MGC50722

**MGC50722**, znan i kao **neokarakterizirani protein LOC399693**, je  protein koji je kod ljudi  kodiran genom **MGC50722** (skr. eng. **M**ammalian **G**ene **C**ollection Project Gene **50722**). Ovaj 965-aminokiselinski ljudski protein ima molekulsku težinu 104,495 kDa i jedan domen nepoznate funkcije (DUF390). Općenito konzerviran kod sisara, ovaj brzo evoluirajući gen pokazuje relativno nisku ekspresiju u većini ljudskih tkiva, osim u sjemenicima.

## Gen 
Ljudski gen pune sdužine ima 40.364 parova baza, dok je neobrađena iRNK duga 25.960 parova baza. Nakon prerade introna, gen sa 10 egzona ima konačnu dužinu iRNK od 3.596 parova baza koja kodira 965 aminokiselina.

### Lokus 
Ljudski * MGC50722 * nalazi se na minus lancu hromosoma 9 u regiji q34 genoma (NCBI gen ID: 399693). Najokarakteriziraniji gen u ovoj regiji ljudskog genoma je *GPSM1*, koji kodira G-proteinski signalni modulator 1.

## Protein 
### Primarna sekvenca i izoforme * * 
Ljudski protein MGC50722 ima 104,495 kDa, sa izoelektričnom tačkom od 10,24. Mješovita nabijena skupina aminokiselina prisutna je između položaja 146 i 182, za koju se čini da je konzervirana kod primata, ali nije prisutna kod drugih sisara. Kod ljudi postoji i šest predviđenih izoformi. Serveri predviđanja na ExPASy također predviđaju više mjesta fosforilacije (NetPhos 2.0 Server), N-terminalno mjesto acetilacije (NetAcet 1.0 Server), mjesta glikacije (NetGlycate 1.0 Server) i mjesto GalNAc O-glikozilacije (NetOGlyc 4.0 Server) at conserved residues in the human MGC50722 protein.

### Sekundarna struktura 
Modeli predviđanja okarakterizirali su protein MGC50722 uglavnom poremećenim, ali sa dvije regije upredenih zavojnica.

### Unutrašnja struktura i svojstva proteina 
## Potencijalna funkcija 
Funkcija proteina MGC50722 je nepoznata. S obzirom na to da se preferirano eksprimiraa u testisima i čini se da je subćelijski lokaliziran u jedru, mogao bi imati važnu ulogu u čelijama gameta.

## Ekspresija 
Nivo ekspresije ljudskog MGC50722 je nizak/odsutan u većini tipova ćelija, a najveći i najobilniji i je u sjemenicima (GEO Profile IDs: 48997768 and 49895282).

### Promotor 
Početno mjesto transkripcije za *MGC50722* najbolje se poravnava sa SPZ1, faktorom određivanja testis (SRY), SP1F i FAST-ovim  veznim mjestima transkripcijskog faktora.

## Homologija i evolucija 
a alfa  i citohroma C. Svaka tačka podataka na grafikonu predstavlja drugi tip i homologni gen date vrste, identificiran BLAST-om. BLAST-ove pretrage provedene su korištenjem ljudskog gena MGC50722, fibrinogena i citohroma C, a postotak identiteta ucrtan je prema stvarnom odstupanju od čovjeka za dati tip homolognog gena]]

### Paralozi 
Utvrđeno je da je protein 350 povezan s centrosomom (CEP350) jedini mogući paralog proteinu MGC50722 kod ljudi. CEP350 je protein dug 3117 aminokiselina i poravnava se s proteinom MGC50722 na svom N-kraju. Ovo ukazuje na to da je razmak paraloga vrlo udaljen kada se * MGC50722* odvoji od *CEP350*.

### Ortolozi 
Konkurentni ortolozi za protein MGC50722 nalaze se samo u sisara, gdje se najviše konzervacije nalazi u N-terminalu i DUF390.

### Udaljeni homolozi 
Najdalji homolog koji se može otkriti je u hrskavičavih riba (divergencija prije 462,5 miliona godina).

### Homologni domen 
Domen nepoznate funkcije 390 (pfam04094: DUF390) dio je porodice proteina koji su identifikovani samo u genomu riža. Iako je funkcija ovog domena nepoznata, to može biti neki tip prijenosnog elementa. Teratozoospermija je stanje u kojem se tokom razvoja zrelih ćelija mijenja morfologija spermatozoida, što dovodi do, u nekim slučajevima, muške neplodnosti. Ekspresija gena pokazuje da je kod normalnih ljudi MGC50722 ispoljen, dok kod onih sa teratozoospermijom nivo ekspresije značajno opada ili se isključuje.
## Reference
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 
* 
*
*

Kategorija:Nekarakterizirani proteini
Kategorija:Geni na hromosomu 9
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika