Tiểu phần lớn ở nhân thực (60S)

Các hạt ribosome được phân biệt theo hệ số lắng của chúng với đơn vị là Svedberg (S). Tiểu phần 60S là tiểu đơn vị lớn của ribosome 80S của sinh vật nhân chuẩn. Tiểu phần này có cấu trúc và chức năng liên quan đến tiểu phần 50S của ribosome 70S ở bọn nhân sơ. Tuy nhiên, tiểu đơn vị 60S là lớn hơn nhiều so với tiểu đơn vị 50S của nhân sơ và chứa nhiều phân đoạn protein bổ sung, cũng như các đoạn mở rộng ARN ribosome.

 Cấu trúc chung 
Đặc điểm đặc trưng của tiểu đơn vị lớn, được hiển thị bên dưới trong "Crown View", bao gồm một vùng lồi lên ở trung tâm (CP) và hai nhánh hai bên, được đặt tên theo thành phần protein vi khuẩn của chúng (nhánh L1 ở bên trái như được thấy từ mặt trong tiểu đơn vị và nhánh L7 / L12 ở bên phải). Có ba vị trí cho tRNA gắn vào, là miền A, miền P và miền E (xem bài viết về Dịch mã để biết chi tiết). Lõi của tiểu đơn vị 60S được hình thành bởi RNA ribosome 28S (viết tắt là 28S rRNA), tương đồng với rRNA 23S ở nhân sơ, cũng góp phần vào vị trí hoạt động (lõi của peptidyl transferase, PTC) của ribosome. rRNA lõi được đi kèm với hàng chục protein. Trong hình "Cấu trúc tinh thể của tiểu đơn vị ribosome nhân thực 60S từ T. thermophila", lõi rRNA được biểu diễn là một dải màu xám và các đoạn mở rộng được thể hiện bằng màu đỏ. Protein có tương đồng ở cả sinh vật nhân chuẩn, vi sinh vật cổ và vi khuẩn được thể hiện là dải màu xanh. Protein chỉ được giống nhau giữa các sinh vật nhân chuẩn và vi sinh vật cổ được thể hiện là các dải màu cam và các protein đặc trưng cho sinh vật nhân chuẩn được biểu hiện là các dải màu đỏ.

 Các protein ribosome của tiểu phần 60S 
Bảng "Protein ribosome 60S" cho thấy các nếp gấp protein riêng lẻ của tiểu đơn vị 60S vẫn sử dụng mã màu như trên. Các phần mở rộng cụ thể của sinh vật nhân thực, từ một vài chuỗi bên hoặc vòng lặp đến các xoắn alpha rất dài và các miền bổ sung, đều được đánh dấu bằng màu đỏ.

Trong lịch sử, các thuật ngữ khác nhau đã được sử dụng cho các protein ribosome. Ví dụ, các protein đã được đánh số theo tính chất di chuyển của chúng trong các thí nghiệm điện di gel. Do đó, các tên gọi khác nhau có thể chỉ các protein tương đồng từ các sinh vật khác nhau, trong khi các tên giống hệt nhau lại không nhất thiết biểu thị các protein giống nhau. Bảng "Protein ribosome 60S" liên kết chéo các tên protein ribosome của con người mà tương đồng ở nấm men, vi khuẩn và vi sinh vật cổ. Thông tin thêm có thể được tìm thấy trong cơ sở dữ liệu gen protein ribosome (RPG).

+ Protein ribosome 60S  Cấu trúc (Nhân thực)<ref>Structure of the T. thermophila,' proteins from the structures of the large subunit PDBS 417, 4A19</ref>
! H. sapiensNomenclature according to the ribosomal protein gene database, applies to H. sapiens and T. thermophila
! amino acid
! Bảo thủEAB means conserved in eukaryotes, archaea and bacteria, EA means conserved in eukaryotes and archaea and E means eukaryote-specific protein
! S. cerevisiaeTraditionally, ribosomal proteins were named according to their apparent molecular weight in gel electrophoresis, leading to different names for homologous proteins from different organisms. The RPG offers a unified nomenclature for ribosomal protein genes based on homology.
! Tương đồng ở Vi khuẩn (E. coli'')  Tương đồng ở Vi sinh vật cổ thumb RPLP0 318EABP0L10L10 thumb  RPL3 404 EABL3L3L3 thumb  RPL4 428 EABL4L4L4 thumb  RPL5 298 EABL5L18L18p thumb  RPL6 289 EL6n/an/a thumb  RPL7 254 EABL7L30L30 thumb RPL7A 267EAL8n/aL7Ae thumb  RPL8 258 EABL2L2L2 thumb  RPL9 193 EABL9L6L6 thumb RPL10 215EABL10L16L10e thumb RPL11 EABL11L5L5 thumb RPL13 EAL13n/aL13e thumbRPL13A 204EABL16L13L13 thumb RPL14 221EAL14n/aL14e thumb RPL15 205EAL15n/aL15e thumb RPL17 185EABL17L22L22 thumb RPL18 189EAL18n/aL18e thumbRPL18A 177EAL20n/aLx thumb RPL19 197EAL19n/aL19 thumb RPL21 161EAL21n/aL21e thumb RPL22 129EL22n/an/a thumb RPL23 141EABL23L14 L14p thumbRPL23A 157EABL25L23 L23 thumb RPL24 158EAL24n/aL24e thumb RPL26 146EABL26L24L24 thumb RPL27 137EL27n/an/a thumbRPL27A 149EABL28L15 L15 thumb RPL28 En/aRPL28 has no detectable homolog in  yeastn/an/a thumb RPL29 EL29n/an/a thumb RPL30 116EAL30n/aL30e thumb RPL31 126EAL31n/aL31e thumb RPL32 136EAL32n/aL32e thumb RPL34 118EAL34n/aL34e thumb RPL35 124EABL35L29 L29 thumbRPL35A EAL33n/aL35Ae thumb RPL36 106EL36n/an/a thumbRPL36A 107EAL42n/aL44e thumb RPL37 98EAL37n/aL37e thumbRPL37A EAL43n/aL37Ae thumb RPL38 EAL38n/aL38e thumb RPL39 52EAL39n/aL37Ae thumb RPL40 129EAL40n/aL40e

Xem thêm
 Tiểu phần nhỏ ở nhân thực (40S)

Tham khảo

 Liên kết ngoài 
 Cơ sở dữ liệu Gen Protein Ribosome (RPG)

Thể loại:ARN ribosome