TMC3

**Transmembranski kanaloliki protein 3**  je protein koji je kod ljudi kodiran genom **TMC3**.

Analizom genomske sekvence, Kurima et al. (2003)  locirali su ljudski  gen TMC3 na hromosomskoj sekvenci 15q25.3, a mišji  gen Tmc3 na hromosomu 7. 
Keresztes et al. (2003) mapirali su ljudski TMC3  na hromosomu 15q23. 
Hartz (2016) mapirala je gen TMC3 na hromosomskoj poziciji 15q25.1, na osnovu  poravnanja sekvence TMC3 (GenBank AY263163) sa genomskom sekvencom (GRCh38).,

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  1.100  aminokiselina, a molekulska težina   125.685 Da..

1020304050
MKTSKASQRYRGIRRNASQCYLYQESLLLSNLDDSFSADETGDSNDPEQI
FQNIQFQKDLMANIRCRPWTMGQKLRALRQAKNIVLKFEGRLTRTRGYQA
AGAELWRKFARLACNFVVIFIPWEMRIKKIESHFGSGVASYFIFLRWLFG
INIVLTIMTGAFIVIPELIAGQPFGSTARKTIPKEQVSSAQDLDTVWSLG
GYLQYSVLFYGYYGRERKIGRAGYRLPLAYFLVGMAVFAYSFIILLKKMA
KNSRTSLASASNENYTFCWRVFCAWDYLIGNPEAAESKTAAIVNSIREAI
LEEQEKKKSKNLAVTICLRIIANILVLLSLAGSIYLIYFVVDRSQKLEQS
KKELTLWEKNEVSVVVSLVTMIAPSAFDLIAALEMYHPRTTLRFQLARVL
VLYLGNLYSLIIALLDKVNSMSIEEMATKNNTSHWIDSTTFFATRTAPEE
EKWSTSRPGMGLRRNNTWALEETSISAYTMPLIKANKTSLHTQSPQDQCW
ETYVGQEMLKLSIIDMLFTVASILLIDFFRGLFVRYLSDYWCWDLESKFP
EYGEFKIAENVLHLVYNQGMIWMGAFFSPCLPAFNVLKLIGLMYLRSWAV
LTCNVPHQQVFRASRSNNFYLAMLLFMLFLCMLPTIFAIVRYKPSLNCGP
FSGQEKIYDIVSETIEKDFPVWFGSVVGHISSPVVILPAVLLLFMLIYYL
QSIARSLKLSNHQLKMQIQNARSEDKKKVAQMVEARIQTQEESTKKLPND
SDLTSQLSSAHSGTPQNNGNVAHFDSGSSKSGRIETVAQSMPQSPRPGDR
APSSPLPGVPKSRLEHETNRYLHGLCASTSDLHRNRSRTPMTFTTHIEDV
HSEPLFRKDFQQINPPHRGPQASTLLAQGPRPHAPRYYVINECDSYKKKH
LNVWPERHFKIDASGDIVELYPRNVRQYASRVPRQPPSPQLSEEEEETPS
RDWIKRSLPPRSLIDLRRAPHFYIGERSESQTRDPEHQGRVHYKSWNEDF
EGHLERPAYVPRKPRSRNFQYPQPPLKPRGKPRFEPSLTESDSVSAASSS
DQQNSSADQYLQVTHSQGRFPRSVGQPSRRKAKSGQELTVDLDDLICSDV

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
Pretragom genomskih i EST baza podataka za sekvence slične TMC1 miša i čovjeka i TMC2, gorepomenuti Kurima et al. (2003) identificirali su TMC3. Izvedeni ljudskii i mišji TMC3 proteini imaju po 724 aminokiseline i dijele 90% identiteta sekvence. Predviđeno je da  se oba nalaze u plazmamembrani, sa 10 potencijalnih transmembranskih domena, približno 120-aminokiselinskim TMC domenom i citoplazmatskim N– i C-krajem. Protein TMC3 također ima brojna potencijalna mjesta za amidaciju, glikozilaciju, miristoilaciju i fosforilaciju, a  i  na N– i na C-kraju pokazuju prevladavanje nabijenih ostataka sličnih onima TMC1 i TMC2. Pored toga, C-kraj mišjeg Tmc3 ima potencijalnu sekvencu PDZ liganda klase I. PCR-analiza otkrila je mišje i ljudske TMC3 samo u bibliotekama cDNK mozga i hipofiza.

Keresztes et al. (2003) klonirali su mišji Tmc3. Izvedeni protein pune dužine od 1.130 aminokiselina ima osam mogućih transmembranskih domena, TMC motiv prije transmembranskog domena 6, a predviđeno je da su N– i C-krajevi  unutarćelijski. C-kraj Tmc3 posebno je dugačak u odnosu na druge TMC proteine. RT-PCR detektirao je ekspresiju Tmc3 u hipofizi, praćenu onom u  malom mozgu i sjemenicima, sa malo ili nimalo ekspresije u drugim ispitivanim organima miša.

## Evolucija
Filogenetičkom analizom mišjeg i ljudskog gena TMC, Kurima et al. (2003) utvrdili su da TMC3 pripada zasebnoj TMC potporodici s TMC1 i TMC2.

## Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 15
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika