СПОСОБ ИНГИБИРОВАНИЯ GM-CSFRα У ПАЦИЕНТА

1. Способ ингибирования или нейтрализации активности альфа-цепи рецептора колониестимулирующего фактора гранулоцитов/макрофагов (GM-CSFRα) у пациента, включающий введение указанному пациенту композиции, содержащей эффективное количество связующего агента, который связывает GM-CSFRα человека, при этом указанный связующий агент:
ингибирует связывание GM-CSF с GM-CSFRα человека;
имеет значение KD меньше чем 5 нМ при связывании GM-CSFRα человека при определении с помощью поверхностного плазменного резонанса, и при этом указанный агент содержит:
набор гипервариабельных участков (CDR) VH-домена: VH CDR1, включающий последовательность SEQ ID NO: 53, VH CDR2, включающий последовательность SEQ ID NO: 54 и VH CDR3, включающий последовательность SEQ ID NO: 55, с каркасными участками VH-домена или белковым каркасом, причем указанный набор CDR VH может содержать не более чем 10 замен аминокислот; и, возможно,
набор CDR VL-домена: VL CDR1, включающий последовательность SEQ ID NO: 58, VL CDR2, включающий последовательность SEQ ID NO: 59 и VL CDR3, включающий последовательность SEQ ID NO: 60 с каркасными участками VL-домена или белковым каркасом, причем указанный набор CDR VL может содержать не более чем 10 замен аминокислот.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что указанный связующий агент представляет собой молекулу антитела, включающую VH-домен антитела, содержащий VH CDR1, VH CDR2 и VH CDR3 и VL-домен антитела, содержащий VL CDR1, VL CDR2 и VL CDR3.
3. Способ лечения ревматоидного артрита, астмы, хронической обструктивной болезни легких или миелоидной лейкемии у пациента, включающий введение указанному пациенту композиции, содержащей эффективное количество молекулы антитела, при этом указанная молекула антитела:
ингибирует связывание GM-CSF с GM-CSFRα человека;
имеет значение KD меньше чем 5 нМ при связывании GM-CSFRα человека при определении с помощью поверхностного плазменного резонанса, и при этом указанный агент содержит:
набор гипервариабельных участков (CDR) VH-домена: VH CDR1, включающий последовательность SEQ ID NO; 53, VH CDR2, включающий последовательность SEQ ID NO: 54 и VHCDR3, включающий последовательность SEQ ID NO: 55, с каркасными участками VH-домена или белковым каркасом, причем указанный набор CDR VH может содержать не более чем 10 замен аминокислот; и, возможно,
набор CDR VL-домена: VL CDR1, включающий последовательность SEQ ID NO: 58, VL CDR2, включающий последовательность SEQ ID NO: 59 и VL CDR3, включающий последовательность SEQ ID NO: 60 с каркасными участками VL-домена или белковым каркасом, причем указанный набор CDR VL может содержать не более чем 10 замен аминокислот.
4. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что VH-домен указанного связующего агента включает следующие остатки аминокислот:
S в положении остатка Н17 при нумерации по Kabat в каркасном участке VH;
I в положении остатка Н34 при нумерации по Kabat в CDR1 VH;
Е в положении остатка Н54 при нумерации по Kabat в CDR2 VH;
I в положении остатка Н57 при нумерации по Kabat в CDR2 VH;
I, L, V, А или М в положении остатка Н94 при нумерации по Kabat в каркасном участке VH;
V, N, А или L в положении остатка Н95 при нумерации по Kabat в CDR3 VH;
S в положении остатка 1-197 при нумерации по Kabat в CDR3 VH; и S, F, Н, Р, Т или W в положении остатка Н99 при нумерации по Kabat в CDR3 VH;-
А, Т, Р, S, V или Н в положении остатка Н100В при нумерации по Kabat в CDR3 VH.
5. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что VL-домен указанного связующего агента включает следующие остатки аминокислот:
S в положении остатка 27А при нумерации по Kabat в CDR1 VL;
f N в положении остатка 27 В при нумерации по Kabat в CDR1 VL;
I в положении остатка 27С при нумерации по Kabat в CDR1 VL;
D в положении остатка 32 при нумерации по Kabat в CDR1 VL;
N в положении остатка 51 при нумерации по Kabat в CDR1 VL;
N в положении остатка 52 при нумерации по Kabat в CDR2 VL;
К в положении остатка 53 при нумерации по Kabat в CDR2 VL;
S, Т или М в положении остатка L90 при нумерации по Kabat в CDR3 VL;
D, Е, Q, S, М или Т в положении остатка L92 при нумерации по Kabat в CDR3 VL; и
S, Р, I или V в положении остатка L96 при нумерации по Kabat в CDR3 VL.
6. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что набор гипервариабельных участков в VH-домене указанного связующего агента содержит VH CDR1 с последовательностью аминокислот SEQ ID NO: 3 или SEQ ID NO: 173, VH CDR2 с последовательностью аминокислот SEQ ID NO: 4 и VH CDR3 с последовательностью аминокислот, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5; SEQ ID NO: 15; SEQ ID NO: 35; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 55; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 125; SEQ ID NO: 135; SEQ ID NO: 145; SEQ ID NO: 155; SEQ ID NO: 165; SEQ ID NO: 175; SEQ ID NO: 185; и SEQ ID NO: 195; при этом указанный набор гипервариабельных участков VL-домена указанного связующего агента содержит VL CDR1 с последовательностью аминокислот SEQ ID NO: 8, VL CDR2 с последовательностью аминокислот SEQ ID NO: 9 и VL CDR3 с последовательностью аминокислот, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO; 40, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 110, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 170, SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 190 и SEQ ID NO: 200.
7. Способ по п.6, отличающийся тем, что VH-домен и VL-домен указанного связующего агента имеют последовательности аминокислот, выбранные из следующей группы:
VH-домен SEQ ID NO: 2 и VL домен SEQ ID NO: 208;
VH-домен SEQ ID NO: 12 и VL домен SEQ ID NO: 210;
VH-домен SEQ ID NO: 32 и VL домен SEQ ID NO: 214;
VH-домен SEQ ID NO: 42 и VL домен SEQ ID NO: 216;
VH-домен SEQ ID NO: 52 и VL домен SEQ ID NO: 218;
VH-домен SEQ ID NO: 62 и VL домен SEQ ID NO: 220;
VH-домен SEQ ID NO: 72 и VL домен SEQ ID NO: 222;
VH-домен SEQ ID NO: 82 и VL домен SEQ ID NO: 224;
VH-домен SEQ ID NO: 92 и VL домен SEQ ID NO: 226;
VH-домен SEQ ID NO: 102 и VL домен SEQ ID NO: 228;
VH-домен SEQ ID NO: 112 и VL домен SEQ ID NO: 230;
VH-домен SEQ ID NO: 122 и VL домен SEQ ID NO: 232;
VH-домен SEQ ID NO: 132 и VL домен SEQ ID NO: 234;
VН-домен SEQ ID NO: 142 и VL домен SEQ ID NO: 236;
VH-домен SEQ ID NO: 152 и VL домен SEQ ID NO: 238;
VH-домен SEQ ID NO: 162 и VL домен SEQ ID NO: 240;
VH-домен SEQ ID NO: 172 и VL домен SEQ ID NO: 242;
VH-домен SEQ ID NO: 182 и VL домен SEQ ID NO: 244 или
VH-домен SEQ ID NO: 192 и VL домен SEQ ID NO: 246.
8. Способ ингибирования или нейтрализации активности альфа-цепи рецептора колониестимулирующего фактора гранулоцитов/макрофагов (GM-CSFRα) у пациента, включающий введение указанному пациенту композиции, содержащей эффективное количество молекулы антитела, при этом указанная молекула антитела содержит VH-домен и VL-домен, причем VH-домен содержит гипервариабельные участки (CDR) тяжелой цепи VH CDR1, VH CDR2 и VH CDR3 и в VL-домен содержит гипервариабельные участки легкой цепи VL CDR1, VL CDR2 и VL CDR3, при этом указанные участки CDR имеют следующие аминокислотные последовательности:
VH CDR1 - SEQ ID NO: 53;
VH CDR2 - SEQ ID NO: 54;
VH CDR3 - SEQ ID NO: 55;
VL CDR1 - SEQ ID NO: 58;
VL CDR2 - SEQ ID NO: 59 и
VL CDR3 - SEQ ID NO: 60.
9. Способ лечения ревматоидного артрита, астмы, хронической обструктивной болезни легких или миелоидной лейкемии у пациента, включающий введение указанному пациенту композиции, содержащей эффективное количество молекулы антитела, при этом указанная молекула антитела содержит VH-домен и VL-домен, причем VH-домен содержит гипервариабельные участки (CDR) тяжелой цепи VH CDR1, VH CDR2 и VH CDR3 и в VL-домен содержит гипервариабельные участки легкой цепи VL CDR1, VL CDR2 и VL CDR3, при этом указанные участки CDR имеют следующие аминокислотные последовательности:
VH CDR1 - SEQ ID NO:53;
VH CDR2 - SEQ ID NO: 54;
VH CDR3 - SEQ ID NO: 55;
VL CDR1 - SEQID NO: 58;
VL CDR2 - SEQ ID NO: 59 и
VL CDR3 - SEQ ID NO: 60.
10. Способ по п.8 или 9 отличающийся тем, что указанная молекула антитела представляет собой молекулу гуманизированного антитела или антитела человека.
11. Способ по п.8 или 9 отличающийся тем, что указанная молекула антитела содержит VH-домен антитела с последовательностью аминокислот SEQ ID NO: 52
12. Способ по п.8 или 9 отличающийся тем, что указанная молекула антитела содержит VL-домен антитела с последовательностью аминокислот SEQ ID NO:218.
13. Способ по п.8 или 9 отличающийся тем, что указанная молекула антитела представляет собой lgG4.
14. Способ по п.13, отличающийся тем, что указанная молекула антитела представляет собой молекулу антитела lgG4 человека, содержащую VH-домен, который имеет последовательность SEQ ID NO: 52 и VL домен, который имеет последовательность SEQ ID NO: 218.
15. Способ по любому из пп.1-3, 8 или 9, согласно которому указанную композицию вводят в комбинации или в дополнение к одному или более из следующего: НПВП, кортикостероиды и модифицирующие заболевание противоревматоидные средства (DMARD).
16. Способ по п.15, согласно которому указанную композицию вводят в комбинации с одним или более из следующего: ЦОГ-2 ингибиторы, преднизон, Хумира (адалимумаб), метотрексат, Арава, Энбрел, (Этанерцепт), Ремикад (Инфликсимаб), Кинерет (Анакинра), Ритуксан (Ритуксимаб), Оренция (абатацепт), соли золота, антималярийные средства, сульфасалазин, d-пенициламид, циклоспорин А, диклофенак, циклофосфамид и азатиоприн.
17. Способ по п.16, согласно которому указанную композицию вводят в комбинации с метотрексатом.
18. Способ получения молекулы антитела, включающий осуществление культивирования клетки-хозяина, которая содержит нуклеиновую кислоту кодирующую указанную молекулу антитела, затем проведение очистки указанной молекулы антитела, при этом указанная молекула антитела конкурирует за связывание с внеклеточным доменом GM-CSFRoc с молекулой антитела, которая имеет VH-домен с последовательностью SEQ ID NO: 52 и VL-домен с последовательностью SEQ ID NO: 218.
19. Способ по п.18, отличающийся тем, что указанная молекула антитела связывает с внеклеточный домен GM-CSFRα человека с аффинностью (KD) меньше чем 5 нМ при определении с помощью поверхностного плазменного резонанса.;
20. Способ получения молекулы антитела к GM-CSFRα человека, включающий: получение путем вставки, делеции или замены одной или более аминокислот в последовательности аминокислот исходного VH-домена, который включает VH CDR1, VH CDR2 и VH CDR3, VH-домена, который представляет собой вариант указанного исходного домена VH в отношении последовательности аминокислот, при этом:
исходный VH-домен имеет VH CDR1 с последовательностью SEQ ID NO: 53;
VH CDR2 с последовательностью SEQ ID NO: 54; VH CDR3 с последовательностью SEQ ID NO: 55; и
объединение таким образом полученного VH-домена с одним или более VL-доменами с получением одной или более комбинаций VH/VL,
при этом указанный один или более VL-доменов получены путем вставки, делеции или замены одной или более аминокислот в последовательности аминокислот исходного VL-домена, который включает VL CDR1, VL CDR2 и VL CDR3, при этом:
указанный исходный VL-домен имеет VL CDR1 с последовательностью SEQ ID NO: 58; VL CDR2 с последовательностью SEQ ID NO: 59; и VL CDR3 с последовательностью SEQ ID NO: 60; и
тестирование указанных одной или более комбинаций VH/VL для выявления молекулы антитела, которая способна связывать GM-CSFRα человека.