СВЯЗАННЫЕ СО ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЯМИ ГЕНЫ CDCA5. EPHA7. STK31 И WDHD1

1. Выделенная двунитевая молекула, которая при введении в клетку ингибирует экспрессию in vivo гена CDCA5 и пролиферацию клеток, при этом указанная двунитевая молекула действует на мРНК, которая соответствует последовательности-мишени, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO:40 (положения нуклеотидов 808-827 в SEQ ID NO:1) и SEQ ID NO:41 (положения нуклеотидов 470-488 в SEQ ID NO:1) для CDCA5.
2. Вектор, экспрессирующий двунитевую молекулу по п.1.
3. Способ ингибирования или уменьшения роста клетки, экспрессирующей ген CDCA5, при этом указанный способ включает стадию применения по меньшей мере одной двунитевой молекулы или вектора, экспрессирующего по меньшей мере одну двунитевую молекулу, при этом указанную двунитевую молекулу или вектор вводят в клетку, и двунитевая молекула или вектор ингибирует или уменьшает экспрессию указанного гена in vivo.
4. Способ лечения или профилактики злокачественной опухоли, экспрессирующей ген CDCA5, при этом указанный способ включает стадию введения по меньшей мере одной двунитевой молекулы или вектора, экспрессирующего по меньшей мере одну двунитевую молекулу, и при этом указанную двунитевую молекулу или вектор вводят в клетку, и двунитевая молекула или вектор ингибирует или уменьшает экспрессию указанного гена in vivo.
5. Композиция для ингибирования или уменьшения роста клетки, экспрессирующей ген CDCA5, которая содержит по меньшей мере одну двунитевую молекулу или вектор, экспрессирующий по меньшей мере одну двунитевую молекулу, при этом указанную двунитевую молекулу или вектор вводят в клетку, и двунитевая молекула или вектор ингибирует или уменьшает экспрессию указанного гена in vivo.
6. Композиция для лечения или профилактики злокачественной опухоли, экспрессирующей ген CDCA5, при этом указанный способ включает стадию введения по меньшей мере одной двунитевой молекулы или вектора, экспрессирующего по меньшей мере одну двунитевую молекулу, и при этом указанную двунитевую молекулу или вектор вводят в клетку, и двунитевая молекула или вектор ингибирует или уменьшает экспрессию указанного гена in vivo и пролиферацию клеток.
7. Способ диагностики рака легкого и/или рака пищевода, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) определение уровня экспрессии гена CDCA5 в биологическом образце; и
(b) установления связи увеличения уровня экспрессии гена по сравнению с нормальным уровнем в контроле с заболеванием.
8. Способ скрининга средства, используемого для диагностики, лечения или профилактики злокачественной опухоли, экспрессирующей ген CDCA5, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) осуществление контакта тестируемого средства с полипептидом, кодируемым геном, или его фрагментом;
(b) выявления связывания между полипептидом и указанным тестируемым средством;
(c) отбор тестируемого средства, которое связывается с указанными полипептидами со стадии (a).
9. Способ скрининга средства, используемого для лечения или профилактики злокачественной опухоли, экспрессирующей ген CDCA5, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) осуществление контакта тестируемого средства с клеткой, экспрессирующей полинуклеотид, кодирующий полипептид CDCA5, или его функциональный эквивалент;
(b) определение уровня экспрессии указанного полинуклеотида или полипептида со стадии (a);
(c) сравнение указанного уровня, определенного на стадии (b), с уровнями, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства; и
(d) отбор тестируемого средства, которое уменьшает или ингибирует указанный уровень, сравниваемый с уровнями, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства, на стадии (c).
10. Способ скрининга средства, используемого для лечения или профилактики злокачественной опухоли, экспрессирующей ген CDCA5, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) осуществление контакта тестируемого средства с клеткой, экспрессирующей полинуклеотид, кодирующий полипептид CDCA5, или его функциональный эквивалент;
(b) выявление биологической активности указанного полинуклеотида или полипептида со стадии (a);
(c) сравнение указанной биологической активности, выявленной на стадии (b), с биологическими активностями, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства; и
(d) отбор тестируемого средства, которое уменьшает указанную биологическую активность, сравниваемую с биологическими активностями, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства, на стадии (c).
11. Способ скрининга средства, которое препятствует взаимодействию или связыванию между полипептидом CDCA5 и полипептидом CDC2 или ERK, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) осуществление контакта полипептида по пп.(i) и (ii) в присутствии тестируемого средства:
(i) полипептид CDCA5 или его функциональный эквивалент; и
(ii) полипептид CDC2 или ERK или его функциональный эквивалент;
(b) определение уровня взаимодействия или связывания между полипептидами;
(c) сравнение уровня, определяемого на стадии (b), с уровнями, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства; и
(d) отбор тестируемого средства, которое уменьшает или ингибирует уровень.
12. Способ по п.11, в котором функциональный эквивалент CDCA5 содержит домен взаимодействия с CDC2 или домен взаимодействия с ERK.
13. Способ по п.11, в котором функциональный эквивалент CDC2 или ERK содержит домен взаимодействия с CDCA5.
14. Способ скрининга средства, которое модулирует CDC2-опосредованное фосфорилирование или ERK-опосредованное фосфорилирование CDCA5, при этом способ включает следующие стадии:
(a) осуществление контакта полипептида по пп.(i) и (ii) в присутствии тестируемого средства:
(i) полипептид CDCA5 или его функциональный эквивалент; и
(ii) полипептид CDC2 или ERK или его функциональный эквивалент;
(b) определение уровня фосфорилирования полипептидов по п. (a)(i);
(c) сравнение уровня фосфорилирования, определяемого на стадии (b), с уровнями фосфорилирования, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства; и
(d) отбор тестируемого средства, которое ингибирует или уменьшает уровень фосфорилирования в качестве ингибитора, или отбор тестируемого средства, которое стимулирует или повышает уровень фосфорилирования в качестве усилителя.
15. Способ по п.14, в котором функциональный эквивалент полипептида CDCA5 содержит по меньшей мере один сайт CDC2-опосредованного фосфорилирования или сайт ERK-опосредованного фосфорилирования полипептида CDCA5.
16. Способ по п.14, в котором сайтом CDC2-опосредованного фосфорилирования является серин-21, серин-75 или треонин-159 последовательности SEQ ID NO: 2 (CDCA5), сайтом ERK-опосредованного фосфорилирования является серин-21, треонин-48, серин-75, серин-79, треонин-111, треонин-115, треонин-159 или серин-209.
17. Способ скрининга средства, используемого для профилактики или лечения злокачественных опухолей, экспрессирующих CDCA5, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) осуществление контакта тестируемого средства с клеткой, экспрессирующей ген, кодирующий полипептид CDCA5 или его функциональный эквивалент;
(b) культивирование в условиях, которые обеспечивают возможность фосфорилирования указанного полипептида со стадии (a);
(c) определение уровня фосфорилирования указанного полипептида со стадии (a);
(d) сравнение уровня фосфорилирования, определяемого на стадии (c), с уровнями фосфорилирования, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства; и
(e) отбор тестируемого средства, которое ингибирует или уменьшает уровень фосфорилирования, сравниваемый с уровнями фосфорилирования, выявляемыми в отсутствие тестируемого средства, на стадии (c).
18. Способ по п.17, в котором средство ингибирует или уменьшает активность CDC2-опосредованного фосфорилирования или активность ERK-опосредованного фосфорилирования CDCA5.
19. Способ по п.17, в котором уровень фосфорилирования является уровнем фосфосерина или фосфотреонина.
20. Способ по п.19, в котором фосфосерином CDCA5 является серин-21, серин-75, серин-79 или серин-209 последовательности SEQ ID NO: 2 (CDCA5).
21. Способ по п.20, в котором фосфотреонином CDCA5 является треонин-48, треонин-111 или треонин-115 последовательности SEQ ID NO: 2 (CDCA5).
22. Способ по п.17, в котором злокачественная опухоль выбрана из группы, состоящей из злокачественных опухолей легкого и злокачественной опухоли пищевода.
23. Способ скрининга средства, используемого для лечения или профилактики злокачественной опухоли, экспрессирующей ген CDCA5, при этом указанный способ включает следующие стадии:
(a) осуществление контакта тестируемого средства с клеткой, в которую был введен вектор, содержащий область регуляции транскрипции гена CDCA5, и репортерный ген, который экспрессируется под контролем области регуляции транскрипции;
(b) измерение экспрессии активности указанного репортерного гена; и
(c) отбор соединения, которое уменьшает уровень экспрессии активности указанного репортерного гена по сравнению с уровнем в отсутствие тестируемого соединения.
24. Способ по п.23, в котором злокачественная опухоль выбрана из группы, состоящей из злокачественных опухолей легкого и злокачественной опухоли пищевода.