C14orf93

**C14orf93** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **C14orf93**. To je okruglasti protein sa konzercviranim C-terminalom koji je lokaliziran u ćelijskom jedru. Iako je relativno visoko eksprimiran u svim tkivima osim nervnog, posebno je izražen u T-ćelijama i ostalim imunskim tkivima.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  538  aminokiselina, a molekulska težina   58.697 Da.

1020304050
MSFSATILFSPPSGSEARCCCCACKSETNGGNTGSQGGNPPPSTPITVTG
HGLAVQSSEQLLHVIYQRVDKAVGLAEAALGLARANNELLKRLQEEVGDL
RQGKVSIPDEDGESRAHSSPPEEPGPLKESPGEAFKALSAVEEECDSVGS
GVQVVIEELRQLGAASVGPGPLGFPATQRDMRLPGCTLAASEAAPLLNPL
VDDYVASEGAVQRVLVPAYAKQLSPATQLAIQRATPETGPENGTKLPPPR
PEDMLNAAAALDSALEESGPGSTGELRHSLGLTVSPCRTRGSGQKNSRRK
RDLVLSKLVHNVHNHITNDKRFNGSESIKSSWNISVVKFLLEKLKQELVT
SPHNYTDKELKGACVAYFLTKRREYRNSLNPFKGLKEKEEKKLRSRRYRL
FANRSSIMRHFGPEDQRLWNDVTEELMSDEEDSLNEPGVWVARPPRFRAQ
RLTELCYHLDANSKHGTKANRVYGPPSDRLPSAEAQLLPPELYNPNFQEE
EDEGGDENAPGSPSFDQPHKTCCPDLNSFIEIKVEKDE

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Gen
c14orf93  lokaliziran je  na kratkom kraku hromosoma 14 (sekvenca 14q11.2). Pristupni broj c14orf93 je 021944, a alijasi su mu FLJ12154 i LOC60686. Gen ima 2430 bp i sedam egzona.

### Svojstva 
Protein c14orf93 ima devet izoformi. Najčešći i najveći izoform
ima 538 aminokiselina, molekuksku težinu od  58,7 kdal, a  teorijsku izoelektričnu tačku od 5,7. Ovaj protein je okruglasti (globulast), sa konzerviranimim C-terminalom, klasterom mješovitog naboja od 371 do 399 i visoko napunjenim nenabijenim segmentom od 28 do 58.  Postoje dva eksperimentalno potvrđena mjesta fosforilacije serina na ostacima 285 i 428, koja mogu služiti kao mjesta aktivacije ili deaktiviranja. N-acetilacija se temelji na drugom ostatku; ova modifikacija utiče na stabilnost i lokalizaciju. Postoji šest motiva s velikom vjerovatnoćom sumoilacija. SUMO (engleski skraćenica od **s**mall **u**biquitin-like **mo**difiers) su mali proteini poput ubikvitina, koji započinju kaskadu uključenu u stabilnost proteina, jedarno-citosolni transport i regulaciju transkripcije.

### Subćelijska lokalizacija 
Podaci PSORTII-a predviđaju da je c14orf93 lokaliziran u  jedru. Postoji signal jedarne lokalizacije na ostacima 298-301 i dva signala za peroksizomsko ciljanje na ostacima 451-459 i 479-487.

## Ekspresija
Eksprimirani c14orf93 je 2,7 puta veći od prosječnog gena u svim tkivima. Primjetno je veća ekspresija  u T-ćelijaama, a postoji nešto viša u drugim dijelovima imunskog sistema, kao što su koštana srž, slezena i limfni čvorovi.

## Interaktivni proteini 
Pokazalo se da C14orf93 fizički komunicira sa PTP1, MRFAP1, Set, APP i MOV10 ; ove interakcije su navedene u donjoj tabeli. Stubac za organizam pokazuje odakle je protein dospio u eksperimentu koji pokazuje fizičke interakcije.

Od ovih pet interakcija, PTP1, MRFAP1 i SET su prošli najviše provjere. PTP1, tirozin-protein fosfataza 1, protein je koji se nalazi u kvascu, ali postoji ortolog kod ljudi. PTP1 može biti odgovoran za aktiviranje/deaktiviranje c14orf93 zbog njegove fosfatazne aktivnosti i perijedare lokacije. MRFAP1, protein 1 povezan s porodicom MORF4, ljudski je protein koji stupa u interakciju s članovima porodice MORF4/ MRG i supresorom tumora Rb. Ovaj protein može biti uključen u starenje, rast ćelija i dugovjećčnost. Postoji ljudski ortolog za mišji pretpostavljeni protein (inhibitor fosfataze 2A ili I2PP2A), koji je lokaliziran u jedru. Skup se veže za DNK, kako bi negativno regulirao apoptozne procese i transkripciju neurona, funkcionirajući kao onkogen.

## Homologija 
Postoje ortolozi za c14orf93 u svim kičmenjacima od *Homo sapiens* do košljoriba. Nema paraloga za c14orf93. C14orf93 je dio porodice DUF4616; ova porodica je označena domenom nepoznate funkcije u domenu C-terminala. Dužini proteina DUF4616 su između 166 i 538 aminokiselina i dio su superporodice sI21231.  Posljednjih 200 ostataka C-kraja je vrlo očuvano sa sedamnaest uzoraka ostataka od 439-456 koji je posebno konzerciran u svim ortolozima. Ova regija vjerovatno ima glavnu ulogu u funkciji c14orf93.

## Reference 
Kategorija:Geni na hromosomu 14
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika
Kategorija:Neokarakterizirani proteini