Pelagibacter ubique

***Candidatus Pelagibacter ubique**** é a única especie do xénero bacteriano ***Pelagibacter'''*, a cal foi illada e nomeada en 2002, e que actualmente está en proceso de ser publicada validamente de acordo co Código Internacional de Nomenclatura Bacteriana, polo que ten polo momento o status de especie candidata (*candidatus*). É un membro moi abondoso do clado SAR11 do filo Alphaproteobacteria. Os membros do SAR11 son organismos moi dominantes que se encontran en augas doces e salgadas de todo o mundo. Inicialmente foi coñecida só polos seus xenes de ARNr, que se identificaron por primeira vez en mostras ambientais tomadas do Mar dos Argazos en 1990 polo laboratorio de Stephen Giovannoni da Universidade do estado de Oregón, e despois atopada en todos os océanos do mundo. "*Ca.* P. ubique" e os seus parentes poden ser os organismos máis abundantes no océano, e moi posiblemente as bacterias máis abundantes no mundo, incluídos os ecosistemas terrestres. Poden supoñer un 25% de todas as células do plancto microbiano, e no verán poden chegar a ser a metade das células presentes na superficie das augas dos océanos temperados.

Ten forma de bacilo ou de crecente, é gramnegativa e é unha das menores células replicantes coñecidas, cunha lonxitude de só 0,37-0,89 µm e un diámetro de só 0,12-0,20&nbsp;µm. O 30% do volume da célula está ocupado polo seu xenoma. Recicla o carbono orgánico disolto, polo que xoga un importante papel no ciclo do carbono na Terra. É un organismo oligótrofo, xa que vive en ambientes con escasos nutrientes.

## Cultivo 
Puideron cultivarse varias cepas de "*Ca.* P. ubique" grazas á mellora das técnicas de illamento. A cepa máis estudada é a HTCC1062 (colección de cultivos de alto rendemento). Hipotetízase que estes organimos foron moldeados na evolución nun ecosistema baixo en nutientes (oligotrófico), como o mar dos Argazos, onde foron descubertos.

Unha poboación de células de "*Ca.* P. ubique" pode duplicarse cada 29 horas, o cal é unha velocidade moi lenta, pero poden replicarse en ambientes moi baixos en nutrientes. Esta especie pode cultivarse nun medio definido, artificial ao que se engada xofre reducido, glicina, piruvato e vitaminas.

## Xenoma 
O xenoma da cepa HTCC1062 de "*Ca.* P. ubique" foi completamente secuenciado en 2005, e ten só 1.308.759 pares de bases), polo que é o xenoma máis pequeno coñecido de todos os organismos vivos de vida libre. As únicas especies con xenomas aínda máis pequenos son parasitos ou simbiontes intracelulares, como *Mycoplasma genitalium* ou *Nanoarchaeum equitans*. Outro exemplo dun ARNnc importante desta especie e doutras especies do clado SAR11 é un riboswitch conservado activado por glicina para a malato sintase, que aparentemente causa "auxotrofia funcional" para a glicina ou precursores da glicina para atinxir un crecemento óptimo.

Atopouse tamén que ten xenes para a proteorrodopsina, que axudan ao funcionamento de bombas de protóns mediadas pola luz. Hai sutís diferenzas na expresión destas secuencias codón cando se someten á exposición á luz ou na escuridade. Exprésanse outros xenes para a fosforilación oxidativa cando están en condicións de escuridade.

## Nome 
O nome procede do latín *pelagus*, mar (á súa vez procedente do grego πέλαγος, pelagos) e o sufixo *-bacter*, bastón, bacteria, e o nome do da especie vén do latín *ubique*, ubicua, que está en todas partes; *ubique* é un adverbio, cando debería ser un nome ou adxectivo, porque as especies *Candidatus* non foron aínda corrixidas gramaticalmente (ver regra 12c do IBCN).

O status de "*Candidatus*" téñeno as especies propostas das cales falta información (cf.), o que impide consideralas especies validadas segundo o código bacteriolóxico, como é o depósito dunha mostra en dous depósitos de células públicos ou a falta de análise de ácido graxo metil ésteres (análise FAME). O "*Candidatus* Pelagibacter ubique" non está nas coleccións de cultivos ATCC http://www.atcc.org/ nin DSMZ http://www.dsmz.de/, nin se lle realizaron análises de lípidos e quinonas. O nome dos *candidatus* non se escribe en cursiva na literatura ata que pasen a ser especies validadas, polo que aparece escrita como "*Candidatus* Pelagibacter ubique" ou, abreviadamente, "*Ca.* Pelagibacter ubique" ou "*Ca.* P. ubique".

A cepa tipo da especie "*Candidatus* P. ubique" é a HTTC1062, que á súa vez é a especie tipo do xénero *Pelagibacter*,

## Bacteriófago 
En 2013 publicouse na revista *Nature* que se descubrira o bacteriófago HTVC010P, que ataca a "*Ca.'' P. ubique", e que este virus era probablemente "o organismo máis común no planeta".

## Notas 
## Véxase tamén 
### Ligazóns externas 
* entrada de MicrobeWiki 
* BBC News: Criatura do océano co 'menor xenoma'
* "Oceans of Microbes", Episode 5 de "Intimate Strangers: Unseen Life on Earth" por PBS https://web.archive.org/web/20120217133708/http://www.podcastdirectory.com/podshows/4339749