TNRC6A

**Protein sa  trinukleotidnim ponavljanjem gena 6A**  je protein koji je kod ljudi kodiran genom **TNRC6A**.

Ovaj gen kodira člana trinukleotidnog ponavljanja koji sadrži  porodica proteina 6. Protein funkcionira u utišanju gena nakon transkripcije, putem RNK-interferencija (RNKi) i mikroRNK puteva. Protein se povezuje sa iRNK i argonaut proteinima u citoplazmatskim tijelima poznatim kao GW-tijela ili P-tijela. Inhibiranje ekspresije ovog gena delokalizira druge proteine GW-tijela i narušava RNKi i mikroRNK-inducirani gen za utišavanje.

1020304050
MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATE
QKIKVPEQIKPSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQ
QQQPQQQQPQQQPQPQPQQQQPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLK
RGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINH
STSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWPSAPGSDPELA
SECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSS
SSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQ
MPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEM
TGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMN
GTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATL
MQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQG
SATSQTNEQSSVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQ
HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGT
EAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPALRWGDSKGSNC
QGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWGDGQKSSQGWS
VSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQ
DIVGSWGIPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKME
IDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAIS
NKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASS
TSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTGWEEEEDVEIG
MWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGD
YNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKL
PPSNSALPNQALGSIAGLGMQNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQP
PAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNGGLNPLFGPQQVAM
LNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLSVQ
QQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSL
DQNSSKHGAISSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSP
NGSSSVNWPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVD
HLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSK
LTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNS
PLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEF
ASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHW
NGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFL
SVDHLGGGGESM

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
Sekvenciranjem klonova dobijenih iz frakcionirane fetusne moždane biblioteke cDNK, Nagase et al . (2000) klonirali su TNRC6A, koji su označili kao KIAA1460. RT-PCR ELISA-test otkrio je ekspresiju TNRC6A u svim ispitivanim tkivima i specifičnim regijama mozga, sa najvećom ekspresijom u cijelom mozgu odrasle osobe.

Korištenjem autoimunih seruma pacijenta sa motornom i senzornom polineuropatijom za pregled biblioteke cDNK HeLa ćelija, nakon čega slijede analiza baze podataka i PCR, Eystathioy et al. (2002) klonirali su TNRC6A pune dužine, koji su nazvali GW182. Izvedeni protein od 1.709 aminokiselina ima izračunatu molekulsku masu od 182 kD. Sadrži signal centralne jedarne lokalizacije, motiv prepoznavanja C-terminalne RNK, brojna ponavljanja glicina/triptofana (GW) i višestruka mjesta fosforilacija. Northern blot analizom otkriven je transkript GW182 od 7,5 kb u svim ispitivanim tkivima, s najvećom ekspresijom u srcu. Označavanje radioaktivnim fosfatom ukazalo je da je GW182 fosfoprotein. Imunolokalizacija u HepG2 ćelijama pokazala je GW182 u jedinstvenim tijelima citoplazme bez membrana koje su Eystathioy et al. (2002) opisali pod nazivom GW tijela. Broj GW tijela kretao se od 0 u mitotskim ćelijama do 30 u nekim interfaznim ćelijama i varirali su u veličini.

Schneider et al. (2006) pbjavili su da protein GW182 sa 1.690 aminokiselina ima N-terminalni domen bogat GW-om, središnju regiju bogatu glutaminom i motiv prepoznavanja R-C-terminalne RNK.

## Funkcija gena
Eystathioy et al. (2002) otkrili su da antitijela na GW182 imunoprecipitiraju širok spektar iRNK. Predložili su da su tijela GW ribonukleoproteinski kompleksi koji mogu biti uključeni u regulaciju transkripata potrebnih za rast ćelija i homeostazu.
Eystathioy et al. (2003) otkrili su da je najčešća klinička dijagnoza pacijenata sa antitijelima na GW182 bio Sjogrenov sindrom, praćen mešovitom motornom/senzornom neuropatijom i sistemskim eritematoznim ćelijskog ciklusa. Većina GW tijela rastavljena je prije mitoze, a mala GW tijela ponovno sastavljena početkom G1 faze. Proliferirajuće mišje ćelije sadržavale su veća, svjetlija i brojnija GW tijela i imale su do pet puta više ukupnog proteina Gw182 od ćelija u mirovanju. Nokdaun Gw182 *in vitro* doveo je do nestanka tijela GW.

Jakymiw et al (2005) otkrili su da su endogeni AGO2 (EIF2C2) i transficirali male molekuke interferirajuće RNK (siRNA) akumulirane u GW tijelima u HeLa ćelijama, te da je GW182 komunicirao s AGO2. N-terminalni fragment GW182 nije se lokalizirao na GW tijelima, a ova konstrukcija je poremetila GW tijela u HeLa ćelijama i ometala sposobnost utišavanja siRNK specifične za lamin-A/C. Zaključili su da GW182 i/ili mikrookruženje citoplazmatskih GW tijela doprinose RNK-induciranom kompleksu za utišavanje i utišavanju RNK.

Schneider et al. (2006) otkrili su ortolog kod *Drosophila* iz ljudske porodice GW182, lokaliziran u tačkasta citoplazmatska žarišta, zavisana od RNK. Smanjivanje neuobičajene aktivnosti mutacijom ili ubrizgavanjem antitijela tokom razvoja sincicijskog embriona dovelo je do abnormalnih jedarnih podjela, što je pokazalo ranu potrebu za regulacijom cRM cRO, posredovane tjelesnim gelom.

Analizom mikromreža, Behm-Ansmant et al. (2006) otkrili su da je iscrpljivanje Gw182 dovelo do promjena u profilu ekspresije iRNK u ćelijama *Drosophila* S2 sličnih onima uočenim nakon iscrpljivanja Ago1. Kada je Gw182 vezan za transkript reporter, utišao je svoju ekspresiju, zaobilazeći potrebu za Ago1, a Gw182 je potiskivao ekspresiju proteina i promovirao raspadanje iRNK. Također su pokazali da su N-terminalni GW ponavlja Gw182, u interakciji sa PIWI domenom Ago1. Zaključili su da GW182 povezuje put mikroRNK s degradacijom iRNK, interakcijom sa AGO1.

## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*

Kategorija:Geni na hromosomu 16
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika