На сколько поставить Fan Speed в MSI Afterburner, чтобы не испортить видеокарту?

 

Здесь нужен личный опыт, наблюдения. Всё зависит от режимов работы устройства, эффективности и состояния охлаждения (забитые пылью радиаторы понижают интенсивность теплоотвода), окружающей температуры, степени разгона. Если боитесь перегрева, лучше ничего не трогайте. Встроенная защита от термических повреждений спасает не всегда.

Отличается ли процесс настройки скорости вращения кулера в ноутбуке?

 

Нет. На ноутбуке нужно выполнить аналогичные действия.