КОМПОЗИЦИИ, СПОСОБЫ И НАБОРЫ ДЛЯ ГИБРИДИЗАЦИИ НУКЛЕИНОВОЙ КИСЛОТЫ

1. Полинуклеотид, имеющий первый полинуклеотидный сегмент смежный со вторым полинуклеотидным сегментом, находящимся в прямом направлении к первому, где последовательность первого нуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности первого зондового сегмента зонда для обнаружения нуклеиновой кислоты-мишени, где последовательность второго полинуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности второго зондового сегмента зонда, где второй зондовый сегмент находится в прямом направлении к первому зондовому сегменту.
2. Полинуклеотид по п.1, отличающийся тем, что последовательности первого и второго полинуклеотидных сегментов представляют собой, соответственно, обратные комплементы последовательностей первого и второго зондовых сегментов.
3. Полинуклеотид по п.1, отличающийся тем, что полинуклеотид дополнительно содержит спейсер между первым и вторым полинуклеотидными сегментами.
4. Полинуклеотид по п.1, отличающийся тем, что полинуклеотид имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO:2.
5. Композиция, содержащая:
a) полинуклеотид, имеющий первый полинуклеотидный сегмент смежный со вторым полинуклеотидным сегментом, находящимся в прямом направлении к первому; и
b) зонд нуклеиновой кислоты для обнаружения последовательности-мишени, где зонд содержит первый зондовый сегмент и второй зондовый сегмент в прямом направлении к первому зондовому сегменту;
где последовательность первого нуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности первого зондового сегмента, где последовательность второго полинуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности второго зондового сегмента.
6. Композиция по п.5, отличающаяся тем, что последовательности первого и второго полинуклеотидных сегментов представляют собой, соответственно, обратные комплементы последовательностей первого и второго зондовых сегментов.
7. Композиция по п.5, отличающаяся тем, что полинуклеотид дополнительно содержит спейсер между первым и вторым полинуклеотидными сегментами.
8. Композиция по п.5, отличающаяся тем, что зонд нуклеиновой кислоты дополнительно содержит FRET пару.
9. Композиция по п.5, отличающаяся тем, что FRET пара представляет собой флуорофор и гаситель.
10. Способ определения присутствия нуклеиновой кислоты-мишени в образце, где способ включает:
контактирование образца с зондом в присутствии полинуклеотида, где полинуклеотид имеет первый полинуклеотидный сегмент смежный со вторым полинуклеотидным сегментом, находящимся в прямом направлении к первому, где зонд представляет собой зонд нуклеиновой кислоты для обнаружения нуклеиновой кислоты-мишени, где зонд содержит первый зондовый сегмент и второй зондовый сегмент в прямом направлении к первому зондовому сегменту, где последовательность первого нуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности первого зондового сегмента, где последовательность второго полинуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности второго зондового сегмента.
11. Способ по п.10, отличающийся тем, что зонд дополнительно содержит FRET пару.
12. Способ по п.11, отличающийся тем, что FRET пара представляет собой флуорофор и гаситель.
13. Способ по п.12, отличающийся тем, что флуорофор имеет флуоресцентный сигнал на первом уровне, когда полинуклеотид является гибридизованным с зондом, причем флуоресцентный сигнал является большим, чем первый уровень, когда в образце присутствует нуклеиновая кислота-мишень.
14. Способ по п.10, отличающийся тем, что дополнительно включает определение изменения в флуоресцентном сигнале зонда при температуре обнаружения.
15. Набор, включающий полинуклеотид, имеющий первый полинуклеотидный сегмент смежный со вторым полинуклеотидным сегментом, находящимся в прямом направлении к первому, где последовательность первого нуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности первого зондового сегмента зонда для обнаружения нуклеиновой кислоты-мишени, где последовательность второго полинуклеотидного сегмента является комплементарной к последовательности второго зондового сегмента зонда, где второй зондовый сегмент находится в прямом направлении к первому зондовому сегменту.
16. Набор по п.15, отличающийся тем, что дополнительно включает зонд.
17. Набор по п.15, отличающийся тем, что последовательности первого и второго полинуклеотидных сегментов представляют собой, соответственно, обратные комплементы последовательностей первого и второго зондовых сегментов.
18. Набор по п.15, отличающийся тем, что полинуклеотид имеет последовательность, как представлено в SEQ ID NO:2.