СПОСОБ АНАЛИЗА КЛЕТОЧНО-ОПОСРЕДОВАННОГО ИММУННОГО ОТВЕТА С ПОВЫШЕННОЙ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬЮ

1. Способ измерения активности клеточно-опосредованного иммунного ответа у субъекта, при этом указанный способ включает приведение в контакт лимфоцитов от субъекта, по меньшей мере, с двумя наборами пептидов, причем первый набор содержит, по меньшей мере, один пептид длиной примерно от 7 до 14 аминокислотных остатков, и второй набор содержит, по меньшей мере, один пептид длиной от 16 аминокислотных остатков или больше, при этом пептиды охватывают весь белковый антиген или его часть, и измерение присутствия или повышения уровня иммунной эффекторной молекулы из иммунных клеток, при этом присутствие или уровень иммунной эффекторной молекулы является показателем уровня клеточно-опосредованной отвечаемости субъекта.
2. Способ по п. 1, в котором субъектом является человек.
+
+
3. Способ по п. 1, в котором пептиды, содержащие от 7 до 14 аминокислот, распознаются CD8 лимфоцитами, и пептиды, содержащие 16 аминокислот или больше, распознаются CD4 лимфоцитами.
4. Способ по п. 1, в котором образец представляет собой неразбавленную цельную кровь.
5. Способ по п. 4, в котором образец представляет собой цельную кровь, которая составляет примерно от 10% до 100% по объему от образца, подлежащего анализу.
6. Способ по п. 5, в котором цельная кровь составляет примерно от 50% до 100% по объему от образца, подлежащего анализу.
7. Способ по п. 6, в котором цельная кровь составляет примерно от 80% до 100% по объему от образца, подлежащего анализу.
8. Способ по п. 1, в котором цельную кровь собирают в пробирку, содержащую гепарин.
9. Способ по п. 1, в котором иммунная эффекторная молекула представляет собой цитокин.
10. Способ по п. 1, в котором цитокин представляет собой гамма-интерферон (IFN-γ).
11. Способ по п 1, в котором иммунные эффекторы выявляют с помощью антител, специфичных в отношении них.
12. Способ по п. 11, в котором иммунные эффекторы выявляют методом иммуноферментного анализа (ELISA).
13. Способ по п. 12, в котором иммунные эффекторы выявляют методом ELISpot.
14. Способ по п. 1, в котором субъект имеет инфекцию, вызванную патогенным агентом, выбранным из видов Mycobacterium, видов Staphylococcus, видов Streptococcus, видов Borrelia, Escherichia coli, видов Salmonella, видов Clostridium, видов Shigella, видов Proteus, видов Bacillus, вируса герпеса, вируса гепатита В или С и вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), или заболевание, связанное с такими инфекциями.
15. Способ по п. 14, в котором заболевание представляет собой инфекцию, вызванную Mycobacterium tuberculosis, или туберкулез (ТВ).
16. Способ по п. 15, в котором антиген выбран из CFP10, ESAT-6, ТВ7.7 и ТВ37.6.
17. Способ по п. 1, в котором субъект имеет заболевание, выбранное из очаговой алопеции, анкилозирующего спондилита, антифосфолипидного синдрома, аутоиммунной болезни Аддисона, рассеянного склероза, аутоиммунного заболевания надпочечников, аутоиммунной гемолитической анемии, аутоиммунного гепатита, аутоиммунного оофорита и орхита, болезни Бехчета, буллезного пемфигоида, кардиомиопатии, целиакии спру-дерматита, синдрома хронической усталости (CFIDS), хронической воспалительной демиелинизации, хронической воспалительной полинейропатии, синдрома Чарга-Стросса, рубцующегося пемфигоида, CREST-синдрома, синдрома холодовой агглютинации, болезни Крона, герпетиформного дерматита, дискоидной волчанки, эссенциальной смешанной криоглобулинемии, фибромиалгии, гломерулонефрита, базедовой болезни, синдрома Гийена-Барре, тиреоидита Хашимото, идиопатического легочного фиброза, идиопатической тромбоцитопенической пурпуры (ΙΤΡ), IgA-нефропатии, сахарного инсулинзависимого диабета (I типа), красного плоского лишая, волчанки, синдрома Меньера, смешанного заболевания соединительной ткани, рассеянного склероза, миастении гравис, миокардита, обыкновенной пузырчатки, пернициозной анемии, узелкового полиартериита, полихондрии, полигландулярных синдромов, ревматической полимиалгии, полимиозита и дерматомиозита, первичной агаммаглобулинемии, первичного билиарного цирроза, псориаза, феномена Рейно, синдрома Рейтера, ревматического полиартрита, ревматоидного артрита, саркоидоза, склеродермии, синдрома Шегрена, синдрома скованного человека, системной красной волчанки, болезни отсутствия пульса, височного артериита/гигантоклеточного артериита, язвенного колита, увеита, васкулита, витилиго и воспалительного заболевания кишечника.
18. Способ по п. 17, в котором заболевание представляет собой целиакию.
19. Способ по п. 18, в котором заболевание представляет собой аутоиммунный диабет.
20. Способ по п. 1, в котором субъект имеет рак, выбранный из протоонкогена ABL1, СПИД-ассоциированных злокачественных опухолей, невриномы слухового нерва, острого лимфоцитарного лейкоза, острого миелолейкоза, аденокистозной карциномы, адренокортикального рака, идиопатической миелоидной метаплазии, алопеции, альвеолярной саркомы мягких тканей, рака анального канала, ангиосаркомы, апластической анемии, астроцитомы, атаксии-телеангиэктазии, базально-клеточной карциномы (кожи), рака мочевого пузыря, рака костей, колоректального рака, глиомы ствола головного мозга, опухолей головного мозга и центральной нервной системы (CNS), рака молочной железы, опухолей CNS, карциноидных опухолей, рака шейки матки, опухолей головного мозга детей, детского рака, детского лейкоза, детской саркомы мягких тканей, хондросаркомы, хориокарциномы, хронического лимфолейкоза, хронического миелолейкоза, колоректального рака, кожной Т-клеточной лимфомы, возвышающейся дерматофибросаркомы, десмопластической мелко-круглоклеточной опухоли, протоковой карциномы, эндокринных злокачественных опухолей, рака эндометрия, эпендимомы, рака пищевода, саркомы Юинга, злокачественной опухоли внепеченочного желчного протока, злокачественной опухоли глаз, меланомы, ретинобластомы глаз, злокачественной опухоли фаллопиевых труб, анемии Фанкони, фибросаркомы, рака мочевого пузыря, рака желудка, злокачественной опухоли желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальной карциноидной опухоли, рака мочеполовой системы, опухолей из половых клеток, гестационно-трофобластической болезни, глиомы, гинекологических злокачественных опухолей, гематологических злокачественных опухолей, волосатоклеточного лейкоза, рака головы и шеи, рака печени, наследственного рака молочной железы, гистиоцитоза, болезни Ходжкина, папилломавируса человека, пузырного заноса, гиперкальцемии, рака гортанной части глотки, внутриглазной меланомы, рака островковых клеток, саркомы Калоши, рака почки, гистиоцитоза клеток Лангерганса, рака гортани, лейомиосаркомы, лейкоза, синдрома Ли-Фраумени, рака губ, липосаркомы, рака печени, рака легких, лимфостаза, лимфомы, лимфомы Ходжкина, неходжкинской лимфомы, рака молочной железы мужчин, злокачественной палочковидной опухоли почек, медуллобластомы, меланомы, рака клеток Меркеля, мезотелиомы, метастазирующей злокачественной опухоли, рака полости рта, множественной эндокринной неоплазии, грибовидного микоза, миелодиспластического синдрома, миеломы, миелопролиферативных нарушений, злокачественной опухоли носа, носоглоточной злокачественной опухоли, аденосаркомы почки, нейробластомы, нейрофиброматоза, синдрома разрывов Неймегена, злокачественной опухоли кожи, не являющейся меланомой, немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), злокачественных опухолей глаз, рака пищевода, рака ротовой полости, злокачественной опухоли ротовой части глотки, остеосаркомы, рака стомы яичников, рака поджелудочной железы, околоносовой злокачественной опухоли, рака паращитовидной железы, злокачественной опухоли околоушной железы, рака полового члена, периферийных нейроэктодермальных опухолей, рака гипофиза, истинной полицитемии, рака предстательной железы, редких злокачественных опухолей и ассоциированных нарушений, почечно-клеточной карциномы, ретинобластомы, рабдомиосаркомы, синдрома Ротмунда-Томсона, злокачественной опухоли слюнных желез, саркомы, шванномы, синдрома Сезари, рака кожи, мелкоклеточного рака легких (SCLC), злокачественной опухоли тонкой кишки, саркомы мягких тканей, опухоли спинного мозга, плоскоклеточной карциномы (кожи), рака желудка, синовиальной саркомы, злокачественной опухоли семенников, злокачественной опухоли тимуса, рака щитовидной железы, переходно-клеточного рака (мочевого пузыря), переходно-клеточного рака (почечной лоханки/мочеточника), трофобластной злокачественной опухоли, рака уретры, рака мочевыделительной системы, уроплакинов, саркомы матки, рака матки, рака влагалища, рака наружных женских половых органов, макроглобулинемии Вальденстрема и опухоли Вильмса.
21. Способ по п. 1, в котором субъект был подвергнут воздействию белковоподобного токсического вещества.
22. Способ по любому из пп. 1 - 21, в котором величина клеточно-опосредованного иммунного ответа коррелирует с состоянием, прогрессированием и/или тяжестью заболевания.
23. Применение, по меньшей мере, двух наборов пептидов, причем первый набор содержит, по меньшей мере, один пептид длиной примерно от 7 до 14 аминокислотных остатков, и второй набор содержит, по меньшей мере, один пептид длиной от 16 аминокислотных остатков или больше, при этом пептиды охватывают весь белковый антиген или его часть, для изготовления набора для диагностики клеточно-опосредованной иммунологической отвечаемости способом, состоящим в инкубации пептидов с лимфоцитами и выявлении присутствия или повышения уровня эффекторных молекул.
24. Способ, позволяющий пользователю определить статус клеточно-опосредованной иммунологической отвечаемости субъекта, при этом способ включает:
(а) получение данных в форме уровней или концентраций иммунной эффекторной молекулы, которые относительно контроля обеспечивают корреляцию с состоянием клеточно-опосредованной иммунологической отвечаемости, от пользователя посредством коммуникационной сети, при этом уровень эффекторной молекулы измеряют после подвергания лимфоцитов воздействию, по меньшей мере, двух наборов пептидов, причем первый набор содержит, по меньшей мере, один пептид длиной примерно от 7 до 14 аминокислотных остатков, и второй пептид содержит, по меньшей мере, один пептид длиной от 16 аминокислотных остатков или больше, при этом пептиды охватывают весь белковый антиген или его часть;
(b) обработку данных субъекта посредством одномерного или многомерного анализа для обеспечения величины иммунологической отвечаемости;
(c) определение статуса субъекта в соответствии с результатами величины иммунологической отвечаемости в сравнении с предварительно определенными величинами; и
(d) передачу показателя статуса субъекта пользователю посредством коммуникационной сети.