Integralni membranski protein

[thumb|right|350px|E=[Vanćelijski prostor; P=Plazma membrana; I=Međućelijski prostor]]
**Integralni  membranski  protein** (**IMP**)  je tip  membranskih proteina koji su  permanentno  privezani za  biološke membrane.  Ovdje su uključeni svi  transmembranski proteini,  ali svi  IMP nisu  transmembranski proteini. IMP čine značajan dio proteina uvrženih u genom organizma. Proteini koji prolaze kroz membranu su okruženi  "prstenastim" lipidaima (pogledajte prstenasta lipidna ljuska), koji se definiraju kao lipidi u direktnom kontaktu sa membranskim proteinima. Takvi proteini mogu biti odvojeni od biološke membrane samo pomoću deterdženata, nepolarnih otapala ili ponekad denaturirajućim agensima.

## Struktura
Određene su trodimenzijske strukture ~160  različitih  integranih membranskih  proteinsa have, na  atomskoj rezoluciji, pomoću X-zrakovne kristalografije  nuklearno-magnetne rezonansne spektroskopije.  One su izazovan predmet za proučavanja vezana za izdvajanje  i kristalizaciju. Osim toga, strukture mnogih  u vodi  rastvorljivih  proteinskih domena IMP dostupne su u Proteinskoj banci podataka. Njihova membranska vezanja  α-heliksa  su uklonjena,  kako bi se olakšalo izdvajanje  i kristalizacija. Traži integralni membranski proteini u PDB (na osnovu  klasifikacije ontologije gena).

IMP mogu se podijeliti u dvije grupe:
# Politopski proteini (Transmembranski proteini)
# Integralni monotopski proteini

### Integralni politopski protein
Najčešći tip IMP je transmembranski protein (TM), koji se proteže čitavom biološkom membranom. **Jednostruko-prelazeći** proteini prelaze membranu samo jednom, dok  **multi-prelazeći** proteini tkaju, izlaze i prelaze po  nekoliko puta. Jenostruko prelazeći  TM proteini mogu se svrstati kao tip I, koji su postavljeni tako da je njihov karboksilni kraj usmjeren prema citosolu, ili tip II, koji imaju amino, odnosno N-krajeve  prema citosolu. Proteini tipa III  imaju više transmembranskih domena u jednom polipeptidu, a tip IV se sastoji od nekoliko različitih polipeptida koji se okupljaju zajedno u kanalu kroz membranu. Proteini tipa V su usidreni u lipidni dvosloj  preko  kovalentno povezanih lipida. Konačno, proteini  tipa  VI imaju i transmembranski domen i lipidna sidra.

### Integralni monotopski proteini
Integralni monotopski proteini su  vezani za membranu sa  jedne strane, ali se ne protežu duž kompletnog lipidnog dvosloja.

### Određivanje strukture proteina
Inicijativa proteinske strukture (PSI), finansirana iz  Američkog  nacionalni instituta za opće medicinske nauke (NIGMS), dio  je Nacionalnog  nistituta zdravlja (NIH), ima među svojim ciljevima  da se utvrdi tridimenzijska struktura proteina i razviju  tehnike za upotrebu u strukturnoj biologiji, uključujući i  membranske proteine. Homologno modeliranje može se koristiti za izgradnju modela atomske rezolucije kao "meta" integralnih proteina iz sekvence aminokiselina i eksperimentalnih trodimenzijskih  struktura,  povezanih homolognih proteina. Ovaj postupak se u velikoj mjeri koristi za ligande,  receptore spregnute sa G-proteinom (receptore) i njihove komplekse.

## Funkcija
Integralni membranski proteini (IMP) uključuju transportere, linkere, ionske kanale, receptore, enzima, strukturne domene membranskih vezanja, proteine koji su  uključeni u akumulacije i prenos energije i proteine koji su odgovorni za ćelijsku adheziju. Klasifikacija transportera mogu se naći u  Baza podataka transporterske klasifikacije.

Kao primjer odnosa između IMP (u ovom slučaju bakterijskih fotoprihvatajućih  pigmenata, bakteriorodopsina) i membrane koja  formira fosfolipidni dvosloj.  U ovom slučaju integralni membranski protein obuhvata fosfolipidni dvosloj sedam puta. Dio proteina koji je ugrađen u hidrofobnim regijama dvosloja su alfa spiralni i sastoje se od pretežno hidrofobnih aminokiselina. Terminalni amino protein je u citosolu, dok je regija C-kraja  izvan ćelije. Membrana koja sadrži ovaj protein ima sposobnost  da funkcionira  u fotosintezi.

## Perimjeri
Primjeri integralnih membranskih proteina su:

*Insulinski receptor,
*Neki tipovi proteina  ćelijske adhezije ili molekula ćelijske adhezije (CAM) kao što su integrini, kaderini, NCAM ili  selektini,
*Neki tipovi proteinskih receptora
*Glikoforin,
*Rodopsin,
*Band 3
*CD36
*GPR30
*Glukozna permeaza,
*Ionski kanali i izlazi
*G protein upareni receptori (tj. Beta-adrenerginski receptor)
*Seipin

## Također pogledajte
*Membranski protein
*Transmembranski protein
*Prstenbasta lipidna ljuska
*Orientations of Proteins in Membranes database
*ITM2A

## Reference
## Vanjski linkovi
Kategorija:Membranska biologija
Kategorija:Integralni membranski proteini
Kategorija:Proteinske strukture
Kategorija:Proteini