ИДЕНТИФИКАЦИЯ ОПУХОЛЕАССОЦИИРОВАННЫХ АНТИГЕНОВ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ И ТЕРАПИИ

1. Фармацевтическая композиция, включающая один или несколько компонентов, выбранных из группы, состоящей из:
(i) опухолеассоциированного антигена или его части,
(ii) нуклеиновой кислоты, кодирующей опухолеассоциированный антиген или его часть,
(iii) антитела, связывающегося с опухолеассоциированным антигеном,
(iv) антисмысловой нуклеиновой кислоты, специфически гибридизующейся с нуклеиновой кислотой, кодирующей опухолеассоциированный антиген,
(v) siRNA, направленной против нуклеиновой кислоты, кодирующей опухолеассоциированный антиген,
(vi) клетки-хозяина, экспрессирующей опухолеассоциированный антиген или его часть, и
(vii) выделенного комплекса между опухолеассоциированным антигеном или его частью и молекулой МНС,
где указанная часть содержит, по меньшей мере, 6 последовательных аминокислот опухолеассоциированного антигена,
причем данный опухолеассоциированный антиген имеет последовательность, которая кодируется нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из:
(a) нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 1,
(b) нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с нуклеиновой кислотой по (a) в строгих условиях,
(c) нуклеиновой кислоты, вырожденной по отношению к нуклеиновой кислоте по (a) или (b), и
(d) нуклеиновой кислоты, комплементарной нуклеиновой кислоте по (a), (b) или (c).
2. Фармацевтическая композиция по п.1, в которой нуклеиновая кислота по (ii) находится в экспрессионном векторе.
3. Фармацевтическая композиция по 1, в которой клетка-хозяин секретирует опухолеассоциированный антиген или его часть.
4. Фармацевтическая композиция по п.1, в которой клетка-хозяин дополнительно экспрессируют молекулу МНС, которая связывается с опухолеассоциированным антигеном или его частью.
5. Фармацевтическая композиция по п.1, в которой клетка-хозяин рекомбинантным образом экспрессирует молекулу МНС и/или опухолеассоциированный антиген или его часть.
6. Фармацевтическая композиция по п.1, в которой клетка-хозяин эндогенно экспрессирует молекулу МНС.
7. Фармацевтическая композиция по п.1, в которой клетка-хозяин представляет собой антиген-презентирующую клетку.
8. Фармацевтическая композиция по п.1, в которой антитело представляет собой моноклональное, химерное или гуманизированное антитело либо является фрагментом антитела.
9. Фармацевтическая композиция по п.1, в которой антитело конъюгировано с терапевтическим или диагностическим средством.
10. Фармацевтическая композиция по п.1, которая может применяться для лечения или профилактики опухоли или ракового заболевания.
11. Фармацевтическая композиция по п.1, которая может быть использована для лечения или предотвращения опухоли или ракового заболевания, где опухоль или раковое заболевание выбрано из группы, состоящей из карциномы толстой кишки, карциномы простаты, карциномы поджелудочной железы, карциномы пищевода, карциномы желудка, рака легких, рака молочной железы, рака яичников, рака головы и шеи, рака почки и рака печени.
12. Фармацевтическая композиция по любому из пп.1-11, в которой опухолеассоциированный антиген включает аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 2, 58-60, 68 и 69.
13. Фармацевтическая композиция по п.1, которая находится в виде вакцины.
14. Фармацевтическая композиция по п.1, которая находится в виде вакцины и предназначена для терапевтического и/или профилактического применения.
15. Способ диагностики или мониторинга опухоли или ракового заболевания, характеризующегося экспрессией или аномальной экспрессией опухолеассоциированного антигена, который включает детектирование или определение количества:
(i) нуклеиновой кислоты, кодирующей опухолеассоциированный антиген, и/или
(ii) опухолеассоциированного антигена в биологическом образце, взятом у пациента,
причем данный опухолеассоциированный антиген имеет последовательность, которая кодируется нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из:
(a) нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность согласно SEQ ID NO: 1,
(b) нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с нуклеиновой кислотой по (a) в строгих условиях,
(c) нуклеиновой кислоты, вырожденной по отношению к нуклеиновой кислоте по (a) или (b), и
(d) нуклеиновой кислоты, комплементарной нуклеиновой кислоте по (a), (b) или (c),
где биологический образец (i) выделен из ткани пациента, где имеется подозрение, что данная ткань поражена указанным заболеванием или (ii) выделен из ткани пациента, для которой известно, что она поражена указанным заболеванием,
где увеличившееся количество указанного опухолеассоциированного антигена или указанной нуклеиновой кислоты, которая кодирует указанный опухолеассоциированный антиген, по сравнению с пациентом у которого нет указанной опухоли или рака, указывает на наличие указанной опухоли или рака.
16. Способ по п.15, в котором детектирование или определение количества включает:
(i) контактирование биологического образца с агентом, специфически связывающимся с нуклеиновой кислотой, кодирующей опухолеассоциированный антиген, или с опухолеассоциированным антигеном, и
(ii) детектирование образования или определение количества комплекса между агентом и нуклеиновой кислотой или опухолеассоциированным антигеном,
в котором агент, специфически связывающийся с нуклеиновой кислотой, кодирующей опухолеассоциированный антиген, представляет собой олигонуклеотид или полинуклеотид, специфически гибридизующийся с данной нуклеиновой кислотой или
в котором агент, специфически связывающийся с опухолеассоциированным антигеном, представляет собой антитело, специфически связывающееся с данным опухолеассоциированным антигеном.
17. Способ по п.15, в котором мониторинг заболевания включает определение регрессирования, течения или возникновения данного заболевания в образце, взятом у пациента, страдающего данным заболеванием или с подозрением на данное заболевание.
18. Способ по п.15, который включает детектирование или определение количества в первом образце в первый момент времени и в следующем образце во второй момент времени и сравнение двух образцов.
19. Способ по п.15, в котором агент метят детектируемым образом.
20. Способ по п.15, в котором образец включает жидкую среду организма и/или ткань организма.
21. Способ по п.15, в котором опухолеассоциированный антиген включает аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 2, 58-60, 68 и 69.
22. Способ по п.16, в котором антитело представляет собой моноклональное, химерное или гуманизированное антитело либо является фрагментом антитела.
23. Способ по п.15, в котором опухоль или раковое заболевание представляет собой карциному толстой кишки, карциному простаты, карциному поджелудочной железы, карциному пищевода, карциному желудка, рак легких, рак молочной железы, рак яичников, рак головы и шеи, рак почки и рак печени.
24. Способ лечения или профилактики опухоли или ракового заболевания, характеризующегося экспрессией или аномальной экспрессией опухолеассоциированного антигена, который включает введение фармацевтической композиции по любому из п.п.1-14,
причем данный опухолеассоциированный антиген имеет последовательность, которая кодируется нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из:
(a) нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность согласно SEQ ID NO: 1,
(b) нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с нуклеиновой кислотой по (a) в строгих условиях,
(c) нуклеиновой кислоты, вырожденной по отношению к нуклеиновой кислоте по (a) или (b), и
(d) нуклеиновой кислоты, комплементарной нуклеиновой кислоте по (a), (b) или (c).
25. Способ по п.24, в котором опухолеассоциированный антиген включает аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 2, 58-60, 68 и 69.
26. Способ по п.24, в котором опухоль или раковое заболевание представляет собой карциному толстой кишки, карциному простаты, карциному поджелудочной железы, карциному пищевода, карциному желудка, рак легких, рак молочной железы, рак яичников, рак головы и шеи, рак почки и рак печени.
27. Способ лечения, профилактики, диагностики или мониторинга опухоли или ракового заболевания, характеризующегося экспрессией или аномальной экспрессией опухолеассоциированного антигена, который включает введение антитела, связывающегося с данным опухолеассоциированным антигеном и конъюгированного с терапевтическим или диагностическим агентом,
причем данный опухолеассоциированный антиген имеет последовательность, которая кодируется нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из:
(a) нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, согласно SEQ ID NO: 1,
(b) нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с нуклеиновой кислотой по (a) в строгих условиях,
(c) нуклеиновой кислоты, вырожденной по отношению к нуклеиновой кислоте по (a) или (b), и
(d) нуклеиновой кислоты, комплементарной нуклеиновой кислоте по (a), (b) или (c).
28. Способ по п.27, в котором антитело представляет собой моноклональное, химерное или гуманизированное антитело либо является фрагментом антитела.
29. Способ по п.27, в котором опухолеассоциированный антиген включает аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 2, 58-60, 68 и 69.
30. Способ по п.27, в котором опухоль или раковое заболевание представляет собой карциному толстой кишки, карциному простаты, карциному поджелудочной железы, карциному пищевода, карциному желудка, рак легких, рак молочной железы, рак яичников, рак головы и шеи, рак почки и рак печени.
31. Способ торможения развития опухоли или рака у пациента, который включает введение эффективного количества фармацевтической композиции по любому из пп.1-14.
32. Способ по п.31, в котором опухолевый антиген содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 2, 58-60, 68 и 69.
33. Способ по п.31, в котором опухоль или раковое заболевание представляет собой карциному толстой кишки, карциному простаты, карциному поджелудочной железы, карциному пищевода, карциному желудка, рак легких, рак молочной железы, рак яичников, рак головы и шеи, рак почки и рак печени.
34. Агент, который специфически связывается с белком или полипептидом, причем данный белок или полипептид кодируется нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из:
(a) нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность согласно SEQ ID NO: 1,
(b) нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с нуклеиновой кислотой по (a) в строгих условиях,
(c) нуклеиновой кислоты, вырожденной по отношению к нуклеиновой кислоте по (a) или (b), и
(d) нуклеиновой кислоты, комплементарной нуклеиновой кислоте по (a), (b) или (c),
где указанный агент представляет собой антитело.
35. Агент по п.34, в котором белок или полипептид содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 58-60, 68 и 69.
36. Агент по п.34, в котором антитело представляет собой моноклональное, химерное или гуманизированное антитело либо является фрагментом антитела.
37. Конъюгат между агентом по любому из пп.34-36 и терапевтическим или диагностическим агентом.
38. Конъюгат по п.37, в котором терапевтическим или диагностическим агентом является токсин.
39. Набор для выявления экспрессии или аномальной экспрессии опухолеассоциированного антигена в биологическом образце, выделенном из ткани пациента с подозрением на наличие опухоли или ракового заболевания, который включает средства для детектирования или определения количества:
(i) нуклеиновой кислоты, кодирующей опухолеассоциированный антиген, причем данный опухолеассоциированный антиген имеет последовательность, которая кодируется нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из:
(a) нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность согласно SEQ ID NO: 1,
(b) нуклеиновой кислоты, гибридизующейся с нуклеиновой кислотой по (a) в строгих условиях,
(c) нуклеиновой кислоты, вырожденной по отношению к нуклеиновой кислоте по (a) или (b), и
(d) нуклеиновой кислоты, комплементарной нуклеиновой кислоте по (a), (b) или (c).