AGRIS - 

2023

Nedashkovskij, I.S. | Konteh, A.F. | Naryshkina, E.N. | Sermyagin, A.A.

The effect of inbreeding on the assessment of the body type of Holstein and Black-and-White cows has been studied. There were studied 14070 animals divided into 4 groups depending on the inbreeding coefficient с шагом of 3.125%. Group I included outbred animals and cows (first-calf heifers) with an inbreeding coefficient of up to and including 1%. Group IV included animals with an inbreeding coefficient of 6.35-25.39%, due to the small number of the latter. A linear assessment of the exterior profile of the studied population of animals was carried out in accordance with the methodology of the Union "Mosplem" using 2 systems: system "A", which includes an appraisal by 100 points, and system "B", which has a 9-point rating value. The average values were used for the desired indicators for assessing the body type, in view the age of the animals after calving from 10 to 160 days. According to system "A", there was a decrease in all indicators: dairy form from 81.11 points in group I to 78.73 points in group IV, body conformation from 81.24 to 78.92, extremities from 79.4 to 77.38, udder from 80.97 to 79.19 points; height at hips from 143.03 cm to 138.85 cm, respectively. According to the "B" score system, there was a significant difference between the groups in terms of such indicators as height at hips, hindfoot height, soundness, width of loin, body depth, foreudder length. The desired indicators decreased from 5.79 points in group I in height at hips to 4.54 points in group IV, body depth from 6.32 to 5.85, width of loin from 5.51 to 5.08, hindfoot height from 4.9 to 4.5, soundness 5.63 to 5.31, dairy form from 6.3 to 5.92, foreudder length from 5.51 to 5.04 points. For breeding and genetic progress in a population, it is necessary to use selection based on control, accurate calculation and prediction of the possible level of inbreeding. | Изучено влияние инбридинга на оценку типа телосложения коров голштинской и черно-пестрой пород. Было исследовано 14070 животных, разделенных на 4 группы в зависимости от коэффициента инбридинга с шагом 3,125%. В I группу вошли аутбредные животные и коровы (первотелки), имеющие коэффициент инбридинга до 1% включительно, в IV - особи с коэффициентом инбридинга 6,35-25,39%, вследствие малочисленности последней. Линейную оценку экстерьерного профиля исследуемой популяции скота проводили в соответствии с методикой Союз "Мосплем" по 2 системам: "А", включающая 100-балльную оценку, и "Б", имеющая 9-балльный номинал. Использовались средние значения по искомым показателям оценки типа телосложения с учетом возраста животных после отела от 10 до 160 дней. По системе "А" наблюдалось снижение значений по всем показателям: молочный тип - с 81,11 балла в I группе до 78,73 балла в IV; туловище - с 81,24 до 78,92; конечности - с 79,4 до 77,38; вымя - с 80,97 до 79,19 балла; высота в крестце - со 143,03 см до 138,85 см соответственно. По системе оценки "Б" отмечалось достоверное различие между группами по таким показателям, как высота в крестце, высота пятки, крепость, ширина зада, глубина туловища, длина передних долей вымени. Искомые показатели снижались: по высоте в крестце - с 5,79 балла в I группе до 4,54 балла в IV, глубине туловища - с 6,32 до 5,85, ширине зада - с 5,51 до 5,08, высоте пятки - с 4,9 до 4,5, крепости - с 5,63 до 5,31, молочному типу - с 6,3 до 5,92, длине передних долей вымени - с 5,51 до 5,04 балла. Для селекционно-генетического прогресса в популяции необходимо применять подбор, опираясь на контроль, точный расчет и прогноз возможного уровня инбридинга.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Mirzaev, V. | Mammadova, G. | Guliyeva, K.

Productive longevity of cattle is associated with the selection process. For the first time in the Sheki-Zakatala and Nagorno-Shirvan economic regions of Azerbaijan, Holstein cows were bred from Israeli selection. The resulting animals have a higher milk production, are highly adaptable to various feeding technologies. The genetic resources of Israeli breeding animals can be widely used to improve the productivity and breeding qualities of animals in various economic regions located in the Sheki-Zakatala and Nagorno-Shirvan zones.

Show more [+]

Less [-]

Publishing center Science and Practice - Russian Federation

2023

Rojter, Ya.S. | Degtyareva, O.N. | Degtyareva, T.N.

Methods of selection and breeding of meat quails aimed at increasing their fertility have been developed. The work was carried out in one of the farms of the Moscow region. The research objects were Radonezh quails. The developed breed is characterized by high meat productivity, however, its reproductive indicators were significantly inferior to quails of the egg and meat-egg directions of productivity, and the conception rate of eggs is at the level of 75-80%, the hatching rate of young birds was 60-65%, respectively. Experiments to study the sexual behavior of birds were carried out at the beginning (10 weeks), middle (25 weeks) and end of the breeding season (35 weeks). The observation was carried out 3 successive days for the entire length of daylight. In the experiment, attempts to mate initiated by a male (group 1) or a female (group 2) were recorded. In parallel with the observations of the sexual behavior of quails, the time of laying eggs and the distribution of mating attempts initiated by males and females for the entire length of daylight were recorded. Based on observations of the sexual behavior of birds, the main causes of low conception rate of eggs are identified and ways to increase it are outlined by selecting males and females when completing a breeding herd. It has been found that when completing a breeding herd of quails, it is necessary to take into account the height of the male quail and female quail, to carry out measurements by measuring the length of the legs from the heel to the sacrolumbar articulation and subsequently to the tip of the beak, and males being selected to females, according to the total measurement, which should be greater than or at the height of the female, for this method patent No. 2750115 of 22.06.2021 is obtained. For group housing the time of introducing females to males should also taken into account. It is recommended to introduce females in a group of males after 2 days of their joint keeping in a cage. Such a procedure of selecting and introducing quails when completing a breeding herd provides a reliable increase in the conception rate of eggs and, accordingly, hatching young quails. | Разрабатывали методы отбора и подбора мясных перепелов, направленные на повышение их плодовитости. Работа проведена в одном из хозяйств Московской области. Исходным материалом выполненной работы служили перепела породы радонежские. Выведенная порода отличается высокой мясной продуктивностью, однако ее воспроизводительные показатели значительно уступали перепелам яичного и мясо-яичного направления продуктивности, оплодотворенность яиц находится на уровне 75-80%, вывод молодняка составлял 60-65% соответственно. Опыты по изучению полового поведения птицы проводили в начале (10 недель), середине (25 недель) и конце племенного сезона (35 недель). Наблюдение проводили 3 дня подряд в течение всего светового дня. В опыте фиксировали попытки к спариванию, начатые по инициативе самца (1 группа) или самки (2 группа). Параллельно с проводимыми наблюдениями за половым поведением перепелов, фиксировали время снесения яиц и распределение попыток к спариванию начатых по инициативе самцов и самок в течение светового дня. На основании наблюдений за половым поведением птицы определены основные причины невысокой оплодотворенности яиц и намечены пути ее повышения путем подбора самцов и самок при комплектовании племенного стада. Установлено, что при комплектовании племенного стада перепелов необходимо учитывать высоту перепела и перепелки, замеры проводить путем измерения длины ног от пятки до крестцово-поясничного сочленения и в последующем до кончика клюва, причем подбирают самцов к самкам, по суммарному замеру, который должен быть больше или на уровне высоты самки, на данный способ получен патент № 2750115 от 22.06.2021 г. При групповом содержании следует также учитывать сроки подсадки перепелок к перепелам. Рекомендовано в группу самцов подсаживать самок после двухсуточного их совместного содержания в клетке. Такая методика подбора и подсадки перепелов при комплектовании племенного стада обеспечивает достоверное повышение оплодотворенности яиц и соответственно вывод перепелят.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Orlova, E.A. | Paraskiva, E.E. | Fedorova, O.I.

Fur breeding is a branch of agriculture that demonstrates the evolution of fur-bearing animal species, compressed in time. For almost 100 years, constant breeding has been carried out to improve the zootechnical indicators of fur-bearing animals, such as body size, coloration, nappiness, and reproductive ability, while maintaining a number of characteristics of their wild ancestors, for example, seasonality of reproduction. The changes are gradual. The exterior (n=547) and interior (n=18) indicators in sables of the Saltykovskaya 1 breed at the present stage of industrial breeding have been studied. The results were compared with the available literature data for 1932-2022. It was found that over the years of breeding sables in cage conditions, their size indicators changed slightly. In 1967, the live weight of males was 1442.3±33.9 g and body length was 46.3±0.35 cm; in females, it was 998.0±13.3 g and 41.4±0.3 cm, respectively. In 2022, males weighed 1489.9±0.01 g and had a body length of 47.0±0.17 cm; in females, it was 1095.6±0.01 g and 40.8±0.05 cm, respectively. The cage keeping had a greater impact on the morphological and functional state of the sable internal organs. The liver has undergone the most significant changes in the process of domestication of sables. The liver of a cage sable increased in comparison with the liver of a game sable by 60.9% in females and by 15.5% in males, which is probably due to a change in the fodder supply at fur farms. The other sable organs have not changed or have changed slightly in the process of industrial breeding of sables. The observed deviation in the relative size of organs in modern farm-bred sables is considered as adaptation to cage-keeping conditions. Data on the identified domestication changes in some exterior and interior indicators of cage-bred sable can be useful in developing new methods of selection for economically valuable traits. | Звероводство - отрасль сельского хозяйства, которая демонстрирует эволюцию видов пушных зверей, сжатую во времени. В течение почти 100 лет ведется постоянная селекция для улучшения зоотехнических показателей пушных зверей, таких, как размер тела, окраска, опушение и воспроизводительная способность, при сохранении ряда характеристик, свойственных их диким предкам, например, сезонность размножения. Изменения происходят постепенно. Исследованы экстерьерные (n=547) и интерьерные (n=18) показатели соболей породы Салтыковская 1 на современном этапе промышленного разведения. Результаты сравнивали с имеющимися литературными данными за 1932-2022 гг. Обнаружено, что за годы разведения соболей в клеточных условиях их размерные показатели изменились незначительно. В 1967 г. живая масса самцов составляла 1442,3±33,9 г, длина тела - 46,3±0,35 см, у самок - 998,0±13,3 г и 41,4±0,3 см соответственно. В 2022 г. масса самцов составляла 1489,9±0,01 г, длина тела - 47,0±0,17 см, у самок - 1095,6±0,01 г и 40,8±0,05 см соответственно. Клеточное содержание больше повлияло на морфологическое и функциональное состояние внутренних органов соболей. Наиболее значительные изменения в процессе доместикации соболей претерпела печень. Печень клеточного соболя увеличилась по сравнению с печенью промыслового на 60,9% у самок и на 15,5% у самцов, что, вероятно, связано с изменением кормовой базы в звероводческих хозяйствах. Остальные органы соболей в процессе промышленного разведения соболей не изменились или изменились незначительно. Наблюдаемое у современных клеточных соболей отклонение в относительной величине органов рассматривается как адаптация к условиям клеточного содержания. Сведения о выявленных доместикационных изменениях некоторых экстерьерных и интерьерных показателей соболя клеточного разведения могут быть полезны при разработке новых методов отбора на хозяйственно ценные признаки.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Kosovskij, G.Yu. | Glazko, V.I. | Glazko, T.T.

The key problems of using genetics and genomic data for accelerated animal breeding using qualitative and quantitative traits are considered; the importance of regulatory networks for the control of the latter is discussed. The data on the origin of the domestic rabbit are presented, its uniqueness as a model for biological research and development of control methods for the purpose of directed management of the diversity of farm animal species is substantiated. The features of the genome organization of the domestic rabbit, the saturation of its genome with mobile genetic elements and related components of regulatory networks are discussed. The accumulated data on specific candidate genes for the control of economically valuable traits, distribution and variability of regulatory factors associated with non-coding RNAs make it possible to increase the preciseness control of genetic structures in animals and to accelerate the selection process. Currently, the genome of the domestic rabbit has been fully sequenced, its genomic sequences have been annotated, key genes for a small number of phenotypic characteristics have been identified, and the complexity of the organization of the transcriptome of the domestic rabbit has been described. It all provides us more possibilities to use marker-assisted selection and genome selection methods. | Рассматриваются ключевые проблемы использования генетических и геномных данных для ускоренной селекции с использованием качественных и количественных признаков; для контроля последних обсуждается важность регуляторных сетей. Представлены данные о происхождении домашнего кролика, обосновывается его уникальность в качестве модели для биологических исследований и разработок методов контроля в целях направленного управления разнообразием животных с.-х. видов. Обсуждаются особенности геномной организации домашнего кролика, насыщенность его генома мобильными генетическими элементами и связанными с ними компонентами регуляторных сетей. Накопленные данные о конкретных генах - кандидатах контроля хозяйственно ценных признаков, распределении и изменчивости регуляторных факторов, связанных с некодирующими РНК, позволяют увеличивать точность контроля индивидуальных генетических структур животных и способствовать ускорению селекционного процесса. В настоящее время геном домашнего кролика полностью секвенирован, аннотированы его геномные последовательности, выявлены ключевые гены для небольшого количества фенотипических характеристик, описана сложность организации транскриптома домашнего кролика. Все это открывает новые возможности использования методов маркер-вспомогательной и геномной селекции.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Sivkin, N.V. | Strekozov, N.I.

An analysis of the state and trends in dairy cattle breeding in Russia for the period 1990-2021 is carried out. It was revealed that by 2021 there was a relative stabilization of the number of cattle and milk production volumes. There is a tendency to increase the number of animals kept in peasant (farm) holdings. It was possible to significantly increase the productivity of animals kept in agricultural organizations and achieve milk yields of 7000 kg/year. In the context of the breed composition in terms of the number and volume of milk yields, Black-and-White and Holstein cattle dominate with a tendency to increase their importance, but the number of cows of Black-and-White and Kholmogory breeds is decreasing. In 2020, 45.60% of the milk produced was obtained from Black-and-White cows, 31.91% - from Holstein cows. Changes in the engineering capability of dairy cattle breeding aimed at increasing the relative number of farms with loose cows and feeding animals with a complete feed mixture. The success of breeding has led to an increase in the milk productivity of animals, but their productive longevity has decreased. In general, the dairy cattle breeding has a potential for development in large agricultural enterprises and peasant (farm) holdings. According to the forecast, the number of livestock will remain at the current level. In Russia, the same productivity of the main dairy breeds has been achieved as in countries with developed animal husbandry; modern technologies are used in many farms. The main ways to increase milk production will be to further increase the productive potential of livestock, improve technologies, and increase the level of feeding completeness. | Проведен анализ состояния и тенденций в молочном скотоводстве России за период 1990-2021 гг. Выявлено, что к 2021 г. наметилась относительная стабилизация численности поголовья крупного рогатого скота и объемов производства молока. Появилась тенденция к росту поголовья животных, содержащихся в крестьянских (фермерских) хозяйствах. Удалось существенно увеличить продуктивность животных, содержащихся в с.-х. организациях, и достичь удоев 7000 кг/год. В разрезе породного состава по численности и объемам удоев молока доминирует черно-пестрый и голштинский скот с тенденцией роста их значимости, однако поголовье коров черно-пестрой и холмогорской пород сокращается. В 2020 г. 45,60% произведенного молока было получено от коров черно-пестрой породы, 31,91% - от голштинских коров. Изменения технологической базы молочного скотоводства направлены на увеличение относительного числа ферм с беспривязным содержанием коров и кормление животных полнорационной кормосмесью. Успехи селекции привели к росту молочной продуктивности животных, но их продуктивное долголетие сократилось. В целом молочное скотоводство имеет потенциал развития в крупных с.-х. предприятиях и крестьянских (фермерских) хозяйствах. Численность поголовья согласно прогнозу сохранится на текущем уровне. В России достигнута такая же продуктивность основных молочных пород, как и в странах с развитым животноводством; во многих хозяйствах применяются современные технологии. Основными путями увеличения производства молока будут дальнейшее наращивание продуктивного потенциала скота, совершенствование технологий, повышение уровня и полноценности кормления.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Popov, D.V. | Kosovskij, G.Yu. | Glazko, V.I. | Glazko, T.T.

An essential step in preventing the negative effects of homozygosity and the appearance of inbred depression is the development of techniques for choosing animal breeding couples that contribute to relatively high heterozygosity in progeny. We assessed the polymorphism of genomic fragments by polylocus genotyping using flanked inverted repeats of the most polymorphic genomic elements, such as microsatellite sites (ISSR-PCR markers) (CTC)6C, (GAG)6C, and (ACC)6G, as well as fragments of long terminal repeats of endogenous retroviruses (IRAP-PCR markers), Berv-LTR-K1 and LTR-sire-1, in cattle (Holsteinized black and white breed (n=11), Estonian red (n=13), Ayrshire (n=11), and Kazakh white-headed breed (n=10)), as well as domestic rabbits (synthetic Rodnik cross (n=10), Californian (n=10), White Giant (n=10), and Soviet chinchilla (n=10)). The data collected showed that the polymorphism of the ISSR-PCR markers was identical in both species, but that the polymorphism of the IRAP-PCR markers was noticeably different. It became discovered that the range of primer (CTC)6C's genomic fragments exhibited the highest heterozygosity in rabbits and cattle. The рolymorphism information content (PIC) values ranged from 0.172 to 0.092 for rabbits and from 0.092 to 0.300 for cows. In rabbits, there is also a high heterozygosity of the spectra obtained using Berv-LTR-K retrotransposon fragments as primers, the PIC values were 0.188–0.475, and for LTR-sire-1 PIC values were 0.341–0.382, whereas in cattle, these values were 0.093-0.165 for the Berv-LTR-K marker and 0.124-0.214 for LTR-sire-1. The results allow us to recommend analyzing the considered spectra in parental groups to avoid high homozygosity level in the offspring. | Для предупреждения негативных проявлений связанных с огомозигочиванием и проявлением инбредной депрессии важным направлением является разработка методов подбора пар животных, способствующих относительно повышенной гетерозиготности потомства. С этой целью выполнена оценка полиморфизма геномных фрагментов методом полилокусного генотипирования с использованием фланкированных инвертированными повторами наиболее полиморфных геномных элементов – участков микросателлитов (ISSR-PCR маркеры) (СТС)6C, (GAG)6C и (ACC)6G, а также фрагментами длинных концевых повторов эндогенных ретровирусов (IRAP-PCR маркеров) – Berv-LTR-K1 и LTR-sire-1 у крупного рогатого скота (голштинизированная черно-пестрая порода (n=11), эстонская красная (n=13), айрширская (n=11) и казахская белоголовая порода (n=10)), а также домашнего кролика (синтетический кросс Родник (n=10), калифорнийская (n=10), белый великан (n=10) и советская шиншилла (n=10)). Полученные данные позволили обнаружить сходство полиморфизма ISSR-PCR маркеров у обоих видов, а также выраженные различия по полиморфизму IRAP-PCR маркеров. Оказалось, что наибольшая гетерозиготность у кроликов и крупного рогатого скота характерна для спектра геномных фрагментов праймера (CTC)6C. У кролика значения PIC (величины информационного полиморфизма) находились в пределах 0,172-0,092, у коров - 0,092-0,300. У кроликов также отмечается высокая гетерозиготность спектров, полученных при использовании в качестве праймеров фрагментов ретротранспозонов Berv-LTR-K, значения PIC составили 0,188-0,475, и LTR-sire-1 - 0,341-0,382, а у исследованных пород коров эти показатели составили 0,093-0,165 для маркера Berv-LTR-K и 0,124-0,214 для LTR-sire-1. Полученные значения позволяют рекомендовать в селекционном процессе анализ рассмотренных спектров у родительских групп для предупреждения повышения огомозигоченности в потомстве.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Goncharenko, G.М. | Kim, S.А.

Представлены в историческом описании исчезнувшие или находящиеся на грани исчезновения сибирские породы свиней с целью лучшего понимания породообразовательного процесса в отечественной системе разведения и гибридизации свиней, определяющего улучшение продуктивных и породных качеств. Обзор пород свиней в Сибири дан с точки зрения истории их выведения, использованных селекционно-генетических методов и полученных достижений. Отсутствие живых представителей исчезнувших пород не позволяет изучить более глубоко их физиологические, морфологические особенности, потенциал продуктивности на высоком уровне кормления как в условиях современных промышленных комплексов, так и с использованием современных генетических методов селекции. Для обзора использованы литературные источники, в которых достаточно полно описаны породы и типы, приведены данные по продуктивности в условиях существовавшей в то время системы содержания и кормления. Освещены аспекты становления, развития и современного состояния свиноводства, а также существующие в отрасли проблемы. Дано описание следующих пород: сибирской северной, кемеровской, скороспелой мясной (СМ-1), новосибирского типа крупной белой породы, ачинского типа крупной белой породы, кемеровского заводского мясного типа свиней (КМ-1), чистогорской породы, алтайской мясной. Показаны методические подходы и селекционные достижения в выведении новых пород и породных типов в Сибири. Отмечено важное практическое значение селекционно-генетических методов в системе промышленного производства в современных условиях. Рассмотрен вопрос о возможности использования генетического потенциала отечественных пород свиней в условиях импортозамещения на основе прогрессивных технологических и методических подходов ученых и практиков в условиях Сибири. | Historical descriptions of extinct Siberian pig breeds or those on the verge of extinction are presented for better understanding of the breeding process in the domestic pig breeding and hybridization system, which determines the improvement of productive and breed characters. An overview of pig breeds in Siberia is given in terms of the history of pig breeding, the breeding and genetic methods used, and the achievements obtained. The absence of living representatives of extinct breeds does not allow studying more deeply their physiological, morphological features, the potential of productivity at a high level of feeding both in conditions of modern industrial complexes and using modern genetic breeding methods. Literature sources used for the review describe in sufficient detail breeds and types; there are data on pig productivity under the conditions of the then-existing system of housing and feeding. Aspects of the formation, development and the current state of pig breeding, as well as the existing problems in the industry are highlighted. The following breeds are described: Siberian Northern, Kemerovo, Early Maturing Meat (EM-1), Novosibirsk Large White Breed, Achinsk Large White Breed, Kemerovo Commercial Meat Pigs (KM-1), Chistogorsky Breed, and Altai Meat Breed. Methodological approaches and breeding achievements in the breeding of new breeds and breed types in Siberia are shown. The important practical significance of breeding and genetic methods in the system of industrial production in modern conditions is noted. The issue of a possibility of using the genetic potential of domestic pig breeds under conditions of import substitution on the basis of advanced technological and methodological approaches of scientists and practitioners in the conditions of Siberia was considered.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Reinbakh, N.R. | Vakhrameev, A.B. | Ryabova, A.E. | Makarova, A.V. | Fedorova, Z.L.

A comparative study of the homozygous regions distribution in Russkaya belaya, Pushkinskaya and Cornish chicken breeds was carried out to identify the relationship between the results of breeding and productivity traits. The material for the study was DNA of these 3 chicken breeds contained in the bioresource collection of the All-Russian Research Institute of Genetics and Breeding Agricultural Animals (Pushkin-town). DNA samples were screened using the Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip microchip (Illumina, USA). Homozygous regions on individual chromosomes were searched using the PLINK 1.9 program and the detectRuns library in Rstudio. Homozygous areas with an incidence of 50% or higher were identified on chromosomes 1-9, 11, 12, and 15. It has been noted that on the first chromosome in more than 50% in Cornish and Pushkinskaya individuals there are common loci accumulating homozygous regions near the 17.5-21.5 Mb (megabase) region. There are also common loci accumulated in more than 50% of individuals in Pushkinskaya and Russkaya belaya breeds in the region of 42.7-44.7 Mb and 158-161 Mb. The accumulated large number of homozygous regions in Cornish chickens is due to breeding specifics, since this breed is intended for industrial production. The genetic structure of Pushkinskaya and Russkaya belaya breeds is more heterogeneous, which is confirmed by the lower accumulation of homozygous regions. The further research plan involves a more in-depth analysis of the marked homozygous regions to search for candidate genes and to study expression levels of them. | Проведено сравнительное изучение распределения гомозиготных районов в породах кур русская белая, пушкинская и корниш, для выявления связи между результатами селекции и признаками продуктивности. Материалом для исследования являлось ДНК от 3 этих пород кур, содержащихся в биоресурсной коллекции Всероссийского НИИ генетики и разведения с.-х. животных (г. Пушкин). Скрининг образцов ДНК проводился микрочипом Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip ("Illumina", США). Поиск гомозиготных районов по отдельным хромосомам проводился с помощью программы PLINK 1.9 и c помощью библиотеки detectRuns в Rstudio. Выявлены гомозиготные районы с частотой встречаемости 50% и выше на хромосомах 1-9, 11, 12 и 15. Было отмечено, что на первой хромосоме у более чем 50% особей у породы корниш и пушкинская имеются общие локусы накопления гомозиготных районов в районе участка 17.5-21.5 Mb (мегабаз). Имеются также общие участки, накопленные у более 50% особей у породы пушкинская и русская белая в районе 42.7-44.7 Mb и 158-161 Mb. Накопленное большое количество гомозиготных районов у породы корниш обуславливается ее спецификой выведения, поскольку данная порода предназначается для промышленного производства. Породы Пушкинская и русская белая имеют более разнородную генетическую структуру, что подтверждается меньшим накоплением гомозиготных районов. Дальнейший план исследований предполагает более углубленный анализ отмеченных гомозиготных районов для поиска кандидатных генов и изучения их уровня экспрессии.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Lemyakin, A.D. | Tyazhchenko, A.N. | Sabetova, K.D. | Chaitskij, A.A. | Shchegolev, P.O. | Korolev, A.A.

Проведение генетических исследований отечественных локальных пород крупного рогатого скота является актуальным ввиду того, что они являются носителями ценных хозяйственно полезных признаков и обладают высокой способностью адаптироваться к местным условиям. Цель исследования – изучить ассоциацию полиморфных вариантов гена лептина с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота костромской, черно-пестрой и ярославской пород, разводимых в Костромской области. Генотипирование проводили методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ) с применением HRM-анализа. Установлено, что в костромской и ярославской породах наибольшей частотой по локусу LEP-A80V обладал генотип AV (0,546 и 0,452 соответственно), а в черно-пестрой – генотип АА (0,550). В разрезе полиморфизма Y7F гена лептина среди животных всех исследуемых пород коров преобладал генотип YY. По локусу LEP-R25C наибольшая частота встречаемости регистрировалась у особей с генотипом RC (0,486), в то время как у крупного рогатого скота ярославской и черно-пестрой породы – генотип RR (0,690 и 0,483 соответственно). Однако не было найдено статистически значимых различий по показателям воспроизводительной способности между коровами различных генотипов по гену лептина. Есть основания полагать, что у крупного рогатого скота костромской породы желательным генотипом является AV, ярославской – AA (LEP-A80V), у черно-пестрой – RR (LEP-R25C). Наблюдаемые тенденции к наличию более высоких воспроизводительных качеств у носительниц аллелей LEP-A80VA и LEP-R25CR в изучаемых породах крупного рогатого скота подтверждаются исследованиями других авторов. Поэтому изучение влияния полиморфизма гена лептина на воспроизводительные способности коров отечественных молочных пород необходимо продолжить с привлечением существенно большего поголовья животных. | Conducting genetic studies of domestic local breeds of cattle is relevant due to the fact that they are carriers of valuable economic traits and have a high adaptive ability to local conditions. The aim of the research is to study the association of polymorphic variants of the leptin gene with the reproductive ability of cattle of the Kostroma, Black-and-White and Yaroslavl breeds bred in the Kostroma region. Genotyping was performed by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) using HRM analysis. It was found that in the Kostroma and Yaroslavl breeds, the AV genotype (0.546 and 0.452, respectively) had the highest frequency for the LEP-A80V locus, and the AA genotype (0.550) in the Black-and-White breed. In terms of polymorphism Y7F of the leptin gene, the YY genotype prevailed among animals of all the studied breeds of cows. For the LEP-R25C locus, the highest frequency of occurrence was recorded in individuals with the RC genotype (0.486), while in cattle of the Yaroslavl and Black-and-White breeds, the RR genotype (0.690 and 0.483, respectively). However, no statistically significant differences were found in terms of reproductive ability between cows of different genotypes for the leptin gene. There is reason to believe that in cattle of the Kostroma breed the desired genotype is AV, in Yaroslavl cattle it is AA (LEP-A80V), and in Black-and-White cattle it is RR (LEP-R25C). The observed tendencies towards the presence of higher reproductive qualities in the carriers of the LEP-A80VA and LEP-R25CR alleles in the studied cattle breeds are confirmed by the studies of other authors. Therefore, the study of the effect of leptin gene polymorphism on the reproductive abilities of cows of domestic dairy breeds must be continued with the involvement of a significantly larger number of animals.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation