VPS25

**Pridruženi protein 25 vakuolskog sortiranja** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **VPS25**.
Patricia Hartz (2007) mapirala  je gen VPS25 na hromosomu 17q21.3,  na osnovu poravnanja VPS25 sekvence (GenBank AB014763) sa genomskom sekvencom (struktura 36.1).

Komponenta je kompleksa ESCRT-II povezanog s endosomnim kompleksima za sortiranje potrebno za transportni protein II. ESCRT (ESCRT-I, -II, -III) kompleksi usaglašavaju efikasno sortiranje ubikvitinskih transmembranskih receptora do lizosoma,  putem multivezikulskih tijela (MVBs). ESCRT-II recruits the transport machinery for protein sorting at MVB. Pored toga, pokazano je da ljudski ESCRT-II tvori kompleks sa RNK-polimeraznim II faktorom elongacije ELL kako bi izvršio transkripciju kontrolne aktivnosti. ESCRT-II se privremeno povezuje sa endosomnom membranom i na taj način inicira formiranje ESCRT-III, membranom povezanog proteinskog kompleksa, koji funkcionira neposredno nizvodno od ESCRT-II tokom sortiranja MVB tereta. ESCRT-II zauzvrat funkcionira nizvodno od ESCRT-I, proteinskog kompleksa koji se veže za ubikvitinizirani endosomski teret.

ESCRT-II je trorežnjeviti kompleks koji se sastoji od dvije kopije vps25, jedne kopije vps22 i C-terminalne regije vps36. Kristalna struktura vps25 otkrila je dvija domena upredenih zavojnica N-terminalnog domens vps25 u interakciji s vps22 i vps36.

Dužina polipeptidnog lanca je 176 aminokiselina, a molekulska težina 20 748 Da-

## Aminokiselinska sekvenca

1020304050
MAMSFEWPWQYRFPPFFTLQPNVDTRQKQLAAWCSLVLSFCRLHKQSSMT
VMEAQESPLFNNVKLQRKLPVESIQIVLEELRKKGNLEWLDKSKSSFLIM
WRRPEEWGKLIYQWVSRSGQNNSVFTLYELTNGEDTEDEEFHGLDEATLL
RALQALQQEHKAEIITVSDGRGVKFF

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
VPS25, VPS36 i SNF8  formiraju ESCRT-II (endosomni kompleks za sortiranje potreban za transport II), kompleks koji je uključen u endocitozu ubikvitiniranih membranskih proteina. VPS25, VPS36 i SNF8 također su povezani u multiproteinskom kompleksu sa faktorom elongacije  RNK-polimeraze II (ELL) (Slagsvold et al., 2005; Kamura et al., 2001).

Kamura et al. (2001) pročistili su kompleks koji sadrži Ell iz ekstrakata jetre pacova, pa sekvenciranjem peptida i analizom baze podataka identificirali su mišaji i ljudski VPS25, koji su nazvali EAP20. Izvedeni proteini miša i čovjeka sadrže 176 aminokiselina, izračunatee molekulske mase od 21 kD i identični su.

Koristeći mišje proteine eksprimirane u ćelijama sisara i insekata, otkrili su da se Eap30 (SNF8) i Eap20 mogu koimunoprecipitirati u odsustvu Eap45 (VPS36), a da se Eap20 i Eap45 mogu koimunoprecipitirati u odsustvu Eap30. Međutim, mali Eap30 koimunoprecipitiran je sa Eap45 u odsustvu Eap20. Zaključili su da EAP20 premošćuje EAP30 i EAP45 i time nukleira sklop EAP kompleksa.

Koimunoprecipitacijom proteina označenih epitopom eksprimiranom u ćelijama HEK293, Yorikawa et al. (2005) pokazali su da je CHMP6 u interakciji s CHMP4B (610897) i EAP20. *In vitro* padajući testovi koji koriste rekombinantne proteine, pokazali su direktnu fizičku interakciju posredovanu N-terminalnom osnovnom polovinom CHMP6. EAP20 označen epitopom se lokalizira difuzno u transficiranim HeLa ćelijama, ali je pokazivao tačku distribuciju kada se koeksprimira sa CHMP6.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*

Kategorija:Proteinske porodice
Kategorija:Geni na hromosomu 17
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika