ОНКОЛИТИЧЕСКИЕ АДЕНОВИРУСНЫЕ КОМПОЗИЦИИ С УЛУЧШЕННЫМИ РЕПЛИКАЦИОННЫМИ СВОЙСТВАМИ

1. Геном рекомбинантного аденовируса, содержащий
область E1A, кодирующая модифицированный белок E1a;
область E3, кодирующую аденовирусный белок смерти (ADP) и содержащую модификацию в кодирующих последовательностях по меньшей мере трех генов E3, выбранных из 12.5κ, 6.7κ, 19κ, RIDα, RIDβ и 14.7κ, где модификация предотвращает экспрессию кодируемого белка; и
область E4, содержащую делецию кодирующей последовательности E4orf6/7.
2. Геном рекомбинантного аденовируса по п.1, где модифицированный белок E1a включает
делецию мотива LXCXE;
делецию остатков 2-11;
замену C124G;
замену Y47H;
замену Y47H и замену C124G; или
замену Y47H, замену C124G и делецию остатков 2-11.
3. Геном рекомбинантного аденовируса по п.1 или п.2, где по меньшей мере три гена E3 включают 12.5κ, 6.7κ и 19κ.
4. Геном рекомбинантного аденовируса по п.3, где гены 12.5κ, 6.7κ и 19κ делетированы.
5. Геном рекомбинантного аденовируса по п.3, где гены 12.5κ, 6.7κ и 19κ включают мутацию старт-кодона, мутацию, которая вводит преждевременный стоп-кодон, или обе этих мутации.
6. Геном рекомбинантного аденовируса по п.1 или п.2, где по меньшей мере три гена E3 включают RIDα, RIDβ и 14.7κ.
7. Геном рекомбинантного аденовируса по п.6, где гены RIDα, RIDβ и 14.7κ делетированы.
8. Геном рекомбинантного аденовируса по п.6, где гены RIDα, RIDβ и 14.7κ включают мутацию старт-кодона, мутацию, которая вводит преждевременный стоп-кодон, или обе этих мутации.
9. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-8, где по меньшей мере три гена E3 включают 12.5κ, 6.7κ, 19κ, RIDα, RIDβ и 14.7κ.
10. Геном рекомбинантного аденовируса по п.9, где гены 12.5κ, 6.7κ, 19κ, RIDα, RIDβ и 14.7κ делетированы.
11. Геном рекомбинантного аденовируса по п.9, где гены 12.5κ, 6.7κ, 19κ, RIDα, RIDβ и 14.7κ включают мутацию старт-кодона, мутацию, которая вводит преждевременный стоп-кодон, или обе этих мутации.
12. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-11, дополнительно включающий делецию E4orf3.
13. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-12, где геном дополнительно кодирует нацеливающий лиганд, слитый со FK506 связывающим белком (FKBP), и белок волокна аденовируса, слитый с белком связывания FKBP и рапамицина (FRB) дикого типа или мутантным белком FRB, способным связывать рапалог.
14. Геном рекомбинантного аденовируса по п.13, где нацеливающий лиганд представляет собой однодоменное антитело.
15. Геном рекомбинантного аденовируса по п.14, где однодоменное антитело специфично для EGFR.
16. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-15, включающий по меньшей мере одну модификацию для удаления печени из числа органов-мишеней аденовируса.
17. Геном рекомбинантного аденовируса по п.16, включающий мутацию гексонового белка.
18. Геном рекомбинантного аденовируса по п.17, где мутация гексона представляет собой мутацию E451Q.
19. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 16-18, дополнительно содержащий один или более сайтов связывания для специфичной для печени микроРНК.
20. Геном рекомбинантного аденовируса по п.19, где один или более сайтов связывания для специфичной для печени микроРНК расположены в 3'-НТО E1A.
21. Геном рекомбинантного аденовируса по п.19 или 20, где специфичная для печени микроРНК представляет собой миР-122.
22. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-21, где геном кодирует химерный белок волокна.
23. Геном рекомбинантного аденовируса по п.22, где химерный белок волокна содержит стержень волокна из аденовируса первого серотипа и утолщение волокна из аденовируса второго серотипа.
24. Геном рекомбинантного аденовируса по п.23, где аденовирус первого серотипа представляет собой Ad5, а аденовирус второго серотипа представляет собой Ad3, Ad9, Ad11, Ad12, Ad34 или Ad37.
25. Геном рекомбинантного аденовируса по п.23, где аденовирус первого серотипа представляет собой Ad5, а аденовирус второго серотипа представляет собой Ad34.
26. Геном рекомбинантного аденовируса по п.25, где утолщение волокна Ad34 включает модификацию, которая предотвращает или ингибирует связывание с CD46.
27. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-25, где геном кодирует белок волокна, модифицированный для включения пептида RGD.
28. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-27, дополнительно содержащий гетерологичную открытую рамку считывания (ОРС).
29. Геном рекомбинантного аденовируса по п.28, где гетерологичная ОРС включает репортерный ген.
30. Геном рекомбинантного аденовируса по п.28, где гетерологичная ОРС включает терапевтический ген.
31. Геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 28-30, где гетерологичная ОРС функционально связана с той же рамкой считывания и находится в той же рамке считывания, что и последовательность, кодирующая саморасщепляющийся пептид, и последовательность, кодирующая ADP.
32. Геном рекомбинантного аденовируса по п.31, где саморасщепляющийся пептид представляет собой пептид 2А.
33. Геном рекомбинантного аденовируса по п.32, где пептид 2A включает пептид 2A свиного тешовируса-1 (PTV1) (P2A), пептид 2A вируса ящура (FMDV) (F2A), пептид 2A вируса лошадиного ринита А (ERAV) (E2A) или пептид 2A вируса Thosea asigna (TaV) (T2A).
34. Геном рекомбинантного аденовируса по п.1, где нуклеотидная последовательность генома по меньшей мере на 95% идентична SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID. NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 57 или SEQ ID NO: 59.
35. Геном рекомбинантного аденовируса по п.1, где нуклеотидная последовательность генома по меньшей мере на 99% идентична SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 57 или SEQ ID NO: 59.
36. Геном рекомбинантного аденовируса по п.1, где нуклеотидная последовательность генома включает SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID. NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 57 или SEQ ID NO: 59.
37. Выделенная клетка, содержащая геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-36.
38. Композиция, содержащая геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-36 или выделенную клетку по п.37 и фармацевтически приемлемый носитель.
39. Выделенный аденовирус, содержащий геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-36.
40. Композиция, содержащая рекомбинантный аденовирус по п.39 и фармацевтически приемлемый носитель.
41. Способ подавления жизнеспособности опухолевых клеток, включающий контактирование опухолевой клетки с геномом рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-36, аденовирусом по п.39 или композицией по п.38 или 40.
in vitro
42. Способ по п.41, где способ представляет собой способ .
in vivo
43. Способ по п. 41, где способ представляет собой способ , и контактирование с опухолевой клеткой включает введение терапевтически эффективного количества генома рекомбинантного аденовируса, аденовируса или композиции субъекту с опухолью.
44. Способ ингибирования прогрессии опухоли или уменьшения объема опухоли у субъекта, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества генома рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-36, аденовируса по п.39 или композиции по п.38 или 40, с подавлением, тем самым, прогрессии опухоли или уменьшением объема опухоли у субъекта.
45. Способ лечения рака у субъекта, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества генома рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 1-36, рекомбинантного аденовируса по п.39 или композиции по п.38 или 40, с излечением, тем самым, рака у субъекта.
46. Геном рекомбинантного аденовируса, где нуклеотидная последовательность генома по меньшей мере на 95% идентична SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56 или SEQ ID NO: 58.
47. Геном рекомбинантного аденовируса по п.46, где нуклеотидная последовательность генома по меньшей мере на 99% идентична SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID. NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56 или SEQ ID NO: 58.
48. Геном рекомбинантного аденовируса по п.46, где нуклеотидная последовательность генома включает SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 45, SEQ ID. NO: 46, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56 или SEQ ID NO: 58.
49. Выделенный аденовирус, содержащий геном рекомбинантного аденовируса по любому из пп. 46-48.