About the problem of Rhododendron L. genus phylogeny based on ITS1-ITS2 spacers sequence studies | К вопросу филогении видов рода Rhododendron L. на основании исследований последовательности спейсеров ITS1-ITS2

About the problem of Rhododendron L. genus phylogeny based on ITS1-ITS2 spacers sequence studies | К вопросу филогении видов рода Rhododendron L. на основании исследований последовательности спейсеров ITS1-ITS2

2014

Baranova, T.V., Voronezh State Univ.

Russian. Исследован участок ITS1-ITS2 (Internal Transcribed Spacer, между 18Sи 25S рибосомальными генами, включающий 5.8S ген) последовательностей ядерной ДНК рода Rhododendron L. Работа предусматривала проведение дополнительного анализа ITS1-ITS2 последовательностей, выявление филогенетических связей и обобщение данных по филогении видов рода Rhododendron L. по результатам исследований других авторов с использованием молекулярных и классических методов. Анализ последовательности рибосомального спейсера выявил низкую вариабельность между видами рода Rhododendron серии Dauricum. Rh. mucronulatum Turcz., Rh. dauricum L. и некоторые другие изучаемые виды имели идентичную нуклеотидную ITS1-ITS2 последовательность, указывающую на искусственность разделения их в отдельные виды. Обнаружены виды, отличающиеся друг от друга на 1–2 или несколько нуклеотидов, что дает возможность предполагать их филогенетическую общность и не исключает принадлежности к одной таксономической единице. По результатам анализа ITS1-ITS2 последовательностей выделено 16 групп видов со сходной последовательностью ITS1-ITS2. При сравнении морфологических описаний некоторых видов рода Rhododendron L. со сходной последовательностью ITS1-ITS2 отмечаются их небольшие различия. На основании результатов молекулярно-генетического анализа предполагается принадлежность Rhododendron dauricum L., Rh. ledebourii Pojark., Rh. sichotense Pojark. и Rh. mucronulatum Turcz. к одному виду. Установление филогенетических связей на основе последовательностей ITS1-ITS2 применимо только в отношении сильно обособленных видов рода Rhododendron L. Для уточнения филогенетических связей рода Rhododendron L. необходимо расширить сравнительный анализ ДНК-последовательности для других универсальных генов или сложных повторов (ретротранспозоны).

Show more [+]

Less [-]

English. The first and second internal transcribed spacer (ITS1 and ITS2) regions of the ribosomal DNA and 5.8S rRNA gene from Rhododendron L. were analysed. This study reveals phylogenetic relationships and collation of data on the phylogeny of the genus Rhododendron L. according to the research of other authors using molecular and classical methods. Sequence analysis of ribosomal spacer showed low variability between species of the genus Rhododendron series of Dauricum. Rh. mucronulatum Turcz., Rh. dauricum L. and some other studied species had identical nucleotide ITS1-ITS2 sequence indicating the artificial division into separate species. Found species differing from each other by 1-2 or few nucleotides, which allows assuming their common phylogenetic affiliation or excluding one taxonomic unit. According to the analysis of ITS1-ITS2 sequences identified 16 groups of species with similar sequence ITS1-ITS2. When comparing the morphological descriptions of some species of the genus Rhododendron L. with a similar sequence of ITS1-ITS2 marked their small differences. Based on the results of molecular genetic analysis it has been assumed that Rhododendron dauricum L., Rh. ledebourii Pojark, Rh. sichotense Pojark and Rh. mucronulatum Turcz belong to the same species. The establishment of phylogenetic relations based on sequence ITS1-ITS2 is applicable only in respect of highly isolated species Rhododendron L. To clarify the phylogenetic relationships of the genus Rhododendron L. necessary to expand the comparative analysis of the DNA sequences of universal genes or complex repeats elements (retrotransposons).

Show more [+]

Less [-]

Bibliographic information

Siberian Journal of Forest Science

Issue

6

ISSN

2311-1410

Other Subjects

Dna sequence; Marqueur genetique; Federacion de rusia; Federation de russie; Marcadores geneticos; Sequence d'adn