CCDC144A

**Domen upredene zavojnice sa  proteinom 144A** je protein  koji je kod ljudi kodiran genom **CCDC144A**. Alijas ovog gena naziva se KIAA0565. Porodica CCDC ima četiri člana : CCDC 144A, 144B, 144C i pretpostavljeni CCDC 144, N-terminalni protein.

## Gen 
Ovaj gen ima nukleotidnu sekvencu dugu 5140 bp sa 641 aminokiselinom.  Nalazi se na kratkom kraku, plus (prednjeg) lanca hromosoma 17, na p11.2.  Informacijska RNK  gena A CCDC144A ima tri alternativne prerađene izoforme zvane A2RUR9-1, A2RUR9-2 i A2RUR9-3, ali još nemaju eksperimentalnu potvrdu.

## Protein 
Protein  kodiran ovim genom poznat je i kao upredena zavojnica,  domen koj sadrži protein 144A (CCDC144A). Sastoji se od 641 aminokiseline. Ovaj protein teži 75,8 kDa i ima izoelektričnu tačku od 6,357. Nalazi se blizu jedra, kao rastvorljivi protein sa hidrofobnosti od -1.021842. Ovaj protein je nesekretorni i ima 10 potencijalnih serina i tri potencijalna treonina  fosforilacijskih lokacija. Nema tirozinnsko sulfacijska mjesta, ali  na ovom proteinu postoji nekoliko potencijalnih mjesta sumoilacije. Predviđa se također da se  ovaj protein ne miristoilira. i ne sadrži signalni peptid.

### Struktura
Dužina polipeptidnog lanca je   1.427 aminokiselina, sa molekulskom težinom od 165.125.

**Aminokiselinska sekvenca**

1020304050
MASWGGEKRGGAEGSPKPAVYATRKTPSVGSQGDQWYLGYPGDQWSSGFP
YSWWKNSVGSESKHGEGALDQPQHDVRLEDLGELHRAARSGDVPGVEHIL
APGDTGVDKRDRKKSIQQLVPEYKEKQTPESLPQNNNPDWHPTNLTLSDE
TCQRSKNLKVDDKCPSVSPSMPENQSATKELGQMNLTEREKMDTGVVLLS
GNDTLHDLCQSQLPENKESKEAEQDSELTSEEEQERLKGCENKQPQKTSQ
EPEMAKDCDREDIPIYPVLPHVQKSEEMWIEQGKLEWKNQLKLVINELKQ
RFGEIYEKYKIPACPEEEPLLDNSTRGTDVKDIPFNLTNNIPGCEEEDAS
EISVSVVFETFPEQKEPSLKNIIHPYYHPYSGSQEHVCQSSSKFHLHENK
LDCDNDNKPGIGHIFSTDKNFHNDASTKKARNPEVVMVEMKEDQEFDLQM
TKNMNQNSDSGSTNNYKSLKPKLENLSSLPPDSDRTSEVYLHEELQQDMQ
KFKNEVNTLEEEFLALKKEDVQLHKDVEEEMEKHRSNSTELSGTLTDGTT
VGNDDDGLNQQIPRKENGEHDRPADKTSNEKNEVKNQIYPEADFADSMEP
SEIASEDCELSHSVYENFMLLIEQLRMEYKDSASLPRIQDTFCLCEHLLK
LKNNHCDQLTVKLKQMENMVSVLQNELSETKKTKLQLELQKIEWEKELYD
LRLALKQENEEKRNADMLYNKDSEQLRIKEEECGKVVETKQQLKWNLRRL
VKELRTVRNNLDLVVQERNDAQKQLSEEQDARILQDQILTSKQKELEMAR
KKMNSEISHRHQKEKDLFHEDCMLQEEIALLRLEIDTIKNQNKQKEKKYF
EDIEAVKEKNDNLQKIIKLNEETLTETILQYSGQLNNLTAENKILNSELE
NGKQNQERLEIEMESYRCRLAAAVRDCDQSQTARDLKLDFQRTRQEWVRL
HDKMKVDMSGLQAKNEILSEKLSNAESKINSLQIQLHNTRDALGRESLIL
ERVQRDLSQTQCQKKETEQMYQIEQSKLKKYIAKQESVEERLSQLQSENM
LLRQQLDDAHKKANSQEKTSSTIQDQFHSAAKNLQAESEKQILSLQEKNK
ELMDEYNHLKERMDQCEKEKAGRKIDLTEAQETVPSRCLHLDAENEVLQL
QQTLFSMKAIQKQCETLQKNKKQLKQEVVNLKSYMERNMLERGKAEWHKL
LIEERARKEIEEKLNEAILTLQKQAAVSHEQLVQLREDNTTSIKTQMELT
IKDLESEISRIKTSQADFNKTELERYKELYLEEVKVRESLSNELSRTNEM
IAEVSTQLTVEKEQTRSRSLFTAYATRPVLESPCVGNLNDSEGLNRKHIP
RKKRSALKDMESYLLKMQQKLQNDLTAEVAGSSQTGLHRIPQCSSFSSSS
LHLLLCSICQPFFLILQLLLNMNLDPI

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Domeni
Ovaj protein ima domen nepoznate funkcije (DUF) 3496, koji je  u eukariota konzerviran.  Domen DUF3496 nalazi se iz aminokiselina 547-622. Umjesto upredene zavojnice pronađen je i leucinski zatvarač.

## Evolucija
  ortologa CCDC144A. 

### Potencijalni ortolozi 
  sindrom delecije hromosoma 17p , sindrom delecije 17p,

### Interaktivni proteini 
Potencijalno mogu postojati dva proteina koja djeluju u interakciji s KIAA0565, a to su ubikvitin specifična peptidaza 32 (USP32) i ubikvitin specifična peptidaza 25 (USP25).

### Ekspresija 
Pokazalo se da ovaj protein ima relativno nisku ekspresiju u svim tkivima.

### Reference
## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 17
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika