TOM1L1

**TOM1-oliki protein 1** je protein koji je kod ljudi kodiran gen om **TOM1L1**.

Dužina polipeptidnog lanca je 476  aminokiselina, a molekulska težina 52.989..

**Aminokiselinska sekvenca**
:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

1020304050
MAFGKSHRDPYATSVGHLIEKATFAGVQTEDWGQFMHICDIINTTQDGPK
DAVKALKKRISKNYNHKEIQLTLSLIDMCVQNCGPSFQSLIVKKEFVKEN
LVKLLNPRYNLPLDIQNRILNFIKTWSQGFPGGVDVSEVKEVYLDLVKKG
VQFPPSEAEAETARQETAQISSNPPTSVPTAPALSSVIAPKNSTVTLVPE
QIGKLHSELDMVKMNVRVMSAILMENTPGSENHEDIELLQKLYKTGREMQ
ERIMDLLVVVENEDVTVELIQVNEDLNNAILGYERFTRNQQRILEQNKNQ
KEATNTTSEPSAPSQDLLDLSPSPRMPRATLGELNTMNNQLSGLNFSLPS
SDVTNNLKPSLHPQMNLLALENTEIPPFAQRTSQNLTSSHAYDNFLEHSN
SVFLQPVSLQTIAAAPSNQSLPPLPSNHPAMTKSDLQPPNYYEVMEFDPL
APAVTTEAIYEEIDAHQHKGAQNDGD

TOM1L1 pripada porodici proteina povezanih s TOM1, koji su uključeni u endocitozu. Ovi proteini imaju N-terminalni Vps27 / HGS /STAM (VHS) domen, nakon čega slijedi GGA/ TOM1 (GAT) domen.

## Kloniranje i ekspresija
N-terminalni domen TOM1 dijeli sličnost sekvenci s N-terminalnim domenima ljudskog HGS-a i STAM-a i kvščevog VPS27, a svi su proteini povezani s prometom vezikula na endosomu. Pretražujući baze podataka sa sekvencama, koristeći TOM1 kao upit, Seroussi et al. (1999) identificirali su TOM1L1 kao drugi protein sa N-terminalnim domenom sličnom onom kod TOM1. Autori su složili sekvence grupe ljudskih TOM1L1 EST u susjednu cDNK,  koja kodira izvedeni protein od 476 aminokiselina. TOM1L1 dijeli 37% identiteta sekvence s TOM1; njegov domen C-terminala nije sličan domenu TOM1. PCR-om biblioteke cDNK ljudske jetre, Katoh et al. (2006) klonirani ljudski TOM1L2. Izvedeni protein ima N-terminalni VHS domen, centraln GAT domen i C-terminalni domen sa sekvencom kutije klatrina.

## Funkcija gena
Koristeći 2-hibridne testove kvasaca, Puertollano (2005) otkrio je da je ljudski TOM1L1 stupio u interakciju sa komponentama multivezikulskih mehanizma  za sortiranje tijela, uključujući TSG101 (601387) i HRS (HGS), endosomski regulator razgradnje proteina. Epitop-označeni TOM1L1 eksprimiran je u citosolu transficiranih HeLa ćelija, ali koekspresija HRS-a preraspodijelila je TOM1L1 na endosome. Ekspresija konstitutivno aktivnog oblika FYN promovirala je fosforilaciju tirozina TOM1L1, inducirala povećanje endosoma i promovirala regrutaciju TOM1L1 u povećane endosome.
Koristeći testove *in vitro*, Franco et al. (2006) otkrili su da je miš Tom1l1 stupio u interakciju i bio supstrat za kinaze porodice SRC  (SFK) ljudskog SRC-a i goveđeg Fyn. Fosforilirani Tom1l1 stabilizirao je Fyn u otvorenoj i aktivnoj konformaciji i povećao aktivnost fosforilacija rekombinantnih ljudskih SRC i FYN. Tom1l1 inhibirao je mitogeni efekt SFK signalizacije, induciran PDGF-om  u fibroblastima miša, ometajući interakciju SFK-PDGF receptora, uzrokujući blokadu G1-fazu ćelijskog ciklusa. Koekspresija ljudskih SFK suprotstavila se G1 bloku induciranom Tom1l1. Nokdaun Tom1l1, neutralizacijom antitijela ili malom interferirajućom RNK,  povećao je broj ćelija koje su ušle u S-fazu nakon PDGF stimulacije. Prekomjerna ekspresija srodnih molekula Tom1l2  i Tom1 također je inhibirala PDGF-induciranu sintezu DNK, ali sa znatno nižom snagom. S obzirom na predviđenu ulogu proteina povezanih s TOM1 u endocitozi, Franco et al. (2006) pretpostavili su da TOM1L1 može sudjelovati u reciklaži PDGF receptora.
Koristeći imunoprecipitaciju i Western blot analizu, Katoh et al. (2006) pokazali su da su C-terminalni domeni TOM1L1 i TOM1L2 u interakciji sa teškim lancem klatrina (CLTC). GAT domene TOM1L1 i TOM1L2 u interakciji su s endosomnim proteinom TOLLIP. Kada su se koeksprimirali, TOM1 i TOM1L1 regrutovani su u TOLLIP pozitivne endosome. Katoh i dr. (2006) zaključili su da, zajedno s TOLLIP-om, proteini porodice TOM1 regrutuju klatrin na endosome i moduliraju endosomsku funkciju.

Gross (2012) mapirao je gen TOM1L1 u hromosomsku sekvencu 17q22, na osnovu poravnanja sekvence TOM1L1 (GenBank AJ010071) sa genomskom sekvencom (GRCh37).

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
* 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 17
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika