ClpX

**ATP-ovisna Clp proteaza**, podjedinica mitohondrijke ATP-vezujućeg  clpX-u sličnog proteina, je enzim koji je kod ljudi kodiran genom  **CLPX**. Ovaj protein je član porodice AAA proteina (AAA + ATPaza) i treba da formira proteinski kompleks Clp proteaze (endopeptidaza Clp).

## Struktura
## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 633  aminokiseline, a molekulska težina   69.224 Da..

1020304050
MPSCGACTCGAAAVRLITSSLASAQRGISGGRIHMSVLGRLGTFETQILQ
RAPLRSFTETPAYFASKDGISKDGSGDGNKKSASEGSSKKSGSGNSGKGG
NQLRCPKCGDLCTHVETFVSSTRFVKCEKCHHFFVVLSEADSKKSIIKEP
ESAAEAVKLAFQQKPPPPPKKIYNYLDKYVVGQSFAKKVLSVAVYNHYKR
IYNNIPANLRQQAEVEKQTSLTPRELEIRRREDEYRFTKLLQIAGISPHG
NALGASMQQQVNQQIPQEKRGGEVLDSSHDDIKLEKSNILLLGPTGSGKT
LLAQTLAKCLDVPFAICDCTTLTQAGYVGEDIESVIAKLLQDANYNVEKA
QQGIVFLDEVDKIGSVPGIHQLRDVGGEGVQQGLLKLLEGTIVNVPEKNS
RKLRGETVQVDTTNILFVASGAFNGLDRIISRRKNEKYLGFGTPSNLGKG
RRAAAAADLANRSGESNTHQDIEEKDRLLRHVEARDLIEFGMIPEFVGRL
PVVVPLHSLDEKTLVQILTEPRNAVIPQYQALFSMDKCELNVTEDALKAI
ARLALERKTGARGLRSIMEKLLLEPMFEVPNSDIVCVEVDKEVVEGKKEP
GYIRAPTKESSEEEYDSGVEEEGWPRQADAANS

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

### Struktura proteina 
Znanje o ljudskom proteinu ClpX uglavnom se temelji na istraživanjima o proteinu *E. coli*. Monomer proteina ClpX u *E. coli* sadrži N-terminalni domen i AAA + modul koji se sastoji od velikog i malog AAA + domena.

### Složeni sklop 
Tokom sastavljanja kompleksa proteaze Clp, podjedinice ClpX čine heksamernu prstenastu strukturu. Prema orijentaciji ClpX podjedinica unutar prstenaste strukture,  mogu se svrstati u dvije klase: "učitavajuća"  (L podjedinica) i "nučitavajuća" podjedinica (U podjedinica). U L podjedinici, veliki i mali AAA + domen čine pukotinu za vezivanje [[nukleotid]nog ATP ili ADP. Međutim, veliki i mali AAA + domeni u U podjedinici rotiraju se za ~80 °, što sprečava vezivanje nukleotida. Kada se okupe u heksamerni prsten, L i U podjedinice čine obrazac "L-L-U-L-L-U", koji ima maksimalan kapacitet da veže po četiri ATP ili ADP.   Elektronsko-mikroskopske  studije (EM) pokazale su da se strukture prstena ClpX slažu koaksijalno na obje strane ili na obje strane kompleksa tetradekamera ClpP, da bi stvorile komplekse proteaze ClpXP. ATP vezivanje može stabilizirati povezanost između struktura ClpX i ClpP prstena.

Kod mikobakterija, ClpXP proteaza se sastoji od komponente ATPaza (ClpX) i dva proteina ClpP (ClpP1 i ClpP2). Zanimljivo je da, za razliku od *E. coli*, u kojoj je poznato da se ATPazna komponenta veže za bilo koju stranu komponente peptidaze u obliku bačve, mikobakterijska  komponent ATPase (ClpX) pristaje na asimetričan način, vežući se samo za jedno stranu kompleksa ClpP1P2 - tj. ClpP2.

## Funkcija 
ClpX je ATP-ovisni šaperon koji može prepoznati proteinske supstrate vežući se na oznake razgradnje proteina. Te oznake mogu biti kratke nestrukturirane peptidne sekvence (npr. SsrA-oznaka u *E coli*). Kao bitna komponenta ClpP proteaznog kompleksa, ClpX regrutuje razgradive supstrate i razvija njihovu tercijarnu strukturu, za što je potrebna energija koju daje hidroliza ATP. Proteoliza|Nakon toga, ovi ClpX šaperoni prenose proteinske supstrate u [proteolitsku]] komoru koju formira ClpP tetradekamer.

## Klinički značaj 
Kod sisara, ClpXP proteaza ima ključni doprinos u kontroli kvaliteta mitohondrijskog proteina. Kompromitovana funkcija ClpXP obično dovodi do akumulacije oštećenih proteina i mitohondrijskih disfunkcija, što je vjerovatno potencijalni uzrok neurodegenerativnih bolesti i starenja.

## Reference 
Kategorija:Peptidaze
Kategorija:EC 3.4
Kategorija:Geni na hromosomu 15
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika