ГЕНОМНЫЙ ОТБОР И СЕКВЕНИРОВАНИЕ С ПОМОЩЬЮ КОДИРОВАННЫХ МИКРОНОСИТЕЛЕЙ

1. Способ определения последовательности молекулы нуклеиновой кислоты-мишени, включающий стадии:
a) получение олигонуклеотидного зонда захвата, присоединенного к кодированному микроносителю, в котором код указанного микроносителя идентифицирует последовательность указанного олигонуклеотидного зонда,
b) гибридизация указанного олигонуклеотидного зонда захвата с образцом, содержащим молекулу нуклеиновой кислоты, в которой указанная молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность, которая по меньшей мере частично комплементарна последовательности олигонуклеотидного зонда захвата,
c) определение последовательности гибридизуемой молекулы нуклеиновой кислоты со стадии b) путем генерации считывания последовательности по меньшей мере 2 нуклеотидов и определение последовательности нуклеотидов, включенных в указанное считывание последовательности,
d) определение кода на микроносителе,
e) идентификация последовательности нуклеотидов олигонуклеотидного зонда захвата, соответствующего коду на микроносителе,
f) объединение информации о последовательности, определенной на стадии с), с информацией, идентифицированной на стадии е), для определения последовательности молекулы нуклеиновой кислоты-мишени.
2. Способ по п.1, дополнительно включающий стадию локализации нуклеотидной последовательности олигонуклеотидного зонда захвата в эталонном геноме.
3. Способ по п.1, в котором молекула нуклеиновой кислоты-мишени содержит по меньшей мере 2 последовательности зонда нуклеиновой кислоты.
4. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором кодированный микроноситель находится в суспензии в ходе одной или более стадий по указанному способу.
5. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором используют множество различным образом кодированных микроносителей и в котором каждый код соответствует уникальной последовательности олигонуклеотидного зонда захвата.
6. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором микроноситель представляет собой магнитную частицу или заряженную частицу.
7. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором реакцию секвенирования осуществляют с помощью зонда захвата в качестве праймера секвенирования.
8. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором реакцию секвенирования осуществляют после амплификации клона на микроносителе или в непосредственной близости от него.
9. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором на стадии d) код клонированного носителя определяется оптическими способами.
10. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором образец нуклеиновой кислоты представляет собой геномную ДНК, фрагментированную ферментом рестрикции.
11. Способ по одному из пп.1 и 2, в котором длина олигонуклеотидного зонда захвата составляет между 40 и 200 нуклеотидами.
12. Устройство для определения последовательности образца нуклеиновой кислоты, содержащее блок отжига зондов захвата с нуклеиновыми кислотами, блок определения последовательности молекулы ДНК, блок для манипуляции микроносителем и блок для определения кода микроносителя.
13. Устройство по п.11, которое представляет собой микрожидкостное устройство.
14. Устройство по п.12 или 13, в котором блок манипуляции микроносителем содержит средства для приложения по меньшей мере одного магнитного поля.