C7orf25 protein UPF0415

**C7orf25-protein UPF0415** (UPF0415) je protein koji je kod ljudi kodiran genom na  hromosomu 7, u otvotenom okviru čitanja 25 (C7orf25), u domenu nepoznate funkcije 1308. C7orf25 nalazi se na minus lancu i kodira 12 proteina, od kojih je jedan UPF0415. Vjeruje se da je ovaj protein aktivan na putu proteasoma. C7orf25 protein UPF0415 nije transmembranski protein i nema signalni peptid. UPF0415 ima dvije izoforme, Q9BPX7-1 i Q9BPX7-2. Oboje se sastoje od  po dva egzona, koji su visoko konzervirani među kičmenjacima.

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 421  aminokiselina, а molekulska težina  46.451 Da.

1020304050
MSAHSMLCERIAIAKELIKRAESLSRSRKGGIEGGAKLCSKLKAELKFLQ
KVEAGKVAIKESHLQSTNLTHLRAIVESAENLEEVVSVLHVFGYTDTLGE
KQTLVVDVVANGGHTWVKAIGRKAEALHNIWLGRGQYGDKSIIEQAEDFL
QASHQQPVQYSNPHIIFAFYNSVSSPMAEKLKEMGISVRGDIVAVNALLD
HPEELQPSESESDDEGPELLQVTRVDRENILASVAFPTEIKVDVCKRVNL
DITTLITYVSALSYGGCHFIFKEKVLTEQAEQERKEQVLPQLEAFMKDKE
LFACESAVKDFQSILDTLGGPGERERATVLIKRINVVPDQPSERALRLVA
SSKINSRSLTIFGTGDTLKAITMTANSGFVRAANNQGVKFSVFIHQPRAL
TESKEALATPLPKDYTTDSEH

**C**: Cistein
**D**: Aspartat
**E**: Glutamat
**F**: Fenilalanin 
**G**: Glicin
**H**: Histidin
**I**: Izoleucin 
**K**: Lizin
**L**: Leucin
**M**: Metionin
**N**: Asparagin
**P**: Prolin
**Q**: Glutamin
**R**: Arginin
**S**: Serin
**T**: Treonin
**V**: Valin
:**W**: Triptofan
**Y**: Tirozin

## Osnovi
## Gensko susjedstvo
C7orf25 je otvoreni okvir čitanja koji kodira 12 proteina. Većina njih je nepoznate funkcije. Jedan od ovih proteina je UPF0415, a drugi je PSMA2 koji je također funkcionalan u proteasomskom putu. Drugi geni koji se nalaze u blizini proteina C7orf25 UPF0415 su TCP1P1, HECW1, MIR3943 i MRPL32.

## Predviđena obilježja  iRNK 
### Promotor 
Promotor za gen proteina C7orf25 UPF0415 obuhvata 600 parova baza, od 42,951.804 do 42,952.404, sa predviđenim  početnim mjestom transkripcije koje kodira sekvwncu od 1844 parova baza. Sekvenca se proteže od 42,908.726 do 42,912.090 bp. Promotorska regija i početak gena C7orf25 (20,008.263 do 20,009.250 bp) u prošlosti nije konzerviran. Ova regija je korištena za određivanje interakcije transkripcijskih faktora.

#### Faktori transkripcije 
Neki od glavnih faktora transkripcije koji se vežu za promotor navedeni su u nastavku.

## Funkcija i ekspresija
Vjeruje se da je protein C7orf25 UPF0415 aktivan u ATP-ovisnoj razgradnji proteina u proteasomskom putu. Kod ljudi, ekspriira se sveprisutno.

## Homologija
Protein C7orf25 UPF0415 ima jedan paralog koji je FLJ18411. UPF0415 je takođe visoko konzerviran kod kičmenjaka. Sljedeća tablela prikazuje mali izbor ortologa pronađenih pomoću BLAST-a i BLAT-a i njihov identitet s proteinom C7orf25 UPF0415.

## Predviđena obilježja proteina 
### Posttranslacijske modifikacije 
UPF0415 protein C7orf25 nije transmembranski protein, jer nema transmembranske domene. C7orf25 protein UPF0415 ima višestruku fosforilaciju za koju se vjeruje da je odgovorna za aktivaciju proteina.

Predviđeno je više petlji na  drškama u 3' i 5' UTR i vjeruje se da su one funkcionalne u transkripciji gena.

### Interakcije 
Ostali proteini za koje je poznato da stupaju u interakciju s proteinom C7orf25 UPF0415 su FRA10AC1, FLJ23825 i TUBB (tubulin, beta klasa I), a samo je TUBB povezan s aktivnošću proteasoma.

### Konceptna prezentacija 
Sve posttranslacijske modifikacije, genetički ili proteasomski faktori koji su relevantni za transkripciju i regulaciju proteina C7orf25 proteina UPF0415, gore spomenuti, označeni su u konceptnoj translaciji:
thumb|Konceptna translacija C7orf25
  C7orf25]]

## C7orf25
C7orf25 kodira 12 različitih transkripata. Dva od ovih transkripata su (PSMA2 i UPF0415). Još uvijek nema specifičnih fenotipova ili polimorfizama s mutacijom u C7orf25. Ovo sugerira da je ovaj otvoreni okvir čitanja važan za preživljavanje kod kičmenjaka. Donja slika prikazuje sve predviđene transkripte kodirane u C7orf25.

## Reference 
Kategorija:Geni na hromosomu 7
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika