БИОМАРКЕРЫ ДЛЯ РАННЕГО ВЫЯВЛЕНИЯ КРИТИЧЕСКОЙ ИЛИ УГРОЖАЮЩЕЙ ЖИЗНИ ОТВЕТНОЙ РЕАКЦИИ НА ЗАБОЛЕВАНИЕ И/ИЛИ ОТВЕТНОЙ РЕАКЦИИ НА ЛЕЧЕНИЕ

1. Способ определения вероятности развития у исследуемого индивидуума критической и/или угрожающей жизни ответной реакции на предполагаемое заболевание, при этом указанный способ включает:
(i) выявление и количественное определение уровня каждого из двух или более белковых биомаркеров в образце, отобранном у исследуемого индивидуума, при этом у исследуемого индивидуума не установлен диагноз или дифференциальный диагноз подозреваемого заболевания и указанные белковые биомаркеры включают следующие белки: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (РСТ), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1, и (ii) сравнение указанных количественных уровней указанных белковых биомаркеров с контрольными уровнями указанных белковых биомаркеров в контрольной популяции, (iii) выявление различных уровней для каждого биомаркера при сравнении на стадии (ii) с целью определить у указанного индивидуума наличие значительно повышенного риска развития критической и/или угрожающей жизни ответной реакции на заболевание.
2. Способ по п. 1, где на стадии (i) выявления и определения количественного уровня используют одно или более устройств для преобразования образца в данные, указывающие на уровни каждого из указанных двух или более белковых биомаркеров, которые можно использовать для сравнения с контрольной популяцией.
3. Способ по п. 2, где указанным одним или более устройств является фермент, связывающий иммунологический анализ, который используют для преобразования образца в данные.
4. Способ по п. 1, где выявление на стадии (iii) свидетельствует о том, что указанному индивидууму следует пройти курс лечения по протоколу в связи с выявленным повышенным риском.
5. Способ по п. 4, где индивидуум проходит курс лечения по протоколу.
6. Способ по п. 1, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, у которых наблюдается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
7. Способ по п. 1, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, у которых наблюдается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание, причем у индивидуумов не развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
8. Способ по п. 1, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, у которых наблюдается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание, причем у индивидуумов развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
9. Способ по п. 1, где указанной контрольной популяцией является популяция здоровых индивидуумов.
10. Способ по п. 1, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, которые не страдали от заболевания, в результате которого развивается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
11. Способ по п. 1, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, где члены контрольной популяции не страдали от заболевания, в результате которого развивается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
12. Способ по п. 1, где заболеванием является пневмония, острое респираторное заболевание верхних дыхательных путей, респираторные инфекции нижних дыхательных путей, вирус гриппа, инфекции Е. coli, бактериемия, риккетсиоз, сальмонеллез, стрептококковые инфекции, стафилококковые инфекции, малярия, сепсис, лихорадка денге, вирус Западного Нила, синдром токсического шока, лептоспироз или вирусная геморрагическая лихорадка.
13. Способ определения вероятности развития у исследуемого индивидуума критической и/или угрожающей жизни ответной реакции на предполагаемое заболевание, где указанный способ включает:
(i) выявление и количественное определение уровня двух или более биомаркеров в образце от исследуемого индивидуума, при этом у исследуемого индивидуума не установлен диагноз или дифференциальный диагноз подозреваемого заболевания и указанные белковые биомаркеры включают следующие белки: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (PCT), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1, и (ii) применение количественных уровней для каждого из указанных белковых биомаркеров в указанном образце в классификаторе, созданном в результате анализа указанных белковых биомаркеров в одной или более контрольных популяциях, (iii) определение у указанного индивидуума наличия повышенного риска развития критической и/или угрожающей жизни ответной реакции, в результате применения указанного классификатора.
14. Способ по п. 13, где на указанной стадии выявления и количественного определения (i) используют одно или более устройств для преобразования образца в данные, указывающие на уровни каждого из указанных двух или более белковых биомаркеров, которые можно использовать в указанном классификаторе.
15. Способ по п. 14, где указанным одним или более устройств для преобразования образца в данные является твердофазный иммуноферментный анализ, который используют для преобразования образца в данные.
16. Способ по п. 13, где стадия определения (iii) свидетельствует о том, что указанному индивидууму следует пройти курс лечения по протоколу в связи с выявленным повышенным риском.
17. Способ по п. 16, где указанный индивидуум проходит курс лечения по протоколу.
18. Способ по п. 13, где указанный классификатор создают с использованием по крайней мере двух контрольных популяций, популяции индивидуумов с подозреваемым заболеванием, у которых не развивается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на подозреваемое заболевание, и популяции индивидуумов с подозреваемым заболеванием, у которых развивается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание.
19. Способ по п. 13, где указанный классификатор создают с использованием по крайней мере двух контрольных популяций, популяции индивидуумов с заболеванием, при котором может развиваться критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция, и у которых не развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание, и популяции индивидуумов с заболеванием, при котором может развиваться критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция, и у которых развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание.
20. Способ по п. 13, где указанный классификатор создают с использованием по крайней мере двух контрольных популяций, популяции индивидуумов, которые считаются здоровыми, и популяции индивидуумов с заболеванием, при котором может развиваться критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция, и у которых развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание.
21. Способ по п. 13, где предполагаемым заболеванием является пневмония, острое респираторное заболевание верхних дыхательных путей, острая респираторная инфекция нижних дыхательных путей, вирус гриппа, инфекции Е. coli, бактериемия, риккетсиоз, сальмонеллез, стрептококковые инфекции, стафилококковые инфекции, малярия, сепсис, лихорадка денге, вирус Западного Нила, синдром токсического шока, лептоспироз или вирусная геморрагическая лихорадка.
22. Способ определения вероятности развития у исследуемого индивидуума критической и/или угрожающей жизни ответной реакции на заболевание, где указанный способ включает:
(i) выявление и количественное определение уровня двух или более биомаркеров в образце от исследуемого индивидуума, при этом указанные белковые биомаркеры включают следующие белки: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (РСТ), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1, (ii) сравнение указанных количественных уровней для каждого из указанных белковых биомаркеров с контрольными уровнями указанных белковых биомаркеров в контрольной популяции, (iii) определение различных уровней каждого биомаркера при сравнении на стадии (ii) с целью выявления у исследуемого индивидуума повышенного риска развития критической и/или угрожающей жизни ответной реакции на заболевание.
23. Способ по п. 22, где на указанной стадии (i) выявления и количественного определения используют одно или более устройств для преобразования образца в данные, указывающие на уровни каждого из указанных двух или более белковых биомаркеров, которые можно использовать для сравнения с контрольной популяцией.
24. Способ по п. 23, где указанным одним или более устройств является фермент, связывающий иммунологический анализ, который используют для преобразования образца в данные.
25. Способ по п. 22, где выявление на стадии (iii) свидетельствует о том, что указанному индивидууму следует пройти курс лечения по протоколу в связи с выявленным повышенным риском.
26. Способ по п. 25, где индивидуум проходит курс лечения по протоколу.
27. Способ по п. 22, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, у которых наблюдается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
28. Способ по п. 22, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, у которых наблюдается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание, причем у индивидуумов не развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
29. Способ по п. 22, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, у которых наблюдается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание, причем у индивидуумов развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
30 Способ по п. 22, где указанной контрольной популяцией является популяция здоровых индивидуумов.
31. Способ по п. 22, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, которые не страдали от заболевания, в результате которого развивается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
32. Способ по п. 22, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов, где члены контрольной популяции не страдали от заболевания, в результате которого развивается критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на заболевание.
33. Способ по п. 22, где заболеванием является пневмония, острое респираторное заболевание верхних дыхательных путей, респираторные инфекции нижних дыхательных путей, вирус гриппа, инфекции Е. coli, бактериемия, риккетсиоз, сальмонеллез, стрептококковые инфекции, стафилококковые инфекции, малярия, сепсис, лихорадка денге, вирус Западного Нила, синдром токсического шока, лептоспироз или вирусная геморрагическая лихорадка.
34. Способ определения вероятности развития у исследуемого индивидуума критической и/или угрожающей жизни ответной реакции на заболевание, где указанный способ включает:
(i) выявление и количественное определение уровня двух или более белковых биомаркеров в образце от исследуемого индивидуума, и указанные белковые биомаркеры включают следующие белки: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (РСТ), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1, и (ii) применение количественных уровней для каждого из указанных белковых биомаркеров в указанном образце в классификаторе, созданном в результате анализа указанных белковых биомаркеров в одной или более контрольных популяциях, (iii) определение у указанного индивидуума наличия повышенного риска развития критической и/или угрожающей жизни ответной реакции, в результате применения указанного классификатора.
35. Способ по п. 34, где на указанной стадии (i) выявления и количественного определения используют одно или более устройств для преобразования образца в данные, указывающие на уровни каждого из указанных двух или более белковых биомаркеров, которые можно использовать в указанном классификаторе.
36. Способ по п. 35, где указанным одним или более устройств для преобразования образца в данные является фермент, связывающий иммунологический анализ, который используют для преобразования образца в данные.
37. Способ по п. 34, где стадия определения (iii) указывает на то, что указанному индивидууму следует пройти курс лечения по протоколу в связи с выявленным повышенным риском.
38. Способ по п. 37, где указанный индивидуум проходит курс лечения по протоколу лечения.
39. Способ по п. 34, где указанный классификатор создают с использованием по крайней мере двух контрольных популяций, популяции индивидуумов с заболеванием, у которых не развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание, и популяции индивидуумов с заболеванием, у которых развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание.
40. Способ по п. 34, где указанный классификатор создают с использованием по крайней мере двух контрольных популяций, популяции индивидуумов с заболеванием, при котором может развиваться критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция, и у которых не развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание, и популяции индивидуумов с заболеванием, при котором может развиваться критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция, и у которых развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание.
41. Способ по п. 34, где указанный классификатор создают с использованием по крайней мере двух контрольных популяций, популяции индивидуумов, которые считаются здоровыми, и популяции индивидуумов с заболеванием, при котором может развиваться критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция, и у которых развивалась критическая и/или угрожающая жизни ответная реакция на указанное заболевание.
42. Способ по п. 34, где заболеванием является пневмония, острое респираторное заболевание верхних дыхательных путей, респираторные инфекции нижних дыхательных путей, вирус гриппа, инфекции Е. coli, бактериемия, риккетсиоз, сальмонеллез, стрептококковые инфекции, стафилококковые инфекции, малярия, сепсис, лихорадка денге, вирус Западного Нила, синдром токсического шока, лептоспироз или вирусная геморрагическая лихорадка.
43. Композиция, включающая коллекцию двух или более антител и пригодное буферное вещество, причем указанная композиция способна селективно связываться по крайней мере с двумя белковыми биомаркерами из образца, отобранного у исследуемого индивидуума, у которого подозревается заболевание, при этом белковые биомаркеры включают следующие белки: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (РСТ), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1, и где композицию используют для количественного определения уровня указанных белковых биомаркеров в указанном образце и определяют наличие у указанного исследуемого индивидуума повышенного риска развития критической и/или угрожающей жизни ответной реакции на заболевание.
44. Композиция по п. 43, где композиция включает коллекцию по крайней мере трех или более антител, и способна селективно гибридизоваться по крайней мере с тремя белковыми биомаркерами, выбранными из следующих биомаркеров: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (РСТ), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1.
45. Композиция по п. 43 или 44, где указанный образец представляет собой образец цельной крови.
46. Композиция по п. 43 или 44, где указанный образец представляет собой образец сыворотки крови.
47. Композиция по п. 43 или 44, где указанный образец представляет собой образец плазмы крови.
48. Композиция по п. 43, где композиция способна селективно связываться по крайней мере с одним белковым биомаркером, выбранным из следующих биомаркеров: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), С-реактивный белок (CRP), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF).
49. Композиция по п. 48, где указанный образец представляет собой образец цельной крови.
50. Композиция по п. 48, где указанный образец представляет собой образец сыворотки крови.
51. Композиция по п. 48, где указанный образец представляет собой образец плазмы крови.
52. Композиция по п. 43, где предполагаемым заболеванием является пневмония, острое респираторное заболевание верхних дыхательных путей, респираторные инфекции нижних дыхательных путей, вирус гриппа, инфекции Е. coli, бактериемия, риккетсиоз, сальмонеллез, стрептококковые инфекции, стафилококковые инфекции, малярия, сепсис, лихорадка денге, вирус Западного Нила, синдром токсического шока, лептоспироз или вирусная геморрагическая лихорадка.
53. Способ определения возможной пользы от применения лечения по протоколу исследуемого индивидуума, у которого наблюдаются один или более симптомов заболевания, где способ включает:
(i) выявление и количественное определение уровня двух или более биомаркеров в образце от исследуемого индивидуума, когда у исследуемого индивидуума не установлен диагноз или дифференциальный диагноз заболевания, при этом указанные белковые биомаркеры включают следующие белки: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (РСТ), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1, и (ii) сравнение указанных количественных уровней указанных белковых биомаркеров с контрольными уровнями указанных белковых биомаркеров в контрольной популяции, (iii) определение различных уровней каждого биомаркера при сравнении на стадии (ii) с целью определения вероятности, что протокол лечения будет оказывать благоприятное действие на исследуемого индивидуума.
54. Способ по п. 53, где на указанной стадии (i) выявления и количественного определения используют одно или более устройств для преобразования образца в данные, указывающие на уровни каждого из указанных двух или более белковых биомаркеров, которые можно использовать для сравнения с контрольной популяцией.
55. Способ по п. 54, где указанным одним или более устройств является фермент, связывающий иммунологический анализ, который используют для преобразования образца в данные.
56. Способ по пп. 53-55, где указанный индивидуум проходит курс лечения по протоколу.
57. Способ по п. 53, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов с заболеванием, на которых лечение оказывает благоприятное действие.
58. Способ по п. 53, где указанной контрольной популяцией является популяция индивидуумов с заболеванием, на которых лечение не оказывает благоприятное действие.
59. Способ по п. 53, где подозреваемым заболеванием является пневмония, острое респираторное заболевание верхних дыхательных путей, респираторные инфекции нижних дыхательных путей, вирус гриппа, инфекции Е. coli, бактериемия, риккетсиоз, сальмонеллез, стрептококковые инфекции, стафилококковые инфекции, малярия, сепсис, лихорадка денге, вирус Западного Нила, синдром токсического шока, лептоспироз или вирусная геморрагическая лихорадка.
60. Способ определения возможной пользы от применения лечения по протоколу исследуемого индивидуума, у которого наблюдаются один или более симптомов заболевания, где указанный способ включает:
(i) выявление и количественное определение уровня каждого из двух или более биомаркеров в образце от исследуемого индивидуума, при этом у исследуемого индивидуума не установлен диагноз или дифференциальный диагноз заболевания и указанные белковые биомаркеры включают следующие белки: фрагмент системы комплемента С5а (С5а), ангиопоэтин-1 (Ang-1), ангиопоэтин-2 (Ang-2), индуцированный гамма-интерфероном белок, 10 кДа (IP-10), растворимая тирозинкиназа с иммуноглобилин-подобной петлей и домен-2 эпидермального фактора роста (sTie-2), растворимый фактор межклеточной адгезии-1 (sICAM-1), эндотелиальный фактор А роста сосудов (VEGF), растворимый рецептор-1 эндотелиального фактора роста сосудов (sFlt-1), хитиназа-3-подобный белок 1 (CHI3L1), растворимый хелперный рецептор-1, экспрессируемый на миелоидных клетках (sTREM-1), С-реактивный белок (CRP), прокальцитонин (РСТ), ангиопоэтин-подобный белок 3 (Ang-подобный 3), фактор комплемента D (фактор D), или интерлейкин 18 связывающий белок (IL18bpa), эндоглин (End), р-селектин (p-SEL), эндотелиальный растворимый рецептор Tie-2 (Tie-2) и фактор Виллибранда(vWF), указанные в таблице 1, и (ii) применение указанных количественных уровней для каждого из указанных белковых биомаркеров из указанного образца в классификаторе, созданном в результате анализа указанных белковых биомаркеров в одной или более контрольных популяций, (iii) определение вероятности благоприятного действия на указанного исследуемого индивидуума лечения по протоколу в результате применения указанного классификатора.
61. Способ по п. 60, где на указанной стадии выявления и количественного определения (i) используют одно или более устройств для преобразования образца в данные, указывающие на уровни каждого из указанных двух или более белковых биомаркеров, которые можно использовать в указанном классификаторе.
62. Способ по п. 61, где указанным одним или более устройств является фермент, связывающий иммунологический анализ, который используют для преобразования образца в данные.
63. Способ по любому из пп. 60-62, где указанный исследуемый индивидуум проходит курс лечения по протоколу.
64. Способ по п. 60, где указанный классификатор создают с использованием по крайней мере двух контрольных популяций, популяции индивидуумов, у которых установлен диагноз или дифференциальный диагноз заболевания, и на которых лечение по протоколу будет оказывать благоприятное действие, и популяции индивидуумов, у которых установлен диагноз или дифференциальный диагноз заболевания, и на которых лечение по протоколу не будет оказывать благоприятное действие.
65. Способ по п. 64, где заболевание, на которое лечение по протоколу будет оказывать благоприятное действие, является бактериальной инфекцией, а заболевание, на которое лечение по протоколу не будет оказывать благоприятное действие, является вирусной инфекцией.
66. Способ по п. 65, где бактериальная инфекция развивается в результате инфицирования бактериями Klebsiella pneumonia, Е. coli, S. aureus, S. flexneri, Salmonella, Streptococcus, H. Influenzae или Acinetobacter.
67. Способ по п. 66, где члены популяции индивидуумов с заболеванием, на которых лечение по протоколу будет оказывать благоприятное действие, все не подвергались действию той же самой бактериальной инфекции.
68. Способ по п. 66, где члены популяции индивидуумов с заболеванием, на которых лечение по протоколу не будет оказывать благоприятное действие, все не подвергались действию той же самой вирусной инфекции.
69. Способ по любому из пп. 60-62, 64-68, где протоколом лечения является введение антибиотиков.