СПОСОБЫ ВЫЯВЛЕНИЯ ПАТОГЕНОВ И КОНТРОЛЯ СТЕПЕНИ ЗАРАЖЕНИЯ МЯСА, РАСТЕНИЙ ИЛИ ЧАСТЕЙ РАСТЕНИЙ

1. Способ выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего мясо, растения или части растений, предусматривающий:
(a) обеспечение образца мяса, растений или частей растений;
(b) осуществление амплификации нуклеиновой кислоты из образца с использованием множества олигонуклеотидных праймеров для по меньшей мере одной целевой последовательности и
(c) определение присутствия или отсутствия по меньшей мере одного патогена в образце.
2. Способ по п. 1, где амплификация нуклеиновой кислоты включает в себя количественную полимеразную цепную реакцию (qPCR) или рекомбиназную полимеразную амплификацию (RPA).
3. Способ по п. 1, где амплификация нуклеиновой кислоты включает в себя рекомбиназную полимеразную амплификацию (RPA).
4. Способ по п. 1, где по меньшей мере один патоген выбран из группы, состоящей из Acremonium spp., Albugo spp., Alternaria spp., Ascochyta spp., Aspergillus spp., Botryodiplodia spp., Botryospheria spp., Botrytis spp., Byssochlamys spp., Candida spp., Cephalosporium spp., Ceratocystis spp., Cercospora spp., Chalara spp., Cladosporium spp., Colletotrichum spp., Cryptosporiopsis spp., Cylindrocarpon spp., Debaryomyces spp., Diaporthe spp., Didymella spp., Diplodia spp., Dothiorella spp., Elsinoe spp., Fusarium spp., Geotrichum spp., Gloeosporium spp., Glomerella spp., Helminthosporium spp., Khuskia spp., Lasiodiplodia spp., Macrophoma spp., Macrophomina spp., Microdochium spp., Monilinia spp., Monilochaethes spp., Mucor spp., Mycocentrospora spp., Mycosphaerella spp., Nectria spp., Neofabraea spp., Nigrospora spp., Penicillium spp., Peronophythora spp., Peronospora spp., Pestalotiopsis spp., Pezicula spp., Phacidiopycnis spp., Phoma spp., Phomopsis spp., Phyllosticta spp., Phytophthora spp., Polyscytalum spp., Pseudocercospora spp., Pyricularia spp., Pythium spp., Rhizoctonia spp., Rhizopus spp., Sclerotium spp., Sclerotinia spp., Septoria spp., Sphaceloma spp., Sphaeropsis spp., Stemphyllium spp., Stilbella spp., Thielaviopsis spp., Thyronectria spp., Trachysphaera spp., Uromyces spp., Ustilago spp., Venturia spp., Verticillium spp. и их комбинаций.
5. Способ по п. 1, где по меньшей мере один патоген выбран из группы, состоящей из Erwinia spp., Pantoea spp., Pectobacterium spp., Pseudomonas spp., Ralstonia spp., Xanthomonas spp.; Salmonella spp., Escherichia spp., Lactobacillus spp., Leuconostoc spp., Listeria spp., Shigella spp., Staphylococcus spp., Candida spp., Debaryomyces spp., Bacillus spp., Campylobacter spp., Clavibacter spp., Clostridium spp., Cryptosporidium spp., Giardia spp., Vibrio spp., Yersinia spp. и их комбинаций.
6. Способ по п. 1, где по меньшей мере один патоген включает в себя Botrytis cinerea.
7. Способ по п. 1, где растения или части растений выбраны из группы, состоящей из банана, ананаса, цитрусового растения, винограда, арбуза, канталупы, мускатной дыни и других разновидностей дыни, яблони, персика, груши, вишни, киви, манго, нектарина, гуавы, папайи, хурмы, сливы, граната, авокадо, инжира, цитрусового растения и ягод.
8. Способ по п. 1, где растения или части растений включают в себя ягоду или ягоды.
9. Способ по п. 8, где ягоды выбраны из группы, состоящей из клубники, черники, малины, ежевики, клюквы и их комбинаций.
10. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна целевая последовательность выбрана из SEQ ID NO: 1-13.
11. Способ по п. 1, где множество олигонуклеотидных праймеров содержит по меньшей мере одну последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 14-29.
12. Способ по п. 1, где множество олигонуклеотидных праймеров содержит по меньшей мере одну последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 30-45.
13. Способ по п. 1, где множество олигонуклеотидных праймеров содержит по меньшей мере одну последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 46-61.
14. Способ выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего мясо, растения или части растений, предусматривающий:
(a) обеспечение образца мяса, растений или частей растений;
(b) осуществление амплификации нуклеиновой кислоты из образца с использованием множества олигонуклеотидных праймеров для по меньшей мере одной целевой последовательности и
(c) определение величины риска для по меньшей мере одного патогена в образце с помощью многоуровневой системы для оценки риска.
15. Способ по п. 14, где многоуровневая система для оценки риска предусматривает три уровня, в том числе низкий уровень риска, средний уровень риска и высокий уровень риска.
16. Способ выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего мясо, растения или части растений, предусматривающий:
(a) обеспечение образца мяса, растений или частей растений;
(b) осуществление амплификации нуклеиновой кислоты из образца с использованием множества олигонуклеотидных праймеров для по меньшей мере одной целевой последовательности и
(c) определение числа спор по меньшей мере одного патогена в образце.
17. Диагностический набор для выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего растения или части растений, содержащий множество олигонуклеотидных праймеров, которое содержит по меньшей мере одну последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 14-29.
18. Диагностический набор для выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего растения или части растений, содержащий множество олигонуклеотидных праймеров, которое содержит по меньшей мере одну последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 30-45.
19. Диагностический набор для выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего мясо, растения или части растений, содержащий множество олигонуклеотидных праймеров, которое содержит по меньшей мере одну последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 46-61.
20. Комбинация олигонуклеотидных праймеров для выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего мясо, растения или части растений, где праймеры характеризуются разной чувствительностью в отношении выявления по меньшей мере одной целевой последовательности.
21. Комбинация олигонуклеотидных праймеров по п. 20, где по меньшей мере одна целевая последовательность выбрана из SEQ ID NO: 1-13.
22. Способ отбора образцов чашечки клубники для выявления по меньшей мере одного патогена, повреждающего мясо, растения или части растений, предусматривающий:
(a) отделение чашечки от клубники;
(b) гомогенизацию отделенной чашечки и
(c) осуществление амплификации нуклеиновой кислоты из образца с использованием множества олигонуклеотидных праймеров для по меньшей мере одной целевой последовательности.
23. Способ по п. 22, где амплификация нуклеиновой кислоты включает в себя количественную полимеразную цепную реакцию (qPCR) или рекомбиназную полимеразную амплификацию (RPA).
24. Способ по п. 22, где амплификация нуклеиновой кислоты включает в себя рекомбиназную полимеразную амплификацию (RPA).