微RNA与微RNA靶数据库

小分子核糖核酸（microRNA，miRNA，微RNA）是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA 分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控.。microRNA (微RNA)参与各种各样的生物学过程，包括凋亡、增殖、分化和细胞周期。此外，microRNA(微RNA)还与肿瘤和其他疾病的发生和发展相关。这里收集了目前比较流行的microRNA（微RNA）基因及其靶基因数据库，以便大家使用和查询.

microRNA靶基因数据库
 数据库名字 数据库描述 数据库类型 网页链接 参考文献targetScantargetScan 搜寻动物的microRNA靶基因。  database,webserver  website   starBasestarBase 从高通量的CLIP-Seq实验数据（CLIP-Seq和HITS-CLIP）和降解组实验数据中（degradome sequencing）搜寻micorRNA的靶标。提供了各式各样的可视化界面去探讨microRNA的靶标  database  website  PicTarPicTar 联合的microRNA靶标预测。  database,webserver,predictions  website  PITAPITA基于靶位点的可接性（target-site accessibility）预测microRNA的靶标。webserver,predictions  predictions   RNA22RNA22基因序列特征预测microRNA的结合位点。  webserver,predictions  webserver  miRecords一个整合的microRNA靶标数据库。  database  website  TarBase一个全面收集已被实验验证的microRNA靶标数据库。  database  website  miRTarBase一个全面收集已被实验验证的microRNA靶标数据库。  database  website  

MicroRNA数据库
 数据库名字 数据库描述 数据库类型 网页链接 参考文献deepBasedeepBase 从新一代测序技术（深度测序技术，deep-sequencing）数据中注释和鉴定microRNA，piRNA，siRNA基因及长非编码RNA基因及其他们的表达模式。  database  website  miRBasemiRBase 数据库是查询和发布发表的microRNA基因。  database  website   microRNA.orgmicroRNA.org 构建和查询microRNA的表达模式及microRNA的靶标。  database  website  miRGenmiRGen研究动物的microRNA基因组织和功能。  database  website   miRNAMapmiRNAMap: 动物microRNA基因的基因组的map和microRNA的靶基因。   database  website  PMRD植物microRNA数据库  database  website    .

参考资料

延伸阅读




 外部链接 
 miRBase database 
 deepBase database
 starBase database
 targetScan 
 picTar
 miRecords database

Category:RNA
Category:小分子核糖核酸
Category:生物信息學
Category:生物學資料庫