Nejasni kompleks

[thumb|upright|[Nuklearna magnetna rezonanca|NMR-na struktura inhibitora ciklin-zavisne kinaze Sic1 sa ubikvitin-ligazom Cdc4 (siva). Od devet fosforilacijskih mjesta Sic 1 (sfere) prikazani su kontakti sa T45 i S76 (narandžasti i plavi).]] 
[thumb|300px|Nejasna veza (prikazana isprekidanom linijom) [ultrabitoraksnog faktora transkripcija (narandžasta) povezuje homedomene i ekstradentikulni homedomen (plava) (PDB kôd 1bi). Alternativno spajanje modulira dužinu nejasnog područja, a time i afinitet vezanja njegove DNK (siva) Ostala regulatorna nejasna područja ultrabitoraksa također su prikazana tačkastim linijama]]
**Nejasni kompleksi** ili **neizraziti kompleksi** su proteinski kompleksi, gdje postoji strukturna dvosmislenost ili postojeća višestrukost i potrebni su za biološke funkcije. Promjena, skraćivanje ili uklanjanje konformacijski dvosmislenih regija utiče na aktivnost odgovarajućih kompleksa. Nejasne komplekse uglavnom formiraju [suštinski poremećeni proteini. Strukturna multiplikacija obično leži u osnovi funkcijske višestrukosti proteinskih kompleksa sljedeći [nejasna logika|nejasnu logiku. Izraziti načini vezanja nukleosoma također se smatraju posebnim nejasnim  slučajem.

## Historijska pozadina 
Gotovo 50 godina molekulska biologija temeljila se na dvije dogme: (1) izjednačavanju biološke funkcije proteina s jedinstvenom trodimenzijskom strukturom i (2) pretpostavljanju izuzetne specifičnosti u proteinskim kompleksima. Specifičnost/ elektivnost osigurava se nedvosmislenim skupom interakcija formiranih između proteina i njegovog liganda (drugog proteina, DNK, RNK ili male molekule). Mnogi proteinski kompleksi, međutim, sadrže funkcijski važne / kritične regije, koje ostaju vrlo dinamične u kompleksu ili usvajaju različite konformacije . Ovaj fenomen definira se nejasnošću. Najvažniji primjer je ciklin-zavisni inhibitor kinaze Sic1, koji se veže za SCF podjedinicu Cdc4 u fosforilacijski ovisnom postupku. Neregularne sekundarne strukture se postižu nakon fosforilacije, uz izmjenu različitih mjesta fosforilacije u kompleksu.

## Klasifikacija nejasnih kompleksa 
Strukturna dvosmislenost u proteinskim kompleksima pokriva širok spektar. Clamp, flankiranjem (bočnom konfiguracijom)  i slučajnim kompleksima, koji su dinamični, gdje se dvosmislene konformacije međusobno izmjenjuju i ne mogu se riješiti. Interakcije u nejasnim kompleksima obično posreduju kratki motivi. Bočni regioni tolerantni su na promjene sekvence sve dok se održava aminokiselinska kompozicija, naprimjer u slučaju histonskih linker C-krajnjih domena  i H4 histona domena N-kraja.

## Regulacijski putevi preko nejasne regija 
Nejasna područja moduliraju konformacijsku ravnotežu 
 ilu fleksibilnost  interfejsa vezanja, putem privremene interakcije. Dynamic regions can also compete with binding sites or tether them to the target. Modifikacije nejasnih područja daljnjim interakcijama, ili posttranslacijskim modifikacijama utiču na afinitet vezanja ili specifičnost. Alternativna prerada mogu modulirati dužinu nejasnih regija, što rezultira vezanjem ovisno o kontekstu (npr. tkivno-specifičnos) na kompleksu. EGF / MAPK, TGF-β i WNT/beskrilni signalni putevi koriste nejasna područja specifična za tkivo.

## Reference 
Kategorija:Struktura proteina
Kategorija:Stereohemija
Kategorija:Biomolekule
Kategorija:Biohemija