AGRIS - 

2016

I. M. Odoyevskaya | I. I. Benediktov | V. V. Aseev | H. V. Hilyuta | L. A. Bukina

Methods for interspecific and intraspecific differentiation of helminthes, iden-tification of genotype Trichinella spiralis using polymerase chain reaction are de-veloped. These methods detect DNA loci specific for genome T. spiralis and ena-bles to determine connection between natural and synanthropic trichinellosis in different biocenosis. Methods are based on interaction of synthesized oligonucleo-tide primers with DNA loci typical for this parasite genotype. The amplified frag-ment length is increasing. Electrophoresis of amplification products enables to vis-ualize the DNA fragments and find their molecular mass. The list of equipment and reagents is presented, the process of preparation of clinical trial materials, release of genomic DNA, preparation of reaction mixture for polymerase chain reaction, amplification and electrophoresis modes are described

Show more [+]

Less [-]

Directory of Open Access Journals - Sweden

2016

A. E. Kuchboev | R. R. Karimova | B. N. Ruziev | I. B. Salahutdinov | Sh. Sh. Egamberdiev

Objective of research: conducting morphological and molecular-genetic identification and studying phylogenetic relations between protostrongylids. Materials and methods:  helminthological material was  collected from  wild  (Capra sibirica, C. falconeri, Ovis vignei and O. ammon) and domestic hollow horned  ruminants (C. hircus and O. aries), and land mollusks of the family Xeropicta in the piedmont and mountain area of Uzbekisan. The morphology of protostrongylids was studied using the  methods of Boev (1975) and Anderson (1978). To identify the nematode type we used temporary preparations treated with glycerol. The first-stage larvae were investigated by examination of fecal samples from animals taking  into account the length, tail form and body size. To study the morphology of  the third-stage protostrongylid larvae  the feet of infected  mollusks  Xeropicta candaсharica were separated and placed into the artificial gastric juice where the cap was destroyed and the infected larvae were eliminated. After determination of species belonging of mature and larval nematodes the material was stored in separate test-tubes with distilled water under the low temperature (- 20 ºС) or in 70 % Ethanol for the molecular analysis. We used microscopes ML 2000 with a digital camera and Olympus CX3. DNA extraction, amplification and sequencing were performed with an automated sequencer. Phylogenetic analysis was conducted using the software Clustal X 2.0. Phylogenetic trees were created by the Neighbor–Joining method. Nucleotide sequences ITS-2 regions of species Protostrongylus rufescens  (EU018485), P. shiozawai  (AB478249),  Ortostrongylus macrotis  (EU018483),  Cystocaulus ocreatus  (EU018481) and Umingmakstrongylus pallikuukensis  (AY648409) received from the NCBI GenBank  were used in phylogenetic analysis.  Results and discussion:  Four species of adult protostrongylid nematodes: Protostrongylus rufescens, P. hobmaieri, Spiculocaulus leuckarti and Cystocaulus ocreatus were determined. DNA from four species of mature protostrongylids and larvae was amplified  by using  ITS-2 regions. Amplificate dimension of nematodes P. rufescens and P. hobmaieri was 380 base pairs (b.p.), S. leuckarti   – 388, C. ocreatus – 399 b.p. According to the  results of phylogenetic analysis and comparison of nucleotide sequences, five protostrongylid  species were found  in animals of the Caprinae subfamily:  P.  rufescens, P.  hobmaieri, Protostrongylus sp., S.  leuckarti  and  C.  ocreatus.  The morphological and molecular-genetic analysis  of detected nematodes enables the precise identification.

Show more [+]

Less [-]

Directory of Open Access Journals - Sweden

2016

Kosovskij G.Yu. | Glazko V.I. | Andrejchenko I.А. | Koval’chuk S.N. | Glazko T.T.

The spread of the bovine leukemia virus (BLV) does a significant economic damage to dairy and beef cattle breeding. The content of viral RNA in blood samples and the proliferative activity of were compared to study a possibility of using these indices for individually testing animals by the both characteristics. The presence or absence of genome integrated provirus DNA in Black-and-White Holstein cows (n = 57, commercial herd) was evaluated and the group of infected animals was revealed when using primers as designed for BLV gag and pol genes. The relative quantity expression of provirus in individual infected cows using reverse transcriptase OCR (RT-PCR) analysis and primers to the fragment of the BLV pol gene were assessed. The count of leukocytes in blood samples of all cows, included in the analysis, was further calculated. The number of leucocytes in cows free from infection, with the exception of one cow, was less than 12*10E9 cells/l. This indicator in infected animals divided the investigated cows into two subgroups — in the first subgroup the leucocyte values did not exceed 17*10E9 cells/l, in the second subgroup the number of leukocytes was significantly higher, reaching 28*10E9 cells/l in some animals. It was important to note, that the amount (above 20*10E9 cells/l) of BLV RNA, sufficient to detect by RT-PCR, was revealed only on the second subgroup. The coincidence of the increased leucocyte amount and the BLV RNA in blood of infected animals indicates that particular these cows represent the greatest infection hazard and suggests that the combination of the two estimates (the number of leukocytes and RNA BLV) can be quite a reliable approach to the herd recovery by priority of their liquidation. | Распространение вируса бычьего лейкоза (Bovine leukemia virus, BLV) наносит существенный экономический ущерб молочному и мясному скотоводству. Проведено сопоставление содержания вирусной РНК в образцах крови и пролиферативной активности лейкоцитов, чтобы изучить возможность использования этих показателей для индивидуального тестирования животных по обеим характеристикам. С использованием разработанных праймеров к генам BLV gag и pol у черно-пестрых голштинизированных коров (n = 57) из промышленного стада определили наличие или отсутствие провирусной ДНК BLV, интегрированной в геном, и выявили группу инфицированных особей. С помощью PCR с обратной транскриптазой (RT-PCR) и праймеров к консервативному фрагменту гена pol BLV оценили относительное количество экспрессирующегося провируса у индивидуальных инфицированных животных. Дополнительно у всех коров, включенных в анализ, подсчитали число лейкоцитов в образцах крови. Инфицированные животные по этому показателю разделились на две подгруппы: у первой значения не превышали 17*10E9 кл/л, у второй — оказались существенно выше, достигая у некоторых особей 28*10E9 кл/л. У коров, свободных от инфекции (за исключением одной особи), число лейкоцитов было ниже 12*10E9 кл/л. Оказалось, что достаточное для выявления в RT-PCR количество РНК вируса BLV обнаруживается только у второй подгруппы инфицированных коров. Повышение количества лейкоцитов (свыше 20*10E9 кл/л) в сочетании с накоплением вирусной РНК в образцах крови инфицированных животных свидетельствует о том, что именно они представляют наибольшую инфекционную опасность. Совместное использование двух показателей (число лейкоцитов и количество вирусной РНК BLV) может быть достаточно надежным подходом при первоочередных мероприятиях по оздоровлению стад крупного рогатого скота.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2016

Колосов, А.Ю. | Леонова, М.А. | Гетманцева, Л.В.

Гормон роста (GH) имеет большое значение для регулирования ростовых процессов, клеточной пролиферации и дифференцировки у всех видов млекопитающих. Целью исследований стало изучение влияния полиморфизма гена GH на продуктивные качества свиней породы ландрас. В статье дана генетическая характеристика свиней породы ландрас по гену гормона роста (GH). Установлена связь полиморфизма гена GH с показателями репродуктивных качеств свиней. Определены аллельные варианты гена, закрепление которых в популяции будет способствовать повышению продуктивных качеств свиней.

Show more [+]

Less [-]

Marina Sokolova Publishings - Russian Federation

2016

Теlnov Nikita О.

We conducted the genotyping of developing povolzhskiy type of red-motley breed cattle in the Republic of Mordovia by locus that determines economically valuable traits. DNA purification from blood samples was performed according to the method of Laura-LeeBoodram (2004). Gene polymorphism of milk proteins was performed by method of polymerase chain reaction (PCR) according by the method of G. Bram and B. Branding. Restriction analysis was performed using the endonuclease HinfI, products of restriction were separated by electrophoresis in polyacryl amide gel. Milk productivity was determined monthly by control milkings. On the basis of control milkings we calculate total milk productivity for 305 days of lactation. Fat content in milk was determined by acid method of Gerberg, and protein content– by the method of measurement the mass fraction of total nitrogen by Kjeldahl method and determination of protein mass fraction. To determine cheese-fitness of milk we used rennet and rennet-fermentation samples. It was established that productivity of cows with BB genotype of kappa-casein gene was higher compared with AA genotype. Milk of cows with AA genotype of kappa-casein gene contained less protein than milk of cows with BB genotype. Yield of milk fat from milk of cows with BB genotype of kappa-casein gene was greater than that from a milk of cows with AA genotypes. Studies have shown that cows with BB genotype of kappa-casein had the best cheese-making properties of milk , they had the maximum output of desirable dense rennet clot and the shortest duration of milk coagulation. On this parameters, they were better then animals with AA genotype. Improvement of genetic structure of red-motley breed cows population of Mordovia selection is possible by increasing the frequencies of occurrence of alleles A and B of kappa-casein gene, which affects milk productivity and cheese-making properties of milk as a «hidden» genetic reserve for the improvement of economically valuable traits. | Было проведено генотипирование формирующегося поволжского типа крупного рогатого скота красно-пестрой породы в Республике Мордовия по локусам, определяющим хозяйственно-ценные признаки. Выделение ДНК из проб крови проводили по методике Laura-LeeBoodram (2004). Полиморфизм генов белков молока проводили методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) по методике Г. Брэма и Б. Брендинга. Реcтрикционный анализ проводили с помощью эндонуклеазы HinfI, продукты рестрикции разделяли с помощью электрофореза в полиакрил амидном геле. Молочную продуктивность определяли ежемесячно путём проведения контрольных доек. На основании контрольных доек рассчитывали общую молочную продуктивность за 305 дней лактации. Содержание жира в молоке определяли кислотным методом по Гербергу, а содержание белка – методом измерения массовой доли общего азота по Кьельдалю и определения массовой доли белка. Для определения сыропригодности молока использовали сычужную и сычужно-бродильную пробы. Установлено, что продуктивность коров с генотипом ВВ гена каппа-казеина была выше по сравнению с генотипом АА. Молоко коров с генотипом АА гена каппа-казеина содержало меньше белка, чем молоко коров с генотипом ВВ. Выход молочного жира из молока коров с генотипом ВВ гена каппа-казеина был больше, чем из молока коров с генотипами АА. Исследования показали, что наилучшими сыродельческими свойствами молока обладали коровы с генотипом ВВ каппа-казеина, у них наибольший выход желательного плотного сычужного сгустка и наименьшая продолжительность свёртывания молока. По этим показателям они превосходили животных с генотипом АА. Улучшение генетической структуры популяции коров красно-пестрой породы мордовской селекции возможно за счет увеличения частот встречаемости аллелей А и В гена каппа-казеина, влияющего на молочную продуктивность и сыродельческие свойства молока как «скрытого» генетического резерва для улучшения хозяйственно-полезных признаков.

Show more [+]

Less [-]

Ulyanovsk State Agrarian University named after P.A. Stolypin - Russian Federation

2016

Kosachev, P.A. | Ivanova, M.S. | Skaptsov, M.V.

In a short report we presents additional information of the DNA content and ploidy levels of 4 species of the genus Pedicularis L. (Orobanchaceae). Data were collected using flow cytometry. For the 3 types ofP. anthemifolia, P. flava, P. venusta measurements were carried out for the first time. Additional data were obtained P. compacta. It was found that the ploidy level of the three species is one and corresponds to a set of chromosomes 2n = 2x = 16. For species P. anthemifolia second set ploidy level 2n = 4x = 32. | В кратком сообщении дается дополнительная информация по содержанию ДНК и уровням плоидности 4 видов рода Pedicularis L. (Orobanchaceae). Данные были получены при помощи метода проточной цитометрии. Для 3-х видов P. anthemifolia, P. flava, P. venusta измерения были проведены впервые. Дополнительно были получены данные для P. compacta. Выяснено, что уровень плоидности для трех видов равен 1 и соответствует набору хромосом 2n=2х=16. Для вида P. anthemifolia установлен второй уровень плоидности 2n = 4x = 32.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2016

N. A. Terentieva | N. F. Timchenko | V. A. Golotin | V. A. Rasskazov

Aim. Study of effect of heat-labile (HLT) and thermostable (HST) lethal toxins of Yersinia pseudotuberculosis on the development of embryos of sea urchin Strongylocentrotus intermedius, processes of biosynthesis of nucleic acids and protein in embryo cells and activity of nucleoside-kinases of sea urchin. Materials and methods. Y. pseudotuberculosis strains 2517 (pYV-) and 512 (pYV48MD, pYV82MD) were used for isolation of HLT and HST. Gametes and embryos of sea urchin S. intermedius were used to carry out the experiments and isolate nucleoside-kinases. Results. Both of the studied toxins of Y. pseudotuberculosis possessed spermiotoxic effect and reduced fertilizing ability of sea urchin spermies. HLT LD50 was 1 (ig/ml, and HST - 2 pg/ml. Toxins affected the development of embryos of sea urchin resulting in severe morphologic damages, cessation of the development of embryos at early stages of embryogenesis, destruction of cells and death of embryos. Wherein, damaging effect of HLT was observed at lower concentrations compared with HST. HLT inhibited DNA and RNA biosynthesis at concentrations of 1-2 pg/ml. HST did not affect biosynthesis of nucleic acids even at high concentrations, but inhibited protein biosynthesis in sea urchin embryos. HLT did not reduce the level of inclusion of labeled amino acids into embryo cells. HLT had inhibiting effect on the activity of thymidine- and uridine-kinase of sea urchin, whereas HST did not affect these enzymes. Conclusion. Both of Y. pseudotuberculosis protein toxins affect the development of sea urchin embryos, however, mechanisms of action of HLT and HST on embryos and processes occurring in them differ.

Show more [+]

Less [-]

Directory of Open Access Journals - Sweden

2016

Shajdullin, R.R. | Sibagatullin, F.S. | Sharafutdinov, G.S., Kazan State Agrarian Univ.

Analysis and generalization of information on bulls-producers, belonging to breeding enterprises of Tatarstan, was done. For this purpose, materials, tribal certificates of Tatarstan type bulls of Kholmogory breed (TTKB), black-motley and Holstein breeds were used. They were evaluated by DNA productivity markers: kappa-casein (CSN3), O-acyltransferase diacylglycerol (DGAT1), beta-lactoglobulin (LGB), prolactin (PRL), somatropin (GH), thyroglobulin (TG5), leptin (LEP). Among bulls-producers of TTKB and Holstein breed BB genotype of beta-lactoglobulin prevails (48.7% and 40.7%) and AA genotype of LGB locus is rarer, 17.9% and 18.6% respectively. Allele frequency in these breeds was almost the same and varied from 0.35 to 0.39 (allele A) and from 0.61 to 0.65 (allele B). In all groups of dairy breeds prevalence of LL genotype of GH locus was noted in somatotropin gene, with the highest frequency in Holstein cattle (84.2%). Bulls of the TTKB are noted by a high frequency of the allele C of the leptin gene, which varied from 1.0 in the Chiftein line of animals to 0.58 in the producers of the Sovering line. TTKB bulls have the highest frequency of heterozygous genotypes in most genes, thus in CSN3, the genotype AB is 34.2%, in PRL, genotype AB - 30.4%, in TG5, genotype TS - 35.9%, in LEP, genotype TC- 66.7%, and of homozygous genotypes in genes DGAT1, LGB, PRL, GH, LEP, genotypes AA (47.2%), BB (48.7%), BB (2.2%), VV (20.0%), SS (33.3%) respectively. The genetic equilibrium was violated in the diacylglycerol gene of O-acyltransferase in bulls of the TTKB (chi-square = 4.72, P is less than 0.05) and black-motley breed (chi-square = 3.91; P - less than 0.05), and in the somatropin gene only in the producers of the TTKB (chi-square = 5.42, P - less than 0.05). The conclusion is that desirable alleles of genes of milk-yield are more often seen in Chif, Houp and Aivengo branches and also in bulls of TTKB they are more often than among representatives of other breeds. | Проведен анализ и обобщение сведений о быках-производителях, принадлежащих племенным предприятиям Татарстана. Для этого использовались материалы, племенные свидетельства быков татарстанского типа холмогорской породы (ТТХП), черно-пестрой и голштинской породы, которые оценены по ДНК-маркерам продуктивности: каппа-казеину (CSN3), диацилглицерол О-ацилтрансферазы (DGAT1), бета-лактоглобулину (LGB), пролактину (PRL), соматропину (GH), тиреоглобулину (TG5), лептину (LEP). Среди быков-производителей ТТХП и голштинской породы преобладают носители генотипа ВВ бета-лактоглобулина, (48,7 и 40,7%), реже встречается генотип АА локуса LGB, 17,9 и 18,6% соответственно. Частота аллелей у данных пород была примерно одинаковой и колебалась от 0,35 до 0,39 (аллель А) и от 0,61 до 0,65 (аллель В). У всех групп молочных пород по гену соматропина отмечено преобладание генотипа LL локуса GH, с наибольшей частотой (84,2%) у голштинского скота. Быки ТТХП выделяются высокой частотой аллеля С гена лептина, которая варьировала от 1,0 у животных линии Чифтейна до 0,58 у производителей линии Соверинга. Быки ТТХП имеют наивысшую частоту гетерозиготных генотипов по большинству генам, так по CSN3 генотип АВ – 34,2%, по PRL генотипу АВ – 30,4%, по TG5 генотипу ТС – 35,9%, по LEP генотипу ТС – 66,7% и по гомозиготным генотипам по генам DGAT1, LGB, PRL, GH, LEP соответственно по генотипу АА (47,2%), ВВ (48,7%), ВВ (2,2%), VV (20,0%), СС (33,3%). Генетическое равновесие нарушено по гену диацилглицерол О-ацилтрансферазы у быков ТТХП (хи-квадрат= 4,72; Р меньше 0,05) и черно-пестрой породы (хи-квадрат= 3,91; Р меньше 0,05), а по гену соматропина только у производителей ТТХП (хи-квадрат= 5,42; Р меньше 0,05). Сделан вывод, что желательные аллели генов молочной продуктивности чаще встречаются в ветвях Чифа, Хоупа и Айвенго, а также у быков ТТХП чаще, чем среди представителей других пород.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation