может ли. главный квартира съемщика отец без согласия выписать из квартиры 

 

самостоятельно и только по своему желанию без участия суда не сможет это сделать.
он должен обратиться с иском в суд и суд будет устанавливать обстоятельства, проживает ли гражданин в помещении. если нет, то почему. добровольно ли он покинул помещение, есть ли там его вещи, имеется ли у него в собственности другое помещение.
но,из суда повестки придут на имя выселяемого, правда не знаю на какой адрес.

могу ли я выписать из квартиры совершеннолетнюю дочь инвалида 3 группы если 

 

2 способа: она сама выпишется (или перепропишится), или только через суд.

можно ли выписать сына из муниципальной квартиры?

 

можно снять сына с регистрационного учета в судебном порядке.

может ли собственник выписать из квартиры отца инвалида 3 группы в никуда?

 

может выписать по суду.

как выписать через суд 40-летнего сына, инвалида 3 й группы,

 

поскольку сын добровольно за все это время с регистрационного учета не снялся, то выписать можно только в судебном порядке. необходимо подать исковое заявление о признании утратившим право пользования жилым помещением и снятии с регистрационного учета. выпишут на основании решения суда через 2-3 месяца.