AGRIS - 

2017

I. Yarova | I. Yarova | V. Bech | I. Zaloilo

Purpose. To investigate the genetic structure of the Galician carp population using microsatellite DNA markers.Methodology. Blood samples taken from the caudal vein of the specimens of the Galician carp farm "Velykyy Lyubin", Lviv region. (N = 15 persons). When landing, they were labeled with electronic chips of the brand Aqua Pump and A-CHIP. The total DNA was isolated using the standard method, using the Gene JET Whole Blood Genomik DNA Purification Mini Kit (USA). The concentration and quality of DNA were determined on an Eppendorf Bio Photometr biophotometer.To study the genetic structure of the Galician carp population, four microsatellite markers were used: MFW 06, MFW 15, MFW 23, MFW 31.Findings. Blood samples taken from the tail vein of fish (n = 15 oz.) Were used as research material. In the course of work, optimal conditions for SSR-PCR analysis have been selected. The conducted studies allowed to determine the factors that have the greatest impact on the amplification efficiency, namely: the concentration of the DNA preparation, the concentration of the primer in the reaction mixture and the number of amplification cycles. In the study group, for all 4 microsatellite loci, only 18 alleles with a molecular weight of 130-343 ng were detected. The number of alleles per locus varied from 3 to 6. The most polymorphous was the locus MFW 23 (6 alleles were detected), and the least polymorphic was the locus MFW 31 (3 alleles were detected). The effective number of alleles in the sample of genotypes studied varied from 2.14 (MFW 31) to 5.23 (MFW 23). According to calculations of allelic frequencies, the main indicators of genetic variability are determined. The maximum level of available heterozygosity is fixed for the MFW 23 locus, the lowest for the MFW locus 31.Originality. For the first time in 65 years the genetic structure of the Galician carp population has been investigated.Practical value. The results will be used in further studies of the arboreal of Galician carp.

Show more [+]

Less [-]

Directory of Open Access Journals - Sweden

2017

Suprun, I.I., North-Caucasian Federalal Center for Horticulture, Viticulture, Wine-making, Krasnodar

By using the polymorphism analysis of microsatellite loci, DNA certification and estimation of the degree of genetic similarity for a set of 20 modern peach varieties bred in Nikita botanical garden (Crimea) were performed. The studied varieties are in demand in horticulture, agroсlimatic conditions of the region and are valuable in breeding as sources of useful adaptive traits. To analyze the polymorphism of studied varieties 13 SSR-markers were used: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 and BPPCT002. Markers were divided into multiplex sets, which included 3-4 markers. Optimal combinations of SSR-markers made it possible to obtain easily interpreted results during fragment analysis. Among the used SSR markers the highest number of alleles (5) was found in markers BPPCT025 and CPPCT044, the least polymorphic markers were CPPCT040, UDP98-409, BPPCT028 (two alleles) and BPPCT002 (one allele). The remaining SSR-markers revealed 3-4 alleles per locus. Analysis of the obtained DNA fingerprints showed that all studied varieties have a unique allelic set. The most polymorphic SSR-markers are promising for use in the DNA certification of peach genetic resources. The cluster analysis revealed three main clusters, the distribution in which, in some cases, corresponds to the origin of the varieties. Genetic similarity data together with data on the origin of varieties can be used for planning of cross combinations when it is necessary to maximize the diversity level in the hybrid offspring. | С использованием анализа полиморфизма микросателлитных локусов выполнена ДНК-паспортизация и оценка степени генетического сходства выборки из 20 современных сортов персика селекции Никитского ботанического сада (Крым). Исследованные сорта являются востребованными в садоводстве в агроклиматических условиях региона и представляют селекционный интерес как источники полезных адаптивных признаков. Для анализа полиморфизма исследуемых сортов использовали 13 SSR-маркеров: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 и BPPCT002. Маркеры были распределены в мультиплексные наборы, включающие 3-4 маркера. Оптимальные сочетания SSR-маркеров позволили получать легко интерпретируемые результаты в ходе фрагментного анализа. Среди использованных SSR-маркеров наибольшее количество аллелей (5) было выявлено для маркеров BPPCT025 и CPPCT044, наименее полиморфными оказались маркеры CPPCT040, UDP 98-409, BPPCT028 (2 аллеля) и BPPCT002 (1 аллель). По остальным SSR-маркерам было выявлено по 3-4 аллеля на локус. Анализ полученных ДНК-фингерпринтов показал, что все изученные сорта обладают уникальным аллельным набором. Наиболее полиморфные SSR-маркеры перспективны для использования при ДНК-паспортизации генетических ресурсов персика. Выполненный кластерный анализ выявил 3 главных кластера, распределение в которых в ряде случаев согласуется с происхождением сортов. Данные о степени генетического сходства в совокупности с данными о происхождении сортов могут быть использованы для планирования комбинаций скрещиваний при необходимости получения максимального уровня разнообразия в гибридном потомстве.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Kosko,I.S. | Sheyko,I.P. | Epishko,O.A. | Chernov,A.S.

Polymorphism of RYR1 gene was studied – ryanodine receptor gene (eng. Ryanodine Receptor 1), which mutation leads to the development of swine stress syndrome, and ESR gene – estrogen receptor gene (eng. Estrogen Receptor), having effect on reproductive traits, in population of hybrid sows of Belarusian Large White X Belarusian Meat (BLW X BM), Belarusian Large White X Yorkshire (BLW X Y) and Landrace X Yorkshire (L X Y) when crossed with boars of Duroc (D) breed and hybrid boars of Duroc X Pietrain (D X P) of German selection. All the tested groups of pigs are monomorphic by RYR1 gene, which indicates absence of species susceptible to malignant hyperthermia in the studied population. By ESR gene, for animals of (BLW X BM) X D and (L X Y) X (D X P) two genotypes were determined: ESRAA and ESRAB, and correlation of (BLW X BM) X (D X P) and (BLW X Y) X (D X P) showed all the three genotypes. Also the effect of ESR gene polymorphism on the number of reproductive traits of sows was studied. Positive effect of ESRB allele was determined with animals of correlations (BLW X BM) X (D X P) and (BLW X Y) X (D X P) on such traits as multiple pregnancy, milkiness, litter weight and piglets weight at weaning in 35 days. However, in the groups of animals not having species of ESRBB genotype, this trend is not traced clearly. The obtained results can be used for implementation in practical breeding by marker genes that will allow to evaluate the frequency of occurrence of desirable and undesirable alleles and conduct further purposeful selection, which will enhance the resistance of animals to stress and increase their performance. | Многоплодие является одним из основных показателей рентабельности свиноводства. Так, содержание матки окупается стоимостью 4–5 откормочных свиней, и только с 6-го поросенка матка начинает приносить доход. Как известно, размер гнезда свиноматки характеризуется низким коэффициентом наследуемости, величина которого колеблется в пределах 0,001–0,360. Отрицательное влияние на многоплодие оказывает интенсивная селекция на мясность. Кроме того, за последние десятилетия показатель многоплодия в странах с развитым свиноводством практически не изменился. В связи с этим актуальными и значимыми являются исследования проблемы повышения показателей репродуктивных признаков свиноматок, проводимые с использованием передовых молекулярно-генетических методов. В статье приведены результаты исследования полиморфизма генов RYR1 и ESR на поголовье свиноматок сочетаний (БКБ X БМ) X Д, (БКБ X БМ) X (Д X П), (БКБ X Й) X (Д X П), (Л X Й) X (Д X П), а также ассоциации полиморфных вариантов гена ESR с репродуктивными признаками животных. Установлено, что все протестированные животные устойчивы к стрессу (имеют генотип ESRNN). Концентрация предпочтительного для селекции аллеля ESRB в изученных группах свиноматок изменялась в пределах 0,25–0,45. Выявлено достоверное превосходство свиноматок генотипа ESRBB над животными альтернативных генотипов по показателям массы гнезда при отъеме и сохранности. Полученные результаты могут использоваться для внедрения в селекционную практику маркерных генов, это позволит оценивать частоту встречаемости желательных и нежелательных аллелей и проводить в дальнейшем целенаправленный отбор, что будет способствовать повышению устойчивости животных к стрессу и увеличению их продуктивности.

Show more [+]

Less [-]

National Academy of Sciences of Belarus - Belarus

2017

Kelleher Colin Thomas | Diskin Aidan

Коллекции живых растений ботанических садов являются хранилищами растительных генетических ресурсов. Однако генетическое разнообразие в ботанических садах часто ограничено из-за наличия только одного или очень немногих индивидуумов растений каждого вида. Задачей проведенного исследования было оценить варьирование генетического материала небольшого числа образцов Magnolia delavayi, культивируемых в ботанических садах в Ирландии, и определить, представляют ли они единый однородный генофонд или относятся к разным клонам. В результате было показано, что образцы в садах содержат два различных генотипа Magnolia delavayi. Исторические данные о происхождении остаются неясными, но анализ ДНК позволяет предположить, что два изученных образца происходят из двух разных источников. Показано, что хлоропластная ДНК может быть использована для разграничивания клонов Magnolia delavayi в коллекциях ботанических садов. | Collections of plants at the botanical gardens are storages of genetic resources. However, their genetic diversity is often limited, because there are only single or very few individual species of a plant. This study has assessed genetic material of small number of samples of Magnolia delavayi at the botanical gardens in Ireland and to establish whether they represent a single homogenous genepool or belong to distinct lineages. The results showed that specimens at the gardens contain two distinct genotypes. The historical data on the origin is unclear, but the DNA evidence suggests that the two lineages come from two different sources. A chloroplast DNA can be used to distinguish clones of Magnolia delavayi in the collections of the botanical gardens.

Show more [+]

Less [-]

Petrozavodsk State University - Russian Federation

2017

Egorashina, E.V. | Tamarova, R.V., Yaroslavl State Agricultural Academy

State programs of the development of animal breeding in Russian Federation set the task of not only increasing milk productivity of cows but also improving quality characteristics of milk especially protein milking ones. The study was done in Yaroslavl region in one of the bred livestock farms specialized in Ayrshires. Milk productivity of 107 cows of three breeds with the use of genetic markers on genotypes of caseines and beta-lactoglobulin has been analyzed. All animals demonstrated high ability in milking from the first to the third lactation. The highest coefficient of milking proved to be in Holsteins, which was 1.6, in Ayrshires – 1.3, in Holstein-Yaroslavl breed – 1.4. Under the highest yields Holsteins have statistically proven difference in the content of protein in milk – 3.0-3.24%, Ayrshires – 3.17-3.31% and Holstein-Yaroslavl cows – 3.19-3.26%. The highest-protein-fat coefficient (129.72) was obtained in cows of Holstein breeds due to high yields, in cows of Ayrshire breeds – 108.87; in Holstein-Yaroslavl breeds – 100.26. It has been found that the best characteristics of milk productivity the animals with the genotype AB on cappa-caseine have. On beta-lactoglobulin the tendency has been marked that the best characteristics of milk productivity the cows of Ayrshire and Holstein breeds with the genotypes AA and AB show. On the basis of the results obtained for increasing protein-milking abilities of Ayrshire and Holstein-Yaroslavl breeds it is recommended to use sires, which nave B allelic variant of cappa-caseine in their genome and to make an individual selection of parents – homogeneous consolidating and heterogeneous improving. | Государственными программами развития животноводства Российской Федерации ставится задача не только увеличения молочной продуктивности коров, но и улучшения качественных показателей молока, особенно по белковомолочности. Исследование проводили в Ярославской области, на одном из племзаводов по айрширской породе. Проанализирована молочная продуктивность 107 коров трех пород с использованием генетических маркеров по генотипам каппа-казеина и бета-лактоглобулина. Все животные показали высокую способность к раздою от первой до 3-ей лактации: наивысший коэффициент раздоя оказался у коров голштинской породы, который составил 1,6; у айрширских коров – 1,3; ярославских голштинизированных – 1,4. При наиболее высоких удоях коровы голштинской породы имеют статистически достоверную разность по содержанию белка в молоке, который изменяется в интервале 3,0-3,24%; в то время как у айрширской породы – 3,17-3,31% и у ярославских голштинизированных коров – 3,19-3,26%. Наивысший белково-жировой коэффициент (129,72) был получен у коров голштинской породы за счет более высоких удоев, у коров айрширской породы он составил 108,87; у ярославских голштинизированных коров – 100,26. Наилучшие показатели молочной продуктивности имеют животные с генотипом АВ по каппа-казеину у всех трех пород. По бета-лактоглобулину отмечена тенденция, что лучшие показатели молочной продуктивности имеют коровы айрширской и голштинской пород с генотипами АА и АВ. Для повышения белковомолочности коров трех разводимых в хозяйстве пород рекомендуем производству использовать быков-производителей, которые имеют В-аллельный вариант каппа-казеина в геноме, и проводить индивидуальный подбор родительских пар – гомогенный консолидирующий и гетерогенный улучшающий.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Zeleneva, Yu.V. | Plakhotnik, V.V. | Sudnikova, V.P., Tambov Research and Development Inst. of Agriculture

The practice has shown that the direct introduction of donors of other regions into the breeding process does not always give a desired result because of the weak adaptive ability of the following generations. The development of highly efficient genetic sources and donors adapted to the regional conditions and possessing a complex of positive traits and properties (e.g. group and/or complex tolerance to stress factors of environment) is necessary, in order not to damage the balance of associated genes among wheat varieties in the Central Chernozem Region and to increase breeding results. The molecular markers have been applied to identify Lr-genes in 79 breeding lines of wheat, grown in the Middle-Russian branch of FSBSI 'Tambov Research Institute of Agriculture'. The wheat lines combined tolerance to brown rust and other positive traits, e.g. resistance to stem pests, drought tolerance, high productivity, and technological quality of grain. The molecular analysis of the material identified single Lr-genes as well as the combination of several genes with different efficiency in one genotype. Among the studied material the Lr9, Lr10, Lr19, Lr20, Lr24, Lr26 and Lr34 genes have been found. There were a lot of lines with the Lr19 gene in a combination with Lr10, Lr20 and Lr26 genes in one genotype. | Практика показала, что прямое включение в селекционный процесс инорайонных доноров не всегда дает желаемый результат, в основном вследствие слабой адаптивности последующих поколений. Для снижения вероятности нарушения сложившегося среди районированных в ЦЧР сортов пшеницы баланса ассоциированных генов и повышения результативности селекции необходимо создание адаптированных к зональным условиям высокоэффективных генетических источников и доноров, обладающих комплексом положительных признаков и свойств; в первую очередь - групповой и (или) комплексной устойчивостью к стрессовым факторам среды. С использованием молекулярных маркеров проведена идентификация Lr-генов у 79 селекционных линий пшеницы, созданных в Среднерусском филиале ФГНБУ "Тамбовский НИИ сельского хозяйства", сочетающих устойчивость к бурой ржавчине с комплексом других положительных признаков (устойчивость к скрытостебельным вредителям, засухоустойчивость, высокая урожайность и технологические качества зерна). В результате молекулярного анализа изучаемого материала идентифицированы как единичные Lr-гены, так и сочетания в одном генотипе нескольких генов различной эффективности. Среди изученного материала были выявлены гены Lr9, Lr10, Lr19, Lr20, Lr24, Lr26, Lr34. Преобладали линии с геном Lr19 в сочетании в одном генотипе с Lr10, Lr20 и Lr26.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Korolev,K.P. | Bogdan,V.Z. | Bogdan,T.M.

Ideas of N.I. Vavilov about the role of mutations in the evolution of crop plants were realized in many achievements of scientific centers. The method of experimental mutagenesis enriched collection nurseries with new material, which is of great importance in the selection according to adaptation and productivity. A famous Swedish geneticist A. Harberg, on the basis of many years of breeding by mutagenesis at the Svalef breeding station, concluded that ‘induction of mutations is the correct way for the creation of new genetic material and a useful tool among others in the breeder’&#039 | Идеи Н. И. Вавилова о роли мутаций в эволюции культурных растений, нашли воплощения в достижениях многих научных центров. Метод экспериментального мутагенеза обогатил коллекционные питомники новым материалом, имеющим большое значение в селекции на адаптацию и урожайность. Известный шведский генетик А. Харберг, на основании многолетней селекционной работы по мутагенезу на Свалефской селекционной станции сделал вывод, что ‘индуцирование мутаций - верная дорога для создания нового генетического материала и полезное орудие среди других в руках селекционера’. К физическим мутагенам относят: радиационные излучения электромагнитной и курпускулярной природы, гамма- и рентгеновские лучи, температурный фактор, ультразвук, импульсный концентрированный солнечный свет. Химические мутагены: алкилирующие соединения, производные гидроксиламина, ингибиторы и аналоги азотистых оснований, окислители, восстановители и свободные радикалы, акридиновые красители, гербициды, фунгициды, инсектициды. Среди биологических мутагенов выделяют: ДНК и РНК природные или синтетические, вирусы, вещества биологической природы, обладающие мутагенными свойствами (афлотоксины, гормоны). Представлены основные методы и способы мутагенного воздействия, отражены исторические аспекты и результаты использования индуцированного мутагенеза в селекции льна-долгунца в отечественных и зарубежных научно-исследовательских учреждениях. Отмечена важность факторов мутагенной природы в повышении генотипической изменчивости и способа создания нового исходного материала для различных направлений селекционного процесса льна-долгунца. | s hands.’ The physical mutagens include: electromagnetic and corpuscular radiation, gamma-rays and X-rays, temperature factor, ultrasound, pulsed concentrated sunlight. Chemical mutagens include: alkylating compounds, hydroxylamine derivatives, inhibitors and analogs of nitrogenous bases, oxidizing agents, regenerating agents and free radicals, acridine dyes, herbicides, fungicides, and insecticides. Biological mutagens include: natural or synthetic DNA and RNA, viruses, biological substances having mutagenic nature (aflatoxins, hormones). The main methods of mutagenic influence, shows the historical aspects and results of using induced mutagenesis in the selection of long-fiber flax in the domestic and foreign research institutions were presented. It was established the importance of factors of mutagenic nature in increased genotypic variability and ways to create new initial material for different directions of selection process of long-fiber flax.

Show more [+]

Less [-]

National Academy of Sciences of Belarus - Belarus