C11orf16

**C11orf16** otvorenog okvira čitanja 16 hromosoma 11 je  protein koji je kod ljudi kodiran genom **C11orf16**.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  467 aminokiselina, sa sedam egzona, a  molekulska težina   51.609 Da..

1020304050
MESSTGPRMPLLKYCSVATSLKAPGWDGAAPPWDLSFTYPFALQAPWLTG
HKPLARHASSCPCLHVADPAWQGPGWLGRAGDAANTWVLARREADGFYYR
AQIKATPELERQGVLLVEFEAPLVAGPKLPAQQQRVVLEEDVIPLSPSVG
YSLRPGDKVLALWEPGQQQYGPGTVLLGLEMRDPQRASKEKEITVHFWNG
KAAKVPLGGVQSVSLTIWKKAVERLHKSFTREHPRPLHWAPCCSLLGPIT
GRITNELPPDAPFLCPLCHHHACCQLLCQGCLCGCPPCGTTWWPLTRTSE
VMARELPELEPTAQLLPLEGPKEEKVAMHAPLAVSSSSSSSCEQDGVEND
LEMGPPQRLMVNSAVNTDPIFLEMPLRQSGLCQPEWRYWKRNGPEPCLGK
PGTRYSNICKEEKDHKQQRAQTAVVGTTKELVSKATHMKPPRTPPGEAEH
RKRSQSLAICQWNKNSR

## Gen
Gen C11orf16 nalazi se na hromosomu 11 (p15.4), počevši od 8,920.076 bp i završavajući na 8,933.006 bb.

U susjedstvu su mu  geni ASCL3 i AKIP1 na hromosomu 11.

## Ekpresija
### Ljudski
Gen nema visoku ekspresiju u testiranim tkivima. Rang percentila u uzorku veći je u gušterači, jajnicima i slijepom crijevu. 
 GEO]]

### Mišji mozak
Iako gen nema značajnu visoku ekspresiju u  mišjem  mozgu, najizraženiji je u srednjem mozgu, izokorteksu, mirisnim područjima i meduli.

### Transkripcijski faktori 
Neki transkripcijski faktori koji imaju veću sličnost matriksa su protein cinkovog prsta nalik Kruppelu, protein prsta cinka 263, ZKSCAN12 (protein cinkovog prsta s KRAB i SCAN domenima 12), horionski specifični transkripcijski faktor GCMa i protein koji reagira na Ras element 1.

## iRNK
### Izoforma
Predviđena varijanta transkripta C11orf16 X1 duga je 2386 bp i ima pristupni broj NCBI od XM_017018013.1.

## Homologija
### Paralozi 
Nisu pronađeni paralozi za gen C11orf16 putem NCBI BLAST-a.

### Ortolozi 
### Konzervacija
Gen C11orf16 konzerviran je u mnogim životinjskim vrstama, uključujući sisare, ptice i gmizavce.

## Protein
### Molekulska težina 
Predviđena molekularna težina proteina kodiranog C11orf16 je 51 kilodaltona.

### Domeni i motivi 
Pronađeno je nekoliko proteinskih domena i motiva, uključujući protein sličan CHD5, tirozin-kinazno mjesto fosforilacije, mjesto fosforilacije protein-kinaze C, mjesto N-miristoilacije, mjesto fosforilacije kazein-kinaze II i mjesto fosforilacije protein-kinaze zavisno od cGMP. Lokacija motiva prikazana je na slici.

### Sekundarna struktura 
Predviđa se da će protein biti sačinjen od 21,2% alfa-heliksa, 15,2% produžene niti i 63% upredene zavojnice. 

### Posttranslacijske modifikacije 
Nema transmembranskih spirala, potencijalnih GPI-modifikacijskih mjesta ili TM-proteina. Nađeno je po sedam predviđenih mjesta sumoilacije i multiplih mjesta fosforilacije, od kojih je većina neodređena, i devet mjesta glikozilacije.

### Subćelijski lokalizacijski prediktor 
Predviđa se da će protein biti lokaliziran u jedru, s vjerovatnoćom od 47,8%; mitohondrijama s vjerovatnoćom 26,1%.

### Proteinska interakcija
Utvrđeno je da su proteini C1orf105 (otvoreni okvir čitanja 105 hromosoma 1), PWWP2A i SMYD1 (SET i MYND domen koja sadrži 1) u interakciji sa C11orf16.

## Klinički značaj 
;Pridruženje bolesti
Također se predviđa da protein kodiran genom C11orf16 ima 19,61% identičnosti sekvence sa supresor tumorski, p53-veznim proteinom, što sugerira da bi ovaj gen mogao biti uključen u proces suzbijanja tumora.

## Reference
## Vanjski linkovi
* 
* C11orf16 information on GeneCards

## Dopunska literatura
*
*
*
*

__FORCETOC__

Kategorija:Geni na hromosomu 11
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika