ХАРАКТЕРНЫЕ НАБОРЫ БИОМАРКЕРОВ СИСТЕМНОЙ КРАСНОЙ ВОЛЧАНКИ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ

1. Способ определения у субъекта патологического состояния, ассоциированного с системной красной волчанкой, включающий этапы:
a) предоставления образца, подлежащего тестированию; и
b) измерения присутствия и/или количества одного или более биомаркеров в тестируемом образце, выбранных из группы, определенной в Таблице А;
причем присутствие и/или количество в тестируемом образце одного или более биомаркеров, выбранных из группы, определенной в Таблице А, указывает на патологическое состояние у субъекта, ассоциированное с системной красной волчанкой.
2. Способ по п. 1, дополнительно включающий этапы:
c) предоставления контрольного образца от индивидуума с другим патологическим состоянием, ассоциированным с системной красной волчанкой, для тестируемого субъекта; и
d) измерения в указанном контрольном образце присутствия и/или количества одного или более из биомаркеров, измеренных на этапе (b);
причем патологическое состояние, ассоциированное с системной красной волчанкой, идентифицируют в том случае, если присутствие и/или количество одного или более биомаркеров в тестируемом образце, измеренное на этапе (b), отличается от присутствия и/или количества одного или более биомаркеров в контрольном образце.
3. Способ по п. 1 или 2, дополнительно включающий или состоящий из этапов:
e) предоставления контрольного образца от индивидуума с тем же патологическим состоянием, ассоциированным с системной красной волчанкой, для тестируемого субъекта; и
f) измерения в указанном контрольном образце присутствия и/или количества одного или более из биомаркеров, измеренного на этапе (b);
причем патологическое состояние, ассоциированное с системной красной волчанкой, идентифицируют в том случае, если экспрессия одного или более биомаркеров в тестируемом образце, измеренная на этапе (b), соответствует экспрессии одного или более биомаркеров в указанном контрольном образце, измеренной на этапе (f).
4. Способ по пп. 1, 2 или 3, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения в тестируемом образце присутствия и/или количества одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице А, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68 или 69 биомаркеров, приведенных в таблице А.
5. Способ по любому из пп. 1-4, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в таблице А(1) и/или (II), например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 биомаркеров, приведенных в таблице А (I) и/или (II).
6. Способ по любому из пп. 1-5, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия в и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице А(III), например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 21, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48 или 49 биомаркеров, приведенных в Таблице А(III).
7. Способ по любому из пп. 1-6, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из:
a) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В(I), например, 2 или 3 биомаркеров, приведенных в Таблице В(1);
b) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В(II), например, 2 или 3 биомаркеров, приведенных в Таблице В(II);
c) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В(III), например, 2 биомаркеров, приведенных в Таблице В(Ш);
d) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(IV), например, 2 биомаркеров, приведенных в Таблице B(IV);
e) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(V), например, 2, 3 или 4 биомаркеров, приведенных в Таблице B(V);
f) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(VI), например, 2 биомаркеров, приведенных в Таблице BV(VI);
g) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце биомаркера, приведенного в Таблице B(VII);
h) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце биомаркера, приведенного в Таблице B(VIII);
i) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце биомаркера, приведенного в Таблице В(IX);
j) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В(Х), например, 2, 3, 4, 5, 6 или 7 биомаркеров, приведенных в Таблице В (X);
k) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В(XI), например, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 биомаркеров, приведенных в Таблица В(XI);
l) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В(XII), например, 2 или 3 биомаркеров, приведенных в Таблице В(XII);
m) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В(XIII), например, 2 биомаркеров, приведенных в Таблице В(XIII);
n) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце биомаркера, приведенного в Таблице B(XIV);
о) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце биомаркера, приведенного в Таблице B(XV);
p) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(XVI), например, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 биомаркеров, приведенных в Таблице B(XVI);
q) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(XVII), например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16 или 17 биомаркеров, приведенных в Таблице B(XVII);
r) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце биомаркера, приведенного в Таблице B(XVIII); и/или
s) измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце биомаркера, приведенного в Таблице В(XIX).
8. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что указанный способ включает, состоит из или предназначен для определения, является ли СКВ-ассоциированное патологическое состояние активной СКВ или не является СКВ.
9. Способ по п. 8, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(I), (II), (III), (IV), (V), (VI), (VIII), (IX), (X), (XI), (XIV) и/или (XVI).
10. Способ по любому из пп. 1-6, отличающийся тем, что указанный способ включает, состоит из или предназначен для определения, является ли СКВ-ассоциированное патологическое состояние неактивной СКВ или не является СКВ.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(I), (II), (III), (V), (VII), (IX), (X), (XII) и/или (XV).
12. Способ по любому из пп. 1-6, отличающийся тем, что указанный способ включает, состоит из или предназначен для определения, является ли СКВ-ассоциированное патологическое состояние высокоактивной СКВ или не является СКВ.
13. Способ по п. 12, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(I), (II), (IV), (VI), (XII), (XIII), (XIV) и/или (XVIII).
14. Способ по любому из пп. 1-6, отличающийся тем, что включает, состоит из или предназначен для определения, является ли СКВ-ассоциированное патологическое состояние активной СКВ или неактивной СКВ.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице В (I), (II), (III), (IV), (V), (VII), (VIII), (XI), (XV) и/или (XVII).
16. Способ по любому из пп. 1-6, отличающийся тем, что включает, состоит из или предназначен для определения, является ли СКВ-ассоциированное патологическое состояние высокоактивной СКВ или неактивной СКВ.
17. Способ по п. 16, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, приведенных в Таблице B(I), (II), (IV), (VI), (XII), (XIII), (XIV) и/или (XVIII).
18. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что указанный способ включает или состоит из измерения всех биомаркеров, приведенных в Таблице А и Таблице В.
19. Способ по любому из пп. 2-18, отличающийся тем, что контрольный образец на этапе (с) или этапе (е) предоставляют от:
a) здорового индивидуума (не имеет СКВ);
b) индивидуума с неактивной СКВ (СКВ без обострения);
c) индивидуума с активной СКВ (обострение СКВ); или
d) индивидуума с высокоактивной СКВ (сильное обострение СКВ).
20. Способ по любому из пп. 2-18 или п. 19(b), (с) или (d), отличающийся тем, что контрольный образец на этапе (с) или этапе (е) предоставляют от:
a) индивидуума с СКВ подтипа 1 (СКВ1);
b) индивидуума с СКВ подтипа 2 (СКВ2); или
c) индивидуума с СКВ подтипа 3 (СКВ3).
21. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что присутствуют физические симптомы патологического состояния, ассоциированного с СКВ.
22. Способ по любому из пп. 1-21 отличающийся тем, что патологическое состояние, ассоциированное с СКВ, определяют до появления физических симптомов патологического состояния, ассоциированного с СКВ.
23. Способ по п. 22, отличающийся тем, что патологическое состояние, ассоциированное с СКВ определяют по меньшей мере за 1 сутки до появления физических симптомов патологического состояния, ассоциированного с СКВ, например, по меньшей мере за 2 суток, 3 суток, 4 суток, 5 суток, 6 суток, 1 неделю, 2 недели, 3 недели, 4 недели, 5 недель, 6 недель, 7 недель, 8 недель, 9 недель, 10 недель, 11 недель, 12 недель, 4 месяца, 5 месяцев или 6 месяцев, 7 месяцев, 8 месяцев, 9 месяцев, 10 месяцев, 11 месяцев, 12 месяцев, 13 месяцев, 14, месяцев, 15, месяцев, 16 месяцев, 17 месяцев, 18 месяцев, 19 месяцев, 20 месяцев, 21 месяцев, 22 месяцев, 23 месяцев или 24 месяца до появления физических симптомов патологического состояния, ассоциированного с СКВ.
24. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что этап (b) и/или этап (d) проводят с использованием связующего агента, способного связываться с одним или более биомаркерами.
25. Способ по п. 24, отличающийся тем, что первый связующий агент представляет собой антитело или его фрагмент.
26. Способ по п. 25, отличающийся тем, что антитело или его фрагмент представляют собой рекомбинантное антитело или его фрагмент.
27. Способ по п. 25 или 26, в котором антитело или его фрагмент выбирают из группы, состоящей из scFv; Fab; связующего домена молекулы иммуноглобулина.
28. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что один или более биомаркер(ов) в тестируемом образце и/или один или более связующих агентов помечены детектируемым фрагментом.
29. Способ по п. 27 или 28, отличающийся тем, что детектируемый фрагмент выбирают из группы, состоящей из флуоресцентного фрагмента; люминесцентного фрагмента; хемилюминесцентного фрагмента; радиоактивного фрагмента и ферментативного фрагмента.
30. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что этап (b), (d) и/или этап (f), когда они присутствуют, осуществляют с использованием массива (array).
31. Способ по п. 30, отличающийся тем, что массив представляет собой массив на основе гранул.
32. Способ по п. 30 или 31, отличающийся тем, что массив представляет собой массив на основе твердой поверхности.
33. Способ по пп. 30, 31 или 32, отличающийся тем, что массив выбирают из группы, состоящей из макромассива (macroarray), микромассива (microarray) и наномассива (nanoarray).
34. Способ по любому из пп. 1-29, отличающийся тем, что этап (b), этап (d) и/или этап (f), если они присутствуют, выполняют с использованием ИФА (иммуноферментного анализа).
35. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что этап (b) включает или состоит из измерения присутствия и/или количества в тестируемом образце одного или более биомаркеров, перечисленных на Фиг. 1 (Е), Фиг. 2 (D), Фиг. 2 (Н), Фиг. 3 (D), Фиг. 3 (Е), Фиг. 3 (F), Фиг. 4 (А), Фиг. 5 (А), Фиг. 5 (В), Фиг. 8 (А), Фиг. 8 (В), Фиг. 8 (С) и/или Фиг. 8 (D).
36. Массив для определения патологического состояния, ассоциированного с системной красной волчанкой, у индивидуума, содержащий один или более связующих агентов по любому из пп. 24-29.
37. Массив по п. 36, отличающийся тем, что указанный массив предназначен для применения в способе по любому из пп. 1-35.
38. Массив по п. 36 или 37, отличающийся тем, что указанный массив определен в любом из пп. 30-33.
39. Массив по любому из пп. 36-38, отличающийся тем, что указанные один или более связующих агентов способны связываться со всеми из белков, приведенными в Таблице А.
40. Применение одного или более биомаркеров, выбранных из группы, определенной в Таблице А, в качестве биомаркера для определения у индивидуума патологического состояния, ассоциированного с системной красной волчанкой.
41. Применение по п. 40, отличающееся тем, что все биомаркеры, определенные в Таблице А, используют в качестве биомаркера для определения у индивидуума патологического состояния, ассоциированного с системной красной волчанкой.
42. Применение одного или более связующего агента по любому из пп. 24-29 для определения у индивидуума патологического состояния, ассоциированного с системной красной волчанкой
43. Применение по п. 42, отличающееся тем, что связующие агенты для всех биомаркеров, приведенных в Таблице А, используют для определения у индивидуума патологического состояния, ассоциированного с системной красной волчанкой.
44. Набор для определения у индивидуума патологического состояния, ассоциированного с системной красной волчанкой, содержащий:
i) один или более связующих агентов, приведенных в любом из пп. 24-29 или массив по пп. 36-39,
ii) инструкции для осуществления способа, определенного в любом из пп. 1-35.