Какой способ лучше всего выбрать для того, чтобы закрыть ту или иную группу?

 

Лучше всего выбрать «официальный» способ, так как при помощи него действительно можно избежать различных проблем с администрации страницы.

По каким причинам администрация вк запрещает пользователям удалять сообщества?

 

Известно это только самой администрации. Никто не может догадаться, почему бы просто не добавить кнопку «Удалить» в настройки группы. 

Где лучше удалять: на телефоне или при помощи компьютера?

 

На компьютере можно быстрее подчистить информацию о группе, нежели при помощи телефона. Если нет возможности с ПК, то можно воспользоваться простым телефоном. Тоже отличный вариант.