SCAMP5

**Sekretorni membranski protein sa nosačem 5** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **SCAMP5**.

Analizom sekvence genoma, Han et al. (2009) mapirali su gen SCAMP5 na hromosomu 15, sekvenca q23.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je   235  aminokiselina, a molekulska težina   26.104 Da..

1020304050
MAEKVNNFPPLPKFIPLKPCFYQDFEADIPPQHVSMTKRLYYLWMLNSVT
LAVNLVGCLAWLIGGGGATNFGLAFLWLILFTPCSYVCWFRPIYKAFKTD
SSFSFMAFFFTFMAQLVISIIQAVGIPGWGVCGWIATISFFGTNIGSAVV
MLIPTVMFTVMAVFSFIALSMVHKFYRGSGGSFSKAQEEWTTGAWKNPHV
QQAAQNAAMGAAQGAMNQPQTQYSATPNYTYSNEM

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Opis
Membranski proteini sekretornog nosača (SCAMP) široko su distribuirani integralni membranski proteini koji učestvuju u membranskom prometu. Većina SCAMP-ova (npr. SCAMP1) ima N-terminalna citoplazmatska ponavljanja NPF (arg-pro-phe), četiri centralne transmembranske regije i kratki C-terminalni rep citoplazme. Ovi SCAMP-ovi vjerovatno imaju ulogu u endocitozi koja je posredovana njihovim NPF ponavljanjima. Ostalim SCAMP-ovima, poput SCAMP5, nedostaju NPF ponavljanja i stoga možda ne funkcioniraju u endocitozi (sažetak Fernandez-Chacon i Sudhof, 2000).
 
## Kloniranje i ekspresija
Pretragom EST baza podataka, Fernandez-Chacon i Sudhof (2000) identificirali su mišji Scamp5 i klonirali njegov pacovski homolog. Izvedeni proteini miša i pacova sa 235 aminokiselina sadrže po četiri transmembranska domena, koji su visoko konzervirani među ostalim SCAMP-ima, s malo konzerciranosti na N– i C-terminalnim krajevima. Scamp5 nema NF-terminalna NPF ponavljanja koja se nalaze u nekoliko drugih SCAMP-ova. Northern blot analiza otkrila je ekspresiju Scamp5 samo u mozgu pacova. Analiza imunoblota otkrila je da se protein Scamp5 u pacovskom mozgu nije eksprimirao sve do druge sedmice nakon rođenja. Imunohistokemijska analiza pokazala je da je Scamp5 eksprimiran specifično u sinapsnim vezikulama u mozgu pacova. 
Han et al (2009) klonirali su ljudski SCAMP5 iz biblioteke cDNK stromskih ćelija koštane srži. Izvedeni protein od 235 aminokiselina ima izračunatu molekulnu masu od 26 kD. Poput Scamp5 miša i pacova, i ljudski SCAMP5 ima kratke N– i C-terminalne citoplazmatske repove i četiri transmembranska domena, ali nema NPF ponavljanja. Northern blot i RT-PCR analize otkrile su ekspresiju 3,4 kb transkripta u ljudskom mozgu, želucu, štitnjači, kičmenoj moždini, limfnim čvorovima, dušniku, nadbubrežnim žlijezdama, koštanoj srži i različitim regijama mozga. SCAMP5 je također eksprimiran i u ćelijskim linijama leukemije, ali ne i u većini ćelijskih linija solidnih tumora. Western blot i imunohistohemijske analize otkrile su SCAMP5 kao integralni membranski protein u ćelijskim linijama karcinoma koštane srži, dojke, nadbubrežne žlijezde i limfoma povezanih s Golgijevim aparatom.
## Funkcija gena
Koristeći eksperimente transfekcija na ćelijskim  linijama ljudskoog epitela, ljudskim monocitima i mišjim makrofazima, Han et al. (2009) pokazali su da je C-terminalni rep SCAMP5, zajedno sa komponentama SNARE i STX4 , promovirao oslobađanje CCL5 i TNF, ali ne i IL1B, sa Golgijevog aparata na plazmamembranu, kao odgovor na agoniste kalcija ili TLR. Zaključili su da je SCAMP5, u saradnji sa komponentama SNARE, uključen u egzocitozu reguliranu kalcij-citokinima, koji sadrže signalni peptid.

Skriningom za regulatore agregacije poliglutamina (polyQ), Noh et al. (2009) identificirali su SCAMP5 kao posrednika agregacije mutantnog huntintina (HTT). Western blot analiza pokazala je povećanu ekspresiju u strijatumu pacijenata s Huntingtonovom bolešću i kulturama neuronskih ćelija pacova, koji eksprimiraju mutirani HTT. Stres izazvan stresom endoplazmatskog retikuluma (ER) izazvao je agregaciju mutantnog HTT-a preko SCAMP5 u primarnim kulturama ćelijskih strijatalnih neurona i ljudskim ćelijama neuroblastoma putem inhibicije endocitoze. Za inhibiciju nije bio potreban SCAMP5 C-kraj. Zaključili su da je SCAMP5 ključna regulatorna molekula koji povezuje ER-stress sa agregacijom poliQ tragova proteina, modulacijom endocitoze.

Koristeći Western blot analizu, Zhao et alk. (2014) otkrili su da je Scamp5 eksprimiran u neuronima pacovskog hipokampusa i da se njegova ekspresija povećavala sa sazrijevanjem neurona. Nokdaun Scamp5-a u kultiviranim neuronima pacovskog hipokampusa rezultirao je smanjenjem ukupnih i reciklažnih veličina sinapsnih bazena vezikula, ali je omjer bazena za recikliranje/mirovanje značajno povećan. Prisustvo Scamp5 također je usporilo endocitozu nakon stimulacije, ali ju je ozbiljno oslabilo tokom jake stimulacije. Degradacija Scamp5 snizila je prag sinapsne aktivnosti pri kojoj endocitoza nije mogla nadoknaditi sinapsnim vezikulima tekuću egzocitozu tokom stimulacije.

## Reference
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 15
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika