IRF2BPL

**Proteinoliki interferonski regulatorno vezujući  faktor 2** ie protein koji je kod ljudi kodiran genom **IRF2BPL**.

Mutacije su mu povezane sa neurološkim problemima. Preciznije, mutacije ovog gena uzrokuju sindrom NEDAMSS, čija skraćenica znači *NEurorazvojni poremećaj s regresijom, abnormalnim pokretima, gubitkom govora i napadima*, prvi put opisanom u 2018.

Analizom genomske sekvence i radijacijso-hibridnim mapranjem , Rampazzo et al. (2000) locirali si gen C14ORF4  na hromosomskoj poziciji 14q24.3. Također su odredili da je ovaj gen bez introna. Bočno područje s 5' mjesta ne sadrži TATA ili CAATT okvire, ali ima puno GC sadržaja i uključuje dva mjesta koja vežu SP1. 3-bazni kraj sadrži dva signala poliadenilacije.

## Molekuska genetika
U sedam nepovezanih pacijenata s neurorazvojnim poremećajem s regresijom, abnormalnim pokretima, gubitkom govora i napadima (NEDAMSS), Marcogliese et al. (2018) identificirali su heterozigotne mutacije u genu IRF2BPL . Mutacije su pronađene sekvenciranjem egzona i potvrđene sangerovskim sekvenciranjem. Mutacije su se dogodile *de novo* kod svih pacijenata kod kojih je roditeljska DNK bila dostupna za analizu. Pet pacijenata nosilo je nonsens mutacije, dok su dva s nešto manje ozbiljnim fenotipom nosil misens mutacije. Prekomjerne ekspresija  nonmsens mutacija kod drozofile nije izazvala smrtnost, kao što je uočeno kod prekomjerne ekspresije gena divljeg tipa, što sugerira da su nonsens mutacije rezultirale gubitkom funkcije. Ekspresija mutacije K418N  rezultirala je smrtnošću pri višim temperaturama, što upućuje na to da uzrokuje djelomični gubitak funkcije, dok je ekspresija varijante P372R  rezultirala smrtnošću, slično divljem tipu. Djelimično nokidiranje gena jama u *Drosophila*, korištenjem RNKi izazvalo je progresivni poremećaj nervne motorike i disfunkciju učenja, a specifično nokautiranje gena u fotoreceptorima oka uzrokovalo je progresivne abnormalnosti. Kompletni poremećaj gena drozofilskih  jama bio je toksičan za mušicu, što je rezultiralo letalnošću, kao i prekomjerna ekspresija obje jame i IRF2BPL. Nalazi sugeriraju da je gen IRF2BPL uključen i u neurološki razvoj i u održavanje neurona.

Koristeći sekvenciranje egzoma, Tran Mau-Them et al. (2019) identificirali su različite *de novo* heterozigotne nonsens mutacije pomjeranja okvira u genu IRF2BPL kod 11 nepovezanih pacijenata s NEDAMSS-om. Sve mutacije izostale su iz baze podataka gnomAD i očekivalo se da kodiraju protein kojem nedostaje C-terminalni RING-prstni domen.

## Životinjski model
Marcogliese et al. (2018) otkrili su da je široko konzerviran najbliži ortolog genu IRF2BPL u *Drosophila*, zvani *pits*, uključujući i u nervni sistem. Ekspresija je otkrivena u različitim dijelovima mozga, uključujući ćelijsko tijelo, jedro i neuronske aksone. Prekid gena jama bio je toksičan za mušicu, što je rezultiralo smrtonosnošću, kao i prekomjerna ekspresija oba *pits*-a i IRF2BPL. Kod *Drosophila*,  gen pits nalazi se na X hromosomu.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  796  aminokiselina, a molekulska težina   82-659 Da..

1020304050
MSAAQVSSSRRQSCYLCDLPRMPWAMIWDFSEPVCRGCVNYEGADRIEFV
IETARQLKRAHGCFQDGRSPGPPPPVGVKTVALSAKEAAAAAAAAAAAAA
AAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLNHVDGSSKPAVLAAPSGLERYG
LSAAAAAAAAAAAAVEQRSRFEYPPPPVSLGSSSHTARLPNGLGGPNGFP
KPTPEEGPPELNRQSPNSSSAAASVASRRGTHGGLVTGLPNPGGGGGPQL
TVPPNLLPQTLLNGPASAAVLPPPPPHALGSRGPPTPAPPGAPGGPACLG
GTPGVSATSSSASSSTSSSVAEVGVGAGGKRPGSVSSTDQERELKEKQRN
AEALAELSESLRNRAEEWASKPKMVRDTLLTLAGCTPYEVRFKKDHSLLG
RVFAFDAVSKPGMDYELKLFIEYPTGSGNVYSSASGVAKQMYQDCMKDFG
RGLSSGFKYLEYEKKHGSGDWRLLGDLLPEAVRFFKEGVPGADMLPQPYL
DASCPMLPTALVSLSRAPSAPPGTGALPPAAPSGRGAAASLRKRKASPEP
PDSAEGALKLGEEQQRQQWMANQSEALKLTMSAGGFAAPGHAAGGPPPPP
PPLGPHSNRTTPPESAPQNGPSPMAALMSVADTLGTAHSPKDGSSVHSTT
ASARRNSSSPVSPASVPGQRRLASRNGDLNLQVAPPPPSAHPGMDQVHPQ
NIPDSPMANSGPLCCTICHERLEDTHFVQCPSVPSHKFCFPCSRESIKAQ
GATGEVYCPSGEKCPLVGSNVPWAFMQGEIATILAGDVKVKKERDP

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi
* 
* Parent Group Europe http://irf2bpl.de(http://irf2bpl.de/)

Kategorija:Geni na hromosomu 14
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika