PRR12

**Prolinom bogati protein  12** (PRR12) je protein nepoznate funkcije, koji je kod ljudi kodiran genom **PRR12**.

## Gen 
Gen  *PRR12*  vrste *Homo sapiens* dug je 34.785 baznih parova, sa 14 egzona  na lokusu 19q13.33. Poznati dvojnici za PRR12 uključuju "prolin bogati 12" i KIAA1205.  Unutar svog genskog susjedstva, uz * PRR12 * nalaze se *PRRG2* i *SCAF1* na smislenom i *RRAS * i * NOSIP * na antisens lancu.  Gla, bogata prolinom, PRRG2, ima Gla domen koji veže hijaluronan i povezan je s proteinima koji su prisutni u *vanćelijskom matriksu* uključeni u adheziju ćelija i migraciju ćelija..  Protein R-Ras povezan s RRAS, pripada porodici Ras i uključen je u organizaciju aktinskih filamenata unutar citoskeleta. SR-povezan je sa CTD-om Protein R-Ras povezan s rasom, RRAS, pripada porodici Ras i uključen je u organizaciju aktinskih filamenata unutar citoskeleta.

**Promotor**

Regija promotora PRR12 predviđena je pomoću ElDorada na Genomatixu. Počinje na poziciji 50094408 i završava na 50095013 hromosoma 19. Ovaj promotorski set konzerviran je kod rezus majmuna, miša, pacova, konja, goveda, svinja, pasa i zebrica. Nije pronađen prepoznatljiv TATA okvir, B element prepoznavanja (BRE) ili CAAT okvir uzvodno od predviđene početne regije transkripcije. Budući da nije pronađen jasan TATA okvir, moguće je da PRR12 regulira promotor bez TATA, koji sadrži nizvodni element promotora (DPE). Međutim, predviđeni DPE je samo 15 bp nizvodno od početnog područja transkripcije, umjesto tipskih baznih parova od +25 do +32. Potrebno je više istraživanja kako bi se proširilo poznavanje  5 ’UTR transkripta PRR12 i potvrdilo gdje se nalazi ispravna promotorska regija.
 

## Transkript 
**Sekvenca iRNK**

Transkript  iRNK PRR12-a dugačak je 6960 parova baza i sadrži nekoliko ponavljanja kratkih sekvenci. PRR12 *Homo sapiens* ima tri izoforme sa izoformom 3 koji sadrži otprilike hiljadu više aminokiselinskih ostataka od ostalih izoformi.  U evidenciji NCBI nije dat UTR za transkript PRR12 vrste *Homo sapiens*. Međutim, u ortologu *Papio anubis* određeno je sedam baznih  parova 5 ’UTR. UTR 3 ’dug je 852 bazna para.
i djelimično ili u potpunosti nisu prisutni u izooblicama 1 i 2.]]

## Ekspresija 
Gen je umjereno eksprimiran na ravnomjernom nivou u širokom spektru tipova  tkiva.  Brojne baze podataka o bioinformatici također su predviđale da je PRR12 topivi protein bez transmembranskih domena.

Jianping Chen navodi da je PRR12  "izuzetno ranjiv protein". Ti proteini imaju regije bogate aminokiselinama koje su „loši zaštitnici“ vodikovih veza duž okosnice proteina, inhibirajući sposobnost tih proteina da se pravilno savijaju i dopuštajući mogućnost njihove agregacije. Ostaci poput G, A, S, Y i P navedeni su kao loši zaštitnici, a PRR12 je bogat i prolinom i glicinom.
PRR12 sadrži mogući signal za jedarni unos,  počevši od P1794. Tipska sekvenca jedarne lokalizacije imala bi sljedeće ostatke: P-P-K-K-K-R-K-V.  PRR12 sadrži DUF4211 domen, počevši od V1836 koji pokazuje homologiju s domenom pfam13926. Ovaj  domenn dobro je konzerviran u ortolozima PRR12. PRR12 također sadrži dobro konzervirane AT-kuke, regije vezanja na P1168 i G1202. Ova područja omogućavaju proteinima da vežu DNK, dodatno podržavajući lokalizaciju PRR12 u jedru. 

## Konzervacija 
### Paralozi
Glutamin i serinom bogati proteini 1 (QSER1) jedini su usko povezani paralozi sa PRR12 (pristup NCBI: EAW68214). QSER1 nema poznatu funkciju i, poput PRR12, sadrži DUF4211 i signal jedarne lokalizacije. QSER1 ne sadrži područja vezanja AT ili antigen Epstein-Barrovog virusa koji se nalazi u PRR12.

### Ortolozi 
Najudaljeniji srodnik pronađen preko BLAST-a,  sa značajnom sličnošću sa PRR12 je riba "Danio rerio". Ortolozi su pronađeni u riba, vodozemaca, gmizavaca i drugih sisara. Iako kod ptica nije pronađen ortolog PRR12, imale su ortologe QSER1, što je blisko paralognom ljudskom PRR12.  Ovaj antigen Epstein-Barrovog virusa povezan je s autoimunskim sistemskim bolesti vezivnog tkiva (CTD), uključujući sistemski eritematozni lupus (SLE), primarni Sjögrenov sindrom (SS), reumatoidni artritis (RA), sistemsku sklerozu (SSc) i sekundarni SS. PRR12 nije samo bogat prolinom, već  i glicinom, što upućuje na mogućnost postojanja veze sa kolagenom, koji je također bogat prolinom i glicinom. Odnos između njih mogao bi biti objašnjenje za pojavu autoimunskih CTD-a, nakon infekcija EBV-om. Međutim, ostaci glicina i prolina u kolagenu uglavnom slijede motiv G-P-X ili G-X-HidroksiP, što se ne događa značajno u PRR12.

## Reference 
Kategorija:Geni
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Geni na hromosomu 19