СПОСОБЫ И НАБОРЫ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ БЕСКЛЕТОЧНЫХ СПЕЦИФИЧЕСКИХ ДЛЯ ПАТОГЕНОВ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ

1. Способ для обнаружения целевой нуклеиновой кислоты, полученной из патогена, у субъекта, включающий:
(а) амплификацию последовательности нуклеиновой кислоты целевой нуклеиновой кислоты, где целевую нуклеиновую кислоту получают из бесклеточной фракции образца крови субъекта, и в результате получают двухцепочечную ДНК, и
(b) обнаружение двухцепочечной ДНК, где наличие двухцепочечной ДНК указывает на присутствие целевой нуклеиновой кислоты у субъекта.
2. Способ по п.1, где целевой нуклеиновой кислотой является ДНК.
3. Способ по п.1, где целевой нуклеиновой кислотой является РНК.
4. Способ по п.1, где бесклеточной фракцией является сыворотка крови.
5. Способ по п.1, где бесклеточной фракцией является плазма крови.
6. Способ по п.1, где патоген представляет собой Mycobacterium tuberculosis (TB).
7. Способ по п.1, где последовательность нуклеиновой кислоты получена из последовательности ДНК Mycobacterium tuberculosis (TB) H37Rv, выбранной из группы, включающей IS6110, IS1084, МРТ 64, rrs, esat6, esat6-like, MDR, rpoB, katG, iniB и их фрагменты.
8. Способ по п.1, где двухцепочечная ДНК имеет 40-60 п.о.
9. Способ по п.1, где объем образца крови составляет 0,2-10 мл.
10. Способ по п.1, где последовательность нуклеиновой кислоты амплифицируют полимеразной цепной реакцией (ПЦР).
11. Способ по п.1, где двухцепочечную ДНК обнаруживают с помощью детектирующего агента, выбранного из группы, включающей флуоресцентно-меченый зонд, интеркалирующий флуоресцентный краситель или праймер Light Upon Extension, (LUX).
12. Способ по п.11, где интеркалирующий флуоресцентный краситель выбирают из группы, включающей SYBR Green, CytoGreen, Eva Green, BOXTO и SYTO9.
13. Способ по п.1, дополнительно включающий концентрирование целевой нуклеиновой кислоты в бесклеточной фракции.
14. Способ по п.1, дополнительно включающий получение бесклеточной фракции из образца крови.
15. Способ по п.1, дополнительно включающий диагностирование TB инфекции у субъекта.
16. Способ по п.15, где TB инфекция является активной.
17. Способ по п.15, где TB инфекция является скрытой.
18. Набор для обнаружения целевой нуклеиновой кислоты, полученной из патогена, у субъекта, содержащий:
(а) один или несколько реагентов или материалов для амплификации последовательности нуклеиновой кислоты целевой нуклеиновой кислоты, полученной из бесклеточной фракции биологического образца субъекта, для получения двухцепочечной ДНК, и
(b) один или несколько реагентов или материалов для обнаружения двухцепочечной ДНК.
19. Набор по п.18, где один или несколько реагентов или материалов для амплификации последовательности целевой нуклеиновой кислоты включают пару праймеров, где двухцепочечная ДНК имеет 40-60 нуклеотидов.
20. Набор по п.18, где патоген представляет собой Mycobacterium tuberculosis (TB).
21. Набор по п.18, где последовательность нуклеиновой кислоты получают из последовательности ДНК Mycobacterium tuberculosis (TB) H37Rv, выбранной из группы, включающей IS6110, IS1084, МРТ 64, rrs, esat6, esat6-like, MDR, rpoB, katG, iniB и их фрагменты.
22. Набор по п.18, где один или несколько реагентов или материалов для обнаружения двухцепочечной ДНК включают интеркалирующий флуоресцентный краситель.