Rhizobium

***Rhizobium*** adalah genus bakteri tanah Gram-negatif yang memfiksasi nitrogen. Spesies Rhizobium membentuk asosiasi pengikat nitrogen endosimbiotik dengan akar kacang-kacangan dan *[[Parasponia]]*.

Bakteri ini mengkolonisasi sel-sel tumbuhan di dalam nodul akar, di mana mereka mengubah nitrogen atmosfer menjadi amonia dan kemudian memberikan senyawa nitrogen organik seperti glutamina atau ureida ke tanaman. Tanaman, pada gilirannya, menyediakan senyawa organik yang dibuat dengan fotosintesis untuk bakteri. Hubungan yang saling menguntungkan ini terjadi pada semua rhizobia, di mana genus *Rhizobium* adalah contoh yang khas.

## Sejarah
Martinus Beijerinck adalah yang pertama kali mengisolasi dan menumbuhkan mikroorganisme dari nodul kacang-kacangan pada tahun 1888. Ia menamakannya *Bacillus radicicola*, yang sekarang ditempatkan dalam *[[Bergey's Manual of Determinative Bacteriology]]* di bawah genus *Rhizobium*.

## Penelitian
*Rhizobium* membentuk hubungan simbiosis dengan tanaman tertentu seperti kacang-kacangan, memfiksasi nitrogen dari udara menjadi amonia, yang bertindak sebagai pupuk alami untuk tanaman. Penelitian saat ini sedang dilakukan oleh ahli mikrobiologi dari Agricultural Research Service untuk menemukan cara untuk memanfaatkan fiksasi nitrogen *Rhizobium*. Penelitian ini melibatkan pemetaan genetik dari berbagai spesies rhizobia dengan spesies tanaman simbiotik masing-masing, seperti alfalfa atau kedelai. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanpa menggunakan pupuk.

Dalam biologi molekuler, *Rhizobium* juga telah diidentifikasi sebagai pencemar dari kit pereaksi ekstraksi DNA dan sistem air ultra murni, sehingga *Rhizobium* dapat muncul secara keliru di kumpulan data mikrobiota atau metagenom. Kehadiran bakteri pengikat nitrogen sebagai kontaminan mungkin karena penggunaan gas nitrogen dalam produksi air ultra-murni untuk menghambat pertumbuhan mikrob dalam tangki penyimpanan.

## Spesies

* *[[Rhizobium aegyptiacum]]* Shamseldin *et al*. 2016
* *[[Rhizobium aggregatum]]* (Hirsch and Müller 1986) Kaur *et al*. 2011
* *[[Rhizobium alamii]]* Berge *et al*. 2009

* *[[Rhizobium altiplani]]* Baraúna *et al*. 2016
* *[[Rhizobium alvei]]* Sheu *et al*. 2015
* *[[Rhizobium anhuiense]]* Zhang *et al*. 2015

* *[[Rhizobium azibense]]* Mnasri *et al*. 2014
* *[[Rhizobium azooxidifex]]* Behrendt *et al*. 2016
* *[[Rhizobium bangladeshense]]* Harun-or Rashid *et al*. 2015
** symbiovar *trifolii*
** symbiovar *viciae*
* *[[Rhizobium binae]]* Harun-or Rashid *et al*. 2015

* *[[Rhizobium calliandrae]]* Rincón-Rosales *et al*. 2013

* *[[Rhizobium capsici]]* Lin *et al*. 2015
* *[[Rhizobium cauense]]* Liu *et al*. 2015
* *[[Rhizobium cellulosilyticum]]* García-Fraile *et al*. 2007
* *[[Rhizobium daejeonense]]* Quan *et al*. 2005
* *[[Rhizobium ecuadorense]]* Ribeiro *et al*. 2015
* *[[Rhizobium endolithicum]]* Parag *et al*. 2014
* *[[Rhizobium endophyticum]]* López-López *et al*. 2010
* *[[Rhizobium etli]]* Segovia *et al*. 1993
** symbiovar *mimosae*
** symbiovar *phaseoli*
* *[[Rhizobium fabae]]* Tian *et al*. 2008
* *[[Rhizobium flavum]]* Gu *et al*. 2014
* *[[Rhizobium freirei]]* Dall'Agnol *et all*. 2013

* *[[Rhizobium gallicum]]* Amarger *et al*. 1997
** symbiovar *gallicum*
** symbiovar *orientale*
** symbiovar *phaseoli*

* *[[Rhizobium grahamii]]* López-López *et al*. 2011
* *[[Rhizobium hainanense]]* Chen *et al*. 1997
* *[[Rhizobium halophytocola]]* Bibi *et al*. 2012
* *[[Rhizobium halotolerans]]* Diange and Lee 2013

* *[[Rhizobium indigoferae]]* Wei *et al*. 2002
* *[[Rhizobium jaguaris]]* Rincón-Rosales *et al*. 2013
* *[[Rhizobium kunmingense]]* Shen *et al*. 2010
* *[[Rhizobium laguerreae]]* Saïdi *et al*. 2014

* *[[Rhizobium leguminosarum]]* (Frank 1879) Frank 1889
** symbiovar *trifolii*
** symbiovar *viciae*
* *[[Rhizobium lemnae]]* Kittiwongwattana & Thawai 2014
* *[[Rhizobium lentis]]* Harun-or Rashid *et al*. 2015
* *[[Rhizobium leucaenae]]* Ribeiro *et al*. 2011
* *[[Rhizobium loessense]]* Wei *et al*. 2003

* *[[Rhizobium lusitanum]]* Valverde *et al*. 2006
* "''Candidatus'' Rhizobium massiliae" Greub *et al*. 2004.
* *[[Rhizobium mayense]]* Rincón-Rosales *et al*. 2013

* *[[Rhizobium mesoamericanum]]* López-López *et al*. 2011
* *[[Rhizobium mesosinicum]]* Lin *et al*. 2009
* *[[Rhizobium metallidurans]]* Grison *et al*. 2015
* *[[Rhizobium miluonense]]* Gu *et al*. 2008
* *[[Rhizobium mongolense]]* Herr Baronn O. Vonn Berkum *et al*. 1998
* *[[Rhizobium multihospitium]]* Han *et al*. 2008
* *[[Rhizobium naphthalenivorans]]* Kaiya *et al*. 2012

* *[[Rhizobium oryzicola]]* Zhang *et al*. 2015

* *[[Rhizobium pakistanensis]]* Khalid *et al*. 2014

* *[[Rhizobium paranaense]]* Dall'Agnol *et al*. 2014
* *[[Rhizobium petrolearium]]* Zhang *et al*. 2012
* *[[Rhizobium phaseoli]]* Dangeard 1926 emend. Ramírez-Bahena *et al*. 2008
* *[[Rhizobium phenanthrenilyticum]]* Wen *et al*. 2011
* *[[Rhizobium pisi]]* Ramírez-Bahena *et al*. 2008
** symbiovar *trifolii*
** symbiovar *viciae*
* *[[Rhizobium pongamiae]]* Kesari *et al*. 2013
* *[[Rhizobium populi]]* Rozahon *et al*. 2014

* *[[Rhizobium qilianshanense]]* Xu *et al*. 2013

* *[[Rhizobium rhizogenes]]* (Riker *et al*. 1930) Young *et al*. 2001
* *[[Rhizobium rhizoryzae]]* Zhang *et al*. 2014
* *[[Rhizobium rosettiformans]]* Kaur *et al*. 2011

* *[[Rhizobium selenitireducens]]* corrig. Hunter *et al*. 2008

* *[[Rhizobium smilacinae]]* Zhang *et al*. 2014
* *[[Rhizobium soli]]* Yoon *et al*. 2010
* *[[Rhizobium sophorae]]* Jiao *et al*. 2014
* *[[Rhizobium sophoriradicis]]* Jiao *et al*. 2014

* *[[Rhizobium straminoryzae]]* Lin *et al*. 2014
* *[[Rhizobium subbaraonis]]* Ramana *et al*. 2013
* *[[Rhizobium sullae]]* Squartini *et al*. 2002

* *[[Rhizobium tarimense]]* Turdahon *et al*. 2012
* *[[Rhizobium tibeticum]]* Hou *et al*. 2009
* *[[Rhizobium tropici]]* Martínez-Romero *et al*. 1991
* *[[Rhizobium tubonense]]* Zhang *et al*. 2011

* *[[Rhizobium vallis]]* Wang *et all*. 2011

* *[[Rhizobium yanglingense]]* Tan *et al*. 2001
* *[[Rhizobium yantingense]]* Chen *et al*. 2015

## Filogeni
Taksonomi yang diterima saat ini berdasarkan List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)  dan National Center for Biotechnology Information (NCBI)
dan filogeninya berdasarkan LTP rilis 106 berbasis 16S rRNA oleh The All-Species Living Tree Project.

## Referensi

## Pranala luar

* Current research on ''Rhizobium leguminosarum'' at the Norwich Research Park
* Video and commentary on root nodules and Rhizobium in White Clover