КОНЪЮГАТЫ АНТИ-HER2 БИПАРАТОПНЫХ АНТИТЕЛ-ЛЕКАРСТВЕННЫХ ВЕЩЕСТВ И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ

1. Конъюгат антитело-лекарственное средство, содержащий анти-HER2 бипаратопное антитело, конъюгированное с аналогом ауристатина посредством линкера (L), с низким значением среднего отношения лекарственного средства к антителу (DAR -англ.: drug-to-antibody ratio),
причем анти-HER2 бипаратопное антитело содержит первую антигенсвязывающую полипептидную конструкцию, которая связывает первый эпитоп HER2, и вторую антигенсвязывающую полипептидную конструкцию, которая связывает второй эпитоп HER2, при этом первый и второй эпитопы HER2 являются различными эпитопами, и
причем низкое значение среднего DAR представляет собой среднее DAR меньше 3,9.
2. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 1, в котором аналог ауристатина-линкер имеет общую формулу (II):
(II)
где
2
2
X представляет собой -C(O)NHCH(CHR)-, или X отсутствует;
1
R выбран из:
и ;
L представляет собой линкер, и
представляет точку присоединения аналога ауристатина-линкера к анти-HER2 бипаратопному антителу.
1
3. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 2, в котором R представляет собой:
или .
4. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 2, в котором отсутствует X.
1
5. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 4, в котором R представляет собой:
.
2
2
6. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 2, в котором X представляет собой -C(O)NHCH(CHR)-.
1
7. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 6, в котором R представляет собой:
.
8. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-7, в котором среднее DAR составляет от 0,5 до 3,5.
9. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-7, в котором среднее DAR составляет от 0,5 до 2,5.
10. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-9, причем конъюгат содержит 5% или больше типов DAR0.
11. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-9, причем конъюгат содержит 15% или больше типов DAR0.
12. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-9, причем конъюгат содержит от около 5% до около 50% типов DAR0.
13. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-9, причем конъюгат содержит от около 10% до около 30% типов DAR0.
14. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-9, причем конъюгат содержит от около 10% до около 25% типов DAR0.
15. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-9, причем конъюгат содержит от около 15% до около 25% типов DAR0.
16. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-15, причем конъюгат содержит 25% или меньше DAR6 или более крупных типов.
17. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-15, причем конъюгат содержит 15% или меньше DAR6 или более крупных типов.
18. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-15, причем конъюгат содержит от 0% до около 15% DAR6 или более крупных типов.
19. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-15, причем конъюгат содержит от около 0% и до около 10% DAR6 или более крупных типов.
20. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-19, в котором L представляет собой расщепляемый линкер.
21. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 20, в котором L представляет собой протеазорасщепляемый линкер.
22. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-21, в котором L имеет общую формулу (VI):
(VI)
где
Z представляет собой функциональную группу, способную взаимодействовать с целевой группой на анти-HER2 бипаратопном антителе;
Str представляет собой удлиняющую вставку;
1
2
1
2
m
AA и AA каждый независимо представляет собой аминокислоту, причем AA-[AA] образует сайт расщепления протеазой;
X представляет собой саморасщепляющуюся группу;
D представляет собой точку присоединения к аналогу ауристатина;
s равно 0 или 1;
m представляет собой целое число от 1 до 4, и
o равно 0, 1 или 2.
23. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-21, в котором L имеет общую формулу (VIII):
(VIII)
где
A-S-представляет собой точку присоединения к анти-HER2 бипаратопному антителу.
Y представляет собой один или более дополнительных линкерных компонентов, или отсутствует, и
D представляет собой точку присоединения к аналогу ауристатина.
24. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-21, в котором L имеет общую формулу (IX):
(IX)
где
A-S-представляет собой точку присоединения к анти-HER2 бипаратопному антителу.
Y представляет собой один или более дополнительных линкерных компонентов, или отсутствует, и
D представляет собой точку присоединения к аналогу ауристатина.
25. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 1, в котором аналог ауристатина-линкер имеет структуру:
,
где A-S-представляет собой точку присоединения к анти-HER2 бипаратопному антителу.
26. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 25, в котором среднее DAR составляет от 0,5 до 2,5.
27. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 25 или 26, причем конъюгат содержит 5% или больше типов DAR0.
28. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 25 или 26, причем конъюгат содержит от около 5% до около 50% типов DAR0.
29. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 25 или 26, причем конъюгат содержит 25% или меньше DAR6 или более крупных типов.
30. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 25 или 26, причем конъюгат содержит от 0% до около 15% DAR6 или более крупных типов.
31. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-30, в котором анти-HER2 бипаратопное антитело связывается с HER2 с более высокой аффинностью по сравнению с соответствующим бивалентным моноспецифическим антителом.
32. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-31, в котором анти-HER2 бипаратопное антитело показывает более высокую интернализацию в HER2-экспрессирующие клетки по сравнению с соответствующим бивалентным моноспецифическим антителом.
33. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-32, в котором первая и вторая антигенсвязывающие полипептидные конструкции представляют собой независимо scFv, Fab, Fab’ или sdAb.
34. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 33, в котором первая и вторая антигенсвязывающие полипептидные конструкции представляют собой независимо scFv или Fab.
35. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 34, в котором первая антигенсвязывающая полипептидная конструкция представляет собой scFv, и вторая антигенсвязывающая полипептидная конструкция представляет собой Fab.
36. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-35, в котором первый и второй эпитопы HER2 представляют собой неперекрывающиеся эпитопы.
37. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-36, в котором первый и второй эпитопы HER2 находятся на различных доменах HER2.
38. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 37, в котором первый эпитоп HER2 находится на ECD4 HER2, и второй эпитоп HER2 находится на ECD2 HER2.
39. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38, в котором первая антигенсвязывающая полипептидная конструкция конкурирует с трастузумабом за связывание с HER2.
40. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-39, в котором вторая антигенсвязывающая полипептидная конструкция конкурирует с пертузумабом за связывание с HER2.
41. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38, в котором первая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит последовательности CDR из ECD4-связывающего плеча из любого из v5019, v5020, v7091, v10000, v6902, v6903 или v6717.
42. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38 и 41, в котором вторая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит последовательности CDR из ECD2-связывающего плеча из любого из v5019, v5020, v7091, v10000, v6902, v6903, v6717, v7133, v15079, v15080, v15081, v15082, v15083, v15084 или v15085.
43. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38 и 41, в котором вторая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит последовательности CDR из ECD2-связывающего плеча v10000.
44. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38, в котором первая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит последовательности CDR из ECD4-связывающего плеча v10000, и вторая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит последовательности CDR из ECD2-связывающего плеча v10000.
45. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38, в котором первая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит набор из шести CDR, которые имеют 90% или более высокую идентичность последовательностей с набором CDR из ECD4-связывающего плеча v10000, причем данная антигенсвязывающая полипептидная конструкция сохраняет способность к связыванию ECD4.
46. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38 и 45, в котором вторая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит набор из шести CDR, которые имеют 90% или более высокую идентичность последовательностей с набором CDR из ECD2-связывающего плеча v10000, причем данная антигенсвязывающая полипептидная конструкция сохраняет способность к связыванию ECD2.
47. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-38, в котором первая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит набор последовательностей CDR, изложенных в SEQ ID NO: 27, 28, 29, 39, 40 и 41, и вторая антигенсвязывающая полипептидная конструкция содержит набор последовательностей CDR, изложенный в SEQ ID NO: 67, 68, 69, 70, 71 и 72.
48. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-47, в котором анти-HER2 бипаратопное антитело дополнительно содержит каркас, и в котором первая и вторая антигенсвязывающие полипептидные конструкции функционально связаны с данным каркасом.
49. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 48, в котором каркас представляет собой Fc-область IgG.
50. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 49, в котором Fc-область IgG представляет собой гетеродимерную Fc-область, содержащую модифицированный домен CH3.
51. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 49, в котором Fc-область IgG представляет собой гетеродимерную Fc-область, содержащую модифицированный домен CH3, имеющий первую полипептидную последовательность, которая содержит аминокислотные модификации в положениях F405 и Y407, и необязательно дополнительно содержит аминокислотную модификацию в положении L351, а вторая полипептидная последовательность содержит аминокислотные модификации в положениях T366 и T394, и необязательно дополнительно содержит аминокислотную модификацию в положении K392, причем аминокислотная модификация в положении F405 представляет собой F405A, F405S, F405T или F405V; аминокислотная модификация в положении Y407 представляет собой Y407I или Y407V; аминокислотная модификация в положении T366 представляет собой T366I, T366L или T366M; аминокислотная модификация в положении T394 представляет собой T394W; аминокислотная модификация в положении L351 представляет собой L351Y и аминокислотная модификация в положении K392 представляет собой K392F, K392L или K392M.
52. Конъюгат антитело-лекарственное средство по п. 51, в котором:
(a) первая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации L351Y, F405A и Y407V, и вторая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T366L, K392M и T394W; или
(b) первая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации L351Y, F405A и Y407V, и вторая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T366L, K392L и T394W; или
(c) первая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T350V, L351Y, F405A и Y407V, и вторая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T350V, T366L, K392M и T394W; или
(d) первая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T350V, L351Y, F405A и Y407V, и вторая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T350V, T366L, K392L и T394W; или
(e) первая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T350V, L351Y, S400E, F405A и Y407V, и вторая полипептидная последовательность модифицированного домена CH3 содержит аминокислотные модификации T350V, T366L, N390R, K392M и T394W.
53. Фармацевтическая композиция, содержащая конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-52 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
54. Способ подавления роста HER2-экспрессирующей раковой клетки, включающий приведение в контакт раковой клетки с эффективным количеством конъюгата антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-52.
55. Способ лечения HER2-экспрессирующего ракового заболевания, включающий введение субъекту с HER2-экспрессирующим раковым заболеванием эффективного количества конъюгата антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-52.
56. Способ по п. 55, в котором HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак молочной железы, рак яичника, рак легкого или рак желудка.
57. Способ по п. 55, в котором HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак молочной железы.
58. Способ по п. 55, в котором HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак яичника.
59. Способ по любому из пп. 55-58, в котором HER2-экспрессирующее раковое заболевание оценивается как HER2 отрицательное методом иммуногистохимии.
60. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-52 для применения в терапии.
61. Конъюгат антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-52 для применения при лечении HER2-экспрессирующего ракового заболевания у нуждающегося в этом субъекта.
62. Конъюгат антитело-лекарственное средство для применения по п. 61, причем HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак молочной железы, рак яичника, рак легкого или рак желудка.
63. Конъюгат антитело-лекарственное средство для применения по п. 61, причем HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак молочной железы.
64. Конъюгат антитело-лекарственное средство для применения по п. 61, причем HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак яичника.
65. Конъюгат антитело-лекарственное средство для применения по любому из пп. 61-64, причем HER2-экспрессирующее раковое заболевание оценивается как HER2 отрицательное методом иммуногистохимии.
66. Применение конъюгата антитело-лекарственное средство по любому из пп. 1-52 в производстве лекарственного средства для лечения HER2-экспрессирующего ракового заболевания.
67. Применение по п. 66, в котором HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак молочной железы, рак яичника, рак легкого или рак желудка.
68. Применение по п. 66, в котором HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак молочной железы.
69. Применение по п. 66, в котором HER2-экспрессирующее раковое заболевание представляет собой рак яичника.
70. Применение по любому из пп. 66-69, в котором HER2-экспрессирующее раковое оценивается как HER2 отрицательное методом иммуногистохимии.
71. Композиция конъюгата антитело-лекарственное средство, содержащая анти-HER2 бипаратопное антитело, конъюгированное с аналогом ауристатина посредством линкера (L), при этом аналог ауристатина-линкер имеет общую формулу (II):
(II)
где
X отсутствует;
1
R выбран из:
и ;
L представляет собой линкер, и
представляет точку присоединения аналога ауристатина-линкера к анти-HER2 бипаратопному антителу;
причем анти-HER2 бипаратопное антитело содержит первую антигенсвязывающую полипептидную конструкцию, которая связывает первый эпитоп HER2 на ECD4 HER2, и вторую антигенсвязывающую полипептидную конструкцию, которая связывает второй эпитоп HER2 на ECD2 HER2, и
при этом композиция конъюгата антитело-лекарственное средство имеет среднее DAR от 0,5 до 2,5 и содержит от около 10% до около 30% типов DAR0 и от 0% до около 15% DAR6 или более крупных типов.