КОМПОНЕНТ 1 МЕХАНОЧУВСТВИТЕЛЬНОГО ИОННОГО КАНАЛА ПЬЕЗО-ТИПА (PIEZO1) И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ

1. Способ идентификации субъекта-человека, имеющего повышенный риск развития варикозного расширения вен, где способ включает определение, запланированное или уже осуществленное, в биологическом образце, полученном от субъекта, наличия или отсутствия:
молекулы геномной нуклеиновой кислоты варианта компонента 1 механочувствительного ионного канала пьезо-типа (PIEZO1) с прогнозируемой потерей функции;
молекулы мРНК варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции;
молекулы кДНК варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции, полученной из молекулы мРНК; или
полипептида варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции;
где:
отсутствие молекулы геномной нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции, молекулы мРНК, молекулы кДНК или полипептида указывает на то, что субъект не имеет повышенного риска развития варикозного расширения вен; и
наличие молекулы геномной нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции, молекулы мРНК, молекулы кДНК или полипептида указывает на то, что субъект имеет повышенный риск развития варикозного расширения вен.
2. Способ диагностирования варикозного расширения вен у субъекта-человека, включающий обнаружение в образце, полученном от субъекта, наличия или отсутствия:
молекулы геномной нуклеиновой кислоты варианта компонента 1 механочувствительного ионного канала пьезо-типа (PIEZO1) с прогнозируемой потерей функции;
молекулы мРНК варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции;
молекулы кДНК варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции, полученной из молекулы мРНК; или
полипептида варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции;
где, если субъект имеет молекулу геномной нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции, молекулу мРНК, молекулу кДНК или полипептид и имеет один или более симптомов варикозного расширения вен, то субъекта диагностируют, как имеющего варикозное расширение вен.
3. Способ по п. 1 или 2, где способ дополнительно включает лечение субъекта с варикозным расширением вен или повышенным риском развития варикозного расширения вен средством, эффективным для лечения варикозного расширения вен.
4. Способ лечения пациента с помощью терапевтического агента, который лечит или ингибирует варикозное расширение вен, где указанный пациент страдает варикозным расширением вен, включающий этапы:
определения того, имеет ли пациент молекулу нуклеиновой кислоты компонента механочувствительного ионного канала 1 пьезо-типа (PIEZO1) с прогнозируемой потерей функции, кодирующую полипептид PIEZO1 человека, путем:
получения, запланированного или уже осуществленного, биологического образца от пациента; и
проведения, запланированного или уже осуществленного, анализа генотипирования биологического образца, чтобы определить, имеет ли пациент генотип, включающий молекулу нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции; и,
если пациент соответствует стандарту PIEZO1, введение или продолжение введения пациенту терапевтического агента, который лечит или ингибирует варикозное расширение вен, в стандартной дозе; и,
если пациент является гетерозиготным или гомозиготным в отношении молекулы нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции, введение или продолжение введения пациенту терапевтического агента, который лечит или ингибирует варикозное расширение вен, в количестве, которое равно или превышает стандартную дозу;
при этом наличие генотипа, включающего молекулу нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции, кодирующую человеческий полипептид PIEZO1, указывает на то, что пациент имеет повышенный риск развития варикозного расширения вен.
in vitro
5. Способ по любому из пп. 1-4, где этап определения, этап обнаружения или анализ генотипирования проводят .
6. Способ по любому из пп. 1-5, где этап определения, этап обнаружения или анализ генотипирования включает секвенирование по меньшей мере части нуклеотидной последовательности молекулы нуклеиновой кислоты PIEZO1 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит позицию, соответствующую позиции варианта с прогнозируемой потерей функции, где в случае обнаружения вариантного нуклеотида в позиции варианта с прогнозируемой потерей функции молекула нуклеиновой кислоты PIEZO1 в биологическом образце представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции.
7. Способ по любому из пп. 1-6, где этап определения, этап обнаружения или анализ генотипирования включает:
a) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизирующимся с частью нуклеотидной последовательности молекулы нуклеиновой кислоты PIEZO1, которая находится вблизи позиции варианта с прогнозируемой потерей функции;
b) удлинение праймера по меньшей мере через позицию варианта с прогнозируемой потерей функции; и
c) определение, содержит ли продукт удлинения праймера вариантный нуклеотид в позиции варианта с прогнозируемой потерей функции.
8. Способ по п. 6 или 7, где этап определения, этап обнаружения или анализ генотипирования включает секвенирование всей молекулы нуклеиновой кислоты.
9. Способ по любому из пп. 1-5, где этап определения, этап обнаружения или анализ генотипирования включает:
а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты PIEZO1, которая кодирует человеческий полипептид PIEZO1, при этом часть содержит позицию варианта с прогнозируемой потерей функции;
b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой;
c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей специфический в отношении изменения зонд, где специфический в отношении изменения зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизируется с позицией варианта с прогнозируемой потерей функции; и
d) обнаружение обнаруживаемой метки.
10. Способ по п. 9, где молекула нуклеиновой кислоты в образце представляет собой мРНК, и эту мРНК обратно транскрибируют в кДНК перед этапом амплификации.
11. Способ по п. 9 или 10, где этап определения, этап обнаружения или анализ генотипирования включает:
приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт со специфическим в отношении изменения зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом специфический в отношении изменения зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизируется с позицией варианта с прогнозируемой потерей функции; и
обнаружение обнаруживаемой метки.
12. Способ по любому из пп. 1-11, где молекула нуклеиновой кислоты варианта PIEZO1 с прогнозируемой потерей функции представляет собой 16:88715629:G:A, 16:88715728:G:T, 16:88715767:G:A, 16:88715802:C:A, 16:88715822:D:4, 16:88715987:I:1, 16:88716359:A:G, 16:88716570:C:T, 16:88716874:G:A, 16:88717213:T:A, 16:88719588:G:A, 16:88719722:C:G, 16:88719870:G:T, 16:88720068:D:2, 16:88720229:C:A, 16:88720248:D:4, 16:88720394:C:T, 16:88720644:D:1, 16:88720698:D:1, 16:88720698:I:1, 16:88721165:C:A, 16:88721268:D:1, 16:88721307:G:A, 16:88721586:G:C, 16:88721652:G:C, 16:88722217:C:T, 16:88722605:I:1, 16:88723005:I:7, 16:88723253:G:A, 16:88723311:C:T, 16:88725081:C:A, 16:88726282:G:A, 16:88726546:C:T, 16:88726619:G:A, 16:88726924:G:A, 16:88727038:C:T, 16:88727072:D:1, 16:88727163:G:A, 16:88731768:D:1, 16:88732334:C:G, 16:88732411:D:1, 16:88732720:D:1, 16:88733326:G:C, 16:88733337:D:4, 16:88733587:C:A, 16:88733965:D:1, 16:88734017:C:A, 16:88734042:I:1, 16:88734679:C:T, 16:88734909:I:1, 16:88736167:D:2, 16:88736324:G:A, 16:88736391:G:T, 16:88736409:C:T, 16:88736671:G:A, 16:88737557:A:C, 16:88737727:C:G, 16:88737815:C:T, 16:88738283:G:C, 16:88738637:G:A, 16:88738735:D:1, 16:88741477:C:T, 16:88742306:D:1, 16:88749399:G:A или 16:88784929:C:T, или полученную из нее молекулу мРНК, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК.