Chlamydophila

***Chlamydophila*** é un xénero de bacterias pertencente á familia Chlamydiaceae, orde Chlamydiales, clase/filo Chlamydiae. As especies deste novo xénero estaban antes clasificadas no xénero *Chlamydia*. O establecemento deste xénero foi controvertido no seu momento e seguiu séndoo, ata que en 2015 se volveu a integrar o xénero de novo dentro de *Chlamydia*.

## Taxonomía 
O xénero *Chlamydophila* foi recoñecido en 1999, e creado con seis especies que antes pertencían ao xénero *Chlamydia* (o cal quedou así só con tres especies). Todas as Chlamydiae son bacterias anaerobias cun ciclo de vida cun desenvolvemento en dúas fases que depende do seu crecemento intracelular obrigado en células hóspede eucarióticas.

Antes de 1999 o criterio para distinguir as especies de clamidias non era excluínte. Por exemplo, naquel momento o xénero *Chlamydia* era igual á familia *Chlamydiaceae*, xa que todas as especies estaban clasificadas nese xénero; *C. psittaci* distinguíase de *C. trachomatis* pola súa resistencia á sulfadiacina, aínda que non todas as *C. psittaci* eran resistentes; *C. pneumoniae* clasificábase pola súa aparencia vista con microscopio electrónico e a súa capacidade de infectar aos humanos, aínda que o aspecto visto ao microscopio electrónico difería dun grupo de investigación a outro, e todas estas especies infectaban aos humanos.

A taxonomía sistemática establecida para as Chlamydiae en 1999 utiliza os criterios postos ao día e imperantes actualmente na clasificación das bacterias, como a reasociación ADN-ADN, semellanza nos xenes dos ARNr 16S e 23S, agrupamento con semellanza de secuencia de xenes codificantes de proteínas, e tamaño do xenoma. Tamén se empregan criterios de complementarios, como a detección de antíxenos, tinguidura do glicóxeno, asociación co hóspede, e morfoloxía vista con microscopio electrónico, dependendo da súa aplicabilidae e dispoñibilidade. En 1999, moitas cepas de *Chlamydia* foron reorganizadas e asignadas ao xénero novo *Chlamydophila*.

As análises de xenómica comparativa identificaron gran cantidade de proteínas sinatura que só están presentes en especies do xénero *Chlamydia* ou *Chlamydophila*, o que apoia a distinción destes xéneros. Con todo, esta visión foi posta en dúbida por unha análise de xenoma completo máis recente, que fixo que algúns autores propuxeran volver a "reunificar as *Chlamydiaceae* nun só xénero, *Chlamydia*". Esta controversia na nomenclatura continuou durante varios anos. Finalmente, en 2015 a inclusión das especies do xénero *Chlamydophila* de novo no xénero *Chlamydia* foi aceptada de forma xeral.

## Diferenciación de *Chlamydophila* 
A semellanza na reasociación ADN-ADN media que distingue *Chlamydophila* de *Chlamydia* é 10,1% (95% intervalo de confianza = 6,8 a 13,5), o que se considera un vaor aceptable para separar os dous xéneros.

A diverxencia entre *Chlamydophila* e *Chlamydia* indícase pola agrupación con semellanza de secuencia de xenes de proteínas codificadas e de ARN ribosómico. As secuencias dos xenes de ARNr 16SA de *Chlamydophila* e *Chlamydia* son idénticos en aproximadamente un 95%. Porén, o 95% non é un punto de corte para separar as Chlamydiaceae, senón só unha guía para establecer novos xéneros dentro das familias das clamidias. Os xenes de ARNr 23S de lonxitude completa de *Chlamydophila* e *Chlamydia* son idénticos en menos do 95%.

## Especies 
Son características específicas de especie tipicamente a morfoloxía vista con microscopio electrónico, resistencia a antibióticos, e plásmidos extracromosómicos.

*Chlamydophila* comprendía as seguintes especies:

* *Chlamydophila pneumoniae*
* *Chlamydophila pecorum*
* *Chlamydophila felis*
* *Chlamydophila psittaci*
* *Chlamydophila abortus*
* *Chlamydophila caviae*

## Notas 
## Véxase tamén 
### Ligazóns externas 
* Chlamydophilagenomes and related information at PATRIC, a Bioinformatics Resource Center funded by NIAID
* Taxonomic Outline of the Procaryotes, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Second Edition Release 1.0, April c. https://web.archive.org/web/20130720103419/http://www.cme.msu.edu/Bergeys/april2001-genus.pdf