PTPLAD1

**Tirozinski fosfatazoliki protein PTPLAD1** je enzim koji je kod ljudi kodiran genom **PTPLAD1**.
Sabbah et al. (2006) utvrdili su da promotorska regija PTPLAD1 sadrži proksimalne CG kutije i nekoliko mjesta vezivanja za faktore transkripcije.
Patficia Hartz (2014) mapiraka je gen PTPLAD1 na [hromosomu 15, sekvenca 15q22.31. na osnovu poravnanja PTPLAD1 sekvence ([GenBank AF161470) sa genomskom sekvencom (GRCh38).
Dugolančane masne kiseline (LCFA) mogu se pretvoriti u vrlo dugolančane masne kiseline (VLCFA) pomoću enzima vezanih za endoplazmatski retikulum (ER) u četverostepenom ciklusu kondenzacije, redukcije, dehidracije i dalje redukcije, uz dodavanje 2 ugljika po ciklusu. PTPLAD1 pripada porodici enzima koji kataliziraju korak dehidracije sinteze VLCFA (sažetak Ikeda et al., 2008).

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  362  aminokiseline, a molekulska težina   43.160 Da.

1020304050
MENQVLTPHVYWAQRHRELYLRVELSDVQNPAISITENVLHFKAQGHGAK
GDNVYEFHLEFLDLVKPEPVYKLTQRQVNITVQKKVSQWWERLTKQEKRP
LFLAPDFDRWLDESDAEMELRAKEEERLNKLRLESEGSPETLTNLRKGYL
FMYNLVQFLGFSWIFVNLTVRFCILGKESFYDTFHTVADMMYFCQMLAVV
ETINAAIGVTTSPVLPSLIQLLGRNFILFIIFGTMEEMQNKAVVFFVFYL
WSAIEIFRYSFYMLTCIDMDWKVLTWLRYTLWIPLYPLGCLAEAVSVIQS
IPIFNETGRFSFTLPYPVKIKVRFSFFLQIYLIMIFLGLYINFRHLYKQR
RRRYGQKKKKIH

Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
Korištenje mišjeg Bind1 za ispitivanje cDNK biblioteke ljudskog mozga, Courilleau et al. (2000) klonirali PTPLAD1, koji su označili BIND1. Izvedeni protein od 370 aminokiselina ima značajnu sličnost sa PTPLA i p23 (PTGES3). Northern blot analiza otkrila je varijabilnu ekspresiju Bind1 u svim ispitivanim tkivima miša, s najvećom ekspresijom u sjemenicima, bubrezima, mozgu i jetri, a znatno nižom u skeletnim mišićima, slezeni i srcu. Ortolozi PTPLAD1 otkriveni su u *C. elegans*' (obla glista) i *S. cerevisiae* (kvasac)
PCR-om biblioteke cDNK u ćelijama HEK293, Ikeda et al. (2008) klonirali su  PTPLAD1, kojeg su označili kao HACD3. Izvedeni protein od 362 aminokiseline ima šest transmembranskih domena i PTP-sličan motiv između transmembranskih domena 2 i 3. Northern blot analizom otkrivena je varijabilna ekspresija prevladavajućeg transkripta HACD3 od 3,2 kb u svim ispitivanim ljudskim tkivima, osim u leukocitima. Najjača ekspresija bila je u mozgu, bubrezima, jetri i posteljici. Epitop-označen kao HACD3 eksprimiran je u ER-u transficiranih HeLa ćelija.

## Funkcija gena
Natrij-butirat je reverzibilni inhibitor histon-deacetilaze, što rezultira hiperacetilacijom histona i promjenama u ekspresiji gena da inducira diferencijaciju i inhibira proliferaciju ćelija. Korištenjem PCR analize diferencijalnog prikaza, Courilleau et al. (2000) otkrili su da natrij-butirat inducira ekspresiju mišjeg Bind1. Ljudski BIND1 je direktno stupio u interakciju s RAC1 u transficiranim ćelijama i potencirao RAC1-induciranu aktivaciju NFKB i JNK.

Koristeći analizu delecija, Sabbah et al. (2006) identificirali su elemente u ljudskom BIND1 promotoru koji su posredovali njegovu aktivaciju inhibitorima HDAC.
Ikeda et al. (2008) otkrili su da je afinitet HACD3 pročišćen iz transficiranih HeLa ćelija pretvorio 3-hidroksipalmitoil-CoA u 2,3-trans heksadecenoil-CoA. Ostali članovi porodice enzima HACD, uključujući HACD1 (PTPLA), HACD2 (PTPLB) i HACD4 (PTPLAD2), pokazali su istu aktivnost, ali svaki je imao različit afinitet i brzinu reakcije. Analiza koimunoprecipitacije transficiranih ćelija HEK293T otkrila je da HACD3 preferira interakciju s nekoliko enzima kondenzacije FA , vjerovatno u kompleksu FA elongaze.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 15
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika