АНТИТЕЛА ПРОТИВ КЛАУДИНА И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ

1. Анти-клаудин 18.2 (анти-CLDN18.2) антитело, содержащее полумаксимальную эффективную концентрацию (EC50), которая ниже, чем EC50 референсного антитела 175D10,
где референсное антитело 175D10 содержит последовательность тяжелой цепи (HC) SEQ ID NO:98 и последовательность легкой цепи (LC) SEQ ID NO:99.
2. Анти-клаудин 18.2 (анти-CLDN18.2) антитело, содержащее по меньшей мере одну мутацию в сайте посттрансляционной модификации.
3. Анти-клаудин 18.2 (анти-CLDN18.2) антитело, содержащее по меньшей мере одну мутацию в области Fc, усиливающую антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC),
где усиленную ADCC сравнивают с референсным антителом 175D10, содержащим последовательность тяжелой цепи (HC) SEQ ID NO:98, и последовательность легкой цепи (LC) SEQ ID NO:99.
4. Анти-CLDN18.2 антитело по п.1, где ЕС50 анти-CLDN18.2 антитела составляет около 5 нМ или меньше.
5. Анти-CLDN18.2 антитело по п.1, где ЕС50 анти-CLDN18.2 антитела составляет около 5 нМ, около 4 нМ, около 3 нМ, около 2 нМ, около 1 нМ, около 0,5 нМ или меньше.
6. Анти-клаудин 18.2 (анти-CLDN18.2) антитело, обладающее более высокой аффинностью связывания с CLDN18.2 по сравнению с аффинностью связывания референсного антитела 175D10,
где референсное антитело 175D10 содержит последовательность тяжелой цепи (HC) SEQ ID NO:98, и последовательность легкой цепи (LC) SEQ ID NO:99.
7. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-6, где анти-CLDN18.2 антитело содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH) и вариабельную область легкой цепи (VL),
где область VH содержит:
1
2
последовательность CDR1 GFSLTSYXVX;
1
2
где X выбран из N или G; и X выбран из Y или H;
3
4
5
6
7
8
9
10
последовательность CDR2 VIWXXGXTXYXXXLXS;
3
4
5
6
7
8
9
10
где X выбран из N или P; X выбран из T или G; X выбран из A или N; X выбран из R или N; X выбран из N, Q или E; X выбран из S или I; X выбран из Т или А; и X выбран из K или M; и
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
последовательность CDR3 DXXXXXXXXXX;
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
где X выбран из S или R; X выбран из A или R; X выбран из M или L; X выбран из P или A; X выбран из A или M; X выбран из I или D; X выбран из P или Y; X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой F; X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой A; и X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой Y.
8. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-6, где область VH содержит
21
22
23
24
25
последовательность CDR1 XXXXXSFGMH;
21
22
23
24
25
где X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой G; X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой F; X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой T; X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой F; и X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой S;
26
27
28
29
30
последовательность CDR2 YISSGSXXIYYXDXXKG;
26
27
28
29
30
где X выбран из S или G; X выбран из P или S; Xвыбран из V или A; X выбран из K или T; и X выбран из L или V; и
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
последовательность CDR3 AXXXXXXXXXXX;
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
где X выбран из G или T; X выбран из Y или S; X выбран из A или Y; X выбран из V или Y; X выбран из R или Y; X выбран из N или G; X выбран из A или N; X выбран из L или A; X выбран из D или L; X выбран из Y или E; и X присутствует или отсутствует, если присутствует, то представляет собой Y.
9. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-8, где
область VH содержит
последовательность CDR1, состоящую из SEQ ID NO:1,
7
9
последовательность CDR2 VIWNTGATRYXSXLKS и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:3,
7
9
где X выбран из N, Q или E; и X выбран из T или A.
10. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-8, где
область VH содержит
последовательность CDR1, состоящую из SEQ ID NO:13,
7
8
последовательность CDR2 VIWPGGNTNYXXALMS и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:15,
7
8
где X выбран из N или E; и X выбран из S или I.
11. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-10, где
область VH содержит
последовательность CDR1, выбранную из SEQ ID NO:1, 7, 10 или 13;
последовательность CDR2, выбранную из SEQ ID NO:2, 4, 5, 6, 8, 11, 14, 16 или 17; и
последовательность CDR3, выбранную из SEQ ID NO:3, 9, 12 или 15.
12. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-10, где
область VH содержит
последовательность CDR1, состоящую из SEQ ID NO:1;
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:2, 4, 5 или 6; и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:3.
13. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-10, где
область VH содержит
последовательность CDR1, состоящую из SEQ ID NO:13;
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:14, 16 или 17; и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:15.
14. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-10, где
область VH содержит
последовательность CDR1, состоящую из SEQ ID NO:7,
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:8, и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:9.
15. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-10, где
область VH содержит
последовательность CDR1, состоящую из SEQ ID NO:10,
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:11, и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:12.
16. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-15, где
область VL содержит
последовательность CDR1, выбранную из SEQ ID NO:18, 21, 24-28, 31-35, 38 или 39;
последовательность CDR2, выбранную из SEQ ID NO:19, 22, 29 или 36; и
последовательность CDR3, выбранную из SEQ ID NO:20, 23, 30 или 37.
17. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-15, где
область VL содержит
последовательность CDR1, выбранную из SEQ ID NO:21 или 24-27;
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:22; и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:23.
18. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-15, где
область VL содержит
последовательность CDR1, выбранную из SEQ ID NO:28 или 31-34;
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:29; и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:30.
19. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-15, где
область VL содержит
последовательность CDR1, выбранную из SEQ ID NO:35, 38 или 39;
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:36; и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:37.
20. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-15, где
область VL содержит
последовательность CDR1, состоящую из SEQ ID NO:18,
последовательность CDR2, состоящую из SEQ ID NO:19, и
последовательность CDR3, состоящую из SEQ ID NO:20.
21. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-20, где анти-CLDN18.2 антитело представляет собой полноразмерное антитело.
22. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-20, где анти-CLDN18.2 антитело представляет собой связывающий фрагмент.
23. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-22, где анти-CLDN18.2 антитело содержит моновалентный Fab', бивалентный Fab2, одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv), диатело, миниантитело, наноантитело, однодоменное антитело (sdAb) или антитело верблюдовых, или их связывающий фрагмент.
24. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-22, где анти-CLDN18.2 антитело содержит гуманизированное антитело или его связывающий фрагмент, химерное антитело или его связывающий фрагмент, моноклональное антитело или его связывающий фрагмент, или биспецифическое антитело или его связывающий фрагмент.
25. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-24, где анти-CLDN18.2 антитело содержит мутацию в сайте посттрансляционной модификации.
26. Анти-CLDN18.2 антитело по п.25, где мутация находится в аминокислотном положении 60, 61 или 62 области VH, и где аминокислотные положения соответствуют положению 60, 61 или 62 из SEQ ID NO:40.
27. Анти-CLDN18.2 антитело по п.26, где мутация находится в аминокислотном положении 60 или 62 из SEQ ID NO:40.
28. Анти-CLDN18.2 антитело по п.26, где мутация находится в аминокислотном положении 60 или 61 из SEQ ID NO:57.
29. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.26-28, где мутация аминокислотного остатка N60 представляет собой мутацию на глутамин или глутаминовую кислоту.
30. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.26-28, где мутация аминокислотного остатка S61 представляет собой мутацию на изолейцин.
31. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.26-28, где мутация аминокислотного остатка T62 представляет собой мутацию на аланин.
32. Анти-CLDN18.2 антитело по п.25, где мутация находится в аминокислотном положении 31 или 32 области VL, и где аминокислотные положения соответствуют положению 31 или 32 из SEQ ID NO:46, 52 или 60.
33. Анти-CLDN18.2 антитело по п.32, где мутация находится в аминокислотном положении 31 или 32 из SEQ ID NO:46, 52 или 60.
34. Анти-CLDN18.2 антитело по п.32 или 33, где мутация аминокислотного остатка N31 представляет собой мутацию на аспарагиновую кислоту или на глутаминовую кислоту.
35. Анти-CLDN18.2 антитело по п.32 или 33, где мутация аминокислотного остатка S32 представляет собой мутацию на лейцин, валин или изолейцин.
36. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.25-35, где мутация повышает аффинность связывания модифицированного анти-CLDN18.2 антитела по сравнению с референсным антителом 175D10.
37. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-36, где аАнти-CLDN18.2 антитело содержит химерное антитело или его связывающий фрагмент.
38. Анти-CLDN18.2 антитело по п.37, где химерное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:40-43, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательности SEQ ID NO:44.
39. Анти-CLDN18.2 антитело по п.37, где химерное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательности SEQ ID NO:45, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:46-50.
40. Анти-CLDN18.2 антитело по п.37, где химерное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательности SEQ ID NO:51, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:52-56.
41. Анти-CLDN18.2 антитело по п.37, где химерное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:57-59, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:60-62.
42. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.37-41, где химерное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область CH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:63, и
область CL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательности SEQ ID NO:64.
43. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-36, где анти-CLDN18.2 антитело содержит гуманизированное антитело или его связывающий фрагмент.
44. Анти-CLDN18.2 антитело по п.43, где гуманизированное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:65-68, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:69-73.
45. Анти-CLDN18.2 антитело по п.43, где гуманизированное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:74-76, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:77-80.
46. Анти-CLDN18.2 антитело по п.43, где гуманизированное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:81-84, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:85-88.
47. Анти-CLDN18.2 антитело по п.43, где гуманизированное антитело или его связывающий фрагмент содержит
область VH, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:89-92, и
область VL, которая по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или 100% идентична последовательностям SEQ ID NO:93-97.
48. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-47, где анти-CLDN18.2 антитело содержит каркас IgM.
49. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-47, где анти-CLDN18.2 антитело содержит каркас IgG2.
50. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-47, где анти-CLDN18.2 антитело содержит каркас IgG1.
51. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-50, где анти-CLDN18.2 антитело содержит одну или несколько мутаций в области FC.
52. Анти-CLDN18.2 антитело по п.51, где одна или нескольк мутаций включают мутацию
в аминокислотном положении S239,
в аминокислотном положении I332,
в аминокислотном положении F243,
в аминокислотном положении R292,
в аминокислотном положении Y300,
в аминокислотном положении V305,
в аминокислотном положении P396 или их комбинацию.
53. Анти-CLDN18.2 антитело по п.51 или 52, где одна или несколько мутаций в области FC усиливают ADCC референсному антителу 175D10.
54. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-53, где анти-CLDN18.2 антитело обладает комплементзависимой цитотоксической (CDC) активностью по сравнению с референсным антителом 175D10.
55. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-54, где анти-CLDN18.2 антитело дополнительно конъюгировано с полезной нагрузкой.
56. Анти-CLDN18.2 антитело по п.55, где полезная нагрузка представляет собой ауристатин или его производное.
57. Анти-CLDN18.2 антитело по п.56, где производное ауристатина представляет собой монометилауристатин E (MMAE).
58. Анти-CLDN18.2 антитело по п.56, где производное ауристатина представляет собой монометилауристатин F (MMAF).
59. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.55-58, где соотношение лекарственное средство/антитело (DAR) составляет около 2, около 3 или около 4.
60. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-59, где анти-CLDN18.2 антитело имеет общий связывающий эпитоп с референсным антителом 175D10.
61. Анти-CLDN18.2 антитело по любому из пп.1-60, где анти-CLDN18.2 антитело обладает активностью перекрестного связывания с белком CLDN18.2 мыши и яванской макаки.
62. Анти-клаудин 18.2 (анти-CLDN18.2) антитело, которое специфически связывается с изоформой CLDN18.2.
63. Анти-CLDN18.2 антитело по п.62, где указанная изоформа CLDN18.2 представляет собой изоформу, экспрессируемую в линии клеток SNU620.
64. Полимер нуклеиновой кислоты, кодирующий анти-CLDN18.2 антитело по пп.1-63.
65. Вектор, содержащий полимер нуклеиновой кислоты по п.64.
66. Фармацевтическая композиция, содержащая:
анти-CLDN18.2 антитело по пп.1-63; и
фармацевтически приемлемый эксципиент.
67. Фармацевтическая композиция по п.66, где фармацевтическая композиция составлена для системного введения.
68. Фармацевтическая композиция по п.66 или 67, где фармацевтическая композиция составлена для парентерального введения.
69. Способ лечения онкологического больного, который характеризуется сверхэкспрессией белка CLDN18.2, включающий:
введение больному анти-CLDN18.2 антитела по пп.1-63 или фармацевтической композиции по пп.66-68 для лечения злокачественной опухоли у больного.
70. Способ по п.69, где злокачественная опухоль представляет собой рак желудочно-кишечного тракта.
71. Способ по п.70, где рак желудочно-кишечного тракта представляет собой рак желудка.
72. Способ по п.70, где рак желудочно-кишечного тракта представляет собой рак поджелудочной железы.
73. Способ по п.70, где рак желудочно-кишечного тракта представляет собой рак пищевода или холангиокарциному.
74. Способ по п.69, где злокачественная опухоль представляет собой рак легкого или рак яичника.
75. Способ по п.69, где способ дополнительно включает введение больному дополнительного терапевтического агента.
76. Способ по п.75, где дополнительный терапевтический агент включает химиотерапевтический агент, иммунотерапевтический агент, нацеленный терапевтический агент, гормональный терапевтический агент, терапевтический агент на основе стволовых клеток или радиационную терапию.
77. Способ по п.75 или 76, где дополнительный терапевтический агент и анти-CLDN18.2 антитело вводят одновременно.
78. Способ по п.75 или 76, где указанный дополнительный терапевтический агент и анти-CLDN18.2 антитело вводят последовательно.
79. Способ по п.78, где дополнительный терапевтический агент вводят до введения анти-CLDN18.2 антитела.
80. Способ по п.78, где дополнительный терапевтический агент вводят после введения анти-CLDN18.2 антитела.
81. Способ по любому из пп.75-80, где дополнительный терапевтический агент и анти-CLDN18.2 антитело составляют в виде раздельных доз.
82. Способ индукции эффекта уничтожения клеток, включающий:
приведение в контакт множества клеток с антителом против CLDN18.2, содержащим полезную нагрузку, в течение периода времени, достаточного для интернализации анти-CLDN18.2 антитела и, таким образом, для индукции эффекта уничтожения клеток.
83. Способ по п.82, где указанное анти-CLDN18.2 антитело включает анти-CLDN18.2 антитело по пп.1-54.
84. Способ по п.83, где полезная нагрузка включает майтансиноид, ауристатин, таксоид, калихеамицины, дуокармицин, аматоксин или их производное.
85. Способ по п.83, где полезная нагрузка включает ауристатин или его производное.
86. Способ по п.85, где полезная нагрузка представляет собой монометилауристатин E (MMAE).
87. Способ по п.85, где полезная нагрузка представляет собой монометилауристатин F (MMAF).
88. Способ по п.82, где клетка представляет собой раковую клетку.
89. Способ по п.88, где клетка представляет собой клетку рака желудочно-кишечного тракта.
90. Способ по п.89, где рак желудочно-кишечного тракта представляет собой рак желудка.
91. Способ по п.89, где рак желудочно-кишечного тракта представляет собой рак поджелудочной железы.
92. Способ по п.89, где рак желудочно-кишечного тракта представляет собой рак пищевода или холангиокарциному.
93. Способ по п.88, где клетка представляет собой клетку из рака легкого или рака яичника.
in vitro.
94. Способ по любому из пп.82-93, где способ представляет собой способ
in vivo.
95. Способ по любому из пп.82-93, где способ представляет собой способ
96. Способ по любому из пп.69-95, где больным является человек.
97. Набор, содержащий анти-CLDN18.2 антитело по пп.1-63, вектор по п.65 или фармацевтическую композицию по пп.66-68.