3D Slicer

3D Slicer是開源的跨平台醫學影像視覺化和三維重建軟體。由美國國家衛生院和全球開發者社群的支援下開發。


它被廣泛用於多種醫療用途，包括自閉症、多發性硬化症、全身性紅斑狼瘡、前列腺癌、肺癌、乳腺癌、思覺失調症、骨科、生物力學、慢性阻塞性肺病、心血管疾病和神經外科。

關於 3D Slicer
3D Slicer是一個免費的開源軟體（基於BSD授權條款），用於影像分析、影像視覺化以及影像導引放射治療（Image Guided Radiotherapy,IGRT），可被用於Linux、MacOSX和windows等作業系統，它具有相當良好的可擴充性，可以透過嵌入模組的方式添加新的功能。

3D Slicer適用於查看全身各個組織的器官，相容於核磁共振造影（MRI）、電腦斷層掃描（CT）、超音波（US）以及顯微鏡下的影像。


3D Slicer支援二維多平面重建，可以用 3D 的形式將器官以不同的角度進行切割來查看不同的切面，並可結合核磁共振造影(MRI)的數據，讓醫師可以對危險程度較高的手術進行更多的事前模擬。 

3D Slicer的功能包括：Pieper S., Lorensen B., Schroeder W., Kikinis R. The NA-MIC Kit: ITK, VTK, Pipelines, Grids and 3D Slicer as an Open Platform for the Medical Image Computing Community. Proceedings of the 3rd IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro 2006; 1:698-701.
 處理DICOM格式的影像，並支援讀取/寫入其他種類的格式
 支援多邊形網格、二維多平面重建以及立體渲染的視覺化
 手動編輯影像
 自動進行影像分割
 擴散張量磁振造影（Diffusion Tensor Imaging,DTI）的數據分析和視覺化。

3D Slicer以BSD授權條款發佈。雖然該許可證在學術及商業用途上沒有任何限制，但是使用者有責任在遵守當地法規的情況下使用，而3D Slicer目前尚未獲得美國FDA正式批准於臨床上使用。

作業系統要求 
 Windows：Windows 10需要1903（2019年5月更新）以上的版本來支援（UTF-8）格式的文字。微軟不再支援Windows 8.1和Windows 7，所以未在這些作業系統上對3D Slicer進行過測試，但仍然可以使用。
 macOS：macOS High Sierra（10.13）或更高版本。
 Linux：Ubuntu 18.04或更高版本
 CentOS 7或更高版本。

 圖片集 

歷史
3D Slicer最初是由MIT的研究生David Gering於1998年和1999年提出的，當時3D Slicer被作為布萊根婦女醫院的外科計劃實驗室與MIT人工智慧實驗室之間的碩士學位論文的一部分。 四年後，3D Slicer 2於2002年發佈，可以透過FTP伺服器免費取得，當時已有數千次的下載量。2007年，3D Slicer於版本3進行了全面的改造。而3D Slicer於2009年開始下一個主要重構，它將3D Slicer採用的GUI套件從KWWidgets轉換為Qt。採用Qt的3D Slicer 4於2011年發布。

用戶
3D Slicer已被用於多種臨床研究中。在影像導引放射治療（Image Guided Radiotherapy,IGRT）的研究中，3D Slicer常被用於建立和視覺化MRI數據，這些數據在手術前和手術中均可用，並可取得用於儀器跟踪的空間坐標。 實際上，3D Slicer在影像導引放射治療中已經發揮了舉足輕重的作用，自1998年以來已有200多家出版物在文獻中引用了3D Slicer。For a list of publications citing Slicer usage since 1998, visit: http://www.slicer.org/publications/pages/display/?collectionid=11 

除了從MRI影像中生成3D模型外，3D Slicer還被用於顯示從fMRI中獲得的訊息、  DTI(diffusion tractography) 和心電圖。 例如，3D Slicer允許DTI影像的轉換和分析。分析的結果可以與MRI，MR血管造影和fMRI的分析結果結合。3D Slicer的其他用途包括古生物學的研究和神經外科手術計劃。

開發人員
3D Slicer建立在VTK環境中，VTK是一種跨平台的圖形應用函式庫，已廣泛用於科學視覺化和ITK（Insight Segmentation and Registration Toolkit）中，ITK是一種廣泛用於開發影像分割和圖像配准的框架。在3D Slicer 4中，程式的核心是使用C ++開發而成，並且可以通過Python程式使用該API ，界面使用Qt來開發，可以使用C ++或Python進行擴充。

3D Slicer支援使用輕量級的XML規範包裝任何語言的CLI程式，從中自動生成圖形使用者介面（GUI）。

對於未在3D Slicer核心程式中發佈的模組，可以使用系統自動建立和分發，以便用戶從3D Slicer中進行選擇並下載。

3D Slicer在建立過程會利用CMake自動建立必備和可選的程式庫（不包括Qt）。

參見
VTK
Python
QT
CMake
MPR

參考文獻

外部連結
Slicer 
Category:自由跨平台软件