TM9SF2

**Protein 1 porodice TSC22 domena** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **TSC22D1**.

TSC22 kodira transkripcijski faktor i pripada velikoj porodici geni ranog odgovora.
TSC22D1 kodira transkripcijski faktor i pripada velikoj porodici gena za rani odgovor.
Putem  fluorescentne ibridizacije *in situ*, Jay et al. (1996) locirali su gen TSC22D1 na hromosomu 13, sekvenca 13q14.

TSC22D1 tvori homodimere, preko konzerviranog domena leucinskog zatvarača i heterodimerizuje s TSC22D4. TSC22D1 ima transkripcijsku represorsku aktivnost.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.073  aminokiseline, a molekulska težina   109.677 Da..

1020304050
MHQPPESTAAAAAAADISARKMAHPAMFPRRGSGSGSASALNAAGTGVGS
NATSSEDFPPPSLLQPPPPAASSTSGPQPPPPQSLNLLSQAQLQAQPLAP
GGTQMKKKSGFQITSVTPAQISASISSNNSIAEDTESYDDLDESHTEDLS
SSEILDVSLSRATDLGEPERSSSEETLNNFQEAETPGAVSPNQPHLPQPH
LPHLPQQNVVINGNAHPHHLHHHHQIHHGHHLQHGHHHPSHVAVASASIT
GGPPSSPVSRKLSTTGSSDSITPVAPTSAVSSSGSPASVMTNMRAPSTTG
GIGINSVTGTSTVNNVNITAVGSFNPNVTSSMLGNVNISTSNIPSAAGVS
VGPGVTSGVNVNILSGMGNGTISSSAAVSSVPNAAAGMTGGSVSSQQQQP
TVNTSRFRVVKLDSSSEPFKKGRWTCTEFYEKENAVPATEGVLINKVVET
VKQNPIEVTSERESTSGSSVSSSVSTLSHYTESVGSGEMGAPTVVVQQQQ
QQQQQQQQQPALQGVTLQQMDFGSTGPQSIPAVSIPQSISQSQISQVQLQ
SQELSYQQKQGLQPVPLQATMSAATGIQPSPVNVVGVTSALGQQPSISSL
AQPQLPYSQAAPPVQTPLPGAPPPQQLQYGQQQPMVSTQMAPGHVKSVTQ
NPASEYVQQQPILQTAMSSGQPSSAGVGAGTTVIPVAQPQGIQLPVQPTA
VPAQPAGASVQPVGQAPAAVSAVPTGSQIANIGQQANIPTAVQQPSTQVP
PSVIQQGAPPSSQVVPPAQTGIIHQGVQTSAPSLPQQLVIASQSSLLTVP
PQPQGVEPVAQGIVSQQLPAVSSLPSASSISVTSQVSSTGPSGMPSAPTN
LVPPQNIAQTPATQNGNLVQSVSQPPLIATNTNLPLAQQIPLSSTQFSAQ
SLAQAIGSQIEDARRAAEPSLVGLPQTISGDSGGMSAVSDGSSSSLAASA
SLFPLKVLPLTTPLVDGEDESSSGASVVAIDNKIEQAMDLVKSHLMYAVR
EEVEVLKEQIKELIEKNSQLEQENNLLKTLASPEQLAQFQAQLQTGSPPA
TTQPQGTTQPPAQPASQGSGPTA

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i  ekspresija
Skriningom male količine klonova u biblioteci cDNK, od  6-sedmičnih mišjih embriona, Jay et al. (1996) klonirali su TSC22D1, koji su nazvali TSC22. Izvedeni protein sa 144 aminokiseline imao je izračunatu molekulsku masu od oko 16,7 kD i leucinski zatvarač, C-kraj bogat glutaminom i prolinom i dva potencijalna mjesta fosforilacije. TSC22 dijeli značajnu homolog[iju sa Tsc22 kod miševa, pacova i kokoši, a 69% identiteta sa svinjskim Dsipom i 52% identiteta sa proteinom za kratkovidnost kod *Drosophila*. Zoo blot analiza otkrila je srodne sekvence kod svih zastupljenih kičmenjaka i voćnih mušica. Signal nije otkriven u dagnjama, nematodama, kvascima i bakterijama.

Prema Southwestern scriningu, Ohta et al. (1996) identificirali su pacovaa Tsc22 vezanjem za G–C-bogati element promotora CNP. Koristili su ovu sekvencu za oblikovanje prajmera i kloniranja ljudskog TSC22, pomoću PCR-a i 3' i 5' RACE biblioteke cDNK fetusnog bubrega. Ljudski TSC22 razlikuje se od proteina pacova po inserciji jednog ostatka i jednoj zamjeni. Proteini pacova i miša su identični.

Prema Northern blot analizi, Jay et al (1996) i Ohta et al. (1996) utvrdili su da je TSC22 eksprimiran kao 1,8 kb transkript u različitim količinama u svim tkivima fetusa i odraslih, osim leukocita periferne krvi. Transkript od oko pet kb također je otkriven u skeletnim mišićima.

## Funkcija gena
Analizom pomaka mobilnosti i kotransfekcijom s reporter-plazmidom, Ohta et al. (1996) potvrdili su da se pacovski Tsc22 veže i može podstaknuti ekspresiju iz sekvence CNP promotora, bogate GC-om. U endotelnim ćelijama ljudske aorte ekspresiju TSC22 stimulirali su citokini, uključujući TGFB, i brzo se izgubila. Ekspresija TSC22 iRNK korelira sa povećanim nivoom CNP iRNK.

Analizom 2-hibrida kvasca, ispitivanjem pomaka gela i eksperimentima povlačenja GST-a, Kester et al. (1999) potvrdili su da TSC22D1 formira homodimere, preko konzerviranog domena leucinskog zatvarača  i da stupa u interakciju s TSC22D4, formiranjem heterodimera. Pokazali su da TSC22D1 ima transkripcijsku represorsku aktivnost.
## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
* 

Kategorija:Transkripcijski faktori
Kategorija:Geni na hromosomu 13
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika