Preinicijacijski PIC

[alt=Skupina ovala koja predstavlja transkripcijski preinicijacijski kompleks smještena je unutar zakrivljenog lanca DNK, između promotorske regije na jednom kraju i pojačivačke regije na drugom.|thumb|Transkripcijski preinicijacijski kompleks, predstavljen centralnim klasterom proteina, uzrokuje vezivanje [RNK-polimeraza za ciljno mjesto DNK. PIC je u stanju vezati i promotorsku sekvencu blizu gena koji se transkribira i pojačivačku sekvencu u drugom dijelu genoma, omogućavajući pojačivačkim sekvencama da reguliraju gen udaljen od njega.]]
**Preinicijacijski kompleks** (skraćeno **PIC**) je kompleks od približno 100 proteina koji je neophodan za transkripciju gena koji kodiraju proteine kod eukariota i arheja. Preinicijacijski kompleks pozicionira RNA polimerazu II (Pol II) na genima mjesto početka transkripcije, denaturira DNK i pozicionira DNK u aktivno mjesto RNK polimeraze II za transkripciju.
Minimalni PIC uključuje RNK polimerazu II i šest općih transkripcijskih faktora: TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF i TFIIH. Dodatni regulatorni kompleksi (kao što je medijator koaktivator i kompleksi remodeliranja hromatina) također mogu biti komponente PIC-a.
 
Preinicijacijski kompleksi se također formiraju tokom transkripcije RNK polimeraze I i RNK polimeraze III.
 
## Sastavljanje (RNK polimeraza II)
Klasičan pogled na formiranje PIC-a na promotoru uključuje sljedeće korake:
* protein koji veže TATA (TBP, podjedinica TFIID-a) veže se za promotor, stvarajući oštar zavoj u DNK promotora.
*Životinje imaju neke faktore povezane s TBP-om (TRF; TBPL1/TBPL2). Oni mogu zamijeniti TBP u nekim posebnim kontekstima.
* TBP regrutuje TFIIA, a zatim TFIIB, na promotor.
* TFIIB regrutuje RNK polimerazu II i TFIIF na promotor.
* TFIIE se pridružuje rastućem kompleksu i regrutuje TFIIH koji ima aktivnost protein kinaze (fosforiliše RNK polimerazu II unutar CTD) i aktivnost DNK helikaze (odmotava DNK na promotoru). Takođe regrutuje proteine za popravku ekscizijom nukleotida.
* Podjedinice unutar TFIIH koje imaju ATPaznu i helikazu aktivnost stvaraju negativnu superspiraciju napetost u DNK.
* Negativna superspiracija uzrokuje da se približno jedan okret DNK odmota i formira transkripcijski mjehurić.
* Matricni lanac transkripcijskog mjehurića spaja se sa aktivnim mjestom RNK polimeraze II.
* Počinje sinteza RNK.
* Nakon sinteze ~10 nukleotida RNK i obavezne faze od nekoliko neuspjelih transkripcijskih ciklusa, RNK polimeraza II napušta promotorsku regiju kako bi transkribirala ostatak gena.
Alternativna hipoteza o PIC sastavljanju postulira regrutovanje prethodno sastavljenog "RNK polimeraza I holoenzima" direktno na promotor (sastavljen od svih, ili gotovo svih GTF-ova i RNK polimeraze II i regulatornih kompleksa), na način sličan bakterijskoj RNK polimerazi (RNAP).
 
## Ostali preinicijacijski kompleksi 
### Kod  Archaea 
Arheje imaju preinicijacijski kompleks koji podsjeća na minimizirani Pol II PIC, s TBP-om i arhejskim transkripcijskim faktorom B (TFB, homolog TFIIB-a). Sklapanje slijedi sličan slijed, počevši s vezivanjem TBP-a za promotor. Zanimljiv aspekt je da je cijeli kompleks vezan u inverznoj orijentaciji u usporedbi s onima koji se nalaze u eukariotskim PIC. Oni također koriste TFE, homolog TFIIE-a, koji pomaže u inicijaciji transkripcije, ali nije obavezan.

### RNK-polimeraza I (Pol I) 
Formiranje preinicijacijskog kompleksa Pol I zahtijeva vezivanje selektivnog faktora 1 (SL1 ili TIF-IB) za središnji element promotora rDNK. SL1 je kompleks sastavljen od TBP i najmanje tri TBP-vezana faktora (TAF). Za bazalne nivoe transkripcije potrebni su samo SL1 i inicijacijski kompetentan oblik Pol I (Pol Iβ), karakteriziran vezivanjem RRN3.
Za aktivirane nivoe transkripcije, potreban je i UBTF (UBF). UBTF se veže kao dimer i za uzvodni kontrolni element (UCE) i za osnovni element rDNK promotora, savijajući DNK i formirajući enhanceosom.
 
### RNK-polimeraza III (Pol III) 
Pol III ima tri klase inicijacije, koje počinju s različitim faktorima koji prepoznaju različite kontrolne elemente, ali svi se konvergiraju oko TFIIIB (slično TFIIB-TBP; sastoji se od TBP/TRF, TFIIB-vezanog faktora i B″ kompleks jedinice) koji regrutuju III poljski kompleks. Ukupna arhitektura podsjeća na onu kod Pol II. Samo TFIIIB treba ostati vezan tokom elongacije.
 
## Reference 
## Vanjski linkovi 
*Descriptive image – biochem.ucl.ac.uk
 

Kategorija:Ekspresija gena