В чем может быть причина неработоспособности Bluetooth при установленном втором диске в ноутбуке?
===================================================================================================

 Заменил родной 2,4 ГГц WiFi модуль в ноутбуке Lenovo Z70-80 новым с поддержкой помимо 2,4 также и 5ГГц диапазона. Новый модуль входит в список разрешенных в BIOS, поэтому заработал, но cо странным глюком - если вместе с SATA SSD в ноутбуке установлен также SATA HDD, то Windows в диспетчере устройств отображает 45-й код на Bluetooth и что устройство не подключено. Стоит включить ноутбук без HDD, как значок Bluetooth тут же начинает работать. Со старым таких проблем нет. Жесткий диск установлен через переходник вместо родного CD-DVD привода, а SSD соответственно установлен на его старое место HDD. Могу указать модели старого и нового WiFi модулей, если нужно.   
  

Проблема программная или аппаратная, может кто сталкивался с такой и знает как ее обойти? 

 Сразу говорю, проблема очень нетипичная, из разряда "-доктор, а почему у меня за левым ухом чешется, если намазать пятку солидолом". Я бы за такое взялся только вживую.  

Могу разве подсказать, что в этой ленове модуль сидит в разъеме M.2 . Wlan - по pci-e, а BT - по USB (обе шины в одном гнезде).  
  

Если копать а направлении питания - то можно запустить с одним SSD и вланом, без винта (БТ работать должен), и потом на горячую "задвинуть" корзину с жестким диском. И смотреть поведение БТ  

А по интерфейсам - каких-либо коллизий/ проблем быть не должно вообще, три независимых интерфейса.... По ним ничего не предположу 

 Ноут не увидит диск на "горячую", если это не прописано в BIOS. А т.к. биос в ноутах обрезан до минимума, то считайте: не увидит никогда. Попробуйте после подключения диска не перезагружать ноут, а в диспетчере устройству обновить конфигурацию оборудования. Если проблема софтовая, то ноут должен свалиться в BSOD.  

А про механическую проблему вы не думали, как расположены относительно друг-друга диск и блютус, а так-же шлейф блютуса?