AGRIS - 

Data provenance by Country

2022

Соломонова, Марина Юрьевна | Сперанская, Наталья Юрьевна | Блинников, Михаил Сергеевич | Жембровская, Татьяна Александровна | Силантьева, Марина Михайловна

В статье рассматривается проблема номенклатуры и классификации фитолитов. На примере злаков подсемейства Pooideae юга Западной Сибири обосновано разделение морфотипа «crenate» (ICPN 2.0) на две формы: полилопастную и волнистую. Анализ литературных данных подтверждает неоднородность этого морфотипа и различные трактовки его вариаций. К первой форме были отнесены высокие в боковой проекции фитолиты с отчетливыми лопастями, ко второй группе – уплощенные формы с волнистым краем. В статье рассмотрено формирование этих двух морфотипов у 52 видов злаков, относящихся к 25 родам. Основное содержание исследования составляет анализ встречаемости форм в различных трибах и подтрибах Pooideae согласно современным сведениям о филогении злаков. На примере трех родов рассмотрены различия в формировании этих морфотипов на секционном и подродовом уровнях. В ходе детального анализа выявлено, что волнистые пластинки наиболее характерны для подтрибы Aveninae(Poeae), полилопастные частицы – для подтрибы Agrostidinae (Poeae) и трибы Meliceae. По некоторым таксонам, например, трибе Stipeae, получены неоднозначные данные, не согласующиеся с информацией по другим территориям, что указывает на необходимость дальнейших исследований обозначенной проблемы. При анализе встречаемости форм на внутриродовом уровне установлено, что в родах Poa и Festucaпрослеживаются различия между отдельными подродами и секциями, а для рода Calamagrostis такие отличия отсутствуют. Полученные результаты указывают на перспективность привлечения к классификации фитолитов филогенетической информации и необходимость более полного изучения крупных родов злаков на предмет фитолитного состава (Festuca, Calamagrostis, Poa, Stipa и др.). | The article deals with the problem of nomenclature and classification of phytoliths. The division of the “crenate” morphotype (ICPN 2.0) into two forms – polylobate and wavy – is substantiated using Pooideae grasses from the south of Western Siberia. An analysis of the literature data confirms the heterogeneity of this morphotype and various interpretations of its variations. The polylobate group includes phytoliths high in lateral projection with distinct lobes, and the wavy group includes flattened forms with a wavy edge. The article details the formation of these two morphotypes in 52 grass species belonging to 25 genera. The main content of the study is an analysis of the occurrence of forms in various tribes and subtribes according to modern information on the phylogeny of cereals. The differences in the formation of these morphotypes at the sectional and subgeneric levels are considered using as examples three genera. The detailed analysis shows that wavy plates are most typical for the subtribe Aveninae(Poeae), polylobed particles are typical for the subtribe Agrostidinae (Poeae) and the tribe Meliceae. For some taxa, for example, the tribe Stipeae, ambiguous data have been obtained that are inconsistent with information from other territories, which indicates the need for further research on this problem. The analysis of occurrence of forms at the intrageneric level shows that in the genera Poa and Festuca there are differences between individual subgenera and sections, while for the genus Calamagrostis there are no such differences. The results obtained point to the prospect of using phylogenetic information in the classification of phytoliths and the need for a more complete study of large genera of grasses in terms of phytolith composition (Festuca, Calamagrostis, Poa, Stipa, etc.).

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2022

Шеховцова, Ирина Николаевна | Шеховцов, Сергей Викторович

This article deals with the problem of species independence of Carex sordida. Closely related species of the sect. Carex, C. sordida, C. atherodes, and C. drymophila, were analyzed based on material from Asian Russia. Based on morphological characteristics, it was suggested that C. sordida is more closely related to C. atherodes than to C. drymophila. Molecular analysis using the matK plastid gene and the ITS2 and ETS nuclear ribosomal spacers confirmed that C. sordida is a distinct species closely related to C. atherodes. Several specimens of hybrid origin among the studied species were found. During the revision of herbarium samples, several new localities of C. sordida were identified, which significantly expanded its range to the west. In this study, for the first time, distribution maps of C. sordida, C. drymophila, and C. atherodes in the Asian part of Russia were published. | В данной статье рассматривается проблема видовой самостоятельности Carex sordida. Проанализированы близкородственные виды C. sordida, C. atherodes и C. drymophila из Азиатской России. Основываясь на морфологических характеристиках, выдвинуто предположение, что C. sordida более тесно связан с C. atherodes, чем с C. drymophila. Молекулярный анализ с использованием пластидного гена matK и ядерных рибосомальных спейсеров ITS2 и ETS подтвердил, что C. sordida является отдельным видом, близким к C. atherodes. Между изученными видами также было обнаружено несколько экземпляров гибридного происхождения. В ходе пересмотра гербарных коллекций выявлено несколько новых местонахождений C. sordida, значительно расширивших его ареал на запад. В данном исследовании приводятся карты распространения C. sordida, C. drymophila и C. atherodes в Азиатской части России.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2022

Шалимов, Александр Петрович | Чжан, Сянь-Чунь

Based on extensive herbarium research of the Selaginella monospora group (incl. S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana, and S. submonospora) and on molecular phylogenetic evidence, an additional new species to this group was discovered. It was collected from Dawei Mountain in southeast Yunnan, and here named as Selaginella subeffusa. The new species distinctly differs from similar species by its coriaceous and densely imbricate ventral leaves on main stems and branches, 2.2–3.1 mm long and 1.1–1.5 mm wide, with enlarged acroscopic base, and strongly overlapping stem and branches, and with denticulate margins; microspores verrucate and perforate. Phylogenetic analyses of three plastid regions (rbcL, atpI, psbA) showed that S. subeffusa clustered with S. submonospora and nested between the “S. microclada – S. effusa” clade and the “S. monospora” clade. | На основе обширных исследований гербарных образцов видов группы Selaginella monospora, включающей S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana и S. submonospora, и молекулярно-филогенетических данных был обнаружен новый вид в этой группе. Он был собран с горы Давей на юго-востоке провинции Юньнань и назван Selaginella subeffusa. Новый вид четко отличается от близких видов кожистыми вентральными листьями, плотно черепитчато расположенными по главному стеблю и боковым ветвям, 2,2–3,1 мм длиной и 1,1–1,5 мм шириной, зубчатыми по краю, с увеличенным акроскопическим основанием, сильно перекрывающими стебель и боковые ветви; микроспоры бородавчатые и перфорированные. Филогенетический анализ трех пластидных фрагментов (rbcL, atpI, psbA) показал, что образцы S. subeffusaсгруппированы с образцами S. submonospora и расположены между кладами “S. microclada – S. effusa” и “S. monospora”.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2022

Шалимов, Александр Петрович | Чжан, Сянь-Чунь

На основе обширных исследований гербарных образцов видов группы Selaginella monospora, включающей S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana и S. submonospora, и молекулярно-филогенетических данных был обнаружен новый вид в этой группе. Он был собран с горы Давей на юго-востоке провинции Юньнань и назван Selaginella subeffusa. Новый вид четко отличается от близких видов кожистыми вентральными листьями, плотно черепитчато расположенными по главному стеблю и боковым ветвям, 2,2–3,1 мм длиной и 1,1–1,5 мм шириной, зубчатыми по краю, с увеличенным акроскопическим основанием, сильно перекрывающими стебель и боковые ветви; микроспоры бородавчатые и перфорированные. Филогенетический анализ трех пластидных фрагментов (rbcL, atpI, psbA) показал, что образцы S. subeffusaсгруппированы с образцами S. submonospora и расположены между кладами “S. microclada – S. effusa” и “S. monospora”. | Based on extensive herbarium research of the Selaginella monospora group (incl. S. effusa, S. microclada, S. monospora, S. subdiaphana, and S. submonospora) and on molecular phylogenetic evidence, an additional new species to this group was discovered. It was collected from Dawei Mountain in southeast Yunnan, and here named as Selaginella subeffusa. The new species distinctly differs from similar species by its coriaceous and densely imbricate ventral leaves on main stems and branches, 2.2–3.1 mm long and 1.1–1.5 mm wide, with enlarged acroscopic base, and strongly overlapping stem and branches, and with denticulate margins; microspores verrucate and perforate. Phylogenetic analyses of three plastid regions (rbcL, atpI, psbA) showed that S. subeffusa clustered with S. submonospora and nested between the “S. microclada – S. effusa” clade and the “S. monospora” clade.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2021

Fisinin, V.I. | Selionova, M.I. | Kovalev, D.A. | Shinkarenko, L.A.

One of the trends of modern industrial agriculture is the reduction of breed genetic recourses in farm animals and poultry. Our purpose was to study genetic diversity and interbreeding differentiation of turkeys of Russian and foreign breeding using microsatellite loci. The research was performed at the North Caucasus zonal experimental station for poultry farming in 2019 Blood samples were taken from 30 individuals of each of 7 turkey breeds of the Russian selection (Belaya shirokogrudaya, BSH; Bronzovaya Severokavkazskaya, BrSK; Belaya Severokavkazskaya, BeSK; Serebristaya Severokavkazskaya, SSK; Moscovskaya Belaya, MB; Chernaya Tikhoretskaya, CHT; Uzbekskaya palevaya, UP). DNA was isolated according to the protocol for the commercial AmpliPrime DNA-sorb-B kit (InterLabService, Russia). Genotyping was performed for 12 microsatellite loci (MNT9-MNT20). The described genotypes of turkeys gene pool farm (AM) (Nicholas Turkey Breeding Farms) of the University of Minnesota were used for comparison with the genotypes of turkeys of Russian breeds. It was shown that low genetic diversity is characteristic of both Russian breeds of turkeys and the AM population. The number of identified alleles in the microsatellite loci as a whole in the breed sample varied from 1 to 4, the average number of alleles per locus ranged from 1 to 1.83. The least genetic difference occurred between the MB and BSH breeds. The BeSK, SSK, and BrSK breeds formed a separate node, with BrSK exhibiting the greatest genetic distance, forming the largest branch by genetic distance. Separate branches at relatively equal distances formed the breeds CHT, UP, and AM population. Thus, the findings confirm an insignificant genetic diversity of the gene pool of the studied Russian turkeys' breeds and populations as compared to the gene pool of other species of farm animals. | Одна из тенденций современного индустриального сельского хозяйства - сокращение генетических ресурсов пород животных и птицы. Цель работы - изучить генетическое разнообразие и межпородную дифференциацию индеек российской и зарубежной селекции с использованием микросателлитных локусов. Работа выполнялась на Северо-Кавказской зональной опытной станции по птицеводству в 2019 г. У 30 особей каждой из 7 пород индеек отечественной селекции (белой широкогрудой, BSH; бронзовой северокавазской, BrSK; белой северокавказской, BeSK; серебристой северокавказской, SSK; московской белой, MB; черной тихорецкой, CHT; узбекской палевой, UP) были отобраны образцы крови. ДНК выделяли в соответствии с протоколом к коммерческому набору АмплиПрайм ДНК-сорб-В ("ИнтерЛабСервис", Россия). Генотипирование проводили по 12 микросателлитным локусам MNT9-MNT20. Для сравнения с генотипами индеек отечественных пород использовали описанные генотипы индеек (AM) генофондной фермы университета Миннесоты (Nicholas Turkey Breeding Farms). Российские породы индеек и популяция АМ характеризовались низким генетическим разнообразием. Число выявленных аллелей в локусах микросаттеллитов в целом по породной выборке варьировало от 1 до 4, число аллелей на 1 локус колебалось от 1,0 до 1,83. Наименьшее генетическое различие установлено между породами MB и BSH. Породы BeSK, SSK и BrSK сформировали отдельный узел, при этом наибольшее генетическое удаление проявляла BrSK, образуя наибольшую по генетическому расстоянию ветвь. В отдельные ветви на относительно равном удалении выделились породы CHT, UP и популяция АМ. Таким образом, получено подтверждение, что генофонд исследованных пород и популяций домашних индеек характеризуется незначительным генетическим разнообразием по сравнению с генофондом других видов с.-х. животных.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Лысова , Майя Валерьевна | Мещерский , Илья Григорьевич | Крамина , Татьяна Евгеньевна

In the Crimea and the Caucasus, the section Dorycnium (Mill.) D. D. Sokoloff of the genus Lotus L. s. l., attributed by many researchers to the genus Dorycnium Mill., is represented by taxa related to L. graecus L. (= Dorycnium graecum) and L. dorycnium L. (= D. pentaphyllum). To clarify the species composition, diagnostic features, and phylogenetic relationships of the representatives of the section in these two geographical regions, seven Crimean and five Caucasian samples were analyzed. A morphological analysis of the Crimean and Caucasian material was carried out using the methods of one-dimensional and multidimensional (Principal Coordinate Analysis) statistics. Separate molecular phylogenetic analyses by ITS1-5.8S-ITS2 nrDNA and trnL-F cpDNA were performed using a representative set of species of the genus Lotus s. l. The study revealed the presence of two species in the Crimea and the Caucasus: L. graecus and L. herbaceus (Vill.) Jauzein (a representative of the L. dorycnium complex), which differ in many morphological characters (e.g., sizes of flowers, leaves, calyx teeth, and the type of pubescence and the presence/absence of root offspring). Interspecific hybrids were not identified. Within each species, the geographical differentiation between the sequences of both studied markers (ITS and trnL-F) was not observed. The study confirmed that the L. dorycnium complex (including L. herbaceus) from Lotus section Dorycnium according to plastid data is not separated from L. hirsutus, a species from Lotus section Bonjeanea with a wide Mediterranean range that does not reach the Crimea and the Caucasus, as was previously shown by other cpDNA markers. | В Крыму и на Кавказе секция Dorycnium (Mill.) D. D. Sokoloff рода Lotus L. s. l., относимая многими исследователями к роду Dorycnium Mill., представлена таксонами родства L. graecus L. (= Dorycnium graecum) и L. dorycnium L. (= D. pentaphyllum). Для уточнения видового состава, диагностических признаков и филогенетических связей представителей секции этих географических регионов были проанализированы семь крымских и пять кавказских выборок. Проведен морфологический анализ крымского и кавказского материала с использованием методов одномерной и многомерной (метод главных координат) статистики. Молекулярно-филогенетический анализ отдельно по ITS1-5,8S-ITS2 ядерной рДНК и trnL-F хпДНК выполнен с привлечением репрезентативного набора видов рода Lotus s. l. Исследование выявило присутствие на территории Крыма и Кавказа двух видов: L. graecus и L. herbaceus (Vill.) Jauzein (представителя комплекса L. dorycnium), отличающихся по многим морфологическим признакам (размерам цветков, листьев, зубцов чашечки, характеру опушения и наличию/отсутствию корневых отпрысков). Межвидовые гибриды не выявлены. В пределах каждого вида географической дифференциации между последовательностями обоих изученных маркеров (ITS и trnL-F) не наблюдалось. Данное исследование подтвердило, что комплекс L. dorycnium (включая L. herbaceus) из секции Dorycnium по пластидным данным не отделен от L. hirsutus, вида из секции Bonjeanea (Rchb.) D. D. Sokoloff с широким средиземноморским ареалом, не доходящим до Крыма и Кавказа, что было ранее показано по другим маркерам хпДНК.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2019

Лысова , Майя Валерьевна | Мещерский , Илья Григорьевич | Крамина , Татьяна Евгеньевна

В Крыму и на Кавказе секция Dorycnium (Mill.) D. D. Sokoloff рода Lotus L. s. l., относимая многими исследователями к роду Dorycnium Mill., представлена таксонами родства L. graecus L. (= Dorycnium graecum) и L. dorycnium L. (= D. pentaphyllum). Для уточнения видового состава, диагностических признаков и филогенетических связей представителей секции этих географических регионов были проанализированы семь крымских и пять кавказских выборок. Проведен морфологический анализ крымского и кавказского материала с использованием методов одномерной и многомерной (метод главных координат) статистики. Молекулярно-филогенетический анализ отдельно по ITS1-5,8S-ITS2 ядерной рДНК и trnL-F хпДНК выполнен с привлечением репрезентативного набора видов рода Lotus s. l. Исследование выявило присутствие на территории Крыма и Кавказа двух видов: L. graecus и L. herbaceus (Vill.) Jauzein (представителя комплекса L. dorycnium), отличающихся по многим морфологическим признакам (размерам цветков, листьев, зубцов чашечки, характеру опушения и наличию/отсутствию корневых отпрысков). Межвидовые гибриды не выявлены. В пределах каждого вида географической дифференциации между последовательностями обоих изученных маркеров (ITS и trnL-F) не наблюдалось. Данное исследование подтвердило, что комплекс L. dorycnium (включая L. herbaceus) из секции Dorycnium по пластидным данным не отделен от L. hirsutus, вида из секции Bonjeanea (Rchb.) D. D. Sokoloff с широким средиземноморским ареалом, не доходящим до Крыма и Кавказа, что было ранее показано по другим маркерам хпДНК. | In the Crimea and the Caucasus, the section Dorycnium (Mill.) D. D. Sokoloff of the genus Lotus L. s. l., attributed by many researchers to the genus Dorycnium Mill., is represented by taxa related to L. graecus L. (= Dorycnium graecum) and L. dorycnium L. (= D. pentaphyllum). To clarify the species composition, diagnostic features, and phylogenetic relationships of the representatives of the section in these two geographical regions, seven Crimean and five Caucasian samples were analyzed. A morphological analysis of the Crimean and Caucasian material was carried out using the methods of one-dimensional and multidimensional (Principal Coordinate Analysis) statistics. Separate molecular phylogenetic analyses by ITS1-5.8S-ITS2 nrDNA and trnL-F cpDNA were performed using a representative set of species of the genus Lotus s. l. The study revealed the presence of two species in the Crimea and the Caucasus: L. graecus and L. herbaceus (Vill.) Jauzein (a representative of the L. dorycnium complex), which differ in many morphological characters (e.g., sizes of flowers, leaves, calyx teeth, and the type of pubescence and the presence/absence of root offspring). Interspecific hybrids were not identified. Within each species, the geographical differentiation between the sequences of both studied markers (ITS and trnL-F) was not observed. The study confirmed that the L. dorycnium complex (including L. herbaceus) from Lotus section Dorycnium according to plastid data is not separated from L. hirsutus, a species from Lotus section Bonjeanea with a wide Mediterranean range that does not reach the Crimea and the Caucasus, as was previously shown by other cpDNA markers.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2018

Zhang, X.-C. | Han, B.

Сообщение посвящено памяти нашего друга, коллеги и учителя – профессора Жан Мин-Ли, признанного эксперта в области ботаники по таким группам, как Fabaceae, Polygonaceae, Tamaricaceae, Nitrariaceae. Он внес большой вклад в изучение флоры Китая и Центральной Азии. В своих исследованиях Жан Мин-Ли использовал не только традиционные методы исследования, но и проявлял большой интерес к кладистике, программам DELTA и другим методам систематики. Профессор Жан Мин-Ли подготовил много прекрасных учеников. Также приводится список опубликованных научных работ учёного. | This work is dedicated to the memory of our friend, colleague and teacher Professor Ming-Li Zhang, a recognized expert in botany in such groups as Fabaceae, Polygonaceae, Tamaricaceae, Nitrariaceae. He made a great contribution to the study of the Flora of China and Central Asia. He used not only the traditional methods of research, but also showed great interest in cladistics, DELTA programs and other methods of systematics throughout his research. Professor Ming-Li Zhang trained many excellent students. In addition, we attach a list of published papers related to his research.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2018

Filippova, V.A. | Kruglov, Yu.V. | Andronov, E.E., All-Russia Research and Development Inst. of Agricultural Economics, Moscow

Soil microbial communities are complex multicomponent systems that form under the influence of a wide range of factors, among them - soil type, plant species, climate, agricultural technology - in general, determining the physical and chemical characteristics of the environment. The aim of our work was to study the influence of various agricultural technicians such as crop rotation and liming, under the conditions of a long field experiment on the phylogenetic structure of prokaryotic micro-organisms in rye crops. The results of the high-throughput DNA sequencing of the soil microbiome and the subsequent analysis of the phylogenetic structure and diversity of the prokaryotic microorganisms of the sod-podzolic soil under the conditions of perennial rye culture showed that the plant is one of the key factors in the formation of the prokaryotic community. Regardless of the agrotechnical methods under the cover of winter rye, the same core structure of prokaryotes, including a small number of types of proteobacteria and actinobacteria, develops in the earing phase. The dominant position among them is occupied by the bacteria of the Rhizobiaceae family, which in this case is to some extent related to the history of the experimental field. Apparently, the bacteria of this family and, above all, the nodule bacteria, find favorable conditions for their development in the rye rhizosphere. In this connection, studies of the viability of Rhizobiaceae in winter rye crops, and their evolution to associative endosymbiotic relationships with rye in the course of a long coexistence are of undoubted interest. The effect of liming on the genetic structure of the prokaryote community of acidic soils may be different. At the same time, apparently, the specific type of plants, as well as the history of the field (crop rotation, permanent culture, fertilizer system, etc.) are of significant importance. | Микробные сообщества почв - это сложные многокомпонентные системы, формирующиеся под влиянием широкого круга факторов, в том числе типа почвы, вида растения, климата, агротехники. Нашей целью было выявление влияния различных агротехник (севооборот и известкование) на филогенетическую структуру прокариотических микроорганизмов в посевах ржи в условиях длительного полевого опыта. Отбор образцов проводили в 2010 году в южной части Клинско-Дмитровской возвышенности на участке многолетнего опыта РГАУ-МСХА им. К.А. Тимирязева. Для филогенетического анализа комплекса прокариотических микроорганизмов в почве использовали делянки, засеянные озимой рожью (Secale cereale L.), которая выращивалась в бессменной культуре и шестипольном севообороте с 1912 г. Севооборот включал чистый пар, озимую рожь, картофель, ячмень с подсевом клевера, клевер первого года пользования, лен. Почвенные пробы отбирали в фазу колошения озимой ржи на глубину пахотного горизонта А1 (0-20 см) в пяти повторностях, из которых составляли средний образец. После тщательного перемешивания его использовали для выделения ДНК. Результаты высокопроизводительного секвенирования ДНК почвенного микробиома и последующего анализа филогенетической структуры и разнообразия прокариотических микроорганизмов в почве показали, что растение служит одним из ключевых факторов формирования прокариотического сообщества. Независимо от агротехнических приемов, под покровом озимой ржи в фазу колошения складывался одинаковый по структуре коровый комплекс прокариот, включающий небольшое количество видов протеобактерий и актинобактерий. Доминирующее положение среди них занимали бактерии семейства Rhizobiaceae, что в определенной степени было связано с историей опытного поля. По-видимому, бактерии этого семейства, прежде всего клубеньковые, находят в ризосфере ржи благоприятные условия для развития. Известкование практически не влияет на видовое богатство в посевах бессменной ржи, но резко снижает его в севообороте.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Zhang, X.-C. | Han, B.

This work is dedicated to the memory of our friend, colleague and teacher Professor Ming-Li Zhang, a recognized expert in botany in such groups as Fabaceae, Polygonaceae, Tamaricaceae, Nitrariaceae. He made a great contribution to the study of the Flora of China and Central Asia. He used not only the traditional methods of research, but also showed great interest in cladistics, DELTA programs and other methods of systematics throughout his research. Professor Ming-Li Zhang trained many excellent students. In addition, we attach a list of published papers related to his research. | Сообщение посвящено памяти нашего друга, коллеги и учителя – профессора Жан Мин-Ли, признанного эксперта в области ботаники по таким группам, как Fabaceae, Polygonaceae, Tamaricaceae, Nitrariaceae. Он внес большой вклад в изучение флоры Китая и Центральной Азии. В своих исследованиях Жан Мин-Ли использовал не только традиционные методы исследования, но и проявлял большой интерес к кладистике, программам DELTA и другим методам систематики. Профессор Жан Мин-Ли подготовил много прекрасных учеников. Также приводится список опубликованных научных работ учёного.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation