TMCO4

**Transmebranski i upredenozavojnički domen 4** jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **TMCO4** sa  hromosoma 1. Njegova funkcija još  nije dobro definirana. Predviđeno je da transmembranski protein tri puta prelazi membranu endoplazmatskog retikuluma. TMCO4 stupa u interakciju s drugim proteinima za koje je poznato da imaju ulogu u razvoju raka, nagoveštavajući moguću ulogu u  toj bolesti.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 634 aminokiseline, a molekulska težina 67.910 Da.

1020304050
MAMWNRPCQRLPQQPLVAEPTAEGEPHLPTGRELTEANRFAYAALCGISL
SQLFPEPEHSSFCTEFMAGLVQWLELSEAVLPTMTAFASGLGGEGADVFV
QILLKDPILKDDPTVITQDLLSFSLKDGHYDARARVLVCHMTSLLQVPLE
ELDVLEEMFLESLKEIKEEESEMAEASRKKKENRRKWKRYLLIGLATVGG
GTVIGVTGGLAAPLVAAGAATIIGSAGAAALGSAAGIAIMTSLFGAAGAG
LTGYKMKKRVGAIEEFTFLPLTEGRQLHITIAVTGWLASGKYRTFSAPWA
ALAHSREQYCLAWEAKYLMELGNALETILSGLANMVAQEALKYTVLSGIV
AALTWPASLLSVANVIDNPWGVCLHRSAEVGKHLAHILLSRQQGRRPVTL
IGFSLGARVIYFCLQEMAQEKDCQGIIEDVILLGAPVEGEAKHWEPFRKV
VSGRIINGYCRGDWLLSFVYRTSSVQLRVAGLQPVLLQDRRVENVDLTSV
VSGHLDYAKQMDAILKAVGIRTKPGWDEKGLLLAPGCLPSEEPRQAAAAA
SSGETPHQVGQTQGPISGDTSKLAMSTDPSQAQVPVGLDQSEGASLPAAA
SPERPPICSHGMDPNPLGCPDCACKTQGPSTGLD

## Gen 
TMCO4 se nalazi na minus lancu hromosoma 1 na sekvenci 1p36.13. The gene consists of 118,172 base pairs stretching from base pair 19,682,213 through 19,800,385. Najčešća varijanta je X1, koja uključuje sve egzone i obuhvata svih 118.172 bazna para. Predviđa se da je N-terminal TMCO4 unutar citosola ćelije, a  C-terminal unutar lumena endoplazmatskog retikuluma. Također se predviđa da TMCO4 ima leucinski zatvarač i veliki domen upredene zavojnice.

### Sekundarna struktura 
Predviđa se da u sekundarnoj strukturi TMCO4 dominiraju alfa heliksi, na osnovu predviđanja softvera iTASSER.

### Posttranslacijske modifikacije 
Predviđena su mnoga mjesta fosforilacija za dva citosolna regiona TMCO4. Mjesta O-vezane glikozilacije predviđena su na drugoj lumenskoj regiji TMCO4. Ove predviđene lokacije mogu se vidjeti i na shematskoj ilustraciji TMCO4 koja se nalazi iznad ili u konceptnoj translaciji TMCO4 koji se nalazi ispod.

### Subćelijska lokalizacija 
Konzistentno se predviđa da se TMCO4 nalazi u membrani endoplazmatskog retikuluma na osnovu mnogih homologa. FLT1 je receptor VEGFreceptor VEGF Poznato je da VEGF ima značajnu ulogu u razvoju raka. Drugi proteini za koje je eksperimentalno pokazano da TMCO4 stupa u interakciju su UBB, UBC, KPTN i BVLF1. KPTN je protein koji je neophodan u neuromorfogenezi. BVLF1 je protein Epstein-Barrovog virusa.

## Homologija 
### Paralozi 
TMCO4 nema nikakve paraloge.

### Ortolozi 
Ortolozi TMCO4 mogu se naći u bakterijama, protistima, biljkama, gljivama, trichoplaxima, beskičmenjacima, ribama, vodozemcima, gmizavcima, pticama i sisarima. Neki od ovih ortologa se mogu naći u donjoj tabeli. Ortolozi su sortirani u opadajućem redosledu datiranja evolucijke divergencije od ljudi, a zatim opadajućem redosledu postotaka identiteta sekvence. TMCO4 je gen koji brzo evoluira i koji je bio visoko konzerviran kroz evoluciju. Regioni TMCO4 koji su visoko konzervirani u ortolozima uključuju različite transmembranske domene i regiju abhidrolaza.

## Ekspresija 
TMCO4 je visoko eksprimiran u mnogim tkivima. Najveća ekspresija se javlja u prostati, trahejama, maternici, tankom crijevu, posteljici, štitnoj žlijezdi, pljuvačnim i nadbubrežnim žlijezdama. Predviđa se da ekspresiju TMCO4 kontroliraju mnogi transkripcijski faktori.

## Klinički značaj 
TMCO4 još nije direktno povezan ni sa jednom bolešću ili poremećenim fenotipom. Međutim, interakcija sa VEGF receptorom može ukazivati na moguću ulogu u kanceru.

## Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 1
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Transmembranski proteini
Kategorija:Proteomika