FAM203B

**Član B porodice sa sličnošću sekvence 203** (FAM203B) je protein koji je kod ljudi kodiran genom **FAM203B** (pozicija 8q24.3). Dok se FAM203B nalazi samo kod ljudi i možda primata koji nisu ljudi, njegov paralog, FAM203A, je visoko konzerviran. Protein FAM203B sadrži dva konzervirana domena nepoznate funkcije, DUF383 i DUF384,
## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 390 aminokiselina, а molekulska težina  42.129 Da.

1020304050
MGEAGAGAGASGGPEASPEAEVVKLLPFLAPGARADLQAAAVRHVLALTG
CGPGRALLAGQAALLQALMELAPASAPARDAARALVNLAADPGLHETLLA
ADPGLPARLMGRALDPQWPWAEEAAAALANLSREPAPCAALMAALAAAEP
ADSGLERLVRALCTPGYNARAPLHYLAPLLSNLSQRPAARAFLLDPDRCV
VQRLLPLTQYPDSSVRRGGVVGTLRNCCFEHRHHEWLLGPEVDILPFLLL
PLAGPEDFSEEEMERLPVDLQYLPPDKQREPDADIRKMLVEAIMLLTATA
PGRQQVRDQGAYLILRELHSWEPEPDVRTACEKLIQVLIGDEPERGMENL
LEVQVPEDVEQQLQQLDCREQEQLERELAPEPWVERATPT

**C**: Cistein
**D**: Aspartat
**E**: Glutamat
**F**: Fenilalanin 
**G**: Glicin
**H**: Histidin
**I**: Izoleucin 
**K**: Lizin
**L**: Leucin
**M**: Metionin
**N**: Asparagin
**P**: Prolin
**Q**: Glutamin
**R**: Arginin
**S**: Serin
**T**: Treonin
**V**: Valin
:**W**: Triptofan
**Y**: Tirozin

## Gen
U ljudskom genomu, * FAM203B* nalazi se na pozitivnom lancu DNK dugog kraka hromosoma 8 na lokusu 24,3 (8q24,3) od 76,368.898 do 76,371,411 bp. Genski proizvod sadrži 2.402 bp iRNK sa 6 predviđenih egzona u ljudskom genu. Nema poznetih izoformi.

### Gensko susjedstvo
Pseudogen * TSSK5P2 * nalazi se na negativnom lancu, nasuprot *FAM203B * (145,440.975 – 145,443.775 bp), dok se  *LOC377711* nalazi odmah  nizvodno, na pozitivnom lancu (145,445.755 - 145,485.896 bp). *FAM203A*, *MROH1* i  *SCXB* nalaze se uzvodno  *FAM203B*.

### Ekspresija gena 
**Profil ekspresije**: Ekspresija iRNK lokalizirana je u mnogim tipovima tkiva (imunskom, nervnom, mišićnom, utrobnom, sekretornom i reproduktivnom) u sličnim količinama i stoga može biti sveprisutna.

**Promotor**: predviđena regija promotora FAM203B se nalazi između 145,437.380 i 145,438.015 bp na hromosomu 8 i ima dužinu od 636 bp. i izoelečnu tačku od 4,56.

### Struktura 
FAM203B sadrži dva domena nepoznate funkcije: DUF383 (ostaci 110-288) i DUF384 (ostaci 292-349).

### Posttranslacijske modifikacije 
U FAM203B ima najmanje šest predviđenih mjesta fosforilacije: S17, S153, Y167, T223, S259 i S320. Predviđeno je da se protein FAM203B nalazi u citoplazmi.

### Proteinske interakcije 
U promotoru * FAM203B * postoji mnogo mogućih mjesta vezanja fakrora transkripcije.  Ispod je tabela najboljih mogućnosti koje imaju visoke vrijednosti pouzdanosti, evolucijska konzerviranost i /ili više mogućih mjesta vezivanja u promotoru.**

Postoji i nekoliko drugih proteina koji mogu direktno stupiti u interakciju s proteinom FAM203B, uključujući C1orf112, HEATR3, MRTO4, BYSL, GINS1, DKC1, TXNDC12, PWP2, IMP4 i NIP7.
 9.05.

### Ortolozi i homolozi 
**Paralozi i homolozi FAM203B'*:

Postoji jedan ortolog FAM203B, moždani protein sličan 16 (BRP16L) u *Macaca mulatta*,
# Ako su geni *BRP16 * u "M mulatti" i "D. rerio" rezultat zasebnih događaja duplikacija, tada je također moguće da su *FAM203B* i *BRP16L* u *M. mulatta" rezultat zasebnih događanja duplickacija.
# BRP16 (moždani protein 16) je pseudonim FAM203A, a BRP16L (moždani protein sličan 16) je pseudonim FAM203B. Gen pod imenom BRP16L jednostavno znači da je gen povezan s FAM203A, ali ne nužno s FAM203B.
# *FAM203A* i * FAM203B * nalaze se u telomernoj regiji hromosoma 8, području u kojem se  često događaju rekombinacije.

Međutim, budući da su FAM203A i FAM203B toliko slični, teško je utvrditi jesu li proteini ortolozi ili samo jednostavno homolozi. 
[right|Neukorijenjeno [filogenetsko stablo sa evolucijskim međuodnosima FAM203B i njegovih homologa.]]

### Filogenija 
Filogenetsko stablo FAM203B i njegovi homolozi podudara se s ukupnom divergencijom odgovarajućih loza.). Postoje značajne varijacije među sisarima, torbarima i monotrematama u pogledu toga gdje počinje domen nepoznate funkcije DUF383, dok je ta varijacija manja kod gmizavaca, vodozemaca, riba, beskičmenjaka, biljaka i gljiva. Osim toga, domen DUF383 završava na istoj lokaciji za sve homologe, dok domen DUF384 počinje i završava na približno istoj lokaciji u svim homolozima. Postoji velika homologija u domenu DUF384 (292..349) i u DUF383 (154..288), a nekoliko aminokiselina je potpuno konzervirano u kičmenjaka, beskičmenjaka, biljaka i gljiva, koje uključuju Arg190, Gly219, Asn226 , Lys273 i Lys338. Druge visoko konzervirane aminokiseline uključuju Asn87, Lys88, Arg216 i Phe229.

## Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 8
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika