ПЕПТИДЫ UBE2T И СОДЕРЖАЩИЕ ИХ ВАКЦИНЫ

1. Выделенный пептид, обладающий способностью к индукции цитотоксических T-лимфоцитов (CTL), где пептид содержит аминокислотную последовательность (a) или (b), ниже:
(a) аминокислотная последовательность, выбранная из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 2, 4, 6, 11, 12, 13, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 27, 29, 30, 32, 36, 38, 41, 48, 49, 51, 52, 53, 55, 56 и 58;
(b) аминокислотная последовательность, в которой в аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 2, 4, 6, 11, 12, 13, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 27, 29, 30, 32, 36, 38, 41, 48, 49, 51, 52, 53, 55, 56 и 58, заменены, введены, удалены и/или добавлены 1, 2 или более аминокислот.
2. Пептид по п. 1, где пептид представляет собой приведенный ниже олигопептид (i) или (ii):
(i) пептид, обладающий одной или обеими из следующих характеристик:
(a) вторая аминокислота от N-конца аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, 2, 4, 6, 11, 12, 13, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или 27 заменена на фенилаланин, тирозин, метионин или триптофан; и
(b) C-концевая аминокислота аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, 2, 4, 6, 11, 12, 13, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или 27 заменена на фенилаланин, лейцин, изолейцин, триптофан или метионин;
(ii) пептид, обладающий одной или обеими из следующих характеристик:
(a) вторая аминокислота от N-конца аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 29, 30, 32, 36, 38, 41, 48, 49, 51, 52, 53, 55, 56 или 58 заменена на лейцин или метионин; и
(b) C-концевая аминокислота аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 29, 30, 32, 36, 38, 41, 48, 49, 51, 52, 53, 55, 56 или 58 заменена на валин или лейцин.
3. Пептид по п. 1 или 2, где пептид представляет собой нонапептид или декапептид.
4. Пептид по п. 3, где пептид состоит из аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 2, 4, 6, 11, 12, 13, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 27, 29, 30, 32, 36, 38, 41, 48, 49, 51, 52, 53, 55, 56 и 58.
5. Выделенный полинуклеотид, кодирующий пептид по любому из пп. 1-4.
6. Композиция для индукции CTL, где композиция содержит по меньшей мере один активный ингредиент, выбранный из группы, состоящей из:
(a) пептида по любому из пп. 1-4;
(b) полинуклеотида по п. 5;
(c) антигенпрезентирующей клетки (APC), которая презентирует пептид по любому из пп. 1-4 на своей поверхности; и
(d) экзосомы, которая презентирует на своей поверхности пептид по любому из пп. 1-4.
7. Фармацевтическая композиция для лечения и/или профилактики злокачественной опухоли, и/или профилактика ее послеоперационного рецидива, где композиция содержит по меньшей мере один активный ингредиент, выбранный из группы, состоящей из:
(a) пептида по любому из пп. 1-4;
(b) полинуклеотида по п. 5;
(c) APC, которая презентирует пептид по любому из пп. 1-4 на своей поверхности;
(d) экзосомы, которая презентирует на своей поверхности пептид по любому из пп. 1-4; и
(e) CTL, который может распознавать клетку, презентирующую пептид по любому из пп. 1-4.
8. Фармацевтическая композиция по п. 7, где фармацевтическую композицию формулируют для введения индивидууму, антиген HLA которого представляет собой HLA-A24 или HLA-A2.
9. Способ индукции APC со способностью к индукции CTL, где способ включает стадию, выбранную из группы, состоящей из:
(a) приведения APC в контакт с пептидом по любому из пп. 1-4, и
(b) введения полинуклеотида, кодирующего пептид по любому из пп. 1-4, в APC.
10. Способ индукции CTL, где способ включает стадию, выбранную из группы, состоящей из:
(a) совместного культивирования CD8-положительной T-клетки с APC, которая презентирует на своей поверхности комплекс антигена HLA и пептида по любому из пп. 1-4;
(b) совместного культивирования CD8-положительной T-клетки с экзосомой, которая презентирует на своей поверхности комплекс антигена HLA и пептида по любому из пп. 1-4; и
(c) введения в CD8-положительную T-клетку полинуклеотида, кодирующего обе субъединицы T-клеточного рецептора (TCR), или полинуклеотидов, кодирующих каждую из субъединиц TCR, где TCR, сформированный указанными субъединицами, способен связываться с комплексом пептида по любому из пп. 1-4 и антигена HLA на клеточной поверхности.
11. Выделенная APC, которая презентирует на своей поверхности комплекс антигена HLA и пептида по любому из пп. 1-4.
12. APC по п. 11, которую индуцируют способом по п. 9.
13. Выделенный CTL, который нацелен на пептид по любому из пп. 1-4.
14. CTL по п. 13, который индуцируют способом по п. 10.
15. Способ индукции иммунного ответа против злокачественной опухоли у индивидуума, где способ включает стадию введения индивидууму композиции, содержащей пептид по любому из пп. 1-4 или полинуклеотид, кодирующий пептид.
16. Антитело или его иммунологически активный фрагмент против пептида по любому из пп. 1-4.
17. Вектор, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую пептид по любому из пп. 1-4.
18. Клетка-хозяин, трансформированная или трансфицированная вектором по п. 17.
19. Диагностический набор, содержащий пептид по любому из пп. 1-4, полинуклеотид по п. 5 или антитело или иммунологически активный фрагмент по п. 16.
20. Способ скрининга пептида, обладающего способностью к индукции CTL, которые обладают специфической цитотоксической активностью против клеток, которые презентируют фрагмент, получаемый из UBE2T, где способ включает стадии:
(i) предоставления последовательности-кандидата, состоящей из аминокислотной последовательности, модифицированной заменой, удалением, встраиванием и/или добавлением одного, двух или более аминокислотных остатков к исходной аминокислотной последовательности, где исходная аминокислотная последовательность выбрана из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 2, 4, 6, 11, 12, 13, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 27, 29, 30, 32, 36, 38, 41, 48, 49, 51, 52, 53, 55, 56 и 58;
(ii) отбора последовательности-кандидата, которая не обладает по существу значимой гомологией с пептидами, получаемыми из любых известных продуктов генов человека, отличных от UBE2T;
(iii) приведения пептида, состоящего из последовательности-кандидата, отобранной на стадии (ii), в контакт с антигенпрезентирующей клеткой;
(iv) приведения антигенпрезентирующей клетки после стадии (iii) в контакт с CD8-положительной T-клеткой; и
(v) идентификации пептида, способность к индукции CTL которого является такой же, как у пептида, состоящего из исходной аминокислотной последовательности, или более высокой.