ПОЛИПЕПТИДЫ, СОДЕРЖАЩИЕ Fc-УЧАСТОК, КОТОРЫЕ ДЕМОНСТРИРУЮТ ПОВЫШЕННУЮ ЭФФЕКТОРНУЮ ФУНКЦИЮ БЛАГОДАРЯ ИЗМЕНЕНИЯМ СТЕПЕНИ ФУКОЗИЛИРОВАНИЯ, И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ
POLYPEPTIDES CONTAINING Fc-SECTION THAT DISPLAY INCREASED EFFECTOR FUNCTION OWING TO VARYING FUCOSYLATION LEVEL AND THEIR APPLICATIONS

1.
Перекрестная ссылка на родственные заявки
Данная заявка заявляет приоритет по заявке на патент США с серийным № 61/249510 (поданной 7 октября 2009 г.), которая включена в данный документ ссылкой в ее полном объеме. Данная заявка дополнительно включена ссылкой в ее полном объеме в заявки на патенты США с серийными №№ 11/952568 (поданную 7 декабря 2007 г.) и 60/869254 (поданную 6 декабря 2006 г.).
2.
ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
например
Данное изобретение относится к полипептидам, содержащим Fc-участок, которые демонстрируют повышенную эффекторную функцию, благодаря изменениям степени фукозилирования, и к способам применения таких полипептидов для лечения или предотвращения раковых опухолей и других заболеваний. Содержащие Fc-участок полипептиды по данному изобретения представляют предпочтительно иммуноглобулины (, антитела), в которых Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную замену по отношению к соответствующей аминокислотной последовательности дикого типа Fc-участка, и которая является достаточной для ослабления пост-трансляционного фукозилирования и опосредует повышенное связывание с активирующим Fc-рецептором и уменьшенное связывание с ингибиторующим Fc-рецептором.
например
например
например
Способы настоящего изобретения особенно полезны в профилактике, лечении или улучшении одного или нескольких симптомов, связанных с заболеванием, нарушением или инфекцией, где повышенная эффективность эффекторной функции клеток (, ADCC), опосредованной FcγR, является желательной, , при раке, инфекционном заболевании. Способы настоящего изобретения представляют также применение в повышении терапевтической эффективности терапевтических антител, действие которых опосредовано ADCC. С другой стороны, способы настоящего изобретения особенно полезны в профилактике, лечении или улучшении одного или нескольких симптомов, связанных с заболеванием или нарушением, в которых сниженная эффективность эффекторной клеточной функции, опосредованной FcγR, является желательной, , при воспалении и т.п. Способы настоящего изобретения также представляют, таким образом, применение в улучшении терапевтической эффективности терапевтических антител, которые ослабляют воспалительные процессы.
3.
ПРЕДПОСЫЛКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
3.1
Fc-РЕЦЕПТОРЫ И ИХ РОЛИ В ИММУННОЙ СИСТЕМЕ
Взаимодействие комплексов антитело-антиген с клетками иммунной системы ведет к широкому спектру ответов, начиная с эффекторных функций, таких как антитело-зависимая цитотоксичность, дегрануляция тучных клеток и фагоцитоз, до иммуномодулирующих сигналов, таких как регулирование пролиферации лимфоцитов и секреции антител. Все эти взаимодействия инициируются посредством связывания Fc-домена антител или иммунных комплексов со специализированными клеточными поверхностными рецепторами на гемопоэтических клетках. Разнообразие клеточных ответов, запускаемых антителами и иммунными комплексами, обусловливается структурной гетерогенностью Fc-рецепторов. Fc-рецепторы имеют общее со структурно родственными лиганд-связывающими доменами, которые предположительно опосредует внутриклеточную сигнализацию.
et al.
Annu. Rev. Immunol.
et al.
Microbes and Infection
et al.
The Journal of Clinical Investigation
et al.
Science
et al.
Annu. Rev. Immunol
Cell
например
Immunobiology: The Immune System in Health and Disease
th
Fc-рецепторы, члены иммуноглобулиннового генного суперсемейства белков, являются поверхностными гликобелками, которые могут связывать Fc-части иммуноглобулиновых молекул. Каждый член семейства узнает иммуноглобулины одного или нескольких изотипов через домен узнавания на α цепи Fc-рецептора. Fc-рецепторы определяются по их специфичности для подтипов иммуноглобулинов. Fc-рецепторы для IgG именуются как FcγR, для IgE - как FεR, и для IgA - как FcαR. Различные дополнительные клетки несут Fc-рецепторы для антител различного изотипа, и изотип антитела определяет, какие дополнительные клетки будет вовлечен в данный ответ (рассмотрено Ravetch J.V.  1991,  9: 457-92; Gerber J.S.  2001 , 3: 131-139; Billadeau D.D. 2002, , 2(109): 161-168l; Ravetch J.V.  2000, , 290: 84-89; Ravetch J.V. , 2001. 19:275-90; Ravetch J.V. 1994, , 78(4): 553-60). Различные Fc-рецепторы, клетки, которые их экспрессируют, и специфичность их изотипов хорошо известны в данной области, см., , , 4 ed. 1999, Elsevier Science Ltd/Garland Publishing, New York, которая в данный документ включена ссылкой в ее полном объеме.
Fcγ-рецепторы
Каждый член данного семейства является интегральным мембранным гликобелком, обладающим внеклеточными доменами, связанными с C2-набором иммуноглобулин-родственных доменов, одиночным мембрано-расположенным доменом и внутрицитоплазматическим доменом разной длины. Существует три известных FcγR, именуемых FcγRI(CD64), FcγRII(CD32) и FcγRIII(CD16). Три рецептора кодируются отдельными генами; тем не менее, обширная гомология между тремя членами семейства предполагает, что они происходят от общего предшественника, по-видимому, путем дупликации гена.
FcγRII(CD32)
6
-1
FcγRII белки являются 40KDa интегральными мембранными гликобелками, которые связывают только комплексованные IgG благодаря низкой аффинности к мономерному Ig (10 M). Данный рецептор является наиболее широко экспрессированным FcγR, присутствует на всех типах гемопоэтических клеток, включая моноциты, макрофаги, B-клетки, NK-клетки, нейтрофилы, тучные клетки и тромбоциты. FcγRII имеет только два иммуноглобулин-подобных участка в иммуноглобулин-связывающей цепи и, следовательно, намного более низкую аффинность к IgG, чем FcγRI. Существует три человеческих гена FcγRII (FcγRII-A, FcγRII-B, FcγRII-C), все из которых связывают IgG в агрегаты или иммунные комплексы.
например
Отдельные различия в пределах цитоплазматических доменов FcγRII-A и FcγRII-B создают два функционально гетерогенных ответа при лигировании рецептора. Фундаментальное отличие состоит в том, что изоформа A инициирует внутриклеточную сигнализацию, ведущую к клеточной активации, такой как фагоцитоз и респираторный бурст, в то время как изоформа B инициирует ингибирующие сигналы, , ингибирование активации B-клетки.
Сигнализация через FcγR
и
т
а
м
и
т
и
м
Оба, как активирующий, так и ингибиторующий, сигналы преобразовываются через последующее лигирование FcγR. Данные диаметрально противоположные функции обусловливаются структурными различиями среди различных изоформ рецепторов. Два отдельных домена в пределах цитоплазматических сигнальных доменов рецептора, названных ммуннорецепторными ирозин-основанными ктивирующими отивами (ITAM) или ммуннорецепторными ирозин-основанными нгибирующими отивами (ITIM), объясняют различные ответы. Привлечение различных цитоплазматических ферментов к данным структурам обуславливает результат FcγR-опосредованных клеточных ответов. ITAM-содержащие FcγR-комплексы включают FcγRI, FcγRIIA, FcγRIIIA, в то время как ITIM-содержащие комплексы включают только FcγRIIB.
например
3
Человеческие нейтрофилы экспрессируют ген FcγRIIA. FcγRIIA-кластеризация через иммунные комплексы или поперечное связывание специфического антитела служит для агрегации ITAM вместе с рецептор-связанными киназами, которые содействуют фосфорилированию ITAM. Фосфорилированный ITAM выступает в качестве сайта стыковки для актиации Syk-киназы, которая ведет к активации расположенных далее субстратов (, PIK). Клеточная активация ведет к высвобождению провоспалительных медиаторов.
++
FcγRIIB ген экспрессируется на B-лимфоцитах; его внеклеточный домен является на 96% идентичным FcγRIIA и связывает IgG-комплексы неотличимым образом. Присутствие ITIM в цитоплазматическом домене FcγRIIB определяет данный ингибиторный подкласс FcγR. Недавно молекулярная основа данного ингибирования была установлена. Когда связанный вместе с активирующим FcγR, ITIM в FcγRIIB становится фосфорилированным и привлекает SH2 домен инозитолфосфат-5'-фосфатазы (SHIP), которая гидрализует фосфоинозитольные мессенджеры, высвобожденные как следствие активации ITAM-содержащей FcγR-опосредованной тирозин-киназы, последовательно предотвращая вход внутриклеточного Ca. Таким образом, поперечное связывание FcγRIIB ослабляет активирующий ответ при FcγR лигировании и ингибирует клеточную ответную реакцию. Актиация В-клетки, пролиферация В-клетки и секреция антитела таким образом прерывается.
3.2
ЗНАЧИМОСТЬ ЗАБОЛЕВАНИЙ
3.2.1
РАКОВАЯ ОПУХОЛЬ
Basic Pathology
Новообразование, или опухоль, представляет новообразуемую массу, возникающую в результате ненормального неконтролируемого клеточного роста, которая может быть доброкачественной или злокачественной. Доброкачественные опухоли, в общем, остаются локальными. Злокачественные опухоли коллективно называются раковыми опухолями. Выражение «злокачественные» в общем означает, что опухоль может вторгаться и разрушать соседствующие структуры тела и достигать удаленных сайтов, вызывая смерть (для обзора, см. Robbins и Angell, 1976, , 2d Ed., W.B. Saunders Co., Philadelphia, pp. 68-122). Злокачественная опухоль может появляться во многих местах тела и ведет себя по-разному в зависимости от ее источника. Раковые клетки разрушают часть тела, в которой они возникают, и затем распространяются в другую(ие) часть(и) тела, где они начинают новый рост и вызывают большее разрушение.
У более чем 1,2 миллиона американцев обнаруживают раковую опухоль каждый год. Рак является второй ведущей причиной смерти в Соединенных Штатах и, если настоящие тенденции продолжатся, рак, как ожидается, станет ведущей причиной, вызывающей смерть к 2010 году. Рак легких и простаты являются главными убийцами мужчин в Соединенных Штатах. Рак легких и молочной железы являются главными убийцами женщин в Соединенных Штатах. У одного из двух мужчин в Соединенных Штатах будут диагностировать раковую опухоль в какое-то время в течение их жизни. У одной из трех женщин в Соединенных Штатах будут диагностировать раковую опухоль в какое-то время в течение их жизни.
Лечение для раковой опухоли все еще не найдено. Современные методы лечения, такие как хирургия, химиотерапия и лучевая терапия, являются, зачастую либо неэффективными, или характеризуются серьезными побочными эффектами.
Терапия рака
Смотри
Scientific American: Medicine
В настоящее время, терапия рака может включать хирургию, химиотерапию, гормональную терапию и/или лучевую терапию для уничтожения опухолевых клеток у пациента (, например, Stockdale, 1998, “Principles of Cancer Patient Management”, в , vol. 3, Rubenstein and Federman, eds., Chapter 12, Section IV). С недавних пор противораковая терапия может также включать биологическую терапию и иммунотерапию. Все данные подходы обладают существенными недостатками для пациента. Хирургия, например, может быть противопоказана из-за состояния здоровья пациента или может быть неприемлема для пациента. Дополнительно, хирургия может не полностью удалять опухолевую ткань. Лучевая терапия является эффективной только, когда опухолевая ткань проявляет большую чувствительность к облучению, чем нормальная ткань, и лучевая терапия может зачастую повлечь за собой серьезные побочные эффекты. Гормональная терапия редко назначается как исключительное средство и, хотя может быть эффективной, часто применяется для предотвращения или приостановки рецидива злокачественной опухоли после того, как другие виды лечений удалили основную часть раковых клеток. Биологические терапии/иммунотерапии ограничены в количестве и могут вызвать побочные эффекты, такие как сыпь или отеки, гриппоподобные симптомы, включая лихорадку, ознобы и усталость, проблемы пищеварительного тракта и аллергические реакции.
Рассмотрено
et al.
и т.п.
The Pharmacological Basis of Therapeutics
По отношению к химиотерапии, существует разнообразие химиотерапевтических средств, доступных для лечения злокачественной опухоли. Значительное большинство раковых химиотерапевтических препаратов действуют путем ингибирования синтеза ДНК либо непосредственно, или опосредованно путем ингибирования биосинтеза предшественников деоксирибонуклеотид-трифосфата, для предотвращения репликации ДНК и сопутствующего клеточного деления (, например, Gilman , Goodman and Gilman's: , Eighth Ed. (Pergamom Press, New York, 1990)). Данные средства, которые включают алкилирующие средства, такие как нитрозомочевина, анти-метаболиты, такие как метотрексат и гидроксимочевина, и другие средства, такие как этопозиды, кампатецины, блеомицин, доксорубицин, даунорубицин , хотя нет необходимости в специфичности клеточного цикла, убивают клетки во время S-фазы из-за их эффекта на репликацию ДНК. Другие средства, в частности кохицин и алкалоид барвинка, такие как винбластин и винкристин, мешают сборке микротрубочек, приводя к остановке митоза. Химиотерапевтические протоколы обычно включают введение комбинации химиотерапевтических средств для увеличения эффективности лечения.
Рассмотрено
и т.п
Scientific American Medicine
Несмотря на доступность разнообразных химиотерапевтических средств, химиотерапия имеет много недостатков (, например, Stockdale, 1998, “Principles Of Cancer Patient Management” в , vol. 3, Rubenstein and Federman, eds., ch. 12, sect. 10). Почти всехимиотерапевтическое средства являются токсическими, и химиотерапия вызвает значительные, и часто опасные, побочные эффекты, включая сильную тошноту, угнетение костного мозга, иммуносупрессию . Дополнительно, даже при введении комбинаций химиотерапевтических средств, многие опухолевые клетки являются устойчивыми или обнаруживают устойчивость к химиотерапевтическим средствам. Фактически, данные клетки, устойчивые к конкретным химиотерапевтическим средствам, применяемым в протоколе лечения, часто оказываютсяустойчивыми к другим лекарственным средствам, даже тем средствам, которые действуют посредством механизмов, отличных от механизмов действия лекарственных средств, применяемых в специфическом лечении; данный феномен называетсяплейотропным лекарственным средством или множественной лекарственной устойчивостью. Таким образом, из-за устойчивости к лекарственному средству, многие злокачественные опухоли оказываются трудноподдающимися лечению в стандартных протоколах химиотерапевтического лечения.
Рассмотрено
et al.
Cancer Treat Rev.
Semin Oncol.
Breast Cancer Res.
например
Существует значительная необходимость в альтернативных лечениях злокачественной опухоли, в частности, лечении злокачественной опухоли, которая оказалась трудноподдающейся лечению при стандартных лечениях злокачественной опухоли, таких как хирургия, лучевая терапия, химиотерапия и гормональная терапия. Обещающей альтернативой является иммунотерапия, при которой раковые клетки специально намечены посредством раковых антиген-специфических антител. Основные усилия были направлены на приспособление специфики иммунного ответа, например, гибридомная технология позволила наработку выбраных моноклональных антител к опухоли ( Green M.C. , 2000 , 26: 269-286; Weiner LM, 1999  26(suppl. 14):43-51), и за прошедшие несколько лет, Управление по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами одобрило первый MAbs для раковой терапии: Ритуксин (анти-CD20) для неходжкинсовой лимфомы и герцептин [анти-(c-erb-2/HER-2)] для метастазной злокачественной опухоли грудной железы (Suzanne A. Eccles, 2001, , 3: 86-90). Однако, потенциальная возможность эффекторной функции антитела, , для опосредования антитело-зависимой клеточной цитотоксичности (“ADCC”), является препятствием для такого лечения. Таким образом, способы улучшения эффективности такой иммунотерапии необходимы.
3.2.2
ВОСПАЛИТЕЛЬНЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ И АУТОИММУННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
Воспаление является процессом, посредством которого белые кровяные клетки тела и химические вещества защищают наши тела от инфекции посторонними веществами, такими как бактерии и вирусы. Оно обычно харакреризуется болью, отеканием, разогревом и краснотой пораженного участка. Химические вещества, известные как цитокины и простагландины, контролируют данный процесс и высвобождаются в упорядоченном и самоограничивающемся каскаде в кровь или пораженные ткани. Данное высвобождение химических веществ увеличивает кровоток к зоне повреждения или инфекции и может вызывать красноту и разогрев. Некоторые из химических веществ вызывают ток жидкости в ткани, приводя к отеканию. Данный защитный процесс может стимулировать нервы и вызвать боль. Данные изменения, если происходят в ограниченный период в соответствующих областях, работают на благо тела.
например
При аутоиммунных и/или воспалительных расстройствах иммунная система запускает воспалительный ответ, когда отсутствуют посторонние вещества для борьбы, и обычно защищающая иммунная система организма вызвает повреждение своих собственных тканей посредством ошибочной атаки самой себя. Существуют многие различные аутоиммунные расстройства, которые действуют на организм различными путями. Например, мозг повреждается у индивидуумов с рассеянным склерозом, кишечник повреждается у индивидуумов с болезнью Крона, и синовиальная оболочка, кость и хрящ разных суставов повреждаются у индивидуумов с ревматоидным артритом. Когда аутоиммунные расстройства развиваются, разрушение одного или нескольких типов ткани организма, ненормальный рост органа или изменения в функции органа могут последовать. Аутоиммунное нарушение может повреждать только один орган или тип ткани или может повреждать многие органы и ткани. Органы и ткани, обычно повреждаемые посредством аутоиммунных расстройств, включают красные кровяные клетки, кровеносные сосуды, соединительные ткани, эндокринные железы (, щитовидная или поджелудочная железы), мышцы, суставы и кожу. Примеры аутоиммунных расстройств включают без ограничения тиреоидит Хашимото, пернициозную анемию, болезнь Аддисона, диабет 1 типа, ревматоидный артрит, системную эритематозную волчанку, дерматомиозит, синдром Шёгрена, дерматомиозит, эритематозную волчанку, рассеянный склероз, аутоиммунное заболевание внутреннего уха, миастению гравис, синдром Рейтера, болезнь Грейвса, аутоиммунный гепатит, семейный аденоматозный полипоз и язвенный колит.
Ревматоидный артрит (RA) и ювенильный ревматоидный артрит представляют собой типы воспалительного артрита. Артрит является общим выражением, которое описывает воспаление в суставах. Некоторые, но не все, типы артрита являются результатом неправильно направленного воспаления. Кроме ревматоидного артрита, другие типы артрита, связанного с воспалением, включают следующие: псориатический артрит, синдром Рейтера, анкилозирующий спондилитный артрит и подагрический артрит. Ревматоидный артрит является типом хронического артрита, который возникает в суставах на обеих сторонах тела (как, например, обе руки, запястья или колени). Данная симметрия помогает отличить ревматоидный артрит от других типов артрита. В дополнении к повреждениям суставов, ревматоидный артрит может иногда повреждать кожу, глаза, легкие, сердце, кровь или нервы.
Ревматоидный артрит поражает примерно 1% мирового населения и представляет потенциально потерю трудоспособности. Происходит приблизительно 2,9 миллиона случаев ревматоидного артрита в Соединенных Штатах. Женщины подвергаются в два-три раза чаще, чем мужчины. Обычный возраст, когда ревматоидный артрит развивается, составляет между 25 и 50. Ювенильный ревматоидный артрит повреждет 71000 молодых американцев (в возрасте восемнадцать и ниже), поражая девочек в шесть раз чаще, чем мальчиков.
Ревматоидный артрит является аутоиммунным нарушением, при котором иммунная система организма ошибочно идентифицирует синовиальные мембраны, которые секретируют смазывающую жидкость в суставах, как чужеродные. Воспаление ведет к тому, что и хрящ, и ткани в и вокруг суставов повреждаются или разрушаются. В тяжелых случаях данное воспаление распространяется на другие соединительные ткани и окружающий хрящ, где оно может разъедать или разрушать кость и хрящ и вести к деформациям сустава. Организм замещает поврежденную ткань рубцовой тканью, являясь причиной того, что нормальне просветы в суставе становятся узкими и кости соединяются вместе. Ревматоидный артрит создает жесткость, отекание, утомляемость, анемию, потерю веса, лихорадку и, часто, деформирующую боль. Некоторые общие симптомы ревматоидного артрита включают суставную жесткость при пробуждении, которая длится час и более; отекание в специфических суставах пальца или запястья; отекание в мягкой ткани вокруг сустава; и отекание на обеих сторонах сустава. Отекание может происходить с и без боли и может прогрессивно ухудшаться или оставаться таким же годами перед дальнейшим развитием.
Диагноз ревматоидного артрита основан на комбинации факторов, включающих: специфическое местоположение и симметрию болезненных суставов, наличие жесткости сустава утром, присутствие неровностей и узелков под кожей (ревматоидных узелков), результаты рентгеновских тестов, которые предплагают ревматоидный артрит, и/или позитивные результаты тестов крови, называемых ревматоидным фактором. Многие, но не все, люди с ревматоидным артритом имеют антитело к ревматоидному-фактору в своей крови. Ревматоидный фактор может присутствовать у людей, которые не имеют ревматоидного артрита. Другие заболевания могут также вызвать продуцирование в кровь ревматоидного фактора. Вот почему диагноз ревматоидный артрит основан на комбинации нескольких факторов, а не только присутствии ревматоидного фактора в крови.
Смотри,
Обычное течение болезни является течением устойчивого, но колеблющегося симптома в суставе, и после примерно 10 лет 90% страдающих людей будут демонстрировать структурные повреждение кости и хряща. Малое процентное соотношение будет иметь непродолжительное заболевание, которое проходит полностью, и другое малое процентное соотношение будет иметь очень тяжелое заболевание с многочисленными деформациями сустава и иногда другие проявления заболевания. Воспалительный процесс вызывает эрозию или разрушение кости и хряща в суставах. В ревматоидном артрите существует аутоиммунный цикл устойчивой антигенной презентации, стимуляции T-клетки, секреции цитокина, активации синовиальной клетки и разрушения сустава. Это заболевание оказывает значительное влияние как на личность, так и на общество, вызывая сильную боль, нарушенные функции и инвалидность, а также расходование миллионов долларов в сфере здравоохранения и потери в заработной плате. (например, веб-сайт NIH (Национальный институт здоровья США) и веб-сайт NIAID (Национальный институт по изучению аллергических и инфекционных заболеваний)).
В настоящее время доступная терапия артрита фокусируется на снижении воспаления суставов противовоспалительными или иммуносупресивными медикаментозными средствами. Первой линией лечения любого артрита является обычно противовоспалительные средства, такие как аспирин, ибупрофен и ингибиторы Cox-2, такие как целекоксиб и рофекоксиб. “Вторая линия лекарственных средств” включает золото, метотрексат и стероиды. Хотя они являются хорошо разработанными линиями лечения артрита, очень мало пациентов придерживаются только данных линий лечения. Недавние достижения в понимании патогенеза ревматоидного артрита привели к применению метотрексата в комбинации с антителами к цитокинам или рекомбинантным растворимым рецепторам. Например, рекомбинантные растворимые рецепторы к опухолевому некротическому фактору (TNF)-α были применены в комбинации с метотрексатом в лечении артрита. Однако, только примерно 50% пациентов, получавших лечение в комбинации метотрексата и анти-TNF-α агентов, таких как рекомбинантные растворимые рецепторы к TNF-α, показывают клинически значительное улучшение. Многие пациенты остаются трудноподдающимися лечению, несмотря на лечение. Все еще остаются сложные вопросы лечения пациентов с ревматоидным артритом. Многие современные методы лечения имеют высокую частоту побочных эффектов и не могут полностью предотвратить дальнейшее развитие болезни. До сих пор никакое лечение не является идеальным, и не существует выздоровления. Новые терапевтические средства необходимы, чтобы более эффективно лечить ревматоидный артрит и другие аутоиммунные расстройства.
3.2.3
ИНФЕКЦИОННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
Инфекционные агенты, которые вызвают заболевание, относятся к пяти группам: вирусы, бактерии, грибы, простейшие и гельминты (черви). Удивительное разнообразие данных патогенов вызвало естественный отбор двух важнейших элементов адаптивного иммунитета. Во-первых, преимущество, заключающееся в способности узнавать широкий диапазон различных патогенов, привело к развитию равного или большего разнообразия рецепторов на В- и Т-клетках. Во-вторых, разным местам обитания и жизненным циклам патогенов пришлось противостоять посредством ряда различных эффекторных механизмов. Характерные черты каждого патогена представлены их способом распространения, их механизмом репликации, их патогенезом или способом, посредством которого он вызвает заболевание, и ответом, который он вызывает.
Данные о человеческих страданиях и смерти от оспы, холеры, тифа, дизентерии, малярии и т.д. доказывают господствующее положение инфекционных заболеваний. Несмотря на выдающиеся успехи в контроле, предоставляемом повышенной санитарией, иммунизацией и антибактериальной терапией, инфекционные заболевания продолжают оставаться общей и серьезной проблемой современной медицины. Наиболее распространенное заболевание человечества, обычная простуда, является инфекционным заболеванием, так же как и пугающее современное заболевание СПИД. Некоторые хронические неврологические заболевания, которые, как считалось ранее, являлись дегенеративными заболеваниями, оказались заразными. Существует мало сомнений, что в будущем будут продолжать выявлять инфекционные заболевания в качестве основных медицинских проблем.
рассмотрено
Textbook of Human Virology
Огромное количество заболеваний людей и животных происходит от вирулентных и приспосабливающихся инфекций от любого из вышеуказанных инфекционных агентов ( Belshe (Ed.) 1984 , PSG Publishing, Littleton, MA).
смотри
, 18
Ed.
Смотри, например
et al.
FASEB J.
Cecil Textbook of Medicine
th
Одна категория инфекционных заболеваний представлена вирусными инфекциями, например. Вирусные заболевания широкого спектра тканей, включая дыхательный тракт, ЦНС, кожу, мочеполовую систему, глаза, уши, иммунную систему, желудочно-кишечный тракт и опорно-двигательную систему, влияют на огромное количество людей всех возрастов(Таблицу 328-2 в Wyngaarden and Smith, 1988, , W.B. Saunders Co., Philadelphia, pp.1750-1753). Несмотря на то, что значительные усилия были вложены в разработку эффективной антивирусной терапии, вирусные инфекции продолжают угрожать жизни миллионов людей во всем мире. В общем, попытки разработать антивирусные лекарства были направлены на несколько стадий жизненного цикла вируса (, Mitsuya , 1991,  5:2369-2381, обсуждение HIV). Однако, общим недостатком, связанным с использованием многих современных антивирусных лекарственных средств, является их вредные побочные эффекты, такие, как токсичность для хозяина или устойчивость со стороны некоторых вирусных штаммов.
4.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ
например
например
Данное изобретение относится к способам лечениия или предотвращения рака и других заболеваний, расстройств и инфекций, используя молекулы, предпочтительно полипептиды, и более предпочтительно иммуноглобулины (, антитела), содержащие вариантный Fc-участок, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещения, но также включая вставки или делеции) в одном или нескольких участках, при этом модификация(и) изменяет (по отношению к Fc-участку дикого типа) соотношение аффинностей варианта Fc-участка к активирующему FcγR (такому как FcγRIIA или FcγRIIIA) по отношению к ингибирующему FcγR (такому как FcγRIIB):
активирующий
Изменение в аффинности к FcγR варианта по отношению к дикому типу
Соотношение аффиностей =
ингибирующий
Изменение в аффинности к FcγR варианта по отношению к дикому типу
<mrow />
Активирующий,
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
например
например
Особый интерес представляют соотношения аффинностей, в которых либо FcγRIIIA или FcγRIIA является FcγR и FcγRIIB является FcγR. Там где вариантный Fc имеет соотношение аффинностей больше чем 1, способы настоящего изобретения имеют специфическое применение в обеспечении терапевтического или профилактического лечения заболевания, нарушения, или инфекции, или улучшении симптома таковых, где повышенная эффективность эффекторной клеточной функции (, ADCC), опосредованной через FcγR, желательна, , рак или инфекционное заболевание. Такое увеличенное соотношение аффинностей может обуславливаться Fc-участком молекулы, имеющим (по отношению к дикому типу Fc) увеличенную аффинность к FcγR (например, FcγRIIIA или FcγRIIA), связанную либо с неизменной аффинностью к FcγR (например, FcγRIIB) или с уменьшением аффинности к такому FcγR. Альтернативно, увеличенное соотношение аффинностей может вытекать из проявления Fc-участком означенной молекулы увеличения аффинности к обоим FcγR и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что увеличенная аффинность к FcγR превышает увеличенную аффинность к FcγR, или может вытекать из проявлениея Fc-участком означенной молекулы уменьшенной аффинности к обоим FcγR и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что уменьшение аффинности к FcγR является меньшим, чем уменьшение аффинности к FcγR, или может вытекать из неизменной аффинностью к FcγR, сопряженной с уменьшением аффинности к FcγR.
например
Активирующий
Ингибирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Там где Fv вариант имеет соотношение аффинностей менее чем 1, способы настоящего изобретения имеют специфическое применение в обеспечении терапевтического или профилактического лечения заболевания или нарушения, или улучшения симптома таковых, где сниженная эффективность эффекторной клеткой функции, опосредованная через FcγR, желательна, , аутоиммунное или воспалительное расстройства. Такое уменьшенное соотношение аффинностей может обусловливаться Fc-участком молекулы, имеющим (по отношению к дикому типу Fc) уменьшеную аффинность к FcγR (например, FcγRIIIA или FcγRIIA) сопряженное либо с неизменной аффинностью к FcγR (например, FcγRIIB), или увеличенной аффинностью к означенному FcγR. Альтернативно, уменьшенное соотношение аффинностей может вытекать из проявления Fc-участком означенной молекулы снижения аффинности к обоим FcγR и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что снижение аффинности к FcγR превышает снижение аффинности к FcγR, или может вытекать из проявления Fc-участком означенной молекулы, увеличенной аффинность к обоим FcγR и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что увеличение аффинности к FcγR является меньшим, чем увеличение аффинности к FcγR, или может вытекать из неизменной аффинности к FcγR, сопряженной с увеличением аффинности к FcγR.
например
et al
et al
и др
Современные подходы к оптимизации функции Fc-участка (, антитело- зависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность, (ADCC), комплемент-зависимая цитотоксическая (CDC) активность) в терапевтических моноклональных антителах и растворимых полипептидах, слитых с Fc-участками, были сосредоточены на ограниченном числе одиночных аминокислотных изменений на основе структурного анализа и/или компьютерного конструирования. Альтернативные подходы к проектированию Fc-участков были сосредоточены на гликозилировании Fc-участка для оптимизации функции Fc-участка. Обоснованность применения соотношений аффинностей вариантного Fc для оценки их терапевтической  возможности была предложена по отношению к вариантным Fc, чьи последовательности были получены с помощью компьютерных алгоритмов поиска пространственной структуры последовательности (Lazar, G.A. . Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 103:4005-4010 (2006)). Данный подход определил четыре варианта Fc: (1) S239D; (2) I322E; (3) S239D и I322E; и (4) S239D, I332E и A330L, все из которых связывали FcγRIIIa, а также FcγRIIb с большей аффинностью, чем дикий тип (Lazar, G.A. . Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 103:4005-4010 (2006). В отличие от этого, данное изобретение основывается, частично, на выборе желаемых молекул, содержащих вариантные Fc, которые демонстрируют измененное соотношение аффинностей для FcγRIII и FcγRII, из объективной библиотеки Fc вариантов. Данный подход обеспечивал возможность идентификации большей совокупности желаемых вариантов Fc, а также вариантов, имеющих соотношение аффинностей намного превышающее те, о которых сообщил Lazar, G.A. . (Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 103:4005-4010 (2006). Данное изобретение включает в себя способы проектирования Fc-участков и идентификации и скрининга новых вариантов Fc за пределами ожидаемых участков, определенных структурными исследованиями. Предполагаемые участки, как используется в данном документе, относятся к тем участкам, которые, на основе структурных и/или биохимических исследований, находятся в контакте с лигандом Fc.
Активирующий
Ингибирующий
т.е.
Терапевтические или профилактические молекулы, которые применяются в соответствии со способами настоящего изобретения, таким образом, содержат вариантные Fc-участки, содержащие одну или несколько аминокислотных модификаций, которые демонстрируют измененное соотношение аффинностей, особенно, где FcγR является либо FcγRIIA, или FcγRIIIA, и FcγR является FcγRIIB. В предпочтительном варианте осуществления молекулы настоящего изобретения также специфически связывают FcγRIIB (через участок Fc) с более низкой аффинностью, чем сравнительная молекула ( имеющая ту же самую аминокислотную последовательность, что и молекула настоящего изобретения, за исключением одной или нескольких аминокислотных модификаций в Fc-участке), содержащая дикий тип Fc-участка, который связывает FcγRIIB. В некоторых вариантах осуществления данное изобретение включает в себя молекулы с вариантными Fc-участками, имеющими одну или несколько аминокислотных модификаций, при этом модификации увеличивают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA и увеличивают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIB по отношению к сравнительной молекуле с дикий типом Fc-участка. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя молекулы с вариантными Fc-участками, имеющими одну или несколько аминокислотных модификаций, при этом модификации увеличивают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA, но не изменяют аффинность вариантных Fc-участков к FcγRIIB по отношению к сравнительной молекуле с диким типом Fc-участка. Предпочтительный вариант осуществления представляет собой вариантный Fc-участок, который имеет увеличенную аффинность к FcγRIIIA и FcγRIIA, но уменьшенную аффинность к FcγRIIB по отношению к сравнительной молекуле с диким типом Fc-участка.
Варианты Fc настоящего изобретения могут быть объединены с другими модификациями Fc, включая без ограничения модификации, которые изменяют эффекторную функцию. Данное изобретение включает в себя объединение вариантного Fc настоящего изобретения с другими модификациями Fc для обеспечения добавочных, синергических или новых свойств в антителах или Fc-слияниях. Предпочтительно, вариантные Fc настоящего изобретения увеличивают фенотип модификации, с которой они объединены. Например, если вариант Fc настоящего изобретения объединен с известным мутантом для связывания с FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнительная молекула, содержащая дикий тип Fc-участка; комбинация с мутантом настоящего изобретения ведет к большему в несколько раз увеличению FcγRIIIA аффинности.
т.е.
В одном варианте осуществления варианты Fc настоящего изобретения могут быть объединены с другими известными вариантами Fc, такими как те, что раскрыты в Duncan et al, 1988, Nature 332:563-564; Lund et al., 1991, J. Immunol 147:2657-2662; Lund et al, 1992, Mol Immunol 29:53-59; Alegre et al, 1994, Transplantation 57:1537-1543; Hutchins et al., 1995, Proc Natl. Acad Sci U S A 92:11980-11984; Jefferis et al, 1995, Immunol Lett. 44:111-117; Lund et al., 1995, Faseb J 9:115-119; Jefferis et al, 1996, Immunol Lett 54:101-104; Lund et al, 1996, J Immunol 157:49634969; Armour et al, 1999, Eur J Immunol 29:2613-2624; Idusogie et al, 2000, J Immunol 164:41784184; Reddy et al, 2000, J Immunol 164:1925-1933; Xu et al., 2000, Cell Immunol 200:16-26; Idusogie et al, 2001, J Immunol 166:2571-2575; Shields et al., 2001, J Biol Chem 276:6591-6604; Shields et al, 2002, J Biol Chem 277:26733-26740; Jefferis et al, 2002, Immunol Lett 82:57-65; Presta et al., 2002, Biochem Soc Trans 30:487-490); Lazar, G.A. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 103:4005-4010 (2006); патентном документе США №5624821; патентном документе США №5885573; патентном документе США №6194551; публикации Международной заявки WO 00/42072; публикации Международной заявки WO 99/58572; публикации Международной заявки WO 04/063351; публикации патентной заявки США 2005/0037000; и публикация патентной заявки США 2005/0064514; каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте. В определенных вариантах осуществления вариантные Fc настоящего изобретения могут быть объединены с одним или несколькими вариантами Fc,  аминокислотными модификациями, относящимися к дикому типу участка Fc, представленными в таблицах 4, 5, 9, и 10 ниже.
Данное изобретение включает в себя молекулы, которые являются гомодимерами или гетеродимерами Fc-участков. Гетеродимеры, содержащие Fc-участки относятся к молекулам, где две цепи Fc имеют одинаковые или различные последовательности. В некоторых вариантах осуществления в гетеродимерных молекулах, содержащих вариантные Fc-участки, каждая цепь имеет одну или несколько различных модификаций от другой цепи. В других вариантах осуществления в гетеродимерных молекулах, содержащих вариантные Fc-участки, одна цепь содержит дикий тип Fc-участка, и другая цепь содержит одну или несколько модификаций. Способы проектирования гетеродимерных Fc-содержащих молекул известны в данном уровне техники и включены в данное изобретение.
Активирующий,
Ингибирующий
Ингибирующий
Ингибирующий
Активирующий,
Активирующий
например
например
В некоторых вариантах осуществления данное изобретение включает в себя молекулы, содержащие вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию, относящуюся к дикому типу Fc-участка, при которой вариантный Fc-участок связывает FcγR, но не связывает FcγR, или связывает FcγR с уменьшенной аффинностью, относительно сравнительной молекулы, содержащей дикий тип участка Fc, как было определено с помощью стандартных испытаний (, in vitro испытаний), известных специалисту в данной области. В альтернативном варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулы, содержащие вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу участка Fc, при этом вариантный Fc-участок связывает FcγR, но не связывает FcγR или связывает  FcγR с уменьшенной аффинностью, по отношению к сравнительной молекуле, содержащей дикий тип участка Fc, как было определено с помощью стандартных испытаний (, in vitro испытаний), известных специалисту в данной области. В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулы, содержащие вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу участка Fc, при этом вариантный Fc-участок связывает только один FcγR, где указанный FcγR является FcγIIIA. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулы, содержащие вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка, при этом вариант Fc-участка связывает только один FcγR, где указанный FcγR является FcγRIIA. В еще одном варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулы, содержащие вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу участка Fc, при этом вариантный Fc-участок связывает только один FcγR, где указанный FcγR является FcγRIIB.
in vitro
т.е.
Смотри
Смотри
in vivo
Аффинности и связывающие свойства молекул настоящего изобретения для FcγR изначально определяют с помощью  испытаний (на основе биохимических или иммуннологических испытаний), известных в данном уровне техники для определения взаимодействий Fc-FcγR,  специфического связывания Fc-участка с FcγR, включая без ограничения ELISA анализ, испытание поверхностного плазмонного резонанса, испытания иммунопреципитации ( Раздел 6.2). Предпочтительно, связывающие свойства молекул настоящего изобретения также характеризуются посредством in vitro функциональных испытаний для определения одной или нескольких FcγR медиаторных эффекторных клеточных функций ( Раздел 6.2.2). В самом предпочтительном варианте осуществления молекулы настоящего изобретения имеют похожие связывающие свойства в  моделях (таких как те, что описаны и раскрыты в данном документе) с теми, что и в in vitro основанных испытаниях. Однако данное изобретение не исключает молекулы настоящего изобретения, которые не демонстрируют желаемый фенотип в in vitro основанных испытаниях, но действительно демонстрируют желаемый фенотип in vivo.
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка и проявляет соотношение аффинностей более чем 1, обеспеченное тем, что указанный вариант Fc-участка не имеет исключительно замещения в любом одном из положений 329, 331 или 332, или не включает, или не является исключительно замещением, любым одним из: (1) аланина в любом из положений 256, 290, 298, 312, 333, 334, 359, 360, 326 или 430; (2) лизина в положении 330; (3) треонина в положении 339; (4) метионина в положении 320; (5) серина в положении 326; (6) аспарагина в положении 326; (7) аспарагиновой кислоты в положении 326; (8) глутаминовой кислоты в положении 326; (9) глутамина в положении 334; (10) глутаминовой кислоты в положении 334; (11) метионина в положении 334; (12) гистидина в положении 334; (13) валина в положении 334; (14) лейцина в положении 334; (15) лизина в положении 335, или (16) только глутаминовой кислоты в положении 332; (17) только глутаминовой кислоты в положении 332 и аспарагиновой кислоты в положении 239; (18) только глутаминовой кислоты в положении 332, аспарагиновой кислоты в положении 239 и лейцина в положении 330.
Данное изобретение главным образом касается молекулы, имеющей такой вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок дополнительно характеризуется обладанием по меньшей мере одной аминокислотной модификацией по отношению к дикому типу Fc-участка в положении 234, 235, 243, 247, 255, 270, 284, 292, 300, 305, 316, 370, 392, 396, 416, 419 и/или 421.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки дополнительно характеризуются обладанием замещениями в по меньшей мере двух положениях: (a) 235 и 243; (b) 243 и 292; (c) 243 и 300; (d) 243 и 305; (e) 243 и 396; (f) 247 и 270; (g) 247 и 421; (h) 255 и 270; (i) 255 и 396; (j) 270 и 316; (k) 270 и 396; (l) 270 и 416; (m) 270 и 421; (n) 292 и 300; (o) 292 и 305; (p) 292 и 396; (q) 300 и 396; (r) 305 и 396; (s) 316 и 416; (t) 392 и 270; (u) 392 и 396; (v) 419 и 270; или (w) 419 и 396.
Данное изобретение также касается такой молекулы, где вариантные Fc-участки дополнительно характеризуются обладанием замещениями в по меньшей мере трех положениях: ((a) 243, 247 и 421; (b) 243, 292 и 300; (c) 243, 292 и 305; (d) 243, 292 и 396; (e) 243 300 и 396; (f) 243, 305 и 396; (g) 247, 270 и 421; (h) 255, 270 и 396; (i) 270, 316 и 416; (j) 270, 392 и 396; (k) 270, 396 и 419; (l) 292 300 и 396; или (m) 292, 305 и 396.
Данное изобретение также касается вариантов осуществления таких антител, где по меньшей мере одна модификация в Fc-домене содержит замещение L234 или замещение L235, или замещения обоих L234 и L235, и, особенно, где замещение L234 представлено L234F, и указанное замещение в L235 представлено L235V.
т.е.
Данное изобретение дополнительно касается вышеописанных способов, где вариантный Fc-участок обладает, по меньшей мере, аминокислотными модификациями по отношению к дикому типу Fc-участка в одном или нескольких положениях: 243, 292, 300 или 396 ( в положении 243, 292, 300 или 396; или как в положении 243, так и в положении 292; или как в положении 243, так и в положении 300; или как в положении 243, так и в положении 396; или как в положении 292, так и в положении 300; или как в положении 292, так и в положении 396; или как в положении 300, так и в положении 396; или в положении 243, в положении 292 и в положении 300; или в положении 243, в положении 292 и в положении 396; или в положении 292, в положении 300 и в положении 396; или в положении 243, в положении 292, в положении 300 и в положении 396). Данное изобретение особенно касается варианта осуществления вышеописаных способов, где такой вариантный Fc-участок обладает модификациями: L234F, L235I, F243L, R292P и/или Y300L.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантный Fc-участок демонстрирует соотношение аффинностей большее, чем 1, и где такой вариантный Fc-участок имеет, по меньшей мере, любое из следующих замещений: (a) F243L; (b) D270E; (c) R292G; или (d) R292P.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки демонстрирует соотношение аффинностей большее, чем 1, и где такие вариантные Fc-участки имеют, по меньшей мере, любую из следующих пар замещений: (a) F243L и R292P; (b) F243L и Y300L; (c) F243L и P396L; (d) D270E и P396L; (e) R292P и Y300L; (f) R292P и V305I; (g) R292P и P396L; (h) Y300L и P396L; и (i) P396L и Q419H.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки демонстрируют соотношение аффинностей большее, чем 1, и где такие вариантные Fc-участки имеют, по меньшей мере, любую из следующих троек замещений: (a) F243L, P247L и N421K; (b) F243L, R292P и Y300L; (c) F243L, R292P и Y300L; (d) F243L, R292P и V305I; (e) F243L, R292P и P396L; (f) F243L, Y300L и P396L; (g) P247L, D270E и N421K; (h) R255L, D270E и P396L; (i) D270E, G316D и R416G; (j) D270E, K392T и P396L; (k) D270E, P396L и Q419H; (l) V284M, R292L и K370N или (m) R292P, Y300L и P396L.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки демонстрируют соотношение аффинностей большее, чем 1, и где такие вариантные Fc-участки имеют, по меньшей мере, любую из следующих тетрад замещениий: (a) L234F, F243L, R292P и Y300L; (b) L235I, F243L, R292P и Y300L; (c) L235Q, F243L, R292P и Y300L; (d) F243L, R292P, Y300L, и P396L; (e) F243L, P247L, D270E и N421K; (f) F243L, R255L, D270E и P396L; (g) F243L, D270E, G316D и R416G; (h) F243L, D270E, K392T и P396L; (i) F243L, D270E, P396L и Q419H; (j) F243L, R292P, V305I и P396L; (k) D270E, G316D, P396L и R416G; (l) P247L, D270E, Y300L и N421K; (m) R255L, D270E, R292G и P396L; или (n) R255L, D270E, Y300L и P396L.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки демонстрируют соотношение аффинностей большее, чем 1, и где такие вариантные Fc-участки имеют, по меньшей мере, любую из следующих пептад замещений: (a) L235V, F243L, R292P, Y300L и P396L; (b) L235P, F243L, R292P, Y300L и P396L; (c) F243L, R292P, V305I, Y300L и P396L; или (d) F243L, R292P, Y300L, V305I и P396L.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки демонстрируют соотношение аффинностей меньшее, чем 1, и где такие вариантные Fc-участки имеют, по меньшей мере, любое из следующих замещений: (a) P396L или (b) Y300L.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки демонстрируют соотношение аффинностей меньшее, чем 1, и где такие вариантные Fc-участки имеют, по меньшей мере, любую из следующих пар замещений: (a) F243L и P396L; (b) P247L и N421K; (c) R255L и P396L; (d) R292P и V305I; (e) K392T и P396L; или (f) P396L и Q419H.
Данное изобретение также касается таких молекул, где вариантные Fc-участки демонстрируют соотношение аффинностей меньшее, чем 1, и где такие вариантные Fc-участки имеют, по меньшей мере, любое из следующих трех замещений: F243L, R292P и V305I.
В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка так, что указанный полипептид специфически связывает FcγRIIA с большей аффинностью, чем сравнительная молекула, содержащая дикий тип участка Fc, который связывает FcγRIIA, обеспеченное тем, что одна или несколько аминокислотных модификаций не включают или не являются исключительно замещением аланина в любом из положений 256, 290, 326, 255, 258, 267, 272, 276, 280, 283, 285, 286, 331, 337, 268, 272 или 430; аспарагина в положении 268; глутамина в положении 272; глутамина, серина или аспарагиновой кислоты в положении 286; серина в положении 290; метионина, глутамина, глутаминовой кислоты или аргинина в положении 320; глутаминовой кислоты в положении 322; серина, глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты в положении 326; лизина в положении 330; глутамина в положении 335; или метионина в положении 301.
и др.
Nature
например
В предпочтительном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка так, что указанная молекула имеет измененную аффинность для FcγR, обеспеченную тем, что указанный вариантный Fc-участок не имеет замещения в положениях, которые совершают прямой контакт с FcγR на основе кристаллографического и структурного анализа Fc-FcγR взаимодействий, таких как те, что раскрыты у Sondermann  (2000 , 406: 267-273, которая включенна в данный документ ссылкой во всей своей полноте). Примерами положений в пределах Fc-участка, которые создают прямой контакт с FcγR, являются аминокислоты 234-239 (шарнирный участок), аминокислоты 265-269 (B/C петля), аминокислоты 297-299 (C'/E петля) и аминокислоты 327-332 (F/G петля). В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантные Fc-участки, содержат модификацию по меньшей мере одного остатка, который не создает прямого контакта с FcγR на основе структурного и кристаллографического анализа, , не находится в пределах Fc-FcγR связывающего сайта.
В еще одном предпочтительном варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка так, чтоб указанная молекула связывала FcγR (через его участок Fc) с измененной аффинностью по отношению к молекуле, содержащей дикий тип Fc-участка, обеспечивая то, что указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация не включает или не является исключительно замещением в любом из положений 255, 256, 258, 267, 268, 269, 270, 272, 276, 278, 280, 283, 285, 286, 289, 290, 292, 293, 294, 295, 296, 298, 300, 301, 303, 305, 307, 309, 312, 320, 322, 326, 329, 330, 332, 331, 333, 334, 335, 337, 338, 339, 340, 359, 360, 373, 376, 416, 419, 430, 434, 435, 437, 438, 439. В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу участка Fc так, что указанная молекула связывает FcγR (через его участок Fc) с измененной аффинностью по отношению к молекуле, содержащей дикий тип участка Fc, обеспечивая то, что указанный вариантный Fc-участок не включает или не является исключительно замещением в любом из положений 255, 258, 267, 269, 270, 276, 278, 280, 283, 285, 289, 292, 293, 294, 295, 296, 300, 303, 305, 307, 309, 322, 329, 332, 331, 337, 338, 340, 373, 376, 416, 419, 434, 435, 437, 438, 439 и не имеет аланина в любом из положений 256, 290, 298, 312, 333, 334, 359, 360, 326 или 430;  лизина в положении 330; треонина в положении 339; метионина в положении 320; серина в положении 326; аспарагина в положении 326; аспарагиновой кислоты в положении 326; глутаминовой кислоты в положении 326; глутамина в положении 334; глутаминовой кислоты в положении 334; метионина в положении 334; гистидина в положении 334; валина в положении 334; или лейцина в положении 334; лизина в положении 335, аспарагина в положении 268; глутамина в положении 272; глутамина, серина или аспарагиновой кислоты в положении 286; серина в положении 290; метионина, глутамина, глутаминовой кислоты или аргинина в положении 320; глутаминовой кислоты в положении 322; серина, глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты в положении 326; лизина в положении 330; глутамина в положении 335; или метионина в положении 301.
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок не включает или не является исключительно замещением в любом из положений 268, 269, 270, 272, 276, 278, 283, 285, 286, 289, 292, 293, 301, 303, 305, 307, 309, 331, 333, 334, 335, 337, 338, 340, 360, 373, 376, 416, 419, 430, 434, 435, 437, 438 или 439 и не имеет гистидина, глутамина или тирозина в положении 280; серина, глицина, треонина или тирозина в положении 290, лейцина или изолейцина в положении 300; аспарагина в положении 294, пролина в положении 296; пролина, аспарагина, аспарагиновой кислоты или валина в положении 298; лизина в положении 295. В еще одном предпочтительном варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу участка Fc так, что указанная молекула связывает FcγR (через его участок Fc) с уменьшенной аффинностью по отношению к молекуле, содержащей дикий тип Fc-участка, обеспечивая то, что указанный вариантный Fc-участок не имеет или не имеет только замещение в любом из положений 252, 254, 265, 268, 269, 270, 278, 289, 292, 293, 294, 295, 296, 298, 300, 301, 303, 322, 324, 327, 329, 333, 335, 338, 340, 373, 376, 382, 388, 389, 414, 416, 419, 434, 435, 437, 438 или 439. В еще одном предпочтительном варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу участка Fc так, что указанная молекула связывает FcγR (через его участок Fc) с повышенной аффинностью по отношению к молекуле, содержащей дикий тип участка Fc, обеспечивая то, что указанный вариантный Fc-участок не имеет или не является исключительно замещением в любом из положений 280, 283, 285, 286, 290, 294, 295, 298, 300, 301, 305, 307, 309, 312, 315, 331, 333, 334, 337, 340, 360, 378, 398 или 430.
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок не включает замещение или не имеет исключительно замещение в любом из положений 330, 243, 247, 298, 241, 240, 244, 263, 262, 235, 269 или 328 и не имеет лейцина в положении 243, аспарагина в положении 298, лейцина в положении 241, и изолейцина или аланина в положении 240, гистидина в положении 244, валина в положении 330, или изолейцина в положении 328.
например
например
В специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный Fc-участок, имеющий один или несколько аминокислотных модификаций (, замещения), при этом модификации увеличивают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA до по меньшей мере 2-кратного уровня по отношению к сравнительной молекуле, содержащей дикий тип Fc-участка. В определенных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный Fc-участок, имеющий одну или несколько аминокислотных модификациий (, замещения), при этом модификации увеличивают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA до уровня более чем 2-кратного, по меньшей мере 4-кратного, по меньшей мере 5-кратного, по меньшей мере 6-кратного, по меньшей мере 8-кратного, или по меньшей мере 10-кратного по отношению к сравнительной молекуле, содержащей дикий тип Fc-участка. В других вариантах осуществления настоящего изобретения молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантный Fc-участок, специфически связывают FcγRIIIA и/или FcγRIIA с по меньшей мере 65%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 100%, по меньшей мере 150%, по меньшей мере 200% большей аффинностью по отношению к молекуле, содержащей дикий тип участка Fc. Такие измерения предпочтительны в in vitro испытаниях.
Данное изобретение включает в себя молекулы с измененными аффинностями для активирующего и/или ингибиторного Fcγ-рецепторов. В частности, данное изобретение предусматривает молекулы с вариантными Fc-участками, имеющими одну или несколько аминокислотных модификаций, при этом модификации увеличивают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB, но снижают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA по отношению к сравнительной молекуле с диким типом Fc-участка. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя молекулы с вариантными Fc-участками, имеющими одну или несколько аминокислотных модификаций, при этом модификации снижают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB и также снижают аффинность вариантных Fc-участков для FcγRIIIA и/или FcγRIIA по отношению к сравнительной молекуле с диким типом участка Fc. Еще в другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулы с вариантными Fc-участками, имеющими одну или несколько аминокислотных модификаций, при этом модификации увеличивают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB и также увеличивают аффинность вариантных Fc-участков для FcγRIIIA и/или FcγRIIA по отношению к сравнительной молекуле с диким типом участка Fc. Еще в другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулы с вариантными Fc-участками, при этом модификации снижают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA, но не изменяют аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB по отношению к сравнительной молекула с диким типом участка Fc. Еще в другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя молекулы с вариантными Fc-участками, при этом модификации увеличивают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA, но снижают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB по отношению к сравнительной молекуле с диким типом участка Fc.
например
В специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный Fc-участок, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещения), при этом одна или несколько модификаций увеличивают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и снижают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB по отношению к сравнительной молекуле, содержащей дикий тип участка Fc, которая связывает FcγRIIIA и FcγRIIB с аффинностью дикого типа. В определенном варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций не являются замещением на аланин в любом из положений 256, 298, 333 или 334.
например
В еще одном специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный Fc-участок, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещения), при этом одна или несколько модификаций увеличивают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIA и снижают аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB по отношению к сравнительной молекуле, содержащей дикий тип Fc-участка, который связывает FcγRIIA и FcγRIIB с диким типом аффинности. В определенном варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций не являются замещением на аргинин в положении 320.
В самых предпочтительных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения с измененными аффинностями для активирующих и/или ингибиторных рецепторов, имеющих вариантные Fc-участки, имеют одну или несколько аминокислотных модификаций, где указанная одна или несколько аминокислотных модификаций представляют замещение в положении 288 на аспарагин, в положении 330 на серин и в положении 396 на лейцин (MgFc10); или замещение в положении 334 на глутаминовую кислоту, в положении 359 на аспарагин и в положении 366 на серин (MgFc13); или замещение в положении 316 на аспарагиновую кислоту, в положении 378 на валин и в положении 399 на глутаминовую кислоту (MgFc27); или замещение в положении 392 на треонин и в положении 396 на лейцин (MgFc38); или замещение в положении 221 на глутаминовую кислоту, в положении 270 на глутаминовую кислоту, в положении 308 на аланин, в положении 311 на гистидин, в положении 396 на лейцин и в положении 402 на аспарагиновую кислоту (MgFc42); или замещение в положении 240 на аланин и в положении 396 на лейцин (MgFc52); или замещение в положении 410 на гистидин и в положении 396 на лейцин (MgFc53); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 305 на изолейцин, в положении 378 на аспарагиновую кислоту, в положении 404 на серин и в положении 396 на лейцин (MgFc54); или замещение в положении 255 на изолейцин и в положении 396 на лейцин (MgFc55); или замещение в положении 370 на глутаминовую кислоту и в положении 396 на лейцин (MgFc59); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин (MgFc88); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин и в положении 396 на лейцин (MgFc88A); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин (MgFc155); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин; или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 396 на лейцин; или замещение в положении 243 на лейцин и в положении 292 на пролин; или замещение в положении 243 на лейцин; или замещение в положении 273 на фенилаланин; или замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В зависимом варианте осуществления вариант Fc-участка дополнительно содержит одну или несколько аминокислотных модификаций, раскрытых в таблицах 4, 5, 9, и 10 ниже.
например
см.
Methods in Enzymology
смотри, например,
В определенных вариантах осуществления данное изобретение включает в себя способы скрининга и идентификации терапевтических и/или профилактических молекул, содержащих вариантные Fc-участки с измененными аффинностями к FcγR (, увеличенная аффинность к FcγRIIIA), используя технику дисплея на поверхности дрожжей (для обзора  Boder and Wittrup, 2000, , 328: 430-444, который включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте). Дисплей на поверхности дрожжей полипептидов, содержащих мутантный Fc, настоящего изобретения может быть выполнен в соответствии с техниками, известными специалистам в данной области техники или описанным в данном документе (публикации патентных заявок США №2005/0037000 и №2005/0064514, и публикацию международной патентной заявки WO 04/063351, каждая из которых включена в данный документ ссылкой в ее полном объеме). Дисплей на дрожжах предлагает преимущество использования фактического связывания с желаемым рецептором для идентификации вариантных Fc-участков, которые имеют повышенное связывание с данным рецептором.
например
т.е.
например
например
В определенных вариантах осуществления данное изобретение включает в себя способы скрининга и идентификации терапевтических и/или профилактических молекул, содержащих вариантные Fc-участки с измененными FcγR аффинностями (, увеличенная FcγRIIIA аффинность), используя технику дисплея на поверхности дрожжей, известный в данном уровне техники или описанный в данном документе в комбинации с одним или несколькими основанными на биохимии испытаниями, предпочтительно высокопропускными методами. Одно или несколько биохимических испытаний могут быть любыми испытаниями, известными в данном уровне техники для идентификации Fc-FcγR взаимодействия,  специфического связывания Fc-участка с FcγR, включая без ограничения ELISA анализ, испытание поверхностного плазмонного резонанса, испытание иммунопреципитации, аффинную хроматографию и равновесный диализ. В некоторых вариантах осуществления скрининг и идентификация молекул, содержащих вариантные Fc-участки с измененными FcγR аффинностями (, увеличенной FcγRIIIA аффинностью), выполняют с применением метода дрожжевого дисплея, как описано в данном документе, в комбинации с одним или несколькими испытаниями, основанными на функциональностях, предпочтительно высокопропускным методом. Тесты, основанные на функциональностях, могут быть любым испытанием, известным в данном уровне техники для характеристики одной или нескольких FcγR опосредованных эффекторных клеточных функций, таких как те, что описаны в данном документе в Разделе 6.2.2. Неограничивающие примеры эффекторных клеточных функций, которые могут использоваться в соответствии со способами настоящего изобретения, включают без ограничения антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC), антитело-зависимый фагоцитоз, фагоцитоз, опсонизацию, опсонофагоцитоз, клеточное связывание, розеткообразование, C1q связывание и комплемент-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность. В некоторых вариантах осуществления скрининг и идентификация молекул, содержащих вариантные Fc-участки с измененными FcγR аффинностями (, увеличенная FcγRIIIA аффинность), выполняют с применением способа дрожжевого дисплея, как описано в данном документе или известно в данном уровне техники, в комбинации с одним или несколькими испытаниями, основанными на биохимии, в комбинации или парралельно с одним или несколькими испытаниями, основанными на функциональностях, предпочтительно высокопропускным методом.
например
например
В предпочтительных вариантах осуществления данное изобретение включает в себя способы скрининга и характеристики FcγR-Fc взаимодействия с применением биохимических испытаний, разработанных изобретателями и раскрытых в публикациях патентных заявок США №2005/0037000 и №2005/0064514, и публикации международрой патентной заявки WO 04/063351, каждая из которых включена в данный документ ссылкой в ее полном объеме. Раскрытые испытания делают возможным обнаружение и количественное определение FcγR-Fc взаимодействия, несмотря на изначально слабую аффинность рецептора к его лиганду, , в микромолярном диапазоне для FcγRIIB и FcγRIIIA. Способ предполагает образование комплекса FcγR (, FcγRIIIA, FcγRIIB), который имеет повышенный авидитет для Fc-участка по отношению к некомплексованным FcγR.
Данное изобретение включает в себя применение иммунных комплексов, образованных в соответствии со способами, описанными выше для обнаружения функциональности молекул, содержащих Fc-участок в клеточном и бесклеточном испытаниях.
например
например
например
т.е.
например
например,
;
В предпочтительных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения (, иммуноглобулины или их фрагменты), содержащие вариантные Fc-участки, также характеризуются в животной модели на предмет взаимодействия с FcγR или животной модели состояния заболевания. Предпочтительные животные модели для применения в способах настоящего изобретения представлены, например, трансгенными мышами, экспрессирующими человеческие FcγRs, , любые мышиные модели, описаны в патентах США №5877397 и №6676927, которые включены в данный документ ссылкой в их полном объеме. Трансгенные мыши для применения в способах настоящего изобретения включают без ограничения нокаут FcγRIIIA мышей, несущих FcγRIIIA человека; нокаут FcγRIIIA мышей, несущих FcγRIIA человека; нокаут FcγRIIIA мышей, несущих FcγRIIB человека, и FcγRIIIA человека; нокаут FcγRIIIA мышей, несущих FcγRIIB человека и FcγRIIA человеканокаут FcγRIIIA и FcγRIIA мышей, несущих FcγRIIIA и FcγRIIA человека; и нокаут FcγRIIIA, FcγRIIA и FcγRIIB мышей, несущих FcγRIIIA, FcγRIIA и FcγRIIB человека. Мышиная линия, применяемая для исследований нокаута, может быть любой подходящий инбредной линией (, B6), как определяется обычно в данном уровне техники. В предпочтительных вариантах осуществления мышиная линия является линией голого генотипа,  иммуно-ослабленной, что делает возможным исследования ксенотрансплантации (, модели раковой опухоль). Такие голые линии включают без ограничения FoxN1 и N/N. В других вариантах осуществления мыши, несущие один или несколько FcγR человека, дополнительно содержат одну или несколько дополнительных генетических мутаций, включая один или несколько нокаутов, RAG1 -/-.
например
например
т.е.
например
2
В специфическом варианте осуществления данное изобретение предлагает модифицированные иммуноглобулины, содержащие вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью для FcγRIIIA и/или FcγRIIA. Такие иммуноглобулины включают IgG молекулы, которые естественно содержат FcγR связывающие участки (, FcγRIIIA и/или FcγRIIB связывающие участки), или производные иммуноглобулина, которые были спроектированы, для того чтобы включать в себя FcγR связывающий участок (, FcγRIIIA и/или FcγRIIB связывающие участки). Модифицированные иммуноглобулины настоящего изобретения включают любую иммуноглобулиновую молекулу, которая связывает, предпочтительно иммуноспецифически,  конкурирует с неспецифическим связыванием, как было определено с помощью иммуноиспытаний, хорошо известных в данном уровне техники, для анализа специфического связывания антиген-антитело, антиген и содержит FcγR связывающий участок (, FcγRIIIA и/или FcγRIIB связывающий участок). Такие антитела включают без ограничения поликлональные, моноклональные, биспецифические, полиспецифические, человеческие, гуманизированные, химерные антитела, антитела с одной цепью, Fab фрагменты, F(ab') фрагменты, дисульфидно-связаные Fv и фрагменты, содержащие либо VL, или VH домен или даже участок, определяющий комплементность (CDR), который специфически связывает антиген, в определенных случаях, спроектированный для того, чтобы содержать или быть слитым с FcγR связывающим участком.
например
В определенном варианте осуществления данное изобретение включает в себя иммуноглобулины, содержащие вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью для FcγRIIIA и/или FcγRIIA так, что иммуноглобулин имеет повышенную эффекторную функцию, , антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность. Эффекторная функция молекул настоящего изобретения может быть проанализирована с применением любого испытания, описанного в данном документе или известного специалистам в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления иммуноглобулины, содержащие вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью для FcγRIIIA и/или FcγRIIA, имеют повышенную ADCC активность по отношению к дикому типу, по меньшей мере 2-кратную, по меньшей мере 4-кратную, по меньшей мере 8-кратную, по меньшей мере 10-кратную, по меньшей мере 50-кратную, или по меньшей мере 100-кратную.
например
например
например
например
например
и т.п.
Данное изобретение включает в себя проектирование человеческих или гуманизированных терапевтических антител (, специфических моноклональных антител к опухоли) в Fc-участке посредством модификации (, замещение, вставка, делеция) одного или нескольких аминокислотных остатков, при этом модификации модулируют аффинность терапевтического антитела для активирующего рецептора FcγR и/или ингибиторного рецептора FcγR. В одном варианте осуществления данное изобретение относится к проектированию человеческих или гуманизированных терапевтических антител (, моноклональных антител специфических к опухоли) в Fc-участке посредством модификации одного или нескольких аминокислотных остатков, при этом модификации увеличивают аффинность Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В другом варианте осуществления данное изобретение относится к проектированию человеческих или гуманизированных терапевтических антител (, моноклональных антител специфических к опухоли) в Fc-участке посредством модификации одного или нескольких аминокислотных остатков, при этом модификация увеличивает аффинность Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA и также снижает аффинность Fc-участка для FcγRIIB. Спроектированные терапевтические антитела могут также иметь повышенную эффекторную функцию, , повышенную ADCC активность, фагоцитозную активность , как было определено с помощью стандартных испытаний, известных специалистам в данной области техники.
SEQ ID NO:31
SEQ ID NO:32
SEQ ID NO:33
SEQ ID NO:34
SEQ ID NO:35
например
et al.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
например
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование моноклонального антитела специфического для Her2/neu протоонкогена (аминокислотной последовательности ) (, 4D5 антитело, как раскрыто в Carter , 1992,  89:4285-9; патенте США №5677171; или публикации международной патентной заявки WO 01/00245, каждый из которых в данном документе включен ссылкой в его полном объеме) посредством модификации (, замещение, вставка, делеция) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, при этом модификация увеличивает аффинность Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В еще одном специфическом варианте осуществления модификация гуманизированного Her2/neu моноклонального антитела может также уменьшать аффинность Fc-участка для FcγRIIB. В еще одном специфическом варианте осуществления спроектированные гуманизированные моноклональные антитела, специфические для Her2/neu, могут также иметь повышенную эффекторную функцию, как было определено с помощью стандартных испытаний, известных в данном уровне техники, и раскрыто в подтверждающих примерах в данном документе. В определенном варианте осуществления 4D5 антитело является химерным. В другом варианте осуществления 4D5 антитело является гуманизированным. В специфическом варианте осуществления 4D5 антитело, спроектированное в соответствии со способами настоящего изобретения, содержит тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность . В еще одном специфическом варианте осуществления 4D5 антитело, спроектированное в соответствии со способами настоящего изобретения, содержит легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность . Еще в других вариантах осуществления 4D5 антитело, спроектированное в соответствии со способами настоящего изобретения, является гуманизированным и содержит тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность . В дополнительных вариантах осуществления 4D5 антитело, спроектированное в соответствии со способами настоящего изобретения, является гуманизированным и содержит легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность .
SEQ ID NO:36
SEQ ID NO:37
SEQ ID NO:38
SEQ ID NO:39
SEQ ID NO:40
SEQ ID NO:41
В специфическом варианте осуществления антитела настоящего изобретения связывают Her2/neu. Антитела к анти-Her2/neu настоящего изобретения могут иметь вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CDR1 (), и/или CDR2 (), и/или CDR3 (), и/или вариабельный участок легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CDR1 (), и/или CDR2 (), и/или CDR3 ().
например
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя антитело 4D5 (, химерное, гуманизированное), содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 4D5 антитело, имеющие лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 4D5 антитело, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 4D5 антитело, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 4D5 антитело, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 4D5 антитело, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
например
В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование анти-CD20 антитела посредством модификации (, замещение, вставка, делеция) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, при этом модификация увеличивает аффинность Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В родственном варианте осуществления анти-CD20 антитело является мышино-человеческим химерным анти-CD20 моноклональным антителом, 2H7. Дальнейшие неограничивающие примеры анти-CD20 антитела, которые могут использоваться в способах настоящего изобретения, раскрыты в патентной заявке США № 11/271140, поданной 10 ноября 2005, включенной в данный документ ссылкой в ее полном объеме. В еще одном специфическом варианте осуществления модификация анти-CD20 моноклонального антитела, 2H7, может также уменьшать аффинность Fc-участка для FcγRIIB. В еще одном специфическом варианте осуществления спроектированное анти-CD20 моноклональное антитело, 2H7, может также иметь повышенную эффекторную функцию, как было определено с помощью стандартных испытаний, известных в данном уровне техники, и раскрыто в подтверждающем примере в данном документе.
например
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 2H7 антитело (, химерное, гуманизированное), содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 2H7 антитело, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 4D5 антитело, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 2H7 антитело, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 2H7 антитело, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 2H7 антитело, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
например
В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование анти-FcγRIIB антитела, в частности, анти-FcγRIIB антитела, которое специфически связывает человеческий FcγRIIB, более конкретно природный человеческий FcγRIIB, посредством модификации (, замещение, вставка, делеция) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, при этом модификация увеличивает аффинность Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA. Неограничивающие примеры типичных анти-FcγRIIB антител раскрыты в предварительной заявке США №60/403266, поданной 12 августа 2002 г.; заявке США №10/643857, поданной 14 августа 2003 г.; и публикациях патентных заявок США №2004-0185045; №2005-0260213; и №2006-0013810, все из которых включены в данный документ ссылками в их полном объеме. Примеры анти-FcγRIIB антител, которые могут быть спроектированы в соответствии со способами настоящего изобретения, представляют моноклональные антитела, выработанные посредством клона 2B6, 3H7, 8B5.4.3, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11, 8B5 и 1F2, имеющие ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960, PTA-7610 и PTA-5959, соответственно (переданы на хранение в ATCC (Американскую коллекцию типовых культур), 10801 University Boulevard, Manassas, VA 02209-2011, все из которых включены в данный документе ссылкой), или их химерные, гуманизированные или другие спроектированные версии.
SEQ ID NO:2
SEQ ID NO:3,
SEQ ID NO:5
SEQ ID NO:6
SEQ ID NO:7
SEQ ID NO:9,
SEQ ID NO:10
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи и/или вариабельный домен легкой цепи 2B6, 3H7 или 8B5.3.4. В еще одном специфическом вариант осуществления, данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного антитела, содержащего CDR от 2B6, 3H7 или 8B5.3.4. В специфическом варианте осуществления, данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1,  или  и вариабельный домен легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, , ,  или SEQ ID NO: 8. В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность  и вариабельный домен легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность .
SEQ ID NO:42
SEQ ID NO:29
SEQ ID NO:30
SEQ ID NO:29
SEQ ID NO:30
SEQ ID NO:43
SEQ ID NO:44,
SEQ ID NO:29
SEQ ID NO:30
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного 2B6 антитела, содержащего тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность . В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного 2B6 антитела, содержащего тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность . Еще в других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного 2B6 антитела, содержащего легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность . В предпочтительном варианте осуществления данное изобретение включает в себя проектирование гуманизированного 2B6 антитела, включающего тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность , и легкую цепь, содержащую последовательность . В специфическом аспекте настоящего изобретения данное изобретение включает в себя применение плазмиды pMGx0675, которая включает нуклеотидные последовательности  и  которые кодируют аминокислотную последовательность тяжелой цепи  и аминокислотную последовательность легкой цепи , соответственно. Плазмида pMGx0675 была передана на хранение в Американскую коллекцию типовых культур (10801 University Boulevard, Manassas, VA. 20110-2209) 23 мая 2006 г. по постановлению Будапештского договора о международном признании депонирования микроорганизмов для целей патентной процедуры и получила инвентарный номер PTA 7609, и включается в данный документ ссылкой.
SEQ ID NO:15
SEQ ID NO:16
SEQ ID NO:2
SEQ ID NO:3
SEQ ID NO:17
SEQ ID NO:18
SEQ ID NO:2
SEQ ID NO:3
SEQ ID NO:19
SEQ ID NO:20
SEQ ID NO:2
SEQ ID NO:3
SEQ ID NO:21
SEQ ID NO:22
SEQ ID NO:8
SEQ ID NO:23
SEQ ID NO:24
SEQ ID NO:25
SEQ ID NO:26
SEQ ID NO:62
SEQ ID NO:27
SEQ ID NO:28
SEQ ID NO:8
В специфических вариантах осуществления данное изобретение включает в себя проектирование антител, предпочтительно гуманизированных, которые связывают внеклеточный домен нативного FcγRIIB человека. Гуманизированные анти-FcγRIIB антитела, охваченные данным изобретением, могут иметь вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CDR1 (, , аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 31-35, как предусмотрено в , или аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 31-35, как предусмотрено в ), и/или CDR2 (, , аминокислотная последовательность соответствующую аминокислотам 50-66, как предусмотрено в , или аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 50-66, как предусмотрено в ), и/или CDR3 (, , аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 100-111, как предусмотрено в , или аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 100-111, как предусмотрено в ), и/или вариабельный участок легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CDR1 (, , или аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 24-34, как предусмотрено в ), и/или CDR2 (, , , , или аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 50-56, как предусмотрено в ), и/или CDR3 (, , или аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотам 90-98, как предусмотрено в ).
В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 2B6 антитело, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 2B6 антитело, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 2B6 антитело, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 2B6 антитело, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя 2B6 антитело, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя 2B6 антитело, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
ниже
В специфическом варианте осуществления модификация анти-FcγRIIB антитела может также уменьшать аффинность Fc-участка для FcγRIIB по отношению к дикому типу антитела. В еще одном специфическом варианте осуществления спроектированное анти-FcγRIIB антитело может также иметь повышенную эффекторную функцию, как было определено с помощью стандартных испытаний, известных в данном уровне техники, и раскрыто и подтверждено примером в данном документе. В специфическом варианте осуществления анти-FcγRIIB моноклональное антитело содержит модификацию в положении 334 на глутаминовую кислоту, в положении 359 на аспарагин и в положении 366 на серин (MgFc13); или замещение в положении 316 на аспарагиновую кислоту, в положении 378 на валин и в положении 399 на глутаминовую кислоту (MgFc27); или замещение в положении 243 на изолейцин, в положении 379 на лейцин и в положении 420 на валин (MgFc29); или замещение в положении 392 на треонин и в положении 396 на лейцин (MgFc38); или замещение в положении 221 на глутаминовую кислоту, в положении 270 на глутаминовую кислоту, в положении 308 на аланин, в положении 311 на гистидин, в положении 396 на лейцин и в положении 402 на аспарагиновую (MgFc42); или замещение в положении 410 на гистидин и в положении 396 на лейцин (MgFc53); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 305 на изолейцин, в положении 378 на аспарагиновую кислоту, в положении 404 на серин и в положении 396 на лейцин (MgFc54); или замещение в положении 255 на изолейцин и в положении 396 на лейцин (MgFc55); или замещение в положении 370 на глутаминовую кислоту и в положении 396 на лейцин (MgFc59); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин (MgFc88); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин и в положении 396 на лейцин (MgFc88A); или замещение в положении 234 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин (MgFc155); или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин; или замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 396 на лейцин; или замещение в положении 243 на лейцин и в положении 292 на пролин; или замещение в положении 243 на лейцин; или замещение в положении 273 на фенилаланин; или замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В родственном варианте осуществления вариантный Fc-участок дополнительно содержит одну или несколько аминокислотных модификаций, раскрытых в таблицах 4, 5, 9, и 10 .
например
В специфических вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с CD79a или CD79b (, химерное, гуманизированное), содержащее вариантный Fc-участок, и применение антитела для лечения раковой опухоли. В специфических вариантах осуществления антитело, которое связывается с CD79b или CD79b, имеет замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с CD79a или CD79b, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с CD79a или CD79b рецепторами, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с CD79a или CD79b, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с CD79a или CD79b, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с CD79a или CD79b, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
например
В специфических вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с ErbB1 (, химерное, гуманизированное), содержащее вариантный Fc-участок, и применение антитела для лечения раковой опухоли. В специфических вариантах осуществления антитело, которое связывается с ErbB1, имеет замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с ErbB1, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с ErbB1 рецептором, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с ErbB1, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с ErbB1, содержащее вариантный Fc-участок, имеющего замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывается с ErbB1, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
например
В специфических вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD103, CTLA4, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-a рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор (, химерное, гуманизированное), содержащее вариантный Fc-участок, и применение антитела для лечения раковой опухоли. В специфических вариантах осуществления антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD103, CTLA4, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, имеет замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин, в положении 300 на лейцин, в положении 305 на изолейцин и в положении 396 на лейцин. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD103, CTLA4, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD103, CTLA4, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 243 на лейцин, в положении 292 на пролин и в положении 300 на лейцин. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD103, CTLA4, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD103, CTLA4, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, содержащее вариантный Fc-участок, имеющий замещение в положении 247 на лейцин, в положении 270 на глутаминовую кислоту и в положении 421 на лизин. В другом варианте осуществления данное изобретение включает в себя антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD103, CTLA4, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
Данное изобретение также включает полинуклеотиды, которые кодируют молекулу настоящего изобретения, включая полипептиды и антитела, идентифицированные способами настоящего изобретения. Полинуклеотиды, кодирующие молекулы настоящего изобретения могут быть получены, и нуклеотидная последовательность полинуклеотидов определена посредством любого способа, известного в данном уровне техники. Данное изобретение относится к выделенной нуклеиновой кислоте, кодирующей молекулу настоящего изобретения. Данное изобретение также обеспечивает вектор, содержащий указанную нуклеиновую кислоту. Данное изобретение также обеспечивает клетки-хозяева, содержащие векторы или полинуклеотиды настоящего изобретения.
Данное изобретение также обеспечивает способы продуцирования молекул настоящего изобретения. Молекулы настоящего изобретения, включающие полипептиды и антитела, могут быть продуцированы посредством любого способа, известного специалистам в данной области техники, в частности, посредством рекомбинантной экспрессии. В специфическом варианте осуществления данное изобретение относится к способу для рекомбинантного продуцирования молекулы настоящего изобретения, указанный способ включает в себя: (i) культивирование в среде клетки-хозяина, содержащую нуклеиновую кислоту, кодирующую указанную молекулу, при условиях подходящих для экспрессии указанной молекулы; и (ii) извлечение указанной молекулы из указанной среды.
например
например
Молекулы, идентифицированные в соответствии со способами настоящего изобретения, полезны в профилактике, лечении или улучшении одного или нескольких симптомов, связанных с заболеванием, нарушением или инфекцией. Молекулы настоящего изобретения особенно полезны для лечения или предотвращения заболевания или нарушения, где повышенная эффективность эффекторной клеточной функции (, ADCC), опосредованной с помощью FcγR, желательна, , раковая опухоль, инфекционное заболевание, и в повышении терапевтической эффективности терапевтических антител, эффект которых опосредуется с помощью ADCC.
В одном варианте осуществления данное изобретение включает в себя способ лечения раковой опухоли у пациента, имеющего раковую опухоль, характеризуемую с помощью ракового антигена, указанный способ включает в себя применение терапевтически эффективного количества терапевтического антитела, которое связывает антиген раковой опухоли, которое было спроектировано в соответствии со способами настоящего изобретения. В специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя способ лечения раковой опухоли у пациента, имеющего раковую опухоль, характеризуемую с помощью антигена раковой опухоли, указанный способ включает в себя применение терапевтически эффективного количества терапевтического антитела, которое специфически связывает указанный раковый антиген, указанное терапевтическое антитело включает в себя вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка так, что указанное терапевтическое антитело специфически связывает FcγRIIIA через свой Fc-участок с большей аффинностью, чем терапевтическое антитело, содержащее дикий тип Fc-участка, связывает FcγRIIIA, обеспечивая то, что указанный вариантный Fc-участок не имеет замещения в положениях 329, 331 или 332, и не имеет аланина в любом из положений 256, 290, 298, 312, 333, 334, 359, 360 или 430; лизина в положении 330; треонина в положении 339; метионина в положении 320; серина в положении 326; аспарагина в положении 326; аспарагиновой кислоты в положении 326; глутаминовой кислоты в положении 326; глутамина в положении 334; глутаминовой кислоты в положении 334; метионина в положении 334; гистидина в положении 334; валина в положении 334; или лейцина в положении 334. В еще одном специфическом варианте осуществления данное изобретение включает в себя способ лечения раковой опухоли у пациента, имеющего раковую опухоль, характеризуемую с помощью антигена раковой опухоли, указанный способ включает введение терапевтически эффективного количества терапевтического антитела, которое специфически связывает антиген раковой опухоли, указанное терапевтическое антитело включает вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок включает по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка так, что указанное терапевтическое антитело специфически связывает FcγRIIIA через свой Fc-участок с большей аффинностью, чем терапевтическое антитело, включающее дикий тип Fc-участка, связывает FcγRIIIA, и указанное терапевтическое антитело также специфически связывает FcγRIIB с более низкой аффинностью, чем терапевтическое антитело, включающее в себя дикий тип Fc-участка, связывает FcγRIIB, обеспечивая то, что указанный вариантный Fc-участок не имеет аланина в любом из положений 256, 298, 333 или 334. Данное изобретение включает способ лечения раковой опухоли у пациента, характеризуемой с помощью антигена раковой опухоли, указанный способ включает в себя применение терапевтически эффективного количества терапевтического антитела, которое специфически связывает антиген указанной раковой опухоли и указанное терапевтическое антитело, включающее вариантный Fc-участок так, что антитело имеет повышенную ADCC активность.
например
например
Данное изобретение включает способ лечении аутоиммунного нарушения и/или воспалительного нарушения у пациента, который в этом нуждается, указанный способ  включает применение указанным пациентом терапевтически эффективного количества молекулы, включающей вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок включает в себя по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по отношению к дикому типу Fc-участка так, что указанная молекула специфически связывает FcγRIIB через его Fc-участок с большей аффинность, чем сравнительная молекула, включающая в себя дикий тип Fc-участка, и указанная молекула также специфически связывает FcγRIIIA через его Fc-участок с более низкой аффинностью, чем сравнительная молекула, включающая в себя дикий тип Fc-участка, и указанная молекула связывает иммунный комплекс (, комплекс антиген/антитело). Данное изобретение включает способ лечения аутоиммунного нарушения и/или воспалительного нарушения, дополнительно включающий применение одного или нескольких дополнительных профилактических или терапевтических средств, , иммуномодуляторных средств, противовоспалительных средств, применяемых для лечения и/или предотвращения таких заболеваний.
Данное изобретение также включает способы лечения или предотвращения инфекционного заболевания у субъекта, включающие применение терапевтически или профилактически эффективного количества одной или нескольких молекул настоящего изобретения, которые связывают инфекционный агент или его клеточный рецептор. Инфекционные заболевания, которые можно лечить или предотвращать с помощью молекул настоящего изобретения, вызываются посредством инфекционных агентов, включая без ограничения вирусы, бактерии, грибы, простейшие и вирусы.
например
В соответствии с одним аспектом настоящего изобретения молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантные Fc-участки, имеют повышенную эффекторную функцию антитела в отношении инфекционных агентов, , патогенного белка, по отношению к сравнительной молекуле, содержащей дикий тип Fc-участка. В специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения увеличивают эффективность лечения инфекционного заболевания посредством увеличения фагоцитоза и/или опсонизации инфекционного агента, вызывающего инфекционное заболевание. В еще одном специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения увеличивают эффективность лечения инфекционного заболевания посредством увеличения ADCC инфицированных клеток, вызывающих инфекционное заболевание.
В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения могут применяться в комбинации с терапевтически или профилактически эффективным количеством одного или дополнительных терапевтических средств, известных специалистам в данной области техники для лечения и/или предотвращения инфекционного заболевания. Данное изобретение предусматривает применение молекул настоящего изобретения в комбинации с антибиотиками, известными специалистам в данной области техники для лечения и/или предотвращения инфекционного заболевания.
например
Данное изобретение предлагает фармацевтические композиции, содержащие молекулу настоящего изобретения, , полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, иммуноглобулин, содержащий вариантный Fc-участок, терапевтическое антитело, спроектированное в соответствии с данным изобретением, и фармацевтически приемлемый носитель. Данное изобретение дополнительно обеспечивает фармацевтические композиции, дополнительно содержащие одно или несколько дополнительных терапевтических средств, включая без ограничения, противораковые средства, противовоспалительные средства, иммуномодуляторные средства.
4.1
ОПРЕДЕЛЕНИЯ
Как используется в данном документе, выражение «Fc-участок» применяется для определения С-терминального участка тяжелой цепи IgG. Хотя границы могут незначительно отличаться, определено, что Fc-участок тяжелой цепи IgG человека простирается от Cys226 до карбокси-конца. Fc-участок IgG содержит два константных домена, CH2 и CH3. CH2 домен Fc-участка IgG человека (также называемый «Cγ2» домен) обычно простирается от аминокислоты 231 до аминокислоты 338. CH3 домен Fc-участка IgG человека обычно простирается от аминокислот 342 до 447. CH2 домен уникален в том, что он не находится тесно в паре с другим доменом. Скорее всего, две N-связанные разветвленные углеводные цепи вставлены между двумя СН2 доменами интактного нативного IgG.
et al.,
Sequences of Proteins of Immunological Interest
th
Во всем данном описании нумерация остатков тяжелой цепи в IgG представлена нумерацией согласно индексу EU, как представелено в Kabat , 5 Ed. Public Health Service, NH1, MD (1991), прямо включенной в данный документ ссылками. «Индекс EU согласно Кабат» относится к нумерации человеческого антитела IgG1 EU.
«Шарнирный участок» в общем определяется как отрезок от Glu216 до Pro230 IgG1 человека. Шарнирные участки других изотипов IgG могут соответствовать последовательности IgG1 посредством размещения первого и последнего цистеиновых остатков, формирующих S-S связи между тяжелыми цепями в тех же самых положениях.
например
т.е.
например
например
1
2
3
4
1
2
Как используется в данном документе, термины «антитело» и «антитела» относятся к моноклональным антителам, многоспецифическим антителам, антителам человека, гуманизированным антителам, синтетическим антителам, химерным антителам, поликлональным антителам, верблюжьим антителам, одноцепочечным Fv (scFv), одноцепочечным антителам, Fab фрагментам, F(ab') фрагментам, дисульфидно-связанным биспецифическим Fv (sdFv), интраантителам и антиидиотипическим (анти-Id) антителам (включая, , анти-Id и анти-анти-Id антитела к антителам настоящего изобретения), и эпитоп-связывающим фрагментам любого из вышеуказанного. В частности, антитела включают иммуноглобулиновые молекулы и иммуннологически активные фрагменты иммуноглобулиных молекул,  молекул, которые содержат антиген-связывающий сайт. Иммуноглобулиновые молекулы могут быть любого типа (, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA и IgY), класса (, IgG, IgG, IgG, IgG, IgA и IgA) или подкласса.
Активирующий
Ингибирующий
Как используется в данном документе, термин «вариантный Fc-участок» предназначен для обозначения Fc-участка, который был модифицирован посредством замещения, вставки или делеции одного или нескольких аминокислотных остатков по отношению к Fc-участку немодифицированной молекулы (т.е. “дикого типа” иммуноглобулина). Данное изобретение относится к молекулам, которые обладают Fc-участками, имеющими измененное соотношение аффинностей для FcγR, который активирует клеточную эффекторную функцию (т.е. “FcγR,” такой как FcγRIIA или FcγRIIIA) по отношению к FcγR, который ингибирует клеточную эффекторную функцию (т.е. “FcγR”, такой как FcγRIIB):
активирующий
Изменение в аффинности к FcγR варианта по отношению к дикому типу
Соотношение аффиностей =
ингибирующий
Изменение в аффинности к FcγR варианта по отношению к дикому типу
Активирующий
Активирующий
FcγRIIIA
FcγRIIIA
Ингибирующий
Ингибирующий
FcγRIIB
FcγRIIB
Активирующий
Ингибирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирование
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Ингибирующий
Активирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Активирующий
Ингибирующий
Ингибирующий
Активирующий
Активирующий
Ингибирование
Таким образом, для любой конкретной молекулы, имеющей вариантный Fc-участок, молекулярное соотношение аффинностей определяется посредством расчета разницы в аффинности вариантного Fc-участка молекулы к FcγR (например, к FcγRIIA или к FcγRIIIA) по отношению к аффинности дикого типа иммуноглобулина к указанному FcγR (например, аффинность вариантного Fc-участка - Аффинность дикого типа иммуноглобулина), и деления такой разницы на разницу в аффинности к FcγR (например, FcγRIIB) вариантного Fc-участка молекулы по отношению к аффинности дикого типа иммуноглобулина к указанному FcγR (например, Аффинность вариантного Fc-участка - Аффинность дикого типа иммуноглобулина). Увеличенное соотношение аффинностей может быть результатом того, что Fc-участок молекулы, имеющий (по отношению к дикому типу Fc) увеличение аффинности к FcγR (например, к FcγRIIA или к FcγRIIIA), сопряженное либо с неизмененной аффинностью с FcγR (например, FcγRIIB), или уменьшением аффинности к указанному FcγR. В соответствии с другим вариантом увеличенное соотношение аффинностей может вытекать из проявления Fc-участоком такой молекулы увеличения аффинности как к FcγR, так и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что увеличение аффинности к FcγR превышает увеличение аффинности к FcγR (т.е. связывание с FcγRявляется «значительно» увеличенным по сравнению со связыванием с FcγR, которое является просто увеличеннным), или могут вытекать из проявления Fc-участком такой молекулы сниженной аффинности как к FcγR, так и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что уменьшение аффинности к FcγR является меньшим, чем снижение аффинности к FcγR (т.е. связывание с FcγRявляется «значительно» сниженным по сравнению со связыванием с FcγR, которое является просто сниженным), или могут быть результатом неизмененной аффинности к FcγR сопряженное с уменьшением аффинности к FcγR. Уменьшенное соотношение аффинностей может быть результатом того, что Fc-участок молекулы имеет (по отношению к дикому типу Fc) уменьшение аффинности к FcγR, сопряженое либо с неизмененной аффинностью с FcγR, или с увеличением аффинности к FcγR. В соответствии с другим вариантом уменьшенное соотношение аффинностей может вытекать из проявления Fc-участком такой молекулы уменьшения аффинности как к FcγR, так и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что уменьшение аффинности к FcγR превышает снижение аффинности к FcγR (т.е. связывание с FcγR является «значительно» сниженным по сравнению со связыванием с FcγR, которое является просто сниженным), или может вытекать из проявления Fc-участком такой молекулы увеличенной аффинности как к FcγR, так и FcγR (по отношению к дикому типу Fc), обеспеченное тем, что увеличение аффинности к FcγR является меньшим, чем увеличение аффинности к FcγR (т.е. связывание с FcγR является «значительно» увеличенным по сравнению со связыванием с FcγR, которое является просто увеличенным), или могут быть результатом неизмененной аффинности к FcγR, сопряженной с увеличением аффинности к FcγR.
т.е.
например
и т.п.
и т.п.
Как используется в данном документе, выражение «производное» в контексте полипептидов или белков относится к полипептиду или белку, который содержит аминокислотную последовательность, которая была изменена посредством введения замещений аминокислотного остатка, делеций или добавлений. Выражение «производное» , как используется в данном документе, также относится к полипептиду или белку, который был модифицирован,  посредством ковалентного прикрепления любого типа молекулы к полипептиду или белку. Например, но не путем ограничения, антитело может быть модифицировано,, посредством гликозилирования, ацетилирования, пегилирования, фосфорилирования, амидирования, дериватизаци с помощью известных защищающих/блокирующих групп, протеолитического отщепления, связывания с клеточным лигандом или другим белком  Производный полипептид или белок могут продуцироваться посредством химических модификаций, используя методы, известные специалистам в данной области, включая без ограничения специфическое химическое отщепление, ацетилирование, формилирование, метаболический синтез туникамицина Также, производный полипептид или белковое производное обладают похожей или идентичной функцией как полипептид или белок, из которого он был произведен.
например
Как используется в данном документе, выражение «производное» в контексте небелковоподобного производного относится ко второй органической или неорганической молекуле, которая формируется на основе структуры первой органической или неорганической молекулы. Производное органической молекулы включает без ограничения молекулу модифицированную, , посредством добавления или удаления гидроксильной, метильной, этиловой, карбоксильной или аминовой группы. Оганическая молекула может быть также эстерифицированной, алкилированной и/или фосфорилированной.
Как используется в данном документе, термины «нарушение» и «заболевание» обычно взаимозаменяемо относятся к условию у субъекта. В частности, выражение «аутоиммунное заболевание» обычно взаимозаменяемо с выражением «аутоиммунное нарушение» относится к условию у субъекта, характеризуемому клеточным, тканевым и/или органным повреждением, вызванным посредством иммунологической реакции субъекта на свои собственные клетки, ткани и/или органы. Выражение «воспалительное заболевание» обычно взаимозаменяемо с выражением «воспалительное нарушение» относится к условию у субъекта, характеризуемому воспалением, предпочтительно хроническим воспалением. Аутоиммунные расстройства могут быть или могут не быть вызваны воспалением. Более того, воспаление может быть или может не быть вызвано аутоиммунным нарушением. Таким образом, определенные расстройства могут быть охарактеризованы и как аутоиммунные, и как воспалительные расстройства.
Как используется в данном документе, выражение «раковая опухоль»относится к новообразованию или опухоли, вызванной ненормальным неконтролируемым ростом клеток. Как используется в данном документе, раковая опухоль четко включает лейкемии и лимфомы. В некоторых вариантах осуществления раковая опухоль относится к доброкачественной опухоли, которая оставалась локальной. В других вариантах осуществления, раковая опухоль относится к злокачественной опухоли, которая вторгалась и разрушала соседствующие структуры тела и распространялась на удаленные сайты. В некоторых вариантах осуществления раковая опухоль ассоциирована со специфическим антигеном раковой опухоли.
Как используется в данном документе, выражение «иммуномодуляторное средство» и вариации такового относятся к средству, которое модулирует хозяйскую иммунную систему. В определенных вариантах осуществения иммуномодуляторное средство представлено иммунодепрессантным средством. В определенных других вариантах осуществления иммуномодуляторное средство представлено иммуностимуляторным средством. Иммуномодуляторные агенты включают без ограничения малые молекулы, пептиды, полипептиды, слитые белки, антитела, неорганические молекулы, миметические агенты и органические молекулы.
Как используется в данном документе, выражение «эпитоп» относится к фрагменту полипептида или белка или небелковой молекулы, имеющему антигенную или иммуногенную активность у животного, предпочтительно у млекопитающего, и наиболее предпочтительно у человека. Эпитоп, имеющий иммуногенную активность, является фрагментом полипептида или белка, который вызывает ответ антителом у животного. Эпитоп, имеющий антигенную активность, является фрагментом полипептида или белка, с которым антитело иммуноспецифически связывается, как определено с помощью любого способа, хорошо известного специалисту в данной области, например посредством иммуноиспытаний. Не требуется, чтобы антигеннные эпитопы были обязательно иммуногенными.
Как используется в данном документе, выражение «фрагмент» относится к пептиду или полипептиду, содержащему аминокислотную последовательность, по меньшей мере 5 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 10 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 15 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 20 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 25 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 40 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 50 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 60 смежных амино остатков, по меньшей мере 70 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 80 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 90 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 100 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 125 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 150 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 175 смежных аминокислотых остатков, по меньшей мере 200 смежных аминокислотых остатков или по меньшей мере 250 смежных аминокислотых остатков аминокислотной последовательности другого полипептида. В специфическом варианте осуществления фрагмент полипептида сохраняет по меньшей мере одну функцию полипептида.
например
например
Как используется в данном документе, термины «нуклеиновые кислоты» и «нуклеотидные последовательности» включают ДНК молекулы (, кДНК или геномную ДНК), РНК молекулы (, мРНК), комбинации ДНК и РНК молекул или гибридные ДНК/РНК молекулы, и аналоги ДНК или РНК молекул. Такие аналоги могут быть образованы с использованием, например, нуклеотидных аналогов, которые включают без ограничения инозин или тритилированные основания. Такие аналоги могут также содержать ДНК или РНК молекулы, содержащие модифицированные каркасы, которые предоставляют полезные качества молекулам, такие как, например, устойчивость к нуклеазе или увеличенную способность пересекать клеточные мембраны. Нуклеиновые кислоты или нуклеотидные последовательности могут быть однонитевыми, двухнитевыми, могут содержать как однонитевые, так и двухнитевые части, и могут содержать трехнитевые части, но предпочтительно представлены двухнитевыми ДНК.
.
например
Как используется в данном документе, «терапевтически эффективное количество» относится к такому количеству терапевтического средства, достаточному, чтобы лечить или оказывать помощь при заболевании или нарушении Терапевтически эффективное количество может относиться к количеству терапевтического средства, достаточному для приостановления или минимизации начала заболевания, , для приостановления или минимизации распространения раковой опухоли. Терапевтически эффективное количество может также относиться к количеству терапевтического средства, которое обеспечивает терапевтическую пользу в лечении или оказаниии помощи при заболевании. Также, терапевтически эффективное количество по отношению к терапевтическому средству настоящего изобретения означает количество терапевтического средства самого по себе, или в комбинации с другими терапиями, что обеспечивает терапевтическую пользу в лечении или оказании помощи при заболевании.
Как используется в данном документе, термины «профилактическое средство» и «профилактические средства» относятся к любому средству(ам), которые могут использоваться для предотвращения нарушения, или предотвращения рецидива или распространения нарушения. Профилактически эффективное количество может относиться к количеству профилактического средства, достаточному для предотвращения рецедива или распространения гиперпролиферативного заболевания, особенно раковой опухоли, или случая такового у пациента, включая без ограничения предрасположенного к гиперпролиферативному заболеванию, например, такого, который генетически предрасположен к злокачественной опухоли или ранее подвергался действию карциногенов. Профилактически эффективное количество может также относиться к количеству профилактического средства, которое обеспечивает профилактическую пользу для предотвращения заболевания. Также, профилактически эффективное количество по отношению к профилактическому средству настоящего изобретения означает количество профилактического средства самого по себе, или в комбинации с другими средствами, которое обеспечивает профилактическую пользу в предотвращении заболевания.
Как используется в данном документе, термины «предотвращать», «предотвращающий» и «предотвращение» относятся к предотвращению рецидива или начала одного или нескольких симптомов нарушения у субъекта как результату введения профилактического или терапевтического средства.
например
например
Как используется в данном документе, выражение «в комбинации» относится к применению более чем одного профилактического и/или терапевтического средства. Применение выражения «в комбинации» не ограничивает порядок, в котором профилактические и/или терапевтическое средства применяются у субъекта с нарушением. Первое профилактическое или терапевтическое средство может применяться перед (, 5 минут, 15 минут, 30 минут, 45 минут, 1 час, 2 часа, 4 часа, 6 часов, 12 часов, 24 часа, 48 часов, 72 часа, 96 часов, 1неделю, 2 недели, 3 недели, 4 недели, 5 недель, 6 недель, 8 недель, или 12 недель перед), одновременно с или последовательно с (, 5 минут, 15 минут, 30 минут, 45 минут, 1час, 2ч аса, 4 часа, 6 часов, 12 часов, 24 часа, 48 часов, 72 часа, 96 часов, 1 неделю, 2 недели, 3 недели, 4 недели, 5 недель, 6 недель, 8 недель, или 12 недель после) введением второго профилактического или терапевтического средства субъекту с нарушением.
«Эффекторная функция», как используется в данном документе, обозначает биохимическое событие, которое вытекает из взаимодействия Fc-участка антитела с Fc-рецептором или лигандом. Эффекторные функции включают без ограничения антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC), антитело-зависимый клеточно-опосредованный фагоцитоз (ADCP) и комплемент-зависимую цитотоксичность (CDC). Эффекторные функции включают как те, что осуществляются после связывания антигена, так и те, что осуществляются независимо от связывания антигена.
«Эффекторная клетка», как используется в данном документе, обозначает клетку иммунной системы, которая экспрессирует один или несколько Fc-рецепторов и опосредует одну или несколько эффекторных функций. Эффекторные клетки включают без ограничения моноциты, макрофаги, нейтрофилы, дендритные клетки, эозинофилы, тучные клетки, тромбоциты, B-клетки, большие гранулярные лимфоциты, клетки Лангерганса, натуральные клетки-киллеры (NK), и могут быть из любого организма, включая без ограничения людей, мышей, крыс, кроликов и обезьян.
«Fc-лиганд», как используется в данном документе, обозначает молекулу, предпочтительно полипептид, из любого организма, который связывается с Fc-участком антитела для образования комплекса Fc-лиганда. Fc-лиганды включают без ограничения FcγRs, FcγRs, FcγRs, FcRn, C1q, C3, стафилококковый белок A, стрептококковый белок G и вирусный FcγR. Fc-лиганды могут включать неоткрытые молекулы, которые связывают Fc.
5.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ
<b>ФИГ. 1.</b>
<b>ПОРЯДОК ПРИНЯТИЯ РЕШЕНИЯ ДЛЯ ВЫБОРА Fc-МУТАНТОВ</b>
Пример протокола для выбора Fc мутантов.
<b>ФИГ. 2.</b>
<b>СХЕМА ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 8B5.3.4 ВАРИАБИЛЬНОГО ДОМЕНА ТЯЖЕЛОЙ ЦЕПИ </b>
Описание 8B5.3.4 VH нуклеотида и аминокислотной последовательности (SEQ ID NOS:12 и 9, соответственно).
<b>ФИГ. 3. </b>
<b>СХЕМА ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ 8B5.3.4 ВАРИАБИЛЬНОГО ДОМЕНА ЛЕГКОЙ ЦЕПИ </b>
Описание 8B5.3.4 VL нуклеотида и аминокислотной последовательности (SEQ ID NOS:11 и 10, соответственно).
<b>ФИГ. 4.</b>
<b>ЗАХВАТ CH 4-4-20 АНТИТЕЛА НА BSA-FITC ПОВЕРХНОСТИ</b>
6 мкл антитела при концентрации приблизительно 20 мкг/мл было введно при 5 мл/мин на поверхность BSA-флуоресцеин-изотиоцианата (FITC). Показана BIAcore сенсограмма связывания ch 4-4-20 антител с мутантом Fc-участков на поверхности BSA-FITC иммобилизованного первичного преобразователя. Маркер был установлен на ответ дикого типа захваченного антитела.
<b>ФИГ. 5.</b>
<b>СЕНСОГРАММА В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ СВЯЗЫВАНИЯ FcγRIIIA С CH 4-4-20 АНТИТЕЛАМИ, НЕСУЩИМИ ВАРИАНТНЫЕ Fc-УЧАСТКИ</b>
Связывание FcγRIIIA с ch-4-4-20 антителами, несущими вариантные Fc-участки, были проанализированы при 200 нМ концентрации. Ответы были нормализованы к уровню ch-4-4-20 антитела, полученому для дикого типа.
Применяемые мутанты были следующими: Mut 6 (S219V), Mut 10 (P396L, A330S, K288N); Mut 18 (K326E); Mut 14 (K334E, K288N); Mut 11 (R255L, F243L); Mut 16 (F372Y); Mut 19 (K334N, K246I).
<b>ФИГ. 6 A-H.</b>
<b>АНАЛИЗ КИНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ СВЯЗЫВАНИЯ FcγRIIIA С АНТИТЕЛАМИ, НЕСУЩИМИ ВАРИАНТНЫЕ Fc-УЧАСТКИ</b>
off
d
off
Кинетические параметры для связывания FcγRIIIA с антителами, несущими вариантные Fc-участки, были получены путем создания отдельных лучших сглаживаний кривых для 200 нМ и 800 нМ. Сплошная линия указывает на связанное сглаживание, которое было получено на основе значений k, рассчитанных для кривых диссоциации в интервале 32-34 сек. Значения K и k представляют среднюю величину двух концентраций.
<b>ФИГ. 7.</b>
<b>СЕНСОГРАММА В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ СВЯЗЫВАНИЯ FcγRIIB-Fc СЛИТЫХ БЕЛКОВ С АНТИТЕЛАМИ, НЕСУЩИМИ ВАРИАНТНЫЕ Fc-УЧАСТКИ </b>
Связывание FcγRIIB-Fc слитых белков с ch-4-4-20 антителами, несущими вариантные Fc-участки, были проанализированы при 200 нМ концентрации. Ответы были нормализованы к уровню ch-4-4-20 антитела, полученному для дикого типа.
<b>ФИГ. 8 A-C.</b>
<b>АНАЛИЗ КИНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ FcγRIIB-Fc СЛИТЫХ БЕЛКОВ С АНТИТЕЛАМИ, НЕСУЩИМИ ВАРИАНТНЫЕ Fc-УЧАСТКИ </b>
off
d
off
Кинетические параметры для связывания FcγRIIB-Fc с антителами, несущими вариантные Fc-участки, были получены посредством создания отдельных лучших сглаживаний кривых для 200 нМ и 800 нМ. Сплошная линия указывает на связанное сглаживание, которое было получено на основе значений k, рассчитанных для кривых диссоциации в 32-34 сек интервале. Значения K и k представляют среднюю величину двух концентраций.
Применяемые мутанты были следующими: Mut 6 (S219V), Mut 10 (P396L, A330S, K288N); Mut 18 (K326E); Mut 14 (K334E, K288N); Mut 11 (R255L, F243L); Mut 16 (F372Y); Mut 19 (K334N, K246I).
<b>ФИГ. 9.</b>
<b>СООТНОШЕНИЯ K</b><sub>off</sub><b> (WT)/K</b><sub>off</sub><b> (MUT) ДЛЯ FcγRIIIA-Fc В ЗАВИСИМОСТИ ОТ ДАННЫХ ADCC </b>
Числа больше, чем один, показывают уменьшенную скорость диссоциации для связывания FcγRIIIA и увеличенную скорость диссоциации для связывания FcγRIIB-Fc относительно дикого типа. Мутанты в прямоугольнике имеют более низкую скорость диссоциации при связывании FcγRIIIA и более высокую скорость диссоциации при связывании FcγRIIB-Fc.
<b>ФИГ. 10.</b>
<b>КОНКУРИРОВАНИЕ С НЕМЕЧЕННЫМ FcγRIIIA</b>
off
Кинетический анализ был выполнен для идентификации мутантов Fc-участка с повышенными уровнями K для связывания FcγRIIIA. Библиотеку вариантных Fc-участков, содержащих P396L мутацию, инкубировали 0,1 мкМ биотинилированным FcγRIIIA-Linker-Avitag в течение одного часа и затем отмывали. Последовательно, 0,8 мкМ немеченного FcγRIIIA инкубировали с мечеными дрожжами в течение различных временных периодов. Дрожжи откручивали и немеченный FcγRIIIA удаляли. Рецептор, связанный с дрожжами, окрашивали с помощью SA (стрептовидин):PE (фикоэритрин) для FACS анализа.
<b>ФИГ. 11 A-C.</b>
<b>FACS АНАЛИЗ НА ОСНОВЕ КИНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА</b>
off
На основе рассчитанного K из данных, представленных на ФИГ. 22, был выбран выбор момента времени в одну минутну. 10-кратное превышение библиотеки инкубировали 0,1 мкМ биотинилированным FcγRIIIA-Linker-Avitag мономером; клетки отмывали и инкубировали с немеченным лигандом в течение одной минуты, затем отмывали и метили с помощью SA:PE. Клетки затем сортировали посредством FACS, отбирая верхние 0,3% связующих веществ. Невыбранную P396L библиотеку сравнивали с дрожжевыми клетками, выбранными для повышенного связывания посредством FACS. Гистограммы показывают процентное соотношение клеток, в которых содержатся как FcγRIIIA/PE, так и козьи анти-человеческие Fc/FITC.
<b>ФИГ. 12 A-B.</b>
<b>ВЫБОР НА ОСНОВЕ ТВЕРДОФАЗНОГО ИСТОЩЕНИЯ СВЯЗУЮЩИХ ВЕЩЕСТВ FcγRIIB Fc </b>
А.
P396L библиотека была проанализирована на основе истощения FcγRIIB и отбора FcγRIIIA с использованием магнитных шариков. Истощение FcγRIIB посредством магнитных шариков повторяли 5 раз. Получаемую популяцию дрожжей проанализировали и обнаружили, что более чем 50% клеток демонстрирует окрашивание козьим анти-человеческим Fc, и очень малое процентное соотношение клеток окрашивалось FcγRIIIA. Затем клетки отбирали дважды посредством FACS с использованием 0,1 мкМ биотинилированного FcγRIIIA-linker-avitag. Дрожжевые клетки анализировали на связывание как FcγRIIIA, так и FcγRIIB после каждой сортировки и сравнивали с диким типом связывания.
B.
Fc-мутантов отбирали из FcγRIIB истощенной дрожжевой популяции с использованием биотинилированного FcγRIIIA 158F linker avitag мономера в качестве лиганда. Интервал отбора устанавливали для отбора верхних 0,25% связующих веществFcγRIIIA 158F. Получающаюся обогащенную популяцию проанализировали посредством FACS на связывание с различными FcγRIIIA (158F и 158V), FcγRIIIB и FcγRIIA (131R).
<b>ФИГ. 13. </b>
<b>ОТНОСИТЕЛЬНЫЕ СКОРОСТИ ЛИЗИСА КЛЕТОК-МИШЕНЕЙ SKBR3, ОПОСРЕДОВАНЫЕ ХИМЕРНЫМИ 4D5 МУТАНТАМИ, СОДЕРЖАЩИМИ FC </b>
Относительные скорости лизиса рассчитывалсь для каждого тестируемого Fc-мутанта. Скорости лизиса для 4D5 антитела с Fc-мутантами были разделены на скорость лизиса, опосредованную диким типом 4D5 антитела. Данные от по меньшей мере 2 независимых тестов были усреднены и изображены на гистограмме. Для каждого Fc-мутанта показаны данные от двух различных концентраций антитела. Концентрации антитела были выбраны для фланкирования точки вдоль кривой, у которой лизис составлял ~50%.
<b>ФИГ. 14.</b>
<b>ОТНОСИТЕЛЬНЫЕ СКОРОСТИ ЛИЗИСА КЛЕТОК DAUDI, ОПОСРЕДОВАНЫЕ ХИМЕРНЫМИ 2H7 МУТАНТАМИ, СОДЕРЖАЩИМИ FC </b>
Относительные скорости лизиса были рассчитаны для каждого тестируемого Fc-мутанта. Скорости лизиса для 2H7 антитела с Fc-мутантами были разделены на скорость лизиса, опосредованную диким типом 2H7 антитела. Данные от по меньшей мере 1-2 независимых тестов были усреднены и изображены на гистограмме. Для каждого Fc-мутанта показаны данные от двух различных концентраций антитела. Концентрации антитела были выбраны на основе точки на кривой, у которой лизис составлял ~50%.
<b>ФИГ. 15, Панели A-E.</b>
<b>ПРОФИЛИ Fc-РЕЦЕПТОРА ПОСРЕДСТВОМ FACS ПРИ ОБРАБОТКЕ ЦИТОКИНОМ МОНОЦИТОВ</b>
Цитокиновая обработка моноцитов увеличивает экспрессию Fc-рецептора с низкой аффинностью. Смытые моноциты культивировали с использованием специфических цитокинов в бессывороточной среде. Профили Fc-рецептора тестировали с использованием FACS.
<b>ФИГ. 16.</b>
<b>УВЕЛИЧЕННОЕ УБИЙСТВО ОПУХОЛОВЫХ КЛЕТОК С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ FC-МУТАНТОВ В МОНОЦИТАХ, ПОЛУЧЕННЫХ ИЗ МАКРОФАГОВ, НА ОСНОВЕ ADCC</b>
Концентрацию Ch4D5 MAb больше 2 logs тестировали с использованием соотношения эффектор:мишень 35:1. Процент лизиса рассчитан как на ФИГ. 30.
<b>ФИГ. 17.</b>
<b>СХЕМА АНАЛИЗА КОМПЛИМЕНТ-ЗАВИСИМОЙ ЦИТОТОКСИЧНОСТИ</b>
Схема суммирует применяемые CDC тесты.
<b>ФИГ. 18.</b>
<b>КОМПЛИМЕНТ-ЗАВИСИМАЯ ЦИТОТОКСИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ</b>
Fc-мутанты, которые показывают повышенное связывание с FcγRIIIA, также показали повышенную активность комплемента. Анти-CD20 ChMAb выше 3 порядков величины титровали. Процент лизиса рассчитывали также как на ФИГ. 30.
<b>ФИГ. 19.</b>
<b>СВЯЗЫВАНИЕ C1q С АНТИТЕЛОМ 2B6</b>
A.
Диаграмма изображает BIAcore формат для анализа связывания 2B6 с первым компонентом комплементного каскада.
B.
Сенсограмма в реальном времени связывания антитела 2B6, несущего вариантные Fc-участки с C1q.
<b>ФИГ. 20 A-D.</b>
<b>СВЯЗЫВАНИЕ C1q С МУТАНТОМ АНТИТЕЛА 2B6</b>
Сенсограмма в реальном времени связывания мутанта антитела 2B6 с C1q (3,25 нМ). Мутанты изображенные на MgFc51 (Q419H, P396L); MgFc51/60 на Панели A; MgFc55 и MgFc55/60 (Панель B), MgFc59 и MgFc59/60 (Панель C); и MgFc31/60 (Панель D).
<b>ФИГ. 21 A-D.</b>
<b>ВАРИАНТЫ Fc СО СНИЖЕНЫМ СВЯЗЫВАНИЕМ С FcγRIIB</b>
D
D,
Связывание FcR с ch4D5 антителами для сравнения эффекта D270E (60) на R255L, P396L двойном мутанте (MgFc55). K проанализировали при различных концентрациях FcR; 400 нМ CD16A 158V; 800 нМ CD16A 158F; 200 нМ CD32B; 200 нМ CD32A 131H. Анализ выполняли с использованием отдельной K с использованием программного обеспечения Biacore 3000.
<b>ФИГ. 22 A-D.</b>
<b>КИНЕТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ МУТАНТОВ 4D5, ВЫБРАННЫХ ИЗ FcγRIIB ИСТОЩЕНИЙ/FcγRIIAH131 ОТБОРА </b>
D
D
Связывание FcR с ch4D5 антителами, несущими различные Fc мутации отобирали посредством CD32B истощения и CD32A H131 скрининговой стратегии. K проанализировали при различных концентрациях FcR; 400 нМ CD16A 158V; 800 нМ CD16A 158F; 200 нМ CD32B; 200 нМ CD32A 131H. Анализ выполняли с использованием отдельной K применяя программное обеспечение Biacore 3000.
<b>ФИГ. 23.</b>
<b>ГРАФИК MDM ADCC ДАННЫХ ОТНОСИТЕЛЬНО K</b><sub>OFF, </sub><b>ОПРЕДЕЛЕННОЙ ДЛЯ СВЯЗЫВАНИЯ CD32A 131H, КАК ОПРЕДЕЛЕНО ПОСРЕДСТВОМ BIACORE</b>
Мутанты представлены следующими: MgFc 25 (E333A, K334A, S298A); MgFc68 (D270E); MgFc38 (K392T, P396L); MgFc55 (R255L, P396L); MgFc31 (P247L, N421K); MgFc59(K370E, P396L).
<b>ФИГ. 24 A-B.</b>
<b>ADCC АКТИВНОСТЬ МУТАНТОВ В ХИМЕРНОМ МОНОКЛОНАЛЬНОМ АНТИТЕЛЕ HER2/NEU</b>
Химерные моноклональные антитела HER2/neu, содержащие мутантные Fc-участки, оценили в двух повторностях на их ADCC активность и сравнили с ADCC активностью дикого типа, химерного Her2/neu антитела. Проанализировали следующие мутанты: MGFc88 (F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L), MGFc88A (F243L, R292P, Y300L, P396L), MGFc155 (F243L, R292P, Y300L).
<b>ФИГ. 25 A-B.</b>
<b>ОЦЕНЕННЫЙ ВЕС ОПУХОЛИ У МЫШЕЙ, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-МУТАНТОМ h2B6</b>
A),
B
2
Balb/c голые мыши были привиты подкожно клетками Daudi и принимали 25 мкг, 2,5 мкг или 0,25 мкг ослабленных доз либо дикого типа h2B6 (илисодержащего Fc h2B6 мутанта MGFc 0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L) (). Мыши, принимавшие только буфер, использовались как контроль. Вес опухоли рассчитывали на основе оцененного объема подкожной опухоли в соответствии с формулой (ширина X длина)/2.
<b>ФИГ. 26 A-B.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ МЫШЕЙ, НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ, ПРИ ЛЕЧЕНИИ ДИКИМ ТИПОМ ИЛИ Fc-МУТАНТОМ h2B6</b>
A),
B
Голые мыши были привиты подкожно клетками Daudi и принимали 25 мкг, 2,5 мкг или 0,25 мкг ослабленных доз либо дикого типа h2B6 (илисодержащего Fc h2B6 мутантаMGFc 0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L) (). Мыши, принимавшие только буфер, использовались как контроль.
<b>ФИГ. 27.</b>
<b>ОЦЕНЕННЫЙ ВЕС ОПУХОЛИ У ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 0088</b>
2
mCD16-/- huCD16A+ RAG1-/- C57BI/6 мыши были привиты подкожно клетками Raji и после двух недель внутрибрюшинно принимали шестинедельно дозы либо только буфера (PBS), или 250 мкг, 25 мкг или 2,5 мкг или дикого типа h2B6 (Rituxan), или h2B6, содержащего мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (MGA321). Вес опухоли рассчитывали на основе оцененного объема подкожной опухоли в соответствии с формулой (ширина X длина)/2. Линии, соответствующие весу опухоли, с течением времени, для каждого индивидуума-мыши тестировали.
<b>ФИГ. 28 A-B. </b>
<b>ОЦЕНЕННЫЙ ВЕС ОПУХОЛИ У ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 0088 </b>
A
B
2
mCD16-/- huCD16A+ RAG1-/- C57BI/6 мыши были привиты подкожно клетками Raji и после трех недель внутрибрюшинно принимали пятинедельные дозы 250 мкг, 25 мкг или 2,5 мкг дикого типа h2B6 (Rituxan “Rituximab”) () или h2B6, содержащего мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (h2B6 0088 “MGA321”) (). Вес опухоли рассчитывали на основе оцененного объема подкожной опухоли в соответствии с формулой (ширина X длина)/2.
<b>ФИГ. 29.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 31/60</b>
mCD16-/- huCD16A+ голые (FoxN1) мыши были внутрибрюшинно привиты EL4-CD32B клетками и внутрибрюшинно принимали в дни 0, 1, 2, 3 и 6 либо дикий тип h2B6 1.3, или h2B6 1.3, содержащий мутант 31/60 (P247L, D270E, N421K) (h2B6 1.3 3160). Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль.
<b>ФИГ. 30.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 31/60 </b>
mCD16-/- huCD16A+ голые (FoxN1) мыши были внутрибрюшинно привиты EL4-CD32B клетками и внутрибрюшинно примимали в дним 0-3 и 6 дозы 10 мкг/г на вес тела либо h2B6, содержащий мутант 31/60 (P247L, D270E, N421K) (h2B6 3160), или дикий тип h2B6.
<b>ФИГ. 31 A-B.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 0088 </b>
A
B
А,
() mCD16-/- huCD16A+ голые (FoxN1 или N/N) мыши были внутрибрюшинно привиты EL4-CD32B клетками и внутрибрюшинно принимали в дни 0-3 дозы либо h2B6 3.5 N297Q (негативный контроль), h2B6 3.5, содержащий мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (h2B6 3.5 0088), или дикий тип h2B6 3.5. Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль (). Мыши, несущие опухоль как в внутрибрюшинно принимали в дни 0-3 и 6 дозы 4 мкг/г веса тела либо PBS, h2B6, содержащий мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (h2B6 0088), или дикий тип h2B6.
<b>ФИГ. 32.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 0088 </b>
mCD16-/- huCD16A+ hCD32A+ голые (FoxN1 или N/N) мыши были внутрибрюшинно привиты EL4-CD32B клетками и внутрибрюшинно принимали в дни 0-3 либо h2B6 3.5 N297Q (негативный контроль), h2B6 содержащий мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (h2B6 3.5 0088), или дикий тип h2B6 3.5. Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль.
<b>ФИГ. 33 A-C.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 0088 </b>
A
B
C
Голые (FoxN1) мыши были внутрибрюшинно привиты EL4-CD32B клетками и внутрибрюшинно принимали в дни 0-3 либо h2B6 3.5 N297Q (негативный контроль), h2B6 содержащий мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (h2B6 3.5 88), или дикий тип h2B6 3.5. Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль. Были исследованы трансгенные линии мышей () mCD16-/- huCD16A+, () mCD16-/- huCD16A+ hCD32A+ и () mCD16-/- hCD32A+.
<b>ФИГ. 34.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ h2B6 0088 ПРИ ВАРЬИРОВАНИИ ИНТЕРВАЛОВ</b>
mCD16-/- huCD16A+ голые (FoxN1 или N/N) мыши были внутрибрюшинно привиты EL4-CD32B клетками и внутрибрюшинно получали лечение h2B6, содержащим мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L) (MGA321), при определенных временных интервалах.
<b>ФИГ. 35 A-B.</b>
<b>ОЦЕНЕННЫЙ ВЕС ОПУХОЛИ У ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ ch4D5 0088 </b>
A
B
2
Голые (FoxN1) мыши с трансгенным генотипом mCD16-/- hCD16A+ () или mCD16-/- hCD16A+ hCD32A+ () были привиты подкожно mSCOV3 клетками и, начиная с дня 0, внутрибрюшинно принимали восьминедельные дозы либо ch4D5 N297Q (негативный контроль) или ch4D5, содержащего мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L) (ch4D5 0088). Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль. Вес опухоли рассчитывали на основе оцененного объема подкожной опухоли в соответствии с формулой (ширина х длина)/2.
<b>ФИГ. 36 A-B.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ ch4D5 0088</b>
A
B
mCD16-/- huCD16A+ голые (N/N) мыши были внутрибрюшинно привиты mSKOV3 клетками и, начиная с дня 0, внутрибрюшинно принимали шестинедельные дозы либо 100 мкг () или 1 мкг (), либо дикого типа ch4D5, ch4D5 N297Q (негативный контроль) или ch4D5, содержащего мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (ch4D5 0088). Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль.
<b>ФИГ. 37 A-B.</b>
<b>ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМИ ВАРИАНТАМИ ch4D5 </b>
A
B
mCD16-/- huCD16A+ голые (N/N) мыши были внутрибрюшинно привиты mSKOV3 клетками и, начиная с дня 0, внутрибрюшинно принимали восьминедельно дозы либо 100 мкг () или 10 мкг (), либо дикого типа ch4D5, ch4D5 N297Q (негативный контроль), ch4D5, содержащего мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (ch4D5 0088), ch4D5 мутант MGFc0155 (F243L, R292P, Y300L) (ch4D5 0155) или ch4D5 мутант MCFc3160 (P247L, D270E, N421K) («ch4D5 3160»). Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль.
<b>ФИГ. 38 A-B.</b>
<b> ВЫЖИВАНИЕ НЕСУЩИХ ОПУХОЛЬ ТРАНСГЕННЫХ МЫШЕЙ, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc-РЕЦЕПТОР, КОТОРЫХ ЛЕЧАТ ДИКИМ </b>Т<b>ИПОМ ИЛИ Fc-ОПТИМИЗИРОВАННЫМ ch4D5 0088 </b>
A
B
Голые (N/N) мыши с трансгенным генотипом mCD16-/- hCD16A+ () или mCD16-/- hCD16A+ hCD32A+ () были внутрибрюшинно привиты mSKOV3 клетками и, начиная с дня 0, внутрибрюшинно принимали восьминедельно дозы либо ch4D5, содержащего мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (ch4D5 0088), или ch4D5 N297Q (негативный контроль). Мыши, принимавшие только буфер (PBS), использовались как контроль.
<b>ФИГ. 39 A-D.</b>
<b>Fc ОПТИМИЗАЦИЯ УВЕЛИЧИВАЕТ ИСТОЩЕНИЕ ОПУХОЛЕВЫХ КЛЕТОК IN VIVO</b>
(A-B) Повышенное уменьшение нагрузки опухоли лечением Fc-спроектированными hu2B6 подкожных ксенотрансплантатов Daudi-клеток у Balb/c FoxN1 (nu/nu) мышей (6-8 мыши/группа). Статистическая значимость между кривыми было определена с помощью Т-теста Стьюдента; WT против MG12, P=0.431; WT против MG4, P = 0,002; MG4 против MG12, P = 0,002. (C-D) Графики выживания Каплана-Мейера mFcγRIII-/- человека CD16A+ FoxN1 мышей с введенными внутрибрюшинно CD32B-EL4 клетками (10 мыши/группа) и получавшими лечение либо WT-Fc hu2B6, или указанными Fc-спроектированными формами hu2B6 (C, 10 мкг/г; D, 4 мкг/г). Данные были проанализированы на значимость с использованием логрангового анализа.
<b>ФИГ. 40.</b>
<b>ГЛИКОЗИЛИРОВАННЫЕ ОБРАЗЦЫ АНТИТЕЛ, ИМЕЮЩИХ ИЗМЕНЕННЫЕ FC-УЧАСТКИ</b>
○
(Панели A-D) показывают результаты исследований в гликозилированных образцах антител настоящего изобретения (изображенное является определяемым сигналом в люменах против времени хроматографического элюирования в минутах). Во всех панелях,  представляет собой GlcNAc;● представляет собой галактозу;  представляет собой маннозу, и Δ представляет собой фруктозу. Панель A показывает распределение N-связанных олигосахаридов, определенных с использованием упомянутой панели антитела. Панели B и C показывают результаты по двум препаратам антитела ch45D4-FcMT2. Панель D является систематическим сводным контролем. Стрелки указывают распределения гликозилированных образцов по пикам; пунктирные стрелки указывают на предполагаемые положения гликозилированных образцов Панели A.
<b>ФИГ. 41.</b>
<b>GlcNAc</b><sub>2</sub><b>Man</b><sub>9</sub><b> (“Man9”) ГЛИКОЗИЛИРОВАННАЯ</b><b>СТРУКТУРА</b>
2
9
2
8
2
7
2
6
2
5
GlcNAcMan (“Man9”) гликозилированая структура. Отщепление маннозных единиц ведет к образованию GlcNAcMan (“Man8”), GlcNAcMan (“Man7”), GlcNAcMan (“Man6”) и GlcNAcMan (“Man5”) структур.
<b>ФИГ. 42.</b>
<b>GlcNAc</b><sub>2</sub><b>Man</b><sub>5</sub><b> (“Man5”) ГЛИКОЗИЛИРОВАННАЯ СТРУКТУРА</b>
2
5
GlcNAcMan (“Man5”) структура обрабатывается посредством успешного действия гликозилтрансферазы для образования “G0F,” “G1F” и “G2F” олигосахаридов.
<b>ФИГ. 43.</b>
<b>ГЛИКОЗИЛИРОВАННАЯ СТРУКТУРА И FcγR СВЯЗЫВАНИЕ FC-ТЕТРА-ВАРИАНТА: F243X, R292P, Y300L, P396L </b>
диссоциации
диссоциации
Фигура показывает эффект изменения отличительной черты остатка, замещенного в положении F243 тетра-варианта (F243X, R292P, Y300L, P396L) на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикого типа / K варианта) Fc-варианта с Fc-рецепторами, CD16A, CD32A и CD32B.
<b>ФИГ. 44.</b>
<b>ГЛИКОЗИЛИРОВАННАЯ СТРУКТУРА И</b><b>FcγR СВЯЗЫВАНИЕ FC-ТЕТРА-ВАРИАНТА: F243L, R292X, Y300L, P396L</b>
диссоциации
диссоциации
Фигура показывает эффект изменения отличительной черты остатка, замещенного в положении R292 тетра-варианта (F243L, R292X, Y300L, P396L) на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикого типа / K варианта) Fc-варианта с Fc-рецепторами, CD16A, CD32A и CD32B.
<b>ФИГ. 45.</b>
<b>ЭФФЕКТ ПРОГРЕССИВНОГО ИЗМЕНЕНИЯ ОСТАТКОВ R292, Y300 И P396 F243C Fc ВАРИАНТА</b>
диссоциации
диссоциации
Фигура показывает эффект прогрессивного изменения отличительной черты остатка, замещенного в положении R292, Y300 и P396 Fc варианта F243C на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикого типа / K варианта) Fc варианта с Fc-рецепторами, CD16A, CD32A и CD32B.
<b>ФИГ. 46.</b>
<b>ЭФФЕКТ ПРОГРЕССИВНОГО ИЗМЕНЕНИЯ ОСТАТКОВ R292, Y300 И P396 F243C Fc-ВАРИАНТА</b>
диссоциации
диссоциации
Фигура показывает эффект прогрессивного изменения отличительной черты остатка, замещенного в положении R292, Y300 и P396 Fc варианта F243L на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикого типа / K варианта) Fc варианта с Fc-рецепторами, CD16A, CD32A и CD32B.
<b>ФИГ. 47.</b>
<b>ЭФФЕКТ ПРОГРЕССИВНОГО ИЗМЕНЕНИЯ ОСТАТКОВ R292, Y300 И P396 F243R Fc ВАРИАНТА</b>
диссоциации
диссоциации
Фигура показывает эффект прогрессивного изменения отличительной черты остатка, замещенного в положении R292, Y300 и P396 Fc варианта F243R на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикого типа / K варианта) Fc варианта с Fc-рецепторами, CD16A, CD32A и CD32B.
<b>ФИГ. 48.</b>
<b>ЭФФЕКТ ПРОГРЕССИВНОГО ИЗМЕНЕНИЯ ОСТАТКОВ R292, Y300 и P396 F243V Fc ВАРИАНТА</b>
диссоциации
диссоциации
Фигура показывает эффект прогрессивного изменения отличительной черты остатка, замещенного в положении R292, Y300 и P396 Fc варианта F243V Fc на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикого типа / K варианта) Fc варианта с Fc-рецепторами, CD16A, CD32A и CD32B.
6.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ
например
например
например
Настоящее изобретение относится к способам лечения злокачественной опухоли или других заболеваний с использованием молекул, предпочтительно полипептидов и более предпочтительно иммуноглобулинов (, антител), содержащих вариантный участок Fc, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замен, но также сюда относятся вставки или делеции) в одном или нескольких участках, которые эти модификации меняют, , увеличивают или уменьшают аффинность участка Fc к FcγR. Увеличение способности иммуноглобулинов опосредовать антитело-зависимую опосредованную клетками цитотоксичность (ADCC), комплемент-зависимую цитотоксичность (CDC) или антитело-зависимый опосредованный клетками фагоцитоз (ADCP) обеспечивает подход к усилению терапевтической активности иммуноглобулинов против злокачественных опухолей и инфекционных заболеваний.
например
например
например
Настоящее изобретение, таким образом, охватывает терапевтические антитела для лечения или предотвращения заболевания или расстройства, или уменьшение интенсивности симптома вследствие этого, там, где желательна усиленная эффективность функции эффекторных клеток (, ADCC), опосредованной FcγR, , злокачественная опухоль или инфекционное заболевание, или где желательно модулирование функции эффекторных клеток, опосредованной FcγR, , аутоиммунные или воспалительные расстройства. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает применение молекул, содержащих участки Fc с аминокислотными модификациями, включая без ограничения любые из модификаций, раскрытые в публикациях патентных заявок США 2005/0037000 и 2005/0064514; и в публикации международной патентной заявки WO 04/063351. Каждая из вышеперечисленных заявок включена в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
Полипептиды настоящего изобретения могут иметь вариантные домены Fc. Модификация домена Fc в норме ведет к измененному фенотипу, например, измененному времени полураспада в сыворотке, измененной стабильности, измененной чувствительности к клеточным ферментам или измененной эффекторной функции. Это может быть желательно для модификации антитела настоящего изобретения в отношении эффекторной функции так, чтобы увеличить эффективность антитела, например, при лечении злокачественной опухоли. Снижение или элиминация эффекторной функции желательны в некоторых случаях, например, в случае антител, чей механизм действия включает блокирование или антагонизм, но не уничтожение клеток, несущих антиген-мишень. Повышенная эффекторная функция обычно желательна, когда направлена на нежелательные клетки, такие как опухолевые и чужеродные клетки, где FcγR экспрессируются на низких уровнях, например, опухоле-специфические B-клетки с низкими уровнями FcγRIIB (например, неходжскинская лимфома, CLL, и лимфома Буркитта). В указанных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения с наделенной или измененной эффекторной функциональной активностью применимы для лечения и/или предотвращения заболевания, расстройства или инфекции, где желательна повышенная эффективность эффекторной функции.
В определенных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения содержат одну или несколько модификаций аминокислот Fc домена, которые снижают аффинность и авидность участка Fc и, таким образом, молекулы настоящего изобретения, для одного или нескольких FcγR-рецепторов. В других вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения содержат одну или несколько модификаций аминокислот участка Fc, которые увеличивают аффинность и авидность участка Fc и, таким образом, молекулы настоящего изобретения, для одного или нескольких FcγR-рецепторов. В других вариантах осуществления молекулы содержат вариант домена Fc, где указанный вариант придает или опосредует повышенную ADCC активность и/или повышенное связывание с FcγRIIA, по сравнению с молекулой, не содержащей домен Fc или содержащей домен Fc дикого типа. В альтернативных вариантах осуществления молекулы содержат вариантный домен Fc, где указанный вариант сообщает или опосредует сниженную ADCC активность (или другую эффекторную функцию) и/или повышенное связывание с FcγRIIB, по сравнению с молекулой, не содержащей домен Fc или содержащей домен Fc дикого типа.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, в которых вариантный участок Fc не обнаруживает определяемого связывания с каким-либо FcγR, по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, в которых вариантный участок Fc связывается только с одним FcγR, предпочтительно одним из FcγRIIA, FcγRIIB или FcγRIIIA.
Полипептиды настоящего изобретения могут содержать измененные аффинности для активирования и/или ингибирования Fcγ-рецептора. В одном варианте осуществления антитело или полипептид содержит вариантный участок Fc, который имеет повышенную аффинность к FcγRIIB и пониженную аффинность к FcγRIIIA и/или FcγRIIA, по сравнению с соответствующей молекулой с Fc-участком дикого типа. В другом варианте осуществления полипептиды настоящего изобретения содержат вариантный участок Fc, который имеет пониженную аффинность к FcγRIIB и повышенную аффинность к FcγRIIIA и/или FcγRIIA по сравнению с соответствующей молекулой с Fc-участком дикого типа. В еще одном варианте осуществления полипептиды настоящего изобретения содержат вариантный участок Fc, который имеет пониженную аффинность к FcγRIIB и пониженную аффинность к FcγRIIIA и/или к FcγRIIA по сравнению с соответствующей молекулой с Fc-участком дикого типа. В еще другом варианте осуществления полипептиды настоящего изобретения содержат вариантный участок Fc, который имеет неизмененную аффинность к FcγRIIB и пониженную (или повышенную) аффинность к FcγRIIIA и/или к FcγRIIA, по сравнению с соответствующей молекулой с Fc-участком дикого типа.
В определенных вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает иммуноглобулины, содержащие вариантный участок Fc с измененной аффинностью к FcγRIIIA и/или к FcγRIIA так, что иммуноглобулины обладают усиленной эффекторной функцией, например, антитело-зависимой опосредованной клетками цитотоксичностью. Не ограничивающие примеры функций эффекторных клеток включают антитело-зависимую опосредованную клетками цитотоксичность (ADCC), антитело-зависимый фагоцитоз, фагоцитоз, опсонизацию, опсонофагоцитоз, связывание с клетками, розеткообразование, связывание с C1q и комплемент-зависимую опосредованную клетками цитотоксичность.
В предпочтительном варианте осуществления изменение аффинности или эффекторной функции является по меньшей мере 2-кратным, предпочтительно по меньшей мере 4-кратным, по меньшей мере 5-кратным, по меньшей мере 6-кратным, по меньшей мере 7-кратным, по меньшей мере 8-кратным, по меньшей мере 9-кратным, по меньшей мере 10-кратным, по меньшей мере 50-кратным, или по меньшей мере 100-кратным, по сравнению с соответствующей молекулой с Fc-участком дикого типа. В других вариантах осуществления настоящего изобретения вариантный участок Fc иммуноспецифично связывает один или несколько FcR по меньшей мере с 65%, предпочтительно с большей по меньшей мере на 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 225% или 250% аффинностью по сравнению с молекулой с Fc-участком дикого типа. Такие измерения могут быть проанализированы in vivo или in vitro, и в предпочтительном варианте осуществления это анализы in vitro, такие как ELISA или поверхностный плазмонный резонанс.
В различных вариантахосуществления молекулы содержат вариант Fc-домена, где указанный вариант агонизирует по меньшей мере одну активность FcγR-рецептора, или антагонизирует по меньшей мере одну активность FcγR-рецептора. В предпочтительном варианте осуществления молекулы содержат вариант, который агонизирует (или антагонизирует) одну или несколько активностей FcγRIIB, например, рецептор-опосредованную сигнальную передачу B-клеток, активацию B-клеток, пролиферацию B-клеток, продукцию антител, поток кальция внутрь B-клеток, последовательность клеточного цикла, FcγRIIB-опосредованное ингибирование сигнальной передачи FcεRI, фосфорилирование FcγRIIB, рекрутинг SHIP, фосфорилирование SHIP и ассоциацию с Shc, или активность одной или нескольких молекул нисходящего направления (например, MAP-киназы, JNK, p38 или Akt) в FcγRIIB-пути передачи сигнала. В другом варианте осуществления молекулы содержат вариант, который агонизирует (или антагонизирует) одну или несколько активностей FcεRI, например, активацию тучных клеток, мобилизацию кальция, дегрануляцию, продукцию цитокинов или высвобождение серотонина.
et al.
et al.
et al.
В определенных вариантах осуществления молекулы содержат Fc-домен, содержащий домены или участки из двух или более изотипов IgG (например, IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4). Разные изотипы IgG демонстрируют различные физические и функциональные свойства, включая время полураспада в сыворотке, фиксацию комплемента, аффинности связывания с FcγR и эффекторно-функциональные активности (например, ADCC, CDC и т.д.), благодаря различиям в аминокислотных последовательностях их шарнирных доменов и/или Fc-доменов, например, как описано в Flesch и Neppert (1999) J. Clin. Lab. Anal. 14:141-156; Chappel  (1993) J. Biol. Chem. 33:25124-25131; Chappel  (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 88:9036-9040; Brüggemann  (1987) J. Exp. Med 166:1351-1361. Этот тип вариантного Fc-домена может быть использован самостоятельно или в комбинации с аминокислотной модификацией для того, чтобы повлиять на Fc-опосредованную эффекторную функцию и/или связывающую активность. В комбинации аминокислотная модификация и шарнирный участок IgG/участок Fc могут демонстрировать сходные функциональные возможности (например, повышенную аффинность к FcγRIIA) и могут действовать аддитивно или, что более предпочтительно, синергично для того, чтобы модифицировать эффекторную функциональную возможность молекулы настоящего изобретения, по сравнению с молекулой настоящего изобретения, содержащей участок Fc дикого типа. В других вариантах осуществления аминокислотная модификация и участок Fc IgG могут демонстрировать противоположные функциональные возможности (например, повышенную и пониженную аффинность к FcγRIIA, соответственно) и могут действовать селективно, регулируя или снижая специфические функциональные возможности молекулы настоящего изобретения, по сравнению с молекулой настоящего изобретения не содержащей участок Fc или содержащей участок Fc дикого типа того же изотипа.
например
например
В специфическихвариантах осуществления настоящее изобретение охватывает терапевтические антитела, которые иммуноспецифически связывают FcγRIIB с помощью их вариабельных доменов с большей аффинностью, чем FcγRIIA, , антитела, полученные из моноклонального антитела мыши, продуцируемого клоном 2B6 или 3H7, имеющими инвентарные номера ATCC PTA-4591 и PTA-4592, соответственно. В других вариантах осуществления антитела к FcγRIIB настоящего изобретения происходят от моноклонального антитела мыши, продуцируемого клонами 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, имеющими инвентарные номера ATCC PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959, соответственно. Гибридомы, продуцирующие антитела 2B6 и 3H7, были переданы на хранение в Американскую коллекцию типовых культур (10801 Университетский бульвар, Манассас, Вирджиния. 20110-2209) 13 августа 2002 г. по постановлению Будапештского договора о международном признании депонирования микроорганизмов для целей патентных процедур и получили инвентарные номера PTA-4591 (для гибридомы, продуцирующей 2B6) и PTA-4592 (для гибридомы, продуцирующей 3H7), соответственно, и включены в данный документ ссылкой. Гибридомы, продуцирующие 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 и 1F2 были переданы на хранение в Американскую коллекцию типовых культур по постановлению Будапештского договора (10801 Университетский бульвар, Манассас, Вирджиния. 20110-2209) 7 мая 2004 г. и получили инвентарные номера PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959, соответственно, и включены в данный документ ссылкой. В предпочтительных вариантах осуществления антитела к FcγRIIB настоящего изобретения (, 2B6) содержат вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc имеет замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином. В другом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 2B6, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 2B6, содержащее вариантный участок Fc, имеющий замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 300 лейцином. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 2B6, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 2B6, содержащее вариантный участок Fc, имеющий замену в положение 247 лейцином, в положении 270 глутаминовой кислотой и в положении 421 лизином. В другом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 2B6, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
SEQ ID NO:31
например
et al.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
например
В специфическомварианте осуществления настоящее изобретение охватывает терапевтические антитела, которые связывают протоонкоген Her2/neu (аминокислотная последовательность ) (, антитело Ab4D5, как раскрыто у Carter , 1992,  89:4285-9; патент США № 5677171; или публикации международной патентной заявки WO 01/00245, каждый из которых вкоючен в данный документ ссылкой во всей своей полноте). В определенном варианте осуществления антитело 4D5 является химерным. В другом варианте осуществления антитело 4D5 является гуманизированным. В специфическом варианте осуществления антитело 4D5 сконструировано так, что содержит вариантный участок Fc с модификацией (, замена, вставка, делеция) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или к FcγRIIA, и/или снижает аффиность участка Fc к FcγRIIB, и/или модулирует эффекторную функцию антитела по сравнению с соответствующим антителом, содержащим участок Fc дикого типа. В определенных вариантах осуществления антитело 4D5 настоящего изобретения содержит вариантный участок Fc, имеющий замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 4D5, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292, лейцин в положении 300, изолейцин в положении 305 и лейцин в положении 396. В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 4D5, содержащее вариантный участок Fc, имеющий замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 300 лейцином. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 4D5, имеющее лейцин в положении 243, пролин в положении 292 и лейцин в положении 300. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 4D5, содержащее вариантный участок Fc, имеющий замещение в положении 247 лейцином, в положении 270 глутаминовой кислотой и в положении 421 лизином. В другом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает антитело 4D5, имеющее лейцин в положении 247, глутаминовую кислоту в положении 292 и лизин в положении 421.
например
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы содержащие вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию относительно Fc участка дикого типа, причем вариантный Fc-участок не показывает выявляемое связывание с каким-либо FcγR (, не связывает FcγRIIA, FcγRIIB или FcγRIIIA, как определено, например, анализом ELISA), относительно аналогичной молекулы содержащий Fc-участок дикого типа.
например
например
В специфическомварианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению Fc-участком дикого типа, причем вариантный участок Fc связывает только один FcγR, где указанный FcγR является FcγIIIA. В другом специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению Fc-участком дикого типа, причем вариантный участок Fc связывает только один FcγR, где указанный FcγR является FcγRIIA. В еще одном варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению Fc-участком дикого типа, причем вариантный участок Fc связывает только один FcγR, где указанный FcγR является FcγRIIB. Настоящее изобретение, в частности, относится к модификации антител человека или гуманизированных терапевтических антител (, опухоле-специфические антиангиогенные или противовоспалительные моноклональные антитела) для повышения эффективности терапевтических антител путем усиления, например, эффекторной функции терапевтического антитела, , усилением ADCC.
В определенных вариантах осуществления молекулы содержат вариантный участок Fc, имеющий одну или несколько аминокислотный модификаций в одном или нескольких участках, в которых модификация(и) меняют (по сравнению Fc-участком дикого типа) соотношение аффиностей вариантного участка Fc к активирующему FcγR (такому как FcγRIIA или FcγRIIIA) относительно ингибирующего FcγR (такого как FcγRIIB):
активирующий
Изменение в аффинности к FcγR варианта по отношению к дикому типу
Соотношение аффиностей =
ингибирующий
Изменение в аффинности к FcγR варианта по отношению к дикому типу
Таблица 1
Таблице 2
Если вариантFc имеет соотношение аффинностей больше 1, способы настоящего изобретения особо применимы для обеспечения терапевтического или профилактического лечения заболевания, расстройства или инфекции или уменьшения интенсивности их симптома, где желательна повышенная эффективность функции эффекторных клеток (например, ADCC), опосредованная FcγR, например, злокачественная опухоль или инфекционное заболевание. Если вариантFc имеет соотношение аффинностей менее 1, способы настоящего изобретения особо применимы для обеспечения терапевтического или профилактического лечения заболевания, расстройства или инфекции или уменьшения интенсивности их симптома, где желательна пониженная эффективность функции эффекторных клеток опосредованная FcγR, например, аутоиммунные или воспалительные расстройства.  перечисляет типичные одиночных, двойные, тройные, четвертные и пятичленные мутации в соответствии с тем, является ли соотношение аффинностей больше или менеше 1. Данные специфического связывания для различных мутаций приведены в , и более подробные сведения относительно этих мутаций можно найти в области технологий конструирования антител.
<b>Таблица 1: Примерные одиночные и множественные мутации перечислены как соотношения аффинностей</b>
<b>Соотношение</b>
<b>Одиночные</b>
<b>Двойные</b>
<b>Тройные</b>
<b>Четвертные</b>
<b>Пятичленные</b>
> 1
F243LD270ER292GR292P
F243L и R292PF243L и Y300LF243L и P396LD270E и P396LR292P и Y300LR292P и V305IR292P и P396LY300L и P396LP396L и Q419H
F243L, P247L и N421KF243L, R292P и Y300LF243L, R292P и V305IF243L, R292P и P396LF243L, Y300L и P396LP247L, D270E и N421KR255L, D270E и P396LD270E, G316D и R416GD270E, K392T и P396LD270E, P396L и Q419HV284M, R292L и K370NR292P, Y300L и P396L
L234F, F243L, R292P и Y300LL235I, F243L, R292P и Y300LL235Q, F243L, R292P и Y300LF243L, P247L, D270E и N421KF243L, R255L, D270E и P396LF243L, D270E, G316D и R416GF243L, D270E, K392T и P396LF243L, D270E, P396L и Q419HF243L, R292P, Y300L, и P396LF243L, R292P, V305I и P396LP247L, D270E, Y300L и N421KR255L, D270E, R292G и P396LR255L, D270E, Y300L и P396LD270E, G316D, P396L и R416G
L235V, F243L, R292P, Y300L и P396LL235P, F243L, R292P, Y300L и P396LF243L, R292P, V305I, Y300L и P396L
< 1
Y300LP396L
F243L и P396LP247L и N421KR255L и P396LR292P и V305IK392T и P396LP396L и Q419H
F243L, R292P и V305I
<b>Таблица 2: Подробная информация связывания для примерных Fc вариантов</b>
<b>Fc последовательность</b>
<b>CD16A</b><b>V158</b>
<b>CD16A</b><b>F158</b>
<b>CD32B</b>
<b>Соотношение аффинностей</b>
<b>CD16A/CD32B</b>
<b>V158</b>
<b>F158</b>
<b>Соотношение аффинностей > 1</b>
<b>Класс I: Повышенное связывание с CD16; пониженное связывание с CD32B</b>
F243L
4,79
3,44
0,84
5,70
4,10
F243L P247L D270E N421K
2,30
3,45
0,32
7,19
10,78
F243L P247L N421K
1,89
1,71
0,17
11,12
10,06
F243L R255L D270E P396L
1,75
1,64
0,38
4,61
4,32
F243L D270E G316D R416G
1,50
1,34
0,20
7,50
6,70
F243L D270E K392T P396L
3,16
2,44
0,44
7,18
5,55
F243L D270E P396L Q419H
1,46
1,15
0,26
5,62
4,42
F243L R292P
4,73
0,12
39,4
F243L R292P
4
1,67
0,16
25
10,44
F243L R292P P300L
6,69
2,3
0,32
20,9
7,19
F243L R292P V305I
2,56
1,43
ND
>25
>25
F243L R292P V305I P396L
5,37
2,53
0,40
13,43
6,33
P247L D270E N421K
1,89
2,46
0,58
3,26
4,24
R255L D270E R292G P396L
1,39
1,30
0,65
2,14
2,00
R255L D270E Y300L P396L
1,52
1,74
0,87
1,75
2,00
R255L D270E P396L
1,34
1,65
0,87
1,54
1,90
D270E
1,25
1,48
0,39
3,21
3,79
D270E G316D R416G
2,18
2,49
0,78
2,79
3,19
D270E K392T P396L
1,81
2,28
0,79
2,29
2,89
D270E P396L
1,38
1,65
0,89
1,55
1,85
D270E P396L G316D R416G
1,22
1,07
1,14
D270E P396L Q419H
1,64
2,00
0,68
2,41
2,94
V284M R292P K370N
1,14
1,37
0,37
3,1
3,7
R292G
1,54
0,25
6,2
R292P
2,90
0,25
11,60
R292P V305I
1,32
1,28
0,37
3,6
3,46
<b>Класс II: Пониженное связывание с CD16; очень пониженное связывание cCD32B</b>
R292P
0,64
0,25
2,56
R292P F243L
0,6
0,12
5,00
<b>Класс III: Повышенное связывание с CD16; неизмененное связывание с CD32B</b>
F243I R292P Y300L V305I P396L
10,9
3,12
1,05
10,4
2,97
F243L R292P Y300L P396L
10,06
5,62
1,07
9,40
5,25
R292P V305I P396L
1,85
1,90
0,92
2,01
2,07
<b>Класс IV: Очень повышенное связывание с CD16; повышенное связывание с CD32B</b>
F243L R292P Y300L V305I P396L
10,06
8,25
1,38
7,29
5,98
D270E G316D P396L R416G
1,22
1,07
1,14
<b>Соотношение аффинностей < 1</b>
<b>Класс V: Неизмененное связывание с CD16; повышенное связывание с CD32B</b>
R255L P396L
1,09
2,22
0,49
Y300L
1,01
1,18
0,99
<b>Класс VI: Повышенное связывание с CD16; очень повышенное связывание с CD32B</b>
F243L P396L
1,49
1,60
2,22
0,67
0,72
P247L N421K
1,29
1,73
2,00
0,65
0,87
R255L P396L
1,39
2,22
0,49
0,63
R292P V305I
1,59
2,11
2,67
0,60
0,79
<b>Таблица 2: Подробная информация связывания для примерных Fc вариантов</b>
<b>Fc последовательность</b>
<b>CD16A</b><b>V158</b>
<b>CD16A</b><b>F158</b>
<b>CD32B</b>
<b>Соотношение аффинностей</b>
<b>CD16A/CD32B</b>
<b>V158</b>
<b>F158</b>
K392T P396L
1,49
1,81
2,35
0,63
0,77
P396L
1,27
1,73
2,58
0,49
0,67
P396L Q419H
1,19
1,19
1,33
0,89
0,89
<b>Класс VII: Пониженное связывание с CD16; повышенное / неизмененное связывание с CD32B</b>
D270E G316D P396L R416G
0,94
1,07
0,88
off
off
off
Таблица 3
Таблице 3
В других вариантах осуществления молекулы содержат вариантный участок Fc, имеющий одну или несколько аминокислотных замен, в котором эти замены меняют (по сравнению с Fc-участком дикого типа) связывание вариантного участка Fc, например, усиливают связывание с активирующим FcγR (таким как FcγRIIA или FcγRIIIA) и/или ослабляют связывание с ингибирующим FcγR (таким как FcγRIIB). Были сконструированы и проанализированы методом поверхностного плазмонного резонанса для определения kразличные мутации Fc, заключающиеся в одном или нескольких изменениях аминокислот, как показано в . Анализом BIAcore были определены константы скорости диссоциации для связывания различных FcγR, и их непосредственно сравнивали с таковыми для Fc дикого типа с соотношением (х = k дт/k мутанта), указанным колонках в с правой стороны по отношению к каждому протестированному FcγR.
Имеется также подробное руководство вобласти технологий конструирования антител относительно желательных модификаций. типичные модификации, которые могут быть желательны в определенных обстоятельствах, перечислены ниже.
В специфическом вариантеосуществления вариантные участки Fc могут содержать любые модификации аминокислот (например, замены) в любом из положений 235, 240, 241, 243, 244, 247, 262, 263, 269, 298, 328 или 330 и предпочтительно один или несколько из следующих остатков: A240, I240, L241, L243, H244, N298, I328 или V330. В другом специфическом варианте осуществления вариантные участки Fc могут содержать любые модификации аминокислот (например, замены) в любом из положений 268, 269, 270, 272, 276, 278, 283, 285, 286, 289, 292, 293, 301, 303, 305, 307, 309, 331, 333, 334, 335, 337, 338, 340, 360, 373, 376, 416, 419, 430, 434, 435, 437, 438 или 439 и предпочтительно один или несколько из следующих остатков: H280, Q280, Y280, G290, S290, T290, Y290, N294, K295, P296, D298, N298, P298, V298, I300 или L300.
В предпочтительномварианте осуществления вариантные участки Fc, которые связывают FcγR с измененной аффинностью, могут содержать любые модификации аминокислот (например, замены) в любом из положений 255, 256, 258, 267, 268, 269, 270, 272, 276, 278, 280, 283, 285, 286, 289, 290, 292, 293, 294, 295, 296, 298, 300, 301, 303, 305, 307, 309, 312, 320, 322, 326, 329, 330, 332, 331, 333, 334, 335, 337, 338, 339, 340, 359, 360, 373, 376, 416, 419, 430, 434, 435, 437, 438 или 439. Предпочтительно, вариантный участок Fc имеет любой из следующих остатков: A256, N268, Q272, D286, Q286, S286, A290, S290, A298, M301, A312, E320, M320, Q320, R320, E322, A326, D326, E326, N326, S326, K330, T339, A333, A334, E334, H334, L334, M334, Q334, V334, K335, Q335, A359, A360 или A430.
В другомварианте осуществления вариантные участки Fc, которые связывают FcγR (через свой участок Fc) с пониженной аффинностью, могут содержать любые модификации аминокислот (например, замены) в любом из положений 252, 254, 265, 268, 269, 270, 278, 289, 292, 293, 294, 295, 296, 298, 300, 301, 303, 322, 324, 327, 329, 333, 335, 338, 340, 373, 376, 382, 388, 389, 414, 416, 419, 434, 435, 437, 438 или 439.
В другом варианте осуществления вариантные участки Fc, которые связывают FcγR (через свой участок Fc) с повышенной аффинностью, могут содержать любые модификации аминокислот (например, замены) в любом из положений: 280, 283, 285, 286, 290, 294, 295, 298, 300, 301, 305, 307, 309, 312, 315, 331, 333, 334, 337, 340, 360, 378, 398 или 430. В другом варианте осуществления, в вар иантах участков Fc, которые связывают FcγRIIA с повышенной аффинностью может содержаться любой из следующих остатков: A255, A256, A258, A267, A268, N268, A272, Q272, A276, A280, A283, A285, A286, D286, Q286, S286, A290, S290, M301, E320, M320, Q320, R320, E322, A326, D326, E326, S326, K330, A331, Q335, A337 или A430.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
et al.
В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает применение любого варианта Fc, известного в данной области, такого как раскрытые у Jefferis  (2002) Immunol Lett 82:57-65; Presta  (2002) Biochem Soc Trans 30:487-90; Idusogie  (2001) J Immunol 166:2571-75; Shields  (2001) J Biol Chem 276:6591-6604; Idusogie  (2000) J Immunol 164:4178-84; Reddy  (2000) J Immunol 164:1925-33; Xu  (2000) Cell Immunol 200:16-26; Armour  (1999) Eur J Immunol 29:2613-24; Jefferis  (1996) Immunol Lett 54:101-04; Hinton et al; 2004, J. Biol. Chem. 279(8): 6213-6; Lund  (1996) J Immunol 157:4963-69; Hutchins  (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 92:11980-84; Jefferis  (1995) Immunol Lett. 44:111-17; Lund  (1995) FASEB J 9:115-19; Alegre  (1994) Transplantation 57:1537-43; Lund  (1992) Mol Immunol 29:53-59; Lund  (1991) J. Immunol 147:2657-62; Duncan  (1988) Nature 332:563-64; в патентах США №№ 5624821; 5885573; 6194551; 7276586 и 7317091; и в публикациях PCT WO 00/42072 и PCT WO 99/58572.
Предпочтительные варианты включают одну или несколько модификаций в любом из положений: 228, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 239, 240, 241, 243, 244, 245, 247, 262, 263, 264, 265, 266, 271, 273, 275, 281, 284, 291, 296, 297, 298, 299, 302, 304, 305, 313, 323, 325, 326, 328, 330 или 332.
Особеннопредпочтительные варианты включают одну или несколько модификаций, выбранных из групп A-AI:
A.
228E, 228K, 228Y или 228G;
B.
230A, 230E, 230Y или 230G;
C.
231E, 231K, 231Y, 231P или 231G;
D.
232E, 232K, 232Y, 232G;
E.
233D;
F.
234I или 234F;
G.
235D, 235Q, 235P, 235I или 235V;
H.
239D, 239E, 239N или 239Q;
I.
240A, 240I, 240M или 240T;
J.
243R, 243, 243Y, 243L, 243Q, 243W, 243H или 243I;
K.
244H;
L.
245A;
M.
247G, 247V или 247L;
N.
262A, 262E, 262I, 262T, 262E или 262F;
O.
263A, 263I, 263M или 263T;
P.
264F, 264E, 264R, 264I, 264A, 264T или 264W;
Q.
265F, 265Y, 265H, 265I, 265L, 265T, 265V, 265N или 265Q;
R.
266A, 266I, 266M или 266T;
S.
271D, 271E, 271N, 271Q, 271K, 271R, 271S, 271T, 271H, 271A, 271V, 271L, 271I, 271F, 271M, 271Y, 271W или 271G;
T.
273I;
U.
275L или 275W;
V.
281D, 281K, 281Y или 281P;
W.
284E, 284N, 284T, 284L, 284Y или 284M;
X.
291D, 291E, 291Q, 291T, 291H, 291I или 291G;
Y.
299A, 299D, 299E, 299F, 299G, 299H, 299I, 299K, 299L, 299M, 299N, 299P, 299Q, 299R, 299S, 299V, 299W или 299Y;
Z.
302I;
AA.
304D, 304N, 304T, 304H или 304L
AB.
305I;
AC.
313F;
AD.
323I;
AE.
325A, 325D, 325E, 325G, 325H, 325I, 325L, 325K, 325R, 325S, 325F, 325M, 325T, 325V, 325Y, 325W или 325P;
AF.
328D, 328Q, 328K, 328R, 328S, 328T, 328V, 328I, 328Y, 328W, 328P, 328G, 328A, 328E, 328F, 328H, 328M или 328N;
AG.
330L, 330Y, 330I или 330V;
AH.
332A, 332D, 332E, 332H, 332N, 332Q, 332T, 332K, 332R, 332S, 332V, 332L, 332F, 332M, 332W, 332P, 332G или 332Y; и
AI.
336E, 336K или 336Y.
Таблице 4
Все жеособенно предпочтительные варианты включают одну или несколько модификаций, выбранных из групп 1-105 в :
<b>Таблица 4</b>
Группа
Вариант
Группа
Вариант
1
A330L / I332E
54
S239D / D265L / N297D / I332E
2
D265F / N297E / I332E
55
S239D / D265T / N297D / I332E
3
D265Y / N297D / I332E
56
S239D / D265V / N297D / I332E
4
D265Y / N297D / T299L / I332E
57
S239D / D265Y / N297D / I332E
5
F241E / F243Q / V262T / V264F
58
S239D / I332D
6
F241E / F243Q / V262T / V264E / I332E
59
S239D / I332E
7
F241E / F243R / V262E / V264R
60
S239D / I332E / A330I
8
F241E / F243R / V262E / V264R / I332E
61
S239D / I332N
9
F241E / F243Y / V262T / V264R
62
S239D / I332Q
10
F241E / F243Y / V262T / V264R / I332E
63
S239D / N297D / I332E
11
F241L / F243L / V262I / V264I
64
S239D / N297D / I332E / A330Y
12
F241L / V262I
65
S239D / N297D / I332E / A330Y / F241S / F243H / V262T / V264T
13
F241R / F243Q / V262T / V264R
66
S239D / N297D / I332E / K326E
14
F241R / F243Q / V262T / V264R / I332E
67
S239D / N297D / I332E / L235D
15
F241W / F243W / V262A / V264A
68
S239D / S298A / I332E
16
F241Y / F243Y / V262T / V264T
69
S239D / V264I / A330L / I332E
17
F241Y / F243Y / V262T / V264T / N297D / I332E
70
S239D / V264I / I332E
18
F243L / V262I / V264W
71
S239D / V264I / S298A / I332E
19
P243L / V264I
72
S239E / D265N
20
L328D / I332E
73
S239E / D265Q
21
L328E / I332E
74
S239E / I332D
22
L328H / I332E
75
S239E / I332E
23
L328I / I332E
76
S239E / I332N
24
L328M / I332E
77
S239E / I332Q
25
L328N / I332E
78
S239E / N297D / I332E
26
L328Q / I332E
79
S239E / V264I / A330Y / I332 E
27
L328T / I332E
80
S239E / V264I / I332 E
28
L328V / I332E
81
S239E / V264I / S298A / A330Y / I332E
29
N297D / A330Y / I332E
82
S239N / A330L / I332E
30
N297D / I332E
83
S239N / A330Y / I332E
31
N297D / I332E / S239D / A330L
84
S239N / I332D
32
N297D / S298A / A330Y / I 332E
85
S239N / I332E
33
N297D / T299L / I332E
86
S239N / I332N
34
N297D / T299F / I332E / N297D / T299H / I332E
87
S239N / I332Q
35
N297D / T299I / I332E
88
S239N1S298A / I332E
36
N297D / T299L / I332E
89
S239Q / I332D
37
N297D / T299V / I332E
90
S239Q / I332E
38
N297E / I332E
91
S239Q / I332N
39
N297S / I332E
92
S239Q / I332Q
40
P230A / E233D / I332E
93
S239Q / V264I / I332E
41
P244H / P245A / P247V
94
S298A / I332E
42
S239D / A330L / I332E
95
V264E / N297D / I332E
43
S239D / A330Y / I332E
96
V264I / A330L / I332E
44
S239D / A330Y / I332E / K326E
97
V264I / A330Y / I332E
45
S239D / A330Y / I332E / K326T
98
V264I / I332E
46
S239D / A330Y / I332E / L234I
99
V264I / S298A / I332E
47
S239D / A330Y / I332E / L235D
100
Y296D / N297D / I332E
48
S239D / A330Y / I332E / V240I
101
Y296E / N297D / I332 E
49
S239D / A330Y / I332E / V264T
102
Y296H / N297D / I332E
50
S239D / A330Y / I332E / V266I
103
Y296N / N297D / I332E
51
S239D / D265F / N297D / I332E
104
Y296Q / N297I / I332E
52
S239D / D265H / N297D / I332E
105
Y296T / N297D / I332E.
53
S239D / D265I / N297D / I332E
et al.
et al.
et al.
Эффекторную функцию можно модифицировать методиками, такими как описанные в области технологий конструирования антител, или другими средствами. Например, в участок Fc можно ввести остаток(и) цистеина, таким образом делая возможным образование межцепочечных дисульфидных связей в этом участке, результатом чего является поколение гомодимерных антител, которые могут иметь улучшенную способность к интернализации и/или повышенную способность к комплемент-опосредованному уничтожении клеток и ADCC. См. Caron  (1992) J. Exp Med. 176:1191-1195; и B. Shopes (1992) J. Immunol. 148:2918-2922. Гомодимерные антитела с повышенной противоопухолевой активностью можно также получить с использованием гетеробифункциональных поперечно-сшивающих средств, как описано у Wolff  (1993) Cancer Research 53:2560-2565. Альтернативно, можно сконструировать антитело, которое будет иметь сдвоенные участки Fc, и может, таким образом, обладать повышенной способностью к лизису комплемента и ADCC (Stevenson  (1989) Anti-Cancer Drug Design 3:219-230).
in vitro
т.е.
in vitro
in
vivo
in vitro
in vitro
in vivo
Аффинности и FcγR-связывающие свойства молекул настоящего изобретения сначала определяются с использованием испытаний  (на основе биохимических или иммунологичских испытаний), известных в данной области для определения взаимодействий Fc-FcγR,  специфического связывания участка Fc с FcγR, включая без ограничения следующией анализ ELISA, анализ поверхностно плазмонного резонанса, анализы иммунопреципитации (см. Раздел 6.2.2). Предпочтительно связывающие свойства молекул настоящего изобретения также характеризуются функциональными испытаниями  для определения одной или нескольких функций эффекторных клеток, опосредованных FcγR (См. Раздел 6.2.2). В наиболее предпочтительных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения имеют связывающие свойства в моделях  (таких как описанные и раскрытые в данном документе), сходные с таковыми в анализах . Однако настоящее изобретение не исключает молекул настоящего изобретения, которые не обнаруживают желаемого фенотипа в анализах , но обнаруживают желаемый фенотип .
В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантный участок Fc, содержат по меньшей мере одну аминокислотную модификацию в CH3-домене участка Fc, который определяется, как находящийся между аминокислотами в положениях 342-447. В других вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантный участок Fc, содержат по меньшей мере одну аминокислотную модификация CH2-домене участка Fc, который определяется, как находящийся между аминокислотами в положениях 231-341. В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения содержат по меньшей мере две аминокислотные модификации, где одна модификация находится в CH3-участке, а другая модификация - в CH2-участке. Настоящее изобретение далее охватывает аминокислотные модификации в шарнирном участке. Молекулы настоящего изобретения с одной или несколькими аминокислотными модификациями в CH2- и/или CH3-доменах имеют измененные аффинности к FcγR, определенные с использованием способов, описанных в данном документе или известных специалисту в данной области.
В конкретном варианте осуществления настоящее изобретение охватывает аминокислотные модификации в CH1-домене участка Fc.
В особенно предпочтительных вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, где указанный вариант имеет повышенную способность связываться с FcγRIIA (CD32A) и/или повышенную активность ADCC, как было измерено с использованием способов, известных специалисту в данной области и показанных в данном документе. Анализы ADCC, используемые в соответствии со способами настоящего изобретения, могут быть NK-зависимыми или макрофаг-зависимыми.
Варианты Fc настоящего изобретения могут сочетаться с другими известными модификациями Fc, включая без ограничения модификации, которые меняют эффекторную функцию и модификации, которые меняют аффинность связывания с FcγR. В конкретном варианте осуществления вариант Fc настоящего изобретения, содержащий первую аминокислотную модификацию в CH3-домене, CH2-домене или в шарнирном участке, может сочетаться со второй модификацией Fc так, чтобы вторая модификация Fc была не в том же самом домене, что и первая, с тем, чтобы первая модификация Fc наделяла дополнительным, синергичным или новым свойством вторую модификацию Fc. В некоторых вариантах осуществления варианты Fc настоящего изобретения не имеют никаких аминокислотных модификаций в CH2-домене.
et al.
Nature
В предпочтительном специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа так, чтобы указанная молекула имела измененную аффинность к FcγR, при условии, что указанный вариантный участок Fc не имеет замены в положениях, которые непосредственно участвуют в контакте с FcγR, что известно на основании кристаллографических и структурных анализов взаимодействий Fc-FcγR, таких, как раскрытые у Sondermann , 2000 (, 406: 267-273, который включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте). Примерами положений в участке Fc, которые непосредственно участвуют в контакте с FcγR, являются аминокислоты 234-239 (шарнирный участок), аминокислоты 265-269 (петля B/C), аминокислоты 297-299 (петля C'/E) и аминокислоты 327-332 (петля F/G). В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантный участок Fc, содержат модификации по меньшей мере одного остатка, который непосредственно участвует в контакте с FcγR, что известно на основании кристаллографических и структурных анализов.
et al.
Nature
Домен, взаимодействующий сFcγR, картируется по нижнему шарнирному участку и сайтам отбора в доменах CH2 и CH3 тяжелой цепи IgG. Аминокислотные остатки, фланкирующие фактические положения контакта и аминокислотные остатки CH3-домене, играют роль во взаимодействиях IgG/FcγR, как установлено исследованиями мутагенеза и исследованиями с использованием малых пептидных ингибиторов, соответственно (Sondermann , 2000 , 406: 267-273; Diesenhofer et al., 1981, Biochemistry, 20: 2361-2370; Shields et al., 2001, J. Biol. Chem. 276: 6591-6604; каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте). Непосредственный контакт, как используется в данном документе, относится к тем аминокислотам, которые локализованы на расстоянии по меньшей мере 1 Å, по меньшей мере 2 или по меньшей мере 3 ангстрема друг от друга или в радиусе Ван Дер Ваальса, составляющем 1 Å, 1,2 Å, 1,5 Å, 1,7 Å или 2 Å.
В другомпредпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа так, что указанная молекула связывается с FcγR посредством участка Fc с измененной аффинностью по сравнению с молекулой, содержащей участок Fc дикого типа, при условии, что указанный вариантный участок Fc не имеет ни одной замены ни в одном из указанных положений 255, 256, 258, 267, 268, 269, 270, 272, 276, 278, 280, 283, 285, 286, 289, 290, 292, 293, 294, 295, 296, 298, 300, 301, 303, 305, 307, 309, 312, 320, 322, 326, 329, 330, 332, 331, 333, 334, 335, 337, 338, 339, 340, 359, 360, 373, 376, 416, 419, 430, 434, 435, 437, 438, 439. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа так, что указанная молекула связывается с FcγR посредством участка Fc с измененной аффинностью по сравнению с молекулой, содержащей участок Fc дикого типа, при условии, что указанный вариантный участок Fc не имеет ни одной замены ни в одном из указанных положений 255, 258, 267, 269, 270, 276, 278, 280, 283, 285, 289, 292, 293, 294, 295, 296, 300, 303, 305, 307, 309, 322, 329, 332, 331, 337, 338, 340, 373, 376, 416, 419, 434, 435, 437, 438, 439 и не имеет аланина ни в одном из положений 256, 290, 298, 312, 333, 334, 359, 360, 326 или 430; лизина в положении 330; треонина в положении 339; метионина в положении 320; серина в положении 326; аспарагина в положении 326; аспарагиновой кислоты в положении 326; глутаминовой кислоты в положении 326; глутамина в положении 334; глутаминовой кислоты в положении 334; метионина в положении 334; гистидина в положении 334; валина в положении 334 или лейцина в положении 334; лизина в положении 335; аспарагина в положении 268; глутамина в положении 272; глутамина, серина или аспарагиновой кислоты в положении 286; серина в положении 290; метионина, глутамина, глутаминовой кислоты или аргинина в положении 320; глутаминовой кислоты в положении 322; серина, глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты в положении 326; лизина в положении 330; глутамина в положении 335 или метионина в положении 301.
В конкретномварианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc не имеет ни одной замены ни в одном из указанных положений 268, 269, 270, 272, 276, 278, 283, 285, 286, 289, 292, 293, 301, 303, 305, 307, 309, 331, 333, 334, 335, 337, 338, 340, 360, 373, 376, 416, 419, 430, 434, 435, 437, 438 или 439 и не имеет гистидина, глутамина или тирозина в положении 280; серина, глицина, треонина или тирозина в положении 290, лейцина или изолейцина в положении 300; аспарагина в положении 294, пролина в положении 296; пролина, аспарагина, аспарагиновой кислоты или валина в положении 298; лизина в положении 295. Еще в одном предпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа так, что указанная молекула связывается с FcγR посредством участка Fc с пониженной аффинностью по сравнению с молекулой, содержащей участок Fc дикого типа, при условии, что указанный вариантный участок Fc не имеет ни одной замены ни в одном из указанных положений 252, 254, 265, 268, 269, 270, 278, 289, 292, 293, 294, 295, 296, 298, 300, 301, 303, 322, 324, 327, 329, 333, 335, 338, 340, 373, 376, 382, 388, 389, 414, 416, 419, 434, 435, 437, 438 или 439. Еще в одном предпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа так, что указанная молекула связывается с FcγR посредством участка Fc с повышенной аффинностью по сравнению с молекулой, содержащей участок Fc дикого типа, при условии, что указанный вариантный участок Fc не имеет ни одной замены ни в одном из указанных положений 280, 283, 285, 286, 290, 294, 295, 298, 300, 301, 305, 307, 309, 312, 315, 331, 333, 334, 337, 340, 360, 378, 398 или 430.
В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc не включает ни одной замены ни в одном из указанных положений 330, 243, 247, 298, 241, 240, 244, 263, 262, 235, 269 или 328 и не имеет лейцина в положении 243, аспарагина в положении 298, лейцина в положении 241 и изолейцина или аланина в положении 240, гистидина в положении 244, валина в положении 330, или изолейцина в положении 328.
В наиболеепредпочтительных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения с измененными аффинностями для активирующих и/или ингибирующих рецепторов, имеющих варианты участков Fc с одной или несколькими аминокислотными модификациями, где одна или несколько указанных аминокислотных модификаций являются замещениями в положении 288 аспарагином, в положении 330 серином и в положении 396 лейцином (MgFc10); или замещениями в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином, и в положении 366 серином (MgFc13); или замещениями в положении 316 аспарагиновой кислотой, в положении 378 валином, и в положении 399 глутаминовой кислотой (MgFc27); или замещениями в положении 392 треонином, и в положении 396 лейцином (MgFc38); или замещениями в положении 221 глутаминовой кислотой, в положении 270 глутаминовой кислотой, в положении 308 аланином, в положении 311 гистидином, в положении 396 лейцином, и в положении 402 аспарагиновой кислотой (MgFc42); или замещениями в положении 240 аланином, и в положении 396 лейцином (MgFc52); или замещениями в положении 410 гистидином, и в положении 396 лейцином (MgFc53); замещениями в положении 243 лейцином, в положении 305 изолейцином, в положении 378 аспарагиновой кислотой, в положении 404 серином, и в положении 396 лейцином (MgFc54); или замещениями в положении 255 изолейцином, и в положении 396 лейцином (MgFc55); или замещениями в положении 370 глутаминовой кислотой и в положении 396 лейцином (MgFc59); или замещениями в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, в положении 305 изолейцином, и в положении 396 лейцином (MgFc88); или замещениями в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, и в положении 396 лейцином (MgFc88A); или замещениями в положении 234 лейцином, в положении 292 пролином, и в положении 300 лейцином (MgFc155); или замещениями в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, и в положении 300 лейцином; или замещениями в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, и в положении 396 лейцином; или замещениями в положении 243 лейцином, и в положении 292 пролином; замещениями в положении 243 лейцином; или замещением в положении 273 фенилаланином; или замещениями в положении 247 лейцином, в положении 270 глутаминовой кислотой и в положении 421 лизином.
В одном специфическомварианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит замены в положении 396 лейцином, в положении 270 глутаминовой кислотой и в положении 243 лейцином. В еще одном специфическом варианте осуществления молекула дополнительно содержит одну или несколько аминокислотных модификаций, таких как раскрытые в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, имеющий аминокислотную модификацию в одном или нескольких из следующих положений: 119, 125, 132, 133, 141, 142, 147, 149, 162, 166, 185, 192, 202, 205, 210, 214, 217, 219, 215, 216, 217, 218, 219, 221, 222, 223, 224, 225, 227, 288, 229, 231, 232, 233, 234, 235, 240, 241, 242, 243, 244, 246, 247, 248, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 258, 261, 262, 263, 268, 269, 270, 272, 273, 274, 275, 276, 279, 280, 281, 282, 284, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 295, 298, 300, 301, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 323, 326, 327, 328, 330, 333, 334, 335, 337, 339, 340, 343, 344, 345, 347, 348, 352, 353, 354, 355, 358, 359, 360, 361, 362, 365, 366, 367, 369, 370, 371, 372, 375, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 404, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 414, 415, 416417, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 427, 428, 431, 433, 435, 436, 438, 440, 441, 442, 443, 446, 447. Предпочтительно такие мутации приводят к образованию молекул, которые имеют измененную аффинность к FcγR и/или измененную опосредованную клетками эффекторную функцию, как было установлено при использовании способов, раскрытых и проиллюстрированных в данном документе и известных специалисту в данной области.
например
например
et al.
Immunology Letters
В некоторых вариантах осуществления молекулы, предпочтительно иммуноглобулины, настоящего изобретения дополнительно содержат один или несколько сайтов гликозилирования так, что одна или несколько углеводных частей ковалентно присоединяется к молекуле. Предпочтительно антитела настоящего изобретения с одним или несколькими сайтами гликозилирования и/или одним или несколькими модификациями в участке Fc имеют усиленную антитело-опосредованную эффекторную функцию, , повышенную активность ADCC. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение дополнительно содержит антитела, содержащие одну или несколько модификаций аминокислот, которые непосредственно или косвенно взаимодействуют с углеводной частью антитела, включая без ограничения аминокислоты в положениях 241, 243, 244, 245, 245, 249, 256, 258, 260, 262, 264, 265, 296, 299 и 301. Аминокислоты, которые непосредственно или косвенно взаимодействуют с углеводной частью антитела, известны в данной области, см., , Jefferis , 1995 , 44: 111-7, включенную в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
Фигура 41
Фигура 42
2
9
2
8
2
7
2
6
2
5
2
5
Glycosylation of Recombinant Antibody Therapeutics
et al
Assembly Of Asparagine-Linked Oligosaccharides
Гликозилирование это котрансляционная/посттрансляционная модификация, которая приводит к прикреплениюгликозилированного олигосахарида с высоким содержанием маннозы (GlcNAc2Man9Glu3), который впоследствии процессируется, сначала до структуры GlcNAcMan (“Man9”) (), а затем с получением GlcNAcMan (“Man8”), GlcNAcMan (“Man7”), GlcNAcMan (“Man6”) и, в конечном счете, структуры GlcNAcMan (“Man5”). Структура GlcNAcMan (“Man5”) затем процессируется последовательным действием гликозилтрансфераз с образованием олигосахаридов “G0F,” “G1F” и “G2F”, которые демонстрируют комплексную диантенную структуру () (Jefferis, R. (2005) “,” Biotechnol. Prog. 21:11-16; Kornfeld, R. . (1985) “,” Ann. Rev. Biochem. 54:631-664).
например
т.е.
например
et al.
.
"In Vitro Mutagenesis," Recombinant ДНК: A Short Course
Настоящее изобретение охватывает антитела, которые были модифицированы введением одного или нескольких сайтов гликозилирования в один или несколько сайтов антител, предпочтительно без изменения функциональных возможностей антитела, , связывающей активности с FcγR. Сайты гликозилирования могут быть введены в вариабельный и/или константный участок антител настоящего изобретения. Как используется в данном документе, “сайты гликозилирования” включают любую специфическую аминокислотную последовательность в антителе, к которой специфически ковалентной связью будет прикрепляться олигосахарид (, углевод, содержащий два или более простых сахара, соединенных вместе). Олигосахаридные боковые цепи типично связаны со скелетом антитела посредством либо N- либо O-связей. N-связанное гликозилирование относится к прикреплению олигосахаридной части к боковой цепи остатка аспарагина. O-связанное гликозилирование относится к прикреплению олигосахаридной части к гидроксиаминокислоте, , серину, треонину. Антитела настоящего изобретения могут содержать один или несколько сайтов гликозилирования, включая N-связанные и O-связанные сайты гликозилирования. Любой сайт гликозилирования для N-связанного или O-связанного гликозилирования, известный в данной области может быть использован в соответствии с настоящим изобретениемПримеромN-связанного сайта гилкозилировния, который полезен в соответствии со способами настоящего изобретения, является аминокислотная последовательность: Asn-X-Thr/Ser, где X может быть любой аминокислотой, и Thr/Ser обозначает треонин или серин. Такой сайт или сайты можно ввести в антитело настоящего изобретения, используя способы, хорошо известные в данной области, к которой принадлежит настоящее изобретение. См., например, , J. D. Watson, W.H. Freeman и Company, New York, 1983, chapter 8, pp. 106-116, которая включена в данный документ ссылкой во всей своей полноте. Типичный способ введения сайта гликозилирования в антитело настоящего изобретения может включать: модифицирование или мутацию аминокислотной последовательности антитела таким образом, что получается желаемая последовательность Asn-X-Thr/Ser.
например
например
например
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает способы модифицирования углеводного содержания антитела настоящего изобретения путем добавления или вырезания сайта гликозилирования. Способы модифицирования углеводного содержания антител хорошо известны в данной области и охватываются данным изобретением, см., , патент США № 6218149; европейский патент № 0359096 B1; публикацию заявки на патент США № 2002/0028486; WO 03/035835; публикацию заявки на патент США № 2003/0115614; патент США № 6218149; патент США № 6472511; все из которых включены в данный документ ссылкой во всей своей полноте. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает способы модифицирования углеводного содержания антитела настоящего изобретения путем вырезания одной или нескольких эндогенных углеводных частей антитела. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает сдвиг сайта гликозилирования участка Fc антитела путем модифицирования положения 297 (, аспарагин замещается остатком без доступной аминогруппы, , глутамином) и/или положений, примыкающих к 297. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает модификацию положения 296 так, что гликозилируется положение 296, а не положение 297.
et al
Fucosylation In Prokaryotes and Eukaryotes
et al
Two Mechanisms Of The Enhanced Antibody-Dependent Cellular Cytotoxicity (ADCC) Efficacy Of Non-Fucosylated Therapeutic Antibody In Human Blood
Фукозилированные углеводные структуры вовлечены в разнообразныебиологические и патологические процессы в эукариотических организмах, включая развитие тканей, ангиогенез, оплодотворение, адгезию клеток, воспаление и метастазирование опухолей (Ma, B. . (Epub 2006 Sep 14) “,” Glycobiology. 16(12):158R-184R). Было обнаружено, что терапевтические антитела с полным отсутствием фукозного кора Fc-олигосахаридов демонстрируют у людей гораздо более высокую ADCC, чем их фукозилированные аналоги (Iida, S. . (2009) “,” BMC Cancer. 18:9:58). Однако получение таких антител раньше требовало ферментативного удаления остатков фукозы (например, с использованием N-гликозидазы F), которые были добавлены к антителу с помощью гликозилазы.
Один аспект настоящего изобретения относится к распознаванию, какие вариации в участке Fc антитела могут вмешиваться в механизм клеточного гликозилирования и, таким образом, давать антитела, которые демонстрируют пониженную степень гликозилирования (и, в частности, фукозилирования).
например
например
например
in vivo,
Настоящее изобретение, таким образом, обеспечивает средства для получения антител, имеющих пониженную степень гликозилирования (и, в частности, фукозилирования) путем замещения одного или более, двух, трех, четырех, пяти или больше остатков нативных остатков Fc для того, чтобы сформировать вариантный участок Fc. Без намерения привязываться к какой-либо теории механизма действия полагается, что подходящие замены дают полипептид, имеющий вариантный участок Fc, который либо менее фукозилирован, чем нативный участок Fc, либо не фукозилирован совсем, и что такие полипептиды, благодаря своей измененной (или отсутствующей) степени гликозилирования (и, в частности, фукозилирования), демонстрируют улучшенную эффекторную функцию по сравнению с полипептидами, имеющими нативный участок Fc. Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды, которые содержат такие вариантные участки Fc, могут быть введены в клетки-хозяева (, клетки CHO, дрожжи и т.д.), включая клетки-хозяева, способные опосредовать нормальное гликозилирование (и, в частности, нормальное фукозилирование), но они будут экспрессироваться в полипептиды, которые меньше подвергаются посттрансляционной модификации гликозилазой (или фукозилазой) или не модифицируются посттрансляционно такими ферментами совсем по сравнению с полипептидами, содержащими нативные участки Fc и, таким образом, демонстрирующие улучшенную эффекторную функцию (, улучшенное связывание с активирующими рецепторами (, CD16A, CD32A) и ослабленное связывание с CD32B. Такое улучшение эфекторной функции можно измерить, используя анализ скорости диссоциации. Такой анализ обеспечивает наилучший показатель потенциального улучшения FcγR-связывающей активности потому что в качестве кинетической переменной он непосредственно отражает взаимодействие Fc-FcγR, независимое от концентрации антитела.
Как используется в данном документе, такая пониженная степень гликозилирования (и, в частности, фукозилирования) предпочтительно составляет менее чем 80%, более предпочтительно менее чем 60%, еще более предпочтительно менее чем 40%, и наиболее предпочтительно менее чем 20% от степени гликозилирования (и, в частности, фукозилирования), демонстрируемой таким антителом в отсутствие таких вариаций в его участке Fc. В более предпочтительном варианте осуществления такие вариации в участке Fc антитела будут элиминировать в значительной степени или полностью степень гликозилирования (и, в частности, фукозилирования), демонстрируемую таким антителом. Способность таких вариантов Fc снижать степень гликозилирования (и, в частности, фукозилирования) является общей характеристикой и проиллюстрирована в данном документе по отношению к антителам к Her2/neu.
например
Фигуру 42
Фигура 41
:
Настоящее изобретение, в частности, касается полипептидов (, антител), обладающих вариантными участками Fc, которые приводят к повышенному соотношению гликозилирования олигосахаридов с высоким содержанием маннозы к гликозилированию комплексных олихосахаридов. Как используется в данном документе, такое соотношение обозначает сравнение степени, до которой гликозилирование, демонстрируемое Fc-участком, является комплексным олигосахаридом либо G0F, G1F, либо G2F (см. ) со степенью, до которой гликозилирование, демонстрируемое Fc-участком, является Man5, Man6, Man7, Man8 или Man9 (см., ). Соотношение гликозилирования олигосахаридов с высоким содержанием маннозы к гликозилированию комплексных олихосахаридов, следовательно, представляет собой: Σ (% Man5 + % Man6 + % Man7 + % Man8 + % Man9)  Σ (% G0F + % G1F + % G2F). Предпочтительно повышенное соотношению гликозилирования олигосахаридов с высоким содержанием маннозы к гликозилированию комплексных олихосахаридов будет составлять более, чем около 0,2. Более предпочтительно, это соотношение будет более, чем около 0,5, еще более предпочтительно это соотношение будет более, чем около 1,0, более, чем около 1,5, более, чем около 2,0, более, чем около 2,5, более, чем около 3,0, более, чем около 3,5, более, чем около 4,0, более, чем около 4,5, более, чем около 5,0, более, чем около 5,5 или более, чем 6,0. Наиболее предпочтительно, когда верхние диапазоны такого соотношения будут менее, чем около 10, более предпочтительно, менее, чем около 9,5, менее, чем около 9, менее, чем около 8,5, менее, чем около 8, менее, чем около 7,5, менее чем, около 7, менее, чем около 6,5, менее, чем около 6 или менее, чем около 5,5. Специфические рассмотренные диапазоны такого соотношения включают более, чем около 0,2, но менее, чем около 5,5; более, чем около 0,5, но менее, чем около 5,5; более, чем около 1,0, но менее, чем около 5,5; более, чем около 2,0, но менее, чем около 5,5; более, чем около 3,0, но менее, чем около 5,5; более, чем около 4,0, но менее, чем около 5,5; и более, чем около 5,0, но менее, чем около 5,5.
Предпочтительно, варианты Fc, демонстрирующие пониженную степень гликозилирования (и, в частности, фукозилирования), содержат аминокислотную замену либо в одном из положений L234 и/или L235, либо в обоих этих положениях. Более предпочтительно, если такие варианты Fc будут дополнительно содержать по меньшей мере одну дополнительную аминокислотную замену в любом из следующих положений: F243, R292, Y300, V305 и/или P396. Таким образом, предпочтительные варианты Fc, демонстрирующие пониженную степень гликозилирования (и, в частности, фукозилирования), содержат замены аминокислот в любом из положений L234 и/или L235, либо в обоих этих положениях, и также в положении F243; положении R292; положении Y300; положении V305; положении P396; положениях F243 и R292; положениях F243 и Y300; положениях F243 и V305; положениях F243 и P396; положениях R292 и Y300; положениях R292 и V305; положениях R292 и P396; положениях Y300 и V305; положениях Y300 и P396; положениях V305 и P396; положениях F243, R292 и Y300; положениях F243, R292 и V305; положениях F243, R292 и P396; положениях F243, Y300 и V305; положениях F243, Y300 и P396; положениях F243, V305 и P396; положениях R292, Y300 и V305, положениях R292, Y300 и P396; положениях R292, V305 и P396; положениях Y300, V305 и P396; положениях F243, R292, Y300 и V305; положениях F243, R292, Y300 и P396; положениях F243, R292, V305 и P396; положениях F243, Y300, V305 и P396; положениях R292, Y300, V305 и P396; или положениях F243, R292, Y300, V305 и P396. L234 замещения L234F и/или L235 замещения L235V являются особенно предпочтительными.
6.1 ПОЛИПЕПТИДЫ И АНТИТЕЛА С ВАРИАНТНЫМИ УЧАСТКАМИ Fc
например
Специалист в данной области оценит то, что помимо замен аминокислот, настоящее изобретение рассматривает другие модификации аминокислотной последовательности участка Fc для того, чтобы получить вариантные участки Fc с одним или несколькими измененными свойствами, , измененной эффекторной функцией. Настоящее изобретение рассматривает делеции одного или нескольких аминокислотных остатков участка Fc с целью ослабления связывания с FcγR. Предпочтительно, в соответствии с этим вариантом осуществления настоящего изобретения вырезается не более 5, не более 10, не более 20, не более 30, не более 50 остатков участка Fc. Участок Fc данного изобретения, содержащий одну или несколько делеций аминокислот, будет предпочтительно сохранять по меньшей мере, приблизительно 80%, и предпочтительно по меньшей мере приблизительно 90%, и наиболее предпочтительно по меньшей мере приблизительно 95%, участка Fc дикого типа. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько свойств молекул сохраняются, такие как, например, неиммуногенность, FcγRIIIA-связывание, FcγRIIA-связывание или сочетание этих свойств.
В альтернативныхвариантах осуществления настоящее изобретение охватывает вставки аминокислот для того, чтобы получить вариантные участки Fc, которые имеют измененные свойства, включая измененную эффекторную функцию. В одном специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает введение по меньшей мере одного аминокислотного остатка, например, одного или двух аминокислотных остатков, и предпочтительно не более 10 аминокислотных остатков, примыкающих к одному или нескольким положениям участка Fc, определенным в данном изобретении. В альтернативных вариантах осуществления настоящее изобретение далее охватывает введение по меньшей мере одного аминокислотного остатка, например, одного или двух аминокислотных остатков, и предпочтительно не более 10 аминокислотных остатков, примыкающих к одному или нескольким положениям участка Fc, известным на данном уровне технологии в качестве влияющих на взаимодействие и/или связывание с FcγR.
например
Настоящее изобретение также охватывает включение искусственных аминокислот для получения вариантных Fc настоящего изобретения. Такие способы известны специалистам в данной области техники, например, те, которые используются в естественном биосинтетическом аппарате для того, чтобы сделать возможным включение искусственных аминокислот в белки, см., , Wang et al., 2002 Chem. Comm. 1: 1-11; Wang et al., 2001, Science, 292: 498-500; van Hest et al., 2001. Chem. Comm. 19: 1897-1904, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте. Альтернативные стратегии сфокусированы на ферментах, ответственных за биосинтез аминоацил-тРНК, смотри, например, Tang et al., 2001, J. Am. Chem. 123(44): 11089-11090; Kiick et al., 2001, FEBS Lett. 505(3): 465; каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
Таблицу 5
in vitro
т.е.
in vitro
in vitro
например
например
Аффинности и связывающие свойства вариантныхFc или их фрагментов, использующихся в данном изобретении, первоначально определяются с использованием системы индикации для дрожжей, предпочтительно в сочетаниями с анализами  (биохимическими или иммунологическими анализами), известными на данном уровне техники для определения взаимодействий Fc-FcγR,  специфического связывания участка Fc с FcγR, включая без ограничения анализы ELISA, поверхностный плазмонный резонанс, иммунопреципитацию (Смотри Раздел 6.2.1). В определенных вариантах осуществления кандидаты вариантных Fc, идентифицированные с использованием системы индикации для дрожжей, далее встраиваются в антитело или его фрагмент для тестирования в указанном анализе . Предпочтительно, связывающие свойства молекулы настоящего изобретения также характеризуются функциональными анализами  для определения одной или нескольких FcγR-опосредованных функций эффекторных клеток (Смотри Раздел 6.2.5). Такие способы были ранее раскрыты изобретателями, смотри, , публикации патентных заявок США 2005/0037000 и 2005/0064514, публикацию международной патентной заявки WO 04/063351, каждая из которых включена в данный документ ссылкой во всей своей полноте, и были использованы для идентификации и характеристики новых мутаций Fc на основе связывающих характеристик с FcγRIIIA и FcγRIIB, смотри, , .
<b>ТАБЛИЦА 5</b><b>Fc МУТАЦИИ, ОПРЕДЕЛЕННЫЕ С ПОМОЩЬЮ ДРОЖЖЕВОГО ДИСПЛЕЯ И ИСПЫТАНИЯ ELISA</b>
<b>Клон #</b>
<b>Сайты мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>IIIA</b><b>связывание</b>
<b>IIB связывание</b>
4
A339V, Q347H
CH2, CH3
<b>+</b>
<b>+</b>
5
L251P, S415I
CH2, CH3
<b>+</b>
<b>+</b>
8
V185M, K218N, R292L, D399E
CH1, шарнир, CH2,CH3
<b>без изменений</b>
<b>-</b>
12
K290E, L142P
CH1,CH2
<b>+</b>
<b>не испытан</b>
16
A141V, H268L, K288E, P291S
CH1,CH2
<b>-</b>
<b>не испытан</b>
19
L133M, P150Y, K205E, S383N, N384K
CH1,CH2,CH3
<b>-</b>
<b>не испытан</b>
21
P396L
CH3
•
<b>•+</b>
<b>ТАБЛИЦА 5</b><b>Fc МУТАЦИИ, ОПРЕДЕЛЕННЫЕ С ПОМОЩЬЮ ДРОЖЖЕВОГО ДИСПЛЕЯ И ИСПЫТАНИЯ ELISA</b>
<b>Клон #</b>
<b>Сайты мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>IIIA</b><b>связывание</b>
<b>IIB связывание</b>
25
P396H
CH3
<b>•••</b>
<b>••</b>
6
K392R
CH3
<b>без изменений</b>
<b>без изменений</b>
15
R301C, M252L, S192T
CH1,CH2
<b>-</b>
<b>не испытан</b>
17
N315I
CH2
<b>без изменений</b>
<b>не испытан</b>
18
S132I
CH1
<b>без изменений</b>
<b>не испытан</b>
26
A162V
CH1
<b>без изменений</b>
<b>не испытан</b>
27
V348M, K334N, F275I, Y202M, K147T
CH1,Ch2
<b>+</b>
<b>+</b>
29
H310Y, T289A, G337E
CH2
<b>-</b>
<b>не испытан</b>
30
S119F, G371S, Y407N, E258D
CH1,CH2,CH3
<b>+</b>
<b>без изменений</b>
31
K409R, S166N
CH1,CH3
<b>без изменений</b>
<b>не испытан</b>
20
S408I, V215I, V125I
CH1,Шарнир,CH3
<b>+</b>
<b>без изменений</b>
24
G385E, P247H
CH2, CH3
<b>•••</b>
<b>+</b>
16
V379M
CH3
<b>••</b>
<b>без изменений</b>
17
S219Y
Шарнир
•
<b>-</b>
18
V282M
CH2
•
<b>-</b>
31
F275I, K334N, V348M
CH2
<b>+</b>
<b>без изменений</b>
35
D401V
CH3
<b>+</b>
<b>без изменений</b>
37
V280L, P395S
CH2
<b>+</b>
<b>-</b>
40
K222N
Шарнир
•
<b>без изменений</b>
41
K246T, Y319F
CH2
•
<b>без изменений</b>
42
F243I, V379L
CH2,CH3
<b>•+</b>
<b>-</b>
43
K334E
CH2
<b>•+</b>
<b>-</b>
44
K246T, P396H
CH2,CH3
•
<b>••+</b>
45
H268D, E318D
CH2
<b>•+</b>
<b>•••••</b>
49
K288N, A330S, P396L
CH2,CH3
<b>•••••</b>
<b>•••</b>
50
F243L, R255L, E318K
CH2
•
<b>-</b>
53
K334E, T359N, T366S
CH2,CH3
•
<b>без изменений</b>
54
I377F
CH3
<b>•+</b>
<b>+</b>
57
K334I
CH2
•
<b>без изменений</b>
58
P244H, L358M, V379M, N384K, V397M
CH2,CH3
<b>•+</b>
<b>•+</b>
<b>ТАБЛИЦА 5</b><b>Fc МУТАЦИИ, ОПРЕДЕЛЕННЫЕ С ПОМОЩЬЮ ДРОЖЖЕВОГО ДИСПЛЕЯ И ИСПЫТАНИЯ ELISA</b>
<b>Клон #</b>
<b>Сайты мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>IIIA</b><b>связывание</b>
<b>IIB связывание</b>
59
K334E, T359N, T366S(независимый изолят)
CH2,CH3
<b>•+</b>
<b>без изменений</b>
61
I377F<b></b>(независимый изолят)
CH3
<b>•••</b>
<b>••+</b>
62
P247L
CH2
<b>••</b>
<b>••+</b>
64
P217S, A378V, S408R
Шарнир, CH3
<b>••</b>
<b>••••+</b>
65
P247L, I253N, K334N
CH2
<b>•••</b>
<b>••+</b>
66
K288M, K334E
CH2
<b>•••</b>
<b>-</b>
67
K334E, E380D
CH2,CH3
<b>•+</b>
<b>-</b>
68
P247L (независимый изолят)
CH2
<b>+</b>
<b>••••</b>
69
T256S, V305I, K334E, N390S
CH2,CH3
<b>•+</b>
<b>без изменений</b>
70
K326E
CH2
<b>•+</b>
<b>••+</b>
71
F372Y
CH3
<b>+</b>
<b>•••••+</b>
72
K326E (независимый изолят)
CH2
<b>+</b>
<b>••</b>
74
K334E, T359N, T366S(независимый изолят)
CH2,CH3
<b>••</b>
<b>без изменений</b>
75
K334E (независимый изолят)
CH2
<b>••+</b>
<b>без изменений</b>
76
P396L (независимый изолят)
CH3
<b>•+</b>
<b>без изменений</b>
78
K326E (независимый изолят)
CH2
<b>••</b>
<b>•••+</b>
79
K246I, K334N
CH2
•
<b>••••</b>
80
K334E (независимый изолят)
CH2
•
<b>без изменений</b>
81
T335N, K370E, A378, T394M, S424L
CH2,CH3
•
<b>без изменений</b>
82
K320E, K326E
CH2
•
•
84
H224L
Шарнир
•
<b>•••••</b>
87
S375C, P396L
CH3
<b>•+</b>
<b>••••+</b>
89
E233D, K334E
CH2
<b>•+</b>
<b>без изменений</b>
91
K334E (независимый изолят)
CH2
•
<b>без изменений</b>
92
K334E (независимый изолят)
CH2
•
<b>без изменений</b>
94
K334E, T359N, T366S, Q386R
CH2
•
<b>без изменений</b>
относительно сравнимой молекулы с Fc-участком дикого типа, • ≡ 1-кратное повышение аффинности; + ≡ до 50% повышение аффинности; и - ≡ 1-кратное понижение аффинности
in vivo
in vitro
in vitro,
in vivo
В самыхпредпочтительных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения имеют связывающие свойства в моделях  (таких как раскрытые здесь и/или известные в данном уровне техники), сходные со свойствами, установленными в анализах . Однако, настоящее изобретение не исключает молекулы настоящего изобретения, которые не демонстрируют желаемый фенотип в анализах но демонстрируют желаемый фенотип . Репрезентативная схема последовательности операций скрининга и характеристики молекул настоящего изобретения описана на ФИГ. 1.
.
Настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, который связывается с более высокой аффинностью с одним или несколькими FcγRs. Такие молекулы предпочтительно опосредуют эффекторную функцию более эффективно, как обсуждается ниже В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, который связывается с более низкой аффинностью с одним или несколькими FcγRs. Снижение или элиминация эффекторной функции желательны в определенных случаях, например, в случае антител, чей механизм действия включает блокировку или антагонизм, но не уничтожение клеток, несущих антиген-мишень. Снижение или элиминация эффекторной функции были бы желательны в случаях аутоиммунных заболеваних, где блокировались бы активирующие рецепторы block FcγR в эффекторных клетках (Этот тип функции присутствовал бы в клетках-хозяевах). В основном, повышенная эффекторная функция направлена против опухолей и чужеродных клеток.
Варианты Fc настоящего изобретения могут комбинироваться с другими модификациями Fc, включая без ограничения модификации, которые меняют эффекторную функцию. Настоящее изобретение охватывает сочетания вариантных Fc настоящего изобретения с другими модификациями Fc с целью обеспечения добавочных, синергичных или новых свойств антител или интеграцию Fc. Предпочтительно, вариантные Fc настоящего изобретения усиливают фенотип модификации, с которой они комбинируются. Например, если вариант Fc настоящего изобретения комбинируется с мутантом, о котором известно, что он связывается с FcγRIIIA с большей аффинностью, чем соответствующая молекула, содержащая участок Fc дикого типа, комбинация с мутантом настоящего изобретения приводит к более многократному увеличению аффинности к FcγRIIIA.
В одном варианте осуществления варианты Fc настоящего изобретения могут комбинироваться с другими известными вариантными Fc, такими как раскрытые в Duncan et al, 1988, Nature 332:563-564; Lund et al., 1991, J. Immunol 147:2657-2662; Lund et al, 1992, Mol Immunol 29:53-59; Alegre et al, 1994, Transplantation 57:1537-1543; Hutchins et al. , 1995, Proc Natl. Acad Sci U S A 92:11980-11984; Jefferis et al, 1995, Immunol Lett. 44:111-117; Lund et al., 1995, Faseb J 9:115-119; Jefferis et al, 1996, Immunol Lett 54:101-104; Lund et al, 1996, J Immunol 157:49634969; Armour et aL, 1999, Eur J Immunol 29:2613-2624; Idusogie et al, 2000, J Immunol 164:41784184; Reddy et al, 2000, J Immunol 164:1925-1933; Xu et al., 2000, Cell Immunol 200:16-26; Idusogie et al, 2001, J Immunol 166:2571-2575; Shields et al., 2001, J Biol Chem 276:6591-6604; Jefferis et al, 2002, Immunol Lett 82:57-65; Presta et al., 2002, Biochem Soc Trans 30:487-490); US 5624821; US 5885573; US 6194551; PCT WO 00/42072; PCT WO 99/58572; каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
т.е.
В некоторых вариантах осуществления вариантные Fc настоящего изобретения встроены в антитело или в объединение Fc, которое содержит одну или несколько сконструированных гликоформ,  углеводную композицию, ковалентно прикрепленную к молекуле, содержащей участок Fc, где указанная углеводная композиция химически отличается от композиции исходной молекулы, содержащей участок Fc. Сконструированные гликоформы могут быть полезны для разнообразных целей, включая без ограничения усиление или ослабление эффекторной функции. Сконструированные гликоформы можно получить любым способом, известным специалисту в данной области, например, используя сконструированные штаммы или вариантные экспрессирующие штаммы, коэкспрессией с одним или несколькими ферментами, например, DI N-ацетилглюкозаминилтрансферазой III (GnTI11), экспрессией молекулы, содержащей участок Fc в различных организмах или клеточных линиях из различных организмов или модификацией углевода(ов) после того, как молекула, содержащая участок Fc, была экспрессирована. Способы производства сконструированных гликоформ известны в данном уровне техники, и включают без ограничения те, которые описаны в Umana et al, 1999, Nat. Biotechnol 17:176-180; Davies et al., 20017 Biotechnol Bioeng 74:288-294; Shields et al, 2002, J Biol Chem 277:26733-26740; Shinkawa et aL, 2003, J Biol Chem 278:3466-3473) US 6602684; USSN 10/277370; USSN 10/113929; PCT WO 00/61739A1; PCT WO 01/292246A1; PCT WO 02/311140A1; PCT WO 02/30954A1; Potillegent™ technology (Biowa, Inc. Принстон, Нью-Джерси); GlycoMAb™ glycosylation engineering technology (GLYCART biotechnology AG, Цюрих, Швейцария); каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте. См., например, WO 00061739; EA01229125; US 20030115614; Okazaki et al., 2004, JMB, 336: 1239-49, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
Вариантные Fc настоящего изобретения могут быть оптимизированы для разнообразия свойств. Свойства, которые могут быть оптимизированы, включают без ограничения повышенную или сниженную аффинность к FcγR, усиленную или ослабленную эффекторную функцию. В предпочтительном варианте осуществления вариантные Fc настоящего изобретения оптимизированы так, чтобы они обладали повышенной аффинностью к активирующему рецептору FcγR человека, предпочтительно FcγR, FcγRIIA, FcγRIIc, FcγRIIIA, и FcγRIIIB, наиболее предпочтительно к FcγRIIIA. В альтернативном предпочтительном варианте осуществления вариантные Fc оптимизированы так, чтобы они обладали пониженной аффинностью к ингибирующему рецептору FcγRIIB человека. Ожидается, что эти предпочтительные варианты осуществления обеспечат и объединения Fc с усиленными терапевтическими свойствами у людей, например, усиленной эффекторной функцией и более высокой противораковой активностью, как описано и проиллюстрировано в данном документе. Ожидается, что эти предпочтительные варианты осуществления обеспечат и объединения Fc со способностью к усиленной элиминации опухолей на моделях ксенотрансплантатов опухолей у мышей.
В альтернативном варианте осуществления вариантные Fc настоящего изобретения оптимизированы так, чтобы иметь сниженную аффинность к человеческому FcγR, включая без ограничения к FcγRI, FcγRIIA, FcγRIIB, FcγRIIc, FcγRIIIA и FcγRIIIB. Ожидается, что эти варианты осуществления обеспечат антитела и объединения Fc с повышенными терапевтическими свойствами у людей, например, сниженной эффекторной функцией и сниженной токсичностью.
например
В альтернативныхвариантах осуществления вариантные Fc настоящего изобретения обладают повышенной или пониженной аффинностью к FcγRs из нечеловеческих организмов, включая без ограничения мышей, крыс, кроликов и обезьян. Вариантные Fc, которые оптимизированы для связывания нечеловеческих FcγR, могут найти применение в экспериментальных работах. Например, модели на мышах доступные для разнообразных заболеваний, которые дают возможность тестировать такие свойства, как эффективность, токсичность и фармакокинетику кандидата в лекарственные средства. Как известно в данном уровне техники, клетки злокачественной опухоли могут быть трансплантированы или введены в мышей для имитации злокачественной опухоли человека, процесс, называемый ксенотрансплантацией. Тестирование антител или объединений Fc, которые содержат вариантные Fc, оптимизированные для одного или нескольких мышинных FcγRs, могут предоставить ценную информацию в отношении эффективности антитела или объединения Fc, его механизма действия и т.п. В определенных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантный участок Fc человека, тестируются на трансгенных мышах, экспрессирующих один или несколько рецепторов Fcγ человека (, FcγRIIIA, FcγRIIA, FcγRIIB).
например
например
in vivo
В то время какпредпочтительным является изменение связыванияс FcγR, настоящее изобретение далее рассматривает вариантные Fc с измененной аффинностью связывания с неонатальным рецептором (FcRn). Хотя, не намереваясь привязываться к конкретному механизму действия, ожидается, что вариантные участки Fc с улучшенной аффинностью к FcRn будут иметь более длительный период полураспада в сыворотке, и такие молекулы будут иметь полезное применение в способах лечения млекопитающих, где желателен более длительный период полураспада в сыворотке применяемого полипептида, , для лечения хронического заболевания или расстройства. Хотя, не намереваясь привязываться к конкретному механизму действия, ожидается, что варианты участка Fc с пониженной аффинностью связывания с FcRn, наоборот, будут иметь более короткий период полураспада в сыворотке, и такие молекулы могут, например, применяться у млекопитающего, где сокращенное время циркуляции может быть выгодным, , для диагностической визуализации  или для полипептидов, которые имеют токсические побочные эффекты при циркуляции в кровеносном потоке на протяжении длительных периодов. Ожидается, что варианты участка Fc с пониженной аффинностью связывания с FcRn будут с меньшей вероятностью проникать через плаценту, и таким образом, могут быть использованы в лечении заболеваний или расстройств беременных женщин.
В других вариантах осуществления эти варианты могут быть скомбинированы с другими известными модификациями Fc с измененной аффинностью к FcRn, такими как раскрытые в международных публикациях №№ WO 98/23289; и WO 97/34631; и патенте США №6277375, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
in vivo,
т.е.
например
in vivo
in vivo
например
Настоящее изобретение охватывает любой другой способ, известный в данном уровне техники, для производства антител, имеющих увеличенный срок полураспада  например, путем введения одной или нескольких аминокислотных модификаций ( замещения, вставки или делеции) в константный домен IgG или его FcRn-связывающий фрагмент (предпочтительно Fc или фрагмент шарнирного Fc-домена). Смотри, , международные публикации №№ WO 98/23289; и WO 97/34631; и патент США №6277375, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте для использования в комбинации с вариантными Fc настоящего изобретения. Далее, антитела настоящего изобретения могут быть конъюгированы с альбумином, чтобы получить антитело или фрагмент антитела, более стабильные  или имеющие более длительный срок полураспада . Методики, хорошо известные на данном уровне техники, смотри в, , международных публикациях №№ WO 93/15199, WO 93/15200, и WO 01/77137, и Европейском патенте № EP 413622, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
Вариант(ы),описанный(е) в данном документе могут подвергаться дальнейшим модификациям, часто зависящим от намеченного применения варианта. Такие модификации могут включать дальнейшее изменение аминокислотной последовательности (замещение, вставка и/или делеция аминокислотных остатков), слияние с гетерологическими пептидом(ами) и/или ковалентные модификации. Такие дальнейшие модификации могут производиться до, одновременно с или после аминокислотной(ых) модификацией(ями), раскрытой в данном документе, которые ведут к изменению свойств, например, изменению связывания с рецептором Fc и/или активности ADCC .
in vitro
in vivo
например
например
Альтернативно или дополнительно, настоящее изобретение охватывает комбинирование аминокислотных модификаций, раскрытых в данном документе, с одной или несколькими дополнительными аминокислотными модификациями, которые меняют связывание с C1q и/или комплемент-зависимую цитотоксическую функцию участка Fc, как было определено  и/или . Предпочтительно, исходная молекула, представляющая особый интерес в данном документе, является той, которая обычно связывается с C1q и обнаруживает комплемент-зависимую цитотоксичность (CDC). Дальнейшие аминокислотные замещения, описанные в данном документе, будут в целом служить для изменения способности исходной молекулы связываться с C1q и/или модификации ее комплемент-зависимой цитотоксической функции, , чтобы снизить и, предпочтительно, разрушить эти эффекторные функции. В других вариантах осуществления молекулы, содержащие замещения в одном или нескольких из описанных положений, с улучшенным связыванием C1q и/или комплемент-зависимой цитотоксической (CDC) функцией рассматриваются в данном документе. Например, исходная молекула может быть неспособна связывать C1q и/или опосредовать CDC, и ее можно модифицириовать в соответствиями с указаниями в данном документе так, чтобы она приобрела эти эффекторные функции в дальнейшем. Более того, молекулы с уже существующей способностью к связыванию C1q и необязательно имеющие способность опосредовать CDC можно модифицировать так, чтобы одна или обе эти активности были изменены, , повышены. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает вариантные участки Fc с измененной CDC активностью без изменения связывания C1q. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает вариантные участки Fc с измененной CDC активностью и измененным связыванием C1q.
et al.
J. Immunol
et al.
J. Immunol.
Чтобы получить участок Fc с измененным связыванием C1q и/или комплемент-зависимой цитотоксичской (CDC) функцией, положения аминокислот, которые должны быть модифицированы, обычно выбираются из следующих положений: 270, 322, 326, 327, 329, 331, 333 и 334, где нумерация остатков в тяжелой цепи IgG это та, которая принята в индексации Евросоюза, как в Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (199). Эти аминокислотные модификации могут быть скомбинированы с одной или несколькими Fc-модификациями, раскрытыми в данном документе, для получения синергичного или дополнительного эффекта на связывание C1q и/или CDC активность. В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает варианты Fc с измененным связыванием C1q и/или комплемент-зависимой цитотоксической (CDC) функцией, содержащие замещение аминокислоты в положении 396 на лейцин и в положении 255 на лейцин; или замещение аминокислоты в положении 396 на лейцин и в положении 419 на гистидин; замещение аминокислоты в положении 396 на лейцин и в положении 370 на глутаминовую кислоту; замещение аминокислоты в положении 396 на лейцин и в положении 240 на аланин; замещение аминокислоты в положении 396 на лейцин и в положении 392 на треонин; замещение аминокислоты в положении 247 на лейцин и в положении 421 на лизин. Настоящее изобретение охватывает любые известные модификации участка Fc, которые изменяют связывание C1q и/или комплемент-зависимую цитотоксическую (CDC) функцию, такие как раскрытые в Idusogie , 2001, . 166(4) 2571-5; Idusogie ,  2000 164(8): 4178-4184; каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
например
например,
например,
Как раскрыто выше, настоящее изобретение охватывает участок Fc с измененной эффекторной функцией, , модифицированным связыванием C1q и/или FcR и, таким образом, измененной CDC активностью и/или ADCC активностью. В специфических вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает вариантные участки Fc с улучшенным связыванием C1q и FcγRIII;  имеющие улучшенные ADCC и CDC активности. В альтернативных вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает вариантные участки Fc с пониженной CDC активностью и/или пониженной ADCC активностью. В других вариантах осуществления можно повысить только одну из этих активностей и факультативно также снизить другую активность, создать вариантный участок Fc с улучшенной ADCC активностью, но со сниженной CDC активностью, и наоборот.
6.1.1 МУТАНТЫ С ПОВЫШЕННЫМИ ИЗМЕНЕННЫМИ АФФИННОСТЯМИ К FCγRIIIA И/ИЛИ FCγRIIA
например
например
например
Настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантный участок Fc, имеющие одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещений) в одном или нескольких участках, где такие модификации меняют аффинность вариантного участка Fc к активирующему FcγR. В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный участок Fc, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещений) в одном или нескольких участках, где эти модификации повышают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIIA и/или FcγRIIA по меньшей мере в 2 раза по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа. В другом специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный участок Fc, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещений) в одном или нескольких участках, где эти модификации повышают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIIA и/или FcγRIIA больше, чем в 2 раза по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа. В других вариантах осуществления настоящего изобретения одна или несколько аминокислотных модификаций повышают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIIA и/или FcγRIIA по меньшей мере в 3 раза, 4 раза, 5 раз, 6 раз, 8 раз или 10 раз по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа. В других вариантах осуществления настоящего изобретения одна или несколько аминокислотных модификаций снижают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIIA и/или FcγRIIA по меньшей мере в 3 раза, 4 раза, 5 раз, 6 раз, 8 раз или 10 раз по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа. Увеличения такой кратности предпочтительно определять с помощью ELISA или поверхностного плазмонного резонанса. В специфическом варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций не включают замещения ни в одном из положений 329, 331 или 322 никакой аминокислотой. В определенных вариантах осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций не включают замещение аланином ни в одном из положений 256, 290, 298, 312, 333, 334, 359, 360 или 430; лизином в положении 330; треонином в положении 339; метионином в положении 320; серином, аспарагином, аспарагиновой кислотой или глутаминовой кислотой в положении 326; глутамином, глутаминовой кислотой, метионином, гистидином, валином или лейцином в положении 334. В еще одном специфическом варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций не включают или сами не являются заместителями ни в одном из положений 280, 290, 300, 294 или 295. В еще одном более специфическом варианте осуществления, одна или несколько аминокислотных модификаций не включают сами не являются заместителями в положении 300 лейцином или изолейцином; в положении 295 лизином; в положении 294 аспарагином; в положении 298 валином; аспарагиновой кислотой, пролином, аспарагином или валином; в положении 280 гистидином, глутамином или тирозином; в положении 290 серином, глицином, треонином или тирозином.
например
например
В другом специфическом вариантеосуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный участок Fc, где указанный вариантный участок Fc содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа так, что указанный полипептид специфически связывается с FcγRIIA через свой участок Fc с более высокой аффинностью, чем соответствующая молекула, содержащая участок Fc дикого типа, связывает FcγRIIA при условии, что указанный вариантный участок Fc не имеет аланина ни в одном из следующих положений 256, 290, 326, 255, 258, 267, 272, 276, 280, 283, 285, 286, 331, 337, 268, 272 или 430; аспарагина в положении 268; глутамина в положении272; глутамина, серина или аспарагиновой кислоты в положении 286; серина в положении 290; метионина, глутамина, глутаминовой кислоты или аргинина в положении 320; глутаминовой кислоты в положении 322; серина, глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты в положении 326; лизина в положении 330; глутамина в положении 335; или метионина в положении 301. В специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный участок Fc, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещений) в одном или нескольких участках, где эти модификации повышают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIA по меньшей мере в 2 раза по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа. В другом специфическом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный участок Fc, содержащий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещений) в одном или нескольких участках, где эти модификации повышают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIA больше, чем в 2 раза по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа. В других вариантах осуществления настоящего изобретения одна или несколько аминокислотных модификаций повышают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIA по меньшей мере в 3 раза, 4 раза, 5 раз, 6 раз, 8 раз или 10 раз по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа.
например
например
В специфическомварианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулы, предпочтительно полипептиды, и более предпочтительно иммуноглобулины (, антитела), содержащие вариантный участок Fc, имеющий одну или несколько аминокислотных модификаций (, замещений, но также сюда включаются вставки или делеции), которые повышают аффинность вариантного участка Fc к FcγRIIIA и/или FcγRIIA по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 99%, по меньшей мере на 100%, по меньшей мере на 150%, и по меньшей мере на 200% по сравнению с соответствующей молекулой, содержащей участок Fc дикого типа.
Таблице 3.
in vitro
В специфическомварианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций, которые повышают аффинность вариантного участка Fc к одному или нескольким активирующим FcγRs, содержат замещение в положении 347 гистидином и в положении 339 валином; или замещение в положении 425 изолейцином и в положении 215 фенилаланином; или замещение в положении 408 изолейцином, в положении 215 изолейцином, и в положении 125 лейцином; или замещение в положении 385 глутаминовой кислотой и в положении 247 гистидином; или замещение в положении 348 метионином, в положении 334 аспарагином, в положении 275 изолейцином, в положении 202 метионином и в положении 147 треонином; или замещение в положении 275 изолейцином, в положении 334 аспарагином и в положении 348 метионином; или замещение в положении 279 лейцином и в положении 395 серином; или замещение в положении 246 треонином и в положении 319 фенилаланином; или замещение в положении 243 изолейцином и в положении 379 лейцином; или замещение в положении 243 лейцином, в положении 255 лейцином и в положении 318 лизином; или замещение в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином и в положении 366 серином; или замещение в положении 288 метионином и в положении 334 глутаминовой кислотой; или замещение в положении 334 глутаминовой кислотой и в положении 380 аспарагиновой кислотой; или замещение в положении 256 серином, в положении 305 изолейцином, в положении 334 глутаминовой кислотой и в положении 390 серином; или замещение в положении 335 аспарагином, в положении 370 глутаминовой кислотой, в положении 378 валином, в положении 394 метионином и в положении 424 лейцином; или замещение в положении 233 аспарагиновой кислотой и в положении 334 глутаминовой кислотой; или замещение в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином, в положении 366 серином и в положении 386 аргинин; или замещение в положении 246 треонином и в положении 396 гистидином; или замещение в положении 268 аспарагиновой кислотой и в положении 318 аспарагиновой кислотой; или замещение в положении 288 аспарагином, в положении 330 серином и в положении 396 лейцином; или замещение в положении 244 гистидином, в положении 358 метионином, в положении 379 метионином, в положении 384 лизином и в положении 397 метионином; или замещение в положении 217 серином, в положении 378 валином и в положении 408 аргинином; или замещение в положении 247 лейцином, в положении 253 аспарагином и в положении 334 аспарагином; или замещение в положении 246 изолейцином и в положении 334 аспарагином; или замещение в положении 320 глутаминовой кислотой и в положении 326 глутаминовой кислотой; или замещение в положении 375 цистеином и в положении 396 лейцином; или замещение в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замещение в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином и в положении 396 лейцином; или замещение в положении 234 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 300 лейцином; или замещение в положении 234 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 396 лейцином; или замещение в положении 234 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 305 изолейцином; или замещение в положении 234 лейцином и в положении 292 пролином; или замещение в положении 234 лейцином; или замещение в положении 247 лейцином, в положении 270 глутаминовой кислотой и в положении 421 лизином. Примеры других замещений аминокислот, которые приводят к повышенной аффинности к FcγRIIIA , раскрываются ниже и обобщены в
Настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 243 изолейцином и в положении 379 лейцином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 1,5 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 288 аспарагином, в положении 330 серином и в положении 396 лейцином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 5 раз выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 243 лейцином и в положении 255 лейцином так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 1 раз выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином и в положении 366 серином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 1,5 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 288 метионином и в положении 334 глутаминовой кислотой, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 3 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 316 аспарагиновой кислотой, в положении 378 валином и в положении 399 глутаминовой кислотой, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 1,5 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления, настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 315 изолейцином, в положении 379 метионином и в положении 399 глутаминовой кислотой, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 1 раз выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 243 изолейцином, в положении 379 лейцином и в положении 420 валином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 2,5 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 247 лейцином и в положении 421 лизином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 3 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положение 392 треонином и в положении 396 лейцином так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 4,5 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 293 валином, в положении 295 глутаминовой кислотой и в положении 327 треонином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 1,5 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 268 аспарагином и в положении 396 лейцином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 2 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает молекулу, содержащую вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит замену в положении 319 фенилаланином, в положении 352 лейцином и в положении 396 лейцином, так, чтобы указанная молекула связывала FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 2 раза выше, чем аффинность, с которой сравнимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, как установлено с помощью испытания ELISA.
В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, где указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 396 гистидином. В специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, где указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 248 метионином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с аффинностью, сходной со сравнимым полипептидом, содержащим Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 392 аргинином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с аффинностью, сходной со сравнимым полипептидом, содержащим Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 315 изолейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с аффинностью, сходной со сравнимым полипептидом, содержащим Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 132 изолейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с аффинностью, сходной со сравнимым полипептидом, содержащим Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 162 валином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 396 лейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 379 метионином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 219 тирозином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 282 метионином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 401 валином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 222 аспарагином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 334 глутаминовой кислотой. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 377 фенилаланином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 334 изолейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислота модификация содержит замену в положении 247 лейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 326 глутаминовой кислотой. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислота модификация содержит замену в положении 372 тирозином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 224 лейцином.
Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 275 тирозином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 398 валином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 334 аспарагином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 400 пролином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 407 изолейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 372 тирозином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с аффинностью, сходной со сравнимым полипептидом, содержащим Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 366 аспарагином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более низкой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 414 аспарагином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более низкой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 225 серином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более низкой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 377 аспарагином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 243 лейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 292 пролином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 300 лейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 305 изолейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 396 лейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с более высокой аффинностью, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 273 фенилаланином.
В специфическом варианте осуществления, настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 2 раза выше, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как установлено с помощью испытания ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 379 метионином. В другом специфическом варианте осуществления настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, чтобы указанный полипептид специфично связывал FcγRIIIA с аффинностью приблизительно в 1,5 раза выше, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как установлено с помощью испытания ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 248 метионином.
in vitro
т.е.
in vitro
например
например
in vitro
in vivo
in vitro
in vivo
В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения имеют измененную аффинность к FcγRIIIA и/или FcγRIIA, как было определено, применяя испытания  (биохимические или иммунологические испытания), известные на данном уровне техники, для определения взаимодействий Fc-FcγR, , специфического связывания Fc-участка с FcγR, включая, но без ограничения, испытания ELISA, испытания поверхностного плазмонного резонанса и испытания иммунопреципитации (См. Раздел 6.2.5.1). Предпочтительно связывающие свойства этих молекул с измененными аффинностями для активирующих рецепторов FcγR также коррелируют с их активностью, как определено  функциональными анализами для определения одной или нескольких FcγR опосредованных функций эффекторных клеток (См. Раздел 6.2.7), , молекулы с вариантными Fc-участками с повышенной аффинностью к FcγRIIIA имеют повышенную ADCC активность. В наиболее предпочтительных вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения, которые имеют измененные свойства связывания по отношению к активирующему Fc рецептору,, FcγRIIIA в испытании  также имеет измененное свойство связывания в моделях  (таких, как описанные и раскрытые в данном документе). Однако настоящее изобретение не исключает молекулы настоящего изобретения, которые не проявляют изменения связывания FcγR в анализах , но проявляют желаемый фенотип .
6.1.2
МУТАНТЫ С ПОВЫШЕННОЙ АФФИННОСТЬЮ К FcγRIIIA И ПОНИЖЕННОЙ АФФИННОСТЬЮ К FcγRIIB ИЛИ СОВСЕМ НЕ ОБЛАДАЮЩИЕ АФФИННОСТЬЮ К FcγRIIB
т.е.
В специфическомварианте осуществления молекулы настоящего изобретения содержат вариантный Fc-участок, имеющий одну или несколько аминокислотных модицикаций (, замен) в одном или нескольких участках, при этом одна или несколько модификаций повышают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIIA и снижают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIB по сравнению с сопоставимой молекулой, содержащей Fc-участок дикого типа, который связывает FcγRIIIA и FcγRIIB с аффинностью дикого типа. В определенном варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций не включают или не являются исключительно заменой аланином в любом из положений 256, 298, 333, 334, 280, 290, 294, 298 или 296; или замены в положении 298 аспарагином, валином, аспарагиновой кислотой или пролином; или замены в положении 290 серином. В определенных аминовоплощениях одна или несколько аминокислотных модификаций повышают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIIA по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 99%, по меньшей мере на 100%, по меньшей мере на 200%, по меньшей мере на 300%, по меньшей мере на 400% и снижают аффинность вариантного Fc-учаска к FcγRIIB по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 99%, по меньшей мере на 100%, по меньшей мере на 200%, по меньшей мере на 300%, по меньшей мере на 400%.
В специфическом варианте осуществления молекула настоящего изобретения, содержащая вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и пониженной аффинностью или не обладающая аффинностью к FcγRIIB, как было определено на основании испытания ELISA и/или испытания на основе ADCC с использованием антитела ch-4-4-20, или испытания поверхностного плазмонного резонанса с использованием химерного антитела 4D5, несущего вариантный Fc-участок, содержит замену в положении 275 изолейцином, в положении 334 аспарагином и в положении 348 метионином; или замену в положение 279 лейцином и в положении 395 сериномом; или замену в положении 246 треонином и в положении 319 фенилаланином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 255 лейцином и в положении 318 лизином; или замену в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином и в положении 366 серином; или замену в положении 334 глутаминовой кислотой и в положении 380 аспарагиновой кислотой; или замену в положении 256 серином, в положении 305 изолейцином, в положении 334 глутаминовой кислотой и в положении 390 серином; или замену в положении 335 аспарагином, в положении 370 глутаминовой кислотой, в положении 378 валином, в положении 394 метионином и в положении 424 лейцином; или замену в положении 233 аспарагиновой кислотой и в положении 334 глутаминовой кислотой; или замену в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином, в положении 366 серином и в положении 386 аргинином; или замену в положении 312 глутаминовой кислотой, в положении 327 аспарагином и в положении 378 серином; или замену в положении 288 аспарагином и в положении 326 аспарагином; или замену в положении 247 лейцином и в положении 421 лизином; или замену в положении 298 аспарагином и в положении 381 аргинином; или замену в положении 280 глутаминовой кислотой, в положении 354 фенилаланином, в положении 431 аспарагиновой кислотой и в положении 441 изолейцином; или замену в положении 255 глутамином и в положении 326 глутаминовой кислотой; или замену в положении 218 аргинином, в положении 281 аспарагиновой кислотой и в положении 385 аргинином; или замену в положении 247 лейцином, в положении 330 треонином и в положении 440 глицином; или замену в положении 284 аланином и в положении 372 лейцином; или замену в положении 335 аспарагином, в положении 387 серином и в положении 435 глутамином; или замену в положении 247 лейцином, в положении 431 валином и в положении 442 фенилаланином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, и в положении 305 изолейцином; или замену в положении 292 пролином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином и в положении 292 пролином; или замену в положении 292 пролином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином; или замену в положении 243 лейцином.
В специфическомварианте осуществления молекула настоящего изобретения, содержащая вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и пониженной аффинностью или не обладающий аффинностью к FcγRIIB, как было определено на основании испытания ELISA и/или испытания на основании ADCC с использованием антитела ch-4-4-20, несущего вариантный Fc-участок, содержит замену в положении 379 метионином; в положении 219 тирозином; в положении 282 метионином; в положении 401 валином; в положении 222 аспарагином; в положении 334 изолейцином; в положении 334 глутаминовой кислотой; в положении 275 тирозином; в положении 398 валином. В еще одном конкретном варианте осуществления молекула настоящего изобретения, содержащая вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и пониженной аффинностью или не обладающий аффинностью к FcγRIIB, как было определено на основании испытания ELISA и/или на основании испытания ADCC с использованием антитела ch-4-4-20 или испытания поверхностного плазмонного резонанса с использованием химерного антитела 4D5, несущего вариантный Fc-участок, содержит замену в положении 243 лейцином; в положении 292 пролином; и в положении 300 лейцином.
Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, что указанный полипептид специфично связывает FcγRIIB с аффинностью приблизительно в 3 раза ниже, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как было определено испытанием ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 288 аспарагином, в положении 330 серином и в положении 396 лейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, что указанный полипептид специфично связывает FcγRIIB с аффинностью приблизительно в 10-15 раз ниже, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как было определено испытанием ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 316 аспарагиновой кислотой, в положении 378 валином и в положении 399 глутаминовой кислотой. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, что указанный полипептид специфично связывает FcγRIIB с аффинностью приблизительно в 10 раз ниже, чем сравнимый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как было определено испытанием ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 315 изолейциномом, в положении 379 метионином и в положении 399 глутаминовой кислотой. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, что указанный полипептид специфично связывает FcγRIIB с аффинностью приблизительно в 7 раз ниже, чем соответствующий полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как было определено испытанием ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 243 изолейциномом, в положении 379 лейцином и в положении 420 валином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, что указанный полипептид специфично связывает FcγRIIB с аффинностью приблизительно в 3 раза ниже, чем соответствующий полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как было определено испытанием ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислоная модификация содержит замену в положении 392 треонином и в положении 396 лейцином. Настоящее изобретение охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, что указанный полипептид специфично связывает FcγRIIB с аффинностью приблизительно в 5 раз ниже, чем соответствующий полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как было определено испытанием ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 268 аспарагином и в положении 396 лейцином. Настоящее изобретение также охватывает изолированный полипептид, содержащий вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит по меньшей мере одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, так, что указанный полипептид специфично связывает FcγRIIB с аффинностью приблизительно в 2 раза ниже, чем соответствующий полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, как было определено испытанием ELISA, при этом указанная по меньшей мере одна аминокислотная модификация содержит замену в положении 319 фенилаланином, в положении 352 лейцином и в положении 396 лейцином.
6.1.3 МУТАНТЫ С ПОВЫШЕННОЙ АФФИННОСТЬЮ К FcγRIIIA И FcγRIIB
Настоящее изобретение охватывает молекулы, содержащие вариантные Fc-участки, имеющие одну или несколько аминокислотных модификаций, модификации которых повышают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIIA и FcγRIIB по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 99%, по меньшей мере на 100%, по меньшей мере на 200%, по меньшей мере на 300%, по меньшей мере на 400% и снижают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIB по по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 99%, по меньшей мере на 100%, по меньшей мере на 200%, по меньшей мере на 300%, по меньшей мере на 400%. В специфическом варианте осуществления молекула настоящего изобретения, содержащая вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и повышенной аффинностью к FcγRIIB (как было определено на основании испытания ELISA и/или на основании испытания ADCC с использованием антитела ch-4-4-20 или испытания поверхностного плазмонного резонанса с использованием химерного антитела 4D5, несущего вариантный Fc-участок, описанный в данном документе), содержит замену в положении 415 изолейцином и в положении 251 фенилаланином; или замену в положении 399 глутаминовой кислотой, в положении 292 лейцином и в положении 185 метионином; или замену в положении 408 изолейцином, в положении 215 изолейцином и в положении 125 лейцином; или замену в положении 385 глутаминовой кислотой и в положении 247 гистидином; или замену в положении 348 метионином, в положении 334 аспарагином, в положении 275 изолейцином, в положении 202 метионином и в положении 147 треонином; или замену в положении 246 треонином и в положении 396 гистидином; или замену в положении 268 аспарагиновой кислотой и в положении 318 аспарагиновой кислотой; или замену в положении 288 аспарагином, в положении 330 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 244 гистидином, в положении 358 метионином, в положении 379 метионином, в положении 384 лизином и в положении 397 метионином; или замену в положении 217 серином, в положении 378 валином и в положении 408 аргинином; или замену в положении 247 лейцином, в положении 253 аспарагином и в положении 334 аспарагином; или замену в положении 246 изолейцином и в положении 334 аспарагином; или замену в положении 320 глутаминовой кислотой и в положении 326 глутаминовой кислотой; или замену в положении 375 цистеином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 343 серином, в положении 353 лейцином, в положении 375 изолейцином, в положении 383 аспарагином; или замену в положении 394 метионином и в положении 397 метионином; или замену в положении 216 аспарагиновой кислотой, в положении 345 лизином и в положении 375 изолейцином; или замену в положении 288 аспарагином, в положении 330 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 247 лейцином и в положении 389 глицином; или замену в положении 222 аспарагином, в положении 335 аспарагином, в положении 370 глутаминовой кислотой, в положении 378 валином и в положении 394 метионином; или замену в положении 316 аспарагиновой кислотой, в положении 378 валином и в положении 399 глутаминовой кислотой; или замену в положении 315 изолейцином, в положении 379 метионином и в положении 394 метионином; или замену в положении 290 треонином и в положении 371 аспарагиновой кислотой; или замену в положении 247 лейцином и в положении 398 глутамином; или замену в положении 326 глутамином; в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином и в положении 366 серином; или замену в положении 247 лейцином и в положении 377 фенилаланином; или замену в положении 378 валином, в положении 390 изолейцином и в положении 422 изолейцином; или замену в положении 326 глутаминовой кислотой и в положении 385 глутаминовой кислотой; или замену в положении 282 глутаминовой кислотой, в положении 369 изолейцином и в положении 406 фенилаланином; или замену в положении 397 метионином; в положении 411 аланином и в положении 415 аспарагином; или замену в положении 223 изолейцином, в положении 256 серином и в положении 406 фенилаланином; или замену в положении 298 аспарагином и в положении 407 аргинином; или замену в положении 246 аргинином, в положении 298 аспарагином и в положении 377 фенилаланином; или замену в положении 235 пролином, в положении 382 метионином, в положении 304 глицином, в положении 305 изолейцином и в положении 323 изолейцином; или замену в положении 247 лейцином, в положении 313 аргинином и в положении 388 глицином; или замену в положении 221 тирозином, в положении 252 изолейцином, в положении 330 глицином, в положении 339 треонином, в положении 359 аспарагином, в положении 422 изолейцином и в положении 433 лейцином; или замену в положении 258 аспарагиновой кислотой и в положении 384 лизином; или замену в положении 241 лейцином и в положении 258 глицином; или замену в положении 370 аспарагином и в положении 440 аспарагином; или замену в положении 317 аспарагином и делецию в положении 423; или замену в положении 243 изолейцином, в положении 379 лейцином и в положении 420 валином; или замену в положении 227 серином и в положении 290 глутаминовой кислотой; или замену в положении 231 валином, в положении 386 гистидином и в положении 412 метионином; или замену в положении 215 пролином, в положении 274 аспарагином, в положении 287 глицином, в положении 334 аспарагином, в положении 365 валином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 293 валином, в положении 295 глутаминовой кислотой и в положении 327 треонином; или замену в положении 319 фенилаланином, в положении 352 лейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 392 треонином и в положении 396 лейцином; замену в положении 268 аспарагином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 290 треонином, в положении 390 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 326 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 268 аспарагиновой кислотой и в положении 396 лейцином; или замену в положении 210 метионином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 358 пролином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 288 аргинином, в положении 307 аланином, в положении 344 глутаминовой кислотой и в положении 396 лейцином; или замену в положении 273 изолейцином, в положении 326 глутаминовой кислотой, в положении 328 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 326 изолейцином, в положении 408 аспарагином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 334 аспарагином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 379 метионином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 227 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 217 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 261 аспарагином, в положении 210 метионином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 419 гистидином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 370 глутаминовой кислотой и в положении 396 лейцином; или замену в положении 242 фенилаланином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 255 лейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 240 аланином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 250 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 247 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 410 гистидином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 419 лейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 427 аланином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 258 аспарагиновой кислотой и в положении 396 лейцином; или замену в положении 384 лизином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 323 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 244 гистидином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 305 лейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 400 фенилаланином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 303 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 305 изолейцином, в положении 378 аспарагиновой кислотой, в положении 404 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 290 глутаминовой кислотой, в положении 369 аланином, в положении 393 аланином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 210 аспарагином, в положении 222 изолейцином, в положении 320 метионином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 217 серином, в положении 305 изолейцином, в положении 309 лейцином, в положении 390 гистидином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 246 аспарагином; в положении 419 аргинином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 217 аланином, в положении 359 аланином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 215 изолейцином, в положении 290 валином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 275 лейцином, в положении 362 гистидином, в положении 384 лизином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 334 аспарагином; или замену в положении 400 пролином; или замену в положении 407 изолейцином; или замену в положении 372 тирозином; или замену в положении 366 аспарагином; или замену в положении 414 аспарагином; или замену в положении 352 лейцином; или замену в положении 225 серином; или замену в положении 377 аспарагином; или замену в положении 248 метионином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином и в положении 396 лейцином; или в положении 292 пролином и в положении 305 изолейцином.
6.1.4
МУТАНТЫ, НЕ СВЯЗЫВАЮЩИЕ КАКОЙ-ЛИБО FcγR
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение включает молекулы, содержащие вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию по сравнению с Fc-участком дикого типа, вариантный Fc-участок которого не связывает ни один FcγR, как определяется известными стандартными испытаниями, известными в данной области и описанные в данном документе, по сравнению со сравниваемой молекулой, содержащей Fc-участок дикого типа. В определенном варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций, которые отменяют связывание для всех FcγRs, содержат замену в положении 232 серином и в положении 304 глицином; или замену в положении 269 лизином, в положении 290 аспарагином, в положении 311 аргинином и в положении 433 тирозином; или замену в положении 252 лейцином; или замену в положении 216 аспарагиновой кислотой, в положении 334 аргинином и в положении 375 изолейцином; или замену в положении 247 лейцином и в положении 406 фенилаланином, или замену в положении 335 аспарагином, в положении 387 серином и в положении 435 глутамином; или замену в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 380 аспарагиновой кислотой и в положении 446 валином; или замену в положении 303 изолейцином, в положении 369 фенилаланином и в положении 428 лейцином; или замену в положении 251 фенилаланином и в положении 372 лейцином; или замену в положении 246 глутаминовой кислотой, в положении 284 метионином и в положении 308 аланином; или замену в положении 399 глутаминовой кислотой и в положении 402 аспарагиновой кислотой; или замену в положении 399 глутаминовой кислотой и в положении 428 лейцином.
6.1.5
МУТАНТЫ С ИЗМЕНЕННЫМИ FcγR-ОПОСРЕДОВАННЫМИ ЭФФЕКТОРНЫМИ ФУНКЦИЯМИ
Настоящее изобретение включает иммуноглобулинсодержащие Fc-варианты с измененными эффекторными функциями. В некоторых вариантах осуществления иммуноглобулины, содержащие Fc-варианты, опосредуют эффекторную функцию более эффективно в присутствии эффекторных клеток, что определено с использованием известных в данной области испытаний и приведено в данном документе в качестве примеров. В других вариантах осуществления иммуноглобулины, содержащие Fc-варианты, опосредует эффекторную функцию менее эффективно в присутствии эффекторных клеток, что определено с использованием известных в данной области испытаний и приведено в данном документе в качестве примеров. В определенных вариантах осуществления Fc-вариант настоящего изобретения может быть объединен с другими известными Fc-модификациями, которые изменяют эффекторную функцию, так, чтобы эта комбинация имела добавочный, синергетический эффект. Fc-варианты настоящего изобретения обладают измененной эффекторной функцией in vitro и/или in vivo.
В определенном варианте осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют повышенную FcγR-опосредованную эффекторную функцию, что определено с помощью испытаний ADCC активности, описанных в данном документе. Примеры эффекторных функций, которые могут быть опосредованы молекулами настоящего изобретения, включают без ограничения C1q связывание, комплемент-зависимую цитотоксичность, антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC), фагоцитоз и др. Эффекторные функции молекул настоящего изобретения могут быть испытаны с использованием стандартных способов, известных на данном уровне техники, примеры которых раскрыты в разделе 6.2.6.
4
5
4
5
4
5
В определенном варианте осуществления, иммуноглобулины настоящего изобретения, содержащие вариантный Fc-участок с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA опосредуют антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC) в 2 раза более эффективно, чем иммуноглобулин, содержащий Fc-участок дикого типа. В других вариантах осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения, содержащие вариантный Fc-участок с повышенным аффинностьм к FcγRIIIA и/или FcγRIIA опосредуют антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC) по меньшей мере в 4 раза, по меньшей мере в 8 раз, по меньшей мере в 10 раз, по меньшей мере в 100 раз, по меньшей мере в 1000 раз, по меньшей мере в 10 раз, по меньшей мере в 10 раз более эффективно, чем иммуноглобулин, содержащий Fc-участок дикого типа. В другом определенном варианте осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют измененную C1q связывающую активность. В некоторых вариантах осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют по меньшей мере в 2 раза, по меньшей мере в 4 раза, по меньшей мере в 8 раз, по меньшей мере в 10 раз, по меньшей мере в 100 раз, по меньшей мере в 1000 раз, по меньшей мере в 10 раз, по меньшей мере в 10 раз более высокую C1q связывающую активность, чем иммуноглобулин, содержащий Fc-участок дикого типа. Еще в одном определенном варианте осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют измененную комплемент-зависимую цитотоксичность. Еще в одном определенном варианте осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют повышенную комплемент-зависимую цитотоксичность по сравнению с иммуноглобулином, содержащим Fc-участок дикого типа. В некоторых вариантах осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют по меньшей мере в 2 раза, по меньшей мере в 4 раза, по меньшей мере в 8 раз, по меньшей мере в 10 раз, по меньшей мере в 100 раз, по меньшей мере в 1000 раз, по меньшей мере в 10 раз, по меньшей мере в 10 раз более высокую комплемент-зависимую цитотоксичность, чем иммуноглобулин, содержащий Fc-участок дикого типа.
Таблицах 6 и 7
ниже
В определенных вариантах осуществления Fc-варианты настоящего изобретения могут быть объединены с или включать в себя любой из Fc-вариантов, предварительно определенных авторами изобретения для модулирования эффекторной функции, как описано в публикациях патентных заявок США 2005/0037000 и 2005/0064514, и публикации WO 04/063351, каждая из которых включена в данный документ посредством ссылок в полном объеме. Примеры таких Fc-вариантов, предварительно идентифицированных авторами, приведены в .
В других вариантах осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют увеличенную фагоцитарную активность по сравнению с иммуноглобулином, содержащим Fc-участок дикого типа, как определено стандартными испытаниями, известными специалистам в данной области или раскрытыми в данном документе. В некоторых вариантах осуществления иммуноглобулины настоящего изобретения с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA имеют по меньшей мере в 2 раза, по меньшей мере в 4 раза, по меньшей мере в 8 раз, по меньшей мере в 10 раз более высокую фагоцитарную активность по отношению к иммуноглобулину, содержащему Fc-участок дикого типа.
<b>Таблица 6</b><b>Краткое описание ADCC активности мутантов в ch4D5</b>
Fc вариант
ADCC
Метка
Станд.
Вариант аминокислоты
1 мкг/мл
0,5 мкг/мл
% специфического лизиса
Нормализовано
% специфического    лизиса
Нормализовано
MGFc-27
2C4
G316D, A378V, D399E
33%
2,24
22%
3,60
MGFc-31
3B9
P247L, N421K
30%
2,05
17%
2,90
MGFc-10
1E1
K288N, A330S, P396L
24%
1,66
10%
1,67
MGFc-28
2C5
N315I, V379M, T394M
20%
1,37
10%
1,69
MGFc-29
3D11
F243I, V379L, G420V
20%
1,35
7%
1,17
CH4-4-20 (P54008)
15%
1,00
6
1,00
MGFc-35
3D2
R255Q, K326E
11%
0,79
3%
0,53
MGFc-36
3D3
K218R, G281D, G385R
10%
0,67
5%
0,78
MGFc-30
3A8
F275Y
9%
0,64
2%
0,37
MGFc-32
3C8
D280E, S354F, A431D,L441I
9%
0,62
4%
0,75
MGFc-33
3C9
K317N, F423Δ
3%
0,18
-1%
-0,22
MGFc-34
3B10
F421L, E258G
-1%
-0,08
-4%
-0,71
MGFc-26
D265A
1%
0,08
-3%
-0,45
Таблица 7: КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ МУТАНТОВ
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Изменения аминокислоты</b>
<b>FcR3A,</b><b>K</b><sub>D</sub><b>/K</b><sub>off</sub>
<b>FcR2B,</b><b>K</b><sub>D</sub><b>/K</b><sub>off</sub>
<b>ELISA</b><b>IIIA</b><b>связывание</b>
<b>ELISA</b><b>IIB </b><b>связывание</b>
<b>Фагоцитоз</b><b>(мутант/дикий тип)</b>
<b>4-4-20</b><b>ADCC</b><b>(мутант/дикий тип)</b>
<b>Анти-HER2</b><b>ADCC</b><b>(мутант/дикий тип)</b>
<b>Wt</b>
<b>ни сколько</b>
<b>198/0,170</b>
<b>94/,094</b>
<b>1</b>
<b>1</b>
<b>1</b>
<b>1</b>
<b>1</b>
MGFc 5
V379M
160/0,167
70/0,10
2X
N/C
0,86
2,09
1,77
MGFc 9
P243I, V379L
99,7/0,105
120/0,113
1,5X
уменьшено
?
2,25
2,04
MGFc 10
K288N, A330S, P396L
128/0,115
33,4/0,050
5X
3X
1,2
2,96
2,50
MGFc 11
F243L, R255L
90/0,075
74,7/0,09
1x
уменьшено
0,8
2,38
1,00
MGFc13
K334E, T359N, T366S
55,20,128
72/0,11
1,5X
N/C
[
1,57
3,67
MGFc 14
K288M, K334E
75,4/0,1
95,6/0,089
3X
уменьшено
[
1,74
MGFc 23
K334E, R292L
70,2/0,105
108/0,107
[
2,09
1,6
MGFc 27
G316D, A378V, D399E
72/0,117
46/0,06
1,5X
14X
1,4
3,60
6,88
MGFc 28
N315I, A379M, D399E
1X
9X
1,37
1,69
1,00
MGFc 29
P243I, V379L, G420V
108/0,082
93,4/,101
2,5X
7X
0,93
1,17
1,00
MGFc 31
P247L, N421K
62/0,108
66/0,065
3X
N/C
1,35
2,90
1,00
MGFc 37
K248M
154/0,175
100/0,091
1,4X
уменьшено
0,98
3,83
0,67
MGFc 38
K392T, P396L
84/0,104
50/0,041
4,5X
2,5X
1,4
3,07
2,50
MGFc 39
E293V, Q295E, A327T
195/0,198
86/0,074
1,4X
уменьшено
1,5
4,29
0,50
MGFc 40
K248M
180/0,186
110/0,09
1,4X
уменьшено
1,14
4,03
MGFc 41
H268N, P396L
178/0,159
46,6/0,036
2,2X
4,5X
1,96
2,24
0,67
MGFc 43
Y319F, P352L, P396L
125/0,139
55,7/0,041
3,5X
2X
1,58
1,09
например
В определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает иммуноглобулин, содержащий вариантный Fc-участок с одной или несколькими аминокислотными модификациями, с повышенной аффинностью к FcγRIIIA и/или FcγRIIA, так, что иммуноглобулин обладает повышенной эффекторной функцией, , антител-зависимой клеточно-опосредованной цитотоксичностью или фагоцитозом. В особом варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций, которые увеличивают аффинность вариантного Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA и увеличивают ADCC активность иммуноглобулина, содержат замену в положении 379 метионином; или a замену в положении 243 изолейцином и в положении 379 лейцином; или замену в положении 288 аспарагином, в положении 330 серином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином и в положении 255 лейцином; или замену в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином и в положении 366 серином; или замену в положении 288 метионином и в положении 334 глутаминовой кислотой; или замещении в положение 334 глутаминовой кислотой и в положении 292 лейцином; или замену в положении 316 аспарагиновой кислотой, в положении 378 валином и в положении 399 глутаминовой кислотой; или замену в положении 315 изолейцином, в положении 379 метионином и в положении 399 глутаминовой кислотой; или замену в положении 243 изолейцином, в положении 379 лейцином и в положении 420 валином; или замену в положении 247 лейцином и в положении 421 лизином; или замену в положении 248 метионином; или замену в положении 392 треонином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 293 валином, в положении 295 глутаминовой кислотой и в положении 327 треонином; или замену в положении 268 аспарагином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 319 фенилаланином, в положении 352 лейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положение 300 лейцином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 300 лейцином.
Таблице 8
В другом определенном варианте осуществления одна или несколько аминокислотных модификаций, которые увеличивают ADCC активность иммуноглобулина, являются одной из мутаций, перечисленных ниже в .
ТАБЛИЦА 8. АМИНОКИСЛОТНАЯ МОДИФИКАЦИЯ, КОТОРАЯ ПОВЫШАЕТ ADCC
E333A, K334A
T250S, P396L
R292L, K334E
P247S, P396L
V379M
K290E, V369A, T393A, P396L
S219Y
K210N, K222I, K320M, P396L
V282M
L410H, P396L
K222N
Q419L,P396L
F243I,V379L
V427A, P396L
F243L,R255L,E318K
P217S, V305I, I309L, N390H, P396L
K334I
E258D, P396L
K334E,T359N,T366S
N384K, P396L
K288M, K334E
V323I, P396L
K288N, A330S,P396L
K246N, Q419R, P396L
K326E
V273I, K326E, L328I, P396L
G316D,A378V,D399E
K326I, S408N, P396L
N315I,V379M,T394M
K334N, P396L
F243I,V379L,G420V
V379M, P396L
E293V,Q295E,A327T
P227S, P396L
Y319F,P352L,P396L
P217S, P396L
K392T,P396L
K261N, K210M, P396L
K248M
Q419H, P396L
H268N,P396L
K370E, P396L
K290T, N390I, P396L
L242F, P396L
<u>K326I, P396L</u>
F243L, V305I, A378D, F404S, P396L
H268D, P396L
R255L, P396L
K210M, P396L
V240A, P396L
L358P, P396L
P217A, T359A, P396L
K288R, T307A, K344E,P396L
P244H, P396L
D270E, G316D, R416G
V215I, K290V, P396L
P247L, N421K
F275L, Q362H, N384K, P396L
P247L, N421K, D270E
V305L, P396L
Q419H, P396L, D270E
S400F, P396L
K370E, P396L, D270E
V303I, P396L
R255L, P396L, D270E
F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L
V240A, P396L, D270E
F243L, R292P, Y300L, P396L
K392T, P396L, D270E
F243L, R292P, Y300L
например
Альтернативно или дополнительно может быть полезным объединить приведенные выше аминокислотные модификации или любые другие аминокислотные модификации, описанные в данном документе, с одной или несколькими дополнительными аминокислотными модификациями, которые изменяют C1q связывание и/или комплемент-зависимую цитотоксическую функцию Fc-участка. Исходная молекула, представляющая особый интерес в данном документе, является, как правило, одной из тех, что связывает C1q и проявляет комплемент-зависимую цитотоксичность (CDC). Дополнительные аминокислотные замещения, описанные в данном документе, обычно послужат для изменения способности исходной молекулы связывать C1q и/или модифицировать комплемент-зависимую цитотоксическую функцию, , уменьшать и предпочтительно отменять эти эффекторные функции. Однако, в данном документе рассматриваются молекулы, содержащие замещения в одном или нескольких описанных позициях с улучшенным C1q связыванием и/или комплемент-зависимой цитотоксической (CDC) функцией. Например, исходная молекула может быть неспособна связывать C1q и/или опосредовать CDC и может быть модифицирована согласно рекомендациям в данном документе так, что она приобретает эти дополнительные эффекторные функции. Более того молекулы с существующей ранее C1q связывающей активностью, при необходимости в дальнейшем способны опосредовать CDC, могут быть модифицированы так, что одна или обе эти активности увеличиваются.
например
например
например
Как описано выше можно создать Fc-участок с измененной эффекторной функцией, , модифицируя C1q связывание и/или FcR связывание и таким образом изменяя CDC активность и/или ADCC активность. Например, можно образовать вариантный Fc-участок с улучшенным C1q связыванием и улучшенным FcγRIII связыванием; , обладающий и улучшенной ADCC активностью, и улучшенной CDC активностью. Альтернативно, если желают, чтобы эффекторная функция была уменьшена или устранена, можно создать вариантный Fc-участок с уменьшенной CDC активностью и/или уменьшенной ADCC активностью. В других вариантах осуществления можно увеличить только одну из этих активностей и, необязательно, также снизить другую активность, , создать вариантный Fc-участок с улучшенной ADCC активностью, но сниженной CDC активностью, и наоборот.
Таблице 9
Таблице 9
Настоящее изобретение заключает определенные варианты Fc-участков, которые были идентифицированы путем использования способов настоящего изобретения из библиотеки дрожжевых мутантов после 2-го - 4-го цикла сортировки, приведены в . В  суммирует различные мутанты, которые были идентифицированы с использованием способов настоящего изобретения. Мутанты испытаны с использованием испытания ELISA для определения связывания к FcγRIIIA и FcγRIIB. Мутанты были также протестированы испытанием ADCC, путем клонирования Fc-вариантов в антитело ch 4-4-20 с использованием способов, раскрытых и приведенных в качестве примеров в данном документе. Выделенные жирным шрифтом пункты относятся к экспериментам, в которых ch4-4-20 были очищены до испытания ADCC. Концентрация использованных антител была в диапазоне 0,5 мкг/мл - 1,0 мкг/мл.
<b>ТАБЛИЦА 9: МУТАЦИИ, ВЫЯВЛЕННЫЕ В Fc УЧАСТКЕ</b>
<b>Мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>Связывание с FcγRIIIA (ELISA)</b>
<b>Связывание с FcγRIIB (ELISA)</b>
<b>4-4-20 ADCC (относительно лизиса (мутант/дикий тип)</b>
<b>pYD-CH1 библиотека FACS сортировки с  A тетрамером</b>
Q347H; A339V
CH3
↑-0,5x
NT
S415I; L251F
CH2,CH3
-↑-0,5x
↑-- ,75x
<b>0,82</b>
K392R
CH3
N/C
NT
<b></b>
D399E; R292L; V185M
CH1,CH2,CH3
N/C
↑--0,5x
<b>0,65 0,9</b>
K290E; L142P
CH1, CH2
N/C
NT
<b></b>
R301C; M252L; S192T
CH1,CH2
↓,5x
NT
<b></b>
P291S; K288E; H268L: A141V
CH1,CH2
↓,5x
NT
<b></b>
N315I
CH2
N/C
-↑- ,75x
<b></b>
S132I
CH1
N/C
NT
<b></b>
S383N; N384K; T256N; V262L; K218E; R214I; K205E; F149Y; K133M
Все
↑0,5x
NT
<b></b>
S408I; V215I; V125L
CH1,CH2,CH3
-↑-0,5x
↑-- ,75x
<b>0,62</b>
P396L
CH3
-↑-1x
↑--1x
<b>0,55</b>
G385E; P247H;
CH2, CH3
-↑-1x
↑-- ,75x
<b>0,44</b>
P396H
CH3
-↑-1x
-↑-1x
<b>0,58</b>
A162V
CH1
N/C
NT
<b></b>
V348M; K334N; F275I; Y202M; K147T
CH1,CH2,CH3
-↑-0,5x
↑--,75x
<b>0,33</b>
H310Y; T289A; G337E
CH2
↑,5x
NT
<b></b>
S119F; G371S; Y407V; E258D
CH1,CH2,CH3
N/C
N/C
<b>0,29</b>
K409R; S166N
CH1, CH3
N/C
NT
<b></b>
<b>in vitro сайт направленные мутанты</b>
R292L
CH2
NT
NT
<b>0,82</b>
T359N
CH3
NT
NT
<b>1,06</b>
T366S
CH3
NT
NT
<b>0,93</b>
E333A, K334A
CH2
NT
NT
<b>1,41</b>
R292L, K334E
CH2
NT
NT
<b>1,41; 1,64</b>
R292L, P396L, T359N
CH2, CH3
NT
NT
<b>0,89; 1,15</b>
V379L
CH3
NT
NT
<b>0,83</b>
K288N
CH2
NT
NT
<b>0,78</b>
<b>ТАБЛИЦА 9: МУТАЦИИ, ВЫЯВЛЕННЫЕ В Fc УЧАСТКЕ</b>
<b>Мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>Связывание с FcγRIIIA (ELISA)</b>
<b>Связывание с FcγRIIB (ELISA)</b>
<b>4-4-20 ADCC (относительно лизиса (мутант/дикий тип)</b>
A330S
CH2
NT
NT
<b>0,52</b>
F243L
CH2
NT
NT
<b>0,38</b>
E318K
CH2
NT
NT
<b>0,86</b>
K288N, A330S
CH2
NT
NT
<b>0,08</b>
R255L, E318K
CH2
NT
NT
<b>0,82</b>
F243L, E318K
CH2
NT
NT
<b>0,07</b>
<b></b>
<b>Мутанты в 4-4-20 мини-библиотеке</b>
<b>Повышенное FcγRIIIA связывание, пониженное или без изменений связывание с FcγRIIB </b><b>N/C означает без изменений; N/B означает без связывания; NT означает не испытано</b>
V379M
CH3
- ↑-2x
N/C
<b>1,47</b>
S219Y
Шарнир
- ↑-1x
↓ или N/B
<b>1,28</b>
V282M
CH2
- ↑-1x
↓ или N/B
<b>1,25; 1</b>
F275I, K334N,V348M
CH2
- ↑-0,5x
N/C
D401V
CH3
-↑- 0,5x
N/C
V279L,P395S
CH2
-↑- 1x
N/C
K222N
Шарнир
-↑- 1x
↓или N/B
<b>1,33; 0,63</b>
K246T,Y319F
CH2
-↑- 1x
N/C
F243I,V379L
CH2,CH3
- ↑-1,5x
↓ или N/B
<b>1,86; 1,35</b>
F243L,R255L,E318K
CH2
↑- 1x
↓ или N/B
<b>1,81; 1,45</b>
K334I
CH2
-↑- 1x
N/C
<b>2,1; 1,97</b>
K334E,T359N,T366S
CH2,CH3
- ↑-1,5x
N/C
<b>1,49; 1,45</b>
K288M, K334E
CH2
↑-- 3x
↓ или N/B
<b>1,61; 1,69</b>
K334E,E380D
CH2,CH3
- ↑-1,5x
N/C
T256S,V305I, K334E,N390S
CH2,CH3
- ↑-1,5x
N/C
K334E
CH2
- ↑-2,5x
N/C
<b>1,75; 2,18</b>
T335N,K370E,A378V,T394M,S424L
CH2,CH3
- ↑-0,5x
N/C
E233D,K334E
CH2
- ↑-1,5x
N/C
<b>0,94; 1,02</b>
K334E, T359N, T366S, Q386R
CH2
↑-- 1x
N/C
<b>Повышенное связывание с FcγIIIA и FcγRIIB</b>
K246T,P396H
CH2,CH3
-↑- 1x
-↑- 2,5x
H268D,E318D
CH2
- ↑-1,5x
↑-- 5x
K288N, A330S,P396L
CH2,CH3
↑-- 5x
↑-- 3x
<b>2,34; 1,66; 2,54</b>
I377F
CH3
- ↑-1,5x
- ↑-0,5x
P244H,L358M, V379M,N384K,V397M
CH2,CH3
- ↑-1,75x
- ↑-1,5x
P217S, A378V,S408R
Шарнир,CH3
-↑- 2x
- ↑-4,5x
P247L, I253N, K334N
CH2
-↑- 3x
-↑- 2,5x
P247L
CH2
- ↑-0,5x
↑-- 4x
<b>0,91; 0,84</b>
F372Y
CH3
- ↑-0,75x
- ↑-5,5x
<b>0,88; 0,59</b>
K326E
CH2
-↑- 2x
-↑- 3,5x
<b>1,63; 2 </b>
K246I, K334N
CH2
- ↑-0,5x
↑-- 4x
<b>0,66; 0,6</b>
K320E,K326E
CH2
-↑- 1x
↑-- 1x
H224L
Шарнир
- ↑-0,5x
↑-- 5x
<b>0,55; 0,53</b>
<b>ТАБЛИЦА 9: МУТАЦИИ, ВЫЯВЛЕННЫЕ В Fc УЧАСТКЕ</b>
<b>Мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>Связывание с FcγRIIIA (ELISA)</b>
<b>Связывание с FcγRIIB (ELISA)</b>
<b>4-4-20 ADCC (относительно лизиса (мутант/дикий тип)</b>
S375C,P396L
CH3
- ↑-1,5x
- ↑-4,5x
D312E,K327N,I378S
CH2,CH3
- ↑0,5x
N/C
K288N, K326N
CH2
↑- 1x
N/C
F275Y
CH2
↑- 3x
N/C
<b>0,64</b>
P247L,N421K
CH2,CH3
-↑ 3x
N/C
<b>2,0</b>
S298N,W381R
CH2,CH3
-↑ 2x
N/C
D280E,S354F,A431D,L441I
CH2,CH3
-↑ 3x
N/C
<b>0,62</b>
R255Q,K326E
CH2
-↑ 2x
N/C
<b>0,79</b>
K218R,G281D,G385R
H,CH2,CH3
- ↑3.5x
N/C
<b>0,67</b>
L398V
CH3
- ↑1,5x
N/C
P247L,A330T,S440G
CH2,CH3
- ↑0,75x
↓ 0,25x
V284A,F372L
CH2,CH3
- 1x
N/C
T335N,P387S,H435Q
CH2,CH3
- 1,25x
N/C
P247L,A431V,S442F
CH2,CH3
- 1x
N/C
<b>Повышенное связывание с FcγRIIIA и FcγRIIB</b>
P343S,P353L,S375I,S383N
CH3
↑- 0,5x
↑- 6x
T394M,V397M
CH3
- ↑0,5x
-↑ 3x
E216D,E345K,S375I
H, CH2,CH3
-↑ 0,5x
↑- 4x
K334N,
CH2
- ↑0,5x
-↑ 2x
K288N,A330S,P396L
CH2,CH3
- ↑0,5x
↑- 9x
P247L,E389G
CH2,CH3
- ↑1,5x
↑- 9x
K222N,T335N,K370E,A378V,T394M
H, CH2,CH3
↑- 1x
↑- 7x
G316D,A378V,D399E
CH2,CH3
- ↑1,5x
↑- 14x
<b>2,24</b>
N315I,V379M,T394M
CH2,CH3
↑- 1x
↑- 9x
<b>1,37</b>
K290T,G371D,
CH2,CH3
-↑ 0,25x
↑- 6x
P247L,L398Q
CH2,CH3
-↑ 1,25x
↑- 10x
K326Q,K334E,T359N,T366S
CH2,CH3
-↑ 1,5x
↑- 5x
S400P
CH3
-↑ 1x
↑- 6x
P247L,I377F
CH2,CH3
-↑ 1x
↑- 5x
A378V,N390I,V422I
CH3
-↑ 0,5x
-↑ 5x
K326E,G385E
CH2,CH3
- ↑0,5x
- ↑15x
V282E,V369I,L406F
CH2,CH3
-↑ 0,5x
-↑ 7x
V397M,T411A,S415N
CH3
-↑ 0,25x
- ↑5x
T223I,T256S,L406F
H, CH2,CH3
-↑ 0,25x
-↑ 6x
S298N,S407R
CH2,CH3
- ↑0,5x
-↑ 7x
K246R,S298N,I377F
CH2,CH3
-↑ 1x
-↑ 5x
S407I
CH3
-↑ 0,5x
- ↑4x
F372Y
CH3
- ↑0,5x
- ↑4x
L235P,V382M,S304G,V305I,V323I
CH2,CH3
-↑ 2x
-↑ 2x
P247L,W313R,E388G
CH2,CH3
- ↑1,5x
- ↑1x
<b>ТАБЛИЦА 9: МУТАЦИИ, ВЫЯВЛЕННЫЕ В Fc УЧАСТКЕ</b>
<b>Мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>Связывание с FcγRIIIA (ELISA)</b>
<b>Связывание с FcγRIIB (ELISA)</b>
<b>4-4-20 ADCC (относительно лизиса (мутант/дикий тип)</b>
D221Y,M252I,A330G,A339T,T359N,V422I,H433L
H, CH2,CH3
-↑2,5x
-↑ 6x
E258D,N384K
CH2,CH3
- ↑1,25x
- ↑4x
F241L,E258G
CH2
-↑ 2x
-↑ 2,5x
<b>-0,08</b>
K370N,S440N
CH3
- ↑1x
-↑ 3,5x
K317N,F423-deleted
CH2,CH3
-↑ 2,5x
-↑ 7x
<b>0,18</b>
F243I,V379L,G420V
CH2,CH3
-↑ 2,5x
- ↑3,5x
<b>1,35</b>
P227S,K290E
H, CH2
-↑ 1x
-↑ 0,5x
A231V,Q386H,V412M
CH2,CH3
- ↑1,5x
-↑ 6x
T215P,K274N,A287G,K334N,L365V,P396L
H, CH2,CH3
- ↑2x
-↑ 4x
<b>Повышенное связывание с FcγRIIB но не с FcγRIIIA</b>
K334E,E380D
CH2,CH3
N/C
- ↑4,5x
T366N
CH3
N/C
↑- 5x
P244A,K326I,C367R,S375I,K447T
CH2,CH3
N/C
-↑ 3x
C229Y,A287T,V379M,P396L,L443V
H, CH2,CH3
↓ 0,25x
- ↑10x
<b>Пониженное связывание с FcγRIIIA и FcγRIIB</b>
R301H, K340E,D399E
CH2,CH3
↓ 0,50x
↓ 0,25x
K414N
CH3
↓ 0,25x
N/B
P291S,P353Q
CH2,CH3
↓ 0,50x
↓ 0,25x
V240I, V281M
CH2
↓ 0,25x
↓ 0,25x
P232S, S304G
CH2
N/B
N/B
E269K,K290N,Q311R,H433Y
CH2,CH3
N/B
N/B
M352L
CH3
N/B
N/B
E216D,K334R,S375I
H, CH2,CH3
N/B
N/B
P247L,L406F
CH2,CH3
N/B
N/B
T335N,P387S,H435Q
CH2,CH3
N/B
N/B
T225S
CH2
↓ 0,25x
↓ 0,50x
D399E,M428L
CH3
↓ 0,50x
↓ 0,50x
K246I,Q362H,K370E
CH2,CH3
N/B
↓ 0,50x
K334E,E380D,G446V
CH2,CH3
N/B
N/B
I377N
CH3
↓ 0,50x
N/B
V303I,V369F,M428L
CH2,CH3
N/B
N/B
L251F,F372L
CH2,CH3
N/B
N/B
K246E,V284M,V308A
CH2,CH3
N/B
N/B
D399E,G402D
CH3
N/B
N/B
D399E,M428L
CH3
N/B
N/B
<b>FcγRIIB сокращение / FcγRIIIA отбор: исходная Fc библиотека.</b>
<b>ТАБЛИЦА 9: МУТАЦИИ, ВЫЯВЛЕННЫЕ В Fc УЧАСТКЕ</b>
<b>Мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>Связывание с FcγRIIIA (ELISA)</b>
<b>Связывание с FcγRIIB (ELISA)</b>
<b>4-4-20 ADCC (относительно лизиса (мутант/дикий тип)</b>
E293V,Q295E,A327T
CH2
↑-0,4x
↓ или N/B
<b>4,29</b>
Y319F,P352L,P396L
CH2,CH3
↑-3,4x
↑-2x
<b>1,09</b>
K392T,P396L
CH3
↑- 4,5x
↑- 2,5x
<b>3,07</b>
K248M
CH2
-↑0,4x
↓ или N/B
<b>4,03</b>
H268N,P396L
CH2,CH3
↑- 2,2x
↑- 4,5x
<b>2,24</b>
<b>Конкуренция растворов 40X FcγRIIB-G2:P396L библиотека</b>
D221E, D270E, V308A, Q311H, P396L, G402D
-↑3,6x
-↑0,1x
3,17
<b>Сбалансированная сортировка: 0.8 µM FcγRIIIA мономер: P396L библиотека</b>
K290T, N390I, P396L
CH2, CH3
-↑2,8x
↑- 6,1x
1,93
<u>K326I, P396L</u>
CH2, CH3
-↑2,9x
-↑ 5,9x
1,16
H268D, P396L
CH2, CH3
-↑3,8x
↑-13,7x
2,15
K210M, P396L
CH1, CH3
- ↑1,9x
-↑ 4,6x
2,02
L358P, P396L
CH3
- ↑1,9x
↑- 4,2x
1,58
K288R, T307A, K344E,P396L
CH2, CH3
↑- 4,1x
↑- 2,3x
3,3
V273I, K326E, L328I, P396L
CH2, CH3
-↑ 1,3x
- ↑10,8x
0,78
K326I, S408N, P396L
CH2, CH3
- ↑4x
-↑ 9,3x
1,65
K334N, P396L
CH2, CH3
- ↑3,1x
↑- 3x
2,43
V379M, P396L
CH3
- ↑1,9x
- ↑5,6x
2,01
P227S, P396L
CH2, CH3
- ↑1,5x
↑- 4x
2,01
P217S, P396L
H, CH3
- ↑1,6x
- ↑4,5x
2,04
K261N, K210M, P396L
CH2, CH3
-↑ 2x
-↑ 4,2x
2,06
<b>Кинетическая сортировка: O,8 µM, 1' с холодным 8 µM FcγRIIIA: P396L библиотека</b>
термин M, P396L
CH3
- ↑1,9x
↑- 7,2x
3,09
Q419H, P396L
CH3
-↑ 2x
-↑ 6,9x
2,24
K370E, P396L
CH3
- ↑2x
- ↑6,6x
2,47
L242F, P396L
CH2, CH3
-↑ 2,5x
-↑ 4,1x
2,4
F243L, V305I, A378D, F404S, P396L
CH2, CH3
- ↑1,6x
- ↑5,4x
3,59
R255L, P396L
CH2, CH3
- ↑1,8x
-↑ 6x
2,79
V240A, P396L
CH2, CH3
-↑ 1,3x
↑- 4,2x
2,35
T250S, P396L
CH2, CH3
-↑ 1,5x
- ↑6,8x
1,60
P247S, P396L
CH2,CH3
-↑ 1,2x
-↑ 4,2x
2,10
K290E, V369A, T393A, P396L
CH2,CH3
- ↑1,3x
-↑ 6,7x
1,55
K210N, K222I, K320M, P396L
H, CH2,CH3
-↑ 2,7x
-↑ 8,7x
1,88
L410H, P396L
CH3
-↑ 1,7x
-↑ 4,5x
2,00
Q419L,P396L
CH3
-↑ 2,2x
-↑ 6,1x
1,70
V427A, P396L
CH3
-↑ 1,9x
- ↑4,7x
1,67
P217S, V305I, I309L, N390H, P396L
H, CH2,CH3
- ↑2x
-↑ 7x
1,54
E258D, P396L
CH2,CH3
-↑ 1,9x
-↑ 4,9x
1,54
N384K, P396L
CH3
-↑ 2,2x
- ↑5,2x
1,49
V323I, P396L
CH2,CH3
-↑ 1,1x
↑- 8,2x
1,29
K246N, Q419R, P396L
CH2,CH3
- ↑1,1x
-↑ 4,8x
1,10
P217A, T359A, P396L
H,CH2,CH3
- ↑1,5x
↑- 4,8x
1,17
P244H, P396L
CH2,CH3
- ↑2,5x
↑- 4x
1,40
V215I, K290V, P396L
H,CH2,CH3
- ↑2,2x
↑- 4,6x
1,74
<b>ТАБЛИЦА 9: МУТАЦИИ, ВЫЯВЛЕННЫЕ В Fc УЧАСТКЕ</b>
<b>Мутации</b>
<b>Домен</b>
<b>Связывание с FcγRIIIA (ELISA)</b>
<b>Связывание с FcγRIIB (ELISA)</b>
<b>4-4-20 ADCC (относительно лизиса (мутант/дикий тип)</b>
F275L, Q362H, N384K, P396L
CH2,CH3
-↑ 2,2x
↑- 3,7x
1,51
V305L, P396L
CH2,CH3
- ↑1,3x
↑- 5,5x
1,50
S400F, P396L
CH3
- ↑1,5x
- ↑4,7x
1,19
V303I, P396L
CH3
- ↑1,1x
-↑ 4x
1,01
<b>FcγRIIB сокращение FcγRIIIA 158V отбор твердой фазы: исходная библиотека</b>
A330V, H433Q, V427M
CH2,CH3
NT
NT
NT
V263Q, E272D, Q419H
CH2,CH3
NT
NT
NT
N276Y, T393N, W417R
CH2,CH3
NT
NT
NT
V282L, A330V, H433Y, T436R
CH2,CH3
NT
NT
NT
A330V, Q419H
CH2,CH3
NT
NT
NT
V284M, S298N, K334E, R355W
CH2,CH3
NT
NT
NT
A330V, G427M, K438R
CH2,CH3
NT
NT
NT
S219T, T225K, D270E, K360R
CH2,CH3
NT
NT
NT
K222E, V263Q, S298N
CH2
NT
NT
NT
V263Q, E272D
CH2
NT
NT
NT
R292G
CH2
NT
NT
NT
S298N
CH2
NT
NT
NT
E233G, P247S, L306P
CH2
NT
NT
NT
D270E
CH2
NT
NT
NT
S219T, T225K, D270E
CH2
NT
NT
NT
K326E, A330T
CH2
NT
NT
NT
E233G
CH2
NT
NT
NT
S254T, A330V, N361D, P243L
CH2,CH3
NT
NT
NT
<b></b>
<b>FcγRIIB сокращение FcγRIIIA 158F отбор твердой фазы: исходная библиотека</b>
<b></b>
<b> 158F by FACS top 0.2%</b>
<b></b>
V284M, S298N, K334E, R355W R416T
CH2,CH3
NT
NT
<b>FcγRIIB сокращение FcgRIIA 131H отбор твердой фазы: исходная библиотека</b>
R292P, V305I
CH2,CH2
NT
NT
D270E, G316D, R416G
CH2,CH3
NT
NT
V284M, R292L, K370N
CH2,CH3
NT
NT
R292P, V305I, F243L
CH2
NT
NT
например
например
например
т.е.,
например
2
В предпочтительных вариантах осуществления настоящее изобретение обеспечивает модификацию молекулы иммуноглобулина (, антитела) с вариантными Fc-участками, имеющей одну или несколько аминокислотных модификации, из которых одна или несколько аминокислотных модификаций увеличивают аффинность молекул к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. Такие иммуноглобулины включают молекулы IgG, которые естественно содержат FcγR связывающие участки (, FcγRIIIA и/или FcγRIIB связывающий участок), или дериваты иммуноглобулина, которые были сконструированы, чтобы содержать FcγR связывающий участок (, FcγRIIIA и/или FcγRIIB связывающий участок). Модифицированные иммуноглобулины настоящего изобретения включают любую иммуноглобулиновую молекулу, которая связывает предпочтительно иммуноспецифично,  конкурирует с неспецифическим связыванием, что определено с помощью хорошо известных в данном уровне техники иммунологических испытаний для оценки специфического связывания антиген-антитело, антиген и содержит FcγR связывающий участок (, FcγRIIIA и/или FcγRIIB связывающий участок). Такие антитела включают, без ограничения, поликлональные, моноклональные, би-специфические, мульти-специфические, человеческие, гуманизированные, химерные антитела, одноцепочечные антитела, Fab фрагменты, F(ab') фрагменты, дисульфид-связанные Fvs и фрагменты, содержащие или VL, или VH домен, или даже участок, определяющий комплемент (CDR), который особым образом связывает антиген, в отдельных случаях сконструированный, чтобы содержать или «сплавляться» FcγR связывающий участок.
В некоторых вариантах осуществления молекулы настоящего изобретения содержат части Fc-участка. Выражение “часть Fc-участка”, как используется в данном документе, относится к фрагментам Fc-участка, предпочтительно часть с эффекторной активностью и/или FcγR связывающей активностью (или сравнимый участок мутанта, лишенного подобной активности). Фрагмент Fc-участка может изменяться в размере от 5 аминокислот до полного Fc-участка минус одна аминокислота. Часть Fc-участка может быть лишена до 10, до 20, до 30 аминокислот из N-конца или C-конца.
Молекулы IgG настоящего изобретения являются предпочтительно IgG1 подклассами IgGs, но могут также быть любыми другими IgG подклассами данных животных. Например, у людей класс IgG включает IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4; а мышиный IgG включает IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c и IgG3.
например
ниж
и др.
Иммуноглобулины (и другие полипептиды, используемые в данном документе) могут быть от животного любого происхождения, включая птиц и млекопитающих. Предпочтительно антитела являются антителами человека, грызуна (, мыши и крысы), осла, овцы, кролика, козла, морской свинки, верблюда, лошади или цыпленка. Как используется в данном документе, “человеческие” антитела включают антитела, имеющие аминокислотную последовательность человеческого иммуноглобулина и включают антитела, выделенные из человеческих иммуноглобулиновых библиотек или из трансгенных животных к одному или нескольким иммуноглобулинам человека, и которые не экспрессируют эндогенные иммуноглобулины, как описано е и, например, в патенте США № 5 939 598, Kucherlapati
См.
например
;
и др.
J. Immunol.
и др.
J. Immunol.
Антитела настоящего изобретения могут быть моноспецифичными, биспецифичными, триспецифичными или большей мультиспецифичности. Мультиспецифические антитела могут быть специфичными к разным эпитопам полипептида или могут быть специфичными к гетерологичным эпитопам, таким как гетерологичный полипептид или твердый материал носителя. , , PCT публикации WO 93/17715WO 92/08802; WO 91/00360; WO 92/05793; Tutt, , , 147:60-69, 1991; патенты США №№ 4 474 893; 4 714 681; 4 925 648; 5 573 920; 5 601 819; Kostelny , , 148:1547-1553, 1992.
Мультиспецифические антитела имеют связывающие специфичности по меньшей мере к двум различным антигенам. Хотя такие молекулы обычно будут только связывать два антигена (т.е. биспецифические антитела, BsAbs), антитела с дополнительными особенностями, такие как триспецифические антитела, охвачены настоящим изобретением. Примеры BsAbs включают без ограничения те, которые с одной стороны направлены против антигена раковых клеток, а с другой стороны направлены против цитотоксической молекулы.
Способы создания биспецифических антител известны в данном уровне техники. Традиционное производство всей длины биспецифических антител основано на коэкспрессии двух пар тяжелой цепи и легкой цепи иммуноглобулина, где две цепи имеют различные специфичности (Millstein et al., Nature, 305:537-539 (1983); включено в данный документ посредством ссылки вполном объеме). Из-за случайного подбора тяжелой и легкой цепей иммуноглобулина эти гибридомы (квадромы) производят потенциальную смесь из 10 различных молекул антител, из которых только одна имеет подходящую биспецифическую структуру. Очистка подходящей молекулы, которая обычно производится путем ступенчатой аффинной хроматографии, является довольно трудоемкой, а выход продукта -  малым. Подобная процедура раскрыта в международной заявке WO 93/08829 и в Traunecker et al., EMBO J., 10:3655-3659 (1991).
Согласно различным подходам, вариабельные домены антитела с желаемыми связывающими способностями (антитело-антиген объединенные сайты) сливаются в последовательности постоянных доменов иммуноглобулина. «Слияние» предпочтительно производится с постоянным доменом тяжелой цепи иммуноглобулина, содержащим по меньшей мере часть петли, CH2 и CH3 участки. Предпочтительно иметь первый постоянный участок тяжелой цепи (CH1), содержащий сайт, необходимый для связывания легкой цепи, представленный по меньшей мере в одном из сплавов. DNA, кодирующие сплавы тяжелой цепи иммуноглобулина и, при необходимости, легкой цепи иммуноглобулина, вставляются в отдельные векторы экспрессии и совместно трансфектируются в подходящий организм хозяина. Это обеспечивает большую гибкость в корректировке совместных пропорций трех полипептидных фрагментов в вариантах осуществления, когда неравные соотношения трех полипептидных цепей, используемых при конструировании, дают оптимальный выход. Однако, является возможным вставить кодирующие последовательности двух или всех трех полипептидных цепей в один вектор экспрессии, когда экспрессия по меньшей мере двух полипептидных цепей в равных соотношениях приводит к высокому выходу или когда соотношения не имеют особенного значения.
В предпочтительном варианте осуществления этого подхода биспецифические антитела состоят из тяжелой цепи гибридного иммуноглобулина с первой связывающей специфичностью с одной стороны и пары легкой и тяжелой цепей гибридного иммуноглобулина (обеспечивающей вторую связывающую специфичность) с другой стороны. Оказалось, что эта асимметрическая структура облегчает разделение желаемого биспецифического соединения от нежелаемых комбинаций цепей иммуноглобулина, поскольку наличие легкой цепи иммуноглобулина только в одной половине биспецифичной молекулы обеспечивает простой способ разделения. Этот подход раскрыт в международной заявке WO 94/04690. Для получения более подробной информации о создании биспецифических антител смотри, например, Suresh et al., Methods in Enzymology, 121:210 (1986). Согласно другому подходу, описанному в международной заявке WO96/27011, пара молекул антител может быть создана, чтобы максимализировать процентное соотношение гетеродимеров, которые получены из рекомбинантной клеточной культуры. Предпочтительная область контакта содержит по меньшей мере часть CH3 домена антитела постоянного домена. В этом способе одна или несколько маленьких аминокислотных боковых цепей области контакта первой молекулы антитела замещается большими боковыми цепями (например, тирозином или триптофаном). Компенсирующие "впадины" идентичных или подобных размеров большой боковой(ых) цепи(ей) образуются на области контакта второй молекулы антитела путем замещения крупных боковых цепей аминокислот более мелкими (например, аланином или треонином). Это обеспечивает механизм увеличения выхода гетеродимера по сравнению с другими нежелательными конечными продуктами, такими как гомодимеры.
Биспецифические антитела включают перекрестносшитые или "гетероконъюгатные" антитела. Например, одно из антител в гетеорконъюгате может быть связано с авидином, другое - с биотином. Такие антитела, например, предложены, чтобы нацелить иммунную систему клеток на нежелательные клетки (патент США № 4 676 980) и для лечения ВИЧ-инфекции (международные заявки WO 91/00360, WO 92/200373 и европейский патентный документ EP 03089). Гетероконъюгантные антитела могут быть созданы с использованием любых удобных способов перекрестной сшивки. Подходящие агенты перекрестной сшивки хорошо известны на данном уровне техники и раскрыты в патенте США № 4 676 980 наряду со многими техниками для перекрестной сшивки.
например
Рассмотрены антитела с более чем двумя валентностями. Например, могут быть приготовлены триспецифические антитела. См., , Tutt et al. J. Immunol. 147: 60 (1991), который включен в данный документ ссылкой.
т.е.
например
Антитела настоящего изобретения включают дериваты, которые модифицированы иным способом,  путем ковалентного присоединения молекулы любого типа к антителу так, что ковалентное присоединение не мешает антителу связанного антигена и/или образованию анти-идиотипической реакции. Например, но без ограничения, дериваты антитела включают антитела, которые были модифицированы, , путем гликозилирования, ацетилирования, пегилирования, фосфорилирования, амидирования, дериватизации известными протектирующими/блокирующими группами, протеолитического расщепления, связывания с клеточным лигандом или другим белком и т. д. Любые из многочисленных химических модификаций могут осуществляться известными техниками, включая, но без ограничения, специфическое химическое расщепление, ацетилирование, формилирование, метаболический синтез тиникамицина и т. д. Кроме того, дериват может содержать одну или несколько неклассических аминокислот.
in vivo
in vitro
См., например
Science
et al.
BioTechniques
et al.
J. Immunol. Methods
например
См.,
например
et al.
et al.
Nature
Molecular Immunology
et al.
Protein Engineering
et al.
Proc Natl. Acad. Sci. USA
Для некоторых применений, включая  применение антител у людей и  испытаний на обнаружение, может быть предпочтительно применять химерные, гуманизированные или человеческие антитела. Химерное антитело является молекулой, в котором различные части антитела получены из различных видов животных, например, антитела, имеющие вариабельный участок, получены из мышиного моноклонального антитела, а постоянный участок получен из человеческого иммуноглобулина. Способы производства химерных антител известны в данном уровне техники. , Morrison, , 229:1202, 1985; Oi ,, 4:214 1986; Gillies , , 125:191-202, 1989; патенты США №№ 5 807 715; 4 816 567 и 4 816 397, которые включены в данный документ в качестве ссылок во всем их объеме. Гуманизированные антитела представляют собой молекулы антител видов животных за исключением человека, которые связывают желаемый антиген, имеющий один или несколько участков, определяющих комплемент (CDR), видов животных за исключением человека и каркасные участки и постоянные домены молекулы человеческого иммуноглобулина. Часто остатки каркаса в человеческих каркасных участках будут заменены соответствующим остатком из CDR донорного антитела для изменения, предпочтительно улучшения, связывания антигена. Эти замены каркаса идентифицируются способами, хорошо известными на данном уровне техники, , путем моделирования взаимодействий CDR и остатков каркаса для идентификации остатков каркаса, важных для связывания антигена, и сравнения последовательностей для идентификации необычных остатков каркаса в определенной позиции. , Queen , патент США № 5 585 089; Riechmann , , 332:323, 1988, которые включены в данный документ в качестве ссылок во всем их объеме. Антитела могут быть гуманизированы с использованием разнообразных техник, известных на данном уровне техники, включая, например, CDR-прививку (европейский патент 239 400; PCT публикация WO 91/09967; патенты США №№ 5 225 539; 5 530 101 и 5 585 089), венирование (veneering) или ресюрфейсинг (resurfacing) (европейский патент 592 106; европейский патент 519 596; Padlan, , 28(4/5):489-498, 1991; Studnicka , , 7(6):805-814, 1994; Roguska , , 91:969-973, 1994), и перетасовку цепи (патент США № 5 565 332), каждый из которых включен в данный документ в качестве ссылки во всем их объеме. Гуманизированные антитела могут быть созданы с использованием любого из способов, раскрытых в патентах США № 5 693 762 (Protein Design Labs), 5 693 761, (Protein Design Labs) 5 585 089 (Protein Design Labs), 6 180 370 (Protein Design Labs) и публикациях США №№ 20040049014, 200300229208, каждый из которых включен в данный документ в качестве ссылки во всем их объеме.
См.
Полностью человеческие антитела являются особенно пригодными для терапевтического лечения пациентов-людей. Человеческие антитела могут быть созданы с помощью разнообразных способов, известных на данном уровне техники, включая методы фагового отображения, описанные выше с использованием библиотек антител, полученных из последовательностей иммуноглобулина человека.  патенты США №№. 4 444 887 и 4 716 111; и PCT публикации WO 98/46645; WO 98/50433; WO 98/24893; WO 98/16654; WO 96/34096; WO 96/33735; и WO 91/10741, каждый из которых включен в данный документ в качестве ссылки во всем его объеме.
см.
Int. Rev. Immunol.
см.
например
Человеческие антитела также могут быть получены с использованием трансгенных мышей, которые не способны экспрессировать функциональные эндогенные иммуноглобулины, но которые могут экспрессировать гены иммуноглобулинов человека. Для обзора технологий получения человеческих антител  Lonberg и Huszar, , 13:65-93, 1995. Для детального рассмотрения вопроса по технологиям получения человеческих антител и моноклональных человеческих антител и протоколов получения таких антител , , PCT публикации WO 98/24893; WO 92/01047; WO 96/34096; WO 96/33735; европейский патент 0 598 877; патенты США №№ 5 413 923; 5 625 126; 5 633 425; 5 569 825; 5 661 016; 5 545 806; 5 814 318; 5 885 793; 5 916 771; и 5 939 598, которые включены в данный документ в качестве ссылок во всем их объеме. К тому же, такие компании как Abgenix, Inc. (Freemont, CA), Medarex (NJ) и Genpharm (San Jose, CA) могут заниматься обеспечением человеческими антителами, направленными против выбранного антигена, с использованием похожей технологии на ту, которая описана выше.
например
et al.
Bio/technology
Полностью человеческие антитела, которые распознают отобранный эпитоп, могут быть созданы с использованием техники, именуемой “направленный отбор" В этом подходе отобранное моноклональное антитело видов животных, за исключением человека, , мышиное антитело, используется, чтобы направить отбор полностью человеческого антитела, распознающего тот же эпитоп (Jespers , , 12:899-903, 1988).
например
например
например
например
.
Настоящее изобретение включает конструирование человеческих или гуманизированных терапевтических антител (, моноклональных антител, специфичных к опухоли) в Fc-участке путем модификации (, замещения, вставки, делеции) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к конструированию человеческих или гуманизированных терапевтических антител (, моноклональных антител, специфичных к опухоли) в Fc-участке путем модификации по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA и далее уменьшает аффинность Fc-участка к FcγRIIB. Сконструированные терапевтические антитела могут в дальнейшем иметь усиленную эффекторную функцию, , усиленную ADCC активность, фагоцитозную активность и т. д, что определяется стандартными испытаниями, известными специалистам данной области техники.
например
et al.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
например
В определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного моноклонального антитела, специфичного к Her2/neu протоонкогену (, Ab4D5 гуманизированное антитело, как раскрыто в Carter , 1992,  89:4285-9), путем модификации (, замещения, вставки, делеции) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В другом определенном варианте осуществления модификация гуманизированного Her2/neu моноклонального антитела также в дальнейшем может уменьшать аффинность Fc-участка к FcγRIIB. В еще одном определенном варианте осуществления сконструированные гуманизированные моноклональные антитела, специфичные к Her2/neu, могут в дальнейшем иметь увеличенную эффекторную функцию, что определено стандартными испытаниями, известными на данном уровне техники, раскрыто и приведено в данном документе в качестве примеров.
например
В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование мышино-человеческого химерного анти-CD20 моноклонального антитела, 2H7 путем модификации (, замещения, вставки, делеции) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В другом определенном варианте осуществления модификация анти-CD20 моноклонального антитела, 2H7 также в дальнейшем может уменьшить аффинность Fc-участка к FcγRIIB. В ещё одном определенном варианте осуществления сконструированное анти-CD20 моноклональное антитело, 2H7 может в дальнейшем иметь усиленную эффекторную функцию, что определено стандартными испытаниями, известными на данном уровне техники, раскрыто и приведено в данном документе в качестве примеров.
например
В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование антитела, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD20, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD79a, CD79b, CD103, CTLA4, ErbB1, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор, или TNF-γ рецептор (особенно гуманизированную или химерную форму антитела) путем модификации (, замещения, вставки, делеции) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В другом определенном варианте осуществления модификация антитела, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD20, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD79a, CD79b, CD103, CTLA4, ErbB1, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, также в дальнейшем может уменьшать аффинность Fc-участка к FcγRIIB. В ещё одном определенном варианте осуществления, антитело, которое связывает A33, CD5, CD11c, CD19, CD20, CD22, CD23, CD27, CD40, CD45, CD79a, CD79b, CD103, CTLA4, ErbB1, ErbB3, ErbB4, VEGF рецептор, TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор или TNF-γ рецептор, может в дальнейшем обладать усиленной эффекторной функцией, что определено стандартными испытаниями, известными на данном уровне техники, раскрыто и приведено в данном документе в качестве примеров.
SEQ ID NO:2
SEQ ID NO:3
SEQ ID NO:5
SEQ ID NO:6
SEQ ID NO:7
SEQ ID NO:13
SEQ ID NO:14
SEQ ID NO:3
SEQ ID NO:8
SEQ ID NO:9
SEQ ID NO:10
В определенных вариантах осуществления настоящее изобретение включает конструирование антитела (или химерной, гуманизированной или других его сконструированных версий), содержащего вариабельный домен тяжелой цепи и/или вариабельный домен легкой цепи моноклонального антитела, полученного клонами 2B6, 3H7, 8B5.4.3, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, обладающих ATCC инвентарными номерами PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно (депонированы ATCC, 10801 University Boulevard, Manassas, VA 02209-2011, все из которых включены в данный документ в качестве ссылок). В определенных вариантах осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного антитела, содержащего вариабельные домены тяжелой цепи и/или вариабельные домены легкой цепи 2B6, 3H7 или 8B5.3.4. В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного антитела, содержащего CDR 2B6, 3H7 или 8B5.3.4. В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1,  или  и вариабельный домен легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, , ,  или SEQ ID NO: 8. В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование анти-FcγRIIB антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность  и вариабельный домен легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность . В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного анти-FcγRIIB антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность  и вариабельный домен легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность . В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного анти-FcγRIIB антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность  и вариабельный домен легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность .
например
например
В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование анти-FcγRIIB антитела, охватывая без ограничения любые антитела, раскрытые в предварительной заявке США № 60/403 266, поданной 12 августа 2002 года, заявке США № 10/643 857, поданной 14 августа 2003 года, предварительной заявке США № 60/562 804, поданной 16 апреля 2004 года, предварительной заявке США № 60/582 044, поданной 21 июня 2004 года, предварительной заявке США №60/582 045, поданной 21 июня 2004 года, предварительной заявке США №60/636 663, поданной 15 декабря 2004 года, и заявке США серийного № 10/524 134, поданной 11 февраля 2005 года, путем модификации (, замещения, вставки, делеции) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного анти-FcγRIIB антитела, охватывая без ограничения любые антитела, раскрытые в предварительной заявке США № 60/569 882, поданной 10 мая 2004 года, предварительной заявке США № 60/582 043, поданной 21 июня 2004 года, и заявке США № 11/126 978, поданной 10 мая 2005 года путем модификации (, замещения, вставки, делеции) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. Каждая из упомянутых заявок включена в данный документ в качестве ссылки в полном объеме. Примерами анти-FcγRIIB антител, которые могут или не могут быть гуманизированы, но могут быть сконструированы в соответствии со способами настоящего изобретения, представляют собой 2B6 моноклональное антитело, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-4591, и 3H7, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-4592, 1D5 моноклональное антитело, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-5958, 1F2 моноклональное антитело, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-5959, 2D11 моноклональное антитело, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-5960, 2E1 моноклональное антитело, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-5961, 8B5.3.4, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-7610, и 2H9 моноклональное антитело, обладающее ATCC инвентарным номером PTA-5962 (все задепонированы в 10801 University Boulevard, Manassas, VA 02209-2011), которые включены в данный документ в качестве ссылки. В другом определенном варианте осуществления модификация анти-FcγRIIB антитела может в дальнейшем также увеличивать аффинность Fc-участка к FcγRIIB. В ещё одном определенном варианте осуществления сконструированное анти-FcγRIIB антитело может в дальнейшем иметь усиленную эффекторную функцию, что определено с использованием стандартных испытаний, известных специалистам в данной области, раскрыто и приведено в данном документе в качестве примеров.
например,
например,
например,
В определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование анти-FcγRIIB антитела, согласно способам настоящего изобретения, которое содержит один или несколько комплемент-определяющих участков (CDR), предпочтительно все 6 CDR, антитела, полученного клонами 2B6, 3H7 или 8B5.3.4 с ATCC инвентарными номерами PTA-4591, PTA-4592 и PTA-7610 соответственно ( CDR3 тяжелая цепь). В определенном варианте осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное согласно способам настоящего изобретения, содержит один или несколько комплемент-определяющих участков (CDR), предпочтительно все 6 CDR, антитела, полученного клонами 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 и 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно ( CDR3 тяжелая цепь). В другом варианте осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное согласно способам настоящего изобретения, связывается с тем же эпитопом, что и мышиное моноклональное антитело, полученное клонами 2B6, 3H7 или 8B5.3.4 с ATCC инвентарными номерами PTA-4591, PTA-4592 и PTA-7610 соответственно, и/или конкурирует с мышиным моноклональным антителом, полученным клонами 2B6, 3H7 или 8B5.3.4 с ATCC инвентарными номерами PTA-4591, PTA-4592 и PTA-7610 соответственно, как определено,  в испытании ELISA или другом соответствующем конкурентноспособном иммуноанализе, а также связывает FcγRIIB с большей аффинностью, чем указанное антитело или его фрагмент связывают FcγRIIA. В другом варианте осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное согласно способам настоящего изобретения, связывается с тем же эпитопом, что и мышиное моноклональное антитело, полученное из клонов 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 и 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно, и/или конкурирует с мышиным моноклональным антителом, полученным из клонов 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 и 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно, как определено, например, в испытании ELISA или другом соответствующем конкурентноспособном иммуноанализе, а также связывает FcγRIIB через его вариабельный участок с большей аффинностью, чем указанное антитело или его фрагмент связывают FcγRIIA.
Настоящее изобретение также включает конструирование анти-FcγRIIB антитела, содержащего вариабельный домен тяжелой цепи и/или вариабельный домен легкой цепи, аминокислотная последовательность которого по меньшей мере на 45%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 55%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95%, или по меньшей мере на 99% идентична аминокислотной последовательности вариабельного домена тяжелой цепи и/или вариабельного домена легкой цепи мышиного моноклонального антитела, полученного клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно. Настоящее изобретение кроме того включает конструирование анти-FcγRIIB антител, содержащих аминокислотную последовательность одного или нескольких CDR, которая по меньшей мере на 45%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 55%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 99% идентична аминокислотной последовательности одного или нескольких CDR мышиного моноклонального антитела, полученного клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно. Вычисление процентной идентичности двух аминокислотных последовательностей может быть определено любым способом, известным специалистам в данной области техники, включая программу поиска белков - BLAST.
et al.
Настоящее изобретение также включает конструирование одного или нескольких анти-FcγRIIB антител, содержащих один или несколько вариабельных доменов, кодируемых нуклеотидной последовательностью, которая гибридизируется с нуклеотидной последовательностью одного или нескольких вариабельных доменов мышиного моноклонального антитела, полученного клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно, при жестких условиях. В предпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование одного или нескольких анти-FcγRIIB антител, содержащих вариабельный домен легкой цепи и/или вариабельный домен тяжелой цепи, кодируемый нуклеотидной последовательностью, которая гибридизируется при жестких условиях с нуклеотидной последовательностью вариабельного домена легкой цепи и/или вариабельного домена тяжелой цепи мышиного моноклонального антитела, произведенного клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно, при жестких условиях. В другом предпочтительном варианте осуществления настоящее изобретение обеспечивает конструирование анти-FcγRIIB антитела, содержащего один или несколько CDR, кодируемых нуклеотидной последовательностью, которая гибридизируется при жестких условиях с нуклеотидной последовательностью одного или нескольких CDR мышиного моноклонального антитела, произведенного клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно. Условия жесткой гибридизации включают, без ограничения, гибридизацию с иммобилизированной на фильтре ДНК в 6X хлориде натрия / цитрате натрий (SSC) при около 45°C с последующей одной или несколькими промывками в 0,2X SSC/0,1% SDS при около 50-65°C, крайне жесткие условия, такие как гибридизация с иммобилизированной на фильтре ДНК в 6X SSC при около 45°C с последующей одной или несколькими промывками в 0,1X SSC/0,2% SDS при около 60°C или любые другие условия жесткой гибридизации, известные специалистам данной области техники (см., например, Ausubel, F.M. , eds. 1989 Current Protocols in Molecular Biology, vol. 1, Green Publishing Associates, Inc. and John Wiley and Sons, Inc., NY at pages 6.3.1 to 6.3.6 and 2.10.3, включенные в данный документ в качестве ссылок).
т.е.,
В предпочтительном варианте осуществления сконструированные антитела настоящего изобретения гуманизируются любым способом, известным на данном уровне техники или описанным в данном документе, и/или содержат CDR участки гуманизированного FcγRIIB специфического антитела или гуманизированного CD20 специфического антитела, где указанные CDR получены из мышиного антитела, специфического к FcγRIIB или CD20 соответственно. В некоторых вариантах осуществления гуманизированные антитела, описанные в данном документе, содержат изменения, включая, без ограничения, аминокислотные делеции, вставки, модификации, акцепторного антитела, человеческие вариабельные домены тяжелой цепи и/или вариабельные домены легкой цепи каркасного участка, которые необходимы для удержания связывающей специфичности моноклонального антитела донора. В некоторых вариантах осуществления участки каркаса гуманизированных антител, описанных в данном документе, не обязательно состоят из точной аминокислотной последовательности участка каркаса встречающегося в природе вариабельного участка человеческого антитела, но содержат различные изменения, включая, без ограничения, аминокислотные делеции, вставки, модификации, которые изменяют свойства гуманизированного антитела, например, улучшают связывающие свойства вариабельного участка гуманизированного антитела, специфичного для той же цели, что и мышиное FcγRIIB или CD20 специфическое антитело. В наиболее предпочтительных вариантах осуществления создано минимальное число изменений в участке каркаса для того, чтобы избежать крупносерийных введений остатков каркаса видов животных, за исключением человека, и обеспечить минимальную иммуногенность гуманизированного антитела настоящего изобретения у людей. Донорное моноклональное антитело предпочтительно является моноклональным антителом, произведенным клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2 (имеющими ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно), которые связывают FcγRIIB, или моноклональное антитело является CD20 антителом, таким как ритуксимаб или 2H7.
например,
например,
В определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование CDR-привитого антитела, которое содержит вариабельный участок тяжелой цепи домена, содержащего участки каркаса антитела реципиента и остатки из моноклонального антитела донора, который в частности связывает FcγRIIB,  моноклональное антитело, произведенное клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2, имеющих ATCC инвентарные номера PTA-4591, PTA-4592, PTA-7610, PTA-5958, PTA-5961, PTA-5962, PTA-5960 и PTA-5959 соответственно. В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование CDR-привитого антитела, которое содержит вариабельный участок легкой цепи домена, содержащего остатки каркаса антитела реципиента и остатки из моноклонального антитела донора, которое в частности связывает FcγRIIB,  моноклональное антитело, произведенное клонами 2B6, 3H7, 8B5.3.4, 1D5, 2E1, 2H9, 2D11 или 1F2.
SEQ ID NO:17
SEQ ID NO:18
SEQ ID NO:20
SEQ ID NO:21
SEQ ID NO:22
SEQ ID NO:23
SEQ ID NO:24
SEQ ID NO:25
SEQ ID NO:26
SEQ ID NO:27
SEQ ID NO:28
Предпочтительно FcγRIIB гуманизированные антитела связывают внеклеточный домен нативного человеческого FcγRIIB. Гуманизированные анти-FcγRIIB антитела этих комбинаций могут иметь вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CDR1 (SEQ ID NO: 15 или SEQ ID NO: 16) и/или CDR2 ( или ) и/или CDR3 (SEQ ID NO: 19 or ) и/или вариабельный участок легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность CDR1 ( или ) и/или CDR2 (, , , или ) и/или CDR3 ( или ).
SEQ ID NO:1
SEQ ID NO:2
SEQ ID NO:3,
SEQ ID NO:4
SEQ ID NO:5
SEQ ID NO:6
SEQ ID NO:7
SEQ ID NO:8
В определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного анти-FcγRIIB антитела с вариабельным доменом тяжелой цепи, имеющим аминокислотную последовательность ,  или  и вариабельным доменом легкой цепи, имеющим аминокислотную последовательность , , ;  или .
et al.
et al.
et al.
et al.
SEQ ID NO:17
SEQ ID NO:19
SEQ ID NO:1
SEQ ID NO:3
SEQ ID NO:29
SEQ ID NO:21
SEQ ID NO:23
SEQ ID NO:24
SEQ ID NO:25
SEQ ID NO:27
SEQ ID NO:4
SEQ ID NO:5
SEQ ID NO:6
SEQ ID NO:7
SEQ ID NO:8
SEQ ID NO:30
В одном определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование гуманизированного анти-FcγRIIB антитела, где VH участок FcγRIIB антитела включает FR сегменты VH сегмента VH1-18 зародышевой линии человека (Matsuda , 1998, J. Exp. Med. 188:2151062), и JH6 (Ravetch , 1981, Cell 27(3 Pt. 2): 583-91), и один или несколько CDR участков 2B6 VH, имеющей аминокислотную последовательность SED ID NO: 1,  или . В одном варианте осуществления 2B6 VH имеет аминокислотную последовательность ,  или . В другом определенном варианте осуществления гуманизированное анти-FcγRIIB антитело дополнительно содержит VL участок, который состоит из FR сегментов VL сегмента VK-A26 зародышевой линии человека (Lautner-Rieske , 1992, Eur. J. Immunol. 22:1023-1029) и JK4 (Hieter , 1982, J. Biol. Chem. 257:1516-22), и один или несколько CDR участков 2B6VL, имеющей аминокислотную последовательность , , ,  и . В одном варианте осуществления 2B6 VL имеет аминокислотную последовательность , , ; ,  или  и при необходимости в комбинации с одной из приведенных выше в качестве ссылки 2B6 VH.
SEQ ID NO:3
В некоторых вариантах осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное в соответствии со способами настоящего изобретения, имеет VH цепь и/или VH домен, содержащий аминокислотную последовательность (H2B6VH-3) ():
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYWIHWVRQAPGQGLEWIGVIDPSDTYPNYNKKFKGRVTMTVDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARNGDSDYYSGMDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO:8
В некоторых вариантах осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное в соответствии со способами настоящего изобретения, имеет VL цепь и/или VL домен, содержащий аминокислотную последовательность (H2B6VL-5) ():
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTFTCRTSQSIGTNIHWYQQKPDQSPKLLIKEVSESISGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQSNTWPFTFGGGTKVEIK
В некоторых вариантах осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное в соответствии со способами настоящего изобретения, имеет VH цепь и/или VH домен, содержащий аминокислотную последовательность (H2B6VH-3):
SEQ ID NO:3
SEQ ID NO:8
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYWIHWVRQAPGQGLEWIGVIDPSDTYPNYNKKFKGRVTMTVDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARNGDSDYYSGMDYWGQGTTVTVSS (), и VL цепь и/или VL домен, содержащий аминокислотную последовательность (H2B6VL-5) ():
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTFTCRTSQSIGTNIHWYQQKPDQSPKLLIKEVSESISGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQSNTWPFTFGGGTKVEIK
В некоторых вариантах осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное в соответствии со способами настоящего изобретения, имеет VH домен и/или VH цепь, содержащую аминокислотную последовательность (8B5.3.4 VH, см. ФИГ. 2):
SEQ ID NO:9
EVKLEESGGGLVQPGGSMKLSCEASGFTFSDAWMDWVRQSPEKGLEWVAEIRNKAKNHATYYAESVIGRFTISRDDSKSSVYLQMNSLRAEDTGIYYCGALGLDYWGQGTTLTVSS ().
SEQ ID NO:10
В некоторых вариантах осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное в соответствии со способами настоящего изобретения, имеет VL домен и/или VL цепь, содержащую аминокислотную последовательность (8B5.3.4 VL, см. РИС. 3) ():
DIQMTQSPSSLLAALGERVSLTCRASQEISGYLSWLQQKPDGTIKRLIYAASTLDSGVPKRFSGSESGSDYSLTISSLESEDFADYYCLQYFSYPLTFGAGTKLELK
SEQ ID NO:9
В некоторых вариантах осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное в соответствии со способами настоящего изобретения, имеет VH домен и/или VH цепь, содержащую аминокислотную последовательность (8B5.3.4 VH) (, см. РИС. 2):
SEQ ID NO:10
EVKLEESGGGLVQPGGSMKLSCEASGFTFSDAWMDWVRQSPEKGLEWVAEIRNKAKNHATYYAESVIGRFTISRDDSKSSVYLQMNSLRAEDTGIYYCGALGLDYWGQGTTLTVSS, и VL домен и/или VL цепь, содержащую аминокислотную последовательность (8B5.3.4 VL, см. РИС. 3) ():
DIQMTQSPSSLLAALGERVSLTCRASQEISGYLSWLQQKPDGTIKRLIYAASTLDSGVPKRFSGSESGSDYSLTISSLESEDFADYYCLQYFSYPLTFGAGTKLELK
SEQ ID NO:7
В другом определенном варианте осуществления анти-FcγRIIB антитело, сконструированное в соответствии со способами настоящего изобретения, является гуманизированным 3H7 антителом, где FcγRIIB VH участок состоит из FR сегментов из VH сегмента зародышевой линии человека и CDR участков 3H7 VH, имеющих аминокислотную последовательность SED ID NO: 37. В другом определенном варианте осуществления гуманизированное 3H7 антитело дополнительно содержит VL участок, который состоит из FR сегментов VH сегмента зародышевой линии человека и CDR участков 3H7VL, имеющих аминокислотную последовательность .
В частности настоящее изобретение включает конструирование анти-FcγRIIB антитела, где антитело иммуноспецифически связывается с внеклеточным доменом нативного человеческого FcγRIIB, а указанное FcγRIIB антитело, содержащее (или альтернативно, состоящее из) CDR последовательности 2B6, 3H7 или 8B5.3.4 в любой из последующих комбинаций: VH CDR1 и VL CDR1; VH CDR1 и VL CDR2; VH CDR1 и VL CDR3; VH CDR2 и VL CDR1; VH CDR2 и VL CDR2; VH CDR2 и VL CDR3; VH CDR3 и VH CDR1; VH CDR3 и VL CDR2; VH CDR3 и VL CDR3; VH1 CDR1, VH CDR2 и VL CDR1; VH CDR1, VH CDR2 и VL CDR2; VH CDR1, VH CDR2 и VL CDR3; VH CDR2, VH CDR3 и VL CDR1, VH CDR2, VH CDR3 и VL CDR2; VH CDR2, VH CDR2 и VL CDR3; VH CDR1, VL CDR1 и VL CDR2; VH CDR1, VL CDR1 и VL CDR3; VH CDR2, VL CDR1 и VL CDR2; VH CDR2, VL CDR1 и VL CDR3; VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR2; VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR3; VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3 и VL CDR1; VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3 и VL CDR2; VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3 и VL CDR3; VH CDR1, VH CDR2, VL CDR1 и VL CDR2; VH CDR1, VH CDR2, VL CDR1 и VL CDR3; VH CDR1, VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR2; VH CDR1, VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR3; VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR2; VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR3; VH CDR2, VH CDR3, VL CDR2 и VL CDR3; VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR2; VH CDR1, VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1 и VL CDR3; VH CDR1, VH CDR2, VL CDR1, VL CDR2, и VL CDR3; VH CDR1, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2, и VL CDR3; VH CDR2, VH CDR3, VL CDR1, VL CDR2, и VL CDR3; или любой их комбинаци из VH CDR и VL CDR, раскрытой в данном документе.
В определенном варианте осуществления анти-FcγRIIB моноклональное антитело содержит модификацию в положении 334 глутаминовой кислотой, в положении 359 аспарагином и в положении 366 серином (MgFc13); или замену в положении 316 аспарагиновой кислотой, в положении 378 валином и в положении 399 глутаминовой кислотой (MgFc27); или замену в положении 243 изолейцином, в положении 379 лейцином и в положении 420 валином (MgFc29); или замену в положении 392 треонином и в положении 396 лейцином (MgFc38); или замену в положении 221 глутаминовой кислотой, в положении 270 глутаминовой кислотой, в положении 308 аланином, в положении 311 гистидином, в положении 396 лейцином и положении 402 аспарагиновой кислотой (MgFc42); или замену в положении 410 гистидином и в положении 396 лейцином (MgFc53); или замену в положении 243 лейцином, в положении 305 изолейцином, в положении 378 аспарагиновой кислотой, в положении 404 серином и в положении 396 лейцином (MgFc54); или замену в положении 255 изолейцином и в положении 396 лейцином (MgFc55); или замену в положении 370 глутаминовой кислотой и в положении 396 лейцином (MgFc59); или замену в положение 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином, в положении 305 изолейцином и в положении 396 лейцином (MgFc88); или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином, в положении 300 лейцином и в положении 396 лейцином (MgFc88A); или замену в положении 234 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 300 лейцином (MgFc155); или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 300 лейцином; или замену в положении 243 лейцином, в положении 292 пролином и в положении 396 лейцином; или замену в положении 243 лейцином и в положении 292 пролином; или замену в положении 243 лейцином; или замену в положении 273 фенилаланином.
6.1.6 ПОЛИПЕПТИДЫ И КОНЪЮГАТЫ АНТИТЕЛ
т.е.
т.е.
,
Молекулы настоящего изобретения ( полипептиды, антитела), содержащие вариантные Fc-участки, могут быть рекомбинантно сплавлены или химически сконъюгированы (включая как ковалентную, так и нековалентную конъюгацию) в гетерологичные полипептиды ( неродственные полипептиды; или их часть, предпочтительно по меньшей мере 10, по меньшей мере 20, по меньшей мере 30, по меньшей мере 40, по меньшей мере 50 по меньшей мере60, по меньшей мере 70, по меньшей мере 80, по меньшей мере 90 или по меньшей мере 100 аминокислот полипептида) для создания сплавленных белков. Сплавление не обязательно должно быть прямым, оно может возникнуть через линкерные последовательности.
т.е.
т.е.
например
см.
et al.
J. Immunol.
например
например
например
Более того, молекулы настоящего изобретения ( полипептиды, антитела), содержащие вариантные Fc-участки, могут быть сопряжены с терапевтическим средством или фрагментом лекарственного средства, которое модифицирует данную биологическую реакцию. Терапевтические средства или фрагменты лекарственных средств не должны рассматриваться, ограничиваясь только как классическими химическими терапевтическими средствами. Например, фрагмент лекарственного средства может быть белком или полипептидом, обладающим направленной биологический активностью. Такие белки могут включать, например, токсин, такой как абрин, рицин A, эндотоксин синегнойной палочки (, PE-40) или дифтерийный токсин, рицин, гелонин, и фитолакковый противовирусный белок, белок, такой как фактор некроза опухоли, интерфероны, включая без ограничения α-интерферон (IFN-α), β-интерферон (IFN-β), фактор роста нервов (NGF), тромбоцитарный фактор роста (PDGF), тканевой активатор плазмогена (TPA), апоптический агент (, TNF-α, TNF-β, AIM I, как раскрыто в PCT публикации № WO 97/33899), AIM II (, PCT публикацию № WO 97/34911), Fas лиганд (Takahashi , , 6:1567-1574, 1994), и VEGI (PCT публикация № WO 99/23105), тромболитическое средство или антиангиогенное средство (, ангиостатин или эндостатин), или модификатор биологической реакции, такой как, например, лимфокин (, интерлейкин-1 (“IL-1”), интерлейкин-2 (“IL-2”), инерлейкин-6 (“IL-6”), гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (“GM-CSF”), и гранулоцитарный колониестимулирующий фактор (“G-CSF”), макрофагальный колониестимулирующий фактор (“M-CSF”) или фактор роста (, гормон роста (“GH”); протеазы или рибонуклеазы.
т.е.
et al.
, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
et al.
Cell
et al.
Biotechniques
Молекулы настоящего изобретения ( полипептиды, антитела) могут быть сплавлены с маркерной последовательностью, такой как пептид для облегчения очистки. В предпочтительных вариантах осуществления, маркерная аминокислотная последовательность является гекса-гистидиновым пептидом, таким как метка, представленная в pQE векторе (QIAGEN, Inc., 9259 Eton Avenue, Chatsworth, CA, 91311), среди прочих, многие из которых являются коммерчески доступными. Как описано в Gentz , 1989, 86:821-824, например, гекса-гистидин предусмаривается для подходящей очистки сплавленного белка. Другие пептидные метки, удобные для очистки, включают без ограничения гемагглютинирующую “HA” метку, которая соответствует эпитопу, полученному из белка гемагглютинина гриппа (Wilson , , 37:767 1984), и “flag” метку (Knappik , , 17(4):754-761, 1994).
например
См.
et al.
Curr. Opinion Biotechnol.
Trends Biotechnol
et al.
J. Mol. Biol
BioTechniques
и т. д.
Дополнительные сплавленные белки могут быть произведены через техники ген-шаффлинг, мотив-шаффлинг, экзон-шаффлинг и/или кодон-шаффлинг (совместно именуемые “ДНК шаффлинг”). ДНК шаффлинг может быть применен для изменения активностей молекул настоящего изобретения (, антител с наивысшими аффинностями и наиболее низкими скоростями диссоциации).  в общем патент США № 5 605 793; 5 811 238; 5 830 721; 5 834 252; и 5 837 458, и Patten , 1997,  8:724-33; Harayama, 1998, . 16:76; Hansson, , 1999, . 287:265; and Lorenzo and Blasco, 1998,  24:308 (каждый из этих патентов и публикаций присутствует в данном документе в качестве ссылок в полном объеме). Молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантные Fc-участки, или нуклеиновые кислоты, кодирующие молекулы настоящего изобретения, могут быть в дальнейшем изменены, будучи подвергнутыми случайному мутагенезу путем ПЦР пониженной точности, случайных нуклеотидных вставок или других способов предварительной рекомбинации. Одна или несколько частей полинуклеотида, кодирующего молекулы настоящего изобретения, могут быть рекомбинированы с одним или несколькими компонентами, мотивами, секциями, частями, доменами, фрагментами,  одной или нескольких гетерологических молекул.
т.е.
например
См.
213
14
51
57
18
153
159
68
67
68
166
115
113
112
111
131
125
123
121
140
177
54
99
103
32
142
149
186
188
105
97
153
47
75
85
35
99
201
113
117
3
133
169
175
90
65
,
Настоящее изобретение также включает молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантные Fc-участки ( антитела, полипептиды), сопряженные с диагностическим или терапевтическим средством или любой другой молекулой, время полужизни которой в крови желательно увеличить и/или направить на определенную субпопуляцию клеток. Молекулы настоящего изобретения могут использоваться с помощью диагностики, например, для слежения за развитием или прогрессированием заболевания, нарушения или инфекции как части клинической тестовой процедуры, , для определения эффективности данной схемы лечения. Обнаружение может быть облегчено путем связывания молекул настоящего изобретения с определяемым веществом. Примеры определяемых веществ включают различные ферменты, протезные группы, флуоресцентные материалы, люминистцентные материалы, биолюминисцентные материалы, радиоактивные материалы, позитрон-эмиссионные металлы и нерадиоактивные парамагнитные ионы металлов. Определяемое вещество может быть связано или сопряжено как непосредственно с молекулами настоящего изобретения, так и опосредовано через промежуточное вещество (такое как, например, линкер, известный на данном уровне техники) с использованием техник, известных на данном уровне развития техники. , например, патент США № 4 741 900, касающийся ионов металлов, которые могут быть сопряжены с антителами для применения в качестве диагностического средства согласно настоящего изобретения. Такие диагностика и определение могут быть осуществлены путем связывания молекул настоящего изобретения с определяемыми веществами, включая без ограничения различные ферменты, ферменты, включающие без ограничения пероксидазу хрена, алкалиновую фосфатазу, бета-галактозидазу или ацетилхолинэстеразу; комплексы протезных групп, таких как, без ограничения, стрептавидин/биотин и авидин/биотин; флуоресцентные материалы, такие как, без ограничения, умбеллиферон, флуоресцеин, флуоресцеин изотиоцианат, родамин, дихлортриазиниламин флуоресцеин, дансил хлорид или фикоэритрин; люминисцентный материал, такой как, без ограничения, люминал; биолюминисцентные материалы, такие как, без ограничения, люцифераза, люциферин и экворин; радиоактивный материал, такой как, без ограничения, висмут (Bi) углерод (C), хром (Cr), кобальт (Co), фтор (F), гадолиний (Gd, Gd), галлий (Ga, Ga), германий (Ge), гольмий (Ho), индий (In, In, In, In), йод (I, I, I, I), лантан (La), лютеций (Lu), марганец (Mn), молибден (Mo), палладий (Pd), фосфор (P), празеодимий (Pr), прометий (Pm), рений (Re, Re), родий (Rh), рутений (Ru), самарий (Sm), скандий (Sc), селен (Se), стронций (Sr), сера (S), технеций (Tc), таллий (Ti), олово (Sn, Sn), тритий (H), ксенон (Xe), иттербий (Yb, Yb), иттрий (Y), цинк (Zn); позитрон-эмиссионные металлы, используемые в различных позитрон-эмиссионных томографиях, и нерадиоактивные парамагнитные ионы металлов.
т.е.
например
например
.
например
например
например
например
например
Молекулы настоящего изобретения ( антитела, полипептиды), содержащие вариантный Fc-участок, могут быть сопряжены с терапевтическими фрагментами, такими как цитотоксин (, цитостатическое средство или средство, разрушающее клетки), терапевтическое средство или радиоактивный элемент (, альфа-излучатели, гамма-излучатели и т. д). Цитотоксины или цитотоксические агенты включают любой агент, который является губительным для клетки. Примеры включают паклитаксел, цитохалазин B, грамицидин D, этидиум бромид, эметин, митомицин, этопозид, тенопозид, винкристин, винбластин, колхицин, доксорубицин, даунорубицин, дигидрокси антрацин дион, митоксантрон, митрамицин, актиномицин D, 1-дегидротестостерон, глюкокортикоиды, прокаин, тетракаин, лидокаин, пропранолол и пиромицин и их аналоги или гомологи. Терапевтические средства включают без ограничения антиметаболиты (, метотрексат, 6-меркаптопурин, 6-тиогуанин, цитарабин, 5-фторурацил декарбазин), алкилирующие агенты (, мехлоретамин, тиотепа хлорамбуцил, мелфалан, кармустин (BSNU) и ломустин (CCNU), циклотосфамид, бусульфан, дибромоманнитол, стрептозотоцин, митомицин С и цисдихлордиамин платины (II) (DDP) цисплатин), антрациклины (, даунорубицин (ранее дауномицин) и доксорубицин), антибиотики (, дактиномицин (ранее актиномицин), блеомицин, митрамицин и антрамицин (AMC) и анти-митотические агенты (, винкристин и винбластин).
см.
et al.
Clin Cancer Res.
et al.
Bioconjug. Chem.
et al.,
Nucl. Med. Biol.
Более того молекула настоящего изобретения может быть сопряжена с терапевтическими фрагментам, такими как радиоактивные материалы или макроциклические хелаторы, пригодные для конъюгирования ионов радиометаллов ( выше примеры радиоактивных материалов). В определенных вариантах осуществления макроциклическим хелатором является 1,4,7,10-тетраазациклододекан-N,N',N'',N'''-тетрауксусной кислоты (DOTA), который может быть присоединен к антителу через линкерную молекулу. Такие линкерные молекулы широко известны на данном уровне техники и описаны в Denardo , 1998, 4:2483-90; Peterson , 1999,10:553; and Zimmerman 1999, 26:943-50, каждый из которых включен в данный документ в качестве ссылки во всем его объеме.
см.
например
et al.
Monoclonal Antibodies And Cancer Therapy
et al.
et al.
Controlled Drug Delivery (2nd Ed.)
et al.
Monoclonal Antibodies '84: Biological And Clinical Applications
et al.
Monoclonal Antibodies For Cancer Detection And Therapy
et al.
et al.
Immunol. Rev.
Техники конъюгирования таких терапевтических фрагментов с антителами являются хорошо известными; , , Arnon , “Monoclonal Antibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy”, in , Reisfeld  (eds.), 1985, pp. 243-56, Alan R. Liss, Inc.); Hellstrom , “Antibodies For Drug Delivery”, in , Robinson  (eds.), 1987, pp. 623-53, Marcel Dekker, Inc.); Thorpe, “Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy: A Review”, in , Pinchera  (eds.), 1985, pp. 475-506); “Analysis, Results, And Future Prospective Of The Therapeutic Use Of Radiolabeled Antibody In Cancer Therapy”, in , Baldwin  (eds.), 1985, pp. 303-16, Academic Press; and Thorpe , , 62:119-58, 1982.
В одном варианте осуществления, где молекула настоящего изобретения является антителом, содержащим вариантный Fc-участок, он может быть введен с или без терапевтического фрагмента, сопряженного с ним, введен самостоятельно или в комбинации с цитотоксическим фактором(ами) и/или цитокином(ами) для применения в качестве терапевтического лечения. Альтернативно антитело настоящего изобретения может быть сопряжено со вторым антителом для формирования гетероконъюгата антитела как описано в патенте США № 4 676 980, Segal, который включен в данный документ ссылкой во всем его объеме. Антитела настоящего изобретения также могут быть присоединены к твердым носителям, которые особенно полезны при иммунологических анализах или очистке целевого антигена. Такие твердые носители включают без ограничения стекло, целлюлозу, полиакриламид, нейлон, полистирол, поливинилхлорид или полипропилен.
6.2
СКРИНИНГ МОЛЕКУЛ С ВАРИАНТНЫМИ Fc-УЧАСТКАМИ ДЛЯ УВЕЛИЧЕНИЯ FcγRIII СВЯЗЫВАНИЯ И ИХ ХАРАКТЕРИСТИКИ
например
т.е.
например
В предпочтительных вариантах осуществления скрининг и идентификация молекул, содержащих вариантные Fc-участки с измененными FcγR свойствами (, увеличенная FcγRIIIA аффинность), выполнены с использованием техники дрожжевого дисплея в комбинации с одним или несколькими испытаниями на основе биохимии предпочтительно с высокой пропускной способностью, как описано в данном документе или как раскрыто в публикациях патентных заявок США 2005/0037000 и 2005/0064514 и в публикации международной патентной заявке WO 04/063351, каждый из которых включен в данный документ в качестве ссылки во всем его объеме. Один или несколько биохимических испытаний могут быть любым из испытаний, известных на данном уровне техники для идентифицирования Fc-FcγR взаимодействия,  специфическое связывание Fc-участка с FcγR, включая без ограничения испытание ELISA, испытания поверхностного плазмонного резонанса, испытание иммунопреципитации, аффинной хроматографии и равновесного диализа. В некоторых вариантах осуществления скрининг и идентификация молекул, содержащих вариантные Fc-участки с измененными FcγR аффинностями (, повышенная FcγRIIIA аффинность), выполнены с использованием техники дрожжевого дисплея, как описано в данном документе в комбинации с одним или несколькими функциональными испытаниями, предпочтительно с высокой пропускной способностью. Функциональные испытания могут быть любыми испытаниями, известными на данном уровне техники для характеристики одной или нескольких FcγR опосредованных эффекторных клеточных функций, таких как те, что описаны в данном документе в Разделе 6.2.7. Неограничивающие примеры эффекторных клеточных функций, которые могут использоваться в соответствии со способами настоящего изобретения, включают без ограничения антитело-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC), антитело-зависимый фагоцитоз, фагоцитоз, опсонизацию, опсонофагоцитоз, клеточное связывание, розеткообразование, C1q связывание и комплемент-зависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность. В некоторых вариантах осуществления скрининг и идентификация молекул, содержащих вариантные Fc-участки с измененными FcγR аффинностями (например, увеличенной FcγRIIIA аффинностью), выполнены с использованием техники дрожжевого дисплея, как описано в данном документе в комбинации с одним или несколькими биохимическими испытаниями в комбинации или параллельно с одним или несколькими функциональными испытаниями, предпочтительно с высокой пропускной способностью.
например
Термин "специфическое связывание" Fc-участка с FcγR относится к взаимодействию Fc-участка и отдельного FcγR, который имеет аффинную константу по меньшей мере около 150 нМ в случае мономерного FcγRIIIA и по меньшей мере около 60 нМ в случае димерного FcγRIIB, что определено с использованием, например, испытания ELISA или испытания поверхностного плазмонного резонанса (например, BIAcore™). Аффинная константа Fc-участка мономерного FcγRIIIA может быть 150 нМ, 200 нМ или 300 нМ. Аффинная константа Fc-участка для димерного FcγRIIB может быть 60 нМ, 80 нМ, 90 нМ или 100 нМ. Димерный FcγRIIB для применения в способах настоящего изобретения может быть создан с помощью способов, известных специалистам в данной области техники. Как правило, внеклеточный участок FcγRIIB ковалентно связан с гетерологичным полипептидом, который способен к димеризации, так, что полученный сплавленный белок является димером, , см., заявку США № 60/439 709, поданную 13 января 2003 года (дело патентного поверенного № 11183-005-888), которая включена в данный документ ссылкой во всем объеме. Конкретное взаимодействие в целом является стабильным при физиологических условиях, включая, например, условия, которые случаются в жизни индивидуума, такого как человек, или же позвоночного или беспозвоночного животного, а также при условиях, которые случаются в клеточной культуре таких условий, которые используются для поддержания и культивирования клеток млекопитающих или клеток других позвоночных организмов и беспозвоночных организмов.
например
например
J. Immunol.
Hybridoma
et al.
Cancer Res.
et al.
Nucl. Acids Res.
et al.
Cancer Res
et al.
J. Natl
Instit
et al.
J. Exp. Med.
et al.
Cancer
et al.
J. Clin. Invest
et al.
Proc. Am. Soc. Clin. ncol
et al.
Cancer Res
et al
Int. J. Cancer
et al.
J. Clin. Immunol
et al.
Blood
et al.
Blood
et al
J. Nucl. Med
et al
J. Immunol.
et al.
Cancer Immunol. Immunother
et al
J. Clin. Oncol
et al
Cancer Res
et al
Cancer. Res
et al.
Cancer Res
et al
J. of Immun
et al
Trends in Bio.
Chem. Sci
et al
Science
Nature
см.
The Cancer Journal
7
HER2
y
a
b
b
y
1
1
5
7
24
D3
M2
D2
В определенном варианте осуществления скрининг и идентификация молекул, содержащих вариантные Fc-участки и измененные FcγR аффинности, включают: отображение молекулы, содержащей вариантный Fc-участок на поверхности дрожжей; и описание связывания молекулы, содержащей вариантный Fc-участок с FcγR (один или несколько), используя биохимическое испытание для определения Fc-FcγR взаимодействия, предпочтительно, испытание на основе ELISA. Как только молекула, содержащая вариантный Fc-участок, описана для ее взаимодействия с одним или несколькими FcγRs и определена, как имеющая измененную аффинность к одному или нескольким FcγR, путем по меньшей мере одного биохимического испытания, , испытания ELISA, молекула может быть сконструирована в полноценный иммуноглобулин, используя способы стандартной рекомбинантной ДНК-технологии, известные на данном уровне техники, и иммуноглобулин, содержащий вариантный Fc-участок, экспрессированный в клетки млекопитающих для дальнейшего биохимического описания. Иммуноглобулин, в который вставлен вариантный Fc-участок настоящего изобретения (, заменив Fc-участок иммуноглобулина), может быть любым иммуноглобулином, включая без ограничения поликлональные антитела, моноклональные антитела, биспецифические антитела, мультиспецифические антитела, гуманизированные анитела и химерные антитела. В предпочтительных вариантах осуществления вариантный Fc-участок вводится в иммуноглобулин, специфичный к рецептору поверхности клетки, опухолевому антигену или антигену злокачественной опухоли. Иммуноглобулин, в который вводится вариантный Fc-участок настоящего изобретения, может специфически связываться с антигеном злокачественной опухоли или опухолевым антигеном, например, включая без ограничения KS 1/4 карциноидный антиген (Perez and Walker, 1990,  142: 3662-3667; Bumal, 1988, (4): 407-415), антиген карциномы яичников (CA125) (Yu , 1991,  51(2): 468-475), простатический кислый фосфат (Tailor , 1990,  18(16): 4928), простат-специфический антиген (Henttu and Vihko, 1989, Biochem. Biophys. Res. Comm. 160(2): 903-910; Israeli , 1993, . 53: 227-230), связанным с меланомой антиген p97 (Estin , 1989, . Cancer . 81(6): 445-446), антиген gp75 меланомы (Vijayasardahl , 1990,  171(4): 1375-1380), высокомолекулярный антиген меланомы (HMW-MAA) (Natali , 1987,  59: 55-63; Mittelman , 1990, . 86: 2136-2144), простат-специфический мембранный антиген, карциноэмбриональный антиген (CEA) (Foon , 1994, . 13: 294), антиген полиморфного эпителиального муцина, антиген жировых глобул грудного молока, антигены, связанные с колоректальной опухолью, такие как: CEA, TAG-72 (Yokata , 1992, . 52: 3402-3408), CO17-1A (Ragnhammar ., 1993,  53: 751-758); GICA 19-9 (Herlyn , 1982, . 2: 135), CTA-1 и LEA, антиген-38,13 лимфомы Беркитта, CD19 (Ghetie , 1994,  83: 1329-1336), антиген-CD20 В-лимфомы человека (Reff , 1994,  83:435-445), CD33 (Sgouros ., 1993, . 34:422-430), антигены, специфический к меланоме, такие как ганглиозид GD2 (Saleh ., 1993, , 151, 3390-3398), ганглиозид GD3 (Shitara , 1993, . 36:373-380), ганглиозид GM2 (Livingston ., 1994, . 12: 1036-1044), ганглиозид GM3 (Hoon ., 1993, . 53: 5244-5250), антиген опухоли конкретного трансплантационного типа клеточной поверхности (TSTA), такие как антигены опухолей, вызванных вирусом, включая T-антиген опухолевых ДНК вирусов и капсульные антигены опухолевых РНК вирусов, онкофетальный антиген- альфа-фетопротеин, такой как CEA толстой кишки, антиген опухоли мочевого пузыря (Hellstrom ., 1985, . 45:2210-2188), дифференцированные антигены, такие как антигены L6, L20 карциномы легких человека (Hellstrom , 1986, . 46: 3917-3923), антигены фибросаркомы, антиген-Gp37 Т-клеточной лейкемии человека (Bhattacharya-Chatterjee ., 1988, . 141:1398-1403), неогликопротеин, сфигнолипиды, антеген злокачественной опухоли груди, такой как EGFR (рецептор эпидермального фактора роста), HER2 антиген (p185), полиморфный эпителиальный муцин (PEM) (Hilkens ., 1992, . 17:359), антиген-APO-1 злокачественных лимфоцитов человека (Bernhard ., 1989,  245: 301-304), дифференцированный антиген (Feizi, 1985,  314: 53-57), такой как антиген I, обнаруженный в эритроцитах плода, основной эндодермальный антиген I, обнаруженный в эритроцитах взрослого чекловека, предимплантационных зародышах, I(Ma), обнаружен в аденокарциномах желудка, M18, M39, обнаруженные в эпителии молочной железы, SSEA-1, обнаруженный в миелоидных клетках, VEP8, VEP9, Myl, VIM-D5, D56-22, обнаруженные в колоректальной злокачественной опухоли, TRA-1-85 (группа крови H), C14, обнаруженный в аденокарциноме прямой кишки, F3, обнаруженный в аденокарциноме легких, AH6, обнаруженный в злокачественной опухоли желудка, Y гаптен, Le, обнаруженные в клетках эмбриональной карциномы, TL5 (группа крови A), EGF рецептор, обнаруженный в A431 клетках, группы E (группа крови B), обнаруженные в злокачественной опухоли поджелудочной железы, FC10.2, обнаруженный в клетках эмбриональной карциномы, антеген желудочной аденокарциномы, CO-514 (группа крови Le), обнаруженный в Аденокарциноме, NS-10, обнаруженный в аденокарциномах, CO-43 (группа крови Le), G49, обнаруженный в EGF рецепторе клеток A431, MH2 (группа крови ALe/Le), обнаруженный в аденокарциноме толстого кишечника, 19.9, обнаруженный в злокачественной опухоли толстого кишечника, муцинах злокачественной опухоли желудка, TA, обнаруженный в миелоидных клетках, R, обнаруженный в меланоме, 4.2, G, D1.1, OFA-1, G, OFA-2, G, и M1:22:25:8, обнаруженные в клетках эмбриональной карциномы, и SSEA-3 и SSEA-4, обнаруженные в эмбрионе от 4-й до 8-й клеточной стадии гистации. В одном варианте осуществления антиген является пептидом, полученным из рецептора Т-клетки, из лимфомы Т-клеток кожи (, Edelson, 1998,  4:62).
Nucl Med Biol
et al
Cancer Res
Expert Opin Biol Ther
et al
J Pathol.
et al
Int J Gynecol Cancer
et al
Semin Oncol
et al
Hematol Cell Ther
et al
et al
Curr Top Microbiol Immunol
et al
Hematol Cell Ther
Haematologica
Haematologica
Lab Hematol
et al
Ann N Y Acad Sci
Curr Oncol Rep
Haematologica
et al
Hematol Cell Ther
et al
et al
Hematol Cell Ther
et al
Cell Cycle
Gynecol Obstet Fertil
et al
Rev Invest Clin
et al
Curr Opin Immunol.
et al
Bull Cancer
et al
Oncogene
et al
et al
Int J Cancer
et al
et al
J Immunother.
et al
et al
Adv Virus Res
Cancer Treat Res
Expert Opin Biol Ther
et al
Curr Oncol Rep
Gynecol Obstet Fertil
et al
J Cell Physiol
Biochim Biophys Acta
et al
Nat Rev Mol Cell Biol
et al
Minerva Urol Nefrol
Cancer Treat Res
Expert Opin Biol Ther
et al
Oncologist
et al
Curr Drug Targets.
Oncologist
Настоящее изобретение в частности касается варианта осуществления, в котором связывание Fc-участка с FcγR активирует клеточный эффектор, который нацелен на клетки, что структурируют антигены злокачественной опухоли, такие как A33 (антиген колоректальной карциномы; Almqvist, Y. 2006, . Nov;33(8):991-998); B1 (Egloff, A.M. . 2006, . 66(1):6-9); BAGE (Bodey, B. 2002 . 2(6):577-84); бета- катенин (Prange W. . 2003  201(2):250-9); CA125 (Bast, R.C. Jr. . 2005  15 Suppl 3:274-81); CD5 (Calin, G.A. . 2006 . 33(2):167-73; CD19 (Troussard, X. . 1998 . 40(4):139-48); CD20 (Thomas, D.A. . 2006 Hematol Oncol Clin North Am. 20(5):1125-36); CD22 (Kreitman, R.J. 2006 AAPS J. 18;8(3):E532-51); CD23 (Rosati, S. . 2005 . 5;294:91-107); CD25 (Troussard, X. . 1998 . 40(4):139-48); CD27 (Bataille, R. 2006  91(9):1234-40); CD28 (Bataille, R. 2006  91(9):1234-40); CD36 (Ge, Y. 2005 . 11(1):31-7); CD40/CD154 (Messmer, D. . 2005 . 1062:51-60); CD45 (Jurcic, J.G. 2005 . 7(5):339-46); CD56 (Bataille, R. 2006  91(9):1234-40); CD79a/CD79b (Troussard, X. . 1998 . 40(4):139-48; Chu, P.G. . 2001 Appl Immunohistochem Mol Morphol. 9(2):97-106); CD103 (Troussard, X. . 1998 . 40(4):139-48); CDK4 (Lee, Y.M. . 2006  5(18):2110-4); CEA (карциноэмбриональный антиген; Mathelin, C. 2006 . 34(7-8):638-46; Tellez-Avila, F.I. . 2005. 57(6):814-9); CTLA4 (Peggs, K.S. . 2006  18(2):206-13); EGF-R (рецептор эпидермального фактора роста; Adenis, A. . 2003 . 90 Spec No:S228-32); Erb (ErbB1; ErbB3; ErbB4; Zhou, H. . 2002  21(57):8732-40; Rimon, E. . 2004 Int J Oncol. 24(5):1325-38); GAGE (GAGE-1; GAGE-2; Akcakanat, A. . 2006 . 118(1):123-8); GD2/GD3/GM2 (Livingston, P.O. . 2005 Cancer Immunol Immunother. 54(10):1018-25); gp100 (Lotem, M. . 2006  29(6):616-27); HER-2/neu (Kumar, Pal S . 2006 Semin Oncol. 33(4):386-91); папилломавирус E6 человека / папилломовирус E7 человека (DiMaio, D. . 2006 . 66:125-59; KSA (17-1A) (Ragupathi, G. 2005 . 123:157-80); MAGE (MAGE-1; MAGE-3; (Bodey, B. 2002 . 2(6):577-84); MART (Kounalakis, N. . 2005 . 7(5):377-82; MUC-1 (Mathelin, C. 2006 . 34(7-8):638-46); MUM-1 (Castelli, C. . 2000 . 182(3):323-31); N-ацетилглукозаминилтрансфераза (Dennis, J.W. 1999 . 6;1473(1):21-34); p15 (Gil, J. . 2006 . 7(9):667-77); PSA (специфический антиген простаты; Cracco, C.M. . 2005 . 57(4):301-11); PSMA (Ragupathi, G. 2005 . 123:157-80); sTn (Holmberg, L.A. 2001 . 1(5):881-91); TNF-рецептор (TNF-α рецептор, TNF-ß рецептор; или TNF-γ рецептор; van Horssen, R. . 2006 . 11(4):397-408; Gardnerova, M. . 2000 1(4):327-64); или рецептор VEGF (O'Dwyer. P.J. 2006 . 11(9):992-8). Также представляют интерес антигены, специфические к особым инфекционным агентам, например, вирусные агенты включают без ограничения вирус иммунодефицита человека (HIV), вирус гепатита B (HBV), гриппа, вирус папилломы человека (HPV), ног и рта (вирусы коксаки), вирус бешенства, вирус простого герпеса (HSV), и возбудители гастроэнтеритов, включая ротавирусы, аденовирусы, калицивирусы, астровирусы и вирус Норуолк; бактериальные агенты включают без ограничения E. coli, Salmonella thyphimurium, Pseudomonas aeruginosa, Vibrio cholerae, Neisseria gonorrhoeae, Helicobacter pylori, Hemophilus influenzae, Shigella dysenteriae, Staphylococcus aureus, Mycobacterium tuberculosis и Streptococcus pneumoniae, грибковые агенты и паразиты, такие как Giardia.
et al.
J. Biol. Chem.
et al.
Journal of Immunology
et al.
Cancer Biother.
В некоторых вариантах осуществления вариантный Fc-участок настоящего изобретения вводится в анти-флуоресцентное моноклональное антитело, 4-4-20 (Kranz , 1982  257(12): 6987-6995; который включен в данный документ ссылкой во всем его объеме). В других вариантах осуществления вариантный Fc-участок настоящего изобретения вводится в мышино-человечское химерное анти-CD20 моноклональное антитело 2H7, которое распознает фосфопротеин поверхности клетки CD20 на В клетках (Liu , 1987, , 139: 3521-6; который включен в данный документ ссылкой во всем его объеме). В других вариантах осуществления вариантный Fc-участок настоящего изобретения вводится в гуманизированное антитело (Ab4D5) против рецептора 2 эпидермального фактора роста человека (p185 HER2), как описано Carter et al. (1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 4285-9; который включен в данный документ ссылкой во всем его объеме). В других же вариантах осуществления вариантный Fc-участок настоящего изобретения вводится в гуманизированное анти-TAG72 антитело (CC49) (Sha , 1994  9(4): 341-9). В других вариантах осуществления вариантный Fc-участок настоящего изобретения вводится в Ритуксан, который используется для лечения лимфом.
например
2
2
2
2
2
В другом определенном варианте осуществления настоящее изобретение включает конструирование анти-FcγRIIB антитела, включая без ограничения любые антитела, раскрытые в публикациях патентных заявок США 2005/02157667; 2004/0185045; 2005/0260213; или 2006/013810; международных публикациях патентных заявок WO 2005/110474 или WO 2005/115452; патентной заявке США 11/305787, поданной 15 декабря 2005 года; или предварительных заявках № 60/809,116; 60/816,126; или 60/816,688, поданных 26 мая 2006 года, 23 июня 2006 года или 26 июня 2006 года соответственно путем модификации (, замещения, вставки, делеции) по меньшей мере одного аминокислотного остатка, модификация которого увеличивает аффинность Fc-участка к FcγRIIIA и/или FcγRIIA. Каждый из упомянутых выше материалов вставлен в данный документ в качестве ссылки во всем его объеме. Примерами анти-FcγRIIB антител, которые могут быть или не могут быть гуманизированы, что может быть сконструировано в соответствии со способами настоящего изобретения, являются 2B6 моноклональным антителом, имеющим ATCC регистрационный номер PTA-4591 и 3H7, имеющим ATCC регистрационный номер PTA-4592, 1D5 моноклональное антитело, имеющее ATCC регистрационный номер PTA-5958, 1F2, имеющее ATCC регистрационный номер PTA-5959, 2D11 моноклональное антитело, имеющее ATCC регистрационный номер PTA-5960, 2E1 моноклональное антитело, имеющее ATCC регистрационный номер PTA-5961, и 2H9 моноклональное антитело, имеющее ATCC регистрационный номер PTA-5962 (все задепонированы 10801 University Boulevard, Manassas, VA 02209-2011), которые вставлены в данный документ в качестве ссылок. В другом определенном варианте осуществления модификация анти-FcγRIIB антитела может также в дальнейшем уменьшить аффинность Fc-участка к FcγRIIB. В еще одном определенном варианте осуществления сконструированное анти-FcγRIIB антитело может в дальнейшем иметь усиленную эффекторную функцию, как определено стандартными испытаниями, известными на данном уровне техники и раскрыто и приведено в данном документе в качестве примера. В некоторых вариантах осуществления вариантный Fc-участок настоящего изобретения вводится в терапевтическое моноклональное антитело, специфическое к антигену злокачественной опухоли или рецептору поверхности клетки, включая без ограничения Erbitux™ (также известный как IMC-C225) (ImClone Systems Inc.), химерное моноклональное антитело против EGFR; HERCEPTIN (Трастузумаб) (Genentech, CA), которое является гуманизированным анти-HER2 моноклональным антителом для лечения пациентов с метастатическим раком молочной железы; REOPRO (абциксимаб) (Centocor), который является анти-гликопротеиновым IIb/IIIa рецептором тромбоцитов для предотвращения образование тромбов; ZENAPAX (даклизумаб) (Roche Pharmaceuticals, Швейцария), который является иммунодепрессивным, гуманизированным анти-CD25 моноклональным антителом для предотвращения острого отторжения почечного аллотрансплантата. Другими примерами являются гуманизированное анти-CD18 F(ab') (Genentech); CDP860, которое представляет собой гуманизированное анти-CD18 F(ab') (Celltech, Великобритания); PRO542, которое представляет собой анти-HIV gp120 антитело сплавленное с CD4 (Progenics/Genzyme Transgenics); C14, которое представляет собой анти-CD14 антитело (ICOS Pharm); гуманизированное анти-VEGF IgG1 антитело (Genentech); OVAREX™, которое представляет собой мышиное анти-CA 125 антитело (Altarex); PANOREX™, которое представляет собой мышиное IgG2a антитело анти-17-IA антигена клеточной поверхности (Glaxo Wellcome/Centocor); IMC-C225, которое представляет собой химерное анти-EGFR IgG антитело (ImClone System); VITAXIN™, которое представляет собой гуманизированное анти-αVβ3 интегриновое антитело (Applied Molecular Evolution/MedImmune); Кампат 1H/LDP-03, которое представляет собой гуманизированное анти CD52 IgG1 антитело (Leukosite); Smart M195, которое представляет собой гуманизированное анти-CD33 IgG антитело (Protein Design Lab/Kanebo); RITUXAN™, которое является химерным анти-CD20 IgG1 антителом (IDEC Pharm/Genentech, Roche/Zettyaku); LYMPHOCIDE™, которое представляет собой гуманизированное анти-CD22 IgG антитело (Immunomedics); Smart ID10, которое представляет собой гуманизированное анти-HLA антитело (Protein Design Lab); ONCOLYM™ (Lym-1) представляет собой радиоактивно меченное мышиное анти-HLA DR антитело (Techniclone); анти-CD11a представляет собой гуманизированное IgG1 антитело (Genetech/Xoma); ICM3 представляет собой гуманизированное анти-ICAM3 антитело (ICOS Pharm); IDEC-114 представляет собой приматизированное анти-CD80 антитело (IDEC Pharm/Mitsubishi); ZEVALIN™ представляет собой радиоактивно меченное мышиное анти-CD20 антитело (IDEC/Schering AG); IDEC-131 представляет собой гуманизированное анти-CD40L антитело (IDEC/Eisai); IDEC-151 представляет собой приматизированное анти-CD4 антитело (IDEC); IDEC-152 представляет собой приматизированное анти-CD23 антитело (IDEC/Seikagaku); SMART anti-CD3 представляет собой гуманизированное анти-CD3 IgG антитело (Protein Design Lab); 5G1.1 представляет собой гуманизированное анти-комплементное антитело фактора 5 (C5) (Alexion Pharm); IDEC-151 представляет собой приматизированное анти-CD4 IgG1 антитело (IDEC Pharm/SmithKline Beecham); MDX-CD4 представляет собой гуманизированное анти-CD4 IgG антитело (Medarex/Eisai/Genmab); CDP571 представляет собой гуманизированное анти-TNF-α IgG4 антитело (Celltech); LDP-02 представляет собой гуманизированное анти-α4β7 антитело (LeukoSite/Genentech); OrthoClone OKT4A представляет собой гуманизированное анти-CD4 IgG антитело (Ortho Biotech); ANTOVA™ представляет собой гуманизированное анти-CD40L IgG антитело (Biogen); ANTEGREN™ представляет собой гуманизированное анти-VLA-4 IgG антитело (Elan); MDX-33 представляет собой человеческое анти-CD64 (FcγR) антитело (Medarex/Centeon); rhuMab-E25 представляет собой гуманизированное анти-IgE IgG1 антитело (Genentech/Norvartis/Tanox Biosystems); IDEC-152 представляет собой приматизированное анти-CD23 антитело (IDEC Pharm); ABX-CBL представляет собой мышиное анти CD-147 IgM антитело (Abgenix); BTI-322 представляет собой крысиное анти-CD2 IgG антитело (Medimmune/Bio Transplant); Orthoclone/OKT3 представляет собой мышиное анти-CD3 IgG2a антитело (ortho Biotech); SIMULECT™ представляет собой химерное анти-CD25 IgG1 антитело (Novartis Pharm); LDP-01 представляет собой гуманизированное анти-β-интегрин IgG антитело (LeukoSite); Anti-LFA-1 представляет собой мышиное анти CD18 F(ab') (Pasteur-Merieux/Immunotech); CAT-152 представляет собой человеческое анти-TGF-β антитело (Cambridge Ab Tech); и Corsevin M представляет собой химерное анти-Фактор VII антитело (Centocor).
например
например
например
Вариантные Fc-участки настоящего изобретения, предпочтительно в контексте иммуноглобулина, могут быть в дальнейшем охарактеризованы с использованием одного или нескольких биохимических испытаний и/или одного или нескольких функциональных испытаний предпочтительно с высокой пропускной способностью. В некоторых альтернативных вариантах осуществления вариантные Fc-участки настоящего изобретения не вводятся в иммуноглобулин и далее характеризуются с использованием одного или нескольких биохимических испытаний и/или одного или нескольких функциональных испытаний с высокой пропускной способностью. Один или несколько биохимических испытаний могут быть любым испытанием, известным на данном уровне техники, для идентифицирования Fc-FcγR взаимодействий, включая без ограничения испытание ELISA, и метод поверхностного плазмонного резонанса для определения кинетических параметров Fc-FcγR взаимодействия, , BIAcore испытание. Одним или несколькими функциональными испытаниями может быть любое известное на данном уровне техники испытание для характеристики одной или нескольких FcγR опосредованных эффекторных клеточных функций, как известно специалистам в данной области техники или описано в данном документе. В определенных вариантах осуществления иммуноглобулины, содержащие вариантные Fc-участки, исследуются испытанием ELISA для связывания одного или нескольких FcγRs, , FcγRIIIA, FcγRIIA, FcγRIIA; с последующим одним или несколькими ADCC испытаниями. В некоторых вариантах осуществления иммуноглобулины, содержащие вариантные Fc-участки, анализировали в дальнейшем, используя испытание поверхностного плазмонного резонанса, , BIAcore. Метод поверхностного плазмонного резонанса является хорошо известным на данном уровне техники, в дальнейшем обсуждается в Разделе 6.2.7 и приводится в данном документе в качестве примера в Примере 7.8.
например
например
например
Пример испытания с высокой пропускной способностью для характеристики иммуноглобулинов, содержащих вариантные Fc-участки, может включать: введение вариантного Fc-участка настоящего изобретения, , путем методов стандартной рекомбинантной ДНК технологии, в 4-4-20 антитело; характеристику специфического связывания 4-4-20 антитела, содержащего вариантный Fc-участокс FcγR (, FcγRIIIA, FcγRIIB) в испытании ELISA; характеристику 4-4-20 антитела, содержащего вариантный Fc-участок в испытании ADCC (используя способы, раскрытые в данном документе), где целевые клетки опсонизируются с 4-4-20 антителом, содержащим вариантный Fc-участок; вариантный Fc-участок затем может быть клонирован во второй иммуноглобулин, , 4D5, 2H7, и этот второй иммуноглобулин характеризуется в испытании ADCC, где целевые клетки опсонизируются со вторым антителом, содержащим вариантный Fc-участок. Второе антитело, содержащее вариантный Fc-участок затем анализируется с использованием испытания ELISA для подтверждения специфического связывания с FcγR.
Предпочтительно, чтобы вариантный Fc-участок настоящего изобретения связывал FcγRIIIA и/или FcγRIIA с более высокой аффинностью, чем Fc-участок дикого типа, что определено в испытании ELISA. Наиболее предпочтительно, чтобы вариантный Fc-участок настоящего изобретения связывал FcγRIIIA и/или FcγRIIA с более высокой аффинностью и связывал FcγRIIB с меньшей аффинностью, чем Fc-участок дикого типа, что определено в испытании ELISA. В некоторых вариантах осуществления вариантный Fc-участок связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA с по крайней мере в 2-раза большей, по крайней мере в 4-раза большей, более предпочтительно по крайней мере в 6-раз большей, наиболее предпочтительно по крайней мере от 8 до 10-раз большей аффинностью, чем Fc-участок дикого типа связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA и связывает FcγRIIB с по крайней мере в 2-раза меньшей, по крайней мере в 4-раза меньшей, более предпочтительно по крайней мере в 6-раз меньшей, наиболее предпочтительно по крайней мере от 8 до 10-раз меньшей аффинностью, чем Fc-участок дикого типа связывает FcγRIIB, что определено в испытании ELISA.
например
Иммуноглобулин, содержащий вариантные Fc-участки, может быть проанализирован в любой момент, используя испытание на основе поверхностного плазмонного резонанса, , BIAcore, для определения кинетических параметров Fc-FcγR взаимодействия, используя способы, раскрытые в данном документе и известные специалистам в данной области техники. Предпочтительно, чтобы Kd вариантного Fc-участка настоящего изобретения для связывания мономерного FcγRIIIA и/или FcγRIIA, как определено с помощью испытания BIAcore, составлял около 100 нМ, предпочтительно около 70 нМ, более предпочтительно около 40 нМ.; и Kd вариантного Fc-участка настоящего изобретения для связывания димерного FcγRIIB составляет около 80 нМ, около 100 нМ, более предпочтительно около 200 нМ.
например
В большинстве предпочтительных вариантах осуществления иммуноглобулин, содержащий вариантные Fc-участки, также характеризуется в модельном животном для взаимодействия с FcγR. Предпочтительными модельными животными для использования в способах настоящего изобретения являются, например, трансгенные мыши, экспрессирующие человеческий FcγRs, , любая мышиная модель, описанная в патентах США №№ 5 877 397 и 6 676 927, которые включены в данный документ в качестве ссылок во всем их объеме. Трансгенные мыши для применения в способах настоящего изобретения включают без ограничения нокаутированные голые FcγRIIIA мышей, несущие человеческий FcγRIIIA; нокаутированные голые FcγRIIIA мышей, несущие человеческий FcγRIIA; нокаутированные голые FcγRIIIA мышей, несущие человеческий FcγRIIB и человеческий FcγRIIIA; нокаутированные голые FcγRIIIA мышей, несущие человеческий FcγRIIB и человеческий FcγRIIA; нокаутированные голые FcγRIIIA и FcγRIIA мышей, несущие человеческие FcγRIIIA и FcγRIIA и нокаутированные голые FcγRIIIA, FcγRIIA и FcγRIIB мышей, несущие человеческие FcγRIIIA, FcγRIIA и FcγRIIB.
6.2.1
СТРАТЕГИИ РАЗРАБОТКИ
Настоящее изобретение охватывает способы конструирования получения Fc вариантов, включая без ограничения вычислительные стратегии разработки, библиотечные способы получения и способы экспериментального получения и проверки. Эти стратегии можно применить индивидуально или в различных комбинациях для конструирования Fc-вариантов настоящего изобретения.
например
В большинстве предпочтительных вариантов осуществления способы конструирования настоящего изобретения содержат способы, в которых аминокислоты на границе контакта между Fc-участком и Fc-лигандом не модифицированы. Fc-лиганды включают, но не ограничиваются, FcγR, C1q, FcRn, C3, рецептором маннозы, белком A, белком G, рецептором маннозы и неисследованными молекулами, которые связывают Fc. Аминокислоты на границе контакта между Fc-участком и Fc-лигандом определяют, как те аминокислоты, которые прямо и/или непрямо связывают Fc-участок и лиганд, играют структурную роль в определении конформации границы контакта или в пределах по меньшей мере 3 ангстрем, в основном, по меньшей мер 2 ангстрем друг от друга, что определено структурным анализом, таким как рентгеновской кристаллографией и молекулярным моделированием. Аминокислоты на границе контакта между Fc-участком и Fc-лигандом включают такие аминокислоты, которые прямо контактируют с FcγR на основе кристаллографических и структурных анализов Fc-FcγR взаимодействий подобных, раскрытых Sondermann и соавт., (2000, Nature, 406: 267-273; что включенно в данный документ ссылкой во всей своей полноте). Примеры положений в пределах Fc-участка, который прямо контактирует с FcγR, являются аминокислоты 234-239 (шарнирный участок), аминокислоты 265-269 (B/C петля), аминокислоты 297-299 (C'/E петля) и аминокислоты 327-332 (F/G) петля. В некоторых вариантах осуществления, молекулы настоящего изобретения, содержащие различные Fc-участки, включают модификацию по меньшей мере одного остатка, который не имеет прямого контакта с FcγR на основе структурного и кристаллографического анализов, , не в пределах Fc-FcγR сайта связывания.
и соавт
например
Преимущественно способы конструирования в настоящем изобретении не модифицируют никакие из аминокислот, что идентифицировано Shields ., находящихся в CH2 домене Fc-участка, ближайшему к шарнирному участку, , Leu234-Pro238; Ala327, Pro329, и влияют на связывание Fc-участка со всеми FcγR человека.
В других вариантах осуществления, настоящее изобретение включает Fc варианты с измененным сродством FcγR и/или измененными эффекторными функциями, так, что Fc вариант не имеет модификации аминокислоты в положении на границе между Fc-участком и Fc-лигандом. Предпочтительно, такие Fc варианты в комбинации с одним или несколькими другими аминокислотными модификациями на границе между Fc-участком и Fc-лигандом имеют дальнейшее влияние на частично измененное свойство, например измененное сродство FcγR. Модифицирование аминокислот на границе между Fc и Fc-лигандом может быть достигнуто с использованием способов, известных в данном уровне техники, например на основании структурного анализа комплексов Fc-лигандов. Например, но без ограничения, исследованием энергетически предпочтительных замен в Fc позициях, что влияет на границу связывания, варианты могут быть созданы так, чтобы выбрать новые конформации границы контакта, некоторые из которых могут улучшать связывание с Fc-лигандом, некоторые из которых могут снижать связывание с Fc-лигандом и некоторые из которых могут иметь другие предпочтительные свойства. Такие новые конформации границы контакта могут быть результатом, например, прямого взаимодействия с остатками Fc-лиганда, формирующими границу или непрямыми воздействиями, вызванными аминокислотными модификациями, такими как перестройка боковой цепи или скелетные конформации.
Настоящее изобретение включает создание Fc вариантов, включающих любую из аминокислотных модификаций, раскрытых в данном документе в комбинации с другими модификациями, в которых изменена конформация Fc углевода в положении 297. Настоящее изобретение включает конформационные и композиционные изменения в углеводе N297, что приводит к требуемому свойству, например к увеличению или снижению сродства для FcγR. Такие модификации могут в дальнейшем усиливать фенотип исходной аминокислотной модификации Fc вариант настоящего изобретения. Хотя не предполагается связь по определенному механизму действия, подобная стратегия сопровождается наблюдением, что структура и конформация углевода существенно влияет на связывание Fc-FcγR и Fc/Cl q (Umaha et aL, 1999, Nat Biotechnol 17:176-180; Davies et aL, 2001, Biotechnol Bioeng 74:288-294; Mimura et aL, 2001, J Biol Chem 276:45539 ; Radaev et aL, 2001, J Biol Chem 276:16478-16483; Shields et aL 2002, J Biol Chem 277:26733-26740; Shinkawa et aL, 2003, J Biol Chem 278:3466-3473).
Другая стратегия разработки для создания Fc вариантов в соответствии с данным изобретением предусматривает перестройку Fc-участка для устранения структурной и функциональной зависимости от гликозилирования. Эта стратегия разработки включает оптимизацию Fc структуры, стабильности, растворимости и/или Fc функции (например, сродство Fc к одному или нескольким Fc-лигандам) в отсутствии углевода N297. В одном подходе позиции, которые подвергают воздествию расторителя в отсутствии гликозилирования, создают так, что они стабильны, структурно связанны с Fc структурой и не имеют склонности к агрегации. Подходы к оптимизации негликозилированного Fc могут включать, но не ограничиваться, разработками модификаций аминокислот, которые повышают стабильность и/или растворимость негликозилированных Fc, путем включения полярных и/или заряженных остатков, оказывающихся внутри оси димера Cg2-Cg2 и путем создания модификаций аминокислот, прямо усиливающих границу контакта негликозилированных Fc-FcγR или границу контакта негликозилированного Fc с некотрым другим Fc-лигандом.
Fc варианты настоящего изобретения можно объединить с другими Fc модификациями, включая, без ограничения, модификации, которые изменяют эффекторную функцию. Настоящее изобретение включает комбинирование Fc варианта настоящего изобретения с другими Fc модификациями для того, чтобы предоставить добавочные, синергичные или новые свойства антител или Fc слияний. Такие модификации могут быть в CH1, CH2 или CH3 доменах или их комбинациях. Предпочтительно Fc варианты настоящего изобретения усиливают свойство модификации, с которой они объединяются. Например, если Fc вариант настоящего изобретения объединить с мутантом, известным тем, что связывает FcγRIIIA с бόльшим сродством, чем аналогичная молекула, содержащая дикий тип Fc-участка; комбинация с мутантом настоящего изобретения приводит к многократному усилению в сродстве FcγRIIIA.
В одном варианте осуществления, Fc варианты настоящего изобретения могут быть объединены с другими известными Fc вариантами, как например теми раскрытыми в Duncan et al, 1988, Nature 332:563-564; Lund et al., 1991, J. Immunol 147:2657-2662; Lund et al, 1992, Mol Immunol 29:53-59; Alegre et al, 1994, Transplantation 57:1537-1543; Hutchins et al., 1995, Proc Natl. Acad Sci U S A 92:11980-11984; Jefferis et al, 1995, Immunol Lett. 44:111-117; Lund et al., 1995, Faseb J 9:115-119; Jefferis et al, 1996, Immunol Lett 54:101-104; Lund et al, 1996, J Immunol 157:49634969; Armour et aL, 1999, Eur J Immunol 29:2613-2624; Idusogie et al, 2000, J Immunol 164:41784184; Reddy et al, 2000, J Immunol 164:1925-1933; Xu et al., 2000, Cell Immunol 200:16-26; Idusogie et al, 2001, J Immunol 166:2571-2575; Shields et al., 2001, J Biol Chem 276:6591-6604; Jefferis et al, 2002, Immunol Lett 82:57-65; Presta et al., 2002, Biochem Soc Trans 30:487-490); патенты США: 5624821, 5885573, 6194551; PCT WO 00/42072; PCT WO 99/58572; каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
6.2.2
ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ МОЛЕКУЛЫ С ВАРИАНТНЫМИ Fc-УЧАСТКАМИ
например
см.
et al.
Methods  Mol. Biol.
et al.
Experientia,
et al.
J. Immunol. Methods
Methods Cell Biol.
et al.
J. Exp. Med.
et al.
Scand. J. Immunol
et al.
Immunity
Настоящее изобретение включает характеристику молекул настоящего изобретения (, антитело, содержащее измененный Fc-участок, идентифицированное с помощью технологии дрожжевого дисплея и исследования связывания FcγR-Fc, раскрытые в публикациях заявок на патенты США №№ 2005/0037000 и 2005/0064514 и в публикации международной патентной заявки WO 04/063351 (каждый из которых включен ссылкой полностью в настоящий документ); или терапевтические моноклональные антитела, сконструированные в соответствии со способами настоящего изобретения), используя исследования, известные специалистам данной области техники для идентификации эффекторной клеточной функции молекул. В частности, настоящее изобретение включает характеризуемые молекулы настоящего изобретения для FcγR-опосредованной эффекторной функции клетки. Примеры эффекторных функций клеток, которые могут быть исследованы согласно настоящему изобретению, включают, но не ограничиваются, антитело-зависимую клеточную цитотоксичность, фагоцитоз, опсонизацию, опсонофагоцитоз, связывание C1q и комплемент зависимую опосредованную клеткой цитотоксичность.Для определения функциональной эффекторной активности клетки могут быть использованы любые клеточные или бесклеточные исследования, известные специалистам в данной области техники (Для исследований эффекторных клеток, Perussia , 2000,  121: 179-92; Baggiolini , 1998 44(10): 841-8; Lehmann , 2000, 243(1-2): 229-42; Brown EJ. 1994, , 45: 147-64; Munn , 1990 , 172: 231-237, Abdul-Majid , 2002 . 55: 70-81; Ding, 1998,  8:403-411, каждый из которых включен ссылкой в данный документ во всей своей полноте).
например
например
см.
Methods Cell Biol.
et al.
J. Biol. Chem.
например
В одном варианте осуществления, молекулы настоящего изобретения могут быть исследованы для FcγR-опосредованного фагоцитоза в моноцитах человека. Альтернативно, FcγR-опосредованный фагоцитоз молекул настоящего изобретения может быть исследован в других фагоцитах, , нейтрофилах (полиморфноядерных лейкоцитах; PMN); моноцитах периферической крови человека, макрофаги, полученные из моноцитов, которые могут быть получены стандартными способами, известными специалистам в данной области техники (, Brown EJ. 1994, , 45: 147-164). В одном варианте осуществления функцию молекул настоящего изобретения характеризуют путем определениея способности THP-1 клеток к фагоцитозу флуоресцентных IgG-опсонированных овечьих эритроцитов (SRBC) ранее описанными способами (Tridandapani , 2000,  275: 20480-7). Например, характерное исследование фагоцитоза молекулы настоящего изобретения, содержащей вариантные  Fc-участки с усиленным сродством к FcγRIIIA, составляющие: обработку THP-1 клеток с молекулой настоящего изобретения или с контрольным антителом, которое не связывается с FcγRIIIA, сравнение уровней активности указанных клеток, где разница в активностях клеток (, активности розеткообразования (количество THP-1 клеток, связывающих IgG-покрытые SRBC), активность адгезии (общее количество SRBC связанных с THP-1 клетками) и скорость фагоцитоза) будет указывать на функциональность молекулы настоящего изобретения. Специалистом в данной области может быть высоко оценено то, что этот характерное исследование может использоваться для исследования любых молекул, идентифицированных способами настоящего изобретения.
Escherichia coli
Staphylococcus aureus-
см.
et al.
. Biol. Chem
E. coli
например
например
E. coli
E. coli
E. coli
E coli
Другой характерное исследование для определения фагоцитоза молекул настоящего изобретения - антитело-зависимая опсоно-фагоцитарная реакция (ADCP), которая заключается в следующем: покрытая мишенью биочастица, такая как -меченный FITC (молекулярные зонды) или FITC с (i) антителом дикого типа 4-4-20, антителом к флуоресцеину (Bedzyk , 1989, J, 264(3): 1565-1569, который включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте), в качестве контрольного антитела для FcγR-зависимого ADCP; или (ii) 4-4-20 антитело, содержащее мутацию D265A, которое делает невозможным связывание с FcγRIII, в качестве предпосылки контроля для FcγR-зависимого ADCP, (iii) 4-4-20 антитело, несущее вариантные Fc-участки, идентифицированные способами настоящего изобретения и полученные как представлено в Примере 7.6; и формируя опсонированную частицу; добавляя любую из описанных (i-iii) опсонированных частиц к THP-1 эффекторным клеткам (клеточная линия моноцитов доступная от ATCC) в соотношении 60:1 позволяет произойти FcγR-опосредованному фагоцитозу; предпочтительно инкубирование клеток и -FITC/антитело при 37°C на протяжении 1,5 часов; добавление трипана синего после инкубации (предпочтительно при комнатной температура в течение 2-3 мин.) к клеткам для подавления флуоресценции бактерий, которые адгезируются на поверхности клеток, не будучи поглощенным; перенос клеток в FACS буфер (, 0,1%, BSA в PBS, 0,1%, азид натрия), анализ флуоресценции THP1 клеток с использованием FACS (, BD FACS Calibur). Предпочтительно, THP-1 клетки, использованные в исследовании, анализировались FACS на экспрессию FcγR на клеточной поверхности. THP-1 клетки экспрессируют как CD32A, так и CD64. CD64 - FcγR с высоким сродством, который блокируется при проведении ADCP исследования в соответствии со способами настоящего изобретения. THP-1 клетки предпочтительно блокируются 100 мкг/мл растворимого IgG1 или 10% сывороткой человека. Для анализа степени ADCP, ворота предпочтительно устанавливают на THP-1 клетках, и вычисялют среднюю интенсивность флуоресценции. ADCP активность для отдельных мутантов вычисляют и  описывают в качестве нормального значения для полученного дикого типа chMab 4-4-20. Опсонированные частицы добавляют к THP-1 клеткам так, чтобы соотношение опсонированных частиц к THP-1 клеткам составляло 30:1 или 60:1. В более предпочтительных вариантах осуществления, ADCP исследование проводят с контролем, таким как -FITC в среде, -FITC и THP-1 клетками (для обеспечения в качестве FcγR-независимой ADCP активности), -FITC, THP-1 клетки и антитело дикого типа 4-4-20 (для обеспечения в качестве FcγR-зависимой ADCP активности), -FITC, THP-1 клетки, 4-4-20 D265A (для обеспечения в качестве фонового контроля для FcγR-зависимой ADCP активности).
например
См., например
et al.
Methods Mol. Biol.
51
51
2
4
В другом варианте осуществления, молекулы настоящего изобретения могут быть исследованы на FcγR-опосредованную ADCC активность в эффекторных клетках, , натуральных клетках-киллерах, с использованием одного из стандартных способов, известных специалистам в данной области техники (, Perussia , 2000,  121: 179-92). Характерным исследованием для определения ADCC активности молекулы настоящего изобретения является таковое на основе анализа высвобождения Cr, который включает в себя следующее: клетки-мишени, меченные [Cr]NaCrO (эта клетачно-мембранная растворимая молекула широко испльзовалась для мечения, поскольку она связывает цитоплазматические белки и, несмотря на то, что она спонтанно высвобождается из клеток со слабой кинетикой, она высвобождается массово, приводя к некрозу клеток-мишеней); опсонирование клеток-мишеней молекулами настоящего изобретения, содержащими вариантные Fc-участки; комбинирование опсонированных клеток-мишеней с радоиактивной меткой с эфекторными клетками в микротирационном планшете в подходящем соотношении клеток-мишеней к эффекторным клеткам; инкубирование смеси клеток на протяжении 16-18 часов при 37°C; сбор супернатантов; и анализ радиоактивности. Цитотоксичность молекул настоящего изобретения может быть затем определена, например использованием следующей формулы: % лизиса = (экспериментальное количество в минуту - вытекание целевой клетки количество в минуту)/(детергентный лизис количество в минуту - вытекание целевой клетки количество в минуту) x 100%. Альтернативно, % лизиса =(ADCC-AICC)/(максимум спонтанного высвобождения). Специфический лизис может быть вычислен по формуле: специфический лизис = % лизиса с молекулами настоящего изобретения - % лизиса в отсутствии молекул настоящего изобретения. Диаграмму можно построить в зависимости от цели: соотношение эффекторных клеток или концентрация антител.
см., например
et al.
Immunity
В еще одном варианте осуществления, молекулы настоящего изобретения характеризуют на антитело зависимую клеточную цитотоксичность (ADCC) , Ding , , 1998, 8:403-11; который включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
например
Предпочтительно, эффекторные клетки, используемые в ADCC исследованиях настоящего изобретения, это мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC), которые в основном получают из нормальной человеческой крови, с использованием стандартных способов, известных специалистам в данной области, , с использованием центрифугирования в градиенте плотности Ficoll-Paque. Предпочтительные эффекторные клетки, применяемые в способах настоящего изобретения, экспрессируют различные FcγR активирующие рецепторы. Настоящее изобретение включает, эффекторные клетоки, THP-1, экспрессирующие FcγRI, FcγRIIA и FcγRIIB и первичные макрофаги полученные из моноцитов полученных из цельной крови человека, экспрессирующие как FcγRIIIA, так и FcγRIIB, для определения того, демонстрируют ли мутанты Fc антител сниженную ADCC активность и фагоцитоз, по сравнению с диким типом IgG1 антител.
et al.
J. Biol Chem.
et al.
PNAS USA
et al.
Nature
Клеточная линия моноцитов человека, THP-1, активирует фагоцитоз через экспрессию высоко аффинного рецептора FcγRI и низко аффинного рецептора FcγRIIA (Fleit et al., 1991, J. Leuk. Biol. 49: 556). THP-1 клетки не конститутивно экспрессируют FcγRIIA или FcγRIIB. Стимулирование этих клеток цитокинами вызывает паттерн экспрессии FcR (Pricop et al., 2000 J. Immunol. 166: 531-7). Рост THP-1 клеток в присутствии цитокина IL4 индуцирует экспрессию FcγRIIB и вызывает снижение экспрессии FcγRIIA и FcγRI. FcγRIIB экспрессия также может быть усилена увеличением плотности клеток (Tridandapani , 2002,  277: 5082-9). В отличие от этого, было показано, что IFNγ может привести к экспрессии FcγRIIIA (Pearse , 1993  90: 4314-8). Присутствие или отсутсвие рецепторов на клеточной поверхности моно определить с помощью FACS, с использование общих способов, известных специалистам в данной области. Индуцированная цитокинами экспрессия FcγR на клеточной поверхности обеспечивает комплекс для определения как активации, так и ингибирования в присутствии FcγRIIB. Если THP-1 клетки не могут экспрессировать FcγRIIB, настоящее изобретение также включает другую линию моноцитов человека, U937. Было показано, что эти клетки необратимо дифференцируются в макрофаги в присутствии IFNγ и TNF (Koren , 1979,  279: 328-331).
et al.
PNAS USA
in vivo,
FcγR зависимое уничтожение опухолевых клеток опосредованое макрофагами и NK клетками в мышиных моделях опухолей (Clynes , 1998,  95: 652-656). Настоящее изобретение включает применение отмытых моноцитов доноров в качестве эффекторных клеток для анализа эффективности Fc мутантов для запуска клеточной цитотоксичности клеток-мишеней в исследованиях, как фагоцитоза, так и ADCC. Паттерны экспрессии FcγRI, FcγRIIIA и FcγRIIB вызывают различными условиями роста. Экспрессия FcγR из замороженных отмытых моноцитов, свежих отмытых моноцитов, моноцитов, полученных в 10% FBS и моноцитов, культивированных в FBS + GM-CSF и или в сыворотке человека может быть определена с использованием известных способов, известных специалистам в данной области техники. Например, клетки могут быть окрашены FcγR специфическими антителами и проанализированы с помощью FACS для определения профилей FcR. Условия, которые наилучшим образом воспроизводят экспрессию FcγR макрофагов  в дальнейшем используют для способов настоящего изобретения.
см.
например
et al.
Immunol
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение включает применение клеток мышей, особенно, когда не могут быть получены клетки человека с правильными профилями FcγR. В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение включает RAW264.7(ATCC) клеточную линию макрофагов мышей, которая может быть трансфицирована человеческими FcγRIIIA и стабильные трасфектанты изолированы, с использованием способов, известных в данном уровне техники, , , Ralph , J. . 119: 950-4). Трансфектанты могут быть количественно проанализированы на экспрессию FcγRIIIA с помощью FACS с использованием обычных способов и высоко экспрессирующих линий, которые можно использовать в анализе ADCC настоящего изобретения. В других вариантах осуществления, настоящее изобретение включает изолирование перитонеальных макрофагов селезенки, экспрессирующих FcγR человека от нокаутных трансгенных мышей, таких как раскрыты в данном документе.
Лимфоциты могут быть получены из периферической крови доноров (PBM) с использованием градиента Ficoll-Paque (Pharmacia). В изолированной мононуклеарной популяции клеток большинство ADCC активности происходит посредством натуральных клеток-киллеров (NK), содержащих FcγRIIIA, но не FcγRIIB на своей поверхности. Результаты с этими клетками показывают эффективность мутантов на запуск ADCC NK клеток и устанавливают реагенты для тестирования отмытых моноцитов.
например
см.
например
et al.
Cancer Res.
например
см.
например
et al.
J. Natl. Cancer Inst.
см.
например
et al.
Cancer Res.
Клетки-мишени, используемые в исследованиях ADCC настоящего изобретения, включают, но не ограничиваются, клеточные линии опухоли груди, , SK-BR-3 с ATCC номером доступа HTB-30 (, , Tremp , 1976, 33-41); B-лимфоциты; клетки полученные из лимфомы Бёркита, , клетки Раджи с ATCC номером доступа CCL-86 (, , Epstein , 1965,  34: 231-240),и клетки Дауди с ATCC номером доступа CCL-213 (, , Klein , 1968,  28: 1300-10). Для анализа клетки-мишени должны быть узнаны антигенами сайта связывания иммуноглобулина.
например
51
2
4
ADCC исследование основывается на способности NK клеток опосредовать клеточную смерть через апоптический путь. NK клетки опосредуют клеточную смерть частично за счет FcγRIIIA узнавания IgG, связанного с антигеном на клеточной поверхности. Исследования ADCC, используемые в соответствии со способами настоящего изобретения, могут быть исследования, основанные на радиоактивности или исследования, основанные на радиоактивности флуоресценции. ADCC исследование, использованное для характеристики молекул настоящего изобретения, включающих вариантные Fc-участки, содержит меченные клетки-мишени,, SK-BR-3, MCF-7, OVCAR3, Раджи, клетки Дауди, опсонирование клеток-мишеней с антителом, которое узнает рецептор клеточной поверхности на клетке-мишени через свой антиген-связывающий сайт; комбинирование меченных опсонированных клеток-мишеней и эффекторных клеток в подходящем соотношении, которое можно определить в ходе обычного эксперимента; сбор клеток; определение меток в супернатанте лизированных клеток-мишеней, используя подходящую схему определения, основанную на использовании меток. Клетки-мишени могут быть помечены, или радиоактивными метками, или флуоресцентными метками, используя стандартные способы, известные в данном уровне техники. Например, метки включают, но не ограничиваются, [Cr]NaCrO; и ацетоксиметиловый сложный эфир лиганда усиливающего флуоресценцию, 2,2':6',2”-тетрпиридин-6-6”-дикарбоксилат (TDA).
например
см.
et al.
Journal of Immunological Methods
например
например
2
В отдельном предпочтительном варианте осуществления, используется флуориметрическое исследование с временным разрешением для измерения ADCC активности против клеток-мишеней, меченных ацетоксиметиловым сложным эфиром лиганда усиливающего флуоресценцию, 2,2':6',2”-тетрпиридин-6-6”-дикарбоксилатом (TDA). Такие флуориметрические исследования известны в данном уровне техники, , , Blomberg , 1996, , 193: 199-206; включенный в данный документ ссылкой во всей своей полноте. Вкратце, клетки-мишени метят мембрано растворимым ацетоксиметильным диэфиром TDA (бис(ацетоксиметил) 2,2':6',2”-терпиридин-6-6”-дикарбоксилат, (BATDA), который быстро проникает через клеточную мембрану жизнеспособных клеток. Внутриклеточные эстеразы отщепляют группы сложных эфиров и регенерируют мембрану, нерастворимая молекула TDA остается внутри клетки. После инкубации эффектора и клеток-мишеней, , на протяжении по меньшей мере от двух часов до 3,5 часов, при 37°C, в 5% CO, TDA, высвобожденный из лизированных клеток-мишеней, хелатируют Eu3+ и сформировавшиеся флуоресцирующие хелаты Европий-TDA количественно измеряют на флуориметре с временным разрешением (, Victor 1420, Perkin Elmer/Wallac).
6
6
например
например
т.е.
et al.
J. Biol. Chem.
et al.
Journal of Immunology
et al.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
например
).
2
В другом отдельном варианте осуществления, ADCC исследование, использованное для характеристики молекул настоящего изобретения, содержащих вариантные Fc-участки, включает следующие этапы: предпочтительно 4-5x10 клеток-мишеней (, SK-BR-3, MCF-7, OVCAR3, клетки Раджи) метят бис(ацетоксиметил)-2,2':6',2”-терпиридин-t-6”-дикарбоксилатом (DELFIA BATDA Reagent, Perkin Elmer/WallacДля оптимальной эффективности мечения количество клеток-мишеней, используемых в ADCC исследовании, не должно превышать 5x10. BATDA реагент добавляют к клеткам, и смесь инкубируют при 37ºC предпочтительно в 5% CO, на протяжении по меньшей мере 30 минут. Затем клетки отмывают физиологическим раствором, , PBS с 0,125 мМ сульфинпиразолом и средой, содержащей 0,125 мМ сульфинпиразола. Меченые клетки-мишени затем опсонируют (покрывают) молекулами настоящего изобретения, включающими вариантный Fc-участок, , иммуноглобулином, включающим вариантый Fc-участок настоящего изобретения, включая, но не ограничиваясь, поликлональное антитело, моноклональное антитело, биспецифичное антитело, мультиспецифичное антитело, гуманизированное антитело или химерное антитело. В предпочтительных вариантах осуществления иммуноглобулин, содержащий вариантый Fc-участок, который использовали в ADCC исследовании, является специфиченым к рецептору клеточной поверхности, опухолевому антигену или антигену рака. Иммуноглобулин, в который включают вариантый Fc-участок настоящего изобретения, может специфично связывать любой раковый или опухолевый антиген такой, как представлены в Пункте 6.4. Дополнительно, иммуноглобулин, в который включают вариантый Fc-участок настоящего изобретения, может быть любым терапевтическим антителом специфичным к раковому антигену такому, как те, что представлены в Пункте 6.4. В некоторых вариантах осуществления иммуноглобулин, содержащий вариантый Fc-участок, использовали в ADCC исследовании, является анти-флуоресцеиновым моноклональным антителом, 4-4-20 (Kranz , 1982  257(12): 6987-6995) мышино-человеческое химерное моноклональное антитело 2H7 к CD20 (Liu , 1987, , 139: 3521-6); или гуманизированное антитело (Ab4D5) к рецептору 2 эпидермального фактора роста человека (p185 HER2) (Carter  (1992,  89: 4285-9). Клетки-мишени в ADCC исследовании выбирают в соответствии с иммуноглобулином, в который включен вариантый Fc-участок настоящего изобретения таким образом, чтобы иммуноглобулин специфически связывал рецептор клеточной поверхности в особенности на клетке-мишени. Предпочтительно, ADCC исследования настоящего изобретения выполнены с использованием, более одного созданного антитела, , анти Her2/neu, 4-4-20, 2B6, Ритуксан и 2H7, содержащего Fc варианты настоящего изобретения. В наиболее предпочтительных вариантах осуществления, Fc варианты настоящего изобретения включают по меньшей мере в 3 антитела и тестируют их активности ADCC. Хотя не предполагается связь с определенным механизмом действия, проверка по меньшей мере 3 антител в этих функциональных исследованиях снизит шанс ошибочной элиминации жизнеспособных Fc мутаций.
например,
например
например
2
Опсонированные клетки-мишени добавляют к эффекторным клеткам, PBMC, для получения соотношений эффектор:мишень приблизительно 50:1, 75:1 или 100:1. В отдельном варианте осуществления, когда иммуноглобулин, содержащий вариантый Fc-участок имеет вариабельный домен 4-4-20, соотношение эффектор:мишень составляет 75:1. Эффекторные клетки и клетки-мишени инкубируют по меньшей мере от двух часов до 3,5 часов, при 37°C, в 5% CO. Получают клеточные супернатанты и добавляют в кислый раствор европия (, DELFIA Раствор Европия, Perkin Elmer/Wallac). Сформированная флуоресценция хелатов Европий-TDA количественно измеряют на флуориметре с временным разрешением (, Victor 1420, Perkin Elmer/Wallac). Максимальный выход (MR) и спонтанный выход (SR) определяют по инкубации клеток-мишеней с 1% TX-100 и одной средой, соответственно. Антитело-независимая клеточная цитотоксичность (AICC) измеряют путем инкубирования клеток-мишеней и эффекторных клеток в отсутствии антитела. Каждое исследование предпочтительно выполнять троекратно. Значение процентного соотношения специфического лизиса вычисляют как:
Экспериментальный выход (ADCC) - AICC)/(MR-SR) x 100.
Настоящее изобретение включает характеристику Fc вариантов, как в NK-зависимых, так и макрофаг-зависимых ADCC исследованиях. Fc варианты настоящего изобретения имеют измененный фенотип также, как и измененную эффекторную функцию, что было показано в NK-зависимом или макрофаг-зависимом исследовании.
Настоящее изобретение включает исследования, известные в данном уровне техники и подтвержденные здесь примерами, для связывания C1q и опосредованной комлемент-зависимой цитотоксичности (CDC). Для определения связывания C1q может быть использовано C1q связывающее ELISA. Анализ образцов может содержать следующее: анализируемые планшеты могут быть иммобилизированы в течение ночи при 4C с полипептидным вариантом или стартовым полипептидом (контроль) в буфере для сенсибилизации поверхности. Потом планшеты могут быть отмыты и блокированы. Следом за отмывкой в каждое гнездо можно добавить аликвоту C1q человека и инкубировать в течение 2 часов при комнатной температуре. После дальнейшего отмывания 100 мкл в каждое гнездо можно добавить овечьи антитела, конъюгированные с анти-комплемент C1q пероксидазой и инкубировать 1 час при комнатной температуре. Планшет снова можно отмыть отмывочным буфером и добавить в каждую лунку 100 мкл субстратного буфера, содержащего OPD (O-фенилендиамин дигидрохлорид (Sigma)). Реакция окисления, наблюдаемая по появлению желтого цвета, может продолжаться в течение 30 минут и быть остановлена добавлением 100 мкл 4,5 NH2 SO4. Абсорбцию можно затем считать при (492-405) нм.
Предпочтительный вариант в соответствии с данным изобретением является таковой, который демонстрирует значительное снижение в связывании C1q, как показано и измерено в этом и подобных исследованиях. Предпочтительно молекула, содержащая Fc вариант, демонстрирует 50-кратное снижение, примерно 60-кратное, примерно 80-кратное, или примерно 90-кратное снижение в C1q связывании по сравнению с контрольным антителом, имеющим немутированный Fc-участок IgG1. В наиболее предпочтительном варианте осуществления, молекула, содержащая Fc вариант, не связывает C1q, т.е. вариант демонстрирует почти 100-кратное или более снижение в C1q связывании по сравнению с контрольным антителом.
Другим экземпляром варианта является такой, который имеет лучшее сродство связывания к C1q человека, чем молекула, содержащая дикий тип Fc-участка. Такая молекула может демонстрировать, например, примерно двукратное или более, и, предпочтительно, примерно пятикратное или более, улучшение в связывании C1q человека, по сравнению с родительской молекулой, содержащей дикий тип Fc-участка. Например, связывание C1q человека может быть от около двукратного до примерно 500-кратного, и предпочтительно от примерно двукратного или пятикратного до примерно 1000-кратного усиления, по сравнению с молекулой, содержащей Fc-участок дикого типа.
, например
6
2
Для оценки активации комплемента, может быть выполнен анализ комплемент-зависимой цитотоксичности (CDC), как описано у Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996), который включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте. Вкратце, различные концентрации молекул, содержащих вариантый Fc-участок, и комплемент человека могут быть разведены в буфере. Клетки, которые экспрессируют антиген, к которому прикрепляется молекула, содержащая вариантый Fc-участок, могут быть разведены в плотности примерно 1x10 клеток/мл. Смеси молекул, содержащие вариантый Fc-участок, растворенный комплемент человека и клетки, экспрессирующие антиген, можно добавить в плоскодонный 96 лунковый планшет для культивирования тканей и инкубировать 2 часа при 37°C и 5% CO для облегчения комплемент-опосредованного клеточного лизиса. Затем в каждую лунку можно добавить 50 мкл alamar blue (Accumed International) и инкубировать в течение ночи при 37°C. Абсорбцию измеряют, используя 96-луночный флуориметр с длиной волны возбуждения 530 нм и эмиссией при 590 нм. Результаты могут быть выражены в относительных единицах флуоресценции (RFU). Показано, что концентрации образца могут быть вычислены по стандартной кривой, и процент активности по сравнению с неизмененной молекулой, т.е., молекулой, содержащей Fc-участок дикого типа.
50
et al.
Immunol. Methods
et al.
J. Immunol Methods
В некоторых вариантах осуществления, Fc вариант настоящего изобретения не активирует комплемент. Предпочтительно, вариант, похоже, не имеет CDC активности в вышеприведенном CDC анализе. Настоящее изобретение также принадлежит к варианту с усиленной CDC, по сравнению с родительской молекулой (молекулой, содержащей Fc-участок дикого типа), например, демонстрирующее около двухкратного до примерно 100-кратного усиления в CDC активности in vitro или in vivo (например, при значениях IC для каждой сравниваемой молекулы). Исследования комплемента могут быть осуществлены на сыворотке морских свинок, кроликов или человека. Комплементарный лизис клеток-мишеней можно диагностировать отслеживанием высобождения таких внутриклеточных ферментов, как лактатдегидрогеназа (LDH), как описано в Korzeniewski , 1983  64(3): 313-20; и Decker , 1988  115(1): 61-9, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте; или высвобождение таких внутриклеточных меток, как европий, хром 51 или индий 111, клетки-мишени мечены, как описано в данном документе.
6.2.3
ДРУГИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
см.
et al.
Methods
et al.
Review in Mol. Biotech.,
et al.
Current Opinion in Biotechnology
et al.
Current Opinion in Biotechnology
Молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантые Fc-участки, можно также проанализировать с использованием исследований, основаных на поверхностном плазмонном резонансе, известных в данном уровне техники для характеристики кинетических параметров связывания Fc-FcγR взаимодействия. Любой SPR инструмент коммерчески доступен, включая, но не ограничиваясь, BIAcore Инструментами, предоставленные Biacore AB (Uppsala, Sweden); IAsys инструменты, предоставленные Affinity Sensors (Franklin, MA.); IBIS система, предоставленная Windsor Scientific Limited (Berks, UK), SPR-CELLIA сисетмы, предоставленные Nippon Laser и Electronics Lab (Hokkaido, Japan), и SPR Detector Spreeta, предоставленный Texas Instruments (Dallas, TX) могут быть использованы в настоящем изобретении. Для обзора технологии, основанной на SPR Mullet , 2000,  22: 77-91; Dong , 2002,  82: 303-23; Fivash , 1998,  9: 97-101; Rich , 2000,  11: 54-61; все ссылки включены в данный документ во всей своей полноте. Дополнительно, любой из SPR инструментов и способов для исследования белок-белковых взаимодействий, основанных на SPR, описаных в патентах США №№ 6373577; 6289286; 5322798; 5341215; 6268125, предполагаются в способах настоящего изобретения, все из которых полностью включены в настоящий документ.
например
Вкратце, исследования, основанные на SPR, включают иммобилизацию члена связанной пары на поверхности и отслеживание его взаимодействия с другим членом связанной пары в растворе в реальном времени. SPR основан на измерении изменения преломляющего индекса растворителя возле поверхности, что происходит при комплексообразовании или диссоциации. Поверхность, на которой происходит иммобилизация, является сенсорным чипом, который находится в центре SPR технологии; он состоит из стеклянной поверхности, покрытой тонким слоем золота, и формирует основу ассортимента специализированных поверхностей, разработанных для оптимизации связывания молекулы с поверхностью. Разнообразие сенсорных чипов коммерчески доступно, особенно для компаний, перечисленных выше, все из которых могут быть использованы в способах настоящего изобретения. Примеры сенсорных чипов включают следующие, предоставленные BIAcore AB, Inc., , Сенсорный чип CM5, SA, NTA, и HPA. Молекула настоящего изобретения может быть иммобилизирована на поверхности сенсорного чипа любым из иммобилизационных способов, известных в данном уровне техники, включая, но не ограничиваясь, прямое ковалентное соединения через аминогруппы, прямое ковалентное соединение через сульфгидрильные группы, прикрепление биотина к авидин покрытой поверхности, альдегидное связывание с углеводными группами, и прикрепление через гистидиновую метку с NTA чипами.
например
например
см.
В некоторых вариантах осуществления, кинетические параметры связывания молекул настоящего изобретения, содержащи вариантные Fc-участки, , иммуноглобулины, содержащие вариантный Fc-участок, с FcγR, может быть определен с использованием инструмента BIAcore (, BIAcore инструмент 1000, BIAcore Inc., Piscataway, NJ). Может использоваться любой FcγR для оценки взаимодействия с молекулами настоящего изобретения, содержащими вариантные Fc-участки. В специфическом варианте осуществления FcγR является FcγRIIIA, предпочтительно растворимым мономерным FcγRIIIA. Например, в одном варианте осуществления, растворимый мономерный FcγRIIIA является внеклеточным участком FcγRIIIA, присоединенный к линкерной AVITAG последовательности (, предварительная заявка на патент США № 60/439498, поданная 9 января 2003 г. (дело патентного поверенного № 11183-004-888) и предварительная заявка на патент США № 60/456041, поданная 19 марта 2003 г., которые полностью включены в данный документ). В другом специфическом варианте осуществления, FcγR - это FcγRIIB, предпочтительно растворимый димерный FcγRIIB. Например, в одном варианте осуществления, растворимый димерный FcγRIIB белок готовится в соответствии со способом, описанном в предварительной заявке на патент США № 60/439709 поданной 13 января 2003 г., которая включена в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
3
Характерное исследование образца для определения кинетических параметров молекулы, содержащей вариантный Fc-участок, где молекула представляет собой 4-4-20 антитело, к FcγR с использованием BIAcore инструмента, содержит следующее: BSA-FITC иммоблизируют на одной из четырех проточных ячеек поверхности сенсорного чипа, предпочтительно через химию связывания амина так, чтобы около 5000 ответных единиц (RU) BSA-FITC были иммобилизованы на поверхности. После того, как подходящая поверхность приготовлена, через поверхность проводят 4-4-20 антитела, несущие Fc мутации, предпочтительно за одну минуту 20 мкг/мл раствора при скорости потока 5 мкл/мл. Уровень 4-4-20 антител, прикрепленных к поверхности, варьирует между 400 и 700 RU. Далее, серии разведений рецептора (FcγRIIA и FcγRIIB-Fc слитый белок) в HBS-P буфере (20 мМ HEPES, 150 мМ NaCl, 3мМ EDTA, pH 7,5) впрыскиваются на поверхность при 100 мкл/мин. Регенерация антитела между различными растворами рецепторов выполняется, предпочтительно, однократным 5 секундным впрыскиванием 100 мМ NaHCO pH 9,4; 3 M NaCl. Любая техника регенерации, известная в данном уровне техники, рассматривается в способе настоящего изобретения.
например
т.е.
Current Opinion in Biotechnology
et al.
Current Opinion in Biotechnology
Current Opinion in Biotechnology
et al.
Analytical Biochemistry
et al.
Analytical Biochemistry
et al.
Analytical Biochemistry
on
off
d
off
on
После сбора всех данных, глобльно подготавливают результирующие кривые связывания, используюя компьютерные алгоритмы, которые поставляются производителями SPR инструментов, , BIAcore, Inc. (Piscataway, NJ). Эти алгоритмы вычисляют, как K и K, из которых состоит истинное равновесие связывания, K выводят из соотношения двух скоростных констант (, K/K). Более детальное изложение получения индивидуальных скоростных констант можно найти в руководстве по BIAevaluaion Программному обеспечению (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ). Анализ общих данных могут быть выполнены с использованием любого способа, известного в данном уровне техники. Для обзора различных способов интерпретации полученных кинетических данных см. Myszka, 1997,  8: 50-7; Fisher , 1994,  5: 389-95; O'Shannessy, 1994, , 5:65-71; Chaiken , 1992, , 201: 197-210; Morton , 1995,  227: 176-85; O'Shannessy , 1996,  236: 275-83; все из которых включены в данный документ ссылками в полном объеме.
например
например
off
off
off
off
off
.
В предпочтительных вариантах осуществления, кинетические параметры определяли используя SPR анализы, , BIAcore, могут быть использованы в качестве предсказывающий измерения того, как молекула настоящего изобретения будет функционировать в функциональном исследовании, , ADCC. Характерный способ для предсказания эффективности молекулы настоящего изобретения на основе полученных из SPR исследований кинетических параметров может содержать следующее: определение значений K для связывания молекулы настоящего изобретения с FcγRIIIA и FcγRIIB; составление графика (1) K(д.т.)/K (мутации) для FcγRIIIA; (2) K (мутации)/K (д.т.) для FcγRIIB против ADCC данных. Числа выше единицы показывают сниженную скорость диссоциации для FcγRIIIA и увеличенную скорость диссоциации для FcγRIIB по сравнению с диким типом; и обладают усиленной ADCC функцией
6.3 СПОСОБЫ РЕКОМБИНАНТНОГО ПОЛУЧЕНИЯ МОЛЕКУЛЫ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ
6.3.1 ПОЛИНУКЛЕОТИДЫ, КОДИРУЮЩИЕ МОЛЕКУЛЫ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение также включает полинуклеотиды, которые кодируют молекулы настоящего изобретения, включая полипептиды и антитела, идентифицированные способами настоящего изобретения. Могут быть получены полинуклеотид-кодирующие молекулы настоящего изобретения, и определена нуклеотидная последовательность полинуклеотидов любым способом, известным в данном уровне техники.
например
например
и др.
см.
et al.
et al.
,
Molecular Cloning, A Laboratory Manual
Current Protocols in Molecular Biology
После определения нуклеотидной последовательности молекул (, антитела), идентифицированных способами настоящего изобретения, с нуклеотидной последовательностью можно обращаться с использованием способов, хорошо известных в данном уровне техники, , техники рекомбинантных ДНК, сайт-направленного мутагенеза, ПЦР,  (, например, техники, описанные в Sambrook , 2001, , 3rd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY; и Ausubel , eds., 1998, , John Wiley & Sons, NY, обе представлены ссылками в данном документа в полном объеме)для получения, например, антител, имеющих различную аминокислотную последовательность, например путем получения аминокислотных замен, делеций, и/или вставок.
see
например
et al.
J. Mol. Biol
В специфическом варианте осуществления, когда нуклеиновые кислоты кодируют антитела, один или несколько CDR включают в участки структуры, используя стандартные техники рекомбинантных ДНК. Участки структуры могут быть встречающиеся в природе или консенсусные участки структуры, и предпочтительно участки структуры человека (, , Chothia , 1998, . 278: 457-479 для перечня каркасных участков человека).
В другом варианте осуществления, человеческие библиотеки или любые другие библиотеки, доступные в данном уровне техники, могут быть продемонстрированы стандартными способами, известными в данном уровне техники, для клонирования нуклеиновых кислот, кодирующих молекулы настоящего изобретения.
6.3.2 РЕКОМБИНАНТНАЯ ЭКСПРЕССИЯ МОЛЕКУЛЫ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ
т.е.
in vitro
in vivo
См.
et al.
et al.
Molecular Cloning, A Laboratory Manual
Current Protocols in Molecular Biology
После получения последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей молекулы настоящего изобретения (, антитела), вектор для продукции молекул может быть получен путем использования технологии рекомбинантной ДНК, хорошо известной в данном уровне техники. Способы, которые хорошо известны специалистам данной области техники, могут быть использованы для построения экспрессионных векторов, содержащих кодирующую последовательность для молекул настоящего изобретения и соответствующие транскрипционные и трансляционные контрольные сигналы. Эти способы включают, например, техникирекомбинантной ДНК, синтетические техники, и генетические рекомбинации. (, например, техники, описанные в Sambrook , 1990, , 2d Ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY и Ausubel  eds., 1998, , John Wiley & Sons, NY).
т.е.
например
Экспрессионный вектор, содержащий нуклеотидную последовательность молекулы, идентифицированной способами настоящего изобретения (, антитело) может быть перенесен в хозяйскую клетку стандартными методиками (, электропорация, липосомальная трансфекция, и преципитация фосфатом кальция), и трансфектированные клетки затем культивируют обычными методами для получения молекул настоящего изобретения. В специфических вариантах осуществления, экспрессия молекул настоящего изобретения регулируется конститутивным, индуцибельным или специфическим, тканевым промотором.
Escherichia coli,
et al.
Gene
et al.
Bio/Technology
Хозяйские клетки, используемые для экспрессии молекул, идентифицированных способами настоящего изобретения, могут быть или бактериальными клетками, такими как  или, предпочтительно, эукариотическими клетками, особенно для экспрессии целых рекомбинантных иммуноглобулиновых молекул. В частности, клетки млекопитающих, такие как клетки яичника китайского хомячка (CHO) в сопряжении с вектором таким, как основной промежуточный элемент промотора раннего гена из цитомегаловируса человека, является эффективной экспрессионной системой для иммуноглобулинов (Foecking , 1998, 45:101; Cockett , 1990,  8:2).
in situ
например
E. coli
B. subtilis
например
Saccharomyces
Pichia
например
например
например
например
например
например
Разнообразие хозяин-экспрессирующих векторных систем может быть использовано для экспрессирования молекул, идентифицированных способами настоящего изобретения. Такие хозяин-экспрессирующие системы представляют собой транспорт, благодаря которому могут быть получены и впоследствии очищены кодирующие последовательности молекул настоящего изобретения, а также представляют собой клетки, которые могут, после трансформации или трансфекции с соответствующими кодирующими последовательностями нуклеотидов экспрессировать молекулы настоящего изобретения . Это включает, но не ограничивается, микроорганизмы, такие как бактерии (,  и ), трансформированные с рекомбинантной ДНК бактериофага, плазмидой ДНК или экспрессирующие векторы космиды ДНК, содержащие кодирующие последовательности для молекул, идентифицированных способами настоящего изобретения; дрожжи (, ), трансформированные с рекомбинантными дрожжевыми экспрессирующими векторми, содержащими кодирующие последовательности для молекул, идентифицированных способами настоящего изобретения; клеточные системы насекомых, инфицированные рекомбинантными вирусными экспрессирующими векторми (, бакуловирус), содержащие последовательности, кодирующие молекулы, идентифицированные способами настоящего изобретения; клеточные системы растений, инфицированные рекомбинантными вирусными экспрессирующими векторами (, вирус мозаики цветной капусты (CaMV) и вирус тобачной мозаики (TMV) или трансформированы рекомбинантными плазмидными экспрессирующими векторами (, Ti плазмида), содержащие последовательности, кодирующие молекулы, идентифицированные способами настоящего изобретения; или клеточные системы млекопитающих (, COS, CHO, BHK, 293, 293T, 3T3 клетки, лимфатические клетки (см. U.S. 5,807,715), Per C.6 клетки (клетки сетчатки глаза человека, открытые Crucell), скрывающие рекомбинантные экспрессирующие конструкции, содержащие промоторы, полученные из генома клеток млекопитающих (, металлотионеин промотор) или из вирусов млекопитающих (, аденовирусный поздний промотор 7.5K промотор вируса коровьей оспы).
E. coli
et al.
EMBO J
lac Z
Nucleic Acids Res.
J. Biol. Chem
В бактериальных системах, ряд экспрессирующих векторов могут быть преимущественно селектированы в зависимости от предназначенного применения экспрессированных молекул. Например, когда продуцируется большое количество такого белка, для получения фармацевтических составов антител, могут требоваться векторы, которые напрявляют экспрессию большого уровня уже очищенных слитых белковых продуктов. Такие векторы включают, но не ограничиваясь ими, экспрессирующий вектор pUR278  (Ruther , 1983, . 2:1791), в котором антитело кодирующая последовательность может быть лигирована в вектор в рамку с  кодирующим участком для продукции слитого белка; pIN векторы (Inouye & Inouye, 1985,  13:3101-3109; Van Heeke & Schuster, 1989, . 24:5503-5509); и т.п.. pGEX векторы могут быть также использованы для экспрессии чужеродных полипептидов как слитых белков с глутатион-S-трансферазой (GST). В основном, такие слитые белки являются растворимыми и легко могут быть очищены из лизированных клеток путем абсорбции и прикрепления к матриксу глутатион-агарозных гранул с последующей десорбцией в присутствии свободного глутатиона. Были разработаны pGEX векторы для включения тромбиновых или Xa протеазных расщепляющих сайтов для того, чтобы клонированный продукт гена-мишени мог быть высвобожден из GST части.
Autographa californica
Spodoptera frugiperda
например,
например
В системе насекомых, ядерный полиэдрозный вирус  (AcNPV) используется в качестве вектора для экспрессии чужеродных генов. Вирус растет в клетках . Антитело кодирующая последовательность может быть клонирована индивидуально в несущественный участок ( ген полигедрина) вируса и помещена под контроль AcNPV промотора (, промотор полигедрина).
например
in vitro
in vivo
например
например
see
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
см.
et al.
Methods in Enzymol.
В хозяйских клетках млекопитающих можно использовать ряд вирусных экспрессирующих систем. В случаях, когда аденовирус используется как экспрессирующий вектор, интересующая антитело-кодирующая последовательность может быть лигирована к аденовирусному транскрипционно/трансляционному контрольному комплексу, , поздний промотор и трехкомпонентная лидирующая последовательность. Этот химерный ген может быть затем вставлен в аденовирусный геном  или  рекомбинацией. Вставка во второстепнный участок вирусного генома (, участок E1 или E3) приведет к рекомбинации вируса, который будет жизнеспособным и способным экспрессировать иммуноглобулиновую молекулу в инфицированных хозяевах (,  Logan & Shenk, 1984,  81:355-359). Могут быть необходимы специфические инициирующие сигналы для эффективной трансляции вставленных антитело-кодирующих последовательностей. Эти сигналы включают ATG инициирующий кодон и примыкающие последовательности. Кроме того, инициирующий кодон должен быть в фазе с рамкой считывания желаемой кодирующей последовательности для правильной трансляции всей вставки. Эти экзогенные трансляционные контролирующие сигналы и инициирующие кодоны могут быть различного происхождения, как натуральными, так и синтетическими. Эффективность экспрессии может быть увеличена включением транскрипционных энхансерных элементов, транскрипционных терминаторов, и т.п. (Bittner , 1987,  153:51-544).
например
например
К тому же может быть выбрана линия клеток-хозяев, которая модулирует экспрессию встроенных последовательностей, или модифицирует и производит генетический продукт необходимым способом. Такие модификации (, гликозилирование) и процессинг (, расщепление) белковых продуктов может быть важен для функционирования белка. Различные клетки-хозяева имеют характеристику и специфические механизмы для пост-трансляционного процессинга и модификации белковых и генных продуктов. Могут быть выбраны подходящие клеточные линии или хозяйские системы для уверенности в правильной модификации и процессинге экспрессированного чужеродного белка. С этой целью могут быть использованы эукариотические клетки-хозяева, которые обладают клеточным аппаратом для нужного процессинга первичного транскрипта, гликозилирования и фосфорилирования генетического продукта. Такие клетки-хозяева млекопитающих включают, но не ограничиваются, CHO, VERY, BHK, Hela, COS, MDCK, 293, 293T, 3T3, WI38, BT483, Hs578T, HTB2, BT20 и T47D, CRL7030 и Hs578Bst.
например
и т.п.
Для длительной продукции рекомбинантных белков с высоким выходом предпочтительна стабильная экспрессия. Например, могут быть разработаны клеточные линии, которые стабильно экспрессируют антитело настоящего изобретения. Вместо использования экспрессирующих векторов, которые содержат репликацию вирусного происхождения, клетки-хозяева могут быть трасформированы с котролируемой ДНК с соответсвующими контрольными элементами экспрессии (, промотор, энхансер, последовательности, терминаторы транскрипции, полиаденилирующие сайты ), и селектируемым маркером. После встраивания чужеродной ДНК, производимым клеткам позволяют расти 1-2 дня в обогащенной среде, и затем переносят в селективную среду. Селектируемый маркер в рекомбинантной плазмиде дает устойчивасть к селекции и позволяет клеткам стабильно интегрировать плазмиду в свои хромосомы и расти, формируя очаги, которые, в свою очередь, могут быть клонированы и расширены до клеточной линии. Этот способ может быть преимущественно использован для создания клеточных линий, которые экспрессируют антитела настоящего изобретения. Такие созданные клеточные линии могут быть частично полезны в демонстрации и оценке веществ, которые взаимодействуют прямо или опосредованно с антителами настоящего изобретения.
et al.
Cell
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
et al.
Cell
et al.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
et al.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
Proc. Natl. Acad. Sci
Clinical Pharmacy
Ann. Rev. Pharmacol. Toxicol
Science
Ann. Rev. Biochem
TIB TECH
et al.
Current Protocols in Molecular Biology
et al.
et al.
J. Mol. Biol.
et al.
Gene
Gene Transfer and Expression, A Laboratory Manual
Current Protocols in Human Genetics
Может быть использован ряд селекционных систем, включая, но не ограничиваясь, тимидин киназу простого вируса герпеса (Wigler , 1977,  11: 223), гипоксантин-гуаниновую фосфорибозилтрансферазу (Szybalska & Szybalski, 1992,  48: 202), и аденин фосфорибозилтрансферазу (Lowy , 1980,  22: 817), гены которых можно применять в tk-, hgprt- или aprt-клетках, соответственно. Также, антиметаболитная устойчивость может использоваться как основа селекции для следующих генов: dhfr, который придает устойчивость к метотрексату (Wigler , 1980,  77:357; O'Hare , 1981,  78: 1527); gpt, который придает устойчивость к микофеноловой кислоте (Mulligan & Berg, 1981, . USA 78: 2072); neo, который придает устойчивость к аминогликозиду G-418 12: 488-505; Wu и Wu, 1991, 3:87-95; Tolstoshev, 1993, . 32:573-596; Mulligan, 1993, 260:926-932; и Morgan и Anderson, 1993, . 62:191-217; May, 1993,  11(5):155-215). Общеизвестные в данном уровне техники способы технологии рекомбинантной ДНК, которые могут быть использованы, описаны у Ausubel  (eds.), 1993,, John Wiley & Sons, NY; Kriegler, 1990, , Stockton Press, NY; и in Chapters 12 и 13, Dracopoli  (eds), 1994, , John Wiley & Sons, NY.; Colberre-Garapin , 1981,  150:1; и hygro, который придает устойчивость к гигромицину (Santerre , 1984, 30:147).
The use of vectors based on gene amplification for the expression of cloned genes in mammalian cells in DNA cloning
et al.
Mol. Cell. Biol
Уровни экспрессии антитела настоящего изобретения могут быть увеличены векторной амплификацией (для обзора, см. Bebbington и Hentschel, , Vol. 3 (Academic Press, New York, 1987). Когда в векторной системе, экспрессирующей антитело, амплифицирован маркер, увеличение уровня ингибитора, присутствующего в культуре клеток-хозяев, будет увеличивать число копий маркерного гена. Поскольку амплифицированный участок ассоциирован с нуклеотидной последовательностью антитела, продукция антитела будет также увеличиваться (Crouse , 1983, . 3:257).
Nature
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
Клетка-хозяин может быть трасфицирована с двумя экспрессирующими векторами настоящего изобретения, первый вектор, кодирующий тяжелую цепь полученного полипептида, а второй вектор, кодирующий легкую цепь полученного полипептида. Два вектора могут содержать идентичные селектируемые маркеры, которые позволяют равно экспрессировать тяжелую и легкую цепи полипетидов. Альтернативно, может быть использован одиночный вектор, который кодирует как тяжелую, так и легкую цепь полипептидов. В таких ситуациях, легкая цепь должна быть расположена перед тяжелой цепью, чтобы избежать избытка токсичной свободной тяжелой цепи (Proudfoot, 1986, 322:52; Kohler, 1980,  77:2197). Кодирующие последовательности для тяжелой и легкой цепей могут содержать cDNA или геномную ДНК.
т.е.
например
Как только молекула настоящего изобретения (, антитела) будет рекомбинантно экспрессирована, она может быть очищена любым способом, известным в данном уровне техники для очистки полипептидов или антител, например, хромтографией (, ионообменной, аффинной, особенно с аффинитетом к специфическому антигену к Белку A и ситовой колоночной хроматографией), центрифугированием, различной растворимостью или любой другой стандартной техникой для очистки полипептидов или антител.
6.4 ПРОФИЛАКТИЧЕСКИЕ И ТЕРАПЕВТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
например
например
т.е.
Настоящее изобретение включает применение одной или нескольких молекул настоящего изобретения (, антитела) у животных, предпочтительно у млекопитающих, и наиболее предпочтительно у человека, для предупреждения, лечения или улучшения одного или нескольких симптомов, связанных с заболеванием, оклонение или инфекцией. Молекулы настоящего изобретения особенно полезны для лечения или предупреждения заболевания или нарушения, когда требуется усиленная эффективность эффекторной клеточной функции (, ADCC), опосредованной FcγR. Способы и композиции настоящего изобретения особенно полезны для лечения и предупреждения первичного или метастатического неопластического заболевания (, злокачественной опухоли), и инфекционных заболеваний. Молекулы настоящего изобретения могут быть предоставлены в фармацевтически приемлемых композициях, как известно в данном уровне техники или как описано в данном документе. Как детализировано ниже, молекулы настоящего изобретения могут использоваться в способах лечения или предупреждения злокачественных опухолей (особенно в пассивной иммунотерапии), аутоиммунных заболеваний, воспалительных расстройств или инфекционных заболеваний.
например
например
.
Молекулы настоящего изобретения могут таже преимущественно быть использованы в комбинации с другими терапевтическими средствами, известными в данном уровне техники для лечения или предупреждения злокачественных опухолей, аутоиммунных заболеваний, воспалительных расстройств или инфекционных заболеваний. В специфическом варианте осуществления, молекулы настоящего изобретения могут быть использованы в комбинации с моноклональными или химерными антителами, лимфокинами или гемопоэтическими факторами роста (такими как, , IL-2, IL-3 и IL-7), которые, например, служат для увеличения количества или активности эффекторных клеток, которые взаимодействуют с молекулами и усиливают иммунный ответ Молекулы настоящего изобретения могут также быть преимущественно использованы в комбинациях с одним или несколькими лекарственными средствами, используемыми для лечения заболевания, отклонения или инфекции такими, как, например, противораковые агенты, противовоспалительные агенты или противовирусные агенты, , как детально представленов в Пунктах 6.4.1.2 и 6.4.2.1 ниже.
6.4.1 ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ ОПУХОЛИ
Настоящее изобретение включает способы и композиции для лечения или профилактики злокачественных опухолей или метастазов у субъекта, включающий применение у субъекта терапевтически эффективного количества одной или нескольких молекул, содержащих вариантный Fc-участок.
т.е.
например
.
.
Молекулы настоящего изобретения (, полипептиды, антитела), содержащие вариантные Fc-участки, могут использоваться для предотвращения, ингибирования или снижения роста первичных опухолей или метастазов злокачественных опухолевых клеток. В одном варианте осуществления, молекула настоящего изобретения содержит вариантный Fc, который связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA с большей аффинностью, чем сравниваемый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA, и/или указанный вариантный Fc-участок имеет усиленную эффекторную функцию, , ADCC, CDC, фагоцитоз, опсонизация, и т.п.Такие молекулы могут использоваться самостоятельно для лечения или предупреждения злокачественной опухоли. В другом варианте осуществления, молекула настоящего изобретения содержит вариантный Fc-участок, который связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA с большей аффинностью, чем сравниваемый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA, и далее связывает FcγRIIB с меньшей аффинностью, чем сравниваемый полипептид, содержащий Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIB, и/или указанный вариантный Fc-участок повышенную эффекторную функцию, ADCC, CDC, фагоцитоз, опсонизацию и т.п.Такие молекулы также могут быть использованы самостоятельно для лечения или предупреждения злокачественной опухоли.
например
например
В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение включает способы и композиции для лечения или предупреждения злокачественной опухоли у субъекта с FcγR полиморфизмом, таким как гомозиготность по FγRIIIA-158V или FcγRIIIA-158F аллелям. В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение включает создание терапевтических антител, , специфических опухолевых моноклональных антител, в соответствии со способами настоящего изобретения так, чтобы созданные антитела имели повышенную эффективность у пациентов, гомозиготных по низко аффинной аллели FcγRIIIA (158F). В других вариантах осуществления, настоящее изобретение включает создание терапевтических антител, , специфических опухолевых моноклональных антител в соответствии со способами настоящего изобретения так, чтобы созданные антитела имели повышенную эффективность у пациентов, гомозиготных по высоко аффинной аллели FcγRIIIA (158V).
et al.
Blood,
et al.
J Clin Oncol.
γ
В некоторых вариантах осуществления, созданные антитела настоящего изобретения особенно эффективны в лечении и/или предупреждении не-ходжкинской лимфомы (NHL). Созданные антитела настоящего изобретения терапевтически более эффективны, чем используемые в настоящее время терапевтически режимы для NHL, включая без ограничения химиотерапию, и иммунотерапию, используя анти-CD20 mAb, Ритуксимаб. Эффективность анти-CD20 моноклональных антител, однако, зависит от FcγR полиморфизма субъекта (Carton , 2002  99: 754-8; Weng , 2003 21(21):3940-7, оба из которых представлены ссылками в настоящем документе в полном объеме). Эти рецепторы экспрессируются на поверхности эффекторных клеток и опосредуют ADCC. Высокоаффинные аллели низкоаффинных активирующих рецепторов, улучшают эффекторную способность клеток к опосредованию ADCC. Способы настоящего изобретения позволяют создавать анти-CD20 антитела, содержащие Fc мутации, для усиления их аффинности к FcγR на эффекторных клетках через их измененные Fc домены. Созданные антитела настоящего изобретения являются лучшими реагентами иммунотерапии для пациентов, независимо от их FcR полиморфизма.
Образцовый способ для определения эффективности созданных анти-CD20 антител у субъекта может включать следующее: плазмиды, содержащие гены химерной анти-HER2/neu тяжелой цепи с Fc мутациями, которые демонстрируют существенное снижение цитолиза в ADCC, могут быть использованы в качестве скелета для переноса вариабельного домена из гена тяжелой цепи Ритуксимаба. Вариабельный участок из анти-HER2/neu Fc вариант заменяется вариабельным участком из Ритуксимаба. Плазмиды, содержащие Fc домены дикого типа или D265A мутацию для отмены FcR связывания или Fc варианты к CD20 скоротечно котрасфицируют с геном легкой цепи Ритуксимаба в 293H клетках, среда отвечающая стандартам и антитело очищают через колонку G белока , используя стандартные способы.
o
In vitro
mAb к CD20, содержащие Fc-варианты, тестируют с ADCC использованием культивированной B линии клеток для определения способности Fc мутаций усиливать ADCC. Стандарт ADCC достигается использованием способов, раскрытых в данном документе. Лимфоциты получают из периферической крови с использование градиента Ficoll-Paque (Pharmacia). Клетки-мишени Дауди, B-клеточную линию, экспрессирующую CD20, вводят с европием (PerkinElmer) и инкубируют с эффекторами 4 часа при 37C. Высвободившийся Европий регистрируют с использованием флуоресцентного планшетного ридера (Wallac). Данные результирующего ADCC демонстрируют эффективность Fc вариант в запуске опосредованной NK-клетками цитотоксичности и установке, какие анти-CD20 Fc-варианты могут быть протестированы как с образцами пациента, так и отмытыми моноцитами. Fc варианты, демонстрирующие наибольший потенциал для усиления эффективности анти-CD20 антитела, затем тестируют в ADCC анализе, используя PBMC от пациентов. PBMC from healthy donors are used as effector cells.  ADCC исследования, с использованием анти-CD20 вариантов и ритуксимаба, выполняются в клетках первичной лимфомы от пациентов с фолликулярной лимфомой. Специфический FcγR полиморфизм доноров определяют и катологизируют, используя способы, известные в данном уровне техники. ADCC анализ выполняют эффекторными клетками от пациентов с дразличными FcγRIIIA и FcγRIIA генотипами.
например
например
Согласно аспекту настоящего изобретения, молекулы (, антитела) настоящего изобретения, содержащие вариантные Fc-участки, усиливают эффективность иммунотерапии злокачественной опухоли, путем уменьшения силы эффекторной функции антитела по отношению к молекуле, содержащей Fc-участок дикого типа, , ADCC, CDC, фагоцитоз, опсонизация, и т.п. В специфическом варианте осуществления, антитело зависимая клеточная токсичность и/или фагоцитоз опухолевых клеток повышается при использовании молекул настоящего изобретения с вариантными Fc-участками. Молекулы настоящего изобретения могут повышать эффективность лечения злокачественных опухолей иммунотерапией путем усиления, по меньшей мере, одной антитело-опосредованной эффекторной функции. В одном определенном варианте осуществления, молекула настоящего изобретения, содержащая вариантный Fc-участок, увеличивает эффективность лечения иммунотерапией путем усиления комплемент зависимого каскада. В другом варианте осуществления настоящего изобретения, молекула настоящего изобретения, содержащая вариантный Fc-участок, усиливает эффективность лечения иммунотерапией путем усиления фагоцитоза и/или опсонизации опухолевых клеток-мишеней. В другом варианте осуществления настоящего изобретения, молекула настоящего изобретения, содержащая вариантный Fc-участок, усиливает эффективность лечения путем усиления антитело-зависимой клеточно опосредованной цитотоксичности (“ADCC”) в деструкции опухолевых клеток-мишеней.
например
например
например
См. Пункт
Streptococcus pneumoniae
например,
Таблицу 9
Таблице 10,
Настоящее изобретение далее рассматривает создание терапевтических антител (, специфических опухолевых моноклональных антител) для усиления терапевтической эффективности терапевтического антитела, например, путем усиления эффекторной функции терапевтического антитела (, ADCC). Предпочтительно терапевтическое антитело является цитотоксическим и/или опсонирующим антителом. Это будет оценено специалистами в данной области, что, поскольку идентифицированы молекулы настоящего изобретения с требуемыми связывающими свойствами (, молекулы с вариантными Fc-участками с, по меньшей мере, одной аминокислотной модификацией, которая усиливает аффинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA по отношению к сравниваемой молекуле, содержащей Fc-участок дикого типа) ( 6.2 и ) в соответствии со способами настоящего изобретения, могут быть созданы терапевтические антитела с использованием стандартной техники рекомбинантной ДНК и любой известной мутагенной техники, как описано в Пункте 6.2.2 для получения разработанных лекарственных средств, несущих идентифицированные мутационные сайты с требуемыми связывающими свойствами. Любые из терапевтических антител, представленные в которые продемонстрировали терапевтическую полезность в лечении злокачественных опухолей, могут быть созданы в соответствии со способами настоящего изобретения, например, путем модифицирования Fc-участка для усиленного аффинитета к FcγRIIIA и/или FcγRIIA, по сравнению с терапевтическим антителом, имеющим Fc-участок дикого типа, и использованы для лечения или предупреждения злокачественных опухолей, характеризующихся антигеном злокачественной опухоли. Другие терапевтические антитела включают антитела против таких патогенных агентов, как серотип 6B, см.,  Sun et al., 1999, Infection и Immunity, 67(3): 1172-9.
т.е.
Fc варианты настоящего изобретения могут быть включены в терапевтические антитела, такие как те, что раскрыты в данном документе или другие Fc слитые клинические кандидаты, , молекула, включающая Fc-участки, которые были одобрены клиническими испытаниями или любые другие молекулы, которые могут полезны из Fc-вариантов настоящего изобретения или их очеловеченных, со зрелым сродством, модифицированных или сконструированных версий.
Настоящее изобретение также включает создание любых других полипептидов, содержащих Fc-участок, который имеет терапевтическую пользу, включая, но не ограничиваясь, ENBREL, в соответсвии со способами настоящего изобретения, с целью усиления терапевтической эффективности таких полипептидов, например, путем усиления эффекторной функции полипептида, содержащего Fc-участок.
<b>ТАБЛИЦА 10.</b>
<b><u>ТЕРАПЕВТИЧЕСКИЕ АНТИТЕЛА, КОТОРЫЕ МОГУТ БЫТЬ РАЗРАБОТАНЫ В СООТВЕТСТВИИ СО СПОСОБАМИ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ</u></b>
<b>Фирма</b>
<b>Продукт</b>
<b>Заболевание</b>
<b>Цель</b>
<b>Abgenix</b>
ABX-EGF™
Злокачественная опухоль
EGF рецептор
<b>AltaRex</b>
OvaRex™
Яичниковая злокачественная опухоль
опухолевый антиген CA125
BravaRex™
Метастатические злокачественные опухоли
опухолевый антиген MUC1
<b>Antisoma</b>
Theragyn™ (pemtumomabytrrium-90)
Яичниковая злокачественная опухоль
PEM антиген
Therex™
злокачественная опухоль молочной железы
PEM антиген
<b>Boehringer Ingelheim</b>
Blvatuzumab
злокачественная опухоль головы и шеи
CD44
<b>Фирма</b>
Продукт
Заболевание
Цель
<b>Centocor/J&J</b>
Panorex™
Колоректальная злокачественная опухоль
17-1A
ReoPro™
PTCA
gp IIIb/IIIa
ReoPro™
Острый MI
gp IIIb/IIIa
ReoPro™
Ишемический инсульт
gp IIIb/IIIa
<b>Corixa</b>
Bexocar™
НХЛ
CD20
<b>CRC Technology</b>
MAb, idiotypic 105AD7
Колоректальная злокачественная опухоль вакцина
gp72
<b>Crucell</b>
Anti-EpCAM
злокачественная опухоль
Ep-CAM
<b>Cytoclonal</b>
MAb,  злокачественная опухоль легкого
Не мелкоклеточная легочная злокачественная опухоль
NA
<b>Genentech</b>
Herceptin
Метастатическаязлокачественная опухоль молочной железы
HER-2
Herceptin
Начальная стадия злокачественной опухоли молочной железы
HER-2
Rituxan
рецидив/трудноподдающийся лечениюслабо выраженный или фолликулообразный НХЛ
CD20
Rituxan
Переходный и высокодеференцированный НХЛ
CD20
MAb-VEGF
NSCLC, метестатический
VEGF
MAb-VEGF
Колоректальная злокачественная опухоль, метестатическая
VEGF
AMD™ Fab
возрастная дегенерация макулы
CD18
E-26™ (2<sup>nd</sup> gen. IgE)
аллергическая бронхиальная астма и риниты
IgE
<b>IDEC</b>
Zevalin™ (Rituxan™ + иттрий-90)
слабо выраженный фолликулообразный, рецидивированный или трудноподдающийся лечению, CD20-положительный, B-клеточный НХЛ и Ритуксимаб-трудноподдающийся
CD20
<b>Фирма</b>
Продукт
Заболевание
Цель
лечению НХЛ
<b>ImClone</b>
Cetuximab™ + иннотекан
трудноподдающаяся лечению колоректальная карцинома
EGF рецептор
Cetuximab™ + цисплатин и радиация
впервые диагносцированная или повторяющаяся время от времени злокачественная опухоль головы и шей
EGF рецептор
Cetuximab™ + гемцитабин
впервые диагностированная метестатическая панкреатическая карцинома
EGF рецептор
Cetuximab™ + цисплатин + 5FU или Taxol
повторяющаяся время от времени или метестатическая злокачественная опухоль
EGF рецептор
Cetuximab™ + карбоплатин + паклитаксел
Впервые диагностированная не мелкоклеточная карцинома легкого
EGF рецептор
Cetuximab™ + Cisplatin™
злокачественная опухоль головы и шеи (обширный неизличимый участок заболевания и отдаленные метастазы)
EGF рецептор
Cetuximab + радиация
местнораспространенная карцинома головы и шеи
EGF рецептор
BEC2 + Bacillus Calmette Guerin
Мелкоклеточная карцинома легкого
Симулирования ганглиозид GD3
BEC2 + Bacillus Calmette Guerin
меланома
Симулирования ганглиозид GD3
IMC-1C11
колоректальная злокачественная опухоль с печеночными метастазами
VEGF-рецептор
<b>ImmonoGen</b>
nuC242-DM1
Колоректальная, желудочная и панкреатическая злокачественная опухоль
nuC242
<b>ImmunoMedics</b>
LymphoCide™
Неходжкинские лимфомы
CD22
<b>Фирма</b>
Продукт
Заболевание
Цель
LymphoCide Y-90™
Неходжкинские лимфомы
CD22
CEA-Cide™
Метестатическая солидная опухоль
CEA
CEA-Cide Y-90™
Метестатическая солидная опухоль
CEA
CEA-Scan™ (Tc-99m-меченный арцитумомаб)
Колоректальная злокачественная опухоль радиоизображение)
CEA
CEA-Scan™ (Tc-99m-меченный арцитумомаб)
Злокачественная опухоль молочной железы (радиоизображение)
CEA
CEA-Scan™ (Tc-99m-меченный арцитумомаб)
Легочная злокачественная опухоль (радиоизображение)
CEA
CEA-Scan™ (Tc-99m-меченный арцитумомаб)
Интраоперационные опухоли (радиоизображение)
CEA
LeukoScan™ (Tc-99m-меченный сулезомаб)
Инфекция мягкой ткани (радиоизображение)
CEA
LymphoScan™ (Tc-99m-меченный)
Лимфомы (радиоизображение)
CD22
AFP-Scan™ (Tc-99m-меченный)
Печеночные 7 гем-клеточные злокачественные опухоли (радиоизображение)
AFP
<b>Intracel</b>
HumaRAD-HN (+ иттрий-90)
Злокачественная опухоль головы и шеи
NA
HumaSPECT
Колоректальная визуализация
NA
<b>Medarex</b>
MDX-101 (CTLA-4)
Простатическая и другие злокачественные опухоли
CTLA-4
MDX-210 (her-2 сверхэкспрессия)
Простатическая злокачественная опухоль
HER-2
MDX-210/MAK
Злокачественная опухоль
HER-2
<b>MedImmune</b>
Vitaxin™
Злокачественная опухоль
αvβ<sub>3</sub>
<b>Merck KGaA</b>
MAb 425
Различные злокачественныеопухоли
EGF рецептор
<b>Фирма</b>
Продукт
Заболевание
Цель
IS-IL-2
Различные злокачественныеопухоли
Ep-CAM
<b>Millennium</b>
Campath (аалемтузумаб)
Хронический лимфолейкоз
CD52
<b>NeoRx</b>
CD20-стрептавидин (+ биотин-иттрий 90)
Неходжкинские лимфомы
CD20
Avidicin (альбумин + NRLU13)
Метестатическая злокачественная опухоль
NA
<b>Peregrine</b>
Oncolym™ (+ йод-131)
Неходжкинские лимфомы
HLA-DR 10 beta
Cotara™ (+ йод-131)
Нерезектабельная злокачественная глиома
ДНК- примесные белки
<b>Pharmacia Corporation</b>
C215 (+ стафилококковый энтеротоксин)
Панкреатическая злокачественная опухоль
NA
MAb, легочная/почечная злокачественная опухоль
Злокачественная опухоль головы и шеи
NA
nacolomab tafenatox (C242 + стафилококковый энтеротоксин)
злокачественная опухоль вызванная кишечной бактерией и панкреатическая
NA
<b>Белок Design Labs</b>
Nuvion™
Т-лимфоцитные злокачественные опухоли
CD3
SMART M195™
AML
CD33
SMART 1D10™
НХЛ
HLA-DR антиген
<b>Titan</b>
CEAVac™
колоректальная злокачественная опухоль, проггресирующая
CEA
TriGem™
Метестатическая меланома и мелкоклеточная злокачественная опухоль легкого
GD2-ганглиозид
TriAb™
Метестатическая злокачественная опухоль молочной железы
MUC-1
<b>Trilex</b>
CEAVa™c
Колоректальная злокачественная опухоль, прогресирующая
CEA
TriGem™
Метестатическая меланома и мелкоклеточная
GD2-ганглиозид
<b>Фирма</b>
Продукт
Заболевание
Цель
злокачественная опухоль легкого
TriAb™
Метестатическая злокачественная опухоль молочной железы
MUC-1
<b>Viventia Biotech</b>
NovoMAb-G2 радиомеченный
Неходжкинские лимфомы
NA
Monopharm C™
Колоректальная и панкреатическая карцинома
SK-1 антиген
GlioMAb-H™ (+ гелонин токсин)
Глиома, меланома и нейробластома
NA
<b>Xoma</b>
Rituxan™
Рецидивированный/трудноподдающийся лечению слабо выраженный или фолликулообразный НХЛ
CD20
Rituxan™
Посреднический и высокодеференцированный НХЛ
CD20
ING-1
Аденокарцинома
Ep-CAM
например
например
например
Таким образом, настоящее изобретение предоставляет способы предупреждения или лечения злокачественных опухолей, характеризованных антигеном злокачественной опухоли, используя терапевтическое антитело, которое связывает антиген злокачественной опухоли и является цитотоксичным, и было модифицировано в одном или нескольких сайтах Fc-участка, по настоящему изобретению, чтобы связывать FcγRIIIA и/или FcγRIIA с большей аффинностью, чем родительское терапевтическое антитело, и/или опосредует эффекторную функцию (, ADCC, фагоцитоз) более эффективно. В другом варианте осуществления, настоящее изобретение предоставляет способы предупреждения или лечения злокачественных опухолей, характеризованных антигеном злокачественной опухоли, используя терапевтическое антитело, которое связывает антиген злокачественной опухоли и является цитотоксичным, и было создано по настоящему изобретению для связывания FcγRIIIA и/или FcγRIIA с большей аффинностью и связывания FcγRIIB с меньшей аффинностью, чем родительское терапевтическое антитело, и/или опосредует эффекторную функцию (, ADCC, фагоцитоз) более эффективно. Терапевтические антитела, которые были созданы по настоящему изобретению, полезны для предупреждения или лечения злокачественных опухолей, поскольку они имеют повышенную цитотоксическую активность (, усиленный цитолиз опухолевых клеток и/или усиленная, например, ADCC активность или CDC активность).
J. Immunol.
Hybridoma
et al.
Cancer Res.
et al.
Nucl. Acids Res.
Biochem. Biophys. Res. Comm.
et al.
Cancer Res.
et al.
J. Natl. Cancer Instit.
et al.
J. Exp. Med.
et al.
Cancer
et al.
J. Clin. Invest.
et al.
Proc. Am. Soc. Clin. Oncol.
et al.
Cancer Res.
et al.
Int. J. Cancer
et al.
J. Clin. Immunol.
et al.
Кровь
et al.
Кровь
et al.
J. Nucl. Med.
et al.
et al.
Cancer Immunol. Immunother.
et al.
J. Clin. Oncol.
et al.
Cancer Res.
et al.
Cancer Res.
et al.
Cancer Res.
et al.
J. of Immun.
et al.
Trends in Bio. Chem. Sci.
et al.
Science
Nature
см.
The Cancer Journal
HER2
y
a
b
b
y
1
1
5
7
24
D3
M2
D2
4
Злокачественные опухоли связанные с раковым антигеном могут лечиться или предупреждаться путем введения терапевтического антитела, которое связывает раковый антиген и оказывает цитотоксический эффект и было разработано в соответсвии со способами настоящего изобретения и имеет, например, повышенную эффекторную функцию. В одном отдельном варианте осуществления, терапевтические антитела, разработанные в соответствии со способами настоящего изобретения, повышают антитело-обусловленный цитотоксический эффект антитела прямо на опухолевый антиген. Например, но не ограничиваясь, злокачественные опухоли, связанные со следующими опухолевыми антигенами, могут лечиться или предотвращаться в соответствии со способами настоящего изобретения: KS 1/4 антиген пан-карциномы (Perez и Walker, 1990,  142:32-37; Bumal, 1988,  7(4):407-415), антиген карциномы яичника (CA125) (Yu , 1991,  51(2):48-475), ортофосфорная кислота простаты (Tailor , 1990,  18(1):4928), специфический антиген простаты (Henttu и Vihko, 1989,  10(2):903-910; Israeli , 1993,  53:227-230), меланома-связанный антиген p97 (Estin , 1989,  81(6):445-44), антиген меланомы gp75 (Vijayasardahl , 1990,  171(4):1375-1380), высокомолекулярный антиген меланомы (HMW-MAA) (Natali , 1987,  59:55-3; Mittelman , 1990,  86:2136-2144)), специфический мембранный антиген простаты, карциноэмбриональный антиген (CEA) (Foon , 1994,  13:294), полиморфный эпителиальный муциновый антиген, антиген жировой глобулы грудного молока, колоректальные опухоле связанные антигены такие как: CEA, МЕТКА-72 (Yokata , 1992,  52:3402-3408), CO17-1A (Ragnhammar , 1993,  53:751-758); GICA 19-9 (Herlyn , 1982,  2:135), CTA-1 и LEA, антиген лимфомы Беркитта - 38.13, CD19 (Ghetie , 1994,  83:1329-1336), человеческий антиген B-lymphoms - CD20 (Reff , 1994,  83:435-445), CD33 (Sgouros , 1993,  34:422-430), меланома специфические антигены такие как ганглиозид GD2 (Saleh , 1993, J.Immunol., 151, 3390-3398), ганглиозид GD3 (Shitara , 1993,  36:373-380), ганглиозид GM2 (Livingston , 1994,  12:1036-1044), ганглиозид GM3 (Hoon , 1993,  53:5244-5250), опухолеспецифический трансплантационный тип поверхностно-клеточного антигена (TSTA): вирус-индуцированные опухолевые антигены, включая T-антиген ДНК вирусов опухолей и антигены оболочки РНК вирусов опухолей, онкофетальный антиген-альфа-фетопротеин, такой как CEA толстого кишечника, онкофетальный антиген опухоли мочевого пузыря (Hellstrom , 1985,  45:2210-2188), дифференцировочный антиген, такой как антиген карциномы легких человека L6, L20 (Hellstrom , 1986,  46:3917-3923), антигены фибросаркомы, Т - клеточный антиген лейкемии человека-Gp37 (Bhattacharya-Chatterjee , 1988,  141:1398-1403), неогликопротеин, сфинголипиды, опухолевый антиген рака груди, такой как EGFR (эпидермальный фактор роста рецептора), HER2 антиген (p185), полиморфный эпителиальный муцин (PEM) (Hilkens , 1992,  17:359), опухолевый лимфоцитарный антиген человека-APO-1 (Bernhard , 1989,  245:301-304), дифференцировочный антиген (Feizi, 1985,  314:53-57), такой как I антиген обнаруженный в фетальных эритроцитах и первичной эндодерме, I(Ma) обнаруженный в аденокарциномах желудка, M18 и M39 обнаруженные в эпителии груди, SSEA-1 обнаружен в миелоидных клетках, VEP8, VEP9, Myl, VIM-D5 и D56-22 обнаружены в колоректальной злокачественной опухоли, TRA-1-85 (кровь группы H), C14 обнаружен в аденокарциноме толстой кишки, F3 обнаружен в аденокарциноме легких, AH6 обнаружен в  злокачественной опухоли желудка, Y гаптен, Le обнаружен в клетках эмбриональной карциномы, TL5 (кровь группы A), EGF рецептор обнаружен в A431 клетках, E серия (кровь группы B) обнаружена в злокачественной опухоли поджелудочной железы, FC10.2 обнаружен в клетках эмбриональной карциномы, аденокарциноме желудка, CO-514 (кровь группы Le) обнаружен в аденокарциноме, NS-10 обнаружен в аденокарциномах, CO-43 (кровь группы Le), G49, EGF рецептор, (кровь группы ALe/Le) обнаружен в аденокарциноме толстого кишечника, 19.9 обнаружен в злокачественной опухоли толстого кишечника, муцины злокачественной опухоли желудка, TA обнаружен в миелоидных клетках, R обнаружен в меланоме, 4.2, G, D1.1, OFA-1, G, OFA-2, G, M1:22:25:8 обнаружен в клетках эмбриональной карциномы и SSEA-3, SSEA-4 обнаружен в эмбрионах на стадии 4-8-ми клеток. В другом варианте осуществления, антигеном является T клеточный рецептор производный пептида из T клеточной лимфомы кожи ( Edelson, 1998, :62).
et al.
Medicine
et al.
Informed Decisions: The Complete Book of Cancer Diagnosis, Treatment, and Recovery
Злокачественные опухоли и связанные нарушения, которые могут быть лечены или предупреждены способами и композициями настоящего изобретения, включают, но не ограничиваясь, следующим: лейкемии, включая, без ограничения, острая лейкемия, острая лимфотическая лейкемия, острые миелоцитарные лейкемии такие как миелобластическая, промиелоцитарная, миеломоноцитарная, моноцитарная, эритролейкемия и миелодиспластический синдром, хронические лейкемии, такие как хроническая миелоцитарная (гранулоцитарная) лейкемия, хроническая лимфоцитарная лейкемия, лейкоз ворсистых клеток; истинная полицитемия; лимфомы, такие как заболевание Ходжкина, неходжкинское заболевание; множественные миеломы, такие как вялотекущая множественная миелома, несекреторная миелома, остеосклеротическая миелома, плазмоклеточный лейкоз, солитарная плазмацитома и экстрамедуллярная плазмацитома; макроглобулинемия Вальденстрома; моноклональная гаммапатия неустановленной этиологии; доброкачественная моноклональная гаммапатия; болезнь тяжёлых цепей; остео и соединительно тканые саркомы, такие как саркома кости, остеосаркома, хондросаркома, саркома Юинга, гигантоклеточная саркома, фибросаркома кости,  хордома, периостальная саркома, паренхиматозные саркомы, ангиосаркома (гемангиосаркома), фибросаркома, саркома Капоши, лейомиосаркома, липосаркома, лимфангиосаркома, неврилеммома, рабдомиосаркома, синовиальная саркома; опухоли головного мозга, включая без ограничения, глиома, астроцитома, глиома стволовой части мозга, эпендимома, олигодендроглиома, неглиальная опухоль, неврилеммома слухового нерва, краниофарингиома, медуллобластома, менингиома, пинеоцитома, пинеобластома, первичная мозговая лимфома; рак груди, включая, без ограничения, аденокарцинома, лобулярная (мелкоклеточная) карцинома, интрадуктальная карцинома, медуллярный рак груди, муцинозный рак груди, тубулярный рак груди, папиллярный рак груди, болезнь Паджета, и воспалительный рак груди; злокачественные опухоли надпочесников, включая без ограничения, феохромоцитома и адренокортикокарцинома, злокачественные опухоли щитовидной железы, такие как, без ограничения, папиллярная или фолликулярная злокачественная опухоль щитовидной железы, медуллярная злокачественная опухоль щитовидной железы и анапластическая злокачественная опухоль щитовидной железы; злокачественная опухоль поджелудочной железы, включая без ограничения, инсулинома, гастринома, глюкагонома, випома, соматостатин секретирующая опухоль и карциноидная или опухоль островков поджелудочной железы; злокачественные опухоли гипофиза, включая без ограничения, болезнь Кушинга, пролактинсекретирующая опухоль, акромегалия и несахарный диабет; злокачественные опухоли глаз, включая без ограничения, глазная меланома, такая как меланома радужки, хороидальная меланома, меланома ресничного тела и ретинобластома; злокачественные опухоли влагалища, включая без ограничения, плоскоклеточная карцинома, аденокарцинома и меланома; vulvar злокачественная опухоль наружнх половых органов, включая без ограничения, плоскоклеточная карцинома, меланома, аденокарцинома, базальноклеточная карцинома, саркома и болезнь Педжета; цервикальные злокачественные опухоли, включая без ограничения, плоскоклеточная карцинома и аденокарцинома; злокачественные опухоли матки, включая без ограничения, эндометриальная карцинома и sarcoma матки; злокачественные опухоли яичников, включая без ограничения, эпителиальная карцинома яичников, пограничная опухоль, герминома и стромальная опухоль; злокачественные опухоли пищевода, включая без ограничения, плоскоклеточная злокачественная опухоль, аденокарцинома, аденоиднкистозная карцинома, мукоэпидермоидная карцинома, аденосквамозная карцинома, саркома, меланома, плазмацитома, бородавчатая карцинома и овсяно-клеточная (мелкоклеточная) карцинома; злокачественные опухоли желудка, включают без ограничения, аденокарцинома, некротическая язва (полипоидный), изъязвления, поверхностно распространенная, диффузно распространенная, злокачественная лимфома, липосаркома, фибросаркома и карциносаркома; злокачественные опухоли толстой кишки; злокачественные опухоли прямой кишки; злокачественные опухоли печени, включая без ограничения, гепатоклеточная карцинома и гепатобластома, злокачественные опухоли жёлчного пузыря, включая без ограничения, аденокарцинома; холангиокарцинома, ключая без ограничения, папиллярный, узелковый и диффузный; злокачественные опухоли легких, включая без ограничения, немелкоклеточный рак легкого, плоскоклеточная карцинома (эпидеомоидная карцинома), аденокарцинома, крупноклеточная карцинома и мелкоклеточная злокачественная опухоль легких; тестикулярные злокачественные опухоли, включают без ограничения, герминома, семинома, анапластическая, классическая (типичная), сперматоцитная, несперматоцитома, эмбриональная карцинома, тератомная карцинома, хориокарцинома (опухоль желточного мешка), злокачественные опухоли простаты, включают без ограничения, аденокарцинома, лейомиосаркома и рабдомиосаркома; раки пенеса; злокачественные опухоли полости рта, включают без ограничения, плоскоклеточная карцинома; базальные злокачественные опухоли; злокачественные опухоли слюнных желез, включают без ограничения, аденокарцинома, мукоэпидермоидная карцинома и аденокистозная карцинома; злокачественные опухоли глотки, включают без ограничения, плоскоклеточный рак и бородавчатый; злокачественные опухоли кожи, включают без ограничения, базальноклеточная карцинома, плоскоклеточная карцинома и меланома, поверхностнорасположенная меланома, узелковая меланома, меланома родимого пятна, акральная лентигиозная меланома; злокачественные опухоли почек, включают без ограничени, злокачественная опухоль эпителиальных клеток почки, аденокарцинома, гипернефрома, фибросаркома, переходноклеточная злокачественная опухоль (почечная лоханка и/ или мочеточник); опухоль Вильмса; злокачественные опухоли мочевого пузыря, включают без ограничения, переходноклеточная карцинома, плоскоклеточная злокачественная опухоль, аденокарцинома, карциносаркома. К тому же злокачественные опухоли включают миксосаркому, остеогенную саркому, эндотелиосаркому, лимфангиоэндотелиосаркому, мезотелиому, синовиому, гемангиобластому, эпителиальную карциному, цистаденокарциному, бронхогенную карциному, карциному потовых желез, карциному сальных желез, сосочковую карциному и сосочковую аденокарциному (для обзора данных заболеваний, см. Fishman , 1985, , 2d Ed., J.B. Lippincott Co., Philadelphia and Murphy , 1997, , Viking Penguin, Penguin Books U.S.A., Inc., United States of America).
Согласно способам и композиции настоящего изобретения, оно также полезно в лечении или предотвращении разнообразных злокачественных опухолей или других нетипичных пролиферативных заболеваний, включая (без ограничения) следующие: карцинома следующих органов - мочевого пузыря, груди, толстого кишечника, почек, печени, легких, яичников, поджелудочной железы, желудка, простаты, шейки матки, щитовидной железы и кожи; включая плоскоклеточную карциному; гематопоэтические опухоли лимфоидной дифференцировки, включая лейкемию, острую лимфоцитную лейкемию, острую лимфобластную лейкемию, B-клеточную лимфому, T-клеточную лимфому, лимфому Беркитта; гематопоэтичекие опухоли миелоидной дифференцировки, включая острую и хроническую миелогенную лейкемию и промиелоцитарную лейкимию; опухоли мезинхимального происхождения, включая фибросаркому и рабдомиосаркому и другие опухоли, включая меланому, семиному, тетратокарциному, нейробластому и глиому; опухоли центральной и периферичекой нервных систем, включая астроцитому, нейробластому, глиому и шваннома; опухоли мезинхимального происхождения, включая фибросаркому, рабдомиосаркому и остеосаркому и другие опухоли, включая меланому, пигментную ксеродерму, кератоакантому, семиному, злокачественная опухоль щитовидной железы и тератокарцинома. Предположительно злокачественные опухоли, вызванные оберрациями в апоптозе, могут также лечиться способами и композицией настоящего изобретения. Такие злокачественные опухоли могут включать, но не ограничиваться, фолликулярной лимфомой, карциномами с p53 мутациями, гормон зависимыми опухолями груди, простаты и яичников, и предраковыми состояниями, такими как семейный аденоматозный полипоз и миелодиспластический синдром. In отдельном варианте осуществления, злокачественные новообразования или диспролиферативные изменения (такие как метаплазия и дисплазия), или гиперпролиферативные нарушения могут лечиться или предотвращаться способами и композицией настоящего изобретения в яичниках, мочевом пузыре, груди, толстом кишечнике, легких, коже, поджелудочной железе или матке. В других специфических вариантах осуществления, саркома, меланома или лейкемия могут лечиться или предотвращаться способами и композицией настоящего изобретения.
например
В специфическом варианте осуществления, молекула настоящего изобретения (, антитело, содержащее вариантный Fc-участок, или терапевтическое моноклональное антитело созданное в соответствие со способами настоящего изобретения) ингибирует или снижает рост первичной опухоли или метастазов раковых клеток по меньшей мере на 99%, по меньшей мере на 95%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мерена  70%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 45%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 45%, по меньшей мере на 35%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 25%, по меньшей мере на 20%, или по меньшей мере на 10% по отношению к росту первичной опухоли или метастазов в случае отсутствия указанной молекулы настоящего изобретения.
6.4.1.1 КОМБИНИРОВАННАЯ ТЕРАПИЯ
например
Таблице 10
Настоящее изобретение далее включает применение молекул настоящего изобретения в комбинации с другими методами лечения, известными специалистам данной области техники, для лечения и предупреждения злокачественных опухолей, включая без ограничения, текущие стандартные и экспериментальные химиотерапии, гормональные терапии, биологические терапии, иммунотерапии, радиационные терапии или хирургию. В некоторых вариантах осуществления, молекулы настоящего изобретения могут быть применены в комбинации с терапевтически или профилактически эффективным количеством одного или нескольких противораковых агентов, терапевтическими  антителами (, антитела, представленные в ), или другими антителами, известными специалистам данной области техники, для лечения и/или предупреждения злокачественных опухолей (См. пункт 6.4.1.2).
например
В определенных вариантах осуществения, одна или несколько молекул настоящего изобретения применяются у млекопитающих, предпочтительно у людей, одновременно с одним или несколькими другими терапевтическими средствами, полезными для лечения злокачественной опухоли. Выражение “одновременно” не означает введение профилактических или терапевтических средств в тоже самое время, скорее это означает, что молекула настоящего изобретения и другое средство применяются у млекопитающего последовательно и с временным интервалом так, чтобы молекула настоящего изобретения могла действовать совместно с другим средством для обеспечения лучшего результата, чем, если они будут применяться независимо. Например, каждое профилактическое или терапевтическое средство (, химиотерапия, радиационная терапия, гормональная терапия или биологическая терапия) могут быть применены в одно и то же время или последовательно в любой очередности в различное время; однако, если они не применяются в одно и то же время, они должны быть применены максимально близко по времени так, чтобы обеспечить требуемый терапевтический или профилактический эффект. Каждое терапевтическое средство может быть введено отдельно, в любой подходящей форме и любым подходящим способом. В различных вариантах осуществления профилактические или терапевтические средства вводятся с интервалом менее 1 часа, с интервалом приблизительно 1 час, с интервалом от приблизительно 1 часа до приблизительно 2 часов, с интервалом от приблизительно 2 часов до приблизительно 3 часов, с интервалом от приблизительно 3 часов до приблизительно 4 часов, с интервалом от приблизительно 4 часов до приблизительно 5 часов, с интервалом от приблизительно 5 часов до приблизительно 6 часов, с интервалом от приблизительно 6 часов до приблизительно 7 часов, с интервалом от приблизительно 7 часов до приблизительно 8 часов, с интервалом от приблизительно 8 часов до приблизительно 9 часов, с интервалом от приблизительно 9 часов до приблизительно 10 часов, с интервалом от приблизительно 10 часов до приблизительно 11 часов, с интервалом от приблизительно 11 часов до приблизительно 12 часов, с интервалом не более 24 часов или с интервалом не более 48 часов. В предпочтительных вариантах осуществления, два или более компонента применяются за один визит пациента.
В других вариантах осуществления, профилактические или терапевтические средства вводятся с интервалом приблизительно от 2 до 4 дней, с интервалом приблизительно от 4 до 6 дней, с интервалом приблизительно неделю, с интервалом приблизительно от 1 до 2 недель или с интервалом более 2 недель. В предпочтительных вариантах осуществления, профилактические или терапевтические средства применяются во временной рамке, когда оба агента все еще активны. Специалист в данной области может определить такую временную рамку по определению времени полужизни применяемых агентов.
В определенных вариантах осуществения, профилактические или терапевтические средства настоящего изобретения применяются у субъекта циклически. Циклическая терапия включает введение первого средства в период времени, следующий за периодом времени введения второго средства и/или третьего средства и повторение этой последовательности введение. Циклическая терапия может уменьшить развитие устойчивости к одному или нескольким методам лечения, избежать или уменьшить побочные эффекты одной из терапий, и/или улучшить эффективность лечения.
В определенных вариантах осуществения, профилактические или терапевтические средства применяются в цикле менее, чем 3 недели, примерно раз в 2 недели, примерно раз каждые 10 дней или примерно каждую неделю. Один цикл может содержать введение терапевтического или профилактического средства путем инфузии более 90 минут на каждый цикл, около 1 часа на каждый цикл, около 45 минут на каждый цикл. Каждый цикл может содержать по меньшей мере 1 неделю отдыха, по меньшей мере 2 недели отдыха, по меньшей мере 3 недели отдыха. Число вводимых циклов - от 1 до примерно 12 циклов, более типично от примерно 2 до примерно 10 циклов, и менее типично от примерно 2 до примерно 8 циклов.
В других вариантах осуществления, терапевтические и профилактические агенты настоящего изобретения применяются в равномерно дозированных режимах, или путем продолжительной инфузии, или частого введения без продолжительных периодов отдыха. Такое равномерное введение может включать дозирование в определенных интервалах без периодов отдыха. Типично, терапевтические средства, в частности цитотоксические агенты, используются в меньших дозах. Такие дозированные режимы охватывают хроническое ежедневное введение относительно низких доз для расширенного периода времени. В предпочтительных вариантах осуществления, применение более низких доз может минимизировать токсические побочные эффекты и убрать периоды отдыха. В определенных вариантах осуществения, терапевтические и профилактические агенты вводят хроническим низко-дозовым или продолжительным инфузионным ранжированием от примерно 24 часов до примерно 2 дней, до примерно 1 недели, до примерно 2 недель, до примерно 3 недель, до примерно 1 месяца, до примерно 2 месяцев, до примерно 3 месяцев, до примерно 4 месяцев, до примерно 5 месяцев, до примерно 6 месяцев. Планирование таких дозовых режимов может быть оптимизировано квалифицированными онкологами.
т.е.
В других вариантах осуществления, курсы лечения применяют у млекопитающих параллельно, , индивидуальные дозы лекарств применяют отдельно все же в пределах временного интервала так, чтобы молекулы настоящего изобретения могли работать вместе с другим средством или агентом. Например, один компонент можно применять один раз в неделю в комбинации с другими компонентами, которые могут быть прменены раз в две недели или раз в каждые три недели. Другими словами, дозовые режимы для лекарств выполняются параллельно, даже если лекарства не применяют одновременно или в один визит пациента.
например
При использовании в комбинациях с другими профилактическими и/или терапевтическими средствами, молекулы настоящего изобретения и профилактическое и/или терапевтическое средство могут действовать совокупно или, более предпочтительно, синергично. В одном варианте осуществления, молекула настоящего изобретения применяется параллельно с одним или несколькими терапевтическими средствами в той же фармацевтической композиции. В другом варианте осуществления, молекула настоящего изобретения применяется параллельно с одним или несколькими другими терапевтическими средствами в раздельной фармацевтической композиции. В том же другом варианте осуществления, молекула настоящего изобретения применяется до или следом за введением другого профилактического или терапевтического средства. Настоящее изобретение рассматривает введение молекулы настоящего изобретения в комбинации с другими профилактическими или терапевтическими средствами теми же или различными путями введения, , оральный и парентеральный. В определенных вариантах осуществения, когда молекула настоящего изобретения применяется параллельно с другим профилактическим или терапевтическим средством, что потенциально продуцирует неблагоприятные побочные эффекты, включая, без ограничения, токсичность, профилактическое или терапевтическое средство может преимущественно быть применено в дозе ниже пороговой величины, вызывающей неблагоприятный эффект.
Physician's Desk Reference
th
Дозированные количества и частота введение, представленные здесь, охватываются терминами терапевтически эффективный и профилактически эффективный. Дозировка и частота далее будут типично варьировать в зависимости от факторов, специфичных для каждого пациента, зависящих от применяемых специфических терапевтических или профилактических агентов, тяжести и типа злокачественной опухоли, способа введения, а также возраста, веса, реакции, и прошлой медицинской истории пациента. Подходящие режимы могут быть выбраны специалистами в данной области после рассмотрения таких факторов и после, например, дозировок, представленных в литературе и рекомендованных в  (56 ed., 2002).
6.4.1.2 ДРУГИЕ ТЕРАПЕВТИЧЕСКИЕ/ПРОФИЛАКТИЧЕСКИЕ
АГЕНТЫ
В особых вариантах осуществления, способы настоящего изобретения включают введение одной или нескольких молекул настоящего изобретения с одним или несколькими терапевтическими средствами, используемыми для лечения и/или предупреждения злокачественной опухоли. В одном варианте осуществления, ингибиторы ангиогенеза могут применяться в комбинации с молекулами настоящего изобретения. Ингибиторы ангиогенеза, которые могут использоваться в способах и композициях настоящего изобретения включают но не ограничиваются: ангиостатин (фрагмент плазминогена); антиангиогенный антитромбин III; ангиозим; ABT-627; Bay 12-9566; бенефин; бевацизумаб; BMS-275291; ингибитор полученный из хряща (CDI); CAI; CD59 фрагмент комплемента; CEP-7055; Col 3; комбретастатин A-4; эндостатин (фрагмент XVIII коллагена); фрагмент фибронектина; Gro-бета; галофугинон; гепариназы; гексасахаридный фрагмент гепарина; HMV833; гонадотропин человека (hCG); IM-862; Интерферон альфа/бета/гамма; Интерферон индуцируемый белок (IP-10); Интерлейкин-12; Крингл 5 (фрагмент плазминогена); маримастат; ингибиторы металлопротеиназ (TIMPs); 2-метоксиэстрадиол; MMI 270 (CGS 27023A); MoAb IMC-1C11; неовастат; NM-3; панзем; PI-88; плацентарный ингибитор рибонуклеазы; ингибитор активатора плазминогена; тромбоцитарный фактор-4 (PF4); приномастат; фрагмент пролактина 16 кДа; пролиферин-связанный белок (PRP); PTK 787/ZK 222594; ретиноиды; солимастат; скваламин; SS 3304; SU 5416; SU6668; SU11248; тетрагидрокортизол-S; тетратиомоливдат; талидомид; тромбоспондин-1 (TSP-1); TNP-470; трансформирующий фактор роста-бета (TGF-b); васкулостатин; вазостатин (фрагмент калретикулина); ZD6126; ZD 6474; ингибиторы фарнезилтрансферазы (FTI) и бисфосфонаты.
Противоопухолевые агенты, которые могут использоваться в комбинации с молекулами настоящего изобретения в различных вариантах осуществления настоящего изобретения, включая фармацевтические композиции и лекарственные формы и наборы настоящего изобретения, включают, но не ограничиваются: ацивицин; акларубицин; акодазол гидрохлорид; акронин; адозелезин; альдеслейкин; альтретамин; амбомицин; аметантрон ацетат; аминоглутетимид; амсакрин; анастрозол; антрамицин; аспарагиназа; асперлин; азацитидин; азетепа; азотомицин; батимастат; бензодепа; Бикалутамид; бизантрен гидрохлорид; биснафид димесилат; бизелесин; блеомицин сульфат; брехинар натрия; бропиримин; бусулфан; кактиномицин; калустерон; карацемид; карбитимер; карбоплатин; кармустин; карубицин гидрохлорид; карзелезин; цедефингол; хлорамбуцил; циролемицин; цисплатин; кладрибин; кризнатол мезилат; циклофосфамид; цитарабин; дакарбазин; дактиномицин; даунорубицин гидрохлорид; децитабин; дексормаплатин; дезагуанин; дезагуанин мезилат; диазигуон; доцетаксел; доксорубицин; доксорубицин гидрохлорид; дролоксифен; дролоксифен цитрат; дромостанолон пропионат; дуазомицин; идатрексат; эфлорнитин гидрохлорид; эльзамитруцин; энлоплатин; энпромат; эпипропидин; эпирубицин гидрохлорид; эрбулозол; эзорубицин гидрохлорид; эстрамустин; эстрамустина фосфат натрия; этанидазол этопозид; этопозид фосфат; этоприн; фадрозол гидрохлорид; фазарабин; фенретинид; флоксуридин; флударабин фосфат; фторурацил; флуроцитабин; фосхидон; фостриецин натрийя; гемцитабин; гемцитабин гидрохлорид; гидроксимочевина; идарубицин гидрохлорид; ифосфамид; илмофозин; интерлейкин II (включая рекомбинантный интерлейкин II, или rIL2), интерферон альфа-2a; интерферон альфа-2b; интерферон альфа-n1; интерферон альфа-n3; интерферон бета-I a; интерферон гамма-I b; ипроплатин; иринотекан гидрохлорид; ланреотид ацетат; летрозол; леупролид ацетат; лиарозол гидрохлорид; лометрексол натрия; ломустин; лозоксантрон гидрохлорид; мазопрокол; майтансин; хлорметин гидрохлорид; мегестрол ацетат; меленгестрол ацетат; мелфалан; меногарил; меркаптопурин; метотрексат; метотрексат натрия; метоприн; метуредепа; митиндомид; митокарцин; митокромин; митогиллин; митомалцин; митомицин; митоспер; митотан; митоксантрон гидрохлорид; микофенольная кислота; нокодазол; ногаломицин; ормаплатин; оксизуран; паклитаксел; пэгаспаргаза; пелиомицин; пентамустин; пепломицин сульфат; перфосфамид; пипоброман; пипосульфан; пироксантрон гидрохлорид; пликамицин; пломестан; порфимер натрия; порфиромицин; преднимустин; прокарбазин гидрохлорид; пуромицин; пуромицин гидрохлорид; пуразофурин; рибоприн; роглетимид; сафингол; сафингол гидрохлорид; семустин; симтразен; спарфозат натрия; спарзомицин; спирогерманий гидрохлорид; спиромустин; спироплатин; стрептонигрин; стрептозоцин; сулофенур; тализомицин; текогалан натрия; тегафур; телоксантрон гидрохлорид; темопорфин; тенипозид; тероксирон; тестолактон; тиамиприн; тиогуанин; тиотепа; тиазофурин; тирапазамин; торимифен цитрат; трестолон ацетат; трицирибин фосфат; триметрексат; триметрексат глюкуронат; трипторелин; тубулозол гидрохлорид; урацил горчицы; уредепа; вапреотид; вертепорфин; винбластин сульфат; винкристин сульфат; виндезин; виндезин сульфат; винепидин сульфат; винглицинат сульфат; винлеурозин сульфат; винорелбин тартрат; винрозидин сульфат; винзолидин сульфат; ворозол; зениплатин; зиностатин; зорубицин гидрохлорид. Другие противоопухолевые лекарственные средства включают, но не ограничиваются: 20-эпи-1,25 дигидроксивитамин D3; 5-этинилурацил; абиратерон; акларубицин; ацилфульвен; адеципенол; адозелезин; альдеслейкин; ALL-TK антагонисты; альтретамин; амбамустин; амидакс; амифостин; аминолевуленовая кислота; амрубицин; амсакрин; анагрелид; анастрозол; ирографолид; ингибиторы ангиогенеза; антагонист D; антагонист G; антареликс; портиво дорсализирующий морфогенетический белок-1; антиандроген,  карцинома предстательной железы; антиэстроген; антинеопластон; антисмысловые олигонуклеотиды; афидиколин глицинат; модуляторы гена апоптоза; регуляторы апоптоза; апуриновая кислота; ара-CDP-DL-PTBA; аргинин диаминаза; азулакрин; атаместан; атримустин; аксинастин 1; аксинастин 2; аксинастин 3; азасетрон; азатоксин; азатирозин; баккатин III производные; баланол; батимастат; BCR/ABL антагонисты; бензохолины; бензоилстауроспорин; производные бета лактама; бета-алетин; бетакламицин B; бетулиновая кислота; bFGF ингибитор; бикалутамид; бизантрен; бизазиридинилспермин; бизнафид; бистратен A; бизелезин; брефлат; бропиримин; будотитан; бутионин сульфоксимин; кальципотриол; калфостин С; производные камптотецина; канарипокс IL-2; капецитабин; карбоксамид-амино-триазол; карбоксиамидотриазол; CaRest M3; CARN 700; ингибитор, полученный из хряща; карзелезин; ингибиторы казеинкиназы (ICOS); кастаноспермин; цекропин В; цетрореликс; хлорины; хлорхиноксалин сульфонамид; цикапрост; цис-порфирин; кладрибин; аналоги кломифена; клотримазол; коллимицин А; коллимицин В; комбретастатин А4; аналог комбретастатин; конагенин; крамбесцидин 816; криснатол; криптофицин 8; производные криптофицина А; курацин А; циклопентантрахиноны; циклоплатам; ципемицин; цитарабин окфосфат; цитолитический фактор; цитостатин; дакликсимаб; децитабин; дегидродидемнин В; деслорелин; дексаметазон; дексифосфамид; дексразоксан; дексверапамил; диазихион; дидемнин В; дидокс; диэтилнорспермин; дигидро-5-азацитидин; дигидротаксол 9-; диоксамицин; дифенилспиромустин; доцетаксел; докозанол; долазетрон; доксифлуридин; дролоксифен; дронабинол; дуокармицин SA; эбселен; экомустин; эделфозин; эдреколомаб; эфлорнитин; элемен; эмитефур; эпирубицин; эпристерид; аналог эстрамустина; агонисты эстрогена; антагонисты эстрогена; этанидазол; этопозид фосфат; эксеместан; фадрозол; фазарабин; фенретинид; филграстим; финастерид; флавопиридол; флезеластин; флуастерон; флударабин; фтордауноруницин гидрохлорид; форфенимекс; форместан; фостриецин; фотемустин; гадолиний тексафирин; галлий нитрат; галоцитабин; ганиреликс; ингибиторы желатиназы; гемцитабин; ингибиторы глутитиона; гепсульфам; герегилин; гексаметилен бисацетамид; гиперицин; ибандроновая кислота; идарубицин; идоксифен; идрамантон; илмофозин; иломастат; имидозоакридоны; имихимод; иммуностимулирующие пептиды; ингибитор рецептора инсулин-подобного фактора роста-1; агонисты интерферона; интерфероны; интерлейкины; иобенгуан; иододоксорубицин; ипомеанол 4-; ироплакт; ирсогладин; изобенгазол; изогомогаликондрин В; итасетрон; джасплакинолид; кагалалид F; ламелларин-N триацетат; ланреотид; леинамицин; ленограстим; лентинан сульфат; лептостатин; летрозол; ингибирующий лейкоз фактор; лейкоцитарный альфа-интерферон; лейпролид + эстроген + прогестерон; лейпрорелин; левамизол; лиарозол; линейный аналог полиамина; липофильный дисахаридный пептид; липофильные соединения платины; лиссоклинамид 7; лобаплатин; ломбрицин; лометрексол; линидамин; лозоксантрон; ловастатин; локсорибин; луртотекан; литий тексафирин; лизофиллин; литические пептиды; маитазин; манностатин А; маримастат; мазопрокол; маспин; ингибиторы матрилизинов; ингибиторы матриксных металлопротеиназ; меногарил; мербарон; метерелин; метиониназу; метоклопрамид; ингибитор MIF; мифепристон; милтефозин; миримостин; несоответствующая двухнитевая РНК; митогуазон; митолактол; аналоги митомицина; митонафид; митотоксин; сапорин-фактор роста фибробластов; митоксантрон; мофаротен; молграмостин; моноклональные антитела; хорионический гонадотропин человека; монофосфорил липид А+клеточная стенка миобактерий sk; мопидамол; ингибитор гена мультилекарственной резистентности; политерапия на основе опухолевого супрессора-1; ипритное противораковое вещество; микапероксид В; экстракт клеточной стенки микобактерий; мириапорон; N-ацетилдиналин; N-замещенные бензамиды; нафарелин; нагрестип; налоксон + пентазоцин; напавин; нафтерпин; нартограстим; недаплатин; неморубицин; неридроновую кислоту; нейтральную эндопептидазу; нилутамид; низамицин; модуляторы оксида азота; нитроксидный антиоксидант; нитруллин; О6-бензилгуанин; октреотид; окиценон; олигонуклеотиды; онапристон; ондансетрон; ондансетрон; орацин; пероральный цитокиновый индуктор; ормаплатин; озатерон; оксалиплатин; оксауномицин; паклитаксел; аналоги паклитакселя; производные паклитакселя; палауамин; пальмитоилгизоксин; памидроновую кислоту; панакситриол; паномифен; парабактин; пазеллиптин; пегаспарагазу; пелдезин; пентосан полисульфат натрия; пентостатин; пентрозол; перфлуброн; перфосфамид; периллиловый спирт; феназиномицин; фенилацетат; ингибиторы фосфатазы; пицибанил; пилокарпин гидрохлорид; пирарубицин; пиритрексим; плацетин А; плацетин В; ингибитор активатора плазминогена; платиновый комплекс; соединения платины; комплекс платина-триамин; порфимер натрия; порфиромицин; преднизолон; пролил-бис-акридон; простагландин J2; ингибиторы протеасом; иммунный модулятор на основе белка А; ингибитор протеинкиназы С; ингибиторы протеинкиназы С; микроалгал; белковые ингибиторы тирозинфосфатазы; ингибиторы пириннуклеозидфосфорилазы; пурпурины; пиразолоакридин; пиридоксилированный конъюгат гемоглобин-полиоксиэтилен; антагонисты raf; ралтитрексед; рамосетрон; ингибиторы ras-фарнезил-протеинтрансферазы; ингибиторы ras; ингибитор ras-GAP; деметилированный ретеллиптин; рений Re 186 этидронат; ризоксин; ризозимы; ретинамид RII; роглетимид; рогитукин; ромуртид; рохинимекс; рубигинон В1; рубоксил; сафингол; саинтопин; SarCNU; саркофитол А; сарграмостим; миметики Sdi 1; семустин; ингибитор 1 старения; смысловые олигонуклеотиды; ингибиторы сигнальной трансдукции; модуляторы сигнальной трансдукции; одноцепочечный антигенсвязывающий белок; сизофиран; собузоксан; борокаптат натрия; фенилацетат натрия; солверол; соматомедин-связывающий белок; сонермин; спарфозивую кислоту; спикамицин D; спиромустин; спленопентин; спонгистатин 1; свкалмин; ингибитор стволовых клеток; ингибиторы деления стволовых клеток; стипиамид; ингибиторы стромелизина; сульфинозин; сверхактивный антагонист вазоактивного интестинального пептида; сурадиста; сурамин; сваинсонин; синтетические глюкозамингликаны; таллимустин; тамоксифен метиодид; тауромустин; тазаротен; текогалан натрий; тегафур; теллурапирилий; ингибиторы теломеразы; темопорфин; темозоломид; тенипозид; тетрахлордекаоксид; тетразомин; талибластин; тиокаралин; тромбопоэтин; тромбопоэтин-миметик; тималфазин; агонист рецептора тимопоэтина; тимотринан; тироид-стимулирующий гормон; тин-этил-этиопурпурин; тирапазамин; титаносен бихлорид; топсентин; торемифен; тотипотентный фактор стволовых клеток; ингибиторы трансляции; третиноин; триацетилуридин; трицирибин; триметрексат; триптогелин; трописетрон; туростерид; ингибиторы тирозинкиназы; тирфостины; ингибиторы UBC; убенимекс; ингибиторный фактор роста мочеполового синуса; антагонисты рецептора урокиназы; вапреотид; вариолин В; векторная система; эритроцитная генная терапия; веларезол; верамин; вердины; вертепорфин; винорелбин; винксалтин; витаксин; ворозол; занотерен; зениплатин; зиласкорб и зиностатин стималамер. Предпочтительнми дополнительными противоопухолевыми лекарственными средствами являются 5-фторурацил и лейковорин.
2
Таблице 10
Примеры терапевтических антител, которые могут использоваться в способах настоящего изобретения включают, но не ограничиваясь, ЗЕНАПАКС (даклизумаб) (Roche Pharmaceuticals, Switzerland), которое является иммуносупрессивным, человеческим анти-CD25 моноклональным антителом для предотвращения острого отторжения аллотрансплантата почки; ПАНОРЕКС™, который является мышиным анти-17-IA клеточным поверхностным антигеном IgG2a антитела (Glaxo Wellcome/Centocor); BEC2 - мышиное антиидиотипическое (GD3 эпитоп) IgG антитело (ImClone System); IMC-C225 - химерное анти-EGFR IgG антитело (ImClone System); ВИТАКСИН™ - человеческий анти-αVβ3 интегрин антитело (Applied Molecular Evolution/MedImmune); Smart M195 - человеческое анти-CD33 IgG антитело (Protein Design Lab/Kanebo); ЛИМФОЦИД™ - человеческое анти-CD22 IgG антитело (Immunomedics); ICM3 - человеческое анти-ICAM3 антитело (ICOS Pharm); IDEC-114 - анти-CD80 антитело приматов (IDEC Pharm/Mitsubishi); IDEC-131 - человеческое анти-CD40L антитело (IDEC/Eisai); IDEC-151 - анти-CD4 антитело приматов (IDEC); IDEC-152 анти-CD23 антитело приматов (IDEC/Seikagaku); SMART анти-CD3 - человеческий анти-CD3 IgG (Protein Design Lab); 5G1.1 - человеческое анти-комплемент фактор 5 (C5) антитело (Alexion Pharm); D2E7 - человеческое анти-TNF-α антитело (CAT/BASF); CDP870 - человеческий анти-TNF-α Fab фрагмент (Celltech); IDEC-151 анти-CD4 IgG1 антитело приматов (IDEC Pharm/SmithKline Beecham); MDX-CD4 - человеческое анти-CD4 IgG антитело (Medarex/Eisai/Genmab); CDP571 - человеческое анти-TNF-α IgG4 антитело (Celltech); LDP-02 - человеческое анти-α4β7 антитело (LeukoSite/Genentech); ортоклон OKT4A - человеческое анти-CD4 IgG антитело (Ortho Biotech); АНТОВА™ - человеческое анти-CD40L IgG антитело (Biogen); АНТЕГРЕН™ - человеческое анти-VLA-4 IgG антитело (Elan) и CAT-152 - человеческое анти-TGF-β антитело (Cambridge Ab Tech). Другие примеры, которые могут использоваться в соответствии с данным изобретением, представлены в .
6.4.2 АУТОИММУННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ И ВОСПАЛИТЕЛЬНЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
например
В некоторых вариантах осуществления, молекулы настоящего изобретения содержат вариантный Fc-участок, имеющий один или несколько аминокислотных модификаций в одном или нескольких участках, что увеличивает афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB, но снижает афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA и/или FcγRIIA. Молекулы настоящего изобретения с такими характеристиками связывания полезны при регуляции имунного ответа, , в ингибировании имунного ответа по отношению к аутоиммунным заболеваниям или воспалительным заболеваниям. Хотя нет предположений, связанных с каким либо механизмом действия, молекулы настоящего изобретения с усилением афинности для FcγRIIB и снижением афинности для FcγRIIIA и/или FcγRIIA могут приводить к ослаблению активационного ответа FcγR и ингибированию клеточной ответной реакции.
т.е.
например
В некоторых вариантах осуществления, молекула настоящего изобретения содержащая вариантный Fc-участок не является иммуноглобулином, и содержит, по меньшей мере, одну аминокислотную модификацию, которая увеличивает афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB также как и молекула, содержащая Fc-участок дикого типа. В других вариантах осуществления, указанные молекулы дополнительно содержат однун или несколько аминокислотных модификаций, которые снижают афинность молекулы для  активированной FcγR. В некоторых вариантах осуществления, молекула является растворимым (, мембрано не связанным) Fc-участком. Настоящее изобретение предполагает другие аминокислотные модификации в растворимом Fc-участке, которые модулируют его афинность для различных Fc рецепторов, включая те, что известны специалистам в данной области как описанные в данном документе. В других вариантах осуществления, молекула (, Fc-участок, содержащий по меньшей мере одну или несколько аминокислотных модификаций) модифицируется с использованием техники, известной специалистам в данной области и что описано в данном документе, что увеличивает in vivo период полужизни Fc-участка. Такие молекулы имеют терапевтическую пользу при лечении и/или предотвращении аутоимунных заболеваний. Хотя не предполагается связь с любыми механизмами действия, такие молекулы с повышенной афинностью для FcγRIIB должны привести к затуханию активационных рецепторов и таким образом к затуханию имунного ответа, и оказывать терапевтическую эффективность для лечения и/или предотвращения аутоимунного нарушения.
В определенных вариантах осуществения, одна или несколько аминокислотных модификаций, которые увеличивают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB, но снижают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA, содержат замещение в положении 246 с треонином и в положении 396 с гистидином; или замещение в положении 268 с аспарагиновой кислотой и в положении 318 с аспарагиновой кислотой; или замещение в положении 217 с серином, в положении 378 с валином, и в положении 408 с аргинином; или замещение в положении 375 с цистеином и в положении 396 с лейцином; или замещение в положении 246 с изолейцином и в положении 334 с аспарагином. В одном варианте осуществления, один или несколько аминокислотных модификаций, которые увеличивают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB, но снижают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA, содержат замещение в положении 247 с лейцином. В другом варианте осуществления, один или несколько аминокислотных модификаций, которые увеличивают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB, но снижают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA, содержат замещение в положении 372 с тирозином. В еще одном варианте осуществления, один или несколько аминокислотных модификаций, которые увеличивают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB, но снижают афинность вариантного t Fc-участка для FcγRIIIA, содержат замещение в положении 326 с глутаминовой кислотой. В одном варианте осуществления, один или несколько аминокислотных модификаций, которые увеличивают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIB, но снижают афинность вариантного Fc-участка для FcγRIIIA, содержат замещение в положении 224 с лейцином.
Вариантные Fc-участки, которые имеют повышенную афинность для FcγRIIB и пониженную афинность для FcγRIIIA и/или FcγRIIA, схожи с молекулой, содержащей Fc-участок дикого типа, могут быть использованы для лечения или предотвращения аутоиммунных заболеваний или воспалительных заболеваний. Настоящее изобретение обеспечивает способы предотвращения, лечения, или контроля за одним или несколькими симптомами, связанными с аутоиммунными или воспалительными нарушениями у субъекта, применяющего терапевтически или профилактически эффективное количество одной или нескольких молекул настоящего изобретения с вариантным Fc-участком, который имеет повышенную афинность для FcγRIIB и пониженную для FcγRIIIA и или FcγRIIA схожую молекулу, содержащую Fc-участок дикого типа.
Настоящее изобретение также обеспечивает способы для предупреждения, лечения, или контроля за одним или несколькими симптомами связанными с воспалительным нарушением у субъекта, дополнительно получающего терапевтически или профилактически эффективное количество одного или нескольких противовоспалительных агентов. Настоящее изобретение также обеспечивает способы для предупреждения, лечения, или контроля за одним или несколькими симптомами, связанными с аутоиммунным заболеванием, при получении субъектом терапевтически или профилактически эффективных количеств одного или нескольких иммуномодуляторных агентов. Пункт6.4.2.1обеспечивает неограниченные примеры противовоспалительных агентов и иммуномодуляторных агентов.
Примеры аутоиммунных расстройств, которые могут лечиться применением молекулы настоящего изобретения включают, но не ограничиваясь, гнездная алопеция, анкилозирующий спондилит, антифосфолипидный синдром, аутоиммунное заболевание Аддисона, аутоиммунные заболевания надпочечников, аутоиммунная гемолитическая анемия, аутоиммунный гепатит, аутоиммунное воспаление придатков и воспаление семенников, аутоиммунная тромбоцитопения, болезнь Бехчета, буллёзный пемфигоид, кардиомиопатия, целиакция спру-дерматит, хронический дисфункциональный имунный синдром усталости (CFIDS), хроническая воспалительная демиелинизирующая полинейропатия, синдром Черджа-Строса, рубцовый пемфигоид, CREST синдром, болезнь холодовых агглютининов, болезнь Крона, дискоидная волчанка, эссенциальная смешанная криоглобулинемия, фибромиалгия-фибромиозит, гломерулонефрит, базедова болезнь, Гийена - Барре, тиреоидит Хашимото, идиопатический фиброз легких, идиопатическая тромбоцитопенийная пурпура (ITP), IgA нейропатия, синдром Стилла, красный плоский лишай, красная волчанка, болезнь Ménière, смешанное заболевание соединительной ткани, рассеянный склероз, 1 типа или имуннообусловленный сахарный диабет, миастения гравис, обыкновенная пузырчатка, пернициозная анемия, нодозный полиартериит, воспаление хрящей, плюригландулярный сидром, ревматическая полимиалгия, полимиозит и дерматомиозит, первичная агаммаглобулинемия, билиарный первичный цирроз печени, псориаз, псориатический артрит, виброболезнь, синдром Рейтера, ревматоидный артрит, саркоидоз, склеродерма, синдром Sjögren', синдром мышечной скованности, системная красная волчанка, красная волчанка, болезнь отсутствия пульса, темпоральный артериит/ гигантоклеточный артериит, неспецифический язвенный колит, увеит, васкулит, такой как герпетиформный васкулярный дерматит, витилиго и гранулематоз Вегенера. Примеры воспалительных расстройства включают, но не ограничиваясь, астма, энцефалит, воспалительное заболевание кишечника, хроническое обструктивное заболевание легких (COPD), аллергические расстройства, септический шок, фиброз лёгких, недиферинцированная спондилоартропатия, недиферинцированная артропатия, артрит, воспалительный остеолиз и хроническое воспаление, являющееся результатом хронической вирусной или бактериальной инфекций. Как описано в данном документе в пункте 3.2.2, некоторые аутоиммунные расстройства связаны с воспалительным состоянием. Таким образом, здесь наблюдается пересечение между тем, что считается аутоимунным заболеванием и тем, что характеризуется как воспалительные нарушения. Следовательно, некоторые аутоиммунные расстройства могут так же быть охарактеризованы как воспалительные расстройства. Примеры воспалительных расстройств, которые могут быть предупреждены, вылечены или скорректированы в соответствии со способами настоящего изобретения включают, но не ограничиваясь, астма, энцефалит, воспалительное заболевание кишечника, хроническое обструктивное заболевание легких (COPD), аллергические расстройства, септический шок, фиброз легких, недифференцированный спондилоартропатия, недифференцированная артропатия, артрит, воспалительные остеолиз и хроническое воспаление, являющееся результатом хронической вирусной или бактериальной инфекций.
Молекулы настоящего изобретения с вариантными Fc-участками, которые имеют повышенную афинность для FcγRIIB и пониженную афинность для FcγRIIIA по отношению к сравниваемой молекуле, содержащей Fc-участок дикого типа, могут также быть использованы для снижения воспаления у опытных животных, особенно млекопитающих, с воспалительными расстройствами. В специфическом варианте осуществления, молекула настоящего изобретения снижает воспаление у животного на по меньшей мере 99%, на по меньшей мере 95%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 45%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 45%, по меньшей мере на 35%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 25%, по меньшей мере на 20%, или по меньшей мере на 10% относительно воспаления у животного, которым не применяли указанные молекулы.
Молекулы настоящего изобретения с вариантными Fc-участками, которые имеют повышенную афинность для FcγRIIB и пониженную афинность для FcγRIIIA, по отношению к сравниваемой молекуле, содержащей Fc-участок дикого типа, могут так же быть использованы для предотвращения отторжения трансплантатов.
Таблице 11
Таблице 12
Настоящее изобретение так же рассматривает разработку любых антител, известных на данном уровне техники для лечения и/или предупреждения аутииммунных или воспалительных заболеваний, таким образом, чтобы антитела содержали вариантный Fc-участок, содержащий один или несколько аминокислотных модификаций, которые идентифицируются способами настоящего изобретения и имеют повышенную афинность для FcγRIIB и сниженную афинность для FcγRIIIA, по отношению к сравниваемой молекуле, содержащей Fc-участок дикого типа. Неограниченный пример антител, которые используются для лечения или предупреждения воспалительных расстройств, которые могут быть разработаны по настоящему изобретению представлены в , и неограниченный пример антител, которые используются для лечения или предупреждения аутоимунног заболевания представлен в .
ТАБЛИЦА 11: АНТИТЕЛА ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ И АУТОИММУННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ, КОТОРЫЕ МОГУТ БЫТЬ СКОНСТРУИРОВАННЫ В СООТВЕТСТВИИ С НАСТОЯЩИМ ИЗОБРЕТЕНИЕМ
<b>Название антитела</b>
<b>Целевой антиген</b>
<b>Тип продукта</b>
<b>Изотип</b>
<b>Спонсоры</b>
<b>Показание</b>
<b>5G1.1</b>
Комплемент (C5)
Гуманизированный
IgG
Alexion Pharm Inc
Ревматоидный артрит
<b>5G1.1</b>
Комплемент (C5)
Гуманизированный
IgG
Alexion Pharm Inc
SLE
<b>5G1.1</b>
Комплемент (C5)
Гуманизированный
IgG
Alexion Pharm Inc
Нефрит
<b>5G1.1-SC</b>
Комплемент (C5)
Гуманизированный
ScFv
Alexion Pharm Inc
Экстрапульмональное кровообращение
<b>5G1.1-SC</b>
Комплемент (C5)
Гуманизированный
ScFv
Alexion Pharm Inc
Инфаркт миокарда
<b>5G1.1-SC</b>
Комплемент (C5)
Гуманизированный
ScFv
Alexion Pharm Inc
Ангиопластика
<b>ABX-CBL</b>
CBL
Человеческий
Abgenix Inc
Реакция ТПХ
<b>ABX-CBL</b>
CD147
Мышиный
IgG
Abgenix Inc
Отторжение аллотрансплантата
<b>ABX-IL8</b>
IL-8
Человеческий
IgG2
Abgenix Inc
Псориаз
<b>Antegren</b>
VLA-4
Гуманизированный
IgG
Athena/Elan
Рассеянный склероз
<b>Anti-CD11a</b>
CD11a
Гуманизированный
IgG1
Genentech Inc/Xoma
Псориаз
<b>Anti-CD18</b>
CD18
Гуманизированный
Fab'2
Genentech Inc
<b>И</b>нфаркт миокарда
<b>Anti-LFA1</b>
CD18
Мышиный
Fab'2
Pasteur-Merieux/Immunotech
Отторжение аллотрансплантата
<b>Antova</b>
CD40L
Гуманизированный
IgG
Biogen
Отторжение аллотрансплантата
<b>Antova</b>
CD40L
Гуманизированный
IgG
Biogen
SLE
<b>BTI-322</b>
CD2
Крысиный
IgG
Medimmune Inc
Реакция ТПХ, Псориаз
<b>CDP571</b>
TNF-alpha
Гуманизированный
IgG4
Celltech
Болезнь Крона
<b>CDP571</b>
TNF-alpha
Гуманизированный
IgG4
Celltech
Ревматоидный артрит
<b>CDP850</b>
E-selectin
Гуманизированный
Псориаз
Псориаз
<b>Название антитела</b>
Целевой антиген
Тип продукта
Изотип
Спонсоры
Показание
<b>Corsevin M</b>
Fact VII
Химерный
Centocor
Антикоагулянт
<b>D2E7</b>
TNF-alpha
Человеческий
CAT/BASF
Ревматоидный артрит
<b>Hu23F2G</b>
CD11/18
Гуманизированный
ICOS Pharm Inc
Рассеянный склероз
<b>Hu23F2G</b>
CD11/18
Гуманизированный
IgG
ICOS Pharm Inc
Stroke
<b>IC14</b>
CD14
ICOS Pharm Inc
Токсический шок
<b>ICM3</b>
ICAM-3
Гуманизированный
ICOS Pharm Inc
Псориаз
<b>IDEC-114</b>
CD80
Приматизированный
IDEC Pharm/Mitsubishi
Псориаз
<b>IDEC-131</b>
CD40L
Гуманизированный
IDEC Pharm/Eisai
SLE
<b>IDEC-131</b>
CD40L
Гуманизированный
IDEC Pharm/Eisai
Рассеянный склероз
<b>IDEC-151</b>
CD4
Приматизированный
IgG1
IDEC Pharm/GlaxoSmithKline
Ревматоидный артрит
<b>IDEC-152</b>
CD23
Приматизированный
IDEC Pharm
Астма/Аллергия
<b>Infliximab</b>
TNF-alpha
Химерный
IgG1
Centocor
Ревматоидный артрит
<b>Infliximab</b>
TNF-alpha
Химерный
IgG1
Centocor
Болезнь Крона
<b>LDP-01</b>
beta2-integrin
Гуманизированный
IgG
Millennium Inc (LeukoSite Inc.)
Stroke
<b>LDP-01</b>
beta2-integrin
Гуманизированный
IgG
Millennium Inc (LeukoSite Inc.)
Отторжение аллотрансплантата
<b>LDP-02</b>
alpha4beta7
Гуманизированный
Millennium Inc (LeukoSite Inc.)
Неспецифический язвенный колит
<b>MAK-195F</b>
TNF alpha
Мышиный
Fab'2
Knoll Pharm, BASF
Токсический шок
<b>MDX-33</b>
CD64 (FcR)
Человеческий
Medarex/Centeon
Аутоиммунные гемолитическиерасстройства
<b>MDX-CD4</b>
CD4
Человеческий
IgG
Medarex/Eisai/Genmab
Ревматоидный артрит
<b>MEDI-507</b>
CD2
Гуманизированный
Medimmune Inc
Псориаз
<b>MEDI-507</b>
CD2
Гуманизированный
Medimmune Inc
Реакция ТПХ
<b>OKT4A</b>
CD4
Гуманизированный
IgG
Ortho Biotech
Отторжение аллотрансплантата
<b>OrthoClone OKT4A</b>
CD4
Гуманизированный
IgG
Ortho Biotech
Аутоиммунное заболевание
<b>Orthoclone/</b><b>anti-CD3 OKT3</b>
CD3
Мышиный
mIgG2a
Ortho Biotech
Отторжение аллотрансплантата
<b>Название антитела</b>
Целевой антиген
Тип продукта
Изотип
Спонсоры
Показание
<b>RepPro/</b><b>Abciximab</b>
gpIIbIIIa
Химерный
Fab
Centocor/Lilly
Осложнение коронарной ангиопластики
<b>rhuMab-E25</b>
IgE
Гуманизированный
IgG1
Genentech/Novartis/Tanox Biosystems
Астма/Аллергия
<b>SB-240563</b>
IL5
Гуманизированный
GlaxoSmithKline
Астма/Аллергия
<b>SB-240683</b>
IL-4
Гуманизированный
GlaxoSmithKline
Астма/Аллергия
<b>SCH55700</b>
IL-5
Гуманизированный
Celltech/Schering
Астма/Аллергия
<b>Simulect</b>
CD25
Химерный
IgG1
Novartis Pharm
Отторжение аллотрансплантата
<b>SMART</b><b>a-CD3</b>
CD3
Гуманизированный
Белок Design Lab
Аутоиммунное заболевание
<b>SMART</b><b>a-CD3</b>
CD3
Гуманизированный
Белок Design Lab
Отторжение аллотрансплантата
<b>SMART</b><b>a-CD3</b>
CD3
Гуманизированный
IgG
Белок Design Lab
Псориаз
<b>Zenapax</b>
CD25
Гуманизированный
IgG1
Белок DesignLab/Hoffman-La Roche
Отторжение аллотрансплантата
ТАБЛИЦА 12: АНТИТЕЛА ДЛЯ АУТОИММУННЫХ РАССТРОЙСТВ, КОТОРЫЕ МОГУТ БЫТЬ СКОНСТРУИРОВАННЫ В СООТВЕТСТВИИ С НАСТОЯЩИМ ИЗОБРЕТЕНИЕМ
<b>Антитело</b>
<b>Показание</b>
<b>Целевой атиген</b>
<b>ABX-RB2</b>
антитело к CBL антигену на T клетки, B клетки и NK клеткиполностью антитела человека от Xenomouse
<b>5c8 (Анти CD-40 антитело к лиганду)</b>
Испытания Фазы II были прекращены в октябре 99 года изучением “побочных реакций”
CD-40
<b>IDEC 131</b>
Системная красная волчанка (SLE)
анти CD40гуманизированный
<b>IDEC 151</b>
Ревматоидный артрит
приматизированный ; анти-CD4
<b>IDEC 152</b>
Астма
приматизированный; анти-CD23
<b>IDEC 114</b>
Псориаз
приматизированный анти-D80
<b>MEDI-507</b>
ревматоидный артрит; рассеянный склероззаболевание Кронапсориаз
анти-CD2
<b>LDP-02 (анти-b7 mAb)</b>
воспалительное заболевание кишечниказаболевание Кронанеспецифический язвенный колит
a4b7 рецептор интегрина на «белые кровяные тельца» (лейкоциты)
<b>SMART Анти-Гамма антитело к интерферону</b>
аутоимунные расстройства
Анти-гамма интерферон
<b>Вертепортин</b>
ревматоидный артрит
<b>MDX-33</b>
заболевания крови вызванные аутоиммунными реакциямиидиопатическая тромбоцитопеническая пурпура (ИТП)аутоиммунная гемолитическая анемия
моноклональное антитело против FcRI рецепторов
<b>MDX-CD4</b>
лечение ревматоидного артрита и других аутоиммунных реакций
моноклональное антитело против молекулы CD4 рецептора
<b>VX-497</b>
аутоимунные расстройстварассеянный склерозревматоидный артритвоспалительное заболевание кишечникаволчанкапсориаз
ингибитор инозина монофосфатдегидрогеназа(фермент, необходим для создания новых РНК и ДНК, используемых в созданиинуклеотидов, необходимых для пролиферации лимфоцитов)
<b>Антитело</b>
Показание
Целевой атиген
<b>VX-740</b>
ревматоидный артрит
ингибитор ИЭСинтерлейкин-1 бэта (превращающий фермент контролируетпуть, ведущий к агрессивному иммунному ответу)
<b>VX-745</b>
Специфичные для воспаленияУчаствующие в химической сигнализации иммунного ответаначало и прогресирование воспаления
ингибитор P38MAP киназамитоген активированный белок (киназа)
<b>Энбрел (этанерцепт)</b>
целевые TNF (фактор некроза опухоли)
<b>IL-8</b>
полностью человеческое моноклональное антитело против IL-8 (интерлейкин 8)
<b>Apogen MP4</b>
рекомбинантный антигенвыборочно разрушает заболевание, связанное с индукцией апоптоза T-клеток, включая апоптозT-клеток, устраненные запрограммированной гибелью клетки больше не атакой собственных клеток организмаспецифическими apogens целевыми специфическими T-клетками
6.4.2.1 ИММУНОМОДУЛЯТОРНЫЕ АГЕНТЫ И ПРОТИВОВОСПАЛИТЕЛЬНЫЕ АГЕНТЫ
например,
например
Настоящее изобретение обеспечивает способы лечения аутоиммунных заболеваний и воспалительных заболеваний, включающие введение молекул с вариантными Fc-участками, имеющих повышенное сродство для FcγRIIB и пониженное сродство для FcγRIIIA и/или FcγRIIA в комплексе с другими лекарственными агентами. Примеры иммуномодуляторных агентов включают, но не ограничиваются метотрексат, Энбрел, ремикад™, лефлуномид, циклофосфамид, циклоспорин A и антибиотики макролиды (FK506 (такролимус)), метилпреднизолон (MP), кортикостероиды, стероиды, мофетила микофенолат, рапамицин (Сиролимус), мизорибин, деоксиспергулин, брехинар, malononitriloamindes (, лефлунамид), модуляторы T - клеточного рецептора и модулятор цитокинового рецептора.
например
Противовоспалительные агенты имеют успех в лечении воспалительных и аутоиммунных расстройств, и сейчас существует общее и стандартное лечение для таких расстройств. Любое противовоспалительное средство хорошо известно специалистам в данной области и может использоваться в способах настоящего изобретения. Примерами противовоспалительных средств являются не-стероидные противовоспалительные лекарственные средства (NSAIDs), стероидные противовоспалительные лекарственные средства, бета-агонисты, антихолинергические средства и метил ксантины. Примеры NSAIDs включают, но не ограничиваются, аспирин, ибупрофен, Целекоксиб (CELEBREX™), диклофенак (VOLTAREN™), этодолак (LODINE™), фенопрофен (NALFON™), индометацин (INDOCIN™), кеторалак (TORADOL™), оксапрозин (DAYPRO™), набуметон (RELAFEN™), сулиндак (CLINORIL™), толметин (TOLECTIN™), рофекоксиб (VIOXX™), напроксен (ALEVE™, NAPROSYN™), кетопрофен (ACTRON™) и набуметон (RELAFEN™). Такие NSAID функционируют путем ингибирования циклооксигеназного фермента (, COX-1 и/или COX-2). Примеры стероидных противовоспалительных лекарственных средства включают, но не ограничиваются, глюкокортикоиды, дексаметазон (DECADRON™), кортизон, гидрокортизон, преднизон (DELTASONE™), преднизолон, триамцинолон, азулфидин и эйкозаноиды такие как простагландины, тромбоксаны и лейкотриены.
6.4.3 ИНФЕКЦИОННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
Настоящее изобретение также включает способы для лечения или предотвращения инфекционных заболеваний у пациентов, получающих терапевтически или профилактиески эффективное количество одной или нескольких молекул настоящего изобретения. Инфекционные заболевания которые могут лечиться или предотвращаться молекулами настоящего изобретения, вызываются инфекционными агентами такими как вирусы, бактерии, грибы, простейшие.
Вирусные заболевания которые могут лечиться или предотвращаться с использованием молекул настоящего изобретения в комплексе со способами настоящего изобретения включают, но не ограничиваются, вызваными гепатитом типа А, гепатитом типа B, гепатитом типа C, гриппом, ветрянкой, аденовирусом, герпетической лихорадкой типа I (HSV-I), герпетической лихорадкой типа II (HSV-II), чумой крупного рогатого скота, риновирусом, эховирусом, ротавирусом, респираторным синцитиальным вирусом, вирусом папилломы, паповавирусом, цитомегаловирусом, эхиновирусом, арбовирусом, хантавирусом, вирусом Коксэки, вирусом паротита, вирусом кори, вирусом краснухи, вирусом полиомиелита, оспой, вирусом Эпштейна-Барра, вирусом человеческого иммунодефицита первого I типа (HIV-I), вирусом человеческого иммунодефицита II типа (HIV-II), и агентами таких вирусных заболеваний, как вирусный менингит, энцефалит, тропическая лихорадка или оспа.
Бактериальные заболевания, которые могут лечиться или предотвращаться использованием молекул настоящего изобретения в комплексе со способами настоящего изобретения, которые включают следующие бактерии, но не ограничиваются только ими, это микобактерия риккетсия, микоплазма,  Нейссерия, пневмококк, Borrelia burgdorferi (заболевание Лайма), Bacillus anthracis (сибирская язва), столбняк, стрептококки, стафилококки, микобактерии, коклюш, холера, plague, дифтерия, хламидия, золотистый стафилококк и легионелла.
Заболевания, вызванные простейшими, которые могут лечиться или предотвращаться использованием молекул настоящего изобретения в комплексе со способами настоящего изобретения, которые включают следующие простейшие, но не ограничиваются только ими, это лейшмания, кокцидия, трипаносома или малярия.
Паразитические заболевания, которые могут лечиться или предотвращаться использованием молекул настоящего изобретения в комплексе со способами настоящего изобретения, которые вызываются следующими паразитами, но не ограничиваются только ими, это хламидия и рикеттсия.
например
например
Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecials, Candida albicans, Proteus vulgaris, Staphylococcus viridans и
Pseudomonas aeruginosa)
например
Согласно одному аспекту настоящего изобретения, молекулы настоящего изобретения, содержащие вариантные Fc-участки, имеют повышенную антитело-эффекторную функцию по отношению к инфекционному агенту, , патогенному белку, по отношению к сравниваемой молекуле, содержащей Fc-участок дикого типа. Примерами инфекционных агентов являются, но не ограничиваются только ими, бактерии (, патогены (, B-лимфотропный паповавирус (LPV); Bordatella pertussis; вирус болезни Борна (BDV); бычий короновирус; вирус хориоменингита, вирус тропической лихорадки; E. coli; эбола; ЕСНО-вирус 1; ЕСНО-вирус-11 (EV); эндотоксин (LPS); энтеробактерии; ЕСНО-вирус; энтеровирусы; вирус лейкемии кошек; вирус ящура; вирус лейкоза гиббонов (GALV); Грам-отрицательные бактерии ; Helicobacter pylori; вирус гепатита В (HBV); вирус герпеса; HIV-1; цитомегаловирус человека; короновирус человека; грипп A, B & C ; легионелла; Leishmania mexicana; листерия моноцитогенная; вирус кори; Meningococcus; вирус гепатита мышей; вирус лейкемии мышей; мышиный гамма герпетический вирус; мышиный ретровирус; мышиный коронавирус, вирус гепатита мышей; Mycobacterium avium-M; Нейссерия гонореи; вирус псевдочумы; парвовирус B19; Plasmodium falciparum; вирус чумы; Pseudomonas; ротавирус; Samonella typhiurium; Shigella; Streptococci; T-клеточный лимфотропный вирус 1; вирус коровьей оспы).
В специфических вариантах осуществления, молекулы настоящего изобретения усиливают эффективность лечения инфекционных заболеваний путем усиления фагоцитоза и/или опсонизации инфекционных агентов, приводящих к инфекционным заболеваниям. В другом специфическом варианте осуществления, молекулы настоящего изобретения усиливают эфективность лечения инфекционных заболеваний путем усиления ADCC инфицированных клеток, вызывающих инфекционные заболевания.
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
например
В некоторых вариантах осуществления, молекулы настоящего изобретения могут применяться в комбинации с терапевтически или прифилактически эффективными количествами одного, или как дополнительные терапевтические средства известные специалистам данной области техники для лечения и/или предотвращения инфекционных заболеваний. Настоящее изобретение предполагает применение молекулы настоящего изобретения в комбинации с антибиотиками, известными специалистам данной области техники лечения или предотвращения инфекционных заболеваний. Антибиотики, которые могут использоваться в комбинации с молекулами настоящего изобретения включают, но не ограничиваются, макролиды (, тобрамицин (Tobi)), цефалоспорины (, цефалексин (Keflex), цефрадин (Velosef), цефуроксимин (Ceftin), цефпрозил (Cefzil), цефаклор (Ceclor), цефиксим (Suprax) или цефадроксил (Duricef)), кларитромицины (, кларитромицин (Biaxin)), эритромицинами (, эритромицин (EMycin)), a пенициллины (, пенициллин V (V-Cillin K or Pen Vee K)) или хинолоны (, офлоксацин (Floxin), ципрофлоксацин (Cipro) или норфлоксацин (Noroxin)), аминогликозидные антибиотики (, апрамицин арбекацин, бамбермицин, бутирозин, дибекацин, неомицин, андециленат, нетилмицин, паромомицин, рибостамицин, сисомицин и спектиномицин), амфеникольные антибиотики (, азидамфеникол, хлорамфеникол, флорфеникол и тиамфеникол), ансамициновые антибиотики (, рифамид и рифампин), карбацефемы (, лоракарбеф), карбапенемы (, биапенем и имипенем), цефалоспорины (, цефаклор, цефадроксил, цефамандол, цефатризил, цефазедон, цефозопран, цефпимизол, цефпирамид и цефпиром), цефамицины (, цефбуперазон, цефметазол и цефминокс), монобактамы (, азтреонам, карумонам и тигемонам), оксацефемы (, фломоксеф и моксалактам), пенициллины (, амдиноциллин, амдиноциллин пивоксил, амоксициллин, бакампициллин, бензилпенициллиновая кислота, бензилпенициллин натрия, эпициллин, фенбенициллин, флоксациллин, пенамциллин, пенетамат гидриодид, пенициллин o-бенетамин, пенициллин 0, пенициллин V, пенициллин V бензатин, пенициллин V гидрабамин, пенимепициклин и фенцихиллин калия), линкозамиды (, клиндамицин и линкомицин), амфомицин, бацитрацин, капреомицин, колистин, эндурацидин, энвиомицин, тетрациклины (, апициклин, хлортетрациклин, хломоциклин и демеклоциклин), 2,4-диаминопиримидины (, бродимоприм), нитрофураны (, фуралтадон и фуразолиум хлорид), хинолоны и их аналоги (, циноксацин, клинафлоксацин, флумеквин и грепаглоксацин), сульфонамиды (, ацетил сульфаметилксипиразин, бензилсульфамид, ноприлсульфамид, фталил-сульфацетамид, сульфахризоидин и сульфацитин), сульфоны (, диатимосульфон, глюкосульфон натрия и соласульфон), циклосерин, мупироцин и туберин.
В определенных вариантах осуществения, молекулы настоящего изобретения могут применяться в комбинации с терапевтически или прифилактически эффективными количествами одного или нескольких антигрибковых агентов. Антигрибковые агенты, которые могут использоваться в комбинации с молекулами настоящего изобретения включают, но не ограничиваются, амфотерицин B, итраконазол, кетоконазол, флуконазол, интратекал, флуцитозин, миконазол, бутоконазол, клотримазол, нистатин, терконазол, тиоконазол, циклопирокс, эконазол, галопрогрин, нафтифин, тербинафин, андециленат и грисеофулдин.
В некоторых вариантах осуществления, молекулы настоящего изобретения могут применяться в комбинации с терапевтическими или профилактическими эффективными количествами одного или несколькими антивирусных средств. Полезными антивирусными агентами, которые могут использоваться в комбинации с молекулами настоящего изобретения включают, но не ограничиваясь, ингибиторы протеаз, ингибиторы нуклеозидов обратной транскриптазы, ингибиторы не-нуклеозидов обратной транскриптазы reverse transcriptase и нуклеозидных аналогов. Примеры антивирусных агентов включают, но не ограничиваются, зидовудин, ацикловир, гангцикловир, видарабин, идоксуридин, трифлуридин и рибавирин, а также фоскарнет, амантадин, римантадин, саквинавир, индинавир, ампренавир, лопинавир, ритонавир, альфа-интерфероны; адефовир, клевадин, энтекавир, плеконарил.
6.5 ВАКЦИНОТЕРАПИЯ
Настоящее изобретение дополнительно охватывает применение композиции настоящего изобретения для индуцирования иммунного ответа на антигенное или иммуногенное средство, включая без ограничения антигены злокачественных опухолей и антигены инфекционных заболеваний (примеры которых раскрыты ниже). Вакцинные композиции настоящего изобретения содержат одно или несколько антигенных или иммуногенных средств, к которым желателен иммунный ответ, где одно или несколько антигенных или иммуногенных средств покрыто вариантом антитела настоящего изобретения, которое имеет усиленную аффинность к FcγRIIIA. Не вдаваясь в определенный механизм действия, покрытие антигенным или иммуногенным средством с вариантным антителом настоящего изобретения, которое имеет усиленную аффинность к FcγRIIIA, усиливает иммунный ответ к желаемому антигенному или иммуногенному средству индуцированием гуморального и клеточно-опосредованного ответов. Вакцинные композиции настоящего изобретения особенно эффективны для вызывания иммунного ответа, предпочтительно защитного иммунного ответа на антигенное или иммуногенное средство.
В некоторых вариантах осуществления антигенное или иммуногенное средство в вакцинных композициях настоящего изобретения содержит вирус, на который желателен иммунный ответ. Вирус может быть рекомбинантным или химерным и предпочтительно ослабленным. Производство рекомбинантных, химерных и ослабленных вирусов может быть выполнено с использованием стандартных способов, известных специалисту в данной области. Настоящее изобретение охватывает живую рекомбинантную вирусную вакцину или инактивированную рекомбинантную вирусную вакцину, сформулированную в соответствии с настоящим изобретением. Живая вакцина может быть предпочтительнее, так как размножение в хозяине приводит к длительному стимулу, характером и величиной подобному тому, что происходит при природных инфекциях, и, следовательно, обеспечивает существенный, длительный иммунитет. Производство таких живых рекомбинантных вирусных вакцинных составов может быть выполнено с использованием общепринятых способов, включающих размножение вируса в клеточной культуре или в аллантоисе куриного эмбриона с последующей очисткой.
например
например
В конкретном варианте осуществления рекомбинантный вирус является непатогенным для субъекта, которому он вводится. В связи с этим применение генно-инженерных вирусов для вакцинных целей может потребовать наличие ослабленных характеристик в этих штаммах. Введение соответствующих мутаций (, делеций) в матрицы, применяемые для трансфекции, может обеспечить новые вирусы с ослабленными характеристиками. Например, специфические миссенс-мутации, которые связаны с температурной чувствительностью или холодовой адаптацией, могут быть сделаны мутациями делецией. Эти мутации должны быть более устойчивыми, чем точечные мутации, связанные с холодо- или температурно-чувствительными мутантами, и частоты возврата должны быть крайне низкими. Рекомбинантные ДНК технологии для инженерных рекомбинантных вирусов известны в данной области и охватываются в данном изобретении. Например, методики для модифицирования вирусов с негативной цепью РНК известны в данной области, см., , патент США № 5166057, который включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
Альтернативно, химерные вирусы с «суицидальными» характеристиками могут быть созданы для применения во внутрикожных вакцинных составах настоящего изобретения. Такие вирусы будут проходить только через один или несколько циклов репликации в хозяине. При применении в качестве вакцины рекомбинантный вирус будет проходить ограниченный цикл(ы) репликации и индуцировать достаточный уровень иммунного ответа, но он не будет действовать дальше в человеке-хозяине и вызывать заболевание. Альтернативно, инактивированный (убитый) вирус может быть сформулирован в соответствии с настоящим изобретением. Инактивированные вакцинные составы могут быть получены с использованием стандартных методик для “убийства” химерных вирусов. Инактивированные вакцины являются “мертвыми” в том смысле, что их инфекционность была нарушена. В идеале инфекционность вируса нарушается без влияния на его иммуногенность. Для того, чтобы получить инактивированные вакцины, химерный вирус может быть выращен в клеточной культуре или в аллантоисе куриного эмбриона, очищен зональным ультрацентрифугированием, инактивирован формальдегидом или β-пропиолактоном и объединен.
например
В определенных вариантах осуществления совершенно чужеродные эпитопы, включая антигены, полученные из других вирусных или невирусных патогенов, могут быть встроены в вирус для применения во внутрикожных вакцинных составах настоящего изобретения. Например, антигены неродственных вирусов, таких как ВИЧ (gp160, gp120, gp41) паразитарные антигены (, малярийные), бактериальные или грибковые антигены или опухолевые антигены могут быть встроены в ослабленный штамм.
Фактически, любая гетерологическая генная последовательность может быть сконструирована в химерных вирусах настоящего изобретения для применения во внутрикожных вакцинных составах. Предпочтительно, гетерологические генные последовательности являются частями и пептидами, которые действуют как модификаторы биологического ответа. Предпочтительно эпитопы, которые индуцируют защитный иммунный ответ на любой из ряда патогенов, или антигены, которые связаны нейтрализующими антителами, могут быть экспрессированы или быть частью химерных вирусов. Например, гетерологические генные последовательности, которые могут быть сконструированы в химерных вирусах настоящего изобретения, включают без ограничения гриппа и парагриппа гемагглютинин, нейраминидазу и слитые гликопротеины, такие как HN и F гены человеческого PIV3. В еще одном варианте осуществления гетерологические генные последовательности, которые могут быть встроены в химерные вирусы, включают такие, которые кодируют белки с иммуномодулирующими активностями. Примеры иммуномодулирующих белков включают без ограничения цитокины, интерферон 1 типа, гамма-интерферон, стимулирующие колонии факторы, интерлейкин-1, -2, -4, -5, -6, -12 и антагонисты этих средств.
В других вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает патогенные клетки или вирусы, предпочтительно ослабленные вирусы, которые экспрессируют вариантное антитело на своей поверхности.
В альтернативных вариантах осуществления вакцинные композиции настоящего изобретения содержат слитый полипептид, где антигенное или иммуногенное средство функционально соединено с вариантным антителом настоящего изобретения, которое имеет повышенную аффинность к FcγRIIIA. Конструирование слитых полипептидов для применения в вакцинных композициях настоящего изобретения выполняется с использованием рутинных способов технологии рекомбинантной ДНК и на уровне обычной квалификации.
Настоящее изобретение дополнительно охватывает способы индуцирования устойчивости у субъекта путем введения композиции настоящего изобретения. Предпочтительно композиция, подходящая для индуцирования устойчивости у субъекта, содержит антигенное или иммуногенное средство, покрытое вариантом антитела настоящего изобретения, где вариантное антитело имеет высокую аффинность к FcγRIIB. Хотя не предполагается связываться с определенным механизмом действия, такие композиции являются эффективными для индуцирования толерантности путем активации FcγRIIB опосредованного ингибиторного пути.
6.6 КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ВВЕДЕНИЯ
т.е.
т.е.
например
и т.д.
например
Настоящее изобретение предоставляет способы и фармацевтические композиции, содержащие молекулы настоящего изобретения (, антитела, полипептиды), содержащие вариантные Fc-участки. Настоящее изобретение также предоставляет способы лечения, профилактики и улучшения одного или нескольких симптомов, связанных с заболеванием, расстройством или инфекцией, путем введения субъекту эффективного количества слитого белка или сопряженной молекулы настоящего изобретения, или фармацевтической композиции, содержащей слитый белок или сопряженную молекулу настоящего изобретения. В предпочтительном аспекте антитело, слитый белок или сопряженная молекула являются главным образом очищенными (, в основном не содержат веществ, которые ограничивают ее эффект или производят нежелательные побочные эффекты). В конкретном варианте осуществления субъект является животным, предпочтительно млекопитающим, например, отличный от примата (, коровы, свиньи, лошади, кошки, собаки, крысы ) и примат (, обезьяна, такая как, обезьяна вида Cynomolgous, и человек). В предпочтительном варианте осуществления субъект является человеком. В еще одном предпочтительном варианте осуществления антитело настоящего изобретения от того же вида, что и субъект.
т.е.
например
см.
например
J. Biol. Chem
например
например
например
и т.д.
например
См.
например
Различные системы доставки известны и могут применяться для введения композиции, содержащей молекулы настоящего изобретения (, антитела, полипептиды), содержащие вариантные Fc-участки, , инкапсуляция в липосомы, микрочастицы, микрокапсулы, рекомбинантные клетки, способные экспрессировать антитело или слитый белок, рецептор-опосредованный эндоцитоз (, , Wu и Wu, 1987, . 262:4429-4432), конструкция из нуклеиновой кислоты как части ретровирусного или иного вектора и т.д. Способы введения молекулы настоящего изобретения включают без ограничения парентеральное введение (, внутрикожное, внутримышечное, внутрибрюшинное, внутривенное и подкожное), эпидуральное, и чресслизистое (, интраназальный и оральный пути). В конкретном варианте осуществления молекулы настоящего изобретения вводят внутримышечно, внутривенно или подкожно. Композиции могут быть введены любым подходящим путем, например, инфузией или болюсной инъекцией, путем всасывания через эпителиальные или слизистые выстилки (, слизистой оболочки полости рта, прямой кишки и слизистой оболочки кишечника ) и могут быть введены совместно с другими биологически активными средствами. Введение может быть системным или местным. Кроме того, легочное введение также может быть использовано, , путем применения ингалятора или небулайзера и состава с аэрозолирующим средством. , , патенты США №№ 6019968, 5985320, 5985309, 5934272, 5874064, 5855913, 5290540 и 4880078; и PCT публикация №№ WO 92/19244; WO 97/32572; WO 97/44013; WO 98/31346 и WO 99/66903, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
т.е.
например
Настоящее изобретение также представляет, что молекулы настоящего изобретения (, антитела, полипептиды), содержащие вариантные Fc-участки, запакованы в герметически запечатанный контейнер, такой как ампула или саше, с указанием количества антител. В одном варианте осуществления молекулы настоящего изобретения поставляются в виде сухого стерилизованого лиофилизированного порошка или безводного концентрата в герметически запечатанном контейнере и могут быть восстановлены, , водой или солевым раствором до соответствующей концентрации для введения субъекту. Предпочтительно, молекулы настоящего изобретения поставляются в виде сухого стерильного лиофилизированного порошка в герметически запечатанном контейнере при единичной дозировке по меньшей мере 5 мг, более предпочтительно по меньшей мере 10 мг, по меньшей мере 15 мг, по меньшей мере 25 мг, по меньшей мере 35 мг, по меньшей мере 45 мг, по меньшей мере 50 мг или по меньшей мере 75 мг. Лиофилизированные молекулы настоящего изобретения должны храниться при температуре от 2 до 8°C в их оригинальном контейнере, и молекулы должны быть введены в течение 12 часов, предпочтительно, в течение 6 часов, в течение 5 часов, в течение 3 часов или в течение 1 часа после восстановления. В альтернативном варианте осуществления молекулы настоящего изобретения поставляются в жидкой форме в герметически запечатанном контейнере с указанием количества и концентрации молекулы, слитого белка, или сопряженной молекулы. Предпочтительно, жидкая форма молекул настоящего изобретения поставляется в герметически запечатанном контейнере по меньшей мере 1 мг/мл, более предпочтительно по меньшей мере 2,5 мг/мл, по меньшей мере 5 мг/мл, по меньшей мере 8 мг/мл, по меньшей мере 10 мг/мл, по меньшей мере 15 мг/кг, по меньшей мере 25 мг/мл, по меньшей мере 50 мг/мл, по меньшей мере 100 мг/мл, по меньшей мере 150 мг/мл, по меньшей мере 200 мг/мл молекул.
Количество композиции настоящего изобретения, которое будет эффективным для лечения, предотвращения или улучшения одного или нескольких симптомов, связанных с нарушением, может быть определено стандартными клиническими методиками. Точная доза, подлежащая использованию в составе, также будет зависеть от пути введения и тяжести состояния и должна определяться в соответствии с решением врача и обстоятельствами каждого пациента. Эффективные дозы могут быть экстраполированы на основе кривых доза-ответ, полученных на in vitro или животных модельных тест-системах.
Для антител, охватываемых настоящим изобретением, дозировка, вводимая пациенту, типично составляет от 0,0001 мг/кг до 100 мг/кг веса тела пациента. Предпочтительно, дозировка, вводимая пациенту, составляет от 0,0001 мг/кг до 20 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 10 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 5 мг/кг, от 0,0001 до 2 мг/кг, от 0,0001 до 1 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 0,75 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 0,5 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 0,25 мг/кг, от 0,0001 до 0,15 мг/кг, от 0,0001 до 0,10 мг/кг, от 0,001 до 0,5 мг/кг, от 0,01 до 0,25 мг/кг или от 0,01 до 0,10 мг/кг веса тела пациента. Как правило, человеческие антитела имеют больший период полураспада в человеческом организме, чем антитела из других видов, благодаря иммунному ответу на чужеродные полипептиды. Таким образом, более низкие дозировки человеческих антител и меньшая частота введения часто являются возможными. Кроме того, дозировка и частота введения антител настоящего изобретения или его фрагментов могут быть снижены усилением поглощения и тканевой проницаемости для антител путем модификаций, таких как, например, липидизация.
В одном варианте осуществления дозировка молекул настоящего изобретения, вводимая пациенту, составляет от 0,01 мг до 1000 мг/день, когда применяется в качестве единственного средства лечения. В другом варианте осуществления молекулы настоящего изобретения применяются в комбинации с другими терапевтическими композициями, и дозировка, вводимая пациенту, ниже, чем когда указанные молекулы применяются в качестве единственного средства лечения.
В конкретном варианте осуществления может оказаться желательным введение фармацевтических композиций настоящего изобретения локально в область, нуждающуюся в лечении; это может быть достигнуто путем, например, без ограничения локальной инфузии, инъекции, или с помощью имплантата, причем указанный имплантат является пористым, непористым или гелеобразным материалом, включая мембраны, такие как силиконовые мембраны, или волокна. Предпочтительно, при введении молекулы настоящего изобретения должны применяться материалы, которые не поглощают молекулы.
см.
Science
см.
Liposomes in the Therapy of Infectious Disease and Cancer
В другом варианте осуществления композиции могут быть доставлены в везикуле, в частности, в липосоме ( Langer,  249:1527-1533 (1990); Treat et al., в , Lopez-Berestein и Fidler (ред.), Liss, New York, pp. 353- 365 (1989); Lopez-Berestein, там же, pp. 317-327; там же).
См
например
et al.
Radiotherapy & Oncology
et al.
PDA Journal of Pharmaceutical Science & Technology
et al.
Pro. Int'l. Symp. Control. Rel. Bioact. Mater
et al.
Proc. Int'l. Symp. Control Rel. Bioact. Mater.
См.
выше
CRC Crit. Ref. Biomed. Eng
et al.
et al.
N. Engl. J. Med.
см., например
Macromol. Sci. Rev. Macromol. Chem.
См.
et al.
Science
et al.
et al.
J. Neurosurg
например
см.
например
выше
et al.
см.
in situ
см.
Medical Applications of Controlled Release
В еще одном варианте осуществления композиции могут быть доставлены в системе с контролируемым высвобождением или непрерывным высвобождением. Любая методика, известная специалисту в данной области, может использоваться для производства составов непрерывного высвобождения, содержащих одну или несколько молекул настоящего изобретения. , , патент США № 4526938; PCT публикацию WO 91/05548; PCT публикацию WO 96/20698; Ning , 1996, “Intratumoral Radioimmunotheraphy of a Human Colon Cancer Xenograft Using a Sustained-Release Gel”,  39:179-189, Song , 1995, “Antibody Mediated Lung Targeting of Long-Circulating Emulsions”, 50:372-397; Cleek , 1997, “Biodegradable Polymeric Carriers for a bFGF Antibody for Cardiovascular Application,” . 24:853-854; и Lam , 1997, “Microencapsulation of Recombinant Humanized Monoclonal Antibody for Local Delivery”,  24:759-760, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте. В одном варианте осуществления может использоваться помпа в системе контролируемого высвобождения ( Langer, ; Sefton, 1987, . 14:20; Buchwald , 1980, Surgery 88:507; и Saudek , 1989,  321:574). В другом варианте осуществления могут использоваться полимерные материалы для достижения контролируемого высвобождения антитела (, , Langer и Wise (ред.), CRC Pres., Boca Raton, Florida (1974); Controlled Drug Bioavailability, Drug Product Design and Performance, Smolen и Ball (ред.), Wiley, New York (1984); Ranger и Peppas, 1983, J.,  23:61; также Levy , 1985,  228:190; During , 1989, Ann. Neurol. 25:351; Howard , 1989, . 7 1:105); патент США № 5679377; патент США № 5916597; патент США № 5912015; патент США № 5989463; патент США № 5128326; PCT публикацию № WO 99/15154; и PCT публикацию № WO 99/20253). Примеры полимеров, применяемых в составах непрерывного высвобождения, включают без ограничения поли(2-гидрокси-этилметакрилат), поли(метилметакрилат), поли(акриловую кислоту), поли(этилен-co-винилацетат), поли(метакриловую кислоту), полигликолиды (PLG), полиангидриды, поли(N-винилпирролидон), поли(виниловый спирт), полиакриламид, поли(этиленгликоль), полилактиды (PLA), поли(лактид-co-гликолиды) (PLGA) и сложные полиортоэфиры. В еще одном варианте осуществления система контролируемого высвобождения может быть размещена в непосредственной близости от терапевтической мишени (, легких), таким образом, требуется только часть системной дозы (, , Goodson, в Medical Applications of Controlled Release, , vol. 2, pp. 115-138 (1984)). В другом варианте осуществления полимерные композиции, пригодные в качестве имплантатов контролируемого высвобождения, применяются согласно Dunn  (патент США № 5945155). Этот конкретный метод основан на терапевтическом эффекте контролируемого высвобождения биологически активного материала из полимерной системы. Имплантация в общем случае может происходить в любом месте в организме пациента, нуждающегося в терапевтическом лечении. В другом варианте осуществления применяется неполимерная система непрерывной доставки, на основании чего неполимерный имплантат в организме субъекта используется как система доставки лекарственного средства. После имплантации в организм органический растворитель имплантата будет разрушаться, рассеиваться или вымываться из композиции в окружающую тканевую жидкость, а неполимерный материал будет постепенно коагулировать или осаждаться с формированием твердой микропористой матрицы ( патент США № 5888533).
Science
См
например
et al.
Radiotherapy & Oncology
et al.
PDA Journal of Pharmaceutical Science & Technology
et al.
Pro. Int'l. Symp. Control. Rel. Bioact. Mater
et al.
Proc. Int'l. Symp. Control Rel. Bioact. Mater
Системы контролируемого высвобождения обсуждаются в обзоре Langer (1990,  249:1527-1533). Любая методика, известная специалисту в данной области, может использоваться для производства составов непрерывного высвобождения, содержащих одно или несколько терапевтических средств настоящего изобретения. , , патент США № 4526938; международные публикации №№ WO 91/05548 и WO 96/20698; Ning , 1996,  39:179-189; Song , 1995,  50:372-397; Cleek , 1997, . 24:853-854; и Lam , 1997, . 24:759-760, каждый из которых включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
in vivo
например
см.
например
См., например
et al.
Proc. Natl. Acad.
Sci. USA
и т.д.
В конкретном варианте осуществления, где композиция настоящего изобретения является нуклеиновой кислотой, кодирующей антитело, нуклеиновая кислота может быть введена  для поддержания экспрессии кодируемого ею антитела, путем конструирования ее как части соответствующего вектора экспрессии нуклеиновой кислоты и путем введения ее таким образом, что она становится внутриклеточной, , с помощью применения ретровирусного вектора ( патент США № 4980286), или непосредственной инъекцией, или путем применения бомбардировки микрочастицами (, генной пушкой; Biolistic, Dupont), или покрытием липидами или рецепторами клеточной поверхности или средствами трансфекции, или введением ее в связь с гомеобокс-подобным пептидом, который, как известно, проникает в ядро (с, Joliot , 1991,  88:1864-1868), Альтернативно, нуклеиновая кислота может быть включена внутриклеточно и встроена в ДНК клетки-хозяина для экспрессии путем гомологичной рекомбинации.
например
Для антител терапевтически или профилактически эффективной дозировкой, вводимой субъекту, типично составляет от 0,1 мг/кг до 200 мг/кг веса тела субъекта. Предпочтительно, дозировка, вводимая субъекту, составляет от 0,1 мг/кг до 20 мг/кг веса тела субъекта, и более предпочтительно, дозировка, вводимая субъекту, составляет от 1 мг/кг до 10 мг/кг веса тела субъекта. Дозировка и частота введения антител настоящего изобретения может быть снижена также усилением поглощения и тканевой проницаемости (, в легких) антител или слитых белков путем модификаций, таких как, например, липидизация.
Лечение субъекта терапевтически или профилактически эффективным количеством молекул настоящего изобретения может включать единичное лечение или, предпочтительно, может включать ряд лечебных процедур. В предпочтительном примере субъекта лечат молекулами настоящего изобретения в диапазоне от примерно 0,1 до 30 мг/кг веса тела, один раз в неделю в течение от примерно 1 до 10 недель, предпочтительно от 2 до 8 недель, более предпочтительно от примерно 3 до 7 недель, и еще более предпочтительно в течение примерно 4, 5 или 6 недель. В других вариантах осуществления фармацевтические композиции настоящего изобретения вводятся один раз в день, дважды в день или три раза в день. В других вариантах осуществления фармацевтические композиции вводятся один раз в неделю, дважды в неделю, один раз каждые две недели, один раз в месяц, один раз каждые шесть недель, один раз каждые два месяца, дважды в год или один раз в год. Следует также отметить, что эффективная дозировка молекул, применяемая для лечения, может увеличиваться или уменьшаться в ходе конкретного лечения.
6.6.1 ФАРМАЦЕВТИЧЕСКИЕ КОМПОЗИЦИИ
например
т.е.
Композиции настоящего изобретения включают объемные композиции лекарственных средств, пригодные для изготовления фармацевтических композиций (, нечистые или нестерильные композиции) и фармацевтические композиции (, композиции, которые подходят для введения субъекту или пациенту), которые могут быть применены для получения единичных лекарственных форм. Такие композиции содержат профилактически или терапевтически эффективное количество профилактического и/или терапевтического средства, раскрытого в данном документе, или комбинацию таких средств и фармацевтически приемлемый носитель. Предпочтительно, композиции настоящего изобретения содержат профилактически или терапевтически эффективное количество одной или нескольких молекул настоящего изобретения и фармацевтически приемлемый носитель.
В одном специфическом варианте осуществления фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество одной или нескольких молекул настоящего изобретения, содержащих вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок, связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA с большей аффинностью, чем сопоставимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA и/или FcγRIIA, и/или указанный вариантный Fc-участок опосредует эффекторную функцию, по меньшей мере, в 2 раза более эффективно, чем сопоставимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа и фармацевтически приемлемый носитель. В другом варианте осуществления фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество одной или нескольких молекул настоящего изобретения, содержащих вариантный Fc-участок, где указанный вариантный Fc-участок связывает FcγRIIIA с большей аффинностью, чем сопоставимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIIA, и указанный вариантный Fc-участок связывает FcγRIIB с более низкой аффинностью, чем сопоставимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, связывает FcγRIIB, и/или указанный вариантный Fc-участок опосредует эффекторную функцию, по меньшей мере, в 2 раза более эффективно, чем сопоставимая молекула, содержащая Fc-участок дикого типа, и фармацевтически приемлемый носитель. В другом варианте осуществления указанные фармацевтические композиции дополнительно содержат одно или несколько противораковых средств.
например
Настоящее изобретение также охватывает фармацевтические композиции, содержащие терапевтическое антитело (, опухоль-специфическое моноклональное антитело), которое является специфическим для конкретного антигена злокачественной опухоли, содержащее одну или несколько аминокислотных модификаций в Fc-участке, как определено в соответствии с настоящим изобретением, и фармацевтически приемлемый носитель.
например
В специфическом варианте осуществления выражение “фармацевтически приемлемый” означает, утвержденный регулирующим органом федерального или государственного управления, или приведенный в Фармакопее США или в другой общепризнанной фармакопее для применения у животных, и, более конкретно, у людей. Выражение “носитель” относится к разбавителю, адъюванту (, адъюванту Фрейнда (полному и неполному), инертному наполнителю или среде, с которой лекарство вводится. Такие фармацевтические носители могут быть стерильными жидкостями, такими как вода и масла, включая полученные из нефти, животных, растений или синтетические, такие как арахисовое масло, соевое масло, минеральное масло, кунжутное масло и т.п. Вода является предпочтительным носителем, когда фармацевтическая композиция вводится внутривенно. Солевые растворы и водные растворы декстрозы и глицерина могут также быть использованы в качестве жидких носителей, особенно для инъекционных растворов. Подходящие фармацевтические наполнители включают крахмал, глюкозу, лактозу, сахарозу, желатин, солод, рис, муку, мел, силикагель, натрия стеарат, глицерина моностеарат, тальк, натрия хлорид, сухое обезжиренное молоко, глицерин, пропиленгликоль, воду, этанол и т.п. Композиция, при желании, может также содержать небольшие количества смачивающих или эмульгирующих средств или средств рН-буферизации. Эти композиции могут иметь форму растворов, суспензий, эмульсий, таблеток, пилюль, капсул, порошков, составов непрерывного высвобождения и т.п.
Как правило, ингредиенты композиции настоящего изобретения поставляются отдельно или смешанными в стандартной лекарственной форме, например, как сухой лиофилизированный порошок или безводный концентрат в герметически запечатанном контейнере, таком как ампула или саше, с указанием количества активного средства. Если композиция будет вводиться инфузией, можно будет обойтись без инфузионной бутыли, содержащей стерильную фармацевтического класса воду или солевой раствор. Если композиция вводится инъекцией, ампула со стерильной водой для инъекции или солевым раствором может быть предоставлена для того, чтобы ингредиенты могли быть смешаны перед введением.
и т.д.
Композиции настоящего изобретения могут быть сформулированы в виде нейтральных или солевых форм. Фармацевтически приемлемые соли включают без ограничения образованные с анионами, такими как производные соляной, фосфорной, уксусной, щавелевой, винной кислот и т.д., и образованные с катионами, такими как производные натрия, калия, аммония, кальция, гидроксида железа, изопропиламина, триэтиламина, 2-этиламиноэтанола, гистидина, прокаина
6.6.2 НАБОРЫ
т.е.
Настоящее изобретение предоставляет фармацевтический пакет или набор, содержащий один или несколько контейнеров, наполненных молекулами настоящего изобретения (, антитела, полипептиды, содержащие вариантные Fc-участки). Кроме того, одно или несколько других профилактических или терапевтических средств, пригодных для лечения заболевания, могут также быть включены в фармацевтический пакет или набор. Настоящее изобретение также предоставляет фармацевтический пакет или набор, содержащий один или несколько контейнеров, наполненных одним или несколькими ингредиентами фармацевтических композиций настоящего изобретения. Факультативно присоединенным к такому контейнеру(ам) может быть уведомление по форме, установленной государственным учреждением, регулирующим производство, применение или продажу фармацевтических средств и биологических препаратов, которое отражает одобрение управлением по производству, применению или продаже для введения человеку.
Настоящее изобретение предоставляет наборы, которые могут применяться вышеописанными способами. В одном варианте осуществления набор содержит одну или несколько молекул настоящего изобретения. В другом варианте осуществления набор дополнительно содержит одно или несколько других профилактических или терапевтических средств, пригодных для лечения злокачественной опухоли, в одном или нескольких контейнерах. В другом варианте осуществления набор дополнительно содержит одно или несколько цитотоксических антител, которые связывают один или несколько опухолевых антигенов, ассоциированных со злокачественной опухолью. В определенных вариантах осуществления другое профилактическое или терапевтическое средство является химиотерапевтическим. В других вариантах осуществления профилактическое или терапевтическое средство является биологическим или гормональным лекарством.
6.7 ХАРАКТЕРИСТИКА И ДЕМОНСТРАЦИЯ ТЕРАПЕВТИЧЕСКОЙ ПРИМЕНИМОСТИ
in vitro
in vitro
например
Некоторые аспекты фармацевтических композиций, профилактических или терапевтических средств настоящего изобретения предпочтительно испытаны , на системе клеточной культуры, и в животном модельном организме, таком как животная модельная система грызунов, на желаемую терапевтическую активность перед применением у людей. Например, испытания, которые могут быть использованы для определения, желательно ли введение специфической фармацевтической композиции, включают испытание на клеточной культуре, при котором образец ткани пациента выращивают в культуре и подвергают действию или иным образом обеспечивают контакт с фармацевтической композицией настоящего изобретения, и наблюдают эффект такой композиции на образец ткани. Образец ткани может быть получен путем биопсии из пациента. Этот тест позволяет идентифицировать терапевтически наиболее эффективную профилактическую или терапевтическую молекулу(ы) для каждого отдельного пациента. В различных конкретных вариантах осуществления испытания  могут быть выполнены на репрезентативных клетках или клеточных типах, вовлеченных в аутоиммунное или воспалительное нарушение (, T-клетки), для определения, имеет ли фармацевтическая композиция настоящего изобретения желаемый эффект на такие типы клеток.
и т.д
Комбинации профилактических и/или терапевтических средств могут быть тестированы на подходящих животных модельных системах перед применением у людей. Такие животные модельные системы включают без ограничения крыс, мышей, кур, коров, обезьян, свиней, собак, кроликов . Любая животная система, хорошо известная в данной области, может быть использована. В конкретном варианте осуществления настоящего изобретения, комбинации профилактических и/или терапевтических средств испытывают на мышиной модельной системе. Такие модельные системы широко используются и известны специалисту в данной области. Профилактические и/или терапевтические средства могут вводиться неоднократно. Некоторые аспекты процедуры могут варьировать. Указанные аспекты включают временные режимы введения профилактических и/или терапевтических средств и введение этих средств отдельно или в качестве добавки.
например
Предпочтительными животными моделями для применения в способах настоящего изобретения являются, например, трансгенные мыши, экспрессирующие человеческие FcγRs на мышиных эффекторных клетках, , любая мышиная модель, описанная в патенте США № 5877396 (который включен в данный документ ссылкой во всей своей полноте) может использоваться в настоящем изобретении. Трансгенные мыши для применения в способах настоящего изобретения включают без ограничения мышей, несущих человеческий FcγRIIIA; мышей, несущих человеческий FcγRIIA; мышей, несущих человеческий FcγRIIB и человеческий FcγRIIIA; мышей, несущих человеческий FcγRIIB и человеческий FcγRIIA.
et al.
Mol. Cell Biol.
et al.
Cancer Immunol. Immunother.
et al.
Clin. Cancer Res.
et al.
Anticancer Res.
Предпочтительно, мутации, показывающие самые высокие уровни активности в функциональных испытаниях, описанных выше, будут тестированы для применения в исследованиях на животной модели перед применением у людей. Антитела, несущие Fc-мутанты, идентифицированные с использованием способов настоящего изобретения и тестированные в ADCC испытаниях, включая ch4D5 и ch520C9, два антитела к Erb-B2, и chCC49, антитело к TAG72, являются предпочтительными для применения на животных моделях, поскольку они ранее были использованы на ксенотрансплантатной мышиной модели (Hudsiak , 1989,  9: 1165-72; Lewis , 1993,  37: 255-63; Bergman , 2001  7: 2050-6; Johnson , 1995,  1387-93). Достаточные количества антител могут быть получены для применения в животных моделях с использования способов, описанных выше, например, с использования систем экспрессии млекопитающих и способов очистки IgG, раскрытых и проиллюстрированных в данном документе. Типичный эксперимент требует по меньшей мере приблизительно 5,4 мг мутантного антитела. Этот расчет основан на средних количествах антитела дикого типа, необходимых для защиты 8-10 мышей весом 30 г после нагрузочной дозы 4 мкг/г и еженедельной поддерживающей дозы 2 мкг/г в течение десяти недель. Настоящее изобретение охватывает линии опухолевых клеток в качестве источника для ксенотрансплантатных опухолей, таких как клетки SK-BR-3, BT474 и HT29, которые получены от пациентов с аденокарциномой молочной железы. Эти клетки имеют одновременно Erb-B2 и пролактиновые рецепторы на своей поверхности. Клетки SK-BR-3 успешно использовались как в ADCC, так и на ксенотрансплантатных опухолевых моделях. В других испытаниях могут быть использованы клетки OVCAR3, полученные из человеческой адренокарциномы яичников. Эти клетки экспрессируют антиген TAG72 на клеточной поверхности и могут использоваться в связи с chCC49 антителом. Применение различных антител и множества опухолевых моделей позволит обойти потерю любых специфических мутаций, благодаря несовместимости антитело-специфического Fc-мутанта.
Таблице 13
Мышиные ксенотрансплантатные модели могут быть применены для изучения эффективности мышиных антител, полученных по отношению к опухоле-специфической мишени, на основе аффинности и специфичности CDR-участков молекулы антитела и способности Fc-участка антитела вызывать иммунный ответ (Wu et al., 2001, Trends Cell Biol. 11: S2-9). Трансгенные мыши, экспрессирующие человеческие FcγR на мышиных эффекторных клетках, являются уникальными и изготовленными по заказу животными моделями для тестирования эффективности человеческих Fc-FcγR взаимодействий. Пары FcγRIIIA, FcγRIIIB и FcγRIIA трансгенных мышиных линий, произведенных в лаборатории Dr. Jeffrey Ravetch (по лицензионному соглашению с Rockefeller U. и Sloan Kettering Cancer center) могут использоваться подобно перечисленным в  ниже.
Таблица 13: Породы мышей
<b>Предпосылки штамма</b>
<b>Человеческий FcR</b>
Nude / CD16A KO
ни одного
Nude / CD16A KO
FcγRIIIA
Nude / CD16A KO
FcγR IIA
Nude / CD16A KO
FcγR IIA и IIIA
Nude / CD32B KO
ни одного
Nude / CD32B KO
FcγR IIB
6
см.
et al.
Nat. Med
t
Предпочтительно, Fc-мутанты, показывающие одновременно усиленную связываемость с FcγRIIIA и сниженную связываемость с FcγRIIB, увеличенную активность в ADCC и фагоцитозном испытаниях, тестировались в экспериментах на животных моделях. Эксперименты на животных моделях изучают увеличение эффективности несущих Fc-мутант антител у FcγRIIIA трансгенных голых нокаутных мышей mCD16A по сравнению с контрольными, которым вводилось нативное антитело. Предпочтительно, группы из 8-10 мышей изучают, применяя стандартный протокол. Примерный эксперимент на животной модели может включать следующие этапы: модель злокачественной опухоли молочной железы ~2 x 10клеток SK-BR-3 инъецируется подкожно в день 1 с 0,1 мл PBS, смешанным с Matrigel (Becton Dickinson). Сначала химерное антитело дикого типа и изотипный контроль вводится для создания кривой для заданной терапевтической дозы, внутривенная инъекция 4D5 в день 1 с начальной дозой 4 мкг/г сопровождается еженедельными инъекциями 2 мк/г. Объем опухоли контролируется в течение 6-8 недель для измерения развития заболевания. Объем опухоли должен увеличиваться линейно со временем у животных, которым инъецировался изотипный контроль. В отличие от этого очень небольшой опухолевый рост должен происходить в группе, инъецируемой 4D5. Результаты исследования стандартных доз используются, чтобы установить верхний предел для экспериментов по тестированию Fc-мутантов. Эти исследования проводятся с использованием субтерапевтических доз содержащих Fc-мутант антител. Одна десятая дозы применялась на ксенотрансплантатных моделях в экспериментах, проведенных на FcγRIIB нокаутных мышах, , Clynes , 2000, . 6: 443-6, с получившимся в результате блокированием роста опухолевых клеток. Поскольку мутанты настоящего изобретения предпочтительно показали увеличение FcγRIIIA активации и снижение FcγRIIB связывания, мутанты изучались при одной десятой терапевтической дозы. Изучение размера опухоли в различных интервалах указывает на эффективность антител в более низкой дозе. Статистический анализ данных с помощью  теста дает возможности определить, являются ли данные достоверными. Fc-мутанты, которые показывают увеличенную эффективность, тестируются при постепенно понижающихся дозах для определения наименьшей возможной дозы в качестве меры их эффективности.
et al.
Противовоспалительная активность комбинированных методов лечения настоящего изобретения может быть определена с помощью различных экспериментальных животных моделей воспалительного артрита, известных в данной области и описанных у Crofford L.J. и Wilder R.L., «Arthritis and Autoimmunity in Animals», в Arthritis and Allied Conditions: A Textbook of Rheumatology, McCarty (ред.), глава 30 (Lee и Febiger, 1993). Экспериментальные и самопроизвольные животные модели воспалительного артрита и аутоиммунных ревматических заболеваний также могут быть использованы для оценки противовоспалительной активности комбинированных методов лечения данного изобретения. Далее некоторые анализы предоставлены в качестве примеров, а не в качестве ограничения.
et al.
Основные животные модели артрита или воспалительного заболевания, известные в данной области и широко используемые, включают: модели адъювант-индуцированного артрита крыс, модели коллаген-индуцированного артрита крыс и мышей и модели антиген-индуцированного артрита крыс, кроликов и хомяков, описанные у Crofford L.J. и Wilder R.L., “Arthritis and Autoimmunity in Animals”, в Arthritis and Allied Conditions: A Textbook of Rheumatology, McCarty (ред.), глава 30 (Lee и Febiger, 1993), включенный в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
et al.
Inflammation
Противовоспалительную активность комбинированных методов лечения настоящего изобретения можно оценить с использованием модели каррагинан-индуцированного артрита крыс. Каррагинан-индуцированный артрит также применяется у кроликов, собак и свиней в исследованиях хронического артрита или воспаления. Количественная гистоморфометрическая оценка используется для определения терапевтической эффективности. Способы использования такой модели каррагинан-индуцированного артрита описаны у Hansra P. , “Carrageenan-Induced Arthritis in the Rat”, , 24(2): 141-155, (2000). Также часто используются модели зимозан-индуцированного воспаления животных, известные и описанные в данной области.
et al.
Proc. Soc. Exp. Biol Med.
in vivo
Противовоспалительную активность комбинированных методов лечения настоящего изобретения можно также оценить измерением ингибирования каррагинан-индуцированного отека лапы у крысы с использованием модификации способа, описанного у Winter C. A. , “Carrageenan-Induced Edema in Hind Paw of the Rat as an Assay for Anti-inflammatory Drugs”  111, 544-547, (1962). Этот анализ применялся в качестве первичного  скрининга противовоспалительной активности большинства NSAID и рассматривается как прогностический для эффективности у человека. Противовоспалительная активность тестируемых профилактических или терапевтических средств выражается как процент ингибирования увеличения веса задней лапы тестируемой группы относительно получившей среду контрольной группы.
et al.
J. Gastroentrol
Dig. Dis. Sci.
Кроме того, животные модели воспалительных заболеваний кишечника также могут быть использованы для оценки эффективности комбинированных методов лечения настоящего изобретения (Kim , 1992, Scand. . 27:529-537; Strober, 1985,  30(12 Suppl):3S-10S). Язвенные колиты и болезнь Крона являются воспалительными заболеваниями кишечника человека, которые могут быть индуцированы у животных. Сульфатированные полисахариды, включая без ограничения амилопектин, карраген, амилопектина сульфат и декстрана сульфат, или химические раздражители, включая без ограничения тринитробензолсульфоновую кислоту (TNBS) и уксусную кислоту, могут быть введены животным перорально для индуцирования воспалительных заболеваний кишечника.
et al.
Autoimmunity
et al.
Biochimie
Semin. Nephrol
Животные модели для аутоиммунных нарушений также могут использоваться для оценки эффективности комбинированных методов лечения настоящего изобретения. Были разработаны животные модели для аутоиммунных нарушений, таких как диабет 1 типа, аутоиммунные заболевания щитовидной железы, системная красная волчанка и гломерулонефрит (Flanders , 1999, 29:235-246; Krogh , 1999, 81:511-515; Foster, 1999, . 19:12-24).
Кроме того, любые испытания, известные специалистам данной области, могут использоваться для оценки профилактической и/или терапевтической применимости комбинаторных методов терапии, раскрытых в данном документе, для аутоиммунных и/или воспалительных заболеваний.
например
50
50
50
50
Токсичность и эффективность профилактических и/или терапевтических протоколов настоящего изобретения могут определяться стандартными фармацевтическими процедурами на клеточных культурах или экспериментальных животных, , для определения LD (дозы, летальной для 50% популяции) и ED (дозы, терапевтически эффективной у 50% популяции). Соотношение между дозами токсических и терапевтических эффектов является терапевтическим индексом и может быть выражено как соотношение LD/ED. Профилактические и/или терапевтические средства, которые показывают большой терапевтический индекс, являются предпочтительными. Если профилактические и/или терапевтические средства, показывающие токсические побочные эффекты, могут быть использованы, следует позаботиться о разработке системы доставки, которая направляет такие средства в место пораженной ткани для минимизации потенциального вреда для неинфицированных клеток и, таким образом, для снижения побочных эффектов.
50
50
т.е.
Данные, полученные в испытаниях клеточных культур и исследованиях на животных, могут использоваться в разработке диапазона дозировок профилактических и/или терапевтических средств для применения у людей. Дозировка таких средств лежит, предпочтительно, в диапазоне циркулирующих концентраций, которые включают ED с небольшой или отсутствующей токсичностью. Дозировка может меняться в этом диапазоне в зависимости от используемой лекарственной формы и использованного пути введения. Для любого средства, примененного в способе настоящего изобретения, терапевтически эффективная доза может первоначально оцениваться из испытаний клеточной культуры. Доза может быть сформулирована на животных моделях для достижения диапазона циркулирующих концентраций, который включает IC (, концентрация тестируемого соединения, при которой достигается половина максимального ингибирования симптомов), как это определено в клеточной культуре. Такая информация может быть использована для более точного определения пригодных доз у людей. Уровни в плазме могут измеряться, например, с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии.
и т.д.,
Relevance of Tumor Models for Anticancer Drug Development
Contributions to Oncology
The Nude Mouse in Oncology Research
Anticancer Drug Development Guide
Противораковую активность методов лечения, примененных в соответствии с настоящим изобретением, также можно определить с использованием различных экспериментальных животных моделей для исследования злокачественной опухоли, такие как мышиная модель SCID или трансгенные мыши или голые мыши с человеческими ксенотрансплантатами, животные модели, такие как хомяки, кролики,  известные в данной области и описанные в (1999, ред. Fiebig и Burger);  (1999, Karger); (1991, ред. Boven и Winograd); и  (1997 ред. Teicher), включенные в данный документ ссылкой во всей своей полноте.
Предпочтительными животными моделями для определения терапевтической эффективности молекул настоящего изобретения являются мышиные ксенотрансплантатные модели. Линии опухолевых клеток, которые могут использоваться в качестве источника для ксенотрансплантатных опухолей, включают без ограничения клетки SKBR3 и MCF7, которые могут быть получены от пациентов с аденокарциномой молочной железы. Эти клетки имеют одновременно erbB2 и пролактиновые рецепторы. Клетки SKBR3 традиционно применяются в данной области в качестве ADCC и ксенотрансплантатных опухолевых моделей. Альтернативно, клетки OVCAR3, полученные из человеческой аденокарциномы яичников, могут использоваться в качестве источника ксенотрансплантатных опухолей.
in vitro
in vivo
например
3
Протоколы и композиции настоящего изобретения предпочтительно тестируются , а затем , на желаемую терапевтическую или профилактическую активность перед применением у людей. Терапевтические средства и способы могут быть отобраны с использованием клеток опухоли или линии злокачественных клеток. Многие испытания, стандартные в данной области, могут использоваться для оценки подобного выживания и/или роста; например, клеточная пролиферация может анализироваться с помощью измерения включения H-тимидина, прямым подсчетом клеток, регистрацией изменений транскрипционной активности известных генов, таких как протоонкогены (, fos, myc), или маркеров клеточного цикла; жизнеспособность клеток можно оценить окрашиванием трипановым синим, дифференциацию можно оценить визуально на основе изменений в морфологии, уменьшенного роста и/или колониеобразования в мягком агаре или образования трубчатой сети в трехмерной базальной мембране или препарате внеклеточного матрикса и т.д.
и т.д.
Соединения для применения в лечении могут тестироваться на подходящих животных модельных системах перед тестированием на людях, включая без ограничения крыс, мышей, кур, коров, обезьян, кроликов, хомяков , например, на животных моделях, описанных выше. Соединения могут затем применяться в соответствующих клинических опытах.
Кроме того, любые испытания, известные специалистам данной области, могут использоваться для оценки профилактической и/или терапевтической применимости комбинаторных методов лечения, раскрытых в данном документе, для лечения или предотвращения злокачественной опухоли, воспалительного нарушения или аутоиммунного заболевания.
Теперь после того, как настоящее изобретение описано в целом, его будет легче понять через ссылки на следующие примеры, которые предоставлены в качестве иллюстрации и не предназначены для ограничения настоящего изобретения, если не указано иное.
7. ПРИМЕРЫ
7.1 ИССЛЕДОВАНИЕ КИНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ Fc-МУТАНТОВ
in vitro
Fc-мутанты, показывающие измененную аффинность к FcγRIIIA и FcγRIIB, были определены путем технологии дрожжевого дисплея и испытаний FcγR-Fc взаимодействия, как раскрыто в публикациях заявок на патенты США №№ 2005/0037000 и 2005/0064514 и в международной публикации заявки на патент WO 04/063351, каждый из которых включен, таким образом, ссылкой во всей своей полноте. Эффекты мутанта в испытаниях  были оценены путем определения кинетических параметров связывания ch4-4-20 антител, несущих Fc-мутанты, с использованием испытания BIAcore (BIAcore instrument 1000, BIAcore Inc., Пискатавэй, Нью-Джерси). FcγRIIIA, использованный в этом анализе, был растворимым мономерным белком, внеклеточный участок FcγRIIIA присоединен к линкер-AVITAG последовательности, в то время как FcγRIIB, использованный в этом испытании, был растворимым димерным белком, оба были получены, как описано в публикациях заявок на патенты США 2005/0037000 и 2005/0064514, и в международной публикации патентной заявки WO 04/063351. Вкратце, примененный FcγRIIB был внеклеточным доменом FcγRIIB, слитым с шарнир-CH2-CH3 доменом человеческого IgG2.
3
BSA-FITC (36 мкг/мл в 10 мМ ацетатного буфера при pH 5,0) был иммобилизирован на одной из четырех проточных кювет (проточная кювета 2) поверхности сенсорного чипа через химию аминной связи (путем модификации карбоксиметильных групп смесью NHS/EDC) так, чтобы около 5000 единиц реагирования (RU) BSA-FITC было иммобилизировано на поверхности. После этого непрореагировавшие активные сложные эфиры были “закончены” инъекцией 1M Et-NH2. Как только подходящая поверхность была подготовлена, ch 4-4-20 антитела, несущие Fc-мутации, были пропущены по поверхности одноминутными инъекциями 20 мкг/мл раствора при скорости потока 5 мкл/мл. Уровень ch-4-4-20 антител, связанных с поверхностью, находился в диапазоне 400 и 700 RU. Далее ряд разведений рецептора (FcγRIIIA и FcγRIIB-Fc слитый белок) в HBS-P буфере (10 мМ HEPES, 150 мМ NaCl, 0,005% поверхностно-активного вещества P20, 3 мМ EDTA, pH 7,4) были впрыснуты на поверхность при 100 мкл/мин. Регенерация антитела между различными разведениями рецептора была проведена однократными 5-секундными инъекциями 100 мМ NaHCO pH 9,4; 3 M NaCl.
Те же разведения рецептора были также впрыснуты на поверхность BSA-FITC без какого-либо ch-4-4-20 антитела в начале и в конце испытания в качестве стандартных инъекций.
on
off
D
off
on
т.е.
После того, как весь набор данных был собран, полученные в результате кривые связывания были глобально установлены с использованием компьютерных алгоритмов, предоставляемых изготовителем, BIAcore, Inc. (Пискатавэй, Нью-Джерси). Эти алгоритмы вычисляют K и K, из которых выводится наглядная равновесная константа связывания K как соотношение двух констант скорости (, K/K). Более детальные трактовки того, как получены отдельные константы скорости, можно найти в BIAevaluaion Software Handbook (BIAcore, Inc., Пискатавэй, Нью-Джерси).
max
2
Кривые связывания для двух различных концентраций (200 нМ и 800 нМ для FcγRIIIA и 200 нМ и 400 нМ для FcγRIIB слитого белка) были приведены в соответствие, и ответы скорректированы до такого же уровня захваченных антител, а стандартные кривые были вычтены из экспериментальных кривых. Фазы ассоциации и диссоциации были установлены отдельно. Константа скорости диссоциации была получена для интервала 32-34 секунд фазы диссоциации; аппроксимация фазы ассоциации была получена с помощью 1:1 модели Лэнгмюра и основная аппроксимация была выбрана на основе R и критерия χ.
РЕЗУЛЬТАТЫ
off
D
off
off
D
off
ФИГ. 4 показывает захват ch 4-4-20 антител с мутантными Fc-участками на BSA-FTIC-иммобилизированном сенсорном чипе. 6 мкл антител при концентрации примерно 20 мкг/мл были впрыснуты при 5 мкл/минута на BSA-FITC поверхность.ФИГ. 5 является сенсограммой связывания в реальном времени FcγRIIIA с ch-4-4-20 антителами, несущими вариантные Fc-участки. Связывание FcγRIIIA анализировали при концентрации 200 нМ и ответы резонансного сигнала нормализовали на уровне ответа, полученного от ch-4-4-20 антитела дикого типа. Кинетические параметры для связывания FcγRIIIA с ch-4-4-20 антителами были получены аппроксимацией данных, полученных при двух различных концентрациях FcγRIIIA, 200 и 800 нМ (ФИГ. 6). Сплошная линия представляет объединенную аппроксимацию, полученную на основе значений K , рассчитанных для кривых диссоциации в интервале 32-34 секунды. K и K представляют среднее, рассчитанное по двум различным использованным концентрациям FcγRIIIA. ФИГ. 7 является сенсограммой в реальном времени связывания FcγRIIB-Fc слитого белка с ch-4-4-20 антителами, несущими вариантный Fc-участок. Связывание FcγRIIB-Fc слитого белка анализировали при концентрации 200 нМ и ответы резонансного сигнала нормализовали на уровне ответа, полученного от ch-4-4-20 антитела дикого типа. Кинетические параметры для связывания FcγRIIB-Fc слитого белка с ch-4-4-20 антителами были получены аппроксимацией данных, полученных при двух различных концентрациях FcγRIIB-Fc слитого белка, 200 и 800 нМ (ФИГ. 8). Сплошная линия представляет объединенную аппроксимацию, полученную на основе K , рассчитанных для кривых диссоциации в интервале 32-34 секунды. K и K представляют среднее, рассчитанное по двум различным использованным концентрациям FcγRIIB-Fc слитого белка.
on
off
off
off
off
off
Таблицы 14
Таблицы 15
т.е.
Кинетические параметры (K и K), которые были определены в BIAcore анализе, коррелировали с характеристикой связывания мутантов, как определено в испытании ELISA, и функциональной активностью мутантов, как определено в испытании ADCC. В частности, как видно из , мутанты, имеющие усиленную ADCC активность относительно белка дикого типа и способные усиленно связываться с FcγRIIIA, как определено в испытании ELISA, имели улучшенную K для FcγRIIIA (, более низкую K). Следовательно, более низкое значение K для FcγRIIIA у мутантного Fc-белка относительно белка дикого типа, вероятно, может иметь усиленную ADCC функцию. С другой стороны, как видно из , мутанты, имеющие усиленную ADCC активность относительно белка дикого типа и имеющие сниженное связывание для FcγRIIB-Fc слитого белка, как определено испытанием ELISA, имели более высокую K для FcγRIIB-Fc слитого белка.
off
off
off
off
off
off
off
off
Таким образом, значения K для FcγRIIIA и FcγRIIB могут использоваться как прогностические измерения того, как мутант будет себя вести в функциональном испытании, таком как испытание ADCC. Фактически, соотношения значений K для FcγRIIIA и FcγRIIB-Fc слитого белка мутантов к белку дикого типа построены на данных ADCC (ФИГ. 9). В частности, в случае значений K для FcγRIIIA соотношение K (дикий тип)/K (мутант) построено на данных ADCC; а в случае значений K для FcγRIIB соотношение K (мутант)/K (дикий тип) построено на данных ADCC. Числа, большие единицы (1) показывают уменьшенную скорость диссоциации для FcγRIIIA и увеличенную скорость диссоциации для FcγRIIB-Fc относительно дикого типа. Мутанты, которые попадают в указанную ячейку, имеют более низкую скорость диссоциации для FcγRIIIA связывания и более высокую скорость диссоциации для FcγRIIB-Fc связывания, и обладают усиленной ADCC функцией.
Таблица 14. Кинетические параметры FcRIIIA связывания с ch4-4-20Ab, полученные “раздельной аппроксимацией” 200нМ и 800нМ кривых связывания
Ch4-4-20Ab
BIAcore Kd,nM
K<sub>on</sub>1/Ms
K<sub>off</sub>, 1/s
ELISA,OD
ADCC, %
Wt(0225)
319
6,0 x 10<sup>5</sup>
0,170
0,5
17,5
Mut11(0225)
90
8,22x10<sup>5</sup>
0,075
0,37
32
Mut5(0225)
214
8,2 x 10<sup>5</sup>
0,172
0,75
26
Mut6(0225)
264
6,67 x 10<sup>5</sup>
0,175
0,6
23
Mut8(0225)
234
8,3 x 10<sup>5</sup>
0,196
0,5
22
Mut10(0225)
128
9,04x10<sup>5</sup>
0,115
1,0
41
Mut12(0225)
111
1,04x 10<sup>6</sup>
0,115
1,0
37
Mut15(0225)
67,9
1,97 x 10<sup>6</sup>
0,133
1,0
15
Mut16(0225)
84,8
1,60 x 10<sup>6</sup>
0,133
1,0
15
Mut18(0225)
92
1,23 x 10<sup>6</sup>
0,112
1,0
28
Mut25(0225)
48,6
2,05 x 10<sup>6</sup>
0,1
1,0
41
Mut14(0225)
75,4
1,37 x 10<sup>6</sup>
0,1
1,1
28
Mut17(0225)
70,5
1,42 x 10<sup>6</sup>
0,1
1,25
30
Mut19(0225)
100
1,20 x 10<sup>6</sup>
0,120
0,75
11
Mut20(0225)
71,5
1,75 x 10<sup>6</sup>
0,126
0,5
10
Mut23(0225)
70,2
1,43x 10<sup>6</sup>
0,105
1,25
25
Выделенные мутанты не подходят в группу по данным ELISA или ADCC.
Таблица 15. Кинетические параметры FcRIIB-Fc связывания с диким типом и мутантом ch4-4-20Ab, полученные “раздельной аппроксимацией” 200нМ и 800нМ кривых связывания
Ch4-4-20Ab
BIAcore Kd,nM
K<sub>on</sub>1/Ms
K<sub>off</sub>, 1/s
ELISA,OD
ADCC, %
Wt(0225)
61,4
0,085
0,4
17,5
Mut11(0225)
82,3
0,1
0,08
32
Mut5(0225)
50
0,057
0,6
26
Mut6(0225)
66,5
0,060
0,35
23
Mut8(0225)
44,2
0,068
0,25
22
Mut10(0225)
41,3
0,05
1,2
41
Mut12(0225)
40,1
0,051
0,4
37
Mut15(0225)
37,8
0,040
1,55
15
Mut16(0225)
40
0,043
1,55
15
Mut18(0225)
51,7
0,043
1,25
28
Mut25(0225)
0,112
0,08
41
Mut14(0225)
95,6
0,089
0,13
28
Mut17(0225)
55,3
0,056
0,38
30
Mut19(0225)
45,3
0,046
1,0
11
Mut20(0225)
24,1
0,028
0,8
10
Mut23(0225)
108
0,107
0,1
25
7.2 СКРИНИНГ Fc-МУТАНТОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МНОГОКРАТНЫХ ЦИКЛОВ ОБОГАЩЕНИЯ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ТВЕРДОФАЗНОГО АНАЛИЗА
например
off
Следующие сортировки мутантов были направлены на выявление дополнительных наборов мутантов, которые показывают улучшенное связывание с FcγRIIIA и сниженное связывание с FcγRIIB. Вторичный скрининг отобранных Fc-вариантов выполнялся с помощью ELISA с последующим тестированием на ADCC в 4-4-20 системе. Мутанты были отобраны, прежде всего, на основе их способности опосредовать ADCC через 4-4-20, с использованием покрытых флуоресцеином SK-BR3 клеток в качестве мишеней и изолированных PBMC от человеческих доноров в качестве популяции эффекторных клеток. Fc-мутанты, которые показали относительное увеличение ADCC, , повышение на 2 порядка, были затем клонированы в chAbs к HER2/neu или к CD20 и тестированы в испытании ADCC с использованием соответствующих опухолевых клеток в качестве мишеней. Мутанты также были проанализированы с помощью BIAcore, и их были определены их относительные K.
7
Таблице 16
Сортировка 1: Последовательное твердофазное истощение и отбор с использованием магнитных гранул, покрытых FcγRIIB с последующим отбором с магнитными гранулами, покрытыми FcγRIIIA. Целью этой сортировки была идентификация Fc-мутантов, которые либо больше не связывают FcγRIIB, либо показывают сниженное связывание с FcγRIIB. 10-кратный избыток наивной библиотеки (~10 клеток) инкубировали с магнитными гранулами (“My One”, Dynal), покрытыми FcγRIIB. Дрожжи, связанные с гранулами, отделяли от несвязанной фракции путем помещения пробирки, содержащей смесь, в магнитное поле. Те дрожжевые клетки, которые не были связаны с гранулами, удаляли и помещали в свежую среду. Затем они связывались с гранулами, покрытыми FcγRIIIA. Дрожжи, связанные с гранулами, отделяли от несвязанной фракции, помещая пробирку, содержащую смесь, в магнитное поле. Несвязанные дрожжи удаляли, и связанные клетки удаляли энергичным встряхиванием. Извлеченные клетки пересевали в питательную среду, содержащую глюкозу, и реиндуцировали в селективной питательной среде, содержащей галактозу. Процесс отбора повторяли. Конечную культуру использовали для сбора ДНК. Вставки, содержащие Fc-домен, амплифицировали с помощью ПЦР и клонировали в 4-4-20. Приблизительно 90 Fc-мутантов сортировали с помощью испытаний 4-4-20 ELISA и ADCC, и получившиеся в результате положительные мутанты показаны в .
Таблица 16: Мутанты, отобранные последовательным твердофазным истощением и отбором с использованием магнитных гранул, покрытых FcγRIIB, с последующим отбором с магнитными гранулами, покрытыми FcγRIIIA
<b>Мутанты</b>
<b>Аминокислотные замены</b>
MgFc37
K248M
MgFc38
K392T, P396L
MgFc39
E293V, Q295E, A327T
MgFc41
H268N, P396LN
MgFc43
Y319F, P352L, P396L
MgFc42
D221E, D270E, V308A, Q311H, P396L, G402D
Сортировки 2 и 3: Мутанты, отобранные с помощью FACS, равновесного и кинетического скрининга:
7
Сортировка первой библиотеки выявила мутацию в положении 396, меняющую аминокислоту пролин на лейцин (P396L). Этот Fc-вариант показал увеличенное связывание одновременно с FcγRIIIA и FcγRIIB. Вторая библиотека была сконструирована с использованием P396L в качестве основной линии. ПЦР мутагенез был применен для генерирования ~10 мутантов, каждый из которых содержал P396L мутацию и содержал дополнительные нуклеотидные замены. P396L библиотека была отсортирована с использованием двух наборов условий.
8
Таблице 17
Равновесная сортировка была выполнена с использованием биотинилированного FcγRIIIA-линкер-AVITAG в качестве мономера с использованием уже описанных способов. Приблизительно 10-кратный избыток библиотеки (10 клеток) инкубировали в 0,5 мл приблизительно 7 нМ FcγRIIIA в течение 1 ч. Смесь сортировали с помощью FACS, отбирая верхнюю часть 1,2% связующих. Отобранные дрожжевые клетки выращивали в селективной среде, содержащей глюкозу, и реиндуцировали в селективной среде, содержащей галактозу. Равновесную сортировку повторяли второй раз, и сортировочные ворота устанавливали для сбора верхней части 0,2% связующих. Затем отобранные дрожжевые клетки выращивали в селективных условиях в глюкозе. Эта культура затем использовалась для сбора ДНК. Вставки, содержащие Fc-домен, амплифицировали с помощью ПЦР и клонировали в нуклеотидной последовательности, кодирующей 4-4-20 изменяемый домен с использованием уже описанных способов. Приблизительно 90 Fc-мутантов сортировали с помощью 4-4-20 ELISA и ADCC, и получившиеся в результате положительные мутанты показаны в .
Таблица 17
Мутанты, отобранные с помощью FACS, используя равновесную сортировку с концентрацией FcRIIIA приблизительно 7
нМ
<b>Мутант</b>
<b>Аминокислотные замены</b>
MgFc43b
K288R, T307A, K344E, P396L
MgFc44
K334N, P396L
MgFc46
P217S, P396L
MgFc47
K210M, P396L
MgFc48
V379M, P396L
MgFc49
K261N, K210M, P396L
MgFc60
P217S, P396L
off
Кинетическая сортировка также осуществлялась для идентификации мутантов с улучшенной K при связывании с FcγRIIIA. Были созданы условия для скрининга P396L библиотеки с использованием штамма с P396L Fc-вариантом, экспонированным на поверхности дрожжей. Вкратце, клетки, выращенные в индуцирующих условиях, инкубировали с 0,1 мкМ биотинилированного FcγRIIIA -линкер-AVITAG мономером в течение 1 ч. Клетки промывали для удаления меченого лиганда. Меченые клетки затем инкубировали в течение различного времени с 0,1 мкМ немеченого FcγRIIIA-линкер-AVITAG мономера, промывали и затем окрашивали SA:PE для анализа FACS (ФИГ. 10). Клетки также окрашивали с антителом козы к Fc человека, чтобы показать, что Fc-дисплей сохранен во время эксперимента.
8
На основе конкурентного исследования было установлено, что 1 минута инкубации имеет своим результатом приблизительно 50% потерю клеточного окрашивания. Данная временная точка была выбрана для кинетической сортировки с использованием P396L библиотеки. Приблизительно 10-кратный избыток библиотеки (10 клеток) инкубировали с 0,1 мкМ биотинилированного FcγRIIIA- линкер-AVITAG мономера в объеме 0,5 мл. Клетки промывали и затем инкубировали в течение 1 минуты с немеченым лигандом. Затем клетки промывали и метили SA:PE. Смесь сортировали с помощью FACS, отбирая верхнюю часть 0,3% связующих. Отобранные дрожжевые клетки выращивали в селективной среде, содержащей глюкозу, и реиндуцировали в селективной питательной среде, содержащей галактозу. Кинетическую сортировку повторяли второй раз, а сортировочные ворота устанавливали для сбора верхней части 0,2% связующих. Неотобранную P396L библиотеку сравнили с дрожжевыми клетками, отобранными для улучшенного связывания с помощью FACS (ФИГ. 11). Гистограммы показывают процентное соотношение клеток, которые окрашивались одновременно с FcγRIIIA /PE и с антителом козы к человеческому Fc/FITC (вверху справа).
Таблице 18
Отобранные дрожжевые клетки из второй сортировки были затем выращены в селективных условиях в глюкозе. Эта культура использовалась для сбора ДНК. Вставки, содержащие Fc-домен, амплифицировали с помощью ПЦР и клонировали в нуклеотидной последовательности, кодирующей 4-4-20 вариабельный домен, используя способы, описанные выше. Приблизительно 90 Fc-мутантов сортировали с помощью 4-4-20 ELISA и ADCC, и получившиеся в результате положительные мутанты показаны в .
Таблица 18
Мутанты, отобранные с помощью FACS, используя кинетическую сортировку, используя эквимолярные количества немеченого CD16A в течение 1 минуты
<b>Мутанты</b>
<b>Аминокислотные замены</b>
MgFc50
P247S, P396L
MgFc51
Q419H, P396L
MgFc52
V240A, P396L
MgFc53
L410H, P396L
MgFc54
F243L, V305I, A378D, F404S, P396L
MgFc55
R255l, P396L
MgFc57
L242F, P396L
MgFc59
K370E, P396L
Сортировки 4 и 5: Сочетание этапа твердофазного FcγRIIB истощения с FcγRIIIA отбором с помощью FACs сортировки с использованием FcγRIIIA 158V аллеля
Анализ Fc-вариантов из Сортировки 1 показало, что мутации, которые были отобраны из вторичной сортировки, имели улучшенное связывание как с FcγRIIIA, так и FcγRIIB. Следовательно, результаты означают, что последовательное истощение и отбор с использованием магнитных гранул (твердая фаза) в созданных условиях неэффективно отбирает относительно дифференциального связывания FcγRIIIA и FcγRIIB. Следовательно, для более эффективной сортировки мутантов, которые связывают FcγRIIIA, в то время как имеют сниженное связывание или отсутствие связывания с FcγRIIB, этап твердофазного FcγRIIB истощения сочетали с FcγRIIIA отбором с помощью сортировки FAC. Эта комбинация идентифицировала Fc-варианты, которые связывают FcγRIIIA с большей или равной аффинностью, чем Fc дикого типа.
7
.
10-кратный избыток наивной библиотеки (~10) инкубировали с магнитными гранулами, покрытыми FcγRIIB. Дрожжи, связанные с гранулами, отделяли от несвязанной фракции, помещая пробирку, содержащую смесь, в магнитное поле. Те дрожжевые клетки, которые не были связаны с гранулами, удаляли и помещали в свежую среду, а затем реиндуцировали в питательной среде, содержащей галактозу. FcγRIIB истощение с магнитными гранулами повторяли 5 раз. Полученную в результате дрожжевую популяцию проанализировали и обнаружили, что она показывает более чем 50% клеток, окрашенных с антителом козы к Fc человека, и очень небольшое процентное содержание клеток, окрашенных FcγRIIIA. Эти клетки затем отбирались дважды с помощью FACS сортировки с использованием 0,1 мкМ биотинилированного FcγRIIIA-линкер-AVITAG (данные не показаны). FcγRIIIA был 158V аллотипомДрожжевые клетки анализировали на связывание FcγRIIIA и FcγRIIB после каждой сортировки и по сравнению со связыванием Fc-домена дикого типа (ФИГ. 12 A-B).
Таблице 19
Отобранные дрожжевые клетки из второй сортировки затем выращивались в селективных условиях в глюкозе. Эта культура затем использовалась для сбора ДНК. Вставки, содержащие Fc-домен, амплифицировали с помощью ПЦР и клонировали в нуклеотидной последовательности, кодирующей 4-4-20 вариабельный домен. Приблизительно 90 Fc-мутантов сортировали с помощью 4-4-20 ELISA и ADCC, и получившиеся в результате положительные мутанты показаны в  (мутанты 61-66).
Таблица 19: Мутанты, отобранные истощением магнитных гранул, используя гранулы, покрытые CD32B и конечного отбора с помощью FACS, используя FcγRIIIA 158валин или 158фенилаланин
<b>Мутанты</b>
<b>Аминокислотные замены</b>
MgFc61
A330V
MgFc62
R292G
MgFc63
S298N, K360R, N361D
MgFc64
E233G
MgFc65
N276Y
MgFc66
A330V, V427M
MgFc67
V284M, S298N, K334E, R355W, R416T
Скрининг Fc-мутантов с использованием 158F аллеля FcγRIIIA
et al.
Blood
et al.
J. Clin. Invest.
Существуют два различных аллеля FcγRIIIA рецептора, которые проявляют различную связывающую аффинность для Fc-домена IgG1 (Koene , 1997,  90: 1109-1114; Wu , 1997,  100: 1059-70). 158F аллель связывает Fc-домен с константой связывания в 5-10 раз ниже, чем 158V аллель. Ранее все из сортировок Fc с использованием дрожжевого дисплея, проводили с использованием высоко связывающегося 158V аллеля в качестве лиганда. В данном эксперименте Fc-мутантов отбирали из FcγRIIB обедненной дрожжевой популяции, используя биотинилированный FcγRIIIA158F-линкер-AVITAG мономер в качестве лиганда. Сортировочные ворота были установлены для отбора верхней части 0,25% FcγRIIIA 158F связывающих. Полученную в результате обогащенную популяцию анализировали с помощью FACS (ФИГ. 12B). Отдельные клоны затем изолировали и их связывание с различными FcγR анализировали с помощью FACS (ФИГ. 12B). Анализ отдельных клонов из популяции имело своим результатом идентификацию единственного мутанта, несущего 5 мутаций MgFc67 (V284M, S298N, K334E, R355W, R416S), который имел усиленное связывание с FcγRIIIA и сниженное связывание с FcγRIIB.
Вторичная сортировка мутантов путем ADCC анализа Сортировок 1, 2 и 3
Таблице 20
Мутантов, которые были отобраны в предыдущих сортировках, затем анализировали, используя стандартное испытание ADCC, для определения относительных скоростей лизиса, опосредованного ch4-4-20, несущим Fc-мутантов. ch4-4-20 антитела, несущие Fc-варианты, создавали с использованием способов, описанных выше. Клетки SK-BR3 применяли в качестве мишеней, а эффекторными клетками были PBMC, которые выделяли из доноров, используя Ficoll градиент, как описано ниже (Раздел 7.7). Результаты ADCC активности для мутантов суммированы в .
Таблице 20
Как видно в , мутанты, изолированные с использованием первичной и вторичной сортировок на основе FcγRΙΙΒ истощения и FcγRIIIA отбора, показывали усиленную ADCC активность относительно дикого типа.
Таблица 20
Исследование ADCC, опосредованного 4-4-20 анти-флуоресцеиновым антителом на SKBR3 клетках, покрытых флуоресцеином
<b>Мутант</b>
<b>Аминокислотные замены</b>
<b>Относительная скорость лизиса</b>
MgFc37
K248M
3,83
MgFc38
K392T, P396L
3,07
MgFc39
E293V, Q295E, A327T
4,29
MgFc41
H268N, P396LN
2,24
MgFc43
Y319F, P352L, P396L
1,09
MgFc42
D221E, D270E, V308A, Q311H, P396L, G402D
3,17
MgFc43b
K288R, T307A, K344E, P396L
3,3
MgFc44
K334N, P396L
2,43
MgFc46
P217S, P396L
2,04
MgFc47
K210M, P396L
2,02
MgFc48
V379M, P396L
2,01
MgFc49
K261N, K210M, P396L
2,06
MgFc50
P247S, P396L
2,1
MgFc51
Q419H, P396L
2,24
MgFc52
V240A, P396L
2,35
MgFc53
L410H, P396L
2
MgFc54
F243L, V305I, A378D, F404S, P396L
3,59
MgFc55
R255l, P396L
2,79
MgFc57
L242F, P396L
2,4
MgFc59
K370E, P396L
2,47
MgFc60
P217S, P396L
1,44
Мутантов 37, 38, 39, 41, 43 проанализировали, используя 0,5 мкг/мл ch4-4-20. Все другие антитела тестировали при 1 мкг/мл. Все скорости нормализовали по дикому типу ch4-4-20 (IgG1).
.
Мутантов дополнительно клонировали в тяжелую цепь моноклонального антитела 4D5 к опухоли (к HER2/neu) и моноклонального антитела 2H7 к CD20 путем замещения Fc-домена этих моноклональных антител. Эти химерные моноклональные антитела экспрессировали, очищали и тестировали в испытании ADCC с использованием стандартных способов временной трансфекции в 293H клетки и очистки на колонке G белка Химерные антитела 4D5 тестировали в испытании ADCC, используя клетки SK-BR3 в качестве мишеней (ФИГ. 13), тогда как химерные 2H7 антитела тестировали в испытании ADCC, используя клетки Daudi в качестве мишеней (ФИГ. 14).
Вторичная сортировка мутантов с помощью BIAcore
Мутантов, которые были отобраны в предыдущей сортировке, затем анализировали с помощью BIAcore для определения кинетических параметров для связывания FcγRIIIA(158V) и FcγRIIB. Использованный способ был таким же, как раскрытый в Разделе 7.1, выше.
off
off
Отображаемые данные являются значениями K относительно скоростей диссоциации дикого типа, как определено в экспериментах с использованием Fc-мутантов в ch4-4-20 моноклональном антителе. Относительные числа, большие единицы, указывают на уменьшение скорости K. Числа, меньшие единицы, указывают на увеличение скорости распада.
Таблице 21
Мутантами, которые показали уменьшение скоростей распада для FcγRIIIA, были MgFc38 (K392, P396L), MgFc43(Y319F, P352L, P396L), MgFc42( D221E, D270E, V308A, Q311H, P396L, G402D), MgFc43b (K288R, T307A, K344E, P396L), MgFc44 (K334N, P396L), MgFc46 (P217S, P396L), MgFc49 (K261N, K210M, P396L). Мутантами, которые показали уменьшение скорости распада для FcγRIIB, были MgFc38(K392, P396L), MgFc39 (E293V, Q295E, A327T), MgFc43 (K288R, T307A, K344E, P396L), MgFc44 (K334N, P396L). Данные Biacore суммированы в .
Таблица 21: Данные BIAcore
<b>Fc-мутант</b>
<b>AA остаток</b>
<b>FcγRIIIA158V</b><b>(K</b><sub>off</sub><b> дикого типа/мутант)</b>
<b>FcγRIIB</b><b>(K</b><sub>off</sub><b> дикого типа/мутант)</b>
MgFc37
K248M
0,977
1,03
MgFc38
K392T, P396L
1,64
2,3
MgFc39
E293V, Q295E, A327T
0,86
1,3
MgFc41
H268N, P396LN
0,92
1,04
MgFc43
Y319F, P352L, P396L
1,23
2,29
MgFc42
D221E, D270E, V308A, Q311H, P396L, G402D
1,38
MgFc43b
K288R, T307A, K344E, P396L
1,27
0,89
MgFc44
K334N, P396L
1,27
1,33
MgFc46
P217S, P396L
1,17
0,95
MgFc47
K210M, P396L
MgFc48
V379M, P396L
MgFc49
K261N, K210M, P396L
1,29
0,85
MgFc50
P247S, P396L
MgFc51
Q419H, P396L
MgFc52
V240A, P396L
MgFc53
L410H, P396L
MgFc54
F243L, V305I, A378D, F404S, P396L
MgFc55
R255l, P396L
MgFc57
L242F, P396L
MgFc59
K370E, P396L
MgFc60
P217S, P396L
MgFc61
A330V
1
0,61
MgFc62
R292G
1
0,67
MgFc63
S298N, K360R, N361D
1
0,67
MgFc64
E233G
1
0,54
MgFc65
N276Y
1
0,64
MgFc66
A330V, G427M,
1
0,62
MgFc67
V284M, S298N, K334E, R355W, R416T
7.3 PBMC ОПОСРЕДОВАННЫЕ ИСПЫТАНИЯ ADCC
МАТЕРИАЛЫ И СПОСОБЫ
Fc варианты, которые показали улучшенное связывание с FcγRIIIA, тестировали с помощью ADCC на основе PBMC, используя соотношение эффектор:мишень 60:1. Две различные опухолевые модельные системы использовали в качестве мишеней, SK-BR3 (к HER2/neu) и Daudi (к CD20). Процент специфического лизиса рассчитывали для каждого мутанта. Линейный регрессионный анализ использовали для расчета данных, устанавливая максимальный процент лизиса как 100%.
51
ADCC активируется в эффекторных клетках иммунной системы через путь передачи сигнала, который инициируется взаимодействием между FcγR низкой аффинности и иммунным комплексом. Популяции эффекторных клеток получали либо из первоначальной крови, либо из макрофагов, полученных из активированных моноцитов (MDM). Клетки-мишени насыщали европием и инкубировали с химерным MAb, а затем инкубировали с популяциями эффекторных клеток. Европий работает таким же образом, как Cr, но он не радиоактивный, и высвобожденный европий выявляется считывающим устройством флуоресцентных планшетов. Лимфоциты, собранные из периферической крови доноров (PBM) с использованием Ficoll-Paque градиента (Pharmacia), содержат первичные клетки натуральных киллеров (NK). Большая часть ADCC активности будет обеспечиваться NK, содержащими FcγRIIIA, а не FcγRIIB, на их поверхности.
Эксперименты выполняли, используя две различные популяции клеток-мишеней, SK-BR-3 и Daudi, экспрессирующих HER2/neu и CD20, соответственно. Испытания ADCC были поставлены с использованием Ch4-4-20/FITC, покрытого SK-BR-3, Ch4D5/SKBR3, и Rituxan/Daudi (данные не показаны). Химерные MAb модифицировали, используя идентифицированные Fc-мутации. Fc-мутантов клонировали в ch4D5. Очищенные антитела использовали для опсонизации SK-BR-3 клеток или клеток Daudi. Fc-мутантов клонировали в ch4D5.
РЕЗУЛЬТАТЫ.
Fc-мутанты показали улучшенную опосредованную PBMC активность ADCC в клетках SK BR3 (ФИГ. 13). График показывает линейный регрессионный анализ стандартного испытания ADCC. Антитело титровали по 3 порядку, используя соотношение эффектора к мишени 75:1. % Лизиса = (экспериментальное высвобождение - SR)/(MR-SR) * 100.
Fc-мутанты показали улучшенную опосредованную PBMC активность ADCC в клетках Daudi (ФИГ. 14).
7.4 ИСПЫТАНИЯ ADCC, ОСНОВАННЫЕ НА МАКРОФАГАХ, ПОЛУЧЕННЫХ ИЗ МОНОЦИТОВ (MDM)
in vivo
т.е.
FcγR зависимое умерщвление опухолевых клеток опосредуется макрофагами и NK клетками в мышиных опухолевых моделях (Clynes et al., 1998, PNAS USA, 95: 652-6). Смытые моноциты доноров использовали в качестве эффекторных клеток для анализа эффективности Fc-мутантов относительно индукции клеточной цитотоксичности к клеткам-мишеням в испытаниях ADCC. На паттерны экспрессии FcγRI, FcγR3A и FcγR2B воздействовали различными условиями роста. Экспрессию FcγR из замороженных моноцитов, культивированных в среде, содержащей различные комбинации цитокинов и сыворотку человека, изучали с помощью FACS, используя FcR-специфические MAb. (ФИГ. 15). Культивированные клетки окрашивали FcγR-специфическими антителами и анализировали с помощью FACS для определения профилей FcγR MDM. Условия, которые лучше всего имитировали  экспрессию FcγR макрофагов, , показывали наибольшую фракцию клеток, экспрессирующих CD16 и CD32B, использовали в испытании ADCC на основе макрофагов, полученных из моноцитов (MDM). Для эксперимента на ФИГ. 15 замороженные смытые моноциты выращивали в течение 8 дней в DMEM и 20% FBS, содержащих M-CSF (условие 1) или GM-CSF (условие 2). Для эксперимента на ФИГ. 16 замороженные смытые моноциты культивировали в течение 2 дней в DMEM и 20% FBS, содержащих GM-CSF, IL-2 и IFNγ, перед испытанием ADCC. Были также разработаны бессывороточные условия, которые позволяют высокие уровни экспрессии CD16 и CD32B (данные не показаны). Вкратце, очищенные моноциты выращивали в течение 6-8 дней в Macrophage-SFM (Invitrogen), содержащей GM-CSF, M-CSF, IL-6, IL-10 и IL-1β. В то время как доля CD32B+/CD16+ клеток в этих культурах является самой высокой при использовании смеси цитокинов, комбинации из двух или более цитокинов также будет усиливать FcγR экспрессию (M-CSF/IL-6, M-CSF/IL-; или M-CSF/IL-1β). Для испытаний ADCC добавляется IFNγ в течение последних 24-48 часов.
ADCC на основе MDM требует времени инкубации >16 часов для наблюдения умерщвления клеток-мишеней. Клетки-мишени нагружали индием-111, который сохраняется в течение длительных инкубаций в клетках-мишенях. Высвобождение индия подсчитывают, используя гамма-счетчик. Все другие реагенты, антитела и клетки-мишени были подобны испытанию ADCC на основе PBMC. ADCC активность в результате FcγRI может быть эффективно блокирована с использованием блокирующего антитела к FcRI (M21, Ancell). Условия испытания немного отличаются от испытания на основе PBMC: 20:1 мишень к эффектору; 18-14 часовая инкубация при 37°C.
Были тестированы Fc-мутанты, которые показывают улучшенную ADCC PBMC, увеличенное связывание с FcγRIIIA или уменьшенное связывание с FcγRIIB (ФИГ. 16).
7.5 ЭФФЕКТ Fc-МУТАНТОВ НА АКТИВНОСТЬ КОМПЛЕМЕНТА
In vivo
Fc-мутанты были первоначально идентифицированы на основе их увеличенного связывания с FcγRIIIA. Затем эти мутанты были подтверждены по их улучшенной аффинности ко всем рецепторам низкой аффинности и во многих случаях улучшенной активности в ADCC, опосредованной PBMC.  опосредованная антителом цитотоксичность может происходить благодаря множеству механизмов. Дополнительно к ADCC другие возможные механизмы включают комплемент-зависимую цитотоксичность (CDC) и апоптоз. Связывание C1q с Fc-участком иммуноглобулина инициирует каскад в результате лизиса клеток с помощью CDC. Взаимодействие C1q и Fc было исследовано на сериях Fc-мутантов. Результаты этих экспериментов указывают, что C1q и FcR с низкой аффинностью связывают перекрывающиеся участки Fc, однако точные контактные участки в Fc варьируют.
Мутанты, которые показали улучшенную ADCC в испытании на основе PBMC, были изучены относительно их эффекта на CDC. Антитела анализировали в Ch-mAb к CD20, 2H7. Была выявлена улучшенная CDC для каждого тестированного мутанта ch-mAb. Интересно, что, несмотря на то, что эти мутанты были отобраны по их улучшенной ADCC, они также показали усиленную CDC.
МАТЕРИАЛЫ И СПОСОБЫ
6
4
o
o
2
2.
. Испытание CDC использовали для тестирования Fc-мутантов с использованием анти-CD20 и клетки Daudi в качестве мишеней. Сыворотку морских свинок использовали в качестве источника комплемента (US Biological). Испытание CDC было подобно ADCC на основе PBMC. Клетки-мишени нагружали европием и опсонизировали с ChMAb. Однако комплемент, сыворотку морских свинок, добавляли вместо эффекторных клеток. ФИГ. 17 показывает технологическую схему испытания. ChMab к CD20 титровали на 3 порядка. Рассчитывали % лизиса. Клетки Daudi (3 x 10) метили реагентом BADTA. Аликвоты 1 x 10 клеток помещали в лунки 96 луночного планшета. Антитела титровали в лунки, используя 3-кратное разведение. Реакции опсонизации позволяли продолжаться в течение 30-40 минут при 37C в 5% CO. Сыворотку морских свинок добавляли в конечной концентрации 20%. Реакции позволяли продолжаться в течение 3,5 часа при 37C в 5% COЗатем 100 uls клеточной среды добавляли к реакции, и клетки центрифугировали. Для регистрации 20 uls супернатанта добавляли к 200 uls раствора европия, и планшеты считывались в Victor2 (Wallac).
РЕЗУЛЬТАТЫ:
Все мутанты, которые показали улучшенное связывание для активации FcR или C1q, были предоставлены для испытания CDC (ФИГ. 18). Fc-мутанты, которые показали усиленное связывание с FcγRIIIA, также показали улучшенную активность комплемента. Каждый из мутантов показывает усиленную активность комплемента по сравнению с диким типом. Тестированные мутанты являются двойными мутантами. В каждом случае одной из имеющихся мутаций является P396L.
off
Таблице
22
Для определения того, коррелирует ли увеличение CDC с увеличенным связыванием между C1q и IgG1 Fc, связывание этих двух белков измеряли в реальном времени с использованием поверхностного плазмонного резонанса. Для изучения связывания между C1q и IgG1 Fc Fc-варианты клонировали в ch-mAb к CD32B, 2B6. Это позволило захватить антитела дикого типа и мутантные антитела на предметное стекло посредством растворимого белка CD32B (ФИГ. 19A). Три из четырех мутантов, тестированных в CDC, были также изучены в Biacore. Все 3 показали значительно усиленную K по сравнению с Fc дикого типа (ФИГ. 19B). BIAcore формат для связывания C1q с 2B6 мутантами демонстрирует усиленное связывание мутантов с мутацией P396L (ФИГ. 20). Мутация D270E может снижать связывание C1q в различной степени. Краткое описание кинетических анализов FcγR и связывания C1q изображено в  ниже.
ТАБЛИЦА 22 Кинетический анализ FcgR и связывание C1q с мутантом 2B6
<b>2B6 Мутанты</b>
<b>3aV158</b>
<b>3aF158</b>
<b>2bfcagl</b>
<b>2aR131Fcagl</b>
<b>2aH131Fcagl</b>
<b>C1q</b>
WT
0,192
0,434
0,056
0,070
0,053
0,124
MgFc38(K392T,P396L)
0,114
0,243
0,024
0,028
0,024
0,096
MgFc51 (Q419H, P396L)
0,142
0,310
0,030
0,036
0,028
0,074
MgFc55 (R255I, P396L)
0,146
0,330
0,030
0,034
0,028
0,080
MgFc59 (K370E, P396L)
0,149
0,338
0,028
0,033
0,028
0,078
MgFc31/60
0,084
0,238
0,094
0,127
0,034
0,210
MgFc51/60
0,112
0,293
0,077
0,089
0,028
0,079
MgFc55/60
0,113
0,288
0,078
0,099
0,025
0,108
MgFc59/60
0,105
0,296
0,078
0,095
0,024
0,107
7.6 РАЗРАБОТКА ВАРИАНТОВ Fc С УМЕНЬШЕННЫМ СВЯЗЫВАНИЕМ С FcγRIIB
На основе отбора Fc-мутантов, которые снижают связывание с FcγRIIB и увеличивают связывание с FcγRIIA 131H, был идентифицирован ряд мутаций, включая D270E. Каждая мутация тестировалась индивидуально на связывание с Fc рецепторами низкой аффинностью и их аллельными вариантами.
D270E имела характеристики связывания, которые свидетельствовали, что она, в частности, будет снижать связывание FcγRIIB. D270E тестировали в комбинации с мутациями, которые ранее были идентифицированы на основе их улучшенного связывания со всеми FcR.
РЕЗУЛЬТАТЫ:
Таблицах
23 и 24
off
Как показано в  и ФИГ. 21 и 22, добавление D270E мутации усиливает H131 связывание FcγRIIIA и FcγRIIA и снижает связывание FcγRIIB. ФИГ. 23 показывает график MDM ADCC результатов в зависимости от K, как определено для H131H связывания CD32A для отобранных мутантов.
ТАБЛИЦА 23
СКОРОСТЬ ДИССОЦИАЦИИ (1/с) СВЯЗЫВАНИЯ FcγR С ДИКОГО ТИПА И МУТАНТНЫМ ХИМЕРНЫМ 4D5 Ab, ПОЛУЧЕННАЯ В АНАЛИЗЕ BIACORE
<b>4D5 Мутанты</b>
<b>3aV158</b>
<b>3aF158</b>
<b>2bfcagl</b>
<b>2aR131Fcagl</b>
<b>2aH131Fcagl</b>
Wt pure
0,175
0,408
0,078
0,067
0,046
MgFc55
0,148
0,381
0,036
0,033
0,029
MgFc55/60
0,120
0,320
0,092
0,087
0,013
MgFc55/60+R292G
0,116
0,405
0,124
0,112
0,037
MgFc55/60+Y300L
0,106
0,304
0,092
0,087
0,015
MgFc52
0,140
0,359
0,038
0,040
0,026
MgFc52/60
0,122
0,315
0,094
0,087
0,013
MgFc59
0,145
0,378
0,039
0,047
0,033
MgFc59/60
0,117
0,273
0,088
0,082
0,012
MgFc31
0,125
0,305
0,040
0,043
0,030
MgFc31/60
0,085
0,215
0,139
0,132
0,020
MgFc51
0,135
0,442
0,060
0,047
0,062
MgFc51/60
0,098
0,264
0,118
0,106
0,023
MgFc38
0,108
0,292
0,034
0,025
0,032
MgFc38/60
0,089
0,232
0,101
0,093
0,021
ТАБЛИЦА 24 КИНЕТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ 4D5 МУТАНТОВ
4D5 Мутанты
3aV158
3aF158
2bfcagl
2aR131Fcagl
2aH131Fcagl
MgFc70
0,101
0,250
0,030
0,025
0,025
MgFc71
0,074
0,212
0,102
0,094
0,020
MgFc73
0,132
0,306
0,190
-----
0,024
MgFc74
0,063
0,370
n.b.
0,311
0,166
WT023 стабильный
0,150
0,419
0,071
0,068
0,043
7.7 ИССЛЕДОВАНИЕ КИНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ Fc-МУТАНТОВ
ниже
ниже.
Кинетические параметры связывания химерных антител 4D5, несущих Fc-мутантов, с двумя аллотипами FcγRIIIA, FcγRIIA 131H и FcγRIIB, были проанализированы с помощью BIAcore с использованием способа, сходного с раскрытым в Разделе 7.8 . Два аллотипа FcγRIIIA, FcγRIIIA 158V и FcγRIIIA 158F, описаны более детально в Разделе 7.9
Материалы и Способы
т.е.
выше.
Оба аллотипа FcγRIIIA, использованные в этом испытании, были растворимыми мономерными белками, причем внеклеточный участок FcγRIIIA присоединен к линкер-AVITAG последовательности, как описано в Разделе 7.1. FcγRIIB и FcγRIIA, использованные в этом испытании, были растворимыми димерными белками,  внеклеточный домен FcγRIIB или FcγRIIA слит с шарнир-CH2-CH3 доменом человеческого IgG2, как описано в Разделе 7.1
Детали BIAcore методологии и анализа изложены в Разделе 7.1. В этом испытании вариантные Fc-участки клонировали в химерном 4D5 антителе, которое является специфическим для рецептора 2 человеческого эпидермального фактора роста (HER2/neu). Антиген HER2/neu иммобилизировали на одной из проточных кювет сенсорного чипа. Химерные антитела 4D5, несущие Fc-мутации, затем пропускали по поверхности 3 минутными инъекциями 300 нМ раствора при скорости потока 5 мкл/мин. Далее ряд разведений рецептора в HBS-P буфере (10 мМ HEPES, 150 мМ NaCl, 0,005% поверхностно-активного вещества P20, 3 мМ EDTA, pH7,4) были впрыснуты на поверхность при 100 мкл/мин.
Кривые связывания для двух различных концентраций рецептора (400 нМ и 800 нМ для FcγRIIIA V158 и FcγRIIIA 158F; 100 нМ и 200 нМ для FcγRIIA и FcγRIIB) были приведены в соответствие и ответы скорректированы до таких же уровней захваченных антител, а стандартные кривые были вычтены из экспериментальных кривых. Фазы ассоциации и диссоциации были установлены отдельно.
Результаты
Связывание FcγRIIIA, аллотип 158 V и 158F, FcγRIIB и FcγRIIA 131H анализировали и резонансные ответы нормализовали на уровне ответа, полученного от дикого типа химерного антитела 4D5. Кинетические параметры для связывания FcγR с химерным антителом 4D5 были получены аппроксимацией данных при двух различных концентрациях FcγR: 400 нМ и 800 нМ для FcγRIIIA V158 и FcγRIIIA 158F; 100 нМ и 200 нМ для FcγRIIA и FcγRIIB.
Таблица
25
представляет скорость диссоциации для каждого из четырех рецепторов, проанализированных в связи с указанными вариантами Fc-участков.
Таблица 25
Скорость диссоциации (1/с) FcγR связывания с дикого типа и мутантным химерным антителом 4D5, полученная в анализе BIAcore
<b>Fc-участок химерного 4D5</b>
<b>Аминокислота в положении</b>
<b>Рецептор FcγR</b>
<b>243</b>
<b>292</b>
<b>300</b>
<b>305</b>
<b>396</b>
3A 158V
3A 158F
2B
2A 131H
<b>Дикого типа</b>
<b>F</b>
<b>R</b>
<b>Y</b>
<b>V</b>
<b>P</b>
<b>0,186</b>
<b>0,294</b>
<b>0,096</b>
<b>0,073</b>
<b>MgFc0088</b>
L
P
L
I
L
0,016
0,064
0,058
0,035
<b>MGFc0143</b>
I
P
L
I
L
0,017
0,094
0,091
0,049
<b>Учетверенный</b>
<b>MGFc0088A</b>
L
P
L
L
0,016
0,094
0,075
0,044
<b>MGFc0084</b>
L
P
I
L
0,048
0,133
0,278
0,083
<b>MGFc0142</b>
L
L
I
L
<b>Тройной</b>
<b>MGFc0155</b>
L
P
L
0,029
0,135
0,155
0,057
<b>MGFc0074</b>
L
P
I
0,063
0,37
NB
0,166
<b>MGFc0093</b>
P
I
L
0,080
0,197
0,125
0,190
<b>Двойной</b>
<b>MGFc0162</b>
L
P
0,041
0,515
0,900
0,18
<b>MGFc0091</b>
L
L
0,108
0,330
0,036
0,026
<b>MGFc0070</b>
P
I
0,101
0,250
0,030
0,025
<b>Единичный</b>
<b>SV12/F243L</b>
L
0,048
0,255
0,112
0,100
<b>MGFc0161</b>
P
0,067
0,485
0,421
0,117
G
0,124
NT
0,384
NT
<b>MGFc0092</b>
L
0,211
NT
0,058
0,02
<b>MGFc0089</b>
L
0,127
0,306
0,031
0,039
Таблица 26
off
off
off
представляет результаты дублированного исследования, где значения K химерного антитела 4D5 вычислены относительно скоростей диссоциации дикого типа. Относительные числа, большие единицы, показывают уменьшение скорости K. Числа, меньшие единицы, показывают увеличение размера K.
Таблица 26. Относительная скорость диссоциации ch4D5 антитела, полученная в исследовании BIAcore
<b>Химерный 4D5 Fc участок</b>
<b>FcγR рецептор, относительная скорость диссоциации</b><b>(K</b><sub>off</sub><b> дикий тип/K</b><sub>off</sub><b> мутант)</b>
<b>3A 158V</b>
<b>3A 158 F</b>
<b>2B</b>
<b>2A 131H</b>
<b>F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L</b>
<b>10,06</b>
<b>8,25</b>
<b>1,38</b>
<b>1,11</b>
<b>F243L, R292P, Y300L</b>
<b>6,69</b>
<b>2,3</b>
<b>0,32</b>
<b>0,65</b>
<b>F243L, R292P, P396L</b>
<b>5,37</b>
<b>3,52</b>
<b>0,32</b>
<b>0,65</b>
<b>F243L, R292P, Y300L, P396L</b>
<b>10,06</b>
<b>5,62</b>
<b>1,07</b>
<b>0,89</b>
<b>F243L, R292P, V305I</b>
<b>2,56</b>
<b>1,43</b>
<b>nb*</b>
<b>0,23</b>
<b>F243L</b>
<b>4,79</b>
<b>3,44</b>
<b>0,84</b>
<b>0,57</b>
*nb, не связывалось
7.8 ADCC АНАЛИЗ Fc-МУТАНТОВ
Fc мутации, выявленные в Примере 7.7 как содержащие увеличенную аффинность к FcγIIIA и/или FcγIIA, были проанализированы на их относительную ADCC активность.
Материалы и Способы
o
o
2
Детали относительно ADCC анализов заложены в Разделе 7.1 и в публикациях заявок на патент США 2005/0037000 и 2005/0064514, и в публикации заявки на международный патент WO 04/063351, каждый из которых включен таким образом ссылкой во всей своей полноте. В этом анализе HT29 клетки карциномы толстой кишки (ATCC Accession No. HTB-38), насыщенные индием-111, использовали в качестве мишеней, а эффекторными клетками были PBMC, изолированные из доноров, используя Ficoll градиент. Клетки-мишени были опсонизированы химерными 4D5 антителами, содержащими вариант Fc-участков в конечных концентрациях 2-5000 нг/мл. Опсонизированные клетки-мишени затем добавляли к эффекторным клеткам для производства соотношения эффектор: мишень 50:1 и инкубировали в течение 18 часов при 37C, 5% CO. После инкубации клетки центрифугировали при ~220 г в течение пяти минут при 10C. Уровень индия-111 в супернатанте регистрировали гамма-счетчиком.
Результаты
Химерные 4D5 антитела, содержащие вариант Fc-участков MGFc88 (F243L,R292P,Y300L,V305I,P396L), MGFc88A (F243L,R292P,Y300L, P396L) и MGFc155 (F243L,R292P,Y300L) были отобраны на основе усиленной афинности к FcγRIIIA и/или FcγIIA и испытаны на их ADCC активность. ФИГ. 24 A и B показывают, что испытанные варианты Fc показывали усиленную ADCC активность относительно антитела дикого типа при концентрациях опсонизации примерно 20 нг/мл зависимым от концентрации образом. Данные указывают, что Fc-мутанты, выявленные как содержащие увеличенное аффинность к FcγRIIIA, также, вероятно, проявляют усиленную ADCC активность.
7.9    Fc МУТАНТАМИ ОПОСРЕДОВАННЫЙ КОНТРОЛЬ ОПУХОЛЕВОГО РОСТА НА IN VIVO ОПУХОЛЕВОЙ МОДЕЛИ
in vivo
Fc мутации, выявленные как содержащие усиленную аффинность к FcγIIIA и/или FcγIIA, были в дальнейшем проанализированы на относительную эффективность опухолевого контроля, используя  опухолевую модельную систему.
Материалы и Способы
6
2
например
Антитела, несущие Fc-мутантов, испытывали на противоопухолевую активность на мышиной ксенотрансплантатной системе. BALBC/голым мышам подкожно вводили 5x10 клеток Daudi и затем контролировали общие признаки заболевания, , набор/потерявеса и активность чистки. Без лечения эта модельная система приводит в результате к 100 % смертности со средним временем выживаемости приблизительно 2 недели после инокуляции опухолевых клеток. Лечение состоит из доз антитела дикого типа или антитела, содержащего вариантный Fc-участок, вводимых с недельными интервалами. Животные, которым вводили один буфер в такие же интервалы, служили в качестве контроля. Вес опухоли вычисляли на основе расчетного объема подкожной опухоли согласно формуле (ширина х длина)/2.
Результаты
С недельными интервалами мыши, инокулированные клетками Daudi, получали дикого типа гуманизированные 2B6 (“h2B6”), гуманизированные 2B6, содержащие мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (“h2B6 0088”) или один буфер. Дикого типа и Fc-мутантное h2B6 антитело показывали сходные уровни подавления опухоли при самых высоких испытанных дозовых режимах, еженедельных дозах 25 мкг (ФИГ. 25 A и B). Однако существенные различия в эффективности антител были отмечены, когда дозировки были снижены. 100 и 10-кратное снижение дозировки дикого типа h2B6 предоставляло не больший опухолевый контроль, чем введение одного буфера (ФИГ. 42 A). В отличие от этого, h2B6 0088 предоставляло защиту при недельных дозах 2,5 мкг и, по меньшей мере, ограниченную защиту при недельных дозах 0,25 мкг (ФИГ. 25 B).
Защита, предоставленная даже самой низкой дозой Fc-мутантного антитела, была подтверждена в сравнениях выживаемости. В 11 недель 4 из 7 мышей оставались живыми в группе, обработанной дозами 0,25 мкг h2B6 0088 по сравнению с только 1 из 7 в группе, обработанной такой же дозой дикого типа h2B6 (ФИГ. 26 A & B).
7.10  Fc-МУТАНТАМИ ОПОСРЕДОВАННЫЙ КОНТРОЛЬ ОПУХОЛЕВОГО РОСТА НА ЭКСПРЕССИРУЮЩЕЙ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ Fc РЕЦЕПТОР ТРАНСГЕННОЙ МЫШИНОЙ ОПУХОЛЕВОЙ МОДЕЛИ
in vivo
Fc мутации, выявленные как содержащие усиленную аффинность к FcγIIIA и/или FcγIIA, были в дальнейшем проанализированы на относительную эффективность опухолевого контроля, используя  ксенотрансплантатную человеческого Fc рецептора трансгенную мышиную опухолевую модельную систему.
Материалы и Способы
6
2
например
Гуманизированные антитела против человеческого CD32B (h2B6) или HER2/neu (h4D5), несущие Fc мутации, испытывали на противоопухолевую активность на мышиной ксенотрансплантатной системе, в которой мышиный FcγIIIA (CD16) был заменен на свой человеческий ортолог CD16A (huCD16A). Иммунодефицитным мышам сделали инъекцию с 5x10 опухолевых клеток и затем контролировали общие признаки заболевания, , набор/потерявеса и активность чистки. Лечение состоит из доз антитела дикого типа или антитела, содержащего вариантный Fc-участок, вводимых с суточными или недельными интервалами (как указано). Животные, которым вводили один буфер или антитело, содержащее мутацию N297Q (которая отменяет связывание с любым FcγR) в такие же интервалы, служили в качестве контроля. Вес опухоли вычисляли на основе расчетного объема подкожной опухоли согласно формуле (ширина X длина)/2.
Результаты
h2B6: Гуманизированное анти-CD32B и Fc варианты
С недельными интервалами, начиная через две недели после инъекции опухоли, RAG1-/- C57BI/6 мыши, которым подкожно ввели клетки Raji (CD32B-экспрессирующие опухолевые клетки), получали дикого типа гуманизированные 2B6 (“h2B6”; Rituxan), гуманизированные 2B6, содержащие мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (“h2B6 0088”; “FcMg88”, или MGA321) или один буфер. Дикого типа и Fc-мутантное h2B6 антитело показывали подобные уровни подавления опухолевого роста при еженедельных дозах 250 мкг и 25 мкг (ФИГ. 27). Однако существенные различия в эффективности антител наблюдались, когда дозировки были снижены до 2,5 мкг: при этой дозировке дикого типа h2B6 предоставляло ограниченный контроль опухолевого роста по сравнению с введением одного буфера; в отличие от этого, дозировка 2,5 мкг h2B6 0088 задерживала прогрессирование опухоли почти на одну неделю (ФИГ. 27). В другом эксперименте эффективность самых низких дозировок испытанного Fc-оптимизированного MGA321 была эквивалентна контрольным (PBS или Rituxin в эквивалентных дозировках); однако, введение самой высокой дозировки (250 мкг) Fc-оптимизированного h2B6 антитела предоставляло существенный контроль опухолевого роста по сравнению с диким типом h2B6 и одним буфером обработанных мышей (ФИГ. 28A-2B).
Защита, предоставленная Fc-мутантным антителом, была подтверждена в сравнениях выживаемости. Голым (FoxN1) мышам внутрибрюшинно вводили EL4-CD32B клетки и затем обрабатывали в день 0, 1, 2, 3, и 6 внутрибрюшинным введением гуманизированного 2B6 1,3 или гуманизированного 2B6 1,3, содержащего мутант 31/60 (P247L, D270E, N421K) (“h2B6 1,3 3160”). В 14 недель по меньшей мере 90% мышей, обработанных h2B6 1,3 3160, выжило по сравнению с 55% или менее в группе, обработанной такой же дозой дикого типа h2B6 1,3 (ФИГ. 29 и ФИГ. 30).
В дальнейших экспериментах по выживанию на такой же системе мышей обрабатывали внутрибрюшинным введением гуманизированного 2B6 3,5, гуманизированного 2B6 3,5, содержащего мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L) (“h2B6 3,5 0088”), гуманизированного 2B6 3,5 N297Q (отрицательный контроль) или одного буфера. В 14 недель все мыши, обработанные h2B6 3,5 0088, выжили по сравнению с 30% в группе, обработанной такой же дозой дикого типа h2B6 3,5, и <20% в группах, обработанных N297Q мутантом или PBS (ФИГ. 31A; обработка на день 0, 1, 2, 3); такой же результат был достигнут при такой низкой дозе как 4 мкг/г веса тела (ФИГ. 31B; обработка на день 0, 1, 2, 3, 4).
выше
Протективные эффекты антител, содержащих вариант Fc-участков, в дальнейшем испытывали на трансгенных мышах, несущих человеческий CD32A в дополнение к mCD16 -/- huCD16A+ генотипу, используя EL4-CD32B модель, описанную . Обработка диким типом h2B6 или отрицательным контролем h2B6 3,5 N297Q, имела своим результатом только 20% на 100 дней после инокуляции опухоли; обработка Fc оптимизированным антителом h2B6 3,5 0088, увеличивала выживаемость на 10%, с 30% выживаемостью на 100 дней после инокуляции (ФИГ. 32).
Эффект экспрессии hCD16A и/или hCD32A в трансгенной мышиной EL4-CD32B опухолевой модели на обработку h2B6 антителом был в дальнейшем исследован, используя голых (FoxN1) мышей, позитивных по hCD16A, позитивных по hCD16A и hCD32A, или позитивных по hCD32A, каждые на фоне mCD16 -/-. Трансгенным внутрибрюшинно вводили клетки EL4-CD32B и затем обрабатывали в день 0, 1, 2, и 3 диким типом гуманизированного 2B6 3,5 (“h2B6 3.5”), гуманизированным 2B6 3,5, содержащим мутант FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L) (“h2B6 3,5 88”), h2B6 N297Q (“h2B6 3,5 N297Q;” отрицательный контроль) или одним буфером. На 100 день после инокуляции опухоли все CD16A позитивные мыши, обработанные h2B6 3,5 88 выжили по сравнению с 50% или менее выживших в группах, обработанных такой же дозой дикого типа h2B6 3,5 или контрольных (ФИГ. 33A). У мышей, несущих человеческий CD32A в дополнение к mCD16 -/- huCD16A+ генотипу, выживших было не более чем 25% на 100 дней после инокуляции, не обращая внимания на обработку (ФИГ. 33B). У мышей экспрессирующих hCD32A, но не hCD16, только мыши в группе Fc-оптимизированной обработки, обработанные h2B6 3,5 88, выжили дольше 1 месяца, с 25% выживших на 100 день после инокуляции опухоли (ФИГ. 33C).
Эффект различных временных курсов обработки Fc-оптимизированными антителами (h2B6 0088; “MGA321”) на выживаемость мышей также исследовали. Внутрибрюшинная инъекция с MGA321 мышам непосредственно после инъекции опухоли предоставляла выживаемость 75%-100% мышей, как при единичной, так и при многократных дозах в течение последующих дней или недель (ФИГ. 34). Когда MGA321 вводили впервые через день или позднее после включения опухоли, оно предоставляло максимум 40% выживаемости, даже когда вводили в многократных дозах в течение нескольких дней или недель (ФИГ. 34).
ch4D5: Химерное анти-HER2/neu и Fc варианты.
HER2/neu позитивную опухолевую модель создавали путем внутрибрюшинной инъекции клеток mSKOV3 (HER2/neu-эекспрессирующих клеток опухоли яичника) mCD16 нокаутным голым (FoxN1) мышам, которые также носили и экспрессировали человеческий CD16A или одновременно человеческий CD16A и человеческий CD32A. При 8 недельных интервалах, начиная с момента времени 0, инокулированным мышам подкожно вводили “дикий тип” химерного антитела против человеческого HER2/neu (ch4D5), ch4D5, содержащий FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L) (“ch4D5 0088”), ch4D5, содержащий N297Q (агликозилированный отрицательный контроль; “ch4D5 N297Q”), или один буфер. Обработка ch4D5 0088 подавляла опухолевый рост в течение всего курса эксперимента (10 недель) у трансгенных мышей, позитивных по человеческому CD16A на фоне mCD16-/- или у трансгенных мышей, несущих человеческий CD32A в дополнение к mCD16 -/- huCD16A+ генотипу (ФИГ. 35A или 35B, соответственно).
Защита, предоставленная Fc-мутантным ch4D5 антителом, была подтверждена в сравнениях выживаемости. Нокаутным mCD16 (mCD16 -/-) голым (N/N) мышам, трансгенным по человеческому CD16A, внутрибрюшинно вводили клетки mSKOV3 и затем обрабатывали диким типом химерного 4D5 (“ch4D5”), ch4D5, содержащим FcMG0088 (F243L, R292P, Y300L, V305I P396L), ch4D5 N297Q (отрицательный контроль), или одним буфером. Инокулированные опухолью мыши получали шесть доз, начиная с дня 0 (день инокуляции опухоли), 100 мкг или 1 мкг антитела, доставленного внутрибрюшинно (ФИГ. 36A и 36B, соответственно). В 14 недель ~60% мышей, обработанных с 100 мкг ch4D5 0088, выжили по сравнению с ~40% в группе, обработанной такой же дозой дикого типа ch4D5 и <10% мышей, обработанных ch4D5 N297Q или одним буфером (ФИГ. 36A). При дозах 1 мкг общая продолжительность выживания мышей, обработанных диким типом или Fc-оптимизированными антителами, была снижена относительно обработанных 100 мкг. Однако, через шесть недель более чем 80% ch4D5 0088-обработанных мышей все еще оставались живы по сравнению с ~10% мышей, которые получали другие обработки (ФИГ. 36B), подтверждая, что умеренная доза Fc-оптимизированного ch4D5 предоставляет существенное улучшение усиления жизнеспособности по сравнению с антителом дикого типа.
Другие Fc варианты ch4D5 испытывали в подобных экспериментах выживаемости.
выше
Химерные 4D5, содержащие мутантный MGFc0155 (F243L, R292P, Y300L) (“ch4D5 0155”) или мутантный MCFc3160 (P247L, D270E, N421K) (“ch4D5 3160”) испытывали совместно с диким типом ch4D5, ch4D5 N297Q, и ch4D5 0088 как описано . Мыши получали восемь еженедельных внутрибрюшинных обработок, начиная со дня 0 (инокуляция опухоли), с 100 мкг антитела. У мышей, получавших дозы 100 мкг, 100% группы, обработанной ch4D5 0155, были живы на 130 день после инокуляции по сравнению с ~85% обработанных ch4D5 0088 и 50% обработанных ch4D5 3160. В отличие от этого, только приблизительно 30% мышей, которым давали ch4D5 дикого типа, были все еще живы на 130 день. Все мыши, обработанные одним буфером или с ch4D5 N297Q, погибли в течение 14 недель и 10 недель соответственно после инъекции опухоли (ФИГ. 37A). При 10-кратном уменьшении дозы Fc-оптимизированные антитела были менее эффективны в усилении выживаемости по сравнению с ch4D5 дикого типа. В то же время ch4D5 0155 было более эффективным для повышения выживаемости на ранних временных точках, в 18 недель ~60% мышей в группе, обработанной ch4D5 0155 или ch4D5 0088, выжило по сравнению с 50% обработанных диким типом и 25% ch 4D5 3160-обработанных (ФИГ. 37B).
В другой серии экспериментов по выживанию нокаутным mCD16 (mCD16 -/-) голым (N/N) мышам, трансгенным по человеческому CD16A или трансгенным одновременно по человеческому CD16A (“hCD16”) и человеческому CD32A (“hCD32A”), внутрибрюшинно вводили клетки mSKOV3 и затем, начиная со дня 0, давали восемь еженедельных обработок с диким типом ch4D5, ch4D5 0088, ch4D5 N297Q или одним буфером. На семь недель после инъекции опухоли все ch4D5 0088-обработанные и hCD16 позитивные мыши были живы, тогда как только ~30% с Ch4D5 N297Q и ~10% обработанных буфером hCD16 позитивных мышей выжило (ФИГ. 38A). Среди голых мышей, несущих человеческий CD32A в дополнение к mCD16 -/- huCD16A+ генотипу 50% мышей, обработанных ch4D5 0088, были живы после восьми недель по сравнению с теми, которые получили ch4D5 N297Q (15% живы после восми недель) или один буфер (все погибли в течение шести недель) (ФИГ. 38B).
7.11     ВАРИАНТЫ Fc, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ ИЗМЕНЕННОЕ СООТНОШЕНИЕ АФИННОСТИ
off
Таблице 27
Иммуноглобулины, чьи Fc-участки были мутированы по образу описанному выше, сортируют относительно Fc вариантов, имеющих измененное соотношение афинности к FcγRIII и FcγRII путем оценки K вариантов и их иммуноглобулинов-предшественников дикого типа. Испытания проводили, используя одновременно V158 и F158 изотипы FcγRIII, и против FcγRIIB и FcγRIIAH131. Результаты суммированы в .
<b>ТАБЛИЦА 27</b><b>СРАВНЕНИЕ K</b><sub>OFF</sub><b> FC МУТАНТОВ И АНТИТЕЛА ДИКОГО ТИПА </b><b>(K</b><sub>OFF</sub><b> ДИКИЙ ТИП / K</b><sub>OFF</sub><b> МУТАНТ)</b>
<b>Fc последовательность</b>
<b>CD16A </b><b>V158</b>
<b>CD16A </b><b>F158</b>
<b>CD32B</b>
<b>CD32A </b><b>H131</b>
<b>Соотношение аффинностей</b>
<b>CD16A/CD32B</b>
<b>V158</b>
<b>F158</b>
WT
1,00
1,00
1,00
1,00
1,00
1,00
F243L
4,79
3,44
0,84
0,57
5,70
4,10
D270E
1,25
1,48
0,39
2,24
3,21
3,79
R292P
2,90
0,64
0,25
0,53
11,60
2,56
R292G
1,54
--
0,25
0,14
6,2
--
Y300L
1,01
1,17
1,18
1,86
0,86
0,99
P396L
1,27
1,73
2,58
1,63
0,49
0,67
P396L D270E
1,38
1,65
0,89
2,44
1,55
1,85
P396L F243L
1,49
1,60
2,22
1,50
0,67
0,72
P247L N421K
1,29
1,73
2,00
1,30
0,65
0,87
P247L N421K D270E
1,89
2,46
0,58
1,95
3,26
4,24
P247L N421K F243L
1,89
1,71
0,17
0,39
11,12
10,06
P247L N421K D270E F243L
2,30
3,45
0,32
0,98
7,19
10,78
<b>ТАБЛИЦА 27</b><b>СРАВНЕНИЕ K</b><sub>OFF</sub><b> FC МУТАНТОВ И АНТИТЕЛА ДИКОГО ТИПА </b><b>(K</b><sub>OFF</sub><b> ДИКИЙ ТИП / K</b><sub>OFF</sub><b> МУТАНТ)</b>
<b>Fc последовательность</b>
<b>CD16A </b><b>V158</b>
<b>CD16A </b><b>F158</b>
<b>CD32B</b>
<b>CD32A </b><b>H131</b>
<b>Соотношение аффинностей</b>
<b>CD16A/CD32B</b>
<b>V158</b>
<b>F158</b>
P247L N421K D270E Y300L
2,44
1,16
0,8
1,84
3,05
1,45
R255L P396L
1,09
1,39
2,22
1,34
0,49
0,63
R255L P396L D270E
1,34
1,65
0,87
3,00
1,54
1,90
R255L P396L D270E F243L
1,75
1,64
0,38
1,44
4,61
4,32
R255L P396L D270E R292G
1,39
1,30
0,65
1,05
2,14
2,00
R255L P396L D270E Y300L
1,52
1,74
0,87
2,60
1,75
2,00
K392T P396L
1,49
1,81
2,35
1,22
0,63
0,77
K392T P396L D270E
1,81
2,28
0,79
1,86
2,29
2,89
K392T P396L D270E F243L
3,16
2,44
0,44
1,70
7,18
5,55
Q419H P396L
1,19
1,19
1,33
0,63
0,89
0,89
Q419H P396L D270E
1,64
2,00
0,68
1,70
2,41
2,94
Q419H P396L D270E F243L
1,46
1,15
0,26
1,11
5,62
4,42
R292P F243L
4,73
0,6
0,12
0,34
39,4
5,00
R292P F243L
4
1,67
0,16
0,52
25
10,44
R292P V284M K370N
1,14
1,37
0,37
1,79
3,1
3,7
R292P V305I
1,59
2,11
2,67
1,56
0,60
0,79
R292P V305I
1,32
1,28
0,37
0,75
3,6
3,46
R292P V305I F243L
2,56
1,43
ND
0,23
>25
>25
R292P V305I F243L P396L
5,37
2,53
0,40
0,78
13,43
6,33
R292P V305I F243L P396L Y300L
10,06
8,25
1,38
1,11
7,29
5,98
R292P V305I F243I P396L Y300L
10,9
3,12
1,05
1,49
10,4
2,97
R292P F243L P396L Y300L
10,06
5,62
1,07
0,89
9,40
5,25
R292P F243L P300L
6,69
2,3
0,32
0,65
20,9
7,19
R292P V305I P396L
1,85
1,90
0,92
1,50
2,01
2,07
R292P V305I P396L F243L
5,37
2,53
0,40
0,78
13,43
6,33
G316D R416G D270E
2,18
2,49
0,78
1,95
2,79
3,19
G316D R416G D270E F243L
1,50
1,34
0,20
1,22
7,50
6,70
G316D R416G D270E P396L
1,22
0,94
1,07
0,95
1,14
0,88
Fc мутанты проанализированы в данном исследовании и представлены в левой колонке. Константы скорости диссоциации связывания Fe с различными FcR были определены путем анализа Biacore. ND= не обнаруженное связывание
Таблице 28
Результаты показывают, что способы настоящего изобретения способны создавать одновременно молекулы, которые обладают Fc-участками, имеющими соотношение афинности большее, чем дикого типа (т.е., >1), а также молекулы, которые обладают Fc-участками, имеющими соотношение афинности меньшее, чем дикого типа (т.е., >1). Анализ Fc вариантов показывает, что молекулы, содержащие вариант Fc, попадают в различные классы, как показано в .
<b>Таблица 28</b>
<b>Fc последовательность</b>
<b>CD16A</b><b>V158</b>
<b>CD16A</b><b>F158</b>
<b>CD32B</b>
<b>Соотношение аффинностей</b>
<b>CD16A/CD32B</b>
<b>V158</b>
<b>F158</b>
<b>Соотношение аффинностей > 1</b>
<b>Класс I: Повышенное связывание с CD16; пониженное связывание с CD32B</b>
F243L
4,79
3,44
0,84
5,70
4,10
D270E
1,25
1,48
0,39
3,21
3,79
R292P
2,90
0,25
11,60
R292G
1,54
0,25
6,2
P396L D270E
1,38
1,65
0,89
1,55
1,85
P247L N421K D270E
1,89
2,46
0,58
3,26
4,24
P247L N421K F243L
1,89
1,71
0,17
11,12
10,06
P247L N421K D270E F243L
2,30
3,45
0,32
7,19
10,78
R255L P396L D270E
1,34
1,65
0,87
1,54
1,90
R255L P396L D270E F243L
1,75
1,64
0,38
4,61
4,32
R255L P396L D270E R292G
1,39
1,30
0,65
2,14
2,00
R255L P396L D270E Y300L
1,52
1,74
0,87
1,75
2,00
K392T P396L D270E
1,81
2,28
0,79
2,29
2,89
K392T P396L D270E F243L
3,16
2,44
0,44
7,18
5,55
Q419H P396L D270E
1,64
2,00
0,68
2,41
2,94
Q419H P396L D270E F243L
1,46
1,15
0,26
5,62
4,42
R292P F243L
4,73
0,12
39,4
R292P F243L
4
1,67
0,16
25
10,44
R292P V284M K370N
1,14
1,37
0,37
3,1
3,7
R292P V305I
1,32
1,28
0,37
3,6
3,46
R292P V305I F243L
2,56
1,43
ND
>25
>25
R292P V305I F243L P396L
5,37
2,53
0,40
13,43
6,33
R292P F243L P300L
6,69
2,3
0,32
20,9
7,19
R292P V305I P396L F243L
5,37
2,53
0,40
13,43
6,33
G316D R416G D270E
2,18
2,49
0,78
2,79
3,19
G316D R416G D270E F243L
1,50
1,34
0,20
7,50
6,70
G316D R416G D270E P396L
1,22
1,07
1,14
<b>Класс II: Пониженное связывание с CD16; очень пониженное связывание cCD32B</b>
R292P
0,64
0,25
2,56
R292P F243L
0,6
0,12
5,00
<b>Класс III: Повышенное связывание с CD16; неизмененное связывание с CD32B</b>
R292P V305I F243I P396L Y300L
10,9
3,12
1,05
10,4
2,97
R292P F243L P396L Y300L
10,06
5,62
1,07
9,40
5,25
R292P V305I P396L
1,85
1,90
0,92
2,01
2,07
<b>Класс IV: Очень повышенное связывание с CD16; повышенное связывание с CD32B</b>
R292P V305I F243L P396L Y300L
10,06
8,25
1,38
7,29
5,98
G316D R416G D270E P396L
1,22
1,07
1,14
<b>Соотношение аффинностей < 1</b>
<b>Класс V: Неизмененное связывание с CD16; повышенное связывание с CD32B</b>
Y300L
1,01
1,18
0,99
R255L P396L
1,09
2,22
0,49
<b>Класс VI: Повышенное связывание с CD16; очень повышенное связывание с CD32B</b>
P396L
1,27
1,73
2,58
0,49
0,67
R255L P396L
1,39
2,22
0,63
P396L F243L
1,49
1,60
2,22
0,67
0,72
P247L N421K
1,29
1,73
2,00
0,65
0,87
R255L P396L
1,39
2,22
0,49
0,63
K392T P396L
1,49
1,81
2,35
0,63
0,77
Q419H P396L
1,19
1,19
1,33
0,89
0,89
R292P V305I
1,59
2,11
2,67
0,60
0,79
<b>Таблица 28</b>
<b>Fc последовательность</b>
<b>CD16A</b><b>V158</b>
<b>CD16A</b><b>F158</b>
<b>CD32B</b>
<b>Соотношение аффинностей</b>
<b>CD16A/CD32B</b>
<b>V158</b>
<b>F158</b>
<b>Класс VII: Пониженное связывание с CD16; повышенное / неизмененное связывание с CD32B</b>
G316D R416G D270E P396L
0,94
1,07
0,88
7.12 ПРОГНОСТИЧЕСКАЯ ЭФФЕКТИВНОСТЬ СООТНОШЕНИЙ АФИННОСТИ
et al.
Blood
et al.
Blood
Fc-домены вариантов Fc, которые проявляли улучшенное соотношение афинности в контексте спектра мышиных FcγRs, оценивают для определения их эффективности in vivo. Для такой цели Fc-домены включали в прототипное терапевтическое антитело и испытывали на ксенотрансплантатных мышыных моделях B-клеточной лимфомы и на опухолевых моделях у FcγRIII-нокаут мышей, экспрессирующих аллель слабой связи человеческого CD16A. Влияние Fc конструирования на очищение опухоли исследовали, используя WT или человеческий FcγR-трансгенная мышь. Hu2B6 использовали в качестве модели mAb, поскольку это антитело не индуцирует комплементный лизис или апоптоз, но ингибирует опухолевый рост у мышей по механизмам, которые полностью Fcγ зависимы (Rankin, C.T.  2006  108:2384-2391). Поскольку hu2B6 перекрестно не реагирует с мышиным (m) FcγRII или другими эндогенными мышиными белками, в этой модели нет другого антитела-мишени, чем имплантированные CD32B-позитивные клетки опухоли (Rankin, C.T.  2006  108:2384-2391). Кроме того, hu2B6 полностью блокирует человеческое CD32B, таким образом исключая связывание hu2B6 Fc-участка с клетками-мишенями в качестве спутывающего фактора. Fc варианты 088, 3160, 5660, 3860 и 0071 были отобраны для этой цели.
Fc варианты 088 и 3160 испытали для лечения B-клеточных опухолей у 16A tg мышей. Fc варианты 088, 3160, 5660, 3860 и 0071 были испытаны для лечения B-клеточных опухолей у Balb/c мышей.
Мышиные опухолевые модели
Ксенотрансплантатные модели:
6
2
Самки бестимусных Balb/c голых (nu/nu) мышей возрастом 8-10 недель приобретаются у Taconic. Клетки Daudi (5x10 на мышь) суспендируют в PBS + Matrigel и вводят подкожно в правый бок Balb/c голых мышей. Развитие опухоли контролируют дважды в неделю, используя кронциркуль и вес опухоли рассчитывают по следующей формуле: вес опухоли= (длина x ширина)/2. Внутрибрюшинные (IP) инъекции антител в различных концентрациях (1 мкг/г или 0,1 мкг/г) выполняют еженедельно в течение 6 недель, начиная с дня 0.
EL4/CD32B модель
:
-/-
+
4
2
Самцы и самки бестимусных mFcγRIII , hCD16A голых мышей, разведенных в MacroGenics, Inc. животной установке. EL4/CD32B клетки (1x10 на мышь) суспендируют в PBS и вводят IP в день 0. IP инъекции антител (10 мкг/г или 4 мкг/г) выполняют в дни 0, 1, 2, и 3. Вес тела мышей измеряют дважды в неделю. Мышей, показывающих чрезмерный набор веса тела, а также признаки асцита опухоли, убивают CO асфиксией. Выживание регистрировали соответственно. Данные анализировали с помощью PRISM (Graphpad Software, San Diego California) для расчета стандартного отклонения (ADCC, опухолевая модель) и статистической достоверности, используя T-тесты и логарифмический ранговый анализ (опухолевые модели).
et al.
Science
Immunity
in vivo
et al.
Science
Immunity
Таблица 29
Таблице 29
Для полной механистической интерпретации данных, профили связывания сконструированных Fcγ с мышиными (m) FcγRs, были полностью охарактеризованы. Из mFcγR, mFcγRII является структурно и функционально гомологичным человеческому CD32B, в то время как mFcγRIII и mFcγRIV являются рецепторами, функционально связанными с человеческими активаторными FcγRs, экспрессирующимися на NK клетках и моноцитах/макрофагах, соответственно (Nimmerjahn, F.  2005  310:1510-1512; Nimmerjahn, F. 2005  23:41-51). Поскольку показана важность соотношения Fcγ-связывания с активаторными и ингибиторными FcγRs в определении антитело-зависимых последствий  (Nimmerjahn, F.  2005  310:1510-1512; Nimmerjahn, F. 2005  23:41-51), мутантов отбирали на основе их профилей связывания () используя человеческие FcRs. Данные в  выражаются как кратные изменения относительно афинности дикого типа.
<b>Таблица 29</b>
<b>MGFc №</b>
<b>Fc мутант</b>
<b>CD16A</b><sup>H</sup>
<b>CD16A</b><sup>L</sup>
<b>CD32A</b><sup>H</sup>
<b>CD32B</b>
<b><u>CD16</u></b><b>CD32B</b>
0193
F243L
+3,8
+2,4
-0,8
-0,2
5,7
0089
P396L
+0,3
+0,7
+0,6
+1,6
0,5
3160
P247L D270E N421K
+0,9
+1,5
+1,0
-0,7
3,3
5560
R255L D270E: P396L
+0,3
+0,7
+2,0
-0,1
1,5
3860
D270E K392T P396L
+0,8
+1,3
+0,9
-0,3
2,3
0074
F243L R292P v3051
+1,6
+0,4
-3,3
-13,3
36,6
0071
D270E G316D R416G
+0,4
+0,1
+0,4
-1,7
3,8
0155
F243L R292P Y300L
+6,4
+3,6
0,0
-0,7
12,3
0031
P247L N421K
+0,3
+0,7
+0,3
+1,0
0,6
0161
R292P
+1,4
+0,6
-0,5
-2,7
8,7
0162
F243L R292P
+3,0
+0,7
-0,9
-5,3
24,7
0170
F243L R292P P396L
+5,3
+2,4
+0,4
-1,6
16,0
0092
Y300L
0,0
+0,2
+1,9
+0,2
0,9
0088
F243L R292F Y300L V305I P396L
+9,1
+7,3
+2:2
+0,4
7,3
0084
F243L R292P V305I P396L
-3,0
+1,3
-0,3
-1,6
10,6
<b>Контроли</b>
Дикий тип
0,0
0,0
0,0
0,0
1,0
AAA*
E333A K334A S298A
+0,6
+0,1
-3,3
-2,5
5,7
XmAb**
S239D I332E 330L
+13,9
+8,1
0,0
+0,74
8,5
Затенение указывает на Fc варианты, испытанные в мышиных опухолевых моделях.* см., Presta, L., патент США № 6,737,056; Shields <i>et al</i>. 2002, J Biol Chem 277:26733-26740** см., Lazar, G.A. <i>et al</i>. Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 103:4005-4010 (2006)
Таблица 29
Мутанты MGFc3160 (P247E/D270E/N421K) и MGFc0088 показали увеличенное связывание с mFcγRIII и mFcγRIV соответственно. MGFc3160, однако, показал сопутствующее увеличенное связывание mFcγRII, в то время как MFc0088 проявил более предпочтительный активаторный-к-ингибиторному профиль, без увеличения связывания с ингибиторным рецептором. Мутант MGFc0071 (D270E/G316D/R416G) демонстрировал WT Fcγ-уровень связывания со всеми mFcγRs () и был включен в качестве контроля.
ФИГ. 39A
ФИГ. 39B
Подкожная инокуляция клеток Daudi голым мышам создавала локализованные прогрессивно растущие опухоли, чей рост существенно снижался ежемесячными внутрибрюшинными (i.p.) инъекциями 1 мкг/г WT hu2B6 (). Еженедельные 0,1 мкг/г дозы, однако, неэффективны. В более высокой дозе обработка с hu2B6-MGFc3160 не отличается от таковой с WT hu2B6, но скромное улучшение по сравнению с WT hu2B6 обнаруживается при низкой дозе. hu2B6-MGFc0088, однако, имеет своим результатом существенное снижение опухолевого роста при всех испытанных дозах согласно его усиленному mFcγRIV связыванию и весьма благоприятному активатор-к-ингибиторному соотношению благодаря отсутствию соответствующего усиления mFcγRII связывания. Hu2B6-MGFc0071, которое показало WT уровень связывания со всеми mFcγRs, вело себя подобно WT hu2B6 ().
Усиленная очистка опухоли у трансгенных мышей с человеческим CD16A
et al.
J. Exp. Med
et al.
Eur. J. Immunol
Brit. J. Canc.
in vivo
phe
-/-
phe+
ФИГ 39C
ФИГ 39D
Таблица 29
Активность Fc-конструированного mAbs в дальнейшем анализировали у mFcγRIII-нокаут мышей, экспрессирующих трансген для аллели низкой афинности человеческого CD16A (Li, M.  1996 . 183:1259-1263). У этих мышей человеческое CD16A-158 экспрессируется NK клетками и мононуклеарными фагоцитами, подобно их клеточно-специфической экспрессии у людей (Perussia, B. .21:425-429). Мышиная линия клеток EL4 (Gorer, P.A. (1950) 4(4):372-379) была трансдуцирована человеческим CD32B и использована вместо клеток Daudi, чья опухоль слабо приживалась у этих трансгенных мышей. Нокаутные трансгенные мыши mFcγRIII/CD16A-158, которым i.p. вводили CD32B-EL4 клетки, погибали в течение восьми недель после инокуляции. Обработка с hu2B6-WT спасала 40% животных, тогда как 90% выживало после получения hu2B6-MGFc3160 (). В отдельном эксперименте схема приема hu2B6-MGFc0088, который не предупреждал опухолевый рост как WT Fcγ, показала 100% выживаемость мышей на протяжении эксперимента (). Следовательно, действенность hu2B6-MGFc3160 и hu2B6-MGFc0088  занимает место в соответствии с их относительным улучшением связывания с FcγRs, экспрессирующимися у мышей ().
in vivo
et al.
Immunity
phe
Таблица 30
Таким образом, соотношение афинности Fc варианта оказывается прогностическим для  эффективности молекул, содержащих вариантный Fc-участок. Одновременно hu2B6-MGFc3160 и hu2B6-MGFc0088 показали усиленное ингибирование роста опухолевых клеток по сравнению с WT mAb. Поскольку MGFc3160 показал изолированное усиление mFcγRIII связывания в отсутствии улучшения mFcγRIV взаимодействия, увеличенная активность может быть отнесена к NK клеткам и мононуклеарным фагоцитам. Напротив, свойства MGFc0088, Fcγ домена с существенно увеличенной аффинностью к mFcγRIV, но mFcγRIII связывающими свойствами, подобными таковым у WT, согласовались с с идеей, что мононуклеарные фагоциты являются критическими клетками для улучшения устранение опухоли. В huFcγR трансгенной мыши замещение mFcγRIII с huCD16A-158 на одновременно NK клетках и моноцитах имело своим результатом увеличение соотношения активатор-к-ингибиторному связыванию для MGFc0088. Опять же, большее увеличение выживаемости мышей с hu2B6-MGFc0088 коррелирует с его увеличенной аффинностью к второму активирующему рецептору, mFcγRIV, экспрессируемому моноцитами/ макрофагами (Nimmerjahn, F.  2005  23:41-51). Способность Fc вариантов связывать смешанные человеческие/мышиные FcγRIII и FcγRII рецепторы была определена. Результаты () указывают, что варианты связывают химерные рецепторы с существенной эквивалентностью.
<b>Таблица 30</b>
<b>№</b>
<b>Fc мутант</b>
<b>hCD16</b><b>mCD32</b>
<b>hCD16</b><b>mCD32</b>
<b>hCD16</b><b>mCD32</b>
0071
D270E G316D R416G
1,0
1,1
3160
P247L D270E N421K
1,7
0,6
2,2
5560
R255L D270E P396L
0,7
1,5
3860
D270E K392T P396L
0,7
1,5
0088
F243L R292F Y300L V305I P396L
10,7
17,3
1,4
Таблице 31
Связывание отобранных Fc вариантов с Fc рецепторами и их соотношения афинности показаны в .
<b>Таблица 31</b>
3aV
3aF
2bFcagl
2aRFcagl
2aHFcagl
32A-131H:32B
16A-158V:32B
16A-158F:32B
Дикий тип
1
1
1
1
1
1
1
1
L234F, F243L, R292P, Y300L
1,7
1,6
0,2
0,2
0,3
1,5
8,5
8
L235I, F243L, R292P, Y300L
2,6
3,3
0,2
0,1
0,5
2,5
13
16,5
L235Q, F243L, R292P, Y300L
1,8
1,3
n.d.
n.d.
0,2
n.d.
n.d.
n.d.
L235V, F243L, R292P, Y300L, P396L
6,1
4,8
0,4
0,4
1,3
3,3
15
12
L235P, F243L, R292P, Y300L, P396L
5,4
2,5
0,2
0,2
0,7
3,5
27
12,5
7.13  FC ВАРИАНТЫ HER2-РЕАКТИВНЫХ АНТИТЕЛ, ПРОЯВЛЯЮЩИХ ОСЛАБЛЕННОЕ ФУКОЗИЛИРОВАНИЕ
Таблица 32
Как обсуждалось выше, один из аспектов данного изобретения относится к признанию того, что вариации в Fc-участке антитела могут влиять на механизм клеточного гликозилирования и таким образом производить антитела, которые проявляют уменьшенную степень гликозилирования (и в частности, фукозилирования). Для того чтобы продемонстрировать влияние таких вариаций в Fc-участке на способность клеток фукозилировать анти-Her2 антитела настоящего изобретения, ряд вариантов анти-Her2/neu антитела ch45D4-FcMT2 были созданы ().
SEQ ID NO: 45
SEQ ID NO: 46
SEQ ID NO:47
48
Phe
Val
Антитело ch4D5-FcMT2 имеет легкую цепь с аминокислотной последовательностью , и тяжелую цепь с аминокислотной последовательностью . ch4D5-FcMT2 имеет N65S замену на легкой цепи, которая имеет своим результатом дегликозилированную легкую цепь, и L235V, F243L, R292P, Y300L, и P396L замены на тяжелой цепи (все пронумерованы согласно Kabat). Это антитело связывается с CD16A (FcγRIII-A), и связывание с CD16-158 усилено пропорционально большим образом, чем связывание с CD16-158, но проявляет сниженное связывание с CD32B (FcγRII-B). Полинуклеотиды, кодирующие ch4D5-FcMT2 легкой и тяжелой цепей предоставлены в  и , соответственно.
Таблица 32
Таблице 32
off
off
показывает соотношение K дикий тип / K мутант для антитела, имеющего указанные Fc вариации. Результаты для антитела ch45D4-FcMT2 показаны жирным шрифтом в затемненном ряду в  (n.b., нет связывания; n.d., нерегистрируемое связывание).
Таблица 3
off
off
Для дальнейшего сравнения показывает соотношение K дикий тип / K мутант для Ch4D5 анти-CD20 (rituximab) антитела, имеющего указанные Fc вариации (см., Stavenhagen, J.B. et al. (2007) “Fc Optimization of Therapeutic Antibodies Enhances Their Ability to Kill Tumor Cells In vitro and Controls Tumor Expansion In vivo via Low-Affinity Activating Fcγ Receptors,” Cancer Res. 67(18):8882-8890).
Таблиц 3 и 32
например
например
Как следует из , антитела, имеющие Fc вариант, содержащий замену в положении L234 или L235, особенно в комбинации с заменой в одном или нескольких положениях F243, R292, Y300, V305, и P396, проявляет измененное Fc связывание с FcγRIII (, улучшенное связывание с активаторными рецепторами (, CD16A, CD32A) и сниженное связывание с CD32B.
Фигуре 40, Панели A-D
Фигура 40, Панель A
Фигуры 40
Панели B и C
Панели A
Фигуре 40
Панели B и C
Гликозилирование антитела ch45D4-FcMT2 исследовали, используя ”MAb Анализ Нейтральных Моносахаридов (3 часовой гидролиз)” (для исследования GLY-2-2-4 гликозилирования) и путем “N-связанного Олигосахаридного Профилирования Нейтральных Олигосахаридов, используя Разделение Жидкостной Хроматографией” (для исследования GLY-12-3-2 гликозилирования). Результаты этого исследования показаны на . показывает распределение N-связанных олигосахаридов как определено с использованием стандартной панели антител. Как следует из  пики гликана, отмеченные для антитела ch45D4-FcMT2 (), не соответствуют ни одному из гликанов, показанных на . Идентичность гликанов легко определена путем проведения хроматографического анализа гликанов антитела ch45D4-FcMT2 в присутствии дополнительного известного гликана, и выявления известного гликана, что вызывает увеличение размера пика любого из пиков, показанных на , .
Таблице 33,
Таблице 9
off
off
Вычислительный анализ моносахаридов антител показан в показывает пмоль/инъекция и моль/моль моносахариды/антитело для моносахаридов фукозы (Fuc), N-ацетилированной галактозы (GALNAc), N- ацетилированной глюкозы (GlcNAc), галактозы (Gal) и маннозы (Man). В  BLQ означает, что концентрация моносахарида была ниже предела количественного определения. Очень высокие уровни маннозы, выявленные в анализе, указывают, что повышенная степень маннозилирования усиливает терапевтическую эффективность (как измерено, например, по соотношению K мутант / K дикий тип) антител, имеющих вариант Fc-участков настоящего изобретения.
<b>Таблица 33: Моносахаридные анализы состава</b>
<b>ch45D4-FcMT2</b>
<b>Fuc</b>
<b>GalNAc</b>
<b>GlcNAc</b>
<b>Gal</b>
<b>Man</b>
Образец 1
пкмоль/введение
BLQ*
BLQ
165,8
BLQ
1033,0
BLQ
BLQ
176,8
BLQ
1014,7
BLQ
BLQ
205,9
BLQ
1135,8
<b>моль/моль</b>
<b>≤ 0,2</b>
<b>≤ 0,3</b>
<b>1,8</b>
<b>≤ 0,5</b>
<b>10,5</b>
Образец 2
пкмоль/введение
BLQ
BLQ
77,0
BLQ
698,7
BLQ
BLQ
104,4
BLQ
836,4
BLQ
BLQ
127,7
BLQ
924,4
<b>моль/моль</b>
<b>≤ 0,2</b>
<b>≤ 0,3</b>
<b>1,0</b>
<b>≤ 0,5</b>
<b>8,1</b>
7.14  САЙТЫ FC ВАРИАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫЕ С ОСЛАБЛЕННЫМ ФУКОЗИЛИРОВАНИЕМ
et al.
The Blockade Of Fc Receptor-Mediated Clearance Of Immune Complexes In Vivo By A Monoclonal Antibody (2.4G2) Directed Against Fc Receptors On Murine Leukocytes
Characterization of a Mooclonal Antibody Directed Against Mouse Macrophage and Lymphocyte Fc Receptors
Таблица 34
Для того, чтобы оценить эффект вариаций в положениях 234, 235, 243, 292, 300 и 396 исключительно или в комбинации друг с другом, на фукозилирование Fc-участков IgG подготовили ряд Fc вариантов, используя IgG ch4D5 (химерное анти-Her2/neu), h2B6 3,5 (анти-FcγRIIB; см. публикацию заявки на патент США 2008/0044417), ch2.4G2 (крысиный анти-мышиный FcγRII-III; Kurlander  (1984) “,” J. Immunol. 133(2):855-862; Unkeless, J.C. (1979) “,” J. Exper. Med. 150:580-596; последовательности для VH и VL цепей этого антитело доступны от Genbank (ACP40510 и ACP40511, соответственно)) создали и определили их соответствующие уровни гликозилирования.  показывает процент, при котором гликозилирование видов G0F, G1F, G2F, man5, man6, man7, man 8, и man9 было получено в Fc вариантах таких антител (man (манноза), cpx (комплексный олигосахарид)).
<b>Таблица 34</b>
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Fc вариант</b>
<b>Процент общего гликозилирования</b>
<b>Общее</b><b>man</b>
<b>Общее</b><b>cpx</b>
<b>Соотноше</b><b>ние man/cpx</b>
<b>G0F</b>
<b>G1F</b>
<b>G2F</b>
<b>man5</b>
<b>man6</b>
<b>man7</b>
<b>man8</b>
<b>man9</b>
<b>Антитело ch4D5</b>
Fc дикого типа
Дикий тип
43
26
7
11
2
1
1
16
76
0,2
1
P396L
31
30
6
21
7
6
33
67
0,5
2
Y300L
34
28
5
13
5
3
2
24
67
0,3
3
F243L R292P Y300L P396L
7
6
2
31
12
10
12
9
75
14
5,2
4
F243L R292P Y300L
5
9
11
31
8
10
11
7
66
25
2,6
5
R292P
51
13
1
15
4
3
2
1
24
66
0,4
6
F243L R292P P396L
8
10
5
30
12
8
7
5
62
23
2,7
7
F243L R292P P396L
6
28
5
12
16
10
43
33
1,3
8
F243L R292P P396L
4
11
10
26
16
10
9
5
66
25
2,6
9
F243L
7
13
14
20
16
13
6
3
58
33
1,7
10
F243V
6
12
33
19
14
6
2
41
51
0,8
11
F243R
6
4
19
12
24
21
5
62
29
2,1
12
F243C
9
16
29
21
11
5
1
38
54
0,7
13
F243F R292P Y300L
52
12
2
13
4
4
4
1
27
65
0,4
14
F243C R292P Y300L
7
12
8
31
13
9
7
2
63
26
2,4
15
F243R R292P Y300L
3
3
27
5
29
26
1
61
32
1,9
16
F243R R292P Y300L
3
4
23
4
29
29
2
64
29
2,2
17
F243V R292P Y300L
5
15
12
22
10
9
10
6
58
32
1,8
18
F243V R292P Y300L
5
11
7
30
14
8
9
5
66
24
2,7
19
L235V F243L R292P Y300L P396L
4
9
6
22
12
11
15
12
73
19
3,7
20
L235V F243L R292P Y300L P396L
4
7
3
27
14
11
15
11
78
14
5,4
21
F243C
7
23
23
19
9
6
3
36
53
0,7
<b>Таблица 34</b>
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Fc вариант</b>
<b>Процент общего гликозилирования</b>
<b>Общее</b><b>man</b>
<b>Общее</b><b>cpx</b>
<b>Соотноше</b><b>ние man/cpx</b>
<b>G0F</b>
<b>G1F</b>
<b>G2F</b>
<b>man5</b>
<b>man6</b>
<b>man7</b>
<b>man8</b>
<b>man9</b>
<b>Антитело ch4D5</b>
R292P
22
F243R R292P
5
5
19
6
25
27
3
61
28
2,2
23
F243V R292P
5
21
29
16
11
6
3
37
55
0,7
24
F243L R292G Y300L
8
19
15
19
8
9
7
4
47
41
1,2
25
F243L R292L Y300L
7
17
34
7
19
10
3
39
58
0,7
26
F243L R292S Y300L
7
21
29
12
12
7
3
34
57
0,6
27
F243L R292M Y300L
6
22
35
8
15
7
2
33
63
0,5
28
F243L R292D Y300L
5
8
27
6
23
19
2
50
40
1,3
29
F243L R292Y Y300L
7
22
32
10
13
6
2
32
61
0,5
30
F243F R292P P396L
43
22
4
9
4
5
5
23
69
0,3
31
F243C R292P P396L
8
21
23
18
9
7
3
37
52
0,7
32
F243R R292P P396L
3
5
22
3
29
28
2
63
31
2,1
33
F243V R292P P396L
5
19
21
18
5
10
8
4
45
45
1,0
34
F243F R292P Y300L P396L
36
13
3
13
6
5
9
4
38
51
0,7
35
F243F R292P Y300L P396L
36
12
14
7
5
9
4
39
48
0,8
36
F243C R292P Y300L P396L
8
14
8
23
10
10
10
6
59
29
2,0
37
F243R R292P Y300L P396L
4
7
26
4
29
25
58
36
1,6
38
F243V R292P Y300L P396L
5
12
7
22
11
10
12
9
65
25
2,6
<b>Таблица 34</b>
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Fc вариант</b>
<b>Процент общего гликозилирования</b>
<b>Общее</b><b>man</b>
<b>Общее</b><b>cpx</b>
<b>Соотноше</b><b>ние man/cpx</b>
<b>G0F</b>
<b>G1F</b>
<b>G2F</b>
<b>man5</b>
<b>man6</b>
<b>man7</b>
<b>man8</b>
<b>man9</b>
<b>Антитело ch4D5</b>
39
F243L R292P
4
19
28
17
12
8
4
41
51
0,8
40
F243L R292G Y300L P396L
6
18
14
20
9
9
9
5
52
38
1,4
41
F243L R292L Y300L P396L
5
19
38
6
18
9
2
36
61
0,6
42
F243L R292S Y300L P396L
6
22
26
13
5
12
7
3
39
54
0,7
43
F243L R292M Y300L P396L
7
23
34
9
14
7
3
32
63
0,5
44
F243L R292M Y300L P396L
7
21
28
9
5
14
7
3
38
55
0,7
45
F243L R292D Y300L P396L
3
10
30
4
24
19
2
49
43
1,1
46
F243L R292Y Y300L P396L
7
23
25
10
5
11
6
3
35
55
0,6
47
S239D A330L I332E
26
47
21
6
6
94
0,1
<b>Антитело 2B6 3.5</b>
WT Fc
WT
46
28
4
6
4
4
3
2
19
79
0,1
48
F243L R292P V305I
6
16
9
33
14
3
4
9
63
30
0,1
49
F243L R292P Y300L V305I P396L
6
6
2
15
13
14
19
18
79
14
0,1
<b>Антитело ch2.4G2</b>
WT Fc
WT
57
15
8
7
4
3
2
24
72
0,1
50
F243L R292P V305I
15
14
15
20
10
10
6
61
30
0,1
51
F243L R292P Y300L V305I P396L
8
5
10
14
13
18
25
80
14
0,1
Таблица 35
Таблицы 34
dissociation
dissociation
показывает относительное связывание (K дикий тип / K вариант) CH4D5 IgG Fc из  с CD16A и Cd32B. Значения, большие чем 1,0 таким образом указывают, что IgG вариант связывал Fc рецептор с большей аффинностью, чем Fc дикого типа, тогда как значения менее чем 1,0 указывают, что IgG вариант связывал Fc рецептор с уменьшенной аффинностью, чем Fc дикого типа.
<b>Таблица 35</b>
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Fc вариант</b>
<b>Соотношение man/cpx</b>
<b>CD16A(V158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD16A(F158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32B-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32A-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
<b>Антитело ch4D5</b>
Дикий тип Fc
Дикий тип
0,2
1,0
1,0
1,0
1
1
P396L
0,5
2,2
1,5
2,1
1,8
2
Y300L
0,3
1,6
1,2
0,8
1,5
3
F243L R292P Y300L P396L
5,2
6,9
4,6
1,2
1,8
4
F243L R292P Y300L
2,6
3,7
2,2
0,5
1,1
5
R292P
0,4
1,0
1,0
0,3
0,6
6
F243L R292P P396L
2,7
2,3
1,6
0,4
0,8
7
F243L R292P P396L
1,3
2,3
1,6
0,4
0,8
8
F243L R292P P396L
2,6
2,3
1,6
0,4
0,8
9
F243L
1,7
1,1
1,1
0,8
0,7
10
F243V
0,8
1,0
1,0
0,8
0,7
11
F243R
2,1
0,3
0,3
0,2
0,2
12
F243C
0,7
0,7
0,6
0,3
0,3
13
F243F R292P Y300L
0,4
2,1
2,0
0,7
1,3
14
F243C R292P Y300L
2,4
2,6
2,1
0,4
0,9
15
F243R R292P Y300L
1,9
1,1
0,8
0,4
0,9
16
F243R R292P Y300L
2,2
1,1
0,8
0,4
0,9
17
F243V R292P Y300L
1,8
3,5
2,0
0,5
1,1
18
F243V R292P Y300L
2,7
3,5
2,0
0,5
1,1
<b>Таблица 35</b>
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Fc вариант</b>
<b>Соотношение man/cpx</b>
<b>CD16A(V158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD16A(F158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32B-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32A-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
<b>Антитело ch4D5</b>
19
L235V F243L R292P Y300L P396L
3,7
5,3
4,5
0,5
1,3
20
L235V F243L R292P Y300L P396L
5,4
5,3
4,5
0,5
1,3
21
F243C R292P
0,7
2,2
1,1
0,3
0,3
22
F243R R292P
2,2
n.d
n.d
n.d
n.d
23
F243V R292P
0,7
3,0
1,1
0,2
0,4
24
F243L R292G Y300L
1,2
4,4
2,5
0,5
1,3
25
F243L R292L Y300L
0,7
2,6
1,7
0,7
1,6
26
F243L R292S Y300L
0,6
2,9
2,1
0,5
1,4
27
F243L R292M Y300L
0,5
2,7
1,9
0,7
1,7
28
F243L R292D Y300L
1,3
1,0
0,8
0,4
0,0
29
F243L R292Y Y300L
0,5
1,5
1,4
0,5
1,1
30
F243F R292P P396L
0,3
1,6
1,8
0,8
1,4
31
F243C R292P P396L
0,7
2,3
1,5
0,4
0,7
32
F243R R292P P396L
2,1
1,2
0,9
0,3
0,6
33
F243V R292P P396L
1,0
2,4
1,8
0,4
0,9
34
F243F R292P Y300L P396L
0,7
4,5
3,4
1,4
2,2
35
F243F R292P Y300L P396L
0,8
4,5
3,4
1,4
2,2
36
F243C
2,0
5,4
3,5
1,1
1,8
<b>Таблица 35</b>
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Fc вариант</b>
<b>Соотношение man/cpx</b>
<b>CD16A(V158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD16A(F158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32B-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32A-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
R292P Y300L P396L
37
F243R R292P Y300L P396L
1,6
1,6
1,5
1,1
1,9
38
F243V R292P Y300L P396L
2,6
6,4
4,1
1,3
2,0
39
F243L R292P
0,8
2,2
1,1
0,3
0,4
40
F243L R292G Y300L P396L
1,4
5,0
3,6
1,1
1,8
41
F243L R292L Y300L P396L
0,6
3,4
2,8
1,2
1,9
42
F243L R292S Y300L P396L
0,7
2,8
2,2
1,4
2,3
43
F243L R292M Y300L P396L
0,5
3,3
2,3
1,3
2,0
44
F243L R292M Y300L P396L
0,7
3,3
2,3
1,3
2,0
45
F243L R292D Y300L P396L
1,1
1,4
1,1
0,8
1,5
46
F243L R292Y Y300L P396L
0,6
2,1
2,0
1,0
1,7
47
S239D A330L I332E
0,1
15,9
11,2
1,5
1,2
<b>Антитело 2B6 3.5</b>
Дикий тип Fc
Дикий тип
0,1
1
1
1
1
48
F243L R292P V305I
0,1
2,6
1,4
0,2
0,1
49
F243L R292P Y300L V305I P396L
0,1
10,1
8,3
3,2
1,4
<b>Таблица 35</b>
<b>Fc</b><b>вариант</b>
<b>Fc вариант</b>
<b>Соотношение man/cpx</b>
<b>CD16A(V158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD16A(F158) (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32B-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
<b>CD32A-G2Ag (дикий тип / мутант)</b>
<b>Антитело ch2.4G2</b>
Дикий тип Fc
Дикий тип
0,1
1
1
1
1
50
F243L R292P V305I
0,1
2,6
1,4
0,2
0,1
51
F243L R292P Y300L V305I P396L
0,1
10,1
8,3
3,2
1,4
Фигуры 43-48
43-48
Результаты, таким образом, указывают, что вариации, затрагивающие позиции 243 и 292, имеют выраженный эффект на полученный уровень фукозилирования и аффинности Fc связывания с CD16A, CD32A и CD32B (). На Фигурах для того, чтобы сохранить одну ось у, процент наблюдаемых уровней гликозилирования man5 или man6 (%man56) или наблюдаемых уровней гликозилирования man7, man8 или man9 (%man789) показан деленным на 10. Таким образом, например, сообщенное значение 4,0 на этой фигуре для уровня гликозилирования %man56 указывает, что 40% гликозилированных аддуктов варианта были man5 или man6. Подобным образом, значения общего процента маннозы (%total man) и общие комплексные полисахариды (% total cpx) также показаны деленными на 10.
Фигура 43
dissociation
dissociation
показывает эффект изменения идентичности остатка, замененного в положении F243 тетраварианта (F243X, R292P, Y300L, P396L) на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикий тип / K вариант) Fc варианта с Fc рецепторами. Фигура показывает, что модификации исключительно в положении 243 способны вызывать изменения гликозилирования и увеличеннуе аффинность к CD16A относительно дикого типа. F243L был особенно способным к увеличению афинности к CD16A относительно Fc дикого типа.
Фигура 44
dissociation
dissociation
показывает эффект изменения идентичности остатка, замещенного в положении R292 тетраварианта (F243L, R292X, Y300L, P396L), на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикий тип / K вариант) Fc варианта с Fc рецепторами. Фигура показывает, что модификации исключительно в положении 292 способны вызывать изменения гликозилирования и увеличенное аффинность к CD16A относительно дикого типа. R292P был особенно способным к увеличению афинности к CD16A относительно Fc дикого типа.
Фигура 45
dissociation
dissociation
показывает эффект постепенных изменений в идентичности остатка, замещенного в положении R292, Y300 и P396 в F243C варианте Fc, на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикий тип / K вариант) Fc варианта с Fc рецепторами. Фигура показывает, что постепенные модификации в этих местах синергично усиливают аффинность к CD16A относительно Fc дикого типа.
Фигура 46
dissociation
dissociation
показывает эффект постепенных изменений в идентичности остатка, замещенного в положениях R292, Y300 и P396 в F243L варианте Fc на наблюдаемом профиле гликозилирования варианта и на относительном связывании (K дикий тип / K вариант) Fc варианта с Fc рецепторами. Фигура показывает, что постепенные модификации в этих местах синергично усиливают аффинность к CD16A относительно Fc дикого типа, с тетравариантом F243L, R292P, Y300L, P396L, проявляющим наибольшее увеличение относительной афинности связывания CD16A.
Фигура 47
dissociation
dissociation
показывает эффект постепенных изменений в идентичности остатка, замещенного в положении R292, Y300 и P396 в F243R тетра варианте, на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикий тип / K вариант) варианта Fc с Fc рецепторами. Фигура показывает, что модификации в положении Y300 или Y396 синергично усиливают аффинность F243R варианта к CD16A относительно Fc дикого типа.
Фигура 48
dissociation
dissociation
показывает эффект постепенных изменений в идентичности остатка, замещенного в положении R292, Y300 и P396 тетра варианта (F243V, R292X, Y300X, P396X), на наблюдаемый профиль гликозилирования варианта и на относительное связывание (K дикий тип / K вариант) варианта Fc с Fc рецепторами. Фигура показывает, что постепенные модификации в этих местах синергично усиливают аффинность к CD16A относительно Fc дикого типа, с тетравариантом F243V, R292P, Y300L, P396L, проявляющим наибольшее увеличение относительной афинности связывания CD16A.
Все публикации и патенты, упомянутые в данном описании, включены в данный документ в качестве ссылки в той же степени, как если бы каждая индивидуальная публикация или патентная заявка была конкретно и индивидуально указана, чтобы быть включенной ссылкой во всей своей полноте. Хотя настоящее изобретение было описано в связи с конкретными вариантами его осуществления, должно быть понятно, что оно способно к дальнейшим модификациям, и эта заявка предназначена для покрытия любых вариаций, применений или адаптаций настоящего изобретения, следуя, в основном, принципам настоящего изобретения и включая такие отступления от настоящего раскрытия, как появившиеся в известной или обычной практике в данной области, к которому относится настоящее изобретение, и как может быть применено к существенным признакам, изложенным выше.
Хотя настоящее изобретение было описано в связи с конкретными вариантами его осуществления, должно быть понятно, что оно способно к дальнейшим модификациям, и эта заявка предназначена для покрытия любых вариаций, применений или адаптаций настоящего изобретения, следуя, в основном, принципам настоящего изобретения и включая такие отступления от настоящего раскрытия, как появившиеся в известной или обычной практике в данной области, к которому относится настоящее изобретение, и как может быть применено к существенным признакам, изложенным выше.