Nepovirus

***Nepovirus*** là một chi virus thuộc bộ *[[Picornavirales]]*, trong họ *[[Secoviridae]]*, thuộc phân họ *[[Comovirinae]]*. Thực vật đóng vai trò là vật chủ tự nhiên. Hiện có 55 loài trong chi này.

Không giống như các chi *[[Comovirus]]* và *[[Fabavirus]]* trong phân họ *Comovirinae*, các virus thuộc chi *Nepovirus* lây truyền qua tuyến trùng (nematode).

## Phân loại
Chi này bao gồm các loài sau đây, được liệt kê theo tên khoa học và theo sau là tên virus đại diện của loài đó:

* *Nepovirus aegaeum*, Artichoke Aegean ringspot virus
* *Nepovirus aeonii*, Aeonium ringspot virus
* *Nepovirus alphaparis*, Paris nepovirus 1
* *Nepovirus alphavitis*, Grapevine nepovirus A
* *Nepovirus americaense*, Cassava American latent virus
* *Nepovirus anatoliense*, Grapevine Anatolian ringspot virus
* *Nepovirus anemones*, Anemone nepovirus A
* *Nepovirus arabis*, Arabis mosaic virus
* *Nepovirus armeniacae*, Apricot latent ringspot virus
* *Nepovirus arracaciae*, Arracacha virus A
* *Nepovirus australiaense*, Lucerne Australian latent virus
* *Nepovirus avii*, Cherry leaf roll virus
* *Nepovirus betae*, Beet ringspot virus
* *Nepovirus betaparis*, Paris polyphylla secovirus 1
* *Nepovirus betasolani*, Potato virus B
* *Nepovirus bulgariense*, Grapevine Bulgarian latent virus
* *Nepovirus cari*, Caraway yellows virus
* *Nepovirus carolinense*, Horse nettle virus
* *Nepovirus cerasiferae*, Myrobalan latent ringspot virus
* *Nepovirus chromusivum*, Grapevine chrome mosaic virus
* *Nepovirus cichorii*, Chicory yellow mottle virus
* *Nepovirus cucumis*, Melon mild mottle virus
* *Nepovirus cycas*, Cycas necrotic stunt virus
* *Nepovirus cynarae*, Artichoke yellow ringspot virus
* *Nepovirus deformationis*, Grapevine deformation virus
* *Nepovirus foliumflabelli*, Grapevine fanleaf virus
* *Nepovirus fontinalis*, Common water moss secovirus
* *Nepovirus glycinis*, Soybean latent spherical virus
* *Nepovirus hibisci*, Hibiscus latent ringspot virus
* *Nepovirus italiaense*, Artichoke Italian latent virus
* *Nepovirus lonchitis*, Tomato fern secovirus
* *Nepovirus lycopersici*, Tomato ringspot virus
* *Nepovirus maculanulatum*, Mulberry ringspot virus
* *Nepovirus manihotis*, Cassava green mottle virus
* *Nepovirus mirae*, Prunus mira virus A
* *Nepovirus mori*, Mulberry mosaic leaf roll associated virus
* *Nepovirus myrtilli*, Blueberry leaf mottle virus
* *Nepovirus nicotianae*, Tobacco ringspot virus
* *Nepovirus nigranuli*, Tomato black ring virus
* *Nepovirus oleae*, Olive latent ringspot virus
* *Nepovirus persicae*, Peach rosette mosaic virus
* *Nepovirus petuniae*, Petunia chlorotic mottle virus
* *Nepovirus poaceae*, Poaceae Liege nepovirus A
* *Nepovirus pratensis*, Red clover nepovirus A
* *Nepovirus ribis*, Blackcurrant reversion virus
* *Nepovirus rubi*, Raspberry ringspot virus
* *Nepovirus sichuanense*, Green Sichuan pepper nepovirus
* *Nepovirus solani*, Potato black ringspot virus
* *Nepovirus stenotaphri*, Stenotaphrum nepovirus
* *Nepovirus theobromatis*, Cocoa necrosis virus
* *Nepovirus trifolii*, Crimson clover latent virus
* *Nepovirus tunisiaense*, Grapevine Tunisian ringspot virus
* *Nepovirus usolani*, Potato virus U
* *Nepovirus vaccinii*, Blueberry latent spherical virus
* *Nepovirus vittariae*, Shoestring fern secovirus

## Cấu trúc
Các virus trong chi *Nepovirus* không có màng bọc, có hình học icosahedral (hai mươi mặt) và đối xứng T=pseudo3. Đường kính khoảng 28-30 nm. Bộ gen là tuyến tính và phân đoạn, gồm hai phần (bipartite), dài khoảng 23,9kb.

## Chu trình sống
Sự nhân lên của virus diễn ra trong tế bào chất. Virus xâm nhập vào tế bào vật chủ thông qua việc thâm nhập trực tiếp. Quá trình nhân lên tuân theo mô hình nhân lên của virus RNA sợi dương. Quá trình phiên mã cũng theo phương thức của virus RNA sợi dương. Virus thoát ra khỏi tế bào vật chủ bằng cách di chuyển qua ống dẫn hướng (tubule-guided viral movement). Thực vật đóng vai trò là vật chủ tự nhiên. Virus được lây truyền qua vật trung gian (tuyến trùng, bọ ve và bọ trĩ).

## Bộ gen
Nepovirus được phân loại là virus nhóm IV theo hệ thống phân loại Baltimore, và do đó chứa bộ gen RNA sợi đơn dương, tuyến tính, gồm hai phần (bipartite). Hai đoạn bộ gen được bao bọc riêng biệt trong hai hạt icosahedral khác nhau. Mỗi đoạn bộ gen tạo ra một chuỗi polypeptide khác nhau, chuỗi này trải qua một loạt các bước (như phân giải protein và các sửa đổi sau dịch mã khác) để tạo ra một protein chức năng.

### RNA1
Đoạn đầu tiên (RNA1) có chiều dài khoảng 8.000 nucleotide và xuất hiện dưới dạng một bản sao duy nhất trong mỗi virion loại B. Nó mã hóa các protein quan trọng trong quá trình nhân lên và là gen đầu tiên được kích hoạt.

### RNA2
Đoạn thứ hai (RNA2) có chiều dài khoảng 4.000–7.000 nucleotide và thường xuất hiện dưới dạng một bản sao duy nhất trong mỗi virion loại M. Nó mã hóa các protein quan trọng trong việc lây truyền giữa các tế bào và trốn tránh sự bảo vệ của tế bào.

## Tham khảo

## Liên kết ngoài
* Viralzone: Nepovirus trên 
* ICTV
* UniProt Taxonomy