SPN1

**Snurportin1** je protein koji je kod ljudi kodiran genom **SNUPN**.

Jedarni unos splajsosomskih snRNP-ova U1, U2, U4 i U5 ovisi o prisutnosti složenog jedarnog lokalizacijskog signala. Potonji je sastavljen od 5'-2,2,7-terminalne trimetilguanozinske (m3G) kapičaste strukture U snRNK i Sm jedarnog domena. Protein koji kodira ovaj gen specifično djeluje s m3G-kapom i funkcionira kao jedarni unosni receptor specifičan za snRNP. Za ovaj gen identificirane su  Alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju isti protein..

1020304050
MEELSQALASSFSVSQDLNSTAAPHPRLSQYKSKYSSLEQSERRRRLLEL
QKSKRLDYVNHARRLAEDDWTGMESEEENKKDDEEMDIDTVKKLPKHYAN
QLMLSEWLIDVPSDLGQEWIVVVCPVGKRALIVASRGSTSAYTKSGYCVN
RFSSLLPGGNRRNSTAKDYTILDCIYNEVNQTYYVLDVMCWRGHPFYDCQ
TDFRFYWMHSKLPEEEGLGEKTKLNPFKFVGLKNFPCTPESLCDVLSMDF
PFEVDGLLFYHKQTHYSPGSTPLVGWLRPYMVSDVLGVAVPAGPLTTKPD
YAGHQLQQIMEHKKSQKEGMKEKLTHKASENGHYELEHLSTPKLKGSSHS
PDHPGCLMEN

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija
Huber et al. (1998) opisali su izolaciju cDN>K i kloniranje proteina od 45 kD, zvanog snurportin-1, koji specifično komunicira sa m3G-kapom, ali ne i sa m7G-kapa-strukturama. Snurportin-1 je pojačao jedarni eksport U snRNP-a ovisan o m3G-kapici u oocitima *Xenopus laevis* i HeLa-ćelijama permeabiliziranim digitaloninom, pokazujući da djeluje kao jedarni uvozni receptor specifičan za snRNP. Čini se da snurportin-1 prepoznaje m3G-kapicu, a ne SM jedro NLS, što ukazuje da najmanje dva različita receptora za unos komuniciraju sa složenim snRNP NLS-om. Snurportin-1 je jedarni importni receptor koji sadrži N-terminalni importin-beta-vezujući (IBB) domen, bitan za funkciju, i C-terminalni m3G-vezni region bez strukturne sličnosti sa domenom ponovnog punjenja importina -alfa (KPNA2; 600685). Koristeći UV test umrežavanja, identificirali su snurportin-1 kao protein sposoban da veže m3G-kapicu. Protein je izoliran, fragmentiran u peptide i mikrosekvenciran. Odgovarajući EST identificirani su iz internetskih baza podataka i sastavljeni u cDNK pune dužine, za koju se predviđa da kodira protein od 360 aminokiselina, s molekulskom težinom od 41 kD.

## Funkcija gena
Narayanan  et al. (2002) izvijestili su da mutantnom snurportinskom konstruktu nedostaje IBB domen, ali koji sadrži netaknuti domen koji veže kapu TMG, lokaliziranu prvenstveno u jedru, dok je snurportin pune dužine lokaliziran u citoplazmi. Snurportin je komunicirao sa SMN, Gemin3, Sm snRNPs i importin-beta.
 
U prisustvu ribonukleaza, interakcije sa SMN i Sm proteinima su ukinute, što sugerira da snRNK mogu posredovati u ovoj interakciji. Studije frakcioniranja ćelija pokazale su da se snurportin prvenstveno veže za citoplazmatske SMN komplekse. Pored toga, SMN je izravno stupio u interakciju s importinom-beta u GST-padajućem testu, što sugerira da SMN kompleks može predstavljati Sm jezgarni NLS receptor predviđen u prethodnim studijama. Autori su zaključili da, nakon sastavljanja SM proteina, SMN kompleks može opstati do završnih faza sazrijevanja citoplazmatskog snRNP i može pružiti RNP somatskih ćelija alternativni NLS.

## Biohemijska svokstva – Kristalna struktura
Dong et al. (2009) predstavili su kristalnu strukturu CRM1, rezolucije 2,9 angstroma, vezane za snurportin-1. Snurportin-1 veže CRM1 bipartitno, pomoću N-terminalnog jedarnog  eksportnog signala bogatog leucinom (LR-NES) i njegovi domeni koji vežu nukleotide.

LR-NES je kombinirana alfa-heliksom proširena struktura koja zauzima hidrofobni žlijeb između 2 CRM1 vanjske spirale. Interfejs LR-NES objašnjava konsenzusni hidrofobni obrazac, preferenciju za intervenciju elektronegativnih ostataka i inhibiciju leptomicina B. Drugi signalni epitop jedarnog eksporta osnovna je površina na domenu vezivanja nukleotida snurportina-1, koja veže kiselo obojenje na CRM1 u blizini lokacije LR-NES. Višestrano prepoznavanje pojedinačno slabih jedarnih izlaznih signalnih epitopa može biti zajedničko supstratima CRM1, poboljšavajući vezivanje CRM1 izvan LR-NES, uglavnom niskog afiniteta. Slična energetska konstrukcija koristi se također u višestraničnim signalima jedarne lokalizacije, kako bi se pružila široka specifičnost supstrata i brza evolucija u jedarnom transportu.
Monecke et al. (2009) predstavili su kristalnu strukturu izlaznog kompleksa SPN1-CRM1-RanGTP, pri rezoluciji od 2,5 angstroma. SPN1 je adapter za jedarni unos za citoplazmatski sastavljene splajsosomne U snRNP-ove s kapacijom od m3G. Struktura je pokazala kako CRM1 može specifično vratiti oblik SPN1, bez tereta u citoplazmu. Opsežno kontaktno područje uključuje pet hidrofobnih ostataka na amino-terminalu SPN1, koji se spajaju u hidrofobnu pukotinu CRM1, kao i brojne hidrofilne kontakte CRM1 na m3G domenu, koji veže kapu i karboksilne terminalne ostatke SPN1. Zaključili su da RanGTP promovira vezivanje tereta za CRM1 isključivo putem dugoročne konformacijske promjene u eksportu.
## Reference
## Dopunska literatura
*
*
*
*
*
*
*
*

## Vanjski linkovi
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 15
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika