AGRIS - 

2013

Rakina, Yu.А. | Valitov, F.R. | Dolmatova, I.Yu., Bashkir State Agrarian Univ., Ufa

Genetic marking at the DNA level enables to test male and female animals of any age. Alpha-lactalbumin (А-LA) is a Ca-binding protein important for transport of calcium and rich in amino acids, such as a building block cysteine. The А-LA polymorphic gene variants frequency in Black-and-White cattle breed was investigated. Different aged Black-and-White brood cows (n=444) of breeding stock were studied. A-LA genotyping was performed by PCR-RFLP method using endonuclease MhlI. In the studied DNA-probes there were 2 alpha-lactalbumin gene alleles - А-LAsup(А) and А-LAsup(В) were revealed and three genotypes were marked correspondingly - А-LAsup(АА), А-LAsup(АВ) and А-LAsup(ВВ). The highest milk yield was shown by the А-LAsup(ВВ) genotype cows (4991 kg), the highest fat and protein content was observed in the milk of the А-LAsup(АВ) genotype cows (correspondingly 3,54% and 3,48%), cows of 239 Poseidon line and 30587 A. Adam can be considered the same, their highest genotype frequency was 72% and 71,1% respectively. The most heat-resistant milk is from А-LAsup(АА) genotype cows (74.13, % of ethanol), the less heat-resistant milk is from the А-LAsup(ВВ) genotype cows (71.29% of ethanol). Rennet coagulation of milk is higher for the A-LAsup(АB) genotype cows (35.35 min), it is less for the A-LAsup(BB) genotype cows (33.81 min) (p0,05). Therefore, A gene variant of alpha-lactalbumin is proved to be associated with higher milk productivity and B gene variant - with higher content of fat and protein in milk. | Генетическое маркирование на уровне ДНК позволяет тестировать животных любого пола и возраста. Альфа-лактальбумин (А-LA) является кальций-связующим белком, который влияет на транспорт кальция и богат аминокислотами, такими как цистеин, который является строительным блоком. Изучена частота встречаемости полиморфных вариантов гена А-LA у крупного рогатого скота черно-пестрой породы. Материалом для исследования послужили племенные коровы маточного поголовья (n=444) разного возраста. Генотипирование по гену А-LA проводили методом ПЦР-ПДРФ с использованием эндонуклеазы MhlI. В изученных препаратах ДНК выявлено 2 аллеля гена альфа-лактоальбумина - А-LAsup(А) и А-LAsup(В) и, соответственно, отмечено наличие 3 генотипов - А-LAsup(АА), А-LAsup(АВ) и А-LAsup(ВВ). Установлено, что наибольшие надои молока были выявлены у коров с генотипом А-LAsup(ВВ) (4991 кг), а наиболее жирномолочными и белковомолочными оказались коровы с генотипом А-LAsup(АВ) (3,54% и 3,48% соответственно), к ним следует отнести коров линий Посейдона 239 и А.Адема 30587, у которых наибольшие показатели частоты генотипов (72% и 71,1% соответственно). Наиболее термоустойчивым является молоко животных с генотипом А-LAsup(АА) (74,13, % этанола), наименее - с генотипом А-LAsup(ВВ) (71,29% этанола). Сычужная свертываемость молока выше у коров с генотипом A-LAsup(АB) - 35,35 мин., меньше с генотипом A-LAsup(BB) - 33,81 мин. (p0,05). Исходя из этого следует отметить, что вариант А гена альфа-лактоальбумина достоверно ассоциирован с большей молочной продуктивностью, а вариант В - с повышенным содержанием жира и белка в молоке.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2013

Gabitova, A.A. | Gareeva, I.T. | Akhmetov, A.R. | Fattakhov, T.Ch., Bashkir State Agrarian Univ., Ufa

Intraspecific genetic polymorphism of the most widespread species of broad-leaved wood plants of South Ural such as English oak (Quercus robur L), Norway maple (Acer platanoides L.), European white elm (Ulmus laevis Pall.), small-leafed linden (Tilia cordata Mill.) was analyzed on the basis of assessment of information value of the ISSR-primers. Concentration of DNA supplied by leaves and buds, was determined by the SpectrofotometrTM NanoDrop 2000 device and diluted to 10 ng/mkl. Amplification was carried out in the MJ MiniCycler thermocycler. Annealing temperature of primer structures varied from 56 to 64 deg C. As a negative control to check purity of reactants in the reactionary mix 5 mcL of the deionized water was added instead of DNA. Products of amplification were divided by an electrophoresis in 1.7% agarose gel in 1хТВЕ, coloured by ethydium bromide and photographed in the passing ultra-violet light. To measure lengths of DNA fragments we used markers of molecular weight and 100 bp +1.5+3 Kb DNA Ladder. The computer analysis of molecular and genetic polymorphism of DNA is carried out by means of the POPGENE 1.31 program and the specific macros GenAlEx6 for the MS-Excel defining a share of polymorphic locus. It is established that intermicrosatellite sequences of the English oak and the Norway maple have sufficient level of polymorphism to perform a big variety of population and genetic applied researches on the basis of the developed molecular and genetic methods of the analysis. The primers studied by the authors are highly informative. This research wasn't successful to achieve reproducibility and the clearness of division of ISSR fragments to determine polymorphism of the European white elm smooth and the small-leaved linden. The possible reason of it is the high contents of secondary metabolites in the cell that prevent the satisfactory output and quality of genomic DNA. It requires species-specific optimization of protocols to determine DNA and carry out a polymerase chain reaction. | Проведен анализ внутривидового генетического полиморфизма наиболее распространенных видов широколиственных древесных растений Южного Урала – дуба черешчатого (Quercus robur L.), клена остролистного (Acer platanoides L.), вяза гладкого (Ulmus laevis Pall.), липы мелколистной (Tilia cordata Mill.) на основе оценки информативности ряда ISSR-праймеров. Концентрацию ДНК, выделенной из листьев и почек, определяли прибором SpectrofotometrTM NanoDrop 2000 и разводили до 10 нг/мкл. Амплификацию проводили в термоциклере MJ MiniCycler. Температура отжига состава праймеров варьировала от 56 до 64 град. С. В качестве отрицательного контроля в реакционную смесь для проверки чистоты реактивов добавляли вместо ДНК 5 мкл деионизированной воды. Продукты амплификации разделяли путем электрофореза в 1,7 %-ном агарозном геле в 1хТВЕ буфере, окрашивали бромистым этидием и фотографировали в проходящем ультрафиолетовом свете. Для определения длин фрагментов ДНК использовали маркеры молекулярной массы и 100 bp +1.5+3 Кb DNA Ladder. Компьютерный анализ молекулярно-генетического полиморфизма ДНК проведен с помощью программы POPGENE 1.31 и специализированного макроса GenAlEx6 для MS-Excel с определением доли полиморфных локусов. Установлено, что межмикросателлитные последовательности дуба черешчатого и клена остролистного обладают достаточным уровнем полиморфизма для выполнения большого круга популяционно-генетических фундаментальных и прикладных исследований на основе уже разработанных молекулярно-генетических методов анализа. Изученные праймеры являются высоко информативными. В данном исследовании не удалось добиться воспроизводимости и четкости разделения ISSR-фрагментов для определения полиморфизма вяза гладкого и липы мелколистной, возможно, из-за высокого содержания в клетке вторичных метаболитов, которые не позволяют обеспечить удовлетворительный выход и качество геномной ДНК. Требуется видоспецифичная оптимизация протоколов выделения ДНК и проведения полимеразной цепной реакции.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation