C16orf95

**Otvoreni okvir čitanja 95 hromosoma 16  (C16orf95)**  jest gen koji kod ljudi kodira  protein **C16orf95**.  Ima ortologe kod sisara, a eksprimiran  je na niskom nivou u mnogim tkivima. C16orf95 se brzo razvija u poređenju sa ostalim proteinima.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  158  aminokiselina, a molekulska težina   16.793 Da..

1020304050
MRASRSPPSPRRCHHHHEATGAASGAAAGGPGAGCVGLCRLALTPSAQDG
RNSTFQTYKKEVCLPRHSMHPGPWAICCECQTRFGGRLPVSRVEAALPYW
VPLSLRPRKQHPCWMHAAGTTAGGSAVMSACCPSSSSSRPPTRTSYRLLQ
RVCCPSAS

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Gen 
C16orf95 je  ljudski  gen, orijentiran na minus lancu hromosoma 16. Nalazi se na citogenom pojasu 16q24,2 i prostire se na 14,62 kilobaza. Gen ima šest introna i sedam egzona.]]

## Protein 
### Struktura
#### Primarna
Najduža izoforma proteina C16orf95 ima 239 aminokiselina. Ima konzerviran domen nepoznate funkcije koji obuhvata ostatke 76 do 239. Prikazana su predviđanja za C-kraj ljudskog i mišjeg proteina. Postoji međuprogramski konsenzus da C16orf95 ima alfa-helikse u svom C-terminalnom repu. To se vidi i kod proteina kod ljudi i kod miševa.]]

## iRNK 
### Alternativna prerada 
Postoje tri varijante prerade C16orf95. Najduži transkript sadrži 1.156 baznih parova i sedam egzona. U poređenju sa varijantom 1, drugoj varijanti transkripta nedostaju egzoni 4 i 5. Ova alternativna prerada  rezultira pomak transripcijskog okvira područja 3'  kodiranja i kraći, jedinstveni C-kraj. U trećoj varijanti transkripta nedostaju egzoni 4 i 5, a koristi se alternativni 5' egzon i početni kodon. The resulting peptide has unique N- and C-termini compared to variant 1.

-vezujuće proteine pronađena su u RBPDB.]]

### Sekundarna struktura 
3 'neprevedene regije iRNK sadrže mjesta vezanja za KH domen – koja sadrže RNK-vezujući protein  povezan sa transdukcijom signala (KHDRBS3) ,unutar struktura unutrašnje petlje. KHDRBS3 regulira preradu iRNK i može djelovati kao negativni regulator rasta ćelija.

## Ekspresija 
Ekspresija C16orf95 nije dobro okarakterizirana. Međutim, otkriven je na niskim nivoima u sljedećim  tkivim sljedećih organa: kosti, mozak, uši, oči, crijeva, bubrezi, pluća, limfni čvorovi, prostata, sjemenici, krajnici, koža i maternica.

### Posttranslacijske modifikacije 
Alati dostupni na ExPASy korišteni su za predviđanje mjesta post-translacijskih modifikacija na C16orf95. Predviđaju se sljedeće modifikacije: palmitoilacija, fosforilacija i O-vezana glikozilacija. Podebljani ostaci u tabeli označavaju mjesta koja su konzervirana u više vrsta.

## Homologija 
### Paralozi 
Nisu poznati paralozi  C16orf95.

### Ortolozi 
Ortolozi  C16orf95 postoje samo kod sisara (identifikovanih preko BLAST-a). Najudaljenij ortolozi nalaze se u oposumima i tasmanskim vragovima.

 koje prikazuje evolucijske odnose među podskupinama ortologa. Primati, glodari i mesojedi su grupirani na osnovu sličnosti njihovih proteinskih sekvenci. Neukorijenjeno stablo napravljeno je pomoću aplikacije ClustalW u SDSC Biology Workbench.|none]]

### Evolucija
C16orf95  je vremenom imao velik broj promjena aminokiselina, što ukazuje da je riječ o proteinu koji se brzo evoluira.
, protein koji brzo evoluira  i citohrom c , protein koji avoluira  polahko.|none]]

## Interaktivnost proteina 
Nema proteina za koje je poznato da stupaju u interakciju sa C16orf95.

## Klinički značaj 
Delecije C16orf95 povezane su sa hidronefrozama, mikrocefalijom, disthiozom , vezikoureterskim refluksom i intelektualnim oštećenjima. Međutim, delecije su uključivale kodirajuće regione sljedećih gena: F-boksni protein 31 (FBXO31), lahki lanac 3 beta, povezan s mikrotubulama (MAP1LC3B) i CCHC prst CCHC tip 14 ( ZCCHC14). Doprinosi svakog od ovih gena posmatranim fenotipovima tek trebaju biti naučno utvrđeni.

## Reference 
Kategorija:Geni na hromosomu 16
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika