AGRIS - 

2023

Baranova, O.A. | Sibikeev, S.N. | Kon'kova, Eh.A.

Due to the increase in the harmfulness of wheat stem rust (Puccinia graminis f. sp. tritici Erikss. and E. Henn.) in the Volga region, and the likelihood of the spread of the aggressive Ug99 race, an assessment of the genetic diversity of wheat breeding lines and identification of effective Sr genes are of fundamental importance. Ninety spring bread wheat introgressive lines with stem rust resistance, developed at the Federal Center of Agriculture Research of the South-East Region, were analyzed. Molecular markers were used to identify resistance genes: Sr24/Lr24, Sr25/Lr19, Sr26, Sr28, Sr31/Lr26, Sr32, Sr36, Sr38/Lr37, Sr39 and Sr57/Lr34. The analysis of plants for resistance was carried out according to standard methods; the Stakman scale was applied to determine the type of reaction. The genes Sr31/Lr26, Sr25/Lr19, Sr57/Lr34, Sr38/Lr37 and Sr39/Lr35 were identified in the analyzed breeding lines. Sr25 was found in 51 lines (56,7% of samples), Sr31 in 41 lines (45.6%), Sr57/Lr34 in 5 lines, Sr38 in 10 lines and Sr39 in one line. Combinations of resistance genes were identified: Sr31+Sr25 in 28 lines (31.1%), Sr25+Sr38 in 5 lines, and Sr25+Sr39 in one line. The Sr24/Lr24, Sr26, Sr28, Sr32 and Sr36 genes were not identified. As a result, promising highly resistant introgressive wheat lines with promising combinations of Sr31+Sr25, Sr25+Sr38 and Sr25+Sr39 genes were identified. They can be used in Russian breeding programs for immunity. | В связи с увеличением вредоносности на территории Поволжья стеблевой ржавчины пшеницы (возбудитель – Puccinia graminis f. sp. tritici Erikss. and E. Henn.) и вероятностью заноса агрессивной расы Ug99 принципиальное значение приобретает оценка генетического разнообразия селекционного материала пшеницы и идентификация эффективных Sr-генов. В работе анализировали 90 интрогрессивных линий яровой мягкой пшеницы селекции Федерального аграрного научного центра Юго-Востока, устойчивых к P. graminis f. sp. tritici. Для выявления генов устойчивости Sr24/Lr24, Sr25/Lr19, Sr26, Sr28, Sr31/Lr26, Sr32, Sr36, Sr38/Lr37, Sr39 и Sr57/Lr34 использовали молекулярные маркеры. Устойчивость растений анализировали по стандартным методикам, тип реакции определяли по шкале Стекмана. У селекционных линий яровой мягкой пшеницы идентифицированы гены Sr31/Lr26, Sr25/Lr19, Sr57/Lr34, Sr38/Lr37 и Sr39/Lr35. Ген Sr25 выявлен у 51 линии (56,7% изученных образцов), Sr31 – у 41 линии (45,6%), Sr57/Lr34 – у 5 линий, Sr38 – у 10 линий и Sr39 – у одной линии. Идентифицированы комбинации генов устойчивости: Sr31+Sr25 – у 28 линий (31,1%), Sr25+Sr38 – у 5 линий и Sr25+Sr39 – у одной линии. Гены Sr24/Lr24, Sr26, Sr28, Sr32 и Sr36 не выявлены. Выделены высокоустойчивые к P. graminis f. sp. tritici линии яровой мягкой пшеницы с перспективными комбинациями генов Sr31+Sr25, Sr25+Sr38 и Sr25+Sr39, которые могут быть использованы в российских селекционных программах.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Il'nitskaya, E.T. | Makarkina, M.V. | Kozina, T.D. | Kozhevnikov, E.A. | Petrov, V.S.

Currently, when implementing breeding programs to produce pathogen-resistant grape genotypes, the DNA marker assessment method is used both directly in breeding-oriented selection and in evaluation of the initial gene pool. The 'Talisman' grape cultivar, with its fine consumer characteristics, resistance to diseases and frost, and a functionally female type of flower, is promising for breeding. We performed a DNA marker assessment of the 'Talisman' genotype and cultivars as well as new hybrids of grapes developed with the participation of cv. 'Talisman' for the presence of the Rpv3 and Rpv12 downy mildew resistance loci. It is known that the presence of these two genes in the same grape genotype has an additive effect. According to the pedigree of cv. 'Talisman' (Frumoasa Albe x Vostorg), the presence of these genes can be assumed in the studied sample. The study was based on PCR with an analysis of the results on an automatic genetic analyzer. DNA was isolated from young shoots of the analyzed plants by the CTAB method. There were used closely linked microsatellite markers recommended for DNA identification of the allelic status of the Rpv3 (UDV305, UDV737) and Rpv12 (UDV343, UDV360) genes. The simultaneous presence of Rpv3 and Rpv12 was detected only in the cv. 'Talisman' genotype. When analyzing the progeny genotypes of cv. 'Talisman', the presence of the Rpv3 downy mildew resistance gene was found in the grape hybrids "Agat Dubovskiy", "Pestry", and Rpv12 gene in the 'Viktor' and 'Preobrazheniye' genotypes. DNA-marker analysis confirmed the prospects of the cv. 'Talisman' genotype for breeding of table cultivars as a donor of the downy mildew resistance genes Rpv3 and Rpv12. | В настоящее время при реализации селекционных программ по созданию устойчивых к патогенам генотипов винограда используют методику ДНК-маркерной оценки как непосредственно в селекционном отборе, так и при оценке исходного генофонда. Сорт винограда 'Талисман', обладая высокими потребительскими характеристиками, устойчивостью к болезням и морозу и функционально женским типом цветка, является привлекательным для селекции. Выполнена ДНК-маркерная оценка генотипа 'Талисман' и сортов, а также новых гибридных форм винограда, созданных с участием сорта 'Талисман' на наличие локусов устойчивости к милдью Rpv3 и Rpv12. Известно, что наличие этих двух генов в одном генотипе винограда имеет аддитивный эффект. Согласно родословной сорта 'Талисман' (Фрумоаса Албэ x Восторг), можно предполагать наличие данных генов в исследуемой выборке. Исследование проведено методом ПЦР с анализом результатов на автоматическом генетическом анализаторе. ДНК выделяли из молодых побегов анализируемых растений методом ЦTAБ. В работе использованы тесно сцепленные микросателлитные маркеры, рекомендованные для ДНК-идентификации аллельного состояния генов Rpv3 (UDV305, UDV737) и Rpv12 (UDV343, UDV360). Одновременное присутствие Rpv3 и Rpv12 определено только в генотипе сорта 'Талисман'. При анализе генотипов – потомков этого сорта наличие гена устойчивости к милдью Rpv3 определено в гибридах винограда под наименованиями "Агат дубовский", "Пёстрый" и гена Rpv12 – в генотипах 'Виктор', 'Преображение'. ДНК-маркерный анализ подтверждает перспективность генотипа 'Талисман' для селекции столовых сортов как донора генов устойчивости к милдью Rpv3 и Rpv12.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Ivanova, I.P. | Kabitskaya, Ya.A.

The genetic improvement of bred dairy cattle is the basis for dairy cattle breeding efficiency increasing and milk production enhancing. The research aim is to identify the polymorphism of the DGAT1 gene in the breeding cows of the dairy-type group. Genotyping of cows was carried out at 4 enterprises situated in the Omsk region, Russia. The number of animals in the selected group was 200 heads. According to the DGAT1 gene, the prevalence range of heterozygotes was from 0.28 to 0.57. At commercial enterprises, the frequency of homozygous genotype AA was 0.16, and at animal breeding enterprises, the frequency of occurrence of the genotype was 0.08. The desired higher frequency genotype occurred in breeding animals and was 0.82. The level of expected heterozygosity (He) for the DGAT1 gene in Red Steppe animals had a significant range of values from 0.3 to 0.49. The analysis carried out to assess the polymorphism of the DGAT1 gene in cattle kept in the Omsk region showed that majority of animals that can transmit to the next generation the desirable breeding performing qualities associated with a high fraction of milk fat are Red Steppe breeding cows of the Omsk regional population. The selection of individuals with the desired genotype to obtain offspring with specified qualities will accelerate the pace of breeding progress in dairy cattle breeding in the Omsk region. | Основой повышения эффективности молочного скотоводства и увеличения производства молока является генетическое совершенствование разводимого крупного рогатого скота молочных пород. Цель исследований – выявить полиморфизм гена DGAT1 у коров селекционной группы молочного направления продуктивности. Генотипирование коров проводилось на 4 предприятиях Омской области. Количество животных в отобранной группе – 200 голов. По гену DGAT1 диапазон частоты встречаемости гетерозигот составлял от 0,28 до 0,57. В товарных предприятиях частота гомозиготного генотипа АА – 0,16, а на предприятиях, разводящих племенных животных, частота встречаемости генотипа составила 0,08. Желательный генотип с большей частотой встречался у племенных животных и составил 0,82. Уровень ожидаемой гетерозиготности (He) по гену DGAT1 у животных красной степной породы имел значительный диапазон – от 0,30 до 0,49. Проведенный анализ по оценке полиморфизма гена DGAT1 у крупного рогатого скота на территории Омской области показал, что большинство животных, которые могут передавать следующему поколению нужные селекционные качества продуктивности, ассоциированные с высокой массовой долей молочного жира – это племенные коровы красной степной породы популяции Омской области. Выделение особей с желательным генотипом с целью получения потомства с заданными качествами позволит ускорить темп селекционного прогресса в молочном скотоводстве Омской области.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Bezborodova, N.A. | Bytov, M.V. | Martynov, N.A. | Kuzhebaeva, U.Zh. | Petropavlovskij, M.V. | Vol'skaya, S.V. | Zubareva, V.D.

At present, much attention of researchers is paid to the study of the role of nitric oxide (NO) in protecting animals from infectious pathogens. The gene for the inducible form of nitric oxide iNOS synthase is expressed after exposure to bacterial agents and inflammatory mediators; it serves as a marker of innate immunity in young cattle; in adult cattle, its allelic variants are associated with the degree of susceptibility to infectious agents. The aim of the study was to evaluate the allelic polymorphism of the iNOS gene for selected markers of resistance and susceptibility of cattle to leukemia in the Ural region. The studies were carried out on Holstein dairy cows (n=164). In the course of the study, the PCR-RFLP protocol was adapted for the analysis of iNOS gene variants for the polymorphism of the AH13-1 marker. Data of the prevalence frequencies of allelic variants of the iNOS gene were obtained according to the restriction fragment length polymorphism: AA is 192/66 b.p.; AB is 258/192/66 b.p.; BB is 258 b.p. In the studied sample of cows (n=164), the frequency of AA genotypes occurrence was 47.6%, AB - 42.7%; BB - 9.7%. The A allele frequency was 0.689, and the B allele frequency was 0.311. A preliminary assessment of the prevalence of allelic polymorphism of the iNOS gene in the study population revealed the greatest distribution of the A allele in dairy cows. In further studies, it is planned to study the degree of association between the iNOS gene polymorphism and the proviral load of the bovine leukemia virus for use in breeding work. | В настоящее время большое внимание исследователей уделяется изучению роли оксида азота (NO) в процессах защиты организма животных от инфекционных патогенов. Ген индуцибельной формы синтазы оксида азота iNOS экспрессируется после воздействия на них бактериальными агентами и медиаторами воспаления; он служит маркером врождённого иммунитета у молодняка крупного рогатого скота, а у взрослого поголовья его аллельные варианты ассоциированы со степенью восприимчивости к инфекционным агентам. Цель исследования - оценка аллельного полиморфизма гена iNOS по выбранным маркерам резистентности и восприимчивости крупного рогатого скота к лейкозу на территории Уральского региона. Исследования проведены на дойных коровах голштинской породы (n=164). В ходе исследования протокол ПЦР-ПДРФ адаптирован для анализа вариантов гена iNOS по полиморфизму маркера AH13-1. Получены данные о частотах распространения аллельных вариантов гена iNOS по полиморфизму длин рестриктных фрагментов: АА равно 192/66 п.н.; AВ равно 258/192/66 п.н.; BВ равно 258 п.н. В исследованной выборке коров (n равно 164) частота встречаемости генотипов АА составляла 47,6%, АВ - 42,7%; ВВ - 9,7%. Частота аллеля A составила 0,689, аллеля B - 0,311. Предварительная оценка распространённости аллельного полиморфизма гена iNOS в исследуемой популяции выявила наибольшее распространение у дойных коров аллеля А. В дальнейших исследованиях планируется изучить степень ассоциации между полиморфизмом гена iNOS и провирусной нагрузкой вируса лейкоза крупного рогатого скота для применения в селекционно-племенной работе.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Shchegolev, P.O. | Sabetova, K.D. | Chaitskij, A.A. | Lemyakin, A.D. | Badanina, L.S.

The work purpose was to analyze scientific publications related to the study describing the effect of the growth hormone gene (bGH) on the performance traits in cattle, mainly in domestic dairy breeds. This review included data of 48 publications selected from electronic libraries: eLibrary, KiberLeninka, and PubMed. The main polymorphisms of the bGH gene, the distribution of genotypes and alleles in various breeds of dairy and beef cattle, as well as the effect of this gene on various performance traits of animals were considered. A review of publications concerning the bGH gene showed a large amount of accumulated data, however, summarizing this information is not an easy task, since some data concerning the issue contradict with each other. Such contradictions may be defined by the complex nature of the interaction of the growth hormone gene with the genes of the somatotropin cascade and some other DNA markers of metabolism. It seems appropriate to study the growth hormone gene exclusively in combination with other genes of the somatotropin cascade (pituitary transcription factor – bPit1, prolactin – bPRL, somatotropin-releasing hormone – bGHRH and insulin-like factor – bIGF1), as well as with other genes encoding metabolic regulators (thyroglobulin – TG5, leptin – LEP, diacylglycerol-O-acyltransferase – DGAT1, etc.) and with genes encoding milk proteins. The study of complex genotypes including the growth hormone gene will reduce the influence of unaccounted genetic factors on the studied animal performance traits. It will increase the accuracy of data analysis and reduce the likelihood of making erroneous decisions during selective and breeding work. | Цель работы - анализ научных публикаций, связанных с изучением влияния гена гормона роста (bGH) на продуктивные признаки крупного рогатого скота, преимущественно в отечественных породах молочного направления продуктивности. В обзор включили данные 48 публикаций из электронных библиотек eLibrary, КиберЛенинка и PubMed. Рассмотрены основные полиморфизмы гена bGH, распределение генотипов и аллелей в различных породах скота молочного и мясного направлений продуктивности, а также влияние данного гена на различные продуктивные признаки животных. Обзор публикаций, затрагивающих ген bGH, показал большой объём накопленных данных, однако обобщение этой информации представляет собой непростую задачу, поскольку некоторые данные о влиянии полиморфизма гена bGH на продуктивные признаки крупного рогатого скота противоречат друг другу. Подобные противоречия могут обуславливаться комплексным характером взаимодействия гена гормона роста с генами соматотропинового каскада и некоторыми другими ДНК-маркерами обмена веществ. Представляется целесообразным изучение гена гормона роста исключительно в комплексе с другими генами соматотропинового каскада (гипофизарного фактора транскрипции – bPit1, пролактина – bPRL, соматотропин-высвобождающего гормона – bGHRH и инсулиноподобного фактора – bIGF1), а также с другими генами, кодирующими регуляторы обмена веществ (тиреоглобулина – TG5, лептина – LEP, диацилглицерол-О-ацилтрансферазы – DGAT1 и др.), и с генами, кодирующими протеины молока. Исследование комплексных генотипов, включающих ген гормона роста, позволит снизить влияние неучтённых генетических факторов на изучаемые продуктивные признаки животных, что повысит точность анализа данных и снизит вероятность принятия ошибочных решений при проведении селекционно-племенной работы.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Safina, N.Yu. | Fattakhova, Z.F. | Gajnutdinova, Eh.R. | Shakirov, Sh.K.

The paper presents the results obtained in 2019-2022. The associations of the coenzyme Q9 (COQ9) gene polymorphism, which affects the energy and metabolic processes in the body, with traits of the reproductive qualities in Holstein heifers have been under study. The experimental population was selected among healthy animal analogues, 251 heads in total. DNA testing of allelic polymorphism G to A (guanine to adenine) of the COQ9 gene, which results in changes in oxidative phosphorylation, that affects the respiratory function of mitochondria, was carried out by PCR-RFLP. Two alleles (A - 0.604; G - 0.396) and three genotypes (AA - 36.6%; AG - 48.2%; GG - 15.5%) have been identified, in the COQ9 - BstMB I gene locus, that indicates the population has genetic biodiversity. The chi-square criterion takes on a value well below the critical value (0.05). The population is in genetic equilibrium according to the Hardy-Weinberg law. The traits of the reproductive ability in 251cows of different genetic groups of the COQ9 gene have been studied. An analysis of the relationship between fertility rates and genotypes of the COQ9 gene showed that individuals with the COQ9AA genotype were characterized by increased live weight during insemination and at calving. Animals with the COQ9AG genotype were characterized by a later age of the first fruitful insemination, while the number of sperm doses spent on them was minimal. The same group of heifers had the shortest calving interval, open day and service period and, as a result, a greater yield of live calves, a high fertility index of Dohi and a reproductive ability coefficient. The data presented in the research prove the influence of genetic factors on the reproductive qualities of cattle, which makes it possible to develop systems for managing the farm animal performance based on the use of molecular genetics methods. | Исследования проводили в 2019-2022 г. с целью изучения ассоциаций полиморфизма гена коэнзим Q9 (COQ9), влияющего на энергетические и метаболические процессы в организме, с показателями репродуктивных качеств коров-первотелок голштинской породы. Опытное поголовье (251 гол.) подбирали из животных-аналогов, содержавшихся в равных условиях в хозяйстве, благополучном по инфекционным и инвазионным заболеваниям. ДНК-тестирование аллельного полиморфизма G - A (гуанин - аденин) гена COQ9, вследствие которого происходят изменения в окислительном фосфорилировании, что отражается на дыхательной функции митохондрий, осуществляли методом ПЦР-ПДРФ. В локусе гена COQ9 - BstMB I идентифицированы два аллеля (A - 0,604; G - 0,396) и три генотипа (AA - 36,6%; AG - 48,2%; GG - 15,5%), что свидетельствует о генетическом биоразнообразии популяции. Хи-квадрат принимает значение намного ниже критического (0,05). Популяция находится в генетическом равновесии согласно закону Харди-Вайнберга. Изучены признаки воспроизводительной способности коров-первотелок разных генетических групп по гену COQ9. По результатам анализа взаимосвязей показателей фертильности и генотипов гена COQ9 особи с генотипом COQ9AA отличались повышенной живой массой во время осеменения и при отеле. Животные с генотипом COQ9AG характеризовались поздним возрастом первого плодотворного осеменения, при этом количество затраченных спермодоз было наименьшим. Первотелки группы COQ9AG отличались самым непродолжительным межотёльным, сухостойным и сервис-периодом, и, как следствие, большим выходом живых телят, высоким индексом Дохи и коэффициентом воспроизводительной способности. Влияние генетических факторов на репродуктивные качества крупного рогатого скота позволяют разрабатывать системы управления продуктивностью с.-х. животных на основе применения молекулярно-генетических методов.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Pozovnikova, M.V. | Larkina, T.A. | Vakhrameev, A.B. | Fedorova, Z.L. | Rejnbakh, N.R. | Ryabova, A.E. | Dement'eva, N.V.

The aim of the study was to analyze the association of polymorphic variants of the LCORL gene for SNP A503G with egg quality in chickens of the Pushkin and Tsarskoye Selo breeds. The sample consisted of dual-use chickens of the Pushkin (n=107) and Tsarskoye Selo (n=90) breeds hatched in 2021 and kept in individual cages. The birds are a part of the bioresource collection "Genetic Collection of Rare Endangered Chicken Breedss" held by All-Russian Research Institute of Genetics and Breeding of Farm Animals (Pushkin, St. Petersburg). The poultry were genotyped by PCR-RFLP. Biophysical properties of the eggs were evaluated in hens at 35 weeks of age. A comparative analysis of the qualitative characteristics of the eggs revealed some differences between the breeds. For example, the eggs of the Pushkin hens differed from the eggs of the Tsarskoye Selo hens in high egg weight (p not more than 0.001) and shell (p not more than 0.01), shell thickness (p not more than 0.01), PPF values (p not more than 0.01), but had a thinner shell membrane (p not more than 0.01). The analysis of the SNP A503G association with the LCORL gene showed that the eggs from the Pushkin chickens with the AG genotype had high mean values for shell thickness (p less than 0.001), shell weight (p less than 0.05) and yolk weight (p less than 0.01). For Tsarskoye Selo chickens, significant associations were obtained for chickens with the AG genotype on the basis of yolk weight (p less than 0.05). | Цель исследований - анализ связи полиморфных вариантов гена LCORL по SNP A503G у кур пород пушкинская и царскосельская с качественными показателями яйца. Выборку составили куры комбинированного направления продуктивности пушкинской (n = 107) и царскосельской (n = 90) пород 2021 г. вывода. Птица содержалась в индивидуальных клетках на базе биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ "Генетическая коллекция редких исчезающих пород кур" (г. Пушкин, Санкт-Петербург). Генотипирование птицы осуществляли методом ПЦР-ПДРФ. Оценку биофизических качеств яиц проводили у кур в возрасте 35 нед. Сравнительный анализ качественных характеристик яиц выявил межпородные различия. Так, яйца кур пушкинской породы по сравнению с яйцами кур царскосельской породы отличались высокой массой яйца (p не более 0,001) и скорлупы (p не более 0,01), толщиной скорлупы (p не более 0,01), значениями ППФ (p не более 0,01), но имели более тонкую подскорлупную оболочку (p не более 0,01). Анализ связи SNP A503G гена LCORL показал, что яйцо, полученное от кур пушкинской породы с генотипом AG, отличалось высокими средними значениями толщины скорлупы (р меньше 0,001), массы скорлупы (р меньше 0,05) и массы желтка (р меньше 0,01). Для кур царскосельской породы значимые ассоциации получены для особей с генотипом AG по признаку массы желтка (p меньше 0,05). Основываясь на полученных данных, SNP A503G гена LCORL можно рекомендовать в качестве ДНК-маркера при селекции кур пушкинской и царскосельской пород для получения яиц с высокой массой желтка.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Volkova, N.A. | German, N.Yu. | Larionova, P.V. | Vetokh, A.N. | Romanov, M.N. | Zinov'eva, N.A.

The rate of fat deposition, including abdominal fat, is one of the important indicators characterizing both meat performance and product quality, as well as the poultry welfare in general. The study objective was to search for SNPs and identify candidate genes associated with abdominal fat deposition in quails. The studies were carried out on F2 males of the model resource population (n = 146) obtained by crossing two quail breeds contrasting in growth rate and meat quality, Japanese (slow growth) and Texas (fast growth). F2 individuals were genotyped using the GBS (genotyping-by-sequencing) method. To identify associations between genome-wide genotyping data and the amount of abdominal fat, PLINK 1.9 software was used with accepted filter settings (geno 0.1, mind 0.1, maf 0.05). The threshold significance criterion was set to be p less than 0.00001. The resultant F2 resource quail population was characterized by high variability in the content of abdominal fat in the carcass. At the age of 56 days, this indicator varied from 0.01 to 10.46 g and averaged 2.41±0.16 g. Based on the GWAS (genome-wide association study) analysis, there were identified 29 SNPs and 11 candidate genes located in the regions of these SNPs that were associated with abdominal fat deposition in quail. The detected SNPs are localized on chromosomes 1, 2, 7, 8, 17, 19, 21, 24 and 28. The candidate genes established (CNTN5, GNAL, PDE1A, RBMS1, PTPRF, SH3GLB2, SLC27A4, TRIM62, IGSF9B, USHBP1, and NR2F6) were identified on chromosomes CJA1 (1 gene), CJA2 (1 gene), CJA7 (2 genes), CJA8 (1 gene), CJA17 (2 genes), CJA21 (1 gene), CJA24 (1 gene) and CJA28 (2 genes). The detected SNPs and candidate genes can serve as genetic markers in breeding programs to improve the meat quality of quails and reduce the fat content in carcasses. | Интенсивность отложения жира, в том числе абдоминального, - один из важных показателей, характеризующих как мясную продуктивность и качество продукции, так и общее здоровье с.-х. птицы. Цель работы - поиск SNPs и идентификация генов-кандидатов, связанных с отложением абдоминального жира у перепелов. Исследования проводили на самцах F2 модельной ресурсной популяции (n = 146), полученной при скрещивании двух контрастных по скорости роста и мясным качествам пород - японских (медленный рост) и техасских (быстрый рост) перепелов. Особей F2 генотипировали методом GBS (genotyping-by-sequencing, генотипирование посредством секвенирования). Для выявления ассоциаций между данными полногеномного генотипирования и количеством абдоминального жира использовали программное обеспечение PLINK 1.9 с принятыми ограничениями (geno 0,1; mind 0,1; maf 0,05). В качестве порогового критерия достоверности установили p менее 0,00001. Полученная F2 ресурсная популяция перепелов характеризовалась высокой вариабельностью по содержанию абдоминального жира в туше. В возрасте 56 сут этот показатель варьировал от 0,01 до 10,46 г и составил в среднем 2,41±0,16 г. На основании проведенного GWAS-анализа (genome-wide association study) идентифицировали 29 SNPs и 11 генов-кандидатов, находящихся в областях расположения этих SNPs, которые ассоциированы с отложением абдоминального жира у перепелов. Обнаруженные SNPs локализуются на хромосомах 1, 2, 7, 8, 17, 19, 21, 24 и 28. Установленные гены-кандидаты (CNTN5, GNAL, PDE1A, RBMS1, PTPRF, SH3GLB2, SLC27A4, TRIM62, IGSF9B, USHBP1, NR2F6) идентифицированы на хромосомах CJA1 (1), CJA2 (1), CJA7 (2), CJA8 (1), CJA17 (2), CJA21 (1), CJA24 (1) и CJA28 (2). Детектированные SNP и гены-кандидаты могут послужить генетическими маркерами в программах селекции на улучшение мясных качеств перепелов и снижение содержания жира в тушках.

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation

2023

Bocharova Yu.A. | Savinova T.A. | Chebotar I.V.

The worldwide successful expansion of ESKAPE pathogens is largely due to their ability to rapidly acquire high antimicrobial resistance levels. The bacterial resistome includes (1) plasmid-encoded genes acquired as a result of horizontal gene transfer, and (2) chromosomal genes associated with the antimicrobial resistance development. This review represents the priority list of the ESKAPE group chromosomal genes, mutations in which are associated with antimicrobial resistance. The diversity of chromosomal genes carrying antimicrobial resistance (AMR) associated mutations confers the rapid pathogen adaptation to antimicrobials by generation of multilevel pathways to neutralize antibiotics. Analysis of the AMR mechanisms associated only with plasmid resistance genes is insufficient. A comprehensive description of AMR mechanisms should include also an analysis of chromosomal genes, mutations in which lead to increased levels of antimicrobial resistance.

Show more [+]

Less [-]

Directory of Open Access Journals - Sweden

2023

Mikhajlova, Yu.A. | Tamarova, R.V.

Interest in studying the beta-casein locus is due to the fact that the products of some of its alleles cause serious abnormalities in the human body. Beta-casein (CSN2) is second in prevalence and content in cow's milk, second only to casein alpha-S1. Of 12 genetic variants of beta-casein, the greatest deteriorators of cow's milk are beta-CNA1 and beta-CNB. The main reason for unfavorable genetic changes is strict selection and the widespread use of a small number of elite bulls, artificial insemination of a large number of cows, multiple ovulation and embryo transplantation (MOET). The entry of the mutant beta-CNA1 allele into Russia occurs through the purchase of breeding material (animals, semen, embryos). In order to assess the possibility of domestic breeding enterprises for breeding to increase the cheese suitability and safety of milk, genotyping at the CSN2 (beta-casein) and CSN3 (kappa-casein) locus was monitored on a sample of Yaroslavl stud bulls and improved genotypes (n=60). It has been established that in Yaroslavl stud bulls, the frequency of occurrence of the desired A2A2 variant at the CSN2 locus (1%) is significantly lower than in bulls of improved genotypes (25%). In terms of the frequency of occurrence of complex desirable genotypes CSN2 and CSN3, Yaroslavl purebred bulls (33%) prevail over bulls of improved genotypes (13%). It is concluded that in order to increase competitiveness, domestic breeding enterprises need to increase the proportion of bulls with genotypes A2A2 (CSN2 locus), AB and BB (CSN3 locus). | Интерес к изучению локуса бета-казеина связан с тем, что продукты некоторых его аллелей вызывают серьёзные отклонения в организме человека. Бета-казеин (CSN2) является вторым по распространённости и по содержанию в молоке коров, уступая только казеину альфа-S1. Из 12 генетических вариантов бета-казеина наибольшими ухудшателями молока коров являются бета-CNА1 и бета-CNВ. Главная причина неблагоприятных генетических сдвигов – это жёсткая селекция и широкое использование небольшого количества элитных быков, искусственное осеменение большого массива коров, множественная овуляция и эмбриотрансплантация (МОЭТ). Поступление мутантного бета-CNА1 аллеля в Россию происходит за счёт покупки племенного материала (животные, семя, эмбрионы). С целью оценки возможности отечественных племенных предприятий для ведения селекции на повышение сыропригодности и безопасности молока, проведен мониторинг генотипирования по локусу CSN2 (бета-казеин) и CSN3 (каппа-казеин) на выборке быков-производителей ярославской породы и улучшенных генотипов (n=60). Установлено, что у быков-производителей ярославской породы частота встречаемости желательного варианта А2А2 по локусу CSN2 (1%) значительно ниже, чем у быков улучшенных генотипов (25%). По частоте встречаемости комплексных желательных генотипов CSN2 и CSN3 ярославские чистопородные быки (33%) преобладают над быками улучшенных генотипов (13%). Заключили, что отечественным племенным предприятиям для повышения конкурентоспособности необходимо увеличить долю быков с генотипами А2А2 (локус CSN2), АВ и ВВ (локус CSN3).

Show more [+]

Less [-]

Central Scientific Agricultural Library - Russian Federation