アグロバクテリウム

**アグロバクテリウム**とはグラム陰性細菌に属する土壌細菌・植物病原菌である*Agrobacterium*属の細菌のことであるが、特にそのうちの1種**アグロバクテリウム・トゥメファシエンス ''Agrobacterium tumefaciens*** を指すことが多い。アグロバクテリウムは、[[植物]][[細胞]]に感染して[[デオキシリボ核酸|DNA]]を送り込む（[[形質転換]]）性質があるため、植物の[[バイオテクノロジー]]でよく利用される。

2001年から2022年にかけ、リゾビウム科は大規模な統合・分割・整理を複数回受けている。アグロバクテリウム属や*Agrobacterium tumefaciens*は、一度消滅した後、以前とは異なる範囲で復活した。

この過程で大幅に分類が変わっているため、植物学やバイオテクノロジーで使用される”アグロバクテリウム”と、分類学上のアグロバクテリウム属や*Agrobacterium tumefaciens*の範囲は一致していない。以降、”アグロバクテリウム”について説明する。

== 植物に対する病原性 ==


腫瘍原性アグロバクテリウムは多くの[[双子葉植物]]および一部の[[裸子植物]]・[[単子葉植物]]に[[虫こぶ]]様の腫瘍（根元などに生じ、根頭癌腫、クラウンゴール crown gall と呼ばれる）を起こす。この菌は[[Tiプラスミド]]（pTi: Tiはtumor-inducingの略）と呼ばれる巨大な[[プラスミド]]を有しており、その一部であるT-DNA（transfer DNAの意）と呼ばれるDNA断片を植物細胞に注入し、T-DNAは[[相同組換え]]により植物細胞の[[ゲノム]]に挿入される。ただし、T-DNAの両末端の極めて短い配列とゲノムの配列との相同組換えであるため挿入位置はかなりランダムであり、実質的にはほとんどが[[非相同組換え]]によってゲノムに挿入されるといってよい。T-DNAは[[植物ホルモン]]（[[オーキシン]]と[[サイトカイニン]]）を生成する[[酵素]]の[[遺伝子]]である*iaaM*(*tms1*), *iaaH*(*tms2*), *iptZ*(*tmr*)を含み、これらによって生産される大量のオーキシンやサイトカイニンにより腫瘍が形成される。またT-DNAはオパイン (オピン: Opine) と総称される特殊な[[イミノ酸]]（アグロバクテリウムは炭素源や窒素源として[[代謝]]できるが、他の細菌はほとんど利用できない）を植物に作らせる酵素をコードしている。[[根粒菌]]などの窒素固定細菌とは異なりアグロバクテリウムは[[寄生]]細菌であって、植物にとって利益はない。このアグロバクテリウムの性質は「植物に対する遺伝的植民地化」とも喩えられる。

Tiプラスミドは大きい（20万[[塩基対]]前後）プラスミドで、T-DNAの他にT-DNAを植物細胞に輸送するのに働く遺伝子群(*vir* region)やオパインを分解消費するための遺伝子などを持っている。*vir* regionは*virA*, *B*, *G*, *C*, *D*, *E*の６つの[[オペロン]]から形成されており、それぞれのオペロンは複数の[[構造遺伝子]]を含んでいる。なお、*virC*オペロンのみ転写方向が他の*vir*オペロンとは異なる。[[サクラ]]の木と[[サクランボ]]の木のクラウンゴールから分離されたTiプラスミド（pTi-SAKURAとpTiC58）の全塩基配列が明らかにされている。最もよく研究されている細胞株は*A. tumefaciens* C58（[[サクランボ]]の木のクラウンゴールから分離された）で、GoodnerらとWoodらにより同時にゲノムの完全配列が明らかにされた。*A. tumefaciens* C58のゲノムは環状の染色体、2個の環状プラスミド、および1本の直線状染色体からなる。環状染色体を有する細菌はごく普通だが、それに加え直線状染色体を持つのはアグロバクテリウム属の一部のグループに特有である。2つの環状プラスミドはpTiC58（[[病原性]]に関与する）とpAtC58である。pAtC58はオパイン（*A. tumefaciens'' C58が生成するオパインはノパリン〔Nopalin〕と呼ばれる）の代謝に関与し、これはpTiC58がない場合には他の細菌にも転移する。

なお、植物の腫瘍はアグロバクテリウムだけでなくむしろ昆虫（虫こぶ）などによるものが多い。根にこぶを作る病原体には根こぶ病菌（原生生物ネコブカビ）やネコブセンチュウ（線虫）がある。

また発根性アグロバクテリウムはpTiに相当するプラスミドpRi内にT-DNAをもつが、これは植物に腫瘍でなく不定根を発生させる性質がある。この不定根の形成はひげ毛病とよばれ、高密度に枝分かれした根が大量に増殖するというものである。これを利用するのが毛状根培養である。

## バイオテクノロジーへの利用

T-DNAは植物遺伝子工学の特に有用なベクターであり、アグロバクテリウムのDNA転移能力は植物の核ゲノムに外来遺伝子を導入する（トランスジェニック植物の作出）手段として盛んに利用されている。

具体的には、目的の遺伝子配列と植物での選択マーカー遺伝子をT-DNA内に挿入し、それを植物細胞の核ゲノムに挿入させる。T-DNAの中で植物ゲノムへの挿入に必須なのはT-DNA両端に存在するRB(right border:右境界配列)とLB(left border:左境界配列)とよばれる25塩基対(コンセンサス配列: 5'-TGGCAGGATATATN(C/G)N(G/A)(T/G)TGTAA(A/T)(T/C)-3', NはACGTのいずれでも構わない)である。RBとLBに挟まれた内側の配列には特異性はなく、どのような配列でも構わない。また、野生型のT-DNA中に存在する腫瘍形成遺伝子群は挿入には必要ないだけでなく植物体再生に悪影響を及ぼす。そこで、腫瘍形成遺伝子群を目的の遺伝子と置き換えれば、目的の遺伝子を植物細胞に導入できるうえに増殖した形質転換細胞が腫瘍を形成することもない。

形質転換植物体を得る方法としては、まず組織または細胞にアグロバクテリウムを感染させ、これを培養して植物体に再生させる方法がある。もう1つの方法としては、花にアグロバクテリウムを感染させ、種子を形成させる方法(フローラル・ディップ(floral dip)法やフローラル・スプレー(floral spray)法)がある。

形質転換植物の作製法の詳細については、遺伝子組換え作物の作製法を参照。

一例としてホタルのルシフェラーゼを用いた「光る植物」の作出にも用いられ、この方法は植物の葉緑体機能の研究やレポーター遺伝子（遺伝子の調節領域の研究用）としての利用に有用である。アグロバクテリウムは自然には双子葉植物などにしか感染しないが、現在ではT-DNAはイネなどの単子葉植物や真菌などでの利用も可能になっている。さらにT-DNAをヒトの細胞に転移することも実験的には可能である。

## その他の性質
アグロバクテリウムが植物細胞にT-DNAを送り込むメカニズムは、タイプIV分泌系といわれ、ヒト病原菌の多くが細胞にタンパク質などを送り込むメカニズム（タイプIII分泌系）に類似している。また多くのグラム陰性細菌に見られるクオラムセンシング（他の同種菌の分泌物質を感知して同調行動を取るためのシグナル伝達系）を有する。

## 脚注

### 注釈

### 出典