AGRIS - 

2015

Kovalchuk,M.A. | Gandzha,A.I. | Zhurina,N.V. | Kurak,O.P. | Simonenko,V.P. | Letkevich,L.L. | Kirillova,I.V.

Genotyping of pigs by PRKAG3 and RYR1 genes by PCR-RFLP method was spend. The objects of research were pigs of the following breeds: Belarusian Large White (BLW), Belarusian Meat (BM), Landrace (L), Duroc (D), Yorkshire (Y), bred in the breeding and hybrid centers of the republic. At molecular and genetic testing polymorphism of PRKAG3 and RYR1 genes was determined with animals of different breeds and sex and age groups (boars producers, sows and young animals at fattening), represented by alleles PRKAG3I, PRKAG3V и RYR1N, RYR1n, and genotypes PRKAG3VV, PRKAG3VI, PRKAG3II, RYR1NN, RYR1Nn were identified. It was found that averagely for all the breeds studied the highest concentration of the preferred PRK-AG3II genotype was observed in Landrace breed animals – 21,05%, and the lowest - in animals of Belarusian Large White breed (5,51%). In general, the concentration of preferred allele PRKAG3I in the breeds studied was low and averaged 0,24-0,50. By RYR1 gene averagely by breeds the frequency of occurrence of animals with RYR1NN genotype, free of mutations, was 90,23-100%, and carriers of the mutant gene RYR1Nn – 5,45-9,77%. | Проведено генотипирование свиней по генам PRKAG3 и RYR1 методом ПЦР-ПДРФ. Объектом исследования являлись свиньи пород: белорусской крупной белой (БКБ), белорусской мясной (БМ), ландрас (Л), дюрок (Д), йоркшир (Й), разводимые в селекционно-гибридных центрах республики. При молекулярно-генетическом тестировании был выявлен полиморфизм генов PRKAG3 и RYR1 у животных различных пород и половозрастных групп (хряков-производителей, свиноматок, откормочного молодняка), представленный аллелями PRKAG3I, PRKAG3V и RYR1N, RYR1n, и идентифицированы генотипы PRKAG3VV, PRKAG3VI, PRKAG3II, RYR1NN, RYR1Nn. Было установлено, что в среднем по всем изучаемым породам наибольшая концентрация предпочтительного генотипа PRKAG3II наблюдалась у животных породы ландрас – 21,05%, а наименьшая – у животных белорусской крупной белой породы (5,51%). В целом концентрация желательного аллеля PRKAG3I у животных исследуемых пород находилась на низком уровне и в среднем составила 0,24-0,50. По гену RYR1 в среднем по породам частота встречаемости животных с генотипом RYR1NN, свободных от мутации, составила 90,23-100 %, носителей мутантного гена RYR1Nn – 5,45-9,77%.

Show more [+]

Less [-]

National Academy of Sciences of Belarus - Belarus

2015

Shaydullin R.R. | Ganiyev A.S.

Presents the results of studies on the polymorphism and determining the frequency of occurrence of allelic variants in the gene Kappa-casein at 122 heifers, 142 fresh cows, 208 high yielding cows of black-motley breed. Heifers genotype gene Kappa-casein AA had 66,4 %, genotype AB was 30,3 % and the BB genotype — 3,3 %. The frequency of genotypes in fresh cows reached AA – 62,7 %, AB – 32,4 %, BB – 4,9 %, high yielding cows, respectively AA - 55,3 %, AB is 40,4 %, BB 4,3% of cows. In all studied animal groups the predominant is allele A gene Kappa-casein with frequency from 0,75 to 0,82. Statistical method of Hardy-Weinberg and χ2 method for detecting deviations of the empirical distribution of frequencies of genotypes of Kappa-casein from the theoretical showed that in a population of black-motley cattle of farms there is no statistically significant shift in genetic equilibrium according to none of the three genotypes at the locus of the gene Kappa-casein. The influence of genotypes on gene Kappa-casein on the main indicators of milk production of cows is studied. Based on the results of the DNA test, the animals were divided into three groups with genotypes AA, AB and BB. Cows with the genotype of Kappa-casein BB at the highest level of milk yield have better indicators of output of milk fat and protein. | Представлены результаты исследований по изучению полиморфизма и определению частоты встречаемости аллельных вариантов по гену каппа-казеина у 122 телок, 142 коров-первотелок, 208 высокопродуктивных коров черно-пестрой породы. У телок генотип гена каппа-казеина АА имели 66,4 %, генотип АВ 30,3 % и генотип ВВ 3,3 %. Частота генотипов у коров-первотелок достигла АА – 62,7 %, АВ – 32,4 %, ВВ – 4,9 %, у высокопродуктивных коров соответственно АА - 55,3 %, АВ 40,4 %, ВВ 4,3 % коров. Во всех изученных групп животных преобладает аллель А гена каппа-казеина с частотой от 0,75 до 0,82. Статистический метод Харди-Вайнберга и метод χ2 для выявления отклонений эмпирического распределения частот генотипов каппа-казеина от теоретического показал, что в популяции черно-пестрого скота хозяйства не имеется статистически достоверного сдвига генетического равновесия ни по одному из трех генотипов по локусу гена каппа-казеина. Изучено влияние генотипов по гену каппа-казеина на основные показатели молочной продуктивности коров. На основании результатов анализа ДНК животные были подразделены на три группы с генотипами АА, АВ и ВВ. коровы с генотипом каппа-казеина ВВ при наиболее высоком уровне удоя обладают лучшими показателями выхода молочного жира и белка.

Show more [+]

Less [-]

Ulyanovsk State Agrarian University named after P.A. Stolypin - Russian Federation

2015

Shaydullin R.R. | Ganiyev A.S.

Presents the results of studies on the polymorphism and determining the frequency of occurrence of allelic variants in the gene Kappa-casein at 122 heifers, 142 fresh cows, 208 high yielding cows of black-motley breed. Heifers genotype gene Kappa-casein AA had 66,4 %, genotype AB was 30,3 % and the BB genotype — 3,3 %. The frequency of genotypes in fresh cows reached AA – 62,7 %, AB – 32,4 %, BB – 4,9 %, high yielding cows, respectively AA - 55,3 %, AB is 40,4 %, BB 4,3% of cows. In all studied animal groups the predominant is allele A gene Kappa-casein with frequency from 0,75 to 0,82. Statistical method of Hardy-Weinberg and χ2 method for detecting deviations of the empirical distribution of frequencies of genotypes of Kappa-casein from the theoretical showed that in a population of black-motley cattle of farms there is no statistically significant shift in genetic equilibrium according to none of the three genotypes at the locus of the gene Kappa-casein. The influence of genotypes on gene Kappa-casein on the main indicators of milk production of cows is studied. Based on the results of the DNA test, the animals were divided into three groups with genotypes AA, AB and BB. Cows with the genotype of Kappa-casein BB at the highest level of milk yield have better indicators of output of milk fat and protein. | Представлены результаты исследований по изучению полиморфизма и определению частоты встречаемости аллельных вариантов по гену каппа-казеина у 122 телок, 142 коров-первотелок, 208 высокопродуктивных коров черно-пестрой породы. У телок генотип гена каппа-казеина АА имели 66,4 %, генотип АВ 30,3 % и генотип ВВ 3,3 %. Частота генотипов у коров-первотелок достигла АА – 62,7 %, АВ – 32,4 %, ВВ – 4,9 %, у высокопродуктивных коров соответственно АА - 55,3 %, АВ 40,4 %, ВВ 4,3 % коров. Во всех изученных групп животных преобладает аллель А гена каппа-казеина с частотой от 0,75 до 0,82. Статистический метод Харди-Вайнберга и метод χ2 для выявления отклонений эмпирического распределения частот генотипов каппа-казеина от теоретического показал, что в популяции черно-пестрого скота хозяйства не имеется статистически достоверного сдвига генетического равновесия ни по одному из трех генотипов по локусу гена каппа-казеина. Изучено влияние генотипов по гену каппа-казеина на основные показатели молочной продуктивности коров. На основании результатов анализа ДНК животные были подразделены на три группы с генотипами АА, АВ и ВВ. коровы с генотипом каппа-казеина ВВ при наиболее высоком уровне удоя обладают лучшими показателями выхода молочного жира и белка.

Show more [+]

Less [-]

Ulyanovsk State Agrarian University named after P.A. Stolypin - Russian Federation

2015

Onishchuk, O.P. | Kurchak, O.N. | Chizhevskaya, E.P. | Provorov, N.A. | Simarov, B.V., All-Russia Research and Development Inst. of Agricultural Microbiology, St. Petersburg

Selection of commercially valuable strains of Rhizobia is usually performed for symbiotic efficiency (ability to increase inoculated host plants mass due to intensive nitrogen fixation) and competitiveness (ability alfalfa rhizobia to colonize plants in presence of other rhizobia strains of same species). By PCR analysis of Sinorhizobium meliloti of various origins there was shown for 1st time natural populations' polymorphism for genes Smc03879 or phbA "effective symbiosis's negative regulator", encoding poly-beta-hydroxybutyrate (PBH) synthesis and Sma0907 or str-107 (involved in competition for nodulation). In poor alkaline soil population (Uralsk region, Kazakhstan) phbA gene was detected in 100% of strains, in rich Chernozem soil population of Ternopol region of Ukraine - in only 82.2% of strains. Even lower phbA occurrence (30.8%) is characteristic of strains isolated from alfalfa nodules collected in Ternopil region. This polymorphism may reflect a different adaptive value for conversion of C-compounds into PBH for rhizobia strains from the different regions. Participation of gene phbA in the control of symbiotic efficiency is confirmed by the fact that for the gene nifH, which encodes for the structure of the small subunit of nitrogenase, but does not affect the intensity of its synthesis, differences in polymorphism between strains of 2 populations were not identified. The absence of polymorphism for gene Smb21375 or eff-798 in all studied populations may be due to the fact that it encodes an ABC transporter required for the uptake by bacteria the broad range of essential nutrients obtained from both the host plant or from the soil. An increased incidence of effective symbionts among strains lacking gene phbA, indicates the prospects to use the molecular probes containing this gene for the selection of practically important rhizobia genotypes that can provide the host plant with the significant amounts of fixed nitrogen. | Отбор хозяйственно ценных штаммов ризобий обычно ведут на симбиотическую эффективность (способность повышать массу инокулированных растений-хозяев благодаря интенсивной азотфиксации) и конкурентоспособность (способность заселять растения в присутствии других штаммов этого же вида ризобий). С помощью ПЦР-анализа штаммов ризобий люцерны (Sinorhizobium meliloti) различного происхождения был впервые показан полиморфизм природных популяций по генам Smc03879, или phbA ("негативный регулятор эффективного симбиоза", кодирующий синтез поли-бета-гидроксибутирата - ПБГ), и Sma0907, или cmp-107 (участвует в конкуренции за образование клубеньков). В популяции из бедной солончаковой почвы (Уральская область, Казахстан), ген phbA выявлен у 100% штаммов, а в популяции из богатой черноземной почвы Тернопольской области Украины - лишь у 82,2% штаммов. Еще более низкая встречаемость гена phbA (30,8%) характерна для штаммов из клубеньков люцерны, собранных в Тернопольской области. Наблюдаемый полиморфизм может отражать разную адаптивную значимость конверсии С-соединений в ПБГ для штаммов ризобий из разных регионов. Участие гена phbA в контроле симбиотической эффективности подтверждается тем, что для гена nifH, который кодирует структуру малой субъединицы нитрогеназы, но не влияет на интенсивность ее синтеза, различий в показателях популяционного полиморфизма между штаммами 2 популяций выявлено не было. Отсутствие во всех изученных популяциях полиморфизма по гену Smb21375, или eff-798, может быть связано с тем, что кодируемый им АВС-транспортер необходим для переноса в бактериальную клетку широкого спектра питательных веществ, получаемых как от растения-хозяина, так и из почвы. Высокая встречаемость эффективных симбионтов среди штаммов, лишенных гена phbA, указывает на возможность использования молекулярных зондов, содержащих этот ген, для отбора практически значимых генотипов ризобий, способных обеспечивать растение-хозяина значительными количествами фиксированного азота.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2015

Zhurina,N.V. | Gandzha,A.I. | Kovalchuk,M.A. | Kurak,O.P. | Letkevich,L.L. | Simonenko,V.P. | Kirillova,I.V.

Изучено влияние полиморфных вариантов генов MUC4, ECR F18/FUT1 и Мх1 на репродуктивные качества свиноматок белорусской крупной белой и белорусской мясной пород. В результате проведённых исследований установлено достоверное увеличение показателей количества поросят к отъёму у свиноматок генотипа MUC4СС на 0,6 поросёнка, количества родившихся и живых поросят у свиноматок комплексного генотипа MUC4СС Mx1АА на 0,6-0,7 поросенка, достоверное снижение процента аварийных опоросов у животных генотипов ECR F18/FUT1АА, MUC4СС ECR F18/FUT1АА, ECR F18/FUT1АА Mx1АА на 11,8-15,5 процентных пунктов, а также тенденция положительного влияния генотипов MUC4СС, Mx1АА, ECR F18/FUT1АА и комплексных генотипов MUC4СС Mx1АА, MUC4СС ECR F18/FUT1АА, ECR F18/FUT1АА Mx1АА на ряд показателей репродуктивных признаков свиноматок белорусской крупной белой и белорусской мясной пород. | The effect of polymorphic variants of MUC4, ECR F18/FUT1 and Mx1 genes on reproductive traits of sows of Belarusian large white and Belarusian meat breeds is studied. As the result of the spent researches the significant increase in the number of piglets to weaning from sows of MUC4CC genotype by 0,6 pig, number of piglets born alive for sows of MUC4СС Mx1АА complex genotype by 0,6-0,7 pig, a significant decrease in the percentage of emergency farrowing for animals of ECR F18/FUT1АА, MUC4СС ECR F18/FUT1АА, ECR F18/FUT1АА Mx1АА genotypes by 11,8-15,5 percentage points, as well trend of positive effect of MUC4СС, Mx1АА, ECR F18/FUT1АА genotypes and MUC4СС Mx1АА, MUC4СС ECR F18/FUT1АА, ECR F18/FUT1АА Mx1АА complex genotypes on a number of indicators of performance traits of sows of Belarus Large White and Belarus Meat breeds.

Show more [+]

Less [-]

National Academy of Sciences of Belarus - Belarus

2015

Levy,A.V. | Voronkova,E.V. | Polyukhovich,Y.V. | Yermishin,A.P.

В результате исследования выделены два SSR-фрагмента, наличие которых достоверно коррелировало с высокой устойчивостью к фитофторозу. Анализ полученных данных позволяет сделать вывод о том, что SSR фрагмент STM3023- 200 (хромосома IV) может рассматриваться в качестве ПЦР-маркера для идентификации ранее не картированного гена устойчивости к фитофторозу S. stoloniferum, родственного Rpi-генам семейства R2. Фрагмент STM0031-173 может служить в качестве ПЦР-маркера для идентификации генетического локуса, вероятно, являющегося аналогом QTL VII/P49, картированного на хромосоме VII в нескольких расщепляющихся диплоидных популяциях гибридов с генами устойчивости к фитофторозу, интрогрессированными от диких видов картофеля. | Late blight (phytophthora) appears one of the most harmful diseases of potato and other Solanum cultivars leading to great crop yield losses. The most perspective directions of potato resistance to phytophthora appears selection of pathogen-resistat potato species due to introgression of resistance genes. As a result of the study of microsatellite DNA loci polymorphism in the population of diploid interspecific hybrids originated from wild allotetraploid potato species Solanum stoloniferum, two SSR-loci were revealed presence onthat was correlated with high level of late blight resistance. The analysis of obtained data made it possible to conclude that the SSR-locus STM 3023-200 (mapped on chromosome IV) may be considered as PCR-marker of late blight resistance gene of Solanum stoloniferum (not mapped earlier) which is related to Rpi-genes of R2 family. The locus STM 0031-173 may be used as the PCR-marker for detection of genetic locus, probably being the analig of QTL VII/P49, mapped on chromosome VII in several segregating diploid populations of hybrids with late blight resistance genes introgressed from wild potato species.

Show more [+]

Less [-]

National Academy of Sciences of Belarus - Belarus