AGRIS - 

Data provenance by Country

2024

Давыдов, Евгений Александрович | Яковченко, Лидия Сергеевна | Харпухаева, Татьяна Михайловна | Желудева, Елена Владимировна | Чесноков, Сергей Владимирович | Конорева, Людмила Александровна | Кузнецова, Екатерина Сергеевна | Стороженко, Юлия Валерьевна | Рыжкова, Полина Юрьевна | Гимельбрант, Дмитрий Евгеньевич

The distribution of Umbilicaria aprina and U. rhizinata in Russia was revised basing on morphological and molecular-phylogenetic data. Umbilicaria aprina is new to Alexandra Land Island (Franz Josef Land Archipelago), Sverdrup Island (Taimyr Dolgano-Nenets District), the republics of Altai, North Ossetia-Alania and Sakha-Yakutia. Umbilicaria rhizinata is new to the republics of Tyva and Buryatia, Putorana Plateau, Kamchatka Peninsula, and the Magadan Region and is therefore reported for the first time to the Asian Subarctic. New localities of the species in other regions are cited. The ITS\5.8S phylogenetic tree supports the distinctness of U. aprina and U. rhizinata. The distribution map is drawn and patterns of distribution of two species are discussed. Umbilicaria aprina occurs in the high Arctic between 74°N and 81°N, whereas the northernmost locality of U. rhizinata is in the vicinity of Norilsk on the Putorana Plateau (ca. 70°N). In mountains U. aprina grows at higher maximal elevations compared to U. rhizinata. | Выявлено распространение Umbilicaria aprina и U. rhizinata в России на основе морфологических и молекулярно-филогенетических данных. Umbilicaria aprina является новым видом на островах Земля Александры (архипелаг Земля Франца-Иосифа), Свердруп (Таймырский Долгано-Ненецкий округ), в республиках Алтай, Северная Осетия-Алания и Саха (Якутия). Umbilicaria rhizinata является новым для республик Тыва и Бурятия, плато Путорана, полуострова Камчатка и Магаданской области. Таким образом, вид U. rhizinata впервые зарегистрирован в Азиатской Субарктике. Указаны новые местонахождения в других регионах. Представлено филогенетическое дeрево, подтверждающее различие U. aprina и U. rhizinata. Составлена карта распространения и обсуждены закономерности распространения двух видов. Umbilicaria aprina встречается в высоких широтах Арктики между 74° и 81° северной широты, тогда как самым северным местонахождением U. rhizinata являются окрестности Норильска на западе Плато Путорана (около 70° северной широты). Аналогично, в горах максимальные отметки U. aprina выше, чем у U. rhizinata.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2023

Калинина, Людмила Борисовна | Малышева, Екатерина Федоровна

The specimens collected in the Russian Far East were identified as Volvopluteus asiaticus, based on morphology and nrITS+nrLSU sequences analyses. The detailed description and illustration of the studied collection are provided. This is the first record of the species in Russia and the second find in the world. | Образцы, собранные на Дальнем Востоке России, были идентифицированы как Volvopluteus asiaticus на основе морфологии и анализа последовательностей nrITS+nrLSU. Приводится подробное описание и иллюстрация изученной коллекции. Это первая регистрация вида в России и вторая находка в мире.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2023

Путра, Иван П. | Риффиани, Р. | Нурхайят, О. Д. | Тоемон, А. И.

Inosperma (Inocybaceae) was originally described as a subgenus of Inocybe. Some species of Inosperma are considered edible mushrooms, but this genus also includes a few toxic species with high levels of muscarine. To date, the knowledge of this genus in Indonesia remains poor. During a mushroom hunting in Central Kalimantan (Indonesia) by the Indonesian mushroom hunter community, some fruiting bodies of inocyboid fungi which consumed and traded by the local people were collected. At glance, the specimens resembled Inosperma or Pseudosperma by the macromorphological characters in the field. Our goal was to justify the taxonomical position of our inocyboid specimens based on morphological and molecular evidence. The fresh fruiting bodies were used for the analysis. The basidiomata was described based on the macro- and micromorphological characters. The molecular analysis and phylogenetic tree construction were performed based on ITS 1–2 sequences. The combination of morphological and molecular analyses confirmed our collection as Inosperma subsphaerosporum. Morphologically, our specimens can be determined by the conical applanate cap with umbo, incurved to decurved margin, dry pileus with fibrillose to rimulose surface, lamellae adnexed to sinuate, cylindrical stipe, subglobose to globose smooth basidiospores, and abundant cheilocystidia in clusters. The yellow intracellular contents of cheilocystidia distinguished our specimen from Pseudosperma, while the outline of basidiospores differed our specimens to closely morphological species of I. carnosibulbosum, I. akirnum, and I. saragum. The BLAST result revealed that our specimen exhibits 96 % similarity to I. subsphaerosporum as the top hit. The phylogenetic tree (RAxML) nested our specimens in the I. subsphaerosporumclade from type material. The current study provides the first information on the occurrence of I. subsphaerosporum in Indonesia. Future study should be done to analyze both nutritional and muscarine content of this Indonesian Inosperma. | Inosperma – род грибов семейства Inocybaceae, первоначально описанный в качестве подрода рода Inocybe. Некоторые виды рода Inosperma считаются съедобными грибами, но этот род также включает несколько токсичных видов с высоким содержанием мускарина. На сегодняшний день изученность этого рода в Индонезии остается фрагментарной. Во время сбора грибов в Центральном Калимантане (Индонезия) индонезийским обществом грибников-любителей было собрано несколько плодовых тел иноцибоидных грибов, которые местные жители употребляли в пищу и продавали. По макроморфологическим признакам в поле образцы напоминали Inosperma или Pseudosperma. Нашей целью было установить видовую принадлежность собранных иноцибоидных образцов на основе морфологических и молекулярных данных. Для анализа использовали свежие плодовые тела (базидиомы). Базидиомы описаны по макро- и микроморфологическим признакам. Молекулярный анализ и построение филогенетического дерева проводили на основе последовательностей ITS 1–2. Сочетание морфологического и молекулярного анализов подтвердило нашу находку как Inosperma subsphaerosporum. Морфологически наши образцы можно определить по конической уплощенной шляпке с вершиной, вогнутой к неизогнутому краю, сухим ворсинкам с волокнистой или слегка ребристой поверхностью, пластинкам, прикрепленным выемкой, цилиндрической ножке, гладким полушаровидным до шаровидных базидиоспорам и многочисленным скоплениям хейлоцистид. Желтое внутриклеточное содержимое хейлоцистид отличало наш образец от Pseudosperma, а очертание базидиоспор отличало наши образцы от близких по морфологии видов I. carnosibulbosum, I. akirnum и I. saragum. Результат BLAST показал, что наш образец имеет 96%-е сходство с I. subsphaerosporum. Филогенетический анализ (RAxML) подтвердил принадлежность наших образцов к кладе I. subsphaerosporum из типового материала. Настоящее сообщение представляет информацию о первой находке I. subsphaerosporum в Индонезии. Для анализа содержания питательных веществ и мускарина в этой индонезийской иносперме необходимы дополнительные исследования.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2023

Савинов, Иван Алексеевич | Соломонова, Екатерина Владимировна | Ембатурова, Елена Юрьевна

The paper reports on the macro- and micromorphology and anatomy of fruits and seeds in 19 species representing 13 African and American genera of subfamily Cassinoideae (family Celastraceae). A diversity of carpological characters was identified: fruit type and peculiarities of its dehiscence; presence of trichomes on fruit surface; subtypes of pyrenaria (polymerous, olygomerous, dimerous, pseudomonomerous); number of seeds, morphology of the seed (shape, presence/absent of outgrowths); the ratio of parenchymatous (ground) and sclerenchymatous (supporting) cell elements in the pericarp, cell shape and number of cell layers in the seedcoat. Fruit and seed characters support the differences between genera, also reflect on their possible relationship. The traits revealed are also used to substantiate and support the recent taxonomic revision of many genera, primarily African. The array of revealed fruit and seed traits strongly support previous taxonomic decisions to define most genera of the subfamily Cassinoideae in a narrow sense. It is especially relevant in the taxonomy of the African representatives, characterizing among others the distinct indigenous flora of the Cape Floristic Region. | В статье представлены новые сведения о макро- и микроморфологии, а также анатомии плодов и семян 19 видов, относимых к 13 африканским и американским родам подсемейства Cassinoideae (Celastraceae). Выявлено разнообразие карпологических признаков: тип плода и особенности его вскрывания, наличие трихом на поверхности плодов, подтипы пиренария (полимерный, олигомерный, димерный или псевдомономерный), число семян, морфология семян (форма, наличие/отсутствие выростов), соотношение паренхимных (основных) и склеренхимных (опорных) клеточных элементов в перикарпии, форма клеток и число клеточных слоев в семенной кожуре. Признаки плодов и семян подтверждают различия между родами, а также отражают их возможное родство. Выявленные признаки также используются для обоснования и поддержки недавней таксономической ревизии многих родов, в первую очередь африканских. Множество выявленных признаков плодов и семян убедительно подтверждают предыдущие таксономические решения по пониманию большинства родов подсемейства Cassinoideae в узком смысле. Это особенно актуально в таксономии африканских представителей, характеризующих, среди прочего, самобытную местную флору Капской флористической области.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2023

Чесноков, Сергей Владимирович | Панькова, Виктория Васильевна | Конорева, Людмила Александровна

During the study of the lichen biota of Shikotan Island, Fissurina inabensis (Vain.) M. Nakan. et Kashiw. was identified on the basis of morphological and anatomical data. It is the first record to Russia both at a species and at genus level. The phylogenetic analysis based on the ITS sequences of the studied specimens supported the close relationship with F. insidiosa C. Knight et Mitt. belonging to the subfamily Fissurinoideae. A detailed description of the morphology, anatomy and secondary metabolites of the studied specimens is given. This species was previously known from Japan, Taiwan, and Thailand, and the area is extended to Shikotan Island where are the northernmost localities of the species. Detection of stictic acid might be variable depending on researchers because of the small amount of the substance. It was well detected using HPLC in this study. Differences in the number and size of ascospores in specimens from Shikotan Island and those from Japan described in the literature are discussed. | В ходе изучения лихенобиоты о. Шикотан на основании морфологии и анатомии был выявлен новый для России вид – Fissurina inabensis (Vain.) M. Nakan. et Kashiw. Филогенетический анализ, основанный на последовательности ITS изученного образца, подтвердил его близкое родство с F. insidiosa C. Knight et Mitt. и принадлежность к подсемейству Fissurinoideae. Приведено подробное описание морфологии, анатомии и вторичных метаболитов изученных образцов. Ранее Fissurina inabensis был известен из Японии Тайваня и Тайланда, в настоящее время его ареал простирается до о. Шикотан, где находятся самые северные места обитания. Выявление стиктовой кислоты может быть затруднено из-за небольшого ее количества. В этом исследовании стиктовая кислота была обнаружена с помощью ВЭЖХ. Обсуждаются различия в числе и размерах спор у образцов с о. Шикотан и из Японии, описанные в литературе.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2023

Ваганов, Алексей Владимирович | Гуреева, Ирина Ивановна | Скапцов, Михаил Викторович | Кузнецов, Александр Александрович | Романец, Роман Сергеевич | Салохин, Алексей Владимирович | Куцев, Максим Геннадьевич | Шмаков, Александр Иванович

This research is the first comprehensive analysis of the intrageneric relationships inside the subfamily Cryptogrammoideae: 14 taxa of Coniogrammeand one species of Cryptogramma were involved additionally in the molecular phylogenetic studies based on rbcL gene of plastid DNA; spore morphology of 32 taxa of cryptogrammoid ferns, namely 22 taxa of Coniogramme, nine species of Cryptogramma and one species of Llavea were studied using scanning electronic microscopy (SEM); 31 taxon of Cryptogrammoideae were studied using herbarium data from Herbaria across Europe and Asia (P, PE, LE, VLA, ALTB, TK) according to global botanical and geographical zones. As a result of this comprehensive analysis, we established a deep divergence of Coniogramme merillii in Coniogramme superclade: this species is the sister lineage to the remainder ofConiogramme. We revealed also the separateness of Co. suprapilosa from Co. rosthornii and Co. longissima, Co. africana from Co. lanceolata and Co. fraxinea, Co. robusta from Co. jinggangshanensis, Co. wilsonii and Co. japonica. Among Cryptogramma species, the relationship of Far Eastern Cr. gorovoi with Cr. crispa from the Caucasus and the Turkish endemic Cr. bithynica but not with any Far Eastern species was revealed. Spores of Coniogramme are characterized by simple smooth, granulate and papillate macro-ornamentation, spores of Cryptogramma species have the more coarse colliculate or tuberculate macro-ornamentation. Peculiarities of macro-ornamentation allow us to define six spore types in cryptogrammoid ferns: four spore types in Coniogramme and two spore types in Cryptogramma; the same spore type we assigned for Llavea cordifolia and Coniogramme suprapilosa. In Coniogramme, the grouping of species attending the spore type does not agree with existing classification and phylogenetic hypotheses. Genetic separateness of Co. suprapilosa corresponds with its exceptional verrucate spore sculpture not found in other Coniogramme species. In Cryptogramma, the grouping on the spore types corresponds with other morphological characteristics, existing system and molecular phylogeny. Spore ornamentation has diagnostic value in the recognition of cryptogrammoid taxa at the generic and section (in Cryptogramma) level. Sino-Japanese and Sino-Himalaian regions of Eastern Asiatic Subkingdom are the centers of origin and diversity for subfamily Cryptogrammoideae and especially for the genus Coniogramme. | Представлен первый комплексный анализ родственных отношений в подсемействе Cryptogrammoideae: 14 таксонов Coniogramme и один вид Cryptogramma были дополнительно привлечены к молекулярно-филогенетическим исследованиям на основе гена rbcL пластидной ДНК; с применением метода сканирующей электронной микроскопии (СЭМ) изучены споры 32 таксонов криптограммоидных папоротников, выявлено распространение 31 таксона Cryptogrammoideae в соответствии с глобальным ботанико-географическим районированием с использованием данных из Гербариев Европы и Азии (P, PE, LE, VLA, ALTB, TK). В результате установлена глубокая дивергенция Coniogramme merillii в суперкладе Coniogramme: этот вид является родственной линией остальной части рода; выявлена обособленность Co. suprapilosa от Co. rosthornii и Co. longissima, Co. africana от Co. lanceolata и Co. fraxinea, Co. robusta от Co. jinggangshanensis, Co. wilsonii и Co. japonica. Среди видов Cryptogramma выявлено родство дальневосточного Cr. gorovoi с кавказской и европейской Cr. crispa и турецким эндемиком Cr. bithynica, а не с каким-либо из дальневосточных видов. Споры Coniogrammeхарактеризуются простой гладкой, зернистой и папиллятной макроскульптурой, споры видов Cryptogramma имеют более грубую колликулятную или бугорчатую макроскульптуру. Особенности макроскульптуры позволяют выделить шесть типов спор у криптограммоидных папоротников: четыре типа спор у Coniogramme и два у Cryptogramma; один и тот же тип спор выявлен у Llaveacordifolia и Coniogramme suprapilosa. Для рода Coniogramme группировка видов по типу спор не согласуется с существующей классификацией и филогенетическими гипотезами. Генетическая обособленность Co. suprapilosa соотносится с необнаруженной у других видов Coniogramme бородавчатой скульптурой спор. В роде Cryptogramma группировка видов по типу спор согласуется с морфологическим характеристиками, существующей системой и молекулярной филогенией. Скульптура спор имеет диагностическое значение при распознавании таксонов криптограммоидных папоротников на родовом и секционном (в роде Cryptogramma) уровне. Центрами происхождения и разнообразия подсемейства Cryptogrammoideae, особенно рода Coniogramme, являются китайско-японский и китайско-гималайский регионы Восточноазиатского подцарства.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2022

Шеховцова, Ирина Николаевна | Шеховцов, Сергей Викторович

This article deals with the problem of species independence of Carex sordida. Closely related species of the sect. Carex, C. sordida, C. atherodes, and C. drymophila, were analyzed based on material from Asian Russia. Based on morphological characteristics, it was suggested that C. sordida is more closely related to C. atherodes than to C. drymophila. Molecular analysis using the matK plastid gene and the ITS2 and ETS nuclear ribosomal spacers confirmed that C. sordida is a distinct species closely related to C. atherodes. Several specimens of hybrid origin among the studied species were found. During the revision of herbarium samples, several new localities of C. sordida were identified, which significantly expanded its range to the west. In this study, for the first time, distribution maps of C. sordida, C. drymophila, and C. atherodes in the Asian part of Russia were published. | В данной статье рассматривается проблема видовой самостоятельности Carex sordida. Проанализированы близкородственные виды C. sordida, C. atherodes и C. drymophila из Азиатской России. Основываясь на морфологических характеристиках, выдвинуто предположение, что C. sordida более тесно связан с C. atherodes, чем с C. drymophila. Молекулярный анализ с использованием пластидного гена matK и ядерных рибосомальных спейсеров ITS2 и ETS подтвердил, что C. sordida является отдельным видом, близким к C. atherodes. Между изученными видами также было обнаружено несколько экземпляров гибридного происхождения. В ходе пересмотра гербарных коллекций выявлено несколько новых местонахождений C. sordida, значительно расширивших его ареал на запад. В данном исследовании приводятся карты распространения C. sordida, C. drymophila и C. atherodes в Азиатской части России.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2022

Шалимов, Александр Петрович | Чжан, Сянь-Чунь

Based on extensive herbarium research of the Selaginella monospora group (incl. S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana, and S. submonospora) and on molecular phylogenetic evidence, an additional new species to this group was discovered. It was collected from Dawei Mountain in southeast Yunnan, and here named as Selaginella subeffusa. The new species distinctly differs from similar species by its coriaceous and densely imbricate ventral leaves on main stems and branches, 2.2–3.1 mm long and 1.1–1.5 mm wide, with enlarged acroscopic base, and strongly overlapping stem and branches, and with denticulate margins; microspores verrucate and perforate. Phylogenetic analyses of three plastid regions (rbcL, atpI, psbA) showed that S. subeffusa clustered with S. submonospora and nested between the “S. microclada – S. effusa” clade and the “S. monospora” clade. | На основе обширных исследований гербарных образцов видов группы Selaginella monospora, включающей S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana и S. submonospora, и молекулярно-филогенетических данных был обнаружен новый вид в этой группе. Он был собран с горы Давей на юго-востоке провинции Юньнань и назван Selaginella subeffusa. Новый вид четко отличается от близких видов кожистыми вентральными листьями, плотно черепитчато расположенными по главному стеблю и боковым ветвям, 2,2–3,1 мм длиной и 1,1–1,5 мм шириной, зубчатыми по краю, с увеличенным акроскопическим основанием, сильно перекрывающими стебель и боковые ветви; микроспоры бородавчатые и перфорированные. Филогенетический анализ трех пластидных фрагментов (rbcL, atpI, psbA) показал, что образцы S. subeffusaсгруппированы с образцами S. submonospora и расположены между кладами “S. microclada – S. effusa” и “S. monospora”.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2022

Шалимов, Александр Петрович | Чжан, Сянь-Чунь

На основе обширных исследований гербарных образцов видов группы Selaginella monospora, включающей S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana и S. submonospora, и молекулярно-филогенетических данных был обнаружен новый вид в этой группе. Он был собран с горы Давей на юго-востоке провинции Юньнань и назван Selaginella subeffusa. Новый вид четко отличается от близких видов кожистыми вентральными листьями, плотно черепитчато расположенными по главному стеблю и боковым ветвям, 2,2–3,1 мм длиной и 1,1–1,5 мм шириной, зубчатыми по краю, с увеличенным акроскопическим основанием, сильно перекрывающими стебель и боковые ветви; микроспоры бородавчатые и перфорированные. Филогенетический анализ трех пластидных фрагментов (rbcL, atpI, psbA) показал, что образцы S. subeffusaсгруппированы с образцами S. submonospora и расположены между кладами “S. microclada – S. effusa” и “S. monospora”. | Based on extensive herbarium research of the Selaginella monospora group (incl. S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana, and S. submonospora) and on molecular phylogenetic evidence, an additional new species to this group was discovered. It was collected from Dawei Mountain in southeast Yunnan, and here named as Selaginella subeffusa. The new species distinctly differs from similar species by its coriaceous and densely imbricate ventral leaves on main stems and branches, 2.2–3.1 mm long and 1.1–1.5 mm wide, with enlarged acroscopic base, and strongly overlapping stem and branches, and with denticulate margins; microspores verrucate and perforate. Phylogenetic analyses of three plastid regions (rbcL, atpI, psbA) showed that S. subeffusa clustered with S. submonospora and nested between the “S. microclada – S. effusa” clade and the “S. monospora” clade.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2018

Zhang, X.-C. | Han, B.

Сообщение посвящено памяти нашего друга, коллеги и учителя – профессора Жан Мин-Ли, признанного эксперта в области ботаники по таким группам, как Fabaceae, Polygonaceae, Tamaricaceae, Nitrariaceae. Он внес большой вклад в изучение флоры Китая и Центральной Азии. В своих исследованиях Жан Мин-Ли использовал не только традиционные методы исследования, но и проявлял большой интерес к кладистике, программам DELTA и другим методам систематики. Профессор Жан Мин-Ли подготовил много прекрасных учеников. Также приводится список опубликованных научных работ учёного. | This work is dedicated to the memory of our friend, colleague and teacher Professor Ming-Li Zhang, a recognized expert in botany in such groups as Fabaceae, Polygonaceae, Tamaricaceae, Nitrariaceae. He made a great contribution to the study of the Flora of China and Central Asia. He used not only the traditional methods of research, but also showed great interest in cladistics, DELTA programs and other methods of systematics throughout his research. Professor Ming-Li Zhang trained many excellent students. In addition, we attach a list of published papers related to his research.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation