AGRIS - 

2018

Novikov, A.A. | Semak, M.S., All-Russia Research and Development Inst. of Animal Breeding, Moscow Region

In the RG the state genetic testing (GT) program for breeding material of agricultural animals has being performed since 2001. The results of generic testing breeding animals were analyzed by the methods of immunogenotypic analysis and DNA testing in dairy breeding, sheep breeding, and horse breeding (data for 2014-2016). There given data on authenticity of origin and occurrence of genetic anomalies. There were tested 1400 cattle heads for authenticity of origin in 2014, 1075 – in 2015, 2738 – in 2016. Inconsistencies were revealed in 3.1% of cases on the average for 3 years. GT was realized most completely in horse breeding (the percentage completion was above 90%) and worst – in dairy breeding (only 60%). The results of GT in 26 regions of the Russian Federation were given. The regions have been revealed where this work is successful and where GT is not performed at all. 4065 cattle heads were tested for 14 types of anomalies in 2014-2016 in the Russian Federation by DNA technologies. The average percent of revealed anomalies was 6%. Practical significance of GT depends on how the results of genetic monitoring are used at farms. The main conditions of effectiveness of genetic monitoring are constancy and regularity of GT by any available method of genetic analysis. | В РФ с 2001 г. выполняется государственная программа генетической экспертизы племенного материала с.-х. животных (ГЭ). Проанализированы результаты генетического тестирования племенных животных методами иммуногенетического и ДНК-анализа в молочном скотоводстве, свиноводстве, овцеводстве, коневодстве (данные за 2014-2016 гг.). Приведены данные по достоверности происхождения и встречаемости генетических аномалий. На достоверность происхождения в 2014 г. проверено 1400 гол. КРС, в 2015 – 1075, в 2016 - 2738. Несоответствия выявлены в 3,1% случаев в среднем за 3 года. В 2016 г. программа ГЭ наиболее полно была реализована в коневодстве (процент выполнения задания свыше 90%) и хуже всего - в молочном скотоводстве (только на 60%). Приведены результаты выполнения ГЭ по 26 областям Российской Федерации. Выявлены регионы, где данная работа идет успешно, и где ГЭ не проводится вообще. Методом ДНК-технологий в Российской Федерации за 2014-2016 гг. на 14 видов аномалий протестировано 4065 гол. КРС. Средний процент выявленных аномалий - 6%. Практическая значимость ГЭ зависит от того, как результаты генетического мониторинга используются в хозяйствах. Основные условия эффективности генетического мониторинга - постоянство и систематичность проведения ГЭ любым из доступных методов генетического анализа.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Kulikov, I.M., All-Russia Selection and Technological Inst. of Horticulture and Plant Breeding, Moscow (Russian Federation) | Kudryavtsev, A.M., Russian Academy of Agricultural Sciences, Moscow (Russian Federation). The N.I. Vavilov Inst. of Common Genetics | Marchenko, L.A. | Morozova, N.G., All-Russia Selection and Technological Inst. of Horticulture and Plant Breeding, Moscow (Russian Federation) | Boris, K.V. | Trifonova, A.A. | Dedova, L.V., Russian Academy of Agricultural Sciences, Moscow (Russian Federation). The N.I. Vavilov Inst. of Common Genetics

The genetic diversity of 16 apples varieties bred by All-Russian Research Horticultural Institute for Breeding, Cultivation and Nursery has been researched in the Vavilov Institute of General Genetics using microsatellite markers. The DNA of all analyzed apple varieties was isolated from fresh young leaves by the CTAB method. For the analysis, 10 SSR markers were selected: CH02c02b, CH03d01, CH03a04, CH02g04, CH01f03b, CH04e03, CH03d08, CH03d11, CH05g08, CH03d12. Amplification of the SSR-loci selected for the analysis was carried out using reagents manufactured by Dialat Ltd., in the T100 Thermal Cycler (Bio-Rad). As a result, 75 allelic variants were identified at ten of the studied loci. The number of alleles per locus varied from 5 (CH04e03, CH03d11, CH05g08) to 11 (CH03d01, CH03a04), and averaged 7.5 alleles per locus. For each of the microsatellite loci studied, clear and reproducible results of fragment analysis were obtained. On the analyzed 16 apple varieties, 75 alleles at ten studied loci were revealed. For one variety on all microsatellite loci used in the analysis, 17 to 20 alleles were amplified. For all studied varieties, except 'Triumph' variety, at least in one of the 10 examined SSR, loci allelic variants or combinations of allelic variants were marked, and they not were found in other varieties of the sample. Within the varieties 'Legenda', 'Marat Busurin' and 'Mayak Zagor'ya', such specific allelic combinations of allelic variants were revealed in six of the ten analyzed loci. The value of the informative index (PIC) was ranged from 0.49 (CH03d11) to 0.84 (CH03a04) and averaged 0.720. The indicators of the expected (HE) and observed (HO) heterozygosity were varied from 0.54 (CH03d11) and 0.50 (CH04e03) to 0.85 (CH03a04) and 1 (CH02g04, CH01f03b and CH03d12) with an average value of 0.752 (HE) and 0.838 (HO). All the studied SSR loci showed a fairly high level of polymorphism. Data on the allelic composition of the 16 studied apple varieties can be used to identify and certify these varieties. | Приведены результаты применения микросателлитных маркеров для изучения генетического разнообразия 16 сортов яблони селекции Всероссийского селекционно-технологического институт садоводства и питомниководства на базе Института общей генетики им. Н.И. Вавилова. ДНК всех проанализированных сортов яблони выделяли из свежих молодых листьев СТАБ методом. Для анализа были выбраны 10 SSR-маркеров: СН02с02b, CH03d01, CH03a04, CH02g04, CH01f03b, CH04e03, CH03d08, CH03d11, CH05g08, CH03d12. Амплификацию отобранных для анализа SSR-локусов проводили с использованием реактивов производства Диалат Лтд, в амплификаторе T100 Thermal Cycler (Bio-Rad). По каждому из изученных микросателлитных локусов были получены четкие и воспроизводимые результаты фрагментного анализа. В результате были выявлены 75 аллельных вариантов по десяти изученным локусам. Число аллелей на локус варьировало от 5 (CH04e03, CH03d11, CH05g08) до 11 (CH03d01, CH03a04), и в среднем составило 7,5 аллелей на локус. Для одного сорта по всем микросателлитным локусам, использованным в анализе, амплифицировалось от 17 до 20 аллелей. Для всех изученных сортов, кроме сорта Триумф, в хотя бы одном из исследованных 10 SSR-локусов отмечены аллельные варианты или сочетания аллельных вариантов, не выявленные у других сортов выборки. У сортов Легенда, Марат Бусурин и Маяк Загорья такие специфичные аллельные сочетания аллельных вариантов выявлены в шести из десяти проанализированных локусах. Значение показателя информативности (PIC) варьировало от 0,49 (CH03d11) до 0,84 (CH03a04) и в среднем составило 0,720. Показатели ожидаемой (HE) и наблюдаемой (HO) гетерозиготности варьировали от 0,54 (CH03d11) и 0,50 (CH04e03) до 0,85 (CH03a04) и 1 (CH02g04, CH01f03b и CH03d12) при среднем значение 0,752 (HE) и 0,838 (HO). Все изученные SSR-локусы показали достаточно высокий уровень полиморфизма. Данные об аллельном составе 16 изученных сортов яблони могут быть использованы для идентификации и паспортизации данных сортов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Larkina, T.A., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

There is an urgent need to find molecular markers for breeding broiler lines to reduce the abdominal fat content. It is to increase the nutritional value of the carcass and reduce the cost of feeding. DNA isolated from 150 broiler liver samples of the Iza Hubbard F-15 cross has been taken as the material to the study. The 35 day-old broilers have been taken from a private farm. DNA has been isolated according to the standard procedure using K proteinase and phenol. Analysis of FABP2 sequence in mutation has showed that the mutation results in recognition of TaqI restriction endonuclease site. Thus, the PCR-RFLP analysis method has been chosen for theoretical simulation of the test system for analyzing polymorphism of FABP2 gene in position -561 at substitution A with C. At the end of the incubation period, the fragments have been electrophoretically separated in a 1.5% agarose gel at 150 V in TBE buffer with the addition of ethidium bromide to a final concentration of 30 ng/ml, and the fragments have been visualized in ultraviolet light. According to the gene test results, the incidence of CC, AC and AA genotypes is the following: (0.42), (0.35) and (0.23), respectively. As for the fat content, Iza Hubbard F-15 cross broilers with heterozygous AS genotype slightly outperform the ones with homozygous genotypes, but these differences are not statistically significant. The medians of fat content in all three genotypes are practically on the same level, which indicates minor differences. Perhaps, to obtain a more meaningful result, it is required to increase the sampling, to include in the research another gene associated fat accumulation, and to study the additive mechanism of the gene action. | Имеется острая необходимость в поиске молекулярных маркеров для селекции родительских линий бройлеров на снижение содержания абдоминального жира, что позволит увеличить пищевую ценность тушки и уменьшить расходы на кормление. Материалом для исследований послужила ДНК, выделенная из 150 образцов печени бройлеров кросса Иза Хаббард Ф-15 в возрасте 35 дней. ДНК выделяли по стандартной методике с использованием протеиназы К и фенола. Анализ последовательности FABP2 в области мутации показал, что мутация приводит к узнаванию сайта рестрикции рестриктазой TaqI. Для теоретического моделирования тест-системы анализа полиморфизма гена FABP2 -561 с заменой A на C был выбран метод ПЦР-ПДРФ анализа. По окончании инкубации проводили электрофоретическое разделение фрагментов в 1,5%-ном агарозном геле при 150В в буфере ТВЕ с добавлением бромистого этидия до конечной концентрации 30 нг/мл и визуализировали фрагменты под ультрафиолетовым светом. По результатам исследования частота встречаемости генотипов составила: СС (0,42), АС (0,35), АА (0,23). Бройлеры кросса "Иза Хаббард Ф-15" с гетерозиготным генотипом АС немного превосходят по содержанию жира особей с гомозиготными генотипами, но эти различия статистически не достоверны. Медианные значения показателя у всех трех генотипов находятся практически на одном уровне, что говорит о незначительных различиях между ними. Возможно, для получения более значимого результата требуется увеличить выборку и добавить в изучение еще один ген, связанный с жиронакоплением, и рассмотреть уже аддитивный механизм работы генов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Marzanov, N.S., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

The researches were carried out during 2013–2017. The material for research was samples of wool bulbs from 24 different age-sex groups of elks living on the territory of the state nature reserve "Sumarokovskiy" (the Kostroma region). DNA on three microsatellite loci of elks (BM6438, CSSM43, BM1225) and 3 ones of cattle (ETH225; TGLA53; CSRM60) was analyzed. It was found that the level of actual heterozygosity varied from 0.375 in the ETH225 locus to 0.985, in the BM1225 locus; while the theoretically calculated index was 0.457 and 0.744, respectively. The greatest number of alleles was found in the BM1225 (n = 8) and CSSM43 (n = 10) loci. The comparison of the actual and theoretical heterozygosity levels showed that in three microsatellite loci (BM6438, CSRM60, ETH225) the heterozygotes were deficient in the studied elk population, which was confirmed by the coefficient data of the of excess (D = 5.7%). For a reliable genetic evaluation of the number of domesticated elks to be obtained the Robertson heterozygosity test and the Robertson homozygosity coefficient were used. The genetic imbalance was observed in 5 of the 6 microsatellite loci. The exception was the TGLA53 locus in which there was no genetic imbalance (xi-square is 2.42, the number of degrees of freedom is 3, P is greater than 0.05). Thus, the above stated data demonstrate the increase of homozygoting of the population, the number of effective alleles decreases, the genetic diversity decreases and thereby, the homogeneity of the studied group of elks under domestication increases. These investigations have shown the necessity of monitoring the allele fund of the elk population under domestication bred not only on the Sumarokovskaya moose farm, but also living in the wild nature of the Kostroma region. | Исследования проводили в течение 2013–2017 гг. Материалом для исследований служили образцы луковиц шерсти от 24 различных половозрастных групп лосей, обитающих на территории государственного природного заказника "Сумароковский" (Костромская обл.). Проанализировано ДНК по трём микросателлитным локусам лосей (BM6438; CSSM43; BM1225) и трём – крупного рогатого скота (ETH225; TGLA53; CSRM60). Установлено, что уровень фактической гетерозиготности варьировал от 0,375 в локусе ETH225 до 0,985 в локусе BM1225, а показатель теоретически рассчитанный составлял 0,457 и 0,744 соответственно. Наибольшее число аллелей было выявлено в локусах BM1225 (n = 8) и CSSM43 (n = 10). Сопоставление фактического и теоретического уровня гетерозиготности показало, что в трёх локусах микросателлитов (BM6438, CSRM60 и ETH225) у изучаемого поголовья лосей отмечался дефицит гетерозигот, что подтверждают данные коэффициента эксцесса (D = 5,7%). Для получения достоверной генетической оценки поголовья одомашниваемых лосей в работе был использован тест гетерозиготности по Робертсону и коэффициент гомозиготности по Робертсону. Нарушение генетического равновесия отмечали у 5 из 6 микросателлитных локусов. Исключением являлся TGLA53 локус, у которого не было отмечено нарушения генного равновесия (сумма хи-квадрат = 2,42; число степеней свободы = 3; Р больше 0,05). Полученные данные свидетельствуют об увеличении огомозигочивания поголовья: уменьшается число эффективных аллелей, снижается генетическое разнообразие, повышается тем самым однородность исследованной группы одомашниваемых лосей. Данные исследования показали необходимость определённого контроля аллелофонда поголовья одомашниваемых лосей, не только разводимых на Сумароковской лосеферме, но и живущих в условиях дикой природы Костромской области.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Romanova, A.B. | Kornienko, E.V. | Koval'chuk, S.N., Center of Experimental Embriology and Reproductive Biotechnology, Moscow

The efficiency of delivery methods for exogenous DNA into bovine in vitro zygotes using liposomes was evaluated. The methods were microinjection of plasmid-liposome complexes into the cytoplasm of zygotes and lipofection of bovine zygotes devoid of a shiny coat. Microinjection was performed in 18–22 h after the start of fertilization, the concentration of the circular plasmid pEGFP-N1 in the injection solution was 18, 26, 250 microg/mL, of the linearized plasmid – 13 microg/mL; the number of embryos was 25, 25, 12 and 25, respectively. Increase in the plasmid concentration did not significantly affect the dynamics of embryo development in vitro and the percentage of embryos expressing the target EGFP gene. All embryos with a fluorescent signal showed a mosaic pattern of expression of the target gene. The fluorescent signal was observed only in 1 blastocyst obtained by microinjection of the linearized plasmid in the complex with liposomes. The efficiency of the method turned out to be low (4.0–8.3%), with the exception of the group where the plasmid concentration was 18 microg/mL (20.0%). For the first time, the effectiveness of the transfection method of zygotes, devoid of the shiny coat, by lipofection for cattle was shown. The start time of transfection with a circular plasmid was in 18, 22, 24, 27 hours from the start of fertilization, the number of embryos was 12, 15, 35, 33; for a linearized plasmid the start time was in 18 and 27 hours from the start of fertilization, and the number was 12 and 13 embryos, respectively. The highest percentage of embryos expressing the TurboGFP gene (51.5%) was observed when transfected in 27 h after the start of fertilization using the circular plasmid. When lipofection was performed using the linearized plasmid, the change in the time of transfection from 18 to 27 h did not significantly affect the value of this indicator (33.3 and 30.8%, respectively). The lipofection method seems promising for non-invasive transfection of bovine zygotes devoid of the shiny coat. | Оценивали эффективность доставки экзогенной ДНК в полученные in vitro зиготы крупного рогатого скота с использованием липосом путем микроинъекции комплексов плазмидалипосомы в цитоплазму зигот и путем липофекции лишенных блестящей оболочки зигот крупного рогатого скота. Микроинъекцию проводили через 18…22 ч после начала оплодотворения, концентрация кольцевой плазмиды pEGFP-N1 в инъекционном растворе составляла 18, 26, 250 мкг/мл, линеаризованной – 13 мкг/мл, количество эмбрионов – 25, 25, 12 и 25 соответственно. Увеличение концентрации плазмиды существенно не повлияло на динамику развития эмбрионов in vitro и на долю эмбрионов, экспрессировавших целевой ген EGFP. У всех эмбрионов с флуоресцентным сигналом отмечен мозаичный характер экспрессии целевого гена. Флуоресцентный сигнал наблюдали только в 1 бластоцисте, полученной при микроинъекции линеаризованной плазмиды в комплексе с липосомами. Эффективность метода оказалась низкой (4,0…8,3%), за исключением группы, где концентрация плазмиды составляла 18 мкг/мл (20,0%). Впервые показана эффективность метода трансфекции лишенных блестящей оболочки зигот путем липофекции в применении к крупному рогатому скоту. Время начала трансфекции кольцевой плазмидой – 18, 22, 24, 27 ч от начала оплодотворения, количество эмбрионов – соответственно 12, 15, 35, 33; линеаризованной – 18 и 27 ч, 12 и 13 эмбрионов соответственно. Больше всего эмбрионов, экспрессировавших ген TurboGFP (51,5%), наблюдали при трансфекции через 27 ч после начала оплодотворения при использовании кольцевой плазмиды. При проведении липофекции с использованием линеаризованной плазмиды изменение времени начала трансфекции с 18 до 27 ч существенно не влияло на величину этого показателя (33,3 и 30,8% соответственно). Метод липофекции представляется преспективным для неинвазивной трансфекции лишенных блестящей оболочки зигот крупного рогатого скота.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Marzanov, N.S. | Popov, A.N. | Marzanova, L.K. | Tokhov, M.Kh. | Popov, N.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

The surveys with 175 Brown Swiss cows have been carried out in the Kabardino-Balkarian Republic to assess the polymorphism associated with the age-related change. A comparative analysis of the frequencies of occurrence of antibodies, alleles, and genotypes between the first-calf heifers and the mature cows of the 3d to 5th lactation is performed. The structural changes in the investigated loci are recorded for each type of the marking systems. The greatest number of antigens and loci with the low frequency of occurrence was found in the mature cows compared to the first-calf heifers; the low frequency values for a pair of variables comprised 49 and 40, respectively. The average frequency values for a pair of variables appeared to be 7 and 18. With respect to the genetic structures of high frequency of occurrence, the paired data comprised 19 and 22, respectively. The obtained data indicate the age-related reduction in size of the allele pool through all the types of the marking systems. The low level of polymorphism at the DNA marker loci except for the kappa-casein locus in the Brown Swiss cows is revealed. The assessment of the status of 8 loci using the homo- and heterozygote frequencies and taking into account the kappa-casein genotypes proved that the greatest number of heterozygous genotypes per specimen were defined in group kappa-CNAA (4.2); in groups kappa-CNAB and kappa-CNBB, this value appeared to be equal to 3.6. The homo- and heterozygous genotype ratio in the complex genotype was displayed as kappa-CNAA and kappa-CNAB (4:3). The highest freaquences of homozygotes, rather than heterozygotes (5:2), were found in the animals with genotype kappa-CNBB, which can indicate the more consolidated group of animals. The milk yield and the contents of fat, protein, and milk solid nonfat were higher in the animals with the kappa-CNBB genotype than in the cows with genotypes kappa-CNAA и kappa-CNAB. The Ayran product made from the milk of cows with genotype kappa-CNBB contained more protein and less fat, when compared to the product made from the milk of cows with genotypes kappa-CNAA and kappa-CNAB. | Brown Swiss breed, Ayran, allele, genotype, blood groups, polymorphic proteins, DNA markers. Исследования проводили в Кабардино-Балкарской Республике на 175 коровах бурой швицкой породы для оценки возрастного полиморфизма. Сравнивали частоту встречаемости антигенов, аллелей и генотипов у первотелок (n=55) и коров 3-5 лактации (n=120). Изменения по структурам исследованных локусов были отмечены по всем типам использованных маркирующих систем (группы крови, полиморфизм белков, ДНК-маркеры). Наибольшее число антигенов и аллелей с низкой встречаемостью обнаружили у полновозрастных коров - 49 против 40. Их средней встречаемости оказалось 7 против 18, что касается генетических структур высокой встречаемости, то их, было 19 против 22. Полученные данные говорят о том, что с возрастом происходит сужение аллелофонда по всем типам маркирующих систем. У коров бурой швицкой породы по локусам ДНК-маркеров (пролактину, PIT-1-гену, гормону роста) показан низкий уровень полиморфизма, исключением являлся каппа-казеин. Оценка состояния 8 локусов (каппа-казеина; пролактина; гормона роста; PIT-1-гена; гемоглобина; трансферрина; альбумина; преальбумина) по встречаемости гомо- и гетерозигот с учетом генотипов каппа-казеина показала, что наибольшее количество гетерозиготных генотипов на 1 особь было выявлено в группе каппа-CNAA (4,2), в группах каппа-CNAB и каппа-CNBB этот показатель оказался равным 3,6. Соотношения гомо- и гетерозиготных генотипов в комплексном генотипе выглядели следующим образом: каппа-CNAA и каппа-CNAB (4:3). У животных с генотипом каппа-CNBB отмечалась максимальная встречаемость гомозигот, чем гетерозигот (5:2), что говорит о более консолидированной группе животных. Удой, содержание жира (Р меньше 0,01), белка и СОМО в молоке (Р меньше 0,05) у животных с каппа-CNBB были выше, чем у коров с каппа-CNAA и каппа-CNAB. Айран, полученный из молока коров с генотипом каппа-CNBB, больше содержал белка и меньше жира, чем из молока коров с каппа-CNAA и каппа-CNAB генотипами.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Suprun, I.I., North-Caucasian Federalal Center for Horticulture, Viticulture, Wine-making, Krasnodar

By using the polymorphism analysis of microsatellite loci, DNA certification and estimation of the degree of genetic similarity for a set of 20 modern peach varieties bred in Nikita botanical garden (Crimea) were performed. The studied varieties are in demand in horticulture, agroсlimatic conditions of the region and are valuable in breeding as sources of useful adaptive traits. To analyze the polymorphism of studied varieties 13 SSR-markers were used: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 and BPPCT002. Markers were divided into multiplex sets, which included 3-4 markers. Optimal combinations of SSR-markers made it possible to obtain easily interpreted results during fragment analysis. Among the used SSR markers the highest number of alleles (5) was found in markers BPPCT025 and CPPCT044, the least polymorphic markers were CPPCT040, UDP98-409, BPPCT028 (two alleles) and BPPCT002 (one allele). The remaining SSR-markers revealed 3-4 alleles per locus. Analysis of the obtained DNA fingerprints showed that all studied varieties have a unique allelic set. The most polymorphic SSR-markers are promising for use in the DNA certification of peach genetic resources. The cluster analysis revealed three main clusters, the distribution in which, in some cases, corresponds to the origin of the varieties. Genetic similarity data together with data on the origin of varieties can be used for planning of cross combinations when it is necessary to maximize the diversity level in the hybrid offspring. | С использованием анализа полиморфизма микросателлитных локусов выполнена ДНК-паспортизация и оценка степени генетического сходства выборки из 20 современных сортов персика селекции Никитского ботанического сада (Крым). Исследованные сорта являются востребованными в садоводстве в агроклиматических условиях региона и представляют селекционный интерес как источники полезных адаптивных признаков. Для анализа полиморфизма исследуемых сортов использовали 13 SSR-маркеров: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 и BPPCT002. Маркеры были распределены в мультиплексные наборы, включающие 3-4 маркера. Оптимальные сочетания SSR-маркеров позволили получать легко интерпретируемые результаты в ходе фрагментного анализа. Среди использованных SSR-маркеров наибольшее количество аллелей (5) было выявлено для маркеров BPPCT025 и CPPCT044, наименее полиморфными оказались маркеры CPPCT040, UDP 98-409, BPPCT028 (2 аллеля) и BPPCT002 (1 аллель). По остальным SSR-маркерам было выявлено по 3-4 аллеля на локус. Анализ полученных ДНК-фингерпринтов показал, что все изученные сорта обладают уникальным аллельным набором. Наиболее полиморфные SSR-маркеры перспективны для использования при ДНК-паспортизации генетических ресурсов персика. Выполненный кластерный анализ выявил 3 главных кластера, распределение в которых в ряде случаев согласуется с происхождением сортов. Данные о степени генетического сходства в совокупности с данными о происхождении сортов могут быть использованы для планирования комбинаций скрещиваний при необходимости получения максимального уровня разнообразия в гибридном потомстве.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Egorashina, E.V. | Tamarova, R.V., Yaroslavl State Agricultural Academy

State programs of the development of animal breeding in Russian Federation set the task of not only increasing milk productivity of cows but also improving quality characteristics of milk especially protein milking ones. The study was done in Yaroslavl region in one of the bred livestock farms specialized in Ayrshires. Milk productivity of 107 cows of three breeds with the use of genetic markers on genotypes of caseines and beta-lactoglobulin has been analyzed. All animals demonstrated high ability in milking from the first to the third lactation. The highest coefficient of milking proved to be in Holsteins, which was 1.6, in Ayrshires – 1.3, in Holstein-Yaroslavl breed – 1.4. Under the highest yields Holsteins have statistically proven difference in the content of protein in milk – 3.0-3.24%, Ayrshires – 3.17-3.31% and Holstein-Yaroslavl cows – 3.19-3.26%. The highest-protein-fat coefficient (129.72) was obtained in cows of Holstein breeds due to high yields, in cows of Ayrshire breeds – 108.87; in Holstein-Yaroslavl breeds – 100.26. It has been found that the best characteristics of milk productivity the animals with the genotype AB on cappa-caseine have. On beta-lactoglobulin the tendency has been marked that the best characteristics of milk productivity the cows of Ayrshire and Holstein breeds with the genotypes AA and AB show. On the basis of the results obtained for increasing protein-milking abilities of Ayrshire and Holstein-Yaroslavl breeds it is recommended to use sires, which nave B allelic variant of cappa-caseine in their genome and to make an individual selection of parents – homogeneous consolidating and heterogeneous improving. | Государственными программами развития животноводства Российской Федерации ставится задача не только увеличения молочной продуктивности коров, но и улучшения качественных показателей молока, особенно по белковомолочности. Исследование проводили в Ярославской области, на одном из племзаводов по айрширской породе. Проанализирована молочная продуктивность 107 коров трех пород с использованием генетических маркеров по генотипам каппа-казеина и бета-лактоглобулина. Все животные показали высокую способность к раздою от первой до 3-ей лактации: наивысший коэффициент раздоя оказался у коров голштинской породы, который составил 1,6; у айрширских коров – 1,3; ярославских голштинизированных – 1,4. При наиболее высоких удоях коровы голштинской породы имеют статистически достоверную разность по содержанию белка в молоке, который изменяется в интервале 3,0-3,24%; в то время как у айрширской породы – 3,17-3,31% и у ярославских голштинизированных коров – 3,19-3,26%. Наивысший белково-жировой коэффициент (129,72) был получен у коров голштинской породы за счет более высоких удоев, у коров айрширской породы он составил 108,87; у ярославских голштинизированных коров – 100,26. Наилучшие показатели молочной продуктивности имеют животные с генотипом АВ по каппа-казеину у всех трех пород. По бета-лактоглобулину отмечена тенденция, что лучшие показатели молочной продуктивности имеют коровы айрширской и голштинской пород с генотипами АА и АВ. Для повышения белковомолочности коров трех разводимых в хозяйстве пород рекомендуем производству использовать быков-производителей, которые имеют В-аллельный вариант каппа-казеина в геноме, и проводить индивидуальный подбор родительских пар – гомогенный консолидирующий и гетерогенный улучшающий.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Zeleneva, Yu.V. | Plakhotnik, V.V. | Sudnikova, V.P., Tambov Research and Development Inst. of Agriculture

The practice has shown that the direct introduction of donors of other regions into the breeding process does not always give a desired result because of the weak adaptive ability of the following generations. The development of highly efficient genetic sources and donors adapted to the regional conditions and possessing a complex of positive traits and properties (e.g. group and/or complex tolerance to stress factors of environment) is necessary, in order not to damage the balance of associated genes among wheat varieties in the Central Chernozem Region and to increase breeding results. The molecular markers have been applied to identify Lr-genes in 79 breeding lines of wheat, grown in the Middle-Russian branch of FSBSI 'Tambov Research Institute of Agriculture'. The wheat lines combined tolerance to brown rust and other positive traits, e.g. resistance to stem pests, drought tolerance, high productivity, and technological quality of grain. The molecular analysis of the material identified single Lr-genes as well as the combination of several genes with different efficiency in one genotype. Among the studied material the Lr9, Lr10, Lr19, Lr20, Lr24, Lr26 and Lr34 genes have been found. There were a lot of lines with the Lr19 gene in a combination with Lr10, Lr20 and Lr26 genes in one genotype. | Практика показала, что прямое включение в селекционный процесс инорайонных доноров не всегда дает желаемый результат, в основном вследствие слабой адаптивности последующих поколений. Для снижения вероятности нарушения сложившегося среди районированных в ЦЧР сортов пшеницы баланса ассоциированных генов и повышения результативности селекции необходимо создание адаптированных к зональным условиям высокоэффективных генетических источников и доноров, обладающих комплексом положительных признаков и свойств; в первую очередь - групповой и (или) комплексной устойчивостью к стрессовым факторам среды. С использованием молекулярных маркеров проведена идентификация Lr-генов у 79 селекционных линий пшеницы, созданных в Среднерусском филиале ФГНБУ "Тамбовский НИИ сельского хозяйства", сочетающих устойчивость к бурой ржавчине с комплексом других положительных признаков (устойчивость к скрытостебельным вредителям, засухоустойчивость, высокая урожайность и технологические качества зерна). В результате молекулярного анализа изучаемого материала идентифицированы как единичные Lr-гены, так и сочетания в одном генотипе нескольких генов различной эффективности. Среди изученного материала были выявлены гены Lr9, Lr10, Lr19, Lr20, Lr24, Lr26, Lr34. Преобладали линии с геном Lr19 в сочетании в одном генотипе с Lr10, Lr20 и Lr26.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2016

Kosovskij G.Yu. | Glazko V.I. | Andrejchenko I.А. | Koval’chuk S.N. | Glazko T.T.

The spread of the bovine leukemia virus (BLV) does a significant economic damage to dairy and beef cattle breeding. The content of viral RNA in blood samples and the proliferative activity of were compared to study a possibility of using these indices for individually testing animals by the both characteristics. The presence or absence of genome integrated provirus DNA in Black-and-White Holstein cows (n = 57, commercial herd) was evaluated and the group of infected animals was revealed when using primers as designed for BLV gag and pol genes. The relative quantity expression of provirus in individual infected cows using reverse transcriptase OCR (RT-PCR) analysis and primers to the fragment of the BLV pol gene were assessed. The count of leukocytes in blood samples of all cows, included in the analysis, was further calculated. The number of leucocytes in cows free from infection, with the exception of one cow, was less than 12*10E9 cells/l. This indicator in infected animals divided the investigated cows into two subgroups — in the first subgroup the leucocyte values did not exceed 17*10E9 cells/l, in the second subgroup the number of leukocytes was significantly higher, reaching 28*10E9 cells/l in some animals. It was important to note, that the amount (above 20*10E9 cells/l) of BLV RNA, sufficient to detect by RT-PCR, was revealed only on the second subgroup. The coincidence of the increased leucocyte amount and the BLV RNA in blood of infected animals indicates that particular these cows represent the greatest infection hazard and suggests that the combination of the two estimates (the number of leukocytes and RNA BLV) can be quite a reliable approach to the herd recovery by priority of their liquidation. | Распространение вируса бычьего лейкоза (Bovine leukemia virus, BLV) наносит существенный экономический ущерб молочному и мясному скотоводству. Проведено сопоставление содержания вирусной РНК в образцах крови и пролиферативной активности лейкоцитов, чтобы изучить возможность использования этих показателей для индивидуального тестирования животных по обеим характеристикам. С использованием разработанных праймеров к генам BLV gag и pol у черно-пестрых голштинизированных коров (n = 57) из промышленного стада определили наличие или отсутствие провирусной ДНК BLV, интегрированной в геном, и выявили группу инфицированных особей. С помощью PCR с обратной транскриптазой (RT-PCR) и праймеров к консервативному фрагменту гена pol BLV оценили относительное количество экспрессирующегося провируса у индивидуальных инфицированных животных. Дополнительно у всех коров, включенных в анализ, подсчитали число лейкоцитов в образцах крови. Инфицированные животные по этому показателю разделились на две подгруппы: у первой значения не превышали 17*10E9 кл/л, у второй — оказались существенно выше, достигая у некоторых особей 28*10E9 кл/л. У коров, свободных от инфекции (за исключением одной особи), число лейкоцитов было ниже 12*10E9 кл/л. Оказалось, что достаточное для выявления в RT-PCR количество РНК вируса BLV обнаруживается только у второй подгруппы инфицированных коров. Повышение количества лейкоцитов (свыше 20*10E9 кл/л) в сочетании с накоплением вирусной РНК в образцах крови инфицированных животных свидетельствует о том, что именно они представляют наибольшую инфекционную опасность. Совместное использование двух показателей (число лейкоцитов и количество вирусной РНК BLV) может быть достаточно надежным подходом при первоочередных мероприятиях по оздоровлению стад крупного рогатого скота.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation