ARL6IP4

**Interaktivni protein 4ADP-ribozilaciolikog faktora 6 ** (ARL6IP4), znan i kao  **SRp25**  je proizvod gena **ARL6IP4**, lociranog na  gene hromosomu 12, sekvenca q24.31. Njegova funkcija nije poznata.

### Lokacija 
Editiranje se događa na mjestu  K/R unutar aminokiselinske pozicije 225 konačnog proteina. Koristeći RT-PCR i sekvenciranje 100 pojedinačnih klonova, 7% izoformi tri proteina, na ovom položaju, tokom sekvenciranja, pokazalo je G umjesto A.  Za editiranje, mogu biti potencijalno prisutna druga manja mjesta, uključujući neke u istom egzonu, kao i glavno mjesto za editiranje. Kao što je to slučaj sa IGFBP7, pre-iRNK, editiranje je neuobičajeno, jer se struktura nabora RNK sastoji samo od egzonake sekvence.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 421  aminokiselina, a  molekulska težina   44.915 Da.

1020304050
MPRCTYQLEQNPGFLPDGPGVHARAHCQDLSGPYGHEFATSESLGGRVGK
TRAPQSGARSRMERAGPAGEEGGAREGRLLPRAPGAWVLRACAERAALEV
GAASADTGVRGCGARGPAPLLASAGGGRARDGTWGVRTKGSGAALPSRPA
SRAAPRPEASSPPLPLEKARGGLSGPQGGRARGAMAHVGSRKRSRSRSRS
RGRGSEKRKKKSRKDTSRNCSASTSQGRKASTAPGAEASPSPCITERSKQ
KARRRTRSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGRKKRGKYKDKRRKKKK
KRKKLKKKGKEKAEAQQVEALPGPSLDQWHRSAGEEEDGPVLTDEQKSRI
QAMKPMTKEEWDARQSIIRKVVDPETGRTRLIKGDGEVLEEIVTKERHRE
INKQATRGDCLAFQMRAGLLP

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Struktura 
Prema drugom izvoru, dužina molekuke je 360 aminokiselina. Eksprimira se sveprisutno, ali samo u G1/S fazi ćelijskog ciklusa. Ljudskia i mišja iRNK  ovog proteina imaju 77% homologije.

Uočena su dva tipa klastera aminokiselina: klaster serina i bazni klaster.

## Editiranje RNK 
Pre-iRNK genskog produkta  ARL6IP4 je podložna editiranju RNK.

### Tip 
Editiranje RNK, od A do I,  katalizira porodica adenozin-deaminaza koje djeluju na RNK (ADAR) koje specifično prepoznaju adenozine unutar dvolančanih regiona pre-iRNK i deaminira ih u inozin. Inozini su prepoznati kao gvanozini, pomoću ćelijskog translacijskog mehanizma. ADAR 1 i ADAR 2 jedini su enzimski aktivni članovi porodice. Smatra se da ADAR3 ima regulatornu ulogu u mozgu. ADAR1 i ADAR 2 široko su eksprimirani u tkivima, dok je ADAR 3 ograničen na mozak. Dvolančane regije RNK nastaju uparivanjem baza između ostataka, u regiji blizu mjesta editiranja, s ostacima obično u susjednom intronu, ali mogu biti egzonska sekvenca. Područje uparivanja baza sa editirajućon regijom poznato je kao komplementarna sekvenca editiranja (ECS).

### Učinci na strukturu proteina 
Editiranje na ovom mjestu rezultira promjenom kodona. iz lizina u arginin. To se događa u visoko baznoj regiji proteina.

### Učinci na funkciju proteina 
Funkcija needsitiranog proteina uglavnom je nekarakteristična. Stoga je i učinak editiranja na pre-iRNK na funkciju proteina također nepoznat. Promjena aminokiselina je konzervativna i nije vjerojatno da će masivno promijeniti funkciju proteina. Međutim, mjesto editiranja može biti važno, jer je aminokiselina koja se mijenja lizin, koji može biti uključen u regulaciju ekspresije proteina. Lizini mogu biti mjesta posttranslacijske modifikacije, a konverzija lizina u arginin može uticati na posttranslacijsku modifikaciju.

## Reference
## Vanjski linkovi 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 12
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika