GPATCH11

**GPATCH11** jest protein koji je kod ljudi   kodiran genom   **G-PATCH11** sa  hromosoma 2, domenom koji sadrži gen za protein 11. Gen ima četiri varijante transkripta koje kodiraju dvije funkcionalne izoforme proteina i eksprimiran je u većini ljudskih tkiva. Utvrđeno je da protein interreagira s nekoliko drugih proteina, uključujući dva iz puta prerade. Pored toga, GPATCH11 ima ortologe u svim taksonima domena Eukaryota .

## Amiokiselininska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 259 aminokiselina, a molkekulska iežina  30.199 Da.

1020304050
MAEEEDYMSDSFINVQEDIRPGLPMLRQIREARRKEEKQQEANLKNRQKS
LKEEEQERRDIGLKNALGCENKGFALLQKMGYKSGQALGKSGGGIVEPIP
LNIKTGKSGIGHEASLKRKAEEKLESYRKKIHMKNQAEEKAAEQFRMRLK
NKQDEMKLEGDLRRSQRACQQLDVQKNIQVPREAWYWLRLEEETEEDEEE
KEQDEDEYKSEDLSVLEKLQILTSYLREEHLYCIWCGTAYEDKEDLSSNC
PGPTSADHD

## Gen 
G-PATCH domen koji sadrži protein 11 je protein koji je kod ljudi kodiran genom GPATCH11 i nalazi se na hromosomu 2, lokacija 2p22.2. Ima nekoliko alijasa, uključujući CCDC75 i CENPY. Gen je dug 14.484 bp i sadrži devet egzona. Iako funkcija proteina još nije poznata, predviđa se da služi u vezivanju nukleinske kiseline i proteina.

## iRNK 
GPATCH11 ima četiri predviđene varijante transkripta, iako je poznato da samo dvije kodiraju funkcionalni protein. Njegov najduži oblik je neprerađen i sadrži devet egzona, dok druga funkcionalna varijanta ima 7 egzona sa izrezanim egzonima 3 i 4. 
  GPATCH11 prema NCBI Aceview. Transkripti a i b imaju poznate funkcionalne proteine.|center]]

## Protein 
GPATCH11 ima molekulnu težinu od oko 33,3 kdal i dug je 285 aminokiselina. Također javlja se i u drugoj izoformi koja ima 156 aminokiselina. Gen sadrži G-patch domen i domen nepoznate funkcije DUF 4138. Sam G-patch domen je novi domen koji se nalazi samo u eukariota. BLAST pretraživanja ljudskog gena za bakterije, arheje i viruse podržavaju ovo otkriće. Pored toga, nivoi ekspresije povećavaju se u kancerogenom tkivu u poređenju sa normalnim .

## Predviđena posttranslacijska modifikacija 
Koristeći različite alate na ExPASy moguće su sljedeće posttranslacijske modifikacije  GPATCH11.
* 3 moguća mesta fosforilacija CK2
* 6 mogućih mesta fosforilacije PKC
* 2 moguća mjesta N-miristoilacija
* 6 mogućih mjesta glikacija

## Proteinske interakcije
Interakcija između GPATCH11 i BAI3 pronađena je putem PSICQUIC-a, mentha, Sveukupno, protein se sastoji uglavnom od nabijenih aminokiselina, i kiselih i baznih. Nije bilo područja trajne nepolarnosti. To implicira da ovo nije transmembranski protein jer je za njega potrebna duga regija nepolarnosti.
, preuzeto preko SDSC Biology Workbench-a. Stablo obuhvata reprezentativne ortologe unutar domena eukariota.]]
Kada se uporedi brzina evolucije GPATCH11 sa poznatim proteinima, kao što su fibrinogen i citohrom c, GPATCH11 evoluira prilično brzo, slično brzini  fibrinogena. Neukorijenjeno evolucijsko stablo može se vidjeti s desne strane, uključujući predstavnike vrsta u rasponu od beskičmenjaka do sisara. Ovo pokazuje hipotetski odnos sekvence GPATCH11 među različitim taksonima, a podržano je vremenom divergencije taksona od ljudi, kao i identitetom/sličnošću sekvence.

### Homologija 
Protein je visoko konzerviran u domenu eukariota. Tabela ispod navodi niz vrsta iz svih različitih taksona čija je sekvenca GPATCH11 upoređena sa sekvencom GPATCH11 kod ljudi. Prikazane su dužine sekvenci proteina, sličnosti i identiteti, uključujući divergenciju u milionima godina.

## Klinički značaj
Klinički značaj još nije poznat, ali GPATCH11 je prisutan u mnogo većim količinama u kancerogenom nego u normalnom tkivu, a pokazao je moguću interakciju proteina s onkogenima, pa bi na neki način mogao biti uključen u kancer.

## Reference 
Kategorija:Geni na hromosomu 2
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika