AGRIS - 

2023

Slovareva, O.Yu. | Muvingi, M. | Yaremko, A.B. | Igonin, V.N. | Rubets, V.S.

Влажные и умеренно теплые условия летнего периода в Центральном регионе России идеально подходят для развития бактериозов. Работа посвящена выявлению и идентификации бактерий в образцах зерновых культур, возделывавшихся на Тимирязевской полевой опытной станции (г. Москва) в 2020 г. Идентификацию бактерий проводили посредством секвенирования ампликонов, полученных в результате ПЦР с парами праймеров PSF/PSR, SyD1/SyD2 и 8UA/519B и сравнения полученных последовательностей с помощью сервиса BLAST с последовательностями, размещенными в GenBank (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov). В результате собраны 55 образцов зерновых культур, выделен и идентифицирован 171 бактериальный изолят, в том числе до вида идентифицированы 34 изолята. Бактериальное разнообразие представлено 14 видами. Среди них - фитопатогены Pantoea ananatis, Clavibacter michiganensis, Rhodococcus fascians, Pseudomonas trivialis, Pseudomonas viridiflava и Pseudomonas syringae. Наибольшая частота встречаемости - 70,9% отмечена у видов, относящихся к роду Pseudomonas. Также высокой частотой встречаемости характеризуются представители родов Frigoribacterium (36,4%), Clavibacter (16,4%), Arthrobacter (12,7%) и Rhodococcus (10,9%). Результаты исследования могут быть использованы при разработке быстрых и достоверных способов диагностики особо опасных и значимых для экспорта зерна видов бактерий. Кроме того, в процессе исследования выделены бактерии, принадлежащие определенным родам, но не относящиеся ни к одному из известных видов, что делает их перспективными для дальнейшего изучения и возможности описания новых видов - представителей микробиоты зерновых культур. | Humid and moderately warm summer conditions in the Central region of Russia are ideal for the development of bacteriosis. The work is devoted to the detection and identification of bacteria in samples of grain crops that were cultivated at the Timiryazevskaya field experimental station (Moscow) in 2020. Bacteria were identified by sequencing the amplicons obtained by PCR with primer pairs PSF/PSR, SyD1/SyD2, and 8UA/519B and comparing the resulting sequences using the BLAST service with sequences posted in GenBank (https://blast.ncbi.nlm. nih.gov). As a result, 55 samples of grain crops were collected, 171 bacterial isolates were isolated and identified, including 34 isolates identified to species. Bacterial diversity is represented by 14 species. Among them, there are phytopathogens Pantoea ananatis, Clavibacter michiganensis, Rhodococcus fascians, Pseudomonas trivialis, Pseudomonas viridiflava and Pseudomonas syringae. The highest frequency of occurrence, 70.9%, was noted in species belonging to the genus Pseudomonas. Representatives of the genera Frigoribacterium (36.4%), Clavibacter (16.4%), Arthrobacter (12.7%) and Rhodococcus (10.9%) also have a high frequency of occurrence. The results of the study can be used in the development of fast and reliable methods for diagnosing especially dangerous and important bacterial species for grain export. In addition, during the study, bacteria were isolated that belong to certain genera, but do not belong to any of the known species, which makes them promising for further study to describe new species in the microbiota of grain crops.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Belov, D.A. | Khyutti, A.V.

Modern phytopathogenic complexes of potato diseases have recently undergone significant changes. The loyal GOST regarding disease requirements is improving methods for diagnosing pathogens, updating the technical and instrumental base, increasing the qualifications of laboratory specialists, closer interaction between agricultural producers and representatives of science. Losses from pathogens and pests, even with complete chemical protection, are at least 25-30%. The most harmful complexes of potato diseases include viral, bacterial, fungal, fungiform and nematode diseases, which neutralize the potential crop yield for each particular variety. Over the past decade, the phytosanitary situation has deteriorated significantly: new viral diseases have appeared on the territory of Russia. Species of the genus Dickeya spp. causing various kinds of rot, as demonstrated by the monitoring of seed potato analyses for 2019-2022 spread all over the country. The danger of Dickeya spp. lies in the aggressiveness scaleв up massively, compared with typical species of Pectobacterium spp. causing the same symptoms, and more harmful. Despite the provision with the entire necessary list of plant protection products, crop losses and deterioration of its quality from fungal and fungiform potato diseases are still significant. The spread of a complex of nematode diseases has also become a new challenge. The potato protection must be constantly improved and revised in accordance with the diagnosed pathocomplex, the technology of growing and storing potatoes, as well as the available set of active substances and their combinations. Only a set of measures in the form of monitoring, agrotechnics, storage systems, regulated seed production and reasonable use of varieties in combination with nutrition and plant protection system can ensure high quality, safety, and sustainable industry development. | Современные фитопатогенные комплексы болезней картофеля за последнее время претерпели значительные изменения: лояльный ГОСТ в отношении требований к болезням, совершенствование методов диагностики патогенов, обновление технической и инструментальной базы, рост квалификации специалистов лабораторий, более тесное взаимодействие сельхозтоваропроизводителей и представителей науки. Потери от возбудителей болезней и вредителей, даже при полной химической защите, составляют не менее 25-30%. К наиболее вредоносным комплексам болезней картофеля относятся вирусные, бактериальные, грибные, грибоподобные и нематодные болезни, которые нивелируют потенциально возможную урожайность культуры для каждого конкретного сорта. За последние десятилетия фитосанитарная ситуация значительно ухудшилась: на территории России появились новые вирусные заболевания. По всей территории России распространились виды рода Dickeya spp., вызывающие различного рода гнили, что продемонстрировал проведенный мониторинг партий семенного картофеля за 2019-2022 гг. Опасность видов Dickeya spp. заключается в возросшей в разы агрессивности по сравнению с типичными видами Pectobacterium spp., вызывающими ту же симптоматику, и большей вредоносности. Несмотря на обеспеченность всем необходимым перечнем средств защиты растений, по-прежнему существенны потери урожая и ухудшение его качества от грибных и грибоподобных заболеваний картофеля. Новым вызовом стало распространение комплекса нематодных болезней. Защиту картофеля необходимо постоянно совершенствовать и пересматривать в соответствии с диагностируемым патокомплексом, технологией выращивания и хранения картофеля, а также доступным набором действующих веществ и их комбинаций. Только комплекс мер в виде мониторинга, агротехники, системы хранения, регламентированного семеноводства и обоснованного использования сортов в сочетании с питанием и системой защиты растений может обеспечить высокое качество, безопасность и устойчивость развития отрасли.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Terletskij, V.P. | Lazarev, A.M. | Novikova, I.I. | Bojkova, I.V. | Zejruk, V.N.

Microorganisms known as producers of biological products and destructors of hydrocarbons are characterized by high spontaneous variability. It can lead to a change in their activity; therefore, during stabilizing selection, it is necessary to confirm periodically strain affiliation. The purpose of the research is assessment of the genetic diversity of bacteria of several genera for the selection of the most effective antagonist strains and destructor strains. The genotyping method used is based on the use of two endonuclease restrictions to cleave the genomic DNA of a bacterium. Present in the reaction mixture DNA polymerase (Taq) provides labeling of DNA fragments with biotinylated deoxycytosine triphosphate (Bio-dCTP). Genotyping of two closely related strains of Pectobacterium atrosepticum makes it possible to recognize about 50 DNA fragments, more than 20% of which are specific to one of the compared strains. 2 pairs of restriction endonucleases namely XbaI/DraI and XbaI/Eco24I were used; the results obtained indicate the same discriminative ability of enzymes when comparing P. atrosepticum strains D822 and G784 by genetic profiles. When genotyping Pseudomonas bacteria, the BcuI/Eco32I pair was optimal, for Bs, the first restrictase was — SgsI (39 cleavage sites), the second (reduces the size of the resulting DNA fragments) - Eco32I. The genetic profiles of microorganisms of the genera Pectobacterium and Pseudomonas, characterizing the individuality of each strain, were obtained by the DSST method. Significant genetic differences between Ps species fluorescens and Ps. marginalis were noted. At the same time, identical DNA fragments were identified, which indicates the generic phylogenetic proximity of these species. Based on the results of genotyping of Pseudomonas biodestructors, a collection of strains that utilize difficult-to-oxidize compounds, including heavy fractions of oil and polyaromatic hydrocarbons, has been formed, which makes it possible to form associations of destructor strains for the disposal of specific pollutants. | Микроорганизмы - продуценты биопрепаратов и деструкторы углеводородов характеризуются высокой спонтанной вариабельностью, что может приводить к изменению их активности, поэтому при стабилизирующем отборе необходимо периодически подтверждать их штаммовую принадлежность. Цель исследований - оценка генетического разнообразия бактерий нескольких родов для отбора наиболее эффективных штаммов-антагонистов и штаммов-деструкторов. Примененный метод генотипирования основан на использовании двух эндонуклеаз рестрикции для расщепления геномной ДНК бактерии. Присутствующая в реакционной смеси ДНК-полимераза (Taq) обеспечивает мечение фрагментов ДНК биотинилированным дезоксицитозинтрифосфатом (Bio-dCTP). Генотипирование двух близкородственных штаммов Pectobacterium atrosepticum позволяет распознать около 50 фрагментов ДНК, более 20% которых специфичны для одного из сравниваемых штаммов. Использовали 2 пары эндонуклеаз рестрикции - XbaI/DraI и XbaI/Eco24I; полученные результаты указывают на одинаковую дискриминационную способность ферментов при сопоставлении штаммов P. atrosepticum Д822 и Г784 по генетическим профилям. При генотипировании бактерий рода Pseudomonas оптимальной была пара BcuI/Eco32I, для Bs первая рестриктаза - SgsI (39 сайтов расщепления), вторая (уменьшает размер получаемых фрагментов ДНК) - Eco32I. Методом ДРИМ получены генетические профили микроорганизмов родов Pectobacterium и Pseudomonas, характеризующие индивидуальность каждого штамма. Отмечены существенные генетические различия между видами Ps. fluorescens и Ps. marginalis. При этом выявлены идентичные фрагменты ДНК, что указывает на родовую филогенетическую близость этих видов. По результатам генотипирования биодеструкторов рода Pseudomonas сформирована коллекция штаммов, утилизирующих трудноокисляемые соединения, включая тяжелые фракции нефти и полиароматические углеводороды, что позволяет составлять ассоциации штаммов-деструкторов для утилизации конкретных загрязнителей.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Minakova, O.A. | Selivanova, G.A. | Aleksandrova, L.V., The A.L. Mazlumov All-Russia Research and Development Inst. of Sugar Beet and Sugar, Voronezh Region

Development and spreading of the diseases in sugar beet fields as well as the crop yield depends both on plant genotype and crop fertilizer level. Aim of the investigations was to study influence of long-term application of fertilizers on spreading and development of sugar beet diseases, beet root yield and sugar content, and mathematical relationship of these indices for Russian and foreign hybrids as well. The experiment scheme included control (no fertilizers) and 5 variants with different doses of mineral fertilizers and manure to cultivate RMS 120 (the domestic hybrid produced by the All-Russian Research Institute of Sugar Beet) and Mitika (the foreign hybrid produced by Lion Seeds Co., Ltd). It was determined that all the fertilizer systems studied in the experiment promoted decrease of black leg spreading and development. The fertilizer background of N135P135K135 +25 t of manure ensured the best indices during the first development period of both hybrids: maximum mass of 100 plants and minimum affection by black leg. In this variant, beet roots with symptoms of vascular bacteriosis and branchiness also were not revealed during the pre-harvesting period. Russian hybrid had better resistance to root borer (of fusariosis etiology) and vascular bacteriosis as compared to the foreign hybrid. The fertilizer system of N135P135K135 +25 t of manure provided maximal yield of the Russian and foreign hybrids (39.3 and 50.4 t/ha) and their sugar yield (7.70 and 10 t/ha), respectively. When applying N90P90K90 + 25 t/ha of manure, the domestic hybrid also had a high yield level (38.4 t/ha). Based on mathematical analysis, it was determined that beet root yield of the domestic hybrid substantially depended on vascular bacteriosis development and somewhat less on root borer. And productivity of the foreign hybrid showed no dependence on the diseases revealed in the experiment. | Развитие и распространение болезней в посевах сахарной свеклы, а также ее урожайность зависит как от генотипа растения, так и от уровня удобренности культуры. Цель исследований: изучить влияние длительного внесения удобрений на распространение и развитие болезней сахарной свеклы, урожайность и сахаристость корнеплодов, а также математическую связь этих показателей на гибридах российской и зарубежной селекции. Схема опыта включала контроль (без удобрений) и 5 вариантов с разными дозами минеральных удобрений и навоза, на которых возделывались отечественный гибрид РМС 120 (селекции Всероссийского НИИ сахарной свеклы) и иностранный гибрид Митика (селекции Lion Seeds Co., Ltd). Установлено, что все изученные в опыте системы удобрения способствовали снижению распространения и развития корнееда. Фон удобренности N135P135K135 +25 т навоза обеспечивал лучшие показатели в начальном периоде развития обоих гибридов: максимальную массу 100 растений и минимальную пораженность корнеедом. В этом варианте в предуборочный период также не было обнаружено корнеплодов с признаками трахеобактериоза и ветвистостью. Российский гибрид имел более высокую устойчивость к корнееду (фузариозной этиологии) и трахеобактериозу по сравнению с зарубежным гибридом. Система удобрения N135P135K135 +25 т навоза обеспечивала максимальную урожайность российского и иностранного гибридов (39,3 и 50,4 т/га) и сбор сахара (7,70 и 10,0 т/га) соответственно. Отечественный гибрид при внесении N90P90K90 + 25 т/га навоза также имел высокий уровень урожайности (38,4 т/га). На основании математического анализа установлено, что урожайность корнеплодов гибрида отечественной селекции в значительной степени зависела от развития трахеобактериоза, несколько меньше – от корнееда, а продуктивность иностранного гибрида не проявляла зависимости от болезней, выявленных в опыте.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Zelentsov, S.V. | Saenko, G.M. | Moshnenko, Е.V.

The ways of penetration of pathogenic bacteria from the infected vegetative parts of plants into soybean seeds remain practically unexplored. It is widely believed that soybean seeds are infected through the vascular system from already infected areas of the vegetative plant parts. The aim of the present research was to study the possibility of bacterial blight pathogen penetration into soybean seeds through the conductive tissues of plants. The studies were carried out in 2019–2021 in the V.S. Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops on plants and seeds of soybean 'Vilana' variety. It was found that the size of stomatal slots in soybean leaves is 8–12 micrometers. This ensures free penetration of bacteria with a diameter of 1.3–1.7 micrometers into the leaf mesophyll. The pore sizes of the sieve plates of the phloem range from 0.4–0.7 to 0.8–1.6 micrometers, depending on plant age. The largest pores of the phloem sieve plates are comparable to the diameters of pathogenic bacteria. However, a large number of transverse sieve plates located in the vessels of the phloem every 0.05–0.1 mm will filter and partially retain bacteria in each sieve tube along the path of cell sap in the phloem. Therefore, the pathogenic bacteria passing through the entire phloem from leaves infected with bacteriosis up to pods is physically unlikely. In pods, the vascular system ends in the area of attachment of the placenta to the seed hilum. In the hilum, there are no conductive tissues, and the further flow of water and nutrients into the seed is carried out diffusely through the plasmodesma of cell walls. It was found that the anatomical structure of the soybean phloem prevents the free movement of pathogenic bacteria along the conductive system directly into the inner tissues of the seeds. Therefore, the hypothesis of soybean seed infection with bacterial blight pathogens through the conducting system of the plant should be considered untenable. | Пути проникновения патогенных бактерий с поражённых вегетативных частей растений в семена сои остаются практически не изученными, однако широко распространено мнение, что семена сои заражаются через сосудистую систему от уже поражённых участков вегетативных частей. Изучали возможность проникновения возбудителей семядольного бактериоза в семена сои через проводящие ткани растений. Исследования проводили в 2019–2021 гг. во ВНИИ масличных культур на растениях и семенах сои сорта Вилана. Установлено, что размеры устьичных щелей у листьев сои составляют 8–12 мкм. Это обеспечивает свободное проникновение бактерий диаметром 1,3–1,7 мкм в мезофилл листа. Размеры пор ситовидных пластинок флоэмы составляют от 0,4–0,7 до 0,8–1,6 мкм в зависимости от возраста растений. Самые крупные поры ситовидных пластинок флоэмы сравнимы с диаметрами патогенных бактерий. Однако большое количество ситовидных пластинок, расположенных во флоэме через каждые 0,05–0,1 мм, будут фильтровать и частично задерживать бактерии в каждой ситовидной трубке по ходу водотока во флоэме. Поэтому свободное перемещение патогенных бактерий через всю флоэму, от поражённых бактериозом листьев до бобов, физически маловероятно. В бобах сосудистая система заканчивается в зоне прикрепления семяножек к рубчикам семян. В рубчике семени проводящие ткани отсутствуют, а дальнейшее поступление воды и питательных веществ в семя осуществляется диффузно через плазмодесмы стенок клеток. Установлено, что анатомическое строение флоэмы сои препятствует свободному передвижению патогенных бактерий по проводящей системе непосредственно во внутренние ткани семян. Поэтому гипотезу инфицирования семян сои возбудителями семядольного бактериоза через проводящую систему растения следует признать несостоятельной.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Zelentsov, S.V. | Saenko, G.М. | Moshnenko, E.V. | Budnikov, E.N., The V.S. Pustovoyt All-Russia Research and Development Inst. of Oil–Producing Crops, Krasnodar

Одной из значимых причин снижения посевных качеств семян у зернобобовых культур во всём мире является семядольный бактериоз в виде некротических распадающихся пятен на внешней или внутренней стороне семядолей. Выдвинута гипотеза о наличии общей первичной небактериальной причины развития некрозов на семядолях, независимо от вида, сорта и зоны выращивания. Исследования проводили в 2016–2020 гг. в Краснодарском крае на семенах сои, фасоли обыкновенной, нута, люпина белого и люпина узколистного. На незрелых семенах здоровых растений сои в фазах полного налива и начала физиологического созреваниясемядольный бактериоз никогда не наблюдается. Вторичное (дождевое) увлажнениезрелых семян приводит к развитию семядольного некроза и снижению их всхожести у сои, фасоли обыкновенной, нута, люпина белого и люпина узколистного. Физиологической причиной формирования семядольных некрозов при вторичном увлажнении зрелых семян является отмирание тканей семядолей, увлажнённых до стадии начала синтеза нуклеиновых кислот и не способных возвратиться к стадии покоя при повторном подсушивании. Симптомы развития некрозов семядолей после вторичного увлажнения зрелых семян и семядольного бактериоза у всех зернобобовых культур практически идентичны. Общей первичной причиной образования некротических пятен на поверхности семядолей, идентифицирующихся как семядольные бактериозы, независимо от вида зернобобовых культур, сорта и эколого-географической зоны выращивания, является вторичное (дождевое) увлажнение семян ещё не убранных в поле созревших растений. Выделение бактериальных возбудителей различных видов и семейств в некрозных участках семядолей может быть объяснено вторичным инфицированием уже отмерших тканей. Поэтому видовой состав бактериальной микрофлоры в каждом конкретном случае будет определяться её наличием в окружающей среде. | One of the significant reasons for the decrease in the sowing quality of seeds in leguminous crops all over the world is bacterial blight of seeds in the form of necrotic decaying spots on the outer or inner side of the cotyledons. A hypothesis was put forward about the presence of a common primary non-bacterial cause of the development of necrosis on cotyledons, regardless of the species, variety and growing zone. The studies were carried out in 2016–2020 in the Krasnodar Krai, on soybeans seeds, common bean, and chickpea, white and narrow-leaved lupines. On immature seeds of healthy soybean plants in the phases of full filling and the beginning of physiological maturation, bacterial blight of seeds are never observed. Secondary (rain) moistening of mature seeds leads to the development of cotyledon necrosis and a decrease in their germination in soybeans, common beans, chickpeas, white lupine and narrow-leaved lupine. The physiological reason for the formation of cotyledon necrosis during the secondary moistening of mature seeds is the death of the tissues of the cotyledons, moistened before the stage of nucleic acid synthesis, and unable to return to the dormant stage upon repeated drying. Symptoms of the development of cotyledon necrosis after secondary moistening of mature seeds, and bacterial blight of seeds, are practically identical in all leguminous crops. The common primary cause of the formation of necrotic spots on the surface of the cotyledons, identified as bacterial blight of seeds, regardless of the species of legumes, variety and ecological-geographical zone of cultivation, is the secondary (rain) moisture of seeds that have not yet been harvested in the field of mature plants. Isolation of bacterial pathogens of various species and families in necrotic areas of the cotyledons can be explained by secondary infection of already dead tissues. Therefore, the species composition of bacterial microflora in each particular case will be determined by its presence in the environment.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Teshich, S. | Pakina, E.N. | Ignatov, A.N., Peoples' Friendship Univ. of Russia, Moscow

Салат посевной, латук посевной или салат латук (Lactuca sativa L.) – вид однолетних травянистых растений рода Латук семейства Астровые (Asteraceae), широко культивируемый повсеместно, в т.ч. в защищенном грунте по гидропонной технологии. Одним из распространенных патогенов салата является Pseudomonas cichorii – возбудитель бактериозов ряда культурных растений. Образцы были предоставлены коммерческой компанией – производителем салата, выращиваемого на проточной гидропонной линии в условиях минимального заражения микроорганизмами. Изучение фитопатогенных бактерий включало ряд этапов: выделение бактерий на полу-селективные питательные среды и получение чистой культуры бактерий; постановка теста на патогенность (вирулентность); изучение фенотипических свойств бактерий; определение таксономического положения выделенных штаммов молекулярными методами. Все исследования проводили в соответствии со стандартными методиками идентификации фитопатогенных бактерий. В результате получено подтверждение распространения вида Pseudomonas cichorii (Swingle 1925) Stapp 1928 в гидропонной культуре салата в РФ. По данным Европейско-средиземноморской организации по защите растений, P. cichorii был впервые описан в России в 1965 г. на основании микробиологических методов идентификации, однако выделенные изоляты сейчас не доступны в коллекциях для подтверждения этого вывода современными диагностическими методами. Двенадцать изолятов P. cichorii были изучены по комплексу биохимических признаков и 4 изолята (01, 04, 06 и 12), показавшие наибольшую агрессивность при проведении инокуляции растений-хозяев и табака, были использованы для секвенирования ДНК фрагмента гена 16S рРНК. Полученные фрагменты ДНК показали высокое сходство (99-100%) с последовательностями P. cichorii из Генбанка. Оценка вирулентности выделенных изолятов на ряде культурных растений, и однородность их биохимических признаков показали, что они представляют группу бактерий, специализированных на салате. | Lettuce (Lactuca sativa L.) is an annual herbaceous species of the genus Lettuce, Asteraceae family. As a vegetable crop, it is cultivated everywhere, including hydroponically. One of the common pathogens of lettuce is Pseudomonas cichorii, causing bacterial diseases of several other crops. The samples for the research were provided by a commercial manufacturer of lettuce grown on a flow-through hydroponic line under conditions of minimal microbial contamination. The study of phytopathogenic bacteria includes a number of stages, namely isolation of bacteria on semi-selective culture media and obtaining a pure culture of bacteria; setting a test for pathogenicity (virulence); studying the phenotypic properties of bacteria; determining the taxonomic position of the isolated strains by molecular methods. All studies were conducted in accordance with the standard methods of identification of phytopathogenic bacteria. As a result of the work, the distribution of the species Pseudomonas cichorii (Swingle 1925) Stapp 1928 in the hydroponic lettuce culture in the Russian Federation was confirmed. Although, according to the EPPO database, P. cichorii was first described in Russia in 1965 by microbiological methods, isolated bacteria are currently not available in microbiological collections to confirm this conclusion with appropriate diagnostic methods. Twelve isolates of P. cichoriiwere studied by a biochemical and phytopathological tests, and four isolates (01, 04, 06, and 12) that showed the greatest aggressiveness on host plants and tobacco leaves were identified by DNA sequencing of the 16S rRNA gene fragment. The obtained DNA fragments showed a high similarity (99-100%) with the sequences of P. cichoriifrom the Genebank. Evaluation of the virulence of the isolated isolates on a number of other cultivated plants, and the uniformity of their biochemical characteristics showed that they represent the lettuce specialized bacteria group.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Karakotov, S.D. | Maslennikova, S.N. | Selivanova, G.A. | Gavrilova, M.Yu., The A.L. Mazlumov All-Russia Research and Development Inst. of Sugar Beet and Sugar, Voronezh Region

The results of field tests of microbiological destructors of plant residues in the soil are presented. The aim of the study is to determine the effectiveness of these preparations in limiting the development of root system diseases and sugar beet productivity. In the experiment, 2 preparations were tested: Biocomposite-Destruct and Biocomposite-correct. The Sternifag biodestructor was used as a standard. These preparations were introduced into the soil before sowing. The control was soil without biodestructors. In the experiment, a foreign hybrid Mitika (LION SEEDS LTD selection) was used. It was established that in the variants with the introduction of biodestructors, the density of seedlings increased and the root-eating disease decreased relative to the control. Also, in the pre-harvest period, there was a decrease in the development of tracheobacteriosis, fusarium rot and branching of root crops compared to the control. Tillage with the preparation Biocomposite-Destruct contributed to a significant increase in yield by 5.7 t/ha and sugar harvesting by 1 t/ha compared to the control, also by 6.3 t/ha and 0.9 t/ha, respectively, relative to the standard (Sternifag). In the application of Biocomposite-correct, the highest sugar content of root crops was observed (18.5%); the estimated sugar collection in this version was 8.3 t/ha, which is 0.6 t/ha higher than in the control, and 0.5 t/ha higher than in the standard version. In the fungal soil complex of the rhizosphere of root crops in the variant with the introduction of Biocomposite-correct into the soil, the lowest concentration of phytopathogens of the genus Fusarium was also noted. | Приведены результаты полевых испытаний микробиологических деструкторов растительных остатков в почве. Цель исследования - определение эффективности действия этих препаратов на ограничение развития болезней корневой системы и продуктивность сахарной свеклы. В опыте испытывались 2 препарата: Биокомпозит-Деструкт и Биокомпозит-коррект. В качестве стандарта был использован биодеструктор Стернифаг. Данные препараты вносили в почву перед севом. Контролем служила почва без биодеструкторов. В опыте использован иностранный гибрид Митика (селекции LION SEEDS LTD). Установлено, что в вариантах с внесением биодеструкторов возросла густота всходов и снизилась пораженность корнеедом относительно контроля. Также в предуборочный период отмечено снижение развития трахеобактериоза, фузариозной гнили и ветвистости корнеплодов по сравнению с контролем. Обработка почвы препаратом Биокомпозит-Деструкт способствовала достоверному увеличению урожая на 5,7 т/га и сбору сахара на 1,0 т/га по сравнению с контролем, также соответственно на 6,3 т/га и 0,9 т/га относительно стандарта (Стернифаг). В варианте применения Биокомпозит-коррект наблюдалась самая высокая сахаристость корнеплодов (18,5%); расчетный сбор сахара в этом варианте составил 8,3 т/га, что на 0,6 т/га выше, чем в контроле, и на 0,5 т/га выше, чем в варианте со стандартом. В грибном почвенном комплексе ризосферы корнеплодов в варианте с внесением в почву Биокомпозит-коррект отмечена и самая низкая концентрация фитопатогенов рода Fusarium.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2020

Smirnov, A.N., Russian State Agrarian Univ., Moscow

Late blight and early blight caused with phytopathogens Phytophthora infestans (PI) and Alternaria alternate (AA) are the dangerous diseases of potato. Potato bacterial blights are the other dangerous problem. Often bacteria especially pectolytic bacteria occur on affected plants with phytopathogeneous pseudofungi and fungi – with PI and AA. The objective is an estimation of bacterial occurrence in PI and AA as well as influence of bacteria on the PI and AA properties. Laboratory investigations were conducted in 2016-2019. PI isolates T-9, IO-37, 161, AA D12 of the Moscow State University and Moscow Agricultural Academy collections were used. Tuber disc inoculation of potato cultivars Zhukovskiy ranniy, Red Scarlett, Sarpo Mira, Lugovskoy and Udacha was performed under the warmer weather conditions in March, 2016 at the laboratory temperature reaching 25 deg. C. Checking bacterial occurrence was done in PI mycelia grown at oatmeal agar by means of light and electronic microscopy as well as with transferring on special selective media King B and YDS. The occurrence of pectolytic bacteria was proved to be in PI and AA hyphosphaere. At bacterial occurrence PI lysis and morphological deviations as well as competitive expression at the loci of Glucose 6 Phosphate Isomerase (Gpi-1) and Malate Dehydrogenase (Mdh-2) are proved to be developed. Inoculation of potato tuber discs of 4 cultivars Zhukovskiy ranniy, Red Scarlett, Sarpo Mira and Udacha with suspensions of pathogens at increased temperature revealed essential bacterial development at increased temperature during already the 1-st day of incubation. Manifestation of these symptoms was significantly suppressed only on cultivar Lugovskoy. PI and AA mycelia as well as pectolytic bacteria of their hyphosphaere form on potato unique and stable pathocomplex with complicated interconnections which should be studied as quickly as possible. This pathocomplex provides strong combined infective phone on potato which is able to be essentially dangerous for this crop. | Фитофтороз и альтернариоз, вызываемые фитопатогенами Phytophthora infestans (PI) и Alternaria alternate (AA), – опаснейшие болезни картофеля. Бактериозы картофеля – другая опасная проблема. Нередко возбудители бактериозов, особенно пектолитические бактерии, присутствуют на пораженных растениях вместе с фитопатогенными псевдогрибами и грибами, в том числе с PI и AA. Цель – оценить присутствие бактерий в гифосфере PI и AA, а также влияние бактерий на характеристики Ph. infestans и AA. Лабораторные исследования проводили в 2016-2019 гг. Использовали изоляты PI T-9, IO-37, 161, AA Д12 из коллекций МГУ и РГАУ-МСХА. Заражение дисков клубней картофеля сортов Жуковский ранний, Ред Скарлетт, Сарпо Мира, Луговской, Удача проводили в марте 2016 г. на фоне потепления погодных условий, температура в лаборатории достигала 25 град. С. Наличие бактерий в мицелиях исследуемых штаммов PI, выращиваемых на овсяном агаре, проверялили посредством световой и электронной микроскопии, а также путем смывов с мицелиев и высевом на специальные питательные среды King B и YDS. Доказано наличие пектолитических бактерий в гифосфере PI и AA. При наличии бактерий доказаны лизис и изменения морфологии PI и конкурентная экспрессия по локусам глюкозо-6 фосфат изомеразы (Gpi-1) и малатдегидрогеназы (Mdh-2). Инокуляция клубневых дисков 4-х сортов картофеля Жуковский ранний, Ред Скарлетт, Сарпо Мира и Удача суспензиями патогенов на фоне повышенной температуры выявили значительное развитие бактериозов уже на 1-е сутки инкубации. Только на сорте Луговской развитие данные симптомов было в значительной степени подавлено. Мицелии PI, AA и пектолитические бактерии их гифосферы образуют на картофеле единый и достаточно стабильный патокомплекс с достаточно сложными взаимосвязями, которые предстоит изучать. Этот патокомплекс способен создать напряженный комбинированный инфекционный фон на картофеле, который в ряде случаев способен представлять для него существенную опасность.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2017

Nefedchenko, A.V. | Glotova, T.I. | Terent'eva, T.E. | Glotov, A.G., Siberia and Far East Inst. of Experimental Veterinary Medicine, Novosibirsk Region

In the dairy farms of Siberia in the period from 2006 to 2016 the frequency of isolation of bacterium Mannheimia haemolytica from animals with different productivity and concentration on limited areas was determined. From sick calves, 54 isolates were recovered and characterized by phenotypic and biochemical traits and further investigated for sensitivity to 24 antibiotics. The differences between isolates in the polymerase chain reaction were determined by leukotoxin gene, 9 of them were classified as lkta-negative isolates - serotype S2 (non-pathogenic), and as 45 lkta-positive -serotypes S1 and S6 (highly pathogenic). All isolates were resistant to at least one anti-microbial agent. Maximal resistance (31.1%) was identified to benzylpenicillin and carbenicillin, and minimal (1%) - to cephalexin, tulatromycin and sulfonamides. Reliable differences in sensitivity between lkta-positive and lkta-negative isolates are established for gentamicin and kanamycin. Differences in the stability of isolates from lungs of calves to antibiotics of old and new generations indicate the need for monitoring circulating and revealing resistant variants of the bacterium. At big dairy farms with animals of import or domestic breeding therapeutic measures with using of broad-spectrum antibiotics are often not effective. It is assumed that along with imported animals multidrug resistant strains of bacterium arrive causing high morbidity and mortality of calves up to the age of 3 months. To increase the effectiveness of therapy, continuous monitoring of the circulation of multidrug-resistant bacterial variants is necessary.. The method of typing and differentiation of M. haemolytica by the leukotoxin gene can be used to study the biological properties of the pathogen, to identify its pathogenic and commensal variants. | В молочных хозяйствах Сибири в период с 2006 по 2016 гг. определяли частоту выделения бактерии Mannheimia haemolytica от животных с разной продуктивностью и концентрацией их на ограниченных площадях. От больных телят выделили и охарактеризовали по фенотипическим и биохимическим признакам 54 изолята, которые дополнительно исследовали на чувствительность к 24 антибиотикам. При определении в полимеразной цепной реакции различий между изолятами по гену лейкотоксина (lkta) 9 из них были lkta-отрицательные, их отнесли к серотипу S2 (непатогенные), а 45 lkta-положительные – к серотипам S1 и S6 (высокопатогенные). Все они проявили резистентность по меньшей мере к одному антимикробному препарату. Максимальную устойчивость (31,1%) отмечали к бензилпенициллину и карбенициллину, а минимальную (1%) – к цефалексину, тулатромицину и сульфаниламидам. Достоверные различия в чувствительности между lkta-положительными и lkta-отрицательными изолятами установлены для гентамицина и канамицина. Разная устойчивость изолятов из легких телят к антибиотикам старого и нового поколения указывает на необходимость мониторинга циркуляции и выявления резистентных вариантов бактерии. На молочных комплексах, укомплектованных животными импортной или отечественной селекции, лечебные мероприятия с использованием антибиотиков широкого спектра действия часто бывают неэффективными. Вероятно, вместе с ввозимыми животными поступают полирезистентные штаммы бактерии, устойчивые к антибиотикам и вызывающие высокую заболеваемость и летальность молодняка до 3-месячного возраста. Для повышения эффективности терапии необходим постоянный мониторинг циркуляции полирезистентных вариантов бактерии. Метод типирования и дифференциации M. haemolytica по гену лейкотоксина можно использовать для изучения биологических свойств возбудителя, выявления его патогенных и комменсальных вариантов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation