AGRIS - 

2019

Laquinta, J.F. | Ardez, K.P. | Guerrero, M.S. | Caoili, B.L. | Navasero, M.V.

Brown planthopper (BPH), Nilaparvata lugens (Stal), is the most destructive rice pest in Asia. It causes severe damage to rice, resulting to great losses to farmers. Since its first record of infestation in the Philippines in 1954, BPH still persists causing resurgence outbreaks in different provinces that imply more complex approaches to manage its population. Using 850-bp cytochrome oxidase I (COI) sequences, three BPH haplotypes were reported in the Philippines, with one dominating just like in other Asian countries. A preliminary analysis of molecular variation among and within BPH populations from Roxas City, Isabela and Calauan, Laguna was conducted. After having the genomic DNA isolation and gene amplification optimized, amplicons were sent for sequencing. Molecular variations were analyzed using the aligned partial nucleotide sequences coding for the COI of BPH. Two haplotypes from 581-bp partial sequences were recognized. Through BLAST, the dominant haplotype showed 100% nucleotide identity while the other showed 99.83% with N. lugens MK032794.1. Polymorphism was found at the 370th nucleotide position showing transversion of A-T.

Show more [+]

Less [-]

University Library, University of the Philippines at Los Baños - Philippines

2019

Rasco, J.L.S. | Banganan, J.C. | Abustan, M.A.M. | Mendoza, M.R.DR. | Lalusin, A.G.

Sugarcane is one of the main sources of sugar and bioethanol globally. To sustain its availability, efforts in the development of new varieties with high yield and resistance to biotic and abiotic stresses are being done. One consideration in the evaluation and selection of parental for hybridization rely on the knowledge of relationships between individuals in a germplasm. However, sugarcane's complex genome poses challenges on genomics-assisted breeding of the crop. In this study, 180 sugarcane accessions from different provinces of the Philippines were analyzed thru genotyping-by-sequencing using Diversity Array Technology (DArT). Single nucleotide polymorphism (SNP) and Silico-DArT markers were developed using DARTseq. The technology employs genome complexity reduction method using methylation-sensitive restriction enzymes and Next-Generation Sequencing (NGS). Thousands of SNP and Silico-DArT markers were developed that can easily cover higher genome coverage for genetic diversity analysis. Dendrogram for each marker system was constructed which shows genetic variation between accessions. Generated dendrograms can be used as basis for parental selection. Genetically variable individuals are preferred as breeding stocks in minimizing inbreeding depression. The use of DArT-seq high-throughput genotyping can be a useful tool to evaluate breeding materials for development of varieties with improved characters.

Show more [+]

Less [-]

University Library, University of the Philippines at Los Baños - Philippines

2019

Vilyunov, S.D., All-Russia Research and Development Inst. of Grain Legumes and Cereal Crops, Orel Region

Under conditions of the Orel region, the mechanism of redistribution of genetic components of multiline millet variety 'Kvartet' (smut resistance genes Sp1, Sp2, Sp3, Sp4) was studied after a 20-year cultivation period in production when seeds were reseeded without a chemical load on the environment by eliminating the seed treatment stage. For 2016–2017 a natural manifestation of the head smut infection was not detected on the variety. In 2018, 'Kvartet' variety together with 'Blagodatnoe' susceptiblemillet variety (Sp0) was included in the experiment against a hard infectious background of pure smut races (1, 2, 3, 4, 6a, 8, 12) and their mixture (1 + 6a + 8); the replication was four-fold. Using mathematical optimization (MS Excel "Search for a solution"), we revealed a change in the multilinear composition of lines with Sp1, Sp2, Sp3 and Sp4 genes from the initial ratio of 30:30:30:10 in 1998 to 58.0:21.8:1.7:18.5 in 2018, respectively. It was suggested that the degression of the line with Sp3 gene from 30% to 1.7% was caused by the influence of the local smut population with the predominance of race 1; the simultaneous increase in the proportion of lines with Sp1 and Sp4 genes by a factor of 1.9 was caused by the degradation of the line with Sp2 gene as less adaptive to the local conditions. A close positive correlation coefficient (r = 0.87) between the number of unstable lines in the composition and their response to the smut race characterizes the presence of nonlinear interactions that cause an increased disease resistance of the multiline composition in the lines. To determine the fractional composition of the multilinear composition, we recommend using test races with one susceptible line as a part of a multilinear variety. | В условиях Орловской области изучали механизм перераспределения генетических компонент мультилинейного сорта проса Квартет (гены устойчивости к головне Sp1, Sp2, Sp3, Sp4) после 20-летнего периода возделывания в производстве при пересеве семенами без протравливания. За 2016– 2017 гг. наблюдений на сорте Квартет не выявили естественного проявления заражения головней. В 2018 г. на сорте Квартет совместно с неустойчивым сортом проса Благодатное (Sp0), был заложен опыт на жестком инфекционном фоне чистых рас головни (1, 2, 3, 4, 6а, 8, 12) и их смеси (1+6a+8 расы) в 4-х кратной повторности. Путем математической оптимизации с использованием пакета MS Excel"Поиск решения" выявлено изменение мультилинейной композиции линий с генами Sp1, Sp2, Sp3 и Sp4 – c начального соотношения 30:30:30:10 в 1998 г. до 58,0:21,8:1,7:18,5 в 2018 г. соответственно. Дегрессия линии с геном Sp3 с уровня 30% до 1,7% может быть вызвана влиянием местной популяцией головни с преобладание расы 1; одновременное возрастание долей линий с генами Sp1 и Sp4 в 1,9 раза – дегрессией линии с геном Sp2 как менее адаптивной к местным условиям. Тесный положительный коэффициент корреляции (r=0,87) между количеством неустойчивых линий в композиции и их реакцией на расу головни характеризует наличие нелинейных взаимодействий, вызывающих повышенную сопротивляемость болезни мультилинейной композиции в линиях. Для определения долевого состава мультилинейной композиции рекомендуем использовать тестирующие расы с одной восприимчивой линией в составе мультилинейного сорта.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Kostyunina, O.V. | Trebunskikh, E.A. | Fornara, M.S. | Karpushkina, T.V., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

A scientific novelty is the study of the allele pool of domestic reproduction pigs, the determination of population genetic parameters by DNA markers, and the search for associations of genetic variants with economically significant traits. The aim of the work was to study the influence of SCD Y487830 polymorphism: g.2228 T C to the IMF content and to search for associations of genotypes with economically significant traits in domestic reproduction pigs. The studies were conducted in 2019 on pigs reared in Selection and Hybrid Center LLC (Voronezh region). Genotyping were determined by the QuantStudio 5 Real-Time PCR System using the developed test system. The content of IMF (%), backfat thickness (mm), lean (%), live weight (kg) in 103 boars and 27 gilts Duroc pigs, 30 Large White boars was determined using an ExaGo ultrasound scan- ner. The main diet and animal welfare conditions were identical and corresponded to zoosanitary standards. Model equation for multivariate analysis of variance with interaction was used to evaluate the effect of genotype by SCD on productive qualities. The frequency of the T allele and TT genotype in the group of Duroc pigs was 0.419 and 12.7%, respectively. Large White pig breeds were characterized by the frequency of the T allele - 0.686, TT genotype - 46.8%. All Landrace pigs were carriers of the TT genotype. The superiority of the C allele carriers in the content of IMF was shown. The difference between Duroc boars with TT and CC genotypes was 0.42% (P no more 0.05), andindividuals with CC genotype exceeded TT genotype carriers in the backfat thickness of more than 3 mm (P no more 0.001). The results confirm the association of the SCD genotype with the content of intramuscular fat and the backfat thickness in the Duroc boars. | Научной новизной характеризуются изучение аллелофонда свиней отечественной репродукции, определение популяционно-генетических параметров по ДНК-маркерам, поиск ассоциаций генетических вариантов с экономически-значимыми признаками. Целью работы являлось изучение влияния полиморфизма SCD Y487830: g.2228 T C на содержание внутримышечного жира и поиск ассоциаций генотипов с экономически значимыми признаками у свиней отечественной репродукции. Исследования проводили в 2019 г. на свиньях, разводимых в одном из хозяйств Воронежской области. Генотипы по SCD определяли методом ПЦР-РВ на ДНК-амплификаторе Quant Studio 5 с использованием разработанной тест-системы. Посредством УЗИ-сканера ExaGo определяли содержание ВМЖ (%), толщину шпика (мм), постность (%), живую массу (кг) у 103 хряков и 27 свинок породы дюрок, 30 хряков породы крупная белая. Основной рацион и условия содержания животных были идентичны и соответствовали зоогигиеническим нормам. Для оценки эффекта генотипа по SCD на продуктивные качества использовали уравнение модели для многофакторного дисперсионного анализа с взаимодействием. Частота аллеля T и генотипа ТТ в группе свиней породы дюрок составила 0,419 и 12,7%, соответственно. Свиньи крупной белой породы характеризовались частотой аллеля Т - 0,686, генотипа ТТ - 46,8%. Все ландрасы являлись носителями генотипа TT. Показано превосходство носителей аллеля С по содержанию ВМЖ. Разница между хряками породы дюрок с генотипами ТТ и СС составила 0,42% (Р не более 0,05), а особи с генотипом СС превосходили носителей генотипа ТТ по толщине шпика более чем на 3 мм (Р не более 0,001). Полученные результаты подтверждают наличие ассоциации генотипа по SCD с содержанием внутримышечного жира и толщиной шпика у хряков породы дюрок.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Besedinа, E.N., All-Russia Research and Development Inst. of Biological Plant Protection, Krasnodar

In order to increase the entomophages use prospects for the natural and artificial pes population regulation, it is necessary to study the genetic structure and genetic diversity in the beneficial insects populations of. The use of DNA-markers allows monitoring of both parasites and predators applied in biological plant protection programs. Using samples of the ectoparasite Habrobracon hebetor Say, the predatory beetles Harmonia axyridis Pall. and Adalia bipunctata L., the predatory bugs Perillus bioculatus F. and Podisus maculiventris Say, we carried out a comparative molecular genetic analysis of laboratory and natural populations of these entomophages using RAPD- and ISSR-markers. An original method has been elaborated for the quality evaluation of laboratory parent populations of entomophages, artificially grown for mass release into the agrocenoses, as bioagents in plant protection. This method is based on the evaluation of DNA polymorphism and genetic diversity of insect populations using RAPD-markers and ISSR-markers and can be used as a quality criterion for commercial lots of bioagents, which can significantly increase the effectiveness of biological protection of agricultural plants against harmful arthropods. The method of molecular genetic diagnostics can be used in the future to control the species composition and quality of the batch of parasitic and predatory entomophags imported from the countries of near and far abroad. | Чтобы повысить перспективность использования энтомофагов для естественной и искусственной регуляции численности вредителей, необходимо изучение генетической структуры и генетического разнообразия популяций полезных насекомых. Использование ДНК-маркеров позволяет проводить мониторинг как паразитов, так и хищников, применяемых в программах биологической защиты растений. На примере эктопаразита Habrobracon hebetor Say, хищных жуков Harmonia axyridis Pall. и Adalia bipunctata L., хищных клопов Perillus bioculatus F. и Podisus maculiventris Say проведен сравнительный молекулярно-генетический анализ лабораторных и природных популяций этих энтомофагов по RAPD- и ISSR-маркерам. Разработан оригинальный метод оценки качества маточных лабораторных популяций энтомофагов, искусственно выращиваемых для массового выпуска в агроценозы как биоагентов в защите растений. Данный метод основан на оценке ДНК-полиморфизма и генетического разнообразия популяций насекомых по RAPD- и ISSR-маркерам и может быть использован как критерий качества коммерческих партий биоагентов для существенного повышения эффективности биологической защиты с.-х. растений от вредных членистоногих. Метод молекулярно-генетической диагностики в дальнейшем может быть использован для контроля видового состава и качества импортируемых из стран ближнего и дальнего зарубежья партий паразитических и хищных энтомофагов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Pozovnikova, M.V., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

The fertility of cows is a polygenic trait, the development of which is determined by the complex interaction of various genes and environmental factors. The aim of our work was to study the polymorphism of the FSHR gene in exon 10 in cows and analyze the connection of its allelic variants with productive and reproductive parameters, as well as with the quality and quantity of oocyte-cumulus complexes (OCC) (obtained from post mortem ovaries). In this study 69 Black and White Holsteinized cows and 138 ovaries obtained postmortem from these animals were analyzed. The biological material was collected in 2017-2018. The indicator of fertility of cows is one of the most important parameters, determining the level of breeding and economic wellness of agricultural enterprises. Since the signs of milk production and fertility of cows very often are in a negative correlation, in our work we analyzed not only a number of economically valuable features, but also studied the reproductive potential of highly productive cows of black-and-white Holstein breed. In the analyzed samples (n=69 cows or 138 ovaries) 3 genotypes were determined: FSHR gene: CC (52 cows), CG (13 cows) and GG (4 cows). There was a tendency of reduction of the breeding value (BV) for milk yield, milk fat and protein from the CC genotype to the GG genotype. A weak positive correlation was found on the signs of BV milk and milk fat with the total yield of OCC (correlation coefficient 0.164 and 0.108, respectively). A conclusion is made that the FSHR gene in cattle weakly reflects the quantitative and qualitative characteristics of OCC obtained from postmortem ovaries and cannot be used as a marker of these parameters. | Фертильность коров – это полигенный признак, развитие которого определяется сложным взаимодействием различных генов и факторов внешней среды. Целью работы было изучить у коров полиморфизм гена FSHR в 10-м экзоне и проанализировать связь его аллельных вариантов с продуктивными и репродуктивными показателями, а также с качеством и количеством ооцит-кумулюсных комплексов (ОКК), полученных postmortem. В данном исследовании было проанализировано 69 коров черно-пестрой голштинизированной породы и 138 яичников полученных postmortem от данных животных. Биологический материал был собран в 2017-2018 гг. Показатель плодовитости коров является одним из важнейших, определяющих уровень селекционно-племенной и хозяйственной деятельности сельхозпредприятий. Так как признаки молочной продуктивности и фертильность коров находятся в отрицательной корреляции, в нашей работе мы проанализировали не только ряд хозяйственно ценных признаков, но и изучили репродуктивный потенциал высокопродуктивных коров черно-пестрой голштинизированной породы. В анализируемой выборке определено 3 генотипа гена рецептора фолликулостимулирующего гормона (FSHR) СС (52 головы), CG (13 голов) иGG (4 головы). Отмечена тенденция по снижению племенной ценности (ПЦ) по удою, молочному жиру и белку от генотипа СС к генотипу GG. Выявлена слабая положительная корреляция по признакам ПЦ удою и молочному жиру с общим выходом ОКК (коэффициент корреляции 0,164 и 0,108 соответственно). Сделан вывод, что ген FSHR у крупного рогатого скота мало отражает количественные и качественные характеристики ОКК, полученных из яичников postmortem, и не может использоваться как маркер этих параметров.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Kritskaya, T.A. | Kashin, A.S., Saratov National Research State Univ.

The current natural habitat of Tulipa suaveolens Roth rapidly decreases. In order to work out the strategy of the species' preservation, evaluation of its intra- and interpopulation polymorphism is required. Molecular-genetic ISSR markers were used to analyze 125 accessions from 10 populations of T. suaveolens occurring in Volgograd Province and 4 populations from Saratov Province. ISSR analysis revealed high intrapopulation polymorphism (73–89%) in T. suaveolens populations from Volgograd Province. AMOVA attributed the largest proportion of variability (74.3%) to intrapopulation polymorphism. Interpopulation differences account for 25.7%. Total subdivision of populations (FST) was 0.257; total gene flow (Nm) between populations was 0.723. According to Bayesian analysis and clustering with both UPGMA and Neighbor Joining methods, all the studied T. suaveolens samples from Volgograd Province make up a large genetic group: within that group none of the potential subgroups may be associated with a particular place of collecting. The NewHybrids software was applied, and the results pointed to the hybrid nature of most samples. Samples of three populations from Saratov Province made up a separate genetic group; those samples fell under the category of parent forms. Considering that genetic subdivision of T. suaveolens populations within the administrative borders of Volgograd Province is insignificant, while all the province's natural parks and a number of protected natural areas undertake measures to preserve the species, the existing conservation strategy may be recognized as effective and sufficient. | Для анализа 125 образцов 10 популяций Tulipa suaveolens Волгоградской области и 4 популяций Саратовской области использовали молекулярно-генетические ISSR-маркеры. ISSR-анализ позволил выявить высокий уровень полиморфизма (73−89%) внутри популяций T. suaveolens Волгоградской области. По результатам анализа молекулярной изменчивости (AMOVA), большая часть изменчивости (74,3%) приходится на внутрипопуляционный полиморфизм. Доля изменчивости, которая приходится на межпопуляционные различия, составила 25,7%. Общая подразделенность популяций (FST) равна 0,257. Общий поток генов (Nm) между популяциями – 0,723. Согласно результатам байесовского анализа и кластеризации двумя различными методами (UPGMA и NeighborJoining), все исследованные особи T. suaveolens Волгоградской области образуют одну большую генетическую группу, в которой ни одна из потенциальных подгрупп не может быть ассоциирована с тем или иным районом сбора образцов. Результаты, полученные в программе NewHybrids, указывают на гибридную природу большей части особей. Отдельную генетическую группу составили образцы трех популяций Саратовской области, которые были отнесены в категорию родительской формы. Учитывая то, что в пределах административных границ Волгоградской области популяции T. suaveolens слабо отличаются друг от друга генетически и охраняются на территории всех природных парков области, а также ряда особо охраняемых природных территорий, введенные меры охраны следует считать достаточными для сохранения вида.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Makarova, E.G. | Kozlova, N.V. | Baregamyan, M.A. | Vojnova, T.V., All-Russia Reseach and Development Inst. of Fishery and Oceanography. Volga-Caspian Branch, Astrakhan

For the first time, a study of genetic variability of Caspian anadromous herring was carried out using molecular genetic methods. Sequencing of the cytochrome B site of mitochondrial DNA allowed to identify 7 haplotypes. The most massive haplotype was Hap_Alosa1 noted in 29 herring individuals. 5 minor haplotypes were detected in few fish individuals. In the marine period of life in fish caught in the Northern Caspian there were noted rare haplotypes Hap_Alosa6 and Hap_Alosa7. In the river period of life in the Volga herring there was observed Hap_Alosa5. The revealed polymorphism of haplotypes was represented by single nucleotide substitutions. The genetic analysis of migratory herring does not give grounds for isolating the studied fish into separate groups. The marked low level of nucleotide diversity of cytochrome B gene of mitochondrial DNA of the anodromous herring indicates a significant genetic homogeneity of the species within the studied range. The results of analysis of nuclear DNA microsatellite loci showed that only three of the six sites of the studied gene were polymorphic. In individuals caught in the river period of life, only Af20 (out of the 6 loci studied) was polymorphic and was characterized by 4 alleles. In a sample of herring from the Northern Caspian, 3 polymorphic loci (Aa16, Af6 and Af20) were observed, in which 2 alleles were recorded. The observed heterozygosity varied from 0.313 to 0.667 exceeding the level of expected heterozygosity. In polymorphic loci a deficit of heterozygotes was not noted. The results obtained in this study indicate a low level of genetic variation of anadromous herring. | Впервые проведено исследование генетической изменчивости каспийской проходной сельди с использованием молекулярно-генетических методов. Секвенирование участка цитохрома B митохондриальной ДНК позволило выявить 7 гаплотипов. Наиболее массовым гаплотипом был Hap_Alosa1, отмеченный у 29 особей сельди. Выявлены 5 минорных гаплотипов, зафиксированных у одной или двух рыб. В морской период жизни у рыб, выловленных в Северном Каспии, были отмечены уникальные гаплотипы Hap_Alosa6 и Hap_Alosa7, в речной период жизни в р. Волге у сельди наблюдался Hap_Alosa5. Выявленный полиморфизм гаплотипов был представлен однонуклеотидными заменами. Проведенный генетический анализ проходной сельди не дает оснований для выделения исследованных рыб в отдельные группы. Отмеченный низкий уровень нуклеотидного разнообразия гена цитохрома B митохондриальной ДНК проходной сельди свидетельствует о значительной генетической однородности вида в пределах изученного ареала. Результаты анализа микросателлитных локусов ядерной ДНК показали, что только 3 участки гена из 6 изученных были полиморфными. У особей, выловленных в речной период жизни, из 6 изученных локусов только Af20 был полиморфным и характеризовался четырьмя аллелями. В выборке сельди с Северного Каспия наблюдалось 3 полиморфных локуса (Aa16, Af6 и Af20), в которых фиксировалось по 2 аллеля. Наблюдаемая гетерозиготность варьировала от 0,313 до 0,667, превышая уровень ожидаемой гетерозиготности. В полиморфных локусах дефицит гетерозигот не был отмечен. Полученные в данном исследовании результаты свидетельствуют о низком уровне генетической изменчивости проходной сельди.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Kostyunina, O.V. | Getmantseva, L.V. | Fornara, M.S. | Prytkov, Yu.A. | Volkova, N.A., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

PRKAG3 gene was considered as a gene, characterized the qualitative characteristics of meat. It plays a key role in the regulation of carbohydrate and lipid metabolism. The purpose of the research was to evaluate the effect of T30N, S52G and I199V mutations on PRKAG3 gene on the quality indicators of pork. The object of the experiments was three-breed young F2 hybrid (Large White x Landrace x Duroc) hogs-analogues (n = 25). The pigs were grown under conditions of the physiological yard and were slaughtered at the age of 203–208 days. The basic diet and husbandry were identical and corresponded to zoohygienic norms. DNA was isolated using the DNA-Extran kit. The polymerase chain reaction was conducted and genotypes were determined according to PRKAG3 gene under the previously developed method. Muscle tissue was sampled after slaughter. For statistical analysis of the results a linear model was used. The frequencies of T and N alleles in p.T30N position were 0.88 and 0.12 respectively. The frequencies of NT and TT genotypes were 24 and 76%, respectively. The frequencies of G and S alleles at p.S52G position were 0.90 and 0.10, respectively. The frequencies of GG and SG genotypes were 80.0 and 20.0%, respectively. The frequencies of alleles I and V in p.I199V position were 0.70 and 0.30, respectively. The frequencies of II, IV and VV genotype were 44.0, 48.0 and 8.0%, respectively. In the meat of heterozygous NT animals the content of adipose tissue was significantly higher (by 2.08%) (5.34 ± 0.47%), than in the meat of TT genotype carriers. The content of hydroxyproline and adipose tissue was significantly higher in the meat of heterozygous IV individuals (51.36 ± 1.30 mg/% and 4.91 ± 0.58%) than in the meat of the carriers of genotype II – by 4.19 mg/% and 2.32%, respectively. Genetic variants on PRKAG3 gene are associated with the qualitative characteristics of the meat of three-breed hybrids and can be used to improve consumer properties of pork. | В качестве гена, характеризующего качественные показатели мяса, рассматривали PRKAG3, играющий ключевую роль в регуляции углеводного и липидного обмена. Цель работы – оценка влияния мутаций T30N, S52G и I199V по PRKAG3 на качественные показатели мяса свиней. Объектом опытов служили трехпородные гибридные боровки F2 (крупная белая x ландрас x дюрок) аналоги (n=25). Свиней выращивали в условиях физиологического двора и подвергали убою в возрасте 203…208 дней. Основной рацион и условия содержания животных были идентичны и соответствовали зоогигиеническим нормам. ДНК выделяли с помощью набора "ДНК-Экстран", постановку полимерзаной цепной реакции и определение генотипов по PRKAG3 осуществляли согласно разработанной ранее методике. После убоя отбирали образцы мышечной ткани. Для статистического анализа результатов использовали линейную модель. Частоты аллелей T и N в позиции p.T30N составляли 0,88 и 0,12, генотипов NT и TT – 24 и 76% соответственно. Частоты аллелей G и S в позиции p.S52G составляли 0,90 и 0,10, генотипов GG и SG – 80,0 и 20,0% соответственно. Частоты аллелей I и V в позиции p.I199V составляли 0,70 и 0,30, генотипов II, IV и VV – 44,0, 48,0 и 8,0% соответственно. Содержание жировой ткани в мясе гетерозиготных особей NT (5,34±0,47%) было достоверно больше (на 2,08%), чем у носителей генотипа TT. По содержанию оксипролина и жировой ткани выявлено значимое превосходство гетерозиготных IV особей (51,36±1,30 мг/% и 4,91±0,58%) над носителями генотипа II на 4,19 мг/% и 2,32% соответственно. Генетические варианты по PRKAG3 ассоциированы с качественными признаками мяса трехпородных гибридов и могут быть использованы при усовершенствовании потребительских свойств свинины.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Fedulova, T.P. | Fedorin, D.N., The A.L. Mazlumov All-Russia Research and Development Inst. of Sugar Beet and Sugar, Voronezh Region

Parental plants of sugar and fodder beet and F1 hybrids obtained from their crossing are the object of the research. Aim of the investigations is to reveal specific DNA-markers for molecular marking and studying genetic diversity of Beta genus breeding material. In the course of the research, crosses between sugar beet male-sterile plants genetically marked using DNA-markers and fodder red and white beet plants have been made. The experimental studies has resulted in determining genetic variability of breeding materials of sugar and fodder beet and hybrids produced with its participation that is characterized by polymorphism in 3 RAPD (OPA-10, OPC-06, OPP-18) and 3 SSR-markers (Bvm 1, Bvm 2, Bvm 3). Transfer of separate DNA fragments from parental forms to beet hybrids has been revealed. Possibility of using the studied specific RAPD- and SSR-markers for molecular marking and identification of Betа genus beet breeding material is discussed. During the investigations, there has been determined the molecular-genetic structure of parental forms (МС-plants of sugar and fodder beet and F1 hybrid posterity obtained from their crossing) using microsatellite loci (Bvm 1, Bvm 2, and Bvm 3) and RAPD-loci (OPA-10, OPC-06, OPP-18). It has allowed identification of the abovementioned plants. Using locus OPP-18, specific PCR-products of 600 b.p. in length for father parent component of fodder white beet (Rw) have been revealed. This distinguishes the given specimen from other genotypes and can serve as a genetic marker for its identification. For the sterile form РС-9, absence of DNA-amplicon of length 1400 b.p. in length that is present in other parental forms has been revealed using the microsattelite locus Bvm 2. his is one of the test-traits when carrying out of certification of this genotype. For more reliable and exact identification of Betа genus beet breeding materials, it is suggested to carry out further fragmental analysis using a genetic analyzer with the help pf the selected polymorphic primers. These investigations represent both theoretical and the practical importance for a marker-assisted breeding of sugar beet. Use of molecular markers will allow accelerating breeding process considerably. | Объект исследования - растения родительских форм сахарной, кормовой свеклы и гибриды F1, полученные от их скрещивания. Цель работы – выявить специфические ДНК-маркеры для молекулярного маркирования и изучения генетического разнообразия селекционного материала (СМ) свеклы рода Beta. Проводились скрещивания генетически маркированных по ДНК-маркерам мужско-стерильных растений сахарной свеклы с растениями кормовой красной и белой свеклы. Установлена генетическая изменчивость СМ сахарной, кормовой свеклы и гибридов с их участием, характеризующаяся полиморфизмом по 3-м RAPD (OPA-10, OPC-06, OPP-18) и 3-м SSR- маркерам (Bvm 1, Bvm 2, Bvm 3). Выявлена передача отдельных фрагментов ДНК от родительских форм гибридам свеклы. Обсуждается возможность использования изученных специфических RAPD и SSR-маркеров для молекулярного маркирования и идентификации СМ свеклы рода Betа. Установлена молекулярно-генетическая структура родительских форм: МС – растений сахарной, кормовой свеклы и гибридного потомства F1 от их скрещивания по микросателлитным локусам: Bvm 1, Bvm 2, Bvm 3 и RAPD-локусам: OPA-10, OPC-06, OPP-18, позволившая провести их идентификацию. Выявлены специфические ПЦР – продукты длиной 600 п.н. для отцовского компонента кормовой белой свеклы (Rw) по локусу OPP-18, что отличает данный номер от других генотипов и может служить генетическим маркером для его идентификации. Для стерильной формы РС-9 выявлено отсутствие ДНК-ампликона длиной 1400 п.н. ампликона по микросателлитному локусу Bvm 2, имеющегося у других родительских форм, что является одним из тест-признаков при проведении паспортизации данного генотипа. Для более точной идентификации СМ свёклы рода Beta предлагается проведение дальнейшего фрагментного анализа на генетическом анализаторе с отобранными полиморфными праймерами. Результаты исследования имеют теоретическую и практическую значимость для маркер-ориентированной селекции сахарной свеклы. Использование молекулярных маркеров позволит значительно ускорить селекционный процесс.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation