АНТИИДИОТИПИЧЕСКИЕ АНТИТЕЛА И СВЯЗАННЫЕ С НИМИ СПОСОБЫ

1. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие:
вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3, соответственно, содержащие аминокислотные последовательности последовательностей CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3, содержащиеся в аминокислотной последовательности области VH с SEQ ID NO: 1; и
вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3, соответственно, содержащие аминокислотные последовательности последовательностей CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3, содержащиеся в аминокислотной последовательности области VL с SEQ ID NO: 5.
2. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 1, где CDR-H1 содержит последовательность SEQ ID NO: 9, 78, 79 или 80; CDR-H2 содержит последовательность SEQ ID NO: 10, 81, 82 или 83; CDR-H3 содержит последовательность SEQ ID NO: 11 или 84; CDR-L1 содержит последовательность SEQ ID NO: 12 или 85; CDR-L2 содержит последовательность SEQ ID NO: 13 или 86; и CDR-L3 содержит последовательность SEQ ID NO: 14 или 87.
3. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 1 или 2, где последовательности CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3, CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 определены с помощью Kabat.
4. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-3, где:
вариабельная область легкой цепи (VL) по меньшей мере на 90% идентична аминокислотной последовательности области VL c SEQ ID NO: 5; и
вариабельная область тяжелой цепи (VH) по меньшей мере на 90% идентична аминокислотной последовательности области VH с SEQ ID NO: 1.
5. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-4, где вариабельная область легкой цепи (VL) содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и вариабельная область тяжелой цепи (VH) содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1.
6. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит:
вариабельная область легкой цепи (VL) по меньшей мере на 90% идентична аминокислотной последовательности области VL c SEQ ID NO: 5; и
вариабельная область тяжелой цепи (VH) по меньшей мере на 90% идентична аминокислотной последовательности области VH с SEQ ID NO: 1.
7. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 6, где вариабельная область тяжелой цепи (VH) содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, и вариабельная область тяжелой цепи (VL) содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5.
8. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-7, где антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывается с мишеневым антителом, которое представляет собой антитело SJ25C1 или его антигенсвязывающий фрагмент, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24.
9. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 8, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv), содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28.
10. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-9, где:
мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент находится в антигенсвязывающем домене экстрацеллюлярной части химерного антигенного рецептора (CAR) или включенным в него; и/или
антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывается с мишеневым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, содержащимся в антигенсвязывающем домене экстрацеллюлярной части CAR или включенным в него.
11. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-10, где антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой:
агонистическое антитело CAR, содержащее мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент; или
антагонист CAR, содержащий мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
12. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-10, где антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой агонистическое антитело CAR, где CAR содержит мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
13. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-12, которое является гуманизированным и/или рекомбинантным.
14. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13, которое является моноклональным.
15. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-14, где антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой антигенсвязывающий фрагмент.
16. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 15, где антигенсвязывающий фрагмент выбран из группы, состоящей из антигенсвязывающих (Fab) фрагментов, F(ab')2 фрагментов, Fab' фрагментов, Fv фрагментов, одноцепочечных вариабельных фрагментов (scFv) и однодоменных антител (sdAb).
17. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п. 15 или п. 16, где антигенсвязывающий фрагмент содержит по меньшей мере часть константной области иммуноглобулина.
18. Антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-14, где антиидиотипическое антитело представляет собой интактное антитело или полноразмерное антитело.
19. Конъюгат для детекции связывания антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и мишеневого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и гетерологичную молекулу или фрагмент, выбранный из группы, состоящей из визуализирующего агента, детектируемого фрагмента и радиоактивного атома, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи (VH) с SEQ ID NO: 23, и последовательность вариабельной области легкой цепи (VL) с SEQ ID NO: 24.
20. Конъюгат для визуализации связывания между антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом и целевым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и гетерологичную молекулу или фрагмент, выбранный из группы, состоящей из визуализирующего агента, детектируемого фрагмента и радиоактивного атома, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24.
21. Конъюгат для диагностики заболевания или расстройства, при котором экспрессируется CD19, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и гетерологичную молекулу или фрагмент, выбранный из группы, состоящей из визуализирующего агента, обнаруживаемого фрагмента и радиоактивного атома.
22. Конъюгат для лечения заболевания или расстройства, при котором экспрессируется CD19, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и гетерологичную молекулу или фрагмент, выбранный из группы, состоящей из цитотоксического агента, лекарственного средства, токсина и радиоактивного атома.
23. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая тяжелую цепь антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-18.
24. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая легкую цепь антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-18.
25. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая тяжелую цепь и легкую цепь антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-18.
26. Вектор для экспрессии молекулы нуклеиновой кислоты, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп. 23-25.
27. Способ получения антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, включающий экспрессию тяжелой и легкой цепи, кодируемой молекулой нуклеиновой кислоты по п. 25, в подходящей клетке-хозяине и восстановление или выделение антитела.
28. Способ получения антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, включающий экспрессию тяжелой цепи, кодируемой молекулой нуклеиновой кислоты по п. 23, и легкой цепи, кодируемой молекулой нуклеиновой кислоты по п. 24, в подходящей клетке-хозяине и восстановление или выделение антитела.
29. Клетка для экспрессии антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, содержащая антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18.
30. Композиция для лечения заболевания или расстройства, при котором экспрессируется CD19, содержащая антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
31. Композиция для детекции, содержащая антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
32. Композиция для визуализации, содержащая антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
33. Композиция для диагностики, содержащая антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
34. Композиция для стимуляции клеток, экспрессирующих антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащая антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи (VH) с SEQ ID NO: 23, и последовательность вариабельной области легкой цепи (VL) с SEQ ID NO: 24.
35. Композиция для отбора клеток, содержащая антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
36. Набор для лечения заболевания или расстройства, при котором экспрессируется CD19, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и инструкцию по применению.
37. Набор для обнаружения, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и инструкцию по применению.
38. Набор для визуализации, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и инструкцию по применению.
39. Набор для диагностики, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и инструкцию по применению.
40. Набор для стимуляции клеток, экспрессирующих антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и инструкции по применению, где антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи (VH) в SEQ ID NO: 23, и последовательность вариабельной области легкой цепи (VL) в SEQ ID NO: 24.
41. Набор для отбора клеток, содержащий антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18 и инструкцию по применению.
42. Способ обнаружения антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, связанного с мишеневым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, включающий:
(a) приведение в контакт композиции, содержащей антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, с антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом по любому из пп. 1-18, которое специфически связывается с мишеневым антителом, которое представляет собой антитело SJ25C1 или его антигенсвязывающий фрагмент, где антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи (VH) с SEQ ID NO: 23, и последовательность вариабельной области легкой цепи (VL) с SEQ ID NO: 24; и
(b) обнаружение антиидиотипического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, связанного с мишеневым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом.
43. Способ детекции клеток, экспрессирующих CAR, содержащий антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, включающий:
(a) приведение в контакт клетки, экспрессирующей CAR, содержащий мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, с антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом по любому из пп. 1-18, которое специфически связывается с антителом-мишенью или его антигенсвязывающим фрагментом,
где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24; и
(b) детекцию клеток, связанных с антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом.
44. Способ отбора клеток, экспрессирующих CAR, содержащий антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, из популяции клеток, включающий:
(a) приведение в контакт клеточной популяции, экспрессирующей CAR, содержащий мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, или клетку, связанную с мишеневым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, с антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом по любому из пп. 1-18,
где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24; и
(b) селекцию клеток, связанных с антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом.
45. Способ стимуляции клеток, экспрессирующих CAR, содержащий антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, включающий инкубацию входной композиции, содержащей клетки, экспрессирующие CAR, содержащие антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, с антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом по любому из пп. 1-18, с получением таким образом выходной композиции, содержащей стимулированные клетки, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24.
46. Способ получения клеточной композиции, включающий:
(a) введение в клетки молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, тем самым получая входную композицию; и
(b) инкубирование входной композиции с антиидиотипическим антителом или антигенсвязывающим фрагментом по любому из пп. 1-18, тем самым получая клеточную композицию.
47. Способ очистки антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, включающий:
(a) приведение в контакт композиции, содержащей антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, с антиидиотипическим антителом или его антигенсвязывающим фрагментом по любому из пп. 1-18, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24; и
(b) выделение комплексов, содержащих антиидиотипическое антитело или антигенсвязывающий фрагмент.
48. Способ истощения клеток, экспрессирующих CAR, содержащих антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, включающий введение индивиду композиции, содержащей антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18, где индивиду вводили CAR, экспрессирующий клетку, содержащий антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент, где антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24.
49. Композиция для истощения клеток индивида, содержащая или антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18, где индивиду вводили CAR, экспрессирующий клетку, содержащую мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL С SEQ ID NO: 24.
50. Набор для детекции мишеневого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, содержащий:
(a) один или более контейнеров, содержащих антиидиотипическое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-18, и инструкции по применению антиидиотипического антитела для детекции мишеневого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или химерного антигенного рецептора, содержащего целевое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24; и
инструкции по отбору или обогащению из популяции клеток сконструированных клеток, экспрессирующих CAR, содержащих антитело SJ25C1 или его антигенсвязывающий фрагмент, или
инструкции по стимуляции входной композиции, содержащей клетки, экспрессирующие химерный антигенный рецептор, содержащий антитело-мишень или его антигенсвязывающий фрагмент; или
(b) один или более контейнеров, содержащих связывающий реагент, содержащий экстрацеллюлярный домен CAR, содержащий мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где экстрацеллюлярный домен или его часть содержит мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где мишеневое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 23, и последовательность VL с SEQ ID NO: 24; и
один или более контейнеров, содержащих антиидиотипическое антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-20.