СПОСОБ ПОДВИДОВОЙ ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ ШТАММОВ ВОЗБУДИТЕЛЯ ЧУМЫ МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ

Способ подвидовой дифференциации штаммов возбудителя чумы, включающий выделение ДНК исследуемого штамма, проведение полимеразной цепной реакции, амплификацию фрагментов межгенных участков, анализ результатов, отличающийся тем, что при проведении ПЦР используют олигонуклеотидные праймеры на межгенные участки wzyE-dapF и YPDSF_0064-YPDSF_0065, имеющие следующие последовательности:
wzyE-dapF-S - ACATACGATGGCCGATCATG,
wzyE-dapF-As - CTGATTATGTGGGGCGCT,
YPDSF_0064-YPDSF_0065-S - CTGAAGGGCGAGGAGAGAC,
YPDSF_0064-YPDSF_0065-As - AGGGTGTTGTTGGTTTTGGT;
дифференциацию штаммов Y.pestis проводят путем сравнения размеров амплифицированных фрагментов wzyE-dapF и YPDSF_0064-YPDSF_0065 с размерами аналогичных фрагментов, характерных для типичных штаммов основного (151 п.н. и 374 п.н.), кавказского (185 п.н. и 434 п.н.), алтайского и гиссарского (202 п.н. и 374 п.н.), а также улегейского (185 п.н. и 374 п.н.) подвидов.