Chlorobium

***Chlorobium*** adalah sebuah genus dari bakteri sulfur hijau. Bakteri ini merupakan pengoksidasi fotolitotrofik sulfur dan yang paling penting memanfaatkan rantai transpor elektron non-siklik untuk mereduksi NAD+. Fotosintesis dicapai dengan menggunakan Pusat Reaksi Tipe 1 menggunakan bakterioklorofil (BChl) *a*. Dua kompleks antena fotosintetik membantu dalam penyerapan cahaya: kompleks Fenna-Matthews-Olson ("FMO", juga mengandung BChl *a*), dan klorosom yang sebagian besar menggunakan BChl *c*, *d*, atau *e*. Hidrogen sulfida digunakan sebagai sumber elektron dan karbon dioksida sebagai sumber karbonnya.

Spesies *Chlorobium* menunjukkan warna hijau gelap; dalam kolom Winogradsky, lapisan hijau yang sering teramati terdiri dari *Chlorobium*. Genus ini hidup dalam kondisi anaerobik ketat di bawah permukaan badan air, umumnya di zona anaerobik dari danau eutrofik.

*[[Chlorobium aggregatum]]* adalah spesies yang hidup dalam hubungan simbiosis dengan bakteri nonfotosintetik tidak berwarna. Spesies ini tampak seperti kumpulan bakteri hijau, yang melekat pada sel pusat seperti batang yang dapat bergerak dengan flagelum. Bakteri hijau bagian luar menggunakan cahaya untuk mengoksidasi sulfida menjadi sulfat. Sel bagian dalam, yang tidak dapat melakukan fotosintesis, mereduksi sulfat menjadi sulfida. Bakteri ini membelah secara serempak, memberikan struktur tersebut penampakan multiseluler yang sangat tidak biasa pada bakteri.

Spesies *Chlorobium* diduga telah memainkan peran penting dalam peristiwa kepunahan massal di Bumi. Jika lautan menjadi anoksik (akibat terhentinya sirkulasi laut), maka *Chlorobium* akan mampu mengungguli kehidupan fotosintetik lainnya. Mereka akan menghasilkan metana dan hidrogen sulfida dalam jumlah besar yang akan menyebabkan pemanasan global dan hujan asam. Hal ini akan berdampak besar bagi organisme laut lainnya dan juga bagi organisme darat. Bukti untuk populasi *Chlorobium* yang melimpah diberikan oleh fosil kimia yang ditemukan dalam sedimen yang diendapkan pada kepunahan massal Kapur.

## Signatur molekuler untuk ''Chlorobiota''

Analisis genomik komparatif telah mengarah pada identifikasi 2 celahan sisipan terlestarikan yang secara unik ditemukan pada anggota filum *Chlorobiota* (sebelumnya Chlorobi) dan dengan demikian menjadi ciri khas filum tersebut. Celahan sisipan pertama adalah sisipan 28-asam amino pada DNA polimerase III dan yang kedua adalah sisipan 12 hingga 14 asam amino pada alanil-tRNA sintetase. Celahan sisipan ini tidak ditemukan pada bakteri lain dan dengan demikian berfungsi sebagai penanda molekuler untuk filum tersebut. Selain celahan sisipan terlestarikan, 51 protein yang secara unik ditemukan pada anggota filum *Chlorobiota*. 65 protein lain telah diidentifikasi yang unik untuk filum *Chlorobiota*, namun protein ini tidak ada pada beberapa spesies *Chlorobiota* dan tidak terdistribusi ke seluruh filum dengan pola yang jelas. Ini berarti bahwa kehilangan gen yang signifikan mungkin telah terjadi, atau keberadaan protein ini mungkin merupakan hasil dari transfer gen horizontal. Dari 65 protein ini, 8 ditemukan hanya pada *Chlorobium luteolum* dan *Chlorobium phaeovibrioides*. Kedua spesies ini membentuk klad yang didukung kuat dalam pohon filogenetik dan hubungan dekat antara spesies ini semakin didukung oleh keunikan berbagi 8 protein ini.

### Keterkaitan filum ''Chlorobiota'' dengan ''Bacteroidota'' dan ''Fibrobacterota''

Spesies dari filum *Bacteroidota* (sebelumnya Bacteroidetes) dan *Chlorobiota* bercabang sangat berdekatan dalam pohon filogenetik, menunjukkan hubungan yang dekat. Melalui penggunaan analisis genomik komparatif, 3 protein telah diidentifikasi yang secara unik digunakan bersama oleh hampir semua anggota filum *Bacteroidota* dan *Chlorobiota*. Keberbagian 3 protein ini signifikan karena selain 3 protein ini, tidak ada protein dari filum *Bacteroidota* atau *Chlorobiota* yang digunakan bersama oleh kelompok bakteri lain mana pun. Beberapa celahan sisipan terlestarikan juga telah diidentifikasi yang secara unik digunakan bersama oleh anggota filum *Bacteroidota* dan *Chlorobiota*. Keberadaan signatur molekuler ini mendukung hubungan dekat filum *Bacteroidota* dan *Chlorobiota*. Selain itu, filum *[[Fibrobacterota]]* (sebelumnya Fibrobacteres) diindikasikan berkerabat secara spesifik dengan kedua filum ini. Sebuah klad yang terdiri dari ketiga filum ini sangat didukung oleh analisis filogenetik berdasarkan sejumlah protein yang berbeda. Filum ini juga bercabang pada posisi yang sama berdasarkan celahan sisipan terlestarikan dalam sejumlah protein penting. Terakhir dan yang terpenting, dua celahan sisipan terlestarikan (dalam protein RpoC dan dalam serin hidroksimetiltransferase) dan satu protein penanda PG00081 telah diidentifikasi yang secara unik digunakan bersama oleh semua spesies dari ketiga filum ini. Semua hasil ini memberikan bukti kuat bahwa spesies dari ketiga filum ini berbagi nenek moyang yang sama secara eksklusif dari semua bakteri lain dan telah diusulkan bahwa mereka semua harus diakui sebagai bagian dari satu superfilum "FCB".

## Filogeni
Taksonomi yang saat ini diterima didasarkan pada Daftar nama Prokariota dengan Standing in Nomenclature (LPSN) dan Pusat Informasi Bioteknologi Nasional (NCBI).

Spesies *incertae sedis*:
* "*C. bathyomarinum*" Betty dkk. 2005
* "*Ca.* C. canadense" Tsuji dkk. 2020
* "*C. gokarna*" Kumar dkk. 2005

## Referensi

## Pranala luar
* ''Chlorobium'' di Bac''Dive'' - Metadatabase Keanekaragaman Bakteri