меди, никеля, кремния, германия, фосфида индия, арсенида галлия и оксида, нитрида или их сплавов или смесей, оксида индия-олова, стеклообразного углерода, сапфира, силикатного стекла и боратного стекла.
68. Применение по любому из пп. 57-67, где поверхность, а предпочтительно поверхность биосенсора, модифицирована полилизином; аминосиланом; эпоксисиланом; нитроцеллюлозой; карбоксидекстраном; углеродной наномембраной; оксидом графена; углеродной поверхностью, такой как черная сажа, углеродное волокно, углеродная пластина, углеродная ткань, активированный углерод, стекловидный углерод, уголь, активированный уголь, графитовый порошок, графитовое волокно, углеродная нанотрубка; фуллереном; карбоксильной группой; азидной группой; тиоловой группой; гидроксигруппой; эпоксидом; малеимидом; алкином; стерическим алкином или любой их комбинацией.
69. Применение по п. 68, где для иммобилизации молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 39-44, поверхность функционализируют первичным амином, тиоловой группой, азидом, алкином, алкеном, тетразином, тетразолом или стерическим циклоалкином, где стерический циклоалкин предпочтительно выбран из группы, включающей дибензоциклооктил (DBCO), бицикло[6.1.0]нон-4-ин (BCN) или азадибензоциклооктин (ADIBO).
70. Применение по п. 69, где для иммобилизации молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 42-43 проводят реакцию циклоприсоединения азида-алкина, стимулируемую стерическим алкином.
71. Применение по любому из пп. 56-70, где молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 44-46 используют для детектирования.
72. Применение по любому из пп. 56-71, где детектирующая система биосенсора основана на оптическом считывании, изменении массы, показателе преломления, заряде, поверхностном натяжении и микроскопии на основе межатомных сил.
73. Применение по п. 72, где детектирующая система биосенсора, основанная на оптическом считывании, представляет собой флуоресценцию, абсорбцию или люминесценцию.
74. Применение по п. 72, где детектирующая система биосенсора, основанная на изменении массы, представляет собой систему микробаланса на основе кварцевых кристаллов или микроэлектромеханические системы.
75. Применение по п. 72, где детектирующая система биосенсора, основанная на показателе преломления, представляет собой поверхностный плазмонный резонанс, круговой резонатор или эллипсометрию.
76. Применение по п. 72, где детектирующая система биосенсора, основанная на заряде, представляет собой электрохимическое сопротивление, вольтамперометрию, амперометрию, потенциометрию, проводимость или полевой транзистор.
77. Применение по п. 72, где детектирующая система биосенсора, основанная на поверхностном натяжении, представляет собой консольный биосенсор.
78. Применение по любому из пп. 56-59, где CXCL8 детектируют с помощью устройства для анализа на гомогенность.
79. Применение молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 для детектирования CXCL8, а предпочтительно, человеческого CXCL8.
80. Применение по п. 79, где CXCL8 детектируют с помощью устройства для сэндвич-анализа на связывание, устройства для анализа на гомогенность, или устройства для анализа на конкурентное связывание.
81. Применение по п. 80, где устройство для сэндвич-анализа на связывание, устройство для анализа на гомогенность, или устройство для анализа на конкурентное связывание являются подходящими для прямого или опосредуемого детектирования CXCL8.
82. Применение по любому из пп. 78-81, где молекула L-нуклеиновой кислоты ковалентно иммобилизована на поверхности реакционного сосуда с диагностическим средством, на поверхности устройства в реакционном сосуде с диагностическим средством или на поверхности биосенсора.
83. Применение по п. 82, где для иммобилизации используют молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 39-44.
84. Применение по любому из пп. 82, 83, где поверхность, а предпочтительно поверхность биосенсора выбрана из группы, состоящей из золота, серебра, титана, циркония, ванадия, хрома, марганца, кобальта, вольфрама, молибдена, платины, алюминия, железа, стали, меди, никеля, кремния, германия, фосфида индия, арсенида галлия и оксида, нитрида или их сплавов или смесей, оксида индия-олова, стеклообразного углерода, сапфира, силикатного стекла и боратного стекла.
85. Применение по любому из пп. 82-84, где поверхность, а предпочтительно поверхность биосенсора модифицирована полилизином; аминосиланом; эпоксисиланом; нитроцеллюлозой; карбоксидекстраном; углеродной наномембраной; оксидом графена; углеродной поверхностью, такой как черная сажа, углеродное волокно, углеродная пластина, углеродная ткань, активированный углерод, стекловидный углерод, уголь, активированный уголь, графитовый порошок, графитовое волокно, углеродная нанотрубка; фуллереном; карбоксильной группой; азидной группой; тиоловой группой; гидроксигруппой; эпоксидом; малеимидом; алкином; стерическим алкином или любой их комбинацией.
86. Применение по п. 85, где для иммобилизации молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 38-44, поверхность функционализируют активированным первичным амином, тиоловой группой, азидом или стерическим циклоалкином, где стерический циклоалкин предпочтительно выбран из группы, включающей дибензоциклооктил (DBCO), бицикло[6.1.0]нон-4-ин (BCN) или азадибензоциклооктин (ADIBO).
87. Применение по п. 86, где для иммобилизации молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 42, 43 проводят реакцию циклоприсоединения азида-алкина, стимулируемую стерическим алкином.
88. Применение по любому из пп. 82-87, где детектирующая система биосенсора основана на оптическом считывании, изменении массы, показателе преломления, заряде, поверхностном натяжении и микроскопии на основе межатомных сил.
89. Применение по п. 88, где детектирующая система биосенсора, основанная на оптическом считывании, представляет собой флуоресценцию, абсорбцию или люминесценцию.
90. Применение по п. 85, где детектирующая система биосенсора, основанная на изменении массы, представляет собой систему микробаланса на основе кварцевых кристаллов или микроэлектромеханическую систему.
91. Применение по п. 88, где детектирующая система биосенсора, основанная на показателе преломления, представляет собой поверхностный плазмонный резонанс, круговой резонатор или эллипсометрию.
92. Применение по п. 88, где детектирующая система биосенсора, основанная на заряде, представляет собой электрохимическое сопротивление, вольтамперометрию, амперометрию, потенциометрию, проводимость или полевой транзистор.
93. Применение по п. 88, где детектирующая система биосенсора, основанная на поверхностном натяжении, представляет собой консольный биосенсор.
94. Применение по любому из пп. 79-81, где молекула L-нуклеиновой кислоты содержит модифицирующую группу, которая позволяет детектировать молекулу L-нуклеиновой кислоты, а предпочтительно, модифицирующая группа представляет собой метку.
95. Применение по п. 94, где метка выбрана из группы, включающей биотин, бромдезоксиуридин, дигоксигенин, олигонуклеотид, флуоресцентную метку, электрохемилюминесцентную метку, радиоактивную метку, ферментную метку, УФ-метку, коллоидное золото, наночастицу и метку в виде молекулы, образующей хелатный комплекс.
96. Набор для детектирования CXCL8, где набор содержит молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 и по меньшей мере вкладыш с инструкцией или реакционный сосуд.
97. Способ детектирования CXCL8 с использованием L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 в образце, где указанный способ включает стадии:
f) получения образца с неизвестной концентрацией CXCL8;
g) контактирования образца или его разведения с диагностическим агентом, диагностическим средством или биосенсором по любому из пп. 56-78;
h) измерения сигнала с использованием диагностического агента, диагностического средства или биосенсора по любому из пп. 56-78;
i) сравнения, но необязательно, сигнала с эталоном;
j) где, необязательно, концентрацию CXCL8 в образце с неизвестной концентрацией CXCL8 определяют путем сравнения с сигналами, полученными по меньшей мере из одного образца с известной концентрацией CXCL8, а предпочтительно, по меньшей мере один образец с известной концентрацией CXCL8 подвергают стадиям b)-c).
98. Комплекс, содержащий молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50 и CXCL8, где комплекс предпочтительно представляет собой кристаллический комплекс.
99. Способ скрининга антагониста активности, опосредуемой CXCL8, где указанный способ включает следующие стадии:
получения кандидата-антагониста активности, опосредуемой CXCL8,
получения молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50;
создания тест-системы, которая будет передавать сигнал в присутствии антагониста активности, опосредуемой CXCL8, и
определения того, является ли кандидат-антагонист активности, опосредуемой CXCL8, таким антагонистом активности, опосредуемой CXCL8.
100. Способ детектирования L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, в образце, где указанный способ включает стадии:
f) получения зонда для захвата, где зонд для захвата по меньшей мере частично комплементарен первой части молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, и зонда для детектирования, где зонд для детектирования по меньшей мере частично комплементарен второй части молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50; или, альтернативно, где зонд для захвата по меньшей мере частично комплементарен второй части молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, а зонд для детектирования по меньшей мере частично комплементарен первой части молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50;
g) добавления зонда для захвата и зонда для детектирования отдельно или в комбинации к образцу, содержащему молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, или, предположительно, содержащему молекулу L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50;
h) обеспечения взаимодействия зонда для захвата и зонда для детектирования либо одновременно, либо последовательно в любом порядке с молекулой L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, или ее части;
i) необязательно, определения того, гибридизуется ли зонд для захвата с молекулой L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, как описано в стадии a); и
j) детектирования комплекса, полученного в стадии c) и состоящего из молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, зонда для захвата и зонда для детектирования.
101. Способ по п. 100, где зонд для детектирования содержит детектирующее средство, и/или где зонд для захвата иммобилизован на носителе, а предпочтительно, на твердом носителе.
102. Способ по п. 100 или 101, где любой зонд для детектирования, который не является частью комплекса, полученного в стадии с), удаляют из реакционной смеси, так, чтобы в стадии е) детектировался только зонд для детектирования, который является частью комплекса.
103. Способ по любому из пп. 100-102, где стадия е) включает стадию сравнения сигнала, генерируемого детектирующим средством, если зонд для захвата и зонд для детектирования гибридизуются в присутствии молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50, или ее части, и в отсутствии указанной молекулы L-нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-50.