СПОСОБ ОБНАРУЖЕНИЯ НЕКРОТИЧЕСКОГО ЭНТЕРИТА ПТИЦ

1. Способ обнаружения некротического энтерита птиц, в частности доклинического некротического энтерита птиц, где способ включает выделение микровезикул из образца из организма птиц и последующее определение присутствия и/или уровня по меньшей мере одного маркера, служащего признаком некротического энтерита, в котором присутствие и/или повышенный уровень указанного по меньшей мере одного маркера по сравнению с незараженным контролем служит признаком некротического энтерита.
2. Способ по п. 1, в котором маркер выбирают из следующих последовательностей:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 1;
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 3;
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 4;
г) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 5;
д) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 7;
е) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 8;
ж) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 9;
з) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 16;
и) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40, 60 или 80, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 10;
к) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 11;
л) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 12;
м) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 13;
н) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(м);
о) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпункте (н);
п) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(о).
3. Способ по п. 2, в котором обнаружение некротического энтерита осуществляют посредством обнаружения по меньшей мере одной из следующих последовательностей:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 1 до 630, в частности от 420 до 630, предпочтительно от 460 до 560 SEQ ID NO: 1,
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 600 до 1000, в частности от 670 до 760, SEQ ID NO: 3,
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 60 до 240, в частности от 80 до 220, SEQ ID NO: 4;
г) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 1300 до 1800, в частности от 1400 до 1700, SEQ ID NO: 5;
д) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 1 до 591, в частности от 100 до 280, SEQ ID NO: 7;
е) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 240 до 540, в частности от 300 до 540, SEQ ID NO: 8;
ж) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 12 до 418, в частности от 240 до 400, SEQ ID NO: 9;
з) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 673 до 5628 SEQ ID NO: 16;
и) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 14 до 25 SEQ ID NO: 10;
к) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18 или 20, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 44 до 65 SEQ ID NO: 11;
л) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18 или 20, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 3 до 24 SEQ ID NO: 12;
м) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18 или 20, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, простирающейся от положения 45 до 66 SEQ ID NO: 13,
н) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(м);
о) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпункте (н);
п) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(о).
4. Способ обнаружения некротического энтерита птиц, в частности, доклинического некротического энтерита птиц, где обнаружение некротического энтерита осуществляют посредством обнаружения присутствия и/или определения количества по меньшей мере одной из следующих последовательностей в образце из организма птиц:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 1;
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 3,
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 4;
г) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 7;
д) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 9;
е) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40, 60 или 80, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 10;
ж) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 11;
з) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 12;
и) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 13;
к) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(и);
л) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпункте (к); м) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(л).
5. Способ обнаружения бактериальной инфекции птиц, предпочтительно некротического энтерита птиц, в частности, доклинического некротического энтерита, где способ включает выделение микровезикул из образца из организма птиц и последующее определение присутствия и/или уровня по меньшей мере одного маркера из организма птиц, служащего признаком инфекции, в котором повышенный уровень указанного по меньшей мере одного маркера из организма птиц по сравнению с незараженным контролем служит признаком инфекции, и в котором по меньшей мере один маркер из организма птиц представляет собой птичью миРНК и его предпочтительно выбирают из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40, 60 или 80, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 10;
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 11;
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 12;
г) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 13;
д) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(г);
е) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпункте (д);
ж) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(е).
6. Способ по одному из предыдущих пунктов, в которых образец из организма птиц представляет собой общую воду организма, предпочтительно кровь, в частности плазму крови или сыворотку крови, или экскремент организма, предпочтительно экскремент в виде фекалий или цекального помета.
7. Способ обнаружения некротического энтерита птиц, в частности, доклинического некротического энтерита птиц, где способ включает определение присутствия и/или уровня по меньшей мере одного маркера, служащего признаком некротического энтерита птиц, в экскрементах птиц в виде фекалий, предпочтительно в микровезикулах, выделенных из экскрементов птиц в виде фекалий, в котором повышенный уровень указанного по меньшей мере одного маркера по сравнению с незараженным контролем служит признаком некротического энтерита, и в котором маркер предпочтительно выбирают из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 1;
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 3;
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 4;
г) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 5;
д) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 7;
е) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 8;
ж) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 9;
з) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(ж);
и) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпункте (з);
к) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(и).
8. Способ обнаружения некротического энтерита птиц, в частности, доклинического некротического энтерита птиц, где способ включает определение присутствия и/или уровня по меньшей мере одного маркера, служащего признаком некротического энтерита птиц, в экскрементах птиц в виде цекального помета, в частности, в микровезикулах, выделенных из экскрементов птиц в виде цекального помета, в котором повышенный уровень указанного по меньшей мере одного маркера по сравнению с незараженным контролем служит признаком некротического энтерита, и в котором маркер предпочтительно выбирают из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 1;
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 3;
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 4;
г) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 5;
д) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 7;
е) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 8;
ж) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 9;
з) олинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 13;
и) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(з);
к) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпункте (и);
л) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(к).
9. Способ обнаружения некротического энтерита птиц, в частности, доклинического некротического энтерита птиц, где способ включает определение присутствия и/или уровня по меньшей мере одного маркера, служащего признаком некротического энтерита птиц, в крови птиц, предпочтительно в микровезикулах, выделенных из крови птиц, в котором повышенный уровень указанного по меньшей мере одного маркера по сравнению с незараженным контролем служит признаком некротического энтерита и в котором маркер предпочтительно выбирают из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40, 60 или 80, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 10;
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 11;
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 8 или 10, предпочтительно по меньшей мере 12, 14, 16, 18, 20, 25, 40 или 60, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 12;
г) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(в);
д) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпункте (г);
е) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(д).
10. Способ обнаружения инфекции птиц, в частности доклинической инфекции птиц, предпочтительно бактериальной инфекции птиц, в частности, доклинической бактериальной инфекции птиц, более предпочтительно некротического энтерита, в частности доклинического некротического энтерита, где способ включает определение присутствия и/или уровня по меньшей мере одного маркера из организма птиц, служащего признаком заболевания, в микровезикулах, выделенных из экскрементов птиц, в частности из экскрементов в виде фекалий или цекального помета, в котором повышенный уровень указанного по меньшей мере одного маркера по сравнению с незараженным контролем служит признаком заболевания.
11. Способ по одному из предыдущих пунктов, в котором образец из организма птиц представляет собой образец из организма домашней птицы, предпочтительно образец из организма кур, индюков, уток, гусей, павлинов, фазанов, серых куропаток, цесарок, перепелов, глухарей, шотландских куропаток, голубей, лебедей, страусов и попугаев, наиболее предпочтительно кур.
12. Способ лечения, включающий осуществление способа по одному из предыдущих пунктов и введение терапевтического агента, предназначенного для лечения заражения некротическим энтеритом.
13. Полинуклеотиды, выбранные из группы, которая состоит из следующих полинуклеотидов:
а) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 100, предпочтительно по меньшей мере 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 1;
б) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 90%, предпочтительно по меньшей мере на 95, 98 или 99%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 1;
в) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 100, предпочтительно по меньшей мере 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 3;
г) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 90%, предпочтительно по меньшей мере на 95, 98 или 99%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 3;
д) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 100, предпочтительно по меньшей мере 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 7;
е) полинуклеотиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 90%, предпочтительно по меньшей мере на 95, 98 или 99%, наиболее предпочтительно на 100%, полинуклеотиду, который содержит по меньшей мере 20, предпочтительно по меньшей мере 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 7;
ж) полинуклеотиды (ДНК и РНК), которые комплементарны последовательностям, указанным в подпунктах (а)-(е);
з) полинуклеотиды, которые содержат полинуклеотиды, указанные в подпунктах (а)-(ж).
14. Вектор, содержащий полинуклеотид по п. 13.
15. Полипептиды, выбранные из группы, которая состоит из следующих полипептидов;
а) полипептиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полипептиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 200, в частности все, последовательно расположенные аминокислоты аминокислотной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 2;
б) полипептиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полипептиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60 или 70, в частности все, последовательно расположенные аминокислоты аминокислотной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 14;
в) полипептиды, которые имеют последовательность, идентичную по меньшей мере на 80%, предпочтительно по меньшей мере на 85, 90 или 95%, наиболее предпочтительно на 100%, полипептиду, который содержит по меньшей мере 10, предпочтительно по меньшей мере 15, 20, 25, 40, 60, 100, 150, 180 или 190, в частности все, последовательно расположенные аминокислоты аминокислотной последовательности, которая представлена в SEQ ID NO: 15;
г) полипептиды, которые содержат полипептиды, указанные в подпунктах (а)-(в).