ZGRF1

**ZGRF1** jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **ZGRF1** od 236.6 kDa sa hromosoma 4. ZGRF1 genski proizvod nalazi se na ćelijskom jedrru i podstiče popravak DNK, stimulirajući homolognu rekombinaciju. Ovaj gen pokazuje relativno nisku ekspresiju u većini ljudskih tkiva, sa povećanom ekspresijom u situacijama hemijske zavisnosti. ZGRF1 je ortologan za skoro sva carstva  eukariota. Funkcionalni domeni ovog proteina povezuju ga sa nizom helikaza, od kojih su najznačajniji domeni AAA_12 i AAA_11.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  2.104 aminokiseline, a molekulska težina  236.602 Da.

1020304050
MESQEFIVLYTHQKMKKSKVWQDGILKITHLGNKAILYDDKGACLESLFL
KCLEVKPGDDLESDRYLITVEEVKVAGAIGIVKQNVNKEAPELNSRTFIS
SGRSLGCQPSGLKRKFTGFQGPRQVPKKMVIMESGESAASHEAKKTGPTI
FSPFCSMPPLFPTVGKKDVNNILADPENIVTYKNRERNAMDFSSVFSPSF
QINPEVLCEENYFCSPVNSGNKLSDSLLTNEPVKRDSLASHYSGVSQNIR
SKAQILALLKSESSSSCEELNSEMTEHFPQKQPQGSLKIATKPKYLIQQE
ECAEMKSTENLYYQHQSENTMRNKSRWAMYLSSQSSPIHSSTVDGNDTER
KPKAQEDDVNSNLKDLSLQKIIQFVETYAEERKKYNVDQSVGNNDPSWNQ
EVKLEIPSFNESSSLQVTCSSAENDGILSESDIQEDNKIPFNQNDKGCIK
GSVLIKENAQEVNTCGTLEKEYEQSESSLPELKHLQIESSNNSRISDDIT
DMISESKMDNESLNSIHESLSNVTQPFLEVTFNLNNFETSDTEEESQESN
KISQDSESWVKDILVNDGNSCFQKRSENTNCEEIEGEHLPFLTSVSDKPT
VTFPVKETLPSQFCDKTYVGFDMGICKTENTGKEIEEYSDTLSNFESFKW
TDAVYGDNKEDANKPIQEVRINYDFALPPNKSKGINMNLHIPHIQNQIAE
NSNLFSEDAQPQPFILGSDLDKNDEHVLPSTSSSDNSVQLLNTNQNHYEC
IALDKSNTHISNSLFYPLGKKHLISKDTEAHISEPEDLGKIRSPPPDHVE
VETAREGKQYWNPRNSSELSGLVNTISILKSLCEHSTALDSLEILKKKNT
VFQQGTQQTYEPDSPPEVRKPFITVVSPKSPHLHKDSQQILKEDEVELSE
PLQSVQFSSSGSKEETAFQAVIPKQIERKTCDPKPVEFQGHQVKGSATSG
VMVRGHSSQLGCSQFPDSTEYENFMTETPELPSTCMQIDFLQVTSPEENI
STLSPVSTFSLNSRDEDFMVEFSETSLKARTLPDDLHFLNLEGMKKSRSL
ENENLQRLSLLSRTQVPLITLPRTDGPPDLDSHSYMINSNTYESSGSPML
NLCEKSAVLSFSIEPEDQNETFFSEESREVNPGDVSLNNISTQSKWLKYQ
NTSQCNVATPNRVDKRITDGFFAEAVSGMHFRDTSERQSDAVNESSLDSV
HLQMIKGMLYQQRQDFSSQDSVSRKKVLSLNLKQTSKTEEIKNVLGGSTC
YNYSVKDLQEISGSELCFPSGQKIKSAYLPQRQIHIPAVFQSPAHYKQTF
TSCLIEHLNILLFGLAQNLQKALSKVDISFYTSLKGEKLKNAENNVPSCH
HSQPAKLVMVKKEGPNKGRLFYTCDGPKADRCKFFKWLEDVTPGYSTQEG
ARPGMVLSDIKSIGLYLRSQKIPLYEECQLLVRKGFDFQRKQYGKLKKFT
TVNPEFYNEPKTKLYLKLSRKERSSAYSKNDLWVVSKTLDFELDTFIACS
AFFGPSSINEIEILPLKGYFPSNWPTNMVVHALLVCNASTELTTLKNIQD
YFNPATLPLTQYLLTTSSPTIVSNKRVSKRKFIPPAFTNVSTKFELLSLG
ATLKLASELIQVHKLNKDQATALIQIAQMMASHESIEEVKELQTHTFPIT
IIHGVFGAGKSYLLAVVILFFVQLFEKSEAPTIGNARPWKLLISSSTNVA
VDRVLLGLLSLGFENFIRVGSVRKIAKPILPYSLHAGSENESEQLKELHA
LMKEDLTPTERVYVRKSIEQHKLGTNRTLLKQVRVVGVTCAACPFPCMND
LKFPVVVLDECSQITEPASLLPIARFECEKLILVGDPKQLPPTIQGSDAA
HENGLEQTLFDRLCLMGHKPILLRTQYRCHPAISAIANDLFYKGALMNGV
TEIERSPLLEWLPTLCFYNVKGLEQIERDNSFHNVAEATFTLKLIQSLIA
SGIAGSMIGVITLYKSQMYKLCHLLSAVDFHHPDIKTVQVSTVDAFQGAE
KEIIILSCVRTRQVGFIDSEKRMNVALTRGKRHLLIVGNLACLRKNQLWG
RVIQHCEGREDGLQHANQYEPQLNHLLKDYFEKQVEEKQKKKSEKEKSKD
KSHS

## Gen 
Cijeli gen je dug 97.663 parova baza i ima neprerađenu iRNK dužine 6.740 nukleotida. Sastoji se od 28 egzona koji kodiraju protein od 2.104 aminokiseline. Za C4orf21.12 postoji 12  varijanti transkripta.

thumb|90px| Položaj ljudskiog gena c4orf21 na dugom kraku hromozoma 4

### Lokus 
ZGRF1 nalazi se na poziciji 4q25 hromosoma 4, u blizini gena LARP7. Kodiran je na minus sekvenci.

## Homologija i evolucija 
### Homologni domeni 
ZGRF1 sadrži domen DUF2439 (domen nepoznate funkcije), zf-GRF domain , i AAA_11 I AAA_12 domen (ATPaza vezana za razne ćelijske aktivnosti). Domeni DUF uključeni su u održavanje telomere i mejotsku segregaciju. AAA_11 and AAA_12  Aadrže motiv P-petlje koji je uključen u konjugativne prijenosne proteine. Drugi domeni helikaza su također prisutni u ortolozima c4orf21.

### Paralozi 
Postoji 9 umjereno povezanih proteina kod ljudi koji su paralogni domenima koji sadrže ATP-ovisnu helikazu na C-kraju c4orf21 nakon 1612. aminokiseline. Većina ovih proteina pripada porodici RNK-helikaza. Nisu poznati paralozi za veliki N-terminalni dio proteina.

 proteina koji su paralogni helikaznom domenu koji sadrži dio c4orf21]]

### Ortolozi 
Potpuni ortolozi gena c4orf21 nalaze se kod sisara. Domen helikaze koji sadrži dio gena na C-terminalu je konzericat širom eukariota.

## Protein 
### Primarna sekvenca  
ZGRF1 je  težak 236,6 kDa.

### Posttranslacijske modifikacije 
Za ZGRF1 eksperimentalno su određena mjesta fosforilacija na pozicijama Y38, S137, S140, S325 i S864. 

### Sekundarna struktura 
U TMHMM serveru, predviđa se slab transmembranski domen sa jednom petljom na C-terminal proteina prije helikaznog jezgra. Ovaj proteinski domen ima oba kraja izvan membrane.

### Tercijarni domeni i kvarternarna struktura 
ZGRF1 ima povezane strukture sa  paralogom Upf1. Ove strukture imaju sposobnost da vežu ione cinka i iRNK. 
a. Ova struktura je zasnovana na kristalnoj strukturi kompleksa između dva faktora raspadanja posredovania judskim nonsensima, upf1 i upf2, ortorombski oblik.]]

## Funkcija i biohemija 
ZGRF1 je 5' do 3' DNK-helikaza koja promovira stabilnost genoma, stimulirajući popravak DNK homolognom rekombinacijom. i Dbl2 *Schizosaccharomyces pombe*, koji imaju slične uloge u rekombinacionoj popravci DNK.

Ljudski paralozi helikaznog jezgra gena ZGRF1 povezani su s translacijom, transkripcijom, nonsens posredovanimm raspadanjeiRNK, prerađenom iRNK, preradom miRNK, RISC sklopa i preradom pre-iRNK. Ovi paralozi djeluju pod motivom SPF1 RNK-helikaza.

Mov10, paralog, i vjerovatna RNK-helikaza  potrebni su za utišavanje gena posredovano RNK pomoću RNK-induciranog kompleksa utišavanja (RISC). Također je potreban i za translacijsku represiju posredovanu  putem miRNK i za cijepanje komplementarnih mRNK putem RISC-a posredovano miRNK, kao i za transkripciju i replikaciju delta virusa (HDV) ljudskog hepatitisa, usmjerenu na RNK. Mov10 stupa u interakciju s HDV RNK s malim kapicama koje su izvedene iz genomskih struktura ukosnica koje označavaju mjesta inicijacije RNK zavisne o HDV transkripcije RNK.

## Ekspresija 
Ekspresija je relativno niska za c4orf21 u odnosu na druge proteine. |Blago je povišena u poređenju sa njegovom prosečnom ekspresijom u tkivu u hematopoetskom i limfnom sistemu, a također je iznad prosjeka u mozgu. Niži proseci postoje u tkivu jetre, ždrijela i kože.

### Interakcije transcripcijskog faktora 
Početno mjesto transkripcije za ZGRF1 najbolje se poravnava aktiviranjem transkripcijskih faktora 2 (ATF), CREB, deltaCREB, E2F i E2F-1, mjestima vezanja transkripcijskih faktora.

## Interaktivni proteini 
C4orf21 eksprimira predviđenu interakciju proteina sa svojim AQR, DNA2, IGHMBP2, LOC91431 i SETX paralozima.

## Klinički značaj 
Nakon ispitivanja varijabilnih GEO profila, bilo je mnogo povezanih s hepatitisom i drugim poremećajima jetre. Najbolje korelativne studije bile su one u vezi sa neuspjehpm transplantacija jetre. GRF1 je pokazao značajno povećanu ekspresiju kod onih koji su bili ovisni o nikotinu u odnosu na kontrolnu grupu nepušača.

Utvrđeno je da paralog ZGRF1 inhibira samoreplikaciju HIV-1, u više faza. Mov10 je uključen u biološke procese utišavanja gena posredovanog RNK, transkripcije, regulacije transkripcije i ima aktivnost hidrolaza i helikaza, putem vezivanja ATP-a i RNK.

## Reference
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
*  
*  
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 4
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika