СПОСОБЫ ПОЛУЧЕНИЯ СОЕДИНЕНИЙ НА ОСНОВЕ 4-ФЕНИЛ-6-(2,2,2-ТРИФТОР-1-ФЕНИЛЭТОКСИ)ПИРИМИДИНА
METHODS OF PRODUCING COMPOUNDS BASED ON 4-PHENYL-6-(2,2,2-TRIFLUORO-1-PHENYLETHOXY)PYRIMIDINE

По этой заявке испрашивается приоритет временной заявки на патент США 60/957744, поданной 24 августа 2007 года, которая полностью включена в настоящее описание путем ссылки.
ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Это изобретение относится к способам получения соединений на основе 4-фенил-6-(2,2,2-трифтор-1-фенилэтокси)пиримидина.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Некоторые соединения на основе 4-фенил-6-(2,2,2-трифтор-1-фенилэтокси)пиримидина являются ингибиторами фермента триптофангидроксилазы (TPH), который катализирует ограничивающую скорость стадию биосинтеза серотонина. Смотрите заявки на патенты США 11/638677 и 60/874596, обе поданные 12 декабря 2006 года. Предполагается, что эти соединения могут использоваться для лечения разнообразных заболеваний и нарушений, связанных с серотонинэргической системой. Следовательно, желательны эффективные способы их получения.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Это изобретение охватывает способы получения соединений формулы I:
и их солей, различные заместители которых определены здесь. При введении млекопитающим предпочтительные соединения этой формулы ингибируют TPH (например, TPH1) и могут быть использованы в лечении различных заболеваний и нарушений.
Это изобретение также охватывает промежуточные соединения, которые могут быть использованы в синтезе соединений формулы I.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ФИГУР
Фиг.1 представляет структуру дифракции рентгеновских лучей кристаллической твердой формы (R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанола. Структура была получена с использованием дифрактометра Rigaku MiniFlex (Cu (1,54060 Å) излучение).
Фиг.2 представляет структуру дифракции рентгеновских лучей кристаллической твердой формы 1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанона. Структура была получена с использованием дифрактометра Rigaku MiniFlex (Cu (1,54060 Å) излучение).
Фиг.3 представляет структуру дифракции рентгеновских лучей кристаллической твердой формы 1-(2-бром-5-хлорфенил)-3-метил-1Н-пиразола. Структура была получена с использованием дифрактометра Rigaku MiniFlex (Cu (1,54060 Å) излучение).
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ
Это изобретение основано на открытии новых способов получения соединений формулы I и промежуточных соединений для их получения. При введении млекопитающим предпочтительные соединения формулы I ингибируют TPH и могут использоваться в лечении различных заболеваний и нарушений. Смотрите в целом заявки на патенты США 11/638677 и 60/874596, обе поданные 12 декабря 2006 года.
Определения
Если не указано иное, термин "алкенил" означает прямую, разветвленную и/или циклическую углеводородную цепь, имеющую от 2 до 20 (например, от 2 до 10 или от 2 до 6) атомов углерода и включающую по меньшей мере одну углерод-углеродную двойную связь. Примеры алкенильных групп включают винил, аллил, 1-бутенил, 2-бутенил, изобутиленил, 1-пентенил, 2-пентенил, 3-метил-1-бутенил, 2-метил-2-бутенил, 2,3-диметил-2-бутенил, 1-гексенил, 2-гексенил, 3-гексенил, 1-гептенил, 2-гептенил, 3-гептенил, 1-октенил, 2-октенил, 3-октенил, 1-ноненил, 2-ноненил, 3-ноненил, 1-деценил, 2-деценил и 3-деценил.
3
2
3
2
2
3
2
3
3
2
4
3
2
5
3
Если не указано иное, термин "алкокси" означает группу -O-алкил. Примеры алкоксигрупп включают -OCH, -OCHCH, -O(CH)CH, -O(CH)CH, −O(CH)CH, -O(циклопентил) и -O(CH)CH. Термин "низший алкокси" относится к -O-(низший алкил).
Если не указано иное, термин "алкил" означает прямую, разветвленную и/или циклическую ("циклоалкил") углеводородную цепь, имеющую от 1 до 20 (например, от 1 до 10 или от 1 до 4) атомов углерода. Алкильные группы, имеющие от 1 до 4 атомов углерода, указаны как "низший алкил". Примеры алкильных групп включают метил, этил, пропил, изопропил, н-бутил, трет-бутил, изобутил, пентил, гексил, изогексил, гептил, 4,4-диметилпентил, октил, 2,2,4-триметилпентил, нонил, децил, ундецил и додецил. Циклоалкильные группы могут быть моноциклическими или полициклическими, и примеры включают циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил и адамантил. Дополнительные примеры алкильных групп имеют прямые, разветвленные и/или циклические части (например, 1-этил-4-метил-циклогексил). Термин "алкил" включает насыщенные углеводороды, а также алкенильные и алкинильные группы.
Если не указано иное, термин "алкиларил" или "алкил-арил" означает алкильную группу, связанную с арильной группой.
Если не указано иное, термин "алкилгетероарил" или "алкил-гетероарил" означает алкильную группу, связанную с гетероарильной группой.
Если не указано иное, термин "алкилгетероцикл" или "алкил-гетероцикл" означает алкильную группу, связанную с гетероциклической группой.
Если не указано иное, термин "алкинил" означает прямую, разветвленную или циклическую углеводородную цепь, имеющую от 2 до 20 (например, от 2 до 20 или от 2 до 6) атомов углерода и включающую по меньшей мере одну углерод-углеродную тройную связь. Примеры алкинильных групп включают ацетиленил, пропинил, 1-бутинил, 2-бутинил, 1-пентинил, 2-пентинил, 3-метил-1-бутинил, 4-пентинил, 1-гексинил, 2-гексинил, 5-гексинил, 1-гептинил, 2-гептинил, 6-гептинил, 1-октинил, 2-октинил, 7-октинил, 1-нонинил, 2-нонинил, 8-нонинил, 1-децинил, 2-децинил и 9-децинил.
Если не указано иное, термин "арил" означает ароматическое кольцо или ароматическую или частично ароматическую кольцевую систему, составленную из атомов углерода и водорода. Арильная группа может включать множество колец, связанных или конденсированных вместе. Примеры арильных групп включают антраценил, азуленил, дифенил, флуоренил, индан, инденил, нафтил, фенантренил, фенил, 1,2,3,4-тетрагидро-нафталин и толил.
Если не указано иное, термин "арилалкил" или "арил-алкил" означает арильную группу, связанную с алкильной группой.
Если не указано иное, термины "биогидролизуемый амид", "биогидролизуемый сложный эфир", "биогидролизуемый карбамат", "биогидролизуемый карбонат", "биогидролизуемый уреидо" и "биогидролизуемый фосфат" означают амид, сложный эфир, карбамат, карбонат, уреидо или фосфат, соответственно, соединения, которое: либо не препятствует биологической активности соединения, но может придавать этому соединению выгодные свойства in vivo, такие как захват, продолжительность действия или начало действия; либо биологически неактивен, но превращается in vivo в биологически активное соединение. Примеры биогидролизуемых сложных эфиров включают сложные эфиры низшего алкила, сложные эфиры алкоксиацилокси, сложные эфиры алкил ациламино алкила и сложные эфиры холина. Примеры биогидролизуемых амидов включают амиды низшего алкила, амиды α-аминокислот, амиды алкоксиацила и амиды алкиламиноалкил-карбонила. Примеры биогидролизуемых карбаматов включают низшие алкиламины, замещенные этилендиамины, аминокислоты, гидроксиалкиламины, гетероциклические и гетероароматические амины и амины простого полиэфира.
Если не указано иное, термин "галоген" охватывает фтор, хлор, бром и йод.
Если не указано иное, термин "гетероалкил" относится к алкильной группе (например, прямой, разветвленной или циклической), в которой по меньшей мере один из ее атомов углерода был заменен гетероатомом (например, N, O или S).
Если не указано иное, термин "гетероарил" означает арильную группу, в которой по меньшей мере один из ее атомов углерода был заменен гетероатомом (например, N, O или S). Примеры включают акридинил, бензимидазолил, бензофуранил, бензоизотиазолил, бензоизоксазолил, бензохиназолинил, бензотиазолил, бензоксазолил, фурил, имидазолил, индолил, изотиазолил, изоксазолил, оксадиазолил, оксазолил, фталазинил, пиразинил, пиразолил, пиридазинил, пиридил, пиримидинил, пиримидил, пирролил, хиназолинил, хинолинил, тетразолил, тиазолил и триазинил.
Если не указано иное, термин "гетероарилалкил" или "гетероарил-алкил" означает гетероарильную группу, связанную с алкильной группой.
Если не указано иное, термин "гетероцикл" относится к ароматическому, частично ароматическому или неароматическому моноциклическому или полициклическому кольцу или кольцевой системе, состоящей из углерода, водорода и по меньшей мере одного гетероатома (например, N, O или S). Гетероцикл может включать множество (то есть два или более) колец, конденсированных или связанных. Гетероциклы включают гетероарилы. Частным случаем гетероциклов являются 5-13-членные гетероциклы, содержащие 1-4 гетероатома, выбранные из азота, кислорода и серы. Другими являются 5-10-членные гетероциклы, содержащие 1-4 гетероатома, выбранные из азота, кислорода и серы. Примеры гетероциклов включают бензо[1,3]диоксолил, 2,3-дигидро-бензо[1,4]диоксинил, циннолинил, фуранил, гидантоинил, морфолинил, оксетанил, оксиранил, пиперазинил, пиперидинил, пирролидинонил, пирролидинил, тетрагидрофуранил, тетрагидропиранил, тетрагидропиридинил, тетрагидропиримидинил, тетрагидротиофенил, тетрагидротиопиранил и валеролактамил.
Если не указано иное, термин "гетероциклоалкил" или "гетероцикл-алкил" относится к гетероциклической группе, связанной с алкильной группой.
Если не указано иное, термин "гетероциклоалкил" относится к неароматическому гетероциклу.
Если не указано иное, термин "гетероциклоалкилалкил" или "гетероциклоалкил-алкил" относится к гетероциклоалкильной группе, связанной с алкильной группой.
Если не указано иное, термин "пролекарство" охватывает фармацевтически приемлемые сложные эфиры, карбонаты, тиокарбонаты, N-ацильные производные, N-ацилоксиалкильные производные, четверичные производные третичных аминов, основания N-Манниха, основания Шиффа, аминокислотые конъюгаты, фосфатные сложные эфиры, соли металла и эфиры сульфоновых кислот соединений, раскрытых здесь. Примеры пролекарств включают соединения, которые включают биогидролизуемую группу (например, биогидролизуемый амид, биогидролизуемый карбамат, биогидролизуемый карбонат, биогидролизуемый сложный эфир, биогидролизуемый фосфат или биогидролизуемый уреидный аналог). Пролекарства соединений, раскрытых здесь, могут быть легко спланированы и получены специалистом. Смотрите, например, Design of Prodrugs, Bundgaard, A. Ed., Elseview, 1985; Bundgaard, hours., "Design and Application of Prodrugs", A Textbook of Drug Design and Development, Krosgaard-Larsen and hours. Bundgaard, Ed., 1991, Chapter 5, p. 113-191; и Bundgaard, hours., Advanced Drug Delivery Review, 1992, 8, 1-38.
rd
nd
Если не указано иное, термин "защитная группа", когда он используется применительно к части молекулы, подвергнутой химической реакции, означает химическую группу, которая не является реакционоспособной в условиях этой химической реакции и которая может быть удалена с получением группы, которая является реакционоспособной в этих условиях. Защитные группы известны в уровне техники. Смотрите, например, Greene, T.W. and Wuts, P.G.M., Protective Groups in Organic Synthesis (3 ed., John Wiley & Sons: 1999); Larock, R.C., Comprehensive Organic Transformations (2 ed., John Wiley & Sons: 1999). Некоторые примеры включают бензил, дифенилметил, тритил, Cbz, Boc, Fmoc, метоксикарбонил, этоксикарбонил и фталимидо.
Если не указано иное, термин "псевдогалоген" относится к многоатомному аниону, который напоминает галогенидный ион по его кислотно-щелочным характеристикам, характеристикам замещения и химии окислительно-восстановительного потенциала, обычно имеет низкую основность и образует свободный радикал в условиях полимеризации радикалов с переносом атома. Примеры псевдогалогенов включают азидные ионы, цианид, цианат, роданид, тиосульфат, сульфонаты и сульфонилгалогениды.
Если не указано иное, термин "стереомерно обогащенная композиция" соединения относится к смеси названного соединения и его стереоизомера(ов), которая содержит больше названного соединения, чем его стереоизомера(ов). Например, стереоизомерно обогащенная композиция (S)-бутан-2-ола охватывает смеси (S)-бутан-2-ола и (R)-бутан-2-ола в отношениях, например, приблизительно 60/40, 70/30, 80/20, 90/10, 95/5 и 98/2.
Если не указано иное, термин "стереоизомерная смесь" охватывает рацемические смеси, а также стереомерно обогащенные смеси (например, R/S=30/70, 35/65, 40/60, 45/55, 55/45, 60/40, 65/35 и 70/30).
Если не указано иное, термин "стереомерно чистый" означает композицию, которая включает один стереоизомер соединения и в основном не содержит других стереоизомеров этого соединения. Например, стереомерно чистая композиция соединения, имеющего один стереоцентр, в основном не содержит противоположного стереоизомера соединения. Стереомерно чистая композиция соединения, имеющего два стереоцентра, в основном не содержит других диастереомеров соединения. Стереомерно чистая композиция соединения, которое имеет множество стереоцентров, но которое изображено или названо таким способом, что стереохимия меньше, чем всех его стереоцентров определена, в основном не содержит изомеров соединения, которые имеют другую стереохимию в стереоцентрах, для которых определена стереохимия. Например, "стереомерно чистый ((1R)-1,2-дихлорпропил)бензол" относится к ((1R)-1,2-дихлорпропил)бензолу, который в основном не содержит ((1S)-1,2-дихлорпропил)бензола.
Типичное стереомерно чистое соединение включает больше чем приблизительно 80 вес.% одного стереоизомера соединения и меньше чем приблизительно 20 вес.% других стереоизомеров соединения, больше чем приблизительно 90 вес.% одного стереоизомера соединения и меньше чем приблизительно 10 вес.% других стереоизомеров соединения, больше чем приблизительно 95 вес.% одного стереоизомера соединения и меньше чем приблизительно 5 вес.% других стереоизомеров соединения, больше чем приблизительно 97 вес.% одного стереоизомера соединения и меньше чем приблизительно 3 вес.% других стереоизомеров соединения, или больше чем приблизительно 99 вес.% одного стереоизомера соединения и меньше чем приблизительно 1 вес.% других стереоизомеров соединения.
2
2
3
3
3
3
2
2
Если не указано иное, термин "замещенный", когда он используется для описания химической структуры или группы, относится к производному этой структуры или группы, в котором один или более атомов водорода замещено атомом, химической группой или функциональной группой, такой как спирт, альдегид, алкокси, алканоилокси, алкоксикарбонил, алкенил, алкил (например, метил, этил, пропил, трет-бутил), алкинил, алкилкарбонилокси (-OC(O)алкил), амид (-C(O)NH-алкил- или -алкилNHC(O)алкил), амидинил (-C(NH)NH-алкил- или -C(NR)NH), амин (первичный, вторичный и третичный, такой как алкиламино, ариламино, арилалкиламино), ароил, арил, арилокси, азо, карбамоил (-NHC(O)O-алкил- или -OC(O)NH-алкил), карбамил (например, CONH, а также CONH-алкил, CONH-арил и CONH-арилалкил), карбонил, карбоксильную группу, карбоновую кислоту, ангидрид карбоновой кислоты, хлорангидрид карбоновой кислоты, циано, сложный эфир, эпоксид, простой эфир (например, метокси, этокси), гуанидино, галоген, галогеналкил (например, -CCl, -CF, -C(CF)), гетероалкил, полуацеталь, имин (первичный и вторичный), изоцианат, изотиоцианат, кетон, нитрил, нитро, кислород (то есть чтобы обеспечить оксо-группу), фосфодиэфир, сульфид, сульфонамидо (например,SONH), сульфон, сульфонил (включая алкилсульфонил, арилсульфонил и арилалкилсульфонил), сульфоксид, тиол (например, сульфгидрил, тиоэфир) и мочевину (-NHCONH-алкил-).
Если не указано иное, фраза "больше чем X", где X обозначает число, имеет то же самое значение, как "X или больше чем X". Точно также фраза "больше чем приблизительно X", где X обозначает число, имеет то же самое значение как "приблизительно X или больше чем приблизительно X".
Если не указано иное, фраза "меньше чем X", где X обозначает число, имеет то же самое значение как "X или меньше чем X". Точно также фраза "меньше чем приблизительно X", где X обозначает число, имеет то же самое значение как "приблизительно X или меньше чем приблизительно X".
Если не указано иное, фраза "от X до Y" охватывает значения от X до Y, а также непосредственно X и Y. Точно также фразы "от приблизительно X до приблизительно Y" и "приблизительно от X до Y" и относятся к значениям от приблизительно X до приблизительно Y, включая приблизительно X и приблизительно Y.
Если не указано иное, термин "включают" имеет то же самое значение, как "включают", и термин "включает" имеет то же самое значение, как "включает, но не ограничен". Точно также термин "такой как" имеет то же самое значение, как термин "такой как, но не ограниченный".
Если не указано иное, одно или более прилагательных, непосредственно предшествующих ряду существительных, должен рассматриваться как относящийся к каждому из существительных. Например, фраза "в случае необходимости замещенный алкил, арил или гетероарил" имеет то же самое значение как "в случае необходимости замещенный алкил, в случае необходимости замещенный арил или в случае необходимости замещенный гетероарил".
Если не указано иное, структура или название соединения или рода соединений охватывают все формы этого соединения или рода соединений, и все композиции, включающие это соединение или род соединений.
Следует отметить, что химическая группа, которая является частью большего соединения, может быть описана здесь с использованием названия, обычно используемого для ее обозначения, когда она существует как отдельная молекула, или название, обычно используемого для радикала. Например, термины "пиридин" и "пиридил" имеют одно и то же значение, когда используются для описания группы, присоединенной к другим химическим группам. Таким образом, две фразы "XOH, в которой X обозначает пиридил" и "XOH, в котором X обозначает пиридин", имеют одно и то же значение и охватывают соединения пиридин-2-ол, пиридин-3-ол и пиридин-4-ол.
Также следует отметить, что, если стереохимия структуры или части структуры не обозначена, например, жирной или пунктирной линией, структура или часть структуры должна интерпретироваться как включающая все стереоизомеры. Точно также названия соединений, имеющих один или более хиральных центров, которые не определяют стереохимию этих центров, охватывают чистые стереоизомеры и их смеси. Кроме того, предполагается, что любой атом, показанный на рисунке с незаполненными валентностями, присоединен к достаточному для заполнения валентностей числу атомов водорода. Кроме того, химические связи, изображенные одной сплошной линией параллельно одной пунктирной линии, охватывают как простую, так и двойную (например, ароматическую) связи, если валентности это позволяют.
Способы синтеза
Это изобретение охватывает способы получения соединений формулы I:
1
1
A
A
B
C
2
A
2
A
A
B
C
2
A
3
A
A
4
A
B
C
и их солей (например, фармацевтически приемлемых солей), в которой:A обозначает в случае необходимости замещенный гетероцикл; каждыйR независимо обозначает амино, галоген, водород, C(O)R, OR, NRR, S(O)R или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил или алкил-гетероцикл;R независимо обозначает амино, галоген, водород, C(O)R, OR, NRR, S(O)R или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил или алкил-гетероцикл;R обозначает водород, C(O)R, C(O)OR или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил, алкил-гетероцикл, арил или гетероцикл;R обозначает водород или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил, алкил-гетероцикл, арил или гетероцикл; каждыйR независимо обозначает водород или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил или алкил-гетероцикл; каждыйR независимо обозначает водород или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил или алкил-гетероцикл; каждыйR независимо обозначает водород или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил или алкил-гетероцикл; и m=1-4.
1
1
В некоторых вариантах осуществления изобретенияA является ароматическим; в других он не является ароматическим. В другихA может быть замещен одним или более галогеном или низшим алкилом.
В некоторых соединение формулы I имеет формулу I(a):
В частных вариантах осуществления соединение формулы I(a) имеет формулу I(b):
5
A
A
B
C
2
A
в которой: каждыйR независимо обозначает амино, галоген, водород, C(O)R, OR, NRR, S(O)R или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил или алкил-гетероцикл; и n=1-3.
1
2
3
3
A
A
4
5
В некоторых вариантах осуществленияR обозначает водород или галоген. В некоторых m=1. В некоторыхR обозначает водород или амино. В некоторыхR обозначает водород или низший алкил. В некоторыхR обозначает C(O)OR и R обозначает алкил. В некоторыхR обозначает водород или низший алкил. В некоторыхR обозначает водород или низший алкил (например, метил). В некоторых n=1.
Частным случаем соединения формулы I(b) является (S)-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовая кислота:
Другим соединением формулы I(b) является (S)-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)этилпропаноат:
Другим соединением формулы I(b) является (S)-2-амино-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)этилпропаноат:
В одном варианте осуществления изобретения соединение формулы I получают согласно общему подходу, показанному ниже на схеме 1:
1
где Y обозначает галоген или псевдогалоген. Здесь соединение формулы II вводят в контакт с одним из соединений формулы III в подходящих реакционных условиях. Такие условия включают использование основания (например, алкиллития, алкилмагния, алкоголятов, гидроксидов щелочных металлов, фосфатов щелочных металлов и карбонатов щелочных металлов), температура от приблизительно 50 до приблизительно 150°C, время реакции от приблизительно 10 до приблизительно 40 часов и полярные апротонные растворители. Частным случаем основания является карбонат цезия.
В некоторых вариантах осуществления соединение формулы II имеет формулу II(a):
1
В некоторых таких соединенияхR обозначает хлор и m=1. Частным случаем такого соединения является (R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанол:
Особая кристаллическая форма этого соединения имеет температуру плавления приблизительно 120°C при измерении дифференциальной сканирующей калориметрией (DSC) (исходная температура). В этом контексте термин "приблизительно" означает ±5,0°C. Эта форма обеспечивает структуру дифракции рентгеновских лучей на порошке (XRPD) с пиками в одном или более из приблизительно 9,9, 11,0, 19,2, 19,9, 24,4, 30,0, 31,0 и/или 40,4 градуса 2θ. В этом контексте термин "приблизительно" означает ±0,3 градуса. Как известно специалисту в данной области, относительные интенсивности пиков в структуре дифракции рентгеновских лучей кристаллической формы могут варьировать в зависимости от того, как получен образец и как собраны данные. С учетом этого, пример структуры XRPD этой кристаллической формы показан на фиг.1.
Соединения формулы II могут быть получены восстановлением соединений формулы IV:
с использованием общеизвестных способов, таких как гидрирование Noyori и гидрирование с переносом Noyori. В частном способе восстановление проводят, используя катализатор на основе металла платиновой группы (например, иридий, рутений, родий) с хиральным лигандом Noyori-типа, таким как (1R,2R)-(-)-N-(4-толуолсульфонил)-1,2-дифенилэтилендиамин.
Частным случаем соединения формулы IV является 1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанон:
Особая кристаллическая форма этого соединения имеет температуру плавления приблизительно 83°C при измерении DSC (исходная температура). В этом контексте термин "приблизительно" означает ±5,0°C. Эта форма обеспечивает структуру XRPD с пиками в одном или более из приблизительно 8,1, 11,3, 16,3, 22,7 и/или 27,3 градуса 2θ. В этом контексте термин "приблизительно" означает ±0,3 градуса. Пример структуры XRPD этой кристаллической формы показан на фиг.2.
Соединения формулы IV могут быть получены из соединений формулы V:
в которой X обозначает бром или йод. Например, соединение формулы V может быть введено в реакцию с алкиллитием или алкилмагнием с получением соответствующего соединения лития или магния, которое может затем быть введено в реакцию с 2,2,2-трифторэтилацетатом. Частные алкиллитиевые реактивы включает н-бутиллитий, втор-бутиллитий и трет-бутиллитий. Частные магниевые реактивы включают изопропилмагний хлорид и трибутилмагний хлорид. Подходящие условия реакции включают температуры от приблизительно -80 до приблизительно 40°C, времена реакции от приблизительно 10 минут до приблизительно 10 часов и апротонные растворители. Таким образом, соединение 1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанон может быть получено из 1-(2-бром-5-хлорфенил)-3-метил-1Н-пиразола:
Особая кристаллическая форма этого соединения имеет температуру плавления приблизительно 76°C при измерении DSC (исходная температура). В этом контексте термин "приблизительно" означает ±5,0°C. Эта форма обеспечивает структуру дифракции рентгеновских лучей на порошке (XRPD) с пиками в приблизительно 8,2, 16,4, 17,3, 19,0, 22,7, 25,8, 28,4, 31,0 и/или 33,6 градуса 2θ. В этом контексте термин "приблизительно" означает ±0,3 градуса. Пример структуры XRPD этой кристаллической формы показан на фиг.3.
Соединения формулы III могут быть получены реакцией сочетания соединения формулы III(a):
с 2-амино-4,6-дихлорпиримидином, причем каждый R' независимо обозначает водород или в случае необходимости замещенный алкил, алкил-арил, алкил-гетероцикл, арил или гетероцикл, или вместе с атомами кислорода, к которым они присоединены, образуют циклический диоксаборолан. Подходящие условия сочетания Suzuki известны из уровня техники и включают использование катализатора на основе палладия. Примеры катализаторов на основе палладия включают бис(трифенилфосфин)-палладий (II) хлорид, смесь соли палладия, такого как хлорид палладия или ацетат палладия, и лиганда, такого как трифенилфосфин, дигидродихлорбис(ди-трет-бутилфосфинито-kP)палладат(2-) (POPd), дигидроди-μ-хлортетракис(ди-трет-бутилфосфинито-kP)дипалладат(2-) (POPd1), дигидроди-μ-хлордихлорбис(ди-трет-бутилфосфинито-kP)дипалладат(2-) (POPd2), дигидродихлорбис(трет-бутилциклогексилфосфинито-kP)палладат(2-) (POPd3), дигидроди-μ-хлордихлорбис(трет-бутилциклогексилфосфинито-kP)дипалладат(2-) (POPd4), дигидроди-μ-хлортетракис(трет-циклогексилфосфинито-kP)дипалладат(2-) (POPd5), дигидроди-μ-хлордихлорбис(дициклогексилфосфинито-kP)дипалладат(2-) (POPd6), дигидроди-μ-хлортетракис(дициклогексилфосфинито-kP)дипалладат(2-) (POPd7), дихлорбис(хлорди-трет-бутилфосфин)палладий (II) (PXPd), дихлор(хлорди-трет-бутилфосфин)палладий (II) димер (PXPd2), дибром(хлорди-трет-бутилфосфин)палладий (II) димер (PXPd2-бром), дихлорбис(хлор-трет-бутилциклогексилфосфин)палладий (II) (PXPd3), дихлор(хлор-трет-бутилциклогексилфосфин)палладий (II) димер (PXPd4), дихлор(хлордициклогексилфосфин)палладий (II) димер (PXPd6) и дихлорбис(хлордициклогексилфосфин)палладий (II) (PXPd7). В одном варианте осуществления катализатор не является бис(трифенилфосфин)-палладий (II) хлоридом.
В одном варианте осуществления соединение формулы III(a) имеет формулу:
Соединения, раскрытые здесь, могут быть кристаллизованы индивидуально или с другими соединениями (например, аминокислотами) с образованием со-кристаллов. Таким образом, один вариант осуществления изобретения охватывает способ образования со-кристалла соединения формулы I, который включает введение соединения формулы I в контакт с фармацевтически приемлемой аминокислотой в условиях, достаточных для образования со-кристалла соединения формулы I и аминокислоты.
ПРИМЕРЫ
Получение 1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанона
В 3-литровую 3-горлую круглодонную колбу, оборудованную приводной мешалкой, регулятором температуры и входным отверстием для подачи азота при комнатной температуре загружали трет-бутоксид калия (Aldrich 95%, 84,6 г, 0,716 моль) и ДМСО (400 мл, 4X) и перемешивали в течение 15 минут. К этому раствору добавляли пиразол 2 (59 г, 0,719 моль) с последующей промывкой ДМСО (50 мл, 0,5X). Полученный оранжевый мутный раствор перемешивали в течение 15 минут, и добавляли фторид 1 (100 г, 0,477 моль) с последующей промывкой ДМСО (50 мл, 0,5X). Эту смесь затем нагревали до 50°C и поддерживали в течение 5 часов при этой температуре. После охлаждения до комнатной температуры, реакционную смесь разбавляли MTBE (750 мл), и добавляли воду (500 мл), получая коричневую мутную смесь. После 15 минут перемешивания органический слой отделяли и последовательно промывали 1 н. HCl (250 мл), солевым раствором (250 мл) и водой (250 мл). Тестирование раствора органического слоя осуществляли, используя GC (преобразование >99%, выходы раствора 3 и его региоизомера 4 составили 83% и 17%, соответственно). Раствор MTBE затем концентрировали в вакууме до общего объема приблизительно 200 мл (KF показал 0,737% воды). Добавляли ТГФ (500 мл) и концентрировали до 2X раствора (KF=0,158%). Последовательность добавление ТГФ-концентрация повторяли, получая 2X раствор (KF=0,023%), который использовали непосредственно на следующей стадии.
1
13
1
13
3
3
3
3
Аналитические образцы соединений 3 и 4 очищали хроматографией на колонках и охарактеризовывали: Соединение 3: белые кристаллы; т.пл.: 76°C (исходная температура DSC). H-ЯМР (400 МГц,CDCl) δ 7,80 (1H, д, J=2,3 Гц), 7,61 (1H, д, J=8,6 Гц), 7,58 (1H, д, J=2,5 Гц), 7,22 (1H, дд, J=8,6, 2,6 Гц), 6,27 (1H, д, J=2,5 Гц), 2,38 (3H, с); C-ЯМР (100 МГц,CDCl) δ 150,8, 140,6, 134,6, 134,1, 132,0, 129,0, 128,2, 115,4, 107,0, 13,6. Соединение 4: белые кристаллы; H-ЯМР (400 МГц,CDCl) δ 7,65 (1H, д, J=8,6 Гц), 7,62 (1H, д, J=1,5 Гц), 7,43 (1H, д, J=2,5 Гц), 7,35 (1H, дд, J=8,6, 2,2 Гц), 6,21 (1H, с), 2,19 (3H, с); C-ЯМР (100 МГц,CDCl) δ 140,6, 140,2, 140,0, 134,1, 133,9, 130,8, 130,2, 120,7, 105,9, 11,4.
Указанный выше раствор ТГФ переносили в снабженную рубашкой 3-литровую 3-горлую круглодонную колбу, оборудованную приводной мешалкой, регулятором температуры и входным отверстием для подачи азота. После разбавления ТГФ (800 мл), содержание воды в растворе проверяли KF (0,053%). К указанному раствору добавляли раствор i-PrMgCl в ТГФ (Aldrich 2 М, 286 мл, 0,572 моль) при 0-10°C за 1 час. Полученный раствор перемешивали в течение 30 минут при 10°C (GC показал завершение реакции обмена магний-бром). Этилтрифторацетат (74 мл, 0,620 моль) затем добавляли к раствору Гриньяра при температуре от -20 до -10°C за 45 минут, медленно нагревали до 0°C и перемешивали в течение 30 минут при той же самой температуре. Реакционную смесь лили в 2 н. HCl (300 мл) при 0°C и перемешивали в течение 30 минут при комнатной температуре. Органический слой разбавляли MTBE (500 мл) и промывали солевым раствором (250 мл), затем водой (250 мл). Тестирование раствора органического слоя осуществляли, используя GC (соединение 5: 67% выход раствора, соответствующий региоизомер 6 присутствовал в количестве приблизительно 20% относительно 5). Раствор затем концентрировали в вакууме до 2X раствора. Чтобы удалять воду, добавляли ТГФ (500 мл) и упаривали до 2X раствора. Добавление ТГФ-концентрацию повторяли, получая 2X раствор. Добавляли гептан (500 мл), концентрировали до 2X раствора для обмена растворителя для перекристаллизации. Снова добавляли гептан (500 мл), концентрировали до 3,5X раствора.
1
13
19
3
3
C-F
C-F
3
3,5X раствор в гептане затем переносили в 1-литровую снабженную рубашкой 3-горлую круглодонную колбу, оборудованную приводной мешалкой, регулятором температуры и входным отверстием для подачи азота. Раствор нагревали при 60°C, и полученный гомогенный раствор медленно (1-2 ч) охлаждали до комнатной температуры с перемешиванием, далее охлаждали до 0°C и перемешивали в течение 30 минут при той же самой температуре. Кристаллы собирали и промывали ледяным гептаном (200 мл), высушивали в вакууме при 50°C, получая твердое вещество светло-желтого цвета (соединение 5, 85,7 г, 99% чистоты по данным GC, 62% выход из фторида 1). Т.пл.: 83°C (исходная температура DSC). H-ЯМР (400 МГц,CDCl) δ 7,85 (1H, д, J=2,5 Гц), 7,48 (1H, д, J=1,7 Гц), 7,38 (1H, д, J=8,3 Гц), 7,31 (1H, дд, J=8,1, 1,8 Гц), 6,33 (1H, д, J=2,5 Гц), 2,30 (3H, с); C-ЯМР (100 МГц,CDCl) δ 184,2 (кв., J=36,6 Гц), 151,7, 138,7, 138,5, 130,7, 126,4, 125,7, 124,5, 116,8, 116,1 (кв., J=289,8 Гц), 109,7, 13,0; F-ЯМР (376 МГц,CDCl) δ=-76,8 (с).
Получение (R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанола
2
2
3
3
3
3
4
4
1
13
+
В 3-литровую снабженную рубашкой 3-горлую круглодонную колбу, оборудованную приводной мешалкой, регулятором температуры и входным отверстием для подачи азота при комнатной температуре последовательно загружали димер дихлор(пентаметилциклопентадиенил)иридия (III) ([Cp*IrCl], STREM, CAS#: 12354-85-7, 34 мг, 0,043 ммоль), (1R,2R)-(-)-N-(4-толуолсульфонил)-1,2-дифенилэтилендиамин (STREM, CAS#: 144222-34-4, 32 мг, 0,087 ммоль) и воду (400 мл, 4X). Полученную смесь перемешивали в течение 3 часов при 40°C, получая гомогенный оранжевый раствор. К этому раствору активного катализатора добавляли формиат калия (145,5 г, 1,73 моль) и раствор кетона 1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанона (100 г, >99% чистота по данным GC, 0,346 моль) вCHCN (500 мл, 5X) при 40°C. Реакционную смесь затем перемешивали при 40°C в течение 2 часов, после чего реакция была полной по данным GC. После охлаждения до 30°C удаляли водный слой (приблизительно 480 мл). Органический слой (приблизительно 600 мл, 6X) обрабатывали активированным углем (Darco G-60, 20 г, 0,2X) при 45°C в течение 2 часов и фильтровали через слой в 1/4 дюйма Celpure P65 (USP-NF, фармацевтического качества, Sigma) и промывалиCHCN (200 мл, 2X). Фильтрат концентрировали до 250 мл (2,5X) и переносили в 2-литровую снабженную рубашкой 3-горлую круглодонную колбу, оборудованную приводной мешалкой и регулятором температуры. Добавляли дополнительное количество CHCN (50 мл, 0,5X), чтобы увеличить объем раствора до 300 мл (3X). Этот раствор нагревали до 60°C, и к этому раствору при той же самой температуре добавляли воду (500 мл, 5X). После перемешивания в течение 15 минут при 60°C, полученную подобную эмульсии смесь молочного цвета медленно охлаждали до комнатной температуры. Кристаллы отфильтровывали при комнатной температуре и промывали смесьюCHCN/вода (1:2, 150 мл, 1,5X). Влажную корку (108 г, KF: 8,83%) высушивали в вакууме при 45°C в течение 4 часов, получая желаемый спирт (твердое вещество белого цвета, 95 г, 94%-ный выход, >99% химическая чистота, >99% энантиомерный избыток, KF: 0,014%). Т.пл.: 120°C (исходная температура DSC); H-ЯМР (метанол-d, 400 МГц) δ 2,19 (шир.с, 3H), 5,23 (дд, 6,8 Гц, 7,2 Гц, 1H), 6,19 (д, 2,4 Гц, 1H), 7,29 (д, 2 Гц, 1H), 7,42 (дд, 2,0 Гц, 6,4 Гц, 1H), 7,59 (д, 2,4 Гц, 1H), 7,68 (д, 8,4 Гц, 1H). C-ЯМР(метанол-d) δ 13,4, 67,2, 108,3, 121,7, 124,5, 127,4, 130,1, 131,9, 134,1, 136,4, 141,6, 152,3. ЖХ/МС: МН=291.
Получение (S)-2-(трет-бутоксикарбониламино)-3-(4-(трифторметилсульфонилокси)фенил)метилпропаноата:
+
+
1
13
19
4
3
1
2
1
2
3
3
Это соединение получали на основании описанной в литературе процедуры (Shieh, et al., J. Org. Chem. 57:379-381 (1992)). К раствору Boc-Tyr-OMe (Bachem, Калифорния, 100 г, 0,34 моль) и N-метилморфолина (51 г, 1,5 экв) в дихлорметане (1000 мл) добавляли трифторметансульфоновый ангидрид (100 г, 1,05 экв) за 2 часа при температуре от -5 до -15°C. Полученный красный раствор перемешивали при -10°C в течение 10 минут. Анализ ВЭЖХ показал полное исчезновение исходного материала. Реакционную смесь гасили 10%-ной лимонной кислотой (500 мл). Органический слой промывали 10% лимонной кислотой (500 мл), затем водой (500 мл). Полученный светло-розовый раствор концентрировали при пониженном давлении до 200 мл. Его разбавляли ацетонитрилом (600 мл) и далее концентрировали до 200 г раствора. Этот раствор использовали на следующей стадии без дальнейшей очистки. Предполагаемый выход составил 98%, при упаривании образца досуха с получением низкоплавкого твердого вещества светло-желтого цвета. ЖХ-МС (ESI): МН=428,0,MNH =445,0. H-ЯМР(CDCl) δ 7,16 (м, 4H), 4,95 (д, J=7,1 Гц, 1H), 4,53 (м, 1H), 3,64 (с, 3H), 3,10 (дд,J=5,7 Гц,J=13,8 Гц, 1H), 2,97 (дд,J=6,3 Гц,J=13,6 Гц, 1H), 1,34 (с, 9H). C-ЯМР(CDCl) δ 172,3, 155,4, 149,0, 137,4, 131,5, 121,7, 119,1 (кв., J=321 Гц), 80,54, 54,62, 52,7, 38,3, 28,6. F-ЯМР(CDCl) δ -73,4.
Получение (S)-2-(трет-бутоксикарбониламино)-3-(4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)фенил)метилпропаноата:
+
+
+
+
1
4
2
2
4
3
Это соединение получали на основании описанной в литературе процедуры (Firooznia, et al., Tetrahedron Lett. 40:213-216 (1999)). Бис(пинаколато)диборон (90 г, 1,1 экв), ацетат калия (63 г, 2 экв), трициклогексилфосфин (2,3 г, 2,5 мол.%) и ацетат палладия (0,72 г, 1 мол.%) смешивали в ацетонитриле (950 мл), и полученную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 5 минут. Добавляли раствор (S)-2-(трет-бутоксикарбониламино)-3-(4-(трифторметилсульфонилокси)-фенил)метилпропаноата (190 г, 0,32 моль), и полученную смесь нагревали при 80°C в течение 1 часа и охлаждали. ВЭЖХ показала полный расход исходного материала. Реакционную смесь гасили водным раствором бикарбоната калия (57 г в 475 мл воды), и полученную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 30 минут. Смесь фильтровали через слой целлюлозы в 20 микрон, чтобы удалить палладиевую чернь. Образец органического слоя концентрировали и очищали хроматографией на колонках (градиент: от 1:10 к 1:4 этилацетат/гексаны), получая эфирное соединение в форме прозрачного масла. ЖХ-МС (ESI): MH=406,2, MNH =423,2, MH=811,5, MNH =428,5. H-ЯМР(CDCl) δ 7,76 (д, J=8,1 Гц, 2H), 7,15 (д, J=7,6 Гц, 2H), 4,96 (д, J=7,3 Гц, 1H), 4,60 (м, 1H), 3,72 (с, 3H), 3,13 (м, 2H), 1,44 (с, 9H), 1,36 (с, 12Н).
+
+
+
+
1
13
4
2
2
4
3
3
Указанный органический слой сложного эфира перемешивали с водным раствором гидроксида лития (23 г в 500 мл воды) при комнатной температуре в течение 30 минут. Полученную суспензию подкисляли до приблизительно рН 10 с помощью 6 н. соляной кислоты и фильтровали. Корку промывали водой (200 мл). Ацетонитрил удаляли из фильтрата при пониженном давлении, получая водную суспензию (950 мл, дополнительное количество воды добавляли в течение дистилляции). Суспензию фильтровали через слой целлюлозы в 20 микрон и промывали водой (200 мл). Фильтрат промывали MTBE (500 мл) и повторно разбавляли 700 мл MTBE. Смесь подкисляли до приблизительно рН 4,5 6 н. соляной кислотой. Органический слой промывали водой (500 мл) и концентрировали при пониженном давлении до кислотного соединения в форме коричневого масла (206 г, 95% выход, основанный на предполагаемой чистоте ЯМР). Сырой продукт может использоваться непосредственно на следующей стадии. Альтернативно, соединение может быть очищено кристаллизацией из смеси MTBE/гептан с получением твердого вещества белого цвета, которое содержит небольшое количество соответствующей бороновой кислоты, (S)-3-(4-боронофенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты. МС (ESI): MH=392,2, MNH =409,2, MH=783,4, MNH =800,4. H-ЯМР(CDCl) δ 7,95 (шир.с, 1H), 7,76 (д, J=7,8 Гц, 2H), 7,21 (д, J=7,6 Гц, 2H), 5,03 (д, J=7,8 Гц, 1H), 4,62 (м, 1H), 3,18 (м, 2H), 1,43 (с, 9H), 1,35 (с, 12Н). C-ЯМР(CDCl) δ 175,8, 155,7, 139,7, 135,4, 129,2, 84,2, 80,5, 54,5, 38,3, 28,7, 25,2.
Получение (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты:
2
2
2
1
В 2-литровую 3-горлую круглодонную колбу, оборудованную приводной мешалкой и регулятором температуры, добавляли (S)-2-(трет-бутоксикарбониламино)-3-(4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)фенил)пропионовую кислоту (30,3 г, 0,078 моль), 2-амино-4,6-дихлорпиримидин (38,03 г, 3,0 экв), катализатор POPd6 (0,605 г, 1,0 мол.%, CombiPhos Catalysts, Inc, Нью-Джерси) и этанол (728 мл). К указанной суспензии при перемешивании затем медленно добавляли водный раствор бикарбоната калия (27,85 г, 3,5 экв, в 173 мл HO) так, чтобы выделение газаCO не было энергичным. Эту смесь нагревали при 75°C в течение 6 часов, после чего анализ ВЭЖХ показал больше чем 99% преобразование исходного материала. Этанол удаляли из смеси при пониженном давлении, получая водную суспензию (~200 мл), добавляли дополнительное количествоHO (90 мл), и раствор концентрировали до ~250 мл. К суспензии добавляли воду (90 мл), затем суспензию фильтровали и промывали водой (60 мл ×2). Фильтрат экстрагировали этилацетатом (150 мл). Водный раствор обрабатывали Darco-G60 (6,0 г) при 60°C в течение 2 часов, фильтровали через целит (Celpure 300, 10 г) и разбавляли ТГФ (240 мл) и толуолом (180 мл). К смеси при комнатной температуре медленно добавляли 6 н. HCl, пока рН не достиг 4,0. Органический слой отделяли и промывали водой (180 мл), и добавляли Darco-G60 (6,0 г): полученную смесь нагревали при 60°C в течение 2 часов. Раствор охлаждали до комнатной температуры и фильтровали через целит (Celpure 300, 10 г). Корку промывали ТГФ (30 мл ×2). Полученный раствор концентрировали в вакууме до общего объема ~180 мл, после чего продукт осаждали из раствора. Суспензию затем охлаждали до комнатной температуры, фильтровали, и корку промывали толуолом (30 мл ×2). Твердое вещество высушивали в печи в вакууме при 50°C в течение ночи, получая 24,0 г продукта в форме твердого вещества светло-желтого цвета, которое по H-ЯМР содержало ~8,0 вес.% толуола с выходом 75% (скорректированным). ВЭЖХ показала 91% чистоту с 9,0% двухосновной примеси.
Альтернативная процедура для получения (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты из (S)-2-амино-3-(4-боронофенил)пропионовой кислоты с использованием карбоната калия в качестве основания (S)-2-амино-3-(4-боронофенил)пропионовую кислоту (Ryscor Science, Inc, Северная Каролина, 1,0 г, 4,8 ммоль) и карбонат калия (1,32 г, 2 экв) смешивали в водном растворе этанола (этанол 15 мл и вода 8 мл). Ди-трет-бутилдикарбонат (1,25 г, 1,2 экв.) добавляли в одной части. После перемешивания в течение 30 минут при комнатной температуре, анализ ВЭЖХ показал полный расход исходного соединения и образование (S)-3-(4-боронофенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты. Добавляли 2-амино-4,6-дихлорпиримидин (1,18 г, 1,5 экв.) и катализатор бис(трифенилфосфин)палладий (II) дихлорид (34 мг, 1 мол.%), и полученную смесь нагревали при 65-70°C в течение 3 часов. Анализ ВЭЖХ показал полный расход промежуточного соединения, (S)-3-(4-боронофенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты. После концентрации и фильтрации, анализ ВЭЖХ полученного водного раствора против титрованного раствора целевого соединения показал 1,26 г (67%-ный выход).
Альтернативная процедура для получения (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты из (S)-2-амино-3-(4-боронофенил)пропионовой кислоты с использованием смеси карбонат калия/бикарбонат калия в качестве основания (S)-2-амино-3-(4-боронофенил)пропионовую кислоту (10 г, 48 ммоль) и бикарбонат калия (14,4 г, 3 экв.) смешивали в водном растворе этанола (этанол 250 мл и вода 50 мл). Ди-трет-бутилдикарбонат (12,5 г, 1,2 экв) добавляли в одной части. Анализ ВЭЖХ показал, что реакция не была полностью завершена после перемешивания в течение ночи при комнатной температуре. Добавляли карбонат калия (6,6 г, 1,0 экв) и дополнительное количество ди-трет-бутилдикарбоната (3,1 г, 0,3 экв). После перемешивания в течение 2,5 часа при комнатной температуре, анализ ВЭЖХ показал полный расход исходного соединения и образование (S)-3-(4-боронофенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты. Добавляли 2-амино-4,6-дихлорпиримидин (11,8 г, 1,5 экв) и катализатор бис(трифенилфосфин)-палладий (II) дихлорид (0,34 г, 1 мол.%), и полученную смесь нагревали при 75-80°C в течение 2 часов. Анализ ВЭЖХ показал полный расход промежуточного соединения, (S)-3-(4-боронофенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты. Смесь концентрировали при пониженном давлении и фильтровали. Фильтрат промывали этилацетатом (200 мл) и разбавляли 3:1 ТГФ/MTBE (120 мл). Эту смесь подкисляли до приблизительно рН 2,4 с помощью 6 н. соляной кислоты. Органический слой промывали солевым раствором и концентрировали при пониженном давлении. Остаток осаждали в изопропаноле, фильтровали и высушивали при 50°C в вакууме, получая целевое соединение в форме твердого вещества грязно-белого цвета (9,0 г, 48%-ный выход). Чистота: 92,9% анализом ВЭЖХ. Концентрацией маточного раствора получали дополнительные 2,2 г грязно-белого порошка (12% выход). Чистота: 93,6% анализом ВЭЖХ.
Альтернативная процедура для получения (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты из (S)-2-амино-3-(4-боронофенил)пропионовой кислоты с использованием смеси ацетата палладия и трифенилфосфина в качестве катализатора
В реактор загружали этанол (330 кг), (S)-2-(трет-бутоксикарбониламино)-3-(4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)фенил)пропионовую кислоту (55 кг), 2-амино-4,6-дихлорпиримидин (70 кг), трифенилфосфин (0,55 кг), ацетат палладия (0,24 кг) и ТГФ (720 кг). К этой смеси медленно добавляли водный раствор гидрокарбоната калия (50,1 кг в 320 кг воды). Полученную смесь нагревали при 68-72°C в течение 20-23 часов и охлаждали. Этанол заменяли водой с помощью повторных перегонок в вакууме и разбавления водой. Нерастворимые вещества отфильтровывали при комнатной температуре, и влажную корку промывали водой. Фильтрат дважды промывали этилацетатом. Водный слой смешивали с ТГФ (664 кг) и толуолом (512 кг), и подкисляли до приблизительно рН 2,5-3,5 с помощью 6 н. HCl. Водный слой дважды экстрагировали этилацетатом. Объединенные органические слои обрабатывали активированным углем при 40-50°C и фильтровали через слой сульфата натрия и целлюлозы. Корку промывали смесью 1:1 ТГФ/толуол. Фильтрат концентрировали, и продукт кристаллизовали из смеси толуол/ТГФ. После высушивания при 40-45°C в вакууме сольват (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты и толуола получали в форме твердого вещества грязно-белого цвета (65% выход).
Получение (S)-2-амино-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)этилпропаноата:
2
3
2
3
В 3-горлую круглодонную колбу на 500 мл, оборудованную приводной мешалкой, регулятором температуры и конденсатором, загружали монохлорид (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты (20,0 г, 51 ммоль), (R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанол (>99% энантиомерный избыток, 16,3 г, 56 ммоль, 1,1 экв), CsCO (24,9 г, 76 ммоль, 1,5 экв.) и безводный 1,4-диоксан (150 мл, 7,5X, KF=0,003%). Смесь перемешивали в атмосфере азота, и температуру увеличивали до 100°C при интенсивном перемешивании. Реакционную смесь перемешивали при 100°C в течение 1 часа и добавляли дополнительное количествоCsCO (33,2 г, 102 ммоль, 2,0 экв). Реакционную смесь затем перемешивали в течение 18 часов при 100°C. Гетерогенную реакционную смесь охлаждали до 90°C, и добавляли воду (150 мл, 7,5X) при интенсивном перемешивании. Смесь охлаждали до комнатной температуры.
1
13
6
6
30
30
3
6
5
К бифазному раствору при комнатной температуре добавляли ди-трет-бутил бикарбонат (1,11 г, 5,1 ммоль, 0,1 экв) и перемешивали в течение 2 часов при той же самой температуре. Добавляли толуол (100 мл, 5X), полученную смесь перемешивали в течение 15 минут при комнатной температуре, и фазы разделяли. К органическому слою добавляли воду (100 мл, 5X), и полученную смесь перемешивали в течение 15 минут при комнатной температуре, и фазы разделяли. Водный слой (рН 10,5) затем подкисляли до рН 7-6 с использованием 6 н. HCl при комнатной температуре. К этой смеси добавляли EtOAc (100 мл, 5X), и дальнейшее подкисление до рН 4 осуществляли, используя 6 н. HCl при комнатной температуре при интенсивном перемешивании. После отделения органического слоя водный слой экстрагировали EtOAc (100 мл, 5X). Объединенные органические слои промывали солевым раствором (100 мл, 5X). Слой EtOAc затем концентрировали в вакууме до общего объема приблизительно 40 мл (2X). Добавляли EtOH (100 мл, 5X), и концентрировали до 2X раствора. Повторяли последовательность добавление EtOH (150 мл, 7,5X)-концентрация, получая 2X раствор (S)-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты, который использовали непосредственно на следующей химической стадии. Тестирование раствора показало, что выход составил приблизительно 75% от (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты, что дает основание считать, что чистота соединения составила 100%. Аналитически чистая Вос-кислота была получена хроматографией на колонках и охарактеризована: H-ЯМР (ДМСО-d, 400 МГц) δ 1,30 (с, 9H), 2,34 (с, 3H), 2,86 (дд, 1H), 3,07 (дд, 1H), 4,14 (м, 1H), 6,45 (д, 1H), 6,83 (с, 1H), 7,29 (дд, 1H), 7,33 (д, 2H), 7,61 (дд, 1H), 7,75 (д, 1H), 7,99 (д, 2H), 8,21 (д, 1H), 12,5-12,8 (шир.с, 1H). C-ЯМР(ДМСО-d) δ 13,99, 13,89, 22,05, 27,78, 28,08, 28,32, 31,21, 36,22, 54,83, 67,41, 67,73, 78,03, 91,15, 107,69, 124,99, 125,18, 126,59, 128,12, 129,30, 130,23, 132,69, 134,65, 135,08, 140,73, 140,89, 150,41, 155,39, 162,76, 166,17, 168,22, 173,40. Аналитически рассчитано для CHClFNO: C, 55,69; H, 4,67; N, 12,99. Найдено: C, 55,65; H, 4,56; N, 12,74.
3
3
3
3
3
3
6
6
32
34
3
6
5
1
13
Указанный 2X раствор разбавляли EtOH (60 мл, 3X) и CHCN (100 мл, 5X) при комнатной температуре. К этому раствору добавляли TBTU (чистота 97%, Fluka, 19,7 г, 61 ммоль, 1,2 экв) и N-метилморфолин (6,17 мл, 56 ммоль, 1,1 экв) (KF=0,034%) в атмосфере азота. Полученный раствор перемешивали при комнатной температуре в течение 4 часов. ВЭЖХ показала, что Вос-кислота была превращена в Вос-эфир (S)-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)этилпропаноата количественно. Реакционную смесь концентрировали до приблизительно 2X при пониженном давлении (температура ванны 40°C, 100 мбар) и разбавляли EtOAc (100 мл, 5X) и водой (100 мл, 5X). Органический слой промывали насыщенным водным растворомKHCO (pH~8,5) (2×100 мл, 5X) и солевым раствором (50 мл, 2,5X). Этот красный органический слой затем обрабатывали активированным углем (Darco G-60, 8 г, 0,4X) при 50°C в течение 1,5 часа и фильтровали через слой в 1/4 дюйма Celpure P65 (USP-NF, фармацевтического качества, Sigma), и корку промывалиCHCN (100 мл, 5X). Полученный желтый фильтрат концентрировали до 2X раствора. ДобавлялиCHCN (100 мл, 5X), и раствор концентрировали до 2X раствора. Последовательность добавлениеCHCN-концентрация повторяли, получая 2X раствор CHCN Вос-сложного эфира, который использовали непосредственно на следующей стадии. Аналитически чистый Вос-сложный эфир получали хроматографией на колонках и охарактеризовывали: H-ЯМР (ДМСО-d, 300 МГц) δ 1,11 (т, J=7,06 Гц, 3H), 1,31 (с, 9H), 2,34 (с, 3H), 2,85-3,08 (м, 2H), 4,1-4,2 (м, 1H), 6,45 (д, J=2,29 Гц, 1H), 6,84 (с, 1H), 7,25-7,41 (м, 3H), 7,66 (дд, J=8,58, 2,10 Гц, 1H) 7,71 (д, J=2,1 Гц, 1H) 7,80 (д, J=8,58 Гц, 1H) 8,0 (д, J=8,39 Гц, 2H) 8,21 (д, J=2,29 Гц, 1H). C-ЯМР (ДМСО-d) δ 13,2, 14,0, 22,1, 24,7, 27,7, 28,0, 28,3, 28,4, 31,2, 33,9, 34,1, 36,2, 36,6, 55,0, 56,3, 60,4, 67,1, 67,4, 67,7, 68,0, 78,2, 78,5, 91,1, 107,7, 122,1, 125,0, 125,2, 126,6, 127,7, 128,1, 129,3, 130,2, 132,7, 134,7, 135,1, 140,4, 140,7, 150,4, 154,2, 155,3, 162,8, 166,1, 168,2, 171,9. Аналитически рассчитано для CHClFNO: C, 56,93; H, 5,08; N, 12,45. Найдено: C, 57,20; H, 4,86; N, 12,21.
3
2
3
2
3
Указанный 2X раствор разбавляли дополнительным количеством CHCN (160 мл, 8X) при комнатной температуре. К этому раствору при комнатной температуре добавляли метансульфоновую кислоту (18,4 мл, 255 ммоль) (KF=0,005%) и перемешивали при 45°C в течение 1 часа, после чего ВЭЖХ показала, что реакция de-Вос была полной. Реакционную смесь концентрировали до 2X, охлаждали до 0-5°C и разбавляли ледяной водой (100 мл, 5X), и этот водный раствор дважды промывали холодным изопропилацетатом (IPAc, 100 мл, 5X и 50 мл, 2,5X). Водный слой затем подщелачивали до рН 6 20% водным растворомNaCO при 5°C с перемешиванием. К этой смеси добавляли IPAc (100 мл, 5X), и далее смесь подщелачивали до рН 8,5, используя 20% водный раствор NaCO при комнатной температуре при интенсивном перемешивании. После отделения органического слоя водный слой экстрагировали IPAc (50 мл, 2,5X). Объединенные мутные органические слои концентрировали до 2X раствора. Добавляли IPAc (100 мл, 5X), и смесь концентрировали до 2X раствора, который содержал неорганические соли. Смесь фильтровали, и твердые частицы промывали IPAc (100 мл, 5X), и фильтрат концентрировали до 2X раствора. Тестирование способом ВЭЖХ этого прозрачного раствора IPAc показало 20,8 г целевого соединения (36 ммоль, >99% - ВЭЖХ, 71% выход раствора).
1
13
6
6
27
26
3
6
3
Аналитически чистое целевое соединение было получено хроматографией на колонках и охарактеризовано: H-ЯМР (ДМСО-d, 400 МГц) δ 1,15 (т, J=7,07 Гц, 3H), 2,39 (с, 3H), 2,50 (м, 2H), 3,63 (т, J=6,82 Гц, 1H), 4,07 (кв., J=7,07, 14,5 Гц, 2H), 6,50 (д, J=2,27 Гц, 2H), 6,87 (с, 1H), 7,33 (м, 3H), 7,65 (дд, J=8,59, 2,27 Гц, 1H), 7,71 (д, J=2,27 Гц, 1H), 7,81 (д, J=8,59 Гц, 1H) 8,01 (д, J=8,08 Гц, 2H), 8,26 (д, J=2,27 Гц, 1H). C-ЯМР(ДМСО-d) δ 13,4, 13,9, 18,5, 21,0, 21,5, 25,4, 55,6, 56,0, 59,9, 66,9, 67,1, 67,4, 67,7, 68,0, 91,1, 107,7, 122,1, 124,9, 125,0, 125,2, 126,5, 127,7, 128,1, 129,4, 130,2, 132,7, 134,6, 135,1, 140,7, 140,9, 150,4, 162,8, 166,2, 168,2, 174,8. Аналитически рассчитано для CHClFNO: C, 56,40; H, 4,56; N, 14,62. Найдено: C, 56,51; H, 4,52; N, 14,51.
Альтернативная процедура для получения (S)-2-амино-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)этилпропаноата
К раствору (S)-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты (2,0 ммоль) в этаноле при 0°C добавляли тионилхлорид (6 экв.), и полученную смесь перемешивали в течение 30 минут при этой температуре и затем при комнатной температуре в течение 24 часов. Анализ ВЭЖХ показал превращение >98% в (S)-2-амино-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)этилпропаноат.
Альтернативная процедура для получения (S)-2-амино-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)этилпропаноата
При температуре рубашки 20°C в реактор загружали (R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтанол (4,23 кг; 1,1 экв) и диоксан (52 л; 10 объемов). При температуре рубашки 80°C и пониженном давлении (160-150 мбар; соответствующая внутренняя температура: 52-53°C), 2,5 объема диоксана (13 л) удаляли перегонкой, чтобы удалить влажность. Раствор охлаждали до 20°C. Добавляли карбонат цезия (6,52 кг; 1,5 экв), и смесь нагревали до 95°C. Частями аккуратно добавляли (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовую кислоту (6,95 кг; 1,0 экв). Смесь нагревали до 101°C в течение 2 часов. После охлаждения до 95°C добавляли дополнительное количество карбоната цезия (8,65 кг; 2,0 экв). Реакционную смесь нагревали до 101°C в течение 24 часов. Добавляли воду (39 л; 7,5 объема), и смесь быстро охлаждали до 22°C. Добавляли ди-трет-бутил бикарбонат (289 г; 0,1 экв), и смесь перемешивали в течение 2 часов при 22°C. Добавляли толуол (26 л; 5 объемов), и смесь перемешивали в течение 15 минут. Слои разделяли (продукт в органическом слое). К органическому слою добавляли воду (26 л; 5 объемов), и смесь перемешивали в течение 15 минут. Слои разделяли (продукт в водном слое). Водный слой подкисляли до приблизительно рН 7,0 добавлением 5 н. HCl (2 л). Добавляли этилацетат (26 л; 5 объемов), и устанавливали рН 4,0 добавлением 5 н. HCl (2 л). Слои разделяли. Водный слой экстрагировали этилацетатом (26 л; 5 объемов). Объединенные органические слои промывали солевым раствором (26 л; 5 объемов). Органический слой концентрировали при температуре рубашки 65°C и пониженном давлении (230-95 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 40°C) до 3 об. Добавляли этанол (31,5 л; 6 объемов) и продолжали перегонку при температуре рубашки 65°C и пониженном давлении (110-100 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 40°C). 5,5 объема растворителя удаляли перегонкой. Добавляли этанол (44 л; 8,5 объема) и продолжали перегонку при температуре рубашки 65°C и пониженном давлении (110-100 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 40°C), чтобы удалить 6,5 объема растворителя. (S)-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты получали в форме этанольного раствора.
К указанному раствору добавляли ацетонитрил (21 л; 4 объема), и раствор охлаждали до 0°C. Добавляли N-метилморфолин (1,614 кг; 1,2 экв). TBTU (5,32 кг; 1,25 экв) добавляли частями, поддерживая температуру 0-5°C. Реакционную смесь перемешивали при 0°C в течение 5 часов, нагревали до 40°C в течение 6 часов и перемешивали в течение дополнительных 8 часов при 40°C. При температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (170-60 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 40°C) реакционную смесь концентрировали до 3 оставшихся объемов. Добавляли этилацетат (26 л; 5 объемов), и смесь охлаждали до 22°C. Добавляли воду (26 л; 5 объемов), и смесь перемешивали в течение 5 минут. Слои разделяли, и органический слой промывали дважды насыщенным раствором бикарбоната натрия (на каждую часть: 26 л; 5 об.; концентрация 7,4%). Органический слой промывали солевым раствором (13 л; 2,5 объема). Для обесцвечивания органический слой фильтровали через картридж фильтра Cuno ZetaCar-bon R55SP. Реактор и картридж промывали ацетонитрилом (11 л; 2 объема). При температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (130-100 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 40°C) фильтрат концентрировали до 2 оставшихся объемов. Добавляли ацетонитрил (32 л; 6 объемов), продолжали перегонку. Шесть объемов растворителя удаляли перегонкой при температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (145-128 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 40°C). Добавляли дополнительную часть ацетонитрила (32 л; 6 объемов), и продолжали перегонку. Шесть объемов растворителя удаляли перегонкой при температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (128-116 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 40°C). Смесь охлаждали до 22°C, и добавляли ацетонитрил (34 л; 6,5 объема). (S)-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)этилпропаноат получали в форме раствора в ацетонитриле.
Метансульфоновую кислоту (4,14 кг; 3,25 экв) добавляли к указанному раствору при внутренней температуре 22-32°C в течение 6 минут. Резервуар для добавления промывали ацетонитрилом (2,5 л; 0,5 объема). Реакционную смесь нагревали до 45°C в течение 40 минут и перемешивали в течение 2,5 часа при этой температуре. При температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (170-140 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 35°C), 6,9 объема растворителя удаляли перегонкой. При 0-5°C аккуратно добавляли воду (26 л; 5 объемов) (65 минут). Водный раствор промывали четыре раза MTBE (на каждую часть: 16 л; 3 объема). Водный слой добавляли к раствору карбоната калия (8,89 кг; 4,85 экв) в воде (36 л; 6,8 объема), и продукт экстрагировали MTBE (26 л; 5 объемов). Водный слой экстрагировали второй частью MTBE (16 л; 3 объема). Объединенные органические слои промывали смесью воды (10,5 л; 2 объема) и этанола (1,5 л; 0,3 объема). При температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (272-262 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 35°C) фильтрат концентрировали до 3 оставшихся объемов. Добавляли этанол (16 л; 3 объема), и продолжали перегонку при температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (206-104 мбар; поддерживая внутреннюю температуру ниже 35°C). Три объема растворителя удаляли. Добавляли дополнительную часть этанола (16 л; 3 объема), и продолжали перегонку при температуре рубашки 60°C и пониженном давлении (131-89 мбар; поддерживая внутреннюю температуру 35°C). Три объема растворителя удаляли. Конечный раствор охлаждали до 20°C и добавляли этанол (10 л; 2 объема). Тестирование ВЭЖХ показало, что выход (S)-2-амино-3-(4-(2-амино-6-((R)-1-(4-хлор-2-(3-метил-1Н-пиразол-1-ил)фенил)-2,2,2-трифторэтокси)пиримидин-4-ил)фенил)этилпропаноата составил 82,6% от (S)-3-(4-(2-амино-6-хлорпиримидин-4-ил)фенил)-2-(трет-бутоксикарбониламино)пропионовой кислоты.
Все публикации (например, патенты и заявки на патент) раскрытые выше, полностью включены в настоящее описание путем ссылки.