Acidobacteria

**Acidobacteria** là một ngành vi khuẩn mới được đề xuất gần đây, với các thành viên của nó là đa dạng về mặt sinh lý học và có mặt ở nhiều nơi, đặc biệt là trong đất, nhưng lại chưa có đủ đại diện trong nuôi cấy.

Các thành viên của ngành này là đa dạng về mặt sinh lý học, một số loài là ái acid, và lần đầu tiên được công nhận như là một nhóm riêng lần đầu tiên năm 1997.
Loài đầu tiên của ngành này, *[[Acidobacterium capsulatum]]*, được phát hiện năm 1991. Các loài đáng chú ý khác có *[[Holophaga foetida]]*, *[[Geothrix fermentans]]*, *[[Acanthopleuribacter pedis]]* và *[[Bryobacter aggregatus]]*.
Do mới được phát hiện gần đây và phần lớn vẫn chưa được nuôi cấy nên sinh thái học và trao đổi chất của các loài vi khuẩn này vẫn chưa được hiểu rõ. Tuy nhiên, các vi khuẩn này có thể là các sinh vật có đóng góp quan trọng cho các hệ sinh thái, do chúng rất phổ biến trong các loại đất.

Cũng do môi trường sống là đất tự nhiên của chúng, nhóm chưa phân loại II của Acidobacteria đã từng bị nhận dạng như là tác nhân gây ô nhiễm các thuốc thử của bộ công cụ tách chiết ADN, điều có thể dẫn tới sự xuất hiện có sai sót của chúng trong các bộ dữ liệu quần thể vi sinh vật (microbiodidea) hay bộ gen học tổng thể (metagenomics).

## Phát sinh chủng loài
Phân loại hiện tại được chấp nhận dựa theo Danh sách các tên gọi sinh vật nhân sơ với vị trí hiện tại trong danh pháp (LPSN)
và phát sinh chủng loài lấy theo LTP phiên bản 123 dựa trên ARN 16S ribosome của Dự án cây sự sống muôn loài.

Lưu ý:
♠ Các chủng tìm thấy tại  NCBI nhưng không được liệt kê trong Danh sách các tên gọi sinh vật nhân sơ với vị trí hiện tại trong danh pháp (LSPN)

## Phân loại
* Chi ?*[[Thermoanaerobaculum]]* Losey et al. 2013
** Loài *[[Thermoanaerobaculum aquaticum]]* Losey et al. 2013
* Chi ?"*[[Thermotomaculum]]*" ♠ Izumi et al. 2012
** Loài "*[[Thermotomaculum hydrothermale]]*" ♠ Izumi et al. 2012
* Lớp Blastocatellia ♠ Pascual et al. 2015
** Chi *[[Chloracidobacterium]]* Tank & Bryant 2015 [*Candidatus* Chloracidobacterium Bryant et al. 2007]
*** Loài *[[Chloracidobacterium thermophilum]]* Tank & Bryant 2015 [*Candidatus* Chloracidobacterium thermophilum Bryant et al. 2007]
** Chi *[[Pyrinomonas]]* Crowe et al. 2014
*** Loài *[[Pyrinomonas methylaliphatogenes]]* Crowe et al. 2014
** Bộ "Blastocatellales" ♠ Pascual et al. 2015
*** Họ "Blastocatellaceae" ♠ Pascual et al. 2015
**** Chi *[[Blastocatella]]* Foesel et al. 2013 emend. Pascual et al. 2015
***** Loài *[[Blastocatella fastidiosa]]* Foesel et al. 2013 emend. Pascual et al. 2015
**** Chi *[[Aridibacter]]* Huber et al. 2014
***** Loài *[[Aridibacter famidurans|A. famidurans]]* Huber et al. 2014
***** Loài *[[Aridibacter kavangonensis|A. kavangonensis]]* Huber et al. 2014
**** Chi "*[[Stenotrophobacter]]*" ♠ Pascual et al. 2015
***** Loài "*[[Stenotrophobacter namibiensis|S. namibiensis]]*" ♠ Pascual et al. 2015
***** Loài "*[[Stenotrophobacter roseus|S. roseus]]*" ♠ Pascual et al. 2015
***** Loài "*[[Stenotrophobacter terrae|S. terrae]]*" ♠ Pascual et al. 2015
**** Chi "*[[Tellurimicrobium]]*" ♠ Pascual et al. 2015
***** Loài "*[[Tellurimicrobium multivorans]]*" ♠ Pascual et al. 2015
* Lớp Holophagae Fukunaga et al. 2008
** Bộ Acanthopleuribacterales Fukunaga et al. 2008
*** Họ Acanthopleuribacteraceae Fukunaga et al. 2008
**** Chi *[[Acanthopleuribacter]]* Fukunaga et al. 2008
***** Loài *[[Acanthopleuribacter pedis]]* Fukunaga et al. 2008
** Bộ Holophagales Fukunaga et al. 2008
*** Họ Holophagaceae Fukunaga et al. 2008
**** Chi *[[Geothrix]]* Coates et al. 1999
***** Loài *[[Geothrix fermentans]]* Coates et al. 1999
**** Chi *[[Holophaga]]* Liesack et al. 1995
***** Loài *[[Holophaga foetida]]* Liesack et al. 1995
* Lớp Solibacteres
** Chi *[[Bryobacter]]* Kulichevskaya et al. 2010
*** Loài *[[Bryobacter aggregatus]]* Kulichevskaya et al. 2010
** Chi *[[Paludibaculum]]* Kulichevskaya et al. 2014
*** Loài *[[Paludibaculum fermentans]]* Kulichevskaya et al. 2014
** Bộ "Solibacterales"
*** Họ "Solibacteraceae"
**** Chi "*Candidatus* Solibacter" Ward et al. 2009
***** Loài "*Candidatus* Solibacter usitatus" Ward et al. 2009
* Lớp **Acidobacteria** Cavalier-Smith 2002
** Bộ Acidobacteriales Cavalier-Smith 2002
*** Họ Acidobacteriaceae
**** Chi *[[Acidicapsa]]* Kulichevskaya et al. 2012
***** Loài *[[Acidicapsa borealis|A. borealis]]* Kulichevskaya et al. 2012 (loài điển hình)
***** Loài *[[Acidicapsa ligni|A. ligni]]* Kulichevskaya et al. 2012
**** Chi *[[Acidobacterium]]* Kishimoto et al. 1991
***** Loài *[[Acidobacterium capsulatum]]* Kishimoto et al. 1991
**** Chi *[[Acidopila]]* Okamura et al. 2015 ["*Acidopila*" Okamura et al. 2011]
***** Loài *[[Acidopila rosea|A. rosea]]* Okamura et al. 2015 ["*Acidopila rosea*" Okamura et al. 2011]
***** Loài *[[Acidipila dinghuensis|A. dinghuensis]]* Jiang et al. 2016
**** Chi *[[Bryocella]]* Dedysh et al. 2012
***** Loài *[[Bryocella elongata]]* Dedysh et al. 2012
**** Chi *[[Edaphobacter]]* Koch et al. 2008
***** Loài *[[Edaphobacter aggregans|E. aggregans]]* Koch et al. 2008 emend. Dedysh et al. 2012
***** Loài *[[Edaphobacter dinghuensis|E. dinghuensis]]* Jiang et al. 2016
***** Loài *[[Edaphobacter modestus|E. modestus]]* Koch et al. 2008 (loài điển hình)
**** Chi "*Candidatus* Koribacter" Ward et al. 2009
***** Loài "*Candidatus* Koribacter versatilis" Ward et al. 2009
**** Chi *[[Occallatibacter]]* Foesel et al. 2015
***** Loài "*[[Occallatibacter riparius|O. riparius]]*" ♠ 
***** Loài *[[Occallatibacter savannae|O. savannae]]* Foesel et al. 2015
**** Chi "*[[Silvibacterium bohemicum]]*" ♠ Llado et al. 2016
***** Loài "*[[Silvibacterium bohemicum]]*" ♠ Llado et al. 2016
**** Chi "*[[Terracidiphilus]]*" ♠ Garcia-Fraile et al. 2016
***** Loài "*[[Terracidiphilus gabretensis]]*" ♠ Garcia-Fraile et al. 2016
**** Chi *[[Terriglobus]]* Eichorst et al. 2007
***** Loài *[[Terriglobus albidus|T. albidus]]* Pascual et al. 2015
***** Loài *[[Terriglobus aquaticus|T. aquaticus]]* Baik et al. 2013
***** Loài *[[Terriglobus roseus|T. roseus]]* Eichorst et al. 2007 (loài điển hình)
***** Loài *[[Terriglobus saanensis|T. saanensis]]* Männistö et al. 2011
***** Loài *[[Terriglobus tenax|T. tenax]]* Whang et al. 2014
**** Chi *[[Granulicella]]* Pankratov& Dedysh 2010 emend. Männistö et al. 2012
***** Loài *[[Granulicella arctica|G. arctica]]* Männistö et al. 2012
***** Loài *[[Granulicella cerasi|G. cerasi]]* Yamada et al. 2014
***** Loài *[[Granulicella mallensis|G. mallensis]]* Männistö et al. 2012
***** Loài *[[Granulicella sapmiensis|G. sapmiensis]]* Männistö et al. 2012
***** Loài *[[Granulicella tundricola|G. tundricola]]* Männistö et al. 2012
***** Loài *[[Granulicella paludicola|G. paludicola]]* Pankratov & Dedysh 2010 (loài điển hình)
***** Loài *[[Granulicella pectinivorans|G. pectinivorans]]* Pankratov & Dedysh 2010
***** Loài *[[Granulicella aggregans|G. aggregans]]* Pankratov & Dedysh 2010
***** Loài *[[Granulicella rosea|G. rosea]]* Pankratov & Dedysh 2010
**** Chi *[[Telmatobacter]]* Pankratov & Dedysh 2012
***** Loài *[[Telmatobacter bradus]]* Pankratov & Dedysh 2012

## Tham khảo

* 
* 

## Liên kết ngoài
* ''Acidobacteria bacterium Ellin345'' Trang về bộ gen 
*Dự án bộ gen Acidobacterium (từ Genomes OnLine Database)
*Bài báo tại Science Daily
*Bài báo tại Scientific American