Protein-ligand yanaştırma (moleküler) yazılımlarının listesi

Halihazırda mevcut olan protein-ligand yanaştırma programlarının sayısı yüksektir ve son on yılda giderek artmıştır. Aşağıdaki liste, en yaygın yanaştırma programlarının bir listesidir. Bu liste programların ilgili yayın yılı, ilgili kuruluş veya kurumu, web hizmetinin kullanılabilirliği ve lisansı ile alakalı genel bir bakış sunmaktadır.

ProgramYayımlanma YılıOrganizasyonWeb HizmetiLisans1-Click Docking2011Mcule   Kullanımı ücretsizAADS2011Hindistan Teknoloji Enstitüsü   Kullanımı ücretsizADAM1994IMMD Inc.   TicariAutoDock1990Scripps Araştırma Enstitüsü   AutoDock Vina2010Scripps Araştırma Enstitüsü   BetaDock2011Hanyang Üniversitesi   Ücretsiz yazılımBlaster2009Kaliforniya San Francisco Üniversitesi Mevcut  Ücretsiz yazılımBSP-SLIM2012Michigan Üniversitesi Mevcut  Ücretsiz yazılımCABS-dock2015Varşova Üniversitesi Mevcut   (bağımsız uygulama)Akademik kullanım için ücretsiz (web sunucusu)DARWIN2000Wistar Enstitüsü   Ücretsiz yazılımDIVALI1995Kaliforniya San Francisco Üniversitesi   Ücretsiz yazılımDOCK1988Kaliforniya San Francisco Üniversitesi   Akademik kullanım için ücretsizDockingServer2009Virtua Drug Ltd   TicariDocking Study with HyperChem2006Motonori Tsuji   TicariDockVision1992DockVision   TicariDOLINA2014Basel Üniversitesi   AkademikEADock2007İsviçre Biyoinformatik Enstitüsü Mevcut  Ücretsiz yazılımeHiTS2006SymBioSys Inc   TicariEUDOC2001Mayo Klinik Kanser Merkezi   AkademikFDS2003Southampton Üniversitesi   AkademikFitted2010Molecular Forecaster Inc.   Akademik kullanım için ücretsizFlexX2001BioSolveIT   TicariFlexAID2015Sherbrooke Üniversitesi   FlexPepDock2010Hebrew Üniversitesi Mevcut  Ücretsiz yazılımFLIPDock2007Scripps Araştırma Enstitüsü   Akademik kullanım için ücretsizFLOG1994Merck Araştırma Laboratuvarları   AkademikFRED2003OpenEye Scientific   Akademik kullanım için ücretsizFTDOCK1997Biyomoleküler Modelleme Laboratuvarı   Ücretsiz yazılımGalaxyPepDock2018Seul Ulusal Üniversitesi Mevcut   (bağımsız uygulama)Akademik kullanım için ücretsiz (web sunucusu)GEMDOCK2004Ulusal Chiao Tung Üniversitesi   Ücretsiz yazılımGlide2004Schrödinger   TicariGOLD1995Sheffield Üniversitesi, GlaxoSmithKline plc ve CCDC arasında işbirliği ile   TicariGPCRautomodel2012INRA Mevcut  Akademik kullanım için ücretsizHADDOCK2003Center Bijvoet Biyomoleküler Araştırma Merkezi Mevcut  Akademik  (Ücretsiz Web hizmeti mevcut)Hammerhead1996Arris Pharmaceutical Corporation   AkademikICM-Dock1997MolSoft   TicariidTarget2012Ulusal Tayvan Üniversitesi Mevcut  Ücretsiz yazılımiScreen2011Çin Tıp Üniversitesi Mevcut  Ücretsiz yazılımLead finder2008MolTech   TicariLigandFit2003BioVia   TicariLigDockCSA2011Seul Ulusal Üniversitesi   AkademikLightDock2018Barselona Süper Bilgisayar Merkezi    (GNU GPL)LIGIN1996Weizmann Bilim Enstitüsü   TicariLPCCSU1999Weizmann Bilim Enstitüsü Mevcut  Ücretsiz yazılımMCDOCK1999Georgetown Üniversitesi Tıp Merkezi   AkademikMEDock2007SIGMBI Mevcut  Ücretsiz yazılımMolecular Operating Environment (MOE)2008Chemical Computing Group   TicariMolegro Virtual Docker2006Molexus   AkademikMOLS 2.02016Madras Üniversitesi    (GNU LGPL)MS-DOCK2008INSERM   AkademikTicariParaDockS2010Halle-Wittenberg Martin Luther Üniversitesi ve Bilgisayarlı Biyoloji Partner Enstitüsü   ParDOCK2007Hindistan Teknoloji Enstitüsü Mevcut  Ücretsiz yazılımPatchDock2002Tel Aviv Üniversitesi Mevcut  Ücretsiz yazılımPLANTS2006Konstanz Üniversitesi   Akademik kullanım için ücretsizPLATINUM2008Moskova Fizik ve Teknoloji Enstitüsü (Devlet Üniversitesi) Mevcut  Ücretsiz yazılımPRODOCK1999Cornell Üniversitesi   AkademikPSI-DOCK2006Peking Üniversitesi   AkademikPSO@AUTODOCK2007Leipzig Üniversitesi   AkademikPythDock2011Hanyang Üniversitesi   AkademikQ-Dock2008Georgia Teknoloji Enstitüsü   Ücretsiz yazılımQXP1997Novartis   AkademikrDock1998 (Ticari)2006 (Akademik)2013 (Açık Kaynak)Vernalis R&D (Ticari)York Üniversitesi (Ticari)Barcelona Üniversitesi (Açık Kaynak)   SANDOCK1998Edinburgh Üniversitesi    AkademikScore2004Alessandro Pedretti & Giulio Vistoli Mevcut  Ücretsiz yazılımSEED1999Zürih Üniversitesi    smina2012Pittsburgh Üniversitesi    SODOCK2007Feng Chia Üniversitesi (Tayvan)   AkademikSOFTDocking1991Kaliforniya Üniversitesi, Berkeley   AkademikSurflex-Dock2003Tripos   TicariSwissDock2011İsviçre Biyoinformatik Enstitüsü Mevcut  Web hizmeti akademik kullanım için ücretsizVoteDock2011Varşova Üniversitesi   AkademikYUCCA2005Virginia Tech   Akademik

 Kaynakça 

 Dış bağlantılar 


Kategori:Yazılım listeleri