AGRIS - 

2019

Raev, S.A. | Yuzhakov, A.G. | Alekseev, K.P. | Anoyatbekov, M. | Aliper, T.I., The Ya.R. Kovalenko All-Russia Research and Development Inst. of Experimental Veterinary, Moscow

Porcine circovirus associated diseases (PCVAD) are one of the most economically significant diseases of swine. No one of the PCVAD has any specific clinical symptoms. Causative agent is a porcine circovirus type 2 (PCV-2), which belongs to Circovirus genus Circoviridae family. Nowadays PCV-2 is ubiquitous. Vaccination against PCVAD is widely using in most of swine farms. Vaccine application against PCVAD does not elicit the development of sterile immunity. These facts make necessary to conduct diagnostic investigations with using materials from animals of different ages/technological groups. Presented are the results of investigations about PCVAD diagnosis with applying the longitudinal method of monitoring which were at 3 pig farms with PCVAD. The use of ELISA test-kits for detection PCV- 2 specific IgG/IgM immunoglobulins and a polymerase chain reaction for detection of the DNA region of the causing agent when investigating blood serum allowed setting significant differences in serology and virology profile at the examined farms. It has been founded that the viremia level in different technological groups ranges from 0 to 40%; the seroprevalence level ranges from 0 to 100 and from 10 to 50% for specific IgG and IgM, respectively. Application of ELISA test-kit for detection of immunoglobulins of IgM to PCV-2 allows detecting a contact of animals with PCV-2 (or vaccination) earlier than in case with IgG immunoglobulins. The obtained data reveals a possibility of application of the scientific-based approach in detection of major pathogen in case of systemic disease development such as porcine respiratory disease complex. The monitoring investigations might be helpful in case of study of a control measures and specific prevention of PCVAD. | Цирковирусные болезни свиней (ЦВБС) – одно из экономически значимых заболеваний свиней. Ни одна из форм ЦВБС не имеет специфических клинических симптомов. Возбудитель заболевания – цирковирус свиней 2-го типа (ЦВС-2) относится к роду Circovirus семейство Circoviridae. На данный момент ЦВС-2 повсеместно распространен по всему миру. Вакцинация против ЦВБС рутинно применяется в большинстве свинокомплексов. Применение вакцин против ЦВБС не приводит к формированию стерильного иммунитета. Эти обстоятельства делают необходимым проведение диагностических исследований с использованием материала от животных различных возрастов/технологических групп. Представлены результаты исследований по использованию поперечного метода мониторинговых исследований по диагностике ЦВБС, которые проводились в 3 свинокомплексах, неблагополучных по ЦВБС. Применение наборов для твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА), направленных на выявление иммуноглобулинов IgG/IgM-класса, а также полимеразной цепной реакции для выявления участка ДНК возбудителя при исследовании сывороток крови позволили установить существенные различия в серологическом и вирусологическом профилях исследованных свиноводческих ферм. Установлено, что уровень виремии у различных технологических групп колеблется в интервале от 0 до 40%; уровень серопревалентности – от 0 до 100% и от 10 до 50% для специфических IgG и IgM, соответственно. Использование ИФА, направленного на выявление иммуноглобулинов IgM-класса к ЦВС-2 позволяет значительно раньше выявить наличие контакта животных с вирусом (или вакцинации) по сравнению с выявлением иммуноглобулинов класса IgG. Полученные результаты свидетельствуют о возможности применения научно-обоснованного подхода при определении ведущего патогена при развитии системных заболеваний, таких как комплекс респираторных болезней свиней. Мониторинговые исследования могут быть полезными при изучении эффективности проводимых мер борьбы и специфической профилактики ЦВБС.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Mustafaev, A.R., Caspian Zone Research Veterinary Inst., Makhachkala

There are given the epizootic data on the spread of bovine leukemia virus (BLV) in the Republic of Dagestan. A complete description of serological studies was conducted in all veterinary laboratories of the Republic, as well as the conjuncture of studies on enzootic leukemia in cattle (EBL) over 2014-2018. Thus, the number of the studied cattle population was 5504 in 2014, 7310 (2015), 10842 (2016), 7466 (2017), 223293 heads in 2018. Respectively, and the number of infected animals varied in years: 295 (5.4%); 1016 (13.9%); 1433 (13.2%); 577 (7.7%); 8998 (4.03%). In general, diagnostic studies EBL was conducted in the regional veterinary laboratories that were located on the plain flat surface, where a large number of cattle in the republic were concentrated. Over 2018, 179817 blood samples were examined in zonal laboratories using the immunodiffusion test (IDT), of which 8824 (4.9%) were seropositive. In other inter-district, district and diagnostic offices for the same period 43476 heads in all were studied. Seropositivity was 348 (0.8%). Thus, studies on EBL for 2018 do not reflect the full picture of the epidemic in the Republic as in the Republic, as in spite of the increased scale they do not include the whole livestock in the Republic amounting at the end of 2017 to more than a million heads. | Приведены эпизоотические данные по распространению вируса лейкоза крупного рогатого скота (ВЛКРС) в республике Дагестан. Изложено полное описание серологических исследований, проведенных во всех ветеринарных лабораториях республики, а также конъюнктуры исследований по энзоотическому лейкозу крупного рогатого скота (ЭЛКРС) за 2014-2018 гг. Так, количество исследованного поголовья КРС составило 5504 гол. в 2014 г., 7310 в 2015 г., 10842 в 2016 г., 7466 в 2017 г. и 223293 голов в 2018 г. Соответственно менялось по годам и количество инфицированных животных: 295 (5,4%); 1016 (13,9%); 1433 (13,2%); 577 (7,7%); 8998 (4,03%). В основном, диагностические исследования по ЭЛКРС проведены в зональных ветеринарных лабораториях, расположенных на равнинной плоскости, где сконцентрировано большое поголовье КРС. За 2018 г. в зональных лабораториях было исследовано с помощью реакции иммунодиффузии (РИД) 179817 проб крови, из которых 8824 (4,9%) оказались сероположительными. В остальных межрайонных, районных и диагностических кабинетах за аналогичный период было исследовано всего 43476 голов. Серопозитивность составила 348 (0,8%). Таким образом, проведенные в 2018 г. исследования на ЭЛКРС не отражают полную эпизоотическую картину в республике, так как, несмотря на увеличившиеся масштабы, не охватывают всё поголовье КРС в республике, составлявшее на конец 2017 г. более миллиона голов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Kononenko, A.B. | Bannikova, D.A. | Britova, S.V. | Pavlova, I.B. | Nabiullina, D.N. | Savinova, E.P, All-Russia Research and Development Inst. of Veterinary Sanitation, Hygiene and Ecology, Moscow

The aim of the work is monitoring the formation of biofilms by opportunistic and pathogenic microorganisms. The cultures of the genera Salmonella, Escherichia, Yersinia, Proteus, Citrobacter, Enterobacter, Prtovidenzia, Morganella, Klebsiella, Cronobacter, Pseudomonas, Bacillus, Staphylococcus were used in the work. The studied microorganisms were cultured in polystyrene 96-well plates. For this purpose, a daily culture of microorganisms was introduced into the wells with meat-peptone broth, having previously established a concentration of 10E4 mc/ml, and incubated for 24-96 h at temperature of 37 deg C. Then the medium with plankton cells was removed from the wells. 200 μl of filtered 0.1% crystal violet solution was poured into the wells of the plate and the plates were kept for 10-15 min at room temperature. Then dye was removed from the wells. Unbound dye was thoroughly washed with saline or distilled water. The plates were turned over on filter paper and dried. The presence and density of biomatrix (biofilm) was determined visually by the intensity of staining the surfaces of plates. Then, for the extraction of paint from the film, 200 μl of 96% ethanol was added to the wells and the optical density was measured on KFK-3KM spectrophotometer at a wavelength of 590 nm. The results of the experiments allowed asserting that within 48 h of cultivation microorganisms form a mature biofilm, which can serve as a model for studying the process of biofilm formation. Biofilm of microorganisms of different taxonomic groups differs in density. In addition, even bacteria belonging to the same genus, under the same conditions, can form a biofilm, the density of which differs by 30-60%. | Цель работы: осуществить мониторинг образования биопленок условно-патогенными и патогенными микроорганизмами. В работе использовали культуры родов Salmonella, Escherichia, Yersinia, Proteus, Citrobacter, Enterobacter, Providencia, Morganella, Klebsiella, Cronobacter, Pseudomonas, Bacillus, Staphylococcus. Изучаемые микроорганизмы культивировали в полистироловых 96-луночных планшетах. Для этого в лунки с мясо-пептонным бульоном вносили суточную культуру микроорганизмов, предварительно установив концентрацию 10E4 м.к/мл, и инкубировали в течение 24…96 ч при температуре 37 град. С. Затем удаляли из лунок среду с планктонными клетками. В лунки планшета вносили по 200 мкл отфильтрованного 0,1%-го раствора кристаллического фиолетового и выдерживали планшеты в течение 10…15 мин при комнатной температуре. Затем удаляли из лунок краситель. Не связавшийся краситель тщательно смывали физиологическим раствором или дистиллированной водой. Планшеты переворачивали на фильтровальную бумагу и высушивали. Наличие и плотность биоматрикса (биопленки) определяли визуально по интенсивности окрашивания поверхности планшета. Затем для экстракции краски из пленки в лунки добавляли по 200 мкл 96%-го этанола и измеряли оптическую плотность на спектрофотометре КФК -3КМ при длине волны 590 нм. Результаты проведенных экспериментов позволили утверждать, что в течение 48 ч культивирования микроорганизмы формируют зрелую биопленку, которая может служить моделью для изучения процесса биопленкообразования. Биопленка микроорганизмов различных таксономических групп различается по плотности. Помимо этого даже бактерии, относящиеся к одному роду, в одинаковых условиях могут образовывать биопленку, плотность которой различается на 30…60%.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Ognivtsev, S.B., The A.A. Nikonov All-Russia Research and Development Inst. of Agricultural Issues and Informatics, Moscow

Proposed and substantiated are the main directions and mechanisms of the Strategy of adaptation of agriculture and agriculture of Russia to climate change. An important role in the Strategy is played by the expansion of international and interregional trade, as well as the development of warehouse infrastructure for the storage of agricultural raw materials and food. Of the total number of currently operating elevator capacities, only 40% meet modern requirements for storage and preservation of grain. The largest number of refrigerating plants has a product storage capacity of 3-5 ths t (21% of the total amount of cold storage of the Russian Federation), as well as 7-10 ths t (19%). The number of modern refrigerants with a storage capacity of more than 30 ths t is minimal. Important areas of the Strategy are the development of adaptive soil, crop and livestock technologies, as well as technologies that reduce the negative and increase the positive effects of climate change. In 2018, with a total area of crops in Russia of more than 80 million ha, only 4.6 million ha (5.7%) were irrigated. The growth of irrigated land is very slow, because 1 ha needs 200-250 ths rub of investments. A special role is given to the information support of the Strategy and the system of models for assessing the effects of climate change on agriculture. Such models can allow quantifying the effectiveness of various proposed adaptive technologies. However, the quality of the forecast when using cognitive models depends crucially on the knowledge of the experts who create them. The cognitive approach can be supplemented with models of typical areas, since each of them has its own real prototype and is characterized by a certain climatic potential. | Предложены и обоснованы основные направления и механизмы Стратегии адаптации сельского хозяйства и АПК России к климатическим изменениям. Важную роль в Стратегии играет расширение международной и межрегиональной торговли, а также развитие складской инфраструктуры для хранения с.-х. сырья и продуктов питания. Из общего количества действующих в настоящее время элеваторных мощностей только 40% отвечают современным требованиям по хранению и обеспечению сохранности зерна. Наибольшее число хладокомбинатов имеет ёмкость хранения продуктов 3–5 тыс. т (21% от общего количества хладокомбинатов РФ), а также 7–10 тыс. т (19%). Количество современных хладокомбинатов, имеющих ёмкость хранения свыше 30 тыс. т, минимально. Важными направлениями Стратегии являются освоение адаптивных почвенных, растениеводческих и животноводческих технологий, а также технологий, снижающих негативные и увеличивающих позитивные последствия изменений климата. в 2018 г. при общей площади посевов в России более 80 млн га на орошении находилось лишь 4,6 млн га (5,7%). Прирост орошаемых земель идет очень медленными темпами, поскольку на 1 га необходимо 200-250 тыс. руб. инвестиций. Особая роль отводится информационному обеспечению Стратегии и системе моделей для оценки последствий климатических изменений на сельское хозяйство. Такие модели могут позволить количественно оценить эффективность различных предлагаемых адаптивных технологий. Однако качество прогноза при использовании когнитивных моделей в решающей степени зависит от знаний создающих их экспертов. Когнитивный подход может быть дополнен моделями типовых районов, так как каждый из них имеет свой реальный прототип и характеризуется определенным климатическим потенциалом.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Ovchinnikov, A.S., Volgograd State Agrarian Univ.

The aim of the research is to create a conceptual skeleton of irrigation monitoring and control (IC) systems developed at the new technical and technological level, with mostly automatic implementation of the control function, using intelligent algorithms and "big data" technologies. As a methodological basis of research, the theory of the staged development of technology and technologies has been adopted, in a form adapted for solving actual problems of land reclamation. The new functional model of irrigation systems of the new generation determines the place and requirements for the created irrigation monitoring and IC complexes. A conceptual and constructive structure of the IC system has been proposed, which makes it possible to establish the most common links and characteristics of the main structural complexes. The analysis was carried out and a functionally oriented scheme of control actions was developed, the implementation of which is potentially possible on the basis of monitoring indicators of the state of agrocenosis and the operation of irrigation equipment in real time. A hierarchical model of the system organization of the management function, suggesting a consistent coverage of the integrated functional modules of the irrigation system, as a conceptual strategy for the development of the technical-technological complex of IC is proposed. At the lowest level, the management of the elements of the technical system, carrying out the technological function directly within the boundaries of irrigated arrays, is carried out. The highest hierarchical level involves the organization of integrated management of all structural and functional elements of the irrigation system according to a single algorithm. Variants of the systemic organization of the information and analytical module of the irrigation monitoring and IC complex have been developed. Evaluation of options on the basis of a set of criteria allows one to give preference to multi-user server schemes as the most flexible in terms of the development and practical development of the latest computational algorithms of intelligent automated control. | Целью исследований - создание концептуального скелета разрабатываемых на новом технико-технологическом уровне систем мониторинга и управления орошением (УО), с преимущественно автоматической реализацией функции управления, использованием интеллектуальных алгоритмов и технологий "больших данных". В качестве методологической основы исследований принята теория стадийного развития техники и технологий, в адаптированной для решения актуальных задач мелиорации форме. Укрупненная функциональная модель оросительных систем нового поколения определяет место и требования к создаваемым комплексам мониторинга и УО. Предложена концептуально-конструктивная структура системы УО, которая позволяет установить самые общие связи и характеристики основных структурных комплексов. Выполнен анализ и разработана функционально ориентированная схема управляющих воздействий, реализация которых потенциально возможна на основе мониторинга показателей состояния агроценоза и работы оросительной техники в режиме реального времени. Предложена иерархическая модель системной организация функции управления, предполагающей последовательный охват укрупненных функциональных модулей оросительной системы как концептуальной стратегии развития технико-технологического комплекса УО. На низшем уровне осуществляется управление элементами технической системы, осуществляющими технологическую функцию непосредственно в границах орошаемых массивов. Высший иерархический уровень предполагает организацию комплексного управления всеми структурно-функциональными элементами оросительной системы по единому алгоритму. Разработаны варианты системной организации информационно-аналитического модуля комплекса мониторинга и УО. Оценка вариантов по совокупности критериев позволяет отдать предпочтение многопользовательским серверным схемам как наиболее гибким в плане развития и практического освоения новейших вычислительных алгоритмов интеллектуального автоматизированного управления.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Rublyuk, M.V. | Ivanov, D.A. | Karaseva, O.V., All-Russia Research and Development Inst. of the Improved Land, Tver Region

We determined the influence of agromicrolandscapes on water, physical, and biological properties of sod-podzolic soil and winter rye productivity in the test plot of the All-Russian Research Institute of Reclaimed Lands in 2015–2018. The soil was sod-podzolic residual carbonate gleyic. The experimental plot was drained by closed drainage. The width of each crop rotation field was 7.2 m, the length was 1200 m. The forecrop was spring rape for green manure. Fertilizers for winter rye were not applied, except for fertilizing with ammonium nitrate at a dose of N30 a.s. into the stem elongation phase. Over the years of the research, the density of the arable layer decreased within the southern slope of the moraine hill (by 0.03–0.06 g/cm3). The moisture content of the arable layer of the soil under winter rye decreased to the most extent in the transit-accumulative regime of the southern slope (by 4.7%). The highest accumulation of moisture was observed in the transit-accumulative variant of the northern slope (4.0%). There was a tendency to increase moisture from the top down the northern slope. Microbiological processes in the soil proceeded most intensively in the southern slope and decrease in the transit microlandscapes of the northern exposure slope. The maximum increase in soil bioactivity (by 18.2%) was observed in the transit-accumulative variant of the southern slope. In a similar variant of the northern exposure slope, the percentage of cellulose decomposition was the least (11.5%). On average, the yield of winter rye varied from 2.14 to 3.16 t/ha (V = 12.9%). The highest yield of grain crops was formed in the transit agromicrolandscape of the southern slope, the least one was in the eluvial-transit variant of the southern slope (the decrease in the yield was 35.4%). We observed a trend of increasing yields on the slopes and its decline in eluvial variants. The most optimal conditions for the growth of winter rye were formed in the transit agromicrolandscape of the slope of the southern exposure, where the largest increase in grain yield (17%) was obtained, compared with the average value from the experiment. | На опытном участке, расположенном в Тверской области, в 2015–2018 гг. проведены исследования с целью изучения влияния агромикроландшафтов на воднофизические и биологические свойства дерново-подзолистой почвы, а также урожайность озимой ржи. Почва дерновоподзолистая остаточно-карбонатная глееватая. Опытный участок осушен закрытым дренажем. Ширина каждого поля севооборота 7,2 м, длина – 1200 м. Предшественник – яровой рапс на сидеральный пар. Удобрения под озимую рожь не применяли, кроме подкормки аммиачной селитрой в дозе N30 в фазе трубкования. За годы исследования произошло снижение плотности пахотного слоя почвы в пределах южного склона конечно-моренного холма (на 0,03-0,06 г/см3). Влажность пахотного слоя почвы под озимой рожью максимально снижалось в транзитноаккумулятивном варианте южного склона (на 4,7%). Наибольшим накоплением влаги отличался транзитно-аккумулятивный вариант северного склона (4,0%). Наблюдали тенденцию увеличения влажности от вершины вниз по северному склону. Микробиологические процессы в почве наиболее интенсивно протекали на южном склоне и замедлялись в транзитных микроландшафтах склона северной экспозиции. Максимальное повышение биоактивности почвы (на 18,2%) отмечено в транзитно-аккумулятивном варианте южного склона. В аналогичном варианте склона северной экспозиции разложения целлюлозы было наименьшим (11,5%). В среднем урожайность озимой ржи варьировала от 2,14 до 3,16 т/га (V=12,9%). Самой высокой она была в транзитном агромикроландшафте южного склона, наименьшей – в элювиально-транзитном варианте южного склона (снижение урожайности на 35,4%). Наблюдали тенденцию повышения урожайности на склонах и ее снижение в элювиальных вариантах. Наиболее близкие к оптимальным условиям для произрастания озимой ржи сложились в транзитном агромикроландшафте склона южной экспозиции, где была получена наибольшая прибавка урожая зерна (17%), по сравнению со средней величиной по опыту.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Dement'ev, V.N., Novosibirsk State Agrarian Univ.

Summarized are the results of additional involvement in the monitoring of information resources of multidimensional statistical analysis on the basis of research materials. In all the indicators of 15533 sows, 1268 boars and their offspring (1327 heads) were anslyzed. For the Large White pigs there are made the equations of multiple regression for the initial forecast of some lifetime parameters of sows, taking into account the obtained reliable values of correlation coefficients on the basis of development at the beginning of animal application. The obtained parameters of phenotypic correlations highlight the possibility of using dairy capacity and number of cows in the herd when weaning to predict the weight of the piglets' litter aged 2 months within the limits of the corresponding (1, 3, 6) sow farrows. The results of using regression equation show that the next farrow or lifetime productivity of a group of pigs can be estimated by means of several indicators of any farrow. It has been found that selection index inheritance coefficient calculated by the method of dispersion analysis of half-sibs according to male (fathers) was 0.41±0.04 (P is less than 0.001). This confirms complex improvement of the reproductive properties of herd by reproductive properties of sows by means of the index. This is proved by the results of ranking the parameters of the investigated features after simulating of 50% selection. Similar selection simulation of the results related to assessment of fattening and meat qualities of young Kemerovo pigs outlines a tendency, which is common for both reproductive qualities of sows and parameters of control fattening. When selecting according to one single feature, obtained are the highest (lowest) results in comparison with the analyzed characteristics that were not subject to selection. However, the index selection prevailed in terms of the set of features. | Излагаются обобщённые результаты дополнительного привлечения к мониторингу информационных ресурсов многомерного статистического анализа по материалам исследований. Всего проанализированы показатели 15533 свиноматок, 1268 хряков и их потомства (1327 гол.). По крупной белой породе свиней, с учётом полученных достоверных значений коэффициентов корреляции, построены уравнения множественной регрессии для начального прогноза некоторых пожизненных показателей свиноматок на основании развития в начале использования животных. Полученные значения фенотипических корреляций свидетельствуют о возможности использования показателей молочности и числа голов в гнезде при отъёме для прогнозирования массы гнезда поросят в возрасте 2 месяцев в пределах соответствующих (1, 3, 6-й) опоросов свиноматок. На основании результатов использования уравнений регрессии отмечено, что по нескольким показателям одного любого опороса можно с большей надежностью судить о результатах следующего опороса или пожизненной продуктивности группы животных. Установлено, что коэффициент наследуемости селекционного индекса, вычисленный методом дисперсионного анализа полусибсов по отцам, составил 0,41±0,04 (P меньше 0,001). Это подтверждает возможность комплексного совершенствования стада по репродуктивным свойствам свиноматок с использованием индекса, о чём свидетельствуют результаты ранжирования показателей изучаемых признаков после моделирования 50%-го отбора. Аналогичное моделирование отбора результатов оценки откормочных и мясных качеств молодняка кемеровской породы позволило установить тенденцию, общую как для репродуктивных качеств свиноматок, так и показателей контрольного откорма. При отборе по одному отдельно взятому признаку получены самые высокие (низкие) результаты в сравнении с анализируемыми признаками, не подвергшимися селекции. Но по комплексу признаков преимущество имела индексная селекция.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Smaragdov, M.G. | Kudinov, A.A., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

Modern molecular genetics allows identifying runs of homozygosity (ROH) in the animal genome indicating the presence of closely related crosses in the pedigree. The purpose of the research was to calculate the inbreeding coefficient for cows based on the full genome ROH data of Holsteinized Black-and-White cows from four breeding farms of the Leningrad region. From each herd from 46 to 85 animals were selected, a total of 263 heads. DNA for genotyping with BovineSNP50 chip was isolated from the blood by the phenol-chloroform method. Criteria for editing genotypes were the following: SNPs (single nucleotide polymorphism) with the frequency of occurrence in the genome of cows less than 5% were removed; SNPs genotypes that did not satisfy the Hardy-Weinberg distribution with confidence p=0.0001 were removed. As a result of the editing of 54,609 SNPs, 43,298 SNPs remained. The quality of genotyping (QS) was 0.99. ROHs in the cow genome were identified using Plink 1.9 software. The ROH selection criteria were as follows: the scanning frame included 50 SNPs; heterozygous SNPs in ROH were banned; the number of missing SNPs in ROH was no more than two. The scanning of the genome of 263 cows showed that the average number of ROH per genome varied from 23 to 25. The average length of ROH in the cow genome varied from 6729 kbp to 7220 kbp (kilobase pairs). Thus, the total ROH length of individual animals ranged from 24 Mbp to 380 Mbp (megabase pairs). The calculated inbreeding coefficient for individual cows varied from 1.0 to 15.1%. The average inbreeding coefficient in four herds varied from 5.5% to 8.0%. Thus, molecular indicators based on ROH allow evaluating the inbreeding coefficient of cows in herds, and this method should be used in breeding. | Современная молекулярная генетика позволяет идентифицировать в геноме животных протяженные гомозиготные районы (ROH), свидетельствующие о наличии близкородственных скрещиваний в родословной. Целью исследования было рассчитать коэффициент инбридинга у коров, исходя из полногеномных ROH-данных голштинизированных черно-пестрых коров из 4племенных заводов Ленинградской области. Из каждого стада отбирали от 46 до 85 животных, всего 263 головы. ДНК для генотипирования чипом BovineSNP50 выделяли из крови фенол-хлороформным методом. Критерии редактирования генотипов были следующими: SNPs (Singlenucleotidepolymorphism – однонуклеотидный полиморфизм) c частотой встречаемости в геноме коров менее 5% удаляли; генотипы SNPs, не удовлетворяющие распределению Харди-Вайнберга с достоверностью p = 0,0001, удаляли. В результате редактирования из 54609 SNPs осталось 43298. Качество генотипирования (QS) составило 0,99. Выявление ROH в геноме коров осуществляли с использованием пакета программ Plink 1.9. Критерии отбора ROH следующие: рамка сканирования включала 50 SNPs; введен запрет на гетерозиготные SNPs в ROH; число пропущенных SNPs в ROH не более двух. В результате сканирования генома 263 коров среднее число ROH на геном составило от 23 до 25. Средняя длина ROH в геноме коров варьировала от 6729 до 7220 т.п.н. (тысяч пар нуклеотидов). При этом суммарная длина ROH у отдельных животных составляла от 24 до 380 м.п.н. (миллионов пар нуклеотидов). Рассчитанный коэффициент инбридинга у отдельных коров варьировал от 1,0 до 15,1%. Средний коэффициент инбридинга в 4стадах составлял от 5,5 до 8,0%. Таким образом, молекулярные показатели на основе ROH позволяют оценить коэффициент инбридинга у коров в стадах, и этот метод следует использовать в селекционной работе.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Golovin, S.E., All-Russia Selection and Technological Inst. of Horticulture and Plant Breeding, Moscow

The studies were aimed at clarifying the composition of micromycetes associated with root and foot rots of strawberry, as well as the identification of species succession in pathological processes with the analysis of the environmental factors contributing to the development of the diseases. Phytosanitary surveys of plantations, as well as the selection of plant and soil samples, were carried out in the Moscow, Tula, Bryansk, Voronezh and Orenburg regions, in the Krasnodar Krai and in the Chechen Republic in 2006–2018. The isolates of fungi and pseudofungi were identified on the basis of microscopy and morphometry using reference guides. The refining diagnostics of Phytophthoracactorum, P. nicotianae and Colletotrichumacutatum species was carried out by the method of polymerase chain reaction. Strawberry root rot was noted in all regions. Their most intensive development was observed in ground greenhouses, when the culture was grown in the open ground with mulching by black film in 3-year-old and older plantings, as well as in the southern regions (in the Krasnodar Krai and the Chechen Republic). At the same time, in addition to direct damage to the root system, symptoms were recorded on the above-ground parts of the plants. Most root and foot rots had a complex etiology. The dominant agent (prevalence of more than 60%) in the Moscow region was oomycete P.cactorum; besides it we found C. destructans, Rh. solani,P.nicotianae, and Pythiumspp. In three regions (Moscow and Orenburg regions and the Chechen Republic), Rh. solani, C. destructans and Fusariumspp. fungi were the most frequently included in micromycetepathocomplexes associated with black root rot. Rare species of Acremonium, Penicillium, Helicosporium, Mucor, Acremoniella (Harzia), Chalara, Arthrobotrys, and Monochaetia genera were also present in the micromycete complexes in different regions. | Цели исследования - уточнить составмикромицетов, ассоциирующихся с корневыми и прикорневыми гнилями земляники, а также выявить сукцессии видов в патологических процессах и провести анализ экологических факторов, способствующих развитию болезней. Фитосанитарные обследования насаждений, отбор растительных образцов и почвы осуществляли в Московской, Тульской, Брянской, Воронежской и Оренбургской областях, в Краснодарском крае и Чеченской Республике в 2006–2018 гг. Изоляты грибов и псевдогрибов идентифицировали на основе микроскопирования и морфометрии по справочникам-определителям. Уточняющую диагностику видов Phytophthoracactorum, P. nicotianae и Colletotrichumacutatum осуществляли методом полимеразной цепной реакции. Корневые гнили земляники отмечали во всех регионах. Наиболее интенсивное их развитие наблюдали в грунтовых теплицах и при выращивании культуры в открытом грунте с мульчированием черной пленкой в посадках 3 лет и старше, а также в южных регионах (Краснодарский край и Чеченская Республика). При этом кроме непосредственного поражения корневой системы фиксировали симптомы на надземных частях растений. Большинство корневых и прикорневых гнилей имело комплексную этиологию. Доминирующим возбудителем (распространенность более 60%) в Московской области был оомицет P. cactorum, кроме него присутствовали C. destructans, Rh. solani, P. nicotianae, Pythiumspp. В патокомплексымикромицетов, ассоциирующихся с черной корневой гнилью, в трех регионах (Московская и Оренбургская области и Чеченская республика) наиболее часто входили грибы Rh. solani, C. destructans и Fusariumspp. В комплексах микромицетов в разных регионах присутствовали также редкие виды из родов Acremonium, Penicillium, Helicosporium, Mucor, Acremoniella (Harzia), Chalara, Arthrobotrys, Monochaetia.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Balabanov, V.I. | Ishchenko, S.A. | Romanenkova, M.S., Russian State Agrarian Univ., Moscow

Considered are some of the features and prospects for the introduction of technologies based on the "Internet of things" in crop production. Presented is an implementation solution for monitoring soil and air indicators by eighteen sensors located in an experimental plot in the Precision Agriculture Center of the Russian State Agrarian University – Moscow Timiryazev Agricultural Academy. Both remote access through existing mobile communication systems and low power consumption through the use of alternative energy sources make the maintenance of such devices an affordable and low-cost option. The low cost of sensors, as well as the use of biodegradable and safe components make it possible to avoid their subsequent collecting for disposal. The simulation results are represented, according to the observation dates, by graphs of soil and air indicators. It is concluded that the introduction of technologies based on the "Internet of Things" will automate processes and eliminate human participation in most of them, while ensuring production efficiency. | Рассмотрены некоторые особенности и перспективы внедрения технологий на базе "Интернета вещей" в растениеводстве. Представлена реализация контроля показателей почвы и воздуха восемнадцатью датчиками, расположенными на опытном земельном участке в центре точного земледелия Российского государственного аграрного университета – МСХА имени К.А. Тимирязева. Возможность удалённого доступа посредством существующих систем подвижной связи и малое энергопотребление за счёт использования альтернативных источников энергии делает обслуживание таких устройств доступным и малозатратным. Низкая стоимость датчиков, применение биоразлагаемых и безопасных компонентов позволяют отказаться от их последующего сбора. Результат моделирования представлен, согласно датам наблюдения, графиками показателей почвы и воздуха. Сделан вывод, что внедрение технологий на базе "Интернета вещей" позволит автоматизировать процессы и исключить участие человека в большинстве из них, обеспечивая при этом эффективность производства.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation