СПОСОБЫ И БЕЛКИ ДЛЯ ПРОФИЛАКТИЧЕСКОГО И/ИЛИ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОГО ЛЕЧЕНИЯ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗВАННЫХ ЧЕТЫРЬМЯ СЕРОТИПАМИ ВИРУСА ДЕНГЕ И ДРУГИМИ ФЛАВИВИРУСАМИ

1. Топографическая и высококонсервативная область, характеризующаяся тем, что она находится на зрелом вирионе, и которая представляет эпитоп, имеющийся у флавивирусов, который может быть использован при разработке молекул широкого спектра действия для профилактики и/или лечения инфекций, вызванных Вирусом Денге 1-4 и другими флавивирусами.
2. Топографическая и высококонсервативная область по п.1, где эта область представляет собой эпитоп Е-белка из оболочки флавивирусов, который определяется следующими остатками Е-белка из Вируса Денге 2 или соответствующих эпитопов из других флавивирусов: ASN67, THR69, THR70, SER72, ARG73, CYS74, LEU82, GLU84, GLU85, ASP87, VAL97, ARG99, GLY100, TRP101, GLY102, ASN103, GLY104, CYS105, GLY106, MET118, HIS244, LYS246, LYS247, GLN248, VAL252.
3. Топографическая область по п.1, характеризующаяся тем, что она находится на поверхности Е-белка следующих флавивирусов: Вируса Западного Нила, Вируса Энцефалита Сент-Луис, Денге 1, Денге 2, Денге 3, Денге 4, Вируса Японского Энцефалита, Вируса Кунжин, Вируса Болезни Леса Киасанур, Вируса Клещевого Энцефалита, Вируса Долины Муррей, Вируса ЛАНГАТ, Вируса Шотландского Энцефалита Овец и Вируса Повассан.
4. Молекулы, используемые для профилактики и/или лечения инфекций, вызванных Вирусом Денге 1-4 и другими флавивирусами, основанные на топографической области, описанной в п.1, характеризующиеся их способностью индуцировать ответ нейтрализующих антител, которые перекрестно взаимодействуют с четырьмя серотипами Вируса Денге и другими флавивирусами у индивидуумов, иммунизированных указанными молекулами.
5. Молекулы по п.4, где указанные молекулы представляют собой рекомбинантные белки или химерные пептиды с идентификационными номерами последовательности 14 и 29-50.
6. Молекулы по п.4, которые являются рекомбинантными белками или химерными пептидами, первичная структура которых определяется последовательностью A-B-L-C, где А представляет собой последовательность пептида из 0-30 аминокислот, В представляет собой последовательность фрагмента Leu237-Val252 Е-белка из Вируса Денге 2 или гомологичную последовательность из Вируса Денге 1, 3, 4 или любого другого флавивируса, L представляет собой последовательность из 3-10 аминокислот, которая функционирует в качестве стабилизирующего линкера, и С представляет собой последовательность фрагмента Lys64-Thr120 Е-белка из Вируса Денге 2 или гомологичную последовательность из вируса Денге 1, 3, 4 или любого другого флавивируса.
7. Молекулы по п.4, которые являются рекомбинантными белками или химерными пептидами, первичная структура которых определяется последовательностью A-C-L-B, где А представляет собой последовательность пептида из 0-30 аминокислот, В представляет собой последовательность фрагмента Leu237-Val252 Е-белка из Вируса Денге 2 или гомологичную последовательность из Вируса Денге 1, 3, 4 или любого другого флавивируса, L представляет собой последовательность из 3-10 аминокислот, которая функционирует в качестве стабилизирующего линкера, и С представляет собой последовательность фрагмента Lys64-Thr120 Е-белка из вируса Денге 2 или гомологичную последовательность Вируса Денге 1, 3, 4 или любого другого флавивируса.
8. Молекула по пп.6 и 7, в которой А представляет собой бактериальный сигнальный пептид.
9. Молекула по пп.6 и 7, в которой А представляет собой сигнальный пептид дрожжей или млекопитающего.
10. Молекула, характеризующаяся тем, что она образована молекулами, описанными в пп.4-9, и N- или C-концевым слиянием с одним или несколькими пептидными или белковыми фрагментами, которые усиливают ее протективный или терапевтический эффект и/или облегчают ее очистку и/или детекцию.
11. Молекула по п.10, в которой партнер по N- или C-концевому слиянию представляет собой один или несколько пептидных или белковых фрагментов, содержащих эпитопы хелперных Т-клеток.
12. Молекула по п.10, в которой партнер по N- или C-концевому слиянию представляет собой гистидиновую метку.
13. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок, соответствующий пп.5-7.
14. Прокариотическая или эукариотическая клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по п.13.
15. Фармацевтическая композиция, характеризующаяся содержанием одной или нескольких молекул по пп.4-7, способных к индуцированию у принимающего организма иммунного ответа нейтрализующих и протективных антител, которые являются перекрестно-реактивными с Вирусом Денге 1-4.
16. Фармацевтическая композиция, характеризующаяся содержанием одной или нескольких молекул по пп.4-7, способных к индуцированию у принимающего организма иммунного ответа нейтрализующих и протективных антител, которые являются перекрестно-реактивными с другими флавивирусами.
17. Фармацевтическая композиция, основанная на применении живых векторов или «голой» ДНК, содержащих гены, кодирующие белки, описанные в пп.4-7, характеризующаяся способностью индуцировать у принимающего организма иммунный ответ нейтрализующих и протективных антител, которые являются перекрестно-реактивными с Вирусом Денге 1-4 и другими флавивирусами.
18. Молекулы по пп.5-7, пригодные в качестве диагностических реагентов для детекции антител к флавивирусу.
19. Молекулы, основанные на топографической области, описанной в пп.1-3, характеризующиеся их способностью предотвращать или ослаблять вирусную инфекцию благодаря их взаимодействию с указанной топографической областью, пригодные для профилактики и/или лечения инфекций, вызванных Вирусом Денге 1-4 и другими флавивирусами.
20. Молекула по п.19, где указанная молекула представляет собой человеческое антитело или антитело, продуцируемое в других видах.
21. Молекула по п.20, где указанное антитело является перекрестно-реактивным с различными флавивирусами и является нейтрализующим для вирусной инфекции.
22. Молекула по п.19, применяемая для профилактики и/или лечения инфекций, вызванных Вирусом Денге 1-4 или другими флавивирусами, где указанная молекула представляет собой рекомбинантный или протеолитический фрагмент антитела.
23. Молекула по п.22, где указанная молекула представляет собой рекомбинантный одноцепочечный фрагмент Fv антитела (scFv).
24. Молекула по п.23, характеризующаяся тем, что является связанной с помощью спейсеров или без их помощи с белковой последовательностью, которая придает указанной молекуле способность собираться в виде молекулы с поливалентным связыванием со зрелыми вирионами.
25. Молекула по п.24, в которой белковая последовательность, связанная с указанной молекулой, содержит спейсер и шарнир, CH2 и CH3 области человеческого иммуноглобулина с последовательностью, представленной в последовательности No.55 и 56.
26. Молекула по п.24, в которой белковая последовательность, связанная с указанной молекулой, содержит спейсер и домен тримеризации с последовательностью, представленной в последовательности No.54.
27. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок, соответствующий пп.20-26.
28. Прокариотические или эукариотические клетки-хозяева, содержащие нуклеиновую кислоту по п.27.
29. Фармацевтическая композиция, характеризующаяся содержанием одной или нескольких молекул по пп.20-26, способная к предотвращению или ослаблению инфекции, вызванной Вирусом Денге 1-4.
30. Фармацевтическая композиция, характеризующаяся содержанием одной или нескольких молекул по пп.20-26, способная к предотвращению или ослаблению инфекции, вызванной другими флавивирусами.
31. Синтетические или рекомбинантные белковые или пептидные молекулы по пп.20-26, применяемые в качестве диагностических реагентов для детекции флавивирусов.
32. Способ, применимый для обнаружения терапевтических молекул-кандидатов широкого спектра действия против флавивирусов, который включает контактирование таких молекул с областью или консервативным эпитопом Е-белка по пп.1-3, где это контактирование или связывание показывает, что указанная молекула представляет собой терапевтический кандидат широкого спектра действия.
33. Способ по п.32, где указанная молекула выбрана среди следующих классов соединений: белков, пептидов, пептидомиметиков и малых молекул.
34. Способ по п.32, где указанная молекула включена в библиотеку соединений.
35. Способ по п.34, где указанная библиотека соединений получена с помощью комбинаторных способов.
36. Способ по п.32, где указанное контактирование измеряют с помощью in vitro анализа.
37. Способ по п.36, где указанный анализ осуществляют посредством блокирования связывания молекул по пп.20-24 с консервативной областью по пп.1-3.
38. Способ по п.36, где указанный способ осуществляют посредством блокирования связывания молекул по пп.20-24 с белковыми молекулами по пп.4-7.
39. Способ по п.32, где указанное объединение измеряют с помощью in vivo анализа.
40. Способ по п.32, где указанный способ представляет собой компьютерный способ, который включает: 1) атомные координаты, соответствующие остаткам, которые образуют высококонсервативную область Е-белка по пп.1-3, и указанные координаты являются доступными из баз данных белковых структур или смоделированы с помощью компьютерных способов, или экспериментально определены, 2) атомные координаты молекул, которые были экспериментально определены или смоделированы с помощью компьютерных способов, 3) компьютерную процедуру молекулярного докинга, которая дает возможность определить, действительно ли молекула способна контактировать с высококонсервативной областью по пп.1-3.