尼尔菌属

尼尔菌属（学名：，或译尼尔属）是芽孢杆菌目芽孢杆菌科的一种革兰氏阳性杆状细菌。 该属的模式种是环状尼尔菌（）。

尼尔菌属的成员以前是属于芽孢杆菌属的物种，由于以前用于将物种划分到该进化枝的标准不明确， 科学界长期以来认为该属表现出广泛的多系和系统发育异质性。已经发表了多项使用比较系统发育分析的研究，试图阐明芽孢杆菌属物种之间的进化关系，从而建立了许多新的属，例如嗜碱盐芽孢杆菌属（Alkalihalobacillus）、短芽孢杆菌属（Brevibacillus）、土壤芽孢杆菌属（Solibacillus）、脂环酸芽孢杆菌属（Alicyclobacillus）、枝芽孢杆菌属（Virgibacillus）和（Evansella）。 此外，芽孢杆菌属已被限制为仅包括与枯草芽孢杆菌和蜡样芽孢杆菌密切相关的物种。

细菌属“Niallia”的名字以英国微生物学家尼尔·A·洛根（Niall A. Logan）教授（格拉斯哥卡利多尼亚大学）的名字命名，以表彰他对芽孢杆菌属成员的分类和用途做出的诸多贡献。

 生化特征和分子特征 
该属成员均为兼性厌氧生物，存在于土壤、污水、食物和人类粪便等多种环境中。所有成员均能运动并产生内生孢子。尼尔菌属的最佳生长温度为30—37°C。 环状尼尔菌是一种重要的细菌，用于水产养殖、生物修复、水处理和酶生产。它也是一种机会性病原体，可导致免疫功能低下患者发生败血症。在蛋白质GAF结构域蛋白和DNA连接酶D中，已鉴定出两个该属独有的（CSI），在大多数情况下，它们由该属的所有或大多数成员独有。 这些CSI是通过分析尼尔菌属物种的基因组序列而确定的，并提供了一种可靠的方法，可以从分子角度将尼尔菌属与其它芽孢杆菌科下的属和细菌区分开来。

 分类学 
截至2021年5月，尼尔菌属共包含5个具有有效发布名称的物种。 在研究芽孢杆菌属内部分类关系的研究中，该属被鉴定为一个单系进化枝，并且在系统发育上与其他芽孢杆菌属的物种无关。 在基因组分类学数据库（GTDB）中也观察到了这种分支模式。

还发现一种未有效发表的物种“Bacillus tuaregi（图阿雷格芽孢杆菌）”在系统发育树中与尼尔菌属的其他成员分组，并以保守特征插入缺失（CSI）的形式共享相同的分子标记。 然而，由于缺乏培养菌株信息，该属的转移并未正式提出。随着更多基因组和新物种的发现和归属，该属需要进一步修订。

系统发育
 基于16S rRNA LTP_10_2024 基于120种标记蛋白 GTDB 09-RS220

参阅
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参考文献

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