Разнообразие и изменчивость популяций патогенных микроорганизмов на современном этапе

Материалы X съезда ВНПОЭМП, Москва, 12-13 апреля 2012 г.

Инфекция и иммунитет

РАЗНООБРАЗИЕ И ИЗМЕНЧИВОСТЬ ПОПУЛЯЦИЙ ПАТОГЕННЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ НА СОВРЕМЕННОМ ЭТАПЕ

А.Б. Жебрун, С.Л. Мукомолов, О.В. Нарвская, И.В. Мокроусов, Г.Я. Ценева, Л.А. Кафтырева, Н.И. Романенкова, О.В. Калинина

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт -Петербург

Изучение генотипической структуры более 20 видов патогенов выявило нарастающий темп изменения их популяций вследствие мутационных, селекционных, рекомбинационных событий в геноме и ввиду заноса генотипов из других зон мира. Высокую изменчивость популяций подтверждают следующие факты:

— циркуляция в России более 80 генетических вариантов (сполиготипов) микобактерий туберкулеза, доминирование генетического семейства Bejing (51,1%) и «взрывная» диссеминация субпопуляции BO/Bejing, которая содержит до 60% мультирезистентных к антибиотикам штаммов;

— быстрый темп микроэволюции генома вируса гепатита А;

— обнаружение ранее неизвестного явления межтиповой рекомбинации у вируса гепатита С;

— отсутствие генов энтеропатогенности у современных популяций E. coli O1, E. coli O6 и E. coli O144, вследствие чего они не могут квалифицироваться как возбудители острых кишечных инфекций без генетической идентификации;

— нарастание частоты CagA+ генотипов H. pylori, увеличение доли кларитроми-цинрезистентных штаммов в циркуляции до 39%;

— генетический дрейф под прессом вакцинопро-филактики в составе диких популяций B .pertussis и вируса краснухи; формирование патогенных дериватов вируса Сэбина (у 1% больных вакци-нассоциированным полиомиелитом);

— возрастающая циркуляция папилломавирусов высокого канцерогенного риска (инфицировано 45% пациентов дерматологического профиля);

— обнаружение «типичных» путей импорта в Россию неэндемичных генотипов вирусов (гепатита А— из Средней Азии, гепатита В — из Вьетнама, гепатита С — из США, полиовируса — из Таджикистана. Возрастающее биоразнообразие патогенов создает систему рисков: появление новых эпидемических клонов; антибиотикорезистентность; потеря актуальности вакцин; реверсия патогенности живых вакцин; «маскировка» патогенов вследствие межвидовой рекомбинации; появление новых онкогенных генотипов; возврат ликвидированных инфекций. В целях парирования рисков необходимы постоянные фундаментальные и прикладные (мониторинговые) исследования генетического разнообразия всех актуальных патогенов.

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ ПРОЦЕСС И ОСОБЕННОСТИ ПОПУЛЯЦИИ HELICOBACTER PYLORI В СОВРЕМЕННЫЙ ПЕРИОД

А.Б. Жебрун, А.В. Сварваль, Р.С. Ферман

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Исследования проведены в Санкт-Петербурге и на территории Северо-Западного Федерального округа в течение 2008—2011 гг. Впервые в стране,

на фоне резко возросшего уровня заболеваемости, обусловленной H. pylori (гастриты и дуодениты, язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки), осуществлено динамическое наблюдение: а) за превалентностью инфекции H. pylori у детей и взрослых; б) за особенностями популяционной структуры возбудителя.

Обследовано 2072 человека: 860 детей, 1212 взрослых лиц

Впервые выявлена новая закономерность: волнообразный характер нарастания превалентности H. pylori по мере взросления детских когорт — с ускорением темпов инфицирования в возрасте 4—5, 7—8 и 11—15 лет. Превалентность H. pylori — инфекции у детей колебалась без выраженной динамики, в пределах 42—54%; у взрослых она достоверно нарастала с 65,5% в 2007 г. до 87,6% в 2011 г. При этом доля cagA-позитивных штаммов в структуре популяции бактерий достоверно возросла до 88,7% у детей и 87,6% у взрослых (рост составил 46% и 22% — соответственно).

Генотипирование выявило следующие доли cagA-позитивных штаммов у больных: при гастрите — 64,7%, язвенной болезни — 72,2%, карциноме желудка — 90,8%.

Рутинные и генетические методы контроля ан-тибиотикоризистентности H. pillory выявили высокие уровни резистентности к метронидазолу (78,6% штаммов) и кларитромицину (39,3%), а так же появление новых, не описанных в литературе сочетаний мутаций, ответственных за резистентность к клари-тромицину.

Заключение: резко возросший в стране за последние 20 лет уровень заболеваемости детей и взрослых гастритами и язвенной болезнью сопровождается неблагоприятными изменениями структуры популяции H. pylory — ростом частоты cagA-позитивных штаммов, распространением метронидазол-и кларитромицина-резистентности, что требует повсеместного контроля этих показателей в клинической и эпидемиологической практике.

АПРОБАЦИЯ ПАН-ФЛЕБОВИРУСНОЙ ОТ-ПЦР ТЕСТ-СИСТЕМЫ

А.С. Климентов1,2, Н.В. Хуторецкая2, О.В. Исаева1, С.В. Бугмырин5, И.С. Холодилов1, Л.А. Беспятова5, Е.П. Иешко5, Л.И. Козловская1, А.С. Шевцова1, Л.Ю. Романова1, И.В. Ковальчук3, Н.И. Соломащенко4, К.А. Пурмак4, Е.Н. Романенко3, Г.А. Тихонова3, Г.Г. Карганова1, А.П. Гмыль1

'ФГБУ ««Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова» РАМН, Московская область; 2ФГБУ«НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского» Минздравсоцразвития России, Москва; 3Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Ставропольскому краю, г. Ставрополь; 4ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Ставропольском крае», г. Ставрополь; 5У РАН Институт биологии карельского научного центра РАН, г. Петрозаводск

Представители рода Флебовирусов относятся к экологической группе арбовирусов. Их широкое распространение и генетическое разнообразие дает основание предполагать, что этиологическими агентами ряда заболеваний, связанных с присасыванием клеща, являются не охарактеризованные представи-