ЭФФЕКТЫ ИНГИБИТОРОВ FGFR3 НА ТРАНСКРИПЦИЮ ГЕНОВ

1. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3 и
тестировании образца, полученного от пациента, после введения ингибитора с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера указывает на кандидатуру пациента для проведения лечения.
2. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся в:
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция присутствия экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера указывает на кандидатуру пациента для проведения лечения.
3. Способ контроля ответа нуждающегося в этом пациента на лечение клеточного пролиферативного нарушения, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3,
тестировании образца, полученного от пациента, после введения ингибитора с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера по сравнению с исходным уровнем является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
4. Способ контроля ответа пациента на лечение ингибитором FGFR3 клеточного пролиферативного заболевания, заключающийся в:
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера по сравнению с исходным уровнем является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
5. Способ применения биомаркера в лечении клеточного пролиферативного заболевания у пациента, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3,
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, и
последующем введении того же или другого ингибитора FGFR3 пациенту, при условии, что благоприятное изменение уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера определяют после введения исходного ингибитора.
6. Способ лечения пациента с множественной миеломой, заключающийся во введении терапевтически эффективного количества агента, который изменяет уровень экспрессии по сравнению с исходным уровнем биомаркера, идентифицированного в табл.I, таким образом ингибируя патологии, ассоциированные с множественной миеломой.
7. Способ регуляции количества дозы ингибитора FGFR3 для лечения клеточного пролиферативного заболевания у пациента, заключающийся во:
введении пациенту исходного количества ингибитора FGFR3,
контроля экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, после введения исходного количества ингибитора, и
регуляции количества последующего введения ингибитора пациенту на основе уровня изменения экспрессии биомаркера или биомаркеров, которое происходит при введении исходного количества.
8. Способ применения биомаркера для идентификации соединения, ингибирующего FGFR3, для потенциального лечения множественной миеломы или для того, чтобы направлять решение совершенствовать соединение, ингибирующее FGFR3, для дальнейшего развития лечения множественной миеломы, заключающийся в:
контактировании соединения с клеточной культурой KMS18 или KMS11 и
тестировании части клеточной культуры с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения экспрессии по меньшей мере одного биомаркера является показателем идентификации соединения для лечения или положительного решения совершенствовать соединение для дальнейшего развития.
9. Способ выбора соответствующего ингибитора FGFR3 для введения пациенту, нуждающемуся в лечении указанным ингибитором, заключающийся во:
введении пациенту исходного ингибитора FGFR3,
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, и
последующем введении исходного ингибитора FGFR3 пациенту, при условии, что благоприятное изменение уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера определяют после введения исходного ингибитора.
10. Способ применения биомаркера для идентификации соединения, ингибирующего FGFR3, для потенциального лечения клеточного пролиферативного заболевания, заключающийся в:
контактировании соединения с клеточной линией или тканью, ассоциированной с нарушением и
тестировании части клеточной культуры или ткани после контактирования с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, которая изменяется по сравнению с исходным уровнем,
причем детекция изменения экспрессии по меньшей мере одного биомаркера является показателем идентификации соединения для лечения.
11. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
12. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
13. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
14. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
15. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров, выбранных из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
16. Способ по пп.1-10, в котором измерение экспрессии гена осуществляют детекцией количества РНК, транскрибируемой биомаркером.
17. Способ по пп.1-10, в котором измерение экспрессии гена осуществляют детекцией количества ДНК, образуемой при обратной транскрипции РНК, транскрибируемой биомаркером.
18. Способ по пп.1-10, в котором измерение экспрессии гена осуществляют детекцией полипептида или белка, кодируемого биомаркером.
19. Способ по пп.1-10, в котором по меньшей мере один биомаркер функционально связан с чипом генов.
20. Способ по пп.1-10, в котором по меньшей мере один биомаркер представлен в компьютерно-читаемом формате.
21. Способ по пп.1-10, в котором тестирование включает контактирование образца с чипом генов, включающим биомаркеры любой из табл.I-V.
22. Способ по пп.1-10, в котором стадия детекции включает сравнение уровня экспрессии гена биомаркера с базой данных генов.
23. Способ по пп.1-3, в котором лечение включат введение пациенту терапевтически эффективного количества того же или другого ингибитора FGFR3.
24. Способ по пп.1 и 2, в котором лечение предназначено для клеточного пролиферативного нарушения.
25. Способ по пп.1-5 или 9-10, в котором лечение предназначено для неопластического заболевания.
26. Способ по пп.1-5 или 9-10, в котором лечение предназначено для множественной миеломы.
27. Способ по пп.1-5 или 9-10, в котором лечение предназначено для множественной миеломы t (4; 14).
28. Способ по пп.1-4, 7 или 9-10, в котором ингибитор выбран из группы, состоящей из CHIR-258, SU-5402 и PD-173074.
29. Способ по пп.1-4, 7 или 9-10, в котором ингибитор представляет собой CHIR-258.
30. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер выбран из группы, состоящей из CCL3, LOC150271, CD48, DUSP4 и ITGB7.
31. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер выбран из группы, состоящей из LOC150271, CD48, DUSP4 и ITGB7.
32. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер представляет собой CCL3.
33. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер не является CCL3.
34. Способ по пп.1, 3 или 5, далее включающий установление у пациента исходного уровня перед введением ингибитора FGFR3.
35. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
36. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
37. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
38. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
39. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров, выбранных из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
40. Способ по п.3, в котором стадию введения повторяют перед стадией тестирования образца, полученного от пациента.
41. Способ по п.3, в котором ингибитор FGFR3 вводят в терапевтически эффективном количестве.
42. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
43. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III.
44. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV.
45. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V.
46. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров, выбранных из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
47. Способ по п.5, в котором каждый, исходный ингибитор и позднее введенный ингибитор, выбраны из группы, состоящей из CHIR-258, SU-5402 и PD-173074.
48. Способ по п.5, в котором исходный ингибитор представляет собой CHIR-258.
49. Способ по п.5, в котором позднее введенный ингибитор представляет собой CHIR-258.
50. Применение агента, который изменяет уровень экспрессии по сравнению с исходным уровнем биомаркера, идентифицированного в табл.I, для изготовлении лекарственного препарата для лечения патологий, ассоциированных с множественной миеломой.
51. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
52. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.III.
53. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.IV.
54. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.V.
55. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
56. Способ по п.6, в котором агент представляет собой CHIR-258.
57. Способ по п.6, в котором пациент представляет собой пациента с t (4:14) множественной миеломой.
58. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
59. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III.
60. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV.
61. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V.
62. Способ по п.7, в котором контроль включает контактирование образца с чипом генов, включающим биомаркеры из любой из табл.I-V, и сравнение уровня экспрессии гена биомаркера с базой данных генов.
63. Способ по п.10, в котором биомаркер выбран из табл.I.
64. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3, и
тестировании образца, полученного от пациента после введения ингибитора, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из группы, состоящей из CCL3, DUSP6, ANXA9, CR2, AL531683, ZNF589, AW274468, FRMD3, LTB и WDR42A,
причем детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
65. Способ контроля ответа пациента на лечение ингибитором FGFR3 при клеточном пролиферативном заболевании, заключающийся в:
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из группы, состоящей из CCL3, DUSP6, ANXA9, CR2, AL531683, ZNF589, AW274468, FRMD3, LTB и WDR42A,
причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера по сравнению с исходным уровнем является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
66. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер не является каким-либо или всеми из CCL3, DUSP6, ANXA9, CR2, AL531683, ZNF589, AW274468, FRMD3, LTB и WDR42A.