AGRIS - 

Data provenance by Country

2023

Lyzhin, A.S. | Luk'yanchuk, I.V.

Improving the fruit aroma is one of the promising directions of modern strawberry breeding. The strawberry fruit aroma is a complex trait, formed by a combination of a large number of volatile compounds. The present study shows the results of assessing the allelic state of the FaOMT gene, determining biosynthesis of mesifurane (volatile compound) in strawberry selected forms created at the "I.V. Michurin Federal Scientific Center". The biological objects of the study were 22 selected intervarietal strawberry forms from 12 crossing combinations. The allelic state of the FaOMT gene was identified using codominant SCAR marker FaOMT-SI/NO. As a result of the studies, the marker fragment of the functional allele FaOMT+ was identified in 86.4% of forms. A heterozygous combination of alleles of the FaOMT gene (average level of mesifurane accumulation in fruits) was detected in 9.1% forms. The homozygous state of the functional allele was detected in 77.3% forms. The homozygous state of the non-functional allele FaOMT- (mesifurane is not produced) is characterized by three genotypes (13.6%). The greatest value for strawberry breeding use are forms with the homozygous state of the FaOMT+ allele: 1/6-41 (Vima Zanta x Polka), 2/2-32, 2/2-41 (Faith x Tea), 3/2-62 (Vima Zanta x Privlekatelnaya), 3/4-6, 3/4-7 (Malwina x Tea), 3/9-5, 3/9-12 (Florence x Faith), 5/1-105 (Polka x Vima Zanta), 5/2-23, 5/2-26, 5/2-32 (San Andreas x Monterey), 6/3-5, 6/3-21 (Kimberly x 9/2-2), 7/2-78 (Asia x Maya), 9/2-2, 9/2-7 (Kimberly x Honeoye). These forms are characterized by the maximum level of mesifurane biosynthesis in fruits and their involvement of which in hybridization allows the transmission of the target allele to 100% of the hybrid seedlings. | Совершенствование аромата плодов – одно из перспективных направлений современной селекции земляники. Аромат плодов земляники – сложный признак, формирующийся сочетанием большого количества летучих ароматообразующих веществ. В представленном исследовании показаны результаты оценки аллельного состояния гена FaOMT биосинтеза мезифурана (соединение ароматического комплекса) у отборных форм земляники садовой селекции ФНЦ имени И.В. Мичурина. Биологическими объектами исследования являлись 22 отборные межсортовые селекционные формы земляники садовой из 12 комбинаций скрещивания. Для идентификации аллельного состояния гена FaOMT использовали кодоминантный SCAR-маркер FaOMT-SI/NO. В результате проведённых исследований маркерный фрагмент функционального аллеля FaOMT+ выявлен у 86,4% форм. Гетерозиготным сочетанием аллелей (средний уровень накопления мезифурана в плодах) характеризуется 9,1% форм, гомозиготным состоянием функционального аллеля – 77,3%. Гомозиготным состоянием нефункционального аллеля FaOMT- (мезифуран в плодах не продуцируется) характеризуются три генотипа (13,6%). Наибольшую ценность для селекционного использования представляют формы с гомозиготным состоянием аллеля FaOMT+: 1/6-41 (Vima Zanta x Polka), 2/2-32, 2/2-41 (Faith x Tea), 3/2-62 (Vima Zanta x Привлекательная), 3/4-6, 3/4-7 (Malwina x Tea), 3/9-5, 3/9-12 (Florence x Faith), 5/1-105 (Polka x Vima Zanta), 5/2-23, 5/2-26, 5/2-32 (San Andreas x Monterey), 6/3-5, 6/3-21 (Kimberly x 9/2-2), 7/2-78 (Asia x Maya), 9/2-2, 9/2-7 (Kimberly x Honeoye). Они характеризуются максимальным уровнем накопления мезифурана в плодах, и вовлечение их в гибридизацию позволяет передать целевой аллель 100% гибридного потомства.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Kornil'ev, G.V. | Risovannaya, V.I. | Polulyakh, A.A. | Chizhova, A.M. | Ryazankina, Ya.Yu.

The article presents genotyping results of 16 grape accessions of the ''Magarach'' Ampelographic Collection with indetermined status by 9 nuclear microsatellite markers (ssrVVMD5, ssrVVMD7, ssrVVMD25, ssrVVMD27, ssrVVMD28, ssrVVMD32, ssrVrZAG62, ssrVrZAG79, ssrVVS2). Extraction of genomic DNA was carried out using a CTAB buffer from an average sample of young leaves or green cambial tissue of shoots. The purity and amount of DNA were assessed spectrophotometrically using a ''Biophotometer plus'' instrument. The polymerase chain reaction was performed on a ''T100 Thermal Cycler'' (BioRad). The PCR mixture consisted of a 2.5x reaction mixture and primers with fluorescent labels FAM, TAMRA, and R6G produced by ''OOO Sintol''. The primers were combined into multiplexes in accordance with the size of the resulting amplicons and the annealing temperature. Fragment analysis of PCR products was performed on an ABI Prism 3130 genetic analyzer using Gene Mapper software. The varieties were identified by comparing the obtained DNA-profiles with the Vitis International Variety Catalog (VIVC) database. According to the genotyping results, accessions with indeterminate status are identified as varieties: 'Asyl Kara', 'Vasarga chernaya', 'Galbena de Odobeshti', 'Genusa Tsibil', 'Grec Rouge', 'Cruciulita', 'Marash Cherven', 'Muscat fleur d'oranger', 'Muscat Hamburg', 'Mtsvane Kakhuri', 'Negru Virtos', 'Ozirovka', 'Plavaie', 'Rkatsiteli', 'Saperavi', 'Tsolikouri'. Deviations in the obtained DNA-profiles from the data of VIVC database by 1-2 alleles were revealed for 8 studied samples, which, presumably, can be explained by population variability, and in some cases by somatic mutations. This study demonstrates the result of molecular-genetic approaches to identify grape varieties. | Представлены результаты генотипирования 16 образцов винограда с неопределенным статусом из Ампелографической коллекции ''Магарач'' по 9 ядерным микросателлитным маркерам (ssrVVMD5, ssrVVMD7, ssrVVMD25, ssrVVMD27, ssrVVMD28, ssrVVMD32, ssrVrZAG62, ssrVrZAG79, ssrVVS2). Экстрагирование геномной ДНК с помощью ЦТАБ-буфера проводили из усреднённой пробы молодых листьев или зелёной камбиальной ткани побегов. Чистоту и количество ДНК оценивали спектрофотометрирически на приборе ''Biophotometer plus''. Полимеразная цепная реакция выполнена на амплификаторе ''T100 Thermal Cycler'' (BioRad). В составе ПЦР-смеси использовали реакционную смесь 2.5х и праймеры с флуоресцентными метками FAM, TAMRA, R6G производства компании ''ООО Синтол''. Праймеры были объединены в мультиплексы в соответствии с размерами получаемых ампликонов и температурой отжига. Фрагментный анализ ПЦР-продуктов выполнен на генетическом анализаторе ABI Prism 3130 с использованием программного обеспечения Gene Mapper. Идентификацию сортов проводили путём сравнительного анализа полученных микросателлитных профилей с базой данных Vitis International Variety Catalogue (VIVC). По результатам генотипирования образцы с неопределённым статусом идентифицированы как сорта: Асыл кара, Васарга чёрная, Галбена де Одобешты, Генуса цибил, Грек руж, Кручулита, Мараш червен, Мускат венгерский, Мускат гамбургский, Мцване кахетинский, Негру выртос, Озировка, Плавай, Ркацители, Саперави, Цоликоури. Выявленные отличия полученных ДНК-профилей от данных базы VIVC по 1-2 аллелям, предположительно, можно объяснить популяционной изменчивость, а в некоторых случаях соматическими мутациями. Данное исследование демонстрирует результат молекулярно-генетического подхода для идентификации сортов винограда.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Sabetova, K.D. | Chaitskij, A.A. | Lemyakin, A.D. | Shchegolev, P.O.

The introduction of DNA diagnostics based on molecular markers of quantitative trait loci (QTL) into animal husbandry practice may contribute to the efficiency of traditional farm animal breeding programs. Somatotropin and thyroglobulin genes are active regulatory participants in metabolic processes, and their polymorphisms should be considered together. There is the small number of scientific works devoted to complex genotypes of GH/TG of cattle. The study of associative relations to the yielding characters of cows is a matter of undoubted significance. So, the research goal is studying the yielding traits of Black-and-White cows with different complex genotypes for the GH and TG genes kept in the conditions of pedigree breeding units of the Kostroma region. The research was carried out at the Kostroma State Agricultural Academy. The object of research was Black-and-White cows (n = 105) kept at the pedigree breeding units of the Kostroma region. The source of breeding and zootechnical recording data is the information analytical system "SELEX". The cows were sampled for genetic material for genotyping by GH and TG genes by real-time polymerase chain reaction (PCR-RV). Amplification of DNA samples was performed on DTlite (Russia). The results were processed by standard biometric analysis methods. As a result of studies, three complex genotypes in somatotropin and thyroglobulin genes - LLCC, LLCT, LLTT - were revealed in the investigated animals. When analyzing the milk performance among animals of different complex GH and TG genotypes, there was no significant difference in the value of milk yield per a lactation, however, a reliable association of the GH(L) and TG(T) alleles with the weight fraction of fat and protein in milk was established. | Внедрение в практику животноводства ДНК-диагностики на основе молекулярных маркеров количественных признаков (QTL) может способствовать повышению эффективности традиционных программ разведения с.-х. животных. Гены соматотропина и тиреоглобулина являются активными участниками-регуляторами обменных процессов, и рассматривать их полиморфизмы следует вместе. Учитывая малочисленность научных работ, посвящённых комплексным генотипам GH/TG крупного рогатого скота, и несомненную значимость исследования ассоциативных связей с продуктивными качествами коров была поставлена цель: изучить продуктивные признаки коров чёрно-пёстрой породы с разными комплексными генотипами по генам GH и TG в условиях племрепродукторов Костромской области. Научные исследования проводили в Костромской государственной сельскохозяйственной академии. Объектом исследований были коровы чёрно-пёстрой породы (n = 105) из племенных репродукторов Костромской области. Источник данных племенного и зоотехнического учёта – информационно-аналитическая система "СЕЛЭКС". У коров проводили отбор проб генетического материала для генотипирования по генам GH и TG методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ). Амплификацию образцов ДНК осуществляли на приборе DTlite (Россия). Результаты были обработаны стандартными методами биометрического анализа. В результате исследований у обследованных животных выявлено три комплексных генотипа по генам соматотропина и тиреоглобулина: LLCC, LLCT, LLTT. При анализе молочной продуктивности среди животных разных комплексных генотипов GH и TG не было выявлено достоверной разницы по величине удоя за лактацию, однако установлена достоверная ассоциация аллелей GH(L) и TG(T) c показателями массовой доли жира и белка в молоке.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation