LRRIQ1

**Leucinom bogati protein 1 sa ponavljanjem motiva IQ** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **LRRIQ1**.
 Ovaj protein je vjerojatno jedarni kodirajući protein mitohondrija and is found in all Metazoans.

## Gen
LRRIQ1 je kod ljudi mapiran na hromosomu 12, na sekvenci 12q21.31. LRRIQ1 je blizu ALX1 na pozitivnom lancu, a TSPAN19 i SLC6115 na negativnom. Pokriva 208,78 KB, od 85430099 do 8563881 bp na direktnoj niti. Sadrži 36 egzona.

## iRNK 
Gen sadrži 31 različita introna, a transkript proizvodi 10 različitih iRNK. LRRIQ1 ima dva potvrđena alternativna mjesta poliadenilacije. Najčešća izoforma sastoji se od 5.460 parova baza  i uključuje 28 od ukupno 29 egzona.

## Protein 
Protein je jedarni kodirani mitohondrijski protein. Ljudski ima 1.760 aminokiselina. Protein se smatra uglavnom neutralnim, iako se 17% primarne strukture sastoji od hidrofobnih ponavljanja bogatih leucinom.

Ponavljanje bogato leucinom tvori strukturni oblik potkove, koji podstiče interakcije protein-protein. Najčešća prevedena izoforma ima predviđenu molekulsku masu od 199,3 kdal. U poređenju sa prosjekom ljudskih sekvenci, unutrašnji sastav bogat je leucinom, glutaminskom kiselinom i lizinom.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  1.722 aminokiseline, a  molekulska težina   199.300  Da..

1020304050
MDDDDAKLKAEIEAELDKLSISSLEKEDIESDAKSETQSDDSDTDSVELP
ESVLHCINIIKNRSKAVEELILQDLEDTDILSCSYGAVSNNHMHLRTGLS
TEYEESSEQLIKILSEIEKEEFMRSKTDCATPDFVPEPSPHDLPMDEHVL
PDDADINFGYCEVEEKCRQSFEAWQEKQKELEDKEKQTLKAQRDREEKQF
QEEEEKRHCWMKQFKVEKKKLENIQKQEQDKMNDELYKEEKIWKEKFKQH
EEYIRNLHLQMEEERTRFKDQQEKEKNSLLKQQNNAAVKIQAKYKAFVAY
QKYGPIIKEQIESKKRKAQEWKEKEAKIRQKEEENRKRLEEEQRIKEERK
KQKEEERKRREKEYEEKKNIVKQEREQLISKEKIILREDASQQLIISSAL
KKSGYNNKHLSLEDISNDKGDIAKNLVDENSKKQEDVLLWLVEESNMKEN
VDRQTILKESIQVKLKESISSQTILADFKMEEKNENLAKKRCSEELVKQE
RKYENTDNKTELGNSDLKGNLKEQFPLQELKSDAQKEEKIMKHVINENTG
QKTQIILGHNQEISEVKTNEEQKIIKDNQQKKIQKVEKEEIQEQNGLLYK
DKDTLVISVKQRSLSLTSENSKDVRENVILQEKEIYSKSKEIEENPKDNA
WNSGIVIFNTTDTMINIEGKRNDQDYVLGRHAPCEGLSNYNAESSMVSKE
VNSLKSEIRNISEKCHENAPEPDSMTCCVSESTLLYSIEERRLAWIKSFK
PWLEIFKQNQQKKIVRRKRPVKCPANMTPALDKLEILRCGPWDTLQQVTT
VTFQDLPGCVLSTLAECTNLQFLSLRRCGLTSLHSLSNCKKLKYIDAQEN
HIEAIECENLENLCVVLLNKNQLTSLHGLDGCTNIQCLELSYNKITRIGY
SFFLEEKLVDNAGFCHHLGTSTSYLSLAQVWIPTGLCWSWIPITSLTKNS
DCNFLISHLYWNCGLESLKNLQQLILDHNQLINTKGLCDTPTIVYLDCSH
NHLTDVEGVENCGLLQILKLQGNYLSELPSLENLVLLRELHLDDNSISTV
EAFSSYWLPLLQNITISQNSLTKIVPLFHFVSLEKLDVSHNCLSDLKSAI
KWFDACYSLHELSLTGNPLLQETNWRDSLLKVLPALRILNGNILNSNSES
RTEEHNQLGSAGFLALCQSQIREFNLLIENYITGKGDVFTLDTAENLCHY
FKKLMILSTEYRHAHERGDVTITKKDESEAQKNHLAPTNSDSTLQNGVFY
SCAREGEPDSPDIPEKWMDSVSSHSPLSKSATCENMEGRHQEILVCQKRE
DSKASSIPTIRIPFKEVVMTNSLLRNHQNIEPSEKIMAAVVIQSYWRGYL
MRRQTHFSTRLHTAATEGLPNSSIKNQTILKKGKRENIVNIRKQREKAAI
LIQAVWKGFILRKKLTTALEAIKNEESDEEYREIDLEDFIFDEAALEEEW
LALDSTRFPSQTLLLSNQLHWPKIPGNLKWDDTSFNLPSNPAQAWLCNDK
ENLSSSEHTQFNSRSENKTSSWTPESKTSRKSLLKSEKEKKISEEWGFKD
ISTAQQMLKRAQKMKSKKLKKKIDSTVRLALFKNNENKVSLPKSPKMVQP
RRDGYFEGIEEDPIHKDTTANEKLERNREYTYQWLHTQVGVHETTSSRNM
KCNHFLPELDPDVLNGGRVQLVARLVSREDTDLDLFSMTNGSALSVNREK
KNQAHRHSAGSSSKLWFPSKLI

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Domeni i motivi 
LRRIQ1 sadrži IQ motiv vezivanja kalmodulina koji se nalazi u jednoj izoformi. Izoforma sadrži tri kopije i služi kao mjesto vezanja za kalmodulin ili CaM-slične proteine.). Kod *Drosophila* konzervirane su motivi koji sadrže IQ i domene ponavljanja bogate leucinom.

## Konzervacija
Pokazalo se da je gen LRRIQ1 visoko konzerviran. Gen ima prave ortologe širom sisarskih taksona i nalazi se u svim Metazoa. Vrijeme divergencije u odnosu na korigirani % divergencije (*m*) određeno  je uzorcima ljudi, gorila, pripitomljene mačke, bizona, kita orka, arapske kamile, domaćeg konja, afričkog grmastog slona, ćelavog orla, Adelievog pingvina, japanskog gekona, karolinske anole i zapadne kandžaste žabe. Korišteni su za kreiranje nagiba linije poređenja za fibrinogen (smatra se relativno brzo evoluirajućim proteinom) i citohrom c (relativno sporijim),  zapadna kandžasta žaba, Xenopus laevis, *Takifugu rubripes*  i *Bos taurus*.

## Ekspresija
LRRIQ1 je slabo eksprimiran (0,6 puta veći od prosječnog gena) u plućima, sjemenicima, epitelnom tkivu, udruženim tumorima zametnih ćelija, tkivima mozga, embrionskm i masnim tkivima.

HES4 je transkripcijski faktor koji se nalazi kod ljudi. Protein veže DNK na motive N-kutije.

## Klinički značaj 
Do danas nije poznat klinički značaj ovog gena.

## Reference 
## Dopunska literatura 
*

Kategorija:Geni na hromosomu 12
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika