NWD1

**NWD1**, skraćenica za NACHT i WD ponavljajuči domen koji sadrži  protein 1, je gen pronađen kod kičmenjaka, koji kodira protein koji sadrži domen NACHT i domen ponavljanje WD40. Prvobitno je identificiran tokom potrage za  genima imunskog sistema kod zebrica, kao sekvenca koja kodira protein povezana sa APAF1; ortolozi su naknadno identificirani kod sisarskih vrsta.  Dosadašnji podaci ukazuju na uzročnu ulogu prekomjerne ekspresije NWD1 povezane sa tumorom, u poremećaju regulacije signalizacije androgenih receptora tokom progresije karcinoma prostate.

‎
## Aminokiselinska sekvenca

1020304050
MQRGKPCRALPTLKCQTFCQRHGLMFEVVDLRWGIRNIEATDHLTTELCL
EEVDRCWKTSIGPAFVALIGDQYGPCLIPSRIDEKEWEVLRDHLTARPSD
LELVARYFQRDENAFPPTYVLQAPGTGEACEPEEATLTSVLRSGAQEARR
LGLITQEQWQHYHRSVIEWEIERSLLSSEDREQGATVFLREIQDLHKHIL
EDCALRMVDRLADGCLDADAQNLLSSLKSHITDMHPGVLKTHRLPWSRDL
VNPKNKTHACYLKELGEQFVVRANHQVLTRLRELDTAGQELAWLYQEIRH
HLWQSSEVIQTFCGRQELLARLGQQLRHDDSKQHTPLVLFGPPGIGKTAL
MCKLAEQMPRLLGHKTVTVLRLLGTSQMSSDARGLLKSICFQVCLAYGLP
LPPAQVLDAHTRVVQFFHTLLHTVSCRNFESLVLLLDAMDDLDSVRHARR
VPWLPLNCPPRVHLILSACSGALGVLDTLQRVLLDPEAYWEVKPLSGNQG
QQMIQLLLAAARRTLSPVHTDLLWASLPECGNPGRLRLAFEEARKWASFT
VPVPLATTAEEATHQLCTRLEQTHGQLLVAHVLGYIVSSRHGLSEAELKD
VLSLDDEVLQDVYRDWTPPSKELLRFPPLLWVRLRRDLGYYLARRPVDGF
TLLAIAHRQLVEVVRERYLSGSERAKRHGVLADFFSGTWSQGTKKLITLP
LVGKPLNLDRKVAPQPLWFSHTVANLRKLKELPYHLLHSGRLEELKQEVL
GSMSWISCRGISGGIEDLLDDFDLCAPHLDSPEVGLVREALQLCRPAVEL
RGMERSLLYTELLARLHFFATSHPALVGQLCQQAQSWFQLCAHPVLVPLG
GFLQPPGGPLRATLSGCHKGITAMAWGVEEKLLVIGTQDGIMAVWDMEEQ
HVIHMLTGHTGEVRCVKIFAKGTLANSASKDYTLHLWNLLSGQEKFTIWD
GGSKNPAEPQIWNLHVDEAHKVVYSASGSKINAWNLETAEPVFHILGDAS
DPWMCMAVLASQATLLTVSRDGVVSLWSSATGKLQGKQHMSSIKEETPTC
AVSVQKQGKLVTGFSNGSISLVSSKGDRLLEKLPDAVRFLVVSEDESLLA
AGFGRSVRIFLADSRGFRRFMAMDLEHEDMVETAVFGTENNLIITGSLDA
LIQVWSLSEQGTLLDILEGVGAPVSLLARGGALVASASPQSSSFKVWDLS
DAHRSRVPAPFLDRTGLTAVSHNGSYVYFPKIGDKNKVTIWDLAEGEEQD
SLDTSSEIRCLEVAEQRKLLFTGLVSGVVLVFPLNSRQDVICIPPPEARK
AINCMSLSKCEDRLAIAYDNIVLVLDITSGDPCPVIDGPRYTFYTQLPET
LSSVAILTDYRVVYSMTNGDLFLYECATSKAFPLETHRSRVACVEVSHKE
QLVVSGSEDALLCLWDLQARKWKFEMSYTSSYCRGVQCACFSKDDKYVYV
GLKDRSILVWSVLDGTLLTVQFVHAVVNRIIPTTSGFIAPTRHGYLIREN
FQCLSAKASPQDPLKNFKKAMWMVKSRQREELVAAAGAPQDLESESAQGN
ETKSNKCSQVCLIV

;Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
‎Correa et al. (2014)‎‎  naveli su da NWD1 protein sadrži 1.358 aminokiselina i ima izračunatu molekulsku masu od 150,8 kD. NWD1 ima N-terminalni WD ponavljajući domen od oko 40 aminokiselina, zatim NACHT domen, prostorni region, 10 tandemskih WD ponavljanja, drugi razmaknik, dva dodatna WD ponavljanja, i kratak C-terminalni rep. Kvantitativnom PCR analizom otkrivena je NWD1 ekspresija u većini od 48 ispitanih ljudskih tkiva, sa najsnažnijim ispoljavanjem u prostati, a slijede sjemenici, mrežnjača, dušnik, očni živac, hipofiza i pluća. Epitopno označeni NWD1 eksprimiran je u citosolu transfektiranih ćelija HEK293T. ‎

‎==Funkcija‎‎ ‎‎ ‎‎gena==

‎Correa et al. (2014)‎‎ identificirali su obogaćivanje lokusa SRY u promotorskoj regiji gena NWD1. PCR analiza je pokazala indukciju ekspresije NWD1 u transficiranim HEK293T i PPC-1 ćelijama prostatskog karcinoma iz SRY i povezanog transkripcijskog faktora SOX9 ‎. Nokautiranje NWD1 ekspresije putem lentivirusnog gena koji utišavajući dramatično smanjuje održivost u androgeno-responzivnim ćelijama LNCaP-a raka prostate. Utišavanje NWD1 u ćelijama LNCaP abrogiralo je aktivnost virusa zavisnih od androgena. Utišavanje NWD1 je također smanjilo i ekspresiju PDEF-a (SPDEF‎) u nekoliko linija ljudskih ćelija i možda je imalo manji efekt u smanjenju aktivacije NF-kappa-B. Ekspresija NWD1  je povišen tokom patogeneze ili progresije raka prostate.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*

Kategorija:Geni
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Geni na hromosomu 19