СПОСОБ И СИСТЕМА ДЛЯ НЕРАЗРУШАЮЩЕГО IN OVO ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛА ПТИЦЫ

1. Способ неразрушающей идентификации характеристики эмбриона Gallus gallus domesticus in ovo, включающий:
(a) получение образца материала, ассоциированного с яйцом, содержащим эмбрион, и
(b) измерение значения оценки на наличие и концентрацию по меньшей мере первого биомаркера в образце, указывающего на характеристику эмбриона, и
(c) применение порога к значению оценки и концентрации, полученным на стадии (b), для идентификации характеристики для эмбриона, ассоциированной с наличием и концентрацией биомаркера, при этом по меньшей мере первый биомаркер содержит аминосоединение, имеющее молекулярную массу в диапазоне от 150 до 170 г/моль; при этом стадия (с) дополнительно включает:
(iv) корреляцию каждого соответствующего сигнала биомаркера с эталонным биомаркером путем сопоставления спектра каждого корреляционного сигнала с ожидаемым спектром корреляционного эталонного биомаркера с использованием меры подобия для определения по меньшей мере одного положительно корреляционного сигнала;
(v) измерение интенсивности каждого положительно корреляционного сигнала и оценки его абсолютной и/или относительной интенсивности сигнала; и
(vi) применение порога к значению оценки, полученной из функции подобия, для определения коррелированной характеристики эмбриона.
2. Способ по п. 1, в котором наличие и концентрация биомаркера коррелируют с вероятностью развития эмбриона во взрослую особь мужского пола или во взрослую особь женского пола, и/или в котором выбранная характеристика представляет собой вероятную жизнеспособность или нежизнеспособность эмбриона для достижения полного роста до вылупления; и/или в котором выбранная характеристика прогноз вероятной стадии развития и времени, необходимого для развития эмбриона до вылупления в условиях инкубации.
3. Способ по любому из пп. 1 или 2, в котором биомаркер выбирают из аминокислот 2-амино-4-этилсульфанилбутановой кислоты или ее структурных изомеров, в том числе без ограничения из 4-(метилсульфанил)изовалина (также известного как 2-амино-2-метил-4-(метилсульфанил)бутановая кислота), N- или изопропилцистеина, 3-(метил-сульфанил)валина, 4-(метилсульфанил)валина, 3-метил-3-сульфанил-изовалина, 4-(метилсульфанил)изовалина, 2-амино-3-метил-4-метилсульфанил-масляной кислоты, 5-(метилсульфанил)норвалина, 2-амино-3-метил-3-сульфанилпентановой кислоты, метил-3-сульфанил-валината, метилсульфония метионина, N-метил-D-метионина; 5-амино-6-сульфанилгексановой кислоты или подобного; из сложных эфиров аминокислот, таких как метил-2-амино-4-метилсульфанил)бутаноат (также известный как метилметионинат) или его структурных изомеров, таких как этилметил-цистеинат, изопропил-цистеинат, N-пропилцистеинат или родственные соединения, такие как 2-[(2-гидроксиэтил)сульфанил]-N-метилпропанамид; из этилгомоцистеината, 2-изопропил-1,2-тиазолидин-1,1-диоксида, 1-амино-2,2-диэтоксиэтан-1-тиона, 3-[(2-гидроксиэтил)сульфанил]-N-метилпропанамида, пропил-2-амино-3-сульфанилпропаноата, 2-(метиламино)-4-(метилсульфанил)бутановой кислоты, 2-[(2-аминоэтил)сульфанил]-2-метилпропановой кислоты, 3-[(2-аминоэтил)сульфанил]-2-метилпропановой кислоты, 3-[(2-аминоэтил)сульфанил]бутановой кислоты, 4-[(2-аминоэтил)сульфанил]бутановой кислоты, 2-амино-3-(пропилсульфанил)пропановой кислоты, 2-амино-3-(пропан-2-илсульфанил)пропановой кислоты и 3-[(2-аминоэтил)сульфанил]бутановой кислоты, в рацемической или энантиомерно или стереоизомерно обогащенной форме в подходящих отношениях и количествах; предпочтительно в котором биомаркером является 3-[(2-аминоэтил)сульфанил]бутановая кислота.
4. Способ по п. 3, в котором концентрация 3-[(2-аминоэтил)сульфанил]бутановой кислоты, составляющая 50 нг/мл или больше, в аллантоисной жидкости в дни 7, 8 или 9 коррелирует с эмбрионом женского пола, тогда как наличие биомаркера, присутствующего при менее чем 50 нг/мл, коррелирует с эмбрионом мужского пола.
5. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором по меньшей мере выявляют и анализируют первый и второй биомаркер, и в котором абсолютные и относительные количества по меньшей мере первого и второго маркеров используют для определения одной или нескольких характеристик.
6. Способ по любому из предыдущих пунктов, включающий применение одного или нескольких из способа магнитно-резонансной визуализации; метода спектрального резонанса; аналитического хроматографического метода в совокупности с одним или несколькими подходящими детекторами; флуоресцентной спектроскопии и/или способов анализа, включающих селективные в отношении биомаркера реагенты, для измерения наличия и концентрации одного или нескольких биомаркеров, предпочтительно в котором масс-спектрометрический анализ включает масс-спектрометрию с электрораспылительной ионизацией (ESI), времяпролетную масс-спектрометрию с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы (MALDI-TOF) или времяпролетную масс-спектрометрию или поверхностную лазерную десорбционную ионизацию (SELDI-TOF), SPE/MS/MS, источник ионов LDTD (абсорбционную спектроскопию на основе настраиваемого диодного лазера) и/или применение датчика подвижности ионов (IMS).
7. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором тестируемый образец обрабатывают перед анализом, предпочтительно в котором обработка образца включает отделение образца с помощью твердофазной экстракции (SPE), газовой хроматографии, одно- или многофазной жидкостной хроматографии высокого давления (HPLC).
8. Способ по любому из пп. 6 или 7, в котором добавляют один или несколько внутренних стандартов эталонных биомаркеров к образцу перед анализом с помощью масс-спектрометрии.
9. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором абсолютную интенсивность сигнала оценивают путем измерения интенсивности сигнала биомаркера и сравнения ее с интенсивностью сигнала одного или нескольких известных внутренних стандартов.
10. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором множество яиц исследуют на предмет одной или нескольких эмбриональных характеристик; и предпочтительно дополнительно включающий определение, является ли эмбрион в яйце жизнеспособным и мужского пола, или жизнеспособным и женского пола, или нежизнеспособным, и отделение множества жизнеспособных яиц мужского пола от множества жизнеспособных яиц женского пола, и одного или более нежизнеспособных яиц.
11. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором способ является полностью автоматизированным.
12. Способ по п. 11, дополнительно включающий сортировку жизнеспособных яиц в соответствии с предполагаемым временем до вероятного вылупления эмбриона.
13. Способ селективной инкубации птенцов видов яйцекладущих со специфической характеристикой, включающий:
a. обеспечение множества яиц от видов, и
b. подвергание яиц способу по пп. 1-12 для определения характеристики эмбриона, и
c. отбор яиц с желаемой характеристикой с формированием отобранного множества яиц, и
d. инкубацию отобранных яиц до вылупления одного или нескольких птенцов.
14. Система выявления и анализа пола эмбрионов видов яйцекладущих, содержащая:
(a) систему забора образцов для получения образцов из отдельных яиц;
(b) аналитическую систему для сбора одного или нескольких спектров, касающихся каждого образца;
(c) средство идентификации пола, стадии развития и/или жизнеспособности, программным образом идентифицирующее сигналы, ассоциированные с одним или несколькими биомаркерами, из одного или нескольких образов, анализируемых с помощью аналитической системы, при этом средство дополнительно выполняет анализ, сравнивая сигналы с сохраненной библиотекой данных зарегистрированных контрольных спектров образца и/или с внутренним стандартом, для идентификации эмбриональной характеристики; и
(d) средство вывода, связывающее информацию одной или нескольких эмбриональных характеристик с образцом и/или анализируемым яйцом.
15. Система по п. 14, в которой средство идентификации реализуется в программном обеспечении на электронном устройстве, сопряженном с аналитической системой.
16. Применение множества яиц, получаемого способом по любому из пп. 1-12, для получения продуктов питания для животного и/или человека, для получения и/или выделения косметических, лекарственных и/или питательных соединений, для получения метана посредством ферментации и/или для получения высококачественных удобрений.
17. Способ идентификации характеристики эмбриона видов яйцекладущих in ovo, включающий:
(a) подвергание образца материала, ассоциированного с яйцом, содержащим эмбрион, масс-спектрометрическому анализу и регистрацию индекса времени удерживания и соответствующей массы, а также массы для каждого выявляемого сигнала;
(b) корреляцию массы, соответствующей каждому сигналу, с эталонной базой данных биомаркерных масс, специфических для видов, с получением корреляции между одним или несколькими сигналами и одним или несколькими эталонными биомаркерами;
(c) подтверждение корреляции между каждым корреляционным сигналом и эталонным биомаркером путем сопоставления масс-спектра каждого корреляционного сигнала с масс-спектром корреляционного эталонного биомаркера с использованием меры подобия для определения по меньшей мере одного положительно корреляционного сигнала;
(d) измерение интенсивности каждого положительно корреляционного сигнала и оценивание его абсолютной или относительной интенсивности сигнала; и
(e) применение порога к значению оценки, полученному из функции распознавания, с определением характеристики для эмбриона, ассоциированной с наличием и концентрацией коррелируемого биомаркера; причем по меньшей мере первый биомаркер содержит аминосоединение, имеющее молекулярную массу в диапазоне от 150 до 170 г/моль.