СПОСОБ ПОЛИПЕПТИДНОЙ МОДИФИКАЦИИ ДЛЯ ОЧИСТКИ ПОЛИПЕПТИДНЫХ МУЛЬТИМЕРОВ

1. Способ получения полипептидного мультимера, который включает первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, который включает стадии:
(a) экспрессии ДНК, которая кодирует первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и ДНК, которая кодирует второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью; и
(b) сбора продукт экспрессии стадии (а),
где один или более аминокислотных остатков в любом из или обоих первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью были модифицированы, так что существует большее различие в способности связывать белок А между первым полипептидом, обладающим антигенсвязывающей активностью и вторым полипептидом, обладающим антигенсвязывающей активностью или не обладающим антигенсвязывающей активностью.
2. Способ по п.1, где продукт экспрессии собирается с использованием аффинной хроматографии с белком А в стадии (b).
3. Способ по п.1, где один или более аминокислотных остатков в любом из или обоих первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью были модифицированы, так что существует большее различие между рН растворителя для элюирования первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью из белка А и рН растворителя для элюирования второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью из белка А.
4. Способ по п.1, где один или более аминокислотных остатков в первом полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или втором полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или не обладающем антигенсвязывающей активностью были модифицированы, чтобы увеличить или уменьшить способность связывать белок А любого из первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью.
5. Способ по п.1, где один или более аминокислотных остатков в первом полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или втором полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или не обладающем антигенсвязывающей активностью были модифицированы для увеличения способности связывать белок А любого из первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью, и уменьшить способность связывать белок А другого полипептида.
6. Способ по п.1, где чистота собранного полипептидного мультимера составляет 95% или более.
7. Способ по п.1, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, включают аминокислотную последовательность Fc домена антитела или аминокислотную последовательность константной области тяжелой цепи антитела.
8. Способ по п.7, где по меньшей мере один аминокислотный остаток выбранный из аминокислотных остатков положений от 250 до 255, от 308 до 317, и от 430 до 436 (EU нумерация) в аминокислотной последовательности Fc домена антитела или константной области тяжелой цепи антитела, был модифицирован.
9. Способ по п.1, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включают аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи антитела.
10. Способ по п.9, где по меньшей мере один аминокислотный остаток был модифицирован в аминокислотных последовательностях FR1, CDR2, и FR3 вариабельной области тяжелой цепи антитела.
11. Способ по п.1, где полипептидный мультимер включает один или два третьих полипептида, обладающих антигенсвязывающей активностью, и стадия (а) включает экспрессию ДНК, которая кодирует третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью.
12. Способ по п.11, где третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
13. Способ по п.11, где полипептидный мультимер дополнительно включает четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, и стадия (а) включает экспрессию ДНК, которая кодирует четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью.
14. Способ по пункту 13, где по меньшей мере один из третьего и четвертого полипептидов, обладающих антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
15. Способ по п.13, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью включает аминокислотные последовательности вариабельной области легкой цепи антитела и константной области тяжелой цепи антитела; второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью включает аминокислотную последовательность тяжелой цепи антитела; третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью включает аминокислотные последовательности вариабельной области тяжелой цепи антитела и константной области легкой цепи антитела; и четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
16. Способ по п.1, где полипептидный мультимер представляет собой полиспецифическое антитело.
17. Способ по п.16, где полиспецифическое антитело представляет собой биспецифическое антитело.
18. Способ по п.1, который включает первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, не обладающий антигенсвязывающей активностью, и где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью включает аминокислотную последовательность антигенсвязывающей области рецептора и аминокислотную последовательность Fc домена антитела, и второй полипептид, не обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность Fc домена антитела.
19. Способ по любому из пп.7-18, где Fc домен антитела или константная область тяжелой цепи антитела получены из IgG человека.
20. Полипептидный мультимер, полученный способом по любому из пп.1-19.
21. Способ очистки полипептидного мультимера, который включает первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, который включает стадии:
(a) экспрессии ДНК, которая кодирует первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и ДНК, которая кодирует второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью; и
(b) сбора продукта экспрессии стадии (а) с помощью аффинной хроматографии с белком А,
где один или более аминокислотных остатков в любом из или обоих первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью были модифицированы, так что существует большее различие в способности связывать белок А между первым полипептидом, обладающим антигенсвязывающей активностью и вторым полипептидом, обладающим антигенсвязывающей активностью или не обладающим антигенсвязывающей активностью.
22. Способ по п.21, где один или более аминокислотных остатков в первом полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или втором полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или не обладающем антигенсвязывающей активностью были модифицированы, чтобы увеличить или уменьшить способность связывать белок А первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью.
23. Способ по п.21, где один или более аминокислотных остатков в первом полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или втором полипептиде, обладающем антигенсвязывающей активностью или не обладающем антигенсвязывающей активностью были модифицированы для увеличения способности связывать белок А любого из первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью, и уменьшить способность связывать белок А другого полипептида.
24. Способ по п.21, где чистота собранного полипептидного мультимера составляет 95% или более.
25. Способ по п.21, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, включают аминокислотную последовательность Fc домена антитела или аминокислотную последовательность константной области тяжелой цепи антитела.
26. Способ по п.25, где по меньшей мере один аминокислотный остаток, выбранный из аминокислотных остатков положений от 250 до 255, от 308 до 317, и от 430 до 436 (EU нумерация) в аминокислотной последовательности Fc домена антитела или константной области тяжелой цепи антитела, был модифицирован.
27. Способ по п.21, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включают аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи антитела.
28. Способ по п.27, где по меньшей мере один аминокислотный остаток был модифицирован в аминокислотных последовательностях FR1, CDR2, и FR3 вариабельной области тяжелой цепи антитела.
29. Способ по п.21, где полипептидный мультимер включает один или два третьих полипептида, обладающих антигенсвязывающей активностью, и стадия (а) включает экспрессию ДНК, которая кодирует третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью.
30. Способ по п.29, где третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
31. Способ по п.29, где полипептидный мультимер дополнительно включает четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, и стадия (а) включает экспрессию ДНК, которая кодирует четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью.
32. Способ по п.31, где по меньшей мере один из третьего и четвертого полипептидов, обладающих антигенсвязывающей активностью включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
33. Способ по п.31, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью включает аминокислотные последовательности вариабельной области легкой цепи антитела и константной области тяжелой цепи антитела; второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность тяжелой цепи антитела; третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотные последовательности вариабельной области тяжелой цепи антитела и константной области легкой цепи антитела; и четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
34. Способ по п.21, где полипептидный мультимер представляет собой полиспецифическое антитело.
35. Способ по п.34, где полиспецифическое антитело представляет собой биспецифическое антитело.
36. Способ по любому из пп.25-35, где Fc домен антитела или константная область тяжелой цепи антитела являются производными от IgG человека.
37. Полипептидный мультимер, который включает первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, где способность связывать белок А отличается для первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью.
38. Полипептидный мультимер по п.37, где существует различие между рН растворителя для элюирования первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью от белка А и рН растворителя для элюирования второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью от белка А.
39. Полипептидный мультимер по п.37, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность Fc домена антитела или аминокислотную последовательность константной области тяжелой цепи антитела, и где, по меньшей мере, один аминокислотный остаток, выбранный из аминокислотных остатков положений от 250 до 255, от 308 до 317, и от 430 до 436 (EU нумерация) в аминокислотной последовательности Fc домена антитела или константной области тяжелой цепи антитела был модифицирован.
40. Полипептидный мультимер по п.37, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, включают аминокислотную последовательность Fc домена антитела или аминокислотную последовательность константной области тяжелой цепи антитела;
где аминокислотный остаток положения 435 (EU нумерация) в аминокислотной последовательности Fc домена антитела или константной области тяжелой цепи антитела представляет собой гистидин или аргинин в любом из первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью; и
где аминокислотный остаток положения 435 (EU нумерация) в аминокислотной последовательности Fc домена антитела или константной области тяжелой цепи антитела в любом из вышеуказанных полипептидов отличается от такового в другом полипептиде.
41. Полипептидный мультимер по п.37, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью или не обладающий антигенсвязывающей активностью, включают аминокислотную последовательность Fc домена антитела или аминокислотную последовательность константной области тяжелой цепи антитела; где аминокислотный остаток положения 435 (EU нумерация) в аминокислотной последовательности Fc домена антитела или константной области тяжелой цепи антитела представляет собой гистидин в любом из первого полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью и второго полипептида, обладающего антигенсвязывающей активностью или не обладающего антигенсвязывающей активностью; и где аминокислотный остаток положения 435 (EU нумерация) в аминокислотной последовательности Fc домена антитела или константной области тяжелой цепи антитела представляет собой аргинин в другом полипептиде.
42. Полипептидный мультимер по п.37, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью и второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью включают аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи антитела, и, по меньшей мере, один аминокислотный остаток был модифицирован в аминокислотных последовательностях FR1, CDR2, и FR3 вариабельной области тяжелой цепи.
43. Полипептидный мультимер по п.37, который дополнительно включает один или два третьих полипептида, обладающих антигенсвязывающей активностью.
44. Полипептидный мультимер по п.43, где третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
45. Полипептидный мультимер по п.43, который дополнительно включает четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью.
46. Полипептидный мультимер по п.45, где по меньшей мере один из третьего и четвертого полипептидов, обладающих антигенсвязывающей активностью включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
47. Полипептидный мультимер по п.45, где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотные последовательности вариабельной области легкой цепи антитела и константной области тяжелой цепи антитела; второй полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность тяжелой цепи антитела; третий полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотные последовательности вариабельной области тяжелой цепи антитела и константной области легкой цепи антитела; и четвертый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность легкой цепи антитела.
48. Полипептидный мультимер по п.37, который представляет собой полиспецифическое антитело.
49. Полипептидный мультимер по п.48, где полиспецифическое антитело представляет собой биспецифическое антитело.
50. Полипептидный мультимер по п.37, который включает первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, и второй полипептид, не обладающий антигенсвязывающей активностью, и где первый полипептид, обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность антигенсвязывающей области рецептора и аминокислотную последовательность Fc домена антитела, и второй полипептид, не обладающий антигенсвязывающей активностью, включает аминокислотную последовательность Fc домена антитела.
51. Полипептидный мультимер по любому из пп.39-50, где Fc домен антитела или константная область тяжелой цепи антитела являются производными от IgG человека.
52. Нуклеиновая кислота, кодирующая полипептид, который составляет полипептидный мультимер по любому из пп.20 и 37-51.
53. Вектор, вставленный с нуклеиновой кислотой по п.52.
54. Клетка, включающая нуклеиновую кислоту по п.52 или вектор по п.53.
55. Фармацевтическая композиция, включающая полипептидный мультимер по любому из пп.20 и 37-51 в качестве действующего ингредиента.