AGRIS - 

2018

Bejshova, I.S., Kostanay State University named after A. Baitursynov

The aim of the investigation was to increase meat productivity of Auliekol and Kazakh White – Headed cattle breeds bred in the territory of the Republic of Kazakhstan by identifying the degree of gene compatibility of pituitary transcription factor (bPit-1), growth hormone (bGH), growth hormone receptor (bGHR) and insulin-like growth factor-1 (bIGF-1). Studies for single nucleotide polymorphism of genes bPit-1, bGH, bGHR and bIGF-1 presence was performed in the Auliekol (n=284, farm "Karkyn") and Kazakh (n=296, LLP "Janibek") breed groups. Blood samples were taken from experimental animals to determine polymorphism of somatotropic cascade genes. DNA was isolated from animal blood using the commercial Pure Link Genomic DNA Kits, according to the manufacturer's instructions. Determination of animal genotypes was performed by PCR-PDRF. On the basis of the conducted researches it has been established that for the formation of the signs of meat productivity, indices of blockiness, boniness, massiviness, lengthiness, narrow quarters at the age of 18 and 24 months, there are associated diplotypes, having a structure comprising genes bGH and bIGF-1. It has been revealed that the presence of the bGH-AluI(LL) genotype in diplotypes leads to a decrease in the signs of meat productivity relative to the total sample, and the presence of the bGH-AluI(LV) genotype – to an increase. The associated diplotypes providing an increase or decrease in the characteristic of meat productivity with age do not change. The data obtained through the analysis of paired combinations allow identifying a greater number of genetic markers, which contributes to the ability to expand the range of animal carriers of the marker genotype to participate in breeding programs. | Цель исследований – повышение мясной продуктивности крупного рогатого скота аулиекольской и казахской белоголовой пород, разводимых на территории Республики Казахстан, за счет выявления степени сочетаемости генов гипофизарного фактора транскрипции (bPit-1), гормона роста (bGH), рецептора гормона роста (bGHR) и инсулиноподобного фактора роста-1 (bIGF-1). Исследования на наличие однонуклеотидного полиморфизма генов bPit-1, bGH, bGHR и bIGF-1 проводили на группах аулиекольской (n=284, хозяйство "Каркын") и казахской белоголовой (n=296, хозяйство "Жанабек") пород. Для определения полиморфизмов генов соматотропного каскада у подопытных животных были отобраны пробы крови. ДНК выделяли из крови животных с использованием коммерческого набора Pure Link Genomic DNA Kits согласно инструкции изготовителя. Определение генотипов животных проводили методом ПЦР-ПДРФ. На основании проведенных исследований установлено, что для формирования признаков мясной продуктивности, индексов сбитости, костистости, массивности, растянутости, шилозадости в возрасте 18 и 24 месяца ассоциированы диплотипы, в структуру которых входят гены bGH и bIGF-1. Выявлено, что наличие в диплотипах генотипа bGH-AluI(LL) приводит к снижению признаков мясной продуктивности относительно общей выборки, а присутствие генотипа bGH-AluI(LV) – к повышению. Ассоциированные диплотипы, обеспечивающие повышение или снижение признака мясной продуктивности, с возрастом не изменяются. Полученные данные за счет анализа парных сочетаний позволяют выявить большее количество генетических маркеров, что способствует возможности расширить диапазон животных – носителей маркерного генотипа для участия в селекционных программах.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Deniskova, T.E. | Kostyunina, O.V. | Solov'eva, A.D. | Zinov'eva, N.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

The Romanov breed is the most interesting local Russian sheep breed with unique biological traits (out-of-season breeding ability, prolificacy). Conservation of the genetic resources of the breed requires constant careful monitoring using DNA markers. The aim of our work was to compare the parameters of the allele pool and genetic diversity, as well as to assess genetic similarity of regional populations of the Romanov breed in comparison with archetypal animals. Tissue samples were (n=298) selected in different regions of Russia (the Yaroslavl, Ryazan and Tula regions, Republics of Khakassia and Komi). Polymorphism of 11 microsatellites was studied with the genetic analyzer ABI3130xl. During the work there was estimated an average number of alleles (Na), effective number of alleles (Ne), number of informative alleles (Na not less 5%), observed (Ho) and expected heterozygosity (He), fixation index (FIS), as well as genetic networks were constructed and PCoA and cluster analyzes were carried out. The Khakass population was characterized by the greatest allelic diversity: Na = 11.30; Ne = 5.99 and Na not less 5% = 5.50 alleles, while minimal Ne (3.95) and Na not less 5% (4.30) were detected for the first and second Yaroslavl populations, respectively. Deficiency of heterozygotes from 6 to 19.5% was observed in all groups, except for the Tula population. Based on the results of building genetic networks, PCoA and cluster analysis, genetic isolation of 3 Yaroslavl populations was shown. Also, a certain genetic detachment of the Ryazan population (Fst from 0.038 to 0.059) should be noted. Thus, it was demonstrated that the parameters of allele pool and the indices of genetic diversity could vary greatly within the breed. In addition, it has been established that the Yaroslavl populations of the Romanov breed still represent a separate group of animals. | Романовская порода овец – это наиболее интересная локальная порода России, обладающая уникальными биологическими особенностями (полиэстричность, многоплодие). Сохранение генетических ресурсов данной породы требует постоянного тщательного мониторинга по ДНК-маркерам. Целью работы было провести сравнение параметров аллелофонда и генетического разнообразия, а также оценить генетическое сходство региональных популяций романовской породы с архетипичными животными. Образцы ткани овец (n=298) были отобраны в разных регионах России (Ярославской, Рязанской, Тульской обл., республиках Хакасия и Коми). Полиморфизм 11 микросателлитов был изучен на генетическом анализаторе АВI3130xl. В ходе выполнения работы были рассчитаны: среднее число аллелей (Na), эффективное число аллелей (Ne), число информативных аллелей (Na не менее 5%), наблюдаемая (Ho) и ожидаемая гетерозиготность (He), индекс фиксации (FIS), а также построены генетические сети, проведены PCoA и кластерный анализы. Хакасская популяция характеризовалась наибольшим аллельным разнообразием: Na = 11,30; Ne = 5,99 и Na не менее 5% = 5,50 аллелей, тогда как минимальные Ne (3,95) и Na не менее 5% (4,30) были детектированы для первой и второй ярославских популяций соответственно. Дефицит гетерозигот от 6,0 до 19,5% был отмечен во всех группах, за исключением тульской популяции. На основании результатов построения генетических сетей, PCoA и кластерного анализа была показана генетическая обособленность трех ярославских популяций, следует также отметить некоторую отдаленность рязанской популяции (Fst от 0,038 до 0,059). Таким образом, было продемонстрировано, что параметры аллелофонда и показатели генетического разнообразия могут сильно различаться внутри одной породы. Кроме того, было установлено, что ярославские популяции романовской породы до сих пор представляют собой обособленный массив животных.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Larkina, T.A., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

There is an urgent need to find molecular markers for breeding broiler lines to reduce the abdominal fat content. It is to increase the nutritional value of the carcass and reduce the cost of feeding. DNA isolated from 150 broiler liver samples of the Iza Hubbard F-15 cross has been taken as the material to the study. The 35 day-old broilers have been taken from a private farm. DNA has been isolated according to the standard procedure using K proteinase and phenol. Analysis of FABP2 sequence in mutation has showed that the mutation results in recognition of TaqI restriction endonuclease site. Thus, the PCR-RFLP analysis method has been chosen for theoretical simulation of the test system for analyzing polymorphism of FABP2 gene in position -561 at substitution A with C. At the end of the incubation period, the fragments have been electrophoretically separated in a 1.5% agarose gel at 150 V in TBE buffer with the addition of ethidium bromide to a final concentration of 30 ng/ml, and the fragments have been visualized in ultraviolet light. According to the gene test results, the incidence of CC, AC and AA genotypes is the following: (0.42), (0.35) and (0.23), respectively. As for the fat content, Iza Hubbard F-15 cross broilers with heterozygous AS genotype slightly outperform the ones with homozygous genotypes, but these differences are not statistically significant. The medians of fat content in all three genotypes are practically on the same level, which indicates minor differences. Perhaps, to obtain a more meaningful result, it is required to increase the sampling, to include in the research another gene associated fat accumulation, and to study the additive mechanism of the gene action. | Имеется острая необходимость в поиске молекулярных маркеров для селекции родительских линий бройлеров на снижение содержания абдоминального жира, что позволит увеличить пищевую ценность тушки и уменьшить расходы на кормление. Материалом для исследований послужила ДНК, выделенная из 150 образцов печени бройлеров кросса Иза Хаббард Ф-15 в возрасте 35 дней. ДНК выделяли по стандартной методике с использованием протеиназы К и фенола. Анализ последовательности FABP2 в области мутации показал, что мутация приводит к узнаванию сайта рестрикции рестриктазой TaqI. Для теоретического моделирования тест-системы анализа полиморфизма гена FABP2 -561 с заменой A на C был выбран метод ПЦР-ПДРФ анализа. По окончании инкубации проводили электрофоретическое разделение фрагментов в 1,5%-ном агарозном геле при 150В в буфере ТВЕ с добавлением бромистого этидия до конечной концентрации 30 нг/мл и визуализировали фрагменты под ультрафиолетовым светом. По результатам исследования частота встречаемости генотипов составила: СС (0,42), АС (0,35), АА (0,23). Бройлеры кросса "Иза Хаббард Ф-15" с гетерозиготным генотипом АС немного превосходят по содержанию жира особей с гомозиготными генотипами, но эти различия статистически не достоверны. Медианные значения показателя у всех трех генотипов находятся практически на одном уровне, что говорит о незначительных различиях между ними. Возможно, для получения более значимого результата требуется увеличить выборку и добавить в изучение еще один ген, связанный с жиронакоплением, и рассмотреть уже аддитивный механизм работы генов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Vinogradova, I.V. | Kostyunina, O.V. | Sermyagin, A.A. | Kharzinova, V.R. | Zinov'eva, N.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

The investigated sample of cows revealed the highest frequency of A alleles (63.4%) by the DGAT_A232K gene and F alleles (78.8%) by the GHR_F279Y gene. The population with allele AA for gene DGAT_A232K was obtained higher milk production and milk quality: milk yield for 305 days of lactation (MY) (6335 kg with genotype AA, 6080кг - with genotype KK), fat yield (FY) (245.0 kg with genotype AA, 241.1 kg with genotype AK) and protein yield (PY) (208.2 kg with genotype AA, 202.5 kg at genotype AK). The difference between the groups with the highest milk yield, with the genotype AA and the lowest with genotype KK amounted to 255 kg (p less 0.05). Animals carrying allele Y for gene GHR_F279Y showed the best results in milk production and milk composition. In cows with the genotype of the FY gene GHR_F279Y fat content was 3.89%, which is 0.08 (p less 0.05k) greater than that of the population with genotype YY, mass fraction of protein is higher by 0.08 (p less 0.001) and equal to 3.30%. Animals with genotype AA for gene DGAT_A232K revealed the highest EBV for MY indicators (+101.2 kg), FY (2.22 kg) and PY (2.84 kg). The highest EBV values for MY (+104.1) were recorded in cows with the YY genotype for the GHR_F279Y gene, in terms of fat yield and protein yield, the advantage was observed in heterozygous individuals. The research as carried out ahs shown that the genetic variants of DNA markers HR_F279Y and DGAT1_A232K are associated with the features of milk productivity and can be used in breeding work. | У исследованной выборки коров выявлена наибольшая частота А аллелей (63,4%) по гену DGAT1_A232K и F аллелей (78,8%) по гену GHR_F279Y. Животные с аллелем АА по гену DGAT1_A232K имели более высокие показатели молочной продуктивности за 305 дней лактации и качества молока (MY) (6335 кг при генотипе АА; 6080 кг при генотипе КК), выхода молочного жира (FY) (245,0 кг при генотипе АА; 241,1 кг при генотипе АК) и молочного белка (PY) (208,2 кг при генотипе АА; 202,5кг при генотипе АК). Разница между группами с наивысшим и с наименьшим удоем составила 255 кг (Р меньше 0,05). Животные, несущие аллель Y по гену GHR_F279Y, показали лучшие результаты по молочной продуктивности и составу молока. У коров с генотипом FY гена GHR_F279Y массовая доля жира составила 3,89%, что на 0,08 (Р меньше 0,05) больше, чем у поголовья с генотипом YY, массовая доля белка также выше на 0,08 (Р меньше 0,001) и равна 3,30%. У животных с генотипом AA по гену DGAT1_A232K выявлены наиболее высокие значения племенной ценности (EBV) по показателям MY (+101,2 кг), FY (2,22 кг) и PY (2,84 кг). Наиболее высокие значения EBV по MY (+104,1) были зафиксированы у коров с генотипом YY по гену GHR_F279Y, по показателям выхода молочного жира и молочного белка преимущество отмечалось у гетерозиготных особей. Проведенные исследования показали, что генетические варианты по ДНК-маркерам GHR_F279Y и DGAT1_A232K ассоциированы с признаками молочной продуктивности и могут использоваться в селекционно-племенной работе.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation