T (gen)

**Brahiurija** (stgrč.  βραχύς – brahis = kratko +  ουρά – ouria = rep) je stanje koje izaziva protein  koji je kod ljudi kodiran genom **TBXT** (T-kutijski transkripcijski faktor  T). Brahiurija funkcionira kao faktor transkripcije unutar porodice T-kutijskih gena.  Brahiurijskli homolozi pronađeni su u svih pregledanih bilateralnih  životinja, kao i u slatkovodnih knidarija roda hidra. a time i uspostavljanje prednje-zadnje osi; ova funkcija je očita u hordata i mehkušaca.
Njegova predačka uloga, ili barem uloga koju ima kod knidarija, je u definiranju blastopora. Tehnike zasnovane na kulturi tkiva pokazale su da jedna od njihovih uloga može biti kontrola brzine ćelija dok napuštaju primitivnu sekvencu. Utiče na transkripciju gena potrebnih za formiranje mezoderma i početak ćelijske diferencijacije.

Pokazalo se da *brahiurija* pomaže u uspostavljanju plana vratnih pršljenova tokom fetusnog razvoja. Broj vratnih pršljenova je visoko konzervirtan među svim sisarima; međutim, spontana mutacija  displazija pršljenova i kičme (VSD) u ovom genu povezana je s razvojem šest ili manje vratnih pršljenova, umjesto uobičajenih sedam.

### Ekspresija
Kod miševa se "T" eksprimira u unutrašnjoj ćelijskoj masi embriona u stadiju blastocita (ali ne u većini mišjih embrionskih matičnih ćelija) nakon čega slijedi primitivna sekvenca (vidi sliku). U kasnijem razvoju ekspresija je lokaliziran na čvor i nohord.

U *T* homologu *Xbra* *Xenopus laevis (*Xenopus, nedavno preimenovanom u *t*) ekspimiran je u mezodermnoj marginalnoj zoni preembrionskih gastrula, nakon čega slijedi lokalizacija u blastoporu i notohordu, u sresnjoj fazi gastrulacije.

### Ortolozi 
Ortolog *Danio rerio* poznat je kao *ntl* (bez repa)

## Klinički značaj 
### Rak 
Braihiurija je uključena u započinjanje i/ili napredovanje niza tipova tumora, uključujući hordom, tumor zametnih ćelija, hemangioblastom, GIST, rak pluća, karcinom nemalih ćelija pluća, rak dojke, karcinom debelog crijeva, hepatoćelijski karcinom, rak prostate i oralno skvamozni karcinom.

U ekspresiji raka dojke, vezana je za recidive metastaze i smanjeno preživljavanje. Također je vezana za rezistenciju na tamoksifen i citotoksičnu hemoterapiju.

Kod raka pluća ekspresija brahiurije povezana je s recidivom i smanjenim preživljavanjem. Također je vezana sa pojavom rezistencije na citotokskičnu hemoterapiju, radijaciju, i inhibitore  EGFR-kinaza.
* Duplikacija zametne linije gena za brahiuriju odgovorna je za porodični hordom. 
* Jednonukleotidni polimorfizam zametne linije u brahiuriji prisutan je u 97% pacijenata sa hordomom.
* Somatske amplifikacije brahiurije vide se u podskupu sporadičnih akorda bilo preko aneuploidije ili fokusne duplikacije.
* Brahiurija  je selektivno najvažniji gen u hordomima,  u odnosu na druge tipove raka.
* Brahiurija je povezana s velikim superpojačivačem u tumorima hordoma i ćelijskim linijama, te je najizraženiji transkripcijski faktor povezan sa superpojačivačem. i pužem.

Nadekspresija  *brahiurije* povezana je s hepatoćelijskim karcinomom (HCC, koji se naziva i maligni hepatom), uobičajenim tipom raka jetre. Dok *brahiurija *podstiče EMT, također može inducirati metastaze HCC-ćelija. Njena ekspresija  je prognostički biomarker za HCC, a gen bi u budućnosti mogao biti meta za liječenje raka.
* Duplikacija zametne linije gena za brahiuriju odgovorna je za porodični hordom. 
* Jednonukleotidni polimorfizam zametne linije u brahiuriji prisutan je u 97% pacijenata sa hordomom.
* Somatske amplifikacije brahiurije vide se u podskupu sporadičnih akorda bilo preko aneuploidije ili fokusne duplikacije.
* Brahiurija  je selektivno najvažniji gen u hordomima,  u odnosu na druge tipove raka.
* Brahiurija je povezana s velikim superpojačivaem u tumorima hordoma i ćelijskim linijama, te je najizraženiji transkripcijski faktor povezan sa superpojačivačem.

* Brahiurija* je važan faktor u podsticanju epitelno-mezenhimske tranzicije (EMT). Ćelije koje pretjerano eksprimiraju *brahiuriuriju* imaju smanjenu ekspresiju adhezijske molekule E-kadherina, što im omogućava da prođu EMT. Ovaj proces je barem djelimično posredovan faktorima transkripcije AKT  i pužem l.

Nadekspresija  *brahiurije* povezana je s hepatoćelijskim karcinomom (HCC, koji se naziva i maligni hepatom), uobičajenim tipom raka jetre. Dok *brahiurija *podstiče EMT, također može inducirati metastaze HCC-ćelija. Njena ekspresija  je prognostički biomarker za HCC, a gen bi u budućnosti mogao biti meta za liječenje raka.

### Ostale bolesti 
Prekomjerna ekspresija *brahiurije * može imati ulogu u EMT-u povezanom s benignom bolešću, poput bubrežne fibroze.

## Uloga kao terapijskog cilja
Budući da se brahiurija eksprimira u tumorima, ali ne i u normalnim tkivima odraslih, predložena je kao potencijalna meta lijeka koja se može primijeniti na sve tipove tumora. Konkretno, brhiurija-specifični peptidi su prisutni na receptorima HLA ćelija u kojima je eksprimiran, što predstavlja tumorski specifičan antigen. Razvijene su različite terapijske vaccine koje imaju za cilj podstaknuti imunski odgovor na ćelije koje eksprimiraju brahiuriju.

## Također pogledajte 
*Homeoboksni protein NANOG
*POU5F1
*SOX2
*MIXL1
*GSC
*Transkripcijski faktor
*Regulatorna mreža gena
*Bioinformatika
*Hordom

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 

## Vanjski linkovi 
* Protein Atlas entry for Brachyury 
* Mouse Genome Informatics entry for Brachyury
* European Bioinformatics Institute InterPro entry for Brachyury
* Information Hyperlinked Over Proteins entry for Brachyury
* Xenbase Gene entry for Brachyury
* 

Kategorija:Transkripcijski faktori
Kategorija:Embriologija
Kategorija:Geni na hromosomu 6
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika