LARP6

**La-srodni protein 6**, znan i kao **aheron**  ili **član 6 porodice  La  ribonukleoproteinskog domena** (LARP6), je protein koji je kod ljudi kodiran genom **LARP6**.

Valavanis et al. (2007) utvrdili su da gen ACHN sadrži najmanje dva egzona i obuhvata približno 22,6 kb. Analizom sekvence, mapirali  su gen ACHN na hromosomu 15q23.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 491  aminokiselina, a molekulska težina   54.737  Da.

1020304050
MAQSGGEARPGPKTAVQIRVAIQEAEDVDELEDEEEGAETRGAGDPARYL
SPGWGSASEEEPSRGHSGTTASGGENEREDLEQEWKPPDEELIKKLVDQI
EFYFSDENLEKDAFLLKHVRRNKLGYVSVKLLTSFKKVKHLTRDWRTTAH
ALKYSVVLELNEDHRKVRRTTPVPLFPNENLPSKMLLVYDLYLSPKLWAL
ATPQKNGRVQEKVMEHLLKLFGTFGVISSVRILKPGRELPPDIRRISSRY
SQVGTQECAIVEFEEVEAAIKAHEFMITESQGKENMKAVLIGMKPPKKKP
AKDKNHDEEPTASIHLNKSLNKRVEELQYMGDESSANSSSDPESNPTSPM
AGRRHAATNKLSPSGHQNLFLSPNASPCTSPWSSPLAQRKGVSRKSPLAE
EGRLNCSTSPEIFRKCMDYSSDSSVTPSGSPWVRRRRQAEMGTQEKSPGT
SPLLSRKMQTADGLPVGVLRLPRGPDNTRGFHGHERSRACV

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
Korištenjem protokola diferencijalnog izbora, Valavanis et al. (2007) identificirali su gen LARP6, koji je povezan s programiranom ćelijskom smrću međusegmentnih mišića moljca *Manduca sexta* (duhanski sokolova sovica) kada završava metamorfozu od kukuljice do odrasle jedinke. Nazvali su gen aheron (Achn), prema rijeci koja u grčkoj mitologiji vodi u carstvo mrtvih. Pregledavanjem biblioteke cDNK ljudskog hipokampusa sa sekvencom koja pokazuje visoki identitet sekvence na Manduca Achn, praćenim RT-PCR,  sastavili su ljudsku ACHN cDNK pune dužine. ACHN kodira izvedeni protein od 491 aminokiseline sa tri ponavljanja N-terminalnog Lupus antigena (La), mjestom amidacije, jedarnim lokalizacijskim i eksportnim signalima, navodnim motivom prepoznavanja RNK, navodnim mjestima fosforilacija i glikozilacija i tri SP ponavljanja. Ljudski protein je 46%, a 94% sličan proteinima *Manduce* i miša. RT-PCR analiza miševa pokazala je najveću ekspresiju Ahna u mozgu, snažnu ekspresiju u srcu, skeletnim mišićima i sjemenicima, a nižu u timusu, slezeni i bubregu. Studije pokretljivosti na gelu pokazale su da je Achn protein posttranslacijski modificiran.

## Funkcija gena
Valavanis et al. (2007) citirali su neobjavljene studije koje pokazuju da je Achn ključni regulatorni protein koji kontrolira diferencijaciju u nekoliko loza, a naročito mišića. Gubitak Achn bilo u C2C12 mioblastima *in vitro*, bilo u embrionima zebrica, rezultirao je neuspjehom u formiranju multijedarnih miocijevi. Zaključili su da je Achn regulatorni protein koji vjerovatno posreduje u različitim razvojnim i homeostatskim procesima.

Funkcionalnom karakterizacijom kvasca, Hussain et al. (2013) pokazali su da ljudski LARP4, LARP6 i LARP7, u punoj dužini nisu supresori posredovani putem tRNK, iako su njihovi La moduli (tj. La motiv (LAM) i susjedni motiv RNK prepoznavanja (RRM)) sami imali aktivnost supresije koja je bila neovisna o stabilnoj 3-prim end-zaštiti pre-tRNK. Umjesto toga, LARP4, LARP6 i LARP7 bili su RNK šaperoni čije su aktivnosti bile neovisne od UUU-3-prim-OH vezivanja i bile su usredotočene oko RRM-a i sekvence neposredno nizvodno od RRM-a. Aktivnost supresije posredstvom tRNK posredovanih La modula povezana je s aktivnošću šaperona, budući da je LAM djelovao kao pomoćna struktura koja je pomogla regrutovanju RNK u susjedni RRM.

## Klinički značaj 
U nedavnoj studiji povezanosti genoma, gen LARP6 povezan je sa osobinama glukoze natašte, *diabetes mellitus tip 2* i gojaznost.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 15
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika