КОМБИНИРОВАННАЯ ТЕРАПИЯ С ПРИМЕНЕНИЕМ T-КЛЕТОК С ХИМЕРНЫМ АНТИГЕННЫМ РЕЦЕПТОРОМ (CAR) И ИНГИБИТОРА КИНАЗЫ

1. Способ лечения, включающий:
(1) введение субъекту, имеющему рак, эффективного количества ингибитора киназы, который представляет собой или включает структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли; и
(2) введение аутологичной T-клеточной терапии субъекту, где указанная T-клеточная терапия включает дозу генетически модифицированных T-клеток, экспрессирующих химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19, где до введения T-клеточной терапии биологический образец был получен у субъекта и обработан, где обработка включает генетическую модификацию T-клеток из образца, необязательно путем введения молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в указанные T-клетки,
где введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере за или приблизительно за 3 дня до получения образца и выполняют по схеме применения, включающей повторные введения ингибитора киназы в интервале введения доз, в течение периода времени, который имеет такую длительность, чтобы, по меньшей мере, включать введение в день или после дня, в который образец получают у субъекта.
2. Способ лечения, включающий:
(1) введение субъекту, имеющему рак, эффективного количества ингибитора киназы, который представляет собой или включает структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли;
(2) получение у субъекта биологического образца и обработку T-клеток указанного образца с получением композиции, включающей генетически модифицированные T-клетки, экспрессирующие химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19; и
(3) введение субъекту аутологичной T-клеточной терапии, включающей дозу генетически модифицированных T-клеток,
где введение ингибитора киназы выполняют по схеме применения, которую начинают по меньшей мере за или приблизительно за 3 дня до получения образца, и которая включает повторные введения ингибитора в интервале введения доз, в течение периода времени, и длится, по меньшей мере, чтобы включать введение соединения в день или после дня, в который образец получают у субъекта.
3. Способ лечения, включающий введение субъекту, имеющему рак, эффективного количества ингибитора киназы, имеющего структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли, где субъект является кандидатом на лечение или подлежит лечению с применением аутологичной T-клеточной терапией, где указанная T-клеточная терапия включает дозу генетически модифицированных T-клеток, экспрессирующих химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19 где:
до введения T-клеточной терапии биологический образец был получен у субъекта и обработан, где обработка включает генетическую модификацию T-клеток из образца, необязательно путем введения молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в указанные T-клетки; и
введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере за или приблизительно за 3 дня до получения образца и выполняют по схеме применения, включающей повторные введения ингибитора в интервале введения доз, в течение периода времени, который длится, по меньшей мере, чтобы включать введение в день или после дня, в который образец получают у субъекта.
4. Способ по п.3, дополнительно включающий введение субъекту T-клеточной терапии.
5. Способ по любому из пп.1, 2 и 4, где после начала введения ингибитора киназы и до введения T-клеточной терапии субъекта подвергали прекондиционированию с применением лимфодеплеционной терапии.
6. Способ по любому из пп.1, 2 и 4, дополнительно включающий, после начала введения ингибитора киназы и до введения T-клеточной терапии, введение лимфодеплеционной терапии субъекту.
7. Способ по п.5 или 6, где введение ингибитора киназы прекращают или останавливают во время лимфодеплеционной терапии.
8. Способ по любому из пп.5-7, где схема применения включает введение ингибитора киназы в течение периода времени, который имеет такую длительность, чтобы, по меньшей мере, включать введение до начала лимфодеплеционной терапии.
9. Способ по любому из пп.5-7, где схема применения включает введение ингибитора киназы в течение периода времени, который включает введение до начала лимфодеплеционной терапии, с последующим прекращением или приостановкой введения ингибитора киназы во время лимфодеплеционной терапии и затем дальнейшее введение ингибитора киназы в течение периода, который длится по меньшей мере в течение 15 дней после начала введения T-клеточной терапии.
10. Способ лечения, включающий:
(1) введение субъекту, имеющему рак, эффективного количества ингибитора киназы, имеющего структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли;
(2) введение лимфодеплеционной терапии субъекту; и
(3) введение аутологичной T-клеточной терапии субъекту, где указанная T-клеточная терапия включает дозу генетически модифицированных T-клеток, экспрессирующих химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19, где до введения T-клеточной терапии, включающей биологический образец, был получен у субъекта и обработан, где обработка включает генетическую модификацию T-клеток из образца, необязательно путем введения молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в указанные T-клетки,
где введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере за или приблизительно за 3 дня до получения получения образца и выполняют по схеме применения, включающей повторное введение ингибитора киназы в интервале введения доз, в течение периода времени, который включает введение до начала лимфодеплеционной терапии, с последующим прекращением или приостановкой введения ингибитора киназы во время лимфодеплеционной терапии, и затем дальнейшее введение ингибитора киназы в течение периода, который длится по меньшей мере в течение 15 дней после начала введения T-клеточной терапии.
11. Способ по п.10, где способ дополнительно включает получение у субъекта биологического образца и обработку T-клеток указанного образца с получением композиции, включающей генетически модифицированные T-клетки, экспрессирующие химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19.
12. Способ по любому из пп.1-11, где введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере за или приблизительно за 4 дня, по меньшей мере за или приблизительно за 5 дней, по меньшей мере за или за 6 дней, по меньшей мере за или приблизительно за 7 дней, по меньшей мере за или приблизительно за 14 дней или больше до получения образца у субъекта.
13. Способ по любому из пп.1-12, где введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере или примерно или приблизительно за 5-7 дней до получения образца у субъекта.
14. Способ по любому из пп.5-13, где введение лимфодеплеционной терапии завершают в течение 7 дней до начала введения T-клеточной терапии.
15. Способ по любому из пп.5-14, где введение лимфодеплеционной терапии завершают за 2-7 дней до начала введения T-клеточной терапии.
16. Способ по любому из пп.9-15, где дальнейшее введение производят в течение периода, который длится в течение 15-29 дней после начала введения T-клеточной терапии.
17. Способ по любому из пп.9-16, где дальнейшее введение ингибитора киназы производят в течение периода, который длится примерно или приблизительно или больше чем три месяца после начала введения T-клеточной терапии.
18. Способ по любому из пп.1-17, где введение ингибитора киназы выполняют один раз в день, в каждый день, в который его вводят во время схемы применения.
19. Способ по любому из пп.1-18, где эффективное количество включает от или приблизительно от 140 мг до или приблизительно до 840 мг или от или приблизительно от 140 мг до или приблизительно до 560 мг в каждый день, в который вводят ингибитор киназы.
20. Способ лечения, включающий:
(1) введение субъекту, имеющему рак, ингибитора киназы, где ингибитор киназы представляет собой или включает структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли; и
(2) введение аутологичной T-клеточной терапии субъекту, где указанная T-клеточная терапия включает дозу генетически модифицированных T-клеток, экспрессирующих химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19, где до введения T-клеточной терапии биологический образец был получен у субъекта и обработан, где обработка включает генетическую модификацию T-клеток из образца, необязательно путем введения молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в указанные T-клетки,
где введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере за или приблизительно за 5-7 дней до получения образца и выполняют по схеме применения, включающей повторное введение ингибитора киназы в интервале введения доз, в течение периода времени, который имеет такую длительность, чтобы, по меньшей мере, включать введение в день или после дня, в который образец получают у субъекта, и дальнейшее введение, которое длится в течение примерно или приблизительно или больше чем трех месяцев после начала введения T-клеточной терапии, где ингибитор киназы вводят в количестве от или приблизительно от 140 мг до или приблизительно до 560 мг один раз в день, в каждый день, в который его вводят во время схемы применения.
21. Способ по п.20, где после начала введения ингибитора киназы и до введения T-клеточной терапии субъекта подвергали прекондиционированию с применением лимфодеплеционной терапии.
22. Способ по п.20, дополнительно включающий, после введения ингибитора киназы и до введения T-клеточной терапии, введение лимфодеплеционной терапии субъекту.
23. Способ по любому из пп.20-22, где введение лимфодеплеционной терапии завершают в течение 7 дней до начала введения T-клеточной терапии.
24. Способ по любому из пп.20-23, где введение лимфодеплеционной терапии завершают за 2-7 дней до начала введения T-клеточной терапии.
25. Способ по любому из пп.22-24, где схема применения включает прекращение или приостановку введения ингибитора киназы во время лимфодеплеционной терапии.
26. Способ лечения, включающий:
(1) введение субъекту, имеющему рак, ингибитора киназы, где ингибитор киназы имеет структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли; и
(2) введение лимфодеплеционной терапии субъекту; и
(3) введение аутологичной T-клеточной терапии субъекту в течение 2-7 дней после завершения лимфодеплеционной терапии, где указанная T-клеточная терапия включает дозу генетически модифицированных T-клеток, экспрессирующих химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19, где до введения T-клеточной терапии биологический образец был получен у субъекта и обработан, где обработка включает генетическую модификацию T-клеток из образца, необязательно путем введения молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в указанные T-клетки,
где введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере за или приблизительно за 5-7 дней до получения образца и выполняют по схеме применения, включающей повторное введение ингибитора киназы в интервале введения доз, включающем введение до начала лимфодеплеционной терапии, с последующим прекращением или приостановкой введения ингибитора киназы во время лимфодеплеционной терапии, и затем дальнейшее введение в течение периода, который длится в течение или больше чем трех месяцев после начала введения T-клеточной терапии, где ингибитор киназы вводят в количестве от или приблизительно от 140 мг до или приблизительно до 560 мг один раз в день, в каждый день, в который его вводят во время схемы применения.
27. Способ по любому из пп.20-26, где способ дополнительно включает получение у субъекта биологического образца и обработку T-клеток в указанном образце с получением композиции, включающей генетически модифицированные T-клетки, экспрессирующие химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19
28. Способ по любому из пп.1-27, где введение ингибитора киназы в день, в который его вводят, производят в количестве от или приблизительно от 280 мг до или приблизительно до 560 мг.
29. Способ по любому из пп.1-28, где введение ингибитора киназы начинают по меньшей мере за или приблизительно за 7 дней до получения образца у субъекта.
30. Способ по любому из пп.1-29, где:
введение ингибитора киназы начинают от или приблизительно от 30 до или приблизительно до 40 дней до начала введения T-клеточной терапии;
образец получают у субъекта от или приблизительно от 23 до или приблизительно до 38 дней до начала введения T-клеточной терапии; и/или
лимфодеплеционную терапию завершают за или приблизительно за 5-7 дней до начала введения T-клеточной терапии.
31. Способ по любому из пп.1-30, где:
введение ингибитора киназы начинают за или приблизительно за 35 дней до начала введения T-клеточной терапии;
образец получают у субъекта от или приблизительно от 28 до или приблизительно до 32 дней до начала введения T-клеточной терапии; и/или
лимфодеплеционную терапию завершают за или приблизительно за 5-7 дней до начала введения T-клеточной терапии.
32. Способ по любому из пп.5-31, где лимфодеплеционная терапия включает введение флударабина и/или циклофосфамида.
2
2
2
2
2
33. Способ по любому из пп.5-32, где лимфодеплеционная терапия включает введение циклофосфамида в количестве или приблизительно 200-400 мг/м, необязательно в количестве или приблизительно 300 мг/м, включительно, и/или флударабина в количестве или приблизительно 20-40 мг/м, необязательно 30 мг/м, ежедневно в течение 2-4 дней, необязательно в течение 3 дней, или где лимфодеплеционная терапия включает введение циклофосфамида в количестве или приблизительно 500 мг/м.
34. Способ по любому из пп.5-33, где:
2
2
лимфодеплеционная терапия включает введение циклофосфамида в количестве или приблизительно 300 мг/м и флударабина в количестве или приблизительно 30 мг/м ежедневно в течение 3 дней; и/или
2
2
лимфодеплеционная терапия включает введение циклофосфамида в количестве или приблизительно 500 мг/м и флударабина в количестве или приблизительно 30 мг/м ежедневно в течение 3 дней.
35. Способ по любому из пп.1-34, где введение ингибитора киназы в каждый день, когда его вводят, производят в количестве примерно или приблизительно 140 мг.
36. Способ по любому из пп.1-34, где введение ингибитора киназы в каждый день, когда его вводят, производят в количестве примерно или приблизительно 280 мг.
37. Способ по любому из пп.1-34, где введение ингибитора киназы в каждый день, когда его вводят, производят в количестве примерно или приблизительно 420 мг.
38. Способ по любому из пп.1-34, где введение ингибитора киназы в каждый день, когда его вводят, производят в количестве примерно или приблизительно 560 мг.
39. Способ по любому из пп.9-38, где период длится в течение примерно или приблизительно или больше чем четырех месяцев после начала введения T-клеточной терапии или примерно или приблизительно или больше чем пяти месяцев после начала введения T-клеточной терапии.
40. Способ по любому из пп.9-39, где дальнейшее введение производят в течение периода, который длится примерно или приблизительно или больше чем шесть месяцев.
41. Способ по любому из пп.9-40, где:
дальнейшее введение ингибитора киназы прекращают в конце периода, если в конце периода субъект демонстрирует полный ответ (CR) после лечения; или
дальнейшее введение ингибитора киназы прекращают в конце периода, если в конце периода рак показал прогрессирование или рецидив после ремиссии после лечения.
42. Способ по любому из пп.9-41, где период длится в течение от или примерно или приблизительно от трех месяцев до или шести месяцев.
43. Способ по любому из пп.9-42, где период длится в течение примерно или приблизительно трех месяцев после начала введения T-клеточной терапии.
44. Способ по любому из пп.9-42, где период длится в течение примерно или приблизительно 3 месяцев после начала введения T-клеточной терапии, если субъект за или приблизительно за 3 месяца достиг полного ответа (CR) после лечения, или рак показал прогрессирование или рецидив после ремиссии после лечения.
45. Способ по п.44, где период длится в течение примерно или приблизительно 3 месяцев после начала введения T-клеточной терапии, если субъект за 3 месяца достиг полного ответа (CR).
46. Способ по любому из пп.9-42, где период длится в течение примерно или приблизительно шести месяцев после начала введения T-клеточной терапии.
47. Способ по любому из пп.9-42, где период длится в течение примерно или приблизительно 6 месяцев после начала введения T-клеточной терапии, если субъект за или приблизительно за 6 месяцев достиг полного ответа (CR) после лечения, или рак показал прогрессирование или рецидив после ремиссии после лечения.
48. Способ по п.47, где период длится в течение примерно или приблизительно 6 месяцев после начала введения T-клеточной терапии, если субъект достиг за 6 месяцев полного ответа (CR).
49. Способ по любому из пп.9-48, где дальнейшее введение продолжают в течение всего периода, даже если субъект достиг полного ответа (CR) в момент времени до конца периода.
50. Способ по любому из пп.9-49, где субъект достигает полного ответа (CR) в момент во время периода и до конца периода.
51. Способ по любому из пп.9-40, 42, 43, 44, 46 и 47, дополнительно включающий продолжение дальнейшего введения после окончания периода, если в конце периода субъект демонстрирует частичный ответ (PR) или стабилизацию заболевания (SD).
52. Способ по любому из пп.9-40, 42, 43, 44, 46, 47 и 51, где дальнейшее введение продолжают в течение больше чем шести месяцев, если за или приблизительно за шесть месяцев субъект демонстрирует частичный ответ (PR) или стабилизацию заболевания (SD) после лечения.
53. Способ по п.51 или 52, где дальнейшее введение продолжают, пока субъект не достигнет полного ответа (CR) после лечения, или пока рак не прогрессирует или не рецидивирует после ремиссии после лечения.
54. Способ по любому из пп.1-53, где ингибитор киназы ингибирует тирозинкиназу Брутона (BTK) и/или ингибирует IL2-индуцируемую T-клеточную киназу (ITK).
50
55. Способ по любому из пп.1-54, где ингибитор киназы ингибирует ITK, и ингибитор ингибирует ITK или ингибирует ITK с полумаксимальной ингибирующей концентрацией (IC) меньше или меньше чем приблизительно 1000 нМ, 900 нМ, 800 нМ, 600 нМ, 500 нМ, 400 нМ, 300 нМ, 200 нМ, 100 нМ или меньше.
56. Способ по любому из пп.1-55, где субъекту ранее вводили ингибитор киназы до введения ингибитора киназы в (1).
57. Способ по любому из пп.1-55, где субъекту ранее не вводили ингибитор киназы до введения ингибитора киназы в (1).
58. Способ по любому из пп.1-57, где:
(i) субъект и/или рак: (a) является резистентным к ингибированию тирозинкиназы Брутона (BTK), и/или (b) включает популяцию клеток, которые являются резистентными к ингибированию ингибитором киназы, где популяция клеток необязательно представляет собой или включает популяцию B-клеток и/или не включает T-клетки;
(ii) субъект и/или рак включает мутацию в нуклеиновой кислоте, кодирующей BTK, где мутация необязательно способна к уменьшению или предотвращению ингибирования BTK ингибитором киназы, где мутация необязательно представляет собой C481S;
(iii) субъект и/или рак включает мутацию в нуклеиновой кислоте, кодирующей фосфолипазу C гамма 2 (PLC-гамма 2), где мутация необязательно приводит к конститутивной сигнальной активности, где мутация необязательно представляет собой R665W или L845F;
(iv) на момент начала введения ингибитора киназы в (1) и, необязательно, на момент начала введения T-клеточной терапии, субъект перенес рецидив после ремиссии после предыдущего лечения с применением, или считался рефрактерный к предыдущему лечению с применением, ингибитора киназы и/или терапии ингибитором BTK;
(v) на момент начала введения ингибитора киназы в (1) и, необязательно, на момент начала T-клеточной терапии, у субъекта наблюдали прогрессирование после предыдущего лечения ингибитором и/или терапией ингибитором BTK, где субъект необязательно продемонстрировал прогрессирующее заболевание как наилучший ответ на предыдущее лечение или прогрессирование после предыдущего ответа на предыдущее лечение; и/или
(vi) на момент начала введения ингибитора киназы в (1) и, необязательно, на момент начала T-клеточной терапии субъект показал ответ, меньший, чем полный ответ (CR), после предыдущего лечения по меньшей мере за 6 месяцев с применением ингибитора и/или терапии ингибитором BTK.
59. Способ по любому из пп.1-58, где рак является B-клеточной неоплазией.
60. Способ по п.59, где B-клеточная неоплазия является лимфомой.
61. Способ по п.60, где лимфома является неходжкинской лимфомой (НХЛ).
62. Способ по п.61, где НХЛ включает агрессивную НХЛ, диффузную B-крупноклеточную лимфому (ДВККЛ), ДВККЛ-БДУ, необязательно трансформировавшуюся из индолентной; ВЭБ-положительные ДВККЛ-БДУ; богатую T-клетками/гистиоцитами B-крупноклеточную лимфому; первичную медиастинальную B-крупноклеточную лимфому (ПМВККЛ); фолликулярную лимфому (FL), необязательно фолликулярную лимфому степени 3B (FL3B); и/или низкодифференцированную B-клеточную лимфому с перестройками MYC и BCL2 и/или BCL6 и гистологией ДВККЛ (с двойным/тройным поражением)
63. Способ по любому из пп.1-62, где субъекта идентифицируют или идентифицировали как имеющего Статус общего состояния по шкале Восточной объединенной онкологической группы (ECOG) меньше или равный 1.
64. Способ по любому из пп.1-63, где ингибитор киназы вводят перорально.
65. Способ по любому из пп.1-64, где CD19 является человеческим CD19.
66. Способ по любому из пп.1-65, где химерный антигенный рецептор (CAR) включает внеклеточный антигенраспознающий домен, который специфично связывается с CD19, и внутриклеточный сигнальный домен, включающий ITAM.
67. Способ по п.66, где внутриклеточный сигнальный домен включает сигнальный домен CD3-дзета цепи (CD3ζ), необязательно CD3-дзета цепи человека.
68. Способ по п.66 или 67, где химерный антигенный рецептор (CAR) дополнительно включает костимулирующую сигнальную область.
69. Способ по п.68, где костимулирующая сигнальная область включает сигнальный домен CD28 или 4-1BB, необязательно CD28 человека или 4-1BB человека.
70. Способ по п.68 или 69, где костимулирующий домен представляет собой или включает сигнальный домен 4-1BB человека.
71. Способ по любому из пп.1-70, где:
CAR включает scFv, специфичный к CD19; трансмембранный домен; цитоплазматический сигнальный домен, полученный из костимулирующей молекулы, которая необязательно представляет собой или включает 4-1BB, необязательно 4-1BB человека; и цитоплазматический сигнальный домен, полученный из первичной сигнальной ITAM-содержащей молекулы, который необязательно представляет собой или включает CD3дзета сигнальный домен, необязательно сигнальный домен CD3дзета человека; и где необязательно CAR дополнительно включает спейсер между трансмембранным доменом и scFv;
CAR включает, в этом порядке, scFv, специфичный к CD19; трансмембранный домен; цитоплазматический сигнальный домен, полученный из костимулирующей молекулы, который необязательно представляет собой или включает сигнальный домен 4-1BB, необязательно сигнальный домен 4-1BB человека; и цитоплазматический сигнальный домен, полученный из первичной сигнальной ITAM-содержащей молекулы, который необязательно является сигнальным доменом CD3-дзета, необязательно сигнальным доменом CD3-дзета человека; или
CAR включает, в этом порядке, scFv, специфичный к CD19; спейсер; трансмембранный домен, цитоплазматический сигнальный домен, полученный из костимулирующей молекулы, которая необязательно является сигнальным доменом 4-1BB, и цитоплазматический сигнальный домен, полученный из первичной сигнальной ITAM-содержащей молекулы, который необязательно представляет собой или включает сигнальный домен CD3 дзета.
72. Способ по п.71, где
1
2
1
2
CAR включает спейсер, причем спейсер является полипептидным спейсером, который: (a) включает или состоит из всей или части шарнирной области иммуноглобулина или ее модифицированной версии или включает приблизительно 15 аминокислот или меньше и не включает внеклеточную область CD28 или внеклеточную область CD8, (b) включает или состоит из всей или части шарнирной области иммуноглобулина, необязательно шарнира IgG4, или ее модифицированной версии, и/или включает приблизительно 15 аминокислот или меньше и не включает внеклеточную область CD28 или внеклеточную область CD8 или (c) имеет длину примерно или приблизительно 12 аминокислот и/или включает или состоит из всей или части шарнирной области иммуноглобулина, необязательно IgG4, или ее модифицированной версии; или (d) имеет или состоит из последовательности SEQ ID NO: 1, последовательности, кодируемой SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, или вариант любой из предшествующих обладающий по меньшей мере 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или большей идентичностью последовательности с ними, или (e) включает или состоит из формулы XPPXP (SEQ ID NO:58), где X является глицином, цистеином или аргинином, и X является цистеином или треонином; и/или
костимулирующий домен включает SEQ ID NO: 12 или его вариант, обладающий по меньшей мере 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или большей идентичностью последовательности с ней; и/или
первичный сигнальный домен включает SEQ ID NO: 13 или 14 или 15, обладающий по меньшей мере 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или большей идентичностью последовательности с ней; и/или
H
L
scFv включает последовательность CDRL1 RASQDISKYLN (SEQ ID NO: 35), последовательность CDRL2 SRLHSGV (SEQ ID NO: 36) и/или последовательность CDRL3 GNTLPYTFG (SEQ ID NO: 37), и/или последовательность CDRH1 DYGVS (SEQ ID NO: 38), последовательность CDRH2 VIWGSETTYYNSALKS (SEQ ID NO: 39) и/или последовательность CDRH3 YAMDYWG (SEQ ID NO: 40), или где scFv включает вариабельную область тяжелой цепи FMC63 и вариабельную область легкой цепи FMC63, и/или последовательность CDRL1 FMC63, последовательность CDRL2 FMC63, последовательность CDRL3 FMC63, последовательность CDRH1 FMC63, последовательность CDRH2 FMC63 и последовательность CDRH3 FMC63, или связывается с тем же эпитопом или конкурирует за связывание с любым из предшествующих, и где scFv необязательно включает, в этом порядке, V, линкер, необязательно включающий SEQ ID NO: 41, и V, и/или scFv включает гибкий линкер и/или включает аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 42.
5
8
6
8
6
8
7
8
7
8
73. Способ по любому из пп.1-72, где доза генетически модифицированных T-клеток включает от или приблизительно от 1×10 до 5×10 суммарных CAR-экспрессирующих T-клеток, от 1×10 до 2,5×10 суммарных CAR-экспрессирующих T-клеток, от 5×10 до 1×10 суммарных CAR-экспрессирующих T-клеток, от 1×10 до 2,5×10 суммарных CAR-экспрессирующих T-клеток, от 5×10 до 1×10 суммарных CAR-экспрессирующих T-клеток, все включительно.
5
5
5
6
6
6
7
7
7
8
8
8
74. Способ по любому из пп.1-73, где доза генетически модифицированных T-клеток включает по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 1×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 2,5×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 5×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 1×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 2,5×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 5×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 1×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 2,5×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 5×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 1×10 CAR-экспрессирующих клеток, по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 2,5×10 CAR-экспрессирующих клеток, или по меньшей мере или по меньшей мере приблизительно 5×10 CAR-экспрессирующих клеток.
7
75. Способ по любому из пп.1-74, где доза генетически модифицированных T-клеток включает примерно или приблизительно 5×10 суммарных CAR-экспрессирующих T-клеток.
8
76. Способ по любому из пп.1-75, где доза генетически модифицированных T-клеток включает примерно или приблизительно 1×10 CAR-экспрессирующих клеток.
77. Способ по любому из пп.1-76, где доза генетически модифицированных T-клеток включает CD4+ T-клетки, экспрессирующие CAR, и CD8+ T-клетки, экспрессирующие CAR, и введение дозы включает введение множества отдельных композиций, где указанное множество отдельных композиций включает первую композицию, включающую одни из CD4+ T-клеток и CD8+ T-клеток, и вторую композицию, включающую другие из CD4+ T-клеток или CD8+ T-клеток.
78. Способ по п.77, где
первую композицию и вторую композицию вводят с интервалом 0-12 часов, с интервалом 0-6 часов или с интервалом 0-2 часа, или где введение первой композиции и введение второй композиции выполняют в один день, выполняют с интервалом от приблизительно 0 до приблизительно 12 часов, с интервалом от приблизительно 0 до приблизительно 6 часов или от приблизительно 0 до 2 часов; и/или
начало введения первой композиции и начало введения второй композиции выполняют с интервалом приблизительно от 1 минута и приблизительно до 1 часа или приблизительно от 5 минут до приблизительно 30 минут.
79. Способ по п.77 или п.78, где первую композицию и вторую композицию вводят с интервалом не больше 2 часов, не больше 1 часа, не больше 30 минут, не больше 15 минут, не больше 10 минут или не больше 5 минут.
80. Способ по любому из пп.77-79, где первая композиция включает CD4+ T-клетки.
81. Способ по любому из пп.77-79, где первая композиция включает CD8+ T-клетки.
82. Способ по любому из пп.77-81, где первую композицию вводят до второй композиции.
83. Способ по любому из пп.1-82, где дозу клеток вводят парентерально, необязательно внутривенно.
84. Способ по любому из пп.1-83, где T-клетки являются первичныит T-клетками, полученными из образца субъекта.
85. Способ по любому из пп.1-82, где T-клетки являются аутологичными для субъекта.
86. Способ по любому из пп.1-85, где обработка включает:
выделение T-клеток, необязательно CD4+ и/или CD8+ T-клеток, из образца, полученного у субъекта, с получением, таким образом, исходной композиции, включающей первичные T-клетки; и
введение молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в T-клетки исходной композиции.
87. Способ по п.86, где выделение включает выполнение иммуноафинного отбора.
88. Способ по любому из пп.1-87, где биологический образец представляет собой или включает образец цельной крови, образец лейкотромбоцитарного слоя, образец мононуклеарных клеток периферической крови (МКПК), нефракционированный образец T-клеток, образец лимфоцитов, образец лейкоцитов, продукт афереза или продукт лейкафереза.
89. Способ по любому из пп.86-88, где до введения, обработка включает инкубирование исходной композиции при стимулирующих условиях, где указанные стимулирующие условия включают присутствие стимулирующего реагента, способного к активации одного или более внутриклеточных сигнальных доменов одного или более компонентов комплекса TCR и/или одного или более внутриклеточных сигнальных доменов одной или более костимулирующих молекул, с получением в результате стимулированной композиции, где молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующая CAR, вводятся в стимулированную композицию.
90. Способ по п.89, где стимулирующий реагент включает основное средство, которое специфично связывается с членом комплекса TCR, необязательно который специфично связывается с CD3.
91. Способ по п.90, где стимулирующий реагент дополнительно включает дополнительное средство, которое специфично связывается с T-клеточной костимулирующей молекулой, где необязательно костимулирующая молекула выбрана из CD28, CD137 (4-1-BB), OX40 или ICOS.
92. Способ по п.90 или 91, где основное и/или дополнительное средства включают антитело, где необязательно стимулирующий реагент включает инкубирование с антителом против CD3 и антителом против CD28 или их антигенсвязывающим фрагментом.
93. Способ по любому из пп.90-92, где основное средство и/или дополнительное средство присутствует на поверхности твердой подложки.
94. Способ по п.93, где твердая подложка представляет собой или включает сферу, где сфера необязательно является магнитной или суперпарамагнитной.
95. Способ по п.94, где сфера включает диаметр больше или больше чем приблизительно 3,5 мкм, но не больше чем приблизительно 9 мкм или не больше чем приблизительно 8 мкм, или не больше чем приблизительно 7 мкм, или не больше чем приблизительно 6 мкм, или не больше чем приблизительно 5 мкм.
96. Способ по п.94 или 95, где сфера включает диаметр примерно или приблизительно 4,5 мкм.
97. Способ по любому из пп.1-96, где введение включает трансдукцию клеток стимулированной композиции вирусным вектором, включающим полинуклеотид, кодирующий рекомбинантный рецептор.
98. Способ по п.97, где вирусный вектор является ретровирусным вектором.
99. Способ по п.97 или 98, где вирусный вектор является лентивирусным вектором или гаммаретровирусным вектором.
100. Способ по любому из пп.86-99, где обработка дополнительно включает, после ведения, культивирование T-клеток, где культивирование необязательно проводят при условиях, которые приводят к пролиферации или экспансии клеток, с получением готовой композиции, включающей T-клеточную терапию.
101. Способ по п.100, где после культивирования способ дополнительно включает включение клеток готовой композиции в состав для криоконсервации и/или для введения T-клеточной терапии субъекту, где включение в состав необязательно производят в присутствии фармацевтически приемлемого вспомогательного вещества.
102. Способ по любому из пп.1-101, где субъектом является человек.
103. Способ по любому из пп.1-102, где:
по меньшей мере 35%, по меньшей мере 40% или по меньшей мере 50% субъектов, подвергнутых лечению согласно методу, достигают полного ответа (CR), который сохраняется или сохраняется по меньшей мере у 60, 70, 80, 90 или 95% субъектов, достигающих CR, в течение примерно или больше чем 6 месяцев или примерно или больше чем 9 месяцев; и/или
где по меньшей мере 60, 70, 80, 90 или 95% субъектов, достигающих CR за шесть месяцев, сохраняют ответ, сохраняют CR, и/или выживают или выживают без прогрессирования в течение больше чем примерно или больше чем 3 месяца, и/или больше, чем 6 месяцев и/или больше чем девять месяцев; и/или
по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60% или по меньшей мере 70% субъектов, подвергнутых лечению согласно способу, достигают объективного ответа (OR), где необязательно OR сохраняется или сохраняется по меньшей мере у 60, 70, 80, 90 или 95% субъектов, достигающих OR, в течение примерно или больше чем 6 месяцев или примерно или больше чем 9 месяцев; и/или
где по меньшей мере 60, 70, 80, 90 или 95% субъектов, достигающих OR за шесть месяцев, сохраняют ответ или выживают в течение больше чем примерно или больше чем 3 месяца и/или примерно или больше чем 6 месяцев.
104. Способ по любому из пп.60-103, где на момент или непосредственно перед введением дозы клеток субъект перенес рецидив после ремиссии после лечения с применением, или стал рефрактерным к одной или более предыдущих терапий для лечения лимфомы, необязательно НХЛ, необязательно одной, двух или трех предыдущих терапий, отличных от другой дозы клеток, экспрессирующих CAR.
105. Способ по любому из пп.60-104, где на момент или до введения T-клеточной терапии, включающей дозу клеток:
субъекта идентифицируют или идентифицировали как имеющего лимфому с двойным/тройным поражением;
субъекта идентифицируют или идентифицировали как имеющего химиорефрактерную лимфому, необязательно химиорефрактерную ДВККЛ; и/или
субъект не достиг полного ответа (CR) в ответ на предшествующую терапию.
106. Набор, включающий одну или более единичных доз ингибитора киназы, который представляет собой или включает структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли и инструкции по введению одной или более единичных доз субъекту, имеющему рак, который является кандидатом на лечение с или подлежит лечению аутологичной T-клеточной терапией, где указанная T-клеточная терапия включает дозу генетически модифицированных T-клеток, экспрессирующих химерный антигенный рецептор (CAR), который специфично связывается с CD19, и где, до введения T-клеточной терапии, биологический образец получают у субъекта и обрабатывают, где обработка включает генетическую модификацию T-клеток из образца, необязательно путем введения нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в T-клетки,
где в инструкциях определены условия начала введения единичной дозы ингибитора киназы субъекту за или по меньшей мере приблизительно за 3 дня до получения образца и по схеме применения, включающей повторные введения одной или более единичных доз в интервале введения доз, в течение периода времени, который имеет такую длительность, чтобы, по меньшей мере, включать введение в день или после дня, в который образец получают у субъекта.
107. Набор по п.106, где инструкции дополнительно определяют условия введения T-клеточной терапии субъекту.
108. Набор по п.106 или 107, где инструкции дополнительно определяют условия, после начала введения ингибитора киназы и до введения T-клеточной терапии, введения лимфодеплеционной терапии субъекту.
109. Набор по п.108, где в инструкциях указано, что введение ингибитора киназы должно быть прекращено во время введения лимфодеплеционной терапии.
110. Набор по п.108 или 109, где в инструкциях указано, что схема применения включает введение ингибитора киназы в течение периода времени, который длится по меньшей мере до начала лимфодеплеционной терапии.
111. Набор по любому из пп.108-110, где в инструкциях указано, что схема применения включает введение ингибитора киназы в течение периода времени, который включает введение до начала лимфодеплеционной терапии, с последующим прекращением или приостановкой введения ингибитора киназы во время лимфодеплеционной терапии, и затем дальнейшее введение ингибитора киназы в течение периода, который длится по меньшей мере в течение 15 дней после начала введения T-клеточной терапии.
112. Набор, включающий одну или более единичных доз ингибитора киназы, который представляет собой или включает структуру
,
или его фармацевтически приемлемой соли и инструкции по проведению способов по любому из пп.1-105.
113. Изделие, включающее набор по любому из пп.106-112.