YIF1A

**Protein YIF1A** je protein koji je kod ljudi kodiran genom  **YIF1A**.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 293   aminokiseline, a molekulska težina
32.011 Da..

1020304050
MAYHSGYGAHGSKHRARAAPDPPPLFDDTSGGYSSQPGGYPATGADVAFS
VNHLLGDPMANVAMAYGSSIASHGKDMVHKELHRFVSVSKLKYFFAVDTA
YVAKKLGLLVFPYTHQNWEVQYSRDAPLPPRQDLNAPDLYIPTMAFITYV
LLAGMALGIQKRFSPEVLGLCASTALVWVVMEVLALLLGLYLATVRSDLS
TFHLLAYSGYKYVGMILSVLTGLLFGSDGYYVALAWTSSALMYFIVRSLR
TAALGPDSMGGPVPRQRLQLYLTLGAAAFQPLIIYWLTFHLVR

## Gen 
### Opća svojstva 
YIF1A (homolog Yip1 interakcijskog faktora A) poznat je i kao YIF1, YIF1P, FinGER7 i 54TM. Kod ljudi,  ima 4.591 parova baza s osam egzona, a nalazi se na minus lancu hromosoma 11,sekvenca 11q13,2.

### Promotori 
Četiri su predviđena promotora za YIIF1A. Predviđena regija promotora s najvećim povjerenjem je GXP_50494 i duga 1.252 parova baza; proteže se od prvog egzona YIF1A. Ovaj promotor se nalazi na minus lancu hromosoma 11.

### Faktori transkripcije 
Promotorska varijanta 1 transkripta YIF1A sadrži brojna mjesta vezanja transkripcijskog faktora. Transkripcijski faktori za koje se predviđa da će se vezati za promotorsku regiju uključuju sljedeće.

* Protein akutne mijeloidne leukemije 1, RUNX1 (transkripcijski faktor 1 povezan s tuntom)
* Protein cinkovog  prsta 263, ZKSCAN12 (protein cinkovog prsta sa KRAB i SCAN domenima 12)
* E2F transkripcijski faktor 1
* EGR1, rani odgovor na rast 1
* GATA-vezujući faktor 1
* CP2-oliki transkripcijski faktor 1 (LBP-9)
* X-boks vezujući protein RFX1
* Elementi odgovora na estrogen (ER alfa), IR3 mjesta
* Laktotransferin i deltalaktoferin, protein koji inhibira rast 12
* TGFB-inducirani protein ranog odgovora na rast 1 (KLF10)

### Ekspresija 
Ekspresija YIF1A je najjača  u duodenumu i jetri. Također se eksprimirs u umjerenim količinama i u tkivima, uključujući debelo crijevo,jajnike, gušteraču, slezenu i jednjak, a izražava se u nižim razinama u raznim drugim tkivima. NCBI GeoProfile data provide the tissue expression graph for YIF1A in humans; it also indicates that YIF1A is expressed at moderately to moderately low across all other tissues.

## iRNK 
YIF1A ima izoforme 1 i 2, s egzonima 8 i 7.

### RNK-vezujući proteini 
5'neprevedena regija ima mjesta vezanja za RBXM, EIF4B i FUS. 3 'neprevedena regija predviđa mjesta vezivanja za ELAVL1, koji je elementima bogatim AU i regulira stabilnost iRNK.

## Protein 
### Opća svojstva 
Najduža proteinska izoforma YIF1A ima 293 aminokiseline. Ima  molekulsku težinu od približno 32,0 kDa, s predviđenom izoelektričnom tačkom od približno 8,98.

### Kompozicija 
YIF1 je vrlo normalan protein u smislu količine aminokiselina koje sadrži. Sastav svakog aminokiselinskog ostatka sličan je njegovom prosječnom relativnom sastavu među ljudskim proteinima. Nema grupa naboja, pokretljivosti ili obrazaca. Postoji ponavljajuća struktura na [201-204 i 288-291] TFHL. Transmembranski domeni su crveni, necitosolni  su žuti, a citosolni su tamnu ružičasti.]]
Struktura YIF1A sastoji se od približno 59% alfa-heliksa, s TM spiralom i neuređenim regijama koje čine ostatak strukture; nije predviđen beta-lanac.

### Lokalizacija 
Predviđena lokacija YIF1A je u endoplazmatskom retikulumu, s unutarćelijskim N– i  vanćelijskin C-krajem.

### Posttranslacijske modifikacije 
YIF1A prolazi kroz cijepanje metionina i N-terminalnu acetilaciju, što je jedna od najčešćih posttranslacijskih modifikacija eukariotskih proteina. Također se fosforilira neodređenim kinazama na nekoliko mjesta. Three glycation site is predicted in lysine residue(lys 104,161, and 211). YIF1A se podvrgava modifikaciji O-ß-GlcNAc na pet lokacija, od kojih je jedno mjesto Yin-Yang.

### Interaktivni proteini 
Na osnovu fluorescentne mikroskopije, potvrđena dva hibrida i anti-tag koimunoprecipitacije, a proteini koji će najvjerojatnije stupiti u interakciju s YIF1A su GPR37, SEC23IP, REEP2 i YIPF5. Studije pokazuju da interakcija između VAPB -a i YIF1A kontrolira isporuku membrane u dendrite. Također učestvuje u ER-proteinu razvijenog odgovora (UPR), indukcijom ERN1/IRE1. Osim toga, protein YIF1A stupa u interakciju s proteinom M SARS-Cov-2.

 (NM 020470)]]

## Homologija 
YIF1A ima jedan paralog pod nazivom YIF1B, koji se nalazi na ljudskom kromosomu 19. Ortolog sadrže kičmenjaci poput sisara, vodozemci i gmizavci. Također imaju i beskičmenjaci kao što su Insecta, Anthozoa i Ascidiacea. Nije pronađen ortolog kod protista, bakterija ili arheja.

Sljedeća tabela daje obrasce ortologa YIF1A.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Proteomika