NIPBL

**Bradavicoliki protein-B** (**NIPBL**), znan i kao **SCC2** ili **delangin** jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **NIPBL**  sa hromosoma 5. NIPBL je potreban za povezivanje kohezina s DNK i glavna je podjedinica kompleksa za punjenje kohezina. Heterozigotne mutacije u *NIPBL* čine oko 60% slučajeva sindroma Cornelije de Lange.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 2.804 aminokiseline, а molekulska težina  316.051 Da..

1020304050
MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNARIAEEV
NCLLACRDDNLVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVL
ARSPNVFREKSMQNRYVQSGMMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHS
PSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHPSSYTTHPQ
MQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSEDYLHM
VHRLSSDDGDSSTMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSEGTPKGSRPPLILQSQ
SLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKEQSEKAAMYDIISS
PSKDSTKLTLRLSRVRSSDMDQQEDMISGVENSNVSENDIPFNVQYPGQT
SKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVAAKQPQT
SVVQNQQQISQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDK
PLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGR
VDSQASITQDSDSIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDIVGSLKSTPENHPETP
KKKSDPELSKSEMKQSESRLAESKPNENRLVETKSSENKLETKVETQTEE
LKQNESRTTECKQNESTIVEPKQNENRLSDTKPNDNKQNNGRSETTKSRP
ETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGESRPETPKQK
NEGRPETPKHRHDNRRDSGKPSTEKKPEVSKHKQDTKSDSPRLKSERAEA
LKQRPDGRSVSESLRRDHDNKQKSDDRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSS
RNEHGIKSDSSKTDKLERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDS
NKSRSDKLGFKSPTSKDDKRTEGNKSKVDTNKAHPDNKAEFPSYLLGGRS
GALKNFVIPKIKRDKDGNVTQETKKMEMKGEPKDKVEKIGLVEDLNKGAK
PVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKNKPSKSNKGSIDQSVLKE
LPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAF
ESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRS
PSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFK
RFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKA
MGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLI
MERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYP
QYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSEL
LEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTAVFSRYEKHRQ
LILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQC
VVHLPSSEKDSNAEEDSNKKIDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCG
SKQGEEDYRPLFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKS
TEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQ
LQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEKAMKSQKDEES
SEGTHHAKEIETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDY
DDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVV
AVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYY
DMLIERILDTGISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEE
GIKKLVNETFQKLWFTPTPHNDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQ
LLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVEHILKYEESLADSDNKGVNSG
RLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQNDFMVICNVAKI
LELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVT
QNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGAL
CRHFDFDLEDFKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAF
IQHPSLMFEQEVKNLYNNILSDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQ
ADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQLYLKQVLEAFFHTQSSVRHF
ALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQQLVEIDKKYA
GFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIR
GNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTDVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIM
HHIDITLSVSGSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSDSEEEVSRP
RKSRKRVDSDSDSDSEDDINSVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLK
QHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSD
MANSKITEEVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVSASTNARNKAI
TSLLGGGSPKNNTAAETEDDESDGEDRGGGTSGSLRRSKRNSDSTELAAQ
MNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQKTSSGFSVQWMAGSYSGSWTE
AKRRDGRKLVPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSLYAAKD
GTSS

## Struktura i interakcije 
nim domenom SCC2 (plavo) pupajučeg kvasca (Hinshaw et al., 2015)]]
NIPBL je  veliki kukasti protein koji sadrži HEAT-ponavljanje. Formira kompleks sa MAU2 (SCC4 u pupajućem kvascu), poznat kao kompleks kohezinskog utovara. Kako ovo ime sugerira, NiPBL i MAU2 potrebni su za početno udruženje kohezina sa DNK.

Smatra se da  kohezin posreduje interakcije poboljšavač-promotor i generira topološki udružujuće domene (TADS) kao i posredovanje kohezije i reguliranje arhitekture DNK.  Kompleks kohezina potreban je za popravak DNK homolognom rekombinacijom. S obzirom da je NIPBL potreban za udruživanje kohezina s DNK, smatra se da je i NiPBL potreban za sve ove procese. Dosljedno, inaktivacija NiPBL-a rezultira u topološkom udruživanju gubitaka i kohezije.

NIPBL se dinamički veže na hromatin, glavnim putem udruživanja sa kohezinom.  Kretanje NiPBL-a unutar hromatina u skladu je sa mehanizmom koji uključuje skakanje između hromosomkog koheziranja prstenova. Pokazana je i kohezina nezavisna  regulacijia ekspresija odgovornog gena.

## Klinički značaj 
Mutacije u ovom genu rezultiraju sindromom Cornelije de Lange (CDLS), poremećaj koji karakterizira dismorfne karakteristike lica, kašnjenje rasta, smanjenje dužine udova i mentalna invalidnost Nije poznato zašto se javlja smanjenje ekspresije NIPBL u CDL-ovima.

## Reference 
Kategorija:Geni na hromosomu 5
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika