AGRIS - 

2023

Naumov, N.M. | Popov, V.S. | Svazlyan, G.A.

The effect of a metabolite-synbiotic suspension on the intestinal microbiome of suckling calves has been under study. Based on the principle of paired analogues, two groups of new-born Black-and-white calves, 10 heads each, were composed. For the first 25 days of life, the animals were kept in a dispensary calf barn, then transferred to individual houses for outdoor housing. Individuals of the control group were kept according to the standard design on the farm, fed only the main diet, which included whole milk and hay infusion throughout the entire experiment, from the third decade – oats, salt and chalk, from the fourth decade – compound feed and hay. Animals of the experimental group from days 7 to 42 of life received daily, in addition to the main diet, a metabolite-synbiotic suspension in the amount of 15 mL/kg of live weight. The supplement included a symbiotic complex of bifidobacteria and lactobacilli in an amount of at least 10E7 CFU/mL, their metabolites, as well as components of the nutrient medium. In calves who consumed the dietary supplement,on the 42nd day of life compared to the 7th day , the number of Proteus decreased by 1.2x10E3 CFU/g or 18.75%, Staphylococcus – by 1.2x10E4 CFU/g or 16.22%. By the 42nd day of life in calves receiving the supplement, 99.12% were lactobacilli (56.26% – 4.2x10E9 CFU/g) and bifidobacteria (42.86% – 3.2x10E9 CFU/g), while in the control calves the share of Escherichia coli was 90.44%, and lactobacilli and bifidobacteria accounted for 5.47% and 0.66%, respectively. The consumption of a dietary supplement stimulated colonisation resistance against microorganisms of the genus Salmonella and Candida, which were found only in the fecal matter of animals in the control group: in the time range from 28 to 42 days, the number of Salmonella increased by 34.78%, Candida – by 18.35%. | Исследования проводили с целью изучения влияния метаболитно-синбиотической суспензии на микробиом кишечника телят молочного периода. По принципу парных аналогов были сформированы две группы из новорожденных телят черно- пестрой породы по 10 голов в каждой. Первые 25 дней жизни животных содержали в условиях телятника профилактория, затем переводили в индивидуальные домики на уличное содержание. Особей контрольной группы содержали по принятой в хозяйстве схеме, скармливали только основной рацион, включавший на протяжении всего опыта цельное молоко и сенной настой, с третьей декады – овес, соль и мел, с четвертой декады – комбикорм и сено. Животные опытной группы с 7 по 42 день жизни ежедневно получали дополнительно к основному рациону метаболитно-синбиотическую суспензию в количестве 15 мл/кг живой массы. Добавка включала в себя симбиотический комплекс бифидо- и лактобактерий в количестве не менее 10E7 КОЕ/мл, их метаболиты, а также компоненты питательной среды. У телят, потреблявших биологически активную добавку, на 42-е сутки жизни количество Proteus уменьшилось по сравнению с 7-ми сутками на 1,2x10E3 КОЕ/г, или 18,75%, Staphylococcus – на 1,2x10E4 КОЕ/г, или 16,22%. К 42-му дню жизни у телят, получавших добавку, 99,12% приходилось на лакто- (56,26% – 4,2x10E9 КОЕ/г) и бифидобактерии (42,86% – 3,2x10E9 КОЕ/г), в то время как в контроле доля Escherichia coli составляла 90,44%, а на лакто- и бифидобактерии приходилось 5,47% и 0,66% соответственно. Применение биологически активной добавки стимулировало колонизационную резистентность в отношении микроорганизмов рода Salmonella и Candida, которые обнаруживались только в фекалиях животных контрольной группы: во временном диапазоне с 28 по 42 сутки численность Salmonella увеличивалась на 34,78%, Candida – на 18,35%.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Fomichev, Yu.P.

В процессе выращивания у молодняка часто возникают желудочно-кишечные и бронхо-легочные заболевания. С целью формирования у них в молочный период выращивания продуктивного здоровья были сформированы 2 группы телят черно-пестрой породы в возрасте 10 дней по 10 голов. Телятам опытной группы до 4 мес к основному рациону добавляли водорастворимый арабиногалактан (пребиотик) в дозе 75 мг/кг, дигидрокверцетин (антиоксидант) - 1 мг/кг живой массы в день и комплекс биоэлементов в мицеллярной форме - в молоко и ЗЦМ по 0,5 мг/л. До 6 мес молодняк кормили по общей схеме выращивания. Животные контрольной группы получали только основной рацион. В результате у телят опытной группы произошли нормализация и повышение интенсивности белкового, азотистого, липидного, углеводного, энергетического обмена, улучшалось функциональное состояние печени, и повысилась патогенетическая резистентность, что в целом положительно сказалось на формировании продуктивного здоровья и приросте. У молодняка опытной группы в возрасте 4 мес отмечалось повышение в сыворотке крови общего белка на 10,76%, в том числе альбумина - на 12,8%, снизилось содержание билирубина на 10,8%, повысилась концентрация глюкозы на 28,7%, уменьшилось количество малонового диальдегида на 26,0% при одновременном повышении антиоксидантной защиты плазмы крови на 10,8%, повысились активность щелочной фосфатазы на 13,1%, содержание кальция - на 4,9%, фосфора - на 9,0%, бактерицидная активность сыворотки крови - на 30,5% и лизоцимная активность - на 77,3%. У телят контрольной группы были выявлены в содержимом толстой кишки колонии коагулазонегативных стафилококков, гемолитической кишечной палочки Escherichia coli, дрожжевые грибы рода Candida и снижение кишечной палочки с нормальной ферментативной активностью. За 6 мес выращивания общий прирост у телят опытной группы составил 85 кг, что было выше на 8,9%, чем в контроле. | In the process of rearing, young animals often develop gastrointestinal and broncho-pulmonary diseases. To form productive health in them during the milk growing period, 2 groups of Black-and-White calves were formed at the age of 10 days, 10 heads each. The calves of the experimental group till 4 months water-soluble arabinogalactan (prebiotic) at a dose of 75 mg/kg, dihydroquercetin (antioxidant) - 1 mg/kg of body weight per day added to the main diet and a complex of bioelements in micellar form - to milk and 0.5 mg/l of milk replacer were. Till 6 months, the young animals were fed according to the general rearing scheme. Animals in the control group received only the basic diet. As a result, the calves of the experimental group normalized and increased the intensity of protein, nitrogen, lipid, carbohydrate, energy metabolism, improved the functional state of the liver and increased pathogenetic resistance, which generally had a positive effect on the formation of productive health and growth. In young animals of the experimental group at the age of 4 months, there was an increase in total protein in the blood serum by 10.76%, including albumin - by 12.8%, the content of bilirubin decreased by 10.8%, the concentration of glucose increased by 28.7%, the amount of malondialdehyde decreased by 26.0% while increasing the antioxidant protection of blood plasma by 10.8%, increased alkaline phosphatase activity by 13.1%, calcium content - by 4.9%, phosphorus - by 9.0%, bactericidal blood serum activity - by 30.5% and lysozyme activity - by 77.3%. In the calves of the control group, colonies of coagulase-negative staphylococci, hemolytic Escherichia coli and yeast fungi of the genus Candida and a decrease in Escherichia coli with normal enzymatic activity were detected in the colon contents. For 6 months of growing, the total gain in the calves of the experimental group was 85 kg, which was higher by 8.9% than in the control.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Lorengel', T.I. | Shabanova, E.O.

The purpose of the research is to study the enterobiocenosis of the gastrointestinal tract of piglets with diarrheal symptom complex and to determine the sensitivity of the isolated microflora to antibacterial drugs. The objects of the study were piglets under the age of 2 months of Large White breed and Landrace with a diarrheal symptom complex. Fecal samples obtained from the rectum with a sterile swab served as material for the research. The studies were carried out by the conventional microbiological methods. It has been found that the leading role in the enterobiocenosis of the gastrointestinal tract of piglets with diarrheal symptom complex belongs to enterobacteria. Microbial associations of microorganisms were isolated from 38 samples (76%) of faeces obtained from sick piglets. Among the isolated cultures, Escherichia coli (O26, O8, O33) and Proteus vulgaris prevailed, both in monoculture and in various combinations with other conditionally pathogenic microorganisms. Associations of microorganisms were represented by: Escherichia coli + Proteus vulgaris (28.9%), Escherichia coli + Enterobacter aerogenes (23.7%), Escherichia coli + Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis + Enterococcus fecalis and Klebsiella pneumoniae + Citrobacter freundii (10.5% each) and Escherichia coli + Enterococcus fecalis (7.9%). Combinations represented by 3 types of opportunistic microorganisms were least identified: Proteus mirabilis + Klebsiella pneumonia + Citrobacter freundii and Escherichia coli + Proteus vulgaris + Enterococcus fecalis 5.3% and 2.6%, respectively. In the monoculture, Escherichia coli prevailed over other types of microorganisms; the frequency of its isolation was 41.7%. In addition to E. coli, Proteus vulgaris (25%), Klebsiella pneumoniae (25%) and Citrobacter freundii (8.3%) were isolated in monoculture. Most of the isolated microorganisms showed high sensitivity to antibacterial drugs from the groups of cephalosporins and fluoruquinolones. | Цель исследований – изучение энтеробиоценоза желудочно-кишечного тракта поросят с симптомокомплексом диареи и определение чувствительности выделенной микрофлоры к антибактериальным препаратам. Объектом исследования являлись поросята (возраст от рождения до 2-х месяцев) крупной белой породы и ландрас с диарейным симптомокомплексом. Материалом для исследований служили пробы фекалий, полученные стерильным тупфером из прямой кишки. Исследования проводились общепринятыми микробиологическими методами. Установлено, что ведущая роль в энтеробиоценозе желудочно-кишечного тракта поросят с диарейным симптомокомплексом принадлежит энтеробактериям. Микробные ассоциации микроорганизмов выделены из 38 проб (76%) фекалий, полученных от больных поросят. Среди выделенных культур преобладали Escherichia coli (О26, О8, О33) и Proteus vulgaris как в монокультуре, так и в различных сочетаниях с другими условно-патогенными микроорганизмами. Ассоциации микроорганизмов были представлены: Escherichia coli + Proteus vulgaris (28,9%), Escherichia coli + Enterobacter aerogenes (23,7%), Escherichia coli + Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis + Enterococcus fecalis и Klebsiella pneumoniae + Citrobacter freundii (10,5% каждая) и Escherichia coli + Enterococcus fecalis (7,9%). Реже изолировали сочетания, представленные 3 видами условно-патогенных микроорганизмов: Proteus mirabilis + Klebsiella pneumonia + Citrobacter freundii и Escherichia coli + Proteus vulgaris + Enterococcus fecalis 5,3% и 2,6% соответственно. В монокультуре преобладала Escherichia coli среди других видов микроорганизмов, частота ее выделения – 41,7%. Кроме кишечной палочки, в монокультуре изолировали Proteus vulgaris (25%), Klebsiella pneumoniae (25%) и Citrobacter freundii (8,3%). Большинство изолированных микроорганизмов проявили высокую чувствительность к антибактериальным препаратам из групп цефалоспоринов и фторхинолонов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Duskaev, G.K. | Leushina, S.G. | Rusakova, E.A. | Deryabin, D.G.

Gamma-lactones are natural compounds that have antibacterial, fungicidal, antifeedant, growth-regulating, insecticidal, attractant, and antitumor activity and can be used as an alternative to antibiotics. Gamma-octalactone was isolated from an Eucalyptus viminalis extract. Its effect on colonization of the intestine with pathogenic microflora was studied when they were added to the diet of broiler chickens. The ileum microbiome was evaluated by sequencing. Total DNA from samples of intestinal contents was isolated using a FastDNA SPIN Kit for Faeces. During the experiment, broiler chickens were divided into 3 groups of 30 heads each. The control group received only the basic diet, the 1st experimental group received gamma-octalactone in a dose of 0.05 to the basic diet, and the 2nd group received 0.20 ml/kg of live weight/day. When analyzing the bacterial profile of the samples of the ileum contents of broiler chickens of the control group 4 phyla of eubacteria were isolated, in chickens of the 1st group - 8 phyla, in chickens of the 2nd group - 5 phyla. The Firmicutes phylum was determined to be dominant in all groups, whose share in the groups was 86.1; 93.13; 94.55%, respectively. The Simpson and Shannon indices were used in the analysis of biological diversity. The Simpson index indicates the dominance of one or more bacterial species; in the control group chickens it was 0.08; 2-nd group - 0.22; 1st group - 0.30. The Shannon Index reflects the complexity of the structure of the cenosis, the greater its diversity, the greater the index. The groups are distributed in the following order: control - 3.15; 2-nd group - 2.18; 1-st group - 2.15. The results obtained allow concluding that the chickens of the experimental groups showed an increase in the number of representatives of the Firmicutes phylum; chickens of the 1st group - a decrease in the content of the genus Streptococcus by 4.21%; in chickens of the 2-nd group - an increase in representatives of the Lactobacillus and Turicibacter genera by 10% relative to the control group. | Гамма-лактоны - натуральные соединения, которые обладают антибактериальной, фунгицидной, антифидантной, рострегулирующей, инсектицидной, аттрактантной, противоопухолевой активностью и могут использоваться в качестве альтернативы антибиотикам. Гамма-октанолактон был выделен из экстракта Eucalyptus viminalis. Исследовали его влияние на заселение кишечника патогенной микрофлорой при добавлении в рацион цыплят-бройлеров. Оценку микробиома подвздошного отдела кишечника осуществляли методом секвенирования. Тотальную ДНК из образцов содержимого кишечника выделяли при помощи набора FastDNA SPIN Kit for Faeces.В ходе эксперимента цыплят-бройлеров разделили на 3 гр. по 30 гол. в каждой. Контрольная группа получала только основной рацион, 1-я опытная гр. к основному рациону получала гамма-октанолактон в дозе 0,05, 2-я гр. - 0,20 мл/кг живой массы/сут. При анализе бактериального профиля образцов содержимого подвздошной кишки цыплят-бройлеров контрольной группы было выделено 4 филума эубактерий, у цыплят 1-й гр. - 8 филумов, у цыплят 2-й гр. - 5 филумов. Доминирующим во всех группах был определен филум Firmicutes, доля которого в группах составила 86,1; 93,13; 94,55% соответственно. При анализе биологического разнообразия были использованы индексы Симпсона и Шеннона. Индекс Симпсона указывает на доминирование одного или нескольких видов бактерий; у цыплят контрольной группы он составил 0,08; 2-й гр. - 0,22; 1-й гр. - 0,30. Индекс Шеннона отображает сложность структуры ценоза, чем больше его разнообразие, тем больше индекс. Группы распределяются в следующем порядке: контроль - 3,15; 2-я гр. - 2,18; 1-я гр. - 2,15. Полученные результаты позволяют сделать вывод, что у цыплят опытных групп отмечен рост численности представителей филума Firmicutes; у цыплят 1-й гр.- снижение содержания рода Streptococcus на 4,21%; у цыплят 2-й гр. - увеличение представителей родов Lactobacillus и Turicibacter на 10%относительно контрольной группы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Prasolova, O.V. | Malik, N.I. | Soltynskaya, I.V. | Krylova, E.V. | Malik, E.V. | Bogomazova, A.N.

Результаты метагеномного анализа выявили высокое филогенетическое и таксономическое разнообразие микробного сообщества как просветной, так и мукозной микрофлоры кишечного микробиома птицы. Анализ таксономической структуры сравниваемых микробиомов показал как сходство, так и различия в таксономическом разнообразии и относительном обилии (%) бактерий сравниваемых микробиомов на уровне порядка, класса, рода. На уровне типов в просветном и мукозном микробиоме кишечника птицы идентифицировано 24 таксономические категории, на уровне класса 35, на уровне порядка 75, на уровне семейства 168, на уровне рода – 350. Основную долю микробного сообщества просветного и мукозного микробиома составляли микроорганизмы, относящиеся к типам Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria Cyanobacteria и Bacteroidetes. Сравнение биологического разнообразия толстокишечного и мукозного микробиомов на уровне филума показало, что относительная величина Proteobacteria по отношению к Firmicutes в мукозном микробиоме было в 3,25 раза выше, а соотношение Firmicutes к Bacteroidetes в толстокишечном микробиоме в 3,98 раза выше, чем в мукозном. На уровне рода различия в составе микробиомов проявились большей относительной долей (по убывающей) в просветном микробиоме представителей рода Lactobacillus, Candidatus Arthromitus, Romboutsia, Gallibacterium, Campylobacter, Enterococcus, и представителей рода Acinetobacter, Staphylococcus, Bacillus и Bradyrhizobium в мукозном. Углублённое изучение кишечной микробиоты с использованием приемов культивирования и высокотехнологичных методов идентификации микроорганизмов с учетом результатов метагеномного анализа позволяет значительно расширить представление о видовом многообразии микробиомов и функциях представителей различных таксонов в поддержании здоровья птицы, а также для формирования переписи представителей нормальной микрофлоры птицы. | The results of the metagenomic analysis revealed a high phylogenetic and taxonomic diversity of the microbial community of both luminal and mucosal microflora of the bird intestinal microbiome. Analysis of the taxonomic structure of the compared microbiomes showed both similarities and differences in the taxonomic diversity and relative abundance (%) of bacteria of the compared microbiomes at the level of order, class, and genus. At the type level, 24 taxonomic categories were identified in the luminal and mucosal intestinal microbiome of birds, at the class level 35, at the order level 75, at the family level 168, at the genus level 350. The main share of the microbial community of the luminal and mucosal microbiome was made up of microorganisms belonging to the Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria Cyanobacteria, and Bacteroidetes types. Comparison of the biological diversity of the colonic and mucosal microbiomes at the phylum level showed that the relative value of Proteobacteria in relation to Firmicutes in the mucosal microbiome was 3.25 times higher, and the ratio of Firmicutes to Bacteroidetes in the colonic microbiome was 3.98 times higher than in the mucosal one. At the genus level, differences in the composition of microbiomes were manifested by a greater relative share (in decreasing order) in the luminal microbiome of representatives of the genus Lactobacillus, Candidatus Arthromitus, Romboutsia, Gallibacterium, Campylobacter, Enterococcus, and representatives of the genus Acinetobacter, Staphylococcus, Bacillus and Bradyrhizobium in the mucosal microbiome. An in-depth study of the intestinal microbiota using cultivation techniques and high-tech methods for identifying microorganisms, in view of the results of metagenomic analysis, can significantly expand the understanding of the species diversity of microbiomes and the functions of representatives of various taxa in maintaining bird health, as well as to form a census of representatives of normal bird microflora.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Jyldyrym, E.A. | Grozina, A.A. | Vertiprakhov, V.G. | Il'ina, L.A. | Filippova, V.A. | Laptev, G.Yu. | Ponomareva, E.S. | Dubrovin, A.V. | Kalitkina, K.A. | Molotkov, V.V. | Akhmatchin, D.A. | Brazhnik, E.A. | Novikova, N.I. | Tyurina, D.G.

The introduction of feed additives into contaminated feed is a strategy for restoring the intestinal microbiome under mycotoxicoses. The research goal was to identify changes in the chyme microbiota and its functional annotation after 14-day exposure to T-2 toxin, artificially introduced with feed, and under the influence of the feed additive Zaslon 2+, fed alone and in combination with the proteolytic drug Axtra Pro. Broiler chickens of the Smena 8 cross aged 33 days were assigned into four groups of 5 birds each. Control group I received a basal diet (BD) without T-2 toxin, group II was fed with BD added with T-2 toxin (200 µg/kg) (BD + T-2), group III - BD + T-2 + additive Zaslon 2+ (1 g/kg feed) (BIOTROF Ltd, Russia), group IV - BD + T-2 + additive Zaslon 2+ added with proteolytic preparation Axtra Pro (DuPont de Nemours, Inc., USA) (100 mg/kg feed). Zaslon 2+ contains diatomite, two Bacillus strains, and a mixture of natural essential oils (eucalyptus, thyme, garlic, and lemon). At the end of the experiment, the caecum content was sampled from three broilers of each group. NGS-sequencing revealed changes in biodiversity and composition of the gut microbiota at the level of phyla. I.e., in group II, the population of superphylum Actinobacteriota and phylum Proteobacteria increased 1.8 and 3.5 times, respectively while the superphylum Desulfobacterota, on the contrary, decreased 2.2 times. In group IV, the abundance of superphylum Actinobacteriota and phylum Proteobacteria also increased compared to group I, while in group III no change occured. The members of superphylum Verrucomicrobiota completely disappeared in groups II and IV, while in group I they accounted for 14.1±0.8%. In group III compared to group I, number of bacteria of the genus Lactobacillus increased. Pathogenic microorganisms which were absent in group I appeared in group II. In groups III and IV, these pathogens were either absent or were present in a significantly smaller amount. | Одной из стратегий восстановления микробиома и борьбы с микотоксикозами стало введение добавок в загрязненные корма. Цель работы - выявление изменений микробиоты химуса и ее функциональная аннотация после 14-суточного воздействия Т-2 токсина и под влиянием кормовой добавки Заслон 2+, применяемой отдельно и в сочетании с протеолитическим препаратом Axtra Pro. Опыты проводили на цыплятах-бройлерах кросса Смена 8 (с 33- до 47-суточного возраста). Птицу разделили на четыре группы по 5 гол. в каждой: I группа (контроль) получала основной рацион (ОР) без введения Т-2 токсина, II группа - ОР с добавлением Т-2 токсина (200 мкг/кг), III - ОР с добавлением Т-2 токсина (200 мкг/кг) и кормовую добавку Заслон 2+, состоящую из сорбирующего материала диатомита, двух культур бактерий Bacillus spp., смеси натуральных эфирных масел эвкалипта, чабреца, чеснока и лимона (ООО БИОТРОФ, Россия) (1 г/кг корма), IV - ОР с добавлением Т-2 токсина (200 мкг/кг), кормовую добавку Заслон 2+ и ферментный препарат с протеолитической активностью Axtra Pro (DuPont de Nemours, Inc., США) (100 мг/кг корма). При проведении NGS-секвенирования микробиома кишечника было показано, что в кишечнике у бройлеров из II группы обилие бактерий суперфилума Actinobacteriota и филума Proteobacteria возрастало соответственно в 1,8 и 3,5 раза, суперфилума Desulfobacterota - напротив, снижалось в 2,2 раза. У птицы из IV группы количество бактерий суперфилума Actinobacteriota и филума Proteobacteria также возрастало по сравнению с I группой, тогда как в III группе подобных изменений не отмечали. Представители суперфилума Verrucomicrobiota полностью исчезали во II и IV группах, но в I группе присутствовали в значительном количестве. У птицы из III группы по сравнению с I группой повышалась численность бактерий рода Lactobacillus. Во II группе появлялись отсутствовавшие в контроле патогенные микроорганизмы. В III и IV группах эти патогены либо отсутствовали, либо были представлены в значительно меньшем количестве.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Sukhinin, A.A. | Krasnopeev, A.Yu. | Gorshkova, A.S. | Belykh, O.I. | Lipko, I. | Potapov, S.A. | Tikhonova, I.V. | Batomunkuev, A.S. | Loginov, S.N.

There has been studied the intestinal microbiome of 12 animals divided into 2 groups (calves and adult cows). Bacteria of taxa Actinobacteriota, Bacteroidota, Campilobacterota, Chloroflexi, Cyanobacteria, Desulfobacterota, Fibrobacterota Firmicutes, Fusobacterota, Halobacterota, Elusimicrobiota, Euryarchaeota, Proteobacteria, Patescibacteria, Spirochaetota, Thermoplasmatota, Verrucomicrobia and a small number of unclassified bacteria were identified. It has been shown that the intestinal microbiome of calves differs from that of adult cows, and diarrhea affects the composition of the intestines of young animals, reducing the biodiversity of the inhabitants. In calves, the Shannon index ranged from 3.18 to 4.3, in adult animals from 4.41 to 5.24. Comparison of the intestonal microbiomes of healthy calves and calves with diarrhea was carried out using the Hutcheson t-test, the difference was significant (P is less than 0.0001). The main phyla of calves' intestinal bacteria are Bacteroidota and Firmicutes, moreover, the diversity and number of microbial lines of Bacteroidota increases with age. Firmicutes of the families Lactobacillae and Lactobacillales_fa, as well as the family Selenomonadaceae, are markers of the juvenile age of animals. Calf-specific Bacteroidota are representatives of Tannerellaceae and Marinifilaceae. The microbiome of adult animals at the phylum level is characterized by the presence of bacteria Verrucomicrobiota, Desulfobacterota, archaea Methanobacteria and Methanomicrobia. At the level of families and genera, the formed microbiome of cows has unique representatives of Bacteroidota and Firmicutes. Thus, there have been obtained data on the main representatives of healthy intestinal bacteria of cows and calves. This information can be used to diagnose the physiological state of animals, as well as in environmental studies to detect fecal environmental pollution. | Исследован микробиом кишечника 12 животных, разделенных на 2 гр. (телята и взрослые коровы). Выявлены бактерии таксонов Actinobacteriota, Bacteroidota, Campilobacterota, Chloroflexi, Cyanobacteria, Desulfobacterota, Fibrobacterota, Firmicutes, Fusobacterota, Halobacterota, Elusimicrobiota, Euryarchaeota, Proteobacteria, Patescibacteria, Spirochaetota, Thermoplasmatota, Verrucomicrobia и небольшое количество неклассифицированных микроорганизмов. Показано, что микробиом кишечника телят отличается от микробиома взрослых коров, а диарея влияет на состав кишечника молодых животных, снижая биоразнообразие обитателей. У телят индекс Шеннона составлял от 3,18 до 4,3, у взрослых животных от 4.41 до 5,24. Сравнение микробиомов кишечника здоровых телят и телят с диареей проведено с помощью t-критерия Хатчесона, разница оказалась значительной (P is less than 0.0001). Основные филумы бактерий кишечника телят - Bacteroidota и Firmicutes, причем разнообразие и количество микробных линий Bacteroidota увеличивается с возрастом. Фирмикуты семейств Lactobacillae и Lactobacillales_fa, а также семейство Selenomonadaceae являтся маркерами ювенильного возраста животных. Специфичные для телят Bacteroidota – представители Tannerellaceae и Marinifilaceae. Микробиом взрослых животных на уровне филумов отличается присутствием бактерий Verrucomicrobiota, Desulfobacterota, архей Methanobacteria и Methanomicrobia. На уровне семейств и родов, сформировавшийся микробиом коров имеет уникальных представителей Bacteroidota и Firmicutes. Таким образом, получены данные об основных представителях бактерий здорового кишечника коров и телят, которые можно использовать для диагностики физиологического состояния животных, а также в экологических исследованиях для выявления фекального загрязнения окружающей среды.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Vesnina, A.D. | Fotina, N.V. | Prosekov, A.Yu. | Kozlova, O.V. | Dyshlyuk, L.S.

The purpose of this work is to form a probiotic consortium of lactic acid strains. The object of the study was the isolated strains of lactobacilli from cow's milk and consortia composed of them. Isolation and identification of microorganisms was carried out using standard and generally accepted methods and using microbiological analysis. The following methods were used: to test resistance to antibiotics, disk diffusion, to determine antagonistic activity against pathogenic and opportunistic strains - diffusion in agar wells, resistance to adverse gastrointestinal conditions - cultivating strains in a medium with the addition of bile, phenol and critical pH values, to assess biocompatibility - the drip method. In the course of the work, the following strains were identified: L. plantarum, L. casei, L. acidophilus, on the basis of which a consortium was drawn up (ratio 3: 1: 1). And the isolated strains, the consortium based on them, showed resistance to the action of a number of antibiotics, to the conditions of the gastrointestinal tract, and antagonistic activity to a number of pathogenic and opportunistic cultures. A nutrient medium was selected for the consortium, which allows accumulating a larger amount of biomass, of the following composition (per 1 liter): glucose – 20 g; pancreatic hydrolyzate of fish meal – 12 g; meat extract – 11.5 g; sodium acetate 3-water – 10 g; yeast extract – 8 g; peptone – 5 g; casein hydrolyzate – 4 g; potassium phosphate 1-substituted – 4 g; ammonium citrate 1-substituted – 2.5 g; Tween-80 – 1 g; manganese sulfate 4-water – 0.95 g; magnesium sulfate 7-water – 0.825 g. | Цель работы - составление пробиотического консорциума из молочнокислых штаммов. Объектом исследования являлись выделенные штаммы лактобактерий из коровьего молока и консорциумы, составленные из них. Выделение и идентификация микроорганизмов осуществлялись с помощью стандартных и общепринятых методик и с помощью микробиологического анализа. Использовали следующие методы: для проверки устойчивости к действию антибиотиков - диско-диффузионный, для определения антагонистической активности по отношению к патогенным и условно-патогенным штаммам – диффузионный в лунках агара, устойчивости к неблагоприятным условиям желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) – культивирование штаммов в среде с добавлением желчи, фенола и критических значений рН, для оценки биосовместимости – капельный способ. В ходе работы выделены штаммы L. plantarum, L. casei, L. acidophilus, на основе которых составлен консорциум (соотношение 3:1:1). Выделенные штаммы, консорциум на их основе проявляли устойчивость к действию ряда антибиотиков, к условиям ЖКТ, и антагонистическую активность к ряду патогенных и условно-патогенных культур. Для консорциума подобрана питательная среда, позволяющая накапливать большее количество биомассы следующего состава (на 1 л): глюкоза – 20,0 г; панкреатический гидролизат рыбной муки – 12,0 г; мясной экстракт – 11,5 г; натрий уксуснокислый 3-водный – 10,0 г; дрожжевой экстракт – 8,0 г; пептон – 5,0 г; гидролизат казеина – 4,0 г; калий фосфорнокислый 1-замещенный – 4,0 г; аммоний лимоннокислый 1-замещенный – 2,5 г; твин-80 – 1,0 г; марганец сернокислый 4-водный – 0,95 г; магний сернокислый 7-водный – 0,825 г.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Zhandalgarova, A.D. | Bakhareva, A.A. | Grozesku, Yu.N. | Nevalennyj, A.N.

The experimental data obtained in 2021 for using pyobacteriophage in rearing red tilapia (Oreochromis mossambicus x O. niloticus) are presented. The microbiocenosis of gills and intestines of the two-year-old red tilapia species was studied after adding polyvalent pyobacteriophage (1 ml/l) to the aquarium water (experimental group 1 – EG) and processing compound feeds with this preparation (5 ml per daily rate) in combination with addition to water (EG2). For the analysis there was used the method of submerged inoculation into the MPA and Sabouraud media. When sowing the intestinal samples into the MPA medium there were inoculated the bacteria isolates: Bacterium, Sarcina, Staphylococcus, Actinomycetales. The dominant position in the qualitative composition of the microflora of the fish intestines belonged to the bacteria Staphylococcus (24 colonies), in EX1 - bacteria Bacterium (64 colonies). The fish intestinal microbiocenosis of EG2 was characterized by the representatives of Staphylococcus - 8 colonies. When inoculating into the Sabouraud's medium, the representatives of Micrococcus (35-56 colonies) dominated in the fish intestines of the control group and EG1; the microorganisms Bacterium, Actinomycetales, and Bacillus were met in single quantities. The gills microflora was stated to consist of a less diverse species composition compared to the microbiota of the digestive tract. Inoculation into the MPA medium showed that the dominant position was occupied by isolates of bacteria Bacterium in EG1 (6 colonies); in the control group the Bacterium representatives were found in single quantities. When sowing on Saburo medium, representatives of only 2 genera were identified in the gills of the red tilapia: Staphylococcus and Bacterium, and their largest number (57 colonies) was characteristic of EG1 (57 colonies). It has been concluded that using pyobacteriophage in fish farming does not have a negative effect on their microbiocenosis. The most effective variant is when the preparation was added to water and the combined feeds were treated with it. In this case, a decrease in the number of colonies of opportunistic microorganisms is achieved. | Представлены полученные в 2021 г. экспериментальные данные по применению пиобактериофага при выращивании красной тиляпии (Oreochromis mossambicus x O. niloticus). Изучен микробиоценоз жабр и кишечника двухгодовиков красной тиляпии при добавлении пиобактериофага поливалентного (1 мл/л) в воду аквариума (1-я опытная группа - ОГ) и обработке данным препаратом комбикормов (5 мл на суточную норму) в сочетании с добавлением в воду (2-я ОГ). Для анализа использован метода глубинного посева на среды МПА и Сабуро. При посеве проб кишечника на среду МПА были высеяны изоляты бактерий родов Bacterium, Sarcina, Staphylococcus, Actinomycetales. Доминирующее положение в качественном составе микрофлоры кишечника рыб занимали бактерии р. Staphylococcus (24 колонии), 1-й ОГ – р. Bacterium (64 колонии). Микробиоценоз кишечника рыб 2-й ОГ характеризовался присутствием представителей р. Staphylococcus – 8 колоний. При посеве на среду Сабуро в кишечнике рыб контрольной и 1-й ОГ доминировали представители р. Micrococcus (35-56 колоний), в единичных экземплярах представлены микроорганизмы р. Bacterium, р. Actinomycetales, р. Bacillus. Установлено, что микрофлора жабр была представлена меньшим видовым составом в сравнении с микробиотой пищеварительного тракта. Посев на среду МПА показал, что доминирующее положение занимали изоляты бактерий р. Bacterium в первой опытной группе (6 колоний), в контроле представители данного рода встречались в единичном экземпляре. При посеве на среду Сабуро в жабрах красной тиляпии выявлены представители лишь 2 родов: Staphylococcus и Bacterium, причем наибольшее их количество (57 колоний) было характерно для 1-ой ОГ. Сделан вывод, что применение пиобактериофага при выращивании рыб не оказывает негативного влияния на их микробиоценоз. Наиболее эффективен вариант, где препарат добавляли в воду и обрабатывали им комбикорма. В этом случае достигается снижение количества колоний условно-патогенных микроорганизмов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Krasnikova, E.S. | Radionov, R.V. | Krasnikov, A.V.

Dyspeptic symptoms are common in neonatal calves from BLV-infected cows. A single drinking the developed composition (patent No 2646831) prevents dyspepsia in animals. The indicator representatives of the intestinal microbiota of calves obtained from leukemia-infected cows were analyzed for the prevention of dyspepsia in them. The studies were carried out involving newborn Simmental calves (n = 1938). It was shown that by the 14th day after drinking the composition; the number of intestinal Lactobacillus in calves increased, and it was 2 times higher than in reference animals which are not given to drink the composition. The quantity of Bifidobacterium in newborn calves of the control group at first sharply decreased, and then gradually was restored. In the experimental group of calves, the dynamics of Bifidobacterium was positive throughout the experiment. Opportunistic enterococci and Escherichia coli were present in the intestinal contents of the control group of calves by an order of magnitude greater than in animals of the experimental group, as well as coagulase-positive bacteria of the genus Staphylococcus. Normalization of the content of the genus Proteus bacteria and yeast-like fungi in the intestinal contents of calves of both groups occurred fairly quickly and synchronously under the influence of normal intestinal microflora. Thus, the use of an original medicinal composition for the prevention of dyspeptic manifestations in neonatal-aged calves obtained from immune-compromised cows contributes to the rapid colonization of the calves' intestines with normal microflora. | Диспептические проявления часто регистрируют у неонатальных телят, полученных от BLV-инфицированных коров. Однократное выпаивание разработанной композиции (патент № 2646831) препятствует развитию диспепсии у таких животных. Анализировали индикаторных представителей микробиоты кишечника телят, полученных от инфицированных лейкозом коров, при профилактике у них диспепсии. Исследования проводились на новорожденных телят симментальской породы (n = 1938). Показано, что к 14-му дню после выпойки композиции, количество лактобацилл в содержимом кишечника телят увеличивалось и достоверно превышало данный показатель у животных, которым композиция не выпаивалась. Количество бифидобактерий у новорожденных телят контрольной группы вначале несколько снижалось, а затем постепенно начинало восстанавливаться. В опытной группе телят динамика бактерий рода Bifidobacterium была положительной на протяжении всего эксперимента. Условно-патогенные энтерококки и кишечная палочка присутствовали в содержимом кишечника контрольной группы телят в количестве на порядок большем, чем у животных экспериментальной группы, также, как и коагулазоположительные бактерии рода Staphylococcus. Нормализация содержания бактерий рода Proteus и дрожжеподобных грибов в содержимом кишечника телят обоих групп происходила достаточно быстро и синхронно под влиянием нормальной кишечной микрофлоры. Таким образом, применение оригинальной лекарственной композиции для профилактики диспептических проявлений у телят неонатального возраста, полученных от иммуноскомпрометированных коров, способствует быстрому заселению кишечника телят нормальной микрофлорой.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation