УНИФИЦИРОВАННАЯ ПОЛОСКА ДЛЯ РЕАКТИВОВ
UNIFIED STRIP FOR REAGENTS

Перекрестная ссылка на родственную заявку
Настоящая заявка испрашивает приоритет согласно предварительной заявке на патент США №61/541991, поданной 30 сентября 2011 г.под названием «Унифицированная полоска для реактивов» (UNITIZED REAGENT STRIP), содержание которой полностью включено в настоящую заявку посредством ссылки.
Область техники
[0001] Описанная здесь технология в целом относится к держателям для реактивов и изделий одноразового использования, которые могут быть использованы для транспортировки реактивов и для выполнения операций обработки посредством реактивов, например, в автоматизированных устройствах для подготовки и обработки проб.
Уровень техники
[0002] Автоматизация диагностических анализов и высокопроизводительный скрининг стали весьма распространенными, причем было разработано несколько устройств, предназначенных для удовлетворения возрастающей потребности в быстром, чувствительном и надежном анализе большого количества проб. Например, в последние годы были разработаны интегрированные устройства, предназначенные для подготовки и обработки проб, например, проб нуклеиновых кислот.
[0003] Многие важные разновидности анализа требуют выделения различных компонентов, таких как нуклеиновые кислоты, белки и т.п., из клинических и/или экологических проб. Выделение нуклеиновых кислот, белков или других определяемых при анализе компонент из клинических или экологических проб может быть длительным и трудоемким. Ручная подготовка проб также подвержена большой вариативности вследствие человеческого фактора и неаккуратности. Несколько переменных, влияющих на надежность и точность подготовки проб, которая обычно включает использование нескольких реактивов и требует многократных операций переноса (например, посредством капания из пипетки). Часто необходимые реактивы весьма разнообразны, что, как правило, требует различного обращения с разными реактивами, и предоставляются различными поставщиками. Соответственно, различия между различными поставщиками и партиями конкретного реактива и различное обращение с различными реактивами со стороны одного или нескольких людей может приводить к вариативности результатов анализа. Во-вторых, многократные операции с пипетками приводят к вероятности перекрестного загрязнения, например, внутри одной пробы и между пробами (например, реактивами, используемыми во время различных стадий подготовки и/или обработки одной пробы).
[0004] Существует необходимость разработки способов и устройств для выполнения операций параллельной подготовки и обработки большого количества проб, которые сводят к минимуму вариативность результатов разных анализов. Желательно, чтобы эти способы и устройства сводили к минимуму объем манипуляций, проводимых пользователем с реактивами и/или изделиями одноразового использования в операциях подготовки и обработки, что обеспечивает возможность выполнять эффективную обработку пробы и сводить к минимуму загрязнения и неточности, и чтобы они поддерживали гибкость в применении.
[0005] Приведенное здесь описание уровня техники включено с целью объяснения контекста описанных здесь изобретений. Оно не должно быть рассмотрено как признание того, что любые упомянутые сведения были опубликованы, были известными или составляли часть общеизвестных сведений на дату приоритета любого из пунктов формулы изобретения.
Раскрытие изобретения
[0006] Здесь предложены унифицированные полоски для реактивов и способы их использования. В качестве одной характерной особенности изобретения предложена унифицированная полоска для реактивов, содержащая: полоску с верхней стороной и нижней стороной, содержащую: первую и вторую оболочки для пипетки, содержащие противоположные стороны, причем указанные первая и вторая оболочки для пипетки содержат первую и вторую апертуру наконечника пипетки, соответственно, каждая из которых содержит отдельное отверстие на верхней стороне полоски, и указанные первая и вторая апертуры наконечника пипетки выполнены с возможностью введения первого и второго наконечника пипетки в указанные первую и вторую оболочки для пипетки, соответственно, и каждая из указанных первой и второй оболочек для пипетки выполнена с возможностью по существу охватывать длину первого и второго наконечника пипетки, соответственно; трубку для обработки; и емкость, содержащую отверстие, проходящее через полоску для реактивов, причем указанная емкость выполнена с возможностью приема трубки для реактива.
[0007] В качестве другой характерной особенности изобретения предложен способ обнаружения наличия или отсутствия наконечника пипетки внутри оболочки для пипетки унифицированной полоски для реактивов, содержащей: полоску с верхней стороной и нижней стороной, содержащую: первую и вторую оболочки для пипетки, содержащие противоположные стороны, причем указанные первая и вторая оболочки для пипетки содержат первую и вторую апертуру наконечника пипетки, соответственно, каждая из которых содержит отдельное отверстие на верхней стороне полоски, и указанные первая и вторая апертуры наконечника пипетки выполнены с возможностью введения первого и второго наконечника пипетки в указанные первую и вторую оболочки для пипетки, соответственно, и каждая из указанных первой и второй оболочек для пипетки выполнена с возможностью по существу охватывать длину первого и второго наконечника пипетки, соответственно; трубку для обработки; и емкость, содержащую проходящее через полоску для реактивов отверстие, причем указанная емкость выполнена с возможностью приема трубки для реактива, причем указанная первая оболочка для пипетки содержит пару апертур, указанная пара апертур содержит первое отлитое с использованием стержня отверстие и второе отлитое с использованием стержня отверстие, проходящие через боковую стенку первой оболочки для пипетки, причем первое и второе отлитые с использованием стержня отверстия размещены на противоположных сторонах боковой стенки первой оболочки для пипетки и размещены на одинаковых расстояниях вдоль длины первой оболочки для пипетки от первой апертуры наконечника пипетки; согласно способу: пропускают оптический луч через первое отлитое с использованием стержня отверстие указанной пары апертур оболочки для пипетки и проверяют, проходит ли указанный оптический луч беспрепятственно через указанное второе отлитое с использованием стержня отверстие указанной первой пары апертур оболочки для пипетки, причем беспрепятственный выход указанного оптического луча из указанного второго отлитого с использованием стержня отверстия указанной первой оболочки для пипетки указывает на отсутствие наконечника пипетки внутри оболочки для пипетки, а заблокированный выход указанного оптического луча из указанного второго отлитого с использованием стержня отверстия указывает на наличие наконечника пипетки внутри указанной первой оболочки для пипетки.
[0008] В качестве другой характерной особенности изобретения предложен способ определения длины наконечника пипетки внутри оболочки для пипетки унифицированной полоски для реактивов, включающий: обеспечение унифицированной полоски для реактивов, содержащей: полоску с верхней стороной и нижней стороной, причем указанная полоска содержит трубку для обработки; емкость, содержащую отверстие, проходящее через полоску для реактивов, причем указанная емкость выполнена с возможностью приема трубки для реактива; первую и вторую оболочку для пипетки, причем каждая из указанных оболочек для пипетки содержит: первую и вторую апертуру наконечника пипетки, соответственно, каждая из которых содержит отдельное отверстие на верхней стороне полоски, причем указанные первая и вторая апертуры наконечника пипетки выполнены с возможностью введения первого и второго наконечника пипетки в указанные первую и вторую оболочки для пипетки, соответственно, и каждая из указанных первой и второй оболочек для пипетки выполнена с возможностью по существу охватывать длину первого и второго наконечника пипетки, соответственно; верхнюю пару апертур оболочки для пипетки и нижнюю пару апертур оболочки для пипетки внутри указанной первой оболочки для пипетки, причем каждая пара из указанных верхней и нижней пар апертур содержит первое и второе отлитые с использованием стержня отверстия, проходящие через боковую стенку первой оболочки для пипетки, причем первое и второе отлитые с использованием стержня отверстия указанных верхней и нижней пар апертур оболочки для пипетки размещены на противоположных сторонах первой оболочки для пипетки, и размещены на одинаковом расстоянии вдоль длины первой оболочки для пипетки от первой апертуры наконечника пипетки, и верхняя пара апертур оболочки для пипетки расположена ближе к первой апертуре наконечника пипетки, чем указанная нижняя пара апертур оболочки для пипетки; пропускание оптического луча через первое отлитое с использованием стержня отверстие указанной верхней пары апертур оболочки для пипетки; пропускание оптического луч через первое отлитое с использованием стержня отверстие указанной нижней пары апертур оболочки для пипетки; проверку, заблокировано ли прохождение указанного оптического луча через указанное второе отлитое с использованием стержня отверстие указанной верхней пары апертур оболочки для пипетки; проверку, заблокировано ли прохождение указанного оптического луча через указанное нижнее отлитое с использованием стержня отверстие указанной первой пары апертур оболочки для пипетки; причем блокировка прохождения указанного оптического луча через второе отлитое с использованием стержня отверстие верхней пары апертур и прохождение указанного оптического луча через указанное второе отлитое с использованием стержня отверстие указанной нижней пары апертур оболочки для пипетки означает, что наконечник пипетки внутри указанной первой оболочки для пипетки имеет длину, которая не доходит вниз до нижней пары апертур оболочки для пипетки при ее введении в первую оболочку для пипетки.
[0009] В качестве еще одной характерной особенности изобретения предложен способ определения длины наконечника пипетки внутри оболочки для пипетки унифицированной полоски для реактивов, согласно которому: обеспечивают унифицированную полоску для реактивов, содержащую: полоску с верхней стороной и нижней стороной, причем указанная полоска содержит: трубку для обработки; емкость, содержащую отверстие, проходящее через полоску для реактивов, причем указанная емкость выполнена с возможностью приема трубки для реактива; первую и вторую оболочку для пипетки, причем каждая из указанных оболочек для пипетки содержит: первую и вторую апертуру наконечника пипетки, соответственно, каждая из которых содержит отдельное отверстие на верхней стороне полоски, причем указанные первая и вторая апертуры наконечника пипетки выполнены с возможностью введения первого и второго наконечника пипетки в указанные первую и вторую оболочки для пипетки, соответственно, и каждая из указанных первой и второй оболочек для пипетки выполнена с возможностью по существу охватывать длину первого и второго наконечника пипетки, соответственно; верхнюю пару апертур оболочки для пипетки и нижнюю пару апертур оболочки для пипетки внутри указанной первой оболочки для пипетки, причем каждая из указанных верхней и нижней пары апертур содержит первое и второе отлитые с использованием стержня отверстия, проходящие через боковую стенку первой оболочки для пипетки, причем первое и второе отлитые с использованием стержня отверстия указанных верхней и нижней пар апертур оболочки для пипетки размещены на противоположных сторонах первой оболочки для пипетки, и размещены на одинаковом расстоянии вдоль длины оболочки для пипетки от апертуры наконечника пипетки, и указанная верхняя пара апертур оболочки для пипетки расположена ближе к первой апертуре наконечника пипетки, чем указанная нижняя пара апертур оболочки для пипетки; пропускают оптический луч через указанное первое отлитое с использованием стержня отверстие указанной верхней пары апертур оболочки для пипетки; пропускают оптический луч через указанное первое отлитое с использованием стержня отверстие указанной нижней пары апертур оболочки для пипетки; проверяют, заблокировано ли прохождение указанного оптического луча через указанное второе отлитое с использованием стержня отверстие указанной верхней пары апертур оболочки для пипетки; проверяют, заблокировано ли прохождение указанного оптического луча через указанное нижнее отлитое с использованием стержня отверстие указанной первой пары апертур оболочки для пипетки; причем блокирование прохождения указанного оптического луча через второе отлитое с использованием стержня отверстие верхней пары апертур и прохождение указанного оптического луча через указанное второе отлитое с использованием стержня отверстие указанной нижней пары апертур оболочки для пипетки указывает, что наконечник пипетки внутри указанной первой оболочки для пипетки имеет длину, которая не доходит вниз до нижней пары апертур оболочки для пипетки при ее введении в первую оболочку для пипетки.
[0010] В качестве еще одной характерной особенности изобретения предложен способ определения длины наконечника пипетки внутри оболочки для пипетки унифицированной полоски для реактивов, согласно которому: обеспечивают унифицированную полоску для реактивов, содержащую: полоску с верхней стороной и нижней стороной, причем указанная полоска содержит: трубку для обработки; емкость, содержащую отверстие, проходящее через полоску для реактивов, причем указанная емкость выполнена с возможностью приема трубки для реактива; первую и вторую оболочку для пипетки, причем каждая из указанных оболочек для пипетки содержит: первую и вторую апертуру наконечника пипетки, соответственно, каждая из которых содержит отдельное отверстие на верхней стороне полоски, причем указанные первая и вторая апертуры наконечника пипетки выполнены с возможностью введения первого и второго наконечника пипетки в указанные первую и вторую оболочки для пипетки, соответственно, и каждая из указанных первой и второй оболочек для пипетки выполнена с возможностью по существу охватывать длину первого и второго наконечника пипетки, соответственно; верхнее отлитое с использованием стержня отверстие и нижнее отлитое с использованием стержня отверстие внутри указанной первой оболочки для пипетки, причем каждое из указанных верхнего отлитого с использованием стержня отверстия и нижнего отлитого с использованием стержня отверстия проходит через боковую стенку оболочки для пипетки, причем указанное верхнее отлитое с использованием стержня отверстие расположено ближе к первой апертуре наконечника пипетки, чем указанное нижнее отлитое с использованием стержня отверстие; определяют, проходит ли наконечник пипетки внутри указанной первой оболочки для пипетки от первой апертуры наконечника пипетки до местоположения первого отлитого с использованием стержня отверстия; и определяют, проходит ли наконечник пипетки внутри указанной первой оболочки для пипетки от первой апертуры наконечника пипетки до местоположения второго отлитого с использованием стержня отверстия.
Краткое описание чертежей
[0011] Один представленный здесь вариант реализации настоящего изобретения или большее количество таких вариантов описаны подробно со ссылками на последующие чертежи. Эти чертежи показаны лишь для целей иллюстрации и просто отображают типичные или взятые в качестве примера варианты реализации настоящего изобретения. Эти чертежи показаны для облегчения понимания изобретения специалистом и не должны быть рассмотрены, как ограничивающие объем, область или применимость изобретения. Следует иметь ввиду, что для ясности и простоты воспроизведения эти чертежи не обязательно показаны в правильном масштабе.
[0012] Некоторые из показанных здесь чертежей иллюстрируют различные варианты реализации настоящего изобретения под различными углами наблюдения. Хотя сопровождающий текст описания может называть такие виды, как виды "сверху", "снизу" или "сбоку", такие ссылки просто описательны и не подразумевают или требуют, чтобы изобретение было выполнено или использовано при конкретной ориентации в пространстве, если иное не указано явно.
[0013] Эти и другие характерные особенности и преимущества различных описанных здесь вариантов реализации настоящего изобретения будет лучше поняты после прочтения последующего описания и рассмотрения чертежей, на которых одинаковые позиционные обозначения повсюду относятся к одинаковым частям, и на которых:
[0014] На фиг. 1А показана аксонометрическая проекция описанной здесь полоски для реактивов.
[0015] На фиг. 1В показана аксонометрическая проекция описанной здесь полоски для реактивов, причем трубка (160) для реактивов показана как отдельно от полоски, так и вставленной в полоску.
[0016] На фиг. 1C показан вид в разрезе трубки для обработки в сечении А-А по фиг. 1А.
[0017] На фиг.ID показан вид в разрезе трубки 140 для реактивов в сечении В-В по фиг. 1А.
[0018] На фиг. 1Е показан вид в разрезе оболочки для пипетки в сечении С-С по фиг. 1А.
[0019] На фиг. 1F показан вид сверху полоски для реактивов по фиг. 1А.
[0020] На фиг. 1G показан вид снизу полоски для реактивов по фиг. 1А.
[0021] На фиг. 1Н показан вид в разрезе для одного варианта реализации полоски для реактивов по фиг. 1А.
[0022] На фиг. 2А показана аксонометрическая проекция описанной выше полоски для реактивов.
[0023] На фиг. 2В показан вид сверху полоски для реактивов по фиг. 2А.
[0024] На фиг. 2С показан вид снизу полоски для реактивов по фиг. 2А.
[0025] На фиг. 3 показан вид сверху описанной выше полоски для реактивов.
[0026] На фиг. 4А-4Е показана последовательность операций при работе с пипеткой в связи с ламинированным слоем.
[0027] На фиг. 5А и 5В показаны варианты реализации ламинированного слоя.
Подробное описание предпочтительного варианта реализации изобретения
[0028] Описанные здесь варианты реализации настоящего изобретения предлагают держатели для реактивов, выполненные с возможностью удержания, транспортировки и хранения нескольких реактивов и материалов, используемых при подготовке и обработке проб, например, клинических и/или экологических проб. Предлагаемые здесь держатели для реактивов обеспечивают несколько преимуществ при подготовке и обработке проб, таких как клинические и/или экологические пробы, пригодных для использования с автоматизированными устройствами для обработки проб. В качестве примера отметим, что некоторые из преимуществ, обеспечиваемых раскрытыми здесь держателями для реактивов, включают, не ограничиваясь этим, конструкцию, которая (1) сводит к минимуму перекрестное загрязнение реактивов и проб; (2) облегчает контроль качества полосок/изделий одноразового использования; (3) упрощает производство; и (4) обеспечивает приспособляемость, полезную для различных молекулярных платформ и автоматизированных устройств.
[0029] Описанные здесь держатели также выполнены с возможностью использования устройством, выполняющим автоматизированную подготовку проб, например, нескольких проб одновременно. Взятая в качестве примера форма выполнения такого устройства описана, например, в публикации заявки на международный патент № WO 09/054870, полностью включенной в настоящую заявку посредством ссылки.
[0030] Подготовка пробы для использования при анализе, например, при испытаниях на нуклеиновые кислоты, например, при амплификации посредством полимеразной цепной реакции или при другой амплификации, может включать одну операцию или большее количество из последующих операций: контактирование пробы полинуклеотида со смесью реактивов для тестирования на нуклеиновые кислоты, например, в случае амплификации посредством полимеразной цепной реакции или другой амплификации, которая содержит полимеразный энзим и несколько нуклеотидов. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения смеси реактивов могут дополнительно содержать пробы гибридизации с поддающимися обнаружению составляющими, причем эти пробы в частности проводят гибридизацию с целевыми нуклеиновыми кислотами (и/или с последовательностями целевых нуклеиновых кислот с позитивной регуляцией).
[0031] В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения смесь реактивов может быть выполнена в виде одной лиофилизированной гранулы или большего их количества, сохраняемых в трубке для реактивов на держателе, а способ может дополнительно включать растворение гранулы реактива в жидкости с созданием раствора смеси реактивов для проведения полимеразной цепной реакции. Здесь держатель автономным способом подает все реактивы, необходимые для подготовки пробы, готовой к проведению тестирования на нуклеиновые кислоты, или в случае поставки пользователю в виде комплекта, содержит в соединении с другими пакетами все необходимые реактивы. Подходящие реактивы и протоколы для их использования при извлечении ДНК и РНК могут быть найдены, соответственно, в публикациях заявок на патент США №2010-0009351 и №2009-0131650, каждая из которых включена в настоящую заявку посредством ссылки.
[0032] Некоторые характерные особенности описанных здесь держателей реактивов описаны со ссылками на показанные здесь чертежи. Каждый взятый в качестве примера держатель, показанный на фиг. 1А-Н, 2А-С и 3, может быть назван "унифицированной полоской одноразового использования" или "унифицированной полоской", поскольку они предназначены для использования в качестве единого блока, выполненного с возможностью содержания всех реактивов и емкостей, необходимых для подготовки пробы, и поскольку они выполнены в виде полоски. Однако, с приведенным здесь описанием совместимы и другие геометрические конструкции различных емкостей, так что это описание не ограничено линейным, или полосовым, устройством, но может включать круговую или сеточную структуру.
[0033] На фиг. 1-3 показаны взятые в качестве примера полоски 100 для реактивов. Полоска 100 для реактивов представляет собой полоску 110, имеющую верхнюю сторону 310 и нижнюю сторону 320 и содержащую различные компоненты, используемым при подготовке и/или обработке пробы, включая одну оболочку 120 для пипетки или большее количество таких оболочек, одну трубку 130 для обработки или большее количество таких трубок, а также содержащую одну выполненную неразъемной трубку 140 для реактивов или большее количество таких трубок, содержащих апертуры 330 трубки для реактивов. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения трубки 140 для реактивов выполнены неразъемными/сплошными с полоской 110. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения трубки 130 для обработки выполнены неразъемными с полоской 110. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения трубки 130 для реактивов выполнены отдельными от унифицированной полоски. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения полоска для реактивов содержит одну емкость 150 в виде трубки или большее количество таких емкостей. Емкости 150 в виде трубок могут быть неразъемными/сплошными с полоской 110 и выполненными с возможностью приема одной трубки 160 для реактивов или большего количества таких трубок, которые не выполнены неразъемными /сплошными с полоской 110. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения трубки 160 для реактивов могут быть выполнены неразъемными с полоской, как показано на фиг. 2А
[0034] В качестве примера описанные здесь унифицированные полоски для реактивов могут содержать 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или большее количество оболочек для пипетки, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или большее количество трубок для обработки, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или большее количество емкостей, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или большее количество неразъемных трубок для реактивов, 1, 2, 3, 4, 5 или большее количество контейнеров для отходов и т.п., выполненных в виде любой конфигурации на полоске.
[0035] В предпочтительных вариантах реализации настоящего изобретения полоска для реактивов содержит одну оболочку 120 для пипетки или большее количество таких оболочек, которые по существу отделены от смежных оболочек для пипетки и/или смежных трубок 140 для реактивов, трубок 130 для обработки или емкостей 150 в виде трубок. Предпочтительно, чтобы оболочки 120 для пипетки были выполнены неразъемными с полоской 110, и таким образом не требовали ручной сборки на полоске 110. Наконечники отдельных пипеток могут быть вставлены в отдельные оболочки 120 для отдельных пипеток при помощи апертур 170 наконечников отдельных пипеток, присутствующих на полосе 110. Оболочки 120 для пипетки по существу охватывают боковые стороны и основания наконечников отдельных пипеток. Термин "по существу охватывает" при его использовании относительно оболочек для пипетки означает, что оболочка охватывает по меньшей мере основную часть наконечника пипетки. Таким образом, вершина наконечника пипетки может содержать выступ или что-то подобное в верхней части наконечника пипетки (через который пипеттор вставлен), который выступает за пределы верхней части полоски 110 (а, возможно покоится на ней). В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения оболочка для пипетки охватывает, например, 70%, 80%, 85%, 80%, 90%, 95% или большую долю длины наконечника пипетки. По существу охватывая наконечники отдельных пипеток, оболочки для пипетки предотвращают контакт между каждым наконечником пипетки и другими наконечниками пипетки, трубками для реактивов, трубками для обработки, контейнерами для отходов и т.п., размещенными на полоске. В частности, каждая оболочка для пипетки выполнена в виде окружения из какого-либо материала или формирует барьер или стенку 290, изолирующую вставленный в нее корпус наконечника пипетки от других реактивов/держателей или изделий одноразового использования (например, других наконечников пипетки) внутри унифицированной полоски. Таким образом, оболочки для отдельных пипеток предотвращают любое перекрестное загрязнение между реактивами и/или пробами, с которыми работают во время подготовки и/или обработки посредством операций с пипетками. Например, оболочки 120 для пипетки предотвращают загрязнение между смежными наконечниками пипетки на той же самой полоске, а также между наконечниками пипетки, размещенными в наконечниках для реактивов, удерживаемых в смежном положении, например, внутри автоматизированного устройства для подготовки/обработки проб.
[0036] В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения, оболочки для пипетки содержат одну апертуру оболочки или большее количество апертур оболочки или отлитые с использованием стержня отверстия 180. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения отлитые с использованием стержня отверстия 180 присутствуют как пары апертур оболочки, тогда как в других вариантах реализации отлитые с использованием стержня отверстия не представляет собой часть пары апертур. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения оболочки для пипетки содержат один, два, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять или большее количество непарных отлитых с использованием стержня отверстий 180. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения оболочки для пипетки содержат множество пар апертур, причем каждая пара апертур оболочки для пипетки представляет собой два отлитых с использованием стержня отверстия 180. Например, оболочка для пипетки может содержать одну пару, две пары, три пары, четыре пары, пять пар, шесть пар, семь пар, восемь пар, девять пар, десять пар или большее количество пар апертур оболочки. Пары апертур оболочки для пипетки содержат первое отлитое с использованием стержня отверстие 180а и второе отлитое с использованием стержня отверстие 180b, которые размещены на противоположных сторонах оболочки 120 для пипетки и равноудалены от ее вершины, как показано например, на фиг. 1D. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения непарные отлитые с использованием стержня отверстия 180 могут присутствовать на противоположных сторонах, и на различных расстояниях от вершины, оболочки 120 для пипетки.
[0037] Отлитые с использованием стержня отверстия 180, независимо от того, выполнены ли они непарными или в виде пары(-р) апертур, могут быть эффективно использованы для определения наличия или отсутствия наконечника пипетки внутри оболочки 120 для пипетки, или вручную (посредством визуального осмотра) или автоматически (например, посредством оптического датчика). Тем самым, отлитые с использованием стержня отверстия 180 обеспечивают дополнительную точку контроля качества до использования унифицированной полоски для реактивов. Например, при автоматизированном обнаружении наконечников пипетки, когда отлитые с использованием стержня отверстия 180 присутствуют в виде пары апертур оболочки для пипетки, можно пропустить свет через первое отлитое с использованием стержня отверстие пары. При отсутствии наконечника пипетки в оболочке 120 для пипетки свет может проходить через первое и второе отлитые с использованием стержня отверстия пары апертур, размещенных на одном уровне на противоположных сторонах оболочки для пипетки. При наличии наконечника пипетки внутри оболочки для пипетки наконечник пипетки блокирует или ослабляет прохождение видимого света между первым и вторым отлитыми с использованием стержня отверстиями каждой пары апертур. При таком подходе пары 180 апертур оболочки для пипетки могут быть непосредственно использованы для определения, присутствует или нет наконечник пипетки в каждой оболочке 120. При наличии отлитых с использованием стержня отверстий 180, не представляющих собой часть пары апертур оболочки для пипетки, можно определить наличие или отсутствие наконечника пипетки внутри оболочки для пипетки, посредством вычисления, например, отражения или ослабления света, проходящего через непарное отлитое с использованием стержня отверстие, поскольку величина отражения или ослабления будет различной в зависимости от того, присутствует или отсутствует наконечник пипетки внутри оболочки для пипетки. Например, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения обнаружение отраженного света может быть выполнено посредством использования известных при настоящем уровне техники средств и устройств, таких как детекторы обратного отражения. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения наличие или отсутствие наконечника пипетки в оболочке может быть определено посредством измерения ослабления света, например, посредством использования известных при настоящем уровне техники средств и устройств, таких как датчики проходящего излучения.
[0038] Как упомянуто выше, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения более одной пары 180 апертур оболочки для пипетки присутствует внутри оболочки для пипетки, как показано например, на фиг. 3. При наличии нескольких отлитых с использованием стержня отверстий 180 внутри оболочки для пипетки (например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или большего количества отверстий), каждое отлитое с использованием стержня отверстие может быть размещено в различном положении или на различном расстоянии вдоль длины оболочки для пипетки относительно верхней стороны полоски 110, которая определяет апертуру наконечника пипетки. К тому же, несколько пар 180 апертур оболочки для пипетки может быть размещено вдоль длины одной оболочки для пипетки, причем каждая пара 180 апертур оболочки для пипетки может быть размещена в различном положении или на различном расстоянии вдоль длины оболочки 120 для пипетки относительно верхней стороны полоски 110, которая определяет апертуру наконечника пипетки. Размещение некоторого количества отлитых с использованием стержня отверстий 180 вдоль длины оболочки для пипетки (или непарных или выполненных как часть пар апертуры оболочки для пипетки) обеспечивает возможность не только определить, присутствует ли наконечник пипетки внутри оболочки, но кроме того, обеспечивает возможность определения длины (размера) наконечника пипетки, введенного внутрь оболочки. Например, при наличии укороченного наконечника пипетки в оболочке 120 наконечник может изменить отражение или ослабление света, направляемого через отлитое с использованием стержня отверстие 180а, но наконечник может быть слишком коротким, чтобы изменить отражение или ослабление света, направляемого через отлитое с использованием стержня отверстие 180d. К тому же, при наличии нескольких пар апертур оболочки, наконечник, размещенный в оболочке пипетки, может препятствовать прохождению света, направленного через отлитое с использованием стержня отверстие 180а после его выхода из отверстия 180b, но может быть слишком коротким, чтобы ослаблять свет, проходящий через пару 180с, 180d, или 180е, 180f апертур оболочки. Таким образом, пары 180 апертур оболочки для пипетки предоставляют преимущества для контроля качества полосок для реактивов посредством обеспечения возможности быстрого определения наличия или отсутствия наконечников, что может быть выполнено вручную (например, посредством визуального осмотра оператором), или может быть легко автоматизировано в ходе производственного процесса или процесса сборки полосок для реактивов. Например, оптические датчики могут быть использованы для пропускания и регистрации света, входящего в первое или второе отлитые с использованием стержня отверстия пар 180 апертур или выходящего из них, с целью обнаружения наличия или отсутствия (и, например, определения длины) наконечников пипетки внутри каждой отдельной оболочки 120.
[0039] В дополнение к обеспечению преимуществ для контроля качества отлитые с использованием стержня отверстия 180 могут облегчить производство полосок 100 для реактивов. В частности, выполнение длинных, относительно узких оболочек, таких как оболочки 120 для пипетки, посредством литья под давлением связано со значительными затруднениями. Оболочки для пипетки обычно имеют длинную, узкую форму, представляя собой сосуды с малым углом конусности. Длинные литейные стержни, обычно используемые при литье под давлением структур типа описываемых здесь оболочек для пипетки наконечника, имеют тенденцию к перемещению при проводимой под высоким давлением инжекции, например, термопластического материала или реактопластического материала, из которого выполнены полоски для реактивов. Наличие отлитых с использованием стержня отверстий 180, независимо от того, выполнены ли они непарными или в виде части пар апертур оболочки, обеспечивает возможность использования стабилизационных стержней, создаваемых при формовании для использования с целью стабилизации длинных литейных стержней, используемых для формования оболочек 120 для пипетки. В соответствии с этим, отлитые с использованием стержня отверстия 180 обеспечивают возможность производства соседствующих друг с другом оболочек для пипетки посредством литья под давлением, тем самым упрощая производство и уменьшая его стоимость.
[0040] В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения полоска для реактивов содержит оболочки для пипетки, имеющие одинаковую длину. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения полоска для реактивов может содержать оболочки для пипетки, имеющие различные длины. Например, как показано на фиг. 2, полоска 100 для реактивов может содержать одну оболочку 140 для пипетки с первой длиной 230 или большее количество таких оболочек, и одну оболочку 140 для пипетки со второй длиной 240 или большее количество таких оболочек, как показано, например на фиг. 2А. Таким образом, оболочки для пипетки, имеющие первую, увеличенную длину 230, могут вмещать более длинные наконечники для пипетки, чем оболочки для пипетки, имеющие вторую, укороченную длину 240. Как описано выше, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения оболочки для пипетки могут содержать одно непарное отлитое с использованием стержня отверстие 180. или большее количество таких отверстий, или отлитые с использованием стержня отверстия, выполненные в виде пар апертур оболочки для пипетки. Однако, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения оболочки для пипетки не содержат отлитых с использованием стержня отверстий 180. Например, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения предложена полоска для реактивов, где полоска для реактивов содержит одну оболочку для пипетки или большее количество таких оболочек, имеющих первую, увеличенную длину и имеющих пары апертур оболочки для пипетки вдоль увеличенной длины оболочки; и одну оболочку для пипетки или большее количество таких оболочек, имеющих вторую, уменьшенную длину и не имеющих отлитых с использованием стержня отверстий или пар апертур оболочки для пипетки. Однако, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения и укороченные и удлиненные оболочки для пипетки могут содержать по меньшей мере одно непарное отлитое с использованием стержня отверстие 180, или по меньшей мере одну пару апертур оболочки для пипетки. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения удлиненная оболочка для пипетки может содержать больше непарных отлитых с использованием стержня отверстий 180 или пар апертур оболочки для пипетки, чем укороченная оболочка для пипетки. В качестве примера, укороченная оболочка для пипетки может содержать одно или два отлитых с использованием стержня отверстия 180, или одну или две пары апертур оболочки для пипетки, а удлиненная оболочка для пипетки может содержать три или четыре непарных отлитых с использованием стержня отверстия 180, или три или четыре пары апертур оболочки для пипетки.
[0041] Как показано на фиг. 3, оболочки 120 для пипетки закрыты у их основания, что обеспечивает пространство для сбора любых жидкостей или подтеков от наконечников пипетки после использования. Поскольку оболочки для отдельных пипеток по существу выполнены раздельными, например, посредством стенки…
[0042] Как описано выше, описанные здесь полоски для реактивов предпочтительно содержат одну емкость 150 или большее количество таких емкостей. Емкости 150 полоски для реактивов могут быть выполнены с возможностью приема трубок для реактивов, которые содержат, соответственно, достаточные количества одного реактива или большего количества реактивов, используемых для подготовки и/или обработки биологических и/или экологических проб. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения реактивы могут быть в твердой форме, например, в лиофилизированной форме, для выполнения операций подготовки и/или обработки пробы, например, для выделения нуклеиновых кислот из пробы для создания пробы, подходящей для проведения тестирования на нуклеиновые кислоты, которая связана с держателем. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения реактивы могут быть в жидкой форме.
[0043] Одна емкость 150 или большее количество емкостей могут иметь одинаковую форму и размер, или могут иметь размеры и формы, отличные друг от друга. Емкости 150 показаны с открытыми основаниями, но не ограничены такой топологией, и могут быть закрытыми за исключением входного отверстия 220 на верхней стороне полоски 110. Предпочтительно, чтобы емкости 150 были выполнены с возможностью принятия обычно используемых в области лабораторного анализа контейнеров, сосудов или трубок, или контейнеров, подходящим образом выполненных для использования с описанным здесь держателем. Трубки 160 для реактивов, не выполненные неразъемными с полоской 110, могут, таким образом, быть сохранены отдельно от полосок для реактивов, и могут быть введены непосредственно перед использованием. Это выгодно, поскольку различные реактивы (например, реактивы для выделения нуклеиновых кислот и реактивы для проведения полимеразной цепной реакции) могут требовать различных условий хранения. Например, лиофилизированные реактивы могут быть чувствительны ко влаге и требовать других условий хранения, чем, например, буфер для лизиса. Конструкция защелкивания трубок для реактивов также обеспечивает изменчивость, поскольку трубки, содержащие различные реактивы, могут быть загружены в полоску 100 для реактивов в зависимости от различного типа операций подготовки/обработки, которую пользователь хочет выполнить для пробы.
[0044] Описанные здесь полоски могут включать передний край 190. Передний край 190 может быть выполнен для облегчения захвата пользователем. Передний край 190 может также быть выполнен для облегчения надлежащего введения и/или размещения полоски 100 для реактивов, например, в устройство автоматизированной подготовки и обработки и/или размещения этой полоски в устройстве. Передний край 190 может содержать некоторые идентификационные особенности, такие как цвет, штриховой код, радиочастотную идентификацию и т.п. для облегчения идентификации и/или отслеживания отдельных полосок 100 для реактивов.
[0045] В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения полоска 100 для реактивов содержит регистрационный элемент, такой как механический ключ 250. Обычно такой ключ представляет собой часть полоски 110, например, часть переднего края 190 и т.п. Механический ключ гарантирует, что держатель оснащен дополнительным элементом в, например, поддерживающей рамке или приемном лотке устройства, которое управляет операциями с пипеткой на реактивах в держателе. Механический ключ 250 обычно представляет собой вырез определенной формы, соответствующий определенному вырезу или выступу в приемного устройстве. Таким образом, полоска 100 для реактивов может содержать механический ключ 250, содержащий пару вырезов прямоугольной формы на одном конце полоски 110. Как показано, эта особенность дополнительно предусматривает выступ, посредством которого пользователь может получить подходящую точку опоры при введении держателя в поддерживающую рамку или другое устройство и при удалении держателя из него. Специалист в данной области техники понимает, что местоположение особенности в виде механического ключа 250 может быть отличным от положения на показанных здесь чертежах. Например, механический ключ 250 может быть размещен на конце полоски 110, отличном от переднего края 190. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения ключ 250 представляет собой углообразный вырез, облегчающий введение держателя в поддерживающую рамку, а также гарантирующий при этом хорошую регистрацию при примыкании к дополнительному углообразному вырезу в углубленной области, выполненной с возможностью приема держателя. Другие варианты реализации механического ключа, конечно, совместимы с приведенным здесь описанием: например, криволинейные вырезы или различные комбинации вырезов или выступов могут облегчить надежную регистрацию держателя.
[0046] В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения полоска для реактивов может содержать идентификатор, прикрепленный к полоске 100. Идентификатор может быть ярлычком, таким как ярлычок с возможностью записи, штриховым кодом, 2-мерным штриховым кодом или меткой радиочастотной идентификации. Идентификатор может быть, например, предназначен для быстрого указания на то, какая комбинация реактивов присутствует в держателе и, таким образом, для какого типа протокола подготовки пробы он предназначен. Для целей контроля качества или ведения записей идентификатор может также указывать партию, из которой держатель был выполнен. Идентификатор может также разрешать пользователю согласовывать определенный держатель с определенной пробой.
[0047] Как описано выше, трубки 140, 160 для реактивов, например, содержащие лиофилизированные реактивы, могут быть герметизированы на их вершинах металлической фольгой, например, алюминиевой фольгой без какого-либо покрывного слоя пластика, как описано далее. Содержащие реактивы трубки 160 для реактивов могут быть выполнены в виде одиночных трубок или множества трубок, содержащих полностью разделенные сосуды, причем эти сосуды соединены вместе, например, посредством устройства соединения. Например, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения больше чем одну трубку 160 для реактивов (например, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять, десять или большее количество) можно выполнить вместе, причем трубки для реактивов совместно закреплены на месте в смежных емкостях 150. В качестве примера, некоторое количество трубок для реактивов 160, содержащих реактивы, обычные для определенной пробы для тестирования на нуклеиновые кислоты (например, содержащих определенные лиофилизированные праймеры и/или пробы для проведения реакции амплификации и/или контрольные нуклеиновые кислоты), может быть соединено вместе и легко защелкнуто в полоску 110, выполненную с возможностью приема множества соединенных вместе отдельных трубок для реактивов. В других вариантах реализации настоящего изобретения емкости выполнены с возможностью индивидуального ввода трубок для реактивов 160 в каждую емкость 150.
[0048] Выполненные неразъемными трубки 140 для реактивов и/или защелкиваемые трубки 160 для реактивов, содержащие различные реактивы, могут иметь различные цвета или нанесенную цветную маркировку для легкой идентификации пользователем. Например, имеющие цветную маркировку и выполненные неразъемными трубки 140 для реактивов могут быть полезными для различения различных типов унифицированных полосок для реактивов, например, тех, что могут быть использованы в различных операциях подготовки пробы. В случае защелкиваемых трубок 160 для реактивов цветная маркировка трубок может быть использована для различения различных реактивов друг от друга. В качестве примера в случае унифицированных полосок для реактивов, используемых для выделения ДНК и образования пробы, готовой к проведению полимеразной цепной реакции, различные кодированные цветом трубки 160 для реактивов могут быть использованы для различения трубок, используемых в связи с различными видами тестирования на нуклеиновые кислоты, например, содержащих различные пары праймеров, пробы и т.п. Например, они могут быть выполнены из различного цветного вещества, такого, как слегка окрашенная пластмасса, или могут иметь некоторую разновидность идентификационных меток на них, таких как цветная полоска или точка. Можно также напечатать метку на их стороне и/или они могут иметь идентификатор, например, штриховой код на уплотнительном слое на вершине. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения трубки 130 для обработки и/или трубки 140, 160 для реактивов могут быть прозрачными.
[0049] Полоски 100 для реактивов показаны выполненными с камерой 200 для отходов, содержащей апертуру 210 для входа отходов на верхней стороне полоски 110. Камера 200 для отходов представляет собой дополнительный элемент и в тех вариантах реализации настоящего изобретения, где она присутствует, выполнена с возможностью приема использованных жидких реактивов. В других вариантах реализации настоящего изобретения, где такая камера отсутствует, использованные жидкие реактивы могут быть переданы в место за пределами держателя и удалены из него, в такое, например, как труба пробы, которая содержала первоначальную пробу, содержимое которой анализируется. Камера 200 для отходов показана как часть блока, содержащего дополнительно две трубки 140 для реактивов или большее количество таких трубок. Следует понимать, что такое расположение выполнено для удобства, например, производства; и как варианты реализации настоящего изобретения возможны и другие расположения камеры 200 для отходов, в которых камера 200 для отходов размещена рядом с трубкой 140 для реактивов, но не присоединена к ней иным образом, кроме как посредством полоски 110.
[0050] Держатель обычно выполнен так, что полоска 110, оболочка(-ки) пипетки 120, трубка 130 для обработки, две трубки 140 для реактивов или большее количество таких трубок и камера для отходов (при ее наличии) выполнены из единой части, выполненной из такого материала, как полипропилен. Как описано в другом месте выше, конструкция раскрытых здесь примеров реализации настоящего изобретения эффективно облегчает производство унифицированной полоски для реактивов посредством, например, литья под давлением.
[0051] На фиг. 1G и 2С показана нижняя сторона 320 полоски 100 для реактивов. Как показано на фиг. 2С, нижняя сторона 320 может содержать распорки 300, обеспечивающие устойчивость и гибкость.
[0052] На фиг. 1Н показан вид в разрезе наконечника 360 пипетки, содержащегося в одной из оболочек 120 для пипетки.
[0053] Хотя приведенные здесь фигуры показывают полоску, выполненную так, что одна оболочка для пипетки или большее количество таких оболочек, одна емкость или большее количество емкостей, соответствующие апертуры трубки для реактивов и трубки для реактивов размещены линейно друг относительно друг друга (то есть, их средние точки лежат на одной и той же оси), специалист в данной области техники понимает, что описываемые здесь держатели не ограничены конкретными конфигурациями емкостей, камер для отходов, трубок для обработки, оболочек для пипетки и трубок для реактивов. Например, некоторые варианты реализации настоящего изобретения предлагают более короткую полоску для реактивов, например, со ступенчатыми апертурами, причем некоторые трубки для реактивов, трубки для обработки или апертуры наконечника пипетки занимают положения со сдвигом от оси. Также различным емкостям и т.д. нет необходимости занимать те положения относительно друг друга, что показаны на фиг. 1-3, на которых трубка для обработки размещена приблизительно около середины держателя, жидкие реактивы сохранены в емкостях, установленных на одной стороне трубки для реактивов, а емкости, содержащие твердые реактивы, установлены с другой стороны трубки для реактивов. Таким образом, на фиг. 1-3 трубка для обработки размещена на одном конце полоски, а оболочка(-ки) пипетки размещена(-ы) на другом конце, смежном, во внутреннем положении, с камерой для отходов и двумя трубками для реактивов или большим количеством таких трубок. Тем не менее, возможны и другие расположения, такие как установка трубки для реактивов на одном конце держателя, установка трубки для реактивов рядом с наконечниками пипеток и оболочками наконечника пипетки (как описано далее) и установка трубки для отходов рядом с трубкой для обработки. Следует понимать, что альтернативные конфигурации различных частей полоски для реактивов приводят только к вариациям формы выполнения и могут быть размещены внутри других описанных вариаций устройства, включая, но не ограничиваясь этим, альтернативные наборы команд для автоматизированной подготовки и обработки проб.
[0054] Трубка 130 для обработки также может также быть трубкой с защелкой, а не частью сплошной детали. Трубка 130 для обработки может быть использована для различных операций смешивания и проведения реакций, имеющих место во время подготовки пробы. Например, в трубке 130 для обработки может происходить лизис клетки, а также извлечение нуклеиновых кислот. Предпочтительно, чтобы трубка 130 для обработки была размещена в таком положении, которое в целом сводит к минимуму операции перемещения головки пипетки, связанные с передачей жидкостей в трубку 130 для обработки.
[0055] Трубки 140 для реактивов обычно выполнены с возможностью содержания различных жидких реактивов. Например, в некоторых вариантах реализации настоящего изобретения полоски для реактивов могут содержать три трубки для реактивов, причем отдельные трубки для реактивов поставлены с буфером промывки пробы, буфером выделения нуклеиновой кислоты и буфером нейтрализации нуклеиновой кислоты, например, с целью очистки нуклеиновых кислот для тестирования на нуклеиновые кислоты.
[0056] Трубки 140 для реактивов, содержащие жидкости или жидкие реактивы, могут быть уплотнены слоистой структурой 400. Эта слоистая структура может содержать слой теплоизоляции, слой пластика, например, полипропилена, и слой металла, например, алюминиевой фольги, причем слой теплоизоляции соседствует с одной трубкой 140 для реактивов или большим количеством таких трубок. Дополнительная пластмассовая пленка, используемая в слоистом материале для емкостей, содержащих жидкие реактивы, обычно предназначена для предотвращения контакта жидкости с алюминием.
[0057] Варианты реализации слоистых структур 400, отличающиеся структурами слоя, описаны, например, в публикации заявки на патент США №2009/0129978, включенной в настоящую заявку посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения слой термоизоляции слоистой структуры 400 может быть выполнен, например, из лака или другого полимера с низкой точкой плавления, и размещен, как показано на фиг. 5А, поверх полоски 100 для реактивов. Слоистая структура 400 может содержать поверх слоя 410 термоизоляции слой 420 пластика, выполненный из полипропилена толщиной в диапазоне 10-50 микрон. Слоистая структура 400 может также содержать поверх слоя пластика металлический слой, содержащий слой алюминиевой фольги 440, сцепленный со слоем 420 пластика слоем 430 клея. В качестве альтернативы металлический слой может быть слоем металла, напыленным или распыленным на место непосредственно на слой пластика, как показано на фиг. 5В.
[0058] Использованные здесь слоистые материалы облегчают долгосрочное хранение, поскольку держатель включает наличие изолированных лиофилизированных реактивов, а также жидкостей, изолированных в непосредственной близости друг от друга, что обычно трудно достижимо.
[0059] В одном примере реализации настоящего изобретения вершины трубок для реактивов имеют скошенную кромку, так что при термическом приклеивании алюминиевой фольги расплав пластика не выходит за пределы оправы трубки. Это выгодно, поскольку уменьшение расплавом пластика внутреннего диаметра трубки вызывает помехи наконечнику пипетки во время работы. В других вариантах реализации настоящего изобретения поднятая плоская часть 260 облегчает нанесение и удаление слоистого материала 400. Поднятая поверхность 260, размещенная на верхней стороне соединительного элемента и окружающая входные апертуры в трубки для реактивов и, при необходимости, камеру для отходов, представляет собой необязательную особенность держателя.
[0060] Способ, посредством которого происходит отсос жидкости пипеткой, таков, что наконечник пипетки, проникающий через фольгу, разрывает ее, не создавая уплотнение вокруг наконечника пипетки. Такое уплотнение вокруг наконечника во время операций с пипеткой было бы нежелательным, поскольку определенный поток воздуха желателен для операций с пипеткой. В этом случае уплотнение не создано, поскольку слоистая структура 400 заставляет проколотую фольгу остаться в положении, первоначально возникшем при проколе. Верхние пять картинок на фиг. 4 иллюстрируют отсос пипеткой реактива из трубки для реактивов, изолированной слоистым материалом, как описано далее. В операции А наконечник пипетки размещен приблизительно центрально над трубкой 140 для реактивов, содержащей реактив 270. В ходе операции В наконечник пипетки опускают, обычно управляемым образом, в трубку для реактива, прокалывая при этом фольгу 280. Увеличенный вид этой области показывает, что край проколотого слоистого материала контактирует с наконечником пипетки в самой широкой части, с которой она проникает в трубку для реактива. В ходе операции С наконечник пипетки слегка подымают, оставляя наконечник внутри массы реактива 270. Увеличенный вид этой области показывает, что проколотая фольга сохранила конфигурацию, принятую при проколе и при опускании наконечника пипетки до его самого глубокого положения внутри трубки для реактивов. В ходе операции D наконечник пипетки отсасывает реактив 270, возможно изменяя его высоту. В ходе операции Е наконечник пипетки полностью удален из трубки для реактивов.
[0061] Вещества различных труб и камер могут быть выполнены с возможностью иметь гладкой по меньшей мере внутреннюю поверхность и содержать поверхностное покрытие, уменьшающее вероятность прикрепления к нему молекул нуклеиновых кислот и других макромолекул. Прикрепление молекул нуклеиновых кислот нежелательно вследствие пониженной чувствительности, которая, вероятно, возникнет при последующем обнаружении и анализе нуклеиновых кислот, не захваченных на поверхности держателя. Трубка для обработки также может иметь поверхность с низкой вероятностью прикрепления молекул и позволяет магнитным гранулам легко скользить вверх и вниз по внутренней стенке, не прикрепляясь к ней. Кроме того, она имеет гидрофобное поверхностное покрытие, обеспечивающее низкую вероятность прилипания текучей среды и, следовательно, низкую вероятность прикрепления молекул нуклеиновых кислот и других молекул. Описанные здесь полоски для реактивов могут быть выполнены из многих различных полимеров, включая все термопласты, некоторые термореактивные материалы и эластомеры. Предпочтительно, чтобы материал подходил для литья под давлением. Неограничивающие примеры полимеров, полезных при производстве описанных здесь полос, включают, например, эпоксидную смолу и фенольные полимеры, нейлоновые, полиэтиленовые и полистиреновые полимеры и т.п. Предпочтительно, чтобы полоски для реактивов были выполнены из пластика, такого как полипропилен, и имели размеры, обеспечивающие жесткость, так чтобы полоски для реактивов не проявляли значительного оседания или прогиба под действием собственного веса и не проявляли возможности легкой деформации во время обычной обработки и транспортировки и, таким образом, не допускали возможности просачивания реактивов из них.
[0062] Также следует считать совместимым с приведенным здесь описанием, что держатель может быть выполнен с дополнительной возможностью принятия пробы, такой как в трубке для пробы. Таким образом, в вариантах реализации настоящего изобретения, описанных здесь в другом месте, поддерживающая рамка принимает несколько трубок для проб и несколько соответствующих держателей таким образом, что трубки для проб и держатели могут быть загружены отдельно и независимо друг от друга. Однако, в других вариантах реализации настоящего изобретения держатель может быть также выполнен с возможностью принять пробу, например в трубе пробы. И, таким образом, дополнительная рамка выполнена с возможностью принятия нескольких держателей, причем каждый держатель содержит пробу, а также реактивы и другие элементы. В таком примере реализации держатель выполнен с возможностью доступности пробы для устройства идентификации пробы.
Комплекты
[0063] Описанные здесь полоски для реактивов могут быть поставлены в виде комплекта. Например, отдельные полоски для реактивов могут быть упакованы вместе или по отдельности в уплотненном мешочке, для уменьшения вероятности контакта воздуха и влаги с реактивами в держателе. Такой уплотненный мешочек может содержать один держатель или большее количество описанных здесь держателей (например, 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 или 24 держателя).
[0064] Держатель может также может быть поставлен как часть комплекта для выполнения операций по подготовке пробы, причем комплект содержит первый мешочек, содержащий один описанный здесь держатель или большее количество таких держателей, причем каждый из держателей выполнен с возможностью содержания жидких реактивов для, например, операций лизиса, промывки и выпуска, и второй мешочек, содержащий внутри инертную атмосферу и одну трубку для реактивов или большее количество таких трубок, содержащих лиофилизированные реактивы для проведения полимеразной цепной реакции. Такой комплект может также быть выполнен с возможностью проведения анализа для множества проб и содержать достаточное количество реактивов для проведения полимеразной цепной реакции (или другие реактивы для амплификации, например, для проведения полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией, опосредованной транскрипцией амплификации, амплификации замещением цепей, амплификации, основанной на последовательности нуклеиновых кислот, геликазо-зависимой амплификации и для других видов амплификации, знакомых специалистам в данной области техники, а также другие описанные здесь реактивы) для обработки таких проб, и некоторое количество отдельных держателей, например, 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 20 или 24 держателя.