Если сгенерировать на компьютере случайным образом последовательность ДНК, то чем она будет отличаться от реальных отсеквенированных последовательностей?

Дело в том, что аденозин/гуанозин, тимидин и цитидин (мы ведь говорим про нуклеотиды, а не про азотистые основания) – это химические соединения, свойства которых различаются и определяются их структурой и ДНК в организме выполняет там определённые функции. Эти функции часто привязаны к определенным элементам, которые имеют характерную структуру, соответственно отличаться такая ДНК от случайной будет "всем".  

Если подойти к вопросу формально и сделать вид, что про функции ДНК нам ничего неизвестно, то и в этом случае отличий будет немало, а именно:  

1. GC состав.  

2. Частота k-меров.  

3. Повторы.  

4. Частотными характеристики   

Кстати, часто изпользуют сгенерированные случайные последовательности, чтобы проверять и доказывать различные гипотезы в процессе работы.