IRF6

**Interferonski regulatorni faktor 6**, znan i kao **IRF6**, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom **IRF6** sa  hromosoma 1..
                             
## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 467 aminokiselina, a molekulska težina 53.130 Da.

1020304050
MALHPRRVRLKPWLVAQVDSGLYPGLIWLHRDSKRFQIPWKHATRHSPQQ
EEENTIFKAWAVETGKYQEGVDDPDPAKWKAQLRCALNKSREFNLMYDGT
KEVPMNPVKIYQVCDIPQPQGSIINPGSTGSAPWDEKDNDVDEEDEEDEL
DQSQHHVPIQDTFPFLNINGSPMAPASVGNCSVGNCSPEAVWPKTEPLEM
EVPQAPIQPFYSSPELWISSLPMTDLDIKFQYRGKEYGQTMTVSNPQGCR
LFYGDLGPMPDQEELFGPVSLEQVKFPGPEHITNEKQKLFTSKLLDVMDR
GLILEVSGHAIYAIRLCQCKVYWSGPCAPSLVAPNLIERQKKVKLFCLET
FLSDLIAHQKGQIEKQPPFEIYLCFGEEWPDGKPLERKLILVQVIPVVAR
MIYEMFSGDFTRSFDSGSVRLQISTPDIKDNIVAQLKQLYRILQTQESWQ
PMQPTPSMQLPPALPPQ

## Funkcija 
Ovaj gen kodira člana porodice interferonskih regulatornih transkripcijskih faktora (IRF). Članovi porodice dijele visoko konzerviran N-terminal helix-turn-helix DNK-vezujući domen i manje očuvan C-terminal domen za vezivanje proteina. Funkcija IRF6 povezana je s formiranjem veznog tkiva, na primjer onog nepca.  Ovaj gen kodira člana porodice interferonskog regulatornog transkripcionog faktora (IRF). Osim toga, uočeno je da je gen IRF6 pod epigenetičkom regulacijom promotora metilacij DNK.

## Patologija 
Mutacija IRF6 gena može dovesti do autosomno dominantnog van der Woudeovog sindroma (VWS) ili srodnog sindroma poplitelnog pterigija (PPS).  Van der Woudeov sindrom može uključivati  rascjep usne i nepca, zajedno sa dentalnim anomalijama i fistulama usana. Osim toga, uobičajeni aleli u IRF6 su također povezani sa nesindromskim slučajevima rascjepa usne i/ili nepca prema  studiji asocijacije na cijelom genomu i u mnogim studijama kandidata za gen. Ovi poremećaji uzrokovani su mutacijama u genu IRF6, a dio fenotipske heterogenosti uzrokovan je različitim tipovima mutacija IRF6-a. Spektar mutacija u VWS i PPS nedavno je sumarizovan. Pokazalo se da IRF6 ima ključnu ulogu u razvoju keratinocita. Uloga IRF6 u uobičajenim oblicima je također demonstrirana je i u slučajevima  rascjepa usne i nepca  i može objasniti samo ~20% slučajeva rascjepa usne. Varijante u IRF6 dale su dosljedne dokaze o povezanosti sa sindromskim rascjepom i/ili nepcem u više studija. Studija Birnbauma i kolega iz 2009. godine potvrdila je uticaj ovog gena na etiologiju rascjepa usne i/ili nepca, a studija GENEVA Cleft Consortium, koja je proučavala porodice iz više populacija, ponovo je potvrdila nalaze da su mutacije IRF6 snažno povezane s rascjepom usne i/ili nepca. Uloga IRF6 u izazivanju rascjepa usne i/ili nepca dalje je podržana analizom IRF6 mutantnih miševa koji pokazuju hiperproliferativnu epidermu koja ne prolazi kroz terminalnu diferencijaciju, što dovodi do višestrukih epitelnih adhezija koje mogu začepiti usnu šupljinu i rezultirati rascjepom nepca. Istraživanja na životinjskim modelima pokazuju da IRF6 određuje proliferaciju keratinocita i također ima ključnu ulogu u formiranju usnn periderme. Nedavno, korištenjem genetike miša, analiza ekspresije gena, studija imunoprecipitacije hromatina i testova reportera luciferaze, pokazalo se da je IRF6 direktna meta p63, koji je u osnovi nekoliko sindromskih malformacija, koje uključuju obilježja rascjepa, a p63 aktivira transkripciju IRF6 putem IRF6 pojačivačkog elementa. Varijacije u elementu pojačivača povećavaju podložnost samo rascjepu usne. I rascjep usne sa ili bez rascjepa nepca i samo rascjepom nepca uočene su u porodicama sa mutacijom IRF6-a. Osim toga, različiti tipovi rascjepa mogu se odvojiti unutar iste porodice. Metilacija promotora IRF6 može biti marker rizika od raka kod pacijenata oboljelih od ove bolesti. Iz tog razloga, ovaj gen je vjerovatno povezan s tumorigenezom i može biti potencijalni prognostički marker za progresiju preneoplazijske lezije grlića maternice. Slično tome, otkriveno je da je IRF6 genetički i epigenetički nereguliran u raku vulve.

## Također pogledajte 
* Interferonski regulatorni faktori

## Reference 
## Vanjski linkovi 
* GeneReview/NIH/UW entry on IRF6-Related Disorders
* 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 1
Kategorija:Transkripcijski faktori
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika