AGRIS - 

Data provenance by Country

2023

Lavrent'eva, S.I. | Bondarenko, O.N. | Blinova, A.A. | Penzin, A.A. | Timkin, P.D. | Ivachenko, L.E. | Nikul'chev, K.A. | Aseeva, T.A. | Butovets, E.S. | Golokhvast, K.S.

The research aimed to study the molecular genetic polymorphism of wild and cultivated soybeans in the Far East region using protein enzymes and SSR markers. Seeds of 6 varieties and 2 forms of wild soybean grown in the Amur region ('Alena', 'Kitrossa', 'Sonata', 'Harmoniya'), Khabarovsk ('Batya', wild soybean XK) and 'Primorsky' (KZ-6337) territories served as the material. The specific activity of hydrolytic enzymes and oxidoreductases was determined in seeds by a spectrophotometric or photocolorimetric method, multiple forms were determined by electrophoresis, and genomic DNA was isolated by a modified CTAB method. For molecular genetic analysis of DNA, 11 pairs of SSR primers were used with an annealing temperature of 45 to 60 degrees Celsius. An increased specific activity of oxidoreductases was found in the seeds of wild soybean samples from the Amur Region and Khabarovsk Territory (for superoxide dis-mutase130.74 and 156.04 units/mg of protein, respectively; for peroxidase, 701.42 and 465.39 units/mg of protein), which corresponds to a small number of their plural forms (respectively 5 and 1). An increased specific activity of the hydrolase complex was established for the 'Kitross' soybean (ribonuclease – 0.24 units/mg of protein; esterases – 0.118 units/mg of protein; acid phosphatases – 0.125 units/mg of protein; amylase – 78.09 units/mg of protein). In other studied samples, the specific activity of ribonucleases in most cases was in the range of 0.09-0.13 ± 0.01 units/mg of protein, esterases – 0.052-0.095 units/mg of protein, acid phosphatases – 0.060-0.088 units/mg of protein, amylase – 7.20-74.08 units/mg of protein. The 'Alena' differed from other studied varieties in 7 microsatellite loci, the 'Batya' differed from the Primorskaya-96 variety in 6 out of 11 loci, and the wild soybean forms were similar in three loci (E178, K135, M170), which indicates their genetic remoteness, which is confirmed by the dendrogram. | Исследования проводили с целью изучения молекулярно-генетического полиморфизма дикой и культурной сои Дальневосточного региона с использованием ферментов белковых и SSR-маркеров. Материалом служили семена 6 сортов и 2 форм дикой сои, выращенные в Амурской области (Алена, Китросса, Соната, Гармония), Хабаровском (Батя, дикая соя ХК) и Приморском (КЗ-6337) краях. Удельную активность гидролитических ферментов и оксидоредуктаз определяли в семенах спектрофотометрическим или фотоколориметрическим методом, множественные формы – методом электрофореза, геномную ДНК выделяли модифицированным СТАВ-методом. Для молекулярно-генетического анализа ДНК использовали 11 пар SSR-праймеров с температурой отжига от 45 до 60 град. С. Повышенная удельная активность оксидоредуктаз выявлена в семенах образцов дикой сои Амурской области и Хабаровского края (для супероксиддисмутазы соответственно 130,74 и 156,04 ед./мг белка; для пероксидазы – 701,42 и 465,39 ед./мг белка), что соотносится с небольшим количеством их множественных форм (соответственно 5 и 1). Повышенная удельная активность гидролазного комплекса установлена для сорта сои Китросса (рибонуклеазы – 0,24 ед./мг белка; эстеразы – 0,118 ед./мг белка; кислых фосфатаз – 0,125 ед./мг белка, амилазы – 78,09 ед./мг белка). У других исследуемых образцов удельная активность рибонуклеаз в большинстве случаев находились в пределах 0,09…0,13 ед./мг белка, эстераз – 0,052…0,095 ед./мг белка, кислых фосфатаз – 0,060…0,088 ед./мг белка, амилаз – 7,20…74,08 ед./мг белка. Сорт Алена отличался от других исследуемых сортов по 7 микросателлитным локусам, сорт Батя – от сорта Приморская-96 по 6 из 11 локусов, а формы дикой сои были схожи по трем локусам (E178, K135, M170), что свидетельствует об их генетической удаленности, которая подтверждается дендрограммой.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Bazanov, T.A. | Ushchapovskij, I.V. | Loginova, N.N. | Smirnova, E.V. | Mikhajlova, P.D.

When researching crop genetic diversity, including flax species, molecular markers are used to identify cultivars, establish phylogenetic relationships among them and select valuable genotypes and sources of useful traits. One of the effective ways to solve these tasks is the use of SSR markers, as a molecular method. The work aim was to study the molecular genetic polymorphism of modern flax cultivars listed in the State Register for Selection Achievements of the Russian Federation, find out their phylogenetic relationships and develop a version of their genetic certification. The materials for the research were 82 flax cultivars (60 cultivars of fiber flax and 22 of oilseed flax) and 3 ancient landraces. Genetic analysis was carried out using the PCR method with a set of 11 SSR markers labeled with fluorescent dyes, followed by the detection of products on the genetic analyzer. The study of the cultivars revealed 50 alleles at 11 loci, with the number of alleles per locus ranging from 2 to 10, averaged to 4.55 alleles per locus. Each flax accession contained a unique set of alleles. The resulting SSR database made it possible to develop genetic certificates for each cultivar in the form of an alphanumeric code. A cluster analysis was also carried out and a dendrogram of genetic similarity was constructed. The identified sib relationships among the cultivars confirmed the information about their origin. | При исследовании генетического разнообразия с.-х. растений, представленного как в виде разрешенных к возделыванию сортов, так и в виде многообразия образцов рабочих и национальных коллекций, применяют молекулярные маркеры, которые позволяют проводить идентификацию сортов, устанавливать филогенетические связи между ними и выявлять ценные генотипы для создания новых высокопродуктивных сортов. Одним из эффективных способов решения этих задач является применение SSR-маркеров. Изучали генетического разнообразие современных сортов льна, представленных в Госреестре сортов Российской Федерации, с помощью SSR-маркеров, определяли их филогенетические связи и проводили генетическую паспортизацию. Объектом исследования стали 82 сорта льна (60 сортов льна-долгунца, 22 сорта льна масличного) и 3 образца стародавних кряжевых льнов. Генетический анализ проводился методом ПЦР с использованием набора из 11 SSR-маркеров, меченых флуоресцентными красителями, с последующей детекцией продуктов на генетическом анализаторе. При исследовании сортов было обнаружено 50 аллелей в 11 локусах, количество аллелей на локус варьировало от 2 до 10, в среднем 4,55 аллелей. Каждый образец льна содержал свойственный только ему набор аллелей. Полученная SSR-база данных позволила разработать генетические паспорта каждого сорта в виде буквенно-цифрового кода. Также был проведен кластерный анализ и построена дендрограмма генетического подобия. Выявленные родственные связи между сортами согласуются с информацией об их происхождении.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Krivoruchko, A.Yu. | Likhovid, A.A. | Kanibolotskaya, A.A. | Saprikina, T.Yu. | Kukharuk, M.Yu. | Yatsyk, O.A.

Despite a large number of studies, methods of genomic and marker-associated selection are still not used in sheep breeding at an economically significant level. One of the important directions is the identification of genomic loci associated with indicators of interbreed variability, which can also be used as markers of animal breed. The research purpose is to search for polymorphisms in the Stavropol breed rams using Illumina 600K BeadChip biochips for the subsequent development of a panel for genotyping by sequencing using AgriSeq technology. The object of the study was rams aged 12 months (n=50). Primary processing of the results and their analysis, determination of the frequency of occurrence of polymorphisms, and assessment of the distribution of SNPs across genomic regions were performed in the Genome Studio 2.0 programme. The genome assembly Ovis_Aries_3.1 was used for SNP mapping. Single nucleotide polymorphisms were identified with a frequency of occurrence of homozygotes, both common and mutant variants, in the range of 0.2850-0.3149. Heterozygous variants of these substitutions were observed with a frequency of 0.381± 0.011. A total of 573 polymorphisms met the selected criteria. The detected SNPs were located along the entire length of the genotyped DNA region. The largest number of them were on chromosomes 1, 2, 3, 5 and X. The fewest polymorphisms were detected on chromosomes 18, 20, 21 and 24. The established set of substitutions will make it possible to effectively accurately identify animals in the process of breeding work, to take into account inbreeding in the population, etc. The proposed set of SNPs can be recommended for use in genotyping by next generation sequencing and customisation of SNP biochips. | Несмотря на достаточно большое количество исследований, методы геномной и маркер-ассоциированной селекции до сих пор не применяют в овцеводстве на хозяйственно значимом уровне. Одно из важных направлений – выявление локусов генома, связанных с показателями межпородной изменчивости, которые также можно будет использовать в качестве маркеров породной принадлежности животных. Цель исследований – поиск полиморфизмов у баранов ставропольской породы с использованием биочипов Illumina 600K BeadChip для последующей разработки панели для генотипирования секвенированием по технологии AgriSeq. Объектом исследования служили баранчики в возрасте 12 месяцев (n=50). Первичную обработку результатов и их анализ, определение частоты встречаемости полиморфизмов, оценку распределения SNP по регионам генома выполняли в программе Genome Studio 2.0. Для картирования SNP использовали сборку генома Ovis_Aries_3.1. Выявлены однонуклеотидные полиморфизмы с частотой встречаемости гомозигот, как распространенных, так и мутантных вариантов в диапазоне 0,2850…0,3149. Гетерозиготные варианты этих замен отмечали с частотой 0,381± 0,011. Всего выбранным критериям полиморфизмов соответствовало 573. Обнаруженные SNP были расположены по всей длине генотипируемой области ДНК. Наибольшее их количество находилось на 1, 2, 3, 5 и Х хромосомах. Меньше всего полиморфизмов выявлено на 18, 20, 21 и 24 хромосомах. Установленный набор замен позволит эффективно точно идентифицировать животных в процессе селекционной работы, проводить учет инбридинга в популяции и др. Предложенный набор SNP можно рекомендовать для использования в генотипировании секвенированием нового поколения и кастомизации SNP-биочипов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Koshkina, O.A. | Kharzinova, V.R. | Zinov'eva, N.A.

The Nenets reindeer breed is the most numerous in the Russian Federation, has unique adaptive abilities and plays a key role in the life of numerous peoples of the Far North. It is relevant to search for and implement various approaches that will expand and clarify the available data on the state of genetic diversity and phylogenetic relationships of regional populations of the Nenets breed. The aim of the work is to validate the developed a test system for the isolation of complete mitochondrial genomes of reindeer and to conduct a phylogenetic analysis of domestic populations of the Nenets breed in comparison with the wild tundra population of reindeer. The test system is based on the amplification of six overlapping mtDNA fragments, which, after purification and quality control of the libraries, were sequenced using NGS technology and performed on a miSeq device (Illumina, USA). Approbation of the test system for the isolation of complete mitochondrial genomes of the reindeer was carried out on representatives of six regional populations of the Nenets breed (n=63), as well as the wild reindeer (n=62). The length of the complete mitogenome was 16367 base pairs, with the following distribution of nucleotide frequencies: A - 33.70%, T - 30.04%, G - 13.16%, C - 23.10%. All studied individuals of the Nenets breed were characterized by high haplotype and nucleotide diversity (Hd = 0.993±0.005; pi = 0.00391±0.00068). No clear population clustering of the studied reindeer samples was observed. Phylogenetic analysis revealed the presence of four main clusters with a mixed composition according to the distribution of haplotypes on the median network. As a result of the study, a test system was developed and tested for the isolation of complete reindeer mitochondrial genomes, new data were obtained on the phylogenetic relationships not only of groups of the Nenets reindeer of various geographical origins, but also of domestic and wild populations of this animal species. | Ненецкая порода северного оленя – самая многочисленная в Российской Федерации, обладает уникальными адаптационными способностями и играет ключевую роль в жизни многочисленных народов Крайнего Севера. Актуален поиск и внедрение различных подходов, которые позволят расширить и уточнить имеющиеся данные о состоянии генетического разнообразия и филогенетических взаимоотношениях региональных популяций ненецкой породы. Цель исследований – выполнить апробацию разработанной тест-системы для выделения полных митохондриальных геномов северных оленей и провести филогенетический анализ домашних популяций ненецкой породы, в сравнении с дикой тундровой популяцией северных оленей. Разработанная тест-система основана на амплификации шести перекрывающихся фрагментов мтДНК, которые после очистки и проверки качества библиотек секвенировали с использованием технологии NGS на приборе miSeq (Illumina, США). Апробацию тест-системы выделения полных митохондриальных геномов северного оленя проводили на представителях шести региональных популяций ненецкой породы (n=63) и диких северных оленей (n=62). Длина полного митогенома составила 16367 пар оснований со следующим распределением частот нуклеотидов: А – 33,70%, Т – 30,04%, G – 13,16%, C – 23,10%. Все исследуемые особи ненецкой породы характеризовались высоким гаплотипическим и нуклеотидным разнообразием (Hd = 0,993±0,005; пи = 0,00391±0,00068). Четкой популяционной кластеризации исследуемых выборок северных оленей не наблюдали. Филогенетический анализ выявил наличие четырех основных кластеров со смешанным составом согласно распределению гаплотипов на медианной сети. Разработана и апробирована тест-система для выделения полных митохондриальных геномов северного оленя, получены новые данные о филогенетических связях группировок ненецкой породы северного оленя различного географического происхождения, а также домашних и диких популяций этого вида животных.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Sejtadzhieva, S.B. | Abdurashitov, S.F. | Zolotilov, V.A. | Nevkrytaya, N.V.

Essential-oil rose is a valuable crop widely used in production. The compliance with international quality standards is relevant for domestic production of essential-oil roses. An important stage of breeding essential-oil roses is assessment of genetic polymorphism, which is necessary for parental form selection, new samples evaluation. To protect property rights of such cultivars bred at the Research Institute of Agriculture of Crimea (RIAC) as 'Zolushka', 'Lan', 'Lada', 'Legrina', and 'Raduga' that are included in the "The state register of breeding achievements permitted for cultivation", it is necessary to develop genetic passports. An available method for genetic diversity study is inter-simple sequence repeats analysis also used for genetic passportization of crops. In 2022, to analyze RIAC essential-oil rose collection genetic diversity with ISSR-PCR, ten rose cultivars were studied, some of which originated from Bulgaria and the others were bred in Crimea. Eight most effective ISSR primers were selected, their optimal annealing temperature was determined and informative parameters such as PIC, EMR and MI were calculated. All primers showed 100% polymorphism of samples. According to ISSR-PCR data, genetic distances matrix was constructed and on its basis samples clustering by UPGMA method was carried out. Due to a dendrogram analysis, two Crimean cultivars 'Aura' and 'Zolushka' were included in the same group with cultivars from Bulgaria. That may indicate genetic proximity of these cultivars to Bulgarian ones which are the world quality standard. At the same time, 'Raduga' is genetically distanced from all other varieties. The work result is development of effective methodology for assessing RIAC essential oil rose collection genetic diversity using ISSR markers. | Роза эфиромасличная – ценная культура, находящая широкое применение в производстве. Для отечественного производства продукции из эфиромасличных роз необходимо соответствие международным стандартам качества. Важным этапом селекционной работы в области выведения эфиромасличных роз является оценка их генетического полиморфизма, необходимая для подбора родительских форм, изучения новых образцов. Для защиты прав собственности сортов селекции НИИ сельского хозяйства Крыма Радуга, Лань, Лада, Легрина и Золушка, включенных в "Государственный реестр селекционных достижений, допущенных к использованию", необходима разработка генетических паспортов. Доступным методом изучения генетического разнообразия является анализ межмикросателлитных последовательностей ISSR, также применяемый для генетической паспортизации культур. Для анализа генетического разнообразия образцов коллекции розы эфиромасличной НИИ СХ Крыма методом ISSR-ПЦР в 2022 г. было изучено десять сортов роз, часть из которых происходит из Болгарии, а другая – выведена в Крыму. В процессе исследования подобрано восемь наиболее эффективных ISSR-праймеров, определена их оптимальная температура отжига, а также рассчитаны информативные параметры, такие как PIC, EMR и MI. Все праймеры показали 100%-ный полиморфизм образцов. По данным ISSR-ПЦР была построена матрица генетических дистанций, на основании которой методом UPGMA была проведена кластеризация образцов. Анализ дендрограммы показал, что два крымских сорта Аура и Золушка вошли в одну группу с сортами из Болгарии. Это может говорить о генетической близости данных отечественных сортов к болгарским, являющимся мировым эталоном качества. При этом сорт Радуга является генетически удаленным от всех сортов. Результатом работы является разработка эффективной методики оценки генетического разнообразия образцов коллекции розы эфиромасличной НИИСХ Крыма с использованием ISSR-маркеров.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Naryshkina, E.N. | Sermyagin, A.A. | Nedashkovskij, I.S. | Lashneva, I.A. | Mikhajlova, M.E. | Todua, D.V. | Zinov'eva, N.A.

The spectrum of fatty acids (FA) in 245 milk samples from gene pool Red Gorbatov cows was studied. In the structure of the components of fatty acid composition in milk saturated FAs dominated - up to 62% (C16:0 - 0.794 g/100 g of milk). A high content of oleic acid (C18:1) of 1.126 g/100 g of milk was found in the group of monounsaturated fatty acids. Depending on the carbon chain length in the spring-summer period medium- and long-chain fatty acids of 1.165 and 1.433 g/100 g of milk, respectively, predominate in milk. The proportion of FA trans-isomers in milk was almost 2% (Cv is 90%), whereas FA contents have a positive correlation of above 0.7 against each other. Common clusters were found on BTA 9 and 22 for palmitic and myristic FAs; on BTA 20 for palmitic, myristic and oleic FAs; on BTA 25 for palmitic, myristic, stearic and oleic FAs. Common associations independent on the FA chain length and localized on the BTA 25 chromosome were found. The group of saturated, unsaturated FA and trans-isomers shows common QTL on BTA 8 (except for NFA, PUFA), 18 (except for MNFA), 20 (except for PUFA) and 25. The genes forming QTL on chromosomes BTA 1, 3, 17, 22, 25, 29: ERG, LRRC8D, RAPGEF2, TEX264, AUTS2, LIMK1, STT3A, ACRV1have been established for the myristic FA; for short-chain FA on chromosomes BTA 1, 13: PCOLCE2, ATRN; for medium-chain FA on BTA 25: HS3ST2; for trans-isomers - on chromosomes BTA 11, 20, 24:POLE4, C1QTNF3, CTNND2, DSG2. For all FA types and trans-isomers, the QTL region on the BTA 25 chromosome - LIMK1 and AUTS2 - is determined. These genes have a pleiotropic effect on some FA traits and are of interest for further study. The annotation of genes showed their conjugation with the traits of milk protein (LRRC8D), milk yield and milking rate (LRRC8D, CTNND2), eye area pigmentation (ATRN), somatic cells count (C1QTNF3), susceptibility to tuberculosis, content of pentadecylic acid in milk and level of thyroxine (CTNND2), as well as the amount of calcium in milk (HS3ST2). | Исследован спектр жирных кислот (ЖК) 245 образцов молока коров генофондной красной горбатовской породы. В структуре компонентов жирнокислотного состава молока преобладали насыщенные ЖК - до 62% (С16:0 - 0,794 г/100 г молока). В группе мононенасыщенных ЖК обнаружено высокое содержание олеиновой (С18:1) ЖК - 1,126 г/100 г молока. В зависимости от длины углеродной цепи в весенне-летний период в молоке преобладают средне- и длинноцепочечные ЖК - 1,165 и 1,433 г/100 г молока соответственно. Доля трансизомеров ЖК в молоке составила почти 2% (Сv - 90%). Между собой ЖК имеют положительную корреляцию более 0,7. Выявлены общие кластеры на BTA 9 и 22 - для пальмитиновой и миристиновой ЖК; на BTA 20 - для пальмитиновой, миристиновой и олеиновой ЖК; на BTA 25 - для пальмитиновой, миристиновой, стеариновой и олеиновой ЖК. Обнаружены общие ассоциации, не зависящие от длины цепи ЖК и локализованные на хромосоме BTA 25. Группа насыщенных, ненасыщенных ЖК и трансизомеров показывает общие QTL на BTA 8 (кроме НЖК, ПНЖК), 18 (кроме МНЖК), 20 (кроме ПНЖК) и 25. Для показателей миристиновой ЖК установлены гены, образующие QTL на хромосомах BTA 1, 3, 17, 22, 25, 29: ERG, LRRC8D, RAPGEF2, TEX264, AUTS2, LIMK1, STT3A, ACRV1; для короткоцепочечных ЖК - на хромосомах BTA 1, 13: PCOLCE2, ATRN; для среднецепочечных ЖК - на BTA 25: HS3ST2; для трансизомеров - на хромосомах BTA 11, 20, 24: POLE4, C1QTNF3, CTNND2, DSG2. Для всех типов ЖК и трансизомеров определен участок QTL на хромосоме BTA 25 - LIMK1 и AUTS2. Эти гены оказывают плейотропное действие на целый ряд показателей ЖК и представляют интерес для дальнейшего изучения. Аннотация генов показала сопряженность их с признаками молочного белка (LRRC8D), удоя и скорости доения (LRRC8D, CTNND2), с пигментацией области глаз (ATRN), количеством соматических клеток в молоке (C1QTNF3), восприимчивостью к туберкулезу, содержанием пентадециловой кислоты в молоке и уровнем тироксина (CTNND2), а также с количеством кальция в молоке (HS3ST2).

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Zinov'eva, S.A. | Kozlov, S.A. | Markin, S.S.

The research is devoted to the theoretical explanation and practical confirmation of the influence of the myostatin C/C gene polymorphism type on the performance of the racing career in Thoroughbred mares. In view of the diverse functions of the myostatin protein in the body and its influence on the growth of muscle tissue, bone matter formation, and carbohydrate metabolism, it is assumed that the corresponding type of myostatin gene polymorphism is accompanied by the manifestation of original features in the exterior of Thoroughbred mares that are fliers and their corresponding distance abilities. In the test group of 50 animals, a variant of the myostatin C/C gene polymorphism was registered in 20% of the population. The success of horse racing performances having the variant of the myostatin C/C gene polymorphism and with fliers' potential exactly at short distances, no more than 1400 m, was confirmed. It is revealed that the content of serum myostatin protein in blood controlled by the corresponding gene decreases with age. It is proposed to consider myostatin not only as a suppressor of muscle mass, but also as an age-related biomarker. It has been established that Thoroughbred mares of the flier group, carrying a variant of the myostatin C/C gene polymorphism, are characterized by a rather low performance in their racing career with a fairly high average number of performances – 6.9 per head, their success (victory index) is only 6.3%. The average length of distances at which victories were won does not exceed 1200 m, with the ratio of the length of distances of victories and losses being close to 1. Flier mares are competitive mainly during one season at the age of 2 years. The performance of their starts at age of 3 years, with rare exception, is close to zero, as the race length increases and competition with stronger distance horses increases. Among the flier mares, there are individuals that have greater distance versatility and are able to successfully perform over several racing seasons. | Исследования посвящены теоретическому обоснованию и практическому подтверждению влияния типа полиморфизма гена миостатина С/С на результативность скаковой карьеры кобыл чистокровной верховой породы. Учитывая многообразные функции белка миостатина в организме и его влияние на рост мышечной ткани и формирование костной массы, углеводный обмен, сделано предположение, что соответствующий тип полиморфизма гена миостатина сопровождается проявлением оригинальных черт в экстерьере кобыл чистокровной верховой породы, являющихся фляерами, и их соответствующими дистанционными способностями. В анализируемой группе из 50 голов вариант полиморфизма гена миостатина С/С зарегистрирован у 20% поголовья. Подтвердилась успешность скаковых выступлений лошадей с вариантом полиморфизма гена миостатина С/С и с задатками фляеров именно на коротких (не более 1400 м) дистанциях. Выявлено, что содержание сывороточного белка миостатина в крови, контролируемого соответствующим геном, снижается с возрастом. Предлагается рассматривать миостатин не только как супрессор мышечной массы, но и как возрастной биомаркер. Установлено, что для кобыл чистокровной верховой породы группы фляеров, несущих вариант полиморфизма гена миостатина С/С, характерна довольно низкая результативность скаковой карьеры при достаточно высоком среднем числе выступлений – 6,9 на голову, их успешность (индекс побед) составляет всего 6,3%. Средняя длина дистанций, на которых одержаны победы, не превышает 1200 м, при соотношении длины дистанций побед и проигрышей близким к 1. Кобылы-фляеры конкурентоспособны в основном в течение одного сезона в возрасте 2-х лет. Результативность их стартов в 3-летнем возрасте, за редким исключением, близка к нулю, поскольку возрастает длина скачек и повышается конкуренция с более сильными лошадьми – дистанционерами. Среди кобыл-фляеров встречаются особи, обладающие большей дистанционной универсальностью и способные успешно выступать в течение нескольких скаковых сезонов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Mikhajlova, Yu.A. | Tamarova, R.V.

Interest in studying the beta-casein locus is due to the fact that the products of some of its alleles cause serious abnormalities in the human body. Beta-casein (CSN2) is second in prevalence and content in cow's milk, second only to casein alpha-S1. Of 12 genetic variants of beta-casein, the greatest deteriorators of cow's milk are beta-CNA1 and beta-CNB. The main reason for unfavorable genetic changes is strict selection and the widespread use of a small number of elite bulls, artificial insemination of a large number of cows, multiple ovulation and embryo transplantation (MOET). The entry of the mutant beta-CNA1 allele into Russia occurs through the purchase of breeding material (animals, semen, embryos). In order to assess the possibility of domestic breeding enterprises for breeding to increase the cheese suitability and safety of milk, genotyping at the CSN2 (beta-casein) and CSN3 (kappa-casein) locus was monitored on a sample of Yaroslavl stud bulls and improved genotypes (n=60). It has been established that in Yaroslavl stud bulls, the frequency of occurrence of the desired A2A2 variant at the CSN2 locus (1%) is significantly lower than in bulls of improved genotypes (25%). In terms of the frequency of occurrence of complex desirable genotypes CSN2 and CSN3, Yaroslavl purebred bulls (33%) prevail over bulls of improved genotypes (13%). It is concluded that in order to increase competitiveness, domestic breeding enterprises need to increase the proportion of bulls with genotypes A2A2 (CSN2 locus), AB and BB (CSN3 locus). | Интерес к изучению локуса бета-казеина связан с тем, что продукты некоторых его аллелей вызывают серьёзные отклонения в организме человека. Бета-казеин (CSN2) является вторым по распространённости и по содержанию в молоке коров, уступая только казеину альфа-S1. Из 12 генетических вариантов бета-казеина наибольшими ухудшателями молока коров являются бета-CNА1 и бета-CNВ. Главная причина неблагоприятных генетических сдвигов – это жёсткая селекция и широкое использование небольшого количества элитных быков, искусственное осеменение большого массива коров, множественная овуляция и эмбриотрансплантация (МОЭТ). Поступление мутантного бета-CNА1 аллеля в Россию происходит за счёт покупки племенного материала (животные, семя, эмбрионы). С целью оценки возможности отечественных племенных предприятий для ведения селекции на повышение сыропригодности и безопасности молока, проведен мониторинг генотипирования по локусу CSN2 (бета-казеин) и CSN3 (каппа-казеин) на выборке быков-производителей ярославской породы и улучшенных генотипов (n=60). Установлено, что у быков-производителей ярославской породы частота встречаемости желательного варианта А2А2 по локусу CSN2 (1%) значительно ниже, чем у быков улучшенных генотипов (25%). По частоте встречаемости комплексных желательных генотипов CSN2 и CSN3 ярославские чистопородные быки (33%) преобладают над быками улучшенных генотипов (13%). Заключили, что отечественным племенным предприятиям для повышения конкурентоспособности необходимо увеличить долю быков с генотипами А2А2 (локус CSN2), АВ и ВВ (локус CSN3).

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Klimenko, I.A. | Shamustakimova, A.O. | Dushkin, V.A. | Mavlyutov, Yu.M. | Antonov, A.A.

Molecular-genetic certification is a powerful strategies and efficient addition to the traditional methods of variety testing and agricultural crops identification. The results of creation a system for identification and genetic certification of Russian red clover cultivars on the base of SSR and SRAP-markers are submitted for the first time. The seeds of 15 domestic varieties from gene pool collection of Federal Williams Research Center of Forage Production and Agroecology and 6 accessions of foreign breeding from Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources were used for investigations. The genome DNA was extracted from 7-day seedlings' tissue. Bulk DNA samples were formed from 30 individual genotypes per each variety. We used basic SDS-method in own modifications. PCR amplification was performed using 35 SSR from the Red Clover Marker Database, and 40 SRAP markers. A total of 476 PCR products were generated with SSR markers for 12 red clover varieties. A set of eight microsatellite loci was selected for identification the tested samples. With application of 40 SRAP markers, we selected 18 informative combinations for analysis of the red clover collection of 16 varieties. Total 812 PCR products were revealed and 85 (10.5%) among them were determined as polymorphic. The set of 7 informative markers were identified for samples differentiation on the base of SRAP analysis. Unique varieties-specific DNA fragments were sequenced (Evrogen Lab company, Russia) for validation the results of analysis. Nucleotide sequences, identifying Russian red clover varieties 'Trifon', 'Mars', 'Topas', 'Atlant', 'Tetraploidniy VIK', 'Meteor', 'VIK 77'. The data of DNA fingerprinting we used for development the molecular-genetic formulas representing microsatellite loci allele composition and polymorphism in exon and intron regions of genome. As a result of this study, 10 etalon genetic certificates were designed for Russian red clover varieties. | Генетическая паспортизация - мощное дополнение к традиционным методам сортоиспытания и эффективный способ идентификации сортов с.-х. растений. Цель работы - разработка системы определения сортовой принадлежности и эталонных генетических паспортов на основе SSR- и SRAP-маркеров для российских сортов клевера лугового. Материалом служили семена 15 российских сортов клевера лугового, полученные в ЦКП Биологические коллекции кормовых растений (ФНЦ ВИК им. В.Р. Вильямса) и 6 образцов зарубежной селекции из Коллекции генетических ресурсов ВИР. Геномную ДНК выделяли из суммарной навески растительной ткани 30 7-суточных проростков от каждого сорта. Использовали базовый SDS-метод с модификациями. Количественные и качественные показатели ДНК-проб определяли посредством электрофореза в агарозном геле, измерения концентрации и оценки чистоты. Генотипирование выполняли с помощью 35 микросателлитных маркеров и 40 комбинаций праймеров к SRAP-маркерам. При анализе 12 сортов клевера лугового с использованием 35 SSR-маркеров было получено 476 продуктов амплификации. Определены 8 пар SSR локуcов, идентифицирующих сорта в изучаемой выборке. Из 40 испытанных комбинаций праймеров, разработанных к SRAP-маркерам, выбрали 18 для анализа на расширенной коллекции из 16 российских и зарубежных сортов. С их использованием было выявлено 812 продуктов ПЦР, включая 85 полиморфных, что составило 10,5%. Набор из 7 SRAP-маркеров можно использовать для определения сортовой принадлежности. Для верификации результатов уникальные для соответствующих сортов фрагменты ДНК были секвенированы. Аннотированные нуклеотидные последовательности, идентифицирующие сорта Трифон, Марс, Топаз, Атлант, Тетраплоидный ВИК, Метеор, ВИК 77. Cоставлены молекулярно-генетические формулы, отображающие аллельный состав микросателлитных локусов и полиморфизм интрон-экзонных участков генома, разработаны 10 эталонных генетических паспортов для сортов клевера лугового российской селекции.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Kulintsev, V.V. | Shevkhuzhev, A.F. | Pogodaev, V.A. | Skorykh, L.N. | Sulyga, N.V.

The genetic polymorphism identification in genes associated with the formation of quantitative and qualitative parameters of beef cattle performance is of scientific and practical interest. The thyroglobulin gene polymorphisms were studied and their associations with the growth and body condition of beef cattle were determined. Molecular genetic studies of the thyroglobulin gene region made it possible to identify 6 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in its structure in Kalmyk cattle: g.8450238T more than G, g.8452338G more than C, g.8450286T more than G, g.8450269C more than T, g.8450226А more than C, g.8450224C more than G. Based on the results of allele frequencies distribution in animals of the test population, 3 genotypes were identified: TT, TG, GG in 2 polymorphisms g.8450286T more than G and g.8450238T more than G; GG, GC, CC in g.8452338G polymorphism more than C; CC, CT, TT in g.8450269C polymorphism more than T; AA, AC, CC in g.8450226A polymorphism more than C; CC, CG, GG in the g.8450224C polymorphism more than G. It was found that animals homozygous for mutant alleles were characterized by high live weight in 4 out of 6 detected polymorphisms in the TG gene. The carriers of the homozygous CC genotype of the g.8452338G polymorphism more than C were characterized by the highest live weight, exceeding individuals with the GG and CG genotypes by 9.6 and 6.8%. Bulls with the TT genotype of the g.8450269C polymorphism more than T also had a higher value of the studied indicator than individuals of the CC and CT genotypes by 14.2 and 21%. The presence of a genotype association of single nucleotide polymorphisms in the TG gene with exterior data of beef cattle showed some heterogeneity of results. The studies have resulted in providing data on the genetic structure and data on the presence of a genotype association of single nucleotide polymorphisms in the TG gene with traits of beef performance in the Kalmyk cattle population. | Выявление генетического полиморфизма в генах, связанных с формированием количественно-качественных параметров мясной продуктивности крупного рогатого скота представляет научный и практический интерес. Изучены полиморфизмы гена тиреоглобулина, определены их ассоциации с показателями роста и телосложения мясного скота. Проведенные молекулярно-генетические исследования участка гена тиреоглобулина позволили выявить в его структуре у крупного рогатого скота калмыцкой породы 6 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP): g.8450238T больше G, g.8452338G больше C, g.8450286T больше G, g.8450269C больше T, g.8450226А больше C, g.8450224C больше G. По результатам распределения частот аллелей у животных исследуемой популяции определены по 3 генотипа: ТТ, TG, GG в двух полиморфизмах g.8450286T больше G и g.8450238T больше G; GG, GС, СС в полиморфизме g.8452338G больше C; СС, СТ, ТТ в полиморфизме g.8450269C больше T; АА, АС, СС в полиморфизме g.8450226А больше C; СС, СG, GG в полиморфизме g.8450224C больше G. Установлено, что животные, гомозиготные по мутантным аллелям, в 4 среди 6 обнаруженных полиморфизмов в гене TG характеризовались высоким значением живой массы. Наибольшей живой массой отличались носители гомозиготного СС-генотипа полиморфизма g.8452338G больше C, превосходящие особей с генотипами GG и CG на 9,6 и 6,8%. Бычки с генотипом ТТ полиморфизма g.8450269C больше T так же имели большее значение изучаемого показателя, чем особи СС- и СТ- генотипов, на 14,2 и 21%. Наличие ассоциации генотипов однонуклеотидных полиморфизмов в гене TG с экстерьерными данными мясного скота показало некоторую неоднородность результатов. В результате исследований получены сведения о генетической структуре и данные о наличии ассоциации генотипов однонуклеотидных полиморфизмов в гене TG с признаками мясной продуктивности в популяции крупного рогатого скота калмыцкой породы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation