PAPOLA

**Poli(A) polimeraza alfa** je enzim koji je kod ljudi kodiran genom **PAPOLA**.

Primjenom fluorescentne *in situ* hibridizacije i  radijacijskom hibridnom analizom, Yamauchi et al. (1999) locirali su gen PAP na poziciji 14q32.1-q32.2.

PAPOLA se veže za FIP1L1 (Faktor koji djeluje u interakciji s PAPOLA i CPSF1), podjedinicu faktora specifičnosti cijepanja i poliadenilacije (CPSF1). Ovaj složeni poliadenilirajući 3' kraj je prekursor iRNK  (pre-iRNK) (vidi CPSF). CPSF1 je proteinska RNK koja se prerađuje i veže se za sekvence bogate uracilom u pre-iRNK. Veže se i stimulira aktivnost polinukleotid adenililtransferaza i time dodaje adenililne ostatke pre-mRNK. Ovo djelovanje poli-adenilila povećava sazrijevanje i pomicanje pre iRNK iz jedra u citoplazmu, dok dramatično povećava stabilnost iRNK nastale iz pre-iRNK: FIP1L1 je faktor 3'-završne prerade pre-iRNK. Fuzije gena *FIP1L1* između njega i *PDGFRA* (*PGDFRA*) ili receptora retinojske kiseline (RARA)  su uzročni geni određenih ljudskih bolesti povezanih s patološki povećanim nivoom eozinofila u krvi i/ili leukemija.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 745 aminokiselina, a molekulska težina   82.843 Da .

1020304050
MPFPVTTQGSQQTQPPQKHYGITSPISLAAPKETDCVLTQKLIETLKPFG
VFEEEEELQRRILILGKLNNLVKEWIREISESKNLPQSVIENVGGKIFTF
GSYRLGVHTKGADIDALCVAPRHVDRSDFFTSFYDKLKLQEEVKDLRAVE
EAFVPVIKLCFDGIEIDILFARLALQTIPEDLDLRDDSLLKNLDIRCIRS
LNGCRVTDEILHLVPNIDNFRLTLRAIKLWAKRHNIYSNILGFLGGVSWA
MLVARTCQLYPNAIASTLVHKFFLVFSKWEWPNPVLLKQPEECNLNLPVW
DPRVNPSDRYHLMPIITPAYPQQNSTYNVSVSTRMVMVEEFKQGLAITDE
ILLSKAEWSKLFEAPNFFQKYKHYIVLLASAPTEKQRLEWVGLVESKIRI
LVGSLEKNEFITLAHVNPQSFPAPKENPDKEEFRTMWVIGLVFKKTENSE
NLSVDLTYDIQSFTDTVYRQAINSKMFEVDMKIAAMHVKRKQLHQLLPNH
VLQKKKKHSTEGVKLTALNDSSLDLSMDSDNSMSVPSPTSATKTSPLNSS
GSSQGRNSPAPAVTAASVTNIQATEVSVPQVNSSESSGGTSSESIPQTAT
QPAISPPPKPTVSRVVSSTRLVNPPPRSSGNAATSGNAATKIPTPIVGVK
RTSSPHKEESPKKTKTEEDETSEDANCLALSGHDKTEAKEQLDTETSTTQ
SETIQTAASLLASQKTSSTDLSDIPALPANPIPVIKNSIKLRLNR

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
Poliadenilacija tri osnovna kraja eukariotskih iRNK je ključni događaj koji se odvija u jedru tokom sazrijevanja iRNK. Reakcija se odvija u dva različita koraka: endoribonukleolitsko cijepanje pre-RNK na poli(A) mjestu, nakon čega slijedi sinteza poli(A) repa na 3-osnovnom kraju gornjeg produkta cijepanja. Poli (A) polimeraza (PAP) potrebna je za reakciju dodavanja adenozina (sažetak Thuresson et al., 1994).

Koristeći RT-PCR za citoplazmatsku RNK iz primarnih ljudskih fibroblasta, Thuresson et al. (1994) dobili su cDNK koja kodira PAP. Izvedeni protein od 500 aminokiselina je 99% sličan goveđoj sekvenci. Western blot analiza ekstrakata HeLa ćelija otkrila je proteine otporne na toplotu od 100 i 106-kD u jedarnim i citoplazmatskim frakcijama, te 90-kD-ni protein osjetljiv na toplotu u jedarnim frakcijama. Protein od 106 kD je fosforiliran. Funkcionalna analiza mutiranih peptida pokazala je da je N-terminalni region PAP potreban za nespecifičnu aktivnost polimeraze, dok su i N– i C-krajevi potrebni za specifičnu aktivnost polimeraze.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 14
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika