TDRD3

**Tudorski domenski protein 3** jeprotein koji je kod ljudi kodiran genom **TDRD3** . Goulet et al. (2008) navode da se gen TDRD3 nalazi u hromosomu 13, sekvenca 13q21.2. Utvrdili su da gen TDRD3 sadrži 14 egzona i da obuhvata oko 176,5 kb. Egzon 14 nije kodirajući.

TDRD3 ije multifunkcijski protein koji djeluje kao  as a transcripcijski koaktivator iu jedru i skelskim proteinima pri stresu citoplazmatskih granula (Yang et al., 2010). 
Sadrži tudorski i UBA proteinski domen i ima tri različite izoforme

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  651 aminokiselina, a molekulska težina   73.185 Da..

1020304050
MLRLQMTDGHISCTAVEFSYMSKISLNTPPGTKVKLSGIVDIKNGFLLLN
DSNTTVLGGEVEHLIEKWELQRSLSKHNRSNIGTEGGPPPFVPFGQKCVS
HVQVDSRELDRRKTLQVTMPVKPTNDNDEFEKQRTAAIAEVAKSKETKTF
GGGGGGARSNLNMNAAGNRNREVLQKEKSTKSEGKHEGVYRELVDEKALK
HITEMGFSKEASRQALMDNGNNLEAALNVLLTSNKQKPVMGPPLRGRGKG
RGRIRSEDEEDLGNARPSAPSTLFDFLESKMGTLNVEEPKSQPQQLHQGQ
YRSSNTEQNGVKDNNHLRHPPRNDTRQPRNEKPPRFQRDSQNSKSVLEGS
GLPRNRGSERPSTSSVSEVWAEDRIKCDRPYSRYDRTKDTSYPLGSQHSD
GAFKKRDNSMQSRSGKGPSFAEAKENPLPQGSVDYNNQKRGKRESQTSIP
DYFYDRKSQTINNEAFSGIKIEKHFNVNTDYQNPVRSNSFIGVPNGEVEM
PLKGRRIGPIKPAGPVTAVPCDDKIFYNSGPKRRSGPIKPEKILESSIPM
EYAKMWKPGDECFALYWEDNKFYRAEVEALHSSGMTAVVKFIDYGNYEEV
LLSNIKPIQTEAWEEEGTYDQTLEFRRGGDGQPRRSTRPTQQFYQPPRAR
N

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Funkcija gena
Linder et al. (2008) otkrili su da je izolirani UBA domen TDRD3 vezan za ubikvitinske veze preko lys48 u lancu tetraubikvitina, ali ne i za monoubikvitin, lys63-ubikvitin ili SUMO1 . Analiza kvaščeve 2-hibridne biblioteke cDNK ljudskog mozga otkrila je da je TDRD3 u interakciji s FXR1. Eksperimenti otpuštanja proteina i koimunoprecipitacije pokazali su da je TDRD3 također u interakciji s FMRP (FMR1) i FXR2. Prekomjerna ekspresija/nadekspresija TDRD3 ili izloženost arsenitu, u HeLa ćelijama uzrokovala je stvaranje stresnih granula koje sadrže TDRD3, FMRP, DAP5 (EIF4G2) i TIAR (TIAL1). Analiza mutacije otkrila je da je regija C-terminalna na tudorskom domenu TDRD3 u interakciji s dva neovisna domena u FMRP-u. Otkrili su da mutacija ile304-to-asn (I304N) u FMRP-u, koja je povezana sa sindromom fragilnog X , poništava interakciju između TDRD3 i FMRP-a.

Nezavisno, Goulet et al. (2008) identificirali su TDRD3 kao komponentu granula citoplazmatskog stresa. TDRD3 nakupljen u granulama stresa nakon ćelijskog stresa izazvanog arsenitom i kolokaliziran s FMRP-om i proteinom G3BP koji veže RNK. I FMRP i TDRD3 slijedili su poliribosome izolirane iz normalnih i stresnih HeLa ćelija, duž kolone za isključivanje veličine. Analiza mutacije otkrila je da je tudorski domen TDRD3 neophodan i dovoljan za translokaciju TDRD3 u granule naprezanja nakon tretmana arsenitom. Eksperimenti smanjenja proteina pokazali su da je TDRD3 u interakciji s proteinima uključenim u obradu RNK, uključujući proteine bogate argininom i glicinom EWS (EWSR1), FUS, DDX3 (DDX3X), SERBP1 i EEF1A1. Objavili suda je tudorski domen tudora simetrični motiv vezanja dimetiliranog arginina (sDMA), te su otkrili *in vitro*da je izolirana tudor domen TDRD3 vezanog imobiliziranog sDMA. Mutacija glu691 u lys (E691K) unutar tudor domene TDRD3 poništila je ovu interakciju. Mutacija E691K je također eliminirala ili oslabila interakciju TDRD3 s EWS, FUS, DDX3 i EEF1A1 i smanjila regrutiranje TDRD3 u granule pod stresom.

Yang et al. (2010) pregledali su mikromrežu proteinskog domena na molekule koje mogu očitati oznake metilarginina povezane s transkripcijskom aktivacijom. Otkrili su da je TDRD3 vezan za aktivirajuću asimetričnu oznaku dimetilarginina na histonu H4 arg3 (H4R3me2a) kataliziranom pomoću PRMT1  i na H3R17me2a,  uz katalizator CARM1. TDRD3 je prepoznao oznaku SDMA H4R3me2s, ali slabije. TDRD3 je funkcionirao kao koaktivator u reporterskim testovima ovisnim o reporterima, estrogenim receptorima (ER ili ESR1) i androgenim receptorima (AR). Analiza imunoprecipitacijske sekvence hromatina otkrila je da je TDRD3 općenito povezan s početnim mjestima transkripcije i da je povezan s promotorom pS2 (TFF1) na način ovisan o CARM1 u ćelijama MCF7 ljudskog raka dojke. Nokautiranje endogenog TDRD3 u MCF7 u ćelijama smanjilo je ER-ovisnu reportersku aktivnost i smanjilo ekspresiju TFF1, NRAS i DDX5. Zaključili su da je TDRD3 protein koji veže metilarginin i koji ima različite uloge u jedru i citoplazmi. Pretpostavili su da je u jedru TDRD3 efektorska molekula za metilne oznake generirane od CARM1 i PRMT1 i da funkcionira kao transkripcijski koaktivator. U citoplazmi, TDRD3 se akumulira u stresnim granulama, kao odgovor na stres i funkcionira kao molekula skele.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 13
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika