C16orf96

**C16orf96** ili otvoreni okvir čitanja 96 hromosoma 16 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **C16orf96** na hromosomu 16.

## Protein
**Aminokiselinska sekvenca**

Dužina polipeptidnog lanca je  1.141   aminokiselina, a molekulska težina 125.041 Da.

1020304050
MSFSLTFTELANIAIPQCGVLNFKALHLLLHGILEHIHMAELKKVLSGDE
DFLQTSQVVIMPREGDAQPILNPMKRLSNVFDHVVSRLDKLENQLALLQD
LPSTAQLLEASQGTARPVQDLWHLIKLRKMVEGHDEVMAKSMQTLQDLLT
DLHALQVTITALRKEVDMLKNMLDKVHPERMDIFAEDFKIQNWKMVALQR
EVASLQNKFKTIPKTEDMVLWSGLHDAMFTSEIGSSPLDLWQSVEQLPEA
ALAQTTKYLEATRAIQVSEPVQNPQLLQTVWHYEVPELLPEGSSAQAVSL
SRAQEPAQPPALTPESAPGCTTEFAPGPAPGTEPVPGLELGLELEPVPAL
GPVPGPSVTPGSLPAPWPVLGPVPAPGAQPPPLGDWPALPRRWPLPQGWP
RVGSWPLWDLGVLRPTQPQPSRAPPPATEFGSLWPRPLQPYQSRQGEALQ
LAAVQVKGEENDVPSLRGLRERARKDGAPKDRTRKDGVPKDRGGKDVDPK
DRAHKDDVPKDRGGKDVDPKDRAHKDDVPKDRGGKDGDPKDRVGKDGAPK
EAQPKAPQSALHRLKTTAAIAAAAAAAYAAATSSAAQAAKVAAKFVKDAP
ATKMAAIATDTAAAGPLGVFADVLGAGPSRGATESQILGDDSEIYEILSP
SYSAASIGPDPALSQAMVATKQAMSPEDKKRAVKYSMSHIAQIPVKHDSL
KEEFAQLSCNLNQRLSYLANMGGPSSLGTTVDILQKKIGSLQKSRLKEEE
LERIWGNQIEMMKDRYITLDKAVENLQIRMDEFKTLQAQIKRLEMNKVNK
STMEEELREKADRSALAGKASRVDLETVALELNEMIQGILFKVTIHEDSW
KKAMEELSKDVNTKLVHSDLDPLKKEMEEVWKIVRKLLIEGLRLDPDSAA
GFRRKLFKRVKCISCDRPVEMMTGPQLITIRKAHLLSRLRPASANSCEYL
QRQQMREQQWLQLQDLGIQEDCQQDWGDGPQNATSLKCKSCNLLTLYPYG
DPHVIDYDSAEVDILGVDGILYKGRVNSQRGAQPLAVAKELAAVKAPSPP
SQSLYDRVHSSALFGAICPPLCPRSSACSAASGPHLTMPARPPSLPPLLL
LPPLIPSLRDPQQAPGSTRLSRAPHIESRVGRKPPEEPANP

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

### Karakteristike 
Molekulska težina prerađenog proteina C16orf96 kod ljudi je 125 kdal sa izoelektričnom tačkom 6,58 Oko 9% aminokiselinskog sastava C16orf96 čini prolin, što je znatno više od prosječnog ljudskog gena.

### Posttranslacijske modifikacije 
Ljudski C16orf96 ima veliku količinu predviđenih mjesta fosforilacija na serinima u cijelom proteinu. Također je utvrđeno da C16orf96 kod primata i ostalih sisara ima signal jedarnog unosa i signal za eksport.

### Domeni
Ovaj gen sadrži neke poznate domene, kao što su: motiv prepoznavanja RNK, površinski merozoitni protein (MSP-1), ponavljanje pentapeptida MXKDX i domen nepoznate funkcije (DUF1387). Ovi domeni mogu naslutiti koja je funkcija ovog gena.

#### Tercijarna struktura 
Još uvijek nema poznate tercijarne strukture C16orf96.

### Ćelijska lokalizacija 
Predviđa se da je protein C16orf96 lokaliziran u jedru 82% vremena,  4,5%  u citosolu i 4,5%  u mitohondrijama.

## Ekspresija
[thumb|280px|Ekspresija  C16orf96 kada su smanjeni različiti [hipoksija|faktori inducirani hipoksijom]]
Ekspresija C16orf96 u ćelijama je općenito niska. Eksperimenti *in situ* hibridizacije sugeriraju da se R16 C16orf96 RNK eksprimira samo u sjemenicima, dok EST profil C16orf96 pokazuje da je ekspresija gena niska samo u testisima i koži.
Ekspresija gena C16orf96 modulira se iscrpljivanjem faktora 1/2 induciranog hipoksijom (HIF1/2α). Kada se isprazni samo jedan od faktora, ekspresija se ne mijenja, sugerirajući da postoji redundantnost sa ova dva HIF-a.

## Funkcija 
Funkcija C16orf96 je još nepoznata. Studije su ovaj gen navele među mnogim drugim genima kao mogućeg kandidata koji utiče na gojaznost djece.

## Homologija
Striktni ortolozi ovog gena postoje samo kod sisara. Međutim, dio DUF1387 nalazi se u udaljenijim vrstama sve do gmizavaca. Nijedan ortolog ovog gena ne može se naći u biljkama, gljivama ili bakterijama, sugerirajući da je ovaj gen relativno nov i da  brzo evoluira.

## Reference 
## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 16
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika