ARMAN (arqueas)

::*Para o escultor Armand Pierre Fernández ver Arman.*

miniatura|dereita|Drenaxe da mina de Iron Mountain.
Os organismos **ARMAN** (siglas en inglés de *Archaeal Richmond Mine Acidophilic Nanoorganisms* ou **Nanoorganismos Acidófilos Arqueanos da Mina Richmond**) son un tipo de arqueas de tamaño diminuto descubertas nunha mina extremadamente ácida situada no norte de California (Mina de Iron Mountain ou Mina Richmond) por Brett Baker no laboratorio de Jill Banfield na Universidade de California, Berkeley. Estes novos grupos de arqueas atopados, que foron denominados ARMAN-1, ARMAN-2 (*Candidatus* Micrarchaeum acidiphilum ARMAN-2 ), e ARMAN-3, pasaran indetectados en estudos previos da comunidade de organismos desa mina baseados na PCR porque os ARMANs teñen varias faltas de correspondencia cos cebadores ou *primers* normalmente usados nas PCR para os xenes do ARNr 16S. Posteriormente, Baker *et al.* detectáronos noutro estudo utilizando unha secuenciación polo método da escopeta (*shotgun*) da comunidade. Os tres grupos de ARMAN representan tres liñaxes únicas que son ramas moi iniciais dentro da árbore das arqueas Euryarchaeota. Os seus xenes de ARNr de 16S presentan diferenzas do 17% entre os tres grupos. Antes do seu descubrimento todas as arqueas que se descubriran na Iron Mountain pertencían á orde Thermoplasmatales (por exemplo, *Ferroplasma acidarmanus*), que non son ARMAN. Posteriormente foron atopados organismos ARMAN noutras partes do mundo.

Aínda que os tres grupos de ARMAN foron considerados dentro dos Euryarchaeota, unha árbore xenómica máis completa das arqueas asignounos ao novo superfilum DPANN. Os grupos de ARMAN agora comprenden filos profundamente diverxentes denominados Micrarchaeota e Parvarchaeota.

## Distribución 
O exame de diferentes sitios da mina Richmond utilizando sondas de fluorescencia específicas para os grupos ARMAN revelou que están sempre presentes en comunidades asociadas con drenaxes ácidas desa mina, que teñen un pH 3 e 0,04&nbsp;µm3. Tamén se encontrou que, malia o seu tamaño infrecuentemente pequeno, é común atopar máis dun tipo de virus adherido a esas células nos biofilmes. Ademais, as células conteñen como media ~92 ribosomas, mentres que a media nunha bacteria típica como *Escherichia coli* en cultivo é de ~10.000 ribosomas. Isto suxire que nas células ARMAN hai un número moito máis limitado de metabolitos. Isto formula a cuestión de cales son os requirimentos mínimos para a vida celular.

As reconstrucións tridimensionais das células ARMAN no seu ambiente revelaron que un pequeno número delas se unen a outras arqueas da orde Thermoplasmatales, aínda que a maioría aparecen como de vida libre. As células ARMAN parece que penetran na parede celular ata chegar ao citoplasma das células das Thermoplasmatales. A natureza desta interacción non está ben determinada. Podería ser un tipo de interacción simbiótica ou parasítica permanente ou transitoria. É posible que as ARMAN tomen deste modo algún tipo de metabolito que non poden producir por elas mesmas.

## Xenómica e proteómica 
Os xenomas de tres grupos de ARMAN secuenciáronse no DOE Joint Genome Institute en 2006 no Community Sequencing Program (CSP). Estes tres xenomas foron distinguidos dos datos xenómicos de toda a comunidade de organismos utilizando o agrupamento ESOM (*Emergent Self-Organizing Map*) de sinaturas de ADN de tetranucleótidos.

O primeiro borrador do *Candidatus* Micrarchaeum acidiphilum ARMAN-2 é de só ~1 Mb. O do ARMAN-2 completouse recentemente utilizando a secuenciación Solexa e 454 doutros biofilmes para cubrir os ocos que quedaran na secuenciación e está preparándose para a súa publicación no NCBI. Os xenomas de ARMAN-4 e ARMAN-5 (tamén de aproximadamente 1 Mb) teñen xenes dun tamaño medio, similares aos de bacterias endosimbióticas ou parasíticas. Isto pode ser a sinatura das súas interaccións interespecíficas con outras arqueas na natureza.) Este encima consta de dúas unidades catalíticas duplicadas e unha unidade estrutural codificada nun só xene, que representa un novo tipo de arquitectura encimática de tres unidades.

## Notas 
* NCBI CoreNucleotide ARMAN-1
* NCBI CoreNucleotide ARMAN-2
* NCBI *Candidatus* Micrarchaeum acidiphilum ARMAN-2 genome
* NCBI *Candidatus* Parvarchaeum acidiphilum ARMAN-4 genome
* NCBI *Candidatus* Parvarchaeum acidophilus ARMAN-5 genome
* http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2011/08/31/nar.gkr692.abstract

## Véxase tamén 
### Outros artigos 
* Acidófilos

### Ligazóns externas 
* Artigo de prensa 
* ASM Small Things Considered 
* JGI Community Sequencing Program
* 2006 Universidade de California, Berkeley
* Dr. Luis Comolli's home page with several images of ARMAN cells
* 2010 Universidade de California, Berkeley 
* 2010 Artigo de prensa
* 2010 artigo do MSNBC