COH1

**VPS13B**, znan i kao **pridruženi protein vakuolskog sortiranja 13B**, je protein koji je kod ljudi kodiran genom **VPS13B**. to je gigantski protein povezan sa Golgijevim aparatom za koji se vjeruje da je uključen u sortiranje i promet aparatom. Mutacije u ljudskom genu VPS13B uzrokuju Cohenov sindrom.

Gen VPS13B se također označava i kao CHS1, COH1, KIAA0532 i DKFZp313I0811.

Citogenetička lokacija ljudskog gena VPS13B je 8q22, što je dugi krak hromosoma 8 na poziciji 22.2. Identificirane su različite varijante transkripta koje kodiraju izoforme. Kanonski oblik eksprimiranog proteina kodiranog ljudskim genom VPS13B ima 3997 aminokiselina.

1020304050
MLESYVTPILMSYVNRYIKNLKPSDLQLSLWGGDVVLSKLELKLDVLEQE
LKLPFTFLSGHIHELRIHVPWTKLGSEPVVITINTMECILKLKDGIQDDH
ESCGSNSTNRSTAESTKSSIKPRRMQQAAPTDPDLPPGYVQSLIRRVVNN
VNIVINNLILKYVEDDIVLSVNITSAECYTVGELWDRAFMDISATDLVLR
KVINFSDCTVCLDKRNASGKIEFYQDPLLYKCSFRTRLHFTYENLNSKMP
SVIKIHTLVESLKLSITDQQLPMFIRIMQLGIALYYGEIGNFKEGEIEDL
TCHNKDMLGNITGSEDETRIDMQYPAQHKGQELYSQQDEEQPQGWVSWAW
SFVPAIVSYDDGEEDFVGNDPASTMHQQKAQTLKDPIVSIGFYCTKATVT
FKLTEMQVESSYYSPQKVKSKEVLCWEQEGTTVEALMMGEPFFDCQIGFV
GCRAMCLKGIMGVKDFEENMNRSETEACFFICGDNLSTKGFTYLTNSLFD
YRSPENNGTRAEFILDSTHHKETYTEIAGMQRFGAFYMDYLYTMENTSGK
GSTNQQDFSSGKSEDLGTVQEKSTKSLVIGPLDFRLDSSAVHRILKMIVC
ALEHEYEPYSRLKSDIKDENETILNPEEVALLEEYIPTRHTSVTLLKCTC
TISMAEFNLLDHLLPVIMGEKNSSNFMNTTNFQSLRPLPSIRILVDKINL
EHSVPMYAEQLVHVVSSLTQPSDNLLHYCYVHCYLKIFGFQAGLTSLDCS
GSYCLPVPVIPSFSTALYGKLLKLPTCWTKRSQIAITEGIFELPNLTIQA
TRAQTLLLQAIYQSWSHLGNVSSSAVIEALINEIFLSIGVKSKNPLPTLE
GSIQNVELKYCSTSLVKCASGTMGSIKICAKAPVDSGKEKLIPLLQGPSD
TKDLHSTKWLNESRKPESLLAPDLMAFTIQVPQYIDYCHNSGAVLLCSIQ
GLAVNIDPILYTWLIYQPQKRTSRHMQQQPVVAVPLVMPVCRRKEDEVSI
GSAPLAKQQSYQASEYASSPVKTKTVTESRPLSVPVKAMLNISESCRSPE
ERMKEFIGIVWNAVKHLTLQLEVQSCCVFIPNDSLPSPSTIVSGDIPGTV
RSWYHGQTSMPGTLVLCLPQIKIISAGHKYMEPLQEIPFVIPRPILEEGD
AFPWTISLHNFSIYTLLGKQVTLCLVEPMGCTSTLAVTSQKLLATGPDTR
HSFVVCLHVDLESLEIKCSNPQVQLFYELTDIMNKVWNKIQKRGNLNLSP
TSPETMAGPVPTSPVRSSIGTAPPDTSTCSPSADIGTTTEGDSIQAGEES
PFSDSVTLEQTTSNIGGTSGRVSLWMQWVLPKITIKLFAPDPENKGTEVC
MVSELEDLSASIDVQDVYTKVKCKIESFNIDHYRSSLGEECWSLGQCGGV
FLSCTDKLNRRTLLVRPISKQDPFSNCSGFFPSTTTKLLDGTHQQHGFLS
LTYTKAVTKNVRHKLTSRNERRSFHKLSEGLMDGSPHFLHEILLSAQAFD
IVLYFPLLNAIASIFQAKLPKTQKEKRKSPGQPMRTHTLTSRNLPLIYVN
TSVIRIFIPKTEEMQPTVEANQAAKEDTVVLKIGSVAMAPQADNPLGRSV
LRKDIYQRALNLGILRDPGSEIEDRQYQIDLQSINIGTAQWHQLKPEKES
VSGGVVTETERNSQNPALEWNMASSIRRHQERRAILTPVLTDFSVRITGA
PAVIFTKVVSPENLHTEEILVCGHSLEVNITTNLDFFLSVAQVQLLHQLI
VANMTGLEPSNKAAEISKQEQKKVDIFDGGMAETSSRYSGAQDSGIGSDS
VKIRIVQIEQHSGASQHRIARPSRQSSIVKNLNFIPFDIFITASRISLMT
YSCMALSKSKSQEQKNNEKTDKSSLNLPEVDSDVAKPNQACISTVTAEDL
LRSSISFPSGKKIGVLSLESLHASTRSSARQALGITIVRQPGRRGTGDLQ
LEPFLYFIVSQPSLLLSCHHRKQRVEVSIFDAVLKGVASDYKCIDPGKTL
PEALDYCTVWLQTVPGEIDSKSGIPPSFITLQIKDFLNGPADVNLDISKP
LKANLSFTKLDQINLFLKKIKNAHSLAHSEETSAMSNTMVNKDDLPVSKY
YRGKLSKPKIHGDGVQKISAQENMWRAVSCFQKISVQTTQIVISMETVPH
TSKPCLLASLSNLNGSLSVKATQKVPGIILGSSFLLSINDFLLKTSLKER
SRILIGPCCATANLEAKWCKHSGNPGPEQSIPKISIDLRGGLLQVFWGQE
HLNCLVLLHELLNGYLNEEGNFEVQVSEPVPQMSSPVEKNQTFKSEQSSD
DLRTGLFQYVQDAESLKLPGVYEVLFYNETEDCPGMMLWRYPEPRVLTLV
RITPVPFNTTEDPDISTADLGDVLQVPCSLEYWDELQKVFVAFREFNLSE
SKVCELQLPDINLVNDQKKLVSSDLWRIVLNSSQNGADDQSSASESGSQS
TCDPLVTPTALAACTRVDSCFTPWFVPSLCVSFQFAHLEFHLCHHLDQLG
TAAPQYLQPFVSDRNMPSELEYMIVSFREPHMYLRQWNNGSVCQEIQFLA
QADCKLLECRNVTMQSVVKPFSIFGQMAVSSDVVEKLLDCTVIVDSVFVN
LGQHVVHSLNTAIQAWQQNKCPEVEELVFSHFVICNDTQETLRFGQVDTD
ENILLASLHSHQYSWRSHKSPQLLHICIEGWGNWRWSEPFSVDHAGTFIR
TIQYRGRTASLIIKVQQLNGVQKQIIICGRQIICSYLSQSIELKVVQHYI
GQDGQAVVREHFDCLTAKQKLPSYILENNELTELCVKAKGDEDWSRDVCL
ESKAPEYSIVIQVPSSNSSIIYVWCTVLTLEPNSQVQQRMIVFSPLFIMR
SHLPDPIIIHLEKRSLGLSETQIIPGKGQEKPLQNIEPDLVHHLTFQARE
EYDPSDCAVPISTSLIKQIATKVHPGGTVNQILDEFYGPEKSLQPIWPYN
KKDSDRNEQLSQWDSPMRVKLSIWKPYVRTLLIELLPWALLINESKWDLW
LFEGEKIVLQVPAGKIIIPPNFQEAFQIGIYWANTNTVHKSVAIKLVHNL
TSPKWKDGGNGEVVTLDEEAFVDTEIRLGAFPGHQKLCQFCISSMVQQGI
QIIQIEDKTTIINNTPYQIFYKPQLSVCNPHSGKEYFRVPDSATFSICPG
GEQPAMKSSSLPCWDLMPDISQSVLDASLLQKQIMLGFSPAPGADSSQCW
SLPAIVRPEFPRQSVAVPLGNFRENGFCTRAIVLTYQEHLGVTYLTLSED
PSPRVIIHNRCPVKMLIKENIKDIPKFEVYCKKIPSECSIHHELYHQISS
YPDCKTKDLLPSLLLRVEPLDEVTTEWSDAIDINSQGTQVVFLTGFGYVY
VDVVHQCGTVFITVAPEGKAGPILTNTNRAPEKIVTFKMFITQLSLAVFD
DLTHHKASAELLRLTLDNIFLCVAPGAGPLPGEEPVAALFELYCVEICCG
DLQLDNQLYNKSNFHFAVLVCQGEKAEPIQCSKMQSLLISNKELEEYKEK
CFIKLCITLNEGKSILCDINEFSFELKPARLYVEDTFVYYIKTLFDTYLP
NSRLAGHSTHLSGGKQVLPMQVTQHARALVNPVKLRKLVIQPVNLLVSIH
ASLKLYIASDHTPLSFSVFERGPIFTTARQLVHALAMHYAAGALFRAGWV
VGSLDILGSPASLVRSIGNGVADFFRLPYEGLTRGPGAFVSGVSRGTTSF
VKHISKGTLTSITNLATSLARNMDRLSLDEEHYNRQEEWRRQLPESLGEG
LRQGLSRLGISLLGAIAGIVDQPMQNFQKTSEAQASAGHKAKGVISGVGK
GIMGVFTKPIGGAAELVSQTGYGILHGAGLSQLPKQRHQPSDLHADQAPN
SHVKYVWKMLQSLGRPEVHMALDVVLVRGSGQEHEGCLLLTSEVLFVVSV
SEDTQQQAFPVTEIDCAQDSKQNNLLTVQLKQPRVACDVEVDGVRERLSE
QQYNRLVDYITKTSCHLAPSCSSMQIPCPVVAAEPPPSTVKTYHYLVDPH
FAQVFLSKFTMVKNKALRKGFP

**C**: Cistein
**D**: Aspartat
**E**: Glutamat
**F**: Fenilalanin 
**G**: Glicin
**H**: Histidin
**I**: Izoleucin 
**K**: Lizin
**L**: Leucin
**M**: Metionin
**N**: Asparagin
**P**: Prolin
**Q**: Glutamin
**R**: Arginin
**S**: Serin
**T**: Treonin
**V**: Valin
:**W**: Triptofan
**Y**: Tirozin

## Gen 
Gen VPS13B nalazi se na hromosomu 8, sekvenca q22, čije su delecije povezane sa Cohenovim sindromom, zbog čega se ovaj gen alternativno naziva COH1. Gen sadrži 66 egzona, od kojih su četiri alternativna. Obrazac alternativne prerade u genu VS13B je složen u analiziranim regijama, uključujući egzone 28B i 28. To na kraju uzrokuje da 4 završna kodona i tri alternativno prerađene izoforme mogu biti u upotrebi. U egzonu 2 dolazi do njegove translacije start kodona. Varijante 1A i 2A su osnovne varijante gena koji kodira proteine od 4.022 i 39.997 aminokiselina.

## Nomenklatura 
Gen VPS13B je također poznat kao:
* CHS1 VPS13B se nalazi na lokusu 8q22.2.

Do sada je gen VPS13B prepoznat kao gen za kodiranje proteina koji proizvodi protein VPS13B. Protein VPS13B povezan je s Golgijevim aparatom i unutarćelijskim procesima kao što su modifikacije proteina, organizacija i distribucija proteina. Kod Cohenovog sindroma smatra se da delecijska mutacija) u genu mijenja oblik proteina VPS13B, rezultirajući kraćim, nefunkcionalnim proteinom. Pokazalo se da pacijenti s Cohenovim sindromom imaju neispravnu proteinsku glikozilaciju, što mu je glavna funkcija, čime se podupire sugestija da disfunkcija Golgijevog aparata doprinosi patologiji Cohenovog sindroma.

Simptomi Cohenovog sindroma počinju se pojavljivati u vrlo mladoj dobi. Novorođenčad pri rođenju ne moraju pokazati nikakve simptome, ali kada počnu razvijati svoje karakteristike lica, to postaje vidljivo. Tada počinje s neuspješnim napredovanjem kod dojenčadi i djece, a od tada počinju i svi razvojni zastoji: mikrocefalija, retinohorodijalna distrofija, psihomotorna retardacija, visoka kratkovidnost, neutropenija, hiperpokretljivost zglobova i izrazite crte lica. Zatim, u tinejdžerskim i adolescentnim godinama, nizak rast i pretilost počinju postajati briga. Gotovo 30% ljudi s ovim sindromom nisu rječitii i nepismeni. U mnogim slučajevima u kojima je kašnjenje govora izraženo kod ovog sindroma, unutar usta nalaze se aftozni čirevi i nanose mnogo boli pogođenoj osobi. Vremenom, mnogi ljudi pogođeni Cohenovim sindromom počinju gubiti vid do svoje tridesete godine. Iako Cohenov sindrom ne smanjuje životni vijek, ali smanjuje kvalitet života zbog nemogućnosti govora i /ili gledanja.

Cohenov sindrom je autosomno recesivni poremećaj koji karakterizira uglavnom dismorfizam lica, mikrocefalija, opuštenost zglobova i povremena neutropenija. Autosomna recesivniobrazac nasljeđivanja pudrazumijeva da postoji 50% šanse da nepogođena osoba bude prenositelj. Djeca ljudi sa ovim sindromom su nositelji gena za sindrom. U finskoj populaciji, 75% osoba sa Cohenovim sindromom, ima mutaciju u obje kopije gena. Mutacije u genu VPS13B javljaju se samo u malom broju porodica, izvan finskih i amiških grupa.

### Neutropenija 
Još jedna bolest kojoj doprinose mutacije gen VPS13B je neutropenija. Bolest se ispoljava u tome što pogođena osoba ima nisku koncentraciju neutrofila. Neutrofili su tip bijelih krvnih zrnaca. Zbog njih osoba može lakše dovbiti druge infekcije i bolesti. Mogu biti različite veličine i različito bolne. Drugi naziv za ovu bolest po kojem je općenito poznata je *afte*. Primjeri su pojave na hrskavicama ili živcima. Razlog za to je što je fetus u maternici prestao da se formira ili se mozak prestao rasti.

## Reference
## Vanjski linkovi 
* Cohen Syndrome association 
* GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on Cohen syndrome

Kategorija:Geni na hromosomu 8
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika