Eukariotska mala ribosomska podjedinica (40S)

**Eukariotska mala ribosomska podjedinica** (**40S**) je manja podjedinica eukariotskog ribosoma (80S), a druga glavna komponenta je velika ribosomska podjedinica (60S). Nazivi "40S" i "60S" potiču od konvencije da se ribosomske čestice označavaju prema njihovim koeficijentima sedimentacije u Svedbergovim jedinicama. Strukturno i funkcionalno je povezana sa 30S podjedinicom 70S prokariotskih ribosoma. Međutim, 40S podjedinica je mnogo veća od prokariotske 30S podjedinice i sadrži mnoge dodatne proteinske segmente, kao i segmente za ekspanziju rRNK.

## Funkcija
40S podjedinica sadrži centar za dekodiranje koji prati komplementarnost tRNK i iRNK u translaciji proteina. Ona je najveća komponenta nekoliko kompleksa za inicijaciju translacije, uključujući 43S i 48S preinicijacijske komplekse (PIC), a vezana je s nekoliko eukariotskih faktora inicijacije, uključujući eIF1, eIF1A i eIF3. 40S ribosomska podjedinica je također čvrsto vezana za HCV IRES kako bi formirala binarni kompleks posredovan interakcijama protein-iRNK i rRNK-iRNK. Više informacija možete pronaći u člancima o ribosomu, eukariotskom ribosomu (80S i članku o translaciji proteina.

## Opća struktura
Oblik male podjedinice može se podijeliti na dva velika segmenta, glavu i tijelo. Karakteristične osobine tijela uključuju lijevo i desno stopalo, rame i platformu. Glava ima šiljastu izbočinu koja podsjeća na ptičji kljun. iRNK se veže u pukotini između glave i tijela, a postoje tri mjesta vezivanja za tRNK, A-mjesto, P-mjesto i E-mjesto (pogledajte članak o translaciji proteina za detalje).

Jezgro 40S podjedinice formira 18S ribosomska RNK (skraćeno 18S rRNK), koja je homologna prokariotskoj 16S rRNK. Ova jedarna rRNK ukrašena je desetinama proteina. Na slici "Kristalna struktura eukariotske 40S ribosomske podjedinice iz *Tetrahymena thermophila*, jedarna ribosomska RNK  predstavljena je kao siva cijev, a ekspanzijski segmenti su prikazani crvenom bojom. Proteini koji imaju homologe kod eukariota, arheja i bakterija prikazani su kao plave trake. Proteini koje dijele samo eukarioti i arheje prikazani su kao narandžaste trake, a proteini specifični za eukariote prikazani su kao crvene trake.

## 40S ribosomski proteini
Tabela: "40S ribosomski proteini" prikazuje pojedinačne proteinske nabore 40S podjedinice obojene konzervacijom. Proteini koji imaju homologe kod eukariota, arheja i bakterija (EAB) prikazani su kao plave trake. Proteini koje dijele samo eukarioti i arheje (EA) prikazani su kao narandžaste trake, a proteini specifični za eukariote (E) prikazani su kao crvene trake. Eukariotski specifični ekstenzije konzerviranih proteina, u rasponu od nekoliko ostataka ili petlji do vrlo dugih alfa heliksa i dodatnih domena, označene su crvenom bojom. Za detalje pogledajte članak o eukariotskom ribosomu. Historijski gledano, za ribosomske proteine korištene su različite nomenklature. Naprimjer, proteini su numerirani prema svojim migracijskim svojstvima u eksperimentima gel elektroforeze. Stoga se različita imena mogu odnositi na homologne proteine iz različitih organizama, dok identična imena ne moraju nužno označavati homologne proteine. Tabela "40S ribosomski proteini" ukršta nazive ljudskih ribosomskih proteina s homologima kvasca, bakterija i arheja. Više informacija možete pronaći u baza podataka gena ribosomskih proteina (RPG).

## Također pogledajte
* Eukariotska velika ribosomska podjedinica (60S)

## Reference
## Vanjske veze 
* Ribosomal Protein Gene Database (RPG)

Kategorija:Ribosomi
Kategorija:RNK