亲水指数

某种氨基酸的亲水指数（hydropathy index）是一个描述其支链的亲水性或疏水性程度大小的值。“亲水指数”于1982年被Jack Kyte与Russell Doolittle提出。亲水指数越大，这种氨基酸的疏水性就越强。

亲水指数是根据蒸汽至水相转移的ΔtrGmɵ以及在形成蛋白质时氨基酸在表面和内部的分布测算的。疏水性最强的两种氨基酸分别是异亮氨酸（亲水指数为4.5）与缬氨酸（亲水指数为4.2）；亲水性最强的两种氨基酸分别是精氨酸（亲水指数为-4.5）和赖氨酸（亲水指数为-3.9）。

+ 20种常见氨基酸的亲水指数（基于Kyte与Doolittle的数据，缩写符号参见氨基酸) R  K  N  D  Q  E  H  P  Y  W  S  T  G  A  M  C  F  L  V  I -4.5  -3.9  -3.5  -3.5  -3.5  -3.5  -3.2  -1.6  -1.3  -0.9  -0.8  -0.7  -0.4 1.8  1.9   2.5   2.8   3.8  4.2  4.5

+ Eisenberg consensus scale（ECS）提供的20种常见氨基酸的亲水指数 R  K  D  Q  N  E  H  S  T  P  Y  C  G  A  M  W  L  V  F  I -2.5  -1.5  -0.90  -0.85  -0.78  -0.74  -0.40  -0.18  -0.05  0.12  0.26  0.29  0.48  0.62  0.64  0.81  1.1  1.1  1.2  1.4

用途
亲水指数在蛋白质结构的研究中十分重要。具有疏水性的氨基酸在蛋白质的三维结构中更常见于蛋白质的内部，而具有亲水性的氨基酸更常出现在蛋白质的表面。

另一个重要用途是预测膜蛋白在细胞膜中的分布。如果发现膜蛋白有连续二十个左右的氨基酸都具有较强的疏水性，那么很有可能这一段氨基酸是膜蛋白横跨细胞膜的部分。

 参见 

Category:生物物理学
Category:分子间作用力