SLITRK1

**Član 1 porodice NTRK-likih proteina** (**SLITRK1**, **SLIT i član**) je ljudski gen koji kodira transmembranski i signalni protein, dio porodice gena SLITRK, odgovornih za  regulaciju sinapsne i presinapsne diferencijacije u mozgu. Ekspresija gena povezana je s ranim stvaranjem ekscitacijskih sinapsi vezanjem s receptorskom tirozin-fosfatazom PTP (LAR-RPTP). Razna istraživanja godinama povezivala su mutacije u genu sa stanjem na OKP spektru, Touretteovom sindromu i trihotilomaniji, ali mutacije u samom genomu uveliko variraju među osobama, pri čemu je većina mutacija uočenih teško ponoviti .

Članovi porodice SLITRK, kao što je SLITRK1, su integralni membranski proteini sa po dva N-terminalna ponavljanja bogata leucinom (LRR), slična onima domena SLIT proteina (vidi SLIT1; MIM 603742). Većina SLITRK-a, ali ne i SLITRK1, također imaju C-terminalne regije koje dijele homologiju s neurotropinskim receptorima (vidi NTRK1; MIM 191315). SLITRK se eksprimiraju pretežno u nervnim tkivima  i imaju neurit-modulirajuću aktivnost (Aruga et al., 2003).

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 696  aminokiselina, a molekulska težina   77.735 Da.

1020304050
MLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSL
QRFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPG
AFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAF
QDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQ
IPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQGK
DLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQEDHAT
PGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLPCPGGCSCDHI
PGSGLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKN
LILLDLGNNNIATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLE
YLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLS
LHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECSCTIVPFKQWAERLGSE
VLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARISPTLTSHSKNSTGLA
ETGTHSNSYLDTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNRKRSK
RRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Gen 
Gen za SLITRK1 nalazi se na hromosomu 13, skvenca 13q31.1. Eksprimira samo u ljudskom mozgu. MRNA se može diferencirati od alternativne prerađenih sekvenci i sadrži domene za vanćelijski matriks, kao i za LRR. Miševi imaju ortolog gena koji se zove Slitrk1.

## Funkcija 
SLITKR1 je visoko eksprimiran u centralnom nervnom sistemu. Eksprimira se tokom embriogeneze i postnatalno, ali se ekspresija s vremenom smanjuje i lokalizirana je na postsinapsnoj membrani. iako njegovo proučavanje može doprinijeti boljem razumijevanju TS-a. Rijetke varijante u SLITRK1 mogu dovesti do TS-a, a mutacije u nekodirajućim regijama SLITRK1 također mogu odigrati ulogu, ali potrebno je izvršiti daljnja istraživanja prije nego što se donesu bilo kakvi zaključci.

Naknadnim ispitivanjem regije gena SLITRK1 nije pronađena mutacija ni kod jednog od 82 pacijenta s Tourettovim sindromom. Autori su zaključili da bi testovi za otkrivanje varijanti u genu vjerojatno imali malu dijagnostičku korist. Eksperiment s efektima mikrodelecije u hromosomu 13q31.1 izveden je na fetusu; majka je mikrodeleciju prenijela na dijete i oboje nisu imali Tourettov sindrom ili bilo koje druge simptome OKP -a, pokazujući da to možda nije izravni uzrok sindroma. Dalji pokušaji da se studija ponovi su napravljeni u više studija. U jednoj japanskoj studiji, korišteno je sekvenciranje sljedeće generacije za pregled 92 pacijenata sa TS i 361 zdrave kontrole, nijedan TS pacijent nije našao mutacije u bilo kojoj varijanti ili bilo kakve nove mutacija u genu. U jednom evropskom istraživanju, otkriveno je da dvije originalne varijacije nisu pronađene ni u jednom od 222 trija koja su proučavana. Međutim, u grupama su obavljeni i testovi na jednonukleotidni polimorfizam (SNP) i za tri je utvrđeno da imaju varijacije. Nađeno je da su dvije od tri varijacije povezane s nastankom Tourettovog sindroma.  U drugom istraživanju 381 kavkazoida s nekim oblikom OKP sa 356 pacijenti bez OKP-a, nakon genetičkog pregleda otkrivene su tri genetičke promjene. Od nnjih tri, dvijesu identificirana samo jednom, a treća je pronađena kod četiri pacijenata sa OKP-om, ali i kod pacijenata koji nisu imali OKP. Pacijent koji nije imao OKP, imao je kompulzivno grickanje nokata, ali ove studije pokazuju da genetička veza između SLITRK1 i pacijenata sa TS-om može postojati i  složenije su prirode nego što se ranije smatralo. U jednoj od prethodno navedenih studija, majka djeteta koja je imala *de novo* translokaciju 13q imala je trihotilomaniju; to bi sugeriralo da bi mogla postojati i genetička veza između SLITRK1 i trihotilomanije.

Izvedeno je i istraživanje u kojem je 44 porodice sa osobama koji su imali trihotilomaniju sekvenciralde svoj gen SLITRK1. Dvije nove nesinonimske mutacije otkrivene su na oko devet parova baza jedna od druge, na području odvojenom od onog gdje su nađene mutacije za Touretteov sindrom. Ovi rezultati su upoređeni s kontrolom i nijedna nije imala mutaciju, što sugerira da su ove mutacije, iako rijetke, bile povezane s trihotilomanijom.

## Također pogledajte
* SLITRK2
* Proteinska tirozin-fosfataza

## Reference 
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 13
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Kategorija:Touretteov sindrom