ЛЕЧЕНИЕ ОФТАЛЬМОЛОГИЧЕСКИХ ПАТОЛОГИЧЕСКИХ СОСТОЯНИЙ ИНГИБИТОРАМИ АНГИОПОЭТИН-ПОДОБНОГО БЕЛКА 7 (ANGPTL7)

1. Способ лечения пациента с повышенным ВГД, включающий введение указанному пациенту ингибитора ангиопоэтин-подобного белка 7 (ANGPTL7).
2. Способ лечения пациента с глаукомой, включающий введение указанному пациенту ингибитора ANGPTL7.
3. Способ по п.1 или 2, где ингибитор ANGPTL7 содержит антисмысловую молекулу нуклеиновой кислоты, малую интерферирующую РНК (миРНК) или короткую шпилечную РНК (кшРНК), которая гибридизуется с мРНК ANGPTL7.
4. Способ по п.1 или 2, где ингибитор ANGPTL7 содержит белок Cas и гидовую РНК (гРНК), которая гибридизуется с последовательностью распознавания гРНК в молекуле геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7.
5. Способ по п.4, где белок Cas представляет собой Cas9 или Cpf1.
6. Способ по п.4 или 5, где последовательность распознавания гРНК содержит или находится рядом с положением, соответствующим: положению 4291 согласно SEQ ID NO:1, положению 4287 согласно SEQ ID NO:1, положению 4243 согласно SEQ. ID NO: 1, положению 4325 согласно SEQ ID NO:1 или положению 4336 согласно SEQ ID NO:1.
7. Способ по любому из пп.4-6, где последовательность распознавания гРНК расположена на расстоянии от около 1000, 500, 400, 300, 200, 100, 50, 45, 40, 35, 30, 25, 20, 15, 10 или 5 нуклеотидов от положения, соответствующего: положению 4291 согласно SEQ ID NO:1, положению 4287 согласно SEQ ID NO:1, положению 4243 согласно SEQ ID NO:1, положению 4325 согласно SEQ ID NO:1, или положению 4336 согласно SEQ ID NO:1.
8. Способ по любому из пп.4-7, где последовательность мотива, примыкающего к протоспейсеру (PAM), расположена на расстоянии от около 2 до 6 нуклеотидов ниже (в направлении 3’) последовательности распознавания гРНК.
9. Способ по любому из пп.4-8, где гРНК содержит от около 17 до около 23 нуклеотидов.
10. Способ по любому из пп.4-8, где последовательность распознавания гРНК содержит нуклеотидную последовательность согласно любой одной из SEQ ID NO:13-131 и 144-165.
11. Способ по любому из пп.1-10, дополнительно включающий обнаружение присутствия или отсутствия вариантной молекулы нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7, кодирующей полипептид ANGPTL7 человека, в биологическом образце от пациента.
12. Способ по п.11, где, если пациент является эталонным по ANGPTL7, пациенту также вводят терапевтический агент, который лечит или ингибирует офтальмологическое патологическое состояние, в количестве стандартной дозы.
13. Способ по п.11, где, если пациент является гетерозиготным по варианту с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7, пациенту также вводят терапевтический агент, который лечит или ингибирует офтальмологическое патологическое состояние, в количестве, которое равно или ниже количества стандартной дозы.
14. Способ по любому из пп.11-13, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую ANGPTL7 Gln175His, Arg177Stop, Trp188Stop, Lys192Gln, Phe161Ile, Arg340His, Arg220His, Asn302Lys или Arg220Cys.
15. Способ по любому из пп.11-13, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую ANGPTL7 Gln175His, Trp188Stop, Lys192Gln, Phe161Ile или Arg177Stop.
16. Способ по п.15, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2, молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8.
17. Способ по п.15, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 4287 согласно SEQ ID NO:3, молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9.
18. Способ по п.15, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 4243 согласно SEQ ID NO:132, молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138.
19. Способ по п.15, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133, молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139.
20. Способ по п.15, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134, молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140.
in vitro
21. Способ по любому из пп.11-20, где этап обнаружения выполняют .
22. Способ по любому из пп.11-16 и 21, где этап обнаружения включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4291 согласно SEQ ID NO:2, или комплементарной нуклеотидной последовательности; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 529 согласно SEQ ID NO:5, или комплементарной нуклеотидной последовательности; и/или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 529 согласно SEQ ID NO:8, или комплементарной нуклеотидной последовательности; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
23. Способ по любому из пп.11-15, 17 и 21, где этап обнаружения включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4287 согласно SEQ ID NO:3, или комплементарной нуклеотидной последовательности; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 525 согласно SEQ ID NO:6, или комплементарной нуклеотидной последовательности; и/или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 525 согласно SEQ ID NO:9, или комплементарной нуклеотидной последовательности; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 4287 согласно SEQ ID NO:3, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
24. Способ по любому из пп.11-15, 18 и 21, где этап обнаружения включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4243 согласно SEQ ID NO:132; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 481 согласно SEQ ID NO:135; и/или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 481 согласно SEQ ID NO:138; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
25. Способ по любому из пп.11-15, 19 и 21, где этап обнаружения включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4325 согласно SEQ ID NO:133, или комплементарной нуклеотидной последовательности; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 563 согласно SEQ ID NO:136, или комплементарной нуклеотидной последовательности; и/или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 563 согласно SEQ ID NO:139, или комплементарной нуклеотидной последовательности; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
26. Способ по любому из пп.11-15, 20 и 21, где этап обнаружения включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 574 согласно SEQ ID NO:137; и/или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 574 согласно SEQ ID NO:140; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит цитозин в положении, соответствующем положению 4 336 согласно SEQ ID NO:134, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
27. Способ по любому из пп.11-16, 21 и 22, где этап обнаружения включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4291 согласно SEQ ID NO:2; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:5; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:8; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, соответствующего положению 4291 согласно SEQ ID NO:2; молекулы мРНК ANGPTL7, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:5; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:8; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5; и/или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8.
28. Способ по любому из пп.11-15, 17, 21 и 23, где этап обнаружения включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:6; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:9; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, соответствующего положению 4287 согласно SEQ ID NO:3; молекулы мРНК ANGPTL7, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:6; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:9; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: тимин в положении, соответствующем положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6; и/или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9.
29. Способ по любому из пп.11-15, 18, 21 и 24, где этап обнаружения включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:135; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:138; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:135; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:138; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: аденин в положении, соответствующем положению 4243 согласно SEQ ID NO:132; аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135; и/или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138.
30. Способ по любому из пп.11-15, 19, 21 и 25, где этап обнаружения включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4325 согласно SEQ ID NO:133; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:136; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:139; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 325 согласно SEQ ID NO:133; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:136; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:139; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136; и/или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139.
31. Способ по любому из пп.11-15, 20, 21 и 26, где этап обнаружения включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:137; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:140; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:137; и/или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:140; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137; и/или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140.
32. Способ по любому из пп.22-31, где этап обнаружения включает секвенирование всей молекулы нуклеиновой кислоты.
33. Способ по любому из пп.11-16, 21, 22, 27 и 32, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8 или комплементарную нуклеотидную последовательность; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
34. Способ по любому из пп.11-15, 17, 21, 23, 28 и 32, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: тимин в положении, соответствующем положению 4287 согласно SEQ ID NO:3 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9 или комплементарную нуклеотидную последовательность; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и/или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
35. Способ по любому из пп.11-15, 18, 21, 24, 29 и 32, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: аденин в положении, соответствующем положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132; аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135; и/или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: аденин в положении, соответствующем положению 4243 согласно SEQ ID NO:132; аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
36. Способ по любому из пп.11-15, 19, 21, 25, 30 и 32, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136; и/или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
37. Способ по любому из пп.11-15, 20, 21, 26, 31 и 32, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137; или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
38. Способ по любому из пп.33-37, где молекула нуклеиновой кислоты в образце представляет собой мРНК, и эта мРНК подвергается обратной транскрипции в кДНК перед этапом амплификации.
39. Способ по любому из пп.11-16 и 21, где этап обнаружения включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с нуклеотидной последовательностью амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и обнаружение обнаруживаемой метки.
40. Способ по любому из пп.11-15, 17 и 21, где этап обнаружения включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с нуклеотидной последовательностью амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4287 согласно SEQ ID NO:3 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9, или комплементарную нуклеотидную последовательность; и обнаружение обнаруживаемой метки.
41. Способ по любому из пп.11-15, 18 и 21, где этап обнаружения включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: аденин в положении, соответствующем положению 4243 согласно SEQ ID NO:132; аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138; и обнаружение обнаруживаемой метки.
42. Способ по любому из пп.11-15, 19 и 21, где этап обнаружения включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139; и обнаружение обнаруживаемой метки.
43. Способ по любому из пп.11-15, 20 и 21, где этап обнаружения включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140; и обнаружение обнаруживаемой метки.
44. Способ лечения пациента с помощью терапевтического агента, который лечит или ингибирует офтальмологическое патологическое состояние, при этом указанный пациент страдает от офтальмологического патологического состояния, и указанный способ включает следующие этапы:
определение того, имеет ли пациент вариантную молекулу нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ангиопоэтин-подобного белка 7 (ANGPTL7), кодирующую полипептид ANGPTL7 человека, путем:
получения или взятия готового биологического образца от пациента; и
выполнения или использования выполненного генотипирования биологического образца для определения того, имеет ли пациент генотип, содержащий вариантную молекулу нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и
когда пациент является эталонным по ANGPTL7, тогда путем введения или продолжения введения пациенту терапевтического агента, который лечит или ингибирует офтальмологическое патологическое состояние, в количестве стандартной дозы, и введения пациенту ингибитора ANGPTL7; а также
когда пациент является гетерозиготным по варианту с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7, тогда путем введения или продолжения введения пациенту терапевтического агента, который лечит или ингибирует офтальмологическое патологическое состояние, в количестве, которое равно или ниже количества стандартной дозы, и введения пациенту ингибитора ANGPTL7;
при этом наличие генотипа, имеющего вариантную молекулу нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7, кодирующую полипептид ANGPTL7 человека, указывает на то, что пациент имеет пониженный риск развития офтальмологического патологического состояния.
45. Способ по п.44, где пациент является эталонным по ANGPTL7, и пациенту вводят или продолжают вводить терапевтический агент, который лечит или ингибирует офтальмологическое патологическое состояние, в количестве стандартной дозы, и вводят ингибитор ANGPTL7.
46. Способ по п.44, где пациент является гетерозиготным по варианту с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7, и пациенту вводят или продолжают вводить терапевтический агент, который лечит или ингибирует офтальмологическое патологическое состояние, в количестве, которое равно или ниже количества стандартной дозы, и вводят ингибитор ANGPTL7.
47. Способ по любому из пп.44-46, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую ANGPTL7 Gln175His, Arg177Stop, Trp188Stop, Lys192Gln, Phe161Ile, Arg340His, Arg220His, Asn302Lys или Arg220Cys.
48. Способ по любому из пп.44-46, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую ANGPTL7 Gln175His, Arg177Stop, Trp188Stop, Lys192Gln или Phe161Ile.
49. Способ по любому из пп.44-48, где молекула вариантной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2; молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5; или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8.
50. Способ по любому из пп.44-48, где молекула вариантной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 4287 согласно SEQ ID NO:3; молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6; или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9.
51. Способ по любому из пп.44-48, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132, молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138.
52. Способ по любому из пп.44-48, где вариантная молекула нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133, молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136, или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139.
53. Способ по любому из пп.44-48, где молекула вариантной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7 представляет собой: молекулу геномной нуклеиновой кислоты, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; молекулу мРНК, имеющую нуклеотидную последовательность, содержащую цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137; или молекулу кДНК, полученную из молекулы мРНК, при этом молекула кДНК имеет нуклеотидную последовательность, содержащую цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140.
54. Способ по любому из пп.44-49, где анализ генотипирования включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4 291 согласно SEQ ID NO:2, или комплементарной нуклеотидной последовательности; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 529 согласно SEQ ID NO:5, или комплементарной нуклеотидной последовательности; или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7, полученной из молекулы мРНК, в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 529 согласно SEQ ID NO:8, или комплементарной нуклеотидной последовательности; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
55. Способ по любому из пп.44-48 и 50, где анализ генотипирования включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4287 согласно SEQ ID NO:3, или комплементарной нуклеотидной последовательности; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 525 согласно SEQ ID NO:6, или комплементарной нуклеотидной последовательности; или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7, полученной из молекулы мРНК, в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 525 согласно SEQ ID NO:9, или комплементарной нуклеотидной последовательности; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
56. Способ по любому из пп.44-48 и 51, где анализ генотипирования включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4243 согласно SEQ ID NO:132; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 481 согласно SEQ ID NO:135; или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7, полученной из молекулы мРНК, в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 481 согласно SEQ ID NO:138; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
57. Способ по любому из пп.44-48 и 52, где анализ генотипирования включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4325 согласно SEQ ID NO:133, или комплементарной нуклеотидной последовательности; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 563 согласно SEQ ID NO:136, или комплементарной нуклеотидной последовательности; или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7, полученной из молекулы мРНК, в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 563 согласно SEQ ID NO:139, или комплементарной нуклеотидной последовательности; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 4 325 согласно SEQ ID NO:133, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
58. Способ по любому из пп.44-48 и 53, где анализ генотипирования включает секвенирование по меньшей мере части: нуклеотидной последовательности молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 4 336 согласно SEQ ID NO:134; нуклеотидной последовательности молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 574 согласно SEQ ID NO:137; или нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце, при этом секвенированная часть содержит положение, соответствующее положению 574 согласно SEQ ID NO:140; при этом: когда секвенированная часть молекулы геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце содержит цитозин в положении, соответствующем положению 4 336 согласно SEQ ID NO:134, тогда молекула геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой молекулу геномной нуклеиновой кислоты с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; когда секвенированная часть молекулы мРНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137, тогда молекула мРНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу мРНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7; и когда секвенированная часть молекулы кДНК ANGPTL7 в биологическом образце содержит цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140, тогда молекула кДНК ANGPTL7 в биологическом образце представляет собой вариантную молекулу кДНК с прогнозируемой потерей функции ANGPTL7.
59. Способ по любому из пп.44-49 и 54, где анализ генотипирования включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4291 согласно SEQ ID NO:2; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:5; или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:8; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, соответствующего положению 4291 согласно SEQ ID NO:2; молекулы мРНК ANGPTL7, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:5; или молекулы кДНК ANGPTL7, соответствующего положению 529 согласно SEQ ID NO:8; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5; или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8.
60. Способ по любому из пп.44-48, 50 и 55, где анализ генотипирования включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:6; или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:9; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, соответствующего положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3; молекулы мРНК ANGPTL7, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:6; или молекулы кДНК ANGPTL7, соответствующего положению 525 согласно SEQ ID NO:9; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: тимин в положении, соответствующем положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6; или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9.
61. Способ по любому из пп.44-48, 51 и 56, где анализ генотипирования включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4243 согласно SEQ ID NO:132; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:135; или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:138; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:135; или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 481 согласно SEQ ID NO:138; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: аденин в положении, соответствующем положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132; аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135; или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138.
62. Способ по любому из пп.44-48, 52 и 57, где анализ генотипирования включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4325 согласно SEQ ID NO:133; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:136; или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:139; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 325 согласно SEQ ID NO:133; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:136; или положения нуклеотидной последовательности молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 563 согласно SEQ ID NO:139; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: аденин в положении, соответствующем положению 4 325 согласно SEQ ID NO:133; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136; или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139.
63. Способ по любому из пп.44-48, 53 и 58, где анализ генотипирования включает: а) приведение биологического образца в контакт с праймером, гибридизующимся с частью нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4336 согласно SEQ ID NO:134; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:137; или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:140; b) удлинение праймера по меньшей мере включительно до положения нуклеотидной последовательности ANGPTL7: молекулы геномной нуклеиновой кислоты, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 4 336 согласно SEQ ID NO:134; молекулы мРНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:137; или молекулы кДНК ANGPTL7, расположенной вблизи положения, соответствующего положению 574 согласно SEQ ID NO:140; и c) определение того, содержит ли продукт удлинения праймера: цитозин в положении, соответствующем положению 4 336 согласно SEQ ID NO:134; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137; или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140.
64. Способ по любому из пп.59-63, где этап обнаружения включает секвенирование всей молекулы нуклеиновой кислоты.
65. Способ по любому из пп.44-49, 54, 59 и 64, где анализ генотипирования включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8 или комплементарную нуклеотидную последовательность; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
66. Способ по любому из пп.44-48, 50, 55, 60 и 64, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: тимин в положении, соответствующем положению 4 287 согласно SEQ ID NO:3 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9 или комплементарную нуклеотидную последовательность; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4287 согласно SEQ ID NO:3 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
67. Способ по любому из пп.44-48, 51, 56, 61 и 64, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: аденин в положении, соответствующем положению 4 243 согласно SEQ ID NO:132 или комплементарную нуклеотидную последовательность; аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138 или комплементарную нуклеотидную последовательность; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: аденин в положении, соответствующем положению 4243 согласно SEQ ID NO:132 или комплементарную нуклеотидную последовательность; аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
68. Способ по любому из пп.44-48, 52, 57, 62 и 64, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: аденин в положении, соответствующем положению 4 325 согласно SEQ ID NO:133 или комплементарную нуклеотидную последовательность; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139 или комплементарную нуклеотидную последовательность; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: аденин в положении, соответствующем положению 4 325 согласно SEQ ID NO:133 или комплементарную нуклеотидную последовательность; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
69. Способ по любому из пп.44-48, 53, 58, 63 и 64, где этап обнаружения включает: а) амплификацию по меньшей мере части молекулы нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид ANGPTL7 человека, при этом амплифицированная часть содержит: цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134 или комплементарную нуклеотидную последовательность; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140 или комплементарную нуклеотидную последовательность; b) мечение амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты обнаруживаемой меткой; c) приведение меченой молекулы нуклеиновой кислоты в контакт с подложкой, содержащей заменоспецифичный зонд, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: цитозин в положении, соответствующем положению 4 336 согласно SEQ ID NO:134 или комплементарную нуклеотидную последовательность; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и d) обнаружение обнаруживаемой метки.
70. Способ по любому из пп.65-69, где молекула нуклеиновой кислоты в образце представляет собой мРНК, и эта мРНК подвергается обратной транскрипции в кДНК перед этапом амплификации.
71. Способ по любому из пп.44-49, где анализ генотипирования включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с нуклеотидной последовательностью амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4291 согласно SEQ ID NO:2 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:5 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 529 согласно SEQ ID NO:8 комплементарную нуклеотидную последовательность; и обнаружение обнаруживаемой метки.
72. Способ по любому из пп.44-48 и 50, где анализ генотипирования включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с нуклеотидной последовательностью амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: тимин в положении, соответствующем положению 4287 согласно SEQ ID NO:3 или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:6 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или тимин в положении, соответствующем положению 525 согласно SEQ ID NO:9 или комплементарную нуклеотидную последовательность; и обнаружение обнаруживаемой метки.
73. Способ по любому из пп.44-48 и 51, где анализ генотипирования включает последовательность нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащую: аденин в положении, соответствующем положению 4243 согласно SEQ ID NO:132, или комплементарную нуклеотидную последовательность; урацил в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:135 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 481 согласно SEQ ID NO:138; и обнаружение обнаруживаемой метки.
74. Способ по любому из пп.44-48 и 52, где анализ генотипирования включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: аденин в положении, соответствующем положению 4325 согласно SEQ ID NO:133, или комплементарную нуклеотидную последовательность; аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:136 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или аденин в положении, соответствующем положению 563 согласно SEQ ID NO:139; и обнаружение обнаруживаемой метки.
75. Способ по любому из пп.44-48 и 53, где анализ генотипирования включает: приведение молекулы нуклеиновой кислоты в биологическом образце в контакт с заменоспецифичным зондом, содержащим обнаруживаемую метку, при этом заменоспецифичный зонд содержит нуклеотидную последовательность, которая в жестких условиях гибридизуется с последовательностью нуклеиновой кислоты амплифицированной молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей: цитозин в положении, соответствующем положению 4336 согласно SEQ ID NO:134, или комплементарную нуклеотидную последовательность; цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:137 или комплементарную нуклеотидную последовательность; или цитозин в положении, соответствующем положению 574 согласно SEQ ID NO:140; и обнаружение обнаруживаемой метки.
76. Способ по любому одному из пп. 44-75, где молекула нуклеиновой кислоты присутствует в клетке, полученной от субъекта-человека.
77. Способ по любому из пп.44-76, где ингибитор ANGPTL7 включает молекулу антисмысловой нуклеиновой кислоты, малую интерферирующую РНК (миРНК) или короткую шпилечную РНК (кшРНК), которые гибридизуются с мРНК ANGPTL7.
78. Способ по любому из пп.44-76, где ингибитор ANGPTL7 включает белок Cas и гидовую РНК (гРНК), которая гибридизуется с последовательностью распознавания гРНК в молекуле геномной нуклеиновой кислоты ANGPTL7.
79. Способ по п.78, где белок Cas представляет собой Cas9 или Cpf1.
80. Способ по п.77 или п. 79, где последовательность распознавания гРНК содержит или находится рядом с положением, соответствующим: положению 4291 согласно SEQ ID NO:1, положению 4287 согласно SEQ ID NO:1, положению 4243 согласно SEQ. ID NO: 1, положению 4325 согласно SEQ ID NO:1 или положению 4336 согласно SEQ ID NO:1.
81. Способ по любому из пп.78-80, где последовательность распознавания гРНК расположена на расстоянии от около 1000, 500, 400, 300, 200, 100, 50, 45, 40, 35, 30, 25, 20, 15, 10 или 5 нуклеотидов от положения, соответствующего: положению 4291 согласно SEQ ID NO:1, положению 4287 согласно SEQ ID NO:1, положению 4243 согласно SEQ ID NO:1, положению 4325 согласно SEQ ID NO:1, или положению 4336 согласно SEQ ID NO:1.
82. Способ по любому из пп.78-81, где последовательность мотива, примыкающего к протоспейсеру (PAM), расположена на расстоянии от около 2 до 6 нуклеотидов ниже (в направлении 3’) последовательности распознавания гРНК.
83. Способ по любому из пп.78-82, где гРНК содержит от около 17 до около 23 нуклеотидов.
84. Способ по любому из пп.78-83, где последовательность распознавания гРНК содержит нуклеотидную последовательность согласно любой одной из SEQ ID NO:13-131 и 144-165.