weiju/cmonkey-python — pull request #10 by fschmitz (2012-03-31 16:23:18+00:00)
Title: Lieber Wei-Ju

Ich habe Deine Änderungen eingearbeitet - oder vielmehr - meine wieder bei Dir eingearbeitet. Auch funktioniert jetzt die gesamte Scala Lösung und der Monkey läuft bis zum Schluss durch. MEME bedarf noch einige tweaks, es läuft aber mit 4.8.1. Die Geschwindigkeit ist verglichen mit R Wahnsinn - R brauchte 3 Tage, das hier brauchte 0.5 bis 1 Tag. Ich kann aber noch nichts über die Ergebnisse sagen.
Beim Display - Du schreibst log10 expression levels - icy denke das is a) abhängig von User und b) normalerweise log2 ratios.
was hast Du als nächstes vor? ich werde mal versuchen, meine Änderungen modularer zu machen, gestern war das schon ein Aufwand, auch wenn es sich gelohnt hat. Kannst Du Veränderungen (z.b. background model oder Network) gebrauchen.
So, jetzt aber mal schönes Wochenende!
Frank