ПРОДУЦИРУЕМЫЙ БАКТЕРИЯМИ МИКРОЦИН С, НОВЫЙ АНТИМИКРОБНЫЙ ПЕПТИД, ЭФФЕКТИВНЫЙ ПРОТИВ ПАТОГЕННЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ, НАПРИМЕР ЭНТЕРОГЕМОРРАГИЧЕСКОЙ Escherichia coli (EHEC)

1. Выделенный полипептид, отличающийся тем, что полипептид:
a) включает аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% или больше идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO:6 или SEQ ID NO:7, причем полипептид включает аминокислотную последовательность с антимикробной активностью;
b) кодирован молекулой нуклеиновой кислоты, включающей нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 70% или больше идентична нуклеотидной последовательности, включающей нуклеотидную последовательность любой одной из SEQ ID NO:1, 2, 3, 4 или 5 или ее комплемента, причем нуклеотидная последовательность включает SEQ ID NO:1, несущую информацию по полипептиду по меньшей мере с антимикробной активностью или аутоиммунной активностью микроцина С или транспортной активностью микроцина С, и причем нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:2, несет информацию по полипептиду с антимикробной активностью, нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:3, несет информацию по полипептиду с аутоиммунной активностью микроцина С, нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:4, несет информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С, и нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:5, несет информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С;
c) кодирован молекулой нуклеиновой кислоты, которая гибридизируется с нуклеотидной последовательностью, комплементарной к нуклеотидной последовательности, включающей последовательность нуклеотидов любой одной из SEQ ID NO:1, 2, 3, 4 или 5 или ее комплемента при строгих условиях, причем нуклеотидная последовательность включает SEQ ID NO:1, несущую информацию по полипептиду по меньшей мере с анти-микробной активностью или аутоиммунной активностью микроцина С или транспортной активностью микроцина С, и причем нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:2, несет информацию по полипептиду с антимикробной активностью, нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:3, несет информацию по полипептиду с аутоиммунной активностью микроцина С, нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:4, несет информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С, и нуклеотидная последовательность, включающая SEQ ID NO:5, несет информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С; или
d) включает встречающийся в природе аллельный вариант полипептида, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6 или SEQ ID NO:7, причем полипептид включает аминокислотную последовательность с антимикробной активностью.
2. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид микроцин С, полипептид с аутоиммунной активностью микроцина С или полипептид с транспортной активностью для микроцина С, отличающаяся тем, что упомянутая молекула нуклеиновой кислоты:
a) включает нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 70% или больше идентична любой одной из SEQ ID NO:1, 2, 3, 4 или 5 или ее комплементу, причем молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:1, несущую информацию по полипептиду по меньшей мере с антимикробной активностью или аутоиммунной активностью микроцина С или транспортной активностью микроцина С, молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:2, несущую информацию по полипептиду с антимикробной активностью, молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:3, несущую информацию по полипептиду с аутоиммунной активностью микроцина С, молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:4, несущую информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С, и молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:5, несущую информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С;
b) включает молекулу нуклеиновой кислоты, которая гибридизируется с нуклеотидной последовательностью, комплементарной нуклеотидной последовательности, включающей нуклеотидную последовательность любой одной из SEQ ID NO:1, 2, 3, 4 или 5 или ее комплемента в строгих условиях, причем молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:1, несущую информацию по полипептиду по меньшей мере с антимикробной активностью или аутоиммунной активностью микроцина С или транспортной активностью микроцина С, молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:2, несущую информацию по полипептиду с антимикробной активностью, молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:3, несущую информацию по полипептиду с аутоиммунной активностью микроцина С, молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:4, несущую информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С, и молекула нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO:5, несущую информацию по полипептиду с транспортной активностью для микроцина С;
c) включает нуклеотидную последовательность, которая кодирует полипептид, включающий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% или больше идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO:6 или SEQ ID NO:7, причем полипептид имеет антимикробную активность; или
d) включает молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует встречающийся в природе аллельный вариант полипептида, включающего аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6 или SEQ ID NO:7, причем полипептид имеет антимикробную активность.
3. Плазмида, включающая молекулу нуклеиновой кислоты по п.2 или несущую информацию по полипептиду по п.1.
4. Клетка, включающая молекулу нуклеиновой кислоты по п.2 и/или полипептид по п.1 и/или плазмиду по п.3, отличающаяся тем, что исключены не выделенные клетки, которые включают встречающуюся в природе молекулу нуклеиновой кислоты по п.2 или встречающийся в природе полипептид по п.1 или встречающуюся в природе плазмиду по п.3.
5. Антитело, которое селективно связывается с полипептидом по п.1.
6. Композиция, включающая:
a) полипептид по п.1 и/или
b) клетку по п.4.
7. Композиция по п.6, отличающаяся тем, что композиция является фармацевтической композицией, кроме того включающей фармацевтически приемлемый носитель.
8. Композиция по п.6, отличающаяся тем, что композиция является дезинфицирующим средством для поверхностей.
9. Полипептид по п.1, или клетка по п.4, или композиция по п.6 для использования в терапии или профилактике.
10. Полипептид по п.1, или клетка по п.4 или композиция по п.6 для использования при лечении или профилактике микробных инфекций.
11. Полипептид по п.10, причем микробная инфекция включает инфекции энтеро-патогенными и/или энтерогеморрагическими бактериями Е. coli (ЕРЕС, ЕНЕС), или для использования при лечении или профилактике микробных инфекций, связанных с гемолитико-уремическим синдромом (HUS).
12. Полипептид по п.1, или клетка по п.4, или композиция по п.6 для использования при лечении или профилактике нарушений желудочно-кишечного тракта или функциональных нарушений желудочно-кишечного тракта.
13. Полипептид по п.1, или клетка по п.4, или композиция по п.6 для использования при лечении опухоли.
14. Способ продукции полипептида по п.1, причем способ включает
использование молекулы нуклеиновой кислоты по п.2, плазмиды по п.3 или клетки по п.4 или синтез полипептида по п.1 способа синтеза из жидкой фазы или твердой фазы.
15. Способ in vitro для идентификации бактерий, которые чувствительны к микроцину С, причем способ включает контакт полипептида по п.1 или полипептида, кодированного молекулой нуклеиновой кислоты по п.2, или клетки по п.4 или композиции по п.6 с клеткой, отличающийся тем, что снижение эффективности адгезии клетки к эпителиальным клеткам кишечника указывает на чувствительность клетки к микроцину С.
16. Способ консервирования пищевых продуктов, причем способ включает:
добавление к пищевому продукту по меньшей мере одного вида натурального антимикробного агента,
отличающийся тем, что агентом является
a) полипептид по п.1,
b) клетка по п.4 и/или
с) композиция по п.6.
17. Способ нанесения покрытия на раневый материал, отличающийся тем, что раневый материал покрывают:
a) полипептидом по п.1 и/или
b) композицией по п.6.