AGRIS - 

2017

Suprun, I.I., North-Caucasian Federalal Center for Horticulture, Viticulture, Wine-making, Krasnodar

By using the polymorphism analysis of microsatellite loci, DNA certification and estimation of the degree of genetic similarity for a set of 20 modern peach varieties bred in Nikita botanical garden (Crimea) were performed. The studied varieties are in demand in horticulture, agroсlimatic conditions of the region and are valuable in breeding as sources of useful adaptive traits. To analyze the polymorphism of studied varieties 13 SSR-markers were used: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 and BPPCT002. Markers were divided into multiplex sets, which included 3-4 markers. Optimal combinations of SSR-markers made it possible to obtain easily interpreted results during fragment analysis. Among the used SSR markers the highest number of alleles (5) was found in markers BPPCT025 and CPPCT044, the least polymorphic markers were CPPCT040, UDP98-409, BPPCT028 (two alleles) and BPPCT002 (one allele). The remaining SSR-markers revealed 3-4 alleles per locus. Analysis of the obtained DNA fingerprints showed that all studied varieties have a unique allelic set. The most polymorphic SSR-markers are promising for use in the DNA certification of peach genetic resources. The cluster analysis revealed three main clusters, the distribution in which, in some cases, corresponds to the origin of the varieties. Genetic similarity data together with data on the origin of varieties can be used for planning of cross combinations when it is necessary to maximize the diversity level in the hybrid offspring. | С использованием анализа полиморфизма микросателлитных локусов выполнена ДНК-паспортизация и оценка степени генетического сходства выборки из 20 современных сортов персика селекции Никитского ботанического сада (Крым). Исследованные сорта являются востребованными в садоводстве в агроклиматических условиях региона и представляют селекционный интерес как источники полезных адаптивных признаков. Для анализа полиморфизма исследуемых сортов использовали 13 SSR-маркеров: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 и BPPCT002. Маркеры были распределены в мультиплексные наборы, включающие 3-4 маркера. Оптимальные сочетания SSR-маркеров позволили получать легко интерпретируемые результаты в ходе фрагментного анализа. Среди использованных SSR-маркеров наибольшее количество аллелей (5) было выявлено для маркеров BPPCT025 и CPPCT044, наименее полиморфными оказались маркеры CPPCT040, UDP 98-409, BPPCT028 (2 аллеля) и BPPCT002 (1 аллель). По остальным SSR-маркерам было выявлено по 3-4 аллеля на локус. Анализ полученных ДНК-фингерпринтов показал, что все изученные сорта обладают уникальным аллельным набором. Наиболее полиморфные SSR-маркеры перспективны для использования при ДНК-паспортизации генетических ресурсов персика. Выполненный кластерный анализ выявил 3 главных кластера, распределение в которых в ряде случаев согласуется с происхождением сортов. Данные о степени генетического сходства в совокупности с данными о происхождении сортов могут быть использованы для планирования комбинаций скрещиваний при необходимости получения максимального уровня разнообразия в гибридном потомстве.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Kudryavtseva, O.V. | Kolganov, A.E. | Nekrasov, D.K. | Fedosovа, M.S., Ivanovo State Agricultural Academy

Studied was a cause-and-effect relationship between an existing genotypic and phenotypic diversity of Yaroslavl breed cows on milk production level. Sources of individual-group genetic diversity of cows was 1) their different origin taking into account natural belonging (Yaroslavl purebred and crossbred animals with Holstein blood of 25 – 37.5%), 2) polymorphism of genotypes of 5 marker genes (MG) that have some connection with the milk productivity of cows. The phenotypic diversity of cows was monitored by individual-group level of milk production in the 1-st lactation, giving priority to milk yield for 305 days. A significant individual phenotypic variability of the trait in the whole population of cows (n = 301) was stated and specific polymorphism of the alleles and genotypes of MG was studied. No significant differences were revealed in milk yield with different genotypes for 4 genes with the exception of the gene for hormone prolactin PRL. In all 9 segments of the variation series for milk yield purebred and crossbred Yaroslavl cows were present in different proportions with a natural increase in the weight of the latter in the right part of the variation series with a significantly increasing level of milk yield and adequate crownest increase in Holstein breed cows from 12.15% to 25.00%. Specific complex genotypes were identified in different combinations of 3 of 5 MG in 32 groups of cows with low average milk yield is less than (average–0,5delta) and in 19 groups of cows with high average milk yield is greater than (average+0,5delta) than general variation series. The complex genotypes of all 5 MG were also identified in 2 groups of absolutely the worst and the best cows in milk yield between which a genetic contrast range has been established in the form of identical complex genotypes absent therein both in 3 and in 5 MG. It is necessary to further expand of controlled MG range that will allow in the future to increase the efficiency of total genomic evaluation of milk production potential and breeding value of domestic milk cattle breeds. | Изучали причинно-следственную взаимосвязь между генотипическим и фенотипическим разнообразием коров ярославской породы по уровню молочной продуктивности. Источники индивидуально-группового генетического разнообразия коров: 1) разное происхождение с учетом породной принадлежности (чистопородные ярославские и помесные животные с кровностью по голштинской породе 25–37,5%); 2) полиморфизм генотипов 5 маркерных генов (МГ), имеющих связь с молочной продуктивностью коров. Фенотипическое разнообразие коров контролировали по индивидуально-групповому уровню у них признаков молочной продуктивности в 1-ю лактацию, отдавая приоритет удою коров за 305 дн. Установлена значительная индивидуальная фенотипическая вариабельность этого признака у всей совокупности коров (n = 301), изучены особенности полиморфизма аллелей и генотипов МГ. Не выявлено достоверных различий по удою коров с разными генотипами по 4 генам за исключением гена гормона пролактина PRL. Во всех 9 сегментах вариационного ряда по удою присутствовали в разном соотношении и чистопородные, и помесные ярославские коровы с закономерным увеличением удельного веса последних в правой части вариационного ряда с достоверно возрастающим уровнем удоя и адекватным увеличением кровности коров по голштинской породе с 12,15% до 25,00%. Выявлены комплексные генотипы разных сочетаний 3-х из 5 МГ в 32-х гр. коров с низким уровнем среднего удоя (ниже среднего больше, чем на 0,5 дельта) и в 19-ти гр. коров с высоким уровнем среднего удоя (выше среднего больше, чем 0,5 дельта) общего вариационного ряда. Выявлены комплексные генотипы всех 5 МГ в 2-х гр. абсолютно худших и лучших коров по удою, между которыми установлена генетическая контрастность в виде отсутствующих в них идентичных комплексных генотипов как по 3-ем, так и по 5 МГ. Необходимо дальнейшее расширение спектра контролируемых МГ, что позволит повысить эффективность общей геномной оценки потенциала молочной продуктивности и племенной ценности крупного рогатого скота отечественных молочных пород.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation