ИНТРОГРЕССИЯ QTL УРОЖАЯ В РАСТЕНИЯ CUCUMIS SATIVUS

1. Культивированное растение Cucumis sativus var. sativus, содержащее фрагмент интрогрессии из дикого родственника огурца на хромосоме 3 в гомозиготной или гетерозиготной форме, где указанный фрагмент интрогрессии содержит локус количественных признаков (QTL), локализованный между маркером однонуклеотидного полиморфизма SNP_01 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 1 и маркером однонуклеотидного полиморфизма SNP_27 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 27, где QTL обеспечивает увеличение урожая плодов огурца.
2. Растение по п. 1, где указанное увеличение урожая плодов огурца фенотипически выражается как значительно более высокое среднее количество плодов на растение (FrPP) линии растений, содержащей фрагмент интрогрессии, по сравнению с линией генетического контроля, не содержащей фрагмент интрогрессии, при выращивании в той же среде, и/или значительно более высокая средняя масса плода на растение (GrPP) линии растений, содержащей фрагмент интрогрессии, по сравнению с линией генетического контроля, не содержащей фрагмент интрогрессии, при выращивании в той же среде.
3. Растение по п. 1, где указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 3 обнаруживается посредством анализа молекулярного маркера, который обнаруживает по меньшей мере один, предпочтительно по меньшей мере 2 или 3, маркеров, выбранных из группы, состоящей из
а) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_01 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 1;
b) генотип TC или TT для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_02 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 2;
c) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_03 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 3;
d) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_04 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 4;
e) генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_05 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 5;
f) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_06 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 6;
g) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_07 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 7;
h) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_08 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 8;
i) генотип CT или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_09 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 9;
j) генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_10 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 10;
k) генотип TG или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_11 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 11;
1) генотип AG или AA для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_12 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 12;
m) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_13 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 13;
n) генотип AG или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_14 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 14;
о) генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_15 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 15;
р) генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_16 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 16;
q) генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_17 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 17;
r) генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_18 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 18;
s) генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_19 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 19;
t) генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_20 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 20;
u) генотип АС или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_21 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 21;
v) генотип TC или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_22 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 22;
w) генотип СТ или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_23 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 23;
x) генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_24 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 24;
у) генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_25 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 25;
z) генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_26 при нуклеотиде 251 последовательности SEQ ID NO: 26;
aa) генотип AG или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_27 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 27; и необязательно
bb) любой специфичный для генома дикого родственника огурца маркер между маркером SNP_01 и SNP_27.
4. Растение по п. 1, содержащее QTL и содержащее по меньшей мере 1, 2, 3, 4 или 5 маркеров, выбранных из одной из групп а), b), с) или d):
а) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_01 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 1; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_02 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 2; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_03 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 3; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_04 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 4; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_05 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 5; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_06 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 6; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_07 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 7; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_08 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 8; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_09 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 9; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_10 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 10; или
b) генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_10 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 10; генотип TG или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_11 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 11; генотип AG или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_12 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 12; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_13 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 13; генотип AG или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_14 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 14; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_15 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 15; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_16 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 16; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_17 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 17; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_18 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 18; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_19 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 19; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_20 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 20; или
c) генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_20 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 20; генотип AC или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_21 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 21; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_22 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 22; генотип СТ или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_23 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 23; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_24 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 24; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_25 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 25; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_26 при нуклеотиде 251 последовательности SEQ ID NO: 26; генотип AG или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_27 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 27; или
d) генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_06 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 6; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_07 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 7; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_08 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 8; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_09 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 9; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_10 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 10; генотип TG или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_11 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 11; генотип AG или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_12 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 12; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_13 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 13; генотип AG или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_14 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 14; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_15 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 15; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_16 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 16; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_17 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 17; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_18 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 18; генотип GA или GG для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_19 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 19; генотип СТ или СС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_20 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 20; генотип AC или АА для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_21 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 21; генотип ТС или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_22 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 22; генотип СТ или ТТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_23 при нуклеотиде 75 последовательности SEQ ID NO: 23.
5. Растение по п. 1, где фрагмент интрогрессии находится в гетерозиготной форме, и один или более SNP маркеров имеют гетерозиготный генотип SNP.
6. Растение по п. 1, где фрагмент интрогрессии находится в гомозиготной форме, и один или более SNP маркеров имеют гомозиготный генотип SNP.
7. Растение по п. 1, где растение относится к одному из следующих типов огурца: салатный огурец, длинный огурец, Европейский тепличный огурец.
8. Растение по п. 1, где растением является гибрид простого скрещивания F1 или инбредная линия.
9. Растение по п. 1, где растением является культивированный огурец Евразийской группы огурцов, и где фрагмент интрогрессии происходит из Cucumis sativus var. hardwickii, С.sativus var. sikkimensis, или Cucumis sativus var. xishuangbannesi.
10. Растение по п. 1, где растение является партенокарпическим.
11. Растение по п. 1, где QTL представляет собой QTL, присутствующий в семенах, депонированных под номером доступа NCIMB42346.
12. Растение по любому из пп. 1-11, где указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 3 является получаемым скрещиванием растения, выращенного из семян, депонированных под номером доступа NCIMB42346, с другим растением огурца.
13. Семена, из которых может быть выращено растение по любому из пп. 1-12.
14. Плод огурца, собранный с растения по любому из пп. 1-12 или с растения, выращенного из семени по п. 13.
15. Растительная клетка, ткань или часть растения по любому из пп. 1-12 или семени по п. 13, содержащая по меньшей мере одну рекомбинантную хромосому 3, где указанная рекомбинантная хромосома 3 содержит фрагмент интрогрессии из дикого родственника огурца, и где указанный фрагмент интрогрессии содержит QTL, обеспечивающий увеличенный урожай плодов.
16. Способ идентификации культивированного растения С. sativus var. sativus, содержащего фрагмент интрогрессии на хромосоме 3, где указанный фрагмент интрогрессии представляет собой как обнаружено в NCIMB42346, или более маленький фрагмент, производный от него, включающий:
a) обеспечение популяции культивированных растений С. sativus var. sativus,
b) скрининг указанной популяции, применяя анализ молекулярного маркера, который обнаруживает по меньшей мере один SNP маркер, выбранный из группы, состоящей из:
SNP_01 - SNP_27 для обнаружения фрагмента интрогрессии на хромосоме 3;
c) идентификацию и/или отбор растения, содержащего:
i) по меньшей мере 1 из SNP маркеров SNP_01 - SNP_27 для обнаружения фрагмента интрогрессии на хромосоме 3; или
ii) по меньшей мере 2, 3, или 4 последовательных маркеров, выбранных из SNP_01 - SNP_27, для обнаружения фрагмента интрогрессии на хромосоме 3.