SYNM

**Sinemin**, znan i kao **dezmuslin**, je protein koji je kod ljudi kodiran genom **SYNM**. Sinemin je član  porodice proteinsa sa intermedijarnim filamentima (IF). Ako su proteini citoskeletni proteini koji pružaju otpornost na mehanički stres,  kodirani su iz raspršene multigenske porodice. Utvrđeno je da ovaj protein stvara vezu između dezmina, koji je podjedinica IF mreže, i vanćelijskog matriksa i pruža važnu strukturnu potporu u mišićima.

Hibridizacijskom analizom zračenja, Nagase i sur. (1997) locirali  su gen SYNM na  hromosomu 15.

Gross (2019)  je precizirao poziciju lokusa SYNM na hromosomsku sekvencu 15q26.3, na temelju poravnanja sekvence  SYNM-a (GenBank BC151243) sa genomskom sekvencom (GRCh38).
## Kloniranje i ekspresija
Sekvenciranjem nasumično odabranih cDNK koje odgovaraju relativno dugim transkriptima iz ljudskog mozga, Nagase et  al. (1997) identificirali su cDNK  i  nazvali je KIAA0353, koja kodira izvedeni protein od 1.374 aminokiselina.

Korištenjem 2-hibridnog pristupa kvasca za traženje proteina koji stupaju u interakciju s alfa-distrobrevinom, Mizuno et al. (2001) identificirali su isti protein, koji su nazvali desmuslin (DMN). Analiza sekvence pokazala je da DMN ima kratki N-terminalni domen, konzervirani domen štapića i dugi C-terminalni domen, sve zajedničke karakteristike intermedijarnog proteina tipa VI. Pozitivna interakcija između DMN i alfa-distrobrevina potvrđena je *in vitro* testom koimunoprecipitacije. Analizom Northern blot-a, Mizuno et al. (2001) otkrili su da se transkript DMN od 7,5 kb eksprimira uglavnom u srcu i skeletnim mišićima, iako postoji određena ekspresija u mozgu. Western blot analiza otkrila je protein od 160 kD u srcu i skeletnim mišićima.

Imunofluorescentna mikroskopija lokalizirala je DMN prugastim uzorkom u uzdužnim presjecima i mozaičnim uzorkom u presjecima skeletnih mišića. Elektronskomikroskopska analiza pokazala je da se DMN kolokalizira s dezminom na Z-linijama. Naknadni eksperimenti s koimunoprecipitacijom potvrdili su interakciju s dezminom. Mizuno i dr. (2001) sugeriraju da DMN može poslužiti kao izravna veza između vanćelijskog matriksa i Z-diskova, putem plektina i može imati važnu ulogu u održavanju integriteta mišićnih ćelija.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  1.565 aminokiselina, a molekulska težina   172.768 Da..

1020304050
MLSWRLQTGPEKAELQELNARLYDYVCRVRELERENLLLEEELRGRRGRE
GLWAEGQARCAEEARSLRQQLDELSWATALAEGERDALRRELRELQRLDA
EERAARGRLDAELGAQQRELQEALGARAALEALLGRLQAERRGLDAAHER
DVRELRARAASLTMHFRARATGPAAPPPRLREVHDSYALLVAESWRETVQ
LYEDEVRELEEALRRGQESRLQAEEETRLCAQEAEALRREALGLEQLRAR
LEDALLRMREEYGIQAEERQRAIDCLEDEKATLTLAMADWLRDYQDLLQV
KTGLSLEVATYRALLEGESNPEIVIWAEHVENMPSEFRNKSYHYTDSLLQ
RENERNLFSRQKAPLASFNHSSALYSNLSGHRGSQTGTSIGGDARRGFLG
SGYSSSATTQQENSYGKAVSSQTNVRTFSPTYGLLRNTEAQVKTFPDRPK
AGDTREVPVYIGEDSTIARESYRDRRDKVAAGASESTRSNERTVILGKKT
EVKATREQERNRPETIRTKPEEKMFDSKEKASEERNLRWEELTKLDKEAR
QRESQQMKEKAKEKDSPKEKSVREREVPISLEVSQDRRAEVSPKGLQTPV
KDAGGGTGREAEARELRFRLGTSDATGSLQGDSMTETVAENIVTSILKQF
TQSPETEASADSFPDTKVTYVDRKELPGERKTKTEIVVESKLTEDVDVSD
EAGLDYLLSKDIKEVGLKGKSAEQMIGDIINLGLKGREGRAKVVNVEIVE
EPVSYVSGEKPEEFSVPFKVEEVEDVSPGPWGLVKEEEGYGESDVTFSVN
QHRRTKQPQENTTHVEEVTEAGDSEGEQSYFVSTPDEHPGGHDRDDGSVY
GQIHIEEESTIRYSWQDEIVQGTRRRTQKDGAVGEKVVKPLDVPAPSLEG
DLGSTHWKEQARSGEFHAEPTVIEKEIKIPHEFHTSMKGISSKEPRQQLV
EVIGQLEETLPERMREELSALTREGQGGPGSVSVDVKKVQGAGGSSVTLV
AEVNVSQTVDADRLDLEELSKDEASEMEKAVESVVRESLSRQRSPAPGSP
DEEGGAEAPAAGIRFRRWATRELYIPSGESEVAGGASHSSGQRTPQGPVS
ATVEVSSPTGFAQSQVLEDVSQAARHIKLGPSEVWRTERMSYEGPTAEVV
EVSAGGDLSQAASPTGASRSVRHVTLGPGQSPLSREVIFLGPAPACPEAW
GSPEPGPAESSADMDGSGRHSTFGCRQFHAEKEIIFQGPISAAGKVGDYF
ATEESVGTQTSVRQLQLGPKEGFSGQIQFTAPLSDKVELGVIGDSVHMEG
LPGSSTSIRHISIGPQRHQTTQQIVYHGLVPQLGESGDSESTVHGEGSAD
VHQATHSHTSGRQTVMTEKSTFQSVVSESPQEDSAGDTSGAEMTSGVSRS
FRHIRLGPTETETSEHIAIRGPVSRTFVLAGSADSPELGKLADSSRTLRH
IAPGPKETSFTFQMDVSNVEAIRSRTQEAGALGVSDRGSWRDADSRNDQA
VGVSFKASAGEGDQAHREQGKEQAMFDKKVQLQRMVDQRSVISDEKKVAL
LYLDNEEEENDGHWF

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Funkcija 
Sinemin je intermedijarni filament (IF) i, kao i drugi IF, primarno funkcionira kao integrirajući mehanički stres i održavajući strukturni integritet u eukariotskim ćelijama. Iako je primijećen u različitim tipovima ćelija, najbolje je proučavan u sarkomerama skeletnih miocita. Lokalizira se na Z-disku i pokazano je da se veže za α-distrobrevin, α-aktinin i dezmin, da djeluje kao mehanički linker u prenošenju sila bočno kroz tkivo, posebno između kontraktilnih miofibrila i vanstaničnog matriksa. Sinemin doprinosi povezivanju kostamera i kontraktilnog aparata u skeletnim mišićima sinemin nul životinja. Synemin plays an important regulatory role in the heart and the consequences of its absence are profound.

## Svojstva 
Sinemin ima svojstva vrlo slična intermedijarnom filamentu sinkoilina. Konkretno, veže se za α-distrobrevin u distrofinom povezanom proteinskom kompleksu da djeluje kao mehanički "linker" između miofibrilske mreže i ćelijske membrane.

## Varijante prerade 
Postoje tri varijante prerade sinemina, α i β i L. Obje izoforme imaju vrlo kratki N-terminalni domen od 10 aminokiselina i dugi C-terminalni domen od 1243 aminokiseline za izoformu-α i 931 aminokiseline za izoformu-β.
 An intronic sequence of the synemin β isoform is used as a coding sequence for synemin α.

## Kancer 
Gen SYNM je posmatran kako se progresivno smanjuje u ljudskii papiloma virus – pozitivan neoplazijski keratinocit izveden iz cerviksa maternice preneoplazijske lezije na različitim nivoima malignosti. Zato je SYNM vjerovatno povezan s tumorigenezom i može biti potencijalni prognostički marker za napredovanje cerviksne preneoplazijske lezije.  Nakon kloniranja kokošijeg sinemina, Mizunoet al. izvijestili su o kloniranju novog IF proteina, ljudskog dezmuslina, kao proteina koji djeluje s α-distrobrevinom. Analiza sekvence pokazala je da je ljudski dezmuslin bio 32% identičan i 11% sličan aminokiselinskoj sekvenci kokošijeg sinemina, dok su IF proteini vimentin i dezmin više od 80% identični kod iste vrste. Iako je nekoliko dijelova bilo vrlo slično između ljudskog dezmuslina i kokošijeg sinemina, nizak stupanj konzerstiviranosti između ova dva proteina u usporedbi s drugim kloniranim IF proteinima sugerirao je da sinemin nije ljudski ortolog dezmuslina. Pored toga, za razliku od kokošijeg sinemina, testovi *in vitro* koimunoprecipitacija nisu mogli otkriti interakciju između ljudskog dezmuslina i α-aktinina. U  2001., Titeux et al. izvestili su o kloniranju α i β varirajuće izoforme ljudskog sinemina i pokazale su da je β-sinemin identičan desmuslinu. 2014. godine prijavljena je prva sinemin – /– nula životinja.

## Reference
## Vanjski linkovi 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 15
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika