CCDC135

**Protein 135 upredene zavojnice**, znan i kao  **CCDC135**, je protein koji je kod ljudi kodiran genom **CCDC135**.

## Gen
Kod ljudi, CCDC90B se nalazi na hromosomu 16. Susjedi su:

* GPR97, G-protein spregnuti receptor 97.
* GPR56, kodira člana porodice receptora povezanih sa G-proteinima (receptor spregnut sa G-proteinom 56). Gen je uključen u regulaciju uzorka korteksa mozga. Protein se specifično veže za transglutaminazu 2 u vanćelijskom prostoru.
* KATNB1, katanin p80 podjedinica B 1. Pomoćni protein koji pomaže ciljanju enzima na centrosom.
* KIFC3, član porodice kinezina C3 izoforma 3. KIFC3 pripada velikoj porodici kinezina, molekulskih motora koji koriste energiju hidrolize ATP za translokaciju tereta duž mikrotubula.

## Protein
### Struktura
Ovaj protein karakteriziraju dva domena.

* Sekvenca jedarne lokalizacije sa rezultatom 4 u aminokiselinama 265–279. Sekvenca aminokiselina za ovu regiju je:
KKQQEIRAQEKKRLR

* Porodica slična transglutaminazama sa E-vrijednosti 0,0018 u aminokiselinama 149–308. Sekvenca aminokiselina za ovu regiju je
:CAQFVSDFLTMVPLPDPLKPPSHLYSSTTVLKYQKGNCFDFSTLLCSMLIGSGYDAYCVNGYGSLDLCHMDLTREVCPLTVKPKETIKKEEK
VLPKKYTIKPPRDLCSRFEQEQEVKKQQEIRAQEKKRLREEEERLMEAEKAKPDALHGLRVHSWVLVL

Dužina polipeptidnog lanca je 874 aminokiseline, a molekulska težina   103.497 Da

;Puna aminokiselinska sekvenca je:

1020304050
MEVLREKVEEEEEAEREEAAEWAEWARMEKMMRPVEVRKEEITLKQETLR
DLEKKLSEIQITVSAELPAFTKDTIDISKLPISYKTNTPKEEHLLQVADN
FSRQYSHLCPDRVPLFLHPLNECEVPKFVSTTLRPTLMPYPELYNWDSCA
QFVSDFLTMVPLPDPLKPPSHLYSSTTVLKYQKGNCFDFSTLLCSMLIGS
GYDAYCVNGYGSLDLCHMDLTREVCPLTVKPKETIKKEEKVLPKKYTIKP
PRDLCSRFEQEQEVKKQQEIRAQEKKRLREEEERLMEAEKAKPDALHGLR
VHSWVLVLSGKREVPENFFIDPFTGHSYSTQDEHFLGIESLWNHKNYWIN
MQDCWNCCKDLIFDLGDPVRWEYMLLGTDKSQLSLTEEDDSGINDEDDVE
NLGKEDEDKSFDMPHSWVEQIEISPEAFETRCPNGKKVIQYKRAKLEKWA
PYLNSNGLVSRLTTYEDLQCTNILEIKEWYQNREDMLELKHINKTTDLKT
DYFKPGHPQALRVHSYKSMQPEMDRVIEFYETARVDGLMKREETPRTMTE
YYQGRPDFLSYRHASFGPRVKKLTLSSAESNPRPIVKITERFFRNPAKPA
EEDVAERVFLVAEERIQLRYHCREDHITASKREFLRRTEVDSKGNKIIMT
PDMCISFEVEPMEHTKKLLYQYEAMMHLKREEKLSRHQVWESELEVLEIL
KLREEEEAAHTLTISIYDTKRNEKSKEYREAMERMMHEEHLRQVETQLDY
LAPFLAQLPPGEKLTCWQAVRLKDECLSDFKQRLINKANLIQARFEKETQ
ELQKKQQWYQENQVTLTPEDEDLYLSYCSQAMFRIRILEQRLNRHKELAP
LKYLALEEKLYKDPRLGELQKIFA

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

Protein ima 17 predviđenih alfa-heliksnih mjesta, karakterističnih za proteine sa upredenom zavojnicom i jedan predviđeni beta-list. Sljedeća slika prikazuje predviđena područja alfa-heliksa i beta-listova dva programa STRAP  i Quickphyre:
Napomena: prikazane su sekundarne konsenzusne strukture. To je izvedeno konstrukcijom višestrukim poravnavanjem sekvenci proteina sa njihovim sekundarnim strukturama (kao što je prikazano dolje). Zatim su predviđene regije unakrsno provjerene pomoću programa Quickphyre .

280px|center

### Predviđena svojstva 
* Molekulska težina: 103502,53 = 103484,53 + 18 kDa
* Izoelektrična tačka: 5,358000
* Transmembranski heliksi: Nema
* Posttranslacijske modifikacije:
::Tranzicijski peptidi hloroplasta: Nema
:: Signalni vrhovi: Da)
:: Ciljanje mitohondrija: Nema
:: Mjesta N-glikozilacije: Da
::: Sekvenca gi|223941912 na pozicijama 100 i 493 sa potencijalima of 0,7200, odnosno  0,6031.

### Ćelijska lokacija 
Predviđa se da je CCDC135 citosolno /jedarni  protein  with no transmembrane spans or segments. It is predicted to contain at least 56 specific phosphorylation sites koji uključuju: 20 mjesta fosforilacija proteina-kinaza C, 11 mjesta fosforilacije kazein-kinaze II i osam mjesta ovisnih o fosforilaciji cAMP/cGMP.

Također se predviđa da aminokiselinska sekvenca sadrži 10 sumoilacija  ns pozicijama K236, K236, K45, K773, K499, K679, K249, K167, K540, K445, and K292.

### Homologija 
LRRC57 je izuzetno dobro konzerviran, kao što je prikazano u bilješci sekvence s desne strane. Anotacija sekvence kreirana je pomoću 20 ortologa prikazanih u donjoj tabeli i pripremljena je pomoću ClustalX2 i ClustalW (u programu *Biology Workbench*).

Sljedeća tabela pruža nekoliko detalja o ortolozima ljudske verzije CCDC135. Ovi ortolozi su prikupljeni iz BLAT-a. u pretragom BLAST-a ,

## Reference
## Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 16
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika