ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ СПОСОБЫ ПРИ ВЫБОРЕ ПЕРСОНИФИЦИРОВАННОГО СПОСОБА ЛЕЧЕНИЯ РАКА

1. Трехмерный (3D) агрегат культуры ткани из клеток, полученных из пробы опухолевой ткани, где ≤30% от общего числа клеток представляют собой клетки, способные препятствовать повторной агрегации; при этом указанный агрегат не содержит искусственный каркас.
2. 3D агрегат культуры ткани по п. 1, отличающийся тем, что клетки, способные препятствовать повторной агрегации, представляют собой лимфоидные клетки.
3. 3D агрегат культуры ткани по п. 1 или 2, отличающийся тем, что клетки, способные препятствовать повторной агрегации, представляют собой CD45+.
4. Способ получения 3D агрегата культуры ткани, включающий:
(a) получение адаптированной популяции клеток из пробы опухолевой ткани путем уменьшения количества клеток, способных препятствовать повторной агрегации, до ≤30% от общего числа клеток; и
(b) получение суспензионной культуры, содержащей клетки указанной адаптированной клеточной популяции, культуральную среду и, необязательно, фибробласты; при отсутствии искусственного каркаса.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что количество фибробластов в исходной суспензионной культуре составляет 5-50% от общего количества клеток.
4
6
6. Способ по п. 4 или 5, отличающийся тем, что количество клеток из адаптированной клеточной популяции в исходной суспензионной культуре составляет от 2×10 до 8×10.
7. Способ по любому из пп. 4-6, отличающийся тем, что количество клеток, способных препятствовать повторной агрегации, уменьшают с помощью иммунологического способа разделения частиц или способа разделения путем сортировки клеток.
8. Способ по любому из пп. 4-7, отличающийся тем, что внеклеточный матрикс в трехмерных (3D) агрегатах культуры опухолевой ткани продуцируют только сами клетки.
9. Способ по любому из пп. 4-8, отличающийся тем, что клетки, способные препятствовать повторной агрегации, представляют собой лимфоидные клетки.
10. Способ по любому из пп. 4-9, отличающийся тем, что клетки, способные препятствовать повторной агрегации, представляют собой CD45+.
11. Применение 3D агрегатов культуры ткани по любому из пп. 1-3 или полученных способом по любому из пп. 4-10 для оценки эффективности противоопухолевого лечения.
12. Способ оценки эффективности противоопухолевого лечения путем измерения влияния указанного лечения на жизнеспособность трехмерных (3D) агрегатов культуры опухолевой ткани.
13. Способ по п. 12, отличающийся тем, что указанные 3D агрегаты культуры опухолевой ткани представляют собой 3D агрегаты культуры ткани по любому из пп. 1-3 или получены способом по любому из пп. 4-9.
14. Способ по п. 12 или 13, отличающийся тем, что жизнеспособность 3D агрегатов культуры опухолевой ткани измеряют с использованием анализа жизнеспособности клеток.
15. Способ по любому из пп. 12-14, дополнительно включающий определение клеточного состава 3D агрегатов культуры опухолевой ткани с помощью анализа маркеров клеточной поверхности с использованием проточной цитометрии.
16. Способ по любому из пп. 12-15, дополнительно включающий оценку чувствительности остаточных раковых стволовых клеток к лекарственному средству после обработки первым противоопухолевым средством путем
(i) выделения опухолевых стволовых клеток с использованием комбинаций маркеров клеточной поверхности;
(ii) повторной агрегации выделенных опухолевых стволовых клеток в 3D-ткань; а также
(iii) приведения агрегированных опухолевых стволовых клеток в контакт со вторым противоопухолевым средством, при этом указанное первое противоопухолевое средство и указанное второе противоопухолевое средство отличаются друг от друга.