Epitop

**Epitop**,  koji je poznat i kao **antigenska determinanta**  (antigenska odrednica), dio je antigena koji je je prepoznatljiv od strane imunog sistema, posebno od strane antitijela, B ćelija ili T ćelija. Na primjer, epitop je specifični dio antigena koji se spaja sa antitijelom u  tvorevinu antigen-antitijelo. Dio antitijela koji se veže za epitop  zove se  paratop. Iako  epitopi obično nisu samo proteini, sekvence odgovora domaćina  mogu ih  prepoznati (kao u slučaju autoimunih bolesti).

Na osnovu njihove strukture i interakcije sa paratopom,  epitopi  proteinskih  antigena su podijeljeni u dvije kategorije:
*konformacijski epitopi i
*linearne epitopi.
Konformacijski epitop se sastoji od diskontinuiranih  dijelova aminokiselinskih sekvenci. Ovi epitopi ulaze u interakciju  sa paratopima na osnovu 3-D oblika i funkcije površine ili tercijarne strukture antigena. Relativni udio konformacionih epitopa u ukupnoj količini epitopa  je nepoznat.

Nasuprot tome, linearne epitopi  ragiraju sa paratopima na osnovu njihove primarne strukture. Linearni epitop se formira kontinuirani m slijedom  aminokiselina u antigenu.
## Epitopi T ćelije
Epitop T ćelije se ispoljavaju na površini antigen prezentirajuće ćelije, gdje su vezani u  molekule Glavnog kompleksa histokompatibilnosti (MHC]).  Molekule epitopa u MHC klasi I sadrže  obično između 8 i 11 aminokiselinskih  peptida, dok molekule MHC klase II  imaju više peptida:  13-17 aminokiselina u dužini, a i ne-klasične MHC molekule su prisutne u ne-peptidskime pitopima kao što glikolipidi.

## Mapiranje epitopa
Epitopi mogu biti  mapirani pomoću proteinskih  mikrozračenja i *ELISPOT*  ili ELISA tehnikom.

Epitopi MHC klase I i II mogu se  pouzdano predvidjeti i samo  računarskim tehnikama, iako  sve takve procjene algoritama T ćelijskih epitopa  nisu ekvivalentni  njihovoj tačnosti.
## Oznake (tagovi) epitopa
Epitopi se često koriste u proteomici i proučavanju drugih genskih proizvoda. Pomoću tehnika rekombinantne DNK genetičke sekvence kodiranja  epitopa koje su prepoznate od zajedničkog antitijela mogu biti spojeni na genu.  Nakon  sinteze proteina, rezultirajući tag epitopa  omogućava antitijelu  pronaći protein ili drugi genski  proizvoda , što omogućavaju laboratorijske tehnike  za lokalizaciju, pročišćavanje i daljnje molekulske  karakterizacije. Zajednički epitopi koji se koriste za ovu svrhu su Myc-tag, HA-tag, FLAG-tag, GST-tag, 6xHispitope tag, koji  postižu ireverzibilnu imobilizaciju.
## Reference
## Također pogledajte
* Paratop
* Mapiranje epitopa
* Izotip

## Vanjski linkovi
## Vanjski linkovi
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?highlight=epitope&rid=imm.section.335#341 ]
* Antigeni se mogu vezati u džepovima ili žljebovima ili proširenim površinama u mjestu vezivanja antitijela
* Lbtope: Poboljšani metod za linearne B-ćelijske epitope. Predikcija pomoću ntigenske primarne sekvence.PLoS ONE 8(5): e62216
* BCEP: Predikcija proteina  B-ćelijskih epitopa pomoću 3D struktura.
### Baze podataka za epitope
*MHCBN: A database of MHC/TAP binder and T-cell epitopes
*Bcipep: A database of B-cell epitopes
* SYFPEITHI - First online database of T cell epitopes
* IEDB - Database of T and B cell epitopes with annotation of recognition context - NIH funded
* ANTIJEN - T and B cell epitope database at the Jenner institute, UK
* IMGT/3Dstructure-DB - Three-dimensional structures of B and T cell epitopes with annotation of IG and TR - IMGT, Montpellier, France
* SEDB: A Structural Epitope Database- Pondicheery University, DIT funded 
* 

Kategorija:Fiziologija
Kategorija:Imunologija
Kategorija:Imunološki sistem