СПОСОБЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ ЗАБОЛЕВАНИЙ, ОПОСРЕДОВАННЫХ PARP

1. Способ определения лечения заболевания, опосредуемого PARP, включающий определение уровня экспрессии в панели идентифицированных генов, в том числе по меньшей мере PARP, во многих образцах выборки, и принятие решения относительно лечения вышеуказанного заболевания, опосредуемого PARP, где указанное решение о выборе способа лечения принято на основе указанного уровня экспрессии по меньшей мере одного идентифицированного гена в панели.
2. Способ по п.1, где указанная панель генов включает гены, экспрессируемые в каналах PARP, рецептора IGF1 или EGFR.
3. Способ по п.1, где указанная панель генов включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S, ABCC1, ABCC5, ABCD4, ACADM, ACLSL1, ACSL3, ACY1L2, ADM, ADRM1, AGPAT5, AHCY, AK3L1, AK3L2, AKIIP, AKR1B1, AKR1C1, AKR1C2, AKR1C3, ALDH18A1, ALDOA, ALOX5, ALPL, ANP32E, AOF1, APG5L, ARFGEF1, ARL5, ARPP-19, ASPH, ATF5, ATF7IP, ATIC, ATP11A, ATP11C, ATP1A1, ATP1B1, ATP2A2, ATP5G3, ATP5J2, ATP6V0B, B3GNT1, B4GALT2, BACE2, BACH, BAG2, BASP1, BCAT1, BCL2L1, BCL6, BGN, BPNT1, C1QBP, CACNB3, CAMK2D, CAP2, CCAR1, CD109, CD24, CD44, CD47, CD58, CD74, CD83, CD9, CDC14B, CDC42EP4, CDC5L, CDK4, CDK6, CDS1, CDW92, CEACAM6, CELSR2, CFLAR, CGI-90, CHST6, CHSY1, CKLFSF4, CKLFSF6, CKS1B, CMKOR1, CNDP2, CPD, CPE, CPSF3, CPSF5, CPSF6, CPT1B, CRR9, CSH2, CSK, CSNK2A1, CSPG2, CTPSCTSB, CTSD, CXADR, CXCR4, CXXC5, CXXC6, DAAM1, DCK, DDAH1, DDIT4, DDR1, DDX21, DDX39, DHTKD1, DLAT, DNAJA1, DNAJB11, DNAJC1, DNAJC10, DNAJC9, DNAJD1, DUSP10, DUSP24, DUSP6, DVL3, ELOVL6, EME1, ENO1, ENPP4, EPS8, ETNK1, ETV6, F11R, FA2H, FABP5, FADS2, FAS, FBXO45, FBXO7, FLJ23091, FTL, FTLL1, FZD6,G1P2, GALNT2, GALNT4, GALNT7, GANAB, GART, GBAS, GCHFR, GCLC, GCLM, GCNT1, GFPT1, GGA2, GGH, GLUL, GMNN, GMPS, GPI, GPR56, GPR89, GPX1, GRB10, GRHPR, GSPT1, GSR, GTPBP4, HDAC1, HDGF, HIG2, HMGB3, HPRT1, HPS5, HRMT1L2, HS2ST1, HSPA4, HSPA8, HSPB1, HSPCA, HSPCAL3, HSPCB, HSPD1, HSPE1, HSPH1, HTATIP2, HYOU1, ICMT, IDE, IDH2, IFI27, IGFBP3, IGSF4, ILF2, INPP5F, INSIG1, KHSRP, KLF4, KMO, KPNA2, KTN1, LAP3, LASS2, LDHA, LDHB, LGR4, LPGAT1, LTB4DH, LYN, MAD2L1, MADP-1, MAGED1, MAK3, MALAT1, MAP2K3, MAP2K6, MAP3K13, MAP4K4, MAPK13, MARCKS, MBTPS2, MCM4, MCTS1, MDH1, MDH2, ME1, ME2, METAP2, METTL2, MGAT4B, MKNK2, MLPH, MOBK1B, MOBKL1A, MSH2, MTHFD2, MUC1, MX1, MYCBP, NAJD1, NAT1, NBS1, NDFIP2, NEK6, NET1, NME1, NNT, NQO1, NRAS, NSE2, NUCKS, NUSAP1, NY-REN-41, ODC1, OLR1, P4HB, PAFAH1B1, PAICS, PANK1, PCIA1, PCNA, PCTK1, PDAP1, PDIA4, PDIA6, PDXK, PERP, PFKP, PFTK1, PGD, PGK1, PGM2L1, PHCA, PKIG, PKM2, PKP4, PLA2G4A, PLCB1, PLCG2, PLD3, PLOD1, PLOD2, PMS2L3, PNK1, PNPT1, PON2, PP, PPIF, PPP1CA, PPP2R4, PPP3CA, PRCC, PRKD3, PRKDC, PRPSAP2, PSAT1, PSENEN, PSMA2, PSMA5, PSMA7, PSMB3, PSMB4, PSMD14, PSMD2, PSMD3, PSMD4, PSMD8, PTGFRN, PTGS1, PTK9, PTPN12, PTPN18, PTS, PYGB, RAB10, RAB11FIP1, RAB14, RAB31, RAB3IP, RACGAP1, RAN, RANBP1, RAP2B, RBBP4, RBBP7, RBBP8, RDH10, RFC3, RFC4, RFC5, RGS19IP1, RHOBTB3, RNASEH2A, RNGTT, RNPEP, ROBO1, RRAS2, SART2, SAT, SCAP2, SCD4, SDC2, SDC4, SEMA3F, SERPINE2, SFI1, SGPL1, SGPP1, SGPP2, SH3GLB2, SHC1, SMARCC1, SMC4L1, SMC4L1, SMS, SNRPD1, SORD, SORL1, SPP1, SQLE, SRD5A1, SRD5A2L, SRM, SRPK1, SS18, SSBP1, SSR3, ST3GAL5, ST6GAL1, ST6GALNAC2, STX18, SULF2, SWAP70, TA-KRP, TALA, TBL1XR1, TFRC, TIAM1, TKT, TMPO, TNFAIP2, TNFSF9, TOX, TPD52, TPI1, TPP1, TRA1, TRIP13, TRPS1, TSPAN13, TSTA3, TXN, TXNL2, TXNL5, TXNRD1, UBAP2L, UBE2A, UBE2D2, UBE2G1, UBE2V1, UCHL5, UGDH, UNC5CL, USP28, USP47, UTP14A, VDAC1, WIG1, YWHAB, YWHAE, YWHAZ или их сочетание.
4. Способ по п.1, где указанная панель генов включает PARP, IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S или их сочетание.
5. Способ по п.1, где указанный уровень экспрессии PARP является повышенным, и решение о выборе способа лечения заключается в выборе для лечения данного заболевания ингибитора PARP и ингибитора по меньшей мере одного гена с повышенным уровнем экспрессии из указанной панели.
6. Способ по п.5, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.
7. Способ по п.1, где вышеупомянутое заболевание выбрано из группы, в которую входят аденокарцинома толстой кишки, аденокарцинома пищевода, гепатоклеточная аденокарцинома печени, плоскоклеточная карцинома, аденокарцинома поджелудочной железы, инсулома, аденокарцинома прямой кишки, стромальная опухоль желудочно-кишечного тракта, аденокарцинома желудка, рак коры надпочечников, фолликулярная карцинома, папиллярная карцинома, рак молочной железы, протоковая карцинома, лобулярная карцинома, интрадуктальный рак, слизеобразующая карцинома, филлоидная цистосаркома, саркома Юинга, аденокарцинома яичников, аденокарцинома эндометрия, гранулезно-клеточная опухоль, слизеобразующая цистаденокарцинома, аденокарцинома шейки матки, плоскоклеточная карцинома вульвы, карцинома базальных клеток, аденокарцинома простаты, гигантоклеточная остеобластома, остеосаркома, карцинома гортани, аденокарцинома легких, карцинома почек, карцинома мочевого пузыря, опухоль Вильмса и лимфома.
8. Способ идентификации генов, применяемый для лечения пациента, страдающего заболеванием, чувствительным к лечению ингибитором PARP, где способ включает:
a. выявление заболевания, поддающегося лечению по меньшей мере одним модулятором PARP, причем уровень экспрессии PARP во многих образцах выборки регулируется по сравнению с контрольным образцом;
b. определение уровня экспрессии панели генов во множестве образцов и
c. выявление генов, которые корегулируются одновременно с указанной регуляцией PARP, при этом уровень экспрессии указанных корегулируемых генов во множестве образцов увеличивается или уменьшается по сравнению с контрольным образцом;
причем модулирование указанных генов, которые корегулируются наряду с регулированием PARP, используется для лечения заболевания, чувствительного по отношению к лечению модулятором PARP.
9. Способ лечения пациента, страдающего заболеванием, которое поддается лечению модулятором PARP, где способ предусматривает:
a. выявление заболевания, которое может лечиться по меньшей мере одним модулятором PARP, причем уровень экспрессии PARP в образце, взятом у пациента, страдающего указанным заболеванием, регулируется по сравнению с контрольным образцом;
b. идентификацию по меньшей мере одного корегулируемого гена в указанном образце по сравнению с контрольным образцом;
c. лечение указанного пациента модуляторами PARP и корегулируемого гена.
10. Способ по п.9, где указанный корегулируемый ген включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, UBE2S, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, ABCC1, ABCC5, ABCD4, ACADM, ACLSL1, ACSL3, ACY1L2, ADM, ADRM1, AGPAT5, AHCY, AK3L1, AK3L2, AKIIP, AKR1B1, AKR1C1, AKR1C2, AKR1C3, ALDH18A1, ALDOA, ALOX5, ALPL, ANP32E, AOF1, APG5L, ARFGEF1, ARL5, ARPP-19, ASPH, ATF5, ATF7IP, ATIC, ATP11A, ATP11C, ATP1A1, ATP1B1, ATP2A2, ATP5G3, ATP5J2, ATP6V0B, B3GNT1, B4GALT2, BACE2, BACH, BAG2, BASP1, BCAT1, BCL2L1, BCL6, BGN, BPNT1, C1QBP, CACNB3, CAMK2D, CAP2, CCAR1, CD109, CD24, CD44, CD47, CD58, CD74, CD83, CD9, CDC14B, CDC42EP4, CDC5L, CDK4, CDK6, CDS1, CDW92, CEACAM6, CELSR2, CFLAR, CGI-90, CHST6, CHSY1, CKLFSF4, CKLFSF6, CKS1B, CMKOR1, CNDP2, CPD, CPE, CPSF3, CPSF5, CPSF6, CPT1B, CRR9, CSH2, CSK, CSNK2A1, CSPG2, CTPSCTSB, CTSD, CXADR, CXCR4, CXXC5, CXXC6, DAAM1, DCK, DDAH1, DDIT4, DDR1, DDX21, DDX39, DHTKD1, DLAT, DNAJA1, DNAJB11, DNAJC1, DNAJC10, DNAJC9, DNAJD1, DUSP10, DUSP24, DUSP6, DVL3, ELOVL6, EME1, ENO1, ENPP4, EPS8, ETNK1, ETV6, F11R, FA2H, FABP5, FADS2, FAS, FBXO45, FBXO7, FLJ23091, FTL, FTLL1, FZD6,G1P2, GALNT2, GALNT4, GALNT7, GANAB, GART, GBAS, GCHFR, GCLC, GCLM, GCNT1, GFPT1, GGA2, GGH, GLUL, GMNN, GMPS, GPI, GPR56, GPR89, GPX1, GRB10, GRHPR, GSPT1, GSR, GTPBP4, HDAC1, HDGF, HIG2, HMGB3, HPRT1, HPS5, HRMT1L2, HS2ST1, HSPA4, HSPA8, HSPB1, HSPCA, HSPCAL3, HSPCB, HSPD1, HSPE1, HSPH1, HTATIP2, HYOU1, ICMT, IDE, IDH2, IFI27, IGFBP3, IGSF4, ILF2, INPP5F, INSIG1, KHSRP, KLF4, KMO, KPNA2, KTN1, LAP3, LASS2, LDHA, LDHB, LGR4, LPGAT1, LTB4DH, LYN, MAD2L1, MADP-1, MAGED1, MAK3, MALAT1, MAP2K3, MAP2K6, MAP3K13, MAP4K4, MAPK13, MARCKS, MBTPS2, MCM4, MCTS1, MDH1, MDH2, ME1, ME2, METAP2, METTL2, MGAT4B, MKNK2, MLPH, MOBK1B, MOBKL1A, MSH2, MTHFD2, MUC1, MX1, MYCBP, NAJD1, NAT1, NBS1, NDFIP2, NEK6, NET1, NME1, NNT, NQO1, NRAS, NSE2, NUCKS, NUSAP1, NY-REN-41, ODC1, OLR1, P4HB, PAFAH1B1, PAICS, PANK1, PCIA1, PCNA, PCTK1, PDAP1, PDIA4, PDIA6, PDXK, PERP, PFKP, PFTK1, PGD, PGK1, PGM2L1, PHCA, PKIG, PKM2, PKP4, PLA2G4A, PLCB1, PLCG2, PLD3, PLOD1, PLOD2, PMS2L3, PNK1, PNPT1, PON2, PP, PPIF, PPP1CA, PPP2R4, PPP3CA, PRCC, PRKD3, PRKDC, PRPSAP2, PSAT1, PSENEN, PSMA2, PSMA5, PSMA7, PSMB3, PSMB4, PSMD14, PSMD2, PSMD3, PSMD4, PSMD8, PTGFRN, PTGS1, PTK9, PTPN12, PTPN18, PTS, PYGB, RAB10, RAB11FIP1, RAB14, RAB31, RAB3IP, RACGAP1, RAN, RANBP1, RAP2B, RBBP4, RBBP7, RBBP8, RDH10, RFC3, RFC4, RFC5, RGS19IP1, RHOBTB3, RNASEH2A, RNGTT, RNPEP, ROBO1, RRAS2, SART2, SAT, SCAP2, SCD4, SDC2, SDC4, SEMA3F, SERPINE2, SFI1, SGPL1, SGPP1, SGPP2, SH3GLB2, SHC1, SMARCC1, SMC4L1, SMC4L1, SMS, SNRPD1, SORD, SORL1, SPP1, SQLE, SRD5A1, SRD5A2L, SRM, SRPK1, SS18, SSBP1, SSR3, ST3GAL5, ST6GAL1, ST6GALNAC2, STX18, SULF2, SWAP70, TA-KRP, TALA, TBL1XR1, TFRC, TIAM1, TKT, TMPO, TNFAIP2, TNFSF9, TOX, TPD52, TPI1, TPP1, TRA1, TRIP13, TRPS1, TSPAN13, TSTA3, TXN, TXNL2, TXNL5, TXNRD1, UBAP2L, UBE2A, UBE2D2, UBE2G1, UBE2V1, UCHL5, UGDH, UNC5CL, USP28, USP47, UTP14A, VDAC1, WIG1, YWHAB, YWHAE, YWHAZ или их сочетание.
11. Способ по п.9, где указанный корегулируемый ген включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S или их сочетание.
12. Способ по п.9, где указанным заболеванием является рак.
13. Способ по п.9, где указанный уровень экспрессии PARP и уровень экспрессии указанных корегулируемых генов повышены, и решение о выборе способа лечения заключается в выборе для лечения данного заболевания ингибиторов PARP и указанных корегулируемых генов.
14. Способ по п.9, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.
15. Способ лечения заболевания, включающий:
a. получение набора образцов от пациентов, страдающих указанным заболеванием;
b. идентификацию по меньшей мере одного регулируемого в каждом образце по сравнению с контрольным образцом;
c. лечение пациента, страдающего указанным заболеванием, модуляторами идентифицированного регулируемого гена (генов) и модулятором PARP.
16. Способ лечения заболевания, которое поддается лечению модулятором PARP, где способ предусматривает:
a. выявление заболевания, поддающегося лечению по меньшей мере одним модулятором PARP, причем уровень экспрессии PARP во многих образцах выборки регулируется по сравнению с контрольным образцом;
b. выявление по меньшей мере одного корегулируемого гена в указанной выборке образцов по сравнению с контрольным образцом;
c. лечение пациента, страдающего указанным заболеванием, модуляторами PARP и корегулируемого гена.
17. Способ по п.16, где указанный уровень экспрессии PARP и уровень экспрессии указанных корегулируемых генов повышены, и решение о выборе способа лечения заключается в выборе для лечения данного заболевания ингибиторов PARP и указанных корегулируемых генов.
18. Способ по п.16, где указанный уровень экспрессии PARP и уровень экспрессии указанных корегулируемых генов понижены, и решение о выборе метода лечения заключается в отказе от выбора для лечения данного заболевания ингибиторов PARP и указанных корегулируемых генов.
19. Способ лечения рака, который поддается лечению ингибитором PARP, где способ предусматривает:
a. выявление рака, поддающегося лечению по меньшей мере одним ингибитором PARP, причем уровень экспрессии PARP во множестве образцов рака повышен;
b. выявление по меньшей мере одного корегулируемого гена в указанном множестве образцов;
c. лечение пациента, страдающего указанным раком, ингибиторами PARP и корегулируемого гена.
20. Способ по п.19, где указанный корегулируемый ген включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S, ABCC1, ABCC5, ABCD4, ACADM, ACLSL1, ACSL3, ACY1L2, ADM, ADRM1, AGPAT5, AHCY, AK3L1, AK3L2, AKIIP, AKR1B1, AKR1C1, AKR1C2, AKR1C3, ALDH18A1, ALDOA, ALOX5, ALPL, ANP32E, AOF1, APG5L, ARFGEF1, ARL5, ARPP-19, ASPH, ATF5, ATF7IP, ATIC, ATP11A, ATP11C, ATP1A1, ATP1B1, ATP2A2, ATP5G3, ATP5J2, ATP6V0B, B3GNT1, B4GALT2, BACE2, BACH, BAG2, BASP1, BCAT1, BCL2L1, BCL6, BGN, BPNT1, C1QBP, CACNB3, CAMK2D, CAP2, CCAR1, CD109, CD24, CD44, CD47, CD58, CD74, CD83, CD9, CDC14B, CDC42EP4, CDC5L, CDK4, CDK6, CDS1, CDW92, CEACAM6, CELSR2, CFLAR, CGI-90, CHST6, CHSY1, CKLFSF4, CKLFSF6, CKS1B, CMKOR1, CNDP2, CPD, CPE, CPSF3, CPSF5, CPSF6, CPT1B, CRR9, CSH2, CSK, CSNK2A1, CSPG2, CTPSCTSB, CTSD, CXADR, CXCR4, CXXC5, CXXC6, DAAM1, DCK, DDAH1, DDIT4, DDR1, DDX21, DDX39, DHTKD1, DLAT, DNAJA1, DNAJB11, DNAJC1, DNAJC10, DNAJC9, DNAJD1, DUSP10, DUSP24, DUSP6, DVL3, ELOVL6, EME1, ENO1, ENPP4, EPS8, ETNK1, ETV6, F11R, FA2H, FABP5, FADS2, FAS, FBXO45, FBXO7, FLJ23091, FTL, FTLL1, FZD6,G1P2, GALNT2, GALNT4, GALNT7, GANAB, GART, GBAS, GCHFR, GCLC, GCLM, GCNT1, GFPT1, GGA2, GGH, GLUL, GMNN, GMPS, GPI, GPR56, GPR89, GPX1, GRB10, GRHPR, GSPT1, GSR, GTPBP4, HDAC1, HDGF, HIG2, HMGB3, HPRT1, HPS5, HRMT1L2, HS2ST1, HSPA4, HSPA8, HSPB1, HSPCA, HSPCAL3, HSPCB, HSPD1, HSPE1, HSPH1, HTATIP2, HYOU1, ICMT, IDE, IDH2, IFI27, IGFBP3, IGSF4, ILF2, INPP5F, INSIG1, KHSRP, KLF4, KMO, KPNA2, KTN1, LAP3, LASS2, LDHA, LDHB, LGR4, LPGAT1, LTB4DH, LYN, MAD2L1, MADP-1, MAGED1, MAK3, MALAT1, MAP2K3, MAP2K6, MAP3K13, MAP4K4, MAPK13, MARCKS, MBTPS2, MCM4, MCTS1, MDH1, MDH2, ME1, ME2, METAP2, METTL2, MGAT4B, MKNK2, MLPH, MOBK1B, MOBKL1A, MSH2, MTHFD2, MUC1, MX1, MYCBP, NAJD1, NAT1, NBS1, NDFIP2, NEK6, NET1, NME1, NNT, NQO1, NRAS, NSE2, NUCKS, NUSAP1, NY-REN-41, ODC1, OLR1, P4HB, PAFAH1B1, PAICS, PANK1, PCIA1, PCNA, PCTK1, PDAP1, PDIA4, PDIA6, PDXK, PERP, PFKP, PFTK1, PGD, PGK1, PGM2L1, PHCA, PKIG, PKM2, PKP4, PLA2G4A, PLCB1, PLCG2, PLD3, PLOD1, PLOD2, PMS2L3, PNK1, PNPT1, PON2, PP, PPIF, PPP1CA, PPP2R4, PPP3CA, PRCC, PRKD3, PRKDC, PRPSAP2, PSAT1, PSENEN, PSMA2, PSMA5, PSMA7, PSMB3, PSMB4, PSMD14, PSMD2, PSMD3, PSMD4, PSMD8, PTGFRN, PTGS1, PTK9, PTPN12, PTPN18, PTS, PYGB, RAB10, RAB11FIP1, RAB14, RAB31, RAB3IP, RACGAP1, RAN, RANBP1, RAP2B, RBBP4, RBBP7, RBBP8, RDH10, RFC3, RFC4, RFC5, RGS19IP1, RHOBTB3, RNASEH2A, RNGTT, RNPEP, ROBO1, RRAS2, SART2, SAT, SCAP2, SCD4, SDC2, SDC4, SEMA3F, SERPINE2, SFI1, SGPL1, SGPP1, SGPP2, SH3GLB2, SHC1, SMARCC1, SMC4L1, SMC4L1, SMS, SNRPD1, SORD, SORL1, SPP1, SQLE, SRD5A1, SRD5A2L, SRM, SRPK1, SS18, SSBP1, SSR3, ST3GAL5, ST6GAL1, ST6GALNAC2, STX18, SULF2, SWAP70, TA-KRP, TALA, TBL1XR1, TFRC, TIAM1, TKT, TMPO, TNFAIP2, TNFSF9, TOX, TPD52, TPI1, TPP1, TRA1, TRIP13, TRPS1, TSPAN13, TSTA3, TXN, TXNL2, TXNL5, TXNRD1, UBAP2L, UBE2A, UBE2D2, UBE2G1, UBE2V1, UCHL5, UGDH, UNC5CL, USP28, USP47, UTP14A, VDAC1, WIG1, YWHAB, YWHAE, YWHAZ или их сочетание.
21. Способ по п.19, где указанный корегулируемый ген включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S или их сочетание.
22. Способ по п.19, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.
23. Способ лечения рака молочной железы, который поддается лечению ингибитором PARP, где способ предусматривает:
a. выявление рака молочной железы, поддающегося лечению по меньшей мере одним ингибитором PARP, причем уровень экспрессии PARP во множестве образцов рака молочной железы повышен;
b. выявление по меньшей мере одного корегулируемого гена в указанном множестве образцов;
c. лечение пациента, страдающего указанным раком молочной железы, ингибиторами PARP и корегулируемого гена.
24. Способ по п.23, где указанный корегулируемый ген включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S или их сочетание.
25. Способ по п.23, где указанный рак молочной железы выбирается из группы, в которую входят лимфомы, карциномы, гормон-зависимые опухоли, мелкоклеточная карцинома, протоковая карцинома, инфильтрирующая протоковая карцинома, инфильтрирующая дольковая карцинома, инфильтрирующая карцинома смешанного протокового и долькового типа и инфильтрирующая протоковая карцинома с метастазами.
26. Способ по п.23, где указанный рак молочной железы является тройным негативным раком.
27. Способ по п.23, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.
28. Способ лечения рака легких, который поддается лечению ингибитором PARP, где способ предусматривает:
a. выявление рака легких, который может лечиться по меньшей мере одним ингибитором PARP, причем уровень экспрессии PARP во множестве образцов рака легких повышен;
b. идентификацию по меньшей мере одного корегулируемого гена в указанном множестве образцов;
c. лечение пациента с указанным раком легких ингибиторами PARP и корегулируемого гена.
29. Способ по п.28, где указанный корегулируемый ген включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S или их сочетание.
30. Способ по п.28, в котором указанный рак легких выбран из группы, включающей аденокарциному легких, мелкоклеточную карциному, немелкоклеточную карциному, плоскоклеточную карциному и крупноклеточную карциному.
31. Способ по п.28, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.
32. Способ лечения эндометриального рака, который поддается лечению ингибитором PARP, где способ предусматривает:
a. выявление эндометриального рака, который может лечиться по меньшей мере одним ингибитором PARP, причем уровень экспрессии PARP во множестве образцов эндометриального рака повышен;
b. идентификацию по меньшей мере одного корегулируемого гена в указанном множестве образцов;
c. лечение указанного пациента ингибиторами PARP и корегулируемого гена.
33. Способ по п.32, в котором указанный эндометриальный рак выбран из группы, включающей аденокарциному эндометрия, аденокарциному шейки матки, плоскоклеточную карциному вульвы, карциному базальных клеток, рак, карциному и лимфому матки.
34. Способ по п.32, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.
35. Способ лечения рака яичника, который поддается лечению ингибитором PARP, где способ предусматривает:
a. выявление рака яичника, который может лечиться по меньшей мере одним ингибитором PARP, причем уровень экспрессии PARP во множестве образцов рака яичника повышен;
b. идентификацию по меньшей мере одного корегулируемого гена в указанном множестве образцов;
c. лечение указанного пациента ингибиторами PARP и корегулируемого гена.
36. Способ по п.35, где указанный корегулируемый ген включает IGF1, IGF2, IGFR, EGFR, mdm2, Bcl2, ETS1, MMP-1, MMP-3, MMP-9, uPA, DHFR, TYMS, NFKB, IKK, REL, RELA, RELB, IRAK1, VAV3, AURKA, ERBB3, MIF, VEGF, VEGFR, VEGFR2, CDK1, CDK2, CDK9, фарнезилтрансферазу, UBE2S или их сочетание.
37. Способ по п.35, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.
38. Набор для диагностики или определения стадии заболевания, где набор включает:
a. средства для измерения уровня экспрессии PARP в образце ткани;
b. средства измерения уровня экспрессии генов, которые ранее были отнесены к корегулируемым вместе с PARP; и
c. сопоставления указанных уровней экспрессии PARP и корегулируемых генов с контрольным образцом,
причем уровень экспрессии при сопоставлении с контрольным образцом указывает на наличие заболевания или стадию заболевания.
39. Набор по п.38, где повышение экспрессии PARP и по меньшей мере один корегулируемый ген указывают на наличие заболевания.
40. Набор по п.38, где измеряется уровень мРНК каждого корегулируемого гена.
41. Набор для лечения заболевания, поддающегося лечению ингибитором PARP, где набор включает:
a. средства для измерения уровня экспрессии PARP в образце ткани, причем уровень экспрессии PARP при сопоставлении с контрольным образцом указывает на наличие заболевания, поддающегося лечению ингибитором PARP;
b. средства измерения уровня экспрессии генов, которые ранее были отнесены к корегулируемым вместе с PARP, причем увеличение уровня экспрессии указанных корегулируемых генов указывает на использование ингибитора указанного корегулируемого гена при лечении указанного заболевания; и
c. ингибиторы PARP и указанных корегулируемых генов для лечения указанного заболевания.
42. Набор по п.41, где измеряется уровень мРНК каждого корегулируемого гена.
43. Набор по п.41, где указанный ингибитор PARP представляет собой 4-йодо-3-нитробензамид или его соль.