AcademiX GNU/Linux

AcademiX GNU/Linux, özellikle eğitim için geliştirilmiş Debian tabanlı Romanya menşeli bir Linux dağıtımıdır. Dağıtım, Debian Linux (Stretch/Buster) dağıtımı üzerine kurulmuştur ve eğitim için özgür yazılım içerir. Dağıtıma dahil olan programlar, ilköğretim seviyesinden üst seviyeye ve/veya üniversite seviyelerine kadar tüm eğitim seviyeleri içindir. Dağıtım, varsayılan olarak MATE masaüstünü kullanır. Mevcut olan son versiyon, 3 Mayıs 2020 tarihinde yayımlanan 2.5 sürümüdür.

Dağıtım Hakkında
AcademiX Linux dağıtımı, matematik, fizik, kimya, coğrafya, biyoloji, istatistik, elektronik, amatör radyo, grafik, ofis, programlama alanlarında çeşitli uygulamaları yüklemek için kullanılabilen bir kurulum yardımcı programını (EDU olarak adlandırılır) içerir - bunların yanında sanal etkileşimli laboratuvarlar ve NASA ile işbirliği içinde geliştirilen sanal bir mikroskop. Robotik Laboratuvarları, dağıtım tarafından sağlanan eğitim programlarının listesini başarıyla tamamlamıştır.

Özel bir bölüm öğretmenlere ayrılmıştır ve hem öğrencilerin kullanımı hem de çevrimiçi yayıncılık için çeşitli makaleler ve içerikler oluşturmalarına olanak tanır. Kurulum yardımcı programı, tek bir tıklama ile kolayca kurulabilen 150'den fazla eğitim programı sunar.

Bazı programlar Debian'a özgüdür, diğerleri geliştirilmiştir ve ABD ve Avrupa'daki çeşitli üniversiteler tarafından kullanılmaktadır. MATE tabanlı masaüstü ortamı, düşük kaynak kullanımı ile modern ve sezgisel bir arayüz arasında iyi bir uzlaşma sunar, böylece dağıtım, hala farklı eğitim kurumları tarafından kullanılan eski bilgisayarlarda sorunsuz bir şekilde çalışabilir.

Bu dağıtımda sağlanan eğitim yazılımlarının çoğu GNU GPL veya BSD lisansları altında lisanslanmıştır, böylece AcademiX GNU/Linux son kullanıcı maliyetleri yalnızca sürekli bakım ve yükseltmelerle temsil edilir. Dağıtım, hem bir DVD Live olarak hem de sabit sürücüye yüklenmiş bağımsız bir işletim sistemi olarak kullanılabilir. Deneysel bir özellik, AcademiX GNU/Linux'u bir sınıfta kullanmayı mümkün kılar.

Dağıtım içerisindeki eğitim yazılımları
Matematik (Mathematics)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası eXtrema  Extrema, başlangıçta nükleer ve parçacık fiziği alanlarında geliştirilmiş bir görselleştirme ve veri analiz aracıdır. Pratik olarak her alandan çeşitli analiz ve grafik zorluklarını yönetebilir. Araştırmacıların büyük, karmaşık veri kümelerini anlamlı bilgilere hızlı bir şekilde damıtmasına olanak tanır. Ayrıca kendi komutlarınızı kolayca geliştirmenize ve son derece özelleştirilmiş grafikler oluşturmanıza olanak tanır.  GPL  İngilizce   Euler  Euler Math Toolbox (EMT), sayısal ve sembolik araçları (bilgisayar cebir sistemi Maxima'yı kullanarak) tek bir ücretsiz ve açık kaynak paketinde birleştiren güçlü bir matematik programıdır. Fikri Matlab'a benzer, ancak sözdizimi tam olarak uyumlu değildir. Özetle Euler'in MatLab ve GNU Octave ile hızlı etkileşimli bir hesap makinesi programı olduğu söylenebilir.  GPL  İngilizce   FreeMat  FreeMat, hızlı mühendislik ve bilimsel prototip oluşturma ve veri işleme için çizim ve 3D görselleştirmeler içeren ücretsiz ve açık kaynaklı bir sayısal hesaplama ortamıdır. FreeMat ayrıca GNU Octave'ye benzer bir programlama dilidir ve MATLAB (Mathworks'ten) ve IDL (Research Systems'den) gibi ticari yazılımlara bir alternatiftir.  GPL  İngilizce   Galculator  galculator, dört hassasiyetli kayan nokta ile temel veya bilimsel modlarda kullanılabilen GTK 2/GTK 3 tabanlı bir hesap makinesidir.  GPL  İngilizce   Geogebra  GeoGebra, kullanımı kolay tek bir pakette geometri, cebir, hesap tabloları, grafik, istatistik ve hesabı bir araya getiren tüm eğitim düzeyleri için dinamik matematik yazılımıdır. GeoGebra, ilkokuldan üniversite düzeyine kadar fen, teknoloji, mühendislik ve matematiği (STEM) öğrenmek ve öğretmek için kullanılan etkileşimli bir matematik yazılım paketidir.  Non-commercial freeware  İngilizce   Geomview  Geomview, Unix ve türevleri için ücretsiz bir etkileşimli 3B görüntüleme programıdır. Geomview, döndürmek, çevirmek, yakınlaştırmak ve uzaklaştırmak için fareyi kullanarak üç boyutlu nesneleri görüntülemenizi ve değiştirmenizi sağlar. Statik nesneler için bağımsız bir görüntüleyici olarak veya dinamik olarak değişen geometri üreten diğer programlar için bir görüntü motoru olarak kullanılabilir ve çeşitli dosya formatlarındaki nesneleri görüntüleyebilir. Geomview çok çeşitli örnek nesnelerle birlikte gelir ve kendi nesnelerinizi de oluşturabilirsiniz.  GPL  İngilizce   Kalgebra  KAlgebra, farklı 2B ve 3B fonksiyon türlerini çizmenize ve toplama, trigonometrik fonksiyonlar veya türevler gibi kolay (ve o kadar da kolay olmayan) hesaplamaları hesaplamanıza olanak tanıyan tam özellikli bir hesap makinesidir. KAlgebra, mevcut tüm işlemler, kod vurgulama ve kod tamamlama için temsiller içeren bir sözlük sağlar ve dil, kullanıcı arayüzüne derinlemesine entegre edilmiştir.  GPL  İngilizce   KBruch  KBruch, kesirler ve yüzdelerle hesaplama pratiği yapmak için küçük bir programdır. Bu amaç için farklı alıştırmalar sağlanır ve öğrenme modunu kesirlerle pratik yapmak için kullanabilirsiniz. Program, kullanıcının girişini kontrol eder ve geri bildirimde bulunur.  GPL  İngilizce   Mathomatic  Mathomatic™, tamamen C programlama dilinde yazılmış ücretsiz bir açık kaynaklı, taşınabilir, komut satırı, eğitici CAS ve hesap makinesi yazılımıdır. Mathomatic™ cebirsel denklemleri sembolik olarak çözebilir, basitleştirebilir, birleştirebilir ve karşılaştırabilir, aynı anda genelleştirilmiş standart, karmaşık sayı, modüler ve polinom aritmetiği gerektiği gibi gerçekleştirebilir.  GPL  İngilizce   Relational  Relational, birinci dereceden mantığın bir dalı olan ilişkisel cebir ile deney yapmak için bir çalışma alanı sağlamak için eğitici bir araçtır. Bir komut satırı arayüzünde veya bir GUI'de ilişkisel sorguları yürütmek için kullanılabilir. İlişkisel sorguları yürütmek, ilişkisel ifadeleri ayrıştırmak ve optimize etmek için kullanılabilecek bağımsız bir Python modülü sağlar.  GPL  İngilizce   wxMaxima  wxMaxima bilgisayar cebir sistemi Maxima için belge tabanlı bir arayüzdür. wxMaxima, birçok yaygın maksimum komut, otomatik tamamlama, satır içi çizimler ve basit animasyonlar için menüler ve diyaloglar sağlar.  GPL  İngilizce   Pyromaths  Pyromaths, matematik alıştırmaları üreten, alıştırma çözümü ve hataları daha iyi anlamak için ayrıntılı bir düzeltme okuması sağlayan ücretsiz ve açık kaynaklı bir programdır. Profesyonel kalitede PDF dosyaları oluşturmak için LaTeX'i kullanır ve bir PDF okuyucu ile doğrudan web sitesinde kullanılabilir. Program, egzersiz birleştirme, kaydın başlığını değiştirme gibi daha fazla işlevsellikle bilgisayarınıza da yüklenebilir.  GPL  Fransızca   Cinderella  Cinderella, matematik, geometri, fizik gibi kesin bilimleri sanatla (grafik gösterimler ve manipülasyonlar yoluyla) birleştiren ücretsiz bir yazılımdır. Program (evde veya okulda), fareyle sezgisel bir şekilde görselleştirmeler oluşturmanıza ve bunları değiştirmenize veya sanal laboratuvarlarda simüle etmenize olanak tanır.  Free  İngilizce   Optgeo  OptGeo, iki boyutlu geometrik optik simülasyonu için ücretsiz bir yazılımdır. Optgeo, Lazarus ile derlenebilir.  GPL  Fransızca   DrGeo  DrGeo, kullanıcılarının etkileşimli Öklid geometrik çizimlerini tasarlamasına ve değiştirmesine olanak tanıyan etkileşimli bir geometri yazılımıdır.  GPL  İngilizce   Geophar  Geophar, kolej ve lise için gelişmiş bir geometrik grafik uygulamasıdır. Png, eps, pdf veya svg olarak dışa aktarılabilen yaklaşık hesaplama, eğri ve geometrik şekillerin çizilmesine olanak sağlar. Ayrıca LaTeX'te varyasyon tabloları ve işaretleri oluşturmak için bir araç içerir.  GPL  Fransızca  

Sanal laboratuvarlar (Virtual laboratories)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Virtual Microscope  Virtual Microscope, NASA tarafından finanse edilen açık kaynaklı bir projedir. Virtual Microscope, çeşitli mikroskop türleri (elektronik, optik ve tarama sondaları) için işlevsel bir destek, bu araçlar için yüksek çözünürlüklü çok boyutlu görüntü veri setleri ("Görüntüleme Teknolojisi Grubu" katkısı aracılığıyla) mikroskopi ve diğer ilgili araçlar hakkında daha fazla bilgi edinmek için bir Java uygulamasıdır. Şu anda, Microscope Suite'in üç farklı cihazından etkileşimli görüntüleme için verileri desteklenmektedir: "Philips Çevresel Taramalı Elektron Mikroskobu" (ESEM), "Floresan Işık Mikroskobu" ve "Atomik Kuvvet Mikroskobu".  GPL  İngilizce   Virtual Lab Chemistry  Virtual Lab, bir kimya laboratuvarının çevrimiçi bir simülasyonudur. Öğrencilerin kimyasal hesaplamaları gerçek laboratuvar kimyasıyla ilişkilendirmelerine yardımcı olmak için tasarlanmıştır. Laboratuvar, öğrencilerin yüzlerce standart reaktif (sulu) arasından seçim yapmasına ve bunları gerçek bir laboratuvara benzeyecek şekilde işlemesine olanak tanır.  GPL  İngilizce   Molecular Workbench  Bilimde hesaplama deneyleri tasarlamak ve yürütmek için ücretsiz bir açık kaynaklı modelleme aracıdır. Öğretim tasarımcılarının model ve simülasyon tabanlı müfredat materyalleri oluşturup yayınlamaları için bir yazarlık sistemi sağlar. Bilimsel araştırmayı destekleyen etkileşimli bir öğrenme ortamı sunar.  GPL  İngilizce   PhET  PhET, ücretsiz, eğlenceli, etkileşimli, araştırmaya dayalı bilim ve matematik simülasyonları sağlar. Simülasyonlar Java, Flash veya HTML5 ile yazılmıştır ve çevrimiçi olarak çalıştırılabilir veya bilgisayarınıza indirilebilir. Tüm simülasyonlar açık kaynaklıdır.  GPL  İngilizce   VGLII  Sanal Genetik Laboratuvarı (VGLII: Virtual Genetics Lab), genetik araştırmalarının hipotez test ortamına olabildiğince yakın bir şekilde yaklaşan bir iletim genetiği simülasyonudur. Amaç, öğrencilerin genetik analizin mantığını anlamalarını sağlamaktır - bir özelliğin nasıl miras alındığını belirlemek ve aktarım genetiği anlayışlarını güçlendirmek için haçlar nasıl kullanılabilir.  GPL  İngilizce   OpenRocket  OpenRocket, roketlerinizi inşa etmeden ve uçurmadan önce tasarlamanıza ve simüle etmenize olanak tanıyan ücretsiz, tam özellikli bir model roket simülatörüdür.  GPL  İngilizce   Mars simulator project  Mars Simülasyon Projesi (mars-sim), Mars'ta insan yerleşimleri kurmanın önemli yönlerini karakterize eden bilgisayar modelleri oluşturmayı amaçlayan açık kaynaklı bir Java projesidir.  GPL  İngilizce   GNS3  Grafik Ağ Simülatörü-3 (Graphical Network Simulator), ağ uzmanları için bir simülatördür. GNS3, sanal ve gerçek cihazların kombinasyonu yoluyla daha iyi karmaşık ağları ve bağlantıları simüle eder. Profesyonel sertifika sınavlarının eğitimi için GNS3 tercih edilmektedir. GNS3, bir üretim ortamında Sanal Makineleri veya araçları yönetmek için değil, deney/öğrenme amacıyla kullanılmak üzere tasarlanmış bir araçtır.  GPL  İngilizce  

Yabancı dil (Foreign Languages)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Anki  Anki, bilgilerinizi kolayca güncellemenizi sağlayan bir programdır. Geleneksel depolama yöntemlerinden çok daha etkili olduğu için, çalışma için harcanan zamanı azaltabilir veya depolanan bilgi miktarını daha da artırabilirsiniz. Günlük hayatta bir şeyleri hatırlaması gereken herkes Anki'yi kullanabilir. Görüntüler, ses, video ve bilimsel yazı (LaTeX) dahil olmak üzere yalnızca doğrulanabilir bilgileri doğruladığından, olanaklar sınırsızdır.  GPL  İngilizce   Babiloo  Babiloo, SDictionary ve StarDict formatındaki sözlükleri ve kabul edilen bazı sözlükler için HTML ekranını destekler. Babiloo, ayrıca İnternet'ten daha fazla sözlük indirmeye de izin verir.  GPL  İngilizce   Gconjugue  Portekizce fiilleri Brezilya'da konuşulduğu şekliyle eşlemek için grafik arayüzlü bir programdır. Girilen ifade bir fiil değilse, GConjugue onu bilinen fiillerin konjuge formları arasında bulmaya çalışır. Ayrıca sıradan Brezilyalıların yaptığı gibi fiil çekimi seçeneğine de sahiptir. Aslında, farklı bölgelerdeki Brezilyalılar, normatif dil bilgisinden farklı şekillerde sapıyorlar, ancak gösterilen çekim, yabancıların Brezilyalıların söylediklerini anlamalarına yardımcı olacaktır. Bu program, eşlenik (Brezilya-eşlenik paketi) olarak bilinen konsol aracı için grafiksel bir ön uçtur. Alternatif olarak, gconjugue için salt metin versiyonu olan conjugar'ı da kullanabilirsiniz.  GPL  İngilizce   Langdrill  langdrill, yabancı dil kelime bilginizi test etmek için bir yardımcıdır. GTK+ araç seti ve VDK (GTK+ çevresinde bir C++ sarmalayıcı) kullanır. langdrill, JavaDrill'e benzer. Japonca karakterleri görüntüleme desteği dahildir. Bunun için, örneğin xfonts-intl-japanese paketi gibi Japonca yazı tiplerinin sisteminize yüklenmesi gerekir.  GPL  İngilizce  

Mimarlık ve Tasarım (Architecture)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası LibreCad  LibreCAD, ücretsiz olarak indirebileceğiniz, kurabileceğiniz ve dağıtabileceğiniz eksiksiz, kapsamlı bir 2B CAD uygulamasıdır. Yardım ve dokümantasyon ücretsizdir, kopyalanabilir, kullanılabilir ve özelleştirilebilir. Özellikler: Katmanlar, bloklar, oluklar, çoklu çizgiler, elips araçları, teğet çizgi ve gelişmiş daire, dönüştürme araçları, gelişmiş yakalama sistemi ve daha fazlası. Dosyaları içe aktarmak ve kaydetmek için DXF dosya formatını kullanır, ancak aynı zamanda çalışmaları SVG, JPG, PNG, PDF vb. dosya türleri halinde dışa aktarabilir.  GPL  İngilizce   FreeCad  FreeCAD, modüler mimari, makine mühendisliği ve ürün tasarımının yanı sıra mimariye sahip bir 3B parametrik modelleme aracıdır. Evde olduğu kadar okulda da kullanımı kolaydır. Temel sistemi değiştirmeden özelliklerle özelleştirilmesi ve genişletilmesi kolaydır. MCAD, PLM, CAx ve CAE'den Catia, SolidWorks veya Solid Edge'e benzer araçlara sahiptir. Step, iges, obj, stl, dxf, svg, dae, ifc, off, nastran, vrml gibi dosyaları yazmak ve okumada destekler. 2B şekiller çizmek veya 2B üretim çizimleri oluşturmak için 3B modelden tasarım ayrıntılarından 2B bileşenler çıkarmak için kullanılabilir. Bilgisayar bilimi alanında var olan tüm büyük açık kaynaklı kütüphaneleri yoğun bir şekilde kullanır. Freecad'in kendisi de diğer programlar için bir kitaplık olarak kullanılabilir.  GPL  İngilizce   BrlCad  BRL-CAD, araçların, mekanik parçaların ve mimarinin tasarımı ve analizi dahil olmak üzere çok çeşitli askeri, akademik ve endüstriyel uygulamalarda kullanılan, 400'den fazla araç, yardımcı program ve uygulamadan oluşan sağlam, güçlü bir modelleme sistemidir. Kutular, elipsoidler, koniler ve simit gibi genişletilmiş geleneksel ilkel CSG örtük katıların yanı sıra NURBS koleksiyonlarından, B-Spline Yüzey Uniformlarından, NMG'nin yanı sıra saf yüz örgüsünü de destekler. Tüm geometrik nesneler, birleşim, kesişim ve fark dahil olmak üzere teorik mantıksal CSG işlemleriyle birleştirilebilir.  GPL  İngilizce   Sweet Home 3D  Sweet Home 3D, insanların yeni mobilya düzenlemelerini denemeden önce test etmelerine ve sonunda 3B görüntülemeyi sanal olarak ziyaret etmelerine olanak tanıyan açık kaynaklı bir iç tasarım uygulamasıdır. Oldukça güçlü ve genişletilebilir, ancak ev tasarımı hakkında çok az şey bilen veya hiçbir şey bilmeyen insanlar için bile kullanımı nispeten basittir. Eğitim, Sweet Home 3D ile tasarım yapmanın ilk adımlarında size rehberlik edecektir.  GPL  İngilizce   OpenSCAD  OpenSCAD, sağlam 3B CAD modelleri oluşturmak için ücretsiz çok platformlu bir yazılımdır. Blender gibi 3B modeller oluşturmak için çoğu özgür yazılımın aksine, 3B modellemenin sanatsal yönlerine değil, CAD yönlerine odaklanır. Bu nedenle, makine parçalarının 3B modellerini oluşturmayı planlarken aradığınız uygulama olabilir, ancak bilgisayar animasyon filmleri oluşturmakla daha fazla ilgilendiğinizde aradığınız şey olmadığından oldukça emin olabilirsiniz. OpenSCAD etkileşimli bir modelleme makinesi değildir. Bunun yerine, nesneyi tanımlayan bir komut dosyasında okuyan ve bu komut dosyasının 3B modelini oluşturan 3B derleyici gibi bir şeydir. Bu size modelleme süreci üzerinde tam kontrol sağlar ve modelleme sürecindeki herhangi bir adımı kolayca değiştirmenize veya yapılandırılabilir parametrelerle tanımlanan tasarımlar yapmanıza olanak tanır. OpenSCAD iki ana modelleme tekniği sunar: katı yapıcı geometri (CSG) ve ikincisi 2D konturların ekstrüzyonudur. Bu 2B kontur için veri alışverişi formatında AutoCAD DXF dosyaları kullanılır. 2B ekstrüzyon yollarına ek olarak, tasarım parametrelerini DXF dosyalarından okumak da mümkündür. DXF dosyalarına ek olarak, OpenSCAD, STL ve OFF dosya formatlarında 3B modelleri okuyabilir ve oluşturabilir.  GPL  İngilizce  

Oyunlar (Games)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Gnome chess  GNOME Chess, oyunların insan ve bilgisayar oyuncularının bir kombinasyonu arasında oynanabildiği bir 2D satranç oyunudur.  GPL  İngilizce   Pychess  PyChess, Python ile yazılmış gelişmiş bir GTK satranç istemcisidir. PyChess, kısa bir rahatlama oyunu için veya İpucu Modu fonksiyonunu kullanarak bilgisayarınızla satranç kabiliyetinizi geliştirmek için kullanımı kolay bir uygulamadır. PyChess, kendi yerleşik satranç motoruyla birlikte gelir ve bilgisayarınızda kurulu oldukları sürece en popüler satranç motorlarını otomatik olarak algılar ve onlarla çalışır. Buna GnuChess, Crafty, Sjeng ve Fruit gibi motorlar ve hatta Rybka gibi Windows motorları dahildir.  GPL  İngilizce   GCompris  GCompris, 2 ila 10 yaş arası çocuklar için 100'den fazla aktivite içeren ücretsiz bir yüksek kaliteli eğitim yazılımı paketi olup eğitim odaklıdır.  GPL  İngilizce   Pybik  Pybik, Ernő Rubik tarafından icat edilen küp hakkında 3 boyutlu bir bulmaca oyunudur.  GPL  İngilizce   Gbrainy  gbrainy, eğlenmek ve beyninizi eğitmek için bir zeka oyunu ve eğiticisidir. gbrainy, muhakeme ve düşünme ve zihinsel hesaplama becerilerinize meydan okumak için tasarlanmıştır. gbrainy, çocuklar, yetişkinler veya yaşlılar için zeki eğlenceli hale getiren farklı zorluk seviyeleri sağlar.  GPL  İngilizce   Warzone2100  Warzone 2100, insanlık nükleer füzelerle neredeyse yok edildikten sonra dünyayı yeniden inşa etmek için açık kaynaklı bir strateji oyunudur. Warzone 2100, tek/çok oyunculu çarpışma modlarına sahiptir.  GPL  İngilizce   Opencity  OpenCity, FreeReign tabanlı eksiksiz bir 3B şehir simülatörüdür.  GPL  İngilizce  

İstatistik (Statistics)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Qtiplot  QtiPlot, platformlar arası bir veri analizi ve bilimsel görselleştirme çözümüdür. QtiPlot, tüm rekabete meydan okuyan fiyatı sayesinde öğrenci bilgisayar laboratuvarları için idealdir. QtiPlot, tüm dünyadaki şirketlerde, liselerde, üniversitelerde ve araştırma enstitülerinde öğretimin yanı sıra karmaşık veri analizi ve görselleştirme için kullanılır. QtiPlot; Origin, SigmaPlot, SPSS, Regressi veya Igor Pro gibi son derece pahalı yazılımlara bir alternatiftir.  GPL  İngilizce   Scidavis  SciDAVis, veri analizi ve yayın kalitesinde çizim yapmayı amaçlayan sezgisel bir grafik arayüze sahip ücretsiz bir interaktif uygulamadır. SciDAVis, uygulama alanında Origin ve SigmaPlot gibi tescilli Windows uygulamalarının yanı sıra QtiPlot, Labplot ve Gnuplot gibi ücretsiz uygulamalara benzer.  GPL  İngilizce   Gretl  Gretl, regresyon ve ekonometrik analiz ve zaman serisi kitaplığı için ücretsiz bir açık kaynaklı çapraz platform yazılım paketidir.  GPL  İngilizce  

Önemli bağlantılar (Remarkable links)
Sağlık & Tıp (Health & Medicine)
 OPENCLINIC 
 CARE2X 
 GNUMED 
 CONNECTOME 
 PATIENTOS 
 WEASIS 

 Biyoloji (Biology)
 PYROSETTA 

Salome-Meca
Salome-Meca, code_aster tarafından geliştirilen, Etüt ve Araştırma için Yapı ve Termomekanik Analizi (Structures and Thermomechanics Analysis for Studies and Research) sanal laboratuvarıdır.

Sanal beyin (Virtual Brain)
Sanal Beyin, karmaşık nörokimya dünyasını sadece küçük bir oranda birleştirmesine rağmen, beynin kendisi kadar karmaşık hale gelmeyerek çok şey kazandırır. Bunun yerine Sanal Beyin, beyin klinik tarayıcıları ile aynı çıktıyı sağlayan modelin karmaşıklığını büyük ölçüde azaltmak için hesaplamalı, bilişsel ve klinik nörolojiden yeni kavramları benimser ve sunar.

MaxFEM
MaxFEM, Santiago de Compostela Üniversitesi tarafından geliştirilen sonlu elemanlar yöntemine dayalı bir elektromanyetik simülasyon yazılımıdır.

KA Lite
KA Lite, İnternet olmadığında bile Khan Academy filmlerini ve egzersizlerini izlemek ve bunlarla etkileşim kurmak için açık kaynaklı bir platformdur. Öğrenciler bir sınıftaki veya başka bir alandaki, dizüstü bilgisayar, tablet veya masaüstündeki bir sunucuya bağlanabilir veya taşınabilir erişim için doğrudan öğrencinin bilgisayarına kurulabilir. KA Lite halihazırda 194'ün üzerinde ülke ve bölgede kurulmuş olup, köyler, yetimhaneler, toplum merkezleri, mülteci kampları, hapishaneler ve evler gibi çeşitli bağlamlarda yaklaşık 4,5 milyon öğrenciye ulaşmıştır.

Kolibri
Kolibri, kırsal okullar, mülteci kampları, yetimhaneler ve resmi olmayan okul sistemleri gibi düşük kaynaklara sahip topluluklarda yüksek kaliteli eğitimi mümkün kılar.

Coğrafya (Geography)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Virtualplanet  Gezegenlerin gözlemlenmesi ve araştırılması için ücretsiz yazılımdır. Her konum, tarih ve saat için bir gezegenin görünümünü görüntüleyebilir. Aynı zamanda benzersiz veritabanı ile bantların çalışılmasına izin verir.  GPL  İngilizce   TunnelX  Tunnel, Survex uyumlu verilere dayalı mağara keşifleri çizmek için ücretsiz bir Java programıdır.  GPL  İngilizce   Survex  Survex, denizaltı mağaraları için verileri işlemek, görüntülemek ve yazdırmak amaçlı çapraz paltform bir yazılım paketidir. Çeşitli dillere çevrilen Survex, son derece büyük ve karmaşık veri kümelerini işleyebilir ve birden çok kaynaktan keşif verilerini okuyabilir.  GPL  İngilizce   SUMO  SUMO, büyük karayolu ağlarının üstesinden gelmek için tasarlanmış açık kaynaklı bir yol trafiği simülasyon paketidir.  GPL  İngilizce   Skychart  Skychart, gelişmiş amatör gök bilimciler için bir gezegen yazılımıdır.  GPL  İngilizce   Savi  Uydu Takımyıldızı Görselleştirme (Satellite Constellation Visualization). SaVi, uydu yörüngelerini ve kapsama alanını iki ve üç boyutlu olarak simüle etmenize olanak tanır. SaVi özellikle uydu takımyıldızlarını simüle etmek için kullanışlıdır. SaVi, özellikle Iridium ve Globalstar gibi uydu takımyıldızlarını simüle etmek için kullanışlıdır. SaVi, 3B oluşturma için isteğe bağlı ancak kullanışlı bir paket olan Geomview'i kullanabilir.  GPL  İngilizce   SAGA GIS  SAGA GIS (Coğrafi Bilimler için Otomatik Analiz Sistemi-Automated Analysis System for Geographical Sciences), mekansal verileri düzenlemek ve analiz etmek için kullanılan ücretsiz ve açık kaynaklı bir coğrafi bilgi sistemidir. Vektör analizi (nokta, çizgi ve çokgen), tablolar, kılavuz ve görüntü verileri için çok sayıda modül içerir. Paket, diğer şeylerin yanı sıra, jeoistatistik, görüntü sınıflandırması, projeksiyonlar, dinamik süreçlerin simülasyonu (hidroloji, peyzaj) ve arazi analizi için modüller içerir. Fonksiyonlara bir GUI, komut satırı veya C++ API kullanılarak erişilebilir.  GPL  İngilizce   Pysatellites  Bu program, insanları temel düzeyde mekansal mekanik konusunda eğitmek için kullanılabilir. Atmosferin dışından, önceden tanımlanmış bir avuç gezegenin etrafından veya hayal edebileceğiniz herhangi bir özel nesnenin etrafından bir uydu fırlatma yetkisine sahipsiniz. Uydunun ilk hız vektörünü girin ve simüle edilmiş yörüngenin yanı sıra hız değişim grafikleri gibi bazı bilgileri alacaksınız. Ek olarak, yörünge periyodu sırasında uydunun bakış açısından görülen gezegeni temsil eden bir filmi hesaplayabilirsiniz.  GPL  İngilizce   OpenUniverse  OpenUniverse (kısaca OU) eğlenceli, hızlı ve ücretsiz bir OpenGL uzay simülatörüdür. Şu anda Güneş Sistemine odaklanıyor ve tüm gezegenleri, çoğu büyük ayı ve renkli, görkemli ve gerçek zamanlı 3B'de geniş bir küçük cisim koleksiyonunu ziyaret etmenize izin veriyor.  GPL  İngilizce   Marble  Marble, KDE uygulamaları için genel bir coğrafi harita widget'ı ve çerçevesidir. Marble, pencere öğesi dünyayı bir küre olarak gösterir ancak donanım hızlandırması gerektirmez. Minimum bir coğrafi veri seti dahil edilmiştir, bu nedenle internet bağlantısı olmadan kullanılabilir.  GPL  İngilizce   Kstars  KStars, dünyanın herhangi bir yerinden, herhangi bir tarih ve saatte gece gökyüzünün doğru bir grafik simülasyonunu gösteren bir KDE planetaryumudur. Ekranda 130.000 yıldız, 13.000 derin gökyüzü nesnesi, tüm 8 gezegen, Güneş ve Ay ve binlerce kuyruklu yıldız ve asteroit yer alır. Astronomik hesaplamalar için araçlar içerir ve teleskopları ve kameraları kontrol edebilir.  GPL  İngilizce   HNSKY  HNSKY (Hallo Northern Sky), 30.000 derin gökyüzü nesnesi ve 12.5 büyüklüğe kadar Tycho2++ yıldız veritabanı içeren bir planetaryum programıdır.  GPL  İngilizce   Gaia Sky  Gaia Sky, gerçek zamanlı, 3B astronomi görselleştirme yazılımıdır. Astronomisches Rechen-Institut'un (ZAH, Universität Heidelberg) Gaia grubundaki Galaksimizin yaklaşık 1 milyar yıldızının haritasını çıkarma ESA'nın Gaia misyonu çerçevesinde geliştirilmiştir. Gaia, Avrupa Uzay Ajansı ESA tarafından 19 Aralık 2013 tarihinde başlatılan ve gökadamızdaki tüm yıldızların yaklaşık yüzde birinin çok yüksek hassasiyetle astrometri, fotometri ve spektroskopi gerçekleştiren büyük bir uzay astronomi görevidir. Gaia, 1980'lerin sonunda ESA'nın HIPPARCOS misyonu tarafından örneklenen Avrupa hassas yıldız haritalama mirasına dayanmaktadır. Bu görev yüz bin yıldızı yüksek hassasiyetle ve bir milyondan fazla yıldızı daha az doğrulukla kataloglarken, Gaia bir milyardan fazla yıldızı benzeri görülmemiş hassasiyet seviyelerine eşler.  GPL  İngilizce   CCDCIEL  Amatör astronom için tasarlanmış bir CCD yakalama yazılımıdır. Gök cisimlerinin dijital görüntüleme CCD gözlemini gerçekleştirmek için gerekli tüm özellikleri içerir. Standart sürücü protokolü INDI ve ASCOM'u kullanarak CCD kamerayı, odaklayıcıyı, filtre çarkını ve teleskop yuvasını bağlayabilir ve kontrol edebilir.  GPL  İngilizce   AWeather  AWeather, hava durumu meraklıları tarafından kullanılmak üzere tasarlanmış gelişmiş bir hava durumu programıdır. AWeather, önceden hesaplanmış bir tahmini gösteren bir hava durumu dock uygulaması değildir. Çeşitli hava durumu verilerini basit bir birleşik arayüzde bütünleştiren, kullanımı kolay bir program olacak şekilde tasarlanmıştır. AWeather şu anda Birleşik Devlet Ulusal Hava Durumu Hizmetinden (United State National Weather Service) gelen radar ve hava durumu uyarılarını desteklemektedir.  GPL  İngilizce   Planets  Planets, gezegen sistemleri simülasyonu için basit bir etkileşimli oyundur. Kullanıcı arayüzü, çocuklar tarafından kolayca kullanılabilecek şekilde açık ve net tasarlanmıştır.  GPL  İngilizce   Google Earth  Google Earth sizi dünya çapında sanal bir tura çıkarıyor. 3B binaları, görüntüleri ve manzaraları keşfedin. Kasabaları, yerleri ve yerel işletmeleri bulun. İster bilgisayar ister mobil cihaz kullanıyor olun, dünyaya onu gerçekte görmeye alıştığınız şekilde 3B görüntüleyin. 3B Uzay Kepenk Modellerini görüntüleyin, geçmiş uzay görevlerinin 360° panoramik panoramalarını, iniş pistlerini, Apollo astronotlarının astronotlarını, 3B uzay mekiği modellerini görüntüleyin, astronotun ayak izlerini görmek için 360 derece panoramik fotoğrafları yakınlaştırın, Apollo görevleriyle arşiv TV görüntülerini görüntüleyin. Herkes binaların, anıtların, çeşmelerin, köprülerin, kulelerin, müzelerin, evlerin ve daha fazlasının 3B modellerini görebilir. Google Earth'te, daha fazla konum bilgisi içeren bir mesaj açmak için bir 3B yapıyı tıklayın.  Free  İngilizce   Stellarium  Stellarium, ücretsiz, açık kaynaklı, planetaryum tipi bir bilgisayar programıdır. Tıpkı çıplak gözle, dürbünle veya bir teleskopla algılanan gerçek göz gibi gerçekçi bir gökyüzünü 3B olarak gösterir. Göksel tonozun planisfer projektörlerinde kullanılır. Sadece bulunduğunuz koordinatları ayarlayın.  GPL  İngilizce   Qgis  QGIS, bir Açık Kaynak Coğrafi Bilgi Sistemidir (CBS). QGIS, Open Geospatial Source Foundation'ın (OSGeo) resmi bir projesidir.  GPL  İngilizce  

Genetik (Genetics)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası StarORF  StarORF, bir DNA dizisi içinde kodlanmış proteinin tanımlanmasını kolaylaştırır. StarORF kullanılarak, DNA dizisi önce RNA'ya kopyalanır ve ardından altı çeviri çerçevesinin her birinde (3'ü ileri yönde ve 3'ü ters yönde) kodlanan tüm potansiyel ORF'lere (Açık Okuma Çerçevesi: Open Reading Frame) çevrilir. Bu, öğrencilerin en uzun protein kodlama dizisine yol açan çeviri çerçevesini belirlemelerine olanak tanır.  GPL  İngilizce   Aevol  Aevol, genetik algoritmalar ve bireysel tabanlı modelleme kullanarak evrim sürecini yakalayan açık kaynaklı bir dijital genetik platformudur. Aevol'deki dijital organizmalar, tipik Darwinci dinamikler altında yüz binlerce nesil boyunca evrim geçirerek, çoğalır, rekabet eder ve mutasyona uğrar. Büyük popülasyonlarda yaşayan bireyler, hem ekolojik hem de evrimsel zaman ölçeklerinde etkileşime girerek tipik olarak deneysel olarak ulaşılamaz senaryoları araştırmamıza izin verir, çünkü seçim özelliklerini (örn. Popülasyon boyutu, ortam türü, çevresel varyasyonlar) veya varyasyonu (örneğin ve mutasyon ve yeniden düzenleme oranları, yatay transfer). Bakteriyel genomiklerden ve deneysel mikrobiyal evrim araştırmalarından esinlenen Aevol, potansiyel olarak değişen sayıda gen, genetik mimari ve kodlama/kodlamayan dizi oranı ile karakterize edilen ayrıntılı ve gerçekçi bir genom modeline sahiptir. Aevol, evrim süreci boyunca popülasyon ve organizma özelliklerinin görselleştirilmesi ve karakterizasyonunun yanı sıra filogeninin yeniden inşası ve analizi için bir dizi araç içerir. Modelin bir uzantısı (R-Aevol), gen ekspresyonunun düzenlenmesinin açık bir modelini içerir, böylece gen düzenleme ağlarının evriminin incelenmesine izin verir.  GPL  İngilizce   Gbench  Genome Workbench, araştırmacılara genetik verileri incelemek ve analiz etmek için zengin bir entegre araçlar seti sunar. Kullanıcılar, NCBI veritabanları veya kullanıcının kendi özel verileri dahil olmak üzere birden çok kaynaktan gelen verileri keşfedebilir ve karşılaştırabilir. Genome Workbench'teki veri analizi, diğerlerinin yanı sıra BLAST, Clustal, Kalign, MAAFT dahil olmak üzere gelişmiş bir endüstri standardı hizalama araçları paketi tarafından desteklenir. Öğrenme ve Keşif, yol boyunca gerçekleştirilir. Bir araştırmacı, Genome Workbench ile sonuçları inceler ve analiz ettiğinde, verileri yeni bir anlayışa ve keşfe götüren yeni şekillerde görür. Kullanıcılar, yayınlarda ve sunumlarda veri analizlerini grafiksel olarak görüntülemek için verilerin filogenetik ağaçları, hizalamaları, tablo görünümü vb. oluşturmak için bu araçların sağladığı esneklikten yararlanmaya davet edilir.  Public Domain Notice  İngilizce   Stargenetics  StarGenetics, MIT'de biyoloji fakültesi, araştırma-eğitimli bilim adamları ve MIT'nin OEIT'indeki teknoloji uzmanları tarafından geliştirilen bir Mendel genetik çapraz simülatörüdür. StarGenetics, öğrencilerin söz konusu özelliklerin doğasını analiz etmek için bir dizi özellikte genetik olarak farklı olan organizmalar arasındaki çiftleşme deneylerini simüle etmelerine olanak tanır. Amacı, öğrencilere genetik deneysel tasarım ve genetik kavramları öğretmektir.  Public Domain Notice  İngilizce   VGLII  Sanal Genetik Laboratuvarı (VGLII: Virtual Genetics Lab), genetik araştırmalarının hipotez test ortamına olabildiğince yakın bir şekilde yaklaşan bir iletim genetiği simülasyonudur. Bu laboratuvarda öğrenciler, belirli bir özelliğin kalıtım mekanizmasını belirlemek için varsayımsal yaratıkları çaprazlar ve soyu inceler. Gerçek araştırmada olduğu gibi, "cevabı görmek" mümkün değildir - öğrenci, modelinden emin olmak için yeterli veriyi ne zaman topladığına kendisi karar vermelidir. Amaç, öğrencilerin genetik analizin mantığını anlamalarını sağlamaktır - bir özelliğin nasıl miras alındığını belirlemek ve aktarım genetiği anlayışlarını güçlendirmek için haçlar nasıl kullanılabilir.  GPL  İngilizce  

Öğretmen araçları (Teacher)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Ardora  Ardora, öğretmenlerin web tasarımı ve programlamayla ilgili önceden herhangi bir teknik bilgi olmadan web tabanlı öğrenme içeriği oluşturmaları için bir yazılım programıdır. Ardora 8, kendi web içeriğini çok basit bir şekilde oluşturmalarına izin veriyor, çabalarını bilgisayar sürecine değil, yalnızca dahil edilecek öğelere odaklıyor. Ardora 8 çapraz platformdur, cihaz ne olursa olsun, firefox, chrome veya opera gibi son standartları destekleyen bir tarayıcıda html5, css3, javascript ve php gibi en son web teknolojileri altında içerik oluşturur. Ardora 8, 35'ten fazla farklı türde etkileşimli etkinliğin yanı sıra, 10'dan fazla farklı türde multimedya sayfası ve öncelikle öğrenciler arasında işbirliğine dayalı çalışma için tasarlanmış "bir sunucu içindeki sayfalar" etkinliklerine izin verir.  GPL  İngilizce   OpenTeacher  OpenTeacher, öğretmenlerin öğrencilerine doğru eğitimi vermelerine yardımcı olan, öğrencinin sonuçlarını iyileştiren ve öğretmene zaman kazandıran, açık kaynaklı, çapraz platformlu bir soru-cevap tipi programdır. OpenTeacher, öğretmenler hala bilgi sağlarken, öğrencilerin çeşitli konuları kendi başlarına, yabancı bir dilden kelime öğrenmelerine yardımcı olabilir.  GPL  İngilizce   Timetable Generator  FET olarak bilinen Timetable Generator, Qt'yi destekleyen herhangi bir sistemde çalışan, hızlı ve verimli bir zaman çizelgesi algoritması kullanarak eğitim kurumlarında zaman çizelgesini otomatik olarak planlamak için ücretsiz bir açık kaynaklı yazılımdır. FET, karmaşık bir zaman çizelgesini maksimum 5-20 dakika içinde çözebilir, ancak 5 dakikadan (bazı durumlarda, daha basit zaman çizelgeleri için birkaç saniye) daha uzun bir süreye (çok zor zaman çizelgeleri için) değişebilir.  GPL v3  İngilizce  

Elektronik (Electronics)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Electric  VLSI Elektrik Tasarım Sistemi (Electric Design System), farklı devre konfigürasyonlarının tasarlanmasına izin veren açık kaynaklı bir elektronik tasarım (EDA) sistemidir.  GPL v3  İngilizce   gEDA  gEDA, bir dizi otomatik devre kartı tasarım aracıdır. Bu araçlar elektrik devresi tasarımı, simülasyon, prototipleme ve üretim için kullanılır.  GPL  İngilizce   Kicad  Kicad, otomatik devre tasarımı için ücretsiz ve çok platformlu bir pakettir.  GPL  İngilizce   Eagle  EAGLE, grafikler için basit, uygulanabilir bir yerleşim düzenleyicidir, mühendislerin, yaratıcıların ve okul öğrencilerinin zorlu taleplerini karşılamak için tasarlanmış güçlü bir PCB tasarım yazılımıdır.  Freeware  İngilizce   Guido van Robot NG  GVR olarak bilinen Guido van Robot, çok dilli çok platformlu bir programlama dili ve uygulamasıdır. Hem sınıfta hem de evde programlamanın temel kavramlarını öğrenmeye yeni başlayanlar için tasarlanmıştır.  GPL  İngilizce   Oregano  Oregano, elektrik devrelerinin şematik olarak yakalanması ve simülasyonu için grafiksel bir uygulamadır. Etkili simülasyon ngspice ve Gnucap tarafından yapılır. GEDA ve KTechlab'a benzer. GNOME teknolojisini kullanır.  GPL  İngilizce   Qelectrotech  QElectroTech, elektrik şemaları oluşturmak için ücretsiz bir programdır.  GPL  İngilizce   Fritzing  Fritzing, elektroniği herkes için yaratıcı bir şekilde erişilebilir kılan açık kaynaklı bir donanım projesidir. Bu program, bir kullanıcı topluluğu sitesi ve Programlama ve Arduino gibi hizmetlerle ilişkili bir dizi özelliğe sahiptir ve kullanıcıların çalışmalarını belgelemelerini, başkalarıyla paylaşmalarını, okullarda elektronik öğretmeyi, profesyonel elektronik devreler inşa etmelerini ve tasarlamalarını sağlayan yaratıcı bir ortamı teşvik eder.  GPL  İngilizce   Logisim  Logisim, dijital mantık devrelerini tasarlamak ve simüle etmek için eğitici bir araçtır. Arayüzü aracılığıyla, Basit araç çubuğu ve devre simülasyon simülasyonu, mantık devreleriyle ilgili temel kavramları öğrenmek için basit bir yol sağlar. Daha küçük alt devreler içeren daha büyük devreler oluşturmaya ve tek bir fare kaydırma ile iş parçacığı geliştirmeye izin verir. Logisim, eğitim amaçlı işlemcileri tasarlamak ve simüle etmek için kullanılabilir.  GPL  İngilizce   QsapecNG  QSapecNG, doğrusal analog devrelerin sembolik analizi için Qt tabanlı bir programdır. Floransa Üniversitesi Elektronik ve Telekomünikasyon Bölümü'ndeki öğrenciler ve araştırmacılar tarafından sürekli olarak geliştirilen çok platformlu ve açık kaynak. Projeye diğer platformlarda tam uyumluluk sağlamak için Windows için SapWin'in bir devamı olarak gelir. QSapecNG kullanıcıları analog devreleri tasarlayabilir, çözebilir, analiz edebilir ve yönetebilir. 2.00 beta1 sürümünden başlayarak, diğer devrelerin bir parçası olarak oluşturulabilen, kaydedilebilen, yeniden açılabilen ve eklenebilen alt yasalar için tam destek de vardır.  GPL  İngilizce   gLogic  gLogic, Python ve GTK+ ile geliştirilmiş eğitici bir grafiksel mantık devresi simülatörüdür. Bu program, temel bileşenleri (örneğin; NOT, AND, OR) ve flip-flop gibi birçok gelişmiş bileşeni içeren mantık devrelerini simüle eder. Bu program, zamanlama diyagramları oluşturabilir ve belirtilen konumdaki anahtarların durumlarını değiştirebilir.  GPL  İngilizce  

Kimya (Chemistry)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Bkchem  BKChem ücretsiz bir kimyasal çizim programıdır. GNU/Linux üzerinde geliştirilmiş ve Python'da yazılmıştır, platformdan bağımsızdır.  GPL  İngilizce   Chemtool  Chemtool, Unix ve Linux sistemleri için GTK kullanarak C'de yazılmış yapısal formülleri çizmek için ücretsiz bir yazılımdır. Çizilen kimyasal yapılar, X bitmap, PostScript, SVG, XFig, MDL molfile ve PNG gibi çeşitli dosya formatlarında kaydedilebilir.  GPL  İngilizce   Gchempaint  GChemPaint, Gnome-2 masaüstü için C++ ile yazılmış bir 2B kimyasal yapı editörüdür, ancak Gtkmm kullanmaz. GChemPaint artık bağımsız bir proje olarak geliştirilmemiştir, ancak Gnome Kimya Araçları'na entegre edilmiştir.  GPL  İngilizce   gElemental  gElemental, kimyasal elementler hakkında ayrıntılı bilgi sağlayan periyodik bir tablo görüntüleyicidir. C++ ve gtkmm için bir GPeriodic bağlantı noktasıdır ve geliştirilmiş bir UI, güncellenmiş ve düzeltilmiş bir veri kümesi, daha iyi bir veri formatı, bir liste görünümü ve daha kolay renklendirme sunar.  GPL  İngilizce   Jmol  Jmol, tarayıcı tabanlı bir HTML5 görüntüleyici ve moleküller, kristaller, malzemeler ve biyomoleküller için özelliklerle 3 boyutlu kimyasal yapılar için bağımsız bir Java görüntüleyicisidir. Jmol, kimya, biyokimya, fizik ve malzeme bilimi alanlarındaki öğrenciler, eğitimciler ve araştırmacılar için ücretsiz bir açık kaynaklı, çapraz platform molekül görüntüleyicisidir.  GPL  İngilizce   RasMol  RasMol, temel olarak biyolojik makromolekül yapılarını betimlemek ve keşfetmek için amaçlanan ve kullanılan önemli bir programdır ve eğitimde önemli hale gelmiştir. RasMol, çeşitli renk şemalarını ve moleküler temsilleri gösteren etkileşimli bir grafik aracıdır.  GPL  İngilizce   XMakemol  XMakemol, atomik ve diğer kimyasal sistemleri görüntülemek ve işlemek için LessTif pencere öğesi seti kullanılarak yazılan fare tabanlı bir programdır. XYZ girişini okur ve atomları, bağları ve hidrojen bağlarını işler.  GPL  İngilizce   Avogadro  Avogadro, hesaplamalı kimya, moleküler modelleme, biyoinformatik, malzeme bilimi ve ilgili alanlarda kullanılmak üzere tasarlanmış ücretsiz bir açık kaynaklı, çapraz platform moleküler oluşturucu ve gelişmiş bir molekül düzenleyici ve görselleştiricidir. Esnek yüksek kaliteli işleme ve güçlü bir eklenti mimarisi sunar.  GPL  İngilizce   Cain  Cain, kimyasal kinetik için stokastik simülasyonlar yoluyla birkaç rastgele değişkenli çoklu reaksiyonları içeren, gerçek dünyadaki farklı durumları hesaplamak için kullanışlı bir uygulamadır. Ancak hiçbir simülasyon, herhangi bir reaksiyon setine doğru yanıt vermeyi garanti etmez.  GPL  İngilizce   Easychem  EasyChem, Linux altında yazılan ve Gtk+ 2 kullanılarak kimyasal moleküller çizmek için tasarlanmış bir programdır. Aslında, tıpkı özel bir vektörel çizim aracı gibidir.  GPL  İngilizce   GDIS  GDIS, izole edilmiş moleküllerin ve periyodik sistemlerin görüntülenmesi ve manipülasyonu için GTK tabanlı bir programdır.  GPL  İngilizce   GPeriodic  GPeriodic, Linux için bir periyodik tablo uygulamasıdır. Elementlerin periyodik tablosuna göz atmanıza ve elementlerin her biri hakkında ayrıntılı bilgileri görüntülemenize olanak tanır. Şu anda 118 öğe listeleniyor.  GPL  İngilizce   PyMOL  PyMOL, yapısal biyolojide açık kaynaklı bir model görselleştirme aracıdır. PyMOL, yüksek kaliteli 3D protein yapısı görüntüleri (küçük moleküller ve proteinler gibi biyolojik makromoleküller) üretebilir.  GPL  İngilizce   Kalzium  Kalzium, Periyodik Tablo için bir kimya uygulamasıdır, bu nedenle onu bir bilgi veritabanı olarak kullanabilirsiniz. Şu anda 103 öğe listeleniyor.  GPL  İngilizce   Viewmol  Viewmol, hesaplamalı kimya programları için açık kaynaklı bir grafik ön uçtur. Hesaplamalar için moleküler yapıların oluşturulmasına grafiksel olarak yardımcı olabilir ve sonuçlarını görselleştirebilir.  GPL  İngilizce  

Biyoloji (Biology)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası BALLView  BALL'a dayanan ve geliştirilen BALLView, moleküler görselleştirme için bağımsız bir araçtır. BALLView, geniş işlevselliği entegre, kullanıcı dostu bir GUI aracılığıyla kullanılabilir hale getirir. BALL, Hesaplamalı Moleküler Biyoloji ve Moleküler Modelleme için özel olarak tasarlanmış bir uygulama çerçevesidir. Moleküler Mekanik için sınıfların yanı sıra kapsamlı bir veri yapıları seti, gelişmiş çözme yöntemleri, protein yapılarının karşılaştırılması ve analizi, dosya içe/dışa aktarımı ve görselleştirme sağlar. BALL, güvenilir veri yapıları ve algoritmalar için halka açık bir depo görevi görmeye çok uygundur.  GPL  İngilizce   ClustalX  ClustalX, Clustal'ın grafik kullanıcı arayüzü versiyonudur. Clustal, filogenetik ağaçların aminoasit veya nükleotit çiftlerinden türetilmesine dayalı olarak çoklu dizileri hizalamak için Biyoinformatikte kullanılan orijinal yazılımdır.  GPL  İngilizce   Gwyddion  Gwyddion, tarama prob mikroskobu veri görselleştirme ve analizi için modüler bir programdır. Öncelikle prob mikroskopi teknikleri (AFM, MFM, STM, SNOM/NSOM) taranarak elde edilen yükseklik alanlarının analizi için tasarlanmıştır ve birçok SPM veri formatını destekler. Bununla birlikte, genel yükseklik alanı ve (gri tonlamalı) görüntü işleme için, örneğin profilometri verilerinin veya görüntüleme spektrofotometrisinden kalınlık haritalarının analizi için kullanılabilir.  GPL  İngilizce   Cytoscape  Cytoscape, moleküler etkileşim ağlarını ve biyolojik yolları görselleştirmek ve bu ağları açıklamalar, gen ifade profilleri ve diğer durum verileriyle entegre etmek için açık kaynaklı bir yazılım platformudur. Cytoscape başlangıçta biyolojik araştırma için tasarlanmış olsa da, şimdi karmaşık ağ analizi ve görselleştirme için genel bir platformdur.  GPL  İngilizce   SeaView  SeaView, Moleküler biyoloji ve evrim için çok platformlu, ücretsiz olarak sunulan bir programdır. SeaView, grafiksel bir kullanıcı arayüzü kullanarak moleküler sıra verilerinden çoklu hizalama ve filogenetik ağaç oluşturmayı kolaylaştırmak için tasarlanmıştır. SeaView, yaygın olarak kullanılan SeaView (önceki sürümlerinde) ve Phylo_win programlarının tüm işlevlerini birleştirir ve sıralı veritabanlarına ağ erişimi ekleyerek, keyfi algoritmayla hizalama, PhyML ile maksimum olasılıklı ağaç oluşturma ve görüntüleme, yazdırma ve köklü veya köksüz, ikili veya çok yönlü filogenetik ağaçların panoya kopyalanması. Filogenetik analizler için mevcut geniş araç ve algoritmalarla ilgili olarak, SeaView özellikle bu tür yazılımları öğretmek ve ara sıra kullanıcıları için yararlıdır.  GPL  İngilizce   Treeviewx  TreeViewX, filogenetik ağaçları görüntülemek için açık kaynaklı ve çok platformlu bir programdır. NEXUS ve Newick biçimli ağaç dosyalarını okuyabilir ve görüntüleyebilir (PAUP*, ClustalX, TREE-PUZZLE ve diğer programların çıktıları gibi). Ağaçların dallarının sipariş edilmesine ve SVG formatında ihraç edilmesine olanak sağlar.  GPL  İngilizce   StarBiochem  StarBiochem, dört farklı protein yapısı düzeyine dayanan yapısal protein bilgilerini temsil eden protein biyolojisinde çalışma için 3B etkileşimli bir görüntüleyicidir.  GPL  İngilizce   NCBI Genome Workbench  Genome Workbench, genetik verileri incelemek ve analiz etmek için zengin bir entegre araçlar kümesidir. Genome Workbench, NCBI veritabanları veya kullanıcının kendi özel verileri dahil olmak üzere birden çok kaynaktan gelen verileri keşfedebilir ve karşılaştırabilir. Genome Workbench'teki veri analizi, diğerlerinin yanı sıra BLAST, Clustal, Kalign, MAAFT dahil olmak üzere gelişmiş bir endüstri standardı hizalama araçları paketi tarafından desteklenir.  GPL  İngilizce   Biogenesis  Biogenesis, doğadaki tek hücreli organizmaların evrimiyle ilgili süreçleri görsel bir şekilde simüle eder. Mutasyon veya evrim fikirlerine didaktik bir yaklaşım olmaya çalışır ve aynı zamanda bir eğlence olarak da kullanılabilir. Öğrencilere bazı temel biyolojik gerçekleri göstermek için bir destek görevi görmesi amaçlanmıştır.  GPL  İngilizce   Adun  Adun, hesaplamalı kimya ve deneysel biyoloji için bir uygulamadır. Simülasyonları oluşturmak ve işlemek için güçlü bir kütüphane olan Adun çerçevesi üzerine inşa edilmiştir. Adun, simülasyon verilerinin analizi ve yönetimi için moleküler simülasyon için gelişmiş algoritmalar ve protokoller tarafından geliştirilen bir moleküler simülasyondur. Pek çok anlamda Adun, herhangi bir moleküler simülasyon aracını içerebilen ve ona neredeyse sınırsız büyüme potansiyeli sağlayan basit bir yapıdır.  GPL  İngilizce  

Çevrimiçi kaynaklar (Online Resources)
Programlama (Programming)

 https://khancacademy.org 
 http://www.freecodecamp.com 
 http://www.codecademy.com 
 http://www.coursera.org 
 http://www.edx.com 
 https://scratch.mit.edu 

Yabancı dil (Foreign Languages)

 http://www.dw.de 
 http://www.busuu.com 
 http://www.interpals.net 
 http://www.duolingo.com 
 https://www.speaky.com  (Chat Miscellaneous Foreign Languages)

Cloud Libre Office

 https://open365.io 

Fizik (Physics)
 Adı  Açıklaması  Lisans  Dil  Web sayfası Tracker  Tracker, Açık Kaynak Fiziği Java kod kitaplığı üzerine kurulmuş bir görüntü ve video analiz paketi ve modelleme aracıdır. Üniversiteye giriş fizik laboratuvarlarında ve derslerde kullanılmak üzere tasarlanmıştır. Tracker Simulator, video özelliklerini bilgisayar modellemeyle birleştirir.  GPL  İngilizce   Light Speed  Light Speed! özel göreliliğin hareketli nesnelerin görünümü üzerindeki etkilerini göstermek için geliştirilmiş OpenGL tabanlı bir programdır. Bir nesne saniyede birkaç milyon metreden daha fazla hızlandığında, garip ve alışılmadık şekillerde çarpık ve rengi atmış görünmeye başlar ve ışık hızına yaklaştıkça etkiler gittikçe daha tuhaf hale gelir. Ek olarak, nesnenin çarpıtılma şekli, gözlemlendiği bakış açısına göre büyük ölçüde değişir.  GPL  İngilizce   Step  Step, etkileşimli bir fizik simülatörüdür. Step size nesnelerin, farklı kuvvetlerin eylemi ve varyasyonu altında fizik kanunlarına göre nasıl evrimleşeceğini gösterir.  GPL  İngilizce   MaxFEM  MaxFEM, sonlu elemanlar yöntemini kullanarak elektromanyetik problemleri sayısal bir şekilde çözmek için açık kaynaklı bir modüler yazılım arayüzüdür. MaxFEM, Santiago de Compostela Üniversitesi Uygulamalı Matematik Bölümü tarafından geliştirilmiştir.  GPL  İngilizce  

Dış bağlantılar










Kaynakça

Kategori:Linux dağıtımları
Kategori:Eğitim yazılımları