ОПРЕДЕЛЕНИЕ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ КЛЕТОК К ОБРАБОТКЕ ИНГИБИТОРОМ B-Raf ПУТЕМ ДЕТЕКЦИИ МУТАЦИИ K-ras И УРОВНЕЙ ЭКСПРЕССИИ RTK

1. Способ идентификации пациента, не отвечающего на лечение ингибитором B-Raf, включающий определение наличия или отсутствия мутации K-ras, причем наличие мутации K-ras указывает на то, что пациент не ответит на лечение указанным ингибитором B-Raf.
2. Способ определения, ответит ли опухоль на лечение ингибитором B-Raf, включающий определение в образце указанной опухоли наличия мутантного белка или гена K-ras, причем наличие мутантного белка или гена K-ras указывает на то, что опухоль не ответит на лечение ингибитором B-Raf.
3. Способ по п.1, где указанная мутация K-ras представляет собой активирующую мутацию.
4. Способ по п.1, где указанная мутация K-ras представляет собой по меньшей мере одну из G12C, G12A, G12D, G12R, G12S, G12V, G13C и G13D.
5. Способ по п.1, где указанный ингибитор B-Raf представляет собой специфический ингибитор B-Raf-киназы.
6. Способ по п.1, где наличие мутации K-ras определяют путем амплификации нуклеиновой кислоты K-ras из указанной опухоли или ее фрагмента, предположительно содержащего мутацию, и секвенирования указанной амплифицированной нуклеиновой кислоты.
7. Способ по п.1, где наличие мутации K-ras определяют путем амплификации нуклеиновой кислоты K-RAS из указанной опухоли или ее фрагмента, предположительно содержащего мутацию, и сравнения электрофоретической подвижности амплифицированной нуклеиновой кислоты с электрофоретической подвижностью соответствующей нуклеиновой кислоты или фрагмента K-ras дикого типа.
8. Способ прогнозирования, ответит ли пациент на лечение специфическим ингибитором B-Raf, включающий определение наличия или отсутствия мутации K-ras в опухоли пациента, где мутация K-ras находится в кодоне 12 или кодоне 13; и где при наличии мутации K-ras прогнозируется, что пациент не ответит на лечение специфическим ингибитором B-Raf.
9. Способ по п.1, где определение наличия или отсутствия мутации K-ras в опухоли содержит амплификацию нуклеиновой кислоты K-ras из опухоли и секвенирование амплифицированной нуклеиновой кислоты.
10. Способ по п.1, где определение наличия или отсутствия мутации K-ras в опухоли содержит определение в образце опухоли мутантного полипептида K-ras, используя агент для специфического связывания с мутантным полипептидом K-ras.
11. Способ по п.1, где мутацию K-ras выбирают из G12S, G12V, G12D, G12A, G12C, G13A и G13D.
12. Набор, используемый для способа по п.1, содержащий специфический материал для детекции мутантного гена или белка K-ras и специфический материал для детекции мутантного гена или белка B-Raf.
13. Набор по п.12, дополнительно содержащий инструкции для применения в идентификации пациента, не отвечающего на лечение ингибитором B-Raf.
14. Набор по п.13, где указанный пациент страдает раком легких или колоректальным раком.
15. Способ классификации опухоли молочных желез, легких, толстого кишечника, яичников, щитовидной железы, меланомы или опухоли поджелудочной железы, включающий стадии: получения образца опухоли; определения в образце экспрессии или активности (i) гена, кодирующего мутанта B-Raf V600E, и (ii) гена, кодирующего мутанта k-Ras.
16. Способ по п.15, дополнительно включающий классификацию опухоли как относящейся к подклассу опухолей исходя из результатов стадии детекции; и подбор лечения исходя из стадии классификации, где при сверхэкспрессии в образце указанной опухоли указанного мутанта k-Ras указанное лечение отличается от лечения специфическим ингибитором B-Raf V600E.
17. Способ идентификации опухоли, не отвечающей на лечение ингибитором B-Raf, включающий определение уровня экспрессии рецепторной тирозинкиназы (RTK), причем аберрантная экспрессия или индукция указанной RTK указывает на то, что указанный пациент не ответит на лечение указанным ингибитором B-Raf, и где указанная опухоль экспрессирует B-Raf V600E.
18. Способ по п.17, где указанная RTK представляет собой EGFR или сМЕТ.
19. Способ по п.18, дополнительно включающий лечение указанной опухоли путем введения эффективного количества ингибитора указанного EGFR или сМЕТ в комбинации с ингибитором B-Raf.
20. Способ по п.19, где указанный ингибитор EGFR представляет собой эрлотиниб.
21. Способ по п.20, где указанную комбинацию вводят в синергетическом количестве.
22. Способ по п.17, где указанный тип опухоли представляет собой рак толстого кишечника или меланому.