AGRIS - S

Procedencia de los datos por país

Palabras clave de AGROVOC

2020

Slobodskova, V.V. | Dovzhenko, N.V. | Pryazhevskaya, T.S., Far Eastern State Technical Fishery Univ., Vladivostok

Deep-sea scallop Mizuhopecten yessoensis is one of the most common reearing species in the Primorsky Kray usually bred by two methods: cage and bottom. The cage (industrial) cultivation type is the most developed, but requires close attention, as improper planning of the mariculture development can affect the scallop survival, which will lead to significant financial losses. Nowadays mariculture farms in different countries register the mass mortality of the cultivated aquatic organisms, the causes of this phenomenon being difficult to be identified. The use of prognostic mechanisms based on biomarkers can help identify the hidden threats in the body of cultivated scallops that lead to the mass mortality. The assessment of the state of mollusks at earlier stages of development will allow predicting and preventing significant losses of commercially valuable species. There have been analyzed the biomarker and scallop mortality rates of the scallop cultivated by the cage method. Different groups of mollusks from 2 generations with the age difference of 10 years have been evaluated. In the course of the study it has been found that with the increasing number of DNA defects and active accumulation of malondialdehyde in tissues the mortality of mollusks increases. It was stated that in scallops aged 1 plus the generations of 2015 there were registered the great number of DNA molecule defects and the high level of malondialdehyde concentration in the digestive gland and in the gills, that is, mollusks experienced a severe oxidative stress. Subsequently this led to the mortality of almost all commercially valuable species aged 3 plus. The approaches used in the work are promising to develop techniques for predicting mariculture farms and marine ecosystems. | Гребешок приморский Mizuhopecten yessoensis является одним из самых распространенных объектов разведения в Приморском крае и обычно выращивается двумя способами: садковым и донным. Садковый (индустриальный) вариант культивирования наиболее развит, но требует пристального внимания, т. к. неправильное планирование хозяйственной деятельности может повлиять на выживаемость гребешка, что приведет к значительным финансовым потерям. В последнее время марикультурные фермы разных стран стали часто сталкиваться с массовой гибелью культивируемых гидробионтов, причем установить причины подобного явления крайне сложно. Использование прогностических механизмов на основе биомаркеров может помочь выявить скрытые угрозы в организме культивируемых гребешков, ведущие к массовой гибели. Оценка состояния моллюсков на более ранних стадиях развития позволит спрогнозировать и предупредить значительные потери среди товарных особей. Проанализированы показатели биомаркеров и смертности гребешка приморского, культивируемого садковым способом. Проведена оценка разновозрастных групп моллюсков 2-х поколений с разницей в 10 лет. В ходе исследования обнаружено, что с увеличением количества повреждений ДНК и активным накоплением малонового диальдегида в тканях риск гибели моллюсков возрастает. Отмечено, что у гребешков возраста 1 плюс поколения 2015 г. в пищеварительной железе и жабрах был зарегистрирован высокий уровень повреждений молекулы ДНК и малонового диальдегида, т.е. моллюски испытали сильный окислительный стресс. Впоследствии это привело к гибели практически всех товарных особей возраста 3 плюс. Использованные в работе подходы перспективны для разработки методик прогнозирования устойчивости хозяйств марикультуры и морских экосистем.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2020

Demurin, Ya.N. | Chebanova, Yu.V. | Borisenko, O.M. | Guchetl', S.Z. | Savichenko, D.L. | Efimenko, S.G. | Rubanova, O.A. | Shirokich, A.A. | Shamraj, V.D., The V.S. Pustovoyt All-Russia Research and Development Inst. of Oil–Producing Crops, Krasnodar

Summaries (Ru, En) | The creation and study of recombinant inbred lines is an effective method in breeding and genetic work with polygenic traits. A similar approach was used to indicate the content of oleic acid in sunflower seed oil. The experiments were carried out in the field and laboratory conditions in Krasnodar, in the period 2012–2020. To obtain recombinant inbred lines with different contents of oleic acid in seed oil, hybridization, self-pollination and disruptive selection were used for three reciprocal combinations LG27 x LG28, LG27 x VK678 and LG27 x LG26. The LG26 line has a high oleic phenotype, LG27 has a mid-oleic, VK678 has an increased oleic and LH28 has a low oleic. The analysis of the fatty acid composition of sunflower seed oil was carried out using the method of gas-liquid chromatography of methyl esters on Chrom-5 and Chromatek-Crystal 5000 instruments. Molecular genetic marking of high oleic sunflower samples was performed using two pairs of primers: F13/R5 and F4/R1. The initial parental lines LG28, VK678, LG27 and LG26 confirmed their belonging to their phenotypic classes. At the same time, with an increase in the oleic acid content from 29 to 88%, a significant decrease in the values of variability of the trait within classes CV from 14 to 1% was observed. The created recombinant inbred lines of sunflower F5 for crossing mid-oleic LG27 cover a wide range of oleic acid content from 30 to 92% in seed oil and are valuable material for further research. The full efficiency of using the molecular marker F4/R1 in the identification of high oleic mutations in lines with high oleic acid content in the phenotypic range of 87–92% has been proved. In this case, the mid-oleic LG27 and the mid-oleic developed recombinant inbred lines do not possess the Ol mutation. | Создание и изучение рекомбинантных инбредных линий является эффективным методом в селекционно-генетической работе с полигенными признаками. В исследовании подобный подход использован для признака содержания олеиновой кислоты в масле семян подсолнечника. Опыты проводили в полевых и лабораторных условиях в г. Краснодар в период 2012–2020 гг. Для получения рекомбинантных инбредных линий с различным количеством олеиновой кислоты в масле семян проводили скрещивание, самоопыление и дизруптивный отбор для трех реципрокных комбинаций ЛГ27 x ЛГ28, ЛГ27 x ВК678 и ЛГ27 x ЛГ26. Линия ЛГ26 обладает высокоолеиновым фенотипом, ЛГ27 – среднеолеиновым, ВК678 – повышенноолеиновым и ЛГ28 – низкоолеиновым.Анализ жирно-кислотного состава масла семян подсолнечника проводили с использованием метода газожидкостной хроматографии метиловых эфиров на приборах Хром-5 и Хроматэк-Кристалл 5000. Молекулярно-генетическое маркирование высокоолеиновых образцов подсолнечника проводили с использованием двух пар праймеров: F13/R5 и F4/R1. Исходные родительские линии ЛГ28, ВК678, ЛГ27 и ЛГ26 подтвердили принадлежность к своим фенотипическим классам. При этом с увеличением содержания олеиновой кислоты с 29 до 88%наблюдалось существенное снижение значений показателя изменчивости признака в пределах классов CVc 14 до 1%. Созданные рекомбинантные инбредные линии подсолнечника F5 при скрещиваниях среднеолеиновой ЛГ27 охватывают широкий интервал значений содержания олеиновой кислоты (от 30 до 92%) в масле семян и являются ценным материалом для дальнейших исследований. Доказана полная эффективность использования молекулярного маркера F4/R1 в идентификации мутации высокоолеиновости у линий с высоким содержанием олеиновой кислоты в фенотипическом интервале 87–92%. При этом полученные среднеолеиновые рекомбинантные инбредные линии и ЛГ27 не обладают мутацией Ol. | 3 tables | 2 ill.,27 ref.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2020

Savichenko, D.L. | Guchetl', S.Z. | Golovatskaya, A.V., The V.S. Pustovoyt All-Russia Research and Development Inst. of Oil–Producing Crops, Krasnodar

Studying of sunflower lines resistant to broomrape race G, bred in the V.S. Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops (VNIIMK), Krasnodar, showed the genetic control of resistance is monogenic with incomplete dominance. The purpose of the research was to seek and analyze molecular markers for the genes of resistance to broomrape race G using PCR-methods. In our research we used six developed in VNIIMK lines-donors resistant to broomrape race G: RGP1, RGP2, RGB, RGL1, RGL2, RGA, and susceptible lines VK 101, VK 678, VK 680. We extracted DNA from the leaves of young sunflower plants using STAB-buffer. For PCR-analysis we used 17 pairs of primers of two types: SCAR (sequence characterized amplified region) and SSR (simple sequence repeat). Conditions of amplification are as recommended by authors of markers with experimental selection of a temperature for primers hybridization. Within the research we balanced involved into work SSR- and SCAR-loci using BLAST and a set of HanXRQr1.0. Due to these data we composed a physical map of loci location. After assessment of six resistant and three susceptible parental lines, seven markers demonstrated polymorphism by a length of locus DNA and two ones – by presence/absence of amplified fragment. For markers ORS 683 and ORS 1112 we observed a relation between loci polymorphism and susceptibility of parental lines to broomrape. This was certified with a presence of an allele of 364 n.p. length in ORS 683 and an absence of an allele of 375 n.p. length in ORS 1112. These markers were noted as primary ones for hybridological analysis in F1и F2 with selected pairs for crossing. Additional markers will be selected individually using obtained data on loci polymorphism. Thus, as a result of the research we created a physical map for the further markers selection, found hybrid combinations and markers from the studied ones for hybridological analysis. | Исследование линий, устойчивых к расе G заразихи, созданных на центральной экспериментальной базе ВНИИМК, показало генетический контроль устойчивости как моногенный с неполным доминированием. Целью работы являлся поиск и анализ молекулярных маркеров для генов устойчивости к расе G заразихи на основе применения методов ПЦР. Материалом исследования служили созданные во ВНИИМК 6 линий-доноров, устойчивых к расе G заразихи: RGP1, RGP2, RGB, RGL1, RGL2, RGA, а также восприимчивые линии ВК 101, ВК 678, ВК 680. Выделение ДНК проводилось из листьев молодых растений с использованием CTAB-буфера. Для ПЦР-анализа использовали 17 пар праймеров 2 типов: SCAR (sequence characterized amplified region) и SSR (simple sequence repeat). Условия амплификации рекомендованные авторами маркеров с экспериментальным подбором температуры гибридизации праймеров.В рамках исследования используемые в работе SSR и SCAR локусы с помощью инструмента BLAST были сопоставлены со сборкой HanXRQr1.0. По этим данным составлена физическая карта положения локусов. При оценке 6 устойчивых и 3 восприимчивых родительских линий полиморфизм по длине локуса ДНК показали 7 маркеров, а по наличию/отсутствию амплифицированного фрагмента – 2 маркера. У маркеров ORS 683 и ORS 1112 была отмечена связь полиморфизма локусов с восприимчивостью растений родительских линий к заразихе. У ORS 683 это выражалось наличием аллеля длиной 364 п.н., а у ORS 1112 – отсутствием аллеля длиной 375 п.н. Данные маркеры отмечены как основные для гибридологического анализа в F1 и F2 с выбранными парами для скрещиваний. Дополнительные маркеры будут подобраны индивидуально на основании полученных данных по полиморфизму локусов. Таким образом, в результате исследования была составлена физическая карта для дальнейшего подбора маркеров, выбраны гибридные комбинации и маркеры из числа изученных для гибридологического анализа.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Ramazanova, S.А. | Antonova, Т.S., The V.S. Pustovoyt All-Russia Research and Development Inst. of Oil–Producing Crops, Krasnodar

One of the most dangerous diseases on sunflower is downy mildew. By now, there are known more than 45 physiological races of the pathogen in the world. The effective method to control the pathogen is to introduce dominant gens of resistance into host-plant. The modern technologies of genetic typing using DNA-markers allowing controlling these genes present at the each stage of breeding process. The aim of the research is to reveal DNA markers to identify genes controlling resistance to Plasmoparahalstedii, and to create a marker systemfor use insunflower breeding for complex resistance to various races of downy mildewcausative agent.We approbated nine STS and three SSR-markers of the gens Pl5, Pl6 and Pl8 well known from the literary sources, which control sunflower resistance to P. halstedii races with purpose to identify these genes in lines-differentiators of sunflower resistance which are included into the international test-set for P. halstedii races identification. We selected and tested a molecular STS-marker НАР3 which can be used for identification of Pl6 locus controlling sunflower complex resistance to downy mildew pathogen, races100, 300, 700, 703, 710, 330, 770 and 730. This marker can be used in marker-assisted sunflower breeding. | Одной из самых вредоносных болезней подсолнечника является ложная мучнистая роса. К настоящему времени в мире обнаружено более 45 физиологических рас патогена. Эффективным методом контроля над возбудителем болезни является введение доминантных генов устойчивости к нему в растение-хозяина. Современные технологии генотипирования с помощью ДНК-маркеров позволяют контролировать наличие этих генов на каждом этапе селекции. Цель работы – поиск ДНК-маркеров для идентификации генов, контролирующих устойчивость к Plasmoparahalstedii, и создание на их основе системы маркеров с последующим использованием ее в селекции подсолнечника на комплексную устойчивость к разным расам возбудителя ложной мучной росы. Апробированы известные из литературных источников девять STS и три SSR-маркера генов Pl5, Pl6 и Pl8, контролирующих устойчивость к расам P. halstedii, для идентификации этих генов у линий-дифференциаторов устойчивости подсолнечника, входящих в международный тест-набор для идентификации рас P. halstedii. Был отобран и апробирован молекулярный STS-маркер НАР3, пригодный для идентификации локуса Pl6, контролирующего устойчивость подсолнечника к расам 100, 300, 700, 703, 710, 330, 770 и 730возбудителяложной мучнистой росы. Маркер может использоваться в маркер-вспомогательной селекцииподсолнечника.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

T. Yu. Gagkaeva | O. P. Gavrilova | A. S. Orina | I. B. Ablova | L. A. Bespalova | Т. Ю. Гагкаева | О. П. Гаврилова | А. С. Орина | И. Б. Аблова | Л. А. Беспалова

Проведен анализ контаминации микромицетами зерна 17 сортов озимой пшеницы, выращенных в Краснодарском крае на естественном фоне инфекции. Кроме традиционной микологической оценки зараженности зерна грибами использовали методы, основанные на количественном выявлении метаболитов грибов, заведомо отсутствующих в растительной ткани. Определяли диапазоны содержаний в зерне пшеницы ДНК грибов Alternaria, Microdochium и Fusarium, а также количества образуемых ими микотоксинов. Установлено обильное присутствие грибов Alternaria в зерне всех сортов. Впервые в России проведено количественное выявление в зерне видов грибов Microdochium. Показано, что содержание ДНК M. nivale значительно превышает содержание ДНК M. majus. ДНК представителей рода Fusarium также выявлено в зерне всех сортов, однако показано, что F. graminearum преобладал в комплексе фузариевых грибов по сравнению с другими видами. Установлен значительный разброс содержаний вторичного метаболита F. graminearum – дезоксиниваленола (ДОН), – в зерне всех сортов. Максимальное количество этого метаболита выявлено в зерне восприимчивого сорта Бригада, а минимальное ‒ в зерне сортов Адель и Курс, которые обладали высокой относительной устойчивостью к патогенным грибам Fusarium. Доля ДНК F. graminearum в процентах от ДНК группы Fusarium, образующих трихотеценовые микотоксины, составляла от 6,1% до 100,9%. Этот показатель является индикатором устойчивости растений к заражению патогенами: значения выше 30% характерны для восприимчивых сортов. Выявлена достоверная положительная связь между контаминацией грибами F. sporotrichioides и M. nivale. В то же время, не установлена связь между наиболее обильно присутствующими в зерне грибами Alternaria и показателями его контаминации другими анализированными грибами. Результаты исследования показывают существенные различия реакции генотипов пшеницы на внедрение различных гетеротрофных грибов, и возможность использования количественных показателей для оценки устойчивости. Существенная вариабельность в зерне содержания маркерных метаболитов, присущих высокоагрессивным видам грибов, и стабильность этих показателей у сапротрофных организмов, может иметь принципиальное значение при выборе объективных количественных показателей оценки устойчивости растений к инфицированию патогенами. | Fungal contamination of 17 winter wheat varieties grown in the Krasnodar region under the natural infections was analyzed. In addition to the traditional mycological analysis of infection with fungi, methods based on the quantitative detection of metabolites inherent in fungi and absent in the host plant were used. For this purpose, the ranges of DNA contents of Alternaria, Fusarium and Microdochium fungi, as well as mycotoxins produced by these fungi were characterized in the grain. Abundant presence of Alternaria fungi was detected without a significant difference between the varieties. A quantitative detection of the Microdochium fungi in grain was carried out at the first time in Russia and it was shown that the content of M. nivale DNA was significantly exceeds the content of M. majus DNA. The dominant of F. graminearumin the complex of Fusarium fungi in comparison to other species and the significant range of the content of the metabolites produced by this pathogen were shown. The high variation of contents of marker metabolites inherent in highly aggressive species of fungi and the stability of these parameters for saprotrophic organisms can be of fundamental importance in the selection of objective for quantitative measurements of plants resistant to pathogens. The maximum amount of F.graminearum metabolites was found in the grains of susceptible Brigada. The minimum content of Fusarium metabolites was established in the grain of Adel and Kurs varieties, which are the relatively resistant to pathogenic Fusarium fungi. The proportion of F.graminearum DNA as a percentage of the DNA of Fusarium group forming trichothecene mycotoxins ranged from 6.1% to 100.9%. This value is an indicator of plant resistance to infection by pathogens. According to our observations, values above 30% are characteristic of susceptible varieties. A positive correlation was found between DNA contents of M.nivale and F. sporotrichioides fungi. Any significant relations between the most abundantly present fungi of Alternaria and the parameters of grain contamination by other analyzed fungi have not been revealed. Diversity of the reactions of wheat genotypes to the invasion of various heterotrophic fungi and the possibility of using objective quantitative assessment of resistance were shown.

Mostrar más [+]

Menos [-]

N.I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources - Russian Federation

2019

Deniskova, T.E. | Dotsev, A.V. | Petrov, S.N. | Fornara, M.S., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

The article presents the results of assessment of genetic diversity and Principal Component Analysis (PCA) in the resource sheep population, originated from crossing of fast-growing (Katahdin) and slow growing (Romanov) breeds for QTL mapping and search for candidate genes associated with growth rate. The study was conducted on 88 sheep from the resource population, including two unrelated families that have been reared in the Moscow region since 2017. Each family consists of a Katahdin ram (founder), Romanov's ewes (mothers), F1 hybrids, and two groups of backcrosses. All sheep were genotyped using a high-density DNA chip Illumina Ovine Infinium HD SNP BeadChip (600 thousand SNP markers). SNP markers were filtered in the PLINK v.1.90. PCA was performed in PLINK v.1.90 and visualized in R package ggplot2. The genetic diversity indices (Ho, uHe, Ar, FIS) were calculated in R package "diversity". It was established that both crosses had higher level of genetic diversity in comparison with the mother breed. F1 hybrids were characterized by the highest level of observed heterozygosity (Ho= 0.409-0.407), while Ho ranged from 0.382 to 0.396 for the backcrosses, respectively. The expected heterozygosity ranged from 0.329 to 0.356 in the groups from the resource population. Allelic richness was high in all studied groups (more than 1.849). PCA showed that the mated parent breeds were highly differentiated, as it should be in successful establishment of the resource population. The phenotypic characteristic of the backcrosses on live weight and nine body measurements at 9, 42 and 90 days is given. The coefficients of variation were the highest by live weight (17.0-19.0%), body length (15.5-22.3%) and oblique body length (16.2% and 22.7%) at 90 days. The results are intermediate and create a genotypic and phenotypic base to perform GWAS at the next stage of our study. | Представлены результаты оценки генетического разнообразия и анализа главных компонент (PCA) в ресурсной популяции овец, специально созданной на основе скрещивания быстрорастущей (катадин) и медленнорастущей (романовская) пород для картирования QTL, ассоциированных со скоростью роста. Исследование было проведено на 88 головах ресурсной популяции овец, включающих 2 неродственных семейства, разводимых на территории Московской области с 2017 г. Каждое семейство состоит из барана-родоначальника породы катадин, романовских маток (матери), межпородных кроссов F1 и 2-х групп возвратных кроссов. Все животные были генотипированы с помощью ДНК-чипа высокой плотности Illumina Ovine Infinium HD SNP BeadChip (600 тысяч SNP-маркеров). В программе PLINK v.1.90 была проведена фильтрация SNP-маркеров и выполнен анализ PCA с визуализацией в R пакете ggplot2. Параметры генетического разнообразия (Ho, uHe, Ar, FIS) рассчитаны в пакете R "diveRsity". Показано, что оба кросса превосходят исходную материнскую породу по уровню генетического разнообразия. Кроссы F1 характеризуются наивысшим уровнем наблюдаемой гетерозиготности (Ho= 0,409-0,407), в то время как Ho составила от 0,382 до 0,396 у возвратных кроссов соответственно. Ожидаемая гетерозиготность варьировала от 0,329 до 0,356 в группах овец, составляющих ресурсную популяцию. Показатель аллельного разнообразия был довольно высоким во всех группах (более 1,849). PCA показал, что подобранные родительские породы являются контрастными, как и должно быть при успешной закладке ресурсной популяции. Дана фенотипическая характеристика возвратных кроссов по живой массе и 9 промерам туловища в 9, 42 и 90 дней. Коэффициенты вариации были наиболее высокими по живой массе (17,0-19,0%), длине туловища (15,5-22,3%) и косой длине туловища (16,2 и 22,7%) в 90 дней. Полученные результаты являются промежуточными и создают генотипическую и фенотипическую базу для проведения GWAS на следующем этапе исследования.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Klimenko, N.S. | Antonova, O.Yu. | Zheltova, V.V. | Fomina, N.A. | Kostina, L.I., The N.I. Vavilov All-Russia Inst. of Plant Genetic Resources, St. Petersburg

Potato Solanum tuberosum L. is infected by about 40 species of viruses, of which one of the most harmful is the potato virus Y (PVY). A number of genes conferring different types of PVY resistance have been identified in potato, of which Ry genes, conferring extreme resistance (the absence of accumulation of viruses in infected plants regardless of the virus strain), are most often involved in breeding programs in different countries. The search for effective markers of target genes remains relevant due to MAS prospects. This paper is the first report on the use of STM0003 marker associated with Rysto gene for screening Russian potato varieties; another marker, Ry364, was previously used once on a small sample of Russian varieties. The objective of this work was to screen 178 Russian varieties with three markers, STM0003, Ry364, and RYSC3 linked to Rysto, Rychc, and Ryadg genes which were introgressed into the breeding gene pool from wild species S. stoloniferum, S. chacoense, and from the Andean native varieties of S. tuberosum ssp. andigenum, respectively. As a result of the molecular screening, 39 (21.8%) of 178 varieties were selected for which diagnostic fragments of at least one of the three markers were revealed, including 7.3% varieties with STM0003 marker (Rysto), 11.7% varieties with Ry364 (Rychc), and 4.5% varieties with RYSC3 (Ryadg) marker. The results obtained indicate a low level of genetic defense against PVY of the analyzed cultivar subset among which 78.2% varieties have no markers linked to the Ry genes. We compared molecular screening results with published PVY resistance/susceptibility data. The marker STM0003 linked to the Rysto gene had the highest diagnostic value, as almost all varieties with this marker are highly resistant (immune) to PVY, while the Ry364298 and RYSC3 markers are not so efficient. | Картофель (Solanum tuberosum L.) поражают около 40 видов вирусов, из них одним из самых вредоносных является Y-вирус картофеля (Potato virus Y, PVY). У картофеля идентифицирован ряд генов, вовлеченных в контроль разных типов устойчивости к PVY, из них Ry гены, обусловливающие отсутствие накопления вирусных частиц в инфицированном растении независимо от штамма вируса, наиболее часто вовлекаются в селекционные программы в разных странах. В задачу исследования входил скрининг 178 сортов отечественной селекции по трем маркерам - STM0003, Ry364, RYSC3, сцепленным с генами Rysto, Rychc и Ryadg, которые были перенесены в селекционный генофонд от диких видов S. stoloniferum и S. chacoense, а также от андийских аборигенных сортов S. tuberosum ssp. andigenum. Для скрининга обширной выборки сортов отечественной селекции маркеры STM0003 и Ry364 привлечены впервые. В результате проведенного молекулярного скрининга в выборке из 178 сортов отобрано 39 (21,8%), у которых выявлены диагностические фрагменты как минимум одного из трех маркеров: у 7,3% сортов имеется маркер STM0003 гена Rysto, у 11,7% - маркер Ry364 гена Rychc и у 4,5% - маркер RYSC3 гена Ryadg. Полученные результаты указывают на невысокую генетическую защищенность изученной выборки от PVY: 78,2% из 178 сортов не имели ни одного из маркеров, сцепленных с Ry генами устойчивости к этому вирусу. Результаты молекулярного скрининга были сопоставлены с данными об устойчивости/восприимчивости сортов к PVY, взятыми из научных публикаций. Наибольшей диагностической ценностью обладает маркер STM0003, сцепленный с геном Rysto; фактически все сорта с этим маркером были высокоустойчивы (иммунны) к PVY, тогда как маркеры Ry364 и RYSC3 оказались не столь эффективны.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Il'nitskaya, Е.Т., North-Caucasian Federal Scientific Center of Horticulture and Viticulture, Krasnodar

The study of the indigenous gene pool of Vitis vinifera L. of different zones of viticulture with the involvement of molecular genetic methods is an urgent due to the wide diversity of grape varieties. 'Kachich' is the oldest Abkhazian grape variety, known for the quality of wines obtained from its harvest. The aim of the research is DNA fingerprinting of the 'Kachich' grape variety based on the analysis of polymorphism of microsatellite loci. The object of the study was the plants corresponding to the variety description, growing in the collection of the agricultural company "Wines and waters of Abkhazia" (Sukhum, Abkhazia). DNA was isolated from the young leaves of the top of the shoot of typical plants of the variety by the CTAB-method. Genotyping was carried out by polymerase chain reaction (PCR) with separation of reaction products by capillary electrophoresis. Highly polymorphic SSR-markers recommended for grapes varieties identification were used for study (VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD25, VVMD27, VVMD28, VVMD32, VrZAG62, VrZAG79). The size of amplified fragments was estimated using the automatic genetic analyzer ABI Prism 3130 and special software GeneMapper and PeakScanner. To clarify the size of amplified fragments, the DNA of reference varieties was used. According to the results of microsatellite analysis, the DNA-certificate of the genotype of the 'Kachich' grape variety was compiled: VVS2153 155 VVMD5234 240 VVMD7239 249 VVMD25239 267 VVMD27186 193 VVMD28234 248 VVMD32262 272 VrZAG62194 196 VrZAG79236 236. The resulting DNA-profile was checked for matches in the Vitis International Variety Catalogue VIVC. No matches of the obtained DNA-profile with any other DNA-profile presented in the Database were found. DNA-certificate of genotype 'Kachich' can be successfully used for varieties identification of grape plants if necessary to clarify their varietals affiliation. | Изучение аборигенного генофонда Vitis vinifera L. различных зон виноградарства с привлечением молекулярно-генетических методов – актуальная задача по причине большого разнообразия сортов винограда. Качич – древнейший абхазский сорт винограда, известный благодаря высокому качеству вин, получаемых из его урожая. Цель исследований – ДНК-паспортизация сорта винограда Качич на основе анализа полиморфизма микросателлитных локусов. Объект исследования - растения, соответствующие сортовому описанию, произрастающие в коллекции агрофирмы "Вина и воды Абхазии" (Сухум, Абхазия). ДНК выделяли из молодых листьев верхушки побега типичных растений сорта методом ЦTAБ. Генотипирование проведено на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) с разделением продуктов реакции методом капиллярного электрофореза. Использовали высокополиморфные SSR-маркеры, рекомендованные для сортовой идентификации винограда (VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD25, VVMD27, VVMD28, VVMD32, VrZAG62, VrZAG79). Оценка размера амплифицированных фрагментов проведена с использованием автоматического генетического анализатора ABI Prism 3130 и специального программного обеспечения GeneMapper и PeakScanner. Для уточнения размеров амплифицированных фрагментов в работе использовали ДНК референсных сортов. По результатам микросателлитного анализа составлен ДНК-паспорт генотипа сорта винограда Качич" – VVS2153 155 VVMD5234 240 VVMD7239 249 VVMD25239 267 VVMD27186 193 VVMD28234 248 VVMD32262 272 VrZAG62194 196 VrZAG79236 236. Полученный ДНК-профиль был проверен на предмет совпадений в международной базе Vitis International Variety Catalogue VIVC. Совпадений полученного ДНК-профиля с каким-либо иным ДНК-профилем из представленных в Базе данных не выявлено. ДНК-паспорт генотипа "Качич" может успешно быть использован для сортовой идентификации растений винограда при необходимости уточнения их сортовой принадлежности.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Vasil'chenko, E.N. | Kolesnikova, E.O. | Zhuzhzhalova, T.P., The A.L. Mazlumov All-Russia Research and Development Inst. of Sugar Beet and Sugar, Voronezh Region

A breeding work success is to a great extent determined by use of carefully selected material. To determine ploidy of crossing components and the obtained hybrids is one of the main elements of cytological studies conducted at all stages of new plant forms' development. However, conventional method of ploidy determination by counting of chromosomes in disposable or permanent preparations under light microscope is rather long and labour-consuming. Cytophotometric method based on measurement of nDNA quantity in cells is the most reliable one to determine ploidy of genotypes. One of the main aspects in sugar beet breeding is developing of heterosis hybrids. Here, heterosis effect in F1 is observed for triploid hybrids which obtaining depends on careful selection of crossing components. To provide high combining ability when conducting hybridization, work on a tetraploid component takes on special significance. In the course of the studies, it has been shown that use of flow cytophotometry allows discarding of plants with changed chromosome number and to select genotypes with a required ploidy. It was noticed that aneuploid forms with unbalanced chromosome number as well as diploid forms (reverse diploids) which quantity was 0.6–10.4% of the analyzed plants' number are found among tetraploid forms. The quantity of nuclear DNA in these forms varied and was 2С and 4С that corresponded to ploidy level of 2n = 18, 36. Obligatory discarding of these forms provided including plants with constant ploidy in breeding process that, as a result, allowed obtaining of triploid hybrids. Use of the cytophotometric analysis promoted selection of diploid (2n = 18) and tetraploid (4n = 36) forms and evaluation of sugar beet breeding material when developing heterosis hybrids with high degree of seed setting. This method is notable for high accuracy of nDNA quantity determination and productivity allowing solving a wide range of issues in plant genetics and breeding. | Одним из основных элементов цитологических исследований, проводимых на всех этапах создания новых форм растений, является определение плоидности компонентов скрещивания и получаемых гибридов. Однако традиционный прием определения плоидности путем подсчета хромосом во временных или постоянных препаратах под световым микроскопом длителен и трудоемок. Наиболее надежным способом определения плоидности генотипов является цитофотометрический метод, основанный на измерении количества яДНК в клетках. Одним из основных аспектов в селекции сахарной свеклы является создание гетерозисных гибридов. При этом у триплоидных гибридов, получение которых зависит от тщательного подбора компонентов скрещивания, наблюдается эффект гетерозиса в F1. Для обеспечения высокой комбинационной способности при гибридизации особое значение приобретает работа над тетраплоидным компонентом. В процессе исследований показано, что использование проточной цитофотометрии позволило провести браковку растений с измененным набором хромосом и отобрать генотипы с требуемой плоидностью. Среди тетраплоидных форм встречались анеуплоидные формы с несбалансированным числом хромосом, а также диплоидные формы (реверсивные диплоиды), количество которых составляло 0,6–10,4% от числа определяемых растений. Количество ядерной ДНК у этих форм варьировало и составляло 2С, 4С, что соответствовало уровню плоидности 2n = 18, 36. Обязательное проведение браковки данных форм обеспечило включение в селекционный процесс растений с постоянной плоидностью, что в итоге позволило получать триплоидные гибриды. Использование цитофотометрического анализа способствовало проведению отбора диплоидных (2n = 18), тетраплоидных (4n = 36) форм и ускоряло оценку селекционного материала сахарной свеклы при создании гетерозисных гибридов с высокой степенью завязываемости семян. Этот прием отличается высокой точностью определения количества яДНК и производительностью, позволяя решать широкий круг задач генетики и селекции растений.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Domblides, A.S., Federal Research Center of Vegetable Crop Selection, Moscow Region

Sterility is a very important trait that is indispensable for hybrid production. Genetic factor underlying in plant sterility can be identified in large plant populations by DNA markers with high effectiveness and reliability. The evaluation of such markers enables to define their current applicability in breeding program. The markers from different publications that had been successfully used were taken to test their effectiveness on 19 accessions of bulb onion (Allium cepa L.). Mitochondrial genes 5'cob, orf725 and orfA501 and alleles of fertility restoring locus Ms were also identified. 4 breeding accessions had S-cytoplasm, 9 accessions were with T-cytoplasm and 6 shared normal cytoplasm not showing any sterility gene in the analysis. As a result of marker testing, the all compositions of the genes in cytoplasm and Ms alleles in nucleus affecting the sterility had been revealed, such as one sterility maintainer, one male sterile accession, and two fertility restorers. However, it should be noted that not all markers tested were in accordance with each other, where the markers originated from chloroplast DNA of did not confirmed the results obtained with those cytoplasm-origins. As it was shown the practical use of the set of markers makes it possible to reveal necessary accessions with required gene composition for hybrid production in bulb onion. | Стерильность является важнейшим качественным признаком, который крайне необходим при получении коммерческих гибридов. Генетические факторы, отвечающие за проявление стерильности, могут быть определены с использованием ДНК маркеров, где при оценке больших популяций необходима их надежность и эффективность. Оценка существующих систем маркирования позволит определить их возможности при оценке селекционного материала. Из литературных источников были взяты наиболее используемые маркеры для определения стерильности и проанализирована их эффективность на 19 селекционных образцах лука репчатого (Allium cepa L.). Гены цитоплазмы 5'cob, orf725 and orfA501, влияющие на проявление признака стерильности были идентифицированы у ряда образцов. Аллели локуса восстановителя фертильности Ms были также обнаружены. 4 селекционных образца имели S тип цитоплазмы, 9 образцов показали Т тип и 6 образцов были с нормальной цитоплазмой по причине отсутствия генов стерильности. В результате использования набора этих маркеров были выявлены все варианты сочетания аллелей цитоплазмы и ядра: один закрепитель стерильности, стерильная форма, и два восстановителя фертильности. Однако необходимо отметить, что не все маркеры были удобными для поиска генов стерильности. Так, маркеры, разработанные на основе полиморфизма хлоропластной ДНК стерильных растений, не дали сходных результатов с анализом митохондриальных генов стерильности. В итоге, показана практическая возможность оценки селекционного материала на наличие генов, отвечающих за проявление признака стерильности с целью поиска линий необходимых для получения гибридов у лука репчатого.

Mostrar más [+]

Menos [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation