CARKD

**Domen ugljikohidratne kinaze koji sadrži protein** (skraćeno **CARKD**), kodiran genom **CARKD**, je ljudski protein nepoznate funkcije. Gen CARKD kodira proteine s predviđenim mitohondrijskim propeptidom (mCARKD), signalnim peptidom (spCARKD) ili niti jednim od njih (cCARKD). Analiza konfokusne mikroskopije transficiranih CHO (jajnika kineskog hrčka) pokazala je da cCARKD ostaje u citosolu, dok su mCARKD i spCARKD usmjereni na mitohondrije i endoplazmatski retikulum. Protein je konzerviran  u mnogim  vrstama, sa  predvđenim  ortolozima  do eukariota, bakterija i arheja.
__TOC__

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  347  aminokiselina, a molekulska težina   36.576 Da..

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

1020304050
MVTRAGAGTAVAGAVVVALLSAALALYGPPLDAVLERAFSLRKAHSIKDM
ENTLQLVRNIIPPLSSTKHKGQDGRIGVVGGCQEYTGAPYFAAISALKVG
ADLSHVFCASAAAPVIKAYSPELIVHPVLDSPNAVHEVEKWLPRLHALVV
GPGLGRDDALLRNVQGILEVSKARDIPVVIDADGLWLVAQQPALIHGYRK
AVLTPNHVEFSRLYDAVLRGPMDSDDSHGSVLRLSQALGNVTVVQKGERD
ILSNGQQVLVCSQEGSSRRCGGQGDLLSGSLGVLVHWALLAGPQKTNGSS
PLLVAAFGACSLTRQCNHQAFQKHGRSTTTSDMIAEVGAAFSKLFET

:Simboli

## Struktura 
### Gen 
Ljudski gen CARKD ima 10 egzona i nalazi se na poziciji q34 hromosoma 13. Sljedeći geni su blizu CARKD -a na hromosomu:
* COL4A2: za A2 podjedinicu kolagena tipa IV
* RAB20: Potencijalni regulator prometa koneksina 43.
* CARS2: za mitohondrijsku cistienil-tRNK sintetazu 2
* ING1: za protein koji potiskuje tumore

### Protein 
Ovaj protein je dio natporodice fosfometilpirimidin-kinaza: ribokinaza / pfkB. Ovu porodicu karakterizira prisutnost domena koju dijeli porodica. CARKD sadrži domen karbohidratne kinaze porodice PF01256.
* Izoelektrična tačka: 9,377
** Ortolozi CARKD-a  imaju visoko varijabilnu izoelektrične tačke.
**Dva mjesta N-vezane glikozilacije 

## Funkcija 
### Tkivna distribucija 
Čini se da je CARKD sveprisutno eksprimiran na visokim nivoima. Podaci o ekspresiji u ljudskom proteinu i mišjeg ortologa ukazuju na njegovu ekspresiju u gotovo svim tkivima. Jedan osebujan obrazac ekspresije CARKD -a je  različito ispoljavanje tokom  razvoja oligodendrocita. Njegova ekspresija je niža u matičnim ćelijama oligodendrocita nego u zrelim oligodendrocitima.

### Vezujući partneri 
Predviđeno je da je partner za vezivanje za CARKD,  prekursor apolipoproteina A-1 ljudskih proteina (APOA1BP). Ovo predviđanje temelji se na istovremenoj pojavi u genomima i koekspresiji. Osim ovih podataka, ortolozi CARKD -a u *Escherichia coli* sadrže domen sličan APOA1BP-u. Ovo ukazuje na to da su dva proteina vjerojatno nastala od zajedničkog evolucijskog pretka i, prema teoriji analize kamena rozeta, mogući su partneri u interakciji čak i kod vrsta poput ljudi, gdje se dva proteina ne proizvode kao jedan polipeptid.

## Klinički značaj 
Na osnovu alela specifične ekspresije CARKD-a, CARKD može imati ulogu u akutnoj limfoblastnoj leukemiji. Osim toga, mikročipni podaci pokazuju da je CARKD reguliran prema gore u tumorima *glioblastoma multiforme*.

## Reference 
## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 13
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika