SKIV2L

**Helikaza SKI2W** jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom **SKIV2L**. Ovaj enzim je ljudski homolog kvašćevog SKI2, koji može biti uključen u antivirusnu aktivnost, blokiranjem translacije  poli (A) deficijentnih iRNK. Gen *SKIV2L* nalazi se u klasi III regije glavnog kompleksa histokompatibilnosti.

1020304050
MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPC
APDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKWQRKTDPWSLLAVLGAPVPS
DLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPT
QYPFWPGGMDEPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKD
CPTPAPGLLSLSCMLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRGDTVSASPCSAP
LARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLI
PQPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQ
KHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTT
EILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSI
ILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRPVPLEHYLFTGNSSKTQ
GELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQD
RGVYLSLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEI
HLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLNRGLGVHHSGILPILKEIVEML
FSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQM
AGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTM
ILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQALAELTKRLGALEEPD
MTGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRVVVVKNQ
EHHNALGVILQVSSNSTSRVFTTLVLCDKPLSQDPQDRGPATAEVPYPDD
LVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQP
KFKKDPPLAAVTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGL
RARKLEELIQGAQCVHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMERLRFLLSDQSLL
LLPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNAL
STLRPEEIAALLSGLVCQSPGDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQV
ACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCI
QRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ

## Identifikacija gena 
Nova ljudska cDNK, homologna genu kvasca SKI2, identificirana je 1995. Istraživači su lokalizovali odgovarajući gen u hromosomu 6, regija p.&nbsp;21.

Gen *SKIV2L*, poznat i kao *SKI2W* ili  *Ski2*-lika RNK helikaza, prostire se na 11 kB i sadrži 28 egzona.

Po prisustvu DEVH-kutije na položaju 423-426 unutar SKI2W zaključuje se da je on član porodice SF-II helikaza.

Ljudski protein je dobio ime SKI2W zbog sličnosti sa proteinom kvasca Ski2, koji ima visoko homologne (gotovo identične) regije na helikaznom domenu i C-terminalu.

## Funkcija 
Većina eukariotskog genoma je transkribirana u molekule RNK, koje zahtijevaju obradu i nadzor radi kontrole obilnog i oštećenog materijala. Multiproteinski kompleks egzosomne RNK obavlja ovu funkciju i ovisan je o kofaktorima. Egzosom je u početku otkriven u kvascu, ali je prisutan i kod viših eukariota. Ima aktivnost i u jedru i u citoplazmi za normalan raspad iRNK i za nadzor i kontrolu kvaliteta RNK putem nonsens mutacijama posredovanih; non-stop i no-go razgradnje.

SKI2W dio je SKI kompleksa tetraproteina koji je obavezni citoplazmatski kofaktor egzosoma RNK i sastoji se od *SKI2W*, *TTC37* i dvije podjedinice WD40 (kodirane sa *WDR61*), kao na prvoj slici. Tačne interakcije nisu dobro opisane, ali  pokazano je da DEVH-helikaze razdvajaju nukleinske niti na način ovisan o energiji. Ski kompleks kvasca opsežnije je proučavan od ljudskog homologa, a stvorena je kristalna struktura egzosoma RNK i njegove interakcije koja podržava ulogu u neprestanom raspadanju, čime se ćelija  štiti od aberantnih proteina.]]
Smatra se da protein Ski2 u kvascu ima ulogu i u antivirusnoj odbrani, vjerovatno svojom ulogom u prometu RNK ili kontrolom razgradnje RNK.

Pokazalo se da je *SKIV2L* negativan regulator receptora sličnih Rig-I (RLR) koji otkrivaju RNK. Autori su otkrili da je egzosom citosolne RNK, definiran "SKIV2L" RNA helikazom, važan za ograničavanje aktivacije RLR-a i antivirusnog odgovora. Ako se endogene RNK ne mogu obraditi, stanica se podvrgava nerazvijenom proteinskom odgovoru koji pokreće odgovor antivirusnog interferona (IFN). Pokazalo se da ljudske ćelije sa nedostatkom *SKIV2L* imaju snažan IFN znak koji ukazuje na hronični antivirusni odgovor. Autori sugeriraju da bi pacijenti kasnije mogli biti skloniji autoimunskim poremećajima, iako se to još nije pokazalo, vjerojatno zbog velike smrtnosti pacijenata. Međutim, ovaj nalaz sugerira vezu između "SKIV2L" i imunskog odgovora.

## Klinički značaj 
Patogene varijante u * SKIV2L * povezane su s triho-hepato-ciijevnim sindromima (THES), poznatim i kao sindromska dijareja (SD) ili fenotipska dijareja (PD). Stankler et al (1982) su ga prvi opisali kao Stanklerov sindrom, a ovo stanje je preimenovano u THES 1994. godine. THES jw rijetka pojava sa procijenjenom prevalencijom od  1:1,000.000. Karakterizira ga neizlečiva dijareja, koja počinje u prvih nekoliko sedmica života; karakteristične abnormalnosti kose, "vunasta" i lomljiva dlaka, ograničenje intrauterinog rasta i karakteristični dismorfizmi lica. Druge asocijacije su disfunkcija jetre, abnormalnosti kože, intelektualni invalidnost i imunodeficijencija. Manje česti nalazi uključuju abnormalnosti trombocita i urođene srčane mahane.

Postoje dva uzročna gena, * SKIV2L * (u 1/3 pacijenata) i *TTC37* (2/3 pacijenata), oba kodiraju proteine u Ski kompleksu i klinički se ne razlikuju jedan od drugog.

Uporni vodenasti proljev gotovo je dosljedna karakteristika u gotovo svim opisanim slučajevima, a gotovo uvijek počinje ubrzo nakon rođenja i obično zahtijeva parenteralnu prehranu. U slučajevima koji ne zahtijevaju takvu prehranu potrebna je elementarna prehrana i suplementacija.

Rjeđe su prijavljeni kongenitalni srčani defekti, uglavnom defekti ventrikularnog septuma (VSD), pretkomorskih pregrada (ASD), a rijetko Fallotova tetralogija i periferna plućna stenoza.

### Stopa mortaliteta 
U početku prijavljeno je čak 62,5% s većinom smrtnih slučajeva u prvoj godini, dok novije izvještaji procjenjuju smrtnost od oko 30%, što je slično drugim poremećajima koji ovise o parenteralnoj prehrani.

## Preporučeni tretman i nadzor 
Za OVE nisu dostupni posebni tretmani. Cilj je maksimizirati povećanje tjelesne težine i smanjiti stopu infekcija.

Većini djece potrebna je parenteralna prehrana (PN) koja se može kombinirati s oralnim hranjenjem, najčešće poluelementarna prehrana koja omogućava pacijentima da s vremenom postanu neovisni o PN. Prehranu i rast treba pomno pratiti. Ako PN nije potreban, izvještaji su opisali upotrebu formule na bazi aminokiselina, iako nije jasno je li povećanje tjelesne težine bilo odgovarajuće.

Treba ispitati nivo imunoglobulina i odgovor na vakcinu. Ako se pronađu bilo kakve abnormalnosti, potrebno je konzultirati pedijatrijskog imunologa i razmotriti  intravenozno davanje  imunoglobulina (IVIG), kako bi se smanjila mogućnost sistemskih infekcija. Infekcija je prijavljena kao uzrok smrti u 20% velike grupe francuskih pacijenata.

Steroidi, imunosupresivi i transplantacija krvotvornih matičnih ćelija bili su  bez uspjeha i stoga se ne preporučuju.

Genetičko savjetovanje treba ponuditi jer je vjerovatnoća ponavljanja pogođene  braće i sestara 25% pri svakom začeću.

## Dobno vezana degeneracija makule (ARMD) 
Pokazalo se  intronski jednonukleotidni polimorfizam  (SNP) u "SKIV2L" u studijama asocijacije na genom zaštićen od starosne degeneracije makule. Nedavno je objavljeno da varijanta 3'UTR u * SKIV2L * ima zaštitni učinak kod polipoidne horoidne vaskulopatije, hemoragijsken bolesti makule, koja dijeli neke karakteristike s neovaskularnom ARMD. Kako varijante ne bi uticale na strukturu proteina, predloženo je da utiče na regulaciju oksidativnih stresova.

Nasuprot tome, jedno drugo istraživanje pokazalo je da je genetička varijanta rs429608 snažno povezana s razvojem ARMD-a u kineskoj populaciji Han, ali potrebne su daljnje studije kako bi se istražila biološka uloga  i patogeneza SKIV2L.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 6
Kategorija:Enzimi
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika