СПОСОБ ДЕТЕКЦИИ НУКЛЕОСОМ, СОДЕРЖАЩИХ ГИСТОНОВЫЕ ВАРИАНТЫ

1. Применение внеклеточной нуклеосомы, включающей гистоновый вариант или гистоновую изоформу, в качестве биомаркера в пробе биологической жидкости для диагностики рака, кардиомиопатии, системной красной волчанки, колита, хронического обструктивного заболевания легких, болезни Крона и ревматоидного артрита.
2. Применение по п.1, где нуклеосома представляет собой мононуклеосому или олигонуклеосому.
3. Применение по п.1, где внеклеточные нуклеосомы, включающие гистоновый вариант или гистоновую изоформу, измеряют в образце крови.
4. Применение по п.1, где рак представляет собой рак мочевого пузыря, молочной железы, ободочной кишки, шейки матки, пищевода, почки, толстой кишки, легкого, полости рта, яичника, поджелудочной железы, предстательной железы, прямой кишки, кожи или желудка.
5. Применение по п.4, где рак представляет собой рак ободочной кишки, легкого, полости рта или поджелудочной железы.
6. Способ детекции присутствия в образце биологической жидкости нуклеосомы, содержащей гистоновый вариант или гистоновую изоформу, включающий следующие стадии:
контакт образца биологической жидкости со связующим веществом, которое связывается с гистоновым вариантом или гистоновой изоформой;
детекцию или количественное определение связывания указанного связующего вещества с гистоновым вариантом или гистоновой изоформой в образце биологической жидкости; и
использование присутствия или степени такого связывания в качестве меры присутствия гистонового варианта или гистоновой изоформы, или нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу в образце биологической жидкости.
7. Способ детекции присутствия в образце биологической жидкости нуклеосомы, содержащей гистоновый вариант или гистоновую изоформу, включающий следующие стадии:
контакт образца биологической жидкости с первым связующим веществом, которое связывается с нуклеосомами;
контакт нуклеосом или образца биологической жидкости со вторым связующим веществом, которое связывается с гистоновым вариантом или гистоновой изоформой;
детекцию или количественное определение связывания указанного второго связующего вещества с гистоновым вариантом или гистоновой изоформой в образце биологической жидкости; и
использование присутствия или степени такого связывания в качестве меры присутствия в образце биологической жидкости нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу.
8. Способ по п.7, в котором гистоновая изоформа представляет собой обычную гистоновую изоформу, которая встречается во всех или большинстве из нуклеосом, для анализа нуклеосом в чистом виде.
9. Способ по п.7, в котором связующее вещество, используемое для связывания гистона, предназначено для связывания области указанного гистона, которая является общей для всех или большинства гистоновых вариантов или изоформ указанного гистонового компонента и встречается во всех или большинстве из нуклеосом, для анализа нуклеосом в чистом виде.
10. Способ по п.7, в котором связующее вещество представляет собой антитело.
11. Способ по п.7, в котором образец биологической жидкости представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
12. Способ детекции присутствия в образце биологической жидкости нуклеосомы, содержащей гистоновый вариант или гистоновую изоформу, включающий следующие стадии:
контакт образца биологической жидкости с первым связующим веществом, которое связывается с гистоновым вариантом или гистоновой изоформой;
контакт нуклеосом или образца биологической жидкости со вторым связующим веществом, которое связывается с нуклеосомами;
детекцию или количественное определение связывания указанного второго связующего вещества с нуклеосомами в образце биологической жидкости; и
использование присутствия или степени такого связывания в качестве меры присутствия в образце биологической жидкости нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу.
13. Способ по п.12, где гистоновая изоформа представляет собой обычную гистоновую изоформу, которая встречается во всех или большинстве из нуклеосом, для анализа нуклеосом в чистом виде.
14. Способ по п.12, где связующее вещество, используемое для связывания гистона, предназначено для связывания области указанного гистона, которая является общей для всех или большинства гистоновых вариантов или изоформ указанного гистонового компонента и встречается во всех или большинстве из нуклеосом, для анализа нуклеосом в чистом виде.
15. Способ по п.12, где связующее вещество представляет собой антитело.
16. Способ по п.12, где образец биологической жидкости представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
17. Способ детекции присутствия в образце крови, сыворотки или плазмы нуклеосомы, содержащей гистоновый вариант или гистоновую изоформу, включающий следующие стадии:
удаление, выделение или экстрагирование гистонового варианта или изоформы из нуклеосомного комплекса для получения свободного компонента гистонового варианта или изоформы;
детекцию или количественное определение свободного гистонового варианта или изоформы в образце; и
использование присутствия или количества свободного гистонового варианта или изоформы в качестве меры присутствия в образце нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу.
18. Способ детекции состояния заболевания животного субъекта или человека, включающий следующие стадии:
детекцию или измерение нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу, в биологической жидкости субъекта; и
использование уровня связанного с нуклеосомами гистонового варианта или гистоновой изоформы, измеренного для определения состояния заболевания субъекта.
19. Способ по п.18, в котором связанный с нуклеосомами гистоновый вариант или гистоновую изоформу определяют или измеряют как один из параметров измерений.
20. Способ оценки животного субъекта или человека в отношении пригодности для терапевтического лечения, включающий следующие стадии:
детекцию или измерение нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу, в биологической жидкости субъекта; и
использование уровня связанного с нуклеосомами гистонового варианта или гистоновой изоформы, определяемого в качестве параметра при выборе подходящего лечения для субъекта.
21. Способ по п.20, в котором связанный с нуклеосомами гистоновый вариант или гистоновую изоформу определяют или измеряют как один из параметров измерений.
22. Способ наблюдения лечения животного субъекта или человека, включающий следующие стадии:
детекцию или измерение нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу, в биологической жидкости субъекта;
повторную детекцию или измерение нуклеосом, содержащих гистоновый вариант или гистоновую изоформу, в биологической жидкости субъекта в один или несколько моментов времени; и
использование любых изменений уровня связанного с нуклеосомами гистонового варианта или гистоновой изоформы, определяемого в качестве параметра любых изменений состояния субъекта.
23. Способ по п.22, где связанный с нуклеосомами гистоновый вариант или гистоновую изоформу определяют или измеряют как один из параметров измерений.