Chargaff kuralları

Chargaff kuralları, Avusturyalı biyokimyacı Edwin Chargaff tarafından 1949-1951'de yayımlanan, DNA'daki çeşitli azotlu bazların miktarları arasındaki ilişkileri ifade eden deneysel kurallardır.

Chargaff'ın çalışmasına kadar "tetranükleotit" teorisi hakimdi, bu teoriye göre DNA dört farklı azotlu bazın (adenin, timin, guanin ve sitozin) tekrar eden birimlerinden oluşmaktaydı. Chargaff ve yardımcıları DNA nükleotitlerini kâğıt kromatografisi ile ayrıştırıp farklı tiplerden nükleotitlerin miktarlarını ölçtüler. Eğer dört baz tekrar eden birimler içinde olsaydı oranlarının eşit olması beklenirdi, oysa ölçümler bunu doğrulamadı. Chargaff tarafından bulunan ilişkiler aşağıdaki gibiydi:Molecular Biology / history of biology since the beginning of XX century to the present day. М.: Наука. Moscow: Nauka. 1975. 1975. sayfa 454 - 454

1. Adenin (A) miktarı timin (T) miktarına eşitti ve guanin (G) miktarı sitozin (C) miktarına eşitti: A = T, C =G.
2. Pürinlerin miktarı pirimidinlerin miktarına eşitti.: A + G = T + C.
3. Amino gruplu bazların miktarı keto gruplu bazlarınkine eşitti: A + C = T + G.

Ancak, farklı biyolojik türlerden elde edilen DNA'daki (A + T): (G + C) oranı farklıydı. Bazı türlerde A+T'ler hakimdi, bazılarında ise G+C'ler.

Chargaff'ın kuralları, James Watson ve Francis Crick'ın önerdiği üç boyutlu DNA yapısının doğruluğunu destekleyici bir bilgi olarak belirtilmiştir.

 DNA'daki bazların yüzdeleri 
Aşağıdaki tablo Erwin Chargaff's 1952 verilerinden bazı örnekler sunar. Listelenmekte olan çeşitli organizmaların baz bileşimleri Chargaff'ın kurallarının desteklemektedir.
Organizma  %A %G %C %T A/T G/C %GC %AT φX174 fajı  24.0  23.3  21.5  31.2  0.77  1.08  44.8  55.2 Mısır 26.8  22.8  23.2  27.2  0.99  0.98  46.1  54.0 Ahtapot  33.2  17.6  17.6  31.6  1.05  1.00  35.2  64.8 Tavuk  28.0  22.0  21.6  28.4  0.99  1.02  43.7  56.4 Sıçan  28.6  21.4  20.5  28.4  1.01  1.00  42.9  57.0 İnsan  29.3  20.7  20.0  30.0  0.98  1.04  40.7  59.3 Çekirge  29.3  20.5  20.7  29.3  1.00  0.99  41.2  58.6 Denizkestanesi  32.8  17.7  17.3  32.1  1.02  1.02  35.0  64.9 Buğday  27.3  22.7  22.8  27.1  1.01  1.00  45.5  54.4 Maya 31.3  18.7  17.1  32.9  0.95  1.09  35.8  64.4 E. coli  24.7  26.0  25.7  23.6  1.05  1.01  51.7  48.3

 Chargaff Eşitlik Kuralı 2 
Daha sonraki yıllarda bu kuralların her bir DNA ipliği için de doğru olup olmadığına bakılmıştır. Eğer yeterince uzun DNA dizilerine bakılırsa her bir DNA iplikçiği %A ~ %T ve %G ~ %C kuralının olduğunu bulunmuştur.Rudner R, Karkas JD, Chargaff E (1968). Separation of B. subtilis DNA into complementary strands. III. Direct Analysis. Proc Natl Acad Sci USA, 60:921-922.  Chargaff'a atfen "Chargaff Eşitlik Kuralı 2" olarak adlandırılan bu kural tek bir DNA ipliğindeki baz bileşiminin global düzeyde bir özelliğidir, kısa DNA dizileri için geçerli değildir.

 Kaynakça 

 Konuyla ilgili yayınlar 






 Dış bağlantılar 
 CBS Genome Atlas Database — yüzlerce baz oranı dengesilik örnekleri bulundurmaktadır.
 The Z curve database of genomes — Genomların analizi için 3 boyutlu bir görüntüleme aracı.

Kategori:DNA
Kategori:Biyomühendislik
Kategori:Biyoteknoloji
Kategori:Moleküler biyoloji