REP белок в качестве белкового антигена для диагностических анализов

1. Белок, связанный с репликацией ДНК (Rep) для диагностики рассеянного склероза (РС), где:
(a) по меньшей мере двукратное повышение уровня Rep-белка или его фрагментов в образце пациента в сравнении с контрольным образцом; или
по меньшей мере двукратное повышение уровня анти-Rep антител белку в образце пациента в сравнении с контрольным образцом
соотносится с диагностированием РС; и
(b) Rep-белок содержит
(i) аминокислотную последовательность, как показано в SEQ ID NO:1.
(ii) фрагмента последовательности SEQ ID NO:1, способного связывать анти-Rep антитела, специфичные по отношению к белку, имеющему аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1; или
(iii) аминокислотной последовательности, на 90% или более гомологичной аминокислотной последовательности (i) или (ii) со способностью к связыванию с Rep-белковыми антителами, специфичными по отношению к белку, содержащему аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO:1.
2. Rep-белок по п. 1, где фрагмент последовательности SEQ ID NO:1 содержит эпитоп в пределах аминокислотной последовательности, состоящей из аминокислот 1 - 229 последовательности SEQ ID NO:1.
3. Rep-белок по пп. 1, где повышение количества Rep-белка или его фрагментов, или анти-Rep антител в по меньшей мере 5 раз в сравнении с контрольным образцом указывает на диагностирование РС.
4. Rep-белок по п. 1, где белок кодируется полинуклеотидной кислотой, как показано в SEQ ID NO:13.
5. Анти-Rep антитело, выбранное из группы, состоящей из антитела AB01 523-1-1 (DSM ACC3327), антитела AB02 304-4-1 (DSM ACC3328), антитела MSBI1 381-6-2 (DSM ACC3329), антитела MSBI1 761-5-1 (DSM ACC3330) и антитела MSBI1 961-2-2.
6. Использование анти-Rep антител по п. 5 в способе по любому из пп. 1-4.
7. Способ диагностики РС у пациента, содержащий следующие этапы:
(a) инкубация образца пациента с Rep-белком, как определено в (b) п. 1;
(b) определение количества антител в образце пациента, образующих иммунологический комплекс с Rep-белком; и
(c) соотнесение по меньшей мере в 2 раза повышенного количества антител, связанных с Rep-белком, в образце пациента, по сравнению с количеством в контрольном образце с диагностированием РС.
8. Способ по п. 7, в котором на этапе (а) Rep-белок иммобилизируют с последующей инкубацией иммобилизированного Rep-белка с образцом пациента.
9. Способ по п. 7, в котором на этапе (а) Rep-белок экспрессируют в клетках с последующей инкубацией клеток с образцом пациента.
10. Способ по п. 8, в котором на этапе (b) количество антител, образующих иммуннологические комплексы с Rep-белком, определяется посредством детекторного связывающего агента, соединенного с сигналообразующим соединением.
11. Способ по п. 7, в котором на этапе (a) антитела в образце пациента иммобилизируют с последующей инкубацией с определенным количеством Rep-белка.
12. Способ по любому из пп. 7-11, в котором образец пациента представляет собой образец сыворотки или плазмы.
13. Способ диагностирования РС у пациента, содержащий следующие этапы:
(a) определение количества Rep-белка в образце пациента с применением анти-Rep антител, связывающихся с эпитопом, состоящим из SEQ ID NO:2 или SEQ ID NO:3, и
(b) соотнесение по меньшей мере в 2 раза повышенного количества Rep-белка в образце пациента на этапе (а) по сравнению с количеством в контрольном образце с диагностированием РС.
14. Способ по п. 13, в котором антитело, специфичное к Rep-белку связывается с эпитопом в пределах аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из аминокислот от 1 до 136, от 137 до 229 и от 230 до 234 последовательности SEQ ID NO:1.
15. Способ по п. 13 или 14, в котором образец пациента выбирают из группы, состоящей из образца сыворотки, образца плазмы или образца ткани.
16. Набор для использования в диагностировании РС, содержащий:
(a) Rep-белок, где Rep-белок содержит:
(i) аминокислотную последовательность, как показано в SEQ ID NO:1.
(ii) фрагмент последовательности SEQ ID NO:1, который способен связывать анти-Rep антитело со специфичностью в отношении белка, имеющего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1; или
(iii) аминокислотную последовательность, на 90% или более гомологичную аминокислотной последовательности (i) или (ii) и способную связывать анти-Rep-антитело со специфичностью в отношении белка, имеющего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1,
(b)  античеловеческое антитело, связанное с детектируемой меткой и способное связываться с анти-Rep антителом со специфичностью в отношении белка, имеющего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, и
(c) твердую матрицу, подходящую для иммобилизации Rep-белка согласно (а) или анти-Rep антител со специфичностью по отношению к белку, имеющему аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, наличие которого предполагается в образце сыворотки или плазмы.
17. Набор по п. 16 для использования в анализе, выбранном из группы, состоящей из иммуносорбентного анализа (ИСА), радиоиммунологического анализа (РИА), иммуноферментного анализа (ИФА), иммунофлуоресцентного анализа, иммунолюминесцентного анализа и анализа с применением тест-полосок.