AGRIS - 

2022

Kovalyuk, N.V. | Yakusheva, L.I. | Volchenko, A.E. | Shakhnazarova, Yu.Yu. | Alferova, E.V.

Изучена генетическая структура субпопуляций голштинской и джерсейской пород (n=2000) ряда хозяйств Краснодарского и Ставропольского краев по микросателлитным локусам: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA53. Определены количество гомозиготных и гетерозиготных животных по обозначенным выше локусам, наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, индекс фиксации (Fis), породоспецифичные и часто встречающиеся аллели. Частота встречаемости уникальных для представленной выборки джерсейской породы аллельных вариантов локуса TGLA122 - аллель 181 составляет 0,4%, и TGLA227 - аллель 101 - 6,1%. У голштинских животных выявлены аллельные варианты, которые не встречались у джерсеев: для локуса ETH3 - аллели 127 (15,7%) и 129 (30,2%), локуса INRA023 - аллель 202 (17,6%), SPS115 - аллель 258 (1,2%), TGLA126 - аллель 119 (1,1%), TGLA122 - аллель 183 (7,1%), TGLA53 - аллели 158 (24,2%), 176 (8,5%), 184 (8,6%) и 186 (10,1%). Самая высокая частота встречаемости в группе джерсейских животных была у аллеля 135 локуса ВМ2113 (81,3%), а в группе голштинов - у аллеля 117 локуса TGLA126 (63,6%). У голштинского скота оказалось выше аллельное разнообразие. Среднее количество аллелей на локус у джерсеев составило 5,8±0,8, у голштинов - 9,0±1,7. Однако число информативных аллелей (т.е. встречающихся с частотой от 5% и выше) практически одинаково в обеих выборках (3,8 и 3,9 соответственно). Полученные профили можно использовать в популяционных исследованиях и в практической работе по отнесению тех или иных групп скота к голштинской или джерсейской породам. | The genetic structure of subpopulations of Holstein and Jersey breeds (n=2000) of a number of farms of Krasnodar and Stavropol territories was studied by microsatellite loci: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA53. The number of homozygous and heterozygous animals according to the loci indicated above, observed and expected heterozygosity, fixation index (Fis), breed-specific and frequently occurring alleles were determined. The occurrence frequency of allelic variants of the locus TGLA122 - allele 181, unique for the presented sample of the Jersey breed, is 0.4%, and TGLA227 - allele 101 is 6.1%. Holstein animals showed allelic variants that were not found in Jerseys: for the ETH3 locus - alleles 127 (15.7%) and 129 (30.2%), locus INRA023 - allele 202 (17.6%), SPS115 - allele 258 (1.2%), TGLA126 - allele 119 (1.1%), TGLA122 - allele 183 (7.1%), TGLA53 - alleles 158 (24.2%), 176 (8.5%), 184 (8.6%) and 186 (10.1%). The highest occurrence frequency in the Jersey group was in the allele 135 of the VM2113 locus (81.3%), and in the Holstein group - in the allele 117 of the TGLA126 locus (63.6%). The Holstein cattle had higher allelic diversity. Thus, the average number of alleles per locus in Jerseys was 5.8±0.8, and in Holsteins it was 9.0±1.7. However, the number of informative alleles (i.e. occurring with a frequency of 5% or higher) is almost the same in both samples (3.8 and 3.9, respectively). The obtained profiles can be used in population studies and in practical work on attributing certain groups of cattle to the Holstein or Jersey breeds.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Maksimov, R.A. | Kiselev, Yu.A. | Shadrina, E.A.

Изучение коллекции ячменя (225 номеров) проводили для получения информации об адаптивности генотипов в различные периоды роста и развития растений. Использовали новый метод дифференциации урожайности по фазам роста и развития, а также определения параметров адаптивной способности на основе аддитивных математических моделей. Эксперименты выполняли в 2011-2021 гг. на юго-западе Свердловской области. Дисперсия по фактору генотип признака урожайность зерна (1,2%) был значительно ниже, чем количественных признаков (количество продуктивных стеблей - 5,9%, количество зерен в колосе - 24,0%, масса 1000 зерен - 20,2%). Применимость аддитивных моделей обоснована коэффициентом ki, величина которого не превышала 15%. Приведены результаты по 10 наиболее адаптивным сортам. Среди них выделены образцы с селекционной ценностью генотипа (СЦГi ) 4,26…3,22. Определяющим критерием в опыте была средовая устойчивость (СУ - сигма CACi), величина которой варьировала в диапазоне 3,26…4,26. Идентифицированы 3 механизма адаптации образцов к условиям выращивания. Первый объединил образцы Ворсинский и Aut 148. Они характеризовались самой лучшей генетической системой средовой устойчивости на протяжении всего периода вегетации: величина СУk у Ворсинского составляла 0,14…0,54, у Aut 148 - 0,57…0,76; динамика общей адаптации нарастала от начала к концу вегетации - взвешенный показатель адаптивности (ВПАki) был равен -0,01…0,15 и 0,09…0,16 соответственно. Второй механизм характерен для генотипа Крипичный - высокая СУ (СУ2 - 0,52…0,74) на всех этапах роста и развития, но динамика общей адаптации сорта "колокообразная", в начале и в конце вегетации он не адаптивен (ВПА1i - -0,37; ВПА3i - -0,09), в середине - сверхадаптивен (ВПА2i - 0,73). Третий механизм отмечен для образцов Раушан и Велес. В начале вегетации они нестабильны (СУ1 - 0,87…0,91), однако их общая адаптация всегда положительна и весома, особенно в зависимости от эффекта числа зерен в колосе (ВПА2i - 0,21…0,22). | 225 accessions of barley collection were studied to obtain information on the adaptability of genotypes in different periods of plant growth and development. A new method of differentiating yields by growth and development phases, as well as determining the parameters of adaptive capacity based on additive mathematical models was used. The experiments were conducted in 2011-2021 in the southwest of the Sverdlovsk region. The dispersion in the genotype factor of the trait grain yield (1.2%) was significantly lower than that of the quantitative traits (number of productive stems was 5.9%, number of grains per spike was 24.0%, and weight of 1000 grains was 20.2%). The applicability of additive models was justified by coefficient ki, the value of which did not exceed 15%. The results for 10 most adaptive varieties are presented. Among them highlighted accessions of high genotype breeding value of 4.26-3.22. The determining criterion in the experiment was environmental stability (ES) known as sigma CACi. The value of it varied in the range of 3.26-4.26. Three adaptation mechanisms to growing conditions were identified. The first combined accessions Vorsinsky and Aut 148. They were characterized by the best genetic system of environmental resistance throughout the entire growing season: the value of ESk for Vorsinsky was 0.14-0.54, for Aut 148 - 0.57-0.76. The dynamics of general adaptation increased from the beginning to the end of the growing season: the weighted adaptability index (WAIki) was equal to -0.01-0.15 and 0.09-0.16, respectively. The second mechanism was typical for the Kripichny genotype: high environmental resistance at all stages of growth and development (ES2 is 0.52-0.74), but the dynamics of the general adaptation of the variety was "bell-shaped". At the beginning and at the end of the growing season it was not adaptive (WAI1i is - 0.37; WAI3i is -0.09), in the middle it was super adaptive (WAI2i is 0.73). The third mechanism was noted for the Raushan and Veles accessions. At the beginning of growing season, they were unstable (ES1 is 0.87-0.91), but their general adaptation was always positive and significant, especially depending on the effect of number of grains per spike (WAI 2i is 0.21-0.22).

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Panikhina, L.V. | Zajtseva, I.Yu. | Kokina, L.P.

Как известно, большая часть пигментного комплекса, обеспечивающего фотосинтетическую деятельность растений, содержится в листьях и представлена хлорофиллами а, b и каротиноидами. Практический интерес представляют полевые исследования образцов ярового ячменя (Hordeum vulgare L.) для выделения генотипов различного эколого-географического происхождения с высоким содержанием листовых пигментов. В 2020-2021 гг. изучали 30 коллекционных образов ярового ячменя на опытном поле ФАНЦ Северо-Востока (г. Киров) в условиях умеренно континентального климата. Стандарт – Белгородский 100. В фазу начала колошения отбирали флаговый и подфлаговый лист и определяли концентрацию пигментов в ацетоновых вытяжках методом спектрофотометрии. Установлено, что содержание хлорофилла а и каротиноидов зависит от условий года, а значение хлорофилла b от сочетания факторов "генотип" и "годы" (при p не менее 0,95). Наиболее стабильным содержанием пигментов во флаговом листе отличались Рейдер и Одесский 115, в подфлаговом – Landrace. Высокая межгенотипическая изменчивость отмечалась по содержанию хлорофилла b как во флаговом (СV=23,5%), так и в подфлаговом (СV=43,6%) листьях. Выделены образцы Новичок, Crusades, Mentor и Sultan в листьях которых содержалось большое количество хлорофилла. Достоверно высокое число каротиноидов во флаговом листе содержалось у образцов Местный (к-5983), Mie, NCL 95098, Rodos. У образцов 752A и Rodos были превышены контрольные значения по показателю каротиноидов в подфлаговом листе. Содержание пигментов в листьях может служить для отбора коллекционных образцов и дальнейшей селекционной работы, направленной на улучшение показателей продуктивности ярового ячменя. | As known, most part of the pigment complex responsible for plant photosynthetic activity is concentrated in the leaves, and it is represented by chlorophylls a, b and carotenoids. Field studies of spring barley (Hordeum vulgare L.) are of practical interest for identifying genotypes of various ecological and geographical origin with a high content of leaf pigments. In 2020-2021, 30 spring barley collection accessions were studied at the experimental field situated in the Kirov region, in a temperate continental climate. The standard variety is Belgorodstkiy 100. In the phase of the beginning of earing, the flag and sub-flag leaves were collected, and the concentration of pigments in acetone extracts was determined by spectrophotometry. It was found that the content of chlorophyll a and carotenoids depends on the conditions of the year, and the value of chlorophyll b depends on the combination of factors "genotype" and "years" (p not more than 0.95). The Reyder and Odesskiy 115 were distinguished by the most stable pigment content in the flag leaf, and Landrace in the sub-flag leaf. High intergenotypic variability was observed in the content of chlorophyll b in both flag (CV=23.5%) and sub-flag (CV=43.6%) leaves. The accessions Novichok, Crusades, Mentor and Sultan were isolated. Their leaves contained a large amount of chlorophyll. Reliably high number of carotenoids in the flag leaf was in accessions Мestnyy (k-5983), Mie, NCL 95098, Rodos. The reference values for carotenoid content in the sub-flag leaf were exceeded in accessions 752A and Rodos. The content of pigments in the leaves can serve a criterion for the selection of collection accessions and further breeding work aimed at improving the productivity of spring barley.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Khudyakova, N.A. | Kudrina, M.A. | Stupina, A.O.

Studies of the breeding stock of Kholmogory cows were carried out at one of the farms situated in the Arkhangelsk region. To determine the alleles of kappa-casein and beta-lactoglobulin, the PCR-PDRF method was used, beta-casein – allele-specific variant of the PCR method (AS-PCR). According to the results of the analysis, the breeding value of 147 animals was determined. The genetic structure of the allelic pool of cows in the studied farm as follows: according to the beta-casein gene (CSN2), the A1 – 0.60 allele prevails; according to the kappa-casein gene (CSN3), the A allele is 0.85; according to the beta-lactoglobulin gene (BLG), the B allele is 0.70. According to the frequency of occurrence of the beta-casein gene, the A1A1 genotype prevails; according to the kappa-casein gene, the AA genotype; according to beta-lactoglobulin, the heterozygous genotype and homozygous BB genotypes are evenly distributed in the herd. In a group of 147 cows, 27 complex genotypes of CSN2/CSN3/BLG were identified. The most common combination is A1A1/AA /BB (18.4% of animals). A1A2/AA/AB genotype complex was detected in 16.3% of cows (n=24), A1A1/AA/AB – in 12.2% (n=18). The most common genotype complexes are A1A1/AA/BB, A1A2/AA/AB, A1A1/AA/AB in 46.9% of the total herd (n=69). The frequency of occurrence of 12 genotypes less than 1% was detected in 4.1% of cows (n=6). With a frequency of occurrence of 1–3%, three genotype complexes were identified in 6.1% of animals (n=9). Of the 27 complex genotypes, the frequency of occurrence of 21 genotypes is less than 5%. | В одном из хозяйств Архангельской области проведены исследования маточного поголовья коров холмогорской породы. Для определения аллелей каппа-казеина и бета-лактоглобулина использован метод ПЦР-ПДРФ, бета-казеина – аллель-специфичный вариант метода ПЦР (АС-ПЦР). По результатам анализа определена племенная ценность 147 животных. Генетическая структура аллелофонда коров в исследуемом хозяйстве следующая: по гену бета-казеина (CSN2) преобладает аллель А1 – 0,60; по гену каппа-казеина (CSN3) аллель А – 0,85; по гену бета-лактоглобулина (BLG) аллель В – 0,70. По частоте встречаемости по гену бета-казеина преобладает генотип А1А1; по гену каппа-казеина генотип АА; по бета-лактоглобулину гетерозиготный генотип и гомозиготный генотипы ВВ равномерно распределены в стаде. В группе из 147 коров выявлено 27 комплексных генотипов CSN2/CSN3/BLG. Наиболее часто встречается сочетание А1А1/АА/ВВ (18,4% животных). Комплекс генотипов А1А2/АА/АВ выявлен у 16,3% коров (n=24), А1А1/АА/АВ – у 12,2% (n=18). Наиболее часто встречаются комплексы генотипов А1А1/АА/ВВ, А1А2/АА/АВ, А1А1/АА/АВ у 46,9% общего стада (n=69). Частота встречаемости 12 генотипов менее 1% выявлены у 4,1% коров (n=6). С частотой встречаемости 1–3% выявлены три комплекса генотипов у 6,1% животных (n=9). Из 27 комплексных генотипов частота встречаемости 21 генотипа менее 5%.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Guchetl', S.Z. | Antonova, T.S. | Araslanova, N.M. | Chelyustnikova, T.A. | Pitinova, Yu.V.

Sunflower is main oil crop in the Russian Federation. One of the main yield decreasing factors in this crop is broomrape. The most effective method to control the parasite is breeding of resistant sunflower forms. The purpose of the work is to genotype and to analyze the molecular-generic diversity basing on isoenzymatic and SSR-loci among breeding lines, which are donors of sunflower resistance to broomrape race G, bred and collected at the All-Russian Research Institute of Oil Crops. The research material was 14 lines of the different origin which are donors of the resistance to broomrape race: 2RGB, 2RGNV, 2RGA, 2RGN, 2RGS, RGL1, RGL2, RGP1, RGP2, RGB, RGN, RGM, RGA, and RG. DNA was isolated by the STAB-method from the cotyledons of seven-day etiolated sunflower seedlings. Genotyping was conducted using 15 microsatellite loci and 4 isoenzymatic systems. The indicators of a discriminating potential of used 15 microsatellite loci were calculated by the standard formulas. A cluster analysis was done by the Ward-method in a program Statisticа 6.0. The research has identified 14 donor lines. The uniqueness of the collection, revealed by the analysis of isoenzyme systems, was 64%, and with the help of microsatellite loci – 100%. The discriminating potential of the DNA-marker system is estimated as average. Due to cluster analysis, all lines were divided into 2 groups. The maximal distance between the lines was 7.4. In spite of the studied lines have a common trait such as resistance to the broomrape race G, molecular traits of them have a distinction. Due to the different genetic background, these lines can be used as a source of additional diversity when involving into the selection programs for breeding sunflower resistant to broomrape race G. | Подсолнечник – основная масличная культура в Российской Федерации. Один из главных факторов, снижающих его урожайность – поражение заразихой. Наиболее эффективным средством борьбы с паразитом является селекция устойчивых форм подсолнечника. Цель работы - провести генотипирование и анализ молекулярно-генетического разнообразия на основе изоферментных и SSR-локусов коллекции линий-доноров устойчивости подсолнечника к расе G заразихи, выведенных во Всероссийском НИИ масличных культур. Материалом для исследования служили 14 линий-доноров устойчивости к этой расе разного происхождения: 2RGB, 2RGNV, 2RGA, 2RGN, 2RGS, RGL1, RGL2, RGP1, RGP2, RGB, RGN, RGM, RGA, RG. Выделение ДНК осуществляли из семядольных листьев семидневных этиолированных проростков подсолнечника СТАВ-способом. Для генотипирования применили 15 микросателлитных локусов и 4 изоферментные системы. Показатели дискриминационного потенциала использованной системы из 15 микросателлитных локусов вычисляли по стандартным формулам. Кластерный анализ выполнен методом Ward в программе Statisticа 6.0. С помощью проведенного исследования идентифицировано 14 линий-доноров. Уникальность коллекции, выявленная при помощи анализа изоферментных систем, составила 64%, а при помощи микросателлитных локусов – 100%. Дискриминационный потенциал системы ДНК-маркеров оценен как средний. По результатам кластерного анализа все линии были разделены на 2 группы. Максимальная дистанция между линиями составила 7,4. Несмотря на то, что изученные линии объединены одним общим признаком – устойчивостью к расе G заразихи, молекулярные признаки у них отличаются. Благодаря разному генетическому фону данные линии могут быть использованы в качестве источников дополнительного разнообразия при вовлечении их в селекционные программы по созданию подсолнечника, устойчивого к расе G заразихи.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Sanova, Z.S.

Совершенствование скота черно-пестрой и холмогорской пород ведется методом чистопородного разведения с использованием в воспроизводстве быков-производителей голштинской породы черно-пестрой масти. Изучены данные зоотехнического и племенного учета ряда хозяйств Калужской области за 2019-2020 гг. Данные по I лактации имелись по 1039 животным, по II лактации – по 597. Анализ показателей молочной продуктивности коров показал, что с увеличением кровности по голштинской породе удой значительно увеличивается. Сравнение удоя за последнюю законченную лактацию показало, что коровы черно-пестрой породы с долей кровности более 87,5% по голштинской породе по сравнению с чистопородными голштинами имеют преимущество (+1026 кг). Коровы холмогорской породы уступают голштинам (-359 кг). Массовая доля жира в молоке голштинских коров была ниже как по I, так и по II лактации по сравнению показателями животных холмогорской и черно-пестрой пород с кровностью более 87,5%, и находилась в пределах 3,88-3,93%. Количество белка в молоке больше у коров черно-пестрой породы и по I, и по II лактации по сравнению с голштинскими коровами на 0,04%. Анализ корреляций показал, что в исследуемых стадах основные признаки у коров имели отрицательные взаимосвязи. В том числе удои у коров за 305 дней лактации и содержание жира в молоке (r= - 0,175, r= -0,176, r= -0,276) соответственно в голштинской, холмогорской и черно-пестрой породах. Отрицательная связь показателей "удой матери и дочери" (r= - 0,034), "процент жира в молоке матери и дочери" (r= - 0,033) наблюдалась у коров голштинской породы. Положительная корреляция "удой матери и дочери" (+ 0,170; +0,396) "процент жира в молоке матери и дочери" (+0,015;+0,116) отмечается у животных холмогорской и черно-пестрой пород. | The improvement of the Black-mottled and Kholmogorskaya cattle breeds is carried out by pure breeding with the use of black-mottled Holstein bulls in reproduction. The data of zootechnical and breeding records for 2019-2020 provided by some farms situated in the Kaluga region were studied. Data for lactation I were available for 1039 animals, for lactation II - for 597. Analysis of cow milk performance indicators has shown that with an increase in Holstein blood percent, milk yield increases significantly. A comparison of milk yield for the last completed lactation showed that the Black-and-white cows with Holstein blood ratio of more than 87.5% have an advantage (+1026 kg) compared to purebred Holsteins. The Kholmogorskaya cows are inferior to Holsteins (-359 kg). The mass fraction of fat in the milk of Holstein cows was lower in both I and II lactation compared to these indicators of Kholmogorskaya and Black-and-white animals having Holstein blood percent of more than 87.5%, and it was in the range of 3.88-3.93%. The protein content in milk is higher in Black-and-white cows in both I and II lactation compared to Holstein cows by 0.04%. The correlation analysis showed that in the studied herds, the main characteristics of cows had negative relationships. Thus, milk yield in cows for 305 days of lactation and fat content in milk was r = -0.175, r= -0.176, r = -0.276, respectively, in Holstein, Kholmogorskaya and Black-and-white cows. A negative relationship between mothers and daughters by milk yield (r= - 0.034), by fat content in milk (r= - 0.033) was observed in Holstein cows. Positive correlation between mother and daughter by milk yield (+ 0.170; +0.396) by percentage of fat in milk (+0.015;+0.116) was recorded in Kholmogorskaya and Black-and-white cows.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Vasylyk, I.A.

The creation of grape varieties of a new generation that are analogues of the Crimean autochthons and are highly productive and high quality, carrying genetic adaptability to environmental conditions is relevant today. The main method for breeding grape varieties of a new generation having genetically determined features of resistance to biotic and abiotic factors is crossing of varieties of complex genetic structure between themselves and with forms of Vitis vinifera L. species belonging to different ecological and geographical groups, saturating crosses between hybrid forms with a complex of features corresponding to the breeding task. The objectives of the studies included the assessment of resistance to low temperatures of the Crimean autochthonous grape varieties and their hybrids; selection of the most frost-resistant genotypes obtained by crossing Crimean autochthonous grape varieties with complex interspecific hybrids on the basis of hybridological analysis. The objects of research were 15 local varieties of Crimea and 481 seedlings in 22 combinations of crossing of Crimean autochthonous varieties with complex interspecific varieties. As a result of hybrid analysis there were identified promising hybrid combinations from crossing Crimean autochthonous varieties with varieties of complex interspecific origin, namely Aibatly x Ifigenia (Hh = 1.9%) and Kokur Chernyi x Spartanets Magaracha (Hh = 2.4%), as well as populations characterized by high breeding value, such as Kok Pandas' x Zeibel 6357 (44.4%), Kefesiya x Spartanets Magaracha (23.5%) and Kok Pandas x Spartanets Magaracha (29.4%). A promising hybrid is Magarach No.8-08-8-4 (Kok Pandas x Zeibel 6357). | Создание сортов винограда нового поколения – аналогов крымских автохтонов – высокопродуктивных и высококачественных, несущих в себе генетическую адаптивность к условиям среды обитания, является актуальным на сегодняшний день. Основным методом выведения сортов винограда нового поколения, обладающих генетически обусловленными признаками устойчивости к биотическим и абиотическим факторам, является скрещивание сортов сложной генетической структуры между собой и с формами вида Vitis vinifera L., принадлежащих к различным эколого-географическим группам, насыщающие скрещивания между гибридными формами с комплексом признаков, соответствующих селекционному заданию. В задачи исследований входила оценка устойчивости к низким температурам автохтонных сортов винограда Крыма и их гибридов; отбор наиболее морозоустойчивых генотипов, полученных в результате скрещивания крымских автохтонных сортов винограда со сложными межвидовыми гибридами на основе гибридологического анализа. Объект исследований: 15 местных сортов Крыма и 481 сеянец в 22 комбинациях скрещивания автохтонных сортов Крыма с сортами сложного межвидового происхождения. В результате гибридологического анализа выделены перспективные гибридные комбинации от скрещивания крымских автохтонных сортов с сортами сложного межвидового происхождения – Айбатлы х Ифигения (Гг=1,9%) и Кокур черный х Спартанец Магарача (Гг=2,4%), а также популяции, характеризующиеся высокой селекционной ценностью – Кок Пандас х Зейбель 6357 (44,4%), Кефессия х Спартанец Магарача (23,5%) и Кок Пандас х Спартанец Магарача (29,4%). Перспективным гибридом является Магарач № 8-08-8-4 (Кок Пандас х Зейбель 6357).

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Shcheglov, S.N. | Ul'yanovskaya, E.V. | Tokmakov, S.V. | Chernutskaya, E.A. | Balapanov, I.M.

Исследования проводили согласно общепринятым и разработанным в Северо-Кавказском федеральном научном центре садоводства, виноградарства, виноделия (СКФНЦСВВ) программам и методикам селекции и сортоизучения в центре коллективного пользования "Исследовательско-селекционная коллекция генетических ресурсов садовых культур" (ЦКП ИСК ГРСК). Объекты исследований – сорта и формы яблони (Malus x domestica Borkh.) разной плоидности и генетического происхождения. Цель исследования оценка аллельного полиморфизма микросателлитных последовательностей генома коллекционных образцов рода Malus Mill. как исходного материала для дальнейшей селекции. Генотипирование 48 сортообразцов яблони (из них 44 диплоида и 4 триплоида) генетической коллекции СКФНЦСВВ проводили с использованием 12 SSR маркеров: CH04c07, GD12, CH03d07, CH02C09, CH01h10, GD96, CH04e05, GD100, Hi02c07, GD147, CH01f02, CH02c11. Установлены маркеры, обладающие следующими характеристиками: наибольшим числом аллелей – GD12 (18 аллелей); наименьшим числом аллелей – CH01h10 и Hi02c07 (10 аллелей); наибольшим числом эффективных аллелей – CH01f02 (9,018) и CH02c11 (9,366); наименьшим числом эффективных аллелей – CH01h10 (3,499). По индексу разнообразия выделены локусы CH01f02 и CH02c11, как обладающие наибольшим аллельным полиморфизмом. Выполнена группировка исследуемых 48 сортов яблони на основе результатов генотипирования по двум наиболее информативным маркерам (CH01а02 и CH02c11) и кластерного анализа. Наибольшая средняя длина аллелей (2480,40) была обнаружена у сортов, вошедших в третий кластер, далее – во второй кластер (1019,66), в четвертый кластер (819,65) и в первый кластер (603,28). Сформированы по средней длине аллелей 4 группы в составе 7, 3, 22 и 16 сортов соответственно. Полученные результаты анализа данной выборки сортов яблони важны для решения задач структурирования генофонда и дальнейших селекционных исследований. | The studies were carried out in accordance with the programs and methods of breeding and variety study generally accepted and developed at the North Caucasus Federal Scientific Center of Horticulture, Viticulture, Winemaking (NCFSCHVW) in the Center for Collective Use "Research and Breeding Collection of Genetic Resources of Horticultural Crops". The research objects are varieties and forms of apple trees (Malus x domestica Borkh.) of different ploidy and genetic origin. The aim of the study was to evaluate the allelic polymorphism of microsatellite sequences in the genome of collection specimens of the genus Malus Mill. as a starting material for further breeding. Genotyping of 48 apple varieties (including 44 diploids and 4 triploids) of the NCFSCHVW genetic collection was carried out using 12 SSR markers: CH04c07, GD12, CH03d07, CH02C09, CH01h10, GD96, CH04e05, GD100, Hi02c07, GD147, CH01f02, CH02c11. Markers have been established that have the following characters: the largest number of alleles – GD12 (18 alleles); the smallest number of alleles – CH01h10 and Hi02c07 (10 alleles); the largest number of effective alleles – CH01f02 (9.018) and CH02c11 (9.366); the smallest number of effective alleles – CH01h10 (3.499). According to the diversity index, loci CH01f02 and CH02c11 were identified as having the highest allelic polymorphism. The grouping of the studied 48 apple varieties was performed based on the results of genotyping for the two most informative markers (CH01a02 and CH02c11) and cluster analysis. The highest average allele length (2480.40) is in the varieties included in the third cluster, then in the second cluster (1019.66), in the fourth cluster (819.65) and in the first cluster (603.28). There were formed 4 groups alleles in terms of average allele length comprising 7, 3, 22 and 16 varieties, respectively. The obtained results of the analysis of this apple variety set are important for solving the problems of structuring the gene pool and further breeding research.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Kolesnik, E.S. | Glazko, V.I. | Glazko, T.T. | Kosovskij, G.Yu.

Modern breeding work with farm animal species is moving towards the more intensive production of new forms, in particular the creation of new breeds and synthetic crosses. This requires developing methods for identifying the "gene pool standard" of a breed based on the most polymorphic genomic sites. The aim of the study was to analyze the genomes of domestic rabbit breeds and the Rodnik cross using primers that can be associated with the formation of G4 quadruplexes. Thus, we examined the polymorphism of genomic sites homologous to fragments of long terminal repeats of 7 retrotransposons (Sabrina111, Sabrina 1336, Bare 123A, LTR IR, Sabrina, GlossyL, LTR OR2) and DNA transposon Helitron in retrotransposons (Sabrina111, Sabrina 1336, Bare 123А, LTR IR, Sabrina, GlossyL, LTR OR2) in 3 rabbit breeds (Sovetskaya Shinshilla, Californyiskaya and Belyi velikan) as well as the new synthetic three-breed cross Rodnik by polylocus genotyping (100 males and 100 females were examined in total). The Sabrina primer has a high polymorphism score and high polymorphic information content (PIC) (0.4125 on average). So in the synthetic cross, the highest proportion of polymorphic loci (PPL) rates were among Sabrina and LTR IR primers and were 87.5%, as well as in the Belyi velikan and the Sovetskaya Shinshilla, while in the Californyiskaya breed, Sabrina stood out at 87.5% and Sabrina 1336 at 71.42%, but the PIC polymorphism rate was higher in the Helitron primer at 0.495. The data obtained indicate that primers with a potential predisposition to form G4 quadruplexes reveal an increased polymorphism in all examined rabbit breeds, thus suggesting an increased information content of such markers in the genotyping of farm animal species. | Современная селекционная работа с животными с.-х. видов идет по направлению интенсификации получения новых форм, в частности создания новых пород и синтетических кроссов, что требует разработки методов выявления "генофондного стандарта" породы на основе наиболее полиморфных геномных участков. Цель исследования - анализ геномов отечественных пород кроликов и кросса Родник с использованием праймеров, которые могут быть связаны с образованием вторичных структур ДНК, G4 квадруплексов. Так, рассмотрен полиморфизм геномных участков, гомологичных фрагментам длинных концевых повторов 7 ретротранспозонов (Sabrina111, Sabrina 1336, Bare 123А, LTR IR, Sabrina, GlossyL, LTR OR2) и ДНК-транспозона Helitron, у трех пород кроликов (советская шиншилла, калифорнийская и белый великан), а также полученного на их основе нового синтетического трехпородного кросса Родник методом полилокусного генотипирования (всего исследованы 100 самцов и 100 самок). Праймер Sabrina имеет высокий показатель полиморфизма - полиморфное информационное содержание (PIC) (0,4125 в среднем). Так у синтетического кросса самые высокие показатели доли полиморфных локусов (ДПЛ) были среди праймеров Sabrina и LTR IR и равнялось 87,5%, так же как у белого великана и советской шиншиллы, при этом у калифорнийской породы выделялись Sabrina- 87,5% и Sabrina 1336- 71,42%, однако по показателю PIC полиморфизм выше у праймера Helitron - 0,495. Получены данные, свидетельствующие о том, что праймеры с потенциальной предрасположенностью к образованию G4 квадруплексов, выявляют повышенный полиморфизм у всех исследуемых пород кроликов, тем самым предполагая повышенную информативность подобных маркеров в генотипировании с.-х. видов животных.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Araslanova, N.M. | Antonova, Т.S. | Saukova, S.L. | Ivebor, M.V.

A wide distribution of rust on sunflower in the different regions of the Russian Federation caused the necessity to identify races of this disease pathogen (Puccinia helianthi) and to conduct breeding for resistance to this obligate parasite. Two methods of inoculation of plants of the lines-differentiators of sunflower resistance were compared: 1) with a mixture of spores of the different uredinia collected on the leaves of an infected plant, and 2) with monopustule isolates (clones of spores from the separate isolated uredinia). The first method is shown to be more appropriate for identification of a racial origin of the field samples of infected sunflower leaves. As being simpler and economic, in a short time, it allows revealing the most common biotypes of a pathogen and identifying a spectrum of races occurring in the studying regions. The second method is necessary for revealing the resistant sunflower genotypes in breeding for resistance to rust. Therefore, it is necessary to create and maintain a working collection of spores of the different races of the pathogen of the various monopustule origins. Identifying monopustule isolates collected from the infected sunflower leaves in the Krasnodar and Saratov region, we determined new races, which were not detected earlier in field samples: 500, 503, 510, 516, and 546. Resistance of the lines HAR 266 and HAR 340 to races of the previous nomenclature (3, 4) was proved under inoculation with the monopustule isolates. However, the biotypes of a rust pathogen with a virulent codes 710 and 747 overcame the resistance of these lines. | Широкое распространение ржавчины подсолнечника в разных регионах Российской Федерации вызвало необходимость идентификации расовой принадлежности возбудителя болезни (Puccinia helianthi) и проведения селекции на устойчивость к этому облигатному паразиту. Сравнивали результаты заражения растений линий-дифференциаторов устойчивости подсолнечника двумя способами: 1) смесью спор из разных урединий, собранных с листьев поражённого растения и 2) монопустульными изолятами (клоны спор из отдельных изолированных урединий). Показано, что первый способ предпочтительнее для идентификации расовой принадлежности полевых образцов поражённых листьев подсолнечника. Как более простой и экономичный, он позволяет в короткий срок выявить наиболее часто встречающиеся биотипы возбудителя и обозначить спектр рас, имеющихся в исследуемых регионах. Второй способ необходим для выявления резистентных генотипов подсолнечника в селекции на устойчивость к ржавчине. Для этого необходимо создать и поддерживать рабочую коллекцию спор разной расовой принадлежности монопустульного происхождения возбудителя. При идентификации монопустульных изолятов, выделенных с поражённых листьев подсолнечника из Краснодарского края и Саратовской области, обнаружились новые расы, которые не были выявлены нами ранее в полевых образцах: 500, 503, 510, 516, 546. Подтвердилась устойчивость линий HAR 266 и HAR 340 к расам старой номенклатуры (3, 4) при заражении инокулятами монопустульных изолятов. Однако биотипы возбудителя ржавчины с вирулентными кодами 710 и 747 преодолели устойчивость этих линий.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation