BRENDA

**BRENDA** (**BRaunschweig ENzyme DAtabase**) é unha base de datos que contén un sistema de información que é un dos repositorios máis completos de datos sobre encimas.

## Introdución 
BRENDA é unha fonte de información electrónica que comprende información molecular e bioquímica sobre encimas que foron clasificados pola IUBMB. Cada encima clasificado é caracterizado con respecto á reacción bioquímica que cataliza. Descríbense en detalle as propiedades cinéticas dos reactivos correspondentes, é dicir, substratos e produtos.
BRENDA proporciona unha inteface de usuario baseada en páxina web que permite un acceso conveniente e sofisticado aos datos.
BRENDA foi fundada en 1987 no anteriormente chamado Centro de Investigación Nacional de Biotecnoloxía alemán (agora chamado Centro Helmholtz para a Investigación de Infeccións) con sede en Braunschweig, e foi publicado inicialmente como unha serie de libros. Desde 1996 a 2007, BRENDA tivo a súa sede na Universidade de Colonia. Alí, BRENDA desenvolveuse nun sistema de información de encimas accesible ao público. En 2007, BRENDA volveu a Braunschweig. Actualmente, BRENDA é mantido e desenvolvido no Departmento de Bioinformática e Bioquímica da Universidade de Tecnoloxía de Braunschweig.

BRENDA contén datos específicos de encimas extraídos manualmente da literatura científica primaria e datos adicionais derivados de métodos de recuperación de información automática como o minado de textos.

Dúas veces ao ano realízase unha actualización principal dos datos de BRENDA. Ademais da actualización do seu contido, incorpóranse tamén á base de datos BRENDA melloras da interface de usuario.

## Contidos e características 
### Base de datos 
A base de datos contén máis de 40 campos de datos con información específica de encimas de máis de 4.800 números EC que son clasificados segundo o indicado pola IUBMB.
Os difeentes campos de datos comprenden información sobre a nomenclatura de encimas, reacción e especificidade, estrutura de encimas, illamento e preparación, estabilidade de encimas, parámetros cinéticos como o valor KM e o número de recambio, aparición e localización, mutantes e encimas de enxeñaría, aplicación de encimas e datos relacionados con ligandos. Actualmente, BRENDA contén datos anotados manualmente duns 130.000 artigos científicos distintos. Cada entrada de encima está claramente ligada a polo menos unha referencia na literatura, ao organismo do que procede, e, cando está dispoñible, á secuencia proteica do encima.

### Acceso aos datos 
Hai varias ferramentas que serven para ter acceso aos datos contidos en BRENDA. Algunhas delas son as que se indican a continuación:

* Varias formas diferentes de consulta (por exemplo, procuras rápidas e avanzadas)
* Buscador da árbore de números EC da Comisión de Encimas
* Buscador da árbore de taxonomía
* Ontoloxías de diferentes dominios da Bioloxía (por exemplo, BRENDA tissue ontology ou ontoloxia de tecidos de BRENDA, Gene Ontology)
* Dicionario de sinónimos de nomes de substancias químicas
* Motor de busca de subestruturas químicas para estruturas de ligandos
* Interface SOAP.

## Dispoñibilidade 
O uso de BRENDA é gratuíto. Ademais, FRENDA e AMENDA son tamén gratuítos para usuarios sen ánimo de lucro. Polo contrario, os usuarios comerciais precisan dunha licenza para usar estas bases de datos a través de BIOBASE.

## Outras bases de datos 
BRENDA proporciona ligazóns a outras bases de datos cun diferente enfoque sobre a temática dos encimas, por exemplo, función metabólica ou estrutura dos encimas. Outras ligazóns levan a consultar información ontolóxica sobre os xenes correspondentes ao encima en cuestión. As ligazóns á literatura científica establécense mediante PubMed.
BRENDA liga coas seguintes bases de datos e repositorios:

* BRENDA tissue ontology (ontoloxía de tecidos de BRENDA)
* ExPASy
* Bases de datos do NCBI (Proteínas, nucleótidos, estrutura, xenoma, OMIM, Dominios)
* IUBMB (nomenclatura de encimas)
* KEGG
* PDB (base de datos con información en 3D)
* PROSITE
* SCOP
* CATH
* InterPro
* ChEBI
* UniProt

## Notas 
## Véxase tamén 
### Bibliografía 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

### Ligazóns externas 
* Páxina web oficial de BRENDA
* Nomenclatura de Encimas
* Biobase BRENDA - A Base de datos de Encimas