Proteína AAA

As **proteínas AAA** ou **A**TPases **A**sociadas con diversas **A**ctividades celulares son unha familia de proteínas que comparten un módulo conservado común de aproximadamente 230 residuos de aminoácidos. Esta é unha familia proteica grande e funcionalmente diversa que pertence á superfamilia de proteínas AAA+ de NTPases de bucle P con forma de anel, que exercen as súas actividades por medio da remodelación dependente de enerxía ou translocación de moléculas.

As proteínas AAA acoplan a enerxía química proporcionada pola hidrólise do ATP a cambios conformacionais que son transducidos a forza mecánica exercida sobre un substrato macromolecular. Os membros da familia AAA encóntranse en todos os organismos e son compartidos por outras NTPases de bucle P, a superfamilia proteica que inclúe a familia AAA. A maioría das proteínas AAA teñen dominios adicionais que se usan para a oligomerización, unión ao substrato e/ou regulación. Estes dominios poden estar situados en posición N- ou C-terminal no módulo AAA.

### Clasificación 
Algunhas clases de proteínas AAA teñen un dominio N-terminal non de ATPase que é seguido por un ou dous dominios AAA (D1 e D2). Nalgunhas proteínas con dous dominios AAA, ambos os dous están ben conservados evolutivamente (como en Cdc48/p97). Noutros, un deles, que pode ser o dominio D2 (como en Pex1p e Pex6p) ou o domino D1 (como en Sec18p/NSF), está mellor conservado evolutivamente.

Aínda que a familia AAA clásica estaba baseada en motivos, a familia foi ampliada usando información estrutural e agora denomínase AAA+.

O poro central pode estar implicado no procesamento do substrato. Na configuración hexamérica, o sitio de unión do ATP está situado na interface entre as subunidades. Despois da unión e hidrólise do ATP, os encimas AAA sofren uns cambios conformacionais nos dominios AAA así como nos dominios N. Estes movementos poden transmitirse á proteína substrato.

## Mecanismo molecular 
A hidrólise do ATP feita polas ATPases AAA propúxose que implica o ataque nucleofílico no fosfato gamma do ATP por parte dunha molécula de auga activada, orixinando o movemento dos subdominios AAA N- e C-terminais un en relación  ao outro. Este movemento permite exercer forza mecánica, amplificada por outros dominios ATPase que hai dentro da mesma estrutura oligomérica. Os dominios adicionais da proteína permiten a regulación ou direccionamento da forza cara a diferentes obxectivos.

### Movemento molecular 
As dineínas, unha das tres grandes clases de proteínas motoras, son proteínas AAA, as cales acoplan a súa actividade de  ATPase ao movemento molecular ao longo de microtúbulos.

A ATPase de tipo AAA Cdc48p/p97 é quizais a proteína AAA mellor estudada. As proteínas secretoras mal pregadas son exportadcas desde o retículo endoplasmático e degradadas pola vía de degradación asociada ao retículo endoplasmático (ERAD). A membrana non funcional e as proteínas luminais extráense do retículo endoplasmático e son degradadas no citosol por proteasomas. A retrotranslocación e extracción do substrato faise coa axuda do complexo Cdc48p(Ufd1p/Npl4p) no lado citosólico da membrana. No lado citosólico é ubiquitinada polos encimas do retículo endoplasmático E2 e E3 antes da degradación polo proteasoma de 26S.

### Envío de proteínas a corpos multivesiculares 
Os corpos multivesiculares son compartimentos endosómicos que clasifican ou escollen proteínas de membrana ubiquitinadas para incorporalas a vesículas. Este proceso implica a acción secuencial de tres complexos multiproteicos, ESCRT I, II e III (ESCRT significa en inglés *endosomal sorting complexes required for transport*, é dicir, complexos de clasificación endosómica requiridos para o transporte). A Vps4p é unha ATPase de tipo AAA implicada nesta vía de clasificación MVB. Orixinalmente fora identificada como un mutante de vps (*vacuolar protein sorting*, proteína de clasificación vacuolar) de ”clase E” e despois viuse que catalizaba a disociación de complexos ESCRT. A Vps4p está ancorada por medio de Vps46p á membrana endosómica. Na ensamblaxe de Vps4p colabora a proteína conservada Vta1p, que regula o seu status de oligomerización e actividade de ATPase.

### Outras funcións 
As proteases AAA usan a enerxía da hidrólise do ATP para translocar unha proteína dentro do proteasoma para a súa degradación.

## Proeínas humanas que conteñen este dominio 
### Familia das ATPases AAA (HGNC) 
AFG3L2;    ATAD1;     ATAD2;     ATAD2B;    ATAD3A;    ATAD3B;
ATAD3C; ATAD5;    BCS1L;     CHTF18; CLBP; CLPP; CLPX;    FIGN;      FIGNL1; FIGNL2;
IQCA1;      KATNA1;    KATNAL1;   KATNAL2;   LONP1;     LONP2;     MDN1; NSF;       NVL;
ORC1;  ORC4;    PEX1;      PEX6;      PSMC1;     PSMC2 (Nbla10058);     PSMC3;     PSMC4;
PSMC5;     PSMC6;     RFC1;      RFC2;  RFC3;    RFC4;      RFC5;      RUVBL1;    RUVBL2;
SPAST;   SPATA5 (SPAF);   SPATA5L1;  SPG7; TRIP13;    VCP;       VPS4A;     VPS4B;
WRNIP1;    YME1L1 (FTSH);

#### Torsinas 
TOR1A; TOR1B; TOR2A;  TOR3A;  TOR4A;

### Outros 
AK6 (CINAP); CDC6; 

### Pseudoxenes 
AFG3L1P;

## Notas 
## Véxase tamén 
### Ligazóns externas 
*
*