Trostrani ATP-nezavisni periplazmatski transporter

**Trostrani periplazmski transporteri nezavisni od ATP-a** (TRAP transporteri) su velika porodica transportera rastvarača koja se nalazi u bakterijama i arheama, ali ne i u eukariotima, a čini se da su specifični za unos organskih kiselina ili srodnih molekula koje sadrže karboksilatnu ili sulfonatnu grupu. Oni su jedinstveni po tome što koriste protein za vezivanje supstrata (SBP) u kombinaciji sa sekundarnim transporterom.

## Historija 
desno|mini|300x300piksel|Šematski prikaz ključnih karakteristika TRAP transportera u poređenju sa ABC transporterom i klasičnim sekundarnim transporterom.
TRAP transporteri su otkriveni u laboratoriji profesora Davida J. Kellyja na Univerzitetu u Sheffieldu, Engleska. Njegova grupa je proučavala mehanizam koji fotosintetska bakterija *Rhodobacter capsulatus* koristi za unos određenih dikarboksilnih kiselina. Oni su karakterisali komponentu proteina za vezivanje (DctP) transportera koja prepoznaje ove spojeve, za koju su pretpostavili da će biti dio tipičnog ABC transportera. Međutim, kada su sekvencirali gene u okolini dctP, otkrili su dva druga gena koja kodiraju integralne proteine membrane, dctQ i dctM, ali nisu pronašli gene koji kodiraju komponente ABC transportera. Nadalje, pokazali su da je unos istih dikarboksilata nezavisan od ATP-a i da unos zahtijeva elektrohemijski ionski gradijent, čime je ovaj transporter postao jedinstveni sekundarni transporter zavisan od proteina za vezivanje. pri čemu mnoge bakterije posjeduju više TRAP transportera, a neke čak više od 20 različitih sistema.

## Podloge 
Do danas, većina supstrata za TRAP transportere sadrži zajedničku osobinu, a to je da su organski kiseline. To uključuje C4-dikarboksilate poput sukcinata, malata i fumarata, kao i šećernu kiselinu N-acetil-neuraminsku kiselinu (ili sialičnu kiselinu). Drugi supstrati uključuju kompatibilne rastvarače ektoin i hidroksiektoin, te piroglutamat. SiaPQM sistemi također pokazuju jedinstvena svojstva za sekundarni transporter jer ne mogu katalizirati bidirekcioni transport, budući da SBP nameće da se kretanje odvija samo u smjeru unosa u ćeliju. trenutno je dostupno više od 10 različitih struktura. Sve imaju vrlo slične ukupne strukture, sa dvije globularne domene povezane zglobom. Mjesto vezivanja supstrata formiraju obje domene koje obuhvataju supstrat. Visoko konzervirana argininska ostatka u TRAP SBP-ovima formira solni most sa karboksilatnom grupom na supstratu, što je važno za prepoznavanje supstrata. Potvrđeno drugom strukturom TRAP transportera, strukture otkriva monomerni mehanizam transporta sličan liftu za TRAP transportere. Dok veća M-podjedinica formira stator- i elevator-domenu, čini se da Q-podjedinica povećava i stabilizuje stator-domenu monomernog transportera. Trenutni modeli sugerišu vezivanje SBP-a za oba funkcionalna dijela transportera, stator- i elevator-domenu, i pokazuju usklađenu konformacijsku povezanost između unutrašnje i vanjske otvorene faze membranskih podjedinica i otvorenog i zatvorenog stanja SBP-a.

## Reference 
## Vanjski linkovi 
* Laboratorijska stranica prof. Davida Kellyja, Univerzitet u Sheffieldu, Engleska
* Laboratorijska stranica dr. Gavina Thomasa, Univerzitet u Yorku, Engleska

Kategorija:Transportni proteini
Kategorija:Gram-negativne bakterije
Kategorija:Mikrobiologija
Kategorija:Membranski proteini