open-index/open-wikipedia-markdown huggingface dataset:
TMEM117

**Transmembranski protein 117** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **TMEM117**.

Projekt Zbirke gena sisara (MGC) Nacionalnog instituta za zdravlje (SAD) osmišljen je za generiranje i sekvenciranje javno dostupnog izvora cDNK koji sadrži potpuni otvoreni okvir čitanja (ORF) za svaki gen čovjeka i miša. Projekt je u početku koristio slučajnu strategiju za odabir klonova iz velikog broja biblioteka cDNK iz različitih tkiva. Klonovi kandidati izabrani su na osnovu 5'-EST sekvenci, a zatim su potpuno sekvencirani do velike tačnosti i analizirani algoritmima razvijenim za ovaj projekt. Sada je više od 11.000 ljudskih i mišjih 10.000 gena zastupljeno u MGC-u, s najmanje jednim klonom s punim ORF-om.

Pristup nasumičnom izboru sada dostiže točku zasićenja, a prijelaz na protokole usmjerene na transkripte koji nedostaju sada je potreban za kompletiranje mišjih i ljudskih zbirki. Usporedba sekvence MGC klonova s referentnim sekvencama genoma otkriva da je većina klonova cDNK vrlo visokog kvaliteta sekvence, iako je vjerojatno da neke cDNK mogu nositi pogrešne varijante kao posljedicu eksperimentalnih artefakata, kao što su PCR, kloniranje ili greške reverzne transkriptaze. Nedavno je projektu dodana komponenta cDNK pacova, a tekući projekti cDNK žabe (*Xenopus*) i zebrice (*Danio*) prošireni su kako bi se iskoristili prednosti visokopropusnog MGC kanala.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  514 aminokiselina, a  molekulska težina   60.185 Da.

1020304050
MGKDFRYYFQHPWSRMIVAYLVIFFNFLIFAEDPVSHSQTEANVIVVGNC
FSFVTNKYPRGVGWRILKVLLWLLAILTGLIAGKFLFHQRLFGQLLRLKM
FREDHGSWMTMFFSTILFLFIFSHIYNTILLMDGNMGAYIITDYMGIRNE
SFMKLAAVGTWMGDFVTAWMVTDMMLQDKPYPDWGKSARAFWKKGNVRIT
LFWTVLFTLTSVVVLVITTDWISWDKLNRGFLPSDEVSRAFLASFILVFD
LLIVMQDWEFPHFMGDVDVNLPGLHTPHMQFKIPFFQKIFKEEYRIHITG
KWFNYGIIFLVLILDLNMWKNQIFYKPHEYGQYIGPGQKIYTVKDSESLK
DLNRTKLSWEWRSNHTNPRTNKTYVEGDMFLHSRFIGASLDVKCLAFVPS
LIAFVWFGFFIWFFGRFLKNEPRMENQDKTYTRMKRKSPSEHSKDMGITR
ENTQASVEDPLNDPSLVCIRSDFNEIVYKSSHLTSENLSSQLNESTSATE
ADQDPTTSKSTPTN

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Reference
## Dopunska literatuar
*
*
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 12
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
RNF34

**E3 ubikvitin-proteinska ligaza RNF34** je enzim koji je kod ljudi kodiran genom  **RNF34**.

Protein kodiran ovim genom sadrži RINF prst, motiv za koji se zna da je uključen u interakcije protein-protein i protein-DNK. Ovaj protein stupa u interakciju s DNAJA3/hTid-1, koji je protein DnaJ, za koji se izvještava da funkcionira kao modulator apoptoze. Pokazalo se da pretjerana ekspresija ovog gena u HeLa ćelijama daje otpornost na apoptozu induciranu TNF-alfa, što ukazuje na anti-apoptotičku funkciju ovog proteina. Ovaj protein se može cijepati kaspazom-3 tokom indukcije apoptoze.  Prijavljene su i alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.

1020304050
MKAGATSMWASCCGLLNEVMGTGAVRGQQSAFAGATGPFRFTPNPEFSTY
PPAATEGPNIVCKACGLSFSVFRKKHVCCDCKKDFCSVCSVLQENLRRCS
TCHLLQETAFQRPQLMRLKVKDLRQYLILRNIPIDTCREKEDLVDLVLCH
HGLGSEDDMDTSSLNSSRSQTSSFFTRSFFSNYTAPSATMSSFQGELMDG
DQTSRSGVPAQVQSEITSANTEDDDDDDDEDDDDEEENAEDRNPGLSKER
VRASLSDLSSLDDVEGMSVRQLKEILARNFVNYSGCCEKWELVEKVNRLY
KENEENQKSYGERLQLQDEEDDSLCRICMDAVIDCVLLECGHMVTCTKCG
KRMSECPICRQYVVRAVHVFKS

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
Kategorija:Proteini RING-prsta
Kategorija:Geni na hromosomu 12
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
John Bardeen

**John Bardeen** (  ; maj 23, 1908 - 30. januar, 1991)  bio je američki inženjer i fizičar. On je jedina osoba koja je dva puta nagrađena Nobelovom nagradom za fiziku: prvo 1956. s Williamom Shockleyjem i Walterom Brattainom za pronalazak tranzistora; i ponovno 1972. s Leonom N Cooperom i Johnom Robertom Schriefferom za temeljnu teoriju konvencionalne supravodljivosti poznatu kao BCS teorija.

Tranzistor je napravio revoluciju u elektroničkoj industriji, omogućivši razvoj gotovo svih modernih elektroničkih uređaja, od telefona do računara, i započeo doba informacija. Bardeen-ov razvoj superprovodljivosti - za koji je dobio drugu Nobelovu nagradu - koristi se u spektroskopiji nuklearne magnetske rezonancije (NMR) i medicinskoj magnetnoj rezonanciji (MRI).

Rođen i odrastao u Wisconsinu, Bardeen je doktorirao fiziku na Univerzitetu Princeton. Nakon služenja u Drugom svjetskom ratu, bio je istraživač u Bell Labs -u i profesor na Univerzitetu Illinois. Godine 1990. Bardeen se pojavilona *listi časopisa Life* za "100 najutjecajnijih Amerikanaca vijeka".

Bardeen je rođen u Madisonu, Wisconsin, 23. maja 1908. Bio je sin Charlesa Bardeena, prvog dekana Medicinskog fakulteta Univerziteta Wisconsin.

Bardeen je pohađao Univerzitetsku srednju školu u Madisonu. Školu je završio 1923. sa 15 godina.

Bardeen je diplomirao elektrotehniku 1928. godine na Univerzitetu Wisconsin -Madison. Diplomirao je 1928. uprkos tome što je uzeo godinu dana odmora da radi u Chicagu. Pohađao je sve diplomske predmete iz fizike i matematike koji su ga zanimali, a diplomirao je za pet godina umjesto uobičajenih četiri. To mu je dalo vremena da završi magistarski rad, koji je nadgledao Leo J. Peters. Magistrirao je elektrotehniku 1929. godine u Wisconsinu.
mini|John Bardeen, William Shockley i Walter Brattain u Bell Labs, 1948
mini|340x340piksel| Stilizirana replika prvog tranzistora izumljenog u Bell Labs -u 23. decembra 1947. godine|lijevo
desno|mini|350x350piksel| Komemorativna ploča koja podjseća na Johna Bardeena i teorije superprovodljivosti na Univerzitetu Illinois u Urbana -Champaign

## Reference 
Kategorija:Rođeni 1908.
Kategorija:Umrli 1991.
Kategorija:Američki fizičari
Kategorija:Kvantni fizičari
Kategorija:Dobitnici Nobelove nagrade za fiziku
Kategorija:Inozemni članovi Kraljevskog društva
Kategorija:Biografije, Madison (Wisconsin)
Međunarodni konzorcij za nokaut-miševe

**Međunarodni konzorcij za nokaut-miševe** (**IKMC**) je naučni projekt pokušaja da se proizvede zbirka mišjih embrionskih matičnih ćelijskih linija kojima nedostaje po neki gen u genomu, a zatim da se ćelije distribuiraju istraživačima da kreiraju nokaut-miševe za proučavanje. Mnogi od ciljanih alela dizajnirani su tako da mogu generirati i potpuno i uvjetno nokautiranje mišjih gena.

IKMC pokrenut je 15. marta 2007. godine na sastanku u Briselu. Do 2011, *Nature* izvijestio je da je Konzorcij već nokaut-onemogućio otprilike 17.000 različitih gena, "ostavljajući još samo oko 3.000 preostalih".

Konzorcij obuhvata četiri glavna, visokoproduktivna programa mutageneze usmjerena na gene: Nacionalni instituti za zdravlje (NIH) sponzorirani program nokaut-miševa (KOMP) i financiran od države preko Teksaškog instituta za genomsku medicinu (TIGM) u SAD-u, Sjevernoamerički program uslovljene mišje mutagenze (NorCOMM) u Kanadi i Evropski uslovni mutagenezni program miša (EUCOMM) u Evropi. Prvi od njegovih godišnjih sastanaka članova i finansijera, čiji je domaćin bila zemlja rotirajućeg predsjedavanja, održan je u NIH-u u Bethesdi, Maryland u Sjedinjenim Državama za period 2007–2008, sa Torontom, Kanada domaćinstvom za 2008–2009.

## Reference 
## Vanjski linkovi 
*International Knockout Mouse Consortium
*Knockout Mouse Project (KOMP) Repository 
*North American Conditional Mouse Mutagenesis (NorCOMM) Program 
*European Union Conditional Mouse Mutagenesis (EUCOMM) Programme
*Texas Institute for Genomic Medicine (TIGM)

Kategorija:Biološke baze podataka
Kategorija:Genetički modificirani organizmi
ACRV1

**Interaktivni kinazni protein 1 (PRKA) ** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **AKIP1**.

Ovaj gen kodira jedarni protein koji stupa u interakciju s katalitskom podjedinicom protein-kinaze A i regulira učinak signalnog puta protein-kinaze, ovisnog o cAMP-u na kaskadu aktivacije NF-kapa-B. Za ovaj gen opisane su i alternativno prerađene varijante transkripta (prema RefSeq, OKt 2011].

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 210   aminokiselina, a molekulska težina  23.114 Da.
 

1020304050
MDNCLAAAALNGVDRRSLQRSARLALEVLERAKRRAVDWHALERPKGCMG
VLAREAPHLEKQPAAGPQRVLPGEREERPPTLSASFRTMAEFMDYTSSQC
GKYYSSVPEEGGATHVYRYHRGESKLHMCLDIGNGQRKDRKKTSLGPGGS
YQISEHAPEASQPAENISKDLYIEVYPGTYSVTVGSNDLTKKTHVVAVDS
GQSVDLVFPV

## Reference 
Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
USP52

**Podjedinica 2 PAB-ovisne poli(A)-specifične ribonukleaze** je enzim koji je kod ljudi kodiran genom *PAN2*.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.102  aminokiseline, a  molekulska težina   135.368 Da.
:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

1020304050
MNFEGLDPGLAEYAPAMHSALDPVLDAHLNPSLLQNVELDPEGVALEALP
VQESVHIMEGVYSELHSVVAEVGVPVSVSHFDLHEEMLWVGSHGGHATSF
FGPALERYSSFQVNGSDDIRQIQSLENGILFLTKNNLKYMARGGLIIFDY
LLDENEDMHSLLLTDSSTLLVGGLQNHIIEIDLNTVQETQKYAVETPGVT
IMRQTNRFFFCGHTSGKVSLRDLRTFKVEHEFDAFSGSLSDFDVHGNLLA
ACGFSSRLTGLACDRFLKVYDLRMMRAITPLQVHVDPAFLRFIPTYTSRL
AIISQSGQCQFCEPTGLANPADIFHVNPVGPLLMTFDVSASKQALAFGDS
EGCVHLWTDSPEPSFNPYSRETEFALPCLVDSLPPLDWSQDLLPLSLIPV
PLTTDTLLSDWPAANSAPAPRRAPPVDAEILRTMKKVGFIGYAPNPRTRL
RNQIPYRLKESDSEFDSFSQVTESPVGREEEPHLHMVSKKYRKVTIKYSK
LGLEDFDFKHYNKTLFAGLEPHIPNAYCNCMIQVLYFLEPVRCLIQNHLC
QKEFCLACELGFLFHMLDLSRGDPCQGNNFLRAFRTIPEASALGLILADS
DEASGKGNLARLIQRWNRFILTQLHQDMQELEIPQAYRGAGGSSFCSSGD
SVIGQLFSCEMENCSLCRCGSETVRASSTLLFTLSYPDGSKSDKTGKNYD
FAQVLKRSICLDQNTQAWCDTCEKYQPTIQTRNIRHLPDILVINCEVNSS
KEADFWRMQAEVAFKMAVKKHGGEISKNKEFALADWKELGSPEGVLVCPS
IEELKNVWLPFSIRMKMTKNKGLDVCNWTDGDEMQWGPARAEEEHGVYVY
DLMATVVHILDSRTGGSLVAHIKVGETYHQRKEGVTHQQWYLFNDFLIEP
IDKHEAVQFDMNWKVPAILYYVKRNLNSRYNLNIKNPIEASVLLAEASLA
RKQRKTHTTFIPLMLNEMPQIGDLVGLDAEFVTLNEEEAELRSDGTKSTI
KPSQMSVARITCVRGQGPNEGIPFIDDYISTQEQVVDYLTQYSGIKPGDL
DAKISSKHLTTLKSTYLKLRFLIDIGVKFVGHGLQKDFRVINLMVPKDQV
LDTVYLFHMPRKRMISLRFLAWYFLDLKIQGETHDSIEDARTALQLYRKY
LELSKNGTEPESFHKVLKGLYEKGRKMDWKVPEPEGQTSPKNAAVFSSVL
AL

## Reference 
## Dopunska literatura
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 12
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Tranzicija

**Tranzicija** ( preći, prelaziti) je pojam koji ima više značenja:

### Druŝtvene nauke: 
# društveno-ekonomske promjene: prelazak feudalizma u kapitalizam, prelazak monarhije u republiku;
#reformske promjene (prelazak iz Druge republike u Treću republiku, tranzicija katoličanstva u protestantizam...);
# prelaz u razne faze društvenog poretkaš (iz državnog kapitalizma u liberalni kapitalizam, iz državnog socijalizma u samoupravni socijalizam, iz liberalnog kapitalizma u globalni monopolizam centara financijske i privredne moći, prelaz kolonijalizma u neokolonijalizam);
# obnova prethodnih poredaka: restauracija monarhije, restauracija feudalizma, restauracija kapitalizma (tzv. tranzicijske zemlje, zemlje koje su u prelazu iz planske privrede u "tržišnu privredu", pretvorbi društvenog ili državnog vlasništva u privatno, tj. iz socijalizma u kapitalizam);
#pokušaj da se uz pomoć znanja i modernizacije premosti vjekovni civilizacijski jaz između razvijenih i nerazvijenih zemalja u relativnom kratkom vremenskom roku od jednog do nekoliko decenija;
#demografska tranzicija, promjene u reprodukciji stanovništva u pojedinim zemljama ili regionima,
#rodna tranzicija (transrodni prelaz)

### Prirodne nauke: 
* U fizici i hemiji pod tranzicijom se podrazumijevaju razne vrste prelaza iz jednog oblika ili stanja u drugi,

* Energetska tranzicija, prelaz sa neobnovljivih izvora energije na obnovljive (ekološka tranzicija)

#### Biologija 
* Tranzicija (genetika), tačkasta mutacija koja mijenja purinski nukleotid u drugi purin (A ↔ G) ili pirimidinski nukleotid u drugi pirimidin (C ↔ T)
* Tranzicioni fosil, bilo koji fosilizovani ostaci životnog oblika koji pokazuju karakteristike dve različite taksonomske grupe

#### Medicina 
* polna tranzicija s hormonalnom terapijom i hirurŝkom intervencijom uz psihološku pomoć

#### Astronomija 
Tranzicija planeta (tranzicija Venere preko sunčevog diska; tranzicija zvjezdanih planeta preko zvjezdanog diska)

### Umjetnost 
* Historijski prelaz iz jedn umjetničke epohe  u drugu (napr. tranzicija renesanse u barok ili modernizma u postmodernizam) ili lična tranzicija umjetnika (napr. Pikasova tranzicija iz ružičaste i plave faze u kubističku i apstraktnu fazu, Mocartova tranzicija iz baroknog u klasicistički izraz)
* muzička tranzicija, modularni prelaz melodija ili tonaliteta u jednoj kompozicji

### Sport 
* Taktička tranzicija u kolektivnim sportovima

* Tranzicioni šampionat, muški profesionalni golf turnir na PGA turniru

Kategorija:Terminologija
Kategorija:Prirodne nauke
Kategorija:Druŝtvene nauke
ALKBH3

**AlkB homolog 3 alfa-ketoglutarat dioksigenaze** je  protein koji je kod ljudi kodiran genom **ALKBH3**.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 286  aminokiselina, a  molekulska težina   33.375 Da.

1020304050
MEEKRRRARVQGAWAAPVKSQAIAQPATTAKSHLHQKPGQTWKNKEHHLS
DREFVFKEPQQVVRRAPEPRVIDREGVYEISLSPTGVSRVCLYPGFVDVK
EADWILEQLCQDVPWKQRTGIREDITYQQPRLTAWYGELPYTYSRITMEP
NPHWHPVLRTLKNRIEENTGHTFNSLLCNLYRNEKDSVDWHSDDEPSLGR
CPIIASLSFGATRTFEMRKKPPPEENGDYTYVERVKIPLDHGTLLIMEGA
TQADWQHRVPKEYHSREPRVNLTFRTVYPDPRGAPW

## Funkcija 
AlkB protein *Escherichia coli* štiti od citotoksičnosti metilacijskih agenasa, popravljanjem specifičnih molekulskih lezija DNK, nastalih u jednolančanoj DNK. ALKBH2 (MIM 610602) i ALKBH3 su homolozi AlkB-a '*E. coli* koji kataliziraju uklanjanje 1-metiladenina i 3-metilcitozina (Duncan et al., 2002 PubMed 12486230]).

## Reference 
## Dopunska literatura 
*
*
*
*
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
TSFM

**Mitohondrijski faktor elongacije Ts** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **TSFM**. To je homolog EF-Ts-a.

Ovaj gen kodira faktor elongacije mitohondrijske translacije. Kodirani protein je enzim, koji katalizira razmjenu guaninskih nukleotida gvanina na faktoru elongacije translacije, tokom koraka produženja mithondrijskog proteina.

Mutacije u ovom genu povezane su sa sindromom kombinirane deficijencije oksidativne fosforilacije-3. Alternativna prerada rezultira u više varijanti transkripta (prema RefSeq, mart 2010.)
Sveprisutna ekspresija nađena je u nadbubrežnim žlijezdama (RPKM 18,8) i bubrezima (RPKM).

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 325 aminokiselina, a  molekulska težina   35.391 Da.

1020304050
MSLLRSLRVFLVARTGSYPAGSLLRQSPQPRHTFYAGPRLSASASSKELL
MKLRRKTGYSFVNCKKALETCGGDLKQAEIWLHKEAQKEGWSKAAKLQGR
KTKEGLIGLLQEGNTTVLVEVNCETDFVSRNLKFQLLVQQVALGTMMHCQ
TLKDQPSAYSKGFLNSSELSGLPAGPDREGSLKDQLALAIGKLGENMILK
RAAWVKVPSGFYVGSYVHGAMQSPSLHKLVLGKYGALVICETSEQKTNLE
DVGRRLGQHVVGMAPLSVGSLDDEPGGEAETKMLSQPYLLDPSITLGQYV
QPQGVSVVDFVRFECGEGEEAAETE

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 12
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Test vruće ploče

**Test vruće ploče** je test odgovora na bol kod životinja, sličan testu trzanja repa. Metodi vruće ploče i trzanja repa općenito se koriste za testiranje analgetika s centralnim djelovanjem, 

Test vruće ploče koristi se u istraživanjima osnovnih bolova i u testiranju efikasnosti analgetika, promatranjem reakcije na bol uzrokovane toplinom. Predložili su ga Eddy i Leimbach 1953. Koristili su model ponašanja nocicepcije, gdje se ponašanja poput skakanja i lizanja stražnjih šapa izazivaju nakon štetnog toplinskog podražaja. Lizanje je brzi odgovor na bolne toplinske podražaje koji je direktan pokazatelj nocicepcijskog praga. Skakanje predstavlja razrađeniji odgovor, sa kašnjenjem i uključuje emocijsku komponentu bijega.

## Postupak 
* Za držanje životinje na zagrijanoj površini ploče, upotrebljava se  prozirni stakleni cilindar. 
*Temperatura ploče podešava se pomoću termoregulirane pumpe sa cirkulacijom vode.
*Vrijeme latencije definira se kao vremenski period između nulte tačke, kada se životinja stavi na površinu ploče za grijanje, i vrijeme kada životinja liže šapu ili skoči kako bi izbjegla toplinsku bol. 

## Reference
## Vanjski linkovi
Kategorija: Skale boli
Kategorija: Tehnike ispitivanja na životinjama
Kategorija: Laboratorijske tehnike
AMOTL1

**Angiomotinoliki protein 1** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **AMOTL1**.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 956   aminokiselina, a  molekulska težina   106.574 Da.
 

1020304050
MWRAKLRRGTCEPAVKGSPSACYSPSSPVQVLEDSTYFSPDFQLYSGRHE
TSALTVEATSSIREKVVEDPLCNFHSPNFLRISEVEMRGSEDAAAGTVLQ
RLIQEQLRYGTPTENMNLLAIQHQATGSAGPAHPTNNFSSTENLTQEDPQ
MVYQSARQEPQGQEHQVDNTVMEKQVRSTQPQQNNEELPTYEEAKAQSQF
FRGQQQQQQQQGAVGHGYYMAGGTSQKSRTEGRPTVNRANSGQAHKDEAL
KELKQGHVRSLSERIMQLSLERNGAKQHLPGSGNGKGFKVGGGPSPAQPA
GKVLDPRGPPPEYPFKTKQMMSPVSKTQEHGLFYGDQHPGMLHEMVKPYP
APQPVRTDVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQLPFPSTMQQHSPMSSQTSSASG
PLHSVSLPLPLPMALGAPQPPPAASPSQQLGPDAFAIVERAQQMVEILTE
ENRVLHQELQGYYDNADKLHKFEKELQRISEAYESLVKSTTKRESLDKAM
RNKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETANRQLSSREYEGHEDKAAEGHYASQN
KEFLKEKEKLEMELAAVRTASEDHRRHIEILDQALSNAQARVIKLEEELR
EKQAYVEKVEKLQQALTQLQSACEKREQMERRLRTWLERELDALRTQQKH
GNGQPANMPEYNAPALLELVREKEERILALEADMTKWEQKYLEESTIRHF
AMNAAATAAAERDTTIINHSRNGSYGESSLEAHIWQEEEEVVQANRRCQD
MEYTIKNLHAKIIEKDAMIKVLQQRSRKDAGKTDSSSLRPARSVPSIAAA
TGTHSRQTSLTSSQLAEEKKEEKTWKGSIGLLLGKEHHEHASAPLLPPPP
TSALSSIASTTAASSAHAKTGSKDSSTQTDKSAELFWPSMASLPSRGRLS
TTPAHSPVLKHPAAKGTAEKLENSPGHGKSPDHRGRVSSLLHKPEFPDGE
MMEVLI

## Funkcija 
Protein kodiran ovim genom je protein periferne membrane koji je komponenta uskih mešućelijskih veze ili TJ. TJ tvore apikalna spojna struktura i djeluju na kontrolu paraćelijske propusnosti i održavanje ćelijske polarnosti. Ovaj protein je povezan sa angiomotinom, proteinom koji veže angiostatin i regulira migraciju endotelnih ćelija i stvaranje kapilarnih.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
AMPD3

**AMP-deaminata 3** je enzim koji je kod ljudi kodiran genom **AMPD3**.

Ovaj gen kodira člana porodice gena AMP-deaminaza. Kodirani protein je visoko regulirani enzim koji katalizira hidrolitsku deaminaciju adenozin-monofosfata u inozin-monofosfat, tačku grananja u adenilatnom katabolitskom putu. Ovaj gen kodira izoforme eritrocita (E), dok drugi članovi porodice kodiraju izoforme koje prevladavaju u mišićnim (M) i jetrenim (L) ćelijama. Mutacije u ovom genu dovode do klinički asimptomskog, autosomno recesivnog stanja, nedostatka AMP-deaminaze eritrocita. Opisane su i alternativno prerađenesu varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme ovog gena.

1020304050
MPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIG
QKEAKERELQKELAEQKSVETAKRKKSFKMIRSQSLSLQMPPQQDWKGPP
AASPAMSPTTPVVTGATSLPTPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGITLEDYEQ
AAKSLAKALMIREKYARLAYHRFPRITSQYLGHPRADTAPPEEGLPDFHP
PPLPQEDPYCLDDAPPNLDYLVHMQGGILFVYDNKKMLEHQEPHSLPYPD
LETYTVDMSHILALITDGPTKTYCHRRLNFLESKFSLHEMLNEMSEFKEL
KSNPHRDFYNVRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKHTYQTEPDRTVAEKRG
RKITLRQVFDGLHMDPYDLTVDSLDVHAGRQTFHRFDKFNSKYNPVGASE
LRDLYLKTENYLGGEYFARMVKEVARELEESKYQYSEPRLSIYGRSPEEW
PNLAYWFIQHKVYSPNMRWIIQVPRIYDIFRSKKLLPNFGKMLENIFLPL
FKATINPQDHRELHLFLKYVTGFDSVDDESKHSDHMFSDKSPNPDVWTSE
QNPPYSYYLYYMYANIMVLNNLRRERGLSTFLFRPHCGEAGSITHLVSAF
LTADNISHGLLLKKSPVLQYLYYLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYSKNPLRE
FLHKGLHVSLSTDDPMQFHYTKEALMEEYAIAAQVWKLSTCDLCEIARNS
VLQSGLSHQEKQKFLGQNYYKEGPEGNDIRKTNVAQIRMAFRYETLCNEL
SFLSDAMKSEEITALTN

 
## Modelni organizmi
U proučavanju PNPO funkcije, korišteni su modelni organizmi.  Uvjetna linija nokaut-miševa, zvana * Pnpotm1a (KOMP) Wtsi,* generirana je kao dio programa Međunarosnog konzorcija za nokaut-miševe – visokopropusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.

Muške i ženske životinje prolazile su standardizirani fenotipski skrining, kako bi se utvrdili efekti delecije. Od 24 izvedena  testa ina mutantnim miševima, uočene su dvije značajne abnormalnosti. Ovaj miš nosi mutaciju koja povećava funkciju AMPD3. Mutantne životinje imaju značajno kraći životni vijek crvenih krvnih ćelija, cikličku eritropoezu, splenomegaliju i otpornost na infekciju sa * Plasmodium chabaudi *.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Kategorija:Mišji mutirani geni
API5

Ljudski  gen **API5** kodira protein **apoptozni inhibitor 5**.

Ovaj gen kodira inhibitorni protein apoptoze, čija ekspresija sprječava apoptozu nakon lišavanja faktora rasta. ovaj protein potiskuje apoptozu izazvanu transkripcijskim faktorom E2F1, a također stupa u interakciju i negativno regulira acinus, jedarni faktor koji je uključen u apopto fragmentacijutskku DNK . Njegovo iscrpljivanje pojačava citotoksično djelovanje hemoterapijskih lijekova. Kristalna struktura API5 pokazala je funkciju interakcije protein-protein.

Bolesti povezane sa API5 uključuju adenokarcinom debelog crijeva i rak grlića materice.

API5 funkcionira u eksportu jedarne iRNK.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 524  aminokiseline, a  molekulska težina   59.005 Da..

1020304050
MPTVEELYRNYGILADATEQVGQHKDAYQVILDGVKGGTKEKRLAAQFIP
KFFKHFPELADSAINAQLDLCEDEDVSIRRQAIKELPQFATGENLPRVAD
ILTQLLQTDDSAEFNLVNNALLSIFKMDAKGTLGGLFSQILQGEDIVRER
AIKFLSTKLKTLPDEVLTKEVEELILTESKKVLEDVTGEEFVLFMKILSG
LKSLQTVSGRQQLVELVAEQADLEQTFNPSDPDCVDRLLQCTRQAVPLFS
KNVHSTRFVTYFCEQVLPNLGTLTTPVEGLDIQLEVLKLLAEMSSFCGDM
EKLETNLRKLFDKLLEYMPLPPEEAENGENAGNEEPKLQFSYVECLLYSF
HQLGRKLPDFLTAKLNAEKLKDFKIRLQYFARGLQVYIRQLRLALQGKTG
EALKTEENKIKVVALKITNNINVLIKDLFHIPPSYKSTVTLSWKPVQKVE
IGQKRASEDTTSGSPPKKSSAGPKRDARQIYNPPSGKYSSNLGNFNYEQR
GAFRGSRGGRGWGTRGNRSRGRLY

## Reference
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
*  
*  
*  

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
B3GNT1

**N-acetilaktosaminid beta-1,3-N-acetilglukozaminiltransferaza** je enzim koji je kod ljudi kodiran genom **B3GNT1**.

## β-1,4-glukuroniltransferaza 
Gen *B3GNT1* kodira β-1,4-glukuroniltransferazu, označenu kao B4GAT1, koja prenosi glukuronsku kiselinu prema α- i β-anomerima ksiloze. B4GAT1 je primarni enzim za LARGE, glikoziltransferazu dvostruke aktivnosti koja je sposobna produžiti produkte B4GAT1. Stoga je uključen u započinjanje velikog ovisnog ponavljajućeg disaharida koji je neophodan za vezivanje proteina vanćelijskog matriksa za O-manosilirani α-distroglikan, koji nedostaje u sekundarnim distroglikanopatijama.
## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 415  aminokiselina, a  molekulska težina   47.119 Da..

1020304050
MQMSYAIRCAFYQLLLAALMLVAMLQLLYLSLLSGLHGQEEQDQYFEFFP
PSPRSVDQVKAQLRTALASGGVLDASGDYRVYRGLLKTTMDPNDVILATH
ASVDNLLHLSGLLERWEGPLSVSVFAATKEEAQLATVLAYALSSHCPDMR
ARVAMHLVCPSRYEAAVPDPREPGEFALLRSCQEVFDKLARVAQPGINYA
LGTNVSYPNNLLRNLAREGANYALVIDVDMVPSEGLWRGLREMLDQSNQW
GGTALVVPAFEIRRARRMPMNKNELVQLYQVGEVRPFYYGLCTPCQAPTN
YSRWVNLPEESLLRPAYVVPWQDPWEPFYVAGGKVPTFDERFRQYGFNRI
SQACELHVAGFDFEVLNEGFLVHKGFKEALKFHPQKEAENQHNKILYRQF
KQELKAKYPNSPRRC

## Pogrešna identifikacija 
Za gen B3GNT1 prvi put je objavljeno da kodira člana porodice beta-1,3-N-acetilglukozaminiltransferaze i smatralo se da je odgovoran za sintezu poli-N-acetilaktosamina, determinante za antigen krvne grupe **i**. Tako je bio poznat i kao iGNT.

## Reference 
## Dopunska literatura
* 
* 

## Vanjski linkovi 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Limfociti periferne krvi

**Limfociti periferne krvi** (**PBL**)  su zreli limfociti koji cirkuliraju u krvi, a ne lokaliziraju se u organima (kao što su slezena ili limfni čvorovi).  Sadrže T-, NK- i B-ćelije.

To je tip  bijelih krvnih zrnaca u imunskom sistemu viličastih kičmenjaka. Limfociti uključuju prirodne ćelije ubice  (koje funkcioniraju u ćelijski posredovanoj imunosti, citotoksičnom urođenoj imunost, T-ćelije  i B-ćelije  (za humoralnu imunost. Oni su glavni tip ćelija u limfi, po čemu su i imenovane "limfociti".

Limfociti čine između 18% i 42% cirkulirajućih bijelih krvnih ćelija, koje se nazivaju i leukociti. 

## Tipovi
 vide se i pomoću svjetlosnog mikroskopa]] 
 
 limfociti u perifernoj krvi]]

## Reference
Kategorija:Limfociti
Crkva svetog proroka Ilije u Marićkoj

**Crkva Svetog Proroka Ilije** u Marićkoj jest srpska pravoslavna crkva, Eparhije banjalučke smještena 20&nbsp;km od Prijedora i najpoznatija je crkva brvnara u Republici Srpskoj.

Kako predstavlja vrijedan i izuzetno dobro očuvan primjer drvenih crkava brvnara u Bosni i Hercegovini, proglašena je za nacionalno dobro kao nacionalni spomenik u Bosni i Hercegovini (Službeni glasnik BiH, broj 102/11).

## Historija 
Na osnovu urezanog natpisa iznad zapadnih vrata, gdje se pominje 1870. godina, nije jasno da li je to godina izgradnje crkve ili neka od njenih obnova. Na tavanu ove crkve nađene su carske dveri, na kojima je urezan datum 30. juli 1753] godine, koji bi se mogao odnositi na crkvu koja je na istom mjestu bila prije ove crkve brvnare. Crkvu je radio Teodor Čanak, sin Marka Čanka, graditelja crkvi u Rakelićima i Busnovima, a pri njenoj nekadašnjoj obnovi pominju se majstori Maksim Kujundžija i Ilija Lukić. Na zapadnoj strani 1898. godine pridodat je trijem iznad kojeg je dignut drveni zvonik. Velika sanacija crkve vršena je 1938. godine kad je, između ostalog, zamijenjena klis-šindra sa crijepom, a uređen je i oltarski prostor.

## Arhitektura 
Arhitektura crkve se odlikuje konstruktivnim rješenjima krova crkve sa prepuštenim širokim strehama, niskim drvenim zidovima, dekorativno-arhitektonskim elementima trijema i zvonika, domišljatim i konstruktivno uspjelim tesarskim vezama drvenih konstruktivnih elemenata, velikih konstruktivnih raspona, ali i vanredan osjećaj za proporcionalnost objekta, svjedoče o izuzetnom zanatskom umijeću lokalnih drvodjelja-neimara. Dostignuće graditelja je tim vrednije, imajući u vidu kompleksnost društveno-političkih i ekonomskih prilika kraja 19. vijeka, u vrijeme kada je crkva bila obnavljana.

Crkva je građena od hrastovih talpi koji su postavljeni na temelj od kamena. Sastoji se od ulaznog trema, trobrodnog naosa, horske galerije i oltarsko dela. Iznad trema poslije 1878. godine sagrađen je drveni zvonik. Tavanica iznad naosa je rađena u kombinaciji ravne tavanice i poluobličastog svoda.

Iz vremena druge obnove crkve (1938) potječe ikonostas sa 22 ikone, rad ikonopisca Pavla Žitetskog. Osim ikonostasa kao zaštićena pokretna dobra čine prijestolni krst, kandilo i drvena vrata s originalnim metalnim ključem, iz vremena prve crkve.

U neposrednoj blizini crkve nalazi se stari hrast lužnjak, za koga stručnjaci smatraju da je star oko 600 godina. Slava crkve je Ilindan, kada se organizuje Veliki narodni zbor u Marićkoj gde se okuplja oko 10.000 posjetilaca. U porti hrama podignuta je spomen-bista dr Jovanu Raškoviću.

## Galerija 

Datoteka:Црква Светог пророка Илије у Марићкој 03.jpg|Bista dr. Jovanu Raškoviću
Datoteka:Црква Светог пророка Илије у Марићкој 04.jpg|Crkva svetog proroka Ilije
Datoteka:Црква Светог пророка Илије у Марићкој 05.jpg|Ulazna vrata u crkvu

## Reference 
## Vanjski linkovi 
* Crkva Marićka 

Kategorija:Nacionalni spomenici u Prijedoru
Kategorija:Crkve brvnare u Bosni i Hercegovini
Kategorija:Eparhija banjalučka
APLNR

**Apelinski receptor** (APLNR, znan i kao **APJ**) je G-protein spregnuti receptor.  APLNR ima dva endogena liganda koji su APELIN i ELABELA. Struktura APLNR riješena je 2017.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 380 aminokiselina, a  molekulska težina   4.660 Da..
 

1020304050
MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVL
WTVFRSSREKRRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTF
FCKLSSYLIFVNMYASVFCLTGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVAT
AVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKVQCYMDYSMVATVSSEWAWEVG
LGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIAGHFRKERIEGLRKRRRLLSII
VVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSLLHWPCDFDLFLMNIFPYCTCISYV
NSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYSSGH
SQGPGPNMGKGGEQMHEKSIPYSQETLVVD

 
## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi 
* 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
APOA4

**Apolipoprotein A-IV** (znan i kao apoA-IV, apoAIV ili apoA4) je plazmatski   protein koji je  kod  ljudi kodiran genom **APOA4**.

## Gen 
APOA4 se nalazi na hromosomu 11 u bliskoj vezi sa APOA1 i APOC3. APOA4 sadrži tri egzona  odvojena s dva introna i predstavlja polimorfni), iako se većina prijavljenih polimorfnih sekvenci  javlja u egzonu 3. Najbolje potvrđeni i proučeni nesinonimni jednonuklrotidni polimorfizmi (SNP9) su supstitucija glutamin → histidin na kodonu 360 i treonin → serin zamjena na kodonu 347; polimorfizam sekvence je također identifikovan u 3' UTR trećeg egzona.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  396 aminokiselina, a  molekulska težina   45 399 Da.

1020304050
MFLKAVVLTLALVAVAGARAEVSADQVATVMWDYFSQLSNNAKEAVEHLQ
KSELTQQLNALFQDKLGEVNTYAGDLQKKLVPFATELHERLAKDSEKLKE
EIGKELEELRARLLPHANEVSQKIGDNLRELQQRLEPYADQLRTQVNTQA
EQLRRQLTPYAQRMERVLRENADSLQASLRPHADELKAKIDQNVEELKGR
LTPYADEFKVKIDQTVEELRRSLAPYAQDTQEKLNHQLEGLTFQMKKNAE
ELKARISASAEELRQRLAPLAEDVRGNLRGNTEGLQKSLAELGGHLDQQV
EEFRRRVEPYGENFNKALVQQMEQLRQKLGPHAGDVEGHLSFLEKDLRDK
VNSFFSTFKEKESQDKTLSLPELEQQQEQQQEQQQEQVQMLAPLES

## Funkcija 
Primarni produkt translacije gena APOA4 je preprotein sa 396 ostataka, koji se podvrgava proteolitskoj obradi, kako bi se dobio apo A-IV, zreli O-vezani glikoprotein sa 376 ostataka. Kod većine sisavara, uključujući ljude, sinteza apo A-IV ograničena je na crijeva; međutim, kod miševa i pacova dolazi do sinteze u jetri. Apo A-IV se izlučuje u cirkulaciju na površini novosintetiziranih hilomikronskih čestica. Apsorpcija masti u crijevima dramatično povećava sintezu i lučenje apo A-IV. Iako njegova primarna funkcija u metabolizmu lipida u ljudi nije utvrđena, otkriveno je da apo A-IV:
* *in vitro* aktivira lecitin-holesterol aciltransferazu i protein transpotra holesteril-holesterola;
* imaju ulogu u regulaciji apetita i sitosti u modelima glodara;
* pokazivanje antioksidativnih i antiaterogenih svojstava *in vitro* i kod modela glodara;
* modulirati efikasnost enterocitnog i jetrenog transcelularnog lipidnog transporta *in vitro*.

Nedostatak judskog apo A-IV nije prijavljen.

## Interakcije 
Dokazano je da APOA4 stupa u interakciju sa 

## Interaktivna mapa puta
## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
* 
* 

Kategorija:Apolipoproteini
Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
ARCN1

**Arhain 1** is a protein koji je kod ljudi kodiran genom **ARCN1**.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  511 aminokiselina, a  molekulska težina   57.210 Da.

1020304050
MVLLAAAVCTKAGKAIVSRQFVEMTRTRIEGLLAAFPKLMNTGKQHTFVE
TESVRYVYQPMEKLYMVLITTKNSNILEDLETLRLFSRVIPEYCRALEEN
EISEHCFDLIFAFDEIVALGYRENVNLAQIRTFTEMDSHEEKVFRAVRET
QEREAKAEMRRKAKELQQARRDAERQGKKAPGFGGFGSSAVSGGSTAAMI
TETIIETDKPKVAPAPARPSGPSKALKLGAKGKEVDNFVDKLKSEGETIM
SSSMGKRTSEATKMHAPPINMESVHMKIEEKITLTCGRDGGLQNMELHGM
IMLRISDDKYGRIRLHVENEDKKGVQLQTHPNVDKKLFTAESLIGLKNPE
KSFPVNSDVGVLKWRLQTTEESFIPLTINCWPSESGNGCDVNIEYELQED
NLELNDVVITIPLPSGVGAPVIGEIDGEYRHDSRRNTLEWCLPVIDAKNK
SGSLEFSIAGQPNDFFPVQVSFVSKKNYCNIQVTKVTQVDGNSPVRFSTE
TTFLVDKYEIL

## Funkcija 
Ovaj gen nalazi se u regiji koja uključuje  gen za leukemiju mjješovite loze i gene integracije virusa 1 šperona virusa leukemije, gdje se javlja višestostruka bolest usljed hromosomskih translokacija. To je unutarćelijski protein. Arhainske sekvence su među eukariotima dobro konzervirane  i ovaj protein može imati temeljnu ulogu u biologiji eukariotskih ćelija. Ima sličnosti sa proteinima toplotnog šoka i  proteinima povezanim s klatrinom, a može biti uključen u strukturu vezikula ili vezikulski promet

## Reference 
## Dopunska literatura 
*

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
C11orf1

**Otvoreni okvir čitanja 1 hromosoma 11**, znan i kao **C11orf1**, je gen koji sadrži protein. Dva hibridna skrining kvasca otkrila su da se vežu za SETDB1, histonski protein metiltransferaza. SETDB1 je upleten u Huntingtonovu bolest, neurodegenerativni poremećaj.

C11orf1 je jedarni protein s nepoznatom funkcijom, ali je pokazano da ima preferencijalnu ekspresiju u nekim bolesnim stanjima u podacima mikrozraka.

## Distribucija po vrstama 
C11orf1 prikazuje konzervacijukod sisara i ortolozi se mogu naći kod morske šprice i morske anemone. Donja tablica prikazuje neke ortologe pronađene pomoću BLASTa.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 150 aminokiselina, a molekulska težina 17.785 Da.
 

1020304050
MAASQCLCCSKFLFQRQNLACFLTNPHCGSLVNADGHGEVWTDWNNMSKF
FQYGWRCTTNENTYSNRTLMGNWNQERYDLRNIVQPKPLPSQFGHYFETT
YDTSYNNKMPLSTHRFKREPHWFPGHQPELDPPRYKCTEKSTYMNSYSKP

## Gen
C11orf1alazi se na hromosomu 11, a susjedi su mu:
* FDXACB1-201
* ALG9-201
* ALG9-202
* AP001781.5-201

## Protein 
### Struktura 
Ovaj protein je dio superporodice UPF0686. Ovu porodicu karakterizira prisutnost domena nepoznate funkcije (DUF) 1143 koji dijeli porodica. Ova porodica DUF1143 ima domen koji uključuje gotovo svih 149 od 150 aminokiselina u ljudskom ortologu. C11orf1 ima šest varijanti splajsosoma i jednu varijantu bez prerade.

### Predviđena svojstva 
Sljedeća svojstva C11orf1 predviđena su pomoću bioinformatičke analize:
* Molekulska težina: 17,76 KDal
* Izoelektrična tačka: 7,28
* Posttranslacijske modifikacije: predviđeno je dvanaest mogućih posttranslacijskih modifikacija:
** Dvije glikozilacije O- (N-acetilaminogalaktozil) -L-treonina na pozicijama 138 i 142 na proteinskoj sekvenci
** Dva mjesta fosforilacije O-fosfo-L-serina na 112 i 141. U jednom eksperimentu je također otkriveno da je ovaj gen nedovoljno eksprimiran kod pacijenata s Huntingtonovom bolešću, dok je SETDB1 prekomjerno eksprimiran.

## Reference 
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Domen nepoznate funkcije

**Domen nepoznate funkcije** (DUF) je proteinski domen koji nema okarakteriziranu funkciju. Ove porodice su prikupljene zajedno u bazi podataka Pfam, koristeći prefiks DUF iza kojeg slijedi broj, s primjerima DUF2992 i DUF1220. Od 2019. godine, u bazi podataka Pfam postoji gotovo 4.000 porodica DUF-a, što predstavlja preko 22% poznatih porodica. Neki DUF-ovi nisu imenovani prema nomenklaturi zbog popularne upotrebe, ali su ipak DUF-ovi.

Oznaka DUF je okvirna, pa se takve porodice obično preimenuju u određenije ime (ili spoje u postojeći domenu nakon što je funkcija identificirana.

## Karakterizacija 
Strukturnogenomički programi pokušali su razumjeti funkciju DUF-a putem određivanja strukture. Strukture više od 250 porodica DUF su riješene. Ovaj rad (2009.) pokazao je da je oko dvije trećine DUF porodica imalo strukturu sličnu prethodno riješenoj i stoga vjerovatno bili različiti članovi postojećih proteinskih superporodica, dok je oko jedne trećine posjedovalo novi protein.

Neke porodice DUF-a dijele homologiju udaljenih sekvenci s domenima koje karakteriziraju funkciju. Računarski rad se može koristiti za povezivanje ovih odnosa. Rad iz 2015. uspio je dodijeliti 20% DUF -ova karakterističnim strukturnim porodicama. Pfam također kontinuirano obavlja (ručno provjerene) dodjele u unosima "porodice" nadporodici.]]
Više od 20% svih proteinskih domena označeno je kao DUF u 2013. Oko 2.700 DUF -a se nalazi u bakterijama, u poređenju sa nešto više od 1.500 u eukariotima. Preko 800 DUF -a se dijeli između bakterija i eukariota, a oko 300 ih je prisutno i u arhejama. Ukupno 2.786 bakterijskih Pfam domena čak se javlja kod životinja, uključujući 320 DUF-a.  Međutim, kada je deletiran u *Escherichia coli* nije otkriven očigledan fenotip. Kasnije se pokazalo da su proteini koji sadrže DUF143, ribosomski faktori utišavanja koji blokiraju sklop dvije ribosomske podjedinice. Iako ova funkcija nije bitna, pomaže da se ćelije prilagođavaju uvjetima s niskim hranjivim tvarima zatvaranjem biosinteze proteina. Kao rezultat toga, ti proteini i DUF postaju relevantni tek kad ćelije gladuju. Stoga se vjeruje da su mnogi DUF (ili proteini nepoznate funkcije, PUF) potrebni samo pod određenim uvjetima.

## Esencijalni DUF-ovi 
Goodacreet al. identificirali su DUF-ovea u 355 esencijalnih proteina (u 16 modelnih vrsta bakterija), od kojih većina predstavlja proteine s jednim domenom, čime je jasno utvrđena biološka esencija DUF-a. Ovi DUF-ovi se nazivaju "esencijalni DUF-ovi" ili eDUF-ovi.

## Reference
## Vanjski linkovi
Kategorija: Proteinski domeni
C11orf52

**C11orf52** je neokarakterizirani  protein kpji je kod  *Homo sapiens* kodiran genom **C11orf52**.

## Gen 
C11orf52 nalazi se na hromosomu 11, sekvenca at 11q23.1, od  111,908,620 bp do   112,064.278 bp. C11orf52 obuhvata 155.658 parova baza i orijentiran je na pozitivnom lancu. Ima molekulsku težinu 14 kDa i protein kodirajući gen od 7,995 bp koji sadrži četiri egzon. Kodirajuća regija sastoji se od 1.168 bp.

U njegovom susjedstvu na hromosomu 11 su geni HSPB2, CRYAB, OLAT i PPIHP1.

### Ekspresija 
C11orf52 je visoko eksprimiran u štitnjači, talamusu, hipofizi, posteljici i prostati, bubrezima, srcu i skeletnim mišićima. Međutim, u ćelijama raka dojke s alfa-utišanim receptorom estrogena MCF-7, zražen je na izuzetno niskom nivou u odnosu na kontrolna tkiva.
im  receptorom alfaa-utišanog  MCF7  proteina ćelija kanceta dojke. Poređene salnim tkivom|centre]]

### Transkript 
Postoji samo jedna varijanta C11orf52 RNK. iRNK sekvenca duga je 1.140 parova baza. Postoji uzvodni stop kodon koji se nalazi na nukleotidima 65 - 67.  Aminokiselina 23. varira između treonina i arginina.
 

1020304050
MGNRVCCGGSWSCPSTFQKKKKTGSQTRRTLKPQPQQLQQNLPKGHETTG
HTYERVLQQQGSQERSPGLMSEDSNLHYADIQVCSRPHAREVKHVHLENA
TEYATLRFPQATPRYDSKNGTLV

## Protein 
Lanac od 123 aminokiseline je domen nepoznate funkcije. Ima molekulsku težinu od 13,9 kDal i predviđena izoelektrična tačka je od 9,74.

C11orf52 također može imati ulogu u raku pluća. C11orf52 se eksprimira u plućima i povezan je s povećanom fosforilacijom u ćelijskim tumorima raka pluća. Postoje dokazi da postoje mehanizmi fosforilacije koji pojačavaju proteine i puteve koji su trebali inhibirati fosforilaciju, kako bi se spriječila ekstremna proliferacija. C11orf52 je jedan gen u kojem se fosforilacija značajno razlikuje između ćelija raka i normalnog tkiva.

## Reference
## Dopunska literatura 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Ne želim tvoju ljubav / Šabn-dabn-šabn-du-bajo

** Ne želim tvoju ljubav** je singl ploča sarajevske pop rock grupe Indexi. Singl je objavila izdavačka kuća Jugoton 1969. godine. Obje kompozicije na singlu komponirao je tada novi klavijaturist Indexa Đorđe Novković.
Tonski snimak pjesme "Ne želim tvoju ljubav" preuzet je sa takmičarskog nastupa Indexa na Zagrebfestu 1969. godine. Festivalskim zabavnim orkestrom koji je pratio Indexe dirigirao je Miljenko Prohaska. Pjesma na B strani singla nosi naziv "Šabn-dabn-šabn-du-bajo" komponirana je u prepoznatljivom pop rock stilu s kraja 1960-ih uz upotrebu distorzije Slobodana "Bode" Kovačevića na električnoj gitari.

## Muzički primjeri 
* Indexi - "Ne želim tvoju ljubav"
* Indexi - "Šabn-dabn-šabn-du-bajo"

## Članovi grupe 
*Davorin Popović - pjevanje
*Ismet Arnautalić - gitara
*Fadil Redžić - bas-gitara 
*Miroslav Šaranović - bubnjevi
*Slobodan Kovačević - gitara
*Đorđe Novković - klavijatura 

## Reference 
Kategorija:Singlovi iz 1969.
Kategorija:Singlovi grupe "Indexi"
Kategorija:Singlovi u izdanju Jugotona
C11orf54

**Otvoreni okvir čitanja 54 hromosoma 11** (C11orf54) je protein koji je kod ljudi kodiran genom **C11orf54**. Ljudski gen C11orf54. poznat je i kao PTD012 i PTOD12. C11orf54 eksprimira hidrolaznu aktivnost na p-nitrofenil acetatu i djeluje na esterske veze, iako sveukupna funkcija u naučnoj zajednici još uvijek nije u potpunosti shvaćena. Protein je visoko konzerviran, a najudaljeniji homolog  nalazi se u bakterijama.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  315 aminokiselina, a  molekulska težina   35.117 Da.
 

1020304050
MACAEFSFHVPSLEELAGVMQKGLKDNFADVQVSVVDCPDLTKEPFTFPV
KGICGKTRIAEVGGVPYLLPLVNQKKVYDLNKIAKEIKLPGAFILGAGAG
PFQTLGFNSEFMPVIQTESEHKPPVNGSYFAHVNPADGGCLLEKYSEKCH
DFQCALLANLFASEGQPGKVIEVKAKRRTGPLNFVTCMRETLEKHYGNKP
IGMGGTFIIQKGKVKSHIMPAEFSSCPLNSDEEVNKWLHFYEMKAPLVCL
PVFVSRDPGFDLRLEHTHFFSRHGEGGHYHYDTTPDIVEYLGYFLPAEFL
YRIDQPKETHSIGRD

## Gen
C11orf54 se nalazi na hromosomu 11, sekvenca 11q21. Uobičajeni alijasi gena su PTD012 i PT0D12. Sastoji od 13 egzona i obuhvata 23730 bp. C11orf54  okružen je genima TAF1D i MED17.

## Protein 
### Primarna sekvenca 
Tabela 2: **Različite karakteristike proteinske sekvence kod ljudi i drugih ortologa**

### Sekundarna struktura 
Protein C11orf54 postoji kao monomer u otopini. Protein poprima globularni oblik od 20 beta niti i četiri alfa-heliks, koji sadrže po devet antiparalelnih beta-lanaca koji tvore područje beta-lista. Regija β-heliksa C11orf54 strukturno liči na domen vezanja cikličnog adenozina 3′, 5′-monofosfata (cAMP) regulatorne podjedinice protein-kinaze A. Ion cinka vezan je za motiv HxHxxxxxxxxxH koji se nalazi u sekvenci.

### Subćelijska lokalizacija
Predviđa se da je C11orf54 lokaliziran 60,9% u citoplazmi, 21,7% u jedru, 13,0% mitohondrijama i 4,3% u Golgijevom aparatu.

### Ekspresija i posttranslacijske modifikacije
 Protein je visoko eksprimiran u bubrezima, a umjereno u nadbubrežnim žlijezdama, debelom crijevu, jetri, sjemenicima i štitnoj žlijezdi.

## Homologija 
### Paralozi 
Nema paraloga za C11orf54.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
C1QTNF4

**Protein 4 srodan C1q i tumorskom faktoru nekroze** je protein koji  je kod ljudi kodiran genom **C1QTNF4**.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 329  aminokiselina, a  molekulska težina   35.256 Da..

1020304050
MLPLLLGLLGPAACWALGPTPGPGSSELRSAFSAARTTPLEGTSEMAVTF
DKVYVNIGGDFDVATGQFRCRVPGAYFFSFTAGKAPHKSLSVMLVRNRDE
VQALAFDEQRRPGARRAASQSAMLQLDYGDTVWLRLHGAPQYALGAPGAT
FSGYLVYADADADAPARGPPAPPEPRSAFSAARTRSLVGSDAGPGPRHQP
LAFDTEFVNIGGDFDAAAGVFRCRLPGAYFFSFTLGKLPRKTLSVKLMKN
RDEVQAMIYDDGASRRREMQSQSVMLALRRGDAVWLLSHDHDGYGAYSNH
GKYITFSGFLVYPDLAPAAPPGLGASELL

## Reference 
## Dopunska literatura 
*

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
C1QTNF5

**Protein 5 srodan C1q i tumorskom faktoru nekroze**, znan i kao  **C1QTNF5**, je  protein koji je kod ljudi kodiran genom **C1QTNF5**. The C1QTNF5 gene secreted and membrane-linked to a protein which is strongly expressed in retinal pigment epithelium cells.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 243  aminokiseline, a  molekulska težina 25.298 Da.

1020304050
MRPLLVLLLLGLAAGSPPLDDNKIPSLCPGHPGLPGTPGHHGSQGLPGRD
GRDGRDGAPGAPGEKGEGGRPGLPGPRGDPGPRGEAGPAGPTGPAGECSV
PPRSAFSAKRSESRVPPPSDAPLPFDRVLVNEQGHYDAVTGKFTCQVPGV
YYFAVHATVYRASLQFDLVKNGESIASFFQFFGGWPKPASLSGGAMVRLE
PEDQVWVQVGVGDYIGIYASIKTDSTFSGFLVYSDWHSSPVFA

## Struktura 
Struktura proteina 5 povezanog sa C1q faktorom nekroze tumora i C1QTNF5 koji se naziva i CTRP5 ima tri bitna domena. Prvi  je jedan peptid koji se nalazi u N-terminalu, drugi je kolažni domenn, a treći domen je globularni komplement 1q (gC1q), u C-terminalnom domenu. Pojedinačna mutacija S163R nalazi se u gC1q domenu što je glavni razlog za kasnopojavnu bolest degeneracije mrežnjače (L-ORD).

## Klinički značaj 
Mutacija u genu C1QTNF5 uzrokuje kasni početak degeneracije mrežnjače.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
CAPRIN1

**Kaprin-1** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **CAPRIN1**. Sugerirano je da je kaprin-1 (RNG105) esencijalan za formiranje dugoročnog pamćenja.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  709 aminokiselina, a  molekulska težina   78.366 Da..

1020304050
MPSATSHSGSGSKSSGPPPPSGSSGSEAAAGAGAAAPASQHPATGTGAVQ
TEAMKQILGVIDKKLRNLEKKKGKLDDYQERMNKGERLNQDQLDAVSKYQ
EVTNNLEFAKELQRSFMALSQDIQKTIKKTARREQLMREEAEQKRLKTVL
ELQYVLDKLGDDEVRTDLKQGLNGVPILSEEELSLLDEFYKLVDPERDMS
LRLNEQYEHASIHLWDLLEGKEKPVCGTTYKVLKEIVERVFQSNYFDSTH
NHQNGLCEEEEAASAPAVEDQVPEAEPEPAEEYTEQSEVESTEYVNRQFM
AETQFTSGEKEQVDEWTVETVEVVNSLQQQPQAASPSVPEPHSLTPVAQA
DPLVRRQRVQDLMAQMQGPYNFIQDSMLDFENQTLDPAIVSAQPMNPTQN
MDMPQLVCPPVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQ
PSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQTTASSSLPAASQPQVFQAGTSKP
LHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFS
SQPHQVEQTELQQEQLQTVVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRS
NQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSG
YTQSQFSAPRDYSGYQRDGYQQNFKRGSGQSGPRGAPRGRGGPPRPNRGM
PQMNTQQVN

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
CCDC90B

**Domen upredene zavojnice sa proteinom 90B**, znan i kao  **CCDC90B**, je   protein koji je kodiran genom **CCDC90B**.
## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  254  aminokiseline, a  molekulska težina   29.506 Da..

1020304050
MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRPRGHFSPALRREFFTTTTKEGYDRRPVD
ITPLEQRKLTFDTHALVQDLETHGFDKTQAETIVSALTALSNVSLDTIYK
EMVTQAQQEITVQQLMAHLDAIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQ
VKQQLMHETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKQLMETTTEFTKKDT
QTKSIISETSNKIDAEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVFTCLAIALGFY
RFWK

## Gen 
Kod ljudi CCDC90B nalazi se na hromosomu 11. U susjedstvu su:
* PCF11,  sisarski protein 2 kompleksa cijepanja pre-iRNK
* ANKRD42, protein ponovljanja ankirina, uključen u vezivanje iona kalcija
* BC070093
* DLG2, član porodice gvanilat-kinaza (MAGUK) povezanih sa membranom

## Protein 
### Struktura 
Ovaj protein karakterizira  domen nepoznate funkcije, DUF1640. Ovaj domen je  obilježje cijelog proteina, s izuzetkom prve 23 aminokiselinska ostatka – MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP –  koji su mjesto ciljanja mitohondrija i cijepani.

Protein ima sedam predviđenih alfa-heliksa, karakteristiku proteina sa zavojnicom.

### Predviđena obilježja 
Molekulska: 26,72 kDa

Izoelektrična tačka: 7.5

Transmembranski šaperoni: Nema

Posttranslacijske modifikacije:
::Hloroplastni tranzitni peptidi:  Nema
::Signalni peptisdi:  Nema
::C-manozulacijska mjesta:  Nema
::N-glikozilacijska mjesta:  Nema
::Mitohondrijski ciljanje: Da
:::Mjesto cijepanja:  MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP

### Ćelijska lokacija 
CCDC90B je vjerojatno mitohondrijski protein. Predviđa se da sadrži najmanje tri specifična mjesta fosforilacija: mjesta fosforilacije protein-kinaze C, mjesta fosforilacije kazein-kinaze II i mjesta ovisna o fosforilaciji ovisnoj o cAMP/cGMP.

## Reference
## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika