КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДЛЯ T-КЛЕТОК С ХИМЕРНЫМ РЕЦЕПТОРОМ АУТОАНТИТЕЛ ПРОТИВ РЕЦЕПТОРА ФОСФОЛИПАЗЫ A2

1. Полинуклеотид, кодирующий химерный рецептор аутоантител (CAAR), где CAAR содержит аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, и, необязательно, трансмембранный домен, внутриклеточный домен костимулирующей молекулы и/или передающий сигналы домен.
2. Полинуклеотид по п.1, где аутоантиген PLA2R или его фрагмент выбран из группы, состоящей из:
(a) внеклеточного домена, содержащего домен лектина типа CysR или рицина B, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа и домен 2 лектина C-типа; и
(b) внеклеточного домена, содержащего домен лектина типа CysR или рицина B, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа, домен 2 лектина C-типа и домен 3 лектина C-типа.
3. Полинуклеотид по п.2, где
внеклеточный домен PLA2R (a) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 8, или
внеклеточный домен PLA2R (b) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 15.
4. Полинуклеотид по п.1, где аутоантиген PLA2R или его фрагмент выбран из группы, состоящей из:
(a) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен,
(b) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II и домен 1 лектина C-типа,
(c) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа, домен 2 лектина C-типа и домен 3 лектина C-типа,
(d) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа, домен 2 лектина C-типа, домен 3 лектина C-типа и домен 7 лектина C-типа,
(e) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа и домен 7 лектина C-типа, и
(f) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен 1 лектина C-типа, и домен 7 лектина C-типа.
5. Полинуклеотид по п.4, где
внеклеточный домен PLA2R (a) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 47 или SEQ ID NO: 60,
внеклеточный домен PLA2R (b) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 50 или SEQ ID NO: 62,
внеклеточный домен PLA2R (c) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 52,
внеклеточный домен PLA2R (d) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 54,
внеклеточный домен PLA2R (e) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 56, или
внеклеточный домен PLA2R (f) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 58.
6. Полинуклеотид по любому из пп. 1-5, где трансмембранный домен содержит трансмембранный домен альфа-цепи CD8.
7. Полинуклеотид по п.6, где трансмембранный домен альфа-цепи CD8 кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 20.
8. Полинуклеотид по п.6, где трансмембранный домен альфа-цепи CD8 содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 19.
9. Полинуклеотид по любому из пп. 1-8, где CAAR дополнительно содержит шарнирный домен.
10. Полинуклеотид по п.9, где шарнирный домен кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 42, или SEQ ID NO: 64.
11. Полинуклеотид по п.9, где шарнирный домен содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: SEQ ID NO: 43 или SEQ ID NO: 44.
12. Полинуклеотид по любому из пп. 1-8, где CAAR дополнительно содержит линкер GS.
13. Полинуклеотид по п.11, где линкер GS кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 68.
14. Полинуклеотид по п.11, где линкер GS содержит SEQ ID NO: 69.
15. Полинуклеотид по любому из пп. 1-14, где внутриклеточный домен костимулирующей молекулы содержит 4-1BB.
16. Полинуклеотид по п.15, где внутриклеточный домен 4-1BB кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 66.
17. Полинуклеотид по п.15, где внутриклеточный домен 4-1BB содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 21.
18. Полинуклеотид по любому из пп. 1-17, где передающий сигналы домен содержит передающий сигналы домен CD3-дзета.
19. Полинуклеотид по п.18, где передающий сигналы домен CD3-дзета кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 24, или SEQ ID NO: 72.
20. Полинуклеотид по п.18, где передающий сигналы домен CD3-дзета содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 23 или SEQ ID NO: 45.
21. Полинуклеотид по любому из пп. 1-20, где CAAR кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11, 17, 25, 27, 29, 31, 33, 35, 37 и 39.
22. Полинуклеотид по любому из пп. 1-20, где CAAR содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12, 18, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38 и 40.
23. Полинуклеотид по любому из пп. 1-5, где CAAR содержит аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, трансмембранный домен иммуноглобулиноподобного рецептора клеток-киллеров (KIR) и цитоплазматический домен KIR.
24. Вектор, содержащий полинуклеотид по любому из пп. 1-23.
25. Вектор по п.24, где вектор представляет собой лентивирусный вектор.
26. Вектор по п.24, где вектор представляет собой РНК-вектор.
27. Химерный рецептор аутоантител (CAAR), содержащий внеклеточный домен, содержащий аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент.
28. Химерный рецептор аутоантител (CAAR), содержащий внеклеточный домен, содержащий аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, и необязательно, трансмембранный домен, внутриклеточный домен костимулирующей молекулы и/или передающий сигналы домен.
29. CAAR по п.27 или 28, где аутоантиген PLA2R или его фрагмент выбран из группы, состоящей из:
(a) внеклеточного домена, содержащего домен типа рицина B лектина, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа и домен 2 лектина C-типа; и,
(b) внеклеточного домена, содержащего домен типа рицина B лектина, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа, домен 2 лектина C-типа и домен 3 лектина C-типа.
30. CAAR по п.29, где
внеклеточный домен PLA2R (a) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 8, или
внеклеточный домен PLA2R (b) кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 15.
31. CAAR по п.27 или 28, где аутоантиген PLA2R или его фрагмент выбран из группы, состоящей из:
(a) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен,
(b) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II, и домен 1 лектина C-типа,
(c) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа, домен 2 лектина C-типа, домен 3 лектина C-типа и домен 7 лектина C-типа,
(d) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа, домен 2 лектина C-типа, домен 3 лектина C-типа и домен 7 лектина C-типа,
(e) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен фибронектина типа II, домен 1 лектина C-типа и домен 7 лектина C-типа, и
(f) внеклеточного домена, содержащего богатый цистеином домен, домен 1 лектина C-типа и домен 7 лектина C-типа.
32. CAAR по п.31, где
внеклеточный домен PLA2R (a) содержит SEQ ID NO: 49 или SEQ ID NO: 61,
внеклеточный домен PLA2R (b) содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 51 или SEQ ID NO: 63,
внеклеточный домен PLA2R (c) содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 53,
внеклеточный домен PLA2R (d) содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 55, или
внеклеточный домен PLA2R (e) содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 57, или
внеклеточный домен PLA2R (f) содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 59.
33. CAAR по любому из пп. 28-32, где трансмембранный домен содержит трансмембранный домен альфа-цепи CD8.
34. CAAR по п.33, где трансмембранный домен альфа-цепи CD8 кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 20.
35. CAAR по п.33, где трансмембранный домен альфа-цепи CD8 содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 19.
36. CAAR по любому из пп. 27-35, где CAAR дополнительно содержит шарнирный домен.
37. CAAR по п.36, где шарнирный домен кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 10, или SEQ ID NO: 42 или SEQ ID NO: 64.
38. CAAR по п.36, где шарнирный домен содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: SEQ ID NO: 43 или SEQ ID NO: 44.
39. CAAR по любому из пп. 27-35, где CAAR дополнительно содержит линкер GS.
40. CAAR по п.39, где линкер GS кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 68.
41. CAAR по п.39, где линкер GS содержит SEQ ID NO: 69.
42. CAAR по любому из пп. 28-41, где внутриклеточный домен костимулирующей молекулы содержит 4-1BB.
43. CAAR по п.42, где внутриклеточный домен 4-1BB кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 66.
44. CAAR по п.42, где внутриклеточный домен 4-1BB содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 21.
45. CAAR по любому из пп. 28-44, где передающий сигналы домен содержит передающий сигналы домен CD3-дзета.
46. CAAR по п.45, где передающий сигналы домен CD3-дзета кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, содержащей SEQ ID NO: 24 или SEQ ID NO: 72.
47. CAAR по п.45, где передающий сигналы домен CD3-дзета содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 23 или SEQ ID NO: 45.
48. CAAR по любому из пп. 28-47, где CAAR кодирован последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11, 17, 25, 27, 29, 31, 33, 35, 37 и 39.
49. CAAR по любому из пп. 28-47, где CAAR содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12, 18, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38 и 40.
50. CAAR по любому из пп. 27-32, где CAAR содержит внеклеточный домен, содержащий аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, трансмембранный домен иммуноглобулиноподобного рецептора клеток-киллеров (KIR) и цитоплазматический домен KIR.
51. Генетически модифицированная клетка, содержащая CAAR по любому из пп. 27-50.
52. Клетка по п.51, экспрессирующая CAAR и имеющая высокую аффинность для BCR на основе аутоантител на B-клетках.
53. Клетка по п.51 или 52, экспрессирующая CAAR и индуцирующая уничтожение B-клеток, экспрессирующих аутоантитела.
54. Клетка по любому из пп. 51-53, экспрессирующая CAAR и имеющая ограниченную токсичность по отношению к здоровым клеткам.
55. Клетка по любому из пп. 51-54, где клетка выбрана из группы, состоящей из T-клетки-помощника, цитотоксической T-клетки, T-клетки памяти, регуляторной T-клетки, гамма-дельта-T-клетки, клетки естественного киллера, индуцированной цитокином клетки естественного киллера, линии клеток из них, стволовой T-клетки памяти, T-клетки, происходящей из плюрипотентной стволовой и другой эффекторной клетки.
56. Генетически модифицированная клетка, содержащая: (a) химерный рецептор аутоантител (CAAR), содержащий внеклеточный домен, содержащий аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, трансмембранный домен иммуноглобулиноподобного рецептора клеток-киллеров (KIR) и цитоплазматический домен KIR; и (b) DAP12.
57. Фармацевтическая композиция, содержащая полинуклеотид по любому из пп. 1-23, CAAR по любому из пп. 27-50 или клетку по любому из пп. 51-56 и фармацевтически приемлемый наполнитель.
58. Способ лечения опосредованного аутоантителами заболевания почки у субъекта, включающий: введение субъекту эффективного количества генетически модифицированной T-клетки, содержащий полинуклеотид, кодирующий химерный рецептор аутоантител (CAAR), где полинуклеотид кодирует аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, и необязательно, трансмембранный домен, внутриклеточный домен костимулирующей молекулы и/или передающий сигналы домен, таким образом, лечение опосредованного аутоантителами заболевания почки у субъекта.
59. Способ предотвращения или уменьшения повреждения клубочков у субъекта, подверженного риску или страдающего от опосредованного аутоантителами заболевания почки, включающий: введение субъекту эффективного количества генетически модифицированной T-клетки, содержащий полинуклеотид, кодирующий химерный рецептор аутоантител (CAAR), где полинуклеотид кодирует аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, и необязательно, трансмембранный домен, внутриклеточный домен костимулирующей молекулы и/или передающий сигналы домен, таким образом, предотвращение или уменьшение повреждения клубочков у субъекта.
60. Способ по любому из пп. 58, 59, где опосредованное аутоантителами заболевание почки выбрано из группы, состоящей из гломерулярной болезни и первичной мембранозной нефропатии.
61. Способ по любому из пп. 58-60, где субъект представляет собой человека.
62. Способ по любому из пп. 58-61, где модифицированная T-клетка нацелена на B-клетки.
63. Способ лечения опосредованного аутоантителами заболевания почки у субъекта, включающий: введение субъекту эффективного количества генетически модифицированной T-клетки, содержащий: (a) полинуклеотид, кодирующий химерный рецептор аутоантител (CAAR), содержащий внеклеточный домен, содержащий аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, трансмембранный домен иммуноглобулиноподобного рецептора клеток-киллеров (KIR) и цитоплазматический домен KIR; и (b) полинуклеотид, кодирующий DAP12, таким образом, лечение опосредованного аутоантителами заболевания почки у субъекта.
64. Способ для предотвращения или уменьшения повреждение клубочков у субъекта, подверженного риску или страдающего от опосредованного аутоантителами заболевания почки, включающий: введение субъекту эффективного количества генетически модифицированной T-клетки, содержащий: (a) полинуклеотид, кодирующий химерный рецептор аутоантител (CAAR), содержащий внеклеточный домен, содержащий аутоантиген рецептор фосфолипазы A2 (PLA2R) или его фрагмент, трансмембранный домен иммуноглобулиноподобного рецептора клеток-киллеров (KIR) и цитоплазматический домен KIR; и (b) полинуклеотид, кодирующий DAP12, таким образом, предотвращение или уменьшение повреждения клубочков у субъекта.
65. Способ по любому из пп. 58-64, где полинуклеотид представляет собой полинуклеотид по любому из пп. 1-23.
66. Способ по любому из пп. 58-65, где генетически модифицированная клетка представляет собой клетку по любому из пп. 52-56.
67. Полинуклеотид по п.23, CAAR по п.50, генетически модифицированная клетка по п.56 или способ по п.63 или 64, где KIR представляет собой KIRS2 или KIR2DS2.
68. Вектор по любому из пп. 24-26, где вектор содержит индуцируемый промотор, функционально связанный с полинуклеотидом, кодирующим CAAR.
69. Клетка по любому из пп. 51-56, где клетка содержит полинуклеотид, кодирующий CAAR, функционально связанный с индуцируемым промотором.