АНАЛИЗ СВЯЗЫВАНИЯ С ЛИГАНДОМ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ГИББЕРЕЛЛИНОВ

1. Анализ связывания с лигандом для обнаружения присутствия гиббереллинов в образце, включающий:
- мишень-связывающий элемент, выбранный для связывания с гиббереллинами; и
- мишень-связывающий элемент, ассоциированный с визуальным индикатором, который указывает на присутствие гиббереллинов в образце, когда мишень-связывающий элемент связывается с гиббереллинами;
- в котором мишень-связывающий элемент представляет собой аптамер.
2. Анализ по п. 1, в котором аптамер имеет 62 нуклеотида с последовательностью нуклеиновой кислоты:
5'-NHMCVNNNHDGCTGAGGTATGCNNNHWNDYDDNDNNHHHNHNVVHNNNNNDNNDBNHNNNHD-3' (SEQ ID NO: 12),
- в которой Y представляет собой Т или С;
- в которой М представляет собой А или С;
- в которой W представляет собой А или Т;
- в которой В представляет собой G или С или Т;
- в которой D представляет собой А или G или Т;
- в которой Н представляет собой А или С или Т;
- в которой V представляет собой А или G или С;
- в которой N это А или G или С или Т;
или ее комплементарную цепь, или РНК-эквивалент молекулы или ее комплементарной цепи.
3. Анализ по п. 1, в котором аптамер имеет 62 нуклеотида с последовательностью нуклеиновой кислоты.
5'-TGAGGDVNVNGCTGAGGTATGCMAAYDHMHNVNNNNNHNNNNNNNNNNNNNNNNNNNDHNNN-3' (SEQ ID NO: 13)
- в которой Y представляет собой Т или С;
- в которой М представляет собой А или С;
- в которой D представляет собой А или G или Т;
- в которой Н представляет собой А или С или Т;
- в которой V представляет собой А или G или С;
- в которой N это А или G или С или Т;
или ее комплементарную цепь, или РНК-эквивалент молекулы или ее комплементарной цепи.
4. Анализ по п. 1, в котором аптамер содержит последовательность нуклеиновой кислоты с по меньшей мере 90% гомологичностью по отношению к любой из последовательностей SEQ ID NO: 1-11.
5. Анализ по пп. 1-4, в котором анализ связывания с лигандом представляет собой анализ в боковом или вертикальном потоке, в котором аптамеры связаны с носителем, а индикатор представлен в виде сигнала связывания от насыщения сайтов связывания аптамера на носителе.
6. Анализ по п. 5, в котором анализ представляет собой анализ ингибирования.
7. Анализ по п. 5 или 6, в котором носитель представляет собой наночастицу золота, связанную с аптамером посредством тиолирования.
8. Анализ по п. 7, в котором поверхностный плазмонный резонанс от высоко локализованной концентрации наночастиц золота обеспечивает визуальный индикатор в отсутствие гиббереллинов в образце.
9. Анализ по п. 8, в котором визуальный индикатор воспринимается как видимый красный сигнал при анализе в боковом или вертикальном потоке.
10. Анализ по п. 8, в котором видимый красный сигнал является результатом того, что связанный с аптамером комплекс наночастиц золота насыщает сайты связывания на носителе и, таким образом, предотвращает агрегацию частиц золота.
11. Анализ по пп. 1-4, в котором анализ представляет собой анализ связывания с нерадиоактивным лигандом, включающий аптамеры, которые химически связаны с парой флуорофор/гаситель, при этом визуальный сигнал представлен в виде флуоресценции в присутствии гиббереллинов.
12. Анализ по п. 11, в котором пара флуорофор/гаситель представляет собой нулеиновокислотный краситель и флуоресцентный гибридизационный зонд.
13. Анализ по пп. 1-4, в котором анализ связывания с лигандом включает аптамеры, которые химически связаны с парой акцептор/донор, при этом визуальный сигнал представлен в виде флуоресценции в присутствии гиббереллинов.