КОЛИЧЕСТВЕННОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ IR-A И IR-B ДЛЯ КЛАССИФИКАЦИИ ОПУХОЛЕЙ

1. Синтетическая нуклеиновая кислота, содержащая 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов, где последовательность синтетической нуклеиновой кислоты содержит, по меньшей мере, 10-20 следующих друг за другом нуклеотидов любой из следующих последовательностей:
(i) SEQ ID NO: 3, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 3 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;
(ii) SEQ ID NO: 4, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 4 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;
(iii) SEQ ID NO: 5, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 5 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; или
(iv) SEQ ID NO: 6, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 6 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях.
2. Набор праймеров для детекции и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-A в биологическом образце, где набор праймеров включает
(a) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов последних 50 оснований экзона 10 гена INSR (SEQ ID NO: 1), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 1 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; и
(b) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов первых 60 оснований экзона 12 гена INSR (SEQ ID NO: 2), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 2 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях.
3. Способ детекции и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-A в биологическом образце, включающий этапы:
(a) приведения биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в контакт с набором праймеров по п.2 в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы; и
(b) детектирования и/или количественного определения амплифицированной последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A.
4. Синтетическая нуклеиновая кислота, содержащая 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов, где последовательность синтетической нуклеиновой кислоты содержит, по меньшей мере, 10-20 следующих друг за другом нуклеотидов любой из следующих последовательностей:
(i) SEQ ID NO: 11, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 11 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; или
(ii) SEQ ID NO: 12, комплементарной ей последовательности или последовательности, способной гибридизоваться с SEQ ID NO: 12 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях.
5. Набор праймеров для детекции и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, где набор праймеров включает:
(a) (i) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов последних 50 оснований экзона 10 гена INSR (SEQ ID NO: 1), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 1 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;
(a) (ii) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов экзона 11 гена INSR (SEQ ID NO: 9), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 9 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях;
a) (iii) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов соединяющих экзоны 10 и 11, комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с ней или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях; и
(b) последовательность синтетической нуклеиновой кислоты, содержащую 10-30 следующих друг за другом нуклеотидов первых 50 оснований экзона 12 гена INSR (SEQ ID NO: 10), комплементарную ей последовательность или последовательность, способную гибридизоваться с SEQ ID NO: 10 или комплементарной ей последовательностью в жестких условиях, или последовательность, ей комплементарную.
6. Способ детекции и/или количественного определения нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, включающий этапы:
(a) приведения биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в контакт с набором праймеров по п.5 в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы; и
(б) детектирования и/или количественного определения амплифицированной последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-B.
7. Способ определения присутствия или отсутствия последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A и последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, включающий:
приведение биологического образца или образца нуклеиновых кислот, приготовленного из биологического образца, в контакт с набором праймеров для детектирования и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-A в биологическом образце в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, где набор праймеров включает набор праймеров по п.2, и/или приведение биологического образца или образца нуклеиновых кислот, приготовленного из биологического образца, в контакт с набором праймеров для детектирования и/или количественного определения последовательности нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, где набор праймеров по пункту включает набор праймеров по п.5; и
детектирование и/или количественное определение амплифицированной последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A или IR-B.
8. Способ выбора пациента, восприимчивого к лиганду IGFI/II или агонисту рецептора IGFR1, где способ включает:
детектирование и/или количественное определение экспрессии IR-A в образце в соответствии с п.3;
детектирование и/или количественное определение экспрессии IR-B в образце в соответствии с п.6; и
где экспрессия IR-A и IR-B служит показателем того, следует ли вводить субъекту лиганд IGFI/II или антагонист рецептора IGFR1.
9. Способ по п.8, отличающийся тем, что лиганд IGFI/II или антагонист рецептора IGFR1 является антителом.
10. Способ по п.9, отличающийся тем, что антитело содержит компоненты последовательностей, перечисленных в таблице 1 и таблице 2.
11. Способ определения относительного присутствия или отсутствия последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-A и последовательности-мишени нуклеиновой кислоты IR-B в биологическом образце, включающий:
приведение биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, в контакт с набором праймеров по п.2;
приведение биологического образца или нуклеиновых кислот, приготовленных из биологического образца, в условиях, пригодных для амплификации на основе полимеразы, в контакт с набором праймеров по п.5;
количественное определение амплифицированной последовательности нуклеиновой кислоты IR-A и IR; и
и посредством этого определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в биологическом образце.
12. Способ классифицирования опухоли, включающий
определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в образце опухоли способом по п.11,
классификацию опухоли в соответствии с критериями, включающими относительную экспрессию IR-A и IR-B.
13. Способ лечения пациента с применением антагониста IGF, включающий
определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в образце ткани способом по п.11,
классификацию пациента в соответствии с критериями, включающими относительную экспрессию IR-A и IR-B; и
введение антагониста IGF в соответствии с классификацией.
14. Способ классифицирования подтипа опухоли рака груди, включающий определение относительной экспрессии IR-A в сравнении с IR-B в образце раковой опухоли груди способом по п.11; и классификацию подтипа опухоли рака груди как люминал-B, если соотношение IR-A:IR-B ниже, чем пороговое значение.