PCNX

**Pekaneksoliki  protein 1**  je  protein koji je kod ljudi kodiran genom **PCNX**. Gen se nalazi u *Homo sapiens* i funkcionira kao kompetitivni endogeni RNK protein 2 povezan sa S-fazom kinaza u raku pluća.

Radijacijskom hibridnom analizom , Nagase et al. (1998) i Nagase et al. (1999) mapirali su gen PCNX1 na hromosomu 14.

Analizom genomske sekvence, Geisinger et al. (2005) locirali su  PCNX1 također na hromosomu 14, ali precizirali  i sekvencu na hromosom 14q24.1. Mapirali su i mišji  gen Pcnx1 na hromosomu 12C3.
Zatim Hartz (2017) lociralala je gen  PCNX1 na poziciji 14q24.2 hromosoma 14, na osnovu poravnavanja sekvence PCNX1 (GenBank AB023212)  sa genomskom sekvencom (GRCh38).

## Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je  2.341  aminokiselina, a molekulska težina   258.676 Da  .

1020304050
MGSQTLQILRQGVWAALSGGWYYDPHQATFVNALHLYLWLFLLGLPFTLY
MALPSTMIIVAVYCPVIAAVFIVLKMVNYRLHRALDAGEVVDRTANEFTD
QRTKAEQGNCSTRRKDSNGPSDPGGGIEMSEFIREATPPVGCSSRNSYAG
LDPSNQIGSGSSRLGTAATIKGDTDTAKTSDDISLSLGQSSSLCKEGSEE
QDLAADRKLFRLVSNDSFISIQPSLSSCGQDLPRDFSDKVNLPSHNHHHH
VDQSLSSACDTEVASLVPLHSHSYRKDHRPRGVPRTSSSAVAFPDTSLND
FPLYQQRRGLDPVSELESSKPLSGSKESLVENSGLSGEFQLAGDLKINTS
QPPTKSGKSKPLKAEKSMDSLRSLSTRSSGSTESYCSGTDRDTNSTVSSY
KSEQTSSTHIESILSEHEESPKAGTKSGRKKECCAGPEEKNSCASDKRTS
SEKIAMEASTNSGVHEAKDPTPSDEMHNQRGLSTSASEEANKNPHANEFT
SQGDRPPGNTAENKEEKSDKSAVSVDSKVRKDVGGKQKEGDVRPKSSSVI
HRTASAHKSGRRRTGKKRASSFDSSRHRDYVCFRGVSGTKPHSAIFCHDE
DSSDQSDLSRASSVQSAHQFSSDSSSSTTSHSCQSPEGRYSALKTKHTHK
ERGTDSEHTHKAHLVPEGTSKKRATRRTSSTNSAKTRARVLSLDSGTVAC
LNDSNRLMAPESIKPLTTSKSDLEAKEGEVLDELSLLGRASQLETVTRSR
NSLPNQVAFPEGEEQDAVSGAAQASEEAVSFRRERSTFRRQAVRRRHNAG
SNPTPPTLLIGSPLSLQDGQQGQQSTAQVKVQSRPPSQAAVLSASASLLV
RNGSVHLEASHDNASAVGGSSLHDELGKFSSTLYETGGCDMSLVNFEPAA
RRASNICDTDSHVSSSTSVRFYPHDVLSLPQIRLNRLLTIDTDLLEQQDI
DLSPDLAATYGPTEEAAQKVKHYYRFWILPQLWIGINFDRLTLLALFDRN
REILENVLAVILAILVAFLGSILLIQGFFRDIWVFQFCLVIASCQYSLLK
SVQPDSSSPRHGHNRIIAYSRPVYFCICCGLIWLLDYGSRNLTATKFKLY
GITFTNPLVFISARDLVIVFTLCFPIVFFIGLLPQVNTFVMYLCEQLDIH
IFGGNATTSLLAALYSFICSIVAVALLYGLCYGALKDSWDGQHIPVLFSI
FCGLLVAVSYHLSRQSSDPSVLFSLVQSKIFPKTEEKNPEDPLSEVKDPL
PEKLRNSVSERLQSDLVVCIVIGVLYFAIHVSTVFTVLQPALKYVLYTLV
GFVGFVTHYVLPQVRKQLPWHCFSHPLLKTLEYNQYEVRNAATMMWFEKL
HVWLLFVEKNIIYPLIVLNELSSSAETIASPKKLNTELGALMITVAGLKL
LRSSFSSPTYQYVTVIFTVLFFKFDYEAFSETMLLDLFFMSILFNKLWEL
LYKLQFVYTYIAPWQITWGSAFHAFAQPFAVPHSAMLFIQAAVSAFFSTP
LNPFLGSAIFITSYVRPVKFWERDYNTKRVDHSNTRLASQLDRNPGSDDN
NLNSIFYEHLTRSLQHSLCGDLLLGRWGNYSTGDCFILASDYLNALVHLI
EIGNGLVTFQLRGLEFRGTYCQQREVEAITEGVEEDEGFCCCEPGHIPHM
LSFNAAFSQRWLAWEVIVTKYILEGYSITDNSAASMLQVFDLRKVLTTYY
VKGIIYYVTTSSKLEEWLANETMQEGLRLCADRNYVDVDPTFNPNIDEDY
DHRLAGISRESFCVIYLNWIEYCSSRRAKPVDVDKDSSLVTLCYGLCVLG
RRALGTASHHMSSNLESFLYGLHALFKGDFRISSIRDEWIFADMELLRKV
VVPGIRMSIKLHQDHFTSPDEYDDPTVLYEAIVSHEKNLVIAHEGDPAWR
SAVLANSPSLLALRHVMDDGTNEYKIIMLNRRYLSFRVIKVNKECVRGLW
AGQQQELVFLRNRNPERGSIQNAKQALRNMINSSCDQPIGYPIFVSPLTT
SYSDSHEQLKDILGGPISLGNIRNFIVSTWHRLRKGCGAGCNSGGNIEDS
DTGGGTSCTGNNATTANNPHSNVTQGSIGNPGQGSGTGLHPPVTSYPPTL
GTSHSSHSVQSGLVRQSPARASVASQSSYCYSSRHSSLRMSTTGFVPCRR
SSTSQISLRNLPSSIQSRLSMVNQMEPSGQSGLACVQHGLPSSSSSSQSI
PACKHHTLVGFLATEGGQSSATDAQPGNTLSPANNSHSRKAEVIYRVQIV
DPSQILEGINLSKRKELQWPDEGIRLKAGRNSWKDWSPQEGMEGHVIHRW
VPCSRDPGTRSHIDKAVLLVQIDDKYVTVIETGVLELGAEV

:Simboli

**C**:  Cistein 
**D**: Asparaginska kiselina 
**E**: Glutaminska kiselina 
**F**:  Fenilalanin 
**G**:  Glicin 
**H**:  Histidin 
**I**:  Izoleucin 
**K**: Lizin 
**L**: Leucin 
**M**:  Metionin 
**N**:  Asparagin 
**P**:  Prolin 
**Q**:  Glutamin 
**R**:  Arginin 
**S**:  Serin 
**T**:  Treonin 
**V**:  Valin 
**W**:  Triptofan 
**Y**:  Tirozin

## Kloniranje i ekspresija 
Sekvenciranjem klonova dobijenih iz frakcionirane biblioteke cDNK ljudskog mozga, Nagase et al. (1998) dobili su djelimični klon PCNX1, koji su označili KIAA0805. Izvedena sekvenca od 1.327 aminokiselina imala je značajan identitet sa *Drosophila pecanex*. RT-PCR ELISA otkrila je varijabilnu ekspresiju KIAA0805 u svih 10 ispitivanih tkiva odraslih ljudi, sa najvećom ekspresijom u mozgu, plućima i jajnicima, praćeno sjemenicima, a najnižom ekspresijom u gušterači i slezeni.

Nagase et al. (1999) također su dobili parcijalni klon PCNX1, koji su označili kao KIAA0995. Izvedeni protein dijeli sličnost sekvence s ljudskim profilagrinom (FLG). RT-PCR ELISA test otkrio je KIAA0995 u svim ispitivanim tkivima odraslih i fetusa, kao i u svim ispitivanim regijama mozga odraslih.

Geisinger et al. (2005) dobili su djelomični pacovski klon Pcnx1 i izveli kodirajuću regiju pune dužine, ispitivanjem odgovarajuće genomske sekvence. Na osnovu poređenja sa Pcnx1 pacova, za ljudski protein PCNX1 pune dužine predviđeno je da sadrži 2.341 aminokiselinu. Northern blot i hibridizacija *in situ* otkrili su ekspresiju Pcnx1 samo u sjemenicima odraslih pacova, sa specifičnom ekspresijom u ćelijama zametne linije i najvećim intenzitetom nakon  mejotske  profaze.

## Reference 
## Dopunska literatura 
* 
* 
* 

Kategorija:Geni na hromosomu 14
Kategorija:Ljudski proteini
Kategorija:Proteomika