AGRIS - 

2023

Prasolova, O.V. | Krylova, E.V. | Soltynskaya, I.V. | Putintseva, A.V. | Timofeeva, I.А. | Kirsanova, N.A. | Osipova, Yu.A. | Ivanova, O.E. | Kish, L.K.

The occurrence of antibiotic-resistant strains of microorganisms was monitored in 7 federal districts of Russia. Using real-time polymerase chain reaction (PCR-RT) 263 samples selected in 2021 and 2022 from clinically healthy animals were examined. The samples were droppings, feces, swabs from udders and from entities of animal and poultry management. The genetic determinants of resistance to 5 antibiotic classes were determined: tetracyclines (tetA, tetO, tetM); fluoroquinolones (qnrS, qnrB); cephalosporins, penicillins (CTX-M-1, CTX-M-9, CMY); olymyxins (mcr-1). In 95% (n=249) of the samples there were found genes associated with resistance to 2 classes of broad-spectrum antibiotics. In 60% (n=158) of the samples, resistance was revealed to tetA, in 52% (n=138) to tetM, in 48% (n=127) to tetO, in 42% (n=111) to qnrB, in 35% (n=92) - to qnrS, in 22% (n=58) - to CTX-M-1, in 13% (n=34) - to CTX-M-9, in 24% (n=63) - to CMY, in 19% (n=50) - to mcr-1. As to animal species, the genetic markers of antibiotic resistance can be arranged in ascending order as follows: sheep – horses – goats – cattle – pigs – poultry. This is consistent with the fact that antibiotics are used in the treatment of pigs and poultry more often than in the treatment of cattle. In samples taken from environmental entities, the detection rate of genetic resistance determinants was comparable to that in samples taken in poultry houses. Resistance genes were detected two to three times oftener in faecal samples than in environmental samples. The study has shown which resistance markers are common in samples from animals and the environment, and the relative amount and detection rate of these markers can serve as a parameter for assessing the risk of further spread of antibiotic resistance. | В 7 федеральных округах России был проведен мониторинг распространения резистентных к антибиотикам штаммов микроорганизмов. С помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-PВ) было исследовано 263 образца, отобранных в 2021 и 2022 гг. от клинически здоровых животных. Образцы представляли собой помет, фекалии, смывы с вымени и с объектов содержания животных и птицы. Определяли генетические детерминанты резистентности к 5 классам антибиотиков: тетрациклины (tetA, tetO, tetM); фторхинолоны (qnrS, qnrB); цефалоспорины, пенициллины (СТХ-М-1, СТХ-М-9, CMY); полимиксины (mcr-1). В 95% (n=249) образцов обнаружили гены, связанных с устойчивостью к 2-м классам антибиотиков широкого спектра действия. У 60% (n=158) образцов выявили устойчивость к tetA, 52% (n=138) - к tetM, 48% (n=127) - к tetO, 42% (n=111) - к qnrB, 35% (n=92) - к qnrS, 22% (n=58) - к CTX-M-1, 13% (n=34) - к CTX-M-9, 24% (n=63) - к CMY, 19% (n=50) - к mcr-1. По видам животных генетические маркеры резистентности к антибиотикам можно расположить по возрастанию в следующем порядке: овцы – лошади – козы – крупный рогатый скот – свиньи – с.-х. птица. Это согласуется с фактом, что антибиотики используются в лечении свиней и с.-х. птицы чаще, чем в лечении крупного рогатого скота. В образцах, отобранных из объектов внешней среды, частота выявления генетических детерминант резистентности была сопоставимой с таковой в образцах, взятых в птичниках. В образцах фекалий гены резистентности выявляли в два-три раза чаще, чем в образцах из окружающей среды. Исследование показало, какие маркеры резистентности распространены в образцах от животных и окружающей среды, а относительное количество и частота обнаружения данных маркеров могут служить параметром оценки риска дальнейшего распространения резистентности к антибиотикам.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Kulintsev, V.V. | Shevkhuzhev, A.F. | Pogodaev, V.A. | Skorykh, L.N. | Sulyga, N.V.

The genetic polymorphism identification in genes associated with the formation of quantitative and qualitative parameters of beef cattle performance is of scientific and practical interest. The thyroglobulin gene polymorphisms were studied and their associations with the growth and body condition of beef cattle were determined. Molecular genetic studies of the thyroglobulin gene region made it possible to identify 6 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in its structure in Kalmyk cattle: g.8450238T more than G, g.8452338G more than C, g.8450286T more than G, g.8450269C more than T, g.8450226А more than C, g.8450224C more than G. Based on the results of allele frequencies distribution in animals of the test population, 3 genotypes were identified: TT, TG, GG in 2 polymorphisms g.8450286T more than G and g.8450238T more than G; GG, GC, CC in g.8452338G polymorphism more than C; CC, CT, TT in g.8450269C polymorphism more than T; AA, AC, CC in g.8450226A polymorphism more than C; CC, CG, GG in the g.8450224C polymorphism more than G. It was found that animals homozygous for mutant alleles were characterized by high live weight in 4 out of 6 detected polymorphisms in the TG gene. The carriers of the homozygous CC genotype of the g.8452338G polymorphism more than C were characterized by the highest live weight, exceeding individuals with the GG and CG genotypes by 9.6 and 6.8%. Bulls with the TT genotype of the g.8450269C polymorphism more than T also had a higher value of the studied indicator than individuals of the CC and CT genotypes by 14.2 and 21%. The presence of a genotype association of single nucleotide polymorphisms in the TG gene with exterior data of beef cattle showed some heterogeneity of results. The studies have resulted in providing data on the genetic structure and data on the presence of a genotype association of single nucleotide polymorphisms in the TG gene with traits of beef performance in the Kalmyk cattle population. | Выявление генетического полиморфизма в генах, связанных с формированием количественно-качественных параметров мясной продуктивности крупного рогатого скота представляет научный и практический интерес. Изучены полиморфизмы гена тиреоглобулина, определены их ассоциации с показателями роста и телосложения мясного скота. Проведенные молекулярно-генетические исследования участка гена тиреоглобулина позволили выявить в его структуре у крупного рогатого скота калмыцкой породы 6 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP): g.8450238T больше G, g.8452338G больше C, g.8450286T больше G, g.8450269C больше T, g.8450226А больше C, g.8450224C больше G. По результатам распределения частот аллелей у животных исследуемой популяции определены по 3 генотипа: ТТ, TG, GG в двух полиморфизмах g.8450286T больше G и g.8450238T больше G; GG, GС, СС в полиморфизме g.8452338G больше C; СС, СТ, ТТ в полиморфизме g.8450269C больше T; АА, АС, СС в полиморфизме g.8450226А больше C; СС, СG, GG в полиморфизме g.8450224C больше G. Установлено, что животные, гомозиготные по мутантным аллелям, в 4 среди 6 обнаруженных полиморфизмов в гене TG характеризовались высоким значением живой массы. Наибольшей живой массой отличались носители гомозиготного СС-генотипа полиморфизма g.8452338G больше C, превосходящие особей с генотипами GG и CG на 9,6 и 6,8%. Бычки с генотипом ТТ полиморфизма g.8450269C больше T так же имели большее значение изучаемого показателя, чем особи СС- и СТ- генотипов, на 14,2 и 21%. Наличие ассоциации генотипов однонуклеотидных полиморфизмов в гене TG с экстерьерными данными мясного скота показало некоторую неоднородность результатов. В результате исследований получены сведения о генетической структуре и данные о наличии ассоциации генотипов однонуклеотидных полиморфизмов в гене TG с признаками мясной продуктивности в популяции крупного рогатого скота калмыцкой породы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation