C10orf67

**Otvoreni okvir čitanja 67 hromosoma 10  (C10orf67)**, znan i kao **C10orf115**, **LINC01552** i  **BA215C7.4**,  jest neokarakterizi ljudski protein-kodirajući gen. Nekoliko studija ukazuje na moguću vezu između genetičkih polimorfizama ovog i nekoliko drugih gena s hroničnim upalnim barijernim bolestima, poput Crohnove bolesti i sarkoidoze.
;Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  551 aminokiselina, a molekulska težina
63 656 Da.

1020304050
MMALVRDRRAHYVMSIVIRWVHCFSSSLRGTFGTRWEAMKAKATELRVCC
ARRKREAREFKPPQMRGSTRLNISDDLKIGFFSTDHATQTDSSEILSVKE
LSSSTQKLAQMMKSLQVDFGFLKQLLQLKFEDRLKEESLSLFTILHDRIL
EIEKHYQQNEDKMRKSFNQQLADAIAVIKGMYQQFFEVEEENVSLQDAST
VKTNILLRKLKEKEEVIKELKEELDQYKDFGFHKMESFAKETSSPKSNLE
KENLEYKVENERLLQIISELEEEIQINLKENSGLEDELISMKEMAEKDHK
TIQKLMDSRDRLREELHYEKSLVQDVINKQKEDKEMRKKYGSLSVKVARS
AKGREASLSPWPKSPPSTTALRPHSATMSVSSAGAQKAKMPKKALKEDQA
VVEDKHGLESQIEALKANLENEKKKVERFRKEADRLNKSWEKRFFILRNS
FHVLKNEMFTRHTLFRQFAVLADTSFNYIKVKPLLVQSRTTMTAISSSSH
CTSSIDGKHVDVVSDQAALQLSPKGKLSESPKEESLEEPSMRQSSPAETV
D

## Gen 
thumb|Mapa hromosoma 10 sa lokacijom C10orf67 (označena crveno)
Gen obuhvata 142.366 parova baza i nalazi se na lokusu 10p12.2 na minus (–) ili smislenom lancu hromosoma 10. Uz bok je uzvodno od gena ARMC3 i nizvodno od gena  KIAA1217. Ovi geni su sa približno 150.000 bp, odnosno  350.000 bp iz C10orf67. [center|thumb|1001x1001px|Ovaj segment prikazuje približno 1.700.000 parova baza hromosoma 10. Zelene linije označavaju početak transkripcije, dok crveni dijamanti označavaju završetak transkripcije. C10orf67 se transkribira u suprotnom smjeru od njegovih bočnih gena koji se nalaze na [smislenost (genetika)|Nonsens lancu.]]

### Transkript 
Postoje 23 alternativno prerađena egzona, koji kodiraju 13 varijante transkripta. Primarni transkript, sa samo 2943 bp, nije dobro konzerviran među ortolozima, već varijanta X2, 3417 bp, ima daleko veći identitet s ortolognim proteinima. Ova varijanta transkripta X2 sadrži 15 egzona što daje polipeptid od 551 aminokiseline.

## Protein 
### Opća svojstva
Ovisno od posttranslacijske modifikacije (PTM-a)

Od ne-PTM-a – svi mogući PTM-i

Izoelektrična tačka je značajno veća od prosjeka za ljudske proteine (6,81).
thumb|Softverski generirana predviđena tercijarna struktura  C10orf67. Na osnovu proteinskog šablona koji pokriva 74% proteinske sekvence sa 96% identiteta. |500x500px

### Struktura 
Desno je prikazana predviđena tercijarna struktura proteina. Obilježena je dugim alfa-heliksima s nekoliko regija zavojnica i beta lancima lokaliziranim na kraju proteina, nasuprot krajevima N – i C-kraja.

### Ekspresija 
thumb|Ekspresija C10orf67 u raznim tkivima.
|500x500px
C10orf67 je umjereno eksprimiran (50–75%) u većini tkiva u tijelu. otkrivši da je ekspresija proteina pala na nulu u prisutnosti IL-13 u epitelu dišnih putova.

### Subćelijska lokalizacija 
Protein sadrži mitohondrijski signalni peptid koji ga lokalizira u mitohondrijski matriks. Softverska analiza za potćelijsku lokalizaciju  potvrdila je ovaj nalaz. Međutim, predviđeno je da će se neki ortolozi lokalizirati u jedru. Iako visoka izoelektrična tačka ljudskog proteina pruža daljnje dokaze za lokalizaciju u mitohondrijama, zbog visokog pH mitohondrijskog matriksa.

### Posttranslacijske modifikacije 
#### Mjesta cijepanja 
Protein se u početku cijepa kako bi se uklonilo 36 aminokiselina N-terminalnog signalnog peptida, nakon što je lokaliziran u mitohondrijama.

#### Fosforilacija 
[thumb|380x380px| Moguća mjesta fosforilacije C10orf67: Koncentracija mogućih mjesta fosforilacije je daleko veća u blizini [C-kraja proteina i daleko niža u blizini N-kraja, koji sadrži signalni peptid.]]
Postoji niz predviđenih mjesta fosforilacije, ali postoji i jedno eksperimentalno potvrđeno mjesto fosforilacije na treoninu 69. Ostala mjesta fosforilacije sažeta su u donjem dijagramu proteina.

#### Sumoilacija 
Postoji pet predviđenih sumoilacijskih mjesta unutar C10orf67. Sažeta su u sljedećoj tabeli:
  
[thumb|center|789x789px|[Posttranslacijske modifikacije C10orf67. N-kraj je lijevo sa signalnim peptidom od 36 aminokiselina, a C-kraj je desno.]]

## Homologija i evolucija 
### Evolucija 
C10orf67 nema poznatih paraloga, ali ima mnogo ortologa unutar eukariota i zadržava značajan identitet sa vrstama koje su udaljene kao beskičmenjaci. Nekoliko odabranih ortologa je dolje navedeno s nekim identifikacijskim podacima.

### Evolucija
[thumb|450x450px| Brzina evolucije C10orf67 u odnosu na fibrinogen i [citohrom c.]]
Brzina evolucije C10orf67 uspoređena je s onom fibrinogena i citohroma c, koje predstavljaju brze i spore stope evolucije. Podebljane vrste u tabeli odabrane su da predstavljaju ortologe fibrinogena i citohroma c, radi određivanja brzine evolucije odgovarajućih proteina.

Brzina evolucije C10orf67 je vrlo zanimljiva jer slijedi logaritamski, a ne linearni trend, poput većine proteina.

## Klinički značaj 
### Sarkoidoza 
Iako je funkcija C10orf67 nepoznata, njegove interakcije s IL-13 dalje ukazuju na njegovu ulogu u sarkoidozi jer je poznato da bolest uključuje različite interleukine.

### Kancer 
Dok nekoliko NCBI GEO profila koji ispituju uticaj različitih faktora na ekspresiju gena pokazuju da je C10orf67 eksprimiran u različitim nivoima u različitim tkivima raka, lokalizacija u mitohondrijama može dati određeni uvid u kliničku funkciju. Pokazalo se da mitohondrie imaju neki uticaj u proliferaciji ćelija. S obzirom na velike potrebe za energijom uzrokovane proliferacijom , postojalo je nekoliko hipoteza da mitohondrije mogu imati ulogu u ćelijskom ciklusu te da bi C10orf67, lokaliziran na mitohondrijama, mogao imati i tu ulogu.

## Reference
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Geni na hromosomu 10
Kategorija:Proteomika