CCDC138

**Protein 138 sa upredenom zavojnicom**, znan i kao  **CCDC138**, jest protein koji je kod ljudi   kodiran genom  **CCDC138** sa  hromosoma 2. Njegova tačna funkcija nije poznata.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 665 aminokiselina, a molekulska težina  76.219 Da.

1020304050
MEPRVVKPPGQDLVVESLKSRYGLGGSCPDEYDFSNFYQSKYKRRTLTSP
GDLDIYSGDKVGSSLKYSDESKHCRTPLGSLFKHVNVNCLDDELDSFHDL
KKQETEEELIENDYRVSTSKITKQSFKEIEKVALPTNTTSSRPRTECCSD
AGDSPLKPVSCPKSKASDKRSLLPHQISQIYDELFQIHLKLQCETAAQQK
FAEELQKRERFLLEREQLLFRHENALSKIKGVEEEVLTRFQIIKEQHDAE
VEHLTEVLKEKNKETKRLRSSFDALKELNDTLKKQLNEASEENRKIDIQA
KRVQARLDNLQRKYEFMTIQRLKGSSHAVHEMKSLKQEKAPVSKTYKVPL
NGQVYELLTVFMDWISDHHLSKVKHEESGMDGKKPQLKFASQRNDIQEKC
VKLLPLMTEQLQWMPFVNIKLHEPFVKFIYWSLRQLDAGAQHSTMTSTLR
RLGEDIFKGVVTKGIQDNSPQHSVENKPKTAAFFKSSNLPLRFLSTLIVL
KTVTQADYLAQAFDSLCLDLKTEEGKTLFLEYQAVPVILSHLRISSKGLL
SNVIDSLLQMTVESKSLQPFLEACSNSLFFRTCSVLLRAPKLDLQILEKL
SIILQKLSKIKSNKKLFELFTIHLMLQEIQRTTNPEHAFLCINLNSTLFN
LGLTKCNSLVSSASP

## Gen
Gen CCDC138 nalazi swe na pozitivnom lancu hromosoma 2.
Llociran je na  dugom (q) kraku, pozicija 12.13, ili na sekvenci 2q12.3. Proteže se između baznih parova 108,786,752 i 108,876.591. The DNA sequence is 89,840bp long.

### Uobičajeni aliasi
CCDC138 je jedini uspostavljeni zajednički alijas.

## Protein
Predviđa se da protein CCDC138 ima molekulsku težinu od 76,2Kda i izoelektričnu tačku od  8,614. Kompozicijska analiza pokazuje da postoji mala upotreba AGP grupiranja u CCDC138, te da nema pozitivnih, negativnih ili mješovitih klastera naelektrisanja. Protein nema motiv zadržavanja ER u C-terminalu ni motiv za vezanje RNK. Predviđeno je i da je topljivi jedarni protein sa leucinskim zatvaračem (PS00029) na poziciji 205 nadalje sa sekvencom LQKRERFLLEREQLLFRHENAL.

### Primarne sekvence i varijante/izoforme
Postoje dvije izoforme proteina CCDC138. Primarna izoforma ima 665 aminokiselina  while the secondary isoform has 577 amino acids, and TMAP suggests that there are no predicted transmembrane domain. SOSUI  dalje predviđa da je CCDC138 rastvorljivi protein bez transmembranskog domena.

### Posttranslacijske modifikacije
Prema SUMOplot Analysis Programu, there are 7 predicted sumoylation at lysine residues K7, K207, K336, K374, K383, K521, and K591.
NetPhos predviđeno je da postoje 44 mjesta fosforilacije, uključujući 29 ostataka serina, 10 ostataka treonina i pet ostataka tirozina.

Nema daljih post-translacijskih modifikacija kako predviđa NetNGlyc, NetOGlyc, SignalP, Sulfinator, and Myristoylator.

### Sekundarna struktura
CCDC138 protein sadrži više alfa heliksa, beta listova i namotanih zavojnica kako su predvideli PELE, CHOFAS i GOR4.

800px|center|Sekundarna struktura CCDC138 kako je predvidio PELE
Žuta prikazuje upredenu zavojnicu, plava alfa-heliks, a crvena beta-list. Većina sekvenci su upredene zavojnice i alfa-heliksi.

### Strukture 3° i 4° 
Ne postoje predviđene strukture od 3° i 4° za protein CCDC138. Međutim, postoji slična struktura koja ima 29% identiteta. Predviđena struktura je lanac A, analiza kristalne strukture Clpb, proteina koji kodira ATP zavisnu proteazu i šaperon. Ovaj protein ima usklađenu dužinu od 144 aminokiseline, a poravnanje se nalazi u domenu nepoznate funkcije CCDC138.

 lanca A Clpb-a]]

## Ekspresija
Gen je eksprimiran na niskim razinama u gotovo svim ljudskim tkivima, ali su viši nivoi uočeni u određenim tkivima kancera. CCDC138 je rastvorljivi protein za koji je predviđeno da se nalazi  u ćelijskom jedru.

Obrasci ekspresije tkiva procijenjeni mikromrežom preko GEO profila pokazuju da je CCDC138 eksprimiran u umjerenim razinama u različitim tkivima uključujući limfocite periferne krvi, fetusni timus, timus odraslih, sjemenike, jajnike, zadnji mozak, debelo crijevo, mliječne žlijezde i koštanu srž.

### Promotor
Regija promotora CCDC138 je prikazan na slici ispod.
 faktora transkripcije]]

### Varijante transkripta
Postoje dvije najznačajnije alternativne varijante transkripta za CCDC138 iRNK. Prva varijanta kao što je prikazano na donjoj slici pronađena je u plućima, krvi i ljudskim embrionskim matičnim ćelijama. Druga varijanta je pronađena kod adenokarcinoma, prostate, pluća i primarnih epitelnih ćelija pluća.

Prvi transkript pokazuje kompletan transkript iRNK. Drugi transkript je prva varijanta, dok je transkript **?** druga varijanta.

## Funkcija i biohemija
Tačna funkcija CCDC138 tek treba biti upoznata.

## Interakcija proteina
Utvrđeno je da protein CCDC138 stupa u interakciju sa ubikvitinom C, proteinom uključenim u ubikvinaciju i na kraju u razgradnju proteina.

### Faktori transkripcije koji se mogu vezati za regulatornu sekvencu
Tabela ispod pokazuje neke transkripcijske faktore koje je predvidio Genomatix, a koji se vezuju za regulatornu sekvencu gena CCDC138.

==Paralozi===
Nisu identifikovani paralozi CCDC138.

## Homologija i evolucija
### Ortolozi
CCDC138 je konzerviran u različitim organizmima kao što je prikazano u tabeli ispod.

### Udaljeni homolozi
Najudaljeniji homolog otkriven ili predviđen je *Trichoplax adhaerans*. Ima očuvan CCDC138 gen i evoluirao je 800 miliona godina prije ljudske loze.

### Homologni domeni
Među gore navedenim ortolozima, postoje različiti homologni konzervirani regioni, prikazani na slikama ispod.
[600px|centar|[Poravnavanje višestrukih sekvenci CCDC138 koje prikazuje konzerviran regije.]] 
[600px|centar||[Poravnavanje višestrukih sekvenci CCDC138 koje prikazuje konzerviran regije.]] 
[600px|centar||[Poravnavanje višestrukih sekvenci CCDC138 koje prikazuje konzerviran regije.]] 
Zelena boja pokazuje potpuno konzervirane ostatke, žuta identične ostatke, cijan  pokazuje slične ostatke, a bijela različite ostatke.

### Filogenija
Uočena filogenija gena CCDC138 gore pomenutih ortologa rekapitulira evolucijsku historiju.

[550px|center|Ukorijenjeno [filogenetsko stsblo CCDC138]]
Slika iznad pokazuje evolucijske odnose  ortologa CCDC138 .

## Klinički značaj
CCDC138 je identifikovan kao jedan od mnogih gena uključenih u iniciranje terminskih porođaja u miometriju.

## Reference 
## Vanjski linkovi 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 2
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika