ПЕПТИДЫ ТОРК И СОДЕРЖАЩИЕ ИХ ВАКЦИНЫ

1. Выделенный пептид, выбранный из указанной ниже группы, состоящей из (i) и (ii):
(i) выделенного пептида из указанных ниже (a) или (b):
(a) выделенного пептида, содержащего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 6, 27 и 28;
(b) выделенного пептида, содержащего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 6, 27 и 28, в которой 1, 2 или несколько аминокислот заменены, введены, удалены и/или добавлены, где пептид обладает способностью к индукции CTL;
(ii) выделенного пептида из указанных ниже (c) или (d):
(c) выделенного пептида, содержащего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 42, 45, 47, 50, 51, 53, 54, 62, 63, 64, 66, 71, 72 и 76;
(d) выделенного пептида, содержащего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 42, 45, 47, 50, 51, 53, 54, 62, 63, 64, 66, 71, 72 и 76, в которой 1, 2 или несколько аминокислот заменены, введены, удалены, и/или добавлены, где пептид обладает способностью к индукции CTL.
2. Выделенный пептид по п. 1, где указанный пептид обладает одной или обеими из следующих характеристик:
(a) вторая аминокислота от N-конца аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 6, 27 и 28, заменена так, чтобы она представляла собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из фенилаланина, тирозина, метионина и триптофана, и
(b) C-концевая аминокислота аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 6, 27 и 28, заменена так, чтобы она представляла собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из фенилаланина, лейцина, изолейцина, триптофана и метионина.
3. Выделенный пептид по п. 1, где указанный пептид обладает одной или обеими из следующих характеристик:
(a) вторая аминокислота от N-конца аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 42, 45, 47, 50, 51, 53, 54, 62, 63, 64, 66, 71, 72 и 76, заменена так, чтобы она представляла собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из лейцина и метионина, и
(b) C-концевая аминокислота аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 42, 45, 47, 50, 51, 53, 54, 62, 63, 64, 66, 71, 72 и 76, заменена так, чтобы она представляла собой аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из валина и лейцина.
4. Выделенный пептид по п. 1, где указанный пептид обладает способностью связываться с HLA-антигеном.
5. Выделенный пептид по п. 4, где указанный HLA-антиген представляет собой HLA-A24 или HLA-A2.
6. Выделенный пептид по любому из пп. 1-5, где указанный пептид представляет собой нонапептид или декапептид.
7. Выделенный полинуклеотид, кодирующий выделенный пептид по любому из пп. 1-6.
8. Композиция для индукции CTL, где композиция содержит один или более пептидов по любому из пп. 1-6 или один или более полинуклеотидов по п. 7.
9. Фармацевтическая композиция, содержащая:
(a) один или более пептидов по любому из пп. 1-6,
(b) один или более полинуклеотидов по п. 7,
(c) одну или более АРС, которые презентируют комплекс пептида по любому из пп. 1-6 и HLA-антигена на своей поверхности;
(d) одну или более экзосом, которые презентируют комплекс пептида по любому из пп.1-6 и HLA-антигена на своей поверхности, или
(e) один или более CTL, которые могут распознавать клетку, презентирующую комплес пептида по любому из пп. 1-6 и HLA-антигена на своей поверхности,
в комбинации с фармацевтически приемлемым носителем, где указанная фармацевтическая композиция составлена для лечения и/или профилактики злокачественной опухоли, предотвращения ее послеоперационного рецидива и/или индукции иммунной реакции против злокачественной опухоли.
10. Фармацевтическая композиция по п. 9, где указанная фармацевтическая композиция составлена для введения индивидууму, у которого HLA-антиген представляет собой HLA-A24 или HLA-A2.
11. Способ индукции антигенпрезентирующей клетки (APC) со способностью к индукции CTL, где указанный способ включает стадию, выбранную из группы, состоящей из:
(a) приведения в контакт APC с пептидом по любому из пп. 1-6 in vitro, ex vivo или in vivo, и
(b) введения полинуклеотида, кодирующего пептид по любому из пп. 1-6, в APC.
12. Способ индукции CTL, где указанный способ включает стадию, выбранную из группы, состоящей из:
(a) совместного культивирования CD8-положительной T-клетки с APC, которая презентирует на своей поверхности комплекс HLA-антигена и пептида по любому из пп. 1-6,
(b) совместного культивирования CD8-положительных T-клеток с экзосомами, которые презентируют на своей поверхности комплекс HLA-антигена и пептида по любому из пп. 1-6, и
(c) введения в CD8-положительную Т-клетку полинуклеотида/полинуклеотидов, кодирующих полипептиды субъединиц T-клеточного рецептора (TCR), где TCR, образуемый указанными полипептидами субъединиц TCR, способен связываться с комплексом HLA-антигена и пептида по любому из пп. 1-6 на клеточной поверхности.
13. Выделенная APC, которая презентирует на своей поверхности комплекс HLA-антигена и пептида по любому из пп. 1-6.
14. APC по п. 13, которая индуцирована способом по п. 11.
15. Выделенный CTL, который направлен на пептид по любому из пп. 1-6.
16. CTL по п. 15, который индуцирован способом по п. 12.
17. Способ индукции иммунной реакции против злокачественной опухоли у индивидуума, где указанный способ включает стадию введения индивидууму композиции, содержащей пептид по любому из пп. 1-6, его иммунологически активный фрагмент или полинуклеотид, кодирующий указанный пептид или указанный фрагмент.
18. Антитело или его иммунологически активный фрагмент против пептида по любому из пп. 1-6.
19. Вектор, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую пептид по любому из пп. 1-6.
20. Клетка-хозяин, трансформированная или трансфицированная вектором по п. 19.
21. Диагностический набор, содержащий пептид по любому из пп. 1-6, полинуклеотид по п. 7 или антитело по п. 18.
22. Способ скрининга пептида, обладающего способностью индуцировать CTL, который обладает специфической цитотоксической активностью против клетки, которая презентирует фрагмент, получаемый из ТОРК, где способ включает стадии:
(i) предоставления последовательности-кандидата, состоящей из аминокислотной последовательности, модифицированной заменой, удалением, введением и/или добавлением одного, двух или нескольких аминокислотных остатков к исходной аминокислотной последовательности, где исходная аминокислотная последовательность выбрана из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 3, 6, 27, 28, 42, 45, 47, 50, 51, 53, 54, 62, 63, 64, 66, 71, 72 и 7 6;
(ii) отбора последовательности-кандидата, которая не обладает по существу значительной гомологией с пептидами, получаемыми из любых известных продуктов генов человека, отличных от TOPK;
(iii) приведения пептида, состоящего из последовательности-кандидата, отобранной на стадии (ii), в контакт с антигенпрезентирующей клеткой,
(iv) приведения антигенпрезентирующей клетки стадии (c) в контакт с CD8-положительной T-клеткой, и
(v) идентификации пептида, способность к индукции CTL которого является такой же, как у пептида, состоящего из исходной аминокислотной последовательности, или более высокой.