PROSER2

**PROSER2**, znan i kao **prolinom i serinom bogti protein  2**, jest protein  koji je kod ljudi kodiran genom **PROSER2**.  *PROSER2* ili otvoreni okvir čitanja 47 hrobosoma 10, nalazi se na pojasu 14  kratkog kraka hromosoma (10p14) i sadrži visoko konzervirani domen SARG. To je brzorazvijajući It gen sa dva paraloga, c1orf116 i specifična androgen-regulirni proteinska izoforma 1. Protein PROSER2 ima još neokarakteriziranu funkciju, ali, kod ljudi, on može imati ulogu u regulaciji ćelijskog ciklusa, reproduktivnom funkcioniranju i potencijalni je biomarker kancera.
## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 435 aminokiselina, а molekulska težina 45.802 Da.

1020304050
MPVTHRKSDASDMNSDTSPSCRLRAFSRGGSLESRSSSSRSRSFTLDDES
LKYLTHEEKDVLLFFEETIDSLDEDFEEPVLCDGGVCCLCSPSLEESTSS
PSEPEDVIDLVQPAPGAGEAEGLPEGTQAAGPAPAGKEHRKQDAETPPPP
DPPAPETLLAPPPLPSTPDPPRRELRAPSPPVEHPRLLRSVPTPLVMAQK
ISERMAGNEALSPTSPFREGRPGEWRTPAARGPRSGDPGPGPSHPAQPKA
PRFPSNIIVTNGAAREPRRTLSRAAVSVQERRAQVLATIHGHAGAFPAAG
DAGEGAPGGGSSPERVARGRGLPGPAESLRAGGQAPRGPALANGFPSAHE
ALKSAPSSFAPAGKSLCFRPGPALPSTRARQSFPGPRQPNGAQDWRRADS
LPRPQGITVQFAGRGSSEEARREALRKLGLLRESS

## Gen 
Ovaj gen je dug 48.880 baza sa 3.360 parova baza nakon transkripcije do iRNK. * PROSER2 * ima pet varijanti prerade, od kojih su tri alternativno prerađene, a dvije su neprerađene forme. Sadrži uzvodno uokvirenistop kodon i 2.000 bp dugipromotor.

### Lokus 
Kod čovjena, *PROSER2* nalazi se na desetom hromosomu (sekvencas 10p14). Orijentiran je na plus lanac DNK i ima pet egzona.

## Transkript PROSER2 
## Homologija i evolucija 
 i fibrinogensku podjedinicu alfa. Svaka tačka podataka na grafikonu predstavlja homolog ljudskog gena nađenog u drugoj vrsti koji je pronađen pomoću BLAST pretraživanja. Ovo pretraživanje rezultiralo je postotkom identiteta koji su graftirani prema procijenjenom vremenu odstupanja od ljudi koje je pronađeno pomoću TimeTree-a. Ovaj grafikon pokazuje da je "PROSER2" gen koji brzo evoluiraa, slično fibrinogenskoj podjedinici alfa.|581x581px]]

### Ortolozi 
Ortologni prostor za *PROSER2* je prilično velik, jer je prijavljeno da 143 organizma imaju ortologe sa ljudskim *PROSER2*. Najdalji ortolog od ljudskog  PROSER2 je morski pas slon, *Callorhinchus milii*. Najdalji srodnici ljudi sa *PROSER2* su ribe, uključujući morske pse (hrskavičave ribe). Po tome može se zaključiti da je *PROSER2* nastalo kod kičmenjaka.

### Paralozi 
Ljudski gen * PROSER2 * ima dva paraloga: otvoreni okvir čitanja c1orf116 i specifičnu izoformu genskog proteina reguliranu androgenima 1.

### Konzervirane regije 
Više poravnavanja sekvenci pokazalo je da je 3’ kraj dva proteina bogatog prolin-serinom 2 visoko konzerviran u udaljenim i bliskim homolozima. Ove široko konzervirane aminokiseline koje se nalaze u svih primata, sisara, gmizavaca, ptica, vodozemaca, riba i morskih pasa za koje su dostupne sekvence uključuju: R421, G406, V409, A424, L425, L428, G429 i L430. Može se primijetiti da ove visoko konzrvirane aminokiseline obuhvataju veći dio 3’ kraja domena specifično reguliranog androgena genskog proteina (SARG). Kraj  5' proteina bogatog 2 prolin-serinom 2 visoko je konzerviran kod bliskih srodnika ljudi, uključujući sve primate, sisare, gmizavce i ptice za koje su dostupne sekvence. *PROSER2* ima ravnomjernu ravnotežu baznih i kiselih ostataka koji su konzervirani u svim homolozima.

### Evolucijski obrazac 
*PROSER2* je brzoevoluirajući gen, sličan fibrinogenskoj podjedinici alfa (*FGA*). Skoro savršeno se usklađuje sa fibrinogenovom evolucionom historijom i mnogo je udaljeniji od evolucijskog vremenskog slijeda ctohroma C (*CYCS*) koji evoluira sporije od *PROSER2* ili *FGA* . Duplikacije gena * PROSER2* dogodile su se otprilike kod  riba koje su divergirale od ljudi prije oko 436,8 miliona godina.

## Prolinomu serinom bogati protein 2
U *Homo sapiens*, *PROSER2* kodira protein 2, bogat prolinom i serinom, koji je dugačak 435 aminokiselina i ima molekulsku težinu od 45.802 Da. Ovaj protein ima prilično neutralnu baznu izoelektričnu tačku od 6,81. Protein 2 bogat prolinom i serinom sadrži konzervirani domen SARG (specifično genski protein reguliran androgenima) koji obuhvata 388 aminokiselina unutar PROSER2. SARG domen pripada porodici gena pfam15385. Njegova prava funkcija tek treba biti razjašnjena, ali se sumnja na androgene receptore, jer je reguliran prema gore u prisutnosti androgena, ali ne i glukokortikoida. SARG domen je visoko eksprimiran u prostati, gde je također prijavljen PROSER2.]]

### Unutrašnja struktura proteina 
### Postranslacijske modifikacije 
PROSER2 sadrži 35 predviđenih mjesta fosforilacije serina, kao i dva predviđena mjesta fosforilacije treoninana konzerviranim ostacima. Predviđa se i da sadrži i dva motiva interakcije SUMO-a, dva mjesta S-palmitoilacije, kao i dva mjesta GalNac O-glikozilacije, koja se nalaze na ili blizu visoko konzerviranih aminokiselina. Ove modifikacije mogu promijeniti proteina|savijanje]] i funkciju proteina za koji se predviđa da će biti lokaliziran u jedru.

### Predviđena sekundarna struktura 
Struktura PROSER2 još je neokarakterizirana. Međutim, vjerojatno će sadržavati četiri alfa-heliksa i pet domena beta-listova koji su konzervirani u svim homolozima sisara. Na temelju strukturnih karakteristika i posttranslacijskih modifikacija, predviđa se da je to topljivi protein koji se izlučuje iz jedra neklasičnim putem sekrecije.

## Funkcija 
Funkcija proteina bogatog prolinom i serinom 2 još je nepoznata. Međutim, u nekoliko američkih patenata naveden je kao potencijalni biomarker) raka. Ovi proteini u interakciji su uključeni u kontrolu apoptoze, umnožavanja reproduktivnih ćelija, održavanja telomera, integriteta ćelije i napredovanja ćelijskog ciklusa. Ove interakcije identificiraju *PROSER2* kao gen koji je snažno uključen u regulaciju ćelijske diferencijacije i apoptoze.

## Ekspresija 
Ekspresija *PROSER2 * je izrazito specifična za tkivo, a koja je često niska. Kod ljudi, *PROSER2* je najviše eksprimirann u koštanoj srži, fetusnom mozgu, fetusnom bubregu, jetri, fetusnoj jetri, plućima, uključujući i fetusna, limfnim čvorovima, prostati, želucu, timusu i dušniku (ID GEO profil: 69555271). Utvrđeno je i da je visoko eksprimiran u debelom crijevu, sjemenicima, paratiroidnoj žlijezdi i maternici (GEO profil ID: 10034772) . Visoka ekspresija u tkivu testisa i prostate je očekivana, s obzirom na postojanje SARG domena u genu i njegovu povezanost s androgenima. *PROSER2* je najmanje eksprimiran u srcu, kičmenoj moždini i nekoliko područja u mozgu odrasle osobe (GEO profil ID: 69555271).*PROSER2* ima veću ekspresiju kod pacijenata sa ETP-ALL (rani prekursor akutnih limfoblastnih leukemija T-ćelija), u poređenju sa kontrolama (GEO profil ID: 92018456) i visoko je eksprimiran u primarnim tumorima prostate u usporedbi s benignim i malignim obrascima (GEO profil ID: 14264706). *PROSER2* je nedovoljno izražen kod muškaraca s AIS-om (sindrom neosjetljivosti na androgene), što slijedi s prethodno opisane dokaze u vezi s domenom SARG. Utvrđeno je da liječenje dihidrotestosteronom inducirs genitalne fibroblaste da povećaju ekspresiju * PROSER2 *, što dodatno potvrđuje da je to gen koji reagira na androgene (GEO profil ID: 20808032).

### Interakcije faktora transkripcije 
*PROSER2* najjače stupa u interakciju sa sljedećim faktorima transkripcije: TATA vezujući proteinski faktor  kičmenjaka, cinkov prst ZF5 POZ domene, transkripcijskim regulatorima porodice CTCF i BORIS gena, E2F- myc aktivatorom/regulatorom ćelijskog ciklusa, MYT1 C2HC proteinom cinkovog prsta, SOX/SRY– spol/testis koji određuje i povezani HMG-boksni faktori, CCAAT vezni faktori, HOX-PBX kompleksi i faktori transkripcije C2HC cinkovog prsta 13. Gen SRY je primarni faktor u određivanju formiranja testisa tokom razvoja, pa je logično da bi povezanost * PROSER2* s androgenima bila kontrolirana transkripcijskim faktorima u SOX -u /SRY-spol/testis koji određuju spol i srodnici faktora HMG kutije. Aktivator E2F-myc/regulator ćelijskog ciklusa je takođe važan jer *Myc* je bio uključen u puteve raka, pa ovaj odnos sa njegovim transkripcijskim faktorom pruža dodatne dokaze o ulozi *PROSER2*  kao potencijalnog biomarkera raka.

## Klinički značaj 
Iako funkcija * PROSER2 * kod ljudi nije razjašnjena, njegov SARG domen, proteini u interakciji/faktori transkripcije i obrasci ekspresije ukazuju da je * PROSER2 * uključen u kontrolu ćelijskog ciklusa i apoptozu te da reagira na prirodne androgene. *PROSER2* može biti biomarker raka epitelnih ćelija, dojke, prostate, jajniks, pluća, mozga i raka krvi, kako je pokazano u nekoliko američkih patenata.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
*

Kategorija:Geni na hromosomu 10
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika