ARMH3

**ARMH3** ili **armadiloliki protein sa domenom3**, znan i kao **UPF0668** i **c10orf76**, je protein koji je kod ljudi kodiran genom **ARMH3**. Njegova funkcija trenutno nije poznata, ali eksperimentalni dokazi sugeriraju da bi mogao biti uključen u regulaciju transkripcije. Protein sadrži konzervirani prolinom bogati motiv, sugerirajući da može sudjelovati u interakcijama protein-protein,  putem SH3-vezujućeg domena, Lokus je alternativno prerađen i predviđeno je da će dati pet proteinskih varijanti, od kojih tri sadrže proteinski domen nepoznate funkcije, DUF1741.

1020304050
MAQVEKRGGLLRKSSASKKPLKEKVVLMYDEIFMTEDPSKCSPRFWEELF
LMKVNLEYLEGKLESLDGEELMKIKDNINCLFQHCIQALGEEHPIRVVNA
LQTLCALIRGVHQKNKSTSGFDIINMLMGFDKAELCMKNLMESLDSLLCA
EGSESLKSLCLKLLLCLVTVTDNISQNTILEYVMINSIFEAILQILSHPP
SRREHGYDAVVLLALLVNYRKYESVNPYIVKLSIVDDEATLNGMGLVIAQ
ALSEYNRQYKDKEEEHQSGFFSALTNMVGSMFIADAHEKISVQTNEAILL
ALYEAVHLNRNFITVLAQSHPEMGLVTTPVSPAPTTPVTPLGTTPPSSDV
ISSVELPLDADVQTSNLLITFLKYSSIVMQDTKDEHRLHSGKLCLIILTC
IAEDQYANAFLHDDNMNFRVNLHRMPMRHRKKAADKNLPCRPLVCAVLDL
MVEFIVTHMMKEFPMDLYIRCIQVVHKLLCYQKKCRVRLHYTWRELWSAL
INLLKFLMSNETVLLAKHNIFTLALMIVNLFNMFITYGDTFLPTPSSYDE
LYYEIIRMHQSFDNLYSMVLRLSTNAGQWKEAASKVTHALVNIRAIINHF
NPKIESYAAVNHISQLSEEQVLEVVRANYDTLTLKLQDGLDQYERYSEQH
KEAAFFKELVRSISTNVRRNLAFHTLSQEVLLKEFSTIS

:**C**: Cistein
:**D**: Asparaginska kiselina
:**E**: Glutaminska kiselina
:**F**: Fenilalanin
:**G**: Glicin
:**H**: Histidin
:**I**: Izoleucin
:**K**: Lizin
:**L**: Leucin
:**M**: Metionin
:**N**: Asparagin
:**P**: Prolin
:**Q**: Glutamin
:**R**: Arginin
:**S**: Serin
:**T**: Treonin
:**V**: Valin
:**W**: Triptofan
:**Y**: Tirozin

## Funkcija 
Utvrđeno je da sadrži potencijalni SH3 vezujući domen, za koje je poznato da učestvuju u interakciji vezivanja proteina-protein; međutim, s c10orf76 eksperimentalno nisu potvrđene nikakve interakcije proteina. Studija ekspresije gena iz 2007. pokazala je da ekspresija c10orf76 varira obrnuto s ekspresijom nekoliko drugih gena, uključujući NFYB, CCR5 i NSBP1, što ukazuje na to da protein može funkcionirati kao regulator transkripcije.

## Gen 
### Karakteristike 
Kod ljudi, gen ARMH3, poznat i pod pseudonimom FLJ13114, proteže se na 210.577 baznih parova  na zadnjoj strani dugog kraka hromosoma 10. Sa 26 alternativno prerađenih egzona kodiraju pet potencijalnih Vrijanti transkripata, od kojih je najveća duga 4.101 parova baza. i KCNIP2 je protein s interakcijom kalijevog kanala s naponom. Isti obrazac primjećen je i u  ortolognom lokusu kod miševa, kao i većine ostalih kičmenjaka.

### Ekspresija 
Profil gena NCBI (GenBank) za c10orf76 označava početak prvog transkribiranog egzona, kao početkom gena. Predviđa se da će ovaj promotor imati dužinu od 658 parova baza i stoga uključuje prvi transkribovani egzon na svom 3' kraju. Može se izlučiti neklasičnim putem. NCBI identifikuje proteinski domen nepoznate funkcije između aminokiselina Asp 435 i Leu 671, poznat kao DUF1741 (domen nepoznate funkcije 1741). Ovo bi moglo poslužiti za regulaciju translaciju proteina. Također, Alu segment u tri primarne neprevedene regije zrele iRNK mogao bi poslužiti kao potencijalni translacijski regulatorni mehanizam.

Utvrđeno je da se protein različito eksprimira u nekim medicinskim stanjima i kao odgovor na određene ćelijske signale. Naprimjer, smanjena ekspresija c10orf76 primijećena je kod pacijenata s hroničnom limfocitnom leukemijom B-ćelija. Smanjena ekspresija se također primjećuje u ćelijama liječenim vaskularnim endotelnim faktorom rasta.

Smatra se da je protein lokaliziran u citoplazmi, iako je to neizvesno. Predviđeno je i da je to 3-prolazni transmembranski protein.

### Struktura 
[thumb|200px| Strukturno predviđanje proteina c10orf76, prema softvwru PHYRE2 za [savijanje proteina. Ova struktura je slična ljudskom simplekinu, proteinu za koji se smatra da regrutira regulatorne faktore u mehanizmu za poliadenilaciju. Potencijalni domen koji se veže za SH3 nalazi se na predviđenom području poremećaja, dodatno podržavajući funkciju vezanja proteina-protein za c10orf76. Predviđeno je da je spiralno područje između aminokiselina 610-655 motiv upredene zavojnice.

Serversko PHYRE2 predviđanje strukture proteina sugeriralo je da prvih 200 ostataka c10orf76 može imati jake strukturne sličnosti sa simplekinom, jedarno lokalizirani protein za koji se smatra da je komponenta skele kompleksa poliadenilacije.

### Predviđene interakcije proteina 
Utvrđeno je da je ekspresija c10orf76 iRNK obrnuto povezana s ekspresijom raznih drugih iRNK, uključujući NFYB, CCR5 i NSBP1. Iako ova studija i predviđeni domeni vezanja SH3 sugeriraju da c10orf76 sudjeluje u interakcijama vezanja proteina-protein, nijedna nije eksperimentalno potvrđena. Kratko pretraživanje pomoću IntAct -a, MINT-a, i STRING-a također je dalo nultu predviđenu interakciju protein-protein.

### Predviđene posttranslacijske modifikacije 
Postoji potencijal da se protein izlučuje neklasičnim putem, Također, postoji devet ostataka za koje NetOGlyc pouzdano (> 90%) predviđa da će  proći O-vezanu glikozilaciju, a svi oni ostaju unutar regije niske složenosti između Leu 325 i Ser 359

Donja tabela sažima najbolje predviđene posttranslacijske modifikacije za c10orf76.

### Regije od potencijalnog istraživačkog interesa 
Protein kodiran najvećom iRNK varijantom c10orf76 kodira prolinom bogati motiv koji sadrži dva domena PxxP, gdje "P" predstavlja ostatak prolina, a "x" bilo koju drugu aminokiselinu 
 
 325  L V **T T** **P** V **S** **P** A **P** **T T** **P** V **T** P L G **T T** P P **S** S    359 

[thumb| Poravnavanje sekvenci pokazuje sličnosti između dijela [Tri primarne neprevedene regije|3`-UTR c10orf76 i ALU elementa iz porodice Alu-Sc. Poravnati su pomoću NCBI-jevog BLAST alata. alatima.

## Modelni organizmi
U proučavanju PNPO funkcije, korišteni su modelni organizmi. Uvjetna linija 9130011E15Rik nokaut-miševa  generirana je kao dio programa Međunarosnog konzorcija za miševe – visokopropusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.

Muške i ženske životinje prolazile su standardizirani fenotipski skrining, kako bi se utvrdili efekti delecije. Od 24 izvedena  testa ina mutantnim miševima, uočene su dvije značajne abnormalnosti. Tokom gestacije,  nije utvrđen homozigotni mutantni embrion, pa tako nijedan nije preživio do odvikavanja. Preostali testovi su izvedeni na mutiranim heterozigotnim odraslim miševima; opažene dvije dodatne značajne abnormalnosti kod ovih životinja.

## Reference 
## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 10
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika