AGRIS - 

Data provenance by Country

2021

Tyapkina , D.Yu. | Slugina, M.A. | Kochieva, E.Z.

Аскорбиновая кислота (аскорбат, витамин С) играет важную роль в различных метаболических процессах и у растений, и у человека, поэтому увеличение содержания аскорбата в клетках растений при помощи селекционных подходов важно для повышения как пищевой ценности плодов, так и устойчивости растений к стрессу. В данной работе амплифицированы, клонированы и секвенированы гомологи гена GME1, играющего ключевую роль в биосинтезе аскорбата, у томата овощного и 11 дикорастущих видов томата. Структурный анализ показал низкую степень вариабельности гена GME1 у изученных образцов. В кодирующих последовательностях GME1 выявлено 28 однонуклеотидных замен (single nucleotide polymorphisms, SNPs), из которых только две (G2E и E281D) приводили к несинонимичным заменам у видов S. neorickii и S. peruvianum var. dentatum. Анализ мотивов и доменов белка GME1 томатов не выявил каких-либо специфических мотивов ни на межвидовом уровне, ни на более отдаленных таксономических уровнях. Наблюдаемый высокий консерватизм GME1 у достаточно эволюционно отдаленных видов томата, по всей видимости, служит свидетельством функциональной значимости этого фермента для синтеза аскорбата и, опосредованно, для защиты от стрессовых факторов, прежде всего фотостресса. Корреляцию между аминокислотными (нуклеотидными) заменами и содержанием аскорбата в плодах не обнаружили. При сравнительном межвидовом органоспецифическом анализе и анализе зависимости количества аскорбата в зрелых плодах у сортов и дикорастущих образцов от уровня экспрессии GME1 также не выявили связи между транскрипционной активностью GME1 и концентрацией аскорбата. Можно также предположить, что определяющее влияние на конечное содержание аскорбата в созревшем плоде томата, вероятно, оказывает не интенсивность экспрессии GME1 на завершающей стадии созревания плода, а то, насколько ген GME1 был активен на более ранних стадиях созревания. | Ascorbic acid (ascorbate, vitamin C) plays an important role in various metabolic processes in both plants and humans, therefore, increasing the content of ascorbate in plant cells using breeding approaches is important for increasing both the nutritional value of fruits and plant resistance to stress. In this study, there are amplified, cloned and sequenced novel GME1 gene homologues, thereby playing a key role in ascorbate biosynthesis in cultivated tomato and 11 wild tomato species. Structural analysis showed a low GME1variability level of in tomato species. In the GME1 coding sequences, 28 SNPs were identified, of which only two led to nonsynonymous aminoacid substitutions (G2E and E281D) in S. neorickii and S. peruvianum var. dentatum. Analysis of GME1 motifs and domains did not reveal any specific motifs either at the interspecific level or at more distant taxonomic levels. The high GME1 conservatism observed in quite evolutionarily distant tomato species is most likely due to the functional significance of this enzyme for the ascorbate synthesis and, indirectly, for protection from stress factors, primarily photostress. No correlation was found between amino acid or nucleotide substitutions and ascorbate levels in fruits. Expression analysis, including comparative interspecies organ-specific analysis and analysis of the dependence of the ascorbate content in mature fruits in tomato cultivars and wild species accessions and the GME1 expression level, also did not reveal a relationship between transcriptional levels and ascorbate concentration. It can also be assumed that the final ascorbate content in the ripe tomato fruit may be influenced not by the intensity of GME1 expression at the last stage of fruit ripening, but by how this gene was active at earlier stages of ripening.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Lejbova, V.B., Nizhnij Novgorod State Engineering and Economic Univ.

The purpose of the work is to analyze the dynamics of the biochemical parameters of blood in the interlactation (dry) period in connection with the duration of the service period in the subsequent lactation in cows with different genotypes of the SCD1 gene according to rs41255693. The studies were carried out on Holstein cows with an average milk yield of 9807±606 kg for 305 days of lactation. Animal genotypes (n = 23) were determined by PCR-RFLP: CC genotype (n = 9) and CT genotype (n = 14). Blood biochemical parameters were analyzed with an interval in the calving date of no more than 20 days: the CC genotype (n = 6) and CT genotype (n = 6). In cows with the CC genotype in the first month of the dry period, the concentration of total cholesterol in the blood was higher (p less than 0.05), and aspartate aminotransferase (AST) activity tended to increase (p = 0.08) as compared with animals with the CT genotype. 30-10 days before calving, the total cholesterol content and AST activity in cows decreased (p less than 0.05 and p = 0.055, respectively), while in animals with the CT genotype they did not change. Correlation analysis showed that the metabolic links in the individuals of the comparable genotypes had differences in force and orientation. The number of correlation links was 3 times more in cows with the CC genotype. The distribution of the animals in groups depending on a genotype and service period has shown that a service period of more than 100 days is observed 2.3 times more frequent in cows with the genotype CC. The dynamics of metabolic processes and the peculiarities of the relationships between metabolic components in cows with the CC genotype are less preferable than in animals with the CT genotype, which may be associated with an increased frequency of occurrence of a longer service period in cows with the CC genotype. | Цель работы - анализ динамики биохимических показателей крови в сухостойный период в связи с продолжительностью сервис-периода в последующую лактацию у коров с различными генотипами гена SCD1 по rs41255693. Исследования проводили на коровах голштинской породы со средним удоем 9807± 606 кг за 305 дней лактации. Генотипы животных (п = 23) устанавливали методом ПЦР-ПДРФ: генотип СС (п = 9) и генотип СТ (п = 14). Биохимические показатели крови анализировали у коров с интервалом в дате отела не более 20 суток: генотип СС (п = 6) и генотип СТ (п = 6). У коров с генотипом СС в первый месяц сухостойного периода концентрация общего холестерина (ОХ) в крови была выше (p меньше 0,05), а активность аспартатаминотрансферазы (АСТ) имела тенденцию повышения (р = 0,08) по сравнению с животными с генотипом СТ. За 30-10 суток до отела содержание ОХ и активность АСТ у коров снизились (p меньше 0,05 и р = 0,055 соответственно), а у животных с генотипом СТ они не изменились. Корреляционный анализ показал, что метаболические связи у особей сравниваемых генотипов имели различия по силе и направленности. Число корреляционных связей было в 3 раза больше у коров с генотипом СТ. Распределение животных по группам в зависимости от генотипа и сервис-периода показало, что сервис-период продолжительностью более 100 дней в 2,3 раза чаще встречается у коров с генотипом СС. Динамика обменных процессов и особенности взаимосвязей компонентов метаболизма у коров с генотипом СС являются менее предпочтительными, чем у животных с генотипом СТ, что может быть связано с повышенной частотой встречаемости более длинного сервис-периода у коров с генотипом СС.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Alexandrov, O.S. | Karlov, G.I., All-Russia Research and Development Inst. of Agricultural Biotechnology, Moscow

Клещевина - важная с.-х. культура, которую выращивают во многих странах мира и используют в основном для получения касторового масла. Цель исследования - изучение промоторов гена U6 клещевины с помощью биоинформационных и молекулярно-генетических подходов. В работе использовали растения клещевины (Ricinus communis L.) сортов Занзибар Грин и Гибзонская. ДНК выделяли из молодых листьев. Обработку последовательностей, выравнивание и определение степени гомологии проводили в программе GenDoc. Праймеры для амплификации промоторов гена U6 клещевины подбирали с помощью программы Primer3. ПЦР проводили на амплификаторе C-100 ('Bio-Rad Laboratories, Inc.', США). Продукты ПЦР разделяли в 1,5% агарозном геле при 6 В/см в камере для горизонтального электрофореза Sub-Cell GT ('Bio-Rad Laboratories, Inc.', США). Ампликоны очищали с помощью набора GeneJET PCR Purification Kit ('Thermo Fisher Scientific, Inc.', США). Очищенные ампликоны клонировали с помощью вектора pAL2-T ('Евроген', Россия). При конструировании CRISPR/Cas9 векторов использовали плазмиду pRGE31, эндонуклеазы рестрикции HindIII и SbfI ('Сибэнзим', Россия) и необходимые олигонуклеотиды. Был проведен биоинформационный поиск в базе генетических данных GenBank и обнаружено 12 скаффолдов, содержащих последовательность гена U6 клещевины. Шесть промоторов, включающих неповрежденные регуляторные элементы USE и ТАТА-бокс, были использованы при подборе праймеров для амплификации на матрице ДНК клещевины сортов Занзибар Грин и Гибзонская. Продукты ПЦР, состоящие из единичных фрагментов, были клонированы и секвенированы. Промоторные области полностью совпадали между сортами. Степень идентичности промоторов из разных ампликонов варьировала в пределах 51-77%. При сравнении этих же промоторов с промоторами гена U6 других растений степень гомологии составляла 42-64%. Последовательности промоторов, содержащие неповрежденные мотивы USE и ТАТА-бокс, были использованы для конструирования CRISPR/Cas9 векторов. | Castor bean is an important crop in many countries. It is mainly used to obtain the castor oil, which is widely applied in various industries. The research aim was to study castor bean gene U6 promoters with help by bioinformatics and molecular genetic approaches. Zanzibar Green and Gibzonskaya varieties of castor bean plants were used in this work. DNA was isolated from young leaves. The preparation of sequences, alignments and homology level calculation were carried out by GenDoc program. Primers for amplification of castor bean U6 promoters were designed by Primer3 program. PCR was performed using a C-100 PCR machine (Bio-Rad Laboratories, Inc., USA). PCR products were separated in 1.5% agarose gel at 6 B/cm in the Sub-Cell GT electrophoresis camera (Bio-Rad Laboratories, Inc., USA). The amplicons were purified with the GeneJET PCR Purification Kit (Thermo Fisher Scientific, Inc., USA). The purified amplicons were cloned into the pAL2-T vector (Evrogen, Russia). In the CRISPR/Cas9 vector construction, the pRGE31, HindIII and SbfI restriction enzymes (Sibenzyme, Russia) and nucleotides were used. Purification of the digested products was carried out with the GeneJET Gel Extraction Kit (Thermo Fisher Scientific, Inc., USA). Bioinformatic search were conducted in the GenBank base, and 12 scaffolds with the castor bean U6 gene were found. Six promoters with intact USE and TATA-box elements of regulation were used in the primer design for amplification with cv. Zanzibar Green and cv. Gibzonskaya DNA matrices. One fragment PCR products were cloned and sequenced. The analysis of the obtained amplicon sequences reveled that promoter regions of two studied varieties were similar. The level of promoter identity from different amplicons ranged within 51-77%. When comparing the same promoters with the U6 gene promoters of other plants the homology degree was 42-64%. The promoter sequences with intact USE and TATA-box motifs were used in construction of the CRISPR/Cas9 vectors.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Barkova, O.Yu. | Krutikova, A.A. | Dement'evа, N.V.

Dysferlin refers to proteins involved in the repair of the muscle membrane. It is assumed that some mononucleotide substitutions in the dysferlin gene (DYSF) are associated with the formation of muscle mass in poultry. The aim of this work was to study single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the dysferlin gene in chicken gene pools and to identify possible associations of DYSF gene polymorphisms with economically valuable traits. The study material was meat of (Cornish) chickens, laying hen (Russkaya Belaya, Rhode Island, Avrora, Austrolorp Chernobelaya, Leningradskaya sittsevaya) and decorative breeds (Russkaya Khokhlataya, Brahma svetlays, Golosheinaya). DNA was isolated from blood collected from the axillary vein by phenol extraction. Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip chip (Illumina, Inc., USA) was used to analyze the rs16455118 polymorphism. Genotyping of 185 hens revealed a single nucleotide polymorphism SNP rs16455118. It was found that the allele frequencies shifted towards an increase in heterozygous genotypes of AC in decorative chickens while the AA genotype was present in the minority. In laying hen, the homozygous genotype AA had the highest frequency of occurrence, the CC genotype was small in number, and it was completely absent in the population of chickens of the Aurora breed. The Cornish meat breed had a more even distribution of genotypes as compared to decorative and laying hens. Sequencing of the 237 bp dysferlin gene region located on chromosome 4 in Russkaya Belaya chickens identified 4 mononucleotide substitutions in the intron 32 mononucleotide substitutions G/A (rs317801013), C/A (rs16455118), A/G (rs318045896) corresponded to those in the publicly available chicken genome in the databases NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP) and ENSEMBL (https://www.ensembl.org/index.html). The mononucleotide polymorphism T/G at 90672805 has been detected for the first time. | Дисферлин относится к белкам, участвующим в репарации мышечной мембраны. Предполагается, что некоторые мононуклеотидные замены в гене дисферлина (DYSF) связаны с формированием мышечной массы у домашней птицы. Цель работы - изучение мононуклеотидных полиморфизмов (SNPs) гена дисферлина у генофондных пород кур и выявление возможных ассоциаций полиморфизмов гена DYSF с хозяйственно ценными характеристиками. Материалом для исследования служили куры мясного (корниш), яичного направления (русская белая, род-айланд, аврора, австролорп черно-пестрый, ленинградская ситцевая) и декоративные породы (русская хохлатая, брама светлая, голошейная). ДНК выделяли фенольным методом из крови, взятой из подкрыльцовой вены. Для анализа полиморфизма rs16455118 пользовались базой данных, полученной в результате генотипирования с применением чиповой технологии Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip ("Illumina, Inc.", США). В результате генотипирования 185 кур был выявлен мононуклеотидный полиморфизм rs16455118. Наблюдали смещение частоты встречаемости аллелей в сторону увеличения гетерозиготных генотипов АС у кур декоративного направления, генотип АА присутствовал в меньшинстве. У кур яичного направления наибольшую частоту встречаемости имел гомозиготный генотип АА, генотип СС был малочисленным, а у популяции кур породы аврора полностью отсутствовал. Мясная порода корниш имела более равномерное распределение генотипов в сравнении с декоративными и яичными. Мы секвенировали участок гена дисферлина размером 237 п.н., расположенный на 4-й хромосоме у кур породы русская белая, и обнаружили 4 мононуклеотидные замены, находящиеся в 32-м интроне. Мононуклеодидные замены G/A (rs317801013), С/А (rs16455118), A/G (rs318045896) соответствовали заменам в геноме кур, зарегистрированным в международных генетических базах данных NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP) и ENSEMBL (https://www.ensembl.org/index.html). Мононуклеотидный полиморфизм T/G в позиции 90672805 выявлен впервые.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Rudaya, E.S. | Dolgikh, E.A.

В основе развития бобово-ризобиального симбиоза лежит сигнальный обмен между партнерами, что обеспечивает их взаимное узнавание, активацию инфекционного процесса и программы органогенеза клубеньков. Цель работы - изучение возможности приобретения растениями Solanum lycopersicum способности к узнаванию сигнальных молекул ризобий за счет переноса генов, кодирующих рецепторы Nod-факторов у бобового растения Pisum sativum. Для проведения экспериментов были получены и использованы 2 вида конструкций в векторе pKm43GW, в которых гены рецепторов PsSym10 или PsK1 были клонированы под промотором гена экстенсина томата pSlEXT1 - pSlEXT1::PsSym10-3xFLAG::T35S и pSlEXT1::PsK1-RFP::T35S. Молодые проростки томата S. lycopersicum сорта Carmello были трансформированы штаммом Agrobacterium rhizogenes Arqua 1. Для анализа использовали трансформированные корни композитных растений томата без инокуляции ризобиями Rhizobium leguminosarum bv. viciae CIAM1026 (контроль, 7 сут), а также трансформированные корни через 7 и 21 сут после инокуляции. При использовании промотора pSlEXT1 наблюдали экспрессию обоих генов PsSym10 и PsK1 в генетически трансформированных корнях растений томата, при этом экспрессия усиливалась под влиянием инокуляции ризобиями. Было показано существенное (примерно в 2,0-2,5 раза) повышение экспрессии гена PsSym10 в ответ на инокуляцию ризобиями как на 7-е, так и на 21-е сут. Уровень экспрессия PsK1 оказался самым высоким через 7 сут после инокуляции в трансформированных корнях композитных растений томата по сравнению с контролем. Чтобы определить, будут ли активироваться компоненты "общего" сигнального пути под влиянием перенесенных рецепторов в композитных растениях томата, были оценены изменения в экспрессии генов S. lycopersicum SlD27, SlNSP2, SlRAM1 и SlMAPK6. Активация экспрессии двух генов SlNSP2 и SlMAPK6 в ответ на инокуляцию может свидетельствовать о влиянии перенесенного гена K1 гороха на восприимчивость растений томата к инокуляции ризобиями. | The development of legume-rhizobial symbiosis is based on signal exchange between partners, which ensures their mutual recognition and activation of the infection process and the program of nodule organogenesis. The aim of this work was to study the possibility of acquiring the ability of Solanum lycopersicum plants to recognize signal molecules of rhizobia after transfer of the genes encoding receptors for Nod factors in the legume plant Pisum sativum. Two types of constructs in the pKm43GW vector were obtained and used, in which the PsSym10 or PsK1 genes encoding receptors were cloned under the pSlEXT1 promotor of tomato extensin gene, namely pSlEXT1::PsSym10-3xFLAG::T35S and pSlEXT1::PsK1-RFP::T35S. Young tomato seedlings of cv. 'Carmello' were transformed with the Agrobacterium rhizogenes Arqua 1 strain. For the analysis we used transformed roots of composite tomato plants without rhizobial Rhizobium leguminosarum bv. viciae CIAM1026 inoculation (control, 7 days), as well as transformed roots at 7 and 21 days after inoculation. In genetically transformed tomato roots the expression of both PsSym10 and PsK1 genes was observed under the pSlEXT1 promoter, moreover the expression was enhanced under the influence of rhizobial inoculation. A significant increase in the expression of the PsSym10 gene was shown in response to inoculation with rhizobia both at 7 and 21 days. The level of PsK1 expression was found to be the highest 7 days after inoculation in the transformed roots of composite tomato plants as compared to the control. Activation of the expression of two genes, the SlNSP2 and SlMAPK6 in response to inoculation may indicate the effect of the introduced pea K1 gene on the susceptibility of tomato plants to rhizobial inoculation.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Chaitskij, A.A. | Baranova, N.S.

Среди сложных белков молока – казеинов – чаще всего встречаются альфа- и бета-казеин. Ген бета-казеина имеет 12 аллельных вариантов, среди которых получили преимущество варианты А1 и А2. При этом, А2 – естественная для человеческого организма разновидность белка бета-казеина, а тип А1 возник в результате природной генетической мутации. Для получения максимального объёма продукции лучшего качества при переориентации производства на молоко А2 необходимо учитывать как основные количественные показатели продуктивности крупного рогатого скота, так и коэффициенты, определяющие эффективность использования коров с точки зрения биологической полноценности продукции, такие как биологической эффективности коров (БЭК), биологической полноценности молока (КБП), кормового коэффициента (FCR) и валовой эффективности использования кормов (GFE). Представлено сравнение количественных и качественных показателей животных разного возраста и групп с учётом степени кровности по улучшающей породе, а также с учётом генотипа по бета-казеину. Впервые проведён анализ реализации биологического потенциала крупного рогатого скота костромской породы с разными аллельными вариантами гена бета-казеина. В ходе исследования установлено, что животные генотипа А2А2 по бета-казеину отличались высоким уровнем БЭК и КБП, а также характеризовались достоверно более высоким уровнем реализации сухого вещества корма в молоко (FCR, GFE), чем у животных А1А2. Так, удои у коров с генотипом А2А2 с кровностью 50% по улучшающей породе за полновозрастную лактацию на 2514 кг больше, чем у животных генотипа А1А2, а коэффициенты БЭК, КБП и FCR выше на 39,79%, 15,81% и 0,57 кг соответственно. | Among the complex proteins of milk – caseins – most often there are alpha- and beta-casein. The beta-casein gene has 12 allelic variants, among which the A1 and A2 variants have gained advantage. At the same time A2 is a natural variety of beta-casein protein for the human body and type A1 arose as a result of a natural genetic mutation. To obtain the maximum volume of production of better quality when reorienting production to milk A2 it is necessary to take into account both the main quantitative indicators of cattle productivity and the coefficients that determine the efficiency of cows use in terms of biological usefulness of products, such as the cow biological efficiency (CBE), the milk biological full-value (MBF), feed coefficient rate (FCR) and gross feed efficiency (GFE). A comparison of quantitative and qualitative indicators of animals of different ages and groups is presented, taking into account the degree of blood relationship by improving breed, as well as taking into account the genotype by beta-casein. For the first time an analysis of the implementation of the biological potential of cattle of the Kostroma breed with different allelic variants of the beta-casein gene was carried out. During the research it was established that animals of a genotype A2A2 on beta casein differed in the CBE and MBF high level and also were characterized by significantly higher level of implementation of dry matter of feed into milk (FCR, GFE), than at animals A1A2. Thus, yields in cows with a genotype A2A2 with a blood relationship of 50% for the improving breed for full-age lactation 2514 kg more than in animals of the genotype A1A2 and the coefficients of CBE, MBF and FCR are higher by 39.79%, 15.81% and 0.57 kg, respectively.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Sebezhko, O.I. | Narozhnykh, K.N. | Korotkevich, O.S. | Aleksandrova, D.A. | Morozov, I.N.

There is considered the current understanding of cholesterol metabolism occurring under physiological conditions. The homeostasis of cholesterol in the body is determined by its endogenous synthesis, the transition to the cell from plasma as part of low-density lipoproteins (LDL), the release of their cells as part of high-density lipoproteins (HDL). The molecular-genetic mechanisms of regulation of cholesterol homeostasis are described in detail. The genes for cholesterol biosynthesis in major multicellular animals were inherited from their last common eukaryotic ancestor and are evolutionarily conserved for cholesterol biosynthesis. Non-coding variants of single-nucleotide polymorphisms can significantly contribute to the phenotypic variability of cholesterol, and missense variants that lead to the replacement of amino acids in proteins can have a significant effect on the phenotypic variability. The modern aspects of cholesterol homeostasis in cattle are formed and presented. During absence of exogenous intake, the balance of cholesterol in cattle is maintained by endogenous synthesis, occurring mainly in the liver, the intake of lipoproteins, as well as reverse transport mechanisms. The stability of homeostasis can be achieved only with the complex interaction of all systems (transport, enzyme, and receptor) involved in this process. The analysis of the latest scientific works concerning the problem of the content and regulation of cholesterol in cow's milk is presented. Significant single-nucleotide polymorphisms localized in the ACAT2, LDLR, DGAT, and AGPAT1 genes involved in the exchange of cholesterol in the liver or its transport and associated with the level of cholesterol in milk are described. Part of the review is devoted to cholesterol deficiency syndrome in Holstein cattle (HCD). Modern data on the prevalence, molecular and genetic basis, clinical and laboratory manifestations of the syndrome are presented. | Рассматриваются современные представления о метаболизме холестерола, протекающем в физиологических условиях. Гомеостаз холестерина в организме определяется его эндогенным синтезом, переходом в клетку из плазмы в составе липопротеинов низкой плотности (ЛПНП), освобождением их клеток в составе липопротеинов высокой плотности (ЛПВП). Подробно охарактеризованы молекулярно-генетические механизмы регуляции гомеостаза холестерола. Гены биосинтеза холестерина у основных многоклеточных животных были унаследованы от их последнего общего эукариотического предка и эволюционно консервативны для биосинтеза холестерина. Некодирующие варианты однонуклеотидных полиморфизмов могут в значительной степени фенотипической изменчивости холестерола, а миссенс-варианты, приводящие к замене аминокислот в белках – могут оказывать ощутимое влияние на фенотипическую вариабельность. Сформированы и представлены современные аспекты гомеостаза холестерина у крупного рогатого скота. При отсутствии экзогенного поступления баланс холестерина у крупного рогатого скота поддерживается путём эндогенного синтеза, протекающего главным образом в печени, поступления липопротеинов, а также механизмов обратного транспорта. Устойчивость гомеостаза может быть достигнута только при комплексном взаимодействии всех систем (транспортных, энзимных, рецепторных), участвующих в этом процессе. Представлен анализ последних научных работ, затрагивающих проблему содержания и регуляции холестерина в молоке коров. Описаны значимые однонуклеотидные полиморфизмы, локализованные в генахACAT2, LDLR, DGAT, AGPAT1, участвующих обмене холестерина в печени или его транспортеи ассоциированные с уровнем холестерина в молоке. Часть обзора посвящена синдрому дефицита холестерина у крупного рогатого скота голштинской породы (HCD). Представлены современные данные о распространённости, молекулярно-генетических основах, клинико-лабораторные проявления синдрома.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Zagidullin, L.R. | Shajdullin, R.R. | Akhmetov, T.M. | Tyul'kin, S.V. | Moskvicheva, A.B.

Изучена взаимосвязь аллельных вариантов генов пролактина и соматотропина с показателями молочной продуктивности коров черно-пестрой породы по 1 и 3 лактации. Были отобраны 151 первотелка и 168 полновозрастных коров черно-пестрой породы, от которых были взяты пробы крови и выделены образцы ДНК. У первотелок, как и у полновозрастных животных, наиболее высокий удой (4642 и 6240 кг), количество молочного жира (174,1 и 215,0 кг) и молочного белка (149,0 и 182,5 кг) достигнуты в группе с генотипом PRL АА. По массовой доле жира и белка в молоке коровы с генотипом PRL ВВ достоверно превосходили животных с генотипом PRL АА на 0,12% (Р меньше 0,05) и 0,05% (Р меньше 0,05) соответственно. По гену соматотропина наибольший уровень молочной продуктивности выявлен у коров с генотипом GH LL при достоверном преимуществе над GH VV у первотелок по удою на 439 кг (Р меньше 0,01), выходу молочного жира - на 13,6 кг (Р меньше 0,001), выходу молочного белка - на 15,3 кг (Р меньше 0,01). У полновозрастных коров превышение над остальными группами было только по удою - на 219-548 кг (Р меньше 0,05). Наибольшая жирномолочность характерна животным с генотипом GH VV по 1 лактации - 3,83% и по 3 лактации - 3,82%, а лучшая белковомолочность - коровам, имеющим аллель V гена GH: 3,21 и 3,23% соответственно. Полученные данные свидетельствуют о более высоком уровне молочной продуктивности у коров с генотипом PRL АА и GH LL, но лучшая жирномолочность и белковомолочность отмечены у особей, имеющих в своем генотипе аллели В гена PRL и V гена GH. | The interrelation of allelic variants of prolactin and somatotropin genes with indicators of milk productivity of Black-and-White cows for the 1st and 3rd lactation was studied. 151 first-heifers and 168 full-aged Black-and-White cows were selected, from which blood samples were taken and DNA samples were isolated. The highest milk yield (4642 and 6240 kg) amount of milk fat (174.1 and 215 kg) and milk protein (149.0 and 182.5 kg) were in the group with the PRL AA genotype in first-calf heifers as well as in full-age animals. In terms of the mass fraction of fat and protein of milk, the cows with the PRL BB genotype significantly exceeded animals with the PRL AA genotype by 0.12% (P less than 0.05) and 0.05% (P less than 0.05), respectively. According to the somatotropin gene, the highest level of milk productivity was revealed in cows with the GH LL genotype with a significant advantage over GH VV in first-calf heifers in milk yield by 439 kg (P less than 0.01), milk fat yield by 13.6 kg (P less than 0.001), milk protein yield by 15.3 kg (P less than 0.01). The excess over the other groups in full-age cows was only in terms of milk yield that was by 219-548 kg (P less-than 0.05). The highest protein content of milk is a characteristic of animals with the GH VV genotype, 3.83% is for the 1st lactation and 3.82% is for the 3rd lactation, and the best protein content of milk in cows with V allele of the GH gene is 3.21 and 3.23%, respectively. The obtained data indicate a higher level of milk productivity in cows with the PRL AA and GH LL genotypes but the best fat and milk content was noted in cows with alleles B of the PRL gene and V of the GH gene in their genotype.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Aparina, V.A. | Bojko, N.I. | Sukhomlinov, V.Yu. | Timofeev, A.A. | Piskarev, V.V.

The work was performed in the forest-steppe of Cis-Ob chernozem zone, West Siberian province, Novosibirsk region, in 2018–2020. The study aimed to determine highly productive sources of known genes resistant to a complex of fungal diseases of spring common wheat. The material for the study was 158 lines of various ecological and geographical origins of three ripeness groups selected from collection samples. Resistance to fungal pathogens was determined according to the following scale: 99 points – no signs of damage, 9 points – damaged by less than 5%, 7 points – damaged by 6–10%, 5 points – damaged by 11–20%, 3 points – damaged by 21–50%; 1 point – damaged by more than 50%. We revealed genotypes from various ripeness groups, combining high yield, the weight of 1,000 grains, and complex resistance to diseases (powdery mildew, brown and stem rust under field conditions) with a resistance varying from 7 points to 99 points. For Svecha variety, we postulated the resistance genes Lr34, Sr12, and Pm38. This variety exceeded Novosibirskaya 31 standard by 6.6 g in the weight of 1,000 grains, and by 86.9 g/m2 in yield. According to the published data, the resistance genes postulated for Gerakl variety were Lr26 and Pm8. It exceeded the specified standard by 10.0 g and 108.2 g/m2, respectively. Resistance to brown rust and powdery mildew (from 7 to 99 points), high yield and the weight of 1,000 grains were characteristic of Kenyon varieties (according to the published data, resistance genes Lr26 or Lr11, Lr13, Lr16, and Sr23 were expected). These varieties exceeded Novosibirskaya 15 standard in the weight of 1,000 grains by 7.4 g, in yield by 134.6 g/m2, as well as variety Lutestsens 503 (genes Lr10, Lr19 and Sr25 were postulated), which significantly exceeded Novosibirskaya 31 standard by 5.7 g and 118.8 g/m2, respectively. | Работу проводили в Новосибирской области в 2018–2020 гг. в лесостепной зоне Западно-Сибирской провинции в Приобском районе черноземов с целью выделения высокопродуктивных источников, несущих известные гены устойчивости к комплексу грибных болезней пшеницы мягкой яровой. Материалом для исследования служили 158 линий, отобранных из коллекционных образцов различного эколого-географического происхождения трех групп спелости. Устойчивость к грибным патогенам определяли по следующей шкале: 99 баллов – признаки поражения отсутствуют, 9 – поражение менее 5%, 7 – 6…10%, 5 – 11…20%, 3 – 21…50%; 1 балл – более 50%. Выявлены генотипы различных групп спелости, сочетающие высокую урожайность, массу 1000 зёрен и комплексную устойчивость к болезням (мучнистой росе, бурой и стеблевой ржавчине в полевых условиях от 7 до 99 баллов). Это сорт Свеча (постулированы гены устойчивости Lr34, Sr12, Pm38), который превышает стандарт Новосибирская 31 по массе 1000 зёрен на 6,6 г, по урожайности – на 86,9 г/м2, и Геракл (по литературным данным постулированы гены Lr26 и Pm8) – превосходство над указанным стандартом составляет соответственно 10,0 г и 108,2 г/м2. Устойчивостью к бурой ржавчине и мучнистой росе (от 7 до 99 баллов), высокой урожайностью и массой 1000 зёрен характеризовались сорта Kenyon (по литературным данным предполагается наличие генов устойчивости Lr26 или Lr11, Lr13, Lr16 и Sr23), превышающий стандарт Новосибирская 15 по массе 1000 зёрен на 7,4 г, по урожайности – на 134,6 г/м2, а также сорт Лютесценс 503 (постулированы гены Lr10,Lr19 и Sr25), значительно превысивший стандарт Новосибирская 31 соответственно на 5,7 г и 118,8 г/м2.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Safina, N.Yu. | Gajnutdinova, Eh.R. | Shakirov, Sh.K. | Fattakhova, Z.F.

Исследование проводили с целью изучения полиморфизма гена (Bos taurus TNF-альфа-824 A/G) фактора некроза опухоли альфа крупного рогатого скота голштинской породы. По итогам ДНК-тестирования 147 коров-первотелок методом ПЦР-ПДРФ татарстанской популяции крупного рогатого скота голштинской породы выявлено следующее распределение: аллели TNF-альфаG и TNF-альфаA – 0,816 и 0,184; генотипы TNF-альфаGG – 66,67%, TNF-альфаGA – 29,93% и TNF-альфаAA – 3,40%. В зависимости от ареала обитания и породы частота встречаемости аллелей и генотипов гена TNF-альфа варьирует. При рождении носители гомозиготного аллеля TNF-альфаG превосходили сверстниц с генотипом TNF-альфаAA по живой массе на 1,8 кг (p меньше 0,05), с генотипом TNF-альфаGA – на 1,2 кг. В возрасте 18 мес. величина этого показателя у животных с аллелем TNF-альфаG была минимальной – на 15,7 кг и 14,2 кг меньше, чем у животных с генотипами TNF-альфаAA и TNF-альфаGA соответственно (p меньше 0,05). Уровень абсолютного (кг) и среднесуточного (г) прироста в различные возрастные периоды превосходил величины этих показателей у особей с генотипами TNF-альфаAA и TNF-альфаGA. Удой за первую полную и стандартную лактацию (p меньше 0,001), содержание белка в молоке (p меньше 0,05) было статистически значимо выше у коров-первотелок с генотипом TNF-альфаAA, а содержание массовой доли жира – у группы с генотипом GG (p мменьше 0,01). У коров с генотипом TNF-альфаAA количество соматических клеток было статистически достоверно (p меньше 0,001) ниже, по сравнению с животными с другими генотипами, более чем на 50,0 Высокопродуктивные коровы с генотипом TNF-альфаAA характеризуются худшими показателями воспроизводительной способности в стаде по всем репродуктивным качествам (p меньше 0,05…0,001). | The purpose of the research was to study the polymorphism of the tumor necrosis factor alpha gene (Bos taurus TNF-alpha -824 A/G) in Holstein cattle. DNA testing of 147 Tatarstan Holstein first-calf cows by PCR-RFLP method revealed the following distribution: TNF-alpha(G) and TNF-alpha(A) alleles – 0.816 and 0.184, respectively; TNF-alpha(GG), TNF-alpha(GA), and TNF-alpha(AA) genotypes – 66.67%, 29.93%, and 3.40%, respectively. Frequencies of alleles and genotypes of TNF-alpha gene depended on the habitat and breed. At birth, carriers of the homozygous TNF-alpha(G) allele outperformed their contemporaries with TNF-alpha(AA) and TNF-alpha(GA) genotypes in live weight by 1.8 kg and 1.2 kg, respectively. At the age of 18 months, the value of this indicator in animals with the TNFalpha(G) allele was minimal – by 15.7 kg and 14.2 kg less than in animals with TNF-alpha(AA) and TNF-alpha(GA) genotypes, respectively. Absolute (kg) and average daily (g) gain in different age periods were higher in animals with TNF-alpha(AA) and TNF-alpha(GA) genotypes. Milk yield for the first full and standard lactation and protein content in milk was statistically significantly higher in first-calf cows with the TNF-alpha(AA) genotype; fat mass fraction was higher in the group with the GG genotype. In cows with the TNF-alpha(AA) genotype, the number of somatic cells was significantly lower than in animals with other genotypes – by more than 50.0. Highly productive cows with the TNF-alpha(AA) genotype were characterized by the worst reproductibility indicators in the herd for all reproductive qualities.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation