Тромбоцитарные биомаркеры в диагностике рака

1. Способ определения того, страдает ли субъект от доброкачественного поражения или от карциномного поражения, включающий:
измерение по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в биологическом образце от указанного субъекта, где указанные по меньшей мере два тромбоцитарных биомаркера выбраны из группы, состоящей из α-актинина 1 (ACTN1), α-актинина 4 (ACTN4), crk-подобного белка (CRKL), белка эндоплазматического ретикулума 29 (ERP29), гомолог 3 семейства фермитина (fermitin family homolog 3; FERM), гамма-цепи фибриногена (FIBG), филамина А (FLNA), гельсолина (GELS), митохондриального белка стресса 70 (GRP75), белка HP, белка теплового шока 70 кДа (HSP70), белка теплового шока 71 кДа (HSP71), интегрина альфа-2b (ITGA2B), интегрина бета-3 (ITB3), ингибитора рибонуклеазы (RINI), протоонкогенной тирозин-протеинкиназы Src (SRC), тубулина (ТВА), цепи альфа-4А тубулина (ТВА4А), 3-меркаптопируват сульфуртрансферазы (ТНТМ), талина-1 (TLN1), цепи бета-1 тубулина (TUBB1), винкулина (VCL) и белка 1, содержащего WD повторы (WDR1); и
определение того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от указанного карциномного поражения на основании указанного измерения.
2. Способ по п. 1, где определение того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от указанного карциномного поражения, включает определение того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от ракового поражения яичника или предстательной железы на основании указанного измерения.
3. Способ по п. 1, где измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает измерение в указанном биологическом образце по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из ERP29, ACTN4, белка HP, TLN1, SRC и ТНТМ.
4. Способ по п. 1, где
измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает измерение соответствующего количества указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в указанном биологическом образце, где указанный способ дополнительно включает:
сравнение указанного соответствующего количества с соответствующим контрольным количеством, представляющим собой количество указанного соответствующего тромбоцитарного биомаркера в биологическом образце от контрольного субъекта, где
определение того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от указанного карциномного поражения, включает определение того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от указанного карциномного поражения на основании указанного сравнения.
5. Способ по п. 1, где определение того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от указанного карциномного поражения, включает определение того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от ранней стадии карциномного поражения на основании указанного измерения.
6. Способ прогнозирования наличия доброкачественного и/или карциномного поражения у субъекта, включающий:
измерение по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в биологическом образце от указанного субъекта, где указанные по меньшей мере два тромбоцитарных биомаркера выбраны из группы, состоящей из диаденозин тетрафосфата (АР4А), субъединицы альфа-1 белка, кэппирующего F-актин (CAZA1), неспецифической дипептидазы цитозоля (CNDP2), гликопротеина IX (GPIX), ингибитора лейкоцитарной эластазы (ILEU), субъединицы RII-бета сАМР-зависимой протеинкиназы (KAP3), прохибитина (РНВ), эндофилина-В1 (SHLB1), серпина В6 (SPB6) и тропомиозина альфа-1 (ТМР1); и
прогнозирование наличия указанного доброкачественного и/или карциномного поражения у указанного субъекта на основании указанного измерения.
7. Способ по п. 6, где прогнозирование наличия указанного доброкачественного и/или карциномного поражения включает прогнозирование наличия доброкачественного поражения и/или ракового поражения яичника или предстательной железы у указанного субъекта на основании указанного измерения.
8. Способ по п. 6, где
измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает измерение соответствующего количества указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в указанном биологическом образце, где указанный способ дополнительно включает:
сравнение указанного соответствующего количества с соответствующим контрольным количеством, представляющим собой количество указанного соответствующего тромбоцитарного биомаркера в биологическом образце от контрольного субъекта, где
прогнозирование наличия указанного доброкачественного и/или карциномного поражения включает прогнозирование наличия указанного доброкачественного и/или карциномного поражения у указанного субъекта на основании указанного сравнения.
9. Способ прогнозирования наличия колоректального рака или рака поджелудочной железы у субъекта, где в указанном способе осуществляют:
измерение по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в биологическом образце от указанного субъекта, где указанные по меньшей мере два тромбоцитарных биомаркера выбраны из группы, состоящей из бета-актина (АСТВ), α-актинина 1 (ACTN1), каспазы 3 (CASP3), кофилина 1 (CLF1), кластерина (CLU), фарнезилпирофосфатсинтазы (FPPS), гельсолина (GELS), глутатион S-трансферазы омега-1 (GSTO1), белка теплового шока HSP 90-бета (HSP90AB1), белка 2, содержащего гидролазный домен, подобный дегалогеназе галогенокислоты (HDHD2), интегрина альфа-2b (ITGA2B), интегрина бета-3 (ITB3), интегрина альфа-6 (ITGA6), малектина (MLEC), прохибитина (РНВ), ингибитора рибонуклеазы (RINI), альфа-синуклеина (SNCA), серпина В6 (SPB6), цепи альфа-4А тубулина (ТВА4А), талина-1 (TLN1), белка гена восприимчивости опухоли 101 (TSG), цепи бета-1 тубулина (ТВВ1), винкулина (VCL) и белка 1, содержащего WD повторы (WDR1); и
прогнозирование наличия указанного колоректального рака или рака поджелудочной железы у указанного субъекта на основании указанного измерения.
10. Способ по п. 9, где
измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает измерение в указанном биологическом образце указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из АСТВ, ACTN1, CAPS3, CFL1, CLU, FPPS, GELS, GSTO1, HDHD2, ITGA2B, ITB3, ITGA6, MLEC, РНВ, RINI, SNCA, SPB6, ТВА4А, TLN1, TSG, TUBB1, VCL и WDR1; и
прогнозирование наличия указанного колоректального рака или рака поджелудочной железы включает прогнозирование наличия указанного колоректального рака у указанного субъекта на основании указанного измерения.
11. Способ по п. 9, где
измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает измерение в указанном биологическом образце указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из АСТВ, ACTN1, CAPS3, CFL1, CLU, FPPS, GELS, HSP90AB1, HDHD2, ITGA2B, ITB3, ITGA6, MLEC, РНВ, RINI, SNCA, SPB6, ТВА4А, TLN1, TSG, TUBB1, VCL и WDR1; и
прогнозирование наличия указанного колоректального рака или рака поджелудочной железы включает прогнозирование наличия указанного рака поджелудочной железы у указанного субъекта на основании указанного измерения.
12. Способ по п. 9, где
измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает измерение соответствующего количества указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в указанном биологическом образце, где указанный способ дополнительно включает:
сравнение указанного соответствующего количества с соответствующим контрольным количеством, представляющим собой количество указанного соответствующего тромбоцитарного биомаркера в биологическом образце от контрольного субъекта, где
прогнозирование наличия указанного колоректального рака или рака поджелудочной железы включает прогнозирование наличия указанного колоректального рака или рака поджелудочной железы у указанного субъекта на основании указанного сравнения.
13. Способ прогнозирования наличия карциномы у субъекта, включающий:
измерение по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в биологическом образце от указанного субъекта, где указанные по меньшей мере два тромбоцитарных биомаркера выбраны из группы, состоящей из α-актинина 1 (ACTN1), гельсолина (GELS), интегрина альфа-2b (ITGA2B), интегрина бета-3 (ITB3), прохибитина (РНВ), ингибитора рибонуклеазы (RINI), серпина В6 (SPB6), цепи альфа-4А тубулина (ТВА4А), талина-1 (TLN1), цепи бета-1 тубулина (ТВВ1), винкулина (VCL) и белка 1, содержащего WD повторы (WDR1); и
прогнозирование наличия указанной карциномы у указанного субъекта на основании указанного измерения.
14. Способ по п. 13, где прогнозирование указанного наличия указанной карциномы включает прогнозирование наличия карциномы на ранней стадии у указанного субъекта на основании указанного измерения.
15. Способ по п. 13, где прогнозирование указанного наличия указанной карциномы включает прогнозирование наличия эпителиального рака у указанного субъекта на основании указанного измерения.
16. Способ по п. 13, где
измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает измерение соответствующего количества указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в указанном биологическом образце, где указанный способ дополнительно включает:
сравнение указанного соответствующего количества с соответствующим контрольным количеством, представляющим собой количество указанного соответствующего тромбоцитарного биомаркера в биологическом образце от контрольного субъекта, где
прогнозирование наличия указанной карциномы включает прогнозирование наличия указанной карциномы у указанного субъекта на основании указанного сравнения.
17. Способ по любому из пп. 1-16, где измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает:
выделение тромбоцитов из образца крови указанного субъекта;
экстракцию тромбоцитарных белков из указанных выделенных тромбоцитов;
измерение количества указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров с использованием соответствующего антитела, которое специфически связывается с соответствующим тромбоцитарным биомаркером из указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров.
18. Способ по любому из пп. 1-16, где измерение указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров включает:
выделение тромбоцитов из образца крови указанного субъекта;
экстракцию тромбоцитарных белков из указанных выделенных тромбоцитов;
разделение указанных экстрагированных тромбоцитарных белков на геле для двумерного гель-электрофореза;
идентификацию указанных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в указанном геле для двумерного гель-электрофореза; и
измерение количества указанных идентифицированных по меньшей мере двух тромбоцитарных биомаркеров в указанном геле для двумерного гель-электрофореза.
19. Способ выбора схемы лечения рака у субъекта, включающий:
определение того, страдает ли указанный субъект от доброкачественного поражения или от карциномного поражения в соответствии с любым из пп. 1-5, 17, 18; прогнозирование наличия доброкачественного и/или карциномного поражения у указанного субъекта в соответствии с любым из пп. 6-8, 17, 18; прогнозирование наличия колоректального рака или рака поджелудочной железы у указанного субъекта в соответствии с любым из пп. 9-12, 17, 18; или прогнозирование наличия карциномы у указанного субъекта в соответствии с любым из пп. 13-18; и
выбор схемы лечения указанного субъекта на основании того, страдает ли указанный субъект от указанного доброкачественного поражения или от указанного карциномного поражения; на основании указанного прогнозируемого наличия указанного доброкачественного и/или карциномного поражения у указанного субъекта; на основании указанного прогнозируемого наличия указанного колоректального рака или рака поджелудочной железы у указанного субъекта; или на основании указанного прогнозируемого наличия указанной карциномы у указанного субъекта.