AGRIS - 

2023

Donnik, I.M. | Makutina, V.A. | Krivonogova, A.S. | Isaeva, A.G. | Dejkin, A.V. | Koshchaev, A.G.

The results of research into genetic methods of breeding agricultural animals with improved characteristics are presented. A significant number of animals with an edited genome have been obtained. Methods of genome modification in cattle are constantly improving. The approaches of gene editing of bovine embryos, delivery of edited constructs and improvement of embryo survival after introduction of editing systems have been studied. The studies were performed on cattle embryos. BLG and SD209 gene editing systems were developed and approbated. Delivery variants of the editing system into cattle cells were studied: microinjection into the zygote of plasmid DNA encoded sequence with CRISPR/Cas9 c sgRNA, the method of viral vectors (adeno-associated AAV viruses, serotypes AAV1, AAV2, AAV6, AAV9, AAVDJ), co-injection of plasmid DNA and sperm into the oocyte at the MII stage, and microinjection of Cas9 and guide RNAs. Different techniques for performing micro-injections have been investigated and refined, and different variants of preparation of Cas9 RNA and guide RNA mixtures have been tested. Based on these results, the protocol for performing microinjection of the editing system was optimized and a model experiment was performed on 160 oocytes, with 80 cells per each construct. The findings have shown that the efficiency of editing has generally increased. When injected with guide RNA against BLG gene and spCas9 mRNA, 84% of the surviving cells initiated cleavage, blastulation was 20%, and BLG knockout was 69.2%. When injected against the CD209 gene and spCas9 mRNA, 44.4% of the surviving embryos started cleaving, blastulation was 16.7%, with CD209 knockout at 44.4%. The novelty of the work lies in obtaining data on the development of editing systems with specific target genes, in improving the delivery system and cultivation of bovine embryos. | Представлены результаты исследования генетических методов создания с.-х. животных с улучшенными характеристиками. Получено значительное количество животных с отредактированным геномом. Методы модификации генома у крупного рогатого скота (КРС) постоянно совершенствуются. Изучены подходы генного редактирования эмбрионов крупного рогатого скота, доставки отредактированных конструкций, повышения выживаемости эмбрионов после внесения систем редактирования. Исследования проводили на эмбрионах КРС. Разработаны и апробированы системы редактирования генов BLG и СД209. Изучены варианты доставки системы редактирования в клетки КРС: микроинъекция в зиготу плазмидной ДНК с закодированной последовательностью с CRISPR/Cas9 c sgRNA, способ вирусных векторов (аденоассоциированные вирусы AAV, серотипы AAV1, AAV2, AAV6, AAV9, AAVDJ), совместное введение плазмидной ДНК и сперматозоида в ооцит на стадии MII, а также микроинъекции РНК Cas9 и гидовых РНК. Исследованы и усовершенствованы различные методики выполнения микроинъекций и опробованы различные варианты приготовления смеси РНК Cas9 и гидовых РНК. На основе полученных результатов оптимизирован протокол выполнения микроинъекции системы редактирования и проведен модельный эксперимент на 160 ооцитах, по 80 клеток на каждую конструкцию. В результате установили, что эффективность редактирования в целом повысилась. При инъекции гидовой РНК против гена BLG и мРНК spCas9 дробление начали 84% выживших клеток, бластуляция составила 20%, оказались с нокаутом по BLG – 69,2%. При инъекции против гена CD209 и мРНК spCas9 дробление начали 44,4% выживших эмбрионов, бластуляция составила 16,7%, с нокаутом по CD209 – 44,4%. Новизна работы заключается в получении данных о разработке систем редактирования с определенными генами-мишенями, в усовершенствовании системы доставки и культивирования эмбрионов КРС.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Kushakov, Sh. | Zuparova, D. | Buriev, Z.

For the first time, a study was conducted on the resistance of gene-knockout varieties of cotton to spider mites Tetranychus turkestani. The work was carried out during 2018-2021. The entomological part of the study included the study of the phenological development of the spider mite in accordance, the study of the colonization and harmfulness of the spider mite. In parallel, the yield of raw cotton, promising hybrid combinations, lines and varieties of cotton was studied. Information about the experiments carried out is given. Resistant lines and hybrids have been identified that can be used to create new varieties of cotton.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Publishing center Science and Practice - Russian Federation

2022

Sermyagin, A.A. | Dotsev, A.V. | Abdel'manova, A.S. | Turbina, I.S. | Sölkner, J. | Zinov'eva, N.A.

The improvement of dairy cattle breeds is a process lasting decades and even centuries. The accumulated experience of breeders has made it possible to conserve some of them to this day, for example, as the red breeds of cattle. There has been studied the modern gene pool of Bestuzhev(BST), Suksun (SKS) and Red Gorbatov (RedGR) cattle in Russia on the basis of the use of genome-wide data and the search for regions in the genome subject to increased breeding pressure. The research used 35 thousand SNP markers for calculating linkage disequilibrium (LD) values between them in 86 heads of different red cattle breeds including Holstein (RedHL) ones. Only for 0.01% of pairs of polymorphisms with an LD level of more than 0.9, the mutations localized between them were studied and annotated. Comparison of LD in the context of breeds and chromosomes was carried out using multiple variance analysis. The distribution of LD blocks depending on the distance at which the paired SNPs are located by breeds showed that at a distance of 0-30 kb, significant differences (P less than 0.001) in average LD values were observed for the group of breeds: RedHL and RedGR (0.303-0.317), BST (0.275), SKS (0.251). For the Red Gorbatov there was an improvement by Holstein cattle. In the analysis for LD between SNPs on chromosomes the Bestuzhev cattle along with the Suksun cattle formed separate genetic groups. The variability of LD score was low in the genome of the Suksun breed. The effective population size for the studied breeds was largest for the Bestuzhev (n=113) and Suksun (n=84) cattle and smallest for the Red Gorbatov (n=79). The results of the search for breeding prints in the genome of Russian red cattle have been obtained, which have shown conjugacy with features of milk quality, fertility, meat productivity and health. | Совершенствование пород молочного скота представляет собой процесс длительностью в десятилетия и даже столетия. Накопленный селекционерами России опыт позволил сохранить часть из них, например, красные породы скота, до наших дней. Изучен современный генофонд бестужевской, суксунской и красной горбатовской пород на основе применения полногеномных данных и поиска регионов в геноме, подверженных повышенному селекционному давлению. В исследованиях использованы около 35 тыс. SNP-маркеров для расчета величины неравновесия по сцеплению (LD) между ними для 86 голов разных пород скота красного корня. Только для 0,01% пар полиморфизмов при уровне LD более 0,9 были изучены и аннотированы локализованные между ними мутации. Сравнение LD в разрезе пород и хромосом проводили с помощью множественного дисперсионного анализа. Распределение LD-блоков в зависимости от дистанции, на которой расположены парные SNP, по породам показало, что при расстоянии 0-30 kb достоверные различия (P меньше 0,001) по средним значениям LD наблюдались для группы пород: RedHL и RedGR (0,303-0,317), BST (0,275), SKS (0,251). Для красной горбатовской породы имело место улучшение голштинским скотом. Бестужевский скот наравне с суксунским при анализе величины LD между SNP на хромосомах образовывал обособленные генетические группы. Вариабельность показателя LD была невысокой в геноме животных суксунской породы. Эффективный размер численности популяций для изученных пород был наибольшим для бестужевской (n=113) и суксунской (n=84) пород и наименьшим - для красной горбатовской (n=79). Получены результаты по поиску отпечатков селекции в геноме красных пород скота России, которые показали сопряженность с признаками качества молока, фертильности, мясной продуктивности и здоровья.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Nedashkovskij, I.S. | Sermyagin, A.A. | Kostyunina, O.V. | Yanchukov, I.N. | Zinov'eva, N.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

ROH (runs of homozygosity) homozygosity patterns can be used to improve the selection of parental pairs and to select animals in the population. The studies were aimed to assess the genomic coefficient of inbreeding based on ROH in relation to the traits of their productivity and fertility of the offspring to improve the matching of parental pairs and selection of animals. With an increase in the pattern size from 1–2 Mb to 16 Mb and more the average ROH length increased from 1.34 Mb to 23.56 Mb. With an increase in FROH (inbreeding coefficient determined using ROH, genomic coefficient of inbreeding) by a moderate value from 4.1% to 7.5%, the volume of bull ejaculate increased on average from 4.62 mL to 4.74 mL; the number of spermatozoa increased from 6.16 billion pcs to 6.62 billion pcs in the average volume of ejaculate; their concentrations increased from 1.33 bln/mL to 1.41 bln/mL. With a further increase in the value of this indicator above 7.6% and 10.9%, there was noted a decrease in the qualitative parameter while maintaining the quantitative parameters. The concentration of sperm cells increased from 1.41 bln pcs to 1.32 bln pcs. Based on the results of the estimated breeding value (EBV) using bulls with a FROH of 7.6% or more, daughters' milk productivity in 305 days increased in comparison with the descendants of stud bulls by 222–228 kg; the yield of milk fat increased by 6.8–7.9 kg; the yield of milk protein increased by 5.1 kg; the number of yield days increased by 3.4–4.2. At the same time, there was observed a negative trend in the number of inseminations required to achieve pregnancy. They decreased by 0.017–0.031 units while the duration of the service period decreased by 4 days and 5.5 days. In the genome of Holstein cattle, there were identified several loci on the chromosomes BTA 6, BTA8, BTA9, BTA10, BTA 14, BTA20, BTA22, and BTA26, which were under selection pressure. | Для совершенствования подбора родительских пар и отбора животных в популяции могут быть использованы ROH (Runs of homozygosity) паттерны гомозиготности. Цель исследования - оценка геномного коэффициента инбридинга на основе ROH во взаимосвязи с признаками собственной продуктивности и фертильности потомства для совершенствования подбора родительских пар и отбора животных. Средняя длина ROH с увеличением размера паттерна с 1…2 Mb до 16 Mb и более возрастала с 1,34 до 23,56 Mb. При увеличении FROH (inbreeding coefficient determined using ROH, геномный коэффициент инбридинга) на умеренную величину с 4,1% до 7,5%, наблюдали повышение среднего объема эякулята быков с 4,62 до 4,74 мл, числа сперматозоидов – с 6,16 до 6,62 млрд шт. в среднем объеме эякулята и их концентрации – с 1,33 до 1,41 млрд/мл. При дальнейшем росте величины этого показателя выше 7,6 и 10,9% отмечено снижение качественного параметра (концентрации спермиев с 1,41 до 1,32 млрд шт.) при сохранении количественных. По результатам оценки племенной ценности (estimated breeding value, EBV) при использовании быков с FROH 7,6% и более молочная продуктивность дочерей за 305 дн. возрастала, по сравнению с потомками аутбредных производителей, на 222...228 кг, выход молочного жира – на 6,8...7,9 кг, молочного белка – на 5,1 кг, количество дойных дней – на 3,4…4,2 дн. Одновременно наблюдали отрицательную динамику количества осеменений, необходимых для достижения стельности, на 0,017…0,031 ед., и продолжительности сервис периода – на 4,0 и 5,5 дн. В геноме голштинского скота установлен ряд регионов на хромосомах BTA 6, BTA8, BTA9, BTA10, BTA 14, BTA20, BTA22 и BTA26, находящихся под давлением отбора.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Alexandrov, O.S. | Karlov, G.I., All-Russia Research and Development Inst. of Agricultural Biotechnology, Moscow

Клещевина - важная с.-х. культура, которую выращивают во многих странах мира и используют в основном для получения касторового масла. Цель исследования - изучение промоторов гена U6 клещевины с помощью биоинформационных и молекулярно-генетических подходов. В работе использовали растения клещевины (Ricinus communis L.) сортов Занзибар Грин и Гибзонская. ДНК выделяли из молодых листьев. Обработку последовательностей, выравнивание и определение степени гомологии проводили в программе GenDoc. Праймеры для амплификации промоторов гена U6 клещевины подбирали с помощью программы Primer3. ПЦР проводили на амплификаторе C-100 ('Bio-Rad Laboratories, Inc.', США). Продукты ПЦР разделяли в 1,5% агарозном геле при 6 В/см в камере для горизонтального электрофореза Sub-Cell GT ('Bio-Rad Laboratories, Inc.', США). Ампликоны очищали с помощью набора GeneJET PCR Purification Kit ('Thermo Fisher Scientific, Inc.', США). Очищенные ампликоны клонировали с помощью вектора pAL2-T ('Евроген', Россия). При конструировании CRISPR/Cas9 векторов использовали плазмиду pRGE31, эндонуклеазы рестрикции HindIII и SbfI ('Сибэнзим', Россия) и необходимые олигонуклеотиды. Был проведен биоинформационный поиск в базе генетических данных GenBank и обнаружено 12 скаффолдов, содержащих последовательность гена U6 клещевины. Шесть промоторов, включающих неповрежденные регуляторные элементы USE и ТАТА-бокс, были использованы при подборе праймеров для амплификации на матрице ДНК клещевины сортов Занзибар Грин и Гибзонская. Продукты ПЦР, состоящие из единичных фрагментов, были клонированы и секвенированы. Промоторные области полностью совпадали между сортами. Степень идентичности промоторов из разных ампликонов варьировала в пределах 51-77%. При сравнении этих же промоторов с промоторами гена U6 других растений степень гомологии составляла 42-64%. Последовательности промоторов, содержащие неповрежденные мотивы USE и ТАТА-бокс, были использованы для конструирования CRISPR/Cas9 векторов. | Castor bean is an important crop in many countries. It is mainly used to obtain the castor oil, which is widely applied in various industries. The research aim was to study castor bean gene U6 promoters with help by bioinformatics and molecular genetic approaches. Zanzibar Green and Gibzonskaya varieties of castor bean plants were used in this work. DNA was isolated from young leaves. The preparation of sequences, alignments and homology level calculation were carried out by GenDoc program. Primers for amplification of castor bean U6 promoters were designed by Primer3 program. PCR was performed using a C-100 PCR machine (Bio-Rad Laboratories, Inc., USA). PCR products were separated in 1.5% agarose gel at 6 B/cm in the Sub-Cell GT electrophoresis camera (Bio-Rad Laboratories, Inc., USA). The amplicons were purified with the GeneJET PCR Purification Kit (Thermo Fisher Scientific, Inc., USA). The purified amplicons were cloned into the pAL2-T vector (Evrogen, Russia). In the CRISPR/Cas9 vector construction, the pRGE31, HindIII and SbfI restriction enzymes (Sibenzyme, Russia) and nucleotides were used. Purification of the digested products was carried out with the GeneJET Gel Extraction Kit (Thermo Fisher Scientific, Inc., USA). Bioinformatic search were conducted in the GenBank base, and 12 scaffolds with the castor bean U6 gene were found. Six promoters with intact USE and TATA-box elements of regulation were used in the primer design for amplification with cv. Zanzibar Green and cv. Gibzonskaya DNA matrices. One fragment PCR products were cloned and sequenced. The analysis of the obtained amplicon sequences reveled that promoter regions of two studied varieties were similar. The level of promoter identity from different amplicons ranged within 51-77%. When comparing the same promoters with the U6 gene promoters of other plants the homology degree was 42-64%. The promoter sequences with intact USE and TATA-box motifs were used in construction of the CRISPR/Cas9 vectors.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Mishina, А.I. | Abdel'manova, A.S.

The decline in the population of local cattle breeds observed over the past decades can lead to a significant reduction in genetic diversity. The Yaroslavskaya breed is one of the oldest Russian cattle breeds. Over the past 30 years, the population of its livestock has decreased by almost 15 times. The investigation aimed to evaluate genomic inbreeding of purebred animals of the Yaroslavskaya breed. The study material was bovine semen (n = 27) and cow blood (n = 25). Holstein animals (n = 15) were taken as a comparison group for the selection of genetically purebred animals of the Yaroslavskaya breed. Genotyping was performed using Bovine HD BeadChip and GGP Bovine 150K DNA chips. To assess genomic inbreeding, the inbreeding coefficient was calculated based on the runs of homozygosity (F(ROH)) and the index of standardized multilocus heterozygosity (sMLH). The F(ROH) inbreeding ratio varied from 6.97% to 21.86% and averaged 13.39%. The Wright-Kislovsky formula was used to detect only the consequences of recent inbreeding (1st–4th line of ancestors), which resulted in the formation of long homozygous regions in the animal's genome. The inbreeding coefficient, calculated on the basis of genome-wide data, made it possible to trace the events that had occurred more than five generations ago. Values characterizing genomic inbreeding calculated from F(ROH) and sMLH correlated with the inbreeding coefficient calculated from pedigree (r = 0.502 and r = -0.486). They allowed for a more accurate estimation of inbreeding in the population of Yaroslavskaya cow breed than the calculation of inbreeding by pedigree. | Наблюдаемое в течение последних десятилетий снижение поголовья локальных пород крупного рогатого скота может привести к значительному сокращению генетического разнообразия. Одна из старейших отечественных пород крупного рогатого скота – ярославская. За последние 30 лет ее численность уменьшилась почти в 15 раз. Исследования проводили с целью оценки геномного инбридинга у чистопородных животных ярославской породы. В качестве материала для исследований использовали сперму быков (n = 27) и кровь коров (n = 25). Группой сравнения при отборе генетически чистопородных животных ярославской породы служили животные голштинской породы (n = 15). Генотипирование осуществляли с использованием ДНК-чипов Bovine HD BeadChip и GGP Bovine 150K. Для оценки геномного инбридинга рассчитывали коэффициент инбридинга на основании длины пробегов гомозиготности (FROH) и показатель стандартизированной мультилокусной гетерозиготности (sMLH). Коэффициент инбридинга FROH варьировал от 6,97% до 21,86% и в среднем составлял 13,39%. С использованием формулы Райта-Кисловского возможно обнаружить только последствия недавнего инбридинга (I…IV линия предков), в результате которого в геноме животного сформировались длинные гомозиготные участки. Коэффициент инбридинга, рассчитанный на основании полногеномных данных, позволяет отследить события, произошедшие более 5 поколений назад. Величины, характеризующие геномный инбридинг, определенные на основании FROH и sMLH, коррелировали с коэффициентом инбридинга, рассчитанным по родословной (r = 0,502 и r = -0,486). Они могут быть использованы для более точной, чем расчет по родословной, оценки инбридинга в популяции коров ярославской породы.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2020

Smaragdov, M.G., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

Изучено влияние неучтенных гетерозиготных и негенотипированных SNPs в протяженных гомозиготных сегментах (ROH) на среднее количество и средний суммарный размер ROH-сегментов, а также на вычисление коэффициента инбридинга у голштинизированных черно-пестрых коров. Из 6 племенных заводов Ленинградской области были отобраны 374 коровы. Полногеномное генотипирование их осуществляли чипом BovineSNP50 v2. При выполнении контроля качества однонуклеотидного полиморфизма (SNP) генотипов коров и полногеномном сканировании ROH использовали программу Plink 1.9. После проведения контроля качества SNP генотипов из 54609 осталось 43298 SNPs. Влияние неучтенных гетерозиготных и негенотипированных SNPs на результаты ROH сканирования оценивали при изменении этих показателей от 0 до 16. Оказалось, что негенотипированные SNPs не влияли на показатели ROH, тогда как количество неучтенных гетерозиготных SNPs существенно влияло на результаты ROH сканирования. Так, по мере увеличения количества неучтенных гетерозиготных SNPs в ROH-сегментах среднее количество ROH-сегментов и их средний суммарный размер в геноме коров росли экспоненциально, хотя средний размер ROH-сегментов в геноме коров варьировал незначительно и составлял 10,4±1,2 Mb. В зависимость от количества гетерозиготных SNPs коэффициент инбридинга также рос экспоненциально. В случае отсутствия гетерозиготных SNPs в ROH-сегментах средний коэффициент инбридинга у коров в 6 стадах изменялся от 4,4±0,4 до 5,6±0,2. Предполагается, что полученные результаты обусловлены не случайным расположением ROH-сегментов, а их кластеризацией в хромосомах коров. Таким образом, для несмещенной оценки результатов ROH-анализа следует исключать гетерозиготные SNPs в ROH-сегментах. | The effect of unrecorded non-genotyped and heterozygous SNPs in extensive homozygous segments (ROH) on the average number and average total size of ROH segments, as well as on the calculation of the inbreeding coefficient of Holsteinized Back-and-White cows has been studied. Of the six breeding farms in the Leningrad Region, 374 cows were selected. Whole - genome genotyping was carried out with the BovineSNP50 v2 chip. When performing quality control of the genotyped cows and genome-wide ROH runs, the Plink 1.9 program was used. Upon quality control of the SNP genotypes of 54609, 43298 SNPs were remained. The effect of unrecorded non-genotyped and heterozygous SNPs at the results of ROH scanning was evaluated by changing these parameters from 0 to 16. It turned out that non-genotyped SNPs did not affect the ROH scores, while the number of allowed heterozygous SNPs significantly affected the results of ROH scanning. Thus, as the number of allowed heterozygous SNPs in ROH segments were increased, the mean number of ROH segments and their mean total size in the cows' genome increased exponentially, although the mean size of the ROH segment varied slightly and amounted to 10.4±1.2 Mb. Depending on the number of heterozygous SNPs in ROH, the inbreeding coefficient as well increased exponentially. In the absence of heterozygous SNPs in ROH segments, the average inbreeding coefficient of the cows in six herds varied from 4.4±0.4 to 5.6±0.2. It is suggested that obtained results are not due to the random distribution of ROH segments, but their clustering in the chromosomes of the cows. Thus, for unbiased assessment of the results of ROH analysis, heterozygous SNPs in ROH segments should be excluded.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Sermyagin, A.A. | Zinov'eva, N.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

The purpose of the study was to determine the possibilities of the selection of stud bulls based on their get quality and genomic data using the Russian dairy cattle reference group bred from the populations of animals from Moscow, Leningrad, and Vologda regions. An integral part of the reference group was 591 genotyped bulls from 145 breeding herds that produced a total of 180455 heifers. The test group of young stud bulls consisted of 96 animals. Genomic data, according to which 39051 polymorphisms were selected, were obtained with the application of BovineSNP50 biochip. We used BLUP, GBLUP, and REML approaches. Breeding values were assigned according to standard estimated deviations. The bulls were born in the period from 1986 to 2010. In this period, the genetic trend in the population, based on estimates of breeding values, was positive averaging over the year +32.1 kg of milk, + 0.001% of the fat and protein content, +1.3 kg of milk fat, and +1.0 kg of milk protein. The greatest genetic variation (heritability) was observed for the following criteria: 305 lactation days (0.343), the amount of milk fat (0.344), and the amount of milk protein (0.349). Only every fifth bull with genetic (EBV) and genomic (GEBV) estimates were selected into a group of stud bulls of absolute improver "++"or improver "+" categories. The minimum values of EBV and GEBV were +690 kg and +900 kg of milk, +25 kg and +31 kg of milk fat, +21 kg and +23 kg of milk protein to the population averages, respectively. Using the reference group of animals gathered mainly from the Russian livestock population made it possible to predict with high efficiency the breeding value of young bulls based on their genomic information. | Цель исследований – определение возможности отбора быков-производителей на основе информации по качеству потомства и геномным данным с использованием российской референтной группы молочного скота, созданной на основе популяций животных Московской, Ленинградской и Вологодской областей. Составной частью референтной группы был 591 генотипированный бык с общим числом дочерей-первотелок – 180455 гол. из 145 племенных стад. Тестируемая группа молодых производителей состояла из 96 гол. Геномные данные, по которым отобрали 39051 полиморфизмов, получены с применением биочипа BovineSNP50. Использовали подходы BLUP и GBLUP, REML. Категории племенной ценности животным присваивали по стандартному отклонению оценок. Генетический тренд в популяции, основанный на оценках племенной ценности, за период рождения быков 1986–2010 гг. имел положительную динамику и составлял в среднем за год +32,1 кг молока, +0,001% содержания жира и белка, +1,3 кг молочного жира и +1,0 кг молочного белка. Наибольшую генетическую изменчивость (наследуемость) наблюдали для признаков удой за 305 дней лактации – 0,343, количество молочного жира – 0,344 и количество молочного белка – 0,349. Только каждый пятый бык с генетической (EBV) и геномной (GEBV) оценками может быть отобран в селекционную группу отцов быков с категориями абсолютного улучшателя "++" или улучшателя "+". Минимальные значения EBV и GEBV быков при этом должны составлять соответственно +690 кг и +900 кг молока, +25 кг и +31 кг молочного жира, +21 кг и +23 кг молочного белка к средним по популяции. Использование референтной группы животных, созданной на основе российской популяции скота, позволяет с высокой эффективностью прогнозировать племенную ценность молодых быков на основе геномной информации.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Glotov, A.G. | Nefedchenko, A.V. | Koteneva, S.V. | Glotova, T.I., Siberia Federal Scientific Center of Agrobiotechnology, Novosibirsk Region

The results of the study of mixed infections in cattle caused by BVDV1 and BVDV2 during an outbreak of the disease in the big dairy farm after importing animals from abroad are presented. The spread of viruses in animal organs was studied by RT-PCR. BVDV1 was detected in thymus, spleen and lymph nodes, liver, cerebellum and lungs, blood and kidneys of aborted fetuses. BVDV2 was present not only in the listed organs, but also in the brain, abomasums mucosa, small and large intestines. The genomes of these viruses were detected in 17.9% of samples (thymus, lymph nodes, spleen, cerebellum, blood, lungs and kidney) while in 7.7% of samples (thymus, lymph nodes, spleen) the both viruses were present. In calves of up to 10 days with diarrhea and systemic infection, BVDV2 was recorded in a wider range of organs and tissues, confirming systemic distribution. In 3 – 4 months old calves viruses were detected less frequently (BVDV1 – in 13.9%; BVDV2 – in 5.6% of samples. The both agents were present in only 5.6% of samples (lungs, lymph nodes). The genetic material of BVDV3 in the tested material was absent. A phylogenetic analysis detected agents of BVDV1b and BVDV2a. The presence of mixed infections of BVDV1b and BVDV2a must be taken into account in diagnostic studies and in the planning of vaccination programs. | Представлены результаты изучения смешанной инфекции у крупного рогатого скота, вызванной вирусом диареи первого (BVDV1) и второго (BVDV2) видов, во время вспышки болезни на молочном комплексе после завоза животных из-за рубежа. Их распространение в органах животных изучали методом ОТ–ПЦР. BVDV1 выявили в тимусе, селезенке и лимфатических узлах, печени, мозжечке, легких, почках и крови абортированных плодов. BVDV2 присутствовал не только в перечисленных органах, но также в головном мозге, слизистой оболочке сычуга, тонком и толстом отделах кишечника. Геномы этих вирусов обнаружили в общей сложности в 17,9% проб биоматериала (тимус, лимфатические узлы, селезенка, мозжечок, легкие, почки, кровь), причем в 7,7% проб (тимус, лимфатические узлы, селезенка) присутствовали оба вируса. У телят до 10 дней с диареей и системной инфекцией BVDV2 регистрировали в более широком диапазоне органов и тканей, подтверждая системное распространение. У молодняка 3 – 4-месячного возраста их выявляли реже: BVDV1 – в 13,9%, BVDV2 – в 5,6% исследованных проб. Оба агента присутствовали только в 5,6% проб биоматериала (легких и лимфатических узлах). Генетический материал BVDV3 в тестированном материале отсутствовал. На основании филогенетического анализа обнаруженные агенты отнесли к BVDV1b и BVDV2a. Возможность смешанных инфекций BVDV1 и BVDV2 необходимо учитывать при диагностических исследованиях и при планировании противоэпизоотических мероприятий с использованием вакцин.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Saksa, E.I. | Plemyashov, K.V. | Maslennikova, E.S., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

The purpose of this work is to compare the results of evaluating the breeding value (BV) of bulls, evaluated by the genome and the quality of the offspring. For analysis, we used data on the genetic value of bulls belonging to foreign companies, domestic breeding enterprises of the CFD and the NWFD. It was revealed that as the time for checking the bulls on the quality of the offspring increases, the effectiveness of their initial genomic estimate for milk production decreases to 74.4% on average for sires owned by foreign companies, to 52.2% and 59.3% for bulls belonging to domestic breeding enterprises. The best results when evaluating the quality of the offspring (+183 kg of milk) were obtained from sires with a high genomic score (+699 kg of milk) belonging to foreign companies. The correlation coefficients between the estimates by genome and by quality of the offspring ranged from 0.66 (P less than 0.01) for bulls belonging to the breeding enterprise of the NWFD, to 0.49 (P less than 0.01) for sires belonging to the breeding enterprise of the CFD. High statistically significant correlations have bulls estimated by their fat content - r=0.72-0.83 (P less than 0.01) and milk protein - r=0.80-0.84 (P less than 0.001). The distribution of bulls by the level of genomic breeding value showed that the genomic score is overestimated in comparison with the offspring quality scoring. Bulls with a genomic score for milk yield less than +500 kg of milk received a negative rating for the quality of offspring (-253 kg) in conditions of the US farms and -325 kg in conditions of farms in the Leningrad region. On average, bulls with a genomic breeding value of 501-600 kg in the conditions of the Leningrad region demonstrated superiority in the BV indicator by 23.6%, with a genomic BV of 901-1100 kg - by 40.9%. Under the US farm conditions, the same genomically evaluated bulls maintained their breeding value by 46.7% and 91.2%. To reduce the risk when using genomically evaluated bulls, it is necessary to select sires with high scores by productivity traits. | Целью работы было сопоставление результатов оценки племенной ценности (ПЦ) быков, оцененных по геному и по качеству потомства. Для анализа использованы данные генетической ценности быков, принадлежащих импортным компаниям (n=17), отечественным племпредприятиям ЦФО (n=15) и СЗФО (n=6). Выявлено, что по мере увеличения времени проверки быков по качеству потомства результативность их первоначальной геномной оценки по удою снижается до 74,4% в среднем по производителям, принадлежащим импортным компаниям, до 52,2 и 59,3% по быкам, принадлежащим отечественным племпредприятиям. Наилучшие результаты при оценке по качеству потомства (+183 кг молока) получены от производителей, имеющих высокую геномную оценку (+699 кг молока), принадлежащих импортным компаниям. Коэффициенты корреляции между оценками по геному и по качеству потомства варьировали от 0,66 (P меньше 0,01) по быкам, принадлежащим племпредприятию СЗФО, до 0,49 (P меньше 0,01) по производителям, принадлежащим племпредприятию ЦФО. Высокие, статистически достоверные корреляции имеют быки, оцененные по содержанию жира - r=0,72-0,83 (P меньше 0,001) и белка - r=0,80-0,84 (P меньше 0,001) в молоке. Распределение быков по уровню геномной ПЦ показало, что геномная оценка завышена по сравнению с оценкой по качеству потомства. Быки, имеющие геномную оценку по удою менее +500 кг молока, получили отрицательную оценку по качеству потомства (-253 кг) в условиях ферм США и -325 кг в условиях хозяйств Ленинградской обл. В среднем быки с геномной ПЦ 501-600 кг в условиях Ленинградской обл. сохранили превосходство показателя ПЦ на 23,6%, с геномной ПЦ 901-1100 кг - на 40,9%. В условиях ферм США эти же геномно оцененные быки сохранили показатель ПЦ, соответственно, на 46,7% и 91,2%. Следовательно, для снижения риска при использовании геномно оцененных быков, необходимо отбирать для воспроизводства производителей с высокой оценкой по признакам продуктивности.

显示更多 [+]

显示较少 [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation