администрация поселения хочет погасить задолженность по ндфл бюджетного учреждения.

 

здравствуйте. ну ладно - у бюджетного учреждения нет юриста, но у администрации поселения должен быть и свой юрист, и свой бухгалтер. соглашением оформляется.
всего вам самого доброго и удачного разрешения проблем.

ликвидация учреждения не закончена, могут ли уволить председателя ликвидационной комиссии бюджетного учреждения.

 

само по себе - могут. просто в таком случае работодатель - должен решить вопрос о порядке взаимодействия с этим председателем комиссии, вряд ли он продолжит действовать бесплатно.

заработная плата руководителей бюджетных учреждений

 

платить должен не член. а руководитель если директор учреждения является председателем комиссии.

обязательно ли сдавать в налоговую инспекцию промежуточный баланс при ликвидации бюджетного учреждения?

 

да нужно сдавать и промежуточный и ликвидационный балансы. это вытекает из ст 63 гк рф.