AGRIS - 

Data provenance by Country

2018

Bejshova, I.S., Kostanay State University named after A. Baitursynov

The aim of the investigation was to increase meat productivity of Auliekol and Kazakh White – Headed cattle breeds bred in the territory of the Republic of Kazakhstan by identifying the degree of gene compatibility of pituitary transcription factor (bPit-1), growth hormone (bGH), growth hormone receptor (bGHR) and insulin-like growth factor-1 (bIGF-1). Studies for single nucleotide polymorphism of genes bPit-1, bGH, bGHR and bIGF-1 presence was performed in the Auliekol (n=284, farm "Karkyn") and Kazakh (n=296, LLP "Janibek") breed groups. Blood samples were taken from experimental animals to determine polymorphism of somatotropic cascade genes. DNA was isolated from animal blood using the commercial Pure Link Genomic DNA Kits, according to the manufacturer's instructions. Determination of animal genotypes was performed by PCR-PDRF. On the basis of the conducted researches it has been established that for the formation of the signs of meat productivity, indices of blockiness, boniness, massiviness, lengthiness, narrow quarters at the age of 18 and 24 months, there are associated diplotypes, having a structure comprising genes bGH and bIGF-1. It has been revealed that the presence of the bGH-AluI(LL) genotype in diplotypes leads to a decrease in the signs of meat productivity relative to the total sample, and the presence of the bGH-AluI(LV) genotype – to an increase. The associated diplotypes providing an increase or decrease in the characteristic of meat productivity with age do not change. The data obtained through the analysis of paired combinations allow identifying a greater number of genetic markers, which contributes to the ability to expand the range of animal carriers of the marker genotype to participate in breeding programs. | Цель исследований – повышение мясной продуктивности крупного рогатого скота аулиекольской и казахской белоголовой пород, разводимых на территории Республики Казахстан, за счет выявления степени сочетаемости генов гипофизарного фактора транскрипции (bPit-1), гормона роста (bGH), рецептора гормона роста (bGHR) и инсулиноподобного фактора роста-1 (bIGF-1). Исследования на наличие однонуклеотидного полиморфизма генов bPit-1, bGH, bGHR и bIGF-1 проводили на группах аулиекольской (n=284, хозяйство "Каркын") и казахской белоголовой (n=296, хозяйство "Жанабек") пород. Для определения полиморфизмов генов соматотропного каскада у подопытных животных были отобраны пробы крови. ДНК выделяли из крови животных с использованием коммерческого набора Pure Link Genomic DNA Kits согласно инструкции изготовителя. Определение генотипов животных проводили методом ПЦР-ПДРФ. На основании проведенных исследований установлено, что для формирования признаков мясной продуктивности, индексов сбитости, костистости, массивности, растянутости, шилозадости в возрасте 18 и 24 месяца ассоциированы диплотипы, в структуру которых входят гены bGH и bIGF-1. Выявлено, что наличие в диплотипах генотипа bGH-AluI(LL) приводит к снижению признаков мясной продуктивности относительно общей выборки, а присутствие генотипа bGH-AluI(LV) – к повышению. Ассоциированные диплотипы, обеспечивающие повышение или снижение признака мясной продуктивности, с возрастом не изменяются. Полученные данные за счет анализа парных сочетаний позволяют выявить большее количество генетических маркеров, что способствует возможности расширить диапазон животных – носителей маркерного генотипа для участия в селекционных программах.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Radchenko, E.E. | Kuznetsova, T.L., The N.I. Vavilov All-Russia Inst. of Plant Genetic Resources, St. Petersburg

The greenbug Schizaphis graminum Rondani damages cereal crops mainly in the southern Russia where it is especially harmful to sorghum. The polymorphism of the Krasnodar S. graminum population was studied in 2009 and 2010. The insects were collected from barley in June, and from sorghum in June, July, and August. Damage was assessed in sorghum accessions with the identified genes of resistance to greenbug: ''Sarvashi' (Sgr1 + Sgr2), 'Shallu' (Sgr3), 'Deer' (Sgr4), 'Sorgogradskoe' (Sgr5), White Durra (Sgr5 + Sgr6), and 'Capbam' (Sgr12). They were divided into two groups, each containing three accessions. The virulence phenotype of the aphid clone was coded with a two-digit number, each of the digits being the sum of the resistance grades of the differentiators. We performed monitoring of greenbugs for their virulence to resistant accessions of barley. To define virulence phenotypes, the accessions were combined into two groups: Post–Herb–Wintermalt and k-16190–k-28129–k-15600. А high level of overall and seasonal variability of the insect in its virulence to sorghum resistance genes was detected. In 2009, when outbreak of the insect was observed on sorghum, 31 phenotypes of greenbug virulence to sorghum resistance genes were identified. In the following year (depression period), 27 aphid virulence phenotypes were identified. The experimental results also testify to a relatively high polymorphism of the Krasnodar S. graminum population in its virulence to barley varieties. In 2009, 16 virulence phenotypes were identified, and 22 were identified in 2010. Natural selection of S. graminum genotypes specifically adapted to host plant species was observed. During the reproduction of the insect on barley plants, the individuals without "redundant" genes for virulence to sorghum had an advantage in competition. Replacement of the host led to rapid accumulation of the clones virulent to the sorghum resistance Sgr1 – Sgr4 and Sgr12. | Обыкновенная злаковая тля Sсhizaphis graminum Rondani повреждает злаки преимущественно в южных регионах России, наиболее значительный ущерб наносит культуре сорго. В 2009–2010 гг. на Кубанской опытной станции ВИР анализировали полиморфизм краснодарской популяции S. graminum. Клоны тли собирали на ячмене в июне, а также на сорго в июне, июле и августе. Оценивали поврежденность образцов сорго с идентифицированными генами устойчивости к тле: 'Сарваши' (гены устойчивости Sgr1 + Sgr2); 'Shallu' (Sgr3); 'Deer' (Sgr4); 'Соргоградское' (Sgr5); Дурра белая (Sgr5 + Sgr6); 'Capbam' (Sgr12). Дифференциаторы распределили в две группы по три образца. Фенотип вирулентности клона тли обозначали числом из двух цифр, каждая из которых являлась суммой реакций устойчивости (восприимчивости) дифференциаторов. Провели также мониторинг вирулентности тли к устойчивым образцам ячменя. Образцы для обозначения фенотипов вирулентности распределили в две группы: Post–Herb–Wintermalt и к-16190–к-28129–к-15600. Для оценки изменчивости субпопуляций тли использовали критерии, предложенные Л. А. Животовским. Выявлена высокая общая и сезонная изменчивость насекомого по вирулентности к генам устойчивости сорго. В 2009 г., когда на сорго наблюдали высокую численность насекомого, выявили 31 фенотип вирулентности S. graminum. В 2010 г. (период депрессии) идентифицировали 27 фенотипов вирулентности тли. Результаты экспериментов свидетельствуют и о достаточно высоком полиморфизме краснодарской популяции S. graminum по вирулентности к сортам ячменя. В 2009 г. идентифицировали 16 фенотипов вирулентности, в 2010 г. – 22. Наблюдали отбор из популяции генотипов S. graminum, специфически приспособленных к виду растения-хозяина. При размножении на ячмене преимущество в конкуренции имели особи, не обладающие "лишними" генами вирулентности к сорго. Смена хозяина приводила к быстрому накоплению клонов, вирулентных к генам устойчивости сорго Sgr1 – Sgr4 и Sgr12.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Konovalova, E.N. | Kostyunina, O.V., The L.K. Ehrnst All-Russia Research and Development Inst. of Animal Husbandry, Moscow Region

In the meat cattle populations there are often genetic defects that can cause serious economic damage to the beef cattle breeding. One of them, occurring in the Aberdeen Angus breed, is developmental duplication (polymelia, DD). The aim of the work was to develop a method of DNA diagnostics for the detection of mutant allele causing of polymelia, which helped to carry out an analysis of spreading animals- carrying this pathology among the Russian populations of Aberdeen Angus cattle. Material of the investigation were DNA samples from the animals (n=1342) from 10 Aberdeen Angus cattle populations from different regions of the Russian Federation. DNA was extracted from the biomaterial samples of animals (skin, sperm and blood) by using the conventional methods. There has been developed a test system of diagnostics of DD genetic defect based on PCR-RFLP analysis. The screening of n cattle populations has revealed 0.9-12.8% animals carrying the mutant allele of the NHLRC2 gene. Review of the American Angus Association database has shown that in 2017-2018 the frequency of animals-DD-carriers is more 20%. Due to the high occurrence of mutant allele of the NHLRC2 gene, which causes the manifestation of clinical cases of developmental duplication, both in Russian and foreign populations of Aberdeen-Angus cattle, there is a risk of spreading this pathology in Russia. Therefore, the identification of animal-carriers of the developmental duplication genetic defect for the purpose of prevention of its appearance and spread is pressing and timely, and the developed test system due its high specificity is suitable for solving this problem. | В популяциях крупного рогатого скота мясного направления продуктивности часто встречаются генетические дефекты, проявление которых может наносить серьезный экономический ущерб мясному скотоводству. Одним из таких дефектов, характерных для животных абердин-ангусской породы, является дупликация развития (полимелия, DD). Для выявления мутантного аллеля, обусловливающего проявление полимелии, был разработан способ ДНК-диагностики, посредством которого был проведен анализ распространения животных-носителей данной патологии среди российских популяций крупного рогатого скота абердин-ангусской породы. Материалом исследования были пробы ДНК животных (n=1342), принадлежащих 10 популяциям абердин-ангусов из различных субъектов Российской Федерации. ДНК выделяли из образцов биоматериала животных (кожа, сперма и кровь) при помощи стандартных методов. Была разработана тест-система диагностики генетического дефекта DD на основе ПЦР-ПДРФ анализа. Скрининг популяций крупного рогатого скота выявил 0,9-12,8% животных-носителей мутантного аллеля гена NHLRC2. Обзор базы данных Американской ассоциации абердин-ангусской породы показал, что за 2017-2018 гг. частота встречаемости животных-носителей DD составила более 20%. В связи с высокой частотой встречаемости мутантного аллеля гена NHLRC2, обусловливающего проявление клинических случаев дупликации развития, как в российских, так и в зарубежных популяциях крупного рогатого скота абердин-ангусской породы, существует риск распространения данной патологии на территории России. Поэтому выявление животных-носителей генетического дефекта дупликации развития с целью профилактики его возникновения и распространения является актуальным и своевременным, а разработанная тест-система вследствие своей высокой специфичности подходит для решения этой проблемы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Pochtovyj, A.A. | Krupin, P.Yu. | Divashuk, M.G. | Kocheshkova, A.A. | Sokolov, P.A. | Karlov, G.I., Russian State Agrarian Univ. Center for Molecular Biotechnology, Moscow

The DREB gene encodes the transcription factor DREB involved in the response of the plant to drought, salinity and heat. We studied the DREB1 orthologs in members of the genera Thinopyrum, Dasypyrum and Pseudoroegneria. Using primers designed on the basis of DREB1 conserved regions we amplified fragments of the DREB1 orthologs in Thinopyrum intermedium, Th. ponticum, Th. bessarabicum, Dasypyrum villosum, Pseudoroegneria spicata, and P. stipifolia. The obtained PCR products were cloned and sequenced. As a result, 30 unique sequences were shown to be highly homologous (92-98%) to the TaDREB genes of bread wheat. Between the sequences, we identified multiple single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and several large insertions/deletions. The resulting DNA sequences were translated in silico into hypothetical amino acid sequences. All nucleotide sequences found by us are capable of encoding a complete protein that has a DNA-binding domain specific for DREB AP2. Comparison of the amino acid sequences of the AP2 DNA-binding domain in the studied samples showed the presence of polymorphisms for individual amino acids. In all hypothetical amino acid sequences, except for one the sequence described, amino acids conserved for the DREB AP2-domain of cereals were found. We developed the CAPS marker P18_FokI, which in most cases can differentiate the DREB1 orthologs between wheat and wild relatives due to the presence of polymorphisms in the restriction sites, the fragment amplified from the genome of bread wheat has a size of about 570 bp. A DREB1 ortholog was localized in the homeological group 3 of Th. elongatum (3Je) using P18_FokI and a series of addition bread wheat lines with Th. elongatum chromosomes. | Ген DREB кодирует транскрипционный фактор DREB (dehydration-responsive element binding), участвующий в ответе растения на засуху, засоление, высокую температуру. В настоящей работе были получены последовательности ДНК генов-ортологов DREB1 у представителей родов Thinopyrum, Dasypyrum, Pseudoroegneria, а также разработан CAPS-маркер P18_FokI, которые позволяет различать ген пшеницы TaDREB1 и гены перечисленных видов. Проведена ПЦР с праймерами, соответствующими консервативным участкам гена DREB1, с целью амплификации фрагментов генов-ортологов DREB1 Thinopyrum intermedium, Th. ponticum, Th. bessarabicum, Dasypyrum villosum, Pseudoroegneria spicata, P. stipifolia, ПЦР-продукты клонированы и секвенированы. Получили 30 уникальных последовательностей с высокой степенью гомологии с генами TaDREB мягкой пшеницы (92-98%). Между выявленными последовательностями установлены множественные однонуклетидные полиморфизмы, обнаружены несколько крупных инсерций/делеций. Эти ДНК-последовательности были транслированы in silico в гипотетические аминокислотные последовательности. Все найденные нуклеотидные последовательности оказались способны кодировать полноценный белок, обладающий специфичным для DREB AP2 ДНК-связывающим доменом. Сравнение аминокислотных последовательностей AP2 ДНК-связывающего домена у изученных образцов показало наличие полиморфизмов по отдельным аминокислотам. Во всех гипотетических аминокислотных последовательностях, кроме одной, были выявлены консервативные для AP2-домена DREB-белков злаков аминокислоты. Был создан CAPS-маркер P18_FokI, который в большинстве случаев позволяет различать гены-ортологи DREB1 пшеницы и дикорастущих злаков благодаря наличию полиморфизмов по сайтам рестрикции; фрагмент, амплифицируемый с генома мягкой пшеницы, имеет размер около 570 п.н. Ген-ортолог DREB1 был локализован в третьей гомеологичной группе Th. elongatum 3Je с использованием P18_FokI и серии дополненных линий мягкой пшеницы с хромосомами Th. elongatum.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Yaluga, V.L. | Prozherin, V.P., Arkhangelsk Research and Development Inst. of Agriculture

There are given the results of the study of the genetic structure of the population of the higher breeding group (HBG) of the Kholmogory breed simultaneously for the genes of milk proteins and hormones directly related to the indicators of milk productivity. Genotypes of CSN3, LGB, PRL, GH, LEP genes and their complexes using the PCR-RFLP method were determined in the Kholmogory cows (n=150) belonging to the leading breeding farms of the Archangelsk region. Alleles CSN3A (0.83), LGBB (0.593), PRLG (0.81), GHL (0.877), LEPA (0.857) were found to predominate. Identified were 9 complex genotypes CSN3/LGB, 13 - PRL/GH/LEP, 49 - CSN3/LGB/PRL/GH/LEP. The Kholmogory cows had the following genotypes of milk proteins: CSN3AA/LGBAB (32.7%), CSN3AA/LGBBV (26%). In general, the majority (50.7%) of animals had within the genotype 2 or 3 alleles B of milk protein genes, 38% of cows had 1 allele B. Most Kholmogory cows were carriers of the following genotypes of milk hormones - PRLGG/GHLL/LEPAA (38%), PRLAG/GHLL/LEPAA (20%). In the studied group of animals of 243 theoretically possible, 49 complex genotypes of CSN3/LGB/PRL/GH/LEP with different frequency were detected. In the Kholmogory cows (33.3%), the most common three genotypes were CSN3AA/LGBAB/PRLGG/GHLL/LEPAA, CSN3AA/LGBBB/PRLGG/GHLL/LEPAA, CSN3AA/LGBBB/PRLAG/GHLL/LEPAA, only they were effective for population and exceeded the information threshold of 5%. 23 complex genotypes out of 49 identified ones were single and occurred at a frequency of less than 1%. It should be noted that a total of 15% of cows possessed unique genotypes in the herd. Rare were 46 out of 49 genotypes, their frequency was less than 5%. Together, their frequency is 66.7%. | Приведены результаты исследования генетической структуры поголовья высшей селекционной группы (ВСГ) холмогорской породы одновременно по генам молочных белков и гормонов, напрямую связанных с показателями молочной продуктивности. У коров холмогорской породы (п=150), принадлежащих ведущим племенным хозяйствам Архангельской обл. были определены генотипы генов CSN3, LGB, PRL, GH, LEP и их комплексы с использованием метода ПЦР-ПДРФ. Установили, что у них преобладали аллели CSN3А (0,83), LGBВ (0,593), PRLG(0,81), GHL (0,877), LEPА (0,857). Выявили 9 комплексных генотипов CSN3/LGB, 13 - PRL/GH/LEP, 49 - CSN3/LGB/PRL/GH/LEP. Холмогорские коровы обладали следующими генотипами молочных белков - CSN3АА/LGBАВ (32,7%), CSN3АА/LGBВВ (26%). В целом более половины (50,7%) животных имели в составе генотипа 2 или 3 аллеля В генов молочных белков, 38% коров имели 1 аллель В. Большинство коров холмогорской породы оказались носителями следующих генотипов молочных гормонов - PRLGG/GHLL/LEPАА (38%), PRLАG/GHLL/LEPАА (20%). В исследованной группе животных из 243 теоретически возможных выявлено наличие 49 комплексных генотипов CSN3/LGB/PRL/GH/LEP, с различной частотой встречаемости. У холмогорских коров (33,3%) наиболее часто встречающимися тремя генотипами были CSN3АА/LGBАВ/PRLGG/GHLL/LEPAA, CSN3АА/LGBBВ/PRLGG/GHLL/LEPAA, CSN3АА/LGBBВ/PRLAG/GHLL/LEPAA, только они явились эффективными для популяции и превысили порог информативности 5%. 23 комплексных генотипа из 49 выявленных оказались единичными и встречались с частотой менее 1%. Следует отметить, что уникальными генотипами в стаде обладали в целом 15% коров. Редкими были 46 из 49 генотипов, частота их встречаемости менее 5%. В совокупности их частота составляет 66,7%.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Shmel'kova, E.O., Peoples' Friendship Univ. of Russia, Moscow

The purpose of research is designing and testing of universal primers for PCR amplification of full-length-beta-fructofuranozidase orthologs genes (acid vacuolar invertase (AVI)) in wild species and potato (Solanum tuberosum) varieties. Starch is the main source of energy and a reserve carbohydrate that accumulates in tubers amyloplasts. Glucose molecule, produced by photosynthesis, reacts with fructose and forms sucrose, which is the main transport type of carbohydrates in the plant. At low temperatures starch in tubers breaks down to reducing sugars. In parallel to this process there is happens resynthesis of sucrose to glucose and fructose by AVI encoded by Pain-1 gene. Together, these processes lead to an excessive accumulation of monosaccharides in tubers, cold- sweetening. It creates conditions for the intensive formation of melanoidins, which considerably impairs the commercial quality of the product. The study of Pain-1 gene that encodes the AVI, its identification and structure analysis is an important task required for the search of donors resistant to cold-induced sweetening. The primary task for this is the design and testing of primer combinations that allow amplifying the full-length gene in wild potato species, varieties and lines of cultivated potato. 6 primer combinations were designed (PainF - PainR, PainF - Pain1exR, Pain1exF - Pain3exR, Pain2inF - Pain2inR, Pain3exF - Pain5exR, Pain5exF - PainR), where PainF - PainR primer combination allowed to amplify a full-sized gene, the rest are internal and will be used in the further fragments sequencing of the beta-fructofuranosidase gene. These primers were successfully tested on 15 samples, including 5 wild species of potato (S. gourlay, S. chacoense, S. pinnatissectum, S. stoloniferum, S. vernei) and 10 varieties of Russian and foreign breeding (Gala, Lasunok, Red Scarlet , Rasset Burbank, Miras, Bashkirsky, Zhukovsky ranniy, Matushka, Elizaveta, Sudaryna). | Цель - разработка и тестирование универсальных праймеров для ПЦР-амплификации полноразмерных генов-ортологов бета-фруктофуранозидазы (кислой вакуолярной инвертазы (КВИ)) у видов и сортов картофеля. Крахмал – основной источник энергии и резервный углевод, накапливающийся в амилопластах клубней. Образовавшаяся в результате фотосинтеза молекула глюкозы при реакции с фруктозой образует сахарозу – основную транспортную форму углеводов в растении. При пониженных температур крахмал в клубнях разрушается до редуцирующих сахаров. Параллельно этому процессу идет ресинтез сахарозы до глюкозы и фруктозы за счет фермента КВИ, кодируемой геном Pain-1. В совокупности эти процессы приводят к избыточному накоплению моносахаров в клубнях - холодовому осахариванию. При этом создаются условия для интенсивного образования меланоидинов, что значительно ухудшает товарное качество продукта. Изучение гена Pain-1, кодирующего КВИ, его идентификация и анализ структуры – важная задача, необходимая для поиска доноров, устойчивых к холодовому осахариванию. Первоочередная задача для этого – разработка и тестирование праймерных комбинаций, позволяющих амплифицировать полноразмерный ген у диких видов картофеля, а также сортов и линий культивируемого картофеля. Разработано 6 праймерных комбинаций (PainF – PainR, PainF – Pain1exR, Pain1exF – Pain3exR, Pain2inF – Pain2inR, Pain3exF – Pain5exR, Pain5exF – PainR), среди которых комбинация PainF – PainR позволяла амплифицировать полноразмерный ген, остальные – внутренние и будут использованы в дальнейшем при секвенировании фрагментов исследуемого гена. Эти праймеры успешно протестированы на 15 образцах, включающих представителей 5 дикорастущих видов картофеля (S. gourlay, S. chacoense, S. pinnatissectum, S. stoloniferum, S. vernei) и 10 сортов российской и зарубежной селекции (Гала, Ласунок, Ред Скарлетт, Рассет Бербанк, Мирас, Башкирский, Жуковский ранний, Матушка, Елизавета, Сударыня).

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Sokolova, E.A., All-Russia Research and Development Inst. of Agricultural Biotechnology, Moscow

The aim of this work was to correlate the results of molecular studies of Phytophthora infestans isolates with their characteristics, obtained by traditional phytopathological methods. The isolates were selected from potato leaves from the field collection of the N. I. Vavilov AllRussian Institute of Plant Genetic Resources in 2013–2015. The virulence of the P. infestans lines was determined on the leaf fractions using a set of differentiation plants from the International Potato Center (CIP, Lima, Peru) recognizing 22 pathotypes of P. infestans. The aggressiveness of the lines was determined in a potato tuber test, the resistance to metalaxyl – on potato tubers of the variety of Sante. Isolates and monozoosporous lines, isolated from isolates, harvested in 2015, were grouped on the basis of profiles of virulence factors (the sum of genes detected with the help of differentiation plants). In isolates in 2013 and monozoosporous lines in 2015 pathotypes with a virulence factor from 7 to 11 dominated, which had a virulence gene of 8; and in isolates in 2014 pathotypes with a virulence factor from 6 to 9 prevailed, which lacked a virulence gene 8. The mating type indicators, recorded in phenotypic analysis and with the help of the CAPS marker W16, coincided in 90% of cases. The molecular method for determining this index is reliable and allows obtaining results much faster than the traditional phytopathological method. The allelic composition of the avirulence genes (Avr genes), identified by the cloning and sequencing method, did not correspond much to the profile of virulence factors. Virulence indicators were not associated with resistance to metalaxyl and aggressiveness in the potato tuber test. Aggressiveness, as an indicator of the real harmfulness of P. infestans, did not correspond to the potential harm (profiles of virulence factors and Avr genes). | Цель работы – соотнести результаты молекулярных исследований изолятов Phytophythora infestans с их характеристиками, полученными традиционными фитопатологическими методами. Изоляты отбирали с листьев картофеля из полевой коллекции Всероссийского института генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова в 2013-2015 гг. Вирулентность линий P. infestans определяли на долях листьев, используя набор растений-дифференциаторов из Международного картофельного центра (CIP, Lima, Peru), распознающий 22 патотипа P. infestans. Агрессивность линий оценивали в тесте с клубнями картофеля, устойчивость к металаксилу – на клубнях картофеля сорта Sante. Изоляты и монозооспоровые линии, выделенные из изолятов, собранных в 2015 г., группировали на основе профилей факторов вирулентности (сумма генов, выявленных с помощью растений- дифференциаторов). У изолятов 2013 г. и монозооспоровых линий 2015 г. преобладали патотипы с фактором вирулентности от 7 до 11, имевшие ген вирулентности 8, а у изолятов 2014 г. – патотипы с фактором вирулентности от 6 до 9, у которых отсутствовал ген вирулентности 8. Показатели типа спаривания, зарегистрированные при фенотипическом анализе и с помощью CAPS маркера W16, совпадали в 90% случаев. Молекулярный метод определения этого показателя надежен и позволяет получить результаты намного быстрее, чем традиционный фитопатологический. Аллельный состав генов авирулентности (Avr генов), идентифицированных методом клонирования и секвенирования, мало соответствовал профилю факторов вирулентности. Показатели вирулентности не были связаны с устойчивостью к металаксилу и агрессивностью в тесте с клубнями картофеля. Агрессивность, как показатель реальной вредоносности P. infestans, не соответствовала потенциальной вредоносности (профилям факторов вирулентности и Avr генов).

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Fedorova, Z.L., All-Russia Research and Development Inst. of Farm Animal Genetics and Breeding, St. Petersburg

Involving into breeding chickens carrying sex-linked dwarf gene "dw" can result in sufficient reduction of poultry meat production costs. Due to the effect of this gene, the body weight in hens and cocks reduces up to 27-35% compared to the standard commercial poultry, and feed consumption becomes 30-35% lower. The interest to the practical application of this gene is determined by some advantages of dwarf poultry, namely higher density on the square meter of the working surface, more efficient utilization of nutrients for production, better reproduction performance, stronger egg shell, less egg shell defects and better hatchability. High reproductive parameters of the dwarf hens and their good crossing ability with the cocks of "standard" body weight makes those dwarf hens an optimal mother form for broiler cross. To create new selection forms, we need to have the genetic collections. Commercialization of modern poultry industry resulted in severe reduction of the number of chicken breeds with specific economical values. Rare and vanishing breeds can be considered as a source of valuable genetic material for prospective breeding. At the current level of the development of the biotechnological approaches, as a most reliable way of the preservation of such breeds seems setting up of the specialized gene pool farms. One of such farm has been set up in the Russian Institute of Farm Animal Genetics and Breeding, where are kept some breeds and populations, carriers of "dw" genes. These breeds and crosses, selected with their use, can be used both in commercial and organic production systems. Besides, they can act as gene donors during development new molecular-genetic methods in poultry breeding. | Значительное снижение себестоимости продукции в мясном птицеводстве даёт использование кур-носителей рецессивного, сцепленного с полом гена карликовости "dw". Живая масса кур и петухов под воздействием этого гена снижается на 27-35%, по сравнению с обычной промышленной птицей, благодаря этому они на 30-35 % потребляют меньше корма. Существующий интерес к практическому применению этого гена обусловлен некоторыми преимуществами мини-кур − более высокая плотность посадки на квадратный метр, более эффективное использование питательных веществ корма для производства яиц, более высокая сохранность, лучшая способность к размножению, у яиц более прочная скорлупа, меньше дефектов и хорошая выводимость. Высокие показатели воспроизводительных качеств мини-кур и сочетаемость с обычной по живой массе птицей делает их оптимальной материнской формой для бройлерного кросса. Для конструирования новых селекционных форм необходим своеобразный "резервуар" – хранилище генов. Промышленный путь развития птицеводства привел к значительному сокращению числа пород, имеющих экономическое значение. Редкие и исчезающие породы представляют собой источник генетического материала для селекции в будущем. При достигнутом уровне развития биотехнологии наиболее надежным способом сохранения этих пород является организация специальных генофондных хозяйств. В одном из них, созданном на базе ВНИИ генетики и разведения с.-х. животных, содержатся некоторые породы и популяции с геном карликовости. Породы, имеющие ген карликовости, а также кроссы, созданные на их основе, могут быть использованы как в промышленном, так и в органическом птицеводстве. Они могут также выступать в качестве доноров генов при использовании генно-инженерных методов для создания новых форм.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Rozhmina, T.A. | Golubeva, L.M., All-Russia Research and Development Inst. of Flax, Tver

We conducted phytopathological testing of 20 modern fiber flax varieties of domestic breeding on different backgrounds: with an artificial population of Fusarium oxysporum f. lini and mono-isolate No. 39 of a fungus, which has a strong virulence. The varieties Lenok, Zaryanka, Diplomat, Rosinka, Alexim (originator – All-Russian Research Institute of Flax), Voshod, Rusich (Pskov Research Institute of Agriculture), Tomskiy 17 (Siberian Research Institute of Agriculture and Turfs) showed a high level of resistance (over 80%) to the pathogen on these infected plots that indicates the presence of an effective R-genes to fusarium wilt. Flax varieties Antey (Pskov Research Institute of Agriculture), Alfa (All-Russian Research Institute of Flax) and Tost 5 (Siberian Research Institute of Agriculture and Turfs) showed a decrease in the expression of genes resistance to the disease on the plot with mono-isolate No. 39, compared to the plot where pathogen population was used. Using the hybridologic analysis, we founded a new dominant gene of resistance to F. oxysporum in the variety Lenok – Fu 11. We established resistance to disease in the variety Zaryanka is determined by the gene Fu 2, Voshod – Fu 5, Rusich – Fu 9 and Diplomat – Fu 10. The widespread introduction of varieties with various effective genes will prevent the danger of epiphytoty of fusarium wilt on fiber flax. | Проведено фитопатологическое тестирование 20 современных сортов льна-долгунца отечественной селекции на различных фонах – с искусственной популяцией Fusarium oxysporum f. lini и моноизолятом № 39 гриба, обладающего сильной вирулентностью. Сорта Ленок, Зарянка, Дипломат, Росинка, Алексим (оригинатор – ВНИИЛ), Восход, Русич (Псковский НИИСХ), Томский 17 (Сибирский НИИСХиТ) проявили высокий уровень устойчивости (свыше 80%) к патогену на данных инфекционных фонах, что указывает на наличие у них эффективных R-генов устойчивости к фузариозному увяданию. У сортов льна Антей (Псковский НИИСХ), Альфа (ВНИИЛ) и Тост 5 (Сибирский НИСХиТ) на фоне с моноизолятом № 39 выявлено снижение экспрессии генов устойчивости к болезни по сравнению с фоном, где использовалась популяция возбудителя. На основе гибридологического анализа у сорта льна-долгунца Ленок идентифицирован новый доминантный ген устойчивости к Fusarium oxysporum f. lini – Fu 11. Установлено, что устойчивость к заболеванию у сорта Зарянка детерминируется геном Fu 2, Восход – Fu 5, Русич – Fu 9 и Дипломат – Fu 10. Широкое освоение в производстве сортов, обладающих различными эффективными генами, позволит предотвратить опасность развития эпифитотий фузариозного увядания на льне-долгунце.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2018

Семина, А.Н.

В настоящее время одним из широко применяемых методов лабораторной диагностики сальмонеллёза является метод полимеразно цепной реакции (ПЦР). В данной работе показана возможность использования ПЦР в сочетании с методом секвенирования для выявления и последующей идентификации Salmonella Enteritidis. В качестве гена маркера для анализа проведя аналитический обзор был выбран ген sefA. Данная область содержит участки с высокой степенью консервативности, что является необходимым условием выбора праймеров для ПЦР. Предлагаемые праймеры обеспечивают выявление Salmonella Enteritidis в биологических материалах за короткий промежутоквремени.

Show more [+]

Less [-]

Marina Sokolova Publishings - Russian Federation