Genetic polymorphism of populations and phylogeny of the Central Siberian Polygonum (Polygonaceae) section using ISSR and chloroplast markers | Генетический полиморфизм популяций и филогения среднесибирских спорышей секции Pоlygonum (Polygonaceae) с использованием ISSR и хлоропластных маркеров

Genetic polymorphism of populations and phylogeny of the Central Siberian Polygonum (Polygonaceae) section using ISSR and chloroplast markers | Генетический полиморфизм популяций и филогения среднесибирских спорышей секции Pоlygonum (Polygonaceae) с использованием ISSR и хлоропластных маркеров

2023

Ямских, Ирина Евгеньевна | Тупицына, Наталья Николаевна | Рябова, Ксения Константиновна | Куцев, Максим Геннадьевич

unknown. This article is devoted to the study of genetic polymorphism of populations and phylogeny of Polygonum section using ISSR and chloroplast markers. Section Polygonum is a taxonomically complex group. Identification of individuals is complicated because of the small size of plants, the processes of interspecific hybridization, heterocarpy, phenological and ecological plasticity. In this work, the genetic variability of six populations of five knotweed species growing in Krasnoyarsk was studied. ISSR analysis revealed that the level of genetic diversity in the populations varies from 4.17 % to 35.83 % and has maximum values for genetically close species P. sabulosum (P = 35.83 %) and P. arenastrum (P = 22.5–30 %). Minimum values of genetic diversity were observed for populations of P. aviculare (P = 4.17 %) and P. calcatum (P = 5 %). The studied populations are characterized by a very high level of genetic differentiation (Gst = 0.78) and reliably belong to different species. On the similarity dendrogram (UPGMA), individuals of these species form clearly distinct clades. The genetic structure of populations using STRUCTURE also shows a reliable division of individuals into 5 clusters corresponding to the studied species. Phylogenetic analysis using the trnL-trnF chloroplast region shows the presence of a 5-nucleotide deletion and two transversions that makes it possible to divide the studied group of Polygonum into two morphologically different clusters. The first group is formed by P. arenastrum, P. calcatum, P. caspicum, P. sabulosum and characterized by the absence of a main shoot, a gradual reduction of leaves to the top of shoots and the perianth dissection by 1/2 of its length. The second group includes P. aviculare, P. boreale, P. neglectum, P rectum that have a main shoot, heterophilly, perianth dissection by 2/3–3/4 of its length. Two substitutions have been identified in the matK sequences, however it is less informative for solving taxonomic issues of the studied group.

Show more [+]

Less [-]

unknown. Статья посвящена исследованию генетического полиморфизма популяций и филогении видов секции Pоlygonum с использованием ISSR и хлоропластных маркеров. Спорыши представляют собой таксономически сложную группу. Идентификация особей осложняется мелкими размерами растений, процессами межвидовой гибридизации, гетерокарпией, фенологической и экологической пластичностью. В данной работе изучена генетическая изменчивость 6 популяций 5 видов спорышей, произрастающих в г. Красноярске. ISSR-анализом установлено, что уровень генетического разнообразия в популяциях варьирует от 4,17 % до 35,83 % и имеет максимальные показатели для генетически близких видов P. sabulosum (P = 35,83 %) и P. arenastrum (P = 22,5–30 %). Минимальные значения генетического разнообразия зафиксированы для популяций P. aviculare (P = 4,17 %) и P. calcatum (P = 5 %). Изученные популяции характеризуются очень высоким уровнем генетической дифференциации (Gst = 0,78) и достоверно относятся к разным видам. На UPGMA-дендрограмме сходства особи данных видов формируют четко обособленные клады. Анализ генотипов особей в программе STRUCTURE также показывает достоверное разделение на 5 кластеров, соответствующих исследуемым видам. Филогенетический анализ с использованием trnL-trnF участка хлоропластной ДНК показывает наличие 5-нуклеотидной делеции и двух трансверсий, позволяющих разделить изучаемую группу спорышей на два кластера, морфологически отличающихся друг от друга. Первую группу формируют виды P. arenastrum, P. calcatum, P. caspicum, P. sabulosum, характеризующиеся отсутствием выраженного главного побега, постепенным уменьшением листьев к верхушкам побегов и расчленением околоцветника на 1/2 своей длины. Во вторую группу входят P. aviculare, P. boreale, P. neglectum, P rectum с выраженным главным побегом, гетерофиллией, расчленением околоцветника на 2/3–3/4 своей длины. В последовательностях гена matKвыявлено 2 замены, он является менее информативным для решения вопросов таксономии изучаемой группы.

Show more [+]

Less [-]

Bibliographic information

Publisher

Altai State University

Other Subjects

Секция polygonum; Trnl-trnf; Genetic structure; Issr-pcr analysis; Matk; Генетическая структура; Issr-pcr анализ; Популяция; Section polygonum

ISSN

1560-7267, 1560-7259

Type

Info:eu-Repo/semantics/article; Info:eu-Repo/semantics/publishedversion

Source

Turczaninowia; Том 26 № 3 (2023): Turczaninowia; 137-147, Turczaninowia; Vol 26 No 3 (2023): Turczaninowia; 137-147, 1560-7267, 1560-7259