人类蛋白质组计划

人类蛋白质组计划（，缩写：HPP）Legrain, P. et al. The human proteome project: Current state and future direction. Mol Cell Proteomics. 10:M111.009993 (2011).是由人类蛋白质组组织（HUPO）HUPO (Human Proteome Organization) 1st World Congress. Mol Cell Proteomics. 9:651-752 (2002).协调的合作计划，目标是通过实验观察所有从人类基因组翻译序列产生的蛋白质。

 历史  
人类蛋白质组组织已成为许多长期运行的蛋白质组学研究项目的协调机构，这些研究项目与临床兴趣的特定人体组织有关，如血浆Omenn, G.S. et al. Overview of the HUPO Plasma Proteome Project. Proteomics. 5, 3226-45 (2005).，肝He, F. Human liver proteome project: plan, progress, and perspectives. Mol Cell Proteomics. 4, 1841-8 (2005).，脑Hamacher, M. et al. HUPO Brain Proteome Project: toward a code of conduct. Mol Cell Proteomics. 7, 457 (2008).，和尿Yamamoto, T., Langham, R.G., Ronco, P., Knepper, M.A. & Thongboonkerd, V. Towards standard protocols and guidelines for urine proteomics. Proteomics. 8, 2156-9 (2008).。它还负责与蛋白质大规模研究相关的具体技术Uhlen, M. & Ponten, F. Antibody-based proteomics for human tissue profiling. Mol Cell Proteomics. 4, 384-93 (2005).和标准Orchard, S. et al. Current status of proteomic standards development. Expert Rev Proteomics. 1, 179-83 (2005).。

在科学文献中，将平行于人类基因组计划的一个更大项目的结构和目标被辩论Archakov A, et al. The Moscow HUPO Human Proteome Project workshop.
Mol Cell Proteomics. 8:2199-200 (2009).Baker MS. Building the 'practical' human proteome project - the next big thing in basic and clinical proteomics. Curr Opin Mol Ther. 2009 11:600-2 (2009).Editorial, The call of the human proteome. Nat Methods. 7:661 (2010).Rabilloud T., et al. Is a gene-centric human proteome project the best way for proteomics to serve biology? Proteomics. 10:3067-72 (2010).Editorial. A Gene-centric Human Proteome Project. Mol Cell Proteomics. 9:427-429 (2010).。经过2009年、2010年和2011年世界大会和一系列会议，人类蛋白质组组织将人类蛋白质组计划分为两个子项目C-HPP和B/D-HPP进行Paik, Y-K., et al. A Chromosome-Centric Human Proteome Project to Characterize the Sets of Proteins Encoded in the Genome. Nature Biotech.30: 221–3(2012).。其中C-HPP将分成25工作组，每个人类染色体1个工作组。而B/D-HPP将按照蛋白质的生物学和疾病相关性进行分组Aebersold R., et al. The Biology/Disease-driven Human Proteome Project (B/D-HPP): Enabling Protein Research for the Life Sciences Community. J. Proteome Res. 12:23–27 (2013).。

 项目和工作组 
当前设定的工作组列举如下（取自www.c-hpp.org ），按照染色体顺序排序。

 染色体 组长 所属机构国家或地区 1 Fuchu He 中国 2 Lydie Lane 瑞士 3 Toshihide Nishimura 日本 	  4 Yu Ju Chen 台湾 5 Rainer Bischoff 荷兰 6 Paul Keown 加拿大 7 Mark Baker 澳大利亚、新西兰	  8 Pengyuan Yang 中国 9 Je-Yoel Cho 韩国，汉城 10 Joshua Labaer 美国 11 Jong Shin Yoo 韩国 12 Visith Thongboonkerd 印度、新加坡、台湾、泰国 	  13 Young Ki Paik 韩国 14 Jérôme Garin 法国 15 Gilberto B Domont 巴西 16 Fernando Corrales 西班牙 17 Bill Hancock 美国 18 Alex Archakov 俄国 19 Gyorgy Marko Varga 瑞典 20 Siqiu Liu 中国 21 Daniel Figeys 加拿大 22 Charles Lee 美国 X Tadashi Yamamoto 日本 Y Hosseini Salekdeh 伊朗 MT Andrea Urbani 意大利

 计算资源 
由Eric Deutsch领导的、美国西雅图系统生物研究所（）的小组正在提供基于MS/MS的蛋白质组学结果的数据简化、分析和验证。与抗体方法相关的数据处理由在瑞典斯德哥尔摩的Kalle von Feilitzen（Human Protein Atlas）进行协调。在瑞士日内瓦SIB的Lydie Lane负责整体整合和报告信息（）。生成的所有数据都存入数据库，作为HPP贡献的一部分。

 现状 
正在进行的按照染色体为基础的人类蛋白质组计划是《蛋白质组研究杂志》（Journal of Proteome Research）特刊（2014年1月3日，第13卷，第1期）的主题。整个项目的状态是在该期上的社论讨论Paik Y-K., et al. Genome-wide Proteomics, Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP), Part II. J. Proteome Res. 13:1–4 (2014).。

一个单独的CHPP-维基 已经被该项目的生物信息学组建立维护当前项目的信息，包括会议、活动、标准操作程序和其他特殊资源的个体染色体团队。

与蛋白质观察相关的置信水平的指标是本项目的关键组成部分。如何定义对所使用的各种实验协议有意义的指标是正在进行的辩论的主题：目前的共识度量已经被发布Omenn GS., et al. Metrics for the Human Proteome Project 2015: Progress on the Human Proteome and Guidelines for High-Confidence Protein Identification. J Proteome Res.  14:3452-60 (2015).。

描述项目最新状况的杂志文章，并宣布推出“Missing ProteinPedia”可以在这里被发现Horvatovich P., et al. A Quest for Missing Proteins: update 2015 on Chromosome-Centric Human Proteome Project. J Proteome Res. Jun 15 (2015).。

 参阅 
 蛋白质组
 蛋白质组学


 参考资料 

 外部链接 
HPP project page (www.hupo.org) 
HPP web site (www.thehpp.org) 
Chromosome-centric HPP web site (www.c-hpp.org) 
BD HPP web site (www.thehpp.org/BD-HPP.php)

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