Omikron (SARS-CoV-2)

[mini|Omicron varijanta i druge glavne ili prethodne [Varijanta zabrinutosti|varijante zabrinutosti SARS-CoV-2 prikazane na stablu radijalno skaliranom genetskom razdaljinom, izvedene iz Nextstrain-a 1. decembra 2021.]]
Varijanta ima mnogo mutacija, od kojih su neke zabrinjavale naučnike. Omicron varijanta ima ukupno 60 mutacija u poređenju sa referentnom/predak varijantom: 50 nesinonimnih mutacija, 8 sinonimnih mutacija i 2 nekodirajuće mutacije. Trideset i dvije mutacije utječu na spajk protein, glavnu antigenu metu antitijela nastalih infekcijama i mnogih vakcina koje se široko primjenjuju. Mnoge od tih mutacija nisu uočene kod drugih sojeva. Ovu varijantu karakteriše 30 promjena aminokiselina, tri male delecije i jedna mala insercija u šiljcima proteina u poređenju sa originalnim virusom, od kojih je 15 locirano u domenu za vezanje receptora (ostaci 319-541). Također nosi niz promjena i brisanja u drugim genomskim regijama. Dodatno, varijanta ima tri mutacije na mjestu cijepanja furina. Mjesto cijepanja furina povećava infektivnost SARS-CoV-2.

Veza sa HIV infekcijom može objasniti veliki broj mutacija u sekvenci Omikron varijante.  Zaista, da bi bio pogođen tako velikim brojem mutacija, virus je morao biti u stanju da evoluira dugo vremena bez da ubije svog domaćina, niti da bude eliminiran. Jedna takva situacija se dešava kod ljudi sa oslabljenim imunološkim sistemom, ali koji primaju dovoljno medicinske njege da prežive. To je slučaj sa HIV pacijentima u Južnoj Africi, koji predstavljaju više od 20% populacije. Zbog nedostatka pristupa klinikama, straha od stigmatizacije i poremećene zdravstvene zaštite, milioni koji žive sa HIV-om u regionu nisu na efikasnoj terapiji HIV-a. Prevencija HIV-a mogla bi biti ključna za smanjenje rizika od nekontroliranog HIV-a koji dovodi do pojave varijanti Covida.

Osim toga, vjeruje se da je jedna od ovih mnogih mutacija, koja sadrži sekvencu od 9 nukleotida, možda stečena od drugog koronavirusa (poznatog kao HCoV-229E ), odgovornog za prehladu. Ovo nije sasvim neočekivano,  s vremena na vrijeme, virusi unutar tijela preuzimaju i zamjenjuju segmente genetskog materijala jedni od drugih, a to je jedan od uobičajenih načina mutacije.

#### Podloze i BA.2 podvarijanta 
Istraživači su utvrdili postojanje tri podloze Omikrona. 'Standardna' podloza se sada naziva BA.1 , a druge dvije podloze poznate su kao BA.2  i BA.3. Oni dijele mnoge mutacije, ali se i značajno razlikuju. BA.1 i BA.2 dijele 32 mutacije, ali se razlikuju za 28. Ovo ih čini jednako različitim kao i neke druge glavne varijante, i predloženo je da BA.2 dobije svoje ime na osnovu grčkog alfabeta. Sredinom decembra 2021., BA.2 se još uvijek činio rijetkim s relativno malo sekvenci iz polovine zemalja koje su učitane u GISAID, ali se broj kasnije brzo povećao. Od 17. januara 2022. BA.2 je otkriven u najmanje 40 zemalja i na svim kontinentima osim Antarktika. Do 31. januara otkriven je u najmanje 57 zemalja.

## Znakovi i simptomi 
Jedinstveni prijavljeni simptom Omicron varijante je noćno znojenje.  Također, gubitak ukusa i mirisa se čini neuobičajenim u poređenju sa drugim sojevima.

Studija koju je od 1. do 7. decembra sproveo Centar za kontrolu bolesti pokazala je da su: "Najčešći prijavljeni simptomi kašalj, umor i začepljenost ili curenje iz nosa" što ga čini teškim za razlikovanje od manje štetne varijante ili drugog virusa.

Istraživanje objavljeno u Londonu 25. decembra 2021. sugerira da su najčešći simptomi koje navode korisnici aplikacije Zoe Covid "curenje iz nosa, glavobolje, umor, kihanje i grlobolja".

## Reference 
Kategorija:CS1 upotrebe (ruski)
Kategorija:CS1 upotrebe (češki)
Kategorija:CS1 upotrebe (njemački)
Kategorija:Pages with unreviewed translations
Kategorija:COVID-19
Kategorija:Pandemija koronavirusa 2019/2020.
Kategorija:Betakoronavirusi