НОВЫЕ МИНИМАЛЬНЫЕ UTR-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

1. Молекула ДНК, которая может транскрибироваться в мРНК, содержащая одну цепь со следующими элементами:
(а) кодирующая область, включая стартовый кодон на ее 5'-конце, которая кодирует полипептид; и
(б) расположенная непосредственно в обратном направлении относительно указанной кодирующей последовательности последовательность, выбранная из группы, которая состоит из:
1
(б1) R-CGCCACC (SEQ ID NO: 1);
или последовательности, где в указанной последовательности С в положении 6 SEQ ID NO: 1 заменен на А и С в положении 7 SEQ ID NO: 1 заменен на G; и/или А в положении 5 SEQ ID NO: 1 заменен на G; и
1
(б2) R-CNGCCACC (SEQ ID NO: 2), в которой нуклеотид N в положении 2 SEQ ID NO: 2 представляет собой нуклеотид, выбранный из группы, которая состоит из Т, G, С или А;
или последовательности, где в указанной последовательности С в положении 7 SEQ ID NO: 2 заменен на А и С в положении 8 SEQ ID NO: 2 заменен на G; и/или А в положении 6 SEQ ID NO: 2 заменен на G,
1
где R обозначает промотор, который распознается ДНК-зависимой РНК-полимеразой;
или содержит комплементарную цепь,
в которой промотор, распознаваемый ДНК-зависимой РНК-полимеразой, выбирают из группы, которая состоит из:
(I) TAATACGACTCACTATAGGGAGA (SEQ ID NO: 3), которая распознается ДНК-зависимой РНК-полимеразой Т7;
(II) AATTAACCCTCACTAAAGGGAGA (SEQ ID NO: 4), которая распознается ДНК-зависимой РНК-полимеразой Т3;
(III) ATTTAGGTGACACTATAGAAG (SEQ ID NO: 5), которая распознается ДНК-зависимой РНК-полимеразой SP6; и
(IV) AATTAGGGCACACTATAGGGA (SEQ ID NO: 6, которая распознается ДНК-зависимой РНК-полимеразой K11.
2. Молекула ДНК по п. 1, в которой нуклеотид N в положении 2 SEQ ID NO: 2 представляет собой нуклеотид, выбранный из группы, которая состоит из Т, G или С, и в которой нуклеотид N не представляет собой А.
3. Молекула ДНК по п. 2, в которой указанный нуклеотид N в положении 2 SEQ ID NO: 2 представляет собой Т.
4. Вектор, содержащий молекулу ДНК по п. 3.
5. Клетка-хозяин, содержащая вектор по п. 4.
6. Композиция, содержащая:
молекулу ДНК по одному из пп. 1-3, вектор по п. 4 или клетку-хозяина по п. 5.
7. Молекула РНК, которая содержит
(а) кодирующую область, включающую стартовый кодон на ее 5'-конце, которая кодирует полипептид; и
(б) расположенную непосредственно в обратном направлении относительно указанной кодирующей последовательности UTR, выбранную из группы, которая содержит:
(б1) UTR-последовательности
2
R-CGCCACC (SEQ ID NO: 1),
или последовательности, где в указанной последовательности UTR С в положении 6 SEQ ID NO: 1 заменен на А и С в положении 7 SEQ ID NO: 1 заменен на G; и/или А в положении 5 SEQ ID NO: 1 заменен на G; и
(б2) UTR-последовательности
2
R-CNGCCACC (SEQ ID NO: 2), в которой нуклеотид N в положении 2 SEQ ID NO: 2 представляет собой нуклеотид, выбранный из группы, которая состоит из Т, G, С или А; или последовательности, где в указанной последовательности С в положении 7 SEQ ID NO: 2 заменен на А и С в положении 8 SEQ ID NO: 2 заменен на G; и/или А в положении 6 SEQ ID NO: 2 заменен на G,
2
где R обозначает последовательность РНК, соответствующую части промоторной области, начинающейся с нуклеотида, с которого ДНК-зависимая РНК-полимераза инициирует синтез РНК,
2
в которой R выбирают из группы, состоящей из:
(I) GGGAGA (SEQ ID NO: 7);
(II) GGGAGA (SEQ ID NO: 8);
(III) GAAG (SEQ ID NO: 9); и
(IV) GGGA (SEQ ID NO: 10); и
где молекула РНК содержит поли-А-хвост на 3'-конце.
8. Молекула РНК по п. 7, в которой нуклеотид N в положении 2 SEQ ID NO: 2 представляет собой нуклеотид, выбранный из группы, которая состоит из U, G или С, и в которой нуклеотид N не представляет собой А.
9. Молекула РНК по п. 8, в которой указанный нуклеотид N в положении 2 SEQ ID NO: 2 представляет собой U.
10. Молекула РНК по одному из пп. 7-9, в которой поли-А-хвост состоит по меньшей мере из 120 нуклеотидов.
11. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая молекулу РНК по одному из пп. 7-10.
12. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по п. 11.
13. Клетка-хозяин, содержащая вектор по п. 12.
14. Фармацевтическая композиция, содержащая молекулу РНК по одному из пп. 7-10, молекулу нуклеиновой кислоты по п. 11, вектор по п. 12 или клетку-хозяина по п. 13 и необязательно фармацевтически приемлемый носитель.
15. Фармацевтическая композиция по п. 14, предназначенная для применения в терапиях на основе РНК.
16. Набор, содержащий молекулу ДНК по одному из пп. 1-3, молекулу РНК по одному из пп. 7-10, молекулу нуклеиновой кислоты по п. 11, вектор по п. 4 или п. 12 или клетку-хозяина по п. 5 или п. 13.
17. Применение UTR по п. 7(б) для трансляции кодирующей области молекулы РНК в полипептид или белок, кодируемый указанной кодирующей областью.