Candidate genes associated with live weight in Russian beef merino | Гены-кандидаты, связанные с живой массой у овец породы российский мясной меринос

Candidate genes associated with live weight in Russian beef merino | Гены-кандидаты, связанные с живой массой у овец породы российский мясной меринос

2023

Safaryan, E.Yu. | Krivoruchko, A.Yu. | Kanibolotskaya, A.A. | Shelud'ko, P.A.

English. Genome-Wide Association Study (GWAS) is widely used in the field of genetics and breeding of farm animals. GWAS is based on determining the relationship between some animal parameter and a single nucleotide polymorphism. The research aimed to identify new candidate genes that affect live weight at birth and at the age of 1 year in Russian beef merino rams. The objects of the study were clinically healthy lambs during the neonatal period and at 12 months of age (n = 50). The experimental work was carried out under the conditions of the Stavropol Territory. Animal genotyping was performed using Ovine Infinium HD BeadChip 600K DNA biochips, according to the manufacturer's protocol. Quality control of genotyping was carried out using PLINK V.1.07 software. 2 replacements associated with live weight at birth and 7 replacements associated with live weight of one-year-old rams were discovered. The localization of the analysed SNPs made it possible to identify 8 candidate genes that affect the parameters of meat performance, located on different chromosomes (SOCS6, ENSOARG00000026317, AMOTL2, C1QL2, GNPDA1, USH2A, SLC1A2, ENSOARG00000014102). The protein products of these genes are involved in important intracellular and physiological processes. Further studies will confirm the influence of the proposed candidate genes on the phenotype, as well as examine their structures in detail, to study mutations that cause changes in the phenotype in Russian Merino meat rams.

Show more [+]

Less [-]

Russian. Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS, Genome-Wide Association Study) широко применяют в области генетики и селекции с.-х. животных. В основе GWAS лежит определение связи между каким-либо параметром животного и однонуклеотидным полиморфизмом. Цель исследований – выявление новых генов-кандидатов, влияющих на живую массу при рождении и в возрасте 1 год у баранчиков породы российский мясной меринос. Объектом исследования служили клинически здоровые баранчики в период новорожденности и в 12-и месячном возрасте (n = 50). Экспериментальную работу проводили в условиях Ставропольского края. Генотипирование животных выполняли с использованием ДНК-биочипов Ovine Infinium HD BeadChip 600K, согласно протоколу производителя. Контроль качества генотипирования осуществляли с использованием программного обеспечения PLINK V.1.07. Обнаружены 2 замены, связанные с живой массой при рождении и 7 замен, связанных с живой массой годовалых баранчиков. Локализация анализируемых SNP позволила выявить 8 генов-кандидатов, влияющих на параметры мясной продуктивности, расположенных на разных хромосомах (SOCS6, ENSOARG00000026317, AMOTL2, C1QL2, GNPDA1, USH2A, SLC1A2, ENSOARG00000014102). Белковые продукты этих генов участвуют в важных внутриклеточных и физиологических процессах. Дальнейшие исследования позволят подтвердить влияние предложенных генов-кандидатов на фенотип, а также детально рассмотреть их структуры, с целью изучения мутаций, вызывающих изменения фенотипа у баранчиков породы российский мясной меринос.

Show more [+]

Less [-]

Bibliographic information

Достижения науки и техники АПК | Achievements of Science and Technology in Agribusiness

Issue

11

ISSN

0235-2451

Other Subjects

Genotype; Federacion de rusia; Federation de russie; Race d'animal d'elevage; Aptitud carnica; Mutacion