Филогенетический анализ вирусов москитных лихорадок, выделенных на территории Афганистана

Электронный научно-образовательный вестник "Здоровье и образование в XXI веке" № 9, 2008 г.

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВИРУСОВ МОСКИТНЫХ ЛИХОРАДОК, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ АФГАНИСТАНА

Клименко И.С., Бутенко АМ., Грибенникова Т.В.

ГУ НИИ вирусологии имени Д.И. Ивановского, г. Москва

Вирусы москитных лихорадок (МЛ) относятся к роду Phlebovirus семейства Bunyaviridae и вызывают неспецифические заболевания по типу лихорадок. Впервые вирусы МЛ были выделены в 1943-1944 гг. Sabin A.B. из крови больных в период эпидемии среди американских солдат в Италии (сицилийская и неаполитанская лихорадки). Геном вирусов МЛ представлен тремя кольцевыми РНК (L, M и S), молекулярная масса которых составляет 2,6-2,8, 1,8-2,2 и 0,7-0,8 кДа, соответственно.

В мае-августе 1986-1987 гг. в Афганистане от больных советских военнослужащих были выделены новые штаммы вирусов МЛ. Эти штаммы, согласно серологическим данным, представлены вариантами неаполитанского (1008) и сицилийского (1028) серокомплекса. Молекулярно-генетический анализ каждого выделенного вирусного штамма МЛ позволит более точно определить их принадлежность к тому или иному серокомплексу. Целью нашего исследования было проведение филогенетического анализа штаммов вирусов МЛ, выделенных на территории Афганистана, на основе нуклеотидных последовательностей фрагментов S-сегмента генома. На основе усредненной последовательности S-сегмента вирусов МЛ, представленных в базе данных NCBI GenBank, мы разработали последовательности специфических нуклеотидов. В результате использования ПЦР и последующего секвенирования была определена первичная структура фрагментов S-сегмента генома штаммов Аф-1008 и Аф-1028 вирусов МЛ, размером 379 пар оснований. Далее был выполнен филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей фрагментов генома исследованных штаммов вирусов МЛ в сравнении с имеющимися в базе данных NCBI Gen Bank. Проведенные исследования показали, что штамм Аф-1008, обнаруженный в Афганистане, является представителем серокомплекса вируса неаполитанской москитной лихорадки, а штамм Аф-1028 - сицилийского серокомплекса. Кроме того, при сравнении нуклеотидной последовательности секвени-рованного участка S-сегмента генома штамм Аф-1008 имел сходство со штаммом индийского происхождения Р-7101795, процент гомологии составил 93%. Штамм Аф-1028 в пределах своего серокомплекса также оказался наиболее близким штамму индийского происхождения I 701735, процент гомологии составил 97%.

ЛИТЕРАТУРА

1. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2007. Т. 9. № 4.

2. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2006. Т. 8. № 4.

3. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2005. Т. 7. № 4.

4. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2004. Т. 6. № 4.

5. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2003. Т. 5. № 4.

6. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2002. Т. 4. № 4.

7. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2001. Т. 3. № 4.

8. Журнал научных статей. Здоровье и образование в XXI веке. 2000. Т. 2. № 4.

9. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2007. Т. 9. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

10. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2006. Т. 8. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

11. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2005. Т. 7. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

12. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2004. Т. 6. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

13. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2003. Т. 5. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

14. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2002. Т. 4. № 12. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

15. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2001. Т. 3. № 1. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

16. Электронный научно-образовательный вестник «Здоровье и образование в XXI веке». 2000. Т. 2. № 1. URL: http ://e-pubmed. org/isu. html.

Материалы IX международного конгресса «Здоровье и образование в XXI веке» РУДН, Москва

Стр. [408]