Superfamilia de proteínas

Unha **superfamilia de proteínas**, na clasificación das proteínas, é o grupo máis grande (clado) de proteínas do que se pode inferir que teñen un antepasado común (ver homoloxía). Xeralmente a existencia desta ascendencia común está baseada no seu aliñamento estrutural e semellanza do seu mecanismo de acción aínda que non se observa semellanza de secuencia evidente. As superfamilias conteñen normalmente varias familias de proteínas, constituídas por proteínas que mostran unha semellanza de secuencia. O termo *clan de proteínas* úsase tamén comunmente para as superfamilias de proteases baseándose no sistema de clasificación de proteases MEROPS. Son o grupo evolutivo meirande baseado en probas directas que é posible establecer actualmente. Están, por tanto, entre os eventos evolutivos máis antigos que se poden estudar hoxe. Algunhas superfamilias teñen membros en todos os reinos de seres vivos, o que indica que o último antepasado común desa superfamilia era o último antepasado común universal de todos os seres vivos (LUCA).

Os membros dunha superfamilia poden atoparse en diferentes especies, e a proteína ancestral é a forma da proteína que existía na especie ancestral (ortoloxía). Inversamente, ditas proteínas poden encontrarse na mesma especie, pero evolucionaron a partir dunha soa proteína cuxo xene foi duplicado no xenoma (paraloxía).

## Exemplos 
* **Clan PA**. Os seus membros comparten un pregamento de barril beta dobre de tipo quimotripsina e mecanismos de proteólise similares, pero a identidade de secuencia é 8β8. É un dos pregamentos proteicos máis comúns, pero a monofilia desta familia aínda se discute.
* **Superfamilia da fosfatase alcalina**. Os seus membros comparten unha estrutura en sándwich αβα e tamén levan a cabo reaccións promiscuas comúns por un mecanismo similar.
* **Superfamilia das inmunoglobulinas**. Os seus membros comparten unha estrutura de tipo sándwich formada por dúas follas de febras beta antiparalelas (pregamento Ig), e están implicados no recoñecemento, unión, e adhesión.
* **Superfamilia das globinas**. Os seus membros comparten un pregamento de globina globular de 8 hélices.

* **Superfamilia Ras**. Os seus membros comparte un domino G catalítico común de folla beta de seis febras rodeada de 5 hélices alfa.

## Recursos sobre superfamilias de proteínas 
Varias bases de datos biolóxicas documentan as superfamilias proteícas e pregamentos proteicos; por exemplo:
* Pfam - Base de datos de familias proteicas de aliñamentos e de HMMs
* PROSITE - Base de datos de dominios de proteínas, familias e sitios funcionais
* PIRSF - SuperFamily Classification System
* PASS2 - Protein Alignment as Structural Superfamilies v2
* SUPERFAMILY - Libraría de HMMs que representa superfamilias e bases de datos de anotacións (superfamilias e familias) para todos os organismos completamente secuenciados
* SCOP e CATH - Clasificacións de estruturas de proteínas en superfamilias, familias e dominios

Igualmente, hai algoritmos que buscan no PDB proteínas con homoloxia estrutural cunha estrutura diana dada; por exemplo:
* DALI - Aliñamento estrutural baseado nun método de matriz de aliñamento de distancia.

## Notas 
## Véxase tamén 
### Outros artigos 
* Dominio proteico
* Familia de proteínas
* Estrutura das proteínas
* Homoloxía (bioloxía)
* SUPERFAMILY