AGRIS - 

2023

Шхалахова, Русет Мадиновна | Маляровская, ‪Валентина Ивановна | Конинская, Наталья Григорьевна

Creating strategies of rare and endangered plants conservation requires studying the intraspecific genetic diversity of each particular species. Thus, efficient marker systems are necessary for implementing these objectives. In this study, the efficiency of 36 SCoT markers were evaluated for characterizing the intraspecific genetic diversity of Cyclamen сoum Mill., Helleborus caucasicus A. Brown, Galanthus woronowii Losinsk., Paeonia caucasica Schipcz. collected from different habitats of the Sochi National Park. Single markers, such as SCoT16 (58,2 %), SCoT6 (50,3 %), SCoT7 (49,6 %), SCoT8 (48,1 %), SCoT30 (42,8 %), SCoT29 (41,1 %), and SCoT20 (39,3 %) showed high levels of polymorphism, indicating good applicability of these markers to assess the intraspecific genetic diversity of the studied of the Western Caucasus flora species. In addition, the results of the study are important for the implementing conservation measures for these species and combating genetic erosion. | Для создания стратегий сохранения редких и исчезающих растений важно изучить внутривидовое генетическое разнообразие каждого конкретного вида. Для выполнения этих задач необходимы эффективные маркерные системы. В данном исследовании оценивалась эффективность 36 SCoT-маркеров для характеристики внутривидового генетического разнообразия Cyclamen сoum Mill., Helleborus caucasicusA. Brown, Galanthus woronowii Losinsk., Paeonia caucasica Schipcz., собранных из разных мест произрастания Сочинского национального парка. Отдельные маркеры, такие как SCoT16 (58,2 %), SCoT6 (50,3 %), SCoT7 (49,6 %), SCoT8 (48,1 %), SCoT30 (42,8 %), SCoT29 (41,1 %) и SCoT20 (39,3 %), показали высокий уровень полиморфизма, что свидетельствует о хорошей применимости этих маркеров для оценки внутривидового генетического разнообразия исследуемых видов природной флоры Западного Кавказа. Кроме того, результаты исследования важны для реализации мер по сохранению данных видов и борьбы с генетической эрозией.

Show more [+]

Less [-]

Altai State University - Russian Federation

2023

Sharshenalieva, G. | Yusupova, M. | Muratbekova, A.

For the first time, the originality of karyotypes of the following small rodents of the Issyk-Kul and Sokuluk Districts was studied: Diploid set of chromosomes of the Meriones tamariscinus of the Issyk-Kul population 2n=40. Number of arms of autosomes NFa=74. 38 autosomes consist of 4 groups: 14 (M) + 10 (Sm) + 12 (St) + 2 (A) + X (M) + Y (M). The stability of karyotypes of the tamarisk gerbil of the Issyk-Kul population was revealed. The diploid set of chromosomes of the Apodemus sylvaticus of the Issyk-Kul population 2n=48. Number of arms of autosomes NFa=68. 46 autosomes consist of the following groups: 8(M)+14(St)+24(A)+X(M)+Y(M). Spatial-biotypic chromosomal polymorphism of wood mouse karyotypes of the Issyk-Kul population was revealed. The diploid set of chromosomes of the Mus musculus of the Issyk-Kul and Sokuluk populations 2n=40. Number of arms of autosomes NFa=38. 38 autosomes are made up of acrocentric chromosomes. The sex chromosomes are made up of acrocentric chromosomes that differ in size. The stability of the karyotypes of the domestic mouse of the Issyk-Kul and Sokuluk populations was revealed. The diploid set of chromosomes of the Dryomys nitedula of the Issyk-Kul population is 2n=48. The number of arms of autosomes is NFa = 90. The chromosome set consists of four groups of chromosomes: 16 (M) + 18 (Sm) + 10 (St) + 2 (A) + X (Sm) + X (Sm). Spatial-biotypic chromosomal polymorphism of karyotypes of forest dormouse of the Issyk-Kul population was revealed. The karyotype of the gray hamster is described for the first time. The karyotype of the gray hamster Cricetulus migratorius of the Sokuluk population was described for the first time: 2n=22, NF=44, 10(M)+2(Sm)+10(St); no sex chromosomes were found. When comparing karyotypes, isolated micropopulations of this species, spatial-biotypic chromosomal polymorphism was determined according to the morphology of autosomes of the diploid set of chromosomes. | Впервые изучено своеобразие кариотипов следующих мелких грызунов Иссык-Кульского и Сокулукского районов: диплоидный набор хромосом тамарисковой песчанки (Meriones tamariscinus) иссык-кульской популяции 2n=40. Число плеч аутосом NFa=74. 38 аутосом состоят из 4 групп: 14 (М)+10 (Sm)+12(St)+2(A)+X(M)+Y(M). Выявлена устойчивость кариотипов тамарисковой песчанки иссык-кульской популяции. Диплоидный набор хромосом лесной мыши (Apodemus sylvaticus) иссык-кульской популяции 2n=48. Число плеч аутосом NFa=68. 46 аутосом состоят из следующих групп: 8(М)+14(St)+24(A)+X(M)+Y(M). Выявлен пространственно-биотопический хромосомный полиморфизм кариотипов лесной мыши иссык-кульской популяции. Диплоидный набор хромосом домовой мыши (Mus musculus) иссык-кульской и сокулукской популяции 2n=40. Число плеч аутосом NFa=38. 38 аутосом состоят из акроцентрических хромосом. Половые хромосомы состоят из различающихся по размеру акроцентрических хромосом. Выявлена устойчивость кариотипов домовой мыши иссык-кульской и сокулукской популяций. Диплоидный набор хромосом лесной сони (Dryomys nitedula) иссык-кульской популяции равно 2n=48. Число плеч аутосом NFa = 90. Хромосомный набор состоит из четырех групп хромосом: 16 (М)+18(Sm)+10(St)+2(A)+X(Sm)+X(Sm). Выявлен пространственно-биотопический хромосомный полиморфизм кариотипов лесной сони иссык-кульской популяции. Впервые описан кариотип серого хомячка Cricetulus migratorius сокулукской популяции: 2n=22, NF=44, 10(М)+2(Sm)+10(St); половые хромосомы не обнаружены. При сравнении кариотипов, обособленных микропопуляций данного вида, определен пространственно-биотопический хромосомный полиморфизм по морфологии аутосом диплоидного набора хромосом.

Show more [+]

Less [-]

Publishing center Science and Practice - Russian Federation

2023

Бакоев Н.Ф. | Кошкина О.А. | Харзинова В.Р. | Сермягин А.А. | Зиновьева Н.А.

В данной работе разработана тест-система праймеров и оптимизированы условия проведения ПЦР для амплификации полных последовательностей митохондриального генома свиней. Валидация разработанной тест-системы проведена на образцах четырех трансграничных пород свиней и диких кабанов двух регионов страны. В результате, получены нуклеотидные последовательности полных митохондриальных геномов образцов свиней (n=17) и дикого кабана (n=3) длиною 16611 п.н. В исследуемой выборке животных было выявлено 16 гаплотипов, из которых 13 были обнаружены у домашних свиней и 3 – у дикого кабана. Общих гаплотипов среди домашних свиней и диких кабанов выявлено не было. На основании полученных полных последовательностей МТ-ДНК, проведен расчет параметров генетического разнообразия, который выявил, что дикие кабаны превосходят породы свиней, как по среднему числу нуклеотидных различий, так и по значениям нуклеотидного разнообразия: k=106,00 и π=0,00638. Филогенетический анализ показал, что, несмотря на небольшую выборку исследованных животных, были определены все пять известных гаплогрупп рода Sus sсrofa A, B, C, D, и E., что свидетельствует об универсальности разработанной тест-системы.

Show more [+]

Less [-]

Marina Sokolova Publishings - Russian Federation