AGRIS - 

2023

Ovchinnikov, R.S. | Zhigalin, A.V. | Gajnullina, A.G. | Yuzhakov, A.G. | Tyuten'kov, O.Yu. | Savinov, V.A. | Moskvitina, N.S. | Kapustin, A.V. | Laishevtsev, A.I. | Gulykin, A.M.

Mass skin lesions in sables in Siberia have been known since the 18th century, but their etiology is still not well studied. The aim of the work was to reveal and identify clinically significant microscopic fungi in sables with clinical manifestations of skin diseases. Pathological material (hair, crusts) was taken from the affected areas of the skins of wild sables, hunted during the 2018-2019 hunting season in various areas of the Tomsk region. A total of 28 samples of pathological material were studied. When examining the affected sables, skin lesions were found, which were localized mainly in the back, waist, and sides and characterized by loss of over hair, alopecia, formation of crusts and scabs. Dark spots were often observed around lesions from the side of the underskin. Lesions were observed both in males and females, mainly in young animals. During visual examination, samples of pathological material were clotted tufts of hair with dried crusts and scales at the base. The result of the luminescent test with a Wood's lamp in all samples was negative. Microscopy revealed tufts of matted downy hair and a large amount of purulent debris, which made it difficult to detect fungal elements. As a result of cultural mycological analysis, 51 cultures were isolated, 18 of fungi were identified. At the same time, keratinophilic dermatophyte fungi (Arthroderma cuniculi, Chrysosporium carmichaelii, Chrysosporium spp.) were isolated from 12% of the samples, probably acting as etiological agents of dermatosis. Growth of dermatophytes was observed only on the DTM-Expert selective differential diagnostic medium, fast-growing non-dermatophyte fungi grew on ordinary media. Non-dermatophyte fungi with keratinolytic properties such as Scopulariopsis brevicaulis (16%), Acremonium spp. (14%), Aspergillus spp. (36%) were also isolated. These fungi can act as secondary opportunistic pathogens. | Массовые кожные заболевания у промысловых соболей на территории Сибири известны с XVIII века, однако их этиология до сих пор недостаточно изучена. Целью работы было выявление и идентификация клинически значимых микроскопических грибов у соболей с проявлениями кожных заболеваний. Патологический материал (волосы, корочки), отбирали с пораженных участков шкур диких соболей, добытых при пушном промысле сезона 2018-2019 гг. в разных районах Томской области. Всего было изучено 28 образцов патологического материала. При осмотре шкур соболей были обнаружены кожные поражения, которые локализовались в основном в области спины, поясницы, боков и характеризовались выпадением остевых волос, алопециями, образованием корочек и струпьев. Часто в области поражений со стороны мездры имелись темные пятна. Поражения наблюдали как у самцов, так и у самок, преимущественно у молодняка. Образцы патологического материала представляли собой слипшиеся пучки волос с засохшими корочками и чешуйками у основания. Результат люминесцентного теста с лампой Вуда во всех образцах был отрицательным. При микроскопии наблюдали пучки слипшихся пуховых волос и большое количество гнойного дебриса, затрудняющего обнаружение грибных элементов. В результате культурального микологического анализа была выделена 51 культура, идентифицировано 18 таксонов грибов. При этом из 12% образцов были изолированы кератинофильные грибы-дерматофиты (Arthroderma cuniculi, Chryso-sporium carmichaelii, Chrysosporium spp.), вероятно, выступающие в качестве этиологических агентов дерматоза. Рост дерматофитов наблюдался только на селективной дифференциально-диагностической среде ДТМ-Эксперт, на обычных средах росли быстрорастущие недерматофитные грибы. Также были изолированы недерматофитные грибы с кератинолитическим свойствами - Scopulariopsis brevicaulis (16%), Acremonium spp. (14%), Aspergillus spp. (36%), которые могут выступать в качестве вторичных оппортунистических патогенов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Lyutikov, A.A. | Shumilina, A.K. | Korolev, A.E.

Morphophysiological and biochemical parameters of wild pike-perches (WP) and artificially grown (commercial) pike-perches (CP) were studied before and after wintering. The study objects were immature perches (age 3+-4.) caught from the Sukhodolskoye Lake, Leningrad region, Russia, and CP comparable to them (age 2+-3.). CP from fingerlings were grown in cages placed in a natural reservoir at natural temperature using artificial feed Biomar Efico Sigma 840 (Denmark). The morphophysiological fish indicators were studied: length (to the end of the scale cover), internal organs indices (liver, gonads, heart, spleen, gastrointestinal tract (GIT)), cavitary fat and condition factor and biochemical parameters: the relative content of moisture, dry matter, lipids, protein, minerals (ash), nitrogen-free extractive substances (NFES) and vitamin C. During winter, in WP and CP the body's energy reserves were consumed and nutrients were redistributed in muscles and liver. This is expressed in a great decrease in the content of cavitary fat in the body of WP and CP (by 45 and 16%, respectively), muscle fat content (by 26% in WP) and liver (by 59% in WP and by 16% in CP), vitamin C in muscles (by 56 and 23%, respectively). While, the content of NFES in muscles and liver increases lots – 2.1 and 2.8 times in WP and 1.5 and 1.4 times in CP. The share of monounsaturated fatty acids in the lipids of pikeperch muscles in winter significantly increases and the share of polyunsaturated fatty acids (PUFA) decreases, especially eicosapentaenoic (EPA), docosahexaenoic (DHA) and arachidonic ones, with an increase in these acids in the liver. As to meat quality estimated by the content of long-chain PUFA, during the wintering period there is a significant decrease in the nutritional value of caught and raised fish, which is expressed in a 2-3-fold decrease in EPA + DHA in muscles. Such changes are the fish adaptation to cold temperature conditions during prolonged wintering and are associated with puberty. | Исследовали морфофизиологические и биохимические параметры диких (ДС) и искусственно выращенных (заводских) судаков (ЗС) до и после зимовки. Объектом исследования служили неполовозрелые судаки (возраст 3+-4.), отловленные из оз. Суходольское, и соразмерные с ними ЗС (возраст 2+-3.). ЗС от сеголеток выращивались в садках, установленных в естественном водоеме, в естественном температурном режиме с использованием искусственных кормов Biomar Efico Sigma 840 (Дания). Исследовали морфофизиологические показатели рыб - длину (до конца чешуйного покрова), индексы внутренних органов (печени, гонад, сердца, селезенки, желудочно-кишечного тракта (ЖКТ)), полостного жира и коэффициент упитанности и биохимические параметры: относительное содержание влаги, сухого вещества, липидов, белка, минеральных веществ (золы), безазотистых экстрактивных веществ (БЭВ), витамина С. У ДС и ЗС в период зимовки произошло расходование энергетических резервов организма и перераспределение питательных веществ в мышцах и печени. Это выражается в значительном снижении содержания полостного жира в теле ДС и ЗС (на 45 и 16% соотв.), жирности мышц (на 26% у ДС) и печени (на 59% у ДС и 16% у ЗС), витамина С в мышцах (на 56 и 23% соотв.). При этом в мышцах и печени многократно повышается содержание БЭВ: в 2,1 и 2,8 раза соотв. у ДС и в 1,5 и 1,4 раза у ЗС. В липидах мышц судаков в зимний период существенно повышается доля мононенасыщенных жирных кислот и снижается доля полиненасыщенных жирных кислот (ПНЖК), особенно эйкозапентаеновой (ЭПК), докозагексаеновой (ДГК) и арахидоновой, на фоне повышения уровня этих кислот в печени. С точки зрения качества мяса, оцененного по содержанию длинноцепочечных ПНЖК, за период зимовки происходит значительное снижение пищевой ценности выловленных и выращенных рыб, что выражается в 2-3-кратном снижении ЭПК + ДГК в мышцах. Подобные изменения являются адаптацией рыб к холодным температурным условиям в период длительной зимовки и связаны с половым созреванием.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Krutikova, A.A. | Peglivanyan, G.K.

The research object is wild reindeer and domestic reindeer kept on farms of the Taimyr Peninsula and Evenkia. The material is DNA isolated by the classical phenolic method from the blood of domestic reindeer of two breeds - Nenets (n=20) and Evenk (n=20), as well as from tissue samples of wild reindeer (n=20). A search and selection of potential variants of genetic polymorphism in the BMP2 gene responsible for the formation of bone tissue and skeletal muscles, which can serve as markers and be used in the practice of breeding reindeer to increase meat productivity, was carried out. For the first time, the nucleotide sequence of significant regions of the BMP2 gene in reindeer was determined by Sanger sequencing. The identified polymorphic loci in the BMPR2 gene had differences in the frequency of occurrence of mutant and wild-type alleles in the studied samples. This indicates the effect of selection factors on the region of the BMP2 gene. The revealed genetic variability of the studied region in reindeer breeds contrasting in performance is a preliminary confirmation of the influence of genetic polymorphism in the BMP2 gene on the variability of phenotypes in key indicators affecting the formation of reindeer meat production. It is suggested that some of the identified variants of genetic polymorphism in the studied region of the BMP2 gene may turn out to be casual mutations affecting the formation of quantitative traits in domestic reindeer. | Объект исследований - дикие северные олени и домашние, содержащиеся в хозяйствах полуострова Таймыр и Эвенкии. Материал - ДНК, выделенная классическим фенольным методом из крови домашнего северного оленя двух пород - ненецкой (n=20) и эвенкийской (n=20), а также из образцов тканей дикого северного оленя (n=20). Провели поиск и отбор потенциальных вариантов генетического полиморфизма в гене BMP2, отвечающего за формирование костной ткани и скелетной мускулатуры, которые могут служить маркерами и использоваться в практике селекции северных оленей на увеличение мясной продуктивности. Методом секвенирования по Сэнгеру впервые была определена нуклеотидная последовательность значимых участков гена BMP2 северных оленей. Выявленные полиморфные локусы в гене BMP2 имели различия по частоте встречаемости аллелей мутантного и дикого типов в изученных выборках. Это говорит о действии факторов отбора на регион гена BMP2. Выявленная генетическая изменчивость исследуемого региона у контрастных по продуктивности пород северного оленя является предварительным подтверждением влияния генетического полиморфизма в гене BMP2 на вариабельность фенотипов по ключевым показателям, влияющим на формирование мясной продуктивности северных оленей. Сделано предположение, что некоторые из выявленных вариантов генетического полиморфизма в изученном регионе гена BMP2 могут оказаться казуальными мутациями, влияющими на формирование количественных признаков у домашних северных оленей.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Koshkina, O.A. | Kharzinova, V.R. | Zinov'eva, N.A.

The Nenets reindeer breed is the most numerous in the Russian Federation, has unique adaptive abilities and plays a key role in the life of numerous peoples of the Far North. It is relevant to search for and implement various approaches that will expand and clarify the available data on the state of genetic diversity and phylogenetic relationships of regional populations of the Nenets breed. The aim of the work is to validate the developed a test system for the isolation of complete mitochondrial genomes of reindeer and to conduct a phylogenetic analysis of domestic populations of the Nenets breed in comparison with the wild tundra population of reindeer. The test system is based on the amplification of six overlapping mtDNA fragments, which, after purification and quality control of the libraries, were sequenced using NGS technology and performed on a miSeq device (Illumina, USA). Approbation of the test system for the isolation of complete mitochondrial genomes of the reindeer was carried out on representatives of six regional populations of the Nenets breed (n=63), as well as the wild reindeer (n=62). The length of the complete mitogenome was 16367 base pairs, with the following distribution of nucleotide frequencies: A - 33.70%, T - 30.04%, G - 13.16%, C - 23.10%. All studied individuals of the Nenets breed were characterized by high haplotype and nucleotide diversity (Hd = 0.993±0.005; pi = 0.00391±0.00068). No clear population clustering of the studied reindeer samples was observed. Phylogenetic analysis revealed the presence of four main clusters with a mixed composition according to the distribution of haplotypes on the median network. As a result of the study, a test system was developed and tested for the isolation of complete reindeer mitochondrial genomes, new data were obtained on the phylogenetic relationships not only of groups of the Nenets reindeer of various geographical origins, but also of domestic and wild populations of this animal species. | Ненецкая порода северного оленя – самая многочисленная в Российской Федерации, обладает уникальными адаптационными способностями и играет ключевую роль в жизни многочисленных народов Крайнего Севера. Актуален поиск и внедрение различных подходов, которые позволят расширить и уточнить имеющиеся данные о состоянии генетического разнообразия и филогенетических взаимоотношениях региональных популяций ненецкой породы. Цель исследований – выполнить апробацию разработанной тест-системы для выделения полных митохондриальных геномов северных оленей и провести филогенетический анализ домашних популяций ненецкой породы, в сравнении с дикой тундровой популяцией северных оленей. Разработанная тест-система основана на амплификации шести перекрывающихся фрагментов мтДНК, которые после очистки и проверки качества библиотек секвенировали с использованием технологии NGS на приборе miSeq (Illumina, США). Апробацию тест-системы выделения полных митохондриальных геномов северного оленя проводили на представителях шести региональных популяций ненецкой породы (n=63) и диких северных оленей (n=62). Длина полного митогенома составила 16367 пар оснований со следующим распределением частот нуклеотидов: А – 33,70%, Т – 30,04%, G – 13,16%, C – 23,10%. Все исследуемые особи ненецкой породы характеризовались высоким гаплотипическим и нуклеотидным разнообразием (Hd = 0,993±0,005; пи = 0,00391±0,00068). Четкой популяционной кластеризации исследуемых выборок северных оленей не наблюдали. Филогенетический анализ выявил наличие четырех основных кластеров со смешанным составом согласно распределению гаплотипов на медианной сети. Разработана и апробирована тест-система для выделения полных митохондриальных геномов северного оленя, получены новые данные о филогенетических связях группировок ненецкой породы северного оленя различного географического происхождения, а также домашних и диких популяций этого вида животных.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation