核苷酸多樣性

核苷酸多樣性（nucleotide diversity）是分子遺傳學（分子生物學）中的一個概念。該概念用於表徵某一種群中多態性的強弱。

根井正利和李文雄在1979年引入了一種計算核苷酸多樣性的方法：在從某一種群中取得的多個樣品DNA上隨機取一段序列，將在這些序列上的同一位點鹼基的不同取平均值，即可得核苷酸多樣性的值。他們將這個值記爲「π」。

這種方法用數學公式表示如下：


xi 、xj分別代表第i個和第j個序列的對應頻率比如一共擁有5個樣本，那麼xi 、xj均爲1/5。πij則爲兩個序列之間不同位點所佔百分比舉個例子來說，假設第i個樣本的序列爲ATTAC，第j個樣本的序列爲ATTAT。進行比較可知，兩個序列的長度均爲5個鹼基對，其中有一對鹼基對在兩個樣本間是不同的，πij爲1/5。n則爲總樣本數。

核苷酸多樣性是遺傳變異（genetic variation）的一個量化值。核苷酸多樣性通常與其他衡量種群多樣性的數值有聯繫，同時也和期望雜合度（expected heterozygosity）有聯繫。核苷酸多樣性通常用於衡量種群內或種群間的多樣性，或作物與相關物種間的遺傳變異。另外，核苷酸多樣性還可以用於推算進化關係。

可通過直接比對DNA序列來算出核苷酸多樣性，亦可使用用分子標記得出的數據（比如使用隨機擴增多態性DNA（RAPD）技術或擴增片段長度多態性PCR（AFLP-PCR）得出的數據）推算出。

註釋

參考

外部連結
一個計算核苷酸多樣性的教程 

Category:分子遺傳學