приобрели товар в кредит, в договоре купли-продаже стоит одна цена,

 

здравствуйте! ту сумму, которую реально заплатили.

можно ли указывать в договоре на доставку от юр.лица физ.

 

можно указать, если все согласны с этим и готовы подписать договор в таком виде (ст. 421 гк рф)

согласно п 3 ст. 455. условие договора о товаре условие договора купли-продажи о товаре считается согласованным,

 

нет, не может.

при продаже товара организация не заключает договор купли-продажи товара.

 

здравствуйте, вера.
в соответствии с общими положениями гражданского кодекса рф сделки должны быть совершены в письменной форме когда стороной в сделке является юридическое лицо. 

сделка оформляется документом который подписывается сторонами и в нем должно быть отражено содержание сделки. для части сделок предусмотрено, что они могут быть совершены без составления таких документов. к таким сделкам относится розничная купля - продажа товаров. 
для некоторых сделок прямо предусмотрено заключение их в письменной форме.

из вашего вопроса не видно, какие сделки совершает ваша организация, поэтому полно ответить на ваш вопрос сейчас невозможно. 
но при этом, могу заметить, что в определенных случаях некоторые документы, которые составляет бухгалтерия, могут быть признаны как документы, подтверждающие заключение сделки в письменной форме.

последствиями незаключенные сделки в письменной форме может повлечь непризнание налоговой инспекцией законными ваших поставок контрагентам и, как следствие, это может повлиять на расчет налоговой базы и другие вредные последствия для вашей организации.

с уважением к вам, адвокат роман владимирович майданчук.