分子設計軟件

分子設計軟體（Molecular design software）是從頭（de novo）開發提供特別支援的分子建模軟體。

與常見的分子建模程式（例如用於分子動力學和量子化學的程式）相比，此類軟體直接支援與構建分子模型相關的方面，包括：
 分子圖形學
 交互式分子繪圖和
 構建聚合分子、晶體和溶劑化系統
 的計算
 幾何優化
 支援力場開發的各個方面

 涵蓋分子設計主要方面的軟體比較 

 3D 滑鼠 聚 DNA 肽 晶 溶 荷 接 優 MM QM FF QSAR FBLD FE SN 備註                   生物分子圖形環境：大分子構建器、 AMBER                  經典分子建模程式 Ascalaph Designer                  通用分子建模套件                    發明者                   用於小分子和大分子系統的分子建模環境 DOCK                  DOCK 演算法  (PC GAMESS)                  從頭算 (Ab initio) 和 DFT 計算化學程式                   用於能量計算和蛋白質設計的力場                   分子對接軟體包 Materials Studio                       軟體環境                   分子建模/藥物發現應用平台，使用科學向量語言 (SVL) 編寫以支援應用程式自訂和開發 Rosetta (RosettaCommons)                  大分子建模套件。用於蛋白質結構建模和分析的演算法。在從頭蛋白質設計、酶設計、配體對接、結構預測方面有關鍵進展                   計算奈米科學（生命科學、材料等）；模組化架構，模組稱為 Elements；免費                   通用目的分子建模套件                   具有分子力學和量子化學引擎的分子建模工具                   蛋白質設計工具；免費軟體                   材料科學的分子建模和視覺化程式                   用於生命科學和材料科學的分子建模平台

 註釋和參考文獻 

 參見 

 外部連結 
分子設計 molecular design  IUPAC術語定義。
電腦輔助分子設計期刊 Journal of Computer-Aided Molecular Design
分子建模資源 Molecular Modeling resources 
材料建模和電腦模擬程式碼 Materials modelling and computer simulation codes 
Click2Drug.org 電腦模擬（電腦輔助）藥物設計工具目錄。
化學資訊與建模期刊 Journal of Chemical Information and Modeling 
計算化學期刊 Journal of Computational Chemistry 

Category:科學軟體
Category:計算化學軟體
Category:分子動力學軟體
Category:分子模擬軟體