C3orf62

**Otvoreni okvir čitanja 62 hromosoma 3** (**C3orf62**), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom  **C3orf62** sa hromosoma 3.
. C3orf62 je protein osiromašen glicinom u odnosu na količinu glicina u proteinima u ostatku genoma. Ima motiv sličan KKXX i predviđa se da se  nalazi u jedru. Ekspresija C3orf62 ostaje najveća u punoj krvi.

## Gen
### Lokus
C3orf62 je mapiran na obrnutom lancu hromosoma 3, na  poziciji 3p21.31 i obuhvata 9.313 baza. Počinje na  baznom paru49,268.597 od kraja kratkog kraka (pter) i završava na 49,277.909 baznom paru pter. Poznato je da ovaj gen ima tri egzona, četiri transkripta i 37 ortologa.

C3orf62 je okružen genima za ubikvitin specifičnu proteazu 4 (USP4) i domen upredene zavojnice koji sadrži 36 (CCDC36).
]]

## Alijasi
C3orf62 ima sljedeća alternativna imena i sinonime: CC062; FLJ43654

## Protein
### Primarna struktura
Ljudski protein C3orf62 (Q6ZUJ4) du je 267 aminokiselina i ima molekulsku masu od 30.194 daltona.
Nemodifikovani protein C3orf62 je "protein osiromašen glicinom" u odnosu na količine glicina u proteinima u ostatku genoma. Čini se da je glicin ravnomjerno raspoređen po cijeloj sekvenci C3orf62, bez preferencije područja za grupiranje. Prije posttranslacijskih modifikacija, C3orf62 je kiseli protein. U C3orf62 nema klastera naelektrisanja i nije pronađen nikakav specifičan razmak cisteina. izoelektrična tačka C3orf62 je 5,211000.

### Domeni i motivi
C3orf62 nema poznatih transmembranskih domena. Ima KKXX sličan motiv u C-terminalu, što znači da može biti odgovoran za izvlačenje ER membranskih proteina iz Golgijevog aparata.

### Sekundarna struktura
Otprilike sedam alfa-heliksa predviđeno je za C3orf62 prema Pele Protein Structure Protein Prediction i ojačano kroz ortologno predviđanje sekundarne strukture u bazi Ali2D.

### Subćelijska lokalizacija
Predviđa se da se C3orf62  nalazi u jedru. Algoritam k-najbližih susjeda predviđa da se C3orf62 klasifikuje na sljedeći način: k=9/23; 69,6% jedarnih, 13,0% mitohondrijskih, 13,0% citoskeletnih, 4,3% citoplazmatskih. C3orf62 ima nisku ekspresiju u moždanim tkivima.

]]

### Post-transkripcione modifikacije
C3orf62 ima dvije posttranslacijske modifikacije, obje su mjesta fosforilacije sa lokacijama na aminokiselinama 210 i 224.

## Regulacija ekspresije
Za C3orf62 predviđeno je 13 promotora.

## Varijante transkripta
Transkripcija C3orf62 proizvodi pet alternativno prerađenih varijanti i jednu neprerađenu formu. Od četiri varijante prerade, od kojih su  dvije protein-kodirajuće, jedna je nonsensno posredovano raspadanje, a jedna je zadržani intron. Interakcijski proteini sa najvećom pouzdanošću za interakciju sa C3orf62 uključuju: HAUS kompleksnu podjedinicu 1 (HAUS-1), inhibitor rasta proteina 5 (ING5), protein 9 koji sadrži domen tioredoksina (TXNDC9 ) i proteine povezane sa porodicom MORF4 (MORF4L1, MFRAP1).

Hemikalije za koje se zna da stupaju u interakciju sa C3orf62 uključuju sljedeće: aflatoksin B1, hidralazin, valproinskuu kiselinu i decitabin.

U regijama gena, NCBI-jevih jednonukleotidnih polimorfitzama identifikovao je 1.326 SNP-a na obrnutom minus lancu C3orf62. In the coding region, NCBI SNP identified 147 common SNPs.

## Homologia
### Paralozi
C3orf62 nema poznatih paraloga.

### Ortolozi
Itbor ortologa C3orf62 je prilično uzak, sa većinom ortologa koji se nalaze kod sisara. Mali dio ortologa je također pronađen u sljedećim klasama: Reptilia, Sarcopterygii i Actinoptergii.

Grupacije gotovo svih ortolognih sekvenci C3orf62sisara su sljedeće: E-vrijednost: 2e–94 do 1e–169; sličnost 56–84%. Sisari u ovoj grupi se uglavnom sastoje od primata, ali uključuju i sljedeće redove: Perissodactyla, Rodentia, Carnivora, Proboscidea, Cetartiodactyla, Cingulata, Artiodactyla, Eulipotyphla, Diselphimorphia i Afrosoricida.

Udaljenije srodne ortologne sekvence C3orf62 uključuju organizme iz klasa Reptilia, Sarcopterygii i Actinopterygii u rasponu od E-vrijednosti od 8e–10 do 3e–59 sa sličnošću od 24-39%. Organizmi u ovoj grupi uključuju redova Testudines, Coelacanthiformes, Squamata i Osteoglossiformes.
Nisu pronađene ortologne sekvence C3orf62 za sljedeće oblike života: bakterije, arheje, protisti, biljke, gljive, ]]trichoplax]], beskičmenjaci, vodozemci ili ptice.

### Filogenija
Najudaljeniji ortolozi C3orf62 su vrste riba i vodozemaca. Ortolozi C3orf62 se ne nalaze kod ptica, beskičmenjaka ili bakterija.

## Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 3
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika