Nükleobaz

Nükleobazlar (veya nükleotit bazları), RNA ve DNA'daki şekerlere bağlı olan, azotlu kimyasal moleküldür. Bunlara adenin, guanin, sitozin, (yalnızca DNA'da bulunan) timin ve (yalnızca RNA'da bulunan) urasil dahildir. Bunlar sırasıyla A, G, C, T ve U olarak kısaltılır. Genetikte bunlara genelde baz olarak değinilir.

Bir DNA dizisi RNA'ya kopyalandığında timinin yerini urasil alır. Bu iki baz birbirine çok benzer, timinin 5' konumundaki metil grubu urasilde eksiktir. Adenin ve guanin, pürin olarak adlandırılan çift halkalı bazlar sınıfına; sitozin, timin ve urasil ise pirimidin olarak adlandırılan tek halkalı bazlar sınıfına aittir. DNA ve RNA dizilerinde pürinler R, pirimidinler Y harfi ile gösterilebilir.

Bir riboz veya deoksiriboz şekerinin 1' karbonuna bağlı bir baz nükleozit olarak adlandırılır. Bir nükleozitin 5' karbonuna bir veya daha fazla fosfat grubu bağlanmış hali nükleotit olarak adlandırılır.

Adenin (A), guanin (G), sitozin (C), timin (T) ve urasil (U) bazlarını taşıyan nükleozitler, sırası ile, adenozin, guanozin, sitidin, timidin ve uridin olarak adlandırılır.

DNA ve RNA sentezlendikten sonra yukarıda sayılan bazların bazıları, belli enzimlerin etkisiyle kimyasal değişime uğrayabilir. DNA'da bulunan tek değişik baz, 5-metilsitozin (m5C)'dir. RNA'da pek çok değişim görmüş baz vardır, bu bazların ait oldukları nükleozitler ların arasında psödouridin (Ψ), dihidrouridin (D), inosin (I), ribotimidin (rT) ve 7-metilguanozin (m7G) sayılabilir.

Hipoksantin ve ksantin, mutagen etkisiyle meydana gelen pek çok bazdan ikisidir, her ikisi de deaminasyon (bir amin grubunun hidroksil grubu ile değişmesi) ürünüdür. Hipoksantin adeninden, ksantin ise guaninden meydana gelir.T Nguyen, D Brunson, C L Crespi, B W Penman, J S Wishnok, and S R Tannenbaum, DNA damage and mutation in human cells exposed to nitric oxide in vitro , Proc Natl Acad Sci U S A. 1992 April 1; 89(7): 3030–3034 Benzer şekilde, sitozinin deaminasyonundan urasil oluşur.

 Yapı 
 Adenin ve guanin bir pürin iskeletine sahiptir, bu yüzden pürin baz olarak adlandırılırlar.
 Sitozin, urasil ve timin bir pirimidin iskelete sahiptir, dolayısıyla bunlara pirimidin baz denir.

 Asıl bazlar 
Bunlar DNA veya RNA sentezi sırasında uzayan zincire dahil edilirler.
 Nükleobaz  58px|Chemical structure of adenineAdenin  86pxGuanin  86pxTimin  51pxSitozin  51pxUrasil Nükleozit  95px|Adenozin'in kimyasal yapısıAdenozinA  123px|Guanozin'in kimyasal yapısıGuanozinG  87px|Timidin'in kimyasal yapısıTimidinT  87px|Sitidin'in kimyasal yapısıSitidinC  87px|Uridin'in kimyasal yapısıUridinU

 Değişmiş pürin bazlar 
Bunlar değişime uğramış adenozin veya guanozine örnektir:

 Nükleobaz  70px|Hipoksantin'in kimyasal yapısıHipoksantin  80px|Ksantin'in kimyasal yapısıKsantin  90px|7-Metilguanin Nükleozit  95px|İnosin'in kimyasal yapısıInosinI  105px|ksantosin'in kimyasal yapısıKsantosinX  118px|7-metilguanozin'in kimyasal yapısı7-metilguanozinm7G

 Değişmiş pirimidin bazlar 
Bunlar sitidin, timidin ve uridinin değişime uğramış hallerine örnektir:
 Nükleobaz  51px|Urasilin kimyasal yapısıUrasil  51px|dihidrourasil'in kimyasal yapısı5,6-Dihidrourasil  65px|5-Metilsitosin'in kimyasal yapısı5-Metilsitosin Nükleozit  87px|Psödouridin'in kimyasal yapısıPsödouridinΨ  87px|Dihidrouridin'in kimyasal yapısıDihidrouridinD  87px|5-metilsitidin'in kimyasal yapısı5-Metilsitidinm5C

 Suni bazlar 

Çok sayıda suni nükleobaz türevi mevcuttur.

En yaygın kullanım alanı fluoresan problardır. bunlar rRNA veya cDNA'nın mikrodizi (mikroarray)'lerde işaretlenmesinde kullanılır.

Bazı araştırma grupları genetik kodu genişletmek için isoguanin veya isositozin gibi fazladan bazları kullanmaya çalışmaktadır. Bazı gruplar ise aynı amaçla 2-amino-6-(2-tienil)pürin ve pirrol-2-karbaldehit gibi fluoresan bazları denemektedir.

Tıpta çeşitli nükleozit türevleri antikanser veya antiviral ilaç olarak kullanılmaktadır. Bu nükleozitler hücre içine alındıktan sonra nükleotitlere dönüşürler, viral polimeraz bu bazları viral nükleik aside dahil edince zincirin uzaması durur, virüs artık kendini çoğaltamaz.

 Ayrıca bakınız 
 Nükleozit
 Nükleotit
 DNA
 RNA

 Kaynakça 

 Dış bağlantılar 
 DNA çift sarmalında hidrojen bağları ile baz eşleşmesi


Kategori:DNA
Kategori:RNA