METHOD FOR IDENTIFICATION OF A BACTERIAL GENE COMPOSITION INVOLVED IN SYNTHESIS AND METABOLISM OF DIFFERENT NEUROACTIVE COMPOUNDS IN MICROBIOMES AND INDIVIDUAL BACTERIAL GENOMES
СПОСОБ ИДЕНТИФИКАЦИИ В МИКРОБИОМАХ И ОТДЕЛЬНЫХ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОМАХ КОМПОЗИЦИИ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В СИНТЕЗЕ И МЕТАБОЛИЗМЕ РАЗЛИЧНЫХ НЕЙРОАКТИВНЫХ СОЕДИНЕНИЙ

Изобретение относится к способу идентификации бактериальных генов, участвующих в синтезе и метаболизме нейроактивных соединений в микробиомах и отдельных геномах бактерий, в частности в микробиоме кишечника человека. Может быть использовано в медицине, медицинской микробиологии и неврологии. В способе используется набор из 45 пар олигонуклеотидов (праймеров) для ПЦР анализа общей геномной ДНК. Праймеры подобраны к десяти ключевым генам, кодирующим ферменты, участвующие в синтезе и метаболизме нейроактивных соединений: серотонина, дофамина, гистамина, мелатонина, гамма-аминомасляной кислоты, тирамина, спермидина, масляной кислоты, газотрансмиттера NO, выявленные в геномах 27 доминирующих видов бактерий кишечной микробиоты человека. Разработанные пары праймеров можно использовать для отдельного поиска выборочных генов нейроактивных соединений в отдельных геномах бактерий и для мониторинга целого микробиома. Предлагаемые наборы пар праймеров можно применять в качестве диагностических систем для исследования микробиоты в норме и при патологиях. Праймеры сконструированы таким образом, что их можно использовать для определения уровня транскриптов отдельных генов с применением метода ПЦР анализа в режиме реального времени.