EGR1

**EGR-1** (skraćenica od engleskog naziva **E**arly  **G**rowth **R**esponse protein **1** = protein odgovora na rani faktor rasta ) znan i kao **ZNF268** (engleska skraćenica za protein cinkovog prsta 268) ili **NGFI-A** (engleska skraćenica za protein A induciran fakrorom rasta) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **EGR1**.

EGR-1 je transkripcijski faktor. Nazvan je i Krox-24, TIS8 i **ZENK**. Prvobitno je otkriven kod miševa.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 543 aminokiselina, а molekulska težina  57.507 Da.

1020304050
MAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLG
AAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHL
TAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLW
PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPLSCAVPSNDSS
PIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFPGSAGTALQYPPPAYPAAKGGFQVP
MIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRTQQPSLTPLSTIKAFATQSG
SQDLKALNTSYQSQLIKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFS
RSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDI
CGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSY
PSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYS
SVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSFSASTGLSDMTATFSPRTIEIC

## Funkcija 
Protein kodiran ovim genom pripada porodici EGR proteina Cys2 njegovog tipacinkovog prsta2 To je jedarni protein i funkcionira kao regulator transkripcije. Proizvodi ciljnih gena koje aktivira potrebni su za diferencijaciju i mitogenezu. Studije sugeriraju da se radi o tumor-supresorskom genu.

Ima jasan obrazac ekspresije u mozgu, a pokazalo se da je njegova indukcija povezana s neuronskom aktivnošću. Nekoliko studija sugerira da ima ulogu u plastičnosti neurona.

EGR-1 je važan faktor transkripcije u formaciji memorija. Ima bitnu ulogu u reprogramiranju epigenetičkih moždanih neurona. EGR-1 regrutuje protein TET1 koji pokreće put demetilacije DNK.  Uklanjanje oznaka metilacije DNK omogućuje aktivaciju nizvodnih gena. EGR-1, zajedno s TET1, koristi se za programiranje distribucije mjesta metilacije DNK mozga tokom njegovog razvoja, u učenju i dugoročnoj neuronskom plastičnosti. Takođe je utvrđeno da EGR-1 regulira ekspresiju VAMP2 (proteina važnog za sinapsne egzocitoze).

Osim svoje funkcije u živčanom sistemu, postoje značajni dokazi da EGR-1 zajedno sa svojim paralogom EGR-2 inducira u fibroznim bolestima, ima ključne funkcije u fibrinogenezi i neophodan je za eksperimentalno induciranu fibrozu kod miševa.

Može biti uključen i u funkciju jajnika.

## Struktura 
Domen koji veže DNK EGR-1 sastoji se od tri  domena cinkovog prsta tipa Cys2His2.
Struktura aminokiselina EGR-1 domena cinkovog  prsta data je u ovoj tabeli, koristeći jednoznačni kod aminokiselina. Prsti od 1 do 3 označeni su sa f1 - f3. Brojevi se odnose na ostatke (aminokiseline) alfa-helikse (nema nule). Ostaci označeni sa "x" nisu dio cinkovih prstiju, već služe za njihovo povezivanje.

;Simboli: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Aspartat (Asp, D), Cistein (Cys, C), Glutamat (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glicin (Gly, G), Histidin (His, H), Izoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lizin (Lys, K), Metionin (Met, M), Fenilalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serin (Ser, S), Treonin (Thr, T), Triptofan (Trp, W), Tirozin (Tyr, Y), Valin (Val, V)

Kristalna struktura DNK vezana domenom cinkovog prsta EGR-1 riješena je 1991. godine, što je uveliko pomoglo rano istraživanje u domenama vezanja DNK za cinkove prste.

Ljudski protein EGR-1 sadrži (u neobrađenom obliku) 543 aminokiselina molekulske mase 57,5 kDa, a gen se nalazi na hromosomu 5.

## Specifičnost vezivanja DNK 
EGR-1 veže DNK sekvencu 5'-GCG TGG GCG-3'(i slične  5'-GCG GGG GCG-3').
Položaj f1 veže 5 'G (prvi broj baze slijeva); položaj f1 3 prema drugoj bazi (C); pozicija f1 -1 veže se za treću poziciju (G); f2 položaj 6 do četvrte baze (T); i tako dalje.

## Interakcije 
Pokazalo se da EGR-1 stupa u interakcije sa:
* CEBPB, 
* CREB-vezujući protein, 
* NAB1, 
* P53, i
* PSMA3

## Također pogledajte 
* Cinkov prst

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi 
* 
* 
* 
* 

Kategorija:Molekularna neuronauka
Kategorija:Transkripcijski faktori
Kategorija:Cinkovi proteini
Kategorija:Geni na hromosomu 5
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika