Антон Буздин: в каждом человеке за время его жизни возникает большое количество мутаций

BUSINESS GUIDE: Как давно ваша лаборатория занимается разработкой технологий по таргетному лечению онкологических заболеваний?

АНТОН БУЗДИН: Мы работаем в сфере молекулярной онкологии около 7 лет, а в области молекулярной биологии — уже 20 лет. А вообще теме молекулярной онкологии уже, наверное, больше 100 лет. Просто сейчас мы занимаемся наиболее передовой областью этой науки, которая касается анализа так называемых больших данных.

Сравнительно недавно, примерно 15 лет назад, появились технологии, которые позволили получать огромное количество молекулярно-биологических данных, чем произвели революцию в методах исследования. Например, стало возможно получать полные портреты работы всех генов в биологических образцах. Раньше это было невозможно. Появление столь мощных методик на тот момент не сопровождалось такими же мощными аналитическими инструментами.

BG: С чем это связано?

А. Б.: Исследователи фактически тонули в том объеме информации, который получали. Есть очень много нормальных вариаций внутри человеческой ДНК, а есть мутации. Необходимо быстро вычленять эти мутации. Надо было также научиться отличать вредоносные мутации от нейтральных, которых обычно больше. В каждом человеке за время его жизни возникает довольно большое число мутаций, некоторые из которых он передает по наследству своим детям. Получая такую полную геномную последовательность, исследователь находил там огромное количество генетических вариантов. В каждом человеке, как правило, более 10 млн таких генетических вариантов, которые отличают его от некоего усредненного генома человека. Попытайтесь представить, что вам выпало счастье работать с таблицей в 10 млн строчек. Это совсем непросто, если делать это стандартными способами.

BG: Суперкомпьютер, который вы применяете в своей лаборатории, как раз и выполняет эту задачу. Как он работает?

А. Б.: Применяя биоинформатические подходы, то есть способы алгоритмического анализа. Мы можем попытаться связать информацию с нужными нам признаками: как будет вести себя опухоль, как она ответит на тот или иной вид лечений. Раковые опухоли очень различны, причем это заметно, даже если посмотреть на них под микроскопом. Внутри одной опухоли часто можно увидеть разные клеточные типы. Можно наблюдать, как они меняются, как дифференцируются со временем. Самое интересное, что даже внутри морфологически однородных групп опухолей существует огромное количество различий на молекулярном уровне. Отличие на молекулярном уровне, например, приводит к тому, что опухоли, которые под микроскопом выглядят совершенно одинаково, на лечение химиотерапевтическими препаратами ответят по-разному.