LRRC40

**LRRIQ3**  (Leucinom-bogarta ponavljanja sa  IQ motivom 3), znan i kao **LRRC44**, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **LRRIQ3** sa  hromosoma 1.                        . It is predominantly expressed in the testes, and is linked to a number of diseases.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 624 aminokiseline, a molekulska težina 73.675 Da.

1020304050
MFHGTVTEELTSHEEWSHYNENIREGQKDFVFVKFNGLHLKSMENLQSCI
SLRVCIFSNNFITDIHPLQSCIKLIKLDLHGNQIKSLPNTKFWNGLKNLK
LLYLHDNGFAKLKNICVLSACPTLIALTMFDCPVSLKKGYRHVLVNSIWP
LKALDHHVISDEEIIQNWHLPERFKACNHRLFFNFCPALRKGTTYEEEIN
NIKHITSKINAILAHNSPVLIVQRWIRGFLVRKNLSPVFFHKKKQQEKII
RGYEAKWIYITKGYEDKLLKDLFFKPETNIKGKLAYWKHNIYYPVDLKNS
SEHRKHVSSILCELKPKDLGMKSKTSRHLIQKGQESEDEIVDEKLDTSFR
ISVFKLPIYTSGSLKNNAVLREKKQHFFPAYPQPIYTTHPKPIIKKDIRL
ERSMKEFFAPQRAGMKLRTFSDIDKYYTEQKKQEYHKEKVRVVAMAQVAR
ERVRVAVNEHLNQKKYATQKLIEENKETIQNSLRQVWQNRFNYLEKARER
KALFLKEKSQKASERLLVQNLNNERTLLTRGLLKIDRLEKNEAVLKEKSL
IVKQKLKAEKYRKNLLKEMKKVRSQEIYKRHCEEKFVMDMIAFEKACERL
QDAKTKVAIVKTNLDFKVPNGLIK

## Gen 
### Lokus 
LRRIQ3 se nalazi na minus lancu kraja kratkog kraka ljudskog hromosoma 1 na  sekvenci 1p31.1.

### Sveukupna struktura 
U  navodnoj sekvenci LRRIQ3 postoji ukupno sedam egzona. sa najvišim nivoima ekspresije u tkivu sjemenika. Postoje relativno visoki nivoi ekspresije u T-ćelijama, epididimisu, bubrezima i brojnim žlijezdama.

## Protein 
### Opća i kompoziciona svojstva 
Izoforma 1 ljudskog proteina LRRIQ3 sastoji se od 624 aminokiseline i ima molekulsku težinu od 73,7 kDa. Izoelektrična tačka LRRIQ3 je 9,73, što sugerira da je LRRIQ3 bazna pri normalnom fiziološkom pH (~7,4). Pored toga, postoje snažni dokazi da se ljudski LRRIQ3 nalazi na  plazmamembrani obojenih antitijela. LRRIQ3 je bogat  lizinskom ostacima, sa ukupno 82 lizina. Ima nešto manje  glicina.

### Domeni i motivi 
Ukupno postoje četiri konzervirana domena unutar LRRIQ3: 3 ponavljanja bogata leucinom i jedan IQ kalmodulin-vezujući motiv. IQ motiv omogućava mjesto vezanja za kalmodulin (CaM) ili proteine slične CaM-u.

### Sekundarna i tercijarna struktura 
Predviđeno je da je LRRIQ3 uglavnom alfa-heliksna struktura, uključujući dugi alfa-heliksni C-terminalni domen. Također je predviđeno da funkcionira kao monomer.
a. Tri ponavljanja bogata leucinom prikazana su u crvenoj, lososnoj i magenta boji. IQ domen koji veže kalmodulin prikazan je zelenom.|292x292px]]

### Posttranslacijske modifikacije 
Predviđa se da će LRRIQ3 biti podvrgnut mnogim posttranslacionim modifikacijama. To uključuje O-GlcNAcilaciju, SUMOilacija, ubikvitinaciju i fosforilaciju. LRRIQ3 is predicted to have 4 well conserved SUMOlyation sites and 1 well conserved ubiquitination site.|563x563px]]

### Interakcije proteina 
Postoje dokazi da LRRIQ3 stupa u interakciju sa brojnim proteinima iz dvohibridni eseji i afinitetna hromatografija. Proteini sa kojima LRRIQ3 stupa u interakciju uključuju LYN, NCK2, GNB4 i ABL1. Ovi proteini povezani su sa ćelijskom signalizacijom, reorganizacijom citoskeleta i ćelijskom diferencijacijom, kao i drugim pojavama.

## Homologija i evolucija 
### Paralozi i ortolozi 
Kod ljudi ne postoji paralog za LRRIQ3. Broj godina od divergencije od ljudskog proteina, naveden u "prije miliona godina" ispod, izračunat je pomoću TimeTree. 

## Klinički značaj 
LRRIQ3 je povezan sa brojnim tipovma raka. Eksperimenti RNK-seq pokazali su da je LRRIQ3 jako smanjeno reguliran (Log2 puta promjene između –3,4 i –4,2) u brojnim bolesnim stanjima, uključujući rak gušterače, kolorektumski rak i rak dojke.

## Reference 
Kategorija:Geni na hromosomu 1
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika