ИСКУССТВЕННЫЕ МОЛЕКУЛЫ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ

1. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая
а. по меньшей мере одну открытую рамку считывания (ОРС); и
б. по меньшей мере один элемент 3'-нетранслируемой области (3'-UTR-элемент) и/или по меньшей мере один элемент 5'-нетранслируемой области (5'-UTR-элемент),
где указанной искусственная молекула нуклеиновой кислоты отличается высокой эффективностью трансляции.
2. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 1, в которой высокая эффективность трансляции обеспечивается по меньшей мере одним элементом 3'-нетранслируемой области (3'-UTR-элементом) и/или по меньшей мере одним элементом 5'-нетранслируемой области (5'-UTR-элементом).
3. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 1 или 2, в которой эффективность трансляции искусственной молекулы нуклеиновой кислоты сопоставима с эффективностью трансляции референс-молекулы нуклеиновой кислоты,
где референс-молекула нуклеиновой кислоты содержит по меньшей мере одну открытую рамку считывания (ОРС), которая идентична по меньшей мере одной ОРС искусственной молекулы нуклеиновой кислоты; и где референс-молекула нуклеиновой кислоты не содержит по меньшей мере один элемент 3'-нетранслируемой области (3'-UTR-элемент) искусственной молекулы нуклеиновой кислоты и/или по меньшей мере один элемент 5'-нетранслируемой области (5'-UTR-элемент) искусственной молекулы нуклеиновой кислоты,
где эффективность трансляции искусственной молекулы нуклеиновой кислоты и эффективность трансляции референс-молекулы нуклеиновой кислоты сравнивают с помощью способа, включающего стадии, на которых:
(I) трансфектируют клетки млекопитающих искусственной молекулой нуклеиновой кислоты и измеряют количества экспрессированного белка, кодируемого ОРС искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, в определенный момент времени после трансфекции (например, через 24 или 48 ч.),
(II) трансфектируют клетки млекопитающих референс-молекулой нуклеиновой кислоты и измеряют количества экспрессируемого белка, кодируемого ОРС референс-молекулы нуклеиновой кислоты, в тот же самый момент времени после трансфекции,
(III) рассчитывают отношение количества белка, экспрессированного с искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, к количеству белка, экспрессированного с референс-молекулы нуклеиновой кислоты,
где величина отношения, рассчитанного на стадии (III), составляет ≥1, предпочтительно >1.
4. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 3, в которой ОРС кодирует белок, который можно оценивать количественно, предпочтительно репортерный белок.
5. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 3 или 4, где референс-молекула нуклеиновой кислоты содержит 3'-UTR-элемент, который не присутствует в искусственной молекуле нуклеиновой кислоты, или
где референс-молекула нуклеиновой кислоты содержит 5'-UTR-элемент, который не присутствует в искусственной молекуле нуклеиновой кислоты.
6. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 5, где референс-молекула нуклеиновой кислоты содержит 3'-UTR-элемент, полученный из 3'-UTR гена альбумина, предпочтительно из 3'-UTR, которая соответствует последовательности, представленной в SEQ ID NO: 207, или
где референс-молекула нуклеиновой кислоты содержит 5'-UTR-элемент, полученный из 5'-UTR ТОР-гена, предпочтительно из 5'-UTR человеческого рибосомального белка большой субъединицы 32 без 5'-концевого олигопиримидинового тракта, предпочтительно из 5'-UTR, которая соответствует последовательности, представленной в SEQ ID NO: 208.
7. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 3 или 4, где референс-молекула нуклеиновой кислоты не содержит никакого элемента 3'-нетранслируемой области (3'-UTR-элемента), или
где референс-молекула нуклеиновой кислоты не содержит никакого элемента 5'-нетранслируемой области (5'-UTR-элемента).
8. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 6, где способ дополнительно отличается, что:
(а) на стадии трансфекции клетки представляют собой клетки млекопитающих, которые выбирают из группы, состоящей из клеток HDF, L929, HEP2G и HeLa;
(б) момент времени для измерения представляет собой момент времени, наступающий через 24 ч. после трансфекции; и
(в) референс-молекула нуклеиновой кислоты представляет собой мРНК, имеющую SEQ ID NO: 205 (фиг. 1А).
9. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-4, в которой открытая рамка считывания получена из гена, отличного от гена, из которого получен по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент.
10. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-9, которая содержит по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и по меньшей мере один 5'-UTR-элемент.
11. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 10, в которой каждая/каждый из по меньшей мере одной открытой рамки считывания, по меньшей мере одного 3'-UTR-элемента и по меньшей мере одного 5'-UTR-элемента является гетерологичной/гетерологичным по отношению друг к другу.
12. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-11, где искусственная молекула нуклеиновой кислоты не содержит 3'-UTR и/или 5'-UTR рибосомального белка S6, RPL36AL, rps16 или рибосомального белка L9 и где открытая рамка считывания искусственной молекулы нуклеиновой кислоты не кодирует белок GFP.
13. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 12, в которой открытая рамка считывания искусственной молекулы нуклеиновой кислоты не кодирует репортерный белок.
14. Искусственная нуклеиновая кислота по одному из пп. 1-13, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент получен из стабильной мРНК.
15. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-14, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, которая получена из 3'-UTR и/или 5'-UTR гена, кодирующего эукариотический белок, предпочтительно из 3'-UTR и/или 5'-UTR гена, кодирующего белок позвоночного, более предпочтительно из 3'-UTR и/или 5'-UTR гена, кодирующего белок млекопитающего, еще более предпочтительно из 3'-UTR и/или 5'-UTR гена, кодирующего белок примата, в частности из 3'-UTR и/или 5'-UTR гена, кодирующего человеческий или мышиный белок.
16. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-15, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент повышает эффективность трансляции указанной искусственной молекулы нуклеиновой кислоты по меньшей мере в 1,2 раза, предпочтительно по меньшей мере в 1,5 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 2 раза, еще более предпочтительно по меньшей мере в 2,5 раза по сравнению с производством белка с референс-молекулы нуклеиновой кислоты, в которой отсутствует 3'-UTR и/или по меньшей мере одна 5'-UTR соответственно, и/или в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент обеспечивает высокую эффективность трансляции указанной искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, превышающую по меньшей мере в 1,5 раза, предпочтительно по меньшей мере в 2 раза, более предпочтительно по меньшей мере в 2,5 раза производство белка с референс-молекулы нуклеиновой кислоты, в которой отсутствует 3'-UTR и/или по меньшей мере одна 5'-UTR соответственно.
17. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-16, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, которая получена из 3'-UTR и/или 5'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, которая состоит из ZNF460, TGM2, IL7R, BGN, ТК1, RAB3B, СВХ6, FZD2, COL8A1, NDUFS7, PHGDH, PLK2, TSPO, PTGS1, FBXO32, NID2, ATP5D, EXOSC4, NOL9, UBB4B, VPS18, ORMDL2, FSCN1, ТМЕМ33, TUBA4A, ЕМР3, ТМЕМ201, CRIP2, BRAT1, SERPINH1, CD9, DPYSL2, CDK9, TFRC, PSMB3 5'-UTR, FASN, PSMB6, PRSS56, KPNA6, SFT2D2, PARD6B, LPP, SPARC, SCAND1, VASN, SLC26A1, LCLAT1, FBXL18, SLC35F6, RAB3D, MAP1B, VMA21, CYBA, SEZ6L2, PCOLCE, VTN, ALDH16A1, RAVER1, KPNA6, SERINC5, JUP, CPN2, CRIP2, EPT1, PNPO, SSSCA1, POLR2L, LIN7C, UQCR10, PYCRL, AMN, MAP1S, NDUFS7, PHGDH, TSPO, ATP5D, EXOSC4, TUBB4B, TUBA4A, EMP3, CRIP2, BRAT1, CD9, CDK9, PSMB3, PSMB6, PRSS56, SCAND1, AMN, CYBA, PCOLCE, MAP1S, VTN, ALDH16A1 (предпочтительно все человеческие) и Dpysl2, Ccnd1, Acox2, Cbx6, Ubc, Ldlr, Nudt22, Pcyox1l, Ankrd1, Tmem37, Tspyl4, Slc7a3, Cst6, Aacs, Nosip, Itga7, Ccnd2, Ebp, Sf3b5, Fasn, Hmgcs1, Osr1, Lmnb1, Vma21, Kif20a, Cdca8, Slc7a1, Ubqln2, Prps2, Shmt2, Aurkb, Fignl1, Cad, Anln, Slfn9, Ncaph, Pole, Uhrf1, Gja1, Fam64a, Kif2c, Tspan10, Scand1, Gpr84, Fads3, Cers6, Cxcr4, Gprc5c, Fen1, Cspg4, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Emr4, Atp5d, 1110001J03Rik, Csf2ra, Aarsd1, Kif22, Cth, Tpgs1, Cel17, Alkbh7, Ms4a8a, Acox2, Ubc, Slpi, Pcyox1l, Igf2bp1, Tmem37, Slc7a3, Cst6, Ebp, Sf3b5, Plk1, Cdca8, Kif22, Cad, Cth, Pole, Kif2c, Scand1, Gpr84, Tpgs1, Ccl17, Alkbh7, Ms4a8a, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Atp5d, 1110001J03Rik, Nudt22, Aarsd1 (предпочтительно все мышиные).
18. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 17, в которой по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 5'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, которая состоит из ZNF460-5'-UTR, TGM2-5'-UTR, IL7R-5'-UTR, BGN-5'-UTR, TK1-5'-UTR, RAB3B-5'-UTR, CBX6-5'-UTR, FZD2-5'-UTR, COL8A1-5'-UTR, NDUFS7-5'-UTR, PHGDH-5'-UTR, PLK2-5'-UTR, TSPO-5'-UTR, PTGS1-5'-UTR, FBXO32-5'-UTR, NID2-5'-UTR, ATP5D-5'-UTR, EXOSC4-5'-UTR, NOL9-5'-UTR, UBB4B-5'-UTR, VPS18-5'-UTR, ORMDL2-5'-UTR, FSCN1-5'-UTR, TMEM33-5'-UTR, TUBA4A-5'-UTR, EMP3-5'-UTR, TMEM201-5'-UTR, CRIP2-5'-UTR, BRAT1-5'-UTR, SERPINH1-5'-UTR, CD9-5'-UTR, DPYSL2-5'-UTR, CDK9-5'-UTR, TFRC-5'-UTR, PSMB3 5'-UTR, FASN-5'-UTR, PSMB6-5'-UTR, PRSS56-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, SFT2D2-5'-UTR, PARD6B-5'-UTR, LPP-5'-UTR, SPARC-5'-UTR, SCAND1-5'-UTR, VASN-5'-UTR, SLC26A1-5'-UTR, LCLAT1-5'-UTR, FBXL18-5'-UTR, SLC35F6-5'-UTR, RAB3D-5'-UTR, MAP1B-5'-UTR, VMA21-5'-UTR, CYBA-5'-UTR, SEZ6L2-5'-UTR, PCOLCE-5'-UTR, VTN-5'-UTR, ALDH16A1-5'-UTR, RAVER1-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, SERINC5-5'-UTR, JUP-5'-UTR, CPN2-5'-UTR, CRIP2-5'-UTR, EPT1-5'-UTR, PNPO-5'-UTR, SSSCA1-5'-UTR, POLR2L-5'-UTR, LIN7C-5'-UTR, UQCR10-5'-UTR, PYCRL-5'-UTR, AMN-5'-UTR, MAP1S-5'-UTR, (предпочтительно все человеческие) и Dpysl2-5'-UTR, Ccnd1-5'-UTR, Acox2-5'-UTR, Cbx6-5'-UTR, Ubc-5'-UTR, Ldlr-5'-UTR, Nudt22-5'-UTR, Pcyox1l-5'-UTR, Ankrd1-5'-UTR, Tmem37-5'-UTR, Tspyl4-5'-UTR, Slc7a3-5'-UTR, Cst6-5'-UTR, Aacs-5'-UTR, Nosip-5'-UTR, Itga7-5'-UTR, Ccnd2-5'-UTR, Ebp-5'-UTR, Sf3b5-5'-UTR, Fasn-5'-UTR, Hmgcs1-5'-UTR, Osr1-5'-UTR, Lmnb1-5'-UTR, Vma21-5'-UTR, Kif20a-5'-UTR, Cdca8-5'-UTR, Slc7a1-5'-UTR, Ubqln2-5'-UTR, Prps2-5'-UTR, Shmt2-5'-UTR, Aurkb-5'-UTR, Fignl1-5'-UTR, Cad-5'-UTR, Anln-5'-UTR, Slfn9-5'-UTR, Ncaph-5'-UTR, Pole-5'-UTR, Uhrf1-5'-UTR, Gja1-5'-UTR, Fam64a-5'-UTR, Kif2c-5'-UTR, Tspan10-5'-UTR, Scand1-5'-UTR, Gpr84-5'-UTR, Fads3-5'-UTR, Cers6-5'-UTR, Cxcr4-5'-UTR, Gprc5c-5'-UTR, Fen1-5'-UTR, Cspg4-5'-UTR, Mrpl34-5'-UTR, Comtd1-5'-UTR, Armc6-5'-UTR, Emr4-5'-UTR, Atp5d-5'-UTR, 1110001J03Rik-5'-UTR, Csf2ra-5'-UTR, Aarsd1-5'-UTR, Kif22-5'-UTR, Cth-5'-UTR, Tpgs1-5'-UTR, Ccl17-5'-UTR, Alkbh7-5'-UTR, Ms4a8a-5'-UTR (предпочтительно все мышиные).
19. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п.17, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 3'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, которая состоит из NDUFS7-3'-UTR, PHGDH-3'-UTR, TSPO-3'-UTR, ATP5D-3'-UTR, EXOSC4-3'-UTR, TUBB4B-3'-UTR, TUBA4A-3'-UTR, EMP3-3'-UTR, CRIP2-3'-UTR, BRAT1-3'-UTR, CD9-3'-UTR, CDK9-3'-UTR, PSMB3-3'-UTR, PSMB6-3'-UTR, PRSS56-3'-UTR, SCAND1-3'-UTR, AMN-3'-UTR, CYBA-3'-UTR, PCOLCE-3'-UTR, MAP1S-3'-UTR, VTN-3'-UTR, ALDH16A1-3'-UTR (предпочтительно все человеческие) и Acox2-3'-UTR, Ubc-3'-UTR, Slpi-3'-UTR, Pcyox1l-3'-UTR, Igf2bp1-3'-UTR, Tmem37-3'-UTR, Slc7a3-3'-UTR, Cst6-3'-UTR, Ebp-3'-UTR, Sf3b5-3'-UTR, Plk1-3'-UTR, Cdca8-3'-UTR, Kif22-3'-UTR, Cad-3'-UTR, Cth-3'-UTR, Pole-3'-UTR, Kif2c-3'-UTR, Scand1-3'-UTR, Gpr84-3'-UTR, Tpgs1-3'-UTR, Ccl17-3'-UTR, Alkbh7-3'-UTR, Ms4a8a-3'-UTR, Mrpl34-3'-UTR, Comtd1-3'-UTR, Armc6-3'-UTR, Atp5d-3'-UTR, 1110001J03Rik-3'-UTR, Nudt22-3'-UTR, Aarsd1-3'-UTR, (предпочтительно все мышиные).
20. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 17-19, в которой по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 5'-UTR транскрипта человеческого гена, выбранного из группы, которая состоит из ZNF460-5'-UTR, TGM2-5'-UTR, IL7R-5'-UTR, COL8A1-5'-UTR, NDUFS7-5'-UTR, PLK2-5'-UTR, FBXO32-5'-UTR, ATP5D-5'-UTR, TUBB4B-5'-UTR, ORMDL2-5'-UTR, FSCN1-5'-UTR, CD9-5'-UTR, PYSL2-5'-UTR, PSMB3-5'-UTR, PSMB6-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, SFT2D2-5'-UTR, LCLAT1-5'-UTR, FBXL18-5'-UTR, SLC35F6-5'-UTR, VMA21-5'-UTR, SEZ6L2-5'-UTR, PCOLCE-5'-UTR, VTN-5'-UTR, ALDH16A1-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, JUP-5'-UTR, CPN2-5'-UTR, PNPO-5'-UTR, SSSCA1-5'-UTR, POLR2L-5'-UTR, LIN7C-5'-UTR, UQCR10-5'-UTR, PYCRL-5'-UTR, AMN-5'-UTR, MAP1S-5'-UTR; или из 5'-UTR транскрипта мышиного гена, выбранного из группы, которая состоит из Dpysl2-5'-UTR, Acox2-5'-UTR, Ubc-5'-UTR, Nudt22-5'-UTR, Pcyox1l-5'-UTR, Ankrd1-5'-UTR, Tspyl4-5'-UTR, Slc7a3-5'-UTR, Aacs-5'-UTR, Nosip-5'-UTR, Itga7-5'-UTR, Ccnd2-5'-UTR, Ebp-5'-UTR, Sf3b5-5'-UTR, Fasn-5'-UTR, Hmgcs1-5'-UTR, Osr1-5'-UTR, Lmnb1-5'-UTR, Vma21-5'-UTR, Kif20a-5'-UTR, Cdca8-5'-UTR, Slc7a1-5'-UTR, Ubqln2-5'-UTR, Prps2-5'-UTR, Shmt2-5'-UTR, Fignl1-5'-UTR, Cad-5'-UTR, Anln-5'-UTR, Slfn9-5'-UTR, Ncaph-5'-UTR, Pole-5'-UTR, Uhrf1-5'-UTR, Gja1-5'-UTR, Fam64a-5'-UTR, Tspan10-5'-UTR, Scand1-5'-UTR, Gpr84-5'-UTR, Cers6-5'-UTR, Cxcr4-5'-UTR, Gprc5c-5'-UTR, Fen1-5'-UTR, Cspg4-5'-UTR, Mrp134-5'-UTR, Comtd1-5'-UTR, Armc6-5'-UTR, Emr4-5'-UTR, Atp5d-5'-UTR, Csf2ra-5'-UTR, Aarsd1-5'-UTR, Cth-5'-UTR, Tpgs1-5'-UTR, Ccl17-5'-UTR, Alkbh7-5'-UTR, Ms4a8a-5'-UTR.
21. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 17-19, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 3'-UTR транскрипта человеческого гена, выбранного из группы, которая состоит из NDUFS7-3'-UTR, PHGDH-3'-UTR, TSPO-3'-UTR, ATP5D-3'-UTR, EXOSC4-3'-UTR, TUBB4B-3'-UTR, TUBA4A-3'-UTR, EMP3-3'-UTR, CRIP2-3'-UTR, BRAT1-3'-UTR, PSMB3-3'-UTR, PSMB6-3'-UTR, SCAND1-3'-UTR, AMN-3'-UTR, CYBA-3'-UTR, PCOLCE-3'-UTR, MAP1S-3'-UTR, VTN-3'-UTR, ALDH16A1-3'-UTR; или 3'-UTR транскрипта мышиного гена, выбранного из группы, которая состоит из Асох2-3'-UTR, Ubc-3'-UTR, Slpi-3'-UTR, Igf2bp1-3'-UTR, Tmem37-3'-UTR, Slc7a3-3'-UTR, Cst6-3'-UTR, Ebp-3'-UTR, Sf3b5-3'-UTR, Cdca8-3'-UTR, Kif22-3'-UTR, Cad-3'-UTR, Pole-3'-UTR, Kif2c-3'-UTR, Scand1-3'-UTR, Gpr84-3'-UTR, Tpgs1-3'-UTR, Ccl17-3'-UTR, Alkbh7-3'-UTR, Ms4a8a-3'-UTR, Mrpl34-3'-UTR, Comtd1-3'-UTR, Armc6-3'-UTR, Atp5d-3'-UTR, 1110001J03Rik-3'-UTR, Nudt22-3'-UTR.
22. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-21, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, идентичной по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 152-204, или в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент содержит или состоит из фрагмента нуклеотидной последовательности, идентичного по меньшей мере примерно на 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% фрагменту нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 152-204.
23. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-22, в которой по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, идентичной по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 1-151, или в которой по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит или состоит из фрагмента нуклеотидной последовательности, идентичного по меньшей мере примерно на 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% фрагменту нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 1-151.
24. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 22 или 23, в которой фрагмент имеет длину от 3 до примерно 500 нуклеотидов, предпочтительно от 5 до примерно 150 нуклеотидов, более предпочтительно от 10 до 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно от 15 до 90, наиболее предпочтительно от 20 до 70.
25. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-24, в которой по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент имеет длину от 3 до примерно 500 нуклеотидов, предпочтительно от 5 до примерно 150 нуклеотидов, более предпочтительно от 10 до 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно от 15 до 90, наиболее предпочтительно от 20 до 70.
26. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-25, дополнительно содержащая
в. поли(А)-последовательность и/или сигнал полиаденилирования.
27. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 26, в которой поли(А)-последовательность или сигнал полиаденилирования находится с 3'-стороны относительно 3'-UTR-элемента.
28. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 26 или 27, в которой сигнал полиаденилирования содержит консенсусную последовательность NN(U/T)ANA, в которой N обозначает А или U, предпочтительно AA(U/T)AAA или A(U/T)(U/T)AAA.
29. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 26-28, в которой сигнал полиаденилирования, предпочтительно консенсусная последовательность NNUANA, локализован на расстоянии менее чем примерно 50 нуклеотидов по ходу транскрипции от 3'-конца 3'-UTR-элемента.
30. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 26-28, в которой поли(А)-последовательность имеет длину от примерно 20 до примерно 300 адениновых нуклеотидов, предпочтительно от примерно 40 до примерно 200 адениновых нуклеотидов, более предпочтительно от примерно 50 до примерно 100 адениновых нуклеотидов, еще более предпочтительно от примерно 60 до примерно 70 адениновых нуклеотидов.
31. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-30, дополнительно содержащая 5'-кэп-структуру, поли(С)-последовательность, гистоновую структуру типа «стебель-петля» и/или IRES-мотив.
32. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по п. 31, в которой гистоновая структура типа «стебель-петля» содержит последовательность, представленную в SEQ ID NO: 209.
33. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-32, в которой нуклеотидная последовательность содержит промотор.
34. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-33, в которой нуклеотидная последовательность содержит 5'-TOP UTR.
35. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-34, где нуклеиновая кислота содержит 3'-UTR, которая содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, полученной из 3'-UTR гена альбумина.
36. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-35, где в искусственной молекуле нуклеиновой кислоты, предпочтительно в открытой рамке считывания, по меньшей мере частично модифицировано содержание G/C, где предпочтительно содержание G/C открытой рамки считывания повышено по сравнению с открытой рамкой считывания дикого типа.
37. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-36, в которой открытая рамка считывания содержит область с оптимизированными кодонами, предпочтительно в которой открытая рамка считывания имеет оптимизированные кодоны.
38. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-37, которая представляет собой РНК, предпочтительно молекулу мРНК.
39. Вектор, содержащий искусственную молекулу нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38.
40. Вектор по п. 39, который представляет собой ДНК-вектор.
41. Вектор по п. 39 или 40, который представляет собой плазмидный вектор или вирусный вектор, предпочтительно плазмидный вектор.
42. Вектор по одному из пп. 39-41, который представляет собой кольцевую молекулу.
43. Вектор по п. 42, в котором за поли(А)-последовательностью, поли(С)-последовательностью, гистоновой структурой типа «стебель-петля» или 3'-UTR-элементом кодирующей цепи в 5'→3'-направлении расположен сайт рестрикции, предназначенный для линеаризации кольцевой векторной молекулы.
44. Клетка, содержащая искусственную молекулу нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38 или вектор по одному из пп. 39-43.
45. Клетка по п. 44, которая представляет собой клетку млекопитающего.
46. Клетка по п. 44 или 45, которая представляет собой клетку млекопитающего, предпочтительно выделенную клетку млекопитающего, предпочтительно человека.
47. Фармацевтическая композиция, содержащая искусственную молекулу нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38, вектор по одному из пп. 39-43 или клетку по одному из пп. 44-46.
48. Фармацевтическая композиция по п. 47, дополнительно содержащая один или большее количество фармацевтически приемлемых носителей, разбавителей и/или эксципиентов и/или один или большее количество адъювантов.
49. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38, вектор по одному из пп. 39-43, клетка по одному из пп. 44-46, или фармацевтическая композиция по п. 47 или 48, для применения в качестве лекарственного средства.
50. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38, вектор по одному из пп. 39-43, клетка по одному из пп. 44-46 или фармацевтическая композиция по п. 47 или 48 для применения в качестве вакцины или для применения в генной терапии.
51. Способ лечения или предупреждения нарушения, включающий введение искусственной молекулы нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38, вектора по одному из пп. 39-43, клетки по одному из пп. 44-46 или фармацевтической композиции по п. 47 или 48 индивидууму, нуждающемуся в этом.
52. Способ лечения или предупреждения нарушения, включающий осуществление трансфекции клетки искусственной молекулой нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38 или вектора по одному из пп. 39-43.
53. Способ по п. 52, в котором трансфекцию клетки осуществляют in vitro/ex vivo и трансфектированную клетку вводят индивидууму, нуждающемуся в этом, предпочтительно больному человеку.
54. Способ по п. 53, в котором клетка, предназначенная для трансфекции in vitro, представляет собой выделенную клетку индивидуума, предпочтительно больного человека.
55. Способ по одному из пп. 51-55, который представляет собой способ вакцинации или способ генной терапии.
56. Способ повышения эффективности трансляции искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, предпочтительно молекулы мРНК или вектора, где способ включает стадию ассоциации открытой рамки считывания с 3'-UTR-элементом и/или 5'-UTR-элементом, где 3'-UTR-элемент и/или 5'-UTR-элемент повышает эффективность трансляции образовавшейся в результате этого искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, с получением искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, предпочтительно молекулы мРНК по одному из пп. 1-38 или вектора по одному из пп. 39-43.
57. Способ повышения эффективности трансляции искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, предпочтительно с молекулы мРНК или вектора по п. 52, где 3'-UTR-элемент и/или 5'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, которая получена из 3'-UTR и/или 5'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, которая состоит из ZNF460, TGM2, IL7R, BGN, ТК1, RAB3B, СВХ6, FZD2, COL8A1, NDUFS7, PHGDH, PLK2, TSPO, PTGS1, FBXO32, NID2, ATP5D, EXOSC4, NOL9, UBB4B, VPS18, ORMDL2, FSCN1, ТМЕМ33, TUBA4A, ЕМР3, ТМЕМ201, CRIP2, BRAT1, SERPINH1, CD9, DPYSL2, CDK9, TFRC, PSMB3 5'-UTR, FASN, PSMB6, PRSS56, KPNA6, SFT2D2, PARD6B, LPP, SPARC, SCAND1, VASN, SLC26A1, LCLAT1, FBXL18, SLC35F6, RAB3D, MAP1B, VMA21, CYBA, SEZ6L2, PCOLCE, VTN, ALDH16A1, RAVER1, KPNA6, SERINC5, JUP, CPN2, CRIP2, EPT1, PNPO, SSSCA1, POLR2L, LIN7C, UQCR10, PYCRL, AMN, MAP1S, NDUFS7, PHGDH, TSPO, ATP5D, EXOSC4, TUBB4B, TUBA4A, EMP3, CRIP2, BRAT1, CD9, CDK9, PSMB3, PSMB6, PRSS56, SCAND1, AMN, CYBA, PCOLCE, MAP1S, VTN, ALDH16A1 (предпочтительно все человеческие) и Dpysl2, Ccnd1, Acox2, Cbx6, Ubc, Ldlr, Nudt22, Pcyox1l, Ankrd1, Tmem37, Tspyl4, Slc7a3, Cst6, Aacs, Nosip, Itga7, Ccnd2, Ebp, Sf3b5, Fasn, Hmgcs1, Osr1, Lmnb1, Vma21, Kif20a, Cdca8, Slc7a1, Ubqln2, Prps2, Shmt2, Aurkb, Fignl1, Cad, Anln, Slfn9, Ncaph, Pole, Uhrf1, Gja1, Fam64a, Kif2c, Tspan10, Scand1, Gpr84, Fads3, Cers6, Cxcr4, Gprc5c, Fen1, Cspg4, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Emr4, Atp5d, 1110001J03Rik, Csf2ra, Aarsd1, Kif22, Cth, Tpgs1, Ccl17, Alkbh7, Ms4a8a, Acox2, Ubc, Slpi, Pcyox1l, Igf2bp1, Tmem37, Slc7a3, Cst6, Ebp, Sf3b5, Plk1, Cdca8, Kif22, Cad, Cth, Pole, Kif2c, Scand1, Gpr84, Tpgs1, Ccl17, Alkbh7, Ms4a8a, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Atp5d, 1110001J03Rik, Nudt22, Aarsd1 (предпочтительно все мышиные).
58. Применение 3'-UTR-элемента и/или 5'-UTR-элемента для повышения эффективности трансляции искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, предпочтительно с молекулы мРНК или вектора, где 3'-UTR-элемент и/или 5'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, которая получена из 3'-UTR и/или 5'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, состоящей из ZNF460, TGM2, IL7R, BGN, ТК1, RAB3B, СВХ6, FZD2, COL8A1, NDUFS7, PHGDH, PLK2, TSPO, PTGS1, FBXO32, NID2, ATP5D, EXOSC4, NOL9, UBB4B, VPS18, ORMDL2, FSCN1, ТМЕМ33, TUBA4A, ЕМР3, ТМЕМ201, CRIP2, BRAT1, SERPINH1, CD9, DPYSL2, CDK9, TFRC, PSMB3 5'-UTR, FASN, PSMB6, PRSS56, KPNA6, SFT2D2, PARD6B, LPP, SPARC, SCAND1, VASN, SLC26A1, LCLAT1, FBXL18, SLC35F6, RAB3D, МАР1В, VMA21, CYBA, SEZ6L2, PCOLCE, VTN, ALDH16A1, RAVER1, KPNA6, SERINC5, JUP, CPN2, CRIP2, EPT1, PNPO, SSSCA1, POLR2L, LIN7C, UQCR10, PYCRL, AMN, MAP1S, NDUFS7, PHGDH, TSPO, ATP5D, EXOSC4, TUBB4B, TUBA4A, EMP3, CRIP2, BRAT1, CD9, CDK9, PSMB3, PSMB6, PRSS56, SCAND1, AMN, CYBA, PCOLCE, MAP1S, VTN, ALDH16A1 (предпочтительно все человеческие) и Dpysl2, Ccnd1, Acox2, Cbx6, Ubc, Ldlr, Nudt22, Pcyox1l, Ankrd1, Tmem37, Tspyl4, Slc7a3, Cst6, Aacs, Nosip, Itga7, Ccnd2, Ebp, Sf3b5, Fasn, Hmgcs1, Osr1, Lmnb1, Vma21, Kif20a, Cdca8, Slc7a1, Ubqln2, Prps2, Shmt2, Aurkb, Fignl1, Cad, Anln, Slfn9, Ncaph, Pole, Uhrf1, Gja1, Fam64a, Kif2c, Tspan10, Scand1, Gpr84, Fads3, Cers6, Cxcr4, Gprc5c, Fen1, Cspg4, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Emr4, Atp5d, 1110001J03Rik, Csf2ra, Aarsd1, Kif22, Cth, Tpgs1, Cel17, Alkbh7, Ms4a8a, Acox2, Ubc, Slpi, Pcyox1l, Igf2bp1, Tmem37, Slc7a3, Cst6, Ebp, Sf3b5, Plk1, Cdca8, Kif22, Cad, Cth, Pole, Kif2c, Scand1, Gpr84, Tpgs1, Ccl17, Alkbh7, Ms4a8a, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Atp5d, 1110001J03Rik, Nudt22, Aarsd1 (предпочтительно все мышиные).
59. Способ по п. 57 или применение по п. 58, в котором по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 3'-UTR и/или 5'-UTR транскрипта человеческого гена, выбранного из группы, которая состоит из ZNF460, TGM2, IL7R, BGN, TK1, RAB3B, CBX6, FZD2, COL8A1, NDUFS7, PHGDH, PLK2, TSPO, PTGS1, FBXO32, NID2, ATP5D, EXOSC4, NOL9, UBB4B, VPS18, ORMDL2, FSCN1, TMEM33, TUBA4A, ЕМР3, TMEM201, CRIP2, BRAT1, SERPINH1, CD9, DPYSL2, CDK9, TFRC, PSMB3 5'-UTR, FASN, PSMB6, PRSS56, KPNA6, SFT2D2, PARD6B, LPP, SPARC, SCAND1, VASN, SLC26A1, LCLAT1, FBXL18, SLC35F6, RAB3D, MAP1B, VMA21, CYBA, SEZ6L2, PCOLCE, VTN, ALDH16A1, RAVER1, KPNA6, SERINC5, JUP, CPN2, CRIP2, EPT1, PNPO, SSSCA1, POLR2L, LIN7C, UQCR10, PYCRL, AMN, MAP1S, NDUFS7, PHGDH, TSPO, ATP5D, EXOSC4, TUBB4B, TUBA4A, EMP3, CRIP2, BRAT1, CD9, CDK9, PSMB3, PSMB6, PRSS56, SCAND1, AMN, CYBA, PCOLCE, MAP1S, VTN, ALDH16A1.
60. Способ по п. 57 или применение по п. 58, в котором по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 3'-UTR и/или 5'-UTR транскрипта мышиного гена, выбранного из группы, которая состоит из Dpysl2, Ccnd1, Асох2, Cbx6, Ubc, Ldlr, Nudt22, Pcyox1l, Ankrd1, Tmem37, Tspyl4, Slc7a3, Cst6, Aacs, Nosip, Itga7, Ccnd2, Ebp, Sf3b5, Fasn, Hmgcs1, Osr1, Lmnb1, Vma21, Kif20a, Cdca8, Slc7a1, Ubqln2, Prps2, Shmt2, Aurkb, Fignl1, Cad, Anln, Slfn9, Ncaph, Pole, Uhrf1, Gja1, Fam64a, Kif2c, Tspan10, Scand1, Gpr84, Fads3, Cers6, Cxcr4, Gprc5c, Fen1, Cspg4, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Emr4, Atp5d, 1110001J03Rik, Csf2ra, Aarsd1, Kif22, Cth, Tpgs1, Ccl17, Alkbh7, Ms4a8a, Acox2, Ubc, Slpi, Pcyox1l, Igf2bp1, Tmem37, Slc7a3, Cst6, Ebp, Sf3b5, Plk1, Cdca8, Kif22, Cad, Cth, Pole, Kif2c, Scand1, Gpr84, Tpgs1, Ccl17, Alkbh7, Ms4a8a, Mrpl34, Comtd1, Armc6, Atp5d, 1110001J03Rik, Nudt22, Aarsd1.
61. Способ или применение по одному из пп. 57-59, в котором по меньшей мере один 3'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 3'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, которая состоит из NDUFS7-3'-UTR, PHGDH-3'-UTR, TSPO-3'-UTR, ATP5D-3'-UTR, EXOSC4-3'-UTR, TUBB4B-3'-UTR, TUBA4A-3'-UTR, EMP3-3'-UTR, CRIP2-3'-UTR, BRAT1-3'-UTR, CD9-3'-UTR, CDK9-3'-UTR, PSMB3-3'-UTR, PSMB6-3'-UTR, PRSS56-3'-UTR, SCAND1-3'-UTR, AMN-3'-UTR, CYBA-3'-UTR, PCOLCE-3'-UTR, MAP1S-3'-UTR, VTN-3'-UTR, ALDH16A1-3'-UTR (предпочтительно все человеческие) и Acox2-3'-UTR, Ubc-3'-UTR, Slpi-3'-UTR, Pcyox1l-3'-UTR, Igf2bp1-3'-UTR, Tmem37-3'-UTR, Slc7a3-3'-UTR, Cst6-3'-UTR, Ebp-3'-UTR, Sf3b5-3'-UTR, Plk1-3'-UTR, Cdca8-3'-UTR, Kif22-3'-UTR, Cad-3'-UTR, Cth-3'-UTR, Pole-3'-UTR, Kif2c-3'-UTR, Scand1-3'-UTR, Gpr84-3'-UTR, Tpgs1-3'-UTR, Ccl17-3'-UTR, Alkbh7-3'-UTR, Ms4a8a-3'-UTR, Mrpl34-3'-UTR, Comtd1-3'-UTR, Armc6-3'-UTR, Atp5d-3'-UTR, 1110001J03Rik-3'-UTR, Nudt22-3'-UTR, Aarsd1-3'-UTR, (предпочтительно все мышиные); предпочтительно по меньшей мере один 3'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, которая получена из 3'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, которая состоит из NDUFS7-3'-UTR, PHGDH-3'-UTR, TSPO-3'-UTR, ATP5D-3'-UTR, EXOSC4-3'-UTR, TUBB4B-3'-UTR, TUBA4A-3'-UTR, EMP3-3'-UTR, CRIP2-3'-UTR, BRAT1-3'-UTR, PSMB3-3'-UTR, PSMB6-3'-UTR, SCAND1-3'-UTR, AMN-3'-UTR, CYBA-3'-UTR, PCOLCE-3'-UTR, MAP1S-3'-UTR, VTN-3'-UTR, ALDH16A1-3'-UTR (все человеческие), Acox2-3'-UTR, Ubc-3'-UTR, Slpi-3'-UTR, Igf2bp1-3'-UTR, Tmem37-3'-UTR, Slc7a3-3'-UTR, Cst6-3'-UTR, Ebp-3'-UTR, Sf3b5-3'-UTR, Cdca8-3'-UTR, Kif22-3'-UTR, Cad-3'-UTR, Pole-3'-UTR, Kif2c-3'-UTR, Scand1-3'-UTR, Gpr84-3'-UTR, Tpgs1-3'-UTR, Ccl17-3'-UTR, Alkbh7-3'-UTR, Ms4a8a-3'-UTR, Mrpl34-3'-UTR, Comtd1-3'-UTR, Armc6-3'-UTR, Atp5d-3'-UTR, 1110001J03Rik-3'-UTR, Nudt22-3'-UTR (все мышиные).
62. Способ или применение по одному из пп. 57-60, в котором по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит нуклеотидную последовательность, которая получена из 5'-UTR транскрипта гена, выбранного из группы, которая состоит из ZNF460-5'-UTR, TGM2-5'-UTR, IL7R-5'-UTR, BGN-5'-UTR, TKl-5'-UTR, RAB3B-5'-UTR, CBX6-5'-UTR, FZD2-5'-UTR, COL8A1-5'-UTR, NDUFS7-5'-UTR, PHGDH-5'-UTR, PLK2-5'-UTR, TSPO-5'-UTR, PTGS1-5'-UTR, FBXO32-5'-UTR, NID2-5'-UTR, ATP5D-5'-UTR, EXOSC4-5'-UTR, NOL9-5'-UTR, UBB4B-5'-UTR, VPS18-5'-UTR, ORMDL2-5'-UTR, FSCN1-5'-UTR, TMEM33-5'-UTR, TUBA4A-5'-UTR, EMP3-5'-UTR, TMEM201-5'-UTR, CRIP2-5'-UTR, BRAT1-5'-UTR, SERPINH1-5'-UTR, CD9-5'-UTR, DPYSL2-5'-UTR, CDK9-5'-UTR, TFRC-5'-UTR, PSMB3 5'-UTR, FASN-5'-UTR, PSMB6-5'-UTR, PRSS56-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, SFT2D2-5'-UTR, PARD6B-5'-UTR, LPP-5'-UTR, SPARC-5'-UTR, SCAND1-5'-UTR, VASN-5'-UTR, SLC26A1-5'-UTR, LCLAT1-5'-UTR, FBXL18-5'-UTR, SLC35F6-5'-UTR, RAB3D-5'-UTR, MAP1B-5'-UTR, VMA21-5'-UTR, CYBA-5'-UTR, SEZ6L2-5'-UTR, PCOLCE-5'-UTR, VTN-5'-UTR, ALDH16A1-5'-UTR, RAVER1-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, SERINC5-5'-UTR, JUP-5'-UTR, CPN2-5'-UTR, CRIP2-5'-UTR, EPT1-5'-UTR, PNPO-5'-UTR, SSSCA1-5'-UTR, POLR2L-5'-UTR, LIN7C-5'-UTR, UQCR10-5'-UTR, PYCRL-5'-UTR, AMN-5'-UTR, MAP1S-5'-UTR, (предпочтительно все человеческие) и Dpysl2-5'-UTR, Ccnd1-5'-UTR, Acox2-5'-UTR, Cbx6-5'-UTR, Ubc-5'-UTR, Ldlr-5'-UTR, Nudt22-5'-UTR, Pcyox1l-5'-UTR, Ankrd1-5'-UTR, Tmem37-5'-UTR, Tspyl4-5'-UTR, Slc7a3-5'-UTR, Cst6-5'-UTR, Aacs-5'-UTR, Nosip-5'-UTR, Itga7-5'-UTR, Ccnd2-5'-UTR, Ebp-5'-UTR, Sf3b5-5'-UTR, Fasn-5'-UTR, Hmgcs1-5'-UTR, Osr1-5'-UTR, Lmnb1-5'-UTR, Vma21-5'-UTR, Kif20a-5'-UTR, Cdca8-5'-UTR, Slc7a1-5'-UTR, Ubqln2-5'-UTR, Prps2-5'-UTR, Shmt2-5'-UTR, Aurkb-5'-UTR, Fignl1-5'-UTR, Cad-5'-UTR, Anln-5'-UTR, Slfn9-5'-UTR, Ncaph-5'-UTR, Pole-5'-UTR, Uhrf1-5'-UTR, Gja1-5'-UTR, Fam64a-5'-UTR, Kif2c-5'-UTR, Tspan10-5'-UTR, Scand1-5'-UTR, Gpr84-5'-UTR, Fads3-5'-UTR, Cers6-5'-UTR, Cxcr4-5'-UTR, Gprc5c-5'-UTR, Fen1-5'-UTR, Cspg4-5'-UTR, Mrpl34-5'-UTR, Comtd1-5'-UTR, Armc6-5'-UTR, Emr4-5'-UTR, Atp5d-5'-UTR, 1110001J03Rik-5'-UTR, Csf2ra-5'-UTR, Aarsd1-5'-UTR, Kif22-5'-UTR, Cth-5'-UTR, Tpgs1-5'-UTR, Ccl17-5'-UTR, Alkbh7-5'-UTR, Ms4a8a-5'-UTR (предпочтительно все мышиные); предпочтительно по меньшей мере один 5'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, которая получена из 5'-UTR транскрипта ZNF460-5'-UTR, TGM2-5'-UTR, IL7R-5'-UTR, COL8A1-5'-UTR, NDUFS7-5'-UTR, PLK2-5'-UTR, FBXO32-5'-UTR, ATP5D-5'-UTR, TUBB4B-5'-UTR, ORMDL2-5'-UTR, FSCN1-5'-UTR, CD9-5'-UTR, PYSL2-5'-UTR, PSMB3-5'-UTR, PSMB6-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, SFT2D2-5'-UTR, LCLAT1-5'-UTR, FBXL18-5'-UTR, SLC35F6-5'-UTR, VMA21-5'-UTR, SEZ6L2-5'-UTR, PCOLCE-5'-UTR, VTN-5'-UTR, ALDH16A1-5'-UTR, KPNA6-5'-UTR, JUP-5'-UTR, CPN2-5'-UTR, PNPO-5'-UTR, SSSCA1-5'-UTR, POLR2L-5'-UTR, LIN7C-5'-UTR, UQCR10-5'-UTR, PYCRL-5'-UTR, AMN-5'-UTR, MAP1S-5'-UTR (все человеческие), Dpysl2-5'-UTR, Acox2-5'-UTR, Ubc-5'-UTR, Nudt22-5'-UTR, Pcyox1l-5'-UTR, Ankrd1-5'-UTR, Tspyl4-5'-UTR, Slc7a3-5'-UTR, Aacs-5'-UTR, Nosip-5'-UTR, Itga7-5'-UTR, Ccnd2-5'-UTR, Ebp-5'-UTR, Sf3b5-5'-UTR, Fasn-5'-UTR, Hmgcs1-5'-UTR, Osr1-5'-UTR, Lmnb1-5'-UTR, Vma21-5'-UTR, Kif20a-5'-UTR, Cdca8-5'-UTR, Slc7a1-5'-UTR, Ubqln2-5'-UTR, Prps2-5'-UTR, Shmt2-5'-UTR, Fignl1-5'-UTR, Cad-5'-UTR, Anln-5'-UTR, Slfn9-5'-UTR, Ncaph-5'-UTR, Pole-5'-UTR, Uhrf1-5'-UTR, Gja1-5'-UTR, Fam64a-5'-UTR, Tspan10-5'-UTR, Scand1-5'-UTR, Gpr84-5'-UTR, Cers6-5'-UTR, Cxcr4-5'-UTR, Gprc5c-5'-UTR, Fen1-5'-UTR, Cspg4-5'-UTR, Mrpl34-5'-UTR, Comtd1-5'-UTR, Armc6-5'-UTR, Emr4-5'-UTR, Atp5d-5'-UTR, Csf2ra-5'-UTR, Aarsd1-5'-UTR, Cth-5'-UTR, Tpgs1-5'-UTR, Ccl17-5'-UTR, Alkbh7-5'-UTR, Ms4a8a-5'-UTR (все мышиные).
63. Способ или применение по одному из пп. 57-61, в котором 3'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, идентичной по меньшей мере примерно на 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 152-204, или в котором 3'-UTR-элемент содержит или состоит из фрагмента нуклеотидной последовательности, идентичной по меньшей мере примерно на 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 152-204.
64. Способ или применение по одному из пп. 57-60 и 62, в котором 5'-UTR-элемент содержит или состоит из нуклеотидной последовательности, идентичной по меньшей мере примерно на 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 1-151, или в котором 5'-UTR-элемент содержит или состоит из фрагмента нуклеотидной последовательности, идентичной по меньшей мере примерно на 40%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 50%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 60%, предпочтительно по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 99% последовательности, выбранной из группы, которая состоит из SEQ ID NO: 1-151.
65. Способ или применение по п. 63 или 64, в котором фрагмент имеет длину от 3 до примерно 500 нуклеотидов, предпочтительно от 5 до примерно 150 нуклеотидов, более предпочтительно от 10 до 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно от 15 до 90, наиболее предпочтительно от 20 до 70.
66. Способ или применение по одному из пп. 57-65, в котором 3'-UTR-элемент и/или 5'-UTR-элемент имеет длину от 3 до примерно 500 нуклеотидов, предпочтительно от 5 до примерно 150 нуклеотидов, более предпочтительно от 10 до 100 нуклеотидов, еще более предпочтительно от 15 до 90, наиболее предпочтительно от 20 до 70.
67. Набор или набор компонентов, содержащий искусственную молекулу нуклеиновой кислоты по одному из пп. 1-38, вектор по одному из пп. 39-43, клетку по одному из пп. 44-46 и/или фармацевтическую композицию по п. 47 или 48.
68. Набор по п. 67, дополнительно содержащий инструкции по применению, клетки для трансфекции, адъювант, средства для введения фармацевтической композиции, фармацевтически приемлемый носитель и/или фармацевтически приемлемый раствор для растворения или разведения искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, вектора, клеток или фармацевтической композиции.
69. Способ создания искусственной молекулы нуклеиновой кислоты, в котором синтезируют искусственную молекулу нуклеиновой кислоты, содержащую по меньшей мере одну открытую рамку считывания и по меньшей мере один 3'-UTR-элемент и/или по меньшей мере один 5'-UTR-элемент по одному из пп. 1-38.
70. Способ создания искусственной молекулы нуклеиновой кислоты по п. 69, в котором для синтеза искусственной молекулы нуклеиновой кислоты применяют вектор по одному из пп. 39-43.
71. Искусственная молекула нуклеиновой кислоты, которую можно получать с помощью способа создания искусственной молекулы нуклеиновой кислоты по одному из  пп. 69-70.