AGRIS - 

Data provenance by Country

2015

Suprun, I.I. | Balapanov, I.М., North-Caucasian Zonal Research and Development Inst. of Horticulture and Viticulture, Krasnodar

It was carried out the molecular and genetic identification of allelic combinations of self-incompatibility gene in 15 modern varieties of sweet cherry breed in Dagestan Experimental Station of Fruit Crops Selection (Buynaksk, Russia) and 3 introduced cultivars. Consensus primer pairs PaConsI PaConsII were used at the first stage of the study to identify alleles of the target gene. Allele-specific markers S1, S2, S5, S12 have been additionally used to confirm data from genotyping with consensus markers as well as identification of non identified alleles. As the results of the study S-allelic set was identified for all examined cultivars. In the studied set of sweet cherry cultivars allele S3 was defined as most frequent - 11 genotypes, hereinafter allele S1 - 7 genotypes; alleles S5 and S9 - 5 genotypes; alleles S4 and S2 - 4 genotypes and allele of S6 and S7 - 1 genotype. Information about allelic combinations of S-gene in the studied sweet cherry cultivars can be used to determine the compatibility of cultivars at pollination and selection of effective pollinators as well as the formation of parental pairs for crossing in the breeding and for DNA fingerprinting of cultivars in combination with other types DNA markers. | Выполнена молекулярно-генетическая идентификация аллельных комбинаций гена самонесовместимости у 15 современных сортов черешни селекции Дагестанской селекционной опытной станции плодовых культур (г. Буйнакск, РФ) и 3-х интродуцированных сортов. На первом этапе исследования, для идентификации аллелей целевого гена использовали консенсусные праймерные пары PaConsI и PaConsII. Для подтверждения полученных результатов и выявления аллелей, не идентифицированных с использованием консенсусных маркеров, был проведен анализ с использованием аллель-специфичных маркеров S1, S2, S5, S12. в результате исследования для всех изученных сортов был определен аллельный набор S-гена. В изученной выборке сортов наиболее часто встречался аллель S3 - 11 генотипов, далее: аллель S1 - 7 генотипов; аллели S5 и S9 - по 5 генотипов; аллели S4 и S2 - по 4 генотипа, и аллели S6 и S7 - по 1 генотипу. Информация об аллельных комбинациях S-гена у изученных сортов может быть использована для определения совместимых при опылении пар сортов и подборе эффективных сортов опылителей, как и при формировании родительских пар для гибридизации в селекционном процессе, а также для ДНК-паспортизации сортов в сочетании с другими типами ДНК-маркеров.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2015

Krytsyna, T.I. | Kochnev, N.N., Novosibirsk State Agrarian Univ.

Ген TNF-альфа кодирует белок - многофункциональный цитокин, который, наряду с функциями иммунного ответа, участвует в процессах морфогенеза и развитии плода, играет важную роль в формировании молочной железы, стимулирует образование простагландинов. Исследовали возможную связь полиморфизма -824 А/G в промоторе гена TNF-альфа с показателями воспроизводства (возраст при первом осеменении, сервис-период, межотельный период, сухостойный период, стельность) у коров красной степной породы. Полиморфизм указанного гена изучали методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом длин рестрикционных фрагментов. Для анализа использовали ДНК, выделенную стандартным методом протеолитической обработки с последующей экстракцией фенол-хлороформом из крови 148 коров красной степной породы. Показатели воспроизводства установлены на основе зоотехнического учета. В изученной выборке частоты встречаемости генотипов по гену TNF-альфа G/G, G/A и A/A составили соответственно 56, 38 и 6%. Частота редкого аллеля A была равна 25%, аллеля G - 75%. Распределение частот генотипов соответствовало равновесию Харди-Вайнберга. У животных с генотипом G/G возраст при первом осеменении был на 2 месяца ниже, чем у коров с генотипом G/A (p менее 0,05). Продолжительность стельности у животных с генотипом G/G превышала величину этого показателя у гетерозигот G/A на 6,6 дн. (p менее 0,05). По другим показателям (сервис-период, межотельный и сухостойный период) статистически достоверных различий между коровами разных генотипов не установлено. | TNF-alpha gene encodes the protein which is a multifunctional cytokine, and along with the functions of the immune response is involved in the morphogenesis and fetation, plays the important role in the formation of a mammary gland, and stimulates the formation of prostaglandins. The possible association between -824 A/G polymorphism in the promoter of TNF-alpha gene with reproductive indices (age at the first insemination, service period, calving interval, interlactation period, pregnancy) of Red Steppe cattle was studied. Polymorphism of the above mentioned gene was studied using polymerase chain reaction followed by restriction fragment length analysis. DNA extracted by the standard method of protease treatment followed by extraction with phenol-chloroform from the blood of 148 cows of Red Steppe breed was used for the analysis. Reproduction indices were determined on the basis of zootechnical calculation. In the studied group the frequencies of genotypes G/G, G/A and A/A for TNF-alpha gene were 56, 38 and 6% respectively. The frequency of the rare A allele was 25%, of G allele - 75%. The distribution of genotype frequencies corresponded to the Hardy-Weinberg equilibrium distribution. The age of animals with G/G genotype when they had their first insemination was 2 months lesser than that of cows with G/A genotype (p less than 0.05). The duration of pregnancy in the animals with G/G genotype was higher than that in G/A genotype by 6.6 days (p less than 0.05). No significant associations were found for other reproductive performance (service period, calving interval and interlactation period) between cows with different genotypes.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation