田岛D检验

田岛D检验（）是日本学者田岛文生于1989年提出的一种统计检验方法，用于检验DNA序列在演化过程中是否遵循中性演化模型。

科学原理
在选择中性模型下，对于一个处于突变-漂变平衡且大小稳定的群体，群体参数「」可以通过计算两两核苷酸差异的平均值「」和分离核苷酸位点数量「」两种方法来估算，且二者相等。因此：

对于双倍体DNA：



对于单倍体DNA：



在公式中，“”表示分离位点的数量，“”表示样本数，“”表示有效群體大小，“”则表示基因突变率。

在存在自然选择或其他破坏中性模型的因素存在时，「」与「」的期望值会发生变化，且不再相等。通过这两者估测的「」值「」与「」之间的差异d，即田岛D检验的统计基础，统计量为与其标准差之商，即：

田岛文生用计算机模拟证明，统计量符合貝塔分布（Beta distribution）。对某一样本，若值处于置信区间之外，则可以拒绝零假设，即否定选择中性。

检验结果阐释
 田岛D值  数学依据  生物学解释1  生物学解释2 D=0  等于（观测值=期望值）：平均两两核苷酸差异等于分离位点数 差异性的观测值符合期望值 群体演化处于突变-漂变均衡，无自然选择的印记 D<0且结果显著 小于（观测值<期望值）：平均两两核苷酸差异小于分离位点数 罕见等位基因过量（罕见等位基因过剩） 近期的选择扫荡或近期瓶颈效应之后的群体扩张 D>0且结果显著 大于（观测值>期望值）：平均两两核苷酸差异大于分离位点数 罕见等位基因不足（罕见等位基因过少） 平衡选择或群体紧缩

 参考文献 

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Category:统计遗传学
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