СПОСОБЫ, КОМПОЗИЦИИ И НАБОРЫ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ВИРУСА ГЕПАТИТА А

1. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность или ее комплемент, как представлено в:
5′-GCG CCC GGC GGG GTC ААС ТСС АТ-3′ (SEQ ID NO: 1);
5′-AGC CAA GTT ААС ACT GCA AGG-3′ (SEQ ID NO: 2); или
5′-TTA GCA TGG AGC TGT AGG AGT СТА AAT TGG GG-3′ (SEQ ID NO: 3).
2. Композиция, которая содержит пару олигонуклеотидных праймеров, включающую прямой праймер, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратный праймер, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2, где пара праймеров является способной к отжигу целевой последовательности при условиях ПЦР для амплификации целевой последовательности.
3. Композиция по п. 2, которая дополнительно включает олигонуклеотидный зонд, который имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 3, где зонд является способным к отжигу целевой последовательности.
4. Способ амплификации целевой последовательности, где способ включает: осуществление ПЦР с целевой последовательностью в качестве матрицы, где осуществление включает обеспечение ПЦР прямым праймером, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратным праймером, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2.
5. Способ по п. 4, где целевая последовательность соответствует кДНК, полученной из РНК образца, включающего HAV.
6. Способ определения HAV в образце, где способ включает:
а. осуществление ПЦР с матрицей нуклеиновой кислоты в образце при использовании прямого праймера, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 1, и обратного праймера, который включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 2; и
b. определение ампликона, который образуется с помощью прямого и обратного праймеров, где присутствие ампликона определяет, является ли HAV присутствующим в образце.
7. Способ по п. 6, где определение включает обеспечение полинуклеотидного зонда для ПЦР, посредством чего ампликон, в случае присутствия, контактирует с зондом, где зонд включает последовательность, как представлено в SEQ ID NO: 3, или ее комплемент.
8. Способ по п. 7, где зонд является меченным с помощью FAM/BHQ-1.
9. Набор, который включает одну или более изолированную молекулу нуклеиновой кислоты по п. 1.