Antimikrobni peptidi

**Antimikrobni peptidi** (**AMP-i**), također zvani **odbrambeni peptidi domaćina** (**HDP-i**) su dio urođenog imunskkog odgovora pronađenog među svim klasama života. Postoje fundamentalne razlike između prokariotskih i eukariotskih ćelija koje mogu predstavljati mete za antimikrobne peptide. Ovi peptidi su moćni antibiotici širokog spektra koji pokazuju potencijal kao novi terapeutski agensi. Dokazano je da antimikrobni peptidi ubijaju Gram-negativne i Gram-pozitivne bakterije, omotani virusi, gljive, pa čak i transformirane ili kancerogene ćelije. Za razliku od većine konvencijskih antibiotika, čini se da antimikrobni peptidi često destabiliziraju biološku membranu, mogu formirati transmembranske kanale, a također mogu imati sposobnost poboljšanja imunosti funkcionirajući kao imunomodulatori.
 
## Struktura 
Antimikrobni peptidi su jedinstvena i raznolika grupa molekula, koje su podijeljene u podgrupe na osnovu sastava i strukture aminokiselina. Antimikrobni peptidi obično imaju između 12 i 50 aminokiselina. Ovi peptidi uključuju dva ili više pozitivno nabijenih ostataka koje osiguravaju arginin, lizin ili, u kiseloj sredini, histidin, i veliki dio (uglavnom >50%) hidrofobnih ostataka. Sekundarne strukture ovih molekula prate 4 teme, uključujući (1) α-heliksnu, (2) β-lance zbog prisustva 2 ili više disulfidne veze s, (3) β-ukosnica ili omča zbog prisustva jedne disulfidne veze i/ili ciklizacije peptidnog lanca, i (4) produženja. Mnogi od ovih peptida su nestrukturirani u slobodnom rasatvoru i savijaju se u svoju konačnu konfiguraciju nakon razdvajanja u biološke membrane. Sadrži hidrofilne aminokiselinske ostatke poređane duž jedne strane i ostatke hidrofobne aminokiseline poredane duž suprotne strane spiralne molekule.
 

## Aktivnosti
Načini djelovanja kojima antimikrobni peptidi ubijaju mikrobe su različiti, i mogu se razlikovati za različite vrste bakterija. Neki antimikrobni peptidi ubijaju i bakterije i gljive, naprimjer, psorijazin ubija *E. coli* i nekoliko filamentnih gljiva. Citoplazmatska membrana je česta meta, ali peptidi takođe mogu ometati sintezu DNK i sintezu proteina, savijanje proteina i sintezu ćelijskog zida. Unutarćelijski modeli vezivanja uključuju inhibiciju sinteze ćelijskog zida, promjenu citoplazmatske membrane, aktivaciju autolizina, inhibiciju DNK, RNK i sinteze proteina i inhibiciju određenih enzima. U mnogim slučajevima tačan mehanizam ubijanja nije poznat. Jedna nova tehnika za proučavanje takvih mehanizama je dvopolarizacijska interferometrija. Za razliku od mnogih konvencionalnih antibiotika, čini se da su ovi peptidi baktericidni
 
AMP mogu imati višestruke aktivnosti uključujući anti-gram-pozitivne bakterije, anti-antigramnsgarivne bakterijske, anti-gljivične, antivirusne, antiparazitske i antikancerogene aktivnosti. Velika funkcionalna analiza AMP-a pokazuje da među svim aktivnostima AMP-a, amfipatičnost i naboj, dva glavna svojstva AMP-a, najbolje razlikuju AMP-ove sa i bez anti-gram-negativnih bakterijskih aktivnosti. Ovo implicira da AMP s antigram-negativnim bakterijskim aktivnostima može preferirati ili čak zahtijevati jaku amfipatičnost i neto pozitivan naboj.
 
## Također pogledajte 
* Aurein
* Bakteriocin
* Katelicidin
* Kopsin
* Diptericin
* Perifernomembranski proteini
* Virtualni broj kolonija
 
## Reference 
## Vanjski linkovi
* ADAM (A Database of Anti-Microbial peptides)  at ntou.edu.tw
* AntiFP Prediction of antifungal peptides
* AntiMPmod Prediction of antimicrobial potential of modified peptides
* 
* AntiTbPred Prediction of anti-tuberculosis peptides
* Antimicrobial Peptide Database  at University of Nebraska Medical Center
* Antimicrobial Peptide Scanner Deep Learning based AMP prediction server
* AntiTbPdb Anti Tubercular Peptide Database
* BioPD at Peking University Health Science Center
* CAMP:Collection of Anti-Microbial Peptides at National Institute for Research in Reproductive Health (NIRRH)
* DBAASP  - Database of Antimicrobial Activity and Structure of Peptides]
* LAMP  at Fudan University
* PeptideLocator Prediction of functional peptides, including antimicrobial peptides, in a protein sequence
* PeptideRanker Bioactive peptide, including antimicrobial peptide, prediction
* modlAMP Python package for computational work with antimicrobial peptides, including sequence handling, -design, -prediction, descriptor calculation and plotting
 


Kategorija:Imunologija
Kategorija:Imunološki sistem
Kategorija:Perifernomembranski proteini
Kategorija:Imunost na insekte