ARID1A

**AT-bogati interaktivni protein 1A  sa domenom** jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **ARID1A**  sa  hromosoma 1.

## Amiokiselininska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 2.285 aminokiselina, a molekulska težina  242.045 Da.

1020304050
MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEM
KAAAGQESEGPAVGPPQPLGKELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDL
KNSNGNAGPRPALNNNLTEPPGGGGGGSSDGVGAPPHSAAAALPPPAYGF
GQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPGLAALQSGGGGGLEPYAGPQQ
NSHDHGFPNHQYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPGSGAAAAAGSK
PPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPSAAGGGTPQPTATPTLNQLLT
SPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAAS
GGAQQRSHHAPMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNP
YSQQQGPPSGPQQGHGYPGQPYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQ
IPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQQQPPYSQQPPSQTPHAQPSY
QQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQSTTQQHPQSQPP
YSQPQAQSPYQQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPP
QELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLPDLSGSIDDLP
MGTEGALSPGVSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPV
GSPASVAQSRSGPLSPAAVPGNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDR
GYMQRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQIHTGMGSYQQNSMGSYGPQG
GQYGPQGGYPRQPNYNALPNANYPSAGMAGGINPMGAGGQMHGQPGIPPY
GTLPPGRMSHASMGNRPYGPNMANMPPQVGSGMCPPPGGMNRKTQETAVA
MHVAANSIQNRPPGYPNMNQGGMMGTGPPYGQGINSMAGMINPQGPPYSM
GGTMANNSAGMAASPEMMGLGDVKLTPATKMNNKADGTPKTESKSKKSSS
STTTNEKITKLYELGGEPERKMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLD
LYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQCL
YAFECKIERGEDPPPDIFAAADSKKSQPKIQPPSPAGSGSMQGPQTPQST
SSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDAFNDGSDSTFQ
KRNSMTPNPGYQPSMNTSDMMGRMSYEPNKDPYGSMRKAPGSDPFMSSGQ
GPNGGMGDPYSRAAGPGLGNVAMGPRQHYPYGGPYDRVRTEPGIGPEGNM
STGAPQPNLMPSNPDSGMYSPSRYPPQQQQQQQQRHDSYGNQFSTQGTPS
GSPFPSQQTTMYQQQQQNYKRPMDGTYGPPAKRHEGEMYSVPYSTGQGQP
QQQQLPPAQPQPASQQQAAQPSPQQDVYNQYGNAYPATATAATERRPAGG
PQNQFPFQFGRDRVSAPPGTNAQQNMPPQMMGGPIQASAEVAQQGTMWQG
RNDMTYNYANRQSTGSAPQGPAYHGVNRTDEMLHTDQRANHEGSWPSHGT
RQPPYGPSAPVPPMTRPPPSNYQPPPSMQNHIPQVSSPAPLPRPMENRTS
PSKSPFLHSGMKMQKAGPPVPASHIAPAPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQ
PVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDNS
IMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPGQRTLLDPGRF
SKVSSPAPMEGGEEEEELLGPKLEEEEEEEVVENDEEIAFSGKDKPASEN
SEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDCSDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGD
TTEHIQTHFESKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGPPPD
GPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHR
NIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFE
MSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWW
DCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQ
DPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYST
MVRFLSDRKNPVCREMAVVLLANLAQGDSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLE
DSLAATQFQQSQASLLHMQNPPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDENHSE
FTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLFLIGQS

## Funkcija 
ARID1A je član porodice SWI/SNF, čiji članovi imaju aktivnosti helikaza i ATPaza i smatra se da regulišu transkripciju određenih gena mijenjajući hromatinsku strukturu oko tih gena. Kodirani protein je dio velikog ATP-ovisnog kompleksa za remodeliranje hromatina SWI/SNF, koji je potreban za transkripcijsku aktivaciju gena koji su normalno potisnuti hromatinom. Ima najmanje dva konzervirana domena koji bi mogli biti važne za njegovu funkciju. Prvo, ima ARID domen, koji je DNK-vezujući domen koji može specifično vezati AT-bogatu DNK sekvencu za koju se zna da je prepoznata putem SWI/SNF kompleksa na beta-globinskom lokusu. Drugo, C-terminal proteina može stimulirati glukokortikoidni receptorski zavisnu aktivaciju transkripcije. Smatra se da protein kodiran ovim genom daje specifičnost kompleksu SWI/SNF i može regrutirati kompleks do svojih ciljeva kroz interakcije protein-DNK ili protein-protein. Za ovaj gen su pronađene dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme. ćelijama raka jajnika, i raka gušterače.
U raku dojke udaljene metastaze dobijaju inaktivacijske mutacije u ARID1A koje se ne vide u primarnom tumoru, a smanjena ekspresija ARID1A daje rezistenciju na različite lijekove kao što su trastuzumab i mTOR-inhibitori. Ovi nalazi daju obrazloženje zašto tumori akumuliraju mutacije ARID1A-e.

## Istraživanje
Čini se da nedostatak ovog gena/proteina štiti pacove od nekih vrsta oštećenja jetre.

## Interakcije 
Pokazalo se da ARID1A ima interakcije sa SMARCB1 i SMARCA4.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 
* 

## Vanjski linkovi
* 
* 
* 

Kategorija:Transkripcijski faktori
Kategorija:Geni na hromosomu 1
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika