AGRIS - 

2020

Mukij, Yu.V. | Bogomaz, D.I. | Pavlova, O.A., St. Petersburg State Univ. of Veterinary Medicine

The study of genes-markers of quantitative traits is an urgent task. According to numerous scientific works, it is known that the K232A mutation in the DGAT1 gene is associated with signs of milk production in cattle: allele K with a % fat content in milk, and allele A with the amount of milk. In this regard, the development of an optimal method for detecting SNP and allelic polymorphism is of scientific interest. To study the K232A polymorphism, 2 methods of molecular genetic analysis were used in the work: 1) real-time PCR with a system of primers and probes labeled with FAM and R6G fluorochromes; 2) PCR-RFLP with processing of amplification products with restriction endonuclease BglI and detection of samples in 15% polyacrylamide gel using a gel documentation system. The study was carried out in 2 stages, corresponding to two reporting periods on the farm. At the first stage, 200 cows were genotyped using real-time PCR. All animals turned out to be homozygous for allele A. At the second stage, the method of PCR polymorphism of the lengths of restriction fragments was used, with the help of which the genotypes of 102 animals were established - 64 cows with the AA genotype; 34 heads with the AK genotype and 4 heads with the KK genotype. The frequency distribution corresponded to the Hardy-Weinberg equilibrium. Allele frequencies were A - p = 0.79; K- q = 0.21. Criterion x2 is 0.04 (р is less than 0.05). Cows with the AA genotype had significantly high milk yield rates of +341.8 kg, p not more than 0.01; with AK genotype, fat percentage +0.131, p not more than 0.01 in 305 days 1 lactation. Calculation of the Student's criterion when comparing milk yield and fat content for full 1 lactation of cows with different genotypes showed that all the empirical values are in the zone of insignificance. | Изучение генов-маркеров количественных признаков у с.-х. животных является актуальной задачей. По многочисленным научным работам известно, что мутация К232А в генеDGAT1 ассоциирует с признаками молочной продуктивности у крупного рогатого скота: аллель К – с % содержанием жира в молоке, а аллель А - с количеством молока. В связи с этим разработка оптимального метода для детекции SNP и аллельного полиморфизма представляет научный интерес. Для изучения полиморфизма К232А в работе использовали 2 метода молекулярно-генетического анализа:1) реал-тайм ПЦР с системой праймеров и зондов, помеченных флюорохромами FAM и R6G; 2) ПЦР-ПДРФ с обработкой продуктов амплификации эндонуклеазой рестрикции BglI и детекцииобразцов в 15% полиакриламидном гелес помощью системы гель-документации ChemiDocXRS+ (BioRad). Исследование было проведено в 2 этапа, соответствующих 2 отчетным периодам в хозяйстве. На 1 этапе было прогенотипировано 200 голов коров с использование реал-тайм ПЦР. Все животные оказались гомозиготными по аллелю А. На 2 этапе был применен метод ПЦР-ПДРФ, с помощью которого установлены генотипы 102 животных - 64 голов коров с генотипом АА; 34 голов с генотипом АК и 4 головы с генотипом КК. Распределение частот соответствовало равновесию Харди-Вайнберга. Частоты аллелей составили А- р=0,79; К- q=0,21. Критерий x2= 0,04(р меньше 0,05). Коровы с генотипом АА имели достоверно высокие показатели по удою +341,8 кг, р не более 0,01; с генотипом АК процентного содержания жира +0,131, р не более 0,01 за 305 дн. 1 лактации. Расчет критерия Стьюдента при сравнении показателей удоя и жирности молока за полную 1 лактацию коров с разными генотипами показал, что все полученные эмпирические значения (t эмп.) находятся в зоне не значимости.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Vinogradova, I.V. | Kostyunina, O.V. | Sermyagin, A.A. | Kharzinova, V.R. | Zinov'eva, N.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

The investigated sample of cows revealed the highest frequency of A alleles (63.4%) by the DGAT_A232K gene and F alleles (78.8%) by the GHR_F279Y gene. The population with allele AA for gene DGAT_A232K was obtained higher milk production and milk quality: milk yield for 305 days of lactation (MY) (6335 kg with genotype AA, 6080кг - with genotype KK), fat yield (FY) (245.0 kg with genotype AA, 241.1 kg with genotype AK) and protein yield (PY) (208.2 kg with genotype AA, 202.5 kg at genotype AK). The difference between the groups with the highest milk yield, with the genotype AA and the lowest with genotype KK amounted to 255 kg (p less 0.05). Animals carrying allele Y for gene GHR_F279Y showed the best results in milk production and milk composition. In cows with the genotype of the FY gene GHR_F279Y fat content was 3.89%, which is 0.08 (p less 0.05k) greater than that of the population with genotype YY, mass fraction of protein is higher by 0.08 (p less 0.001) and equal to 3.30%. Animals with genotype AA for gene DGAT_A232K revealed the highest EBV for MY indicators (+101.2 kg), FY (2.22 kg) and PY (2.84 kg). The highest EBV values for MY (+104.1) were recorded in cows with the YY genotype for the GHR_F279Y gene, in terms of fat yield and protein yield, the advantage was observed in heterozygous individuals. The research as carried out ahs shown that the genetic variants of DNA markers HR_F279Y and DGAT1_A232K are associated with the features of milk productivity and can be used in breeding work. | У исследованной выборки коров выявлена наибольшая частота А аллелей (63,4%) по гену DGAT1_A232K и F аллелей (78,8%) по гену GHR_F279Y. Животные с аллелем АА по гену DGAT1_A232K имели более высокие показатели молочной продуктивности за 305 дней лактации и качества молока (MY) (6335 кг при генотипе АА; 6080 кг при генотипе КК), выхода молочного жира (FY) (245,0 кг при генотипе АА; 241,1 кг при генотипе АК) и молочного белка (PY) (208,2 кг при генотипе АА; 202,5кг при генотипе АК). Разница между группами с наивысшим и с наименьшим удоем составила 255 кг (Р меньше 0,05). Животные, несущие аллель Y по гену GHR_F279Y, показали лучшие результаты по молочной продуктивности и составу молока. У коров с генотипом FY гена GHR_F279Y массовая доля жира составила 3,89%, что на 0,08 (Р меньше 0,05) больше, чем у поголовья с генотипом YY, массовая доля белка также выше на 0,08 (Р меньше 0,001) и равна 3,30%. У животных с генотипом AA по гену DGAT1_A232K выявлены наиболее высокие значения племенной ценности (EBV) по показателям MY (+101,2 кг), FY (2,22 кг) и PY (2,84 кг). Наиболее высокие значения EBV по MY (+104,1) были зафиксированы у коров с генотипом YY по гену GHR_F279Y, по показателям выхода молочного жира и молочного белка преимущество отмечалось у гетерозиготных особей. Проведенные исследования показали, что генетические варианты по ДНК-маркерам GHR_F279Y и DGAT1_A232K ассоциированы с признаками молочной продуктивности и могут использоваться в селекционно-племенной работе.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2016

Shajdullin, R.R. | Sibagatullin, F.S. | Sharafutdinov, G.S., Kazan State Agrarian Univ.

Analysis and generalization of information on bulls-producers, belonging to breeding enterprises of Tatarstan, was done. For this purpose, materials, tribal certificates of Tatarstan type bulls of Kholmogory breed (TTKB), black-motley and Holstein breeds were used. They were evaluated by DNA productivity markers: kappa-casein (CSN3), O-acyltransferase diacylglycerol (DGAT1), beta-lactoglobulin (LGB), prolactin (PRL), somatropin (GH), thyroglobulin (TG5), leptin (LEP). Among bulls-producers of TTKB and Holstein breed BB genotype of beta-lactoglobulin prevails (48.7% and 40.7%) and AA genotype of LGB locus is rarer, 17.9% and 18.6% respectively. Allele frequency in these breeds was almost the same and varied from 0.35 to 0.39 (allele A) and from 0.61 to 0.65 (allele B). In all groups of dairy breeds prevalence of LL genotype of GH locus was noted in somatotropin gene, with the highest frequency in Holstein cattle (84.2%). Bulls of the TTKB are noted by a high frequency of the allele C of the leptin gene, which varied from 1.0 in the Chiftein line of animals to 0.58 in the producers of the Sovering line. TTKB bulls have the highest frequency of heterozygous genotypes in most genes, thus in CSN3, the genotype AB is 34.2%, in PRL, genotype AB - 30.4%, in TG5, genotype TS - 35.9%, in LEP, genotype TC- 66.7%, and of homozygous genotypes in genes DGAT1, LGB, PRL, GH, LEP, genotypes AA (47.2%), BB (48.7%), BB (2.2%), VV (20.0%), SS (33.3%) respectively. The genetic equilibrium was violated in the diacylglycerol gene of O-acyltransferase in bulls of the TTKB (chi-square = 4.72, P is less than 0.05) and black-motley breed (chi-square = 3.91; P - less than 0.05), and in the somatropin gene only in the producers of the TTKB (chi-square = 5.42, P - less than 0.05). The conclusion is that desirable alleles of genes of milk-yield are more often seen in Chif, Houp and Aivengo branches and also in bulls of TTKB they are more often than among representatives of other breeds. | Проведен анализ и обобщение сведений о быках-производителях, принадлежащих племенным предприятиям Татарстана. Для этого использовались материалы, племенные свидетельства быков татарстанского типа холмогорской породы (ТТХП), черно-пестрой и голштинской породы, которые оценены по ДНК-маркерам продуктивности: каппа-казеину (CSN3), диацилглицерол О-ацилтрансферазы (DGAT1), бета-лактоглобулину (LGB), пролактину (PRL), соматропину (GH), тиреоглобулину (TG5), лептину (LEP). Среди быков-производителей ТТХП и голштинской породы преобладают носители генотипа ВВ бета-лактоглобулина, (48,7 и 40,7%), реже встречается генотип АА локуса LGB, 17,9 и 18,6% соответственно. Частота аллелей у данных пород была примерно одинаковой и колебалась от 0,35 до 0,39 (аллель А) и от 0,61 до 0,65 (аллель В). У всех групп молочных пород по гену соматропина отмечено преобладание генотипа LL локуса GH, с наибольшей частотой (84,2%) у голштинского скота. Быки ТТХП выделяются высокой частотой аллеля С гена лептина, которая варьировала от 1,0 у животных линии Чифтейна до 0,58 у производителей линии Соверинга. Быки ТТХП имеют наивысшую частоту гетерозиготных генотипов по большинству генам, так по CSN3 генотип АВ – 34,2%, по PRL генотипу АВ – 30,4%, по TG5 генотипу ТС – 35,9%, по LEP генотипу ТС – 66,7% и по гомозиготным генотипам по генам DGAT1, LGB, PRL, GH, LEP соответственно по генотипу АА (47,2%), ВВ (48,7%), ВВ (2,2%), VV (20,0%), СС (33,3%). Генетическое равновесие нарушено по гену диацилглицерол О-ацилтрансферазы у быков ТТХП (хи-квадрат= 4,72; Р меньше 0,05) и черно-пестрой породы (хи-квадрат= 3,91; Р меньше 0,05), а по гену соматропина только у производителей ТТХП (хи-квадрат= 5,42; Р меньше 0,05). Сделан вывод, что желательные аллели генов молочной продуктивности чаще встречаются в ветвях Чифа, Хоупа и Айвенго, а также у быков ТТХП чаще, чем среди представителей других пород.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation