CARD domen

**Kaspazni domen regrutacije**  ili **kaspazni domeni aktivacije i regrutacjije** (**CARD-i**), su interakcijski motivi koji se nalaze u širokom spektru proteina, tipski onih koji su uključeni u procese koji se odnose na upale i apoptozu. Ovi domeni posreduju u formiranju većih proteinskih kompleksa putem direktnih interakcija između pojedinačnih CARD-ova. CARD domeni se nalaze na zapanjujuće širokom spektru proteina, uključujući helikaze, kinaze, mitohondrijske proteine, kaspaze i ostalee citoplazmatske faktore.
 
## Osnovne karakteristike
CARD domeni su potklasa proteinskog motiva poznata kao smrtni nabor, koji ima raspored od šest do sedam antiparalelnih alfa-heliksa sa hidrofobnim jezgrom i vanjskom površinom sastavljenom od nabijenih ostataka. Ostali motivi u ovoj klasi uključuju pirinski domen (PYD), smrtni domen (DD) i domen efektora smrti (DED), koji također funkcionišu prvenstveno u regulaciji apoptoze i upalne reakcije.
 
## U apoptozi
CARD domeni su prvobitno karakterizirani na osnovu njihove uključenosti u regulaciju aktivacije kaspaze i apoptoze.   Čini se da je osnovna struktura domen sa šest spirala konzedrvirana još od gena *ced-3* i *ced-4* u *C. elegans*, organizam u kojem je prvi put okarakterisano nekoliko komponenti apoptotičke mašinerije. CARD motivi su prisutni na brojnim proteinima koji podstiču apoptozu, prvenstveno kaspaze 1,2,4,5,9 i 15 kod sisara.
 
## U imunskom odgovoru sisara
### Obrada IL-1 i IL-18
Pokazalo se da brojni CARD proteini imaju ulogu u regulaciji upale kao odgovor na bakterijske i virusne patogene, kao i na razne endogene signale stresa. Nedavno su studije o NLR proteinu Ipaf-1 pružile uvid u to kako CARD proteini učestvuju u imunskom odgovoru. Ipaf-1 ima N-terminalni CARD domen, domen koji se vezuje za nukleotide i ]]C-terminal]]n ponavljsnjs bogats leucinom (LRRs), za koje se smatra da funkcionišu na sličan način kao i kod Toll-liki receptori. Čini se da je primarna uloga ove molekule regulacija proteolitske obrade pro-IL-1β i pro-IL-18 u njihove zrele forme, putem povezivanja u velikom kompleksu poznatom kao inflamasom. Nakon aktivacije Ipaf-1 unutarćelijskom  bakterijom *S. typhimurium* ili drugih signala stresa, Ipaf-1 regrutuje adapter koji sadrži CARD nazvan ASC i kaspaza-1 u nepoznatoj stehiometriji putem CARD-CARD asocijacije. Ovaj kompleks zauzvrat dovodi do autoproteolitske aktivacije kaspaze-1 i kasnijeg sazrevanja IL-1β i IL-18.
 
### Antivirusna signalizacija
Nedavno se pokazalo da podskup CARD proteina učestvuje u prepoznavanju unutarćtlijskre dvolančane RNK, zajedničkog sastojka brojnih virusnih genoma, uključujući para- i ortomoksoviride i rhabdoviride. Za razliku od NLR-a, ovi proteini, zvani RIG-I i MDA5, sadrže dvostruke N-terminalne CARD domene i C-terminalne RNK-helikazne domene koje direktno komuniciraju i obrađuju dvolančanu virusnu RNK. Ova obrada čini CARD domene dostupnim za interakciju sa CARD motivom IPS-1/MAVS/VISA/Cardif, nizvodnim adapterom usidrenim u mitohondrjama. Iako su interakcije između IPS-1 i RIG-I/MDA-5 prikazane *in vitro*, priroda kompleksa formiranog nakon virusne detekcije nije okarakterisana.
 
Adapter protein VISA dalje aktivira inhibitor jedarnog faktora kapa-B kinaze (IKK)-protein-kinaze članova porodice. Iako su kanonski članovi IKK porodice IKKa i IKKb neophodni za aktivaciju NF-κB izazvanu virusom, nekanonski članovi IKK porodice TBK1 i IKBKE su odgovorni za fosforilaciju i aktiviranje IRF3 i IRF7 (Fitzgerald et al., 2003; Hemmi et al., 2004; Matsui et al., 2006). Razne studije su takođe pokazale učešće nekoliko drugih komponenti signalizacije u virusom izazvanoj aktivaciji NF-κB i/ili IRF3, uključujući TRAF3, TRAF6, TANK, NEMO (IKKg), TRADD, FADD i RIP (Kawai et al., 2005; Michallet et al., 2008; Oganesyan et al., 2006; Saha et al., 2006; Xu et al., 2005; Zhao et al., 2007).
 
## Autoimunost
Zbog njihove uloge regulatora upala, sugerirano je da konstitutivna aktivacija određenih CARD proteina, bilo uzrokovana mutacijom ili stalnim prisustvom signala stresa, ia uzročnu ulogu u brojnim upalnim sindromima. Mutacije pojačanja funkcije u unutarćelijskom NOD2 proteinu povezane su s povećanim rizikom za Crohnovu bolest. Aktiviranje mutacija u najmanje dva srodna proteina koja sadrže PYD, kriopirin/CIAS-1 i pirin/MEFV, povezana je sa Muckle-Wellsovim sindromom i porodičnom mediteranskom groznicom.
 
## Lista CARD-a koji sadrži proteine
* BIRC2  bakulovirusni inhibitor apoptoze (IAP) koji sadrži ponavljanje 2, također poznat kao C-IAP1 https://web.archive.org/web/20070715075853/http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=590
* BIRC3 bakulovirusni IAP koji ponavlja 3, također poznat kao C-IAP2 http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=591
* Kaspaza 1: kaspaza 1, cistein peptidaza povezana s apoptozom (interleukin 1, beta, konvertaza; ICE) =1499
* Kaspaza 2: kaspaza 2, cistein-peptidaza povezana s apoptozom http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=1503
* Kaspaza 4: kaspaza 4, cistein peptidaza povezana s apoptozom http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=1505
* Kaspaza 5: kaspaza 5, cistein peptidaza povezana s apoptozom http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=1506
* Kaspaza-9: kaspaza 9, cistein peptidaza povezana s apoptozom http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=1511
* Kaspaza 12: kaspaza 12, cistein peptidaza povezana s apoptozom http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=19004
* Kaspaza 13: kaspaza 13, cistein peptidaza povezana s apoptozom https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=protein&val=10720034
* ICEBERG: inhibitor kaspaze 1 ledenog brjega http://expasy.org/uniprot/P57730
* Pseudo-ICE:Dominantno negativni inhibitor kaspaze-1 Pseudo-ICE, također poznat kao COP1 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=protein&val=62953113
* MDA-5: Dominantno negativni inhibitor kaspaze-1 Pseudo-ICE, također poznat kao COP1http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=18873
* MAVS: Mitohondrijski antivirusni signalni protein također poznat kao *CARD adapter koji indukuje interferon-beta* https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=protein&val=83776598
* CRADD: Kaspaza i RIP adapter sa domenom smrti takođe poznat kao *RIP-povezan protein sa domenom smrti* (RAIDD)https://archive.today/20070812190132/http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=2340
* RAIDD-2: Molekula adaptera smrti RAIDD-2 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=protein&val=5051868
* RIG-I: Protein gena 1 inducibilnog retinoinskom kiselinom, također poznat kao protein 58 DEAD-kutija  (DDX58) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=19102
* RIPK2: serin-treonin kinaza 2 s interakcijom s receptorima (takođe nazvana kardiak, RIP2 ili RICK kinaza)https://archive.today/20070812190132/http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=10020
* BCL10: B-ćelijski limfom/leukemija 10 protein http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=989
* BINCA: CARD protein koji djeluje na Bcl10 ili BinCARD, koji se također naziva otvoreni okvir čitanja 89 (C9orf89) hromosoma 9 http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=28148
* CARD6: porodica domena za regrutaciju kaspaze, član 6 http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16394
* CARD8/CARDINAL: porodica domena za regrutaciju kaspaze, član 8 6 http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=17057
* CARD9: porodica domena za regrutaciju kaspaze, član 9 http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16391
* CARD10: cporodica domena za regrutaciju kaspaze, član 10 (zvani CARMA3) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16422
* CARD11: porodica domena za regrutaciju kaspaze, član 11 (zvani CARMA1) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16393
* CARD14: cporodica domena za regrutaciju kaspaze, član 14  (zvani CARMA2) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16446
* APAF1: faktor 1 koji aktivira apoptoznu peptidazu (također zvani CED4) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=576
* GLAVA1: glavaris faktor aktiviranja peptidaze 1 (također zvani GLAV1) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=576
* IPAF: Faktor aktiviranja ledene proteaze, također poznat kao *NLR porodica, sadrži domene CARD 4 (NLRC4)*, *CARD, LRR, i NACHT-sadržeći protein* (CLAN) i protein 12 koji sadrži domen regrutacije kaspaze (CARD12) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16412
* NOD1: nukleotid-vezujući oligomerizacijski sa domenom 1 http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16390
* NOD2: domen 2 oligomerizacije koji se vezuje za nukleotide  http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=5331
* NLRC3: NOD-liki receptor porodice CARD sa domenom 3 http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=29889
* NLRP1: NLR porodica, sa pirinskim domenom 1 (nekadašnji NALP1) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=14374
* NOL3: jedarčani protein 3 (apoptozni represor sa CARD domenom) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=7869
* PYCARD: PYD CARD domen sa proteinom (zvani ASC) http://www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/data/get_data.php?hgnc_id=16608
* Ced-3 analog kasapaze 9 kod *Caenorhabditis elegans*
* AIRE Autoimunski regulator http://www.jbc.org/content/283/3/1723.abstract

## Reference
*
*
*
*
*
 
## Vanjski linkovi
Kategorija:Struktura proteina
Kategorija:Proteinski domeni
Kategorija:Programirana ćelijska smrt