AGRIS - 

2018

Il'ina, L.A. | Lajshev, K.A., Northwest Center for Interdisciplinary Research of Food Scurity Problems, St. Petersburg

Reindeer husbandry is a strategically important industry in the Arctic regions of Russian Federation. Observing the characteristics of rumen microorganisms' composition is necessary to deepen the information on the reindeer physiology. Samples of ruminal contents were collected from 3 animals of each age group in 2017 summer-autumn period in the Yamal-Nenets Autonomous District and the Murmansk Province. The bacterial community composition of the reindeer rumen was analyzed by T-RFLP method. According to the biodiversity indicators, the Yamal-Nenets Autonomous District reindeer ruminal microorganisms' diversity was significantly higher (P less than 0.05) than that in the reindeers of Murmansk region. Young reindeers from the Yamalo-Nenets Autonomous District showed lower biodiversity indicators (P less than 0.05) comparing to adults, whereas in the Murmansk region this was not observed. According to the taxonomic affiliation, it has been established that up to 83.50±5.07% of the phylotypes belong to four bacterial phylums, the Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria and Proteobacteria, while Tenericutes, Fusobacteria, Acidobacteria, Cyanobacteria were less frequent. Note, that several Eubacteriaceae and Clostridiaceae members are capable of detoxification of usnic acid and other secondary metabolites produced by lichens. During the reindeer ontogenesis, noticeable changes in the ratio of phylotypes and taxonomic groups in rumen microbiota were found. The greatest age changes were noticed in the phylum Firmicutes composition. Identification of a significant number of opportunistic and pathogenic microorganisms in the Rangifer tarandus rumen bacterial community, with the dominance of the phylum Fusobacteria, families Сampylobacteriaceae and Enterobacteriaceae, is also of interest. Up to date, this issue has been poorly observed. Direct regularity in changing ruminal pathogen profiles in reindeers of different age or from different habitat was not revealed. | Оленеводство - стратегически значимая отрасль животноводства в арктических регионах Российской Федерации. Наблюдения за составом микробиоценоза рубца у северного оленя важны для углубления знаний по физиологии вида. Цель работы заключалась в сравнительной оценке таксономического состава бактериального сообщества рубца молодых и взрослых особей Rangifer tarandus из разных мест обитания. Образцы содержимого рубца отбирали в летне-осенний период в 2017 г. от трех молодых (возраст 1-2 года) и трех взрослых особей (3-6 лет) в Ямало-Ненецком автономном округе (АО) и Мурманской области. Состав бактериального сообщества рубца анализировали методам Т-RFLP. У северных оленей из Ямало-Ненецкого АО разнообразие микроорганизов в рубце было достоверно более высоким (Р меньше 0,05) по сравнению с животными из Мурманской области. У молодняка оленей из Ямало-Ненецкого АО отмечены достоверно меньшие (Р меньше 0,05) показатели биоразнообразия по сравнению со взрослыми особями, тогда как у животных из Мурманской области такая закономерность отсутствовала. Установлено, что до 83,50±5,07% филотипов относились к четырем бактериальным филумам - Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Proteobacteria, менее представленными оказались Tenericutes, Fusobacteria, Acidobacteria и Cyanobacteria. В течение онтогенеза у северных оленей наблюдались заметные изменения в соотношении количества филотипов и таксономических групп микробиоты рубца. Наибольшие возрастные изменения были выявлены в составе филума Firmicutes. Выявлено значительное количество условно-патогенных и патогенных микроорганизмов, среди которых доминирующими были представители семейств Сampylobacteriaceae, Enterobacteriaceae, филума Fusobacteria. Вероятно, детектированные различия в представленности перечисленных патогенных и условно-патогенных микроорганизмов были связаны с особенностями пастбищного рациона в различных регионах и эпизоотической ситуацией в стаде, что требует дополнительных исследований.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Zelentsov, S.V. | Moshnenko, E.V. | Shuvaeva, T.P. | Zelentsov, V.S., The V.S. Pustovoyt All-Russia Research and Development Inst. of Oil–Producing Crops, Krasnodar

Modern domestic menthol mints were developed with the involvement of various breeding methods, including interspecific hybridization. This led to the appearance of high-menthol varieties, markedly different from the typical phenotype of peppermint. All-Russian Research Institute of Oil Crops by V.S. Pustovoit also maintains a collection of menthol mints with a wide variation in the main taxonomically significant traits. We conducted our researches in Voznesensky branch (Labinsk district of the Krasnodar region) and on fields of the institute (Krasnodar) in the period of 2017–2018. We studied the main taxonomically significant traits in 20 variety samples. We used as the standard the English Peppermint variety, which possesses a typical peppermint morphotype for the species, including a short spike inflorescence and an egg-shaped lanceolate short-petiole leaf. As a result of the taxonomic analysis of the collection, mint forms with an elongated spikelike inflorescence with densely located whorls and fertile flowers; with a loose spike-shaped inflorescence with whorls widely spaced along the flowering axis; with elongated spherical and capitate leafy inflorescences were selected. The trait 'leaf shape' in the collection varies from typical for peppermint egg-shaped lanceolate, hairless leaf, to pubescent or hairless leaves of lanceolate, egg-shaped, oval-rhombic shape. Also we revealed variability by type of the edge of the leaf blade. An obvious variability identified by the type of connection of the leaf with the node of the shoot. In general, the presence of taxonomic trait characterizing the other species of mints in some studied variety samples suggests their complex interspecific origin. The taxonomic description of all menthol mints in the collection of variety samples makes it possible to use it for a more in-depth study of this collection, as well as in the selection or development of taxonomic identification methods suitable for field application. | Современные отечественные ментольные мяты создавались с привлечением различных методов селекции, включая межвидовую гибридизацию. Это привело к появлению высокоментольных сортов, заметно отличающихся от типового фенотипа мяты перечной. Во Всероссийском НИИ масличных культур им. В.С. Пустовойта (Краснодар) также поддерживается коллекция ментольных мят с широкой изменчивостью по основным таксономически значимым признакам. Исследования проводили в 2017–2018 гг. в Вознесенском филиале (Краснодарский край) и на опытных полях ВНИИМК (Краснодар). Изучали основные таксономически значимые признаки у 20 сортообразцов. Стандартом служил сорт мяты Английская перечная, обладающий типовым для вида мята перечная морфотипом, включая короткое колосовидное соцветие и яйцевидно-ланцетовидный неопушённый короткочерешковый лист. В результате таксономического анализа коллекции выделены формы мяты с удлинённым колосовидным соцветием с плотно расположенными мутовками и фертильными цветками; с рыхлым колосовидным соцветием с широко расставленными по цветоносной оси мутовками; с удлинённо-шаровидным и головчатым облиственным соцветиями. Признак "форма листа" в коллекции варьирует от типового для мяты перечной яйцевидно-ланцетовидного неопушённого листа до опушённых или неопушённых листьев ланцетовидной, яйцевидной, овально-ромбической формы. Также выявлена изменчивость по типу края листовой пластинки – от зубчатого до пильчатого и редкопильчатого. Заметная изменчивость выявлена по типу соединения листа с узлом побега. В целом, наличие у некоторых изучаемых сортообразцов таксономических признаков, характерных для других видов мят, позволяет предположить их сложное межвидовое происхождение. Выполненное таксономическое описание всех имеющихся в коллекции сортообразцов ментольных мят позволяет использовать его для более углублённого изучения этой коллекции, а также при подборе или разработке пригодных для применения в полевых условиях методов таксономической идентификации.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Temraleeva, A.D. | Moskalenko, S.V. | Portnaya, E.A., Russian Academy of Sciences, Moscow Region (Russian Fedeartion). Institute of Physicochemical and Biological Problems of Soil Science

The article describes the morphological and molecular genetic approaches used to identify the green microalgae of the Trebouxiophyceae class from the ACSSI collection. In the brown semi-desert and chestnut soils, we found Muriella terrestris. In the buried meadow-chestnut soil we found Edaphochlorella mirabilis. Three more strains are characterized as new uncharacterized taxa: ACSSI 014 is a new species related to the genus Watanabea isolated from gray forest soil, with a pyrenoid surrounded by several starch grains, in contrast to the type species, and ACSSI 104 and 144 are a Nannochloris-like genus, whose representatives were found in solonetz and chestnut soil and are characterized by poor morphological specificities. It is shown that use any single criterion (either morphological or other specificity, calculation of genetic distances, analysis and comparison of the ITS2 secondary structure, search for compensatory changes and molecular signatures) does not allow reliable classification of taxa. Therefore, due to this fact, it is necessary to apply a polyphasic approach in the systematics of algae, especially when identifying taxa with simple cellular morphology, which are often found in soils. | Описываются морфологический и молекулярно-генетический подходы, использованные при идентификации зеленых микроводорослей класса Trebouxiophyceae из коллекции ACSSI. В бурой полупустынной и каштановой почвах были обнаружены водоросли Muriella terrestris, в погребенной лугово-каштановой почве – Edaphochlorella mirabilis. Еще 3 штамма являются новыми неописанными таксонами: ACSSI 014 – новый вид рода Watanabea, изолированный из серой лесной почвы и имеющий пиреноид с крахмальной обверткой в отличие от типового вида, и ACSSI 104 и 144 – Nannochloris-подобный род, представители которого найдены в солонце и каштановой почве и обладают скудными морфологическими признаками. Показано, что ни один критерий в отдельности (морфологический или иной признак, вычисление генетических дистанций, анализ и сравнение вторичной структуры ITS2, поиск компенсаторных замен и молекулярных подписей) не позволяет надежно классифицировать таксоны, поэтому в систематике водорослей необходимо использовать полифазный подход. Это особенно актуально при идентификации таксонов с простой клеточной морфологией, которые часто встречаются в почвах.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation