NOTCH 1-СПЕЦИФИЧЕСКИЕ МОЛЕКУЛЫ МИРНК

1.Молекула нуклеиновой кислоты, содержащая двухцепочечную структуру,
где двухцепочечная структура образована первой цепью и второй цепью,
где первая цепь содержит первый фрагмент смежных нуклеотидов, и вторая цепь содержит второй фрагмент смежных нуклеотидов,
где первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит
a) нуклеотидную последовательность, где нуклеотидная последовательность является по меньшей мере на 63% идентичной по отношению к
(i) нуклеотидной последовательности 5'-ACGAGCUGGACCACUGGUC-3' (SEQ ID NO: 1) или
(ii) нуклеотидной последовательности 5'-CGAGCUGGACCACUGGU-3' (SEQ ID NO: 8); или
b) нуклеотидную последовательность, где нуклеотидная последовательность содержит, по меньшей мере, фрагмент из 8 или 9 нуклеотидов из
(i) нуклеотидной последовательности 5'-ACGAGCUGGACCACUGGUC-3' (SEQ ID NO: 1) или
(ii) нуклеотидной последовательности 5'-CGAGCUGGACCACUGGU-3' (SEQ ID NO: 8)
и
где молекула нуклеиновой кислоты способна вызывать посттранскрипционный сайленсинг гена.
2. Молекула нуклеиновой кислоты по п.1, где посттранскрипционный сайленсинг гена является РНК-интерференцией.
3. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1 и 2, где ген является Notch 1, предпочтительно, Notch 1 человека.
4. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-3, где молекула нуклеиновой кислоты способна вызывать деградацию мРНК, кодирующую ген или предшественник указанной мРНК, предпочтительно, в клетке.
5. Молекула нуклеиновой кислоты по п.4, где нуклеотидная последовательность кДНК мРНК доступна в GenBank под регистрационным номером NM_017617.3.
6. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-5, где кДНК состоит из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 2.
7. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-6, где второй фрагмент смежных нуклеотидов является по меньшей мере частично комплементарным части первого фрагмента смежных нуклеотидов.
8. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-7, где второй фрагмент смежных нуклеотидов является по меньшей мере частично комплементарным первому фрагменту смежных нуклеотидов.
9. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-8, где первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит от 13 до 29 нуклеотидов, предпочтительно от 17 до 25 или от 19 до 25 нуклеотидов, и более предпочтительно от 19 до 23 нуклеотидов.
10. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-9, где второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит от 13 до 29 нуклеотидов, предпочтительно от 17 до 25 или от 19 до 25 нуклеотидов, и более предпочтительно от 19 до 23 нуклеотидов.
11. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-10, где первый фрагмент смежных нуклеотидов и второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит от 13 до 29 нуклеотидов, предпочтительно от 17 до 25 или от 19 до 25 нуклеотидов, и более предпочтительно от 19 до 23 нуклеотидов.
12. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 9-11, где нуклеотиды являются последовательными нуклеотидами.
13. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-12, где первая цепь состоит из первого фрагмента смежных нуклеотидов.
14. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-13, где вторая цепь состоит из второго фрагмента смежных нуклеотидов.
15. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-14, где первая цепь состоит из первого фрагмента смежных нуклеотидов, и вторая цепь состоит из второго фрагмента смежных нуклеотидов.
16. молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-14, где двухцепочечная структура содержит от 13 до 29 пар оснований, предпочтительно от 16 до 27 или от 19 до 25 пар оснований, и более предпочтительно от 19 до 23 пар оснований.
17. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-16, где первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-ACGAGCUGGACCACUGGUC-3' (SEQ ID NO: 1) или
(ii) нуклеотидную последовательность 5'-CGAGCUGGACCACUGGU-3' (SEQ ID NO: 8).
18. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-17, где второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-GACCAGUGGUCCAGCUCGU-3' (SEQ ID NO: 3) или
(ii) нуклеотидную последовательность 5'-ACCAGUGGUCCAGCUCG-3' (SEQ ID NO: 9).
19. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 17 и 18, где первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-ACGAGCUGGACCACUGGUC-3' (SEQ ID NO: 1) или
(ii) нуклеотидную последовательность 5'-CGAGCUGGACCACUGGU-3' (SEQ ID NO: 8), и
второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-GACCAGUGGUCCAGCUCGU-3' (SEQ ID NO: 3) или
(ii) нуклеотидную последовательность 5'-ACCAGUGGUCCAGCUCG-3' (SEQ ID NO: 9).
20. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-19, где молекула нуклеиновой кислоты имеет тупой конец по меньшей мере на одном конце.
21. Молекула нуклеиновой кислоты по п.20, где молекула нуклеиновой кислоты имеет тупой конец на конце, определяемом 5'-концом первой цепи и 3'-концом второй цепи.
22. Молекула нуклеиновой кислоты по п.20, где молекула нуклеиновой кислоты имеет тупой конец на конце, определяемом 3'-концом первой цепи и 5'-концом второй цепи.
23. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 20-22, где молекула нуклеиновой кислоты имеет тупой конец на конце,
определяемом 5'-концом первой цепи и 3'-концом второй цепи, и на конце, определяемом 3'-концом первой цепи и 5'-концом второй цепи.
24. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-19, где молекула нуклеиновой кислоты имеет липкий конец по меньшей мере на одном конце.
25. Молекула нуклеиновой кислоты по п.24, где молекула нуклеиновой кислоты имеет липкий конец на конце, определяемом 5'-концом первой цепи и 3'-концом второй цепи.
26. Молекула нуклеиновой кислоты по п.25, где липкий конец является липким 5'-концом.
27. Молекула нуклеиновой кислоты по п.25, где липкий конец является липким 3'-концом.
28. Молекула нуклеиновой кислоты по п.24, где молекула нуклеиновой кислоты имеет липкий конец на конце, определяемом 3'-концом первой цепи и 5'-концом второй цепи.
29. Молекула нуклеиновой кислоты по п.28, где липкий конец является липким 5'-концом.
30. Молекула нуклеиновой кислоты по п.28, где липкий конец является липким 3'-концом.
31. Молекула нуклеиновой кислоты по п.24, где молекула нуклеиновой кислоты имеет липкий конец на конце, определяемом 5'-концом первой цепи и 3'-концом второй цепи, и на конце, определяемом 3'-концом первой цепи и 5'-концом второй цепи.
32. Молекула нуклеиновой кислоты по п.31, где липкий конец является липким 5'-концом.
33. Молекула нуклеиновой кислоты по п.32, где липкий конец является липким 3'-концом.
34. Молекула нуклеиновой кислоты по п. 24, где липкий конец состоит из одного, двух, трех, четырех или пяти нуклеотидов.
35. Молекула нуклеиновой кислоты по п.34, где липкий конец состоит из двух нуклеотидов.
36. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 34 и 35, где нуклеотид является dT.
37. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-19 и
24-36, где первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-ACGAGCUGGACCACUGGUCdTdT-3' (SEQ ID NO: 4) или
(ii) нуклеотидную последовательность 5'-CGAGCUGGACCACUGGUdTdT-3' (SEQ ID NO: 10).
38. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-19 и 24-37, где второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-GACCAGUGGUCCAGCUCGUdTdT-3' (SEQ ID NO: 5) или
(ii) нуклеотидную последовательность 5'-ACCAGUGGUCCAGCUCGdTdT-3' (SEQ ID NO: 11).
39. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 37 и 38, где
первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-ACGAGCUGGACCACUGGUCdTdT-3' (SEQ ID NO: 4) или
(i) нуклеотидную последовательность 5'-CGAGCUGGACCACUGGUdTdT-3' (SEQ ID NO: 10), и
второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит
(i) нуклеотидную последовательность 5'-GACCAGUGGUCCAGCUCGUdTdT-3' (SEQ ID NO: 5) или
(Ii) нуклеотидную последовательность 5'-ACCAGUGGUCCAGCUCGdTdT-3' (SEQ ID NO: 11).
40. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-39, где первая цепь и вторая цепь ковалентно связаны друг с другом, предпочтительно, 3'-конец первой цепи ковалентно связан с 5'-концом второй цепи.
41. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-40, где один или несколько нуклеотидов, образующих первый фрагмент смежных нуклеотидов, являются модифицированными.
42. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-41, где один или несколько нуклеотидов, образующих второй фрагмент смежных нуклеотидов, являются модифицированными.
43. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 41 и 42, где один или несколько нуклеотидов, образующих первый фрагмент смежных нуклеотидов, являются модифицированными, и один или
несколько нуклеотидов, образующих второй фрагмент смежных нуклеотидов, являются модифицированными.
44. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-43, где один или несколько нуклеотидов, образующих первую цепь, являются модифицированными.
45. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-44, где один или несколько нуклеотидов, образующих вторую цепь, являются модифицированными.
46. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 44 и 45, где один или несколько нуклеотидов, образующих первую цепь, являются модифицированными, и один или несколько нуклеотидов, образующих вторую цепь, являются модифицированными.
47. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 41-46, где модификация одного или нескольких нуклеотидов является модификацией сахарного остатка одного или нескольких нуклеотидов и/или модификацией фосфатного остатка одного или нескольких нуклеотидов.
48. Молекула нуклеиновой кислоты по п.47, где модификация сахарного остатка выбрана из группы, содержащей 2'O-метил и 2'-F.
49. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 47 и 48, где модификация фосфатного остатка является такой, что между двумя нуклеотидами образуется фосфотиоатная связь.
50. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 41-43 и 47-49, где один или несколько нуклеотидов в зависимости от положения во фрагменте являются модифицированными.
51. Молекула нуклеиновой кислоты по п.50, где по всей длине первого и/или второго фрагмента или его части нуклеотид в четном положении фрагмента является модифицированным.
52. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 50 и 51, где по всей длине первого и/или второго фрагмента или его части нуклеотид в нечетном положении фрагмента является модифицированным.
53. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 51 и 52, где по всей длине первого и/или второго фрагмента или его части нуклеотид в четном положении фрагмента является
модифицированным, и где по всей длине первого и/или второго фрагмента или его части нуклеотид в четном положении фрагмента является модифицированным, где модификация нуклеотидов в четном положении отличается от модификации нуклеотидов в нечетном положении.
54. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 51-53, где (a) модификация нуклеотидов в четном положении является 2'-O-метильной модификацией, и модификация нуклеотидов в нечетном положении является 2'-F-модификацией, или (b) модификация нуклеотидов в нечетном положении является 2'-O-метильной модификацией, и модификация нуклеотидов в четном положении является 2'-F-модификацией.
55. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 44-50, где один или несколько нуклеотидов являются модифицированными в зависимости от положения в цепи.
56. Молекула нуклеиновой кислоты по п.55, где по всей длине первой и/или второй цепи или ее части нуклеотид в четном положении цепи является модифицированным.
57. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 55 и 56, где по всей длине первой и/или второй цепи или ее части нуклеотид в нечетном положении цепи является модифицированным.
58. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 56-57, где по всей длине первой и/или второй цепи или ее части нуклеотид в четном положении цепи является модифицированным, и где по всей длине первой и/или второй цепи или ее части нуклеотид в четном положении цепи является модифицированным, где модификация нуклеотидов в четном положении отличается от модификации нуклеотидов в нечетном положении цепи.
59. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 56-58, где (a) модификация нуклеотидов в четном положении является 2'-O-метильной модификацией, и модификация нуклеотидов в нечетном положении является 2'-F-модификацией, или (b) модификация нуклеотидов в нечетном положении является 2'-O-метильной модификацией, и модификация нуклеотидов в четном положении является 2'-F-модификацией.
60. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 41-54,
где первый фрагмент содержит на 5'-конце, по меньшей мере, один, предпочтительно два нуклеотида, где по меньшей мере один нуклеотид является 2'-F-модифицированным.
61. молекула нуклеиновой кислоты по п.60, где после по меньшей мере одного нуклеотида непосредственно следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным нуклеотидом по всей длине первого фрагмента или его части.
62. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 60 и 61, где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'-F-модифицированным нуклеотидом по всей длине первого фрагмента или его части.
63. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 41-55 и 60-62, где второй фрагмент содержит на 5'-конце по меньшей мере один, предпочтительно два нуклеотида, где по меньшей мере один нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
64. Молекула нуклеиновой кислоты по п.63, где после по меньшей мере одного нуклеотида непосредственно следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'-F-модифицированным нуклеотидом по всей длине второго фрагмента или его части.
65. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 63 и 64, где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным нуклеотидом по всей длине первого фрагмента или его части.
66. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 60-65, где первый фрагмент содержит на 5'-конце по меньшей мере один, предпочтительно два нуклеотида, где по меньшей мере один нуклеотид является 2'-F-модифицированным, где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'-F-модифицированным нуклеотидом по всей длине первого фрагмента или его части, где второй фрагмент содержит на 5'-конце по меньшей мере один, предпочтительно два нуклеотида, где
по меньшей мере один нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным, и где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным нуклеотидом по всей длине первого фрагмента или его части.
67. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 60-66, где первый фрагмент содержит на своем 3'-конце два dT нуклеотида, и второй фрагмент содержит на своем 3'-конце два dT нуклеотида, где два dT нуклеотида ковалентно связаны посредством фосфотиоатной связи.
68. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 41-49 и 55-59, где первая цепь содержит на 5'-конце по меньшей мере один, предпочтительно два нуклеотида, где по меньшей мере один нуклеотид является 2'-F-модифицированным.
69. Молекула нуклеиновой кислоты по п.68, где после по меньшей мере одного нуклеотида непосредственно следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным нуклеотидом по всей длине первой цепи или ее части.
70. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 68 и 69, где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'-F-модифицированным нуклеотидом по всей длине первой цепи или ее части.
71. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 41-49, 55-59 и 68-70, где вторая цепь содержит на 5'-конце по меньшей мере один, предпочтительно два нуклеотида, где по меньшей мере один нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
72. Молекула нуклеиновой кислоты по п.71, где после по меньшей мере одного нуклеотида непосредственно следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'-F-модифицированным нуклеотидом по всей длине второй цепи или ее части.
73. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 71 и 72, где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй
следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным нуклеотидом по всей длине первой цепи или ее части.
74. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 68-73, где первая цепь содержит на 5'-конце по меньшей мере один, предпочтительно два нуклеотида, где по меньшей мере один нуклеотид является 2'-F-модифицированным, где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'-F-модифицированным нуклеотидом по всей длине первой цепи или ее части, где вторая цепь содержит на 5'-конце по меньшей мере один, предпочтительно два нуклеотида, где по меньшей мере один нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным, и где, начиная после по меньшей мере одного нуклеотида, второй следующий (в 5'->3' направлении) нуклеотид и каждый последующий второй нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным нуклеотидом по всей длине первой цепи или ее части.
75. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 68-74, где первая цепь содержит на своем 3'-конце два dT нуклеотида, и вторая цепь содержит на своем 3'-конце два dT нуклеотида, где два dT нуклеотида ковалентно связаны посредством фосфотиоатной связи.
76. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-75, где
нуклеотидную последовательность 5'-ACGAGCUGGACCACUGGUC-3' (SEQ ID NO: 1) модифицируют следующим образом:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6), и
нуклеотидную последовательность 5'-CGAGCUGGACCACUGGU-3' (SEQ ID NO: 8) модифицируют следующим образом:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
77. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-76, где
нуклеотидную последовательность 5'-GACCAGUGGUCCAGCUCGU-3' (SEQ ID NO: 3) модифицируют следующим образом
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7), и
нуклеотидную последовательность 5'-ACCAGUGGUCCAGCUCG-3' (SEQ ID NO: 9) модифицируют следующим образом
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
78. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-77, где первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6) или
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
79. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-78, где второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7) или
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
80. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-79, где
a) первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6), и
второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7), или
b) первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13), и
второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7), или
c) первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6), и
второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14), или
d) первый фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13), и
второй фрагмент смежных нуклеотидов содержит следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
81. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-80, где молекула нуклеиновой кислоты состоит из
a) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7), или
b) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7), или
c) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14), или
d) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
82. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-81, где молекула нуклеиновой кислоты состоит из
a) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7), или
b) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccu-3' (SEQ ID NO: 7), или
c) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgu-3' (SEQ ID NO: 6), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14), или
d) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaug-3' (SEQ ID NO: 13), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgug-3' (SEQ ID NO: 14),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является 2'O-метил-модифицированным.
83. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-81, где молекула нуклеиновой кислоты состоит из
a) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgudTsdT-3' (SEQ ID NO: 69), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccudTsdT-3' (SEQ ID NO: 70), или
b) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaugdTsdT-3' (SEQ ID NO: 71), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
GA
C
G
G
U
C
G
U
G
5'-caugcaccudTsdT-3' (SEQ ID NO: 70), или
c) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
G
G
U
G
C
A
U
G
C
5'-acacgaccgudTsdT-3' (SEQ ID NO: 69), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgugdTsdT-3' (SEQ ID NO: 72), или
d) первого фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
A
C
G
A
C
C
G
U
5'-cggugcaugdTsdT-3' (SEQ ID NO: 71), и
второго фрагмента смежных нуклеотидов, содержащего следующую нуклеотидную последовательность:
AC
A
U
G
C
A
C
C
5'-cggucgugdTsdT-3' (SEQ ID NO: 72),
где то, что нуклеотид указан строчной буквой, указывает на то, что нуклеотид является 2'-F-модифицированным, и подчеркивание нуклеотида указывает на то, что нуклеотид является
2'O-метил-модифицированным и
где dTsdT указывает на то, что на 3'-конце присоединен динуклеотид, состоящих из двух dT, где указанные два dT ковалентно связаны посредством фосфотиоатной связи.
84. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83 для применения в способе лечения и/или профилактики заболевания.
85. Молекула нуклеиновой кислоты по п.84, где заболевание является заболеванием, которое можно лечить, снижая экспрессию гена Notch 1 и, более конкретно, снижая трансляцию мРНК, кодирующей Notch 1.
86. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 84 и 85, где заболевание выбрано из группы, содержащей рак пищевода, плоскоклеточный рак полости рта, рак головы и шеи, рак языка, лейкоз, почечноклеточную карциному, рак желудка, аденокарциному толстого кишечника, рак эндометрия/тела матки, рак шейки матки, внутрипеченочную холангиокарциному, печеночноклеточную карциному, остеосаркому, карциному мочевого пузыря, злокачественную меланому, рак щитовидной железы, аденокарциному легких, рак предстательной железы, рак молочной железы, рак яичников, рак поджелудочной железы и глиому.
87. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 84-86, где способ включает дополнительное введение фармацевтически активного средства.
88. Молекула нуклеиновой кислоты по п.87, где фармацевтически активное средство является цитостатическим средством.
89. Молекула нуклеиновой кислоты по п.88, где фармацевтически активное средство выбрано из группы, содержащей гемцитабин, доцетаксел, цисплатин, оксалиплатин, 5-фторурацил, иринотекан, паклитаксел, дексаметазон и темозоломид.
90. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83 для применения в способе восстановления чувствительности злокачественных клеток к лекарственному средству.
91. Молекула нуклеиновой кислоты по п.90, где чувствительность к лекарственному средству является чувствительностью к лекарственному средству, опосредуемой и/или
включающей каскад NF-kappaB.
92. Применение молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83 для получения лекарственного средства для лечения и/или профилактики заболевания.
93. Применение по п.92, где заболевание является заболеванием, которое можно лечить, снижая экспрессию гена Notch 1, и более конкретно, снижая трансляцию мРНК, кодирующей Notch 1.
94. Применение по любому из пп. 92 и 93, где заболевание выбрано из группы, включающей рак пищевода, плоскоклеточный рак полости рта, рак головы и шеи, рак языка, лейкоз, почечноклеточную карциному, рак желудка, аденокарциному толстого кишечника, рак эндометрия/тела матки, рак шейки матки, внутрипеченочную холангиокарциному, печеночноклеточную карциному, остеосаркому, карциному мочевого пузыря, злокачественную меланому, рак щитовидной железы, аденокарциному легких, рак предстательной железы, рак молочной железы, рак яичников, рак поджелудочной железы и глиому.
95. Применение по любому из пп. 92-94, где лекарственное средство предназначено для введения вместе с дополнительным фармацевтически активным средством.
96. Применение по п.95, где фармацевтически активное средство является цитостатическим средством.
97. Применение по п.96, где фармацевтически активное средство выбрано из группы, содержащей гемцитабин, доцетаксел, цисплатин, оксалиплатин, 5-фторурацил, иринотекан, паклитаксел, дексаметазон и темозоломид.
98. Применение молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83 в получении средства для восстановления чувствительности злокачественных клеток к лекарственному средству.
99. Применение по п.98, где чувствительность к лекарственному средству является чувствительностью к лекарственному средству, опосредуемой и/или включающей каскад NF-kappaB.
100. Наноэмульсия, содержащая дискретную фазу, непрерывную
водную фазу и молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83.
101. Наноэмульсия по п.100, где дискретная фаза содержит перфторуглеродную фазу.
102. Наноэмульсия по любому из пп. 1-101, где наноэмульсия содержит усиливающую эндоцитоз поверхность, предпочтительно, усиливающая эндоцитоз поверхность содержит усиливающий эндоцитоз компонент, где усиливающий эндоцитоз компонент выбран из группы, содержащей по меньшей мере одно соединение, индуцирующее клеточный захват наноэмульсии или частиц наноэмульсии посредством эндоцитоза.
103. Наноэмульсия по любому из пп. 100-102 для применения в лечении и/или профилактике заболевания.
104. Наноэмульсия по любому из пп. 100-102 для применения в способе восстановления чувствительности злокачественных клеток к лекарственному средству.
105. Применение наноэмульсии по любому из пп. 100-102 для получения лекарственного средства для лечения и/или профилактики заболевания.
106. Применение наноэмульсии по любому из пп. 100-102 в получении средства для восстановления чувствительности злокачественных клеток к лекарственному средству.
107. Фармацевтическая композиция, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83 и/или наноэмульсию по любому из пп. 100-102 и фармацевтически приемлемый эксципиент.
108. Фармацевтическая композиция по п.107 для применения в лечении и/или профилактике заболевания.
109. Фармацевтическая композиция по п.107 для применения в способе восстановления чувствительности злокачественных клеток к лекарственному средству.
110. Способ лечения и/или профилактики заболевания, где способ включает введение индивидууму нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83, наноэмульсии по любому из пп. 100-102 и/или фармацевтической композиции по п.107.
111. Способ восстановления чувствительности злокачественных клеток к лекарственному средству, где способ включает введение
индивидууму нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-83, наноэмульсии по любому из пп. 100-102 и/или фармацевтической композиции по п.107, где индивидуум страдает злокачественным новообразованием, и клетки злокачественного новообразования являются резистентными к лекарственному средству.