Hesaplamalı biyoloji

Hesaplamalı biyoloji veya bilişimsel biyoloji, biyolojik, ekolojik, davranışsal ve sosyal sistemlerin araştırılmasında veri analitik ve teorik yöntemlerin, matematiksel modelleme ve hesaplamalı simülasyon tekniklerinin geliştirilmesini ve uygulanmasını içerir. Disiplinlerarası bir alandır ve de farklı disiplinleri kucaklar. Temelinde biyoloji, uygulamalı matematik, istatistik, biyokimya, kimya, biyofizik, moleküler biyoloji, genetik, genomik, bilgisayar bilimi ve evrim yer almaktadır.

Hesaplamalı biyoloji alanı biyolojik bilgisayar disipliniyle karıştırılmamalıdır. Biyolojik bilgisayar disiplini, bilgisayar bilimleri ve bilgisayar mühendisliği'nin bir alt dalıdır ve bilgisayar inşaası için biyoloji ve biyomühendislik temellerini kullanır. Bir diğer disiplinlerarası alan olan, bilgisayarlarla biyolojik data işlemesi üzerine odaklanan biyoinformatik hesaplamalı biyolojiye daha çok benzerlik gösterir.

 Alt dallar 

 Hesaplamalı anatomi
 Hesaplamalı biyo-modelleme
 Hesaplamalı genomik
 Hesaplamalı sinirbilim
 Hesaplamalı farmakoloji
 Hesaplamalı evrimsel biyoloji
 Hesaplamalı kanser biyolojisi
 Hesaplamalı nöropsikiyatri

 Kullanılan yazılımlar ve veritabanları 
Hesaplamalı Biyologlar çeşitli yazılımlar kullanırlar. Bunlar komut satırı programlarından, web tabanlı programlara kadar değişiklik gösterebilir.

Aynı zamanda veritabanları da hesaplamalı biyoloji araştırmalarında çok önemli bir yerer sahiptir. Biyolojik veri, araştırmaların bel kemiğini oluşturmaktadır ve de dünyaca ünlü açık erişim veritabanları sayesinde araştırmalar her isteyen tarafından yapılabilmektedir.

Veritabanlarına ve yazılımlara bazı örnekler olarak şunlar gösterilebilir:

  Kyoto Encylopedia of Genes and Genomes (KEGG): Biyolojik yolakların, genlerin, proteinlerin ve de genomların çok fazla tür için bütün detaylarını gösteren bir veritabanıdır. 
   (MEME): Verilen genetik dizilimde tekrar eden motif paternlerini saptayan açık kaynaklı web-tabanlı yazılım. 
  Tomtom: Verilen bir motifi veritabanındaki başka motifler ile karşılaştıran web-tabanlı yazılım.

 Konferanslar 
Hesaplamalı biyoloji ile ilgili birkaç büyük konferans mevcuttur. Bazı önemli örnekler olarak şunlar verilebilir:  (ISMB),  (ECCB) ve  (RECOMB).

 Bilimsel Dergiler 
Hesaplamalı biyolojiye adanmış çok sayıda dergi vardır. Bazı önemli örnekler olarak  ve  gösterilebilir. PLOS Computational Biology  dergisi hakemli bir dergi olup, bu alanda çeşitli önemli projelere öncülük etmektedir. Yazılımlarla ilgili incelemeler, açık kaynaklı yazılım tutorialları sunar ve yaklaşan hesaplamalı biyoloji konferansları hakkında bilgiler verir. Aynı zamanda açık erişimli bir dergidir . Atıfta bulunulduğu süreçte dergideki yayınlar özgürce ve bedelsiz bir şekilde kullanılabilir.

 Ayrıca bakınız 

 Biyoinformatik
 Biyosimülasyon
 Biyoistatistik
 Hesaplamalı kimya
 Hesaplamalı bilim
 Hesaplamalı tarih
 Biyolojik simülasyon
 Matematiksel biyoloji
 Monte Carlo metodu
 Moleküler modelleme
 Ağ biyolojisi
 Yapısal biyoloji
 Sentetik biyoloji
 Sistem biyolojisi

 Kaynakça 

Kategori:Biyoenformatik