ХИМЕРНЫЕ АНТИГЕННЫЕ РЕЦЕПТОРЫ И СВЯЗЫВАЮЩИЕ АГЕНТЫ, НАЦЕЛЕННЫЕ НА DLL3

1. Химерный антигенный рецептор, содержащий внеклеточный домен, транс мембранный домен и внутриклеточный домен, где внеклеточный домен содержит антигенсвязывающий домен против DLL3, который специфически связывается с DLL3, и где антигенсвязывающий домен содержит по меньшей мере одно из:
(a) CDR1 вариабельной тяжелой цепи, содержащая аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 10, 19, 28, 37, 46, 55, 64, 73, 82, 91, 100, 109, 118, 127, 136, 145, 154, 163, 172, 181, 190, 199, 208, 217, 226, 235, 244, 253, 262, 271, 280, 289, 298, 307, 316, 325, 334, 343, 352, 361, 370, 379, 388, 397, 406, 415, 424, 433, 442, 451 и 460;
(b) CDR2 вариабельной тяжелой цепи, содержащая аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 11, 20, 38, 47, 56, 65, 74, 83, 92, 101, 110, 119, 128, 137, 146, 155, 164, 173, 182, 191, 200, 209, 218, 227, 236, 245, 254, 263, 272, 281, 290, 299, 308, 317, 326, 335, 344, 353, 362, 371, 380, 389, 398, 407, 416, 425, 434, 443, 452, 461 и 695;
(c) CDR3 вариабельной тяжелой цепи, содержащая аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3, 12, 21, 30, 39, 48, 57, 66, 75, 84, 93, 102, 111, 120, 129, 138, 147, 156, 165, 174, 183, 192, 201, 210, 219, 228, 237, 246, 255, 264, 273, 282, 291, 300, 309, 318, 327, 336, 345, 354, 363, 372, 381, 390, 399, 408, 417, 426, 435, 444, 453 и 462;
(d) CDR1 вариабельной легкой цепи, содержащая аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4, 13, 22, 31, 40, 49, 58, 67, 85, 94, 103, 112, 121, 130, 139, 148, 157, 166, 175, 184, 193, 202, 211, 220, 229, 238, 247, 256, 265, 274, 283, 292, 301, 310, 319, 328, 337, 346, 355, 364, 373, 382, 391, 400, 409, 418, 427, 436, 445, 454, 463 и 696;
(e) CDR2 вариабельной легкой цепи, содержащая аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5, 14, 23, 32, 41, 50, 59, 68, 77, 86, 95, 104, 113, 122, 131, 140, 149, 158, 167, 176, 185, 194, 203, 212, 221, 230, 239, 248, 257, 266, 275, 284, 293, 302, 311, 320, 329, 338, 347, 356, 365, 374, 383, 392, 401, 410, 419, 428, 437, 446, 455 и 464;
(f) CDR3 вариабельной легкой цепи, содержащая аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 6, 15, 24, 33, 42, 51, 60, 69, 78, 87, 96, 105, 114, 123, 132, 141, 150, 159, 168, 177, 186, 195, 204, 213, 222, 231, 240, 249, 258, 267, 276, 285, 294, 303, 312, 321, 330, 339, 348, 357, 366, 375, 384, 393, 402, 411, 420, 429, 438, 447, 456 и 465.
2. Химерный антигенный рецептор, содержащий внеклеточный домен, транс мембранный домен и внутриклеточный домен, где внеклеточный домен содержит антигенсвязывающий домен против DLL3, который специфически связывается с DLL3, и где антигенсвязывающий домен содержит:
(a) CDR1 вариабельной тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 10, 19, 28, 37, 46, 55, 64, 73, 82, 91, 100, 109, 118, 127, 136, 145, 154, 163, 172, 181, 190, 199, 208, 217, 226, 235, 244, 253, 262, 271, 280, 289, 298, 307, 316, 325, 334, 343, 352, 361, 370, 379, 388, 397, 406, 415, 424, 433, 442, 451 и 460;
(b) CDR2 вариабельной тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 11, 20, 38, 47, 56, 65,74, 83, 92, 101, ПО, 119, 128, 137, 146, 155, 164, 173, 182, 191, 200, 209, 218, 227, 236, 245, 254, 263, 272, 281, 290, 299, 308, 317, 326, 335, 344, 353, 362, 371, 380, 389, 398, 407, 416, 425, 434, 443, 452, 461 и 695;
(c) CDR3 вариабельной тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3, 12, 21, 30, 39, 48, 57, 66, 75, 84, 93, 102, 111, 120, 129, 138, 147, 156, 165, 174, 183, 192, 201, 210, 219, 228, 237, 246, 255, 264, 273, 282, 291, 300, 309, 318, 327, 336, 345, 354, 363, 372, 381, 390, 399, 408, 417, 426, 435, 444, 453 и 462.
3. Химерный антигенный рецептор, содержащий внеклеточный домен, транс мембранный домен и внутриклеточный домен, где внеклеточный домен содержит антигенсвязывающий домен против DLL3, который специфически связывается с DLL3, и где антигенсвязывающий домен содержит:
(a) CDR1 вариабельной легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4, 13, 22, 31, 40, 49,58, 67, 85,94, 103, 112, 121, 130, 139, 148, 157, 166, 175, 184, 193,202,211, 220, 229, 238, 247, 256, 265, 274, 283, 292, 301, 310, 319, 328, 337, 346, 355, 364, 373, 382, 391, 400, 409, 418, 427, 436, 445, 454, 463 и 696;
(b) CDR2 вариабельной легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5, 14, 23, 32, 41, 50, 59, 68, 77, 86, 95, 104, 113, 122, 131, 140, 149, 158, 167, 176, 185, 194, 203, 212, 221, 230, 239, 248, 257, 266, 275, 284, 293, 302, 311, 320, 329, 338, 347, 356, 365, 374, 383, 392, 401, 410, 419,
428, 437, 446, 455 и 464;
(c) CDR3 вариабельной легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 6, 15, 24, 33, 42, 51, 60, 69, 78, 87, 96, 105, 114, 123, 132, 141, 150, 159, 168, 177, 186, 195, 204, 213, 222, 231, 240, 249, 258, 267, 276, 285, 294, 303, 312, 321, 330, 339, 348, 357, 366, 375, 384, 393, 402, 411, 420, 429, 438, 447, 456 и 465.
4. Химерный антигенный рецептор, содержащий внеклеточный домен, транс мембранный домен и внутриклеточный домен, где внеклеточный домен содержит антигенсвязывающий домен против DLL3, который специфически связывается с DLL3, и где антигенсвязывающий домен содержит по меньшей мере одну из:
(a) вариабельной тяжелой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 7, 16, 25, 34, 43, 52, 61, 70, 79, 88, 97, 106, 115, 124, 133, 142, 151, 160, 169, 178, 187, 196, 205,214, 223, 232, 241,250, 259, 268, 277,286, 295, 304, 313, 322, 331, 340, 349, 358, 367, 376, 385, 394, 403, 412, 421, 430, 439, 448, 457, 466;
(b) вариабельной легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 8, 17, 26, 35, 44, 53, 62, 71, 80, 89, 98, 107, 116, 125, 134, 143, 152, 161, 170, 179, 188, 197, 206, 215, 224, 233, 242, 251, 260, 269, 278, 287, 296, 305, 314, 323, 332, 341, 350, 359, 368, 377, 386, 395, 404, 413, 422, 431, 440, 449, 458 и 467,
где вариабельная тяжелая цепь и вариабельная легкая цепь связаны по меньшей мере одним линкером.
5. Химерный антигенный рецептор, содержащий внеклеточный домен, транс мембранный домен и внутриклеточный домен, где внеклеточный домен содержит антигенсвязывающий домен против DLL3, который специфически связывается с DLL3, и где антигенсвязывающий домен содержит:
(a) вариабельную тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 7, 16, 25, 34, 43, 52, 61, 70, 79, 88, 97, 106, 115, 124, 133, 142, 151, 160, 169, 178, 187, 196, 205, 214, 223, 232, 241, 250, 259, 268, 277, 286, 295, 304, 313, 322, 331, 340, 349, 358, 367, 376,
385, 394, 403, 412, 421, 430, 439, 448, 457 и 466;
(b) вариабельную легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 8, 17, 26, 35, 44, 53, 62, 71, 80, 89, 98, 107, 116, 125, 134, 143, 152, 161, 170, 179, 188, 197, 206, 215, 224, 233, 242, 251, 260, 269, 278, 287, 296, 305, 314, 323, 332, 341, 350, 359, 368, 377, 386, 395, 404, 413, 422, 431, 440, 449, 458 и 467,
где вариабельная тяжелая цепь и вариабельная легкая цепь связаны по меньшей мере одним линкером.
6. Химерный антигенный рецептор, содержащий внеклеточный домен, транс мембранный домен и внутриклеточный домен, где внеклеточный домен содержит антигенсвязывающий домен против DLL3, который специфически связывается с DLL3, и где антигенсвязывающий домен содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из scFv, представленных в таблице 1d.
7. Химерный антигенный рецептор, который специфически связывается с DLL3, где химерный антигенный рецептор содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 98%, 99% или на 100% идентичную любой из SEQ ID NO: 482-533 и SEQ ID NO: 632-683.
8. Химерный антигенный рецептор по любому из пп. 1-7, где внутриклеточный домен содержит по меньшей мере один ко стимулирующий домен.
9. Химерный антигенный рецептор по п. 8, где костимулирующий домен представляет собой сигнальную область CD28, ОХ-40, 4-1BB/CD137, CD2, CD7, CD27, CD30, CD40, программируемую смерть-1 (PD-1), индуцибельный костимулятор Т-клеток (ICOS), антиген 1, связанный с функцией лимфоцитов (LFA-1 (CD1 1a/CD18), CD3-гамма, CD3-дельта, CD3-эпсилон, CD247, CD276 (В7-Н3), LIGHT, (TNFSF14), NKG2C, Ig-альфа (CD79a), DAP-10, Fc-гамма-рецептор, молекулу МНС класса I, белки TNF-рецептора, белок иммуноглобулина, рецептор цитокинов, интегрины, сигнальные молекулы активации лимфоцитов (SLAM-белки), активирующие рецепторы NK-клеток, BTLA, лиганды Toll-рецепторов, ICAM-1, В7-Н3, CDS, ICAM-1, GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL-2R-бета, IL-2R-гамма, IL-7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD1 1d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD1 1a, LFA-1, ITGAM, CD1 lb, ITGAX, CD1 1c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAMI (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRT AM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a, лиганд, который специфически связывается с CD83, или любую их комбинацию.
10. Химерный антигенный рецептор по п. 9, где костимулирующий домен содержит сигнальную область 4-1BB/CD137.
11. Химерный антигенный рецептор по п. 10, где костимулирующий домен 4-1BB/CD137 содержит SEQ ID NO: 480 или ее фрагмент.
12. Химерный антигенный рецептор по любому из пп. 1-11, где внутриклеточный домен содержит по меньшей мере один активирующий домен.
13. Химерный антигенный рецептор по п. 12, где активирующий домен содержит CD3.
14. Химерный антигенный рецептор по п. 13, где CD3 включает CD3-дзета.
15. Химерный антигенный рецептор по п. 14, где СО3-дзета содержит SEQ ID NO: 481 или ее фрагмент.
16. Химерный антигенный рецептор по любому из пп. 1-15, где химерный антигенный рецептор кодируется полинуклеотидной последовательностью любой из SEQ ID NO: 570-621 и 631.
17. Химерный антигенный рецептор по любому из пп. 1-16, дополнительно содержащий предохранительный переключатель.
18. Химерный антигенный рецептор по п. 17, где предохранительный переключатель содержит мимотоп CD20 или эпитоп QBEND-10.
19. Химерный антигенный рецептор по п. 18, где предохранительный переключатель содержит один или более мимотопов CD20, или один или более эпитопов QBEND-10, или их комбинации.
20. Химерный антигенный рецептор по любому из пп. 17-19, где химерный антигенный рецептор содержит один или более предохранительных переключателей в формате QR3, SR2, RSR или R2S.
21. Химерный антигенный рецептор по любому из пп. 17-20, где химерный антигенный рецептор содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 98%, 99% или на 100% идентичную любой из SEQ ID NO: 622-628, 474-476, 565 и 684-694.
22. Выделенный полинуклеотид, кодирующий любой из химерных антигенных рецепторов по пп. 1-21.
23. Вектор экспрессии, содержащий полинуклеотид по п. 22.
24. Вектор по п. 23, где вектор представляет собой ретровирусный вектор, ДНК-вектор, плазмиду, РНК-вектор, аденовирусный вектор, аденоассоциированный вирусный вектор, лентивирусный вектор или любую их комбинацию.
25. Сконструированная иммунная клетка, экспрессирующая любой из химерных антигенных рецепторов по пп. 1-21.
26. Сконструированная иммунная клетка, экспрессирующая полинуклеотид по п. 22 или вектор по п. 23 или 24.
27. Сконструированная иммунная клетка по п. 25 или п. 26, где иммунная клетка представляет собой Т-клетку, опухоль-инфильтрирующий лимфоцит (TIL), NK-клетку, TCR-экспрессирующую клетку, дендритную клетку или NK-T-клетку.
28. Сконструированная иммунная клетка по п. 27, где клетка представляет собой аутологичную Т-клетку.
29. Сконструированная иммунная клетка по п. 27, где клетка представляет собой аллогенную Т-клетку.
30. Фармацевтическая композиция, содержащая сконструированную иммунную клетку по любому из пп. 25-29.
31. Способ лечения заболевания или нарушения у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение указанному субъекту сконструированной иммунной клетки по любому из пп. 25-29 или фармацевтической композиции по п. 30.
32. Способ по п. 31, где заболевание или нарушение представляет собой рак.
33. Способ по п. 31 или 32, где заболевание или нарушение представляет собой мелкоклеточный рак легкого.
34. Изделие, содержащее сконструированную иммунную клетку по любому из пп. 25-29 или фармацевтическую композицию по п. 30.
35. Связывающий агент против DLL3, содержащий
(a) CDR1 вариабельной тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 10, 19, 28, 37, 46, 55, 64, 73, 82, 91, 100, 109, 118, 127, 136, 145, 154, 163, 172, 181, 190, 199, 208, 217, 226, 235, 244, 253, 262, 271, 280, 289, 298, 307, 316, 325, 334, 343, 352, 361, 370, 379, 388, 397, 406, 415, 424, 433, 442, 451 и 460;
(b) CDR2 вариабельной тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 11, 20, 38, 47, 56, 65, 74, 83, 92, 101, 110, 119, 128, 137, 146, 155, 164, 173, 182, 191, 200, 209, 218, 227, 236, 245, 254, 263, 272, 281, 290, 299, 308, 317, 326, 335, 344, 353, 362, 371, 380, 389, 398, 407, 416, 425, 434, 443, 452, 461 и 695;
(c) CDR3 вариабельной тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3, 12, 21, 30, 39, 48, 57, 66, 75, 84, 93, 102, 111, 120, 129, 138, 147, 156, 165, 174, 183, 192, 201, 210, 219, 228, 237, 246, 255, 264, 273, 282, 291, 300, 309, 318, 327, 336, 345, 354, 363, 372, 381, 390, 399, 408, 417, 426, 435, 444, 453 и 462;
(d) CDR1 вариабельной легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4, 13, 22, 31, 40, 49,58, 67, 85,94, 103, 112, 121, 130, 139, 148, 157, 166, 175, 184, 193,202,211, 220, 229, 238, 247, 256, 265, 274, 283, 292, 301, 310, 319, 328, 337, 346, 355, 364, 373, 382, 391, 400, 409, 418, 427, 436, 445, 454, 463 и 696;
(e) CDR2 вариабельной легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5, 14, 23, 32, 41, 50, 59, 68, 77, 86, 95, 104, 113, 122, 131, 140, 149, 158, 167, 176, 185, 194, 203, 212, 221, 230, 239, 248, 257, 266, 275, 284, 293, 302, 311, 320, 329, 338, 347, 356, 365, 374, 383, 392, 401, 410, 419, 428, 437, 446, 455 и 464; и
(f) CDR3 вариабельной легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 6, 15, 24, 33, 42, 51, 60, 69, 78, 87, 96, 105, 114, 123, 132, 141, 150, 159, 168, 177, 186, 195, 204, 213, 222, 231, 240, 249, 258, 267, 276, 285, 294, 303, 312, 321, 330, 339, 348, 357, 366, 375, 384, 393, 402, 411, 420, 429, 438, 447, 456 и 465.
36. Связывающий DLL3 агент по п. 35, где связывающий агент представляет собой антитело, конъюгат антитела или его антигенсвязывающий фрагмент, необязательно Е(аь')2-фрагмент, Fab'-фрагмент, Fab-фрагмент, Fv-фрагмент, scFv-фрагмент, dsFv-фрагмент или dAb-фрагмент.
37. Связывающий агент против DLL3 по п. 36, где связывающий агент представляет собой моноклональное антитело, содержащее константную область IgG.
38. Связывающий агент против DLL3 по любому из пп. 35-37, содержащий последовательность вариабельной тяжелой цепи (VH), по меньшей мере приблизительно на 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 98%, 99% или на 100% идентичную последовательности VH, представленной в таблице 1b.
39. Связывающий агент против DLL3 по любому из пп. 35-38, содержащий последовательность вариабельной легкой цепи (VL), по меньшей мере приблизительно на 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 98%, 99% или на 100% идентичную последовательности VL, представленной в таблице 1 с.
40. Связывающий агент против DLL3 по любому из пп. 35-39, где связывающий агент содержит последовательность, по меньшей мере приблизительно на 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 98%, 99% или на 100% идентичную последовательности scFv, представленной в таблице 1d.
41. Связывающий агент против DLL3 по любому из пп. 35-40, где связывающий агент представляет собой слитый белок, содержащий scFv-фрагмент, слитый с константной Fc-областью.
42. Фармацевтическая композиция, содержащая связывающий агент против DLL3 по любому из пп. 35-41 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
43. Способ лечения заболевания или нарушения у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение указанному субъекту связывающего агента против DLL3 по любому из пп. 35-41 или фармацевтической композиции по п. 42.
44. Способ по п. 43, где заболевание или нарушение представляет собой рак.
45. Способ по п. 43 или 44, где заболевание или нарушение представляет собой мелкоклеточный рак легкого.