AGRIS - 

2023

Safaryan, E.Yu. | Krivoruchko, A.Yu. | Kanibolotskaya, A.A. | Shelud'ko, P.A.

Genome-Wide Association Study (GWAS) is widely used in the field of genetics and breeding of farm animals. GWAS is based on determining the relationship between some animal parameter and a single nucleotide polymorphism. The research aimed to identify new candidate genes that affect live weight at birth and at the age of 1 year in Russian beef merino rams. The objects of the study were clinically healthy lambs during the neonatal period and at 12 months of age (n = 50). The experimental work was carried out under the conditions of the Stavropol Territory. Animal genotyping was performed using Ovine Infinium HD BeadChip 600K DNA biochips, according to the manufacturer's protocol. Quality control of genotyping was carried out using PLINK V.1.07 software. 2 replacements associated with live weight at birth and 7 replacements associated with live weight of one-year-old rams were discovered. The localization of the analysed SNPs made it possible to identify 8 candidate genes that affect the parameters of meat performance, located on different chromosomes (SOCS6, ENSOARG00000026317, AMOTL2, C1QL2, GNPDA1, USH2A, SLC1A2, ENSOARG00000014102). The protein products of these genes are involved in important intracellular and physiological processes. Further studies will confirm the influence of the proposed candidate genes on the phenotype, as well as examine their structures in detail, to study mutations that cause changes in the phenotype in Russian Merino meat rams. | Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS, Genome-Wide Association Study) широко применяют в области генетики и селекции с.-х. животных. В основе GWAS лежит определение связи между каким-либо параметром животного и однонуклеотидным полиморфизмом. Цель исследований – выявление новых генов-кандидатов, влияющих на живую массу при рождении и в возрасте 1 год у баранчиков породы российский мясной меринос. Объектом исследования служили клинически здоровые баранчики в период новорожденности и в 12-и месячном возрасте (n = 50). Экспериментальную работу проводили в условиях Ставропольского края. Генотипирование животных выполняли с использованием ДНК-биочипов Ovine Infinium HD BeadChip 600K, согласно протоколу производителя. Контроль качества генотипирования осуществляли с использованием программного обеспечения PLINK V.1.07. Обнаружены 2 замены, связанные с живой массой при рождении и 7 замен, связанных с живой массой годовалых баранчиков. Локализация анализируемых SNP позволила выявить 8 генов-кандидатов, влияющих на параметры мясной продуктивности, расположенных на разных хромосомах (SOCS6, ENSOARG00000026317, AMOTL2, C1QL2, GNPDA1, USH2A, SLC1A2, ENSOARG00000014102). Белковые продукты этих генов участвуют в важных внутриклеточных и физиологических процессах. Дальнейшие исследования позволят подтвердить влияние предложенных генов-кандидатов на фенотип, а также детально рассмотреть их структуры, с целью изучения мутаций, вызывающих изменения фенотипа у баранчиков породы российский мясной меринос.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2022

Tetyannikov, N.V. | Bome, N.A.

Метод индуцированного мутагенеза применяется с целью кратковременного повышения частоты мутаций, позволяющих с большей вероятностью получить растения, несущие новые аллели и ценные для селекции признаки. Поиск новых веществ, обладающих высокой мутагенной активностью, представляет интерес для развития мутационной селекции. Для ячменя таким мутагеном является фосфемид. Полевые и лабораторные испытания проводились в 2016–2018 гг. Три генотипа ячменя были обработаны водным раствором препарата фосфемид в концентрациях 0,002% и 0,01%, экспозиция – 3 часа. Статистическая обработка экспериментальных данных проведена методами многофакторного дисперсионного анализа с использованием программного обеспечения Statistica 7. Для средних величин была рассчитана ошибка среднего (Sx). Достоверность различий (P меньше 0.05) определена при помощи t-критерия Стьюдента. Проведена оценка частоты мутаций (Mf), мутагенной результативности (ME) и эффективности (Me). Выявлено, что наибольший вклад в формирование полевой всхожести семян мутантных популяций в поколениях М1 и М2 вносил мутагенный фактор (20,36%), а также взаимодействие факторов "генотип x среда" (18,55%) и "мутаген x среда" (14,93%). Концентрация 0,01% отнесена к полулетальной для двух образцов. В поколении М2 мутагенная результативность 0,002-процентной концентрации фосфемида превышала 0,01% более чем в 4 раза. Низкая концентрация была более эффективна и действенна для сорта 'Зерноградский 813' (17,43%) и образца Dz02-129 (12,04%). Для образца C.I. 10995 высокая концентрация фосфемида оказалась более эффективной (29,66%), обеспечив высокую частоту мутаций (9,79%) на фоне относительно низкой летальности (33,00%). В спектре мутаций выделено 9 различных типов. В поколении М3 отчетливое наследование изменений подтвердилось в 46,43% семей. Наибольшее число семей с подтвержденными изменениями отмечено у образца C.I. 10995 в опыте с более высокой концентрацией. | The method of induced mutagenesis is used to temporarily increase the frequency of mutations, allowing a higher probability of obtaining plants with new alleles and traits valuable for breeding. The search for new agents with high mutagenic activity is of particular interest for the development of mutational breeding. A new mutagen for barley is phosphemide. Field and laboratory studies were conducted in 2016–2018. Three barley genotypes were treated with an aqueous solution of phosphemide at two concentrations: 0.002% and 0.01%, exposure: 3 hours. Experimental data were statistically processed by the analysis of variance (ANOVA) using Statistica 7. The error of the mean (Sx) was calculated for the mean values. Significance of differences (P less than 0.05) was determined by Student's t-test. Mutation frequency (Mf), mutagenic effectiveness (ME), and efficiency (Me) were assessed. It was found that the greatest contribution to formation of field seed germination of mutant populations in M1 and M2 generations was made by the mutagenic factor (20,36%) and interaction of the genotype x environment (18,55%) and mutagen x environment factors (14,93%). The concentration of 0.01% was recognized as semi-lethal for two accessions. In the M2 generation, the mutagenic effectiveness of the 0.002% phosphemide concentration exceeded that of 0.01% more than 4 times. The low concentration was more effective for cv. 'Zernogradsky 813' (17.43%) and accession Dz02-129 (12.04%). For C.I. 10995, a higher concentration of phosphemide had greater effect (29.66%) providing a high mutation frequency (9.79%) against a relatively low lethality (33.00%). Nine different types were identified in the mutation spectrum. In M3 generation, distinct inheritance of the changes was confirmed in 46.43% of families. The highest number of families with confirmed changes was recorded for C.I. 10995 in the experiment with a higher concentration.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Samojlov, A.V. | Suraeva, N.M. | Zajtseva, M.V. | Petrov, A.N.

The most common food preservatives, benzoic and sorbic acids, can pose a risk to human health with prolonged and excessive use and cause mutagenic and carcinogenic effects. A plant bioassay (with Allium cepa) was used to analyze the nature of the side effects of these acids and its reversibility. The experimental technique consisted in the treatment of onion roots with 50 and 100 mg/l of aqueous solutions of benzoic and sorbic acids, followed by reductive germination in water. A comparative assessment of experimental samples with control was carried out on the basis of the following indicators: weight gain and activity of lipid peroxidation enzymes in root tissues, mitotic index and chromosomal aberrations in meristem cells. A reversible toxic effect of these preservatives on the growth of root weight was recorded, since under conditions of regenerative germination. Rate of growth in the experimental samples did not differ or even exceeded (at 100 mg/l) the control values. The treatment of roots with sorbic and benzoic acids led to a multiple decrease in the mitotoxic index in the cells of the meristem; however, upon further incubation in the absence of preservatives, the level of proliferation in the experimental samples did not differ from that in the control samples. Similar results were obtained when evaluating oxidative stress in root tissues caused by exposure to sorbic acid. Irreversible reliable genotoxic effect was recorded only in the analysis of chromosomal aberrations after treatment of roots with benzoic acid at a concentration of 100 mg/l. The level of chromosomal aberrations was higher and their spectrum was different in these samples, in comparison with the control. | Наиболее распространенные пищевые консерванты - бензойная и сорбиновая кислоты - могут представлять риск для здоровья человека при продолжительном и чрезмерном их употреблении и стать причиной проявления мутагенных и канцерогенных эффектов. Для анализа характера побочных эффектов воздействия этих кислот, а именно, их обратимости использовали растительный биотест (Allium cepa). Методика эксперимента заключалась в обработке корней лука водными растворами бензойной и сорбиновой кислот концентрацией 50 и 100 мг/л с последующим восстановительным проращиванием в воде. Сравнительную оценку осуществляли с использованием следующих показателей: прирост массы и активность ферментов перекисного окисления липидов в тканях корней, митотический индекс и хромосомные аберрации в клетках меристемы. Зафиксирован обратимый эффект токсичного действия изучаемых консервантов на прирост массы корней, так как в условиях восстановительного проращивания его скорость в опытных образцах не отличалась или даже превышала (при 100 мг/л) контрольные значения. Обработка корней сорбиновой и бензойной кислотами приводила к многократному снижению митотоксического индекса в клетках меристемы, однако при дальнейшей инкубации в отсутствии консервантов уровень пролиферации в опытных образцах не отличался от такового в контроле. Аналогичные результаты получены при оценке оксидативного стресса в тканях корней, обусловленного воздействием сорбиновой кислоты. Только при анализе хромосомных аберраций после обработки корней бензойной кислотой в концентрации 100 мг/л зафиксирован достоверный необратимый генотоксичный эффект. В этих образцах уровень хромосомных аберраций был выше, чем в контроле, кроме того, отличался и их спектр.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2021

Kovalyuk, N.V. | Shiryaeva, E.V. | Yakusheva, L.I. | Shakhnazarova, Yu.Yu.

The fishy taste in cow's milk is caused by the presence of a nonsense mutation (g.39523051C greater than T) in the bovine FMO3 gene. The object of study was Ayrshire bulls (n = 45). There has been developed a test system for detecting FMO3 polymorphism based on a polymerase chain reaction followed by analysis of restriction fragment length polymorphism using TaqI endonuclease. Fragments that were amplified from the wild-type FMO3 gene site were cleaved by TaqI endonuclease into 2 fragments: 136 and 99 bp. The fragments amplified from the mutant allele did not have a restriction site (their size was - 235 bp). The occurrence of mutation carriers in the domestic subpopulation of Ayrshire cattle was determined. It was found that among Ayrshire bulls belonging to various domestic and foreign breeding organizations, the frequency of occurrence of carriers of the mutation in the FMO gene was 9%. Based on the PCR method/PDRF using TaqI restriction endonuclease there has been developed an easy-to-use test system that allows genotyping cattle by the FMO3 locus. Given that the identified carriers of the mutation are intensively used and can transmit this anomaly to a significant number of daughters, genotyping by the FMO3 locus should become mandatory for breeding bulls and groups of bull-producing cows of breeding Ayrshire farms. | Рыбный привкус в коровьем молоке вызван наличием нонсенс-мутации (g.39523051C больше T) в гене бычьего FMO3. Объектом изучения служили быки айрширской породы (n = 45). Разработана тест-система для выявления FMO3- полиморфизма, основанная на полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин фрагментов рестрикции с использованием эндонуклеазы TaqI. Фрагменты, которые амплифицировались с участка гена FMO3 "дикого" типа, расщеплялись эндонуклеазой TaqI на 2 фрагмента: 136 и 99 пн. Фрагменты, амплифицированные с мутантного аллеля, сайта рестрикции не имели (их размер составлял 235 пн). Определена частота встречаемости носителей мутации в отечественной субпопуляции айрширского скота. Установлено, что среди айрширских быков-производителей, принадлежащих различным отечественным и зарубежным племорганизациям, частота встречаемости носителей мутации в гене FMO составила 9%. На основе метода ПЦР/ПДРФ с использованием эндонуклеазы рестрикции TaqI разработана простая в использовании тест-система, позволяющая генотипировать крупный рогатый скот по локусу FMO3. Учитывая, что выявленные носители мутации интенсивно используются и могут передавать эту аномалию значительному числу дочерей, генотипирование по локусу FMO3 должно стать обязательным для быков-производителей и групп быкопроизводящих коров племенных айрширских хозяйств.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2020

Guchetl', S.Z., The V.S. Pustovoyt All-Russia Research and Development Inst. of Oil–Producing Crops, Krasnodar

Summaries (Ru, En) | 5 ill.,16 ref. | Currently, sunflower varieties and hybrids with high content of oleic acid are very promising. Thus, it is necessary to develop and validate methods of molecular-genetic searching of mutation in high oleic oil of sunflower of the Russian breeding that can advance breeding process using marker-associated selection. As a material we used constant lines and F1 hybrids from the genetic collection of the V.S. Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops (VNIIMK) which are differed by a content of oleic acid on seeds. We evolved genomic DNA from cotyledons of 5–7-days sunflower seedlings using SТАB-buffer. Amplification was done in thermal cycler S1000 (BioRad, США). We used 11 INDEL, HO-specific fragment и SSR-primers developed by foreign authors. In an experimental way, we selected optimal temperatures for hybridization (annealing) for all the primers combinations with DNA matrix. They were from 50 to 65 deg С. Sizes of amplified DNA fragments generally corresponded to the same ones the authors of these markers had. Genotyping of high oleic and linoleic sunflower samples was done using seven pairs of primers. Two loci (F13/R5иN1-1F/N1-1R) of the studied ones amplified in all genotypes independently of a presence of Ol mutation. This allows their using to exclude false negative results for mutation presence. Loci N1-2F/N2-1R, N1-3F/N2-1R,N1-3F/N2-2R,N1-3F/N2-3R F4/R1 are dominant and indicate Ol mutation in high oleic genotypes. These markers are easy to use and require only agar gel usage. The results presented in this article can be used for marker-assistant selection of parental mutant forms in development of hybrids basing on the genotypes differed with their fatty-acid composition. | Перспективными являются сорта и гибриды подсолнечника с высоким содержанием олеиновой кислоты. В связи с этим необходима разработка и валидация методов молекулярно-генетического выявления мутации высокоолеиновости масла в материале подсолнечника российской селекции, что способствовало бы ускорению селекционного процесса при помощи маркер-ассоциированного отбора. Материалом для исследования служили константные линии и гибриды F1 генетической коллекции ВНИИМК, отличающиеся по признаку содержания олеиновой кислоты в семенах. Геномную ДНК выделяли из семядольных листьев 5–7-дневных проростков подсолнечника с использованием СТАВ-буфера. Амплификацию выполняли в термоциклере. Использовали 11 INDEL, HO-specificfragment и SSR-праймеров, разработанных иностранными авторами. Экспериментальным путем были подобраны оптимальные температуры гибридизации (отжига) всех праймерных комбинаций с матрицей ДНК. Они составили от 50 до 65 град. С. Размеры амплифицированных фрагментов ДНК в основном соответствовали полученным авторами, разработавшими данные маркеры. Генотипированиевысокоолеиновых и линолевых образцов подсолнечника проводили с использованием семи пар праймеров. Из анализированных локусов – два (F13/R5 и N1-1F/N1-1R) амплифицируются у всех генотипов независимо от наличия мутации Ol. Это позволяет использовать их для исключения ложноотрицательных результатов на наличие мутации. Локусы N1-2F/N2-1R, N1-3F/N2-1R,N1-3F/N2-2R,N1-3F/N2-3RF4/R1 являются доминантными и маркируют наличие мутации Ol у высокоолеиновых генотипов. Данные маркеры просты в использовании и требуют применения только агарозных гелей. Представленные результаты могут быть использованы для маркер-сопутствующего отбора родительских мутантных форм при получении гибридов на основе генотипов, различающихся по жирно-кислотному составу. | 3 tables

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2020

Kovalyuk, N.V., Krasnodar Research Center for Animal Breeding and Veterinary

In 2018, a new genetic anomaly of Holstein cattle in the SDE2 gene (g.29773628A-G; rs434666183) was discovered by the method of identification of regions with loss of homozygosity. In the heterozygous state, it leads to the carrier of the haplotype HH6, in the homozygous state, it causes a slowdown in the growth of the embryo and spontaneous abortion before the 56th day of pregnancy. The originator of this anomaly is considered to be the Holstein sire MOUNTAIN USAM000002070579 born in 1987. The frequency of occurrence in the modern Holstein population of carriers of the HH6 haplotype is about 1.2%. The frequency of occurrence of carriers of the haplotype HN6 among Holstein cows and sires used in the system of artificial insemination of the Krasnodar territory was established. There are presented the sequences of primers and the method of genotyping. It was found that the frequency of occurrence of carriers of the HH6 haplotype in the genotyped group (60 cows and 63 bulls) was less than 1% (0.8%). The problem of spreading the carrier haplotype HH6 for dairy cattle in the Krasnodar territory is currently not acute, but testing for the presence of haplotype HH6 is desirable to include together with testing for the presence of other haplotypes of Holstein cattle (HH1, HH2, HH3, HH4, HH5, HSD) in the list of mandatory genetic testing of breeding animals in order to prevent the further spread of mutations in the SDE2 gene. | В 2018 г. методом идентификации регионов с потерей гомозиготности открыта новая генетическая аномалия крупного рогатого скота голштинской породы в гене SDE2 (g.29773628A-G; rs434666183). В гетерозиготном состоянии она приводит к носительству гаплотипа НН6, в гомозиготном - вызывает замедление роста эмбриона и самопроизвольный аборт до 56 дня стельности. Родоначальником этой аномалии считают голштинского производителя MOUNTAIN USAM000002070579 1987 г. р. Частота встречаемости в современной голштинской популяции носителей НН6 гаплотипа составляет около 1,2%. Была установлена частота встречаемости носителей гаплотипа НН6 среди коров и быков-производителей голштинской породы, используемых в системе искусственного осеменения Краснодарского края. Приведены последовательности праймеров и методика генотипирования. Установлено, что частота встречаемости носителей гаплотипа НН6 в генотипированной группе (60 коров и 63 быка-производителя) составила менее 1% (0,8%). Проблема распространения носительства гаплотипа НН6 для молочного скотоводства Краснодарского края в настоящее время не является острой, однако тестирование на наличие гаплотипа НН6 желательно включить вместе с тестированием на наличие других гаплотипов голштинского скота (НН1, НН2, НН3, НН4, НН5, НСD) в список обязательных генетических тестирований племенных животных с целью не допустить распространения мутации в гене SDE2 в дальнейшем.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2020

Milovanov, A.V., Kuban State Agrarian Univ., Krasnodar

Европейский культурный виноград Vitis vinifira L. - одна из наиболее распространенных с.-х. культур. Цель исследования - выявление, установление особенностей строения и сравнение аллелей гена VvMybA1 у двух аборигенных и двух интродуцированных в России сортов винограда. В качестве материала были выбраны два окрашенных (Каберне Кортис и Сыпун черный) и два неокрашенных (Шардоне и Сибирьковый) сорта винограда аборигенного и интродуцированного происхождения. Отбирали материал верхушечных листьев растений. ДНК выделяли согласно модифицированной CTAB-методике с добавлением меркаптоэтанола. Для проведения ПЦР и выделения искомых аллелей гена VvMybA1 использовали маркеры, которые позволяют идентифицировать сразу два аллеля - VvMybA1b и VvMybA1c. По результатам выравнивания сиквенсов в программе ClustalO была выявлена однонуклеотидная вставка у белоягодных сортов и замены нуклеотидов в разных позициях у сортов с окрашенной и неокрашенной ягодой. При сравнении с базой данных GenBank NCBI было установлено, что нуклеотидные последовательности аллелей гена VvMybA1 у окрашенных сортов характерны для сортов с ярко выраженной окраской ягод, а у неокрашенных потеря окраски, по-видимому, имела конкретную причину. Так, у сорта Шардоне выявлен аллель, для которого характерна вставка транспозона Gret-1, блокирующего нормальную экспрессию гена VvMybA1. У сорта Сибирьковый аллель гена VvMybA1 не функционален из-за блокировки транспозоном Gret-1. При изучении аминокислотной последовательности, транслируемой с нуклеотидной последовательности анализируемых аллелей, также обнаружены различия между группами окрашенных и неокрашенных сортов. В целом эти различия можно разделить на типичные для окрашенных и неокрашенных сортов, однако у сорта Сыпун черный была выявлена мутация, которая вызвала замену изолейцина на валин, но не повлияла на общую окраску ягод. | European cultivated grape Vitis vinifira L. is one of the most common agricultural crops grown by man since ancient times. The purpose of our study is to describe four alleles of the VvMybA1 gene in the 'Chardonnay', 'Sibirkovskii', 'Cabernet Cortis' and 'Sypun cherny' varieties. The leaves were collected for DNA extraction. DNA was isolated by CTAB method with mercaptoethanol. PCR was performed using primers and amplification parameters published in the literature. For PCR amplification and isolation of VvMybA1 gene alleles we used markers which allow simultaneous identification of two alleles, VvMybA1b and VvMybA1c. Alignment of sequences in the ClustalO program revealed structural features of the allele nucleotide sequences. In particular, a single nucleotide insert was found in white-berry varieties and nucleotide substitutions in different places in varieties with colored and uncolored berries. Further, comparing with the GenBank NCBI database found that the alleles of colored varieties have a structure characteristic for varieties with a pronounced color of berries, while uncolored varieties apparently have a specific reason for the loss of color. Thus, it was found that the 'Chardonnay' has an allele with the insertion of Gret-1 transposon which blocks the normal expression of VvMybA1 gene. It was also revealed that the 'Sibirkovky' also has the allele of VvMybA1 gene which is not functional due to the blocking by Gret-1 transposon. A study of the amino acid sequence also revealed differences between the groups of colored and uncolored varieties. These differences can be obviously divided into those characteristic of colored and uncolored varieties. However, a mutation was detected in 'Sypun cherny', which affected the replacement of the amino acid isoleucine with valine, but did not affect the overall color of the berries.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2019

Konovalova, E.N. | Kostyunina, O.V. | Romanenkova, O.S. | Volkova, V.V., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

Osteopetrosis is a lethal genetic defect with a simple somatic recessive mode of inheritance, which was originally identified in mice and humans. The aim of the work is to study the clinical signs of the disease, the features of its inheritance, as well as the mutation g.114437192_114439942del of the SLC4A2 gene, which is the cause of osteopetrosis in cattle. A test system was developed based on DNA analysis by the ACP-PCR method, which allows identification of the mutant allele of the SLC4A2 gene associated with osteopetrosis, regardless of gender, age and physiological state of the animals. Using the developed test system, screening of Russian cattle populations of Aberdeen-Angus, Simmental, Hereford and Holstein breeds (n = 1025) was carried out, animals-carriers of osteopetrosis were detected in six populations of Aberdeen-Angus breed at a frequency of 1.1-3 3%. The mutant allele frequency of the gene SLC4A2 ir relatively low and does not exceed 5%. The use of the obtained results will provide information on the presence or absence of a mutant allele in the genotype of animals, causing the development of osteopetrosis, and can be recommended as a means of preventing the manifestation of this genetic defect in cattle by eliminating the crossing of carrier animals with each other. | Остеопетроз является летальным генетическим дефектом с простым соматическим рецессивным типом наследования, который первоначально был идентифицирован у мыши и человека. Цель работы – изучить клинические признаки болезни, особенности ее наследования, а также мутацию g.114437192_114439942del гена SLC4A2, являющуюся причиной остеопетроза у крупного рогатого скота. Разработана тест-система, базирующаяся на анализе ДНК методом АС-ПЦР, позволяющая идентифицировать мутантный аллель гена SLC4A2, ассоциированного с остеопетрозом, независимо от пола, возраста и физиологического состояния животных. С использованием разработанной тест-системы проведен скрининг российских популяций крупного рогатого скота абердин-ангусской, симментальской, герефордской и голштинской пород (n=1025), выявлены животные-носители остеопетроза в 6 популяциях абердин-ангусской породы с частотой встречаемости 1,1-3,3%. Частота встречаемости мутантного аллеля гена SLC4A2 относительно низкая и не превышает 5%. Использование полученных результатов позволит получать информацию о наличии или отсутствии в генотипе животных мутантного аллеля, вызывающего развитие остеопетроза, и может быть рекомендовано в качестве средства профилактики проявления данного генетического дефекта у крупного рогатого скота за счёт исключения скрещивания животных-носителей между собой.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Mitrofanova, O.V. | Dement'eva, N.V., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

Using the PCR-RFLP method the interrelation of a single nucleotide substitution in the position of rs313744840 in the myostatin gene and the rate of growth of Pushkin breed cockerels from bioresource collection (St. Petersburg, Pushkin) grown on different types of feed has been analyzed. Cockerels were weighed at birth and at the age of 7, 14, 21, 34, 40, 49, 56, 63, 70 and 90 days. Two groups of birds differing in type of feeding at the rearing stage have been studied. In cockerels grown on the diet for broilers (n = 52) the AG heterozygotes in substitution of rs313744840 in the myostatin gene have differed by the greatest weight gain, they began to show the significant difference (p less 0.05) to their peers from the 14th day of life. In cockerels grown on feed for young laying hens (n = 46) the AA homozygotes have had an advantage in growth, but the difference between the groups has proved to be unreliable. Individuals grown on feeds for broilers with the heterozygous AG genotype in substitution of rs313744840 in the parsley MSTN gene exceeded the live weight of their peers practically during the entire observation period. The use of feed with increased protein content and available energy makes it possible to realize the genetic potential of the bird. | С помощью ПЦР-ПДРФ метода была проанализирована взаимосвязь однонуклеотидной замены в положении rs313744840 в гене миостатина и скорости роста петушков пушкинской породы из биоресурсной коллекции (Санкт-Петербург, Пушкин), выращенных на разном типе корма. Петушков взвешивали при рождении, а затем в возрасте 7, 14, 21, 34, 40, 49, 56, 63, 70 и 90 дней. Изучались две группы птицы, различающиеся по типу кормления на стадии выращивания. У петушков, выращенных на кормах для бройлеров (n=52), наибольшими привесами отличались гетерозиготы AG по замене rs313744840 в гене миостатина, которые начали достоверно (p меньше 0,05) отличаться от своих сверстников с 14 дня жизни. У петушков, выращенных на кормах для молодняка несушек (n=46), преимуществом в росте обладали гомозиготы АА, но различия между группами оказались недостоверными. При сравнении особей с гетерозиготным генотипом AG по замене rs313744840 в гене MSTN петушки, выращиваемые на бройлерных кормах, достоверно превосходили по показателям живой массы своих сверстников практически в течение всего периода наблюдения. Использование корма с повышенным содержанием протеина и обменной энергии позволяет реализовать генетический потенциал птицы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Konovalova, E.N. | Kostyunina, O.V. | Romanenkova, O.S., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

A molecular genetic test system based on the multiplex single-tube allele-specific PCR (STAS PCR) was developed to identify carriers of mutation responsible for the occurrence of multiple arthrogryposis in cattle. The spread of this mutation has been studied in the Russian beef cattle populations. DNA samples of calves, steers, heifers, cows and bulls from 5 populations (n=1205) of Aberdeen-Angus breed: PP1 (n=282), PP2 (n=101), PP3 (n=731), PP4; (n=60), PP5 (n=31) respectively, and one mixed population (hybrid of Kalmyk and Aberdeen-Angus breeds) – PP6: (n=37) were used in the study. The experiment was conducted in the farms of Leningrad (PP 1, 4), Kaluga (P5), Smolensk (P6), Bryansk (P3) and Voronezh (P2) regions. The primer design was developed using the Primer3Plus software. The method provided that from DNA-probes of mutation-free animals will be amplified the normal allele (357 b.p.) only, and from mutation carriers ones - the normal (357 b.p) and mutant (242 b.p) alleles simultaneously. The presence of 2 fragments on the electrophoregramm corresponding to the normal and mutant allele let us to identify carriers of mutation. Screening showed the presence of carriers of multiple arthrogryposis of PP2 cows with a frequency of 0.99% (101 heads) and in 2 PP bulls (PP 1 and 3, 282 heads) with frequencies of 1.06 and 0.94% respectively. The mutation was not detected among cows and young stock in PP 3-6. Carriage of multiple arthrogryposis is relatively rare in Russian populations of cattle, nevertheless the development of measures to prevent spread of this genetic anomaly remains relevant. | Разработана молекулярно-генетическая тест-система на основе метода мультиплексной однопробирочной аллель-специфичной ПЦР (STAS PCR) для выявления носителей мутации, ответственной за возникновение множественного артрогрипоза КРС (МА). Изучали распространение этой мутации в популяциях мясного скота России. Использовали пробы ДНК телят, бычков, телок, коров и быков 5 популяций (ПП) (n=1205) абердин-ангусской породы: ПП1 (n=282), ПП2 (n=101), ПП3 (n=731), ПП4; (n=60), ПП5 (n=31) и одной смешанной ПП (гибрид калмыцкой и абердин-ангусской пород) – ПП6: (n=37), принадлежащих хозяйствам Ленинградской (ПП1, 4), Калужской (ПП5), Смоленской (ПП6), Брянской (ПП3) и Воронежской (ПП2) обл. Дизайн праймеров был разработан с использованием программного обеспечения Primer3Plus и предусматривал у животных, свободных от мутации, амплификацию в ходе ПЦР только нормального аллеля длиной 357 п.н., а у носителей мутации - одновременную амплификацию нормального (357 п.н.) и мутантного (242 п.н.) аллелей. Носителей МА выявляли по наличию на электрофореграмме 2 фрагментов, соответствующих нормальному и мутантному аллелям. Скрининг показал наличие носителей МА в ПП2 коров с частотой 0,99% (101 гол.) и в 2 ПП быков (ПП 1 и 3, 282 гол.) с частотами 1,06 и 0,94% соответственно. Среди коров и молодняка ПП 3-6 мутации не выявляли. Несмотря на относительно низкую частоту встречаемости носительства МА в российских популяциях КРС, разработка мер по профилактике его распространения очень важна.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation