БИОЛОГИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ДЛЯ МОНИТОРИРОВАНИЯ ОТВЕТА ПАЦИЕНТА НА АНТАГОНИСТЫ VEGF

1. Способ мониторирования того, ответит ли пациент, который получил, по меньшей мере, одну дозу антагониста VEGF, на лечение антагонистом VEGF, где способ включает:
(a) детекцию экспрессии, по меньшей мере, одного гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце, полученном от пациента после введения, по меньшей мере, одной дозы антагониста VEGF; и
(b) сравнение уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена с уровнем экспрессии, по меньшей мере, одного гена в биологическом образце, полученном от пациента до введения антагониста VEGF пациенту,
где по уменьшению уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена в образце, полученном после введения антагониста VEGF, идентифицируют пациента, который ответит на лечение антагонистом VEGF.
2. Способ оптимизации терапевтической эффективности антагониста VEGF, где способ включает:
(a) детекцию экспрессии, по меньшей мере, одного гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце, полученном от пациента, который получал, по меньшей мере, одну дозу антагониста VEGF, после введения, по меньшей мере, одной дозы антагониста VEGF; и
(b) сравнение уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена с уровнем экспрессии, по меньшей мере, одного гена в биологическом образце, полученном от пациента до введения антагониста VEGF пациенту,
где по уменьшению уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена в образце, полученном после введения антагониста VEGF, идентифицируют пациента с увеличенной вероятностью получения пользы от лечения антагонистом VEGF.
3. Способ по п.1 или 2, где экспрессию, по меньшей мере, одного гена детектируют посредством измерения уровня мРНК.
4. Способ по п.1 или 2, где экспрессию, по меньшей мере, одного гена детектируют посредством измерения уровней белка в плазме.
5. Способ по п.1 или 2, дополнительно включающий детекцию экспрессии, по меньшей мере, второго гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце от пациента.
6. Способ по п.5, дополнительно включающий детекцию экспрессии, по меньшей мере, третьего гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце от пациента.
7. Способ по п.6, дополнительно включающий детекцию экспрессии, по меньшей мере, четвертого гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце от пациента.
8. Способ по п.1 или 2, где, по меньшей мере, один ген выбран из группы, состоящей из: ABCC9; AFAP1L1; CD93; CTLA2A; CTLA2B; CNTNAP2; COL18A1; COL4A1; COL4A2; EGFL7; ELTD1; ESM1; FAM38B; FAM167B; GIMAP1; GIMAP5; GIMAP6; GNG11; GPR116; HBB; ICAM2; KCNE3; KDR; MCAM; MEST; MMRN2; MYCT1; MYL9; NID1; NID2; NOS3; NOTCH4; OLFML2A; PCDH17; PDE6D; PODXL; PRND; RAPGEF3; RASGRP3; RBP7; SPARCL1; SPRY4; TAGLN; TMEM88 и TSPAN18.
9. Способ по п.1 или 2, где антагонист VEGF представляет собой антитело к VEGF.
10. Способ по п.9, где антитело к VEGF представляет собой бевацизумаб.
11. Способ по п.1 или 2, где пациент страдает ангиогенным нарушением.
12. Способ по п.11, где пациент страдает злокачественной опухолью, выбранной из группы, состоящей из: колоректального рака, рака молочной железы, рака легкого, глиобластомы и их комбинаций.
13. Способ выбора терапии для пациента, который получил, по меньшей мере, одну дозу антагониста VEGF, где способ включает:
(a) детекцию экспрессии, по меньшей мере, одного гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце, полученном от пациента после введения антагониста VEGF;
(b) сравнение уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена с уровнем экспрессии, по меньшей мере, одного гена в биологическом образце, полученном от пациента до введения антагониста VEGF пациенту; и
(c) выбор антагониста VEGF в качестве терапии, если уменьшение уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена детектировано в образце, полученном после введения антагониста VEGF; или
(d) выбор терапии, не являющейся антагонистом VEGF, если уменьшения уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена не детектировано в образце, полученном после введения антагониста VEGF.
14. Способ по п.13, дополнительно включающий детекцию экспрессии, по меньшей мере, второго гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце от пациента.
15. Способ по п.14, дополнительно включающий детекцию экспрессии, по меньшей мере, третьего гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце от пациента.
16. Способ по п.15, дополнительно включающий детекцию экспрессии, по меньшей мере, четвертого гена, указанного в любой из таблиц 1-3, в биологическом образце от пациента.
17. Способ по п.13, где терапия по (c) включает введение средства, выбранного из группы, состоящей из: антинеопластического средства, химиотерапевтического средства, ингибирующего рост средства, цитотоксического средства и их комбинаций.
18. Способ по п.13, дополнительно включающий
(e) введение эффективного количества антагониста VEGF пациенту, если уменьшение экспрессии, по меньшей мере, одного гена детектировано в образце, полученном после введения антагониста VEGF.
19. Способ по п.18, где антагонист VEGF представляет собой антитело к VEGF.
20. Способ по п.19, где антитело к VEGF представляет собой бевацизумаб.
21. Способ по п.20, дополнительно включающий введение эффективного количества, по меньшей мере, второго средства.
22. Способ по п.21, где второе средство выбрано из группы, состоящей из: антинеопластического средства, химиотерапевтического средства, ингибирующего рост средства, цитотоксического средства и их комбинаций.
23. Способ по п.13, где терапия по (d) включает введение средства, выбранного из группы, состоящей из: антинеопластического средства, химиотерапевтического средства, ингибирующего рост средства, цитотоксического средства и их комбинаций.
24. Способ идентификации биомаркера для мониторирования способности отвечать на антагонист VEGF, где способ включает:
(a) детекцию экспрессии биомаркера-кандидата в биологическом образце, полученном от пациента, которому ввели, по меньшей мере, одну дозу антагониста VEGF;
(b) сравнение экспрессии биомаркера-кандидата с уровнем экспрессии биомаркера-кандидата в эталонном образце,
где биомаркер-кандидат, экспрессированный на уровне, по меньшей мере, в 1,99 раза ниже по сравнению с эталонным образцом, идентифицируют как биомаркер, пригодный для мониторирования способности отвечать на антагонист VEGF.
25. Способ по п.24, где биомаркер-кандидат, экспрессированный на уровне, по меньшей мере, в 2,0 раза ниже в биологическом образце по сравнению с эталонным образцом, идентифицируют как биомаркер, пригодный для мониторирования способности отвечать на антагонист VEGF.
26. Способ по п.24, где биомаркер-кандидат, экспрессированный на уровне, по меньшей мере, в 2,7 раза ниже в биологическом образце по сравнению с эталонным образцом, идентифицируют как биомаркер, пригодный для мониторирования способности отвечать на антагонист VEGF.
27. Способ по п.24, где биомаркер-кандидат, экспрессированный на уровне, по меньшей мере, в 2,9 раза ниже в биологическом образце по сравнению с эталонным образцом, идентифицируют как биомаркер, пригодный для мониторирования способности отвечать на антагонист VEGF.
28. Способ по п.24, где биомаркер-кандидат, экспрессированный на уровне, по меньшей мере, в 3,1 раза ниже в биологическом образце по сравнению с эталонным образцом, идентифицируют как биомаркер, пригодный для мониторирования способности отвечать на антагонист VEGF.
29. Способ по п.24, где эталонный образец представляет собой биологический образец, полученный от пациента до введения антагониста VEGF пациенту.
30. Способ по п.24, где антагонист VEGF представляет собой антитело к VEGF.
31. Способ по п.30, где антитело к VEGF представляет собой бевацизумаб.