AGRIS - 

2017

Karymsakov, T.N. | Gladyr', E.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

A comparative survey into the allele pool of Kazakhstan's cattle populations of 3 related breeds of the Black-and-White root, such as: Black and White Holstein, Black-and-White, and Aulie-Ata using 11 microsatellite loci have been carried out. The greatest allelic richness was shown in the Black-and-White breed (119 alleles) and the lowest one- in Holsteins (94 alleles). Aulie-Ata cattle revealed the intermediate value of this parameter (107 alleles). The number of private alleles (which occurs only in one of the breed) was 2, 14 and 10 alleles in Holsteins, Black-and-White and Aulie-Ata cattle, respectively. The number of the rare alleles (occurs in 1% and less) of the total number of the identified alleles comprised of 14.9%, 32.8%, and 22.4% in the Holsteins, the Black-and-White cattle, the Aulie-Ata breed, during incidental inbreeding 0.006, 0.038 and 0.042, respectively. The level of expected heterozygosity at loci varies from 0.596 at locus SPS115 to 0.867 at locus TGLA227 among the Holsteins, from 0.603 at locus BM1818 to 0.844 at locus BM2113 among the Black-and-White cattle, and from 0.603 at locus BM1818 to 0.844 at locus BM2113 among the Aulie-Ata breed. The mean expected heterozygosity values over all the loci were as follows: 0.715, 0.738, and 0.735 in the Black-and-White Holstein, Black-and-White, and Aulie-Ata cattle, respectively. It has been concluded that the holsteinized animals of the Kazakhstan's populations compared to the purebred Holstein cattle can show a greater genetic diversity in the allelic richness, which must be associated with combining the gene pool of the cattle of breeds representing various origins. | Проведено сравнительное изучение аллелофонда казахстанских популяций крупного рогатого скота 3 родственных пород черно-пестрого корня: голштинской черно-пестрой масти, черно-пестрой и аулиеатинской с использованием 11 микросателлитных локусов. Наибольшее аллельное разнообразие установлено в черно-пестрой породе (119 аллелей), наименьшее – у голштинского скота (94 аллеля). В аулиеатинской породе наблюдалось промежуточное значение данного показателя (107 аллелей). Число приватных аллелей (встречаются только у одной из пород) составило 2, 14 и 10 аллелей у голштинской, черно-пестрой и аулиеатинской пород, соответственно. Число редких аллелей (встречаются с частотой 1% и менее) от общего числа идентифицированных аллелей в голштинской черно-пестрой породе составило 14,9%, в черно-пестрой – 32,8%, а в аулиеатинской – 22,4%. В голштинской породе черно-пестрой масти уровень ожидаемой гетерозиготности по локусам варьирует от 0,596 в локусе SPS115 до 0,867 в TGLA227, в черно-пестрой породе – от 0,603 в локусе BM1818 до 0,844 в BM2113 и в аулиеатинской - от 0,603 в локусе BM1818 до 0,844 в BM2113. Средний показатель ожидаемой гетерозиготности по всем локусам в голштинской черно-пестрой породе был на уровне 0,715, в черно-пестрой – 0,738 и в аулиеатинской - 0,735, при случайном инбридинге 0,066, 0,038 и 0,042, соответственно. Сделан вывод, что голштинизированные животные казахстанских популяций в сравнении с чистопородным голштинским скотом имеют большее генетическое разнообразие по числу аллелей что, по всей видимости, связано с объединением генофонда пород различного происхождения.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Yulmet'eva, Yu.R. | Shakirov, Sh.K., Tatarstan Research and Development Inst. of Agriculture, Kazan

Molecular genetic markers for economically important performance traits are widely used in evaluating the breeding value of farm animals. There was studied the systems effect of somatotropin (GH) and thyroglobulin (TG5) candidate genes on the productivity of Kholmogory Tatarstan breed type cows. The research material was blood of cows (n=271) and fresh cows (n=61). As to the occurrence of the candidate gene GH in the sample animals-carriers of allele L 078 prevail. The distribution for the gene-candidate TG5 has shown that the prevalent allele is T making 0.79. As to the TG5 candidate gene there was revealed a polymorphism correlation with the body weight value. So, animals with genotype TT were heavier, their superiority in body weight compared with cows with homozygous genotype for C allele was 14 kg, or 2.5%. However, it is not associated with the age of the studied animals, because heavier individuals were younger, the difference in the compared groups was 0.4 lactation. High productivity of animals by GH gene was achieved in samples with homozygous genotype for V allele, whereas in the subsamples with LL and LV genotypes the values of productivity were lower. The difference was 398 kg and 16 kg of milk per lactation, 0.01% and 0.06% of weight fraction of protein, respectively. The study of association of TG5 gene polymorphism with productivity showed that animals with the CC genotype had high milk yields that were higher by 369 kg of milk, or 5.7% compared to individuals with TT genotype. The study has found a true dependence of indicators of economic values of cows on the polymorphic status of GH and of TG5 candidate genes. | Молекулярно-генетические маркеры хозяйственно-ценных признаков продуктивности широко используются при оценке племенной ценности с.-х. животных. Было изучено комплексное влияние генов-кандидатов соматотропин (GH) и тиреоглобулин (TG5) на показатели продуктивности коров холмогорской породы Татарстанского типа. Материалом исследований послужила кровь коров (п=271) и первотелок (п=61). По частоте встречаемости аллелей гена-кандидата GH в выборке преобладают животные-носители аллеля L с показателем 0,78. Распределение частоты встречаемости аллелей по гену-кандидату TG5 показало, что превалирует аллель Т и составляет 0,79. По гену-кандидату TG5 выявлена связь полиморфизма с величиной живой массы. Так, более тяжеловесными оказались животные с генотипом ТТ, их превосходство в живой массе, по сравнению с коровами с гомозиготным генотипом по аллелю С, составило 14 кг, или 2,5%. Однако оно не связано с возрастом изучаемых животных, так как более массивные особи оказались и более молодыми, разница в сравниваемых группах 0,4 лактации. Высокая продуктивность животных по гену-кандидату GH отмечена в выборках с гомозиготным генотипом по V-аллелю, тогда как в подвыборках с генотипами LL и LV значения продуктивности были ниже на 398 и 16 кг молока за лактацию, и на 0,01 и 0,06% массовой доли белка, соответственно. Изучение ассоциации полиморфизма гена-кандидата TG5 с продуктивностью показало, что от животных с генотипом СС получены высокие удои, что выше по отношению к особям с генотипом ТТ на 369 кг молока, или на 5,7%. В результате исследований установлена достоверная зависимость показателей хозяйственной ценности коров от полиморфного состояния генов-кандидатов GH и TG5.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Fenchenko, N.G. | Khajrullina, N.I. | Shamsutdinov, D.Kh., Bashkir Research and Development Inst. of Agriculture, Ufa

Scientific research was conducted in the conditions of breeding farm and agrofirm for breeding of Simmental and Black-and-Motley cattle in the Republic of Bashkortostan. Studies of DNA of microsatellites and qualitative indicators of milk productivity were carried out on the basis of selected blood and milk samples of experimental animals. The aim of the research was a comparative analysis of the genetic diversity of Black-and-Motley and Simmental cattle on the basis of microsatellite analysis. The animals were formed into groups according to the principle of analogues, taking into account the age, the calving date, mothers' productivity, the linear origin in the amount of 200 animals. Interbred genetic differences were studied using the methods of zootechnical and molecular-genetic analysis. It was found that from 11 determined loci the experimental animals had six: BM 1824, BM 2113, ETN 10, ETN 35, SPS 115, TGLA 122. The frequency of occurrence of each of microsatellite loci alleles which Black-and-Motley and Simmental bulls-producers' daughters had was determined. Analysis of the genealogical structure of the herd showed that there was a specific tendency that determines the relation between the frequency of occurrence of certain allelic variants of microsatellite DNA loci and animal productivity indicators, taking into account their linearity. Comparative genetic analysis showed that there were significant differences in occurrence frequency of certain microsatellite loci alleles in terms of breeds, lines and bulls-producers. Tendencies that determine the relation between the frequencies of occurrence of certain variants of microsatellite DNA loci and milk yield for 305 days of lactation, fat mass fraction in milk, and live weight of offspring from bulls-producers of different genotypes were found. | Научные исследования проводили в условиях племрепродуктора и агрофирмы по разведению симментальского и чёрно-пёстрого скота в Республике Башкортостан. Изучение ДНК микросателлитов и качественных показателей молочной продуктивности проводили на основе отобранных образцов крови и молока подопытных животных. Целью исследований был сравнительный анализ генетического разнообразия черно-пестрого и симментальского скота на основе микросателлитного анализа. Животных в группы формировали по принципу аналогов, с учетом возраста, даты отела, продуктивности матерей, линейного происхождения в количестве 200 голов. Межпородные генетические различия изучали методами зоотехнического и молекулярного-генетического анализа. Установлено, что из 11 определяемых у крупного рогатого скота локусов у подопытных животных имелось 6: ВМ 1824, ВМ 2113, ЕТН 10, ЕТН 35, SPS 115, TGLA 122. Определена частота встречаемости каждого из аллелей микросателлитных локусов дочерей быков-производителей линий черно-пестрой и симментальской пород. Анализ генеалогической структуры стада показал, что прослеживается определенная тенденция, определяющая взаимосвязь между частотой встречаемости определенных аллельных вариантов микросателлитных локусов ДНК и показателями продуктивности животных с учетом их линейной принадлежности. Сравнительный генетический анализ показал, что имеются существенные различия по частоте встречаемости отдельных аллелей микросателлитных локусов по породам, линиям и быкам производителям. Выявлены тенденции, определяющие взаимосвязь между частотами встречаемости определенных вариантов микросателлитных локусов ДНК с уровнем удоя за 305 дней лактации, массовой долей жира в молоке и живой массой потомства быков-производителей разного генотипа.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Gorlov, I.F., Volga Research and Development Inst. of Production and Processing of Meat and Dairy Products, Volgograd

The results of molecular genetic studies of the gene pool of Angus cattle and Russian clod of breeds (Australian selection) showed that the gene pool of these populations has a fairly high similarity. However, for a number of genes there were certain differences. Thus, the AA genotype for the RORC gene was more often 12.6% found in the population of the Russian clod of breed, the genotype AG in the Angus breed population by 12.5%. There are no differences in the genotype of GG in the population. The genotype LL for the GH gene was found most often in populations with a difference of 2.25, while the VV genotype was less frequent with a difference of 3.3% between populations. For the gene GNR, the genotype often found in the gene pool of the population was more frequent than the AA genotype with the difference between the populations of 5.6% and most rarely the GG genotype with the difference between the populations of 1.8%. High in the populations was the occurrence of the AA genotype and the Lep gene (79.7 and 86.7%) and the CC gene Lep R (98.3 and 75.0%). Studies of conjugated genotypes in the GH/RORC genes showed that AA/AA genotype (18.4, 19.7%), AA/AG (17.5, 14.7%), AG/AA (13.3, 16.4%) and rarely GG/GG (2.5, 2.2%), GG/AG (8.8, 6.4%), and AG/GG (6.2, 7.2%). Most often, the desired genotypes of GG/AA, AG/AA and AA/AA were found in the cattle population of the Russian clod of breed. | Результаты молекулярно-генетических исследований генофонда скота ангусской и русской комолой пород (австралийской селекции) показали, что генофонд этих популяций имеет довольно высокое сходство. При этом по ряду генов имелись определенные различия. Так, генотип АА по гену RORC на 12,6% чаще встречался в популяции русской комолой породы, генотип АG у популяции ангусской породы на 12,5%. Различий по генотипу GG в популяции не установлено. Генотип LL по гену GH встречался в популяциях наиболее часто при разнице между ними 2,25, тогда как генотип VV реже с разницей между популяциями в 3,3%. По гену GНR, часто встречаемому в генофонде популяции, чаще встречался генотип АА с разницей между популяциями в 5,6% и наиболее редко генотип GG при разнице между популяциями 1,8 %. Высокой в популяциях была встречаемость генотипа АА и гена Leр (79,7 и 86,7%) и по СС гену Leр R (98,3 и 75,0%). Исследования сопряженных генотипов по генам GH/RORC показали, что в общих популяциях чаще встречался генотип АА/АА (18,4; 19,7%), АА/АG (17,5; 14,7%), АG/АА (13,3;16,4%) и редко GG/GG (2,5; 2,2%), GG/АG (8,8; 6,4%) и АG/GG (6,2; 7,2%). При этом наиболее часто желательные генотипы GG/АА, АG/АА и АА/АА встречались в популяции скота русской комолой породы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Shirokova, N.V. | Getmantseva, L.V. | Kolosov, Yu.А. | Bakoev, N.F., Don State Agrarian Univ., Rostov Region

The Salsk breed of sheep is created as a result of many years work of breeders in the Rostov region. Studies of its genetic diversity are necessary for their conservation, further improvement and use of the breed. The aim of the work was to study polymorphism of microsatellite loci OarCP549, CSRD247, FCB20, and MAF65 in sheep of Salsk breed. Tissue samples were collected in sheep kept at one of the breeding farms in the Rostov Region). Analysis of microsatellites was performed nu a 16-capillary ABI3130xl Genetic Analyzer. To estimate polymorphism of loci it was taken into account: the Number of Alleles per locus (NA); Observed (Ho) and the Expected (He) Heterozygosity, the Effective Number of Alleles per locus (Ae). The highest Number of Alleles (NA = 17) and the Effective Number of Alleles (Ae = 7) was determined from the locus OarCP49 in the sheep of the Salsk breed. At other loci, the Number of Alleles was 15, 12 and 9, and the Effective Number of Alleles was 5.56, 5.33 and 3.85 respectively for CSRD247, FCB20 and MAF65. The heterozygote deficiency in the population is noted at the loci CSRD247 and MAF65. Average index of fixation for four loci was 0.094. There was detected polymorphism of microsatellite loci OarCP49, CSRD247, FCB20 and MAF65 and grounded the expediency of their inclusion in the panel of DNA markers for assessing the genetic diversity and authenticity of the origin for the sheep of Salsk breed. | В результате многолетней работы селекционеров Ростовской обл. была создана сальская порода овец. Исследование ее генетического разнообразия необходимо для сохранения, дальнейшего совершенствования и использования породы. Цель работы - изучить полиморфизм микросателлитных локусов OarCP549, CSRD247, FCB20 и MAF65 у овец сальской породы. Образцы тканей были взяты у 95 овец, содержащихся на одном из племзаводов в Ростовской обл. Анализ микросателлитов выполняли на 16-капиллярном генетическом анализаторе АВI3130xl Genetic Analyzer. Для оценки полиморфизма локусов учитывали количество аллелей на локус (NА); наблюдаемую (Но) и ожидаемую (Не) гетерозиготность, эффективное число аллелей на локус (Ае). Связь между индивидуальными особями и популяцией в целом определяли на основе индекса фиксации (Fis). Наибольшее количество аллелей (NA=17) и эффективное число аллелей (Ae = 7) у изучаемого поголовья овец было определено по локусу OarCP49. По другим локусам количество аллелей составило 15, 12 и 9, эффективное число аллелей 5,56; 5,33 и 3,85 соответственно для CSRD247, FCB20 и MAF65. Дефицит гетерозигот в популяции отмечен по локусам CSRD247 и MAF65. В среднем по четырем локусам индекс фиксации составил 0,094. Выявлено наличие полиморфизма микросателлитных локусов OarCP49, CSRD247, FCB20 и MAF65, обоснована целесообразность их включения в панель ДНК-маркеров для оценки генетического разнообразия и достоверности происхождения овец сальской породы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Koshchaev, A.G. | Shuklin, S. Yu. | Shchukina, I.V., Kuban State Agrarian Univ. named after I.T. Trubilin, Krasnodar

The genetic diversity of the Aberdeen-Angus cattle was studied in 3 leading farms in the Krasnodar Territory. Research was carried out in the three leading farms of the Krasnodar Territory. During the work the following was investigated: the genealogical structure of the population, pedigree certificates and the outline diagram of animals, the structure of microsatellite loci, the indices of heterozygosity, and the values of Fis. It has been established that the population of Aberdeen-Angus cattle used in the Krasnodar Territory refers to more than 20 legitimate genealogical complexes: 12 groups (63.2%) belong to American breeding, - 3 (15.8%) - to Canadian- 4 (21.0%) to Australian and New Zealand. The average number of offspring per stud bull is up to 150 goals. Five-year monitoring of the exterior signs of stud bulls, it is established that all animals have a strong physique. The use of animals in the conditions of the southern foothill zone, with pasture management, affects the strength of the limbs, so in the Australian bulls, the feet with an enlarged thumb can be found by 7% more than at the age of 12 months, and in Canada - by 7.2%. The study of the structure of the most important microsatellite loci: BM1824, BM2113, BM1818, CSRM60, CSSM66, ETH3, ETH10, ETH225, INRA023, ILSTS006, SPS115, TGLA227, TGLA126, TGLA122, TGLA53, made it possible to establish that there are 69 peaks in the population, high heterozygosity from 0.67 to 0.957, the Fis values are within the confidence interval (95%). Inasmuch as the studied populations have a stable genealogical structure, and there is no close inbreeding, there are numerous variants for modeling further breeding work. | В трех ведущих хозяйствах Краснодарского края исследовали генетическое разнообразие популяции абердин-ангусской породы крупного рогатого скота. При проведении работы анализировались генеалогическая структура популяции, племенные свидетельства и экстерьерный профиль животных, структура микросателлитных локусов, показатели гетерозиготности, значения Fis. Установлено, что популяция абердин-ангусского скота, используемая в Краснодарском крае, относится более чем к 20 правомерным генеалогическим комплексам: американской селекции принадлежат 12 групп (63,2%), канадской - 3 (15,8%), австралийской и новозеландской - 4 (21,0%). Среднее число потомков в расчете на одного производителя составляет до 150 гол. Пятилетним мониторингом экстерьерных признаков быков-производителей изучаемых генеалогических комплексов, установлено, что все животные имеют крепкое телосложение. Использование животных в условиях южно-предгорной зоны, при пастбищном содержании влияет на крепость конечностей. Так, у австралийских быков ступни с разросшимся большим пальцем встречаются на 7% больше чем в возрасте 12 месяцев, а у канадских - на 7,2%. Изучение структуры наиболее важных микросателлитных локусов: BM1824, BM2113, BM1818, CSRM60, CSSM66, ETH3, ETH10, ETH225, INRA023, ILSTS006, SPS115, TGLA227, TGLA126, TGLA122, TGLA53 - дало возможность установить, что в популяции имеются 69 пиков, гетерозиготность высокая - от 0,67 до 0,957; значения Fis находятся в пределах доверительного интервала (95%). Поскольку изученные популяции имеют устойчивую генеалогическую структуру и отсутствует тесный инбридинг, имеются многочисленные варианты моделирования дальнейшей селекционно-племенной работы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Anisimova, I.N. | Ryabova, D.N., The N.I. Vavilov All-Russia Inst. of Plant Genetic Resources, St. Petersburg

Seven different types of cytoplasmic male sterility (CMS) are known for the grain sorghum (Sorghum bicolor L. Moench), however, only A1 (milo) is used in heterotic hybrid breeding. The genetic control of pollen fertility restoration of CMS A1 is complex and determined by two or three Rf (Restoration of Fertility) genes, and also by a number of modifiers. In the present paper we have demonstrated the nucleotide polymorphism in the coding regions of the recessive and dominant alleles of Rf2 gene and also of the candidate RFL-PPR gene homologous to the rice Rf1 gene. Here, we studied polymorphism of the CMS-Rf genetic system related traits in sorghum accessions from the VIR collection, including the fertility restorers k-928 and k-929; a half-restorer k-1362, the sterile lines A-10598 and A-83 (CMS A1) and their fertile analogs, the F8-F12 BC1-BC2 sister lines resistant to Schizaphis graminum Rond. which have been isolated among the hybrids derived from crosses between the sterile (CMS A1) line N-81 and lines k-929 and k-928, and also hybrids between the sister lines. In the CMS lines and fertility restorers a significant polymorphism (18 polymorphic sites) was revealed in the 825 bp fragment of the Rf2 coding region (reference fragment XM_002459403.1, chromosome SDI02) and also in RFL-PPR candidate gene located in the chromosome 3 (reference fragment XM_002458104.1). The sequenced regions of the structural nuclear gene ALDH2b encoding mitochondrial aldehyde dehydrogenase, the maize Rf2 gene homolog, and also of the mitochondrial F0F1 ATPase alpha subunit were identical in the CMS and fertility restorer lines. Variability of pollen fertility indices was studied using acetocarmine stained cytological preparations. The lines resistant to S. graminum, and their hybrids differed in the percentage of stained (fertile) pollen grains, the presence of anomalous large pollen grains, giant pollen grains and deformed pollen grains. | У зернового сорго (Sorghum bicolor L. Moench) известны 7 различных типов цитоплазматической мужской стерильности (ЦМС), однако в селекции используется лишь А1 (milo). Генетический контроль восстановления фертильности ЦМС А1 обусловлен действием двух или трех генов Rf (Restoration of Fertility), а также ряда модификаторов. Показан нуклеотидный полиморфизм в кодирующих последовательностях рецессивного и доминантного аллелей гена Rf2, а также гена-кандидата RFL-PPR, характеризующихся гомологией с геном Rf1 риса. Материалом служили образцы сорго из мировой коллекции ВИР: восстановители фертильности к-928 и к-929, полувосстановитель к-1362, стерильные линии А-10598 и А-83 (ЦМС А1) и их фертильные аналоги, устойчивые к Schizaphis graminum Rond. сестринские линии F8-F12 BC1-BC2, выделенные из гибридов от скрещиваний линии Н-81 (ЦМС А1) с линиями к-929 и к-928, а также гибриды между сестринскими линиями. У линий ЦМС и восстановителей фертильности обнаружен значительный нуклеотидный полиморфизм (18 полиморфных сайтов) фрагмента кодирующей последовательности гена Rf2 длиной 825 п.н. (референсный фрагмент XM_002459403.1, хромосома SDI02), а также PPR-гена, локализованного в 3-й хромосоме (референсный фрагмент XM_002458104.1). Секвенированные участки структурного ядерного гена ALDH2b, кодирующего альдегиддегидрогеназу, - гомолога гена Rf2 кукурузы и митохондриального гена альфа-субъединицы АТФ-синтазы F0F1 у линий ЦМС и восстановителей фертильности оказались идентичными. Сравнение изменчивости показателей фертильности пыльцы с использованием окрашенных ацетокармином цитологических препаратов показало, что устойчивые к S. graminum линии, а также их гибриды различались по частоте формирования окрашенных (фертильных), аномально крупных (диаметром 54-70 мкм), гигантских (до 84 мкм) и деформированных пыльцевых зерен. Наблюдавшаяся изменчивость может быть обусловлена различиями в аллельном составе генов Rf, полученных от рекуррентного родителя.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Koval'chuk, S.N. | Arkhipova, A.L. | Andrejchenko, I.N. | Kosovskij, G.Yu., Center of Experimental Embriology and Reproductive Biotechnology, Moscow

Acyl-CoA:diacylglycerol acyltransferase 1(DGAT1) is a key enzyme in triacylglycerol synthesis. Among known allelic variants of bovine dgat1 gene, the non-synonymous mutation (replace GC with AA) at positions 10433/10434 (according to GenBank no. AJ318490 sequence) results in the nonhomologous substitution of amino acid residue 232 (A replaced with K). Numerous studies showed a strong association of the DGAT1 K232 allele with increasing saturated fat content in milk and beef. Therefore, dgat1 was considered as a candidate gene for control of milk and beef fat contents and composition. The aim of this work was to improve the method for identification of K and A allelic variants of dgat1 gene by shortening the duration of the procedure for genotyping cattle. In the developed method, two primers flanking 279-bp fragment of dgat1 gene and two allele-specific TagMan probes were used. Identification of A and K alleles was performed on basis of increasing Fam and Cy5 fluorescence, respectively. The developed method was validated with PCR- RFLP analysis of 50 DNA samples from holsteinized Black-and-White cows. The developed real-time PCR-base method requires less time (up to 1 hour) in comparison with PCR-RFLP analysis and could be used for rapid and effective identification of K and A allelic variants of DGAT1 in cattle. | Диацилглицерол-О-ацилтрансфераза 1 (DGAT1) является одним из ключевых ферментов биосинтеза триглицеридов. Среди известных аллельных вариантов гена dgat1 крупного рогатого скота мутация замены GC на AA в позиции 10433/10434 (согласно нумерации последовательности GenBankno. AJ318490) приводит к негомологичной замене 232-го аминокислотного остатка (замена A на K). Ряд исследований показал связь аллеля К с повышенным содержанием насыщенных жиров в молоке и мясе крупного рогатого скота. В связи с этим dgat1 рассматривается в качестве гена-кандидата для контроля количества и состава жира в молоке и мясе крупного рогатого скота. Цель работы – усовершенствование способа идентификации аллельных вариантов К и А гена dgat1 с целью сокращения длительности процедуры генотипирования крупного рогатого скота. В разработанном способе используются два праймера, фланкирующие участок гена dgat1 длиной 279 п.н. и два аллель-специфичных флуоресцентно-меченых зонда типа TaqMan. Идентификация аллелей А и К проводится по нарастанию флюоресценции по каналам Fam и Cy5, соответственно. Разработанный способ был валидирован ПЦР-ПДРФ−анализом на 50 образцах ДНК коров голштинизированной черно-пестрой породы. Разработанный способ на основе ПЦР в реальном времени позволяет значительно сократить время проведения анализа (до 1 ч) по сравнению с ПЦР-ПДРФ и может быть использован для быстрой и эффективной идентификации аллельных вариантов К и А DGAT1 у крупного рогатого скота.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Fedulova, T.P. | Bogomolov, M.A. | Fedorin, D.N., The A.L. Mazlumov All-Russia Research and Development Inst. of Sugar Beet and Sugar, Voronezh Region

The purpose of this work consisted in revealing polymorphism of the SSR-markers characterizing genetic variability of beet breeding materials within Betа genus. Object of the investigation were plants of sugar, fodder red, and wild beet Beta corolliflora Zoss. parental forms and F1 hybrids obtained from crossing. In the course of the investigations, hybridization between genetically labeled male sterile plants of sugar beet and plants of fodder red and Beta corolliflora Zoss. wild beet was performed. To reveal polymorphism and genetic structure of parental forms and of their hybrids, five SSR-primers of Sb series, namely Sb04, Sb06, Sb07, Sb09, Sb10 were used. As a result of PCR-analysis of 20 breeding accessions, high heterogeneity of the amplification products with the primers used was revealed. Sb06 primer was the least polymorphous. With amplification of genome DNA of all investigated beet materials, only one PCR-product of about 150 bp in length was obtained. The Sb10 primer showed the greatest polymorphism, in different samples of DNA it produced a product of different length. The Sb06, Sb07, Sb09 primers have different level of polymorphism in different samples of beet DNA. Significant relationship between productivity of beet breeding samples and the studied microsatellite loci was not revealed. | Цель работы - установление полиморфизма SSR-маркеров, характеризующих генетическую изменчивость селекционных материалов свеклы рода Betа. Объектом исследования являлись растения родительских форм сахарной, кормовой красной, дикой свеклы Beta corolliflora Zoss. и гибриды F1, полученные от их скрещивания. В процессе исследований проводилась гибридизация генетически маркированных мужскостерильных растений сахарной свеклы с растениями кормовой красной и дикой свеклы Beta corolliflora Zoss. Для выявления полиморфизма и генетической структуры родительских форм сахарной, кормовой свеклы, дикой свеклы и их гибридов использовали пять SSR-праймеров серии Sb: Sb04, Sb06, Sb07, Sb09, Sb10. В результате ПЦР-анализа 20 селекционных номеров свеклы выявлена высокая гетерогенность продуктов амплификации с применяемыми праймерами. Наименьшей полиморфностью обладает праймер Sb06. При амплификации с ним геномной ДНК всех исследуемых материалов свеклы был получен только один ПЦР-продукт длиной около 150 п.н. Праймер Sb10 показал наибольшую полиморфность, поскольку в разных образцах ДНК он имел продукт разной длины. Праймеры Sb06, Sb07, Sb09 имеют разную степень полиморфности в разных образцах ДНК свеклы. Значимой связи продуктивности селекционных образцов свеклы и изученных микросателлитных локусов не выявлено.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Lepekhov, S.B., Altai Research and Development Inst. of Agriculture, Barnaul

Genetic diversity is the basis for successful breeding programs and can be evaluated by different methods. This paper discusses genetic divergence and correlation between morphobiological yielding capacity differences of varieties. From 2013 to 2016, thirty one spring bread wheat genotypes grown in the Altai Research Institute of Agriculture (Barnaul) were evaluated for Euclidean distance and correlations of six morphobiological traits (plant height, number of sterile spikelets per spike, kernel number per spike, harvest index, days of sprouting-heading period and yield). The differences of varieties regarding the studied traits appeared every year. Grain yield showed moderate significant positive correlation with plant height (correlation coefficient varied from 0.17 to 0.66 through the years) and kernel number per spike (0.20-0.66). Euclidean distance of complex traits showed low but significant correlation with square of yield difference (0.07-0.41). The studied morphobiological traits explain the yield differences of the varieties only in some way. | В основе успешных селекционных программ лежит изучение генетического разнообразия, которое оценивается с помощью различных методов. Рассматриваются генетическая дивергенция и взаимосвязь между морфобиологическими различиями сортов и различиями в их урожайности. В 2013-2016 гг. в Алтайском НИИСХ (г. Барнаул) были изучены евклидовы расстояния и сопряжённость 6 морфобиологических признаков (высота растения, количество стерильных колосков, озернённость главного колоса, уборочный индекс, продолжительность периода всходы-колошение и урожайность) у 31 генотипа яровой мягкой пшеницы. Различия сортов по рассматриваемым признакам стабильно проявлялись каждый год. Обнаружена значимая положительная корреляция между урожайностью и высотой растения (варьирование коэффициента корреляции по годам 0,17-0,65), а также озернённостью главного колоса (0,20-0,66). Коэффициент корреляции между евклидовым расстоянием совокупности изучаемых признаков и квадратом разности урожайности был низким и варьировал от 0,07 до 0,41. Рассмотренные морфобиологические признаки лишь в небольшой степени объясняют различия сортов по урожайности.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation